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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttttagaACC---------TTC-------------ACATTA-AGGTGAAGTTCAAAGGTCAAGG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttagagtcaaatactatttaatgttcttgaaaatattcaaaaagacataaaaaataattttttttttaaattttgatgctgaTAGACTTGATTAAT--GATTTCAGA--GACTTTCAAGGGCAATAACTATGCATAAaaaaggtcaagg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACTTT--TTATTATAAGTT--TCA--AG-GATAT-TCCGGTAGGAAAGACG-TATGAAA---T--G----CTATTTTT---GATAATTTTGTA-TA---T----GACCT-GA-C-CTTTG----------ACTTGACCCTA---AT---TTT--CA---AG----TCAAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTGCTTATAAT--GTTGCCCA--AG-AATAT-TCCTGTAGAACAG----TATGGAAAAAT--GCT--TTTTTTTT---GA--GATTT-GG-AA---T----GAC-TTGA-CGCATTT----------A------CTTGCTAAT---TTT--CA---AG----TCAAAGGT-CACTGACTCT-C-ATTGCAGTT-GG-TCAGTGC-----CCATA-GATT--ACGGTC-TTC-AGTTTtatgattattgacagtggttcgtgccatcattaaccgtttctctccggcaagttttttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataattaatattttcgagatgtccttgatgaactataaagtctttgatcatttgaaacaaagatttttttttgacggcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ac--TTATAAT--GTG--TCATAAG-GATATTCCCTGTAGGAAAGCTGGTATTGTAAAAT--GCAATTTTTCGAT---AA--ATTT---G-AA---T----GACCTTGATC-CTTTGTATCTTCGAAA------CCTA---AA---TTT--CAAAGTAA---TTAAAGGTTCACTGA-TCC-CTATTGCAGTTTGGTGTCGTGCCCCATTGCA-CGATTTAACGGTTTCTCAAGTTTGACGTGT--TT-----ACAATGAA-TCATT---------AAAAATAGGGGTTAA---TCTTTCTTAAAGGtcccattttacatagaaatgtaaaatttaagttgggccaataactctttaaagggtcattga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acttttgcCAAAAAGACATAAAAAATAAT--T----TTTTTTTT---AA--ATTTT----GATGCT----GACCTTGA-C-CTTTGA---------A------CTTC---AC---CTTAATG---TGAAGGTAAAAGGT-CAgcattgggaatcctttttgtttaattttccctataaatttattcgaaatggatcaatctattaagaatatgatataggtttaatccacattgcattactgaataaaaaaggagttagtgtggataataagattcttatgcaaagtttcaaaactccgtaaagggtcataaggtcagatgatgtttgggtgataataaatcattttctcgaaatgcctatatgaattataagtctttttgataagtcttcgaaacaaataatattttatgacgggcggaaattaataataagaaacagtaagaaaagcaataggtttccacagttaaaggtggtaaaagcctctaat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttttagagtcaaatactatttaatgttcttgaaaatattTTGA-C-CTT-G----------G------CCCG---AT---TTT--CA---AGG---TCAAAGGT-CACTGA-CCT-C-ATTCCAGTT-AGTCCTGTTC-----CCATACGATT-AAGGGTT-CTCAAGTTTagg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acatT---TTT--CA---AGG---TCAAAGGT-CACTGT-TCT-C-ACTGCAGTT-GGTCACATGC-----CCATACGATT-AATGGTT-CTCAAGTTTtaagttgaaattgttaaacataaggggcaataactatcataaagggccatt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATT-AATA-TT-TTCGAG------ATGTCCTTGATGAACTATAAAGTCTTTGATCATTTGAAACA--------AAGATTTTTTTTTGACGGtttttttcgttttacatagaaatcgtaaaattcaaggggaaataactctctaagcggtcatagaa
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TATATGATGAAGCATAGTTGCTTATCAATAAGTCTTCAAACAAAAGCATTTTGGACCGGCAGGAATATAATAAATAATAATAATAATAAACAGGAACAATACTAATAGGATTTCCACAGAAAGCTGGAAAGCTCCCTAATAATAATAATAATAATAATTAAACAGAACAATAACAATAGGACTGTCCGACAGAAAGGTGGAAAGCCACTAATAAACAGAACGAATAACAATAGGACTATCCCACCAGCAAAGGTGGAAAGCCCTAATAAAACAGAACAATAACAACTAGGACTTCCACAAGAAAGGTGGAAAGCCCTAAATTACAGAGAATGATTCACA
Unaligned ( gi|7 ): TCCCGGTTCATTTATTGTATCCCTAAAAGTTAAAATTGGCTTATAATTCTACAGGTTTCATTGCCTTCTTGAGGAGTTAAGAGGATAGTCATACTGTTTTTATGAGGGCCAAGTATCCGTAAGGGGTAATAGGTAATAACGTTGGGTGATTTGAGGATCCGAGAAGTCTATACTATGAGCATAGGCATGCTTATCAAAAGTCTTGAAACAAAAGCATTTTGACGGCAGGATTAATTAAATATAA
Unaligned ( gi|8 ): ATAAAAAACAGCAATAATTCGCAATAGGTCTTTCGCCGAATAGTCGAAAAGGCCCTAATAAAATAATATAACAAGAACTAGCATTAGGTACTTCCGCCGGAGTCGTAAAAGCCCTAAATCAACTAGGAACAATAACATATTAGGACACGCCTTTCCACAGAAGGTGGAAAGCCCTAATGAATGAATAAGACAGAAAAAAGCATATAGGACTTTCTCACCAGAAAGTGAAATCCC
Unaligned ( gi|13 ): TTAAAATGAAATTTTTTTTTTTCTATNCCAGAGGGCAAGTGAGAGTACAAAAATTAATAATAACTAGTGATTCCTAATTGTTCCGAAAATTAGAGG
Unaligned ( gi|14 ): TTAAAATATGATACCTTGAATTTTGACCTTGACAAAAATTCAGTCAATGATTTAGATGTAAGCTGAAGTCCTATTGATTTTTAATAGTATCAAA






Alignments
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Reference ( family-773 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              NNTTTATATATCA-TGAAAATCTCAACA--ANGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATTAAGGTCTTTTTA--GNGTCAAATAAT-ATT--TANTGTTCTTG--AAAATATTCTAAAAGAC-ATTG---AA--AATAAAAATTT-TTT-----TTTTT----A-----------TG-ACCT---------TG-------------ACCTTA-ATGTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAATTAAT--ACAAGTGGT--CATGTTGTTTTATCTTCTTGTTAAGGGTAGAAAGCTGTAGGCNTGATTAATCAGATNTCGGATTGACTTTCAGGGGCAGTAACTATGCGTAAGGGTCCT-TAAACTCG--TTAAAAAACT-TCATGCAAGGGATTTTTATA-GTTAATAAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATATG-ATTTCAGGTTCAGTTGAGATACGCCGCGTACAAA--AACTTTTTGACGTTAGTCAT-GTAATCTGGAAATAAGGAAGTACGAAGTAACATTCA--ATTCAAATTAATCA-GC-AAAAGCAAATTATATAATATAATAGGATAATTNTTTATNAT--GTN--TCA--AGGATAT-TCCN-GTAGAAAAGANG-TATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CTNATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTG-CAGTT-GGTCCCGTGCCC-AT---ACGATT-AA-CGGTT-CT------CAAGTTTGACGTGTCCTTGATGAACNATGAAGTCNTTGATCATTTGAAANATAGGGGTTAAGATTCTTTCTTGANGG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcagaagttgaaaaag-----------TA-ACTT---------TG-------------ATTTTT-TTGTCAAGGTCAAAAGTCAAGG---TC-ATTCAT--Atgacaaaaaaatcaaagttaatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaatttttatatatcatgaaaatctcaacaacggaggtaatatgtcaaaaaggatattaaggtctttttagagtcaatactatttatgttattgttaaaatattcaaaagactgaaaaataattttttcaaaatttttgatgatggacctgtgatttgttgactttaatgtgaaggtcaaaggtcaaggttaattaatacaagtggtcatgttgttttatcttcttgttaagggtagaaagctgtaggcataaatcagatattgaattgactttcaggggcagtaatatgtgaagggtccttaaactcgttaaaaaacttcatgcaagggatttttatagttaataaatacactgaaacaggagctttctgcgtctcatatgatttcaggttcagttgagatacgccgcgtacaaaaactttttgacgttagtcatgtaatctggaaataaggaagtacgaagtaacattcaattcaaattaatcagcaaaagcaaattatataatataataggataatcgttaatcatgtatcatgaatattccagaggaaaacagatagaaaaatccattttttttttgagatttttgagatataggactttgacttgacactactaatttcaaggtcggttctgatctacatgcagtggtctcaccatagattaacggtaatcagtt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcagaagttgaaaaagttaaaTTTATATATCA-TGAAAATCTCAACA--ACGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATTAAGGTCTTTTTA--GAGTCAA-TACT-ATT--TA-TGTTATTGTTAAAATATTC-AAAAGAC---TG---AA--AA--ATAATTT-TTTCAAAATTTTTGATGA-----------TGGACCTGTGATTTGTTG-------------ACTTTA-ATGTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAATTAAT--ACAAGTGGT--CATGTTGTTTTATCTTCTTGTTAAGGGTAGAAAGCTGTAGGCATAA---ATCAGATATTGAATTGACTTTCAGGGGCAGTAA-TATGTG-AAGGGTCCT-TAAACTCG--TTAAAAAACT-TCATGCAAGGGATTTTTATA-GTTAATAAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATATG-ATTTCAGGTTCAGTTGAGATACGCCGCGTACAAA--AACTTTTTGACGTTAGTCAT-GTAATCTGGAAATAAGGAAGTACGAAGTAACATTCA--ATTCAAATTAATCA-GC-AAAAGCAAATTATATAATATAATAGGATAATCGTTAATCAT--GTA--TCA--TGAATAT-TCCA-GAGGAAAACAG---ATAGAAAAATCCATTTTTTT---TTTGA-GATTTT-TGAG-ATATAGGACTTTGA-C---TTG----------A------CACTACTAA-TTTCAAGGT---C---GGT-T-CTGA-TCTAC-A-TG-CAG-T-GGTCTCA---CC-AT---A-GATT-AA-CGGTatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaatttttatatatcatgaaaatctcaacaacggaggtaatatgtcaaaaaggatattaaggtctttttagagtcaatactatttatgttattgttaaaatattcaaaagactgaaaaataattttttcaaaatttttgatgatggacctgtgatttgttgactttaatgtgaaggtcaaaggtcaaggttaattaatacaagtggtcatgttgttttatcttcttgttaagggtagaaagctgtaggcataaatcagatattgaattgactttcaggggcagtaatatgtgaagggtccttaaactcgttaaaaaacttcatgcaagggatttttatagttaataaatacactgaaacaggagctttctgcgtctcatatgatttcaggttcagttgagatacgccgcgtacaaaaactttttgacgttagtcatgtaatctggaaataaggaagtacgaagtaacattcaattcaaattaatcagcaaaagcaaattatataatataataggataatcgttaatcatgtatcatgaatattccagaggaaaacagatagaaaaatccattttttttttgagatttttgagatataggactttgacttgacactactaatttcaaggtcggttctgatctacatgcagtggtctcaccatagattaacggtaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcagaagttgaaaaagttaaatatgaatgaccttgacttttgaccttgacaaaaaaatcaaagttaatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaattTTGA-C-CTT-G----------G------C----CCGATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-CCT-C-ATTC-CAGTT-AGTCCTGTTCCC-AT---ACGATT-AA-GGGTT-CT------CAAGTTTaatcagtt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGGAT-ATGAAGGTCTTTTTA--GGATCAAATAAT-ATTTATATTCTTCTTG--AAAATATACTAAAAGAC-TTTG---GA--AATGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAGACTTGATTAAT--GATTTCAGA--GACTTTCAAGGGCAATAACTATGCATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTACACATGA-CAAAGA-CTAAGAA--AGGGAGGTAAATATGTCAAAAGGGAT-ATAAAAGTCGTCTTA--TTGTCAAATTAT-ATC--TATTGTCCTGG--AAAA-ATTATAAAAGAC-CTTGGGGAATGAATGAAATTTTATTT-----TCTTT----A-----------TG-ACCT---------TG-------------ACTTTA-ATTTGAAGGTCAAAGGTTAAGGGGCTTAATACATGTATAAGAGGCTCCATCTC--TATATCTT--TATTAATG-CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGTGTAAATGTCCTATCCATTTGGTTTAT----CTCTCATGACAGAGGTGTTTAAAAGTGAATTAATA-ACT---ACAAG---TTTC-ATGTCTC-TACGCATTTT-GGTTCAGTAGGAGTA------GCACAAACAAGCTTTCTGATGAGAGTCATTGTAATTAGGAGA-AAGG---T-CAAAGT-----TCAGAATTTCCATTAGTTATGCTGAAAGCAAAT-----AAGAT-----GATAATTCTTTATCAT--GTT--TCA--AGG-TATCTCCT-GTGCAAAAGGGGGTATAAAAAAATG--TTCTCTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CCGATTTTTATGAT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTT-CAGTT-AGTTCCATGCTG-AA---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTAACATGT--TT--TGAACTATGAAGTCTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agTTGCTTATAAT--GTG--TCATAAGGATAT-TCCCTGTAGGAAAGCTGGTATTGTAAAATGC-AATTTTTCGAT---A-AATTT---G-A-AT----GACCTTGATC-CTTTGTATCTTCGAAA------C----CTAAATTTCAAAGTAATTAAAGGTTCACTGA-TCC-CTATTG-CAGTTTGGTGTCGTGCCCCATTGCACGATTTAA-CGGTTTCT------CAAGTTTGACGTGT--TT-----ACAATGA--------ATCATT--AAAAATAGGGGTTAA---TCTTTCTTAAAGGcaaacaaattttttttgacgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acttACTTTTTATTATAAGTT--TCA--AGGATAT-TCCG-GTAGGAAAGACG-TATG---AAATGC-TATTTTT---G---ATAATTTTGTA-T-AT----GACC-TGA-C-CTTTG----------ACTTGACC----CTAATTTTCAA-GT---CAAAG---TA-TGA---T-T-ATTGACAG-T-GGT-TCGTGCC-------ATCATT-AACCGTTT-CTCTCCGGCAAGTTTgcattgggaatcctttttgtttaattttccctataaatttattcgaaatggatcaatctattaagaatatgatataggtttaatccacattgcattactgaataaaaaaggagttagtgtggataataagattcttatgcaaagtttcaaaactccgtaaagggtcataaggtcagatgatgtttgggtgataataaatcattttctcgaaatgcctatatgaattataagtctttttgataagtcttcgaaacaaataatattttatgacgggcggaaattaataataagaaacagtaagaaaagcaataggtttccacagttaaaggtggtaaaagcctctaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCGAGATGTCCTTGATGAACTATAAAGTCTTTGATCATTTGAAACA--------AAGATTTTTTTTTGACGGtttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataattaatattttcgagatgtccttgatgaactataaagtctttgatcatttgaaacaaagatttttttttgacggcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|6                          : actttttattataagtttcaaggatattccggtaggaaagacgtatgaaatgctatttttgataattttgtatatgacctgacctttgacttgaccctaattttcaagtcaaagtatgattattgacagtggttcgtgccatcattaaccgtttctctccggcaagttttttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataattaatattTTTTTATATCAATAATAATCTCA-CATTAAGGAGGTAA-T-TGTCAAAAAAGATGATTAAGGT-TTTTTAATAAGTCGAATATTAATT--TAATGTTCT----AAAATATTATAAAAGACAATTG---AA--AATAAAAA------A-----TGATG----A-----------TG-ACCT---------TG-------------ACCTTATATTTGAcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caaaatgttgtaaattgattaaaattatatgaccttatggacttttgaccttcaaccaaaaattcaagtgtcaatgatttaagattcgaaagctgatacacgtccacattgattatttaataatatcaaagaaaatagtaatTGCTTATAAT--GTTGCCCA--AGAATAT-TCCT-GTAGAACAG----TATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---T-GAGATT-TG-GAAT----GA-CTTGA-CGCATTT----------A------CTTG-CTAATTTTCAA-GT---CAAAGGT-CACTGACTCT-C-ATTG-CAGTT-GGT-CAGTGCCC-AT---A-GATT--A-CGGTC-TT------C-AGTTTcttt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TATATGATGAAGCATAGTTGCTTATCAATAAGTCTTCAAACAAAAGCATTTTGGACCGGCAGGAATATAATAAATAATAATAATAATAAACAGGAACAATACTAATAGGATTTCCACAGAAAGCTGGAAAGCTCCCTAATAATAATAATAATAATAATTAAACAGAACAATAACAATAGGACTGTCCGACAGAAAGGTGGAAAGCCACTAATAAACAGAACGAATAACAATAGGACTATCCCACCAGCAAAGGTGGAAAGCCCTAATAAAACAGAACAATAACAACTAGGACTTCCACAAGAAAGGTGGAAAGCCCTAAATTACAGAGAATGATTCACA
Unaligned ( gi|7 ): TCCCGGTTCATTTATTGTATCCCTAAAAGTTAAAATTGGCTTATAATTCTACAGGTTTCATTGCCTTCTTGAGGAGTTAAGAGGATAGTCATACTGTTTTTATGAGGGCCAAGTATCCGTAAGGGGTAATAGGTAATAACGTTGGGTGATTTGAGGATCCGAGAAGTCTATACTATGAGCATAGGCATGCTTATCAAAAGTCTTGAAACAAAAGCATTTTGACGGCAGGATTAATTAAATATAA
Unaligned ( gi|8 ): ATAAAAAACAGCAATAATTCGCAATAGGTCTTTCGCCGAATAGTCGAAAAGGCCCTAATAAAATAATATAACAAGAACTAGCATTAGGTACTTCCGCCGGAGTCGTAAAAGCCCTAAATCAACTAGGAACAATAACATATTAGGACACGCCTTTCCACAGAAGGTGGAAAGCCCTAATGAATGAATAAGACAGAAAAAAGCATATAGGACTTTCTCACCAGAAAGTGAAATCCC
Unaligned ( gi|13 ): TTAAAATGAAATTTTTTTTTTTCTATNCCAGAGGGCAAGTGAGAGTACAAAAATTAATAATAACTAGTGATTCCTAATTGTTCCGAAAATTAGAGG
Unaligned ( gi|14 ): TTAAAATATGATACCTTGAATTTTGACCTTGACAAAAATTCAGTCAATGATTTAGATGTAAGCTGAAGTCCTATTGATTTTTAATAGTATCAAA






Alignments
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Reference ( family-773 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NNTTTATATATCA-TAAAAATCTCAGCA--ANGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATNAAGGTCTTTTTA--GAGTCAAATANT-ATT--TANTGTTCTTG--AAAATATTCTAAAAGAC-NTTG---AA--AATGAAAATTT-TTT-----TTTTT-A----------T----GACC---------TTG-------------ACTTTA-ATGTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTCAT--ACAAGNGGCTCCATNTCGTTNTATCTTCTT---GTTAANGG----CAGAAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCGGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGCGTAAGNGTCCTATNNACTCGGTTTANAAAACTCTCATGNNAGGGGTNTTTANAAGTNAATNAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATACGCATTTCAGGTTCAGTNGGGGTACGCCGCGCACAAACAAGCTTTCTGACGNNAGTCATTGTAATCNGGAGATAAGGAAGTACGAAGTAACATTCAGAATTCNNATTAGTCATGCTGAAAGCAAATTATATAANATAATAGGATAATTGTTTATNAT--GTT--TCA--AGGATAT-TCCN-GTAGAAAAGANGGTATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CTAATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTG-CAGTT-GGTCCCGTGCCC-AT---ACGATT-AA-CGGTT-CT------CAAGTTTGACGTGTTT--TGAACTATGAAGTCTTTGATCATTTGAAANATAGGGGTTAAGATTCTTTCTTGANGG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcagaagttgaaaaagttaaaTTTATATATCA-TGAAAATCTCAACA--ACGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATTAAGGTCTTTTTA--GAGTC-AATACT-ATT--TA-TGTTATTGTTAAAATATTC-AAAAGAC---TG---AA--AA--ATAATTT-TTTCAAAATTTTTGA----------TGATGGACCTGTGATTTGTTG-------------ACTTTA-ATGTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTAAT--ACAAGTGG--TCATGTTGTTTTATCTTCTT---GTTAAGGG----TAGAAAGCTGTAGGCATAA---ATCAGATATTGAATTGACTTTCAGGGGCAGTAA-TATGTG-AAGGGTCCT-TAAACTCG--TTAAAAAACT-TCATGCAAGGGATTTTTAT-AGTTAATAAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATATG-ATTTCAGGTTCAGTTGAGATACGCCGCGTACAA--AAACTTTTTGACGTTAGTCA-TGTAATCTGGAAATAAGGAAGTACGAAGTAACATTC--AATTCAAATTAATCA-GC-AAAAGCAAATTATATAATATAATAGGATAATCGTTAATCAT--GTA--TCA--TGAATAT-TCCA-GAGGAAAACAG---ATAGAAAAATCCATTTTTTT---TTTGA-GATTTT-TGAG-ATATAGGACTTTGA-C---TTG----------A------CACTACTAA-TTTCAAGGT---C---GGT-T-CTGA-TCTAC-A-TG-CAG-T-GGTCTCA---CC-AT---A-GATT-AA-CGGTatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaatttttatatatcatgaaaatctcaacaacggaggtaatatgtcaaaaaggatattaaggtctttttagagtcaatactatttatgttattgttaaaatattcaaaagactgaaaaataattttttcaaaatttttgatgatggacctgtgatttgttgactttaatgtgaaggtcaaaggtcaaggttaattaatacaagtggtcatgttgttttatcttcttgttaagggtagaaagctgtaggcataaatcagatattgaattgactttcaggggcagtaatatgtgaagggtccttaaactcgttaaaaaacttcatgcaagggatttttatagttaataaatacactgaaacaggagctttctgcgtctcatatgatttcaggttcagttgagatacgccgcgtacaaaaactttttgacgttagtcatgtaatctggaaataaggaagtacgaagtaacattcaattcaaattaatcagcaaaagcaaattatataatataataggataatcgttaatcatgtatcatgaatattccagaggaaaacagatagaaaaatccattttttttttgagatttttgagatataggactttgacttgacactactaatttcaaggtcggttctgatctacatgcagtggtctcaccatagattaacggtaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcagaagttgaaaaagttaaatatgaatgaccttgacttttgaccttgacaaaaaaatcaaagttaatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaattTTGA-C-CTT-G----------G------C----CCGATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-CCT-C-ATTC-CAGTT-AGTCCTGTTCCC-AT---ACGATT-AA-GGGTT-CT------CAAGTTTaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acat----------T----GACC---------TTG-------------GCCCGA-TTTTCAAGGTCAAAGGTCA------CTGACCTCAT-----------TCCAGTTAGTCCTGTTCCCATACGATTAAGGGTTCTC---AAGTTTTAAGTTGAA---AT----TGTTAAA--CA---TAAGGGGCAATAACTAT-CATAAAGGGCCtaagttgaaattgttaaacataaggggcaataactatcataaagggccatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acattTTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGT-TCT-C-ACTG-CAGTT-GGTCACATGCCC-AT---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTA--GAGTCAAATACT-ATT--TAATGTTCTTG--AAAATATTCAAAAAGAC-ATAA---AA--AAT---AATTT-TTT-----TTTTA-AATTTTGATGCT----GACC---------TTGACCTTTGAACTTCACCTTA-ATGTGAAGGTAAAAGGTCAAGG---tttttttcgttttacatagaaatcgtaaaattcaaggggaaataactctctaagcggtcatagaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAGGAT-ATGAAGGTCTTTTTA--GGATCAAATAAT-ATTTATATTCTTCTTG--AAAATATACTAAAAGAC-TTTG---GA--AATGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAGACTTGATTAAT--GATTTCAGA--GACTTTCAAGGGCAATAACTATGCATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTACACATGA-CAAAGA-CTAAGAA--AGGGAGGTAAATATGTCAAAAGGGAT-ATAAAAGTCGTCTTA--TTGTCAAATTAT-ATC--TATTGTCCTGG--AAAA-ATTATAAAAGAC-CTTGGGGAATGAATGAAATTTTATTT-----TCTTT-A----------T----GACC---------TTG-------------ACTTTA-ATTTGAAGGTCAAAGGTTAAGGGGCTTAA-TACATGTATAAGAGGCTCCATCTC--TATATCTT--T---ATTAATG-----CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGTGTAAATGTCCTATCCATTTGGTTTAT----CTCTCATGACAGAGGTGTTTAAAAGTGAATTAATA-ACT---ACAAG---TTTC-ATGTCTC-TACGCATTTT-GGTTCAGTAGGAGTA------GCACAAACAAGCTTTCTGATGAGAGTCATTGTAATTAGGAGA-AAGG---T-CAAAGT-----TCAGAATTTCCATTAGTTATGCTGAAAGCAAAT-----AAGAT-----GATAATTCTTTATCAT--GTT--TCA--AGG-TATCTCCT-GTGCAAAAGGGGGTATAAAAAAATG--TTCTCTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CCGATTTTTATGAT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTT-CAGTT-AGTTCCATGCTG-AA---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTAACATGTTT--TGAACTATGAAGTCTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agTTGCTTATAAT--GTG--TCATAAGGATAT-TCCCTGTAGGAAAGCTGGTATTGTAAAATGC-AATTTTTCGAT---A-AATTT---G-A-AT----GACCTTGATC-CTTTGTATCTTCGAAA------C----CTAAATTTCAAAGTAATTAAAGGTTCACTGA-TCC-CTATTG-CAGTTTGGTGTCGTGCCCCATTGCACGATTTAA-CGGTTTCT------CAAGTTTGACGTGTTT-----ACAATGA--------ATCATT--AAAAATAGGGGTTAA---TCTTTCTTAAAGGcaaacaaattttttttgacgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acttTTTATTATAAGTT--TCA--AGGATAT-TCCG-GTAGGAAAGAC-GTATG---AAATGC-TATTTTT---G---ATAATTTTGTA-T-AT----GACC-TGA-C-CTTTG----------ACTTGACC----CTAATTTTCAA-GT---CAAAG---TA-TGA---T-T-ATTGACAG-T-GGT-TCGTGCC-------ATCATT-AACCGTTT-CTCTCCGGCAAGTTTgcattgggaatcctttttgtttaattttccctataaatttattcgaaatggatcaatctattaagaatatgatataggtttaatccacattgcattactgaataaaaaaggagttagtgtggataataagattcttatgcaaagtttcaaaactccgtaaagggtcataaggtcagatgatgtttgggtgataataaatcattttctcgaaatgcctatatgaattataagtctttttgataagtcttcgaaacaaataatattttatgacgggcggaaattaataataagaaacagtaagaaaagcaataggtttccacagttaaaggtggtaaaagcctctaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acttATT-AA-TA-TT-TT------CGAG----ATGTCCTTGATGAACTATAAAGTCTTTGATCATTTGAAACA--------AAGATTTTTTTTTGACGGtttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataattaatattttcgagatgtccttgatgaactataaagtctttgatcatttgaaacaaagatttttttttgacggcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|6                          : actttttattataagtttcaaggatattccggtaggaaagacgtatgaaatgctatttttgataattttgtatatgacctgacctttgacttgaccctaattttcaagtcaaagtatgattattgacagtggttcgtgccatcattaaccgtttctctccggcaagttttttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataTTTTTATATCAATAATAATCTCA-CATTAAGGAGGTAA-T-TGTCAAAAAAGATGATTAAGGT-TTTTTAATAAGTCGAATATTAATT--TAATGTTCT----AAAATATTATAAAAGACAATTG---AA--AATAAAAA------A-----TGATG-A----------T----GACC---------TTG-------------ACCTTATATTTGAcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caaaatgttgtaaattgattaaaattatatgaccttatggacttttgaccttcaaccaaaaattcaagtgtcaatgatttaagattcgaaagctgatacacgtccacattgattatttaataatatcaaagaaaatagtaatTGCTTATAAT--GTTGCCCA--AGAATAT-TCCT-GTAGAACAG----TATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---T-GAGATT-TG-GAAT----GA-CTTGA-CGCATTT----------A------CTTG-CTAATTTTCAA-GT---CAAAGGT-CACTGACTCT-C-ATTG-CAGTT-GGT-CAGTGCCC-AT---A-GATT--A-CGGTC-TT------C-AGTTTcttt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|7 ): TCCCGGTTCATTTATTGTATCCCTAAAAGTTAAAATTGGCTTATAATTCTACAGGTTTCATTGCCTTCTTGAGGAGTTAAGAGGATAGTCATACTGTTTTTATGAGGGCCAAGTATCCGTAAGGGGTAATAGGTAATAACGTTGGGTGATTTGAGGATCCGAGAAGTCTATACTATGAGCATAGGCATGCTTATCAAAAGTCTTGAAACAAAAGCATTTTGACGGCAGGATTAATTAAATATAA
Unaligned ( gi|8 ): ATAAAAAACAGCAATAATTCGCAATAGGTCTTTCGCCGAATAGTCGAAAAGGCCCTAATAAAATAATATAACAAGAACTAGCATTAGGTACTTCCGCCGGAGTCGTAAAAGCCCTAAATCAACTAGGAACAATAACATATTAGGACACGCCTTTCCACAGAAGGTGGAAAGCCCTAATGAATGAATAAGACAGAAAAAAGCATATAGGACTTTCTCACCAGAAAGTGAAATCCC
Unaligned ( gi|13 ): TTAAAATGAAATTTTTTTTTTTCTATNCCAGAGGGCAAGTGAGAGTACAAAAATTAATAATAACTAGTGATTCCTAATTGTTCCGAAAATTAGAGG
Unaligned ( gi|14 ): TTAAAATATGATACCTTGAATTTTGACCTTGACAAAAATTCAGTCAATGATTTAGATGTAAGCTGAAGTCCTATTGATTTTTAATAGTATCAAA






Alignments
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Reference ( family-773 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NNTTTATATATCA-TAAAAATCTCAGCA--ANGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATNAAGGTCTTTT--TAGAGTCAAATANTA-TT--TANTGTTCTTG--AAAATATTCTAAAAGACN-TTG---AA--AATGAAAATTT-TT------TTTTTNA----------T----GACC---------TTG-------------ACCTT------A-ATNTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTCAT--ACAAG--GG--TCCATNTCGTTNTATCTTC-TATTAAGGG--CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGCGTAAAGGTCCTATNNACTCGGTTTANAAAACTCTCATGNNAGGGGTNTTTANAAGTNAATNAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATACGCATTTCAGGTTCAGTNGGGGTACGCCGCGCACAAACAAGCTTTCTGACGNNAGTCATTGTAATCNGGAGATAAGGAAGTACGAAGTAACATTCAGAATTCNNATTAGTCATGCTGAAAGCAAATTATATAANATAATAGGATAATTGTTTATNAT--GTT--TCA--AGGATAT-TCCN-GTAGAAAAGANGGTATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CTAATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTG-CAGTT-GGTCCCGTGCCC-AT---ACGATT-AA-CGGTT-CT------CAAGTTTGACGTGTTT--TGAACTATGAAGTCTTTGATCATTTGAAANATAGGGGTTAAGATTCTTTCTTGANGG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcagaagttgaaaaagttaaaTTTATATATCA-TGAAAATCTCAACA--ACGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATTAAGGTCTTTT--TAGAGTC-AATACTA-TT--TA-TGTTATTGTTAAAATATTC-AAAAGAC---TG---AA--AA--ATAATTT-TTTCAAAATTTTTGA----------TGATGGACCTGTGATTTGTTG-------------ACTTT------A-ATGTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTAAT--ACAAGT-GG--T-CATGTTGTTTTATCTTCTTGTTAAGGG--TAGAAAGCTGTAGGCATAA---ATCAGATATTGAATTGACTTTCAGGGGCAGTAA-TATGTG-AAGGGTCCT-TAAACTCG--TTAAAAAACT-TCATGCAAGGGATTTTTAT-AGTTAATAAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATATG-ATTTCAGGTTCAGTTGAGATACGCCGCGTACAA--AAACTTTTTGACGTTAGTCA-TGTAATCTGGAAATAAGGAAGTACGAAGTAACATTC--AATTCAAATTAATCA-GC-AAAAGCAAATTATATAATATAATAGGATAATCGTTAATCAT--GTA--TCA--TGAATAT-TCCA-GAGGAAAACAG---ATAGAAAAATCCATTTTTTT---TTTGA-GATTTT-TGAG-ATATAGGACTTTGA-C---TTG----------A------CACTACTAA-TTTCAAGGT---C---GGT-T-CTGA-TCTAC-A-TG-CAG-T-GGTCTCA---CC-AT---A-GATT-AA-CGGTatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaatttttatatatcatgaaaatctcaacaacggaggtaatatgtcaaaaaggatattaaggtctttttagagtcaatactatttatgttattgttaaaatattcaaaagactgaaaaataattttttcaaaatttttgatgatggacctgtgatttgttgactttaatgtgaaggtcaaaggtcaaggttaattaatacaagtggtcatgttgttttatcttcttgttaagggtagaaagctgtaggcataaatcagatattgaattgactttcaggggcagtaatatgtgaagggtccttaaactcgttaaaaaacttcatgcaagggatttttatagttaataaatacactgaaacaggagctttctgcgtctcatatgatttcaggttcagttgagatacgccgcgtacaaaaactttttgacgttagtcatgtaatctggaaataaggaagtacgaagtaacattcaattcaaattaatcagcaaaagcaaattatataatataataggataatcgttaatcatgtatcatgaatattccagaggaaaacagatagaaaaatccattttttttttgagatttttgagatataggactttgacttgacactactaatttcaaggtcggttctgatctacatgcagtggtctcaccatagattaacggtaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcagaagttgaaaaagttaaatatgaatgaccttgacttttgaccttgacaaaaaaatcaaagttaatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaattTTGA-C-CTT-G----------G------C----CCGATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-CCT-C-ATTC-CAGTT-AGTCCTGTTCCC-AT---ACGATT-AA-GGGTT-CT------CAAGTTTaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acat---------TTG-------------ACCTTGGCCCGA-TTTTCAAGGTCAAAGGTCA------CTGACCTCAT--TCCAGTTAG--TCC-TGTTCCCATA----C-GATTAAGGGTTCT-CAAGTTTTAAGTTGAA---AT----TGTTAAA--CA---TAAGGGGCAATAACTAT-CATAAAGGGCCtaagttgaaattgttaaacataaggggcaataactatcataaagggccatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acatTTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGT-TCT-C-ACTG-CAGTT-GGTCACATGCCC-AT---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT--TAGAGTCAAATACTA-TT--TAATGTTCTTG--AAAATATTCAAAAAGACA-TAA---AA--AAT---AATTT-TT------TTTTTAAATTTTGATGCT----GACC---------TTGACCTTTGAACTTCACCTT------A-ATGTGAAGGTAAAAGGTCAAGG---tttttttcgttttacatagaaatcgtaaaattcaaggggaaataactctctaagcggtcatagaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAGGAT-ATGAAGGTCTTTT--TAGGATCAAATAATA-TTTATATTCTTCTTG--AAAATATACTAAAAGACT-TTG---GA--AATGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAGACTTGATTAAT--GATTTCAGA--GACTTTCAAGGGCAATAACTATGCATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTACACATGA-CAAAGA-CTAAGAA--AGGGAGGTAAATATGTCAAAAGGGAT-ATAAAAGTCGTCT--TATTGTCAAATTATA-TC--TATTGTCCTGG--AAAA-ATTATAAAAGACC-TTGGGGAATGAATGAAATTTTATT------TTCTTTA----------T----GACC---------TTG-------------ACTTT------A-ATTTGAAGGTCAAAGGTTAAGGGGCTTAA-TACATGTATAAG--AGGCTCCATCTC--TATATCTT--TATTAATG---CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGTGTAAATGTCCTATCCATTTGGTTTAT----CTCTCATGACAGAGGTGTTTAAAAGTGAATTAATA-ACT---ACAAG---TTTC-ATGTCTC-TACGCATTTT-GGTTCAGTAGGAGTA------GCACAAACAAGCTTTCTGATGAGAGTCATTGTAATTAGGAGA-AAGG---T-CAAAGT-----TCAGAATTTCCATTAGTTATGCTGAAAGCAAAT-----AAGAT-----GATAATTCTTTATCAT--GTT--TCA--AGG-TATCTCCT-GTGCAAAAGGGGGTATAAAAAAATG--TTCTCTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CCGATTTTTATGAT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTT-CAGTT-AGTTCCATGCTG-AA---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTAACATGTTT--TGAACTATGAAGTCTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agTTGCTTATAAT--GTG--TCATAAGGATAT-TCCCTGTAGGAAAGCTGGTATTGTAAAATGC-AATTTTTCGAT---A-AATTT---G-A-AT----GACCTTGATC-CTTTGTATCTTCGAAA------C----CTAAATTTCAAAGTAATTAAAGGTTCACTGA-TCC-CTATTG-CAGTTTGGTGTCGTGCCCCATTGCACGATTTAA-CGGTTTCT------CAAGTTTGACGTGTTT-----ACAATGA--------ATCATT--AAAAATAGGGGTTAA---TCTTTCTTAAAGGcaaacaaattttttttgacgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acttTTTATTATAAGTT--TCA--AGGATAT-TCCG-GTAGGAAAGAC-GTATG---AAATGC-TATTTTT---G---ATAATTTTGTA-T-AT----GACC-TGA-C-CTTTG----------ACTTGACC----CTAATTTTCAA-GT---CAAAG---TA-TGA---T-T-ATTGACAG-T-GGT-TCGTGCC-------ATCATT-AACCGTTT-CTCTCCGGCAAGTTTgcattgggaatcctttttgtttaattttccctataaatttattcgaaatggatcaatctattaagaatatgatataggtttaatccacattgcattactgaataaaaaaggagttagtgtggataataagattcttatgcaaagtttcaaaactccgtaaagggtcataaggtcagatgatgtttgggtgataataaatcattttctcgaaatgcctatatgaattataagtctttttgataagtcttcgaaacaaataatattttatgacgggcggaaattaataataagaaacagtaagaaaagcaataggtttccacagttaaaggtggtaaaagcctctaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acttATT-AA-TA-TT-TT------CGAG----ATGTCCTTGATGAACTATAAAGTCTTTGATCATTTGAAACA--------AAGATTTTTTTTTGACGGtttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataattaatattttcgagatgtccttgatgaactataaagtctttgatcatttgaaacaaagatttttttttgacggcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|6                          : actttttattataagtttcaaggatattccggtaggaaagacgtatgaaatgctatttttgataattttgtatatgacctgacctttgacttgaccctaattttcaagtcaaagtatgattattgacagtggttcgtgccatcattaaccgtttctctccggcaagttttttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataTTTTTATATCAATAATAATCTCA-CATTAAGGAGGTAA-T-TGTCAAAAAAGATGATTAAGGTTTTTTAATA-AGTCGAATATTAATT--TAATGTTCT----AAAATATTATAAAAGACAATTG---AA--AATAAAAAATG-AT-----------GA----------T----GACC---------TTG-------------ACCTT------ATATTTGAcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caaaatgttgtaaattgattaaaattatatgaccttatggacttttgaccttcaaccaaaaattcaagtgtcaatgatttaagattcgaaagctgatacacgtccacattgattatttaataatatcaaagaaaatagtaatTGCTTATAAT--GTTGCCCA--AGAATAT-TCCT-GTAGAACAG----TATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---T-GAGATT-TG-GAAT----GA-CTTGA-CGCATTT----------A------CTTG-CTAATTTTCAA-GT---CAAAGGT-CACTGACTCT-C-ATTG-CAGTT-GGT-CAGTGCCC-AT---A-GATT--A-CGGTC-TT------C-AGTTTcttt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|7 ): TCCCGGTTCATTTATTGTATCCCTAAAAGTTAAAATTGGCTTATAATTCTACAGGTTTCATTGCCTTCTTGAGGAGTTAAGAGGATAGTCATACTGTTTTTATGAGGGCCAAGTATCCGTAAGGGGTAATAGGTAATAACGTTGGGTGATTTGAGGATCCGAGAAGTCTATACTATGAGCATAGGCATGCTTATCAAAAGTCTTGAAACAAAAGCATTTTGACGGCAGGATTAATTAAATATAA
Unaligned ( gi|8 ): ATAAAAAACAGCAATAATTCGCAATAGGTCTTTCGCCGAATAGTCGAAAAGGCCCTAATAAAATAATATAACAAGAACTAGCATTAGGTACTTCCGCCGGAGTCGTAAAAGCCCTAAATCAACTAGGAACAATAACATATTAGGACACGCCTTTCCACAGAAGGTGGAAAGCCCTAATGAATGAATAAGACAGAAAAAAGCATATAGGACTTTCTCACCAGAAAGTGAAATCCC
Unaligned ( gi|13 ): TTAAAATGAAATTTTTTTTTTTCTATNCCAGAGGGCAAGTGAGAGTACAAAAATTAATAATAACTAGTGATTCCTAATTGTTCCGAAAATTAGAGG
Unaligned ( gi|14 ): TTAAAATATGATACCTTGAATTTTGACCTTGACAAAAATTCAGTCAATGATTTAGATGTAAGCTGAAGTCCTATTGATTTTTAATAGTATCAAA






Alignments
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Reference ( family-773 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NNTTTATATATCA-TAAAAATCTCAGCA--ANGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATNAAGGTCTTTT--TAGAGTCAAATANTA-TT--TANTGTTCTTG--AAAATATTCTAAAAGACN-TTG---AA--AATGAAAATTT-TT------TTTTTGA----------T----GACC---------TTG-------------ACCTTA-ATNTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTCAT--ACAAG-TAG--TCCATGTT-CTATATCTTC-TATTAAGGG--CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGCGTAAAGGTCCTATNNACTCGGTTTANAAAACTCTCATGNNAGGGGTNTTTANAAGTNAATNAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATACGCATTTCAGGTTCAGTNGGGGTACGCCGCGCACAAACAAGCTTTCTGACGNNAGTCATTGTAATCNGGAGATAAGGAAGTACGAAGTAACATTCAGAATTCNNATTAGTCATGCTGAAAGCAAATTATATAANATAATAGGATAATTGTTTATNAT--GTT--TCA--AGGATAT-TCCN-GTAGAAAAGANGGTATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CTAATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTG-CAGTT-GGTCCCGTGCCC-AT---ACGATT-AA-CGGTT-CT------CAAGTTTGACGTGTTT--TGAACTATGAAGTCTTTGATCATTTGAAANATAGGGGTTAAGATTCTTTCTTGANGG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcagaagttgaaaaagttaaaTTTATATATCA-TGAAAATCTCAACA--ACGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATTAAGGTCTTTT--TAGAGTC-AATACTA-TT--TA-TGTTATTGTTAAAATATTC-AAAAGAC---TG---AA--AA--ATAATTT-TTTCAAAATTTTTGA----------TGATGGACCTGTGATTTGTTG-------------ACTTTA-ATGTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTAAT--ACAAG-TGG--T-CATGTTGTTTTATCTTCTTGTTAAGGG--TAGAAAGCTGTAGGCATAA---ATCAGATATTGAATTGACTTTCAGGGGCAGTAA-TATGTG-AAGGGTCCT-TAAACTCG--TTAAAAAACT-TCATGCAAGGGATTTTTAT-AGTTAATAAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATATG-ATTTCAGGTTCAGTTGAGATACGCCGCGTACAA--AAACTTTTTGACGTTAGTCA-TGTAATCTGGAAATAAGGAAGTACGAAGTAACATTC--AATTCAAATTAATCA-GC-AAAAGCAAATTATATAATATAATAGGATAATCGTTAATCAT--GTA--TCA--TGAATAT-TCCA-GAGGAAAACAG---ATAGAAAAATCCATTTTTTT---TTTGA-GATTTT-TGAG-ATATAGGACTTTGA-C---TTG----------A------CACTACTAA-TTTCAAGGT---C---GGT-T-CTGA-TCTAC-A-TG-CAG-T-GGTCTCA---CC-AT---A-GATT-AA-CGGTatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaatttttatatatcatgaaaatctcaacaacggaggtaatatgtcaaaaaggatattaaggtctttttagagtcaatactatttatgttattgttaaaatattcaaaagactgaaaaataattttttcaaaatttttgatgatggacctgtgatttgttgactttaatgtgaaggtcaaaggtcaaggttaattaatacaagtggtcatgttgttttatcttcttgttaagggtagaaagctgtaggcataaatcagatattgaattgactttcaggggcagtaatatgtgaagggtccttaaactcgttaaaaaacttcatgcaagggatttttatagttaataaatacactgaaacaggagctttctgcgtctcatatgatttcaggttcagttgagatacgccgcgtacaaaaactttttgacgttagtcatgtaatctggaaataaggaagtacgaagtaacattcaattcaaattaatcagcaaaagcaaattatataatataataggataatcgttaatcatgtatcatgaatattccagaggaaaacagatagaaaaatccattttttttttgagatttttgagatataggactttgacttgacactactaatttcaaggtcggttctgatctacatgcagtggtctcaccatagattaacggtaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcagaagttgaaaaagttaaatatgaatgaccttgacttttgaccttgacaaaaaaatcaaagttaatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaattTTGA-C-CTT-G----------G------C----CCGATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-CCT-C-ATTC-CAGTT-AGTCCTGTTCCC-AT---ACGATT-AA-GGGTT-CT------CAAGTTTaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acat----------T----GACC---------TTG-------------GCCCGA-TTTTCAAGGTCAAAGGTCA------CTGACCTCAT--TCCAGTTAG--TCC-TGTTCCCATA----C-GATTAAGGGTTCT-CAAGTTTTAAGTTGAA---AT----TGTTAAA--CA---TAAGGGGCAATAACTAT-CATAAAGGGCCtaagttgaaattgttaaacataaggggcaataactatcataaagggccatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acattTTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGT-TCT-C-ACTG-CAGTT-GGTCACATGCCC-AT---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT--TAGAGTCAAATACTA-TT--TAATGTTCTTG--AAAATATTCAAAAAGACA-TAA---AA--AAT---AATTT-TT------TTTTTAAATTTTGATGCT----GACC---------TTGACCTTTGAACTTCACCTTA-ATGTGAAGGTAAAAGGTCAAGG---tttttttcgttttacatagaaatcgtaaaattcaaggggaaataactctctaagcggtcatagaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAGGAT-ATGAAGGTCTTTT--TAGGATCAAATAATA-TTTATATTCTTCTTG--AAAATATACTAAAAGACT-TTG---GA--AATGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGACTTGATTAAT--GATTTCAGA--GACTTTCAAGGGCAATAACTATGCATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTACACATGA-CAAAGA-CTAAGAA--AGGGAGGTAAATATGTCAAAAGGGAT-ATAAAAGTCGTCT--TATTGTCAAATTATA-TC--TATTGTCCTGG--AAAA-ATTATAAAAGACC-TTGGGGAATGAATGAAATTTTATT------TTCTTTA----------T----GACC---------TTG-------------ACTTTA-ATTTGAAGGTCAAAGGTTAAGGGGCTTAA-TACATGTATAAG--AGGCTCCAT-CT-CTATATCTT--TATTAATG---CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGTGTAAATGTCCTATCCATTTGGTTTAT----CTCTCATGACAGAGGTGTTTAAAAGTGAATTAATA-ACT---ACAAG---TTTC-ATGTCTC-TACGCATTTT-GGTTCAGTAGGAGTA------GCACAAACAAGCTTTCTGATGAGAGTCATTGTAATTAGGAGA-AAGG---T-CAAAGT-----TCAGAATTTCCATTAGTTATGCTGAAAGCAAAT-----AAGAT-----GATAATTCTTTATCAT--GTT--TCA--AGG-TATCTCCT-GTGCAAAAGGGGGTATAAAAAAATG--TTCTCTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CCGATTTTTATGAT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTT-CAGTT-AGTTCCATGCTG-AA---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTAACATGTTT--TGAACTATGAAGTCTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agTTGCTTATAAT--GTG--TCATAAGGATAT-TCCCTGTAGGAAAGCTGGTATTGTAAAATGC-AATTTTTCGAT---A-AATTT---G-A-AT----GACCTTGATC-CTTTGTATCTTCGAAA------C----CTAAATTTCAAAGTAATTAAAGGTTCACTGA-TCC-CTATTG-CAGTTTGGTGTCGTGCCCCATTGCACGATTTAA-CGGTTTCT------CAAGTTTGACGTGTTT-----ACAATGA--------ATCATT--AAAAATAGGGGTTAA---TCTTTCTTAAAGGcaaacaaattttttttgacgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acttTTTATTATAAGTT--TCA--AGGATAT-TCCG-GTAGGAAAGAC-GTATG---AAATGC-TATTTTT---G---ATAATTTTGTA-T-AT----GACC-TGA-C-CTTTG----------ACTTGACC----CTAATTTTCAA-GT---CAAAG---TA-TGA---T-T-ATTGACAG-T-GGT-TCGTGCC-------ATCATT-AACCGTTT-CTCTCCGGCAAGTTTgcattgggaatcctttttgtttaattttccctataaatttattcgaaatggatcaatctattaagaatatgatataggtttaatccacattgcattactgaataaaaaaggagttagtgtggataataagattcttatgcaaagtttcaaaactccgtaaagggtcataaggtcagatgatgtttgggtgataataaatcattttctcgaaatgcctatatgaattataagtctttttgataagtcttcgaaacaaataatattttatgacgggcggaaattaataataagaaacagtaagaaaagcaataggtttccacagttaaaggtggtaaaagcctctaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acttATT-AA-TA-TT-TT------CGAG----ATGTCCTTGATGAACTATAAAGTCTTTGATCATTTGAAACA--------AAGATTTTTTTTTGACGGtttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataattaatattttcgagatgtccttgatgaactataaagtctttgatcatttgaaacaaagatttttttttgacggcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|6                          : actttttattataagtttcaaggatattccggtaggaaagacgtatgaaatgctatttttgataattttgtatatgacctgacctttgacttgaccctaattttcaagtcaaagtatgattattgacagtggttcgtgccatcattaaccgtttctctccggcaagttttttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataTTTTTATATCAATAATAATCTCA-CATTAAGGAGGTAA-T-TGTCAAAAAAGATGATTAAGGTTTTTTAATA-AGTCGAATATTAATT--TAATGTTCT----AAAATATTATAAAAGACAATTG---AA--AATAAAAAATG-AT-----------GA----------T----GACC---------TTG-------------ACCTTATATTTGAcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caaaatgttgtaaattgattaaaattatatgaccttatggacttttgaccttcaaccaaaaattcaagtgtcaatgatttaagattcgaaagctgatacacgtccacattgattatttaataatatcaaagaaaatagtaatTGCTTATAAT--GTTGCCCA--AGAATAT-TCCT-GTAGAACAG----TATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---T-GAGATT-TG-GAAT----GA-CTTGA-CGCATTT----------A------CTTG-CTAATTTTCAA-GT---CAAAGGT-CACTGACTCT-C-ATTG-CAGTT-GGT-CAGTGCCC-AT---A-GATT--A-CGGTC-TT------C-AGTTTcttt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TATATGATGAAGCATAGTTGCTTATCAATAAGTCTTCAAACAAAAGCATTTTGGACCGGCAGGAATATAATAAATAATAATAATAATAAACAGGAACAATACTAATAGGATTTCCACAGAAAGCTGGAAAGCTCCCTAATAATAATAATAATAATAATTAAACAGAACAATAACAATAGGACTGTCCGACAGAAAGGTGGAAAGCCACTAATAAACAGAACGAATAACAATAGGACTATCCCACCAGCAAAGGTGGAAAGCCCTAATAAAACAGAACAATAACAACTAGGACTTCCACAAGAAAGGTGGAAAGCCCTAAATTACAGAGAATGATTCACA
Unaligned ( gi|7 ): TCCCGGTTCATTTATTGTATCCCTAAAAGTTAAAATTGGCTTATAATTCTACAGGTTTCATTGCCTTCTTGAGGAGTTAAGAGGATAGTCATACTGTTTTTATGAGGGCCAAGTATCCGTAAGGGGTAATAGGTAATAACGTTGGGTGATTTGAGGATCCGAGAAGTCTATACTATGAGCATAGGCATGCTTATCAAAAGTCTTGAAACAAAAGCATTTTGACGGCAGGATTAATTAAATATAA
Unaligned ( gi|8 ): ATAAAAAACAGCAATAATTCGCAATAGGTCTTTCGCCGAATAGTCGAAAAGGCCCTAATAAAATAATATAACAAGAACTAGCATTAGGTACTTCCGCCGGAGTCGTAAAAGCCCTAAATCAACTAGGAACAATAACATATTAGGACACGCCTTTCCACAGAAGGTGGAAAGCCCTAATGAATGAATAAGACAGAAAAAAGCATATAGGACTTTCTCACCAGAAAGTGAAATCCC
Unaligned ( gi|13 ): TTAAAATGAAATTTTTTTTTTTCTATNCCAGAGGGCAAGTGAGAGTACAAAAATTAATAATAACTAGTGATTCCTAATTGTTCCGAAAATTAGAGG
Unaligned ( gi|14 ): TTAAAATATGATACCTTGAATTTTGACCTTGACAAAAATTCAGTCAATGATTTAGATGTAAGCTGAAGTCCTATTGATTTTTAATAGTATCAAA






Alignments
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Reference ( family-773 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NNTTTATATATCA-TAAAAATCTCAGCA--ANGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATNAAGGTCTTTT--TAGAGTCAAATANTA-TT--TANTGTTCTTG--AAAATATTCTAAAAGACN-TTG---AA--AATGAAAATTT-TT------TTTTTGA----------T----GACC---------TTG-------------ACCTTA-ATNTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTCAT--ACAAG-TAG--TCCATGTT-CTATATCTTC-TATTAAGGG--CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGCGTAAAGGTCCTATNNACTCGGTTTANAAAACTCTCATGNNAGGGGTNTTTANAAGTNAATNAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATACGCATTTCAGGTTCAGTNGGGGTACGCCGCGCACAAACAAGCTTTCTGACGNNAGTCATTGTAATCNGGAGATAAGGAAGTACGAAGTAACATTCAGAATTCNNATTAGTCATGCTGAAAGCAAATTATATAANATAATAGGATAATTGTTTATNAT--GTT--TCA--AGGATAT-TCCN-GTAGAAAAGANGGTATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CTAATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTG-CAGTT-GGTCCCGTGCCC-AT---ACGATT-AA-CGGTT-CT------CAAGTTTGACGTGTTT--TGAACTATGAAGTCTTTGATCATTTGAAANATAGGGGTTAAGATTCTTTCTTGANGG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcagaagttgaaaaagttaaaTTTATATATCA-TGAAAATCTCAACA--ACGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATTAAGGTCTTTT--TAGAGTC-AATACTA-TT--TA-TGTTATTGTTAAAATATTC-AAAAGAC---TG---AA--AA--ATAATTT-TTTCAAAATTTTTGA----------TGATGGACCTGTGATTTGTTG-------------ACTTTA-ATGTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTAAT--ACAAG-TGG--T-CATGTTGTTTTATCTTCTTGTTAAGGG--TAGAAAGCTGTAGGCATAA---ATCAGATATTGAATTGACTTTCAGGGGCAGTAA-TATGTG-AAGGGTCCT-TAAACTCG--TTAAAAAACT-TCATGCAAGGGATTTTTAT-AGTTAATAAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATATG-ATTTCAGGTTCAGTTGAGATACGCCGCGTACAA--AAACTTTTTGACGTTAGTCA-TGTAATCTGGAAATAAGGAAGTACGAAGTAACATTC--AATTCAAATTAATCA-GC-AAAAGCAAATTATATAATATAATAGGATAATCGTTAATCAT--GTA--TCA--TGAATAT-TCCA-GAGGAAAACAG---ATAGAAAAATCCATTTTTTT---TTTGA-GATTTT-TGAG-ATATAGGACTTTGA-C---TTG----------A------CACTACTAA-TTTCAAGGT---C---GGT-T-CTGA-TCTAC-A-TG-CAG-T-GGTCTCA---CC-AT---A-GATT-AA-CGGTatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaatttttatatatcatgaaaatctcaacaacggaggtaatatgtcaaaaaggatattaaggtctttttagagtcaatactatttatgttattgttaaaatattcaaaagactgaaaaataattttttcaaaatttttgatgatggacctgtgatttgttgactttaatgtgaaggtcaaaggtcaaggttaattaatacaagtggtcatgttgttttatcttcttgttaagggtagaaagctgtaggcataaatcagatattgaattgactttcaggggcagtaatatgtgaagggtccttaaactcgttaaaaaacttcatgcaagggatttttatagttaataaatacactgaaacaggagctttctgcgtctcatatgatttcaggttcagttgagatacgccgcgtacaaaaactttttgacgttagtcatgtaatctggaaataaggaagtacgaagtaacattcaattcaaattaatcagcaaaagcaaattatataatataataggataatcgttaatcatgtatcatgaatattccagaggaaaacagatagaaaaatccattttttttttgagatttttgagatataggactttgacttgacactactaatttcaaggtcggttctgatctacatgcagtggtctcaccatagattaacggtaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcagaagttgaaaaagttaaatatgaatgaccttgacttttgaccttgacaaaaaaatcaaagttaatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaattTTGA-C-CTT-G----------G------C----CCGATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-CCT-C-ATTC-CAGTT-AGTCCTGTTCCC-AT---ACGATT-AA-GGGTT-CT------CAAGTTTaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acat----------T----GACC---------TTG-------------GCCCGA-TTTTCAAGGTCAAAGGTCA------CTGACCTCAT--TCCAGTTAG--TCC-TGTTCCCATA----C-GATTAAGGGTTCT-CAAGTTTTAAGTTGAA---AT----TGTTAAA--CA---TAAGGGGCAATAACTAT-CATAAAGGGCCtaagttgaaattgttaaacataaggggcaataactatcataaagggccatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acattTTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGT-TCT-C-ACTG-CAGTT-GGTCACATGCCC-AT---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT--TAGAGTCAAATACTA-TT--TAATGTTCTTG--AAAATATTCAAAAAGACA-TAA---AA--AAT---AATTT-TT------TTTTTAAATTTTGATGCT----GACC---------TTGACCTTTGAACTTCACCTTA-ATGTGAAGGTAAAAGGTCAAGG---tttttttcgttttacatagaaatcgtaaaattcaaggggaaataactctctaagcggtcatagaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAGGAT-ATGAAGGTCTTTT--TAGGATCAAATAATA-TTTATATTCTTCTTG--AAAATATACTAAAAGACT-TTG---GA--AATGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGACTTGATTAAT--GATTTCAGA--GACTTTCAAGGGCAATAACTATGCATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTACACATGA-CAAAGA-CTAAGAA--AGGGAGGTAAATATGTCAAAAGGGAT-ATAAAAGTCGTCT--TATTGTCAAATTATA-TC--TATTGTCCTGG--AAAA-ATTATAAAAGACC-TTGGGGAATGAATGAAATTTTATT------TTCTTTA----------T----GACC---------TTG-------------ACTTTA-ATTTGAAGGTCAAAGGTTAAGGGGCTTAA-TACATGTATAAG--AGGCTCCAT-CT-CTATATCTT--TATTAATG---CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGTGTAAATGTCCTATCCATTTGGTTTAT----CTCTCATGACAGAGGTGTTTAAAAGTGAATTAATA-ACT---ACAAG---TTTC-ATGTCTC-TACGCATTTT-GGTTCAGTAGGAGTA------GCACAAACAAGCTTTCTGATGAGAGTCATTGTAATTAGGAGA-AAGG---T-CAAAGT-----TCAGAATTTCCATTAGTTATGCTGAAAGCAAAT-----AAGAT-----GATAATTCTTTATCAT--GTT--TCA--AGG-TATCTCCT-GTGCAAAAGGGGGTATAAAAAAATG--TTCTCTT---T---A-AATTTT-TG-G-AT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CCGATTTTTATGAT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTT-CAGTT-AGTTCCATGCTG-AA---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTAACATGTTT--TGAACTATGAAGTCTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agTTGCTTATAAT--GTG--TCATAAGGATAT-TCCCTGTAGGAAAGCTGGTATTGTAAAATGC-AATTTTTCGAT---A-AATTT---G-A-AT----GACCTTGATC-CTTTGTATCTTCGAAA------C----CTAAATTTCAAAGTAATTAAAGGTTCACTGA-TCC-CTATTG-CAGTTTGGTGTCGTGCCCCATTGCACGATTTAA-CGGTTTCT------CAAGTTTGACGTGTTT-----ACAATGA--------ATCATT--AAAAATAGGGGTTAA---TCTTTCTTAAAGGcaaacaaattttttttgacgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acttTTTATTATAAGTT--TCA--AGGATAT-TCCG-GTAGGAAAGAC-GTATG---AAATGC-TATTTTT---G---ATAATTTTGTA-T-AT----GACC-TGA-C-CTTTG----------ACTTGACC----CTAATTTTCAA-GT---CAAAG---TA-TGA---T-T-ATTGACAG-T-GGT-TCGTGCC-------ATCATT-AACCGTTT-CTCTCCGGCAAGTTTgcattgggaatcctttttgtttaattttccctataaatttattcgaaatggatcaatctattaagaatatgatataggtttaatccacattgcattactgaataaaaaaggagttagtgtggataataagattcttatgcaaagtttcaaaactccgtaaagggtcataaggtcagatgatgtttgggtgataataaatcattttctcgaaatgcctatatgaattataagtctttttgataagtcttcgaaacaaataatattttatgacgggcggaaattaataataagaaacagtaagaaaagcaataggtttccacagttaaaggtggtaaaagcctctaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acttATT-AA-TA-TT-TT------CGAG----ATGTCCTTGATGAACTATAAAGTCTTTGATCATTTGAAACA--------AAGATTTTTTTTTGACGGtttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataattaatattttcgagatgtccttgatgaactataaagtctttgatcatttgaaacaaagatttttttttgacggcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|6                          : actttttattataagtttcaaggatattccggtaggaaagacgtatgaaatgctatttttgataattttgtatatgacctgacctttgacttgaccctaattttcaagtcaaagtatgattattgacagtggttcgtgccatcattaaccgtttctctccggcaagttttttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataTTTTTATATCAATAATAATCTCA-CATTAAGGAGGTAA-T-TGTCAAAAAAGATGATTAAGGTTTTTTAATA-AGTCGAATATTAATT--TAATGTTCT----AAAATATTATAAAAGACAATTG---AA--AATAAAAAATG-AT-----------GA----------T----GACC---------TTG-------------ACCTTATATTTGAcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caaaatgttgtaaattgattaaaattatatgaccttatggacttttgaccttcaaccaaaaattcaagtgtcaatgatttaagattcgaaagctgatacacgtccacattgattatttaataatatcaaagaaaatagtaatTGCTTATAAT--GTTGCCCA--AGAATAT-TCCT-GTAGAACAG----TATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---T-GAGATT-TG-GAAT----GA-CTTGA-CGCATTT----------A------CTTG-CTAATTTTCAA-GT---CAAAGGT-CACTGACTCT-C-ATTG-CAGTT-GGT-CAGTGCCC-AT---A-GATT--A-CGGTC-TT------C-AGTTTcttt


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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-773 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NNTTTATATATCA-TAAAAATCTCAGCA--ANGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATNAAGGTCTTTT--TAGAGTCAAATANTA-TT--TANTGTTCTTG--AAAATATTCTAAAAGACN-TTG---AA--AATGAAAATTT-TT------TTTTTGA----------T----GACC---------TTG-------------ACCTTA-ATNTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTCAT--ACAAG-TAG--TCCATGTT-CTATATCTTC-TATTAAGGG--CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGCGTAAAGGTCCTATNNACTCGGTTTANAAAACTCTCATGNNAGGGGTNTTTANAAGTNAATNAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATACGCATTTCAGGTTCAGTNGGGGTACGCCGCGCACAAACAAGCTTTCTGACGNNAGTCATTGTAATCNGGAGATAAGGAAGTACGAAGTAACATTCAGAATTCNNATTAGTCATGCTGAAAGCAAATTATATAANATAATAGGATAATTGTTTATNAT--GTT--TCA--AGGATAT-TCCN-GTAGAAAAG--G-G--TATGGAAAAATGC-TTTTTTT---T---A-AATTTT-TG-NAT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CTAATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTG-CAGTT-GGTCCCGTGCCC-AT---ACGATT-AA-CGGTT-CT------CAAGTTTGACGTGTTT--TGAACTATGAAGTCTTTGATCATTTGAAANATAGGGGTTAAGATTCTTTCTTGANGG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcagaagttgaaaaagttaaaTTTATATATCA-TGAAAATCTCAACA--ACGGAGGTAA-TATGTCAAAAAGGAT-ATTAAGGTCTTTT--TAGAGTC-AATACTA-TT--TA-TGTTATTGTTAAAATATTC-AAAAGAC---TG---AA--AA--ATAATTT-TTTCAAAATTTTTGA----------TGATGGACCTGTGATTTGTTG-------------ACTTTA-ATGTGAAGGTCAAAGGTCAAGG---TTAA-TTAAT--ACAAG-TGG--T-CATGTTGTTTTATCTTCTTGTTAAGGG--TAGAAAGCTGTAGGCATAA---ATCAGATATTGAATTGACTTTCAGGGGCAGTAA-TATGTG-AAGGGTCCT-TAAACTCG--TTAAAAAACT-TCATGCAAGGGATTTTTAT-AGTTAATAAATACACTGAAACAGGAGCTTTCTGCGTCTCATATG-ATTTCAGGTTCAGTTGAGATACGCCGCGTACAA--AAACTTTTTGACGTTAGTCA-TGTAATCTGGAAATAAGGAAGTACGAAGTAACATTC--AATTCAAATTAATCA-GC-AAAAGCAAATTATATAATATAATAGGATAATCGTTAATCAT--GTA--TCA--TGAATAT-TCCA-GAGGAAAAC--A-G---ATAGAAAAATCCATTTTTTT---TTTGA-GATTTT-TGAGATATAGGACTTTGA-C---TTG----------A------CACTACTAA-TTTCAAGGT---C---GGT-T-CTGA-TCTAC-A-TG-CAG-T-GGTCTCA---CC-AT---A-GATT-AA-CGGTatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaatttttatatatcatgaaaatctcaacaacggaggtaatatgtcaaaaaggatattaaggtctttttagagtcaatactatttatgttattgttaaaatattcaaaagactgaaaaataattttttcaaaatttttgatgatggacctgtgatttgttgactttaatgtgaaggtcaaaggtcaaggttaattaatacaagtggtcatgttgttttatcttcttgttaagggtagaaagctgtaggcataaatcagatattgaattgactttcaggggcagtaatatgtgaagggtccttaaactcgttaaaaaacttcatgcaagggatttttatagttaataaatacactgaaacaggagctttctgcgtctcatatgatttcaggttcagttgagatacgccgcgtacaaaaactttttgacgttagtcatgtaatctggaaataaggaagtacgaagtaacattcaattcaaattaatcagcaaaagcaaattatataatataataggataatcgttaatcatgtatcatgaatattccagaggaaaacagatagaaaaatccattttttttttgagatttttgagatataggactttgacttgacactactaatttcaaggtcggttctgatctacatgcagtggtctcaccatagattaacggtaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tcagaagttgaaaaagttaaatatgaatgaccttgacttttgaccttgacaaaaaaatcaaagttaatgattaagataagctgaaagtcccattgatatcttaatagtataaaactaattTTGA-C-CTT-G----------G------C----CCGATTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGA-CCT-C-ATTC-CAGTT-AGTCCTGTTCCC-AT---ACGATT-AA-GGGTT-CT------CAAGTTTaatcagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acat----------T----GACC---------TTG-------------GCCCGA-TTTTCAAGGTCAAAGGTCA------CTGACCTCAT--TCCAGTTAG--TCC-TGTTCCCATA----C-GATTAAGGGTTCT-CAAGTTTTAAGTTGAA---AT----TGTTAAA--CA---TAAGGGGCAATAACTAT-CATAAAGGGCCtaagttgaaattgttaaacataaggggcaataactatcataaagggccatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acattTTTTCAAGGT---CAAAGGT-CACTGT-TCT-C-ACTG-CAGTT-GGTCACATGCCC-AT---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT--TAGAGTCAAATACTA-TT--TAATGTTCTTG--AAAATATTCAAAAAGACA-TAA---AA--AAT---AATTT-TT------TTTTTAAATTTTGATGCT----GACC---------TTGACCTTTGAACTTCACCTTA-ATGTGAAGGTAAAAGGTCAAGG---tttttttcgttttacatagaaatcgtaaaattcaaggggaaataactctctaagcggtcatagaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAGGAT-ATGAAGGTCTTTT--TAGGATCAAATAATA-TTTATATTCTTCTTG--AAAATATACTAAAAGACT-TTG---GA--AATGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGACTTGATTAAT--GATTTCAGA--GACTTTCAAGGGCAATAACTATGCATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTACACATGA-CAAAGA-CTAAGAA--AGGGAGGTAAATATGTCAAAAGGGAT-ATAAAAGTCGTCT--TATTGTCAAATTATA-TC--TATTGTCCTGG--AAAA-ATTATAAAAGACC-TTGGGGAATGAATGAAATTTTATT------TTCTTTA----------T----GACC---------TTG-------------ACTTTA-ATTTGAAGGTCAAAGGTTAAGGGGCTTAA-TACATGTATAAG--AGGCTCCAT-CT-CTATATCTT--TATTAATG---CA-AAAGCTGTAGGCTTAA---AT--GATATCAGA--GACTTTCAGGGGCAGTAACTATGTGTAAATGTCCTATCCATTTGGTTTAT----CTCTCATGACAGAGGTGTTTAAAAGTGAATTAATA-ACT---ACAAG---TTTC-ATGTCTC-TACGCATTTT-GGTTCAGTAGGAGTA------GCACAAACAAGCTTTCTGATGAGAGTCATTGTAATTAGGAGA-AAGG---T-CAAAGT-----TCAGAATTTCCATTAGTTATGCTGAAAGCAAAT-----AAGAT-----GATAATTCTTTATCAT--GTT--TCA--AGG-TATCTCCT-GTGCAAAAG--G-GGGTATAAAAAAATG--TTCTCTT---T---A-AATTTT-TG-GAT----GACCTTGA-C-CTTTG----------A------C----CCGATTTTTATGAT---CAAAGGT-CACTGA-TCT-C-ATTT-CAGTT-AGTTCCATGCTG-AA---ACGATT-AA-TGGTT-CT------CAAGTTTAACATGTTT--TGAACTATGAAGTCTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agTTGCTTATAAT--GTG--TCATAAGGATAT-TCCCTGTAGGAAAGCTG-G--TATTGTAAAATGC-AATTTTTCGAT---A-AATTT---G-AAT----GACCTTGATC-CTTTGTATCTTCGAAA------C----CTAAATTTCAAAGTAATTAAAGGTTCACTGA-TCC-CTATTG-CAGTTTGGTGTCGTGCCCCATTGCACGATTTAA-CGGTTTCT------CAAGTTTGACGTGTTT-----ACAATGA--------ATCATT--AAAAATAGGGGTTAA---TCTTTCTTAAAGGcaaacaaattttttttgacgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acttTTTATTATAAGTT--TCA--AGGATAT-TCCG-GTAGGAAAG--ACG--TATG---AAATGC-TATTTTT---G---ATAATTTTGTA-TAT----GACC-TGA-C-CTTTG----------ACTTGACC----CTAATTTTCAA-GT---CAAAG---TA-TGA---T-T-ATTGACAG-T-GGT-TCGTGCC-------ATCATT-AACCGTTT-CTCTCCGGCAAGTTTgcattgggaatcctttttgtttaattttccctataaatttattcgaaatggatcaatctattaagaatatgatataggtttaatccacattgcattactgaataaaaaaggagttagtgtggataataagattcttatgcaaagtttcaaaactccgtaaagggtcataaggtcagatgatgtttgggtgataataaatcattttctcgaaatgcctatatgaattataagtctttttgataagtcttcgaaacaaataatattttatgacgggcggaaattaataataagaaacagtaagaaaagcaataggtttccacagttaaaggtggtaaaagcctctaat
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gi|6                          : actttttattataagtttcaaggatattccggtaggaaagacgtatgaaatgctatttttgataattttgtatatgacctgacctttgacttgaccctaattttcaagtcaaagtatgattattgacagtggttcgtgccatcattaaccgtttctctccggcaagttttttccattttacatagaaatcgtaaatttgtcaggggcaataactctttaaggggtattgaatctctttcgtttattgtaccactattctcctaattacctctataatccaataaaggtttcgttgccatctatatgccagttttaaaatagaagtagtttataacgggtttttagcgggcataacccaggtaaggggttaagtcaatgacgtgggtgataTTTTTATATCAATAATAATCTCA-CATTAAGGAGGTAA-T-TGTCAAAAAAGATGATTAAGGTTTTTTAATA-AGTCGAATATTAATT--TAATGTTCT----AAAATATTATAAAAGACAATTG---AA--AATAAAAAATG-AT-----------GA----------T----GACC---------TTG-------------ACCTTATATTTGAcggaaaaataataatataagaactagtgatccctaattgttcggaacaattagag
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TATATGATGAAGCATAGTTGCTTATCAATAAGTCTTCAAACAAAAGCATTTTGGACCGGCAGGAATATAATAAATAATAATAATAATAAACAGGAACAATACTAATAGGATTTCCACAGAAAGCTGGAAAGCTCCCTAATAATAATAATAATAATAATTAAACAGAACAATAACAATAGGACTGTCCGACAGAAAGGTGGAAAGCCACTAATAAACAGAACGAATAACAATAGGACTATCCCACCAGCAAAGGTGGAAAGCCCTAATAAAACAGAACAATAACAACTAGGACTTCCACAAGAAAGGTGGAAAGCCCTAAATTACAGAGAATGATTCACA
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Unaligned ( gi|8 ): ATAAAAAACAGCAATAATTCGCAATAGGTCTTTCGCCGAATAGTCGAAAAGGCCCTAATAAAATAATATAACAAGAACTAGCATTAGGTACTTCCGCCGGAGTCGTAAAAGCCCTAAATCAACTAGGAACAATAACATATTAGGACACGCCTTTCCACAGAAGGTGGAAAGCCCTAATGAATGAATAAGACAGAAAAAAGCATATAGGACTTTCTCACCAGAAAGTGAAATCCC
Unaligned ( gi|13 ): TTAAAATGAAATTTTTTTTTTTCTATNCCAGAGGGCAAGTGAGAGTACAAAAATTAATAATAACTAGTGATTCCTAATTGTTCCGAAAATTAGAGG
Unaligned ( gi|14 ): TTAAAATATGATACCTTGAATTTTGACCTTGACAAAAATTCAGTCAATGATTTAGATGTAAGCTGAAGTCCTATTGATTTTTAATAGTATCAAA