lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111111                                                                                                                                  111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11                                             5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555     111111         11     333333333333333333333333333                           3333333333333                            333333          1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666                     111111111  333                1111          11111        1111       22                                                                                                                                                                                                                       111                           0000000000000        11    111111111111111                   1       88888888888888888888888888888              11   44444        2222         111111111111111   111             1111           2                 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777        11111111         1      888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888         3333333333333                               8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888               111                 11111111111     4444444444444444444444444444                11111          00000000000000000000000000   11    111                                                 222       333333333333333333333333333333333333333                                           22222222222                          111111      111111               1111       1111      444444444444444444444444                                       111   1111           99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999           11      2222222222222   1111          22222222222      11111                                                                            222222222222             111    1111                                            3333333333         4444444444444444444                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             2      33  4 44  4 4    4            4  3   4    4    777   2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     333333 1   66  66     888888888888888888888888888         0    888          3333333333333 222     0 777  0 44   0    333333          0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 1     0     9999    555555555  999 5     66       0000       5  22222    5   4444       44       2                                                                                                                                                                                                  6            222  5         5      0       2222222222222  55    11 7  888888888888888 2    6  6  1  6   3     5 33333333333333333333333333333 3      8     33   66666 1      1111 6  7    333333333333333   666    6        2222    99 6   0   6   8     77  7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777        55555555  6      9      333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333    1    2222222222222        4    4  4  9999 777 4  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333    999 3      333  3   666 3      99999999999 0   0000000000000000000000000000  4      5 4    55555   4   4  00000000000000000000000000   22    444  888 4  66          4    4  99999         1 2   555       888888888888888888888888888888888888888    3 4 4 0   777           0    66  66  4 66666666666     4   88   3     7777  666666  3   444444 555 3  5 2    0000   77  4444 4    555555555555555555555555     4 4     6666666  4      4    55   111   3333    66     55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555     55  4 11   4  3333333333333   7777    3  5  44444444444   8  11111    8   777    3 4  8888    4      4  8888      55    3  5555   3 4   7777  555555555555   999    3  222    0000 3  88888  555 6   999        88   4 77     3333333333   6     0000000000000000000   3         6    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .      ..  . ..  . .    .            .  .   .    .    ...   .................................................................................................     ...... .   ..  ..     ...........................         .    ...          ............. ...     . ...  . ..   .    ......          . .................................................... .     .     ....    .........  ... .     ..       ....       .  .....    .   ....       ..       .                                                                                                                                                                                                  .            ...  .         .      .       .............  ..    .. .  ............... .    .  .  .  .   .     . ............................. .      .     ..   ..... .      .... .  .    ...............   ...    .        ....    .. .   .   .   .     ..  ................................................................        ........  .      .      ...............................................................    .    .............        .    .  .  .... ... .  ............................................................................    ... .      ...  .   ... .      ........... .   ............................  .      . .    .....   .   .  ..........................   ..    ...  ... .  ..          .    .  .....         . .   ...       .......................................    . . . .   ...           .    ..  ..  . ...........     .   ..   .     ....  ......  .   ...... ... .  . .    ....   ..  .... .    ........................     . .     .......  .      .    ..   ...   ....    ..     ...........................................................................................................................................................     ..  . ..   .  .............   ....    .  .  ...........   .  .....    .   ...    . .  ....    .      .  ....      ..    .  ....   . .   ....  ............   ...    .  ...    .... .  .....  ... .   ...        ..   . ..     ..........   .     ...................   .         .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             0      77  4 22  4 4    4            4  4   4    0    000   4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444     666666 1   99  44     555555555555555555555555555         8    888          4444444444444 555     1 000  1 88   2    333333          0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 0     5     4444    666666666  222 0     99       6666       0  44444    3   2222       66       5                                                                                                                                                                                                  0            666  0         4      1       1111111111111  66    00 8  000000000000000 5    7  7  0  7   3     6 00000000000000000000000000000 0      0     88   22222 0      2222 7  3    333333333333333   888    7        7777    22 7   0   7   9     99  6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666        33333333  0      2      000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000    0    4444444444444        4    3  4  4444 888 4  2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222    555 6      666  6   444 6      00000000000 4   8888888888888888888888888888  4      1 4    66666   4   4  11111111111111111111111111   66    999  888 4  11          4    4  88888         0 4   111       333333333333333333333333333333333333333    9 0 0 1   000           7    11  77  0 33333333333     0   66   6     7777  777777  3   222222 888 3  3 2    0000   22  0000 0    666666666666666666666666     0 0     1111111  0      0    55   000   9999    11     33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     55  8 22   4  9999999999999   4444    1  0  11111111111   9  11111    9   888    4 0  5555    4      0  5555      00    6  5555   6 8   7777  333333333333   333    9  222    4444 3  33333  888 7   222        66   4 11     4444444444   7     8888888888888888888   3         0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGGT-ACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G---C---CT-----T-----------T-----------G-A-C------A--TA--G--T---------AA-A--TAG--TGTTA--------GATGT-C----TGTAA--AAACTCAAC-T--TTT-ATT-----C-N-----CCNTGAACAACATTTAT---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCACC--A--------G--TGCAT-------ACG-----AATA------------C-CCAAGAATGAAGCGAA-AACATCGAGTAT-AA---A-TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGCTNTGTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAAN---ATAAGCA-TCATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATA--NTGTGAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGCA----CGGCAACG-CACATTTCATTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCG----C--AAGAATCAATTAAAAATGTTTACCGAG---GAAT--T-ACAATAT-TTCATTATT--TG----------T--AAN-----TTCA------A---T-CA--TTT-AATT-ATTG-TA----TTATTATTTTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG----TA--NGAA---------ATGGNAACACGAACCTNAGTATATGTTGTTACGC---TATG-AGGTCAGTT-GA---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GA----A---A-TGG---CCTGG----------A-CAN---AA-TAA--G--C---G-------CTGT-A-GG------CCTAG-TC---GTGT--TT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-----------TTCTC-GC--A-G-TT--A-A-CC-GGGT--T-GC-TGTCCAAC-TGTT-----TAT-GTT-TTCCTTTATTTT---------TTT--A-ACAG-TACG-NGGA---C-AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA----NAA--AAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACC-NCCCTT-ATT--CTG-ACAGC----TA------GT-ACA------C---C-CGTAACCGAC---ACA-NAA----C-ACCC--GA--------------AC----GTAAT-G-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT-AACG--TGA---TAA----TTGC--CTTTTTTGCCT-T----TT-TG--T-CCAT-TAAATC--GAATCT-TTCTATNAATA-TGC-C--TA-A-N--AGT-----TGTTTA-CN---TT--CT------A--A-----GGGCG-C--GT---AT-G-AC-GTCA-C-ACA-ACA-ACA-CCA--TGGCG--CGCA-AAAT-AC----C--------GAG--A-AAAATAT-GC-A--C------ATCGCA-----AGAT-TTG---AATTTC-AT----CGCT-TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TAN-T-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGC---ATACAAAG--AAG-TG-ATTTTGC---NTAANAAA-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TC-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGGT-ACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G---C---CT-----T-----------T-----------G-A-T------A--TA--G--T---------AA-A--TAG--TGTTA------TAGATGT-C----TGTAA--AACCTCAAC-C--TT--ATT-----C-T-----CTCTGAACAACATTTAT---TTCGATGTTGA------CATATGTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTACCAT--GTTTTAGCCATC--T--------G--TGCAT-------GCG-----AATA------------C-CCAAGAATGAAGCAAA-AACATCGGGTAT-AAT-TA-TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGATATG----GGCCGCTCGGTAAACAGTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATTTAAAAAAAACCAACAAACAATCATTTTTTTTATAT--GTATAT-ATA--GTGTGAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGCATTGTCAGCAATA-CACATCTCAT-----GTCATGGT----TGAAAGCGCGTACACGAAAGAA--AATTATAAATGTTTACTGAA---GAAT--T-ACA-TAT-TTTCTTATT--TG----------T--AAT-----TTCA------A---T-C---TTT-AATT-ATTG-TA----TTATTATTTTT-T--TTTTTAGATGTGCCATTTGG----TA--GGAA---------ATGGAAACACGAACCTGGGTATTTGTTGTTGTGCTATTATGTAGGTCAGTTTGA---GTGC---GGGCGTGT-ATTTTGT-GA----A---A-TGG---CCTGG----------A-CAT---AA-TAA--G--C---G-------CTGT-A-GA------CCTAA-TCA--GTGT--CT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-----------TTCTCAGC--A-A-TT--A-A-TC-GGGA--T-GC-TGTCCAAC-TGTT-----TAT-GTT-TTCCTTTATTTC---------TTT--G-ACAG-TACA-AAGA---C-AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCTTTG-A-GTCGACA----CAA--AAT----------TT----C----------CTCGTA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACC-ACCCTT-ATT--CTG-ACAGC----TA------GT-ACA------C---C-CGCAACCGAC---ACA-CAA----C-ACCC--AA--------------AC----GTAAT-G-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT-AACG--TGA---TAA----TTGC--CTTTTCTGCCTGT----TTCTG--T-CCAT-TACATC--GATTTT-TTTTATTAATA-TGC-C--TG-A-G--AGT-----TGTTTA-CA---TT--C-------A--A-----GGGCG-T--GT---AT-G-AC-GTCA-C-ACAGACACACA-CCA--TGGCG--CGCA-GAAT-AC----C--------GAG--A-AAAATAT-GC-A--T------ATTTCA-----AGAT-TTG---AATTTC-AT----TGCT-TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TAT-T-----CA--AAAT--ACATCTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGC---ATACAAAG--AAG-TG-ATTTTCC---ATGACAAA-TAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGAATAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAATTTCAAAAAGTATTTTTAAGTT-AG-CCTAGGATAGTCACGTGGT-ACCGTGGACGT-CAGA---TAC---G---C---CCGATC-T-----------TCGACAACA---G-A-T------A--AA--G--T---------AA-A--TAG--TGTCA--------GATGTTC----TGTAA--AAACTCAGC-C--TT--ATT-----C-T-----CTCTGAACAACATTTAT---TTCGATGTTGA------CAAATTTTTCGAATCTT--AAAATTCAAATCGTATCAT--GTTTTAGCCACC--A--------G--TGCAT-------ACG-----AATA-------------------------GCGAA-AACATCGTCTAT-AAT--A-TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGACATG----GGCCGCTTTGTAAACAGTAATTGG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cCGACTTTAAAAAGTATTT--GA-TT-CG-C-TAGG-TAGTCACGTGAT-ACCGTG-ACGT-CCGG---TGCA--A---C---CT-----TCTTCAACCAGCT-----------G-ATT------A--T---G--A---------AA-G--TAG--TATTG------C--GTGT-C----TATAA--AAACTCAACGT--TT--CTT-----CAT-----CT-TGAATAACATTTAT---TTCGATGTTG---------TTCTTTTTGAGTTTTCAAAAATACAAACCGTA-TAG--ATTTTAGCAACC--A--------G--TGCACACACATGGCGATTTAAATG------------C-CCAATAAAGAATCGAA-GATA---------AA---G-TCGCC--AATTGCG----AGTAAAT-TGATATATTTATACG----GGCCATTCATTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaaaatccaaagtataaatcaaggtgctttattaaaaaagcaatcacattatatatattttattgttgattattaccgattgcaaggtataggcctaaagccggcggagagcacggcaatacacatccattgattgccatggttaaaccgcagaatcaatgaaatgtttactgaggaatattacatattttattatttgtaatacaagttcacttttttaatttattattattatcattattttgtaaatgtgcgatttggaaattattggaataccgatcaataggaacacgaacctcattatttgttgttatgctattatgtaggtcagttggacgtgggcgagtatttcgtgaaatggcctggacacaataaacgctgtaggtatagtcgtgtttagcttcatatataacacctctcgcaattaaactgggttgctgtccatctgtttatttttcctttattttattatttttttaacatacaaggacaaaggcgactgttttatttatggtaaagtccttgtggtcgacacaaaatttcctcgcacctccttcgaaaaagtgaaaaaatcagattgccgcccttattcttacggctagttacacccgtagccgatacataacactcgaacgtaatgctatttgcaatctgttaacgtgataattgccttttttgtctattaaatcgaatctactctatgatatgctcttgagagttgtttaacatttccaaaggcgtatctgacgtcacacacccatggcgcgcagaataccgagaaaatatgcatattgccagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttatattaaaatacatctgtaggcatacagagaagtaattttgcctaaaaaattaataaagtttagaaacatgggatatg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cCGATTTCAAAAAGTCTTTT-AA-TT-GG-C-TAAG-AAGACATGTGGT-ACTGTG-TCGT-CAGACGGTGCTCAG---C---CT-----C-----------T-----------G-A-CAAGCGAA--TC--G--T---------AA-AAGTAG--TGTTACATATGTAAATAT-T----TATAACCAAAATCAAC-TG-TT--AAT-----C-A-----CCAAGAA-AACAATGAT---TTAGATGTCGC------CGAATTTCTCGAGTATT---AAAT-------------T--GTTTTAGCCACC--A--------G--TGCAT-------GTA-----AATAACGCTGTAAACGC-CTAAGAAAGAAGCGAG-GAAAGCGAATATGAA---A-TCGAT--AATTGCG----AGTAAAT-TA---CGTTGAAATA----Gttagaagggttatgcatttaaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGATATCAAAAG---TTTTTAA-TT-AAAC-TAGG-TAGTAAACTTGT-AC-GTG-ACGTTCAGA---TAC---GGTCCTTGCT-----T-----------C-----------G-A-C------AGACA--GGAT---------AAGA--TAAGATGTTA--------GATTA-T----TGTAA--AGC-TCAAC-TCTTT--ATT-----A-A-----CTCTGGACAACAATTATGTTTTCGATGTTGG------CAAATATCTCGAGTCTT--AAA--TTAAAACGTA-CAT--GTTTTAGCCA-CAATAAAGACAAG--TG-AT-------ACA-----AATAG-----------CACAAAGAAT-AAGC----AACA--GGATAT-AAA-TAGTGGGC--AATTGCG-----GTAAAT-ttatctgc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCATGTGGTTACCATG-ATGT-CAGA---TAA---G---C---CC-----T-----------TTCTTCGACCAGA-A-T------A--TAAAG--T---------AA-A--TAG--TGT--------TAGATGgtatagacataattg
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGGT-AC
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cCGAATTCAAAA-GTCTTT--AA-TTTAG-C-TAGG-TAGTCACGTG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccGATTTCAAA--GTCGTTTTAA-TT-AG-C-TAG-----TTATGTGAT-ACTGTG-ACGT-CAGA---TGT---AT--C---CT-----T-----------TCAAC-------G-A-CCAGCTGA--TA--A--TGA-------AA-A--TAG--TGTTA--------GATAT-C----TGTAA--AAACTCAAC-T--TTT-ATT-----C-A-----CCTTGAACAACAATTAT---TTC------GA------C-TAT----------------------AGCTATAC-----GTTTTAGCCACC--A--------A--TGCAT-------CCA-----AATA------------C-CCAAGAATGAAACAAA-AACAGCGAGTAT-AA--AA-TCAGC--AATTGCAAGCTAGTAAAT-CA---TATTGACAGA----GGTAACTGTTTAAAAATGAATTGGtgttagc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTTTTTAA-T--AG-C-TAGG-TAGTCACGTGGT-ACCGTG-ACTT-CAAA---AGC---A---A---CCATTCGT-----------T-----------G-A-C---------CA--G--TTGCTTGTGAAA-A--TAT--TGTTA--------GATAT-T----TAAAA--TAATTCAAT-T--TTT-ATT-----T-A-----CCCTAGACAACATTTAT---TTCGATGTTGAAAAATTTAAATTTATCAAGTC-T--AAAATTCAAATCGTA-TATTCACTTTAGCCAGC--C--------AGTTGCA--------ACG-----AATG------------A-CCAAGAATGAAGCGA-----GTTAGG-A--AA---G-TCGGCCAAATTGCG----AGTAAAC-TA---TACTGAaaaagttatttaaacatgtattattatgtaattatacgtatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaaattcatagtaaaaatcaaagtgttttttttgaaaaatagtaatagcatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAT-ACAATG-ACGT-CACC---TGC---GA--C---CT-----TCT---------T-----------GTA-TCAGGTAA--TA--G--TGAAA-----AA-A--TAG--TGTTA--------AATAT-C----TATTA--AAACTCAGC-T--TTT-ATTAACTAC-TTATTACTATTAACTAAGTTT-----TTCGATGTTGA------CATTTACC--GAGACTT--AACATTCAAACTGTA-CAT--GTTTTAGCCATC--A--------G--TACA---------CA-----AATc
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTG-ACGT-CAGA---TAC---G---C---CT-----T-----------TG----------G-A-A------A--TG--T--T---------AA-A--CAgt
gi|23                         : ccaatttcaaaaagtatttttaagttagcctaggatagtcacgtggtaccgtggacgtcagatacgcccgatcttcgacaacagataaagtaaatagtgtcagatgttctgtaaaaactcagccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacaaatttttcgaatcttaaaattcaaatcgtatcatgttttagccaccagtgcatacgaatagcgaaaacatcgtctataatatcggtaattgcgagtaaattgttttgacatgggccgctttgtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaaaatccaaagtataaatcaaggtgctttattaaaaaagcaatcacattatatatattttattgttgattattaccgattgcaaggtataggcctaaagccggcggagagcacggcaatacacatccattgattgccatggttaaaccgcagaatcaatgaaatgtttactgaggaatattacatattttattatttgtaatacaagttcacttttttaatttattattattatcattattttgtaaatgtgcgatttggaaattattggaataccgatcaataggaacacgaacctcattatttgttgttatgctattatgtaggtcagttggacgtgggcgagtatttcgtgaaatggcctggacacaataaacgctgtaggtatagtcgtgtttagcttcatatataacacctctcgcaattaaactgggttgctgtccatctgtttatttttcctttattttattatttttttaacatacaaggacaaaggcgactgttttatttatggtaaagtccttgtggtcgacacaaaatttcctcgcacctccttcgaaaaagtgaaaaaatcagattgccgcccttattcttacggctagttacacccgtagccgatacataacactcgaacgtaatgctatttgcaatctgttaacgtgataattgccttttttgtctattaaatcgaatctactctatgatatgctcttgagagtCGT-C-GA---TGG---G---C----------------------T-----------G-A-T---------T---G--T---------AA-A--------ATTAAAAG--TAGATGT-TACATTTTAA--AAC-TCTAC-T--TTTAATC-----G-T-----C-ATGGCCAACATGTAT---TTCGATTTTGA------AAAAATTCCTGAGTCTG--AGCATTAAAACacacccatggcgcgcagaataccgagaaaatatgcatattgccagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttatattaaaatacatctgtaggcatacagagaagtaattttgcctaaaaaattaataaagtttagaaacatgggatatg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tAATGAAACGAA-AACATCGAGTAT-AAT--A-TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGTCGCTGTGTAAACATTAATatatatgtatagtcaccattgc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTGAAGCGAAGAACATCGATT-T-AGTATA-TCGGC--ATTTGCG----AGTAAATGGG---TTTTGACATGAAAAGCCCGCTT-GTACACAGTAATTG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTCAAATTCATAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTTTTTGAAAAAataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcagtactaagatcaagtggttatatgaaaaggcattcgtatttttaaaatgtcttttatatcgtgatatactgaattaacaaggtaattgccgaagagttacggcaacgcacatttcattgatgccatggtgttatgaagcgcgtgaatcaattaaatatgtttactgagaatttacataaatttcttatgtataaatacagtgcacatcattaattaatatatattattattatttgtaaatgtgcgtttggtgagaataaatacgaacctgggtattgttgttaggctattatgtagttcagttagatttgtgcgggcttgcatttcgaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gatttcaaagtcgttttaattagctagttatgtgatactgtgacgtcagatgtatcctttcaacgaccagctgataatgaaaatagtgttagatatctgtaaaaactcaacttttattcaccttgaacaacaattatttcgactatagctatacgttttagccaccaatgcatccaaatacccaagaatgaaacaaaaacagcgagtataaaatcagcaattgcaagctagtaaatcatattgacagaggtaactgtttaaaaatgaattggaaaagttatttaaacatgtattattatgtaattatacgtatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTCAGATTTAAATTA-G-AA-ATCAAAGTGCTTTATTTAAAAAAAAATAATAA-----CATGTTTTTtagtaatagcatttt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagaaattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaAAATCCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATT-----AAAA-----AAGCAATCACATTATATATAT--TT---T-ATT--GT-TGATTATTACCGA-TTG-CAAGGTATAG-GCCTAAAGCCGGCGGAGAGCA----CGGCAATA-CACATC-CATTGATTGCCATGGT----T-AAACCGC---------AGAATCAATGA--AATGTTTACTGAG---GAATATT-ACA-TAT-TTTATTATT--TG----------T--AATACAAGTTCA------C---T-T---TTTTAATTTATT---A----TTATTATCATTAT--TTTGTAAATGTGCGATTTGGAAATTATTGGAATACCGATCAATAGGAACACGAACCTCATTATTTGTTGTTATGCTATTATGTAGGTCAGTTGGA----CGT---GGGCGAGT-ATTTCGT-GA----A---A-TGG---CCTGG----------A-CAC---AA-TAA--A--C---G-------CTGT-A-GG------TATAG-TC---GTGT--TT-AGCTTC----A-TAT---ATAACACC-----------T-CTC-GC--A-A-TT--A-A-ACTGGGT--T-GC-TGTCCATC-TGTT-----TAT--TT-TTCCTTTATTTTATTATTTT-TTT--A-ACA--TACA-AGGA---C-AA--AGGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTGTG-GTCGACA----CAA--AAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CT-CC---TTCGAAAAAGT-GAAA--AAA-TC-AGAT--TGCC-GCCCTT-ATT--CTT-ACGGC----TA------GTTACA------C---C-CGTAGCCGAT---ACA-TAA----C-ACTC--GA--------------AC----GTAAT-G-CTATT-T-GC--AA-TCTGTT-AACG--TGA---TAA----TTGC--CTTTTTTGTCT-----------------AT-TAAATC--GAATCTACTCTAT-GATA-TGC-TCTTG-A-G--AGT-----TGTTTAACA---TTTCC-------A--A-----AGGCG-T--AT---CT-G-AC-GTCA-C-ACA------C--CCA--TGGCG--CGCA-GAAT-AC----C--------GAG--A-AAA-TAT-GC-A--T------ATTGCC-----AGAT-TTG---AATTTC-AT----TGCT-TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TATAT-----TA--AAAT--ACATCTG---------------------T---A-GGC---ATACAGAG--AAG-TA-ATTTTGC---CTAAAAAATTAATA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATATattttattg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccaatttcaaaaagtatttttaagttagcctaggatagtcacgtggtaccgtggacgtcagatacgcccgatcttcgacaacagataaagtaaatagtgtcagatgttctgtaaaaactcagccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacaaatttttcgaatcttaaaattcaaatcgtatcatgttttagccaccagtgcatacgaatagcgaaaacatcgtctataatatcggtaattgcgagtaaattgttttgacatgggccgctttgtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaAAATTCAAAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTATTGAAAAATAGT-----AATAG-CATTTTTG--AAAT-----TCT-CTA--GTGTGAT-AT-ACCGA-TTG-TAAGG-A-A--GC------------GAGAGCA----CGGCAATATTTCAT-TGAT-----GTCTTGAT----g
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cATTCAAATCA-T-AA-ATAAAGGTGTTTTATTTAAAAAAATC-----AACAATCAATTTTTTTATAT--GTATAT-ATATAATGTGAT-AT-ACCGA-TTG-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAATA-TCAA-ATAAGGGTGATTTATTTAAAAGAATGTGATA-----------TATCTATATTGGTATAT-AT------TGA-----ACCGA-TTGACAAGGGA-TT---------------GAGAGCG-GGCCA--AATA-CA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaattaaaaaAGTACT-AAGATCAAG-TGGTT-ATATGAAAAGG---------CATTCGTATTTTTAAAAT--GTCTTTTATA--TCGTGAT-AT-ACTGAATTAACAAGGTA-ATTGCC----------GAAGAG--TTA-CGGCAACG-CACATTTCATTGAT-GCCATGGTGTTATGAA-GCGCGT--------GAATCAATTAAATATGTTTACTGAG---AATT--T-ACA-TAAATTTCTTATG--TA----------T--AAA-----TACAGTGCACA---T-C---ATT-AATT-AATA-TA----T-ATTATTATT-A--TTTGTAAATGTGC-GTTTGG----TG--AGAA----------T--AAATACGAACCTGGGTATT-GTTGTTAGGCTATTATGTAGTTCAGTTAGATTTGTGC---GGGCTTGC-ATTTCG--AA----A---A-C-----CCT----------------T------CAA--GGTC---T-------TTTT-A-GA-------CTAA-TTGGTGTGT--TT-TTTTTC---T--TAT---A-AACAatatgtttacttgatgcgaattacggtttctttgtttgcaaagtagaataaattcaaatttcatttaattattttaagcctaattatttattagtttgtaaatgtgcgatttggtaaagaaaagggaataacgcacctgtatagaagtgtatagtaaggtgtgtatttcgtgaaagtggctagacacacaaatgtgcgattagttctgtgctaagtcgtgttaagcttcttatataaaaaacacctcctccagtttaaactgggttgtcaactgtttatgcttttctacaataagaggacaacaggactgtatttatttaggtaagtcttgtggaaaataattttcatcggacttcttcgcaaagtggaaaataagctcaggcacactattaattggctgaacagatagtcaccatgtaatgaacacaaaacccaacgtaattgtgtataattgccttttttgtcattaagaatattgttataattatgtctaatcagttaaaatgtgtattttctcgagcgagaggacaaaatgagagtcaacatcatgggcgccaaatactgagaaaaaatatgcttattgcaagattttgattattgcttcaaaactgaaaagtaagcaaatatttattcaaaaacatttgtagtcatttaatattaggttaaatcaaataagataattttgcgtaaaataaaaatcagtgttttaaaaaaaaaatgcgatgtg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttgaagcgaagaacatcgatttagtatatcggcatttgcgagtaaatgggttttgacatgaaaagcccgcttgtacacagtaattgataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatc-AA-ATCAAGGTGGTTTATTTGAAAAGG--CAATAAG-----ATTTTTAGAA-AT--GTATTT-ATA--TTGTGAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AC-GCC----------GAAGAGTA----CGGCAACG-CACATTTCAT-----
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAT----TGAGAGCGGG----CCAAATAC--AAT-----ATGTTTACTTGATGCGAAT--T-ACG--GT-TTCTTTGTT--TGCAAAGTAGAAT--AAA-----TTCA------AATTT-CA--TTT-AATT-ATTT-TAAGCCTAATTATTTAT-TAGTTTGTAAATGTGCGATTTGG----TAAAGAAA---------AGGGAATAACGCACCTG--------------------TATAGAAGT--GTAT-A---GTA----AGGTGTGT-ATTTCGT-GA----A---AGTGG----CTAG----------A-CACACAAA-TGT--G--C---GATTAGTTCTGT-G----------CTAAGTC---GTGT--TA-AGCTTCT--TA-TATAAAA-AACACC-----------TCCTC--C--A-G-TTTAA-A-CT-GG------GT-TGT-CAAC-TGTT-----TAT-GCT-TTTCT-----------------------ACAA-TAAG-AGGA---C-AA--CAG-GACTGTATTTA-TT--T--A-GGT-AAGTCTT-----GTGGAAA----ATA--ATT----------TT----C----------ATCGGA-C---TTC---TTCG-CAAAGTGGAAAATAAGCTC-AGGC---A-C-ACTATTAATTGGCTGAACAGA----TA------GT--CA------C---CATGTAA-TGA----ACA-CAA----A-ACCC---A--------------AC----GTAAT---------T-G--------TGT----------A---TAA----TTGC--CTTTTTTG------------------TCAT-TA-A----GAATAT-TGTTATAATTA-TGT-C--TA-ATC--AGTTAAAATGTGTA-TT---TT--C-------T--C-----GAGCG-A--G----AG-G-AC-AAAA-TGAGAGTCA-ACA-TCA--TGG-G--CGCC-AAAT-AC----T--------GAGA-A-AAAATAT-GC-T--T------ATTGCA-----AGAT-TTT---GATT---AT----TGC--TTCAAA-AC----TGAAAA--GTAA-GC----AAA-T-ATT----TAT-T-----CA--AAA---ACATTTG-T-AGTC----A-TTTAATATT---A-GGTTAAAT-CAAAT--AAGATA-ATTTTGC---GTA--AAA-TAAAA-----------ATCAGTGTTTTAAAAAt
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaattaaaaaaaaatatcaaataagggtgatttatttaaaagaatgtgatatatctatattggtatatattgaaccgattgacaaggACGCATGAATCAATTAAAAAT--TTACTGAG---GAAT--TTACAATAT-CTTATTATT--TG----------TA-AAT-----TGCA------A-----G---TTT-AATT-aaaaatgcgatgtg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taaa--AATTAAAAGT-TTTACCGGA---GGAT--T-ACAATAT-TTCATTATTATTA----------A--AAA-----TTCA------A---G-CAAGTTC-AATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACT--G----TG--C------------ATGGTCACAC--ACCCTAGTATATGTTGTTA-------A---AGGTCAGTT-AA---GT-C---AAGCGTGC-ATTTCGTTGA----A---A-TGG---CTTGG----------AACAG---AG-TTA--G------G-------CTTT-G-GG------CT--G-T-----TTT--TT-AGCAGCA--TAATAT---A-AATATC-----------TTCTC-GC--G-AGTT--ATA-CT-GGG----------TCCG-C-TGTTC----TAC-GTG-TT---TTGTGTT---------TT-----ACAT-TACGTGAGC---CGAA--AAGTG-CTAT-TTTAATT--TCCATGGTAAAGACCTTG-TTGTCGACA----AAC--AATG---------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAGCGCT------AATCTC-G----------ATCCTT-ATT--CTG-ACAGTAACTTA------GT-ACA------CGACC-CGTAACCGAT---GC--CAAAT--C-ACCC--GA---------------CTA--GTAATTGCTTATC-A-TC--GA-GCTGTT-AGTG--TGA---TAAA---TTGC--CTTTTTAGC------------G----CTATATA-ATCT-AATCTG-TTCTATAAA-A-TGG-C--TA-A-C--AGT-----TGTT-A-CT---TG--CT------A--A-----GATTG-G--AC---AT-G-AC-GTC---------CACACAATTA--TGGCG--CAGA-AAAT-AC----C--------GAG--T-AAAATAT--C-AGTC------ATCCCA-----ATTT-TTG---AATTGT-AT----TGCT-TCAAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAGTTCATA----TAG-T-----AG--AAAA--ACATTTA-C-TGCC----ACTT-----TT---ACGGC---ATACACAA--AAG-TC-ATTTTc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tATAAAAGTTTACCGAG---GAAT--T-ACAATAT-TTCATTATT--TA----------TTAAAA-----ATCA------A---TGCAAGTTC-AATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACCTGG----CA--TG-------------GGTCACAC--ACCCTAGTATATGTTGTTACA---------AGGTCAGTT--A---GTCA---AAGCGTGC-ATTTCGT-GA----A---A-TGG---CTGGA----------A-CAG---AG-TAG--G--CTTGG-------CTGT-----------------------TTT--TT-AGCAGC---TA-TAT---A-AATATC-----------TTCTC-GC--A-G-TT--ATA-CT-GGGT--C-GC-TGTC--ACGTGTT-----TTT-GTT-TT--------------------------ACAT-TACG-TGAG---C-AA--AAGTGACTAT-TTTA-TC--C--ATGGTAAAGACCTTG-T-GTCGACA-----AA--ACTG---------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAGCGCT-------ATCTC-G----------ATCCTT-ATT--CTG-ACAGC----TAACTA--GT-ACA------C---C-CGTAACCGAT---GCA-AAT----C-ACCC--GA--------------CT----GTAAT-G-TTATC-A-TC--GA-GCTGTT-AGTG--TGA---TAA----TTGC--CTTTTA-GCCT-----------------AT-CAAATC--TAATCT-GTTCATAAA-A-TGG-C--TA-A-C--AGT-----TGTTTA-CT---TG--CT------A--A-----GATTG-G--AC---AT-G-AC-GTCA-C-ACA---------TTA--TGGCG--CAGA-AAAT-AC----C--------GAG--T-AAAATAT-GC-A--T------ATCCCA-----ATAT-TTG---AATTGT-AT----TGCT-TTCAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAA-TGTTA----TAA-T-----AAG-AAAA--ACATTTA-C-TGCC----A-TT-----TT---A-GGC---ATACAAA---AAG-TC-ATTTTGCTTGATGACgctga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTATT--TG----------C--CAT-----TT-A------A---T-C---TTT-TCTT-ATT---A----TTATTATGTTG-T-------AAGTGCGCAACATGG----TA--TGAA---------ATGGGAGCACGAACCTCAGTACATG-TG--GTAC--------AAGTTAAGTTGA----TGCCAGGAGTTTGT-ATTTTGT-GAACAGA---A-TG---------------------CAC---AA-TA------T---G-------CTAT-ATGC------CTTGA-T----GTGT--TT-AGCTTC---TA-AAT---A-AACACA-----------TTCTC-GC--A-G-TT--A-A-cctttatacacaattggaaaata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tag---GTGC---GGATGTGT-ATTTCGT-GA----A---A-TGG---TCTGGTGGGCACAATG-CAT---AA-TA------T---G-------CTGT-A-GG------CCTAG--CT--GTGT--TT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACATT-----------TTCTGA-T--A-G-TT--A-A-AC-TATG--TCGC-TGTCCAAC-T-TT-----TA--GCT-TTCCAGTATTTT---------TTTTAGTACAG-TACA-TGGA---C-AA--AAGCGACTGT-TTTA-TTTAT--ATGGTAAAGTCCCTG-T-ATTGACA----AAC--AAT----------TT----CCCGTCTTTTTCTCACA-C-CTTCC---TTTGAATAA-TTGAAA--AAACTC-AGGCTATACC-TCCCTA-ATT--CTG-ACAGC----TA------GT-ACA------C---C-actagg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgC---GAGTGTGT-ATTTCTT-AA----ATTGA-TGAAGACCTGG----------T-CAG---AG-CAT--A--T---G-------TTGT-A-TG------CCTAG--CT--GAGC--TT-AG-TTC---CA-TAT---A-ATTATT-----------TTCTT-GC--A-C-TT--T-G-CCTGGGC--T-GT-TGTTCATC-TGTC-----TGT-GTT-TTG--------------------T--A-AC---TACA-TGGA---C-AA--AGACAACTGG-TTTT-CT--A--ATGGCA------TTG-T-GCCGACA----TAACAAATATCCGTCTTTTT----T----------CTCATA-C-CCTCC---CTTGCA------GAAA--ACAATC-AGCT--TATC-----TT-CTT--CTG-ACAGC----TT------GT-ACA------T---C-CGTAACTGAT---ACA-AAA----C-ACCC--TA--------------AG----TTAAT-G-TTATT-T-AC--AT-GCCATG-AACG--TAA---TAA----TTGCGTCTTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGCGTGTGATTTCGT-GA----A---A-TGGA--CCTGG----------A-CAT---AAATAAAGG--C---G-------CTGTCA-GATCGATGCCTAA-TCT--GTGTGTCTGAGCTTTCTGTA-CAT---A-AACACCATATCTCGAGATCCTGGGCGGA-A-TT--T-A-TC-GGGAATT-GCCTGTCACAC-TGTTGGTAATGTAGTTATTCTTGTTTTTA---------TTT--A-ACAGATACAGAAGAGAAC-AAGAAAGCGACTGT----------------GTAGA---TTTGTA-GTCGACAATAACAA--ACC----------TTATACCA---------CTCGTAACACTTCCGATTTCGAAAAAGTTGGAA--AAATTCCAGGC--TACCGACCATT-ATTA-CTG-ACAGC----TA------GT-ACAGACACCC---C-CGTA--TGAC---ACA-CAAGTCTC-ACCCCGAAGGGGACACACCGATACT---GTCAT-G-TTATCGT-GC--AAAGCTGTT-AAGA--TGAAATTAA----TTGC--CATTT-------------TCTG--TACCAT-TAAA-C--GAATTA-T---ATTTATA-TGCAC--TG-A-G--AGT-----TTTTTA-CA---TT--C-------A--ATCTAAGGGCGGT--GTC--AT-G-AC-GGCGTC-ACA-----ATA-CCAAATGGCGAACGCAAGCAC-ACTATCC--------GAG--A-AAGAGATAGC-A--CTAATAGATTGCA-----AGATCTTG---ACTTCC-AT----TGCT-TTCAAAACT----TGAAAAACCAAA-GC-A--AAA-TAACTATCATAA-TA----CA--AAAT--ACATTTGGT-AGTCT---A-TC-----TTTAGA-GGC---ATACAAAAGAAAG-TGGATTTTGC---ATGACAAA-GAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGGATATaatccattaattagatactctaaaatcttgaaaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggc--C---G-------CTGC-A-AG------CCTAG-CC---GTCT--TT-AGCTTC---TA-CAT---A-AACACC-----------TTCTC-GC--G-G-TT--A-AATT-GGGT--T-GC-TGTCCAAC-TGTT-----TAT-GTT-TTCCgtcc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gacaGT--TT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-----------TCCTC-GC--ATG-TA--A-A-CT-GGGT--T-GC-TGTCCATC-TGTT-----TAT-GTT-TTCCTTTATTTTATTATTTTTTTT--A-ACAG-TACA-AGGA---C-AA--AGGCGACTGT-TTTG-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA----CAA--AAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AA--AAGCAACAGT-TTTA-TT--T--ATGAAAAAGTTCTTG-T-ATCAACA------A--ATT----------TT----C----------CTTGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AA-CTC-GGGC--TACC-TCCCTA-ATT--CTG-ACAGC----TA------GT-ACA------C---C-ATCAACCGAC---ACA-CAA----C-ACCC--AA--------------AA----GTAAT-G-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT-AATG--TGA---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacttcttatcgctagtacagactcgtaccggactttacaataacgactcaaacaaccgtactgttattttgtctaacctgttcaacgcgtgactaaagactagccttttttgtctttaggatgctgaatctattttgatacttatagtgctgtagttagttgtttacagtcttctaaccagggcgtaggtcccattgtactgtcaacgacactcgggatggtgcgacaattaccccggtcatgagcaaaaaggatcctgcattccgtggccagacattgcgaagtctcacaaggtgcttccaaactccggtaaaaaccaagccaaaataatttattgttggcaaaatacacatttgtcagtcatcaatcttaggctatagaaggtatccgattgcataaggaaggataaaag
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --ATGGTAAAGTCTTTG-T-GTCGACA----AAA--CAT----------T-----C----------CTCGCA-T-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAG--AAA----AAAA--AA--------T-ATT--ATG-ACAGC----TA------GT-ACA------C---C-CG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACTT-AGGC--TGCC-TCCCGT-CTT--CTG-ACAGC----TAAGCCTAGT-AAC------C---C-CGAACCCGGT---ACA-AAA----C-ACCC--GA--------------CT----GTAAT-G-TTATC-T-AC--AA-GTCGTT-AACA--CGA---TGA----TAGC--CATTT-------T----TTTTA--T-CCCT-TCAATCTAGA-------TAATTAAT----C-C-----A-T--AAT-----TA-TTA-CC---CT--CTCGCTCGA--A-----GGTCG-C--AT---AT-G-AC-GTCA-C-ACATA---------A--TGGCG--CGTA-t
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TT--CTT-ATCGC----TA------GT-ACAGA----C---T-CGTACCGGACTTTACAATAA----CGACTC--AA--------------ACAACCGTACT-G-TTATT-TTGTCTAA-CCTGTTCAACGCGTGAC--TAAAGACTAGC--CTTTTTTGTCTTTAGGATGCTGAAT-CTAT-T---TT--GATACT-T-------ATAGTGC----TGTA-GTTAGT-----TGTTTA-CAGTCTT--CTA-----ACCA-----GGGCG-TAGGTCCCATTGTACTGTCA---AC-GACACTCG-GGA--TGGTG--CG-A-CAATTAC----CCCGGTCATGAGCAA-AAAGGAT-CCTG--C------ATTCCGTGGCCAGACATTGCGAAGTCTC-ACAAGGTGCT-TCCAAA-CTCCGGTAAAAA--CCAA-GCCA--AAA-TAATT----TAT-TGTTGGCA--AAATACACATTTG-TCAGTCATCAA-TC-----TT---A-GGCT--ATAGAAGG--
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtttagcttctatataaacacctcctcgcatgtaaactgggttgctgtccatctgtttatgttttcctttattttattattttttttaacagtacaaggacaaaggcgactgttttgtttatggtaaagtccttgtgtcgacacaaaatttcctcgcaccttccttcgaaaaagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacA------GT-ACA------C---C-ATTAAACAGC---ACA-AAA----C-ACCG--TA--------------AT----GCAAT-G-TTATT-T-AC--AA-AACATT-AACG--TCA---TAA----TTGG--CTTTTTTGtatccgattgcataaggaaggataaaag
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCT-T----TTATG--T-CCAT-TAAATT--GA-ATT-TGCTAATAATT-TGG-C--TA-A-C--AGC-----TGTTTT-C-----T--CGCA----A--A-----GGATG-T--AT---CT-G-AC-ttgattaaatataatc
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  at-C--TA-A-G--AGT-----TGTTTT-C-----T--CGCG----A--A-----GGACT-C--GT---AT-G-AT-GTCA-C-ACA---------TCA--TGGCG--CGCA-AAAT-A
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--GT---AT-G-AC-GTCA-C-ACAGATAT-----------GCA--CGTA----------------------------AAAA----GC-T--C------ATCTCA-----AAAT-TCT---TATTTCGAC----AACAATTCGAA-CT----TAAAAA--CTAACGC-G--AAA-TATTT----CAT-T-----TATAAAAC--ATATTTA-A-AATC----A-TT-----AT---ATGGC---ATGCAAAG--AAT-TG-ATTTT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatttacaaggtcggaacgcgataattggtttgtttgtccattagtaccgaatttatttcacacACACATA-C----TGGCG--CGTA-ATAT-AC----C--------GAG--ATAAAATGT-GA-A--T------TTCACA-----AGAT-TTG---GATTTC-AT----CGCgctaaaatatatatacataa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tttccaaggttgcatacaattataatgtaA-----AGAT-TAG---AATTTC-AT----CACT-TTCAAA-TT----TAAAAA--TT---GC-ACCAAA-T-GTT----TG---------A--AAAC--ACATTTA-A-ACTT----A-CT-----TT---A-GGC---ATGCAAGG--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              C-AT----TGCT-TCCAAA-CT----TGAAAA--ATAA-GC-A--AAA-TGATT----TAA-T-----CA--ATAT--ACATTTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGC---ACACAAAG--AAG-TA-ATTTTGC----------A-TAGAATTTCTTTTTTTA--AG---TTTAAAAACATGAGATGT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atatggttgatagttgtttactcgcaaagaactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAA-CT----CTAAAG--GTAC-AT-A--AAA-TAA--------------------AAAT-------TA-T-AGTC----A-TT-----AT---A-GAC---ATGCAATG--AAT-TG-ATTTTGT---TTAATGAT-TAAAA-------------------TTTAGAAACATGg
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAAAA--TCGC-GC-A--AAA-TATTT----CAT-T-----TA--AAAC--ACATCTA-A-AGTC----A--T-----GT---A-GGC---ATcg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tta-AGTC----A-TT-----TT---A-GGC---ATACAAAGA-AAA-TA-TTTTTTC---TTTAAAAA-TCAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATG
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): AACTTGATATGAAACGGGGGTACAAACCAGTGGACATGTTTCAGAAGGTCACTTGGTGTGATTGTTTAATTCGTAATATGCATGATCTGCTGTAAGCCTAGTTAGGTTTAGCTTT
Unaligned ( gi|35 ): CAGTTGGCGCTAGTGTGATTGTATATTCCATGAAATTGTCTGAGGGGACAGAATACATGCATATGCTGTAGCTGTGTTTAG
Unaligned ( gi|36 ): AATACCTATGTAAATGCCAGAAAAATGTAGCGAGGAAAACGATTATTAAATCGGTAAATGCGAGGAAATTTTTGAAAAGGT
Unaligned ( gi|41 ): CAGTTGCCTAACCATTCTTCCTTGGCCATGGCTACACCCGTAGCCGATACATAACACTCGAA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444              22222222                                 1111111111                                1111111111             111                                 11111111             222222222222    33333333333333                      111111111   1  111111                                         1111       1                                                                                                                                                                                                                                                     44444444444444444        11                111                    1       33333333333333333       111111                                    1111          333333333                                        11                2222222222222  111111      33333333333         333333333333           1111                    33333333333333333333                                 8888888888888888         22222222222                           1111    111111111111111111          3333333333333333333      1111111        1111             111                          1111111111         1111                                           8888888888888888888888888888888888   11                                                                   11111       222222222222222222222222222                                                                                   111111         111111                       1111      333333333333333333333                                                             44444444444444444                  222222           1111           11111        11111   22222222222                                 77777777777777777777777777777                        11111111   1111       111   2222222222                                                                                  111111111111             111                                                                          22222222222222  111                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  0      11  4  4  4 4    4           4   1   4    4    777   3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333  4 55   99   00000000     3 4  2   66         55      9999999999 1  1         2    777          8888888888             000     77   1    8   66          4 66666666 4   4   0   555555555555    55555555555555 66              44   000000000   2  666666     55       8888       4  777 1        2222       4        1                                                                                                                                                                                                               999  4         1       3     44444444444444444   5  0 11    77    1 77  000   5   5  5     5   1     3 88888888888888888       444444    99  44 6    6    6     8        7777 55       555555555   88    5 0  0 4     77  666    77 5   22      5     77  7777777777777  555555  5   66666666666 66      555555555555  5     2  4444                    33333333333333333333     1    5 4    88   66  3      0000000000000000         55555555555   7777        3       3   4444 3  666666666666666666  7777  3 4444444444444444444    3 0000000   3    1111      6      333  3   666 3      3 3    3 5555555555 3 3 55  8888  55   55  4  4        8    55 444   55  4 3333333333333333333333333333333333   00   9999 1    55  55          4    4  88888         00    3 7       55555  55 0 888888888888888888888888888      3 3 3   666          1     55  66  3    55555 2 666  3  3   77   3    7777   555555 2   555 222222  2    1     555   44  0000 3    000000000000000000000    3  3     5555 44  4444   77    44  3 999 3  7777     0   66666666666666666    44   3   1 3  000000   33 555  0000 4   999   00000  0  4  11111   00000000000  55  2  44  3 999999      3  3  44444444444444444444444444444      55  1  8888    4  66666666   9999       222   5555555555   2      8   777    2   99999   55      3  7777      44    3  3 44   3 3   7777  999999999999   777       000    9999 3  77777  555 6      555     77   3 66   666    8 0 3  777 4     99999999999999  000                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .      ..  .  .  . .    .           .   .   .    .    ...   ...............................................................................  . ..   ..   ........     . .  .   ..         ..      .......... .  .         .    ...          ..........             ...     ..   .    .   ..          . ........ .   .   .   ............    .............. ..              ..   .........   .  ......     ..       ....       .  ... .        ....       .        .                                                                                                                                                                                                               ...  .         .       .     .................   .  . ..    ..    . ..  ...   .   .  .     .   .     . .................       ......    ..  .. .    .    .     .        .... ..       .........   ..    . .  . .     ..  ...    .. .   ..      .     ..  .............  ......  .   ........... ..      ............  .     .  ....                    ....................     .    . .    ..   ..  .      ................         ...........   ....        .       .   .... .  ..................  ....  . ...................    . .......   .    ....      .      ...  .   ... .      . .    . .......... . . ..  ....  ..   ..  .  .        .    .. ...   ..  . ..................................   ..   .... .    ..  ..          .    .  .....         ..    . .       .....  .. . ...........................      . . .   ...          .     ..  ..  .    ..... . ...  .  .   ..   .    ....   ...... .   ... ......  .    .     ...   ..  .... .    .....................    .  .     .... ..  ....   ..    ..  . ... .  ....     .   .................    ..   .   . .  ......   .. ...  .... .   ...   .....  .  .  .....   ...........  ..  .  ..  . ......      .  .  .............................      ..  .  ....    .  ........   ....       ...   ..........   .      .   ...    .   .....   ..      .  ....      ..    .  . ..   . .   ....  ............   ...       ...    .... .  .....  ... .      ...     ..   . ..   ...    . . .  ... .     ..............  ...                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  8      55  0  0  0 0    0           0   9   4    4    888   6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666  0 55   55   00000000     9 4  7   11         22      4444444444 0  0         2    888          2222222222             777     77   9    9   11          4 11111111 4   4   9   666666666666    00000000000000 44              44   555555555   0  999999     55       5555       0  888 3        1111       0        0                                                                                                                                                                                                               999  4         0       7     11111111111111111   9  1 11    99    0 11  999   7   7  7     7   4     2 55555555555555555       333333    22  33 7    7    7     0        0000 88       888888888   88    0 3  1 3     11  000    99 7   99      1     99  6666666666666  333333  7   33333333333 99      444444444444  0     1  0000                    66666666666666666666     0    0 5    55   99  6      0000000000000000         22222222222   5555        3       6   1111 6  444444444444444444  4444  6 9999999999999999999    3 6666666   3    3333      2      666  6   444 6      6 6    6 9999999999 6 6 00  9999  22   55  0  0        0    55 666   55  0 8888888888888888888888888888888888   11   4444 0    55  55          0    0  00000         66    6 3       88888  00 1 444444444444444444444444444      6 6 7   444          2     55  55  6    22222 3 444  6  6   99   3    1111   444444 9   000 111111  9    6     888   33  4444 3    111111111111111111111    6  6     6666 66  1111   99    66  3 222 3  7777     1   88888888888888888    66   3   4 6  333333   22 777  2222 0   000   00000  8  0  44444   99999999999  00  0  99  3 666666      6  6  66666666666666666666666666666      00  2  5555    0  11111111   9999       222   6666666666   9      0   000    2   44444   55      6  7777      66    3  3 66   3 7   1111  999999999999   888       222    6666 1  77777  444 2      888     99   6 33   444    8 5 8  000 4     66666666666666  000                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G---C-----C-----T-----T-----------C----G-ACCAG---A-----T----A--G--T---------AA-A--TAG--TGT--------TAGATGT-CTGTAA--AAACTCAACT-TTTATT----------CACCCTGAACAACATTTAT---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGCT-TGTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAAA---A-TA--AGCA-TCATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AAA-----TT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTTA-GC---TAC---GTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACAA----AA--AAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAA-ATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC-T---TTC----T------AA--GGGCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A----CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
Reference ( family-549 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G---C-----C-----T-----T-----------T----G-AC------A-----T----A--G--T---------AA-A--TAG--TGT--------TAGATGT-CTGTAA--AAACTCAACT-TTTATT----------CNCCNTGAACAACATTTAT---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGCTNTGTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAAN---A-TA--AGCA-TCATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAN--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AAN-----TT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTTTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGNAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTTACGC---TAT---G-AGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGTC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACAN----AA--AAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAN-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAA-ATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC-N---TTC----T------AA--GGGCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A----CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAATTTCAAAAAGTATTTTTAAGTT-AG-CCTAGGATAGTCACGTGG-TACCGTGGACGT-CAGA---TAC---G---C-----CCGATCT-----T-----------C----G-AC------AACAGAT----AAAG--T---------AA-A--TAG--TGT--------CAGATGTTCTGTAA--AAACTCAGCC-TT-ATT----------CTCTCTGAACAACATTTAT---TTCGATGTTGA------CAAATTTTTCGAATCTT--AAAATTCAAATCGTATCAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA--------------------------GCGAA-AACATCGT----CTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGACATG----GGCCGCTTTGTAAACAGTAATTGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cAAATCCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATT----AAAA-------A--AGCAATCACATT----ATAT--ATATTT--TAT--TGTTGATTATTACCGA-TTG-CAAGGTATAG-GCCTAAAGCCGGCGGAGAGC-A----CGGC--AATAC-ACAT-C-CA-TTGATTGCCATGGT----T-AAACCGC---------AGAAT-CAAT--GAAATGTTTACT-GA-G-GAATATT-ACA--TATTTTATTATT--TG----------T--AATACAAGTT-CAC---T---TT--T--TTAATTTATT---A----TTATTATCATTAT--TTTGTAAATGTGCGATTTGGAAATTATTGGAATACCGATCAATAGGAACA-CGAACCTCATT--ATTTGTTGTTATGC---TATTATGTAGGTCAGTT-G-----G---ACGT---GGGCGAGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---CAA-T----AA--AC-G-------CTGT-AG------GTA-TAGTC---GTGTTT-AGCTTC----A-TAT---ATAACACC---TCTC-G----------C-A-A--TTA-A-ACT-GGG--TT-GC-TGTCCATC-TGTT--T-A-T-T--TT-TCCTTTATTTTATTA-TTTT---------TTTA--ACA--TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-TGGTCGACAC----AA--AAT----------TT----C----------CTCGCA-C-C-TCC---TTCGAAAAAG-TGAAA--AAA-TC-AGAT--TGCCGC---CC-TT-ATT--CTT-ACGG----CTA------GTTAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAC-----------GTAA-TG-CTATT-T-GC--AA-TCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCT-----------TTTT-TGT-CTAT--TAA-ATCGA-ATCTACTCTATG-ATA-TGCTC-T-TGA-G-AGT-----TGTTTAACAT---TTC----C------AA--AGGCG-TAT-C------TGACGT-CA-CA---------C--A----C-----CC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG----AAAATAT---GCA---T------ATTGCCAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TATAT-----TA--AAAT--ACATCTG---------------------T---A-GGCATA---CAGAG--AAG-TA-ATT---TTGCCTAAAAA---ATTAATA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaaaatccaaagtataaatcaaggtgctttattaaaaaagcaatcacattatatatattttattgttgattattaccgattgcaaggtataggcctaaagccggcggagagcacggcaatacacatccattgattgccatggttaaaccgcagaatcaatgaaatgtttactgaggaatattacatattttattatttgtaatacaagttcacttttttaatttattattattatcattattttgtaaatgtgcgatttggaaattattggaataccgatcaataggaacacgaacctcattatttgttgttatgctattatgtaggtcagttggacgtgggcgagtatttcgtgaaatggcctggacacaataaacgctgtaggtatagtcgtgtttagcttcatatataacacctctcgcaattaaactgggttgctgtccatctgtttatttttcctttattttattatttttttaacatacaaggacaaaggcgactgttttatttatggtaaagtccttgtggtcgacacaaaatttcctcgcacctccttcgaaaaagtgaaaaaatcagattgccgcccttattcttacggctagttacacccgtagccgatacataacactcgaacgtaatgctatttgcaatctgttaacgtgataattgccttttttgtctattaaatcgaatctactctatgatatgctcttgagagttgtttaacatttccaaaggcgtatctgacgtcacacacccatggcgcgcagaataccgagaaaatatgcatattgccagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttatattaaaatacatctgtaggcatacagagaagtaattttgcctaaaaaattaataaagtttagaaacatgggatatg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccaatttcaaaaagtatttttaagttagcctaggatagtcacgtggtaccgtggacgtcagatacgcccgatcttcgacaacagataaagtaaatagtgtcagatgttctgtaaaaactcagccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacaaatttttcgaatcttaaaattcaaatcgtatcatgttttagccaccagtgcatacgaatagcgaaaacatcgtctataatatcggtaattgcgagtaaattgttttgacatgggccgctttgtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaC---GAGTGTGT-ATTTCTT-AAATTG-A-TGAAGACCTG----G---T-CA---GAG-C----AT--AT-G-------TTGT-AT------GCC-TAGCT---GAGCTT-AG-TTC---CA-TAT---A-ATTATT-T-TCTT-G----------C-A-C--TT--T-GCCTGGG--CT-GT-TGTTCATC-TGTC--T-G-TGT--TT-TG-----------------------------TA--AC---TAC----ATGGAC--AA--AGACAACTGG-TTTT-CT--A--ATGGCA------TTG-T-GCCGACAT----AACAAATATCCGTCTTTTT----T----------CTCATA-C-CCTCC---CTTGCA------GAAA--ACAATC-AGCT--TATCTT---C------TT--CTG-ACAG----CTT------G-TAC---A------TC-CGTAACTGAT---ACAA-AA----C-ACCC------TAAG-----------TTAA-TG-TTATT-T-AC--AT-GCCATG--AACG--TA-A---T-AA----TTGC-------GT-C--TTTT-AAT-CCAT--TAA-g
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGACTTTAAAAAGTATTT--GA-TT-CG-C-TAGG-TAGTCACGTGA-TACCGTG-ACGT-CCGG---TGC---AA--C-----C-----T-----TCTTCAACCAGCT----G-ATT-----A-----T-------G--A---------AA-G--TAG--TAT--------TGCGTGT-CTATAA--AAACTCAACG-TTTCTT----------CATCTTGAATAACATTTAT---TTCGATGTTGT------T---CTTTTTGAGTTTTCAAAAATACAAACCGTA-TAG--ATTTTAGCAA-C--------C-AGT-GCACACACATGGCGATTTAAATG------------C-CC-AATAAAGAATCGAA-GATA-------------AA--G---TCGCC--AATTGCG----AGTAAAT-TGATATATTTATACG----GGCCATT-------CATTAATTAGttagatactctaaaatcttgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      cCGATTTCAAAAAGTCTTTT-AA-TT-GG-C-TAAG-AAGACATGTGG-TACTGTG-TCGT-CAGACGGTGCTCAG---C-----C-----T-----C-----------T----G-ACAAGCGAA-----T----C--G--T---------AA-AAGTAG--TGTTACATATGTAAATAT-TTATAACCAAAATCAACT-GTTAAT----------CACCAAGAA-AACAATGAT---TTAGATGTCGC------CGAATTTCTCGAGTATT---AAAT-------------T--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATGTA------------AATAACGCTGTAAACGC-CT-AAGAAAGAAGCGAG-GAAAGCGA----ATATGAA--A---TCGAT--AATTGCG----AGTAAAT-TA---CGTTGAAATA----Gaagggttatgcatttaaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---GTGC---GGATGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---TCTG----GTGGG-CA---CAA-TGCATAAT-AT-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCT---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACATT-T-TCTG-A----------T-A-G--TTA-A-ACT-ATG--TC-GC-TGTCCAAC-T-TT--T-A--GC--TT-TCCA--------GTATTTTT---------TTTAGTACAG-TAC----ATGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TTTAT--ATGGTAAAGTCCCTG-T-ATTGACAA----AC--AAT----------TT----CCCGTCTTTTTCTCACA-C-CTTCC---TTTGAATAA-TTGAAA--AAACTC-AGGCTATACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ttatctgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgCGATATCAAAAG---TTTTTAA-TT-AAAC-TAGG-TAGTAAACTTG-TAC-GTG-ACGTTCAGA---TAC---GGTCCTTG--C-----T-----T-----------C----G-AC------AGA---C----A--GGAT---------AAGA--TAAGATGT--------TAGATTA-TTGTAA--AG-CTCAACTCTTTATT----------AACTCTGGACAACAATTATGTTTTCGATGTTGG------CAAATATCTCGAGTCTT--AAA--TTAAAACGTA-CAT--GTTTTAGCCA-CAATAAAGACAAGT-G-ATACA------------AATAG-----------CACA-AAGAAT-AAGC----AACA--GG----ATAT-AA--ATAGTGGGC--AATTGCG-----GTAAA--TG---TATAGACAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTTAA-T--AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACTT-CAAA---AGC---A---A-----C-----CATTCGT-----------T----G-AC------------C----A--G--TTGCTTGTGAAA-A--TAT--TGT--------TAGATAT-TTAAAA--TAATTCAATT-TTTATT----------TACCCTAGACAACATTTAT---TTCGATGTTGAAAAATTTAAATTTATCAAGTCT---AAAATTCAAATCGTA-TATTCACTTTAGCCAGC--------C-AGTTGCA-ACG------------AATG------------A-CC-AAGAATGAAGCGAG-----TT-A----GGA--AA--G---TCGGCCAAATTGCG----AGTAAAC-TA---TACTGACaattg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCAGATTTAAATTA-G-AA-ATCAAAGTGCTTTATTTAAAAAAAA---A-TA--A-TA-ACATGTTTT-TAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cagaaattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaTATT-T-AC--AA-G--GTCGGAACG--CG-A---T-AA----TTG----GTTTG-------TT-TGT-CCAT--TAGTACCGA-ATTT-tttattg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CA-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-G-------ATAT--------GCA--CGTAA----AA-------------------------A----GCT---C------ATCTCAAAAT-TCT---TATTTCGA----CAACAATTCGAA-CT----TAAAAA--CTAACGC-G--AAA-TATTT----CA-TT-----TATAAAAC--ATATTTA-A-AATC----A-TT-----AT---ATGGCATG---CAAAG--AAT-TG-ATT---TTGC-TAAAAT---A-TAatttcacacgtatgacgtcacacagatatgcacgtaaaaagctcatctcaaaattcttatttcgacaacaattcgaacttaaaaactaacgcgaaatatttcatttataaaacatatttaaaatcattatatggcatgcaaagaattgattttgctaaaatatatatacataa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatttacaaggtcggaacgcgataattggtttgtttgtccattagtaccgaatttatttcaCAT----TGCT--TCCAAA-CT----TGAAAA--ATAA-GC-A--AAA-TGATT----TA-AT-----CA--ATAT--ACATTTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCACA---CAAAG--AAG-TA-ATT---TTGC----------A-TAGAATTTCTTTTTTTA--AG---TTTAAAAACATGAGATGTtatacataa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atatggttgatagttgtttactcgcaaagaactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---CA--T--TTAATC--TTT-TC----TTATTATTATTAT--GTTGTAAGTGCGCAACATGG------------TAT-GA--AATGGGAGCA-CGAACCTCAGT--ACATGTGGT---------AC---A-AGTTAAGTT-G-----A----TGCCAGGAGTTTGT-ATTTTGT-GAACAGAA-TG------------------CA---CAA-T----A----T-G-------CTAT-AT------GCC-TTGAT---GTGTTT-AGCTTC---TA-AAT---A-AACACA-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-Ag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          tagttttatttgcCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TC-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G---C-----C-----T-----T-----------T----G-AT------A-----T----A--G--T---------AA-A--TAG--TGTTA------TAGATGT-CTGTAA--AACCTCAAC--CTTATT----------CTCTCTGAACAACATTTAT---TTCGATGTTGA------CATATGTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTACCAT--GTTTTAGCCA-T--------C-TGT-GCATGCG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCAAA-AACATCGG----GTAT-AATTA---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGATATG----GGCCGCTCGGTAAACAGTAATTGGactagg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATTTAAAAAAAACCAA-CA--AACAATCATTTTTTTTATAT--GTATAT-ATAG--TGT-GAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-ATTGTCAGC--AATAC-ACAT-CTCA-T-----GTCATGGT----TGAAAGCGCGTACACGAAAGAA---AATTATAAATGTTTACT-GA-A-GAAT--T-ACA--TATTTTCTTATT--TG----------T--AAT-----TT-CAA---T---C---T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTTTT-T--TTTTTAGATGTGCCATTTGG------------TAG-GA--AATGGAAACA-CGAACCTGGGT--ATTTGTTGTTGTGC---TATTATGTAGGTCAGTTTG-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTTGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---TAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------ACC-TAATCA--GTGTCT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTCAG----------C-A-A--TT--A-ATC-GGG--AT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTC---------TTTG--ACAG-TAC----AAAGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCTTTG-A-GTCGACAC----AA--AAT----------TT----C----------CTCGTA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCAC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTCTGC-CTGTTTC-TGT-CCAT--TAC-ATCGA-TTTT-TTTTATTAATA-TG--C-C-TGA-G-AGT-----TGTTT-AC-A---TTC-----------AA--GGGCG-TGT-A------TGACGT-CA-CA---------CAGA----CACACACC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---T------ATTTCAAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-TT-----CA--AAAT--ACATCTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTCCATGACAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaattcaaagtataaatcaaggtgctttatttaaaaaaaaccaacaaacaatcattttttttatatgtatatatagtgtgatatactgattgcaaggtaatgccggagagcattgtcagcaatacacatctcatgtcatggttgaaagcgcgtacacgaaagaaaattataaatgtttactgaagaattacatattttcttatttgtaatttcaatctttaattattgtattattatttttttttttagatgtgccatttggtaggaaatggaaacacgaacctgggtatttgttgttgtgctattatgtaggtcagtttgagtgcgggcgtgtattttgtgaaatggcctggacataataagcgctgtagacctaatcagtgtctagcttctatataaacaccttctcagcaattaatcgggatgctgtccaactgtttatgttttcctttatttctttgacagtacaaagacaaaagcgactgttttatttatggtaaagtctttgagtcgacacaaaatttcctcgtaccttccttcgaaaaagttgaaaaaactcaggctaccacccttattctgacagctagtacacccgcaaccgacacacaacacccaaacgtaatgttatctgcaagctgttaacgtgataattgccttttctgcctgtttctgtccattacatcgattttttttattaatatgcctgagagttgtttacattcaagggcgtgtatgacgtcacacagacacacaccatggcgcgcagaataccgagaaaaatatgcatatttcaagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttattcaaaatacatctgtagtcattttaggcatacaaagaagtgattttccatgacaaataaaaaagtttgaaaacatggaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgatttcaaaaagtctttttaatcagctaggtagtcacgtggtaccgtgacgtcagatgcgcctttgatatagtaaatagtgttatagatgtctgtaaaacctcaaccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacatatgtctcgagtcttaaaattcaaaccgtaccatgttttagccatctgtgcatgcgaatacccaagaatgaagcaaaaacatcgggtataattatcggcaattgcgagtaaattgttttgatatgggccgctcggtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT-AGGC--TGCCTC---CC-GT-CTT--CTG-ACAG----CTAAGCCTAG-TAA---C------CC-CGAACCCGGT---ACAA-AA----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-T-AC--AA-GTCGTT--AACA--CG-A---T-GA----TAGCCATTT--------TTTT-TAT-CCCT--TCA-ATCTAGATA------ATTAAT------C-C---A-T-AAT-----TA-TT-AC-C---CTC----TCGCTCGAA--GGTCG-CAT-A------TGACGT-CA-CA---------C--A----TA----------ATGGCG--CGTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GA-TACAATG-ACGT-CACC---TGC---GA--C-----C-----T-----TCT---------T----GTATCAGGTAA-----T----A--G--TGAAA-----AA-A--TAG--TGT--------TAAATAT-CTATTA--AAACTCAGCT-TTTATTAACTACTTATTACTATTAACTAAGTTT-----TTCGATGTTGA------CA--TTTACCGAGACTT--AACATTCAAACTGTA-CAT--GTTTTAGCCA-T--------C-AGT-ACACA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --AA--AAGCAACAGT-TTTA-TT--T--ATGAAAAAGTTCTTG-T-ATCAACA------A--ATT----------TT----C----------CTTGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AA-CTC-GGGC--TACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ATCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAA-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AATG--TG-A---T-aatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------AA-G--TAGA-TGT--------TACAT-T-TT---A--AAACTCTACT-TTTAAT----------CGTCATGGCCAACATGTAT---TTCGATTTTGA------AAAAATTCCTGAGTCTG--AGCATT-AAAACATA-TAT--G-TATAGTCA-C--------C-ATT-GC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcgtcgatgggctgattgtaaaattaaCAAATTCAAAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTA-TTGAAAAATA---G-TA--A-TA-GCATTTTTGAAAT-------TCT-CTAG--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-TAAGG-A-A--GC------------GAGAGC-A----CGGC--A-----ATAT-TTCA-TTGAT-GTCTTGAT----
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTTGA------------TAT-GA--AACGGGGGTA-CAAACC--AGTGGACATGTT------T---CAG---A-AGGTCACTT-G---------GTGT---GATTGTTT-AATTCGT-AAT----A-TG------------------CA---TGA-T---------CTG-------CTGT-AA------GCC-TAGTT---AGGTTT-AGCTT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a-AA-ATCAAGGTGGTTTATTTGAAAAGGC---AATA--AG-----AT-TTTTAGAAAT--GTATTT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AC-GCC----------GAAGAGT-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCATGTGGTTACCATG-ATGT-CAGA---TAA---G---CCCTTTC-----T-----T-----------C----G-ACCAGA--A-----TATAAA--G--T---------AA-A--TAG--TGT--------TAGATG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         c---TTC----C------AA--GGTTG-CAT-ACAATTATAATGT-AA-CA---------CA----------TAC------TGGCG--CGTAA----TATA-CC--------GAG--ATAAAATGT---GAA---T------TTCACAAGAT-TTG---GATTTCAT----CGC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tA------G-TAC---A------CC-ATTAAACAGC---ACAA-AA----C-ACCG------TAAT-----------GCAA-TG-TTATT-T-AC--AA-AACATT--AACG--TC-A---T-AA----TTGGCTTTTTTG--------T-TG----AT--TAA-ATATA-ATC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAATA-TCAA-ATAAGGGTGATTTATTTAAAAGAAT---G-TG--A-----TATA---TCTATATTGGTATAT-AT------T-GA-----ACCGA-TTGACAAGGGA-TT---------------GAGAGC-G-----GGCCAAATACAATATGTTTACTTGAT-GC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaattaaaaaGAT----TGAGAGCGGGCC------A-AATACAAT-----ATGTTTACTTGATGCGAAT--T-ACG-GT--TTCTTTGTT--TGCAAAGTAGAAT--AAA-----TT-CAAATTT---CA--T--TTAATT-ATTT-TAAGCCTAATTATTTAT-TAGTTTGTAAATGTGCGATTTGG------------TAAAGA--AAAGGGAATAACGCACCT--GT--ATA--------------------G-AAGT--GTA-T-----A---GTA----AGGTGTGT-ATTTCGT-GAA----AGTGG----CTA----G---A-CACACAAA-T----GT--GC-GATTAGTTCTGT---------GCT-AAGTC---GTGTTA-AGCTTCT--TA-TATAAAA-AACACC-T-CCTC------------C-A-G--TTTAA-ACT-GGG--TT-G-----TCAAC-TGTT--T-A-TGC--TT-TTCT-------------------------------ACAA-TAA----GAGGAC--AA--CAG-GACTGTATTTA-TT--T--A-GGT-AAGT-CTTG-T-G--GAAAA----TA--ATT----------TT----C----------ATCGGA-C---TTC---TTCG-CAAAGTGGAAAATAAGCTC-AGGC---A-CAC---TA-TTAATTGGCTGAACAG----ATA------G-T-C---A------CCATGTAATGAAC---ACAA-AA----C--CC--------AAC-----------GTAA-T---------------------------TG--TGTA---T-AA----TTGCCTTTTTTG--------------TCAT--TAA----GA-ATAT-TGTTATAATTA-TG--T-C-TAATC-AGTTAAAATGTGT-AT-T---TTC----T-------C--GAGCG-AG--A------GGACA---A-AA---------TG-AGAGTCA-ACATC----ATGG-G--CGCCA----AATA-CT--------GAGA-A-AAAATAT---GCT---T------ATTGCAAGAT-TTT---GATT--AT----TGC---TTCAAA-AC----TGAAAA--GTAA-GC----AAA-T-ATT----TA-TT-----CA--AAA---ACATTTG-T-AGTC----A-TTTAATATT---A-GGT-TAAATCAAAT--AAGATA-ATT---TTGCGTA--AA---A-TAAAA-----------ATCAGTGTTTTAAAAAgaattacggtttctttgtttgcaaagtagaataaattcaaatttcatttaattattttaagcctaattatttattagtttgtaaatgtgcgatttggtaaagaaaagggaataacgcacctgtatagaagtgtatagtaaggtgtgtatttcgtgaaagtggctagacacacaaatgtgcgattagttctgtgctaagtcgtgttaagcttcttatataaaaaacacctcctccagtttaaactgggttgtcaactgtttatgcttttctacaataagaggacaacaggactgtatttatttaggtaagtcttgtggaaaataattttcatcggacttcttcgcaaagtggaaaataagctcaggcacactattaattggctgaacagatagtcaccatgtaatgaacacaaaacccaacgtaattgtgtataattgccttttttgtcattaagaatattgttataattatgtctaatcagttaaaatgtgtattttctcgagcgagaggacaaaatgagagtcaacatcatgggcgccaaatactgagaaaaaatatgcttattgcaagattttgattattgcttcaaaactgaaaagtaagcaaatatttattcaaaaacatttgtagtcatttaatattaggttaaatcaaataagataattttgcgtaaaataaaaatcagtgttttaaaaaaaaaatgcgatgtg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaattaaaaaaaaatatcaaataagggtgatttatttaaaagaatgtgatatatctatattggtatatattgaaccgattgacaaggCAAA-CT----CTAAAG--GTAC-AT-A--AAA-TAA--------------------AAAT-------TA-T-AGTC----A-TT-----AT---A-GACATG---CAATG--AAT-TG-ATT---TTGTTTAATGA---T-TAAAA-------------------TTTAGAAACATGaaaaatgcgatgtg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --ATGGTAAAGTCTTTG-T-GTCGACAA----AA--CAT----------T-----C----------CTCGCA-T-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAG--AAA----AAAA--AA-----------T-ATT--ATG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTcg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-------CTGC-AA------GCC-TAGCC---GTCTTT-AGCTTC---TA-CAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-G-G--TTA-A-ATT-GGG--TT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCC
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gacaATTCAAATCA-T-AA-ATAAAGGTGTTTTATTT--AAAAAA---A-TC--AACAATCAATTTTTTTATAT--GTATAT-ATATAATGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAGAT-TAG---AATTTCAT----CACT--TTCAAA-TT----TAAAAA--TT---GC-ACCAAA-T-GTT----TG---------A--AAAC--ACATTTA-A-ACTT----A-CT-----TT---A-GGCATG---CAAGG--
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAGTT-GGCGCTA---GTGT---GATTGTAT-ATTCCAT-GAA----A-TTG---TCTGAGGGG---A-CA---GAA-T----AC--AT-G-------C-AT-AT------GCTGTAGCT---GTGTTT-AG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ------------AATG------------C-CAGAAAAATGTAGCGAG-GAAAACGA----TTATTAA--A---TCGGT--AAATGCG----AGGAAAT-T
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatacctatgtaAATGAAACGAA-AACATCGA----GTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGTCGCTGTGTAAACATTAATtttgaaaaggt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTGC-C--TTTTATGT-CCAT--TAA-ATTGA-AT-T-TGCTAATAATT-TG--G-C-TAA-C-AGC-----TGTTT-TC-T---CGC----A------AA--GGATG-TAT-C------TGAC
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aCGCA------TGAAT-CAATTAAAAAT--TTACT-GA-G-GAAT--TTACA-ATATCTTATTATT--TG----------T--AAA-----TTGCAA--------G--T--TTAATT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taaaaGGCGTGTGATTTCGT-GAA----A-TGGA--CCTG----G---A-CA---TAAAT----AAAGGC-G-------CTGTCAGATCGATGCC-TAATCTGTGTGTCTGAGCTTTCTGTA-CAT---A-AACACCATATCTC-GAGATCCTGGGC-G-GAATT--T-ATC-GGGAATT-GCCTGTCACAC-TGTTGGT-AATGTAGTTATTCT--------TGT-TTTTA--------TTTA--ACAGATACAGAAGAGAAC--AAGAAAGCGACTGT----------------GTAGA---TTTG-TAGTCGACAATAACAA--ACC----------TTATACCA---------CTCGTAACACTTCCGATTTCGAAAAAGTTGGAA--AAATTCCAGGC--TACCGA---CCATT-ATTA-CTG-ACAG----CTA------G-TAC---AGACACCCC-CGTA--TGAC---ACAC-AAGTCTC-ACCCCGAAGGGGACACACCGATACTGTCA-TG-TTATCGT-GC--AAAGCTGTT--AAGA--TG-AAATT-AA----TTGCCATTTTC-----------TGTACCAT--TAA-A-CGA-AT----TATATTTATA-TG--CAC-TGA-G-AGT-----TTTTT-AC-A---TTCAATCT------AA--GGGCGGTGTCA------TGACGG-CGTCA---------CA-A----TA-CCAA-----ATGGCGAACGCAAGCACACTATCC--------GAG--A-AAGAGATA--GCA---CTAATAGATTGCAAGATCTTG---ACTTCCAT----TGCT--TTCAAAACT----TGAAAAACCAAA-GC-A--AAA-TAACTATCATA-ATA----CA--AAAT--ACATTTG-GTAGTCT---A-TC-----TTTAGA-GGCATA---CAAAAGAAAG-TGGATT---TTGCATGACAA---A-GAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGGATATc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggcTTTA-A-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAGA-AAA-TA-TTT---TTTCTTTAAAA---A-TCAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGCGGTATgtcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAgt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cagttgcctaaccattcttccttggccatggc-C-TAA-G-AGT-----TGTTT-TC-T---CGC----G------AA--GGACT-CGT-A------TGATGT-CA-C---------------------ACATC----ATGGCG--CGCAA----AATA-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gGAAAA--TCGC-GC-A--AAA-TATTT----CA-TT-----TA--AAAC--ACATCTA-A-AGTC----A--T-----GT---A-GGCAT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttaCGAATTCAAAA-GTCTTT--AA-TTTAG-C-TAGG-TAGTCACGTG
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACtgttagc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cAATTAAAAGT-TTTACC-GG-A-GGAT--T-ACA-ATATTTCATTATTATTA----------A--AAA-----TT-CAA---G---CAAGT--TCAATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACT--G------------TGC------ATGGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTTA------------A-AGGTCAGTT-A-----A---GT-C---AAGCGTGC-ATTTCGTTGAA----A-TGG---CTTG----G---AACA---GAG-T----TA--G--G-------CTTT-GG------GCT---GT-----TTTTT-AGCAGCA--TAATAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------CGA-G--TT--ATACT-GGG--TCCGC-TGTTCTACGTGTT--TTG-TGT--TT-T----------------------------------ACAT-TAC----GTGAGCCGAA--AAGTG-CTAT-TTTAATT--TCCATGGTAAAGACCTTGTT-GTCGACAA----AC--AATG---------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAGCGCT------AATCTC-G---------AT---CC-TT-ATT--CTG-ACAGTAACTTA------G-TACACGA------CC-CGTAACCGAT---GCCA-AAT---C-ACCC------G-ACTA---------GTAATTGCTTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---TAAA----TTGCCTTTTTAGCGC--TAT--------AT----A-ATCTA-ATCTGTTCTATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TG-TT-AC-T---TGC----T------AA--GATTG-GAC-A------TGACGTCCA-CA---------CA-----------ATT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG--T-AAAATAT----CAGT-C------ATCCCAATTT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TCAAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAGTTCATA----TA-GT-----AG--AAAA--ACATTTA-C-TGCC----ACTT-----TT---ACGGCATA---CACAA--AAG-TC-ATT---TTGC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTAAAA--GTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TA----------TTAAAA-----AT-CAA---TG--CAAGT--TCAATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACCTGG------------CAT-G------GGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTTACA------------AGGTCAGTT-------A---GTCA---AAGCGTGC-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CTGG----A---A-CA---GA------------------------GT-AG------GCT-TGGCT---GTTTTTTAGCAGC---TA-TAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--ATACT-GGG--TC-GC-TGTC--ACGTGTT--T-T-TGT--TT-T----------------------------------ACAT-TAC----GTGAGC--AA--AAGTGACTAT-TTTA-TC--C--ATGGTAAAGACCTTG-T-GTCGACA-----AA--ACTG---------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAG---------------C---GC--TATCTCGATCC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTAACTA--G-TAC---A------CC-CGTAACCGAT---GCAA-AT----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTA-GC-C--T----------AT--CAA-ATCTA-ATCT-GTTCATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TGTTT-AC-T---TGC----T------AA--GATTG-GAC-A------TGACGT-CA-CA---------CA------------TT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG--T-AAAATAT---GCA---T------ATCCCAATAT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TTCAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAA-TGTTA----TA-AT-----AAG-AAAA--ACATTTA-C-TGCC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAA---AAG-TC-ATT---TTGCTTGATGA---tga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-CCTC-G----------C-ATG--TA--A-ACT-GGG--TT-GC-TGTCCATC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTTATTATTTTTTTTA--ACAG-TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTTG-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACAC----AA--AAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGccctttatacacaattggaaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TT--CTT-ATCG----CTA------G-TAC---AGA----CT-CGTACCGGACTTTACAATAA----CGACTC------AAACAACC-------GTAC-TG-TTATT-TTGTCTAA-CCTGTTC-AACGCGTG-AC--T-AAAGACTAGCCTTTTTTGT-C--TTTA-GG----ATGCTGA-ATCTA--TTT-TGATACTTATAGTG--C-TGTAG-TTAGT-----TGTTT-AC-AGTCTTC----T------AACCAGG-G-CGT-A-------G--GT-CC-CATTGTACTGTCA-A----CG-ACACTCGGGATGGTG--CGACA----ATTA-CCCCGGTCATGAGCAA-AAAGGATCCTGCATTCC------GTGGCCAGACATTGCGAAGTCTCACAAGGTGCT--TCCAAA-CTCCGGTAAAAA--CCAA-GCCA--AAA-TAATT----TA-TTGTTGGCA--AAATACACATTTGTC-AGTCATCAA-TC-----TT---A-GGC-TA---T--AG--AAG-GT-ATCCGATTGCATAAGGAAGGA-TAAAA-----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacttcttatcgctagtacagactcgtaccggactttacaataacgactcaaacaaccgtactgttattttgtctaacctgttcaacgcgtgactaaagactagccttttttgtctttaggatgctgaatctattttgatacttatagtgctgtagttagttgtttacagtcttctaaccagggcgtaggtcccattgtactgtcaacgacactcgggatggtgcgacaattaccccggtcatgagcaaaaaggatcctgcattccgtggccagacattgcgaagtctcacaaggtgcttccaaactccggtaaaaaccaagccaaaataatttattgttggcaaaatacacatttgtcagtcatcaatcttaggctatagaaggtatccgattgcataaggaaggataaaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtttagcttctatataaacacctcctcgcatgtaaactgggttgctgtccatctgtttatgttttcctttattttattattttttttaacagtacaaggacaaaggcgactgttttgtttatggtaaagtccttgtgtcgacacaaaatttcctcgcaccttccttcgaaaaagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacTGAAGCGAAGAACATCGATTTAGTAT-A-------TCGGC--ATTTGCG----AGTAAATGGG---TTTTGACATGAAAAGCCCGCT-TGTACACAGTAATTGg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tAGTACT-AAGATCAAG-TGGTT-ATATGAAAAGGC---A-T--------TCGTATTTTTAAAAT--GTCTTTTATAT--CGT-GAT-AT-ACTGAATTAACAAGGTA-ATTGCC----------GAAGAGTTA----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGTGTTATG-AAGCGCGT--------GAAT-CAATTAAATATGTTTACT-GA-G-AATT--T-ACATAAATTTC-TTATG--TA----------T--AAA-----TA-CAG---TGCACA--TCATTAATT-AATA-TA-----TATTATTATT-A--TTTGTAAATGTGCG-TTTGG------------TGA-G---AAT--AAATA-CGAACCTGGGT--AT-TGTTGTTAGGCTATTAT---GTAGTTCAGTTAG-----ATTTGTGC---GGGCTTGC-ATTTCGataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcagtactaagatcaagtggttatatgaaaaggcattcgtatttttaaaatgtcttttatatcgtgatatactgaattaacaaggtaattgccgaagagttacggcaacgcacatttcattgatgccatggtgttatgaagcgcgtgaatcaattaaatatgtttactgagaatttacataaatttcttatgtataaatacagtgcacatcattaattaatatatattattattatttgtaaatgtgcgtttggtgagaataaatacgaacctgggtattgttgttaggctattatgtagttcagttagatttgtgcgggcttgcatttcgaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          : ttgaagcgaagaacatcgatttagtatatcggcatttgcgagtaaatgggttttgacatgaaaagcccgcttgtacacagtaattgataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcGATTTCAAA--GTCGTTTTAA-TT-AG-C-TAG-----TTATGTGA-TACTGTG-ACGT-CAGA---TGT---AT--C-----C-----T-----T-----------TCAACG-ACCAGCTGA-----T----A--A--TGA-------AA-A--TAG--TGT--------TAGATAT-CTGTAA--AAACTCAACT-TTTATT----------CACCTTGAACAACA---AT---T-------------------ATTTC--GA--CT------AT---AGCTATA-C----GTTTTAGCCA-C--------C-AAT-GCATCCA------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAACAAA-AACAGCGA----GTATAAA--A---TCAGC--AATTGCAAGCTAGTAAAT-CA---TATTGACAGA----GGTAACTGTTTAAAAATGAATTGGaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCAAATTCATAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTTTTTGAAAAATA---G-TAATAGCA-Taaaagttatttaaacatgtattattatgtaattatacgtatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaaattcatagtaaaaatcaaagtgttttttttgaaaaatagtaatagcatttt





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888              22222222                                                                         1111111111             111                                 11111111             222222222222    33333333333333                      111111111   1  111111                                         1111        222                                                                                                                                                                                                                                                    333333333333333333   11                                            1       33333333333333333       111111                                    1111          333333333                                        11                2222222222222  11111       33333333333         333333333333           1111                    33333333333333333333                                 88888888888888888         22222222222                           1111    111111111111111111          3333333333333333333      1111111       11111             111                          1111111111         1111                                           8888888888888888888888888888888888   11                                                                               222222222222222222222222222                                                                                   111111         111111                       1111      333333333333333333333                                                             44444444444444444                 222222                    111                111       1111111                                 66666666666666666666666666666                        11111111   1111       111   2222222222                                                                                  111111111111             111                                                                          22222222222222  111                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  0      11  4  4  4 4    4           4   1   4    4    777   55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555  4 55   99   00000000     3 4  2   66         55          4          2 777  9999 777          8888888888             000     77   1    8   66          4 66666666 4   4   0   555555555555    55555555555555 66              44   000000000   2  666666     55       8888       4  777 1        2222      6 111       1                                                                                                                                                                                                               999  4         1       7     111111111111111111   00   88    77    1 77  999   5   5  5     5   1     3 88888888888888888       444444    99  44 6    6    6     8        7777 55       555555555   88    5 0  0 4     77  666    77 5   22      5     77  7777777777777  44444   5   66666666666 66      555555555555  5     1  4444                    33333333333333333333     0    5 4    88   66  3      77777777777777777         55555555555   7777        3       3   4444 3  666666666666666666  7777  3 4444444444444444444    3 0000000   3   11111      6      333  3   666 3      3 3    3 5555555555 3 3 55  8888  55   99999  4        8    55 444   55  4 3333333333333333333333333333333333   00   9999 1    55  55          4    4  88888         00    3 7       888888 3  0 444444444444444444444444444      3 3 3   666          1     55  66  3    55555 2 666  3  3   77   3    7777   555555 2   555 222222  2    1     555   44  0000 3    000000000000000000000    3  3     5555 44  4444   77    44  3 999 3  7777     0   66666666666666666    44 0    3 3  777777   33   3  8888 3   000   88888     3  111  5555 5555555  44  2  33  3 888888      3  3  99999999999999999999999999999      44  1  7777    3  44444444   8888       111   3333333333   2      7   666    3   99999   55      3  7777      44    3  3 44   3 3   7777  777777777777   999       000    9999 3  77777  555 6      555     77   3 66   666    8 0 3  777 4     99999999999999  000                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .      ..  .  .  . .    .           .   .   .    .    ...   ..............................................................  . ..   ..   ........     . .  .   ..         ..          .          . ...  .... ...          ..........             ...     ..   .    .   ..          . ........ .   .   .   ............    .............. ..              ..   .........   .  ......     ..       ....       .  ... .        ....      . ...       .                                                                                                                                                                                                               ...  .         .       .     ..................   ..   ..    ..    . ..  ...   .   .  .     .   .     . .................       ......    ..  .. .    .    .     .        .... ..       .........   ..    . .  . .     ..  ...    .. .   ..      .     ..  .............  .....   .   ........... ..      ............  .     .  ....                    ....................     .    . .    ..   ..  .      .................         ...........   ....        .       .   .... .  ..................  ....  . ...................    . .......   .   .....      .      ...  .   ... .      . .    . .......... . . ..  ....  ..   .....  .        .    .. ...   ..  . ..................................   ..   .... .    ..  ..          .    .  .....         ..    . .       ...... .  . ...........................      . . .   ...          .     ..  ..  .    ..... . ...  .  .   ..   .    ....   ...... .   ... ......  .    .     ...   ..  .... .    .....................    .  .     .... ..  ....   ..    ..  . ... .  ....     .   .................    .. .    . .  ......   ..   .  .... .   ...   .....     .  ...  .... .......  ..  .  ..  . ......      .  .  .............................      ..  .  ....    .  ........   ....       ...   ..........   .      .   ...    .   .....   ..      .  ....      ..    .  . ..   . .   ....  ............   ...       ...    .... .  .....  ... .      ...     ..   . ..   ...    . . .  ... .     ..............  ...                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  8      55  0  0  0 0    0           0   9   4    4    888   22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  0 55   55   00000000     9 4  7   11         22          4          2 888  4444 888          2222222222             777     77   9    9   11          4 11111111 4   4   9   666666666666    00000000000000 44              44   555555555   0  999999     55       5555       0  888 3        1111      7 777       0                                                                                                                                                                                                               999  4         0       4     666666666666666666   99   11    99    0 11  111   7   7  7     7   4     2 55555555555555555       333333    22  33 7    7    7     0        0000 88       888888888   88    0 3  1 3     11  000    99 7   99      1     99  6666666666666  33333   7   33333333333 99      444444444444  0     0  0000                    66666666666666666666     2    0 5    55   99  6      55555555555555555         22222222222   5555        3       6   1111 6  444444444444444444  4444  6 9999999999999999999    3 6666666   3   44444      2      666  6   444 6      6 6    6 9999999999 6 6 00  9999  22   22222  0        0    55 666   55  0 8888888888888888888888888888888888   11   4444 0    55  55          0    0  00000         66    6 3       999999 6  1 777777777777777777777777777      6 6 7   444          2     55  55  6    22222 3 444  6  6   99   3    1111   444444 9   000 111111  9    6     888   77  4444 3    111111111111111111111    6  6     6666 66  1111   99    66  3 222 3  7777     1   88888888888888888    66 3    6 6  444444   55   6  9999 3   999   33333     3  555  6666 5555555  22  6  88  1 888888      3  3  33333333333333333333333333333      66  2  7777    6  55555555   0000       000   1111111111   7      3   444    4   44444   55      6  7777      66    3  3 66   3 7   1111  999999999999   888       222    6666 1  77777  444 2      888     99   6 33   444    8 5 8  000 4     66666666666666  000                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T-A---AA-A--TAG--TGT--------TAGATGT-CTGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGC-T-T-GTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATA--AGCA-T-CATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AA-----ATT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTTA-G-----TAC---GTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAAATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA--GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A----CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
Reference ( family-549 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T-----AA-A--TAG--TGT--------TAGATGT-CTGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGC-T-T-GTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATA--AGCA-T-CATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AA-----ATT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTTA-G----CTAC---GTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAAATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA--GGGCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A----CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAATTTCAAAAAGTATTTTTAAGTT-AG-CCTAGGATAGTCACGTGG-TACCGTGGACGT-CAGA---TAC---G----C-----CCGATCTT----C--G---ACAACAG---AT----AAA-G--T-----AA-A--TAG--TGT--------CAGATGTTCTGTAA--AAACTCAGCC-TT-ATTCTCT-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTTTCGAATCTT--AAAATTCAAATCGTATCAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA--------------------------GCGAA-AACATCGT----CTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGACATG----GGCCGCTT-T-GTAAACAGTAATTGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cAAATCCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATT---AAAAA-A---GCA--ATCA---CAT------TATAT--ATATTT--TAT--TGTTGATTATTACCGA-TTG-CAAGGTATAG-GCCTAAAGCCGGCGGAGAGC-A----CGGC--AATAC-ACAT-C-CA-TTGATTGCCATGGT----T-AAACCGC---------AGAAT-CAAT--GAAATGTTTACT-GA-G-GAATATT-ACA--TATTTTATTATT--TG----------T--AATACAAGTT-CAC---T---TT--T--TTAATTTATT---A----TTATTATCATTAT--TTTGTAAATGTGCGATTTGGAAATTATTGGAATACCGATCAATAGGAACA-CGAACCTCATT--ATTTGTTGTTATG----CTATTATGTAGGTCAGTT-G-----G---ACGT---GGGCGAGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---CAA-T----AA--AC-G-------CTGT-AG------GTA-TAGTC---GTGTTT-AGCTTC----A-TAT---ATAACACC---TCTC-G----------C-A-A--TTA-A-ACT-GGG--TT-GC-TGTCCATC-TGTT--T-A-T-T--TT-TCCTTTATTTTATTA-TTTT---------TTTA--ACA--TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-TGGTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-C-TCC---TTCGAAAAAG-TGAAA--AAA-TC-AGAT--TGCCGC---CC-TT-ATT--CTT-ACGG----CTA------GTTAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAC-----------GTAA-TG-CTATT-T-GC--AA-TCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCT-----------TTTT-TGT-CTAT--TAAATCGA-ATCTACTCTATG-ATA-TGCTC-T-TGA-G-AGT-----TGTTTAACA--TT---TCC------AA--AGGCG-TAT-C------TGACGT-CA-CA---------C--A----C-----CC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG----AAAATAT---GCA---T------ATTGCCAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TATAT-----TA--AAAT--ACATCTG---------------------T---A-GGCATA---CAGAG--AAG-TA-ATT---TTGCCTAAAAA---ATTAATA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaaaatccaaagtataaatcaaggtgctttattaaaaaagcaatcacattatatatattttattgttgattattaccgattgcaaggtataggcctaaagccggcggagagcacggcaatacacatccattgattgccatggttaaaccgcagaatcaatgaaatgtttactgaggaatattacatattttattatttgtaatacaagttcacttttttaatttattattattatcattattttgtaaatgtgcgatttggaaattattggaataccgatcaataggaacacgaacctcattatttgttgttatgctattatgtaggtcagttggacgtgggcgagtatttcgtgaaatggcctggacacaataaacgctgtaggtatagtcgtgtttagcttcatatataacacctctcgcaattaaactgggttgctgtccatctgtttatttttcctttattttattatttttttaacatacaaggacaaaggcgactgttttatttatggtaaagtccttgtggtcgacacaaaatttcctcgcacctccttcgaaaaagtgaaaaaatcagattgccgcccttattcttacggctagttacacccgtagccgatacataacactcgaacgtaatgctatttgcaatctgttaacgtgataattgccttttttgtctattaaatcgaatctactctatgatatgctcttgagagttgtttaacatttccaaaggcgtatctgacgtcacacacccatggcgcgcagaataccgagaaaatatgcatattgccagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttatattaaaatacatctgtaggcatacagagaagtaattttgcctaaaaaattaataaagtttagaaacatgggatatg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccaatttcaaaaagtatttttaagttagcctaggatagtcacgtggtaccgtggacgtcagatacgcccgatcttcgacaacagataaagtaaatagtgtcagatgttctgtaaaaactcagccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacaaatttttcgaatcttaaaattcaaatcgtatcatgttttagccaccagtgcatacgaatagcgaaaacatcgtctataatatcggtaattgcgagtaaattgttttgacatgggccgctttgtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaC---GAGTGTGT-ATTTCTT-AAATTG-A-TGAAGACCTG----G---T-CA---GAG-C----AT--AT-G-------TTGT-AT------GCC-TAGCT---GAGCTT-AG-TTC---CA-TAT---A-ATTATT-T-TCTT-G----------C-A-C--TT--T-GCCTGGG--CT-GT-TGTTCATC-TGTC--T-G-TGT--TT-TG-----------------------------TA--AC---TAC----ATGGAC--AA--AGACAACTGG-TTTT-CT--A--ATGGCA------TTG-T-GCCGACATA----ACAAATATCCGTCTTTTT----T----------CTCATA-C-CCTCC---CTTGCA------GAAA--ACAATC-AGCT--TATCTT---C------TT--CTG-ACAG----CTT------G-TAC---A------TC-CGTAACTGAT---ACAA-AA----C-ACCC------TAAG-----------TTAA-TG-TTATT-T-AC--AT-GCCATG--AACG--TA-A---T-AA----TTGC-------GT-C--TTTT-AAT-CCAT--TAAg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGACTTTAAAAAGTATTT--GA-TT-CG-C-TAGG-TAGTCACGTGA-TACCGTG-ACGT-CCGG---TGC---AACCTT-----C-----TT----C--A---AC--CAG---CT----G---A--TTATGAAA-G--TAG--TAT--------TGCGTGT-CTATAA--AAACTCAACG-TTTCTTCATC-TTGAATAACATT---TA----T---TTCGATGTTGT------T---CTTTTTGAGTTTTCAAAAATACAAACCGTA-TAG--ATTTTAGCAA-C--------C-AGT-GCACACACATGGCGATTTAAATG------------C-CC-AATAAAGAATCGAA-GATA-------------AA--G---TCGCC--AATTGCG----AGTAAAT-TGATATATTTATACG----GGCCAT-T--------CATTAATTAGttagatactctaaaatcttgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      cCGATTTCAAAAAGTCTTTT-AA-TT-GG-C-TAAG-AAGACATGTGG-TACTGTG-TCGT-CAGACGGTGCTCAG----C-----C-----TC----T--G---AC--AAGCGAAT----C---G--T-----AA-AAGTAG--TGTTACATATGTAAATAT-TTATAACCAAAATCAACT-GTTAATCACC-AAGAA-AACAAT---GA----T---TTAGATGTCGC------CGAATTTCTCGAGTATT---AAAT-------------T--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATGTA------------AATAACGCTGTAAACGC-CT-AAGAAAGAAGCGAG-GAAAGCGA----ATATGAA--A---TCGAT--AATTGCG----AGTAAAT-TA---CGTTGAAATA----Gaagggttatgcatttaaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---GTGC---GGATGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---TCTG----GTGGG-CA---CAA-TGCATAAT-AT-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCT---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACATT-T-TCTG-A----------T-A-G--TTA-A-ACT-ATG--TC-GC-TGTCCAAC-T-TT--T-A--GC--TT-TCCA--------GTATTTTT---------TTTAGTACAG-TAC----ATGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TTTAT--ATGGTAAAGTCCCTG-T-ATTGACA-A----A-CAAT----------TT----CCCGTCTTTTTCTCACA-C-CTTCC---TTTGAATAA-TTGAAA--AAACTC-AGGCTATACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ttatctgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgCGATATCAAAAG---TTTTTAA-TT-AAAC-TAGG-TAGTAAACTTG-TAC-GTG-ACGTTCAGA---TAC---GGTC-CTTG--C-----TT----C--G---AC---AG---AC----A---GGAT-----AAGA--TAAGATGT--------TAGATTA-TTGTAA--AG-CTCAACTCTTTATTAACT-CTGGACAACAAT---TA----TGTTTTCGATGTTGG------CAAATATCTCGAGTCTT--AAA--TTAAAACGTA-CAT--GTTTTAGCCA-CAATAAAGACAAGT-G-ATACA------------AATAG-----------CACA-AAGAAT-AAGC----AACA--GG----ATAT-AA--ATAGTGGGC--AATTGCG-----GTAAA--TG---TATAGACAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTTAA-T--AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACTT-CAAA---AGC---AA---C-----CA----TT----C--GTTGAC--CAG---TT----GCTTG--TGA---AA-A--TAT--TGT--------TAGATAT-TTAAAA--TAATTCAATT-TTTATTTACC-CTAGACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGAAAAATTTAAATTTATCAAGTCT---AAAATTCAAATCGTA-TATTCACTTTAGCCAGC--------C-AGTTGCA-ACG------------AATG------------A-CC-AAGAATGAAGCGAG-----TT-A----GGA--AA--G---TCGGCCAAATTGCG----AGTAAAC-TA---TACTGACaattg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAGATTTAAATTA-G-AA-ATCAAAGTGCTTTATTTAAAAAAA-A---ATA--A-TA-A-CATGTTTT-TAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagaaattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaTATT-T-AC--AA-G--GTCGGAACG--CG-A---T-AA----TTGG----TTTG-------TT-TGT-CCAT--T--------------------AGTA-----C-C-GAA-------------TTT-A----TT---TC-------------ACA-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-G-------ATAT--------GCA--CGTAA----AA-------------------------A----GCT---C------ATCTCAAAAT-TCT---TATTTCGA----CAACAATTCGAA-CT----TAAAAA--CTAACGC-G--AAA-TATTT----CA-TT-----TATAAAAC--ATATTTA-A-AATC----A-TT-----AT---ATGGCATG---CAAAG--AAT-TG-ATT---TTGC-TAAAAT---A-TAtttattg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATA-TG--G-T-TGA-T-AGT-----TGTTT-AC---TC---GCA------AA--GAACT-CAN-N------NNNNNN-NN-NN---------NN-N----NN-NNNNN----NNNNNN--NNNNN----NNNN-NN--------NNN--N-NNNNNNN---NNN---N------NNNNNNNNNN-NN---------CAT----TGCT--TCCAAA-CT----TGAAAA--ATAA-GC-A--AAA-TGATT----TA-AT-----CA--ATAT--ACATTTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCACA---CAAAG--AAG-TA-ATT---TTGC----------A-TAGAATTTCTTTTTTTA--AG---TTTAAAAACATGAGATGTtatacataa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---CA--T--TTAATC--TTT-TC----TTATTATTATTAT--GTTGTAAGTGCGCAACATGG------------TAT-GA--AATGGGAGCA-CGAACCTCAGT--ACATGTGGT----------AC---A-AGTTAAGTT-G-----A----TGCCAGGAGTTTGT-ATTTTGT-GAACAGAA-TG------------------CA---CAA-T----A----T-G-------CTAT-AT------GCC-TTGAT---GTGTTT-AGCTTC---TA-AAT---A-AACACA-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-Ag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          tagttttatttgcCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TC-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----T--G---AT--------AT----A---G--T-----AA-A--TAG--TGTTA------TAGATGT-CTGTAA--AACCTCAAC--CTTATTCTCT-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CATATGTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTACCAT--GTTTTAGCCA-T--------C-TGT-GCATGCG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCAAA-AACATCGG----GTAT-AATTA---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGATATG----GGCCGC-T-CGGTAAACAGTAATTGGactagg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATTTAAAAAAA-ACCAACA--AACAAT-CATTTTTTTTATAT--GTATAT-ATAG--TGT-GAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-ATTGTCAGC--AATAC-ACAT-CTCA-T-----GTCATGGT----TGAAAGCGCGTACACGAAAGAA---AATTATAAATGTTTACT-GA-A-GAAT--T-ACA--TATTTTCTTATT--TG----------T--AA-----TTT-CAA---T---C---T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTTTT-T--TTTTTAGATGTGCCATTTGG------------TAG-GA--AATGGAAACA-CGAACCTGGGT--ATTTGTTGTTGTG----CTATTATGTAGGTCAGTTTG-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTTGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---TAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------ACC-TAATCA--GTGTCT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTCAG----------C-A-A--TT--A-ATC-GGG--AT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTC---------TTTG--ACAG-TAC----AAAGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCTTTG-A-GTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGTA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCAC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTCTGC-CTGTTTC-TGT-CCAT--TACATCGA-TTTT-TTTTATTAATA-TG--C-C-TGA-G-AGT-----TGTTT-AC---AT---TC-------AA--GGGCG-TGT-A------TGACGT-CA-CA---------CAGA----CACACACC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---T------ATTTCAAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-TT-----CA--AAAT--ACATCTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTCCATGACAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaattcaaagtataaatcaaggtgctttatttaaaaaaaaccaacaaacaatcattttttttatatgtatatatagtgtgatatactgattgcaaggtaatgccggagagcattgtcagcaatacacatctcatgtcatggttgaaagcgcgtacacgaaagaaaattataaatgtttactgaagaattacatattttcttatttgtaatttcaatctttaattattgtattattatttttttttttagatgtgccatttggtaggaaatggaaacacgaacctgggtatttgttgttgtgctattatgtaggtcagtttgagtgcgggcgtgtattttgtgaaatggcctggacataataagcgctgtagacctaatcagtgtctagcttctatataaacaccttctcagcaattaatcgggatgctgtccaactgtttatgttttcctttatttctttgacagtacaaagacaaaagcgactgttttatttatggtaaagtctttgagtcgacacaaaatttcctcgtaccttccttcgaaaaagttgaaaaaactcaggctaccacccttattctgacagctagtacacccgcaaccgacacacaacacccaaacgtaatgttatctgcaagctgttaacgtgataattgccttttctgcctgtttctgtccattacatcgattttttttattaatatgcctgagagttgtttacattcaagggcgtgtatgacgtcacacagacacacaccatggcgcgcagaataccgagaaaaatatgcatatttcaagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttattcaaaatacatctgtagtcattttaggcatacaaagaagtgattttccatgacaaataaaaaagtttgaaaacatggaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cgatttcaaaaagtctttttaatcagctaggtagtcacgtggtaccgtgacgtcagatgcgcctttgatatagtaaatagtgttatagatgtctgtaaaacctcaaccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacatatgtctcgagtcttaaaattcaaaccgtaccatgttttagccatctgtgcatgcgaatacccaagaatgaagcaaaaacatcgggtataattatcggcaattgcgagtaaattgttttgatatgggccgctcggtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT-AGGC--TGCCTC---CC-GT-CTT--CTG-ACAG----CTAAGCCTAG-TAA---C------CC-CGAACCCGGT---ACAA-AA----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-T-AC--AA-GTCGTT--AACA--CG-A---T-GA----TAGCCATTT--------TTTT-TAT-CCCT--TCAATCTAGATA------ATTAAT------C-C---A-T-AAT-----TA-TT-AC---CC---TCTCGCTCGAA--GGTCG-CAT-A------TGACGT-CA-CA---------C--A----TA----------ATGGCG--CGTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GA-TACAATG-ACGT-CACC---TGC---GA---C-----C-----TT----CTTGT--AT--CAGGTAAT----A---G--TGAAA-AA-A--TAG--TGT--------TAAATAT-CTATTA--AAACTCAGCT-TTTATTAACTACTTATTACTATTAACTAAGTTT---TTCGATGTTGA------CA--TTTACCGAGACTT--AACATTCAAACTGTA-CAT--GTTTTAGCCA-T--------C-AGT-ACACA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --AA--AAGCAACAGT-TTTA-TT--T--ATGAAAAAGTTCTTG-T-ATCAACA-A----A-T--T----------TT----C----------CTTGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AA-CTC-GGGC--TACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ATCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAA-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AATG--TG-A---T-aatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -----AA-G--TAGA-TGT--------TACAT-T-TT---A--AAACTCTACT-TTTAATCGTC-ATGGCCAACATG---TA----T---TTCGATTTTGA------AAAAATTCCTGAGTCTG--AGCATT-AAAACATA-TAT--G-TATAGTCA-C--------C-ATT-GC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcgtcgatgggctgattgtaaaattaaCAAATTCAAAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTA-TTGAAAAAT-A---GTA--A-TA-G-CATTTTTGAAAT-------TCT-CTAG--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-TAAGG-A-A--GC------------GAGAGC-A----CGGC--A-----ATAT-TTCA-TTGAT-GTCTTGAT----
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTTGA------------TAT-GA--AACGGGGGTA-CAAACC--AGTGGACATGTT-TCA-G------A------AGGTCACTT-G---------GTGT---GATTGTTT-AATTCGT-AAT----A-TG------------------CA---TGA-T---------CTG-------CTGT-AA------GCC-TAGTT---AGGTTT-AGCTT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a-AA-ATCAAGGTGGTTTATTTGAAAAGGCA---ATA--AG------AT-TTTTAGAAAT--GTATTT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AC-GCC----------GAAGAGT-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCATGTGGTTACCATG-ATGT-CAGA---TAA---G----CCCTTTC-----TT----C--G---AC--CAGA--ATATAAA---G--T-----AA-A--TAG--TGT--------TAGATG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c---TT---TCC------AA--GGTTG-CAT-ACAATTATAATGT-AA-CA---------CA----------TAC------TGGCG--CGTAA----TATA-CC--------GAG--ATAAAATGT---GAA---T------TTCACAAGAT-TTG---GATTTCAT----CGC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A------G-TAC---A------CC-ATTAAACAGC---ACAA-AA----C-ACCG------TAAT-----------GCAA-TG-TTATT-T-AC--AA-AACATT--AACG--TC-A---T-AA----TTGGCTTTTTTG--------T-TG----AT--TAAATATA-ATC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAATA-TCAA-ATAAGGGTGATTTATTT--AAAAG-A---ATG--TG-A-T--ATA---TCTATATTGGTATAT-AT------T-GA-----ACCGA-TTGACAAGGGA-TT---------------GAGAGC-G-----GGCCAAATACAATATGTTTACTTGAT-GC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaattaaaaaGAT----TGAGAGCGGGCC------A-AATACAAT-----ATGTTTACTTGATGCGAAT--T-ACG-GT--TTCTTTGTT--TGCAAAGTAGAAT--AA-----ATT-CAAATTT---CA--T--TTAATT-ATTT-TAAGCCTAATTATTTAT-TAGTTTGTAAATGTGCGATTTGG------------TAAAGA--AAAGGGAATAACGCACCT--GT--ATA---------------------G-AAGT--GTA-T-----A---GTA----AGGTGTGT-ATTTCGT-GAA----AGTGG----CTA----G---A-CACACAAA-T----GT--GC-GATTAGTTCTGT---------GCT-AAGTC---GTGTTA-AGCTTCT--TA-TATAAAA-AACACC-T-CCTC------------C-A-G--TTTAA-ACT-GGG--T-----TGT-CAAC-TGTT--T-A-TGC--TT-TTCT-------------------------------ACAA-TAA----GAGGAC--AA--CAG-GACTGTATTTA-TT--T--A-GGT-AAGT-CTTG-T-G--GAAA-A----T-AATT----------TT----C----------ATCGGA-C---TTC---TTCG-CAAAGTGGAAAATAAGCTC-AGGC---A-CAC---TA-TTAATTGGCTGAACAG----ATA------G-T-C---A------CCATGTAATGAAC---ACAA-AA----C--CC--------AAC-----------GTAA-T---------------------------TG--TGTA---T-AA----TTGCCTTTTTTG--------------TCAT--TAA---GA-ATAT-TGTTATAATTA-TG--T-C-TAATC-AGTTAAAATGTGT-AT---TT---TCT-------C--GAGCG-AG--A------GGACA---A-AA---------TG-AGAGTCA-ACATC----ATGG-G--CGCCA----AATA-CT--------GAGA-A-AAAATAT---GCT---T------ATTGCAAGAT-TTT---GATT--AT----TGC---TTCAAA-AC----TGAAAA--GTAA-GC----AAA-T-ATT----TA-TT-----CA--AAA---ACATTTG-T-AGTC----A-TTTAATATT---A-GGT-TAAATCAAAT--AAGATA-ATT---TTGCGTA--AA---A-TAAAA-----------ATCAGTGTTTTAAAAAgaattacggtttctttgtttgcaaagtagaataaattcaaatttcatttaattattttaagcctaattatttattagtttgtaaatgtgcgatttggtaaagaaaagggaataacgcacctgtatagaagtgtatagtaaggtgtgtatttcgtgaaagtggctagacacacaaatgtgcgattagttctgtgctaagtcgtgttaagcttcttatataaaaaacacctcctccagtttaaactgggttgtcaactgtttatgcttttctacaataagaggacaacaggactgtatttatttaggtaagtcttgtggaaaataattttcatcggacttcttcgcaaagtggaaaataagctcaggcacactattaattggctgaacagatagtcaccatgtaatgaacacaaaacccaacgtaattgtgtataattgccttttttgtcattaagaatattgttataattatgtctaatcagttaaaatgtgtattttctcgagcgagaggacaaaatgagagtcaacatcatgggcgccaaatactgagaaaaaatatgcttattgcaagattttgattattgcttcaaaactgaaaagtaagcaaatatttattcaaaaacatttgtagtcatttaatattaggttaaatcaaataagataattttgcgtaaaataaaaatcagtgttttaaaaaaaaaatgcgatgtg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaattaaaaaaaaatatcaaataagggtgatttatttaaaagaatgtgatatatctatattggtatatattgaaccgattgacaaggCAAA-CT----CTAAAG--GTAC-AT-A--AAA-TAA-----------------A--AA--------TTA-T-AGTC----A-TT-----AT---A-GACATG---CAATG--AAT-TG-ATT---TTGTTTAATGA---T-TAAAA-------------------TTTAGAAACATGaaaaatgcgatgtg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --ATGGTAAAGTCTTTG-T-GTCGACA-A----A-ACAT----------T-----C----------CTCGCA-T-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAG--AAA----AAAA--AA-----------T-ATT--ATG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTcg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              C-G-------CTGC-AA------GCC-TAGCC---GTCTTT-AGCTTC---TA-CAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-G-G--TTA-A-ATT-GGG--TT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCC
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gacaATTCAAATCA-T-AA-ATAAAGGTGTTTTATTT--AAAAA-A---ATC--AACAAT-CAATTTTTTTATAT--GTATAT-ATATAATGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGAT-TAG---AATTTCAT----CACT--TTCAAA-TT----TAAAAA--TT---GC-ACCAAA-T-GTT----TG---------A--AAAC--ACATTTA-A-ACTT----A-CT-----TT---A-GGCATG---CAAGG--
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAGTT-GGCGCTA---GTGT---GATTGTAT-ATTCCAT-GAA----A-TTG---TCTGAGGGG---A-CA---GAA-T----AC--AT-G-------C-AT-AT------GCTGTAGCT---GTGTTT-AG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------------AATG------------C-CAGAAAAATGTAGCGAG-GAAAACGA----TTATTAA--A---TCGGT--AAATGCG----AGGAAAT-T
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatacctatgtaAATGAAACGAA-AACATCGA----GTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGTCGC-TGT-GTAAACATTAATtttgaaaaggt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTTGC-C--TTTTATGT-CCAT--TAAATTGA-AT-T-TGCTAATAATT-TG--G-C-TAA-C-AGC-----TGTTT-TC---TC---GCA------AA--GGATG-TAT-C------TGAC
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aCGCA------TGAAT-CAATTAAAAAT--TTACT-GA-G-GAAT--TTACA-ATATCTTATTATT--TG----------T--AA-----ATTGCAA--------G--T--TTAATT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taaaaGGCGTGTGATTTCGT-GAA----A-TGGA--CCTG----G---A-CA---TAAAT----AAAGGC-G-------CTGTCAGATCGATGCC-TAATCTGTGTGTCTGAGCTTTCTGTA-CAT---A-AACACCATATCTC-GAGATCCTGGGC-G-GAATT--T-ATC-GGGAATT-GCCTGTCACAC-TGTTGGT-AATGTAGTTATTCT--------TGT-TTTTA--------TTTA--ACAGATACAGAAGAGAAC--AAGAAAGCGACTGT----------------GTAGA---TTTG-TAGTCGACA-ATAACA-AACC----------TTATACCA---------CTCGTAACACTTCCGATTTCGAAAAAGTTGGAA--AAATTCCAGGC--TACCGA---CCATT-ATTA-CTG-ACAG----CTA------G-TAC---AGACACCCC-CGTA--TGAC---ACAC-AAGTCTC-ACCCCGAAGGGGACACACCGATACTGTCA-TG-TTATCGT-GC--AAAGCTGTT--AAGA--TG-AAATT-AA----TTGCCATTTTC-----------TGTACCAT--TAAA-CGA-AT----TATATTTATA-TG--CAC-TGA-G-AGT-----TTTTT-ACA--TTCAATCT------AA--GGGCGGTGTCA------TGACGG-CGTCA---------CA-A----TA-CCAA-----ATGGCGAACGCAAGCACACTATCC--------GAG--A-AAGAGATA--GCA---CTAATAGATTGCAAGATCTTG---ACTTCCAT----TGCT--TTCAAAACT----TGAAAAACCAAA-GC-A--AAA-TAACTATCATA-ATA----CA--AAAT--ACATTTG-GTAGTCT---A-TC-----TTTAGA-GGCATA---CAAAAGAAAG-TGGATT---TTGCATGACAA---A-GAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGGATATc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggcTTTA-A-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAGA-AAA-TA-TTT---TTTCTTTAAAA---A-TCAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGCGGTATgtcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAgt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cagttgcctaaccattcttccttggccatggc-C-TAA-G-AGT-----TGTTT-TC---TC---GCG------AA--GGACT-CGT-A------TGATGT-CA-C---------------------ACATC----ATGGCG--CGCAA----AATA-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gGAAAA--TCGC-GC-A--AAA-TATTT----CA-TT-----TA--AAAC--ACATCTA-A-AGTC----A--T-----GT---A-GGCAT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttaCGAATTCAAAA-GTCTTT--AA-TTTAG-C-TAGG-TAGTCACGTG
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACtgttagc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cAATTAAAAGT-TTTACC-GG-A-GGAT--T-ACA-ATATTTCATTATTATTA----------A--AA-----ATT-CAA---G---CAAGT--TCAATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACT--G------------TGC------ATGGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTTA-A-------------AGGTCAGTT-A-----A---GT-C---AAGCGTGC-ATTTCGTTGAA----A-TGG---CTTG----G---AACA---GAG-T----TA--G--G-------CTTT-GG------GCT---GT-----TTTTT-AGCAGCA--TAATAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------CGA-G--TT--ATACT-GGG--TCCGC-TGTTCTACGTGTT--TTG-TGT--TT-T----------------------------------ACAT-TAC----GTGAGCCGAA--AAGTG-CTAT-TTTAATT--TCCATGGTAAAGACCTTGTT-GTCGACA-A----A-CAATG---------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAGCGCT------AATCTC-G---------AT---CC-TT-ATT--CTG-ACAGTAACTTA------G-TACACGA------CC-CGTAACCGAT---GCCA-AAT---C-ACCC------G-ACTA---------GTAATTGCTTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---TAAA----TTGCCTTTTTAGCGC--TAT--------AT----AATCTA-ATCTGTTCTATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TG-TT-AC---TT---GCT------AA--GATTG-GAC-A------TGACGTCCA-CA---------CA-----------ATT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG--T-AAAATAT----CAGT-C------ATCCCAATTT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TCAAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAGTTCATA----TA-GT-----AG--AAAA--ACATTTA-C-TGCC----ACTT-----TT---ACGGCATA---CACAA--AAG-TC-ATT---TTGC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTAAAA--GTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TA----------TTAAA-----AAT-CAA---TG--CAAGT--TCAATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACCTGG------------CAT-G------GGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTTA---------C---A-AGGTCAGTT-------A---GTCA---AAGCGTGC-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CTGG----A---A-CA---GA------------------------GT-AG------GCT-TGGCT---GTTTTTTAGCAGC---TA-TAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--ATACT-GGG--TC-GC-TGTC--ACGTGTT--T-T-TGT--TT-T----------------------------------ACAT-TAC----GTGAGC--AA--AAGTGACTAT-TTTA-TC--C--ATGGTAAAGACCTTG-T-GTCGACA-A----A-ACTG----------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAG---------------C---GC--TATCTCGATCC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTAACTA--G-TAC---A------CC-CGTAACCGAT---GCAA-AT----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTA-GC-C--T----------AT--CAAATCTA-ATCT-GTTCATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TGTTT-AC---TT---GCT------AA--GATTG-GAC-A------TGACGT-CA-CA---------CA------------TT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG--T-AAAATAT---GCA---T------ATCCCAATAT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TTCAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAA-TGTTA----TA-AT-----AAG-AAAA--ACATTTA-C-TGCC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAA---AAG-TC-ATT---TTGCTTGATGA---tga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-CCTC-G----------C-ATG--TA--A-ACT-GGG--TT-GC-TGTCCATC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTTATTATTTTTTTTA--ACAG-TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTTG-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGccctttatacacaattggaaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TT--CTT-ATCG----CTA------G-TAC---AGA----CT-CGTACCGGACTTTACAATAA----CGACTC------AAACAACC-------GTAC-TG-TTATT-TTGTCTAA-CCTGTTC-AACGCGTG-AC--T-AAAGACTAGCCTTTTTTGT-C--TTTA-GG----ATGCTGAATCTA--TTT-TGATACTTATAGTG--C-TGTAG-TTAGT-----TGTTT-ACAGTCT---TCT------AACCAGG-G-CGT-A-------G--GT-CC-CATTGTACTGTCA-A----CG-ACACTCGGGATGGTG--CGACA----ATTA-CCCCGGTCATGAGCAA-AAAGGATCCTGCATTCC------GTGGCCAGACATTGCGAAGTCTCACAAGGTGCT--TCCAAA-CTCCGGTAAAAA--CCAA-GCCA--AAA-TAATT----TA-TTGTTGGCA--AAATACACATTTGTC-AGTCATCAA-TC-----TT---A-GGC-TA---T--AG--AAG-GT-ATCCGATTGCATAAGGAAGGA-TAAAA-----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacttcttatcgctagtacagactcgtaccggactttacaataacgactcaaacaaccgtactgttattttgtctaacctgttcaacgcgtgactaaagactagccttttttgtctttaggatgctgaatctattttgatacttatagtgctgtagttagttgtttacagtcttctaaccagggcgtaggtcccattgtactgtcaacgacactcgggatggtgcgacaattaccccggtcatgagcaaaaaggatcctgcattccgtggccagacattgcgaagtctcacaaggtgcttccaaactccggtaaaaaccaagccaaaataatttattgttggcaaaatacacatttgtcagtcatcaatcttaggctatagaaggtatccgattgcataaggaaggataaaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtttagcttctatataaacacctcctcgcatgtaaactgggttgctgtccatctgtttatgttttcctttattttattattttttttaacagtacaaggacaaaggcgactgttttgtttatggtaaagtccttgtgtcgacacaaaatttcctcgcaccttccttcgaaaaagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacTGAAGCGAAGAACATCGATTTAGTAT-A-------TCGGC--ATTTGCG----AGTAAATGGG---TTTTGACATGAAAAGCCCGC-T-T-GTACACAGTAATTGg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tAGTACT-AAGATCAAG-TGGTT-ATATGAAAAG------------GCA-TTCGTATTTTTAAAAT--GTCTTTTATAT--CGT-GAT-AT-ACTGAATTAACAAGGTA-ATTGCC----------GAAGAGTTA----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGTGTTATG-AAGCGCGT--------GAAT-CAATTAAATATGTTTACT-GA-G-AATT--T-ACATAAATTTC-TTATG--TA----------T--AA-----ATA-CAG---TGCACA--TCATTAATT-AATA-TA-----TATTATTATT-A--TTTGTAAATGTGCG-TTTGG------------TGA-G---AAT--AAATA-CGAACCTGGGT--AT-TGTTGTTA-GGCTATTAT---GTAGTTCAGTTAG-----ATTTGTGC---GGGCTTGC-ATTTCGataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcagtactaagatcaagtggttatatgaaaaggcattcgtatttttaaaatgtcttttatatcgtgatatactgaattaacaaggtaattgccgaagagttacggcaacgcacatttcattgatgccatggtgttatgaagcgcgtgaatcaattaaatatgtttactgagaatttacataaatttcttatgtataaatacagtgcacatcattaattaatatatattattattatttgtaaatgtgcgtttggtgagaataaatacgaacctgggtattgttgttaggctattatgtagttcagttagatttgtgcgggcttgcatttcgaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          : ttgaagcgaagaacatcgatttagtatatcggcatttgcgagtaaatgggttttgacatgaaaagcccgcttgtacacagtaattgataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcGATTTCAAA--GTCGTTTTAA-TT-AG-C-TAG-----TTATGTGA-TACTGTG-ACGT-CAGA---TGT---AT---C-----C-----TTTCAAC--G---AC--CAGCTGAT----A---A--TGA---AA-A--TAG--TGT--------TAGATAT-CTGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-TTGAACAACA------A----T---T-------------------ATTTC--GA--CT------AT---AGCTATA-C----GTTTTAGCCA-C--------C-AAT-GCATCCA------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAACAAA-AACAGCGA----GTATAAA--A---TCAGC--AATTGCAAGCTAGTAAAT-CA---TATTGACAGA----GGTAAC-TGT-TTAAAAATGAATTGGaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAAATTCATAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTTTTTGAAAAAT-A---GTAATAGCA-T-aaaagttatttaaacatgtattattatgtaattatacgtatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaaattcatagtaaaaatcaaagtgttttttttgaaaaatagtaatagcatttt





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777                22222222                                                                            1111111111             111                                 11111111             222222222222    33333333333333                      111111111   1  111111                                         1111        222                                                                                                                                                                                                                                                    333333333333333333   11                                            1       33333333333333333       111111                                    1111          333333333                                        11                2222222222222  11111       33333333333         333333333333           1111                    33333333333333333333                                  555555555555555555         22222222222                           1111    111111111111111111          3333333333333333333      1111111       11111             111                          1111111111         1111                                           8888888888888888888888888888888888   11                                                                               222222222222222222222222222                                                                                   111111         111111                       1111      333333333333333333333                                                             44444444444444444                 222222                    111                111       1111111                                  77777777777777777777777777777777                        11111111   1111       111   2222222222                                                                                  111111111111             111                                                                          22222222222222  111                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  0      11  4  4  4 4    4           4   1   4    4    777   44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444   4 8888  55   00000000       99999     66         55          4          2 777  9999 777          8888888888             000     77   1    8   66          4 66666666 4   4   0   555555555555    55555555555555 66              44   000000000   2  666666     55       8888       4  777 1        2222      6 111       1                                                                                                                                                                                                               999  4         1       7     111111111111111111   00   88    77    1 77  999   5   5  5     5   1     3 88888888888888888       444444    99  44 6    6    6     8        7777 55       555555555   88    5 0  0 4     77  666    77 5   22      5     77  7777777777777  44444   5   66666666666 66      555555555555  5     1  4444                    33333333333333333333     0    5 4    88   66  3   22  888888888888888888  2      44444444444    666 0      3       3   4444 3  666666666666666666  7777  3 4444444444444444444    3 0000000   3   11111      6      333  3   666 3      3 3    3 5555555555 3 3 55  8888  55   99999  4        8    55 444   55  4 3333333333333333333333333333333333   00   9999 1    55  55          4    4  88888         00    3 7       888888 3  0 444444444444444444444444444      3 3 3   666          1     55  66  3    55555 2 666  3  3   77   3    7777   555555 2   555 222222  2    1     555   44  0000 3    000000000000000000000    3  3     5555 44  4444   77    44  3 999 3  7777     0   66666666666666666    44      3 3  777777   777777  8888 3   000   88888     3  111  5555 5555555  555  5  33  3 888888      3  3  22222222222222222222222222222222      44  1  7777    3  44444444   8888       111   3333333333   2      7   666    3   99999   55      3  7777      44    3  3 44   3 3   7777  999999999999   777       000    9999 3  77777  555 6      555     44   7 66   666    8 0 3  777 4     99999999999999  000                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .      ..  .  .  . .    .           .   .   .    .    ...   ..............................................................   . ....  ..   ........       .....     ..         ..          .          . ...  .... ...          ..........             ...     ..   .    .   ..          . ........ .   .   .   ............    .............. ..              ..   .........   .  ......     ..       ....       .  ... .        ....      . ...       .                                                                                                                                                                                                               ...  .         .       .     ..................   ..   ..    ..    . ..  ...   .   .  .     .   .     . .................       ......    ..  .. .    .    .     .        .... ..       .........   ..    . .  . .     ..  ...    .. .   ..      .     ..  .............  .....   .   ........... ..      ............  .     .  ....                    ....................     .    . .    ..   ..  .   ..  ..................  .      ...........    ... .      .       .   .... .  ..................  ....  . ...................    . .......   .   .....      .      ...  .   ... .      . .    . .......... . . ..  ....  ..   .....  .        .    .. ...   ..  . ..................................   ..   .... .    ..  ..          .    .  .....         ..    . .       ...... .  . ...........................      . . .   ...          .     ..  ..  .    ..... . ...  .  .   ..   .    ....   ...... .   ... ......  .    .     ...   ..  .... .    .....................    .  .     .... ..  ....   ..    ..  . ... .  ....     .   .................    ..      . .  ......   ......  .... .   ...   .....     .  ...  .... .......  ...  .  ..  . ......      .  .  ................................      ..  .  ....    .  ........   ....       ...   ..........   .      .   ...    .   .....   ..      .  ....      ..    .  . ..   . .   ....  ............   ...       ...    .... .  .....  ... .      ...     ..   . ..   ...    . . .  ... .     ..............  ...                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  8      55  0  0  0 0    0           0   9   4    4    888   99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   0 5555  55   00000000       33333     11         22          4          2 888  4444 888          2222222222             777     77   9    9   11          4 11111111 4   4   9   666666666666    00000000000000 44              44   555555555   0  999999     55       5555       0  888 3        1111      7 777       0                                                                                                                                                                                                               999  4         0       4     666666666666666666   99   11    99    0 11  111   7   7  7     7   4     2 55555555555555555       333333    22  33 7    7    7     0        0000 88       888888888   88    0 3  1 3     11  000    99 7   99      1     99  6666666666666  33333   7   33333333333 99      444444444444  0     0  0000                    66666666666666666666     2    0 5    55   99  6   66  999999999999999999  5      22222222222    444 1      3       6   1111 6  444444444444444444  4444  6 9999999999999999999    3 6666666   3   44444      2      666  6   444 6      6 6    6 9999999999 6 6 00  9999  22   22222  0        0    55 666   55  0 8888888888888888888888888888888888   11   4444 0    55  55          0    0  00000         66    6 3       999999 6  1 777777777777777777777777777      6 6 7   444          2     55  55  6    22222 3 444  6  6   99   3    1111   444444 9   000 111111  9    6     888   77  4444 3    111111111111111111111    6  6     6666 66  1111   99    66  3 222 3  7777     1   88888888888888888    66      6 6  444444   222222  9999 3   999   33333     3  555  6666 5555555  444  1  88  1 888888      3  3  55555555555555555555555555555555      66  2  7777    6  55555555   0000       000   1111111111   7      3   444    4   44444   55      6  7777      66    3  3 66   3 7   1111  999999999999   888       222    6666 1  77777  444 2      888     66   3 33   444    8 5 8  000 4     66666666666666  000                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T----AAAA-T----AG--TGT--------TAGATGT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGC-T-T-GTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATA--AGCA-T-CATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AA-----ATT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTT-----A-G-----TACGTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAAATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA---GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A-------CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
Reference ( family-549 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T----AAAA-T----AG--TGT--------TAGATGT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGC-T-T-GTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATA--AGCA-T-CATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AA-----ATT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTT-----A-G-----TACGTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAAATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA---GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A-------CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAATTTCAAAAAGTATTTTTAAGTT-AG-CCTAGGATAGTCACGTGG-TACCGTGGACGT-CAGA---TAC---G----C-----CCGATCTT----C--G---ACAACAG---AT----AAA-G--T----AAA--T----AG--TGT--------CAGATGTTC---TGTAA--AAACTCAGCC-TT-ATTCTCT-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTTTCGAATCTT--AAAATTCAAATCGTATCAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA--------------------------GCGAA-AACATCGT----CTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGACATG----GGCCGCTT-T-GTAAACAGTAATTGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cAAATCCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATT---AAAAA-A---GCA--ATCA---CAT------TATAT--ATATTT--TAT--TGTTGATTATTACCGA-TTG-CAAGGTATAG-GCCTAAAGCCGGCGGAGAGC-A----CGGC--AATAC-ACAT-C-CA-TTGATTGCCATGGT----T-AAACCGC---------AGAAT-CAAT--GAAATGTTTACT-GA-G-GAATATT-ACA--TATTTTATTATT--TG----------T--AATACAAGTT-CAC---T---TT--T--TTAATTTATT---A----TTATTATCATTAT--TTTGTAAATGTGCGATTTGGAAATTATTGGAATACCGATCAATAGGAACA-CGAACCTCATT--ATTTGTTGTT-----ATGCTAT-TATGTAGGTCAGTT-G-----G---ACGT---GGGCGAGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---CAA-T----AA--AC-G-------CTGT-AG------GTA-TAGTC---GTGTTT-AGCTTC----A-TAT---ATAACACC---TCTC-G----------C-A-A--TTA-A-ACT-GGG--TT-GC-TGTCCATC-TGTT--T-A-T-T--TT-TCCTTTATTTTATTA-TTTT---------TTTA--ACA--TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-TGGTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-C-TCC---TTCGAAAAAG-TGAAA--AAA-TC-AGAT--TGCCGC---CC-TT-ATT--CTT-ACGG----CTA------GTTAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAC-----------GTAA-TG-CTATT-T-GC--AA-TCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCT-----------TTTT-TGT-CTAT--TAAATCGA-ATCTACTCTATG-ATA-TGCTC-T-TGA-G-AGT-----TGTTTAACA--TT---TCC------AA---AGGCG-TAT-C------TGACGT-CA-CA---------C--A-------C-----CC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG----AAAATAT---GCA---T------ATTGCCAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TATAT-----TA--AAAT--ACATCTG---------------------T---A-GGCATA---CAGAG--AAG-TA-ATT---TTGCCTAAAAA---ATTAATA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaaaatccaaagtataaatcaaggtgctttattaaaaaagcaatcacattatatatattttattgttgattattaccgattgcaaggtataggcctaaagccggcggagagcacggcaatacacatccattgattgccatggttaaaccgcagaatcaatgaaatgtttactgaggaatattacatattttattatttgtaatacaagttcacttttttaatttattattattatcattattttgtaaatgtgcgatttggaaattattggaataccgatcaataggaacacgaacctcattatttgttgttatgctattatgtaggtcagttggacgtgggcgagtatttcgtgaaatggcctggacacaataaacgctgtaggtatagtcgtgtttagcttcatatataacacctctcgcaattaaactgggttgctgtccatctgtttatttttcctttattttattatttttttaacatacaaggacaaaggcgactgttttatttatggtaaagtccttgtggtcgacacaaaatttcctcgcacctccttcgaaaaagtgaaaaaatcagattgccgcccttattcttacggctagttacacccgtagccgatacataacactcgaacgtaatgctatttgcaatctgttaacgtgataattgccttttttgtctattaaatcgaatctactctatgatatgctcttgagagttgtttaacatttccaaaggcgtatctgacgtcacacacccatggcgcgcagaataccgagaaaatatgcatattgccagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttatattaaaatacatctgtaggcatacagagaagtaattttgcctaaaaaattaataaagtttagaaacatgggatatg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccaatttcaaaaagtatttttaagttagcctaggatagtcacgtggtaccgtggacgtcagatacgcccgatcttcgacaacagataaagtaaatagtgtcagatgttctgtaaaaactcagccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacaaatttttcgaatcttaaaattcaaatcgtatcatgttttagccaccagtgcatacgaatagcgaaaacatcgtctataatatcggtaattgcgagtaaattgttttgacatgggccgctttgtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaC---GAGTGTGT-ATTTCTT-AAATTG-A-TGAAGACCTG----G---T-CA---GAG-C----AT--AT-G-------TTGT-AT------GCC-TAGCT---GAGCTT-AG-TTC---CA-TAT---A-ATTATT-T-TCTT-G----------C-A-C--TT--T-GCCTGGG--CT-GT-TGTTCATC-TGTC--T-G-TGT--TT-TG-----------------------------TA--AC---TAC----ATGGAC--AA--AGACAACTGG-TTTT-CT--A--ATGGCA------TTG-T-GCCGACATA----ACAAATATCCGTCTTTTT----T----------CTCATA-C-CCTCC---CTTGCA------GAAA--ACAATC-AGCT--TATCTT---C------TT--CTG-ACAG----CTT------G-TAC---A------TC-CGTAACTGAT---ACAA-AA----C-ACCC------TAAG-----------TTAA-TG-TTATT-T-AC--AT-GCCATG--AACG--TA-A---T-AA----TTGC-------GT-C--TTTT-AAT-CCAT--TAAg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGACTTTAAAAAGTATTT--GA-TT-CG-C-TAGG-TAGTCACGTGA-TACCGTG-ACGT-CCGG---TGC---AACCTT-----C-----TT----C--A---AC--CAG---CT----G---A--TTATGAAAG-T----AG--TAT--------TGCGTGT-C---TATAA--AAACTCAACG-TTTCTTCATC-TTGAATAACATT---TA----T---TTCGATGTTGT------T---CTTTTTGAGTTTTCAAAAATACAAACCGTA-TAG--ATTTTAGCAA-C--------C-AGT-GCACACACATGGCGATTTAAATG------------C-CC-AATAAAGAATCGAA-GATA-------------AA--G---TCGCC--AATTGCG----AGTAAAT-TGATATATTTATACG----GGCCAT-T--------CATTAATTAGttagatactctaaaatcttgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      cCGATTTCAAAAAGTCTTTT-AA-TT-GG-C-TAAG-AAGACATGTGG-TACTGTG-TCGT-CAGACGGTGCTCAG----C-----C-----TC----T--G---AC--AAGCGAAT----C---G--T----AAAAGT----AG--TGTTACATATGTAAATAT-T---TATAACCAAAATCAACT-GTTAATCACC-AAGAA-AACAAT---GA----T---TTAGATGTCGC------CGAATTTCTCGAGTATT---AAAT-------------T--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATGTA------------AATAACGCTGTAAACGC-CT-AAGAAAGAAGCGAG-GAAAGCGA----ATATGAA--A---TCGAT--AATTGCG----AGTAAAT-TA---CGTTGAAATA----Gaagggttatgcatttaaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---GTGC---GGATGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---TCTG----GTGGG-CA---CAA-TGCATAAT-AT-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCT---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACATT-T-TCTG-A----------T-A-G--TTA-A-ACT-ATG--TC-GC-TGTCCAAC-T-TT--T-A--GC--TT-TCCA--------GTATTTTT---------TTTAGTACAG-TAC----ATGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TTTAT--ATGGTAAAGTCCCTG-T-ATTGACA-A----A-CAAT----------TT----CCCGTCTTTTTCTCACA-C-CTTCC---TTTGAATAA-TTGAAA--AAACTC-AGGCTATACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ttatctgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgCGATATCAAAAG---TTTTTAA-TT-AAAC-TAGG-TAGTAAACTTG-TAC-GTG-ACGTTCAGA---TAC---GGTC-CTTG--C-----TT----C--G---AC---AG---AC----A---GGAT----AAGA-T----AAGATGT--------TAGATTA-T---TGTAA--AG-CTCAACTCTTTATTAACT-CTGGACAACAAT---TA----TGTTTTCGATGTTGG------CAAATATCTCGAGTCTT--AAA--TTAAAACGTA-CAT--GTTTTAGCCA-CAATAAAGACAAGT-G-ATACA------------AATAG-----------CACA-AAGAAT-AAGC----AACA--GG----ATAT-AA--ATAGTGGGC--AATTGCG-----GTAAA--TG---TATAGACAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTTAA-T--AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACTT-CAAA---AGC---AA---C-----CA----TT----C--GTTGAC--CAG---TT----GCTTG--TG---AAAA-T----AT--TGT--------TAGATAT-T---TAAAA--TAATTCAATT-TTTATTTACC-CTAGACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGAAAAATTTAAATTTATCAAGTCT---AAAATTCAAATCGTA-TATTCACTTTAGCCAGC--------C-AGTTGCA-ACG------------AATG------------A-CC-AAGAATGAAGCGAG-----TT-A----GGA--AA--G---TCGGCCAAATTGCG----AGTAAAC-TA---TACTGACaattg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCAGATTTAAATTA-G-AA-ATCAAAGTGCTTTATTTAAAAAAA-A---ATA--A-TA-A-CATGTTTT-TAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cagaaattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaTATT-T-AC--AA-G--GTCGGAACG--CG-A---T-AA----TTGG----TTTG-------TT-TGT-CCAT--TAG-----------------------TA--C-C-GAA-------------TTT-A----TT---TC--------------ACA-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-G----------ATAT--------GCA--CGTAA----AA-------------------------A----GCT---C------ATCTCAAAAT-TCT---TATTTCGA----CAACAATTCGAA-CT----TAAAAA--CTAACGC-G--AAA-TATTT----CA-TT-----TATAAAAC--ATATTTA-A-AATC----A-TT-----AT---ATGGCATG---CAAAG--AAT-TG-ATT---TTGC-TAAAAT---A-TAtttattg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATA-TG--G-T-TGA-T-AGT-----TGTTT-AC---TC---GCA------AA---GAACT-CAN-N------NNNNNN-NN-NN---------NN-N-------NN-NNNNN----NNNNNN--NNNNN----NNNN-NN--------NNN--N-NNNNNNN---NNN---N------NNNNNNNNNN-NN---------CAT----TGCT--TCCAAA-CT----TGAAAA--ATAA-GC-A--AAA-TGATT----TA-AT-----CA--ATAT--ACATTTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCACA---CAAAG--AAG-TA-ATT---TTGC----------A-TAGAATTTCTTTTTTTA--AG---TTTAAAAACATGAGATGTtatacataa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---CA--T--TTAATC--TTT-TC----TTATTATTATTAT--GTTGTAAGTGCGCAACATGG------------TAT-GA--AATGGGAGCA-CGAACCTCAGT--ACATGT---------G-G-----TACA-AGTTAAGTT-G-----A----TGCCAGGAGTTTGT-ATTTTGT-GAACAGAA-TG------------------CA---CAA-T----A----T-G-------CTAT-AT------GCC-TTGAT---GTGTTT-AGCTTC---TA-AAT---A-AACACA-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-Ag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          tagttttatttgcCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TC-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----T--G---AT--------AT----A---G--T-----AAA-T----AG--TGTTA------TAGATGT-C---TGTAA--AACCTCAAC--CTTATTCTCT-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CATATGTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTACCAT--GTTTTAGCCA-T--------C-TGT-GCATGCG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCAAA-AACATCGG----GTAT-AATTA---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGATATG----GGCCGC-T-CGGTAAACAGTAATTGGactagg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATTTAAAAAAA-ACCAACA--AACAAT-CATTTTTTTTATAT--GTATAT-ATAG--TGT-GAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-ATTGTCAGC--AATAC-ACAT-CTCA-T-----GTCATGGT----TGAAAGCGCGTACACGAAAGAA---AATTATAAATGTTTACT-GA-A-GAAT--T-ACA--TATTTTCTTATT--TG----------T--AA-----TTT-CAA---T---C---T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTTTT-T--TTTTTAGATGTGCCATTTGG------------TAG-GA--AATGGAAACA-CGAACCTGGGT--ATTTGTTGTTGTGCTA-T-----TATGTAGGTCAGTTTG-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTTGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---TAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------ACC-TAATCA--GTGTCT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTCAG----------C-A-A--TT--A-ATC-GGG--AT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTC---------TTTG--ACAG-TAC----AAAGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCTTTG-A-GTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGTA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCAC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTCTGC-CTGTTTC-TGT-CCAT--TACATCGA-TTTT-TTTTATTAATA-TG--C-C-TGA-G-AGT-----TGTTT-AC---AT---TC-------AA---GGGCG-TGT-A------TGACGT-CA-CA---------CAGA-------CACACACC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---T------ATTTCAAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-TT-----CA--AAAT--ACATCTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTCCATGACAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaattcaaagtataaatcaaggtgctttatttaaaaaaaaccaacaaacaatcattttttttatatgtatatatagtgtgatatactgattgcaaggtaatgccggagagcattgtcagcaatacacatctcatgtcatggttgaaagcgcgtacacgaaagaaaattataaatgtttactgaagaattacatattttcttatttgtaatttcaatctttaattattgtattattatttttttttttagatgtgccatttggtaggaaatggaaacacgaacctgggtatttgttgttgtgctattatgtaggtcagtttgagtgcgggcgtgtattttgtgaaatggcctggacataataagcgctgtagacctaatcagtgtctagcttctatataaacaccttctcagcaattaatcgggatgctgtccaactgtttatgttttcctttatttctttgacagtacaaagacaaaagcgactgttttatttatggtaaagtctttgagtcgacacaaaatttcctcgtaccttccttcgaaaaagttgaaaaaactcaggctaccacccttattctgacagctagtacacccgcaaccgacacacaacacccaaacgtaatgttatctgcaagctgttaacgtgataattgccttttctgcctgtttctgtccattacatcgattttttttattaatatgcctgagagttgtttacattcaagggcgtgtatgacgtcacacagacacacaccatggcgcgcagaataccgagaaaaatatgcatatttcaagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttattcaaaatacatctgtagtcattttaggcatacaaagaagtgattttccatgacaaataaaaaagtttgaaaacatggaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgatttcaaaaagtctttttaatcagctaggtagtcacgtggtaccgtgacgtcagatgcgcctttgatatagtaaatagtgttatagatgtctgtaaaacctcaaccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacatatgtctcgagtcttaaaattcaaaccgtaccatgttttagccatctgtgcatgcgaatacccaagaatgaagcaaaaacatcgggtataattatcggcaattgcgagtaaattgttttgatatgggccgctcggtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT-AGGC--TGCCTC---CC-GT-CTT--CTG-ACAG----CTAAGCCTAG-TAA---C------CC-CGAACCCGGT---ACAA-AA----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-T-AC--AA-GTCGTT--AACA--CG-A---T-GA----TAGCCATTT--------TTTT-TAT-CCCT--TCAATCTAGATA------ATTAAT------C-C---A-T-AAT-----TA-TT-AC---CC---TCTCGCTCGAA---GGTCG-CAT-A------TGACGT-CA-CA---------C--A-------TA----------ATGGCG--CGTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GA-TACAATG-ACGT-CACC---TGC---GA---C-----C-----TT----CTTGT--AT--CAGGTAAT----A---G--TGAA-AAAA-T----AG--TGT--------TAAATAT-C---TATTA--AAACTCAGCT-TTTATTAACTACTTATTACTATTAACTAAGTTT---TTCGATGTTGA------CA--TTTACCGAGACTT--AACATTCAAACTGTA-CAT--GTTTTAGCCA-T--------C-AGT-ACACA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --AA--AAGCAACAGT-TTTA-TT--T--ATGAAAAAGTTCTTG-T-ATCAACA-A----A-T--T----------TT----C----------CTTGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AA-CTC-GGGC--TACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ATCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAA-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AATG--TG-A---T-aatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G---AT----T---G--T----AAAA-TTAAAAG--T-----------AGATGT-TACATTTTA--AAACTCTACT-TTTAATCGTC-ATGGCCAACATG---TA----T---TTCGATTTTGA------AAAAATTCCTGAGTCTG--AGCATT-AAAACATA-TAT--G-TATAGTCA-C--------C-ATT-GC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcgtcgatgggctCAAATTCAAAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTA-TTGAAAAAT-A---GTA--A-TA-G-CATTTTTGAAAT-------TCT-CTAG--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-TAAGG-A-A--GC------------GAGAGC-A----CGGC--A-----ATAT-TTCA-TTGAT-GTCTTGAT----
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACTTGA------------TAT-GA--AACGGGGGTA-CAAACC--AGTGGACATGTT-TC-----A-G------A---AGGTCACTT-G---------GTGT---GATTGTTT-AATTCGT-AAT----A-TG------------------CA---TGA-T---------CTG-------CTGT-AA------GCC-TAGTT---AGGTTT-AGCTT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-ATCAAGGTGGTTTATTTGAAAAGGCA---ATA--AG------AT-TTTTAGAAAT--GTATTT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AC-GCC----------GAAGAGT-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCATGTGGTTACCATG-ATGT-CAGA---TAA---G----CCCTTTC-----TT----C--G---AC--CAGA--ATATAAA---G--T-----AAA-T----AG--TGT--------TAGATG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              c---TT---TCC------AA---GGTTG-CAT-ACAATTATAATGT-AA-CA---------CA-------------TAC------TGGCG--CGTAA----TATA-CC--------GAG--ATAAAATGT---GAA---T------TTCACAAGAT-TTG---GATTTCAT----CGC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A------G-TAC---A------CC-ATTAAACAGC---ACAA-AA----C-ACCG------TAAT-----------GCAA-TG-TTATT-T-AC--AA-AACATT--AACG--TC-A---T-AA----TTGGCTTTTTTG--------T-TG----AT--TAAATATA-ATC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAATA-TCAA-ATAAGGGTGATTTATTT--AAAAG-A---ATG--TG-A-T--ATA---TCTATATTGGTATAT-AT------T-GA-----ACCGA-TTGACAAGGGA-TT---------------GAGAGC-G-----GGCCAAATACAATATGTTTACTTGAT-GC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaattaaaaaGAT----TGAGAGCGGGCC------A-AATACAAT-----ATGTTTACTTGATGCGAAT--T-ACG-GT--TTCTTTGTT--TGCAAAGTAGAAT--AA-----ATT-CAAATTT---CA--T--TTAATT-ATTT-TAAGCCTAATTATTTAT-TAGTTTGTAAATGTGCGATTTGG------------TAAAGA--AAAGGGAATAACGCACCT--GT--ATAGA----------A-G-----TGTATAG------T-A-----A---G--------GTGTGT-ATTTCGT-GAA----AGTGG----CTA----G---A-CACACAAA-T----GT--GC-GATTAGTTCTGT---------GCT-AAGTC---GTGTTA-AGCTTCT--TA-TATAAAA-AACACC-T-CCTC------------C-A-G--TTTAA-ACT-GGG--T-----TGT-CAAC-TGTT--T-A-TGC--TT-TTCT-------------------------------ACAA-TAA----GAGGAC--AA--CAG-GACTGTATTTA-TT--T--A-GGT-AAGT-CTTG-T-G--GAAA-A----T-AATT----------TT----C----------ATCGGA-C---TTC---TTCG-CAAAGTGGAAAATAAGCTC-AGGC---A-CAC---TA-TTAATTGGCTGAACAG----ATA------G-T-C---A------CCATGTAATGAAC---ACAA-AA----C--CC--------AAC-----------GTAA-T---------------------------TG--TGTA---T-AA----TTGCCTTTTTTG--------------TCAT--TAA---GA-ATAT-TGTTATAATTA-TG--T-C-TAATC-AGTTAAAATGTGT-AT---TT---TCT--------------CG-AGC-G------AGAGG---A-CA---------AA-ATGAGAGTCA-ACATC----ATGG-G--CGCCA----AATA-CT--------GAGA-A-AAAATAT---GCT---T------ATTGCAAGAT-TTT---GATT--AT----TGC---TTCAAA-AC----TGAAAA--GTAA-GC----AAA-T-ATT----TA-TT-----CA--AAA---ACATTTG-T-AGTC----A-TTTAATATT---A-GGT-TAAATCAAAT--AAGATA-ATT---TTGCGTA--AA---A-TAAAA-----------ATCAGTGTTTTAAAAAgaattacggtttctttgtttgcaaagtagaataaattcaaatttcatttaattattttaagcctaattatttattagtttgtaaatgtgcgatttggtaaagaaaagggaataacgcacctgtatagaagtgtatagtaaggtgtgtatttcgtgaaagtggctagacacacaaatgtgcgattagttctgtgctaagtcgtgttaagcttcttatataaaaaacacctcctccagtttaaactgggttgtcaactgtttatgcttttctacaataagaggacaacaggactgtatttatttaggtaagtcttgtggaaaataattttcatcggacttcttcgcaaagtggaaaataagctcaggcacactattaattggctgaacagatagtcaccatgtaatgaacacaaaacccaacgtaattgtgtataattgccttttttgtcattaagaatattgttataattatgtctaatcagttaaaatgtgtattttctcgagcgagaggacaaaatgagagtcaacatcatgggcgccaaatactgagaaaaaatatgcttattgcaagattttgattattgcttcaaaactgaaaagtaagcaaatatttattcaaaaacatttgtagtcatttaatattaggttaaatcaaataagataattttgcgtaaaataaaaatcagtgttttaaaaaaaaaatgcgatgtg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaattaaaaaaaaatatcaaataagggtgatttatttaaaagaatgtgatatatctatattggtatatattgaaccgattgacaaggCAAA-CT----CTAAAG--GTAC-AT-A--AAA-TAA--------------------AAAT-------TA-T-AGTC----A-TT-----AT---A-GACATG---CAATG--AAT-TG-ATT---TTGTTTAATGA---T-TAAAA-------------------TTTAGAAACATGaaaaatgcgatgtg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --ATGGTAAAGTCTTTG-T-GTCGACA-A----A-ACAT----------T-----C----------CTCGCA-T-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAG--AAA----AAAA--AA-----------T-ATT--ATG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTcg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-G-------CTGC-AA------GCC-TAGCC---GTCTTT-AGCTTC---TA-CAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-G-G--TTA-A-ATT-GGG--TT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCC
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gacaATTCAAATCA-T-AA-ATAAAGGTGTTTTATTT--AAAAA-A---ATC--AACAAT-CAATTTTTTTATAT--GTATAT-ATATAATGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAGAT-TAG---AATTTCAT----CACT--TTCAAA-TT----TAAAAA--TT---GC-ACCAAA-T-GTT----TG---------A--AAAC--ACATTTA-A-ACTT----A-CT-----TT---A-GGCATG---CAAGG--
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CAGTT-GGCGCTA---GTGT---GATTGTAT-ATTCCAT-GAA----A-TTG---TCTGAGGGG---A-CA---GAA-T----AC--AT-G-------C-AT-AT------GCTGTAGCT---GTGTTT-AG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------------AATG------------C-CAGAAAAATGTAGCGAG-GAAAACGA----TTATTAA--A---TCGGT--AAATGCG----AGGAAAT-T
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatacctatgtaAATGAAACGAA-AACATCGA----GTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGTCGC-TGT-GTAAACATTAATtttgaaaaggt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTTGC-C--TTTTATGT-CCAT--TAAATTGA-AT-T-TGCTAATAATT-TG--G-C-TAA-C-AGC-----TGTTT-TC---TC---GCA------AA---GGATG-TAT-C------TGAC
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aCGCA------TGAAT-CAATTAAAAAT--TTACT-GA-G-GAAT--TTACA-ATATCTTATTATT--TG----------T--AA-----ATTGCAA--------G--T--TTAATT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taaaaGGCGTGTGATTTCGT-GAA----A-TGGA--CCTG----G---A-CA---TAAAT----AAAGGC-G-------CTGTCAGATCGATGCC-TAATCTGTGTGTCTGAGCTTTCTGTA-CAT---A-AACACCATATCTC-GAGATCCTGGGC-G-GAATT--T-ATC-GGGAATT-GCCTGTCACAC-TGTTGGT-AATGTAGTTATTCT--------TGT-TTTTA--------TTTA--ACAGATACAGAAGAGAAC--AAGAAAGCGACTGT----------------GTAGA---TTTG-TAGTCGACA-ATAACA-AACC----------TTATACCA---------CTCGTAACACTTCCGATTTCGAAAAAGTTGGAA--AAATTCCAGGC--TACCGA---CCATT-ATTA-CTG-ACAG----CTA------G-TAC---AGACACCCC-CGTA--TGAC---ACAC-AAGTCTC-ACCCCGAAGGGGACACACCGATACTGTCA-TG-TTATCGT-GC--AAAGCTGTT--AAGA--TG-AAATT-AA----TTGCCATTTTC-----------TGTACCAT--TAAA-CGA-AT----TATATTTATA-TG--CAC-TGA-G-AGT-----TTTTT-ACA--TTCAATCT------AA---GGGCGGTGTCA------TGACGG-CGTCA---------CA-A-------TA-CCAA-----ATGGCGAACGCAAGCACACTATCC--------GAG--A-AAGAGATA--GCA---CTAATAGATTGCAAGATCTTG---ACTTCCAT----TGCT--TTCAAAACT----TGAAAAACCAAA-GC-A--AAA-TAACTATCATA-ATA----CA--AAAT--ACATTTG-GTAGTCT---A-TC-----TTTAGA-GGCATA---CAAAAGAAAG-TGGATT---TTGCATGACAA---A-GAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGGATATc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcTTTA-A-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAAATA-TTT---TTTCTTTAAAA---A-TCAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGCGGTATgtcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -TAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAgt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagttgcctaaccattcttccttggccatggc-C-TAA-G-AGT-----TGTTT-TC---TC---GCG------AA---GGACT-CGT-A------TGATGT-CA-C------------------------ACATC----ATGGCG--CGCAA----AATA-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAAAA--TCGC-GC-A--AAA-TATTT----CA-TT-----TA--AAAC--ACATCTA-A-AGTC----A--T-----GT---A-GGCAT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttaCGAATTCAAAA-GTCTTT--AA-TTTAG-C-TAGG-TAGTCACGTG
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACtgttagc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cAATTAAAAGT-TTTACC-GG-A-GGAT--T-ACA-ATATTTCATTATTATTA----------A--AA-----ATT-CAA---G---CAAGT--TCAATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACT--G------------TGC------ATGGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTT-----A-A----------AGGTCAGTT-A-----A---GT-C---AAGCGTGC-ATTTCGTTGAA----A-TGG---CTTG----G---AACA---GAG-T----TA--G--G-------CTTT-GG------GCT---GT-----TTTTT-AGCAGCA--TAATAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------CGA-G--TT--ATACT-GGG--TCCGC-TGTTCTACGTGTT--TTG-TGT--TT-T----------------------------------ACAT-TAC----GTGAGCCGAA--AAGTG-CTAT-TTTAATT--TCCATGGTAAAGACCTTGTT-GTCGACA-A----A-CAATG---------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAGCGCT------AATCTC-G---------AT---CC-TT-ATT--CTG-ACAGTAACTTA------G-TACACGA------CC-CGTAACCGAT---GCCA-AAT---C-ACCC------G-ACTA---------GTAATTGCTTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---TAAA----TTGCCTTTTTAGCGC--TAT--------AT----AATCTA-ATCTGTTCTATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TG-TT-AC---TT---GCT------AA---GATTG-GAC-A------TGACGTCCA-CA---------CA--------------ATT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG--T-AAAATAT----CAGT-C------ATCCCAATTT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TCAAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAGTTCATA----TA-GT-----AG--AAAA--ACATTTA-C-TGCC----ACTT-----TT---ACGGCATA---CACAA--AAG-TC-ATT---TTGC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tTAAAA--GTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TA----------TTAAA-----AAT-CAA---TG--CAAGT--TCAATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACCTGG------------CAT-G------GGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTT-----A---------CA-AGGTCAGTT-------A---GTCA---AAGCGTGC-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CTGG----A---A-CA---GA------------------------GT-AG------GCT-TGGCT---GTTTTTTAGCAGC---TA-TAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--ATACT-GGG--TC-GC-TGTC--ACGTGTT--T-T-TGT--TT-T----------------------------------ACAT-TAC----GTGAGC--AA--AAGTGACTAT-TTTA-TC--C--ATGGTAAAGACCTTG-T-GTCGACA-A----A-ACTG----------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAG---------------C---GC--TATCTCGATCC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTAACTA--G-TAC---A------CC-CGTAACCGAT---GCAA-AT----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTA-GC-C--T----------AT--CAAATCTA-ATCT-GTTCATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TGTTT-AC---TT---GCT------AA---GATTG-GAC-A------TGACGT-CA-CA---------CA---------------TT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG--T-AAAATAT---GCA---T------ATCCCAATAT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TTCAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAA-TGTTA----TA-AT-----AAG-AAAA--ACATTTA-C-TGCC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAA---AAG-TC-ATT---TTGCTTGATGA---tga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-CCTC-G----------C-ATG--TA--A-ACT-GGG--TT-GC-TGTCCATC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTTATTATTTTTTTTA--ACAG-TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTTG-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGccctttatacacaattggaaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TT--CTT-ATCG----CTA------G-TAC---AGA----CT-CGTACCGGACTTTACAATAA----CGACTC------AAACAACC-------GTAC-TG-TTATT-TTGTCTAA-CCTGTTC-AACGCGTG-AC--T-AAAGACTAGCCTTTTTTGT-C--TTTA-GG----ATGCTGAATCTA--TTT-TGATACTTATAGTG--C-TGTAG-TTAGT-----TGTTT-ACAGTCT---TCT------AACCAGG--G-CGT-A-------G--GT-CC-CATTGTACTGTCA-A-------CG-ACACTCGGGATGGTG--CGACA----ATTA-CCCCGGTCATGAGCAA-AAAGGATCCTGCATTCC------GTGGCCAGACATTGCGAAGTCTCACAAGGTGCT--TCCAAA-CTCCGGTAAAAA--CCAA-GCCA--AAA-TAATT----TA-TTGTTGGCA--AAATACACATTTGTC-AGTCATCAA-TC-----TT---A-GGC-TA---T--AG--AAG-GT-ATCCGATTGCATAAGGAAGGA-TAAAA-----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacttcttatcgctagtacagactcgtaccggactttacaataacgactcaaacaaccgtactgttattttgtctaacctgttcaacgcgtgactaaagactagccttttttgtctttaggatgctgaatctattttgatacttatagtgctgtagttagttgtttacagtcttctaaccagggcgtaggtcccattgtactgtcaacgacactcgggatggtgcgacaattaccccggtcatgagcaaaaaggatcctgcattccgtggccagacattgcgaagtctcacaaggtgcttccaaactccggtaaaaaccaagccaaaataatttattgttggcaaaatacacatttgtcagtcatcaatcttaggctatagaaggtatccgattgcataaggaaggataaaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtttagcttctatataaacacctcctcgcatgtaaactgggttgctgtccatctgtttatgttttcctttattttattattttttttaacagtacaaggacaaaggcgactgttttgtttatggtaaagtccttgtgtcgacacaaaatttcctcgcaccttccttcgaaaaagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacTGAAGCGAAGAACATCGATTTAGTAT-A-------TCGGC--ATTTGCG----AGTAAATGGG---TTTTGACATGAAAAGCCCGC-T-T-GTACACAGTAATTGg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tAGTACT-AAGATCAAG-TGGTT-ATATGAAAAG------------GCA-TTCGTATTTTTAAAAT--GTCTTTTATAT--CGT-GAT-AT-ACTGAATTAACAAGGTA-ATTGCC----------GAAGAGTTA----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGTGTTATG-AAGCGCGT--------GAAT-CAATTAAATATGTTTACT-GA-G-AATT--T-ACATAAATTTC-TTATG--TA----------T--AA-----ATA-CAG---TGCACA--TCATTAATT-AATA-TA-----TATTATTATT-A--TTTGTAAATGTGCG-TTTGG------------TGA-G---AAT--AAATA-CGAACCTGGGT--AT-TGTTGTT-----A-GGCTATTATGTAGTTCAGTTAG-----ATTTGTGC---GGGCTTGC-ATTTCGataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcagtactaagatcaagtggttatatgaaaaggcattcgtatttttaaaatgtcttttatatcgtgatatactgaattaacaaggtaattgccgaagagttacggcaacgcacatttcattgatgccatggtgttatgaagcgcgtgaatcaattaaatatgtttactgagaatttacataaatttcttatgtataaatacagtgcacatcattaattaatatatattattattatttgtaaatgtgcgtttggtgagaataaatacgaacctgggtattgttgttaggctattatgtagttcagttagatttgtgcgggcttgcatttcgaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          : ttgaagcgaagaacatcgatttagtatatcggcatttgcgagtaaatgggttttgacatgaaaagcccgcttgtacacagtaattgataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcGATTTCAAA--GTCGTTTTAA-TT-AG-C-TAG-----TTATGTGA-TACTGTG-ACGT-CAGA---TGT---AT---C-----C-----TTTCAAC--G---AC--CAGCTGAT----A---A--TG---AAAA-T----AG--TGT--------TAGATAT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-TTGAACAACA------A----T---T-------------------ATTTC--GA--CT------AT---AGCTATA-C----GTTTTAGCCA-C--------C-AAT-GCATCCA------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAACAAA-AACAGCGA----GTATAAA--A---TCAGC--AATTGCAAGCTAGTAAAT-CA---TATTGACAGA----GGTAAC-TGT-TTAAAAATGAATTGGaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCAAATTCATAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTTTTTGAAAAAT-A---GTAATAGCA-T-aaaagttatttaaacatgtattattatgtaattatacgtatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaaattcatagtaaaaatcaaagtgttttttttgaaaaatagtaatagcatttt





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777                22222222                                                                            1111111111             111                                 11111111             222222222222    33333333333333                      111111111   1  111111                                         1111        222                                                                                                                                                                                                                                                    333333333333333333   11                                            1       33333333333333333       111111                                    1111          333333333                                        11                2222222222222  11111       33333333333         333333333333           1111                    33333333333333333333                                  555555555555555555         22222222222                           1111    111111111111111111          3333333333333333333      1111111       11111             111                          1111111111         1111                                           8888888888888888888888888888888888   11                                                                               222222222222222222222222222                                                                                   111111         111111                       1111      333333333333333333333                                                             44444444444444444                 222222                    111                111       1111111                                  77777777777777777777777777777777                        11111111   1111       111   2222222222                                                                                  111111111111             111                                                                          22222222222222  111                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  0      11  4  4  4 4    4           4   1   4    4    777   44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444   4 8888  55   00000000       99999     66         55          4          2 777  9999 777          8888888888             000     77   1    8   66          4 66666666 4   4   0   555555555555    55555555555555 66              44   000000000   2  666666     55       8888       4  777 1        2222      6 111       1                                                                                                                                                                                                               999  4         1       7     111111111111111111   00   88    77    1 77  999   5   5  5     5   1     3 88888888888888888       444444    99  44 6    6    6     8        7777 55       555555555   88    5 0  0 4     77  666    77 5   22      5     77  7777777777777  44444   5   66666666666 66      555555555555  5     1  4444                    33333333333333333333     0    5 4    88   66  3   22  888888888888888888  2      44444444444    666 0      3       3   4444 3  666666666666666666  7777  3 4444444444444444444    3 0000000   3   11111      6      333  3   666 3      3 3    3 5555555555 3 3 55  8888  55   99999  4        8    55 444   55  4 3333333333333333333333333333333333   00   9999 1    55  55          4    4  88888         00    3 7       888888 3  0 444444444444444444444444444      3 3 3   666          1     55  66  3    55555 2 666  3  3   77   3    7777   555555 2   555 222222  2    1     555   44  0000 3    000000000000000000000    3  3     5555 44  4444   77    44  3 999 3  7777     0   66666666666666666    44      3 3  777777   777777  8888 3   000   88888     3  111  5555 5555555  555  5  33  3 888888      3  3  22222222222222222222222222222222      44  1  7777    3  44444444   8888       111   3333333333   2      7   666    3   99999   55      3  7777      44    3  3 44   3 3   7777  999999999999   777       000    9999 3  77777  555 6      555     44   7 66   666    8 0 3  777 4     99999999999999  000                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .      ..  .  .  . .    .           .   .   .    .    ...   ..............................................................   . ....  ..   ........       .....     ..         ..          .          . ...  .... ...          ..........             ...     ..   .    .   ..          . ........ .   .   .   ............    .............. ..              ..   .........   .  ......     ..       ....       .  ... .        ....      . ...       .                                                                                                                                                                                                               ...  .         .       .     ..................   ..   ..    ..    . ..  ...   .   .  .     .   .     . .................       ......    ..  .. .    .    .     .        .... ..       .........   ..    . .  . .     ..  ...    .. .   ..      .     ..  .............  .....   .   ........... ..      ............  .     .  ....                    ....................     .    . .    ..   ..  .   ..  ..................  .      ...........    ... .      .       .   .... .  ..................  ....  . ...................    . .......   .   .....      .      ...  .   ... .      . .    . .......... . . ..  ....  ..   .....  .        .    .. ...   ..  . ..................................   ..   .... .    ..  ..          .    .  .....         ..    . .       ...... .  . ...........................      . . .   ...          .     ..  ..  .    ..... . ...  .  .   ..   .    ....   ...... .   ... ......  .    .     ...   ..  .... .    .....................    .  .     .... ..  ....   ..    ..  . ... .  ....     .   .................    ..      . .  ......   ......  .... .   ...   .....     .  ...  .... .......  ...  .  ..  . ......      .  .  ................................      ..  .  ....    .  ........   ....       ...   ..........   .      .   ...    .   .....   ..      .  ....      ..    .  . ..   . .   ....  ............   ...       ...    .... .  .....  ... .      ...     ..   . ..   ...    . . .  ... .     ..............  ...                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  8      55  0  0  0 0    0           0   9   4    4    888   99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   0 5555  55   00000000       33333     11         22          4          2 888  4444 888          2222222222             777     77   9    9   11          4 11111111 4   4   9   666666666666    00000000000000 44              44   555555555   0  999999     55       5555       0  888 3        1111      7 777       0                                                                                                                                                                                                               999  4         0       4     666666666666666666   99   11    99    0 11  111   7   7  7     7   4     2 55555555555555555       333333    22  33 7    7    7     0        0000 88       888888888   88    0 3  1 3     11  000    99 7   99      1     99  6666666666666  33333   7   33333333333 99      444444444444  0     0  0000                    66666666666666666666     2    0 5    55   99  6   66  999999999999999999  5      22222222222    444 1      3       6   1111 6  444444444444444444  4444  6 9999999999999999999    3 6666666   3   44444      2      666  6   444 6      6 6    6 9999999999 6 6 00  9999  22   22222  0        0    55 666   55  0 8888888888888888888888888888888888   11   4444 0    55  55          0    0  00000         66    6 3       999999 6  1 777777777777777777777777777      6 6 7   444          2     55  55  6    22222 3 444  6  6   99   3    1111   444444 9   000 111111  9    6     888   77  4444 3    111111111111111111111    6  6     6666 66  1111   99    66  3 222 3  7777     1   88888888888888888    66      6 6  444444   222222  9999 3   999   33333     3  555  6666 5555555  444  1  88  1 888888      3  3  55555555555555555555555555555555      66  2  7777    6  55555555   0000       000   1111111111   7      3   444    4   44444   55      6  7777      66    3  3 66   3 7   1111  999999999999   888       222    6666 1  77777  444 2      888     66   3 33   444    8 5 8  000 4     66666666666666  000                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T----AAAA-T----AG--TGT--------TAGATGT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGC-T-T-GTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATA--AGCA-T-CATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AA-----ATT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTT-----A-G-----TACGTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAAATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA---GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A-------CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
Reference ( family-549 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T----AAAA-T----AG--TGT--------TAGATGT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGC-T-T-GTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATA--AGCA-T-CATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AA-----ATT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTT-----A-G-----TACGTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAAATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA---GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A-------CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAATTTCAAAAAGTATTTTTAAGTT-AG-CCTAGGATAGTCACGTGG-TACCGTGGACGT-CAGA---TAC---G----C-----CCGATCTT----C--G---ACAACAG---AT----AAA-G--T----AAA--T----AG--TGT--------CAGATGTTC---TGTAA--AAACTCAGCC-TT-ATTCTCT-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTTTCGAATCTT--AAAATTCAAATCGTATCAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA--------------------------GCGAA-AACATCGT----CTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGACATG----GGCCGCTT-T-GTAAACAGTAATTGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cAAATCCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATT---AAAAA-A---GCA--ATCA---CAT------TATAT--ATATTT--TAT--TGTTGATTATTACCGA-TTG-CAAGGTATAG-GCCTAAAGCCGGCGGAGAGC-A----CGGC--AATAC-ACAT-C-CA-TTGATTGCCATGGT----T-AAACCGC---------AGAAT-CAAT--GAAATGTTTACT-GA-G-GAATATT-ACA--TATTTTATTATT--TG----------T--AATACAAGTT-CAC---T---TT--T--TTAATTTATT---A----TTATTATCATTAT--TTTGTAAATGTGCGATTTGGAAATTATTGGAATACCGATCAATAGGAACA-CGAACCTCATT--ATTTGTTGTT-----ATGCTAT-TATGTAGGTCAGTT-G-----G---ACGT---GGGCGAGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---CAA-T----AA--AC-G-------CTGT-AG------GTA-TAGTC---GTGTTT-AGCTTC----A-TAT---ATAACACC---TCTC-G----------C-A-A--TTA-A-ACT-GGG--TT-GC-TGTCCATC-TGTT--T-A-T-T--TT-TCCTTTATTTTATTA-TTTT---------TTTA--ACA--TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-TGGTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-C-TCC---TTCGAAAAAG-TGAAA--AAA-TC-AGAT--TGCCGC---CC-TT-ATT--CTT-ACGG----CTA------GTTAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAC-----------GTAA-TG-CTATT-T-GC--AA-TCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCT-----------TTTT-TGT-CTAT--TAAATCGA-ATCTACTCTATG-ATA-TGCTC-T-TGA-G-AGT-----TGTTTAACA--TT---TCC------AA---AGGCG-TAT-C------TGACGT-CA-CA---------C--A-------C-----CC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG----AAAATAT---GCA---T------ATTGCCAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TATAT-----TA--AAAT--ACATCTG---------------------T---A-GGCATA---CAGAG--AAG-TA-ATT---TTGCCTAAAAA---ATTAATA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaaaatccaaagtataaatcaaggtgctttattaaaaaagcaatcacattatatatattttattgttgattattaccgattgcaaggtataggcctaaagccggcggagagcacggcaatacacatccattgattgccatggttaaaccgcagaatcaatgaaatgtttactgaggaatattacatattttattatttgtaatacaagttcacttttttaatttattattattatcattattttgtaaatgtgcgatttggaaattattggaataccgatcaataggaacacgaacctcattatttgttgttatgctattatgtaggtcagttggacgtgggcgagtatttcgtgaaatggcctggacacaataaacgctgtaggtatagtcgtgtttagcttcatatataacacctctcgcaattaaactgggttgctgtccatctgtttatttttcctttattttattatttttttaacatacaaggacaaaggcgactgttttatttatggtaaagtccttgtggtcgacacaaaatttcctcgcacctccttcgaaaaagtgaaaaaatcagattgccgcccttattcttacggctagttacacccgtagccgatacataacactcgaacgtaatgctatttgcaatctgttaacgtgataattgccttttttgtctattaaatcgaatctactctatgatatgctcttgagagttgtttaacatttccaaaggcgtatctgacgtcacacacccatggcgcgcagaataccgagaaaatatgcatattgccagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttatattaaaatacatctgtaggcatacagagaagtaattttgcctaaaaaattaataaagtttagaaacatgggatatg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccaatttcaaaaagtatttttaagttagcctaggatagtcacgtggtaccgtggacgtcagatacgcccgatcttcgacaacagataaagtaaatagtgtcagatgttctgtaaaaactcagccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacaaatttttcgaatcttaaaattcaaatcgtatcatgttttagccaccagtgcatacgaatagcgaaaacatcgtctataatatcggtaattgcgagtaaattgttttgacatgggccgctttgtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaC---GAGTGTGT-ATTTCTT-AAATTG-A-TGAAGACCTG----G---T-CA---GAG-C----AT--AT-G-------TTGT-AT------GCC-TAGCT---GAGCTT-AG-TTC---CA-TAT---A-ATTATT-T-TCTT-G----------C-A-C--TT--T-GCCTGGG--CT-GT-TGTTCATC-TGTC--T-G-TGT--TT-TG-----------------------------TA--AC---TAC----ATGGAC--AA--AGACAACTGG-TTTT-CT--A--ATGGCA------TTG-T-GCCGACATA----ACAAATATCCGTCTTTTT----T----------CTCATA-C-CCTCC---CTTGCA------GAAA--ACAATC-AGCT--TATCTT---C------TT--CTG-ACAG----CTT------G-TAC---A------TC-CGTAACTGAT---ACAA-AA----C-ACCC------TAAG-----------TTAA-TG-TTATT-T-AC--AT-GCCATG--AACG--TA-A---T-AA----TTGC-------GT-C--TTTT-AAT-CCAT--TAAg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGACTTTAAAAAGTATTT--GA-TT-CG-C-TAGG-TAGTCACGTGA-TACCGTG-ACGT-CCGG---TGC---AACCTT-----C-----TT----C--A---AC--CAG---CT----G---A--TTATGAAAG-T----AG--TAT--------TGCGTGT-C---TATAA--AAACTCAACG-TTTCTTCATC-TTGAATAACATT---TA----T---TTCGATGTTGT------T---CTTTTTGAGTTTTCAAAAATACAAACCGTA-TAG--ATTTTAGCAA-C--------C-AGT-GCACACACATGGCGATTTAAATG------------C-CC-AATAAAGAATCGAA-GATA-------------AA--G---TCGCC--AATTGCG----AGTAAAT-TGATATATTTATACG----GGCCAT-T--------CATTAATTAGttagatactctaaaatcttgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      cCGATTTCAAAAAGTCTTTT-AA-TT-GG-C-TAAG-AAGACATGTGG-TACTGTG-TCGT-CAGACGGTGCTCAG----C-----C-----TC----T--G---AC--AAGCGAAT----C---G--T----AAAAGT----AG--TGTTACATATGTAAATAT-T---TATAACCAAAATCAACT-GTTAATCACC-AAGAA-AACAAT---GA----T---TTAGATGTCGC------CGAATTTCTCGAGTATT---AAAT-------------T--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATGTA------------AATAACGCTGTAAACGC-CT-AAGAAAGAAGCGAG-GAAAGCGA----ATATGAA--A---TCGAT--AATTGCG----AGTAAAT-TA---CGTTGAAATA----Gaagggttatgcatttaaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---GTGC---GGATGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---TCTG----GTGGG-CA---CAA-TGCATAAT-AT-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCT---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACATT-T-TCTG-A----------T-A-G--TTA-A-ACT-ATG--TC-GC-TGTCCAAC-T-TT--T-A--GC--TT-TCCA--------GTATTTTT---------TTTAGTACAG-TAC----ATGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TTTAT--ATGGTAAAGTCCCTG-T-ATTGACA-A----A-CAAT----------TT----CCCGTCTTTTTCTCACA-C-CTTCC---TTTGAATAA-TTGAAA--AAACTC-AGGCTATACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ttatctgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgCGATATCAAAAG---TTTTTAA-TT-AAAC-TAGG-TAGTAAACTTG-TAC-GTG-ACGTTCAGA---TAC---GGTC-CTTG--C-----TT----C--G---AC---AG---AC----A---GGAT----AAGA-T----AAGATGT--------TAGATTA-T---TGTAA--AG-CTCAACTCTTTATTAACT-CTGGACAACAAT---TA----TGTTTTCGATGTTGG------CAAATATCTCGAGTCTT--AAA--TTAAAACGTA-CAT--GTTTTAGCCA-CAATAAAGACAAGT-G-ATACA------------AATAG-----------CACA-AAGAAT-AAGC----AACA--GG----ATAT-AA--ATAGTGGGC--AATTGCG-----GTAAA--TG---TATAGACAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTTAA-T--AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACTT-CAAA---AGC---AA---C-----CA----TT----C--GTTGAC--CAG---TT----GCTTG--TG---AAAA-T----AT--TGT--------TAGATAT-T---TAAAA--TAATTCAATT-TTTATTTACC-CTAGACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGAAAAATTTAAATTTATCAAGTCT---AAAATTCAAATCGTA-TATTCACTTTAGCCAGC--------C-AGTTGCA-ACG------------AATG------------A-CC-AAGAATGAAGCGAG-----TT-A----GGA--AA--G---TCGGCCAAATTGCG----AGTAAAC-TA---TACTGACaattg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCAGATTTAAATTA-G-AA-ATCAAAGTGCTTTATTTAAAAAAA-A---ATA--A-TA-A-CATGTTTT-TAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cagaaattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaTATT-T-AC--AA-G--GTCGGAACG--CG-A---T-AA----TTGG----TTTG-------TT-TGT-CCAT--TAG-----------------------TA--C-C-GAA-------------TTT-A----TT---TC--------------ACA-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-G----------ATAT--------GCA--CGTAA----AA-------------------------A----GCT---C------ATCTCAAAAT-TCT---TATTTCGA----CAACAATTCGAA-CT----TAAAAA--CTAACGC-G--AAA-TATTT----CA-TT-----TATAAAAC--ATATTTA-A-AATC----A-TT-----AT---ATGGCATG---CAAAG--AAT-TG-ATT---TTGC-TAAAAT---A-TAtttattg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATA-TG--G-T-TGA-T-AGT-----TGTTT-AC---TC---GCA------AA---GAACT-CAN-N------NNNNNN-NN-NN---------NN-N-------NN-NNNNN----NNNNNN--NNNNN----NNNN-NN--------NNN--N-NNNNNNN---NNN---N------NNNNNNNNNN-NN---------CAT----TGCT--TCCAAA-CT----TGAAAA--ATAA-GC-A--AAA-TGATT----TA-AT-----CA--ATAT--ACATTTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCACA---CAAAG--AAG-TA-ATT---TTGC----------A-TAGAATTTCTTTTTTTA--AG---TTTAAAAACATGAGATGTtatacataa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---CA--T--TTAATC--TTT-TC----TTATTATTATTAT--GTTGTAAGTGCGCAACATGG------------TAT-GA--AATGGGAGCA-CGAACCTCAGT--ACATGT---------G-G-----TACA-AGTTAAGTT-G-----A----TGCCAGGAGTTTGT-ATTTTGT-GAACAGAA-TG------------------CA---CAA-T----A----T-G-------CTAT-AT------GCC-TTGAT---GTGTTT-AGCTTC---TA-AAT---A-AACACA-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-Ag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          tagttttatttgcCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TC-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----T--G---AT--------AT----A---G--T-----AAA-T----AG--TGTTA------TAGATGT-C---TGTAA--AACCTCAAC--CTTATTCTCT-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CATATGTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTACCAT--GTTTTAGCCA-T--------C-TGT-GCATGCG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCAAA-AACATCGG----GTAT-AATTA---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGATATG----GGCCGC-T-CGGTAAACAGTAATTGGactagg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATTTAAAAAAA-ACCAACA--AACAAT-CATTTTTTTTATAT--GTATAT-ATAG--TGT-GAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-ATTGTCAGC--AATAC-ACAT-CTCA-T-----GTCATGGT----TGAAAGCGCGTACACGAAAGAA---AATTATAAATGTTTACT-GA-A-GAAT--T-ACA--TATTTTCTTATT--TG----------T--AA-----TTT-CAA---T---C---T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTTTT-T--TTTTTAGATGTGCCATTTGG------------TAG-GA--AATGGAAACA-CGAACCTGGGT--ATTTGTTGTTGTGCTA-T-----TATGTAGGTCAGTTTG-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTTGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---TAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------ACC-TAATCA--GTGTCT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTCAG----------C-A-A--TT--A-ATC-GGG--AT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTC---------TTTG--ACAG-TAC----AAAGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCTTTG-A-GTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGTA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCAC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTCTGC-CTGTTTC-TGT-CCAT--TACATCGA-TTTT-TTTTATTAATA-TG--C-C-TGA-G-AGT-----TGTTT-AC---AT---TC-------AA---GGGCG-TGT-A------TGACGT-CA-CA---------CAGA-------CACACACC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---T------ATTTCAAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-TT-----CA--AAAT--ACATCTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTCCATGACAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaattcaaagtataaatcaaggtgctttatttaaaaaaaaccaacaaacaatcattttttttatatgtatatatagtgtgatatactgattgcaaggtaatgccggagagcattgtcagcaatacacatctcatgtcatggttgaaagcgcgtacacgaaagaaaattataaatgtttactgaagaattacatattttcttatttgtaatttcaatctttaattattgtattattatttttttttttagatgtgccatttggtaggaaatggaaacacgaacctgggtatttgttgttgtgctattatgtaggtcagtttgagtgcgggcgtgtattttgtgaaatggcctggacataataagcgctgtagacctaatcagtgtctagcttctatataaacaccttctcagcaattaatcgggatgctgtccaactgtttatgttttcctttatttctttgacagtacaaagacaaaagcgactgttttatttatggtaaagtctttgagtcgacacaaaatttcctcgtaccttccttcgaaaaagttgaaaaaactcaggctaccacccttattctgacagctagtacacccgcaaccgacacacaacacccaaacgtaatgttatctgcaagctgttaacgtgataattgccttttctgcctgtttctgtccattacatcgattttttttattaatatgcctgagagttgtttacattcaagggcgtgtatgacgtcacacagacacacaccatggcgcgcagaataccgagaaaaatatgcatatttcaagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttattcaaaatacatctgtagtcattttaggcatacaaagaagtgattttccatgacaaataaaaaagtttgaaaacatggaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgatttcaaaaagtctttttaatcagctaggtagtcacgtggtaccgtgacgtcagatgcgcctttgatatagtaaatagtgttatagatgtctgtaaaacctcaaccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacatatgtctcgagtcttaaaattcaaaccgtaccatgttttagccatctgtgcatgcgaatacccaagaatgaagcaaaaacatcgggtataattatcggcaattgcgagtaaattgttttgatatgggccgctcggtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT-AGGC--TGCCTC---CC-GT-CTT--CTG-ACAG----CTAAGCCTAG-TAA---C------CC-CGAACCCGGT---ACAA-AA----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-T-AC--AA-GTCGTT--AACA--CG-A---T-GA----TAGCCATTT--------TTTT-TAT-CCCT--TCAATCTAGATA------ATTAAT------C-C---A-T-AAT-----TA-TT-AC---CC---TCTCGCTCGAA---GGTCG-CAT-A------TGACGT-CA-CA---------C--A-------TA----------ATGGCG--CGTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GA-TACAATG-ACGT-CACC---TGC---GA---C-----C-----TT----CTTGT--AT--CAGGTAAT----A---G--TGAA-AAAA-T----AG--TGT--------TAAATAT-C---TATTA--AAACTCAGCT-TTTATTAACTACTTATTACTATTAACTAAGTTT---TTCGATGTTGA------CA--TTTACCGAGACTT--AACATTCAAACTGTA-CAT--GTTTTAGCCA-T--------C-AGT-ACACA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --AA--AAGCAACAGT-TTTA-TT--T--ATGAAAAAGTTCTTG-T-ATCAACA-A----A-T--T----------TT----C----------CTTGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AA-CTC-GGGC--TACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ATCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAA-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AATG--TG-A---T-aatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G---AT----T---G--T----AAAA-TTAAAAG--T-----------AGATGT-TACATTTTA--AAACTCTACT-TTTAATCGTC-ATGGCCAACATG---TA----T---TTCGATTTTGA------AAAAATTCCTGAGTCTG--AGCATT-AAAACATA-TAT--G-TATAGTCA-C--------C-ATT-GC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcgtcgatgggctCAAATTCAAAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTA-TTGAAAAAT-A---GTA--A-TA-G-CATTTTTGAAAT-------TCT-CTAG--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-TAAGG-A-A--GC------------GAGAGC-A----CGGC--A-----ATAT-TTCA-TTGAT-GTCTTGAT----
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACTTGA------------TAT-GA--AACGGGGGTA-CAAACC--AGTGGACATGTT-TC-----A-G------A---AGGTCACTT-G---------GTGT---GATTGTTT-AATTCGT-AAT----A-TG------------------CA---TGA-T---------CTG-------CTGT-AA------GCC-TAGTT---AGGTTT-AGCTT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-ATCAAGGTGGTTTATTTGAAAAGGCA---ATA--AG------AT-TTTTAGAAAT--GTATTT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACTGA-TTG-CAAGGTA-AC-GCC----------GAAGAGT-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCATGTGGTTACCATG-ATGT-CAGA---TAA---G----CCCTTTC-----TT----C--G---AC--CAGA--ATATAAA---G--T-----AAA-T----AG--TGT--------TAGATG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              c---TT---TCC------AA---GGTTG-CAT-ACAATTATAATGT-AA-CA---------CA-------------TAC------TGGCG--CGTAA----TATA-CC--------GAG--ATAAAATGT---GAA---T------TTCACAAGAT-TTG---GATTTCAT----CGC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A------G-TAC---A------CC-ATTAAACAGC---ACAA-AA----C-ACCG------TAAT-----------GCAA-TG-TTATT-T-AC--AA-AACATT--AACG--TC-A---T-AA----TTGGCTTTTTTG--------T-TG----AT--TAAATATA-ATC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAATA-TCAA-ATAAGGGTGATTTATTT--AAAAG-A---ATG--TG-A-T--ATA---TCTATATTGGTATAT-AT------T-GA-----ACCGA-TTGACAAGGGA-TT---------------GAGAGC-G-----GGCCAAATACAATATGTTTACTTGAT-GC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaattaaaaaGAT----TGAGAGCGGGCC------A-AATACAAT-----ATGTTTACTTGATGCGAAT--T-ACG-GT--TTCTTTGTT--TGCAAAGTAGAAT--AA-----ATT-CAAATTT---CA--T--TTAATT-ATTT-TAAGCCTAATTATTTAT-TAGTTTGTAAATGTGCGATTTGG------------TAAAGA--AAAGGGAATAACGCACCT--GT--ATAGA----------A-G-----TGTATAG------T-A-----A---G--------GTGTGT-ATTTCGT-GAA----AGTGG----CTA----G---A-CACACAAA-T----GT--GC-GATTAGTTCTGT---------GCT-AAGTC---GTGTTA-AGCTTCT--TA-TATAAAA-AACACC-T-CCTC------------C-A-G--TTTAA-ACT-GGG--T-----TGT-CAAC-TGTT--T-A-TGC--TT-TTCT-------------------------------ACAA-TAA----GAGGAC--AA--CAG-GACTGTATTTA-TT--T--A-GGT-AAGT-CTTG-T-G--GAAA-A----T-AATT----------TT----C----------ATCGGA-C---TTC---TTCG-CAAAGTGGAAAATAAGCTC-AGGC---A-CAC---TA-TTAATTGGCTGAACAG----ATA------G-T-C---A------CCATGTAATGAAC---ACAA-AA----C--CC--------AAC-----------GTAA-T---------------------------TG--TGTA---T-AA----TTGCCTTTTTTG--------------TCAT--TAA---GA-ATAT-TGTTATAATTA-TG--T-C-TAATC-AGTTAAAATGTGT-AT---TT---TCT--------------CG-AGC-G------AGAGG---A-CA---------AA-ATGAGAGTCA-ACATC----ATGG-G--CGCCA----AATA-CT--------GAGA-A-AAAATAT---GCT---T------ATTGCAAGAT-TTT---GATT--AT----TGC---TTCAAA-AC----TGAAAA--GTAA-GC----AAA-T-ATT----TA-TT-----CA--AAA---ACATTTG-T-AGTC----A-TTTAATATT---A-GGT-TAAATCAAAT--AAGATA-ATT---TTGCGTA--AA---A-TAAAA-----------ATCAGTGTTTTAAAAAgaattacggtttctttgtttgcaaagtagaataaattcaaatttcatttaattattttaagcctaattatttattagtttgtaaatgtgcgatttggtaaagaaaagggaataacgcacctgtatagaagtgtatagtaaggtgtgtatttcgtgaaagtggctagacacacaaatgtgcgattagttctgtgctaagtcgtgttaagcttcttatataaaaaacacctcctccagtttaaactgggttgtcaactgtttatgcttttctacaataagaggacaacaggactgtatttatttaggtaagtcttgtggaaaataattttcatcggacttcttcgcaaagtggaaaataagctcaggcacactattaattggctgaacagatagtcaccatgtaatgaacacaaaacccaacgtaattgtgtataattgccttttttgtcattaagaatattgttataattatgtctaatcagttaaaatgtgtattttctcgagcgagaggacaaaatgagagtcaacatcatgggcgccaaatactgagaaaaaatatgcttattgcaagattttgattattgcttcaaaactgaaaagtaagcaaatatttattcaaaaacatttgtagtcatttaatattaggttaaatcaaataagataattttgcgtaaaataaaaatcagtgttttaaaaaaaaaatgcgatgtg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaattaaaaaaaaatatcaaataagggtgatttatttaaaagaatgtgatatatctatattggtatatattgaaccgattgacaaggCAAA-CT----CTAAAG--GTAC-AT-A--AAA-TAA--------------------AAAT-------TA-T-AGTC----A-TT-----AT---A-GACATG---CAATG--AAT-TG-ATT---TTGTTTAATGA---T-TAAAA-------------------TTTAGAAACATGaaaaatgcgatgtg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --ATGGTAAAGTCTTTG-T-GTCGACA-A----A-ACAT----------T-----C----------CTCGCA-T-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAG--AAA----AAAA--AA-----------T-ATT--ATG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTcg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-G-------CTGC-AA------GCC-TAGCC---GTCTTT-AGCTTC---TA-CAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-G-G--TTA-A-ATT-GGG--TT-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCC
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gacaATTCAAATCA-T-AA-ATAAAGGTGTTTTATTT--AAAAA-A---ATC--AACAAT-CAATTTTTTTATAT--GTATAT-ATATAATGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAGAT-TAG---AATTTCAT----CACT--TTCAAA-TT----TAAAAA--TT---GC-ACCAAA-T-GTT----TG---------A--AAAC--ACATTTA-A-ACTT----A-CT-----TT---A-GGCATG---CAAGG--
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CAGTT-GGCGCTA---GTGT---GATTGTAT-ATTCCAT-GAA----A-TTG---TCTGAGGGG---A-CA---GAA-T----AC--AT-G-------C-AT-AT------GCTGTAGCT---GTGTTT-AG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------------AATG------------C-CAGAAAAATGTAGCGAG-GAAAACGA----TTATTAA--A---TCGGT--AAATGCG----AGGAAAT-T
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatacctatgtaAATGAAACGAA-AACATCGA----GTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGTCGC-TGT-GTAAACATTAATtttgaaaaggt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTTGC-C--TTTTATGT-CCAT--TAAATTGA-AT-T-TGCTAATAATT-TG--G-C-TAA-C-AGC-----TGTTT-TC---TC---GCA------AA---GGATG-TAT-C------TGAC
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aCGCA------TGAAT-CAATTAAAAAT--TTACT-GA-G-GAAT--TTACA-ATATCTTATTATT--TG----------T--AA-----ATTGCAA--------G--T--TTAATT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taaaaGGCGTGTGATTTCGT-GAA----A-TGGA--CCTG----G---A-CA---TAAAT----AAAGGC-G-------CTGTCAGATCGATGCC-TAATCTGTGTGTCTGAGCTTTCTGTA-CAT---A-AACACCATATCTC-GAGATCCTGGGC-G-GAATT--T-ATC-GGGAATT-GCCTGTCACAC-TGTTGGT-AATGTAGTTATTCT--------TGT-TTTTA--------TTTA--ACAGATACAGAAGAGAAC--AAGAAAGCGACTGT----------------GTAGA---TTTG-TAGTCGACA-ATAACA-AACC----------TTATACCA---------CTCGTAACACTTCCGATTTCGAAAAAGTTGGAA--AAATTCCAGGC--TACCGA---CCATT-ATTA-CTG-ACAG----CTA------G-TAC---AGACACCCC-CGTA--TGAC---ACAC-AAGTCTC-ACCCCGAAGGGGACACACCGATACTGTCA-TG-TTATCGT-GC--AAAGCTGTT--AAGA--TG-AAATT-AA----TTGCCATTTTC-----------TGTACCAT--TAAA-CGA-AT----TATATTTATA-TG--CAC-TGA-G-AGT-----TTTTT-ACA--TTCAATCT------AA---GGGCGGTGTCA------TGACGG-CGTCA---------CA-A-------TA-CCAA-----ATGGCGAACGCAAGCACACTATCC--------GAG--A-AAGAGATA--GCA---CTAATAGATTGCAAGATCTTG---ACTTCCAT----TGCT--TTCAAAACT----TGAAAAACCAAA-GC-A--AAA-TAACTATCATA-ATA----CA--AAAT--ACATTTG-GTAGTCT---A-TC-----TTTAGA-GGCATA---CAAAAGAAAG-TGGATT---TTGCATGACAA---A-GAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGGATATc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcTTTA-A-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAAATA-TTT---TTTCTTTAAAA---A-TCAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGCGGTATgtcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -TAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAgt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagttgcctaaccattcttccttggccatggc-C-TAA-G-AGT-----TGTTT-TC---TC---GCG------AA---GGACT-CGT-A------TGATGT-CA-C------------------------ACATC----ATGGCG--CGCAA----AATA-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAAAA--TCGC-GC-A--AAA-TATTT----CA-TT-----TA--AAAC--ACATCTA-A-AGTC----A--T-----GT---A-GGCAT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttaCGAATTCAAAA-GTCTTT--AA-TTTAG-C-TAGG-TAGTCACGTG
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACtgttagc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cAATTAAAAGT-TTTACC-GG-A-GGAT--T-ACA-ATATTTCATTATTATTA----------A--AA-----ATT-CAA---G---CAAGT--TCAATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACT--G------------TGC------ATGGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTT-----A-A----------AGGTCAGTT-A-----A---GT-C---AAGCGTGC-ATTTCGTTGAA----A-TGG---CTTG----G---AACA---GAG-T----TA--G--G-------CTTT-GG------GCT---GT-----TTTTT-AGCAGCA--TAATAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------CGA-G--TT--ATACT-GGG--TCCGC-TGTTCTACGTGTT--TTG-TGT--TT-T----------------------------------ACAT-TAC----GTGAGCCGAA--AAGTG-CTAT-TTTAATT--TCCATGGTAAAGACCTTGTT-GTCGACA-A----A-CAATG---------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAGCGCT------AATCTC-G---------AT---CC-TT-ATT--CTG-ACAGTAACTTA------G-TACACGA------CC-CGTAACCGAT---GCCA-AAT---C-ACCC------G-ACTA---------GTAATTGCTTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---TAAA----TTGCCTTTTTAGCGC--TAT--------AT----AATCTA-ATCTGTTCTATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TG-TT-AC---TT---GCT------AA---GATTG-GAC-A------TGACGTCCA-CA---------CA--------------ATT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG--T-AAAATAT----CAGT-C------ATCCCAATTT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TCAAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAGTTCATA----TA-GT-----AG--AAAA--ACATTTA-C-TGCC----ACTT-----TT---ACGGCATA---CACAA--AAG-TC-ATT---TTGC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tTAAAA--GTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TA----------TTAAA-----AAT-CAA---TG--CAAGT--TCAATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACCTGG------------CAT-G------GGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTT-----A---------CA-AGGTCAGTT-------A---GTCA---AAGCGTGC-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CTGG----A---A-CA---GA------------------------GT-AG------GCT-TGGCT---GTTTTTTAGCAGC---TA-TAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--ATACT-GGG--TC-GC-TGTC--ACGTGTT--T-T-TGT--TT-T----------------------------------ACAT-TAC----GTGAGC--AA--AAGTGACTAT-TTTA-TC--C--ATGGTAAAGACCTTG-T-GTCGACA-A----A-ACTG----------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAG---------------C---GC--TATCTCGATCC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTAACTA--G-TAC---A------CC-CGTAACCGAT---GCAA-AT----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTA-GC-C--T----------AT--CAAATCTA-ATCT-GTTCATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TGTTT-AC---TT---GCT------AA---GATTG-GAC-A------TGACGT-CA-CA---------CA---------------TT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG--T-AAAATAT---GCA---T------ATCCCAATAT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TTCAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAA-TGTTA----TA-AT-----AAG-AAAA--ACATTTA-C-TGCC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAA---AAG-TC-ATT---TTGCTTGATGA---tga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-CCTC-G----------C-ATG--TA--A-ACT-GGG--TT-GC-TGTCCATC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTTATTATTTTTTTTA--ACAG-TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTTG-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGccctttatacacaattggaaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TT--CTT-ATCG----CTA------G-TAC---AGA----CT-CGTACCGGACTTTACAATAA----CGACTC------AAACAACC-------GTAC-TG-TTATT-TTGTCTAA-CCTGTTC-AACGCGTG-AC--T-AAAGACTAGCCTTTTTTGT-C--TTTA-GG----ATGCTGAATCTA--TTT-TGATACTTATAGTG--C-TGTAG-TTAGT-----TGTTT-ACAGTCT---TCT------AACCAGG--G-CGT-A-------G--GT-CC-CATTGTACTGTCA-A-------CG-ACACTCGGGATGGTG--CGACA----ATTA-CCCCGGTCATGAGCAA-AAAGGATCCTGCATTCC------GTGGCCAGACATTGCGAAGTCTCACAAGGTGCT--TCCAAA-CTCCGGTAAAAA--CCAA-GCCA--AAA-TAATT----TA-TTGTTGGCA--AAATACACATTTGTC-AGTCATCAA-TC-----TT---A-GGC-TA---T--AG--AAG-GT-ATCCGATTGCATAAGGAAGGA-TAAAA-----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacttcttatcgctagtacagactcgtaccggactttacaataacgactcaaacaaccgtactgttattttgtctaacctgttcaacgcgtgactaaagactagccttttttgtctttaggatgctgaatctattttgatacttatagtgctgtagttagttgtttacagtcttctaaccagggcgtaggtcccattgtactgtcaacgacactcgggatggtgcgacaattaccccggtcatgagcaaaaaggatcctgcattccgtggccagacattgcgaagtctcacaaggtgcttccaaactccggtaaaaaccaagccaaaataatttattgttggcaaaatacacatttgtcagtcatcaatcttaggctatagaaggtatccgattgcataaggaaggataaaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtttagcttctatataaacacctcctcgcatgtaaactgggttgctgtccatctgtttatgttttcctttattttattattttttttaacagtacaaggacaaaggcgactgttttgtttatggtaaagtccttgtgtcgacacaaaatttcctcgcaccttccttcgaaaaagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacTGAAGCGAAGAACATCGATTTAGTAT-A-------TCGGC--ATTTGCG----AGTAAATGGG---TTTTGACATGAAAAGCCCGC-T-T-GTACACAGTAATTGg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tAGTACT-AAGATCAAG-TGGTT-ATATGAAAAG------------GCA-TTCGTATTTTTAAAAT--GTCTTTTATAT--CGT-GAT-AT-ACTGAATTAACAAGGTA-ATTGCC----------GAAGAGTTA----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGTGTTATG-AAGCGCGT--------GAAT-CAATTAAATATGTTTACT-GA-G-AATT--T-ACATAAATTTC-TTATG--TA----------T--AA-----ATA-CAG---TGCACA--TCATTAATT-AATA-TA-----TATTATTATT-A--TTTGTAAATGTGCG-TTTGG------------TGA-G---AAT--AAATA-CGAACCTGGGT--AT-TGTTGTT-----A-GGCTATTATGTAGTTCAGTTAG-----ATTTGTGC---GGGCTTGC-ATTTCGataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcagtactaagatcaagtggttatatgaaaaggcattcgtatttttaaaatgtcttttatatcgtgatatactgaattaacaaggtaattgccgaagagttacggcaacgcacatttcattgatgccatggtgttatgaagcgcgtgaatcaattaaatatgtttactgagaatttacataaatttcttatgtataaatacagtgcacatcattaattaatatatattattattatttgtaaatgtgcgtttggtgagaataaatacgaacctgggtattgttgttaggctattatgtagttcagttagatttgtgcgggcttgcatttcgaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          : ttgaagcgaagaacatcgatttagtatatcggcatttgcgagtaaatgggttttgacatgaaaagcccgcttgtacacagtaattgataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcGATTTCAAA--GTCGTTTTAA-TT-AG-C-TAG-----TTATGTGA-TACTGTG-ACGT-CAGA---TGT---AT---C-----C-----TTTCAAC--G---AC--CAGCTGAT----A---A--TG---AAAA-T----AG--TGT--------TAGATAT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-TTGAACAACA------A----T---T-------------------ATTTC--GA--CT------AT---AGCTATA-C----GTTTTAGCCA-C--------C-AAT-GCATCCA------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAACAAA-AACAGCGA----GTATAAA--A---TCAGC--AATTGCAAGCTAGTAAAT-CA---TATTGACAGA----GGTAAC-TGT-TTAAAAATGAATTGGaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCAAATTCATAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTTTTTGAAAAAT-A---GTAATAGCA-T-aaaagttatttaaacatgtattattatgtaattatacgtatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaaattcatagtaaaaatcaaagtgttttttttgaaaaatagtaatagcatttt


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT  .  T  A .    .           T   C   .    T    CGG   GACCTTCTTGTATCAGGTAATAGTGAAA                                     G TAAA  GA   TACATATG       TACA      CC         TC          A          T AAC  AGTT GTT          AAAAATTTAA             TCA     AC   C    C   TC          G AATAAAGA A   T       CATGGCGATTTA    ACGCTGTAAACGC  AG              GA   TCGATTTAG   G  ATAG       CA       AGCT       G  ATA A        AAAA      . CG        T                                                                                                                                                                                                               TC   G         C       A     AACCAACAAACAAT       GT   TT    TG    A TA  TAA   .   .  .     A   A     T ATTGCC                  ATTGT     CA  TA A    G    C     .        GTTA GA       TACACGAAA   TA    T      G     TT  TGC    .  T   TA      C     AT  CAAAGTAGAAT    .       G   ATTTCA      CA      ATTTTAAGCC    A     A  TAG                     TAAAGA                        A G    TC   GG  A   TG  GTGCTATTATGT        T      GGCGCTA        CAG        G       T   CAGA G  GTCTGAGGGGA         CACA  A GTGCGATTAGTT           C GATCGAT   G   TCTGT      G      CTG  A   AAA .      A A    A AGATCCTGGG G T AA  TAA   CT   AATT   C        G    GG AA    AG  A CCTTTATTTTATTATTTTTTTTA              GA   AGAA T    CG  GA          A    A  TAT                 T A       ATAAC  C    ATCCGTCTTTTTT                    A A C   GAT          T     AT  AA  C    TATAC T GAT  A  A   GG   A    TAAC   AGCCTA .   ACG GACACC  A    A     TTT   AT  GTCT G    CGAAGGGGACACACCGATACT    T  C     GTG  CT  AGCT   GG    CG  T AAT A  AGAC         CTGCCTGTTTCTGT       GC      G G  CTGTTC   TTATAG  CA   G   TC    TAAAA     .  AGT  CAAT TCGCTCG  CCA  A  GT  C CAATTA      C  T  TTGTACTGTCAACGACACTCGGG               AA  T  GCAC    T  CCGGTCAT   CAA        CCT   CTAATAG      T      C   CGA    T   AAGGT   AA      A  CCGG      AC    C  C CC   T A   ATCA  TTGTTGGCA      TAC       GT     ATCA C  TAATA  TAG T      AAT     GA   A GG   CGA    A   A  AGG .     TTTCTTTTTTTA    TGT
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT  .  .  . .    .           .   T   .    .    .     AACCATTCGTTGACCAGTTGCTTGTGA                                      . .     .    TA             C         .          G           .          A .    .    .            CCGA                   T       TT   A    .   .           . .        .   .       .               GCA            C               G    GCGAA       T  TTA        .        .          .  .   G        .         . GT        G                                                                                                                                                                                                               CT   .         C       A     TAGTAATAGCAT         TT   AA    .     C A   G     .   .  .     .   A     T ATGCC                   TA        .   CG .    .    .     .        .    GA       CCA         T     T      G     T   A      .  .   G       T     .   TTA            .       .   TGCAAG      .       ATTGTA        A     T  AT                      TATGA                         . G    TG   .   T   TG  AGGCTATTATGT        G      AGATTT         .          .       .   TTG  .  AAGACCTGGT          G     . GCATAATATG             . T         .   TCA        T      T    .   .   .      . .    . .          . . .   AA    T    TCC    .        G    .  TG    .   . CCAGTATTTTTTTTAGT                    G    .    T    .   .           .    .  TCC                 . .       TA     .    TTCCCGTCTTTTT                    . . T   .            T     .   AC  .    TAT   T .    .  .   A    .    .      ACTA   .   .   GA      .    A     .     A   T    .    AAACAACC                 .  .     TTG  .   GCC    C     .   . C   .  .            TTGCCTTTTATGT        .       T .  TTTTT    TAATA   C    .   TT    .         .  A    T    A        .    A  C   . .           .  .  AAATGAGAGTCAACATC                     .   N  .       .  .          AT         A     TTCC         N      A   .      T   C       .       .  .         .     .  . .    . G   .     TTTATA         C         TC     T    .  .      .   C      .       .    A G    .      G   C  .   .     ATC             .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT  .  .  . .    .           .   C   .    .    .     GCCCTTTCTTCGACCAGAATATAAAGT                                      . .     .    .              T         .          T           .          A .    .    .            GCAA                   T       TC   T    .   .           . .        .   .       .               C              T               G    TCGGG       A  TA         .        .          .  .   A        .         . GT        T                                                                                                                                                                                                               G    .         T       G     AAATCAACAAT          TT   AG    .     T C   G     .   .  .     .   .     G ACGCC                   A         .   TA .    .    .     .        .    G        CAT         T     T      G     T   G      .  .   A       A     .   T              .       .   TGCACA      .       AATATA        A     T  T                       TAGGA                         . A    CT   .   A   TG  AGTGTAT             G      TGA            .          .       .   .    .  GTCTGGTGGG          C     . AAAGGCG                . G         .   CT         .      A    .   .   .      . .    . .          . . .   AA    C    CT     .        .    .  G     .   . TCTTGTTTTTATTTA                      G    .    A    .   .           .    .  A                   . .       A      .    TTATACCA                         . . T   .            T     .   AC  .    TAC   A .    .  .   .    .    .      .      .   .   .       .    C     .     C   .    .    GACTA                    .  .     TA   .   GCT    .     .   . .   .  .            TTGTCTTTAGG          .       T .  ATTGT    AATTA   G    .   T     .         .  .    G    C        .    G  C   . .           .  .  CAGACACACACC                          .   C  .       .  .          AA         .     GTC          T      .   .      T   T       .       .  .         .     .  . .    . A   .     ATACA          T         A      .    .  .      .   .      .       .    . A    .      T   T  .   .     A               .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT  .  .  . .    .           .   C   .    .    .     ATCCTTTCAACGACCAGCTGATAATGA                                      . .     .    .              T         .          T           .          T .    .    .            ACAT                   T       TC   C    .   .           . .        .   .       .               A              A               A    ACGAT       .  G          .        .          .  .   A        .         . T         G                                                                                                                                                                                                               T    .         G       G     AAATAATAA            TT   CT    .     A A   T     .   .  .     .   .     T AGC                     A         .   CG .    .    .     .        .             T           .     T      G     C   A      .  .   A       A     .   T              .       .   GCAAG       .       TTTTC         A     T  T                       TATGA                         . G    CT   .   A   TG  GGTACA              G      GA             .          .       .   .    .  GACCTGGA            C     . ATATG                  . T         .   CT         .      .    .   .   .      . .    . .          . . .   AT    T    TC     .        .    .  A     .   . CCTTTATTTCTTTG                       A    .    A    .   .           .    .  T                   . .       C      .    GTTC                             . . T   .            T     .   AC  .    TGC   T .    .  .   .    .    .      .      .   .   .       .    A     .     A   .    .    TAAG                     .  .     TA   .   GTC    .     .   . .   .  .            GTCTTTTAAT           .       G .  CTGTT    TAATT   C    .   G     .         .  .    T    T        .    T  T   . .           .  .  NNNNNNNNNN                            .   T  .       .  .          N          .     C            A      .   .      T   T       .       .  .         .     .  . .    . A   .     ATAAG          T         T      .    .  .      .   .      .       .    . G    .      A   C  .   .     A               .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT  .  .  . .    .           .   A   .    .    .     AACCTTCTTCAACCAGCTGATTATGA                                       . .     .    .              T         .          T           .          T .    .    .            AAAA                   T       TC   C    .   .           . .        .   .       .               C              C               A    TCGAG       .  A          .        .          .  .   T        .         . .         T                                                                                                                                                                                                               A    .         A       G     TAGTAATAG            AT   TT    .     A A   T     .   .  .     .   .     . TT                      G         .   .  .    .    .                                              T      .     C   G      .  .   A       A     .   A              .       .   TC          .       TGATC         .     T  T                       CATG                          . G    TG   .   A   T   AGA                 G      AA             .          .       .   .    .  GCTTGGAA            T     . AAGCG                  . G         .   AT         .      .    .   .   .      . .    . .          . . .   AT    T    AT     .        .    .  A     .   . GTA                                  T    .    A    .   .           .    .  T                   . .       A      .    TTC                              . . T   .            T     .   GC  .    TAC   T .    .  .   .    .    .      .      .   .   .       .    A     .     C   .    .    AAAC                     .  .     TG   .   GCT    .     .   . .   .  .            TAGCGCTAT            .       G .  TTTGA    TTATA   C    .   T     .         .  .    T    A        .    T  C   . .           .  .  CAATACCAA                             .   T  .       .  .          A          .     N            G      .   .      C   C       .       .  .         .     .  . .    . A   .     ATCA           T         T      .    .  .      .   .      .       .    . A    .      T   A  .   .     A               .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT  .  .  . .    .           .   C   .    .    .     GGTCCTTGCTTCGACAGACAGGATA                                        . .     .    .              C         .          T           .          T .    .    .            ACA                    G       T    A    .   .           . .        .   .       .               C              C               G    GCGAG       .  G          .        .          .  .   A        .                                                                                                                                                                                                                                     T    .         T       G     GAATGTGAT            T    TA    .     T A   .     .   .  .     .   .                                                                                                         .      .     T   G      .  .   .       .     .   T              .       .   G           .       TGATC         .     A  A                       TGAG                          . .    T    .   A   .   ACA                 T      AA             .          .       .   .    .  GCCTGGA             T     . ACATG                  . A         .   TT         .      .    .   .   .      . .    . .          . . .   T     C    TT     .        .    .  A     .   . TCT                                  T    .    T    .   .           .    .  T                   . .       A      .    TTC                              . . T   .            T     .   AT  .    TAC   A .    .  .   .    .    .      .      .   .   .       .    A     .     A   .    .    GACT                     .  .     TA   .   AAC    .     .   . .   .  .            TTGTTTGT             .       G .  TTGC     TAAT    T    .   C     .         .  .    T    T        .    A  C   . .           .  .  CAGATAT                               .   C  .       .  .          A          .     T            G      .   .      G   T       .       .  .         .     .  . .    . A   .     TTCA           C         T      .    .  .      .   .      .       .    . G    .      T   T  .   .     .               .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   .  .  . .    .           .   T   .    .    .     TCAGCCTCTGACAAGCGAATCGTA                                         . .     .    .              C         .          T           .          T .    .    .            TT                     .       .    C    .   .           . .        .   .       .               C              C               A    TTAG        .  A          .        .          .  .   T                                                                                                                                                                                                                                              A    .         G       .     GCAATAAG             A    T                                                                                                                                                                                                                                          .                                                      TGC                           . .    .    .   .   .   AA                  .      G              .          .       .   .    .  GCTGGAA             G     . TAGG                   . A         .   TC         .      .    .   .   .      . .    . .          . . .   A     T    TC     .        .    .  A     .   . .                                    G    .    T    .   .           .    .  C                   . .       A      .    TTC                              . . A   .            C     .   TC  .    TAT   G .    .  .   .    .    .      .      .   .   .       .    G     .     A   .    .    AAAA                     .  .     TG   .   GCT    .     .   . .   .  .            TTTTTAT              .       T .  TA       AAAA    G    .   G     .         .  .    T    G        .    G  A   . .           .  .  CATAC                                 .   C  .       .  .          T          .     T            C      .   .      G   C       .       .  .         .     .  . .    . C   .     TTCA           T         T      .    .  .      .   .      .       .    . A    .      A   G  .   .                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .   .  .  . .    .           .   .   .    .    .     GCCTTTGATATAGT                                                   . .     .    .              C         .          .           .          . .    .    .            .                      .       .    .    .   .           . .        .   .                                                      A    GGA         .  A          .        .          .  .   A                                                                                                                                                                                                                                                   .         T       .     GCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A              .          .       .   .    .  GCTAGA              T     . ATG                    . T         .   CC         .      .    .   .   .      . .    . .          . . .   A     T    TT     .        .    .  T     .   . .                                    .    .    A    .   .           .    .  T                   . .       A      .    TTC                              . . A   .            T     .   C   .    AA    A .    .  .   .    .    .      .      .   .   .       .    A     .     C   .    .    TAAT                     .  .     TA   .   GCT    .     .   . .   .  .            TTGTTG               .       T .  A        AAAA    G    .   G     .         .  .    G    T        .    A  T   . .           .  .  ACATC                                 .   C  .       .  .          T          .     T            C      .   .      T   T       .       .  .         .     .  . .    . G   .     TTTA           C         A      .    .  .      .   .      .       .    . C    .      .   .  .   .                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .   .  .  . .    .           .                                                                                        . .     .    .                                                                                                                                                                                                                  .    .           .  .          .        .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .          .       .   .    .  .                   G     . CTG                    . G         .   CT         .      .    .   .   .      . .    . .          . . .   T     T    T      .        .    .  A     .   .                                                     .   .           .    .  .                   . .       A      .    TTC                              . . T   .            .     .   A   .    A     T .    .  .   .    .    .      .      .   .   .       .    A     .     T   .    .    GACT                     .  .     AT   .   CCT    .     .   . .   .  .            TCTGTA               .       T .  .        .       G    .   C     .         .  .    G    T        .    T  C   . .           .  .  CAATT                                 .   G  .       .  .          .          .     T            G      .   .      .   T       .       .  .         .     .  . .    . A   .     GTAG           A         A      .    .  .      .   .      .       .    . C    .      .   .  .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .          .       .   .    .  .                   G     . .                      . G         .   CT         .      .    .   .   .      . .    . .          . . .   A                                                                                                                                              . .       C      .    TC                               . . .   .            .         .   .    .     . .    .  .   .    .    .      .      .   .   .       .    C     .     A   .    .    AAC                      .  .     AT   .   G      .     .   . .   .  .            AGCCT                .       . .                   C    .   C     .         .  .    G    T        .    T  G   . .           .  .  CATA                                  .   G  .       .                                                  .   .      .   T               .  .         .     .  . .    . .   .     A              A         A      .    .  .      .   .      .       .    . T    .                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                                                                      . .         .   T          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .    .    .      .      .   .   .       .    .     .     A   .    .                                      .    .   .      .     .   . .   .               TTG                  .                                  .   .     .         .  .    G    .        .    .  G   . .           .  .  CATT                                  .   A                                                                                                         .     .  . .    . .   .     .              .         C      .    .  .      .   .      .       .                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .      .   .   .       .                                                                                                                                                                                               .    T    .        .    .  C   . .                                                                                                                                                                                                                          C      .    .  .      .   .                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .   .   .       .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C****                                                                                                                                                                C************* C*                                  A*****                                                     GT*                                                                                                                                                                                                                                                                         TT   NN            A*                                 ATGCC************                                                               CN*******                                 **     A*                               *****       TGCAG******                                T***                    TANGA***************                                                                                                                                                                                                                                                A***                                           CCTTTTTTTTA***********************   G*                                                                                                                                               AC                                                                                                                                                                                    TTGTCTGT*********                 TTTN**   NAATA*  N***                        ***                                                                                                                   N***                                                                                                         NTCA********             N**
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T----AAAA-T----AG--TGT--------TAGATGT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGC-T-T-GTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATA--AGCA-T-CATNTTTTNTATAT--GTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCA------AGAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTATT--TG----------T--AA-----ATT-CAA---T---CA--T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTT-----A-G-----TACGTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCT--------TTA-TTTT---------TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGC-C--TTTT-TGT-CCAT--TAAATCGA-ATCT-TTCTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA---GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A-------CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG--A-AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T----AAAA-T----AG--TGT--------TAGATGTC----TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATAC-------------CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AAA-----TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGC-TGT-GTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATA--AGCA-T-CATTTTTTNNATAT--GTATNTA-TAT--TGT-GAT-AT-ACCGA-TTG-CAAGGTAATGCC------------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCN-------GAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACAA-TATTTCATTATT--TG----------T--AA-----ATT-CAATGCAG------T--TTAATT-ATTG-TA----TTATTATTNTTT---TTTGTAAATGTGCGACTTGGTANGA---------------AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTT-----A-G-----TACGTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCGT-GAA----A-TGG---CCTG----G---A-CA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---TA-TAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TTA---ACC-GGG--TC-GC-TGTCCAAC-TGTT--T-A-TGT--TT-TCCTTTTTTTTA-----------------------ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTTA-TT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTGTCTGT---------CCAT--TAAATCGA-ATTTTN--TATNAATA-TGN---C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA---GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A-------CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAGN---AAAATAT---GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TANTCA--------AAAT--ACATTTGN--AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777                22222222                                                                            1111111111             111                                 11111111             222222222222    33333333333333                      111111111   1  111111                                         1111       1                                                                                                                                                                                                                                                     44444444444444444444444444444       11               22222         1       33333333333333333       111111                                    1111          444444444                                        11                2222222222222        222222222            222222222222           1111                    33333333333333333333                                  555555555555555555         22222222222                                      1111111111111111           3333333333333333333      1111111       11111             11111                        1111111111         1111                             11111          9999999999999999999999999999999999999999   11                                                                               222222222222222222222222222                                                                                   111111         111111                       1111      333333333333333333333                                                              333333333333333333               222222222222           1111                        111       1111111                                  77777777777777777777777777777777                        11111111   111    11111       2222222222                                                                                  111111111111             111                                                                          22222222222222  111                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  0      11  4  4  4 4    4           4   1   4    4    777   44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444   4 8888  55   00000000       99999     66         55          4          2 777  9999 777          8888888888             000     77   1    8   66          4 66666666 4   4   0   555555555555    55555555555555 66              44   000000000   2  666666     55       8888       4  777 1        2222       5        1                                                                                                                                                                                                               999  4         1       7     22222222222222222222222222222 0   1 11   66   5   5  00000     5   1     3 88888888888888888       444444    99  44 6    6    6     8        7777  0 0     000000000   88    5 0  0 4     77  666    77 5   22      5    77   7777777777777  1 5   888888888 66  888    888888888888  5     1  4444                    33333333333333333333     0    5 4    88   66  3  3 2  888888888888888888  2      44444444444    666 0      3      3   7777 666 3  7777777777777777   7777  3 4444444444444444444    3 0000000   3   11111      6      44444    666 3      3 3    3 5555555555 3 3 55  8888  55   99999  4        8  4  00000   4   4  3333333333333333333333333333333333333333   00   9999 1    55  55          4   4   88888         00    3 7       888888 3  0 444444444444444444444444444      3 3 3   666          1     55  66  3    55555 2 666  3  3   77   3    7777   555555 2   555 222222  2    1     555   44  0000 3    000000000000000000000    3  3     5555 44  4444   77    44  3 999 3  7777          666666666666666666  44   3   55  888888888888   777777  0000 3   888   88888     3  111  5555 5555555  555  5  33  3 888888      3  3  22222222222222222222222222222222      44  1  7777    3  44444444   444    00000   4   3333333333   2      7   666    3   99999   55      3  7777      44    3  3 44   3 3   7777  999999999999   777       000    9999 3  77777  555 6      555     77   3 66   666    8 0 3  777 4     99999999999999  000                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .      ..  .  .  . .    .           .   .   .    .    ...   ..............................................................   . ....  ..   ........       .....     ..         ..          .          . ...  .... ...          ..........             ...     ..   .    .   ..          . ........ .   .   .   ............    .............. ..              ..   .........   .  ......     ..       ....       .  ... .        ....       .        .                                                                                                                                                                                                               ...  .         .       .     ............................. .   . ..   ..   .   .  .....     .   .     . .................       ......    ..  .. .    .    .     .        ....  . .     .........   ..    . .  . .     ..  ...    .. .   ..      .    ..   .............  . .   ......... ..  ...    ............  .     .  ....                    ....................     .    . .    ..   ..  .  . .  ..................  .      ...........    ... .      .      .   .... ... .  ................   ....  . ...................    . .......   .   .....      .      .....    ... .      . .    . .......... . . ..  ....  ..   .....  .        .  .  .....   .   .  ........................................   ..   .... .    ..  ..          .   .   .....         ..    . .       ...... .  . ...........................      . . .   ...          .     ..  ..  .    ..... . ...  .  .   ..   .    ....   ...... .   ... ......  .    .     ...   ..  .... .    .....................    .  .     .... ..  ....   ..    ..  . ... .  ....          ..................  ..   .   ..  ............   ......  .... .   ...   .....     .  ...  .... .......  ...  .  ..  . ......      .  .  ................................      ..  .  ....    .  ........   ...    .....   .   ..........   .      .   ...    .   .....   ..      .  ....      ..    .  . ..   . .   ....  ............   ...       ...    .... .  .....  ... .      ...     ..   . ..   ...    . . .  ... .     ..............  ...                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  8      55  0  0  0 0    0           0   9   4    4    888   99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   0 5555  55   00000000       33333     11         22          4          2 888  4444 888          2222222222             777     77   9    9   11          4 11111111 4   4   9   666666666666    00000000000000 44              44   555555555   0  999999     55       5555       0  888 3        1111       0        0                                                                                                                                                                                                               999  4         0       4     33333333333333333333333333333 2   0 22   99   7   7  00000     7   4     2 55555555555555555       333333    22  33 7    7    7     0        0000  8 8     222222222   88    0 3  1 3     11  000    99 7   99      1    99   6666666666666  7 4   111111111 99  888    444444444444  0     0  0000                    66666666666666666666     2    0 5    55   99  6  2 5  999999999999999999  5      22222222222    444 1      3      3   7777 444 6  3333333333333333   4444  6 9999999999999999999    3 6666666   3   44444      2      11111    444 6      6 6    6 9999999999 6 6 00  9999  22   22222  0        0  0  00000   0   0  4444444444444444444444444444444444444444   11   4444 0    55  55          0   0   00000         66    6 3       999999 6  1 777777777777777777777777777      6 6 7   444          2     55  55  6    22222 3 444  6  6   99   3    1111   444444 9   000 111111  9    6     888   77  4444 3    111111111111111111111    6  6     6666 66  1111   99    66  3 222 3  1111          111111111111111111  66   3   55  888888888888   222222  6666 3   888   33333     3  555  6666 5555555  444  1  88  1 888888      3  3  55555555555555555555555555555555      66  2  7777    6  55555555   333    00000   0   1111111111   7      3   444    4   44444   55      6  7777      66    3  3 66   3 7   1111  999999999999   888       222    6666 1  77777  444 2      888     99   6 33   444    8 5 8  000 4     66666666666666  000                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T----AAAA-T----AG--TGT--------TAGATGT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGCT-TGTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATAAGCA---CATTTTTT--ATATGTATTT-ATAT--TGT-GAT-AT-----ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCN-------GAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTAT--TTG----------T--AAATTCAA--TGC-A-GT--TT---AATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTT-----A-G-----TACGTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCG-TGA----A---A-TGG---CCTG----G---ACA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---T-ATAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--T-CGC-TGTCCAAC-TG-TT-----TAT-GTT-TTCC------------T-----------TT---TT-TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTT-ATT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTG------T-CTGT-CC-AT--TAA-ATC--GA-AT-T--T--TNTATNAATA-TG--C-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA---GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A-------CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG-N-AAAA-----TAT-GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
Reference ( family-549 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----C--G---AC--CAG---AT----A---G--T----AAAA-T----AG--TGT--------TAGATGT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTA-CAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCGAA-AACATCGA----GTAT-AA--A---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGCCGCTGTGTAAACANTAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGNTTTATTTGAAAAAA-A---ATAAGCA-T-CATTTTTTNNATATGTATNT-ATAT--TGT-GAT-AT-----ACCGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGT----TGAAAGCGCGCN-------GAAT-CAATTAAAAATGTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTAT--TTG----------T--AAATTCAA--TGC-A-GT--TT---AATT-ATTG-TA----TTATTATTNTT-T--TTTGTAAATGTGCGACTTGG------------TAN-GA--AATGGGAACA-CGAACCTNAGT--ATATGTTGTT-----A-G-----TACGTAGGTCAGTT-G-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTCG-TGA----A---A-TGG---CCTG----G---ACA---NAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCC---GTGTTT-AGCTTC---T-ATAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-ACC-GGG--T-CGC-TGTCCAAC-TG-TT-----TAT-GTT-TTCC------------T-----------TT---TT-TTTA--ACAG-TAC----GNGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTT-ATT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-A----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCNC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTAACCGAC---ACAA-AA----C-ACCC------GAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCCGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTG------T-CTGT-CC-AT--TAA-ATC--GA-AT-T--T--TNTATNAATA-TG--N-C-TAA-N-AGT-----TGTTT-AC---TT---TCT------AA---GGNCG-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-A-------CA-ACACC----ATGGCG--CGCAA----AATA-CC--------GAG-N-AAAA-----TAT-GCA---C------ATCGCAAGAT-TTG---AATTTCAT----CGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-NT-----CA--AAAT--ACATTTG-N-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTGCNTAANAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAATTTCAAAAAGTATTTTTAAGTT-AG-CCTAGGATAGTCACGTGG-TACCGTGGACGT-CAGA---TAC---G----C-----CCGATCTT----C--G---ACAACAG---AT----AAA-G--T----AAA--T----AG--TGT--------CAGATGTTC---TGTAA--AAACTCAGCC-TT-ATTCTCT-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CAAATTTTTCGAATCTT--AAAATTCAAATCGTATCAT--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATACG------------AATA--------------------------GCGAA-AACATCGT----CTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGACATG----GGCCGCTTTGTAAACAGTAATTGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cAAATCCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATT---AAAAA-A---GCAATCA---CATT------ATATATATTT--TAT--TGTTGATTATT----ACCGA-TTG-CAAGGTATAG-GCCTAAAGCCGGCGGAGAGC-A----CGGC--AATAC-ACAT-C-CA-TTGATTGCCATGGT----TAAA--C-CGCA-------GAAT-CAAT--GAAATGTTTACT-GA-G-GAATATT-ACA--TATTTTATTAT--TTG----------T--AA-TACAAG-TTC-A-CT--TTTTTAATTTATT---A----TTATTATCATTAT--TTTGTAAATGTGCGATTTGGAAATTATTGGAATACCGATCAATAGGAACA-CGAACCTCATT--ATTTGTTGTT-----ATGCTAT-TATGTAGGTCAGTT-G-----G---ACGT---GGGCGAGT-ATTTCG-TGA----A---A-TGG---CCTG----G---ACA---CAA-T----AA--AC-G-------CTGT-AG------GTA-TAGTC---GTGTTT-AGCTTC-----ATAT---ATAACACC---TCTC-G----------C-A-A--TTA-A-ACT-GGG--T-TGC-TGTCCATC-TG-TT-----TAT--TT-TTCC------------TTTATTTTATTATT---TT-TTTA--ACA--TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTT-ATT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-TGGTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-C-TCC---TTCGAAAAAG-TGAAA--AAA-TC-AGAT--TGCCGC---CC-TT-ATT--CTT-ACGG----CTA------GTTAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAC-----------GTAA-TG-CTATT-T-GC--AA-TCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTTTG------T-CT------AT--TAA-ATC--GA-AT-C--TACTCTATG-ATA-TGCTC-T-TGA-G-AGT-----TGTTTAACA--TT---TCC------AA---AGGCG-TAT-C------TGACGT-CA-CA---------C--A-------C-----CC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG---AAAA-----TAT-GCA---T------ATTGCCAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TATAT-----TA--AAAT--ACATCTG---------------------T---A-GGCATA---CAGAG--AAG-TA-ATT---TTGCCTAAAAA---ATTAATA-----------A--AG---TTTAGAAACATGGGATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaaaatccaaagtataaatcaaggtgctttattaaaaaagcaatcacattatatatattttattgttgattattaccgattgcaaggtataggcctaaagccggcggagagcacggcaatacacatccattgattgccatggttaaaccgcagaatcaatgaaatgtttactgaggaatattacatattttattatttgtaatacaagttcacttttttaatttattattattatcattattttgtaaatgtgcgatttggaaattattggaataccgatcaataggaacacgaacctcattatttgttgttatgctattatgtaggtcagttggacgtgggcgagtatttcgtgaaatggcctggacacaataaacgctgtaggtatagtcgtgtttagcttcatatataacacctctcgcaattaaactgggttgctgtccatctgtttatttttcctttattttattatttttttaacatacaaggacaaaggcgactgttttatttatggtaaagtccttgtggtcgacacaaaatttcctcgcacctccttcgaaaaagtgaaaaaatcagattgccgcccttattcttacggctagttacacccgtagccgatacataacactcgaacgtaatgctatttgcaatctgttaacgtgataattgccttttttgtctattaaatcgaatctactctatgatatgctcttgagagttgtttaacatttccaaaggcgtatctgacgtcacacacccatggcgcgcagaataccgagaaaatatgcatattgccagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttatattaaaatacatctgtaggcatacagagaagtaattttgcctaaaaaattaataaagtttagaaacatgggatatg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccaatttcaaaaagtatttttaagttagcctaggatagtcacgtggtaccgtggacgtcagatacgcccgatcttcgacaacagataaagtaaatagtgtcagatgttctgtaaaaactcagccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacaaatttttcgaatcttaaaattcaaatcgtatcatgttttagccaccagtgcatacgaatagcgaaaacatcgtctataatatcggtaattgcgagtaaattgttttgacatgggccgctttgtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattaaC---GAGTGTGT-ATTTCT-TAA----ATTGA-TGAAGACCTG----G---TCA---GAG-C----AT--AT-G-------TTGT-AT------GCC-TAGCT---GAGCTT-AG-TTC---C-ATAT---A-ATTATT-T-TCTT-G----------C-A-C--TT--T-GCCTGGG--C-TGT-TGTTCATC-TG-TC-----TGT-GTT-TTG-----------------------------------TA--AC---TAC----ATGGAC--AA--AGACAACTGG-TTT-TCT--A--ATGGCA------TTG-T-GCCGACATA----ACAAATATCCGTCTTTTT----T----------CTCATA-C-CCTCC---CTTGCA------GAAA--ACAATC-AGCT--TATCTT---C------TT--CTG-ACAG----CTT------G-TAC---A------TC-CGTAACTGAT---ACAA-AA----C-ACCC------TAAG-----------TTAA-TG-TTATT-T-AC--AT-GCCATG--AACG--TA-A---T-AA----TTGCGTCTTTTA----------AT-CC-AT--TAA-g
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGACTTTAAAAAGTATTT--GA-TT-CG-C-TAGG-TAGTCACGTGA-TACCGTG-ACGT-CCGG---TGC---AACCTT-----C-----TT----C--A---AC--CAG---CT----G---A--TTATGAAAG-T----AG--TAT--------TGCGTGT-C---TATAA--AAACTCAACG-TTTCTTCATC-TTGAATAACATT---TA----T---TTCGATGTTGT------T---CTTTTTGAGTTTTCAAAAATACAAACCGTA-TAG--ATTTTAGCAA-C--------C-AGT-GCACACACATGGCGATTTAAATG------------C-CC-AATAAAGAATCGAA-GATA-------------AA--G---TCGCC--AATTGCG----AGTAAAT-TGATATATTTATACG----GGCCATT-------CATTAATTAGttagatactctaaaatcttgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      cCGATTTCAAAAAGTCTTTT-AA-TT-GG-C-TAAG-AAGACATGTGG-TACTGTG-TCGT-CAGACGGTGCTCAG----C-----C-----TC----T--G---AC--AAGCGAAT----C---G--T----AAAAGT----AG--TGTTACATATGTAAATAT-T---TATAACCAAAATCAACT-GTTAATCACC-AAGAA-AACAAT---GA----T---TTAGATGTCGC------CGAATTTCTCGAGTATT---AAAT-------------T--GTTTTAGCCA-C--------C-AGT-GCATGTA------------AATAACGCTGTAAACGC-CT-AAGAAAGAAGCGAG-GAAAGCGA----ATATGAA--A---TCGAT--AATTGCG----AGTAAAT-TA---CGTTGAAATA----Gaagggttatgcatttaaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---GTGC---GGATGTGT-ATTTCG-TGA----A---A-TGG---TCTG----GTGGGCA---CAA-TGCATAAT-AT-G-------CTGT-AG------GCC-TAGCT---GTGTTT-AGCTTC---T-ATAT---A-AACATT-T-TCTG-A----------T-A-G--TTA-A-ACT-ATG--T-CGC-TGTCCAAC-T--TT-----TA--GCT-TTCCAGTA--------T-----------TT---TT-TTTAGTACAG-TAC----ATGGAC--AA--AAGCGACTGT-TTT-ATTTAT--ATGGTAAAGTCCCTG-T-ATTGACA-A----A-CAAT----------TT----CCCGTCTTTTTCTCACA-C-CTTCC---TTTGAATAA-TTGAAA--AAACTC-AGGCTATACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ttatctgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgCGATATCAAAAG---TTTTTAA-TT-AAAC-TAGG-TAGTAAACTTG-TAC-GTG-ACGTTCAGA---TAC---GGTC-CTTG--C-----TT----C--G---AC---AG---AC----A---GGAT----AAGA-T----AAGATGT--------TAGATTA-T---TGTAA--AG-CTCAACTCTTTATTAACT-CTGGACAACAAT---TA----TGTTTTCGATGTTGG------CAAATATCTCGAGTCTT--AAA--TTAAAACGTA-CAT--GTTTTAGCCA-CAATAAAGACAAGT-G-ATACA------------AATAG-----------CACA-AAGAAT-AAGC----AACA--GG----ATAT-AA--ATAGTGGGC--AATTGCG-----GTAAA--TG---TATAGACAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTTAA-T--AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACTT-CAAA---AGC---AA---C-----CA----TT----C--GTTGAC--CAG---TT----GCTTG--TG---AAAA-T----AT--TGT--------TAGATAT-T---TAAAA--TAATTCAATT-TTTATTTACC-CTAGACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGAAAAATTTAAATTTATCAAGTCT---AAAATTCAAATCGTA-TATTCACTTTAGCCAGC--------C-AGTTGCA-ACG------------AATG------------A-CC-AAGAATGAAGCGAG-----TT-A----GGA--AA--G---TCGGCCAAATTGCG----AGTAAAC-TA---TACTGACaattg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAGATTTAAATTA-G-AA-ATCAAAGTGCTTTATTTAAAAAAA-A---ATAA-TA-A-CATGTTTT-------TATTT--TAT--TG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagaaattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaTATT-T-AC--AA-G--GTCGGAACG--CG-A---T-AA----TTGG----TTTG------T-TTGT-CC-AT--TAGTACC--GA-A-------------------------------------------TTT-A----TT---TC--------------ACA-CGT-A------TGACGT-CA-CA---------CA-G----------ATAT--------GCA--CGTAA----AA-----------------------------A--GCT---C------ATCTCAAAAT-TCT---TATTTCGA----CAACAATTCGAA-CT----TAAAAA--CTAACGC-G--AAA-TATTT----CA-TT-----TATAAAAC--ATATTTA-A-AATC----A-TT-----AT---ATGGCATG---CAAAG--AAT-TG-ATT---TTGC-TAAAAT---A-TA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATA-TG--G-T-TGA-T-AGT-----TGTTT-AC---TC---GCA------AA---GAACT-CAN-N------NNNNNN-NN-NN---------NN-N-------NN-NNNNN----NNNNNN--NNNNN----NNNN-NN--------NNN-N-NNNN-----NNN-NNN---N------NNNNNNNNNN-NN---------CAT----TGCT--TCCAAA-CT----TGAAAA--ATAA-GC-A--AAA-TGATT----TA-AT-----CA--ATAT--ACATTTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCACA---CAAAG--AAG-TA-ATT---TTGC----------A-TAGAATTTCTTTTTTTA--AG---TTTAAAAACATGAGATGTtatacataa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TGC-C-AT--TT---AATC--TTT-TC----TTATTATTATTAT--GTTGTAAGTGCGCAACATGG------------TAT-GA--AATGGGAGCA-CGAACCTCAGT--ACATG----T-----G-G-----TACA-AGTTAAGTT-G-----A----TGCCAGGAGTTTGT-ATTTTG-TGAACAGA---A-TG-----------------CA---CAA-T----A----T-G-------CTAT-AT------GCC-TTGAT---GTGTTT-AGCTTC---T-AAAT---A-AACACA-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--A-Ag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                             tagttttattCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TC-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACCGTG-ACGT-CAGA---TGC---G----C-----C-----TT----T--G---AT--------AT----A---G--T-----AAA-T----AG--TGTTA------TAGATGT-C---TGTAA--AACCTCAAC--CTTATTCTCT-CTGAACAACATT---TA----T---TTCGATGTTGA------CATATGTCTCGAGTCTT--AAAATTCAAACCGTACCAT--GTTTTAGCCA-T--------C-TGT-GCATGCG------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAGCAAA-AACATCGG----GTAT-AATTA---TCGGC--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TTTTGATATG----GGCCGCTCGGTAAACAGTAATTGGactagg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTAAATTCAAAGTA-T-AA-ATCAAGGTGCTTTATTTAAAAAAA-ACCAACAAACAAT-CATTTTTTTTATATGTATAT-ATAG--TGT-GAT-AT-----ACTGA-TTG-CAAGGTA-AT-GCC----------GGAGAGC-ATTGTCAGC--AATAC-ACAT-CTCA-T-----GTCATGGT----TGAAAGCGCGTACACGAAAGAA---AATTATAAATGTTTACT-GA-A-GAAT--T-ACA--TATTTTCTTAT--TTG----------T--AATTTCAA--T-C----T--TT---AATT-ATTG-TA----TTATTATTTTT-T--TTTTTAGATGTGCCATTTGG------------TAG-GA--AATGGAAACA-CGAACCTGGGT--ATTTGTTGTTGTGCTA-T-----TATGTAGGTCAGTTTG-----A---GTGC---GGGCGTGT-ATTTTG-TGA----A---A-TGG---CCTG----G---ACA---TAA-T----AA--GC-G-------CTGT-AG------ACC-TAATCA--GTGTCT-AGCTTC---T-ATAT---A-AACACC-T-TCTCAG----------C-A-A--TT--A-ATC-GGG--A-TGC-TGTCCAAC-TG-TT-----TAT-GTT-TTCC------------T-----------TTATTTC-TTTG--ACAG-TAC----AAAGAC--AA--AAGCGACTGT-TTT-ATT--T--ATGGTAAAGTCTTTG-A-GTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGTA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AAACTC-AGGC--TACCAC---CC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAC-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AACG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTCTGCCTGTTT-CTGT-CC-AT--TAC-ATC--GATTT-T--T--TTTATTAATA-TG--C-C-TGA-G-AGT-----TGTTT-AC---AT---TC-------AA---GGGCG-TGT-A------TGACGT-CA-CA---------CAGA-------CACACACC----ATGGCG--CGCAG----AATA-CC--------GAG-A-AAAA-----TAT-GCA---T------ATTTCAAGAT-TTG---AATTTCAT----TGCT--TTCAAA-CT----TGAAAA--CTAA-GC-A--AAA-TAATT----TA-TT-----CA--AAAT--ACATCTG-T-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAG--AAG-TG-ATT---TTCCATGACAA---A-TAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaattcaaagtataaatcaaggtgctttatttaaaaaaaaccaacaaacaatcattttttttatatgtatatatagtgtgatatactgattgcaaggtaatgccggagagcattgtcagcaatacacatctcatgtcatggttgaaagcgcgtacacgaaagaaaattataaatgtttactgaagaattacatattttcttatttgtaatttcaatctttaattattgtattattatttttttttttagatgtgccatttggtaggaaatggaaacacgaacctgggtatttgttgttgtgctattatgtaggtcagtttgagtgcgggcgtgtattttgtgaaatggcctggacataataagcgctgtagacctaatcagtgtctagcttctatataaacaccttctcagcaattaatcgggatgctgtccaactgtttatgttttcctttatttctttgacagtacaaagacaaaagcgactgttttatttatggtaaagtctttgagtcgacacaaaatttcctcgtaccttccttcgaaaaagttgaaaaaactcaggctaccacccttattctgacagctagtacacccgcaaccgacacacaacacccaaacgtaatgttatctgcaagctgttaacgtgataattgccttttctgcctgtttctgtccattacatcgattttttttattaatatgcctgagagttgtttacattcaagggcgtgtatgacgtcacacagacacacaccatggcgcgcagaataccgagaaaaatatgcatatttcaagatttgaatttcattgctttcaaacttgaaaactaagcaaaataatttattcaaaatacatctgtagtcattttaggcatacaaagaagtgattttccatgacaaataaaaaagtttgaaaacatggaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgatttcaaaaagtctttttaatcagctaggtagtcacgtggtaccgtgacgtcagatgcgcctttgatatagtaaatagtgttatagatgtctgtaaaacctcaaccttattctctctgaacaacatttatttcgatgttgacatatgtctcgagtcttaaaattcaaaccgtaccatgttttagccatctgtgcatgcgaatacccaagaatgaagcaaaaacatcgggtataattatcggcaattgcgagtaaattgttttgatatgggccgctcggtaaacagtaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT-AGGC--TGCCTC---CC-GT-CTT--CTG-ACAG----CTAAGCCTAG-TAA---C------CC-CGAACCCGGT---ACAA-AA----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-T-AC--AA-GTCGTT--AACA--CG-A---T-GA----TAGCCATTTTT-------T-TTAT-CC-CT--TCA-ATCTAGA----------TA-ATTAAT------C-C---A-T-AAT-----TA-TT-AC---CC---TCTCGCTCGAA---GGTCG-CAT-A------TGACGT-CA-CA---------C--A-------TA----------ATGGCG--CGTA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GA-TACAATG-ACGT-CACC---TGC---GA---C-----C-----TT----CTTGT--AT--CAGGTAAT----A---G--TGAA-AAAA-T----AG--TGT--------TAAATAT-C---TATTA--AAACTCAGCT-TTTATTAACTACTTATTACTATTAACTAAGTTT---TTCGATGTTGA------CA--TTTACCGAGACTT--AACATTCAAACTGTA-CAT--GTTTTAGCCA-T--------C-AGT-ACACA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --AA--AAGCAACAGT-TTT-ATT--T--ATGAAAAAGTTCTTG-T-ATCAACA-A----A-T--T----------TT----C----------CTTGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAA--AA-CTC-GGGC--TACCTC---CC-TA-ATT--CTG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-ATCAACCGAC---ACAC-AA----C-ACCC------AAAA-----------GTAA-TG-TTATC-T-GC--AA-GCTGTT--AATG--TG-A---T-aatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G---AT----T---G--T----AAAA-TTAAAAG--T-----------AGATGT-TACATTTTA--AAACTCTACT-TTTAATCGTC-ATGGCCAACATG---TA----T---TTCGATTTTGA------AAAAATTCCTGAGTCTG--AGCATT-AAAACATA-TAT--G-TATAGTCA-C--------C-ATT-GC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcgtcgatgggctCAAATTCAAAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTA-TTGAAAAAT-A---GTAA-TA-G-CATTTTTGAAAT-----TCT-CTAG--TGT-GAT-AT-----ACCGA-TTG-TAAGG-A-A--GC------------GAGAGC-A----CGGC--A-----ATAT-TTCA-TTGAT-GTCTTGAT----
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACTTGA------------TAT-GA--AACGGGGGTA-CAAACC--AGTGGACATGTT-TC-----A-G------A---AGGTCACTT-G---------GTGT---GATTGTTT-AATTCG-TAA----T---A-TG-----------------CA---TGA-T---------CTG-------CTGT-AA------GCC-TAGTT---AGGTTT-AGCTT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       a-AA-ATCAAGGTGGTTTATTTGAAAAGGCA---ATAAG------ATTTTTAGAA-ATGTATTT-ATAT--TGT-GAT-AT-----ACTGA-TTG-CAAGGTA-AC-GCC----------GAAGAGT-A----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCATGTGGTTACCATG-ATGT-CAGA---TAA---G----CCCTTTC-----TT----C--G---AC--CAGA--ATATAAA---G--T-----AAA-T----AG--TGT--------TAGATG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      c---TT---TCC------AA---GGTTG-CAT-ACAATTATAATGT-AA-CA---------CA-------------TAC------TGGCG--CGTAA----TATA-CC--------GAG-ATAAAA-----TGT-GAA---T------TTCACAAGAT-TTG---GATTTCAT----CGC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A------G-TAC---A------CC-ATTAAACAGC---ACAA-AA----C-ACCG------TAAT-----------GCAA-TG-TTATT-T-AC--AA-AACATT--AACG--TC-A---T-AA----TTGGCTTTTTTG------T--TG-----AT--TAA-AT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAAATA-TCAA-ATAAGGGTGATTTATTT--AAAAG-A---ATGTG-----------------ATATATCT-ATAT--TGG-TAT-ATATTGAACCGA-TTGACAAGGGA-TT---------------GAGAGC-G-----GGCCAAATACAATATGTTTACTTGAT-GCataatc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaattaaaaaGAT----TGAGAGCGGGCC-------AAATACAAT-----ATGTTTACTTGATGCGAAT--T-ACG-GT--TTCTTTGT--TTGCAAAGTAGAAT--AAATTCAAATTTC-A--T--TT---AATT-ATTT-TAAGCCTAATTATTTAT-TAGTTTGTAAATGTGCGATTTGG------------TAAAGA--AAAGGGAATAACGCACCT--GT--ATAGA----------A-G-----TGTATAG------T-A-----A---G--------GTGTGT-ATTTCG-TGA----A---AGTGG----CTA----G---ACACACAAA-T----GT--GC-GATTAGTTCTGT---------GCT-AAGTC---GTGTTA-AGCTTCT--T-ATATAAAA-AACACC-T-CCTC------------C-A-G--TTTAA-ACT-GGG--T-----TGT-CAAC-TG-TT-----TAT-GCT-TTTC------------T-------------------------ACAA-TAA----GAGGAC--AA--CAG-GACTGTATTT-ATT--T--A-GGT-AAGT-CTTG-T-G--GAAA-A----T-AATT----------TT----C----------ATCGGA-C---TTC---TTCG-CAAAGTGGAAAATAAGCTC-AGGC---A-CAC---TA-TTAATTGGCTGAACAG----ATA------G-T-C---A------CCATGTAATGAAC---ACAA-AA----C--CC--------AAC-----------GTAA-T---------------------------TG--TGTA---T-AA----TTGCCTTTTTTG------T-------C-AT--TAA------GA-ATAT--T--GTTATAATTA-TG--T-C-TAATC-AGTTAAAATGTGT-AT---TT---TCT--------------CG-AGC-G------AGAGG---A-CA---------AA-ATGAGAGTCA-ACATC----ATGG-G--CGCCA----AATA-CT--------GAGAA-AAAA-----TAT-GCT---T------ATTGCAAGAT-TTT---GATT--AT----TGC---TTCAAA-AC----TGAAAA--GTAA-GC----AAA-T-ATT----TA-TT-----CA--AAA---ACATTTG-T-AGTC----A-TTTAATATT---A-GGT-TAAATCAAAT--AAGATA-ATT---TTGCGTA--AA---A-TAAAA-----------ATCAGTGTTTTAAAAAgaattacggtttctttgtttgcaaagtagaataaattcaaatttcatttaattattttaagcctaattatttattagtttgtaaatgtgcgatttggtaaagaaaagggaataacgcacctgtatagaagtgtatagtaaggtgtgtatttcgtgaaagtggctagacacacaaatgtgcgattagttctgtgctaagtcgtgttaagcttcttatataaaaaacacctcctccagtttaaactgggttgtcaactgtttatgcttttctacaataagaggacaacaggactgtatttatttaggtaagtcttgtggaaaataattttcatcggacttcttcgcaaagtggaaaataagctcaggcacactattaattggctgaacagatagtcaccatgtaatgaacacaaaacccaacgtaattgtgtataattgccttttttgtcattaagaatattgttataattatgtctaatcagttaaaatgtgtattttctcgagcgagaggacaaaatgagagtcaacatcatgggcgccaaatactgagaaaaaatatgcttattgcaagattttgattattgcttcaaaactgaaaagtaagcaaatatttattcaaaaacatttgtagtcatttaatattaggttaaatcaaataagataattttgcgtaaaataaaaatcagtgttttaaaaaaaaaatgcgatgtg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaattaaaaaaaaatatcaaataagggtgatttatttaaaagaatgtgatatatctatattggtatatattgaaccgattgacaaggCAAA-CT----CTAAAG--GTAC-AT-A--AAA-TAA--------------------AAAT-------TA-T-AGTC----A-TT-----AT---A-GACATG---CAATG--AAT-TG-ATT---TTGTTTAATGA---T-TAAAA-------------------TTTAGAAACATGaaaaatgcgatgtg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --ATGGTAAAGTCTTTG-T-GTCGACA-A----A-ACAT----------T-----C----------CTCGCA-T-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGAAG--AAA----AAAA--AA-----------T-ATT--ATG-ACAG----CTA------G-TAC---A------CC-CGTcg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C-G-------CTGC-AA------GCC-TAGCC---GTCTTT-AGCTTC---T-ACAT---A-AACACC-T-TCTC-G----------C-G-G--TTA-A-ATT-GGG--T-TGC-TGTCCAAC-TG-TT-----TAT-GTT-TTCC------------
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gacaATTCAAATCA-T-AA-ATAAAGGTGTTTTATTT--AAAAA-A---ATCAACAAT-CAATTTTTTTATATGTATAT-ATATAATGT-GAT-AT-----ACCGA-TTG-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGAT-TAG---AATTTCAT----CACT--TTCAAA-TT----TAAAAA--TT---GC-ACCAAA-T-GTT----TG---------A--AAAC--ACATTTA-A-ACTT----A-CT-----TT---A-GGCATG---CAAGG--
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAGTT-GGCGCTA---GTGT---GATTGTAT-ATTCCA-TGA----A---A-TTG---TCTGAGGGG---ACA---GAA-T----AC--AT-G-------C-AT-AT------GCTGTAGCT---GTGTTT-AG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------------AATG------------C-CAGAAAAATGTAGCGAG-GAAAACGA----TTATTAA--A---TCGGT--AAATGCG----AGGAAAT-T
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatacctatgtaAATGAAACGAA-AACATCGA----GTAT-AAT-A---TCGGT--AATTGCG----AGTAAAT-TG---TATTGACATG----GGTCGCTGTGTAAACATTAATtttgaaaaggt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aA----TTGCCTTTT-----------ATGT-CC-AT--TAA-ATT--GA-AT-T--T--GCTAATAATT-TG--G-C-TAA-C-AGC-----TGTTT-TC---TC---GCA------AA---GGATG-TAT-C------TGAC
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAACGCA-T-------GAAT-CAATTAAAAAT--TTACT-GA-G-GAAT--TTACA-ATATCTTATTAT--TTG----------T--AAAT------TGCAA-GT--TT---AATT-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGGCGTGTGATTTCG-TGA----A---A-TGGA--CCTG----G---ACA---TAAAT----AAAGGC-G-------CTGTCAGATCGATGCC-TAATCTGTGTGTCTGAGCTTTCTGT-ACAT---A-AACACCATATCTC-GAGATCCTGGGC-G-GAATT--T-ATC-GGGAAT-TGCCTGTCACAC-TG-TTGGTAATGTAGTTATTCT------------TGT---------TT---TTATTTA--ACAGATACAGAAGAGAAC--AAGAAAGCGACTGT----------------GTAGA---TTTG-TAGTCGACA-ATAACA-AACC----------TTATACCA---------CTCGTAACACTTCCGATTTCGAAAAAGTTGGAA--AAATTCCAGGC--TACCGA---CCATT-ATTA-CTG-ACAG----CTA------G-TAC---AGACACCCC-CGTA--TGAC---ACAC-AAGTCTC-ACCCCGAAGGGGACACACCGATACTGTCA-TG-TTATCGT-GC--AAAGCTGTT--AAGA--TG-AAATT-AA----TTGCCATTTT----------CTGTACC-AT--TAA-A-C--GA-AT-T------ATATTTATA-TG--CAC-TGA-G-AGT-----TTTTT-ACA--TTCAATCT------AA---GGGCGGTGTCA------TGACGG-CGTCA---------CA-A-------TA-CCAA-----ATGGCGAACGCAAGCACACTATCC--------GAG-A-AAGA-----GATAGCA---CTAATAGATTGCAAGATCTTG---ACTTCCAT----TGCT--TTCAAAACT----TGAAAAACCAAA-GC-A--AAA-TAACTATCATA-ATA----CA--AAAT--ACATTTG-GTAGTCT---A-TC-----TTTAGA-GGCATA---CAAAAGAAAG-TGGATT---TTGCATGACAA---A-GAAAA-----------A--AG---TTTGAAAACATGGGATATc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggcTTTA-A-AGTC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAAGA-AAA-TA-TTT---TTTCTTTAAAA---A-TCAAA-----------A--AG---TTTAGAAACATGCGGTATgtcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TAC---A------CC-CGTAGCCGAT---ACAT-AA----C-ACTC------GAAgt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagttgcctaaccattcttccttggccatggc-C-TAA-G-AGT-----TGTTT-TC---TC---GCG------AA---GGACT-CGT-A------TGATGT-CA-C------------------------ACATC----ATGGCG--CGCAA----AATA-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gGAAAA--TCGC-GC-A--AAA-TATTT----CA-TT-----TA--AAAC--ACATCTA-A-AGTC----A--T-----GT---A-GGCAT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttaCGAATTCAAAA-GTCTTT--AA-TTTAG-C-TAGG-TAGTCACGTG
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccCGATTTCAAAAAGTCTTTTTAA-TT-AG-C-TAGG-TAGTCACGTGG-TACtgttagc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cAATTAAAAGT-TTTACC-GG-A-GGAT--T-ACA-ATATTTCATTATTATTA----------A--AAATTCAA---GCAA-GT--TC---AAT---TTGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACT--G------------TGC------ATGGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTT-----A-A----------AGGTCAGTT-A-----A---GT-C---AAGCGTGC-ATTTCGTTGA----A---A-TGG---CTTG----GA--ACA---GAG-T----TA--G--G-------CTTT-GG------GCT---GT-----TTTTT-AGCAGCA--TAATAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------CGA-G--TT--ATACT-GGG--TCCGC-TGTTCTACGTGTTT-----TGT-GTT-TT----------------------------------------ACAT-TAC----GTGAGCCGAA--AAGTG-CTAT-TTTAATT--TCCATGGTAAAGACCTTGTT-GTCGACA-A----A-CAATG---------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAGCGCT------AATCTC-G---------AT---CC-TT-ATT--CTG-ACAGTAACTTA------G-TACACGA------CC-CGTAACCGAT---GCCA-AAT---C-ACCC------G-ACTA---------GTAATTGCTTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---TAAA----TTGCCTTTTTAG------CGCTAT----AT----A-ATC--TA-AT-CTGT--TCTATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TG-TT-AC---TT---GCT------AA---GATTG-GAC-A------TGACGTCCA-CA---------CA--------------ATT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG-T-AAAA-----TAT--CAGT-C------ATCCCAATTT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TCAAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAGTTCATA----TA-GT-----AG--AAAA--ACATTTA-C-TGCC----ACTT-----TT---ACGGCATA---CACAA--AAG-TC-ATT---TTGC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTAAAA--GTTTACC-GA-G-GAAT--T-ACA-ATATTTCATTAT--TTA----------TTAAAAATCAA--TGC-AAGT--TC---AATT---TGATC----TT-TCATTTTT-T--TTTGCAAATGTGAGACCTGG------------CAT-G------GGTCACA-C--ACCCTAGT--ATATGTTGTT-----A---------CA-AGGTCAGTT-------A---GTCA---AAGCGTGC-ATTTCG-TGA----A---A-TGG---CTGG----A---ACA---GA------------------------GT-AG------GCT-TGGCT---GTTTTTTAGCAGC---T-ATAT---A-AATATC-T-TCTC-G----------C-A-G--TT--ATACT-GGG--T-CGC-TGTC--ACGTG-TT-----TTT-GTT-TT----------------------------------------ACAT-TAC----GTGAGC--AA--AAGTGACTAT-TTT-ATC--C--ATGGTAAAGACCTTG-T-GTCGACA-A----A-ACTG----------TT----C----------TTCACA-C-CATCC---ATCGAAAG---------------C---GC--TATCTCGATCC-TT-ATT--CTG-ACAG----CTAACTA--G-TAC---A------CC-CGTAACCGAT---GCAA-AT----C-ACCC------GACT-----------GTAA-TG-TTATC-A-TC--GA-GCTGTT--AGTG--TG-A---T-AA----TTGCCTTTTA------------GC-CT-AT--CAA-ATC--TA-AT-C--TG-TTCATAAA-A-TG--G-C-TAA-C-AGT-----TGTTT-AC---TT---GCT------AA---GATTG-GAC-A------TGACGT-CA-CA---------CA---------------TT----ATGGCG--CAGAA----AATA-CC--------GAG-T-AAAA-----TAT-GCA---T------ATCCCAATAT-TTG---AATTGTAT----TGCT--TTCAAA-TG----TGAAAA--CTAA-GG-A--AAA-TGTTA----TA-AT-----AAG-AAAA--ACATTTA-C-TGCC----A-TT-----TT---A-GGCATA---CAAA---AAG-TC-ATT---TTGCTTGATGA---tga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGTTT-AGCTTC---T-ATAT---A-AACACC-T-CCTC-G----------C-ATG--TA--A-ACT-GGG--T-TGC-TGTCCATC-TG-TT-----TAT-GTT-TTCCTTTATTTTATTAT-----------TT---TT-TTTA--ACAG-TAC----AAGGAC--AA--AGGCGACTGT-TTT-GTT--T--ATGGTAAAGTCCTTG-T-GTCGACA-C----A-AAAT----------TT----C----------CTCGCA-C-CTTCC---TTCGAAAAAGTTGccctttatacacaattggaaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT--CTT-ATCG----CTA------G-TAC---AGA----CT-CGTACCGGACTTTACAATAA----CGACTC------AAACAACC-------GTAC-TG-TTATT-TTGTCTAA-CCTGTTC-AACGCGTG-AC--T-AAAGACTAGCCTTTTTTG------T-CTTT-AGGATGCTGA-ATC--TA-TT-T--T--GATACTTATAGTG--C-TGTAG-TTAGT-----TGTTT-ACAGTCT---TCT------AACCAGG--G-CGT-A-------G--GT-CC-CATTGTACTGTCA-A-------CG-ACACTCGGGATGGTG--CGACA----ATTA-CCCCGGTCATGAG-C-AAAAAGGATCCT-GCATTCC------GTGGCCAGACATTGCGAAGTCTCACAAGGTGCT--TCCAAA-CTCCGGTAAAAA--CCAA-GCCA--AAA-TAATT----TA-TTGTTGGCA--AAATACACATTTGTC-AGTCATCAA-TC-----TT---A-GGC-TA---T--AG--AAG-GT-ATCCGATTGCATAAGGAAGGA-TAAAA-----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacttcttatcgctagtacagactcgtaccggactttacaataacgactcaaacaaccgtactgttattttgtctaacctgttcaacgcgtgactaaagactagccttttttgtctttaggatgctgaatctattttgatacttatagtgctgtagttagttgtttacagtcttctaaccagggcgtaggtcccattgtactgtcaacgacactcgggatggtgcgacaattaccccggtcatgagcaaaaaggatcctgcattccgtggccagacattgcgaagtctcacaaggtgcttccaaactccggtaaaaaccaagccaaaataatttattgttggcaaaatacacatttgtcagtcatcaatcttaggctatagaaggtatccgattgcataaggaaggataaaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtttagcttctatataaacacctcctcgcatgtaaactgggttgctgtccatctgtttatgttttcctttattttattattttttttaacagtacaaggacaaaggcgactgttttgtttatggtaaagtccttgtgtcgacacaaaatttcctcgcaccttccttcgaaaaagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgttgaaaaactcgagacggtctgctctgaccgcgggttttcttttggacTGAAGCGAAGAACATCGATTTAGTAT-A-------TCGGC--ATTTGCG----AGTAAATGGG---TTTTGACATGAAAAGCCCGCT-TGTACACAGTAATTGg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tAGTACT-AAGATCAAG-TGGTT-ATATGAAAAG----------GCA-TTCGTATTTTTAAAATGTCTTTTATAT--CGT-GAT-AT-----ACTGAATTAACAAGGTA-ATTGCC----------GAAGAGTTA----CGGC--AACGC-ACAT-TTCA-TTGAT-GCCATGGTGTTATG-AAGCGCG-T-------GAAT-CAATTAAATATGTTTACT-GA-G-AATT--T-ACATAAATTTC-TTAT--GTA----------T--AAATACAG--TGC-ACATCATT---AATT-AATA-TA-----TATTATTATT-A--TTTGTAAATGTGCG-TTTGG------------TGA-G---AAT--AAATA-CGAACCTGGGT--AT-TGTTGTT-----A-GGCTATTATGTAGTTCAGTTAG-----ATTTGTGC---GGGCTTGC-ATTTCG-ataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcagtactaagatcaagtggttatatgaaaaggcattcgtatttttaaaatgtcttttatatcgtgatatactgaattaacaaggtaattgccgaagagttacggcaacgcacatttcattgatgccatggtgttatgaagcgcgtgaatcaattaaatatgtttactgagaatttacataaatttcttatgtataaatacagtgcacatcattaattaatatatattattattatttgtaaatgtgcgtttggtgagaataaatacgaacctgggtattgttgttaggctattatgtagttcagttagatttgtgcgggcttgcatttcgaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          : ttgaagcgaagaacatcgatttagtatatcggcatttgcgagtaaatgggttttgacatgaaaagcccgcttgtacacagtaattgataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataatcGATTTCAAA--GTCGTTTTAA-TT-AG-C-TAG-----TTATGTGA-TACTGTG-ACGT-CAGA---TGT---AT---C-----C-----TTTCAAC--G---AC--CAGCTGAT----A---A--TG---AAAA-T----AG--TGT--------TAGATAT-C---TGTAA--AAACTCAACT-TTTATTCACC-TTGAACAACA------A----T---T-------------------ATTTC--GA--CT------AT---AGCTATA-C----GTTTTAGCCA-C--------C-AAT-GCATCCA------------AATA------------C-CC-AAGAATGAAACAAA-AACAGCGA----GTATAAA--A---TCAGC--AATTGCAAGCTAGTAAAT-CA---TATTGACAGA----GGTAACTGTTTAAAAATGAATTGGaaaacccttcaaggtctttttagactaattggtgtgttttttttcttataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAATTCATAGTA-A-AA-ATCAAAGTGTTTTTTTTGAAAAAT-A---GTAA-TA-G-CATTTTaaaagttatttaaacatgtattattatgtaattatacgtatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcaaattcatagtaaaaatcaaagtgttttttttgaaaaatagtaatagcatttt