lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 66666666666666666666 11 2222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33333333 111111111 444444444444 11111111111 11 3333333333333 111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222222222222 555555555555 22222222 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3333333 11 1111111111 11 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555555555555555555555 111
lowQualScore : 6 5 88888888888888888888 5 2 1 44 3 3 3 6666 5 2 777 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 8 2 333 4444 00000000 2 777 6666 2 2 4 333333333 2 000000000000 4 77777777 77777777777 2 1 7777777 3 1 44 0 1 44 1 44 1 55 3 1 1 44 3 1 6666666 6666666666666 44444 1 3 44 22 555 1 3 22 44444 22 4444 555555 8888 333333 1 8888888 333 8888 44 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 2 6 22 4444 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33 33 0 4444444444444444 2 000000000000 33 77 2 66666666 2 5 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 77 3 3 9 5555555 77 2 99 2 2 5 7777777777 55 2 444 2 33 666 2 2 7777 2 2 00 7 444 2 33 555 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 6 3 1111111111111111111111 0 333 999 3 55 3 0
lowQualScore : . . .................... . . . .. . . . .... . . ... ............................................................................. . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ............ . ........ ........... . . ....... . . .. . . .. . .. . .. . . . .. . . ....... ............. ..... . . .. .. ... . . .. ..... .. .... ...... .... ...... . ....... ... .... .. ..................................................... . . . .. .... ........................................................................ .. .. . ................ . ............ .. .. . ........ . . . ........................................................................................................................................... .. . . . ....... .. . .. . . . .......... .. . ... . .. ... . . .... . . .. . ... . .. ... ......................................................................... . . . ...................... . ... ... . .. . .
lowQualScore : 0 0 44444444444444444444 7 1 7 44 6 3 3 6666 7 9 999 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 4 1 777 5555 00000000 1 444 6666 1 1 4 666666666 2 444444444444 2 66666666 66666666666 0 9 5555555 8 8 33 1 8 66 8 33 9 33 6 8 9 55 8 9 2222222 8888888888888 88888 9 8 55 66 222 9 8 66 88888 66 0000 555555 1111 666666 9 1111111 333 5555 33 88888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 1 3 99 5555 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 11 3 9999999999999999 2 999999999999 11 00 4 22222222 5 0 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99 3 1 2 3333333 44 9 66 7 5 0 7777777777 99 5 444 5 44 999 5 5 4444 4 4 33 5 444 7 99 888 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 4 6 3333333333333333333333 4 111 333 6 00 6 1
consensus : NNNNTTTATCACATATTGACCCCTTG-------------------TGTG-ATANTTTTTTTCA-T-A-TCACC--CACAG-TAT-GTATT---C--CT---ACG----C-CG---CGT--GA--CG--AAA----------------AT---CA--GGA-T----------GACAGAATTCCCA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GA-AGT--------GGNA--------C-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA--TAA-AT-TT-A-TA-TG--A-T-TG-------T-C-----A--AGAA-----A-T-TG-G--T---TA-A-G--ATC-----GAAAAG--G----C------C----CGT------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATC-------T----------A-------T--T---CTTG-AAAG-TC-AA--AA----TGT---A-A-CA--AC-CCCC-C-CC--------A---------------------C---C-CC------G----TT--CCG--TCCGAAA-----C-------TG-AAC---G-A-----CGTAC--T-NTG-T---AA---TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGC-CACC-G--AACT-C-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGACA---N---CTA-GC-A--TCT-C-T-GCTCC--G-A----GAC--AAA-GC---GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---A---AGCANGCNCAACGACNCTNNANGNNCNCANGANNCNTNANNTCNCNTTCAGGNNNNATNGT---------CAA-TGGCGATGTA-CAG-------------------A--TACTC--CAT--NAC-A--CTCGCG-ACAACAAG
Reference ( gi|4 ) : TATATTTATCACATACTTACCCCTTG-------------------TGTG-ATATTTTTTTTCA-T-A-TCACC--CACAG-TAT-GTATT---C--ATGAAACT----C-TG---CGT--GA--CA--AAA----------------AT---CA--GGA-T----------GACAGAATTCCCA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GA-AGT--------GAAA--------C-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA--TAA-AT-GT-A-TA-TG--A-T-TG-------T-T-----A--A--A-----A-T-TA-G--T---TA-A-G--ATC-----GAAAAG--G----C------C----TGT------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATC-------T----------A-------T--C---CTTG-AAAG-TC-AA--AA----TGT---A-A-CA--AC-CCCC-T-CC--------A---------------------C---C-CC------G----TT--CCG--TCTG-AA-----C-------TG-AA----G-A---C-CGTAC--T-CTG-T---AA---TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACC-G--A-CT-C-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCACA---A---CTA-TC-A--TCT-C-T-GCTCT--G-A----GAC--AAA-AC---GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---A---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC---------CAA-TGGCAATGTA-CAG-------------------A--TACTC--TAT--GAC-A--CTCGCA-ACAACAAG
gi|14 : TTTATCACATATTGACCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCATGTG-ATAATTTATTTCA---A-TCACC---ACAG--AT-GTATC---C---TGA--CG----C-CA---CAT--GA--CA--AAATGTGTATCGCAATGG-AT---CA--GG--C----------GACATAATTCCAA-ATAA--T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---GA-AGT--------GGCA--------C-A-TATGTTA-----TTA---TTCT-T--CAAA-TTTAAAA-ACAC-AA--TAA-AT-TT-A-TA-TG--A-T-TG-------TAC-----A--A--G-----ACT-TGTG--T---TA-A-G--ACT-----G-AAAG--G----C------C----TGT------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATCATAATAAT----------G-------T--C-----TGAAAAG-TCTAAATAA----TGT---A-A--A-------------C--------A---------------------C---C-CC-----------TT--CTA--TCTGAAA-----C-------TG-AAT---G-------CGTA---T-CTG-TGTAAA---TC-TCT
gi|16 : tCTTTG-------------------T-TGTATATTTTTTTTCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTATTTTCC--CT--AACG----CACG---CAT--CATGCG--AAA----------------AT---CA--AGAAC----------GACAGAATTTCCA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---GAGAGT--------GAAA--------C-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA--TCA-AT-TTAA-TA-TG--ATT-TG-------T-T-----ATGA--A-----A-T-TA-G--T---TA-A-G--ATC-------AAAG--G----C------C----TGT------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC-------
gi|13 : acctttatccagttgatatcaCTT--------------------TGTG-ATAATTTTT--CA-T-G-TCACC---ACAG-CATTGTATTT--C--CT---ACG----C-CA---C-T--GA--CA--AAATGTAG-----------ATTTGCAATGGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCCCA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---GA-AGT--------GGCA--------C-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTT-AT-A-TA-TG--ATT-TG-------T-C-----A--A--GAAGATA-T-TG-G--T---TA-A-GGTATC-----GAAAAA--GGGCAC------C----TGT------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATC-------TGATAAAACTAG-------T--T---CTTGAAAAG-TT-TA--AATAAGTGT---A-A--A-------------C--------A---------------------C---C-CT------G----TC--TGA--TCTG-AAAC---T-------TG-AA----T-G---G-CGTAC--T-GTG-TTAAAA---TC-TCTggagagatggcaaaat
gi|33 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatCTTG-------------------TGTG-ATATTTTTTT-CA-T-A-TCAC----ATAG-TAT-GTATT---C--CT---ACA----C-CG---CAT--GA--CG--GAA-----------------T---CA--GGA-C----------GACAGAATTCCCA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-
gi|18 : tccagttgtaacataTA-------------------TGTG-ATAATTTTT--CA-T-A-ACACC---ACAA-TAT-GTATT---CCTATG---------C-TG---CTT--GG--CG--AAATTTGTATTGAAACTGGAT---CAA-GGA-T----------GACAGAATTCCCA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---GA-CAT--------GACA----------T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA--TGA-AT-GT-A-
gi|1 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcataGTG-ATATTTTTT--CA-T---TCAC----ATAGATAT-GTATT---C--C----ACG----C-CG---CTT--GA--C-----------------------------------C----------GACC--ATTCCCACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---GT-AGT--------TAAGGGCAC---C-T-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAA-TAA-TT-TT-A-TA-TG--A-T-TA-------T-C-----A--AGAA-----A-TGTG-C--C---TA-ACG--ATC-----GAAGAG--G----C------C----CGTGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATC-------T----------A-------TGTT---CTTG-AAAG-TC-AA--AA----TAT---T-A-CA--ACATCCC-T-C-------------------------------C---C-CT------GCATCTTTGCCT--TCGA-AA-----CGCTG---TG-AAT---G-A---CACGTAC--G-GTA-T---AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-N--N-NTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATG-AT--CTA-GCAA--TTTGC-T-G-TCC--G-AAACGGAC--AAAGGC---GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--ATG-T---AAGCAA--ACCC---A---aaagttaatacgatatgtgtt
gi|37 : ccagttgatatcacctaGTG-ATATTTT---TCA-T-A-TCACC--CATAG-TAT-GTATT---C--CT---ACG----T-TG---CAT--GA--TG--AAA----------------acaacaaatttctagctcatacatcagctccagcgaccttccatactgttacaggaaaatataccaaagttctaatcagaatgaggagtaacagatacccatttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|31 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaTTTCA-T-A-TCAC----ACAG-TAT-GTATT---C--CT---ACC----C-TG---CAT--GA--CG--AAA-----------------T---CA--GGA-T----------GACATAATTCCCA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCGA-AAT--------GAAA--------C-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAt
gi|21 : TTTCA-TCA-ACACT--TTCAG-TAT-GTATT---C--CTACACCTAGTGT-TGAAATGT--GAA-TAGGAAATGG-------------AT---CA--GGA-T----------GACAAAATTCCAA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---AA-AGT--------GGCC--------C-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA--T
gi|3 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaCA-T-ACTCAC----ATAG-TAT-GTATT---C--CT---ACC----C--G---CTT--GA--C--------------------------------------------------GAATTCCCAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-GA-AGT--------GCAG--------C-C-TATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA--TAA-TT-TT-A-TA-TGA-A-T-TA-------T-C-----AAGA--A-----A-T-TG-C--C---TA-A-G--ATC-----GAAAAG--G----C------CCGGGCGT------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATC-------T----------A-------TG-T---CTTG-AAAG-TC-AA--AA----TAT---A-A-AC--AT-ACCC-G-CC--------A---------------------C---C--------------TT--CCG--TTCGAAA-----C-------TGCAA----T-A-----CGTAC--TGTTG-TA--AA---TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACC-G--A-AC-T-AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGACA---GT--CTA-GC-A--TCT-C-TGGCTCC--ACA----GAC--AAA-GC---GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--ATATT---AAG-AA--ACCC---A---gcat
gi|24 : -T-A-TCACCTGCACAG-TTT-GTATC---T--CT---ACG----C-CG---CGT--GA--CC--AAATGTGTATTGAAACTAGAC---CA--GGG-T----------GATA-AATTCCCA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-TTGG-T---G---GA-AGT--------GACA--------C-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA--GAA-AT-GT-A-TA---------TG-------T-C-----AAGA--A-----A-T-TG-G--T---TA-A-G--ATT-----GAACAG--T----C------C----TGT------C-A-------T---TTTC--acaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|8 : -A-TCACC--CACAG-TAT-GTATT---C--CT--AGCG----C-CG---CGT--GA--CG--AAA----------------TG---CA--GGA-T----------GGCAGAAATTCCACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-GG-AGT--------GAAA--------C-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA--TAA-AT--T---TA-TG--A-T-TG-------T-TTAAACG--A--A-----A-TATA-G--T------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TTT------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T-------------------------------------------------------A----TGT---AGA-CA-------CC-TACC--------A---------------------C---C-CC------A-----T--CCG--TCTGAAA-----C-------TG-AA----GCA---G-CGT-C--T-CTT-A---AA---TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC-A--A-CT-C-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCACA---T---CTA-GC-AGTCCT-C-T-GCTCT--G-A----AACA-AAA-AC---GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AACTANNN---N---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCAATGGC-----------A-TGTCAATATA-CAG-------------------ATCTATTC--CAT--GAC-A--CTCGCG-ACAATAA
gi|15 : ACCA-CATAGATAT-GTATT---C--CT-AACCG----C-CG---CTTTAGA--CC--GAA----------------AC---CA------------------------TTCCCACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---GATAGTTCAATTGGGCAC--------C-T-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA--TAA-TTTGT-A-TAATG--A-T-TA-------T-C-----A--AG-A-----A-A-TG-G--CC--TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CGTGGA---C-AGTCGATTT---CTTC--A-A-TA--TGC--A---GC-----TTATC-------T----------A-------T--TGTTCTTC-GAAG-TC-AA--AA----TATTACA-A-CA--TC-CCCC-C-CC--------T---------------------C---C-CC------caaatggagaaaaaa
gi|20 : ctCC--CAC-G-TAT-GTATT---C--CT---ACG----C-CG---CGT--GA--CG--AAA-----------------T---GT--GGA-------------ACAGAATTCCCA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---GA-AGT--------GCA---------C-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA--TAA-AT-CT-A-TA-AG--A-T-TG-------T-T-----A--AGAA-----A-T-TG-G--T---TA-A-G--ATC-----GAAAAG--G----C------C----TGT------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-
gi|7 : ----------------AT---CA--AGG-T----------GAAATAATTTCCA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGGA-AGT--------GGCG--------C-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA--TAA-A--GTCA-TA-TG--G-T-TG-------T-C-----A--AGAA-----A-T-TG-G--T---TA-A-T--AAA-----GAATAG--G----C------C----TGT------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATC-------T----------ATG-----T--T---CTTG-AAAG-TCTCT--AA----TGT-----------AC-CCC------------------------------------C---C-CC------T----TT--CCG--TCCGAAA-----C-------TG-AAT---G-A-----CGTAC--G-GTG-TA--AA---TC-TCTCCAA-Gaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|9 : gtgacgaaatgtgtattgggactgg----------------AT---CA--GGA--------------CAGAATTTCCA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---GA-AAT--------GGCA--------C-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAA---------------------A-AT---------------T-TC-------T-C-----A--AGAA-----A-T-TG-G--T---TT-A-T--ATC-----GAACAA--G----C------C----TGT------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACA-------T----------G-------T--T---CTTG-AAAG-TCTAA--AA----CGT---A-A-CA-------------C--------A---------------------CACGC-CC------------T--CCG--TCCGAAA-----C-------TG-AA----T-A---A-CGTAC--T-GTG-T---AA---ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|10 : gtgacgaaatgcttattgcaactgg-T----------GAGAAATTTTCCA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---GA-AGT--------GAC---------C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA--TAA-AT-TT-A-TA-TG--A-T-TA-------T-C-----AAGA--A-----A-T-GC-C--T---TA-A-G--ATG-----AAAAGG--G----CCCGTGGC----CGT------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC---------------------------------------AAG-TC-AA--AA----TAT---A-A-CATTAC-CCCC-C-CC------------------------------C---C-C------------TT--CCGTATCGA-AA-----C-------TG-AAT---G-A-----CGTAC--T--TG-TA--AA---TC-TCTCTGA-Gatatctttgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaatgcaccaaatgaacccggggtaactcaacaacccctgctcacaaaagattccatcaaaaatacagatgtaagacacccaagcacatctaacaatattaaaaagctccacaatctttcatgtcacattcaggaaacatacaaattctctcaatggcaatgtacatgtgcactagtagtggagagtttatcgttagcattcacacgcactccacgac
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccact-T----------GACGAAATTCCCA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---GA-AGT--------GGTA--------C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA--TAA-AT--T-ATTA-TG--A-T-TA-------T-C-----A--AG-A-----A-A-TC-GCCT---TT-A-T--ATC-----GAAAAG--G----C------C----CGT------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACT-------T----------A-------T--C----------AG-TC-AA--AA----T-----------------CCC-T-CC--------------------------------------------------T--TCG--CCCGAAA-----C-------TG-AA----T-A-----CGTACTGT-CTGTT---AAAT-TC-TCTCCGA-Gcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|5 : cacatagtaatggttctacgccgct-T----------GAC-GACTTCC-A-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G------AGG--------GAAAGTGCGCACC-T-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA--TAA--T-TT-A-TA-TG--A-T-TA-------T-C-----A--AGAA-----A-T-TG-C--C---TACACG--ATC-------AAAG--G----C------C----CGTGCGCT-C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATC-------T----------A-------TG-T---CTTG-AAAG-TC-AA--AA----TATA--A-A-CAT-AC-CC-------------------------------------C---G-CC------T----TT--CCG--TTCGAAA-----C-------TG-AT----G-AATGA-CGTAC--G-GTG-T---AACT-TC-TCTCCGA-Gtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagctAATTCCCA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGGA-AGT--------GGCA--------CCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA--TAA-AT-TT-A-TA-TGAAA-T-TA-------T-C-----AAGA--A-----A-T-TG-C--C---TA-A-G--ATC-----GAAAAG--G----C------C----CGT------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATC-------T----------AATAGATGT--T---TTTG-AAAG-TC-AA--AA----TATA--A-A-CAT-AC-CCCC-C-CC--------C---------------------C---C-CCCCCCCTC----TT--CCG--TTCG-AA-----CTGAATGATG-AA----G-G---C-CCTAC--T-GTG-T---AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACC-GAAA-CT-C-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGACA---T---CTA-GC-A--TCT-CTT-GCTCC--G-A----GAC--AAA-GC---GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--ATG-T---AAG-AA--ACCC---A---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAT---------CAAGTGGCGATGTA-CAG----------------------TACTC--CAT--TTCTA--CTCGCA-ACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|2 : a-AGT--------GGAA--------C-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA--TAC-TT-TT-A-TA-TG--A-TGTGAATTCATT-T-----G--ACCA-----A-T-TG-A--CCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGAAG--G----C------CGTGGCGT------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATC-------T----------AATGT---T--C---TCTG-GAAGATC-AA--AA----Tatttaatggagagagagaaaa
gi|36 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccA--------C-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA--TAA-AG-TT-A-TA-TG--A-T-TG-------T-C-----A--AGAA-----A-C-TG-G--T---CA-A-G--ATC-----GAAAAG--G----C------C----TGT------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-agtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|25 : c-GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA--TAA-AT-CT-A-TA-TG--A-T-CG-------T-T-----G--AGAA-----A-T-TA-G--T---TA-A-G--ATC-----GAAAAG--G----C------C----TGT------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATC-------T----------A-------T--C---CTTG-AAAG-TC-AA--AA----TTT---A-A-CAC-ACACCCC-T-CC--------AC--------------------C---C-CC------G----TT--CCG--TCTGAAA-----C-------TG-AAC---G-A-----CGTAC--T-CTG-CA--AA---TC-TCT
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA--TCA-AT-TT-A-TA--G--A-T-TG-------T-T-----ATAA--A-----A-T-TA-G--T---TA-A-G--ATA-----GAAAAG--G----C------C----TGT------C-A-------T---TT------------TGC--A--------------------------------------------------------G-TC-AA--AA----TGTA--A-A-CA--AC-CCCCTT-TC--------ACCCCCCCTTCCCCCTTTCTACC---C-CC------G----TT--TCG--TCTGAAA-----T-------TG-AAC---G-A-----CGTAC--T-CTG-TA--AA---TC-TTTCCG
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA--TAA-AT-TT-A-TA-TG--A-T-GA-------T-T-----A--AGAA-----A-T-TA-G--T---TA-A-G--ATC-----GAAAAT--A----C------C----CGT------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATC-------T----------A-------T--C---CTTG-AAAG-TC-AA--AA----TGT---A-A-C
gi|34 : T-A-TA-TG--A-T-TG-------T-T-----ATGA--A-----A-T-TA-G--T---AA-A-G--ATT-----GAAAAG--G----C-------------------------------------------------------CTGT-----C-ATT-------T---------------------------TG-GA-G-TC-AA--AA----TGTA--A-A-CA--AC-CCCC---CC--------A---------------------C---C-CC------c
gi|12 : ttTG-GAAG-TC-AA--AA----TGT---A-C-CA--CC-CCCC-C-CC--------T---------------------C---CTTC------G----TT--CCG--TCTGAAA-----C-------TG-AAT---G-A-----CGTAC--T-CTG-TA--AA---TA-TCTCCGA-Gccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|38 : AG-TC-AA--AA----TGT---A-AGCA--AC-CCCT-C-CCCCTTTTCTAC--------------------C---C-CC------G----TT--TTG--TCTGAAA-----C-------TG-AAC---G-A-----GGTAC--T-CTG-TC--AA---TA-TCTCCGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|20 : tgc--------A---------------------C---C-CC---------------CCG--TCTG-AAA----C-------TG-AAT---G-A-----CGTAC--T-C
gi|2 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaacccca---C-CC------G----TT--CCG--TTCG-AACT---C-------TG-AAAAATG-A-----CGTA---T-GTG-T---AT---TC-TCTCCGA-G
gi|17 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaaT--CCG--TTCG-AAACTGAT-------TG-AAT---G-A---C--GTAC--T-GTG-T---AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACC-G--AACT-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACATAGAT--CTA-GC-A--TTT-C-T-GCTCC--G-A----GAC--AAA-GC---GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AA--ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|12 : -CACC-G--AACT-C-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGACA---T---CTA-GC-A--TCT-C-T-GCTCT--G-A----GAC--AAA-AC---GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCCGTTG---ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT---------CAA-TGGTGATGTA-CAA-------------------A--TACTC--CAT--GAC-A--TTTGCG-ACAACAA
gi|10 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatg-CACC-G--AACT-C-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGACAT--C---CTA-GC-AA-TCT-C-CCGCTCTA-G-A----GAC--AAA-GC---GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-Acaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|5 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatg-CACC-G--A-AC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACT---AGATCTA-GC-A--TTT-C-T-GCTCTCGA-A----GACCAAAA-GC---GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AA--ACCC---A---AAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAT--CAG-TGGC-ATGTA-CAG-------------------A--TACTC--CATTCTAC-T--CTCGCA---AACAAGtaattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|42 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatg-CACCTA--A-CG-C-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCACA---T---CTA-GC-A--TCT-C-T-aggaagagggagaaaaaaa
gi|11 : gACC-G--AACT-CGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGACA---T---CTAGCC-A--TCT-C-T-GCTCC--G-A----GAC---AA-GC---GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATATG-T---AAG-A
gi|9 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgt---CCG---GGGT--A-------AC-TCAACA---A---C----------CC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A----GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AC--ACCC---A---AGCACATCTAACAATATTAAAAAGCTCCACAATCTTTCATGTCACATTCAGGAAACATA-CAAATTCTCTCAA-TGGCAATGTA-CAT-------------------G--TGCAC--TAttctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|2 : gtgacgaaatgcttattgcaactggatcaggacagaatttccaataaatcgatattataaaacacatcgatggaaatggcacagatgttgttaaattcttcaaaatttctcaagaaattggtttatatcgaacaagcctgtcattttcaaatactgtatctacatgtatacatgttcttgaaagtctaaaacgtaacacacacgccctccgtccgaaactgaataacgtactgtgtaaatatctttgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaatgcaccaaatgaac---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGACA---T---CTA-GC-AG-TCT-C-T-GCTCC----A----G-C--AAA-GC---GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--ATA-TGTGAAA-AG--ACCC---A---gtagtggagagtttatcgttagcattcacacgcactccacgac
gi|22 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacC-TCCACA---T---CTA-GC-A--TCT-C-T-GC-CT--G-A----GAC--ATA-AA---GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--ATG-T---gaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|26 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaac-A--TCT-C-T-GCTC-------------------AT---AAT-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--
gi|23 : cacaatcaaccacataggtaacttgtT-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT---GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--ATGGT---AAG-AA--ACCC---A---TGCAAGCACAATGACCCTCCATGTGCACAGGAAACATAAATTTCTT------------------------CAA-TGGCGATGTA-CAGGAATTATCGATTAACATTCA--CACTC--C-T--GAC-ACTCTCGCA-ACAAccatgcaagcacacggacctccattgtcacaggaacaatcaaaattctctcaatggatgtaagaatttaatgttaacattcacactaccatgaccatcctgacaaaacaatttaaaaatc
gi|27 : accaaatgcacccaagggtaacttgatattcct-T-GCTCT--G-A----AAT--AAA-AGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--ATGTT---AAG-AA--ACCC---A----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT---------CAG-TGGCGATGTA-CAG-------------------A--T-CTCCACAT--TCT-A--CTCGCG-ACAAGAAaattttaaa
gi|7 : AC--ACA-AC---GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---A---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCT---------CAA-TAGCGATCTA-CAGAATGTATCGTTAACATTC-A--CACTC--CAT--AAC-A--CTCGTG-ACAAGAAatggagagagagaaaaaa
gi|29 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT---------CAG-TGGCGATGTA-CAG-------------------A--T-CTC--AAT--TCT-A--CTCGCG-ACAAGAAcaaatgaa
gi|2 : tGACGATGTAACAG-------------------A--TACTC---AT--TCC-A--CTCGCAGACAAatggagagagagaaaaa
gi|39 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcg-CAG-------------------A--TACTC--CAT--GAC-A--CTCGCA-ACAACAAga
gi|35 : -------------------A--CACTC--CAT--AAC-A--CTCGCG-ACAACAAacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TATATGTTCTTGAATGTAACCCCCTACCGAATTGAATGACGTACTGCAATCTGAGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCACCAAATAAACCCGGGTAGCTCGACATTCATTCCTGTTCACAAAATCCTCTGTCACAGGACAC
Unaligned ( gi|30 ): TGTATTCCTACGCCGAGTGACATATTGAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAATCTGGGTGACAGAATTCCACAAAATGCATGGTAAAATTCATGAAAATAACGCAGGTGTTGTAAAATTGTCAATGCTTTAAAACGAT
Unaligned ( gi|40 ): CAATGGCGATTTACAGACTTTATAGTTAACGTTCACACTCAATGACACTCACGACAACAGCAAA
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 1 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111 222222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 0 2 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 7777 77777777 1 666 6666 1 444 222222222 33333333333333333 3 0000000 222 7 1 7777777 3 1 44 1 66 1 3 44 1 1 22 5 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 3333 88888 888888 1 5555555 333 1 0000 33 5555555555555555555555555555555555555555555555 2 2 2 6 22 99999 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333 2 2 9999 333 4444 66 22 2 6666666 2 22 3 2 2 444444444 2 2 0 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 666 3 1 3 1111111111111 77 3 2 999999999 2 2 2 99 2 2 2 2 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 4 666 2 33 555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 33 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 33 1 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . . . . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . .... ........ . ... .... . ... ......... ................. . ....... ... . . ....... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... . .... .. .............................................. . . . . .. ..... ...................................................................... ................ . . .... ... .... .. .. . ....... . .. . . . ......... . . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ......... . . . .. . . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. . ... . .. ... .................................................................................. . .. . ......................................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 6 8 9 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 4444 11111111 9 777 0000 9 444 222222222 11111111111111111 8 2222222 666 3 7 3333333 5 7 00 7 11 7 5 11 7 8 55 5 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 9999 44444 444444 8 9999999 222 8 0000 66 7777777777777777777777777777777777777777777777 1 1 0 0 88 22222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9999999999999999 0 0 8888 555 2222 11 88 0 5555555 0 88 1 1 1 222222222 1 7 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555 3 1 3 3333333333333 33 1 9 777777777 7 7 7 00 5 4 4 5 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 77 7 555 5 77 000 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 99 7 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 99 0 9 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGATA-TTTTTTTCA-T-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-TC----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------AT----T---G---G----A-AGT-------G-GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTT-C--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-A-TCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-C--TGT-G-T---A-A---TCT-CTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AT----C-TAG-C-A--TCT-C-T-G-CTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---AA-------GCAAGCACAACGACNCTCCANNGNCACAGGANCNNTCANNNCNCNCTCA--GGANNNAT--------N---G---TCAA-T--GGCGATGTA-CAG-------------------A------------------T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGATANTTTTTTTCA-T-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-TC----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------AT----T---G---G----A-AGT-------G-GNAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTT-C--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-A-TCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-C--TNT-G-T---A-A---TCT-CTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AN----C-TAG-C-A--TCT-C-T-G-CTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---AA-------GCANGCNCAACGACNCTNNANGNNCNCANGANNCNTNANNTCNCNTTCA--GGNNNNAT--------N---G---TCAA-T--GGCGATGTA-CAG-------------------A------------------T------------------ACT-CCA--TNAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGATA--TTTTTTCA-T---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-TC-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----AT----T---G---G----T-AGTTAAG---G-GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTT-A--C-AATA--TGC--A---GC-----TTA-TCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-C--GGT-A-T---A-AACTTCT-CTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGAT----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G--TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--ATG-T---AAGCAA--ACCC---AA-------
gi|10 : ccagttgatatcaccta-T-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--TC----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------CTGA--T---G---G----A-AGT-------G-AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTT-C--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-A-TC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-C--T-T-G-TA--A-A---TCT-CTCTGA-Gcaacaaatttctagctcatacatcagctccagcgaccttccatactgttacaggaaaatataccaaagttctaatcagaatgaggagtaacagatacccatttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---AT----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCG-CTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-Acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-TC----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------ATGA--T---G---G----A-AGT-------G-GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTT-C--A-AATAT-TG-------GC-----A-A-CTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCT-GTT---A-AAT-TCT-CTCCGA-GTGTGTAGtaattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : caCCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AT----C-TAGCC-A--TCT-C-T-G-CTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATATG-T---AAG-Acccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataa-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-C--TCT-G-TA--A-A---TAT-CTCCGA-Gttctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AT----C-TAG-C-A--TCT-C-T-G-CTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCCGTTGA-------CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------N---G---TCAA-T--GGTGATGTA-CAA-------------------A------------------T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGATAATTTTT--CA-T-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-TC----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------ATATGAT---G---G----A-AGT-------G-GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTT-CAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-A-TCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-C--TGT-G-TTAAA-A---TCT-CTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTTCA---A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-TC----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------ATGA--TA--G---G----A-AGT-------G-GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTT-C----AATACTTGC------GT-----T-A-TC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATC--TGT-G-TA--A-A---TCT-CT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-TC----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGAT----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG-GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTT-C----AATA--TGC--A---GCT----T-A-TCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-ATATTTTTTTTCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-TC----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------ATTGA-T---G---G----AGAGT-------G-AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTA-CA-A-AATAC-TGT-------C-----T-A-TC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-C--TGT-G-T---A-AACTTCT-CTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---ATAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-G-CTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AA--ACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGATAATTTTT--CA-T-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-TT----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------ATTGA-T---G---G----A-CAT-------G-ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|2 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-AGT-------G-GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTT-C----AATAT-TGCCGA-CT-------T-A-TCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA----TGT-G-T---A-T---TCT-CTCCGA-Gaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---AT----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-G-CTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--ATA-TGTGAAA-AG--ACCC---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcac---TCAG-TCGGACGATGTAACAG-------------------A------------------T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAgaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-TC----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------AT----TAATG---G----A-AGT-------G--CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTT-C--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-C--Taccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTTCA-TCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-TC----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------ATTGA-T---G---A----A-AGT-------G-GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-T--CTT-G-TA--A-A---TCT-CTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---AT----C-TAG-C-A--TCT-C-T-G-C-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--ATG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-C-T-G-CTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--ATGGT---AAG-AA--ACCC---AT-------GCAAGCACAATGACCCTCCATGTGCACAGGAAACATAAATT-----------------T--------C---T---TCAA-T--GGCGATGTA-CAGGAATTATCGATTAACATTCA------------------C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggtaacttgatattcct-T-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-TC----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------AT----T---G---GTGG-A-AGT-------G-ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTT-C--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTT-T--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-A-TCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-C--TCT-G-CA--A-A---TCT-CT
gi|26 : ---AA----C-TTG-T-A--TCT-C-T-G-CTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA----CC---AT-------GCAAGCACACGGAC-CTCCATTGTCACAGGAACAATCAAAATTCTCTCAATGGATGTA---------A---GAATTTAA-T--GTTAACATT-C---------------------A------------------C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggt-T-G-CTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--ATG-TT--AAG-AA--ACCC---AN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN------------G---TCAG-T--GGCGATGTA-CAG-------------------A------------------T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT-------------TGC--A-----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-C--TCT-G-TA--A-A---TCT-TTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---AN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------NNNNG---TCAG-T--GGCGATGTA-CAG-------------------A------------------T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : tCA-T-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG-GCTG--------TCTA---TA----A------T---------AT----TT--GAT-G----A-AGT-------G-CAGC-C-TATGT-G-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAATTT--T-ATA-TG--AATTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CGGGCG-T------C-A-------T---TTTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------T-AATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---C----A-AT--A-CG-------TA-C--TGTTG-T---A-AA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACTA-A----A---C-----GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT---C-TAG-C-A--TCT-C-T-GGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--ATATT---AAG-AA--ACCC---AA-------atggagagagagaaaaa
gi|30 : T-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------CA----T---G---A----A-AAT-------A-ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-caaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTTCA-T-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-TC----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------AT----T---GATCG----A-AAT-------G-AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTT-C--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-A-TCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGATA-TTTTTTTCA-T-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-TC----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A---------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : CAC-T--GGTGATGTA-CAG-------------------AATTTATCATTAACATTTAC------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : attttccatgtcacatgaaacataaaaattctcAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCT-C--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : c-GTGATA---TTTTTCA-T-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-C--TCT-G-TC--A-A---TAT-CTCCGA-t
gi|39 : tgc-CAG-------------------A------------------T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGATATTTTTTTTCA-T-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-TC----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------AT----T---G---G----A-AGT-------G-AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTT-C--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-A-TCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-C--TCT-G-T---A-A---TCT-CTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---AA----C-TAT-C-A--TCT-C-T-G-CTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---AN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------N---G---CCAA-T--GGCAATGTA-CAG-------------------A------------------T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-T--GGCGATTTA-CAG-------------------A------------------CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---AT----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : gA-T-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-TCATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------AT----T---G---AGGGAA-AGT-------GCGCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT----A-CACAT-TGC--A-CT-------T-A-TCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-C--GGT-G-T---A-ACT-TCT-CTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGAT----C-TAG-C-A--TTT-C-T-G-CTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AA--ACCC---AAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------N---A---TCAG-T--GGC-ATGTA-CAG-------------------A------------------T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-TC----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------AT----T---GATGG----A-AGT-------G-GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTT-C----AATAT-TGC--A-CT-------T-A-TCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-C--TGT-G-T---A-AAT-TCT-CTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AT----C-TAG-C-A--TCT-CTT-G-CTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--ATG-T---AAG-AA--ACCC---AN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNA--------T---A---TCAAGT--GGCGATGTA-CAG--------------------------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-TT----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------AT----T---GATGG----A-AGT-------G-GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTT-C--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-A-TCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-C--GGT-G-TA--A-A---TCT-CTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACCC---AN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------N---C---TCAA-T--AGCGATCTA-CAGAATGTATCGTTAACATTC-A------------------C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGTC----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------AT----T---GAT-G----G-AGT-------G-AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTT-C--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T----------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--C--TCT-T-A---A-A---TAT-CTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---AT----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-G-CTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AACTANNN---NN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNCCCAAT--------G---G---C--A-T--GTCAATATA-CAG-------------------ATC----------------T------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-TC----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------ATCGA-T---G---G----A-AAT-------G-GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTT-C--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-A-CAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA-------------------CAC----------------A--CGCC-C----------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-C--TGT-G-T---AAA---TAT-CTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATGC--ACCA-AATGA-AC-------CCG---GGGT--A-------AC-TCAAC---AA----C-----------CC-C-T-G-CTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AC--ACCC---AA-------GCACATCTAACAATATTAAAAAGCTCCACAATCTTTCATGTCACATTCA--GGAAACATACAAATTCT---C---TCAA-T--GGCAATGTA-CAcaaatggagaaaaaa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TATATGTTCTTGAATGTAACCCCCTACCGAATTGAATGACGTACTGCAATCTGAGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCACCAAATAAACCCGGGTAGCTCGACATTCATTCCTGTTCACAAAATCCTCTGTCACAGGACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222 111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55555555555555555555555555555555555555555
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 333 4444 77777777 1 666 6666 1 1 4 222222222 2 11111111111111111 3 0000000 44 7 1 0 66666 3 1 44 1 33 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 5 22 88888 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 777 2 333 555 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 3 1 3 1111111111111 77 2 2 999 2 8888 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 4 666 2 33 2 444 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 33 33 2 2 66666666666666666666666666666666666666666 2 33 1 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ................. . ....... .. . . . ..... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. ............................................. . . . . .. ..... ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . ... ... . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ... . .... . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. . ... . .. . ... ............................................................................................... . .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 333 0000 11111111 9 777 0000 9 9 0 222222222 0 11111111111111111 8 2222222 55 3 7 5 11111 5 7 00 7 99 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 9 7 66 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 222 0 555 222 0 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999 3 1 3 3333333333333 33 9 7 333 7 8888 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 77 7 555 5 44 7 777 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 77 77 5 5 11111111111111111111111111111111111111111 7 99 2 9 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-TA--AA---TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---AA-------GCAAG--------CA--CAACGACCCTCCATNG--NCACAGGAACNNTCAANTTNCTCTCA--GGANNNAT--------N---G---TCAA-T--GGCGATG--TA-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T---AA---TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---AA-------GCAAG--------CA--CAACGACNCTCCANNG--NCACAGGANCNNTCANNNCNCNCTCA--GGANNNAT--------N---G---TCAA-T--GGCGATG--TA-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---G----T-AGTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T---AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGA-T----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--ATG-T---AAGCAA--ACC-C---AA--------CAA
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-TA--AA---TC-TCTCTGA-Gcaaatttctagctcatacatcagctccagcgaccttccatactgttacaggaaaatataccaaagttctaatcagaatgaggagtaacagatacccatttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---A-T----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-Acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT---AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAGtaattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : caTAACCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATATG-T---AAG-AT--TCTAC---AG-------GCTAGTACTACTCCA--CAACG--CCTCCATAG--TAACGGAAATATACAAATTCCTATCA--AG---------------------------T--GGCGATGTTTA-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-TA--AA---TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-CGTTGA-------CNNNN--------NN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------N---G---TCAA-T--GGTGATG--TA-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA---TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-TA--AA---TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--TGC--A---GCT----T-ATCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----AGAGT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T---AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---A-TAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AA--ACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----A-CAT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-----T-ATAT----------G-------T-------TCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-C----TG-C---AA---TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : -AGT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT---TC-TCTCCGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---A-T----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--ATA-TGTGAAA-AG--ACC-C---A----------GAA--------CA--CAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcac---TCAG-TCGGACGATG--TAAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---G----A-AGT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---A----A-AGT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-TA--AA---TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--ATG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-AAC-TTGAT---A-TTC--C-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--ATGGT---AAG-AA--ACC-C---AT-------GCAAG--------CA--CAATGACCCTCCATGT--GCACAGGAAACATAAATT---TCT----------------------------TCAA-T--GGCGATG--TA-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggT-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GTGG-A-AGT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-CA--AA---TC-TCT
gi|26 : ----C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA----C-C---AT-------GCAAG--------CA--CACGGAC-CTCCATTG--TCACAGGAACAATCAAAATTCTCTCAATGGATGTA---------A---GAATTTAA-T--GTTAACA--TT-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--ATG-TT--AAG-AA--ACC-C---AN-------NNNNN--------NN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN------------G---TCAG-T--GGCGATG--TA-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------TGC--A----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-TA--AA---TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---AN-------NNNNN--------NN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------NNNNG---TCAG-T--GGCGATG--TA-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-G----A-AGT-------GCAGC-C-T--ATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-TA--AA---TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACT--AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT----C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--ATATT---AAG-AA--ACC-C---AA--------CAAC--------CA--CCCCAACCCCCCatggagagagagaaaaa
gi|30 : T-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T---------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------C-A----T---G---A----A-AAT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-cccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCG----A-AAT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : CA--GAATTTAT--------C---A---TTAA-C------ATT--TA-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : attttccatgtcacatgaaacataaaaattctccactggtgatgtaCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-TC--AA---TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA---TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---A-A----C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---AN-------NNNNN--------NN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------N---G---CCAA-T--GGCAATG--TA-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-T--GGCGATT--TA-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : g--AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G---AGGGAA-AGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T---AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGA-T----C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AA--ACC-C---AAAGTNNNNNNNNN--------NN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------N---A---TCAG-T--GGC-ATG--TA-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T---AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---AN-------NNNNN--------NN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNA--------T---A---TCAAGT--GGCGATG--TA-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-TA--AA---TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---AN-------NNNNN--------NN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--------N---C---TCAA-T--AGCGATC--TA-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-G----G-AGT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T---------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--TT-A---AA---TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AACTANN-N---NN-------NNNNN--------NN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNCCCAAT--------G---G---C--A-T--GTCAATA--TA-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---G----A-AAT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-TA--AA---TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATG--CACCA-AATGA-AC-------CCG---GGG--------T-AAC-TCAAC---A--------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AC--ACC-C---AA-------GCA----------CATCTAACAATATTAAAAAGCTCCACA--ATCTTTCATGTCACATTCA--GGAAACATACAAATTCT---C---TCAA-T--GGCAATG--TA-C-Acaaatggagaaaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55555555555555555555555555555555555555555
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 333 4444 77777777 1 666 6666 1 1 4 222222222 2 11111111111111111 3 0000000 44 7 1 0 66666 3 1 44 1 33 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 5 22 88888 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 666 2 22 11 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 3 1 3 1111111111111 77 2 2 999 2 8888 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 4 666 2 33 2 444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 33 33 33 2 2 11111111111111111111111111111111111111111 2 33 2 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ................. . ....... .. . . . ..... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. ............................................. . . . . .. ..... ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . .. .. . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ... . .... . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. . ... . .. . ... ......................................................................................................................... . .. .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 333 0000 11111111 9 777 0000 9 9 0 222222222 0 11111111111111111 8 2222222 55 3 7 5 11111 5 7 00 7 99 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 9 7 66 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 000 0 88 55 0 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999 3 1 3 3333333333333 33 9 7 333 7 8888 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 77 7 555 5 44 7 777 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 44 44 44 4 4 55555555555555555555555555555555555555555 5 77 1 7 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---A--A-------GCAAG---------CA-----------CAACGACCCTCCAT--NG--TCACAGGAANNNTCAAANTTCTCT------------CA--GGANNTAT--------C---G---TCAA-T--GGCGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---A--A-------GCAAG---------CA-----------CAACGACCCTCCAT--NG--NCACAGGAACNNTCAANTTNCTCT------------CA--GGANNNAT--------N---G---TCAA-T--GGCGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---G----T-AGTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T--AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGA-T----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--ATG-T---AAGCAA--ACC-C---AACA-------ACAAATTTCTAGCTCATACATCAGCTCCAGCGACCTTCCATACTG--TTACAGGAA
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-T--AAA--TC-TCTCTGA-Gaatataccaaagttctaatcagaatgaggagtaacagatacccatttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---A-T----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-Acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT--AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAGtaattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : caTAACCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATATG-T---AAG-AT--TCTAC---A--G-------GCTAGTACTACTC-CA-----------CAACG--CCTCCAT--AG--TAACGGAAATATACAAATTCCTAT------------CA--AG---------------------------T--GGCGATGTTT--A-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-CGTTG--A-------CNNNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NN--NNNNNNNN--------N---G---TCAA-T--GGTGATG--T--A-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA--TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-T--AAA--TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--TGC--A---GCT----T-ATCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----AGAGT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---A-TAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AA--ACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----A-CAT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-----T-ATAT----------G-------T-------TCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--C------AA--TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : -AGT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT--TC-TCTCCGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---A-T----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--ATA-TGTGAAA-AG--ACC-C---A------------GAA---------CA-----------CAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcac---TCAG-TCGGACGATG--T--AAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---G----A-AGT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---A----A-AGT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--ATG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-AAC-TTGAT---A-TTC--C-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--ATGGT---AAG-AA--ACC-C---A--T-------GCAAG---------CA-----------CAATGACCCTCCAT--GT--GCACAGGAAACAT-AAATTTCT------------------------------------------TCAA-T--GGCGATG--T--A-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggT-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GTGG-A-AGT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-C--AAA--TC-TCT
gi|26 : ----C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA----C-C---A--T-------GCAAG---------CA-----------CA-CGGACCTCCAT--TG--TCACAGGAACAATCAAAATTCTCT------------CAATGGATGTA---------A---GAATTTAA-T--GTTAACA--T--T-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--ATG-TT--AAG-AA--ACC-C---A--N-------NNNNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NN--NNNNNNNN------------G---TCAG-T--GGCGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------TGC--A----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---A--N-------NNNNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NN--NNNNNNNN--------NNNNG---TCAG-T--GGCGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-G----A-AGT-------GCAGC-C-T--ATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-T--AAA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACT--AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT----C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--ATATT---AAG-AA--ACC-C---A--A--------CAAC---------CA-----------CCCCAACCCCCCatggagagagagaaaaa
gi|3 : AG---------CT-----------CTACGACCCTCCAT------ATACAGGAATATACAA--TTCT-----------------------TAT--------C---G--------T--GACGATG--TTAA-C-AG-------------------A--T------------------ACC-CC---TCAC-CCTCcccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|30 : catactcacatagtatgtattcctacccgcttgacgaattcccagataaatgtaggctgtctataatatttgatgaagtgcagcctatgtgataaattctttaaaatttgaaaacaataattttatatgaattatcaagaaattgcctaagatcgaaaaggcccgggcgtcatttttcaaatattgcacttaatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacatacccgccaccttccgttcgaaactgcaatacgtactgttgtaaatcttctccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccatgcgcaccgaactaaacgggtaggcctaactcgacagtctagcatctctggctccacagacaaagcgattccacaacgaatacaaatattaagaaacccaacaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T---------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------C-A----T---G---A----A-AAT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-tttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCG----A-AAT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : TCCAT---G--TCACATGAAACATAAAAATTCTCCACTGGTGATGTACA--GAATTTAT--------C---A---TTAA-C------ATT--T--A-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : atttCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-T--CAA--TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA--TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---A-A----C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---A--N-------NNNNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NN--NNNNNNNN--------N---G---CCAA-T--GGCAATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-T--GGCGATT--T--A-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : g--AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G---AGGGAA-AGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGA-T----C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AA--ACC-C---A--AAGTNNNNNNNNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NN--NNNNNNNN--------N---A---TCAG-T--GGC-ATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T--AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---A--N-------NNNNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NN--NNNNNNNA--------T---A---TCAAGT--GGCGATG--T--A-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AAA--TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--ACC-C---A--N-------NNNNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NN--NNNNNNNN--------N---C---TCAA-T--AGCGATC--T--A-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-G----G-AGT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T---------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--T--T--AAA--TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AACTANN-N---N--N-------NNNNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NN--NNCCCAAT--------G---G---C--A-T--GTCAATA--T--A-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---G----A-AAT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATG--CACCA-AATGA-AC-------CCG---GGG--------T-AAC-TCAAC---A--------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AC--ACC-C---A--A-------GCA-----------CATC---------TAACAATATTAAAA--AGCTCCACA--ATCTTTCATGTCACATT------------CA--GGAAACATACAAATTCT---C---TCAA-T--GGCAATG--T--A-C-Acaaatggagaaaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 333 4444 77777777 1 666 6666 1 1 4 222222222 2 11111111111111111 3 0000000 44 7 1 0 66666 3 1 44 1 33 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 5 22 88888 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 666 2 22 11 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 3 1 3 1111111111111 77 2 2 999 2 8888 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 4 666 2 2 444 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 55555 33 55 2 2 77777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ................. . ....... .. . . . ..... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. ............................................. . . . . .. ..... ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . .. .. . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ... . .... . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. . ... . . ... .......................................................................................................................................... . ..... .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 333 0000 11111111 9 777 0000 9 9 0 222222222 0 11111111111111111 8 2222222 55 3 7 5 11111 5 7 00 7 99 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 9 7 66 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 000 0 88 55 0 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999 3 1 3 3333333333333 33 9 7 333 7 8888 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 77 7 555 5 7 777 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 99999 22 66 2 2 44444444444444444444444444444444444444444 4 44 1 7 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--A-------GC------------------AAG---------CA-----------CNACGACCCTCCAT--NGTCA----CAGGAA---NNANCAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--A-------GC------------------AAG---------CA-----------CAACGACCCTCCAT--NGTCA----CAGGAA---NNNTCAAANTTCT-CT------------CA--GGANNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---G----T-AGTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T--AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGA-T----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--ATG-T---AAGCAAACC-C---AACA-------AC------------------AAATTTCTAGCTCATACATCAGCTCCAGCGACCTTCCATACTGTTA----CAGGAAAATATACCAAAGTTCTAAT------------CA--G------------------AA-TGA-----GGA-G--TA-A-C-AG-------------------A--T------------------AC--CCA--T
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-T--AAA--TC-TCTCTGA-Gttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---A-T----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-Acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT--AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAGtaattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : caTAACCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATATG-T---AAG-ATTCTAC---A--G-------GC------------------TAGTACTACTC-CA-----------CAACG--CCTCCAT--AGTAA----CGGAAA---TATACAAATTCCT-AT------------CA--AG--------------------TGG-----CGATGTTT--A-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-CGTTG--A-------CN------------------NNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GTCAA-TGG-----TGATG--T--A-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA--TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-T--AAA--TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--TGC--A---GCT----T-ATCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----AGAGT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---A-TAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AAACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----A-CAT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-----T-ATAT----------G-------T-------TCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--C------AA--TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : -AGT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT--TC-TCTCCGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---A-T----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--ATA-TGTGAAA-AGACC-C---A------------------------------GAA---------CA-----------CAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacGA-----CGATG--T--AAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcgCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---G----A-AGT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---A----A-AGT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--ATG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-AAC-TTGAT---A-TTC--C-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--ATGGT---AAG-AAACC-C---A--T-------GC------------------AAG---------CA-----------CAATGACCCTCCAT--GTGCA----CAGGAA---ACAT-AAATTTCT------------------------------------TCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggT-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GTGG-A-AGT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-C--AAA--TC-TCT
gi|26 : ----C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--C-C---A--T-------GC------------------AAG---------CA-----------C-ACGGACCTCCAT--TGTCA----CAGGAA---CAATCAAAATTCT-CT------------CAATGGATGTAAGAAT-----TTAA-TGT-----TAACA--T--T-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--ATG-TT--AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------NNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NN----GTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------TGC--A----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------NNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNNNNNGTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-G----A-AGT-------GCAGC-C-T--ATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-T--AAA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACT--AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT----C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--ATATT---AAG-AAACC-C---A--A--------C------------------AAC---------CA-----------CCCCAACCCCCCatggagagagagaaaaa
gi|3 : AG---------CT-----------CTACGACCCTCCAT--A--TA----CAGGAA---TATACAA--TTCT------------------------T----ATC---GT-----GA-----CGATG--TTAA-C-AG-------------------A--T------------------ACC-CC---TCAC-CCTCcccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|30 : catactcacatagtatgtattcctacccgcttgacgaattcccagataaatgtaggctgtctataatatttgatgaagtgcagcctatgtgataaattctttaaaatttgaaaacaataattttatatgaattatcaagaaattgcctaagatcgaaaaggcccgggcgtcatttttcaaatattgcacttaatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacatacccgccaccttccgttcgaaactgcaatacgtactgttgtaaatcttctccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccatgcgcaccgaactaaacgggtaggcctaactcgacagtctagcatctctggctccacagacaaagcgattccacaacgaatacaaatattaagaaacccaacaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T---------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------C-A----T---G---A----A-AAT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-tttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCG----A-AAT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : TCCAT---GTCA----CATGAA---ACATAAAAATTCT-CCACTGGTGATGTACA--GAATTT----ATC---ATTAA-C---------ATT--T--A-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : atttCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-T--CAA--TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA--TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---A-A----C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------NNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GCCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-TGG-----CGATT--T--A-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : g--AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G---AGGGAA-AGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGA-T----C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AAACC-C---A--AAGTNNNNNN------------------NNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---ATCAG-TGG-----C-ATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T--AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------NNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NAT---ATCAAGTGG-----CGATG--T--A-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AAA--TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------NNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---CTCAA-TAG-----CGATC--T--A-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-G----G-AGT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T---------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--T--T--AAA--TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA----C---T--A-------NN------------------NNN---------NN-----------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NCC-----CAA-TGGCATGTCAATA--T--A-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---G----A-AAT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATG--CACCA-AATGA-AC-------CCG---GGG--------T-AAC-TCAAC---A--------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-ACACC-C---A--A-------GCACATCTAACAATATTAAAAAG---------CT-----------CCACAATCTTTCAT---GTCACATTCAGGAA---ACATACAAATTCT-C----------------------------------TCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-Acaaatggagaaaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 333 4444 77777777 1 666 6666 1 1 4 222222222 2 11111111111111111 3 0000000 44 7 1 0 66666 3 1 44 1 33 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 5 22 88888 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 666 2 22 11 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 3 1 3 1111111111111 77 2 2 999 2 8888 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 4 666 2 2 444 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 55555 33 55 2 2 77777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ................. . ....... .. . . . ..... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. ............................................. . . . . .. ..... ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . .. .. . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ... . .... . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. . ... . . ... ................................................................................................................................................. . ..... .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 333 0000 11111111 9 777 0000 9 9 0 222222222 0 11111111111111111 8 2222222 55 3 7 5 11111 5 7 00 7 99 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 9 7 66 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 000 0 88 55 0 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999 3 1 3 3333333333333 33 9 7 333 7 8888 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 77 7 555 5 7 777 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5 99999 22 66 2 2 44444444444444444444444444444444444444444 4 44 1 7 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AGCN-----CCA-CGAC-CCTCCAT--NGTCA----CAGGAA---NNANCAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AGCA-----CNA-CGAC-CCTCCAT--NGTCA----CAGGAA---NNANCAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---G----T-AGTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T--AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGA-T----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--ATG-T---AAGCAAACC-C---AACA-------AC------------------AAATTTCTAGCTCATACATCAGCT-----CCAGCGAC-CTTCCATACTGTTA----CAGGAAAATATACCAAAGTTCTAAT------------CA--G------------------AA-TGA-----GGA-G--TA-A-C-AG-------------------A--T------------------AC--CCA--T
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-T--AAA--TC-TCTCTGA-Gttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---A-T----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-Acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT--AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAGtaattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : caTAACCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATATG-T---AAG-ATTCTAC---A--G-------GC------------------T-------------------AGTACTACTCCA-CAACGCCTCCAT--AGTAA----CGGAAA---TATACAAATTCCT-AT------------CA--AG--------------------TGG-----CGATGTTT--A-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-CGTTG--A-------CN------------------N-------------------NNNN-----NNN-NNNN-NNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GTCAA-TGG-----TGATG--T--A-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA--TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-T--AAA--TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--TGC--A---GCT----T-ATCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----AGAGT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---A-TAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AAACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----A-CAT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-----T-ATAT----------G-------T-------TCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--C------AA--TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : -AGT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT--TC-TCTCCGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---A-T----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--ATA-TGTGAAA-AGACC-C---A--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacGA-----CGATG--T--AAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAgaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcgCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---G----A-AGT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---A----A-AGT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--ATG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-AAC-TTGAT---A-TTC--C-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--ATGGT---AAG-AAACC-C---A--T-------GC------------------A-------------------AGCA-----CAA-TGAC-CCTCCAT--GTGCA----CAGGAA---ACAT-AAATTTCT------------------------------------TCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggT-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GTGG-A-AGT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-C--AAA--TC-TCT
gi|26 : ----C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA--C-C---A--T-------GC------------------A-------------------AGCA-----C-A-CGGA-CCTCCAT--TGTCA----CAGGAA---CAATCAAAATTCT-CT------------CAATGGATGTAAGAAT-----TTAA-TGT-----TAACA--T--T-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--ATG-TT--AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NNNN-----NNN-NNNN-NNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NN----GTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------TGC--A----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NNNN-----NNN-NNNN-NNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNNNNNGTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-G----A-AGT-------GCAGC-C-T--ATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-T--AAA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACT--AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT----C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--ATATT---AAG-AAACC-C---A--A--------C------------------A-------------------ACCA-----CCC-CAAC-CCCCCatggagagagagaaaaa
gi|3 : -------------------AGCT-----CTA-CGAC-CCTCCAT--A--TA----CAGGAA---TATACAA--TTCT------------------------T----ATC---G-----TGA-----CGATG--TTAA-C-AG-------------------A--T------------------ACC-CC---TCAC-CCTCcccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|30 : catactcacatagtatgtattcctacccgcttgacgaattcccagataaatgtaggctgtctataatatttgatgaagtgcagcctatgtgataaattctttaaaatttgaaaacaataattttatatgaattatcaagaaattgcctaagatcgaaaaggcccgggcgtcatttttcaaatattgcacttaatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacatacccgccaccttccgttcgaaactgcaatacgtactgttgtaaatcttctccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccatgcgcaccgaactaaacgggtaggcctaactcgacagtctagcatctctggctccacagacaaagcgattccacaacgaatacaaatattaagaaacccaacaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T---------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------C-A----T---G---A----A-AAT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-tttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCG----A-AAT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : TCCAT---GTCA----CATGAA---ACATAAAAATTCT-CCACTGGTGATGTACA--GAATTT----ATC---ATTAA-C---------ATT--T--A-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : atttCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-T--CAA--TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA--TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---A-A----C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NNNN-----NNN-NNNN-NNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GCCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-TGG-----CGATT--T--A-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : g--AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G---AGGGAA-AGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGA-T----C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATATG-T---AAG-AAACC-C---A--AAGTNNNNNN------------------N-------------------NNNN-----NNN-NNNN-NNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---ATCAG-TGG-----C-ATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T--AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NNNN-----NNN-NNNN-NNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NAT---ATCAAGTGG-----CGATG--T--A-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AAA--TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AAACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NNNN-----NNN-NNNN-NNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---CTCAA-TAG-----CGATC--T--A-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-G----G-AGT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T---------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--T--T--AAA--TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-AA----C---T--A-------NN------------------N-------------------NNNN-----NNN-NNNN-NNNNNNN--NNNNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NCC-----CAA-TGGCATGTCAATA--T--A-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---G----A-AAT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATG--CACCA-AATGA-AC-------CCG---GGG--------T-AAC-TCAAC---A--------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--ATG-T---AAG-ACACC-C---A--A-------GCACATCTAACAATATTAAAA-------------------AGCT-----CCA-CAAT-CTTTCAT---GTCACATTCAGGAA---ACATACAAATTCT-C----------------------------------TCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-Acaaatggagaaaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 333 4444 77777777 1 666 6666 1 1 4 222222222 2 11111111111111111 3 0000000 44 7 1 0 66666 3 1 44 1 33 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 5 22 88888 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 666 2 22 11 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 3 1 3 1111111111111 77 2 2 999 2 8888 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 33 4 999 55555 2 2 2 444 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 55555 33 55 2 2 77777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ................. . ....... .. . . . ..... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. ............................................. . . . . .. ..... ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . .. .. . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ... . .... . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. .. . ... ..... . . . ... .......................................................................................................................................................... . ..... .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 333 0000 11111111 9 777 0000 9 9 0 222222222 0 11111111111111111 8 2222222 55 3 7 5 11111 5 7 00 7 99 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 9 7 66 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 000 0 88 55 0 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999 3 1 3 3333333333333 33 9 7 333 7 8888 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 22 11 4 222 99999 4 4 5 444 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5 99999 22 66 2 2 44444444444444444444444444444444444444444 4 44 1 7 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGGAA---NNATCAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGGAA---NNANCAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---G----T-AGTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T--AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGA-T----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--A--TG-T---A-----AGCAA-ACC-C---AACA-------AC------------------AAATTTCTAGCTCATACATCAG-----CTCCAGCGAC-CT-------TCCATACTG--TTA----CAGGAAAATATACCAAAGTTCTAAT------------CA--G------------------AA-TGA-----GGA-G--TA-A-C-AG-------------------A--T------------------AC--CCA--T
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-T--AAA--TC-TCTCTGA-Gttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---A-T----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-AT--AATTG-TCC-ATACATAT-AATACA-T---A--A-------TT------------------A-------------------GGAC---TCCCT-CGAC-TCGTCACCGTCTAT--AGCTTCA----CAGGAA----TATAAAATTCCT-CT------------cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT--AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAG
gi|11 : caTAACCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATA--TG-T---A-----AG-AT-TCTAC---A--G-------GC------------------T-------------------AGTACTACTCCA-CAACGCC-------TCCAT--AG--TAA----CGGAAA---TATACAAATTCCT-AT------------CA--AG--------------------TGG-----CGATGTTT--A-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-CGTTG--A-------CN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GTCAA-TGG-----TGATG--T--A-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA--TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-T--AAA--TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--TGC--A---GCT----T-ATCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----AGAGT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---A-TAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----A-CAT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-----T-ATAT----------G-------T-------TCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--C------AA--TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : -AGT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT--TC-TCTCCGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---A-T----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--A--TA-TGTGA-----AA-AG-ACC-C---A--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacGA-----CGATG--T--AAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAgaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcgCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---G----A-AGT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---A----A-AGT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-AAC-TTGAT---A-TTC--C-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--A--TGGT---A-----AG-AA-ACC-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CACAA-TGAC-CC-------TCCAT--GT--GCA----CAGGAA---ACAT-AAATTTCT------------------------------------TCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggT-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GTGG-A-AGT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-C--AAA--TC-TCT
gi|26 : ----C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA---C-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CA-CA-CGGA-CC-------TCCAT--TG--TCA----CAGGAA---CAATCAAAATTCT-CT------------CAATGGATGTAAGAAT-----TTAA-TGT-----TAACA--T--T-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--A--TG-TT--A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NN----GTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------TGC--A----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNNNNNGTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-G----A-AGT-------GCAGC-C-T--ATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-T--AAA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACT--AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT----C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--A--TATT---A-----AG-AA-ACC-C---A--A--------C------------------A-------------------AC-----CACCC-CAAC-CC-------CCCatggagagagagaaaaa
gi|3 : -------------------AG-----CTCTA-CGAC-CC-------TCCAT--A----TA----CAGGAA---TATACAA--TTCT------------------------T----ATC---G-----TGA-----CGATG--TTAA-C-AG-------------------A--T------------------ACC-CC---TCAC-CCTCcccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|30 : catactcacatagtatgtattcctacccgcttgacgaattcccagataaatgtaggctgtctataatatttgatgaagtgcagcctatgtgataaattctttaaaatttgaaaacaataattttatatgaattatcaagaaattgcctaagatcgaaaaggcccgggcgtcatttttcaaatattgcacttaatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacatacccgccaccttccgttcgaaactgcaatacgtactgttgtaaatcttctccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccatgcgcaccgaactaaacgggtaggcctaactcgacagtctagcatctctggctccacagacaaagcgattccacaacgaatacaaatattaagaaacccaacaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T---------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------C-A----T---G---A----A-AAT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-tttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCG----A-AAT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : -------TCCAT---G--TCA----CATGAA---ACATAAAAATTCT-CCACTGGTGATGTACA--GAATTT----ATC---ATTAA-C---------ATT--T--A-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : atttCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-T--CAA--TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA--TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---A-A----C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GCCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-TGG-----CGATT--T--A-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : g--AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G---AGGGAA-AGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGA-T----C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--AAGTNNNNNN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---ATCAG-TGG-----C-ATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T--AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NAT---ATCAAGTGG-----CGATG--T--A-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AAA--TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---CTCAA-TAG-----CGATC--T--A-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-G----G-AGT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T---------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--T--T--AAA--TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-----C---T--A-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NCC-----CAA-TGGCATGTCAATA--T--A-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---G----A-AAT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATG--CACCA-AATGA-AC-------CCG---GGG--------T-AAC-TCAAC---A--------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AC-ACC-C---A--A-------GCACATCTAACAATATTAAAA-------------------AG-----CTCCA-CAAT-CT-------TTCAT---G--TCACATTCAGGAA---ACATACAAATTCT-C----------------------------------TCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-Acaaatggagaaaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 333 4444 77777777 1 666 6666 1 1 4 222222222 2 11111111111111111 3 0000000 44 7 1 0 66666 3 1 44 1 33 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 5 22 88888 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 666 2 22 11 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 3 1 3 1111111111111 77 2 2 999 2 8888 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 33 4 999 55555 2 2 2 444 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 55555 33 55 2 2 77777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ................. . ....... .. . . . ..... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. ............................................. . . . . .. ..... ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . .. .. . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ... . .... . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. .. . ... ..... . . . ... ........................................................................................................................................................... . ..... .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 333 0000 11111111 9 777 0000 9 9 0 222222222 0 11111111111111111 8 2222222 55 3 7 5 11111 5 7 00 7 99 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 9 7 66 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 000 0 88 55 0 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999 3 1 3 3333333333333 33 9 7 333 7 8888 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 22 11 4 222 99999 4 4 5 444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 99999 22 66 2 2 44444444444444444444444444444444444444444 4 44 1 7 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGGAA---ACAT-NAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGGAA---NNAT-CAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---G----T-AGTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T--AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGA-T----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--A--TG-T---A-----AGCAA-ACC-C---AACA-------AC------------------AAATTTCTAGCTCATACATCAG-----CTCCAGCGAC-CT-------TCCATACTG--TTA----CAGGAAAATATAC-CAAAGTTCTAAT------------CA--G------------------AA-TGA-----GGA-G--TA-A-C-AG-------------------A--T------------------AC--CCA--T
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-T--AAA--TC-TCTCTGA-Gttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---A-T----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-AT--AATTG-TCC-ATACATAT-AATACA-T---A--A-------TT------------------A-------------------GGAC---TCCCT-CGAC-TCGTCACCGTCTAT--AGCTTCA----CAGGAA----TAT-AAAATTCCT-CT------------cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT--AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAG
gi|11 : caTAACCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATA--TG-T---A-----AG-AT-TCTAC---A--G-------GC------------------T-------------------AGTACTACTCCA-CAACGCC-------TCCAT--AG--TAA----C-GGAA---ATATACAAATTCCT-AT------------CA--AG--------------------TGG-----CGATGTTT--A-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-CGTTG--A-------CN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GTCAA-TGG-----TGATG--T--A-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA--TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-T--AAA--TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--TGC--A---GCT----T-ATCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----AGAGT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---A-TAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----A-CAT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-----T-ATAT----------G-------T-------TCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--C------AA--TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : -AGT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT--TC-TCTCCGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---A-T----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--A--TA-TGTGA-----AA-AG-ACC-C---A--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacGA-----CGATG--T--AAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAgaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcgCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---G----A-AGT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---A----A-AGT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-AAC-TTGAT---A-TTC--C-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--A--TGGT---A-----AG-AA-ACC-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CACAA-TGAC-CC-------TCCAT--GT--GCA----CAGGAA---ACAT--AAATTTCT------------------------------------TCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggT-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GTGG-A-AGT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-C--AAA--TC-TCT
gi|26 : ----C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA---C-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CAC-A-CGGA-CC-------TCCAT--TG--TCA----CAGGAA---CAAT-CAAAATTCT-CT------------CAATGGATGTAAGAAT-----TTAA-TGT-----TAACA--T--T-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--A--TG-TT--A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NN----GTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------TGC--A----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNNNNNGTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-G----A-AGT-------GCAGC-C-T--ATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-T--AAA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACT--AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT----C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--A--TATT---A-----AG-AA-ACC-C---A--A--------C------------------A-------------------AC-----CACCC-CAAC-CC-------CCCatggagagagagaaaaa
gi|3 : -------------------AG-----CTCTA-CGAC-CC-------TCCAT--A----TA----CAGGAA----TAT--ACAATTCT------------------------T----ATC---G-----TGA-----CGATG--TTAA-C-AG-------------------A--T------------------ACC-CC---TCAC-CCTCcccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|30 : catactcacatagtatgtattcctacccgcttgacgaattcccagataaatgtaggctgtctataatatttgatgaagtgcagcctatgtgataaattctttaaaatttgaaaacaataattttatatgaattatcaagaaattgcctaagatcgaaaaggcccgggcgtcatttttcaaatattgcacttaatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacatacccgccaccttccgttcgaaactgcaatacgtactgttgtaaatcttctccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccatgcgcaccgaactaaacgggtaggcctaactcgacagtctagcatctctggctccacagacaaagcgattccacaacgaatacaaatattaagaaacccaacaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T---------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------C-A----T---G---A----A-AAT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-tttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCG----A-AAT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : -------TCCAT---G--TCA----CATGAA---ACAT-AAAAATTCT-CCACTGGTGATGTACA--GAATTT----ATC---ATTAA-C---------ATT--T--A-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : atttCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-T--CAA--TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA--TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---A-A----C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GCCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-TGG-----CGATT--T--A-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : g--AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G---AGGGAA-AGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGA-T----C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--AAGTNNNNNN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---ATCAG-TGG-----C-ATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T--AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NAT---ATCAAGTGG-----CGATG--T--A-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AAA--TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---CTCAA-TAG-----CGATC--T--A-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-G----G-AGT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T---------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--T--T--AAA--TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-----C---T--A-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NCC-----CAA-TGGCATGTCAATA--T--A-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---G----A-AAT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATG--CACCA-AATGA-AC-------CCG---GGG--------T-AAC-TCAAC---A--------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AC-ACC-C---A--A-------GCACATCTAACAATATTAAAA-------------------AG-----CTCCA-CAAT-CT-------TTCAT---G--TCACATTCAGGAA---ACAT-ACAAATTCT-C----------------------------------TCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-Acaaatggagaaaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 333 4444 77777777 1 666 6666 1 1 4 222222222 2 11111111111111111 3 0000000 44 7 1 0 66666 3 1 44 1 33 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 5 22 88888 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 666 2 22 11 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 3 1 3 1111111111111 77 2 2 999 2 8888 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 33 4 999 55555 2 2 2 444 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 55555 33 55 2 2 77777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ................. . ....... .. . . . ..... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. ............................................. . . . . .. ..... ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . .. .. . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ... . .... . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. .. . ... ..... . . . ... ......................................................................................................................................................... . ..... .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 333 0000 11111111 9 777 0000 9 9 0 222222222 0 11111111111111111 8 2222222 55 3 7 5 11111 5 7 00 7 99 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 9 7 66 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 000 0 88 55 0 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999 3 1 3 3333333333333 33 9 7 333 7 8888 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 22 11 4 222 99999 4 4 5 444 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 99999 22 66 2 2 44444444444444444444444444444444444444444 4 44 1 7 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGGAA---ACATAAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGGAA---ACATNAAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---G----T-AGTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T--AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGA-T----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--A--TG-T---A-----AGCAA-ACC-C---AACA-------AC------------------AAATTTCTAGCTCATACATCAG-----CTCCAGCGAC-CT-------TCCATACTG--TTA----CAGGAAAATATACCAAAGTTCTAAT------------CA--G------------------AA-TGA-----GGA-G--TA-A-C-AG-------------------A--T------------------AC--CCA--T
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-T--AAA--TC-TCTCTGA-Gttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---A-T----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-AT--AATTG-TCC-ATACATAT-AATACA-T---A--A-------TT------------------A-------------------GGAC---TCCCT-CGAC-TCGTCACCGTCTAT--AGCTTCA----CAGG-A---ATATAAAATTCCT-CT------------cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT--AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAG
gi|11 : caTAACCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATA--TG-T---A-----AG-AT-TCTAC---A--G-------GC------------------T-------------------AGTACTACTCCA-CAACGCC-------TCCAT--AG--TAA----C-GGAA---ATATACAAATTC------------------------CT----ATC---A--AG-TGG-----CGATGTTT--A-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-CGTTG--A-------CN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GTCAA-TGG-----TGATG--T--A-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA--TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-T--AAA--TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--TGC--A---GCT----T-ATCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----AGAGT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---A-TAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----A-CAT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-----T-ATAT----------G-------T-------TCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--C------AA--TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : -AGT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT--TC-TCTCCGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---A-T----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--A--TA-TGTGA-----AA-AG-ACC-C---A--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacGA-----CGATG--T--AAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAgaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcgCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---G----A-AGT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---A----A-AGT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-AAC-TTGAT---A-TTC--C-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--A--TGGT---A-----AG-AA-ACC-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CACAA-TGAC-CC-------TCCAT--GT--GCA----CAGGAA---ACAT-AAATTTCT------------------------------------TCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggT-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GTGG-A-AGT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-C--AAA--TC-TCT
gi|26 : ----C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA---C-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CAC-A-CGGA-CC-------TCCAT--TG--TCA----CAGGAA---CAATCAAAATTCT-CT------------CAATGGATGTAAGAAT-----TTAA-TGT-----TAACA--T--T-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--A--TG-TT--A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NN----GTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------TGC--A----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNNNNNGTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-G----A-AGT-------GCAGC-C-T--ATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-T--AAA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACT--AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT----C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--A--TATT---A-----AG-AA-ACC-C---A--A--------C------------------A-------------------AC-----CACCC-CAAC-CC-------CCCatggagagagagaaaaa
gi|3 : -------------------AG-----CTCTA-CGAC-CC-------TCCAT--A----TA----CAGGAA----TATACAA-TTCT------------------------T----ATC---GT-----GA-----CGATG--TTAA-C-AG-------------------A--T------------------ACC-CC---TCAC-CCTCcccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|30 : catactcacatagtatgtattcctacccgcttgacgaattcccagataaatgtaggctgtctataatatttgatgaagtgcagcctatgtgataaattctttaaaatttgaaaacaataattttatatgaattatcaagaaattgcctaagatcgaaaaggcccgggcgtcatttttcaaatattgcacttaatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacatacccgccaccttccgttcgaaactgcaatacgtactgttgtaaatcttctccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccatgcgcaccgaactaaacgggtaggcctaactcgacagtctagcatctctggctccacagacaaagcgattccacaacgaatacaaatattaagaaacccaacaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T---------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------C-A----T---G---A----A-AAT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-tttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCG----A-AAT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : -------TCCAT---G--TCA----CATGAA---ACATAAAAATTCT-CCACTGGTGATGTACA--GAATTT----ATC---ATTAA-C---------ATT--T--A-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : atttCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-T--CAA--TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA--TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---A-A----C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GCCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-TGG-----CGATT--T--A-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : g--AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G---AGGGAA-AGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGA-T----C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--AAGTNNNNNN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---ATCAG-TGG-----C-ATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T--AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NAT---ATCAAGTGG-----CGATG--T--A-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AAA--TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---CTCAA-TAG-----CGATC--T--A-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-G----G-AGT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T---------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--T--T--AAA--TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-----C---T--A-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NCC-----CAA-TGGCATGTCAATA--T--A-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---G----A-AAT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATG--CACCA-AATGA-AC-------CCG---GGG--------T-AAC-TCAAC---A--------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AC-ACC-C---A--A-------GCACATCTAACAATATTAAAA-------------------AG-----CTCCA-CAAT-CT-------TTCAT---G--TCACATTCAGGAA---ACATACAAATTCT-C----------------------------------TCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-Acaaatggagaaaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 111111111 33333333333333333 1111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4444444444444 1111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 333 4444 77777777 1 666 6666 1 1 4 222222222 2 11111111111111111 3 0000000 44 7 1 0 66666 3 1 44 1 33 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 5 22 88888 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 666 2 22 11 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 3 1 3 1111111111111 77 2 2 999 2 8888 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 33 4 999 55555 2 2 2 444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 55555 33 55 2 2 77777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . ... .... ........ . ... .... . . . ......... . ................. . ....... .. . . . ..... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. ............................................. . . . . .. ..... ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . .. .. . . ............................................................................................... ... . . . ............. .. . . ... . .... . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. .. . ... ..... . . . ... .......................................................................................................................................................... . ..... .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 6 9 333 0000 11111111 9 777 0000 9 9 0 222222222 0 11111111111111111 8 2222222 55 3 7 5 11111 5 7 00 7 99 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 9 7 66 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 000 0 88 55 0 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999 3 1 3 3333333333333 33 9 7 333 7 8888 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 22 11 4 222 99999 4 4 5 444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 99999 22 66 2 2 44444444444444444444444444444444444444444 4 44 1 7 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGG-AAACATA--AAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGG-AAACATA--AAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T---C-----ATAGGCTAGT-C-TA---TA----AACA-A-TTTTG-----A-T----T---G---G----T-AGTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--TGC--A---GC-----TTATCT----------A-------TGT-----TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T--AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNTGC-AC-CTGAACTCA---GGGT--AGTCCT-AATATCGACATGA-T----C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--A--TG-T---A-----AGCAA-ACC-C---AACA-------AC------------------AAATTTCTAGCTCATACATCAG-----CTCCAGCGAC-CT-------TCCATACTG--TTA----CAGGAAAATATACCAAAGTTCTAAT------------CA--G------------------AA-TGA-----GGA-G--TA-A-C-AG-------------------A--T------------------AC--CCA--T
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T---C----GATAGGACTGT-C-TA---TA----AA-T-A-T---------C-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-T-----T-ATC-----------------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-T--AAA--TC-TCTCTGA-Gttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : ATGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGTTAAGGAGT-TAC-TCGAC---A-T----CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-AT--AATTG-TCC-ATACATAT-AATACA-T---A--A-------TT------------------A-------------------GGAC---TCCCT-CGAC-TCGTCACCGTCTAT--AGCTTCA----CAGG--AATATA--AAATTCCT-CT------------cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGG------C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-TGA--T---G---G----A-AGT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TG-------GC-----A-ACTT----------A-------T-------C--------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT--AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAG
gi|11 : caTAACCATTG-TACCG-AACTCGAC-------CCGTACGGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATA--TG-T---A-----AG-AT-TCTAC---A--G-------GC------------------T-------------------AGTACTACTCCA-CAACGCC-------TCCAT--AG--TAA----C-GG-AAATATA--CAAATTC------------------------CT----ATC---A--AG-TGG-----CGATGTTT--A-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CATGC--ACCG-AACTC-ACACTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-CGTTG--A-------CN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GTCAA-TGG-----TGATG--T--A-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAT-------T-TA---TA----AA-A-ATT---------A-TATGAT---G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-TGC--A-CCTCG----T-ATCTGATAAAACTAG-------T-------TCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA--TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T---C----GATA--------T-CA---TA----AA-A-A-T---------A-TGA--TA--G---G----A-AGT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTTGC------GT-----T-ATC-----------A-------TAATAATGTCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-T--AAA--TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T---C----GATAGGCTGAGTC-TA---TG----AA-A-A-TCATATTTTGA-T----TC--G---G----ATAGTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--TGC--A---GCT----T-ATCT----------ATTG----T-------TCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T---C----GATA--------T-TA---TAAATCAA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----AGAGT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-TGT-------C-----T-ATC
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC--ACCG-AACTC-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGAC---A-TAGATC-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---T----GATA--------T-C----TT----AA-A-A-T---------A-TTGA-T---G---G----A-CAT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-----T-ATAT----------G-------T-------TCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--C------AA--TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : -AGT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-TGCCGA-CT-------T-ATCT----------AATG----T-------TCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT--TC-TCTCCGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgacc---GGGTG-AGGCCT-A-C-TCGAC---A-T----C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--A--TA-TGTGA-----AA-AG-ACC-C---A--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacGA-----CGATG--T--AAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAgaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcgCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----AATA--------T-TA---TA----AA-A-AAT---------A-T----TAATG---G----A-AGT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-T-T---------A-TTGA-T---G---A----A-AGT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : C-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacT-AAC-TTGAT---A-TTC--C-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--A--TGGT---A-----AG-AA-ACC-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CACAA-TGAC-CC-------TCCAT--GT--GCA----CAGG-AAACAT---AAATTTCT------------------------------------TCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : accaaatgcacccaagggT-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TT----AA-A-A-T---------A-T----T---G---GTGG-A-AGT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA-TG--------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-C--AAA--TC-TCT
gi|26 : ----C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA---C-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CAC-A-CGGA-CC-------TCCAT--TG--TCA----CAGG-AACAATC--AAAATTCT-CT------------CAATGGATGTAAGAAT-----TTAA-TGT-----TAACA--T--T-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--A--TG-TT--A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NN----GTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------TGC--A----------------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNNNNNGTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-TGTAG----GCTG--------TCTA---T--------A-A-T---------ATT----T---GAT-G----A-AGT-------GCAGC-C-T--ATG-TG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTG-AA-A-AC-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-TGC--A-CT-------TAATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-T--AAA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCGCACCG-AACT--AAAC-----------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---AGT----C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--A--TATT---A-----AG-AA-ACC-C---A--A--------C------------------A-------------------AC-----CACCC-CAAC-CC-------CCCatggagagagagaaaaa
gi|3 : -------------------AG-----CTCTA-CGAC-CC-------TCCAT--A----TA----CAGG--AATATA--CAA-TTCT------------------------T----ATC---G-----TGA-----CGATG--TTAA-C-AG-------------------A--T------------------ACC-CC---TCAC-CCTCcccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|30 : catactcacatagtatgtattcctacccgcttgacgaattcccagataaatgtaggctgtctataatatttgatgaagtgcagcctatgtgataaattctttaaaatttgaaaacaataattttatatgaattatcaagaaattgcctaagatcgaaaaggcccgggcgtcatttttcaaatattgcacttaatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacatacccgccaccttccgttcgaaactgcaatacgtactgttgtaaatcttctccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccatgcgcaccgaactaaacgggtaggcctaactcgacagtctagcatctctggctccacagacaaagcgattccacaacgaatacaaatattaagaaacccaacaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T---------GCA--------T-GG---TA----AA-A-T-T---------C-A----T---G---A----A-AAT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-tttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T---C----GATA--------T-TA---TG----AA-A-C-T---------A-T----T---GATCG----A-AAT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTAC-----A-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T---C----GGTA--------T-TA---TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------------------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : -------TCCAT---G--TCA----CATG-AAACATA--AAAATTCT-CCACTGGTGATGTACA--GAATTT----ATC---ATTAA-C---------ATT--T--A-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : atttCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-TGC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-T--CAA--TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TA---------A--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------CCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA--TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGC-CACCG--ACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCCAC---A-A----C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GCCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-TGG-----CGATT--T--A-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : -CACCT-AACGC-ACGCTG---CCA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : g--AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T---CATAGGCTA--------G-TC---TAT---AA-A-A-T---------A-T----T---G---AGGGAA-AGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------A-------TG------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCATGC--ACCG-AAC-C-ACG-------------GGT--AGGCCT-AAA-TCGACTAGA-T----C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--AAGTNNNNNN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---ATCAG-TGG-----C-ATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATAGGC-----C-TAGTCTA----TA-A-A-T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-TGC--A-CT-------T-ATCT----------AATAGATGT-------TTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T--AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CACCGAAACTC-A---------CG---GGTT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NAT---ATCAAGTGG-----CGATG--T--A-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T---T----GTTA--------T-CA---TA----AA-A---T---------A-T----T---GATGG----A-AGT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CT-------T-ATCT----------ATG-----T-------TCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AAA--TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---CTCAA-TAG-----CGATC--T--A-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT---C----GATT--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---GAT-G----G-AGT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-TGC--A-CTGC-----T---------------------------------------------------A-----TGT---A---G-------AC-ACCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--T--T--AAA--TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG--CACC--AACTC-ACGCTG---CCA---GGG---AAGTCT-AAC-TCCAC---A-T----C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-----C---T--A-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NCC-----CAA-TGGCATGTCAATA--T--A-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-ACA-C---------A-TCGA-T---G---G----A-AAT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGT--ATCTACATGTAT-ACAT----------G-------T-------TCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---ATG--CACCA-AATGA-AC-------CCG---GGG--------T-AAC-TCAAC---A--------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AC-ACC-C---A--A-------GCACATCTAACAATATTAAAA-------------------AG-----CTCCA-CAAT-CT-------TTCAT---G--TCACATTCAGG-AAACATA--CAAATTCT-C----------------------------------TCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-Acaaatggagaaaaaa
blockSeqs : A T TAT AATCAAGTTGATAACATTCA T A TT CA C C CTGC A T T TTC GAA AC A A T TA TG CAAATGTGTATT AATACAACTACGTGTAGAAATAAATCTGGGT T A C G GTA ATAG GGCTGAGT C GTC AATC . C T CATATTTTG T ATGATGG T TCAATTG CA C A GCCCA C C GT G CA T T TA A A AA T T A TTCATTT CC GAT A C CTA C C GT TGGCG AG GGCA CCGTGG GTGG TGCGC GGA . GTCGATT TTC AAA CT ACCTCGTATCTGATAAAACTAGT C A A T AT TAGTT AGCACACTAGTATCGCTCCCATCCCCCGGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTC A T TGA AAA TTGA G . C AAGGCCC T GTC T TA CT T T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN CGC A T G ACTGCCG TA A . TAG G AGAT C C . GT . T C TCGAA CA A AA . CC T T T AATT . . AT AT G GTG TACAT . T A GTT AGCACATCTAACAATATTAAAAAGCTCCACAATCTTTCATGTCACATTCAGGAAACATACAAATTCTCT G CATGT TT TA A A GAATTATCGATTAACATTCAC A CA T T A
blockSeqs : . . . G . . T . . . CAC . . . T . A . . T . . ATATT TGTAGATTTGCAATGGATCTGAGCGGCT T . G . . . GGACTGT . GTC T . . A . . TGAGGGA G . C C . . . . C . A . . G . . A T . . AC . . . T . . . . . . . . CGGG . . . T . AA T ATCTACATGTATACATGT . . . T . TAAG AAACAACCCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTACCCCCGTTT . . T C . . . . . . GT . . T . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAT GT . T . GCTGCCG G . . . . TC . . . A . . G TAGA A . . . . . . . A . . AT . T CC . . . . . AAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAT . . . . . . ACTTTATAGTTAACGTTCAC . . G . .
blockSeqs : A . . T . . . CC . . . T . G . . A . . . TTTGTATTGAAACTGGATCAAGGAT G . C . . . GGC . . . . . . . . GATAGG . . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC T ACTTATCTAATAGATGT . . . T . . AAGCAACCCCTCCCCCTTTTCTACCCCCGTTT . . . . . . . . . . C . . T . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN CC . T . GCTGCCA . . . . . . . . . G . . . CACA . . . . . . . . . . . AT . . T . . . . . TGCAAGCACACGGACCTCCATTGTCACAGGAACAATCAAAATTCTCTCAATGGATGTAAGAATT . . . . . . AATGTATCGTTAACATTCAC . . G . .
blockSeqs : G . . T . . . CC . . . . . . . . T . . . TGTGAATAGGAAATGGATCAGGAT G . . . . . GG . . . . . . . . TGATGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C GTTATCATAATAATG . . . . . . AAACATACCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTTC . . . . . . . . . . G . . T . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN C . T . GCTGCCA . . . . . . . . . . . . . CGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT . . . . . . ATCT . . T . .
blockSeqs : G . . T . . . TT . . . . . . . . A . . . TGTGTATCGCAATGGATCAGGC G . . . . . T . . . . . . . . TGATGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C CGACTTATCTAATGT . . . . . . AACACACACCCCTCCACCCCCGTTC . . . . . . . . . . G . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN C . T . CCGTAC . . . . . . . . . . . . . TGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT . . . . . . AT . . T . .
blockSeqs : . . T . . . CC . . . . . . . . T . . . TGCTTATTGCAACTGGATCAG A . . . . . . . . . . . . . . TAATGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T AGCTTATCTATTGT . . . . . . ACCACCCCCCCCCTCCTTCGTTC . . . . . . . . . . G . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA C . T . CCG . . . . . . . . . . . . . CGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC . . . . . . AT . . C . .
blockSeqs : . . T . . . CC . . . . . . . . G . . . CTAGACCAGGGT G . . . . . . . . . . . . . . TGATGA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C ACTGCTATCTAT . . . . . . AACAACCCCCTCCACCCCGTTC . . . . . . . . . . G . . . . . C . G . AC . . . . . . . . . . . . . TGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAT . . . . . . AT . . A . .
blockSeqs : . . . . CC . . . . . . . . G . . . ATCAAGAAC T . . . . . . . . . . . . . . TGGTGG . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C ACTTAATCTATG . . . . . . AACATTACCCCCCCCCCCTTC . . . . . . . . . . G . . . . . C . T . CG . . . . . . . . . . . . . TGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCT . . . . . . AC . . G . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . G . . . ATCAGGAT G . . . . . . . . . . . . . . TGATCG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T ACTACAATCTAT . . . . . . AAACATACCCGCCACCTTC . . . . . . . . . . T . . . . . C . T . G . . . . . . . . . . . . . TGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT . . . . . . AT . . G . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . T . . . ATCAAGGT G . . . . . . . . . . . . . . TGATGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C ACTGCTATCTAT . . . . . . AGACACCTACCACCCCATC . . . . . . . . . . C . . . . . C . G . G . . . . . . . . . . . . . CGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC . . . . . . AT . . G . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . G . . . TGCAGGAT T . . . . . . . . . . . . . . TGATGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C ACTTATCTATGT . . . . . . AAACATACCCCGCCTTTC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . TGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGCTAGTACTACTCCACAACGCCTCCATAGTAACGGAAATATACAAATTCCTATCA . . . . . . AT . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . TCAGGAT G . . . . . . . . . . . . . . CGATGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C ACTTATCTATG . . . . . . AACACACACGCCCTC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGCAAGCACAATGACCCTCCATGTGCACAGGAAACATAAATTTCTT . . . . . . AT . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . TCAGGAC G . . . . . . . . . . . . . . GATGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T GCAACTTAT . . . . . . AAACACCCTGTCT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . TGTGGA . . . . . . . . . . . . . . . GATGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T ACTTTATC . . . . . . ACCCCCCCCTTTC . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . ACCA . . . . . . . . . . . . . . . TGATG . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C ACTGCT . . . . . . AAACACCCCTTC . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . TGATG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . AACCCCCTACC . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . CCCTCCTT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : G******************* T* CC** ATCAGGAT**************************************** ******** ********* TGATGG*********** ******* ***** ****** C* ACTTATCTATGT********************************* **** ** ** C** CCCG********* *** CGA******* *** **
originalCons : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-T----T---G---G----A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGC--A-CTGC-----T-ATCT----------A-------T-------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC-CACCG-AACTC-ACGCTG---CCG---GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGG-AAACATA--AAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
finalCons : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACCC--ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAAATCAGGAT----------------------------------------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T---C----GATA--------T-TA---TA----AA-A-A-T---------A-TTGATGG-----------A-AGT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-TGCACTTATCTATGT---------------------------------TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCATGC--ACCG-AACTC-ACCCCG---------GGGT--AGGCCT-AAC-TCGAC---A-T----C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTCCGA-------GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGG-AAACATA--AAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 55555555555555555555 2222 111111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222222222222 1111111 1111 33333333333333333333333333333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5555555555555555555 1111 1111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 7 7 333 55555555555555555555 5 5 99 44 2 2 2222 4 2 2 777 333 77 2 2 5 22 22 555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 7 1 1 7777 66666666666666666 5555 1 1 1 555 555555 3 44 22 66 1 66 1 0000000 44 7 1 7777777 3 1 44 1 66 1 3 44 1 1 44 3 1 1 8888888 22 333 3 3 333 1 3 22 44444 22 3333 555555 7777 44444 888888 1 7777777 333 0000 33 1 44 6 2 00000000000000000000000000000 2 2 1 5 22 88888 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 9999 555 4444 1 22 1 6666666 1 666 2 22 11 2 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 77 3 2 2 1111111111111111111 33 2 2 5555 2 33 2 2 2 88 2 2 4 5555555555 55 4 33 2 33 666 2 2 6666 2 2 99 33 4 999 55555 2 2 2 444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 55555 33 55 2 2 77777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 2 2
lowQualScore : . . ... .................... . . .. .. . . .... . . . ... ... .. . . . .. .. ............ ................................................ . . . . . .... ................. .... . . . ... ...... . .. .. .. . .. . ....... .. . . ....... . . .. . .. . . .. . . .. . . . ....... .. ... . . ... . . .. ..... .. .... ...... .... ..... ...... . ....... ... .... .. . .. . . ............................. . . . . .. ..... . ......................................................................................... . . .... ... .... . .. . ....... . ... . .. .. . . ............................................................................................... .. . . . ................... .. . . .... . .. . . . .. . . . .......... .. . .. . .. ... . . .... . . .. .. . ... ..... . . . ... .......................................................................................................................................................... . ..... .. .. . . ......................................... . .. . . .
lowQualScore : 3 3 333 33333333333333333333 0 0 33 66 7 7 4444 4 1 1 999 777 11 1 1 2 88 88 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 8 3 8 8 0000 66666666666666666 7777 8 8 9 222 555555 8 55 66 44 9 44 9 2222222 55 3 7 3333333 5 7 00 7 11 7 5 11 7 8 33 6 8 8 4444444 55 222 6 6 222 8 6 55 55555 55 9999 222222 7777 55555 444444 8 7777777 222 0000 66 9 88 0 2 11111111111111111111111111111 0 0 9 7 66 88888 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9 3333 222 0000 9 66 9 2222222 9 000 0 88 55 0 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33 1 9 9 4444444444444444444 99 7 7 0000 7 44 5 5 5 44 5 4 7 0000000000 66 7 22 4 22 555 4 4 9999 2 2 22 11 4 222 99999 4 4 5 444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 99999 22 66 2 2 44444444444444444444444444444444444444444 4 44 1 7 9
consensus : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T-C----GATA--------T-T-A----TA----AA-A-A-T---A------T-T--G--AT--G-GA--A-GT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-T-GC--A-C-T-----T-ATC-T-----A-T-------GTTCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCAT--G-CACCG-AACT-CAC-----C--C-----CG---GGGT--AGGCCTAA-C-TCGAC----A-T--C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGG-AAACATA--AAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
Reference ( family-753 ) : NNNNTTTATCACATATTGA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T-C----GATA--------T-T-A----TA----AA-A-A-T---A------T-T--G--AT--G-GA--A-GT-------G--GCAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-T-GC--A-C-T-----T-ATC-T-----A-T-------GTTCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCAT--G-CACCG-AACT-CAC-----C--C-----CG---GGGT--AGGCCTAA-C-TCGAC----A-T--C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--A-------GC------------------A-------------------AG-----CNCCA-CGAC-CC-------TCCAT--NG--TCA----CAGG-AAACATA--AAANTTCT-CT------------CA--GGATNT----ATC---GTCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAACAAG
gi|1 : -GTGAT-ATTTTTT--C--AT---TCAC----ATAGATAT-GT-ATT---CC----A--CGC-C-GCTT--GA--C-----------------------------------------------------C----------GACC--ATTCC-CACATAAA-T-C-----ATAGGCTAGT-C-T-A----TA----AACA-A-T---T------T-T--G--ATT-G-GT--A-GTTAAG---G--GCACCT-AAGGTGGC----ATACAATTCG-T--TAAAATTAGAAG-A-AC-AAATAATTT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---ATGTG-CC---TA-ACG--ATC-----GAAG--AGG----C------C----CG-----TGGACGTCGA-------T---TTTA--C-AATA--T-GC--AGC-T-----T-ATC-T-----A-T-------GTTCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---TA-CA-------AC-ATCC-----CTC-------------------C-CC-T------GCATCT---TTG----------------CCT-TCGAAA-CGCTGTG---A----A-TGACA-CG-------TA-CGG--TA-T--AAACTTC-TCTCCGA-GTGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N-NNNNN-NNNTGCACCTGAAC--T-----CA---GGGT--AGTCCTAA-TATCGACATG-A-T--C-TAG-CAA--TTTGC-T-G-TC-C-G-AAACGGAC--AAAGGC--GATCT--CCGTACT-C--CGAA----TCACAAA--A--TG-T---A-----AGCAA-ACC-C---AACA-------AC------------------AAATTTCTAGCTCATACATCAG-----CTCCAGCGAC-CT-------TCCATACTG--TTA----CAGGAAAATATACCAAAGTTCTAAT------------CA--G------------------AA-TGA-----GGA-G--TA-A-C-AG-------------------A--T------------------AC--CCA--T
gi|10 : ccagttgatatcacctaT-A-TCAC----ATAG-TAT-GTTATTT--CCT---A--CGC-C-ACTT--GA----------------GAA-----------------------AT------------------------------TTTC-CA-ATAA--T-C----GATAGGAC----TGT-C----TA----TA-A-A-T---A------TCT--G--AT--G-GA--A-GT-------G--AC-C-T-AATGTGG-----ATA-AATTCA-T--TTAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GC-CT---TA-A-G--ATG-----AAAA--GGG----CCCGTGGC----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-T-GC--A-CTT-----T-ATC---------------------------AAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-CATT-----AC-CCCC-----CCC-------------------C-CC-----------------TTC----------------CGTATCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CT---TG-T--AAA--TC-TCTCTGA-Gttctactgcccaacagagtcgaaaagtcaatagaagagagagaaaaaa
gi|10 : AT--G-CACCG-AACT-CAC-------------------GGGTTAAGGAGTTA-C-TCGAC----A-T--CCTAG-C-AA-TCT-C-CCGCTC-TAG-A----GAC--AAA-GC--GAT-TCCCCAT--T-C-ACGAA----T-AC-AT--AATTG-TCC-ATACATAT-AATACA-T---A--A-------TT------------------A-------------------GGAC---TCCCT-CGAC-TCGTCACCGTCTAT--AGCTTCA----CAGG--AATATA--AAATTCCT-CT------------cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaatgcaccgaactcacgggttaaggagttactcgacatcctagcaatctcccgctctagagacaaagcgattccccattcacgaatacataattgtccatacatataatacataattaggactccctcgactcgtcaccgtctatagcttcacaggaatataaaattcctct
gi|11 : tatcacatagtatgttatttcctacgccacttgagaaattttccaataatcgataggactgtctataaatatctgatggaagtgacctaatgtggataaattcatttaaatttgaaaaacaataaatttatatgattatcaagaaatgccttaagatgaaaagggcccgtggccgtcattttcaaatattgcactttatcaagtcaaaatataacattacccccccccccttccgtatcgaaactgaatgacgtacttgtaaatctctctgagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgca--CATAG-TA--AT-GGT---TCT---A--CGC-C-GCTT--GA--C------------GAAA-------------------------------------------------------TTCC-CA-ATAAA-T-C----GATAGG------C-T-AGTC-TA----TA-A-A-T---A------T----G--AT--G-GA--A-GT-------G--GTAC-T-AATGTGG-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGGAA-A-AC-AA-TAAATT--A-TTA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-CGCCT---TT-A-T--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAT-TGGCA-A-C-T-----T-ATC----------------------------AG-TC-AA--AA-----T------------------C-CCTC-----C-------------------------------------------TT----------------CGC-CCGAAA-C----TG---A----A-T---A-CG-------TA-CTGTCTGTT--AAAT-TC-TCTCCGA-GTGTGTAG
gi|11 : caTAACCATT-G-TACCG-AACT-CGA-----C--C-----CGTACGGGT--AGGCCTAA-C-TCGAC----A-T--C-TAGCC-A--TCT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC---AA-GC--GAT-T--CCT---T-C-ACGAA----T-AC-AGATA--TG-T---A-----AG-AT-TCTAC---A--G-------GC------------------T-------------------AGTACTACTCCA-CAACGCC-------TCCAT--AG--TAA----C-GG-AAATATA--CAAATTC------------------------CT----ATC---A--AG-TGG-----CGATGTTT--A-CAAG-------------------A--T------------------ACT-Ccccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccaccataaccattgtaccgaactcgacccgtacgggtaggcctaactcgacatctagccatctctgctccgagacaagcgattccttcacgaatacagatatgtaagattctacaggctagtactactccacaacgcctccatagtaacggaaatatacaaattcctatcaagtggcgatgtttacaagatactc
gi|12 : cacatagtaatggttctacgccgcttgacgaaattcccaataaatcgataggctagtctataaatatgatggaagtggtactaatgtggataaattctttaaaatttggaaaacaataaattattatgattatcaagaaatcgcctttatatcgaaaaggcccgtcattttcaaatattggcaacttatcagtcaaaatccctccttcgcccgaaactgaatacgtactgtctgttaaattctctccgagtgtgtagcccaaacccggatagaggacacattacgaacaaaagagaaaagatccgttatcacgtaatttactcccttttattataatggatcatcactttcaccaactccacca-TG-GAAG-TC-AA--AA-----TGT---AC-CA-------CC-CCCC-----CCC----------------T--C-CTTC------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TA-TCTCCGA-G
gi|12 : CAT--G-CACCG-AACT-CACA----CTGC-----CG---GGGT--AGGCCTAA-C-TCGAC----A-T--C-TAG-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAC-T--CAA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-CGTTG--A-------CN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GTCAA-TGG-----TGATG--T--A-C-AA-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ATTTGC-GACAACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtacatgcaccgaactcacactgccggggtaggcctaactcgacatctagcatctctgctctgagacaaaacgactcaatcacgaatacagatgtaagaaacccgttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaatggtgatgtacaaatactccatgacatttgcgacaacaacaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|13 : tggaagtcaaaatgtaccaccccccccctccttcgttccgtctgaaactgaatgacgtactctgtaaatatctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtaCTT--------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-G-TCACC---ACAG-CATTGT-ATTT--CCT---A--CGC-C-AC-T--GA--C------------AAAATGTAG------------------ATTTGCAAT-GGA-TCTGAGCGGCTAACATAATTCC-CA-ATAAA-T-C----GATA--------T-TTA----TA----AA-A-A-TT--A------TAT--G--AT--G-GA--A-GT-------G--GCAC-A-GATGTT------ATT-AATTCT-T--CAAAATTTAAAA-A-AC-AATTTAATTTAT-ATA-TG--ATTTG-T-CAA-------GA--AGATAT-TG-GT---TA-A-GGTATC-----GAAA--AAGGGCAC------C----TG-----T------C-A-------T---TTTCAAA-AATAC-T-GC--A-C-CTCG--T-ATC-TG----A-TAAAACTAGTTCT-TGAAAAG-TT-TA--AATAAG-TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-T------G--------TCT----------------GAT-CTGAAA-CT---TG---A----A-TG--G-CG-------TA-CTG--TG-TTAAAA--TC-TCTcaaaaagatagagagaaaaaaaca
gi|14 : cacatattttgacccccttttattccagtttgataacaatTTTATCACATATTGA---CCCCTTAATCAAGTTGATAACATTCAT-GTGATAATTTATTT-C--A--A-TCA-C--CACAG--AT-GT-ATC---CTG---A--CGC-C-ACAT--GA--C------------AAAATGTGTATCGCAATGG--------AT---CA---GG--C----------GACATAATTCC-AA-AT-AA-T-C----GATA--------T-C-A----TA----AA-A-A-T---A--------T--G--ATA-G-GA--A-GT-------G--GCAC-A-TATGTTA-----TT---ATTCT-T--C-AAATTTAAAA-ACAC-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TTG-TACAA-------G---A---CT-TGTGT---TA-A-G--ACT-----G-AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC----AATACTT-GC--G---T-----T-ATCATAATA-A-T-------G-TCT-GA-AAAG-TCTAAATAA-----TGT---AA--A---------------------C----------------A--C-CC-C---------------TTC----------------TAT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG----CG-------TATCTG--TG-T--AAA--TC-TCT
gi|15 : tACCA-CATAGATAT-GT-ATT---CCT---AACCGC-C-GCTTTAGA--C------------CGAA-----------------------AC---CA-------------------------TTCC-CACATAAA-T-C----GATAGGCTGAGTC-T-A----TG----AA-A-A-TCATA------T-TTTG--ATTCG-GAT-A-GTTCAATTGG--GCACCT-AATGGTGGCCCAATACAATTCT-T---AAAATTAGAAGGA-AC-AA-TAATTTG-T-ATAATG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-GG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAAAGAGG----C------C----CG-----TGGA---C-AGTCGATTT---CTTC----AATA--T-GC--AGC-T-----T-ATC-T-----ATT-------GTTCT-TC-GAAG-TC-AA--AA-----TATTACAA-CA-------TC-CCCC-----CCC----------------T--C-CC-C------
gi|16 : ctTTTATC-CA-GTTGATATCACTTTG-------------------TTGT-AT-ATTTTTTT-TCAAT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATTTTCCCT---AA-CGCAC-GCAT--CATGC------------GAAA-----------------------AT---CA---AGAAC----------GACAGAATTTC-CA-ATCAA-T-C----GATA--------T-T-A----TAAATCAA-A-A-T---A------T-T--G--AT--G-GAG-A-GT-------G--AAAC-T-CATGTAG-----ATA-ATTTCT-TC-CAACATTTGAAA-A-AC-AA-TCAATT--TAATA-TG--ATTTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-------AA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------A---TTACA-A-AATAC-T-G
gi|17 : accTC----------------CGT-TCGAAA-C----TG---ATTGAA-TG--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAACTTC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--G-CACCG-AACT-CAC-------------------GGGT--AGGCCTAA-A-TCGACATAGA-T--C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACtctatcggagagatggcaaaat
gi|18 : TA-------------------T-GTGAT-AATTTTT--C--AT-A-ACACC---ACAA-TAT-GT-ATT---CCT---A--TGC-T-GCTT--GG--C------------GAAATTTGTATTGAAACTGG-------AT---CAA--GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T-T----GATA--------T-C------TT----AA-A-A-T---A------T-T--G--AT--G-GA--C-AT-------G--ACA--T-GATGT--------TA-AATTCC-T--CAAAA----GAA-A-AC-TA-TGAATG--T-A
gi|19 : cacatatttataccctttataagctttgtacagtcgatatatcactcata-T-----A-T-------GTTCT-TG-AA-----------------TGT---AA-C-------------CC-----CCT----------------A--C-C--------------------------------------------GAA-T----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTG--C------AA--TC-T----GA-GTAAaaagttaatacgatatgtgtt
gi|2 : taCC-CA-ATAAA-TTC----GATAGGC-----T-C-AAGTCTA----GT-A-A-T---ACTTGACT-T--GGTAT--GCGACCA-GT-------G--GAAC-TAGATGTGG-----ATA-AATTCTCT--TAGAATTTGAAA-A-GCTAA-TACTTT--T-ATA-TG--A--TG-T-GAATTCATTTGACCA---AT-TG-ACCTATA-G-A--ATCTGGCGGGGA--AGG----C------CGTGGCG-----T------C-A-------TTTCTTTC----AATAT-T-GCCGA-C-T-----T-ATC-TA----A-T-------GTTCTCTG-GAAGATC-AA--AATAGTTTAT---AG-CACACTAGTAT-CGCT-----CCC----------------ATCC-CC-C------GGTCAGGTTTTCGAACGGGAACCCGTTCCGT-TCGAACTC----TGAAAA----A-TG--A-CG-------TA--TG--TG-T---AT--TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N-NNNNA-A--T-CGC-----C--CGATCACG---GGTG--AGGCCT-A-C-TCGAC----A-T--C-TAG-C-AG-TCT-C-T-GCTC-C---A----G-C--AAA-GC--GAC-T--TCA---T-C-ACGTA----T-AC-AA--A--TA-TGTGA-----AA-AG-ACC-C---A--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaccaaataaacccgggtagctcgacattcattcctgttcacaaaatcctctgtcacaggacac
gi|2 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgGA-----CGATG--T--AAC-AG-------------------A--T------------------ACT--CA--TTCC-ACTCGCAGACAAgaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcggacgatgtaacagatactcattccactcgcagacaaga
gi|20 : catatccgaactagttatgtattcccttaattaaggcggacttgatcgaaagtttgcccaataaattcgataggctcaagtctagtaatacttgacttggtatgcgaccagtggaactagatgtggataaattctcttagaatttgaaaagctaatacttttatatgatgtgaattcatttgaccaattgacctatagaatctggcggggaaggccgtggcgtcatttctttcaatattgccgacttatctaatgttctctggaagatcaaaatagtttatagcacactagtatcgctcccatcccccggtcaggttttcgaacgggaacccgttccgttcgaactctgaaaaatgacgtatgtgtattctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgcccgatcacgggtgaggcctactcgacatctagcagtctctgctccagcaaagcgacttcatcacgtatacaaatatgtgaaaagacccagaacacaaattttttattattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcgCC--CAC-G-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA------------------------T---GT---GGA-------------ACAGAATTCC-CA-ATAAA-T-C----AATA--------T-T-A----TA----AA-A-AAT---A------T-T--A--AT--G-GA--A-GT-------G---CAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTGT-T--CAAAATTC-AAA-A-AT-AA-TAAATC--T-ATA-AG--A-TTG-T-TAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-T-GC--A-ga
gi|20 : CC-----CCA----------------A--C-CC-C-----------------C----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CTaccccaaccccccgtctgaaactgaatgacgtactc
gi|21 : cccacgtatgtattcctacgccgcgtgacgaaatgtggaacagaattcccaataaatcaatattataaaaaatattaatggaagtgcactgatgttgataaattgttcaaaattcaaaaataataaatctataagattgttaagaaattggttaagatcgaaaaggcctgtcattttcaaatactgcaaTTT-C--ATCA-ACACT--TTCAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-TAGT--GT--T------------GAAATGTGAATAGGAAATGG-------AT---CA---GGA-T----------GACAAAATTCC-AA-ATAAA-T-C----GATA--------T-T-A----TA----AA-A-T-T---A------T-T--G--AT--G-AA--A-GT-------G--GCCC-T-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAATTTTG-AA-A-AC-AA-Tc
gi|22 : atcataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TC-TCT--TG-T--AAA--TC-TCTCCGA-gcat
gi|22 : -C-TCCAC----A-T--C-TAG-C-A--TCT-C-T-GC-C-T-G-A----GAC--ATA-AA--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacctccacatctagcatctctgcctgagacataaagattccatcacaatacagatgt
gi|23 : tctgaaactgaacgacgtctcttgtaaatctctccgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcatgcttcgaacACCA-AATG-CAC-----C--C-----AA---GGGT--A------A-C-TTGAT----A-TTCC-T----------T-C-T-GCTC-----------AT--AAA-AT--GAT-T--CCA---TTC-ACGAAA---T-AC-AG--A--TGGT---A-----AG-AA-ACC-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CACAA-TGAC-CC-------TCCAT--GT--GCA----CAGG-AAACAT---AAATTTCT------------------------------------TCAA-TGG-----CGATG--T--A-C-AGGAATTATCGATTAACATTCA--C------------------ACT-CC---TGAC-ACTCTC-G-CAACAA
gi|24 : T-A-TCACCTGCACAG-TTT-GT-ATC---TCT---A--CGC-C-GCGT--GA--CCAAATGTGTATTGAAACTAG-------------------AC---CA---GGG-T----------GATA-AATTCC-CA-ATAAA-T-C----GATA--------T-T-A----TT----AA-A-A-T---A------T-T--G--GT--G-GA--A-GT-------G--ACAC-A-GATGTTG-----TTA-AAGTCT-T--CA------GAAA-A-A--AA-GAAATG--T-ATA--------TG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-G--ATT-----GAAC--AGT----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--aattttaaa
gi|25 : -GATGTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAT-A--C-AA-TAAATC--T-ATA-TG--A-TCG-T-TGA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------A-A-------T---TTTT--A-AATGC-T-GC--A-C-TGC---T-ATC-T-----A----------TCCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TTT---AA-CAC------ACACCCC-----TCC----------------AC-C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-C--AAA--TC-TCT
gi|26 : --C-TTG-T-A--TCT-C-T-GCTC-----------AT--AA--------T-T--TCA---T-CTAC-AA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA---C-C---A--T-------GC------------------A-------------------AG-----CAC-A-CGGA-CC-------TCCAT--TG--TCA----CAGG-AACAATC--AAAATTCT-CT------------CAATGGATGTAAGAAT-----TTAA-TGT-----TAACA--T--T-C----------------------A--C------------------ACTACCA--TGAC-CATCCT-GACAA
gi|27 : cacaatcaaccacataggtaa-T-GCTC-T-G-A----AAT--AAAAGTAAGAT-T--CCA---T-C-ATGAA----T-AC-AG--A--TG-TT--A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NN----GTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CCACATTCT-ACTCGC-GACAAGAAaacaatttaaaaatc
gi|28 : TCT-T--CAACATTTGAAA-A--C-AA-TCAATT--T-ATA--G--A-TTG-T-TAT-------AA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATA-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TT------------T-GC--A-------------------------------------------G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------AC-CCCCTTTCACCCCCCCTTCCCCCTTTCTA--CCCC-C------G--------TTT----------------CGT-CTGAAA-T----TG---A----A-CG--A-CG-------TA-CTC--TG-T--AAA--TC-TTTCCGatggagagagagaaaaaa
gi|29 : GAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNNNNNGTCAG-TGG-----CGATG--T--A-C-AG-------------------A--T-------------------CT-CAA--TTCT-ACTCGC-GACAAGAA
gi|3 : t-C--AT-ACTCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--C-C-C-GCTT--GA--C------------GAA--------------------------------------------------------TTCC-CAGATAAA-T-GTAG-GCTG--------TCT-A----TA----A------T---A------T-TT-G--AT--G--A--A-GT-------GCAGC-C-T--ATGT-G-----ATA-AATTCT-T--TAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAATTT--T-ATA-TGA-A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------CCGGGCG-----T------C-AT------T---TTTC--A-AATAT-T-GC--A-C-T-----TAATC-T-----A-T-------G-TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---AA-AC-------AT-ACCC-----GCC----------------A--C-C------------------TTC----------------CGT-TCGAAA-C----TGC--A----A-T---A-CG-------TA-CTGT-TG-T--AAA--TCTTCTCCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATGCG-CACCG-AACT-AAA-----C-------------GGGT--AGGCCTAA-C-TCGAC----AGT--C-TAG-C-A--TCT-C-TGGCTC-C-ACA----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---C-A-ACGAA----T-AC-AA--A--TATT---A-----AG-AA-ACC-C---A--A--------C------------------A-------------------AC-----CACCC-CAAC-CC-------CCCatggagagagagaaaaa
gi|3 : -------------------AG-----CTCTA-CGAC-CC-------TCCAT--A----TA----CAGG--AATATA--CAA-TTCT------------------------T----ATC---G-----TGA-----CGATG--TTAA-C-AG-------------------A--T------------------ACC-CC---TCAC-CCTCcccccccccccccccccattcactaaatagatagctctacgaccctccatatacaggaatatacaattcttatcgtgacgatgttaacagatacccctcaccctctttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|30 : catactcacatagtatgtattcctacccgcttgacgaattcccagataaatgtaggctgtctataatatttgatgaagtgcagcctatgtgataaattctttaaaatttgaaaacaataattttatatgaattatcaagaaattgcctaagatcgaaaaggcccgggcgtcatttttcaaatattgcacttaatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacatacccgccaccttccgttcgaaactgcaatacgtactgttgtaaatcttctccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccatgcgcaccgaactaaacgggtaggcctaactcgacagtctagcatctctggctccacagacaaagcgattccacaacgaatacaaatattaagaaacccaacaaccaccccaacccccccccccccccccccccccattcactaaatagatT-GT-ATT---CCT---A--CGC-C-GAGT--GA--CATATT-------GAAAAATACAACTACGTGTAGAAATAAAT---CT---GGG-T----------GACAGAATTCCACA---AAA-T-------GCA--------T-G-G----TA----AA---------A------T-T--C--AT--G-AA--A-AT-------A--ACGC-A-GGTGTTG------TA-AAATTG-T--CAATGCTTTAAA-A-tttccctcctcccccatcgcaacaagaaatggagagagagagaaaac
gi|31 : TTT-C--AT-A-TCAC----ACAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CCC-T-GCAT--GA--C------------GAAA------------------------T---CA---GGA-T----------GACATAATTCC-CA-GTAAA-T-C----GATA--------T-T-A----TG----AA-A-C-T---A------T-T--G--AT--C-GA--A-AT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-ATTTCT-T--CAcgat
gi|32 : AATTTGAAA-A--C-AA-TAAATT--T-ATA-TG--A-TGA-T-TAA-------GA--A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--ATA----C------C----CG-----T------T-A-------T---TTTC--A-AATAC-T-GC--A-C-TAC---A-ATC-T-----A----------TCCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-C
gi|33 : CTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTT-C--AT-A-TCAC----ATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CAC-C-GCAT--GA--C------------GGAA------------------------T---CA---GGA-C----------GACAGAATTCC-CA-ATCAA-T-C----GGTA--------T-T-A----TA----AA-A-c
gi|34 : tccagttgtaacataTT--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAT-------GA--A---AT-TA-GT---AA-A-G--ATT-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-----------------------------------------------------------------TTT-TG-GA-G-TC-AA--AA-----TGTA--AA-CA-------A--CCCC-----CCC----------------A--C-CC-C------
gi|35 : -------TCCAT---G--TCA----CATG-AAACATA--AAAATTCT-CCACTGGTGATGTACA--GAATTT----ATC---ATTAA-C---------ATT--T--A-C-A-------------------------------------------CT-CCA--TAAC-ACTCGC-GACAACAAccctcccccctttctaccctcgttccgt
gi|36 : atttCAC-T-GATGTTT-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTT-AAA-A-AC-AA-TAAAGT--T-ATA-TG--A-TTG-T-CAA-------GA--A---AC-TG-GT---CA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TCTC--A-AATAC-T-GC--A-attttaaaaaat
gi|37 : -GTGAT-ATTTT--T-C--AT-A-TCACC--CATAG-TAT-GT-ATT---CCT---A--CGT-T-GCAT--GA--T------------GAAA-----------------------
gi|38 : atttaattatcatttacccctttatccaattgataacaatcatgtcaAG-TC-AA--AA-----TGT---AAGCA-------AC-CCCT-----CCCCCTTTTCT--------A--C-CC-CC-----G--------TTT----------------TGT-CTGAAA-C----TG---A----A-CG--A-GG-------TA-CTC--TG-T--CAA--TA-TCTCCGA-t
gi|39 : tgc-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TGAC-ACTCGC-AACAACAA
gi|4 : TTTATCACATACTTA---CCCCTTG-------------------T-GTGAT-ATTTTTTTTC--AT-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CATGAAA--CTC-T-GCGT--GA--C------------AAAA-----------------------AT---CA---GGA-T----------GACAGAATTCC-CA-ATAAA-T-C----GATA--------T-T-A----TA----AA-A-A-T---A------T-T--G--------GA--A-GT-------G--AAAC-T-GATGTTG-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATG--T-ATA-TG--A-TTG-T-TAA-----------A---AT-TA-GT---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-T-GC--A-C-TGC---T-ATC-T-----A----------TCCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TGT---AA-CA-------AC-CCCC-----TCC----------------A--C-CC-C------G--------TTC----------------CGT-CTG-AA-C----TG---A----A--G--ACCG-------TA-CTC--TG-T---AA--TC-TCTACGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--GCCACCG--ACT-CACG----CTGC-----CG---GGGT--AGGCCTAA-C-TCCAC----A-A--C-TAT-C-A--TCT-C-T-GCTC-T-G-A----GAC--AAA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---GCCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CTA--TGAC-ACTCGC-AACAACAAGacggagagagagagaaagaaaaacaacatcgcgtcatc
gi|40 : tataCAA-TGG-----CGATT--T--A-C-AG-------------------A--CTTTATAGTTAACGTTCACACT-CAA--TGAC-ACTCAC-GACAACA
gi|42 : --G-CACCT-AACG-CACG----CTGC-----CA---GGGT--AGGCCTAAAC-TCCAC----A-T--C-TAG-C-A--TCT-C-T-gcaaa
gi|5 : --AT-G-TCACT-----AG-TAT-GT-ATT---CC----A--CGC-CAGCTT--GA--C------------GA---------------------------------------------------------CTTC-CA-ATAAA-T-CATAGGCTA--------G-T-C----TAT---AA-A-A-T---A------T-T--G--AG--G-GA--AAGT-------GC-GCACCT-AGTGTGG-----ATA-AATTCT-TGTTAAAATTTGAAA-A-CA-AA-TAA-TT--T-ATA-TG--A-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TACACG--ATC-------AA--AGG----C------C----CGTGCGCT------C-A-------T---TTT---A-CACAT-T-GC--A-C-T-----T-ATC-T-----A-T-------G-TCT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TAT---A---A-------AC-ATAC-----CCC----------------G--C-CT-----------------TTC----------------CGT-TCGAAA-CTGA-TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AACT-TC-TCTCCGA-G
gi|5 : TCCAT--G-CACCG-AAC--CAC-------------------GGGT--AGGCCTAA-A-TCGACTAG-A-T--C-TAG-C-A--TTT-C-T-GCTCTC-G-AA---GACCAAAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-AC-AA----T-AC-AAATA--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--AAGTNNNNNN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---ATCAG-TGG-----C-ATG--T--A-C-AG-------------------A--T------------------ACT-CCA--TTCT-ACTCTC-GCAAACAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattccatgcaccgaaccacgggtaggcctaaatcgactagatctagcatttctgctctcgaagaccaaaagcgattccatcacaatacaaatatgtaagaaacccaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtggcatgtacagatactccattctactctcgcaaacaagaggaagagggagaaaaaaa
gi|6 : atgtcactagtatgtattccacgccagcttgacgacttccaataaatcataggctagtctataaaatattgagggaaagtgcgcacctagtgtggataaattcttgttaaaatttgaaaacaaataatttatatgattatcaagaaattgcctacacgatcaaaggcccgtgcgctcattttacacattgcacttatctatgtcttgaaagtcaaaatataaacataccccgcctttccgttcgaaactgatgaatgacgtacggtgtaacttctctccgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatAATTCC-CA-ATAAA-T-C----GATAGGC-----C-T-AGTC-TA----TA-A-A-T---A------T-T--G--AT--G-GA--A-GT-------G--GCACCT-AATGTGG-----ATA-AATTCT-A--TAAAATTTGAAA-A-AC-AA-TAAATT--T-ATA-TGAAA-TTA-T-CAA-------GA--A---AT-TG-CC---TA-A-G--ATC-----GAAA--AGG----C------C----CG-----T------C-A-------T---TTTC----AATAT-T-GC--A-C-T-----T-ATC-TAATAGA-T-------GTTTT-TG-AAAG-TC-AA--AA-----TATA--AA-CAT------AC-CCCC-----CCC----------------C--C-CC-CCCCCCTC--------TTC----------------CGT-TCG-AA-C----TG---A----A-TG--A-TGAAGGCCCTA-CTG--TG-T--AAAT-TC-TCTCCGA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----CACCGAAACT-CA---------------CG---GGTT--AGGCCTAA-C-TCGAC----A-T--C-TAG-C-A--TCT-CTT-GCTC-C-G-A----GAC--AAA-GC--GAT-T--CCA---T-C-A-GAAAATTT-AA-AT--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NAT---ATCAAGTGG-----CGATG--T--A-C-AG----------------------T------------------ACT-CCA--TTTCTACTCGC-AACAACAAaggaagagggagaaaaaaa
gi|7 : a-----------------------AT---CA---AGG-T----------GAAATAATTTC-CA-ATAAA-T-T----GTTA--------T-C-A----TA----AA-A---T---A------T-T--G--AT--G-GA--A-GT-------G--GCGC-T-GATCTTA-----ATA-AATTCT-T--CAAAATTTGAAA-A--C-AA-TAAAGT--C-ATA-TG--G-TTG-T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TA-A-T--AAA-----GAAT--AGG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-T-GC--A-C-T-----T-ATC-T-----A-T-------GTTCT-TG-AAAG-TCTCT--AA-----TGT---------------AC-CCC----------------------------C-CC-C------T--------TTC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TG--A-CG-------TA-CGG--TG-T--AAA--TC-TCTCCAA-GTatttaatggagagagagaaaa
gi|7 : gtgacgaaatgtgtattgggactggAC--ACA-AC--GAT-T--CCA---T-C-ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-ACC-C---A--N-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NNN---CTCAA-TAG-----CGATC--T--A-C-AGAATGTATCGTTAACATTC-A--C------------------ACT-CCA--TAAC-ACTCGT-GACAAGAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatcacacaacgattccatcacgaatacagatgtaagaaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcaatagcgatctacagaatgtatcgttaacattcacactccataacactcgtgacaagaacaaatgaa
gi|8 : gtgacgaaatgtgtattgggactggatcaaggtgaaataatttccaataaattgttatcataaaatattgatggaagtggcgctgatcttaataaattcttcaaaatttgaaaacaataaagtcatatggttgtcaagaaattggttaataaagaataggcctgtcattttcaaatactgcacttatctatgttcttgaaagtctctaatgtacccccccctttccgtccgaaactgaatgacgtacggtgtaaatctctccaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctaccaaatgaacccgcgcagcgcagccggggtaatgcttatc-A-TCACC--CACAG-TAT-GT-ATT---CCT---AG-CGC-C-GCGT--GA--C------------GAAA-----------------------TG---CA---GGA-T----------GGCAGAAATTC-CACATAAAGT-C----GATT--------T-T-A----TA----AA-A-A-T---A------T-T--G--AT--G-G---A-GT-------G--AAAC-T-GATGTT------------TTCT-T--C-AAATTTG-AA-A-AC-AA-TAAATT-----TA-TG--A-TTGTT-TAAAC-----GA--A---ATATA-GT------A-G--ATC-----GAAA----G----C------A----TT-----T------C-A-----------TTTC--ACAATAC-T-GC--A-C-T--------GC-T-----A-T-------GT---------AG----------------------A-CA-----------CCT-----ACC----------------A--C-CC-C------A---------TC----------------CGT-CTGAAA-C----TG---A----AGCA--G-CG-------T--CTC--T--T--AAA--TA-TCTCCGA-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--G-CACC--AACT-CACG----CTGC-----CA---GGG---AAGTCTAA-C-TCCAC----A-T--C-TAG-C-AGTCCT-C-T-GCTC-T-G-A----AACA-AAA-AC--GAT-T--CAA---T---ACGAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AA-----C---T--A-------NN------------------N-------------------NN-----NNNNN-NNNN-NN-------NNNNN--NN--NNN----NNNN-NNNNNNN--NNNNNNNN-NN------------NN--NNNNNN----NCC-----CAA-TGGCATGTCAATA--T--A-C-AG-------------------ATCT------------------ATT-CCA--TGAC-ACTCGC-GACAATAAcaaatgaa
gi|9 : GT--GA--C------------GAAATGCTT------------------ATTG-CAACTGGA-TCAG-------GACAGAATTTC-CA-ATAAA-T-C----GATA--------T-T-A----TA----AA-ACA-C---A------T-C--G--AT--G-GA--A-AT-------G--GCAC-A-GATGTTG-----TTA-AATTCT-T--CAAAATTT--------C----------------------------T-CAA-------GA--A---AT-TG-GT---TT-A-T--ATC-----GAAC--AAG----C------C----TG-----T------C-A-------T---TTTC--A-AATAC-T-GT--ATC-TACATGT-ATA-C-----A-T-------GTTCT-TG-AAAG-TCTAA--AA-----CGT---AA-CA------------CA-----CAC----------------G--C-CC------------------TC----------------CGT-CCGAAA-C----TG---A----A-TA--A-CG-------TA-CTG--TG-T--AAA--TA-TCTT-----TGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---AT--G-CACCA-AA-T-GAA-----C--C-----CG---GGG--------TAA-C-TCAAC----A------------A--CCC-C-T-GCTC-----------AC--AAA-A---GAT-T--CCA---T-C-AAAAA----T-AC-AG--A--TG-T---A-----AG-AC-ACC-C---A--A-------GCACATCTAACAATATTAAAA-------------------AG-----CTCCA-CAAT-CT-------TTCAT---G--TCACATTCAGG-AAACATA--CAAATTCT-C----------------------------------TCAA-TGG-----CAATG--T--A-C-Acaaatggagaaaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): GTTTATTTTATCCCCTTTTAACTCGTTGAATATCACATTGATGTTAGATATTCTTTTTCAT
Unaligned ( gi|43 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN