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Reference ( gi|10 ) : AAAAAA-ATT---CAAC-AAAAACAG----TT-CATTT-CA-AT-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-CA---A-TA-CTT--GA---T-A-AA----TCCA-T---AAT-----ATT--TTTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT--T---C-A-AACAC--A--A-AC-AAC-G--AT---------TCC-CA-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T---AC--AC--T-ATC--AC--AA----G-AC--TAACGT-T-T---A-GAGAT--T--T-T-C-AAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCA
gi|12 : AAAAAA-ATT---CAAC-AAAAACAG----TT-CATTT-CA-AT-C----G--T---T--------ACGCT--GT-CGCT-CA---A-TA-CTT--GA---T-A-AA----TCCA-T---AAT-----ATT--TTTCT-C---G--G-AT-GCCA-G--T--G--TA---A--G--TTT--T---C-A-AACAC--A--G-AC-AAC-G--AT---------ACC-GA-A-ACGA---T----TTC--T--------T-TGCT---TT---T---AC--AC--T-ATC--AC--AA----G-AC--TAAAGT-T-T---A-TATAT--T--T-T-C-CAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TTGTG---TTAAA
gi|7 : aAAAAAA-AAT---CAAA-ACGAAAAG----TT-CATTT-CA-AT-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-CA---A--A-ATT--GA---T-A-AA----TCCA-A---AAT-----ATT--TTTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT--T---T-A-AACAC--A--G-AC-AAT-G--AT---------ACC-GA-A-ACGA---T----TTTCGT--------T-TGCG---TT---T---AC--AC--T-ATC--AC--AA----G-AC--TAACTT-T-TATAA-TAGAT--T--T-TCC-AAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTCAAA--ATCA
gi|6 : tAAAAAC-ATTTTTCAAC-GAAA-CAG----T--CATTT----AT-C----G--T---T--------A-GCT--AT-TGCT-CA---A-TA-CTC--GA---T-A-AAC---TCCA-T-----T-----AAT--TTTCT-----G--G-AT-GC-A-G--T--A--TA---AAAG--TTT--T---C-CTAACAC--A--G-AC-AAC-G--AT---------ACC-TA-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---A---AC--AC--T-ATC--AC--GA----G-AC--TTAAG----T---A-TAAAT--T--T-TCC-AAT---TCA--C-T----CA--ATA-AAA-TC-TA---TTAAAA--ATtcagacc
gi|13 : attaaatAAAAAATATT---CACT-GAAAACAG----TTTCATTT--A-AT-C----G--T---T--------A-GCT--AT-CGCT-CA---ACTA-CC---GA---T-A-AA----TCCA-T---TAT-----ATT--TTTCT-C---G--GCAT--C-A-G--T--T--TA---A--G--TTT--T---C-T-AACAC--A--G-AC-AAT-G--AT--------------A------------------CTT--------T-TGCG---TT---T---AC--AC--TAATC--AC--GA----G-AC--TAA-G--T-T---A-TAGAT--T--T-TCC-AAT---TCA--T-T----CA--A-A-AAA-TCGTA---TTAAAA--ATCAgcatccg
gi|5 : ttAAAACA-TTT---CAACGAAAAACAG----TT-CATT---A-AT-C----GGTT---T--------A-GCT--AT-TGCT-CA---A-AA-CTC--GA---T-T-A------TCA-T---TAT-----ATT--TTTTT-TCG-G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G---TT--T---C-T-AACAC--A--AGACTAACGG--AT---------ACC-TA-A-ACGA---T----TTTCTT--------A-TTCG---TCCTAT---ACAAAC--T-ATC--AC--GA----G-ACT-TAA--T-T-T---A-TAAAT--T--T-C-C-GATGTGTTA--C------TC--A-A-AAA-TCGTA---TTAAAAG-ATCAtcaaac
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gi|1 : attaaAACAAA-ATT---CAAC-GAAAATAG----TT-CATTTAAA-AT-C----G--TC--T--------A-GCTAGGTGCGCT-CAGACA-TATCTC--GA---T-A-AAATGCTTCAGTGTGAAT------TT--CTTCT-----G--G-AT-AC-A-G--T--T--TATTTA-----TTT--T---C-T-AACAC--ATGG-AC--GC-G--AC---------ACC-TA-A-TCGA---T----TTTCTTATATATAGT-GGTA---TA---T---AT--AC--T-ATTAAAC--GAACGCG-ACTATAAGGTCT-T---ATGAAATTGT--C-T-C-AAT---TCA--C-G----CT--------A-TTTTGTAATTAAAA--ATaatcaga
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gi|22 : AAAAA-ACC---CACC-C----CAG----TT-CAATT-TA-AT-CC---G--T---T--------G-ACT--GT-CGCT-CA---A-TA-TTC--CA---T-A-AA----TTCA-----GGT------CG--TTTCT-C---G--G-AT-G------------------A--A--TT------------ACAC--A--T-GC-ATT-G--AT---------GCC-TA-A-ATAA---G----TTTTCT--------A-TGCG---TT---TTACAC--AC--T--TC--ACTTAA----A-AT--CAAAGT-T-----------T--T--T-C-C-AAT---TTA--C-T----tcagacc
gi|19 : AA-ATT---CACT-GAAAACAG----TT--ATTT--A-AT-C----G--T---T--------A-GCT--AT-CGCT-CA-----TA-CTC--GA---T-A-AA----TCCA-T---TAT-----ATT--TTTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--T--TA---A--G--TTT--T---C-T-AACAC--A--G-AC-AAT-G--AT--------------A-A----------------CTT--------T-TGCG---TT---T---AC--AC--T-ATC--AC--GA----G-AC--TTAAGT-T-T---A-TAGAT--T--T-TCC-AAT---TCA----T----TCAAA-A-AAA-TCGTA----TAAAA--ATCA
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gi|17 : taacaatttTT---CGTC-AATAACAG----TT-CATT--AA-AT-CC---G--T---TGGAGCG--A-GCT--GT-TGTT-CG---A-TA-TTT--GA---TTA-AA----TCCG-T---G--------TT--TTTTT-C---G--G-TG-GC-A-T--T--AAATA---A--G--TTT--T---C-T-AACA---A--G-AC-AAC-G--AT---------GCG-TA-A-ACGA---G----TTTC-T--------T-TGCA---TT---T---cgtttaaatcatcaaag
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gi|11 : tagataacaaattttcgtccACGG----TC-CATTA-AA-AT-CC---G--T---TGGAGCCC-A-GCT--GT-CGCT-CG---A-TA-TTT--GA---T-A-AA----TCC-------AT-----GTT--TTTCT-G---G--G-TT-AC-A-T--T--A---A---A--G--TTTC-T---C-T-AACA---A--G-AC-AAC-G--AT---------GCG-TA-A-ACGA---A----TTTC-T--------T-TGCA---TT---T---G-------T-AAC--AC--A----------------T-C-T---A-CAGAT--T--T-TCC-AAT---TCT--T-T----TT--ccttttaatcatcaaacct
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gi|27 : atatagataataaattttcgtcggattagcagttggagccc--------A-GCT--G----CT-CG---A-TA-TTT--GA---T-A-AA----TCC-------AT-----GTT--TTTt
gi|26 : atgtagataataaatttttgtcgataacagttggagcccAT-----GTT--TTTCT-C---G--GGAT--C-A----------TG---A--G--TTT--T---C-T-AACAA--G--A-A--AAC-T--AT---------GCG-TA-A-ACGA---G----TTTCT---------T-TACA---TT---TGTAAC--AC----ATC--
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Reference ( family-692 ) : AAAAAA-ATT---CAA--CGAAAA-CAG----TT-C--A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-T-A------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT--T---C-N-AAC-AC--A--GAC-AAC-G--ATGC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TA--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCA
gi|1 : AACAAA-ATT---CAA--CGAAAA-TAG----TT-C--A-TTTAAA-A--T-C----G--TC--T--------A-GCTAGGTGCGCT-CAGA-C----ATATCTC--GA---T-A-AAATGCTTC-AGT-G------TGAATT--TCTTCT-----G--G-AT-AC-A-G--T--T--TATTTA-----TTT--T---C-T-AAC-AC--ATGGAC--GC-G--ACAC---------C-T----A-A-TCGA---T----TTTCTTATATATAGT-GGTA---TA---T-----AT--A-C--T-ATTAAACG--AACGCG--AC--TAT-AAGGTCT-T---ATGA-AATTG-TCTCAAT---TCA--C-G----CT--------A-TTTTGTAATTAAAA--AT
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gi|12 : atatagataataattttcgtctgatcAAAAAA-ATT---CAA--CAAAAA-CAG----TT-C--A-TTTC-A-A--T-C----G--T---T--------ACGCT--GT-CGCT-C-AA-T----A---CTT--GA---T-A-AA----TCC-A-T-AA-----T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GCCA-G--T--G--TA---A--G--TTT--T---C-A-AAC-AC--A--GAC-AAC-G--ATAC---------C-G----A-A-ACGA---T----TTC--T--------T-TGCT---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TA--AAG--TT-T---AT-A-TATTT-TC-C-AT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TTGTG---TTAAActctttaaatcatcaac
gi|13 : aAAAAAATATT---CAC--TGAAAA-CAG----TTTC--A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--AT-CGCT-C-AACT----A---C-C--GA---T-A-AA----TCC-A-TTA------T--ATT--T-TTCT-C---G--GCAT--C-A-G--T--T--TA---A--G--TTT--T---C-T-AAC-AC--A--GAC-AAT-G--ATA------------------------------------CTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--TAATC--ACG--A----G--AC--TA--AG----T-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--T-T----CA--A-A-AAA-TCGTA---TTAAAA--ATCA
gi|14 : ttAAAA-CAGCTAGTT-C--A-TTT--A-A--T-CC---G--T---T--------G-GCT--GT-CGCT-T-GA-T----A---TTC--GA---T-A-AA----TTC-----A------T--GTT--T-TTCT-C---G--T-GT-GC-A-AATT--A--TA---A--GTTTTT--T---T-T-AAC-AC--A--GCC-AAC-A--ATGC---------G-T----A-A-ACGA---G----TTTC-T--------T-TGCA---TT---T-----AC--A-C--------------------------------G--TC-T---AC-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--tcaaac
gi|15 : tagataacaaattttcgtccAATAAA-TTT---CGT--CGATAA-CAG----TC-C--A-TAA--A-A--T-CC---G--T---TTGGAGCCCA-GCTT-GT-CGCT-C-GA-T----A---CT------------GA----TC------------------------TCT-C---G--G-GT-GC-A-T--TT-A--TA---A--G--TTT--T---C-T-AAC-A---A--GAC-AAC-G--ATGC---------G-T----A-A-TCGA---A----TTTTCT--------T-TGCA---TT---T--------------T-GT-----A--A----A--AT--CA--ACA--TC-T---AC-A-GATTTCTC-CAAT---TCA--C-T----TT--ccttttaatcatcaaacct
gi|16 : tatagatAAAAAA-AAT---CAA--C--AAA-GAA----TT-C--C-TTT--C-A--A-C-------T---T--------A-GCT---T-CGCT-C-AA------A---CT---GA---T-A-AAA---TAC-A-T-A------A--ATTATT-TTCT-C---G----AT-GC-A-G-----G--CA---A--T--TAT--T---C---AAC-AC--A--GAC-AAC-A--ACGC----------------G-A-ACAC---A----CTTCTA--------T-TAA---------------AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TA--AAG--AT-T---AT-A-GA-TT-TA-CAA----TCA--C-T----TT--A-AGAAA-T--TG---GTAAAA--ATtctttaaatcatcaaacct
gi|17 : attaaTT---CGT--CAATAA-CAG----TT-C--A-TTA--A-A--T-CC---G--T---TGGAGCG--A-GCT--GT-TGTT-C-GA-T----A---TTT--GA---TTA-AA----TCC-G-T-G------T----T--T-TTTT-C---G--G-TG-GC-A-T--T--AAATA---A--G--TTT--T---C-T-AAC-A---A--GAC-AAC-G--ATGC---------G-T----A-A-ACGA---G----TTTC-T--------T-TGCA---TT---TGTAAAAC--ATC--T-AT-----G--A----G--AT--Taatcaga
gi|18 : atatagataataaattTT---CGA--AGAAAA-CTG----TT-C--A-CTT--A-A--T-CC---G--T---T--------G-GCT--GT-AGCT-C-GA-T----A---TTC--AA---T-A-AA----TCC-A-G-G------T--TTT--T-TTTT-C---G--G-GT-GT-A----T--C--TA---A--A--TTT--G---T-T-TAC-AC--G--GGC-ATT-G--ATGC---------C-T----A-A-AAGAATTT----TTTTTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACT--A----G--AA--TC--AAA--TT-T---AC-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--tcacctttaaatcatcaaacctca
gi|19 : tagataacaaattAA-ATT---CAC--TGAAAA-CAG----TT----A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--AT-CGCT-C--A-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-TTA------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--T--TA---A--G--TTT--T---C-T-AAC-AC--A--GAC-AAT-G--AT--------------------A-AC--------------TT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TT--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA----T----TCAAA-A-AAA-TCGTA----TAAAA--ATCA
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gi|20 : aaaaaataccacacaacg--------A-GCT--GT-CGCT-C-G--T----A---TTT--GAA--T-A-A------CC-A-T-G------T--ATT--T-T----C---G--G-GT-GCCA-T--T--A--TA---A--G--TTT--A---T-C-AAC-A---A--GAC-AAC-G--TTGC---------C-C----GTA-ACGAG--T----TTTCTT--------T-TGCA---TTTG-T-----AA--A-A--T-ATCT-ACG--A----ta
gi|21 : atatagataataaattttcgtcggattagcagttggagcccTT---CAA--AGAAAA-AAG----TT-C--A-TTT--A-A--TTC----G--T---T--------T-GTT--CT-CGCT-C--A-T----A---GTTTGGA---T-A-GA----TCC-A-T-G------T----T--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-T--T--A--CC---A--G--TTT--T---C-T-GAA-TC--A--GAG-AAC-G--ACAT---------C-T----A-A-AC-A---T----ATTTTT--------T-TTCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC-------------------------------T---AC-A-TATTT-TT-CAAT---TCA--T-T----TT--atagcctttaaaatcattatcacctcaaatatt
gi|22 : taacaatttAAAAA-ACC---CAC--CC-----CAG----TT-C--AATTT--A-A--T-CC---G--T---T--------G-ACT--GT-CGCT-C-AA-T----A---TTC--CA---T-A-AA----TTC-A-G-G------T---CG--T-TTCT-C---G--G-AT-G------------------A--A--TT------------AC-AC--A--TGC-ATT-G--ATGC---------C-T----A-A-ATAA---G----TTTTCT--------A-TGCG---TT---TTAC--AC--A-C--T--TC--AC------------T--TA--AAA---T-C---AA-A-GTTTT-TC-CAAT---TTA--C-T----cgtttaaatcatcaaag
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gi|25 : TCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TATAAAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--CTT----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCAcgctaatagaagtcatcaaacct
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gi|27 : c--------A-GCT--G----CT-C-GA-T----A---TTT--GA---T-A-AA----TCC-A-T-G------T---TT--T-Ttctc
gi|28 : atgtagataataaatttttgtcgataacagttggagcccTT---CGA--AGGAAA-CAT----TT-T--A-TTT--A-A--T-CC---G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----
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gi|7 : attaaatAAAAAA-AAT---CAAAACGAAAA---G----TT-C--A-TTTC-A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-AA------A---ATT--GA---T-A-AA----TCCAA-A-A------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT--T---T-A-AAC-AC--A--GAC-AAT-G--ATAC---------C-G----A-A-ACGA---T----TTTCGT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TA--ACT--TT-TATAAT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTCAAA--ATCAgcatccg
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gi|9 : AAAA-CAA----TT-TCAA-TTC--T-A--T-CTGGTA--T---T--------G-GCT--GT-CGAT-C-GC-TTGTGA---TTG--AA---T-ACAA----TCC-A-T-A---------GTT--T-TTCT-C---GGTG-AT-GC-ACT--T--A--TAC--A--G--TTT--A---CTA-AAC-AC--A--G-C-AAC-G--ACGTA--------C-G----G-T-ACAA---TGCAATTTC-T--------T-TGC----TT---T-----AC--A-C----ATC-------------------------------T---AC-A-GA-GT-TC-CATT---TCA--C-TTTCCTT--A-A-AGA-TCATtcaaaac
Alignments
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Reference ( family-692 ) : AAAAAA-ATT---CAA--CGAAAA-CAG----TT-C--A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-T-A------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATGC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TA--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCA
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gi|16 : tatagatAAAAAA-AAT---CAA--C--AAA-GAA----TT-C--C-TTT--C-A--A-C-------T---T--------A-GCT---T-CGCT-C-AA------A---CT---GA---T-A-AAA---TAC-A-T-A------A--ATTATT-TTCT-C---G----AT-GC-A-G-----G--CA---A--T--TAT-TC-----AAC-A---C-A--GAC-AAC-A--ACGC----------------G-A-ACAC---A----CTTCTA--------T-TAA---------------AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TA--AAG--AT-T---AT-A-GA-TT-TA-CAA----TCA--C-T----TT--A-AGAAA-T--TG---GTAAAA--ATtctttaaatcatcaaacct
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gi|19 : tagataacaaattAA-ATT---CAC--TGAAAA-CAG----TT----A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--AT-CGCT-C--A-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-TTA------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--T--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAT-G--AT--------------------A-AC--------------TT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TT--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA----T----TCAAA-A-AAA-TCGTA----TAAAA--ATCA
gi|2 : AA--CAAAAA-CAG----TT-C--T-TTC--AGA--T-C----G--AGAAT--------A-GCT--GT-CGCT----A-T----A---CTT--GA---T-A-AA----TCC-A---A------T--ATT--T-GTCG-CTTGG--G-AT-GC-A-G--TCTG--TAC--A--G--TTT-AT-T---CAC-AAACCGA--GAC-AACCG--ATAC---------TGT----A-ACACGA---T----TTTCCT--------TGTGCG---TT---T-----AC--A-CGCT-ATC--ACGGAA----G--ATAATA--AAG--TTGT---AT-AAGATTT-GC-CAATC--TCAGCT-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAATCATCAtcaaac
gi|20 : aaaaaataccacacaacg--------A-GCT--GT-CGCT-C-G--T----A---TTT--GAA--T-A-A------CC-A-T-G------T--ATT--T-T----C---G--G-GT-GCCA-T--T--A--TA---A--G--TTT-AT-C---AAC-A-----A--GAC-AAC-G--TTGC---------C-C----GTA-ACGAG--T----TTTCTT--------T-TGCA---TTTG-T-----AA--A-A--T-ATCT-ACG--A----ta
gi|21 : atatagataataaattttcgtcggattagcagttggagcccTT---CAA--AGAAAA-AAG----TT-C--A-TTT--A-A--TTC----G--T---T--------T-GTT--CT-CGCT-C--A-T----A---GTTTGGA---T-A-GA----TCC-A-T-G------T----T--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-T--T--A--CC---A--G--TTT-TC-T---GAA-T---C-A--GAG-AAC-G--ACAT---------C-T----A-A-AC-A---T----ATTTTT--------T-TTCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC-------------------------------T---AC-A-TATTT-TT-CAAT---TCA--T-T----TT--atagcctttaaaatcattatcacctcaaatatt
gi|22 : taacaatttAAAAA-ACC---CAC--CC-----CAG----TT-C--AATTT--A-A--T-CC---G--T---T--------G-ACT--GT-CGCT-C-AA-T----A---TTC--CA---T-A-AA----TTC-A-G-G------T---CG--T-TTCT-C---G--G-AT-G------------------A--A--TT----------AC-A---C-A--TGC-ATT-G--ATGC---------C-T----A-A-ATAA---G----TTTTCT--------A-TGCG---TT---TTAC--AC--A-C--T--TC--AC------------T--TA--AAA---T-C---AA-A-GTTTT-TC-CAAT---TTA--C-T----cgtttaaatcatcaaag
gi|23 : --G--TA---T--A--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATAC---------G-T----A-A-ATGA---A----TTTC-T--------T-TGCA---TT---T-----AC--A-C----ATC-------------------------------T---AC-A-GATTT-CC---AT---TCA--C-T----TT--
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gi|28 : atgtagataataaatttttgtcgataacagttggagcccTT---CGA--AGGAAA-CAT----TT-T--A-TTT--A-A--T-CC---G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----
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gi|9 : AAAA-CAA----TT-TCAA-TTC--T-A--T-CTGGTA--T---T--------G-GCT--GT-CGAT-C-GC-TTGTGA---TTG--AA---T-ACAA----TCC-A-T-A---------GTT--T-TTCT-C---GGTG-AT-GC-ACT--T--A--TAC--A--G--TTT-AC-TA--AAC-A---C-A--G-C-AAC-G--ACGTA--------C-G----G-T-ACAA---TGCAATTTC-T--------T-TGC----TT---T-----AC--A-C----ATC-------------------------------T---AC-A-GA-GT-TC-CATT---TCA--C-TTTCCTT--A-A-AGA-TCATtcaaaac
Alignments
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Reference ( family-692 ) : AAAAAA-ATT---CAA--CGAAAA-CAG----TT-C--A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-T-A------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATGC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TA--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCA
gi|1 : AACAAA-ATT---CAA--CGAAAA-TAG----TT-C--A-TTTAAA-A--T-C----G--TC--T--------A-GCTAGGTGCGCT-CAGA-C----ATATCTC--GA---T-A-AAATGCTTC-AGT-G------TGAATT--TCTTCT-----G--G-AT-AC-A-G--T--T--TATTTA-----TTT-TC-T---AAC-A---C-ATGGAC--GC-G--ACAC---------C-T----A-A-TCGA---T----TTTCTTATATATAGT-GGTA---TA---T-----AT--A-C--T-ATTAAACG--AACGCG--AC--TAT-AAGGTCT-T---ATGA-AATTG-TCTCAAT---TCA--C-G----CT--------A-TTTTGTAATTAAAA--AT
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gi|11 : A-CGG----TC-C--A-TTA--A-AATC-C----G--T---TGGAGCCC-A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----A---TTT--GA---T-A-AA----TCC-----A------T--GTT--T-TTCT-G---G--G-TT-AC-A-T--T--A---A---A--G--TTTCTC-T---AAC-A-----A--GAC-AAC-G--ATGC---------G-T----A-A-ACGA---A----TTTC-T--------T-TGCA---TT---T-----G--------T-AAC--AC---------------------A--TC-T---AC-A-GATTT-TC-CAAT---TCT--T-T----TT--
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gi|29 : tagataacaaatt----A-A-GCGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--A
gi|3 : AA--CAAAAA-CAG----TT-C--T-TTC--AGA--T-C----G--AGAAT--------A-GCT--GT-CGCT----A-T----A---CTT--GA---T-A-AA----TCC-A---A------T--ATT--T-GTCG-CTTGG--G-AT-GC-A-G--TCTG--TAC--A--G--TTT-AT-T---CAC-AAACCGA--GAC-AACCG--ATAC---------TGT----A-ACACGA---T----TTTCCT--------TGTGCG---TT---T-----AC--A-CGCT-ATC--ACGGAA----G--ATAATA--AAG--TTGT---AT-AAGATTT-GC-CAATC--TCAGCT-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAATCATCA
gi|4 : aaaaaataccacacaacgAAAAA-AGT---CAA--CAAACA-AAG----TT-C--C-TTTCCA-A----C----G--T---TT-------A-G-T--GTTCGCTGC-AA-T----A---CTT--GAATAC-A-AA----TCC-A-T-AATTATTT--ATT--T-GTCTGC---G--G-ATTGC-A-G--T--G--CA---A--A--TTT-TT-TTCAAAC-A---C-A--GAC-AAC-GTAGCAC---------C-G----A-A-ACGA---CA---TTTTTT--------T-TGCAGTATT---T-----AC--A-CC-T-ATCTCACG--A----AGTACG-TA--AAG--CT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT----A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCAta
gi|5 : AAAACA-TTT---CAA--CGAAAAACAG----TT-C--A-TT---A-A--T-C----GGTT---T--------A-GCT--AT-TGCT-C-AA-A----A---CTC--GA---T-T-A-----TCA-T-T-A------T--ATT--T-TTTT-TCG-G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G---TT-TC-T---AAC-A---CAA--GACTAACGG--ATAC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------A-TTCG---TCCTAT-----ACAAA-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TT--AA---TT-T---AT-A-AA-TT-TC-CGATGTGTTA--C------TC--A-A-AAA-TCGTA---TTAAAAG-ATCAtcagacc
gi|6 : atagaatAAAAAC-ATTTTTCAA--CGAAA--CAG----T--C--A-TTT--A----T-C----G--T---T--------A-GCT--AT-TGCT-C-AA-T----A---CTC--GA---T-A-AAC---TCC-A-T--------T--AAT--T-TTCT-----G--G-AT-GC-A-G--T--A--TA---AAAG--TTT-TCCT---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATAC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---A-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TT--AAG-----T---AT-A-AATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----CA--ATA-AAA-TC-TA---TTAAAA--ATctc
gi|7 : attaaatAAAAAA-AAT---CAAAACGAAAA---G----TT-C--A-TTTC-A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-AA------A---ATT--GA---T-A-AA----TCCAA-A-A------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT-TT-A---AAC-A---C-A--GAC-AAT-G--ATAC---------C-G----A-A-ACGA---T----TTTCGT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TA--ACT--TT-TATAAT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTCAAA--ATCAgcatccg
gi|8 : tA--CGAAAA-CA-----TT-C--A-TTT--A-A--T-C----G--TACTT--------A-GCT--AT-CGCT-C-AA-T----A---CTC--GA---T-A-CA----TCC-A-TTA------T--ATT--T-TTCT-C---GT-G-AT-GCTA-G-----A--TA---A--G--TTTCTC-T---AACCA---C-A--GAC-AAC-G--ATACGTCTGTATCC-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT-----------GCG---TT---------AC--A-C--C-ATC--ACG--A-------AC--TT--AAG--TT-T---AT-A-AATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----CA--A-A-AAAGTCGTA---TTAAAA--ATCAtcagacc
gi|9 : AAAA-CAA----TT-TCAA-TTC--T-A--T-CTGGTA--T---T--------G-GCT--GT-CGAT-C-GC-TTGTGA---TTG--AA---T-ACAA----TCC-A-T-A---------GTT--T-TTCT-C---GGTG-AT-GC-ACT--T--A--TAC--A--G--TTT-AC-TA--AAC-A---C-A--G-C-AAC-G--ACGTA--------C-G----G-T-ACAA---TGCAATTTC-T--------T-TGC----TT---T-----AC--A-C----ATC-------------------------------T---AC-A-GA-GT-TC-CATT---TCA--C-TTTCCTT--A-A-AGA-TCATtcaaaac
blockSeqs : T TTT AA A CTAG T CA A CC G AT T CGTTTGGAGCCC C T T G A C TGTG . TTG ATA T C A A TAATTATTTA AT . G TTG GT C T C AATTA C AA TT C C TCA C AACCG . T C TA GTCTGTATCCT T C TGCAA T . G GTA CTA GTAAA AA T GCT ACGGAAGATAATAAAGTTG ATA . A C . GTG GC T TTCC AAA G G . TC
blockSeqs : . . . . . . . . C G . . GTTGGAGCCC . . . . G . . . T A . . C . TAATA . . . TTG T G . C TTAAA C . . C . A . AACCG . . C . TTTTAA . C ATTT T . G . TG TAC . . GCT ACGGAAGATAATAAAGTTG . . A . . C GC . . AT . . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . CGTTGGAGCG . . . . A . . . T . . . . . TAATA . . . CG . . . T GTCTG C . . . . . . CA . . G . TGT . . GT C . . . . GTA . . TA TCACGAAGTACGTAAAGCT . . . . . C . . . A . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . TGGTATT . . . . A . . . T . . . . . TTATA . . . . . . . . GTCTG . . . . . . . C . . . . TGT . . CA T . . . . . . . CT ACAAGACTATAAAGTT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GAGAAT . . . . G . . . C . . . . . TTATA . . . . . . . . TTTA . . . . . . . C . . . . ACG . . T T . . . . . . . T ACAAGACTAACGTT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GAGAAT . . . . G . . . C . . . . . TTATA . . . . . . . . CTTA . . . . . . . C . . . . CC . . A T . . . . . . . T ACAAGACTAAAGTT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GTACTT . . . . A . . . T . . . . . TAAA . . . . . . . . GTG . . . . . . . C . . . . GT . . T C . . . . . . . T ACAAGACTAAAGAT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GGTTT . . . . G . . . C . . . . . GGTT . . . . . . . . TTA . . . . . . . C . . . . CG . . G T . . . . . . . T ACTAGAATCAAATT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CGTT . . . . G . . . C . . . . . TGTA . . . . . . . . GTG . . . . . . . C . . . . GT . . A T . . . . . . . T ACGAGACTTAAGTT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CGTT . . . . G . . . T . . . . . TATA . . . . . . . . GTT . . . . . . . C . . . . GT . . A C . . . . . . . T AGTAGACTCAATTA . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CGTT . . . . A . . . T . . . . . AATA . . . . . . . . GTT . . . . . . . C . . . . GT . . G T . . . . . . . T ACAAGACTAACTTT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . CGTT . . . . G . . . C . . . . . ATG . . . . . . . . TTA . . . . . . . C . . . . CT . . T T . . . . . . . T ACGAGACTTAATT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GTTT . . . . G . . . T . . . . . ATG . . . . . . . . TTA . . . . . . . C . . . . CC . . T C . . . . . . . T ACGAACTTAAGTT . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GTT . . . . A . . . T . . . . . TGT . . . . . . . . GTG . . . . . . . C . . . . CT . . G T . . . . . . . T ACGAGACTAAGT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GTT . . . . A . . . T . . . . . ATA . . . . . . . . GTG . . . . . . . C . . . . CT . . A T . . . . . . . T AAAATCAACATC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GTT . . . . A . . . C . . . . . TGT . . . . . . . . GTA . . . . . . . C . . . . GT . . G T . . . . . . . T ACGAGACTTAAG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GTT . . . . A . . . C . . . . . GGT . . . . . . . . GTG . . . . . . . C . . . . GT . . T G . . . . . . . T ACTTAAAAT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GTT . . . . A . . . T . . . . . TGT . . . . . . . . GG . . . . . . . C . . . . CG . . T T . . . . . . . T ACATC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GTT . . . . G . . . C . . . . . ATA . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . CT . . T . . . . . . . . T GTC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GTT . . . . . . . . G . . . . . TTA . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . CT . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqCons : ** GTT***************** ** G* *** **** TATA********** *** ** ******** ACGAGACTAAAGTT***************** A*** ***
originalCons : AAAAAA-ATT---CAA--CGAAAA-CAG----TT-C--A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-T-A------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATGC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TA--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCA
finalCons : AAAAAA-ATT---CAA--CGAAAA-CAG----TT-C--A-TTT--A-A--T-CGTT-----------------A-GCT--GT-CGCT-CG-A-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-ATATA----------TT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATGC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATCACGAGACTAAAGTT-----------------T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TTA---A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCA
Alignments
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lowQualScore : 3 444 22 1 3333 1 22 1 00 3 22 1 33333333333333333333 1 44 3 1 44 1 3333 333 555 444 1 1 7777 1 66666666666666 22 1 1 888 44 3 1 5 4444444444 777 22 22 3 1 444 1 11111 22 1 4 22 0 5555555555555555 1 3 22222222 6 55555555 3 222 444 88888 22 1 5555 3333333333333333333333333333333 333 1 3 1 1 666 44 1 3333 2222 2 2 555 11
lowQualScore : . ... .. . .... . .. . .. . .. . .................... . .. . . .. . .... ... ... ... . . .... . .............. .. . . ... .. . . . .......... ... .. .. . . ... . ..... .. . . .. . ................ . . ........ . ........ . ... ... ..... .. . .... ............................... ... . . . . ... .. . .... .... . . ... ..
lowQualScore : 3 444 99 8 9999 8 55 8 55 6 55 8 99999999999999999999 7 00 3 7 66 7 5555 000 555 888 7 7 2222 7 11111111111111 33 7 7 555 11 5 7 2 9999999999 999 33 33 3 7 666 7 11111 22 6 8 22 7 3333333333333333 5 1 00000000 8 44444444 0 666 666 99999 00 5 9999 5555555555555555555555555555555 000 7 5 7 7 555 88 7 7777 7777 7 7 000 55
consensus : AAAAAA-ATT---CAA--CGAAAA-CAG----TT-C--A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-T-A------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATGC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TA--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCA
Reference ( family-692 ) : AAAAAA-ATT---CAA--CGAAAA-CAG----TT-C--A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-T-A------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATGC---------C-T----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TA--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCA
gi|1 : AACAAA-ATT---CAA--CGAAAA-TAG----TT-C--A-TTTAAA-A--T-C----G--TC--T--------A-GCTAGGTGCGCT-CAGA-C----ATATCTC--GA---T-A-AAATGCTTC-AGT-G------TGAATT--TCTTCT-----G--G-AT-AC-A-G--T--T--TATTTA-----TTT-TC-T---AAC-A---C-ATGGAC--GC-G--ACAC---------C-T----A-A-TCGA---T----TTTCTTATATATAGT-GGTA---TA---T-----AT--A-C--T-ATTAAACG--AACGCG--AC--TAT-AAGGTCT-T---ATGA-AATTG-TCTCAAT---TCA--C-G----CT--------A-TTTTGTAATTAAAA--AT
gi|10 : aAAAAAA-ATT---CAA--CAAAAA-CAG----TT-C--A-TTTC-A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--GT-CGCT-C-AA-T----A---CTT--GA---T-A-AA----TCC-A-T-AA-----T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--G--TA---A--G--TTT-TC-A---AAC-A---C-A--AAC-AAC-G--ATTC---------C-C----A-A-ACGA---T----TTTCTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TA--ACG--TT-T---AG-A-GATTT-T--CAAT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAA--ATCAtcatca
gi|11 : A-CGG----TC-C--A-TTA--A-AATC-C----G--T---TGGAGCCC-A-GCT--GT-CGCT-C-GA-T----A---TTT--GA---T-A-AA----TCC-----A------T--GTT--T-TTCT-G---G--G-TT-AC-A-T--T--A---A---A--G--TTTCTC-T---AAC-A-----A--GAC-AAC-G--ATGC---------G-T----A-A-ACGA---A----TTTC-T--------T-TGCA---TT---T-----G--------T-AAC--AC---------------------A--TC-T---AC-A-GATTT-TC-CAAT---TCT--T-T----TT--
gi|12 : atatagataataattttcgtctgatcAAAAAA-ATT---CAA--CAAAAA-CAG----TT-C--A-TTTC-A-A--T-C----G--T---T--------ACGCT--GT-CGCT-C-AA-T----A---CTT--GA---T-A-AA----TCC-A-T-AA-----T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GCCA-G--T--G--TA---A--G--TTT-TC-A---AAC-A---C-A--GAC-AAC-G--ATAC---------C-G----A-A-ACGA---T----TTC--T--------T-TGCT---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TA--AAG--TT-T---AT-A-TATTT-TC-C-AT---TCA--C-T----TT--A-A-AAA-TTGTG---TTAAActctttaaatcatcaac
gi|13 : aAAAAAATATT---CAC--TGAAAA-CAG----TTTC--A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--AT-CGCT-C-AACT----A---C-C--GA---T-A-AA----TCC-A-TTA------T--ATT--T-TTCT-C---G--GCAT--C-A-G--T--T--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAT-G--ATA------------------------------------CTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--TAATC--ACG--A----G--AC--TA--AG----T-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--T-T----CA--A-A-AAA-TCGTA---TTAAAA--ATCA
gi|14 : ttAAAA-CAGCTAGTT-C--A-TTT--A-A--T-CC---G--T---T--------G-GCT--GT-CGCT-T-GA-T----A---TTC--GA---T-A-AA----TTC-----A------T--GTT--T-TTCT-C---G--T-GT-GC-A-AATT--A--TA---A--GTTTTT-TT-T---AAC-A---C-A--GCC-AAC-A--ATGC---------G-T----A-A-ACGA---G----TTTC-T--------T-TGCA---TT---T-----AC--A-C--------------------------------G--TC-T---AC-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--tcaaac
gi|15 : tagataacaaattttcgtccAATAAA-TTT---CGT--CGATAA-CAG----TC-C--A-TAA--A-A--T-CC---G--T---TTGGAGCCCA-GCTT-GT-CGCT-C-GA-T----A---CT------------GA----TC------------------------TCT-C---G--G-GT-GC-A-T--TT-A--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A-----A--GAC-AAC-G--ATGC---------G-T----A-A-TCGA---A----TTTTCT--------T-TGCA---TT---T--------------T-GT-----A--A----A--AT--CA--ACA--TC-T---AC-A-GATTTCTC-CAAT---TCA--C-T----TT--ccttttaatcatcaaacct
gi|16 : tatagatAAAAAA-AAT---CAA--C--AAA-GAA----TT-C--C-TTT--C-A--A-C-------T---T--------A-GCT---T-CGCT-C-AA------A---CT---GA---T-A-AAA---TAC-A-T-A------A--ATTATT-TTCT-C---G----AT-GC-A-G-----G--CA---A--T--TAT-TC-----AAC-A---C-A--GAC-AAC-A--ACGC----------------G-A-ACAC---A----CTTCTA--------T-TAA---------------AC--A-C--T-ATC--ACA--A----G--AC--TA--AAG--AT-T---AT-A-GA-TT-TA-CAA----TCA--C-T----TT--A-AGAAA-T--TG---GTAAAA--ATtctttaaatcatcaaacct
gi|17 : attaaTT---CGT--CAATAA-CAG----TT-C--A-TTA--A-A--T-CC---G--T---TGGAGCG--A-GCT--GT-TGTT-C-GA-T----A---TTT--GA---TTA-AA----TCC-G-T-G------T----T--T-TTTT-C---G--G-TG-GC-A-T--T--AAATA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A-----A--GAC-AAC-G--ATGC---------G-T----A-A-ACGA---G----TTTC-T--------T-TGCA---TT---TGTAAAAC--ATC--T-AT-----G--A----G--AT--Taatcaga
gi|18 : atatagataataaattTT---CGA--AGAAAA-CTG----TT-C--A-CTT--A-A--T-CC---G--T---T--------G-GCT--GT-AGCT-C-GA-T----A---TTC--AA---T-A-AA----TCC-A-G-G------T--TTT--T-TTTT-C---G--G-GT-GT-A----T--C--TA---A--A--TTT-GT-T---TAC-A---C-G--GGC-ATT-G--ATGC---------C-T----A-A-AAGAATTT----TTTTTT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACT--A----G--AA--TC--AAA--TT-T---AC-A-GATTT-TC-CAAT---TCA--C-T----TT--tcacctttaaatcatcaaacctca
gi|19 : tagataacaaattAA-ATT---CAC--TGAAAA-CAG----TT----A-TTT--A-A--T-C----G--T---T--------A-GCT--AT-CGCT-C--A-T----A---CTC--GA---T-A-AA----TCC-A-TTA------T--ATT--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-G--T--T--TA---A--G--TTT-TC-T---AAC-A---C-A--GAC-AAT-G--AT--------------------A-AC--------------TT--------T-TGCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC--ACG--A----G--AC--TT--AAG--TT-T---AT-A-GATTT-TC-CAAT---TCA----T----TCAAA-A-AAA-TCGTA----TAAAA--ATCA
gi|2 : AA--CAAAAA-CAG----TT-C--T-TTC--AGA--T-C----G--AGAAT--------A-GCT--GT-CGCT----A-T----A---CTT--GA---T-A-AA----TCC-A---A------T--ATT--T-GTCG-CTTGG--G-AT-GC-A-G--TCTG--TAC--A--G--TTT-AT-T---CAC-AAACCGA--GAC-AACCG--ATAC---------TGT----A-ACACGA---T----TTTCCT--------TGTGCG---TT---T-----AC--A-CGCT-ATC--ACGGAA----G--ATAATA--AAG--TTGT---AT-AAGATTT-GC-CAATC--TCAGCT-T----TT--A-A-AAA-TCGTG---TTAAAATCATCAtcaaac
gi|20 : aaaaaataccacacaacg--------A-GCT--GT-CGCT-C-G--T----A---TTT--GAA--T-A-A------CC-A-T-G------T--ATT--T-T----C---G--G-GT-GCCA-T--T--A--TA---A--G--TTT-AT-C---AAC-A-----A--GAC-AAC-G--TTGC---------C-C----GTA-ACGAG--T----TTTCTT--------T-TGCA---TTTG-T-----AA--A-A--T-ATCT-ACG--A----ta
gi|21 : atatagataataaattttcgtcggattagcagttggagcccTT---CAA--AGAAAA-AAG----TT-C--A-TTT--A-A--TTC----G--T---T--------T-GTT--CT-CGCT-C--A-T----A---GTTTGGA---T-A-GA----TCC-A-T-G------T----T--T-TTCT-C---G--G-AT-GC-A-T--T--A--CC---A--G--TTT-TC-T---GAA-T---C-A--GAG-AAC-G--ACAT---------C-T----A-A-AC-A---T----ATTTTT--------T-TTCG---TT---T-----AC--A-C--T-ATC-------------------------------T---AC-A-TATTT-TT-CAAT---TCA--T-T----TT--atagcctttaaaatcattatcacctcaaatatt
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