lowQualScore                  :                                                                       4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         11111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                          1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                        
lowQualScore                  :          1    99999999999       2              55      33             1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                 3               2222222              11111                2          5555555    2222                             99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999                 22    1111             4444        4444                       444            22222      1111      55555555555        11111      111111111          22222                 11         888888888888888888888888         22222        55      11        555555555          333333333          999999999                        33  1           2            1       333333333333333333           1      44444     1            1111    44444444444444444444        55555555        11        1111     222222222222   111  444       22222222          00000000000000000000000000000000000000                    11          11     444         3333    222         6666666666666666666666666666666666666666666666666      2   11              22222   0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000       1   22222         222    444         11  555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555       55               
lowQualScore                  :     3    5    00000000000       6 6            55      55   99   99   1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111    99  6   99   1       99 6    0000000    99    6   55555         6   6  3  3     6 3333333    0000   999999  2  6  6        6  11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                 55    4444    99  88   1111        3333   666      6  6 6     000      6     11111  1   3333      11111111111        66666      444444444   99 6   99999    6   6   99   55   99    222222222222222222222222         55555        55      11   8  0 777777777   0  8   000000000   1      111111111     0 8    0  0     1  00  6   0   0   4 8  0       3       000000000000000000 6    99   7  99  00000 6   5 6    6     7777    44444444444444444444        00000000 1      11        7777     222222222222   333  999       11111111  9       44444444444444444444444444444444444444       3   99999    11          11     444   99    8888    777     8   2222222222222222222222222222222222222222222222222      3   11     5        00000   2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222       6   00000         000    888  8      33  777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777       55            6  
lowQualScore                  :     .    .    ...........       . .            ..      ..   ..   ..   ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................    ..  .   ..   .       .. .    .......    ..    .   .....         .   .  .  .     . .......    ....   ......  .  .  .        .  ....................................................................                 ..    ....    ..  ..   ....        ....   ...      .  . .     ...      .     .....  .   ....      ...........        .....      .........   .. .   .....    .   .   ..   ..   ..    ........................         .....        ..      ..   .  . .........   .  .   .........   .      .........     . .    .  .     .  ..  .   .   .   . .  .       .       .................. .    ..   .  ..  ..... .   . .    .     ....    ....................        ........ .      ..        ....     ............   ...  ...       ........  .       ......................................       .   .....    ..          ..     ...   ..    ....    ...     .   .................................................      .   ..     .        .....   ...................................................................       .   .....         ...    ...  .      ..  .................................................................................       ..            .  
lowQualScore                  :     0    5    22222222222       0 7            00      55   22   22   8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888    22  7   22   8       22 7    8888888    22    7   22222         7   7  7  5     7 0000000    7777   222222  5  7  7        0  33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                 88    7777    22  55   8888        3333   777      7  7 7     777      7     55555  7   5555      22222222222        77777      555555555   22 7   88888    0   7   22   88   22    000000000000000000000000         00000        00      00   0  8 444444444   6  0   222222222   0      000000000     6 0    8  8     0  88  0   8   8   0 0  8       3       555555555555555555 7    22   7  22  77777 7   0 7    7     0000    66666666666666666666        66666666 4      00        0000     222222222222   222  222       00000000  8       44444444444444444444444444444444444444       2   22222    00          00     222   00    0000    000     0   0000000000000000000000000000000000000000000000000      2   00     2        00000   4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444       0   88888         888    888  0      88  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888       00            0  
consensus                     :  ATCNAACTTATTT--CGGTC----ATAATTA-G-GTCCGATAACTC--TGTTTT-GACA--ATG--AGAC---TATCC-T-TGTTGACTAAACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAA-TTAAATACGCG-AGA-CATTTT--G-TGACA-G-TAGGG-AAGTAATGAG------------TTACAGGG---ATGTTAATT-TACC-T-TNAAAAACCCCCA---ATTCACACC-----AT---TGATTTAATTTTATC---AGA--TTTTAATTC-ATAT---GATTA-C-AAAGTAT--TAA-AACAGA-----AGT--AG-CACGAGCAC-A-TA-TT-GTGT--TTTTGTC-TTTATTACGA--TG-AAACTTAAATCTTACAGGGGGG------------------AA------------ATTTACGTGTT-GAA-AAAA-T-AT-GTT-GAATACAT--ATGCGATTA-TT--GATATACTT-ATGATCCT-CACGATTTTGTG-AATGATG-AATG-AATAAACT----CTTC--A--TGC-T-TAACTTAAA-CGTGG-CTTTC----GTT-GAAAATT----GA-GGTG-TTA--G-G--TGTC-ACT-----TGTTAA-ATT-T-T-----TC--TGTGNTTTCC----CCTGCCAA-T--TCCTTA-T-----TAC--TTGTAA---AT-GCA--TGC---TCCTA---------A--TTAT-GAAAT---G-G-T--C-CTCT-AGATC----NTA---TTCAAA--CC-AAT--TAT-CGGATAG--C-TAAAA------CAAC--ACAA-ATT--C-TTCCAACAAC-ACA-TC-AAATGATA-TA------ATTGAG-TAGA-TA-T-AACCT-TT-GTTTGTACAAGT---------AAAA-GACAA-TGGCTTCTAAAGATTT---ATCA-ATGGT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGCA--AGCA-C-TTGTA--TTNGTGG----TCAGTCAAGGA-AAGGACATTTCT-GA-A-CTTCAT-GGGTAAGCAATGA----TTTTCTCTT-TCTTGTCA----TTTAT-TCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTT-T-A-AAATAAAC-ACA--ACT--TTC--ACATGA-----C---------CGCT---TTGTTTACTCCNGCTTGCGTCC--GCCATT--TTG-AAAT--GTT-TCAATATCG-GTGAA-AAN---TCTTAATTTT--CA-AGACGATTTTG-AAGCAATAAAAGTAGG-TTCATGAACTGAATGTT-TTTCATGTTT-CATATAG-TTTA----GTGTT----T-TAAC--TTTTAC--AC-TAG-A-TGTCCCAACT-TTTTT--CACAGAT------AT----ATGA---AAAAAAGGTTTTGGA-AAAATACC--TTTTTATA----CACGCA--A---AATN-CCGAA-AA-A-TTCACCA-CAT--GCTCGTTGATTTAC-NA--CGTAT---AA-TCAATTAAAG---------GACGTATANACANTACTTTTC--AAATGAATTT--TGAAG---CAAT-AAAT--CATTTTT--CCGAA-CTG----AAATAAAATATAT----C--ATC-TTT---TGT-AGAAAATT---AATGCT-CTT--TCAGGCCAGGGGTC-----CAACTTTATTCTANT-TTATA--CAATNCAT-G---TAAAA--A--AGTTATAATA-----TAGT-----TTAATCA-CAC----ACTCCCCGTT-ATCGCCTATTA-TATAAA--TAC-CAG---A-A--GT---AC-TCTA-T-GATAGAAGT--AAAC---AAAT--------AAC-------CGA-CAAGT-C--GTGACGG--CCGCAATAGTTGGAT
Reference ( gi|2 )            :  ATCAAACTTATTTTGCGATCGTGTATAATTACG-GTCCGATAACTCCTTGTTTTTGACA--ATG--AGACGTACATCCGTGTGTTGACTAAACGGTAGTT-GT---GATCAGGAGAA-T-AAATACGCACAGATTATTTT--G-TGACATGCTAGGGTAAGTAATGAGCTCAAAACAAAGTTACAGGGGCAATGTTAATTATACCACATAAAAAACCCCCA---ATTCACACC-----AT---TG-TTTAATTTTATCG--AGAATTTTTAATTTTATAT---G-TTA-CAAAAGTAT--AAA-AACAGA-----AGTTAAA-CACAAGCAC-A-TA-TT-GCTT--TTTTATC-TT-ATTACGA--TGGAAACTTATATCTTCCAGGGGGG------------------GA------GGGGGGATTTATATGTT-GAA-AAAA-T-AT-GTT-GAATATAT--ATGCGATTA-T---GATATACTT-ATAATCCTGCATGATTTTGTG-AATGATGTAATGCAATAAA-T----CTC---A--TGC-T-TAACATAA--CGTGGACGTTT----GT--GAACATT----GA-GGTG-TTA--G-G--TGTC-ACT-----TGTTAA-ACT-TCTAAAGATC--TGTGATTTCC----CCTGCCAAAT--TTCTTAGT-----TAC--TTGTAA---ATTACA--TGC---TCCTA---------A--G-AT-GAAAT---A-G-T--C-CTCTCAGATC----TTA---G-CAAA--CC-AAT--TATTCGGATAG--C-TAAAA------CAAC--ACAA-ATT--C-GTCCAACAAC-ACA-TCAAAATGATA-TA------ATTGAGTTAGA-TA-T-AACCT-TT-GTTTGTACGAG----------AAAA-GACAA-TGTCTTCTAAAGATTT---ATC--ATGGT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGCAC-AGCA-C-TTGTA--TTAGTGGC---TCAGTCAAGGACAAGGACATTTCT-GA-A-CTTCATCTGGTAAGCAATGA----TTTTCTCTT-TCTTGTCA----TTTA--TCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTT-T-A-AAATAAAC-ACA--ACT--TTC--ACATGA-----C---------CGCT---TTGTTTACTCCCGGTTGCGTCCGAGCCATT--TTG-AAAT--GTTATC-ATATCG-GTG-A-AAT---TCTTAATTTTTCCACAGTTGATTTTG-AAGCAATAAAAGTAGGTTTC-TGAACTGAATG-T-TTTCATGTTT-CATATAGATTCA----GT-TT----T-TAAC--TTTGAC--ACGTAGCA-TGTCCCAACT-TTTTT--C-CAGAA------AT----ATG----AAAAAAGGTTTTGAA-AAAATACC--TTTTTATA----CACGCA--A---AATG-CCGAG-AAAACTTCACCA-TAT--GCTCATTAATTT-C-T---CGTAT---AA-TCAGTT---G---------GACGTATACACACCATTTTTC--AAATGAATTT--TGAAG--ACAAT-AAAT--C-TTTTA--CCGAA-CTG----AAATAA---ATAG----C--ATC-TTT---TGTCATAACATT---AATGCTCCTT--TCAGGTCAGGGGTC-----CAACTTTATTCTAAT-TGATA-GTAATGCAT-GA-ATAAAA--A--AGTTATGA-A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----ACTCCCCGTT-TTCGCC-A-TA-TATAAA--TAC-C-----ACA--GT---AC-TCT--T-GATAGAAAT--AAAC---AAATTG-----AAAC-------TGATCAAAT-CA-GTGATGGCCCCGCAATAGTTGAATG
gi|9                          :  ATCCAACT-ATTT--CGGTC----ATAATTA-G-GTCCGATAACTC--TGTTTT-GACA--ATG--A-----------------T-ACTATACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAA-TTAAATACACG-AGAT-ATTTT--GGTGATA-G-TAGGG-AAGTTATGAG------------TTACAGGG---ATGTCAATT-TACC---TTAAAAACCCC-----ATTCACAC------AT---TGATTTAATTTTATC---ACA--TTTTAA-TTCATAT---GATTA-C-AAAGTAT--TGA-AACAGA-----AGT--AG-CGC-AGCACAA-TATTT-G--T--CTTTGTCTTT-ATTACGA--T-GAAACTTAAATCTTACAGTGGGG------------------AA--------------TTACGTGTT-G-A-AAAA-T-AT-ATT-GA----AT--ATGCGATTATT---GATAT
gi|13                         : tATCAAACT-ATTT--CGGTC----ATAATTA-G-GTCCGATAACTC--TGTTTTT-ACA--AGG--AGAC---TATCC-T-TGTTGACTAAAC-GT-----------ATCAGATGAATT-AAATACGCA-AGA-CATTTTG-G-TGACA-G-TAGGG-AAGTAATGAG
gi|6                          :       catTATTTCGCG-TCATA---AATTAAGCGTCCGATAACTC--TGTTTT--GCA--ATG--AGA-----------------ACTATACGTTAGTTCGTATTGATCAG----A-T-GAAT----------TATTTTTGG-TGACACG-TAGG--AAGTTATGAG-----------GTTACAGG----ATGTTAATTTTACC-TGTAAGAATCCCCCA----TTCACACC------T---TGATTTAATTTTATC---AGA--TTTTAATTC-ATAT---GATTG---AAAGTATT-AAA-AACAGA-----AGTTAGCTCAGAAACA--A-TA-TT-TTGT--TTTTCT--TT-ATTACGA--TG-AAACTTAAATCTT--AGCGGGGCGTAGTCCCAGGTTTATTGAACTGCGGGGGGGATT-ACATGTTTGAA-AAAA-TTAT-GTTTGAG---AT--ATGCGATTA-TTG-AATATACTT-ATG-TCTT-C-TGATTTTGTG-A-TGATG--AT-TAATAAA-C----CTCC--A--TGC-TCTAACTTAA--CGTGGCTATTG----TT--GAAGATT----GAGGGTG-TTA--A-GAAT-TC-AC------TGTTAA-ATT-------G--C--TGTGTTTTTC----CCTGCCAA----TTGCTAAT-----TACT-TTGTAA---ATT-CA--TGCCT-TCCTA---------ATTT-AT-G--AT---AGG-T--T-CGCT-AGATCGATATT------CAAA--CC-AAT--TAATC-GATAG--C-TAAAA------CAAC---CAA-ATTTCT-GTCCAACAATAACA-CC-AAATGACA-T-------ATTGAG-TAGA------------------TGTACAAAT---------AAAA-GACAA-TGGCTTCT-AAGATTT----TCA-ATGATTATATTG-----------CCC--AAGTCATTTG--C-AGCA-C-TTGTACTTTGGTGG----TCAATCAAAGG-AAGACCATTTCTGGA-A-CTTCAT-GGGTAAGCAATGA----TTT--TCTT-TCCTATAA----TT------ATAGTC-----CATTTACCA-A----GAT--A-CTC-T-T-AGTTGTAC-ATA--GCTG-TTC--AAAC-A-----C---------CTTT---TTGTT
gi|11                         :      ccaaTATTT--CGGTC----ATAATTA-G-GTTCGATAACTC--TGTTTT-GACA--ATG--AGAC---TATCC-T-TGTTGACTAA-CGGTAGTTCGT----ATCAGATGAA-TTAAATACGC---GA------------GACA-GTTAGGG-AAATAATGAG------------TTACAGGG---ATGTTAATT-TACC---TTAAAAACCCC-----ATTCACATC------T---TGATTTGATTTTATC---AGA--------TTTTA------G-TT-------------------CAGT-----AG------CACA-GCAC---TA-TTTG--T--TTTTGTC-TTTATAACGA--TG-AAACTTGAATCTTACAGGGG
gi|12                         :                 atatcccacATAATT-TG-GTTCGATTACTC--TGTTTTC-ACA--ATG--AGACTT-TATCC--CTATTGACTAACAGGTAG
gi|14                         :                  tacttcggtcAATTAGG-GTCCGATAACTC--TGTTTTGAACAACATGAAAGATATACcgcatacgtgaattagacaggggaggtaatcgagagttagagctttaggtgacagagatgcagggagattaatttattctaaatccctcgttcacaccttgatttgattgtg
gi|10                         :                                                                                                                   tatcaactattattcaggtcctaTTTG--G-TGACA-G-TAGGG-AAGGAATGAG----------A--TGCAGGGA-AAT--TAATT-TACCTT-TAAA---CCGCTC---ATTCACACC------T---TG-------------------ATTTTTAATTCAA-AT---GATTA-CAAA-GTAT--TGA-AACAGA-----AGT--AG-CA---GGGC-A-TA-AT-GTTTGTTTTTGTC-TTTAATACAA--TTT---CTTAAATCTTACAGGGCGG------------------AA--------------TTATATGTT-GA-----------------AACATAT--ATG-----A-TA--GATACACTT-CTGATCCT-CGCGATTTTGTG--ATG--GTGATA-AATAAACT----TCC---A--TGC-ggtagttcgtaca
gi|1                          :                                                                                                                                                                                       cggcaaattgcaacagatgtatcgagttaacgctCCCTCATATATTGACACCGGCATATGAATA-TTAAATTTTATCA--AGA--TTTTAATTCAATCTCTGA-TTAACTGAAGTATTGAAATAGCAGAGAAGTAGCTGGA-CACCAATAA-A-T--CT-GGGT--TTTTGTC-TTTATTACGAAATGCAAACTTACCTCTTACAGGGGA---------------------------------ATTTACAT-TT-GAA-AAAA-T-GT-------AGACAT--ATGCGATTA-TTTTGATATACTTTATGAC---ACATGATTT-GTGTAATGAT--AAGGACTTAAA-TACGACTT---ACCTGCAT-TAACTTAAACTGTAGGCTTTTTGTTGT--AGAAATTATGAGA-GGTGGTTACGG-G--TGTCGACTAGAGGTACTAATATTATC-----ATCGCTGTTGTT--------CTTCCACATGCTCCGTTCT-----TTC--TTGTAACAAATGCCA--TGC---TTCTATTTTGCTTGC--G-CTAGAAATTCAG-G-T--C-TTACTAGATC----GTATTCG-ATAATCCC-AATGTTAT-CGGATAGAGCATGAAAACATAGCAACCAATAA-TTT--CTGTCCAACAAC-ACA-TC-CAATGACA-T-------ATTG-GTAAGAGTATT-AACCTGTTGGTTTGTACAAAT---------AAAATGAAAATTGGCTTCTAAGAATTTGCAATC---TGAT----CTATTTAGCCCTATCCCACACGTCA-TTGCA--AGCACC-TTGTA--TTCGTGGTGTGTCAGTCAAGG---AGT---TTTCT-GACATCTACAATTGGGAAGCAATGGAAGTTTTCCTGTTGTCTCGTCAAGTGTTTATTTCATAACACACCGCAATTA--ATA----CAG--AGTCT-TGA-AAATAAAC-ACA--ACTTCTTCTAGCATAAAGTAGCTCGTTAAAGCGCTCTATCGTTTACTCCGGCGTGCTGCC--GCCATCTGTTG-AA-------------ATCGAGTG-AGAATTGCTCTTAATTTTT---CAGACGATATTT-CAGC-AT-AAAGTTGGTTTC-TGA--TGAATGTT-TTTCATGTTTCCATATAGTTTCACATTGT-AT----T-TAACTATTTAACCTAC-TAGGATTGTCCACACTGTTTTTCAC-CAAGATGCTGGAT----ATGA---AAAAAAGG--TTGAATATAATATCGTTTTTTATAACAGCGCGCA--A---CATACCCGCGCAAAATCTCACCA-AATCAG-TC-TTAATTT-CATA--CGC-T---AATTTAATT---GAAGGTCCAAAACATAAATATATAGTGTTTCGAAAATGAGTTTTCTGAAGGCGCAATAAAAT--CTTTTTAATTCGAA-CTGAATAAAATAA---ACAGAATTCAAATC-TCTCTGTGTTAGAAATTT---ACTGCTCTTTAATCGGATGATGGGACGTAATAAACTT--TTCTACT-TTATATACATTCCATCGC-GTAAAATTAATAGTTCTAA--------GGTTCGAATTAACCAGCAC----G-TCCCCGTTATGCGCCTA-TA-GGTAAAGGTAC-CAGG--ATAAGGT---A--TCT--TAGATAGGATTG-AAAC---AAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                         tgaacttaatacgcgagagatattttggtgaagtaaatgaggttttatgagcttgactagggataaatttaccttaaacattAATTATATTGTCAGA--TTTTAATTC---AC---A-TTA-TGA---TAT--TAA-AACAGA-----AGT--AG-CACG-GCAC-AATA-CT-ATAG--TTTTGCC-TTTATTACAA--TG-AAACT-A-ATCTCACAAGGGGG------------------AA--------------TTATGTGAT-GAACAAAA-T-AT-GGT-AAATACATGTATGTGGTTA-TT--GTTATACTT-ATGATCC-GCACAATTGTGTG-A-TGGTG--ATA-AATAAACT----TTT---A--TGC-T-TGACTTAA--CTTGGTCCTTC----AT--GAA-ATT----GA-GGCG-TTA--ATG--AGTC-ACT-----T-TTAA-A-----TAA---TC---ATAATGT---------GTCAACT--TCTTT----------C--TTACAA---AT-GCA--TGC---TCCTA---------A--TTAT-AAAAT-----G-T--CTCTTTTAGATC----TTA---TTCAAA--CC-TAT--TAT-CGTATAG--C-TGAAA------CAAC--ACAA-TTT--C-TTCCAACAAC-ACA-TC-AAATGATA-TAT-----TTTG---TAGA-TA-T-AACCT-TT-GTTTTGACAAGT---------ACAC-GGTAC-TGGTTTCT-AAGCTTT----TCA-ATAGT----TTG-----------CCTAAAAATTGTTTGCACTAGC--------A--TTAGTGG----TCAGTCAA-AAGAAGTACGTTTCT-GA-A-CTTCAT-GGGTAAGCAATGA----TTATCTCCT--------A----T-----TCATAACA-----CAAATA--G-ATTTGCAAACA-TCT-A-A-AAATAAATAACATTAAT--TCC--ATAT-A-----CAAAA-----CGAT---TTGTTTACTCCAGCTTGCGTCC--ACCATT--TTG-AAATAAGTTTTA-ATATCG-GTGAA-AAT---TCTAAATTTT--CA-AGACGATTTGG-AAGCATGAAAAGTAGG-TTC-TGAACTGAATA-TCTTTTATGTTT-CATACA-ATGCA----AT-GT----TATAAC--T---AT--AC-TA-TA-TGTCCAAAC--GATTT--C-CAGAA------GTAATAATGTAATAAACAA----TTG---ATAATTCC--GTTTTATA----CATGCT--A---AATC-CCT-G-AATA-TTAAACA-TAT--GTTCATTGATTT--------GTATGTAAA-TCA-TT---T---------GACGAATAAACAGTACGTTAC--AAATGAAATT--TGATG---CAAG-AAATA-A-TTTTC--CTAAA-TTG----AAAGAAAATATAT----C--ATC-CTT---TG---TAGAATTA--AATG-TTCTT--TCAAGCAAGGGGTC-----CAA---------AAT-GTAT--GT-ATTCAT-TATATGAAA--AT-AGTTATCATA-----TA-------TTAATTATTAC-----CACCCC--T-AACGCCTATTG-TATAAA--TAC-G-----A-A--AT---AC-TATA-T-AATAG--GT--AAAC---AAAT--------AAT-------CGAACAAGTCCC-GTGACGA--CCGCTATAGTTGGATaaatcgctacatgttcagcgtgatgacgcgttatatgtctggagatatggtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agcttagattaagaataggtctacttaaaattttagcggccgatttgatgctttgcattaaTATATGTT-GAA-AAAAAT-ATTGTT-GAATAT------GTGATAT-T---GATATACTT-ATGATCCT-CATGATTTT-TG---TGATG-AATG-AATAA--T----CTTCCGA--TGC-T-TAACTTAAA-CGTGG-CTTTT----GTTTGAA-ATT----GA-GGT--TAA--G-A--TTTT-TCC-----TGGTCG-GTT-TTTCC---TC--TGCAATTTCTGTATCCTAC--AAT--T-CTTA-T-----TAC-------A---ATTACAAATGCCTGTCCTA---------A--TTAT-GAAAT---A-G-TAGC-CTCT-AGATC----GTA---TTCAAA--CCCAAT--TAT-CGGATAG--C-TAAG-------CAAC--ACAAGATT--C-TTCCAACAAC-ACA-TCAAT-TGATA-TATAATTTATTGAGT--GA-TA-T-AACCT-TT-GTTTGTACAAG----------TAAA-AACA----TTTTC-AATGGTGT---A-------------TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGCA--AGCA-C-GTGTA--TTA-TGG----TCAGTCAAG---AAAGAAATTTTG-GA-A-CTTCAT-GGGTAAG-AATGA-----TTTCTCTC-TCTTGTC-----TTTAT-TCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTTCT-ATAAAT-AAC-ACA--ACT--TTC--ACATGG---------------CGCT---TTGTTTACT-CCGCTTGCGTCC--GCCATT--TTGAAAAT--GT--TCAATAGCG-GTGAA-AAA---TCTTAATTTT--CA-AGACGATTTTGAAAGCAATAAAAGTAGG--TCATGAACTG-ATGTT-TTTCATGTTT-CATATAG-TTTA----GTGTT----T-TAAC--TTTTAC--AC-TAG-A-TGT-CCAACT-TTTTT--CACAGAT------AT----ATGA---AAAAAAGGTT---GA-AAAATACA--TTTTTATA----CACGCAACA---AATG-CCGAA-AA---TTCACCA-CCT--CCTCGTTGATTTAC-A---CGTAT------TCAATTAAAG---------GACGTATACACTACA-TTTTC--AAATGAATTT--TGAAG---CAAT-AAAT--CATTTTT--CCGAAGCTG-----AAT-----ATAT----C--ATCTTTT---TGT-AGAA-ATT---AATGCT-CTT--TCAGGCCAGAGGTC-----CAACTTAAT--TAATCTTATA-TGAATGCAT-G------AA--A--AATTAT-A-A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----ACTCCCCGTT-ATCGCCTATTG-TATAAA--TA-----------------------------ATATAGGT--AAAC---AAAT--------AAC--------------------GTGATGG--CCGCAATAGTTGG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACTTAA--CGTGG-CTTTT----GTT-GAAAATT----GA-GGTG-TCA--G-G--TG-C-ACG-----TGTTAA-A-----------TCA-TGTGTTTTCC----CCTGCCAA-T--TACTTATTACATGTAC--TTGTAA---AG-GCA--CGC---TCCTA---------A--TTAT-GAAAT---G-GGC--C-CTCTAAG-TC----TTA---TTCAAA--CC-AAT--TAT-CGGATAG--C-TAAAA------CAAC--ACAA-ATT--C-TTCCAACAAC-ACA-TC-AAATGATG-T-------ATTGAG-TAGA-TA-T-TA-CT-TT-GTTTGTACAAGTAACATGAGTAAAA-GACAA-TGGCTTA-AAAGATTT----TCAAATGGT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGCA--AGCA-CTTTGTA--TTTGTGG----TCAGT-AAGGA-AAGGACATTTCT-GA-A-CCTCA--TGGTAAGCAATGA----TTTTCTC-T-ACTTGTC-----TTTAT-TCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTT-T---AAATTAAC-ACA--ACT--TTC--AC----------------------------------------TTGCGTCC--GCCGTT--TTG-AAAT--GTT-TCAATATTG-GTG-A-AA--------AATCTT----------ATTTTG-AAGCAATAAAAGTCGG-TTC-TGAACTAAATG-T-TT---TGTTT-CATATAG-TTTA----GT-TCTCAGT-TAAC--TTTTAC--AC-TAGAA--GT-CCAACT-TTTTC--C-CAGAT------AT----ATG----AAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TGTGTTTTTC----CCTGCCAA-T--TTCTTA-T-----TACAATTACAA---AT-GCA--TGC---TCCTA---------A--TTAT-GAAAT---G-GAT--C-CTCT-AGATC----GTA---TTCAAA--CC-AAT--TAT-CGGATAG--C-TAAAG------CAAC--ACAA-ATT--C-TTCCAACAAC-ACATTCAATTTGATATTAATT---ATTGAGATAGA-TA-TAAACCT-TT-GTTTGTACAAG----------TAAA-AACA----TTTTC--AATGTGT---A-------------TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGCCA-AGCA-C--TGTA--TTA-TG-----TCAGTCAAG---AAAGAAATTTCT-GA-A-CTTCAT-GGGTAAG-AATGA-----TTTCTC-T-TCTTGTC-----TTTAT-TCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTTCT-T-AAATAA---ACA--ACT--TTC--ACATGG---------------CGCT---TTGTTTACT-CCGCTTGCGTCC--GCCATT--TTG-AAAT--GT--TCAATAGCG-GTGAA-AAA---TCTTAATTTT--CA-AGACGATTTGA-AAGCAATAAAAGTAGG--TCATGAACTGAATGTT-TTTCATGTTT-CATATAG-TTTA----GTGTT----T-TAAC--TTT-AC--ACATAG-A-TGTCC--ACT-TTTTT--CACAGAT------AT----ATGA---AAAAAAGGTT---GA-AAAATAAC--TTTTTATA----CACGCA--ACATAATGTCCGAA-AA---TTCACCA-CAT--CCTCGTTGATTTAC-A---CGT-T---TA-TCAATTAAAG---------GACGTATACACACTATTTTTC--AAATGAATTT--TGAAG---CAAT-AAAT--CATTTTT--CCGAA-CTG-----AAT-----ATAT----C--ATC-TTT---TGT-AGAA-ATT---AATGCT-CTT--TCAGGCCAGAGGTC-----CAACTTTAAT-TATT-CTATA--TAATGCAT-G----AAAA--A--AGTTAT-A-A-----TAGT-----TTAATCA-TAC----ACTCCCCGTT-ATCGCCTA-TAGTATAAA--TATGCAATGAAAA--GTTGGACATCTAGT-G-TAAAAGTTAAAACACTAAACTATAGGTAAACAAATAATTGATCAAAT-CACGTGATGG--CCGCAATAGTTGGAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTTTACCTATAG-TTTA----GTGTT----T-TAAC--TTTTAC--AC-TAG-A-TGT-CCAACT-TTTat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtgtttttccctgccaatttcttattacaattacaaatgcatgctcctaattatgaaatggatcctctagatcgtattcaaaccaattatcggatagctaaagcaacacaaattcttccaacaacacattcaatttgatattaattattgagatagatataaacctttgtttgtacaagtaaaaacattttcaatgtgtattgcccaaaagtcatttgccaagcactgtattatgtcagtcaagaaagaaatttctgaacttcatgggtaagaatgatttctcttcttgtctttattcataacacaattaaacagatttcttaaataaacaactttcacatggcgctttgtttactccgcttgcgtccgccattttgaaatgttcaatagcggtgaaaaatcttaattttcaagacgatttgaaagcaataaaagtaggtcatgaactgaatgtttttcatgtttcatatagtttagtgttttaactttacacatagatgtccacttttttcacagatatatgaaaaaaaggttgaaaaataactttttatacacgcaacataatgtccgaaaattcaccacatcctcgttgatttacacgtttatcaattaaaggacgtatacacactatttttcaaatgaattttgaagcaataaatcatttttccgaactgaatatatcatcttttgtagaaattaatgctctttcaggccagaggtccaactttaattattctatataatgcatgaaaaaagttataatagtttaatcatacactccccgttatcgcctatagtataaatatgcaatgAAAGATT---GA-AAATTACG--TTTTTATA----CATGCC--A---TGTC-CCTAA-AA---TTTACCACTA---GCTCGTTAATTT-A-TATGCGT-T---GA-TCATTT---G----------ACTTGTAACCACTACTTTTC--AAATGAATTT--TGAAG---CAAA-AAATCAC-TTTT---CCGAA-CTG----AAATGAAATATAT----C--ATT-TTC---TGT-AGAA-ATTTTAAATGCT-CTT--TCAGGACAGGGGTG-----CAAAAGTTTTCT------ATA--CAATATTT-G----AAAA--A--AGTTATAATAGTAATTAGT-----TTAATTA-CACACTGACTCGCCGTT-ATCGCC---TA-Taataattgatcaaatcacgtgatggccgcaatagttggatat

Unaligned ( gi|15 ): TCCAGCTTAGATCCACATTTTGCAATAAGTTTTAATTCGGT
Unaligned ( gi|16 ): AGCTTAGATTAAGAATACTTAAAATTTTAGTGGCCGAT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                            
lowQualScore                  :            111            1111    1      11                                 4444444444444444                  1111                      222222222222222222     111      1111              2222222222222          111                1111         333333         2222                                       111111       1111111             11111            1111    2222  111  1                        1              444444444444444444444444444444444444444444444                  1   111    1111                                                 222     2222222          11111111               1       1    11  1111      1111           1111111       222222      55555555555555555555              1111          1             333333      111                     2222222222       111  1111                        11                            111111                 1                           555555555        1                           222222222       11   11111111111       2            333333333333333333                111                    111111                                                    1111       1111      22222              11111           1111          22222                 11         666666666666666666666666           1                                                  1111          11111                               1                                   111       111           111   1                        1111    33333                 3333                     1111      111111     111111                               33333   22222      33333333333                11                       111                             11111       111111              111    1     11          111              22222222     333333333333    111       3333333    11111       33333333    11111       11  1111                                 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000          111  6666666666666666         11                  
lowQualScore                  :       8    999    77  5   2222    1   5  33           77      888   77      4444444444444444  0 33       3    5555            2   66    222222222222222222   4 333    5 5555    999  5  5 6666666666666 77  5    000       5  5     4444    1    444444         4444 5   888   0   888     555  77         444444   1   9999999     66      44444   5 77  77 4444    3333  000  7                    77  1              111111111111111111111111111111111111111111111   33 66   1 5    1   000    6666  77          999 5        6        6 22         555     9999999 88    6  88888888    6 8        5 6  6  3    00  4444      4444  6    6   3333333 2  6  222222 1    99999999999999999999 5  5 5 666   2222   5      1  8 5   5    777777      000  5  5    77      5  5555555555       000  8888   5  5     66       77 33     77 5  5       77 5 2   666666    77    999    1         5        5 77     111111111    1 5 1   5  5   66  5  5         222222222       00   88888888888       8  5  77  5  111111111111111111                222    5 5 1   77  55  555555        1  5   999      5  5 5     77 66      4     2222   7   2222      77777    77        44444      77 5 2222   77 5   33333    3   5   77   33   77 3  000000000000000000000000           6          99      99   6    99 3 6  1   3         2222          11111           6                   5                       6       6   111   2 6 111      6  3 111   3   9999   6 6    6      0000    00000      6          8888  888      99        4444      111111   1 222222    99 6         6 99  3       33333   22222   2  11111111111    99   3   1  00     99          99    111 6    6     3    99      6   88888       999999  99   666    111 6  5     55      6   111              00000000  2  000000000000    111   1   4444444    33333       44444444    66666       00  4444  6          6      7 1 1    99  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8        444  4444444444444444 8    2  11 8   1   8  8     
lowQualScore                  :       .    ...    ..  .   ....    .   .  ..           ..      ...   ..      ................  . ..       .    ....            .   ..    ..................   . ...    . ....    ...  .  . ............. ..  .    ...       .  .     ....    .    ......         .... .   ...   .   ...     ...  ..         ......   .   .......     ..      .....   . ..  .. ....    ....  ...  .                    ..  .              .............................................   .. ..   . .    .   ...    ....  ..          ... .        .        . ..         ...     ....... ..    .  ........    . .        . .  .  .    ..  ....      ....  .    .   ....... .  .  ...... .    .................... .  . . ...   ....   .      .  . .   .    ......      ...  .  .    ..      .  ..........       ...  ....   .  .     ..       .. ..     .. .  .       .. . .   ......    ..    ...    .         .        . ..     .........    . . .   .  .   ..  .  .         .........       ..   ...........       .  .  ..  .  ..................                ...    . . .   ..  ..  ......        .  .   ...      .  . .     .. ..      .     ....   .   ....      .....    ..        .....      .. . ....   .. .   .....    .   .   ..   ..   .. .  ........................           .          ..      ..   .    .. . .  .   .         ....          .....           .                   .                       .       .   ...   . . ...      .  . ...   .   ....   . .    .      ....    .....      .          ....  ...      ..        ....      ......   . ......    .. .         . ..  .       .....   .....   .  ...........    ..   .   .  ..     ..          ..    ... .    .     .    ..      .   .....       ......  ..   ...    ... .  .     ..      .   ...              ........  .  ............    ...   .   .......    .....       ........    .....       ..  ....  .          .      . . .    ..  ......................................................... .        ...  ................ .    .  .. .   .   .  .     
lowQualScore                  :       8    999    99  7   1111    4   7  66           99      666   99      6666666666666666  7 33       4    6666            2   99    111111111111111111   5 111    0 6666    555  0  0 2222222222222 99  7    000       7  7     4444    9    000000         2222 0   888   9   888     999  99         000000   4   4444444     66      33333   7 99  99 3333    0000  000  3                    99  4              999999999999999999999999999999999999999999999   11 44   4 7    4   999    4444  99          333 7        7        7 33         333     8888888 88    7  00000000    7 0        5 7  7  3    00  8888      2222  7    7   0000000 5  7  333333 0    22222222222222222222 7  7 7 777   1111   7      4  9 7   7    999999      000  7  7    99      7  0000000000       000  1111   7  7     77       99 66     99 7  7       99 7 3   444444    99    999    4         7        7 99     111111111    7 7 4   7  7   44  7  7         999999999       00   99999999999       1  7  99  7  444444444444444444                999    7 7 7   99  33  000000        7  7   777      7  7 7     99 44      3     1111   1   4444      66666    11        33333      99 7 1111   99 7   00000    9   7   99   66   99 0  666666666666666666666666           3          22      22   7    22 2 7  7   0         7777          77777           7                   3                       7       7   777   5 7 777      7  2 777   3   3333   7 7    7      7777    88888      7          3333  777      22        2222      888888   0 333333    22 7         7 22  7       22222   33333   2  55555555555    22   3   0  33     22          22    777 7    7     5    22      7   00000       222222  22   888    777 7  5     88      7   777              00000000  5  888888888888    333   0   5555555    77777       33333333    77777       33  2222  7          7      3 0 7    22  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0        000  8888888888888888 0    8  00 0   4   0  0     
consensus                     :    ATCNAACT--TATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TCCGATAACTC--TGTTTT-G-ACA--ATGAGAC---TATCC-T-TGTTGACTAAACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACGCG-AGA--T-ATTTT--GGTGACA-G-TAGG-G----AAGTN--AT-GA-G------------TT--AC-AGGG---ATGTTAA-TT-TACCT--TNAAAAACCCC-C----ATTCACACC---AT-TGA---TTTAATT---TTATC-A-GA--TTTTAATTC-A---TATGATTA--CAAA-GTATT-GAAACAG-----AAG-T--AG--CACGAGCAC--A-TA---TT-TGTTTTTGTCTTTATTACGA--TG-AAACTTAAATCTTA--------------CAGG-------------GGGGGA------ATTTACGTG-TTGAA-AAAA-TAT-G-TTGAATACAT--ATGCGATTATT--G-ATATACTT-ATGATCCT-CACGATTTTGTG-AATGATG-AA----TA-AATA-AACTCTCC--ATGC-T-TAACTTAAAC-GT-GG-CTTTT-GTTG--GAAATT----GA-GGTG-TTA--G-G--TGTC-ACT-----TGTTAA-ATT----TC---G------C-TG-T-GTT-TTC----CCC-TGCCAA-TTNC-TTA-TTACA-----TTGTAA---AT-GC-ATGC--TCCTAA-TT----------ATGAAAT---GG-T--CCT-CT-AGATC-GTATTCAA--A--CCAAT--T-AT-CGGATAG--C-TAAAA------CAAC--ACAA-A-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAA-T--GATAT--A------ATTGAG-T-AGA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTGTACA---------AGTAAAA-GACAA-TGGCTTCTAAAGATTT-TC-AA--TG-GT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-A-AGCA-C-TTGTA--TTAGTG----G-TCAGTCAAGGA-AAGAACATTTCT-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAGCAATGA----TTTTCTCTT-TCTTGTCA----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTT-T-A-AAATAAAC-ACA--ACT--TTC--ACATGA-----C---------CGCT---TTGTTTACTCC-GCTTGCGTCC--GCCATT--TTG-AAAT--GTT-TCAATATCGGTGAAAA---NTCTTAATTTT--CA-AGACGATTTTG-AAGCAATAAAAGTAGGTTC-TGAACTGAATGTTTTTCATGTTT-CATATAG-TTT---AGTGT-T---TTAACT-TTTA---CAC-TAG-A--TGTCCCAACT-TTTTTCAC--AGAT-----ATATGA-AAAAAAGGTT---GAA-A-AATACC--TTTTTATA----CACGCA--A---AATGC---CNGAAAA--T-TCACCACATGC--TCGTTGATTTACT-ACGTATAA-TCANTTAAAGG------ACGT--ATANACACTAC-TTTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAT-AAATCATTTT--TCCGAA-CTGAAATAAAATATA------TC--ATC-T-TTTG---T-AGAAAATT--AATGCT-CTT---TCAGGCCAGGGGTC-----C--AACTTTATT-TA-TT--TATA-C-AATGCAT---G---AAAA--A--AGTTATAA-A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----AC-TCCCCGTTAT-CGCCTATTGTATAAA--TAC-C----AG----AAGT---AC-TCTA-TGATAGAAG--------------------T-AAACAAAT---AATCG--ATCAAGTCC--C-GTGATGG--C-CGCAATA-GT-TGGAT
Reference ( family-848 )      :    ATCNAACT--TATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TCCGATAACTC--TGTTTT-G-ACA--ATGAGAC---TATCC-T-TGTTGACTAAACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACGCG-AGA--C-ATTTT--G-TGACA-G-TAGG-G----AAGTA--AT-GA-G------------TT--AC-AGGG---ATGTTAA-TT-TACCT--TNAAAAACCCC-CA---ATTCACACC---AT-TGA---TTTAATT---TTATC-A-GA--TTTTAATTC-A---TATGATTA--CAAA-GTATT-AAAACAG-----AAG-T--AG--CACGAGCAC--A-TA---TTGTGTTTTTGTCTTTATTACGA--TG-AAACTTAAATCTTA--------------CAGG-------------GGGGAA------ATTTACGTG-TTGAA-AAAA-TAT-G-TTGAATACAT--ATGCGATTATT--G-ATATACTT-ATGATCCT-CACGATTTTGTG-AATGATG-AA----TG-AATA-AACTCTTC--ATGC-T-TAACTTAAAC-GT-GG-CTTTC-GTTG--AAAATT----GA-GGTG-TTA--G-G--TGTC-ACT-----TGTTAA-ATT----TT---T------C-TG-T-GNT-TTC----CCC-TGCCAA-TTCC-TTA-TTAC------TTGTAA---AT-GC-ATGC--TCCTAA-TT----------ATGAAAT---GG-T--CCT-CT-AGATC-NTATTCAA--A--CCAAT--T-AT-CGGATAG--C-TAAAA------CAAC--ACAA-A-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAA-T--GATAT--A------ATTGAG-T-AGA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTGTACA---------AGTAAAA-GACAA-TGGCTTCTAAAGATTTATC-AA--TG-GT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-A-AGCA-C-TTGTA--TTNGTG----G-TCAGTCAAGGA-AAGGACATTTCT-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAGCAATGA----TTTTCTCTT-TCTTGTCA----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTT-T-A-AAATAAAC-ACA--ACT--TTC--ACATGA-----C---------CGCT---TTGTTTACTCCNGCTTGCGTCC--GCCATT--TTG-AAAT--GTT-TCAATATCGGTGAAAA---NTCTTAATTTT--CA-AGACGATTTTG-AAGCAATAAAAGTAGGTTCATGAACTGAATGTTTTTCATGTTT-CATATAG-TTT---AGTGT-T---TTAACT-TTTA---CAC-TAG-A--TGTCCCAACT-TTTTTCAC--AGAT-----ATATGA-AAAAAAGGTTTTGGAA-A-AATACC--TTTTTATA----CACGCA--A---AATNC---CGAAAAA--T-TCACCACATGC--TCGTTGATTTACN-ACGTATAA-TCAATTAAAGG------ACGT--ATANACANTAC-TTTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAT-AAATCATTTT--TCCGAA-CTGAAATAAAATATA------TC--ATC-T-TTTG---T-AGAAAATT--AATGCT-CTT---TCAGGCCAGGGGTC-----C--AACTTTATTCTANTT--TATA-C-AATNCAT---G--TAAAA--A--AGTTATAATA-----TAGT-----TTAATCA-CAC----AC-TCCCCGTTAT-CGCCTATTATATAAA--TAC-C----AG----AAGT---AC-TCTA-TGATAGAAG--------------------T-AAACAAAT---AACCG--A-CAAGT----C-GTGACGG--C-CGCAATA-GT-TGGAT
gi|1                          :                                                                                                                         TGAACTTAAT--ACGCG-AGAGAT-ATTTT--GGTGA-A-G-TAAATG----AGGTTTTAT-GA-G------------CTTGACTAGGG---ATA--AA-TT-TACCT--TAAACATTCCCTCATATATTGACACCGGCATATGAATATTAAATT---TTATC-AAGA--TTTTAATTC-AATCTCTGATTAACTGAA-GTATT-GAAATAGCAGAGAAG-T--AG--C-TGGACACCAA-TAAATCTGGGTTTTTGTCTTTATTACGAAATGCAAACTTACCTCTTA--------------CAGG-------------GG---A------ATTTACAT--TTGAA-AAAA-TGT-------AGACAT--ATGCGATTATTTTG-ATATACTTTATGA--CA-CATGATTT-GTGTAATGATA-AGGACTTA-AATACGACT-TAC--CTGCAT-TAACTTAAACTGTAGG-CTTTTTGTTGTAGAAATTATGAGA-GGTGGTTACGG-G--TGTCGACTAGAGGTACTAATATTATCATC---G------C-TG-TTGTTCTTC----CACATGC-----TCCGTTC-TTTC------TTGTAACAAAT-GCCATGC--TTCTAT-TTTGCTTGCGCTA-GAAATTCAGG-T--CTTACT-AGATC-GTATTCGATAATCCCAATGTT-AT-CGGATAGAGCATGAAAACATAGCAACCAATAA-T-TTCTGTCCAACAAC-ACATCCAA-T--GACAT---------ATTG-G-TAAGAGTATTAA-CCTGTTGGTTTGTACA---------AATAAAATGAAAATTGGCTTCTAAGAATTTG-C-AATCTG-AT----CTATTTAGCCCTATCCCACACGTCA-TTGC-A-AGCACC-TTGTA--TTCGTGGTGTG-TCAGTCAAGGA-G-----TTTTCT-GACATCTACAATT-GGG-AAGCAATGGAAGTTTTCCTGTTGTCTCGTCAAGTGTTTATTTCATAACACACCGCAATTA--ATA----CAG--AGTCT-TGA-AAATAAAC-ACA--ACTTCTTCTAGCATAAAGTAGCTCGTTAAAGCGCTCTATCGTTTACTCCGGCGTGCTGCC--GCCATCTGTTG-AAA-------TCGA-----GTGAGAATTGCTCTTAATTTT--TC-AGACGATATTT-CAGC-AT-AAAGTTGGTTTCTGA--TGAATGTTTTTCATGTTTCCATATAG-TTTCACATTGTAT---TTAACTATTTAACCTAC-TAG-GATTGTCCACACTGTTTTTCACCAAGATGCTGGATATGA-AAAAAAGGTT---GAATATAATATCGTTTTTTATAACAGCGCGCA--A---CATACCCGCGCAAAA--TCTCACCAAAT-CAGTC-TTAATTTCAT-ACGC-TAATTTAATTGAAGGTCCAAAACATAAATATATAGTG---TTTCGAAAATGAGTTTTCTGAAGGCG-CAATAAAATCTTTTTAATTCGAA-CTG-AATAAAATAAACAGAATTCAAATC-TCTCTGTGTT-AGAAATTT--ACTGCT-CTTTAATCGGATGATGGGACGTAATA--AACTT--TTCTACTTTATATA-C-ATTCCATCGCG--TAAAATTAATAGTTCTAA--------GGTTCGAATTAACCA--GC----ACGTCCCCGTTATGCGCCTA-TAGGTAAAGGTAC-C----AGGATAAGGT---AT-CTTA--GATAGGAT--------------------TGAAACAAAA---AATCGCTA-CATGTTCAGC-GTGATGA--CGCGTTATATGTCTGGA
gi|10                         :                                                                                                    CGGCAAATTGC----AACAGATGTATCGAGTTAACGC----------TTTT--GGTGACA-G-TAGG-G----AAGGA--AT-GA-G------------AT--GC-AGGG---AAATTAA-TT-TACCT--TTAAA--CCGC-TC---ATTCACACC----T-TGA---TTT---------------------TTAATTC-A---AATGATTA--CAAA-GTATT-GAAACAG-----AAG-T--AG--CA-GGGCATA-A-TG---TT-TGTTTTTGTCTTTAATACAA--TT---TCTTAAATCTTA--------------CAGG-------------GCGG-A------ATT----------------A-TAT-G-TTGAA-ACAT--ATATGA-TA----G-ATACACTT-CTGATCCT-CGCGATTTTGTG--ATGGTG--A----TA-AATA-AACT-TCC--ATGC-gatatggtc
gi|11                         :    ATCCCACT---ATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TTCGATAACTC--TGTTTT-G-ACA--ATGAGAC---TATCC-T-TGTTGACT-AACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACGCG-AGA--C-A------G-T-------TAGG-G----AAATA--AT-GA-G------------TT--AC-AGGG---ATGTTAA-TT-TACCT--T-AAAAACCCC------ATTCACATC----T-TGA---TTTGATT---TTATC-A-GA--TTTTAGTTC---------------------------------------AG-T--AG--CAC-AGCAC----TA---TT-TGTTTTTGTCTTTATAACGA--TG-AAACTTGAATCTTA--------------CAGG-------------GG
gi|12                         :          at--TACTT--CG-GTC----ATAA-TTT-GG--TTCGATTACTC--TGTTTT-C-ACA--ATGAGACTT-TATCC-C-TATTGACTAACAGGTAG--CGC----AT-ACGTGAATTAGAC--AGGGG-AGG--T-AAT------CGAGA-GTTAGA-GCTTTAGGTG--ACAGA-G------------AT--GC-AGGG---AGATTAA-TT-TA--T--TCTAAATCCCT-C----GTTCACACC----T-TGA---TTTGATT---
gi|13                         :    ATCAAACT---ATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TCCGATAACTC--TGTTTT-T-ACA--AGGAGAC---TATCC-T-TGTTGACTAAA--------CGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACGCA-AGA--C-ATTTTG-G-TGACA-G-TAGG-G----AAGTA--AT-GA-G------------gtg
gi|14                         : catATC-AACTATTATTC--AG-GTC----CTAAATTA-GGG-TCCGATAACTC--TGTTTT-GAACAACATGAAA----------------GA-TATACGGTAGTTCGT----A
gi|2                          :   tATCAAACT--TATTTTGCG-ATCGTGTATAA-TTACGG--TCCGATAACTCCTTGTTTTTG-ACA--ATGAGACGTACATCCGTGTGTTGACTAAACGGTAGTT-GTG---ATCAGGAGAAT-AAAT--ACGCACAGA--TTATTTT--G-TGACATGCTAGG-GT---AAGTA--AT-GA-GCTCAAAACAAAGTT--AC-AGGGGCAATGTTAA-TTATACCACATAAAAAACCCC-CA---ATTCACACC---AT-TG----TTTAATT---TTATCGA-GAATTTTTAATTTTA---TATG-TTA--CAAAAGTATA-AAAACAG-----AAG-TTAAA--CACAAGCAC--A-TA---TTGCTTTTTTATCTT-ATTACGA--TGGAAACTTATATCTTC--------------CAGG-------------GGGGGAGGGGGGATTTATATG-TTGAA-AAAA-TAT-G-TTGAATATAT--ATGCGATTAT---G-ATATACTT-ATAATCCTGCATGATTTTGTG-AATGATGTAA----TGCAATA-AA-TCT-C--ATGC-T-TAACATAA-C-GT-GGACGTTT-GT-G--AACATT----GA-GGTG-TTA--G-G--TGTC-ACT-----TGTTAA-ACT----TC---TAAAGATC-TG-T-GAT-TTC----CCC-TGCCAAATTTC-TTAGTTAC------TTGTAA---ATTAC-ATGC--TCCTAA-G-----------ATGAAAT---AG-T--CCT-CTCAGATC-TTAG-CAA--A--CCAAT--T-ATTCGGATAG--C-TAAAA------CAAC--ACAA-A-TTCG-TCCAACAAC-ACATCAAAAT--GATAT--A------ATTGAG-TTAGA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTGTACG---------AG-AAAA-GACAA-TGTCTTCTAAAGATTTATC-A---TG-GT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-ACAGCA-C-TTGTA--TTAGTG----GCTCAGTCAAGGACAAGGACATTTCT-GA-A-CTTCA--TCTGGTAAGCAATGA----TTTTCTCTT-TCTTGTCA----TTTA--TCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTT-T-A-AAATAAAC-ACA--ACT--TTC--ACATGA-----C---------CGCT---TTGTTTACTCCCGGTTGCGTCCGAGCCATT--TTG-AAAT--GTTATC-ATATCGGTG-AAA---TTCTTAATTTTTCCACAGTTGATTTTG-AAGCAATAAAAGTAGGTTTCTGAACTGAATG-TTTTCATGTTT-CATATAGATTC---AGT-T-T---TTAACT-TTGA---CACGTAGCA--TGTCCCAACT-TTTTTC-C--AGAA-----ATATG--AAAAAAGGTTTTGAAA-A-AATACC--TTTTTATA----CACGCA--A---AATGC---CGAGAAAACT-TCACCATATGC--TCATTAATTT-CT--CGTATAA-TCAGTT---GG------ACGT--ATACACACCAT-TTTTC--AAATGAATTT--TGAA---GACAAT-AAATC-TTTT--ACCGAA-CTGAAATAA---ATA------GC--ATC-T-TTTG---TCATAACATT--AATGCTCCTT---TCAGGTCAGGGGTC-----C--AACTTTATTCTAATT--GATAGT-AATGCAT---GAATAAAA--A--AGTTATGA-A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----AC-TCCCCGTTTT-CGCC-A-TATATAAA--TAC-C----A-----CAGT---AC-TCT--TGATAGAAA--------------------T-AAACAAATTGAAACTG--ATCAAAT----CAGTGATGGCCC-CGCAATA-GT-TGAATca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                C---AT-TAA------AATTATATTGTC-A-GA--TTTTAATTC-A---CATTATGA--------TATT-AAAACAG-----AAG-T--AG--CACG-GCAC--AATA---CTATAGTTTTGCCTTTATTACAA--TG-AAACT--AATCTCA--------------CAAG-------------GGGGAA--------TTATGTG-ATGAACAAAA-TAT-G-GTAAATACATGTATGTGGTTATT--G-TTATACTT-ATGATCCG-CACAATTGTGTG-A-TGGTG-A-----TA-AATA-AACTTTT---ATGC-T-TGACTTAA-C-TT-GGTCCTTC-AT----GAAATT----GA-GGCG-TTA--ATG--AGTC-ACT-----T-TTAA-ATA----AT---C------A-TAAT-G--------------TGTCAACTTCT-TTC-TTAC----------AA---AT-GC-ATGC--TCCTAA-TT----------ATAAAAT---GTCT--CTT-TT-AGATC-TTATTCAA--A--CCTAT--T-AT-CGTATAG--C-TGAAA------CAAC--ACAA-T-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAA-T--GATAT---------ATTTTG-T-AGA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTTGACA---------AGTACAC-GGTAC-TGGTTTCT-AAGCTTT-TC-AA--TA-GT----TTG-----------CCTAAAAATTGTTT------GCA-C-TAGCA--TTAGTG----G-TCAGTCAAAAG-AAGTACGTTTCT-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAGCAATGA----TTATCTC----------------CTA-TTCATAACA-----CAAATA--G-ATTTGCAAACA-TCT-A-A-AAATAAATAACATTAAT--TCC--ATAT-A-----CAAAA-----CGAT---TTGTTTACTCCAGCTTGCGTCC--ACCATT--TTG-AAATAAGTT-TTAATATCGGTGAAAA---TTCTAAATTTT--CA-AGACGATTTGG-AAGCATGAAAAGTAGGTTC-TGAACTGAATATCTTTTATGTTT-CATACAA-TGC---AATGT-T---ATAAC----TA---TAC-TAT-A--TGTCCAAACG-ATTTCCAG--AAGTAATA-ATGTAATAAACAA----TTG--A-T-AATTCC--GTTTTATA----CATGCT--A---AATCC---CTGAATA--T-TAAACATATGT--TCATTGATTTG-T-ATGTA-AA-TCATTT----G------ACGA--ATAAACAGTAC-GTTAC--AAATGAAATT--TGAT---G-CAAG-AAATAATTTT--CCTAAA-TTGAAAGAAAATATA------TC--ATC-C-TTTG---T-AG--AATTA-AATGTT-CTT---TCAAGCAAGGGGTC-----C--AA----AATGTA-TG--TATT-C-ATTATAT---G---AAAA--T--AGTTATCATA-----TA-------TTAATTATTAC-----C-ACCCC--TAA-CGCCTATTGTATAAA--TAC-------G----AAAT---AC-TATA-TAATAG--G--------------------T-AAACAAAT---AATCGA-A-CAAGTCC--C-GTGACGA--C-CGCTATA-GT-TGGATg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agcttagattaagaataggtctacttaaaattttagcggccgatttgatgctttgTATATG-TTGAA-AAAAATATTG-TTGAATA------TGTGAT-ATT--G-ATATACTT-ATGATCCT-CATGATTTT-TG---TGATG-AA----TG-AATA-A--TCTTCCGATGC-T-TAACTTAAAC-GT-GG-CTTTT-GTTT--GAAATT----GA-GGT--TAA--G-A--TTTT-TCC-----TGGTCG-GTT----TTTCCT------C-TG-C-AAT-TTCTGTATCC-TA-CAA-TT-C-TTA-TTACAA----TTACAA---AT-GC-CTG---TCCTAA-TT----------ATGAAAT---AG-TAGCCT-CT-AGATC-GTATTCAA--AC-CCAAT--T-AT-CGGATAG--C-T-AAG------CAAC--ACAAGA-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAT-T--GATAT--ATAATTTATTGAG-T--GA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTGTACA---------AGTAAAA--AC---------------ATTT-TC-AA--TG-GTGTA-TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-A-AGCA-C-GTGTA--TTA-TG----G-TCAGTCAA-GA-AAGAA-ATTTTG-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAG-AATGA-----TTTCTCTC-TCTTGTC-----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTTCT-ATAAAT-AAC-ACA--ACT--TTC--ACATGG---------------CGCT---TTGTTTACTCC-GCTTGCGTCC--GCCATT--TTGAAAAT--G-T-TCAATAGCGGTGAAAA---ATCTTAATTTT--CA-AGACGATTTTGAAAGCAATAAAAGTAGG-TCATGAACTG-ATGTTTTTCATGTTT-CATATAG-TTT---AGTGT-T---TTAACT-TTTA---CAC-TAG-A--TGT-CCAACT-TTTTTCAC--AGAT-----ATATGA-AAAAAAGGTT---GAA-A-AATACA--TTTTTATA----CACGCAACA---AATGC---CG-AAAA--T-TCACCACCTCC--TCGTTGATTTAC--ACGTAT---TCAATTAAAGG------ACGT--AT--ACACTACATTTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAT-AAATCATTTT--TCCGAAGCTG------AATATA------TC--ATCTT-TTTG---T-AG-AAATT--AATGCT-CTT---TCAGGCCAGAGGTC-----C--AACTTAATTA-ATCT--TATA-TGAATGCAT---G-----AA--A--AATTATA--A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----AC-TCCCCGTTAT-CGCCTATTGTATAAA--TA------------------------------ATATAGG--------------------T-AAACAAAT---AA----------------C-GTGATGG--C-CGCAATA-GT-TGGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TG-T-GTT-TTT----CCC-TGCCAA-TTTC-TTA-TTACAA----TTACAA---AT-GC-ATGC--TCCTAA-TT----------ATGAAAT---GGAT--CCT-CT-AGATC-GTATTCAA--A--CCAAT--T-AT-CGGATAG--C-TAAAG------CAAC--ACAA-A-TTCT-TCCAACAAC-ACATTCAA-TTTGATATTAATT----ATTGAGAT-AGA-TA-TAAACCT-TT-GTTTGTACA---------AGTAAAA--ACA---------------TTT-TC-AA--TGTGTA---TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGCCA-AGCA-C-T-GTA--TTA-TG------TCAGTCAAG-A-AAGAA-ATTTCT-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAG-AATGA----TTT-CTCTT--CTTGTC-----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTTCT-T-AAATAAAC-A----ACT--TTC--ACATGG-----C----------GCT---TTGTTTACTCC-GCTTGCGTCC--GCCATT--TTG-AAAT--GTT--CAATAGCGGTGAAAA---ATCTTAATTTT--CA-AGACGATTTGA-AAGCAATAAAAGTAGGT-CATGAACTGAATGTTTTTCATGTTT-CATATAG-TTT---AGTGT-T---TTAACT-TT-A---CACATAG-A--TGTCC--ACT-TTTTTCAC--AGAT-----ATATGA-AAAAAAGGTT---GAA-A-AATAAC--TTTTTATA----CACGCA--ACATAATGT---CCGAAAA--T-TCACCACATCC--TCGTTGATTTAC--ACGTTTA--TCAATTAAAGG------ACGT--ATACACACTAT-TTTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAT-AAATCATTTT--TCCGAA-CTG------AATATA------TC--ATC-T-TTTG---T-AG-AAATT--AATGCT-CTT---TCAGGCCAGAGGTC-----C--AACTTTAAT-TATTC--TATA-T-AATGCAT---G---AAAA--A--AGTTATA--A-----TAGT-----TTAATCA-TAC----AC-TCCCCGTTAT-CGCCTATAGTATAAA--TATGCAATGAA----AAGTTGGACATCTAGTG-TAAAAGTTAAAACACTAAACTATAGGT-AAACAAAT---AATTG--ATCAAATCA--C-GTGATGG--C-CGCAATA-GT-TGGAT
gi|6                          :            --TATTT--CGCGTC----ATAAATTA-AGCGTCCGATAACTC--TGTTTT-G--CA--ATGAGA-----------------ACTATACGTTAGTTCGTATTGATCAGATGAATT-------------------ATTTTTGG-TGACACG-TA-G-G----AAGTT--AT-GAGG------------TT--AC-A-GG---ATGTTAATTT-TACCT--GTAAGAATCCC-CC---ATTCACACC----T-TGA---TTTAATT---TTATC-A-GA--TTTTAATTC-A---TATGATTG---AAA-GTATTAAAAACAG-----AAGTT--AGCTCAGAAACA---A-TA---TTTTGTTTT--TCTTTATTACGA--TG-AAACTTAAATCTTAGCGGGGCGTAGTCCCAGGTTTATTGAACTGCGGGGGG------GATTACATGTTTGAA-AAAATTAT-GTTTGAG---AT--ATGCGATTATT--GAATATACTT-ATG-TCTT-C-TGATTTTGTG--ATGATG--A----TT-AATA-AAC-CTCC--ATGC-TCTAACTT-AAC-GT-GG-CTATT-GTTG--AAGATT----GAGGGTG-TTA--A-GAAT-TC-AC------TGTTAA-A------TT---G------C-TG-T-GTT-TTT----CCC-TGCCAA-TTGC-TAA-TTACT-----TTGTAA---AT-TC-ATGCCTTCCTAATTT----------ATGATA----GG-T--TCG-CT-AGATCGATATTCAA--A--CCAAT--TAAT-C-GATAG--C-TAAAA------CAAC---CAA-ATTTCTGTCCAACAATAACACCAAA-T--GACAT---------ATTGAG-T-AGA------------------TGTACA---------AATAAAA-GACAA-TGGCTTCT-AAGATTT-TC-AA--TG-ATTATATTG-----------CCC--AAGTCATTTGC---AGCA-C-TTGTACTTTGGTG----G-TCAATCAAAGG-AAGACCATTTCTGGA-A-CTTCA--T-GGGTAAGCAATGA----TTT--TCTT-TCCTATAA----TT------ATAGTC-----CATTTACCA-A----GAT--A-CTC-T-T-AGTTGTAC-ATA--GCTG-TTC--AAAC-A-----C---------CTTT---TTGTTat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccaaAACTTAA-C-GT-GG-CTTTT-GTTG--AAAATT----GA-GGTG-TCA--G-G--TG-C-ACG-----TGTTAA-AT-----------------CATG-T-GTT-TTC----CCC-TGCCAA-TTAC-TTA-TTACATGTACTTGTAA---AG-GC-ACGC--TCCTAA-TT----------ATGAAAT---GGGC--CCT-CT-AAGTC-TTATTCAA--A--CCAAT--T-AT-CGGATAG--C-TAAAA------CAAC--ACAA-A-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAA-T--GATGT---------ATTGAG-T-AGA-TA-TTA--CT-TT-GTTTGTACAAGTAACATGAGTAAAA-GACAA-TGGCTTA-AAAGATTT-TCAAA--TG-GT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-A-AGCA-CTTTGTA--TTTGTG----G-TCAGT-AAGGA-AAGGACATTTCT-GA-A-CCTCA--T--GGTAAGCAATGA----TTTTCTC-T-ACTTGTC-----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAG--A-TTT-T---AAATTAAC-ACA--ACT--TTC--A----------------------------------------CTTGCGTCC--GCCGTT--TTG-AAAT--GTT-TCAATATTGGTGAAAA---ATCTT----------------ATTTTG-AAGCAATAAAAGTCGGTTC-TGAACTAAATGTTT----TGTTT-CATATAG-TTT---AGTTC-TCAGTTAACT-TTTA---CAC-TAG-A--AGT-CCAACT-TTTTCC-C--AGAT-----ATATGA-AA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAGATT---GAA-A-ATTACG--TTTTTATA----CATGCC--A---TGTCC---CTAAAA---T-TTACCACTAGC--TCGTTAATTTATATGCGT-TGA-TCATTT----G------ACTT--GTAACCACTAC-TTTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAA-AAATCACTTT--TCCGAA-CTGAAATGAAATATA------TC--ATT-T-TCTG---T-AGAAATTTTAAATGCT-CTT---TCAGGACAGGGGTG-----CAAAAGTTT-------TC--TATA-C-AATATTT---G---AAAA--A--AGTTATAATAGTAATTAGT-----TTAATTA-CACACTGAC-TCGCCGTTAT-CGCCTATTGT---AA--TAC-G----AG----GTAT---AC-TCTA-
gi|9                          :    ATCCAACT---ATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TCCGATAACTC--TGTTTT-G-ACA--ATGATAC---TAT---------------ACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACACG-AGA--T-ATTTT--GGTGATA-G-TAGG-G----AAGTT--AT-GA-G------------TT--AC-AGGG---ATGTCAA-TT-TACCT--T-AAAAACCCC------ATTCACAC----AT-TGA---TTTAATT---TTATC-A-CA--TTTTAATTC-A---TATGATTA--CAAA-GTATT-GAAACAG-----AAG-T--AG--CGC-AGCACA-A-TA---TT-TGTCTTTGTCTTTATTACGA--TG-AAACTTAAATCTTA--------------CAGT-------------GGGGAA--------TTACGTG-TTG-A-AAAA-TAT-A-TTGA----AT--ATGCGATTATT--G-ATATaatcgctcttgaaagtcacgtgataaccgctata

Unaligned ( gi|15 ): TCCAGCTTAGATCCACATTTTGCAATAAGTTTTAATTCGGT
Unaligned ( gi|16 ): AGCTTAGATTAAGAATACTTAAAATTTTAGTGGCCGAT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                            
lowQualScore                  :            111            1111    1      11                                 4444444444444444                  1111                      111111111            111      1111              2222222222222          111                        22      11111          2222                                       111111       1111111             11111            1111    2222  11     11                      1              4444444444444444444444444444444      33333333                  1   111    1111                                                 222     2222222               1               1       1        1111       1111           1111111       222222         555555555555555555            1111                       33333333                            2222222222     111  1111                       111                            1111111                 1                           444444444        1                           222222222       11   222222222222222                333333333333333333                                       111111                                                    1111   1     11      22222              11111           1111    11   22222                 11         666666666666666666666666            1                                                  1111          11111                                                                   111       111     11    111   1                        1111    22222                  111                      1111      1111111      222222                              22222   22222      33333333333                                        111                             11111       111111              111    1     11          111              11111    2222222222222222    11111111        111              333333333    11111       11  1111                                22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222        111     2222222222222222                            
lowQualScore                  :       8    999    77  5   2222    1   5  33           77      888   77      4444444444444444  0 33       3    5555            2   66    333333333 0 0      4 333    5 5555    777  5  5 6666666666666 77  5    000       5  5     77 1    11  5   44444 5        4444 5   888   0   888     555  77         444444   1   9999999     66      44444   5 77  77 4444    3333  33  5  55                 77   1              9999999999999999999999999999999      22222222   33 66   1 5    1   000    6666  77         77 1 5      6          6 22         555     9999999 77    6    6  0    6 8        5 6  6  3 6      9999   6   4444  6   6    3333333 2  6  222222 1    6  777777777777777777  5    5    7777     5   5  6   999    22222222 11    777     77      5    5555555555     000  8888   5  5     66       5 000  5  77  5  5     77   5    6666666    77    999    1         5        5 77     444444444    5 5 1   5  5   66  5  5         222222222       00   111111111111111   5  5  77  5  111111111111111111                999    5 5 1   77  44  555555         777   888      5  5 5     77 66      4     2222   4   0 44      77777  1 77        44444      77 5 2222    33   33333    3    5  77   33   77 3  000000000000000000000000         6  3          99      99   6    99 3 6  1   3         2222          11111           6                6                          6       6   111   2 6 111     44    111   3   9999   6 6    6      0000    33333  6   6           111   888      99        4444      5555555   6  000000    6 6         6 99  3       66666   22222   1  11111111111       3   2   888    99          99    111 6    6     3    99      6   88888       999999  99   666    111 6  5     55      6   111              66666    4444444444444444    66666666  6     111   99  6      444444444    66666       00  4444  6          6       6          88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888        111  1  3333333333333333        99 6   4   6  8     
lowQualScore                  :       .    ...    ..  .   ....    .   .  ..           ..      ...   ..      ................  . ..       .    ....            .   ..    ......... . .      . ...    . ....    ...  .  . ............. ..  .    ...       .  .     .. .    ..  .   ..... .        .... .   ...   .   ...     ...  ..         ......   .   .......     ..      .....   . ..  .. ....    ....  ..  .  ..                 ..   .              ...............................      ........   .. ..   . .    .   ...    ....  ..         .. . .      .          . ..         ...     ....... ..    .    .  .    . .        . .  .  . .      ....   .   ....  .   .    ....... .  .  ...... .    .  ..................  .    .    ....     .   .  .   ...    ........ ..    ...     ..      .    ..........     ...  ....   .  .     ..       . ...  .  ..  .  .     ..   .    .......    ..    ...    .         .        . ..     .........    . . .   .  .   ..  .  .         .........       ..   ...............   .  .  ..  .  ..................                ...    . . .   ..  ..  ......         ...   ...      .  . .     .. ..      .     ....   .   . ..      .....  . ..        .....      .. . ....    ..   .....    .    .  ..   ..   .. .  ........................         .  .          ..      ..   .    .. . .  .   .         ....          .....           .                .                          .       .   ...   . . ...     ..    ...   .   ....   . .    .      ....    .....  .   .           ...   ...      ..        ....      .......   .  ......    . .         . ..  .       .....   .....   .  ...........       .   .   ...    ..          ..    ... .    .     .    ..      .   .....       ......  ..   ...    ... .  .     ..      .   ...              .....    ................    ........  .     ...   ..  .      .........    .....       ..  ....  .          .       .          ...........................................................        ...  .  ................        .. .   .   .  .     
lowQualScore                  :       8    999    99  7   1111    4   7  66           99      666   99      6666666666666666  7 33       4    6666            2   99    111111111 4 1      5 111    0 6666    999  0  0 2222222222222 99  7    000       7  7     99 0    66  7   33333 7        2222 0   888   9   888     999  99         000000   4   4444444     11      33333   7 99  99 3333    0000  66  7  77                 99   4              7777777777777777777777777777777      33333333   11 44   4 7    4   999    4444  99         99 4 7      7          7 33         333     8888888 00    7    3  8    7 0        5 7  7  3 7      0000   7   2222  7   7    0000000 5  7  333333 0    7  222222222222222222  7    7    9999     7   7  6   333    44444444 33    333     99      7    0000000000     000  1111   7  7     44       7 000  7  99  7  7     99   7    6666666    99    999    4         7        7 99     111111111    0 7 4   7  7   44  7  7         999999999       00   000000000000000   7  7  99  7  444444444444444444                444    7 7 7   99  66  000000         666   111      7  7 7     99 44      3     1111   1   1 44      66666  4 11        33333      99 7 1111    66   00000    9    7  99   66   99 0  666666666666666666666666         7  3          22      22   7    22 2 7  7   0         7777          77777           7                7                          7       7   777   5 7 777     00    777   3   3333   7 7    7      7777    33333  7   7           777   777      22        2222      0000000   7  000000    7 7         7 22  7       55555   33333   0  55555555555       3   5   333    22          22    777 7    7     5    22      7   00000       222222  22   888    777 7  5     88      7   777              77777    0000000000000000    55555555  7     777   22  7      000000000    77777       33  2222  7          7       7          77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777        777  7  0000000000000000        22 7   0   7  0     
consensus                     :    ATCNAACT--TATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TCCGATAACTC--TGTTTT-G-ACA--ATGAGAC---TATCC-T-TGTTGACTAAACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACGCG-AGA--T-ATTTTGGTGACA-G-TAGG-G----AAGTN--AT-GA-G------------TT--AC-AGGG---ATGTTAA-TT-TACCT--TAAAAA--CC-CCC-----A-TTCACACC---AT-TGA---TTTAATT---TTATC-A-GA--TTTTAATTC-A---TATGATTA--CAAA-GTATT-GAAACAG-----AAG-T--AG--CACGAGCAC--A-TA--TT-TG--TTTTTGTCTTTATTACG--ATG-AAACTTAAATCTTA--------------CAGG-------------GGGGGA------ATTTACGTG-TTGAA-AAAA-TAT-G-TTGAATACAT--ATGCGATTA--TTG-ATATAC-TTATGATCCT-CACGATTTTGTG-AATGATG-AA----TA-AATA-AACTTTCCATGC-T-TAACTTAAAC-GT-GG-C-TTTTGTTG--GAA-ATT----GA-GGT-GTTA--G-G--TGTC-ACT-----TGTTAA-ATT----T---C----G--CTG-TGTT-TTCC----CCTGC-CAA-TTNCTT-A-TTACA-T-----TGCAAAT-G-CATGC--TCCTAA-TTAT----------GAAAT---GG-T--CCT-CT-AGATCG-TATTCAA-A---CC-AA--TT-AT-CGGAT--AGC-TAAAA------CAAC--ACAA-A-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAA-T--GATAT--A------ATTGAG-T-AGA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTGTACA---------AGTAAAA-GACAA-TGGCTTCTAAAGATTT-TC-AA--TG-GT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-A-AGCA-C-TTGTA--TTAGTG----G-TCAGTCAAGGA-AAGAACATTTCT-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAGCAATGA----TTTTCTCTT-TCTTGTCA----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAGA--TTT-T-A-AAATAAACA-CA--ACT--TTC--ACATGA-----C---------CGCT---TTGTTTACT-CC-GCTTGCGTCC--GCCATT--TTG-AAAT--GTT-TCAATATCGGTGAAAA---NTCTTAATTTT--CA-AGACGATTTTG-AAGCAATAAAAGTAGG-TTCTGAACTGAATGTTTTTCATGTTT-CATATAG-TTT---AGTGT-T---TTAACT-TTTA---CAC-TAG-A--TGTCCCAACT-TTTTTCAC--AGAT-----AT-ATG-AAAAAAAGGTT---GAA-A-AATACC--TTTTTATA----CACGCA--A---AATG-CC-CG---AAAA-T-TCACCACATGC--TCGTTGATTTAC-TACGTATAA-TCANTTAAAGG------ACGTATANACACTAC-T-TTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAT-AAATCATTTT--TCCGAA-CTGAAATAAAATATA------TC--ATC-T-TTTG---T-AGAAAATT--AATGCT-CTT---TCAGGCCAGGGGTC-----CAACTTTATTT--AT-T---TATA-C-A----AT-GCATG---AAA--AA-AGTTATAA-A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----AC-TCCCCGTTAT-CGCCTAT-TGTATAAATAC-C----AG----AAGT---AC-TCTA-TGATAGAAG--------------------T-AAACAAAT---AATCGAT-C----AAGTCC--CGTGATGG--C-CGCNATA-GT-TGGAT
Reference ( family-848 )      :    ATCNAACT--TATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TCCGATAACTC--TGTTTT-G-ACA--ATGAGAC---TATCC-T-TGTTGACTAAACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACGCG-AGA--T-ATTTTGGTGACA-G-TAGG-G----AAGTN--AT-GA-G------------TT--AC-AGGG---ATGTTAA-TT-TACCT--TNAAAAA-CC-CCC-----A-TTCACACC---AT-TGA---TTTAATT---TTATC-A-GA--TTTTAATTC-A---TATGATTA--CAAA-GTATT-GAAACAG-----AAG-T--AG--CACGAGCAC--A-TA--TT-TG--TTTTTGTCTTTATTACG--ATG-AAACTTAAATCTTA--------------CAGG-------------GGGGGA------ATTTACGTG-TTGAA-AAAA-TAT-G-TTGAATACAT--ATGCGATTA--TTG-ATATAC-TTATGATCCT-CACGATTTTGTG-AATGATG-AA----TA-AATA-AACTCTCCATGC-T-TAACTTAAAC-GT-GG-C-TTTTGTTG--GAA-ATT----GA-GGT-GTTA--G-G--TGTC-ACT-----TGTTAA-ATT----T---C----G--CTG-TGTT-TTCC----CCTGC-CAA-TTNCTT-A-TTACA-T-----TGTAAAT-G-CATGC--TCCTAA-TTAT----------GAAAT---GG-T--CCT-CT-AGATCG-TATTCAA-A---CC-AA--TT-AT-CGGAT--AGC-TAAAA------CAAC--ACAA-A-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAA-T--GATAT--A------ATTGAG-T-AGA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTGTACA---------AGTAAAA-GACAA-TGGCTTCTAAAGATTT-TC-AA--TG-GT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-A-AGCA-C-TTGTA--TTAGTG----G-TCAGTCAAGGA-AAGAACATTTCT-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAGCAATGA----TTTTCTCTT-TCTTGTCA----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAGA--TTT-T-A-AAATAAACA-CA--ACT--TTC--ACATGA-----C---------CGCT---TTGTTTACT-CC-GCTTGCGTCC--GCCATT--TTG-AAAT--GTT-TCAATATCGGTGAAAA---NTCTTAATTTT--CA-AGACGATTTTG-AAGCAATAAAAGTAGG-TTCTGAACTGAATGTTTTTCATGTTT-CATATAG-TTT---AGTGT-T---TTAACT-TTTA---CAC-TAG-A--TGTCCCAACT-TTTTTCAC--AGAT-----AT-ATG-AAAAAAAGGTT---GAA-A-AATACC--TTTTTATA----CACGCA--A---AATG-CC-NG---AAAA-T-TCACCACATGC--TCGTTGATTTAC-TACGTATAA-TCANTTAAAGG------ACGTATANACACTAC-T-TTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAT-AAATCATTTT--TCCGAA-CTGAAATAAAATATA------TC--ATC-T-TTTG---T-AGAAAATT--AATGCT-CTT---TCAGGCCAGGGGTC-----CAACTTTATTT--AT-T---TATA-C-A----AT-GCATG---AAA--AA-AGTTATAA-A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----AC-TCCCCGTTAT-CGCCTAT-TGTATAAATAC-C----AG----AAGT---AC-TCTA-TGATAGAAG--------------------T-AAACAAAT---AATCGAT-C----AAGTCC--CGTGATGG--C-CGCAATA-GT-TGGAT
gi|1                          :                                                                                                                         TGAACTTAAT--ACGCG-AGAGAT-ATTTTGGTGA-A-G-TAAATG----AGGTTTTAT-GA-G------------CTTGACTAGGG---ATA--AA-TT-TACCT--TAAACAT-TC-CCTCATATA-TTGACACCGGCATATGAATATTAAATT---TTATC-AAGA--TTTTAATTC-AATCTCTGATTAACTGAA-GTATT-GAAATAGCAGAGAAG-T--AG--C-TGGACACCAA-TAAATC-TGGGTTTTTGTCTTTATTACGAAATGCAAACTTACCTCTTA--------------CA----------------GGGGA------ATTTACAT--TTGAA-AAAA-TGT-------AGACAT--ATGCGATTATTTTG-ATATACTTTATGA--CA-CATGA-TTTGTGTAATGATA-AGGACTTA-AATACGACTTACC-TGCAT-TAACTTAAACTGTAGG-CTTTTTGTTGTAGAA-ATTATGAGA-GGTGGTTACGG-G--TGTCGACTAGAGGTACTAATATTATCAT---C----G--CTGTTGTTCTTCCA---CATGCTCCG-TTCTTT-C-TTGTA--------ACAAAT-GCCATGC--TTCT-A-TTTTGCTTGCGCTAGAAATTCAGG-T--CTTACT-AGATCG-TATTCGATAATCCC-AATGTT-AT-CGGATAGAGCATGAAAACATAGCAACCAATAA-T-TTCTGTCCAACAAC-ACATCCAA-T--GACAT---------ATTG-G-TAAGAGTATTAA-CCTGTTGGTTTGTACA---------AATAAAATGAAAATTGGCTTCTAAGAATTT-GC-AATCTG-AT----CTATTTAGCCCTATCCCACACGTCA-TTGC-A-AGCACC-TTGTA--TTCGTGGTGTG-TCAGTCAAGGA-G-----TTTTCT-GACATCTACAATT-GGG-AAGCAATGGAAGTTTTCCTGTTGTCTCGTCAAGTGTTTATTTCATAACACACCGCAATTA--ATA----CAGAG-TCT-TGA-AAATAAACA-CA--ACTTCTTCTAGCATAAAGTAGCTCGTTAAAGCGCTCTATCGTTTACT-CCGGCGTGCTGCC--GCCATCTGTTG-AAA-------TCGA-----GTGAGAATTGCTCTTAATTTT--TC-AGACGATATTT-CAGC-ATAAAGTTGGT-TTCTGA--TGAATGTTTTTCATGTTTCCATATAG-TTTCACATTGTAT---TTAACTATTTAACCTAC-TAG-GATTGTCCACACTGTTTTTCACCAAGATGCTGGAT-ATG-AAAAAAAGGTT---GAATATAATATCGTTTTTTATAACAGCGCGCA--A---CATA-CC-CGCGCAAAA-TCTCACCAAAT-CAGTC-TTAATTTCA-TACGC-TAATTTAATTGAAGGTCCAAAACATAAATATA-TAG-TGTTTCGAAAATGAGTTTTCTGAAGGCG-CAATAAAATCTTTTTAATTCGAA-CTG-AATAAAATAAACAGAATTCAAATC-TCTCTGTGTT-AGAAATTT--ACTGCT-CTTTAATCGGATGATGGGACGTAATAAACTTT-TCT--AC-TTTATATA-C-ATTCCATCGCGTA---AAATTAATAGTTCTAA--------GGTTCGAATTAACCA--GC----ACGTCCCCGTTATGCGCCTATAGGTAAAGGTAC-C----AGGATAAGGT---AT-CTTA--GATAGGAT--------------------TGAAACAAAA---AATCGCTAC----ATGTTCAGCGTGATGA--CGCGTTATATGTCTGGA
gi|10                         :                                                                                                    CGGCAAATTGC----AACAGATGTATCGAGTTAACGC----------TTTTGGTGACA-G-TAGG-G----AAGGA--AT-GA-G------------AT--GC-AGGG---AAATTAA-TT-TACCT--TTAAA---CCGCTC-----A-TTCACACC----T-TGA---TTT---------------------TTAATTC-A---AATGATTA--CAAA-GTATT-GAAACAG-----AAG-T--AG--CA-GGGCATA-A-TG--TT-TG--TTTTTGTCTTTAATACA--ATT---TCTTAAATCTTA--------------CA-G-------------GGCGGA------ATT----------------A-TAT-G-TTGAA-ACAT--ATATGA-TA----G-ATACAC-TTCTGATCCT-CGCGATTTTGTG--ATGGTG--A----TA-AATA-AACT-TCCATGC-gatatggtc
gi|11                         :    ATCCCACT---ATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TTCGATAACTC--TGTTTT-G-ACA--ATGAGAC---TATCC-T-TGTTGACT-AACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACGCG-AGA--C-A-----GT-------TAGG-G----AAATA--AT-GA-G------------TT--AC-AGGG---ATGTTAA-TT-TACCT--TAAAAA---C-CCC-----A-TTCACATC----T-TGA---TTTGATT---TTATC-A-GA--TTTTAGTTC---------------------------------------AG-T--AG--CAC-AGCAC----TA--TT-TG--TTTTTGTCTTTATAACG--ATG-AAACTTGAATCTTA--------------CAGG-------------GG
gi|12                         :          at--TACTT--CG-GTC----ATAA-TTT-GG--TTCGATTACTC--TGTTTT-C-ACA--ATGAGACTT-TATCC-C-TATTGACTAACAGGTAG--CGC----AT-ACGTGAATTAGAC--AGGGG-AGG--T-AAT----CGAGA-GTTAGA-GCTTTAGGTG--ACAGA-G------------AT--GC-AGGG---AGATTAA-TT-TA--T--TCTAAAT-CC-CTC-----G-TTCACACC----T-TGA---TTTGATT---
gi|13                         :    ATCAAACT---ATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TCCGATAACTC--TGTTTT-T-ACA--AGGAGAC---TATCC-T-TGTTGACTAAA--------CGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACGCA-AGA--C-ATTTTGGTGACA-G-TAGG-G----AAGTA--AT-GA-G------------gtg
gi|14                         : catATC-AACTATTATTC--AG-GTC----CTAAATTA-GGG-TCCGATAACTC--TGTTTT-GAACAACATGAAA----------------GA-TATACGGTAGTTCGT----A
gi|2                          :   tATCAAACT--TATTTTGCG-ATCGTGTATAA-TTACGG--TCCGATAACTCCTTGTTTTTG-ACA--ATGAGACGTACATCCGTGTGTTGACTAAACGGTAGTT-GTG---ATCAGGAGAAT-AAAT--ACGCACAGA--TTATTTTG-TGACATGCTAGG-GT---AAGTA--AT-GA-GCTCAAAACAAAGTT--AC-AGGGGCAATGTTAA-TTATACCACATAAAAAA-CC-CCC-----AATTCACACC---AT-TG----TTTAATT---TTATCGA-GAATTTTTAATTTTA---TATG-TTA--CAAAAGTATA-AAAACAG-----AAG-TTAAA--CACAAGCAC--A-TA--TT--GCTTTTTTATCTT-ATTACG--ATGGAAACTTATATCTTC--------------CAGG-------------GGGGGAGGGGGGATTTATATG-TTGAA-AAAA-TAT-G-TTGAATATAT--ATGCGATTA--T-G-ATATAC-TTATAATCCTGCATGATTTTGTG-AATGATGTAA----TGCAATA-AA-TCTC-ATGC-T-TAACATAA-C-GT-GGAC-GTTTGT----GAACATT----GA-GGT-GTTA--G-G--TGTC-ACT-----TGTTAA-ACT----T---CTAAAGATCTG-TGAT-TTCC----CCTGC-CAAATTTCTT-AGTTAC--T-----TGTAAATTA-CATGC--TCCTAA-G-AT----------GAAAT---AG-T--CCT-CTCAGATCT-TAG-CAA-A---CC-AA--TT-ATTCGGAT--AGC-TAAAA------CAAC--ACAA-A-TTCG-TCCAACAAC-ACATCAAAAT--GATAT--A------ATTGAG-TTAGA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTGTACG---------AG-AAAA-GACAA-TGTCTTCTAAAGATTTATC-A---TG-GT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-ACAGCA-C-TTGTA--TTAGTG----GCTCAGTCAAGGACAAGGACATTTCT-GA-A-CTTCA--TCTGGTAAGCAATGA----TTTTCTCTT-TCTTGTCA----TTTA--TCATAACA-----CAATTA--A-A----CAGA--TTT-T-A-AAATAAACA-CA--ACT--TTC--ACATGA-----C---------CGCT---TTGTTTACTCCC-GGTTGCGTCCGAGCCATT--TTG-AAAT--GTTATC-ATATCGGTG-AAA---TTCTTAATTTTTCCACAGTTGATTTTG-AAGCAATAAAAGTAGGTTTCTGAACTGAATG-TTTTCATGTTT-CATATAGATTC---AGT-T-T---TTAACT-TTGA---CACGTAGCA--TGTCCCAACT-TTTTTC-C--AGAA-----AT-ATG--AAAAAAGGTTTTGAAA-A-AATACC--TTTTTATA----CACGCA--A---AATG-CCGAG---AAAACT-TCACCATATGC--TCATTAATTT-C-T-CGTATAA-TCAGTT---GG------ACGTATACACACCAT-T-TTTC--AAATGAATTT--TGAA---GACAAT-AAATC-TTTT--ACCGAA-CTGAAATAA---ATA------GC--ATC-T-TTTG---TCATAACATT--AATGCTCCTT---TCAGGTCAGGGGTC-----CAACTTTATTCTAAT-T---GATAGT-A----AT-GCATGAATAAA--AA-AGTTATGA-A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----AC-TCCCCGTTTT-CGCC-A--TATATAAATAC-C----A-----CAGT---AC-TCT--TGATAGAAA--------------------T-AAACAAATTGAAACTGAT-C----AAAT-C--AGTGATGGCCC-CGCAATA-GT-TGAATca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                 C---AT-TAA------AATTATATTGTC-A-GA--TTTTAATTC-A---CATTATGA--------TATT-AAAACAG-----AAG-T--AG--CACG-GCAC--AATA--CTATA--GTTTTGCCTTTATTACA--ATG-AAACT--AATCTCA--------------CAAG-------------GGGGAA--------TTATGTG-ATGAACAAAA-TAT-G-GTAAATACATGTATGTGGTTA--TTG-TTATAC-TTATGATCCG-CACAATTGTGTG-A-TGGTG-A-----TA-AATA-AACTTTT-ATGC-T-TGACTTAA-C-TT-GGTC-CTTCAT----GAA-ATT----GA-GGC-GTTA--ATG--AGTC-ACT-----T-TTAA-ATAA---T---C----A--TAA-TGT-------------GT-CAA-CTTCTTTC-TTACA-----------AAT-G-CATGC--TCCTAA-TTAT----------AAAAT---GTCT--CTT-TT-AGATCT-TATTCAA-A---CC-TA--TT-AT-CGTAT--AGC-TGAAA------CAAC--ACAA-T-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAA-T--GATAT--A------TTTT-G-T-AGA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTTGACA---------AGTACAC-GGTAC-TGGTTTCTAA-GCTTT-TC-AA--TA-GT----TTG-----------CCTAAAAATTGTTTGC-A------C-TAGCA--TTAGTG----G-TCAGTCAAAAG-AAGTACGTTTCT-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAGCAATGA----TTATCTCCT----------------A-TTCATAACA-----CAAATA--G-ATTTGCAAACATCT-A-A-AAATAAATAACATTAAT--TCC--ATAT-A-----CAAAA-----CGAT---TTGTTTACT-CCAGCTTGCGTCC--ACCATT--TTG-AAATAAGTT-TTAATATCGGTGAAAA---TTCTAAATTTT--CA-AGACGATTTGG-AAGCATGAAAAGTAGG-TTCTGAACTGAATATCTTTTATGTTT-CATACAA-TGC---AATGT-T---ATAAC----TA---TAC-TAT-A--TGTCCAAACG-ATTTCCAG--AAGTA----ATAATGTAATAAACAATT---G-A-T-AATTCC--GTTTTATA----CATGCT--A---AATC-CC-TG---AATA-T-TAAACATATGT--TCATTGATTTG--TATGTA-AA-TCATTT----G------ACGAATAAACAGTAC-G-TTAC--AAATGAAATT--TGAT---G-CAAG-AAATAATTTT--CCTAAA-TTGAAAGAAAATATA------TC--ATC-C-TTTG---T-AG--AATTA-AATGTT-CTT---TCAAGCAAGGGGTC-----CAAA---ATGT--AT-G---TATT-C-A----TT-ATATG---AAA--AT-AGTTATCATA-----TA-------TTAATTATTAC-----C-ACCCC--TAA-CGCCTAT-TGTATAAATAC-------G----AAAT---AC-TATA-TAATAG--G--------------------T-AAACAAAT---AATCGAA-C----AAGTCC--CGTGACGA--C-CGCTATA-GT-TGGATg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agcttagattaagaataggtctacttaaaattttagcggccgatttgatgctttgTATATG-TTGAA-AAAAATATTG-TTGAATA------TGTGAT-A--TTG-ATATAC-TTATGATCCT-CATGATTTT-TG---TGATG-AA----TG-AATA-ATCTTCCGATGC-T-TAACTTAAAC-GT-GG-C-TTTTGTTT--GAA-ATT----GA-GGT--TAA--G-A--TTTT-TCC-----TGGTCG-GTT----TTTCC----T--CTG-CAAT-TTCTGTATCCTAC--AA-TT-CTT-A-TTACAAT-----TACAAAT-G-CCTG---TCCTAA-TTAT----------GAAAT---AG-TAGCCT-CT-AGATCG-TATTCAA-A---CCCAA--TT-AT-CGGAT--AGC-TAAG-------CAAC--ACAAGA-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAT-T--GATAT--ATAATTTATTGAG-T--GA-TA-TAA-CCT-TT-GTTTGTACA---------AGTAAAA--ACA---------------TTT-TC-AA--TG-GTGTA-TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-A-AGCA-C-GTGTA--TTA-TG----G-TCAGTCAAG-A-AAGAA-ATTTTG-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAG-AATGA----TTT-CTCTC-TCTTGTC-----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAGA--TTTCT-ATAAAT-AACA-CA--ACT--TTC--ACATGG---------------CGCT---TTGTTTACT-CC-GCTTGCGTCC--GCCATT--TTGAAAAT--G-T-TCAATAGCGGTGAAAA---ATCTTAATTTT--CA-AGACGATTTTGAAAGCAATAAAAGTAGG-TCATGAACTG-ATGTTTTTCATGTTT-CATATAG-TTT---AGTGT-T---TTAACT-TTTA---CAC-TAG-A--TGT-CCAACT-TTTTTCAC--AGAT-----AT-ATG-AAAAAAAGGTT---GAA-A-AATACA--TTTTTATA----CACGCAACA---AATG-CC--G---AAAA-T-TCACCACCTCC--TCGTTGATTTAC--ACGTAT---TCAATTAAAGG------ACGTAT--ACACTACAT-TTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAT-AAATCATTTT--TCCGAAGCTG------AATATA------TC--ATCTT-TTTG---T-AG-AAATT--AATGCT-CTT---TCAGGCCAGAGGTC-----CAACTTAATTA--ATCT---TATA-TGA----AT-GCATG---AAA--AA---TTAT-A-A-----TAGT-----TTAATCA-CAC----AC-TCCCCGTTAT-CGCCTAT-TGTATAAATA------------------------------ATATAGG--------------------T-AAACAAAT---AA-------------------CGTGATGG--C-CGCAATA-GT-TGGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TG-TGTT-TTTC----CCTGC-CAA-TTTCTT-A-TTACAAT-----TACAAAT-G-CATGC--TCCTAA-TTAT----------GAAAT---GGAT--CCT-CT-AGATCG-TATTCAA-A---CC-AA--TT-AT-CGGAT--AGC-TAAAG------CAAC--ACAA-A-TTCT-TCCAACAAC-ACATTCAA-TTTGATATTAATT----ATTGAGAT-AGA-TA-TAAACCT-TT-GTTTGTACA---------AGTAAAA--ACA---------------TTT-TC-AA--TGTGTA---TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGCCA-AGCA-C-T-GTA--TTA-TG------TCAGTCAAG-A-AAGAA-ATTTCT-GA-A-CTTCA--T-GGGTAAG-AATGA----TTT-CTCTT--CTTGTC-----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAGA--TTTCT-T-AAATAAACA-----ACT--TTC--ACATGG-----C----------GCT---TTGTTTACT-CC-GCTTGCGTCC--GCCATT--TTG-AAAT--GTT--CAATAGCGGTGAAAA---ATCTTAATTTT--CA-AGACGATTTGA-AAGCAATAAAAGTAGG-TCATGAACTGAATGTTTTTCATGTTT-CATATAG-TTT---AGTGT-T---TTAAC--TTTA---CACATAG-A--TGTCC--ACT-TTTTTCAC--AGAT-----AT-ATG-AAAAAAAGGTT---GAA-A-AATAAC--TTTTTATA----CACGCA--ACATAATG-TC-CG---AAAA-T-TCACCACATCC--TCGTTGATTTAC--ACGT-TTA-TCAATTAAAGG------ACGTATACACACTAT-T-TTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAT-AAATCATTTT--TCCGAA-CTG------AATATA------TC--ATC-T-TTTG---T-AG-AAATT--AATGCT-CTT---TCAGGCCAGAGGTC-----CAACTTTAATT--AT-TC--TATA-T-A----AT-GCATG---AAA--AA-AGTTAT-A-A-----TAGT-----TTAATCA-TAC----AC-TCCCCGTTAT-CGCCTAT-AGTATAAATATGCAATGAA----AAGTTGGACATCTAGTG-TAAAAGTTAAAACACTAAACTATAGGT-AAACAAAT---AATTGAT-C----AAATCA--CGTGATGG--C-CGCAATA-GT-TGGAT
gi|6                          :            --TATTT--CGCGTC----ATAAATTA-AGCGTCCGATAACTC--TGTTTT-G--CA--ATGAGA-----------------ACTATACGTTAGTTCGTATTGATCAGATGAATT--AT----------------TTTTGGTGACACG-TA-G-G----AAGTT--AT-GAGG------------TT--AC-A-GG---ATGTTAATTT-TACCT--GTAAGAATCC-CCC-----A-TTCACACC----T-TGA---TTTAATT---TTATC-A-GA--TTTTAATTC-A---TATGATTG---AAA-GTATTAAAAACAG-----AAGTT--AGCTCAGAAACA---A-TAT-TT-TG--TTTT--TCTTTATTACG--ATG-AAACTTAAATCTTAGCGGGGCGTAGTCCCAGGTTTATTGAACTGCGGGGGG------GATTACATGTTTGAA-AAAATTAT-GTTTGAG---AT--ATGCGATTA--TTGAATATAC-TTATG-TCTT-C-TGATTTTGTG--ATGATG--A----TT-AATA-AAC-CTCCATGC-TCTAACTT-AAC-GT-GG-C-TATTGTTG--AAG-ATT----GAGGGT-GTTA--A-GAAT-TC-AC------TGTTAA-ATT-------------G--CTG-TGTT-TTTC----CCTGC-CAA-TTGCTA-A-TTACT-T-----TGTAAAT-T-CATGCCTTCCTAATTTAT----------GATA----GG-T--TCG-CT-AGATCGATATTCAA-A---CC-AA--TTAAT-C-GAT--AGC-TAAAA------CAAC---CAA-ATTTCTGTCCAACAATAACACCAAA-T--GACAT---------ATTGAG-T-AGA------------------TGTACA---------AATAAAA-GACAA-TGGCTTCT-AAGATTT-TC-AA--TG-ATTATATTG-----------CCC--AAGTCATTTGC---AGCA-C-TTGTACTTTGGTG----G-TCAATCAAAGG-AAGACCATTTCTGGA-A-CTTCA--T-GGGTAAGCAATGA----TTT--TCTT-TCCTATAA----TT------ATAGTC-----CATTTACCA-A----GATA--CTC-T-T-AGTTGTACA-TA--GCTG-TTC--AAAC-A-----C---------CTTT---TTGTTat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccaaAACTTAA-C-GT-GG-C-TTTTGTTG--AAA-ATT----GA-GGT-GTCA--G-G--TG-C-ACG-----TGTTAA-AT---------C----A---TG-TGTT-TTCC----CCTGC-CAA-TTACTT-A-TTACA-TGTACTTGTAAAG-G-CACGC--TCCTAA-TTAT----------GAAAT---GGGC--CCT-CT-AAGTCT-TATTCAA-A---CC-AA--TT-AT-CGGAT--AGC-TAAAA------CAAC--ACAA-A-TTCT-TCCAACAAC-ACATCAAA-T--GATGT---------ATTGAG-T-AGA-TA-TTA--CT-TT-GTTTGTACAAGTAACATGAGTAAAA-GACAA-TGGCTTA-AAAGATTT-TCAAA--TG-GT----TTG-----------CCCAAAAGTCATTTGC-A-AGCA-CTTTGTA--TTTGTG----G-TCAGT-AAGGA-AAGGACATTTCT-GA-A-CCTCA--T--GGTAAGCAATGA----TTTTCTC-T-ACTTGTC-----TTTA-TTCATAACA-----CAATTA--A-A----CAGA--TTT-T---AAATTAACA-CA--ACT--TTC--A-----------------------------------------CTTGCGTCC--GCCGTT--TTG-AAAT--GTT-TCAATATTGGTGAAAA---ATCTT----------------ATTTTG-AAGCAATAAAAGTCGG-TTCTGAACTAAATGTTT----TGTTT-CATATAG-TTT---AGTTC-TCAGTTAACT-TTTA---CAC-TAG-A--AGT-CCAACT-TTTTCC-C--AGAT-----AT-ATG-AAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAAGATT---GAA-A-ATTACG--TTTTTATA----CATGCC--A-----TGTCC-CT---AAAA-T-TTACCACTAGC--TCGTTAATTTATATGCGT-TGA-TCATTT----G------ACTTGTAACCACTAC-T-TTTC--AAATGAATTT--TGAA---G-CAAA-AAATCACTTT--TCCGAA-CTGAAATGAAATATA------TC--ATT-T-TCTG---T-AGAAATTTTAAATGCT-CTT---TCAGGACAGGGGTG-----CAAA---AGTT--TT-C---TATA-C-A----AT-ATTTG---AAA--AA-AGTTATAATAGTAATTAGT-----TTAATTA-CACACTGAC-TCGCCGTTAT-CGCCTAT-TGT---AATAC-G----AG----GTAT---AC-TCTA-------------------------------------------AATCGCT-CTTGAAAGTCA--CGTGATAA--C-CGCTATA-
gi|9                          :    ATCCAACT---ATTT--CG-GTC----ATAA-TTA-GG--TCCGATAACTC--TGTTTT-G-ACA--ATGATAC---TAT---------------ACGGTAGTTCGT----ATCAGATGAATTAAAT--ACACG-AGA--T-ATTTTGGTGATA-G-TAGG-G----AAGTT--AT-GA-G------------TT--AC-AGGG---ATGTCAA-TT-TACCT--TAAAAA---C-CCC-----A-TTCACAC----AT-TGA---TTTAATT---TTATC-A-CA--TTTTAATTC-A---TATGATTA--CAAA-GTATT-GAAACAG-----AAG-T--AG--CGC-AGCACA-A-TA--TT-TG--TCTTTGTCTTTATTACG--ATG-AAACTTAAATCTTA--------------CAGT-------------GGGGAA--------TTACGTG-TTG-A-AAAA-TAT-A-TTGA----AT--ATGCGATTA--TTG-ATAT