lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 666 33 11 1 999999999999999999999999999 11 1 11 6666666666666 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 77777777777777777 222222222222 1 11111 444444444444444444444444444444444 1111 6666666666666666666666666666 22222222 111 1111 1111 44444444444444 2222 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 333333 1 22 22222 66666666666666666666 1111 111 111111 1111 3 22 11 666666666 11111 111111 11111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333333333 11111 2222 1111111 3333333 111111 222222 1111 111111 111 222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111111 11111 111 11 3333333333333333 111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 11 22 111 111 33333333333 1111 11111 111111 1111 1 1111 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222222222222 1111 3 22222222 5555555555555555555555 111 2222 2222 11 22 1 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 5555555555555555 44 1
lowQualScore : 3 7 111 11 33 77 1 111111111111111111111111111 5 7 8 66 5 11 0 5 5 777 5 11 1111111111111 1 5 5 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 1 5 6 00000000000000000 6 99 5 222222222222 77 1 5 2 5 5 0 66 5 55555 5 66 888888888888888888888888888888888 66 66 0000 66 5 6 5 5 5 1111111111111111111111111111 00 33333333 5 000 6 4444 77 6 4444 33333333333333 6 7777 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 88 3 555555 0 33 77777 88888888888888888888 5 5 2222 000 666666 77 4444 3 22 6 999 4 5 1 5 5 5 77 77 77 3 111111111 44444 5 222222 5 44444 5 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111 22222 5555 5 8888888 5 4444444 666666 77 5 888888 5 5 5 1 2222 555555 4 111 222222222 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 4444 2 555555 5 888 55555 0 1 000 44 5 1 1111111111111111 5 8 000 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 99 222 6 99 4 6 88 22 222 8 444 33333333333 8 8 7777 6 99999999 66666 666666 8888 99 1 4444 6 9 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77 999999999999 6666 5 0 99 99999999 4444444444444444444444 6 111 8 5555 8 8 2222 33 6 22 3 88 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 33 3333333333333333 3 3 77 0 7
lowQualScore : . . ... .. .. .. . ........................... . . . .. . .. . . . ... . .. ............. . . . . ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . . . . ................. . .. . ............ .. . . . . . . .. . ..... . .. ................................. .. .. .... .. . . . . . ............................ .. ........ . ... . .... .. . .... .............. . .... .. ................................................................................................................................................................................................................ .. . ...... . .. ..... .................... . . .... ... ...... .. .... . .. . ... . . . . . . .. .. .. . ......... ..... . ...... . ..... . ...................................................................... .......... ..... .... . ....... . ....... ...... .. . ...... . . . . .... ...... . ... ......... . ...................................................................................... . .... . ...... . ... ..... . . ... .. . . ................ . . ... ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . .. ... . .. . . .. .. ... . ... ........... . . .... . ........ ..... ...... .... .. . .... . . ........................................................................... .. ............ .... . . .. ........ ...................... . ... . .... . . .... .. . .. . .. ............................................................... . .. ................ . . .. . .
lowQualScore : 3 3 000 33 66 99 4 111111111111111111111111111 7 1 9 99 0 99 0 0 0 111 0 99 1111111111111 9 0 0 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 4 7 0 00000000000000000 0 22 7 777777777777 99 4 7 1 0 0 0 99 0 11111 0 99 444444444444444444444444444444444 99 99 6666 99 0 0 0 0 0 9999999999999999999999999999 66 00000000 7 222 7 2222 77 7 2222 55555555555555 7 5555 00 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 2 555555 0 22 00000 44444444444444444444 7 7 1111 000 444444 99 2222 3 00 7 000 2 7 7 7 7 7 44 99 99 9 444444444 33333 7 333333 7 33333 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111 55555 3333 7 6666666 7 8888888 444444 99 7 999999 7 7 7 4 1111 000000 0 777 333333333 7 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0000 5 888888 0 888 66666 1 4 000 11 7 7 6666666666666666 0 4 000 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 88 000 7 22 2 7 33 00 222 0 000 00000000000 0 0 0000 7 55555555 77777 000000 3333 22 3 2222 7 3 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 99 333333333333 0000 7 2 22 00000000 3333333333333333333333 7 777 0 0000 0 0 2222 88 7 00 3 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 88 8888888888888888 2 2 55 0 3
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGACC--G--ATGAT---GTT-GTA-----CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGT--TT-GT--AT-CA-GA-C-A-A-TTT--TCC---G-AAA-ATA-AAAACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCTCTTCGAA--------------T----------G--TTT---GA----T----T--TT-GA----TTG--T------------T--AC-C-----------------A------------------C--GGAN----------AT-C---------T----------T-CGA--------AC---------------CGA----C-AACTTTC-AAACGTAG----TAGAGC-GAACC--A-ATACTTA-TGG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAG---CA--TC-ATT--C-GTT-AT-TGTTAACAAAATA----A--ATA-CAATTG-CAGAAATAT-AGAAATATTT-ATTAAAATT-AT--A-ATGTAA-T-GTGTCCGTTT--AACA-ACAAAA-A-----CA---TTTT--TTAAAAA-TCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGATTTT-----AT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T--CG-ACC-AA-TA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-T---GT-TT-CTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATA-GA-TA--------AAAC-ATTTA----TTTGT--TTTTTT--A------TTTAAA---TGCA-CACCT---AGG-----CCCG-AAC-TAG-TGC-----AT------GT--TGAAAATTTAT-T-TTAAA--TCGAATTA---TACTG--ATTT--AA--AATCA--A-A---TA-G---CGA--CCT-CT-GCGCCGA-C-NC---CCCCCCCC-CCTCACCC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGC-GAAAGGTATTATGAA---C-AATTGGG-TCCTTGTGGGT------AATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-NTTACA----TGCACATTATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-C-TTGACAAA--AAT--TAATTATTCA--CGAA--AGA-----GAG-A---T--TG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------GT---------------------G--N-CA--G-------G----AGGAA---A-TA---TTTCA-----TTTTCTTT-GT-AAAC-------G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CA-T--A-CT-G-CT-TGTTGGATT----TAGG-----TTNACT-G-TT--A------A-TACAGTC--GTCA--------CCCAA-C-T-----TCCG-T-A-TTG-ACATA--A-----------TTAT-ATTAA--TTA-TA-TGA--A-TTTT--T-AAGAC-A----AGA-A---AAA---ATCAA---AA-ACTTG-AAGAA---G------------CAGAAAACG---AGTATC-----------GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCT--TTCA--GACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----GA----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCCAT----AGA-AGA-C-TA----TAC-AGAG---AAG--AAATC--A------ANA-G-----TG---T---C---A-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-A-A-ATAAA-A-----N-A-AA-ACCTT---G-TAC--------GG---T-AGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCCA-T-GC-C---GAGGA-----TTTAA-TGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAG-GGGGGGGCAATATATT-TT----GGTG---------AGGCAT--------------------------TT------------TTGGGT--GCC------------AAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGTAT--TGTTT-AGT--ATATTTTTG-GTGAA---G----A-----GGGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAATCC-GCC-AC---TGA--TAGGTGGGC-CGA-ACTA--ATA-------AAT--------------GTACCACGCTGTTTT-A--ANGCA------AATGAA---AA-AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-ACCG-TTTTGGACTCGTCCAAGTCCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( gi|1 ) : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGACCCCGC-ATGA----GTT-GTA-----ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGT--TT-GT--AT-CA-GA-C-A-A-TTT--TCC---ATAAACATATAAAACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATGCAAA-TGCAACTTTTTCTCTTCAAA--------------T----------G--TTT---GA----T----T--TT-GA----TTGT-T------------T--AC-C-----------------A------------------A--AGAC----------AT-C---------T----------T-CGA--------AC---------------CGA----C-AA--TTC-AA-CGTAG----TAGAGC-ACACC--A-ATACTTA-TGG--T-AT-TCAAA----AA---T---A--T-TAAG---TA--TCAATTG-C-GTT-AT-TGTTAACAAAATAA--CA--ATA-CAATTG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACATGTAA-T-GTGTCTGTTT--AACA-ACAAAA-A-----TA---TTTT--TCAAAAA-TCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTTT----AT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T--CG-AAC-AA-TA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-T---G--TT-CTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATA-AT-TA--------AAAC-ATTTA----TTTGT--TTTTTT--A------T---AA---TGCA-CA-CT---AGG-----CC---AAC-TAG-TGC--AATAT------GT--TGAAAATTTATAC-TTAAA--TCGAACTA---T--TT--ATTT--AA--AATCA--A-A---TA-G---TGAACTTTACTAACG-TGA-C-AC---CCCCCCTC-TCTC-----------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGC-GAAAGATATTATGAA---G-AATTGTG-TCCTTGTGGGT---T--AATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGC-CATTATCTTAATTA-TTTCCAAACATG-TTTCA-AAA-C-TGAACAAA--AAT--TAATTATTC---C-----AGA-----GAG-A---T--TG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------GT---------------------G--G-CA--G-------G----AGGAA---A-T----TTTCA-----TTTTC-T--GT-AAAC-------G-AAGT-A-TAA-TCTT------T--GGC-CA-T--A-CT-G-CT-TGTTGGATT----TAGG-----TTTACT-G-TT--A------A-TACAG----GTCA--------CCCAA-C-T-----T-CG-T-A-TTG-ACATA--AA----------TTAT-ATTAAC-TTA-TA-TGA--A-TTTT--T-AAGAC-A----AGA-A---AGA---ATCAA---AA-ACTTG-AAAAA---G------------CAGAAAACG---AGTATA-----------GTGTTT--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCT--TTCA--G-CA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----GA----AAATCGC--A-C-TGCA-AGC--T----AGA-AGA-C-TA----TAC-AGAG---AA---AAATC--A------ATA-G-----TG---T---C---A-A-TG-TA-AA---G-CTA-C-G-A--A----T----A-A-A-ATAAA-A-----T---AA-ACCTA---G-TAC--------GG---A-AGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAA--TCA-T-GC-C---GAGGA-----TT-AG-TGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAG-GGTGGGG----------------GGGG---------GGGCAT--------------------------TT------------TTGGGT--GCC------------AAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGTAT--TGTTTCAGC--ATATTTT---GTGAC---G----G-----GGGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAATCT-GCC-AC---TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AAT--------------GTACGACAGTGTTTT-A--AAGCA-----AAATGAA--TAA-AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-ACCG-TTTTGGACTCGTCCAAG--CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|2 : GTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGACC--G--ATGAT---GTT-GTA-----CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGT--TG-TT--AT-CAAGA-C-A-T-TTTA-TTC---GAAAATAAA-AGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACTT---CTCTTCAAAA-------------T----------GGTTTT---GA----T----T--T--GA----TTGT-T---------------ACAC-----------------A------------------G--AAA-----------AT------------------------------------------------------A----C-TA--TTC-GA-CCGAG----AAGACC----CCGGA-AAATTT------------TCAAATCGTAA---T---A-----AAG---CA--CCA--TA-C--TT-ATGTATT--TAAAA------A--ATT-TAATTT-----AATA---GAAATATTT-ATTAAAATTAATGTAAAT-----T-GTGTTCGTTT--AACACACAAAA-A-----CA---TTTT--TTAAAGT-TCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----AT-TGTT-TG-TG-----------GG---AA--CT----T--CG-AAC-AA--A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TATGG--TT-CTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATA-GA-TA--------AAGC-TTTTAG---TTTGT--TTTGTT--A------TCTAAA---TGCA-CACCT---AGG-----CCCAAAAC-TAGTTGC-----AT------GTTGTGAAGAATTAC-T-TTAAA--TCGAATTAATCT--TG--ATTT---A--AATCA--A-A-----------------TACTCACG-TGA-CAACGGGCCCTCCTT-CATC-----------CGAGAT--TC------AAACTAATAAA--AAT-ACTGCTGAAAG-TATTATGAA---C-AATTGGG-TCTTTGTG------TAAAATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATCTAATTATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-C-TTGACAAA--AAT--TAATTCATC---C-----AAA-----GAG-AGATT--TGTTA-----C-ATAT-----------GGTTA---------GT---------------------G--GTCAAGG-------G----AGGAA---T-A----TTTCA-----TTCT--T--GT--AAC-------G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CA-TTGA-CTGG-CTGTGTTGAA------TAGT-----TTAACT-G-TT--A------A-TACAGTT--GTCA---------CCAA-C-T-----TCCG-TAA-TTG-ACAT-----------------------------------GA--A-TTTT--TGAAGAC-A----AAA-ACACAAA---ATTCA---AA-ACTTG-AAGAA---G------------CAG-AAACG---AGTATC-----------GTGTTCTGGTAG--CC-GGTGC--T--CCTTC---TTCA--G-AA--TG--------TTG------C------T----------------------A----------GA----AAATCGC--AGC-GACA-AGCCAT----AGA-AGATC-TA----TAC-AGAGA--AA---AAATCAAA------ATG-T-----TG---T---C---A-A-TG-TATAA---G-TTA-A-C-A--ATTATT----A-A-A-ATAAATA-----A---AA-ACTTT---G-TAC--------GG---T-AGCAATTTA--TTTTTCATGT-A--TCA-AA--TACAAAAATCCA-T-GC-C---GAGGAT----TT-AA-TGTT-T-GCTAGAA----GGAAA--A--T--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----TAAAG-GG-GGGGCAAGTATATTATTGTAGGTA---------AGCCAT--------------------------TTTAAAAGGCCATTTTTGAT--GCC------------AAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGTAT--TGTTT-AGT--ATATTTTTG-GTGAA---A----A-----GGGGG-GGGG---
gi|10 : gGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAATTGGG--T--AAT-TTCGACC--G--ATGAT---GTT-GTA-----CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GT--TT-GT--AT-CA-GA-C-A-A-TTT--TCC---G-AAA-ATA-AAAACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAAATGCAACTTTT-CTCTTCAAA--------------T----------G--TTT---GA----T----T--TTTAA----TTGT-T---------------AC-CACAGAATCTCGACCGAGA------------------A--GGAC----------GC-CCCGGGAAAAT----------T-ACA--------AA---------------CGA----C-AACTTTC-AAACGTAA----TAGAGC-GAACC--ACATACTTA-TGG--T-AT-TTAAA----AAATTT---AATC-TAAG---AA--TACATTG-CCGTT-AT-TGTTAA-ATAATAC--CA---TA-CAATTG-CAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-ATGTAATTGT------TGTCCGTTT--AACA-ACAAAA-A-----CA---TTTT--TTAAAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----AT-TGTT-TG-TG-----------GGT--AA--CT----T--CG-AAC-AA-TA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA-G---T--TT-CTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATA-GA-TA--------AAAC-ATTTATTTTTTTAT--TTTTTTTAA------TTA-AA---TGCA-CACCT---AG
gi|12 : gGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCA--TTGGG-T--AATCTTCGACTC----GTGAT---GTTTGTA-----CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGT--TTTGT--AT-CA-GA-CCA-A-TTT--TCC---G-AGGAATG-AAAACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------GCAAA-TGCA--------------------------------------------TTT---GA----A----T--TT-GA----TTGT-TACACAGAAATCTTCGAC-C-----------------G------------------AGAAGAC----------GC-CCCGGGGAAAT----------TACGA--------AA---------------CGA----C-AACTTTC-AAACGTAA----TAGAGCGACAC---A-AGACTTA-TGG--T-AT-TTAAA----AA---TTTAA--T-CAAG---TAATTC-ATTGCC-GTT-AT-TGTTAACAAAATAA--TACCATACCAATTG-CAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAATT-------ATGTAATT-GTGTCCGTTT--AACA-ACAAAACA-----TT---TTTT--TTTTAAA-TCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCAC--TAGACA--CAATTTT
gi|4 : ggTTGG--TCTAAC-TTCGACC--G--ATGAT---GTT--TA-----CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGT--TT-GT--AT-CA-GG-C---A-TTT--TCC---G-AAA-ATA-AAAACATTC-CCCC-ACTATGTT---T----------TGCAAC-CTTTCTCTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT---GA----T----T--TT-GA----TTG--T------------T--AC-C-----------------ACGGAAATCCTCGACCGAGA--AGACGCCCCAAGAAAT-T---------T----------A-CGA--------AC----------------GA----C-AACTTTCAAA-CGTAATAT-TAAAGC-GAACC--A-ATGCTTATTGA--T-AT-TT-AA----AA---T------C-TAAG---C-----------C-GTTAAT-TGTTAACAAA-------A--AT---------------------AAATATTT-ATTAAAATT-------ATGTAATT-ATGTCCGTTC--AACA-ACAAAA-A-----CATTTTTTT--TCAAAAA-TCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTTT----AT-TGTT-T-GTA-----------AGT--AA--CT----T--TG-ACC-AA-TA-TGT---------------------------------TAAAA-T---GT-TT-CTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATA-GA-TA--------ACAC-ATTTAT---TTTGT--TTTTTT--T------TTTAAA---TGCA-CACCT---AGG-----CCCG-GAC-TAG-TG-------T------GT--TGAAAAT---TACTTTAAA--TCAAATTA---TACTG--ATTTA-AA--AATCA--A-A---TA---------------TAGCGCCGACC-AC---CCCCCCCC-CCCCACTCT------CCAGAT--TC------AAACTAATAAAAAA---TATGC-GAAAG-TATTATGAA---C-AATTG--------------------GATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-A--ACA----TGCACATTATC-AAATTA-TTTTC-AGCATGTTTTCA-AAA-C-TTGACAAA--AAT--TAATTATTCA--CGAAA-AGA-----GAG-A---T--TG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------GTTCCAACAGTTAATAATCTTAAG--T-CA--G-------GA---AAAAA---A-T----ATTCA-----TTTTCTT--GT-AAAC-------G-AAGT-A-C---TCTT------T--GGC-CA-TG-A-CT-G-CT-TGTTGGATT----TAGG-----TTTACT-A-TT---------A-TACAGTC--GTCA--------CCCAA-CTT-----T-CGAT-A-TTGCACGCA---------------TAC-ATTTGA-TTA-TA-TGA--ATTTTT--T-AAGAC------AGA-A---
gi|11 : GG--T--A-T-TTCGAC---GCGATGACT--GTT-GTA-----CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GT--TT-GTTTATGCG-GA-C-A-A-TTT--CCG---A-AAATATA-----CATTT-CCTC-ATAAT-----ATTTTTGCA-----CA--CTTTTCT-TTCGAA--------------TT---------A--TTTATAGAGTTGT----T--TT-GAATTTTTGCGT------------T--AC-C-----------------ACAGGAAATCCTTCGGCGGA--AGAC----------GC-C---------CGGGAAAAGACT-CGA--------AC----------------GA----CTAAC-TTC-AA-TGTATATATTAGAGCCAAACA--G-ATACATA-TGG--TGATCTTAAA----AA---TTTAA--TCTAAGA--TAGTTCAGC---C-ATT-ATATGTTAACAAAATAATACG--ATA-C--TTG-TAAAAATAT-AGAA-TATTT-ATTAAAATT-------ATGTAA-TTGTGTCCGTTT--AACA-ACGAAT-T-----TT---TTTT--TTAAAAA-TCGGTCG-A-AGTT-A--C-C-------------------------AT-TGTT-T-GT------------GGT--CA--CT----T--CG-ACC-AA-TA-TGT------------------------------AAATAAAA-T---GT-TT-CTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAGAT-----------AAAC-ATTTG----TGTGT--cag
gi|14 : ggtagcgtgtacgtggtactgg--T--AAC-TTCGAC-------TGATTATGTT-TTA-----CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGT--TT-GT--AT-CA-GA-C-A-A-TTT--TCC---G-AAA-ATA-AAAACATTT-CCCCCATTGTGTT-------T------TGCACCCTTTTCTCTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT---GA----T----T--TT-CA----TTG--T------------T--AC-C-----------------A------------------C--GGAA----------AT-C---------C----------T-CGACAGAGAAGACGCCCCAAGAAAATTACGAACGAC-AACTTTCAAA-CGTAATTT-TAAAGC-GAACC--A-ATGCCTA-TGA--T-AT-TT-GA----AA---T------T-TAAG---C-----------C-ATT-AT-TGTTAACAAAATA----A--ATA-T--TTATCAAAAAT-TAAAA-----TT-AGTAAAA--TATACATATGTgacaatttctttaaatcgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|9 : agcgtggtc--T--AATGTTCGAC---GG-ATGA------T-GTATGTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GA-C-A-AGTTT--TCCGAAATAAAAA-AAAAAACATTTCCCCC-ATTATGTTA-----ATGCCAA-TATGGC------------AA--------------T-------------TTT---GA----T----T--TT-GA----TTGG-T------------T--AC-C-----------------ACG----------------C--AGATA---------AT-C---------TG---------T-CAG--------AC---------------CGA----cgttcaac
gi|20 : T--TT-GTC-AT-AA-GAAC-ATA-CTTAATTC---ACGAA-ATA-AAAACATTT-CCCC-ATTATG------TTATGCTA---GCAACTTTTTCTCTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
gi|23 : A-TGCAACCTTTTCTCTTCGAAT-------------T----------A--TTT---GA----TACAGTTGTT-AG----TTG--T------------T--AC-C-----------------A------------------C--GGAA----------AT-C---------C----------T-CGA--------Agcggcttcgaattatgttaaatacagattatgtaat
gi|13 : -TGCAACCTTTTCTCTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT---GA----TTTGAT--TT-GA----TTG--T------------T--AC-C-----------------A------------------C--GGAA----------ATCC---------T----------T-CG---------AC---------------CGA----G-AA--aagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|13 : gtttC-C-----------------A------------------A--GAAA----------AT-----------T----------A-CGA--------AC----------------GA----C-AACTTTC-AAACGTAGATATTAAAGC-GAACC--T-ATGCTTA-TAGATT-AT-TTAAA----A----T---C--T-AAAGCCGTA--T--ATT-----TT-GT--GTTAAC------------------------CCCAAATA-----AATATTTGATTAAAAT--------ATGTAA-TTATGGCCGTTCTCAACA-ACAAAA-AACATTTA---TTTT--TCAAAAA-TCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--C--TAG-CA--CGATT-------ATCTGAT-TG-TA-----------AGT--AAGCTT----T--TG-ACCCAA-TA-TGT--------------------------AAAAAA-------T---G--TTTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATA-GA-TA--------ACAC-ATTTA----TTTgaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|25 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgcccc--TTC-AAACGTAG----TAGAGC-AAACC--A-ATACTTA-TGG--T-AT-TCAAA----A
gi|11 : aactA-ACAGAA-A-----CA---TTTTATTTACATA-TTGGTCG-A-AGTG-A--C-C--A--CAA--A--CAAT--------------------------------GGT--AA--CT----T--CG-ACC-GA-TT-TTT--------------------------AAAAAAAAAA
gi|9 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaa-A-AGTT-A--C-C--TATTAG-CAGCCAATTTCTTAATAT-TGTTCTGATGCATTTATCTTTGGTTAAA--CTGGACTGGCGCAAC-AAATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGT---GTTTT-TTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATA-GTATAGGAATAACAAACTATTTT----TTTTTTATTTTTT--ATTAGATT---AAATTTGCACCA-CCTTAAGGCATGCCC---AACTTAG-TGTCAAACATGTGTGGGT--TGAAAATTtgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgtgtgtgacaatttctttaaatcgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : taatgttcgacggatgatgtatgtttctccagatttttatttcaccgttgttgtatgcagacaagttttccgaaataaaaaaaaaaacatttcccccattatgttaatgccaatatggcaattttgattttgattggttaccacgcagataatctgtcagaccgaagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaa-TGTC-TAGTG-----------GGT--AA--CT----T--CG-ACT-GA-TT-T------------------------------AAAAAAAAAA-T---G--TT-TTGTT
gi|3 : gggtagcgtaatctaacttcgaccattgggtaatcttcgactcgtgatgtttgtactccagtatttttatttcaccgttttgtatcagaccaattttccgaggaatgaaaacatttccctattatgttaagcaaatgcatttgaatttgattgttacacagaaatcttcgaccgagaagacgccccggggaaattacgaaacgacaactttcaaacgtaatagagcgacacaagacttatggtatttaaaaatttaatcaagtaattcattgccgttattgttaacaaaataataccataccaattgcagaaaatgagaagtattattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacT------GG--TGGAAATTTAT-T-TTAAA--TCGT-TTG---T--TCTGATTT--AATAAATCATTA-T---TACG---CGATCCCC-----CGCTGG-C-TC---CCCCCCCCATCTCACCCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AA-AAAAGA-T-TATGC-GAAATGTATTATGAAATCG-AATTGGG-T--TTCTGGGTAGTC--AATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GT-TTAACA----TGCACATTATCT-AATTA-TTTTCAA-CA-A-TTTTA-AAATC-TTGACAAA--A-T--TAATTATTCA--C-----AAAAGGAAGAGGA---T--TG-TA-----C-ATATTATTCCAGCTTA--TAAGAATCTTCGA---------------------G--T-CA--G-------G----AAGAA---A-A----TCACA-----TTTTC-TT-GT-AAAT-------G-A-GT-A-C---TCTT------T--GGC-CA-TG-A-CT-G-CT-TGT-GGATT----TAGG-----TTTTAT-A-TT--ATATATTA-TACAGCC--GTC----------CAAA-C-T-----T-CG-T-A-TTG-GCATA-----------------C-ATTAA--TGA-TACTGA--A-TTTT----AAGAC-A----AGA-A---A-----ATCAA---AA--CTTG-AAGAA---G------------CAGAAA-CG---AGTATC-----------GTGTTT--GTAG--CTGGTT----C--TCTCCT--T-CA--GACA--TG--------TTG------CCTTTT-T----------------------A--AGAC----GA----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCCAT----AGA-AGA-C--A----TACTAGAG---AAGATAAATC--A------AAATG-----TT---T---C---ATA-AA-TT-AA---G-TTAAC------A----T----T-A-A-ATAAA-A-----CTA-AA-ACCTTT--G-TAC--------GG---T-AGTAATTTAT-TT---CATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA--TCA-TTGC-C---GAGGA-----TTTAA-TGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT----C--AGAAATTT----TACAG-GG-GGGGCAATATATTGTA----GGTGCCTTTAAAAAGGCAT--------------------------TT------------TTGGGT--GCC------------AAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTAA--TGGTTTA-C--AAGTTTT---ATGAT---G----GAAAAAGAGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAATCT-G-C-AG---TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AAT--------------GTACCCC----TCTT-----CGC----------------AA-GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTACC-----TGA--TCATCCAAGT-CGTCGA-TGTAGCGGAGGTcaatttt
gi|8 : TAAAGGTCGAATTA---TACTG--ATCTTGAA--AATCA--ATACCCTA-GCAATGAAATTTCC----------C-CC---CGCCCCTC-TCTC-----------C-AGAT---C-----AAAA---ATACAA--ATATATGC-GAAAAGTATGAGTAA---GCAATTGGGCTCCTTGTAAGT------AATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GT-TTTACACAAGTGC-ACTTATCTAATTTA-TTTC-ACACATC-TTTCA-AAA-C-TTGACAAA--AAT--TTATTATCC---CGAA--AGA-----GAG-A---T--TG-TA-----CAATATC----------G--TA---------GT---------------------GGTG-CA--GTTGGAGCA----AGGAA---A-TATAATATCACTATTTTTTCTT--GT-AAAC-------GAAAGT-A-TAT-TCTCACATTGT--GGC-CA-T-----T-G-CG-CTTTG---T----TAG-----------T-G-TTAAA------A-TCCAGTT--GTCAAC------CTCAA-C-T-----TCCG-T-ATTTG-ACATA--AA------------ATCATTTAC-TTT-TA-TCA--A-TATT--T-AA----A----AGACA---AGATTCATCAC---AATACTTG-AAAAA---G------------CAGAAAA-G---AGTATC-----------GTACAT--GTAGAATTAGGTTCTGC--TATCCC--TTCA--G-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT-TC---------------------ATCAGAC----GAGAAGAAATCGCA-A-C-TGCA-AGC------------------A----TAA-ATAG--------AAATC--A------A-A-A-----TG---T---CGCAG-A-TG-T--AA---T-TTA-C-A-G--A----TTCAAA-A-G-ATAAA-A-----TAGAAA-ATCTT---G-T-C--------GT-----AGTAAATTAT-TTTTGGATGT-A--TTC-AA--TACAGAcccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|7 : cacttcATGAA---C-AATTGGG-TCCTTGTGG-T---A--AATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATTATC-TAATTA-TTTTC-AACATG-TTTCA-AAA-C-TTGACAAA--AAT--TAATTATTCA--CAA---AGA-----GAG-A---T--TG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------GT---------------------G--GTCAG-G-------G----AGGAA---A-TA---TTTCA-----TTTTCTT--GT-AAAC-------G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CATT--A-CT-G-CT-TGTTTGATT----TAGG-----TTTACT-G-TT--A------A-TACAGTT--GTCA--------CCCAA-C-T-----TCCG-T-A-TTG-ACAT-----------------------------------GA--A-TTTT--T-GAGACAA----AAA-A---AAA---ATC-A---AA-ACTTG-AAGAAGCTG------------CAG-AAACG---AGTATC-----------GTGTTCTGGTAGC-CTGG---------TCTCCTTCTTCA--GACA--TG--------TTG------C---T------------------------------AC----GA----AAATCGCCAG-C-TGCA-AGC--CATA-AGA-AGA-C-TA----TAC-AGAG---AAG--AAATC--A------AAT-G-----TG---T---C---A-A-TG-TT-AA-----TTA-C-A-ATTAT---T----A-A-A-ATAAATA-----A---AA-ACTTT---G-TAC--------GG---T-AGCAATTTAT-TTTTCCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCA-T-GC-C---GAGGA-----TT-TA-TGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--AATT--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----TAAAG-GGGGGGGCAGTATATTATTGTA-GGTA---------AGCCAT--------------------------AT------------TTAAGTAAGCCATTTTTGATGCAAAAT-C--GAGTT-TTAT-TAGTAT--TGTTT-AGT--ATATTTTTG-GTGAA---A----A-----GGGGG-G
gi|5 : --AATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGT-ATTACA----TGCACATGATCTAATTTA-TTTTCAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATTA-TC---C-----AAA-----GAG-A---GGATG-TA-----C-ATAT-----------GATTAAGCTTCG--AC---------------------G--T-CA--G-------GGGATGGGAAAATA-T----TTCCA-----TTTCT-TTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTAC-TCTT------TTAGGC-CATT--ACCT-G--T-TGTTGGATT----TAGGTAATTTTCACTCGTTT--A------A-GTCAGTCTTGTCAC-------CCCAA-C-TTCCGCT-CG-T-A--TG-ACATACCAT----------TTAT-ATTAA--TTA-TA-TTG--A-TTTT--T-AACGC-ACAAGAGA-A---AAA---ATCAA---AA-CTTTG-AAAAA---AGAAGCCACAGATCAGAAACTG---CATGTATTTTCGTCTCCGTGTTTG-GTAG--CT-GGTG-------CTCCC--TTCAAGA-CATTTG--------TTG------C---TT-TTGTATTTTTTAACTATAGTACGG--AGAA----AA----AAATCGC--A-CTTGCA-AGC--CCAAAGGA-AGA-CATATTATTAC-AGAGAGAAG---AAATCAAA------ATT-GTTCCTTG---T---C---ATATTGTTA-AA---G-TTA-C-A-G--A----TTA--A-A-A-AGAAAGA-----TTA-AA-ACCTT---GTTACTAATGGTAGG---ATAGTAATGTATATTTATCATGTCATTTTATAATATACAAAA--TCATT-GC-CCCTGAGGAATTTTTT-AGATGTTGTGGCTGGAACAGGGG-AAAGA--T--CAGAAAGTTGAC---AGCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCTAAAGCGGT
gi|19 : aggattacgggtacttttgaaattaCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GT-TTTA
gi|19 : G-TTTTA-AAA-C-CTGACAAA--AAT--TAATTACTCATGCACAAAAGA-----GAG-A---T--TG-TACAATTC-ATAT-----------A--TA---------GT--------------------------CA--G-------GA---AGGAA---A-TA---TTTCA-----TTTTC-aaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|26 : ctggatattggaatgacaaagctca-CA--G-------G----AAAAA---AATA---TTTCA-----TTTTC-TT-GT-AAAC-------G-AAGT-A-
gi|6 : tTT------T--GGCACA-G--A-CT-GATT-TGTTAGATTATATTGAG-----TAAACTCG-TT--A------AATACAGTAATGTCAAAACCCACCTCAATC-T-----T-CA-T-A-T---ATAGA--AAACTTTCATTTTTAT-AT-AACATTAATAATGATAA-TTTTA-T-AAGA--------AA-A---AGA---A-CAACTCAA-ACTTGCAAGAA---G-------------AGAACACGCGAAATCAA-----------GTATTT--GTAG--CTG--TTC--TAATCTC-T--TTCA--G-AAACTG--------TAG------C---TTAT----------------------GG-AGACTCAGAA----AAATAGC--A-CATGAACAGCCAT----AGATAGA---TAAAC-TAC-AGAG---AAGA-AAACC--ACAAAACATA-------TG---TTCCC---A-A-TGCTA-AACAGG-TTA-CTGTA--A----C----A-ATATATAAA-AAGACCT---AACACCTATATG-TAC--------GGTGTA-AATAAT----------------A--TTA-AAT-TACACAA--CTA-A-ACGC---GAGGA-----TTTAA-TGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT----C--AACAATTT----TAAAA-AGGGAGG----------------GGAG---------GAG
gi|17 : actacaa-TTG-ATAT---------------TTGT-ATTA----TA-TA-T------TTTTGTT-AATAC-A----AGA-A---A-A---ACCAA---TA--CTTG-AAGAA---G------------CAGAAA-CG---AGTAGA----------------T--CTAT--C---GTGT-----TCTCCT----CA--GACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------AT-AGAC----GAGAA-AAATCGC--A-C-TGCC-A----T----AGA-AG----------------------A---AAATC--A------AAA-T-----TGTTCT---C---A-ATTG-TA-AA---GTTTA-C-G----C----T----AGA-A-AGAAA-A-----aggggggaggggcagatataaaataaattgtaaaagtaaggacctttttttaaaagactatttgggtgccaaactggagtgattattagtaaaatgtgtagtaatttttaggtgaataaaaaaaaggggggggctttgtaaatagaccgatgtatgataggtgggctcgacaataatattatcgtaatcccacaaaaaaccactagaacactgttttatcaggcacaatgaaaaaatc
gi|21 : -AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAA-AGGGGGG----------------GGGG---------GTGCATTGTAGGTAAGCCTTTTCAAAAGGTCATT------------TTGGGT--GCC------------AAATAT-GGAGTT-TTAT
gi|22 : --------------------------TT------------TTGGGT--GCT------------AAAT-CTGGAGTT-TTA-ATGACAT----TTTTAGTAAATGTTTG---GCGAA---G----A-----GGGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATATCC-GCC-AC---TGt
gi|6 : ccaT------------TTGGGT--GCC------------AAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGT--A-ATTTTTAGGTGAATAAA----A-----AAAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAG-ACCGATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGCA-----CAATGAA---AA-AATC
gi|15 : actacaatttggcacagactgatttgttagattatattgagtaaactcgttaaatacagtaatgtcaaaacccacctcaatcttcatatatagaaaactttcatttttatataacattaataatgataattttataagaaaaagaacaactcaaacttgcaagaagagaacacgcgaaatcaagtatttgtagctgttctaatctctttcagaaactgtagcttatggagactcagaaaaatagcacatgaacagccatagatagataaactacagagaagaaaaccacaaaacatatgttcccaatgctaaacaggttactgtaacaatatataaaaagacctaacacctatatgtacggtgtaaataatattaaattacacaactaaacgcgaggatttaatgtttgctagaaggaaatcacaatgacaaaagatcaacaattttaaaaagggaggggaggagaggggggaggggcagatataaaataaattgtaaaagtaaggacctttttttaaaagactaT------------TTGGGT--GCC------------AAAT-C-T-AGTT-T-ATTTAGCAT--TGCT--AGT--A-ATTTT---TTGGC---GAAGAG-----AGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGTCT-GCC-AC---TGA--T
gi|16 : tgtaaataagccttttttaaaggccaG---GGTCTATTG----AAATCTTGCC-A----TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------T--------------G-ACCACGTTGTTTTTA--AAGCATATGAAAATTAA----A-AATCGGCTT--GCGTTTTGGACGGAACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGctaccgtgtttttttaaaaattggcctgcgttttggactcgtccaagtcgtcgatgtacgggggtaacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|18 : TGAAACTAACAAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-ACCG-TTTTGGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGTagtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|15 : gtattcaatacagacgAA-AATTGGCCT--GCGTT----------------TTGGACTCGTCCAAGT-CGTCGA-TGTACGGG-GGTActatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 11111 22222222222222 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 777777777777777777777777777777777777777 1 66666666666666666666666666666666 4444444 2222 11111 111 1 11111 111111 333333333333333 111111111 666666666666666666666666666 1111 1111 1111 22222222 1 11111 11111 11 111 1 1 1 55555555555555555 1 11 9999999999999999999999999 444444444444 3333333333 11 111111 1 1111 111111111 1111 111111 1111 222222222 11111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 11111 11 1 111111111 1111 111111 22 1111 11111 1 11111111 11111 22222222 1111 666666666666666666666666666666666 1111 111111 1111 1111 11111111 22222222222222 11 333333333333333 111 11 11111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 333333333333333333 11111 44444444 1111111 1 11111 4444444444444444 11111111 222222222222 222222222 11 1 111 1111 1111 11111111 22222 1111111 444444444444444444444 111 111 111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 111 111 2222 111 11 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 1 22
lowQualScore : 8 3 0 6 11 66 0 9999 5 5 5 5 5 5 5 6 66 5 66 0 5 5 55 5 5 4 55555 4 66 4 4 44444444444444 3 8 000000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8888 222 777 7777 777 777 1 8 1 4 66 4 4 000000000000000000000000000000000000000 3 5 0 11111111111111111111111111111111 1 5 0 5 8888888 2222 5 66 5 0 44444 77 555 6 5 5 0 66 5 22222 5 66 3 5 222222 5 5 777777777777777 77 77 555555555 0 5 5 333333333333333333333333333 1 1 5 1111 77 5 2222 5 5 2222 5 00000000 5 1 44444 99 99 55555 99 8 11 777 99 0 0 0 22222222222222222 6 99 3 0 6 99 6 5 55 99 99 6 6666666666666666666666666 1 8 222222222222 2222222222 00 0 999999 1 6 0000 6 33 888888888 5 5 0000 888 444444 66 2222 5 8 5 5 0 5 2 5 0 5 5 5 66 66 5 777777777 66 5 5 5 22222 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5555555555 4 11111 66 00 4 9999 9 5 333333333 5 3333 5 444444 66 5 5 11 5 5 5 5 0 0000 5 22222 1 0 66666666 5 44444 55555555 5 5 5 5555 5 4 4 333333333333333333333333333333333 8 1 66 4 1111 1 000000 4 4 777 1111 3 888 5555 888 88888888 9 66 55555555555555 88 666666666666666 333 5 44 11 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 5 0 5 66 5 5 666666666666666666 1 66 22222 1 00000000 888 888 2222222 0 88 33333 5 3333333333333333 5 99999999 555555555555 5 222222222 5 666 5 77 2 5 44 1 2 111 4444 6 6 6 4444 5 77 77 44444444 00000 2222222 8 111111111111111111111 222 111 2 333 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 22 5 5 33 5 9 999 777 5 5 000 6 0000 111 77 2 11 11 0 5 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 0 99999 6 8 0 0 33 8 3
lowQualScore : . . . . .. .. . .... . . . . . . . . .. . .. . . . .. . . . ..... . .. . . .............. . . ...... ............................................................................................................................................................................. .... ... ... .... ... ... . . . . .. . . ....................................... . . . ................................ . . . . ....... .... . .. . . ..... .. ... . . . . .. . ..... . .. . . ...... . . ............... .. .. ......... . . . ........................... . . . .... .. . .... . . .... . ........ . . ..... .. .. ..... .. . .. ... .. . . . ................. . .. . . . .. . . .. .. .. . ......................... . . ............ .......... .. . ...... . . .... . .. ......... . . .... ... ...... .. .... . . . . . . . . . . . . .. .. . ......... .. . . . ..... . ........................................................... .......... . ..... .. .. . .... . . ......... . .... . ...... .. . . .. . . . . . .... . ..... . . ........ . ..... ........ . . . .... . . . ................................. . . .. . .... . ...... . . ... .... . ... .... ... ........ . .. .............. .. ............... ... . .. .. ........ ........................................................ .. . . . .. . . .................. . .. ..... . ........ ... ... ....... . .. ..... . ................ . ........ ............ . ......... . ... . .. . . .. . . ... .... . . . .... . .. .. ........ ..... ....... . ..................... ... ... . ... ............................................................................................... . .. . . .. . . ... ... . . ... . .... ... .. . .. .. . . ................................................................................... .. . ..... . . . . .. . .
lowQualScore : 0 8 8 7 99 99 0 0000 0 0 0 0 0 0 1 5 99 0 99 0 0 0 44 0 0 4 66666 4 11 4 4 11111111111111 5 8 555555 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5555 222 888 2222 888 888 1 9 4 4 11 4 4 222222222222222222222222222222222222222 4 0 0 88888888888888888888888888888888 4 1 1 0 2222222 9999 0 99 7 1 33333 99 777 3 0 0 0 99 0 00000 0 99 1 0 666666 7 7 999999999999999 99 99 333333333 7 7 7 111111111111111111111111111 4 6 7 6666 99 7 1111 7 7 1111 7 77777777 7 4 33333 22 22 88888 22 0 00 555 00 0 0 0 22222222222222222 7 22 5 8 7 22 7 7 88 22 22 0 4444444444444444444444444 0 0 444444444444 4444444444 66 8 222222 4 7 0000 7 55 999999999 0 0 6666 888 444444 00 1111 7 7 4 7 1 0 3 0 2 0 0 0 99 99 0 111111111 99 0 0 0 55555 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0000000000 4 11111 33 66 4 4444 2 0 222222222 0 2222 7 444444 99 0 0 99 0 0 0 0 1 6666 0 55555 0 0 55555555 0 99999 00000000 0 0 0 6666 0 4 4 888888888888888888888888888888888 9 1 11 4 4444 1 333333 4 4 888 9999 1 555 6666 888 11111111 4 99 22222222222222 88 888888888888888 999 0 66 99 11111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 0 0 99 0 0 111111111111111111 4 99 55555 0 88888888 888 888 6666666 0 66 11111 0 6666666666666666 0 88888888 444444444444 7 999999999 7 444 7 99 3 7 44 3 5 777 2222 7 7 7 2222 7 99 99 44444444 00000 1111111 4 000000000000000000000 111 777 5 333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 55 0 0 66 7 1 444 999 7 7 000 7 8888 777 33 5 88 00 8 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 6 44444 0 0 8 8 88 0 2
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T----T--TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAG-C---A--T-CA-TTG-CGTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT---AT--ATGTAA--TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TTTAAA--TCGAATT-AT-CTGATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CCC-TAGC--GC-CGA---CNCCCCCCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------T---------------------G--TCA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CA-T--AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TNACT-GTT-A------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------CAT--A---TT-ATA-TTA-A-TTA-TA-TGA--A-TTTT--T-AAGAC-A----A-GA-A---AAA---ATCAAAA-ACTTG----AAGAA---G--------CAGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCT--TTC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--AT-AGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AATC-----AAAAT-G-----TG---T---C---A-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCNATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT---CC--AGAAATTT----T----------------AAA--GGGGGG---GGCA-A-TATA-------TT-GTA--G------------------GTA---------AGN-CAT------------TT------------TT--------------GGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--ANGC-A--A--TGAA-A---A-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-ACCG-TTTTGGACTCGTCCAAGT-CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( family-90 ) : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T----T--TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-NAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAG-C---A--T-CA-TT--CGTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATAT-AGAAATATTT-ATTAAAATT---ATA-ATGTAA--T-G-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAT-TTTAAA--TCGAATT-ATACTGATTT--AA--AATCA--AATA-GCGACCTC-T-GC--GC-CGA---CNCCCCCCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-NTTACA----TGCACATT-ATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------T---------------------G--NCA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCTTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CA-T--AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TNACT-GTT-A------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------CAT--A--ATT-ATA-TTA-A-TTA-TA-TGA--A-TTTT--T-AAGAC-A----A-GA-A---AAA---ATCAAAA-ACTTG----AAGAA---G--------CAGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCT--TTC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--AT-AGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AATC-----AANA--G-----TG---T---C---A-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT---CC--AGAAATTT----T----------------AAA--GGGGGG---GGCA-A-TATA-------TT-TT---G------------------GTG---------AGG-CAT------------TT------------TT--------------GGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGC-CGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGCTGTTTT-A--ANGC-A-AA--TGAA-A---A-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-ACCG-TTTTGGACTCGTCCAAGTCCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|1 : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGAC-CCCGCATGA--GT-T-GTA-ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCATAA-AC----ATATAAA--ACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATGCAAA-TGCAACTTTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T----T--TT-GA----TT-G--TTT---------------A-------CC-------AA-A------GA-CAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAA-----TTCAA----CGTAG----TA---GAGC---ACACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----AA---T---A--T-TAAG-T---A--T-CAATTG-CGTTA-T-TGTTAACAAAATA-ACA--ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACATGTAA--T-G-TGTCTGTTT--AACA-ACAAAAA-----TA--TTTTTC---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG----TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAA-TTA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT-------AA--TGCA-CA-CT--AGGC---C--AA-C-TAGT-G-----CAATAT------GT-TG--AAAATTTATACTTAAA--TCGAACT-AT--TTATTT--AA--AATCA--AATA-GTGAACTT-T-ACTAACGTGA---CACCCCCCCTC-TCT-----C-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGATATTA-TGAA--G-AATTGTG-TCCTTGTGGGTTA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGC-CATT-ATCTTAATTA-TTTCCAAACATG-TTTCA-AAA-CTGA-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----C-C----AG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------T---------------------G--GCA--G-------G-AGG-----AAA-T-T--T-TCA----TTTTC--TG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAA-TCTT------T--GGC-CA-T--AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TTACT-GTT-A------A-TACAG------GTCA--------CCC-AA-CTT--CG----T-A-TTG-A-------CATA-A--ATT-ATA-TTA-ACTTA-TA-TGA--A-TTTT--T-AAGAC-A----A-GA-A---AGA---ATCAAAA-ACTTG----AAAAA---G--------CAGAAA--ACGAGTA-T---------A--GTGTTT--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCT--TTC-AG-CA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGC----T-AGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAA-A--AATC-----AATA--G-----TG---T---C---A-A-TG-TA-AA---G-CTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---T--AAACCT----------A-G-TAC---------GGAAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAA--TCATGCC---GAGGA-----TTA-GTGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT---CC--AGAAATTT----T----------------AAA--GGGTGG---GG------------------------G------------------GGG---------GGG-CAT------------TT------------TT--------------GGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGT--ATTGTTTCAGCATATTTT----GTG---ACGGG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACG------ACAGTGTTTT-A--AAGCAA-AA--TGAATA---A-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-ACCG-TTTTGGACTCGTCCAAG--CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|10 : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGGG-T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAAATGCAAC-TTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T----T--TTTAA----TT-G--TTACCACAGAATCTCG--A-------CCGAGAAGGAC-GCCCCGGGA-AAA-T-T-AC----AA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GAACCACATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AAATTT---AATC-TAAG-A---A--TACA-TTGCCGTTA-T-TGTTAA-ATAATACC----ATA-CAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-------ATGTAAT-T-GTTGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTA--AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-T-GTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA--G-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTTTTTTATT--TTT--TTTAA----TTAAA--TGCA-CACCT--AG
gi|11 : gGG--T--A-T-TTCGACGC--G-ATGACTGT-T-GTA-CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GTT--T-GTTTATGCG-GAC-AA-TTT--CCG-AA-A-----ATA-TA----CATTT-CCTC-ATAATATTTT-----TGCA-----CA--CTTTTCT-------TTCGAA--------------TT---------A--TTTATA-GAGTTGT----T--TT-GAATTTTT-GCGTT----------------A-------CC-------ACAG------GA-AAT-CCT-TCGGCGGA--------AGACGCC---------------CGGGAAAAGACTCGAA----CGACTAACTTCAATGTATATAT----TA---GAGC---CAAACAGATACATAT-GG--TGATCTTAAA----AA---TTTAA--TCTAAGAT---AGTT-CA-GC--CATTA-TATGTTAACAAAATA-A-----TA-CGATACTTG-TAAAAATAT-AGAA-TATTT-ATTAAAATT---AT----GTAA--TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACGAATT-----TT--TTTTTT---AAAAATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--------------------------AT-TGTT-T-GT------------GGT--CA--CT----T----CGACC-AATA-TGT------------------------------AAATAAAA-TG-T--TTCTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-AT---------AAAC-ATTTG-TGT-----GT--GACAATTTCT----TTAAA--T
gi|11 : ggtagcgtgtacgtggtactggT------GTGTG--ACAATTT-C-TTTAAA--TCGAATT-AT-CCAATTT--AA--AATCA--Acgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaattttttttttaaaaatcggtcgaagttaccattgtttgtggtcacttcgaccaatatgtaaataaaatgtttctgtttgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAT-TGGG--T--AATCTTCGAC-T--C-GTGA-TGT-TTGTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--TTGT--AT-CA-GACCAA-TTT-TCCG-AGGA-----ATG-AAA--ACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------GCAAA-TGCA----TTTGA------ATTTGAT--------------T----------G--TTACACAGAAAT-C----T--TC-GA----CC-G--AG----------------AAGACGCCCC-------GG-G------GA-AAT---T-AC----GA--------A-----A---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GACACA-AGACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---TTTAA--T-CAAG-T---AATT-CA-TTGCCGTTA-T-TGTTAACAAAATA-ATACCATACCAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAATT-------ATGTAAT-T-G-TGTCCGTTT--AACA-AC-AAAA-----CATTTTTTTT---TTAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCAC--TAGACA--CAA-TTT-----Ttat
gi|13 : gg-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT----GA----TTTGAT--TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AATCC-T-TC----G---------A-----C---------------CG-------------A----GAA
gi|13 : gttt-------CC-------AA-G------AA-AAT---T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAGATATTA---AAGC---GAACCT-ATGCTTAT-AGATT-AT-TTAAA----A----T---C--T-AAAG-CCGTA--T--A-TT----TTG-T--GTTAAC--------------------------CCCAAATA-----AATATTTGATTAAAAT--------ATGTAA--TTA-TGGCCGTTCTCAACA-ACAAAAAACATTTA--TTTTTC---AAAAATCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--C--TAG-CA--CGA-TT-------ATCTGAT-TG-TA-----------AGT--AAGCTT----T----TGACCCAATA-TGT--------------------------AAAA------AA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTA-TTT-----gaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|14 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgccccAG-CGTGGTCTAACTTCGACTGA-TT
gi|14 : --T--AAC-TTCGAC-T--G-ATTA-TGT-T-TTA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTTCCCCC-ATTGTGTT-------T------TGCACCCTTTTCT------CTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT----GA----T----T--TT-CA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GACAGAGAAGA-----CGCCCCAAGAAAATTACG-------------AACGACAACT---TTCAA---ACGTAATTT-TA---AAGC---GAACCA-ATGCCTAT-GA--T-AT-TT-GA----AA---T------T-TAAG-C---------------CATTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-T--T---TATCAAAAAT-T-AAAA----TT-AGTAAAA-T---ATACAT---A--T-G-T---CGTTC--AACatgttttactccagtatttttagttcactgtttgtatcagacaattttccgaaaataaaaacatttcccccattgtgttttgcacccttttctcttcgaattatttaatacagttgtttgattttcattgttaccacggaaatcctcgacagagaagacgccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtaattttaaagcgaaccaatgcctatgatatttgaaatttaagccattattgttaacaaaataaatatttatcaaaaattaaaattagtaaaatatacatatgtcgttcaac
gi|15 : agcgtggtcT------------TT--------------GGGTGCCAAAT-C-T-AGTT-TATT-TAGC--ATTGCT--AGTAATTTTT-T-GGCG---AAGAGAGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGT---CT-GCCAC-TGA--T-------C-------------------------T--------ACC------GTGTTTTTTT------------------A-A---A-----AATTGGCCT--G---------------CG-TTTTGGACTCGTCCAAGT-CGTCGA-TGTACGGG-GGTA
gi|16 : tgtaaataagccttttttaaaggccaG---GGTCTATTG----AAAT---CTTGCCA--TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------TG---------ACC------ACGTTGTTTTTA--AAGC-A-TA--TGAA-A---ATTAAAAATCGGCTT--GCGTTTTGGACGGAACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|17 : -TTG-A-------TAT------TT-GTA-TTA----TA-TA-T------TTTTGTT-AATAC-A----A-GA-A---AAA-----CCAAT-ACTTG----AAGAA---G--------CAG-AA--ACGAGTA----------------GATC---TAT--C---GTG---T--TCTCC----TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------AT-AGAC----GAGAA----AAATCGC--A-C-T-----GCC--AT-AGA-AGA-------------------------A--AATC-----AAAA--T-----TGTTCT---C---A-ATTG-TA-AA---GTTTA-C-G----C----T----AGAAAGAAA--A---agtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|18 : TTC-A--ATAC-A-GACGTGAA-ACTAAC----AAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-ACCG-TTTTGGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGT
gi|19 : gtaCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GT-TTTActatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
gi|19 : G-TTTTA-AAA-CCTG-ACAAAA--ATT--AATT-ACTCATGCACA-AAAG--AGAG-A-TTG-TACAATTC-ATAT-----------A--TA---------G-------T-------------------------CA--G-------GAAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCaaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|2 : ctggatattggaatgacaaagctcaGTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGTT--G-TT--AT-CAAGAC-AT-TTTATTCG-AA-A-----ATA-AAAGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAAC---TTCT------CTTCAAAA-------------T----------GGTTTT----GA----T----T--T--GA----TT-G--TT----------------A-------C--------AC-A------GA-AA-----------------------------------------------------------A----TA-CTA--TTCGA---CCG-AG----AA---GACCCCGGAA--A-AT-----------T--T-TCAAATCGTAA---T---A-----AAG-C---A--C-CA-TA--C-TTA-TGTATT--TAAAA---A----ATT-TAAT---T--TA-----AT-AGAAATATTT-ATTAAAATT---A---ATGTAAATT-G-TGTTCGTTT--AACACACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAGTTCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TG-----------GG---AA--CT----T----CGAAC-AA-A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TA-TGGTTCTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAGC-TTTTAGTTT-----GT--TTT--GTTAT----CTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCAAAAC-TAGTTG-----C---AT------GT-TGTGAAGAATTAC-TTTAAA--TCGAATTAATCTTGATTT---A--AATCA--AATA------CTCAC-GT--GA-CAA---CG--GGCCCTC-CTTCA--TC-------CGAGAT--TC------AAACTAATAAA--AAT-ACTGCTGAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCTTTGTGTA-AA----ATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATCT-AATTATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATTCATC----C----AAAG--AGAG-ATTTGTTA-----C-ATAT-----------GGTTA---------G-------TG--------------------G--TCAAGG-------G-AGG------AA-TAT--T-TCA----TT---CTTG-T-AA----C----G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CA-TTGAC-TGG-CTGTGTTGAA------TAG-TT-----TAACT-GTT-A------A-TACAGT--T--GTCA---------CC-AA-CTTC-CG----TAA-TTG-A-------C--------------------------A-TGA--A-TTTT--TGAAGAC-A----A-AA-ACACAAA---ATTCAAA-ACTTG----AAGAA---G--------CAG-AA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CC-GGTGC--T--CCTTC---TTC-AGA-A--TG--------TTG------C------T----------------------A----------G---A----AAATCGC--AGC-GACA-AGCC--AT-AGA-AGATC-------TA---TAC-AGAGAAAA--AATC-----AAAAT-GT----TG---T---C---A-A-TG-TATAA---G-TTA-A-C-A--ATTATT----A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA--TTTTTCATGT-A--TCA-AA--TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAAA--A--TCA--G-----TGACA-----AT---CC--AG-AATTT----T----------------AAA---GGGGG---GGCA-AGTATA-------TTATTGTAG------------------GTA---------AGC-CATTTTAAAAGGCCATT------------TT--------------TGATGCCAAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-GGGG---
gi|20 : gA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTT-A-----TGCTA---GCAACTTTTTCTCTGCGGCTTCGAA--------------T----------
gi|21 : tttgtcataagaacatacttaattcacg-AA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT---CC--AGAAATTT----T----------------AAAAAGGGGGG---GGGG-G-TGCA-------TT-GTA--G------------------GTA---------AGC-CTT------------TTCAAAAGGTCATTTT--------------GGGTGCCAAATAT-GGAGTT-TTAT-Ttatgttaaatacagattatgtaat
gi|22 : ------------TT------------TT--------------GGGTGCTAAAT-CTGGAGTT-TTAA-TGAC--ATT-TTT-AGTAAATGTT-T-GGCG---AAGAG-GGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATAT---CC-GCCAC-TG
gi|23 : ccaA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAAT-------------T----------A--TTT----GA----TACAGTTGTT-AG----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GA--------A-----
gi|25 : AACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---AAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----Aaagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|26 : CA--G-------G-AAA-----AAAATAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-
gi|3 : tT------GG-TG--GAAATTTAT-TTTAAA--TCGT-TT-GTTCTGATTT--AATAAATCATTATTACGCGATCCC-C--C--GC-TGG---CTCCCCCCCCCATCTCAC-CCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AA-AAAAGA-T-TATGCGAAATGTATTA-TGAAATCGAATTGGG-T--TTCTGGG-TAGTCAATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GT-TTAACA----TGCACATT-ATCTAA-TTA-TTTTCAA-CA-A-TTTTA-AAATCTTG-ACAAAA---TT--AATT-ATT----CACA-AAAGGAAGAGGA-TTG-TA-----C-ATATTATTCCAGCTTA--TAAGAATCTTCG-------A---------------------G--TCA--G-------G-AAG-----AAA--AT--C-ACA----TTTTCTT-G-TAAA----T----G-AG-----TAC-TCTT------T--GGC-CA-TG-AC-T-G-CT-TGT-GGATT----TAG-GT-----TTTAT-ATT-ATATATTA-TACAGC--C--GTC----------CA-AA-CTTC--G----T-A-TTG-G-------CAT--A-------CA-TTA-A-TGA-TACTGA--A-TTTT----AAGAC-A----A-GA-A---AA-----TCAAAA--CTTG----AAGAA---G--------CAGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTT--GTAG--CTGGTT----C--TCTCCT--T-C-AGACA--TG--------TTG------CCTTTT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--AT-AGA-AGA-C--------A---TACTAGAGAAGATAAATC-----AAAAT-G-----TT---T---C---ATA-AA-TT-AA---G-TTAAC------A----T----T-AAATAAA--A---CTAAAACCT----------TTG-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TT---CATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA-TCATTGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT----C--AGAAATTT----T----------------ACA---GGGGG---GGCA-A-TATA-------TT-GTA--G------------------GTGCCTTTAAAAAGG-CAT------------TT------------TT--------------GGGTGCCAAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTA-ATGGTTT-A-CAAGTTTTAT-GATGGA-AAAAG-AGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-G-CAG-TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AATGT--------ACC------CC----TCTT-----CGC------------A---A-----GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTACC-----TGA--TCATCCAAGT-CGTCGA-TGTAGCGGAGGT
gi|4 : -TTGG--TCTAAC-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T--TA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GGC-A--TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTC-CCCC-ACTATGTT-------T------TGCAACCTTT-CT------CTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT----GA----T----T--TT-GA----TT-G--TTACCACGGAAATCCTCGA-------CCGAGAAG-AC-GCCCCAAGA-AAT-T-T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TATTAAAGC---GAACCA-ATGCTTATTGA--T-AT-TTAAA----A----T------C-TAAG-C---------------CGTTAAT-TGTTAACAAAA-----------------------------AT-A--AATATTT-ATTAAAATT---AT----GTAA--TTA-TGTCCGTTC--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTTTCAAAAATCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TA-----------AGT--AA--CT----T----TGACC-AATA-TGT--------------------------TAAAA--------TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTATTTT-----GT--TTT--TTTTT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGGA-C-TAGT-G----------T------GT-TG--AAAA-TTAC-TTTAAA--TCAAATT-ATACTGATTTA-AA--AATCA--AATA----------TAGC--GC-CGAC--CACCCCCCCCC-CCCCACTCT-------CCAGAT--TC------AAACTAATAAAAAA---TATGCGAAA-GTATTA-TGAA--C-AATTGG-------------------ATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-A--ACA----TGCACATT-ATC-AAATTA-TTTTC-AGCATGTTTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACGAAAAG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------TTCCAACAGTTAATAATCTTAAG--TCA--G-------G-AAA-----AAA--ATA-T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAG----TAC-TCTT------T--GGC-CA-TG-AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TTACT-ATT--------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTT-CGA---T-A-TTGCA-------CGC--A----T-ACATTTG-A-TTA-TA-TGA--ATTTTT--T-AAGAC------A-GA-A---cccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|5 : A----ATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGT-ATTACA----TGCACATG-ATCTAATTTA-TTTTCAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATT-ATC----CA----AAG--AGAG-G-ATG-TA-----C-ATAT-----------GATTA---------AGCTTCGAC---------------------G--TCA--G-------G-GGATGGGAAAA-TAT--T-TCC----ATTTCTTTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTAC-TCTT------TTAGGC-CA-TT-ACCT-G--T-TGTTGGATT----TAG-GTAATTTTCACTCGTTTA------A-GTCAGT--CTTGTCA--------CCCCAA-CTTC-CGCTCGT-A-T-G-A-------CAT--ACCATTTATA-TTA-A-TTA-TA-TTG--A-TTTT--T-AACGC-ACAAGA-GA-A---AAA---ATCAAAA-CTTTGAAAAAAGAA---GCCACAGATCAGAAACTGCATGTA-TTTTCGTCTCC--GTGTTTG-GTAG--CT-GGTG-------CTCCC--TTCAAGACATTTG--------TTG------C---TT-TTGTATTTTTTAACTATAGTACGG--AGAA----A---A----AAATCGC--A-CTTGCA-AGCCCAAA-GGA-AGA-CATATTATTA---CAG-AGAGAAGA--AATC-----AAAATTGTTCCTTG---T---C---ATATTGTTA-AA---G-TTA-CAG-A--T----T----A-AAAAGAA--AGATT-AAAACCT----------T-GTTACTAATGGTAGGATAGTAATGTATATTTATCATGTCATTTTATAATATAC-AAAATCATTGCCCCTGAGGAATTTTTTAGATGTTGTGGCTGGAACAGGGG-AAAGA--TCA--GAAAGTTGACA---GCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCT----------------AAA--GCGGcag
gi|6 : aggattacgggtacttttgaaattaTT------T--GGCACA-G--AC-T-GATT-TGTTAGATTATATTGA-GT-----AAACTCGTT-A------AATACAGTAAT--GTCAAAACCCACCTC-AATCTTCATA----T-A-TAG-AAAACTTTCAT--T--TTT-ATA-TAACA-TTAATAATGATAA-TTTTA-T-AAGAA-A----AAGA-A---CAA---CTCAAA---CTTGC---AAGAA---G---------AGAAC--ACGCGAAAT---------CAAGTATTT--GTAG--CTG--TTC--TAATCTC-T--TTC-AGAAAC-TG--------TAG------C---TTAT----------------------GG-AGACTCAGA---A----AAATAGC--A-CATGAACAGCC--AT-AGATAGA---------TAAACTAC-AGAGAAGA--AAACCACAAAACAT-A-----TG---TTCCC---A-A-TGCTA-AACAGG-TTA-CTGTA--A----C----A-ATATATA--A---A-AAGACCTAACACCTATAT-G-TAC---------GGT-GTAAATAAT------------A--TTA-AAT-TACACAACTAAACGC----GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT---C---AACAATTT----TAAAAAGGGAGGGGAGGAGA--GGGGGGAGGGGCAGA-TATAAAATAAATT-GT---AAAA---------------GTA---------AGGACCT------------TT------------TTTTAAAAGACTATTTGGGTGCCAAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGTA-ATTTT-TAGGTGAATAAAAA-AAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAGACC-GATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGC-ACAA--TGAA-A---A-----AATCt
gi|7 : actacaaA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGT-AA----ATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCT-AATTA-TTTTC-AACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CAC--AAAG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------TG--------------------G--TCAG-G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CATT--AC-T-G-CT-TGTTTGATT----TAG-GT-----TTACT-GTT-A------A-TACAGT--T--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------C--------------------------A-TGA--A-TTTT--T-GAGACAA----A-AA-A---AAA---ATC-AAA-ACTTG----AAGAAGCTG--------CAG-AA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAGC-CTGG---------TCTCCTTCTTC-AGACA--TG--------TTG------C---T------------------------------AC----G---A----AAATCGCCAG-C-TGCA-AGCC--ATAAGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AATC-----AAAT--G-----TG---T---C---A-A-TG-TT-AA-----TTA-C-A-ATTAT---T----A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTAT-TTTTCCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTT--ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--AATTCA--G-----TGACA-----AT---CC--AG-AATTT----T----------------AAA--GGGGGG---GGCA-G-TATA-------TTATT---GTAGGTAAGCCATATTTAAGTA---------AGC-CAT------------TT------------TT---------------GATGCAAAAT-C--GAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-G
gi|8 : T-TCTAAAGGTCGAATT-ATACTGATCTTGAA--AATCA--A-TA------CCC-TAGC--AA-TGAAATTTCCCCCCGCC-CCTC-T-CT-------CCAGAT---C-----AAAA---ATACAA--ATATATGCGAAAAGTATGAGTAAG--C-AATTGGGCTCCTTGTAAG-TA----ATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GT-TTTACACAAGTGCAC-TT-ATCTAATTTA-TTT-CACACATC-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--TATT-ATC----C-CG-AAAG--AGAG-A-TTG-TA-----CAATATC----------G--TA---------G-------T---------------------GGTGCA--GTTGGAGCA-AGG-----AAA-TATAATATCACTATTTTTTCTTG-TAAA----C----GAAAGT-A-TAT-TCTCACATTGT--GGC-CA-T-----T-G-CG-CTTTG---T----TAGTGT-----TAA-------A------A-TCCAGT--T--GTCAAC------CTC-AA-CTTC-CG----T-ATTTG-A-------CATAAA--ATC-AT--TTA-C-TTT-TA-TCA--A-TATT--T-AA----A----A-GACA---AGATTCATCACAATACTTG----AAAAA---G--------CAGAAA--A-GAGTA-T---------C--GTACAT--GTAGAATTAGGTTCTGC--TATCCC--TTC-AG-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT-TC---------------------ATCAGAC----G---AGAAGAAATCGCA-A-C-TGCA-AG-C--AT-AAA-------------T-------------AGA--AATC-----AAAA--------TG---T---CGCAG-A-TG-T--AA---T-TTA-C-A-G--A----TTCAAA-AGATAAAATA---G-AAAATCT----------T-G-T-C----------GTAGTAAATTAT-TTTTGGATGT-A--TTC-AA--TACAGA
gi|9 : cac--T--AATGTTCGAC-G--G-ATGA-TGTAT-GTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GAC-AAGTTT-TCCG-AA-ATAAAAAAA-AAA--ACATTT-CCCCCATTATGTTAA-----TGCCAA-TATGGC------------------AA--------------T-------------TTT----GA----T----T--TT-GA----TTGG--TT----------------A-------CC-------AC-GCA----GATAAT-C-TGTC----AG--------A-----C---------------CG-------------A----
gi|9 : -A-AGTT-A--C-C--TATTAG-CAGCCAA-TTTCTTAATAT-TGTTCTGATGCATTTATCTTTGGTTAAA--CTGGACTGGCGCAACA-AATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGTGTT--TTTTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATAGTATAGGAATAACAAACTATTTT-TTT-----TTTATTT--TTTATTAGATTAAATTTGCACCACCTTAAGGCATGCCCAA-CTTAGT-GTCAAAC---ATGTGTGGGT-TG--AAAATTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 11111 22222222222222 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666 1 55555555555555555555555555555555 222222222 11111 111 1 11111 111111 333333333333333 111111111 666666666666666666666666666 1111 1111 1111 22222222 1 11111 11111 11 111 1 1 1 55555555555555555 2 11 8888888888888888888888888 333333333333 2222222222 111 22222 1111 111111111 1111 111111 1111 222222222 11111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111 11111 11 11 111111111 1111 111111 22 1111 11111 1 11111111 11111 22222222 1111 6666666666666666666666666666666666666 1111 111111 1111 1111 11111111 22222222222222 11 333333333333333 111 11 11111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 333333333333333333 11111111 1111111 111 1 11111 4444444444444444 11111111 222222222222 222222222 11 11 111 1111 1111 11111 111111 1111 1111 44444444444444444444 4444444444444444 222222222 00000000000000000000000000000 11 11 111 111 2222 111 11 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 111
lowQualScore : 8 3 0 6 11 66 0 9999 5 5 5 5 5 5 5 6 66 5 66 0 5 5 55 5 5 4 55555 4 66 4 4 44444444444444 3 8 000000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 222 777 7777 777 777 1 8 1 4 66 4 4 9999999999999999999999999999999999999999999 5 0 55555555555555555555555555555555 2 0 5 777777777 5 5 66 5 0 44444 77 555 5 5 0 66 5 22222 5 66 3 5 222222 5 5 777777777777777 77 77 555555555 0 5 5 333333333333333333333333333 1 1 5 1111 77 5 2222 5 5 2222 5 00000000 5 1 44444 99 99 55555 99 8 11 777 99 0 0 0 22222222222222222 6 99 3 6 6 99 6 0 77 55 99 99 6 7777777777777777777777777 1 8 8 222222222222 2222222222 111 0 88888 3 6 0000 6 33 888888888 5 5 0000 888 444444 5 2222 5 8 5 5 0 5 2 5 0 5 5 5 66 66 5 777777777 66 5 5 5 22222 5 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 5555555555 4 11111 66 00 4 9999 66 5 333333333 5 3333 5 444444 66 5 5 11 5 5 5 5 0 0000 5 22222 1 0 66666666 5 44444 55555555 5 5 5 5555 5 4 4 4444444444444444444444444444444444444 4 4 6 4 1111 1 000000 4 4 777 1111 3 888 5555 888 88888888 9 66 55555555555555 88 666666666666666 333 5 44 11 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 5 0 5 66 5 5 666666666666666666 1 66 888 66 77777777 1111111 666 0 88 33333 5 3333333333333333 5 99999999 555555555555 5 222222222 00 666 5 77 2 5 44 5 3 7 111 4444 6 6 6 4444 5 77 77 77 44444 111111 4444 77 8 2222 77 88888888888888888888 2 8888888888888888 99 222222222 5 1 11111111111111111111111111111 5 22 5 5 33 5 6 999 1 777 5 5 000 6 0000 111 77 2 11 11 0 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 0 99999 111 8 0 8 3 8 3
lowQualScore : . . . . .. .. . .... . . . . . . . . .. . .. . . . .. . . . ..... . .. . . .............. . . ...... ............................................................................................................................................................................. .... ... ... .... ... ... . . . . .. . . ........................................... . . ................................ . . . ......... . . .. . . ..... .. ... . . . .. . ..... . .. . . ...... . . ............... .. .. ......... . . . ........................... . . . .... .. . .... . . .... . ........ . . ..... .. .. ..... .. . .. ... .. . . . ................. . .. . . . .. . . .. .. .. .. . ......................... . . . ............ .......... ... . ..... . . .... . .. ......... . . .... ... ...... . .... . . . . . . . . . . . . .. .. . ......... .. . . . ..... . ....................................................... . .......... . ..... .. .. . .... .. . ......... . .... . ...... .. . . .. . . . . . .... . ..... . . ........ . ..... ........ . . . .... . . . ..................................... . . . . .... . ...... . . ... .... . ... .... ... ........ . .. .............. .. ............... ... . .. .. ........ ........................................................ .. . . . .. . . .................. . .. ... .. ........ ....... ... . .. ..... . ................ . ........ ............ . ......... .. ... . .. . . .. . . . ... .... . . . .... . .. .. .. ..... ...... .... .. . .... .. .................... . ................ .. ......... . . ............................. . .. . . .. . . ... . ... . . ... . .... ... .. . .. .. . . ................................................................................ .. . ..... ... . . . . . .
lowQualScore : 0 8 8 7 99 99 0 0000 0 0 0 0 0 0 1 5 99 0 99 0 0 0 44 0 0 4 66666 4 11 4 4 11111111111111 5 8 555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 222 888 2222 888 888 1 9 4 4 11 4 4 7777777777777777777777777777777777777777777 0 0 66666666666666666666666666666666 0 1 0 111111111 0 0 99 7 1 33333 99 777 0 0 0 99 0 00000 0 99 1 0 666666 7 7 999999999999999 99 99 333333333 7 7 7 111111111111111111111111111 4 6 7 6666 99 7 1111 7 7 1111 7 77777777 7 4 33333 22 22 88888 22 0 00 555 00 0 0 0 22222222222222222 7 22 5 7 7 22 7 0 77 88 22 22 0 4444444444444444444444444 0 0 0 444444444444 6666666666 444 8 22222 8 7 0000 7 55 999999999 0 0 6666 888 444444 0 1111 7 7 4 7 1 0 3 0 2 0 0 0 99 99 0 111111111 99 0 0 0 55555 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 0000000000 4 11111 33 66 4 4444 44 0 222222222 0 2222 7 444444 99 0 0 99 0 0 0 0 1 6666 0 55555 0 0 55555555 0 99999 00000000 0 0 0 6666 0 4 4 1111111111111111111111111111111111111 4 4 7 4 4444 1 333333 4 4 888 9999 1 555 6666 888 11111111 4 99 22222222222222 88 888888888888888 999 0 66 99 11111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 0 0 99 0 0 111111111111111111 4 99 888 99 99999999 5555555 000 0 66 11111 0 6666666666666666 0 88888888 444444444444 7 999999999 77 444 7 99 3 7 44 0 2 5 777 2222 7 7 7 2222 7 99 99 99 33333 000000 3333 99 4 1111 99 66666666666666666666 5 3333333333333333 22 999999999 7 0 00000000000000000000000000000 0 55 0 0 66 7 6 444 4 999 7 7 000 7 8888 777 33 5 88 00 8 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 6 44444 888 0 8 0 8 0 2
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA---CACCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------TG--------------------GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CA-T--AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TNACT-GTT-A------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGAC-A----A-GA-A---AAA---ATCAAAA-ACTTG----AAGAA---G--------CAGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCT--TTC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--AT-AGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGT---------AA-GCCAT-T--AA--------T--------------TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( family-90 ) : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCCGA---CNCCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------T---------------------GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CA-T--AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TNACT-GTT-A------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGAC-A----A-GA-A---AAA---ATCAAAA-ACTTG----AAGAA---G--------CAGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCT--TTC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--AT-AGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCNATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGT---------AA-GNCAT--------------T--------------TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--ANG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|1 : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGAC-CCCGCATGA--GT-T-GTA-ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCATAA-AC----ATATAAA--ACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATGCAAA-TGCAACTTTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTT---------------A-------CC-------AA-A------GA-CAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAA-----TTCAA----CGTAG----TA---GAGC---ACACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----AA---T---A--T-TAAGT---A--T-CAATT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ACA--ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACATGTAA-T-G-TGTCTGTTT--AACA-ACAAAAA-----TA--TTTTTC---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG----TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAA-TTA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT-------AA--TGCA-CA-CT--AGGC---C--AA-C-TAGT-G-----CAATAT------GT-TG--AAAATTTATACT-TAAA--TCGAACTA-T-TT--ATTT--AA--AATCA--AATA-GTGA-ACTTTACTAACG-TGA---CACCCC-CCCTC-TCT-----C-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGATATTA-TGAA--G-AATTGTG-TCCTTGTGGGTTA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGC-CATT-ATCTTAATTA-TTTCCAAACATG-TTTCA-AAA-CTGA-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----C-C----AG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------T---------------------GG-CA--G-------G-AGG-----AAA-T-T--T-TCA----TTTTC--TG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAA-TCTT------T--GGC-CA-T--AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TTACT-GTT-A------A-TACAG------GTCA--------CCC-AA-CTT--CG----T-A-TTG-A-------------CATAA-A----TTATA-TTAACTTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGAC-A----A-GA-A---AGA---ATCAAAA-ACTTG----AAAAA---G--------CAGAAA--ACGAGTA-T---------A--GTGTTT--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCT--TTC-AG-CA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGC----T-AGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAA-A--AA---TCAAT--A--G-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-CTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---T--AAACCT----------A-G-TAC---------GGAAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TAC-AAAATC-ATGCC---GAGGA-----TTA-GTGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGTGGGG--------------------------GGG---------GG-GGCAT--------------T--------------TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGT--ATTGTTTCAGCATATTTT----GTG---ACGGG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACG------ACAGTGTTTT-A--AAG--CAAA-ATGAATAA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAG-CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|10 : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGGG-T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAAATGCAAC-TTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TTTAA----TT-G--TTACCACAGAATCTCG--A-------CCGAGAAGGAC-GCCCCGGGA-AAA-T-T-AC----AA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GAACCACATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AAATTT---AATC-TAAGA---A--TACA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAA-ATAATACC----ATA-CAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTGTTGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTA--AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-T-GTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA--G-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTTTTTTATT--TTT--TTTAA----TTAAA--TGCA-CACCT--AG
gi|11 : gGG--T--A-T-TTCGACGC--G-ATGACTGT-T-GTA-CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GTT--T-GTTTATGCG-GAC-AA-TTT--CCG-AA-A-----ATA-TA----CATTT-CCTC-ATAATATTTT-----TGCA-----CA--CTTTTCT-------TTCGAA--------------TT---------A--TTTATA-GAGTTGT-----T-TT-GAATTTTT-GCGTT----------------A-------CC-------ACAG------GA-AAT-CCT-TCGGCGGA--------AGACGCC---------------CGGGAAAAGACTCGAA----CGACTAACTTCAATGTATATAT----TA---GAGC---CAAACAGATACATAT-GG--TGATCTTAAA----AA---TTTAA--TCTAAG----A--T-AG-TTCAG-CCATTA-TATGTTAACAAAATA-A-----TA-CGATACTTG-TAAAAATAT-AGAA-TATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACGAATT-----TT--TTTTTT---AAAAATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--------------------------AT-TGTT-T-GT------------GGT--CA--CT----T----CGACC-AATA-TGT------------------------------AAATAAAA-TG-T--TTCTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-AT---------AAAC-ATTTG-TGT-----GT--GACAATTTCT----TTAAA--T
gi|11 : ggtagcgtgtacgtggtactggT------GTGTG--ACAATTT-C-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CC-AATTT--AA--AATCA--Acgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaattttttttttaaaaatcggtcgaagttaccattgtttgtggtcacttcgaccaatatgtaaataaaatgtttctgtttgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAT-TGGG--T--AATCTTCGAC-T--C-GTGA-TGT-TTGTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--TTGT--AT-CA-GACCAA-TTT-TCCG-AGGA-----ATG-AAA--ACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------GCAAA-TGCA----TTTGA------ATTTGAT--------------T----------G--TTACACAGAAAT-C-----T-TC-GA----CC-G--AG----------------AAGACGCCCC-------GG-G------GA-AAT---T-AC----GA--------A-----A---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GACACA-AGACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---TTTAA--T-CAAGT---AATT-CA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ATACCATACCAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-AC-AAAA-----CATTTTTTTT---TTAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCAC--TAGACA--CAA-TTT-----Ttat
gi|13 : gg-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT----GA----TTTGA-T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AATCC-T-TC----G---------A-----C---------------CG-------------A----GAA
gi|13 : gttt-------CC-------AA-G------AA-AAT---T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAGATATTA---AAGC---GAACCT-ATGCTTAT-AGATT-AT-TTAAA----A----T---C--T-AAAGCCGTA--T--A-TT-------TTG-T--GTTAAC--------------------------CCCAAATA-----AATATTTGATTAAAAT--------ATGTAA-TTA-TGGCCGTTCTCAACA-ACAAAAAACATTTA--TTTTTC---AAAAATCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--C--TAG-CA--CGA-TT-------ATCTGAT-TG-TA-----------AGT--AAGCTT----T----TGACCCAATA-TGT--------------------------AAAA------AA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTA-TTT-----gaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|14 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgccccAG-CGTGGTCTAACTTCGACTGA-TT
gi|14 : --T--AAC-TTCGAC-T--G-ATTA-TGT-T-TTA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTTCCCCC-ATTGTGTT-------T------TGCACCCTTTTCT------CTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-CA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GACAGAGAAGA-----CGCCCCAAGAAAATTACG-------------AACGACAACT---TTCAA---ACGTAATTT-TA---AAGC---GAACCA-ATGCCTAT-GA--T-AT-TT-GA----AA---T------T-TAAGC-----------------C-ATTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-T--T---TATCAAAAAT-TAAAA-----TT-AGTAAAA-T-----ATACATA---TG-T---CGTTC--AACatgttttactccagtatttttagttcactgtttgtatcagacaattttccgaaaataaaaacatttcccccattgtgttttgcacccttttctcttcgaattatttaatacagttgtttgattttcattgttaccacggaaatcctcgacagagaagacgccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtaattttaaagcgaaccaatgcctatgatatttgaaatttaagccattattgttaacaaaataaatatttatcaaaaattaaaattagtaaaatatacatatgtcgttcaac
gi|15 : agcgtggtc---------AG-GCCAT--------------T--------------T--GGGTGCCAAAT-C-T-AGTT-TATT-TAGC--ATTGCT--AGTAATTTTT-T-GGCG---AAGAGAGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGT---CT-GCCAC-TGA--T-------C-------------------------T--------ACC------GTGTTTTTTT------------------A-AA-----AATTGGCCT--G----------------CGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGG-GGTA
gi|16 : tgtaaataagccttttttaaG---GGTCTATTG----AAAT---CTTGCCA--TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------TG---------ACC------ACGTTGTTTTTA--AAG--C--ATATGAA-AATTAAAAATCGGCTT--GCGTTTTGGACGG-AACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|17 : -TTG-A-------------TAT--------TTGTA-TTA---TAT-A-T----TTTTGTT-AATAC-A----A-GA-A---AAA-----CCAAT-ACTTG----AAGAA---G--------CAG-AA--ACGAGTA----------------GATC---TAT--C---GTG---T--TCTCC----TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------AT-AGAC----GAGAA----AAATCGC--A-C-T-----GCC--AT-AGA-AGA-------------------------A--AA---TCAAA--A-T------TGTTCT---CA-ATTG-TA-AA---GTTTA-C-G----C----T----AGAAAGAAA--A---agtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|18 : A-AC-----AAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGT
gi|19 : gtattcaatacagacgtgaaactCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GT-ctatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
gi|19 : G-TTTTA-AAA-CCTG-ACAAAA--ATT--AATT-ACTCATGCACA-AAAG--AGAG-A-TTG-TACAATTC-ATAT-----------A--TA---------------------------------------GT-CA--G-------GAAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCtttaaaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|2 : ctggatattggaatgacaaagctcaGTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGTT--G-TT--AT-CAAGAC-AT-TTTATTCG-AA-A-----ATA-AAAGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAAC---TTCT------CTTCAAAA-------------T----------GGTTTT----GA----T-----T-T--GA----TT-G--TT----------------A-------C--------AC-A------GA-AA-----------------------------------------------------------A----TA-CTA--TTCGA---CCG-AG----AA---GACCCCGGAA--A-AT-----------T--T-TCAAATCGTAA---T---A-----AAGC---A--C-CA-T---A-C--TTA-TGTATT--TAAAA---A----ATT-TAAT---TT-----AATA---GAAATATTT-ATTAAAATT-----A-ATGTAAATTG-TGTTCGTTT--AACACACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAGTTCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TG-----------GG---AA--CT----T----CGAAC-AA-A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TA-TGGTTCTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAGC-TTTTAGTTT-----GT--TTT--GTTAT----CTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCAAAAC-TAGTTG-----C---AT------GT-TGTGAAGAATTAC-TT-TAAA--TCGAATTAAT-CTTGATTT--AA--A-TCA--AATA------------CTCACGT-GA---CAACGGGCCCTC-CTTCAT-CC-------G-AGAT--TC-----AAA-CTAATAAAA--AT-ACTGCTGAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCTTTGTGTA-AA----ATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATCT-AATTATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATTCATC----C----AAAG--AGAG-ATTTGTTA-----C-ATAT-----------GGTTA---------G-------TG--------------------GT-CAAGG-------G-AGG------AA-TAT--T-TCA----TT---CTTG-T-AA----C----G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CA-TTGAC-TGG-CTGTGTTGAA------TAG-TT-----TAACT-GTT-A------A-TACAGT--T--GTCA---------CC-AA-CTTC-CG----TAA-TTG-A-------------C--------------------------A-TGAA-TTTT--TGAAGAC-A----A-AA-ACACAAA---ATTCAAA-ACTTG----AAGAA---G--------CAG-AA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CC-GGTGC--T--CCTTC---TTC-AGA-A--TG--------TTG------C------T----------------------A----------G---A----AAATCGC--AGC-GACA-AGCC--AT-AGA-AGATC-------TA---TAC-AGAGAAAA--AA---TCAAA--A-TGT----TG---T---CA-A-TG-TATAA---G-TTA-A-C-A--ATTATT----A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA--TTTTTCATGT-A--TCA-AA--TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAAA--A--T--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----T--AAA--------------------GGGGGGGCA-AGTATATT-------ATTGT--AGGT---------AA-GCCATTTTAAAAGGCCA--T--------------TTTTGATGCCAAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-GGGG---
gi|20 : gA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTT-A-----TGCTA---GCAACTTTTTCTCTGCGGCTTCGAA--------------T----------
gi|21 : tttgtcataagaacatacttaattcacg-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAAA-------------------GGGGGGGGGG-G-TG---C-------ATTGT--AGGT---------AA-GCCTTTTCAAAAGGTCA--T--------------TTTGGGTGCCAAATAT-GGAGTT-TTAT-Ttatgttaaatacagattatgtaat
gi|22 : --------------T--------------TTTGGGTGCTAAAT-CTGGAGTT-TTAA-TGAC--ATT-TTT-AGTAAATGTT-T-GGCG---AAGAG-GGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATAT---CC-GCCAC-TG
gi|23 : ccaA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TT---------A--TTT----GA----TACAGTTGTT-AG----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GA--------A-----
gi|25 : AACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---AAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----Aaagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|26 : T-CA--G-------G-AAA-----AAAATAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-
gi|3 : T------GG-TG--GAAATTTAT-TT-TAAA--TCGT-TTG-TTCT-GATTT--AATAAATCATTATTACGCGATCC----CC--CGCTGG---CTCCCC-CCCCCATCTCAC-CCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AA-AAAAGA-T-TATGCGAAATGTATTA-TGAAATCGAATTGGG-T--TTCTGGG-TAGTCAATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GT-TTAACA----TGCACATT-ATCTAA-TTA-TTTTCAA-CA-A-TTTTA-AAATCTTG-ACAAAA---TT--AATT-ATT----CACA-AAAGGAAGAGGA-TTG-TA-----C-ATATTATTCCAGCTTA--TAAGAATCTTCG-------A---------------------GT-CA--G-------G-AAG-----AAA--AT--C-ACA----TTTTC-TTG-TAAA----T----G-AG-----TAC-TCTT------T--GGC-CA-TG-AC-T-G-CT-TGT-GGATT----TAG-GT-----TTTAT-ATT-ATATATTA-TACAGC--C--GTC----------CA-AA-CTTC--G----T-A-TTG-G-------------CAT---A----C---A-TTAA-TGAT-ACTGAA-TTTT----AAGAC-A----A-GA-A---AA-----TCAAAA--CTTG----AAGAA---G--------CAGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTT--GTAG--CTGGTT----C--TCTCCT--T-C-AGACA--TG--------TTG------CCTTTT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--AT-AGA-AGA-C--------A---TACTAGAGAAGATAAA---TCAAA--A-TG-----TT---T---CATA-AA-TT-AA---G-TTAAC------A----T----T-AAATAAA--A---CTAAAACCT----------TTG-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TT---CATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA-TCATTGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT----C--AGAAATTT----T--ACA--------------------GGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGTGCCTTTAAAAA-GGCAT--------------T--------------TTTGGGTGCCAAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTA-ATGGTTT-A-CAAGTTTTAT-GATGGA-AAAAG-AGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-G-CAG-TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AATGT--------ACC------CC----TCTT-----CG--C----------AA-----GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTA-CC----T-GA--TCATCC-AAGTCGTCGA-TGTAGCGGAGGT
gi|4 : -TTGG--TCTAAC-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T--TA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GGC-A--TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTC-CCCC-ACTATGTT-------T------TGCAACCTTT-CT------CTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTACCACGGAAATCCTCGA-------CCGAGAAG-AC-GCCCCAAGA-AAT-T-T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TATTAAAGC---GAACCA-ATGCTTATTGA--T-AT-TTAAA----A----T------C-TAAGC-----------------C-GTTAAT-TGTTAACAAAA-----------------------------AT---AAATATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTA-TGTCCGTTC--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTTTCAAAAATCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TA-----------AGT--AA--CT----T----TGACC-AATA-TGT--------------------------TAAAA--------TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTATTTT-----GT--TTT--TTTTT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGGA-C-TAGT-G----------T------GT-TG--AAAA-TTAC-TT-TAAA--TCAAATTA-TACT-GATTTA-AA--AATCA--AATA-------------TAGCGCCGAC--CACCCC-CCCCC-CCCCACTCT-------CCAGAT--TC------AAACTAATAAAAAA---TATGCG-AAAGTATTA-TGAA--C-AATTGG-------------------ATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-A--ACA----TGCACATT-ATC-AAATTA-TTTTC-AGCATGTTTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACGAAAAG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------TTCCAACAGTTAATAATCTTAAGT-CA--G-------G-AAA-----AAA--ATA-T-TCA----TTTT-CTTG-TAAA----C----G-AAG----TAC-TCTT------T--GGC-CA-TG-AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TTACT-ATT--------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTT-CGA---T-A-TTGCA-------------CGC---A-----TACATTTGA-TTAT-A-TGAATTTTT--T-AAGAC------A-GA-A---cccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|5 : A----ATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGT-ATTACA----TGCACATG-ATCTAATTTA-TTTTCAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATT-ATC----CA----AAG--AGAG-G-ATG-TA-----C-ATAT-----------GATTA---------AGCTTCGAC---------------------GT-CA--G-------G-GGATGGGAAAA-TAT--T-TCC----ATTTCTTTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTAC-TCTT------TTAGGC-CA-TT-ACCT-G--T-TGTTGGATT----TAG-GTAATTTTCACTCGTTTA------A-GTCAGT--CTTGTCA--------CCCCAA-CTTC-CGCTCGT-A-T-G-A-------------CAT---ACCATTTATA-TTAA-TTAT-A-TTGA-TTTT--T-AACGC-ACAAGA-GA-A---AAA---ATCAAAA-CTTTGAAAAAAGAA---GCCACAGATCAGAAACTGCATGTA-TTTTCGTCTCC--GTGTTTG-GTAG--CT-GGTG-------CTCCC--TTCAAGACATTTG--------TTG------C---TT-TTGTATTTTTTAACTATAGTACGG--AGAA----A---A----AAATCGC--A-CTTGCA-AGCCCAAA-GGA-AGA-CATATTATTA---CAG-AGAGAAGA--AA---TCAAA--ATTGTTCCTTG---T---CATATTGTTA-AA---G-TTA-CAG-A--T----T----A-AAAAGAA--AGATT-AAAACCT----------T-GTTACTAATGGTAGGATAGTAATGTATATTTATCATGTCATTTTATAATATAC-AAAATCATTGCCCCTGAGGAATTTTTTAGATGTTGTGGCTGGAACAGGGG-AAAGA--T--CAGAAAGTTGAC---AGCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCT--AAA-------------------GCGGcag
gi|6 : aggattacgggtacttttgaaattaTT------T--GGCACA-G--AC-T-GATT-TGTTAGATTATATTGA-GT-----AAACTCGTT-A------AATACAGTAAT--GTCAAAACCCACCTC-AATCTTCATA----T-A-TAG-AAAACTTTCATTTTTAT---A----TAACA-TTAA-TAATGA-T-AA-TTTTA-T-AAGAA-A----AAGA-A---CAA---CTCAAA---CTTGC---AAGAA---G---------AGAAC--ACGCGAAAT---------CAAGTATTT--GTAG--CTG--TTC--TAATCTC-T--TTC-AGAAAC-TG--------TAG------C---TTAT----------------------GG-AGACTCAGA---A----AAATAGC--A-CATGAACAGCC--AT-AGATAGA---------TAAACTAC-AGAGAAGA--AAACCACAAAACA-TA-----TG---TTCCCA-A-TGCTA-AACAGG-TTA-CTGTA--A----C----A-ATATATA--A---A-AAGACCTAACACCTATAT-G-TAC---------GGT-GTAAATAA-----------T-A--TTA-AAT-TACACAACTAAACG-C---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT----C--AACAATTT----T--AAAAAGGGAGGGGAGGAGAGGGGGGAGGGGCAGA-TA---TAAAATAAATTGTAAAAGT---------AAGGACCT--------------TTTTTTAAAAGACTATTTGGGTGCCAAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGTA-ATTTT-TAGGTGAATAAAAA-AAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAGACC-GATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGCAC--A-ATGAA-AA-----AATCt
gi|7 : actacaaA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGT-AA----ATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCT-AATTA-TTTTC-AACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CAC--AAAG--AGAG-A-TTG-TA-----C-ATAT-----------G--TA---------G-------TG--------------------GT-CAG-G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTT-CTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CATT--AC-T-G-CT-TGTTTGATT----TAG-GT-----TTACT-GTT-A------A-TACAGT--T--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------------C--------------------------A-TGAA-TTTT--T-GAGACAA----A-AA-A---AAA---ATC-AAA-ACTTG----AAGAAGCTG--------CAG-AA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAGC-CTGG---------TCTCCTTCTTC-AGACA--TG--------TTG------C---T------------------------------AC----G---A----AAATCGCCAG-C-TGCA-AGCC--ATAAGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TC-AA--A-TG-----TG---T---CA-A-TG-TT-AA-----TTA-C-A-ATTAT---T----A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTAT-TTTTCCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTT--ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--AATT--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-G-TATATT-------ATTGT--AGGT---------AA-GCCATATTTAAGTAAGCCAT--------------TTTTGATGCAAAAT-C--GAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-G
gi|8 : AC-TTCTAAAGGTCGAATTA-TACT-GATCTTGAA--AATCA--A-TA------CC----CTAGCAATGAAATTTCCCC-CCGCC-CCTC-T-CT-------CCAGAT---C-----AAAA---ATACAA--ATATATGCGAAAAGTATGAGTAAG--C-AATTGGGCTCCTTGTAAG-TA----ATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GT-TTTACACAAGTGCAC-TT-ATCTAATTTA-TTT-CACACATC-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--TATT-ATC----C-CG-AAAG--AGAG-A-TTG-TA-----CAATATC----------G--TA---------G-------TG--------------------GTGCA--GTTGGAGCA-AGG-----AAA-TATAATATCACTATTTTTTCTTG-TAAA----C----GAAAGT-A-TAT-TCTCACATTGT--GGC-CA-T-----T-G-CG-CTTTG---T----TAGTGT-----TAA-------A------A-TCCAGT--T--GTCAAC------CTC-AA-CTTC-CG----T-ATTTG-A-------------CATAAAA----TCAT--TTAC-TTTT-A-TCAA-TATT--T-AA----A----A-GACA---AGATTCATCACAATACTTG----AAAAA---G--------CAGAAA--A-GAGTA-T---------C--GTACAT--GTAGAATTAGGTTCTGC--TATCCC--TTC-AG-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT-TC---------------------ATCAGAC----G---AGAAGAAATCGCA-A-C-TGCA-AG-C--AT-AAA-------------T-------------AGA--AA---TCAAA--A-TG-----TC---G---CAGA-TG-T--AA---T-TTA-C-A-G--A----TTCAAA-AGATAAAATA---G-AAAATCT----------T-G-T-C----------GTAGTAAATTAT-TTTTGGATGT-A--TTC-AA--TACAGA
gi|9 : c--T--AATGTTCGAC-G--G-ATGA-TGTAT-GTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GAC-AAGTTT-TCCG-AA-ATAAAAAAA-AAA--ACATTT-CCCCCATTATGTTAA-----TGCCAA-TATGGC------------------AA--------------T-------------TTT----GA----T-----T-TT-GA----TTGG--TT----------------A-------CC-------AC-GCA----GATAAT-C-TGTC----AG--------A-----C---------------CG-------------A----
gi|9 : -A-AGTT-A--C-C--TATTAG-CAGCCAA-TTTCTTAATAT-TGTTCTGATGCATTTATCTTTGGTTAAA--CTGGACTGGCGCAACA-AATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGTGTT--TTTTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATAGTATAGGAATAACAAACTATTTT-TTT-----TTTATTT--TTTATTAGATTAAATTTGCACCACCTTAAGGCATGCCCAA-CTTAGT-GTCAAAC---ATGTGTGGGT-TG--AAAATTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 11111 22222222222222 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666 1 55555555555555555555555555555555 222222222 11111 111 1 11111 111111 333333333333333 111111111 666666666666666666666666666 1111 1111 1111 22222222 1 11111 11111 11 111 1 1 1 55555555555555555 2 11 888888888888 1 111 333333333333 2222222222 111 22222 1111 111111111 1111 111111 1111 1 222222222 1111 88888888888888888888888888888 111111111 11111 11 11 111111111 1111 111111 22 1111 11111 1 11111111 11111 22222222 1111 5555555555555555555555555555555555555 1111 11111 111 1111 222222222222 111 22222222222222 11 11 3333333 11 11111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 333333333333333333 22222222222 1111111 111 1 11111 4444444444444444 11111111 222222222222 222222222 11 11 111 1111 1111 11111 111111 1111 1111 44444444444444444444 4444444444444444 2222222222222222222222222222222222222 11 11 111 111 2222 111 11 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 111
lowQualScore : 8 3 0 6 11 66 0 9999 5 5 5 5 5 5 5 6 66 5 66 0 5 5 55 5 5 4 55555 4 66 4 4 44444444444444 3 8 000000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 222 777 7777 777 777 1 8 1 4 66 4 4 9999999999999999999999999999999999999999999 5 0 55555555555555555555555555555555 2 0 5 777777777 5 5 66 5 0 44444 77 555 5 5 0 66 5 22222 5 66 3 5 222222 5 5 777777777777777 77 77 555555555 0 5 5 333333333333333333333333333 1 1 5 1111 77 5 2222 5 5 2222 5 00000000 5 1 44444 99 99 55555 99 8 11 777 99 0 0 0 22222222222222222 6 99 3 6 6 99 6 0 77 55 99 99 6 444444444444 77 5 8 444 8 8 222222222222 2222222222 111 0 88888 3 6 0000 6 33 888888888 5 5 0000 888 444444 5 2222 5 1 2 5 0 9 5 0 5 5 5 66 66 5 777777777 66 5 5 5 5 888 7777 99999999999999999999999999999 4 66 555555555 11111 66 00 4 9999 77 5 333333333 5 3333 5 444444 66 5 66 5 5 5 5 0 0000 5 22222 1 0 66666666 5 44444 55555555 5 5 5 5555 5 4 4 8888888888888888888888888888888888888 4 4 6 4 1111 1 9999 4 4 777 66666 444 5555 333333333333 3 222 55555555555555 88 66 11 3333333 7777 5 44 11 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 5 0 5 66 5 5 666666666666666666 1 66 888 11111111111 1111111 666 0 88 33333 5 3333333333333333 5 99999999 555555555555 5 222222222 00 666 5 77 2 5 44 5 3 7 111 4444 6 6 6 4444 5 77 77 77 44444 111111 4444 77 8 2222 77 88888888888888888888 2 8888888888888888 77 0 77 4444444444444444444444444444444444444 5 22 5 5 33 5 6 999 1 777 5 5 000 6 0000 111 77 2 11 11 0 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 0 99999 111 8 0 8 3 8 3
lowQualScore : . . . . .. .. . .... . . . . . . . . .. . .. . . . .. . . . ..... . .. . . .............. . . ...... ............................................................................................................................................................................. .... ... ... .... ... ... . . . . .. . . ........................................... . . ................................ . . . ......... . . .. . . ..... .. ... . . . .. . ..... . .. . . ...... . . ............... .. .. ......... . . . ........................... . . . .... .. . .... . . .... . ........ . . ..... .. .. ..... .. . .. ... .. . . . ................. . .. . . . .. . . .. .. .. .. . ............ .. . . ... . . ............ .......... ... . ..... . . .... . .. ......... . . .... ... ...... . .... . . . . . . . . . . . .. .. . ......... .. . . . . ... .... ............................. . .. ......... ..... .. .. . .... .. . ......... . .... . ...... .. . .. . . . . . .... . ..... . . ........ . ..... ........ . . . .... . . . ..................................... . . . . .... . .... . . ... ..... ... .... ............ . ... .............. .. .. .. ....... .... . .. .. ........ ........................................................ .. . . . .. . . .................. . .. ... ........... ....... ... . .. ..... . ................ . ........ ............ . ......... .. ... . .. . . .. . . . ... .... . . . .... . .. .. .. ..... ...... .... .. . .... .. .................... . ................ .. . .. ..................................... . .. . . .. . . ... . ... . . ... . .... ... .. . .. .. . . ................................................................................ .. . ..... ... . . . . . .
lowQualScore : 0 8 8 7 99 99 0 0000 0 0 0 0 0 0 1 5 99 0 99 0 0 0 44 0 0 4 66666 4 11 4 4 11111111111111 5 8 555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 222 888 2222 888 888 1 9 4 4 11 4 4 7777777777777777777777777777777777777777777 0 0 66666666666666666666666666666666 0 1 0 111111111 0 0 99 7 1 33333 99 777 0 0 0 99 0 00000 0 99 1 0 666666 7 7 999999999999999 99 99 333333333 7 7 7 111111111111111111111111111 4 6 7 6666 99 7 1111 7 7 1111 7 77777777 7 4 33333 22 22 88888 22 0 00 555 00 0 0 0 22222222222222222 7 22 5 7 7 22 7 0 77 88 22 22 0 444444444444 00 0 0 000 0 0 444444444444 6666666666 444 8 22222 8 7 0000 7 55 999999999 0 0 6666 888 444444 0 1111 7 7 4 7 1 3 0 2 0 0 0 99 99 0 111111111 99 0 0 0 0 888 0000 00000000000000000000000000000 4 11 111111111 11111 33 66 4 4444 11 0 222222222 0 2222 7 444444 99 0 99 0 0 0 0 1 6666 0 55555 0 0 55555555 0 99999 00000000 0 0 0 6666 0 4 4 8888888888888888888888888888888888888 4 4 7 4 4444 1 4444 4 4 888 99999 666 6666 111111111111 2 000 22222222222222 88 99 66 5555555 9999 0 66 99 11111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 0 0 99 0 0 111111111111111111 4 99 888 99999999999 5555555 000 0 66 11111 0 6666666666666666 0 88888888 444444444444 7 999999999 77 444 7 99 3 7 44 0 2 2 777 2222 7 7 7 2222 7 99 99 99 33333 000000 3333 99 4 1111 99 66666666666666666666 5 3333333333333333 99 1 99 2222222222222222222222222222222222222 0 55 0 0 66 7 6 444 4 999 7 7 000 7 8888 777 33 5 88 00 8 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 00 6 44444 888 0 8 0 8 0 2
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CATT-AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TNACT-GTT-A------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGTAAG--CC----N---TT----AA-----C-A--------T----TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( family-90 ) : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CAT--AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TNACT-GTT-A------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGTAAG--CC----A---TT----A--------A--------T----TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|1 : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGAC-CCCGCATGA--GT-T-GTA-ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCATAA-AC----ATATAAA--ACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATGCAAA-TGCAACTTTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTT---------------A-------CC-------AA-A------GA-CAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAA-----TTCAA----CGTAG----TA---GAGC---ACACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----AA---T---A--T-TAAGT---A--T-CAATT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ACA--ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACATGTAA-T-G-TGTCTGTTT--AACA-ACAAAAA-----TA--TTTTTC---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG----TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAA-TTA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT-------AA--TGCA-CA-CT--AGGC---C--AA-C-TAGT-G-----CAATAT------GT-TG--AAAATTTATACT-TAAA--TCGAACTA-T-TT--ATTT--AA--AATCA--AATA-GTGA-ACTTTACTAACG-TGA-CA---CCCC-CCCTC-TCT-----C-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGATATTA-TGAA--G-AATTGTG-TCCTTGTGGGTTA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGC-CATT-ATCTTAATTA-TTTCCAAACATG-TTTCA-AAA-CTGA-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----C-C----AG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--G--CA--G-------G-AGG-----AAA-T-T--T-TCA----TTTTC--TG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAA-TCTT------T--GGC-CAT--AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TTACT-GTT-A------A-TACAG------GTCA--------CCC-AA-CTT--CG----T-A-TTG-A-------------CATAA-A----TTATA-TTAACTTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AGA---A-TCAAAA-ACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------A--GTGTTT--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AG-CA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGC----TA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAA-A--AA---TCAAT--A--G-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-CTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---T--AAACCT----------A-G-TAC---------GGAAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TAC-AAAATC-ATGCC---GAGGA-----TTA-GTGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGTGGGG--------------------------GGGGGG--GC----A---T-----------------------T----TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGT--ATTGTTTCAGCATATTTT----GTG---ACGGG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACG------ACAGTGTTTT-A--AAG--CAAA-ATGAATAA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAG-CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|10 : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGGG-T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAAATGCAAC-TTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TTTAA----TT-G--TTACCACAGAATCTCG--A-------CCGAGAAGGAC-GCCCCGGGA-AAA-T-T-AC----AA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GAACCACATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AAATTT---AATC-TAAGA---A--TACA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAA-ATAATACC----ATA-CAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTGTTGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTA--AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-T-GTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA--G-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTTTTTTATT--TTT--TTTAA----TTAAA--TGCA-CACCT--AG
gi|11 : gGG--T--A-T-TTCGACGC--G-ATGACTGT-T-GTA-CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GTT--T-GTTTATGCG-GAC-AA-TTT--CCG-AA-A-----ATA-TA----CATTT-CCTC-ATAATATTTT-----TGCA-----CA--CTTTTCT-------TTCGAA--------------TT---------A--TTTATA-GAGTTGT-----T-TT-GAATTTTT-GCGTT----------------A-------CC-------ACAG------GA-AAT-CCT-TCGGCGGA--------AGACGCC---------------CGGGAAAAGACTCGAA----CGACTAACTTCAATGTATATAT----TA---GAGC---CAAACAGATACATAT-GG--TGATCTTAAA----AA---TTTAA--TCTAAG----A--T-AG-TTCAG-CCATTA-TATGTTAACAAAATA-A-----TA-CGATACTTG-TAAAAATAT-AGAA-TATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACGAATT-----TT--TTTTTT---AAAAATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--------------------------AT-TGTT-T-GT------------GGT--CA--CT----T----CGACC-AATA-TGT------------------------------AAATAAAA-TG-T--TTCTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-AT---------AAAC-ATTTG-TGT-----GT--GACAATTTCT----TTAAA--T
gi|11 : ggtagcgtgtacgtggtactggT------GTGTG--ACAATTT-C-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CC-AATTT--AA--AATCA--Acgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaattttttttttaaaaatcggtcgaagttaccattgtttgtggtcacttcgaccaatatgtaaataaaatgtttctgtttgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAT-TGGG--T--AATCTTCGAC-T--C-GTGA-TGT-TTGTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--TTGT--AT-CA-GACCAA-TTT-TCCG-AGGA-----ATG-AAA--ACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------GCAAA-TGCA----TTTGA------ATTTGAT--------------T----------G--TTACACAGAAAT-C-----T-TC-GA----CC-G--AG----------------AAGACGCCCC-------GG-G------GA-AAT---T-AC----GA--------A-----A---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GACACA-AGACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---TTTAA--T-CAAGT---AATT-CA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ATACCATACCAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-AC-AAAA-----CATTTTTTTT---TTAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCAC--TAGACA--CAA-TTT-----Ttat
gi|13 : gg-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT----GA----TTTGA-T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AATCC-T-TC----G---------A-----C---------------CG-------------A----GAA
gi|13 : gttt-------CC-------AA-G------AA-AAT---T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAGATATTA---AAGC---GAACCT-ATGCTTAT-AGATT-AT-TTAAA----A----T---C--T-AAAGCCGTA--T--A-TT-------TTG-T--GTTAAC--------------------------CCCAAATA-----AATATTTGATTAAAAT--------ATGTAA-TTA-TGGCCGTTCTCAACA-ACAAAAAACATTTA--TTTTTC---AAAAATCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--C--TAG-CA--CGA-TT-------ATCTGAT-TG-TA-----------AGT--AAGCTT----T----TGACCCAATA-TGT--------------------------AAAA------AA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTA-TTT-----gaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|14 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgccccAG-CGTGGTCTAACTTCGACTGA-TT
gi|14 : --T--AAC-TTCGAC-T--G-ATTA-TGT-T-TTA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTTCCCCC-ATTGTGTT-------T------TGCACCCTTTTCT------CTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-CA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GACAGAGAAGA-----CGCCCCAAGAAAATTACG-------------AACGACAACT---TTCAA---ACGTAATTT-TA---AAGC---GAACCA-ATGCCTAT-GA--T-AT-TT-GA----AA---T------T-TAAGC-----------------C-ATTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-T--T---TATCAAAAAT-TAAAA-----TT-AGTAAAA-T-----ATACATA---TG-T---CGTTC--AACatgttttactccagtatttttagttcactgtttgtatcagacaattttccgaaaataaaaacatttcccccattgtgttttgcacccttttctcttcgaattatttaatacagttgtttgattttcattgttaccacggaaatcctcgacagagaagacgccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtaattttaaagcgaaccaatgcctatgatatttgaaatttaagccattattgttaacaaaataaatatttatcaaaaattaaaattagtaaaatatacatatgtcgttcaac
gi|15 : agcgtggtcTGT--AAATAAG--CC----T---TTTTTAA--------A--------GGCCATTTGGGTGCCAAAT-C-T-AGTT-TATT-TAGC--ATTGCT--AGTAATTTTT-T-GGCG---AAGAGAGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGT---CT-GCCAC-TGA--T-------C-------------------------T--------ACC------GTGTTTTTTT------------------A-AA-----AATTGGCCT--G----------------CGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGG-GGTA
gi|16 : G---GGTCTATTG----AAAT---CTTGCCA--TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------TG---------ACC------ACGTTGTTTTTA--AAG--C--ATATGAA-AATTAAAAATCGGCTT--GCGTTTTGGACGG-AACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|17 : -TTG-A-------------TAT--------TTGTA-TTA---TAT-A-T----TTTTGTT-AATACA----A-GA-A---AAA------CCAAT-ACTTG----AAGAAG--------C---AG-AA--ACGAGTA----------------GATC---TAT--C---GTG---T--TCTCC----TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------AT-AGAC----GAGAA----AAATCGC--A-C-T-----GCC--ATA-GA-AGA-------------------------A--AA---TCAAA--A-T------TGTTCT---CA-ATTG-TA-AA---GTTTA-C-G----C----T----AGAAAGAAA--A---agtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|18 : A-AC-----AAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGT
gi|19 : gtattcaatacagacgtgaaactCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GT-ctatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
gi|19 : G-TTTTA-AAA-CCTG-ACAAAA--ATT--AATT-ACTCATGCACA-AAAG--AGAG-A-TTG-TAC-AATTCAT-A--TA-----T--------------------A--GT-CA--G-------GAAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCtttaaaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|2 : ctggatattggaatgacaaagctcaGTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGTT--G-TT--AT-CAAGAC-AT-TTTATTCG-AA-A-----ATA-AAAGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAAC---TTCT------CTTCAAAA-------------T----------GGTTTT----GA----T-----T-T--GA----TT-G--TT----------------A-------C--------AC-A------GA-AA-----------------------------------------------------------A----TA-CTA--TTCGA---CCG-AG----AA---GACCCCGGAA--A-AT-----------T--T-TCAAATCGTAA---T---A-----AAGC---A--C-CA-T---A-C--TTA-TGTATT--TAAAA---A----ATT-TAAT---TT-----AATA---GAAATATTT-ATTAAAATT-----A-ATGTAAATTG-TGTTCGTTT--AACACACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAGTTCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TG-----------GG---AA--CT----T----CGAAC-AA-A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TA-TGGTTCTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAGC-TTTTAGTTT-----GT--TTT--GTTAT----CTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCAAAAC-TAGTTG-----C---AT------GT-TGTGAAGAATTAC-TT-TAAA--TCGAATTAAT-CTTGATTT--AA--A-TCA--AATA------------CTCACG-TGA-CA---ACGGGCCCTC-CTTCAT-CC-------G-AGAT--TC-----AAA-CTAATAAAA--AT-ACTGCTGAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCTTTGTGTA-AA----ATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATCT-AATTATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATTCATC----C----AAAG--AGAG-ATTTGTTAC-A---TAT-GGTTAG----T--------------------G--GT-CAAGG-------G-AGG------AA-TAT--T-TCA----TT---CTTG-T-AA----C----G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CATTGAC-TGG-CTGTGTTGAA------TAG-TT-----TAACT-GTT-A------A-TACAGT--T--GTCA---------CC-AA-CTTC-CG----TAA-TTG-A-------------C--------------------------A-TGAA-TTTT--TGAAGACA----A-AA-ACACAAA---A-TTCAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AG-AA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CC-GGTGC--T--CCTTC-T--TC-AGA-A--TG--------TTG------C------T----------------------A----------G---A----AAATCGC--AGC-GACA-AGCC--ATA-GA-AGATC-------TA---TAC-AGAGAAAA--AA---TCAAA--A-TGT----TG---T---CA-A-TG-TATAA---G-TTA-A-C-A--ATTATT----A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA--TTTTTCATGT-A--TCA-AA--TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAAA--A--T--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----T--AAA--------------------GGGGGGGCA-AGTATATT-------ATTGT--AGGTAAG--CC----ATT-TT----AAAAGGCC-A--------T----TTTTGATGCCAAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-GGGG---
gi|20 : gA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTT-A-----TGCTA---GCAACTTTTTCTCTGCGGCTTCGAA--------------T----------
gi|21 : tttgtcataagaacatacttaattcacg-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAAA-------------------GGGGGGGGGG-G-TG---C-------ATTGT--AGGTAAG--CC----T---TTTC--AAAAGGTC-A--------T----TTTGGGTGCCAAATAT-GGAGTT-TTAT-Ttatgttaaatacagattatgtaat
gi|22 : --------A--------T----TTTGGGTGCTAAAT-CTGGAGTT-TTAA-TGAC--ATT-TTT-AGTAAATGTT-T-GGCG---AAGAG-GGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATAT---CC-GCCAC-TG
gi|23 : ccA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TT---------A--TTT----GA----TACAGTTGTT-AG----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GA--------A-----
gi|25 : AACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---AAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----Aaagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|26 : T-CA--G-------G-AAA-----AAAATAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-
gi|3 : T------GG-TG--GAAATTTAT-TT-TAAA--TCGT-TTG-TTCT-GATTT--AATAAATCATTATTACGCGATCC----CC--CGCTGG-CT---CCCC-CCCCCATCTCAC-CCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AA-AAAAGA-T-TATGCGAAATGTATTA-TGAAATCGAATTGGG-T--TTCTGGG-TAGTCAATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GT-TTAACA----TGCACATT-ATCTAA-TTA-TTTTCAA-CA-A-TTTTA-AAATCTTG-ACAAAA---TT--AATT-ATT----CACA-AAAGGAAGAGGA-TTG-TAC-A---TAT----TAT----TCCAGCTTATAAGAATCTTCGA--GT-CA--G-------G-AAG-----AAA--AT--C-ACA----TTTTC-TTG-TAAA----T----G-AG-----TAC-TCTT------T--GGC-CATG-AC-T-G-CT-TGT-GGATT----TAG-GT-----TTTAT-ATT-ATATATTA-TACAGC--C--GTC----------CA-AA-CTTC--G----T-A-TTG-G-------------CAT---A----C---A-TTAA-TGAT-ACTGAA-TTTT----AAGACA----A-GA-A---AA------TCAAAA--CTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTT--GTAG--CTGGTT----C--TCTCCTT---C-AGACA--TG--------TTG------CCTTTT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C--------A---TACTAGAGAAGATAAA---TCAAA--A-TG-----TT---T---CATA-AA-TT-AA---G-TTAAC------A----T----T-AAATAAA--A---CTAAAACCT----------TTG-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TT---CATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA-TCATTGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT----C--AGAAATTT----T--ACA--------------------GGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGT--G--CC----T---TT----A--------AAAAGGCATT----TTTGGGTGCCAAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTA-ATGGTTT-A-CAAGTTTTAT-GATGGA-AAAAG-AGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-G-CAG-TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AATGT--------ACC------CC----TCTT-----CG--C----------AA-----GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTA-CC----T-GA--TCATCC-AAGTCGTCGA-TGTAGCGGAGGT
gi|4 : -TTGG--TCTAAC-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T--TA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GGC-A--TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTC-CCCC-ACTATGTT-------T------TGCAACCTTT-CT------CTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTACCACGGAAATCCTCGA-------CCGAGAAG-AC-GCCCCAAGA-AAT-T-T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TATTAAAGC---GAACCA-ATGCTTATTGA--T-AT-TTAAA----A----T------C-TAAGC-----------------C-GTTAAT-TGTTAACAAAA-----------------------------AT---AAATATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTA-TGTCCGTTC--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTTTCAAAAATCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TA-----------AGT--AA--CT----T----TGACC-AATA-TGT--------------------------TAAAA--------TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTATTTT-----GT--TTT--TTTTT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGGA-C-TAGT-G----------T------GT-TG--AAAA-TTAC-TT-TAAA--TCAAATTA-TACT-GATTTA-AA--AATCA--AATA-------------TAGCGCCGACCA---CCCC-CCCCC-CCCCACTCT-------CCAGAT--TC------AAACTAATAAAAAA---TATGCG-AAAGTATTA-TGAA--C-AATTGG-------------------ATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-A--ACA----TGCACATT-ATC-AAATTA-TTTTC-AGCATGTTTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACGAAAAG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----TTCCAACAGTTAATAATCTTAA--GT-CA--G-------G-AAA-----AAA--ATA-T-TCA----TTTT-CTTG-TAAA----C----G-AAG----TAC-TCTT------T--GGC-CATG-AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-GT-----TTACT-ATT--------A-TACAGT--C--GTCA--------CCC-AA-CTTT-CGA---T-A-TTGCA-------------CGC---A-----TACATTTGA-TTAT-A-TGAATTTTT--T-AAGAC-----A-GA-A---cccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|5 : A----ATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGT-ATTACA----TGCACATG-ATCTAATTTA-TTTTCAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATT-ATC----CA----AAG--AGAG-G-ATG-TAC-A---TAT-GATTAAGCTTC--------------------GACGT-CA--G-------G-GGATGGGAAAA-TAT--T-TCC----ATTTCTTTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTAC-TCTT------TTAGGC-CATT-ACCT-G--T-TGTTGGATT----TAG-GTAATTTTCACTCGTTTA------A-GTCAGT--CTTGTCA--------CCCCAA-CTTC-CGCTCGT-A-T-G-A-------------CAT---ACCATTTATA-TTAA-TTAT-A-TTGA-TTTT--T-AACGCACAAGA-GA-A---AAA---A-TCAAAA-CTTTGAAAAAAGAAGCCACAGATC---AGAAACTGCATGTA-TTTTCGTCTCC--GTGTTTG-GTAG--CT-GGTG-------CTCCCT--TCAAGACATTTG--------TTG------C---TT-TTGTATTTTTTAACTATAGTACGG--AGAA----A---A----AAATCGC--A-CTTGCA-AGCCCAAAG-GA-AGA-CATATTATTA---CAG-AGAGAAGA--AA---TCAAA--ATTGTTCCTTG---T---CATATTGTTA-AA---G-TTA-CAG-A--T----T----A-AAAAGAA--AGATT-AAAACCT----------T-GTTACTAATGGTAGGATAGTAATGTATATTTATCATGTCATTTTATAATATAC-AAAATCATTGCCCCTGAGGAATTTTTTAGATGTTGTGGCTGGAACAGGGG-AAAGA--T--CAGAAAGTTGAC---AGCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCT--AAA-------------------GCGGcag
gi|6 : aggattacgggtacttttgaaattaTT------T--GGCACAG--AC-T-GATT-TGTTAGATTATATTGA-GT-----AAACTCGTT-A------AATACAGTAAT--GTCAAAACCCACCTC-AATCTTCATA----T-A-TAG-AAAACTTTCATTTTTAT---A----TAACA-TTAA-TAATGA-T-AA-TTTTA-T-AAGAAA----AAGA-A---CAA---C-TCAAA---CTTGC---AAGAAG------------AGAAC--ACGCGAAAT---------CAAGTATTT--GTAG--CTG--TTC--TAATCTC-TT--TC-AGAAAC-TG--------TAG------C---TTAT----------------------GG-AGACTCAGA---A----AAATAGC--A-CATGAACAGCC--ATA-GATAGA---------TAAACTAC-AGAGAAGA--AAACCACAAAACA-TA-----TG---TTCCCA-A-TGCTA-AACAGG-TTA-CTGTA--A----C----A-ATATATA--A---A-AAGACCTAACACCTATAT-G-TAC---------GGT-GTAAATAA-----------T-A--TTA-AAT-TACACAACTAAACG-C---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT----C--AACAATTT----T--AAAAAGGGAGGGGAGGAGAGGGGGGAGGGGCAGA-TA---TAAAATAAATTGTAAAAGTAAGGACCTTTTT---TT----A--------AAAGAC---TA---TTTGGGTGCCAAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGTA-ATTTT-TAGGTGAATAAAAA-AAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAGACC-GATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGCAC--A-ATGAA-AA-----AATCt
gi|7 : actacaaA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGT-AA----ATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAA-TTA-TTTTCAA-CATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CAC--AAAG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------GGAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CATT-AC-T-G-CT-TGTTTGATT----TAG-GT-----TTACT-GTT-A------A-TACAGT--T--GTCA--------CCC-AA-CTTC-CG----T-A-TTG-A-------------CAT---------------------------GAA-TTTT--T-GAGACA----A-AA-A---AAA---AATCAAAA--CTTG----AAGAAG--------CTGCAGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCTGGT--------CTCCTTCTTC-AGACA--TG--------TTG------C---T------------------------------AC----G---A----AAATCGCCAG-C-TGCA-AGCC--ATAAGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA----TG-----TG---T---CA-A-TG-TT-AA-----TTA-C-A-ATTA----TT---A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTAT-TTTTCCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTT--ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--AATT--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-G-TATATT-------ATTGT--AGGTAAG--CC----ATATTT----AAGTAAGCCA--------T----TTTTGATGCAAAAT-C--GAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-G
gi|8 : AC-TTCTAAAGGTCGAATTA-TACT-GATCTTGAA--AATCA--A-TA------CC----CTAGCAATGA-AATTTCCCC-CCGCC-CCTC-T-CT-------CCAGAT---C-----AAAA---ATACAA--ATATATGCGAAAAGTATGAGTAAG--C-AATTGGGCTCCTTGTAAG-TA----ATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GT-TTTACACAAGTGCAC-TT-ATCTAATTTA-TTT-CACACATC-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--TATT-ATC----C-CG-AAAG--AGAG-A-TTG-TACAA---TATCG--TAG----T--------------------G--GTGCA--GTTGGAGCA-AGG-----AAA-TATAATATCACTATTTTTTCTTG-TAAA----C----GAAAGT-A-TAT-TCTCACATTGT--GGC-CAT-----T-G-CG-CTTTG---T----TAGTGT-----TAA-------A------A-TCCAGT--T--GTCAAC------CTC-AA-CTTC-CG----T-ATTTG-A-------------CATAAAA----TCAT--TTAC-TTTT-A-TCAA-TATT--T-AA---A----A-GACA---AGATTCA-TCACAATACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--A-GAGTA-T---------C--GTACAT--GTAGAATTAGGTTCTGC--TATCCCT--TC-AG-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT-TC---------------------ATCAGAC----G---AGAAGAAATCGCA-A-C-TGCA-AG-C--ATA-AA-------------T-------------AGA--AA---TCAAA--A-TG-----TC---G---CAGA-TG-T--AA---T-TTA-C-A-G--A----TTCAAA-AGATAAAATA---G-AAAATCT----------T-G-T-C----------GTAGTAAATTAT-TTTTGGATGT-A--TTC-AA--TACAGA
gi|9 : c--T--AATGTTCGAC-G--G-ATGA-TGTAT-GTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GAC-AAGTTT-TCCG-AA-ATAAAAAAA-AAA--ACATTT-CCCCCATTATGTTAA-----TGCCAA-TATGGC------------------AA--------------T-------------TTT----GA----T-----T-TT-GA----TTGG--TT----------------A-------CC-------AC-GCA----GATAAT-C-TGTC----AG--------A-----C---------------CG-------------A----
gi|9 : -A-AGTT-A--C-C--TATTAG-CAGCCAA-TTTCTTAATAT-TGTTCTGATGCATTTATCTTTGGTTAAA--CTGGACTGGCGCAACA-AATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGTGTT--TTTTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATAGTATAGGAATAACAAACTATTTT-TTT-----TTTATTT--TTTATTAGATTAAATTTGCACCACCTTAAGGCATGCCCAA-CTTAGT-GTCAAAC---ATGTGTGGGT-TG--AAAATTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 11111 22222222222222 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666 1 55555555555555555555555555555555 222222222 11111 111 1 11111 111111 333333333333333 111111111 666666666666666666666666666 1111 1111 1111 22222222 1 11111 11111 11 111 1 1 1 55555555555555555 2 11 888888888888 1 111 333333333333 2222222222 111 22222 1111 111111111 1111 111111 1111 1 222222222 1111 88888888888888888888888888888 111111111 11111 11 11 111111111 1111 111111 1111 11111 111 111111 11111 33333333 1111 5555555555555555555555555555555555555 1111 11111 111 1111 222222222222 111 22222222222222 11 11 3333333 11 11111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 333333333333333333 22222222222 1111111 111 1 11111 4444444444444444 11111111 222222222222 222222222 11 11 111 1111 1111 11111 111111 1111 1111 44444444444444444444 4444444444444444 99999999999999999999 11 11 111 111 2222 111 11 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 111
lowQualScore : 8 3 0 6 11 66 0 9999 5 5 5 5 5 5 5 6 66 5 66 0 5 5 55 5 5 4 55555 4 66 4 4 44444444444444 3 8 000000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 222 777 7777 777 777 1 8 1 4 66 4 4 9999999999999999999999999999999999999999999 5 0 55555555555555555555555555555555 2 0 5 777777777 5 5 66 5 0 44444 77 555 5 5 0 66 5 22222 5 66 3 5 222222 5 5 777777777777777 77 77 555555555 0 5 5 333333333333333333333333333 1 1 5 1111 77 5 2222 5 5 2222 5 00000000 5 1 44444 99 99 55555 99 8 11 777 99 0 0 0 22222222222222222 6 99 3 6 6 99 6 0 77 55 99 99 6 444444444444 77 5 8 444 8 8 222222222222 2222222222 111 0 88888 3 6 0000 6 33 888888888 5 5 0000 888 444444 5 2222 5 1 2 5 0 9 5 0 5 5 5 66 66 5 777777777 66 5 5 5 5 888 7777 99999999999999999999999999999 4 66 555555555 11111 66 00 4 9999 77 5 333333333 5 3333 5 444444 66 5 888 777 5 5 0 0000 5 22222 1 222 444444 5 44444 00000000 5 5555 5 5 4 4 8888888888888888888888888888888888888 4 4 6 4 1111 1 9999 4 4 777 66666 444 5555 333333333333 3 222 55555555555555 88 66 11 3333333 7777 5 44 11 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 5 0 5 66 5 5 666666666666666666 1 66 888 11111111111 1111111 666 0 88 33333 5 3333333333333333 5 99999999 555555555555 5 222222222 00 666 5 77 2 5 44 5 3 7 111 4444 6 6 6 4444 5 77 77 77 44444 111111 4444 77 8 2222 77 88888888888888888888 2 8888888888888888 77 0 77 33333333333333333333 5 66 5 22 5 5 33 5 6 999 1 777 5 5 000 6 0000 111 77 2 11 11 0 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 0 99999 111 8 0 8 3 8 3
lowQualScore : . . . . .. .. . .... . . . . . . . . .. . .. . . . .. . . . ..... . .. . . .............. . . ...... ............................................................................................................................................................................. .... ... ... .... ... ... . . . . .. . . ........................................... . . ................................ . . . ......... . . .. . . ..... .. ... . . . .. . ..... . .. . . ...... . . ............... .. .. ......... . . . ........................... . . . .... .. . .... . . .... . ........ . . ..... .. .. ..... .. . .. ... .. . . . ................. . .. . . . .. . . .. .. .. .. . ............ .. . . ... . . ............ .......... ... . ..... . . .... . .. ......... . . .... ... ...... . .... . . . . . . . . . . . .. .. . ......... .. . . . . ... .... ............................. . .. ......... ..... .. .. . .... .. . ......... . .... . ...... .. . ... ... . . . .... . ..... . ... ...... . ..... ........ . .... . . . . ..................................... . . . . .... . .... . . ... ..... ... .... ............ . ... .............. .. .. .. ....... .... . .. .. ........ ........................................................ .. . . . .. . . .................. . .. ... ........... ....... ... . .. ..... . ................ . ........ ............ . ......... .. ... . .. . . .. . . . ... .... . . . .... . .. .. .. ..... ...... .... .. . .... .. .................... . ................ .. . .. .................... . .. . .. . . .. . . ... . ... . . ... . .... ... .. . .. .. . . ................................................................................ .. . ..... ... . . . . . .
lowQualScore : 0 8 8 7 99 99 0 0000 0 0 0 0 0 0 1 5 99 0 99 0 0 0 44 0 0 4 66666 4 11 4 4 11111111111111 5 8 555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 222 888 2222 888 888 1 9 4 4 11 4 4 7777777777777777777777777777777777777777777 0 0 66666666666666666666666666666666 0 1 0 111111111 0 0 99 7 1 33333 99 777 0 0 0 99 0 00000 0 99 1 0 666666 7 7 999999999999999 99 99 333333333 7 7 7 111111111111111111111111111 4 6 7 6666 99 7 1111 7 7 1111 7 77777777 7 4 33333 22 22 88888 22 0 00 555 00 0 0 0 22222222222222222 7 22 5 7 7 22 7 0 77 88 22 22 0 444444444444 00 0 0 000 0 0 444444444444 6666666666 444 8 22222 8 7 0000 7 55 999999999 0 0 6666 888 444444 0 1111 7 7 4 7 1 3 0 2 0 0 0 99 99 0 111111111 99 0 0 0 0 888 0000 00000000000000000000000000000 4 11 111111111 11111 33 66 4 4444 11 0 222222222 0 2222 7 444444 99 0 222 111 0 0 1 6666 0 55555 0 111 444444 0 99999 00000000 0 6666 0 0 4 4 8888888888888888888888888888888888888 4 4 7 4 4444 1 4444 4 4 888 99999 666 6666 111111111111 2 000 22222222222222 88 99 66 5555555 9999 0 66 99 11111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 0 0 99 0 0 111111111111111111 4 99 888 99999999999 5555555 000 0 66 11111 0 6666666666666666 0 88888888 444444444444 7 999999999 77 444 7 99 3 7 44 0 2 2 777 2222 7 7 7 2222 7 99 99 99 33333 000000 3333 99 4 1111 99 66666666666666666666 5 3333333333333333 99 1 99 88888888888888888888 0 99 0 55 0 0 66 7 6 444 4 999 7 7 000 7 8888 777 33 5 88 00 8 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 00 6 44444 888 0 8 0 8 0 2
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CATT-AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-T-A-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGTAAG--CC---TTTT-----AAAAGG--CA-T--TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( family-90 ) : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAAATTA-TTTTCAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CATT-AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-T-A-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGTAAG--CC---NTT------AA------CA-T--TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|1 : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGAC-CCCGCATGA--GT-T-GTA-ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCATAA-AC----ATATAAA--ACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATGCAAA-TGCAACTTTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTT---------------A-------CC-------AA-A------GA-CAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAA-----TTCAA----CGTAG----TA---GAGC---ACACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----AA---T---A--T-TAAGT---A--T-CAATT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ACA--ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACATGTAA-T-G-TGTCTGTTT--AACA-ACAAAAA-----TA--TTTTTC---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG----TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAA-TTA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT-------AA--TGCA-CA-CT--AGGC---C--AA-C-TAGT-G-----CAATAT------GT-TG--AAAATTTATACT-TAAA--TCGAACTA-T-TT--ATTT--AA--AATCA--AATA-GTGA-ACTTTACTAACG-TGA-CA---CCCC-CCCTC-TCT-----C-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGATATTA-TGAA--G-AATTGTG-TCCTTGTGGGTTA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-ATTACA----TGC-CATT-ATCTTAATTA-TTTCCAAACATG-TTTCA-AAA-CTGA-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----C-C----AG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--G--CA--G-------G-AGG-----AAA-T-T--T-TCA----TTTTC--TG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAA-TCTT------T--GGC-CA-T-AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAG------GTCA--------CCCAA-CTT-----CG-T-A-TTG-A-------------CATAA-A----TTATA-TTAACTTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AGA---A-TCAAAA-ACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------A--GTGTTT--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AG-CA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGC----TA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAA-A--AA---TCAAT--A--G-----TG---T---CA-A-TG-TA-AA---G-CTA-C-G-A--A----T----A-AAATAAA--A---T--AAACCT----------A-G-TAC---------GGAAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TAC-AAAATC-ATGCC---GAGGA-----TTA-GTGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGTGGGG--------------------------GGGGGG--GC---AT------------------T--TTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGT--ATTGTTTCAGCATATTTT----GTG---ACGGG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACG------ACAGTGTTTT-A--AAG--CAAA-ATGAATAA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAG-CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|10 : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGGG-T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAAATGCAAC-TTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TTTAA----TT-G--TTACCACAGAATCTCG--A-------CCGAGAAGGAC-GCCCCGGGA-AAA-T-T-AC----AA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GAACCACATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AAATTT---AATC-TAAGA---A--TACA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAA-ATAATACC----ATA-CAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTGTTGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTA--AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-T-GTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA--G-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTTTTTTATT--TTT--TTTAA----TTAAA--TGCA-CACCT--AG
gi|11 : gGG--T--A-T-TTCGACGC--G-ATGACTGT-T-GTA-CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GTT--T-GTTTATGCG-GAC-AA-TTT--CCG-AA-A-----ATA-TA----CATTT-CCTC-ATAATATTTT-----TGCA-----CA--CTTTTCT-------TTCGAA--------------TT---------A--TTTATA-GAGTTGT-----T-TT-GAATTTTT-GCGTT----------------A-------CC-------ACAG------GA-AAT-CCT-TCGGCGGA--------AGACGCC---------------CGGGAAAAGACTCGAA----CGACTAACTTCAATGTATATAT----TA---GAGC---CAAACAGATACATAT-GG--TGATCTTAAA----AA---TTTAA--TCTAAG----A--T-AG-TTCAG-CCATTA-TATGTTAACAAAATA-A-----TA-CGATACTTG-TAAAAATAT-AGAA-TATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACGAATT-----TT--TTTTTT---AAAAATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--------------------------AT-TGTT-T-GT------------GGT--CA--CT----T----CGACC-AATA-TGT------------------------------AAATAAAA-TG-T--TTCTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-AT---------AAAC-ATTTG-TGT-----GT--GACAATTTCT----TTAAA--T
gi|11 : ggtagcgtgtacgtggtactggT------GTGTG--ACAATTT-C-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CC-AATTT--AA--AATCA--Acgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaattttttttttaaaaatcggtcgaagttaccattgtttgtggtcacttcgaccaatatgtaaataaaatgtttctgtttgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAT-TGGG--T--AATCTTCGAC-T--C-GTGA-TGT-TTGTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--TTGT--AT-CA-GACCAA-TTT-TCCG-AGGA-----ATG-AAA--ACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------GCAAA-TGCA----TTTGA------ATTTGAT--------------T----------G--TTACACAGAAAT-C-----T-TC-GA----CC-G--AG----------------AAGACGCCCC-------GG-G------GA-AAT---T-AC----GA--------A-----A---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GACACA-AGACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---TTTAA--T-CAAGT---AATT-CA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ATACCATACCAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-AC-AAAA-----CATTTTTTTT---TTAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCAC--TAGACA--CAA-TTT-----Ttat
gi|13 : gg-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT----GA----TTTGA-T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AATCC-T-TC----G---------A-----C---------------CG-------------A----GAA
gi|13 : gttt-------CC-------AA-G------AA-AAT---T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAGATATTA---AAGC---GAACCT-ATGCTTAT-AGATT-AT-TTAAA----A----T---C--T-AAAGCCGTA--T--A-TT-------TTG-T--GTTAAC--------------------------CCCAAATA-----AATATTTGATTAAAAT--------ATGTAA-TTA-TGGCCGTTCTCAACA-ACAAAAAACATTTA--TTTTTC---AAAAATCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--C--TAG-CA--CGA-TT-------ATCTGAT-TG-TA-----------AGT--AAGCTT----T----TGACCCAATA-TGT--------------------------AAAA------AA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTA-TTT-----gaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|14 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgccccAG-CGTGGTCTAACTTCGACTGA-TT
gi|14 : --T--AAC-TTCGAC-T--G-ATTA-TGT-T-TTA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTTCCCCC-ATTGTGTT-------T------TGCACCCTTTTCT------CTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-CA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GACAGAGAAGA-----CGCCCCAAGAAAATTACG-------------AACGACAACT---TTCAA---ACGTAATTT-TA---AAGC---GAACCA-ATGCCTAT-GA--T-AT-TT-GA----AA---T------T-TAAGC-----------------C-ATTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-T--T---TATCAAAAAT-TAAAA-----TT-AGTAAAA-T-----ATACATA---TG-T---CGTTC--AACatgttttactccagtatttttagttcactgtttgtatcagacaattttccgaaaataaaaacatttcccccattgtgttttgcacccttttctcttcgaattatttaatacagttgtttgattttcattgttaccacggaaatcctcgacagagaagacgccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtaattttaaagcgaaccaatgcctatgatatttgaaatttaagccattattgttaacaaaataaatatttatcaaaaattaaaattagtaaaatatacatatgtcgttcaac
gi|15 : agcgtggtcTGT--AAATAAG--CC---TTTTTTA--AAGGC---CA-T--TT-GGGTGCCAAAT-C-T-AGTT-TATT-TAGC--ATTGCT--AGTAATTTTT-T-GGCG---AAGAGAGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGT---CT-GCCAC-TGA--T-------C-------------------------T--------ACC------GTGTTTTTTT------------------A-AA-----AATTGGCCT--G----------------CGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGG-GGTA
gi|16 : G---GGTCTATTG----AAAT---CTTGCCA--TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------TG---------ACC------ACGTTGTTTTTA--AAG--C--ATATGAA-AATTAAAAATCGGCTT--GCGTTTTGGACGG-AACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|17 : -TTG-A-------------TAT--------TTGTA-TTA---TAT-A-T----TTTTGTT-AATACA----A-GA-A---AAA------CCAAT-ACTTG----AAGAAG--------C---AG-AA--ACGAGTA----------------GATC---TAT--C---GTG---T--TCTCC----TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------AT-AGAC----GAGAA----AAATCGC--A-C-T-----GCC--ATA-GA-AGA-------------------------A--AA---TCAAA--A-T------TGTTCT---CA-ATTG-TA-AA---GTTTA-C-G----C----T----AGAAAGAAA--A---agtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|18 : A-AC-----AAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGT
gi|19 : gtattcaatacagacgtgaaactCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GT-ctatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
gi|19 : G-TTTTA-AAA-CCTG-ACAAAA--ATT--AATT-ACTCATGCACA-AAAG--AGAG-A-TTG-TAC-AATTCAT-A--TA-----T--------------------A--GT-CA--G-------GAAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCtttaaaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|2 : ctggatattggaatgacaaagctcaGTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGTT--G-TT--AT-CAAGAC-AT-TTTATTCG-AA-A-----ATA-AAAGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAAC---TTCT------CTTCAAAA-------------T----------GGTTTT----GA----T-----T-T--GA----TT-G--TT----------------A-------C--------AC-A------GA-AA-----------------------------------------------------------A----TA-CTA--TTCGA---CCG-AG----AA---GACCCCGGAA--A-AT-----------T--T-TCAAATCGTAA---T---A-----AAGC---A--C-CA-T---A-C--TTA-TGTATT--TAAAA---A----ATT-TAAT---TT-----AATA---GAAATATTT-ATTAAAATT-----A-ATGTAAATTG-TGTTCGTTT--AACACACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAGTTCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TG-----------GG---AA--CT----T----CGAAC-AA-A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TA-TGGTTCTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAGC-TTTTAGTTT-----GT--TTT--GTTAT----CTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCAAAAC-TAGTTG-----C---AT------GT-TGTGAAGAATTAC-TT-TAAA--TCGAATTAAT-CTTGATTT--AA--A-TCA--AATA------------CTCACG-TGA-CA---ACGGGCCCTC-CTTCAT-CC-------G-AGAT--TC-----AAA-CTAATAAAA--AT-ACTGCTGAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCTTTGTGTA-AA----ATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATCT-AATTATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATTCATC----C----AAAG--AGAG-ATTTGTTAC-A---TAT-GGTTAG----T--------------------G--GT-CAAGG-------G-AGG------AA-TAT--T-TCA----TT---CTTG-T-AA----C----G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CATTGAC-TGG-CTGTGTTGAA------TAG-T-----TTAACT-G-TTA------A-TACAGT--T--GTCA---------CCAA-CTTC----CG-TAA-TTG-A-------------C--------------------------A-TGAA-TTTT--TGAAGACA----A-AA-ACACAAA---A-TTCAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AG-AA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CC-GGTGC--T--CCTTC-T--TC-AGA-A--TG--------TTG------C------T----------------------A----------G---A----AAATCGC--AGC-GACA-AGCC--ATA-GA-AGATC-------TA---TAC-AGAGAAAA--AA---TCAAA--A-TGT----TG---T---CA-A-TG-TATAA---G-TTA-A-C-A--ATTATT----A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA--TTTTTCATGT-A--TCA-AA--TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAAA--A--T--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----T--AAA--------------------GGGGGGGCA-AGTATATT-------ATTGT--AGGTAAG--CCAT-TTT------AAAAGGC-CA-T--TTTTGATGCCAAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-GGGG---
gi|20 : gA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTT-A-----TGCTA---GCAACTTTTTCTCTGCGGCTTCGAA--------------T----------
gi|21 : tttgtcataagaacatacttaattcacg-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAAA-------------------GGGGGGGGGG-G-TG---C-------ATTGT--AGGTAAG--CC---TTTTC----AAAAGGT-CA-T--TTTGGGTGCCAAATAT-GGAGTT-TTAT-Ttatgttaaatacagattatgtaat
gi|22 : ------CA-T--TTTGGGTGCTAAAT-CTGGAGTT-TTAA-TGAC--ATT-TTT-AGTAAATGTT-T-GGCG---AAGAG-GGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATAT---CC-GCCAC-TG
gi|23 : cA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TT---------A--TTT----GA----TACAGTTGTT-AG----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GA--------A-----
gi|25 : AACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---AAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----Aaagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|26 : T-CA--G-------G-AAA-----AAAATAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-
gi|3 : T------GG-TG--GAAATTTAT-TT-TAAA--TCGT-TTG-TTCT-GATTT--AATAAATCATTATTACGCGATCC----CC--CGCTGG-CT---CCCC-CCCCCATCTCAC-CCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AA-AAAAGA-T-TATGCGAAATGTATTA-TGAAATCGAATTGGG-T--TTCTGGG-TAGTCAATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GT-TTAACA----TGCACATT-ATCTAA-TTA-TTTTCAA-CA-A-TTTTA-AAATCTTG-ACAAAA---TT--AATT-ATT----CACA-AAAGGAAGAGGA-TTG-TAC-A---TAT----TAT----TCCAGCTTATAAGAATCTTCGA--GT-CA--G-------G-AAG-----AAA--AT--C-ACA----TTTTC-TTG-TAAA----T----G-AG-----TAC-TCTT------T--GGC-CATG-AC-T-G-CT-TGT-GGATT----TAG-G-----TTTTAT-A-TTATATATTA-TACAGC--C--GTC----------CAAA-CTTC-----G-T-A-TTG-G-------------CAT---A----C---A-TTAA-TGAT-ACTGAA-TTTT----AAGACA----A-GA-A---AA------TCAAAA--CTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTT--GTAG--CTGGTT----C--TCTCCTT---C-AGACA--TG--------TTG------CCTTTT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C--------A---TACTAGAGAAGATAAA---TCAAA--A-TG-----TT---T---CATA-AA-TT-AA---G-TTAAC------A----T----T-AAATAAA--A---CTAAAACCT----------TTG-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TT---CATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA-TCATTGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT----C--AGAAATTT----T--ACA--------------------GGGGGGGCA-A-TA---T-------ATTGT--AGGT--G--CC---TTT------AAAAAGG-CATT--TTTGGGTGCCAAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTA-ATGGTTT-A-CAAGTTTTAT-GATGGA-AAAAG-AGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-G-CAG-TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AATGT--------ACC------CC----TCTT-----CG--C----------AA-----GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTA-CC----T-GA--TCATCC-AAGTCGTCGA-TGTAGCGGAGGT
gi|4 : -TTGG--TCTAAC-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T--TA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GGC-A--TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTC-CCCC-ACTATGTT-------T------TGCAACCTTT-CT------CTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTACCACGGAAATCCTCGA-------CCGAGAAG-AC-GCCCCAAGA-AAT-T-T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TATTAAAGC---GAACCA-ATGCTTATTGA--T-AT-TTAAA----A----T------C-TAAGC-----------------C-GTTAAT-TGTTAACAAAA-----------------------------AT---AAATATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTA-TGTCCGTTC--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTTTCAAAAATCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TA-----------AGT--AA--CT----T----TGACC-AATA-TGT--------------------------TAAAA--------TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTATTTT-----GT--TTT--TTTTT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGGA-C-TAGT-G----------T------GT-TG--AAAA-TTAC-TT-TAAA--TCAAATTA-TACT-GATTTA-AA--AATCA--AATA-------------TAGCGCCGACCA---CCCC-CCCCC-CCCCACTCT-------CCAGAT--TC------AAACTAATAAAAAA---TATGCG-AAAGTATTA-TGAA--C-AATTGG-------------------ATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GT-A--ACA----TGCACATT-ATC-AAATTA-TTTTC-AGCATGTTTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACGAAAAG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----TTCCAACAGTTAATAATCTTAA--GT-CA--G-------G-AAA-----AAA--ATA-T-TCA----TTTT-CTTG-TAAA----C----G-AAG----TAC-TCTT------T--GGC-CATG-AC-T-G-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-A-TT-------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTT----CGAT-A-TTGCA-------------CGC---A-----TACATTTGA-TTAT-A-TGAATTTTT--T-AAGAC-----A-GA-A---cccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|5 : A----ATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGT-ATTACA----TGCACATG-ATCTAATTTA-TTTTCAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATT-ATC----CA----AAG--AGAG-G-ATG-TAC-A---TAT-GATTAAGCTTC--------------------GACGT-CA--G-------G-GGATGGGAAAA-TAT--T-TCC----ATTTCTTTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTAC-TCTT------TTAGGC-CATT-ACCT-G--T-TGTTGGATT----TAG-GTAATTTTCACTCGTTTA------A-GTCAGT--CTTGTCAC-------CCCAA-CTTCCGCTCG-T-A--TG-A-------------CAT---ACCATTTATA-TTAA-TTAT-A-TTGA-TTTT--T-AACGCACAAGA-GA-A---AAA---A-TCAAAA-CTTTGAAAAAAGAAGCCACAGATC---AGAAACTGCATGTA-TTTTCGTCTCC--GTGTTTG-GTAG--CT-GGTG-------CTCCCT--TCAAGACATTTG--------TTG------C---TT-TTGTATTTTTTAACTATAGTACGG--AGAA----A---A----AAATCGC--A-CTTGCA-AGCCCAAAG-GA-AGA-CATATTATTA---CAG-AGAGAAGA--AA---TCAAA--ATTGTTCCTTG---T---CATATTGTTA-AA---G-TTA-CAG-A--T----T----A-AAAAGAA--AGATT-AAAACCT----------T-GTTACTAATGGTAGGATAGTAATGTATATTTATCATGTCATTTTATAATATAC-AAAATCATTGCCCCTGAGGAATTTTTTAGATGTTGTGGCTGGAACAGGGG-AAAGA--T--CAGAAAGTTGAC---AGCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCT--AAA-------------------GCGGcag
gi|6 : aggattacgggtacttttgaaattaTT------T--GGCACAG--AC-T-GATT-TGTTAGATTATATTGA-G-----TAAACTCG-TTA------AATACAGTAAT--GTCAAAACCCACCTCAATCTTCA---TA-T-A-TAG-AAAACTTTCATTTTTAT---A----TAACA-TTAA-TAATGA-T-AA-TTTTA-T-AAGAAA----AAGA-A---CAA---C-TCAAA---CTTGC---AAGAAG------------AGAAC--ACGCGAAAT---------CAAGTATTT--GTAG--CTG--TTC--TAATCTC-TT--TC-AGAAAC-TG--------TAG------C---TTAT----------------------GG-AGACTCAGA---A----AAATAGC--A-CATGAACAGCC--ATA-GATAGA---------TAAACTAC-AGAGAAGA--AAACCACAAAACA-TA-----TG---TTCCCA-A-TGCTA-AACAGG-TTA-CTGTA--A----C----A-ATATATA--A---A-AAGACCTAACACCTATAT-G-TAC---------GGT-GTAAATAA-----------T-A--TTA-AAT-TACACAACTAAACG-C---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT----C--AACAATTT----T--AAAAAGGGAGGGGAGGAGAGGGGGGAGGGGCAGA-TA---TAAAATAAATTGTAAAAGTAAGGACC---TTTTTTTAAAA------GA-CTATTTGGGTGCCAAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGTA-ATTTT-TAGGTGAATAAAAA-AAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAGACC-GATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGCAC--A-ATGAA-AA-----AATCt
gi|7 : actacaaA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGT-AA----ATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GT-ATTACA----TGCACATT-ATCTAA-TTA-TTTTCAA-CATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CAC--AAAG--AGAG-A-TTG-TAC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------GGAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAC-TCTT------T--GGC-CATT-AC-T-G-CT-TGTTTGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAGT--T--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-T-A-TTG-A-------------CAT---------------------------GAA-TTTT--T-GAGACA----A-AA-A---AAA---AATCAAAA--CTTG----AAGAAG--------CTGCAGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCTGGT--------CTCCTTCTTC-AGACA--TG--------TTG------C---T------------------------------AC----G---A----AAATCGCCAG-C-TGCA-AGCC--ATAAGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA----TG-----TG---T---CA-A-TG-TT-AA-----TTA-C-A-ATTA----TT---A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTAT-TTTTCCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTT--ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--AATT--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-G-TATATT-------ATTGT--AGGTAAG--CCATATTT------AAGTAAGCCA-T--TTTTGATGCAAAAT-C--GAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-G
gi|8 : AC-TTCTAAAGGTCGAATTA-TACT-GATCTTGAA--AATCA--A-TA------CC----CTAGCAATGA-AATTTCCCC-CCGCC-CCTC-T-CT-------CCAGAT---C-----AAAA---ATACAA--ATATATGCGAAAAGTATGAGTAAG--C-AATTGGGCTCCTTGTAAG-TA----ATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GT-TTTACACAAGTGCAC-TT-ATCTAATTTA-TTT-CACACATC-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--TATT-ATC----C-CG-AAAG--AGAG-A-TTG-TACAA---TATCG--TAG----T--------------------G--GTGCA--GTTGGAGCA-AGG-----AAA-TATAATATCACTATTTTTTCTTG-TAAA----C----GAAAGT-A-TAT-TCTCACATTGT--GGC-CATT-GC---G-CT---TTG---T----TAGTG-----TTAA-------A------A-TCCAGT--T--GTCAAC------CTCAA-CTTC----CG-T-ATTTG-A-------------CATAAAA----TCAT--TTAC-TTTT-A-TCAA-TATT--T-AA---A----A-GACA---AGATTCA-TCACAATACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--A-GAGTA-T---------C--GTACAT--GTAGAATTAGGTTCTGC--TATCCCT--TC-AG-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT-TC---------------------ATCAGAC----G---AGAAGAAATCGCA-A-C-TGCA-AG-C--ATA-AA-------------T-------------AGA--AA---TCAAA--A-TG-----TC---G---CAGA-TG-T--AA---T-TTA-C-A-G--A----TTCAAA-AGATAAAATA---G-AAAATCT----------T-G-T-C----------GTAGTAAATTAT-TTTTGGATGT-A--TTC-AA--TACAGA
gi|9 : c--T--AATGTTCGAC-G--G-ATGA-TGTAT-GTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GAC-AAGTTT-TCCG-AA-ATAAAAAAA-AAA--ACATTT-CCCCCATTATGTTAA-----TGCCAA-TATGGC------------------AA--------------T-------------TTT----GA----T-----T-TT-GA----TTGG--TT----------------A-------CC-------AC-GCA----GATAAT-C-TGTC----AG--------A-----C---------------CG-------------A----
gi|9 : -A-AGTT-A--C-C--TATTAG-CAGCCAA-TTTCTTAATAT-TGTTCTGATGCATTTATCTTTGGTTAAA--CTGGACTGGCGCAACA-AATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGTGTT--TTTTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATAGTATAGGAATAACAAACTATTTT-TTT-----TTTATTT--TTTATTAGATTAAATTTGCACCACCTTAAGGCATGCCCAA-CTTAGT-GTCAAAC---ATGTGTGGGT-TG--AAAATTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 11111 22222222222222 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666 1 55555555555555555555555555555555 222222222 11111 111 1 11111 111111 333333333333333 111111111 666666666666666666666666666 1111 1111 1111 22222222 1 11111 11111 11 111 1 1 1 55555555555555555 2 11 888888888888 1 111 333333333333 2222222222 111 22222 1111 111111111 1111 111111 1111 1 222222222 1111 88888888888888888888888888888 111111111 11111 11 11 111111111 1111 111111 1 1111 11111 111 111111 11111 33333333 1111 55555555555555555555555555555555555555555555 1111 11111 111 1111 222222222222 111 22222222222222 11 3333333 111 11 11111111 777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 11 1 333333333333333333 1111 11111111111111111111 111 1 11111 444444444444 11111111 222222222222 222222222 111 111 1111 1111 11 11111111 22222 1111111 1111 4444444444444444444 44444444444444444444 111 22222222 111 11 11 111 111 2222 111 11 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 111
lowQualScore : 8 3 0 6 11 66 0 9999 5 5 5 5 5 5 5 6 66 5 66 0 5 5 55 5 5 4 55555 4 66 4 4 44444444444444 3 8 000000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 222 777 7777 777 777 1 8 1 4 66 4 4 9999999999999999999999999999999999999999999 5 0 55555555555555555555555555555555 2 0 5 777777777 5 5 66 5 0 44444 77 555 5 5 0 66 5 22222 5 66 3 5 222222 5 5 777777777777777 77 77 555555555 0 5 5 333333333333333333333333333 1 1 5 1111 77 5 2222 5 5 2222 5 00000000 5 1 44444 99 99 55555 99 8 11 777 99 0 0 0 22222222222222222 6 99 3 6 6 99 6 0 77 55 99 99 6 444444444444 77 5 8 444 8 8 222222222222 2222222222 111 0 88888 3 6 0000 6 33 888888888 5 5 0000 888 444444 5 2222 5 9 55 9 5 0 5 5 5 66 66 5 444444444 66 5 5 5 5 888 7777 99999999999999999999999999999 4 66 555555555 11111 66 00 4 9999 77 5 333333333 5 3333 5 444444 66 5 888 5 0 5 0000 5 22222 1 222 444444 5 44444 00000000 5 5555 5 8 4 77777777777777777777777777777777777777777777 4 1111 1 9999 4 4 777 66666 444 5555 333333333333 888 55555555555555 88 66 7777 3333333 0 000 5 44 11 88888888 666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 11 0 5 5 66 5 5 666666666666666666 1 66 0000 88888888888888888888 666 0 88 33333 5 333333333333 5 99999999 555555555555 5 222222222 5 333 5 77 2 5 77 5 3 7 111 4444 6 6 6 4444 77 33 44444444 00000 2222222 1 2222 77 4444444444444444444 2 33333333333333333333 77 1 77 111 11111111 5 222 5 22 5 5 33 5 6 999 1 777 5 5 000 6 0000 111 77 2 11 11 0 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 0 99999 111 8 0 8 3 8 3
lowQualScore : . . . . .. .. . .... . . . . . . . . .. . .. . . . .. . . . ..... . .. . . .............. . . ...... ............................................................................................................................................................................. .... ... ... .... ... ... . . . . .. . . ........................................... . . ................................ . . . ......... . . .. . . ..... .. ... . . . .. . ..... . .. . . ...... . . ............... .. .. ......... . . . ........................... . . . .... .. . .... . . .... . ........ . . ..... .. .. ..... .. . .. ... .. . . . ................. . .. . . . .. . . .. .. .. .. . ............ .. . . ... . . ............ .......... ... . ..... . . .... . .. ......... . . .... ... ...... . .... . . .. . . . . . . .. .. . ......... .. . . . . ... .... ............................. . .. ......... ..... .. .. . .... .. . ......... . .... . ...... .. . ... . . . .... . ..... . ... ...... . ..... ........ . .... . . . ............................................ . .... . .... . . ... ..... ... .... ............ ... .............. .. .. .... ....... . ... . .. .. ........ ....................................... ............. .. . . . .. . . .................. . .. .... .................... ... . .. ..... . ............ . ........ ............ . ......... . ... . .. . . .. . . . ... .... . . . .... .. .. ........ ..... ....... . .... .. ................... . .................... .. . .. ... ........ . ... . .. . . .. . . ... . ... . . ... . .... ... .. . .. .. . . ................................................................................ .. . ..... ... . . . . . .
lowQualScore : 0 8 8 7 99 99 0 0000 0 0 0 0 0 0 1 5 99 0 99 0 0 0 44 0 0 4 66666 4 11 4 4 11111111111111 5 8 555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 222 888 2222 888 888 1 9 4 4 11 4 4 7777777777777777777777777777777777777777777 0 0 66666666666666666666666666666666 0 1 0 111111111 0 0 99 7 1 33333 99 777 0 0 0 99 0 00000 0 99 1 0 666666 7 7 999999999999999 99 99 333333333 7 7 7 111111111111111111111111111 4 6 7 6666 99 7 1111 7 7 1111 7 77777777 7 4 33333 22 22 88888 22 0 00 555 00 0 0 0 22222222222222222 7 22 5 7 7 22 7 0 77 88 22 22 0 444444444444 00 0 0 000 0 0 444444444444 6666666666 444 8 22222 8 7 0000 7 55 999999999 0 0 6666 888 444444 7 1111 7 4 99 3 0 2 0 0 0 99 99 0 111111111 99 0 0 0 0 888 0000 00000000000000000000000000000 4 11 111111111 11111 33 66 4 4444 11 0 222222222 0 2222 7 444444 99 0 222 0 0 0 6666 0 55555 0 111 444444 0 99999 00000000 0 6666 0 9 4 22222222222222222222222222222222222222222222 4 4444 1 4444 4 4 888 99999 666 6666 111111111111 111 22222222222222 88 99 2222 5555555 9 111 0 66 99 11111111 444444444444444444444444444444444444444 0000000000000 99 0 0 0 99 0 0 111111111111111111 4 99 6666 88888888888888888888 000 0 66 11111 0 666666666666 0 88888888 444444444444 7 999999999 7 444 7 99 3 7 44 0 2 2 777 2222 7 7 7 2222 99 66 44444444 00000 1111111 4 1111 99 3333333333333333333 5 33333333333333333333 99 4 99 666 99999999 0 222 0 55 0 0 66 7 6 444 4 999 7 7 000 7 8888 777 33 5 88 00 8 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 00 6 44444 888 0 8 0 8 0 2
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TCTAA-TTATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AATC----AAA-A-TG-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--ATT---A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTT-CATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A---TA---T-A-------TTGTAG--GTAAG--CC-T-TTT---A-A--AAGG-C-A-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( family-90 ) : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TCTAAATTATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AATC----AAA-A-TG-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-G-A--AT----A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A---TA---T-A-------TTGTAG--GTAAG--CC-T-TTT---A-A--AAGG-C-A-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|1 : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGAC-CCCGCATGA--GT-T-GTA-ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCATAA-AC----ATATAAA--ACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATGCAAA-TGCAACTTTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTT---------------A-------CC-------AA-A------GA-CAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAA-----TTCAA----CGTAG----TA---GAGC---ACACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----AA---T---A--T-TAAGT---A--T-CAATT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ACA--ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACATGTAA-T-G-TGTCTGTTT--AACA-ACAAAAA-----TA--TTTTTC---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG----TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAA-TTA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT-------AA--TGCA-CA-CT--AGGC---C--AA-C-TAGT-G-----CAATAT------GT-TG--AAAATTTATACT-TAAA--TCGAACTA-T-TT--ATTT--AA--AATCA--AATA-GTGA-ACTTTACTAACG-TGA-CA---CCCC-CCCTC-TCT-----C-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGATATTA-TGAA--G-AATTGTG-TCCTTGTGGGTTA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGC-CATTA-TCTTAATTATTTC-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTGA-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----C-C----AG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--G--CA--G-------G-AGG-----AAA-T-T--T-TCA----TTTTC--TG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAAT-CTT------T--GGC-CA-T-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAG------GTCA--------CCCAA-CTT-----CG-TA-TTG-A-------------CATAA-A----TTATA-TTAACTTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AGA---A-TCAAAA-ACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------A--GTGTTT--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AG-CA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGC----TA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAA-A--AATC----AAT-A--G-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-CTA-C-G-A--AT----A-AAATAAA--A---T--AAACCT----------A-G-TAC---------GGAAGTAATTTAT-TTTTTCATGT-A--TTA-AAT-TAC-AAAATC-ATGCC---GAGGA-----TTA-GTGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGTGGGG------------------------GGGG--G------------------------GG-C-ATTTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGT--ATTGTTTCAGCATATTTT----GTG---ACGGG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACG------ACAGTGTTTT-A--AAG--CAAA-ATGAATAA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAG-CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|10 : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGGG-T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAAATGCAAC-TTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TTTAA----TT-G--TTACCACAGAATCTCG--A-------CCGAGAAGGAC-GCCCCGGGA-AAA-T-T-AC----AA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GAACCACATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AAATTT---AATC-TAAGA---A--TACA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAA-ATAATACC----ATA-CAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTGTTGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTA--AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-T-GTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA--G-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTTTTTTATT--TTT--TTTAA----TTAAA--TGCA-CACCT--AG
gi|11 : gGG--T--A-T-TTCGACGC--G-ATGACTGT-T-GTA-CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GTT--T-GTTTATGCG-GAC-AA-TTT--CCG-AA-A-----ATA-TA----CATTT-CCTC-ATAATATTTT-----TGCA-----CA--CTTTTCT-------TTCGAA--------------TT---------A--TTTATA-GAGTTGT-----T-TT-GAATTTTT-GCGTT----------------A-------CC-------ACAG------GA-AAT-CCT-TCGGCGGA--------AGACGCC---------------CGGGAAAAGACTCGAA----CGACTAACTTCAATGTATATAT----TA---GAGC---CAAACAGATACATAT-GG--TGATCTTAAA----AA---TTTAA--TCTAAG----A--T-AG-TTCAG-CCATTA-TATGTTAACAAAATA-A-----TA-CGATACTTG-TAAAAATAT-AGAA-TATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACGAATT-----TT--TTTTTT---AAAAATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--------------------------AT-TGTT-T-GT------------GGT--CA--CT----T----CGACC-AATA-TGT------------------------------AAATAAAA-TG-T--TTCTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-AT---------AAAC-ATTTG-TGT-----GT--GACAATTTCT----TTAAA--T
gi|11 : ggtagcgtgtacgtggtactggT------GTGTG--ACAATTT-C-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CC-AATTT--AA--AATCA--Acgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaattttttttttaaaaatcggtcgaagttaccattgtttgtggtcacttcgaccaatatgtaaataaaatgtttctgtttgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAT-TGGG--T--AATCTTCGAC-T--C-GTGA-TGT-TTGTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--TTGT--AT-CA-GACCAA-TTT-TCCG-AGGA-----ATG-AAA--ACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------GCAAA-TGCA----TTTGA------ATTTGAT--------------T----------G--TTACACAGAAAT-C-----T-TC-GA----CC-G--AG----------------AAGACGCCCC-------GG-G------GA-AAT---T-AC----GA--------A-----A---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GACACA-AGACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---TTTAA--T-CAAGT---AATT-CA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ATACCATACCAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-AC-AAAA-----CATTTTTTTT---TTAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCAC--TAGACA--CAA-TTT-----Ttat
gi|13 : gg-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT----GA----TTTGA-T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AATCC-T-TC----G---------A-----C---------------CG-------------A----GAA
gi|13 : gttt-------CC-------AA-G------AA-AAT---T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAGATATTA---AAGC---GAACCT-ATGCTTAT-AGATT-AT-TTAAA----A----T---C--T-AAAGCCGTA--T--A-TT-------TTG-T--GTTAAC--------------------------CCCAAATA-----AATATTTGATTAAAAT--------ATGTAA-TTA-TGGCCGTTCTCAACA-ACAAAAAACATTTA--TTTTTC---AAAAATCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--C--TAG-CA--CGA-TT-------ATCTGAT-TG-TA-----------AGT--AAGCTT----T----TGACCCAATA-TGT--------------------------AAAA------AA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTA-TTT-----gaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|14 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgccccAG-CGTGGTCTAACTTCGACTGA-TT
gi|14 : --T--AAC-TTCGAC-T--G-ATTA-TGT-T-TTA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTTCCCCC-ATTGTGTT-------T------TGCACCCTTTTCT------CTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-CA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GACAGAGAAGA-----CGCCCCAAGAAAATTACG-------------AACGACAACT---TTCAA---ACGTAATTT-TA---AAGC---GAACCA-ATGCCTAT-GA--T-AT-TT-GA----AA---T------T-TAAGC-----------------C-ATTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-T--T---TATCAAAAAT-TAAAA-----TT-AGTAAAA-T-----ATACATA---TG-T---CGTTC--AACatgttttactccagtatttttagttcactgtttgtatcagacaattttccgaaaataaaaacatttcccccattgtgttttgcacccttttctcttcgaattatttaatacagttgtttgattttcattgttaccacggaaatcctcgacagagaagacgccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtaattttaaagcgaaccaatgcctatgatatttgaaatttaagccattattgttaacaaaataaatatttatcaaaaattaaaattagtaaaatatacatatgtcgttcaac
gi|15 : agcgtggtcTGTAA--ATAAG--CC-T-TTT---TTA--AAGG-C-C-ATTTGGGTGCCAAAT-C-T-AGTT-TATT-TAGC--ATTGCT--AGTAATTTTT-T-GGCG---AAGAGAGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGT---CT-GCCAC-TGA--T-------C-------------------------T--------ACC------GTGTTTTTTT------------------A-AA-----AATTGGCCT--G----------------CGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGG-GGTA
gi|16 : G---GGTCTATTG----AAAT---CTTGCCA--TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------TG---------ACC------ACGTTGTTTTTA--AAG--C--ATATGAA-AATTAAAAATCGGCTT--GCGTTTTGGACGG-AACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|17 : -TTG-A-------------TAT--------TTGTA-TTA---TAT-A-T----TTTTGTT-AATACA----A-GA-A---AAA------CCAAT-ACTTG----AAGAAG--------C---AG-AA--ACGAGTA----------------GATC---TAT--C---GTG---T--TCTCC----TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------AT-AGAC----GAGAA----AAATCGC--AC-T------GCC--ATA-GA-AGA-------------------------A--AATC----AAA-A-T------T-GTTCT---CA-ATTG-TA-AA---GTTTA-C-G----CT----AGAAAGAAA--A---agtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|18 : A-AC-----AAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGT
gi|19 : gtattcaatacagacgtgaaactCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GTctatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
gi|19 : G-TTTTA-AAA-CCTG-ACAAAA--ATT--AATT-ACTCATGCACA-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-AATTCAT-A--TA-----T--------------------A--GT-CA--G-------GAAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCtttaaaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|2 : ctggatattggaatgacaaagctcaGTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGTT--G-TT--AT-CAAGAC-AT-TTTATTCG-AA-A-----ATA-AAAGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAAC---TTCT------CTTCAAAA-------------T----------GGTTTT----GA----T-----T-T--GA----TT-G--TT----------------A-------C--------AC-A------GA-AA-----------------------------------------------------------A----TA-CTA--TTCGA---CCG-AG----AA---GACCCCGGAA--A-AT-----------T--T-TCAAATCGTAA---T---A-----AAGC---A--C-CA-T---A-C--TTA-TGTATT--TAAAA---A----ATT-TAAT---TT-----AATA---GAAATATTT-ATTAAAATT-----A-ATGTAAATTG-TGTTCGTTT--AACACACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAGTTCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TG-----------GG---AA--CT----T----CGAAC-AA-A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TA-TGGTTCTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAGC-TTTTAGTTT-----GT--TTT--GTTAT----CTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCAAAAC-TAGTTG-----C---AT------GT-TGTGAAGAATTAC-TT-TAAA--TCGAATTAAT-CTTGATTT--AA--A-TCA--AATA------------CTCACG-TGA-CA---ACGGGCCCTC-CTTCAT-CC-------G-AGAT--TC-----AAA-CTAATAAAA--AT-ACTGCTGAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCTTTGTGTA-AA----ATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATCTAA-TTATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATTCATC----CA----AAG--AGAG-ATTTGTTAC-A---TAT-GGTTAG----T--------------------G--GT-CAAGG-------G-AGG-----AA--TAT--T-TCA----TT---CTTG-TAA-----C----G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CATTGAC-TGGCTGTGTTGAAT------AG-T-----TTAACT-G-TTA------A-TACAGT--T--GTCA--------CC-AA-CTTC----CG-TAATTG-A-------------CAT---------------------------GAA-TTTT--TGAAGACA----A-AA-ACACAAA---A-TTCAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCGG-TGC--T--CCTTCTT---C-AGA-A--TG--------TTG------C---T------------------------------A-----G---A----AAATCGC--AG-CGACA-AGCC--ATA-GA-AGATC-------TA---TAC-AGAGAAAA--AATC----AAA-A-TG-----TTG---T---CA-A-TG-TATAA---G-TTA-A-C-A--ATTATTA-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTAT-TTTT-CATGT-A--TCA-AAT--ACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--AA-TCA--G-----TGACA-----AT---CC--AGAA-TTT----T--AAA-------------------GGGGGGG-CA-AGTATA---TTA-------TTGTAG--GTAAG--CCAT-TTT---A-A--AAGG-CCA-TTTTTGATGCCAAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-GGGG---
gi|20 : gA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTT-A-----TGCTA---GCAACTTTTTCTCTGCGGCTTCGAA--------------T----------
gi|21 : tttgtcataagaacatacttaattcacgAA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT---CC--AGAAATTT----TAAAAA-------------------GGGGGGGGGG-G---TG---C-A-------TTGTAG--GTAAG--CC-T-TTTC--A-A--AAGGTC-A-TTTTGGGTGCCAAATAT-GGAGTT-TTAT-Ttatgttaaatacagattatgtaat
gi|22 : -C-A-TTTTGGGTGCTAAAT-CTGGAGTT-TTAA-TGAC--ATT-TTT-AGTAAATGTT-T-GGCG---AAGAG-GGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATAT---CC-GCCAC-TG
gi|23 : cA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TT---------A--TTT----GA----TACAGTTGTT-AG----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GA--------A-----
gi|25 : AACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---AAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----Aaagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|26 : T-CA--G-------G-AAA-----AAAATAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-
gi|3 : T------GG-TG--GAAATTTAT-TT-TAAA--TCGT-TTG-TTCT-GATTT--AATAAATCATTATTACGCGATCC----CC--CGCTGG-CT---CCCC-CCCCCATCTCAC-CCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AA-AAAAGA-T-TATGCGAAATGTATTA-TGAAATCGAATTGGG-T--TTCTGGG-TAGTCAATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GTT-TAACA----TGCACATTA-TCTAA-TTATTTT-CAA-CA-A-TTTTA-AAATCTTG-ACAAAA---TT--AATT-ATT----CACA-AAAGGAAGAGGATT-GT-AC-A---TAT----TAT----TCCAGCTTATAAGAATCTTCGA--GT-CA--G-------G-AAG-----AAA--AT--C-ACA----TTTTC-TTG-TAAA----T----G-AG-----TACT-CTT------T--GGC-CATG-AC-TG-CT-TGT-GGATT----TAG-G-----TTTTAT-A-TTATATATTA-TACAGC--C--GTC----------CAAA-CTTC-----G-TA-TTG-G-------------CAT---A----C---A-TTAA-TGAT-ACTGAA-TTTT----AAGACA----A-GA-A---AA------TCAAAA--CTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTT--GTAG--CTGGTT----C--TCTCCTT---C-AGACA--TG--------TTG------CCTTTT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C--------A---TACTAGAGAAGATAAATC----AAA-A-TG-----T-T---T---CATA-AA-TT-AA---G-TTAAC------AT----T-AAATAAA--A---CTAAAACCT----------TTG-TAC---------GGTAGTAATTTAT-TT---CATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA-TCATTGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--TCA--G-----TGACA---G-AT----C--AGAAATTT----T--ACA--------------------GGGGGGGCA-A---TA---T-A-------TTGTAG--GT--G--CC-T-TTA---A-A--AAGG-C-ATTTTTGGGTGCCAAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTA-ATGGTTT-A-CAAGTTTTAT-GATGGA-AAAAG-AGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-G-CAG-TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AATGT--------ACC------CC----TCTT-----CG--C----------AA-----GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTA-CC----T-GA--TCATCC-AAGTCGTCGA-TGTAGCGGAGGT
gi|4 : -TTGG--TCTAAC-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T--TA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GGC-A--TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTC-CCCC-ACTATGTT-------T------TGCAACCTTT-CT------CTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTACCACGGAAATCCTCGA-------CCGAGAAG-AC-GCCCCAAGA-AAT-T-T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TATTAAAGC---GAACCA-ATGCTTATTGA--T-AT-TTAAA----A----T------C-TAAGC-----------------C-GTTAAT-TGTTAACAAAA-----------------------------AT---AAATATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTA-TGTCCGTTC--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTTTCAAAAATCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TA-----------AGT--AA--CT----T----TGACC-AATA-TGT--------------------------TAAAA--------TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTATTTT-----GT--TTT--TTTTT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGGA-C-TAGT-G----------T------GT-TG--AAAA-TTAC-TT-TAAA--TCAAATTA-TACT-GATTTA-AA--AATCA--AATA-------------TAGCGCCGACCA---CCCC-CCCCC-CCCCACTCT-------CCAGAT--TC------AAACTAATAAAAAA---TATGCG-AAAGTATTA-TGAA--C-AATTGG-------------------ATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA---ACA----TGCACATTA-TC-AAATTATTTT-C-AGCATGTTTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACGAAAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----TTCCAACAGTTAATAATCTTAA--GT-CA--G-------G-AAA-----AAA--ATA-T-TCA----TTTT-CTTG-TAAA----C----G-AAG----TACT-CTT------T--GGC-CATG-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-A-TT-------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTT----CGATA-TTGCA-------------CGC---A-----TACATTTGA-TTAT-A-TGAATTTTT--T-AAGAC-----A-GA-A---cccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|5 : A----ATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGTA-TTACA----TGCACATGA-TCTAATTTATTTT-CAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATT-ATC----CA----AAG--AGAG-GAT-GT-AC-A---TAT-GATTAAGCTTC--------------------GACGT-CA--G-------G-GGATGGGAAAA-TAT--T-TCC----ATTTCTTTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTACT-CTT------TTAGGC-CATT-ACCTG--T-TGTTGGATT----TAG-GTAATTTTCACTCGTTTA------A-GTCAGT--CTTGTCAC-------CCCAA-CTTCCGCTCG-TA--TG-A-------------CAT---ACCATTTATA-TTAA-TTAT-A-TTGA-TTTT--T-AACGCACAAGA-GA-A---AAA---A-TCAAAA-CTTTGAAAAAAGAAGCCACAGATC---AGAAACTGCATGTA-TTTTCGTCTCC--GTGTTTG-GTAG--CT-GGTG-------CTCCCT--TCAAGACATTTG--------TTG------C---TT-TTGTATTTTTTAACTATAGTACGG--AGAA----A---A----AAATCGC--ACTTG-CA-AGCCCAAAG-GA-AGA-CATATTATTA---CAG-AGAGAAGA--AATC----AAA-ATTGTTCCTT-G---T---CATATTGTTA-AA---G-TTA-CAG-A--TT----A-AAAAGAA--AGATT-AAAACCT----------T-GTTACTAATGGTAGGATAGTAATGTATATTTATCATGTCATTTTATAATATAC-AAAATCATTGCCCCTGAGGAATTTTTTAGATGTTGTGGCTGGAACAGGGGAAAGA--TCA--GAAAGTTGACA---GCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCT--AAA-------------------GCGGcag
gi|6 : aggattacgggtacttttgaaattaTT------T--GGCACAG--AC-TGATT-TGTTAGATTATATTGA-G-----TAAACTCG-TTA------AATACAGTAAT--GTCAAAACCCACCTCAATCTTCA---TA-TA-TAG-AAAACTTTCATTTTTAT---A----TAACA-TTAA-TAATGA-T-AA-TTTTA-T-AAGAAA----AAGA-A---CAA---C-TCAAA---CTTGC---AAGAAG------------AGAAC--ACGCGAAAT---------CAAGTATTT--GTAG--CTG--TTC--TAATCTC-TT--TC-AGAAAC-TG--------TAG------C---TTAT----------------------GG-AGACTCAGA---A----AAATAGC--ACATG-AACAGCC--ATA-GATAGA---------TAAACTAC-AGAGAAGA--AAACCACAAAACA-TA-----T-G---TTCCCA-A-TGCTA-AACAGG-TTA-CTGTA--AC----A-ATATATA--A---A-AAGACCTAACACCTATAT-G-TAC---------GGT-GTAAATAAT------------A--TTA-AAT-TACACAACTAAACGC----GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT---C---AACAATTT----T--AAAAAGGGAGGGGAGGAGAGGGGGGAGGGGCAGA---TA---T-AAAATAAATTGTAAAAGTAAGGACC-T-TTTTTTA-A--AAGA-C-T-ATTTGGGTGCCAAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGTA-ATTTT-TAGGTGAATAAAAA-AAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAGACC-GATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGCAC--A-ATGAA-AA-----AATCt
gi|7 : actacaaA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGT-AA----ATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TCTAA-TTATTTT-CAA-CATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CAC--AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------GGAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTTGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAGT--T--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---------------------------GAA-TTTT--T-GAGACA----A-AA-A---AAA---AATCAAAA--CTTG----AAGAAG--------CTGCAGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCTGGT--------CTCCTTCTTC-AGACA--TG--------TTG------C---T------------------------------AC----G---A----AAATCGCCAGC-TG-CA-AGCC--ATAAGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AATC----AAA---TG-----T-G---T---CA-A-TG-TT-AA-----TTA-C-A-ATTATT---A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTAT-TTTTCCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTT--ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--AATTCA--G-----TGACA-----AT---CC--AG-AATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-G---TATATT-A-------TTGTAG--GTAAG--CCATATTT---A-AGTAAGC-C-A-TTTTTGATGCAAAAT-C--GAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-G
gi|8 : AC-TTCTAAAGGTCGAATTA-TACT-GATCTTGAA--AATCA--A-TA------CC----CTAGCAATGA-AATTTCCCC-CCGCC-CCTC-T-CT-------CCAGAT---C-----AAAA---ATACAA--ATATATGCGAAAAGTATGAGTAAG--C-AATTGGGCTCCTTGTAAG-TA----ATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GTT-TTACACAAGTGCAC-TTA-TCTAATTTATTT--CACACATC-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--TATT-ATC----C-CG-AAAG--AGAG-ATT-GT-ACAA---TATCG--TAG----T--------------------G--GTGCA--GTTGGAGCA-AGG-----AAA-TATAATATCACTATTTTTTCTTG-TAAA----C----GAAAGT-A-TATT-CTCACATTGT--GGC-CATT-GC--G-CT---TTG---T----TAGTG-----TTAA-------A------A-TCCAGT--T--GTCAAC------CTCAA-CTTC----CG-TATTTG-A-------------CATAAAA----TCAT--TTAC-TTTT-A-TCAA-TATT--T-AA---A----A-GACA---AGATTCA-TCACAATACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--A-GAGTA-T---------C--GTACAT--GTAGAATTAGGTTCTGC--TATCCCT--TC-AG-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT-TC---------------------ATCAGAC----G---AGAAGAAATCGCA-AC-TG-CA-AG-C--ATA-AA-------------T-------------AGA--AATC----AAA-A-TG-----T-C---G---CAGA-TG-T--AA---T-TTA-C-A-G--ATTCAAA-AGATAAAATA---G-AAAATCT----------T-G-T-C----------GTAGTAAATTAT-TTTTGGATGT-A--TTC-AA--TACAGA
gi|9 : c--T--AATGTTCGAC-G--G-ATGA-TGTAT-GTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GAC-AAGTTT-TCCG-AA-ATAAAAAAA-AAA--ACATTT-CCCCCATTATGTTAA-----TGCCAA-TATGGC------------------AA--------------T-------------TTT----GA----T-----T-TT-GA----TTGG--TT----------------A-------CC-------AC-GCA----GATAAT-C-TGTC----AG--------A-----C---------------CG-------------A----
gi|9 : -A-AGTT-A--C-C--TATTAG-CAGCCAA-TTTCTTAATAT-TGTTCTGATGCATTTATCTTTGGTTAAA--CTGGACTGGCGCAACA-AATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGTGTT--TTTTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATAGTATAGGAATAACAAACTATTTT-TTT-----TTTATTT--TTTATTAGATTAAATTTGCACCACCTTAAGGCATGCCCAA-CTTAGT-GTCAAAC---ATGTGTGGGT-TG--AAAATTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 11111 22222222222222 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666 1 55555555555555555555555555555555 222222222 11111 111 1 11111 111111 333333333333333 111111111 666666666666666666666666666 1111 1111 1111 22222222 1 11111 11111 11 111 1 1 1 55555555555555555 2 11 888888888888 1 111 333333333333 2222222222 111 22222 1111 111111111 1111 111111 1111 222222222 1111 88888888888888888888888888888 111111111 11111 11 11 111111111 1111 111111 1 1111 11111 111 111111 11111 33333333 1111 55555555555555555555555555555555555555555555 1111 11111 111 1111 222222222222 111 22222222222222 11 3333333 111 11 11111111 777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 11 1 333333333333333333 222222222222222222222 111 1 11111 1 33333 11111111 222222222222 222222222 111111 111 1111 1111 11 11111 111111 1111 1111 4444444444444444444 333333333333333 111 22222 111111 111 1 11 111 111 2222 111 11 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 111
lowQualScore : 8 3 0 6 11 66 0 9999 5 5 5 5 5 5 5 6 66 5 66 0 5 5 55 5 5 4 55555 4 66 4 4 44444444444444 3 8 000000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 222 777 7777 777 777 1 8 1 4 66 4 4 9999999999999999999999999999999999999999999 5 0 55555555555555555555555555555555 2 0 5 777777777 5 5 66 5 0 44444 77 555 5 5 0 66 5 22222 5 66 3 5 222222 5 5 777777777777777 77 77 555555555 0 5 5 333333333333333333333333333 1 1 5 1111 77 5 2222 5 5 2222 5 00000000 5 1 44444 99 99 55555 99 8 11 777 99 0 0 0 22222222222222222 6 99 3 6 6 99 6 0 77 55 99 99 6 444444444444 77 5 8 444 8 8 222222222222 2222222222 111 0 88888 3 6 0000 6 33 888888888 5 5 0000 888 444444 5 2222 5 5 5 5 9 5 0 5 5 5 66 66 5 444444444 66 5 5 5 5 888 7777 99999999999999999999999999999 4 66 555555555 11111 66 00 4 9999 77 5 333333333 5 3333 5 444444 66 5 888 5 0 5 0000 5 22222 1 222 444444 5 44444 00000000 5 5555 5 8 4 77777777777777777777777777777777777777777777 4 1111 1 9999 4 4 777 66666 444 5555 333333333333 888 55555555555555 88 66 7777 3333333 0 000 5 44 11 88888888 666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 11 0 5 5 66 5 5 666666666666666666 1 66 888 000000000000000000000 666 0 88 33333 0 00000 2 888 5 99999999 555555555555 5 222222222 999 333333 5 77 2 5 77 5 3 7 111 4444 88 6 6 4444 77 33 77 44444 111111 4444 77 5 2222 77 4444444444444444444 2 666666666666666 000 77 1 77 11111 111111 5 222 5 0 2 5 5 33 5 6 999 1 777 5 5 000 6 0000 111 77 2 11 11 0 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 0 99999 111 8 0 8 3 8 3
lowQualScore : . . . . .. .. . .... . . . . . . . . .. . .. . . . .. . . . ..... . .. . . .............. . . ...... ............................................................................................................................................................................. .... ... ... .... ... ... . . . . .. . . ........................................... . . ................................ . . . ......... . . .. . . ..... .. ... . . . .. . ..... . .. . . ...... . . ............... .. .. ......... . . . ........................... . . . .... .. . .... . . .... . ........ . . ..... .. .. ..... .. . .. ... .. . . . ................. . .. . . . .. . . .. .. .. .. . ............ .. . . ... . . ............ .......... ... . ..... . . .... . .. ......... . . .... ... ...... . .... . . . . . . . . . . .. .. . ......... .. . . . . ... .... ............................. . .. ......... ..... .. .. . .... .. . ......... . .... . ...... .. . ... . . . .... . ..... . ... ...... . ..... ........ . .... . . . ............................................ . .... . .... . . ... ..... ... .... ............ ... .............. .. .. .... ....... . ... . .. .. ........ ....................................... ............. .. . . . .. . . .................. . .. ... ..................... ... . .. ..... . ..... . ... . ........ ............ . ......... ... ...... . .. . . .. . . . ... .... .. . . .... .. .. .. ..... ...... .... .. . .... .. ................... . ............... ... .. . .. ..... ...... . ... . . . . . .. . . ... . ... . . ... . .... ... .. . .. .. . . ................................................................................ .. . ..... ... . . . . . .
lowQualScore : 0 8 8 7 99 99 0 0000 0 0 0 0 0 0 1 5 99 0 99 0 0 0 44 0 0 4 66666 4 11 4 4 11111111111111 5 8 555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 222 888 2222 888 888 1 9 4 4 11 4 4 7777777777777777777777777777777777777777777 0 0 66666666666666666666666666666666 0 1 0 111111111 0 0 99 7 1 33333 99 777 0 0 0 99 0 00000 0 99 1 0 666666 7 7 999999999999999 99 99 333333333 7 7 7 111111111111111111111111111 4 6 7 6666 99 7 1111 7 7 1111 7 77777777 7 4 33333 22 22 88888 22 0 00 555 00 0 0 0 22222222222222222 7 22 5 7 7 22 7 0 77 88 22 22 0 444444444444 00 0 0 000 0 0 444444444444 6666666666 444 8 22222 8 7 0000 7 55 999999999 0 0 6666 888 444444 7 1111 7 7 7 7 3 0 2 0 0 0 99 99 0 111111111 99 0 0 0 0 888 0000 00000000000000000000000000000 4 11 111111111 11111 33 66 4 4444 11 0 222222222 0 2222 7 444444 99 0 222 0 0 0 6666 0 55555 0 111 444444 0 99999 00000000 0 6666 0 9 4 22222222222222222222222222222222222222222222 4 4444 1 4444 4 4 888 99999 666 6666 111111111111 111 22222222222222 88 99 2222 5555555 9 111 0 66 99 11111111 444444444444444444444444444444444444444 0000000000000 99 0 0 0 99 0 0 111111111111111111 4 99 888 666666666666666666666 000 0 66 11111 0 11111 2 888 0 88888888 444444444444 7 999999999 444 666666 7 99 3 7 44 0 2 2 777 2222 33 7 7 2222 99 66 99 33333 000000 3333 99 0 1111 99 3333333333333333333 5 777777777777777 000 99 4 99 66666 999999 0 222 0 0 5 0 0 66 7 6 444 4 999 7 7 000 7 8888 777 33 5 88 00 8 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 00 6 44444 888 0 8 0 8 0 2
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-GA--ATT---A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A---TAT-------ATT---GT--AGGTAAG--CC---T-TTT-A-A--AAGG-C-A-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( family-90 ) : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-GA--ATT---A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A---TAT-------ATT---GT--AGGTAAG--CC---T-TTT-A-A--AAGG-C-A-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|1 : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGAC-CCCGCATGA--GT-T-GTA-ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCATAA-AC----ATATAAA--ACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATGCAAA-TGCAACTTTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTT---------------A-------CC-------AA-A------GA-CAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAA-----TTCAA----CGTAG----TA---GAGC---ACACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----AA---T---A--T-TAAGT---A--T-CAATT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ACA--ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACATGTAA-T-G-TGTCTGTTT--AACA-ACAAAAA-----TA--TTTTTC---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG----TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAA-TTA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT-------AA--TGCA-CA-CT--AGGC---C--AA-C-TAGT-G-----CAATAT------GT-TG--AAAATTTATACT-TAAA--TCGAACTA-T-TT--ATTT--AA--AATCA--AATA-GTGA-ACTTTACTAACG-TGA-CA---CCCC-CCCTC-TCT-----C-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGATATTA-TGAA--G-AATTGTG-TCCTTGTGGGTTA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGC-CATTA-TCTTAATT-ATTTC-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTGA-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----C-C----AG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--G--CA--G-------G-AGG-----AAA-T-T--T-TCA----TTTTC--TG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAAT-CTT------T--GGC-CA-T-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAG------GTCA--------CCCAA-CTT-----CG-TA-TTG-A-------------CATAA-A----TTATA-TTAACTTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AGA---A-TCAAAA-ACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------A--GTGTTT--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AG-CA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGC----TA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAA-A--AA---TCAAT--A--G-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-CTA-C-GA--A-T---A-AAATAAA--A---T--AAACCT----------A-G-TAC---------GGAAGTAATTTATT-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TAC-AAAATC-ATGCC---GAGGA-----TTA-GTGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGTGGGG-----------------------GG--GGG------------------------GG-C-ATTTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGT--ATTGTTTCAGCATATTTT----GTG---ACGGG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACG------ACAGTGTTTT-A--AAG--CAAA-ATGAATAA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAG-CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|10 : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGGG-T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAAATGCAAC-TTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TTTAA----TT-G--TTACCACAGAATCTCG--A-------CCGAGAAGGAC-GCCCCGGGA-AAA-T-T-AC----AA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GAACCACATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AAATTT---AATC-TAAGA---A--TACA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAA-ATAATACC----ATA-CAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTGTTGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTA--AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-T-GTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA--G-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTTTTTTATT--TTT--TTTAA----TTAAA--TGCA-CACCT--AG
gi|11 : gGG--T--A-T-TTCGACGC--G-ATGACTGT-T-GTA-CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GTT--T-GTTTATGCG-GAC-AA-TTT--CCG-AA-A-----ATA-TA----CATTT-CCTC-ATAATATTTT-----TGCA-----CA--CTTTTCT-------TTCGAA--------------TT---------A--TTTATA-GAGTTGT-----T-TT-GAATTTTT-GCGTT----------------A-------CC-------ACAG------GA-AAT-CCT-TCGGCGGA--------AGACGCC---------------CGGGAAAAGACTCGAA----CGACTAACTTCAATGTATATAT----TA---GAGC---CAAACAGATACATAT-GG--TGATCTTAAA----AA---TTTAA--TCTAAG----A--T-AG-TTCAG-CCATTA-TATGTTAACAAAATA-A-----TA-CGATACTTG-TAAAAATAT-AGAA-TATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACGAATT-----TT--TTTTTT---AAAAATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--------------------------AT-TGTT-T-GT------------GGT--CA--CT----T----CGACC-AATA-TGT------------------------------AAATAAAA-TG-T--TTCTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-AT---------AAAC-ATTTG-TGT-----GT--GACAATTTCT----TTAAA--T
gi|11 : ggtagcgtgtacgtggtactggT------GTGTG--ACAATTT-C-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CC-AATTT--AA--AATCA--Acgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaattttttttttaaaaatcggtcgaagttaccattgtttgtggtcacttcgaccaatatgtaaataaaatgtttctgtttgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAT-TGGG--T--AATCTTCGAC-T--C-GTGA-TGT-TTGTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--TTGT--AT-CA-GACCAA-TTT-TCCG-AGGA-----ATG-AAA--ACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------GCAAA-TGCA----TTTGA------ATTTGAT--------------T----------G--TTACACAGAAAT-C-----T-TC-GA----CC-G--AG----------------AAGACGCCCC-------GG-G------GA-AAT---T-AC----GA--------A-----A---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GACACA-AGACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---TTTAA--T-CAAGT---AATT-CA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ATACCATACCAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-AC-AAAA-----CATTTTTTTT---TTAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCAC--TAGACA--CAA-TTT-----Ttat
gi|13 : gg-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT----GA----TTTGA-T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AATCC-T-TC----G---------A-----C---------------CG-------------A----GAA
gi|13 : gttt-------CC-------AA-G------AA-AAT---T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAGATATTA---AAGC---GAACCT-ATGCTTAT-AGATT-AT-TTAAA----A----T---C--T-AAAGCCGTA--T--A-TT-------TTG-T--GTTAAC--------------------------CCCAAATA-----AATATTTGATTAAAAT--------ATGTAA-TTA-TGGCCGTTCTCAACA-ACAAAAAACATTTA--TTTTTC---AAAAATCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--C--TAG-CA--CGA-TT-------ATCTGAT-TG-TA-----------AGT--AAGCTT----T----TGACCCAATA-TGT--------------------------AAAA------AA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTA-TTT-----gaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|14 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgccccAG-CGTGGTCTAACTTCGACTGA-TT
gi|14 : --T--AAC-TTCGAC-T--G-ATTA-TGT-T-TTA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTTCCCCC-ATTGTGTT-------T------TGCACCCTTTTCT------CTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-CA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GACAGAGAAGA-----CGCCCCAAGAAAATTACG-------------AACGACAACT---TTCAA---ACGTAATTT-TA---AAGC---GAACCA-ATGCCTAT-GA--T-AT-TT-GA----AA---T------T-TAAGC-----------------C-ATTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-T--T---TATCAAAAAT-TAAAA-----TT-AGTAAAA-T-----ATACATA---TG-T---CGTTC--AACatgttttactccagtatttttagttcactgtttgtatcagacaattttccgaaaataaaaacatttcccccattgtgttttgcacccttttctcttcgaattatttaatacagttgtttgattttcattgttaccacggaaatcctcgacagagaagacgccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtaattttaaagcgaaccaatgcctatgatatttgaaatttaagccattattgttaacaaaataaatatttatcaaaaattaaaattagtaaaatatacatatgtcgttcaac
gi|15 : agcgtggtcT---GT--AAATAAG--CC---T-TTT-TTA--AAGG-C-C-ATTTGGGTGCCAAAT-C-T-AGTT-TATT-TAGC--ATTGCT--AGTAATTTTT-T-GGCG---AAGAGAGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGT---CT-GCCAC-TGA--T-------C-------------------------T--------ACC------GTGTTTTTTT------------------A-AA-----AATTGGCCT--G----------------CGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGG-GGTA
gi|16 : G---GGTCTATTG----AAAT---CTTGCCA--TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------TG---------ACC------ACGTTGTTTTTA--AAG--C--ATATGAA-AATTAAAAATCGGCTT--GCGTTTTGGACGG-AACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|17 : -TTG-A-------------TAT--------TTGTA-TTA---TAT-A-T----TTTTGTT-AATACA----A-GA-A---AAA------CCAAT-ACTTG----AAGAAG--------C---AG-AA--ACGAGTA----------------GATC---TAT--C---GTG---T--TCTCC----TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------AT-AGAC----GAGAA----AAATCGC--AC-T------GCC--ATA-GA-AGA-------------------------A--AA---TCAAA--A-T------T-GTTCT---CA-ATTG-TA-AA---GTTTA-C-G----CT---AGAAAGAAA--A---agtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|18 : A-AC-----AAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGT
gi|19 : gtattcaatacagacgtgaaactCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GTctatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
gi|19 : G-TTTTA-AAA-CCTG-ACAAAA--ATT--AATT-ACTCATGCACA-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-AATTCAT-A--TA-----T--------------------A--GT-CA--G-------GAAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCtttaaaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|2 : ctggatattggaatgacaaagctcaGTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGTT--G-TT--AT-CAAGAC-AT-TTTATTCG-AA-A-----ATA-AAAGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAAC---TTCT------CTTCAAAA-------------T----------GGTTTT----GA----T-----T-T--GA----TT-G--TT----------------A-------C--------AC-A------GA-AA-----------------------------------------------------------A----TA-CTA--TTCGA---CCG-AG----AA---GACCCCGGAA--A-AT-----------T--T-TCAAATCGTAA---T---A-----AAGC---A--C-CA-T---A-C--TTA-TGTATT--TAAAA---A----ATT-TAAT---TT-----AATA---GAAATATTT-ATTAAAATT-----A-ATGTAAATTG-TGTTCGTTT--AACACACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAGTTCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TG-----------GG---AA--CT----T----CGAAC-AA-A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TA-TGGTTCTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAGC-TTTTAGTTT-----GT--TTT--GTTAT----CTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCAAAAC-TAGTTG-----C---AT------GT-TGTGAAGAATTAC-TT-TAAA--TCGAATTAAT-CTTGATTT--AA--A-TCA--AATA------------CTCACG-TGA-CA---ACGGGCCCTC-CTTCAT-CC-------G-AGAT--TC-----AAA-CTAATAAAA--AT-ACTGCTGAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCTTTGTGTA-AA----ATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATC-TAATT-ATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATTCATC----CA----AAG--AGAG-ATTTGTTAC-A---TAT-GGTTAG----T--------------------G--GT-CAAGG-------G-AGG-----AA--TAT--T-TCA----TT---CTTG-TAA-----C----G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CATTGAC-TGGCTGTGTTGAAT------AG-T-----TTAACT-G-TTA------A-TACAGT--T--GTCA--------CC-AA-CTTC----CG-TAATTG-A-------------CAT---------------------------GAA-TTTT--TGAAGACA----A-AA-ACACAAA---A-TTCAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCGG-TGC--T--CCTTCTT---C-AGA-A--TG--------TTG------C---T------------------------------A-----G---A----AAATCGC--AG-CGACA-AGCC--ATA-GA-AGATC-------TA---TAC-AGAGAAAA--AA---TCAAA--A-TG-----TTG---T---CA-A-TG-TATAA---G-TTAAC-AATTATT---A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TCA-AAT--ACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--AA-T--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AGAA-TTT----T--AAA-------------------GGGGGGG-CA-AGTATATT------ATT---GT--AGGTAAG--CCA--T-TTT-A-A--AAGG-CCA-TTTTTGATGCCAAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-GGGG---
gi|20 : gA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTT-A-----TGCTA---GCAACTTTTTCTCTGCGGCTTCGAA--------------T----------
gi|21 : tttgtcataagaacatacttaattcacgAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAAA-------------------GGGGGGGGGG-G---TGC-------ATT---GT--AGGTAAG--CC---T-TTTCA-A--AAGGTC-A-TTTTGGGTGCCAAATAT-GGAGTT-TTAT-Ttatgttaaatacagattatgtaat
gi|22 : -C-A-TTTTGGGTGCTAAAT-CTGGAGTT-TTAA-TGAC--ATT-TTT-AGTAAATGTT-T-GGCG---AAGAG-GGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATAT---CC-GCCAC-TG
gi|23 : cA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TT---------A--TTT----GA----TACAGTTGTT-AG----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GA--------A-----
gi|25 : AACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---AAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----Aaagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|26 : T-CA--G-------G-AAA-----AAAATAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-
gi|3 : T------GG-TG--GAAATTTAT-TT-TAAA--TCGT-TTG-TTCT-GATTT--AATAAATCATTATTACGCGATCC----CC--CGCTGG-CT---CCCC-CCCCCATCTCAC-CCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AA-AAAAGA-T-TATGCGAAATGTATTA-TGAAATCGAATTGGG-T--TTCTGGG-TAGTCAATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GTT-TAACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAA-CA-A-TTTTA-AAATCTTG-ACAAAA---TT--AATT-ATT----CACA-AAAGGAAGAGGATT-GT-AC-A---TAT----TAT----TCCAGCTTATAAGAATCTTCGA--GT-CA--G-------G-AAG-----AAA--AT--C-ACA----TTTTC-TTG-TAAA----T----G-AG-----TACT-CTT------T--GGC-CATG-AC-TG-CT-TGT-GGATT----TAG-G-----TTTTAT-A-TTATATATTA-TACAGC--C--GTC----------CAAA-CTTC-----G-TA-TTG-G-------------CAT---A----C---A-TTAA-TGAT-ACTGAA-TTTT----AAGACA----A-GA-A---AA------TCAAAA--CTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTT--GTAG--CTGGTT----C--TCTCCTT---C-AGACA--TG--------TTG------CCTTTT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C--------A---TACTAGAGAAGATAAA---TCAAA--A-TG-----T-T---T---CATA-AA-TT-AA---G-TTAAC-----ATT---A-AA-TAAA--A---CTAAAACCT----------TTG-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TT----C-ATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA-TCATTGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT----C--AGAAATTT----T--ACA--------------------GGGGGGGCA-A---TAT-------ATT---GT--AGGT--G--CC---T-TTA-A-A--AAGG-C-ATTTTTGGGTGCCAAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTA-ATGGTTT-A-CAAGTTTTAT-GATGGA-AAAAG-AGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-G-CAG-TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AATGT--------ACC------CC----TCTT-----CG--C----------AA-----GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTA-CC----T-GA--TCATCC-AAGTCGTCGA-TGTAGCGGAGGT
gi|4 : -TTGG--TCTAAC-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T--TA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GGC-A--TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTC-CCCC-ACTATGTT-------T------TGCAACCTTT-CT------CTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTACCACGGAAATCCTCGA-------CCGAGAAG-AC-GCCCCAAGA-AAT-T-T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TATTAAAGC---GAACCA-ATGCTTATTGA--T-AT-TTAAA----A----T------C-TAAGC-----------------C-GTTAAT-TGTTAACAAAA-----------------------------AT---AAATATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTA-TGTCCGTTC--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTTTCAAAAATCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TA-----------AGT--AA--CT----T----TGACC-AATA-TGT--------------------------TAAAA--------TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTATTTT-----GT--TTT--TTTTT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGGA-C-TAGT-G----------T------GT-TG--AAAA-TTAC-TT-TAAA--TCAAATTA-TACT-GATTTA-AA--AATCA--AATA-------------TAGCGCCGACCA---CCCC-CCCCC-CCCCACTCT-------CCAGAT--TC------AAACTAATAAAAAA---TATGCG-AAAGTATTA-TGAA--C-AATTGG-------------------ATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA---ACA----TGCACATTA-TC-AAATT-ATTTT-C-AGCATGTTTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACGAAAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----TTCCAACAGTTAATAATCTTAA--GT-CA--G-------G-AAA-----AAA--ATA-T-TCA----TTTT-CTTG-TAAA----C----G-AAG----TACT-CTT------T--GGC-CATG-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-A-TT-------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTT----CGATA-TTGCA-------------CGC---A-----TACATTTGA-TTAT-A-TGAATTTTT--T-AAGAC-----A-GA-A---cccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|5 : A----ATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGTA-TTACA----TGCACATGA-TC-TAATTTATTTT-CAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATT-ATC----CA----AAG--AGAG-GAT-GT-AC-A---TAT-GATTAAGCTTC--------------------GACGT-CA--G-------G-GGATGGGAAAA-TAT--T-TCC----ATTTCTTTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTACT-CTT------TTAGGC-CATT-ACCTG--T-TGTTGGATT----TAG-GTAATTTTCACTCGTTTA------A-GTCAGT--CTTGTCAC-------CCCAA-CTTCCGCTCG-TA--TG-A-------------CAT---ACCATTTATA-TTAA-TTAT-A-TTGA-TTTT--T-AACGCACAAGA-GA-A---AAA---A-TCAAAA-CTTTGAAAAAAGAAGCCACAGATC---AGAAACTGCATGTA-TTTTCGTCTCC--GTGTTTG-GTAG--CT-GGTG-------CTCCCT--TCAAGACATTTG--------TTG------C---TT-TTGTATTTTTTAACTATAGTACGG--AGAA----A---A----AAATCGC--ACTTG-CA-AGCCCAAAG-GA-AGA-CATATTATTA---CAG-AGAGAAGA--AA---TCAAA--ATTGTTCCTT-G---T---CATATTGTTA-AA---G-TTA-C-AG--ATT---A-AAAAGAA--AGATT-AAAACCT----------T-GTTACTAATGGTAGGATAGTAATGTA-TATTTAT-C-ATGTCATTTTATAATATAC-AAAATCATTGCCCCTGAGGAATTTTTTAGATGTTGTGGCTGGAACAGGGGAAAGA--T--CAGAAAGTTGAC---AGCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCT--AAA-------------------GCGGcag
gi|6 : aggattacgggtacttttgaaattaTT------T--GGCACAG--AC-TGATT-TGTTAGATTATATTGA-G-----TAAACTCG-TTA------AATACAGTAAT--GTCAAAACCCACCTCAATCTTCA---TA-TA-TAG-AAAACTTTCATTTTTAT---A----TAACA-TTAA-TAATGA-T-AA-TTTTA-T-AAGAAA----AAGA-A---CAA---C-TCAAA---CTTGC---AAGAAG------------AGAAC--ACGCGAAAT---------CAAGTATTT--GTAG--CTG--TTC--TAATCTC-TT--TC-AGAAAC-TG--------TAG------C---TTAT----------------------GG-AGACTCAGA---A----AAATAGC--ACATG-AACAGCC--ATA-GATAGA---------TAAACTAC-AGAGAAGA--AAACCACAAAACA-TA-----T-G---TTCCCA-A-TGCTA-AACAGG-TTA-CTGT--AAC---A-ATATATA--A---A-AAGACCTAACACCTATAT-G-TAC---------GGT-GTAAATAA--------------T-A--TTA-AAT-TACACAACTAAACG-C---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT----C--AACAATTT----T--AAAAAGGGAGGGGAGGAGAGGGGGGAGGGGCAGA---TATAAAATAAATT---GTAAAAGTAAGGACCTTTT-TTT-A-A--AAGA-C-T-ATTTGGGTGCCAAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGTA-ATTTT-TAGGTGAATAAAAA-AAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAGACC-GATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGCAC--A-ATGAA-AA-----AATCt
gi|7 : actacaaA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGT-AA----ATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAA-CATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CAC--AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------GGAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTTGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAGT--T--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---------------------------GAA-TTTT--T-GAGACA----A-AA-A---AAA---AATCAAAA--CTTG----AAGAAG--------CTGCAGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCTGGT--------CTCCTTCTTC-AGACA--TG--------TTG------C---T------------------------------AC----G---A----AAATCGCCAGC-TG-CA-AGCC--ATAAGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA----TG-----T-G---T---CA-A-TG-TT-AA-----TTA-C-AATTATT---A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA-T-TTT-T-CCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA--TGTT-T-GCTAGAA----GGAA--AATT--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AGAA-TTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-G---TAT-------ATTATTGT--AGGTAAG--CCA--TATTT-A-AGTAAGC-C-A-TTTTTGATGCAAAAT-C-G-AGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-G
gi|8 : AC-TTCTAAAGGTCGAATTA-TACT-GATCTTGAA--AATCA--A-TA------CC----CTAGCAATGA-AATTTCCCC-CCGCC-CCTC-T-CT-------CCAGAT---C-----AAAA---ATACAA--ATATATGCGAAAAGTATGAGTAAG--C-AATTGGGCTCCTTGTAAG-TA----ATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GTT-TTACACAAGTGCAC-TTA-TC-TAATT-TATTT-CACACATC-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--TATT-ATC----C-CG-AAAG--AGAG-ATT-GT-ACAA---TATCG--TAG----T--------------------G--GTGCA--GTTGGAGCA-AGG-----AAA-TATAATATCACTATTTTTTCTTG-TAAA----C----GAAAGT-A-TATT-CTCACATTGT--GGC-CATT-GC--G-CT---TTG---T----TAGTG-----TTAA-------A------A-TCCAGT--T--GTCAAC------CTCAA-CTTC----CG-TATTTG-A-------------CATAAAA----TCAT--TTAC-TTTT-A-TCAA-TATT--T-AA---A----A-GACA---AGATTCA-TCACAATACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--A-GAGTA-T---------C--GTACAT--GTAGAATTAGGTTCTGC--TATCCCT--TC-AG-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT-TC---------------------ATCAGAC----G---AGAAGAAATCGCA-AC-TG-CA-AG-C--ATA-AA-------------T-------------AGA--AA---TCAAA--A-TG-----T-C---G---CAGA-TG-T--AA---T-TTA-C-AG--ATTCAAA-AGATAAAATA---G-AAAATCT----------T-G-T-C----------GTAGTAAATTA-T-TTT-TGG-ATGT-A--TTC-AA--TACAGA
gi|9 : c--T--AATGTTCGAC-G--G-ATGA-TGTAT-GTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GAC-AAGTTT-TCCG-AA-ATAAAAAAA-AAA--ACATTT-CCCCCATTATGTTAA-----TGCCAA-TATGGC------------------AA--------------T-------------TTT----GA----T-----T-TT-GA----TTGG--TT----------------A-------CC-------AC-GCA----GATAAT-C-TGTC----AG--------A-----C---------------CG-------------A----
gi|9 : -A-AGTT-A--C-C--TATTAG-CAGCCAA-TTTCTTAATAT-TGTTCTGATGCATTTATCTTTGGTTAAA--CTGGACTGGCGCAACA-AATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGTGTT--TTTTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATAGTATAGGAATAACAAACTATTTT-TTT-----TTTATTT--TTTATTAGATTAAATTTGCACCACCTTAAGGCATGCCCAA-CTTAGT-GTCAAAC---ATGTGTGGGT-TG--AAAATTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 11111 22222222222222 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666 1 55555555555555555555555555555555 222222222 11111 111 1 11111 111111 333333333333333 111111111 666666666666666666666666666 1111 1111 1111 22222222 1 11111 11111 11 111 1 1 1 55555555555555555 2 11 888888888888 1 111 333333333333 2222222222 111 22222 1111 111111111 1111 111111 1111 222222222 1111 88888888888888888888888888888 111111111 11111 11 11 111111111 1111 111111 1 1111 11111 111 111111 11111 33333333 1111 55555555555555555555555555555555555555555555 1111 11111 111 1111 222222222222 111 22222222222222 11 3333333 111 11 11111111 777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 11 1 333333333333333333 222222222222222222222 111 1 11111 1 33333 11111111 222222222222 222222222 111111 111 1111 1111 11 11111 111111 1111 1111 4444444444444444444 333333333333333 111 22222 111111 111 1 11 111 111 2222 111 11 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 111
lowQualScore : 8 3 0 6 11 66 0 9999 5 5 5 5 5 5 5 6 66 5 66 0 5 5 55 5 5 4 55555 4 66 4 4 44444444444444 3 8 000000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 222 777 7777 777 777 1 8 1 4 66 4 4 9999999999999999999999999999999999999999999 5 0 55555555555555555555555555555555 2 0 5 777777777 5 5 66 5 0 44444 77 555 5 5 0 66 5 22222 5 66 3 5 222222 5 5 777777777777777 77 77 555555555 0 5 5 333333333333333333333333333 1 1 5 1111 77 5 2222 5 5 2222 5 00000000 5 1 44444 99 99 55555 99 8 11 777 99 0 0 0 22222222222222222 6 99 3 6 6 99 6 0 77 55 99 99 6 444444444444 77 5 8 444 8 8 222222222222 2222222222 111 0 88888 3 6 0000 6 33 888888888 5 5 0000 888 444444 5 2222 5 5 5 5 9 5 0 5 5 5 66 66 5 444444444 66 5 5 5 5 888 7777 99999999999999999999999999999 4 66 555555555 11111 66 00 4 9999 77 5 333333333 5 3333 5 444444 66 5 888 5 0 5 0000 5 22222 1 222 444444 5 44444 00000000 5 5555 5 8 4 77777777777777777777777777777777777777777777 4 1111 1 9999 4 4 777 66666 444 5555 333333333333 888 55555555555555 88 66 7777 3333333 0 000 5 44 11 88888888 666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 11 0 5 5 66 5 5 666666666666666666 1 66 888 000000000000000000000 666 0 88 33333 0 00000 2 888 5 99999999 555555555555 5 222222222 999 333333 5 77 2 5 77 5 3 7 111 4444 88 6 6 4444 77 33 77 44444 111111 4444 77 5 2222 77 4444444444444444444 2 666666666666666 000 77 1 77 11111 111111 5 222 5 0 2 5 5 33 5 6 999 1 777 5 5 000 6 0000 111 77 2 11 11 0 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 0 99999 111 8 0 8 3 8 3
lowQualScore : . . . . .. .. . .... . . . . . . . . .. . .. . . . .. . . . ..... . .. . . .............. . . ...... ............................................................................................................................................................................. .... ... ... .... ... ... . . . . .. . . ........................................... . . ................................ . . . ......... . . .. . . ..... .. ... . . . .. . ..... . .. . . ...... . . ............... .. .. ......... . . . ........................... . . . .... .. . .... . . .... . ........ . . ..... .. .. ..... .. . .. ... .. . . . ................. . .. . . . .. . . .. .. .. .. . ............ .. . . ... . . ............ .......... ... . ..... . . .... . .. ......... . . .... ... ...... . .... . . . . . . . . . . .. .. . ......... .. . . . . ... .... ............................. . .. ......... ..... .. .. . .... .. . ......... . .... . ...... .. . ... . . . .... . ..... . ... ...... . ..... ........ . .... . . . ............................................ . .... . .... . . ... ..... ... .... ............ ... .............. .. .. .... ....... . ... . .. .. ........ ....................................... ............. .. . . . .. . . .................. . .. ... ..................... ... . .. ..... . ..... . ... . ........ ............ . ......... ... ...... . .. . . .. . . . ... .... .. . . .... .. .. .. ..... ...... .... .. . .... .. ................... . ............... ... .. . .. ..... ...... . ... . . . . . .. . . ... . ... . . ... . .... ... .. . .. .. . . ................................................................................ .. . ..... ... . . . . . .
lowQualScore : 0 8 8 7 99 99 0 0000 0 0 0 0 0 0 1 5 99 0 99 0 0 0 44 0 0 4 66666 4 11 4 4 11111111111111 5 8 555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 222 888 2222 888 888 1 9 4 4 11 4 4 7777777777777777777777777777777777777777777 0 0 66666666666666666666666666666666 0 1 0 111111111 0 0 99 7 1 33333 99 777 0 0 0 99 0 00000 0 99 1 0 666666 7 7 999999999999999 99 99 333333333 7 7 7 111111111111111111111111111 4 6 7 6666 99 7 1111 7 7 1111 7 77777777 7 4 33333 22 22 88888 22 0 00 555 00 0 0 0 22222222222222222 7 22 5 7 7 22 7 0 77 88 22 22 0 444444444444 00 0 0 000 0 0 444444444444 6666666666 444 8 22222 8 7 0000 7 55 999999999 0 0 6666 888 444444 7 1111 7 7 7 7 3 0 2 0 0 0 99 99 0 111111111 99 0 0 0 0 888 0000 00000000000000000000000000000 4 11 111111111 11111 33 66 4 4444 11 0 222222222 0 2222 7 444444 99 0 222 0 0 0 6666 0 55555 0 111 444444 0 99999 00000000 0 6666 0 9 4 22222222222222222222222222222222222222222222 4 4444 1 4444 4 4 888 99999 666 6666 111111111111 111 22222222222222 88 99 2222 5555555 9 111 0 66 99 11111111 444444444444444444444444444444444444444 0000000000000 99 0 0 0 99 0 0 111111111111111111 4 99 888 666666666666666666666 000 0 66 11111 0 11111 2 888 0 88888888 444444444444 7 999999999 444 666666 7 99 3 7 44 0 2 2 777 2222 33 7 7 2222 99 66 99 33333 000000 3333 99 0 1111 99 3333333333333333333 5 777777777777777 000 99 4 99 66666 999999 0 222 0 0 5 0 0 66 7 6 444 4 999 7 7 000 7 8888 777 33 5 88 00 8 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 00 6 44444 888 0 8 0 8 0 2
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-GA--ATT---A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A---TAT-------ATT---GT--AGGTAAG--CC---T-TTT-A-A--AAGG-C-A-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( family-90 ) : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-GA--ATT---A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A---TAT-------ATT---GT--AGGTAAG--CC---T-TTT-A-A--AAGG-C-A-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|1 : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGAC-CCCGCATGA--GT-T-GTA-ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCATAA-AC----ATATAAA--ACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATGCAAA-TGCAACTTTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTT---------------A-------CC-------AA-A------GA-CAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAA-----TTCAA----CGTAG----TA---GAGC---ACACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----AA---T---A--T-TAAGT---A--T-CAATT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ACA--ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACATGTAA-T-G-TGTCTGTTT--AACA-ACAAAAA-----TA--TTTTTC---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAATTTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG----TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAA-TTA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT-------AA--TGCA-CA-CT--AGGC---C--AA-C-TAGT-G-----CAATAT------GT-TG--AAAATTTATACT-TAAA--TCGAACTA-T-TT--ATTT--AA--AATCA--AATA-GTGA-ACTTTACTAACG-TGA-CA---CCCC-CCCTC-TCT-----C-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGATATTA-TGAA--G-AATTGTG-TCCTTGTGGGTTA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGC-CATTA-TCTTAATT-ATTTC-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTGA-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----C-C----AG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--G--CA--G-------G-AGG-----AAA-T-T--T-TCA----TTTTC--TG-TAAA----C----G-AAGT-A-TAAT-CTT------T--GGC-CA-T-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAG------GTCA--------CCCAA-CTT-----CG-TA-TTG-A-------------CATAA-A----TTATA-TTAACTTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AGA---A-TCAAAA-ACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------A--GTGTTT--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AG-CA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGC----TA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAA-A--AA---TCAAT--A--G-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-CTA-C-GA--A-T---A-AAATAAA--A---T--AAACCT----------A-G-TAC---------GGAAGTAATTTATT-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TAC-AAAATC-ATGCC---GAGGA-----TTA-GTGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGTGGGG-----------------------GG--GGG------------------------GG-C-ATTTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGT--ATTGTTTCAGCATATTTT----GTG---ACGGG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACG------ACAGTGTTTT-A--AAG--CAAA-ATGAATAA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAG-CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|10 : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGGG-T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAAATGCAAC-TTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TTTAA----TT-G--TTACCACAGAATCTCG--A-------CCGAGAAGGAC-GCCCCGGGA-AAA-T-T-AC----AA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GAACCACATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AAATTT---AATC-TAAGA---A--TACA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAA-ATAATACC----ATA-CAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTGTTGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTA--AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-T-GTG-----------GGT--AA--CT----T----CGAAC-AATA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA--G-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTTTTTTATT--TTT--TTTAA----TTAAA--TGCA-CACCT--AG
gi|11 : gGG--T--A-T-TTCGACGC--G-ATGACTGT-T-GTA-CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GTT--T-GTTTATGCG-GAC-AA-TTT--CCG-AA-A-----ATA-TA----CATTT-CCTC-ATAATATTTT-----TGCA-----CA--CTTTTCT-------TTCGAA--------------TT---------A--TTTATA-GAGTTGT-----T-TT-GAATTTTT-GCGTT----------------A-------CC-------ACAG------GA-AAT-CCT-TCGGCGGA--------AGACGCC---------------CGGGAAAAGACTCGAA----CGACTAACTTCAATGTATATAT----TA---GAGC---CAAACAGATACATAT-GG--TGATCTTAAA----AA---TTTAA--TCTAAG----A--T-AG-TTCAG-CCATTA-TATGTTAACAAAATA-A-----TA-CGATACTTG-TAAAAATAT-AGAA-TATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACGAATT-----TT--TTTTTT---AAAAATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C--------------------------AT-TGTT-T-GT------------GGT--CA--CT----T----CGACC-AATA-TGT------------------------------AAATAAAA-TG-T--TTCTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-AT---------AAAC-ATTTG-TGT-----GT--GACAATTTCT----TTAAA--T
gi|11 : ggtagcgtgtacgtggtactggT------GTGTG--ACAATTT-C-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CC-AATTT--AA--AATCA--Acgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaattttttttttaaaaatcggtcgaagttaccattgtttgtggtcacttcgaccaatatgtaaataaaatgtttctgtttgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAT-TGGG--T--AATCTTCGAC-T--C-GTGA-TGT-TTGTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--TTGT--AT-CA-GACCAA-TTT-TCCG-AGGA-----ATG-AAA--ACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------GCAAA-TGCA----TTTGA------ATTTGAT--------------T----------G--TTACACAGAAAT-C-----T-TC-GA----CC-G--AG----------------AAGACGCCCC-------GG-G------GA-AAT---T-AC----GA--------A-----A---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GACACA-AGACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---TTTAA--T-CAAGT---AATT-CA-TT--GCC-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-ATACCATACCAAT---TG-CAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAAT-------TATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-AC-AAAA-----CATTTTTTTT---TTAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCAC--TAGACA--CAA-TTT-----Ttat
gi|13 : gg-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT----GA----TTTGA-T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AATCC-T-TC----G---------A-----C---------------CG-------------A----GAA
gi|13 : gttt-------CC-------AA-G------AA-AAT---T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAGATATTA---AAGC---GAACCT-ATGCTTAT-AGATT-AT-TTAAA----A----T---C--T-AAAGCCGTA--T--A-TT-------TTG-T--GTTAAC--------------------------CCCAAATA-----AATATTTGATTAAAAT--------ATGTAA-TTA-TGGCCGTTCTCAACA-ACAAAAAACATTTA--TTTTTC---AAAAATCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--C--TAG-CA--CGA-TT-------ATCTGAT-TG-TA-----------AGT--AAGCTT----T----TGACCCAATA-TGT--------------------------AAAA------AA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTA-TTT-----gaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|14 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgccccAG-CGTGGTCTAACTTCGACTGA-TT
gi|14 : --T--AAC-TTCGAC-T--G-ATTA-TGT-T-TTA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTTCCCCC-ATTGTGTT-------T------TGCACCCTTTTCT------CTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-CA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GACAGAGAAGA-----CGCCCCAAGAAAATTACG-------------AACGACAACT---TTCAA---ACGTAATTT-TA---AAGC---GAACCA-ATGCCTAT-GA--T-AT-TT-GA----AA---T------T-TAAGC-----------------C-ATTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-T--T---TATCAAAAAT-TAAAA-----TT-AGTAAAA-T-----ATACATA---TG-T---CGTTC--AACatgttttactccagtatttttagttcactgtttgtatcagacaattttccgaaaataaaaacatttcccccattgtgttttgcacccttttctcttcgaattatttaatacagttgtttgattttcattgttaccacggaaatcctcgacagagaagacgccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtaattttaaagcgaaccaatgcctatgatatttgaaatttaagccattattgttaacaaaataaatatttatcaaaaattaaaattagtaaaatatacatatgtcgttcaac
gi|15 : agcgtggtcT---GT--AAATAAG--CC---T-TTT-TTA--AAGG-C-C-ATTTGGGTGCCAAAT-C-T-AGTT-TATT-TAGC--ATTGCT--AGTAATTTTT-T-GGCG---AAGAGAGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGT---CT-GCCAC-TGA--T-------C-------------------------T--------ACC------GTGTTTTTTT------------------A-AA-----AATTGGCCT--G----------------CGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGG-GGTA
gi|16 : G---GGTCTATTG----AAAT---CTTGCCA--TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------TG---------ACC------ACGTTGTTTTTA--AAG--C--ATATGAA-AATTAAAAATCGGCTT--GCGTTTTGGACGG-AACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|17 : -TTG-A-------------TAT--------TTGTA-TTA---TAT-A-T----TTTTGTT-AATACA----A-GA-A---AAA------CCAAT-ACTTG----AAGAAG--------C---AG-AA--ACGAGTA----------------GATC---TAT--C---GTG---T--TCTCC----TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------AT-AGAC----GAGAA----AAATCGC--AC-T------GCC--ATA-GA-AGA-------------------------A--AA---TCAAA--A-T------T-GTTCT---CA-ATTG-TA-AA---GTTTA-C-G----CT---AGAAAGAAA--A---agtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|18 : A-AC-----AAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGT
gi|19 : gtattcaatacagacgtgaaactCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GTctatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
gi|19 : G-TTTTA-AAA-CCTG-ACAAAA--ATT--AATT-ACTCATGCACA-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-AATTCAT-A--TA-----T--------------------A--GT-CA--G-------GAAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCtttaaaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|2 : ctggatattggaatgacaaagctcaGTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGTT--G-TT--AT-CAAGAC-AT-TTTATTCG-AA-A-----ATA-AAAGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAAC---TTCT------CTTCAAAA-------------T----------GGTTTT----GA----T-----T-T--GA----TT-G--TT----------------A-------C--------AC-A------GA-AA-----------------------------------------------------------A----TA-CTA--TTCGA---CCG-AG----AA---GACCCCGGAA--A-AT-----------T--T-TCAAATCGTAA---T---A-----AAGC---A--C-CA-T---A-C--TTA-TGTATT--TAAAA---A----ATT-TAAT---TT-----AATA---GAAATATTT-ATTAAAATT-----A-ATGTAAATTG-TGTTCGTTT--AACACACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAGTTCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--C--TAG-CA--CAA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TG-----------GG---AA--CT----T----CGAAC-AA-A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TA-TGGTTCTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAGC-TTTTAGTTT-----GT--TTT--GTTAT----CTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCAAAAC-TAGTTG-----C---AT------GT-TGTGAAGAATTAC-TT-TAAA--TCGAATTAAT-CTTGATTT--AA--A-TCA--AATA------------CTCACG-TGA-CA---ACGGGCCCTC-CTTCAT-CC-------G-AGAT--TC-----AAA-CTAATAAAA--AT-ACTGCTGAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCTTTGTGTA-AA----ATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATC-TAATT-ATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATTCATC----CA----AAG--AGAG-ATTTGTTAC-A---TAT-GGTTAG----T--------------------G--GT-CAAGG-------G-AGG-----AA--TAT--T-TCA----TT---CTTG-TAA-----C----G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CATTGAC-TGGCTGTGTTGAAT------AG-T-----TTAACT-G-TTA------A-TACAGT--T--GTCA--------CC-AA-CTTC----CG-TAATTG-A-------------CAT---------------------------GAA-TTTT--TGAAGACA----A-AA-ACACAAA---A-TTCAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCGG-TGC--T--CCTTCTT---C-AGA-A--TG--------TTG------C---T------------------------------A-----G---A----AAATCGC--AG-CGACA-AGCC--ATA-GA-AGATC-------TA---TAC-AGAGAAAA--AA---TCAAA--A-TG-----TTG---T---CA-A-TG-TATAA---G-TTAAC-AATTATT---A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TCA-AAT--ACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--AA-T--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AGAA-TTT----T--AAA-------------------GGGGGGG-CA-AGTATATT------ATT---GT--AGGTAAG--CCA--T-TTT-A-A--AAGG-CCA-TTTTTGATGCCAAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-GGGG---
gi|20 : gA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTT-A-----TGCTA---GCAACTTTTTCTCTGCGGCTTCGAA--------------T----------
gi|21 : tttgtcataagaacatacttaattcacgAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAAA-------------------GGGGGGGGGG-G---TGC-------ATT---GT--AGGTAAG--CC---T-TTTCA-A--AAGGTC-A-TTTTGGGTGCCAAATAT-GGAGTT-TTAT-Ttatgttaaatacagattatgtaat
gi|22 : -C-A-TTTTGGGTGCTAAAT-CTGGAGTT-TTAA-TGAC--ATT-TTT-AGTAAATGTT-T-GGCG---AAGAG-GGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATAT---CC-GCCAC-TG
gi|23 : cA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TT---------A--TTT----GA----TACAGTTGTT-AG----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GA--------A-----
gi|25 : AACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---AAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TCAAA----Aaagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|26 : T-CA--G-------G-AAA-----AAAATAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-
gi|3 : T------GG-TG--GAAATTTAT-TT-TAAA--TCGT-TTG-TTCT-GATTT--AATAAATCATTATTACGCGATCC----CC--CGCTGG-CT---CCCC-CCCCCATCTCAC-CCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AA-AAAAGA-T-TATGCGAAATGTATTA-TGAAATCGAATTGGG-T--TTCTGGG-TAGTCAATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GTT-TAACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAA-CA-A-TTTTA-AAATCTTG-ACAAAA---TT--AATT-ATT----CACA-AAAGGAAGAGGATT-GT-AC-A---TAT----TAT----TCCAGCTTATAAGAATCTTCGA--GT-CA--G-------G-AAG-----AAA--AT--C-ACA----TTTTC-TTG-TAAA----T----G-AG-----TACT-CTT------T--GGC-CATG-AC-TG-CT-TGT-GGATT----TAG-G-----TTTTAT-A-TTATATATTA-TACAGC--C--GTC----------CAAA-CTTC-----G-TA-TTG-G-------------CAT---A----C---A-TTAA-TGAT-ACTGAA-TTTT----AAGACA----A-GA-A---AA------TCAAAA--CTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTT--GTAG--CTGGTT----C--TCTCCTT---C-AGACA--TG--------TTG------CCTTTT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C--------A---TACTAGAGAAGATAAA---TCAAA--A-TG-----T-T---T---CATA-AA-TT-AA---G-TTAAC-----ATT---A-AA-TAAA--A---CTAAAACCT----------TTG-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TT----C-ATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA-TCATTGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT----C--AGAAATTT----T--ACA--------------------GGGGGGGCA-A---TAT-------ATT---GT--AGGT--G--CC---T-TTA-A-A--AAGG-C-ATTTTTGGGTGCCAAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTA-ATGGTTT-A-CAAGTTTTAT-GATGGA-AAAAG-AGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-G-CAG-TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AATGT--------ACC------CC----TCTT-----CG--C----------AA-----GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTA-CC----T-GA--TCATCC-AAGTCGTCGA-TGTAGCGGAGGT
gi|4 : -TTGG--TCTAAC-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T--TA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GGC-A--TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTC-CCCC-ACTATGTT-------T------TGCAACCTTT-CT------CTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTACCACGGAAATCCTCGA-------CCGAGAAG-AC-GCCCCAAGA-AAT-T-T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TATTAAAGC---GAACCA-ATGCTTATTGA--T-AT-TTAAA----A----T------C-TAAGC-----------------C-GTTAAT-TGTTAACAAAA-----------------------------AT---AAATATTT-ATTAAAATT-----AT--GTAA-TTA-TGTCCGTTC--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTTTCAAAAATCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TG-TA-----------AGT--AA--CT----T----TGACC-AATA-TGT--------------------------TAAAA--------TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTATTTT-----GT--TTT--TTTTT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGGA-C-TAGT-G----------T------GT-TG--AAAA-TTAC-TT-TAAA--TCAAATTA-TACT-GATTTA-AA--AATCA--AATA-------------TAGCGCCGACCA---CCCC-CCCCC-CCCCACTCT-------CCAGAT--TC------AAACTAATAAAAAA---TATGCG-AAAGTATTA-TGAA--C-AATTGG-------------------ATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA---ACA----TGCACATTA-TC-AAATT-ATTTT-C-AGCATGTTTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACGAAAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----TTCCAACAGTTAATAATCTTAA--GT-CA--G-------G-AAA-----AAA--ATA-T-TCA----TTTT-CTTG-TAAA----C----G-AAG----TACT-CTT------T--GGC-CATG-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-A-TT-------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTT----CGATA-TTGCA-------------CGC---A-----TACATTTGA-TTAT-A-TGAATTTTT--T-AAGAC-----A-GA-A---cccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|5 : A----ATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGTA-TTACA----TGCACATGA-TC-TAATTTATTTT-CAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATT-ATC----CA----AAG--AGAG-GAT-GT-AC-A---TAT-GATTAAGCTTC--------------------GACGT-CA--G-------G-GGATGGGAAAA-TAT--T-TCC----ATTTCTTTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTACT-CTT------TTAGGC-CATT-ACCTG--T-TGTTGGATT----TAG-GTAATTTTCACTCGTTTA------A-GTCAGT--CTTGTCAC-------CCCAA-CTTCCGCTCG-TA--TG-A-------------CAT---ACCATTTATA-TTAA-TTAT-A-TTGA-TTTT--T-AACGCACAAGA-GA-A---AAA---A-TCAAAA-CTTTGAAAAAAGAAGCCACAGATC---AGAAACTGCATGTA-TTTTCGTCTCC--GTGTTTG-GTAG--CT-GGTG-------CTCCCT--TCAAGACATTTG--------TTG------C---TT-TTGTATTTTTTAACTATAGTACGG--AGAA----A---A----AAATCGC--ACTTG-CA-AGCCCAAAG-GA-AGA-CATATTATTA---CAG-AGAGAAGA--AA---TCAAA--ATTGTTCCTT-G---T---CATATTGTTA-AA---G-TTA-C-AG--ATT---A-AAAAGAA--AGATT-AAAACCT----------T-GTTACTAATGGTAGGATAGTAATGTA-TATTTAT-C-ATGTCATTTTATAATATAC-AAAATCATTGCCCCTGAGGAATTTTTTAGATGTTGTGGCTGGAACAGGGGAAAGA--T--CAGAAAGTTGAC---AGCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCT--AAA-------------------GCGGcag
gi|6 : aggattacgggtacttttgaaattaTT------T--GGCACAG--AC-TGATT-TGTTAGATTATATTGA-G-----TAAACTCG-TTA------AATACAGTAAT--GTCAAAACCCACCTCAATCTTCA---TA-TA-TAG-AAAACTTTCATTTTTAT---A----TAACA-TTAA-TAATGA-T-AA-TTTTA-T-AAGAAA----AAGA-A---CAA---C-TCAAA---CTTGC---AAGAAG------------AGAAC--ACGCGAAAT---------CAAGTATTT--GTAG--CTG--TTC--TAATCTC-TT--TC-AGAAAC-TG--------TAG------C---TTAT----------------------GG-AGACTCAGA---A----AAATAGC--ACATG-AACAGCC--ATA-GATAGA---------TAAACTAC-AGAGAAGA--AAACCACAAAACA-TA-----T-G---TTCCCA-A-TGCTA-AACAGG-TTA-CTGT--AAC---A-ATATATA--A---A-AAGACCTAACACCTATAT-G-TAC---------GGT-GTAAATAA--------------T-A--TTA-AAT-TACACAACTAAACG-C---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT----C--AACAATTT----T--AAAAAGGGAGGGGAGGAGAGGGGGGAGGGGCAGA---TATAAAATAAATT---GTAAAAGTAAGGACCTTTT-TTT-A-A--AAGA-C-T-ATTTGGGTGCCAAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGTA-ATTTT-TAGGTGAATAAAAA-AAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAGACC-GATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGCAC--A-ATGAA-AA-----AATCt
gi|7 : actacaaA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGT-AA----ATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAA-CATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CAC--AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------GGAGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTC-TTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTTGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAGT--T--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---------------------------GAA-TTTT--T-GAGACA----A-AA-A---AAA---AATCAAAA--CTTG----AAGAAG--------CTGCAGAAA---CGAGTA-T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCTGGT--------CTCCTTCTTC-AGACA--TG--------TTG------C---T------------------------------AC----G---A----AAATCGCCAGC-TG-CA-AGCC--ATAAGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA----TG-----T-G---T---CA-A-TG-TT-AA-----TTA-C-AATTATT---A-AAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA-T-TTT-T-CCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA--TGTT-T-GCTAGAA----GGAA--AATT--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AGAA-TTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-G---TAT-------ATTATTGT--AGGTAAG--CCA--TATTT-A-AGTAAGC-C-A-TTTTTGATGCAAAAT-C-G-AGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-G
gi|8 : AC-TTCTAAAGGTCGAATTA-TACT-GATCTTGAA--AATCA--A-TA------CC----CTAGCAATGA-AATTTCCCC-CCGCC-CCTC-T-CT-------CCAGAT---C-----AAAA---ATACAA--ATATATGCGAAAAGTATGAGTAAG--C-AATTGGGCTCCTTGTAAG-TA----ATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GTT-TTACACAAGTGCAC-TTA-TC-TAATT-TATTT-CACACATC-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--TATT-ATC----C-CG-AAAG--AGAG-ATT-GT-ACAA---TATCG--TAG----T--------------------G--GTGCA--GTTGGAGCA-AGG-----AAA-TATAATATCACTATTTTTTCTTG-TAAA----C----GAAAGT-A-TATT-CTCACATTGT--GGC-CATT-GC--G-CT---TTG---T----TAGTG-----TTAA-------A------A-TCCAGT--T--GTCAAC------CTCAA-CTTC----CG-TATTTG-A-------------CATAAAA----TCAT--TTAC-TTTT-A-TCAA-TATT--T-AA---A----A-GACA---AGATTCA-TCACAATACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--A-GAGTA-T---------C--GTACAT--GTAGAATTAGGTTCTGC--TATCCCT--TC-AG-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT-TC---------------------ATCAGAC----G---AGAAGAAATCGCA-AC-TG-CA-AG-C--ATA-AA-------------T-------------AGA--AA---TCAAA--A-TG-----T-C---G---CAGA-TG-T--AA---T-TTA-C-AG--ATTCAAA-AGATAAAATA---G-AAAATCT----------T-G-T-C----------GTAGTAAATTA-T-TTT-TGG-ATGT-A--TTC-AA--TACAGA
gi|9 : c--T--AATGTTCGAC-G--G-ATGA-TGTAT-GTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GAC-AAGTTT-TCCG-AA-ATAAAAAAA-AAA--ACATTT-CCCCCATTATGTTAA-----TGCCAA-TATGGC------------------AA--------------T-------------TTT----GA----T-----T-TT-GA----TTGG--TT----------------A-------CC-------AC-GCA----GATAAT-C-TGTC----AG--------A-----C---------------CG-------------A----
gi|9 : -A-AGTT-A--C-C--TATTAG-CAGCCAA-TTTCTTAATAT-TGTTCTGATGCATTTATCTTTGGTTAAA--CTGGACTGGCGCAACA-AATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGTGTT--TTTTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATAGTATAGGAATAACAAACTATTTT-TTT-----TTTATTT--TTTATTAGATTAAATTTGCACCACCTTAAGGCATGCCCAA-CTTAGT-GTCAAAC---ATGTGTGGGT-TG--AAAATTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
blockSeqs : A A . CT CT C GC . C A T T T T C GT T TT G A C AG A . G TAAAA . GA C C AATGCAAAA A C CTGCGG ATTATTTAAGCAGTTGTTTGATTTTGATTGTTACCACGGAAATCCTCGACCGAGAAGACGCCCCAAGAAATTTACGAACG ACGA AAC TGT ATAT TTA CCG C C A T AT G C AAATTTAATCTAAGAATACATTGCCG A A TAATACCATACCAATTGCAGAAAATG A G TATA A T TC C ACATT TT TTC G T C AC A CAC A GC A . TCTTAA C C GATGCATTTATCTTT TA GC GGACTGGCG C A TATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA A A G TGG AG C ATTA C T CCAA T GGAATAAC T G TTTTA TA AA TAGAT TT C TA ATG CA A T T TCAAACATGTGTGG G TG T . C GG A T TG TG TA TT A CGCGATCC CA C C TTT G A ACCCACTCTGT GCTCTAGGTA ACT GAT G G ATCG C CT GGTAGTCA G C AACT CGA CGGTGA A CAAG A . T T A T T T G TA GT C CATGCACA GA G T T A ATT GGT TTCCAGCTTATAAGAATCTTCGA G AG TTGGAGCA TGGGA AT AA A CTAT CT G ACGACTGAG A TCAC T ACATTG TA A TTG C G G ATAT T TAATT A CGT TATATT A CTT AAACCCAC T CGCT A A C AAACTTTCATTTTTATATAACATTAATAATGAT T GTT T CAAG A C CAC TTCA ATA AAAA CCACAGATC CTG TTTTCGTCTCC TG AA TGGT TCTAA CTT A AC TT ATGAATGA CTTTTGTATTTTTTAACTATAGTACGG TCAGAA CA T A C CA A T CATATTATTACAG A TA ACC ATTGTTCCTTGT TAT T AT CAGG A AATT C CAA G AGATT AACACCTATAT T TAATGGTAG TA TATC C TT C T TA A A C CCT ATTT GA G G CAGG AG AT CA AAAGT AAAAG AGGC AA A TTCC AA AAGGGAGGGGAGGAGAGGG C GATATAAAATAA ATT AA A GA TTTT AAGT T CA A T G A . AA . A AT C AAT A T TCT A CTCT AGA TT C TA GT G TCGACAATAATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTTATCAGGCACAATGAAAA GG TGGAC AA T A T C A
blockSeqs : . A . G . G C . . . . . . T T . . . G . . A . . . . . . . . AATGCAAA A C . TTATTTATAGAGTTGTTTTGAATTTTTGCGTTACCACAGGAAATCCTTCGGCGGAAGACGCCCGGGAAAAGACTCGA . A . TTT . . A G A . . . . AATTTAATCTAAGATAGTTCAGCCA . G TAATACGATACTTGTAAAAATAT G . TAT . . . . . . A . . C . . TAT . . A . T . . GTG . . T . . G A T . TT . . . . . . . . . T . . . T . . . . CG . . . CAT . . A . . . . A A A . . T CC AG C . . . . ACTCT TCA CT ATA A . C . CC TAAA . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CACGA . . . . . . GAT GTTCCAACAGTTAATAATCTTAA . . GA . T A . . TC . C . TA . . . . TG . A . . . . T CG . . AAT AC . A . T . CATACCATTTATATTAATTATATT . TG G . . . . AA TA C CTGC A ATCAA TG . CTGG TCTGC T . AC C . ACTGGCCTTTCATC GAGAAG A A . . . . . TAAACTAC G . . ACATATGTTCC AT C A GT A AATT T . . ATAG TT . . T TTCC . . T . T A A A . . A . . . . A . . AGC C . A . . . G AGTATATT . . A . ATA TTA . AT . T G . . A . T TA T GA . . . . T . T C C . G GAACTAATATGACCACGTTGTTTTTAAAGCATATGAAAATTAAA . TGGAT TA . . C . A
blockSeqs : . G . . . . T . . . . . . T C . . . . . . A . . . . . . . . AATGCCAA C C . TTATTTAATACAGTTGTTTGATTTTCATTGTTACCACGGAAATCCTCGACAGAGAAGACGCCCCAAGAAAATTACG . . . . . . A . A . . . . AATTTAATCAAGTAATTCATTGCCG . . TACCATACAATTGCAGAAAATG A . TAA . . . . . . . . . . . . C . . G . T . . GTA . . T . . A A A . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . CC . . . T . . T . . . . A G . . . A . AG A . . . . ATCC TC A AT A . C . CC GTAA . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CACA . . . . . . CG AGCTTCGAC . . GG . T . . . C . C . TA . . . . TG . . . . . . T G . . T C . . . . . CATAAAATCATTTACTTTTATC . AT G . . . . A AA . C A TC G . TAGG GCT T . AC . . CCTTTTTA GAGAA . . . . . . . TCTATAC G . . ATTGTTCT TA . T G . TGT T . . ACT T . . T TTGG . . T . T A C A . . A . . . . . . . AG C . A . . . C GTGC . . A . AT CAA . C . . G . . . . A T C . . . . . . . C C C . . CGAACTAATATAAATGTACCCCTCTTCGCAA . . A . . T . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . C T . . . . . . A . . . . . . . . AAGCAAA A T . TGTTTGATTTTTAATTGTTACCACAGAATCTCGACCGAGAAGGACGCCCCGGGAAAATTACAAACG . . . . . . C . G . . . . TCGTAATAAAGCACCATAC . . TAAATATTTATCAAAAATTA A . TAT . . . . . . . . . . . . C . . A . T . . GTG . . T . . T A A . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . TCT CA A AA . . C . . AGTA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CAC . . . . . . A GTG . . G . T . . . C . T . TA . . . . TT . . . . . . C A . . C . . . . . . CGCATACATTTGATTATATG . T G . . . . A AC . C A TC . . CGG GT T . AA . . CTTATGG GA . . . . . . . CATACT G . . ATGTTGT GA . A G . AG T . . TA T . . T TTC . . C . T A A A . . A . . . . . . . AG C . A . . . C ATAT . . A . T AA . A . . G . . . . A T T . . . . . . . T A G . . TACCGTGTTTTTTTAAA . . . . . T .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . T C . . . . . . A . . . . . . . . TTTGCA A C . TTATTTAAGACACTTGATTTGATTTGATTGTTACCACGGAAATCCTTCGACCG . . . . . . C . G . . . . ATCTAAAGCCGTATATT . . AATTTAATTTAATA A . TA . . . . . . . . . . . . C . . G . T . . GTA . . T . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCG . . . . . . G GTG . . G . T . . . C . C . T . . . . TT . . . . . . A A . . C . . . . . . CATACATTAATGATACTG . T C . . . . C A . C . TC . . TGG C T . AC . . CTTTAT GA . . . . . . . CTATAC G . . ATGTTT A . A G . AG A . . AA T . . T C . . T . A A . C . . . . . . . . . . A . . . . . . C GTAT . . A . T AA . A . . G . . . . T T T . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . ATGCTA A C . TGTTACACAGAAATCTTCGACCGAGAAGACGCCCCGGGGAAATTACGAAACG . . . . . . C . A . . . . AATTTAAGCCA . . CCCAAATA . . TA . . . . . . . . . . . . C . . A . . . . GT . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . G GTG . . G . T . . . C . C . . . . . . TT . . . . . . T G . . T . . . . . . TATTTGTATTATATAT . T G . . . . . A . C . TC . . TG G . . A . . CT AA . . . . . . . T G . . ATGTCG A . T T . G T . . TA T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T AA . T . . . . . . . . T T . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . TTTTGATTTTGATTGGTTACCACGCAGATAATCTGTCAGACCG . . . . . . C . G . . . . ATCTAAGCCG . . AT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . TA . . G . . . . . C . C . . . . . G . . . . . . A . . . T . . . . . . CATG . T G . . . . . . . . . . . . G . . . T . . CT GA . . . . . . . . . . . TGTGT A . . . . . T . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T G . . ATGGTTTTGATTTGATTGTTACACAGAAA . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CATG . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : C*** ***** AATGCAA******* AATCTAATAAGCAGTCATGCCG********************* TAAATACTAATTCAAAAAATA*********** TA******* GTG************ T*** T**** G* C*********** ATCT******** TCA******* A** AT*** NNAA***** CACA***** TT* T**** CATAATATATTAATTATAT************************* T****** AC CTTTAT********************************* ATGTTGT************** AGT** T** TTC*** AG**** GTAT*********** AT*** AA**** A** T** A**
originalCons : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TGCAAA-TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAA----AA---T---A--T-TAAGC---A--T-CA-TT--G-C-GTTA-T-TGTTAACAAAATA-A----ATA-CAAT---TG-CAGAAATATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-----ATATGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGGTG-----------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-G-GA-CC----CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCAC-CC-------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGG-TA----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATT----CACG-AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGT--C--GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-A-------------CAT---A----TTATA-TTAA-TTAT-A-TGAA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTGC--C--TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTG------C---TT-T----------------------A--AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA--A-TG-----T-G---T---CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-C-GA--ATT---A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCA-A---TAT-------ATT---GT--AGGTAAG--CC---T-TTT-A-A--AAGG-C-A-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
finalCons : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGACC---G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAATGCAA-------TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTAT-GG--T-AT-TTAAAAATCTAATAAGCAGTCATGCCG---------------------TTA-T-TGTTAACAAAATAAATACTAATTCAAAAAATA-----------AGAAATATTT-ATTAAAATTA-------TGTAA-TTG-TGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--C--TAG-CA--CGA-TTT-----TAT-TGTT-TGTG------------GGT--AA--CT----T----CGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TGT---TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTATT----TAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----C---AT------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CTG-ATTT--AA--AATCA--AATAC-----------CTAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCATCT--------CCAGATTCA-------AAA--AATAAAAAT---TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGNNAA-----ATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAATT-ATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTTG-ACAAAA--ATT--AATT-ATTCACA-----AAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TAG----T--------------------G--GT-CA--G-------G-AGG-----AAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTTG-TAAA----C----G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-AC-TG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAGTT----GTCA--------CCCAA-CTTC----CG-TA-TTG-ACATAATATATTAATTATAT-------------------------AA-TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA-T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGTT------TCTCCTT--TC-AGACA--TG--------TTGCTTTAT---------------------------------AGAC----G---A----AAATCGC--AC-TG-CA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAAATGTTGT--------------CA-A-TG-TA-AA---G-TTA-CAGT--ATT---A-AAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTAT--TTTTC---ATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAA--A--T--CAG-----TGACAG----AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCAGTAT-----------ATT---GT--AGGTAAG--CCAT---TTTAA----AAGG-CA--TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTTT--GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGGA--CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 11111 333333333333333 111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 88888888888888888888 1 666666666666666666666666666666 1111111 11111 111 1111 6666666666666666666666666666666 1111 1111 22222222 1 11111 11111 11 111 1 1 1 44444444444444444 2 11 6666666666666666 1 111 444444444444 333333333333333 11 1111 333333 1111 111111 1111 111111111 1111 8888888888888888888888888888 222222222 11 11 1111111 1111 111111 1 1111 11111 111 111111 11111 222 4444444444444444444444 11111 1 666666666666666666666666666 11 11111 111 1111 222222222222 111 222222222222 1111 222222222 1111 11 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 333333333333333333 111111 1111 111 1 11111 22222 11111111 222222222222 222222222 111111 11 111 1111 1111 11111 111111 1111 1111 4444444444444444444 33333333333333333 111 111 1 1 11 111 111 2222 111 11 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 111
lowQualScore : 8 3 0 6 11 66 0 9999 5 5 5 5 5 5 5 6 66 5 66 0 5 5 55 5 5 4 55555 4 66 4 4 333333333333333 3 8 000000 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222 777 7777 777 777 1 8 1 4 66 4 4 4 88 66 22222222222222222222 77 5 0 0 444444444444444444444444444444 0 0 5 6666666 5 5 5 66 5 0 44444 77 000 5 5 5 2222 5 77 5 2 1 5 6 6 3 99 0 5 5 7777777777777777777777777777777 1 5 5 77 77 5 2222 5 5 2222 5 00000000 5 1 44444 99 99 55555 99 8 11 777 99 0 0 0 66666666666666666 6 99 3 6 6 99 6 0 77 55 99 99 6 4444444444444444 5 8 444 8 8 444444444444 000000000000000 11 8 3 6 0000 5 333333 5 5 0000 888 444444 5 2222 5 5 5 5 9 5 0 5 5 5 66 66 5 999999999 66 5 5 5 5 888 7777 9999999999999999999999999999 4 66 666666666 66 00 4 9999 77 5 5 6666666 5 3333 5 444444 66 5 888 5 0 5 0000 5 22222 1 222 444444 5 22222 000 4444444444444444444444 00000 5 0 000000000000000000000000000 66 00 4 1 9999 4 4 777 66666 444 5555 333333333333 888 222222222222 66 9999 66 999999999 0000 66 0 5 44 11 88888888 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 5 0 5 66 5 5 666666666666666666 1 66 888 777777 0000 2 111 0 88 33333 5 44444 3 888 99999999 555555555555 5 222222222 999 333333 5 77 2 5 44 5 3 7 111 4444 88 6 6 4444 5 77 77 77 44444 111111 4444 77 1 2222 77 4444444444444444444 11111111111111111 000 77 0 77 777 5 0 77 0 55 5 0 2 5 5 33 5 6 999 1 777 5 5 000 6 0000 111 77 2 11 11 0 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 0 99999 111 8 0 8 3 8 3
lowQualScore : . . . . .. .. . .... . . . . . . . . .. . .. . . . .. . . . ..... . .. . . ............... . . ...... .................................................................................................................................................................................. ... ... .... ... ... . . . . .. . . . .. .. .................... .. . . . .............................. . . . ....... . . . .. . . ..... .. ... . . . .... . .. . . . . . . . .. . . . ............................... . . . .. .. . .... . . .... . ........ . . ..... .. .. ..... .. . .. ... .. . . . ................. . .. . . . .. . . .. .. .. .. . ................ . . ... . . ............ ............... .. . . . .... . ...... . . .... ... ...... . .... . . . . . . . . . . .. .. . ......... .. . . . . ... .... ............................ . .. ......... .. .. . .... .. . . ....... . .... . ...... .. . ... . . . .... . ..... . ... ...... . ..... ... ...................... ..... . . ........................... .. .. . . .... . . ... ..... ... .... ............ ... ............ .. .... .. ......... .... .. . . .. .. ........ .................................................... .. . . . .. . . .................. . .. ... ...... .... . ... . .. ..... . ..... . ... ........ ............ . ......... ... ...... . .. . . .. . . . ... .... .. . . .... . .. .. .. ..... ...... .... .. . .... .. ................... ................. ... .. . .. ... . . .. . .. . . . . . .. . . ... . ... . . ... . .... ... .. . .. .. . . ................................................................................ .. . ..... ... . . . . . .
lowQualScore : 0 8 8 7 99 99 0 0000 0 0 0 0 0 0 1 5 99 0 99 0 0 0 44 0 0 4 66666 4 11 4 4 999999999999999 5 8 555555 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222 888 2222 888 888 1 9 4 4 11 4 4 6 22 11 22222222222222222222 99 0 0 1 222222222222222222222222222222 1 1 0 2222222 0 0 0 99 7 1 33333 99 000 7 7 7 4444 7 99 7 7 4 7 7 7 7 22 7 7 7 9999999999999999999999999999999 9 7 7 99 99 7 1111 7 7 1111 7 77777777 7 4 33333 22 22 88888 22 0 00 555 00 0 0 0 33333333333333333 7 22 5 7 7 22 7 0 77 88 22 22 0 2222222222222222 0 0 000 0 0 000000000000 444444444444444 00 0 8 7 0000 7 666666 0 0 6666 888 444444 7 1111 7 7 7 7 3 0 2 0 0 0 99 99 0 444444444 99 0 0 0 0 888 0000 2222222222222222222222222222 4 11 222222222 33 66 4 4444 11 0 0 2222222 0 2222 7 444444 99 0 222 0 0 0 6666 0 55555 0 111 444444 0 88888 666 4444444444444444444444 99999 0 0 444444444444444444444444444 11 66 4 1 4444 4 4 888 99999 666 6666 111111111111 111 999999999999 99 1111 99 000000000 6666 99 1 0 66 99 11111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 99 0 0 0 99 0 0 111111111111111111 4 99 888 888888 6666 5 000 0 66 11111 0 55555 6 888 88888888 444444444444 7 999999999 444 666666 7 99 3 7 44 0 2 2 777 2222 33 7 7 2222 7 99 99 99 33333 000000 3333 99 4 1111 99 3333333333333333333 00000000000000000 000 99 1 99 000 7 3 99 0 22 0 0 5 0 0 66 7 6 444 4 999 7 7 000 7 8888 777 33 5 88 00 8 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 00 6 44444 888 0 8 0 8 0 2
consensus : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TG-CAA--TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTA-TGG--T-AT-TTAAAAA-TC-TAATC-AA-G-TA--T-CA--T-GCCGTT-AT-TGTTAACAAAATAA----ATAC--TAATTGCAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-------A-TGTAA-TTGT-GTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAA-ATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--CTAG-CACGATTTT-AT-TGTTTG-TGGGTAA--CTTCGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----CA---T------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-----C---A-C-TAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCA-TC-------TCCAGAT--TC-----AAAAT-AATAAAA--AT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGNANT--AATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAA-TTATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTT-GACAAA--AAT--TAATT-ATT----CAC-AAAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TA------GT--------------------GGT-CA--G-------G-AGGAAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTT-GT-AAAC-------G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-A-CTG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAG--T--CGTCA---CCCA----------------------ACTTC----CG-TA-TTGACATG--A--TAT-A-TTA-A-TTAT-A-T-GA--TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA--T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGT--T----TCT----CCT--TTC-AGACA--TG--------TTG------C---TT--------------T-AT-AG-AC----G------A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA----A-TG----TTGTCA-A-TG-TA-AA---G-TT-ACGG-T-ATT---AAAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCAG-TA---T-------ATT---GT--AGGTAAG--CC--NT-TTTAA--AAGG-CA-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
Reference ( family-90 ) : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGG--T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TG-CAA--TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---GAACCA-ATACTTA-TGG--T-AT-TTAAAAA-TC-TAAT--AA-G-CAG-T-CA--T-GCCGTT-AT-TGTTAACAAAATAA----ATAC--TAATT-CAAAAA-ATAAGAAATATTT-ATTAAAATT-------A-TGTAA-TTGT-GTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAA-ATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--CTAG-CACGATTTT-AT-TGTTTG-TGGGTAA--CTTCGACC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGAA-C-TAGT-G-----CA---T------GT-TG--AAAATTTAC-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CT-GATTT--AA--AATCA--AATA-----C-----C-TAGCGCTGA-CA---CCCC-CCCCC-CCTCA-TC-------TCCAGAT--TC-----AAAA--AATAAAA--AT-TATGCGAAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGNNA---AATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAA-TTATTTT-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTT-GACAAA--AAT--TAATT-ATT----CAC-AAAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TA------GT--------------------GGT-CA--G-------G-AGGAAA-TAT--T-TCA----TTTTCCTT-GT-AAAC-------G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-A-CTG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTNACT-G-TTA------A-TACAG--T--TGTCA---CCCA----------------------ACTTC----CG-TA-TTGACATA--A--TAT-A-TTA-A-TTAT-A-T-AA--TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AAA---A-TCAAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA--T---------C--GTGTTC--GTAG--CTGGGT--T----TCT----CCT--TTC-AGACA--TG--------TTG------C---TT--------------T-AT-AG-AC----G------A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA----A-TG----TTGTCA-A-TG-TA-AA---G-TT-ACAG-T-ATT---AAAATAAA--A---N-AAAACCT----------T-G-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TACAAAAATCAATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCAG-TA---T-------ATT---GT--AGGTAAG--CC--AT-TTTAA--AAGG-CA-TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTANATTTT-T-GGCG---AAGAG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CC-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACC------ACGTTGTTTT-A--AAG--C--A-ATGAA-AA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|1 : GTAG-CGTAATCTA--CTCGACCAAATTGG--T--AAT-TTCGAC-CCCGCATGA--GT-T-GTA-ATC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCATAA-AC----ATATAAA--ACATGT-CCCC-ATTATGTTAAATTTATG-CAAA-TGCAACTTTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTT---------------A-------CC-------AA-A------GA-CAT-C-T-TC----GA--------A-----C---------------CG-------------A----CAA-----TTCAA----CGTAG----TA---GAGC---ACACCA-ATACTTA-TGG--T-AT-TCAAAAA-TA-T--T--AA-G-TA--T-CAATT-GC-GTT-AT-TGTTAACAAAATAACA--ATAC---AATTGCAGAAATATGAGAAATATTT-ATTGAAATTTATGTACA-TGTAA-T-GT-GTCTGTTT--AACA-ACAAAAA-----TA--TTTTTC---AAAA-ATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--CTAG-CACAATTTTTAT-TGTTTGGTGGGTAA--CTTCGAAC-AATA-TGT--------------------------AAAAAAAAAAAA-TG-T--T-CTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAA-TTA--------AAAC-ATTTA-TTT-----GT--TTT--TTTAT-------AA--TGCA-CAC-T--AGGC---C--AA-C-TAGT-G-----CAATAT------GT-TG--AAAATTTATACT-TAAA--TCGAACTA-T-TT--ATTT--AA--AATCA--AATAGTGAACTTTA-C-TAACG-TGA-CA---CCCC-CCCTC-TCTC------------CCAGAT--TC-----AAAACTAATAAAAGAAT-TATGCGAAAGATATTA-TGAA--G-AATTGTG-TCCTTGTGGGTT--AATGTCTTCTGGAT-A-TTGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA-TTACA----TGC-CATTA-TCTTAA-TTATTTC-CAAACATG-TTTCA-AAA-CTG-AACAAA--AAT--TAATT-ATT----C-C----AG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TA------GT--------------------GG--CA--G-------G-AGGAAA-T-T--T-TCA----TTTTC--T-GT-AAAC-------G-AAGT-A-TAAT-CTT------T--GGC-CA-T-A-CTG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAG------GTCA---CCCA----------------------ACTT-----CG-TA-TTGACATA--AATTAT-A-TTA-ACTTAT-A-TGAA--TTTT--T-AAGACA----A-GA-A---AGA---A-TCAAAA-ACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--ACGAGTA--T---------A--GTGTTT--GTAG--CTGGGTGCC----TCT----CCT--TTC-AG-CA--TG--------TTG------C---TT--------------T-A--AG-AC----G------A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGC----TA-GA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAA-A--AA---TC--A----A-TA----GTGTCA-A-TG-TA-AA---G-CT-ACG----AAT---AAAATAAA--A---T--AAACCT----------A-G-TAC---------GGAAGTAATTTATT-TTT-T-C-ATGT-A--TTA-AAT-TAC-AAAATC-ATGCC---GAGGA-----TTA-GTGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----T--AAA-------------------GGGTGGGG----------------------------GGGGGG--GC--AT----------------TTTTGGGTGCCAAAT-C-GGAGTT-TTATCTAGT--ATTGTTTCAGCATATTTT----GTG---ACGGG-GGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-GCCAC-TGA--TAGGTGGGCTCGA-ACTA--ATA-------AATGT--------ACG------ACAGTGTTTT-A--AAG--CAAA-ATGAATAA-----AATCGGCCT--GCGTTTTGGACGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCC-AAG-CGTCGA-TGTACGGGAGGTA
gi|10 : GTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAA-TTGGG-T--AAT-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCAC-GTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTTAA-----TG-CAAAATGCAAC-TTTTCT------CTTCAAA--------------T----------G--TTT----GA----T-----T-TTTAA----TT-G--TTACCACAGAATCTCG--A-------CCGAGAAGGAC-GCCCCGGGA-AAA-T-T-AC----AA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GAACCACATACTTA-TGG--T-AT-TTAAAAAATT-TAATCTAA-G-AAT-A-CA--TTGCCGTT-AT-TGTTAA-ATAATACC---ATAC---AATTGCAGAAA-ATGAGAAATATTT-ATTAAAATT-------A-TGTAA-TTGTTGTCCGTTT--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAAAATCAGTCG-A-AGTT-A--C-C--CTAG-CACAATTTT-AT-TGTTTG-TGGGTAA--CTTCGAAC-AATA-TGG--------------------------GGGGAAAAAAAA--G-T--TTCTGTTC--GC-TAT----ATA-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAAC-ATTTA-TTTTTTTATT--TTT--TTTAA----TTAAA--TGCA-CACCT--AG
gi|11 : gGG--T--A-T-TTCGACGC--G-ATGACTGT-T-GTA-CTC-CAG-ATTTTT-TTTCAT-GTT--T-GTTTATGCG-GAC-AA-TTT--CCG-AA-A-----ATA-TA----CATTT-CCTC-ATAATATTTT-----TG-CA-----CA--CTTTTCT-------TTCGAA--------------TT---------A--TTTATA-GAGTTGT-----T-TT-GAATTTTT-GCGTT----------------A-------CC-------ACAG------GA-AAT-CCT-TCGGCGGA--------AGACGCC---------------CGGGAAAAGACTCGAA----CGACTAACTTCAATGTATATAT----TA---GAGC---CAAACAGATACATA-TGG--TGATCTTAAAAA-TT-TAATCTAA-GATAG-TTCA----GCCATT-ATATGTTAACAAAATAA-----TACGATACTT-GTAAAA-ATATAGAATATTT-ATTAAAATT-------A-TGTAA-TTGT-GTCCGTTT--AACA-ACGAATT-----TT--TTTTTT---AAAA-ATCGGTCG-A-AGTT-A--C-C-----------------AT-TGTTTG-T-GGTCA--CTTCGACC-AATA-TGT------------------------------AAATAAAA-TG-T--TTCTGTTT--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-AT---------AAAC-ATTTG-TGT-----GT--GACAATTTCT----TTAAA--T
gi|11 : ggtagcgtgtacgtggtactgg---T------GTGTG--ACAATTT-C-TT-TAAA--TCGAATTA-T-CC-AATTT--AA--AATCA--Acgaattatccaatttaaaatcaatat
gi|12 : ggtagcgtgtacgtggtactggggtatttcgacgcgatgactgttgtactccagattttttttcatgtttgtttatgcggacaatttccgaaaatatacatttcctcataatatttttgcacacttttctttcgaattatttatagagttgttttgaatttttgcgttaccacaggaaatccttcggcggaagacgcccgggaaaagactcgaacgactaacttcaatgtatatattagagccaaacagatacatatggtgatcttaaaaatttaatctaagatagttcagccattatatgttaacaaaataatacgatacttgtaaaaatatagaatatttattaaaattatgtaattgtgtccgtttaacaacgaattttttttttaaaaatcggtcgaagttaccattgtttgtggtcacttcgaccaatatgtaaataaaatgtttctgtttgctatatggcagtgcaaaatagataaacatttgGTAG-CGTAATCTAACTTCGACCAT-TGGG--T--AATCTTCGAC-T--C-GTGA-TGT-TTGTA-CTC-CAGTATTTTTATTTCACCGTT--TTGT--AT-CA-GACCAA-TTT-TCCG-AGGA-----ATG-AAA--ACATTT-CCCT-ATTATGTTAA------G-CAAA-TGCA----TTTGA------ATTTGAT--------------T----------G--TTACACAGAAAT-C-----T-TC-GA----CC-G--AG----------------AAGACGCCCC-------GG-G------GA-AAT---T-AC----GA--------A-----A---------------CG-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TA---GAGC---GACACA-AGACTTA-TGG--T-AT-TTAAAAA-TT-TAATC-AA-G-TAATT-CAT-T-GCCGTT-AT-TGTTAACAAAATAATACCATAC--CAATTGCAGAAA-ATGAGAAGTA-TT-ATTAAAATT-------A-TGTAA-TTGT-GTCCGTTT--AACA-AC-AAAA-----CATTTTTTTT---TTAA-ATCAGTCG-A-AGTT-A--C-CCACTAGACACAATTTT-tat
gi|13 : gg--TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TTATTTAAGACA--CTT----GA----TTTGA-T-TT-GA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AATCC-T-TC----G---------A-----C---------------CG-------------A----GAA
gi|13 : gttt-------CC-------AA-G------AA-AAT---T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAGATATTA---AAGC---GAACCT-ATGCTTA-TAGATT-AT-TTAAAA--TC-TAA----A-G-CCG-T--A--T-ATT-TT-GT--GTTAAC--------------------CC-CAAA----TAA---ATATTTGATTAAAAT--------A-TGTAA-TTAT-GGCCGTTCTCAACA-ACAAAAAACATTTA--TTTTTC---AAAA-ATCCGTCGGA-AGTTCA--CAC--CTAG-CACGATT---ATCTGATTG-TAAGTAAGCTTTTGACCCAATA-TGT--------------------------AAAA------AA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTA-TTT-----gaccgccccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtagatattaaagcgaacctatgcttatagattatttaaaatctaaagccgtatattttgtgttaaccccaaataaatatttgattaaaatatgtaattatggccgttctcaacaacaaaaaacatttatttttcaaaaatccgtcggaagttcacacctagcacgattatctgattgtaagtaagcttttgacccaatatgtaaaaaatgtttctgttggctatatggcagtgcaaaatagataacacatttattt
gi|14 : gttttgcaaccttttctcttcgaattatttaagacacttgatttgatttgattgttaccacggaaatccttcgaccgagaagaccgccccAG-CGTGGTCTAACTTCGACTGA-TT
gi|14 : --T--AAC-TTCGAC-T--G-ATTA-TGT-T-TTA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GAC-AA-TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTTCCCCC-ATTGTGTT-------T-------TGCACCCTTTTCT------CTTCGAATTATTTAATACAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-CA----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GACAGAGAAGA-----CGCCCCAAGAAAATTACG-------------AACGACAACT---TTCAA---ACGTAATTT-TA---AAGC---GAACCA-ATGCCTA-TGA--T-AT-TT-GAAA-TT-TAA--------------------GCCATT-AT-TGTTAACAAAATAA----ATAT--TTA-T-CAAAAA-TTAAAA-----TT-AGTAAAA-T-------A-TACA---TAT-GT-CGTTC--AACatgttttactccagtatttttagttcactgtttgtatcagacaattttccgaaaataaaaacatttcccccattgtgttttgcacccttttctcttcgaattatttaatacagttgtttgattttcattgttaccacggaaatcctcgacagagaagacgccccaagaaaattacgaacgacaactttcaaacgtaattttaaagcgaaccaatgcctatgatatttgaaatttaagccattattgttaacaaaataaatatttatcaaaaattaaaattagtaaaatatacatatgtcgttcaac
gi|15 : agcgtggtcT---GT--AAATAAG--CC--TT-TTTTA--AAGG-CC-ATTTGGGTGCCAAAT-C-T-AGTT-TATT-TAGC--ATTGCT--AGTAATTTTT-T-GGCG---AAGAGAGGGG-GGGG---GGGCT-TTA----AAGT---CT-GCCAC-TGA--T-------C-------------------------T--------ACC------GTGTTTTTTT------------------A-AA-----AATTGGCCT--G----------------CGTTTT-GGACTCGTCC-AAGTCGTCGA-TGTACGGG-GGTA
gi|16 : G---GGTCTATTG----AAAT---CTTGCCA--TGAGTTAG-TAGGC--GA-ACTA--ATA---------TG---------ACC------ACGTTGTTTTTA--AAG--C--ATATGAA-AATTAAAAATCGGCTT--GCGTTTTGGACGG-AACCGTTTTTGGACTCGTCC-AGTCCGTCGA-TGTACGGacaggttatcaccatggtaacatcctgtaccctacctcttgaaaacggttcatttaaatcgaatttaataaattgatgggttaattcattcattttcaagtgcaaatcttccttaccccctcccccttattgtgttcaa
gi|17 : TG--A--TAT---TTGTA-TTAT-A-T-AT--TTTTGTT-AATACA----A-GA-A---AAA------CCAAT-ACTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTAGAT---------C---TAT-C--GTG-----------T----TCT----CCT----C-AGACA--TG--------TTG------C---TT--------------T-AT-AG-AC----GAGA---A----AAATCGC--A-C-T-----GCC--ATA-GA-AGA-------------------------A--AA---TCAAA----ATTG----TTCTCA-ATTG-TA-AA---GTTT-ACGC-T-A-----GAAAGAAA--A---agtaacttatcttttgaaatcgaatttaataaagattgatggtttaaattaattcatttatagtgcatattcttcattaccccccccccttccctcgtggttcaaaatacgtt
gi|18 : tA-AC-----AAGCGGACT--GCGGTTTGGATGG-A-CCGTTTT-GGACTCGTCCAAAGTCGTCGACTGTGCGGAAGGT
gi|19 : gtattcaatacagacgtgaaactCTGGAT-A-TTGG----AAT---GACAAAGCTCA------GTctatatcttttgacaaatcgaattaataaattgatgtgctttataattcattcattttta
gi|19 : G-TTTTA-AAA-CCT-GACAAA--AAT--TAATT-ACTCATGCAC-AAAAG--AGAG-ATT-GT-AC-AATTCAT-A--TA-------T--------------------AGT-CA--G-------GAAGGAAA-TAT--T-TCA----TTTTCtttaaaacctgacaaaaattaattactcatgcacaaaagagagattgtacaattcatatatagtcaggaaggaaatatttcattttc
gi|2 : ctggatattggaatgacaaagctcaGTAGACGTA-TCTAACTTCGACCAA-TTGGCTT--AAT-TCCGAC-C--G-ATGA-TGT-T-GTA-CTCTCAGCATTTTTATTTCACCGTT--G-TT--AT-CAAGAC-AT-TTTATTCG-AA-A-----ATA-AAAGAACATGT-CTCC-ATTATGTTAA-----TG-CAAA-TGCAAC---TTCT------CTTCAAAA-------------T----------GGTTTT----GA----T-----T-T--GA----TT-G--TT----------------A-------C--------AC-A------GA-A--------------A--------A-----T-------------------------------------ACTA--TTCGA---CCG-AG----AA---GACCCCGGAA--A-AT--------------T-TTCAAA--TCGTAAT--AAAG-CA--C-CA--T-AC--TT-ATGTATTTAAAAAAT---------T--TAATT-TAA-----TA-GAAATATTT-ATTAAAATT-------AATGTAAATTGT-GTTCGTTT--AACACACAAAAA-----CA--TTTTTT---AAAG-TTCAGTCG-ATAGTT-GACC-C--CTAG-CACAATTTT-AT-TGTTTG-TGGG-AA--CTTCGAAC-AA-A-TGTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TA-TGGTTCTGTTC--GCCTAT----ATACG-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------AAGC-TTTTAGTTT-----GT--TTT--GTTAT----CTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCAAAAC-TAGTTG-----CA---T------GT-TGTGAAGAATTAC-TT-TAAA--TCGAATTAAT-CTTGATTT--AA--A-TCA--AATA-----C-----T-CA-CG-TGA-CA---ACGGGCCCTC-CTTCA-TC--------CGAGAT--TC-----AAACT-AATAAAA--AT-ACTGCTGAAAGTATTA-TGAA--C-AATTGGG-TCTTTGTGTAA---AATGTAATTTGGAT-ACTTGG----GAT---GA-ATAGCT-A------GTAATTACA----TGCACATTAATC-TAA-TTATTTTTCAAACATG-TTC---AAA-CTT-GACAAA--AAT--TAATTCATC----CA----AAG--AGAG-ATTTGTTAC-A---TAT-GGTTA------GT--------------------GGT-CAAGG-------G-AGGAA--TAT--T-TCA----TT---CTT-GT-AA-C-------G-AAGT---TACTTCTT------T--GTC-CATTGA-CTGGCTGTGTTGAAT------AG-T-----TTAACT-G-TTA------A-TACAG--T--TGTCA---CC-A----------------------ACTTC----CG-TAATTGACATG--A------------------------A--TTTT--TGAAGACA----A-AA-ACACAAA---A-TTCAAA-ACTTG----AAGAAG--------C---AG-AA--ACGAGTA--T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCGG----T----GCT----CCTTCTTC-AGA-A--TG--------TTG------C-------------------T-A-----------G------A----AAATCGC--AGC-GACA-AGCC--ATA-GA-AGATC-------TA---TAC-AGAGAAAA--AA---TCAAA----A-TG----TTGTCA-A-TG-TATAA---G-TTAACAATT-ATT---AAAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA-T-TTT-T-C-ATGT-A--TCA-AA--TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GGAAA--A--T--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AG-AATTT----T--AAA-------------------GGGGGGGCAAG-TATATT-------ATT---GT--AGGTAAG--CC--AT-TTTAA--AAGGCCA-TTTTTGATGCCAAAT-C-TGAGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-GGGG---
gi|20 : gA-A-----ATA-AAA--ACATTT-CCCC-ATTATGTT-A-----TG-CTA---GCAACTTTTTCTCTGCGGCTTCGAA--------------T----------
gi|21 : tttgtcataagaacatacttaattcacg-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT---CC--AGAAATTT----TAAAAA-------------------GGGGGGGGGGG-TG---C-------ATT---GT--AGGTAAG--CC--TT-TTCAA--AAGGTCA-TTTTGGGTGCCAAATAT-GGAGTT-TTAT-Ttatgttaaatacagattatgtaat
gi|22 : -CA-TTTTGGGTGCTAAAT-CTGGAGTT-TTAA-TGAC--ATT-TTT-AGTAAATGTT-T-GGCG---AAGAG-GGGGTGGGGTCTGGGCC-CCGCTCTATAT---CC-GCCAC-TG
gi|23 : cA--TGCAACCTTTTCT------CTTCGAA--------------TT---------A--TTT----GA----TACAGTTGTT-AG----TT-G--TT----------------A-------CC-------AC-G------GA-AAT-C-C-TC----GA--------A-----
gi|25 : AACT---TTCAA---ACGTAG----TA---GAGC---AAACCA-ATACTTA-TGG--T-AT-TCAAAAaagagaagacaccccgggaaaattacgaacg
gi|26 : T-CA--G-------G-AAAAAAATAT--T-TCA----TTTTC-TT-GT-AAAC-------G-AAGT-A-
gi|3 : ---T------GG-TG--GAAATTTAT-TT-TAAA--TCGT-TTG-TTCT-GATTT--AATAAATCATTATTA-----CGCGATC-CCCCGCTGG-CT---CCCC-CCCCCATCTCA-CCCACTCTGTCCAGATGCTCTAGGTAAAA--AAAAAAG--AT-TATGCGAAATGTATTA-TGAAATCGAATTGGG-TTTCTGGGTAGTC-AATGTCTTCTGGATGA-TTGG----GAT---GACAAGCCCCA------GTT-TAACA----TGCACATTA-TC-TAA-TTATTTT-CAA-CA-A-TTTTA-AAATCTT-GACAAA--A-T--TAATT-ATT----CAC-AAAAGGAAGAGGATT-GT-AC-A---TAT----TA------TTCCAGCTTATAAGAATCTTCGAGT-CA--G-------G-AAGAAA--AT--C-ACA----TTTTC-TT-GT-AAAT-------G-AG-----TACT-CTT------T--GGC-CATG-A-CTG-CT-TGT-GGATT----TAG-G-----TTTTAT-A-TTATATATTA-TACAG--C--CGTC-----CAA----------------------ACTTC-----G-TA-TTGGCATA-------C-A-TTA-A-TGAT-ACT-GA--ATTT--T-AAGACA----A-GA-A---AA------TCAAAA--CTTG----AAGAAG--------C---AGAAA---CGAGTA--T---------C--GTGTTT--GTAG--CTGGTT--C----TCT----CCT--T-C-AGACA--TG--------TTG------CCTTTT--------------T-A--AG-AC----G------A----AAATCGC--A-C-TGCA-AGCC--ATA-GA-AGA-C--------A---TACTAGAGAAGATAAA---TCAAA----A-TG----TT-TCATA-AA-TT-AA---G-TT-A--A-C-ATT---AAA-TAAA--A---CTAAAACCT----------TTG-TAC---------GGTAGTAATTTA-T-TT----C-ATGT-A--T-A-AAT-TACAAAA-TCATTGCC---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--T--CAG-----TGAC---AG-AT----C--AGAAATTT----T--ACA--------------------GGGGGGGCAA-TA---T-------ATT---GT--AGGT--G--CC---T-TTAAA--AAGG-CATTTTTGGGTGCCAAAT-CTGGAGTT-TTAT-TAGTA-ATGGTTT-A-CAAGTTTTAT-GATGGA-AAAAG-AGGG-GGGG---GGGCT-TTG----AAAT---CT-G-CAG-TGA--TAGGTGGG--CGA-ACTAATATA-------AATGT--------ACC------CC----TCTT-----CG--C----------AA-----GATCGGCCTGGGCGTTT-----GGTA-CC----T-GA--TCATCC-AAGTCGTCGA-TGTAGCGGAGGT
gi|4 : -TTGG--TCTAAC-TTCGAC-C--G-ATGA-TGT-T--TA-CTC-CAGTATTTTTAGTTCACTGTT--T-GT--AT-CA-GGC-A--TTT-TCCG-AA-A-----ATA-AAA--ACATTC-CCCC-ACTATGTT-------T-------TGCAACCTTT-CT------CTTCGGAATTATTTAAGCAGTT----------G--TTT----GA----T-----T-TT-GA----TT-G--TTACCACGGAAATCCTCGA-------CCGAGAAG-AC-GCCCCAAGA-AAT-T-T-AC----GA--------A-----C----------------G-------------A----CAACT---TTCAA---ACGTAA----TATTAAAGC---GAACCA-ATGCTTATTGA--T-AT-TT-AAAA-TC-TAA--------------------GCCGTTAAT-TGTTAACAA---AA----AT----------------------AAATATTT-ATTAAAATT-------A-TGTAA-TTAT-GTCCGTTC--AACA-ACAAAAA-----CA--TTTTTTTTCAAAA-ATCCGTCG-A-AGTTCA--C-C--CTAG-CACGATTTT-AT-TGTTTG-TAAGTAA--CTTTGACC-AATA-TGT---------------------------------TAAAA-TG-T--TTCTGTTG--GC-TAT----ATG-G-CAGTG----CAAAATAG-ATA--------ACAC-ATTTATTTT-----GT--TTT--TTTTT----TTAAA--TGCA-CACCT--AGGC---CCGGA-C-TAGT-G----------T------GT-TG--AAAA-TTAC-TT-TAAA--TCAAATTA-TACT-GATTTA-AA--AATCA--AATA-------------TAGCGCCGACCA---CCCC-CCCCC-CCCCACTC-------TCCAGAT--TC-----AAACT-AATAAAA--AA-TATGCG-AAAGTATTA-TGAA--C-AATTGG-----------------ATGTCCTCTGGTT-A--TGG----GAT---GACAAAGCTCA------GTA---ACA----TGCACATTA-TC-AAA-TTATTTT-C-AGCATGTTTTCA-AAA-CTT-GACAAA--AAT--TAATT-ATT----CACGAAAAG--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TA------GTTCCAACAGTTAATAATCTTAAGT-CA--G-------G-AAAAAA--ATA-T-TCA----TTTT-CTT-GT-AAAC-------G-AAG----TACT-CTT------T--GGC-CATG-A-CTG-CT-TGTTGGATT----TAG-G-----TTTACT-A-TT-------A-TACAG--T--CGTCA---CCCA----------------------ACTTT----CGATA-TTG-CACGC-A--TAC-ATTTG-A-TTAT-A-T-GAATTTTT--T-AAGAC-----A-GA-A---cccttatctcttgaagtccgattttaataaaattgatcggttaattaattcattttaagtgcatatctatcccccccccccccctccgttgtttcaaaaata
gi|5 : GGG-TACTTTTGAAATTAAATGTCTTCTGGA--A-TTGGAACTGAT---GACAAAGCTCACGGTGAGTA-TTACA----TGCACATGA-TC-TAATTTATTTT-CAAGCATG-TTTCGTAAA-CTTGGACAAAATAATTGTAATT-ATC----C----AAAG--AGAG-GAT-GT-AC-A---TAT-GATTAAGCTTCGA--------------------CGT-CA--GGGGAT--G-GGAAAA-TAT--T-TCC----ATTTCTTTGGTAAAACGACTGAGG-AAGTCACTACT-CTT------TTAGGC-CATT-ACCTG--T-TGTTGGATT----TAG-GTAATTTTCACTCGTTTA------A-GTCAGTCT--TGTCAC--CCCA----------------------ACTTCCGCTCG-TA--TGACATACCATTTAT-A-TTA-A-TTAT-ATT-GA--TTTT--T-AACGCACAAGA-GA-A---AAA---A-TCAAAA-CTTTGAAAAAAGAAGCCACAGATC---AGAAACTGCATGTA--TTTTCGTCTCC--GTGTTTG-GTAG--CTGG----T----GCT----CCC--TTCAAGACATTTG--------TTG------C---TTTTGTATTTTTTAACT-AT-AGTAC----GGAGAAAA----AAATCGC--A-CTTGCA-AGCCCAAAG-GA-AGA-CATATTATTA---CAG-AGAGAAGA--AA---TCAAA----ATTGTTCCTTGTCATATTGTTA-AA---G-TT-ACAG---ATT---AAAAAGAA--AGATT-AAAACCT----------T-GTTACTAATGGTAGGATAGTAATGTA-TATTTAT-C-ATGTCATTTTATAATATAC-AAAATCATTGCCCCTGAGGAATTTTTTAGATGTTGTGGCTGGAACAGGGG-AAAGA--T--CAGAAAGTTGAC---AGCATAGGCCAAAGAAATTTTTCCT--AAA-------------------GCGGcag
gi|6 : aggattacTT------T--GGCACAG--A-CTGATT-TGTTAGATTATATTGA-G-----TAAACTCG-TTA------AATACAG--TAATGTCAAAACCCACCTCAATCTTCATATATAGAAAACTTT----CA-TT-TTTATATA--A--CAT----TA-A-TAATGA-T-AA--TTTTA-T-AAGAAA----AAGA-A---CAA---C-TCAAA---CTTGC---AAGAAG------------AGAAC--ACGCGAAA-T---------CAAGTATTT--GTAG--CTG-----T----TCTAATCTCT--TTC-AGAAAC-TG--------TAG------C---TTA-------------T-GG-AG-ACTCAGA------A----AAATAGC--A-CATGAACAGCC--ATA-GATAGA---------TAAACTAC-AGAGAAGA--AAACCACAAAACATA-TG----TTCCCA-A-TGCTA-AACAGG-TT-ACTG-T-AAC---AATATATA--A---A-AAGACCTAACACCTATAT-G-TAC---------GGT-GTAAATAA--------------T-A--TTA-AAT-TACACAACTAAACG-C---GAGGA----TTTA-ATGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--A--TCACAA-----TGACAAAAG-AT----C--AACAATTT----T--AAAAAGGGAGGGGAGGAGAGGGGGGAGGGGCAGATA---TAAAATAAATT---GTAAAAGTAAGGACCTTTT-TTTAA--AAGA-CT-ATTTGGGTGCCAAAC-T-GGAGTGATTAT-TAGTAAAATGTGT-AGTA-ATTTT-TAGGTGAATAAAAA-AAAG-GGGG---GGGCT-TTGT---AAATAGACC-GATGTATGA--TAGGTGGGCTCGACAATA--ATATTATCGTAATCCCACAAAAAACCACTAGAACACTGTTTT-ATCAGGCAC--A-ATGAA-AA-----AATCt
gi|7 : actacaaA-TGAA--C-AATTGGG-TCCTTGTGGTA---AATGTATTATGGAT-A-TTGG----GAT---GACATAGCTCA------GTA-TTACA----TGCACATTA-TC-TAA-TTATTTT-CAA-CATG-TTTCA-AAA-CTT-GACAAA--AAT--TAATT-ATT----CAC-AAA-G--AGAG-ATT-GT-AC-A---TAT-G--TA------GT--------------------GGT-CA--G-------GGAGGAAA-TAT--T-TCA----TTTTC-TT-GT-AAAC-------G-AAGT-A-TACT-CTT------T--GGC-CATT-A-CTG-CT-TGTTTGATT----TAG-G-----TTTACT-G-TTA------A-TACAG--T--TGTCA---CCCA----------------------ACTTC----CG-TA-TTGACATG--A------------------------A--TTTT--T-GAGACA----A-AA-A---AAA---AATCAAAA--CTTG----AAGAAG--------CTGCAGAAA---CGAGTA--T---------C--GTGTTCTGGTAG--CCTGGT--C----TCC----TTC--TTC-AGACA--TG--------TTG------C---T-----------------------AC----G------A----AAATCGCCAG-C-TGCA-AGCC--ATAAGA-AGA-C-------TA---TAC-AGAGAAGA--AA---TCAAA------TG----T-GTCA-A-TG-TT-AA-----TT-ACAA-TTATT---AAAATAAA--T---A-AAAACTT----------T-G-TAC---------GGTAGCAATTTA-T-TTT-T-CCATGT-A--TCA-GAA-TACAAAAATCCATGCC---GAGGA----TTTA--TGTT-T-GCTAGAA----GG-AA--AATT--CAG-----TGAC---A--AT---CC--AGAA-TTT----T--AAA-------------------GGGGGGGGCAG-TA---T-------ATTATTGT--AGGTAAG--CC--ATATTTAAGTAAGC-CA-TTTTTGATGCAAAAT-C-G-AGTT-TTAT-TAGT--ATTGTTT-AGTATATTTT-T-GGTG---AAAAG-GGGG-G
gi|8 : AC-TTCTAAAGGTCGAATTA-TACT-GATCTTGAA--AATCA--A-TA-----C-----CCTAGCAATGA-AATTTCCCC-CCGCC-CCTC--TC-------TCCAGAT--C-------AAA--AATACAA--ATATATGCGAAAAGTATGAGTAAG--C-AATTGGGCTCCTTGTAAGT---AATGTCTTGTGGAT-A-TTGG----AACCGAAACAAAGCTCA------GTT-TTACACAAGTGCAC-TTA-TC-TAA-TTTATTT-CACACATC-TTTCA-AAA-CTT-GACAAA--AAT--TTATT-ATC----C-C-GAAAG--AGAG-ATT-GT-ACAA---TATCG--TA------GT--------------------GGTGCA--GTTGGAGCA-AGGAAA-TATAATATCACTATTTTTTCTT-GT-AAAC-------GAAAGT-A-TATT-CTCACATTGT--GGC-CATT-G-C-G-CT---TTG---T----TAGTG-----TTAA-------A------A-TCCAG--T--TGTCAAC-CTCA----------------------ACTTC----CG-TATTTGACATA--A--AATCATTTA-C-TTTT-A-TCAA--TATT--T-AA---A----A-GACA---AGATTCA-TCACAATACTTG----AAAAAG--------C---AGAAA--A-GAGTA--T---------C--GTACAT--GTAGAATTAGGT--TCTGCTAT----CCC--TTC-AG-TA--TGATGAATGATTGACTGGCC---TT--------------TCATCAG-AC----G------AGAAGAAATCGCA-A-C-TGCA-AG-C--ATA-AA-------------T-------------AGA--AA---TCAAA----A-TG----TCGCAG-A-TG-T--AA---T-TT-ACAG---ATTCAAAAGATAAAATA---G-AAAATCT----------T-G-T-C----------GTAGTAAATTA-T-TTT-TGG-ATGT-A--TTC-AA--TACAGA
gi|9 : c--T--AATGTTCGAC-G--G-ATGA-TGTAT-GTTTCTC-CAG-ATTTTTATTTCACCGTTGTT-GT--ATGCA-GAC-AAGTTT-TCCG-AA-ATAAAAAAA-AAA--ACATTT-CCCCCATTATGTTAA-----TGCCAA--TATGGC------------------AA--------------T-------------TTT----GA----T-----T-TT-GA----TTGG--TT----------------A-------CC-------AC-GCA----GATAAT-C-TGTC----AG--------A-----C---------------CG-------------A----
gi|9 : CAACA-AATAATGT--------------------------AAAAAAAAAAAAGTGTT--TTTTGTTCAGGC-TACATTAATG-GTCTGTGCCAACAAAATAGTATAGGAATAACAAACTATTTT-TTT-----TTTATTT--TTTATTAGATTAAATTTGCACCACCTTAAGGCATGCCCAA-CTTAGT-GTCAAACA---TGTGTGGGT-TG--AAAATTagaagacgcgccccggtactctagtccgacgaaccggcgtgattggaaaattacgataacaattacatttctaaaaggtttgtaattcctccctccctttcccgacgttagataagtatcgaaccaaaatacttatgggatgatttaaataaaaagttacctattagcagccaatttcttaatattgttctgatgcatttatctttggttaaactggactggcgcaacaaataatgtaaaaaaaaaaaagtgttttttgttcaggctacattaatggtctgtgccaacaaaatagtataggaataacaaactattttttttttattttttattagattaaatttgcaccaccttaaggcatgcccaacttagtgtcaaacatgtgtgggttgaaaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCATTTTAAGATTGCATATCTTCATTACCCCCTCACCCTCGTTGTGTTCAAAATA