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Reference ( family-633 ) : TATACATATC-CTAG-AT-A------TGTC-ACGC-AGT--AAAA---A-CTCCAGATTC-C----GAA--ATG-C------CA----C--CCAC-----TAAA-TTTT---GAT--TCGAATCGATAG---C-TG----------AC-TTAAT----CGT---------G-GA-AACAACAGAAC---AA-A-T-TCGAAA----CT-GTGACGA------------C---G----G--AACG-TT--GAGCACT---TA-CC-TGGGTCTGT---T-TA-AGCCAA-ACA---T-A-TG-A--GAA----GGGAAT-A--ATTGTGCAT-ATGCAACACAAAA--CAAA-ACA-CCAA--TA--GGACA--TTC-A-T-ATC-TGC------ATT-TTA-TT-TAC-T--TGTAG----------T--T--GTA-AC----------CG-----AAGT-----------CT-GT--AC-AC-A--T-TGTAGG--AATG--CGGTA-AATC---G-AG---TAACGC-CACGT---G-CC-------AA---CCG--ATCAGA--CTTC-ACTC-G-CC-GAC-AA-C-AAA---AGAAA-T-A--CTT---GC-G-TTGT-AATT----C---AT--GTATA--CACATG
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gi|6 : tattG-AT-A------TGT--ACGT-AGT--AAAA---T-CTC-AGATTC-C----GAA---TGAC------CA----C--CCAC-----TAAA-TCTTCTTGAT--TCGAATTGATA------------------------AT----CGT---------ATGA-AAGAACAGAAC---AA-A-TGTCGAAA----C---TGACTA----------------G----GATAGCG-TT--GAACACT---TA-CC-TGGATCGGT---TCTA-AG-CAA-AC----T-A-TGAA--GAA----GGGATA-A--ATTGTGCAT-ATGCAA-AC--------AA-ACA-CCAA--TA--GGGCA--TTC-ACT-ATC-TGC------ATA-TTA--T-TAC-T--TGTAA----------T--T--GTA-ACAGCTTA----CA-----AAGT-----------CTCGT--AC-AC-ACTC-TGTAGG---AT---CGGTA-AATC---G-AG---TAGCG--CACGT-----CC-------AGC--CCG--ATCAT---TTTC-ACTC-G-CC-GAC-AA-C-AA------AAA-T-GT-CTT---GC-G-TTGT-AATC----CA--AT--ATATATTCACA
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gi|8 : taaaaagtatacaattcctggcatatttcacgcagtaaaaacttcagattcgcgaaatgttagtggccgccactatttttgattgtcgaatcgattagaacatggcgaaactggactaaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna---------G-GA-AACAACAAAAC---AA-A-T-TTGAAT----CT-GTGACGA------------CTC-G----GCCGACGATT--GAGCAGT---TGTCC-TGGGCCTGT---G-TA-G--CAA-ACA---T-A-T--A--GAA----AGGAAT-A--ACTGTGCAT-ATGCAA-ACAAAA--TAAA-ACA-CCAAA-TA--GGGCA--TTC-A---GTC-TGCTTTGTGATT-TTA-TT-TACCT--TGTAG----------C--T--GTA-AC----------GG-----A-------------------------C----T-TGTAGG--AATGGCCGGTA-AATC---GTAG---TA-TGC-CACGT---G-CC-------AA---CTG--AACAAA--ATTCAATTC-G-CC-G-C-AA-CAAAA---AGAAAGTAA--TTT---GCGG-TTGT-TATT----T---AT--GTATA--CACATGggcctgtacgaggccttcgg
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blockSeqs : . . . . . . . ACTTC GC . . . . . C . T . AGCTGCACTT . . . . . . . . . . G CTCGGCCC . A . . . . GT . C . . A GT . T . . C . . . . . . . T . . . . . . . TTGTGACGGACTTCTCGCTTACAACTGTACACA . . . . . . . C . . . C G T . . . . . . . . . . . T . . . A CA . .
blockSeqs : . . . . . . . AACC C . . . . . C . T . AGCTATACTT . . . . . . . . . . G CTCG . T . . . . TC . C . . A GA . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . TTGTGACGACTTCTCGCTTACAACTGTACACA . . . . . . . C . . . . C T . . . . . . . . . . . T . . . A C . .
blockSeqs : . . . . . . . AACC C . . . . . A . T . GCTAACTT . . . . . . . . . . T CTCG . A . . . . T . C . . T GA . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . TTGTAACAGCTTACAAAGTCTCGTACACACT . . . . . . . C . . . . G T . . . . . . . . . . . C . . . A C . .
blockSeqs : . . . . . . . ACTC C . . . . . C . T . ACCTGT . . . . . . . . . . T TA . . . . . . T . C . . T GA . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . AGGACTTCTAGACCCTGTCCGTTTACATA . . . . . . . G . . . . G C . . . . . . . . . . . C . . . T C . .
blockSeqs : . . . . . . . ACTC C . . . . . T . T . AGCTGC . . . . . . . . . . A CG . . . . . . T . C . . A GA . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . TTGTAACCGAAGTCTGTACACA . . . . . . . C . . . . G C . . . . . . . . . . . C . . . T T .
blockSeqs : . . . . . . . ATTC C . . . . . C . T . C . . . . . . . . . . T CG . . . . . . T . C . . T GA . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . CTGTAACGGAC . . . . . . . C . . . . G T . . . . . . . . . . . T . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . ATTC C . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . T G . . . . . . T . C . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTGTAAGGAC . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . TCTC G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G G . . . . . . G . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . ACT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . G . . . . A G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . G . . . . A A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . .
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consensus : TATACATATC-CTAG-AT-A------TGTC-ACGC-AGT--AAAAA--C-TCA-GATTC-C----GAA--ATG-C------CA----C--CCAC-----TAAA-TTTT---GAT--TCGAATCGATAG---C-TG----------AC-TTAAT----CGT---------G-GA-AACAACAGAAC---AA-A-T-TCGAAA----CT-GTGACGA------------C---G----G--AACG-TT--GAGCACT---TA-CC-TGGGTCTGT---T-TA-AGCCAA-ACA---T-A-TG-A--GAA----GGGAAT-A--ATTGTGCAT-ATGCAACACAAAA--CAAA-ACA-CCAA--TA--GGACA--TTC-A-T-ATC-TGC------ATT-TTA-TT-TAC-T--TGTAG----------T--T--GTA-AC----------CG-----AAGT-----------CT-GT--AC-AC-A--T-TGTAGG--AATG--CGGTA-AATC---G-AG---TAACGC-CACGT---G-CC-------AA---CCG--ATCAGA--CTTC-ACTC-G-CC-GAC-AA-C-AAA---AGAAA-T-A--CTT---GC-G-TTGT-AATT----C---AT--GTATA--CACATG
Reference ( family-633 ) : TATACATATC-CTAG-AT-A------TGTC-ACGC-AGT--AAAAA--C-TCA-GATTC-C----GAA--ATG-C------CA----C--CCAC-----TAAA-TTTT---GAT--TCGAATCGATAG---C-TG----------AC-TTAAT----CGT---------G-GA-AACAACAGAAC---AA-A-T-TCGAAA----CT-GTGACGA------------C---G----G--AACG-TT--GAGCACT---TA-CC-TGGGTCTGT---T-TA-AGCCAA-ACA---T-A-TG-A--GAA----GGGAAT-A--ATTGTGCAT-ATGCAACACAAAA--CAAA-ACA-CCAA--TA--GGACA--TTC-A-T-ATC-TGC------ATT-TTA-TT-TAC-T--TGTAG----------T--T--GTA-AC----------CG-----AAGT-----------CT-GT--AC-AC-A--T-TGTAGG--AATG--CGGTA-AATC---G-AG---TAACGC-CACGT---G-CC-------AA---CCG--ATCAGA--CTTC-ACTC-G-CC-GAC-AA-C-AAA---AGAAA-T-A--CTT---GC-G-TTGT-AATT----C---AT--GTATA--CACATG
gi|1 : ATATATC-CTA------------TTTCTATGCCAGT--AAAAAACT-TCA-GATTC-C----GAA--ATA-CATGTACCAT---C--CCACAGGGATAAA-TTTT---GATCCTCGAATCAATCA---CGTGGGAAAAAAAAAA-TCAAT----CATCTGCCTGAAG-AA-AAAGACAGAAC---AA-AGT-TTGACA----CTTGGGACGATATCACCAGGCCC---A----G--GGCG-TTATGAGCACT---TA-CCGTGGGTCTGT---G-CACAGCCAATACA---T-ATTG-A--GAAAAAGGGAAAT-ATTGTTGTGCAT-A---AATGCAAAATTCAAATACACCCGATCTA--GGACATCTTC-A-C-A-------------------------------GTGG----------TTCT--GCA-AA----------CG-----GAAC-----------CT--T-----------T-CGTA-G--AATG--CTGTA-AATCTGAG-AG---TACTTC-TACGTGGAG-CCCGAAATGAA---ACA--A-CAAA--CTTCTATTC-G-CC-GAC-AAGC-GAAAATAGAAA-T-A--GTTTTAGC-GCTTGTAAATTTGACT---AT--GTATA--CACATG
gi|10 : tgtacatatttaacttagattaATTC-C----TAA--ATT-C------CA----C--AAAC-----TAAA-TTTG---GAT--T----TCGA-AC---C-TG--------------TAAT----GGT---------G-GA-AACAACCGAAC---AA-A-T-TCGAAATAAACT-GCAACGA---------------------------A-TT--GA------------------TCCGT---T-CA-AGCAAA-ACG---T-A-TG-T--GAA----GGGAAT-A--ACTGTGTAC-ATGCAACATTAAA--CAAC-TCA-CCAA--TA--TGAAA--TTC-A-T-ATC-TGC------ACT-CAA-TG-TAC-T--TGCAaatgtttt
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gi|6 : tattG-AT-A------TGT--ACGT-AGT--AAAAT--C-TCA-GATTC-C----GAA---TGAC------CA----C--CCAC-----TAAA-TCTTCTTGAT--TCGAATTGATA------------------------AT----CGT---------ATGA-AAGAACAGAAC---AA-A-TGTCGAAA----C---TGACTA----------------G----GATAGCG-TT--GAACACT---TA-CC-TGGATCGGT---TCTA-AG-CAA-AC----T-A-TGAA--GAA----GGGATA-A--ATTGTGCAT-ATGCAA-AC--------AA-ACA-CCAA--TA--GGGCA--TTC-ACT-ATC-TGC------ATA-TTA--T-TAC-T--TGTAA----------T--T--GTA-ACAGCTTA----CA-----AAGT-----------CTCGT--AC-AC-ACTC-TGTAGG---AT---CGGTA-AATC---G-AG---TAGCG--CACGT-----CC-------AGC--CCG--ATCAT---TTTC-ACTC-G-CC-GAC-AA-C-AA------AAA-T-GT-CTT---GC-G-TTGT-AATC----CA--AT--ATATATTCACA
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gi|8 : taaaaagtatacaattcctggcatatttcacgcagtaaaaacttcagattcgcgaaatgttagtggccgccactatttttgattgtcgaatcgattagaacatggcgaaactggactaaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna---------G-GA-AACAACAAAAC---AA-A-T-TTGAAT----CT-GTGACGA------------CTC-G----GCCGACGATT--GAGCAGT---TGTCC-TGGGCCTGT---G-TA-G--CAA-ACA---T-A-T--A--GAA----AGGAAT-A--ACTGTGCAT-ATGCAA-ACAAAA--TAAA-ACA-CCAAA-TA--GGGCA--TTC-A---GTC-TGCTTTGTGATT-TTA-TT-TACCT--TGTAG----------C--T--GTA-AC----------GG-----A-------------------------C----T-TGTAGG--AATGGCCGGTA-AATC---GTAG---TA-TGC-CACGT---G-CC-------AA---CTG--AACAAA--ATTCAATTC-G-CC-G-C-AA-CAAAA---AGAAAGTAA--TTT---GCGG-TTGT-TATT----T---AT--GTATA--CACATGggcctgtacgaggccttcgg
gi|9 : AAT----CGT---------G-GA-AACAACAGAAC---AA-A-T-TCGAAA----CT-GTGACGA------------CTC-G----G--AACA-TG--GAACACT---TA-CC-TGTGTCTGT---T-TA-AGCCAA-ACA---T-A-TG-A--GAA----AGGAAT-A--GTTGTGCAT-ATGCAACACAAAA--CAAA-ACA-CCAA--TA--GGATA--TTC-A-T-ATC-CGC------ATT-TTA-TT-TAC-T--TGTAAAGGAC-----T--T--CTAGAC----------CC-----T-GT-----------CC-GTTTAC-AT-A--T-TGTAGG--AATG--CGGTA-AATC---G-AG---TAACGC-CACGT---G-CC-------AA---CCA--ATCAGA--CTGC-ACTC-G-CT-GAC-AA-C-AAA---ATAAA-T-A--CTT---GC-G-TTAT-TATT----C---AT--ATac