lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 66666666666666666666666666666666666666666 11111 3333333 333333333333333 2222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 1111111 2222222222222222 11111111 55555555555 1 111 66666666666666666666666666666 222222222222222 2222222222222 111 5555555555555555555555555555555555 1 444444444444444444 111111 33333333333333333333 11111 111111 44444444444444444444444 11111111 22 111 2222 66666666666666666 1 11111 111111 1111
lowQualScore : 3 77777 6 44 44 3 3 3 44 555 2 5 3 3 3 8 555 2 2 4 2 3 2 77 66 33 2 2 88888888888888888888888888888888888888888 2 1 44 11111 3 3 1 5 555 55 3333333 2 7 77777 555555555555555 3 3 3 7777 4 7777777 4 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 8888 5 2 99 1111111 2 2 2 33 66 222 2 2 2 33 2 2 0000000000000000 33 777 3 3 66666666 55 3 99 3 77 44 3 77777777777 3 44 4 333 3 333 99 555 11111111111111111111111111111 6666 3 3 3 555555555555555 77 555 33 888 555 2 5 2 2 7777 2 5 2 33 66666 2 2 2222222222222 555 3 111 6 3 9999999999999999999999999999999999 3 3 7777 555 33 1 555 1 555 44 666666666666666666 3 44 3 999 66 444 5555 2 888888 22222222222222222222 11111 5555 444444 33 77777777777777777777777 00000000 2 33 444 5 8888888 444 111 33 2 2 8888 2 33 55 33 7777 9999 66 33 2 5 33 2 2 8888 33 33 2 2 66666 5555 00000000000000000 2 99999 66 5 2 777 0 33 33 99 8 2 8888 2 6666 00000 0 666666 3 7777 6
lowQualScore : . ..... . .. .. . . . .. ... . . . . . . ... . . . . . . .. .. .. . . ......................................... . . .. ..... . . . . ... .. ....... . . ..... ............... . . . .... . ....... . .. ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. . .... . . .. ....... . . . .. .. ... . . . .. . . ................ .. ... . . ........ .. . .. . .. .. . ........... . .. . ... . ... .. ... ............................. .... . . . ............... .. ... .. ... ... . . . . .... . . . .. ..... . . ............. ... . ... . . .................................. . . .... ... .. . ... . ... .. .................. . .. . ... .. ... .... . ...... .................... ..... .... ...... .. ....................... ........ . .. ... . ....... ... ... .. . . .... . .. .. .. .... .... .. .. . . .. . . .... .. .. . . ..... .... ................. . ..... .. . . ... . .. .. .. . . .... . .... ..... . ...... . .... .
lowQualScore : 6 77777 2 22 22 1 1 3 66 888 1 3 1 1 1 6 000 9 9 1 9 1 9 55 99 99 9 9 22222222222222222222222222222222222222222 5 8 66 77777 3 3 2 0 555 00 7777777 6 3 88888 999999999999999 6 6 6 7777 0 0000000 0 99 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 6666 7 9 66 0000000 9 9 9 99 88 999 9 9 9 99 9 9 2222222222222222 99 999 1 1 11111111 33 1 33 1 33 22 1 00000000000 3 66 2 777 1 222 22 444 55555555555555555555555555555 5555 1 1 1 777777777777777 44 000 33 999 555 7 3 7 5 8888 5 0 5 44 22222 5 5 9999999999999 888 3 777 7 5 2222222222222222222222222222222222 3 3 1111 888 88 5 000 8 222 22 999999999999999999 1 22 1 555 33 777 7777 7 000000 44444444444444444444 88888 7777 000000 99 99999999999999999999999 44444444 9 99 777 3 1111111 777 888 77 7 7 0000 5 44 99 44 8888 8888 33 77 7 3 44 7 7 9999 77 77 7 7 77777 7777 22222222222222222 7 33333 33 3 7 333 7 77 77 00 0 7 9999 9 1111 66666 5 888888 1 0000 2
consensus : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAANATC---ATGAC-GTC-ACAA-TTG-ACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NA-ATTGA---AATGA--A-----A-GTGG-CAANTA--TAA--TCCCTGC----C-GTTTGTTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A-------CA-ATCGA--TATT--TNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAACTTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTAC-A-TACAAG-TTGCAAA--GA-------AAA--TT-CAA-TAGA-TTT-AAA---A--GTTTT-AAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA-----------A---------A--T--AA----------------A----TCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A--C-A-C-G-G-A--ATGCA-C-AAA-------C---A---AT--ATA---G-G-G----A--GCC-TTT-TCGC-T-CAC--TTT--CCG-AGCAANGN--AT--GTAA-AT--GTTGAC-A-GAGAAA-CG-G-ACAG-GA---CAA----A-GAC--C-ATACATGTATA---GCCCTT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA---AT-A-T-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-TA-AA-T-T----A----AAC---AT-A---TA-TATGTC---------TTTG--A--T-CA--T-NNT--TTGAAG-T-TT----ACA---TTTGAAATG--AGAAG--AAA--AA----A-TCAT--------T-TAC--C-AGAGTTG--ACG--T---CGCT----GGCATTT-TA----CACC-------N-----G------GGG----GG----G------GG--GGGTA---------A--TG--AT---TAA--------AGT-G--CC---A-TAGTA----A---CA---TT--AT-GAAC-CT---GA-C--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-AT-A-----A----GC-TA-C----ATT----TTA-TAT-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AAT---GTG-TCTTCATTT
Reference ( gi|5 ) : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-ATAA-TTG-ACGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--GA-ATTGA---AATGA--A-----A-GTGG-CAAATA--TAA--TCCCTGC----C-GTTTGTTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A-------CA-ATTGA--TATC--TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAACTTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA----TATAAGTTTATAAA--GA-------AAA--T--CAA-TAGA-TT----A---A--GTTTTTAAAAACTGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA-----------A---------A--T--AA----------------A----TCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A--C-A-C-G-G-A--ATGCA-C-AAA-------C---A---AT--ATA---G-G-G----A--ACT-TTT-TCGT-T-CAC--TTT--CCG-AGCAATGTACAT--GTAA-AT--GTTCAC-A-GAGAAA-CG-G-ACAA-GA---CAA----A-GAC--C-ATACATGTATA---GCCCTT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA---AT-A-T-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-TA-AA-T-T----A----AAC---AT-A---TA-TATGTC---------TTTG--A--T-CA--T-ATT--TTCAAG-T-TT----ACA---TTTGAAATG--AGAAG--AAA--AA----A-TCAC-------CT-TAC--C-AGAGTTA--ACG--T---CGCT----GGCATTT-TG----TACC-------C-----G------GGA----GG----G------GG--GGGT----------A--TG--AT---TAA--------AGT-G--CC---A-TAGCA----A---CA---TT--AT-GAAC-C----GA-C--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-AT-A-----A----G--TA-C----ATT----TTA-TAT-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AAT---TTG-TCTTCATTT
gi|38 : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--TA--CGTG-G-T
gi|3 : taaaaAAGGAAG-T-AT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG---TTTATT-GCACTTTAGT---ACGGGAAA--TTAT-GACATC-A-A-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-ACAAATTGGACGTT-TACC-AA--TTGAA-C-CTTT------------------------------------GA---AATGA--A-----AAGTGG-CAAATA--TAA--ATCGTG-----C-GTTTTTTT-TTTTTTTTATTG---A-----------T-ATT-A-TTATAAAA-A-------CA-ATTGA--CATT--T
gi|27 : AAGGAAG-TGAT-----T-GCGTTGTAT--CA--CGTG-G-TTGATT-GC--TTTAGT---ACGGG-GAAATTAT-GACATC-ACA-AT----GGC---ATGAC-GTC-ACAA-TTG-ACGCA-TACC-AA-GCT--A-C-ATTT------------atgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaacttgcatgtctaagttcatgagatatgttagagtaaaatccacgttgtaaacaaaatcaatagagttaaaagttttaaaaaactgtaacttaaaatgaataaaaataacaaacccaataacaaatcaatacagaaaaacaacttttgtcaagcagaaatgcacaaacaattaatataggggagccttttcgctcactttccgagcaaaggtcataatgttgacacgagaaacggacaaggacaagaccatacatgtaatgccattacgacaaatagtgggaaaaaaatatgaaaagatatcatctccaagcaactgttaaataaacatatatatgtcttgacattatttgaagtttacattttgaatgagaagaaaaaaaatcatttaccagagttgacgtggctggcattttacaccggggaggggggggggggtaatgataaagtgtccattgtaaaattatgaacctgactatccaaaccgatacttttaccaattaatactcgctaacataagctatattatatgtaaataaaaggaaattcaatgtcaattactttccagggctgaaatgttgtcttc
gi|26 : AAGAAAG-TAATACATGTAGCTTGATAT--CA--CGTA-G-TTTATT-GC--TTTATT---ACGAGAAAA-TTAT-GACATC-ATA-ATTTATATC---ATGAC-GTC-ATAA-TTG-GCGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CGTT------------tgt
gi|36 : AGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGCAT--CA--TGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAA
gi|4 : GGAAG-GGAT-----TTGCGTGCTATTTCA--CGTGCGCTTTATT-GC--TTTAAG---ATGG-AAAAATTAG-CACATC-ACACATTAAAATC---ATGACCGTCCACAA-TTG--CTTT-TACCCAA-GTT--A-C-ATTT------------A-CT--------ATAG--GA-ATTGA---AATGG--A-----A-TTGGCCAAATAATCAATTTCCCTG-----C-GTTTTTTTATTTAT----TTGCC-ATT---------T-ATT-ACT----AAACA-------CA-AGTGA--TTTC--
gi|1 : GGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-ACAA-TTG-ATGCT-TACC-TA-GTT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--CA-A---A---AGTTA--ACCTTTA-GAGG-CAATTT--TAA--TCCCTG-----A-GTTTGCTTATTTAA----TTG---GATAT-------T-ATT-A-T----AAA-ACCCCTCCCA-ATTGA--Tattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacacaacactgcatggtatataagttcatttgaatgcttttagatcttaaaatccacgatgtaataacaaaatccaatagatttaaaaagttttaaaaactgtaccttaagatatgaataaaaataacaacccccaataagaacatcagtacagaaaacaactttcatgcgcccggaatgcagggagccttttcgctcactttatccgcagcaatggtcataaattttgaccgagaaacgacaaggatccaaaagaccatcctagatttgccctcaatatgggggataaaaattatgaataattatatctccaacagcacttttaaataaaacgtactatatatgtctcgaaaccattatttgaagtttacatttgaatgagaaaaacaaatatttaccagagttgacatcgctggcattttacaccggggcgggggaggggtaatgataaagtgctaatagtaacattatgaacctgactatcgagacaaatacttttatcaattcataccgctaacataagctacaatatatgtaaaaatgaaagaaatccaatggtcaattagttcttcagggctgaaaatgtgtcttcattt
gi|6 : GAAGCTGAT-----T--CGTGGTAT--CA---GTG-G-TTTATTAGC--TTTAGTTTTACGGCGAAAATTAT--ACATCCACA-ATTAA---T---ATGAC-GTC-A-AA-TTG-ACGTTGTACC-AGCGTT--A-C-CTT-------------G-CT--------A------ATATTTA---GATAACTAT----A-GTAG-CCTTTT--AAA--TCCCTGC------GTTTGCCT-TTT---------------------------TT-A-T--------------------TTGA--TATTCTTTGTTATAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAACT-G------CAT-----A-----TA-G-CA----TCAT--GA-G-AT--G---C---TACATGTAGG-GA----AAA-TCTACGATTACAAG---ACGAA--GG-------AAAATT--CAACTAGA-CTTTAAA---A--GTTT----AAACCGTTT--GTACCT-AC---------AA-------A-----AATA-----------A---------T--T--AACA--------------A----TCAA-----T---------ATA-GCCGAA-A-A--CGGCT-----TTT-GCT-C--A--C-C-C-G-G-A--ATGC--C-AAA-------C---A---AT--ATA---G-G-G----A--GTTCTTT-TCGC-T-TAC--TTT--CCG-AGCCAAGC------GTAAGAT---TTGACCG-GAGAAA-CG-G-ACAG-GA---CAA----A-GAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-AA-TGG-GGG-A--------------AA-AT---A-GAA---AT-A-T-G-TC-TCCTT----GG-CCAC-ACTT-----AT-TA-AA-T------A----AAC---AT-A---TA-TGT-------------TTG--A-------------------AG-T-TT----ATA---TT--AAATGCGAGAAC--AAA--AA----A--CA---------T-TAT--C-CGAGTTA--ACG--T---CAAT----GTCATTT-TA----CACC-------C-----G------GGG----GG----GA-----GG--GGGTA---------A--TG--A----TAA--------AGT-GA-CC---G-TA-TA----A---CATT-TT--AT-AACC-T----GA-C--TATCCCCAAA---C----GGTAC----TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-T--GC--TAA--C-AT-A-----A----GCCTA-C----A------TTA-TAT-----GCTAA-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGTGTAATT----A---G-TTCCC-A-GC-GGCTAAA-AAT---ATG-TCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgaaactacatacatagatcatgacgcatgctacggtaaaatctacaagtacaagtaacgaactttcaaagattataaagttttaaaccgcttctgtacctttaaacacaaatagaccaataacaatcgattgtcacaggaaaaaactggctatttagtcacccggacaatgcgcaaaaacaaaataatagaggaagcacttttctcacatcacctttccgagcacggacatcggcaattaattagacgagaaacggacaggaccaagaccatatgcccttcaatttgggggaaaaattcaatgaaataatgatctccaattacggcacatgtcaaaaatacaacaatatatacatgtcactgtcatgcttcattatattttgaagatattacaaatcctgaattagagaaaagcctattccaggtggcgttcgctgttctttttactgtgggtgagggaggggggggtgattaatgatcaaagtgaccgccctaacatttatgaacctggtaacaatatccaaacctaaaaatatttctttatcaagtcaatgactgctaacaataagctacattatatggtagaaaataaaagaaagttcaatggtcaattagttcgtccagcggctgaacctgtgtctttaat
gi|20 : GAAA-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTT-GT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAAAAGC---ATGAC-ATC-ACAA-TTG-ACATT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT---------------------------TGA--A-----A-GTGG-CAAATA--TTA--TCCCTG-----C-GTTTATTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----atta
gi|18 : AAG-TGAG-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGGAAAATTAT-GACATC-ACA-A-TAAAACT---ATGAC-GTC-ATAA-TTG-ACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-C---------ATAGAAGA-ATTGAC--AATGA--A-----A-GTGG-CAAATA--TAA--TCCCTGC----C-GTTTG-TT-TTTAT----TTG---A-----------TGATTAA-T----AAA-AAACC---CA-ATTtat
gi|19 : AG-TTAT-----T-GCGTGATAT--CA--CGCG-A-TTTATC-GC--TTTAGT---ACGGGGAGAG-TAT-GAACTC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GCC-ACAA-TTA-ACTTT-TACC-AA-ACT--A-CTTTTT------------G-TT--------ATAT--TA-GCTCT---A--GA--A-----A-TTGT-----TA--TAA--TCCCTG-----C-GTTTGTTT-C--------------A-----------T-ATT-A-C----AAA-A-------CA-ATCAA--T
gi|2 : GAT-----T-GCTTTGT-T--CATACATG-G-T--AGT-GC--TTTAGT---A--GGGAATATAATAGACAGC-ACA-ATTAAT-TCTCTATGAC-GTC--CAA-TTG-ACGTT-TACA-AATATT--ATC-CTTT---------------T--------GTAA--CA-TTAGT---AAC-A--T-----A-GTAG-C-AATT--TA----TCCTG-----C-GTTTG-TT-TTTAT----TTGGATA-----------T-ATT-A-T----TAC-A-------CATATCGA--Ttaagt
gi|8 : tg-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--------------------ATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-ACAA-TTG-ACGTT-TACC-AA----------------------------------------AG--AA-ATTGA---AATGA--A-----A-ATGG-CAATTA--TAA--TCCCTGT----G-GTT-GTCT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-ATA-----CA-ATTGAACTATT--TGTTGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGCATAGTATAATTTG------TATG---T-----------T-----TCAT--GA-A-AT--G---T---TA-------GTGT----AAT-CCTA----T----GATTGTAAG--GA-------GAA--T--TAAGTAGA-TTGAAAA---A--GTTT-----AACCGTTT---TAGGCTAA---------AA-------T-----AA-A-----------A---------A-----AA----------------A----CCAA-----TAACAAAGAAACA-GA---A-A-A--CAAC------TTT-G-T-C--A----A-C-G-G-A--ATGC--C-AAA-------C---A---AT--ATA---G-G-G----AT-GCC-TTT-TCAC-T-CAC--TTT--CC---GCAA-----AT--GTAA-ATTCGTGACC-A-GAGAAA------ACAG-GA---CAG----A------C-AAACCT-TATA---ATACTT----CAA-T------GGG-ATAA----------AAATTT---AT--A---AT-A-T-G-TC-TCC-A----AG-C-AC-A--T-----GT-TA-AA-ttattttgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatattacttgtctatatattatgagtcatgagtgtaattaggctaaaatctaacattacagaacgatgtaggtaaattgcaatagattttaaaagtttaaaccgttgtacctttacaaaataataataaaggcatcaagtatgtatgaaaacggtttgtctaacgccggaatgcacgaaacaatatagggatgtaattttcgcggttacgttttccgagcaaggttaatggttgacggagaaacgcgacaggaaaagacgtatgccttgaagactggggagtaaaaaaattgaaatgttccttgggcacatctgaggttgtatttaaatagaacatatatgtttgaattttgtattagatgagggacgattttttttttttaccgagagtaacgtcatgtcattttacaaccacccgggggggggtggtgggggtgtgtaatagataacgtggccgtagtaatttagacctgactatgcagacctgatactgtttatcaagtcagtctcgctgaaccatagacgcgtaggattaattagtgtacaacaataaatagaaagttcaatgttattagttctccagggctgaagaatatgtctttt
gi|26 : agAATTAT-GACGTC-ATG-ATATAAATT---ATGAT-GTC-ATAA-TTg
gi|23 : aagaaagtaatacatgtagcttgatatcacgtagtttattgctttattacgagaaATTAT-GACATC-AAT-ATTAATAGC---ATGAC-GCC-ATAA-TTG-ATACT-TTTT-G----T--A-G-CATT------------AGCT--------ATAG--GA-ATTGA---AATGA--A-----A-GTGG-Cggcgtttactaagttaccgtt
gi|22 : tttcttttgaacattgtaattgtacaatcttaaagaagtgattgcatggtttTC---ATAAC-GTC-ACAA-TTG-ACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTTTGTAATACATGTA-TTTTAAAATGATAG--AA-ATTAA---ATTGA--A-----A-GTGG-CGATGA--TAA--TTCCTGCGTTACGGTTTGTTT-TTTAA----TTG---A-----------T-ATT-A-C----AAA-A-------TA-ATg
gi|29 : GTT-TACC-AA-GCT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--CA--TTAGTTCACT-A--T-----A-GTAG-CAATTT--TCA--TCCCTGC------GTTTGTTT-TTTAT----TTG---ACATAAAGACATT-ATT-A-T----AAA-A-------CA-ATCGA--Tc
gi|1 : ---------ATAACTTGAAACTACATA---CA-----TA-G-A-----TCAT--GACGCAT--G---C---TAC------G-GT----AAAATCTACAAGTACAAGT----AAC--GA-------ACT--TT-CAA--AGA-TT----ATAAA--GTTTT---AAACCGCTTCTGTACCTTTA---------AACAC----A-----AATAGACC-------A---------A--T--AACA--------------A----TCGA-----TTGTC-----ACA-GG---A-A-A--AAACTGGCTATTTAG-T-C--A--C-C-C-G-G-ACAATGCG-C-AAAAACAAAAT---A---AT--AGA---G-G-A----AGCACT-TTTCTCACAT-CACC-TTT--CCG-AGCA-CGGACATCGGCAA-TT--AATTAG-ACGAGAAA-CG-G-ACAG-GA---CCA----A-GAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-TT-TGG-GGG-A-------------AAA-ATTCAATGAA---AT-AAT-GATC-TCCAATTACGG-C-AC-A--T-----GT-CA-AA-AAT----ACAACAAT---AT-A---TA-CATGTCACTGTCATGCTTC--A--T-TA--T-ATT--TTGAAGATATT----ACAAATCCTGAATT------AG--AGA--AA----A---GC-------CTATTC--C-AGG--TG--GCGT-T---CGCT----GTTCTTT-T-----TACTGTGGGTGA-----G------GGA----GG----G------GG--GGGTGATTA-----A--TG--AT---CAA--------AGT-GA-CC---G-CCCTA----A---CAT--TT--AT-GAAC-CTGGTAA-CAATAT--CCAAA--CCTAAAAATAT-TTCTTT--AT--CA-AGTC-AA-TGAC-T--GC--TAA--CAAT-A-----A----GC-TA-C----A------TTA-TATG----GT--AGAA-A---ATAA--A--A--GAAAGTT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCGTC-C-AGCGGCTGAA-CCT---GTG-TCTTTAtt
gi|2 : ggaagtgattgcgtggtatcacgtggtttattgctttagtacgggaaaattatgacatcacaattaatatcatgacgtcacaattgatgcttacctagttaccttttgtaacaaaagttaacctttagaggcaattttaatccctgagtttgcttatttaattggatattattataaaacccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---------ATTACTTG------TCTA---TA-----TA-T-TATGAGTCAT--GA-G--T--G---TAATTA-------G-GCTA--AAA-TCTA-----ACA---TTACAGAACGATGTAGGTAAA--TTGCAA-TAGA-TTTTAAA---A--GTTT----AAACCGTT---GTACCTTTA---------CA-------A-----AATA-----------ATA-------A--T--AA----------------AGGCATCAAGTATGT---------ATG-A----A-A-A--CGG-------TTT-G-T-CTAA--C-G-CCG-G-A--ATGCA-CGAAA-------C---A---AT--ATA---G-G-GATGTA--ATT-TTC-GCGG-T-TACGTTTT--CCG-AGCAAGGTTAAT--G--------GTTGAC-G-GAGAAA-CGCG-ACAG-GA----AA----A-GAC----------GTATG-----CCTT----GAA-GACTGG-GGA-GTAA----------AAA-AA---TTGAA---AT-G-T-T-CC-TT--G----GG-C-AC-A--TCTGAGGT-TGTAT-T-T----A----AATAGAAC-A---TA-TATG-----------TTTG--A----------ATT--TT---G-T---------A---TT--AGATG--AG--G--GAC--GATTTTT-TTTT-------TT-TAC--CGAGAG-TA--ACG--T---CA-T----GTCATTT-TACAACCACC-------C-----G------GGG----GG----GGGTGGTGG--GGGT----------G--TGTAATAGATAA--------CGTGG--CC---G-TAGTA----A---T----TT--A--GACC-T----GA-C--TAT--GCAGA--CCT---GATAC-TG-TTT--AT--CA-AGTC-AG-T-CT-C--GC--TGAACC-AT-A-----GACGCG--TAGG----ATTAA--TTAGTGT-----AC--A-AC-A---AT-A--AATA--GAAAGTT-CAA----TGTT---ATT----A---G-TTCTC-CAG--GGCTGAAGAAT---ATG-TCTTat
gi|7 : tggattgctttgttcatacatggtagtgctttagtagggaatataatagacagcacaattaattctctatgacgtccaattgacgtttacaaatattatccttttgtaacattagtaacatagtagcaatttatcctgcgtttgtttttatttggatatattattacacatatcgatttattttgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatAACTTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-AT----AAA----A----TCCACGATTGTAAA--GA-------AAA--T--CAA-TAGA-TT----A---AAAGTATT-AAAAACTGT------ACCTTAA---------AA-------ATGAATAATA-----------A---------A--T--AACACCCCAAATAACAAAA----TCAG-----T---------ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTT-G-T-C--C--C-A-C-G-G-A--ATGCA-------------------------------G-G-G----A--GCC-TTT-TCGC-T-CAC--TTT--CCG-AGCAAGGTA------TAA-AT--TTTGAC-C-GAGAAA-CG-G-ACAG-GA---CAA----A-GACATC--TAGATGTATA----CCCTT----CAAATA-TGG-G----TAA----------A----T---ATGAA---AT-A-T-A-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-TA-AA-T------A----AAC---AT-A---TA-TATGTC---------T--G--A--C-CA--T-TAT--TTGAAG-T-TT----ACA---TTTGAA-TG--A-AAG--AAA--AA----A-TCAT--------T-TAC--C-AGAGTTG--ACG--T---CGCT----TTCATTT-TG----CACC-------G-----G------GGAGAG-GG----G------GG--GGGTAA--------A--TG--A----TAA--------AGT-GT-CC---A-TAGT-----A---CA---TT--AT-GAAC-T----GA-A--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--ATCACA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--A-AT-A-----A----GC-TA-T----A------TTA-TAT-----GTA-A-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A----CTTCTC-C-A--GGCTGAA-AAT---GTG-TCTT-ATTtt
gi|3 : aaAACTTG------CATG---TC-----TAAG-T-----TCAT--GA-G-ATATG---T---TA-------GAGT----AAA----A----TCCACGTT-GTAAA--CA-------AAA--T--CAA-TAGAGTT----A---AAAGTTTTAAAAAACTGT------AACTTAA---------AATGAATAAA-----AATAACAAACCCAATA---------A--C--AA----------------A----TCAA-----T---------ACA-GAA--A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--AAGC-A---G-A-A--ATGCA-C-AAA-------C---A---ATTAATATAGG-G-G----A--GCC-TTT-TCGC-T-CAC--TTT--CCG-AGCAAAGGTCAT-----A-AT--GTTGAC-ACGAGAAA-CG-G-ACAAGGA---C-A----A-GAC--C-ATACATGTAAT---GCCATTACGACAA--A-TAGTGGG-A-AA----------AAA-AT---ATGAAAAGAT-A-TCA-TC-TCC-A----AG-C-AA-C--T-----GT-TA-AA---T----A----AAC---AT-A---TA-TATGTC----------TTG--A----CA--T-TAT--TTGAAG-T-TT----ACA---TTTTGAATG--AGAAGAAAAA--AA----A-TCA--------TT-TAC--C-AGAGTTG--ACG--T---GGCT----GGCATTT-TA----CACC-------G-----G------GGAGGGGGG----G------GG--GGGTA---------A--TG--A----TAA--------AGT-GT-CC---A-TTGTA----A---AA---TT--AT-GAAC-CT---GA-C--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AC--CA-A-TT-AA-T-ACTC--GC--TAA--C-AT-A-----A----GC-TA-T----A------TTA-TAT-----GT--A-AA-T---AA-A--A--G--GAAA-TT-CAA----T-GT-CAATT----A---CTTTC-C-A-G--GGCTGAA-ATG---TTG-TCTTC
gi|10 : aaggaagtattgcgtggtatcacgtgtttattgcactttagtacgggaaattatgacatcaaattaaaatcatgacgtcacaaattggacgtttaccaattgaacctttgaaatgaaaagtggcaaatataaatcgtgcgtttttttttttttttattgatattattataaaaacaattgacatttatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataACTTG------CATG---TAACTTATA-GAT-----TCAG--GA-G-AT--G---T---CG-------C-GA----CAT-TCTA----AATA---TTACAAG--GT-------AAA--TT-CAA-TAGA-TT----------------TAAAA-CCGTTT--GTACCTT-A---------AA-------A-----AATA-----------AG--------A--T--AA----------------------CAAAG---T---------AAA-AT---A-A-A--TAATA-----ATA-A-T-A--A--TAA-A-A-G-A--ACACATC-AAAAC-----C---A---AT--ACA---G-A-G----A--ACA-ATT-TTGT-TACAC-----------GGTAATGCACA
gi|4 : TG------CATGGTATA-----TAAG-T-----TCATTTGA---AT--GCTTT---TA-------G-ATCTTAAAA-TCCACGA-TGTAA-----TAAC--AA-------AAT--C--CAA-TAGA-TTTAAAA---A--GTTTT-AAAAACTGT------ACCTTAAGATATGAATAA-------A-----AATA-----------ACAACCCCCAA--T--AAGAAC------------A----TCAG-----T---------ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTC-A-TGC--G--C-C-C-G-G-A--ATGCA-------------------------------G-G-G----A--GCC-TTT-TCGC-T-CAC--TTTATCCGCAGCAATGGTCAT----AA-AT--TTTGAC-C-GAGAAA-CG---ACAA-GGATCCAA----AAGAC--C-ATCC---TAGATTTGCCCT-----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-TT---ATGAATA-ATTA-T-A-TC-TCCAAC---AG-C-AC----T-----TT-TA-AA-T-A----A----AAC---GT-ACTATA-TATGTC---------TC-G--AAAC-CA--T-TAT--TTGAAG-T-TT----ACA---TTTGAA-TG--AGAAA--AAC--AA----A-T-AT--------T-TAC--C-AGAGTTG--ACA--T---CGCT----GGCATTT-TA----CACC-------G-----G------GGC----GG----G------GGAGGGGT----------AA-TG--AT----AA--------AGT-G--CT---AATAGTA----A---CA---TT--AT-GAAC-CT---GA-C--TAT--CGAGA--CA----AATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-C--GC--TAA--C-AT-A-----A----GC-TA-C----A------ATA-TAT-----GT--A-AA-A---ATGA--A--A--GAAA-TC-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCTTC-A-G--GGCTGAA-AAT---GTG-TCTTCATTTacaatatagggggagccttttctcactttccgagcaaggtaatgttgaccgagaaacggcaggacaatactcatgttattcaatatgggggtataaatatgaattgtctccaaagcaacatgttaagtt
gi|15 : ggaagggatttgcgtgctatttcacgtgcgctttattgctttaagatggaaaaattagcacatcacacattaaaatcatgaccgtccacaattgcttttacccaagttacatttactataggaattgaaatggaattggccaaataatcaatttccctgcgtttttttatttatttgccatttattactaaacacaagtgatttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacacaacacTAA---------AA-------G-----AACA-----------AC--------A--TC-AA----------------A----ACAA-----T---------ACA-G----AGA-A--CAATT-----TTT-G-T-T--A--C-A-C-G-G-A--ATGCA-C-AAA-------C---A---AT--ATAG--G-G-G----A--GCC-TTT-TCGC-T-CAC--TTT--CCG-AGCAA-G-------GTAA-AT--GTTGAC-C-GAGAAA-CG-G-ACAG-GA---CAA-----------T-ACTCATGT-TA-------TT----CAA-TA-TGG-GGG-GT--------------A-AT---AT-----------T-G-TCTTCCAA----AG-C-AA-A--T-----GT-TA-A
gi|10 : ttaaaaaataagataacaaagtaaaataataataataataaTAA---------AA-------G-----AACA-----------C---------A--TCAAA----------------A----CCAA-----T---------ACA-G----AGA-A--CAA-T-----TTT-G-T-T--A--C-A-C-G-GTA--ATGCA-C-AA--------C---A---AT--ATA---G-G-GGG--A--GCC-TTT-TC---T-CAC--TTT--CCG-AGCAAGGT---------A-AT--GTTGAC-C-GAGAAA-CG-G--CAG-GA---CAA-----------T-ACTCATGT-TA-------TT----CAA-TA-TGG-GGGTAT-------------AA-AT---ATG-A---AT---T-G-TC-TCCAA----AG-CAAC-A--T-----GT-TA-AG-T-T----g
gi|17 : acttgcatgtaacttatagattcaggagatgtcgcgacattctaaatattacaaggtaaattcaatagatttaaaaccgtttgtaccttaaaaaataagataacaaagtaaaataaataataataataa---------AA-------A-----AACA-----------A---------AACC--AA----------------A----ACAA---------------ACA-G----A-AGA--CAATG-----TTT-G-T-C--A--C-A-C-A-G-A--ATACA-C-AAA-------C---A---AT--ATA---GAG-G----AG-ACT-TTT-T-GC-T-CAC--TTT--CCG-AGC-ATG-------GTAA-AA--GTTAAC-A-GATAAA-TG-G-ACAG-GA---CAA----A-GAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-TA--GG-GGG-AT------------AAA-AT---ATCAA---AT-A-T-G-TT-TCCAA----CG-G-ACTA--T-----GT-TA-AA-T-
gi|9 : aaccAA-----T---------ACAAG----A-A-AACCAACT-----TTT-G-T-C--AG-C-ATC-GTG-A--AT-CA-C-AG---------------------------------------CC-TTT-ACGC-T--AC--TGT--TTG-AGCGAAGTA-AT-------AT--GTTGAC---GAGAAAGCG-GTACA--GA---CAGTAATA-TAT--C-A-ACATGGA-----GCC-TT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAG----------AAA--T---ATAAA---A--A-T-GGTC-TCCAA----ATTC-AC-A--C-----GT-TA-AAAC-T----A----AAC---AT-ACAATA-TATG-C---------TTTGGAA--TGCA--TTATT--T--GAG-T-TTTACAATA---TTTCAA------GAAG--AAA--AA----AATAAT-------AT-TAC--C-AAGTTTG--AAG--T---CGCT----GGCATTT-T-----TGCC-------CACCTGG------GGA----GG----GGT----GG--GGGT----------AATTG--AT---CTA--------AGT-G--CC---GCTAGT-----A---CA---TTTAAT-GCAC-CTG--GG-C--TAT---CAAA--GC----GATAC-T--TCTTGAT--CA-A-TCAAA-T-ACTC--GCTGTAA--C----G-----A----G--CA-C-----TT----CTA-TGT-----GT--A-AA-ATGTAG-A--A--A--GAAATTT-CAAATAGTGGT-CAATT----ATACTTTTCTC-C----GGCTG---AAT---GTGATCTTCATacc
gi|21 : ccaaattcgAA-----T---------A-A-G----A-A-A-------------TT-G-C-C--A--C-A-C-G-G-A--ATTCA-C-AAA-------A---A---AT--ATA---c
gi|30 : aaaa----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--G--C-A-C-G-G-A--ATGCA-C-ATA-------TTTTACTTGT--ATA---G-GAG----A--GCC-TTT-TCGC-T-CAC--TTT--C-A-AG---TG---AG--GTAA-AT--GTTGAC-A-GACAAA-CA-A-ACAG-Gatatgtcttcatcattaattaaagtttacattttcataaaatatgtcgctggcattgtacacccgatggggtgtaataataaagtgtccatagtaac
gi|28 : gaAC-A-GAGAAA-CA-G-ACAG-GA---CAA----A-GAC--C-A------TATA---G--CTT----TAA-TA-TAG-GGG-ATAATGTTCATATCAAATAT---ATG------T-A-T-G-TC-TCCAA----AA-C-AC-A--T-----GT-TA-AA---T----A----AAC---AT-A---TA-T
gi|11 : g-GA---CAA----A-GAC--CTATTGATG----------CTT------A-TA-TGG-GG---T------------------------AA---AT-A-T-G-TC-T-CAA----A-------A--T-----GT-TA-AA-T-----------AAC---ATGA---TA-TA-GTC----------TTG--A--T-CAATT-A-T--TTGGAG-T-TT----GCA---TTTG--ATG--AGAAG-------AA----A-TCAA-------T----C--C-AG-GT----ACG--T---CGCTAATAGGCAAAA-TG----CAC----------------------------GG----G------GG--GGTT----------GATTA--AT---TAA--------AGT-GCCCC---A-TTGTA----A---CT---CT--AT-GAAC-CT---GA-C--TAT--CCA-----C----GATAC----TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-A--C--GC--T-A--C--T-A-----A----GC-TA------ACG----TTA-TAC-----GT--ACAATA---AT-A--A--A--GAAA-TTGCAA----TGGT-CA--T----A---GTT--TC-C-G--G--TAGA-AAT---GTG-t
gi|21 : AA----------AAA-AT---AAGAA---AT---T-G-CC---------------AC-A--C-----G---G-AA-T-TCACAA----AAA---AT-A---TAATATGTC---------TTC---A--T-CA--T-TAA--TTAAAG-T-TT----ACA---TTT----------------------------TCAT-----------------AAAAT----ATG--T---CGCT----GGCATTG-TA----CACC-------C--------------------G----A------TG--GGGT----------G--TA--ATAA-TAA--------AGT-GT-CC---A-TAGTA----A---Ccatta
gi|12 : -A-T-A-TC-TTCAA----AC-C-AT-A--A-----ACATA-GA-G-T----A----TAT---GT-A---TAATATGTC----------TTG--A----CA--TCATTACTTGAAG-T-TT----GCG---TTAGAAATT--ATAA---ATA--AG----A-T-AT-------CT---C--C-AGAATTG--ACGATC---CGTT----GGAACAT-CG----TA
gi|31 : aatggataagaA----AG-C-AC-A--T-----GT-TA-AA-T------A----AAC---AT-A---CA-CATGCC---------CT-G--A--T-CA--T-TAT--TTGAAG-T-TT----ACA---TGTGAA-TG--AGAAA--AAA--AA----A-T-----------T-TAC--C-AGAGTTG--ACG--T---AGCT----GGCATTT-acataacaacctgaactatccaatcgatactttttatcatcaaacactaacataatctacattatatgtaaaataaaagaaatccaattagaattacttctcaggggttaaaaatgtgtcttcattt
gi|14 : G-T-AT----ACA---TTTGGAATG--AAAAG--AAAAAAA----A-TCATTTGTTGGTT-TACAAC-AGAATTCTTATG--TTACCGCG----GGCATTTCTGTC--TACC-------G-----G------GGA----GGGCGTG------GG--GGAG----------G--TA--AT---TAATTTTAAGTAGT-G-------A-TGGCATTGTATGTCATCTTT--AT-GAAC-CT---GA-A--TATG-CTAAAACCC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-CCTAC--TGA--C-ATCATGCCCA----A--TA-TAATGATTTTACTTA-TGT-----GT--A-GA-A---AT-AACA--A--TAAA-TT-
gi|16 : --AAA--AA----A-T-AT--------T-TAT--C-AGAGTTG--ACG--T---CACT----GGCACTT-TA----CACC-------CG----G------GGA----GG----A------GG--GTGTA---------A--TG--A----TGA--------AGT-GC-CC---A-TAGTA----A---CA---TT--AT-GAACTT----GA-C--TAT--CCAAA--TC------TAC-T--TTT--AT--CACA-CC-AATT-GC-T--GC--TAA--C-AT-A-----A----GC-TA-C-----------TTA-TACTGGGGGT--A-AA-AT--AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----CG---CAATT----A---GTTTCTT-C-A--GGCTAAA-AAT---GTG-TCTTCATTT
gi|32 : TTG--ACG--T---CGCT----GGCATTT-TA----CACCGGG----C-----GGGGGGAGGG----GG----G------GG--GGGTA---------A--TA--A----TAA--------AGG-GC-CC---A-TATTA----A---CA---TT--AT-GAAC-CT---GA-A--TAT--CCAAA--CC----G
gi|33 : aTNG--ACG--T---CGCT----GTCATTT-TA----CACC-------G-----G------GGG----GG----G------G
gi|13 : aatgacagaaatgaatgtattgctgt-----G------GGG----GG----G------GG--GGGTGGGTTGGAAAA--TG--AT-----A--------AGT-C--CC---A-TA-TA----A----A---TT--ATTGAAC-T----TA-C--TAT--CCAAA--CC-----ATACGT--TTT--AT--CA-G-TC-AA-T-AC---------AA--C-AT-A-----A----GCATA-C----CTT----TTG-TA----------A-AA-A---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATTATTAA---ATTTCTC-C-AT-GCCTGAA-AATGCGTCGATCTTCATTTttaatg
gi|25 : atcaattgtattaaagttaaacatttgaatgagatttttttctaaacataagtgcgtcgtgcgtttaaacaccgg----GG----G------GG--GGGT----------A------A----TGA--------AGT-G--CCCTTA-TGACA----A---AA---CT------AAC-CT---AA-A--TGT--CGACA--CC----GCTAC----TTT--AT--TG-A-TA-AA-T-AC-C--AC--ACA--G-AT-A-----A----G--C---------------------------T--A-AA-A---GT-A--A--AACAGAA-TC-CAA----AGAT-CAATT----A---CTTCC
gi|12 : gC---A-TCGTA----A---CA---TA--AC-AACC-T----GAAC--TAT--CCAA---TC----GATAC-T--TTTT-AT--CA---TC-AA---AC----AC--TAA--C-AT-A-----A----TC-TA-C----ATT------A-TAT-----GT--A-AA-A---TA-A--A--A--GAAA-TC-CAAT---TAG---AATT----A----CTTCTCAG-G--GGTTAAA-AAT---GTG-TCTTCATTTg
gi|35 : aatggataagaatatcttcaaaccataaacatagagtatatgtataatatgtcttgacatcattacttgaagtttgcgttagaaattataaataagatatctccagaattgacgatccgttggaa--AT-GAAC-CT---GA-T--TAT--CCAAG--CA----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--AA--TAA--T-AT-A-----A----G--
gi|24 : -C--TA---CCAAG--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TGA--C-AT-A-----A----GC-TA-C------T----TTA-TAT-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----TGGT-TAATT----A---CTTCTTC-G-G--GGCTGAA-AAT---GAG-TCTTCATTTct
gi|34 : ccaataatataagTA-TAT-----GT--A-AA-G---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGCT-CAAT---------GT--------G-----TGGA-AAT---GTG-TCTTCAT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTCTTTATAAATAATTATGATTTTGCAATTTTTTAAATAACTTAAAT
Alignments
lowQualScore : 4444444444444444444444444444444 11111 2222222 333333333333333 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666 11 11 1111 111 111111111 2222222222222 777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111111 1111 11 11111111111111111111111 33333333333 111 444444444444444 222222222222222 11111111111 44444444444444444444 1111 1111111111111111111111111 11111111111111111 111111 1111111111111111 2222 22 1111 4444444444444444444 1 111111
lowQualScore : 3 77777 5 33 33 2 2 3 44 555 1 5 3 3 3 2 555 2 2 2 2 2 2 55 33 2 2 4444444444444444444444444444444 1 0 888 1 33 44 00000 3 1 666 44 9999999 555 6 7777 000000000000000 3 3 3 7777 3 55 4 33 22 1 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 222222 000000000000000000000 66 666 66 9999999 11111111111111111111111111111111111111111111 4 33 4 8 11 4 7777 000 66 0 333333333 0000000000000 111111111111111111111111111111111111111111111 44444444444444444444 3 2222 6 3 44 0 77777 3 3 3 44 3 6 3 3 44 3 3 3 77777777777777777777777 3 3 3 77 6 9 999 77 44 3 99999999999 3 6666 2 2 222 2 2 2 2 2 555 77777 33 2 777777777777777 6666 2 2 2 555555555555555 5 444 11 2 888 2 5 2 2 99999999 2 2 66 999999999 2 4 77777777777 555 888 6 0 11111111111111111111 3 3 44 3 2 2 2 555 555 0000 33 33 9999999999999999999999999 33 2 33 444 55 444 5555 2 444 99999999 66666 88888888888888888 333333 2 6666666666666666 7777 4 1111 33 2 00 444 2 2 1 33 66 444 33 2 2 444 33 55 33 7777 1111 33 33 2 5 2 2 2 5 33 33 33 2 2 2 5555555555555555555 2 88888 55 5 2 666 0 33 33 88 7 2 8888 2 5555 9999 444444 0 2 2 8888
lowQualScore : . ..... . .. .. . . . .. ... . . . . . . ... . . . . . . .. .. . . ............................... . . ... . .. .. ..... . . ... .. ....... ... . .... ............... . . . .... . .. . .. .. . . ............................................................... . ...... ..................... .. ... .. ....... ............................................ . .. . . .. . .... ... .. . ......... ............. ............................................. .................... . .... . . .. . ..... . . . .. . . . . .. . . . ....................... . . . .. . . ... .. .. . ........... . .... . . ... . . . . . ... ..... .. . ............... .... . . . ............... . ... .. . ... . . . . ........ . . .. ......... . . ........... ... ... . . .................... . . .. . . . . ... ... .... .. .. ......................... .. . .. ... .. ... .... . ... ........ ..... ................. ...... . ................ .... . .... .. . .. ... . . . .. .. ... .. . . ... .. .. .. .... .... .. .. . . . . . . .. .. .. . . . ................... . ..... .. . . ... . .. .. .. . . .... . .... .... ...... . . . ....
lowQualScore : 3 11111 7 99 99 9 9 1 22 444 2 3 1 1 1 1 000 9 9 9 9 7 7 88 77 7 7 3333333333333333333333333333333 6 2 555 6 99 22 88888 1 0 222 66 3333333 000 7 1111 222222222222222 3 3 3 1111 6 00 4 88 00 0 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 888888 777777777777777777777 11 222 11 9999999 22222222222222222222222222222222222222222222 1 44 4 9 99 4 8888 111 11 2 333333333 7777777777777 222222222222222222222222222222222222222222222 88888888888888888888 3 7777 2 1 66 2 77777 1 1 1 22 1 2 1 1 22 1 5 1 11111111111111111111111 1 1 1 33 2 2 666 33 22 1 66666666666 1 2222 9 9 777 9 9 9 9 9 000 66666 99 9 666666666666666 1111 9 9 9 666666666666666 3 777 88 7 333 5 0 5 5 77777777 4 4 55 444444444 4 7 22222222222 444 555 2 3 55555555555555555555 1 1 22 1 9 9 9 000 000 0000 99 99 9999999999999999999999999 77 7 22 111 66 111 0000 4 111 00000000 22222 11111111111111111 222222 4 5555555555555555 4444 7 4444 44 5 99 444 5 5 4 44 33 777 44 5 5 444 22 66 22 4444 1111 44 44 5 0 5 5 5 0 44 44 44 5 5 5 2222222222222222222 5 88888 99 0 5 999 0 44 44 44 5 5 3333 7 7777 1111 222222 1 9 9 9999
consensus : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA---AATG-A--A-----AGTGG-CAATTA--TAA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---GTT-GTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-GTTTT-AAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA---------A-----------A--T--AA----------------ATCAA-----T----A---------CA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GC-CTTTTCGC---TCAC--TT--TCCG-AGCAAGGN-A-----GTAA-AT--G-TT-GA-C-A-GAGAAA-CG-G-AC-A-GGAC---AA----AGAC--C-ATACATGTATA---GCCCTT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA-A---T-AT-G-TC-TCCAA----A-G-C-AC-A--TG---------T-T-AAATT----A----AACA---T---ATA-TATGTC---------TTCG--A--T-C-A-TTAT-TTGAAG-T-TTA-C---A---TTTGAAAT--GAGAAG-AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----G-GCATTT---T---A----C-----ACCGGG---------G----GGGG------GG-GG---------G------T----AA-TGA----TAA--AGT-G--C---C-A-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA-C----A-T----TTA-TAT-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
Reference ( family-68 ) : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAANATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA---AATG-A--A-----AGTGG-CAANTA--TAA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---GTT-GCAAAGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-GTTTT-AAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA---------A-----------A--T--AA----------------ATCAA-----T----A---------CA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GC-CTTTTCGC---TCAC--TT--TCCG-AGCAANGN-A--T--GTAA-AT--G-TT-GA-C-A-GAGAAA-CG-G-AC-A-GGAC---AA----AGAC--C-ATACATGTATA---GCCCTT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA-A---T-AT-G-TC-TCCAA----A-G-C-AC-A--TG---------T-T-AAATT----A----AACA---T---ATA-TATGTC---------TTTG--A--T-C-A-TNNT-TTGAAG-T-TTA-C---A---TTTGAAAT--GAGAAG-AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----G-GCATTT---T---A----C-----ACCNGG---------G----GGGG------GG-GG---------G------T----AA-TGA---TTAA--AGT-G--C---C-A-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA-C----ATT----TTA-TAT-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
gi|1 : GGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GATGCT-TACC-TA-GTT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--CAA---A---AGTT-A--ACCTTTAGAGG-CAATTT--TAA--TCCCTG-----A-GTTTG--CTTATTTAA----TTG---GATAT-------T-ATT-A-T----AAA-A--C
gi|1 : ---------ATAAC-TTGAAACTACATA---CA-----TA-G-A-----TCAT--GACGCAT--G---C---TAC------G-GT----AAAATCTA-C-AAGT-ACAA---GT----AACGAACTTT-CAA--AGA-TTA-TAAA-GTTTT-AAA--CCGCTTCTGTACCTTTA---------AACAC----A-----AATAGACC-----A-----------A--T--AACA--------------ATCGA-----TTGTCA---------CA-GG---A-A-A--AAACTGGCTATTTAG-T-C--A-CC-CG-G-ACAA-TGCGC-AAAAACAAAAT---A---AT----AGA-G-G-A--A-GCACTTTTCTCACATCACC-TT--TCCG-AGCACGGACA--TCGGCAA-TT--AATTAGA-C---GAGAAA-CG-G-AC-A-GGAC---CA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-TT-TGG-GGG----A----------AAA-ATTCAATGAA-A---TAAT-GATC-TCCAATTACG-G-C-AC-A--TG---------T-CAAAAAT----ACAACAATA---T---ATA-CATGTCACTGTCATGCTTC--A--T-T-A-TATT-TTGAAGATATTA-C---AAATCCTG-AAT--TAG-AG-AAAAG-----C--CTA-T-T----------C--C-AGG--TG--G---CGT-T---CGCT----GTTCTTTT---T---A----CTGTGGGTGAGG---------G----AGGG------GG-GG---------GTGAT--T----AA-TGA---TCAA--AGT-GA-C---C-G-CCCTAA--CAT-T---T--AT-GAACCT-GGTAACAATAT--CCAAA--CCTAAAAATAT-TTCTTT--AT--CA-AGTC-AA-TGAC-T--GC--TAA--CAATAA-G-C----TA-C----A------TTA-TATG----GT--AGAA-A---ATAA--A--A--GAAAGTT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCGTC-C-AGCGGCTGAA-CCTG-TG----TCTTTAccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgaaactacatacatagatcatgacgcatgctacggtaaaatctacaagtacaagtaacgaactttcaaagattataaagttttaaaccgcttctgtacctttaaacacaaatagaccaataacaatcgattgtcacaggaaaaaactggctatttagtcacccggacaatgcgcaaaaacaaaataatagaggaagcacttttctcacatcacctttccgagcacggacatcggcaattaattagacgagaaacggacaggaccaagaccatatgcccttcaatttgggggaaaaattcaatgaaataatgatctccaattacggcacatgtcaaaaatacaacaatatatacatgtcactgtcatgcttcattatattttgaagatattacaaatcctgaattagagaaaagcctattccaggtggcgttcgctgttctttttactgtgggtgagggaggggggggtgattaatgatcaaagtgaccgccctaacatttatgaacctggtaacaatatccaaacctaaaaatatttctttatcaagtcaatgactgctaacaataagctacattatatggtagaaaataaaagaaagttcaatggtcaattagttcgtccagcggctgaacctgtgtctttaat
gi|10 : ggaagtgattgcgtggtatcacgtggtttattgctttagtacgggaaaattatgacatcacaattaatatcatgacgtcacaattgatgcttacctagttaccttttgtaacaaaagttaacctttagaggcaattttaatccctgagtttgcttatttaattggatattattataaaacccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAC-TTG------CATG---TAACTTATA-GAT-----TCAG--GA-G-AT--G---T---CG-------C-GA----CAT-TCTA-A-A--T-A-------TT-ACAAGGTAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA------------CCGTTT--GTACCTT-A---------AA-------A-----AATA---------AG----------A--T--AA----------------at
gi|10 : TAA---------AA-------G-----AACA---------C-----------A--TCAAA----------------ACCAA-----T----A---------CA-G----AGA-A--CAA-T-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-GTA--A-TGCAC-AA--------C---A---AT----ATA-G-G-GGGA-GC-CTTTTC-----TCAC--TT--TCCG-AGCAAGGT----------A-AT--G-TT-GA-C-C-GAGAAA-CG-G--C-A-GGAC---AA----------T-ACTCATGT-TA-------TT----CAA-TA-TGG-GGGTAT-------------AA-AT---ATG-A-A---T--T-G-TC-TCCAA----A-G-CAAC-A--TG---------T-T-AAGTT----caaagtaaaataaataataataataataaaagaacacatcaaaaccaatacagagaacaattttgttacacggtaatgcacaacaatatagggggagccttttctcactttccgagcaaggtaatgttgaccgagaaacggcaggacaatactcatgttattcaatatgggggtataaatatgaattgtctccaaagcaacatgttaagtt
gi|11 : acttgcatgtaacttatagattcaggagatgtcgcgacattctaaatattacaaggtaaattcaatagatttaaaaccgtttgtaccttaaaaaataagataacaaagtaaaataaataataataataaGAC---AA----AGAC--CTATTGATG----------CTT------A-TA-TGG-GG---T------------------------AA-A---T-AT-G-TC-T-CAA----A--------A--TG---------T-T-AAAT----------AACA---TG--ATA-TA-GTC----------TTG--A--T-CAA-TTAT-TTGGAG-T-TTG-C---A---TTTG--AT--GAGAAG----AA-----A--TCA-A-T----------C--C-AG-GT----A---CG--T---CGCTAATAG-GCAAAA---T---G----C-----AC-------------------GGG------GG-GG---------T------T----GATTAA---TTAA--AGT-GCCC---C-A-TTGTAA--CT--C---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCA-----C----GATAC----TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-A--C--GC--T-A--C--TAA-G-C----TA------ACG----TTA-TAC-----GT--ACAATA---AT-A--A--A--GAAA-TTGCAA----TGGT-CA--T----A---GTT--TC-C-G--G--TAGA-AATG-TG----
gi|12 : -AT-A-TC-TTCAA----A-C-C-AT-A--AA---------CAT-AGAGT----A----TATG---T---ATAATATGTC---------TT-G--ACAT-C-A-TTAC-TTGAAG-T-TTG-C---G---TTAGAAAT--TATAA--ATAAG-----A--T-A-T-CT---------C--C-AGAATTG--A---CGATC---CGTT----G-G-A----------A----C-----ATC-----------------------------------------G------T----AA------------------------C-A-TAACAA--C----------CT-GAAC-----------TAT--CC-AA--TC----GATACTT--TTT--AT--C--A-TC-AA---A--C--AC--TAA--C-ATAA-T-C----TA-C----A------TTA-TAT-----GT--A-AA-A---TA-A--A--A--GAAA-TC-CAAT---TAG---AATT----A----CTTCTCAG-G--GGTTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTcatta
gi|13 : aatggataaga--A--T-C-AATTGTATTAAAG-T-TAAAC---A---TTTGAA-T--GAGA----------------TTT-T-TT--------TC--T-AAACATA--AGTGCG--T---CGT-------GCGTTT---A---AA---C-----ACCGGG---------G----GGGG------GG-GG---------GGTGGGTTGGAAAA-TGA---T--A--AGT-C--C---C-A-TA-TAA---A--T---T--ATTGAACTT-----AC--TAT--CCAAA--CC-----ATACGT--TTT--AT--CA-G-TC-AA-T-AC---------AA--C-ATAA-G-CA---TA-C----CTT----TTG-TA----------A-AA-A---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATTATTAA---ATTTCTC-C-AT-GCCTGAA-AATG-CGTCGATCTTCATTT
gi|14 : G-T-ATA-C---A---TTTGGAAT--GAAAAG-AAAAA-----AAATCA-T-TTGTTGGTTTACAAC-AGAATTCTTA---TG--TTACCGCG----G-GCATTTCTGT---C----T-----ACCGGG---------G----AGGGCGTGGGGG-AG---------G------T----AA-TTAATTTTAAGTAGT-G--ATGGC-A-TTGTATGTCA--TCTTT--AT-GAACCT-G---AA--TATG-CTAAAACCC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-CCTAC--TGA--C-ATCATG-CCCAATA-TAATGATTTTACTTA-TGT-----GT--A-GA-A---AT-AACA--A--TAAA-TT-
gi|15 : TAA---------AA-------G-----AACA---------AC----------A--TC-AA----------------AACAA-----T----A---------CA-G----AGA-A--CAATT-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATAGG-G-G--A-GC-CTTTTCGC---TCAC--TT--TCCG-AGCAAG---------GTAA-AT--G-TT-GA-C-C-GAGAAA-CG-G-AC-A-GGAC---AA----------T-ACTCATGT-TA-------TT----CAA-TA-TGG-GGG-GT--------------A-AT---AT-----------T-G-TCTTCCAA----A-G-C-AA-A--TG---------T-T-AA
gi|16 : ttaaaaaataagataacaaagtaaaataataataataataa-AAAAA-----A--T-A-T-TT--------AT--C-AGAGTTG--A---CG--T---CACT----G-GCACTT---T---A----C-----ACCCGG---------G----GAGG------AG-GGT--------G------T----AA-TGA----TGA--AGT-GC-C---C-A-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACTT-G---AC--TAT--CCAAA--TC------TAC-T--TTT--AT--CACA-CC-AATT-GC-T--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA-C-----------TTA-TACTGGGGGT--A-AA-AT--AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----CG---CAATT----A---GTTTCTT-C-A--GGCTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTg
gi|17 : ---------AA-------A-----AACA---------A-----------AACC--AA----------------AACAA----------A---------CA-G----A-AGA--CAATG-----TTT-G-T-C--A-CA-CA-G-A--A-TACAC-AAA-------C---A---AT----ATA-GAG-G--A-GA-CTTTTTGC---TCAC--TT--TCCG-AGCA-TG--------GTAA-AA--G-TT-AA-C-A-GATAAA-TG-G-AC-A-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-TA--GG-GGG-AT------------AAA-AT---ATCAA-A---T-AT-G-TT-TCCAA----C-G-G-ACTA--TG---------T-T-AAAT
gi|18 : aaccAAG-TGAG-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGGAAAATTAT-GACATC-ACA-A-TAAAACT---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-C---------ATAGAAGAATTGAC--AATG-A--A-----AGTGG-CAAATA--TAA--TCCCTGC----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTG---A-----------TGATTAA-T----AAA-A--acc
gi|19 : AG-TTAT-----T-GCGTGATAT--CA--CGCG-A-TTTATC-GC--TTTAGT---ACGGGGAGAGT-AT-GAACTC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GCC-AC-AATT-AACTTT-TACC-AA-ACT--A-CTTTTT------------G-TT--------ATAT--TAGCTCT---A--G-A--A-----ATTG-----TTA--TAA--TCCCTG-----C-GTTTG--TTT-C--------------A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--CA-ATCAA--Taacccaatt
gi|2 : GAT-----T-GCTTTGT-T--CATACATG-G-T--AGT-GC--TTTAGT---A--GGGAATATAATAGACAGC-ACA-ATTAAT-TCTCTATGAC-GTC--C-AATT-GACGTT-TACA-AATATT--ATC-CTTT---------------T--------GTAA--CATTAGT---AAC--A--T-----AGTAG-CAATT---TA----TCCTG-----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTGGATA-----------T-ATT-A-T----TAC-A--CATATCGATTTATTTtaagt
gi|2 : tg---------ATTAC-TTG------TCTA---TA-----TA-T-TATGAGTCAT--GA-G--T--G---TAATTA-------G-GCTA--AAA-TCTAAC-A--TTACAGAACGAT-GTAG-GTAAATTGCAA-TAGATTTT-AAAA-GTTT----AAACCG-TT--GTACCTTTA---------CA-------A-----AATAAT-------A-----------A--T--AAAGGC------------ATCAAGTATGT----A---------TG-A----A-A-A--CGG-------TTT-G-T-CTAA-CGCCG-G-A--A-TGCACGAAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATGTAATTTTCGCGG-TTACGTTT--TCCG-AGCAAGGT--------TAA-TG--G-TT-GA-C-G-GAGAAA-CGCG-AC-A-GGA----AA----AGAC----------GTATG-----CCTT----GAA-GACTGG-GGA-GTAA----------AAA-AA---TTGAA-A---T-GT-T-CC-TT--G----G-G-C-AC-ATCTGAGGTTGTATT-T-AAATA----G----AACA---T---ATA-T-------------------------------GT-TTGAAT-T-TTG-T---A---TT--AGAT--GAG--G-GACGATTTTTT--TTT-T-TT--------AC--CGAGAG-TA--A---CG--T---CA-T----G-TCATTT---T---ACAACC-----ACCCGG---------G----GGGG------GGTGGTGGGGGTGTG------T----AA-TAG---ATAA--CGTGG--C---C-G-TAGTA----A--T---T---T-AGACCT-G---AC--TAT--GCAGA--CCT---GATAC-TG-TTT--AT--CA-AGTC-AG-T-CT-C--GC--TGAACC-ATAG-A-CGCG-TAGG----ATTAA--TTAGTGT-----AC--A-AC-A---AT-A--AATA--GAAAGTT-CAA----TGTT---ATT----A---G-TTCTC-CAG--GGCTGAAGAATA-TG----TCTTtgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatattacttgtctatatattatgagtcatgagtgtaattaggctaaaatctaacattacagaacgatgtaggtaaattgcaatagattttaaaagtttaaaccgttgtacctttacaaaataataataaaggcatcaagtatgtatgaaaacggtttgtctaacgccggaatgcacgaaacaatatagggatgtaattttcgcggttacgttttccgagcaaggttaatggttgacggagaaacgcgacaggaaaagacgtatgccttgaagactggggagtaaaaaaattgaaatgttccttgggcacatctgaggttgtatttaaatagaacatatatgtttgaattttgtattagatgagggacgattttttttttttaccgagagtaacgtcatgtcattttacaaccacccgggggggggtggtgggggtgtgtaatagataacgtggccgtagtaatttagacctgactatgcagacctgatactgtttatcaagtcagtctcgctgaaccatagacgcgtaggattaattagtgtacaacaataaatagaaagttcaatgttattagttctccagggctgaagaatatgtctttt
gi|20 : tggattgctttgttcatacatggtagtgctttagtagggaatataatagacagcacaattaattctctatgacgtccaattgacgtttacaaatattatccttttgtaacattagtaacatagtagcaatttatcctgcgtttgtttttatttggatatattattacacatatcgatttattttgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatGAAA-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTT-GT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAAAAGC---ATGAC-ATC-AC-AATT-GACATT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------------------------TG-A--A-----AGTGG-CAAATA--TTA--TCCCTG-----C-GTTTA--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----tt
gi|21 : AA----------AAA-AT---AAGAA-A---T--T-G-CC----------------AC-A--CG-------------GAATTCACAA----AAAA---T---ATAATATGTC---------TTC---A--T-C-A-TTAA-TTAAAG-T-TTA-C---A---TTT---------------------------TCA-T-----------------AAAAT----A---TG--T---CGCT----G-GCATTG---T---A----C-----ACCC----------------GATG------GG-GT---------G------T----AA-TAA----TAA--AGT-GT-C---C-A-TAGTAA--Ctat
gi|22 : TC---ATAAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTTTGTAATACATGTA-TTTTAAAATGATAG--AAATTAA---ATTG-A--A-----AGTGG-CGATGA--TAA--TTCCTGCGTTACGGTTTG--TTT-TTTAA----TTG---A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--TA-ATC
gi|23 : ATTAT-GACATC-AAT-ATTAATAGC---ATGAC-GCC-AT-AATT-GATACT-TTTT-G----T--A-G-CATT------------AGCT--------ATAG--GAATTGA---AATG-A--A-----AGTGG-C
gi|24 : tttcttttgaacattgtaattgtacaatcttaaagaagtgattgcatggtttC--TA---CCAAG--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TGA--C-ATAA-G-C----TA-C------T----TTA-TAT-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----TGGT-TAATT----A---CTTCTTC-G-G--GGCTGAA-AATG-AG----TCTTCATTTg
gi|25 : ccaataatataag----GGGG------GG-GG---------G------T----AA-TG-------A--AGT-G--C---C-C-TTATGA--CA--A---A--AC-TAACCT-A---AA--TGT--CGACA--CC----GCTAC----TTT--AT--TG-A-TA-AA-T-AC-C--AC--ACA--G-ATAA-G-C--------------------------------T--A-AA-A---GT-A--A--AACAGAA-TC-CAA----AGAT-CAATT----A---CTTCC
gi|26 : AAGAAAG-TAATACATGTAGCTTGATAT--CA--CGTA-G-TTTATT-GC--TTTATT---ACGAGAAAA-TTAT-GACATC-ATA-ATTTATATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GGCGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CGTT------------g
gi|27 : AAGGAAG-TGAT-----T-GCGTTGTAT--CA--CGTG-G-TTGATT-GC--TTTAGT---ACGGG-GAAATTAT-GACATC-ACA-AT----GGC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGCA-TACC-AA-GCT--A-C-ATTT------------
gi|28 : -GA-C-A-GAGAAA-CA-G-AC-A-GGAC---AA----AGAC--C-A------TATA---G--CTT----TAA-TA-TAG-GGG-ATAATGTTCATATCAAATAT---ATG-------T-AT-G-TC-TCCAA----A-A-C-AC-A--TG---------T-T-AAA-T----A----AACA---T---ATA-Ttgt
gi|29 : GTT-TACC-AA-GCT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--CA-TTAGTTCACT--A--T-----AGTAG-CAATTT--TCA--TCCCTGC------GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---ACATAAAGACATT-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--Tt
gi|3 : AAGGAAG-T-AT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG---TTTATT-GCACTTTAGT---ACGGGAAA--TTAT-GACATC-A-A-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-ACAAATTGGACGTT-TACC-AA--TTGAA-C-CT-----------------------------------TTGA---AATGAA--A-----AGTGG-CAAATA--TAA--ATCGTG-----C-GTTTT--TTT-TTTTTTTTATTG---A-----------T-ATT-A-TTATAAAA-A--CA-ATTGA--CATTTtt
gi|3 : AAC-TTG------CATG---TC-----TAAG-T-----TCAT--GA-G-ATATG---T---TA-------GAGT----AAA--------A--T-CCAC---GTT-GTAAACAAAAT--CAA-TAGA-GTT-AAAA-GTTTT-AAAAAAC---T--GTAACTTAA---------AATGAATAAA-----AATA---------ACAAACCCAATAA--C--AA----------------ATCAA-----T----A---------CA-G----A-A-AAACAACT-----TTT-G-T-C--A-AG-CA-G-A--AATGCAC-AAA-------C---A---ATTAATATA-G-G-GG-A-GC-CTTTTCGC---TCAC--TT--TCCG-AGCAAAGG-T--C--ATAA--T--G-TT-GA-C-ACGAGAAA-CG-G-AC-AAGGAC---AA-----GAC--C-ATACATGTAAT---GCCATTACGACAA--A-TAGTGGG-A-AA----------AAA-AT---ATGAA-AAGAT-ATCA-TC-TCCAA------G-C-AA-C--TG---------T-T-AAAT-----A----AACA---T---ATA-TATGTC---------TT-G--A----C-A-TTAT-TTGAAG-T-TTA-C---A---TTTTGAAT--GAGAAG-AAAAA-----AAATCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---GGCT----G-GCATTT---T---A----C-----ACCGGG---------GAGGGGGGG------GG-GG---------G------T----AA-TGA----TAA--AGT-GT-C---C-A-TTGTAA--AA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AC--CA-A-TT-AA-T-ACTC--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA-T----A------TTA-TAT-----GT--A-AA-T---AA-A--A--G--GAAA-TT-CAA----T-GT-CAATT----A---CTTTC-C-A-G--GGCTG-A-AATGTTG----TCTTCatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaacttgcatgtctaagttcatgagatatgttagagtaaaatccacgttgtaaacaaaatcaatagagttaaaagttttaaaaaactgtaacttaaaatgaataaaaataacaaacccaataacaaatcaatacagaaaaacaacttttgtcaagcagaaatgcacaaacaattaatataggggagccttttcgctcactttccgagcaaaggtcataatgttgacacgagaaacggacaaggacaagaccatacatgtaatgccattacgacaaatagtgggaaaaaaatatgaaaagatatcatctccaagcaactgttaaataaacatatatatgtcttgacattatttgaagtttacattttgaatgagaagaaaaaaaatcatttaccagagttgacgtggctggcattttacaccggggaggggggggggggtaatgataaagtgtccattgtaaaattatgaacctgactatccaaaccgatacttttaccaattaatactcgctaacataagctatattatatgtaaataaaaggaaattcaatgtcaattactttccagggctgaaatgttgtcttc
gi|30 : aaggaagtattgcgtggtatcacgtgtttattgcactttagtacgggaaattatgacatcaaattaaaatcatgacgtcacaaattggacgtttaccaattgaacctttgaaatgaaaagtggcaaatataaatcgtgcgtttttttttttttttattgatattattataaaaacaattgacatttatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnata----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--G-CA-CG-G-A--A-TGCAC-ATA-------TTTTACTTGT----ATA-G-GAG--A-GC-CTTTTCGC---TCAC--TT--TC------AAGTG-A--G--GTAA-AT--G-TT-GA-C-A-GACAAA-CA-A-AC-A-GG
gi|31 : gaA----A-G-C-AC-A--TG---------T-T-AAAT-----A----AACA---T---ACA-CATGCC---------CT-G--A--T-C-A-TTAT-TTGAAG-T-TTA-C---A---TGTGAA-T--GAGAAA-AAAAA-----A--T-----TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---AGCT----G-GCATTT---
gi|32 : TTG--A---CG--T---CGCT----G-GCATTT---T---A----C-----ACCGGGCGGGGGGAGG----GGGG------GG-GG---------G------T----AA-TAA----TAA--AGG-GC-C---C-A-TATTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----G
gi|33 : aTNG--A---CG--T---CGCT----G-TCATTT---T---A----C-----ACC------------G----GGGG------GG-GG---------T------T----AA-TG
gi|34 : aatgacagaaatgaatgtattgctgtTA-TAT-----GT--A-AA-G---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGCT-CAAT---------GT--------G-----TGGA-AATG-TG----TCTTCAT
gi|35 : --AT-GAACCT-G---AT--TAT--CCAAG--CA----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--AA--TAA--T-ATAA-G-C----Tgt
gi|36 : AGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGCAT--CA--TGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAA
gi|38 : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--TA--CGTG-G-T
gi|4 : taaaaGGAAG-GGAT-----TTGCGTGCTATTTCA--CGTGCGCTTTATT-GC--TTTAAG---ATGG-AAAAATTAG-CACATC-ACACATTAAAATC---ATGACCGTCCAC-AATT-G-CTTT-TACCCAA-GTT--A-C-ATTT------------A-CT--------ATAG--GAATTGA---AATG-G--A-----ATTGGCCAAATAATCAATTTCCCTG-----C-GTTTT--TTTATTTAT----TTGCC-ATT---------T-ATT-ACT----AAACA--CA-AGTGA--T
gi|4 : C---------ACAACACTG------CATGGTATA-----TAAG-T-----TCATTTGA---AT--GCTTT---TA-------G-ATCTTAAAA-TCCA-CGA--T-GTAA-----T----AACAAAATC-CAA-TAGA-TTTAAAAA-GTTTT-AAAAAC----T--GTACCTTAAGATATGAATAA-------A-----AATAACAACCCCCA-----------A--T--AAGAAC------------ATCAG-----T----A---------CA-GA---A-A-A--CAACT-----TTC-A-TGC--G-CC-CG-G-A--A-TGC-----------------------------A-G-G-G--A-GC-CTTTTCGC---TCAC--TTTATCCGCAGCAATGG-T--C--ATAA-AT--T-TT-GA-C-C-GAGAAA-C--G-ACAA-GGATCCAAA----AGAC--C-ATCC---TAGATTTGCCC-T----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-TT---ATGAATAAT-T-AT-A-TC-TCCAAC---A-G-C-AC----TT---------T-T-AAATA----A----AACGTACT---ATA-TATGTC----------TCGAAA--C-C-A-TTAT-TTGAAG-T-TTA-C---A---TTTG-AAT--GAGAAA-AACAA-----A--T-A-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CA--T---CGCT----G-GCATTT---T---A----C-----ACCGGGGC-------G----GGGG------AG-GG---------G------T----AA-TGA----TAA--AGT-G--C---TAA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CGAGA--CA----AATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA-C----A------ATA-TAT-----GT--A-AA-A---ATGA--A--A--GAAA-TC-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCTTC-A-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTTttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacacaacactgcatggtatataagttcatttgaatgcttttagatcttaaaatccacgatgtaataacaaaatccaatagatttaaaaagttttaaaaactgtaccttaagatatgaataaaaataacaacccccaataagaacatcagtacagaaaacaactttcatgcgcccggaatgcagggagccttttcgctcactttatccgcagcaatggtcataaattttgaccgagaaacgacaaggatccaaaagaccatcctagatttgccctcaatatgggggataaaaattatgaataattatatctccaacagcacttttaaataaaacgtactatatatgtctcgaaaccattatttgaagtttacatttgaatgagaaaaacaaatatttaccagagttgacatcgctggcattttacaccggggcgggggaggggtaatgataaagtgctaatagtaacattatgaacctgactatcgagacaaatacttttatcaattcataccgctaacataagctacaatatatgtaaaaatgaaagaaatccaatggtcaattagttcttcagggctgaaaatgtgtcttcattt
gi|5 : ggaagggatttgcgtgctatttcacgtgcgctttattgctttaagatggaaaaattagcacatcacacattaaaatcatgaccgtccacaattgcttttacccaagttacatttactataggaattgaaatggaattggccaaataatcaatttccctgcgtttttttatttatttgccatttattactaaacacaagtgatttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaTTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--GAATTGA---AATG-A--A-----AGTGG-CAAATA--TAA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATTGA--TATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-T-A--T-A--A---GTTTATAAAGAAAAT--CAA-TAGA-TT----AA-GTTTTTAAAAACTGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA---------A-----------A--T--AA----------------ATCAA-----T----A---------CA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-AC-TTTTTCGT---TCAC--TT--TCCG-AGCAATGT-ACAT--GTAA-AT--G-TT-CA-C-A-GAGAAA-CG-G-AC-A-AGAC---AA----AGAC--C-ATACATGTATA---GCCCTT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA-A---T-AT-G-TC-TCCAA----A-G-C-AC-A--TG---------T-T-AAATT----A----AACA---T---ATA-TATGTC---------TTTG--A--T-C-A-TATT-TTCAAG-T-TTA-C---A---TTTGAAAT--GAGAAG-AAAAA-----A--TCACC-TT--------AC--C-AGAGTTA--A---CG--T---CGCT----G-GCATTT---T---G----T-----ACCCGG---------G----AGGG------GG-GG---------G------T-----A-TGA---TTAA--AGT-G--C---C-A-TAGCAA--CA--T---T--AT-GAACC--G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G------TA-C----ATT----TTA-TAT-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATT-TG----TCTTCATTT
gi|6 : GAAGCTGAT-----T--CGTGGTAT--CA---GTG-G-TTTATTAGC--TTTAGTTTTACGGCGAAAATTAT--ACATCCACA-ATTAATAT------GAC-GTC-A--AATT-GACGTTGTACC-AGCGTT--A-C-CTT-------------G-CT--------A-----ATATTTA---GATA-ACTAT----AGTAG-CCTTTT--AAA--TCCCTGC------GTTTGCCTTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT---------------------------CTTTGTTATAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC-T-G------CAT-----A-----TA-G-CA----TCAT--GA-G-AT--G---C---TACATGTAGG-GA----AAA-TCTA-C-GATT-ACAA---GAC-G-AAGGAAAATT-CAACTAGACTTT-AAAA-GTTT----AAACCGTTT--GTACCT-AC---------AA-------A-----AATA---------A-----------T--T--AACA--------------ATCAA-----T----A---------TA-GCCGAA-A-A--CGGCT-----TTT-GCT-C--A-CC-CG-G-A--A-TGC-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GTTCTTTTCGC---TTAC--TT--TCCG-AGCCAAGC-------GTAAGAT----TT-GA-CCG-GAGAAA-CG-G-AC-A-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-AA-TGG-GGG---------------AAA-AT---A-GAA-A---T-AT-G-TC-TCCTT----G-GCC-AC-ACTTA---------T-T-AAA-T----A----AACA---T---ATA-T-------------------------------GT-TTGAAG-T-TTA-T---A---TT--AAATGCGAGAAC-AAAAA-----A---CA---TT--------AT--C-CGAGTTA--A---CG--T---CAAT----G-TCATTT---T---A----C-----ACCCGG---------G----GGGGA-----GG-GG---------G------T----AA-TGA----TAA--AGT-GA-C---C-G-TA-TAA--CATTT---T--AT--AACCT-G---AC--TATCCCCAAA---C----GGTAC----TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-T--GC--TAA--C-ATAA-GCC----TA-C----A------TTA-TAT-----GCTAA-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGTGTAATT----A---G-TTCCC-A-GC-GGCTAAA-AATA-TG----TCT
gi|7 : AAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-AT----AAAATCCA-C-G-----------ATT-GTAAAGAAAAT--CAA-TAGA-TT--AAAA-GTATT-AAAAAC----T--GTACCTTAA---------AA-------ATGAATAATA---------A-----------A--T--AACACCCCAAATAACAAAATCAG-----T----A---------CA-G----A-A-AA-CAACT-----TTT-G-T-C--C-CA-CG-G-A--A-TGCA------------------------------G-G-G--A-GC-CTTTTCGC---TCAC--TT--TCCG-AGCAAGGT-A--T----AA-AT--T-TT-GA-C-C-GAGAAA-CG-G-AC-A-GGAC---AA----AGACATC--TAGATGTATA----CCCTT----CAAATA-TGG-G----TAA----------A----T---ATGAA-A---T-AT-A-TC-TCCAA----A-G-C-AC-A--TG---------T-T-AAAT-----A----AACA---T---ATA-TATGTC---------T--G--A--C-C-A-TTAT-TTGAAG-T-TTA-C---A---TTTGAA-T--GA-AAG-AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----T-TCATTT---T---G----C-----ACCGGG---------GAGA-GGGG------GG-GG---------G------TA---AA-TGA----TAA--AGT-GT-C---C-A-TAGT-A--CA--T---T--AT-GAA-CT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--ATCACA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--A-ATAA-G-C----TA-T----A------TTA-TAT-----GTA-A-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A----CTTCTC-C-A--GGCTGAA-AATG-TG----TCTT-ATTatta
gi|8 : aa-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--------------------ATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA----------------------------------------AG--AAATTGA---AATG-A--A-----AATGG-CAATTA--TAA--TCCCTGT----G-GTT-G--TCT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-ATACA-ATTGAACTATTTGTTGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGCATAGTATAAT-TTG------TATG---T-----------T-----TCAT--GA-A-AT--G---T---TA-------GTGT----AA--TCC-------T-ATGA----TT-GTAAGGAGAATT-AAG-TAGA-TTG-AAAAAGTTT-----AACCGTTT---TAGGCTAA---------AA-------T-----AA-A---------A-----------A-----AA----------------ACCAA-----T----AACAAAGAAACA-G----A-A-AA-CAACT-----TT--G-T-C--A--A-CG-G-A--A-TGC-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATGC-CTTTTCAC---TCAC--TT--TCC---GCAA----A--T--GTAA-ATTCG--T-GACC-A-GAGAAA------AC-A-GGAC---AG----A-----C-AAACCT-TATA---ATACTT----CAA-T------GGG-ATAA----------AAATTT---AT--A-A---T-AT-G-TC-TCC-A----A-G-C-AC-A--TG---------T-T-AAA
gi|9 : agAA-----T----A---------CAAG----A-A-AACCAACT-----TTT-G-T-C--AGCATCGTG-A--A-T-CAC-A------------------------------------GC-CTTTACGC---T-AC--TG--TTTG-AGCGAAGT-A-------AT-AT--G-TT-GA-C---GAGAAAGCG-GTAC-A-G-AC---AGTAATATAT--C-A-ACATGGA-----GCC-TT----CAA-TA-TGG-GGG-AT-A----------GAA-AT---ATAAA-A-----ATGG-TC-TCCAA----ATT-C-AC-A--CG---------T-TAAAACT----A----AACA---TACAATA-TATG-C---------TTTGGAA--TGC-A-TTAT-TTGAGT-T-TTA-CAATA---TTTCA------AGAAGAAAAAA-----A--TAA-TATT--------AC--C-AAGTTTG--A---AG--T---CGCT----G-GCATTT---TTGCC----C-----ACCTGG---------G----GAGGGGT---GG-GG---------G------T----AATTGA---TCTA--AGT-G--C---C-GCTAGT-A--CA--T---TTAAT-GCACCTGG---GC--TAT---CAAA--GC----GATAC-T--TCTTGAT--CA-A-TCAAA-T-ACTC--GCTGTAA--C---GA-G-C-----A-C-----TT----CTA-TGT-----GT--A-AA-ATGTAG-A--A--A--GAAATTT-CAAATAGTGGT-CAATT----ATACTTTTCTC-C----GGCTG---AATG-TGA---TCTTCATg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTCTTTATAAATAATTATGATTTTGCAATTTTTTAAATAACTTAAAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 4444444444444444444444444444444 11111 2222222 333333333333333 11 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 11111 222222222 555555555555555555555555555555555555555555 11 11 1111 111 111111111 2222222222222 777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222 1111 11 11111111111111111111111 33333333333333333 444444444444444 222222222222222 1111111 111 44444444444444 111 1 1111111111111111111111111 11111 1111111111111111111 111111 111111 22 1111 3333333333333333333 1 111111
lowQualScore : 3 77777 5 33 33 2 2 3 44 555 1 5 3 3 3 1 555 2 2 2 2 2 2 55 33 2 2 4444444444444444444444444444444 1 0 888 1 33 44 00000 44 1 3 44 9999999 555 6 7777 000000000000000 3 3 3 7777 3 55 4 33 22 1 1 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 222222 777 11111 000000000 66 666 66 9999999 222222222222222222222222222222222222222222 0 0 33 4 8 11 4 7777 000 66 0 333333333 0000000000000 111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333 3 2222 6 3 44 0 77777 3 3 3 44 3 6 3 3 44 3 3 77777777777777777777777 3 3 3 77 6 3 6 999 77 44 3 77777777777777777 6 555 5 99 2 2 2 5 555 77777 33 2 777777777777777 6666 2 2 2 333333333333333 66 444 11 33 55555 2 5 2 9999999 2 2 33 55555 2 2 2 7777777 6666 555 3 000 6 2 22222222222222 3 3 555 3 2 2 2 000 22 0 33 444 8888888888888888888888888 33 2 33 444 55 444 5555 444 66666 11111 8888888888888888888 777 000000 5555 66666 222222 7777 2 2 7777 2 2 33 2 00 444 5 1 33 66 444 33 2 2 444 33 55 33 7777 1111 33 33 2 5 2 2 2 5 33 33 33 2 2 2 6666666666666666666 33 88888 55 7 5 666 2 0 33 33 88 7 2 8888 2 5555 9999 444444 0 2 2 8888
lowQualScore : . ..... . .. .. . . . .. ... . . . . . . ... . . . . . . .. .. . . ............................... . . ... . .. .. ..... .. . . .. ....... ... . .... ............... . . . .... . .. . .. .. . . .......................................................................... . ...... ... ..... ......... .. ... .. ....... .......................................... . . .. . . .. . .... ... .. . ......... ............. .......................................... ............... . .... . . .. . ..... . . . .. . . . . .. . . ....................... . . . .. . . . ... .. .. . ................. . ... . .. . . . . ... ..... .. . ............... .... . . . ............... .. ... .. .. ..... . . . ....... . . .. ..... . . . ....... .... ... . ... . . .............. . . ... . . . . ... .. . .. ... ......................... .. . .. ... .. ... .... ... ..... ..... ................... ... ...... .... ..... ...... .... . . .... . . .. . .. ... . . .. .. ... .. . . ... .. .. .. .... .... .. .. . . . . . . .. .. .. . . . ................... .. ..... .. . . ... . . .. .. .. . . .... . .... .... ...... . . . ....
lowQualScore : 3 11111 7 99 99 9 9 1 22 444 2 3 1 1 1 0 000 9 9 9 9 7 7 88 77 7 7 3333333333333333333333333333333 6 2 555 6 99 22 88888 22 6 3 66 3333333 000 7 1111 222222222222222 3 3 3 1111 6 00 4 88 00 0 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 888888 888 11111 000000000 11 222 11 9999999 000000000000000000000000000000000000000000 8 9 44 4 9 99 4 8888 111 11 2 333333333 7777777777777 222222222222222222222222222222222222222222 888888888888888 3 7777 2 1 66 2 77777 1 1 1 22 1 2 1 1 22 1 1 11111111111111111111111 1 1 1 33 2 1 2 666 33 22 1 33333333333333333 2 888 7 99 9 9 9 7 000 66666 99 9 666666666666666 1111 9 9 9 333333333333333 33 777 88 77 55555 5 0 5 7777777 4 4 22 99999 4 4 4 3333333 5555 444 1 888 2 4 00000000000000 1 1 444 1 9 9 9 000 66 2 99 999 9999999999999999999999999 77 7 22 111 66 111 0000 111 88888 22222 4444444444444444444 444 000000 0000 22222 555555 8888 5 5 8888 5 5 44 5 99 444 0 4 44 33 777 44 5 5 444 22 66 22 4444 1111 44 44 5 0 5 5 5 0 44 44 44 5 5 5 6666666666666666666 44 88888 99 5 0 999 5 0 44 44 44 5 5 3333 7 7777 1111 222222 1 9 9 9999
consensus : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA---AATG-A--A-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---GTT-GTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-GTTTT-AAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCA-----A--G-GT----GTAA-AT--GTTGA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--CG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA---------CA--TTAT--AT-----GT--A-AA-A---A-T-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
Reference ( family-68 ) : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA---AATG-A--A-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---GTT-GTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-GTTTT-AAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCA-----A--G-GNA---GTAA-AT--GTTGA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--CG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA---------CA-TTTAT--AT-----GT--A-AA-A---A-T-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
gi|1 : GGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GATGCT-TACC-TA-GTT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--CAA---A---AGTT-A--ACCTTTAGAGGC--AATTTT-AA--TCCCTG-----A-GTTTG--CTTATTTAA----TTG---GATAT-------T-ATT-A-T----AAA-A--C
gi|1 : ---------ATAAC-TTGAAACTACATA---CA-----TA-G-A-----TCAT--GACGCAT--G---C---TAC------G-GT----AAAATCTA-C-AAGT-ACAA---GT----AACGAACTTT-CAA--AGA-TTA-TAAA-GTTTT-AAA--CCGCTTCTGTACCTTTA---------AACAC----A-----AATAGACCA-----------A--T--A--ACA--------------ATCGA-----TTGTC-----ACA-GG---A-A-A--AAACTGGCTATTTAG-T-C--A-CC-CG-G-ACAA-TGCGC-AAAAACAAAAT---A---AT----AGA-G-G-A--A-G-CACTTTTCTCACATCACC-TTT--CCG-AGCACGGACATCG-GCA---ATTA-AT---TAGA-C--GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---CA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-TT-TGG-GGG----A----------AAA-ATTCAATGAA--A---TAAT-GATC-TCCAATTACGG-C-AC-A--T-----GT-CAA-AA-AT----ACAACAAT---AT-A---TA-CATGTCAC--TGTCATGCTT-C-A-TTATATT-TTGAAGATATTA-CAAATCCTG-AAT--TAG-AG--AAAAG-----C--CTA-T-T----------C--C-AGG--TG--G---CGT-T---CGCT----GTTCTTT---T-----TA-----CT-GTGGGTGAG---------GG---AGGG------G----GGG-----GTGAT--T----AA-T-GA----TCA-A--AGT-GA-C---CG-CCCTAA--CAT-T---T--AT-GAACCT-GGTAACAATAT--CCAAA--CCTAAAAATAT-TTCTTT--AT--CA-AGTC-AA-TGAC-T--GC--TAA--CAATAA-G-C----TA---------CA--TTAT--ATG----GT--AGAA-A---A-TAA--A--A--GAAAGTT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCGTC-C-AGCGGCTGAA-CCTG-TG----TCTTTAccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgaaactacatacatagatcatgacgcatgctacggtaaaatctacaagtacaagtaacgaactttcaaagattataaagttttaaaccgcttctgtacctttaaacacaaatagaccaataacaatcgattgtcacaggaaaaaactggctatttagtcacccggacaatgcgcaaaaacaaaataatagaggaagcacttttctcacatcacctttccgagcacggacatcggcaattaattagacgagaaacggacaggaccaagaccatatgcccttcaatttgggggaaaaattcaatgaaataatgatctccaattacggcacatgtcaaaaatacaacaatatatacatgtcactgtcatgcttcattatattttgaagatattacaaatcctgaattagagaaaagcctattccaggtggcgttcgctgttctttttactgtgggtgagggaggggggggtgattaatgatcaaagtgaccgccctaacatttatgaacctggtaacaatatccaaacctaaaaatatttctttatcaagtcaatgactgctaacaataagctacattatatggtagaaaataaaagaaagttcaatggtcaattagttcgtccagcggctgaacctgtgtctttaat
gi|10 : ggaagtgattgcgtggtatcacgtggtttattgctttagtacgggaaaattatgacatcacaattaatatcatgacgtcacaattgatgcttacctagttaccttttgtaacaaaagttaacctttagaggcaattttaatccctgagtttgcttatttaattggatattattataaaacccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAC-TTG------CATG---TAACTTATA-GAT-----TCAG--GA-G-AT--G---T---CG-------C-GA----CAT-TCTA-A-A--T-A-------TT-ACAAGGTAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA------------CCGTTT--GTACCTT-A---------AA-------A-----AATA----AG----------A--T--A--A----------------at
gi|10 : TAA---------AA-------G-----AACA----C-----------A--TCAA--A----------------ACCAA-----T---------ACA-G----AGA-A--CAA-T-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-GTA--A-TGCAC-AA--------C---A---AT----ATA-G-G-GGGA-G-C-CTTTTC-----TCAC--TTT--CCG-AGCA-----A--G-GT-------A-AT--GTTGA-CC-GAGAAA-CG-G--CA-GGAC---AA----------T-ACTC---ATGT-TA----TT----CAA-TA-TGG-GGGTAT-------------AA-AT---ATG-A--A---T--T-G-TC-TCCAA----AG-CAAC-A--T-----GT-T-A-AG-TT----caaagtaaaataaataataataataataaaagaacacatcaaaaccaatacagagaacaattttgttacacggtaatgcacaacaatatagggggagccttttctcactttccgagcaaggtaatgttgaccgagaaacggcaggacaatactcatgttattcaatatgggggtataaatatgaattgtctccaaagcaacatgttaagtt
gi|11 : acttgcatgtaacttatagattcaggagatgtcgcgacattctaaatattacaaggtaaattcaatagatttaaaaccgtttgtaccttaaaaaataagataacaaagtaaaataaataataataataaGAC---AA----AGAC--CTATTG---ATG-------CTT------A-TA-TGG-GG---T------------------------AA--A---T-AT-G-TC-T-CAA----A-------A--T-----GT-T-A-AA-T----------AAC---ATGA---TA-TA-GTCTT---G--A----T-CAA-TTA---T-TTGGAG-T-TTG-CA---TTTG--AT--GAGAAG-----AA-----A--TCA-A-T----------C--C-AG-GT----A---CG--T---CGCTAATAGGCAAAA---T---G-CA-----C----------G---------GG---GGGG------T----TGA-----T------T----AA-T-------T-A-A--AGT-GCCC---CA-TTGTAA--CT--C---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCA-----C----GATAC----TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-A--C--GC--T-A--C--TAA-G-C----TA---------AC-GTTAT--AC-----GT--ACAATA---A-T-A--A--A--GAAA-TTGCAA----TGGT-CA--T----A---GTT--TC-C-G--G--TAGA-AATG-TG----
gi|12 : -AT-A-TC-TTCAA----AC-C-AT-A--A-----ACAT-A-GA-GT----A----TAT---GT-A---TAATATGTCTTGAC---A----T-C-A-TTA---C-TTGAAG-T-TTG-CG---TTAGAAAT--TATAA---ATAAG-----A--T-A-T-CT---------C--C-AGAATTG--A---CGATC---CGTT----GG-A----------A-CA-----TC-----------------------------------------------G------T----AA---------------------------CA-TAACAA--C----------CT-GAA---------C--TAT--CC-AA--TC----GATACTT--TTT--AT--C--A-TC-AA---A--C--AC--TAA--C-ATAA-T-C----TA---------CA--TTAT--AT-----GT--A-AA-A---T-A-A--A--A--GAAA-TC-CAAT---TAG---AATT----A----CTTCTCAG-G--GGTTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTcatta
gi|13 : aatggataaga--A----T-C-AATTG---TATTAAAG-T-TAAACA---TTTGAA-T--GAGA-----------------TTT-T-TT--------TC--T-AAACATA--AGTGCG--T---CGT------GCGTTT---A---AACA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----GGTGGGTTGGAAAA-T-GA----T-A-A---GT-C--C---CA-TA-TAA---A--T---T--ATTGAACTT-----AC--TAT--CCAAA--CC-----ATACGT--TTT--AT--CA-G-TC-AA-T-AC---------AA--C-ATAA-G-CA---TA---------CC-TTT-----T-----GT--A-AA-A---AAT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATTATTAA---ATTTCTC-C-AT-GCCTGAA-AATG-CGTCGATCTTCATTT
gi|14 : G-T-ATA-CA---TTTGGAAT--GAAAAG--AAAAA-----AAATCA-T-TTGTTGGTTTACAAC-AGAATTCTTA---TG--TTACCGCG----GGCATTTCTGT---C-TA-----CC-G-------G---------GG---AGGGCGTGGGG----GAG-----G------T----AA-T-TAATTTT-A-AGTAGT-G--ATGGCA-TTGTATGTCA--TCTTT--AT-GAACCT-G---AA--TATG-CTAAAACCC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-CCTAC--TGA--C-ATCATG-CCCAATATAATGATTTTA-CTTAT--GT-----GT--A-GA-A---A-T-AACA--A--TAAA-TT-
gi|15 : TAA---------AA-------G-----AACA----AC----------A--TC-A--A----------------AACAA-----T---------ACA-G----AGA-A--CAATT-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATAGG-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCA-----A--G-------GTAA-AT--GTTGA-CC-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----------T-ACTC---ATGT-TA----TT----CAA-TA-TGG-GGG-GT--------------A-AT---AT------------T-G-TCTTCCAA----AG-C-AA-A--T-----GT-T-A-A
gi|16 : ttaaaaaataagataacaaagtaaaataataataataataa--AAAAA-----A--T-A-T-TT--------AT--C-AGAGTTG--A---CG--T---CACT----GGCACTT---T---A-CAC----CC-G-------G---------GG---AGGA------G----GGT-----G------T----AA-T-GA----T-G-A--AGT-GC-C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACTT-G---AC--TAT--CCAAA--TC------TAC-T--TTT--AT--CACA-CC-AATT-GC-T--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA---------C---TTAT--ACTGGGGGT--A-AA-AT--A-T-A--A--A--AAAA-TT-CAA----CG---CAATT----A---GTTTCTT-C-A--GGCTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTg
gi|17 : ---------AA-------A-----AACA----A-----------AACC--A--A----------------AACAA---------------ACA-G----A-AGA--CAATG-----TTT-G-T-C--A-CA-CA-G-A--A-TACAC-AAA-------C---A---AT----ATA-GAG-G--A-G-A-CTTTTTGC---TCAC--TTT--CCG-AGCA-----T--G-G------TAA-AA--GTTAA-CA-GATAAA-TG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-TA--GG-GGG-AT------------AAA-AT---ATCAA--A---T-AT-G-TT-TCCAA----CG-G-ACTA--T-----GT-T-A-AA-T
gi|18 : aaccAAG-TGAG-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGGAAAATTAT-GACATC-ACA-A-TAAAACT---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-C---------ATAGAAGAATTGAC--AATG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTG---A-----------TGATTAA-T----AAA-A--acc
gi|19 : AG-TTAT-----T-GCGTGATAT--CA--CGCG-A-TTTATC-GC--TTTAGT---ACGGGGAGAGT-AT-GAACTC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GCC-AC-AATT-AACTTT-TACC-AA-ACT--A-CTTTTT------------G-TT--------ATAT--TAGCTCT---A--G-A--A-----ATTG------TTAT-AA--TCCCTG-----C-GTTTG--TTT-C--------------A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--CA-ATCAA--Taacccaatt
gi|2 : GAT-----T-GCTTTGT-T--CATACATG-G-T--AGT-GC--TTTAGT---A--GGGAATATAATAGACAGC-ACA-ATTAAT-TCTCTATGAC-GTC--C-AATT-GACGTT-TACA-AATATT--ATC-CTTT---------------T--------GTAA--CATTAGT---AAC--A--T-----AGTAGC--AATT-T-A----TCCTG-----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTGGATA-----------T-ATT-A-T----TAC-A--CATATCGATTTATTTtaagt
gi|2 : tg---------ATTAC-TTG------TCTA---TA-----TA-T-TATGAGTCAT--GA-G--T--G---TAATTA-------G-GCTA--AAA-TCTAAC-A--TTACAGAACGAT-GTA-GGTAAATTGCAA-TAGATTTT-AAAA-GTTT----AAACCG-TT--GTACCTTTA---------CA-------A-----AATAAT--A-----------A--T--A--AAGGC------------ATCAAGTATGT---------ATG-A----A-A-A--CGG-------TTT-G-T-CTAA-CGCCG-G-A--A-TGCACGAAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATG-TAATTTTCGCGG-TTACGTTTT--CCG-AGCA-----A--G-GT-----TAA-TG--GTTGA-CG-GAGAAA-CGCG-ACA-GGA----AA----AGAC-------------GTATG--CCTT----GAA-GACTGG-GGA-GTAA----------AAA-AA---TTGAA--A---T-GT-T-CC-TT--G----GG-C-AC-A--TCTGAGGT-T-GTAT-TT----A----AATAGAAC-A---TA-TATG---------------------------T-TTGAAT-T-TTG-TA---TT--AGAT--GAG--G--GACGATTTTTT--TTT-T-TT--------AC--CGAGAG-TA--A---CG--T---CA-T----GTCATTT---T---A-CAACCACCC-G-------G---------GG---GGGG------GTGGTGGGGGTGTG------T----AA-TAGA----T-A-A--CGTGG--C---CG-TAGTA----A--T---T---T-AGACCT-G---AC--TAT--GCAGA--CCT---GATAC-TG-TTT--AT--CA-AGTC-AG-T-CT-C--GC--TGAACC-ATAG-A-CGCG-TAG--------GA-TTAATTAGT-----GT--ACAACA---A-T-A--AATA--GAAAGTT-CAA----TGTT---ATT----A---G-TTCTC-CAG--GGCTGAAGAATA-TG----TCTTtgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatattacttgtctatatattatgagtcatgagtgtaattaggctaaaatctaacattacagaacgatgtaggtaaattgcaatagattttaaaagtttaaaccgttgtacctttacaaaataataataaaggcatcaagtatgtatgaaaacggtttgtctaacgccggaatgcacgaaacaatatagggatgtaattttcgcggttacgttttccgagcaaggttaatggttgacggagaaacgcgacaggaaaagacgtatgccttgaagactggggagtaaaaaaattgaaatgttccttgggcacatctgaggttgtatttaaatagaacatatatgtttgaattttgtattagatgagggacgattttttttttttaccgagagtaacgtcatgtcattttacaaccacccgggggggggtggtgggggtgtgtaatagataacgtggccgtagtaatttagacctgactatgcagacctgatactgtttatcaagtcagtctcgctgaaccatagacgcgtaggattaattagtgtacaacaataaatagaaagttcaatgttattagttctccagggctgaagaatatgtctttt
gi|20 : tggattgctttgttcatacatggtagtgctttagtagggaatataatagacagcacaattaattctctatgacgtccaattgacgtttacaaatattatccttttgtaacattagtaacatagtagcaatttatcctgcgtttgtttttatttggatatattattacacatatcgatttattttgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatGAAA-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTT-GT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAAAAGC---ATGAC-ATC-AC-AATT-GACATT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------------------------TG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-TA--TCCCTG-----C-GTTTA--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----tt
gi|21 : AA----------AAA-AT---AAGAA--A---T--T-G-CC---------------AC-A--C-----G----G-AA-TTCACAA----AAA---AT-A---TAATATGTCTT--C---A----T-C-A-TTA---A-TTAAAG-T-TTA-CA---TTT----------------------------TCA-T-----------------AAAAT----A---TG--T---CGCT----GGCATTG---T---A-CA-----CC--------------------C---GATG------G----GGT-----G------T----AA-T-AA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TAGTAA--Ctat
gi|22 : TC---ATAAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTTTGTAATACATGTA-TTTTAAAATGATAG--AAATTAA---ATTG-A--A-----AGTGGC--GATGAT-AA--TTCCTGCGTTACGGTTTG--TTT-TTTAA----TTG---A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--TA-ATC
gi|23 : ATTAT-GACATC-AAT-ATTAATAGC---ATGAC-GCC-AT-AATT-GATACT-TTTT-G----T--A-G-CATT------------AGCT--------ATAG--GAATTGA---AATG-A--A-----AGTGGC--
gi|24 : tttcttttgaacattgtaattgtacaatcttaaagaagtgattgcatggtttC--TA---CCAAG--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TGA--C-ATAA-G-C----TA---------C--TTTAT--AT-----GT--A-AA-A---A-T-A--A--A--AAAA-TT-CAA----TGGT-TAATT----A---CTTCTTC-G-G--GGCTGAA-AATG-AG----TCTTCATTTg
gi|25 : ccaataatataag---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA-----------AGT-G--C---CC-TTATGA--CA--A---A--AC-TAACCT-A---AA--TGT--CGACA--CC----GCTAC----TTT--AT--TG-A-TA-AA-T-AC-C--AC--ACA--G-ATAA-G-C---------------------------------T--A-AA-A---G-T-A--A--AACAGAA-TC-CAA----AGAT-CAATT----A---CTTCC
gi|26 : AAGAAAG-TAATACATGTAGCTTGATAT--CA--CGTA-G-TTTATT-GC--TTTATT---ACGAGAAAA-TTAT-GACATC-ATA-ATTTATATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GGCGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CGTT------------g
gi|27 : AAGGAAG-TGAT-----T-GCGTTGTAT--CA--CGTG-G-TTGATT-GC--TTTAGT---ACGGG-GAAATTAT-GACATC-AC-----AATGGC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGCA-TACC-AA-GCT--A-C-ATTT------------
gi|28 : GA-CA-GAGAAA-CA-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-A---------TATAG--CTT----TAA-TA-TAG-GGG-ATAATGTTCATATCAAATAT---ATG--------T-AT-G-TC-TCCAA----AA-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA--T----A----AAC---AT-A---TA-Ttgt
gi|29 : GTT-TACC-AA-GCT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--CA-TTAGTTCACT--A--T-----AGTAGC--AATTTT-CA--TCCCTGC------GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---ACATAAAGACATT-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--Tt
gi|3 : AAGGAAG-T-AT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG---TTTATT-GCACTTTAGT---ACGGGAAA--TTAT-GACATC-A-A-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-ACAAATTGGACGTT-TACC-AA--TTGAA-C-CT-----------------------------------TTGA---AATGAA--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--ATCGTG-----C-GTTTT--TTT-TTTTTTTTATTG---A-----------T-ATT-A-TTATAAAA-A--CA-ATTGA--CATTTtt
gi|3 : AAC-TTG------CATG---TC-----TAAG-T-----TCAT--GA-G-ATATG---T---TA-------GAGT----AAA--------A--T-CCAC---GTT-GTAAACAAAAT--CAA-TAGA-GTT-AAAA-GTTTT-AAAAAAC---T--GTAACTTAA---------AATGAATAAA-----AATA----ACAAACCCAATAA--C--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-AAACAACT-----TTT-G-T-C--A-AG-CA-G-A--AATGCAC-AAA-------C---A---ATTAATATA-G-G-GG-A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCA-----AA-G-GTC---ATAA--T--GTTGA-CACGAGAAA-CG-G-ACAAGGAC---AA-----GAC--C-ATAC---ATGTAATGCCATTACGACAA--A-TAGTGGG-A-AA----------AAA-AT---ATGAA--AAGAT-ATCA-TC-TCCAA-----G-C-AA-C--T-----GT-T-A-AA-T-----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT---G--A------C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTTGAAT--GAGAAGAAAAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---GGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-GGGGA---G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TTGTAA--AA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AC--CA-A-TT-AA-T-ACTC--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA---------TA--TTAT--AT-----GT--A-AA-T---A-A-A--A--G--GAAA-TT-CAA----T-GT-CAATT----A---CTTTC-C-A-G--GGCTG-A-AATGTTG----TCTTCatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaacttgcatgtctaagttcatgagatatgttagagtaaaatccacgttgtaaacaaaatcaatagagttaaaagttttaaaaaactgtaacttaaaatgaataaaaataacaaacccaataacaaatcaatacagaaaaacaacttttgtcaagcagaaatgcacaaacaattaatataggggagccttttcgctcactttccgagcaaaggtcataatgttgacacgagaaacggacaaggacaagaccatacatgtaatgccattacgacaaatagtgggaaaaaaatatgaaaagatatcatctccaagcaactgttaaataaacatatatatgtcttgacattatttgaagtttacattttgaatgagaagaaaaaaaatcatttaccagagttgacgtggctggcattttacaccggggaggggggggggggtaatgataaagtgtccattgtaaaattatgaacctgactatccaaaccgatacttttaccaattaatactcgctaacataagctatattatatgtaaataaaaggaaattcaatgtcaattactttccagggctgaaatgttgtcttc
gi|30 : aaggaagtattgcgtggtatcacgtgtttattgcactttagtacgggaaattatgacatcaaattaaaatcatgacgtcacaaattggacgtttaccaattgaacctttgaaatgaaaagtggcaaatataaatcgtgcgtttttttttttttttattgatattattataaaaacaattgacatttatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnata----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--G-CA-CG-G-A--A-TGCAC-ATA-------TTTTACTTGT----ATA-G-GAG--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--C------A-----A--GTGAG---GTAA-AT--GTTGA-CA-GACAAA-CA-A-ACA-GG
gi|31 : gaA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-T-----A----AAC---AT-A---CA-CATGCCCT---G--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TGTGAA-T--GAGAAA--AAAAA-----A--T-----TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---AGCT----GGCATTT---
gi|32 : TTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------GGCGGGGGGAGG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-AA----T-A-A--AGG-GC-C---CA-TATTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----G
gi|33 : aTNG--A---CG--T---CGCT----GTCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----
gi|34 : aatgacagaaatgaatgtattgctgtTAT--AT-----GT--A-AA-G---A-T-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGCT-CAAT---------GT--------G-----TGGA-AATG-TG----TCTTCATttaatg
gi|35 : --AT-GAACCT-G---AT--TAT--CCAAG--CA----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--AA--TAA--T-ATAA-G-C----Tgt
gi|36 : AGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGCAT--CA--TGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAA
gi|38 : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--TA--CGTG-G-T
gi|4 : taaaaGGAAG-GGAT-----TTGCGTGCTATTTCA--CGTGCGCTTTATT-GC--TTTAAG---ATGG-AAAAATTAG-CACATC-ACACATTAAAATC---ATGACCGTCCAC-AATT-G-CTTT-TACCCAA-GTT--A-C-ATTT------------A-CT--------ATAG--GAATTGA---AATG-G--A-----ATTGGCCAAATAATCAATTTCCCTG-----C-GTTTT--TTTATTTAT----TTGCC-ATT---------T-ATT-ACT----AAACA--CA-AGTGA--T
gi|4 : C---------ACAACACTG------CATGGTATA-----TAAG-T-----TCATTTGA---AT--GCTTT---TA-------G-ATCTTAAAA-TCCA-CGA--T-GTAA--------TAAC-AAAATC-CAA-TAGA-TTT-AAAAAGTTTT-AAAAAC----T--GTACCTTAAGATATGAATAA-------A-----AATA----ACAACCCCCA--A--T--A--AGAAC------------ATCAG-----T---------ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTC-A-TGC--G-CC-CG-G-A--A-TGCA------------------------------G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTTATCCGCAGCA-----AT-G-GTC---ATAA-AT--TTTGA-CC-GAGAAA-CG---ACAAGGATCCAAA----AGAC--C-ATCCTAGATTT---GCCCT-----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-TT---ATGAATAA---TTAT-A-TC-TCCAAC---AG-C-AC----T-----TT-T-A-AA-TA----A----AAC---GT-ACTATA-TATGTCT---CG--AAA--C-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAA-T--GAGAAA--AACAA-----A--T-A-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CA--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GGCG-GGGG------A----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---TAATAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CGAGA--CA----AATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----TA---------CA--ATAT--AT-----GT--A-AA-A---A-TGA--A--A--GAAA-TC-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCTTC-A-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTTttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacacaacactgcatggtatataagttcatttgaatgcttttagatcttaaaatccacgatgtaataacaaaatccaatagatttaaaaagttttaaaaactgtaccttaagatatgaataaaaataacaacccccaataagaacatcagtacagaaaacaactttcatgcgcccggaatgcagggagccttttcgctcactttatccgcagcaatggtcataaattttgaccgagaaacgacaaggatccaaaagaccatcctagatttgccctcaatatgggggataaaaattatgaataattatatctccaacagcacttttaaataaaacgtactatatatgtctcgaaaccattatttgaagtttacatttgaatgagaaaaacaaatatttaccagagttgacatcgctggcattttacaccggggcgggggaggggtaatgataaagtgctaatagtaacattatgaacctgactatcgagacaaatacttttatcaattcataccgctaacataagctacaatatatgtaaaaatgaaagaaatccaatggtcaattagttcttcagggctgaaaatgtgtcttcattt
gi|5 : ggaagggatttgcgtgctatttcacgtgcgctttattgctttaagatggaaaaattagcacatcacacattaaaatcatgaccgtccacaattgcttttacccaagttacatttactataggaattgaaatggaattggccaaataatcaatttccctgcgtttttttatttatttgccatttattactaaacacaagtgatttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaTTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--GAATTGA---AATG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATTGA--TATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-T-A--T-A--A---GTTTATAAAGAAAAT--CAA-TAGA-TT----AA-GTTTTTAAAAACTGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-A-C-TTTTTCGT---TCAC--TTT--CCG-AGCA-----A--T-GTACATGTAA-AT--GTTCA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-AGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--TG--A----T-C-A-TAT---T-TTCAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCACC-TT--------AC--C-AGAGTTA--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---G-TA-----CC-C-------G---------GG---AGGG------G----GGG-----G------T-----A-T-GAT---T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGCAA--CA--T---T--AT-GAACC--G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G------TA---------CATTTTAT--AT-----GT--A-AA-A---A-T-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATT-TG----TCTTCATTT
gi|6 : GAAGCTGAT-----T--CGTGGTAT--CA---GTG-G-TTTATTAGC--TTTAGTTTTACGGCGAAAATTAT--ACATCCACA-ATTAATAT------GAC-GTC-A--AATT-GACGTTGTACC-AGCGTT--A-C-CTT-------------G-CT--------A-----ATATTTA---GATA-ACTAT----AGTAGC--CTTTTA-AA--TCCCTGC------GTTTGCCTTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT---------------------------CTTTGTTATAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC--TG------CA-----TA-----TA-G-CA----TCAT--GA-G-AT--G---C---TACATGTAGG-GA----AAA-TCTA-C-GATT-ACAA---GAC-G-AAGGAAAATT-CAACTAGACTTT-AAAA-GTTT----AAACCGTTT--GTACC-TAC---------AA-------A-----AATA----A-----------T--T--AACA----------------ATCAA-----T---------ATA-GCCGAA-A-A--CGGCT-----TTT-GCT-C--A-CC-CG-G-A--A-TGC-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GTT-CTTTTCGC---TTAC--TTT--CCG-AGCC-----A--A-GC----GTAAGAT---TTGACCG-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----CAA-AA-TGG-GGG---------------AAA-AT---A-GAA--A---T-AT-G-TC-TCCTT----GGCC-AC-ACTT-----AT-T-A-AA--T----A----AAC---AT-A---TA---------------------------TG---T-TTGAAG-T-TTA-TA---TT--AAATGCGAGAAC--AAAAA-----A---CA---TT--------AT--C-CGAGTTA--A---CG--T---CAAT----GTCATTT---T---A-CAC----CC-G-------G---------GG---GGGA------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-GA-C---CG-TA-TAA--CATTT---T--AT--AACCT-G---AC--TATCCCCAAA---C----GGTAC----TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-T--GC--TAA--C-ATAA-GCC----TA---------CA--TTAT--AT-----GCTAA-AA-A---A-TAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGTGTAATT----A---G-TTCCC-A-GC-GGCTAAA-AATA-TG----TCT
gi|7 : AAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-AT----AAAATCCA-C-G-----------ATT-GTAAAGAAAAT--CAA-TAGA-TT--AAAA-GTATT-AAAAAC----T--GTACCTTAA---------AA-------ATGAATAATA----A-----------A--T--A--ACACCCCAAATAACAAAATCAG-----T---------ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTT-G-T-C--C-CA-CG-G-A--A-TGCA------------------------------G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCA-----A--G-GTA----TAA-AT--TTTGA-CC-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGACATC--TAG---ATGTATA-CCCTT----CAAATA-TGG-G----TAA----------A----T---ATGAA--A---T-AT-A-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-T-----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCT----G--A----C-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAA-T--GA-AAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----TTCATTT---T---G-CA-----CC-G-------G---------GGAGAGGGG------G----GGG-----G------TA---AA-T-GA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TAGT-A--CA--T---T--AT-GAA-CT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--ATCACA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--A-ATAA-G-C----TA---------TA--TTAT--AT-----GTA-A-AA-A---A-TAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A----CTTCTC-C-A--GGCTGAA-AATG-TG----TCTT-ATTatta
gi|8 : aa-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--------------------ATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA----------------------------------------AG--AAATTGA---AATG-A--A-----AATGGC--AATTAT-AA--TCCCTGT----G-GTT-G--TCT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-ATACA-ATTGAACTATTTGTTGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGCATAGTATAAT-TTG------TATG---T-----------T-----TCAT--GA-A-AT--G---T---TA-------GTGT----AA--TCC-------T-ATGA----TT-GTAAGGAGAATT-AAG-TAGA-TTGAAAAA-GTTT-----AACCGTTT---TAGGCTAA---------AA-------T-----AA-A----A-----------A-----A--A----------------ACCAA-----TAACAAAGAAACA-GA---A-A-A--CAAC------TTT-G-T-C--A--A-CG-G-A--A-TGC-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATG-C-CTTTTCAC---TCAC--TTT--CC---GCA-----A-----AT---GTAA-ATTCG-TGACCA-GAGAAA------ACA-GGAC---AG----A-----C-AAAC---CT-TATAATACTT----CAA-T------GGG-ATAA----------AAATTT---AT--A--A---T-AT-G-TC-TCC-A----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-
gi|9 : agAA-----T---------ACAAG----A-A-AACCAACT-----TTT-G-T-C--AGCATCGTG-A--A-T-CAC-A------------------------------------G-C-CTTTACGC---T-AC--TGT--TTG-AGC-----------GAA---GTAATAT--GTTGA-C--GAGAAAGCG-GTACA-G-AC---AGTAATATAT--C-A-AC---ATGGA--GCC-TT----CAA-TA-TGG-GGG-ATAG----------AAA--T---ATAAA--A-----AT-GGTC-TCCAA----ATTC-AC-A--C-----GT-T-A-AAACT----A----AAC---AT-ACAATA-TATG-CTT--TGGAA----TGC-A-TTA---T-TTGAGT-T-TTA-CAATATTTCAA------GAAG--AAAAA-----AA-TAA-TATT--------AC--C-AAGTTTG--A---AG--T---CGCT----GGCATTT---TTGCC-CA-----CCTG-------G---------GG---AGGGGT----G----GGG-----G------T----AATT-GA----T-CTA--AGT-G--C---CGCTAGT-A--CA--T---TTAAT-GCACCTGG---GC--TAT---CAAA--GC----GATAC-T--TCTTGAT--CA-A-TCAAA-T-ACTC--GCTGTAA--C---GA-G-C-----A---------CT-TCTAT--GT-----GT--A-AA-ATGTA-G-A--A--A--GAAATTT-CAAATAGTGGT-CAATT----ATACTTTTCTC-C----GGCTG---AATG-TGA---TCTTCATg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTCTTTATAAATAATTATGATTTTGCAATTTTTTAAATAACTTAAAT
Alignments
lowQualScore : 44444444444444444444444444444444 11111 2222222 333333333333333 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 11111 222222222 555555555555555555555555555555555555555555 11 111 111 111111111 2222222222222 777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222 1111 11 11111111111111111111111 3333333333 444444444444444 222222222222222 1111111 111 44444444444444 111 1111111111111111111111111 11111 1111111111111111111 111111 111111 22 1111 22222222222222222222 1 111111
lowQualScore : 3 77777 5 33 33 2 2 3 44 555 1 5 3 3 3 1 555 2 2 2 2 2 2 55 33 2 2 44444444444444444444444444444444 0 77 3 44 00000 44 1 3 44 9999999 555 6 7777 000000000000000 3 3 3 7777 3 55 4 33 22 1 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 222222 777 11111 000000000 66 666 66 9999999 222222222222222222222222222222222222222222 0 0 88 4 8 11 4 4 333 000 66 0 333333333 0000000000000 111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333 3 2222 6 3 44 0 77777 3 3 3 44 3 6 3 3 44 3 3 77777777777777777777777 3 3 3 77 6 3 6 999 77 44 3 3 1111111111 3 6 6666 2 5 99 2 2 2 5 555 77777 33 2 777777777777777 6666 2 2 2 888888888888888 5 444 11 33 55555 2 5 2 9999999 2 2 33 55555 2 2 2 7777777 6666 555 3 000 6 2 22222222222222 3 3 555 3 2 2 2 000 8888 33 444 8888888888888888888888888 33 2 33 444 55 444 5555 444 66666 11111 8888888888888888888 777 000000 5555 66666 222222 7777 2 2 7777 2 2 33 2 00 444 5 1 33 66 444 33 2 2 444 33 55 33 7777 1111 33 33 2 5 2 2 2 5 33 33 33 2 2 2 00000000000000000000 2 33 2 88888 55 7 5 666 0 33 33 88 7 2 8888 2 5555 9999 444444 0 2 2 8888
lowQualScore : . ..... . .. .. . . . .. ... . . . . . . ... . . . . . . .. .. . . ................................ . .. . .. ..... .. . . .. ....... ... . .... ............... . . . .... . .. . .. .. . . ............................................................... . ...... ... ..... ......... .. ... .. ....... .......................................... . . .. . . .. . . ... ... .. . ......... ............. .......................................... ............... . .... . . .. . ..... . . . .. . . . . .. . . ....................... . . . .. . . . ... .. .. . . .......... . . .... . . .. . . . . ... ..... .. . ............... .... . . . ............... . ... .. .. ..... . . . ....... . . .. ..... . . . ....... .... ... . ... . . .............. . . ... . . . . ... .... .. ... ......................... .. . .. ... .. ... .... ... ..... ..... ................... ... ...... .... ..... ...... .... . . .... . . .. . .. ... . . .. .. ... .. . . ... .. .. .. .... .... .. .. . . . . . . .. .. .. . . . .................... . .. . ..... .. . . ... . .. .. .. . . .... . .... .... ...... . . . ....
lowQualScore : 3 11111 7 99 99 9 9 1 22 444 2 3 1 1 1 0 000 9 9 9 9 7 7 88 77 7 7 77777777777777777777777777777777 2 33 1 22 88888 22 6 3 66 3333333 000 7 1111 222222222222222 3 3 3 1111 6 00 4 88 00 0 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 888888 888 11111 000000000 11 222 11 9999999 000000000000000000000000000000000000000000 8 9 00 4 9 99 4 4 333 111 11 2 333333333 7777777777777 222222222222222222222222222222222222222222 888888888888888 3 7777 2 1 66 2 77777 1 1 1 22 1 2 1 1 22 1 1 11111111111111111111111 1 1 1 33 2 1 2 666 33 22 1 1 3333333333 1 2 2222 9 7 99 9 9 9 7 000 66666 99 9 666666666666666 1111 9 9 9 222222222222222 3 777 88 77 55555 5 0 5 7777777 4 4 22 99999 4 4 4 1111111 5555 444 1 888 2 4 00000000000000 1 1 444 1 9 9 9 000 3333 99 999 9999999999999999999999999 77 7 22 111 66 111 0000 111 88888 22222 4444444444444444444 444 000000 0000 22222 555555 8888 5 5 8888 5 5 44 5 99 444 0 4 44 33 777 44 5 5 444 22 66 22 4444 1111 44 44 5 0 5 5 5 0 44 44 44 5 5 5 99999999999999999999 5 44 5 88888 99 5 0 999 0 44 44 44 5 5 3333 7 7777 1111 222222 1 9 9 9999
consensus : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---G-TTGTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-G-TTTTAAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T--GT-A-A-AT--G-TT-GA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--CG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
Reference ( family-68 ) : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---G-TTGTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-G-TTTTAAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T--GT-A-A-AT--G-TT-GA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--CG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
gi|1 : GGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GATGCT-TACC-TA-GTT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--CAA---A--AGTT-A--ACCTTTAGAGGC--AATTTT-AA--TCCCTG-----A-GTTTG--CTTATTTAA----TTG---GATAT-------T-ATT-A-T----AAA-A--C
gi|1 : ---------ATAAC-TTGAAACTACATA---CA-----TA-G-A-----TCAT--GACGCAT--G---C---TAC------G-GT----AAAATCTA-C-AAGT-ACAA---G-T---AACGAACTTT-CAA--AGA-TTA-TAAA-G-TTTTAAA--CCGCTTCTGTACCTTTA---------AACAC----A-----AATAGACCA-----------A--T--A--ACA--------------ATCGA-----TTGTC-----ACA-GG---A-A-A--AAACTGGCTATTTAG-T-C--A-CC-CG-G-ACAA-TGCGC-AAAAACAAAAT---A---AT----AGA-G-G-A--A-G-CACTTTTCTCACATCACC-TTT--CCG-AGCAC-GGACA-TCGGC-A-A-TT--AATTAGA-C--GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---CA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AATT-TGG-GGG----A----------AAA-ATTCAATGAA--A---TAAT-GATC-TCCAATTACGG-C-AC-A--T-----GT-CAA-AA-AT----ACAACAAT---AT-A---TA-CATGTCAC--TGTCATGCTT-C-A-TTATATT-TTGAAGATATTA-CAAATCCTG-AAT--TAG-AG--AAAAG-----C--CTA-T-T----------C--C-AGG--TG--G---CGT-T---CGCT----GTTCTTT---T-----TA-----CT-GTGGGTGAG---------GG---AGGG------G----GGG-----GTGAT--T----AA-T-GA----TCA-A--AGT-GA-C---CG-CCCTAA--CAT-T---T--AT-GAACCT-GGTAACAATAT--CCAAA--CCTAAAAATAT-TTCTTT--AT--CA-AGTC-AA-TGAC-T--GC--TAA--CAATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-TG----GT--AGAA-A---ATAA--A--A--GAAAGTT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCGTC-C-AGCGGCTGAA-CCTG-TG----TCTTTAccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgaaactacatacatagatcatgacgcatgctacggtaaaatctacaagtacaagtaacgaactttcaaagattataaagttttaaaccgcttctgtacctttaaacacaaatagaccaataacaatcgattgtcacaggaaaaaactggctatttagtcacccggacaatgcgcaaaaacaaaataatagaggaagcacttttctcacatcacctttccgagcacggacatcggcaattaattagacgagaaacggacaggaccaagaccatatgcccttcaatttgggggaaaaattcaatgaaataatgatctccaattacggcacatgtcaaaaatacaacaatatatacatgtcactgtcatgcttcattatattttgaagatattacaaatcctgaattagagaaaagcctattccaggtggcgttcgctgttctttttactgtgggtgagggaggggggggtgattaatgatcaaagtgaccgccctaacatttatgaacctggtaacaatatccaaacctaaaaatatttctttatcaagtcaatgactgctaacaataagctacattatatggtagaaaataaaagaaagttcaatggtcaattagttcgtccagcggctgaacctgtgtctttaat
gi|10 : ggaagtgattgcgtggtatcacgtggtttattgctttagtacgggaaaattatgacatcacaattaatatcatgacgtcacaattgatgcttacctagttaccttttgtaacaaaagttaacctttagaggcaattttaatccctgagtttgcttatttaattggatattattataaaacccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAC-TTG------CATG---TAACTTATA-GAT-----TCAG--GA-G-AT--G---T---CG-------C-GA----CAT-TCTA-A-A--T-A--------TTACAAGGTAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA------------CCGTTT--GTACCTT-A---------AA-------A-----AATA----AG----------A--T--A--A----------------at
gi|10 : TAA---------AA-------G-----AACA----C-----------A--TCAA--A----------------ACCAA-----T---------ACA-G----AGA-A--CAA-T-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-GTA--A-TGCAC-AA--------C---A---AT----ATA-G-G-GGGA-G-C-CTTTTC-----TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T-------A-AT--G-TT-GA-CC-GAGAAA-CG-G--CA-GGAC---AA----------T-ACTC---ATGT-TA----TT----C-AATA-TGG-GGGTAT-------------AA-AT---ATG-A--A---T--T-G-TC-TCCAA----AG-CAAC-A--T-----GT-T-A-AG-TT----caaagtaaaataaataataataataataaaagaacacatcaaaaccaatacagagaacaattttgttacacggtaatgcacaacaatatagggggagccttttctcactttccgagcaaggtaatgttgaccgagaaacggcaggacaatactcatgttattcaatatgggggtataaatatgaattgtctccaaagcaacatgttaagtt
gi|11 : acttgcatgtaacttatagattcaggagatgtcgcgacattctaaatattacaaggtaaattcaatagatttaaaaccgtttgtaccttaaaaaataagataacaaagtaaaataaataataataataaGAC---AA----AGAC--CTATTG---ATG-------CTT-------ATA-TGG-GG---T------------------------AA--A---T-AT-G-TC-T-CAA----A-------A--T-----GT-T-A-AA-T----------AAC---ATGA---TA-TA-GTCTT---G--A----T-CAA-TTA---T-TTGGAG-T-TTG-CA---TTTG--AT--GAGAAG-----AA-----A--TCA-A-T----------C--C-AG-GT----A---CG--T---CGCTAATAGGCAAAA---T---G-CA-----C----------G---------GG---GGGG------T----TGA-----T------T----AA-T-------T-A-A--AGT-GCCC---CA-TTGTAA--CT--C---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCA-----C----GATAC----TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-A--C--GC--T-A--C--TAA-G-C----TAA-CG----------T-TA--TA-C-----GT--ACAATA---AT-A--A--A--GAAA-TTGCAA----TGGT-CA--T----A---GTT--TC-C-G--G--TAGA-AATG-TG----
gi|12 : -AT-A-TC-TTCAA----AC-C-AT-A--A-----ACAT-A-GA-GT----A----TAT---GT-A---TAATATGTCTTGAC---A----T-C-A-TTA---C-TTGAAG-T-TTG-CG---TTAGAAAT--TATAA---ATAAG-----A--T-A-T-CT---------C--C-AGAATTG--A---CGATC---CGTT----GG-A----------A-CA-----TC-----------------------------------------------G------T----AA---------------------------CA-TAACAA--C----------CT-GAA---------C--TAT--CC-AA--TC----GATACTT--TTT--AT--C--A-TC-AA---A--C--AC--TAA--C-ATAA-T-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---TA-A--A--A--GAAA-TC-CAAT---TAG---AATT----A----CTTCTCAG-G--GGTTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTcatta
gi|13 : aatggataaga--A----T-C-AATTG---TATTAAAG-T-TAAACA---TTTGAA-T--GAGA-----------------TTT-T-TT--------TC--T-AAACATA--AGTGCG--T---CGT------GCGTTT---A---AACA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----GGTGGGTTGGAAAA-T-GA----T-A-A---GT-C--C---CA-TA-TAA---A--T---T--ATTGAACTT-----AC--TAT--CCAAA--CC-----ATACGT--TTT--AT--CA-G-TC-AA-T-AC---------AA--C-ATAA-G-CA---T-A-CC----------T-TT--TG-T-----A---A-AA-A---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATTATTAA---ATTTCTC-C-AT-GCCTGAA-AATG-CGTCGATCTTCATTT
gi|14 : G-T-ATA-CA---TTTGGAAT--GAAAAG--AAAAA-----AAATCA-T-TTGTTGGTTTACAAC-AGAATTCTTA---TG--TTACCGCG----GGCATTTCTGT---C-TA-----CC-G-------G---------GG---AGGGCGTGGGG----GAG-----G------T----AA-T-TAATTTT-A-AGTAGT-G--ATGGCA-TTGTATGTCA--TCTTT--AT-GAACCT-G---AA--TATG-CTAAAACCC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-CCTAC--TGA--C-ATCATG-CCCAAT-A-TAATGATTTTACT-TA--TG-T-----GT--A-GA-A---AT-AACA--A--TAAA-TT-
gi|15 : TAA---------AA-------G-----AACA----AC----------A--TC-A--A----------------AACAA-----T---------ACA-G----AGA-A--CAATT-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATAGG-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-G--------GT-A-A-AT--G-TT-GA-CC-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----------T-ACTC---ATGT-TA----TT----C-AATA-TGG-GGG-GT--------------A-AT---AT------------T-G-TCTTCCAA----AG-C-AA-A--T-----GT-T-A-A
gi|16 : ttaaaaaataagataacaaagtaaaataataataataataa--AAAAA-----A--T-A-T-TT--------AT--C-AGAGTTG--A---CG--T---CACT----GGCACTT---T---A-CAC----CC-G-------G---------GG---AGGA------G----GGT-----G------T----AA-T-GA----T-G-A--AGT-GC-C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACTT-G---AC--TAT--CCAAA--TC------TAC-T--TTT--AT--CACA-CC-AATT-GC-T--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-C-----------T-TA--TA-CTGGGGGT--A-AA-AT--AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----CG---CAATT----A---GTTTCTT-C-A--GGCTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTg
gi|17 : ---------AA-------A-----AACA----A-----------AACC--A--A----------------AACAA---------------ACA-G----A-AGA--CAATG-----TTT-G-T-C--A-CA-CA-G-A--A-TACAC-AAA-------C---A---AT----ATA-GAG-G--A-G-A-CTTTTTGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAT-GG----T-----A-A-AA--G-TT-AA-CA-GATAAA-TG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AATA--GG-GGG-AT------------AAA-AT---ATCAA--A---T-AT-G-TT-TCCAA----CG-G-ACTA--T-----GT-T-A-AA-T
gi|18 : aaccAAG-TGAG-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGGAAAATTAT-GACATC-ACA-A-TAAAACT---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-C---------ATAGAAGAATTGAC-AATG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTG---A-----------TGATTAA-T----AAA-A--acc
gi|19 : AG-TTAT-----T-GCGTGATAT--CA--CGCG-A-TTTATC-GC--TTTAGT---ACGGGGAGAGT-AT-GAACTC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GCC-AC-AATT-AACTTT-TACC-AA-ACT--A-CTTTTT------------G-TT--------ATAT--TAGCTCT--A--G-A--A-----ATTG------TTAT-AA--TCCCTG-----C-GTTTG--TTT-C--------------A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--CA-ATCAA--Taacccaatt
gi|2 : GAT-----T-GCTTTGT-T--CATACATG-G-T--AGT-GC--TTTAGT---A--GGGAATATAATAGACAGC-ACA-ATTAAT-TCTCTATGAC-GTC--C-AATT-GACGTT-TACA-AATATT--ATC-CTTT---------------T--------GTAA--CATTAGT--AAC--A--T-----AGTAGC--AATT-T-A----TCCTG-----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTGGATA-----------T-ATT-A-T----TAC-A--CATATCGATTTATTTtaagt
gi|2 : tg---------ATTAC-TTG------TCTA---TA-----TA-T-TATGAGTCAT--GA-G--T--G---TAATTA-------G-GCTA--AAA-TCTAAC-A--TTACAGAACG-ATGTA-GGTAAATTGCAA-TAGATTTT-AAAA-G-TTT---AAACCG-TT--GTACCTTTA---------CA-------A-----AATAAT--A-----------A--T--A--AAGGC------------ATCAAGTATGT---------ATG-A----A-A-A--CGG-------TTT-G-T-CTAA-CGCCG-G-A--A-TGCACGAAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATG-TAATTTTCGCGG-TTACGTTTT--CCG-AGCAA-GG----T---T-A-A-TG--G-TT-GA-CG-GAGAAA-CGCG-ACA-GGA----AA----AGAC-------------GTATG--CCTT----G-AAGACTGG-GGA-GTAA----------AAA-AA---TTGAA--A---T-GT-T-CC-TT--G----GG-C-AC-A--TCTGAGGT-T-GTAT-TT----A----AATAGAAC-A---TA-TATG---------------------------T-TTGAAT-T-TTG-TA---TT--AGAT--GAG--G--GACGATTTTTT--TTT-T-TT--------AC--CGAGAG-TA--A---CG--T---CA-T----GTCATTT---T---A-CAACCACCC-G-------G---------GG---GGGG------GTGGTGGGGGTGTG------T----AA-TAGA----T-A-A--CGTGG--C---CG-TAGTA----A--T---T---T-AGACCT-G---AC--TAT--GCAGA--CCT---GATAC-TG-TTT--AT--CA-AGTC-AG-T-CT-C--GC--TGAACC-ATAG-A-CGCG-T-AGGA----------T-TAATTAGT-----GT--ACAACA---AT-A--AATA--GAAAGTT-CAA----TGTT---ATT----A---G-TTCTC-CAG--GGCTGAAGAATA-TG----TCTTtgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatattacttgtctatatattatgagtcatgagtgtaattaggctaaaatctaacattacagaacgatgtaggtaaattgcaatagattttaaaagtttaaaccgttgtacctttacaaaataataataaaggcatcaagtatgtatgaaaacggtttgtctaacgccggaatgcacgaaacaatatagggatgtaattttcgcggttacgttttccgagcaaggttaatggttgacggagaaacgcgacaggaaaagacgtatgccttgaagactggggagtaaaaaaattgaaatgttccttgggcacatctgaggttgtatttaaatagaacatatatgtttgaattttgtattagatgagggacgattttttttttttaccgagagtaacgtcatgtcattttacaaccacccgggggggggtggtgggggtgtgtaatagataacgtggccgtagtaatttagacctgactatgcagacctgatactgtttatcaagtcagtctcgctgaaccatagacgcgtaggattaattagtgtacaacaataaatagaaagttcaatgttattagttctccagggctgaagaatatgtctttt
gi|20 : tggattgctttgttcatacatggtagtgctttagtagggaatataatagacagcacaattaattctctatgacgtccaattgacgtttacaaatattatccttttgtaacattagtaacatagtagcaatttatcctgcgtttgtttttatttggatatattattacacatatcgatttattttgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatGAAA-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTT-GT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAAAAGC---ATGAC-ATC-AC-AATT-GACATT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT-------------------------TG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-TA--TCCCTG-----C-GTTTA--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----tt
gi|21 : AA----------AAA-AT---AAGAA--A---T--T-G-CC---------------AC-A--C-----G----G-AA-TTCACAA----AAA---AT-A---TAATATGTCTT--C---A----T-C-A-TTA---A-TTAAAG-T-TTA-CA---TTT----------------------------TCA-T-----------------AAAAT----A---TG--T---CGCT----GGCATTG---T---A-CA-----CC--------------------C---GATG------G----GGT-----G------T----AA-T-AA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TAGTAA--Ctat
gi|22 : TC---ATAAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTTTGTAATACATGTA-TTTTAAAATGATAG--AAATTAA--ATTG-A--A-----AGTGGC--GATGAT-AA--TTCCTGCGTTACGGTTTG--TTT-TTTAA----TTG---A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--TA-ATC
gi|23 : ATTAT-GACATC-AAT-ATTAATAGC---ATGAC-GCC-AT-AATT-GATACT-TTTT-G----T--A-G-CATT------------AGCT--------ATAG--GAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--
gi|24 : tttcttttgaacattgtaattgtacaatcttaaagaagtgattgcatggtttC--TA---CCAAG--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TGA--C-ATAA-G-C----T-A-CT----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----TGGT-TAATT----A---CTTCTTC-G-G--GGCTGAA-AATG-AG----TCTTCATTTg
gi|25 : ccaataatataag---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA-----------AGT-G--C---CC-TTATGA--CA--A---A--AC-TAACCT-A---AA--TGT--CGACA--CC----GCTAC----TTT--AT--TG-A-TA-AA-T-AC-C--AC--ACA--G-ATAA-G-C------------------------------------T--A-AA-A---GT-A--A--AACAGAA-TC-CAA----AGAT-CAATT----A---CTTCC
gi|26 : AAGAAAG-TAATACATGTAGCTTGATAT--CA--CGTA-G-TTTATT-GC--TTTATT---ACGAGAAAA-TTAT-GACATC-ATA-ATTTATATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GGCGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CGTT------------g
gi|27 : AAGGAAG-TGAT-----T-GCGTTGTAT--CA--CGTG-G-TTGATT-GC--TTTAGT---ACGGG-GAAATTAT-GACATC-AC-----AATGGC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGCA-TACC-AA-GCT--A-C-ATTT------------
gi|28 : -GA-CA-GAGAAA-CA-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-A---------TATAG--CTT----T-AATA-TAG-GGG-ATAATGTTCATATCAAATAT---ATG--------T-AT-G-TC-TCCAA----AA-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA--T----A----AAC---AT-A---TA-Ttgt
gi|29 : GTT-TACC-AA-GCT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--C-ATTAGTTCACT-A--T-----AGTAGC--AATTTT-CA--TCCCTG-----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---ACATAAAGACATT-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--Tt
gi|3 : AAGGAAG-T-AT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG---TTTATT-GCACTTTAGT---ACGGGAAA--TTAT-GACATC-A-A-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-ACAAATTGGACGTT-TACC-AA--TTGAA-C-CT-----------------------------------TTGA--AATGAA--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--ATCGTG-----C-GTTTT--TTT-TTTTTTTTATTG---A-----------T-ATT-A-TTATAAAA-A--CA-ATTGA--CATTTtt
gi|3 : AAC-TTG------CATG---TC-----TAAG-T-----TCAT--GA-G-ATATG---T---TA-------GAGT----AAA--------A--T-CCAC---G-TTGTAAACAAAAT--CAA-TAGA-GTT-AAAA-G-TTTTAAAAAAC---T--GTAACTTAA---------AATGAATAAA-----AATA----ACAAACCCAATAA--C--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-AAACAACT-----TTT-G-T-C--A-AG-CA-G-A--AATGCAC-AAA-------C---A---ATTAATATA-G-G-GG-A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-AG-------GTCATA-AT--G-TT-GA-CACGAGAAA-CG-G-ACAAGGAC---AA-----GAC--C-ATAC---ATGTAATGCCATTACGAC-AA-A-TAGTGGG-A-AA----------AAA-AT---ATGAA--AAGAT-ATCA-TC-TCCAA-----G-C-AA-C--T-----GT-T-A-AA-T-----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT---G--A------C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTTGAAT--GAGAAGAAAAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---GGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-GGGGA---G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TTGTAA--AA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AC--CA-A-TT-AA-T-ACTC--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-TA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-T---AA-A--A--G--GAAA-TT-CAA----T-GT-CAATT----A---CTTTC-C-A-G--GGCTG-A-AATGTTG----TCTTCatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaacttgcatgtctaagttcatgagatatgttagagtaaaatccacgttgtaaacaaaatcaatagagttaaaagttttaaaaaactgtaacttaaaatgaataaaaataacaaacccaataacaaatcaatacagaaaaacaacttttgtcaagcagaaatgcacaaacaattaatataggggagccttttcgctcactttccgagcaaaggtcataatgttgacacgagaaacggacaaggacaagaccatacatgtaatgccattacgacaaatagtgggaaaaaaatatgaaaagatatcatctccaagcaactgttaaataaacatatatatgtcttgacattatttgaagtttacattttgaatgagaagaaaaaaaatcatttaccagagttgacgtggctggcattttacaccggggaggggggggggggtaatgataaagtgtccattgtaaaattatgaacctgactatccaaaccgatacttttaccaattaatactcgctaacataagctatattatatgtaaataaaaggaaattcaatgtcaattactttccagggctgaaatgttgtcttc
gi|30 : aaggaagtattgcgtggtatcacgtgtttattgcactttagtacgggaaattatgacatcaaattaaaatcatgacgtcacaaattggacgtttaccaattgaacctttgaaatgaaaagtggcaaatataaatcgtgcgtttttttttttttttattgatattattataaaaacaattgacatttatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnata----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--G-CA-CG-G-A--A-TGCAC-ATA-------TTTTACTTGT----ATA-G-GAG--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--C-A-AGTGA-GG----T-----A-A-AT--G-TT-GA-CA-GACAAA-CA-A-ACA-GG
gi|31 : gaA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-T-----A----AAC---AT-A---CA-CATGCCCT---G--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TGTGAA-T--GAGAAA--AAAAA-----A--T-----TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---AGCT----GGCATTT---
gi|32 : TTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------GGCGGGGGGAGG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-AA----T-A-A--AGG-GC-C---CA-TATTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----G
gi|33 : aTNG--A---CG--T---CGCT----GTCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----
gi|34 : aatgacagaaatgaatgtattgctgt-TA--TA-T-----GT--A-AA-G---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGCT-CAAT---------GT--------G-----TGGA-AATG-TG----TCTTCATttaatg
gi|35 : --AT-GAACCT-G---AT--TAT--CCAAG--CA----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--AA--TAA--T-ATAA-G-C----T-gt
gi|36 : AGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGCAT--CA--TGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAA
gi|38 : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--TA--CGTG-G-T
gi|4 : taaaaGGAAG-GGAT-----TTGCGTGCTATTTCA--CGTGCGCTTTATT-GC--TTTAAG---ATGG-AAAAATTAG-CACATC-ACACATTAAAATC---ATGACCGTCCAC-AATT-G-CTTT-TACCCAA-GTT--A-C-ATTT------------A-CT--------ATAG--GAATTGA--AATG-G--A-----ATTGGCCAAATAATCAATTTCCCTG-----C-GTTTT--TTTATTTAT----TTGCC-ATT---------T-ATT-ACT----AAACA--CA-AGTGA--T
gi|4 : C---------ACAACACTG------CATGGTATA-----TAAG-T-----TCATTTGA---AT--GCTTT---TA-------G-ATCTTAAAA-TCCA-CGA--T-GTAA--------TAAC-AAAATC-CAA-TAGA-TTT-AAAAAG-TTTTAAAAAC----T--GTACCTTAAGATATGAATAA-------A-----AATA----ACAACCCCCA--A--T--A--AGAAC------------ATCAG-----T---------ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTC-A-TGC--G-CC-CG-G-A--A-TGCA------------------------------G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTTATCCGCAGCAATGG----TC-AT-A-A-AT--T-TT-GA-CC-GAGAAA-CG---ACAAGGATCCAAA----AGAC--C-ATCCTAGATTT---GCCCT-----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-TT---ATGAATAA---TTAT-A-TC-TCCAAC---AG-C-AC----T-----TT-T-A-AA-TA----A----AAC---GT-ACTATA-TATGTCT---CG--AAA--C-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAA-T--GAGAAA--AACAA-----A--T-A-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CA--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GGCG-GGGG------A----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---TAATAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CGAGA--CA----AATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------A-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---ATGA--A--A--GAAA-TC-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCTTC-A-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTTttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacacaacactgcatggtatataagttcatttgaatgcttttagatcttaaaatccacgatgtaataacaaaatccaatagatttaaaaagttttaaaaactgtaccttaagatatgaataaaaataacaacccccaataagaacatcagtacagaaaacaactttcatgcgcccggaatgcagggagccttttcgctcactttatccgcagcaatggtcataaattttgaccgagaaacgacaaggatccaaaagaccatcctagatttgccctcaatatgggggataaaaattatgaataattatatctccaacagcacttttaaataaaacgtactatatatgtctcgaaaccattatttgaagtttacatttgaatgagaaaaacaaatatttaccagagttgacatcgctggcattttacaccggggcgggggaggggtaatgataaagtgctaatagtaacattatgaacctgactatcgagacaaatacttttatcaattcataccgctaacataagctacaatatatgtaaaaatgaaagaaatccaatggtcaattagttcttcagggctgaaaatgtgtcttcattt
gi|5 : ggaagggatttgcgtgctatttcacgtgcgctttattgctttaagatggaaaaattagcacatcacacattaaaatcatgaccgtccacaattgcttttacccaagttacatttactataggaattgaaatggaattggccaaataatcaatttccctgcgtttttttatttatttgccatttattactaaacacaagtgatttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaTTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--GAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATTGA--TATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCT----A--T-ATAA---GTTTATAAAGAAAA-T-CAA-TAGA-TT----AA-GTTTTTAAAAACTGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-A-C-TTTTTCGT---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-TGTACAT--GT-A-A-AT--G-TT-CA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-AGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--TG--A----T-C-A-TAT---T-TTCAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCACC-TT--------AC--C-AGAGTTA--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---G-TA-----CC-C-------G---------GG---AGGG------G----GGG-----G------T-----A-T-GAT---T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGCAA--CA--T---T--AT-GAACC--G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G------T-A-CATT--------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATT-TG----TCTTCATTT
gi|6 : GAAGCTGAT-----T--CGTGGTAT--CA---GTG-G-TTTATTAGC--TTTAGTTTTACGGCGAAAATTAT--ACATCCACA-ATTAATAT------GAC-GTC-A--AATT-GACGTTGTACC-AGCGTT--A-C-CTT-------------G-CT--------A-----ATATTTA--GATA-ACTAT----AGTAGC--CTTTTA-AA--TCCCTGC------GTTTGCCTTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT---------------------------CTTTGTTATAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC--TG------CA-----TA-----TA-G-CA----TCAT--GA-G-AT--G---C---TACATGTAGG-GA----AAA-TCTA-C-GATT-ACAA---G-ACG-AAGGAAAATT-CAACTAGACTTT-AAAA-G-TTT---AAACCGTTT--GTACC-TAC---------AA-------A-----AATA----A-----------T--T--AACA----------------ATCAA-----T---------ATA-GCCGAA-A-A--CGGCT-----TTT-GCT-C--A-CC-CG-G-A--A-TGC-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GTT-CTTTTCGC---TTAC--TTT--CCG-AGCCA-AG----C--GT-A-AGAT----TT-GACCG-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AAAA-TGG-GGG---------------AAA-AT---A-GAA--A---T-AT-G-TC-TCCTT----GGCC-AC-ACTT-----AT-T-A-AA--T----A----AAC---AT-A---TA---------------------------TG---T-TTGAAG-T-TTA-TA---TT--AAATGCGAGAAC--AAAAA-----A---CA---TT--------AT--C-CGAGTTA--A---CG--T---CAAT----GTCATTT---T---A-CAC----CC-G-------G---------GG---GGGA------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-GA-C---CG-TA-TAA--CATTT---T--AT--AACCT-G---AC--TATCCCCAAA---C----GGTAC----TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-T--GC--TAA--C-ATAA-GCC----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GCTAA-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGTGTAATT----A---G-TTCCC-A-GC-GGCTAAA-AATA-TG----TCT
gi|7 : AAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-AT----AAAATCCA-C-G-----------A-TTGTAAAGAAAAT--CAA-TAGA-TT--AAAA-G-TATTAAAAAC----T--GTACCTTAA---------AA-------ATGAATAATA----A-----------A--T--A--ACACCCCAAATAACAAAATCAG-----T---------ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTT-G-T-C--C-CA-CG-G-A--A-TGCA------------------------------G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T--AT-A-A-AT--T-TT-GA-CC-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGACATC--TAG---ATGTATA-CCCTT----CAAATA-TGG-G----T-------------AA-AT---ATGAA--A---T-AT-A-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA--T----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCT----G--A----C-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTG-AAT--GA-AAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----TTCATTT---T---G-CA-----CC-G-------G---------GGAGAGGGG------G----GGG-----G------TA---AA-T-GA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TAGT-A--CA--T---T--AT-GAA-CT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--ATCACA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--A-ATAA-G-C----T-A-TA----------T-TA--TA-T-----GTA-A-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A----CTTCTC-C-A--GGCTGAA-AATG-TG----TCTT-ATTatta
gi|8 : aa-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--------------------ATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA----------------------------------------AG--AAATTGA--AATG-A--A-----AATGGC--AATTAT-AA--TCCCTGT----G-GTT-G--TCT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-ATACA-ATTGAACTATTTGTTGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGCATAGTATAAT-TTG------TATG---T-----------T-----TCAT--GA-A-AT--G---T---TA-------GTGT----AA--TCC-------T-ATGA-----TTGTAAGGAGAATT-AAG-TAGA-TTGAAAAA-G-TTT----AACCGTTT---TAGGCTAA---------AA-------T-----AA-A----A-----------A-----A--A----------------ACCAA-----TAACAAAGAAACA-GA---A-A-A--CAAC------TTT-G-T-C--A--A-CG-G-A--A-TGC-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATG-C-CTTTTCAC---TCAC--TTT--CC---GCAA--A----T--GT-A-A-ATTCG--T-GACCA-GAGAAA------ACA-GGAC---AG----A-----C-AAAC---CT-TATAATACTT----C-AAT------GGG-ATAA----------AAATTT---AT--A--A---T-AT-G-TC-TCC-A----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-
gi|9 : agAA-----T---------ACAAG----A-A-AACCAACT-----TTT-G-T-C--AGCATCGTG-A--A-T-CAC-A------------------------------------G-C-CTTTACGC---T-AC--TGT--TTG-AGCGA-AG----T-----A-ATAT--G-TT-GA-C--GAGAAAGCG-GTACA-G-AC---AGTAATATAT--C-A-AC---ATGGA--GCC-TT----C-AATA-TGG-GGG-ATAG----------AAA--T---ATAAA--A-----AT-GGTC-TCCAA----ATTC-AC-A--C-----GT-T-A-AAACT----A----AAC---AT-ACAATA-TATG-CTT--TGGAA----TGC-A-TTA---T-TTGAGT-T-TTA-CAATATTTCAA------GAAG--AAAAA-----AA-TAA-TATT--------AC--C-AAGTTTG--A---AG--T---CGCT----GGCATTT---TTGCC-CA-----CCTG-------G---------GG---AGGGGT----G----GGG-----G------T----AATT-GA----T-CTA--AGT-G--C---CGCTAGT-A--CA--T---TTAAT-GCACCTGG---GC--TAT---CAAA--GC----GATAC-T--TCTTGAT--CA-A-TCAAA-T-ACTC--GCTGTAA--C---GA-G-C------A-CT----------TCTA--TG-T-----GT--A-AA-ATGTAG-A--A--A--GAAATTT-CAAATAGTGGT-CAATT----ATACTTTTCTC-C----GGCTG---AATG-TGA---TCTTCATg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTCTTTATAAATAATTATGATTTTGCAATTTTTTAAATAACTTAAAT
Alignments
lowQualScore : 44444444444444444444444444444444 11111 2222222 333333333333333 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 11111 222222222 555555555555555555555555555555555555555555 11 111 111 111111111 2222222222222 777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222 1111 11 11111111111111111111111 3333333333 444444444444444 222222222222222 1111111 111 44444444444444 111 1111111111111111111111111 11111 1111111111111111111 111111 111111 22 1111 22222222222222222222 1 111111
lowQualScore : 3 77777 5 33 33 2 2 3 44 555 1 5 3 3 3 1 555 2 2 2 2 2 2 55 33 2 2 44444444444444444444444444444444 0 77 3 44 00000 44 1 3 44 9999999 555 6 7777 000000000000000 3 3 3 7777 3 55 4 33 22 1 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 222222 777 11111 000000000 66 666 66 9999999 222222222222222222222222222222222222222222 0 0 88 4 8 11 4 4 333 000 66 0 333333333 0000000000000 111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333 3 2222 6 3 44 0 77777 3 3 3 44 3 6 3 3 44 3 3 77777777777777777777777 3 3 3 77 6 3 6 999 77 44 3 3 1111111111 3 6 6666 2 5 99 2 2 2 5 555 77777 33 2 777777777777777 6666 2 2 2 888888888888888 5 444 11 33 55555 2 5 2 9999999 2 2 33 55555 2 2 2 7777777 6666 555 3 000 6 2 22222222222222 3 3 555 3 2 2 2 000 8888 33 444 8888888888888888888888888 33 2 33 444 55 444 5555 444 66666 11111 8888888888888888888 777 000000 5555 66666 222222 7777 2 2 7777 2 2 33 2 00 444 5 1 33 66 444 33 2 2 444 33 55 33 7777 1111 33 33 2 5 2 2 2 5 33 33 33 2 2 2 00000000000000000000 2 33 2 88888 55 7 5 666 0 33 33 88 7 2 8888 2 5555 9999 444444 0 2 2 8888
lowQualScore : . ..... . .. .. . . . .. ... . . . . . . ... . . . . . . .. .. . . ................................ . .. . .. ..... .. . . .. ....... ... . .... ............... . . . .... . .. . .. .. . . ............................................................... . ...... ... ..... ......... .. ... .. ....... .......................................... . . .. . . .. . . ... ... .. . ......... ............. .......................................... ............... . .... . . .. . ..... . . . .. . . . . .. . . ....................... . . . .. . . . ... .. .. . . .......... . . .... . . .. . . . . ... ..... .. . ............... .... . . . ............... . ... .. .. ..... . . . ....... . . .. ..... . . . ....... .... ... . ... . . .............. . . ... . . . . ... .... .. ... ......................... .. . .. ... .. ... .... ... ..... ..... ................... ... ...... .... ..... ...... .... . . .... . . .. . .. ... . . .. .. ... .. . . ... .. .. .. .... .... .. .. . . . . . . .. .. .. . . . .................... . .. . ..... .. . . ... . .. .. .. . . .... . .... .... ...... . . . ....
lowQualScore : 3 11111 7 99 99 9 9 1 22 444 2 3 1 1 1 0 000 9 9 9 9 7 7 88 77 7 7 77777777777777777777777777777777 2 33 1 22 88888 22 6 3 66 3333333 000 7 1111 222222222222222 3 3 3 1111 6 00 4 88 00 0 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 888888 888 11111 000000000 11 222 11 9999999 000000000000000000000000000000000000000000 8 9 00 4 9 99 4 4 333 111 11 2 333333333 7777777777777 222222222222222222222222222222222222222222 888888888888888 3 7777 2 1 66 2 77777 1 1 1 22 1 2 1 1 22 1 1 11111111111111111111111 1 1 1 33 2 1 2 666 33 22 1 1 3333333333 1 2 2222 9 7 99 9 9 9 7 000 66666 99 9 666666666666666 1111 9 9 9 222222222222222 3 777 88 77 55555 5 0 5 7777777 4 4 22 99999 4 4 4 1111111 5555 444 1 888 2 4 00000000000000 1 1 444 1 9 9 9 000 3333 99 999 9999999999999999999999999 77 7 22 111 66 111 0000 111 88888 22222 4444444444444444444 444 000000 0000 22222 555555 8888 5 5 8888 5 5 44 5 99 444 0 4 44 33 777 44 5 5 444 22 66 22 4444 1111 44 44 5 0 5 5 5 0 44 44 44 5 5 5 99999999999999999999 5 44 5 88888 99 5 0 999 0 44 44 44 5 5 3333 7 7777 1111 222222 1 9 9 9999
consensus : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---G-TTGTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-G-TTTTAAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T--GT-A-A-AT--G-TT-GA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--CG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
Reference ( family-68 ) : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---G-TTGTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-G-TTTTAAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T--GT-A-A-AT--G-TT-GA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--CG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
gi|1 : GGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GATGCT-TACC-TA-GTT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--CAA---A--AGTT-A--ACCTTTAGAGGC--AATTTT-AA--TCCCTG-----A-GTTTG--CTTATTTAA----TTG---GATAT-------T-ATT-A-T----AAA-A--C
gi|1 : ---------ATAAC-TTGAAACTACATA---CA-----TA-G-A-----TCAT--GACGCAT--G---C---TAC------G-GT----AAAATCTA-C-AAGT-ACAA---G-T---AACGAACTTT-CAA--AGA-TTA-TAAA-G-TTTTAAA--CCGCTTCTGTACCTTTA---------AACAC----A-----AATAGACCA-----------A--T--A--ACA--------------ATCGA-----TTGTC-----ACA-GG---A-A-A--AAACTGGCTATTTAG-T-C--A-CC-CG-G-ACAA-TGCGC-AAAAACAAAAT---A---AT----AGA-G-G-A--A-G-CACTTTTCTCACATCACC-TTT--CCG-AGCAC-GGACA-TCGGC-A-A-TT--AATTAGA-C--GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---CA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AATT-TGG-GGG----A----------AAA-ATTCAATGAA--A---TAAT-GATC-TCCAATTACGG-C-AC-A--T-----GT-CAA-AA-AT----ACAACAAT---AT-A---TA-CATGTCAC--TGTCATGCTT-C-A-TTATATT-TTGAAGATATTA-CAAATCCTG-AAT--TAG-AG--AAAAG-----C--CTA-T-T----------C--C-AGG--TG--G---CGT-T---CGCT----GTTCTTT---T-----TA-----CT-GTGGGTGAG---------GG---AGGG------G----GGG-----GTGAT--T----AA-T-GA----TCA-A--AGT-GA-C---CG-CCCTAA--CAT-T---T--AT-GAACCT-GGTAACAATAT--CCAAA--CCTAAAAATAT-TTCTTT--AT--CA-AGTC-AA-TGAC-T--GC--TAA--CAATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-TG----GT--AGAA-A---ATAA--A--A--GAAAGTT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCGTC-C-AGCGGCTGAA-CCTG-TG----TCTTTAccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgaaactacatacatagatcatgacgcatgctacggtaaaatctacaagtacaagtaacgaactttcaaagattataaagttttaaaccgcttctgtacctttaaacacaaatagaccaataacaatcgattgtcacaggaaaaaactggctatttagtcacccggacaatgcgcaaaaacaaaataatagaggaagcacttttctcacatcacctttccgagcacggacatcggcaattaattagacgagaaacggacaggaccaagaccatatgcccttcaatttgggggaaaaattcaatgaaataatgatctccaattacggcacatgtcaaaaatacaacaatatatacatgtcactgtcatgcttcattatattttgaagatattacaaatcctgaattagagaaaagcctattccaggtggcgttcgctgttctttttactgtgggtgagggaggggggggtgattaatgatcaaagtgaccgccctaacatttatgaacctggtaacaatatccaaacctaaaaatatttctttatcaagtcaatgactgctaacaataagctacattatatggtagaaaataaaagaaagttcaatggtcaattagttcgtccagcggctgaacctgtgtctttaat
gi|10 : ggaagtgattgcgtggtatcacgtggtttattgctttagtacgggaaaattatgacatcacaattaatatcatgacgtcacaattgatgcttacctagttaccttttgtaacaaaagttaacctttagaggcaattttaatccctgagtttgcttatttaattggatattattataaaacccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAC-TTG------CATG---TAACTTATA-GAT-----TCAG--GA-G-AT--G---T---CG-------C-GA----CAT-TCTA-A-A--T-A--------TTACAAGGTAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA------------CCGTTT--GTACCTT-A---------AA-------A-----AATA----AG----------A--T--A--A----------------at
gi|10 : TAA---------AA-------G-----AACA----C-----------A--TCAA--A----------------ACCAA-----T---------ACA-G----AGA-A--CAA-T-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-GTA--A-TGCAC-AA--------C---A---AT----ATA-G-G-GGGA-G-C-CTTTTC-----TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T-------A-AT--G-TT-GA-CC-GAGAAA-CG-G--CA-GGAC---AA----------T-ACTC---ATGT-TA----TT----C-AATA-TGG-GGGTAT-------------AA-AT---ATG-A--A---T--T-G-TC-TCCAA----AG-CAAC-A--T-----GT-T-A-AG-TT----caaagtaaaataaataataataataataaaagaacacatcaaaaccaatacagagaacaattttgttacacggtaatgcacaacaatatagggggagccttttctcactttccgagcaaggtaatgttgaccgagaaacggcaggacaatactcatgttattcaatatgggggtataaatatgaattgtctccaaagcaacatgttaagtt
gi|11 : acttgcatgtaacttatagattcaggagatgtcgcgacattctaaatattacaaggtaaattcaatagatttaaaaccgtttgtaccttaaaaaataagataacaaagtaaaataaataataataataaGAC---AA----AGAC--CTATTG---ATG-------CTT-------ATA-TGG-GG---T------------------------AA--A---T-AT-G-TC-T-CAA----A-------A--T-----GT-T-A-AA-T----------AAC---ATGA---TA-TA-GTCTT---G--A----T-CAA-TTA---T-TTGGAG-T-TTG-CA---TTTG--AT--GAGAAG-----AA-----A--TCA-A-T----------C--C-AG-GT----A---CG--T---CGCTAATAGGCAAAA---T---G-CA-----C----------G---------GG---GGGG------T----TGA-----T------T----AA-T-------T-A-A--AGT-GCCC---CA-TTGTAA--CT--C---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCA-----C----GATAC----TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-A--C--GC--T-A--C--TAA-G-C----TAA-CG----------T-TA--TA-C-----GT--ACAATA---AT-A--A--A--GAAA-TTGCAA----TGGT-CA--T----A---GTT--TC-C-G--G--TAGA-AATG-TG----
gi|12 : -AT-A-TC-TTCAA----AC-C-AT-A--A-----ACAT-A-GA-GT----A----TAT---GT-A---TAATATGTCTTGAC---A----T-C-A-TTA---C-TTGAAG-T-TTG-CG---TTAGAAAT--TATAA---ATAAG-----A--T-A-T-CT---------C--C-AGAATTG--A---CGATC---CGTT----GG-A----------A-CA-----TC-----------------------------------------------G------T----AA---------------------------CA-TAACAA--C----------CT-GAA---------C--TAT--CC-AA--TC----GATACTT--TTT--AT--C--A-TC-AA---A--C--AC--TAA--C-ATAA-T-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---TA-A--A--A--GAAA-TC-CAAT---TAG---AATT----A----CTTCTCAG-G--GGTTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTcatta
gi|13 : aatggataaga--A----T-C-AATTG---TATTAAAG-T-TAAACA---TTTGAA-T--GAGA-----------------TTT-T-TT--------TC--T-AAACATA--AGTGCG--T---CGT------GCGTTT---A---AACA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----GGTGGGTTGGAAAA-T-GA----T-A-A---GT-C--C---CA-TA-TAA---A--T---T--ATTGAACTT-----AC--TAT--CCAAA--CC-----ATACGT--TTT--AT--CA-G-TC-AA-T-AC---------AA--C-ATAA-G-CA---T-A-CC----------T-TT--TG-T-----A---A-AA-A---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATTATTAA---ATTTCTC-C-AT-GCCTGAA-AATG-CGTCGATCTTCATTT
gi|14 : G-T-ATA-CA---TTTGGAAT--GAAAAG--AAAAA-----AAATCA-T-TTGTTGGTTTACAAC-AGAATTCTTA---TG--TTACCGCG----GGCATTTCTGT---C-TA-----CC-G-------G---------GG---AGGGCGTGGGG----GAG-----G------T----AA-T-TAATTTT-A-AGTAGT-G--ATGGCA-TTGTATGTCA--TCTTT--AT-GAACCT-G---AA--TATG-CTAAAACCC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-CCTAC--TGA--C-ATCATG-CCCAAT-A-TAATGATTTTACT-TA--TG-T-----GT--A-GA-A---AT-AACA--A--TAAA-TT-
gi|15 : TAA---------AA-------G-----AACA----AC----------A--TC-A--A----------------AACAA-----T---------ACA-G----AGA-A--CAATT-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATAGG-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-G--------GT-A-A-AT--G-TT-GA-CC-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----------T-ACTC---ATGT-TA----TT----C-AATA-TGG-GGG-GT--------------A-AT---AT------------T-G-TCTTCCAA----AG-C-AA-A--T-----GT-T-A-A
gi|16 : ttaaaaaataagataacaaagtaaaataataataataataa--AAAAA-----A--T-A-T-TT--------AT--C-AGAGTTG--A---CG--T---CACT----GGCACTT---T---A-CAC----CC-G-------G---------GG---AGGA------G----GGT-----G------T----AA-T-GA----T-G-A--AGT-GC-C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACTT-G---AC--TAT--CCAAA--TC------TAC-T--TTT--AT--CACA-CC-AATT-GC-T--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-C-----------T-TA--TA-CTGGGGGT--A-AA-AT--AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----CG---CAATT----A---GTTTCTT-C-A--GGCTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTg
gi|17 : ---------AA-------A-----AACA----A-----------AACC--A--A----------------AACAA---------------ACA-G----A-AGA--CAATG-----TTT-G-T-C--A-CA-CA-G-A--A-TACAC-AAA-------C---A---AT----ATA-GAG-G--A-G-A-CTTTTTGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAT-GG----T-----A-A-AA--G-TT-AA-CA-GATAAA-TG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AATA--GG-GGG-AT------------AAA-AT---ATCAA--A---T-AT-G-TT-TCCAA----CG-G-ACTA--T-----GT-T-A-AA-T
gi|18 : aaccAAG-TGAG-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGGAAAATTAT-GACATC-ACA-A-TAAAACT---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-C---------ATAGAAGAATTGAC-AATG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTG---A-----------TGATTAA-T----AAA-A--acc
gi|19 : AG-TTAT-----T-GCGTGATAT--CA--CGCG-A-TTTATC-GC--TTTAGT---ACGGGGAGAGT-AT-GAACTC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GCC-AC-AATT-AACTTT-TACC-AA-ACT--A-CTTTTT------------G-TT--------ATAT--TAGCTCT--A--G-A--A-----ATTG------TTAT-AA--TCCCTG-----C-GTTTG--TTT-C--------------A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--CA-ATCAA--Taacccaatt
gi|2 : GAT-----T-GCTTTGT-T--CATACATG-G-T--AGT-GC--TTTAGT---A--GGGAATATAATAGACAGC-ACA-ATTAAT-TCTCTATGAC-GTC--C-AATT-GACGTT-TACA-AATATT--ATC-CTTT---------------T--------GTAA--CATTAGT--AAC--A--T-----AGTAGC--AATT-T-A----TCCTG-----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTGGATA-----------T-ATT-A-T----TAC-A--CATATCGATTTATTTtaagt
gi|2 : tg---------ATTAC-TTG------TCTA---TA-----TA-T-TATGAGTCAT--GA-G--T--G---TAATTA-------G-GCTA--AAA-TCTAAC-A--TTACAGAACG-ATGTA-GGTAAATTGCAA-TAGATTTT-AAAA-G-TTT---AAACCG-TT--GTACCTTTA---------CA-------A-----AATAAT--A-----------A--T--A--AAGGC------------ATCAAGTATGT---------ATG-A----A-A-A--CGG-------TTT-G-T-CTAA-CGCCG-G-A--A-TGCACGAAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATG-TAATTTTCGCGG-TTACGTTTT--CCG-AGCAA-GG----T---T-A-A-TG--G-TT-GA-CG-GAGAAA-CGCG-ACA-GGA----AA----AGAC-------------GTATG--CCTT----G-AAGACTGG-GGA-GTAA----------AAA-AA---TTGAA--A---T-GT-T-CC-TT--G----GG-C-AC-A--TCTGAGGT-T-GTAT-TT----A----AATAGAAC-A---TA-TATG---------------------------T-TTGAAT-T-TTG-TA---TT--AGAT--GAG--G--GACGATTTTTT--TTT-T-TT--------AC--CGAGAG-TA--A---CG--T---CA-T----GTCATTT---T---A-CAACCACCC-G-------G---------GG---GGGG------GTGGTGGGGGTGTG------T----AA-TAGA----T-A-A--CGTGG--C---CG-TAGTA----A--T---T---T-AGACCT-G---AC--TAT--GCAGA--CCT---GATAC-TG-TTT--AT--CA-AGTC-AG-T-CT-C--GC--TGAACC-ATAG-A-CGCG-T-AGGA----------T-TAATTAGT-----GT--ACAACA---AT-A--AATA--GAAAGTT-CAA----TGTT---ATT----A---G-TTCTC-CAG--GGCTGAAGAATA-TG----TCTTtgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatattacttgtctatatattatgagtcatgagtgtaattaggctaaaatctaacattacagaacgatgtaggtaaattgcaatagattttaaaagtttaaaccgttgtacctttacaaaataataataaaggcatcaagtatgtatgaaaacggtttgtctaacgccggaatgcacgaaacaatatagggatgtaattttcgcggttacgttttccgagcaaggttaatggttgacggagaaacgcgacaggaaaagacgtatgccttgaagactggggagtaaaaaaattgaaatgttccttgggcacatctgaggttgtatttaaatagaacatatatgtttgaattttgtattagatgagggacgattttttttttttaccgagagtaacgtcatgtcattttacaaccacccgggggggggtggtgggggtgtgtaatagataacgtggccgtagtaatttagacctgactatgcagacctgatactgtttatcaagtcagtctcgctgaaccatagacgcgtaggattaattagtgtacaacaataaatagaaagttcaatgttattagttctccagggctgaagaatatgtctttt
gi|20 : tggattgctttgttcatacatggtagtgctttagtagggaatataatagacagcacaattaattctctatgacgtccaattgacgtttacaaatattatccttttgtaacattagtaacatagtagcaatttatcctgcgtttgtttttatttggatatattattacacatatcgatttattttgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatGAAA-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTT-GT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAAAAGC---ATGAC-ATC-AC-AATT-GACATT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT-------------------------TG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-TA--TCCCTG-----C-GTTTA--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----tt
gi|21 : AA----------AAA-AT---AAGAA--A---T--T-G-CC---------------AC-A--C-----G----G-AA-TTCACAA----AAA---AT-A---TAATATGTCTT--C---A----T-C-A-TTA---A-TTAAAG-T-TTA-CA---TTT----------------------------TCA-T-----------------AAAAT----A---TG--T---CGCT----GGCATTG---T---A-CA-----CC--------------------C---GATG------G----GGT-----G------T----AA-T-AA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TAGTAA--Ctat
gi|22 : TC---ATAAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTTTGTAATACATGTA-TTTTAAAATGATAG--AAATTAA--ATTG-A--A-----AGTGGC--GATGAT-AA--TTCCTGCGTTACGGTTTG--TTT-TTTAA----TTG---A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--TA-ATC
gi|23 : ATTAT-GACATC-AAT-ATTAATAGC---ATGAC-GCC-AT-AATT-GATACT-TTTT-G----T--A-G-CATT------------AGCT--------ATAG--GAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--
gi|24 : tttcttttgaacattgtaattgtacaatcttaaagaagtgattgcatggtttC--TA---CCAAG--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TGA--C-ATAA-G-C----T-A-CT----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----TGGT-TAATT----A---CTTCTTC-G-G--GGCTGAA-AATG-AG----TCTTCATTTg
gi|25 : ccaataatataag---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA-----------AGT-G--C---CC-TTATGA--CA--A---A--AC-TAACCT-A---AA--TGT--CGACA--CC----GCTAC----TTT--AT--TG-A-TA-AA-T-AC-C--AC--ACA--G-ATAA-G-C------------------------------------T--A-AA-A---GT-A--A--AACAGAA-TC-CAA----AGAT-CAATT----A---CTTCC
gi|26 : AAGAAAG-TAATACATGTAGCTTGATAT--CA--CGTA-G-TTTATT-GC--TTTATT---ACGAGAAAA-TTAT-GACATC-ATA-ATTTATATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GGCGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CGTT------------g
gi|27 : AAGGAAG-TGAT-----T-GCGTTGTAT--CA--CGTG-G-TTGATT-GC--TTTAGT---ACGGG-GAAATTAT-GACATC-AC-----AATGGC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGCA-TACC-AA-GCT--A-C-ATTT------------
gi|28 : -GA-CA-GAGAAA-CA-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-A---------TATAG--CTT----T-AATA-TAG-GGG-ATAATGTTCATATCAAATAT---ATG--------T-AT-G-TC-TCCAA----AA-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA--T----A----AAC---AT-A---TA-Ttgt
gi|29 : GTT-TACC-AA-GCT--A-C-CTTT---------------T--------GTAA--C-ATTAGTTCACT-A--T-----AGTAGC--AATTTT-CA--TCCCTG-----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---ACATAAAGACATT-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--Tt
gi|3 : AAGGAAG-T-AT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG---TTTATT-GCACTTTAGT---ACGGGAAA--TTAT-GACATC-A-A-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-ACAAATTGGACGTT-TACC-AA--TTGAA-C-CT-----------------------------------TTGA--AATGAA--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--ATCGTG-----C-GTTTT--TTT-TTTTTTTTATTG---A-----------T-ATT-A-TTATAAAA-A--CA-ATTGA--CATTTtt
gi|3 : AAC-TTG------CATG---TC-----TAAG-T-----TCAT--GA-G-ATATG---T---TA-------GAGT----AAA--------A--T-CCAC---G-TTGTAAACAAAAT--CAA-TAGA-GTT-AAAA-G-TTTTAAAAAAC---T--GTAACTTAA---------AATGAATAAA-----AATA----ACAAACCCAATAA--C--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-AAACAACT-----TTT-G-T-C--A-AG-CA-G-A--AATGCAC-AAA-------C---A---ATTAATATA-G-G-GG-A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-AG-------GTCATA-AT--G-TT-GA-CACGAGAAA-CG-G-ACAAGGAC---AA-----GAC--C-ATAC---ATGTAATGCCATTACGAC-AA-A-TAGTGGG-A-AA----------AAA-AT---ATGAA--AAGAT-ATCA-TC-TCCAA-----G-C-AA-C--T-----GT-T-A-AA-T-----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT---G--A------C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTTGAAT--GAGAAGAAAAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---GGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-GGGGA---G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TTGTAA--AA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AC--CA-A-TT-AA-T-ACTC--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-TA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-T---AA-A--A--G--GAAA-TT-CAA----T-GT-CAATT----A---CTTTC-C-A-G--GGCTG-A-AATGTTG----TCTTCatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaacttgcatgtctaagttcatgagatatgttagagtaaaatccacgttgtaaacaaaatcaatagagttaaaagttttaaaaaactgtaacttaaaatgaataaaaataacaaacccaataacaaatcaatacagaaaaacaacttttgtcaagcagaaatgcacaaacaattaatataggggagccttttcgctcactttccgagcaaaggtcataatgttgacacgagaaacggacaaggacaagaccatacatgtaatgccattacgacaaatagtgggaaaaaaatatgaaaagatatcatctccaagcaactgttaaataaacatatatatgtcttgacattatttgaagtttacattttgaatgagaagaaaaaaaatcatttaccagagttgacgtggctggcattttacaccggggaggggggggggggtaatgataaagtgtccattgtaaaattatgaacctgactatccaaaccgatacttttaccaattaatactcgctaacataagctatattatatgtaaataaaaggaaattcaatgtcaattactttccagggctgaaatgttgtcttc
gi|30 : aaggaagtattgcgtggtatcacgtgtttattgcactttagtacgggaaattatgacatcaaattaaaatcatgacgtcacaaattggacgtttaccaattgaacctttgaaatgaaaagtggcaaatataaatcgtgcgtttttttttttttttattgatattattataaaaacaattgacatttatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnata----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--G-CA-CG-G-A--A-TGCAC-ATA-------TTTTACTTGT----ATA-G-GAG--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--C-A-AGTGA-GG----T-----A-A-AT--G-TT-GA-CA-GACAAA-CA-A-ACA-GG
gi|31 : gaA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-T-----A----AAC---AT-A---CA-CATGCCCT---G--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TGTGAA-T--GAGAAA--AAAAA-----A--T-----TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---AGCT----GGCATTT---
gi|32 : TTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------GGCGGGGGGAGG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-AA----T-A-A--AGG-GC-C---CA-TATTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----G
gi|33 : aTNG--A---CG--T---CGCT----GTCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----
gi|34 : aatgacagaaatgaatgtattgctgt-TA--TA-T-----GT--A-AA-G---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGCT-CAAT---------GT--------G-----TGGA-AATG-TG----TCTTCATttaatg
gi|35 : --AT-GAACCT-G---AT--TAT--CCAAG--CA----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--AA--TAA--T-ATAA-G-C----T-gt
gi|36 : AGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGCAT--CA--TGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAA
gi|38 : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--TA--CGTG-G-T
gi|4 : taaaaGGAAG-GGAT-----TTGCGTGCTATTTCA--CGTGCGCTTTATT-GC--TTTAAG---ATGG-AAAAATTAG-CACATC-ACACATTAAAATC---ATGACCGTCCAC-AATT-G-CTTT-TACCCAA-GTT--A-C-ATTT------------A-CT--------ATAG--GAATTGA--AATG-G--A-----ATTGGCCAAATAATCAATTTCCCTG-----C-GTTTT--TTTATTTAT----TTGCC-ATT---------T-ATT-ACT----AAACA--CA-AGTGA--T
gi|4 : C---------ACAACACTG------CATGGTATA-----TAAG-T-----TCATTTGA---AT--GCTTT---TA-------G-ATCTTAAAA-TCCA-CGA--T-GTAA--------TAAC-AAAATC-CAA-TAGA-TTT-AAAAAG-TTTTAAAAAC----T--GTACCTTAAGATATGAATAA-------A-----AATA----ACAACCCCCA--A--T--A--AGAAC------------ATCAG-----T---------ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTC-A-TGC--G-CC-CG-G-A--A-TGCA------------------------------G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTTATCCGCAGCAATGG----TC-AT-A-A-AT--T-TT-GA-CC-GAGAAA-CG---ACAAGGATCCAAA----AGAC--C-ATCCTAGATTT---GCCCT-----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-TT---ATGAATAA---TTAT-A-TC-TCCAAC---AG-C-AC----T-----TT-T-A-AA-TA----A----AAC---GT-ACTATA-TATGTCT---CG--AAA--C-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAA-T--GAGAAA--AACAA-----A--T-A-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CA--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GGCG-GGGG------A----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---TAATAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CGAGA--CA----AATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------A-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---ATGA--A--A--GAAA-TC-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCTTC-A-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTTttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacacaacactgcatggtatataagttcatttgaatgcttttagatcttaaaatccacgatgtaataacaaaatccaatagatttaaaaagttttaaaaactgtaccttaagatatgaataaaaataacaacccccaataagaacatcagtacagaaaacaactttcatgcgcccggaatgcagggagccttttcgctcactttatccgcagcaatggtcataaattttgaccgagaaacgacaaggatccaaaagaccatcctagatttgccctcaatatgggggataaaaattatgaataattatatctccaacagcacttttaaataaaacgtactatatatgtctcgaaaccattatttgaagtttacatttgaatgagaaaaacaaatatttaccagagttgacatcgctggcattttacaccggggcgggggaggggtaatgataaagtgctaatagtaacattatgaacctgactatcgagacaaatacttttatcaattcataccgctaacataagctacaatatatgtaaaaatgaaagaaatccaatggtcaattagttcttcagggctgaaaatgtgtcttcattt
gi|5 : ggaagggatttgcgtgctatttcacgtgcgctttattgctttaagatggaaaaattagcacatcacacattaaaatcatgaccgtccacaattgcttttacccaagttacatttactataggaattgaaatggaattggccaaataatcaatttccctgcgtttttttatttatttgccatttattactaaacacaagtgatttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaTTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACT-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--GAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--AAATAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATTGA--TATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCT----A--T-ATAA---GTTTATAAAGAAAA-T-CAA-TAGA-TT----AA-GTTTTTAAAAACTGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-A-C-TTTTTCGT---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-TGTACAT--GT-A-A-AT--G-TT-CA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-AGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--TG--A----T-C-A-TAT---T-TTCAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCACC-TT--------AC--C-AGAGTTA--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---G-TA-----CC-C-------G---------GG---AGGG------G----GGG-----G------T-----A-T-GAT---T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGCAA--CA--T---T--AT-GAACC--G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G------T-A-CATT--------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATT-TG----TCTTCATTT
gi|6 : GAAGCTGAT-----T--CGTGGTAT--CA---GTG-G-TTTATTAGC--TTTAGTTTTACGGCGAAAATTAT--ACATCCACA-ATTAATAT------GAC-GTC-A--AATT-GACGTTGTACC-AGCGTT--A-C-CTT-------------G-CT--------A-----ATATTTA--GATA-ACTAT----AGTAGC--CTTTTA-AA--TCCCTGC------GTTTGCCTTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT---------------------------CTTTGTTATAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC--TG------CA-----TA-----TA-G-CA----TCAT--GA-G-AT--G---C---TACATGTAGG-GA----AAA-TCTA-C-GATT-ACAA---G-ACG-AAGGAAAATT-CAACTAGACTTT-AAAA-G-TTT---AAACCGTTT--GTACC-TAC---------AA-------A-----AATA----A-----------T--T--AACA----------------ATCAA-----T---------ATA-GCCGAA-A-A--CGGCT-----TTT-GCT-C--A-CC-CG-G-A--A-TGC-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GTT-CTTTTCGC---TTAC--TTT--CCG-AGCCA-AG----C--GT-A-AGAT----TT-GACCG-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AAAA-TGG-GGG---------------AAA-AT---A-GAA--A---T-AT-G-TC-TCCTT----GGCC-AC-ACTT-----AT-T-A-AA--T----A----AAC---AT-A---TA---------------------------TG---T-TTGAAG-T-TTA-TA---TT--AAATGCGAGAAC--AAAAA-----A---CA---TT--------AT--C-CGAGTTA--A---CG--T---CAAT----GTCATTT---T---A-CAC----CC-G-------G---------GG---GGGA------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-GA-C---CG-TA-TAA--CATTT---T--AT--AACCT-G---AC--TATCCCCAAA---C----GGTAC----TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-T--GC--TAA--C-ATAA-GCC----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GCTAA-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGTGTAATT----A---G-TTCCC-A-GC-GGCTAAA-AATA-TG----TCT
gi|7 : AAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-AT----AAAATCCA-C-G-----------A-TTGTAAAGAAAAT--CAA-TAGA-TT--AAAA-G-TATTAAAAAC----T--GTACCTTAA---------AA-------ATGAATAATA----A-----------A--T--A--ACACCCCAAATAACAAAATCAG-----T---------ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTT-G-T-C--C-CA-CG-G-A--A-TGCA------------------------------G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T--AT-A-A-AT--T-TT-GA-CC-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGACATC--TAG---ATGTATA-CCCTT----CAAATA-TGG-G----T-------------AA-AT---ATGAA--A---T-AT-A-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA--T----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCT----G--A----C-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTG-AAT--GA-AAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----TTCATTT---T---G-CA-----CC-G-------G---------GGAGAGGGG------G----GGG-----G------TA---AA-T-GA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TAGT-A--CA--T---T--AT-GAA-CT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--ATCACA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--A-ATAA-G-C----T-A-TA----------T-TA--TA-T-----GTA-A-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A----CTTCTC-C-A--GGCTGAA-AATG-TG----TCTT-ATTatta
gi|8 : aa-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--------------------ATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA----------------------------------------AG--AAATTGA--AATG-A--A-----AATGGC--AATTAT-AA--TCCCTGT----G-GTT-G--TCT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-ATACA-ATTGAACTATTTGTTGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGCATAGTATAAT-TTG------TATG---T-----------T-----TCAT--GA-A-AT--G---T---TA-------GTGT----AA--TCC-------T-ATGA-----TTGTAAGGAGAATT-AAG-TAGA-TTGAAAAA-G-TTT----AACCGTTT---TAGGCTAA---------AA-------T-----AA-A----A-----------A-----A--A----------------ACCAA-----TAACAAAGAAACA-GA---A-A-A--CAAC------TTT-G-T-C--A--A-CG-G-A--A-TGC-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATG-C-CTTTTCAC---TCAC--TTT--CC---GCAA--A----T--GT-A-A-ATTCG--T-GACCA-GAGAAA------ACA-GGAC---AG----A-----C-AAAC---CT-TATAATACTT----C-AAT------GGG-ATAA----------AAATTT---AT--A--A---T-AT-G-TC-TCC-A----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-
gi|9 : agAA-----T---------ACAAG----A-A-AACCAACT-----TTT-G-T-C--AGCATCGTG-A--A-T-CAC-A------------------------------------G-C-CTTTACGC---T-AC--TGT--TTG-AGCGA-AG----T-----A-ATAT--G-TT-GA-C--GAGAAAGCG-GTACA-G-AC---AGTAATATAT--C-A-AC---ATGGA--GCC-TT----C-AATA-TGG-GGG-ATAG----------AAA--T---ATAAA--A-----AT-GGTC-TCCAA----ATTC-AC-A--C-----GT-T-A-AAACT----A----AAC---AT-ACAATA-TATG-CTT--TGGAA----TGC-A-TTA---T-TTGAGT-T-TTA-CAATATTTCAA------GAAG--AAAAA-----AA-TAA-TATT--------AC--C-AAGTTTG--A---AG--T---CGCT----GGCATTT---TTGCC-CA-----CCTG-------G---------GG---AGGGGT----G----GGG-----G------T----AATT-GA----T-CTA--AGT-G--C---CGCTAGT-A--CA--T---TTAAT-GCACCTGG---GC--TAT---CAAA--GC----GATAC-T--TCTTGAT--CA-A-TCAAA-T-ACTC--GCTGTAA--C---GA-G-C------A-CT----------TCTA--TG-T-----GT--A-AA-ATGTAG-A--A--A--GAAATTT-CAAATAGTGGT-CAATT----ATACTTTTCTC-C----GGCTG---AATG-TGA---TCTTCATg
blockSeqs : C ACATG A TT TA C C A AC TTT G A A C C A TCT C C A G G C TA GA T T TGTAATACATGTATTTTAAAATGATAGAA TT A CT T CA A C TT CGTTACG CCT A TTTA ACATAAAGACAT G A C TATA C TA T TT TG T T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGCATAGT A . GTA ACTTA TTATGAG TT G AT TAAT CATGTAGGGAAAATCTACGATTACAAGAC TG C T GA A T TAA CGT . GATATGAAT TGAATAAA AATAACACCCCAAATAACAAA TAACAAAGAA A CCGA G G AA . . C G TA G C T T . A G TATTTTACTTGT G A A GG T T A GG GT AT C T TACATGT T G TCG . C AC G C T A CCA TAATA AT T TACATGTAATGC ACGA A C T ATAATGTTCATATC T . CA TA AGAT C G T CAG A T CT CTGAG A . T TTCACA . AGA G CTA A T TTGGAATG A A . A . . A ATA GAAA GC GAA AAATCATTTGTTGGTTTA AA G TT GTG AT TAC AATA CTG TGCC ACCAC GGGCGGGGGGA AGA CGTGGG TGGT GGTGT GTGGGT GGAA T A ATTT . T GT G CC TGG A G GT TT CTT TA T G . . CC AC T TT TG CA C G A T . T CT TG AC . T C CCAATATAATGATTTTAC C AT G TGGGG TA C T TGT G AC AT AC G G ATAG G ATTA TACT AGG G T TCGA
blockSeqs : . . T . . . . . . . G G . . . T . . . . . . . CG . . . ACATAGAAGA C . . . . A . . CC T . . CCATT . . . . . . . AC GT G A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . GAT . G . CTTT GGCTAAAATCTAACATTACAGAACGAT T . C T . . TAA TGT . . ATGAAT ACAACCCCCAATAAGAAC GTATGT . A G . AC . . . . . . T . . . . . AACAATTAAT . . . G T . . . . . . . TCAT . T G . C C . . . A . A . . TCCTAGATTTGC . . . . GTAA T . GA . TT . . . GGC . . . . . . . ACT . . . CAA A T TGACAT . . . . . . . . GGAA . G TTTTTTTTTTTTA . . . . . . . . AA C GGGGAG CG GT . . . A . . T . . . . C . C A . . . . . . . . G . . GT . . . . . . . T . . . . . . GCGTAGGA . . . . A C C T A . . A T . T . . G CAT . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . G A . . . T . . . . . . . G . . . AGCTATAGGA . . . . . A . . CC T . . GATA . . . . . . . . . . . . AGT . G . T GATCTTAAAATCCACGATGTAA C . . T . . TAA CGT . . A ACAAACCCAATAACAA T . . . . A . . . . . . . . . . . . AACAAT . . . . . . . . . . . . GTC . . G . . C . . . . . A . . TACATGTATAGC . . . . ATAA . . GA . T . . . ATT . . . . . . . TT . . . . . T CGAAAC . . . . . . . . TGAA . G AATAATATTA . . . . . . . . G C TGG . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . TACATT . . . . . . . . A . . A . . . . . A CAG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A A . . . A . . . . . . . A . . . GTTATATTA . . . . . A . . TG T . . A . . . . . . . . . . . . AGT . G . T GGTAAATCTATATAAGTTT T . . T . . TAA CGT . . G ATAATAAAGGC T . . . . A . . . . . . . . . . . . AACAAT . . . . . . . . . . . . CGT . . G . . A . . . . . A . . TAGATGTATAC . . . . ATAA . . GA . T . . . AG . . . . . . . GT . . . . . T TTGAT . . . . . . . . GAAA . G ATCACCTTA . . . . . . . . A . GG . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TAACG . . . . . . . . . . . . . . . . . G AGC . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A A . . . T . . . . . . . G . . . ACTATAGGA . . . . . T . . C T . . A . . . . . . . . . . . . GCA . G . T CGACATTCTAAATATT T . . T . . . CG . . G CATCAAA T . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAAT . . . . . . . . . . . . TAT . . G . . G . . . . . A . . AACCTTATAAT . . . . ATAA . . GA . T . . . AC . . . . . . . TT . . . . . C TGAT . . . . . . . . GAA . A ATCATTTA . . . . . . . . C . GG . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . ATACC . . . . . . . . . . . . . . . . . G CG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A A . . . T . . . . . . . G . . . ACTATAGGA . . . . . A . . C T . . A . . . . . . . . . . . . GT . G . C GAGTAAAATCCACGTT T . . T . . . C . . A ACATCAA T . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAAT . . . . . . . . . . . . TGT . . G . . A . . . . . A . . CTCATGTTA . . . . ATAG . . GA . T . . . AG . . . . . . . TA . . . . . T TCAT . . . . . . . . AGA . A ATCATTTA . . . . . . . . A . GG . . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TACA . . . . . . . . . . . . . . . . . C CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A A . . . T . . . . . . . G . . . TGTAACA . . . . . A . . C T . . A . . . . . . . . . . . . GT . A . T GATAAAATCCACGATT . . . . . . . . . . A AAACCAA T . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAAT . . . . . . . . . . . . GT . . G . . A . . . . . A . . CTCATGTTA . . . . TAT . . GA . T . . . CG . . . . . . . TT . . . . . T TGAT . . . . . . . . GAA . G TTTTTTT . . . . . . . . A . GG . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TACT . . . . . . . . . . . . . . . . . C GG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A A . . . A . . . . . . . G . . . TGTAAC . . . . . A . . C T . . A . . . . . . . . . . . T . . . T GTGTAATCCTATGATT . . . . . . . . . . A ATTAACA T . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAAT . . . . . . . . . . . . TT . . T . . C . . . . . A . . ACATGGAGC . . . . AAA . . GA . T . . . GG . . . . . . . T . . . . . T TGA . . . . . . . . GAA . C ATATTTA . . . . . . . . A . GG . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TATA . . . . . . . . . . . . . . . . . C AG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A A . . . A . . . . . . . G . . . GCTAAT . . . . . T . . C T . . A . . . . . . . A AGATAA T . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAAT . . . . . . . . . . . . T . . G . . A . . . . . A . . TTGATG . . . . GT . . AA . T . . . AA . . . . . . . T . . . . . . GAC . . . . . . . . AAA . G ATATTTA . . . . . . . . A . GG . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TACA . . . . . . . . . . . . . . . . . G AG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . G . . . AGAA . . . . . A . . C . . . A . . . . . . . A AATAA T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . . . . A . . TATGC . . . . AT . . G . T . . . AG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . GAA . G ATCAAT . . . . . . . . A . CG . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TACA . . . . . . . . . . . . . . . . . G CG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . G . . . ACT . . . . . . . . C . . . A . . . . . T AAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . C . . . . . . . . GTATG . . . . T . . A . T . . . AG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . ATATCT . . . . . . . . A . GG . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TATA . . . . . . . . . . . . . . . . . G CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . TATAG . . . . T . . G . T . . . AG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . GA . . ACATTA . . . . . . . . A . GG . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TAC . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TATGC . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . T . . . . . . . ATTTA . . . . . . . . G . G . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . TCAT . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ACTATAGA************************ ***** A************** ****** GT******* G** GATAAAATCCACGATT************************** ** A************ AAACCAA*********************************** T************** **** ***** ** AACAAT***************** *** ** TGT******* G*** N* ATAA*********** *** T**** AG***** T****** **** TGAT********** *** *** ATCATTTA***************** ** A**** GG***************** ****** ** ** *** ** **** T*** ***** CG****
originalCons : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTT------------A-CT--------ATAG--NAATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-------G-GT----AAA-TCTA-C-A--T-ACAA---G-TTGTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-G-TTTTAAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATA----A-----------A--T--A--A----------------ATCAA-----T---------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GG----T--GT-A-A-AT--G-TT-GA-CA-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC-A--T-----GT-T-A-AA-TT----A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTT--CG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
finalCons : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-C-CTTTACTATAGA------------------------ATTGA--AATG-A--A-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTGA--------------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TAGT-------TCAT--GAG--AT--G---T---TAGATAAAATCCACGATT--------------------------GTAAGGAAAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-G-TTTTAAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AAA------------AATAAAACCAA-----------------------------------ATCAAT--------------ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCAC-AAACAAT-----------------ATA-G-G-G--A-G-C-CTTTTCGC---TCAC--TTT--CCG-AGCAA-GGTGT-------A-A-ATG---TT-GA-CN-GAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGGATAA-----------AAA-AT---ATGAA--AT----AT-G-TC-TCCAAAG-----C-AC-A--T-----GT-T-A-AAT------A----AAC---AT-A---TA-TATGTCTTGAT----------C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAG--AAAAAATCATTTA-----------------C--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---TA----CA-----CCGG-----------------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATACT---TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTCCG----GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTCTTTATAAATAATTATGATTTTGCAATTTTTTAAATAACTTAAAT
Alignments
lowQualScore : 66666666666666666666666666666666666666666666 11111 2222222 333333333333333 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 222222222222222222222 2222222222222222 22222222222 11111 1111111 1111 111 111111111 2222222222222 55555555555555555555555555555 1111111111 1111 11 111111111111111 333333333333 44444444444444 222222222222222 111111 111 2222222222222 111 1111111111111111111111111 11111 1111111111111111111 111111 111111 22 1111 22222222222222222222 1 111111
lowQualScore : 3 77777 5 33 33 2 2 3 44 555 5 1 3 3 3 1 555 2 2 2 2 2 2 55 33 2 33 77777777777777777777777777777777777777777777 00000 77777 44 1 3 44 9999999 555 6 7777 000000000000000 3 3 3 7777 3 55 4 33 22 1 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 222222 000000000000000000000 66 666 66 9999999 7777777777777777 777 4 11111111111 11111 3333333 66 88 4 8 66 4 7777 000 66 0 333333333 1111111111111 66666666666666666666666666666 44 555 3333333333 3 4444 8 2 00 7777777 2 2 2 33 2 5 2 2 33 2 55 2 777777777777777 6666 2 2 2 66 5 8 888 2 66 44 3 000000000000 3 3 6 6666 2 2 99 2 2 2 2 5 555 77777 33 2 55555555555555 11 6666 2 2 2 888888888888888 5 444 11 33 55555 2 5 2 9999999 2 111111 999999999 33 2 55 6666 3 3 000 3 2222222222222 3 3 555 3 2 2 2 000 99 3 33 1 33 8888888888888888888888888 33 2 33 444 55 444 5555 444 66666 11111 8888888888888888888 777 000000 5555 66666 222222 7777 2 2 7777 2 2 33 2 00 444 5 1 33 66 444 33 2 2 444 33 55 33 7777 1111 33 33 2 5 2 2 2 5 33 33 33 2 2 2 00000000000000000000 2 33 2 88888 55 7 5 666 0 33 33 88 7 2 8888 2 5555 9999 444444 0 2 2 8888
lowQualScore : . ..... . .. .. . . . .. ... . . . . . . ... . . . . . . .. .. . .. ............................................ ..... ..... .. . . .. ....... ... . .... ............... . . . .... . .. . .. .. . . ............................................................... . ...... ..................... .. ... .. ....... ................ ... . ........... ..... ....... .. .. . . .. . .... ... .. . ......... ............. ............................. .. ... .......... . .... . . .. ....... . . . .. . . . . .. . .. . ............... .... . . . .. . . ... . .. .. . ............ . . . .... . . .. . . . . . ... ..... .. . .............. .. .... . . . ............... . ... .. .. ..... . . . ....... . ...... ......... .. . .. .... . . ... . ............. . . ... . . . . ... .. . .. . .. ......................... .. . .. ... .. ... .... ... ..... ..... ................... ... ...... .... ..... ...... .... . . .... . . .. . .. ... . . .. .. ... .. . . ... .. .. .. .... .... .. .. . . . . . . .. .. .. . . . .................... . .. . ..... .. . . ... . .. .. .. . . .... . .... .... ...... . . . ....
lowQualScore : 3 11111 7 99 99 9 9 1 22 444 0 5 1 1 1 0 000 9 9 9 9 7 7 88 77 7 77 99999999999999999999999999999999999999999999 00000 77777 22 6 3 66 2222222 000 7 1111 222222222222222 3 3 3 1111 6 00 4 88 00 0 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 888888 777777777777777777777 11 222 11 9999999 3333333333333333 888 4 11111111111 33333 7777777 11 00 4 9 44 4 8888 111 11 2 333333333 8888888888888 11111111111111111111111111111 22 444 0000000000 1 6666 6 9 77 5555555 9 9 9 99 9 7 9 9 99 9 44 9 000000000000000 1111 9 9 9 88 7 6 999 9 88 22 1 000000000000 1 1 2 2222 9 9 44 9 9 9 9 7 000 66666 99 9 88888888888888 44 1111 9 9 9 222222222222222 3 777 88 77 55555 5 0 5 7777777 4 555555 444444444 22 4 99 1111 1 1 888 1 8888888888888 1 1 444 1 9 9 9 000 66 2 99 2 77 9999999999999999999999999 77 7 22 111 66 111 0000 111 88888 22222 4444444444444444444 444 000000 0000 22222 555555 8888 5 5 8888 5 5 44 5 99 444 0 4 44 33 777 44 5 5 444 22 66 22 4444 1111 44 44 5 0 5 5 5 0 44 44 44 5 5 5 99999999999999999999 5 44 5 88888 99 5 0 999 0 44 44 44 5 5 3333 7 7777 1111 222222 1 9 9 9999
consensus : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-CCTT--T------------A-CT--------AT---A-G-AA-TT-GA---AAT---G-AA-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-GA-T------A----AA---ATCC-A-----------CGATT----GTAAG------GA--AAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-GTTTT-AAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATAA--A----AC--C----------AA-----ATC--A---A-----T----ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCA-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GC-CTTTTCGC---T-CAC--TTT--CCG-AGCAA-GG---T----GT-A-A-AT--G-TT-GA-CN-G-AGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC---A--TG---------TT--A-AA--TA----AA-CAT-A---TA-TATGTC-TTG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAGAAAA--A-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
Reference ( family-68 ) : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-CCTT--T------------A-CT--------AT---A-G-AA-TT-GA---AAT---G-AA-----AGTGGC--AATTAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--TATTTNNTNANAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-GA-T------A----AA---ATCC-A-----------CGATT----GTAAG------GA--AAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA-GTTTT-AAAAACCGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATAA--A----AC--C----------AA-----ATC--A---A-----T----ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCA-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GC-CTTTTCGC---T-CAC--TTT--CCG-AGCAA-GG---T----GT-A-A-AT--G-TT-GA-CN-G-AGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC---A--TG---------TT--A-AA--TA----AA-CAT-A---TA-TATGTC-TTG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAGAAAA--A-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTT
gi|1 : GGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGG-AAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GATGCT-TACC-TA-GTT--A-CCTT--T---------------T--------GT---A-A-CA----AA---AGT---T-AACCTTTAGAGGC--AATTTT-AA--TCCCTG-----A-GTTTG--CTTATTTAA----TTG---GATAT-------T-ATT-A-T----AAA-A--C
gi|1 : ---------ATAAC-TTGAAACTACATA---CA-----TA-G-A-----TCAT--GACGCAT--G---C---TACGG-T------A----AA---ATCT-A-----------CAAGTACAAGTAAC------GA--ACTTT-CAA--AGA-TTA-TAAA-GTTTT-AAA--CCGCTTCTGTACCTTTA---------AACAC----A-----AATAG--A-----C--C----------AATAACAATC--G---A-----TTGTCACA-GG---A-A-A--AAACTGGCTATTTAG-T-C--A-CC-CG-G-ACAA-TGCG-C-AAAAACAAAAT---A---AT----AGA-G-G-A--A-GCACTTTTCTCACAT-CACC-TTT--CCG-AGCAC-GGACATCG--GC-A-A-TT--AATTAGA-C--G-AGAAA-CG-G-ACA-GGAC---CA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AATT-TGG-GGG----A----------AAA-ATTCAATGAA--A---TAAT-GATC-TCCAATTACGG-C-AC---A--TG---------TCAAA-AA--TACAACAA-TAT-A---TA-CATGTCACTGTCATGCTT-C-A-TTATATT-TTGAAGATATTA-CAAATCCTG-AAT--TAG-AGAAAA--G-----C--CTA-T-T----------C--C-AGG--TG--G---CGT-T---CGCT----GTTCTTT---T-----TA-----CT-GTGGGTGAG---------GG---AGGG------G----GGG-----GTGAT--T----AA-T-GA----TCA-A--AGT-GA-C---CG-CCCTAA--CAT-T---T--AT-GAACCT-GGTAACAATAT--CCAAA--CCTAAAAATAT-TTCTTT--AT--CA-AGTC-AA-TGAC-T--GC--TAA--CAATAA-G-C----T-A-CA----------T-TA--TA-TG----GT--AGAA-A---ATAA--A--A--GAAAGTT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCGTC-C-AGCGGCTGAA-CCTG-TG----TCTTTAccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgaaactacatacatagatcatgacgcatgctacggtaaaatctacaagtacaagtaacgaactttcaaagattataaagttttaaaccgcttctgtacctttaaacacaaatagaccaataacaatcgattgtcacaggaaaaaactggctatttagtcacccggacaatgcgcaaaaacaaaataatagaggaagcacttttctcacatcacctttccgagcacggacatcggcaattaattagacgagaaacggacaggaccaagaccatatgcccttcaatttgggggaaaaattcaatgaaataatgatctccaattacggcacatgtcaaaaatacaacaatatatacatgtcactgtcatgcttcattatattttgaagatattacaaatcctgaattagagaaaagcctattccaggtggcgttcgctgttctttttactgtgggtgagggaggggggggtgattaatgatcaaagtgaccgccctaacatttatgaacctggtaacaatatccaaacctaaaaatatttctttatcaagtcaatgactgctaacaataagctacattatatggtagaaaataaaagaaagttcaatggtcaattagttcgtccagcggctgaacctgtgtctttaat
gi|10 : ggaagtgattgcgtggtatcacgtggtttattgctttagtacgggaaaattatgacatcacaattaatatcatgacgtcacaattgatgcttacctagttaccttttgtaacaaaagttaacctttagaggcaattttaatccctgagtttgcttatttaattggatattattataaaacccctcccaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAC-TTG------CATG---TAACTTATA-GAT-----TCAG--GA-G-AT--G---T---CGCGA-C------ATTCTAA---AT-----------------ATT----ACAAG------GT--AAATT-CAA-TAGA-TTT-AAAA------------CCGTTT--GTACCTT-A---------AA-------A-----AATAA--G----ATAAC----------AA-----AGT--A---A-----A----ATA-A----ATA-A--TAATA-----ATA-A-T-A--A-AA----G-A--A-CACATC-AAAAC-----C---A---AT----ACA-G-A-G--A-AC-AATTTTGT---TACAC--at
gi|10 : TAA---------AA-------G-----AACAC--A----TC--A----------AA-----ACC--A---A-----T----ACA-G----AGA-A--CAA-T-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-GTA--A-TGCA-C-AA--------C---A---AT----ATA-G-G-GGGA-GC-CTTTTC-----T-CAC--TTT--CCG-AGCAA-GG---T---------A-AT--G-TT-GA-CC-G-AGAAA-CG-G--CA-GGAC---AA----------T-ACTC---ATGT-TA----TT----C-AATA-TGG-GGGTAT-------------AA-AT---ATG-A--A---T--T-G-TC-TCCAA----AG-CAAC---A--TG---------TT--A-AG--Tggtaatgcacaacaatatagggggagccttttctcactttccgagcaaggtaatgttgaccgagaaacggcaggacaatactcatgttattcaatatgggggtataaatatgaattgtctccaaagcaacatgttaagtt
gi|11 : acttgcatgtaacttatagattcaggagatgtcgcgacattctaaatattacaaggtaaattcaatagatttaaaaccgtttgtaccttaaaaaataagataacaaagtaaaataaataataataataaGAC---AA----AGAC--CTATTG---ATG-------CTT-------ATA-TGG-GG---T------------------------AA--A---T-AT-G-TC-T-CAA----A---------A--TG---------TT--A-AA--T-----AA-CATGA---TA-TA-GTC-TTG--A----T-CAA-TTA---T-TTGGAG-T-TTG-CA---TTTG--AT--GAGAAG---A--A-----A--TCA-A-T----------C--C-AG-GT----A---CG--T---CGCTAATAGGCAAAA---T---G-CA-----C----------G---------GG---GGGG------T----TGA-----T------T----AA-T-------T-A-A--AGT-GCCC---CA-TTGTAA--CT--C---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCA-----C----GATAC----TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-A--C--GC--T-A--C--TAA-G-C----TAA-CG----------T-TA--TA-C-----GT--ACAATA---AT-A--A--A--GAAA-TTGCAA----TGGT-CA--T----A---GTT--TC-C-G--G--TAGA-AATG-TG----t
gi|12 : -AT-A-TC-TTCAA----AC-C-AT---AAACA---------TA--G-AG--TA----TA-TGT-A---TAATATGTC-TTG--ACA--T-C-A-TTA---C-TTGAAG-T-TTG-CG---TTAGAAAT--TATAA-ATAA--G-----A--T-A-T-CT---------C--C-AGAATTG--A---CGATC---CGTT----GG-A----------A-CA-----TC-----------------------------------------------G------T----AA---------------------------CA-TAACAA--C----------CT-GAA---------C--TAT--CC-AA--TC----GATACTT--TTT--AT--C--A-TC-AA---A--C--AC--TAA--C-ATAA-T-C----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---TA-A--A--A--GAAA-TC-CAAT---TAG---AATT----A----CTTCTCAG-G--GGTTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTcatta
gi|13 : aatggataaga--A----T-C-AATTG---TATTAAAG-T-TAAACA---TTTGAA-T--GAGA-----------------TTT-T-TT--------TC--T-AAACATA--AGTGCG--T---CGT------GCGTTT---A---AACA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----GGG-----GGTGGGTTGGAAAA-T-GA----T-A-A---GT-C--C---CA-TA-TAA---A--T---T--ATTGAACTT-----AC--TAT--CCAAA--CC-----ATACGT--TTT--AT--CA-G-TC-AA-T-AC---------AA--C-ATAA-G-CA---T-A-CC----------T-TT--TG-T-----A---A-AA-A---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATTATTAA---ATTTCTC-C-AT-GCCTGAA-AATG-CGTCGATCTTCATTT
gi|14 : G-T-ATA-CA---TTTGGAAT--GAAAAGAAAA--A-----AAATCA-T-TTGTTGGTTTACAAC-AGAATTCTTA---TG--TTACCGCG----GGCATTTCTGT---C-TA-----CC-G-------G---------GG---AGGGCGTGGGG----GAG-----G------T----AA-T-TAATTTT-A-AGTAGT-G--ATGGCA-TTGTATGTCA--TCTTT--AT-GAACCT-G---AA--TATG-CTAAAACCC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-CCTAC--TGA--C-ATCATG-CCCAAT-A-TAATGATTTTACT-TA--TG-T-----GT--A-GA-A---AT-AACA--A--TAAA-TT-
gi|15 : TAA---------AA-------G-----AACAA--C----AT--C----------AA-----AAC--A---A-----T----ACA-G----AGA-A--CAATT-----TTT-G-T-T--A-CA-CG-G-A--A-TGCA-C-AAA-------C---A---AT----ATAGG-G-G--A-GC-CTTTTCGC---T-CAC--TTT--CCG-AGCAA-G---------GT-A-A-AT--G-TT-GA-CC-G-AGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----------T-ACTC---ATGT-TA----TT----C-AATA-TGG-GGG-GT--------------A-AT---AT------------T-G-TCTTCCAA----AG-C-AA---A--TG---------TT--A-A
gi|16 : ttaaaaaataagataacaaagtaaaataataataataataaAAAA--A-----A--T-A-T-TT--------AT--C-AGAGTTG--A---CG--T---CACT----GGCACTT---T---A-CAC----CC-G-------G---------GG---AGGA------G----GGT-----G------T----AA-T-GA----T-G-A--AGT-GC-C---CA-TAGTAA--CA--T---T--AT-GAACTT-G---AC--TAT--CCAAA--TC------TAC-T--TTT--AT--CACA-CC-AATT-GC-T--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-C-----------T-TA--TA-CTGGGGGT--A-AA-AT--AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----CG---CAATT----A---GTTTCTT-C-A--GGCTAAA-AATG-TG----TCTTCATTTg
gi|17 : ---------AA-------A-----AACAA--A----AC--C----------AA-----AAC--A---A----------ACA-G----A-AGA--CAATG-----TTT-G-T-C--A-CA-CA-G-A--A-TACA-C-AAA-------C---A---AT----ATA-GAG-G--A-GA-CTTTTTGC---T-CAC--TTT--CCG-AGCAT-G---------GT-A-A-AA--G-TT-AA-CA-G-ATAAA-TG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AATA--GG-GGG-AT------------AAA-AT---ATCAA--A---T-AT-G-TT-TCCAA----CG-G-ACT--A--TG---------TT--A-AA--TA----
gi|18 : aaccAAG-TGAG-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGGAAAATTAT-GACATC-ACA-A-TAAAACT---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-CCTT--T------------A-C---------ATAGAA-G-AA-TT-GAC--AAT---G-AA-----AGTGGC--AAATAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTG---A-----------TGATTAA-T----AAA-A--cc
gi|19 : AG-TTAT-----T-GCGTGATAT--CA--CGCG-A-TTTATC-GC--TTTAGT---ACGGGGAGAGT-AT-GAACTC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GCC-AC-AATT-AACTTT-TACC-AA-ACT--A-CTTT--TT-----------G-TT--------AT---A------TT--A---GCTCTAG-AA-----ATTG------TTAT-AA--TCCCTGC------GTTTG--TTT-C--------------A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--CA-ATCAA--Taacccaatt
gi|2 : GAT-----T-GCTTTGT-T--CATACATG-G-T--AGT-GC--TTTAGT---A--GGGAATATAATAGACAGC-ACA-ATTAAT-TCTCTATGAC-GTC--C-AATT-GACGTT-TACA-AATATT--ATCCTT--T---------------T--------GT---A-A-CA-TTAGT---AAC-----AT-----AGTAGC--AATT-T-A----TCCTG-----C-GTTTG---TT-TTTAT----TTGGATA-----------T-ATT-A-T----TAC-A--CATATCGATTTATTTtaagt
gi|2 : tg---------ATTAC-TTG------TCTA---TA-----TA-T-TATGAGTCAT--GA-G--T--G---TAATTA-GGCT------A----AA---ATCT-AACATTACAGAACGAT-----GTA-G------GT--AAATTGCAA-TAGATTTT-AAAA-GTTT----AAACCG-TT--GTACCTTTA---------CA-------A-----AATAAT-A----AT--A----------AAGGC--ATC--A---AGTATGT----ATG-A----A-A-A--CGG-------TTT-G-T-CTAA-CGCCG-G-A--A-TGCA-CGAAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATGTAATTTTCGCGG-T-TACGTTTT--CCG-AGCAA-GG---T-----T-A-A-TG--G-TT-GA-CG-G-AGAAA-CGCG-ACA-GGA----AA----AGAC-------------GTATG--CCTT----G-AAGACTGG-GGA-GTAA----------AAA-AA---TTGAA--A---T-GT-T-CC-TT--G----GG-C-AC---ATCTGAGGTTGTATTT--A-AA--TA----GA--AC-A---TA-TATG-------------------------T-TTGAAT-T-TTG-TA---TT--AGAT--GAG--GGACG--ATTTTTT--TTT-T-TT--------AC--CGAGAG-TA--A---CG--T---CA-T----GTCATTT---T---A-CAACCACCC-G-------G---------GG---GGGG------GTGGTGGGGGTGTG------T----AA-TAGA----T-A-A--CGTGG--C---CG-TAGTA----A--T---T---T-AGACCT-G---AC--TAT--GCAGA--CCT---GATAC-TG-TTT--AT--CA-AGTC-AG-T-CT-C--GC--TGAACC-ATAG-A-CGCG-T-AGGA----------T-TAATTAGT-----GT--ACAACA---AT-A--AATA--GAAAGTT-CAA----TGTT---ATT----A---G-TTCTC-CAG--GGCTGAAGAATA-TG----TCTTtgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatattacttgtctatatattatgagtcatgagtgtaattaggctaaaatctaacattacagaacgatgtaggtaaattgcaatagattttaaaagtttaaaccgttgtacctttacaaaataataataaaggcatcaagtatgtatgaaaacggtttgtctaacgccggaatgcacgaaacaatatagggatgtaattttcgcggttacgttttccgagcaaggttaatggttgacggagaaacgcgacaggaaaagacgtatgccttgaagactggggagtaaaaaaattgaaatgttccttgggcacatctgaggttgtatttaaatagaacatatatgtttgaattttgtattagatgagggacgattttttttttttaccgagagtaacgtcatgtcattttacaaccacccgggggggggtggtgggggtgtgtaatagataacgtggccgtagtaatttagacctgactatgcagacctgatactgtttatcaagtcagtctcgctgaaccatagacgcgtaggattaattagtgtacaacaataaatagaaagttcaatgttattagttctccagggctgaagaatatgtctttt
gi|20 : tggattgctttgttcatacatggtagtgctttagtagggaatataatagacagcacaattaattctctatgacgtccaattgacgtttacaaatattatccttttgtaacattagtaacatagtagcaatttatcctgcgtttgtttttatttggatatattattacacatatcgatttattttgactttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgaatGAAA-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTT-GT---ACGGGAAAA-TTAT-GACATC-ACA-ATTAAAAGC---ATGAC-ATC-AC-AATT-GACATT-TACC-AA-GTT--A-CCTT--T------------A-CT------------------------------T---G-AA-----AGTGGC--AAATAT-TA--TCCCTG-----C-GTTTA--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----tt
gi|21 : AA----------AAA-AT---AAGAA--A---T--T-G-----CCA--------C-ACGGAA--T----------TC--ACAA--AA----AA-TAT-A----A-TATGTC-TTC--A----T-C-A-TTA---A-TTAAAG-T-TTA-CA---TTT----------------------------TCA-T-----------------AAAAT----A---TG--T---CGCT----GGCATTG---T---A-CA-----CC--------------------C---GATG------G----GGT-----G------T----AA-T-AA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TAGTAA--Ctat
gi|22 : TC---ATAAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA-GTT--A-CCTT--TTGTAATACATGTA-TTTTAAAATGAT---A-G-AAATT-AA---ATT---G-AA-----AGTGGC--GATGAT-AA--TTCCTGCGTTACGGTTTG--TTT-TTTAA----TTG---A-----------T-ATT-A-C----AAA-A--TA-ATC
gi|23 : ATTAT-GACATC-AAT-ATTAATAGC---ATGAC-GCC-AT-AATT-GATACT-TTTT-G----T--A-GCAT--T------------AGCT--------AT---AGG-AA-TT-GA---AAT---G-AA-----AGTGGC--
gi|24 : tttcttttgaacattgtaattgtacaatcttaaagaagtgattgcatggtttC--TA---CCAAG--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-C--GC--TGA--C-ATAA-G-C----T-A-CT----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--AAAA-TT-CAA----TGGT-TAATT----A---CTTCTTC-G-G--GGCTGAA-AATG-AG----TCTTCATTTg
gi|25 : ccaataatataag---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA-----------AGT-G--C---CC-TTATGA--CA--A---A--AC-TAACCT-A---AA--TGT--CGACA--CC----GCTAC----TTT--AT--TG-A-TA-AA-T-AC-C--AC--ACA--G-ATAA-G-C------------------------------------T--A-AA-A---GT-A--A--AACAGAA-TC-CAA----AGAT-CAATT----A---CTTCC
gi|26 : AAGAAAG-TAATACATGTAGCTTGATAT--CA--CGTA-G-TTTATT-GC--TTTATT---ACGAGAAAA-TTAT-GACATC-ATA-ATTTATATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GGCGTT-TACT-AA-GTT--A-CCGT--T------------g
gi|27 : AAGGAAG-TGAT-----T-GCGTTGTAT--CA--CGTG-G-TTGATT-GC--TTTAGT---ACGGG-GAAATTAT-GACATC-AC-----AATGGC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGCA-TACC-AA-GCT--A-CATT--T------------
gi|28 : -GA-CA-G-AGAAA-CA-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATA---------TAGC--TT----T-AATA-TAG-GGG-ATAATGTTCATATCAAATAT---ATG--------T-AT-G-TC-TCCAA----AA-C-AC---A--TG---------TT--A-AA--TA----AA-CAT-A---TA-Ttgt
gi|29 : GTT-TACC-AA-GCT--A-CCTT--T---------------T--------GT---A-A-CA-TT-AGTTCACT-----AT-----AGTAGC--AATTTT-CA--TCCCTGC------GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---ACATAAAGACATT-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATCGA--Tt
gi|3 : AAGGAAG-T-AT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG---TTTATT-GCACTTTAGT---ACGGGAAA--TTAT-GACATC-A-A-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-ACAAATTGGACGTT-TACC-AA--TTGAA-CCT----------------------------------------TT-GA---AAT---GAAA-----AGTGGC--AAATAT-AA--ATCGTG-----C-GTTTT--TTT-TTTTTTTTATTG---A-----------T-ATT-A-TTATAAAA-A--CA-ATTGA--CATTTtt
gi|3 : AAC-TTG------CATG---TC-----TAAG-T-----TCAT--GA-G-ATATG---T---TA-GAGT------A----AA---ATCC-A-----------CG-TT----GTAAA------CA--AAAT--CAA-TAGA-GTT-AAAA-GTTTT-AAAAAAC---T--GTAACTTAA---------AATGAATAAA-----AATAACAA----AC--CCAATAAC---AA-----ATC--A---A-----T----ACA-G----A-A-AAACAACT-----TTT-G-T-C--A-AG-CA-G-A--AATGCA-C-AAA-------C---A---ATTAATATA-G-G-GG-A-GC-CTTTTCGC---T-CAC--TTT--CCG-AGCAA-AG--------GTCATA-AT--G-TT-GA-CACG-AGAAA-CG-G-ACAAGGAC---AA-----GAC--C-ATAC---ATGTAATGCCATTACGAC-AA-A-TAGTGGG-A-AA----------AAA-AT---ATGAA--AAGAT-ATCA-TC-TCCAA-----G-C-AA---C--TG---------TT--A-AA--TA----AA-CAT-A---TA-TATGTC-TTG--A------C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTTGAAT--GAGAAGAAAAAAA-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---GGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-GGGGA---G---------GG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TTGTAA--AA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AC--CA-A-TT-AA-T-ACTC--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-TA----------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-T---AA-A--A--G--GAAA-TT-CAA----T-GT-CAATT----A---CTTTC-C-A-G--GGCTG-A-AATGTTG----TCTTCatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaacttgcatgtctaagttcatgagatatgttagagtaaaatccacgttgtaaacaaaatcaatagagttaaaagttttaaaaaactgtaacttaaaatgaataaaaataacaaacccaataacaaatcaatacagaaaaacaacttttgtcaagcagaaatgcacaaacaattaatataggggagccttttcgctcactttccgagcaaaggtcataatgttgacacgagaaacggacaaggacaagaccatacatgtaatgccattacgacaaatagtgggaaaaaaatatgaaaagatatcatctccaagcaactgttaaataaacatatatatgtcttgacattatttgaagtttacattttgaatgagaagaaaaaaaatcatttaccagagttgacgtggctggcattttacaccggggaggggggggggggtaatgataaagtgtccattgtaaaattatgaacctgactatccaaaccgatacttttaccaattaatactcgctaacataagctatattatatgtaaataaaaggaaattcaatgtcaattactttccagggctgaaatgttgtcttc
gi|30 : aaggaagtattgcgtggtatcacgtgtttattgcactttagtacgggaaattatgacatcaaattaaaatcatgacgtcacaaattggacgtttaccaattgaacctttgaaatgaaaagtggcaaatataaatcgtgcgtttttttttttttttattgatattattataaaaacaattgacatttatgtttgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnata----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--G-CA-CG-G-A--A-TGCA-C-ATA-------TTTTACTTGT----ATA-G-GAG--A-GC-CTTTTCGC---T-CAC--TTT---CA-AGTGA-G---------GT-A-A-AT--G-TT-GA-CA-G-ACAAA-CA-A-ACA-GG
gi|31 : gaA----AG-C-AC---A--TG---------TT--A-AA--TA----AA-CAT-A---CA-CATGCC-CTG--A----T-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TGTG-AAT--GAGAAAAAAA--A----------A-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---AGCT----GGCATTT---
gi|32 : TTG--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------GGCGGGGGGAGG---GGGG------G----GGG-----G------T----AA-T-AA----T-A-A--AGG-GC-C---CA-TATTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----G
gi|33 : aTNG--A---CG--T---CGCT----GTCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GG---GGGG------G----
gi|34 : aatgacagaaatgaatgtattgctgt-TA--TA-T-----GT--A-AA-G---AT-A--A--AA-GAAA-TT-CAA----TGCT-CAAT---------GT--------G-----TGGA-AATG-TG----TCTTCATttaatg
gi|35 : --AT-GAACCT-G---AT--TAT--CCAAG--CA----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--AA--TAA--T-ATAA-G-C----T-gt
gi|36 : AGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGCAT--CA--TGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAA
gi|38 : TTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--TA--CGTG-G-T
gi|4 : taaaaGGAAG-GGAT-----TTGCGTGCTATTTCA--CGTGCGCTTTATT-GC--TTTAAG---ATGG-AAAAATTAG-CACATC-ACACATTAAAATC---ATGACCGTCCAC-AATT-G-CTTT-TACCCAA-GTT--A-CATT--T------------A-CT--------AT---AGG-AA-TT-GA---AAT---G-GA-----ATTGGCCAAATAATCAATTTCCCTG-----C-GTTTT--TTTATTTAT----TTGCC-ATT---------T-ATT-ACT----AAACA--CA-AGTGA--T
gi|4 : C---------ACAACACTG------CATGGTATA-----TAAG-T-----TCATTTGA---AT--GCTTT---TA-GA-TCTT---A----AA---ATCC-A-----------CGAT-----GTAAT------AACAAAATC-CAA-TAGA-TTT-AAAAAGTTTT-AAAAAC----T--GTACCTTAAGATATGAATAA-------A-----AATAAC-A----AC--CCCCAATAAG-AAC----ATC--A---G-----T----ACA-G----A-A-AA-CAACT-----TTC-A-TGC--G-CC-CG-G-A--A-TGCA-------------------------------G-G-G--A-GC-CTTTTCGC---T-CAC--TTTATCCGCAGCAATGG---TC---AT-A-A-AT--T-TT-GA-CC-G-AGAAA-CG---ACAAGGATCCAAA----AGAC--C-ATCCTAGATTT---GCCCT-----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-TT---ATGAATAA---TTAT-A-TC-TCCAAC---AG-C-AC------TT---------TT--A-AA--TA----AAACGT-ACTATA-TATGTC-TCG--AAA--C-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTGAA-T--GAGAAAAACA--A-----A--T-A-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CA--T---CGCT----GGCATTT---T---A-CA-----CC-G-------G---------GGCG-GGGG------A----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-G--C---TAATAGTAA--CA--T---T--AT-GAACCT-G---AC--TAT--CGAGA--CA----AATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-CA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G-C----T-A-CA----------A-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---ATGA--A--A--GAAA-TC-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTCTTC-A-G--GGCTGAA-AATG-TG----TCTTCATTTttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacacaacactgcatggtatataagttcatttgaatgcttttagatcttaaaatccacgatgtaataacaaaatccaatagatttaaaaagttttaaaaactgtaccttaagatatgaataaaaataacaacccccaataagaacatcagtacagaaaacaactttcatgcgcccggaatgcagggagccttttcgctcactttatccgcagcaatggtcataaattttgaccgagaaacgacaaggatccaaaagaccatcctagatttgccctcaatatgggggataaaaattatgaataattatatctccaacagcacttttaaataaaacgtactatatatgtctcgaaaccattatttgaagtttacatttgaatgagaaaaacaaatatttaccagagttgacatcgctggcattttacaccggggcgggggaggggtaatgataaagtgctaatagtaacattatgaacctgactatcgagacaaatacttttatcaattcataccgctaacataagctacaatatatgtaaaaatgaaagaaatccaatggtcaattagttcttcagggctgaaaatgtgtcttcattt
gi|5 : ggaagggatttgcgtgctatttcacgtgcgctttattgctttaagatggaaaaattagcacatcacacattaaaatcatgaccgtccacaattgcttttacccaagttacatttactataggaattgaaatggaattggccaaataatcaatttccctgcgtttttttatttatttgccatttattactaaacacaagtgatttcattgtgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaTTAAGGAAG-TGAT-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--TTTAGT---ACGGGAAAAATTAT-GACATC-ACA-ATTAAAATC---ATGAC-GTC-AT-AATT-GACGTT-TACT-AA-GTT--A-CCTT--T------------A-CT--------AT---A-GGAA-TT-GA---AAT---G-AA-----AGTGGC--AAATAT-AA--TCCCTGC----C-GTTTG--TTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-A--CA-ATTGA--TATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-GG-T------A----AATCTATAT-A-----------AGTTT----ATAAA------GA--AAAT--CAA-TAGA-TT----AA-GTTTTTAAAAACTGTTT--GTACCTTAA---------AA-------A-----AATAA--A--------T----------AA-----ATC--A---A-----T----ACA-G----A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--A-CA-CG-G-A--A-TGCA-C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-AC-TTTTTCGT---T-CAC--TTT--CCG-AGCAA-TG---TACATGT-A-A-AT--G-TT-CA-CA-G-AGAAA-CG-G-ACA-AGAC---AA----AGAC--C-ATAC---ATGTATAGCCCTT----C-AATA-TGG-GGG-ATAA----------AAA-AT---ATGAA--A---T-AT-G-TC-TCCAA----AG-C-AC---A--TG---------TT--A-AAT-TA----AA-CAT-A---TA-TATGTCTTTG--A----T-C-A-TAT---T-TTCAAG-T-TTA-CA---TTTGAAAT--GAGAAGAAAA--A-----A--TCACC-TT--------AC--C-AGAGTTA--A---CG--T---CGCT----GGCATTT---T---G-TA-----CC-C-------G---------GG---AGGG------G----GGG-----G------T-----A-T-GAT---T-A-A--AGT-G--C---CA-TAGCAA--CA--T---T--AT-GAACC--G---AC--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--AT--CA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--C-ATAA-G------T-A-CATT--------T-TA--TA-T-----GT--A-AA-A---AT-A--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A---GTTTCTC-C-G--GGCTGAA-AATT-TG----TCTTCATTT
gi|6 : GAAGCTGAT-----T--CGTGGTAT--CA---GTG-G-TTTATTAGC--TTTAGTTTTACGGCGAAAATTAT--ACATCCACA-ATTAATAT------GAC-GTC-A--AATT-GACGTTGTACC-AGCGTT--A-CCTTGCT------------A-AT--------ATTT-A-G-A---T------AAC---T-AT-----AGTAGC--CTTTTA-AA--TCCCTGC------GTTTGCCTTT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT---------------------------CTTTGTTATAAAAAATCGATTTATTTTGTTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ATAAC-T-G------CAT-----A-----TA-G-CA----TCAT--GA-G-AT--G---C---TA-CA-TGTAGGGA----AA---ATCT-A-----------CGATT----ACAAGACGAAGGA--AAATT-CAACTAGACTTT-AAAA-GTTT----AAACCGTTT--GTACCT-AC---------AA-------A-----AATAATTA----AC--------------A-----ATC--A---A-----T----ATA-GCCGAA-A-A--CGGCT-----TTT-GCT-C--A-CC-CG-G-A--A-TGC--C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--A-GTTCTTTTCGC---T-TAC--TTT--CCG-AGCCA-AG---C----GT-A-AGAT----TT-GA-CC-GGAGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGAC--C-ATAT----------GCCCTT----C-AAAA-TGG-GGG---------------AAA-AT---A-GAA--A---T-AT-G-TC-TCCTT----GGCC-AC---ACTTA---------TT--A-AA--TA----AA-CAT-A---TA-------------------------TG---T-TTGAAG-T-TTA-TA---TT--AAATGCGAGAACAAAA--A-----A---CA---TT--------AT--C-CGAGTTA--A---CG--T---CAAT----GTCATTT---T---A-CAC----CC-G-------G---------GG---GGGA------G----GGG-----G------T----AA-T-GA----T-A-A--AGT-GA-C---CG-TA-TAA--CATTT---T--AT--AACCT-G---AC--TATCCCCAAA---C----GGTAC----TTT--AT--CA-A-TC-AA-T-AC-T--GC--TAA--C-ATAA-GCC----T-A-CA----------T-TA--TA-T-----GCTAA-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGTGTAATT----A---G-TTCCC-A-GC-GGCTAAA-AATA-TG----TCT
gi|7 : AAC-TTG------CATG---TA-----TA-G-T-----TCAT--GA-G-AT--G---T---TA-GA-T------A----AA---ATCC-A-----------CGATT----GTAAA------GA--AAA-T-CAA-TAGA--TT-AAAA-GTATT-AAAAAC----T--GTACCTTAA---------AA-------ATGAATAATAA--ATAACAC--CCCAAATAACAAA-----ATC--A---G-----T----ACA-GA---A-A-A--CAACT-----TTT-G-T-C--C-CA-CG-G-A--A-TGC------------------------------A-G-G-G--A-GC-CTTTTCGC---T-CAC--TTT--CCG-AGCAA-GG---T----AT-A-A-AT--T-TT-GA-CC-G-AGAAA-CG-G-ACA-GGAC---AA----AGACATC--TAG---ATGTATA-CCCTT----CAAATA-TGG-G----T-------------AA-AT---ATGAA--A---T-AT-A-TC-TCCAA----AG-C-AC---A--TG---------TT--A-AA--TA----AA-CAT-A---TA-TATGTC--TG--A----C-C-A-TTA---T-TTGAAG-T-TTA-CA---TTTG-AAT--GA-AAGAAAA--A-----A--TCA-T-TT--------AC--C-AGAGTTG--A---CG--T---CGCT----TTCATTT---T---G-CA-----CC-G-------G---------GGAGAGGGG------G----GGG-----G------TA---AA-T-GA----T-A-A--AGT-GT-C---CA-TAGT-A--CA--T---T--AT-GAA-CT-G---AA--TAT--CCAAA--CC----GATAC-T--TTT--ATCACA-A-TT-AA-T-AC-C--GC--TAA--A-ATAA-G-C----T-A-TA----------T-TA--TA-T-----GTA-A-AA-A---ATAA--A--A--GAAA-TT-CAA----TGGT-CAATT----A----CTTCTC-C-A--GGCTGAA-AATG-TG----TCTT-ATTatta
gi|8 : aa-----T-GCGTGGTAT--CA--CGTG-G-TTTATT-GC--------------------ATTAT-GACATC-ACA-ATTAATATC---ATGAC-GTC-AC-AATT-GACGTT-TACC-AA--------------------------------------------A-G-AAATT-GA---AAT---G-AA-----AATGGC--AATTAT-AA--TCCCTGT----G-GTT-G--TCT-TTTAT----TTG---A-----------T-ATT-A-T----AAA-ATACA-ATTGAACTATTTGTTGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGCATAGTATAAT-TTG------TATG---T-----------T-----TCAT--GA-A-AT--G---T---TA-G--T------G----TA---ATCCTA-----------TGATT----GTAAG------GA--GAATT-AAG-TAGA-TTGAAAAA-GTTT-----AACCGTTT---TAGGCTAA---------AAT------A-----AAAAA--A----AC--C----------AAT----AAC--AAAGA-----A----ACA-GA---A-A-A--CAAC------TTT-G-T-C--A--A-CG-G-A--A-TGC--C-AAA-------C---A---AT----ATA-G-G-G--ATGC-CTTTTCAC---T-CAC--TTT--CC---GCAA--A---T----GT-A-A-ATTCG--T-GACCA-G-AGAAA------ACA-GGAC---AG----A-----C-AAAC---CT-TATAATACTT----C-AAT------GGG-ATAA----------AAATTT---AT--A--A---T-AT-G-TC-TCC-A----AG-C-AC---A--TG---------TT--A-AA--
gi|9 : agC--C----------AA-----ATTCGA---A-----T----ACAAG----A-A-AACCAACT-----TTT-G-T-C--AGCATCGTG-A--A-T-CA-C-A------------------------------------GC-CTTTACGC---T--AC--TGT--TTG-AGCGA-AG---T-------A-ATAT--G-TT-GA-C--G-AGAAAGCG-GTACA-G-AC---AGTAATATAT--C-A-AC---ATGGA--GCC-TT----C-AATA-TGG-GGG-ATAG----------AAA--T---ATAAA--A-----AT-GGTC-TCCAA----ATTC-AC---A--CG---------TT--A-AAACTA----AA-CAT-ACAATA-TATGCT-TTGGAA----TGC-A-TTA---T-TTGAGT-T-TTA-CAATATTTCAA------GAAGAAAA--A-----AA-TAA-TATT--------AC--C-AAGTTTG--A---AG--T---CGCT----GGCATTT---TTGCC-CA-----CCTG-------G---------GG---AGGGGT----G----GGG-----G------T----AATT-GA----T-CTA--AGT-G--C---CGCTAGT-A--CA--T---TTAAT-GCACCTGG---GC--TAT---CAAA--GC----GATAC-T--TCTTGAT--CA-A-TCAAA-T-ACTC--GCTGTAA--C---GA-G-C------A-CT----------TCTA--TG-T-----GT--A-AA-ATGTAG-A--A--A--GAAATTT-CAAATAGTGGT-CAATT----ATACTTTTCTC-C----GGCTG---AATG-TGA---TCTTCATg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTCTTTATAAATAATTATGATTTTGCAATTTTTTAAATAACTTAAAT