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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAG-TTGCTTGTTGGTCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCCATGACGGTGACAGCTTTGGCAATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTAAAGTGAGAGGTT-GCTGGTGATTGTT-GAGCCCAGGTATGTGAGTAGTGATCAGT-GACT---TCTAGCTCCTCATTGTCAATGCGAAATTGCT-GGTGGAGAGGGGACATCCTGACCCATGACGTTGG--T--TCTTGATGCTGATCGTC--G--CCGAATTCCCTGCATGAGTGGGAGAACCT-----GTCCATCAACCGCTGAAGT-CTTCCTCGGTGTGCGA-GCTCAGAGCTGCATCTTCTGCTAAATAATTAGCATTTCCCT---TATGAAGAC-TGCAG-ACCTTGGTCTTTGCTTTCAGCCGTGTCAGATTG-AAAGCTTTCCATC--ACTTCTGGTGTGCAAGTG------AACCCC----TTCTGTG--GACA---GCTGTTCAAATGCAGTGGGGAGAAAATACACCAGACAAAGTCGGTGCAAGGACGCAGCCTTGTTTCACGCCACT-CTGATGGGG-AAGGGTTCTGAGGCGTTG--TCGTCATAGCTGATGGTGCCCTTCACATCGTCATGGAAGGAGGCAGTGAT-CTGAG--CAGCT--GGGGAGGACAGCCAATCTTCTTTAGCAGCTGGAAAAG-GCCCTTCCTGC-TGA-CAAGGTCAAA-AGCCTT-CA-TAGGTC-AT-----CA------A-ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCCACTGTTGACCTCTCG-GCTCTGAAGCTACACTGCGACTCTGGGT--ATA--TGTGTTTGGCGAGGACTTGCAGTCGAGCGGAGACAACGC--GCAAAGACTTTACCCACAATGCTCATTAGAG-AGAT-TCCCCTGTTACAGTAGTTA-T-ACAGTCACTGT-G-TCTCGTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGTGTCGCGCATATCCTGGGGTACTTTGCCTTC--TCTCCAGCAGAGACACAGGAGTTCATG-AAGTG-TTCCAAGA--GGGCTGGCTTTCC--AC--ATTTAATGACCTCGGGTGGAA-GC-TG-CT-T-CAC--CAGGT-GCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATTGCTTTGCTGAGCTCCTCCATAGTTGG---TTCAGAGTTCAGCTCTTTCAGTACGGGCAGCTCTTCAATTGTGTCTACTGCTTCTTGGGACACAATGTTTTCTCTTGCGTAGTCTC--AATTCCAGGAAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATTTGCTTTCCCCTGTCTGTGATGACTTCCCCTGTCTTTGAT-TTCAGAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAG-TTGCTTGTTG-TCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCTATGATGGCGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTG-TCTAATTCTGTGTCAAGTGAGAGGTT-GCTGGTGATGGTT-GAGCCCAGGTATGTGA--AGTGATCTGT-GACT---GCTAGCTCCTCGTTGTCAATGCG-AATTGCT-GGTGAAGAGGGGACATCCTGACCCAT-ACATTAGTTT--TCTTGATGCTGATCGTC--AGCCCGAATT-CCTGC
gi|1                          :   tccttccgtctcgggagacgatggtttgcgccctgtgtgatttggatcagtcttgttgagagcagcgacgggtgtgactcagcagccgatccttgcatggcagtctctaccgcagttgacgcacacgtagtttgactgtggttttgtgcttgttctgcttaccatctttccgccttgctctcctctcctcaagccgttttctttctcttctcctcacctttcttgactccctccctcaccgcatatctccagccactcggttgtcagcgagcgattcccaggtgttagagtcgatgtttactaatttcatgtctcgcttgcagacatccctgaaacgcagagctggacggccggttggtcgacgtccagaagctagctcaccatacatgatgtcttgggtatgcgtccatcgtccatcctgtgtacgtgaccgagccatcgcaaacgtcgctggcagagctgagatgtatgctgagggaactcgctttttttagcacctcgatgttggtgaccctgttcctgccacttaatgcagaaaatttcgtcgtagacagcgaatgtggaagctttccagacggttctcttgtctggcgtatgttgtccaggattcgatgccgtacagtaggctactgagtacgcacagcccTTGGTGTTTGCTGTCAGGTTG-TTGTTTGCCCACACTATCTTGTGTAGCTTAGAAATTACTGCGGAAGCTTTGGCAAT-C-CTTGATCTCAGGCT-C---AAGGGAGAGGTTTGC-GCTGATAGTA-GACCCCAGATAC-TGAA-----ATCTGTCGACTGAGTTGAGCTCCTGACTTCCTATGCGGA--TGCTCGGTGGGGAGTCAGTACTCTGTCCCATCACTTCAG--TCTTCCTTATGCTAATGATGAGG--CCATAGTCGTTACATGC-----AGAAGCCAGGTGGTTAATTAGCCTCTGAAGTGCTTCCTCTGTGTGTGTTGC-CAGAGCAGCATCATCAGC-AAAGAG--GGC--CTCCCT---GATGGCGACCTGCCTCACCTTGGTATTGG---TGAG----G-CAGGTTGTACAGCCTACAGTCGGACCTCC--TGTGCAAGTGTTCTCTATCCTCGTTGTTCT-TGAAGGCATAAGC----CAGGAGCATTGAGAAGAAGAC---CTAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACAGCCCTGCTTGACCCCGCTGTTGATGGGGGAATGAGTCTGA--CGTTGAGCCACTGTAACTCACTGTGCTGAGCATATCGGTATGAAAGGACACAATGAT-G-GAGTGCAGCTTTGGGGGGG-CAGCCATTTTATTTCAGGAGTTGGAAAAG-ACCACTTCTGT-TGA-CGAGGTCATA-TGCCTT-TGTTAGGTCTAT------A------A-AGGCAAGGAAAA-----GTGGCTTGTTTTGCTCCTGGCACTTATCTT-------GCTAATGTCTGACAGAGAACAGAGAAG-ATAATGTCGGTGGTGGATCTCCCT-GCTCTGAATCTGCACTGAGATTCTGGAT--AAACTCGTGCT--GCCAGCATTTGTAGTCGGGCCAAAATGACTCTTGCAAAGACTTTGCCCATGGTGCCCAACAGGGAAAAT-GTCCCGGT---AGCGGT---T-GCAGTTGCTACGG-TCGCCTTTG-TTTTTATAGAGAGTAA-CCATCTTGGAACCACGCACATCATGAGGCAGAGAGCCCTC--CCTCCTACACAGGCAGAGCAGTTCATGCAGGTC-TTCAATCA--GTTCT-TCTTTCCCTGC--G-TTGATCACTTC---TGGAG-GTATA-CCAT-CATCACAAGTAGCTTTGTCATTAGCGAGA-CAGTCGATGGCCCTTCCGAGTTCCTCTGTTGTTGGATCCTCA---TCTAGTTCATCCAAAATGGGCAGCTGAGTAATGGCATCGAGCGCTGCATCAGTTACGATGTT-----CTGCGTGGAC-CAGAACTCAAGGTAGTGCTCTATCCA-CCTCTCCATCTGCTTTTTCTTGTCAGTGATGTTCTCGCCTGAC-TTGCTCTTCAG
gi|7                          : tgactgatataagaggttaggaagccatatatttgtcgtcgtcggcctccttccgtctcgagctcgagagacgatgcctgcaccaggttaagtcaggtttggttgctgcatctcgtatggctgtggaggccgatgcgggagtggcagtctttgccgcagaggctacatatgtgggttgttgccacctggtctgtggagctgggtttgcgcgtggctcttttcttcctcaggcattcagtgcggttctacttggcttgcttggtaccgctctatactgcagatttccaggagtcccgggatcctacgaggctttcccatgactgtgtgtcaattccagcgctcttcatgtccattttgcaggtgtctttgaagcgtaatctggacggctatgggttctggaagcttttgaaagctctccatacaacaaatcattggggatccggccatcttccattctgtacacgtgaccaagccagcgaagacgccgctggcttagaaggatgaagattgtcgtcagtccagcacgttttagcacatcagtattcgggattctgtcttgccatttgattccgagtatgcgtctcagagagcggagatggaagttgttcagtcgcttttcctgggtggtgtaggatgtccaagtttcgctggagtagaatagtgtggacaatacgctggctctgtgtacatgcatcGTTATGTCATTGTTGTTGCTGCTTTGCCTATGCGAGTG-TTTAGTTCGGTGTCTGGTGAAAGGTT-GCT--TGATAGCTGGAGACCAGGTcgggacacacttgatgacagacgggtctgtggcttgtttgatgccagcatacatgctacatgtgttgccctgttctgagtttgcttgtatcctctgacttagcttaagccagtagtcattagcacaacctatagctatttgttagcatttgctgcgagcggtcctgagtgcacctttggtgttatggcatgaattgttctcatatgctagatgtgcagcacgcttgtcctccactgcagtttccattacttcccagttatcctcgaaccagtcctcattccaatgtttcttcttcccaaaggcctctagcccggattggtatagggctgcacgcatttgcttccactttgcgactgtggtggtggaatctcctcttagttttccc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agcacaatctctgttggggacacggttttaccaatgatggccagggtatttctggactgcgcatgtgaaggcattcagtctgcgttcttggcgtgaatgtacagagtcttttgactcgcttgctatagaggaggagtgctatacacaccaggtctgtacagctctcatattgggtgttcggtagtctgcatgaatgATTTGCTTTTCCCTATCTGTGATGAC-TTC----CCTTG-TCTTTGATTTCAGAGGTG-CAGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctgaggcgttgtcgtcatagctgatggtgcccttcacatctcatggaaggaggcagtgatgctgagaacagctggggaggacagccaatcttctttagcagctggaaaggcccttcctgctaaaaggtcaaaagcctttcattagtcatcaatatgcgatgtagaggggcatctgctgttctacggagaaaattatgtccactgttgacctctcggctctgaagctacactgtgactctgggtatatgtgttcggcggggacttgcagtcgagcgaggacaacgcgcaaagactttacccacaatgctcagtagagagattcccctgttacagtagttattacagtcactgtggtctcctttgtttttgtagatggtgataatcttggtgtcgcgcatatcctggggtactttgccttctctccagcagagacacaggagtttatgaagtggttccaatagggctggctttccacatttgatgatctcaggtggaatgctgttttcaccaggtgctctgccacaagccagagcatcgattgctttgcagagctcctccatagttggttcagagttcagctctttcagtacgggcagctcttcaattgtgtctactgcttcttgggacacaatgttttctctggcgtagtctcagttccaggaagtgctctatccatcttcccCTGAGGCGTTG--TCGTCATAGCTGATGGTGCCCTTCACATC-TCATGGAAGGAGGCAGTGATGCTGAGAACAGCT--GGGGAGGACAGCCAATCTTCTTTAGCAGCTGGAAA-G-GCCCTTCCTGC-TAA--AAGGTCAAA-AGCCTTTCA-TTAGTC-AT-----CA------ATATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCCACTGTTGACCTCTCG-GCTCTGAAGCTACACTGTGACTCTGGGT--ATA--TGTGTTCGGCGGGGACTTGCAGTCGAGCGAGGACAACGC--GCAAAGACTTTACCCACAATGCTCAGTAGAG-AGAT-TCCCCTGTTACAGTAGTTA-TTACAGTCACTGT-GGTCTCCTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGTGTCGCGCATATCCTGGGGTACTTTGCCTTC--TCTCCAGCAGAGACACAGGAGTTTATG-AAGTGGTTCCAATA--GGGCTGGCTTTCC--AC--ATTTGATGATCTCAGGTGGAATGC-TG-TT-TTCAC--CAGGT-GCTCTGCCACAAGCCAGAGCA-TCGATTGCTTTGCAGAGCTCCTCCATAGTTGG---TTCAGAGTTCAGCTCTTTCAGTACGGGCAGCTCTTCAATTGTGTCTACTGCTTCTTGGGACACAATGTTTTCTCTGGCGTAGTCTC--AGTTCCAGGAAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATTTGCTTTTCCCTATCTGTGATGACTTCCCTTGTCTTTGAT-TTCAGAGtctttgtgggtttgcctgttgcctgtttaatgcccttatacatgcccatgatgttgccactatccgatgcttgcttgatgttgtccaacaaatgaagccagtagtcgttggcgcaacgtcatgctgtttgctgtgctttgctgcatgcagctcgcaatgcctctaggttcctctgaattgggtcatgcttatagctgataagtgcgctgcgtttggcatcaatgactggctccatctcagtaatactggcttcaaaccaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               G--CAGCTTCGGGAA--ACGATCGATCTTCTTTAGGAGTTGGAAGAGTACCCACTCTGCTTGAGCAAGGTCAAACGGCCTT-TGTTAGATCTATGAAGGCAAGGAATA-ATGCTTTGTTTACTCTTGGCAC--------------------TTC-TCTTGGCAAC---TG-TCT-CGCA-------AAAAGACCGTGTCGATTGTGGATCTCCTGTGCTCTGA-----------GATTCGGGATCAACT--CGTGCC--ATCAGGATATGTAGTCGGAC--AAACGACTCTTGCAAATACTTTGCCCACGATGCTCAACAAGG-AAATATCC-------CGGTAGCTGTT-GCAGTCACTACGG-TCAGCTTTGTTTTTTATAGATAGTCACTAATCTTGGCACCATGCATATCATGTGACACGGAGCCCTCCTTCCCCAGCACAGGCAGAGAAATTTGTGTGAATC-TTC---GATCAGTTTTTCTTTCC--CCTGCTTTGATCACCTCTGGTGGAATGC-CATCC-T-CAT--CAGGG-GCTTTGCCGATGGCGAGA-CAGTCGATGACTTTGTCTAGTTCCTCTGCTGTTGG---CTC---------CTCGTCCAGAATGGGCAGC----------TGGATGATGCATCT---GTCACAACGTTCTGTGTGGAGTAG------AGCTCAAGGTAGCGCTCTATCCACTGTTTCC-TCTGCgtgcagttttctttgtgggtttgcctgttgcctgtttaatgcccttatacatgcccatgatgttgccactatccgatgcttgcttgatgttgtccaacaaatgaagccagtagtcgttggcgcaacgtcatgctgtttgctgtgctttgctgcatgcagctcgcaatgcctctaggttcctctgaattgggtcatgcttatagctgataagtgcgctgcgtttggcatcaatgactggctccatctcagtaatactggcttcaaaccaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agggctcgatgatggaatG--CAGCT--TCGGGACACGATCGATCTTCTTTAGGAGTTGGAAGAT-ACCACCTCTGC-TGA-CAAGGTCAAA-CGCCTT-TGTTAGATC-ggttttttgttctcgcctaacttgctcttcagcgggatgccttgtttaatgcctgctcatatgctggctctatttccctggtctgcatctgattgtatcctctggcttagcttgagccagtagtgattagcacagcatctagctgtctgctgtcatttgctgcgggcggccccgagtgcattttggtgctatatatgctagcacgtttgacctccactgcaggttccatcgattcccagttcttctcaaaccagttctcattccgatgtttcttctaaccaatgtatctagccaggattggtatagggttgtaatgcattgcttctacttagcgtctgtagtggtggagtctcctctggttttccc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gggctcgatgatggaatTCTGAAGCCGCATTGTGAATCTGGGT--ACA--CACGCCCTGTCAATACCTGTAGTCGTGTGAGTACAACtatg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtgaatcttcctgaTCCAAGA--GGGCTGGCTTTCC--AC--ATTTAATGATTTCGGGTGGAATGT-TGTCT-T-CAC--ATGGT-GCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATTagttactctggcaatgacctttccta
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GGCAAGAGCAGCGTCTCGTGTGACCGAAACGGCCAATACGTGAGTGTCTCTTCCGCAGAGGTTGCATCTGTGGGTGGTCGCTGGTCTGTTGGAGATGTGACCCTCCTTCCTTCGCGCCCACTTGTCCTCAGCTTGTTGCATCAGCTTCTTTTCTCCTGACTTTAGAAGTTGGTTTAAAATGTTCCTCCACCTCCCACGCTCATCTGCAAGTCCCTCCCAAGTCTCTGTGTCAATGTCAAGAGCTTTTATGTCTCTCTTACATACTGAAGCGCAGGTGTGGGCGGCCCGCACTTTTCCTTCCAATTAACAGCTCTCCATAGAGGATGTCTTTAGGAATGCGACCATCCTCCATGCGGTACACATGGCCCAGCCAACGTAGTCTGCGTTGACTGAGGAGGGTGTACATGCTGGGAAGGCCAGCGCGAGACAATACCTCGGTGTTGGGTACTCTGTAT
Unaligned ( gi|8 ): TTCGTCTTCTGCTTACTAATGTTAACCCAAAGCCTTTGCAGGATTGTGCGAAGCGATCTATCAGCAGTTGCAGATCCCGTGGGGTGTGAGTCACAACTGCGGCGTCATCAGTGAACTGCGTTTCTCTGATGAGGATTGTTCGGACAGGATTGAAGATCCTACCATATGATCTGGTCCACAGGTAGATACCCTCTTGGGTTGTGCCAAAAGCGTGTCTCACCAGGAGTGTAAAAAACCCAAAGAAGGTTGGGGCAAGCACACAGC
Unaligned ( gi|9 ): GTCTCCCTGCAGAGGTACGCATCATAGATACGCCGCGTAGGTCAATAGGTACATGTCTTTGGTGGTTGCCCTCCTTCCTGCAGAGCCCGCTTTGTCCTCGGTTTTGATCAAATATAATTTAGGTTTTGCACCAGTTTCTTTTCTCCTGACTTCAGATGTTTCTCCACCCCCCACCCGGTTACATCTGCATGACCCTCCCAATACTCTTT
Unaligned ( gi|10 ): GCCGCCCGCACCTCCTTTCAAATAAACAGCTCTCCATAAGGATGTTTTTGGAATTGCGGCCATACTTCCGATGCGGGCACATGGCCAAGCGCCCAGCGTAGTGTTTGCTGTACTGAGGAGGTGTACATATGCTTTCCCATGCCGCGCGAGGGGACAATACCTTGGTGTTGGATACTCTGT
Unaligned ( gi|11 ): AAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACACAACCCTACCTGACTCCACTGTTGATGAGGAATGGGTCTGATGTTGAGCCATTGTAGGTAACTGTGCTGAGCATATCGGTATGAAAGG
Unaligned ( gi|15 ): TTTATTAATCTCTCTGCAGACATCCTTGAACCTTAGGAGCGGTTTGCCGGTTGGTTAGTGCCAGTAGCAAGCTCAC
Unaligned ( gi|16 ): TTTGCTGTGCTTTGCTACGTGCAGCTTGCAAAGCCTGTACGTTATTCAGACTTGGG
Unaligned ( gi|17 ): TGAAGCTAGAAGTCGTTGGCGCAACGTCGTGCTGTTT






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Reference ( family-595 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCGNNGTNAGGTTGCTTGTTNGCCCACACTNTCTTGCGCAGTTNTGNNATTATTGCGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTCAAGTGAGAGGTT-GCT-G-TGATAGTT-GAGCCCAGGTACGTGAA-AGTGATCTGTCGACTGAGNCGAGCTCCTCGCTNCCNATGCGGAATTGCTCGGTGGGGAGNCGGCACCCTGNCCCATCACNTCAGTTTCTTCCTNATGCTGATCGTNAGGGCCCGNANTCNCTGCATGC-----AGAAGCCAGGTGGTTAATTAGCCTCTGAAGTGCTTCCTCTGTGTGTGTTGC-CAGAGCAGCATCATCAGC-AAAGAGTTNGCTTCTCCCTATCNGTGGCGACCTNCCTCACCTTGGTNTTNGATTTNAGAGGTG-CAGNTTGTACAGCCTACAGTCGGACCTCC--TGTGCAAGTGTTCTCTATCCTCGTTGTTCT-TGAAGGCATAAGC----CAGGAGCATTGAGAAGAAGAC---CTAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACA--GCCCTGCTTGACCCCGCTGTTGATGGGGGAATGAGTCTGAGGCGTTGAGCCGCCGTAGCTNACGGTGCCGNNCACATCGNCATGGAAGGACGCAGTGATGNTG--AG-G-CAGCTTCGGGGGGGACGGCCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAG-ACCNCCTCTGCT-GA-CAAGGTCAAANG-CCTT-CGTTAGGTCTAT-----CAA------ATGCGATGTANA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATNATGTCGATTGTGGATCTCCCG-GCTCTGAAGCCGCACTGTGATTCTGGGT--ACA--CGTGCCC-GCCAGN-ACTTGTAGTCGGGCGAG---AACG---ACTCTTGCAAAGACTTTGCCCACGATGCTCAACAGGG-AAATTCCCC-GT--CAGTAGTTG-T-GCAGTCGCTACGGTCGCCTTTG-TTTTTATAGATAGTNA-TAATCTTGGCGCCGCGCATATCATGNGGCACGGAGCCCTC--TCTCCAGCACAGGCAGAGNAGTTTATGCGAGT-CTTCCAANAGGNCTGNCTTTCC---GCGTTTGATNACCTCGGGTGGAATGCTGTCCTCACCAGGTGCTCTGCCACNGGCNAGAGCAGTCGATNGCTTTGCCGAGTTCCTCCGTTGTTGG---CTCA---TCCAGCTCGTCCAGAACGGGCAGC---T---CAA-T-GCGTCTANCGCTTC-TTGGT-CACGACG--TTCT-T-CGGCGTAG--CCAG--CTCAAGGTAGCGCTCTATCCA-TCTTTCCATCTGC--TTTTCCCTGTCNGTGATGNCCTCNCCTGNCTTTGNTCTTCAGAG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgactgatataagaggttaggaagccatatatttgtcgtcgtcggcctccttccgtctcgagctcgagagacgatgcctgcaccaggttaagtcaggtttggttgctgcatctcgtatggctgtggaggccgatgcgggagtggcagtctttgccgcagaggctacatatgtgggttgttgccacctggtctgtggagctgggtttgcgcgtggctcttttcttcctcaggcattcagtgcggttctacttggcttgcttggtaccgctctatactgcagatttccaggagtcccgggatcctacgaggctttcccatgactgtgtgtcaattccagcgctcttcatgtccattttgcaggtgtctttgaagcgtaatctggacggctatgggttctggaagcttttgaaagctctccatacaacaaatcattggggatccggccatcttccattctgtacacgtgaccaagccagcgaagacgccgctggcttagaaggatgaagattgtcgtcagtccagcacgttttagcacatcagtattcgggattctgtcttgccatttgattccgagtatgcgtctcagagagcggagatggaagttgttcagtcgcttttcctgggtggtgtaggatgtccaagtttcgctggagtagaatagtgtggacaatacgctggctctgtgtacatgcatcAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACACAACCCTACCTGACTCCACTGTTGATGAGG-AATGGGTCTGA--TGTTGAGCCATTGTAGGTAACTGTGCTGAGCATATCGGTATGAAAGGcgggacacacttgatgacagacgggtctgtggcttgtttgatgccagcatacatgctacatgtgttgccctgttctgagtttgcttgtatcctctgacttagcttaagccagtagtcattagcacaacctatagctatttgttagcatttgctgcgagcggtcctgagtgcacctttggtgttatggcatgaattgttctcatatgctagatgtgcagcacgcttgtcctccactgcagtttccattacttcccagttatcctcgaaccagtcctcattccaatgtttcttcttcccaaaggcctctagcccggattggtatagggctgcacgcatttgcttccactttgcgactgtggtggtggaatctcctcttagttttccc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTGAATCTTCCT-GATCTGAAGCCGCATTGTGAATCTGGGT--ACA--CACGCCCTGTCAAT-ACCTGTAGTCGTGTGAGTACAACAGTTACTCTGGCAATGACCTTTCCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aGATGATGGAAT-G-CAGCTTCGGGAC--ACGATCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAT-ACCACCTCTGCT-GA-CAAGGTCAAACG-CCTT-TGTTAGATCTAT-----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gggctcTCCAAGAGGGCTGGCTTTCC---ACATTTAATGATTTCGGGTGGAATGTTGTCTTCACATGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAG-TTGCTTGTTGGTCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCCATGACGGTGACAGCTTTGGCAATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTAAAGTGAGAGGTT-GCT-GGTGATTGTT-GAGCCCAGGTATGTGAGTAGTGATCAGT-GACT---TCTAGCTCCTCATTGTCAATGCGAAATTGCT-GGTGGAGAGGGGACATCCTGACCCATGACGTTGGTT----CTTGATGCTGATCGTCG----CCGAATTCCCTGCATGAGTGGGAGAACCT-----GTCCATCAACCGCTGAAGT-CTTCCTCGGTGTGCGA-GCTCAGAGCTGCATCTTCTGCTAAATAATTAGCATTTCCCT---TATGAAGAC-TGCAG-ACCTTGGTCTTTGCTTTCAGCCGTGTCAGATTG-AAAGCTTTCCATC--ACTTCTGGTGTGCAAGTG------AACCCC----TTCTGTG--GACA---GCTGTTCAAATGCAGTGGGGAGAAAATACACCAGACAAAGTCGGTGCAAGGACGCA--GCCTTGTTTCACGCCACT-CTGATGGGG-AAGGGTTCTGAGGCGTTG--TCGTCATAGCTGATGGTGCCCTTCACATCGTCATGGAAGGAGGCAGTGAT-CTG--AG---CAGCT--GGGGAGGACAGCCAATCTTCTTT-AGCAGCTGGAAAAG-GCCCTTCCTGCT-GA-CAAGGTCAAAAG-CCTT-CAT-AGGTC-AT-----CAA------ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCCACTGTTGACCTCTCG-GCTCTGAAGCTACACTGCGACTCTGGGT--ATA--TGTGTTTGGCGAGG-ACTTGCAGTCGAGCGGA---GACA---ACGC--GCAAAGACTTTACCCACAATGCTCATTAGAG-AGATTCCCCTGTTACAGTAGTTA-T-ACAGTCACTGT-GTCTCGTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGTGTCGCGCATATCCTGGGGTACTTTGCCTTC--TCTCCAGCAGAGACACAGGAGTTCATG-AAGT-GTTCCAAGAGGGCTGGCTTTCC---ACATTTAATGACCTCGGGTGGAA-GCTG-CTTCACCAGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATTGCTTTGCTGAGCTCCTCCATAGTTGG---TTCAGAGTTCAGCTCTTTCAGTACGGGCAGCTCTT---CAATT-GTGTCTACTGCTTC-TTGGGACACAATGTTTTCT-C-TTGCGTAGTCTCAA--TTCCAGGAAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATTTGC--TTTCCCCTGTCTGTGATGACTTCCCCTGTCTTTGAT-TTCAGAGt
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGGGCTCGATGATGG-A--AT-G-CAGCTTCGGGAA--ACGATCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAGTACCCACTCTGCTTGAGCAAGGTCAAACGGCCTT-TGTTAGATCTATGAAGGCAAGGAATAATGCTTTGTTTACTCTTGGCAC--------------------TTC-TCTTGGCAAC---TGT-CT-CGCA-------AAAAGACCGTGTCGATTGTGGATCTCCTGTGCTCTGA-----------GATTCGGGATCAACT--CGTGCC--ATCAGG-ATATGTAGTCGGACAA-----ACG---ACTCTTGCAAATACTTTGCCCACGATGCTCAACAAGG-AAATATCCC-G-----GTAGCTGTT-GCAGTCACTACGGTCAGCTTTGTTTTTTATAGATAGTCACTAATCTTGGCACCATGCATATCATGTGACACGGAGCCCTCCTTCCCCAGCACAGGCAGAGAAATTTGTGTGAAT-CTTCGATCA-GTTTTTCTTTCCCCTGC-TTTGATCACCTCTGGTGGAATGCCATCCTCATCAGGGGCTTTGCCGATGGCGAGA-CAGTCGATGACTTTGTCTAGTTCCTCTGCTGTTGG---CTC---------CTCGTCCAGAATGGGCAGC---T---GGA-T-G------ATGCATC-T--GT-CACAACG--TTCTGTGTGGAGTAG----AG--CTCAAGGTAGCGCTCTATCCACTGTTTCC-TCTGCGGTTTTT-----------TGTTCTCGCCTAAC-TTGCTCTTCAGgtgcagttttctttgtgggtttgcctgttgcctgtttaatgcccttatacatgcccatgatgttgccactatccgatgcttgcttgatgttgtccaacaaatgaagccagtagtcgttggcgcaacgtcatgctgtttgctgtgctttgctgcatgcagctcgcaatgcctctaggttcctctgaattgggtcatgcttatagctgataagtgcgctgcgtttggcatcaatgactggctccatctcagtaatactggcttcaaaccaa
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-595 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCGAAGTGAG-TTGCTTGTT-G-TCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCCATNACGGCGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTCAAGTGAGAGGTT-GCT-G-TGATAGTT-GAGCCCAGGTACGTGAA-AGTGATCTGT-GACTG--TCTAGCTCCTCGTTGTCAATGCGGAATTGCT-GGTGGAGAGGGGACATCCTGACCCAT-ACGTTAGTTTTCTTGATGCTGATCGTC--G--CCGAATTC-C-TGCATGNGTGGGAGAANCCAGGTGGTCNATCAGCCNCTGAAGTGCTTCCTCNGTGTGCGNTGCTCAGAGCNGCATCNTCNGCTAAANAGTTGGCATCTCCCTNATGGNGACCTGCNNCACCTTGGTNTTNGCTTTNAGCCGTGTCAGGTTGTANAGCCTNCCGTCGGACCTCCGGTGTGCAAGTGTTCTCTANCCCCGTTGTTCTGTGAAGGCATAAGC----CAGGAGCGTTGGGGAGAAAAC---CCAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACA--GCCCTGCTTGACNCCGCTGTTGAT-GGGGAATGGGTCTGAGGCGTTGAGCCGTCGTAGCTGACGGTGCCGNNCACATCGNCATGGAAGGACGCAGTGATGNTG--AG-G-CAGCTTCGGGGAGGACGGCCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAG-ACCCCTTCTGCT-GA-CAAGGTCAAACG-CCTT-CGTTAGGTCTAT-----CAA------ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCNACTGTGGATCTCCCG-GCTCTGAAGCTGCACTGCGACTCTGGGT--ACA--CGTGCCC-GCC-AGG-ACTTGTAGTCGGGCGAGGACG------ACTCTTGCAAAGACTTTGCCCACGATGCTCAACAGGG-AGATNCCCCTGTTACAGTAGTTA-T-GCAGTCGCTGCGGTCNCCTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGCGCCGCGCATATCNTGGGGCACNNNGCCCTC--TCTCCAGCANAGGCANAGGAGTTCATGCAAGTN-TTCCAANAGGGCTGGCTTTCCC--ACATTTGATGACCTCGGGTGGAATGCCGTCTTCACCAGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCAGTCGATNGCTTTGCCGAGCTCCTCCGTNGTTGG---CTCAGAGTTCAGCTCNTCCAGNACGGGCAGCTCTTCAATTGCGTCTANTGCTTC-TCGGNACACAATGTTTTCTCTGGCGTAGTCTCAG--CTCNAGGNAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATCTGC--TTTTCCCTGTCTGTGATGNCCTCNCCTGNCTTTGNTCTTCAGAG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgactgatataagaggttaggaagccatatatttgtcgtcgtcggcctccttccgtctcgagctcgagagacgatgcctgcaccaggttaagtcaggtttggttgctgcatctcgtatggctgtggaggccgatgcgggagtggcagtctttgccgcagaggctacatatgtgggttgttgccacctggtctgtggagctgggtttgcgcgtggctcttttcttcctcaggcattcagtgcggttctacttggcttgcttggtaccgctctatactgcagatttccaggagtcccgggatcctacgaggctttcccatgactgtgtgtcaattccagcgctcttcatgtccattttgcaggtgtctttgaagcgtaatctggacggctatgggttctggaagcttttgaaagctctccatacaacaaatcattggggatccggccatcttccattctgtacacgtgaccaagccagcgaagacgccgctggcttagaaggatgaagattgtcgtcagtccagcacgttttagcacatcagtattcgggattctgtcttgccatttgattccgagtatgcgtctcagagagcggagatggaagttgttcagtcgcttttcctgggtggtgtaggatgtccaagtttcgctggagtagaatagtgtggacaatacgctggctctgtgtacatgcatcAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACACAACCCTACCTGACTCCACTGTTGAT-GAGGAATGGGTCTGA--TGTTGAGCCATTGTAGGTAACTGTGCTGAGCATATCGGTATGAAAGGcgggacacacttgatgacagacgggtctgtggcttgtttgatgccagcatacatgctacatgtgttgccctgttctgagtttgcttgtatcctctgacttagcttaagccagtagtcattagcacaacctatagctatttgttagcatttgctgcgagcggtcctgagtgcacctttggtgttatggcatgaattgttctcatatgctagatgtgcagcacgcttgtcctccactgcagtttccattacttcccagttatcctcgaaccagtcctcattccaatgtttcttcttcccaaaggcctctagcccggattggtatagggctgcacgcatttgcttccactttgcgactgtggtggtggaatctcctcttagttttccc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTGAATCTTCCT-GATCTGAAGCCGCATTGTGAATCTGGGT--ACA--CACGCCCTGTC-AAT-ACCTGTAGTCGTGTGAGTACAACAGTTACTCTGGCAATGACCTTTCCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGATGATGGAAT-G-CAGCTTCGGGAC--ACGATCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAT-ACCACCTCTGCT-GA-CAAGGTCAAACG-CCTT-TGTTAGATCTAT-----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gggctcTCCAAGAGGGCTGGCTTTCC---ACATTTAATGATTTCGGGTGGAATGTTGTCTTCACATGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAG-TTGCTTGTT-GGTCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCCATGACGGTGACAGCTTTGGCAATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTAAAGTGAGAGGTT-GCT-GGTGATTGTT-GAGCCCAGGTATGTGAGTAGTGATCAGT-GACT---TCTAGCTCCTCATTGTCAATGCGAAATTGCT-GGTGGAGAGGGGACATCCTGACCCATGACGTTGGTT--CTTGATGCTGATCGTC--G--CCGAATTC-CCTGCATGAGTGGGAGAACCT-----GTCCATCAACCGCTGAAGT-CTTCCTCGGTGTGCGA-GCTCAGAGCTGCATCTTCTGCTAAATAATTAGCATTTCCCTTATGAAGAC-TGCAG-ACCTTGGTCTTTGCTTTCAGCCGTGTCAGATTG-AAAGCTTTCCATC--ACTTCTGGTGTGCAAGTG------AACCCC----TTCTGTG--GACA---GCTGTTCAAATGCAGTGGGGAGAAAATACACCAGACAAAGTCGGTGCAAGGACGCA--GCCTTGTTTCACGCCACT-CTGAT-GGGGAAGGGTTCTGAGGCGTTG--TCGTCATAGCTGATGGTGCCCTTCACATCGTCATGGAAGGAGGCAGTGAT-CTG--AG---CAGCT--GGGGAGGACAGCCAATCTTCTTT-AGCAGCTGGAAAAG-GCCCTTCCTGCT-GA-CAAGGTCAAAAG-CCTT-CAT-AGGTC-AT-----CAA------ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCCACTGTTGACCTCTCG-GCTCTGAAGCTACACTGCGACTCTGGGT--ATA--TGTGTTT-GGCGAGG-ACTTGCAGTCGAGCGGAGACA------ACGC--GCAAAGACTTTACCCACAATGCTCATTAGAG-AGATTCCCCTGTTACAGTAGTTA-T-ACAGTCACTGTG-TCTCGTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGTGTCGCGCATATCCTGGGGTACTTTGCCTTC--TCTCCAGCAGAGACACAGGAGTTCATG-AAGTG-TTCCAAGAGGGCTGGCTTTCC---ACATTTAATGACCTCGGGTGGAA-GCTG-CTTCACCAGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATTGCTTTGCTGAGCTCCTCCATAGTTGG---TTCAGAGTTCAGCTCTTTCAGTACGGGCAGCTCTTCAATTGTGTCTACTGCTTC-TTGGGACACAATGTTTTCTCTTGCGTAGTCTCAA--TTCCAGGAAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATTTGC--TTTCCCCTGTCTGTGATGACTTCCCCTGTCTTTGAT-TTCAGAGt
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-595 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCGAAGTGAG-TTGCTTGTT-G-TCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCCATNACGGCGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTCAAGTGAGAGGTT-GCT-G-TGATAGTT-GAGCCCAGGTACGTGAA-AGTGATCTGT-GACTG--TCTAGCTCCTCGTTGTCAATGCGGAATTGCT-GGTGGAGAGGGGACATCCTGACCCAT-ACGTTAGTTTTCTTGATGCTGATCGTC--G--CCGAATTC-C-TGCATGNGTGGGAGAANCCAGGTGGTCNATCAGCCNCTGAAGTGCTTCCTCNGTGTGCGNTGCTCAGAGCNGCATCNTCNGCTAAANAGTTGGCATCTCCCTNATGGNGACCTGCNNCACCTTGGTNTTNGCTTTNAGCCGTGTCAGGTTGTANAGCCTNCCGTCGGACCTCCGGTGTGCAAGTGTTCTCTANCCCCGTTGTTCTGTGAAGGCATAAGC----CAGGAGCGTTGGGGAGAAAAC---CCAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACA--GCCCTGCTTGACNCCGCTGTTGAT-GGGGAATGGGTCTGAGGCGTTGAGCCGTCGTAGCTGACGGTGCCGNNCACATCGNCATGGAAGGACGCAGTGATGNTG--AG-G-CAGCTTCGGGGAGGACGGCCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAG-ACCCCTTCTGCT-GA-CAAGGTCAAACG-CCTT-CGTTAGGTCTAT-----CAA------ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCNACTGTGGATCTCCCG-GCTCTGAAGCTGCACTGCGACTCTGGGT--ACA--CGTGCCC-GNC-AGG-ACTTGTAGTCGGGCGAGGACG------ACTCTTGCAAAGACTTTGCCCACGATGCTCAACAGGG-AGATNCCCCTGTTACAGTAGTTA-T-GCAGTCGCTGCGGTCNCCTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGCGCCGCGCATATCNTGGGGCACNNNGCCCTC--TCTCCAGCANAGGCANAGGAGTTCATGCAAGTN-TTCCAANAGGGCTGGCTTTCCC--ACATTTGATGACCTCGGGTGGAATGCCGTCTTCACCAGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCAGTCGATNGCTTTGCCGAGCTCCTCCGTNGTTGG---CTCAGAGTTCAGCTCNTCCAGNACGGGCAGCTCTTCAATTGCGTCTANTGCTTC-TCGGNACACAATGTTCTCTCTGGCGTAGTCTCAG--CTCNAGGNAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATCTGC--TTTTCCCTGTCTGTGATGNCCTCNCCTGNCTTTGNTCTTCAGAG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgactgatataagaggttaggaagccatatatttgtcgtcgtcggcctccttccgtctcgagctcgagagacgatgcctgcaccaggttaagtcaggtttggttgctgcatctcgtatggctgtggaggccgatgcgggagtggcagtctttgccgcagaggctacatatgtgggttgttgccacctggtctgtggagctgggtttgcgcgtggctcttttcttcctcaggcattcagtgcggttctacttggcttgcttggtaccgctctatactgcagatttccaggagtcccgggatcctacgaggctttcccatgactgtgtgtcaattccagcgctcttcatgtccattttgcaggtgtctttgaagcgtaatctggacggctatgggttctggaagcttttgaaagctctccatacaacaaatcattggggatccggccatcttccattctgtacacgtgaccaagccagcgaagacgccgctggcttagaaggatgaagattgtcgtcagtccagcacgttttagcacatcagtattcgggattctgtcttgccatttgattccgagtatgcgtctcagagagcggagatggaagttgttcagtcgcttttcctgggtggtgtaggatgtccaagtttcgctggagtagaatagtgtggacaatacgctggctctgtgtacatgcatcAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACACAACCCTACCTGACTCCACTGTTGAT-GAGGAATGGGTCTGA--TGTTGAGCCATTGTAGGTAACTGTGCTGAGCATATCGGTATGAAAGGcgggacacacttgatgacagacgggtctgtggcttgtttgatgccagcatacatgctacatgtgttgccctgttctgagtttgcttgtatcctctgacttagcttaagccagtagtcattagcacaacctatagctatttgttagcatttgctgcgagcggtcctgagtgcacctttggtgttatggcatgaattgttctcatatgctagatgtgcagcacgcttgtcctccactgcagtttccattacttcccagttatcctcgaaccagtcctcattccaatgtttcttcttcccaaaggcctctagcccggattggtatagggctgcacgcatttgcttccactttgcgactgtggtggtggaatctcctcttagttttccc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTGAATCTTCCT-GATCTGAAGCCGCATTGTGAATCTGGGT--ACA--CACGCCCTGTC-AAT-ACCTGTAGTCGTGTGAGTACAACAGTTACTCTGGCAATGACCTTTCCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGATGATGGAAT-G-CAGCTTCGGGAC--ACGATCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAT-ACCACCTCTGCT-GA-CAAGGTCAAACG-CCTT-TGTTAGATCTAT-----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gggctcTCCAAGAGGGCTGGCTTTCC---ACATTTAATGATTTCGGGTGGAATGTTGTCTTCACATGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAG-TTGCTTGTT-GGTCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCCATGACGGTGACAGCTTTGGCAATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTAAAGTGAGAGGTT-GCT-GGTGATTGTT-GAGCCCAGGTATGTGAGTAGTGATCAGT-GACT---TCTAGCTCCTCATTGTCAATGCGAAATTGCT-GGTGGAGAGGGGACATCCTGACCCATGACGTTGGTT--CTTGATGCTGATCGTC--G--CCGAATTC-CCTGCATGAGTGGGAGAACCT-----GTCCATCAACCGCTGAAGT-CTTCCTCGGTGTGCGA-GCTCAGAGCTGCATCTTCTGCTAAATAATTAGCATTTCCCTTATGAAGAC-TGCAG-ACCTTGGTCTTTGCTTTCAGCCGTGTCAGATTG-AAAGCTTTCCATC--ACTTCTGGTGTGCAAGTG------AACCCC----TTCTGTG--GACA---GCTGTTCAAATGCAGTGGGGAGAAAATACACCAGACAAAGTCGGTGCAAGGACGCA--GCCTTGTTTCACGCCACT-CTGAT-GGGGAAGGGTTCTGAGGCGTTG--TCGTCATAGCTGATGGTGCCCTTCACATCGTCATGGAAGGAGGCAGTGAT-CTG--AG---CAGCT--GGGGAGGACAGCCAATCTTCTTT-AGCAGCTGGAAAAG-GCCCTTCCTGCT-GA-CAAGGTCAAAAG-CCTT-CAT-AGGTC-AT-----CAA------ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCCACTGTTGACCTCTCG-GCTCTGAAGCTACACTGCGACTCTGGGT--ATA--TGTGTTT-GGCGAGG-ACTTGCAGTCGAGCGGAGACA------ACGC--GCAAAGACTTTACCCACAATGCTCATTAGAG-AGATTCCCCTGTTACAGTAGTTA-T-ACAGTCACTGTG-TCTCGTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGTGTCGCGCATATCCTGGGGTACTTTGCCTTC--TCTCCAGCAGAGACACAGGAGTTCATG-AAGTG-TTCCAAGAGGGCTGGCTTTCC---ACATTTAATGACCTCGGGTGGAA-GCTG-CTTCACCAGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATTGCTTTGCTGAGCTCCTCCATAGTTGG---TTCAGAGTTCAGCTCTTTCAGTACGGGCAGCTCTTCAATTGTGTCTACTGCTTC-TTGGGACACAATGTTTTCTCTTGCGTAGTCTCAA--TTCCAGGAAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATTTGC--TTTCCCCTGTCTGTGATGACTTCCCCTGTCTTTGAT-TTCAGAGt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGAGGCGTTG--TCGTCATAGCTGATGGTGCCCTTCACATC-TCATGGAAGGAGGCAGTGATGCTG--AG-AACAGCT--GGGGAGGACAGCCAATCTTCTTT-AGCAGCTGGAA-AG-GCCCTTCCTGCT-AA--AAGGTCAAAAG-CCTTTCATTAG-TC-AT-----CAAT-----ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCCACTGTTGACCTCTCG-GCTCTGAAGCTACACTGTGACTCTGGGT--ATA--TGTGTTC-GGC-GGGGACTTGCAGTCGAGCGAGGACA------ACGC--GCAAAGACTTTACCCACAATGCTCAGTAGAG-AGATTCCCCTGTTACAGTAGTTA-TTACAGTCACTGTGGTCTCCTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGTGTCGCGCATATCCTGGGGTACTTTGCCTTC--TCTCCAGCAGAGACACAGGAGTTTATG-AAGTGGTTCCAATAGGGCTGGCTTTCC---ACATTTGATGATCTCAGGTGGAATGCTGTTTTCACCAGGTGCTCTGCCACAAGCCAGAGCA-TCGATTGCTTTGCAGAGCTCCTCCATAGTTGG---TTCAGAGTTCAGCTCTTTCAGTACGGGCAGCTCTTCAATTGTGTCTACTGCTTC-TTGGGACACAATGTTTTCTCTGGCGTAGTCTCAG--TTCCAGGAAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATTTGC--TTTTCCCTATCTGTGATGACTTCCCTTGTCTTTGAT-TTCAGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGGGCTCGATGATGG-A--AT-G-CAGCTTCGGGAA--ACGATCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAGTACCCACTCTGCTTGAGCAAGGTCAAACGGCCTT-TGTTAGATCTATGAAGGCAAGGAATAATGCTTTGTTTACTCTTGGCAC--------------------TTC-TCTTGGCAAC---TGT-CT-CGCA-------AAAAGACCGTGTCGATTGTGGATCTCCTGTGCTCTGA-----------GATTCGGGATCAACT--CGTGCC--ATC-AGG-ATATGTAGTCGGACAA--ACG------ACTCTTGCAAATACTTTGCCCACGATGCTCAACAAGG-AAATATCC------CGGTAGCTGTT-GCAGTCACTACGGTCAGCTTTGTTTTTTATAGATAGTCACTAATCTTGGCACCATGCATATCATGTGACACGGAGCCCTCCTTCCCCAGCACAGGCAGAGAAATTTGTGTGAATC-TTCGATCA-GTTTTTCTTTCCCCTGC-TTTGATCACCTCTGGTGGAATGCCATCCTCATCAGGGGCTTTGCCGATGGCGAGA-CAGTCGATGACTTTGTCTAGTTCCTCTGCTGTTGG---CTC---------CTCGTCCAGAATGGGCAGCT----------GGATGATGCATC-T--GT-CACAACGTTCTGTGTGGAGTAG----AG--CTCAAGGTAGCGCTCTATCCACTGTTTCC-TCTGCGGTTTTT-----------TGTTCTCGCCTAAC-TTGCTCTTCAGgtgcagttttctttgtgggtttgcctgttgcctgtttaatgcccttatacatgcccatgatgttgccactatccgatgcttgcttgatgttgtccaacaaatgaagccagtagtcgttggcgcaacgtcatgctgtttgctgtgctttgctgcatgcagctcgcaatgcctctaggttcctctgaattgggtcatgcttatagctgataagtgcgctgcgtttggcatcaatgactggctccatctcagtaatactggcttcaaaccaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAG-TTGCTTGTT-G-TCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCTATGATGGCGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTG-TCTAATTCTGTGTCAAGTGAGAGGTT-GCTGG-TGATGGTT-GAGCCCAGGTATGTG-A-AGTGATCTGT-GACTG---CTAGCTCCTCGTTGTCAATGC-GAATTGCT-GGTGAAGAGGGGACATCCTGACCCAT-ACATTAGTTTTCTTGATGCTGATCGTC--AGCCCGAATTC-C-TGCcgggatgccttgtttaatgcctgctcatatgctggctctatttccctggtctgcatctgattgtatcctctggcttagcttgagccagtagtgattagcacagcatctagctgtctgctgtcatttgctgcgggcggccccgagtgcattttggtgctatatatgctagcacgtttgacctccactgcaggttccatcgattcccagttcttctcaaaccagttctcattccgatgtttcttctaaccaatgtatctagccaggattggtatagggttgtaatgcattgcttctacttagcgtctgtagtggtggagtctcctctggttttccc
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcacaatctctgttggggacacggttttaccaatgatggccagggtatttctggactgcgcatgtgaaggcattcagtctgcgttcttggcgtgaatgtacagagtcttttgactcgcttgctatagaggaggagtgctatacacaccaggtctgtacagctctcatattgggtgttcggtagtctgcatgaatgC----CAGGAGTGT-----AAAAAAC---CCAAAGAAGGTTGGGGCAAGCACACA--GC


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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|9 ): GTCTCCCTGCAGAGGTACGCATCATAGATACGCCGCGTAGGTCAATAGGTACATGTCTTTGGTGGTTGCCCTCCTTCCTGCAGAGCCCGCTTTGTCCTCGGTTTTGATCAAATATAATTTAGGTTTTGCACCAGTTTCTTTTCTCCTGACTTCAGATGTTTCTCCACCCCCCACCCGGTTACATCTGCATGACCCTCCCAATACTCTTT
Unaligned ( gi|10 ): GCCGCCCGCACCTCCTTTCAAATAAACAGCTCTCCATAAGGATGTTTTTGGAATTGCGGCCATACTTCCGATGCGGGCACATGGCCAAGCGCCCAGCGTAGTGTTTGCTGTACTGAGGAGGTGTACATATGCTTTCCCATGCCGCGCGAGGGGACAATACCTTGGTGTTGGATACTCTGT
Unaligned ( gi|15 ): TTTATTAATCTCTCTGCAGACATCCTTGAACCTTAGGAGCGGTTTGCCGGTTGGTTAGTGCCAGTAGCAAGCTCAC
Unaligned ( gi|16 ): TTTGCTGTGCTTTGCTACGTGCAGCTTGCAAAGCCTGTACGTTATTCAGACTTGGG
Unaligned ( gi|17 ): TGAAGCTAGAAGTCGTTGGCGCAACGTCGTGCTGTTT






Alignments
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Reference ( family-595 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCGAAGTGAG-TTGCTTGTT-G-TCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCCATNACGGCGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTCAAGTGAGAGGTT-GCT-G-TGATAGTT-GAGCCCAGGTACGTGAA-AGTGATCTGT-GACTG--TCTAGCTCCTCGTTGTCAATGCGGAATTGCT-GGTGGAGAGGGGACATCCTGACCCAT-ACGTTAGTTTTCTTGATGCTGATCGTC--G--CCGAATTC-C-TGCATGNGTGGGAGAANCCAGGTGGTCNATCAGCCNCTGAAGTGCTTCCTCNGTGTGCGNTGCTCAGAGCNGCATCNTCNGCTAAANAGTTGGCATCTCCCTNATGGNGACCTGCNNCACCTTGGTNTTNGCTTTNAGCCGTGTCAGGTTGTANAGCCTNCCGTCGGACCTCCGGTGTGCAAGTGTTCTCTANCCCCGTTGTTCTGTGAAGGCATAAGC----CAGGAGCGTTGGGGAGAAAAC---CCAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACA--GCCCTGCTTGACNCCGCTGTTGAT-GGGGAATGGGTCTGAGGCGTTGAGCCGTCGTAGCTGACGGTGCCGNNCACATCGNCATGGAAGGACGCAGTGATGNTG--AG-G-CAGCTTCGGGGAGGACGGCCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAG-ACCCCTTCTGCT-GA-CAAGGTCAAACG-CCTT-CGTTAGGTCTAT-----CAA------ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCNACTGTGGATCTCCCG-GCTCTGAAGCTGCACTGCGACTCTGGGT--ACA--CGTGCCC-GNC-AGGACTTGTAGTCGGGCGAGGACG------ACTC-T-GCAAAGACTTTGCCCACGATGCTCAACAGGG-AGATNCCCCTGTTACAGTAGTTA-TGCAGTCGCTGCGGTCNCCTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGCGCCGCGCATATCNTGGGGCACNNNGCCCTC--TCTCCAGCANAGGCANAGGAGTTCATGCAAGT-NTTCCAANAGGGCTGGCTTTCC--AC--ATTTGATGACCTCGGGTGGAATGCCGTCTTCACCAGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCAGTCGATNGCTTTGCCGAGCTCCTCCGTNGTTGG---CTCAGAGTTCAGCTCNTCCAGNACGGGCAGCTCTTCAATTGCGTCTANTGCTTC-TCGGNACACAATGTTCTCTCTGGCGTAGTCTCAG--CTCNAGGNAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATCTGC--TTTTCCCTGTCTGTGATGNCCTCNCCTGNCTTTGNTCTTCAGAG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgactgatataagaggttaggaagccatatatttgtcgtcgtcggcctccttccgtctcgagctcgagagacgatgcctgcaccaggttaagtcaggtttggttgctgcatctcgtatggctgtggaggccgatgcgggagtggcagtctttgccgcagaggctacatatgtgggttgttgccacctggtctgtggagctgggtttgcgcgtggctcttttcttcctcaggcattcagtgcggttctacttggcttgcttggtaccgctctatactgcagatttccaggagtcccgggatcctacgaggctttcccatgactgtgtgtcaattccagcgctcttcatgtccattttgcaggtgtctttgaagcgtaatctggacggctatgggttctggaagcttttgaaagctctccatacaacaaatcattggggatccggccatcttccattctgtacacgtgaccaagccagcgaagacgccgctggcttagaaggatgaagattgtcgtcagtccagcacgttttagcacatcagtattcgggattctgtcttgccatttgattccgagtatgcgtctcagagagcggagatggaagttgttcagtcgcttttcctgggtggtgtaggatgtccaagtttcgctggagtagaatagtgtggacaatacgctggctctgtgtacatgcatcAAAGAGGGTTGGGGCGAGTACACACAACCCTACCTGACTCCACTGTTGAT-GAGGAATGGGTCTGA--TGTTGAGCCATTGTAGGTAACTGTGCTGAGCATATCGGTATGAAAGGcgggacacacttgatgacagacgggtctgtggcttgtttgatgccagcatacatgctacatgtgttgccctgttctgagtttgcttgtatcctctgacttagcttaagccagtagtcattagcacaacctatagctatttgttagcatttgctgcgagcggtcctgagtgcacctttggtgttatggcatgaattgttctcatatgctagatgtgcagcacgcttgtcctccactgcagtttccattacttcccagttatcctcgaaccagtcctcattccaatgtttcttcttcccaaaggcctctagcccggattggtatagggctgcacgcatttgcttccactttgcgactgtggtggtggaatctcctcttagttttccc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTGAATCTTCCT-GATCTGAAGCCGCATTGTGAATCTGGGT--ACA--CACGCCCTGTC-AATACCTGTAGTCGTGTGAGTACAACAGTTACTC-TGGCAATGACCTTTCCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGATGATGGAAT-G-CAGCTTCGGGAC--ACGATCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAT-ACCACCTCTGCT-GA-CAAGGTCAAACG-CCTT-TGTTAGATCTAT-----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gggctcTCCAAGAGGGCTGGCTTTCC--AC--ATTTAATGATTTCGGGTGGAATGTTGTCTTCACATGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAG-TTGCTTGTT-GGTCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCCATGACGGTGACAGCTTTGGCAATGCGCTTG-TCTAATTCTGCGTAAAGTGAGAGGTT-GCT-GGTGATTGTT-GAGCCCAGGTATGTGAGTAGTGATCAGT-GACT---TCTAGCTCCTCATTGTCAATGCGAAATTGCT-GGTGGAGAGGGGACATCCTGACCCATGACGTTGGTT--CTTGATGCTGATCGTC--G--CCGAATTC-CCTGCATGAGTGGGAGAACCT-----GTCCATCAACCGCTGAAGT-CTTCCTCGGTGTGCGA-GCTCAGAGCTGCATCTTCTGCTAAATAATTAGCATTTCCCTTATGAAGAC-TGCAG-ACCTTGGTCTTTGCTTTCAGCCGTGTCAGATTG-AAAGCTTTCCATC--ACTTCTGGTGTGCAAGTG------AACCCC----TTCTGTG--GACA---GCTGTTCAAATGCAGTGGGGAGAAAATACACCAGACAAAGTCGGTGCAAGGACGCA--GCCTTGTTTCACGCCACT-CTGAT-GGGGAAGGGTTCTGAGGCGTTG--TCGTCATAGCTGATGGTGCCCTTCACATCGTCATGGAAGGAGGCAGTGAT-CTG--AG---CAGCT--GGGGAGGACAGCCAATCTTCTTT-AGCAGCTGGAAAAG-GCCCTTCCTGCT-GA-CAAGGTCAAAAG-CCTT-CAT-AGGTC-AT-----CAA------ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCCACTGTTGACCTCTCG-GCTCTGAAGCTACACTGCGACTCTGGGT--ATA--TGTGTTT-GGCGAGGACTTGCAGTCGAGCGGAGACA------ACGC---GCAAAGACTTTACCCACAATGCTCATTAGAG-AGATTCCCCTGTTACAGTAGTTA-TACAGTCACTGTG-TCTCGTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGTGTCGCGCATATCCTGGGGTACTTTGCCTTC--TCTCCAGCAGAGACACAGGAGTTCATG-AAGT-GTTCCAAGAGGGCTGGCTTTCC--AC--ATTTAATGACCTCGGGTGGAA-GCTG-CTTCACCAGGTGCTCTGCCACAGGCCAGAGCA-TCGATTGCTTTGCTGAGCTCCTCCATAGTTGG---TTCAGAGTTCAGCTCTTTCAGTACGGGCAGCTCTTCAATTGTGTCTACTGCTTC-TTGGGACACAATGTTTTCTCTTGCGTAGTCTCAA--TTCCAGGAAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATTTGC--TTTCCCCTGTCTGTGATGACTTCCCCTGTCTTTGAT-TTCAGAGt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGAGGCGTTG--TCGTCATAGCTGATGGTGCCCTTCACATC-TCATGGAAGGAGGCAGTGATGCTG--AG-AACAGCT--GGGGAGGACAGCCAATCTTCTTT-AGCAGCTGGAA-AG-GCCCTTCCTGCT-AA--AAGGTCAAAAG-CCTTTCATTAG-TC-AT-----CAAT-----ATGCGATGTAGA-----GGGGC--------------------ATC-T-------GC---TGTTCTACGGA-------GAAA-ATTATGTCCACTGTTGACCTCTCG-GCTCTGAAGCTACACTGTGACTCTGGGT--ATA--TGTGTTC-GGCGGGGACTTGCAGTCGAGCGAGGACA------ACGC---GCAAAGACTTTACCCACAATGCTCAGTAGAG-AGATTCCCCTGTTACAGTAGTTATTACAGTCACTGTGGTCTCCTTTG-TTTTTGTAGATGGTGA-TAATCTTGGTGTCGCGCATATCCTGGGGTACTTTGCCTTC--TCTCCAGCAGAGACACAGGAGTTTATG-AAGTGGTTCCAATAGGGCTGGCTTTCC--AC--ATTTGATGATCTCAGGTGGAATGCTGTTTTCACCAGGTGCTCTGCCACAAGCCAGAGCA-TCGATTGCTTTGCAGAGCTCCTCCATAGTTGG---TTCAGAGTTCAGCTCTTTCAGTACGGGCAGCTCTTCAATTGTGTCTACTGCTTC-TTGGGACACAATGTTTTCTCTGGCGTAGTCTCAG--TTCCAGGAAGTGCTCTATCCA-TCTTCCCATTTGC--TTTTCCCTATCTGTGATGACTTCCCTTGTCTTTGAT-TTCAGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGGGCTCGATGATGG-A--AT-G-CAGCTTCGGGAA--ACGATCGATCTTCTTT-AGGAGTTGGAAGAGTACCCACTCTGCTTGAGCAAGGTCAAACGGCCTT-TGTTAGATCTATGAAGGCAAGGAATAATGCTTTGTTTACTCTTGGCAC--------------------TTC-TCTTGGCAAC---TGT-CT-CGCA-------AAAAGACCGTGTCGATTGTGGATCTCCTGTGCTCTGA-----------GATTCGGGATCAACT--CGTGCC--ATC-AGGATATGTAGTCGGACAA--ACG------ACTC-TTGCAAATACTTTGCCCACGATGCTCAACAAGG-AAATATCC------CGGTAGCTGTTGCAGTCACTACGGTCAGCTTTGTTTTTTATAGATAGTCACTAATCTTGGCACCATGCATATCATGTGACACGGAGCCCTCCTTCCCCAGCACAGGCAGAGAAATTTGTGTGAAT-CTTCGATCA-GTTTTTCTTTCC--CCTGCTTTGATCACCTCTGGTGGAATGCCATCCTCATCAGGGGCTTTGCCGATGGCGAGA-CAGTCGATGACTTTGTCTAGTTCCTCTGCTGTTGG---CTC---------CTCGTCCAGAATGGGCAGCT----------GGATGATGCATC-T--GT-CACAACGTTCTGTGTGGAGTAG----AG--CTCAAGGTAGCGCTCTATCCACTGTTTCC-TCTGCGGTTTTT-----------TGTTCTCGCCTAAC-TTGCTCTTCAGgtgcagttttctttgtgggtttgcctgttgcctgtttaatgcccttatacatgcccatgatgttgccactatccgatgcttgcttgatgttgtccaacaaatgaagccagtagtcgttggcgcaacgtcatgctgtttgctgtgctttgctgcatgcagctcgcaatgcctctaggttcctctgaattgggtcatgcttatagctgataagtgcgctgcgtttggcatcaatgactggctccatctcagtaatactggcttcaaaccaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAG-TTGCTTGTT-G-TCCACACTCTCTTGCTCAGTTGTGCTATGATGGCGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTG-TCTAATTCTGTGTCAAGTGAGAGGTT-GCTGG-TGATGGTT-GAGCCCAGGTATGTG-A-AGTGATCTGT-GACTG---CTAGCTCCTCGTTGTCAATGC-GAATTGCT-GGTGAAGAGGGGACATCCTGACCCAT-ACATTAGTTTTCTTGATGCTGATCGTC--AGCCCGAATTC-C-TGCcgggatgccttgtttaatgcctgctcatatgctggctctatttccctggtctgcatctgattgtatcctctggcttagcttgagccagtagtgattagcacagcatctagctgtctgctgtcatttgctgcgggcggccccgagtgcattttggtgctatatatgctagcacgtttgacctccactgcaggttccatcgattcccagttcttctcaaaccagttctcattccgatgtttcttctaaccaatgtatctagccaggattggtatagggttgtaatgcattgcttctacttagcgtctgtagtggtggagtctcctctggttttccc
gi|7                          : tccttccgtctcgggagacgatggtttgcgccctgtgtgatttggatcagtcttgttgagagcagcgacgggtgtgactcagcagccgatccttgcatggcagtctctaccgcagttgacgcacacgtagtttgactgtggttttgtgcttgttctgcttaccatctttccgccttgctctcctctcctcaagccgttttctttctcttctcctcacctttcttgactccctccctcaccgcatatctccagccactcggttgtcagcgagcgattcccaggtgttagagtcgatgtttactaatttcatgtctcgcttgcagacatccctgaaacgcagagctggacggccggttggtcgacgtccagaagctagctcaccatacatgatgtcttgggtatgcgtccatcgtccatcctgtgtacgtgaccgagccatcgcaaacgtcgctggcagagctgagatgtatgctgagggaactcgctttttttagcacctcgatgttggtgaccctgttcctgccacttaatgcagaaaatttcgtcgtagacagcgaatgtggaagctttccagacggttctcttgtctggcgtatgttgtccaggattcgatgccgtacagtaggctactgagtacgcacagcccGTTATGTCATTGTTGTTGCTGCTTTGCCTATGCGAGTG-TTTAGTTCGGTGTCTGGTGAAAGGTT-GCT---TGATAGCTGGAGACCAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcacaatctctgttggggacacggttttaccaatgatggccagggtatttctggactgcgcatgtgaaggcattcagtctgcgttcttggcgtgaatgtacagagtcttttgactcgcttgctatagaggaggagtgctatacacaccaggtctgtacagctctcatattgggtgttcggtagtctgcatgaatgC----CAGGAGTGT-----AAAAAAC---CCAAAGAAGGTTGGGGCAAGCACACA--GC
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GGCAAGAGCAGCGTCTCGTGTGACCGAAACGGCCAATACGTGAGTGTCTCTTCCGCAGAGGTTGCATCTGTGGGTGGTCGCTGGTCTGTTGGAGATGTGACCCTCCTTCCTTCGCGCCCACTTGTCCTCAGCTTGTTGCATCAGCTTCTTTTCTCCTGACTTTAGAAGTTGGTTTAAAATGTTCCTCCACCTCCCACGCTCATCTGCAAGTCCCTCCCAAGTCTCTGTGTCAATGTCAAGAGCTTTTATGTCTCTCTTACATACTGAAGCGCAGGTGTGGGCGGCCCGCACTTTTCCTTCCAATTAACAGCTCTCCATAGAGGATGTCTTTAGGAATGCGACCATCCTCCATGCGGTACACATGGCCCAGCCAACGTAGTCTGCGTTGACTGAGGAGGGTGTACATGCTGGGAAGGCCAGCGCGAGACAATACCTCGGTGTTGGGTACTCTGTAT
Unaligned ( gi|9 ): GTCTCCCTGCAGAGGTACGCATCATAGATACGCCGCGTAGGTCAATAGGTACATGTCTTTGGTGGTTGCCCTCCTTCCTGCAGAGCCCGCTTTGTCCTCGGTTTTGATCAAATATAATTTAGGTTTTGCACCAGTTTCTTTTCTCCTGACTTCAGATGTTTCTCCACCCCCCACCCGGTTACATCTGCATGACCCTCCCAATACTCTTT
Unaligned ( gi|10 ): GCCGCCCGCACCTCCTTTCAAATAAACAGCTCTCCATAAGGATGTTTTTGGAATTGCGGCCATACTTCCGATGCGGGCACATGGCCAAGCGCCCAGCGTAGTGTTTGCTGTACTGAGGAGGTGTACATATGCTTTCCCATGCCGCGCGAGGGGACAATACCTTGGTGTTGGATACTCTGT
Unaligned ( gi|15 ): TTTATTAATCTCTCTGCAGACATCCTTGAACCTTAGGAGCGGTTTGCCGGTTGGTTAGTGCCAGTAGCAAGCTCAC
Unaligned ( gi|16 ): TTTGCTGTGCTTTGCTACGTGCAGCTTGCAAAGCCTGTACGTTATTCAGACTTGGG
Unaligned ( gi|17 ): TGAAGCTAGAAGTCGTTGGCGCAACGTCGTGCTGTTT