lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 111111 11111111 33333333333 2 222 22222 33333333333333333333333 1 11 1 11 1111111 333 1111111 111 1 11 2222222222222 111 1 888888888888888888888888888888888888888888888888 11 11111111111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0000000000000000 11 11 11 111 11111 111 444444444444444444444444444 2222222222222 666666666666 33333333333333333 11111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 11111 2222 777777777777777777 22222222222 1 11 111111 1 1111 111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 111111111111 1 3333333333333333333333333 111111 2222222 1111 1111 1111111 33333333333333333333333333333 111 222 11111111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 22 11 111
lowQualScore : 2 2 0 000000 6 11111111 777 5 5 4 2 9 5 33333333333 5 5 777 0 5 44444 99999999999999999999999 5 0 0 33 1 4 4 4 11 4444444 555 2222222 4 333 0 2 55 2 3333333333333 999 3 3 777777777777777777777777777777777777777777777777 0 22 3 99999999999999999 3 0 6 3 6 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 0 55 55 4 6 4 4444444444444444 2 00 3 88 9 6 44 00 2 2 999 5 111 3 44444 3 44 000 6 99999 3 7 7 444444444444444444444444444 0 3333333333333 3 7 222222222222 3 3 7 3 55 66666666666666666 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111 5555 66 2 66 888 000000000000000000 33333333333 6 5 33 7777 888888 4 66 777 4 8 777 777 66 1 5 1 0000 555 66 5 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 3 4 777 444444444444 4 4 7 1 4 7777777777777777777777777 5 777777 4 5555555 777 1111 4 5555 55 7777777 4 4 3 88888888888888888888888888888 7 3 66 3 7 000 88 3 444 55 55 3 77777777777 7777 99999 555 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 55 3 2 1 22 3 666 00 3 3 22 3 000 44 7777 5 3 3 3 7
lowQualScore : . . . ...... . ........ ... . . . . . . ........... . . ... . . ..... ....................... . . . .. . . . . .. ....... ... ....... . ... . . .. . ............. ... . . ................................................ . .. . ................. . . . . . ........................................................................................................................... . . . .. .. . . . ................ . .. . .. . . .. .. . . ... . ... . ..... . .. ... . ..... . . . ........................... . ............. . . ............ . . . . .. ................. ..... ..................................................................... .... ..... .... .. . .. ... .................. ........... . . .. .... ...... . .. ... . . ... ... .. . . . .... ... .. . ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . . . ... ............ . . . . . ......................... . ...... . ....... ... .... . .... .. ....... . . . ............................. . . .. . . ... .. . ... .. .. . ........... .... ..... ... ............................................................................................................................. . .. . . . .. . ... .. . . .. . ... .. .... . . . . .
lowQualScore : 7 7 9 999999 2 22222222 888 0 0 1 8 6 0 00000000000 0 0 555 9 1 00000 66666666666666666666666 0 4 0 88 2 0 0 0 44 0000000 000 6666666 0 555 9 3 00 8 6666666666666 222 3 3 999999999999999999999999999999999999999999999999 4 55 3 55555555555555555 1 4 7 3 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 5 5 00 00 0 0 0 9999999999999999 5 55 3 55 5 2 99 88 7 7 333 3 777 3 77777 6 66 999 7 11111 6 3 3 000000000000000000000000000 4 1111111111111 6 3 444444444444 6 6 3 2 11 44444444444444444 11111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2222 11111 0000 99 0 99 888 888888888888888888 88888888888 4 0 99 0000 333333 4 11 888 4 9 888 888 11 4 0 4 6666 666 99 0 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9 3 0 000 000000000000 2 0 5 2 0 2222222222222222222222222 0 666666 4 9999999 666 7777 4 8888 55 0000000 0 0 6 77777777777777777777777777777 6 3 22 6 3 000 66 6 555 00 00 6 33333333333 7777 11111 888 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 00 6 4 0 22 3 444 88 6 6 55 6 000 66 1111 2 3 1 3 5
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGTTCACAATTTCACTGN-------C-TTAGCTACAGTGCACA-TTGCTTTTATAGCGTATTCATTACACTATA---ACTC-AAA--ATGA---CTTG---A--A-AGA-G--CAAACAAT-G-C-ACTTGAAATTA--GGG-CCTATA--TA-A-----A-AAT-TAGGTCCTT--ACTTGGCAT-------------TAAA---CC-GT-AGATATTCA--NT-GT---G-AGGTNTGTG-ATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGTC-TC---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A-GGTG----GGTT--GC------TAAG-AT------A--TTNAAAACA--GGT---G-AACAC-------ATGTAN-C-----GC--C----AAN------T-C-C---TA--------AG-TCGC-CCTGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAA-CA-TCGTAAA-A-AT-T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGCAA-TTGGCTCG-GATGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCACGT---G-TTCA---N-GGTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA--G---CGC---TG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GAA--------ATTAT---CAAA-------------A--TAT--------------ATC-----------AAAAANACT--T-ATG-AC---TAAT----TTA--G-TTACT--NG--GTGAT--GAG---AC--------------T---TTG-----------AGCCAAAACGTAAGAGTT-CT--A-ACAGA---AT-C-T--G---G-G-C---ATCA---G--AAAATGCAA-AACGTCC-TAGTAT---TG--CTAAAA-GATTACG-AAC---CGT----GAAGT-TT--TTAT-G-TAT---TT-TTTTTTTTTTTTTAC---ACAATA-AAGGCCCTGTCATGCGAAT-ATCCTT-GTGC-CAAAGGGC-AAAACAGTC-ACAG-GTAACTT--CT-ATAAAA-------A-----GTT-TT-A-------T-GAA-AA-AC------G--A-----T------ATT---A-------C-----G----TCG-C--C--CTC----A-------A---CGG---GTATN-A--AG-TATCTCCGAATT-------TTT-GC-ACG-ACAATG-----TGCA-CCTG--CACACAA---AGCA-CGCA-T-GTGAC-CGAG---TA------T-----TTCG-AGGCGGAAAAGGT-TACTG-----TC---CTAC---CACCCA-ACCCC-CG-----TT-CTCNC----CAGATTTA-GCTCCGTGCG---AC-TTT--TT--TCTG-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----C-----------N--T-ATCTGGA-AAAAGATACAA-ATCAC-GAAATGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTA-N-ATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT----TG-----AGGAGTA---TGA------A----------AA----------AAGTG--------------------T--------------ATCCA--GGCT-AAGGGT-G-GGTAC---TTTGNAGGGCANGG-A-C-G-AAT---AAAAGGAT--CAAAGAT-TAATAAATGTAAGGGTGA-GTAC---TTTGAAGGGCAGG-G-A-CGAA-T---AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGNCAAGTG-TCATTATTTTTT
Reference ( gi|1 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCACTAT-------C-CTAGCTACAG-GTACA-TTACTTTTATAGCGTATTCATTGCACTATA---ACTCTGAA--GTAA---CTTG---A--A-AAA-G--CATACAAT-G-C-ACTTTAAATTA--AGG-ACTAT---TA-A-----A-AAT-TAGGTCATT--ACTTGGCAT-------------TAAA---CC-GT-AGATATTTA--ATAGC---T-AGGCTTGT--ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGTT-TC---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A-GGTA----G--T--GC------TAAGAAT------A--TTCAAAACA--TGT---G-AATAC-------ATGTAC-C-----AC--C----AAA------T-C-T---TN--------AG-TCAC-CTTGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAA-CA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGACAA-TTGGCTCG-TATGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCACGT---G-TTCA---A-GGTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA--G---GTC---TG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GGA--------ATTGT---CAAA-------------A--TAT--------------ATC-----------AAAAATACT--T-ATG-A----TAAT----TTA--A-TTAC---GG--GTGGT--GAG---AC--------------T---TTG-----------AGCCAAAACATACGAGTT-GT--A-ACAGA---AA-C-T--G---G-G-C---ATCA---G--AAAACGCAA-AACGTCC-TTATGT---TG--CTAAAA-GATTAC--AAC---CGT----AAAGT-TT--TTAT-G-TAT---TT-TTTTTTTTTTTTTAC---ATAGTATGAGGCCCTGTCATGCTAATCATTCTTAGTGCATAAAGTGCGAAAACAGTC-ACAGAGTAATTT--CTAATAAAG-------A-----GTT-CT-A-------T-GCA-AA-AC------G--A-----T------ATT---A-------C-----A----TCG-C--C--CTC----G-------A---CGG---GT-TT-A--AG-TATGTCCGAATTC------TTT-GC-ACGCACAAT------TGCAACCTG-ACACA-AA---AGCATCGCA-T-ATGAC-CGAG---TA------T-----TTTG-ATGCGGAGAAGGT-TACTG-----TT---C-AC---CACCCA-ACCCC-CG-----TT-CTCAC----CAGATTTA-GTTCCGTGCA---AC-TAT--TT--TCTG-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----C-----------A--T-ATCTTGT-AAAAGATGCAA-ATCAC-AAAATGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTA-A-ATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT----TG-----AGGAGTA---TGA------A----------AA----------AAGTG--------------------T--------------ACCCA--GGCT-AAGAGT-G-AGTAC---TTTATAGGACATGG-A-A-G-AAT---AAAAGGAT--CAAAGAT-TAATAAATNTAAGAATGA-GTAC---TTTATAGGGCAGG-G-A-AGAA-T---AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCATTTTTTTTTTGG
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCACTAT-------C-CTAGCTACAGTGTACA-TTACTTTTATAGCGTATTCATTGCACTATA---ACTCTGAAAGGTAAACTCTTG---A--A-AAAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGG-ACTATG--TA-A-----AGAAT-TAGGTCATT--ACTTG-CATG------------TAAAAGCCC-GTTAGATATTCA--ATACT---T-AGGCTGTT--ATA-C------TAT---GGAAT-TGTCAC-AATGTT-TC---------AA-----TA-G-TCTGTT-TGTCA-GGTA----G--T--GC------TAAG------------TTCAAAACA--TGT---ATAACAC-------CT-----C-----AT-------AAA------TGC-TGC-TC---------G-T-AC-CTTG-AACATCGCCTTACAACCGAATAATAA-CA-G-TTGAATA-A-GTACCACCAAATCT-ACA-AAAGACG--AAG-ATA----CCGT-AGACAAATTGGCTCG--ATGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCACGT---GCTTCA---A-GGTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAA-GCT-TA-----GGA-AAGAT-AAACGC--------GT--GC--------G------ATACCT----C---A----TT--GCTGTA--G---GTC---TGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------G-A--------ATTGT---CAAA-------------A--TAT--------------ATC-----------AAAAATACTCTT-ATG-AC---TAAT----CTA--A-TTAC---GG--GTGGT--GAG---AC--------------T---TTG-----------AGC-AAAACATACGAGTTAGT--ACACAGA---AT-C-TTCG---G-G-CTCAAACA---G--AAAA------AACGTCTATTATGT---TG--CTAAAA-GATT-C--AAC---CGT----AAAGT-TT--TTAT-G-TTTCTTTT-TTTTTTTTTTTTTAC---A-AG---AAGGCCCTGTCATGCAAA--ATTCGTTGTGC-CAAAG-GC-AAAACAGTC-ACAG-GTAATTT--CTA-TAAA--------A-----GTT-CTTA-------T-GAA-AAGAA------A--A-----T------GTT-----------C-----G----TCG-C--C--CTC----G-------AA--CGG---GT-TT-A--AG--ATCTC-GAATT--------TT-GC-ACG-ACAAT------TGCA-CCTG-ACACC-AA---A-CA-CGCA-T-ATGAC-CGAG---TA------T-----TTTG-A-GCGGAGAAGGT-TACTG-----TT---C-AC----ACCCA-ACCCCACT-----TT-CTCAC----CAGAT--A-TTTCCGTGCA---AA-TAT--TT---CTG-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----C-----------A--T-ATCTTGT-AAAAGATGCAA-ATCAC-AAAATGTCCTT-GGTCTGGCAAT---TTA--TCA-GTA-A-ATGATG--GG-GT--C-C-----------CTAT----TG-----AGGAGTA---TGA------A----------AATTTCCAG---AAGTG--------------------TTAGCGTCAAAATGAAGCCA--GGCT-AACGAT-G-AGTACCTTTTTATAGG-CATGG-ACA-GAAAT---AAAAGGAT--CAAAGAT-TAA-AAATGT
gi|23 : aCGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACgggtgaaaacagccaagtgttcatttttttttgg
gi|29 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggCGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATta
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|45 : CGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---
gi|33 : aGAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|35 : atGAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGGA
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAAgaa
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|47 : AGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|49 : AGGA-TGTGCCAGAAA-TAATGACACTTGACCGTGT---TCAC
gi|46 : aagattaataaaagtggGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|44 : agGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAgg
gi|43 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|9 : cagGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCACTGA-------C-TTAGCTACAGTGGACA-TTGC-ATCATAACGTATTCATTACACTAT----ACTC-AAA--ATGA---CAGG---A--ACAGA-G--GAAACACT-G-C-ACTTGAAATTA--AGG-CCTATA--TA-C-----A-AGT---G-----T--ACATG-----------------TAAA---AG-GT-AGGTCCTT-------CCCGT-AGGTATGTG-ATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGCC-TC---------ATACATGTA-GGTATGTT-CGT-A-GGTG----GGTT--GCTTTT--TA--AAT------AGGTTACGAACA--CCT---T-AAAAA-------AGCTGCTC-----GC--C----AA-------------------------GG-TCGT-CCTGCAACA--G--TTGCAACggcaca
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAGTGA-------C-TTCGCTACAGAGTACA-TTGCTTT-ATGGCGTATTCATTAAACTATA----CTC-AAA--ATGG---CTGG---A--A-AAA-GATCAAAAAAT-G-C-GCTGGAAATTA--GGG-CCTATA--TATA-----A-AATGTAGGTCCTT--ACTTGGCATCCAGGCTTGGCATTAAAT--CC-GT-AGATATCCA--TTG-------AGGTCAGTG-ATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGTC-TC---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A-GGTG----GGTT--GC------TAA----------A--TTGTAAACA--GGT-------TAC----------TAA-C-----AC--CTC--AAAGAT---T-C-TGC-TCGCCAA---AG-TCAC-CCTACAATA--G--TTACAACC-AATATT---------------------CCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGCAA-TTGGTTCG-GATGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTCGT---G-TTCA---T-GGTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAGCGCTA-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTT-GTT-CA--G---CGA---TG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------AA--------ATTAT---CAAAATTGTATCCATATA--TAT--------------ACC-----------AAAAAGATT-----TG-A----TAAT----TTA--G-ATAC---TG--GTGAT--GAG---ACATGGGTATACTAT-T---TTG-----------AGCCAGAACGTAAGAGAT-CT--A-ACAGA---AT-C-T--G---G-A-C---ATCA---G--AAAATGCAA-AATGTCC-TAGTAT---TG--CTAAAC-GATTACG-AAG---CGT----GAAG--------AA-G-GAT---TTATGTTATATTCTTTG----GCAATA-AAGGCCCTGTTAT
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCACTGG-------CTTTAACTACAGTGTTCA-TTGC-TTCATAGCGTATTCATTACACTACA---
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTA-TATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTA-TTTTATAGTGT--TTATTTCAATACACATACTTCAAA--ATGA---CT-G---A--A-GAATGATCAAATAAT-GGC-ACTTGAA--TG--AAG-CCTAAA--TA-A-----A-AAG-TAGGTCGTCC-ACTTGCTAT-------------TAAAG--CC-GT-AGATATTCA--TTGTG---A-AGGTCTGT--GTA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TATGGTCTGTT-TGT-A-AGT-----G--TTTGT------TGA-------------TTTAAAACA--GAT---T-AAAAT--------TGTGC-CTGCTCGC--C----A-----------------G--------GG-TTGC---TACAACT--G--TTACAACC-AATAATAA-CA-T--CGAA-AAAT-CAC-ATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGCAAATTGGCTCGGCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCA---T-GGTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----G-A-AA-AT--AAC-CTAAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTT-GCT-TA--G---CACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GAA--------ATTAT---TAAA-------------AT-TGT--------------ATCCAATATACA--AAAAAGACT-----TG-A----TAAC----TTA--GTTTACT--CG--GTGAT--GAT---AC--------------C---TTGTATTTATTTTAAGCCAAAAC--------T-GT------------AG-C-T--G---G-GCC---ATCATATG--AAAATGGAC-ACCGTAC-CTAAGTTACTG--CTAAAACGACTACG-AAC---CGTC---AAGGT-TT--TTAT-A-TGC---TC-TTTTCTTT------G---ACAATA-AAGGTCCTGCTATGC-AA--ATTCCT-GTGC-CAAAGGGC--AAACAG---AAAAGGTAATTT--CT-ATAGAATGTTGTTA-----ATT-TT-A-------A-AAA-AA-AT------G--AAGAAGT------GCC---A-------CGAAAAA----TCG-TCGC--CTTAA--A-------A---CGG---GG-TT-ATCAG--------GAATTCTTTAATTTT-ACAACG-ACAA-------TGC-GCCCG--CACA-CAT--AGC--CCCA-T-GTGAC-CGAG---TA------T-----TACG-AGGC-GAAAAGGT-TACTG-----TC---CTACATGTACTAA-ACACT-CA-----TT-CTCTC----CAGATTTA-GCACCGTGCG---ACTTCT--TT--TC----------TCCC-AAA-ATTT-AAAATCCA----A-----------C--T-ACCTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA--GAAAT--------------CAAT---TTA--TTA-GTATA-ATGGTG--GATATACC-T-----------CTTT----TG-----AGGAGTA---TGA------AAAATGTTTCCAA----------AAGTG--------------------G--------------ATTTATCGTCT-AAAGAC-G-TGTAC---CTCTCAGGGCAAGACA-A-G-TATTTGAAAACGAT--CAAAGAT-TAATAAGTcccaaaatga
gi|11 : CAG-GCACA-TTG--TTTATAGCGTATGCATTATACTAT----ACTC-AAA--ATGA----TTGGACA--A-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAG-TCTATA--TA-ACTTCTA-AGT-T--TTTTTT--ACTTTGCAT-------------TAAAC--CC-GT-AAATACTC---ATTGT---G-AAGAATGTG-ATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGCC-TC---------A------TA-GGTATGTT-TAT-A-TATAAATTA--T--GTAAGGTATAAGGATTGCTAAA--TTTAAAGCA--GGTTACG-AACACCTCAAAGATGTAA-A-----ACTGC----TAC------T-CGC---TA--------AGAACGT-CTTGCAAAA--G--TTACAGAA-AAAAATAAGAA-T-GTAAA---AT-T-CCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GATGAC-A-AA-C---TTGTC-gggtgaacacggtcaagtgtcattattctggcacatccttcgtctataga
gi|14 : G-GCACA-TTA---TTATAGCGTATGCATTATACTATA----CTC-AAA--ATGA----TTG---ACAA-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA----G-AGTCT---TA-T-----A-ATTCTAAGTTTTTTTACTTTGCAT-------------AAAA---CCCGT-AAATACTCA--TT-GT---G-AAGAATGTG-ATA-TCTATG-TATA-GAAAATGC-TCATAGATGTT-T----------A------TA-TATAAATTATGT-AAGGTA------------------TAAGGATTGCTAAA--TTAAAAGCGGTTAC---G-AACACCTCAAAGATGTAA-A-----ACTGC----TAC------T-CGC---TA--------AG--AACGCTTGCAAAA--G--TTACAAAA-AA-AATAA-TAAT-GTAAA---AT-T-CCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GATGACAA-AA-C---TTGTC-ATa
gi|13 : G-GCACA-TTA---TTATAGCGTATGCATTATACTATA----CTC-AAA--ATGA----TTG---ACAA-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA----G-AGTCT---TA-T-----A-ATTCTAAGTTTTTTTACTTTGCAT-------------AAAA---CCCGT-AAATACTCA--TT-GT---G-AAGAATGTG-ATA-TCTATTGTATA-GAAAATGC-TCATAGATGTT-T----------A------TA-TATAAATTATGT-AAGGTA------------------TAAGGATTGCTAAA--TTAAAAGCGGTTAC---G-AACACCTCAAAGATGTAA-A-----ACTGC----TAC------T-CGC---TA--------AG--AACGCTTGCAAAA--G--TTACAAAA-AA-AATAA-TAAT-GTAAA---AT-T-CCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GATGAC-ATAA-C---TTGTC-AT
gi|15 : TTA---G--A-AGA-G--TGAACAAT-G-C-ACTTGCAATTT--GGG-CCTATA--TA-A-----A-AAG-TTGGTCCTT--ACTTGACAT-------------TAAG---CCCGT-AGATATTCATCATG-------AGGTATGTG-ATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATATT-TTGTGTATATAA------TA-GGTCTGTT-TGT-A-GGTG----GGTT--GC------TAA----------A--TTTAAAACA--GGT---T-ATTATG------ATGTAC-------GC--C----AAG-------------------------G-TCACACATG-AACA--C--TTAAAACC-AATGATAA-CA-TCGTAAA-A-AT---CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGCGA-TTGTCTCG-GATGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCACGT---G-TTCA---
gi|50 : tattatagagctctttaaggatgactgTACAAT-G-C-A-TATAAATTT--AGGTCCTATA--TA-A-----A-AGA-TAGGTCCTT--ACCTGGCAT-------------ttct
gi|31 : gACAAT-G-C-TCTTGAAATTA--GGG-CCTATATATA-A-----A-AAG-TAGGTTCTT--ACTTGGCAT-------------TAAAC--CC-CT-AAATATTC---ATTGT---T-AGGTCTGTG-ATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGTC-TC---------G------TA-GGTCTG
gi|7 : aaGGCAT-------------TAAA---CCCGT-AGATATTC---AT--C---TGAGGTCTGCG-ATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGTC-TC---------A------TA-
gi|40 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngAAC---CC-GT-AGACATTCA---TCGT---G-AGGTATGTG-ATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGTC-TC---------A------TA-GGTATGTA-GGC-A-GGT--------T--GC------TA--AAT---------TTCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|12 : ---CC-GT-AGATATTCA---TCGT---G-AGATCCGTGAATG-A------TATC------TATGTCT--TATACT------------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A-TGTG----GGTT--GC------TAA----------A--TTTGAAACA--GGT-------TAC-------G---AT-C-----AC--CTCAAAGA------T-G-T---TGCTCGCCAAGG-TCAC-CCTGTAACA--A--TTACAACC-AATAATAA-CA-TCGTAAA--CAT---CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAG--------GCTCA-GATGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACACAT---G-TTCA---T-GGTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-GAATGGTACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TAT-GCT-TA-------TCGA-TA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GAA--------ATTAT---TAAA-------------AT-TGT--------------ATC-----------caggctacgaac
gi|21 : aacac---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A-GGTG----GGTT--GC------TAAGca
gi|38 : T-TGT-A-GGTG----GGTT--GC------TAA----------A--TTTAAAACA--------G-AGTGC-------AAACAC-C------T--C----AAAGATATTT-C-TCGCTA--------AGGTCGC-CCTGCAAAA--G--TTACAACC-AATAATAA-CA-TCGTAAAtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|4 : -TCGC-CCTGCAACA--G--TTCCAACC-AAAATTAA-CA-TCGTAAA-A-AT---CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGCAA-TTAGCTCG-GATGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCACGT---G-TCCA---A-GGTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAG-A-AAGAT-AAACACTA-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTT-GCT-TA--G---CGA---TG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------GAATTATTAAAATTGTATCCAGA-------------A--TAT--------------ACC-----------AAAGA--CT--T---G-A----TAAT----TTT--G-TTAC---TG--GTGAT--GAG---ACCTAGGTATACTTATT---TTG-----------AGCCAAAACGTA-AAGTG-CT--A-ACAGACAGAATC-T--G---A-G-C---ATCA---G--AAAATGCAA-AACGTCC-TAGTAT---TA--CTAGAA-GATTATG-AAC---TGT----GAAGGGTT--TTAT-GCTAT---TT-CT-------TGGGAA---ATAG---AAGGCCC-ATCATAGCAAG-ATTAGTGATGCA-GAAGC-CGTAATAGGTCGACAGA-TGACTT--TGTATAATG--------------TT-TT-AAAAA---T-GAA-AG-AG------G--A-----TGATAAAATT-----------C-----A----TGG-A--C--ATA----A-------A---CGG---GT-AA-A--AGGTA-ATCTAGACAA------TTG-GA-ACGAGCAATGTGCCGTGCA---CG-ACATG-GA---GGCA-AGGA-T-GTGGT-GGAGAGCTG------T-----TTTG-GGGTGGTAAAGGTGTA-TGAGAGTCT---T-AA---AACCCC-GCCAC-CGCCATTTT-CTCAC-----AGATT-A-G---AATGCATGTGC-TATGCTTAATCTG-------TACGCACAA-ATGTGAAATTGCA----C-----------G--CCAGATTG---GAAGAT--AA-ATCAC-GAAATGCGCTTGGGTCTTGGAAT---TTAGATCA-GTA-T-AGGGTGATGGTGT--C-CTATTGGGAGGTCTATGAAATGTTTCCAGAAATGGATTGATCGTCTA----------AA----------CAGCG--------------------T--------------ATCCA--GACA-AAGGGC-G-AGTAC---TTTGAAGTGTAGGG-A-C-A-AAT---AAAAGGAT--CTCAGAT-TGATAAACGTa
gi|5 : ATCATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGCAA-TTGGCTTG-CATAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCACAA---G-TTCA---T-TGTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----G-A-ATGAT-GAACGCTA-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA--A---CGA---TG-AAGAA-A---AGAATCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGAA--------ATTTT---TAAA-------------ATTTAT--------------ATCTAAAACATACAAAAAAAACT--T-TTA-T----TAAT----TTA--G-TTAT---TG--GTGAT--GAG---ACTAT-----------T---TTG-----------AGCCAAAACGTAAGACTT-CT--A-ACAGA---AC-C-T--G---G-G-C---ATCA---G--AAAATGCAA-AACTTCC-AAGTAT---TG--CTAAAT-GGTTACG-AAT---CGT----GAATG-TT--TTATAG-AA-------TGTGATTTTCTTTA----ACAATA-AAGGTCCTGTCATGCGAAT-A-CCT--GTAC-CAAAGGGC-AAAACTTCT-ACAAA--AATTTTGTTATTAAAA-------A-----ACT---------------CA-AG-A-------A--A-----T------ATTTCCAAAGT---C-----G----TCG-C--C--C-CAA--A-------A---CGG---GCATA-A--AG-TATCTCCGA----------TTTAGC-ATG-ACAA-------TGC-GTCTG--CACATAA---TGCG-CGCATT-GTGAC-CGAG---TA------CCGGTATTTGTAGACTGAAAAGGT-TACTG-----TC---CTAC---CACACA---CCC-CG-----AT-TTCTC----CAGATTTA-CTTCCGTGCG---AC-TTC--TT--TCTGTTCGATATTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----C-----------T--T-ATCTGGA-AAAAGATACAA-ATCAC-AAAATATCCCCTGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTA-ATATGATG--TGTGT--C-C-----------CTAT----TG-----AGAAGT------A------A----------AT----------AAATG--------------------T--------------TTCCA--G----AAG------------------TAG---ATTG-ATC-G-TCT---AAAA------CAAAGATGTATCCAGGCCAAGGGTGT-GTAC---TTTGAAGGACAGG-G-A-CGAA-T---AAAAGGATCA--AAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCATTATTTTgggtgaaaacaggcaagtgtcattattttggaa
gi|17 : aaATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGCAA-TTGGCTCG-TGAGATAA-AA-CCAATTGTCAGTT--TACGCAAAG-TTTT---A-TGTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----G-ATAAGATAAAACGCTA-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGT-TCT-TACTG---G-CAA-TG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAA------TG----------TT-T---CAAA-------------AGGTAT--------------AT-----------------TTCT--T-AGG-ACTTTTAATTATATTA--A-ATACTATGG--GTGAT--GAG---AC--------------ggaacat
gi|16 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGCAA-TTGGCTCG-TGAGATAA-AA-CCAATTGTCAGTT--TACGCAAAG-TTTT---A-TGTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----G-ATAAGATAAAACGCTA-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGT-TCT-TACTG---G-CAA-TG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAA------TG----------TT-T---CAAA-------------AGGTAT--------------AT-----------------TTCT--T-AGG-ACTTTTAATTATATTA--A-ATACTATGG--GTGAT--GAG---AC--------------atgttgtccagtttaattattgtgggcaaaacgttaagaagttttctacacataattatcggtgctgggcgttccgagaagaaatgcaa
gi|7 : A--CCTTGAGGCAA-TTGGCTCG-GATGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCACGT---G-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----G-A-AAGAT-ACATG-TA-----A-----------------------ACCT----C---A----TTT-GCT-TA--G---CGA---TG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GAA--------ATTAT---TAAA-------------A--Tatgttgtccagtttaattattgtgggcaaaacgttaagaagttttctacacataattatcggtgctgggcgttccgagaagaaatgcaa
gi|48 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncATGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCACGT---G-TTCG---T-GGTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-Ttgta
gi|21 : -A-AA-C---TTTTC-TTTAGCACGT---G-TCTA---T-GGTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----G-A-AAAAT-AAACGTCA-----GGG--G---------G------ATAC---------------TTG-GC------G---A-----TG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGT
gi|18 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----G-A-AAGAT-AAA-GCTTCT---GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---A----TTTTGCTCTA--GCAAG------G-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTGAAA--TGCAAA------G-A--------ATTAA---TAAA-------------A--TATGCTATCCAAACAATATC-----------AAAAAGACT--TGAAGTA----TAAT----CTAGTA-TTTC---GGTGATGGTCTGGGTATAC--------------TATATTG-----------A-CCAAAACATAAAAGTT-CT--A-ACAGG---AA-TAT--A---GCGCC---ATCA---A--AAGAGCCAA-AACGCTC-CTATGTAG-TG--CTAAAA-GATTACG-AAC---CGTGAAGAAAGT-TTTATCAT-A-TA--------------------ACCTGATAATA-AAGTCCCTGTCATGCAAAT
gi|26 : tatTG-----------AGCCAAAATGTAAGAGTT-CT--A-ACTGA---CT-C-T--G---A-G-C---ATCA---G--AAAATGCGA-AACATCC-TAGTAT---TG--CTAGAA----TAC--AAA---C-T-------GT-TG--CTA-----------------TTTTCTTTGAC-----AATA-AAGGTCCTGTCATGCAAA--GTCCT--GTTC-CAACGGAC-AAAACAGTC-AAAG-GTAACT------ATAAAtc
gi|52 : accaTG-----------AGCCAAAATGTAAGAGTT-CT--A-ACTGA---CT-C-T--G---A-G-C---ATCA---G--AAAAa
gi|24 : AAAACGTAAGAGTT-TTCTA-ACAGT---AT-A-T--GTGAG-G-C---ATCA---GGAAAAATGCAGTAAC-TTC-TAGAAT---TGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGC----TAAG--------AA-A-CAT---TG-TTATTTTTCTTTTAA---ACAATA-AAGGCCCTTTCATGTAAAT--TCCTT--TGCACAGAt
gi|27 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaTTTTTTTTTTAC-----AGTA-AAGGCCCCGACGTGCGAAT--TCCT--GTGC-CAAAGGGCT-AAACAATC-ACAG-GTAACTT--TT-ATAAAA-------AATGTTGTT-AT-AAAAAAACT-GAAGAA-AT------GAAA-----T------ATT---A-------CG----A----GAG-C--C--GTC----GTCCCAAAA---CGG---GTATG-A--AG-TATCTCCGAttacttctgtaattaaatgttattattaa
gi|8 : CTGTCATGC-AA--ATTCCT-GTGC-CAAAGGGC-ATAACAGTC-ACGG-GTAACTT--CTA-TAAAA-------AT----GTT-TTTA-------TTAAA-AA-ACTGAAGAA--A-----T------TTT---A-------C-----GAAAGTCG-T--CGCCTC----A-------AAAATAG---GTATG-A--AG-TATCTCCGACTT--------TT-GC-ACA-ACAATG-----CGCA---TG--CGCACAA---AGCA-CGTA-TTGTGAC-CGAG---TA------T-----CACG-AGGCGGGAAAGGT-TACTG-----Tc
gi|39 : AAAACAGTC-ACAG-GTAACTT--CT-ATAAAA-------AC----GTTGCT-A-------T-TAA-AAGACTAA---A--A-----T------ATT---ATGAAAGTC-----G----TCGTC--C--CAA----A-------A---CGG---GTATG-A--AG-TATATTTGACTTcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|20 : gc--A-----T------ATT---A-------C-----GAAAGTCG-T--C--TCCCAAAA-------A---CGGCCCGT-TTGA--AG-TATCTCC-AACT-------TTT-GC-ACA-ACAATG-----TGC---CTG--CACACAA---AGCA-CGCA-TTATGAC-CGAG---TA------T-----TTGG-AGGCGGAAAAGGT-TACTG-----TCTTAC-AC---CCCCCC--CCCC-CA-----CC-CTCTTTTTTCATAATTA-GCTTTGTACG---AC-TTC--TT--TCTGG------TTCCC-CAA-ACTT-TAATTCCA----CCTACATGTACTG--T-ATCTGGA-AAAAGATACAA-ATCAC-AGAATACCCTTGGGTCT-GCAATTTATTA--TCA-GTA-T-TTGATA--GTTGT--C-C-----------CTAT----TG-----AGGAGTA---TGA------A----------AA----------ATGT
gi|10 : gaaagaa----TCG-C--C--CAA----A-------A---CGG---GTATC-A--AG-TATCTCCGGCTT--------TT-GC-ACG-ACAGTA-----TGC---TTG--TACATAA---AGCA-CGCA-TTGTGAC-CGAG---TACTAATAT-----TTGG-AGATGGAAAAGCT-CCCTG-----T------GC---TAC--A-TCCCC-CG-----TTTCTCA------AGATTTA-GCTTCAAGGT---AC-TTT--TT--TCTG-------ATCC-----------AAATTTCA----C-----------C--G-ATCTGG--AAAAGATACGA-ATCAA-TAAGTGCCCTTCGGTCT-GTACT------------------ATGATG--GGAGT--G-C-----------CTAA----TA-----GGAAGTA---TAA------G----------AACTGACTCCAGAAGTGGACTGATCTTCTAAAAAGTTT--------------ATCCA--GGCTCAAGA-T-G-GGTAC---TATGAAAGGCGGGG-A-T-A-AAT---AAAAAGAG--TAAA-AT-TAATAAATGT--GGATGA-tt
gi|51 : aaagtggCCTG--CACACAA---AGCA-AGCACT-ATGAA-CGAC---AA------T-----TTCG-AGGTGGAGAAGGT-Taaacgaataagtgtaattttcttt
gi|42 : gCCTGCACACA-AAGCAAGCAT-----T-ATGAAGCGAC---AA------T-----TACG-AGGTGGAGAAGGT-T
gi|19 : cgC-CGTG---TA------T-----TTGG-AGGTGAAAAAGGT-TGCTG-----TT---CTAC---CACCCCCACCCC-C------TT-TTCTC----CAGATTTAGGCTCC-TGCG---AC-T-T--TT--TCCG-------TTCCC-CAA-AA---AAATTTCA----A-----------C--G-ATC---T-AAAAAAAACAA---CAC-GACATGCGCTTGGGTCT-GCCATA--GTA--TCA-GTATG-ATGATA--GGTAT--CAG-----------CAAT----TG-----AGAGACA---TGA------C----------AA----------ATGTttatgaactattctgcaacacgccctgttt
gi|41 : CCCC-CC-----TT-CTG------CAAATTTA-TCACCGTACG---AT-TTC--TT--TCAT-------TTCCC-CAATACTT-AAATTCCAAGTAC-----------AAGT-ATCTGGA-AAAAGATACAA-ATCAT-GAAATttcagaaatggattgatcatctgaaaactgtataccagggctaagcgtgaagtactttgaggacagatgaaatataaagattcaaaattatgtgagtaaatacagccaagtatcatttgttttggaaaa
gi|22 : -----TT-CTCG------AGATTTA-GTTCTGTGCG---AC-TCC--CC--TCTG-------TTCCC-AAA-TCTT-AAATTCCA----T-----------C--T-ATCTGGGGAAAAGATACAA-ATCAC-GAAATGCCGTTTGGCCT-GTAAT---GTA--TCT-GTA-T-ATGATT--AGTTT--C-C-----------CTGT----TG-----AGGAGTA---TGA------C----------AA----------A--TG--------------------T--------------TTCCA--G------AAGT-G-G----------ATTG---ATCG-A-C-G-AAA---AAGTGCAT--CCAGG-----------CCGAGGGTGA-GTAC---TTTGAAGGGCGGG-G-A-CGAA-T---AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCATTATTTT
gi|23 : T--TT--TCTG-------TTCCC-AAA-ACTT-ATAGGCCC----C-----------A----ACTGTG--AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC--GCAAT---TTAA-TCGTATA-T-ATGATG--GGTAT--C-C-----------CTAT----TG-----AGGAGTA---TG------------------GA----------AAGTG--------------------T--------------TTCCA-----T---GAGT-G-GG------TTGAT----CGTCT-A-A---------AAAAGTGT-------AT---ACAGACAAAAG-GTGA-GTAC---TTTAAAGGGCAGG-G-A-CCAA-T---AAAAGGATCA--CAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCATTATTTTT
gi|28 : tTT-AAATTCCA----C-----------C--T-ATCTTG--AAAAAATACAA-ATCAT-GAAATGCCCATGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTACATATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT----TG-----AGTAGCA---TGA------A----------AA----------A--TG--------------------T--------------TCCCA--Gggaacatccctcgta
gi|25 : CAA-ATCAC-TAAATATCTTAGGGTCT-ACACT---TCA--TTA-GTA-T-ATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT----TG-----AGGGGTA---TGA------A----------AAATGTTTCCAGAAGTGGATTGATCGTCTAAAGTG--T--------------ATCCC--GGAC-AAGAGT-G-AGTAT---TTTGAAGGGCAGAT-A-T-G-AA----AAAATGATCACAAAGAT-TAATACATGTaagtggatcgattgtctaaaaagtgtatcc
gi|19 : a---TGA------A----------AA----------CTGTA--------------------T--------------ACCAG--GGCT-AAGCGT-GAAGTAC---TTTG-AGGACA--G-A-T-GAAAT---ATAAAGAT--TCAAAAT-TAggttgaaaacatgcaagtgtcatttttggg
gi|8 : ccgtgtatttggaggtgaaaaaggttgctgttctaccacccccacccccttttctccagatttaggctcctgcgactttttccgttccccaaaaaaatttcaacgatctaaaaaaaacaacacgacatgcgcttgggtctgccatagtatcagtatgatgataggtatcagcaattgagagacatgacaaatgtttcagaaatggattgatcatcA------A----------AA----------AAGTG--------------------T--------------ATACA--GGCA-AAGGGT-A-GGTAC---TTTGAAGGGCAGGG-A-C-C-AATA--AAAAGGAT--CACAGAT-tgtgagtaaatacagccaagtatcatttgttttggaaaa
gi|32 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtct----------AA----------ACATG--------------------T--------------ATCCA--GGCC-AATAGTTA-AGTAC---TTTCAAGGACA-GG-A-ACG-AAT---AAAAGGAT--CAGAGAT-TAATTAATgtgggtgaaaaca
gi|3 : tcccgaaagtgggctgatcgtctTCTAAAGACGT-GTAC---CTCTCAGGGCAAG-ACA-AGTA-TTTGAAAACGATCA--AAG----ATTAATAA---GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCATTATTCTaaatatgggcgaaaacagccaagtg
gi|2 : catgggcaaaattttatatggattgacttagtatagtgtgcaattattttatagtgtttatttcaatacacatacttcaaaatgactgaagaatgatcaaataatggcacttgaatgaagcctaaataaaaagtaggtcgtccacttgctattaaagccgtagatattcattgtgaaggtctgtgtatttattgaatggtacatgttcttatatggtctgtttgtaagtgtttgttgatttaaaacagattaaaattgtgcctgctcgccagggttgctacaactgttacaaccaataataacatcgaaaaatcacatcaaatattacagaaagacgcaagcgtataccatgccgcaaattggctcggcctgacaaacttgtcgttatcacgttcatggtatttttgaaaaaaaattccaaagcttggaaaataacctaaaagggtggaaaaaaataactttcccaaatttttgcttagcacacatgaacaagatgaatgttaaaaactgaacggaaattattaaaattgtatccaatatacaaaaaagacttgataacttagtttactcggtgatgataccttgtatttattttaagccaaaactgtagctgggccatcatatgaaaatggacaccgtacctaagttactgctaaaacgactacgaaccgtcaaggtttttatatgctcttttctttgacaataaaggtcctgctatgcaaattcctgtgccaaagggcaaacagaaaaggtaatttctatagaatgttgttaattttaaaaaaaatgaagaagtgccacgaaaaatcgtcgccttaaaacggggttatcaggaattctttaattttacaacgacaatgcgcccgcacacatagccccatgtgaccgagtattacgaggcgaaaaggttactgtcctacatgtactaaacactcattctctccagatttagcaccgtgcgacttcttttctcccaaaatttaaaatccaactacctggaaaaagaaagacatcagaaatcaatttattagtataatggtggatatacctcttttgaggagtatgaaaaatgtttccaaaagtggatttatcgTAACGATGA-GTACCTTTTTATAGG-CATG-G-ACAGAAAT---AAAAGGATCA--AAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCATTTTTTTTTggcacatccttcgtctataga
gi|19 : acgaggatttcaaaaataatgtcatttcaccttcttcgcgttaatcgttgaaatatcttactgaaccacattgacactgttaagaatcactgaaccgtagtggaaggaaatttcatgatcacaatttcactatcctagctacagtgtacattacttttatagcgtattcattgcactataactctgaaaggtaaactcttgaaaaaagcatacaattgcgactttaaattatagggactatgtaaagaattaggtcattacttgcatgtaaaagcccgttagatattcaatacttaggctgttatactatggaattgtcacaatgtttcaatagtctgtttgtcaggtagtgctaagttcaaaacatgtataacacctcataaatgctgctcgtaccttgaacatcgccttacaaccgaataataacagttgaataagtaccaccaaatctacaaaagacgaagataccgtagacaaattggctcgatgataaactttcttagcacgtgcttcaaggtattttgaaaaaaaatctaagcttaggaaagataaacgcgtgcgatacctcattgctgtaggtctgcaacaagaagagagtccggtttgaaaatgcaaagaattgtcaaaatatatcaaaaatactcttatgactaatctaattacgggtggtgagactttgagcaaaacatacgagttagtacacagaatcttcgggctcaaacagaaaaaacgtctattatgttgctaaaagattcaaccgtaaagtttttatgtttctttttttttttttttttacaagaaggccctgtcatgcaaaattcgttgtgccaaaggcaaaacagtcacaggtaatttctataaaagttcttatgaaaagaaaatgttcgtcgccctcgaacgggtttaagatctcgaattttgcacgacaattgcacctgacaccaaacacgcatatgaccgagtattttgagcggagaaggttactgttcacacccaaccccactttctcaccagatatttccgtgcaaatatttctgttccccaaacttaaattccacatatcttgtaaaagatgcaaatcacaaaatgtccttggtctggcaatttatcagtaaatgatggggtccctattgaggagtatgaaaatttccagaagtgttagcgtcaaaatgaagccaggcTAAGCGTGAAGTAC---TTTG-AGGACAGATG-A-AATA-T---AAA--GATTC--AAA----ATTA-----T-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTgg
gi|4 : ccgtgtatttggaggtgaaaaaggttgctgttctaccacccccacccccttttctccagatttaggctcctgcgactttttccgttccccaaaaaaatttcaacgatctaaaaaaaacaacacgacatgcgcttgggtctgccatagtatcagtatgatgataggtatcagcaattgagagacatgacaaatgtttcagaaatggattgatcatctgaaaactgtataccagggcAAGGGCGA-GTAC---TTTGAAGTGTAGG-G-A-CAAA-T---AAAAGGATCT--CAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCATTATTTTggaaaa
gi|10 : tcgccctgcaacagttccaaccaaaattaacatcgtaaaaatccaccaaatcttacagaaagacgtaaaattgtgaggcaattagctcggatgacaaacttgtcgtaagcacgtgtccaaggtactttgaaaaaaaatcaaaagcttacggtagaaagataaacactagatggatacctcctttgcttagcgatgaacaaaagagagtccgcgttgaaaatgcaaagaattattaaaattgtatccagaatataccaaagacttgataattttgttactggtgatgagacctaggtatacttattttgagccaaaacgtaaagtgctaacagacagaatctgagcatcagaaaatgcaaaacgtcctagtattactagaagattatgaactgtgaagggttttatgctatttcttgggaaatagaaggcccatcatagcaagattagtgatgcagaagccgtaataggtcgacagatgactttgtataatgttttaaaaatgaaagaggatgataaaattcatggacataaacgggtaaaaggtaatctagacaattggaacgagcaatgtgccgtgcacgacatggaggcaaggatgtggtggagagctgttttggggtggtaaaggtgtatgagagtcttaaaaccccgccaccgccattttctcacagattagaatgcatgtgctatgcttaatctgtacgcacaaatgtgaaattgcacgccagattggaagataaatcacgaaatgcgcttgggtcttggaatttagatcagtatagggtgatggtgtcctattgggaggtctatgaaatgtttccagaaatggattgatcgtctaaacagcgtatccagacaAAGA-TGG-GTAC---TATGAAAGGCGGG-G-A-TAAA-T---AAAAAGAGTA--AA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAATTTTCTTTggaa
gi|25 : aaagtggtcgcccaaaacgggtatcaagtatctccggcttttgcacgacagtatgcttgtacataaagcacgcattgtgaccgagtactaatatttggagatggaaaagctccctgtgctacatcccccgtttctcaagatttagcttcaaggtacttttttctgatccaaatttcaccgatctggaaaagatacgaatcaataagtgcccttcggtctgtactatgatgggagtgcctaataggaagtataagaactgactccagaagtggactgatcttctaaaaagtttatccaggctcAAGAGTGA-GTAT---TTTGAAGGGCAGA-T-A-TGAA-----AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCATTTTT
gi|8 : acaaatcactaaatatcttagggtctacacttcattagtatatgatgggtgtccctattgaggggtatgaaaaatgtttccagaagtggattgatcgtctaaagtgtatcccggacAAGGGTAG-GTAC---TTTGAAGGGCAGG-G-A-CCAA-TA--AAAAGGATCA--CAG------------AT-GTGGGTGAAAACAggg
gi|32 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaTAA-GTAC---TTTCAAGGACAGG-A-A-CGAA-T---AAAAGGATCA--GAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-
gi|49 : tcccgaaagtgggctgatcgtctaaacatgtatccaggccaatagt--AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCATTATTTCT
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCATTATTTTggcacatcct
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): TGTCGGGCAAATCCGTATGCTAAATAGCACCTTCTATGAAAATGTTATTTAAGAACTTAAGAAATATTATCAATCAAATCCGTCGCAAAACAACGGGTTTGAAGTATCTCTGA
Unaligned ( gi|36 ): TGTCGGGCAAATCCGTATGCTAAATAGCACCTTCTATGAAAATGTTATTTAAGAACTTAAGAAATATTATCAATCAAAGTCGTCGCAAAAAACGGGTTTGAAGTATCTCTGA
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 22222222222222 22222222 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 5555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 1 111 333333333333333333333333333 2222222222222 111 1111 22222222222222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 11111111111111111111111111111111111111111 111 1 22222222222222 111 555555555555555555555555555555555555555 2222222222 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 11 11 2 2222222222222 111111 1111 111111 1111111 222222222222222222222222 11111111111 222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111 1111 11 2222222222222222222222222 222222222222222
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 3 999999 1 6 8 1 99 66 4 77 222 00000000000000 4 4 66 3 3 3 0 55 66666666 3 3 8 1 3 3 1 8888888888888 3 777 9 3 3 4 3 3 44 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 3 7777 1 3 555 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44 55 44 44 3 4 666 7777777 1 88 3 77 2222 5 2 0 2 888 5 000 3 888888 3 3 44 6 0 6 88888 3 6 6 44 111111111111111111111111111 2222222222222 6 111 4444 3 3 6 2 3 55555555555555555555555 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888 4 3333 66666666 00000000000000000000000000000000000000000 3 6 111 44 3 0 3 44444444444444 44 555 3 6 555 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 888 4 000000000000000000000000000000000000000 0 8 3 7 6666666666 4 44 1 66 44 4 4 3 44 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555 44 5 1 6 5555555 4 3 5 5 5 44 33 4 4 777 4 0 4 4 1111111111111 3 3 000000 777 0 7777 2 999 4 4 9999 666666 4 4 99999 55 5555555 3 3 3 222222222222222222222222 55 3 3 2 6 999 77 3 99999 44 44 3 55555555555 000000000 88888 555 99999999999999999999999999999999999999999999999 44 8888888888888888 33 5555 11 3 555555555 7777777777777777777777777 1 555 44 1 777777777777777 2 44 99 55 7777 4 3 2 1 3 3 6
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . . .. .. . .. ... .............. . . .. . . . . .. ........ . . . . . . . ............. . ... . . . . . . .. .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . . ... ....................................................................... .. .. .. .. . . ... ....... . .. . .. .... . . . . ... . ... . ...... . . .. . . . ..... . . . .. ........................... ............. . ... .... . . . . . ....................... . ........................................................... .... . .... ........ ......................................... . . ... .. . . . .............. .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ... . ....................................... . . . . .......... . .. . .. .. . . . .. .................................................................................................................. ... .. . . . ....... . . . . . .. .. . . ... . . . . ............. . . ...... ... . .... . ... . . .... ...... . . ..... .. ....... . . . ........................ .. . . . . ... .. . ..... .. .. . ........... ......... ..... ... ............................................... .. ................ .. .... .. . ......... ......................... . ... .. . ............... . .. .. .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 7 222222 0 7 7 7 33 11 4 33 222 44444444444444 4 4 11 6 6 6 3 00 44444444 6 6 9 4 5 6 8 3333333333333 3 777 2 1 1 0 1 1 66 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 3 8888 0 1 444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66 77 66 66 6 6 555 1111111 4 99 1 99 9999 7 7 0 5 888 0 888 1 555555 3 1 22 2 8 2 33333 3 7 7 66 777777777777777777777777777 9999999999999 7 777 6666 3 3 7 1 6 11111111111111111111111 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9999 4 8888 11111111 55555555555555555555555555555555555555555 3 7 777 66 3 0 3 77777777777777 66 888 3 7 888 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 000 4 888888888888888888888888888888888888888 7 0 6 1 0000000000 4 66 6 44 77 0 0 3 66 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888 66 7 0 7 8888888 4 4 0 0 0 00 66 0 0 000 0 0 0 0 8888888888888 5 6 555555 000 8 9999 9 888 0 0 6666 555555 0 0 00000 00 5555555 6 6 3 333333333333333333333333 22 1 1 5 7 222 99 3 77777 66 66 3 88888888888 444444444 33333 888 33333333333333333333333333333333333333333333333 66 2222222222222222 99 6666 77 3 999999999 0000000000000000000000000 0 888 66 2 666666666666666 5 66 55 00 7777 3 6 0 0 3 6 0
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--GA--A-AGA-G--CAAACAAT-G-C-ACTTGAAATTA--GGGCCTATATA--A-----A-AGT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-T-AGATATTCATC-G-TG-AGGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATG-TCTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAG-G---TTACG--AACAC-------ATGT--A----------NCGC--C----AANTCG--CT--------A-AG-T-CG--CCC-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-G-ATGAC-A-AAC---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTG-AAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCGA---TG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAAA--T-------------ATATC-----------AA------AAANACT--T-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC-TG-----------T---TTG-----------A--------GCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--C-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG--AA-G-----TTTTAT-G-TAT-TT-TTTTTTTTTTTTTAN---ACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACAG-TC-ACAG-GTAACTTCTA-TAA--AA-------AT-G-T--T--TTA----TGAA---AA-A----------C------GA-----T------ATT---A--A--------C----G-------TCG-C--CCN-N----AACGG---G--TATGAAGTA-TCTC--CGAACT-TTTGC-ACG-A-CAATGTGCG-CCTG-CAC-ACA---AAGCA-CGCATT-GTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTCTC----CAGAT-TTAG-CTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----CC--T---A-----------TCTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--A-TATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------A-------AAGTGT----------AT----CCA--GG-CTAAGGGT-G-GGTAC---TTTG-AGGGCANGGA-C--G-AAT-----AAAAGG---AT--CAAAGATTAATAAAT--G-TAAGGGTGA-GTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AATAAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGTTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGCACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--GA--A-AGA-G--CAAACAAT-G-C-ACTTGAAATTA--GGGCCTATATA--A-----A-AAT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-T-AGATATTCANT-G-TG-AGGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATG-TCTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAAGA-TATTNAAAACAG-G---T---G--AACAC-------ATGT--A----------NCGC--C----AANTC---CT--------A-AG-T-CG--CCC-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-G-ATGAC-A-AAC---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCANG----GTA-TTTTG-AAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCGC---TG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAAA--T-------------ATATC-----------AA------AAANACT--T-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TNGGTGATG--------AGAC--------------T---TTG-----------A--------GCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--C-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG--AA-G---T-TTTTAT-G-TAT-TT-TTTTTTTTTTTTTAC---ACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCGAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACAG-TC-ACAG-GTAACTTCTA-TAA--AA-------A--G-T--T--TTA----TGAA---AA-A----------C------GA-----T------ATT---A-----------C----G-------TCG-C--CCT-C----AACGG---G--TATNAAGTA-TCTC--CGAATT-TTTGC-ACG-A-CAATGTGCA-CCTG-CAC-ACA---AAGCA-CGCA-T-GTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTCNC----CAGAT-TTAG-CTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----CN--T---A-----------TCTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--A-NATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------A-------AAGTGT----------AT----CCA--GG-CTAAGGGT-G-GGTAC---TTTGNAGGGCANGGA-C--G-AAT-----AAAAGG---AT--CAAAGATTAATAAAT--G-TAAGGGTGA-GTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AATAAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGNCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--GA--A-AAA-G--CATACAAT-G-C-ACTTTAAATTA--AGGACTAT-TA--A-----A-AAT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-T-AGATATTTAATAG-CT-AGGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATG-TTTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACAT-G---T---G--AATAC-------ATGT--A----------CCAC--C----AAATC---TT--------N-AG-T-CA--CCT-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGAC-AA-TTGGCTCG-T-ATGAT-A-AAC---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTG-AAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GGTC---TG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GG---AAT---------TGTCAAAA--T-------------ATATC-----------AA------AAATACT--T-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC--------------T---TTG-----------A--------GCCAAAAC-A-TACGAG---TT--G-TA-ACA-GA----AA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TGT--TGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA--AA-G---T-TTTTAT-G-TAT-TT-TTTTTTTTTTTTTAC---ATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACAG-TC-ACAGAGTAATTTCTAATAA--AG-------A--G-T--T--CTA----TGCA---AA-A----------C------GA-----T------ATT---A-----------C----A-------TCG-C--CCT-C----GACGG---G--T-TTAAGTA-TGTC--CGAATTCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTGACAC-A-A---AAGCATCGCA-T-ATG-ACCGA------G------TATTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT---GTTC-AC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTCAC----CAGAT-TTAG-TTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----CA--T---A-----------TCTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--A-AATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------A-------AAGTGT----------AC----CCA--GG-CTAAGAGT-G-AGTAC---TTTATAGGACATGGA-A--G-AAT-----AAAAGG---AT--CAAAGATTAATAAAT--N-TAAGAATGA-GTAC--TTTATAGGGCAGGGAAG--AATAAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : ----G-------TCG-C--CCA-A----AACGG---G--TATCAAGTA-TCTC--CG-GCT-TTTGC-ACG-A-CAGTATG---CTTG-TAC-ATA---AAGCA-CGCATT-GTG-ACCGA------GTACTAATATTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT---GTGCTA--------CA-TC-CCC-CG---TT-TCTC----AAGAT-TTAG-CTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-------ATCC-----------AAATTTCA----CC--G---A-----------TCTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTCT-GTACT-------------------ATGATG--GGAGT--G-C-----------CTAA---------TA-----GGAAGTA---T-------------A----------A--------------G-------AACTGA----------CT----CCA--G----AA--GT-G-G--AC---T------------GATC--T-TCT-----AAAAAGTTTAT--CCAGGCTCA--AGAT-------GGGT-----AC--TATGAAAGGCGGGGATA--AATAAAAAGAGTA--AA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aaagtgCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--GACAA-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCTATATA--ACTTCTA-AGT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-T-AAATACTCATT-G-TG-AAGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATG-CCTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAG-G---TTACG--AACACCTCAAAGATGT--A----------AAACTGC----TACTCG--CT--------A-AGAA-CG--TCT-TGCAAAA--G--TTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-G-ATGAC-A-AAC---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-T-AGATATTCATC-G-TG-AGATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TG-TCTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAG-G---TTACG--ATCACCTCAAAGATGTTGC----------TCGC--C----AAG------------------G-T-CA--CCC-TGTAACA--A--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA-----TCCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGA---------GGCTCA-G-ATGACAA-AAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-GAATGGT--ACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TATGCT-TA---TCGA---TA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GA---AAT---------TATTAAAAT-T-------------GTATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--GACAA-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCT-TATA--ATTCT-A-AGT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-T-AAATACTCATT-G-TG-AAGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATG-TTT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-G-G---TTACG--AACACCTCAAAGATGT--A----------AAACTGC----TACTCG--CT--------A-AG-AACG--CT--TGCAAAA--G--TTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-G-ATGAC-ATAAC---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--GACAA-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCT-TATA--ATTCT-A-AGT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-T-AAATACTCATT-G-TG-AAGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATG-TTT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-G-G---TTACG--AACACCTCAAAGATGT--A----------AAACTGC----TACTCG--CT--------A-AG-AACG--CT--TGCAAAA--G--TTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-G-ATGACAA-AAC---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--AG--A-AGA-G--TGAACAAT-G-C-ACTTGCAATTT--GGGCCTATATA--A-----A-AAG-TTGGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-T-AGATATTCATC-A-TG-AGGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATA-TTTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAG-G---T---T--ATTATG------ATGT--A-----------CGC--C----AAG------------------G-T-CA--CACATG-AACA--C--TTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-GA-TTGTCTCG-G-ATGAC-A-AAC---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCA
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTG-A-GATAA-AACCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTT-CACA--AGAA---CAAACCTCTA-----G-ATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCAA---TG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAAAGGT-------------ATAT-----------------------TTCT--T-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACATGTTGTCCAG---T---TTA-----------ATTATTGTGGGCAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--C-TACACA-TA----ATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-ttct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTG-A-GATAA-AACCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTT-CACA--AGAA---CAAACCTCTA-----G-ATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCAA---TG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAAAGGT-------------ATAT-----------------------TTCT--T-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACATGTTGTCCAG---T---TTA-----------ATTATTGTGGGCAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--C-TACACA-TA----ATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : -AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----G-A-AAGAT-AAA-GCTTCT-----GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---AT---TTTGCTCTA---GCAA---GG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTG-AAA-TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAAA--CA------------ATATC-----------AA------AAAGACT--TGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--------------TATATTG-----------A---------CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--C-TA-ACAGGA----AT--------AT--A---GCGCC---ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TAG--TGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG--AA-GAAAG-TTTTATCA-TA----------------TAACCTGATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGT------G------TATTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT---GTTCTAC---CACCCCCAC-CCC-C----TTTTCTC----CAGAT-TTAGGCTCC-TGCGACT--T--TT--TCCG-------TTCCC-CAA-AA---AAATTTCA----AC--G---A-----------TCTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTCT-GCCATA--GTA--TCA-GT--ATGATGATA--GGTAT--CAG-----------CAAT---------TG-----AGAGACA---T-----GA------C----------A--------------A-------A--TGT-----------T----TCA--Gtc
gi|19 : ----------A--------------A-------AACTGT----------ATA---CCA--GGGCTAAGCGT-GAAGTAC---TTTG-AGGACA--GA-T--GAAAT-----ATAAAG---AT--TCAAAATT-----AT--G-T--GAGTAA-ATAC--aaatggattgatcatctgaaaactgtataccagggctaagcgtgaagtactttgaggacagatgaaatataaagattcaaaattatgtgagtaaatacagccaagtatcatttgttttggaaaa
gi|19 : ccgtgtatttggaggtgaaaaaggttgctgttctaccacccccacccccttttctccagatttaggctcctgcgactttttccgttccccaaaaaaatttcaacgatctaaaaaaaacaacacgacatgcgcttgggtctgccatagtatcagtatgatgataggtatcagcaattgagagacatgacaaatgtttcagaaatggattgatcatctg-TAAGCGTGAAGTAC--TTTG-AGGACA--GATGA-AATATAAAGATTC--AAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTagccaagtatcatttgttttggaaaa
gi|2 : ccgtgtatttggaggtgaaaaaggttgctgttctaccacccccacccccttttctccagatttaggctcctgcgactttttccgttccccaaaaaaatttcaacgatctaaaaaaaacaacacgacatgcgcttgggtctgccatagtatcagtatgatgataggtatcagcaattgagagacatgacaaatgtttcagaaatggattgatcatctgaaaactgtataccagggcCGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GA--A-AAAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA--A-----AGAAT-TAGGTCATT-ACTTG-C-------------ATGTAAAAGCCC-G-TTAGATATTCAAT-ACTT-AGG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATG-TTTC---------AA-----TA-----G-TCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAAG----TTCAAAACAT-G---T---AT-AACAC-------CT-C--A----------T----------AAATG---CT-----------GCT-CGTACCT-TG-AACATCGCCTTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATCT-ACA-AAAGACG--AAG-ATA----CCGT-AGAC-AAATTGGCTCG---ATGAT-A-AAC---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTG-AAAA--AAAA-TCTAA-GCT-TA-----GGA-AAGAT-AAACGC----------GT--GC--------G------ATACCT----C---A----TT-GCTGTA---GGTC---TGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------GA---A-T---------TGTCAAAA--T-------------ATATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC--------------T---TTG-----------A--------GC-AAAAC-A-TACGAG---TT--AGTACACA-GA----AT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--AAA------AACG-T-C-TA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA--AA-G---T-TTTTAT-G-TTTCTT-TTTTTTTTTTTTTTT---ACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAAGG-C-AAAACAG-TC-ACAG-GTAATTTCTA-TAA--AA-------G--T-T--C--TTA----TGAA---AAGA----------A------AA-----T------GTT---------------C----G-------TCG-C--CCT-CG---AACGG---G--T-TTAAG-A-TCTC---GAATT-TT-GC-ACG-A-CAAT-TGCA-CCTG--AC-ACC---AAACA-CGCA-T-ATG-ACCGA------G------TATTTTGAG-CGGAGAAGGT-T------ACT---GTTC-AC----ACCCA-AC-CCCACT---TTCTCAC----CAGATATT----TCCGTGCAAATA-T--TT---CTG-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----CA--T---A-----------TCTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTCTGGCAAT---TTA--TCA-GT--A-AATGATG--GG-GT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------ATTTCCAGAAGTGTTAGCGTCAAAATGAAGCCA--GG-CTAACGAT-G-AGTACCTTTTTATA-GGCATGGA-CAGA-AAT-----AAAAGG---AT--CAAAGATTAA-AAAT--G-T--GGGTGA-ggaaaa
gi|2 : a-TAACGATGA-GTACCTTTTTATAGGCATGGACAGAAATAAAAGGATCA--AAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTaaacagccaagtgttcatttttttttgg
gi|20 : acgaggatttcaaaaataatgtcatttcaccttcttcgcgttaatcgttgaaatatcttactgaaccacattgacactgttaagaatcactgaaccgtagtggaaggaaatttcatgatcacaatttcactatcctagctacagtgtacattacttttatagcgtattcattgcactataactctgaaaggtaaactcttgaaaaaagcatacaattgcgactttaaattatagggactatgtaaagaattaggtcattacttgcatgtaaaagcccgttagatattcaatacttaggctgttatactatggaattgtcacaatgtttcaatagtctgtttgtcaggtagtgctaagttcaaaacatgtataacacctcataaatgctgctcgtaccttgaacatcgccttacaaccgaataataacagttgaataagtaccaccaaatctacaaaagacgaagataccgtagacaaattggctcgatgataaactttcttagcacgtgcttcaaggtattttgaaaaaaaatctaagcttaggaaagataaacgcgtgcgatacctcattgctgtaggtctgcaacaagaagagagtccggtttgaaaatgcaaagaattgtcaaaatatatcaaaaatactcttatgactaatctaattacgggtggtgagactttgagcaaaacatacgagttagtacacagaatcttcgggctcaaacagaaaaaacgtctattatgttgctaaaagattcaaccgtaaagtttttatgtttctttttttttttttttttacaagaaggccctgtcatgcaaaattcgttgtgccaaaggcaaaacagtcacaggtaatttctataaaagttcttatgaaaagaaaatgttcgtcgccctcgaacgggtttaagatctcgaattttgcacgacaattgcacctgacaccaaacacgcatatgaccgagtattttgagcggagaaggttactgttcacacccaaccccactttctcaccagatatttccgtgcaaatatttctgttccccaaacttaaattccacatatcttgtaaaagatgcaaatcacaaaatgtccttggtctggcaatttatcagtaaatgatggggtccctattgaggagtatgaaaatttccagaagtgttagcgtcaaaatgaagccaggcGAA---AG-A-----------------AA-----T------ATT---A-----------C----GAAAG---TCG-T--CTC-CCAAAAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTC--C-AACT-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTG-CAC-ACA---AAGCA-CGCA-TTATG-ACCGA------G------TATTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCTTACA--CCCCCC-CC-CCC-CA---CCCTCTTTTTTCATAA-TTAG-CTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGG------TTCCC-CAA-ACTT-TAATTCCA----CC--T---ACATGTACTGTATCTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTCT-GCAATTTATTA--TCA-GT--A-TTTGATA--GTTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------A-------ATGTgg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAAG----TGTAAATCAG-GTTAT---G--AACAC-------tt
gi|21 : C-A-AAC---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTG-AAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----G-A-AAAAT-AAACGTC--A-----GGG--G---------G------ATA--------------------CT-TG---GCGA---TG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTcgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---TTCTCG------AGAT-TTAG-TTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-------TTCCC-AAA-TCTT-AAATTCCA----TC--T---A-----------TCTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCCT-GTAAT---GTA--TCT-GT--A-TATGATT--AGTTT--C-C-----------CTGT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------C----------A--------------A-------A--TGT----------TT----CCA--G----AA--GT-G-GA-------TTG------ATCGA-C--G-AAA-----AAGTGC---AT--CCAGG------------C-CGAGGGTGA-GTAC--TTTGAAGGGCGGGGACG--AATAAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : T-T--TT--TCTG-------TTCCC-AAA-ACTT-ATAGGCCC----C-------A-----------ACTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC--GCAAT---TTAA-TCGTAT--A-TATGATG--GGTAT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----G------------------G--------------A-------AAGTGT----------TT----CCA------T--GAGT-G-GG-------TTG------ATCGT-C--T-AA------AAAAGT---GT-------AT--ACAGAC--A--AAAGGTGA-GTAC--TTTAAAGGGCAGGGACC--AATAAAAGGATCA--CAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTC-TA-ACA-GT----AT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AAT--TGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCTAA-G---------AA-A-CAT-TG-TTATTTTTCTTTTAA---ACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTCTG-TAATTAA-------AT-G-T--TA-TTA----TTAA---ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTCT-ACACT---TCA--TTA-GT--A-TATGATG--GGTGT--C-C-----------CTATTGAGGGGTATG-----AAAAATG---TTTCCAGA------A----------GTGGATTGATCGTCTA-------AAGTGT----------AT----CCC--GG-ACAAGAGT-G-AGTAT---TTTGAAGGGCAGATA-T--G-AA------AAAATG---ATCACAAAGATTAATACAT--G-T--GGTTGA-
gi|25 : AAGAGTGA-GTAT--TTTGAAGGGCAGATATG--AA-AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTTaaacatgcaagtgtcatttttggg
gi|26 : acaaatcactaaatatcttagggtctacacttcattagtatatgatgggtgtccctattgaggggtatgaaaaatgtttccagaagtggattgatcgtctaaagtgtatcccggacTG-----------A--------GCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--C-TA-ACT-GA----CT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TAT--TGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-----------------T-GCTAT-TT-TCTTT---------G---ACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACAG-TC-AAAG-GTAA---CTA-TAA--AA-------ggg
gi|27 : accaTTTTTTTTTTAC---A--GTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACAA-TC-ACAG-GTAACTTTTA-TAA--AA-------AATG-T--TG-TTA----TAAA---AA-AACTGAAGAAAT------GAAA---T------ATT---A-----------C----GAGAGCCGTCGTC--CCA-A----AACGG---G--TATGAAGTA-TCTC--CGA
gi|28 : TT-AAATTCCA----CC--T---A-----------TCTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTACA-TATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGTAGCA---T-----GA------A----------A--------------A-------A--TGT----------TC----CCA--Gc
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATaagtggatcgattgtctaaaaagtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAGA--A-TGA-T--CAAATAAT-GGC-ACTTGAA--TG--AAGCCTAAATA--A-----A-AAG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-T-AGATATTCATT-G-TGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT-----GTTTGTTG-----ATTTAAAACAG-A---T---T--AAAAT--------TGT---------------GC--C----TGCTCG--CC--------AGGG-T-TG----C-TACAACT--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGCAAA-TTGGCTCG-GCCTGAC-A-AAC---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTG-AAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----G-A-AA-AT--AAC-CT--AAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTTGCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GA---AAT---------TATTAAAAT-T-------------GTATCCAATATACA--AA------AAAGACT-----TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATAC--------------C---TTGTATTTATTTTAA--------GCCAAAACTG-TAG-----------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTAC--TGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC--AAGG---T-TTTTAT-A-TGC-TC-TTTTCTTT------G---ACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACAG--A-AAAG-GTAATTTCTA-TAG--AATGTTGTTA--A-T--T--TTA----AAAA---AA-A----------T------GAAGAAGT------GCC---ACGAAAAAT---C----G-------TCG-C--CTTAA----AACGG---GGTTATCAGGAATTCTT--TAA--T-TTTACAACG-A-CAA--TGCG-CCCG-CAC-ACA---TAGC--CCCA-T-GTG-ACCGA------G------TATTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT---GTCCTACATGTACTAA-AC-ACT-CA---TTCTCTC----CAGAT-TTAG-CACCGTGCGACTTCT--TT--TC----------TCCC-AAA-ATTT-AAAATCCA----AC--T---A-----------CCTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T--------------CAAT---TTA--TTA-GT--ATAATGGTG--GATATACC-T-----------CTTT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------AAAATGTTTCCA--------------A-------AAGTGG----------AT----TTATCGT-CTAAAGAC-G-TGTAC---CTCTCAGGGCAA-GA-C--A-AGTATTTGAAAACG---AT--CAAAGATTAATAAGT-------GGGTGA-ACAC--
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggtcaagtgtcattattctggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAAT-G-C-TCTTGAAATTA--GGGCCTATATATAA-----A-AAG-TAGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCT-AAATATTCATT-G-TT-AGGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATG-TCTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : ----------A--------------A-------ACATGT----------AT----CCA--GG-CCAATAGTTA-AGTAC---TTTCAAGGACAGGAA-C--G-AAT-----AAAAGG---AT--CAGAGATTAATTAATAAA-TATGGGCGA-
gi|32 : tcccgaaagtgggctgatcgtctTAA-GTAC--TTTCAAGGACAGGAACG--AATAAAAGGATCA--GAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-aaacagccaagtg
gi|33 : tcccgaaagtgggctgatcgtctaaacatgtatccaggccaatagtGAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atCTTCTA-TGA--AA-------AT-G-T--TATTTA----AGAACTTAA-G----------A------AA-----T------ATT---ATCAATCAAATCC----G-------TCG-C--AAAAC----AACGG---G--TTTGAAGTA-TCTC--TGA
gi|35 : tgtcgggcaaatccgtatgctaaatagcacGAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : CTTCTA-TGA--AA-------AT-G-TTAT--TTA----AGAACTTAA-G----------A------AA-----T------ATT---ATCAATCAAAGTC----G-------TCG-C--AAA-A----AACGG---G--TTTGAAGTA-TCTC--TGA
gi|37 : tgtcgggcaaatccgtatgctaaatagcacCAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAG---T---GCAAACAC-------CT-C--A----------AAGA--T----ATTTCTCGCT--------A-AGGT-CG--CCC-TGCAAAA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACAG-TC-ACAG-GTAACTTCTA-TAA--AA-------AC-G-T--TG-CTA----TTAA---AAGA----------CTAA---AA-----T------ATT---ATGAAAGT----C----G-------TCGTC--CCA-A----AACGG---G--TATGAAGTA-TATT--TGACTT-
gi|4 : -T-CG--CCC-TGCAACA--G--TTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGC-AA-TTAGCTCG-G-ATGAC-A-AAC---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTG-AAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAG-A-AAGAT-AAACACT--A-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTTGCT-TA---GCGA---TG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------GA---A-T---------TATTAAAA--TT------------GTATCCAG--------AATATACCAAAGACT--T---GA----TAAT----TTTG-TTAC--T-GGTGATG--------AGACCTAGGTATACTTATT---TTG-----------A--------GCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--C-TA-ACA-GACAGAAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG--AA-G---GGTTTTAT-GCTAT-TT-CTT----------GG---GAAATAGAAGGCCC-ATCATAGC-AAG-ATTA-GT-GATGC--AGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTT-TG-TAT--AA-------T--G-T--T--TTAAAAATGAA---AG-A----------G------GA-----TGATAAAATT---------------C----A-------TGG-A--CAT-A----AACGG---G--TAAAAGGTAATCTAGACAA----TTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTG-CACGACATGGAGGCA-AGGA-T-GTG-GTGGA------GAGC---TGTTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------ATGAGAGTCTTAA---AACCCC-GC-CAC-CGCCATTTTCTCA---CAGAT-TAGA-ATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-------TACGCACAA-ATGTGAAATTGCA----CG--CCAGA-----------T-TGGA-A---GATA--A-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTTGGAAT---TTAGATCA-GT--A-TAGGGTGATGGTGT--C-CTATTGGGAGGTCTATGAAA-----TGTTTCCAGAAATGGATT-----GATCGTCTA----------A--------------A-------CAGCGT----------AT----CCA--GA-CAAAGGGC-G-AGTAC---TTTGAAGTGTAGGGA-C--A-AAT-----AAAAGG---AT--CTCAGATTGATAAAC--G-T--GGGTGA-
gi|4 : AAGGGCGA-GTAC--TTTGAAGTGTAGGGACA--AATAAAAGGATCT--CAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTTaaacaggcaagtgtcattattttggaa
gi|40 : tcgccctgcaacagttccaaccaaaattaacatcgtaaaaatccaccaaatcttacagaaagacgtaaaattgtgaggcaattagctcggatgacaaacttgtcgtaagcacgtgtccaaggtactttgaaaaaaaatcaaaagcttacggtagaaagataaacactagatggatacctcctttgcttagcgatgaacaaaagagagtccgcgttgaaaatgcaaagaattattaaaattgtatccagaatataccaaagacttgataattttgttactggtgatgagacctaggtatacttattttgagccaaaacgtaaagtgctaacagacagaatctgagcatcagaaaatgcaaaacgtcctagtattactagaagattatgaactgtgaagggttttatgctatttcttgggaaatagaaggcccatcatagcaagattagtgatgcagaagccgtaataggtcgacagatgactttgtataatgttttaaaaatgaaagaggatgataaaattcatggacataaacgggtaaaaggtaatctagacaattggaacgagcaatgtgccgtgcacgacatggaggcaaggatgtggtggagagctgttttggggtggtaaaggtgtatgagagtcttaaaaccccgccaccgccattttctcacagattagaatgcatgtgctatgcttaatctgtacgcacaaatgtgaaattgcacgccagattggaagataaatcacgaaatgcgcttgggtcttggaatttagatcagtatagggtgatggtgtcctattgggaggtctatgaaatgtttccagaaatggattgatcgtctaaacagcgtatccagacaAAC---CC-G-T-AGACATTCATC-G-TG-AGGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATG-TCTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAG-G---ggaa
gi|41 : C-CCC-CC---TTCTG------CAAAT-TTAT-CACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-------TTCCC-CAATACTT-AAATTCCAAGTACAAGT---A-----------TCTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-Tctacgaac
gi|42 : CG-CCTG-CAC-ACA---AAGCA-AGCATT-ATGAAGCGA------C------AATTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT---ATTCTGC---AAC----ACGCCC-TG---TT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : -ATGAC-A-AAC---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTG-AAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : --AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGC-AA-TTGGCTTG-C-ATAGC-A-CAC---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTG-AAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----G-A-ATGAT-GAACGCT--A-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---ACGA---TG-AAGAA-A---AGAATCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGA---AAT---------TTTTAAAATTT-------------ATATCTAAAACATACAAA------AAAAACT--T--TTAT---TAAT----TTAG-TTA---TTGGTGATG--------AGACTAT-----------T---TTG-----------A--------GCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--C-TA-ACA-GA----AC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TAT--TGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG--AA-T---G-TTTTATAG-AA-----TGTGATTTTCTTTA----ACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-A--C-CT-G-TAC-CAAAGGGC-AA----------------AACTTCTA-CAA--AA-------A--T-T--TTGTTAT---TAAA---AA-A----------CTCAAGAAA-----T------ATTTCCAAAGT-------C----G-------TCG-C--CC--CAA--AACGG---G--CATAAAGTA-TCTC--CGA--T-TTAGC-ATG-A-CAA--TGCG-TCTG-CAC-ATA---ATGCG-CGCATT-GTG-ACCGAGTACCGG------TATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACACA----CCC-CG---ATTTCTC----CAGAT-TTAC-TTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTGTTCGATATTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCA----CT--T---A-----------TCTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTA-A-TATGATG--TGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGAAGT-----------A------A----------A--------------T-------AAATGT----------TT----CCA--G----AA--GT-A-GA-------TTG------AT----C--G-TCT-----AAAA---------CAAAGATGTATCCAG--GCCAAGGGTGT-GTAC--TTTGAAGGACAGGGACG--AATAAAAGGATCA--AAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAAT-G-C-ATATAAATTTA--GGTCCTATATA--A-----A-AGA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-CCTG-CAC-ACA---AAGCA-AGCACT-ATG-AACGA------C------AATTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : gTG-----------A--------GCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--C-TA-ACT-GA----CT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--GA--A-AAA-GATCAAAAAAT-G-C-GCTGGAAATTA--GGGCCTATATAT-A-----A-AATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-T-AGATATCCATT-G----AGGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATG-TCTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAG-G---T--------TAC----------T--A----------ACAC--CTCAAAGATT---CTGCTCGCCAA-AG-T-CA--CCC-TACAATA--G--TTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGC-AA-TTGGTTCG-G-ATGAC-A-AAC---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTG-AAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAGCGCT--A-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTTGTT-CA---GCGA---TG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------A---AAT---------TATCAAAA--TTGTATCCATATATATACC-----------AA------AAAGATT--T---GA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACATGGGTATACTAT-T---TTG-----------A--------GCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--C-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TAT--TGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG--AA-G---------AA-G-GAT-TTATGTTATATTCTTTG----GCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-T-AGATATTCA-T-C-TG-AGGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATG-TCTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGC-AA-TTGGCTCG-G-ATGAC-A-A-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTA-AAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----G-A-AAGAT-ACATG-T--A-----A-----------------------ACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCGA---TG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATTAAAA--T-------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACAG-TC-ACGG-GTAACTTCTA-TAA--AA-------AT-GTT--T--TTAT---TAAA---AA-A----------CTGAAGAAA-----T------TTT---A-----------CGAAAG-------TCG-TCGCCT-CAAA-AATAG---G--TATGAAGTA-TCTC--CG-ACT-TTTGC-ACA-A-CAATGCGCA---TG-CGC-ACA---AAGCA-CGTATT-GTG-ACCGA------G------TATCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT---GTCTTAtgta
gi|8 : A------A----------A--------------A-------AAGTGT----------AT----ACA--GG-CAAAGGGT-A-GGTAC---TTTGAAGGGCAGGGA-C--C-AATA----AAAAGG---AT--CACAGATgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--GA--ACAGA-G--GAAACACT-G-C-ACTTGAAATTA--AGGCCTATATA--C-----A-AGT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-T-AGGTCCTTCCC-G-T--AGGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATG-CCTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAG-G---TTACG--AACAC-------CT-T--AAAAAAGCTGCTCGC--C----AAG------------------G-T-CG--TCC-TGCAACA--G--TTGCAACgtgggtgaaaaca
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 22222222222222 222222222 111 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 00000000000000000000000000000000 222 1111111 111 333333333333333333333333333 2222222222222 111 22222222222222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 222222222222222222222222222222222222222222222 111 1 22222222222222 111 333333333333333333333333333333333333333333 333333333333 11111111 11 1111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 11111 1111 11 2222222222222 111111 1111 1111 1111111 222222222222222 11111111111 222222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 99 66 4 77 222 00000000000000 4 4 66 3 3 3 0 55 777777777 3 3 444 1 3 3 1 8888888888888 3 777 9 3 3 6 3 3 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 5 6666 2 33333333333333333333333333333333 7 000 44 77 44 44 3 4 666 7777777 1 88 3 77 1 5 5 2 7 2 2 888 5 000 3 77777 3 44 9 0 6 88888 3 6 6 44 111111111111111111111111111 2222222222222 6 111 555 3 3 6 2 3 55555555555555555555555 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 4 0000 66666666 333333333333333333333333333333333333333333333 3 6 111 44 3 0 3 44444444444444 44 555 3 6 555 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 999999999999999999999999999999999999999999 8 3 000000000000 44 22222222 00 3 2 3 3 3 44 3 1111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 00000 77 555 44 5 1 6 1 8888 5 5 5 55 77 1 4 4 777 4 33 4 1111111111111 3 3 000000 777 0 7777 2 999 4 4 0000 0 99999 4 4 4 5555 55 3 1111111 3 3 3 666666666666666 3 55 3 3 2 6 999 77 3 77 6 44 44 3 55555555555 000000000 88888 555 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 555 44 1 444 0 9999999 0 44 88 3 44 7777 0 5 3 1 3 3 6
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . .. .. . .. ... .............. . . .. . . . . .. ......... . . ... . . . . ............. . ... . . . . . . .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . ................................ . ... .. .. .. .. . . ... ....... . .. . .. . . . . . . . ... . ... . ..... . .. . . . ..... . . . .. ........................... ............. . ... ... . . . . . ....................... . ............................................................. .... . .... ........ ............................................. . . ... .. . . . .............. .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. .......................................... . . ............ .. ........ .. . . . . . .. . ....... ........................................................................... . ..... .. ... .. . . . . .... . . . .. .. . . . ... . .. . ............. . . ...... ... . .... . ... . . .... . ..... . . . .... .. . ....... . . . ............... . .. . . . . ... .. . .. . .. .. . ........... ......... ..... ... .............................................................................................................................. . ... .. . ... . ....... . .. .. . .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 33 11 4 33 222 44444444444444 4 4 11 6 6 6 3 00 777777777 6 6 555 4 5 6 8 3333333333333 3 777 2 1 1 2 8 1 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 2 5555 1 55555555555555555555555555555555 3 888 66 88 66 66 6 6 555 1111111 4 99 1 99 1 7 7 7 5 5 5 888 0 888 1 55555 3 22 2 8 2 33333 3 7 7 66 777777777777777777777777777 9999999999999 7 777 888 3 3 7 1 6 11111111111111111111111 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9999 4 8888 11111111 444444444444444444444444444444444444444444444 3 7 777 66 3 0 3 77777777777777 66 888 3 7 888 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 999999999999999999999999999999999999999999 0 1 555555555555 88 22222222 66 3 4 3 3 3 66 6 8888888 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 99999 99 888 66 7 0 7 6 4444 0 0 0 00 22 6 0 0 000 0 11 0 8888888888888 5 6 555555 000 8 9999 9 888 0 0 2222 9 66666 0 0 0 1111 00 6 8888888 6 6 3 333333333333333 3 22 1 1 5 7 222 99 3 99 7 66 66 3 88888888888 444444444 33333 888 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 8 888 66 2 666 3 5555555 5 66 66 6 66 1111 3 2 3 8 3 6 0
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--GA--A-AGA-G--CAAACAAT-G-C-ACTTGAAATTA--GGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-T-AGATATTCA-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACAC-------AT-----GT---AANG--C--CTACTCGCTAA-G-T-CG--CCC-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGCAA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANACT--T-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T---G----------T---------T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--C-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG----AA-G--TTTT-AT-G-TAT-TTTTTTTTTTTTTTT-GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACAG-TC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TG-------TTG-TT-A----T-GAA------AA-A----------C------GA--------TATT------A----AGN-----CGTCG-CC-CAA-AA--CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAACT-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTC----TC-CAGAT-TTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCT-G-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---C-----------TAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------A-------AAGTGT----------AT----CCA--GGC-AA-GGGT-GGGTA-C---TTT-G-AGG-GCAGGGA-C--GAAT-----AAAAGG---AT--CAAAGATTA-ATAAAC--G-TAAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--GA--A-AGA-G--CAAACAAT-G-C-ACTTGAAATTA--GGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-T-AGATATTCA-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACAC-------AT-----GT---ANCG--C--CAANTCGCTAA-G-T-CG--CCC-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGCAA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANACT--T-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T---G----------T---------T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--C-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG----AA-G--TTTT-AT-G-TAT-TTTTTTTTTTTTTTTANACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACAG-TC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TG-------TT--TT-A----T-GAA------AA-A----------C------GA--------TATT------A----A-------CGTCG-CC-CNN-AA--CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAACT-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTC----TC-CAGAT-TTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCT-G-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---C-----------TAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------A-------AAGTGT----------AT----CCA--GGCTAA-GGGT-GGGTA-C---TTT-G-AGG-GCANGGA-C--GAAT-----AAAAGG---AT--CAAAGATTA-ATAAAT--G-TAAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--GA--A-AAA-G--CATACAAT-G-C-ACTTTAAATTA--AGGACTAT-TA---A-----A-A-AT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-T-AGATATTTAATAGCTA-GGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATAC-------AT-----GT---ACCA--C--CAAATC-TTNA-G-T-CA--CCT-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGACAA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GG---AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATACT--T-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC-----------------T---------T-----------------TGAGCCAAAAC-A-TACGAG---TT--G-TA-ACA-GA----AA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TGT--TGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA----AA-GT-TTTT-AT-G-TAT-TTTTTTTTTTTTTTTACATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACAG-TC-ACAGAGTAATTTC-TAATAA--AGA--G-------TT--CT-A----T-GCA------AA-A----------C------GA--------TATT-----------A-------CATCG-CC-CTC-GA--CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAATTCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT---GTTC-AC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTC----AC-CAGAT-TTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCT-G-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---A-----------TAT-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--AA-ATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------A-------AAGTGT----------AC----CCA--GGCTAA-GAGT-GAGTA-C---TTT-ATAGG-ACATGGA-A--GAAT-----AAAAGG---AT--CAAAGATTA-ATAAAT--N-TAAGAATGAGTAC--TTTATAGGGCAGGGAAG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : GTCG-CC-CAA-AA--CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-CT-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------GTACTAATATTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT---GTGCTA--------CA-TC-CCC-CG---TT-TC----TC-AAGAT-TTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCT-G-------ATCC-----------AAATTTCAC---C-----------GAT-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTCT-GTA-----------C-------T-ATGATG--GGAGT--G-C-----------CTAA---------TA-----GGAAGTA---T-------------A----------A--------------G-------AACTGA----------CT----CCA--G---AA---GT-GG--A-C---T--------------GATC--TTCT-----AAAAAGTTTAT--CCAGGCTCA---AGAT--G----GG-----TAC--TATGAAAGGCGGGGATA--AAT-AAAAAGAGTA--AA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aaagtgCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--GACAA-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCTATATA---ACTTCTA-A-GT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-T-AAATACTCA-TTGTGA-AGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGAT-----GT---AAAA--CTGCTACTCGCTAA-GAA-CG--TCT-TGCAAAA--G--TTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-T-AGATATTCA-TCGTGA-GATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TGT-CTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCACCTCAAAGAT-----GT-----TG--C------TCGCCAA-GGT-CA--CCC-TGTAACA--A--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA----T-CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC--------TCA-GA-TGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-GAATGGT--ACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TATGCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--GACAA-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-T-AAATACTCA-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACCTCAAAGAT-----GT---AAAA--CTGCTACTCGCTAA-G-AACG--CT--TGCAAAA--G--TTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAA-C---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--GACAA-AGA-G--CAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-T-AAATACTCA-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACCTCAAAGAT-----GT---AAAA--CTGCTACTCGCTAA-G-AACG--CT--TGCAAAA--G--TTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AA-C---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--AG--A-AGA-G--TGAACAAT-G-C-ACTTGCAATTT--GGGCCTATATA---A-----A-AAGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-T-AGATATTCA-TCATGA-GGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTAT---TATG------AT-----GT---A-CG--C--CAAG--------G-T-CA--CACATG-AACA--C--TTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGCGA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGCAA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----G-ATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TTCT--T-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T---G----------T---------TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--C-TACACA-TA----ATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGCAA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----G-ATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TTCT--T-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T---G----------T---------TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--C-TACACA-TA----ATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----G-A-AAGAT-AAA-GCTTCT-----GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---AT---TTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTG-AAA-TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAA-------------A--CAATATC-----------AA------AAAGACT--TGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--T---A----------TA--------T-----------------TGA-CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--C-TA-ACAGGA----AT--------AT--A---GCGCC---ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TAG--TGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTGAAGAAA-G--TTTT-ATCA-TAT-AACCT-----------GATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGT------G------TATTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT---GTTCTAC---CACCCCCAC-CCC-C----TTTTC----TC-CAGAT-TTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCC-G-------TTCCC-CAA-AA---AAATTTCAA---C-----------GAT-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTCT-GCCATA--GTA--TCA-GT--ATGATGATA--GGTAT--CAG-----------CAAT---------TG-----AGAGACA---T-----GA------C----------A--------------A-------A--TGT-----------T----TCA--GA--AATGGAT-TGATC-A---TCT-G-AAA-AC------T--GTAT-----ACCAGG---GC-------------TAAGC--G-TGAAG-----TAC--TTTG-AGGACA--GATGA-AAT-ATAAAGATTC--AAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTtc
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GA--A-AAAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA---A-----AGA-AT-TAGGTCATT-ACTTG-C-------------ATGTAAAAGCCC-G-TTAGATATTCAATACTTA-GG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATGT-TTC---------AA-----TA-----G-TCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATGT-AT-AACAC-------CT------C---AT--------AAAT-GCT---GCT-CGTACCT-TG-AACATCGCCTTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATCT-ACA-AAAGACG--AAG-ATA----CCGT-AGACAAATTGGCTCG--A-TGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAA-GCT-TA-----GGA-AAGAT-AAACGC----------GT--GC--------G------ATACCT----C---A----TT-GCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------GA---A-T---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC--T------------------------T-----------------TGAGC-AAAAC-A-TACGAG---TT--AGTACACA-GA----AT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--AAA------AACG-T-C-TA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA----AA-G--TTTTTAT-G-TTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAAGG-C-AAAACAG-TC-ACAG-GTAATTTC-T-ATAA--AAG-T--------TC--TT-A----T-GAA------AAGA----------A------AA--------TGTT-------------------CGTCG-CC-CTCGAA--CGG---G--T-TTAAG-A-TCTC-GAA-T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCAT-ATG-ACCGA------G------TATTTTGAG-CGGAGAAGGT-T------ACT---GTTC-AC----ACCCA-AC-CCCACT---TTCTC----AC-CAGATATT----TCCGTGCAAATA-T--TT---CT-G-------TTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---A-----------TAT-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTCTGGCAAT---TTA--TCA-GT--AA-ATGATG--GG-GT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------ATTTCCAGAAGTGTTAGCGTCAAAATGAAGCCA--GGCTAA-CGAT-GAGTA-CCTTTTT-A-TAG-GCATGGA-CAGAAAT-----AAAAGG---AT--CAAAGATTA-A-AAAT--G-T--GGGTGAggaaaa
gi|2 : a-TAACGATGAGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGAAAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTaaacagccaagtgttcatttttttttgg
gi|20 : acgaggatttcaaaaataatgtcatttcaccttcttcgcgttaatcgttgaaatatcttactgaaccacattgacactgttaagaatcactgaaccgtagtggaaggaaatttcatgatcacaatttcactatcctagctacagtgtacattacttttatagcgtattcattgcactataactctgaaaggtaaactcttgaaaaaagcatacaattgcgactttaaattatagggactatgtaaagaattaggtcattacttgcatgtaaaagcccgttagatattcaatacttaggctgttatactatggaattgtcacaatgtttcaatagtctgtttgtcaggtagtgctaagttcaaaacatgtataacacctcataaatgctgctcgtaccttgaacatcgccttacaaccgaataataacagttgaataagtaccaccaaatctacaaaagacgaagataccgtagacaaattggctcgatgataaactttcttagcacgtgcttcaaggtattttgaaaaaaaatctaagcttaggaaagataaacgcgtgcgatacctcattgctgtaggtctgcaacaagaagagagtccggtttgaaaatgcaaagaattgtcaaaatatatcaaaaatactcttatgactaatctaattacgggtggtgagactttgagcaaaacatacgagttagtacacagaatcttcgggctcaaacagaaaaaacgtctattatgttgctaaaagattcaaccgtaaagtttttatgtttctttttttttttttttttacaagaaggccctgtcatgcaaaattcgttgtgccaaaggcaaaacagtcacaggtaatttctataaaagttcttatgaaaagaaaatgttcgtcgccctcgaacgggtttaagatctcgaattttgcacgacaattgcacctgacaccaaacacgcatatgaccgagtattttgagcggagaaggttactgttcacacccaaccccactttctcaccagatatttccgtgcaaatatttctgttccccaaacttaaattccacatatcttgtaaaagatgcaaatcacaaaatgtccttggtctggcaatttatcagtaaatgatggggtccctattgaggagtatgaaaatttccagaagtgttagcgtcaaaatgaagccaggc-GAA------AG-A-----------------AA--------TATT------ACGAAAGT-----CGTCT-CC-CAA-AAA-CGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AACT-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGA------G------TATTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCTTACA--CCCCCC-CC-CCC-CA---CCCTCTTTTTT-CATAA-TTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGG-------TTCCC-CAA-ACTT-TAATTCCAC---CTACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTCT-GCAATTTATTA--TCA-GT--AT-TTGATA--GTTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------A----------A--------------A-------ATGTgg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACAC-------tt
gi|21 : C-A-AA-C---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----G-A-AAAAT-AAACGTC--A-----GGG--G---------G------ATA--------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTcgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTC----TC-GAGAT-TTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCT-G-------TTCCC-AAA-TCTT-AAATTCCAT---C-----------TAT-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCCT-GTAAT---GTA--TCT-GT--AT-ATGATT--AGTTT--C-C-----------CTGT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------C----------A--------------A-------A--TGT----------TT----CCA--G---AA---GT-GGA--------TT-G-------ATCGA-C--GAAA-----AAGTGC---AT--CCAGG-------------C-CGAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCGGGGACG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCT-G-------TTCCC-AAA-ACTT-ATAGGCC-----C-----------CAA-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC--GCAAT---TTAA-TCGTAT--AT-ATGATG--GGTAT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGGAGTA---T-----G------------------G--------------A-------AAGTGT----------TT----CCA-----T---GAGT-GGG--------TT-G-AT----------C--GTCT-----AAA-----------AAAGTGTATACAGAC--A--AAAGGTGAGTAC--TTTAAAGGGCAGGGACC--AAT-AAAAGGATCA--CAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTC-TA-ACA-GT----AT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AAT--TGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCT--AA-G-------AA-A-CAT-TGTTATTTTTCTTTTAAACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GTAATTAAA-TG-------TTA-TT-A----T-TAA------ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTCT-ACACT---TCA--TTA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-C-----------CTATTGAGGGGTATG-----AAAAATG---TTTCCAGA------A----------GTGGATTGATCGTCTA-------AAGTGT----------AT----CCC--GGACAA-GAGT-GAGTA-T---TTT-GAAGG-GCAGATA-T--GAA------AAAATG---ATCACAAAGATTA-ATACAT--G-T--GGTTGA
gi|25 : AAGAGTGAGTAT--TTTGAAGGGCAGATATG--AA--AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTTaaacatgcaagtgtcatttttggg
gi|26 : acaaatcactaaatatcttagggtctacacttcattagtatatgatgggtgtccctattgaggggtatgaaaaatgtttccagaagtggattgatcgtctaaagtgtatcccggac-----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--C-TA-ACT-GA----CT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TAT--TGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-----------------T-GCTAT-TTTCTTT---------GACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACAG-TC-AAAG-GTAA---C-T-ATAA--AAggg
gi|27 : accaTTTTTTTTTTA--CAGTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACAA-TC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAA--AAAATG-------TTG-TT-A----T-AAA------AA-AACTGAAGAAAT------GAAA------TATT------ACGAGAGC-----CGTCGTCC-CAA-AA--CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : TT-AAATTCCAC---C-----------TAT-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTACAT-ATGATG--GGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGTAGCA---T-----GA------A----------A--------------A-------A--TGT----------TC----CCA--Gc
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATaagtggatcgattgtctaaaaagtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAGA--A-TGA-T--CAAATAAT-GGC-ACTTGAA--TG--AAGCCTAAATA---A-----A-A-AG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-T-AGATATTCA-TTGTGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-AAAT----------T-----GT------G--C--CTGCTCGCCAG-GGT-TG--C---TACAACT--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGCAAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----G-A-AA-AT--AAC-CT--AAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTTGCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAATATACA--AA------AAAGACT-----TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATACCTT---GTATTTAT---T---------T-----------------TAAGCCAAAACTG-TAG-----------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTAC--TGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC----AA-GGTTTTT-AT-A-TGC-TCTTTTCTTT------GACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACAG--A-AAAG-GTAATTTC-T-AT-A--GAA-TGTTGTTAATT--TT-A----A-AAA------AA-A----------T------GAAGAAGTGCCACG------A----AAAAT---CGTCG-CCTTAA-AA--CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA--T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGA------G------TATTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT---GTCCTACATGTACTAA-AC-ACT-CA---TTCTC----TC-CAGAT-TTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC-----------TCCC-AAA-ATTT-AAAATCCAA---C-----------TAC-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T--------------CAAT---TTA--TTA-GT--ATAATGGTG--GATATACC-T-----------CTTT---------TG-----AGGAGTA---T-----GA------AAAATGTTTCCA--------------A-------AAGTGG----------AT----TTATCGTCTAA-AGAC-GTGTACC---TCT-C-AGG-GCAA-GA-C--AAGTATTTGAAAACG---AT--CAAAGATTA-ATAAGT-------GGGTGAACAC--
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggtcaagtgtcattattctggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAAT-G-C-TCTTGAAATTA--GGGCCTATATATAAA-----A-A-GT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCT-AAATATTCA-TTGTTA-GGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : ----------A--------------A-------ACATGT----------AT----CCA--GGCCAA-TAGTTAAGTA-C---TTTCA-AGG-ACAGGAA-C--GAAT-----AAAAGG---AT--CAGAGATTA-ATTAATAAA-TATGGGCGA
gi|32 : tcccgaaagtgggctgatcgtctTAAGTAC--TTTCAAGGACAGGAACG--AAT-AAAAGGATCA--GAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-aaacagccaagtg
gi|33 : tcccgaaagtgggctgatcgtctaaacatgtatccaggccaatagtGAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TAG--C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TG-------TTATTT-A----A-GAACTTAAGAA-A----------T------AT--------TATC------A----ATCAAATCCGTCG-CA-AAACAA--CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TAG--C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TG-------TTATTT-A----A-GAACTTAAGAA-A----------T------AT--------TATC------A----ATCAAAGTCGTCG-CA-AAA-AA--CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACAC-------CTCAAAGAT---ATTT--C------TCGCTAA-GGT-CG--CCC-TGCAAAA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACAG-TC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-CG-------TTG-CT-A----T-TAA------AAGA----------CTAA---AA--------TATT------ATG--AAAGT---CGTCGTCC-CAA-AA--CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-ACT-T
gi|4 : -T-CG--CCC-TGCAACA--G--TTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGCAA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAG-A-AAGAT-AAACACT--A-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------GA---A-T---------TATTAAA-------------A--TTGTATCCAG--------AATATACCAAAGACT--T---GA----TAAT----TTTG-TTAC--TGG-TGATG--------AGAC--CTAGG----------TATACTTATTT-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--C-TA-ACA-GACAGAAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG----AA-GGGTTTT-AT-GCTAT-TTCTT----------GGGAAATAGAAGGCCC-ATCATAGCAAG--ATTA-GT-GATGC--AGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-ATAA------TG-------TT--TT-AAAAAT-GAA------AG-A----------G------GA--------TGAT------A----AAATT---CATGG-AC-ATA-AA--CGG---G--TAAAAGGTAATCT--AGACAATTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGAT-GTG-GTGGA------GAGC---TGTTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------ATGAGAGTCTTAA---AACCCC-GC-CAC-CGCCATTTTC----TCACAGAT-TAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCT-G-------TACGCACAA-ATGTGAAATTGCACG--C-----------CAGATTGGA-A---GATA--A-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTTGGAAT---TTAGATCA-GT--AT-AGGGTGATGGTGT--C-CTATTGGGAGGTCTATGAAA-----TGTTTCCAGAAATGGATT-----GATCGTCTA----------A--------------A-------CAGCGT----------AT----CCA--GACAAA-GGGC-GAGTA-C---TTT-G-AAGTGTAGGGA-C--AAAT-----AAAAGG---AT--CTCAGATTG-ATAAAC--G-T--GGGTGA
gi|4 : AAGGGCGAGTAC--TTTGAAGTGTAGGGACA--AAT-AAAAGGATCT--CAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTTaaacaggcaagtgtcattattttggaa
gi|40 : tcgccctgcaacagttccaaccaaaattaacatcgtaaaaatccaccaaatcttacagaaagacgtaaaattgtgaggcaattagctcggatgacaaacttgtcgtaagcacgtgtccaaggtactttgaaaaaaaatcaaaagcttacggtagaaagataaacactagatggatacctcctttgcttagcgatgaacaaaagagagtccgcgttgaaaatgcaaagaattattaaaattgtatccagaatataccaaagacttgataattttgttactggtgatgagacctaggtatacttattttgagccaaaacgtaaagtgctaacagacagaatctgagcatcagaaaatgcaaaacgtcctagtattactagaagattatgaactgtgaagggttttatgctatttcttgggaaatagaaggcccatcatagcaagattagtgatgcagaagccgtaataggtcgacagatgactttgtataatgttttaaaaatgaaagaggatgataaaattcatggacataaacgggtaaaaggtaatctagacaattggaacgagcaatgtgccgtgcacgacatggaggcaaggatgtggtggagagctgttttggggtggtaaaggtgtatgagagtcttaaaaccccgccaccgccattttctcacagattagaatgcatgtgctatgcttaatctgtacgcacaaatgtgaaattgcacgccagattggaagataaatcacgaaatgcgcttgggtcttggaatttagatcagtatagggtgatggtgtcctattgggaggtctatgaaatgtttccagaaatggattgatcgtctaaacagcgtatccagacaAAC---CC-G-T-AGACATTCA-TCGTGA-GGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CC---TTCTG-------CAAAT-TTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCA-T-------TTCCC-CAATACTT-AAATTCCAAGTACAAG--------TAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGA------C------AATTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT---ATTCTGC---AAC----ACGCCC-TG---TT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : --AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGCAA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----G-A-ATGAT-GAACGCT--A-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-A---AGAATCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGA---AAT---------TTTTAAA-------------ATTT-ATATCTAAAACATACAAA------AAAAACT--T--TTAT---TAAT----TTAG-TTAT--T-GGTGATG--------AGAC--T---AT---------T---------T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--C-TA-ACA-GA----AC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TAT--TGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG----AATG--TTTT-ATAG-AAT-GTGATTTTCTTT----AACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-A--C-CT-G-TAC-CAAAGGGC-AA----------------AACTTC-T-ACAA--AAA-TT-------TTG-TT-AT---T-AAA------AA-A----------CTCAAGAAA--------TATTTCC---A----AAGT----CGTCGCCC-CAA-AA--CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA--T-TTAGC-ATG-A-CAA--TGC-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAGTACCGG------TATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACACA----CCC-CG---ATTTC----TC-CAGAT-TTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCT-GTTCGATATTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---T-----------TAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTA-AT-ATGATG--TGTGT--C-C-----------CTAT---------TG-----AGAAGT-----------A------A----------A--------------T-------AAATGT----------TT----CCA--G---AA---GT-AGA--------TT-G-AT----------C--GTCT-----AAAA---------CAAAGATGT-ATCCAG--GCCAAGGGTGTGTAC--TTTGAAGGACAGGGACG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAAT-G-C-ATATAAATTTA--GGTCCTATATA---A-----A-A-GA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGA------C------AATTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : -----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--C-TA-ACT-GA----CT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--GA--A-AAA-GATCAAAAAAT-G-C-GCTGGAAATTA--GGGCCTATATAT--A-----A-A-ATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-T-AGATATCCA-T--TGA-GGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACAC-------CT------C---AAAGATT--CTGCTCGCCAAAG-T-CA--CCC-TACAATA--G--TTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGCAA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAGCGCT--A-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTTGTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------A---AAT---------TATCAAAATTGTATCCATATA--T-ATACC-----------AA------AAAGATT-----TGA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACA-T---GGGTATACTATT---------T-----------------TGAGCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--C-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TAT--TGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG----AA-G-------AA-G-GAT-TTATGTTATATTCTTTGGCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-T-AGATATTCA-TC-TGA-GGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGCAA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----G-A-AAGAT-ACATG-T--A-----A-----------------------ACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------A--T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACAG-TC-ACGG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TG-------TT--TTTA----TTAAA------AA-A----------CTGAA--GA--------AATTTTACGAA----AGT-----CGTCG-CC-TCA-AAAATAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-CT-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGA------G------TATCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT---GTCTTAtgta
gi|8 : A------A----------A--------------A-------AAGTGT----------AT----ACA--GGCAAA-GGGT-AGGTA-C---TTT-GAAGG-GCAGGGA-C--CAATA----AAAAGG---AT--CACAGATgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|8 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctAAGGGTAGGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACC--AATAAAAAGGATCA--CAG------------AT-GTGGGTGAAAACAgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--GA--ACAGA-G--GAAACACT-G-C-ACTTGAAATTA--AGGCCTATATA---C-----A-A-GT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-T-AGGTCCTTC-CCGT-A-GGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACAC-------CT------TAAAAAAG--C--T-GCTCGCCAAGG-T-CG--TCC-TGCAACA--G--TTGCAAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 222222222222222 222222222 111 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 666666666666666666666666666 222 1111111 111 11111 333333333333333333333333333 2222222222222 111 22222222222 111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 222222222222222222222222222222222222 111 1111 22222222 111 888888888888888888888888888888888 333333333333 11111111 11111111 111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111 222 11 1 2222222222222 111111 111111111 1111 1111111 1111111 11111111111 111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 99 66 4 77 222 444444444444444 4 66 3 3 3 0 55 777777777 3 3 444 1 3 3 0 8888888888888 3 777 9 6 3 3 3 3 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 5 6666 2 999999999999999999999999999 666 7 222 77 44 44 3 4 666 7777777 1 88 44 77 4444 5 2 7 2 2 888 5 000 3 77777 3 44 9 0 6 11111 6 6 44 111111111111111111111111111 2222222222222 6 111 555 3 3 6 2 3 88888888888 444444444 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 4 6666 66666666 333333333333333333333333333333333333 3 3 6 111 77 7777 3 44444444 44 555 3 6 555 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 000000000000000000000000000000000 1 4 4 8 3 000000000000 3 22222222 3 7 3 2 3 3 3 1 44 3 8 66666666 33 111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0000 3 3 555 44 5 1 3 000 4 5 5 5 55 77 1 4 4 777 4 2 4 1111111111111 3 3 000000 8888 333333333 99999 4 4 4 0 1 2222 4 0 7777 55 5555555 3 3 3 0000000 55555555555 3 99 3 3 2 333 999 44 3 3 77 6 44 44 3 333333333 555 88888 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 44 88 3 44 7777 0 5 3 1 3 3 6
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . .. .. . .. ... ............... . .. . . . . .. ......... . . ... . . . . ............. . ... . . . . . . .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . ........................... ... . ... .. .. .. . . ... ....... . .. .. .. .... . . . . . ... . ... . ..... . .. . . . ..... . . .. ........................... ............. . ... ... . . . . . ........... ......... . ............................................................. .... . .... ........ .................................... . . . ... .. .... . ........ .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ................................. . . . . . ............ . ........ . . . . . . . . .. . . ........ .. ... ...................................................... . .... . . ... .. . . . ... . . . . .. .. . . . ... . . . ............. . . ...... .... ......... ..... . . . . . .... . . .... .. ....... . . . ....... ........... . .. . . . ... ... .. . . .. . .. .. . ......... ... ..... ....................................................................................................................................................... .. .. . .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 33 11 4 33 222 999999999999999 4 11 6 6 6 3 00 777777777 6 6 555 4 5 6 4 3333333333333 3 777 2 2 1 1 8 1 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 2 5555 1 111111111111111111111111111 444 3 888 88 66 66 6 6 555 1111111 4 99 55 99 7777 7 7 5 5 5 888 0 888 1 55555 3 22 2 8 2 77777 7 7 66 777777777777777777777777777 9999999999999 7 777 888 3 3 7 1 6 88888888888 555555555 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9999 4 3333 11111111 444444444444444444444444444444444444 6 3 7 777 99 1111 3 22222222 66 888 3 7 888 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 777777777777777777777777777777777 1 0 0 0 1 555555555555 6 66666666 3 2 3 4 3 3 3 7 66 6 0 00000000 66 777 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 2222 3 3 888 66 7 0 3 111 4 0 0 0 00 22 6 0 0 000 0 1 0 8888888888888 5 6 555555 5555 666666666 33333 0 0 8 9 1 5555 0 8 5555 00 5555555 6 6 3 5555555 88888888888 3 33 1 1 5 777 222 66 3 3 99 7 66 66 3 333333333 888 33333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66 66 6 66 1111 3 2 3 8 3 6 0
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACAC-------CT-GT---AAAG--C--C--TG---CTCGCCAA-GGT-CGCCC-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG----AA--G--TTTTAT-G--TATT--T-TTTTTTTCTTTG-A-CAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TCGTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTAT---------TGAGGAG---TAT-----GAAA--------------A-------AAGTGT----------NT----CCA-----GG----------C-AAGGGT-GGGTA-C---TTT-G-A-GGGCA-GGA-C--GAAT-----AAAAGG---ATCA--AAGATTA-AT--AAAC--GTAAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACAC-------AT-GT---AANG--C--C--TA---CTCGCTAA-G-T-CGCCC-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG----AA--G--TTTTAT-G--TATTT-TTTTTTTTTTTTTG-A-CAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--NCGTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTAT---------TGAGGAG---TAT-----GAAA--------------A-------AAGTGT----------AT----CCA-----GG----------C-AAGGGT-GGGTA-C---TTT-G-A-GGGCAGGGA-C--GAAT-----AAAAGG---ATCA--AAGATTA-AT--AAAC--GTAAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--G-A--A-AAAG--CATACAA-TG-C-ACTTTAAAT--TAAGGACTAT-TA---A-----A-A-AT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTT-AATAGCTA-GGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATAC-------AT-GT---ACCA--C--C--AA---ATC-TTNA-G-T-CACCT-TGCAACA--G--TTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGAC-AA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GG---AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATA--CTT-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-A-TACGAG---TT--GTA----ACA-GAAA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TG--TTGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA----AA--GT-TTTTAT-G--TATTT-TTTTTTTTTTTTTACA-TAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACA-GTC-ACAGAGTAATTTC-TAATAA--AGA--GTT-CT----A---T-GCA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A-------------CATCG-CC-C--TC-GA-CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAAT-TCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCAC----CAGATTTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AA-ATGATG--GGTGT--C-CCTAT---------TGAGGAG---TAT-----GAAA--------------A-------AAGTGT----------AC----CCA-----GG----------CTAAGAGT-GAGTA-C---TTT-ATA-GGACATGGA-A--GAAT-----AAAAGG---ATCA--AAGATTA-AT--AAAT--NTAAGAATGAGTAC--TTTATAGGGCAGGGAAG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : --------A--------AG--TGGTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-C-T-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------GTACTAATATTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT----GTGCT---A--------CA-TC-CCC-CGTT-TCTC----AAGATTTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-------ATC-C----------AAATTTCAC---C---GA-----------T-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTC-T-GTA------------C-------T-ATGATG--GGAGT--G-CCTAA---------TAGGAAG---TAT-------AA--------------G-------AACTGA----------CT----CCA-----G-------------AA--GT-GG--A-C---T--------------GATC--TTCT-----AAAAAGTTTATCC--AGGCTCA-A--------------GATGGGTAC--TATGAAAGGCGGGGATA--AAT-AAAAAGAGTA--AA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCTATATA---ACTTCTA-A-GT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGAT-GT---AAAA--CTGC--TA---CTCGCTAA-GAA-CGTCT-TGCAAAA--G--TTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TGT-CTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCAC-------CT--C---AAAG--A--TGTTG---CTCGCCAA-GGT-CACCC-TGTAACA--A--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA----T-CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC---------TCA-GA-TGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-GAATGGT--ACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TATGCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACCTCAAAGAT-GT---AAAA--CTGC--TA---CTCGCTAA-G-AACGCT--TGCAAAA--G--TTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAA-C---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACCTCAAAGAT-GT---AAAA--CTGC--TA---CTCGCTAA-G-AACGCT--TGCAAAA--G--TTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AA-C---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--A-G--A-AGAG--TGAACAA-TG-C-ACTTGCAAT--TTGGGCCTATATA---A-----A-AAGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-TAGATATTC-A-TCATGA-GGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTAT--------------T-AT---GATG--------TA---C--GCCAA-GGT-CACACATG-AACA--C--TTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-GA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACA-TAATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACA-TAATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----GA-AAGAT-AAA-GCTTCT-----GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---AT---TTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTG-AAA-TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAA-------------A--CAATATC-----------AA------AAAGA--CTTGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--T--A----------TAT-----------------TGA-CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--CTA----ACAGGAAT--------AT--A---GCGCC---ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TA--GTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTGAAGAAA--G--TTTTATCA--TA-----------TAACCTG-A-TAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGT------G------TATTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT----GTTCT---AC---CACCCCCAC-CCC-C-TTTTCTC----CAGATTTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCCG-------TTC-CCCAA-AA---AAATTTCAA---C---GA-----------T-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTC-T-GCCATA--GT--A-TCA-GT--ATGATGATA--GGTAT--CAGCAAT---------TGAGAGA---CAT-----GACA--------------A-------A--TGT-----------T----TCA-----GA----------A-ATGGAT-TGATC-A---TCT-G-A-AAAC------T--GTAT-----ACCAGG---GC-------------T--AAGC--GTGA-----AGTAC--TTTG-AGGACA--GATGA-AAT-ATAAAGATTC--AAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTtc
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GAA--A-AAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA---A-----AGA-AT-TAGGTCATT-ACTT-GC-------------ATGTAAAAGCCC-GTTAGATATTCAA-TACTTA-GG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATGT-TTCA--------A------TA------GTCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATG-TAT-AACAC-------CTCAT---AAAT--G--C--TG---CTCG-TA--------CCT-TG-AACATCGCCTTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATC-TACA-AAAGACG--AAG---ATA--CCGT-AGACAAA-TTGGCTC--GA-TGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCT-AAGCT-TAG----GA-AAGAT-AAACGC----------GT--GC--------G------ATACCT----C---A-----TTGCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------G----AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------TGAG-CAAAAC-A-TACGAG---TTA-GTAC---ACA-GAAT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--A-----AA-AACG-T--CTA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA----AA--GT-TTTTAT-GTTTCTTT-TTTTTTTTTTTTTT-A-CAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAA-GGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAATTTC-T-ATAA--AA---GTTCTT----A---T-GAA---AAGA----------A------AA--T-----GTT----------------------CGTCG-CC-CT-CG-AA-CGG---G--T-TTAAG-A-TCT-CGAA--T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGA-GCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----A----CACCCA-AC-CCCACTTTCTCAC----CAGA--TA-TTTCCGTGCAAA-T-A--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTC-TGGCAAT---TT--A-TCA-GT--AA-ATGATG--GG-GT--C-CCTAT---------TGAGGAG---TAT-----GAAA--------------ATTTCCAGAAGTGTTAGCGTCAAAATGAAGCCA-----GG----------CTAACGAT-GAGTA-CCTTTTT-A-T-AGGCATGGA-CAGAAAT-----AAAAGG---ATCA--AAGATTA-A---AAAT--GT--GGGTGAggaaaa
gi|2 : aTAACGATGAGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGAAAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTaaacagccaagtgttcatttttttttgg
gi|20 : acgaggatttcaaaaataatgtcatttcaccttcttcgcgttaatcgttgaaatatcttactgaaccacattgacactgttaagaatcactgaaccgtagtggaaggaaatttcatgatcacaatttcactatcctagctacagtgtacattacttttatagcgtattcattgcactataactctgaaaggtaaactcttgaaaaaagcatacaattgcgactttaaattatagggactatgtaaagaattaggtcattacttgcatgtaaaagcccgttagatattcaatacttaggctgttatactatggaattgtcacaatgtttcaatagtctgtttgtcaggtagtgctaagttcaaaacatgtataacacctcataaatgctgctcgtaccttgaacatcgccttacaaccgaataataacagttgaataagtaccaccaaatctacaaaagacgaagataccgtagacaaattggctcgatgataaactttcttagcacgtgcttcaaggtattttgaaaaaaaatctaagcttaggaaagataaacgcgtgcgatacctcattgctgtaggtctgcaacaagaagagagtccggtttgaaaatgcaaagaattgtcaaaatatatcaaaaatactcttatgactaatctaattacgggtggtgagactttgagcaaaacatacgagttagtacacagaatcttcgggctcaaacagaaaaaacgtctattatgttgctaaaagattcaaccgtaaagtttttatgtttctttttttttttttttttacaagaaggccctgtcatgcaaaattcgttgtgccaaaggcaaaacagtcacaggtaatttctataaaagttcttatgaaaagaaaatgttcgtcgccctcgaacgggtttaagatctcgaattttgcacgacaattgcacctgacaccaaacacgcatatgaccgagtattttgagcggagaaggttactgttcacacccaaccccactttctcaccagatatttccgtgcaaatatttctgttccccaaacttaaattccacatatcttgtaaaagatgcaaatcacaaaatgtccttggtctggcaatttatcagtaaatgatggggtccctattgaggagtatgaaaatttccagaagtgttagcgtcaaaatgaagccaggc-GAA---AG-A-----------------AA--T-----ATT--------ACGAA----AG--TCGTCT-CC-C--AA-AAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AAC-T-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGA------G------TATTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCTT---ACA--CCCCCC-CC-CCC-CACCCTCTTTTTTCATAATTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGG------TTC-CCCAA-AC-TTTAATTCCAC---C---TACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTC-T-GCAATTTATT--A-TCA-GT--AT-TTGATA--GTTGT--C-CCTAT---------TGAGGAG---TAT-----GAAA--------------A-------ATGTgg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACAC-------tt
gi|21 : C-A-AA-C---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----GA-AAAAT-AAACGTC--A-----GGG--G---------G------ATA--------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTcgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTC----GAGATTTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-------TTC-CCAAA-TC-TTAAATTCCAT---C---TA-----------T-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCC-T-GTAAT---GT--A-TCT-GT--AT-ATGATT--AGTTT--C-CCTGT---------TGAGGAG---TAT-----GACA--------------A-------A--TGT----------TT----CCA-----G-------------AA--GT-GGA--------TT-G-A---TC---GA-C--GAAA-----AAGTGC---ATCC--AGG-----------CC--G--AGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCGGGGACG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCTG-------TTC-CCAAA-AC-TTATAGGCC-----C---CA-----------A-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC---GCAAT---TT--AATCGTAT--AT-ATGATG--GGTAT--C-CCTAT---------TGAGGAG---TAT-----G--G--------------A-------AAGTGT----------TT----CCA-----T---------------GAGT-GGG--------TT-G-A-T---------C--GTCT-----AAA---------A--AAGTGTATAC--AGAC--A-AAAGGTGAGTAC--TTTAAAGGGCAGGGACC--AAT-AAAAGGATCA--CAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTCTA----ACA-GTAT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AA--TTGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCT--AA--G------AA-A--CATTG-TTATTTTTCTTTTA-AACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GTAATTAAA-TGTTATT----A---T-TAA---ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTC-T-ACACT---TC--A-TTA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGGGTATGAAAAA---TGTTTCCAGAAGTGGATTGATCGTCTA-------AAGTGT----------AT----CCC-----GGA---------C-AAGAGT-GAGTA-T---TTT-G-AAGGGCAGATA-T--GAA------AAAATG---ATCACAAAGATTA-AT--ACAT--GT--GGTTGA
gi|25 : AAGAGTGAGTAT--TTTGAAGGGCAGATATG--AA--AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTTaaacatgcaagtgtcatttttggg
gi|26 : acaaatcactaaatatcttagggtctacacttcattagtatatgatgggtgtccctattgaggggtatgaaaaatgtttccagaagtggattgatcgtctaaagtgtatcccggac-----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACT-GACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-----------------T-GC-TA---------TTTTCTTTG-A-CAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACA-GTC-AAAG-GTAA---C-T-ATAA--AAggg
gi|27 : accaTTTTTTTTTT-A-CAGTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACA-ATC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAA--AAAATGTTGTT----A---T-AAA---AA-AACTGAAGAAAT------GAAAT-----ATT--------ACGAG----AG--CCGTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : -TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTACAT-ATGATG--GGTGT--C-CCTAT---------TGAGTAG---CAT-----GAAA--------------A-------A--TGT----------TC----CCA-----Gc
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATaagtggatcgattgtctaaaaagtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAG-A--A-TGAT--CAAATAA-TGGC-ACTTGAA----TGAAGCCTAAATA---A-----A-A-AG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-TAGATATTC-A-TTGTGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-AAAT----------T-GT------G--C--C--TG---CTCGCCAG-GGT-TGC---TACAACT--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGC-AAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----GA-AA-AT--AAC-CT--AAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTTGCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAATATACA--AA------AAAGA--CT---TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATACCTT--GTATTTAT---T-T-----------------TAAGCCAAAACTG-TAG---------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTA--CTGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC----AA--GGTTTTTAT-A--TG------CTCTTTTCTTTG-A-CAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACA-G-A-AAAG-GTAATTTC-T-AT-A--GAA-TGTTGTT----AATTT-TAA---AA-A----------A------AA--TGAAGAAGTGCCACGAAA--------AA--TCGTCG-CCTT--AA-AA-CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA---T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGA------G------TATTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---ACATGTACTAA-AC-ACT-CATTCTCTC----CAGATTTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC----------TC-CCAAA-AT-TTAAAATCCAA---C---TA-----------C-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T---------------CAAT---TT--A-TTA-GT--ATAATGGTG--GATATACC-TCTTT---------TGAGGAG---TAT-----GAAA--------------A-------A--TGT----------TT----CCAAAAGTGGATTTATCGTCT-AAAGAC-GTGTACC---TCT-C-A-GGGCA-AGA-C--AAGTATTTGAAAACG---ATCA--AAGATTA-AT--AA----GT--GGGTGAACAC--
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggtcaagtgtcattattctggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAA-TG-C-TCTTGAAAT--TAGGGCCTATATATAAA-----A-A-GT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCTAAATATTC-A-TTGTTA-GGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : A--------------A-------ACATGT----------AT----CCA-----GG----------CCAATAGTTAAGTA-C---TTTCA-A-GGACAGGAA-C--GAAT-----AAAAGG---ATCA--GAGATTA-AT--TAATAAATATGGGCGA
gi|32 : tcccgaaagtgggctgatcgtctTAAGTAC--TTTCAAGGACAGGAACG--AAT-AAAAGGATCA--GAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-aaacagccaagtg
gi|33 : tcccgaaagtgggctgatcgtctaaacatgtatccaggccaatagtGAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCAAAT--CCGTCG-CA-A--AACAA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCAAAG--TCGTCG-CA-A--AA-AA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACAC-------CT--C---AAAG--A-----TATTTCTCGCTAA-GGT-CGCCC-TGCAAAA--G--TTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-CGTTGCT----A---T-TAA---AAGA----------CTAA---AA--T-----ATTATGA----A--------AG--TCGTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-AC-T-T
gi|4 : -T-CGCCC-TGCAACA--G--TTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGC-AA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAGA-AAGAT-AAACACT--A-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------G----AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAG--------AATATACCAAAGA--CT---TGA----TAAT----TTTG-TTAC--T-GGTGATG--------AGAC--CTAGGTATACTTATT-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--CTAACAGACA-GAAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG----AAGGG--TTTTAT-GC-TA----------TTTCTTGG-G-AAATAGAAGGCCC-ATCATAGCAAG--ATTA-GT-GATG--CAGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-AT-----AA-TGTT-TTAAAAA---T-GAA---AG-A----------G------GA--T-----GAT--------A--------AAATTCATGG-AC-A--TA-AA-CGG---G--TAAAAGGTA--ATCTAGACAA-TTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGA-TGTG-GTGGA------GAGC---TGTTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------A-TGAGAGTCTTAAAAC---CCCGCC-AC-CGC-CATTTTCTCA---CAGATTAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-------TACGCACAA-ATGTGAAATTGCACG--C---CA-----------GATTGG----AAGAT--AA-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTT-GGAAT---TTAGA-TCA-GT--AT-AGGGTGATGGTGT----CCTAT---------TG-GGAGGTCTAT-----GAAA-------------------------TGT----------TT----CCA-----GA----------A-ATGGAT-TGATC-G---TCT-A-A---ACAG----C--GTAT-----CCA--G---A-CA--AAG--------------------GGCGAGTAC--TTTGAAGTGTAGGGACA--AAT-AAAAGGATCT--CAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|40 : AAC---CC-G-TAGACATTC-A-TCGTGA-GGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CCTTCTG------CAAATTTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-------TTC-CCCAATAC-TTAAATTCCAAGTACAAGTA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGA------C------AATTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT----ATTCT---GC---AAC----ACGCCC-TGTT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : --AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGC-AA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----GA-ATGAT-GAACGCT--A-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-A---AGAATCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGA---AAT---------TTTTAAA-------------ATTT-ATATCTAAAACATACAAA------AAAAA--CTT--TTAT---TAAT----TTAG-TTAT--T-GGTGATG--------AGAC--T--AT---------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--CTA----ACA-GAAC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TA--TTGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG----AAT-G--TTTTATAG--AA----TGTGATTTTCTTTA-A-CAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-A--C-CT-G-TAC-CAAAGGGC-AA----------------AACTTC-T-ACAA--AAA-TTTTGTT----AT--T-AAA---AA-A----------CTCAAGAAA--T-----ATTTCCA----A--------AG--TCGTCGCCC-C--AA-AA-CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA---T-TTAGC-ATG-A-CAA--TGC-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAGTACCGG------TATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACACA----CCC-CGATTTCTC----CAGATTTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTGTTCGATATTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---T---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTA-AT-ATGATG--TGTGT--C-CCTAT---------TGAGAAG---T--------AAA--------------T-------AAATGT----------TT----CCA-----G-------------AA--GT-AGA--------TT-G-A-T---------C--GTCT-----AAAA-------CA--AAGATGT-ATCCAGGC---CAAGGGTGTGTAC--TTTGAAGGACAGGGACG--AAT-AAAAGGATCA--AAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAA-TG-C-ATATAAATT--TAGGTCCTATATA---A-----A-A-GA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGA------C------AATTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : -----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACT-GACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--G-A--A-AAAGATCAAAAAA-TG-C-GCTGGAAAT--TAGGGCCTATATAT--A-----A-A-ATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-TAGATATCC-A-T--TGA-GGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACAC-------CT--C---AAAGATT--C--TG---CTCGCCAAAG-T-CACCC-TACAATA--G--TTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGC-AA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAGCGCT--A-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTTGTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------A---AAT---------TATCAAAATTGTATCCATATA--T-ATACC-----------AA------AAAGA--TT---TGA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACA-T--GGGTATACTATT-T-----------------TGAGCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG----AA--G------AA-G--GATTTATGTTATATTCTTTG-G-CAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAGATATTC-A-TC-TGA-GGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----GA-AAGAT-ACATG-T--A-----A-----------------------ACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------A--T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACA-GTC-ACGG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTTTT----A---TTAAA---AA-A----------CTGAA--GA--A-----ATTTTACGA--A--------AG--TCGTCG-CC-TCAAA-AA-TAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-C-T-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGA------G------TATCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT----GTCTT---Atgta
gi|8 : AAA--------------A-------AAGTGT----------AT----ACA-----GG----------CAAAGGGT-AGGTA-C---TTT-GAA-GGGCAGGGA-C--CAATA----AAAAGG---ATCA--CAGATgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|8 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctAAGGGTAGGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACC--AATAAAAAGGATCA--CAG------------AT-GTGGGTGAAAACAgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--G-A--ACAGAG--GAAACAC-TG-C-ACTTGAAAT--TAAGGCCTATATA---C-----A-A-GT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-TAGGTCCTT-C-CCGT-A-GGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACAC-------CT--TAAAAAAG-----C--TG---CTCGCCAAGG-T-CGTCC-TGCAACA--G--TTGCAAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 222222222222222 222222222 111 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 66666666666666666666666666666666 11 1111111 111 11111 333333333333333333333333333 2222222222222 111 22222222222 111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 222222222222222222222222222222222222 111 1111 22222222 111 77777777777777777777777777777777777 1111 333333333333 11111111 11111111 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1111 222 11 1 2222222222222 111111 111111111 1111 1111111 1111111 11111111111 2222222222 1111111111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 99 66 4 77 222 444444444444444 4 66 3 3 3 0 55 777777777 3 3 444 1 3 3 0 8888888888888 3 777 9 6 3 3 3 3 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 5 6666 2 44444444444444444444444444444444 55 666 00 1 3 4 666 7777777 1 88 44 77 4444 5 2 7 2 2 888 5 000 3 77777 3 44 9 0 6 11111 6 6 44 111111111111111111111111111 2222222222222 6 111 555 3 3 6 2 3 88888888888 444444444 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 4 6666 66666666 333333333333333333333333333333333333 3 3 6 111 77 7777 3 44444444 44 555 3 6 555 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 33333333333333333333333333333333333 3333 8 3 000000000000 3 22222222 3 7 3 2 3 3 3 1 44 3 8 66666666 33 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888 44 3 0 0000 3 3 555 44 5 1 3 000 4 5 5 5 55 77 1 4 4 777 4 2 4 1111111111111 3 3 000000 8888 333333333 99999 4 4 4 0 1 2222 4 0 7777 55 5555555 3 3 3 0000000 55555555555 3 99 3 3 2 333 999 44 3 3 77 6 44 44 3 555 4444444444 2222222222222222 77777 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44 88 3 55 7777 0 5 3 1 3 3 6
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . .. .. . .. ... ............... . .. . . . . .. ......... . . ... . . . . ............. . ... . . . . . . .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . ................................ .. ... .. . . . ... ....... . .. .. .. .... . . . . . ... . ... . ..... . .. . . . ..... . . .. ........................... ............. . ... ... . . . . . ........... ......... . ............................................................. .... . .... ........ .................................... . . . ... .. .... . ........ .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ................................... .... . . ............ . ........ . . . . . . . . .. . . ........ .. ... ................................................. .. . . .... . . ... .. . . . ... . . . . .. .. . . . ... . . . ............. . . ...... .... ......... ..... . . . . . .... . . .... .. ....... . . . ....... ........... . .. . . . ... ... .. . . .. . .. .. . ... .......... ................ ..... ................................................................................................. .. .. . .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 33 11 4 33 222 999999999999999 4 11 6 6 6 3 00 777777777 6 6 555 4 5 6 4 3333333333333 3 777 2 2 1 1 8 1 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 2 5555 1 33333333333333333333333333333333 00 444 66 8 6 6 555 1111111 4 99 55 99 7777 7 7 5 5 5 888 0 888 1 55555 3 22 2 8 2 77777 7 7 66 777777777777777777777777777 9999999999999 7 777 888 3 3 7 1 6 88888888888 555555555 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9999 4 3333 11111111 444444444444444444444444444444444444 6 3 7 777 99 1111 3 22222222 66 888 3 7 888 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 66666666666666666666666666666666666 2222 0 1 555555555555 6 66666666 3 2 3 4 3 3 3 7 66 6 0 00000000 66 777 1111111111111111111111111111111111111111111111111 66 3 0 2222 3 3 888 66 7 0 3 111 4 0 0 0 00 22 6 0 0 000 0 1 0 8888888888888 5 6 555555 5555 666666666 33333 0 0 8 9 1 5555 0 8 5555 00 5555555 6 6 3 5555555 88888888888 3 33 1 1 5 777 222 66 3 3 99 7 66 66 3 888 0000000000 7777777777777777 77777 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 66 66 6 00 1111 3 2 3 8 3 6 0
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG----AA----G--TTTTAT-G----TA-T-TT-TTTTTCTTT---GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAA-------AA-TGT----TT----------CCA-----GG----------C-AA-GGGT-GGGTA-C---TTT-G-AGGGCA-GGA-C--GNAT-----AAAA-GG---ATCAAAGATTA-AT--AAGC--GTAAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG----AA----G--TTTTAT-G----TATTTTT-TTTTTCTTT---GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAA-------AAGTGT----NT----------CCA-----GG----------C-AA-GGGT-GGGTA-C---TTT-G-AGGGCA-GGA-C--GAAT-----AAAA-GG---ATCAAAGATTA-AT--AAAC--GTAAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--G-A--A-AAAG--CATACAA-TG-C-ACTTTAAAT--TAAGGACTAT-TA---A-----A-A-AT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTT-AATAGCTA-GGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATACA-------T-------GT---ACCA--C--C--AAATCT--TN---A--GTCACCT-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGAC-AA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GG---AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATA--CTT-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-A-TACGAG---TT--GTA----ACA-GAAA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TG--TTGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA----AA----GT-TTTTAT-G----TATTTTT-TTTTTTTTTTTACATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACA-GTC-ACAGAGTAATTTC-TAATAA--AGA--GTT-CT----A---T-GCA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A-------------C-ATCG-CC-C--TC-GA-CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAAT-TCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCAC----CAGATTTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AA-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAA-------AAGTGT----AC----------CCA-----GG----------CTAA-GAGT-GAGTA-C---TTT-ATAGGACATGGA-A--GAAT-----AAAA-GG---ATCAAAGATTA-AT--AAAT--NTAAGAATGAGTAC--TTTATAGGGCAGGGAAG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : --------A--------AG--TG-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-C-T-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------GTACTAATATTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT----GTGCT---A--------CA-TC-CCC-CGTT-TCTC----AAGATTTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-------ATC-C----------AAATTTCAC---C---GA-----------T-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTC-T-GTA------------C-------T-ATGATG--GGAGT--G-CCTAATAGGAAG---TAT--AAG-------AACTGA----CT----------CCA-----G-------------AA---GT-GG--A-C---T-------------GATC--TTCT-----AAAA-AGTTTATCCAGGCTCA-A--------------GATGGGTAC--TATGAAAGGCGGGGATA--AAT-AAAAAGAG--TAAA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCTATATA---ACTTCTA-A-GT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGAT-------GT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGTCT-TGCAAAAGTTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TGT-CTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCACC-------T--------C---AAAG--A--TGTTGCTCG--CC---AAGGTCACCC-TGTAACAATTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA----T-CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC---------TCA-GA-TGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-GAATGGT--ACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TATGCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAA-C---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AA-C---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--A-G--A-AGAG--TGAACAA-TG-C-ACTTGCAAT--TTGGGCCTATATA---A-----A-AAGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-TAGATATTC-A-TCATGA-GGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTAT--------------T-------AT---GA----------TGTACG--CC---AAGGTCACACATG-AACACTTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-GA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACA-TAATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACA-TAATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----GA-AAGAT-AAA-GCTTCT-----GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---AT---TTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTG-AAA-TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAA-------------A--CAATATC-----------AA------AAAGA--CTTGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--T--A----------TAT-----------------TGA-CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--CTA----ACAGGAAT--------AT--A---GCGCC---ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TA--GTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTGAAGAAA----G--TTTTATCA----TA---------TAACCT---GATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGT------G------TATTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT----GTTCT---AC---CACCCCCAC-CCC-C-TTTTCTC----CAGATTTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCCG-------TTC-CCCAA-AA---AAATTTCAA---C---GA-----------T-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTC-T-GCCATA--GT--A-TCA-GT--ATGATGATA--GGTAT--CAGCAATTGAGAGA---CATGACAA-------A--TGT----TT-----------CA-----GA----------A-AT-GGAT-TGATC-A---TCT-G-AAAAC------T--GTAT-----ACCA-GG---GC-----------T--AAGC--GTGA-----AGTAC--TTTG-AGGACA--GATGA-AAT-ATAAAGAT--TCAAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTtc
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GAA--A-AAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA---A-----AGA-AT-TAGGTCATT-ACTT-GC-------------ATGTAAAAGCCC-GTTAGATATTCAA-TACTTA-GG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATGT-TTCA--------A------TA------GTCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATG-TAT-AACACC-------TC------AT---AAAT--G--C--TGCTCGTACCTTGAACATCGCC----------TTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATC-TACA-AAAGACG--AAG---ATA--CCGT-AGACAAA-TTGGCTC--GA-TGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCT-AAGCT-TAG----GA-AAGAT-AAACGC----------GT--GC--------G------ATACCT----C---A-----TTGCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------G----AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------TGAG-CAAAAC-A-TACGAG---TTA-GTAC---ACA-GAAT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--A-----AA-AACG-T--CTA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA----AA----GT-TTTTAT-GTTTCTTTTTTT-TTTTTTTTT---TACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAA-GGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAATTTC-T-ATAA--AA---GTTCTT----A---T-GAA---AAGA----------A------AA--T-----GT----------------------TC-GTCG-CC-CT-CG-AA-CGG---G--T-TTAAG-A-TCT-CGAA--T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGA-GCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----A----CACCCA-AC-CCCACTTTCTCAC----CAGA--TA-TTTCCGTGCAAA-T-A--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTC-TGGCAAT---TT--A-TCA-GT--AA-ATGATG--GG-GT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAATTTCCAGAAGTGTTAGCGTCAAAATGAAGCCA-----GG----------CTAA-CGAT-GAGTA-CCTTTTT-A-TAGGCATGGA-CAGAAAT-----AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A---AAAT--GT--GGGTGAggaaaa
gi|2 : aTAACGATGAGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGAAAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTaaacagccaagtgttcatttttttttgg
gi|20 : acgaggatttcaaaaataatgtcatttcaccttcttcgcgttaatcgttgaaatatcttactgaaccacattgacactgttaagaatcactgaaccgtagtggaaggaaatttcatgatcacaatttcactatcctagctacagtgtacattacttttatagcgtattcattgcactataactctgaaaggtaaactcttgaaaaaagcatacaattgcgactttaaattatagggactatgtaaagaattaggtcattacttgcatgtaaaagcccgttagatattcaatacttaggctgttatactatggaattgtcacaatgtttcaatagtctgtttgtcaggtagtgctaagttcaaaacatgtataacacctcataaatgctgctcgtaccttgaacatcgccttacaaccgaataataacagttgaataagtaccaccaaatctacaaaagacgaagataccgtagacaaattggctcgatgataaactttcttagcacgtgcttcaaggtattttgaaaaaaaatctaagcttaggaaagataaacgcgtgcgatacctcattgctgtaggtctgcaacaagaagagagtccggtttgaaaatgcaaagaattgtcaaaatatatcaaaaatactcttatgactaatctaattacgggtggtgagactttgagcaaaacatacgagttagtacacagaatcttcgggctcaaacagaaaaaacgtctattatgttgctaaaagattcaaccgtaaagtttttatgtttctttttttttttttttttacaagaaggccctgtcatgcaaaattcgttgtgccaaaggcaaaacagtcacaggtaatttctataaaagttcttatgaaaagaaaatgttcgtcgccctcgaacgggtttaagatctcgaattttgcacgacaattgcacctgacaccaaacacgcatatgaccgagtattttgagcggagaaggttactgttcacacccaaccccactttctcaccagatatttccgtgcaaatatttctgttccccaaacttaaattccacatatcttgtaaaagatgcaaatcacaaaatgtccttggtctggcaatttatcagtaaatgatggggtccctattgaggagtatgaaaatttccagaagtgttagcgtcaaaatgaagccaggc-GAA---AG-A-----------------AA--T-----ATT--------ACGAA----AG--TC-GTCT-CC-C--AA-AAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AAC-T-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGA------G------TATTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCTT---ACA--CCCCCC-CC-CCC-CACCCTCTTTTTTCATAATTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGG------TTC-CCCAA-AC-TTTAATTCCAC---C---TACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTC-T-GCAATTTATT--A-TCA-GT--AT-TTGATA--GTTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAA-------A--TGT----TT----------gg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACACC-------
gi|21 : C-A-AA-C---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----GA-AAAAT-AAACGTC--A-----GGG--G---------G------ATA--------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTC----GAGATTTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-------TTC-CCAAA-TC-TTAAATTCCAT---C---TA-----------T-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCC-T-GTAAT---GT--A-TCT-GT--AT-ATGATT--AGTTT--C-CCTGTTGAGGAG---TATGACAA-------A--TGT----TT----------CCA-----G-------------AA---GT-GGA--------TT-G-A--TC---GA-C--GAAA-----AAGT-GC---ATCCAGG-----------CC--G--AGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCGGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCTG-------TTC-CCAAA-AC-TTATAGGCC-----C---CA-----------A-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC---GCAAT---TT--AATCGTAT--AT-ATGATG--GGTAT--C-CCTATTGAGGAG---TATG--GA-------AAGTGT----TT----------CCA-----T----------------GAGT-GGG--------TT-G-AT---------C--GTCT-----AAA----------AAAGTGTATAC--AGAC--A-AAAGGTGAGTAC--TTTAAAGGGCAGGGACC--AAT-AAAAGGAT--CACAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTCTA----ACA-GTAT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AA--TTGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCT--AA----G------AA-A----CATTGTTATTTTTCTTTTA-AACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GTAATTAAA-TGTTATT----A---T-TAA---ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTC-T-ACACT---TC--A-TTA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGGG---TATGAAAA-------A--TGT----TT----------CCA-----G-------------AA---GT-GGA--------TT-G-AT---------C--GTCT-----AAAGTGT---ATCCCGG-----AC--AAGA--GTGAG------TAT--TTTGAAGGGCAGATATG--AA--AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTT
gi|26 : -----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACT-GACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-------------------T-GC---TA-------TTTTCTTT---GACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACA-GTC-AAAG-GTAA---C-T-ATAA--AAggg
gi|27 : acca-TTTTTTTTT---TACAGTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACA-ATC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAA--AAAATGTTGTT----A---T-AAA---AA-AACTGAAGAAAT------GAAAT-----ATT--------ACGAG----AG--CC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : -TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTACAT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGTAG---CATGAAAA-------A--TGT----TC----------CCA-----Gc
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATaagtggatcgattgtctaaaaagtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAG-A--A-TGAT--CAAATAA-TGGC-ACTTGAA----TGAAGCCTAAATA---A-----A-A-AG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-TAGATATTC-A-TTGTGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-AAAT----------T-------GT------G--C--C--TGCTCG--CC---AGGGTTGC---TACAACTGTTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGC-AAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----GA-AA-AT--AAC-CT--AAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTTGCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAATATACA--AA------AAAGA--CT---TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATACCTT--GTATTTAT---T-T-----------------TAAGCCAAAACTG-TAG---------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTA--CTGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC----AA----GGTTTTTAT-A----TG---CT-CTTTTCTTT---GACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACA-G-A-AAAG-GTAATTTC-T-AT-A--GAA-TGTTGTT----AATTT-TAA---AA-A----------A------AA--TGAAGAAGTGCCACGAAA--------AA--TC-GTCG-CCTT--AA-AA-CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA---T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGA------G------TATTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---ACATGTACTAA-AC-ACT-CATTCTCTC----CAGATTTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC----------TC-CCAAA-AT-TTAAAATCCAA---C---TA-----------C-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T---------------CAAT---TT--A-TTA-GT--ATAATGGTG--GATATACC-TCTTTTGAGGAG---TATGAAAA-------A--TGT----TT----------CCAAAAGTGGATTTATCGTCT-AA-AGAC-GTGTACC---TCT-C-AGGGCA-AGA-C--AAGTATTTGAAAA-CG---ATCAAAGATTA-AT--AA----GT--GGGTGAACAC--
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggtcaagtgtcattattctggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAA-TG-C-TCTTGAAAT--TAGGGCCTATATATAAA-----A-A-GT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCTAAATATTC-A-TTGTTA-GGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : AA-------ACATGT----AT----------CCA-----GG----------CCAA-TAGTTAAGTA-C---TTTCA-AGGACA-GGAAC--GAAT-----AAAA-GG---ATCAGAGATTA-AT--TAATAAATATGGGCGA
gi|32 : tcccgaaagtgggctgatcgtctTAAGTAC--TTTCAAGGACAGGAACG--AAT-AAAAGGAT--CAGAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-aaacagccaagtg
gi|33 : tcccgaaagtgggctgatcgtctaaacatgtatccaggccaatagtGAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCA-AA--TCCGTCG-CA-A--AACAA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCAAAG--TC-GTCG-CA-A--AA-AA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACACC-------T--------C---AAAG--A--TATTTCTCG--CT---AAGGTCGCCC-TGCAAAAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-CGTTGCT----A---T-TAA---AAGA----------CTAA---AA--T-----ATTATGA----A--------AG--TC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-AC-T-T
gi|4 : TCGCCC-TGCAACAGTTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGC-AA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAGA-AAGAT-AAACACT--A-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------G----AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAG--------AATATACCAAAGA--CT---TGA----TAAT----TTTG-TTAC--T-GGTGATG--------AGAC--CTAGGTATACTTATT-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--CTAACAGACA-GAAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG----AAGG--G--TTTTAT-GC---TA--------TTTCTTG---GGAAATAGAAGGCCC-ATCATAGCAAG--ATTA-GT-GATG--CAGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-AT-----AA-TGTT-TTAAAAA---T-GAA---AG-A----------G------GA--T-----GAT--------A--------AAATTC-ATGG-AC-A--TA-AA-CGG---G--TAAAAGGTA--ATCTAGACAA-TTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGA-TGTG-GTGGA------GAGC---TGTTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------A-TGAGAGTCTTAAAAC---CCCGCC-AC-CGC-CATTTTCTCA---CAGATTAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-------TACGCACAA-ATGTGAAATTGCACG--C---CA-----------GATTGG----AAGAT--AA-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTT-GGAAT---TTAGA-TCA-GT--AT-AGGGTGATGGTGT----CCTATTG-GGAGGTCTATGAAA-----------TGT----TT----------CCA-----GA----------A-AT-GGAT-TGATC-G---TCT-A-A--ACA-G---C--GTAT-----CCA---G---A-CAAAG--------------------GGCGAGTAC--TTTGAAGTGTAGGGACA--AAT-AAAAGGAT--CTCAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|40 : AAC---CC-G-TAGACATTC-A-TCGTGA-GGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CCTTCTG------CAAATTTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-------TTC-CCCAATAC-TTAAATTCCAAGTACAAGTA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGA------C------AATTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT----ATTCT---GC---AAC----ACGCCC-TGTT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGC-AA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----GA-ATGAT-GAACGCT--A-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-A---AGAATCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGA---AAT---------TTTTAAA-------------ATTT-ATATCTAAAACATACAAA------AAAAA--CTT--TTAT---TAAT----TTAG-TTAT--T-GGTGATG--------AGAC--T--AT---------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--CTA----ACA-GAAC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TA--TTGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG----AAT---G--TTTTAT-A----GAATGTG-ATTTTCTTT---AACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-A--C-CT-G-TAC-CAAAGGGC-AA----------------AACTTC-T-ACAA--AAA-TTTTGTT----AT--T-AAA---AA-A----------CTCAAGAAA--T-----ATTTCCA----A--------AG--TC-GTCGCCC-C--AA-AA-CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA---T-TTAGC-ATG-A-CAA--TGC-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAGTACCGG------TATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACACA----CCC-CGATTTCTC----CAGATTTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTGTTCGATATTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---T---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTA-AT-ATGATG--TGTGT--C-CCTATTGAGAAG---T---AAAT-------AAATGT----TT----------CCA-----G-------------AA---GT-AGA--------TT-G-AT---------C--GTCT-----AAAA--------CAAAGATGT-ATCCAGGC---CAAGGGTGTGTAC--TTTGAAGGACAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAA-TG-C-ATATAAATT--TAGGTCCTATATA---A-----A-A-GA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGA------C------AATTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : -----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACT-GACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--G-A--A-AAAGATCAAAAAA-TG-C-GCTGGAAAT--TAGGGCCTATATAT--A-----A-A-ATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-TAGATATCC-A-T--TGA-GGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACACC-------T--------C---AAAGATT--C--TGCTCG--CC---AAAGTCACCC-TACAATAGTTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGC-AA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAGCGCT--A-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTTGTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------A---AAT---------TATCAAAATTGTATCCATATA--T-ATACC-----------AA------AAAGA--TT---TGA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACA-T--GGGTATACTATT-T-----------------TGAGCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG----AAGAAGG--ATTTAT-G---------TT-ATATTCTTT---GGCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAGATATTC-A-TC-TGA-GGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----GA-AAGAT-ACATG-T--A-----A-----------------------ACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------A--T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACA-GTC-ACGG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTTTT----A---TTAAA---AA-A----------CTGAA--GA--A-----ATTTTACGA--A--------AG--TC-GTCG-CC-TCAAA-AA-TAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-C-T-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGA------G------TATCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT----GTCTT---Atgta
gi|8 : AAAA-------AAGTGT----AT----------ACA-----GG----------C-AAAGGGT-AGGTA-C---TTT-GAAGGGCAGGGA-C--CAATA----AAAA-GG---ATCACAGATgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|8 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctAAGGGTAGGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACC--AATAAAAAGGAT--CACAG------------AT-GTGGGTGAAAACAgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--G-A--ACAGAG--GAAACAC-TG-C-ACTTGAAAT--TAAGGCCTATATA---C-----A-A-GT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-TAGGTCCTT-C-CCGT-A-GGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACACC-------T--------TAAAAAAG-----C--TGCTCG--CC---AAGGTCGTCC-TGCAACAGTTGCAAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 222222222222222 222222222 111 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 66666666666666666666666666666666 11 1111111 111 11111 333333333333333333333333333 2222222222222 111 22222222222 111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 222222222222222222222222222222222222 111 1111 22222222 111 5555555555555555555555555555555555555 111111 333333333333 11111111 11111111 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1111 222 11 1 2222222222222 111111 111111111 1111 1111111 1111111 11111111111 22222222222 1111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 99 66 4 77 222 444444444444444 4 66 3 3 3 0 55 777777777 3 3 444 1 3 3 0 8888888888888 3 777 9 6 3 3 3 3 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 5 6666 2 44444444444444444444444444444444 55 666 00 1 3 4 666 7777777 1 88 44 77 4444 5 2 7 2 2 888 5 000 3 77777 3 44 9 0 6 11111 6 6 44 111111111111111111111111111 2222222222222 6 111 555 3 3 6 2 3 88888888888 444444444 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 4 6666 66666666 333333333333333333333333333333333333 3 3 6 111 77 7777 3 44444444 44 555 3 6 555 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 7777777777777777777777777777777777777 2 000000 8 3 000000000000 3 22222222 3 7 3 2 3 3 3 1 44 3 8 66666666 33 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888 44 3 0 0000 3 3 555 44 5 1 3 000 4 5 5 5 55 77 1 4 4 777 4 2 4 1111111111111 3 3 000000 8888 333333333 99999 4 4 4 0 1 2222 4 0 7777 55 5555555 3 3 3 0000000 55555555555 3 99 3 3 2 333 999 44 3 3 77 6 44 44 3 555 44444444444 2 6666 2222222222 77777 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44 88 3 55 7777 0 5 3 1 3 3 6
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . .. .. . .. ... ............... . .. . . . . .. ......... . . ... . . . . ............. . ... . . . . . . .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . ................................ .. ... .. . . . ... ....... . .. .. .. .... . . . . . ... . ... . ..... . .. . . . ..... . . .. ........................... ............. . ... ... . . . . . ........... ......... . ............................................................. .... . .... ........ .................................... . . . ... .. .... . ........ .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ..................................... . ...... . . ............ . ........ . . . . . . . . .. . . ........ .. ... ................................................. .. . . .... . . ... .. . . . ... . . . . .. .. . . . ... . . . ............. . . ...... .... ......... ..... . . . . . .... . . .... .. ....... . . . ....... ........... . .. . . . ... ... .. . . .. . .. .. . ... ........... . .... .......... ..... ............................................................................................. .. .. . .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 33 11 4 33 222 999999999999999 4 11 6 6 6 3 00 777777777 6 6 555 4 5 6 4 3333333333333 3 777 2 2 1 1 8 1 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 2 5555 1 33333333333333333333333333333333 00 444 66 8 6 6 555 1111111 4 99 55 99 7777 7 7 5 5 5 888 0 888 1 55555 3 22 2 8 2 77777 7 7 66 777777777777777777777777777 9999999999999 7 777 888 3 3 7 1 6 88888888888 555555555 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9999 4 3333 11111111 444444444444444444444444444444444444 6 3 7 777 99 1111 3 22222222 66 888 3 7 888 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 4444444444444444444444444444444444444 3 777777 0 1 555555555555 6 66666666 3 2 3 4 3 3 3 7 66 6 0 00000000 66 777 1111111111111111111111111111111111111111111111111 66 3 0 2222 3 3 888 66 7 0 3 111 4 0 0 0 00 22 6 0 0 000 0 1 0 8888888888888 5 6 555555 5555 666666666 33333 0 0 8 9 1 5555 0 8 5555 00 5555555 6 6 3 5555555 88888888888 3 33 1 1 5 777 222 66 3 3 99 7 66 66 3 444 44444444444 9 1111 5555555555 77777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 66 66 6 00 1111 3 2 3 8 3 6 0
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAA--------AAA-TGTT----T----------CCA-----GG----------C-AA-GGGT-GGGTA-C---TTT-G-AGGGCA-GGA-C--GTAT---AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A--T--AGGC-CAAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAA--------AAA-TGTT----T----------CCA-----GG----------C-AA-GGGT-GGGTA-C---TTT-G-AGGGCA-GGA-C--GNAT---AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A--T--AAGCGTAAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--G-A--A-AAAG--CATACAA-TG-C-ACTTTAAAT--TAAGGACTAT-TA---A-----A-A-AT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTT-AATAGCTA-GGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATACA-------T-------GT---ACCA--C--C--AAATCT--TN---A--GTCACCT-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGAC-AA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GG---AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATA--CTT-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-A-TACGAG---TT--GTA----ACA-GAAA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TG--TTGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTTTTTTTTTACATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACA-GTC-ACAGAGTAATTTC-TAATAA--AGA--GTT-CT----A---T-GCA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A-------------C-ATCG-CC-C--TC-GA-CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAAT-TCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCAC----CAGATTTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AA-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAA--------AAAGTGTA----C----------CCA-----GG----------CTAA-GAGT-GAGTA-C---TTT-ATAGGACATGGA-A--GAAT---AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A--T--AAATNTAAGAATGAGTAC--TTTATAGGGCAGGGAAG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : --------A--------AG--TG-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-C-T-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------GTACTAATATTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT----GTGCT---A--------CA-TC-CCC-CGTT-TCTC----AAGATTTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-------ATC-C----------AAATTTCAC---C---GA-----------T-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTC-T-GTA------------C-------T-ATGATG--GGAGT--G-CCTAATAGGAAG---TAT-AAG--------AAC-TGAC----T----------CCA-----G-------------AA---GT-GG--A-C---T-------------GATC--TTCT---AAAA-AGTTTATCCAGGCTCA-A--------------GATGGGTAC--TATGAAAGGCGGGGATA--AAT-AAAAAGAG--TAAA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCTATATA---ACTTCTA-A-GT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGAT-------GT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGTCT-TGCAAAAGTTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TGT-CTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCACC-------T--------C---AAAG--A--TGTTGCTCG--CC---AAGGTCACCC-TGTAACAATTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA----T-CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC---------TCA-GA-TGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-GAATGGT--ACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TATGCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAA-C---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AA-C---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--A-G--A-AGAG--TGAACAA-TG-C-ACTTGCAAT--TTGGGCCTATATA---A-----A-AAGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-TAGATATTC-A-TCATGA-GGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTAT--------------T-------AT---GA----------TGTACG--CC---AAGGTCACACATG-AACACTTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-GA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACA-TAATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACA-TAATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----GA-AAGAT-AAA-GCTTCT-----GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---AT---TTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTG-AAA-TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAA-------------A--CAATATC-----------AA------AAAGA--CTTGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--T--A----------TAT-----------------TGA-CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--CTA----ACAGGAAT--------AT--A---GCGCC---ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TA--GTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTGAAGA-AA----G-TTTTATCA------TA---------TAACCT-----GATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGT------G------TATTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT----GTTCT---AC---CACCCCCAC-CCC-C-TTTTCTC----CAGATTTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCCG-------TTC-CCCAA-AA---AAATTTCAA---C---GA-----------T-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTC-T-GCCATA--GT--A-TCA-GT--ATGATGATA--GGTAT--CAGCAATTGAGAGA---CATG-AC--------AAA-TGTT----T-----------CA-----GA----------A-AT-GGAT-TGATC-A---TCT-G-AAAAC------T--GTAT---ACCA-GG---GC-------------T--AAGCGTGA-----AGTAC--TTTG-AGGACA--GATGA-AAT-ATAAAGAT--TCAAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTtc
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GAA--A-AAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA---A-----AGA-AT-TAGGTCATT-ACTT-GC-------------ATGTAAAAGCCC-GTTAGATATTCAA-TACTTA-GG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATGT-TTCA--------A------TA------GTCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATG-TAT-AACACC-------TC------AT---AAAT--G--C--TGCTCGTACCTTGAACATCGCC----------TTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATC-TACA-AAAGACG--AAG---ATA--CCGT-AGACAAA-TTGGCTC--GA-TGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCT-AAGCT-TAG----GA-AAGAT-AAACGC----------GT--GC--------G------ATACCT----C---A-----TTGCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------G----AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------TGAG-CAAAAC-A-TACGAG---TTA-GTAC---ACA-GAAT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--A-----AA-AACG-T--CTA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-GTTTCTTTTT-TTT--TTTTTTTT-----TACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAA-GGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAATTTC-T-ATAA--AA---GTTCTT----A---T-GAA---AAGA----------A------AA--T-----GT----------------------TC-GTCG-CC-CT-CG-AA-CGG---G--T-TTAAG-A-TCT-CGAA--T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGA-GCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----A----CACCCA-AC-CCCACTTTCTCAC----CAGA--TA-TTTCCGTGCAAA-T-A--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTC-TGGCAAT---TT--A-TCA-GT--AA-ATGATG--GG-GT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAATTTCCAGAAG-TGTTAGCGTCAAAATGAAGCCA-----GG----------CTAA-CGAT-GAGTA-CCTTTTT-A-TAGGCATGGA-CAGAAAT---AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A-----AAATGT--GGGTGAggaaaa
gi|2 : aTCAAA-ATGA-AGCC--AGGC-TAACGATGAGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGAAAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTaaacagccaagtgttcatttttttttgg
gi|20 : acgaggatttcaaaaataatgtcatttcaccttcttcgcgttaatcgttgaaatatcttactgaaccacattgacactgttaagaatcactgaaccgtagtggaaggaaatttcatgatcacaatttcactatcctagctacagtgtacattacttttatagcgtattcattgcactataactctgaaaggtaaactcttgaaaaaagcatacaattgcgactttaaattatagggactatgtaaagaattaggtcattacttgcatgtaaaagcccgttagatattcaatacttaggctgttatactatggaattgtcacaatgtttcaatagtctgtttgtcaggtagtgctaagttcaaaacatgtataacacctcataaatgctgctcgtaccttgaacatcgccttacaaccgaataataacagttgaataagtaccaccaaatctacaaaagacgaagataccgtagacaaattggctcgatgataaactttcttagcacgtgcttcaaggtattttgaaaaaaaatctaagcttaggaaagataaacgcgtgcgatacctcattgctgtaggtctgcaacaagaagagagtccggtttgaaaatgcaaagaattgtcaaaatatatcaaaaatactcttatgactaatctaattacgggtggtgagactttgagcaaaacatacgagttagtacacagaatcttcgggctcaaacagaaaaaacgtctattatgttgctaaaagattcaaccgtaaagtttttatgtttctttttttttttttttttacaagaaggccctgtcatgcaaaattcgttgtgccaaaggcaaaacagtcacaggtaatttctataaaagttcttatgaaaagaaaatgttcgtcgccctcgaacgggtttaagatctcgaattttgcacgacaattgcacctgacaccaaacacgcatatgaccgagtattttgagcggagaaggttactgttcacacccaaccccactttctcaccagatatttccgtgcaaatatttctgttccccaaacttaaattccacatatcttgtaaaagatgcaaatcacaaaatgtccttggtctggcaatttatcagtaaatgatggggtccctattgaggagtatgaaaatttccagaagtgttagcg-GAA---AG-A-----------------AA--T-----ATT--------ACGAA----AG--TC-GTCT-CC-C--AA-AAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AAC-T-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGA------G------TATTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCTT---ACA--CCCCCC-CC-CCC-CACCCTCTTTTTTCATAATTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGG------TTC-CCCAA-AC-TTTAATTCCAC---C---TACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTC-T-GCAATTTATT--A-TCA-GT--AT-TTGATA--GTTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATG-AA--------AAA-TGTT----T----------gg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACACC-------
gi|21 : C-A-AA-C---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----GA-AAAAT-AAACGTC--A-----GGG--G---------G------ATA--------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTC----GAGATTTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-------TTC-CCAAA-TC-TTAAATTCCAT---C---TA-----------T-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCC-T-GTAAT---GT--A-TCT-GT--AT-ATGATT--AGTTT--C-CCTGTTGAGGAG---TATG-AC--------AAA-TGTT----T----------CCA-----G-------------AA---GT-GGA--------TT-G-A--TC---GA-C--GAAA---AAGT-GC---ATC------------C--AGGC-CGAGGGTGAGTAC--TTTGAAGGGCGGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCTG-------TTC-CCAAA-AC-TTATAGGCC-----C---CA-----------A-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC---GCAAT---TT--AATCGTAT--AT-ATGATG--GGTAT--C-CCTATTGAGGAG---TATG-GA--------AAG-TGTT----T----------CCA-----T----------------GAGT-GGG--------TT-G-AT---------C--GTCT---AAA----------AAAGTGTATA--C--AGACA-AAAGGTGAGTAC--TTTAAAGGGCAGGGACC--AAT-AAAAGGAT--CACAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTCTA----ACA-GTAT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AA--TTGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCTAAGAA----A-CATTGT--------TAT-TTT--TCTT-TTA-----AACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GTAATTAAA-TGTTATT----A---T-TAA---ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTC-T-ACACT---TC--A-TTA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGGG---TATG-AA--------AAA-TGTT----T----------CCA-----G-------------AA---GT-GGA--------TT-G-AT---------C--GTCT---AAAGTGT---ATCCCGGA---------------CAAGAGTGAGTAT--TTTGAAGGGCAGATATG--AA--AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTT
gi|26 : -----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACT-GACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-------------------T-GC-----TA-------TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACA-GTC-AAAG-GTAA---C-T-ATAA--AAggg
gi|27 : accaT--TTTTTTTT-----TACAGTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACA-ATC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAA--AAAATGTTGTT----A---T-AAA---AA-AACTGAAGAAAT------GAAAT-----ATT--------ACGAG----AG--CC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : -TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTACAT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGTAG---CATG-AA--------AAA-TGTT----C----------CCA-----Gc
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATaagtggatcgattgtctaaaaagtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAG-A--A-TGAT--CAAATAA-TGGC-ACTTGAA----TGAAGCCTAAATA---A-----A-A-AG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-TAGATATTC-A-TTGTGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-AAAT----------T-------GT------G--C--C--TGCTCG--CC---AGGGTTGC---TACAACTGTTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGC-AAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----GA-AA-AT--AAC-CT--AAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTTGCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAATATACA--AA------AAAGA--CT---TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATACCTT--GTATTTAT---T-T-----------------TAAGCCAAAACTG-TAG---------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTA--CTGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC-----AA----G-GTTTTT-A------TATGCTC--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACA-G-A-AAAG-GTAATTTC-T-AT-A--GAA-TGTTGTT----AATTT-TAA---AA-A----------A------AA--TGAAGAAGTGCCACGAAA--------AA--TC-GTCG-CCTT--AA-AA-CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA---T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGA------G------TATTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---ACATGTACTAA-AC-ACT-CATTCTCTC----CAGATTTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC----------TC-CCAAA-AT-TTAAAATCCAA---C---TA-----------C-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T---------------CAAT---TT--A-TTA-GT--ATAATGGTG--GATATACC-TCTTTTGAGGAG---TATG-AA--------AAA-TGTT----T----------CCAAAAGTGGATTTATCGTCT-AA-AGAC-GTGTACC---TCT-C-AGGGCA-AGA-CAAGTATTTGAAAA-CG---ATCAAAGATTA-A--T--AAGT----GGGTGAACAC--
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggtcaagtgtcattattctggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAA-TG-C-TCTTGAAAT--TAGGGCCTATATATAAA-----A-A-GT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCTAAATATTC-A-TTGTTA-GGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : AA--------ACA-TGTA----T----------CCA-----GG----------CCAA-TAGTTAAGTA-C---TTTCA-AGGACA-GGAAC--GAAT---AAAA-GG---ATCAGAGATTA-A--T--
gi|32 : tcccgaaagtgggctgatcgtctTAAGTAC--TTTCAAGGACAGGAACG--AAT-AAAAGGAT--CAGAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-taataaatatgggcgaaaacagccaagtg
gi|33 : tcccgaaagtgggctgatcgtctaaacatgtatccaggccaatagtGAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCA-AA--TCCGTCG-CA-A--AACAA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCAAAG--TC-GTCG-CA-A--AA-AA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACACC-------T--------C---AAAG--A--TATTTCTCG--CT---AAGGTCGCCC-TGCAAAAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-CGTTGCT----A---T-TAA---AAGA----------CTAA---AA--T-----ATTATGA----A--------AG--TC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-AC-T-T
gi|4 : TCGCCC-TGCAACAGTTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGC-AA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAGA-AAGAT-AAACACT--A-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------G----AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAG--------AATATACCAAAGA--CT---TGA----TAAT----TTTG-TTAC--T-GGTGATG--------AGAC--CTAGGTATACTTATT-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--CTAACAGACA-GAAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG-----AAGG--G-TTTTAT-GC-----TA--------TTTCTTG-----GGAAATAGAAGGCCC-ATCATAGCAAG--ATTA-GT-GATG--CAGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-AT-----AA-TGTT-TTAAAAA---T-GAA---AG-A----------G------GA--T-----GAT--------A--------AAATTC-ATGG-AC-A--TA-AA-CGG---G--TAAAAGGTA--ATCTAGACAA-TTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGA-TGTG-GTGGA------GAGC---TGTTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------A-TGAGAGTCTTAAAAC---CCCGCC-AC-CGC-CATTTTCTCA---CAGATTAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-------TACGCACAA-ATGTGAAATTGCACG--C---CA-----------GATTGG----AAGAT--AA-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTT-GGAAT---TTAGA-TCA-GT--AT-AGGGTGATGGTGT----CCTATTG-GGAGGTCTATG-----------AAA-TGTT----T----------CCA-----GA----------A-AT-GGAT-TGATC-G---TCT-A-A--ACA-G---C--GTAT--------------CCAGACA----------------AAGGGCGAGTAC--TTTGAAGTGTAGGGACA--AAT-AAAAGGAT--CTCAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|40 : AAC---CC-G-TAGACATTC-A-TCGTGA-GGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CCTTCTG------CAAATTTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-------TTC-CCCAATAC-TTAAATTCCAAGTACAAGTA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGA------C------AATTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT----ATTCT---GC---AAC----ACGCCC-TGTT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGC-AA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----GA-ATGAT-GAACGCT--A-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-A---AGAATCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGA---AAT---------TTTTAAA-------------ATTT-ATATCTAAAACATACAAA------AAAAA--CTT--TTAT---TAAT----TTAG-TTAT--T-GGTGATG--------AGAC--T--AT---------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--CTA----ACA-GAAC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TA--TTGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG-----AAT---G-TTTTAT-A------GAA-TGTGATTTTCTTT-----AACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-A--C-CT-G-TAC-CAAAGGGC-AA----------------AACTTC-T-ACAA--AAA-TTTTGTT----AT--T-AAA---AA-A----------CTCAAGAAA--T-----ATTTCCA----A--------AG--TC-GTCGCCC-C--AA-AA-CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA---T-TTAGC-ATG-A-CAA--TGC-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAGTACCGG------TATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACACA----CCC-CGATTTCTC----CAGATTTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTGTTCGATATTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---T---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTA-AT-ATGATG--TGTGT--C-CCTATTGAGAAG---TA--AAT--------AAA-TGTT----T----------CCA-----G-------------AA---GT-AGA--------TT-G-AT---------C--GTCT---AAAA--------CAAAGATGT-A--TCCAGGC-CAAGGGTGTGTAC--TTTGAAGGACAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAA-TG-C-ATATAAATT--TAGGTCCTATATA---A-----A-A-GA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGA------C------AATTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : -----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACT-GACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--G-A--A-AAAGATCAAAAAA-TG-C-GCTGGAAAT--TAGGGCCTATATAT--A-----A-A-ATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-TAGATATCC-A-T--TGA-GGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACACC-------T--------C---AAAGATT--C--TGCTCG--CC---AAAGTCACCC-TACAATAGTTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGC-AA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAGCGCT--A-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTTGTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------A---AAT---------TATCAAAATTGTATCCATATA--T-ATACC-----------AA------AAAGA--TT---TGA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACA-T--GGGTATACTATT-T-----------------TGAGCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG-----AAGAAGG-ATTTAT-G----------TTA--TATTCTTT-----GGCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAGATATTC-A-TC-TGA-GGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----GA-AAGAT-ACATG-T--A-----A-----------------------ACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------A--T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACA-GTC-ACGG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTTTT----A---TTAAA---AA-A----------CTGAA--GA--A-----ATTTTACGA--A--------AG--TC-GTCG-CC-TCAAA-AA-TAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-C-T-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGA------G------TATCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT----GTCTT---Atgta
gi|8 : G---TCTAAAA--------AAG-TGTA----T----------ACA-----GG----------C-AAAGGGT-AGGTA-C---TTT-GAAGGGCAGGGA-C--CAATA--AAAA-GG---ATCACAGATgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|8 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcAAGGGTAGGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACC--AATAAAAAGGAT--CACAG------------AT-GTGGGTGAAAACAgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--G-A--ACAGAG--GAAACAC-TG-C-ACTTGAAAT--TAAGGCCTATATA---C-----A-A-GT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-TAGGTCCTT-C-CCGT-A-GGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACACC-------T--------TAAAAAAG-----C--TGCTCG--CC---AAGGTCGTCC-TGCAACAGTTGCAAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 222222222222222 222222222 111 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 66666666666666666666666666666666 11 1111111 111 11111 333333333333333333333333333 2222222222222 111 22222222222 111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 222222222222222222222222222222222222 111 1111 22222222 111 5555555555555555555555555555555555555 111111 333333333333 11111111 11111111 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1111 222 11 1 2222222222222 111111 111111111 1111 1111111 1111111 11111111111 22222222222 1111111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 99 66 4 77 222 444444444444444 4 66 3 3 3 0 55 777777777 3 3 444 1 3 3 0 8888888888888 3 777 9 6 3 3 3 3 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 5 6666 2 44444444444444444444444444444444 55 666 00 1 3 4 666 7777777 1 88 44 77 4444 5 2 7 2 2 888 5 000 3 77777 3 44 9 0 6 11111 6 6 44 111111111111111111111111111 2222222222222 6 111 555 3 3 6 2 3 88888888888 444444444 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 4 6666 66666666 333333333333333333333333333333333333 3 3 6 111 77 7777 3 44444444 44 555 3 6 555 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 7777777777777777777777777777777777777 2 000000 8 3 000000000000 3 22222222 3 7 3 2 3 3 3 1 44 3 8 66666666 33 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888 44 3 0 0000 3 3 555 44 5 1 3 000 4 5 5 5 55 77 1 4 4 777 4 2 4 1111111111111 3 3 000000 8888 333333333 99999 4 4 4 0 1 2222 4 0 7777 55 5555555 3 3 3 0000000 55555555555 3 99 3 3 2 333 999 44 3 3 77 6 44 44 3 555 22222222222 3 6666 3333333333 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 5 3 3 44 88 3 55 7777 0 5 3 1 3 3 6
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . .. .. . .. ... ............... . .. . . . . .. ......... . . ... . . . . ............. . ... . . . . . . .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . ................................ .. ... .. . . . ... ....... . .. .. .. .... . . . . . ... . ... . ..... . .. . . . ..... . . .. ........................... ............. . ... ... . . . . . ........... ......... . ............................................................. .... . .... ........ .................................... . . . ... .. .... . ........ .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ..................................... . ...... . . ............ . ........ . . . . . . . . .. . . ........ .. ... ................................................. .. . . .... . . ... .. . . . ... . . . . .. .. . . . ... . . . ............. . . ...... .... ......... ..... . . . . . .... . . .... .. ....... . . . ....... ........... . .. . . . ... ... .. . . .. . .. .. . ... ........... . .... .......... ............................................................................................ . . . . .. .. . .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 33 11 4 33 222 999999999999999 4 11 6 6 6 3 00 777777777 6 6 555 4 5 6 4 3333333333333 3 777 2 2 1 1 8 1 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 2 5555 1 33333333333333333333333333333333 00 444 66 8 6 6 555 1111111 4 99 55 99 7777 7 7 5 5 5 888 0 888 1 55555 3 22 2 8 2 77777 7 7 66 777777777777777777777777777 9999999999999 7 777 888 3 3 7 1 6 88888888888 555555555 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9999 4 3333 11111111 444444444444444444444444444444444444 6 3 7 777 99 1111 3 22222222 66 888 3 7 888 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 4444444444444444444444444444444444444 3 777777 0 1 555555555555 6 66666666 3 2 3 4 3 3 3 7 66 6 0 00000000 66 777 1111111111111111111111111111111111111111111111111 66 3 0 2222 3 3 888 66 7 0 3 111 4 0 0 0 00 22 6 0 0 000 0 1 0 8888888888888 5 6 555555 5555 666666666 33333 0 0 8 9 1 5555 0 8 5555 00 5555555 6 6 3 5555555 88888888888 3 33 1 1 5 777 222 66 3 3 99 7 66 66 3 444 22222222222 1 5555 5555555555 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 8 3 3 66 66 6 00 1111 3 2 3 8 3 6 0
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAA--------AAA-TGTT----T----------CCA-----GG------------AA-GGGTGGGTA-C---TTTG-ANGGCA-GGA-C--GT--AT---AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A--C--AGG-CCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------G------TATTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAA--------AAA-TGTT----T----------CCA-----GG----------C-AA-GGGTGGGTA-C---TTTG-AGGGCA-GGA-C--GT--AT---AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A--T--AGG-CCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--G-A--A-AAAG--CATACAA-TG-C-ACTTTAAAT--TAAGGACTAT-TA---A-----A-A-AT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTT-AATAGCTA-GGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATACA-------T-------GT---ACCA--C--C--AAATCT--TN---A--GTCACCT-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGAC-AA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GG---AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATA--CTT-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-A-TACGAG---TT--GTA----ACA-GAAA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TG--TTGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTTTTTTTTTACATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACA-GTC-ACAGAGTAATTTC-TAATAA--AGA--GTT-CT----A---T-GCA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A-------------C-ATCG-CC-C--TC-GA-CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAAT-TCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCAC----CAGATTTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AA-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAA--------AAAGTGTA----C----------CCA-----GG----------CTAA-GAGTGAGTA-C---TTTATAGGACATGGA-A--GA--AT---AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A--T--AAATNTAAGAAT-G-AGTAC--TTTATAGGGCAGGGAAG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : --------A--------AG--TG-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-C-T-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGA------GTACTAATATTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT----GTGCT---A--------CA-TC-CCC-CGTT-TCTC----AAGATTTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-------ATC-C----------AAATTTCAC---C---GA-----------T-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTC-T-GTA------------C-------T-ATGATG--GGAGT--G-CCTAATAGGAAG---TAT-AAG--------AAC-TGAC----T----------CCA-----G-------------AA---GTGG--A-C---T------------GATC--TT--CT---AAAA-AG-----------TTT-A--TCCAGG-CTCAAGAT-G-GGTAC--TATGAAAGGCGGGGATA--AAT-AAAAAGAG--TAAA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCTATATA---ACTTCTA-A-GT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGAT-------GT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGTCT-TGCAAAAGTTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TGT-CTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCACC-------T--------C---AAAG--A--TGTTGCTCG--CC---AAGGTCACCC-TGTAACAATTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA----T-CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC---------TCA-GA-TGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-GAATGGT--ACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TATGCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAA-C---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AA-C---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--A-G--A-AGAG--TGAACAA-TG-C-ACTTGCAAT--TTGGGCCTATATA---A-----A-AAGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-TAGATATTC-A-TCATGA-GGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTAT--------------T-------AT---GA----------TGTACG--CC---AAGGTCACACATG-AACACTTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-GA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACA-TAATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAA-------------AGGT-ATAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGTGGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACA-TAATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----GA-AAGAT-AAA-GCTTCT-----GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---AT---TTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTG-AAA-TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAA-------------A--CAATATC-----------AA------AAAGA--CTTGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--T--A----------TAT-----------------TGA-CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--CTA----ACAGGAAT--------AT--A---GCGCC---ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TA--GTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTGAAGA-AA----G-TTTTATCA------TA---------TAACCT-----GATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGT------G------TATTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT----GTTCT---AC---CACCCCCAC-CCC-C-TTTTCTC----CAGATTTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCCG-------TTC-CCCAA-AA---AAATTTCAA---C---GA-----------T-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTC-T-GCCATA--GT--A-TCA-GT--ATGATGATA--GGTAT--CAGCAATTGAGAGA---CATG-AC--------AAA-TGTT----T-----------CA-----GA----------A-AT-GGATTGATC-A---TCTG-AAAAC------T--GT--AT---ACCA-G-----------------------GG-CTAAGCGT-GAAGTAC--TTTG-AGGACA--GATGA-AAT-ATAAAGAT--TCAAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTtc
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GAA--A-AAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA---A-----AGA-AT-TAGGTCATT-ACTT-GC-------------ATGTAAAAGCCC-GTTAGATATTCAA-TACTTA-GG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATGT-TTCA--------A------TA------GTCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATG-TAT-AACACC-------TC------AT---AAAT--G--C--TGCTCGTACCTTGAACATCGCC----------TTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATC-TACA-AAAGACG--AAG---ATA--CCGT-AGACAAA-TTGGCTC--GA-TGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCT-AAGCT-TAG----GA-AAGAT-AAACGC----------GT--GC--------G------ATACCT----C---A-----TTGCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------G----AAT---------TGTCAAA-------------A--T-ATATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------TGAG-CAAAAC-A-TACGAG---TTA-GTAC---ACA-GAAT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--A-----AA-AACG-T--CTA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-GTTTCTTTTT-TTT--TTTTTTTT-----TACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAA-GGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAATTTC-T-ATAA--AA---GTTCTT----A---T-GAA---AAGA----------A------AA--T-----GT----------------------TC-GTCG-CC-CT-CG-AA-CGG---G--T-TTAAG-A-TCT-CGAA--T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCA-TATG-ACCGA------G------TATTTTGA-GCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----A----CACCCA-AC-CCCACTTTCTCAC----CAGA--TA-TTTCCGTGCAAA-T-A--TT--TCTG-------TTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTC-TGGCAAT---TT--A-TCA-GT--AA-ATGATG--GG-GT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAATTTCCAGAAG-TGTTAGCGTCAAAATGAAGCCA-----GG----------CTAA-CGATGAGTA-CCTTTTTA-TAGGCATGGA-C--AGAAAT---AAAA-GG---ATCAAAGATTA-A--ggaaaa
gi|2 : aTCAAA-ATGA-AGCC--AGG-CTAACGAT-G-AGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGAAAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTaaatgtgggtgaaaacagccaagtgttcatttttttttgg
gi|20 : acgaggatttcaaaaataatgtcatttcaccttcttcgcgttaatcgttgaaatatcttactgaaccacattgacactgttaagaatcactgaaccgtagtggaaggaaatttcatgatcacaatttcactatcctagctacagtgtacattacttttatagcgtattcattgcactataactctgaaaggtaaactcttgaaaaaagcatacaattgcgactttaaattatagggactatgtaaagaattaggtcattacttgcatgtaaaagcccgttagatattcaatacttaggctgttatactatggaattgtcacaatgtttcaatagtctgtttgtcaggtagtgctaagttcaaaacatgtataacacctcataaatgctgctcgtaccttgaacatcgccttacaaccgaataataacagttgaataagtaccaccaaatctacaaaagacgaagataccgtagacaaattggctcgatgataaactttcttagcacgtgcttcaaggtattttgaaaaaaaatctaagcttaggaaagataaacgcgtgcgatacctcattgctgtaggtctgcaacaagaagagagtccggtttgaaaatgcaaagaattgtcaaaatatatcaaaaatactcttatgactaatctaattacgggtggtgagactttgagcaaaacatacgagttagtacacagaatcttcgggctcaaacagaaaaaacgtctattatgttgctaaaagattcaaccgtaaagtttttatgtttctttttttttttttttttacaagaaggccctgtcatgcaaaattcgttgtgccaaaggcaaaacagtcacaggtaatttctataaaagttcttatgaaaagaaaatgttcgtcgccctcgaacgggtttaagatctcgaattttgcacgacaattgcacctgacaccaaacacgcatatgaccgagtattttgagcggagaaggttactgttcacacccaaccccactttctcaccagatatttccgtgcaaatatttctgttccccaaacttaaattccacatatcttgtaaaagatgcaaatcacaaaatgtccttggtctggcaatttatcagtaaatgatggggtccctattgaggagtatgaaaatttccagaagtgttagcg-GAA---AG-A-----------------AA--T-----ATT--------ACGAA----AG--TC-GTCT-CC-C--AA-AAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AAC-T-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGA------G------TATTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCTT---ACA--CCCCCC-CC-CCC-CACCCTCTTTTTTCATAATTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGG------TTC-CCCAA-AC-TTTAATTCCAC---C---TACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTC-T-GCAATTTATT--A-TCA-GT--AT-TTGATA--GTTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATG-AA--------AAA-TGTT----T----------gg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACACC-------
gi|21 : C-A-AA-C---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----GA-AAAAT-AAACGTC--A-----GGG--G---------G------ATA--------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTC----GAGATTTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-------TTC-CCAAA-TC-TTAAATTCCAT---C---TA-----------T-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCC-T-GTAAT---GT--A-TCT-GT--AT-ATGATT--AGTTT--C-CCTGTTGAGGAG---TATG-AC--------AAA-TGTT----T----------CCA-----G-------------AA---GTGGA--------TTG-A--TC---GA-C--G--------AAAA-AGTGCATC------------C--AGG-CCGAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCGGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCTG-------TTC-CCAAA-AC-TTATAGGCC-----C---CA-----------A-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC---GCAAT---TT--AATCGTAT--AT-ATGATG--GGTAT--C-CCTATTGAGGAG---TATGGAA--------AG--TGTT----T----------CCA-----TG----------------AGTGGGT--------TG-AT---------C--GT--CT---AAAA----------AAGTGTATA--C--AGA-CAAAAGGT-G-AGTAC--TTTAAAGGGCAGGGACC--AAT-AAAAGGAT--CACAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTCTA----ACA-GTAT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AA--TTGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCTAAGAA----A-CATTGT--------TAT-TTT--TCTT-TTA-----AACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GTAATTAAA-TGTTATT----A---T-TAA---ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTC-T-ACACT---TC--A-TTA-GT--AT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGGG---TATG-AA--------AAA-TGTT----T----------CCA-----G-------------AA---GTGGA--------TTG-AT---------C--GT--CT---AAAGTGT---ATC------------C--CGG-ACAAGAGT-G-AGTAT--TTTGAAGGGCAGATATG--AA--AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTT
gi|26 : -----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACT-GACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-------------------T-GC-----TA-------TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACA-GTC-AAAG-GTAA---C-T-ATAA--AAggg
gi|27 : accaT--TTTTTTTT-----TACAGTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACA-ATC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAA--AAAATGTTGTT----A---T-AAA---AA-AACTGAAGAAAT------GAAAT-----ATT--------ACGAG----AG--CC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : -TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTACAT-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGTAG---CATG-AA--------AAA-TGTT----C----------CCA-----Gc
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATaagtggatcgattgtctaaaaagtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAG-A--A-TGAT--CAAATAA-TGGC-ACTTGAA----TGAAGCCTAAATA---A-----A-A-AG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-TAGATATTC-A-TTGTGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-AAAT----------T-------GT------G--C--C--TGCTCG--CC---AGGGTTGC---TACAACTGTTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGC-AAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----GA-AA-AT--AAC-CT--AAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTTGCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GA---AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAATATACA--AA------AAAGA--CT---TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATACCTT--GTATTTAT---T-T-----------------TAAGCCAAAACTG-TAG---------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTA--CTGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC-----AA----G-GTTTTT-A------TATGCTC--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACA-G-A-AAAG-GTAATTTC-T-AT-A--GAA-TGTTGTT----AATTT-TAA---AA-A----------A------AA--TGAAGAAGTGCCACGAAA--------AA--TC-GTCG-CCTT--AA-AA-CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA---T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGA------G------TATTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---ACATGTACTAA-AC-ACT-CATTCTCTC----CAGATTTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC----------TC-CCAAA-AT-TTAAAATCCAA---C---TA-----------C-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T---------------CAAT---TT--A-TTA-GT--ATAATGGTG--GATATACC-TCTTTTGAGGAG---TATG-AA--------AAA-TGTT----T----------CCAAAAGTGGATTTATCGTCT-AA-AGACGTGTACC---TCTC-AGGGCA-AGA-CAAGT--ATTTGAAAA-CG---ATCAAAGATTA-A--T--AAG-T---GGGT-G-AACAC--
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggtcaagtgtcattattctggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAA-TG-C-TCTTGAAAT--TAGGGCCTATATATAAA-----A-A-GT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCTAAATATTC-A-TTGTTA-GGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : --AGG-CCAATAGTTA-AGTAC--TTTCAAGGACAGGAACG--AAT-AAAAGGAT--CAGAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-
gi|33 : tcccgaaagtgggctgatcgtctaaacatgtatccGAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCA-AA--TCCGTCG-CA-A--AACAA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCAAAG--TC-GTCG-CA-A--AA-AA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACACC-------T--------C---AAAG--A--TATTTCTCG--CT---AAGGTCGCCC-TGCAAAAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-CGTTGCT----A---T-TAA---AAGA----------CTAA---AA--T-----ATTATGA----A--------AG--TC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-AC-T-T
gi|4 : TCGCCC-TGCAACAGTTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGC-AA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAGA-AAGAT-AAACACT--A-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------G----AAT---------TATTAAA-------------AT-T-GTATCCAG--------AATATACCAAAGA--CT---TGA----TAAT----TTTG-TTAC--T-GGTGATG--------AGAC--CTAGGTATACTTATT-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--CTAACAGACA-GAAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG-----AAGG--G-TTTTAT-GC-----TA--------TTTCTTG-----GGAAATAGAAGGCCC-ATCATAGCAAG--ATTA-GT-GATG--CAGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-AT-----AA-TGTT-TTAAAAA---T-GAA---AG-A----------G------GA--T-----GAT--------A--------AAATTC-ATGG-AC-A--TA-AA-CGG---G--TAAAAGGTA--ATCTAGACAA-TTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGA-TGTG-GTGGA------GAGC---TGTTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------A-TGAGAGTCTTAAAAC---CCCGCC-AC-CGC-CATTTTCTCA---CAGATTAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-------TACGCACAA-ATGTGAAATTGCACG--C---CA-----------GATTGG----AAGAT--AA-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTT-GGAAT---TTAGA-TCA-GT--AT-AGGGTGATGGTGT----CCTATTG-GGAGGTCTATG-----------AAA-TGTT----T----------CCA-----GA----------A-AT-GGATTGATC-G---TCTA-A--ACA-G---C--GT-----------------ATC------------C--AGA-CAAAGGGC-G-AGTAC--TTTGAAGTGTAGGGACA--AAT-AAAAGGAT--CTCAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|40 : AAC---CC-G-TAGACATTC-A-TCGTGA-GGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CCTTCTG------CAAATTTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-------TTC-CCCAATAC-TTAAATTCCAAGTACAAGTA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGA------C------AATTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT----ATTCT---GC---AAC----ACGCCC-TGTT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGC-AA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----GA-ATGAT-GAACGCT--A-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTTGCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-A---AGAATCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGA---AAT---------TTTTAAA-------------ATTT-ATATCTAAAACATACAAA------AAAAA--CTT--TTAT---TAAT----TTAG-TTAT--T-GGTGATG--------AGAC--T--AT---------T-T-----------------TGAGCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--CTA----ACA-GAAC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TA--TTGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG-----AAT---G-TTTTAT-A------GAA-TGTGATTTTCTTT-----AACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-A--C-CT-G-TAC-CAAAGGGC-AA----------------AACTTC-T-ACAA--AAA-TTTTGTT----AT--T-AAA---AA-A----------CTCAAGAAA--T-----ATTTCCA----A--------AG--TC-GTCGCCC-C--AA-AA-CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA---T-TTAGC-ATG-A-CAA--TGC-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAGTACCGG------TATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACACA----CCC-CGATTTCTC----CAGATTTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTGTTCGATATTC-CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---T---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTA-AT-ATGATG--TGTGT--C-CCTATTGAGAAG---TA--AAT--------AAA-TGTT----T----------CCA-----G-------------AA---GTAGA--------TTG-AT---------C--GT--CT---AAAA--------CAAAGATGT-A--TCCAGG-CCAAGGGT-G-TGTAC--TTTGAAGGACAGGGACG--AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAA-TG-C-ATATAAATT--TAGGTCCTATATA---A-----A-A-GA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGA------C------AATTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : -----------------TGAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACT-GACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--G-A--A-AAAGATCAAAAAA-TG-C-GCTGGAAAT--TAGGGCCTATATAT--A-----A-A-ATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-TAGATATCC-A-T--TGA-GGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACACC-------T--------C---AAAGATT--C--TGCTCG--CC---AAAGTCACCC-TACAATAGTTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGC-AA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAGCGCT--A-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTTGTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------A---AAT---------TATCAAAATTGTATCCATATA--T-ATACC-----------AA------AAAGA--TT---TGA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACA-T--GGGTATACTATT-T-----------------TGAGCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--CTA----ACA-GAAT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG-----AAGAAGG-ATTTAT-G----------TTA--TATTCTTT-----GGCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAGATATTC-A-TC-TGA-GGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----GA-AAGAT-ACATG-T--A-----A-----------------------ACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATTAAA-------------A--T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACA-GTC-ACGG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTTTT----A---TTAAA---AA-A----------CTGAA--GA--A-----ATTTTACGA--A--------AG--TC-GTCG-CC-TCAAA-AA-TAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-C-T-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGA------G------TATCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT----GTCTT---Atgta
gi|8 : G---TCTAAAA--------AAG-TGTA----T----------ACA-----GG----------C-AAAGGGTAGGTA-C---TTTGAAGGGCAGGGA-C--CA--ATA--AAAA-GG---ATCACAGATgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|8 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatc-A--C--AGG-CAAAGGGT-A-GGTAC--TTTGAAGGGCAGGGACC--AATAAAAAGGAT--CACAG------------AT-GTGGGTGAAAACAgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--G-A--ACAGAG--GAAACAC-TG-C-ACTTGAAAT--TAAGGCCTATATA---C-----A-A-GT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-TAGGTCCTT-C-CCGT-A-GGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACACC-------T--------TAAAAAAG-----C--TGCTCG--CC---AAGGTCGTCC-TGCAACAGTTGCAAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 222222222222222 222222222 111 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 66666666666666666666666666666666 11 1111111 111 11111 333333333333333333333333333 1111111111111 111 3333333333333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 111111111111111111111111111111111111 111 1111 22222222 111 5555555555555555555555555555555555555 111111 333333333333 1111111 11111111111 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 222 1 111111 111111 111111 111111111 1111 1111111 1111111 11111111111 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 99 66 4 77 222 444444444444444 4 66 3 3 3 0 55 777777777 3 3 444 1 3 3 0 8888888888888 3 777 9 6 3 3 3 3 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 5 6666 2 44444444444444444444444444444444 55 666 00 1 3 4 666 7777777 1 88 44 77 4444 5 2 7 2 2 888 5 000 3 77777 3 44 9 0 6 11111 6 6 666666666666666666666666666 9999999999999 3 6 111 555 3 3 6 2 33 3333333333333333333 55 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 4 0000 66666666 888888888888888888888888888888888888 3 3 3 6 111 77 7777 3 44444444 44 555 3 3 999 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 7777777777777777777777777777777777777 2 000000 8 3 000000000000 3 1111111 3 7 3 2 3 0 0 3 3 1 44 3 8 55555555555 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888 44 3 6 3333 3 3 555 44 5 1 3 000 4 5 5 5 999 77 1 4 4 777 4 2 4 666666 000000 3 3 000000 8888 333333333 99999 4 4 4 0 1 2222 4 0 7777 55 3 5555555 3 3 0000000 55555555555 3 99 3 3 2 333 999 44 3 3 44 3 6 44 44 3 555 8 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 1 1 3 3 44 8888 3 44 6666 4 3 2 3 3 4
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . .. .. . .. ... ............... . .. . . . . .. ......... . . ... . . . . ............. . ... . . . . . . .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . ................................ .. ... .. . . . ... ....... . .. .. .. .... . . . . . ... . ... . ..... . .. . . . ..... . . ........................... ............. . . ... ... . . . . .. ................... .. . ............................................................... .... . .... ........ .................................... . . . . ... .. .... . ........ .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ..................................... . ...... . . ............ . ....... . . . . . . . . . . .. . . ........... ... ................................................. .. . . .... . . ... .. . . . ... . . . . ... .. . . . ... . . . ...... ...... . . ...... .... ......... ..... . . . . . .... . . .... .. . ....... . . ....... ........... . .. . . . ... ... .. . . .. . . .. .. . ... . . ................................................................ . . . . . .. .... . .. .... . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 33 11 4 33 222 999999999999999 4 11 6 6 6 3 00 777777777 6 6 555 4 5 6 4 3333333333333 3 777 2 2 1 1 8 1 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 2 5555 1 33333333333333333333333333333333 00 444 66 8 6 6 555 1111111 4 99 55 99 7777 7 7 5 5 5 888 0 888 1 55555 3 22 2 8 2 77777 7 7 222222222222222222222222222 6666666666666 3 7 777 888 3 3 7 1 88 7777777777777777777 00 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 9999 4 8888 11111111 999999999999999999999999999999999999 6 6 3 7 777 99 1111 3 22222222 66 888 3 3 222 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 4444444444444444444444444444444444444 3 777777 0 1 555555555555 6 5555555 3 2 3 4 3 4 2 3 3 7 66 6 0 00000000000 777 1111111111111111111111111111111111111111111111111 66 3 7 5555 3 3 888 66 7 0 3 111 4 0 0 0 000 22 6 0 0 000 0 1 0 888888 555555 5 6 555555 5555 666666666 33333 0 0 8 9 1 5555 0 8 5555 00 6 5555555 6 3 5555555 88888888888 3 33 1 1 5 777 222 66 3 3 66 3 7 66 66 3 444 5 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 6 0 3 3 66 2222 3 66 5555 1 1 1 1 3 8
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCAGA--AA---GTGGAT--TTTG-AT--C-----G-CGTCT-AAAA-GG-----CAAAG--T-TA--CAGG-CCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCAGG--AA-GGGTGGGTACTTTG-ANGGC--A-GGACGTAT-AAAA-GG---ATCAAAG-AT-TA-ACAGG-CCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--G-A--A-AAAG--CATACAA-TG-C-ACTTTAAAT--TAAGGACTAT-TA---A-----A-A-AT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTT-AATAGCTA-GGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATACA-------T-------GT---ACCA--C--C--AAATCT--TN---A--GTCACCT-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGAC-AA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GGA----------AT--TGTCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAATA--CTT-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-A-TACGAG---TT--GTA----ACAG-AAA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TG--TTGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTTTTTTTTTACATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACA-GTC-ACAGAGTAATTTC-TAATAA--AGA--GTT-CT----A---T-GCA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A-------------C-ATCG-CC-C--TC-GA-CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAAT-TCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGAG------TA------TTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCAC----CAGATTTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-A-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAAGTGTACCCAGGCTAA-GAGTGAGTACTTTATAGGAC--ATGGAAGAAT-AAAA-GG---ATCAAAG-AT-TA-ATAAATNTAAGAAT-G-AGTAC--TTTATAGGGCAGGGAA--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : --------A--------AG--TG-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-C-T-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAGTACTAATA------TTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT----GTGCT---A--------CA-TC-CCC-CGTT-TCTC----AAGATTTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-ATC-------C----------AAATTTCAC---C---GA-----------T-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTC-T-GTA------------C--------T-ATGATG--GGAGT--G-CCTAATAGGAAG---TAT-AAGAAC-TGACTCCAGA--A----GTGG--AC--TG-AT----------CTTCT-AA-----------AAAG-TT-TATCCAGG-CTCAAGAT-G-GGTAC--TATGAAAGGCGGGGAT--A-AAT-AAAAAGAG--TAAA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCTATATA---ACTTCTA-A-GT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGAT-------GT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGTCT-TGCAAAAGTTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TGT-CTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCACC-------T--------C---AAAG--A--TGTTGCTCG--CC---AAGGTCACCC-TGTAACAATTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA----T-CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC---------TCA-GA-TGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-GAATGGTACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TAT-GCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GAA----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAA-C---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AA-C---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--A-G--A-AGAG--TGAACAA-TG-C-ACTTGCAAT--TTGGGCCTATATA---A-----A-AAGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-TAGATATTC-A-TCATGA-GGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTAT--------------T-------AT---GA----------TGTACG--CC---AAGGTCACACATG-AACACTTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-GA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCTA-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGT-TCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G-------------T--T-TCAAA-------------AGGT--A-TAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGT-GGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACAT-AATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCTA-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGT-TCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G-------------T--T-TCAAA-------------AGGT--A-TAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGT-GGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACAT-AATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----GA-AAGAT-AAA-GCTTCT---GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---A----TTTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTGAAA--TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAA-------------A--C--AATATC-----------AA------AAAGA--CTTGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--T--A----------TAT-----------------T-GA-CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--CTA----ACAGGAAT--------AT--A---GCG-CC--ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TA--GTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTGAAGA-AA----G-TTTTATCA------TA---------TAACCT-----GATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGTG------TA------TTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT----GTTCT---AC---CACCCCCAC-CCC-C-TTTTCTC----CAGATTTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCCG-TTC-------CCCAA-AA---AAATTTCAA---C---GA-----------T-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTC-T-GCCATA--GT--A-TCA-GT--A-TGATGATA--GGTAT--CAGCAATTGAGAGA---CATG-ACAAA-TGTTT-CAGA--AATGGATTGATCATCTG-AAAAC-------TGTAT-ACCA-G---------------------GG-CTAAGCGT-GAAGTAC--TTTG-AGGACA--GAT--GAAAT-ATAAAGAT--TCAAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTtc
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GAA--A-AAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA---A-----AGA-AT-TAGGTCATT-ACTT-GC-------------ATGTAAAAGCCC-GTTAGATATTCAA-TACTTA-GG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATGT-TTCA--------A------TA------GTCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATG-TAT-AACACC-------TC------AT---AAAT--G--C--TGCTCGTACCTTGAACATCGCC----------TTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATC-TACA-AAAGACG--AAG---ATA--CCGT-AGACAAA-TTGGCTC--GA-TGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCT-AAGCT-TAG----GA-AAGAT-AAACGC--------GT--GC--------G------ATACCT----C---A-----TT-GCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------G-A----------AT--TGTCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------T-GAG-CAAAAC-A-TACGAG---TTA-GTAC---ACAG-AAT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--A-----AA-AACG-T--CTA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-GTTTCTTTTT-TTT--TTTTTTTT-----TACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAA-GGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAATTTC-T-ATAA--AA---GTTCTT----A---T-GAA---AAGA----------A------AA--T-----GT----------------------TC-GTCG-CC-CT-CG-AA-CGG---G--T-TTAAG-A-TCT-CGAA--T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCA-TATG-ACCGAG------TA------TTTTGA-GCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----A----CACCCA-AC-CCCACTTTCTCAC----CAGA--TA-TTTCCGTGCAAA-T-A--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTC-TGGCAAT---TT--A-TCA-GT--A-A-ATGATG--GG-GT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAA-----TTTCCAGA--A----GTG-----TT----------A-G--CGT-C-AAAA-TG-------AAG-------CCAGG-CTAACGAT-G-AGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGA-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTggaaaa
gi|20 : a-GAA---AG-A-----------------AA--T-----ATT--------ACGAA----AG--TC-GTCT-CC-C--AA-AAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AAC-T-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGAG------TA------TTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCTT---ACA--CCCCCC-CC-CCC-CACCCTCTTTTTTCATAATTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGGTTC-------CCCAA-AC-TTTAATTCCAC---C---TACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTC-T-GCAATTTATT--A-TCA-GT--A-T-TTGATA--GTTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATG-AAAAA-TGTTTgg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACACC-------
gi|21 : C-A-AA-C---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----GA-AAAAT-AAACGTCA-----GGG--G---------G------ATA---------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTC----GAGATTTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-TTC-------CCAAA-TC-TTAAATTCCAT---C---TA-----------T-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCC-T-GTAAT---GT--A-TCT-GT--A-T-ATGATT--AGTTT--C-CCTGTTGAGGAG---TATG-ACAAA-TGTTTCCAGA--A----GTGGA----TTG-AT--C-----GACG----AAAA-AGTGCATC------------CAGG-CCGAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCGGGGAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCTG-TTC-------CCAAA-AC-TTATAGGCC-----C---CA-----------A-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC---GCAAT---TT--AATCGTAT--A-T-ATGATG--GGTAT--C-CCTATTGAGGAG---TATGGAAAG--TGTTTCCATG--A----GTGGGT----TG-AT----------CGTCT-AAAA----------AAG-TG-TATACAGA-CAAAAGGT-G-AGTAC--TTTAAAGGGCAGGGAC--C-AAT-AAAAGGAT--CACAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTCTA----ACAG-TAT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AA--TTGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCTAAGAA----A-CATTGT--------TAT-TTT--TCTT-TTA-----AACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GTAATTAAA-TGTTATT----A---T-TAA---ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTC-T-ACACT---TC--A-TTA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGGG---TATG-AAAAA-TGTTTCCAGA--A----GTGGA----TTG-AT----------CGTCT-AAAGTGT---ATC------------CCGG-ACAAGAGT-G-AGTAT--TTTGAAGGGCAGATAT--G-AA--AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTT
gi|26 : -----------------T-GAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACTG-ACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-------------------T-GC-----TA-------TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACA-GTC-AAAG-GTAA---C-T-ATAA--AAggg
gi|27 : accaT--TTTTTTTT-----TACAGTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACA-ATC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAA--AAAATGTTGTT----A---T-AAA---AA-AACTGAAGAAAT------GAAAT-----ATT--------ACGAG----AG--CC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : -TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTACA-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGTAG---CATG-AAAAA-TGTTCCCAGA--A----GTGGATc
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATcgattgtctaaaaagtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAG-A--A-TGAT--CAAATAA-TGGC-ACTTGAA----TGAAGCCTAAATA---A-----A-A-AG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-TAGATATTC-A-TTGTGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-AAAT----------T-------GT------G--C--C--TGCTCG--CC---AGGGTTGC---TACAACTGTTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGC-AAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----GA-AA-AT--AAC-CTAAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTT-GCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GAA----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATCCAATATACA--AA------AAAGA--CT---TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATACCTT--GTATTTAT---T-T-----------------T-AAGCCAAAACTG-TAG---------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTA--CTGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC-----AA----G-GTTTTT-A------TATGCTC--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACA-G-A-AAAG-GTAATTTC-T-AT-A--GAA-TGTTGTT----AATTT-TAA---AA-A----------A------AA--TGAAGAAGTGCCACGAAA--------AA--TC-GTCG-CCTT--AA-AA-CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA---T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGAG------TA------TTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---ACATGTACTAA-AC-ACT-CATTCTCTC----CAGATTTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC----TC-------CCAAA-AT-TTAAAATCCAA---C---TA-----------C-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T---------------CAAT---TT--A-TTA-GT--A-TAATGGTG--GATATACC-TCTTTTGAGGAG---TATG-AAAAA-TGTTTCC-----AA-AAGTGGA---TTTA-TCGTCTAA-AGACGTGT-A-----------C------C-TC-TCAGG-GCAA-GAC-A-AGTA---TTTGA--------------------AAACGAT--CAAAG----ATTAATAA---GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTCT
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAA-TG-C-TCTTGAAAT--TAGGGCCTATATATAAA-----A-A-GT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCTAAATATTC-A-TTGTTA-GGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : CAGG-CCAATAGTTA-AGTAC--TTTCAAGGACAGGAAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAGAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-
gi|33 : tcccgaaagtgggctgatcgtctaaacatgtatcGAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCA-AA--TCCGTCG-CA-A--AACAA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCAAAG--TC-GTCG-CA-A--AA-AA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACACC-------T--------C---AAAG--A--TATTTCTCG--CT---AAGGTCGCCC-TGCAAAAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-CGTTGCT----A---T-TAA---AAGA----------CTAA---AA--T-----ATTATGA----A--------AG--TC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-AC-T-T
gi|4 : TCGCCC-TGCAACAGTTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGC-AA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAGA-AAGAT-AAACACTA-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------G-A----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATCCAG--------AATATACCAAAGA--CT---TGA----TAAT----TTTG-TTAC--T-GGTGATG--------AGAC--CTAGGTATACTTATT-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--CTAACAGACAG-AAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG-----AAGG--G-TTTTAT-GC-----TA--------TTTCTTG-----GGAAATAGAAGGCCC-ATCATAGCAAG--ATTA-GT-GATG--CAGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-AT-----AA-TGTT-TTAAAAA---T-GAA---AG-A----------G------GA--T-----GAT--------A--------AAATTC-ATGG-AC-A--TA-AA-CGG---G--TAAAAGGTA--ATCTAGACAA-TTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGA-TGTG-GTGGAGAGC---TG------TTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------A-TGAGAGTCTTAAAAC---CCCGCC-AC-CGC-CATTTTCTCA---CAGATTAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-TACG------CACAA-ATGTGAAATTGCACG--C---CA-----------GATTGG----AAGAT--AA-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTT-GGAAT---TTAGA-TCA-GT--A-T-AGGGTGATGGTGT----CCTATTG-GGAGGTCTATG---AAA-TGTTTCCAGA--AA----TGGA----TTG-AT----------CGTCT-AAA---------CAGCGTAT-C---CAGA-CAAAGGGC-G-AGTAC--TTTGAAGTGTAGGGAC--A-AAT-AAAAGGAT--CTCAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|40 : AAC---CC-G-TAGACATTC-A-TCGTGA-GGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CCTTCTG------CAAATTTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-TTC-------CCCAATAC-TTAAATTCCAAGTACAAGTA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGAC------AA------TTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT----ATTCT---GC---AAC----ACGCCC-TGTT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGC-AA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----GA-ATGAT-GAACGCTA-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-AA-GAA--TCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGAA----------AT--TTTTAAA-------------A--TTTA-TATCTAAAACATACAAA------AAAAA--CTT--TTAT---TAAT----TTAG-TTAT--TGG-TGATG--------AGAC--T--A----------T-T-----------------TTGAGCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--CTA----ACAG-AAC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TA--TTGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG-----AAT---G-TTTTAT-A------GAA-TGTGATTTTCTTT-----AACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-ACC---T-G-TAC-CAAAGGGC-AAAAC----------------TTC-T-ACAA--AAA-TTTTGTT----A---TTAAA---AA-A----------CTCAAGAAA--T-----ATTTCCA----A--------AG--TC-GTCG-CC-CC-AA-AA-CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA---T-TTAGC-ATG-A-CAATG--C-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAG------TACCGGTATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACACA----CCC-CGATTTCTC----CAGATTTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTG-TTCGATATTCCCCAA-AC-TTAAATTCCAC---T---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AAT-ATGATG--TGTGT--C-CCTATTGAGAAG---TA--AATAAA-TGTTTCCAGA--A----GTAGAT----TG-AT----------CGTCT-AAAA--------CAAAG-ATGTATCCAGG-CCAAGGGT-G-TGTAC--TTTGAAGGACAGGGAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAA-TG-C-ATATAAATT--TAGGTCCTATATA---A-----A-A-GA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGAC------AA------TTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : -----------------T-GAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACTG-ACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--G-A--A-AAAGATCAAAAAA-TG-C-GCTGGAAAT--TAGGGCCTATATAT--A-----A-A-ATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-TAGATATCC-A-T--TGA-GGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACACC-------T--------C---AAAGATT--C--TGCTCG--CC---AAAGTCACCC-TACAATAGTTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGC-AA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAGCGCTA-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTT-GTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------AA----------AT--TATCAAAATTGTATCCATATA--T--A-TACC-----------AA------AAAGA--TT---TGA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACA-T--GGGTATACTATT-T-----------------T-GAGCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG-----AAGAAGG-ATTTAT-G----------TTA--TATTCTTT-----GGCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAGATATTC-A-TC-TGA-GGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----GA-AAGAT-ACATG-TA-----A-----------------------ACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATTAAA-------------A--T--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACA-GTC-ACGG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTTTT----A---TTAAA---AA-A----------CTGAA--GA--A-----ATTTTACGA--A--------AG--TC-GTCG-CC-TCAAA-AA-TAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-C-T-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGAG------TA------TCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT----GTCTT---Atgta
gi|8 : G---TCTAAAAAAG-TGTATACAGGCAAA-GGGTAGGTACTTTGAAGGGC--AGGGACCAATAAAAA-GG---ATCACAG-AT-gctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|8 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatc-ACAGG-CAAAGGGT-A-GGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--C-AATAAAAAGGAT--CACAG------------AT-GTGGGTGAAAACAgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--G-A--ACAGAG--GAAACAC-TG-C-ACTTGAAAT--TAAGGCCTATATA---C-----A-A-GT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-TAGGTCCTT-C-CCGT-A-GGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACACC-------T--------TAAAAAAG-----C--TGCTCG--CC---AAGGTCGTCC-TGCAACAGTTGCAAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 222222222222222 222222222 111 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 66666666666666666666666666666666 11 1111111 111 11111 333333333333333333333333333 1111111111111 111 3333333333333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 111111111111111111111111111111111111 111 1111 22222222 111 5555555555555555555555555555555555555 111111 333333333333 1111111 11111111111 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 222 1 111111 111111 111111 111111111 1111 1111111 1111111 11111111111 1 11111 111111111111111111111111111111111111111111111111 11111
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 99 66 4 77 222 444444444444444 4 66 3 3 3 0 55 777777777 3 3 444 1 3 3 0 8888888888888 3 777 9 6 3 3 3 3 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 5 6666 2 44444444444444444444444444444444 55 666 00 1 3 4 666 7777777 1 88 44 77 4444 5 2 7 2 2 888 5 000 3 77777 3 44 9 0 6 11111 6 6 666666666666666666666666666 9999999999999 3 6 111 555 3 3 6 2 33 3333333333333333333 55 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 4 0000 66666666 888888888888888888888888888888888888 3 3 3 6 111 77 7777 3 44444444 44 555 3 3 999 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 7777777777777777777777777777777777777 2 000000 8 3 000000000000 3 1111111 3 7 3 2 3 0 0 3 3 1 44 3 8 55555555555 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888 44 3 6 3333 3 3 555 44 5 1 3 000 4 5 5 5 999 77 1 4 4 777 4 2 4 666666 000000 3 3 000000 8888 333333333 99999 4 4 4 0 1 2222 4 0 7777 55 3 5555555 3 3 0000000 55555555555 3 99 3 3 2 333 999 44 3 3 44 3 6 44 44 3 555 6 66 3 44444 1 555555555555555555555555555555555555555555555555 44 3 3 3 44 0 7777 11111 44 6666 4 3 1 2 3 3 4
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . .. .. . .. ... ............... . .. . . . . .. ......... . . ... . . . . ............. . ... . . . . . . .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . ................................ .. ... .. . . . ... ....... . .. .. .. .... . . . . . ... . ... . ..... . .. . . . ..... . . ........................... ............. . . ... ... . . . . .. ................... .. . ............................................................... .... . .... ........ .................................... . . . . ... .. .... . ........ .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ..................................... . ...... . . ............ . ....... . . . . . . . . . . .. . . ........... ... ................................................. .. . . .... . . ... .. . . . ... . . . . ... .. . . . ... . . . ...... ...... . . ...... .... ......... ..... . . . . . .... . . .... .. . ....... . . ....... ........... . .. . . . ... ... .. . . .. . . .. .. . ... . .. . ..... . ................................................ .. . . . .. . .... ..... .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 33 11 4 33 222 999999999999999 4 11 6 6 6 3 00 777777777 6 6 555 4 5 6 4 3333333333333 3 777 2 2 1 1 8 1 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 2 5555 1 33333333333333333333333333333333 00 444 66 8 6 6 555 1111111 4 99 55 99 7777 7 7 5 5 5 888 0 888 1 55555 3 22 2 8 2 77777 7 7 222222222222222222222222222 6666666666666 3 7 777 888 3 3 7 1 88 7777777777777777777 00 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 9999 4 8888 11111111 999999999999999999999999999999999999 6 6 3 7 777 99 1111 3 22222222 66 888 3 3 222 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 4444444444444444444444444444444444444 3 777777 0 1 555555555555 6 5555555 3 2 3 4 3 4 2 3 3 7 66 6 0 00000000000 777 1111111111111111111111111111111111111111111111111 66 3 7 5555 3 3 888 66 7 0 3 111 4 0 0 0 000 22 6 0 0 000 0 1 0 888888 555555 5 6 555555 5555 666666666 33333 0 0 8 9 1 5555 0 8 5555 00 6 5555555 6 3 5555555 88888888888 3 33 1 1 5 777 222 66 3 3 66 3 7 66 66 3 888 8 55 3 44444 2 333333333333333333333333333333333333333333333333 66 7 3 3 66 4 4444 77777 66 5555 1 1 1 1 1 3 8
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCA-G----AAAGTGGAT-TTTGATCG--CGT------CTAAA-AN--G--CAAAG-T---TA--C--AGGCCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCA-G----AAAGTGGAT-TTTGATCG--CGT------CTAAA-AG--G--CAAAG-T---TA--C--AGGCCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--G-A--A-AAAG--CATACAA-TG-C-ACTTTAAAT--TAAGGACTAT-TA---A-----A-A-AT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTT-AATAGCTA-GGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATACA-------T-------GT---ACCA--C--C--AAATCT--TN---A--GTCACCT-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGAC-AA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GGA----------AT--TGTCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAATA--CTT-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-A-TACGAG---TT--GTA----ACAG-AAA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TG--TTGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTTTTTTTTTACATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACA-GTC-ACAGAGTAATTTC-TAATAA--AGA--GTT-CT----A---T-GCA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A-------------C-ATCG-CC-C--TC-GA-CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAAT-TCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGAG------TA------TTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCAC----CAGATTTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-A-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAAGTGTACCCA-GGCTAAGAGTGAGTACTTTATAGGACATGGAAGAATAAA-AG--GATCAAAGAT---TAATA--AATNTAAGAAT-G-AGTAC--TTTATAGGGCAGGGAA--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : --------A--------AG--TG-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-C-T-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAGTACTAATA------TTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT----GTGCT---A--------CA-TC-CCC-CGTT-TCTC----AAGATTTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-ATC-------C----------AAATTTCAC---C---GA-----------T-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTC-T-GTA------------C--------T-ATGATG--GGAGT--G-CCTAATAGGAAG---TAT-AAGAAC-TGACTCCA-G-----AAGTGGA---CTGAT----CTT------CTAAA-AA--G--T-----T---TATCC--AGGCTCAAGAT-G-GGTAC--TATGAAAGGCGGGGAT--A-AAT-----AAAAAGAG--TAAA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCTATATA---ACTTCTA-A-GT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGAT-------GT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGTCT-TGCAAAAGTTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TGT-CTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCACC-------T--------C---AAAG--A--TGTTGCTCG--CC---AAGGTCACCC-TGTAACAATTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA----T-CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC---------TCA-GA-TGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-GAATGGTACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TAT-GCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GAA----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAA-C---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AA-C---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--A-G--A-AGAG--TGAACAA-TG-C-ACTTGCAAT--TTGGGCCTATATA---A-----A-AAGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-TAGATATTC-A-TCATGA-GGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTAT--------------T-------AT---GA----------TGTACG--CC---AAGGTCACACATG-AACACTTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-GA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCTA-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGT-TCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G-------------T--T-TCAAA-------------AGGT--A-TAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGT-GGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACAT-AATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCTA-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGT-TCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G-------------T--T-TCAAA-------------AGGT--A-TAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGT-GGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACAT-AATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----GA-AAGAT-AAA-GCTTCT---GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---A----TTTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTGAAA--TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAA-------------A--C--AATATC-----------AA------AAAGA--CTTGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--T--A----------TAT-----------------T-GA-CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--CTA----ACAGGAAT--------AT--A---GCG-CC--ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TA--GTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTGAAGA-AA----G-TTTTATCA------TA---------TAACCT-----GATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGTG------TA------TTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT----GTTCT---AC---CACCCCCAC-CCC-C-TTTTCTC----CAGATTTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCCG-TTC-------CCCAA-AA---AAATTTCAA---C---GA-----------T-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTC-T-GCCATA--GT--A-TCA-GT--A-TGATGATA--GGTAT--CAGCAATTGAGAGA---CATG-ACAAA-TGTTT-CA-G----AAA-TGGA---TTGAT----CAT------CTGAA-AACTG--TA--------TA--CCAGGGCTAAGCGT-GAAGTAC--TTTG-AGGACA--GAT--GAAAT-----ATAAAGAT--TCAAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTtc
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GAA--A-AAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA---A-----AGA-AT-TAGGTCATT-ACTT-GC-------------ATGTAAAAGCCC-GTTAGATATTCAA-TACTTA-GG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATGT-TTCA--------A------TA------GTCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATG-TAT-AACACC-------TC------AT---AAAT--G--C--TGCTCGTACCTTGAACATCGCC----------TTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATC-TACA-AAAGACG--AAG---ATA--CCGT-AGACAAA-TTGGCTC--GA-TGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCT-AAGCT-TAG----GA-AAGAT-AAACGC--------GT--GC--------G------ATACCT----C---A-----TT-GCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------G-A----------AT--TGTCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------T-GAG-CAAAAC-A-TACGAG---TTA-GTAC---ACAG-AAT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--A-----AA-AACG-T--CTA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-GTTTCTTTTT-TTT--TTTTTTTT-----TACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAA-GGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAATTTC-T-ATAA--AA---GTTCTT----A---T-GAA---AAGA----------A------AA--T-----GT----------------------TC-GTCG-CC-CT-CG-AA-CGG---G--T-TTAAG-A-TCT-CGAA--T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCA-TATG-ACCGAG------TA------TTTTGA-GCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----A----CACCCA-AC-CCCACTTTCTCAC----CAGA--TA-TTTCCGTGCAAA-T-A--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTC-TGGCAAT---TT--A-TCA-GT--A-A-ATGATG--GG-GT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAA-----TTTCCA-G-----AAGTG-----TTA---G--CGT------C-AAA-AT--G----AAG-C-------C--AGGCTAACGAT-G-AGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGA-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTggaaaa
gi|20 : a-GAA---AG-A-----------------AA--T-----ATT--------ACGAA----AG--TC-GTCT-CC-C--AA-AAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AAC-T-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGAG------TA------TTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCTT---ACA--CCCCCC-CC-CCC-CACCCTCTTTTTTCATAATTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGGTTC-------CCCAA-AC-TTTAATTCCAC---C---TACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTC-T-GCAATTTATT--A-TCA-GT--A-T-TTGATA--GTTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATG-AAAAA-TGTTTgg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACACC-------
gi|21 : C-A-AA-C---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----GA-AAAAT-AAACGTCA-----GGG--G---------G------ATA---------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTC----GAGATTTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-TTC-------CCAAA-TC-TTAAATTCCAT---C---TA-----------T-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCC-T-GTAAT---GT--A-TCT-GT--A-T-ATGATT--AGTTT--C-CCTGTTGAGGAG---TATGACAAA--TGTTTCCA-G----AA-GTGGAT-T--GATCGA-CGA--------AAA-AGT-G--CA--------TC--C--AGGCCGAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCGGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCTG-TTC-------CCAAA-AC-TTATAGGCC-----C---CA-----------A-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC---GCAAT---TT--AATCGTAT--A-T-ATGATG--GGTAT--C-CCTATTGAGGAG---TATGGAAAG--TGTTTCCATG----A--GTGGGT-T--GATCG----T------CTAAA-A--------AAG-TGTATA--C--AGACAAAAGGT-G-AGTAC--TTTAAAGGGCAGGGAC--C-AAT-----AAAAGGAT--CACAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTCTA----ACAG-TAT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AA--TTGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCTAAGAA----A-CATTGT--------TAT-TTT--TCTT-TTA-----AACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GTAATTAAA-TGTTATT----A---T-TAA---ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTC-T-ACACT---TC--A-TTA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGGG---TATG-AAAAA-TGTTTCCA-G-----AAGTGGA---TTGAT----CGT------CTAAA-GT--G--TA--------TC--C--CGGACAAGAGT-G-AGTAT--TTTGAAGGGCAGATAT--G-AA------AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTT
gi|26 : -----------------T-GAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACTG-ACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-------------------T-GC-----TA-------TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACA-GTC-AAAG-GTAA---C-T-ATAA--AAggg
gi|27 : accaT--TTTTTTTT-----TACAGTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACA-ATC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAA--AAAATGTTGTT----A---T-AAA---AA-AACTGAAGAAAT------GAAAT-----ATT--------ACGAG----AG--CC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : -TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTACA-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGTAG---CATG-AAAAA-TGTTCCCA-G-----AAGTGGA---TCGAT----TGT------CTAAA-AA--G--c
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAG-A--A-TGAT--CAAATAA-TGGC-ACTTGAA----TGAAGCCTAAATA---A-----A-A-AG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-TAGATATTC-A-TTGTGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-AAAT----------T-------GT------G--C--C--TGCTCG--CC---AGGGTTGC---TACAACTGTTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGC-AAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----GA-AA-AT--AAC-CTAAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTT-GCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GAA----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATCCAATATACA--AA------AAAGA--CT---TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATACCTT--GTATTTAT---T-T-----------------T-AAGCCAAAACTG-TAG---------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTA--CTGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC-----AA----G-GTTTTT-A------TATGCTC--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACA-G-A-AAAG-GTAATTTC-T-AT-A--GAA-TGTTGTT----AATTT-TAA---AA-A----------A------AA--TGAAGAAGTGCCACGAAA--------AA--TC-GTCG-CCTT--AA-AA-CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA---T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGAG------TA------TTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---ACATGTACTAA-AC-ACT-CATTCTCTC----CAGATTTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC----TC-------CCAAA-AT-TTAAAATCCAA---C---TA-----------C-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T---------------CAAT---TT--A-TTA-GT--A-TAATGGTG--GATATACC-TCTTTTGAGGAG---TATG-AAAAA-TGTTTCCA------AAAGTGGAT-TT--AT----CGT------CT-AA-AG--A--C---G-T-------------------------GTAC--CTCTCAGGGCA-AGAC--A-AGTATTTGAAAACGAT--CAAAG----ATTAATAA---GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTCT
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAA-TG-C-TCTTGAAAT--TAGGGCCTATATATAAA-----A-A-GT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCTAAATATTC-A-TTGTTA-GGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : TCCC-G----AAAGTGGGC-T--GATCG----T------CTAAACAT--G--TA--------TC--C--AGGCCAATAGTTA-AGTAC--TTTCAAGGACAGGAAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAGAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-
gi|33 : GAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCA-AA--TCCGTCG-CA-A--AACAA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCAAAG--TC-GTCG-CA-A--AA-AA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACACC-------T--------C---AAAG--A--TATTTCTCG--CT---AAGGTCGCCC-TGCAAAAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-CGTTGCT----A---T-TAA---AAGA----------CTAA---AA--T-----ATTATGA----A--------AG--TC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-AC-T-T
gi|4 : TCGCCC-TGCAACAGTTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGC-AA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAGA-AAGAT-AAACACTA-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------G-A----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATCCAG--------AATATACCAAAGA--CT---TGA----TAAT----TTTG-TTAC--T-GGTGATG--------AGAC--CTAGGTATACTTATT-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--CTAACAGACAG-AAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG-----AAGG--G-TTTTAT-GC-----TA--------TTTCTTG-----GGAAATAGAAGGCCC-ATCATAGCAAG--ATTA-GT-GATG--CAGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-AT-----AA-TGTT-TTAAAAA---T-GAA---AG-A----------G------GA--T-----GAT--------A--------AAATTC-ATGG-AC-A--TA-AA-CGG---G--TAAAAGGTA--ATCTAGACAA-TTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGA-TGTG-GTGGAGAGC---TG------TTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------A-TGAGAGTCTTAAAAC---CCCGCC-AC-CGC-CATTTTCTCA---CAGATTAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-TACG------CACAA-ATGTGAAATTGCACG--C---CA-----------GATTGG----AAGAT--AA-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTT-GGAAT---TTAGA-TCA-GT--A-T-AGGGTGATGGTGT----CCTATTG-GGAGGTCTATG---AAA-TGTTTCCA-G----AAA-TGGA---TTGAT----CGT------CTAAA-CA--G--C---G-TA--TC--C--AGACAAAGGGC-G-AGTAC--TTTGAAGTGTAGGGAC--A-AAT-----AAAAGGAT--CTCAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|40 : AAC---CC-G-TAGACATTC-A-TCGTGA-GGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CCTTCTG------CAAATTTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-TTC-------CCCAATAC-TTAAATTCCAAGTACAAGTA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGAC------AA------TTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT----ATTCT---GC---AAC----ACGCCC-TGTT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGC-AA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----GA-ATGAT-GAACGCTA-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-AA-GAA--TCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGAA----------AT--TTTTAAA-------------A--TTTA-TATCTAAAACATACAAA------AAAAA--CTT--TTAT---TAAT----TTAG-TTAT--TGG-TGATG--------AGAC--T--A----------T-T-----------------TTGAGCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--CTA----ACAG-AAC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TA--TTGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG-----AAT---G-TTTTAT-A------GAA-TGTGATTTTCTTT-----AACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-ACC---T-G-TAC-CAAAGGGC-AAAAC----------------TTC-T-ACAA--AAA-TTTTGTT----A---TTAAA---AA-A----------CTCAAGAAA--T-----ATTTCCA----A--------AG--TC-GTCG-CC-CC-AA-AA-CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA---T-TTAGC-ATG-A-CAATG--C-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAG------TACCGGTATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACACA----CCC-CGATTTCTC----CAGATTTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTG-TTCGATATTCCCCAA-AC-TTAAATTCCAC---T---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AAT-ATGATG--TGTGT--C-CCTATTGAGAAG---TA--AATAAA-TGTTTCCA-G----AA-GTAGAT-T--GATCG----T------CTAAA-A------CAAAGATG--TATCC--AGGCCAAGGGT-G-TGTAC--TTTGAAGGACAGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAA-TG-C-ATATAAATT--TAGGTCCTATATA---A-----A-A-GA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGAC------AA------TTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : -----------------T-GAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACTG-ACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--G-A--A-AAAGATCAAAAAA-TG-C-GCTGGAAAT--TAGGGCCTATATAT--A-----A-A-ATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-TAGATATCC-A-T--TGA-GGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACACC-------T--------C---AAAGATT--C--TGCTCG--CC---AAAGTCACCC-TACAATAGTTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGC-AA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAGCGCTA-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTT-GTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------AA----------AT--TATCAAAATTGTATCCATATA--T--A-TACC-----------AA------AAAGA--TT---TGA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACA-T--GGGTATACTATT-T-----------------T-GAGCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG-----AAGAAGG-ATTTAT-G----------TTA--TATTCTTT-----GGCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAGATATTC-A-TC-TGA-GGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----GA-AAGAT-ACATG-TA-----A-----------------------ACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATTAAA-------------A--T--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACA-GTC-ACGG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTTTT----A---TTAAA---AA-A----------CTGAA--GA--A-----ATTTTACGA--A--------AG--TC-GTCG-CC-TCAAA-AA-TAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-C-T-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGAG------TA------TCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT----GTCTT---Atgta
gi|8 : GTGGGT-T--GATCG----T------CTAAA-A--------AAG-TGTATA--C--AGGCAAAGGGT-A-GGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--C-AATA----AAAAGGAT--CACAG------------AT-GTGGGTGAAAACgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--G-A--ACAGAG--GAAACAC-TG-C-ACTTGAAAT--TAAGGCCTATATA---C-----A-A-GT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-TAGGTCCTT-C-CCGT-A-GGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACACC-------T--------TAAAAAAG-----C--TGCTCG--CC---AAGGTCGTCC-TGCAACAGTTGCAACa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11 11 111 222222222222222 222222222 111 1111111111111 111 33333333 11 11 11111111111111111 11111 22222222222222 1111 66666666666666666666666666666666 11 1111111 111 11111 333333333333333333333333333 1111111111111 111 3333333333333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2222 11111111 111111111111111111111111111111111111 111 1111 22222222 111 5555555555555555555555555555555555555 111111 333333333333 1111111 11111111111 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 222 1 111111 111111 111111 111111111 1111 1111111 1111111 11111111111 1 11111 111111111111111111111111111111111111111111111111 11111
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 99 66 4 77 222 444444444444444 4 66 3 3 3 0 55 777777777 3 3 444 1 3 3 0 8888888888888 3 777 9 6 3 3 3 3 22 22222222 44 0 3 11 3 66666666666666666 00000 6 11111111111111 6 9999 5 6666 2 44444444444444444444444444444444 55 666 00 1 3 4 666 7777777 1 88 44 77 4444 5 2 7 2 2 888 5 000 3 77777 3 44 9 0 6 11111 6 6 666666666666666666666666666 9999999999999 3 6 111 555 3 3 6 2 33 3333333333333333333 55 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 4 0000 66666666 888888888888888888888888888888888888 3 3 3 6 111 77 7777 3 44444444 44 555 3 3 999 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 7777777777777777777777777777777777777 2 000000 8 3 000000000000 3 1111111 3 7 3 2 3 0 0 3 3 1 44 3 8 55555555555 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888 44 3 6 3333 3 3 555 44 5 1 3 000 4 5 5 5 999 77 1 4 4 777 4 2 4 666666 000000 3 3 000000 8888 333333333 99999 4 4 4 0 1 2222 4 0 7777 55 3 5555555 3 3 0000000 55555555555 3 99 3 3 2 333 999 44 3 3 44 3 6 44 44 3 555 6 66 3 44444 1 666666666666666666666666666666666666666666666666 44 5 333 44 0 7777 11111 44 6666 4 3 1 2 3 3 4
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . .. .. . .. ... ............... . .. . . . . .. ......... . . ... . . . . ............. . ... . . . . . . .. ........ .. . . .. . ................. ..... . .............. . .... . .... . ................................ .. ... .. . . . ... ....... . .. .. .. .... . . . . . ... . ... . ..... . .. . . . ..... . . ........................... ............. . . ... ... . . . . .. ................... .. . ............................................................... .... . .... ........ .................................... . . . . ... .. .... . ........ .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ..................................... . ...... . . ............ . ....... . . . . . . . . . . .. . . ........... ... ................................................. .. . . .... . . ... .. . . . ... . . . . ... .. . . . ... . . . ...... ...... . . ...... .... ......... ..... . . . . . .... . . .... .. . ....... . . ....... ........... . .. . . . ... ... .. . . .. . . .. .. . ... . .. . ..... . ................................................ .. . ... .. . .... ..... .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 33 11 4 33 222 999999999999999 4 11 6 6 6 3 00 777777777 6 6 555 4 5 6 4 3333333333333 3 777 2 2 1 1 8 1 99 77777777 22 2 1 55 1 00000000000000000 00000 2 22222222222222 2 6666 2 5555 1 33333333333333333333333333333333 00 444 66 8 6 6 555 1111111 4 99 55 99 7777 7 7 5 5 5 888 0 888 1 55555 3 22 2 8 2 77777 7 7 222222222222222222222222222 6666666666666 3 7 777 888 3 3 7 1 88 7777777777777777777 00 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 9999 4 8888 11111111 999999999999999999999999999999999999 6 6 3 7 777 99 1111 3 22222222 66 888 3 3 222 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 4444444444444444444444444444444444444 3 777777 0 1 555555555555 6 5555555 3 2 3 4 3 4 2 3 3 7 66 6 0 00000000000 777 1111111111111111111111111111111111111111111111111 66 3 7 5555 3 3 888 66 7 0 3 111 4 0 0 0 000 22 6 0 0 000 0 1 0 888888 555555 5 6 555555 5555 666666666 33333 0 0 8 9 1 5555 0 8 5555 00 6 5555555 6 3 5555555 88888888888 3 33 1 1 5 777 222 66 3 3 66 3 7 66 66 3 888 8 55 3 44444 2 000000000000000000000000000000000000000000000000 66 8 555 66 4 4444 77777 66 5555 1 1 1 1 1 3 8
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCA-G----AAAGTGGAT-TTTGATCG--CGT------CTAAA-A--NG--TAAAG-T---TA--C--AGGCCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCA-G----AAAGTGGAT-TTTGATCG--CGT------CTAAA-A--NG--CAAAG-T---TA--C--AGGCCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCT--GAAGTAA---CT--T--G-A--A-AAAG--CATACAA-TG-C-ACTTTAAAT--TAAGGACTAT-TA---A-----A-A-AT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTT-AATAGCTA-GGCTTGT-ATA-C------TATA-GGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATACA-------T-------GT---ACCA--C--C--AAATCT--TN---A--GTCACCT-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTACCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGAC-AA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GGA----------AT--TGTCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAATA--CTT-ATGA----TAAT----TTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-A-TACGAG---TT--GTA----ACAG-AAA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TG--TTGC--TAAAA-GATTAC-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTTTTTTTTTACATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCATTC-TTAG-TGCATAAAGTGCGAAAACA-GTC-ACAGAGTAATTTC-TAATAA--AGA--GTT-CT----A---T-GCA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A-------------C-ATCG-CC-C--TC-GA-CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAAT-TCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGAG------TA------TTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCAC----CAGATTTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-A-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAAGTGTACCCA-GGCTAAGAGTGAGTACTTTATAGGACATGGAAGAATAAA-A--GGATCAAAGAT---TAATA--AATNTAAGAAT-G-AGTAC--TTTATAGGGCAGGGAA--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : --------A--------AG--TG-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-C-T-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAGTACTAATA------TTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT----GTGCT---A--------CA-TC-CCC-CGTT-TCTC----AAGATTTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-ATC-------C----------AAATTTCAC---C---GA-----------T-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTC-T-GTA------------C--------T-ATGATG--GGAGT--G-CCTAATAGGAAG---TAT-AAGAAC-TGACTCCA-G-----AAGTGGA---CTGAT----CTT------CTAAA-A--AG--T-----T---TATCC--AGGCTCAAGAT-G-GGTAC--TATGAAAGGCGGGGAT--A-AAT-----AAAAAGAG--TAAA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : aCAG-GCACATTG--TTTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA---TT--G--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCTATATA---ACTTCTA-A-GT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATATC------TAT--TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-----GGTATGTT-TATATATAAATTATGTAA-GGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGAT-------GT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGTCT-TGCAAAAGTTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGT-AAAA----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-
gi|12 : ---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GATCCGTGA-A-T------GATA----------TCT--A-TGT-CTT---------A------TACTATAGGTCTGTT-TGT--------------A-TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCACC-------T--------C---AAAG--A--TGTTGCTCG--CC---AAGGTCACCC-TGTAACAATTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAACA----T-CCACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC---------TCA-GA-TGAC-A-AAAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTA-TATTGAAAA--AAAAATCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-GAATGGTACATGTAGTTGG---------G------ATACTT----C---A----TAT-GCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GAA----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATC-----------a
gi|13 : aacacGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATTGTATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAA-C---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACATTA---TTATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CTC---AAAATGA----T--T--G-ACAA-AGAG--CAAACCA-TG-C-ACTTGTAAT--TAGAGTCT-TATA---ATTCT-A-A-GT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCG-TAAATACTC-A-TTGTGA-AGAATGTGATA-TCTATG-TATA-GAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-----TATAAATTATGT--------------AAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACC-------TCAAAGATGT---AAAA--CTGC--TACTCG--CT---AAGAACGCT--TGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAAA-----TTCCACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCC-TC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AA-C---TTGTC-AT
gi|15 : gATGA---CTGTT--A-G--A-AGAG--TGAACAA-TG-C-ACTTGCAAT--TTGGGCCTATATA---A-----A-AAGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAG---CCCG-TAGATATTC-A-TCATGA-GGTATGTGATATC------TAT--GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTAT--------------T-------AT---GA----------TGTACG--CC---AAGGTCACACATG-AACACTTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAAAA----T-CCAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-GA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCTA-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGT-TCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G-------------T--T-TCAAA-------------AGGT--A-TAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGT-GGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACAT-AATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGC-AA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AA-CCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTA-TTTTTCACA--AGAA---CAAACCTCTA-----GATAAGATAAAACGCTA-----TGTGAG---------G------GTACTTA---CTAAA----TGT-TCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G-------------T--T-TCAAA-------------AGGT--A-TAT-----------------------TT--CTT-AGGACTTTTAATTATATTAA-ATACTATGGGTGATG--------AGACA-T--G----------T-TGTCCAGTTTAATTATTGT-GGG-CAAAAC-GTTAAGAAGTTTT--CTAC---ACAT-AATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : AAAA--AAAA-T-TAAAACT-TT-----GA-AAGAT-AAA-GCTTCT---GGT--AAATACAAATG------ATACCT----C---A----TTTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTGAAA--TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAA-------------A--C--AATATC-----------AA------AAAGA--CTTGAAGTA---TAAT----CTAG-TATT--TCGGTGATGGTCTGGGTATAC--T--A----------TAT-----------------T-GA-CCAAAAC-A-TAAAAG---TT--CTA----ACAGGAAT--------AT--A---GCG-CC--ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TA--GTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTGAAGA-AA----G-TTTTATCA------TA---------TAACCT-----GATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GCAAAT-
gi|19 : tatCCGTG------TA------TTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT----GTTCT---AC---CACCCCCAC-CCC-C-TTTTCTC----CAGATTTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCCG-TTC-------CCCAA-AA---AAATTTCAA---C---GA-----------T-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTC-T-GCCATA--GT--A-TCA-GT--A-TGATGATA--GGTAT--CAGCAATTGAGAGA---CATG-ACAAA-TGTTT-CA-G----AAA-TGGA---TTGAT----CAT------CTGAA-AACTG--TA--------TA--CCAGGGCTAAGCGT-GAAGTAC--TTTG-AGGACA--GAT--GAAAT-----ATAAAGAT--TCAAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTTtc
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACATTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACTCTGAAAGGTAAACTCT--T--GAA--A-AAAG--CATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGTA---A-----AGA-AT-TAGGTCATT-ACTT-GC-------------ATGTAAAAGCCC-GTTAGATATTCAA-TACTTA-GG-CTGTTATA-C------TAT---GGAATT-GTCAC-AATGT-TTCA--------A------TA------GTCTGTT-TGTC-------------A-GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATG-TAT-AACACC-------TC------AT---AAAT--G--C--TGCTCGTACCTTGAACATCGCC----------TTACAACCGAATAATAACAGTTGAATAAG----TACCACCAAATC-TACA-AAAGACG--AAG---ATA--CCGT-AGACAAA-TTGGCTC--GA-TGAT-A-AA-C---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCT-AAGCT-TAG----GA-AAGAT-AAACGC--------GT--GC--------G------ATACCT----C---A-----TT-GCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------G-A----------AT--TGTCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAA-TTAC---GGGTGGTG--------AGAC----------------T-T-----------------T-GAG-CAAAAC-A-TACGAG---TTA-GTAC---ACAG-AAT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--A-----AA-AACG-T--CTA-T--TATGTTGC--TAAAA-GATT-C-AA--CCGTA-----AA----GTTTTTAT-GTTTCTTTTT-TTT--TTTTTTTT-----TACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GCAAA--ATTCGTT-G-TGC-CAAA-GGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAATTTC-T-ATAA--AA---GTTCTT----A---T-GAA---AAGA----------A------AA--T-----GT----------------------TC-GTCG-CC-CT-CG-AA-CGG---G--T-TTAAG-A-TCT-CGAA--T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCA-TATG-ACCGAG------TA------TTTTGA-GCGGAGAAGGT-T------ACT----GTTC----A----CACCCA-AC-CCCACTTTCTCAC----CAGA--TA-TTTCCGTGCAAA-T-A--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTC-TGGCAAT---TT--A-TCA-GT--A-A-ATGATG--GG-GT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAA-----TTTCCA-G-----AAGTG-----TTA---G--CGT------C-AAA-A--TG----AAG-C-------C--AGGCTAACGAT-G-AGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGA-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTggaaaa
gi|20 : a-GAA---AG-A-----------------AA--T-----ATT--------ACGAA----AG--TC-GTCT-CC-C--AA-AAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AAC-T-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGAG------TA------TTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCTT---ACA--CCCCCC-CC-CCC-CACCCTCTTTTTTCATAATTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGGTTC-------CCCAA-AC-TTTAATTCCAC---C---TACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTC-T-GCAATTTATT--A-TCA-GT--A-T-TTGATA--GTTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATG-AAAAA-TGTTTgg
gi|21 : ---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACACC-------
gi|21 : C-A-AA-C---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTA-TATTGAAAAAAAAAA-TCTGAAGCT-TA-----GA-AAAAT-AAACGTCA-----GGG--G---------G------ATA---------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTC----GAGATTTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-TTC-------CCAAA-TC-TTAAATTCCAT---C---TA-----------T-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCC-T-GTAAT---GT--A-TCT-GT--A-T-ATGATT--AGTTT--C-CCTGTTGAGGAG---TATGACAAA--TGTTTCCA-G----AA-GTGGAT-T--GATCGA-CG---------AAA-A--AG--TGCA------TC--C--AGGCCGAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCGGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCTG-TTC-------CCAAA-AC-TTATAGGCC-----C---CA-----------A-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC---GCAAT---TT--AATCGTAT--A-T-ATGATG--GGTAT--C-CCTATTGAGGAG---TATGGAAAG--TGTTTCCATG----A--GTGGGT-T--GATCG----T------CTAAA-A--------AAG-TGTATA--C--AGACAAAAGGT-G-AGTAC--TTTAAAGGGCAGGGAC--C-AAT-----AAAAGGAT--CACAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggAAAAC-G-TAAGAG---TTTTCTA----ACAG-TAT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AA--TTGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCTAAGAA----A-CATTGT--------TAT-TTT--TCTT-TTA-----AACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GTAAAT--TCC-TT---TG--------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GTAATTAAA-TGTTATT----A---T-TAA---ta
gi|25 : ttactggtgatgaggaccttgatgtcagtatattatattttgggtgaaACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTC-T-ACACT---TC--A-TTA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGGG---TATG-AAAAA-TGTTTCCA-G-----AAGTGGA---TTGAT----CGT------CTAAA-G--TG--TA--------TC--C--CGGACAAGAGT-G-AGTAT--TTTGAAGGGCAGATAT--G-AA------AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTT
gi|26 : -----------------T-GAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACTG-ACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAGAA----TACAAA--CTGT-------------------T-GC-----TA-------TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCAAA--GTCC--T-G-TTC-CAACGGAC-AAAACA-GTC-AAAG-GTAA---C-T-ATAA--AAggg
gi|27 : accaT--TTTTTTTT-----TACAGTA-AAGGCCCCGACGT-GCGAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-TAAACA-ATC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAA--AAAATGTTGTT----A---T-AAA---AA-AACTGAAGAAAT------GAAAT-----ATT--------ACGAG----AG--CC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : -TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GTACA-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGTAG---CATG-AAAAA-TGTTCCCA-G-----AAGTGGA---TCGAT----TGT------CTAAA-A--AG--c
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAATtgtatcc
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTTATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATACTTC---AAAATGA---CT--GAAG-A--A-TGAT--CAAATAA-TGGC-ACTTGAA----TGAAGCCTAAATA---A-----A-A-AG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-G-TAGATATTC-A-TTGTGAAGGTCTGTG-TA-T------T-TA-TTGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TAT----GGTCTGTT-TGT--------------A-AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-AAAT----------T-------GT------G--C--C--TGCTCG--CC---AGGGTTGC---TACAACTGTTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAAAA----TCACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGC-AAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTATCAC-----G-TTCATG----GTATTTTTGAAAA--AAAATTCCAAAGCT-TG-----GA-AA-AT--AAC-CTAAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTT-GCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGA------ATGTTAAAAACTGAACG------GAA----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATCCAATATACA--AA------AAAGA--CT---TGA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATG--------ATACCTT--GTATTTAT---T-T-----------------T-AAGCCAAAACTG-TAG---------------------------------CT--G---G-GCC---ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTA--CTGC--TAAAACGACTACGAA--CCGTC-----AA----G-GTTTTT-A------TATGCTC--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GCAAAT--TCC--T-G-TGC-CAAAGGGC--AAACA-G-A-AAAG-GTAATTTC-T-AT-A--GAA-TGTTGTT----AATTT-TAA---AA-A----------A------AA--TGAAGAAGTGCCACGAAA--------AA--TC-GTCG-CCTT--AA-AA-CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA---T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGAG------TA------TTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---ACATGTACTAA-AC-ACT-CATTCTCTC----CAGATTTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC----TC-------CCAAA-AT-TTAAAATCCAA---C---TA-----------C-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T---------------CAAT---TT--A-TTA-GT--A-TAATGGTG--GATATACC-TCTTTTGAGGAG---TATG-AAAAA-TGTTTCCA------AAAGTGGAT-TT--AT----CGT------CTAA--------------------------AGAC-----GT----GTAC--CTCTCAGGGCA-AGAC--A-AGTATTTGAAAACGAT--CAAAG----ATTAATAA---GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTCT
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCATTGC-TTCATAGCGT--ATT-CATTACACTAC-ACCC---AAAATGA---ggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAA-TG-C-TCTTGAAAT--TAGGGCCTATATATAAA-----A-A-GT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-CCTAAATATTC-A-TTGTTA-GGTCTGTGATA-T------CAAT-GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-----GGTCTG
gi|32 : TCCC-G----AAAGTGGGC-T--GATCG----T------CTAAACA--TG--TA--------TC--C--AGGCCAATAGTTA-AGTAC--TTTCAAGGACAGGAAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAGAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-
gi|33 : GAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCA-AA--TCCGTCG-CA-A--AACAA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GCAAAT---CC-GT-A-TGC-TAAA---------TA-G-C-AC-------CTTC-T-ATGA--AAA-TGTTATTT---A---A-GAACTTAA-G----------A------AA--T-----ATT--------ATCAATCAAAG--TC-GTCG-CA-A--AA-AA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACACC-------T--------C---AAAG--A--TATTTCTCG--CT---AAGGTCGCCC-TGCAAAAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAA
gi|39 : GC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-CGTTGCT----A---T-TAA---AAGA----------CTAA---AA--T-----ATTATGA----A--------AG--TC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-AC-T-T
gi|4 : TCGCCC-TGCAACAGTTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAAAA----T-CCACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGC-AA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTA-CTTTGAAAA--AAAA-TCAAAAGCT-TACGGTAGA-AAGAT-AAACACTA-----GAT--G---------G------ATACCT----C---C----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------G-A----------AT--TATTAAA-------------AT-T--G-TATCCAG--------AATATACCAAAGA--CT---TGA----TAAT----TTTG-TTAC--T-GGTGATG--------AGAC--CTAGGTATACTTATT-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAA-AG---TG--CTAACAGACAG-AAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTAC--TAGAA-GATTATGAA--CTGTG-----AAGG--G-TTTTAT-GC-----TA--------TTTCTTG-----GGAAATAGAAGGCCC-ATCATAGCAAG--ATTA-GT-GATG--CAGAAGCC-GTAATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-AT-----AA-TGTT-TTAAAAA---T-GAA---AG-A----------G------GA--T-----GAT--------A--------AAATTC-ATGG-AC-A--TA-AA-CGG---G--TAAAAGGTA--ATCTAGACAA-TTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGA-TGTG-GTGGAGAGC---TG------TTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------A-TGAGAGTCTTAAAAC---CCCGCC-AC-CGC-CATTTTCTCA---CAGATTAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-TACG------CACAA-ATGTGAAATTGCACG--C---CA-----------GATTGG----AAGAT--AA-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTT-GGAAT---TTAGA-TCA-GT--A-T-AGGGTGATGGTGT----CCTATTG-GGAGGTCTATG---AAA-TGTTTCCA-G----AAA-TGGA---TTGAT----CGT------CTAAA-C--AG--C---G-TA--TC--C--AGACAAAGGGC-G-AGTAC--TTTGAAGTGTAGGGAC--A-AAT-----AAAAGGAT--CTCAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|40 : AAC---CC-G-TAGACATTC-A-TCGTGA-GGTATGTGATAGC------TATA-GG-AATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTA-----TGT--------------A-GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CCTTCTG------CAAATTTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-TTC-------CCCAATAC-TTAAATTCCAAGTACAAGTA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGAC------AA------TTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT----ATTCT---GC---AAC----ACGCCC-TGTT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AA-C---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTA-TATTGAAAA--AAAA-TCTTAAGCT-T
gi|49 : AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : AAA----T--CATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGC-AA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CA-C---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TTCAAACTT-TA-----GA-ATGAT-GAACGCTA-----GGT--A---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-AA-GAA--TCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGAA----------AT--TTTTAAA-------------A--TTTA-TATCTAAAACATACAAA------AAAAA--CTT--TTAT---TAAT----TTAG-TTAT--TGG-TGATG--------AGAC--T--A----------T-T-----------------TTGAGCCAAAAC-G-TAAGAC---TT--CTA----ACAG-AAC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TA--TTGC--TAAAT-GGTTACGAA--TCGTG-----AAT---G-TTTTAT-A------GAA-TGTGATTTTCTTT-----AACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GCGAAT-ACC---T-G-TAC-CAAAGGGC-AAAAC----------------TTC-T-ACAA--AAA-TTTTGTT----A---TTAAA---AA-A----------CTCAAGAAA--T-----ATTTCCA----A--------AG--TC-GTCG-CC-CC-AA-AA-CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA---T-TTAGC-ATG-A-CAATG--C-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAG------TACCGGTATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACACA----CCC-CGATTTCTC----CAGATTTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTG-TTCGATATTCCCCAA-AC-TTAAATTCCAC---T---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--AAT-ATGATG--TGTGT--C-CCTATTGAGAAG---TA--AATAAA-TGTTTCCA-G----AA-GTAGAT-T--GATCG----T------CTAAA-A------CAAAGATG--TATCC--AGGCCAAGGGT-G-TGTAC--TTTGAAGGACAGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAA-TG-C-ATATAAATT--TAGGTCCTATATA---A-----A-A-GA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGAC------AA------TTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : -----------------T-GAGCCAAAAT-G-TAAGAG---TT--CTA----ACTG-ACT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACATTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CTC---AAAATGG---CT--G--G-A--A-AAAGATCAAAAAA-TG-C-GCTGGAAAT--TAGGGCCTATATAT--A-----A-A-ATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-G-TAGATATCC-A-T--TGA-GGTCAGTGATA--------TATATGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACACC-------T--------C---AAAGATT--C--TGCTCG--CC---AAAGTCACCC-TACAATAGTTACAACC-AATA--------------------TTCCTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGC-AA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAA--TATAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAGCGCTA-----GGT--G---------G------ATACTT----C---A----TTT-GTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------AA----------AT--TATCAAAATTGTATCCATATA--T--A-TACC-----------AA------AAAGA--TT---TGA----TAAT----TTAG-ATAC--T-GGTGATG--------AGACA-T--GGGTATACTATT-T-----------------T-GAGCCAGAAC-G-TAAGAG---AT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAC-GATTACGAA--GCGTG-----AAGAAGG-ATTTAT-G----------TTA--TATTCTTT-----GGCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAAC--CC-G-TAGATATTC-A-TC-TGA-GGTCTGCGATATC------TAT--GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A--C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTA-TTTTAAAAA--AAAAATCTAAACCT-TA-----GA-AAGAT-ACATG-TA-----A-----------------------ACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATTAAA-------------A--T--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GCAAAT--TCC-T--G-TGC-CAAAGGGC-ATAACA-GTC-ACGG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTTTT----A---TTAAA---AA-A----------CTGAA--GA--A-----ATTTTACGA--A--------AG--TC-GTCG-CC-TCAAA-AA-TAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-C-T-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGAG------TA------TCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT----GTCTT---Atgta
gi|8 : GTGGGT-T--GATCG----T------CTAAA-A--------AAG-TGTATA--C--AGGCAAAGGGT-A-GGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--C-AATA----AAAAGGAT--CACAG------------AT-GTGGGTGAAAACgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACATTGC-ATCATAACGT--ATT-CATTACACTAT-ACTC---AAAATGA---CA--G--G-A--ACAGAG--GAAACAC-TG-C-ACTTGAAAT--TAAGGCCTATATA---C-----A-A-GT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-G-TAGGTCCTT-C-CCGT-A-GGTATGTGATA--------TATATGCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-----GGTATGTT-CGT--------------A-GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACACC-------T--------TAAAAAAG-----C--TGCTCG--CC---AAGGTCGTCC-TGCAACAGTTGCAACa
blockSeqs : A T TCTTTC A ATGTTATG TAA T A A ATGGAT T T T CT TT T AA TGA ACTCTTGAA C AT T G G TA ACTTCT G A GTA T T C ATCCAGGCTTGGC G AGC C T A . T A AA TCTATTG AT . TA T TGTGTATATAA CTATA A ATATAAATTATGTA A ATAA A . G TCAAAGATGTAAAACTGC TA TTG CA A G A GTT ATT A CC CG GA AAA T C A T A CAA A AAA C GAATG T AA A C CGGTA T A CTGGTAAATACAAATG TTCCCAAATT T C CTG CAC C G T T AC GAATTAATAAAAT GC A ATTTATATCTAAAACATACAAAAAAAACTTTTAT TATA T TATG GTCTGGGT ATGTTGTCCAGTTTAATTATTG T C T T GTT TT ACAG G TATCGGTG TC TGA C C TCA CCG TAT GA AG T GC A AGT TG AA C G AC AAAGTTTTTATGTTTCTTTTTTTT A G G A ATTCGTTG . GGACAA G T G A . G . A TT A C AAAAATG CTT AACTGAAGAAATGAAATATTACGAG AT C T TCA C A CCC GT A C T ACA . A . G TGT G T G . TGG . T A TACTAA CCGGTA G G TTATGA GAGA TACATG CCCCA G A G T TTTT G TGC AA G GATATTC T G GTACAAG CATGTACTGTA A GG C A C TG TTA AG A T AC A G AT AC A GTC A C T A A TTGATCGTCTAAAACAAAGATGTATC CA T GA CT AGA ATTTG CA ATTA T C G A T T G
blockSeqs : . T TTC A . . . . G . A . T AT . . AC . TTGGACA . . . . . . ATTCT . . TA G T . . . C C C . . C . TC TCTATG AT . TA . CATACATG T A C A ATAA G . G TCAAAGATGTAAAACTGC . . T C . T AT GTA C CC C GA AAA T . A . . CAA A AAA . G . . T C G T A AAAGGGTGGAAAAAA ACTAAA . G CTG . . . T T A AAAATCGAA . A ATTGTATCCATATATATACCAAAAAGATTTGA TATA . TATG . ATGTTGTCCAGTTTAATTATTG . C . T GTT A C . TATCGGTG . . . . C CCG . . AG . G . TG . . . G . GCTAAGAAACATTGTTATTTT T T . . ATTAGTGA . GGGCTA . T . A . . . A . . A AATTTT CTT AAAATGAAGAAGTGCCACGAAA . . T CT . . . . T T . AC . . . . TGT A C . . . . T . AGC . G . . . TAAAAC CCAA . . T T A . CT . . G . . GC . . A . . G TT A . . . . . A . . . . A A . A A TTGATCGTCTAAAAAAGTGTATA . T TA . GA A . . T . A C . . T
blockSeqs : . T TTC . . . . . T . G . T CT . . A . CTGTTAG . . . . . . ATTCT . . TA G T . . . G C . . . T . AA TC A . C . CAA . . . . ATAA A . G TCAAAGATGTAAAACTGC . . C A . T TC ATC A A A . TC . . A . . . . . . G . . A . . . . CATGTAGTTGGG ACTAAA . . . . . . . T T GAA . G ATTGTATCCAATATACAAAAAAGACTTGA . . TC . CTAGGTATACTTATTT . C . . . . C . . . . . . . . . . . . A . T . . . A . GAATGTTTTATAGAATGTGA C A . . TTCCTT . AGCCGT . T . A . . . A . . G TAAG . ACTCAAGAAATATTTCCAA . . . TT . . . . A G . AC . . . . GT G C . . . . T . . . T . . . TACA CCCC . . A A . . T . . . . . C . . T . . G T . . . . . . . . . . . A A . A A TTGATCGTCTAAAAAAGTGTATA . T G . A . . . T . A C . . A
blockSeqs : . C TTC . . . . . T . A . A C . . A . CTGAAGA . . . . . . TAAA . . TA G C . . . T . . . . T . AA TC A . . . CA . . . . . A . G TCAAAGATGT . . C A . T AT AT A C C . TC . . . . . . . . . G . . . . . . . TGTGAGG CA . . . . . . . T T GAA . A ATTGTATCCAGAATATACCAAAGACTTGA . . TC . ATGGGTATACTATTT . C . . . . C . . . . . . . . . . . . G . G . . . G . GAAGAAAGTTTTATCATA T G . . GTCCTG . GGGCAA . T . A . . . A . . G TAAG . ACTGAAGAAATTTTACGAA . . . CC . . . . A G . C . . . . TT G C . . . . T . . . G . . . TAC TAAA . . A T . . T . . . . . C . . A . . T T . . . . . . . . . . . G A . A A CTGATCTTCTAAAAAGTTTATC . C G . G . . . T . A C . . A
blockSeqs : . A TTG . . . . . T . A . T C . . A . TTGACA . . . . . . TA . . T G A . . . C . . . . C . TA GC A . . . TA . . . . . G . G TCATAAATGC . . C C . T AT TT C A C . TC . . . . . . . . . G . . . . . . . TGTGAGG CA . . . . . . . T A GAA . A ACAATATCAAAAAGACTTGAAGTA . . TG . CTTGTATTTATTT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . G . . . G . CAAGGTTTTTATATGCTC C T . . TTCCTG . GGGCAT . T . A . . . G . . A ATTA . GAAATATTATCAATCAA . . . C . . . . T C . A . . . . TG G C . . . . C . . . C . . . TGC GCCA . . A T . . A . . . . . A . . G . . G T . . . . . . . . . . . A A . A A TTGATCATCTGAAAACTGTATA . A G . C . . . T . G C . . A
blockSeqs : . C TTC . . . . . . . . . A . TTGACA . . . . . . A . . T G G . . . . . . . . A . TC TC A . . . TA . . . . . G . A TCAAAGATAT . . C C . T TC TT C A A . GA . . . . . . . . . G . . . . . . . GTGCG CA . . . . . . . G A TG . T ATATATCAAAAATACTCTTATGAC . . G . TATAT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . . . G . GAAGAAGGATTTATGTTA C G . . TTCCTG . GGCAA . T . A . . . G . . A ATTA . GACTAAAATATTATGAA . . . C . . . . T G . C . . . . TG G C . . . . T . . . T . . . TAC CAT . . C T . . C . . . . . C . . A . . G T . . . . . . . . . . . . A . A A TTGATCGACGAAAAAGTGCATC . C G . G . . . T . A G . . A
blockSeqs : . A GCC . . . . . . . . A . CTGGA . . . . . . A . . T G C . . . . . . . . T . TC T T . . . CG . . . . . G . A TCAAAGATTC . . C A . A TC AT C C A . AA . . . . . . . . . G . . . . . . . GGGGG CC . . . . . . . T A TG . A AGGTATATTTCTTAGGACTTT . . T . TATT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . G . . . G . GAAGGGTTTTATGCTA C G . . TCCGTA . GGGCA . . . A . . . A . . G ATG . GAAATATTATCAATCA . . . C . . . . A G . . . . . . T G C . . . . . . . . C . . . TA ACA . . G T . . C . . . . . C . . A . . G T . . . . . . . . . . . . A . A A TTGATCGTCTAAACAGCGTATC . C G . A . . . T . G T . . A
blockSeqs : . A TTT . . . . . . . . A . CAGGA . . . . . . A . . T . C . . . . . . . . T . TA C A . . . CA . . . . . G . G TTAAAAAAGC . . . C . T TC AT C C A . AA . . . . . . . . . T . . . . . . . GATGG CA . . . . . . . T A GA . A AGGTATATTTCTTAGGACTTT . . T . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TGCTA C A . . TCCGTA . . . . . G . . . A . . G ATT . AAATATTACGAA . . . A . . . . A G . . . . C . . . . . . . . G . . . A A . . G T . . T . . . . . C . . A . . G T . . . . . . . . . . . . A . . A CTGATCGTCTAAACATGTATC . A G . G . . . . . A C . . A
blockSeqs : . T TTT . . . . . . . A . . A . C . . . . . . . . C . TC T . . . . CA . . . . . G . T TGTGCC . . . T . . TC AT C T A . AA . . . . . . . . . G . . . . . . . GGTAG CA . . . . . . . . A GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . TACCTG . . . . . . . . . A . . T ATA . AGGATGATA . . . A . . . . A A . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . C . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . TTGATCGTCTAAAGTGTATC . C G . A . . . . . A G . . A
blockSeqs : . A TTA . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . TC T . . . . CA . . . . . G . G TATGA . . . C . . . TT . C A . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . GGTGG CA . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCCTG . . . . . . . . . . . . . ATT . GAAAATGT . . . C . . . . A A . . . C . . C . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTAGCGTCAAAATGAAGC . A A . G . . . . . G T . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . C . TA . . . . . A . . . . . . . . . . . A . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTATCGTCTAA . . . . C . . . . . A A . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : C* A* *** CTGAA********** TA* TC****** **** TCAAAGATGTAAATGC**************** TC* NT***** GAA**************** TG** CCGTTATTATTT************************ G***** TTCCTG****** GGGCA** GATGAAATATTACGAA********************************* AC* G* TAC****** A* A**** TTGATCGTCTAAAAAAGTGTATC*************************
originalCons : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGCTTTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATAACTC---AAAATGA---CT--T--G-A--A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATA-C------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACC-------T-------GT---AAAG--C--C--TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAAAA----TTCCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GAA----------AT--TATCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTAC--TGGGTGATG--------AGAC--T--G----------T-T-----------------T-GAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAAT-ATCC-TT-G-TGC-CAAAGGGC-AAAACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AA-A----------C------GA--T-----ATT--------A--------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCT---AC---CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCA-G----AAAGTGGAT-TTTGATCG--CGT------CTAAA-A--NG--TAAAG-T---TA--C--AGGCCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
finalCons : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACATTGC-TTTATAGCGT--ATT-CATTACACTATA-CTC---AAAATGACTGAA----------A-AGAG--CAAACAA-TG-C-ACTTGAAAT--TAGGGCCTATATA---A-----A-A-GTTA-GGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-G-TAGATATTC-A-TCGTGA-GGTNTGTGATATC------TATA-GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-----GGTCTGTT-TGT--------------A-GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACCTCAAAGATGTAAATGC----------------TGCTCG--CC---AAGGTCGCCC-TGCAACAGTTACAACC-AATAATAACATC-GTAAAANT-----CCACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGC-AA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AA-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTA-TTTTGAAAA--AAAA-TCTAAAGCT-TA-----GA-AAGAT-AAACGCTA-----GGT--G---------G------ATACCT----C---A----TTT-GCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAAGAA----------------AT--TATCAAA-------------A--T--A-TATC-----------AA------AAANA--CTT-ATGAC---TAAT----TTAG-TTACTG--GGTGATG--------AGACCCGTTATTATTT------------------------T-GAGCCAAAAC-G-TAAGAG---TT--CTA----ACAG-AAT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TA--TTGC--TAAAA-GATTACGAA--CCGTG-----AA----G-TTTTAT-G------TAT-TTT--TTTTCTTTG-----ACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GCAAATTCCTG------TGC-CAAAGGGCA--AACA-GTC-ACAG-GTAACTTC-T-ATAA--AAA-TGTTGTT----A---T-GAA---AAGATGAAATATTACGAA---------------------------------AG--TC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAAC-T-TTTGC-ACG-A-CAATGTGCG-CCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT----GTCCTAC------CACCCA-AC-CCC-CGTTCTCTC----CAGATTTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CCCAA-AC-TTAAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTC-T-GCAAT---TT--A-TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCA-GA----AAGTGGATTGATCGTCTAAAAAAGTGTATC-------------------------C--AGGCCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-----AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111111 111111 11111111 222222222 111 1111111111111 111 1 4444444 11 11111111111111111 22222222222222 1111 444444444 111111 1 111 33333333333333333333 2222222222222 111 22222222222222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 111 1 11111111111111111111111111111111 111 1 22222222222222 111 4444444444444444444444444444444444444444444 111111 111111111 22222222222 444444444444 11111111 1111 1111 111111 111111 111111 1111 1111 1111 1111111 1111111 11111111111 1 11111 1111111 1111111111
lowQualScore : 2 5 000000 5 00000000 777 4 4 1 999999 1 6 8 4 8 8 66 4 8 4 8 777 77777777 66 4 66 3 3 3 0 55 3 777777777 3 444 1 3 3 1 8888888888888 3 777 2 3 6 3 3 22 6666 0 0000000 3 11 3 88888888888888888 2 6 3 44444444444444 9999 5 6666 0 0 0 0 777777777 1 55 666 000000 44 3 1 3 4 666 555 44 7 3 1 88 3 77 5 5 2 0 2 888 5 000 44 77777 3 3 44 5555 6 88888 3 6 6 44 00000000000000000000 999999 2222222222222 6 111 555 3 3 6 2 3 55555555555555555555555 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888 4 111 0 4 22222222222222222222222222222222 4 44 3 6 666 3 0 3 44444444444444 44 555 3 3 999 111 555 44 99 3 44 4 6666 66 66 4 2 66 9999999999999999999999999999999999999999999 2 000000 8 3 3 77 3 3 3 3 3 999999999 1 7 3 2 3 0 3 3 3 44 8 33333333333 333333333333 666 66666666 3 6 3333 3 3 555 44 5 1 6 1 8888 5 5 5 999 77 1 4 4 777 4 33 4 666666 000000 3 3 000000 777 0 7777 2 999 4 4 0000 0 1 2222 4 4 5555 55 3 1111111 3 3 3 0000000 55555555555 3 55 3 3 2 6 999 77 3 44 3 6 44 44 3 555 2 88 3 44444 1 555 6666 1111111 44 0 3 3 555 3 4444444444 1 1 3 3 44 1 8888 3 44 6666 4 3 1 2 3 3 4
lowQualScore : . . ...... . ........ ... . . . ...... . . . . . . .. . . . . ... ........ .. . .. . . . . .. . ......... . ... . . . . ............. . ... . . . . . .. .... . ....... . .. . ................. . . . .............. .... . .... . . . . ......... . .. ... ...... .. . . . . ... ... .. . . . .. . .. . . . . . ... . ... .. ..... . . .. .... . ..... . . . .. .................... ...... ............. . ... ... . . . . . ....................... . ........................................................... .... . ... . . ................................ . .. . . ... . . . .............. .. ... . . ... ... ... .. .. . .. . .... .. .. . . .. ........................................... . ...... . . . .. . . . . . ......... . . . . . . . . . .. . ........... ............ ... ........ . . .... . . ... .. . . . . .... . . . ... .. . . . ... . .. . ...... ...... . . ...... ... . .... . ... . . .... . . .... . . .... .. . ....... . . . ....... ........... . .. . . . . ... .. . .. . . .. .. . ... . .. . ..... . ... .... ....... .. . . . ... . .......... . . . . .. . .... . .. .... . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 999999 7 44444444 000 4 4 0 222222 0 7 7 4 4 9 11 4 9 4 9 000 77777777 11 4 11 6 6 6 3 00 6 777777777 6 555 4 5 6 8 3333333333333 3 777 3 1 2 8 1 99 5555 4 7777777 1 55 1 66666666666666666 9 2 1 22222222222222 6666 2 5555 8 5 5 5 000000000 2 00 444 555555 33 7 8 6 6 555 888 66 3 6 4 99 1 99 7 7 7 0 5 888 0 888 66 55555 3 1 22 5555 2 33333 3 7 7 66 00000000000000000000 666666 9999999999999 7 777 888 3 3 7 1 6 11111111111111111111111 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9999 0 888 0 0 11111111111111111111111111111111 0 66 3 7 222 3 0 3 77777777777777 66 888 3 3 222 777 888 66 22 6 66 4 9999 11 11 4 9 11 1111111111111111111111111111111111111111111 3 777777 0 1 3 99 3 3 6 6 6 000000000 0 2 3 4 3 4 3 3 3 66 0 55555555555 888888888888 444 99999999 3 7 5555 3 3 888 66 7 0 7 6 4444 0 0 0 000 22 6 0 0 000 0 11 0 888888 555555 5 6 555555 000 8 9999 9 888 0 0 2222 9 1 5555 0 0 1111 00 6 8888888 6 6 3 5555555 88888888888 3 22 1 1 5 7 222 99 3 66 3 7 66 66 3 888 7 55 3 44444 2 444 5555 8888888 22 4 1 1 444 3 6666666666 6 0 3 3 66 3 2222 3 66 5555 1 1 1 1 1 3 8
consensus : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACA-TTGCTTT-ATAGCGT--ATT-CATTACACTATA-CT-C-AAAATG---ACT---G--A-A--A-A--GAGCAAACAAT-G-C-ACTTGAAATTA--GGGCCTATAT-A---A-----A-AGT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-GT-AGATATTCA-TCGTGA-GGTNTGTGA----TATCTAT------GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A--------------GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACCTCAAAGATGTAAA--TGC-TGCTCG--CC---AAG------GTCGC-CCTGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAA---AN-T-C-CACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGCAA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AAC---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTATTTT-G-AAAA--AAAA-T-CTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------GA------TACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAAA--T-------------ATATC-----------AA------AAANACT--T-A-GAC---TAAT----TTAGTT-AC--TGGGTGATGA-GAC-------C----C--G--T---T--A-T----T-ATTTTGAGC--CAAAAC-G-TAAGAG---TTC-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TG--CTAAAA-GATTACGAA--CCGT-----G----AA----G--TTTT-AT-G-TAT------TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GC-AA--A-TTC-CT-G-TGC-CAAAGG-GC--A-AACAGTC-ACAG-GTAACTTC-T-AT-AA--AAATGTTGTTA---------TNAAAA----GA-C----GAAATA---TTA-CG-A---AAGTC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAACT-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTCTC----CAGAT-TTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCA-G----AAAGTGGA---TTGAT----CGTCTAA----AA--AAG-TGTAT-C---CA-GG----------CCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
Reference ( family-752 ) : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCGGAAGAAAATTTCATGNTCACAATTTCAC------TGNC-TTAGCTACAGTGTACA-TTGCTTT-ATAGCGT--ATT-CATTACACTATA-CT-C-AAAATG---ACT---G--A-A--A-A--GAGCAAACAAT-G-C-ACTTGAAATTA--GGGCCTATAT-A---A-----A-AGT-TAGGTCCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-GT-AGATATTCA-TCGTGA-GGTNTGTGA----TATCTAT-----AGGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A--------------GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTACGAACACCTCAAAGATGTAAA--TGC-TGCTCG--CC---AAG------GTCGC-CCTGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAA---AN-T-C-CACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGCAA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-AAC---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATG----GTATTTT-G-AAAA--AAAA-T-CTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------GA------TACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATCAAAA--T-------------ATATC-----------AA------AAANACT--T-ATGAC---TAAT----TTAGTT-AC--TGGGTGATGA-GAC-------C----C--G--T---T--A-T----T-ATTTTGAGC--CAAAAC-G-TAAGAG---TTC-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TG--CTAAAA-GATTACGAA--CCGT-----G----AA----G--TTTT-AT-G-TAT------TTT--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGCCCTGTCAT-GC-AA--A-TTC-CT-G-TGC-CAAAGG-GC--A-AACAGTC-ACAG-GTAACTTC-T-AT-AA--AAATGTTGTTA---------TGAAAA----GA-T----GAAATA---TTA-CG-A---AAGTC-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGAACT-TTTGC-ACG-A-CAATGTGC-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAG------TA------TTTCGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTCTC----CAGAT-TTA-GCTCCGTGCGACTT-T--TT--TCTG-TTC-------CC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---C---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAA-TGTTTCCA-G----AAAGTGGA---TTGAT----CGTCTAA----AA--AAG-TGTAT-C---CA-GG----------CCAAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACGGCCAAGTG-TCA-TTATTTTTT
gi|1 : CGAGGAGTGTTCCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAT---TGACAC-GTTA-GATTGATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAG-GTACA-TTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACT-CTGAAGTA---ACT---T--G-A--A-A--AAGCATACAAT-G-C-ACTTTAAATTA--AGGACTAT-T-A---A-----A-AAT-TAGGTCATT-ACTTGGC-------------AT-TAAA---CC-GT-AGATATTTAATAGCTA-GGCTTGT-A----TA-CTAT-----AGGGAATGTGTCA--AATGT-TTC---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A--------------GGT----AG--TGCTAAGAATATTCAAAACATGT---GAATAC-------ATGTA-----------CCA--CC---AAATCTTNAGTCAC-CTTGCAACAGTTACAACC-AATAATAACA-T-GTGAATACATGTAC-CACCAAATCTTACAGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGAGACAA-TTGGCTCG-TA-TGAT-A-AAC---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAAG----GTATTTT-G-AAAA--AAAA-T-CTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAACGCT--A-----GGT--G---------GA------TACCT----C---A----TTTGCT-TA---GGT---CTG-AACAA-AA-GAGAGTCCGTGTTGAAAA-TGCAAA------GG---AAT---------TGTCAAAA--T-------------ATATC-----------AA------AAATACT--T-ATGA----TAAT----TTAATT-AC---GGGTGGTGA-GAC------------------------------------TTTGAGC--CAAAAC-A-TACGAG---TTG-TA-ACA-GA----AA--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAACGCAA-AACG-T-CCTT-A--TGT--TG--CTAAAA-GATTAC-AA--CCGT-----A----AA----GT-TTTT-AT-G-TAT------TTT--TTTTTTTTTTTTACATAGTATGAGGCCCTGTCAT-GCTAATCA-TTC-TTAG-TGCATAAAGT-GCGAA-AACAGTC-ACAGAGTAATTTC-TAAT-AA--AGA-GTT-CTA---------TGCAAA-----A-C----G--ATA---TTA------------C-ATCG-CC-C--TC-GA-CGG---G--T-TTAAGTA-TGTCCGAATTCTTTGC-ACGCA-CAAT-TGCAACCTG-AC-ACAA---AAGCATCGCA-TATG-ACCGAG------TA------TTTTGATGCGGAGAAGGT-T------ACT---GTTC-AC---CACCCA-AC-CCC-CG---TTCTCAC----CAGAT-TTA-GTTCCGTGCAACTA-T--TT--TCTG-TTC-------CC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGCCCTTGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--A-A-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAAAAGTGTACCCA-GGCTAAGAGTGAGTACTTTATAGGACATGGAAGAATAA--AAG--G-AT-C---AA-AGATTAATAAATNTAAGAAT-G-AGTAC--TTTATAGGGCAGGGAA--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTG-TCA-TTTTTTTTT
gi|10 : -A---AAGTG-GTCG-CC-C--AA-AA-CGG---G--TATCAAGTA-TCTCCGG-CT-TTTGC-ACG-A-CA--GTAT-GCTTGTAC-AT-A---AAGCA-CGCATTGTG-ACCGAGTACTAATA------TTTGGAGATGGAAAAGCT-C------CCT---GTGCTA--------CA-TC-CCC-CG---TT-TCTC----AAGAT-TTA-GCTTCAAGGTACTT-T--TT--TCTG-ATC-------C-----------AAATTTCAC---C---GA-----------T-CTGG--AAAAGATACGA-ATCAATAAG-TGCCCTTCGGTCT-GTA-----------C--------T-ATGATG--GGAGT--G-CCTAATAGGAAG---TAT-AAGAAC-TGACTCCA-G-----AAGTGGA---CTGAT----CTTCT-A----AA--AAG-TTTAT-C---CA-GG----------CTCAAGAT-G-GGTAC--TATGAAAGGCGGGGAT--A-AAT-AAAAAGAG--TAAA-----ATTAATAAAT-GTGGATGAAAACGAATAAGTG-TAA-TT-TTCTTTtgg
gi|11 : CAG-GCACA-TTG-TTT-ATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CT-C-AAAATG---ATT---G--G-ACAA-A--GAGCAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCTATAT-A---ACTTCTA-AGT-T--TTTTTT-ACTTTGC-------------AT-TAAA---CCCGT-AAATACTCA-TTGTGA-AGAATGTGA----TATCTAT------TGTAATA-GAAA--AATGC-CTC---------A------TA-GGTATGTT-TAT-ATATAAATTATGTAAGGTATAAGGATTGCTAA----ATTTAAAGCAGGTTACGAACACCTCAAAGATGTAAAACTGC-TACTCG--CT---AAG------AACGT-CTTGCAAAAGTTACAGAA-AAAAATAAGA-ATGTAAA---AT-T-C-CACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GA-TGAC-A-AAC---TTGTC-
gi|12 : ---CC-GT-AGATATTCA-TCGTGA-GATCCGTGAATGATATCTAT--------------GTCT--TATA--CT----------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A--------------TGT----GGGTTGCTAA----ATTTGAAACAGGTTACGATCACCTCAAAGATGT---------TGCTCG--CC---AAG------GTCAC-CCTGTAACAATTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAA---CA-T-C-CACCAAATCTTACCGAAAGACGC-AAG-ATATA--CCGTGA--------GGCTCA-GA-TGACAA-AAC---TTGTC-GTTAACAC---ATG-TTCATG----GTATATT-GAAAAA--AAAA-T-CTAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-GAATGGT--ACATGTAGTTGG---------GA------TACTT----C---A----TATGCT-TA---TCG---ATA-AACTA-GA-GAAAGTCCGTGTTAAAAA-TACAAA------GA---AAT---------TATTAAAAT-T-------------GTATC-----------a
gi|13 : aacacGCACA-TTA--TT-ATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CT-C-AAAATG---ATT---G--ACA--A-A--GAGCAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCT-TAT-A---ATTCT-A-AGT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCGT-AAATACTCA-TTGTGA-AGAATGTGA----TATCTATTGTATAGAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-TATAAATTATGT-AA-------------GGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACCTCAAAGATGTAAAACTGC-TACTCG--CT---AAG------AACG--CTTGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAA---AT-T-C-CACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GA-TGAC-ATAAC---TTGTC-ATca
gi|14 : gGCACA-TTA--TT-ATAGCGT--ATG-CATTATACTATA-CT-C-AAAATG---ATT---G--ACA--A-A--GAGCAAACCAT-G-C-ACTTGTAATTA--GAGTCT-TAT-A---ATTCT-A-AGT-T---TTTTT-ACTTTGC-------------AT-AAAA---CCCGT-AAATACTCA-TTGTGA-AGAATGTGA----TATCTATGTAT-AGAAAATG-CTCATAGATGT-TT----------A------TA-TATAAATTATGT-AA-------------GGTATAAGGATTGCTAA----ATTAAAAGC-GGTTACGAACACCTCAAAGATGTAAAACTGC-TACTCG--CT---AAG------AACG--CTTGCAAAAGTTACAAAA-AA-AATAATA-ATGTAAA---AT-T-C-CACAAAATCTTAAAGAAAGACGA-TAG-CTATA--CCGTGAGCCTC-TTGCTTCG-GA-TGACAA-AAC---TTGTC-AT
gi|15 : gATG---ACT---GTTA-G--A-A--GAGTGAACAAT-G-C-ACTTGCAATTT--GGGCCTATATAA---A-----A-AGT-T-GGTCCTT-ACTTGAC-------------AT-TAAGC--CC-GT-AGATATTCA-TCATGA-GGTATGTGA----TATCTAT------GGGAATG-GTCA--AATAT-TTTGTGTATATAA------TA-GGTCTGTT-TGT-A--------------GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGGTTATTA-----T----GATGTA------------CG--CC---AAG------GTCACACATG-AACACTTAAAACC-AATGATAACA-TCGTAAA---AA-T-C-CAACAAATCTTACAGAAAGATGC-AAG-ATATA--CCGTGAGGCGA-TTGTCTCG-GA-TGAC-A-AAC---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCAT
gi|16 : tattatagagctctttaaggATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGCAA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AACCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTATTTT-T-CACA--AGAA----CAAACCTCTA-----G-ATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------GG------TACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAAAGGT-------------ATAT-----------------------TTCT--T-AGGACTTTTAATTATATTAAAT-ACTATGGGTGATGA-GACATGTTGTC----CA-G--T---TTAA-T----T-ATTGTGGG---CAAAAC-GTTAAGAAGTTTTC-TACACA-TA----ATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-tct
gi|17 : ATTTAACGGAAAGACACCAAA-ATATAGACCGTGAGGCAA-TTGGCTCGTGA--GATAA-AACCAATTGTCAGTTTACGCAAAGT--TTTAT-----GTATTTT-T-CACA--AGAA----CAAACCTCTA-----G-ATAAGATAAAACGCT--A-----TGTGAG---------GG------TACTTA---CTAAA----TGTTCT-TACTGGCA---ATG-TACAA-AA-GAGAATCCGTGT--AAAT-TGCAAAT-----G------T---------T-TCAAAAGGT-------------ATAT-----------------------TTCT--T-AGGACTTTTAATTATATTAAAT-ACTATGGGTGATGA-GACATGTTGTC----CA-G--T---TTAA-T----T-ATTGTGGG---CAAAAC-GTTAAGAAGTTTTC-TACACA-TA----ATTATCGGTGCT--G---G-G-C---GTTCCGA---G--AAGAAATGCAA-
gi|18 : -AAAA--AAAA-T--TAAAACT-TT-----G-A-AAGAT-AAA-GCTTCT-----GGT--AAATACAAATGA------TACCT----C---AT---TTTGCTCTA---GCA---AGG-AACAG-AATGATAGTCC-TGTTG-AAA-TGCAAA------GAATTAATAAAATATGCTATCCAAA--CA------------ATATC-----------AA------AAAGACT--TGAAGTA---TAAT----CTAGTA-TT--TCGGTGATG--GTC-------T----G--G--G---T--A-TAC--T-ATATTGA-C--CAAAAC-A-TAAAAG---TTC-TA-ACAGGA----AT--------AT--A---GCGCC---ATC---A---A--A--AGAGCCAA-AACGCT-CCTATG--TAG--TG--CTAAAA-GATTACGAA--CCGT-----GAAGAAA----G--TTTT-ATCA-TA--------------TAACCT-----GATAATA-AAGTCCCTGTCAT-GC-AA--A-TTC-
gi|19 : tatCCGTG------TA------TTTGGAGGTGAAAAAGGT-T------GCT---GTTCTAC---CACCCCCAC-CCC-C----TTTTCTC----CAGAT-TTAGGCTCC-TGCGAC-T-T--TT--TCCG-TTC-------CC-CAA-AA---AAATTTCAA---C---GA-----------T-CTAAA-AAAA---ACAA---CACGACA-TGCGCTTGGGTCT-GCCATA--GTA--TCA-GT--A-TGATGATA--GGTAT--CAGCAATTGAGAGA---CATG-ACAAA-TGTTT-CA-G----AAA-TGGA---TTGAT----CATCT-G----AA--AAC-TGTATAC---CAGGG----------CTAAGCGT-GAAGTAC--TTTG-AGGACA--GAT--GAAAT-ATAAAGAT--TCAAA----ATT-----AT-GTGAGTAAATACAGCCAAGTA-TCATTTGTTTT
gi|2 : CGAGGA---TTTCAAAAA-TAATGTCATTTCACCTTCT---TCGCGTTAA---TC--------GTTGAAATATCTTACTGAA-CCACAT---TGACACTGTTAAGA---ATCACTGAACCGTAGTGGAAGGAAATTTCATGATCACAATTTCAC------TATC-CTAGCTACAGTGTACA-TTACTTTTATAGCGT--ATT-CATTGCACTATAACT-CTGAAAGGTAAACTCTTG--A-A--A-A--AAGCATACAATTG-CGACTTTAAATTATAGGGACTATGT-A---A-----AGAAT-TAGGTCATT-ACTTG-C-------------ATGTAAAAGCCC-GTTAGATATTCAATACTTA-GG-CTGTTA----TA-CTAT-------GGAATT-GTCAC-AATGT-TTC---------AA-----TA-G-TCTGTT-TGTCA--------------GGT----AG--TGCTAA----GTTCAAAACATGT-AT-AACACCTCA------TAAA--TGC-TGCTCGTACCTTGAAC------ATCGC-C---------TTACAACCGAATAATAACAGTTGAATA---AG-TAC-CACCAAATCT-ACA-AAAGACG--AAG-ATA----CCGT-AGACAAATTGGCTCG--A-TGAT-A-AAC---TT-TC--TTAGCAC---GTGCTTCAAG----GTATTTT-G-AAAA--AAAA-T-CTAA-GCT-TA-----GGA-AAGAT-AAACGC----------GT--GC--------GA------TACCT----C---A----TT-GCTGTA---GGT---CTGCAACAAGAA-GAGAGTCCGGTTTGAAAA-TGCAAA------GA---A-T---------TGTCAAAA--T-------------ATATC-----------AA------AAATACTCTT-ATGAC---TAAT----CTAATT-AC---GGGTGGTGA-GAC------------------------------------TTTGAGC---AAAAC-A-TACGAG---TTAGTACACA-GA----AT--------CTTCG---G-G-CTCAAAC---A---G--A--AAA------AACG-T-C-TA-T--TATGTTG--CTAAAA-GATT-C-AA--CCGT-----A----AA----G--TTTTTAT-G-TTTCTTTTTTTT--TTTTTTTT-----TACAA-G-AAGGCCCTGTCAT-GC-AA--AATTCGTT-G-TGC-CAAAGG-CA--A-AACAGTC-ACAG-GTAATTTC-T-AT-AA--AA--GTTCTTA---------TGAAAA----GA-------AAATG---TT-------------C-GTCG-CC-CT-CG-AA-CGG---G--T-TTAAG-A-TCTC-GAA-T-TTTGC-ACG-A-CAAT-TGC-ACCTG-AC-AC-C---AAACA-CGCAT-ATG-ACCGAG------TA------TTTTGAG-CGGAGAAGGT-T------ACT---GTTC-AC----ACCCA-AC-CCCACT---TTCTCAC----CAGATATT----TCCGTGCAAATA-T--TT---CTG-TTC-------CC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---A---TA-----------T-CTTGT-AAAAGATGCAA-ATCACAAAA-TGTCCTT-GGTCTGGCAAT---TTA--TCA-GT--A-A-ATGATG--GG-GT--C-CCTATTGAGGAG---TATGAAAA-----TTTCCA-G-----AAGTG-----TT-AG----CGTC--------A--AAA-TGAAG-C---CA-GG----------CTAACGAT-G-AGTACCTTTTTATAGGCATGGACAGA-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAAT-GTGGGTGAAAACAGCCAAGTGTTCA-TTTTTTTTTggaaaa
gi|20 : a----GAAATA---TTA-CG-A---AAGTC-GTCT-CC-C--AA-AAACGGCCCG--TTTGAAGTA-TCTCC-AACT-TTTGC-ACA-A-CAATGTGC---CTGCAC-AC-A---AAGCA-CGCATTATG-ACCGAG------TA------TTTGGAGGCGGAAAAGGT-T------ACT---GTCTTACA--CCCCCC-CC-CCC-CA---CCCTCTTTTTTCATAA-TTA-GCTTTGTACGACTT-C--TT--TCTGGTTC-------CC-CAA-ACTT-TAATTCCAC---C---TACATGTACTGTAT-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAGAA-TACCCTTGGGTCT-GCAATTTATTA--TCA-GT--A-T-TTGATA--GTTGT--C-CCTATTGAGGAG---TATG-AAAAA-TGTTTgg
gi|21 : gaaa---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A--------------GGT----GGGTTGCTAA----GTGTAAATCAGGTTATGAACACC
gi|21 : C-A-AAC---TTTTC-TTTAGCAC---GTG-TCTATG----GTATATT-G-AAAAAAAAAA-T-CTGAAGCT-TA-----G-A-AAAAT-AAACGTC--A-----GGG--G---------GA------TA--------------------CT-TG---GCG---ATG-AACAA-AG-GGGAGTCCGTGTgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaacttttctttagcacgtgtctatggtatattgaaaaaaaaaatctgaagcttagaaaaataaacgtcagggggatacttggcgatgaacaaaggggagtccgtgt
gi|22 : ataggtctgtttgtaggtgggttgctaagtgtaaatcaggttatgaacaccgcgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTC----GAGAT-TTA-GTTCTGTGCGACTC-C--CC--TCTG-TTC-------CC-AAA-TCTT-AAATTCCAT---C---TA-----------T-CTGGGGAAAAGATACAA-ATCACGAAA-TGCCGTTTGGCCT-GTAAT---GTA--TCT-GT--A-T-ATGATT--AGTTT--C-CCTGTTGAGGAG---TATGACAAA--TGTTTCCA-G----AA-GTGGA---TTGAT----CGAC-GA----AA--AAG-TGCAT-C---CA-GG----------CCGAGGGT-G-AGTAC--TTTGAAGGGCGGGGAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAATAAAT-GTGGGTAAAAAGAGCCAAGTG-CCA-TTATTTT
gi|23 : tT-T--TT--TCTG-TTC-------CC-AAA-ACTT-ATAGGCC-----C---CA-----------A-CTGTG-AAAAGATAAAACATCACGAAAATGCCCATGGGTC--GCAAT---TTAA-TCGTAT--A-T-ATGATG--GGTAT--C-CCTATTGAGGAG---TATGGAAAG--TGTTTCCATG----A--GTGGG---TTGAT----CGTCTAA----AA--AAG-TGTAT-A---CA-GA----------CAAAAGGT-G-AGTAC--TTTAAAGGGCAGGGAC--C-AAT-AAAAGGAT--CACAG------------AT-GCGGGTGAAAACGGCGAAGTG-TCA-TTATTTTT
gi|23 : CGAGGGATGTTCCAAAAA-TAATGACACTTCGCCGTTT---TCACggaacatccctcgta
gi|24 : tttttctgttcccaaaacttataggccccaactgtgaaaagataaaacatcacgaaaatgcccatgggtcgcaatttaatcgtatatatgatgggtatccctattgaggagtatggaaagtgtttccatgagtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacagacaaaaggtgagtactttaaagggcagggaccaataaaaggatcacagatgcggTT-AC--TGG-TGATGAGGAC-------CTTGAT--G--TCAGT--A-TATTAT-ATTTTGGGTGAAAAAAC-G-TAAGAGTT-TTC-TA-ACA-GT----AT--------AT--GTGAG-G-C---ATC---A---GGAA--AAATGCAGTAAC--T-TCTA-G--AAT--TGAAATAAAA-GACTACGAAACCCACGCTAAG----AA----A--CATT-GT---TAT------TTT--TCTT-TTA-----AACAATA-AAGGCCCTTTCAT-GT-AA--A-TTC-CT-T-TG---------------------C-ACAG-ATTACTTC-T-GT-AATTAAATGTTATTA---------TTAAta
gi|25 : ACAA-ATCACTAAA-TATCTTAGGGTCT-ACACT---TCA--TTA-GT--A-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGGGG---TATG-AAAAA-TGTTTCCA-G-----AAGTGGA---TTGAT----CGTCT-------A--AAG-TGTAT-C---CC-GG----------ACAAGAGT-G-AGTAT--TTTGAAGGGCAGATAT--G-AA--AAAATGATCACAAAG----ATTAATACAT-GTGGTTGAAAACATGCAAGTG-TCA-TT-TTT
gi|26 : TGAGC--CAAAAT-G-TAAGAG---TTC-TA-ACT-GA----CT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCGA-AACA-T-CCTA-G--TAT--TG--CTAGAA----TACAAA--CTGT-------------------------T-GCTA------------TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GC-AA--A-GTC-CT-G-TTC-CAACGG-ACA-A-AACAGTC-AAAG-GTAA---C-T-AT-AA--AAggg
gi|27 : accaT--TTTTTTTT-----TACAGTA-AAGGCCCCGACGT-GC-GA--A-TTC-CT-G-TGC-CAAAGG-GCT-A-AACAATC-ACAG-GTAACTTT-T-ATAAA--AAATGTTGTTATAAAAAAACTGAAGA----AA-T----GAAATA---TTA-CG-A---GAGCC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA
gi|28 : TT-AAATTCCAC---C---TA-----------T-CTTGA-AAAA-ATACAA-ATCATGAAA-TGCCCATGGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GTACA-T-ATGATG--GGTGT--C-CCTATTGAGTAG---CATG-AAAAA-TGTTCCCA-G-----AAGTGGA---TCGAT----TGTCT-A----AA--AAG-TGTAT-C---Cc
gi|29 : CGAGGAGTGTTCCAATAA-TAATGTCATTTCACCTTTT---TCGCGTAAAAA-TCATGTTATGATGTAAATATTTTACTGAAACCACATTAATGACAC-GTTA-TATTAATCACTGAACCGTAGCACAAGAAAAT
gi|3 : CATGGGCAAAATTTTATATGGATTGAC-TTAG-TATAGTGTGCAATTATTTT-ATAGTGTTTATTTCAATACAC-ATA-CTTC-AAAATG---ACT---G--A-A--G-AATGATCAAATAAT-GGC-ACTTGAA--TG--AAGCCTAAAT-A---A-----A-AAG-TAGGTCGTCCACTTGCT-------------AT-TAAAG--CC-GT-AGATATTCA-TTGTGAAGGTCTGTG-----TATTTAT-------TGAATG-GT-A--CATGTTCTT---------A------TATGGTCTGTT-TGT-A--------------AGT----GT-TTGTTGA-----TTTAAAACAGATTA-----------AAATTGT------GCCTGCTCG--CC---AGG------GTTGC---TACAACTGTTACAACC-AATAATAACA-TCG-AAA---AA-T-CACATCAAATATTACAGAAAGACGC-AAGCGTATA--CCATGCCGCAAATTGGCTCG-GCCTGAC-A-AAC---TTGTC-GTTATCAC---GT---TCATG----GTATTTTTG-AAAA--AAAA-TTCCAAAGCT-TG-----G-A-AA-AT-AA-C-CT--AAAAG-GGT--G---------GAAAAAAATAACTTTCCC---AAATTTTTGCT-TA---GCACACATG-AACAA-GATGAA------TGTTAAAAACTGAACG------GA---AAT---------TATTAAAA--TT------------GTATCCAATATACA--AA------AAAGACT--T---GA----TAAC----TTAGTTTAC--TCGGTGATGA-TAC-------C----T--T--G---T--A-T----TTATTTTAAGC--CAAAACTG-TAG---------------------------------CT--G---G-G-CC--ATC---ATATG--A--AAATGGAC-ACCG-TACCTA-AGTTAC--TG--CTAAAACGACTACGAA--CCGT-----C----AA----G--GTTT-TT-A-TATG-----CTC--TTTTCTTT-----GACAATA-AAGGTCCTGCTAT-GC-AA--A-TTC-CT-G-TGC-CAAAGG-GC--A-AACAG-A-AAAG-GTAATTTC-T-AT--A--GAATGTTGTTAATTT-----TAAAAAAAATGA-A----GAAGTG---CCA-CGAA---AAATC-GTCG-CCTT--AA-AA-CGG---GGTTATCAGGAATTCTTTAA--T-TTTACAACG-A-CAA--TGC-GCCCGCAC-AC-A---TAGC--CCCA-TGTG-ACCGAG------TA------TTACGAGGC-GAAAAGGT-T------ACT---GTCCTACATGTACTAA-AC-ACT-CA---TTCTCTC----CAGAT-TTA-GCACCGTGCGACTTCT--TT--TC----TC-------CC-AAA-ATTT-AAAATCCAA---C---TA-----------C-CTGGA-AAAAGAAAGAC-ATCA-GAAA-T--------------CAAT---TTA--TTA-GT--A-TAATGGTG--GATATACC-TCTTTTGAGGAG---TATG-AAAAA-TGTTTCCA------AAAGTGGA---TTTAT----CGTCTAA----AG--ACG-TGTAC-CTCTCA-GG----------GCAA-GAC-A-AGTA---TTTG--------------------AAAACGAT--CAAAG----ATTAATAA---GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTCT
gi|30 : CCACAT---TGACAC-GCTA-GATTGATCACTGAATCATAGCGGAATAAAATTTCATGTTAACATATTCAC------TGGCTTTAACTACAGTGTTCA-TTGCTTC-ATAGCGT--ATT-CATTACACTACA-CC-C-AAAATG---Aggcacatccttcgtctataga
gi|31 : AAACAAT-G-C-TCTTGAAATTA--GGGCCTATAT-ATAAA-----A-AGT--AGGTTCTT-ACTTGGC-------------AT-TAAAC--CC-CT-AAATATTCA-TTGTTA-GGTCTGTGA----TATCAAT------GGGAAAG-GTCA--AATGT-CTC---------G------TA-GGTCTG
gi|32 : TCCC-G----AAAGTGGG---CTGAT----CGTCTAA----AC--A---TGTAT-C---CA-GG----------CCAATAGTTA-AGTAC--TTTCAAGGACAGGAAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAGAGATTAATTAATAAAT-ATGGGCGAAAACAGCCAAGTG-
gi|33 : GAGGAGTGTTCCAAATA-TAACGCCATTTCACCTTTTCTTTCGCGTGAAAA-TC--------GTATAAATATCTAACTGAGATCACAT---TGACTC-GTTA-TATTGATCACTGAACCGTAGCGG
gi|34 : atTGTCGG-GC-AA--A-TCC-GT-A-TGC-TAAA-----------TAG-C-AC-------CTTC-T-AT-GA--AAATGTTATT----------TAAGAA----CT-TAA--GAAATA---TTATCA-ATC-AAATCCGTCG-CA-A--AACAA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|35 : GAGGCGTGTTCCATAAA-TAAAGGCATATTACTTCCT---TGACGTGAAAG-TC--------GTGTAAATATTTTACTAAAACCACAT---TAACAA-GTTA-GATTAATAACTGAATCGTAGCGG-AGAA
gi|36 : TGTCGG-GC-AA--A-TCC-GT-A-TGC-TAAA-----------TAG-C-AC-------CTTC-T-AT-GA--AAATGTTATT----------TAAGAA----CT-TAA--GAAATA---TTATCA-ATCAAAGTC-GTCG-CA-A--AA-AA-CGG---G--TTTGAAGTA-TCTCTGA
gi|37 : CAAGTGGTGTTCCAAAAA-TAACGTCTTTTCGTTTTTT---TCGCGTGAAAA-TC--------TTGTAAATATCTTACTGCAACCACAT---TGACAC-ATTA-GATTGATCACTGAACCGTAGCAGAA
gi|38 : T-TGT-A--------------GGT----GGGTTGCTAA----ATTTAAAACAGAGTGCAAACACCTCAAAGATAT---------TTCTCG--CT---AAG------GTCGC-CCTGCAAAAGTTACAACC-AATAATAACA-TCGTAAA---A
gi|39 : --A-AACAGTC-ACAG-GTAACTTC-T-AT-AA--AAACGTTGCTA---------TTAAAA----GACT----AAAATA---TTA-TG-A---AAGTC-GTCGTCC-C--AA-AA-CGG---G--TATGAAGTA-TATTTG-ACT-T
gi|4 : gcaTCGC-CCTGCAACAGTTCCAACC-AAAATTAACA-TCGTAAA---AA-T-C-CACCAAATCTTACAGAAAGACGT-AAA-AT------TGTGAGGCAA-TTAGCTCG-GA-TGAC-A-AAC---TTGTC-GTAAGCAC---GTG-TCCAAG----GTACTTT-G-AAAA--AAAA-T-CAAAAGCT-TACGGTAG-A-AAGAT-AAACACT--A-----GAT--G---------GA------TACCT----C---C----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTCCGCGTTGAAAA-TGCAAA------GA---A-T---------TATTAAAA--TT------------GTATCCAG--------AATATACCAAAGACT--T---GA----TAAT----TTTGTT-AC--TGG-TGATGA-GAC-------C----TAGG--TA--T--ACT----T-ATTTTGAGC--CAAAAC-G-TAA-AG---TGC-TA-ACA-GACAGAAT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACG-T-CCTA-G--TAT--TA--CTAGAA-GATTATGAA--CTGT-----G----AA----GGGTTTT-AT-GCTAT------TT-------CTTG-----GGAAATAGAAGGCCC-ATCATAGC-AAG-A-TTA-GT-GATGC-AGAAGCCGT--A-ATAGGTCGACAG-ATGACTTTGT-AT-AA-----TGTT-TTA-------------AA----AA-T----GAAAGAGGATGA-TA-A---AATTC-ATGG-AC-A--TA-AA-CGG---G--TAAAAGGTAATCT--AGACAATTGGA-ACG-AGCAATGTGC--CGTGCACGAC-ATGGAGGCA-AGGAT-GTG-GTGGAGAGC---TG------TTTTGGGGTGGTAAAGGTGT------ATGAGAGTCTTAA---AACCCC-GC-CAC-CGCCATTTTCTCA---CAGAT-TAG-AATGCATGTG-CTA-TGCTTAATCTG-TAC-------GCACAA-ATGTGAAATTGCACG--C---CA-----------GATTGGA-A---GATA--A-ATCACGAAA-TGCGCTTGGGTCTTGGAAT---TTAGATCA-GT--A-T-AGGGTGATGGTGT--C-C-TATTG-GGAGGTCTATGAAA----TGTTTCCA-G----AAA-TGGA---TTGAT----CGTCTAA----AC--A-G-CGTAT-C---CA-GA----------CAAAGGGC-G-AGTAC--TTTGAAGTGTAGGGAC--A-AAT-AAAAGGAT--CTCAG----ATTGATAAAC-GTGGGTGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|40 : AAC---CC-GT-AGACATTCA-TCGTGA-GGTATGTGA----TAGCTAT-----A-GGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-GGTA-----TGT-A--------------GGC----AGGTTGCTAA----ATTTCAAACAGGCTACGAACggaa
gi|41 : C-CCC-CC---TTCTG------CAAAT-TTA-TCACCGTACGATTT-C--TT--TCAT-TTC-------CC-CAATACTT-AAATTCCAAGTACAAGTA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCATGAAA-T
gi|42 : C-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCATTATGAAGCGAC------AA------TTACGAGGTGGAGAAGGT-TTTATGAACT---ATTCTGC---AAC----ACGCCC-TG---TT
gi|43 : GGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAt
gi|44 : cagGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAAACC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCAggcaca
gi|45 : cagCGAAGAGTGTTCCAAAA--TACTGTCATTTCACCTTT------GTGTGAAAA-TC--------GTGTATATATCTTAATGAAACCATAT---ggcaca
gi|46 : aGGACTGTGCCAAAAA-GGAAATCACTTCACCTTC------GCGTGAAAA-CC--------GTGTAAAAATCTTACTGAAACCA
gi|47 : agAGGAGTATTCCAATAA-TAATGCTATTTTACCTTTG---CCGCGTGAAAA-TC--------ATGTAAATATCTTACTGAAACCgg
gi|48 : A-TGAC-A-AAC---TTGTC-AATAGCAC---GTG-TTCGTG----GTATATT-G-AAAA--AAAA-T-CTTAAGCT-T
gi|49 : AAG----ATTAATAAAA-GTGGGTGAACACGGTCAAGTG-TCA-TTATTTCT
gi|5 : A---AA-T-C--ATCATATCTTACAGAAAGACGC-AAA-A-ATG--CCCTTAGGCAA-TTGGCTTG-CA-TAGC-A-CAC---TTGTC-GTCAGCAC---AAG-TTCATT----GTATTTT-G-AAAA--AAAA-T-TCAAACTT-TA-----G-A-ATGAT-GAACGCT--A-----GGT--A---------GA------TACCT----C---A----TTTGCT-TA---ACG---ATG-AAGAA-AA-GAA--TCCGTGTGGAAAA-TGCAAAAAAATCGA---AAT---------TTTTAAAA--TTT-----------ATATCTAAAACATACAAA------AAAAACT--T--TTAT---TAAT----TTAGTT-AT--TGG-TGATGA-GAC--------------------------------T-ATTTTGAGC--CAAAAC-G-TAAGAC---TTC-TA-ACA-GA----AC--------CT--G---G-G-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AACT-T-CCAA-G--TAT--TG--CTAAAT-GGTTACGAA--TCGT-----G----AAT---G--TTTT-AT-A-GAA------TGTGATTTTCTTT-----AACAATA-AAGGTCCTGTCAT-GC-GA--A-TAC-CT-G-TAC-CAAAGG-GC--A-AA--------------ACTTC-T-AC-AA--AAATTTTGTTA---------TTAAAA----AA-CTCAAGAAATA---TTT-CC-A---AAGTC-GTCG-CC-CC-AA-AA-CGG---G--CATAAAGTA-TCTCCGA--T-TTAGC-ATG-A-CAATG--C-GTCTGCAC-AT-A---ATGCG-CGCATTGTG-ACCGAG------TACCGGTATTTGTAGACTGAAAAGGT-T------ACT---GTCCTAC---CACACA----CCC-CG---ATTTCTC----CAGAT-TTA-CTTCCGTGCGACTT-C--TT--TCTG-TTCGATATTCCC-CAA-ACTT-AAATTCCAC---T---TA-----------T-CTGGA-AAAAGATACAA-ATCACAAAA-TATCCCCTGGTCT-GCAAT---TTA--TCA-GT--AAT-ATGATG--TGTGT--C-CCTATTGAGAAG---TA--AATAAA-TGTTTCCA-G----AA-GTAGA---TTGAT----CGTCTAA----AACAAAGATGTAT-C---CA-GG----------CCAAGGGT-G-TGTAC--TTTGAAGGACAGGGAC--G-AAT-AAAAGGAT--CAAAG----ATTAA-AAATCGTGGGTGAAAACAGACACGTG-TCA-TTATTTTggcacatcct
gi|50 : ACAAT-G-C-ATATAAATTTA--GGTCCTATAT-A---A-----A-AGA-TAGGTCCTT-ACCTGGC-------------AT-ggaacat
gi|51 : gt-GCCTGCAC-AC-A---AAGCA-AGCACTATG-AACGAC------AA------TTTCGAGGTGGAGAAGGT-T------
gi|52 : TGAGC--CAAAAT-G-TAAGAG---TTC-TA-ACT-GA----CT--------CT--G---A-G-C---ATC---A---G--A--AAAT
gi|53 : GAGAAGTGTTCCAAAA--TAATGTAATTTCAACTTCT---TTGCGTGAAA
gi|54 : TGAAAACAGGCAAGTG-TCA-TTATTTT
gi|6 : A-TC--------GTGTAAATAACTCACTGAAGCCACAT---TGACAC-GTGA-AATTGATCATTGAACCGTATCGGAAGAAAATTTAATGTTCACAATTTCAG------TGAC-TTCGCTACAGAGTACA-TTGCTTT-ATGGCGT--ATT-CATTAAACTATA-CT-C-AAAATG---GCT---GGAA-A--A-A--GATCAAAAAAT-G-C-GCTGGAAATTA--GGGCCTATAT-AT--A-----A-AATGTAGGTCCTT-ACTTGGCATCCAGGCTTGGCAT-TAAAT--CC-GT-AGATATCCA-T--TGA-GGTCAGTGA----TATATAT------GGGAATG-GTCA--AATGT-CTC---------A------TA-GGTCTGTT-TGT-A--------------GGT----GGGTTGCTAA----ATTGTAAACAGGTTACTAACACCTCAAAGAT-------T-C-TGCTCG--CC---AAA------GTCAC-CCTACAATAGTTACAACC-AATA------------------T-T-C-CTC--AATCTTGTAAAA---------G-ATATA--TCGTGGGGCAA-TTGGTTCG-GA-TGAC-A-AAC---TTGTC-GTTAGGTC---GTG-TTCATG----GTATTTT-G-AAAA--AAA--T-ATAAAGCT-TA-----G-A-AAGAT-AAGCGCT--A-----GGT--G---------GA------TACTT----C---A----TTTGTT-CA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAATCTGTGTTGAAAA-TGCAAA-------A---AAT---------TATCAAAA--TTGTATCCATATATATACC-----------AA------AAAGATT--T---GA----TAAT----TTAGAT-AC--TGG-TGATGA-GAC-------A----T--GGGTA--T--A-C----T-ATTTTGAGC--CAGAAC-G-TAAGAG---ATC-TA-ACA-GA----AT--------CT--G---G-A-C---ATC---A---G--A--AAATGCAA-AATG-T-CCTA-G--TAT--TG--CTAAAC-GATTACGAA--GCGT-----G----AAGAAGG--ATTT-AT-G----------TTA--TATTCTTT-----GGCAATA-AAGGCCCTGTTAT-ggaacatctct
gi|7 : AGGAGTGTTTCAAAAAATATTGTCATTTCACTTTTT---TTGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTA
gi|7 : GGC-------------AT-TAAA---CCCGT-AGATATTCA-TC-TGA-GGTCTGCGA----TATCTAT------GGGAATG-GTAA--AATGT-CTC---------A------TA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|7 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA--CCTTGAGGCAA-TTGGCTCG-GA-TGAC-A-A-C---TTGTC-GTTAGCAC---GTG-TTCATGAATGGTATTTT-A-AAAA--AAAAAT-CTAAACCT-TA-----G-A-AAGAT-ACATG-T--A-----A-----------------------ACCT----C---A----TTTGCT-TA---GCG---ATG-AACAA-AA-GAGAGTACGTGTTGCAAA-TGCAAA------GA---AAT---------TATTAAAA--T-------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccttgaggcaattggctcggatgacaacttgtcgttagcacgtgttcatgaatggtattttaaaaaaaaaatctaaaccttagaaagatacatgtaaacctcatttgcttagcgatgaacaaaagagagtacgtgttgcaaatgcaaagaaattattaaaattgta
gi|8 : aggagtgtttcaaaaaatattgtcatttcactttttttgcgtgaaaatcgtgtaaatatcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcattaaacccgtagatattcatctgaggtctgcgatatctatgggaatggtaaaatgtctcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCTGTCAT-GC-AA--A-TTC-CT-G-TGC-CAAAGG-GC--ATAACAGTC-ACGG-GTAACTTC-T-AT-AA--AAATGTTTTTA---------TTAAAAAACTGA-A----GAAATT---TTA-CG-A---AAGTC-GTCG-CC-TCAAA-AA-TAG---G--TATGAAGTA-TCTCCGA-CT-TTTGC-ACA-A-CAATG--C-GCATGCGC-AC-A---AAGCA-CGTATTGTG-ACCGAG------TA------TCACGAGGCGGGAAAGGT-T------ACT---GTCTTAtgta
gi|8 : GTGGG---TTGAT----CGTCTAA----AA--AAG-TGTAT-A---CA-GG----------CAAAGGGT-A-GGTAC--TTTGAAGGGCAGGGAC--C-AATAAAAAGGAT--CACAG------------AT-GTGGGTGAAAACgctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgggttgatcgtctaaaaaagtgtatacaggcaaagggtaggtactttgaagggcagggaccaataaaaaggatcacagatgtgggtgaaaaca
gi|9 : ctgtcatgcaaattcctgtgccaaagggcataacagtcacgggtaacttctataaaaatgtttttattaaaaaactgaagaaattttacgaaagtcgtcgcctcaaaaataggtatgaagtatctccgacttttgcacaacaatgcgcatgcgcacaaagcacgtattgtgaccgagtatcacgaggcgggaaaggttactgtcttagctagcacatcctctttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAGTGTTCCAAAAA-TAACGTCATTTCACTTTCT---TAGCGTGAAAA-TC--------GTGTAAATATCTTACTGAAACCACAA---TGACAC-GTTA-GATTGGTCACTGAACCGTAGCAGAAGATAATGTCATGTTCACAATTTCAC------TGAC-TTAGCTACAGTGGACA-TTGCATC-ATAACGT--ATT-CATTACACTATA-CT-C-AAAATG---ACA---G--G-A--ACA--GAGGAAACACT-G-C-ACTTGAAATTA--AGGCCTATAT-A---C-----A-AGT---G-----T-ACATG------------------TAAA---AG-GT-AGGTCCTTC-CCGT-A-GGTATGTGA----TATATAT------GCGAATG-GTCA--CATGC-CTC---------ATACATGTA-GGTATGTT-CGT-A--------------GGT----GGGTTGCT-------TTTTAAATAGGTTACGAACACCTTAAA-----AAA---GC-TGCTCG--CC---AAG------GTCGT-CCTGCAACAGTTGCAACa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|55 ): TAGATGTGTTATTTCCTTAAATATTCCTACA