lowQualScore                  :                                                                                                                                 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
lowQualScore                  :                          2222222222222                                                          444444444   222222222           66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666                                            3333   11  111                          666666666666666666666666666  1                                                                 11  33333333       66666666666666666666666666                             1            11111                         22      1                  22222             111                 1111  1111   1   11    111111111                     1111111111           11111          11111                           111        4444444      11   222222          11                    111             
lowQualScore                  :             8            4444444444444     0   3 777777  555  44      44 3   3    6 0      3 3  555555555   111111111           33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5    5 66 0  99 5   6 888    5 5  5 0      6666   33  000      77          5 5     777777777777777777777777777  5      0    999    5    5   5   5        77  77       5    8      11  66666666   8   55555555555555555555555555      99  6  2       9   3   6   6 6      77777  6    6                 55      5         6   77   33333     5       777 66   66 77  5   0000  0000   2   11    111111111  5     66 3 5  5  0 5555555555    7  77  00000   5  5   55555      5 5      5 5     77  555        2222222      22   111111  888 66  77 1     5     5    0 999  5          
lowQualScore                  :             .            .............     .   . ......  ...  ..      .. .   .    . .      . .  .........   .........           ..................................................................................................... .    . .. .  .. .   . ...    . .  . .      ....   ..  ...      ..          . .     ...........................  .      .    ...    .    .   .   .        ..  ..       .    .      ..  ........   .   ..........................      ..  .  .       .   .   .   . .      .....  .    .                 ..      .         .   ..   .....     .       ... ..   .. ..  .   ....  ....   .   ..    .........  .     .. . .  .  . ..........    .  ..  .....   .  .   .....      . .      . .     ..  ...        .......      ..   ......  ... ..  .. .     .     .    . ...  .          
lowQualScore                  :             9            9999999999999     8   1 444444  444  22      22 1   1    2 4      6 6  555555555   000000000           88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7    0 99 1  11 0   0 888    0 0  0 1      6666   66  000      99          7 7     333333333333333333333333333  3      1    333    7    7   7   7        99  99       7    0      00  44444444   0   00000000000000000000000000      22  7  5       0   2   7   7 0      33333  7    7                 00      0         0   99   99999     0       111 99   99 99  0   6666  6666   5   99    999999999  0     99 8 0  0  1 4444444444    6  99  44444   7  7   11111      7 7      7 7     99  444        9999999      44   999999  888 99  00 9     7     7    7 000  7          
consensus                     :       AATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-T-T----AA---GA--TTTCCC--A-ATA-CATG-AACTTTAT-T-CT-A-T--AC-ACTGCCCAT---GAATAGAAATC----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCCCANCN----TA------C-AATT-T--TTCA-CT-TGTAA---CATT-T-AT-TTTGGAGAG--TTTT--AT---CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAAT-A--TGATTGA-ACA-TCTCAT--ATAGCCAGTGTTTATGA--TTTTT-AATC-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACTTA-CAAA-GACTGT--GT------G-GTT-AGA--------ATTTAACAAAA--TTT-TATTCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCATA-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AA-TTT----AA----AAAAAAT--TGAA-TGA---CGGG-TTTTT--ANG-AA-AATA------T---GAATNAT--GT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-ATTTT--TT--GTTCATTTT---GGGGGGTTTT-CCTAATA-TTTT---C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCA
Reference ( gi|4 )            :       AATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-T-T----AA---GA--TTTCCC--A-ATA-CATG-AACTTTAT-T-CT-G-T--A--ACTATCCGC---GAATAGAAATC----AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACA----TA------C-AATT-T--TTCA-TT-TGTGA---CATT-T-AT-TTTGGAGA---CTTT--AT---CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAAT-T--TTATTGA-ACA-TGTCATATATAGCAAGTGTTTATGA--CTTTT-AATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACTTA-CAAA-GACTGT--GT------T-GTT-AGA--------ATTTAACAAA---TTTGGATTCTT--GT-ACCACTGAAAGCAAACATTATT-TGTTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCATA-CTTTCACCAAAAGGTGAATGG--GTT----AATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AA-TTT----AA----AAAGAAT--TGAA-CGA---CAGG-TTTTT--ATG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAATTG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-ATTTT--TT--ATTCATTTT---AATAGGTTTT-TCTATTA-TATT---C--AAATTTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCA
gi|1                          :       AATGAA-CAATTTTTCCTTT------A-----TATATTTTT-T-TTTAAAA---GA--ATTTCC--A-A-A-CATGAAACTTTTG-T-CTAA-T--AGCACTG-ACGCATGGAATAGAAATN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNTAGC-AGCT-TGTTTCA-CT-TCTAA---CATT-TAAT-TTTGGAGAGGTTTTT--AT---CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAATAA--TGATTAATACA-TCT----TATAGCCAGTGTTTATGAATTTTTT-AATTGGTT-CTAGTTGAAATTTGCC--TGACTTA-CAAA-GACTGT--GT------G-GTT-AGA-------------------------------T--GT---CGC----AACAAACATAATTGTATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCATA-TTTTCACGAAAAGGTG-GTGGGCGTTG---GGTATCGTTTCACT-AGCAGACA--C--AA-TTA----AA----AAAAAAT--TCAATCGAAAGCGGGTTTTTT--AAG-AA-ATTA------T---GGATTATCGGT-A---CTG-AGAAAAATG--CTTTTG-CAAAAGAG-C-ATTTTTGTT--GTTCATTTT---GAAGGGTTTTGCCTAATA-T-TT---A--AAAAAATGGCA-AATGCGCAAACATA-AA-GATTAGTT
gi|7                          :  attgtAATGAAACATTTTTCCTTT-------A-----TATAAATTT-TTT----AA---GA--TTTCCC--A-ATACCGTG-AACTTTAT-C-TT-A-G--AC-ACTA-CCAT---GAATAGAt
gi|13                         : tattgtAATGAA-CATTTTTTCCTTT-A-ATAT-----CATAGAATT-T-G----AA---GA--TTTCCT----ATA-CATG-CACTTTAT-T-CC-A-T--AC-ACTGTCTAC---GAATAGAAATcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaaacgccccccccccccttacaatttttcactctgtaacatttattttggagagttttttcaatttagataaataaatgaatatgattgaacatcttatagccagtgtttatgatttttaattgttatattgaaattcctgacttacaa
gi|14                         :  atcgtAATGAA-T-TTTTTTCCTTT-A-ATA--------TAAATTT-T------AA---GA--TTTCCC--A-ATA-CATG-AACTTTAC-T-CT-A-TACA--ACTGCCC-T---GATTAGAAA
gi|12                         :     gtAATGAA-CATTTTTCCTTT------AG-----TATTAATTTCT-T----AA---GA--TTTCCC--A-ATA-CATGAAACTTTATCT-CT---T--AC-ACTG-CCAT---GAATAGAAATC----
gi|19                         : tattgtAATGAA-TATTTTTTACTTT-A-TTAT-----TATCAATTC-T-T----AA---GA--TTTCCC--A-ATG-CATG-AACTTt
gi|5                          :     cgcATGAAACACTTTTCCTTT------AA-----TATAAATTT-T-T----AA---GA--TTTCCC--A-ATA-CCTG-AACTT-AT-T-CT-AAT--AC-ACTGCCCAT---GCATAGAAATN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCTTA------CCAATTAT--TTCA-CT-TGTAAAACCATT-T-ATATTTGGAGA---GTTT--GTATTCAACTTTAAGATAAATAACA-TGAAT-------------CA-TG------ATTGCTAGTGTTCATGA--TTTTC-AATC-GTTTATA-TTGAAATT--TCCTTGACTTA-CAAAAGACTGTTTGT------G-GTTCAGA--------TGTTAACAAAAT-TTTATGTTCTTTGGT-ACCACTGAAAACAA-CATAATT-TATTCAATAAAT-TA-ATCTTAGCTTCAATAGTTCATA-TTTTCATGAAAA-GTGAGTGG--CTTGGTAGGTATC-TTTTACTGA-C--CCA--C--AA-TTT----AA----A---AAT--TCAA-TGA---C-GG-TTTTT--AAG-AAGAATA------
gi|9                          :        ATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-AT-A-----TA-AAATTT-T-T----AA---AA--TTTCCC--A-ATG------------AT-T-CT-A-T--AT-ACTGCTCAT---GAGTAGAAATN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-----CG----TA------C-AGTT-T--TTCA-CT-TGTAA---CATT-T-AT-TTT
gi|16                         : tattgtgATGAA-CATTTTTTCCTTTTA-ATAACTTATTATCAATTT-T-C----AA---GA--TTCCCT--A-ATA-TATG-AACTTTA
gi|3                          :                TTTTTCCCTTT-A-ATA--------TAATTTT-T-T----AA---GA--TTTCC---A-ATA-CATG-A-CTTTAT-T-CT-A-T--AC-ACTACCCAT---TAATAGAAATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCCAG------TA------C-AATT-T--T-CA-CT--GTAA---CATT-T-AT-T--GGAGA---TTTTT-AT---CAAATT--ATAGAAATAA-AATGAAT-A--TGATTGA-ACA-TTTCATA----GCCAGTGTTTATGA--CTATT-AATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--GGACTTA-CAAA-GACTGC--GT------TGGTT-AAA--------ATTTAACAAA----TTGTATTCTT--GTCACGACTGAAACCAAACATAATT-TATTCAAT-A-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCATA--TTTCAGAAAAAGGTGAGTGA--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AA-TTT----TA----AAA-AAT--TGAA--GA---TGGG-TTTTT--ATG-AA-AATA------T---GAATTAT--AT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-T-AAAGAG-T-ATTTT--TT--GTTTATTTT---GGAGAGTTTT-ACTA--A-TATTTCAC--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGATA-AA-AA
gi|2                          :  cattgtaattatttTTTTTCCTTTT-ATATAA-----TTTA---TT-T-T----AAATAGAGCTTTCCCTTATACA-CATG-A-CTTTAT-TACT-A-T--AC-ACTGCCCAT---GAATAGAAgataaaagtatttcaa
gi|18                         : catgtattatgaaattTTTTTCCTTT-A-ATA------TATAATTTT-T-T----AA---GA--TATCCC--A-ATA-CATG-AACTTTCT-T-CT-A-T--AC-ACTtagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcctaaattttcactttgtaacatttggagagtttttatcctttttgataaataaatgaatatgatttgacaatctcactagccatgttatgatttttaattgttaatttgaaattcctgacgaaacaaagactgtgtgttagatgttaaagctaacaaactaaacaaaattttattcttgtacattgaacataatttattcaatttatatctagcttcaatgttcataattttcacgaaaaagtgagtggattgatatctttttctcacaatcaaatttaaaaaaaaataaatgacaagtttttatgaaaaataaagaatatgtacttgagaaaatgcttttgcaaagagcaatttttgttcattttgaggggttttcctaatattttcaaaaaatttggcataatgtcaaacatgaaactatttca
gi|15                         :                   TTTCCTTT-A-A-AA-----TATATTTTT-T-T----AA---GA--TTTCTC--A-ATA-CATG-AACTTTAT-C-CT-A-TC-C--ACTGCCCAT---GAATAAAAAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                          ----TA------C-AATT-T--TTCA-CTCTGTAA---CATT-T-AT-TTTGGAGAG--TTTT--TT---CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAAT-A--TGATTGA-ACA-TCT----TATAGCCAGTGTTTATGA--TTTTT-AATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACTTA-CAA
gi|6                          :                                            tattgtaatgaaacatttttcctttatataaattttttaagatttcccaataccgtgaactttatcttagacactaccatgaatagacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaaacgcccccccccccct-AATT-T--TTCA-CT-TGTAA---GATTCT-AT-TTTGGGGAG--TTTT--AT---CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAAA-TGATGATTGA-ACA-TCTCATA----ACCAGTGTTTATGA--CTTTTTAATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACTTA-CAAA-GACCGT--GT------G-GTT-AGA--------ATTTAACAAAAATTTT--ATTCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATGATT-TATTCAATAA-CATA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCATGTTTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTTAT-A-C--ACA--CAAAA-TTT----AA----AAAAAAT--TGAA-TGA---CGGG-TTTTT--ATGTAA-AATA------T---GAATATT--GTAA---CTT-AG-AAAATGT-TTTTTG-C--AAGAG-C-ATTTT--TT--GTTCATTTTTTGGA-GGGTTTT-CCTAATATTTTT---C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-T-AA-AACTATTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                       -AAAT-T--TTCACTT-TGTAA---CATT-T-------GGAGAGT-TTTT--AT---CCTTTT--TGATAAATAA-A-TGAAT-A--TGATTTG-ACAATCTCAC---TAGCCA-TGTT-ATGA--TTTTT-AATT-GTT-AAT-TTGAAATT--CC--TGACGAAACAAA-GACTGT--GTGTTAGAT-GTT-AAAGCTAACAAACTAAACAAA---ATTTTATTCTT--GT-AC-ATTGAA------CATAATT-TATTCAAT---T-TATATCT-AGCTTCAAT-GTTCATAATTTTCACGAAAAAGTGAGTGG--ATT----GATATC-TTTTTCT---C--ACAATC--AAATTT----AA----AAAAAAA--TAAA-TGA---CAAG-TTTTT--ATG-AA-AA-A------TAAAGAAT-AT--GT-A---CTTGAG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-AATTT--TT--GTTCATTTT---GAGGGGTTTT-CCTAATA-TTTT---CAAAAAATTTGGCATAATGT-CAAACA-T-GA-AACTATTTCA
gi|20                         :                                                          catgtattatgaaatttttttccttttatataatttattttaaatagagctttcccttatacacatgactttattactatacactgcccatgaatagaatagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcctATT-T--TGTA-CT-TGTAA---CATT-T-AT-TTTGGAAA---TTTTTTAT---CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acGTGTTTATGA--TTTTC-AATC-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACTTA-CAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TAT-CAATA--T-TA-ATCT-AG-TTCAATAGTTC-TA-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GA-ATC-TTTTACT-AAC--ACA--C--A--TTT----AATAAAAAAAAAT--TGAA-TGA---CGTG-TTTTT--ATG-AA-AATAATATTAT---GA-TAAT--GT-A---CTT-AG-AAAATT--CTTTTG-C-AAAGAG-C-ATTTT--TT--GTTT-TTTT---GGAGGGTTTT-CCTA-TA-T-TT---C--A---------A-AAT-T-CAAAGA-ATAA-AACTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttAAAGGTGAGTAG--GTT----GATACC-TTTTACT-A-C--ACA--
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-TTTTACTCA-C--ACA--C--AA-TTTTTTAAA----AAACAATCATGAC-CG------GG-TTTTTTAAAG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-AGCCCTG-AG-AAAATGGTCCCTTGCC-AAAGAGCC-ATTTT--TTTGTTTCATTTTC--GGGAGGGTTT-CCCCTAA-TATT---C--AAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcA-TTT----AA----AAAAAAAA-TGAA-TAA---CAGG-TTGTC--AGG-AA-AAGA------T---GAATCAT--GT-T---CTT-AG-AAATAG--TTTTTG-C-AAAGAG-CAATGTT--TT--GTTCATTTT---ATGGGGTTTT-CCTAACA-TTTT---C--AATATATGGCA-AGAGT-CAAAGA-A-AATAACTATATCAaaaaaggcaaagtggccaaaacaataaaattcattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttaattcaatCATTTT---GGAGGGTTTT-CTTAATA-TTTT---C--AACATTTGGCA-AATGT-CAAACA-C-AA-CACTATTTCA

lowQualScore                  :                                                                                                                                       111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
lowQualScore                  :                                  1111111111111                                                                                        333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                           111                                    1                22222222              11                                                       22222222     22222222                                                               11                                                       1111              111         11     111111111                                            111111                                 11                  1                                         11                               111             
lowQualScore                  :                     8            9999999999999     0   2  8888  555  33      33 2    2   5        3 3  3 3  3 3    3     3       3    999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5    4 66 1    4     777    4 4  4        444   5 5  5      66          5 5    5 7       55  5    44444444              11        77   5   5        66  66     5      6      99  00000000   6 44444444  55     6   7  1   77    77  5 0     1              5         44 5  5    5                5 5                     66   5555      4       444 66   66 11     000000000    4   4 2   4  777 55  4     66 1 4  4    222222 888    5  66  5 888   5  5      11      5 5      5  0    66   5    66    66  3      4 4       11   4 66     4     4     4      555  5          
lowQualScore                  :                     .            .............     .   .  ....  ...  ..      .. .    .   .        . .  . .  . .    .     .       .    ............................................................................................................... .    . .. .    .     ...    . .  .        ...   . .  .      ..          . .    . .       ..  .    ........              ..        ..   .   .        ..  ..     .      .      ..  ........   . ........  ..     .   .  .   ..    ..  . .     .              .         .. .  .    .                . .                     ..   ....      .       ... ..   .. ..     .........    .   . .   .  ... ..  .     .. . .  .    ...... ...    .  ..  . ...   .  .      ..      . .      .  .    ..   .    ..    ..  .      . .       ..   . ..     .     .     .      ...  .          
lowQualScore                  :                     0            3333333333333     1   9  9999  000  99      99 9    9   7        3 3  3 3  3 3    6     6       6    777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0    4 11 8    4     888    4 4  4        444   0 0  0      99          0 0    0 1       99  7    77777777              99        00   0   0        99  99     0      7      22  00000000   7 22222222  00     7   5  3   99    99  7 7     4              7         11 7  7    7                7 7                     99   6666      4       222 11   11 99     222222222    4   4 9   4  888 33  4     11 0 4  4    888888 888    9  99  0 888   0  0      99      0 0      0  0    99   0    11    11  4      4 4       88   4 11     9     4     4      555  0          
consensus                     :               AATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AACTTTAT-T-CT-A-TA-C-ACTG-CCCAT-GAATAGA-AATCNANNTAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNC----T----------C----CCCANCTTA------C-AATT-T--TTCACT-TGTAA---CATT-T-AT-TTTGGAGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-ATGATTGA-AC-ATCTCATATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ANG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-CA-TTTT--TTG-TTCA--TTTT--GGAGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCA
Reference ( family-552 )      :               AATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AACTTTAT-T-CT-A-TA-C-ACTG-CCCAT-GAATAGA-AATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T----------C----CCCANCNTA------C-AATT-T--TTCACT-TGTAA---CATT-T-AT-TTTGGAGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-ATGATTGA-AC-ATCTCATATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATC-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ANG-AA-AATA------T---GAATNAT--GT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-CA-TTTT--TTG-TTCA--TTTT--GGGGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCA
gi|1                          :               AATGAA-CAATTTTTCCTTT------A-----TATATTTTT-TTTTAAAA---GA--ATTTCC--A-A-AC-ATGAAACTTTTG-T-CTAA-TAGC-ACTGACGCATGGAATAGA-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----------N----NNNNNNNNNNNNTAGC-AGCT-TGTTTCACT-TCTAA---CATT-TAAT-TTTGGAGAGGTTTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-TAATGATTAATAC-ATCT--TATA--GCCAGTGTTTATGAATTTTTTAATTGGTT-CTAGTTGAAATTTGCC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GA-----------------------T--GT---CGC----AACAAACATAATTGTATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTG-GTGGGCGTTG---GGTATCGTTTCACT-AGCAGACA--C--AATTA---AA----AAAA-AAT-TCAATCGAAAGC-GGGTTTTTT--AAG-AA-ATTA------T---GGATTATCGGT-A---CTG-AGAAAAATG--CTTTTG-CAAAAGAG-CA-TTTTTGTTG-TTCA--TTTT--GAAGGGTTT-TGCCTAATA--TTT-A--AAAAAATGGCA-AATGCGCAAACATA-AA-GATTAGTT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attgtC-TTTTACTCA-C--ACA--C--AATTTTTTAA----AAAACAAT-C--AT-GA---CCGGG-TTTTTTAAAG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-AGCCCTG-AG-AAAATGGTCCCTTGCC-AAAGAGCCATTTTT--TTGTTTCA--TTTTCGGGAGGGTTTCC-CCTAATA---TT-C--AAAA------A-AAAGG-CAAAGt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcATTT---AA----AAAA-AAAATGAAT-AA---C-AGG-TTGTC--AGG-AA-AAGA------T---GAATCAT--GT-T---CTT-AG-AAATAG--TTTTTG-C-AAAGAG-CAATGTT--TTG-TTCA--TTTT--ATGGGGTTT-T-CCTAACA-TTTT-C--AATATATGGCA-AGAGT-CAAAGA-A-AATAACTATATCAtggccaaaacaataaaattcattt
gi|12                         :    tttaattcaatAATGAA-CATTTTTCCTTT------AG-----TATTAATTTCTT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATGAAACTTTATCT-CT---TA-C-ACTG--CCAT-GAATAGA-AATC
gi|13                         :         tattgtAATGAA-CATTTTTTCCTTT-A-ATAT-----CATAGAATT-TG----AA---GA--TTTCCT--A--TAC-ATG-CACTTTAT-T-CC-A-TA-C-ACTG-TCTAC-GAATAGA-AATt
gi|14                         :          atcgtAATGAA-T-TTTTTTCCTTT-A-ATA--------TAAATTT-T-----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AACTTTAC-T-CT-A-TA-CAACTG-CCC-T-GATTAGA-AA
gi|15                         :                         gtTTTCCTTT-A-A-AA-----TATATTTTT-TT----AA---GA--TTTCTC--A-ATAC-ATG-AACTTTAT-C-CT-A-TC-C-ACTG-CCCAT-GAATAAA-AAT
gi|16                         :                ATGAA-CATTTTTTCCTTTTA-ATAACTTATTATCAATTT-TC----AA---GA--TTCCCT--A-ATAT-ATG-AACTTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CA--TTTT--GGAGGGTTT-T-CTTAATA-TTTT-C--AACATTTGGCA-AATGT-CAAACA-C-AA-CACTATTTCA
gi|18                         :                         TTTTTCCTTT-A-ATA------TATAATTTT-TT----AA---GA--TATCCC--A-ATAC-ATG-AACTTTCT-T-CT-A-TA-C-ACTa
gi|19                         :               AATGAA-TATTTTTTACTTT-A-TTAT-----TATCAATTC-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATGC-ATG-AACTT
gi|2                          :                     cgcTTTTTCCTTTT-ATATAA-----TTTA---TT-TT----AAATAGAGCTTTCCCTTATACAC-ATG-A-CTTTAT-TACT-A-TA-C-ACTG-CCCAT-GAATAGA-A-------TAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCT----T----------C----CTAAATTTT------C-ACTT-T----------GTAA---CA--------TTTGGAGAGT-TTT-T-AT-CCTTTT--TGATAAATAA-A-TGAA-T-ATGATTTG-ACAATCTCAC-TA--GCCA-TG-TTATGA--TTTTTAATT-GTT-AAT-TTGAAATT--CC--TGACGAAACAAA-GACTGT--GT-GTTAGATGTT-AAAGCTAACAAACTAAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-A-CATTG------AACATAATT-TATTCAAT---T-TATATCT-AGCTTCAAT-GTTCATAA-TTTTCACGAAAAAGTGAGTGG--ATT----GATATC-TTTTTCT---C--ACAATCA-AATTT---AA----AAAA-AAA-TAAAT-GA---C-AAG-TTTTT--ATG-AA-AA-A------TAAAGAAT-AT--GT-A---CTTGAG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-CA-ATTT--TTG-TTCA--TTTT--GAGGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-CAAAAAATTTGGCATAATGT-CAAACA-T-GA-AACTATTTCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                         catgtattatgaaattATT-T--TGTACT-TGTAA---CATT-T-AT-TTTGGAAAT--TTT-TTAT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acGTGTTTATGA--TTTTCAATC-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAGGTGAGTAG--GTT----GATACC-TTTTACT-A-C--ACA--
gi|3                          :                        TTTTTCCCTTT-A-ATA--------TAATTTT-TT----AA---GA--TTTCC---A-ATAC-ATG-A-CTTTAT-T-CT-A-TA-C-ACTA-CCCAT-TAATAGA-AATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T----CCCAG--TA------C-AATT-T--T-CACT--GTAA---CATT-T-AT-T--GGAGAT--TTT-T-AT-CAAATT--ATAGAAATAA-AATGAA-T-ATGATTGA-AC-ATTTCATA----GCCAGTGTTTATGA--CTATTAATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--GGACT-TACAAA-GACTGC--GTTG------GTT-A--------AAATTTAAC-AAA-TTGTAT--TCTT--GTCACGACTGAAACCAAACATAATT-TATTCAATA--T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTT-CAGAAAAAGGTGAGTGA--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---TA----AAAA-A-T-TGAA--GA---T-GGG-TTTTT--ATG-AA-AATA------T---GAATTAT--AT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-T-AAAGAG-TA-TTTT--TTG-TTTA--TTTT--GGAGAGTTT-T-ACTAATA-TTTCAC--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGATA-AA-AA
gi|4                          : cattgtaattatttAATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AACTTTAT-T-CT-G-TA---ACTA-TCCGC-GAATAGA-AATCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----------N----NNCAACATA------C-AATT-T--TTCATT-TGTGA---CATT-T-AT-TTTGGAGA---CTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-TTTATTGA-AC-ATGTCATATATAGCAAGTGTTTATGA--CTTTTAATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-T------GTT-A--------GAATTTAAC-AAATTTGGAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAGCAAACATTATT-TGTTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-CTTTCACCAAAAGGTGAATGG--GTT----AATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAG-AAT-TGAAC-GA---C-AGG-TTTTT--ATG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAATTG--CTTTTG-C-AAAGAG-CA-TTTT--TTA-TTCA--TTTT--AATAGGTTT-T-TCTATTA-TATT-C--AAATTTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCAgataaaagtatttcaa
gi|5                          :                ATGAAACACTTTTCCTTT------AA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-CTG-AACTT-AT-T-CT-AATA-C-ACTG-CCCAT-GCATAGA-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----------NNNNNCCCCCCTTA------CCAATTAT--TTCACT-TGTAAAACCATT-T-ATATTTGGAGAG--TTTGT-ATTCAACTTTAAGATAAATAACA-TGAA-TCATGATTG------------------CTAGTGTTCATGA--TTTTCAATC-GTTTATA-TTGAAATT--TCCTTGACT-TACAAAAGACTGTTTGT-G------GTTCA--------GATGTTAAC-AAAATTTTATGTTCTTTGGT-ACCACTGAAAACAA-CATAATT-TATTCAATAAAT-TA-ATCTTAGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCATGAAAA-GTGAGTGG--CTTGGTAGGTATC-TTTTACTGA-C--CCA--C--AATTT----------AAA-AAT-TCAAT-GA---C--GG-TTTTT--AAG-AAGAATA------
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       -AATT-T--TTCACT-TGTAA---GATTCT-AT-TTTGGGGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAAATGATGATTGA-AC-ATCTCATA----ACCAGTGTTTATGAC-TTTTTAATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACCGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAACAAAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATGATT-TATTCAATAA-CATA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-GTTTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTTAT-A-C--ACA--CAAAATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ATGTAA-AATA------T---GAATATT--GTAA---CTT-AG-AAAATGT-TTTTTG-C--AAGAG-CA-TTTT--TTG-TTCATTTTTT--GGAGGGTTT-T-CCTAATATTTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-T-AA-AACTATTT
gi|7                          :               AATGAAACATTTTTCCTTT-------A-----TATAAATTT-TTT---AA---GA--TTTCCC--A-ATACCGTG-AACTTTAT-C-TT-A-GA-C-ACTA-CC-AT-GAATAGACAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC----TAAACGCCCCCC----CCCCCCTTA------C-AATT-T--TTCACTCTGTAA---CATT-T-AT-TTTGGAGAG--TTT-T-TT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-ATGATTGA-AC-ATCT--TATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATT-GTT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tattgtTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TAT-CAATA--T-TA-ATCT-AG-TTCAATAGTTC-T-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GA-ATC-TTTTACT-AAC--ACA--C--A-TTT---AATAAAAAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GTG-TTTTT--ATG-AA-AATAATATTAT---GA-TAAT--GT-A---CTT-AG-AAAATT--CTTTTG-C-AAAGAG-CA-TTTT--TTG-TTT---TTTT--GGAGGGTTT-T-CCT-ATA--TTT-C--AAAAT-----------T-CAAAGA-ATAA-AACTA
gi|9                          :                ATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATA------TA-AAATTT-TT----AA---AA--TTTCCC--A-ATG------------AT-T-CT-A-TA-T-ACTG-CTCAT-GAGTAGA-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----------C---------CGTA------C-AGTT-T--TTCACT-TGTAA---CATT-T-AT-TTT

lowQualScore                  :                                                                                                                                             1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                  1111111111111                                                                            1111111           3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                      1                              111               22222222              11                                                       22222222     22222222                                                               11                                                       1111              111         11     111111111                                            111111                                 11                                                             11                               111             
lowQualScore                  :                     8            9999999999999     0   2  8888  555  33      33 2    2   2  2      3 3   6  3 3      3    1111111      3    8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   5    4 66 4    555    777    4  4 4        999   5 0  5      66          5 5    5 111      55   5   44444444              11          5  5   5        66  66     5      6      99  00000000   6 44444444  55     6   7  1   77    77  5 0     1              5         44 5  5    5                5 5                     66   5555      4       444 66   66 11     000000000    4   4 2   4  777 55  4     66 1 4  4    222222 888       66  5 888   5  5      11      5 5      5 5 5    66   5    66    66         4 4       11   4 66     4     4     4      555  5          
lowQualScore                  :                     .            .............     .   .  ....  ...  ..      .. .    .   .  .      . .   .  . .      .    .......      .    .......................................................................................................   .    . .. .    ...    ...    .  . .        ...   . .  .      ..          . .    . ...      ..   .   ........              ..          .  .   .        ..  ..     .      .      ..  ........   . ........  ..     .   .  .   ..    ..  . .     .              .         .. .  .    .                . .                     ..   ....      .       ... ..   .. ..     .........    .   . .   .  ... ..  .     .. . .  .    ...... ...       ..  . ...   .  .      ..      . .      . . .    ..   .    ..    ..         . .       ..   . ..     .     .     .      ...  .          
lowQualScore                  :                     0            3333333333333     1   9  9999  000  99      99 9    9   9  9      3 3   7  3 3      6    8888888      6    6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666   0    4 11 6    333    888    4  4 4        444   0 0  0      99          0 0    0 999      99   7   77777777              99          0  0   0        99  99     0      7      22  00000000   7 22222222  00     7   5  3   99    99  7 7     4              7         11 7  7    7                7 7                     99   6666      4       222 11   11 99     222222222    4   4 9   4  888 33  4     11 0 4  4    888888 888       99  0 888   0  0      99      0 0      0 0 0    99   0    11    11         4 4       88   4 11     9     4     4      555  0          
consensus                     :               AATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAT-T-CTA-TA-C-ACTGCC-CATG-------AATAGA-AATCNANNTAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNC----T----------C----CCCNNCTTAC-AATT-T--TTCACT-T-GTAA---CATT-TA-T-TTTGGAGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-A-TGATTGA-ACA-TCTCATATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ANG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-TTTT--TTG-TTCA--TTTT--GGAGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCA
Reference ( family-552 )      :               AATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAT-T-CTA-TA-C-ACTGCC-CATG-------AATAGA-AATCNANNTAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNC----T----------C----CCCANCTTAC-AATT-T--TTCACT-T-GTAA---CATT-TA-T-TTTGGAGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-A-TGATTGA-ACA-TCTCATATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ANG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-TTTT--TTG-TTCA--TTTT--GGAGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCA
gi|1                          :               AATGAA-CAATTTTTCCTTT-A----------TATATTTTT-TTTTAAAA---GA--ATTTCC--A-A-AC-ATG-AAACTTTTG-T-CTAATAGC-ACTGACGCATGGAATAGAAATNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----------N----NNNNNNTAGC-AGCT-TGTTTCACT-T-CTAA---CATT-TAAT-TTTGGAGAGGTTTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-AATGATTAATACA-TCT--TATA--GCCAGTGTTTATGAATTTTTTAATTGGTT-CTAGTTGAAATTTGCC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GA-----------------------T--GT---CGC----AACAAACATAATTGTATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTG-GTGGGCGTTG---GGTATCGTTTCACT-AGCAGACA--C--AATTA---AA----AAAA-AAT-TCAATCGAAAGC-GGGTTTTTT--AAG-AA-ATTA------T---GGATTATCGGT-A---CTG-AGAAAAATG--CTTTTG-CAAAAGAG-C-A-TTTTTGTTG-TTCA--TTTT--GAAGGGTTT-TGCCTAATA--TTT-A--AAAAAATGGCA-AATGCGCAAACATA-AA-GATTAGTT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           attgtC-TTTTACTCA-C--ACA--C--AATTTTTTAA----AAAACAAT-C--AT-GA---CCGGG-TTTTTTAAAG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-AGCCCTG-AG-AAAATGGTCCCTTGCC-AAAGAGCC-ATTTTT--TTGTTTCA--TTTTCGGGAGGGTTTCC-CCTAATA---TT-C--AAAA------A-AAAGG-CAAAGt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcATTT---AA----AAAA-AAAATGAAT-AA---C-AGG-TTGTC--AGG-AA-AAGA------T---GAATCAT--GT-T---CTT-AG-AAATAG--TTTTTG-C-AAAGAG-CAA-TGTT--TTG-TTCA--TTTT--ATGGGGTTT-T-CCTAACA-TTTT-C--AATATATGGCA-AGAGT-CAAAGA-A-AATAACTATATCAtggccaaaacaataaaattcattt
gi|12                         :    tttaattcaatAATGAA-CATTTTTCCTTT------AG-----TATTAATTTCTT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATGAAA-CTTTATCT-CT--TA-C-ACTG-C-CATG-------AATAGA-AATC
gi|13                         :         tattgtAATGAA-CATTTTTTCCTTT-A-ATAT-----CATAGAATT-TG----AA---GA--TTTCCT--A--TAC-ATG-CA-CTTTAT-T-CCA-TA-C-ACTGTC-TACG-------AATAGA-AATt
gi|14                         :          atcgtAATGAA-T-TTTTTTCCTTT-A-ATA--------TAAATTT-T-----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAC-T-CTA-TA-CAACTGCC-C-TG-------ATTAGA-AA
gi|15                         :                         gtTTTCCTTT-A-A-AA-----TATATTTTT-TT----AA---GA--TTTCTC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAT-C-CTA-TC-C-ACTGCC-CATG-------AATAAA-AAT
gi|16                         :                ATGAA-CATTTTTTCCTTTTA-ATAACTTATTATCAATTT-TC----AA---GA--TTCCCT--A-ATAT-ATG-AA-CTTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CA--TTTT--GGAGGGTTT-T-CTTAATA-TTTT-C--AACATTTGGCA-AATGT-CAAACA-C-AA-CACTATTTCA
gi|18                         :                         TTTTTCCTTT-A-ATA------TATAATTTT-TT----AA---GA--TATCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTCT-T-CTA-TA-C-ACTa
gi|19                         :               AATGAA-TATTTTTTACTTT-A-TTAT-----TATCAATTC-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATGC-ATG-AA-CTT
gi|2                          :                     cgcTTTTTCCTTTT-ATATAA-----TTTA---TT-TT----AAATAGAGCTTTCCCTTATACAC-ATG-A--CTTTAT-TACTA-TA-C-ACTGCC-CATG-------AATAGA-A-------TAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCT----T----------C----C------TA--AATT-T--T-CACT-TTGTAA---CATT-T-------GGAGAG--TTT-TTAT-CCTTTT--TGATAAATAA-A-TGAA-T-A-TGATTTG-ACAATCTCAC-TA--GCCA-TGTT-ATGA--TTTTTAATTG-TT-AAT-TTGAAATT--CC--TGACGAAACAAA-GACTGT--GT-GTTAGATGTT-AAAGCTAACAAACTAAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-A-CATTG------AACATAATT-TATTCAAT---T-TATATCT-AGCTTCAAT-GTTCATAA-TTTTCACGAAAAAGTGAGTGG--ATT----GATATC-TTTTTCT---C--ACAATCA-AATTT---AA----AAAA-AAA-TAAAT-GA---C-AAG-TTTTT--ATG-AA-AA-A------TAAAGAA-TAT--GT-A---CTTGAG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-ATTT--TTG-TTCA--TTTT--GAGGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-CAAAAAATTTGGCATAATGT-CAAACA-T-GA-AACTATTTCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                         catgtattatgaaattATT-T--TGTACT-T-GTAA---CATT-TA-T-TTTGGAAAT--TTT-TTAT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acGTGTTTATGA--TTTTCAATCG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAGGTGAGTAG--GTT----GATACC-TTTTACT-A-C--ACA--
gi|3                          :                        TTTTTCCCTTT-A-ATA--------TAATTTT-TT----AA---GA--TTTCC---A-ATAC-ATG-A--CTTTAT-T-CTA-TA-C-ACTACC-CATT-------AATAGA-AATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T----CCCAG--TAC-AATT-T--T-CACT---GTAA---CATT-TA-T-T--GGAGAT--TTT-T-AT-CAAATT--ATAGAAATAA-AATGAA-T-A-TGATTGA-ACA-TTTCATA----GCCAGTGTTTATGA--CTATTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--GGACT-TACAAA-GACTGC--GTTG------GTT-A--------AAATTTAAC-AAA-TTGTAT--TCTT--GTCACGACTGAAACCAAACATAATT-TATTCAATA--T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTT-CAGAAAAAGGTGAGTGA--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---TA----AAAA-A-T-TGAA--GA---T-GGG-TTTTT--ATG-AA-AATA------T---GAATTAT--AT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-T-AAAGAG-T-A-TTTT--TTG-TTTA--TTTT--GGAGAGTTT-T-ACTAATA-TTTCAC--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGATA-AA-AA
gi|4                          : cattgtaattatttAATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAT-T-CTG-TA---ACTATC-CGCG-------AATAGA-AATCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----------N----NNCAACATAC-AATT-T--TTCATT-T-GTGA---CATT-TA-T-TTTGGAGA---CTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-T-TTATTGA-ACA-TGTCATATATAGCAAGTGTTTATGA--CTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-T------GTT-A--------GAATTTAAC-AAATTTGGAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAGCAAACATTATT-TGTTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-CTTTCACCAAAAGGTGAATGG--GTT----AATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAG-AAT-TGAAC-GA---C-AGG-TTTTT--ATG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAATTG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-TTTT--TTA-TTCA--TTTT--AATAGGTTT-T-TCTATTA-TATT-C--AAATTTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCAgataaaagtatttcaa
gi|5                          :                ATGAAACACTTTTCCTTT------AA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-CTG-AA-CTT-AT-T-CTAATA-C-ACTGCC-CATG-------CATAGA-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----------NNNNNCCCCCCTTACCAATTAT--TTCACT-T-GTAAAACCATT-TA-TATTTGGAGAG--TTTGT-ATTCAACTTTAAGATAAATAACA-TGAA-TCA-TGATTG------------------CTAGTGTTCATGA--TTTTCAATCG-TTTATA-TTGAAATT--TCCTTGACT-TACAAAAGACTGTTTGT-G------GTTCA--------GATGTTAAC-AAAATTTTATGTTCTTTGGT-ACCACTGAAAACAA-CATAATT-TATTCAATAAAT-TA-ATCTTAGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCATGAAAA-GTGAGTGG--CTTGGTAGGTATC-TTTTACTGA-C--CCA--C--AATTT----------AAA-AAT-TCAAT-GA---C--GG-TTTTT--AAG-AAGAATA------
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       -AATT-T--TTCACT-T-GTAA---GATTCTA-T-TTTGGGGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAAATGA-TGATTGA-ACA-TCTCATA----ACCAGTGTTTATGAC-TTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACCGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAACAAAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATGATT-TATTCAATAA-CATA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-GTTTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTTAT-A-C--ACA--CAAAATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ATGTAA-AATA------T---GAATATT--GTAA---CTT-AG-AAAATGT-TTTTTG-C--AAGAG-C-A-TTTT--TTG-TTCATTTTTT--GGAGGGTTT-T-CCTAATATTTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-T-AA-AACTATTT
gi|7                          :               AATGAAACATTTTTCCTTT-------A-----TATAAATTT-TTT---AA---GA--TTTCCC--A-ATACCGTG-AA-CTTTAT-C-TTA-GA-C-ACTACC--ATG-------AATAGACAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC----TAAACGCCCCCC----CCCCCCTTAC-AATT-T--TTCACTCT-GTAA---CATT-TA-T-TTTGGAGAG--TTT-T-TT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-A-TGATTGA-ACA-TCT--TATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tattgtTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TAT-CAATA--T-TA-ATCT-AG-TTCAATAGTTC-T-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GA-ATC-TTTTACT-AAC--ACA--C--A-TTT---AATAAAAAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GTG-TTTTT--ATG-AA-AATAATATTAT---GA-TAAT--GT-A---CTT-AG-AAAATT--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-TTTT--TTG-TTT---TTTT--GGAGGGTTT-T-CCT-ATA--TTT-C--AAAAT-----------T-CAAAGA-ATAA-AACTA
gi|9                          :                ATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATA------TA-AAATTT-TT----AA---AA--TTTCCC--A-ATG-------------AT-T-CTA-TA-T-ACTGCT-CATG-------AGTAGA-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----------C---------CGTAC-AGTT-T--TTCACT-T-GTAA---CATT-TA-T-TTT

lowQualScore                  :                                                                                                                                             11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                  1111111111111                                                                            1111111           33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                      1                              111               22222222              11                                                       22222222     22222222                                                               11                                                       1111              111         11     111111111                                            111111                                 11                                                             11                               111             
lowQualScore                  :                     8            9999999999999     0   2  8888  555  33      33 2    2   2  2      3 3   6  3 3      3    1111111      3    00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000   5    4 66 4    555    777    4  4 4        999   5 0  5      66          5 5    5 111      55   5   44444444              11          5  5   5        66  66     5      6      99  00000000   6 44444444  55     6   7  1   77    77  5 0     1              5         44 5  5    5                5 5                     66   5555      4       444 66   66 11     000000000    4   4 2   4  777 55  4     66 1 4  4    222222 888       66  5 888   5  5      11      5 5      5 5 5    66   5    66    66         4 4       11   4 66     4     4     4      555  5          
lowQualScore                  :                     .            .............     .   .  ....  ...  ..      .. .    .   .  .      . .   .  . .      .    .......      .    .....................................................................................................   .    . .. .    ...    ...    .  . .        ...   . .  .      ..          . .    . ...      ..   .   ........              ..          .  .   .        ..  ..     .      .      ..  ........   . ........  ..     .   .  .   ..    ..  . .     .              .         .. .  .    .                . .                     ..   ....      .       ... ..   .. ..     .........    .   . .   .  ... ..  .     .. . .  .    ...... ...       ..  . ...   .  .      ..      . .      . . .    ..   .    ..    ..         . .       ..   . ..     .     .     .      ...  .          
lowQualScore                  :                     0            3333333333333     1   9  9999  000  99      99 9    9   9  9      3 3   7  3 3      6    8888888      6    99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   0    4 11 6    333    888    4  4 4        444   0 0  0      99          0 0    0 999      99   7   77777777              99          0  0   0        99  99     0      7      22  00000000   7 22222222  00     7   5  3   99    99  7 7     4              7         11 7  7    7                7 7                     99   6666      4       222 11   11 99     222222222    4   4 9   4  888 33  4     11 0 4  4    888888 888       99  0 888   0  0      99      0 0      0 0 0    99   0    11    11         4 4       88   4 11     9     4     4      555  0          
consensus                     :               AATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAT-T-CTA-TA-C-ACTGCC-CATG-------AATAGA-AATCNANNTAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCT----------C----CCCCCCN--TAC-AATT-T--TTCACT-T-GTAA---CATT-TA-T-TTTGGAGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-A-TGATTGA-ACA-TCTCATATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ANG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-TTTT--TTG-TTCA--TTTT--GGAGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCA
Reference ( family-552 )      :               AATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAT-T-CTA-TA-C-ACTGCC-CATG-------AATAGA-AATCNANNTAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCT----------C----CCCNNCT--TAC-AATT-T--TTCACT-T-GTAA---CATT-TA-T-TTTGGAGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-A-TGATTGA-ACA-TCTCATATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ANG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-TTTT--TTG-TTCA--TTTT--GGAGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCA
gi|1                          :               AATGAA-CAATTTTTCCTTT-A----------TATATTTTT-TTTTAAAA---GA--ATTTCC--A-A-AC-ATG-AAACTTTTG-T-CTAATAGC-ACTGACGCATGGAATAGAAATNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N----NNNNNNT--AGC-AGCT-TGTTTCACT-T-CTAA---CATT-TAAT-TTTGGAGAGGTTTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-AATGATTAATACA-TCT--TATA--GCCAGTGTTTATGAATTTTTTAATTGGTT-CTAGTTGAAATTTGCC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-G------GTT-A--------GA-----------------------T--GT---CGC----AACAAACATAATTGTATTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCACGAAAAGGTG-GTGGGCGTTG---GGTATCGTTTCACT-AGCAGACA--C--AATTA---AA----AAAA-AAT-TCAATCGAAAGC-GGGTTTTTT--AAG-AA-ATTA------T---GGATTATCGGT-A---CTG-AGAAAAATG--CTTTTG-CAAAAGAG-C-A-TTTTTGTTG-TTCA--TTTT--GAAGGGTTT-TGCCTAATA--TTT-A--AAAAAATGGCA-AATGCGCAAACATA-AA-GATTAGTT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attgtC-TTTTACTCA-C--ACA--C--AATTTTTTAA----AAAACAAT-C--AT-GA---CCGGG-TTTTTTAAAG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-AGCCCTG-AG-AAAATGGTCCCTTGCC-AAAGAGCC-ATTTTT--TTGTTTCA--TTTTCGGGAGGGTTTCC-CCTAATA---TT-C--AAAA------A-AAAGG-CAAAGt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcATTT---AA----AAAA-AAAATGAAT-AA---C-AGG-TTGTC--AGG-AA-AAGA------T---GAATCAT--GT-T---CTT-AG-AAATAG--TTTTTG-C-AAAGAG-CAA-TGTT--TTG-TTCA--TTTT--ATGGGGTTT-T-CCTAACA-TTTT-C--AATATATGGCA-AGAGT-CAAAGA-A-AATAACTATATCAtggccaaaacaataaaattcattt
gi|12                         :    tttaattcaatAATGAA-CATTTTTCCTTT------AG-----TATTAATTTCTT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATGAAA-CTTTATCT-CT--TA-C-ACTG-C-CATG-------AATAGA-AATC
gi|13                         :         tattgtAATGAA-CATTTTTTCCTTT-A-ATAT-----CATAGAATT-TG----AA---GA--TTTCCT--A--TAC-ATG-CA-CTTTAT-T-CCA-TA-C-ACTGTC-TACG-------AATAGA-AATt
gi|14                         :          atcgtAATGAA-T-TTTTTTCCTTT-A-ATA--------TAAATTT-T-----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAC-T-CTA-TA-CAACTGCC-C-TG-------ATTAGA-AA
gi|15                         :                         gtTTTCCTTT-A-A-AA-----TATATTTTT-TT----AA---GA--TTTCTC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAT-C-CTA-TC-C-ACTGCC-CATG-------AATAAA-AAT
gi|16                         :                ATGAA-CATTTTTTCCTTTTA-ATAACTTATTATCAATTT-TC----AA---GA--TTCCCT--A-ATAT-ATG-AA-CTTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CA--TTTT--GGAGGGTTT-T-CTTAATA-TTTT-C--AACATTTGGCA-AATGT-CAAACA-C-AA-CACTATTTCA
gi|18                         :                         TTTTTCCTTT-A-ATA------TATAATTTT-TT----AA---GA--TATCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTCT-T-CTA-TA-C-ACTa
gi|19                         :               AATGAA-TATTTTTTACTTT-A-TTAT-----TATCAATTC-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATGC-ATG-AA-CTT
gi|2                          :                     cgcTTTTTCCTTTT-ATATAA-----TTTA---TT-TT----AAATAGAGCTTTCCCTTATACAC-ATG-A--CTTTAT-TACTA-TA-C-ACTGCC-CATG-------AATAGA-A-------TAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTT----------C----C--------TA--AATT-T--T-CACT-TTGTAA---CATT-T-------GGAGAG--TTT-TTAT-CCTTTT--TGATAAATAA-A-TGAA-T-A-TGATTTG-ACAATCTCAC-TA--GCCA-TGTT-ATGA--TTTTTAATTG-TT-AAT-TTGAAATT--CC--TGACGAAACAAA-GACTGT--GT-GTTAGATGTT-AAAGCTAACAAACTAAAC-AAAATTTTAT--TCTT--GT-A-CATTG------AACATAATT-TATTCAAT---T-TATATCT-AGCTTCAAT-GTTCATAA-TTTTCACGAAAAAGTGAGTGG--ATT----GATATC-TTTTTCT---C--ACAATCA-AATTT---AA----AAAA-AAA-TAAAT-GA---C-AAG-TTTTT--ATG-AA-AA-A------TAAAGAA-TAT--GT-A---CTTGAG-AAAATG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-ATTT--TTG-TTCA--TTTT--GAGGGGTTT-T-CCTAATA-TTTT-CAAAAAATTTGGCATAATGT-CAAACA-T-GA-AACTATTTCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                       catgtattatgaaattATT-T--TGTACT-T-GTAA---CATT-TA-T-TTTGGAAAT--TTT-TTAT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acGTGTTTATGA--TTTTCAATCG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAGGTGAGTAG--GTT----GATACC-TTTTACT-A-C--ACA--
gi|3                          :                        TTTTTCCCTTT-A-ATA--------TAATTTT-TT----AA---GA--TTTCC---A-ATAC-ATG-A--CTTTAT-T-CTA-TA-C-ACTACC-CATT-------AATAGA-AATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N----NNTTCCCAGTAC-AATT-T--T-CACT---GTAA---CATT-TA-T-T--GGAGAT--TTT-T-AT-CAAATT--ATAGAAATAA-AATGAA-T-A-TGATTGA-ACA-TTTCATA----GCCAGTGTTTATGA--CTATTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--GGACT-TACAAA-GACTGC--GTTG------GTT-A--------AAATTTAAC-AAA-TTGTAT--TCTT--GTCACGACTGAAACCAAACATAATT-TATTCAATA--T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-TTT-CAGAAAAAGGTGAGTGA--GTT----GATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---TA----AAAA-A-T-TGAA--GA---T-GGG-TTTTT--ATG-AA-AATA------T---GAATTAT--AT-A---CTT-AG-AAAATG--CTTTTG-T-AAAGAG-T-A-TTTT--TTG-TTTA--TTTT--GGAGAGTTT-T-ACTAATA-TTTCAC--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGATA-AA-AA
gi|4                          : cattgtaattatttAATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATAA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-ATG-AA-CTTTAT-T-CTG-TA---ACTATC-CGCG-------AATAGA-AATCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N----NNCAACA--TAC-AATT-T--TTCATT-T-GTGA---CATT-TA-T-TTTGGAGA---CTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-T-TTATTGA-ACA-TGTCATATATAGCAAGTGTTTATGA--CTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACTGT--GT-T------GTT-A--------GAATTTAAC-AAATTTGGAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAGCAAACATTATT-TGTTCAATAA-T-TA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-A-CTTTCACCAAAAGGTGAATGG--GTT----AATATC-TTTTACT-A-C--ACA--C--AATTT---AA----AAAG-AAT-TGAAC-GA---C-AGG-TTTTT--ATG-AA-AATA------T---GAATTAT--GT-A---CTT-AG-AAATTG--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-TTTT--TTA-TTCA--TTTT--AATAGGTTT-T-TCTATTA-TATT-C--AAATTTTGGCA-AATGT-CAAAGA-A-AA-AACTATTTCAgataaaagtatttcaa
gi|5                          :                ATGAAACACTTTTCCTTT------AA-----TATAAATTT-TT----AA---GA--TTTCCC--A-ATAC-CTG-AA-CTT-AT-T-CTAATA-C-ACTGCC-CATG-------CATAGA-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNCCCCCCT--TACCAATTAT--TTCACT-T-GTAAAACCATT-TA-TATTTGGAGAG--TTTGT-ATTCAACTTTAAGATAAATAACA-TGAA-TCA-TGATTG------------------CTAGTGTTCATGA--TTTTCAATCG-TTTATA-TTGAAATT--TCCTTGACT-TACAAAAGACTGTTTGT-G------GTTCA--------GATGTTAAC-AAAATTTTATGTTCTTTGGT-ACCACTGAAAACAA-CATAATT-TATTCAATAAAT-TA-ATCTTAGCTTCAATAGTTCAT-A-TTTTCATGAAAA-GTGAGTGG--CTTGGTAGGTATC-TTTTACTGA-C--CCA--C--AATTT----------AAA-AAT-TCAAT-GA---C--GG-TTTTT--AAG-AAGAATA------
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                     -AATT-T--TTCACT-T-GTAA---GATTCTA-T-TTTGGGGAG--TTT-T-AT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAAATGA-TGATTGA-ACA-TCTCATA----ACCAGTGTTTATGAC-TTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAAA-GACCGT--GT-G------GTT-A--------GAATTTAACAAAAATTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATGATT-TATTCAATAA-CATA-ATCT-AGCTTCAATAGTTCAT-GTTTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GATATC-TTTTTAT-A-C--ACA--CAAAATTT---AA----AAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GGG-TTTTT--ATGTAA-AATA------T---GAATATT--GTAA---CTT-AG-AAAATGT-TTTTTG-C--AAGAG-C-A-TTTT--TTG-TTCATTTTTT--GGAGGGTTT-T-CCTAATATTTTT-C--AAAATTTGGCA-AATGT-CAAAGA-T-AA-AACTATTT
gi|7                          :               AATGAAACATTTTTCCTTT-------A-----TATAAATTT-TTT---AA---GA--TTTCCC--A-ATACCGTG-AA-CTTTAT-C-TTA-GA-C-ACTACC--ATG-------AATAGACAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTAAACGCCCCCC----CCCCCCT--TAC-AATT-T--TTCACTCT-GTAA---CATT-TA-T-TTTGGAGAG--TTT-T-TT-CAATTT--AGATAAATAA-A-TGAA-T-A-TGATTGA-ACA-TCT--TATA--GCCAGTGTTTATGA--TTTTTAATTG-TT-ATA-TTGAAATT--CC--TGACT-TACAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tattgtTTTAT--TCTT--GT-ACCACTGAAAACAAACATAATT-TAT-CAATA--T-TA-ATCT-AG-TTCAATAGTTC-T-A-TTTTCACGAAAAGGTGAGTGG--GTT----GA-ATC-TTTTACT-AAC--ACA--C--A-TTT---AATAAAAAAA-AAT-TGAAT-GA---C-GTG-TTTTT--ATG-AA-AATAATATTAT---GA-TAAT--GT-A---CTT-AG-AAAATT--CTTTTG-C-AAAGAG-C-A-TTTT--TTG-TTT---TTTT--GGAGGGTTT-T-CCT-ATA--TTT-C--AAAAT-----------T-CAAAGA-ATAA-AACTA
gi|9                          :                ATGAA-CATTTTTCCCTTT-A-ATA------TA-AAATTT-TT----AA---AA--TTTCCC--A-ATG-------------AT-T-CTA-TA-T-ACTGCT-CATG-------AGTAGA-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------C---------CG--TAC-AGTT-T--TTCACT-T-GTAA---CATT-TA-T-TTT