lowQualScore : 11 11 222222222 11 333 111 333 111111 11 1 11 1 111111
lowQualScore : 88 99 44 3 6 6 7 6 6 6 6 4 3 666666666 0 55 666 3 7777 0 3 3 22 3 7 6 555 777 33 8888888 44 44 3 3 333 55 3 222222 3 3 3 3 3 88 55 3 4 4 66 888 66 66 4 00 5 4 2 4 4 4 3 4 4 4 4 777777 4 5
lowQualScore : .. .. .. . . . . . . . . . . ......... . .. ... . .... . . . .. . . . ... ... .. ....... .. .. . . ... .. . ...... . . . . . .. .. . . . .. ... .. .. . .. . . . . . . . . . . . ...... . .
lowQualScore : 33 22 00 3 7 7 3 7 7 7 7 0 6 444444444 5 00 444 6 7777 5 6 6 33 6 3 7 000 777 88 4444444 66 66 6 6 222 00 6 333333 6 3 3 3 3 66 00 6 0 1 11 666 11 33 4 00 7 4 2 4 4 4 3 4 4 4 4 222222 4 0
consensus : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTGT------GCGCATGA--T---GAA-TA----TCGAG-AAT-T--TG-AG-AGTGATG-CAAT--ACTAAGGA-AAAAGT-GAA-T----T--GT--AT-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGT-ATAC-ATT-TTANTC--T-TTTG-TTAG--CCGT--AG--T-AAAT-AAAG-ACTAAAAGAG-ACTC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
Reference ( gi|6 ) : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATGAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTGT------GCGCATGA--T---GAA-TA----TCGAG-AAT-T--TG-AG-AGTGATG-CAA---ACTAAGGA-AAAAGT-GAA-T----T--GT--AT-A-ATATATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGT-ATAC-ATT-TTAATC--T-TTTG-TAAG--CCGT--GG--T-AAAT-AAAG-ACTAAAAGAG-ACTC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
gi|2 : CCCCACACTTTTTTC--AAAAA--TATGAA-TTAAATGGCAGAA-TCTA-T-ATTCC
gi|1 : ctCCCAACACTTTT--C--AAAGA-ATATAAA-T-AAATG--AGAATTCTACT-ATTCCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagatattacatttgagccatgatgaatatcgatagtttctgagagtgcaatataagggaaaagtcgaattgtataataatttcacggtgaaattttacaacgtatacatttattcttttttgttaccgttagttaaataaaattaaaagagactctatatctatgacattttcctttacgatatgacgttaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|4 : CCCAACACTTTT--C--AAAAA--TATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatatacatgtgcataaatgaatatcgagatttagagtagtgatgacaatttactaaggaaaagtgaatctgatatacaataatttcacgtaactttaacatgtatacatatttcttttgtagccatagtaaaataaagcactaaaaaggactcttaatattaatgacatttcctacgatatgcacgtcaacgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|15 : aCCCAACACTTTT--CCCAAAAACATATAAA-T-AA-CG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatattacatttgcgcataatgaatatcgagaatttgagagtgatgaaatactaagaaaagtgaattgtataaaaatttcacgttgaaaattttacatgtatacattttatctttacattttatattgcgttgtcaacacaattttctgaataaaaaaggacgtgtgttgtgacaatttatacgataattgaaa
gi|5 : gcaCCAACACTTTTATC--AAAAA-A---AGA-T-AA-TG-CAGAA-TCTA-T-AGTCC
gi|16 : CCAACACTTTT--C---AAAA-ATATAAATT-AAATG-CAGAA-TCTA-TGATTCCannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattacattgcgcataatgaatatcagaatcttgagagatgcaatacaaaggaaaagggaagttgttaaaagtcacagttagaaaagtgtacacaaatacatgttattcttttgttagtcgagtaaataagataaaagagactatcctatttatacattttcccctacgaatgacgtgcaagcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|2 : GTAGATATT-AC-ATTTGA------GC-CATGA--T---GAA-TA----TCGAT-AGT-TTCTG-AG-AG---TG-CAA---TATAAGGG-AAAAGTCGAA-T----T--GT--AT-A-ATA-ATTTC--A-CGGT---GAAA-TTTTACAACGT-ATAC-A-T-TTATTCTTT-TTTG-TTA---CCGTTAGT--T-AAAT-AAA--ATTAAAAGAG-ACTC-T-A-TA-TCT-ATGA-CATTTT-CCTTTA------CGATATG-ACG-TTa
gi|3 : ctccccacacttttttcaaaaatatgaattaaatggcagaatctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTAGATATTTAC-ATTTG--------CGCATGA--T---GAA-TG----TC-AA-AAT-T--TG-AGAAGTGCTGCCAAAT-ACTAAGG--AATAGT-GA-------T--GT--AT-ACATA-ATTCC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTAATAC-A-T-TTATTC--T-TTTG-TTAG--CCGT--AG--T--AAT-AAA----TAAAAAAG-AGAC-TAA-TA-T-T-ATGA-CAATTT--C-CTAC-----CGATAT----G-TTCAAaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|1 : tccatcactttcaaaaattaaaaataaaaatgcacgaaatcctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTAGATAT--AC-AT--GT------GCATA-AA--T---GAA-TA----TCGAG-ATT-T--AG-AGTAGTGATGACAATTTACTAAGG--AAAAGT-GAA-TCTGAT--AT--AC-A-ATA-ATTTC--A-C-GT----AAC-TTTAAC-ATGT-ATAC-ATA-TT--TC--T-TTTG-T-AG--CCAT--AG--TAAAAT-AAAGCACTAAAAAGG-ACTCTTAA-TA-T-TAATGA-CATTT---C-CTA------CGATATGCACG--TCAAcgca
gi|4 : cccaacacttttcaaagaatataaataaatgagaattctactattccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTAGATATT-AC-ATT--T------GCGCATAA--T---GAA-TA----TCGAG-AAT-T--TG-AG-AGTGATG-AAAT--ACTAAG---AAAAGT-GAA-T----T--GT--AT-A-A-AAATTTC--A-C-GTTG-AAAA-TTTTAC-ATGT-ATAC-ATT-TT-ATC--T-TTcgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|13 : acccaacacttttcaaaaatataaataaatgcagaatctatattccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGATATT-AC-ATTTGCGCATAAGCGCATGC--TGGGGAA-TATCACTCGAGAAAT-TA-TGCAG-AGTGATG-CAAT--ACTAAG-----AAGC--AA-T----T--GT--Aacattttatattgcgttgtcaacacaattttctgaataaaaaaggacgtgtgttgtgacaatttatacgataattgaaa
gi|9 : ACATT-AA-ATTTG-------GCGCAGGA--T---AAA-TA----TCGAG-AAT-T--TG-AA-AGTGATG-CAAAT-ACTAAG----AAAG--GAATT----T--GT--ATAA-ATA-ATTTC--ATT-GT---GAAA-TGTTAC-ACGT--TACTATT-T--ATC--T-TTTG-TTAG--CCGT--AG--T-AAATAAAAG-ACTAAATGAG-GCAC-TAC-T--T-T-ATGA-CATTTT-CC-C-A------CGATATA-A
gi|7 : tATATT-ACGATTT-T------GCG-ATAAAGT---GAACTA----TCG-G-AAT-T--TG-AG-AGTGATG-AAAT--ACTAAGGA-AGAAGT-GAA-T----T--GCTAAT-A-ATA-ATTTCTTA-C--T---GAAATTTTTAC-ATGT-AT-T-ATT-TTACT---T-TTTGTTTAG--CCAT--AG--T-AAAA-TAAG-ACTAAAAGAGAACTC-TAA-TA-TGT-ATGAGCATTTT-CC-CTA------CGATA-G-ACG-TTCAAgtg
gi|8 : TATT-AC-ATTTG--------CGCATAA--T---AAA-TA----TCGAG-AAT-TA-TG-AG-AGTGATG-AAAT--ACTAAGGA-AAA-GT-GAA-T----G--GT--AT-T-A-ATAATTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ATGT-ATAC-ATT-TTA-TC--T-TTTG-TTAG--CCAT--AG--T-AAAT-AAAG-ACTAAAAGAG-ACTC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACGATTCAAcgtaaacattaatgacgcatttt
gi|5 : ATT-AC-ATT---------GCGCATAA--T---GAA-TA----TC-AG-AATCT--TG-AG-A--GATG-CAAT--ACAAAGGA-AAAGGG-AAG-T----T--GT---T-A-A---AAGTC--A-CAGTTAGAAAA-GTGTAC-ACAA-ATAC-ATG-TTATTC--T-TTTG-TTAG--TCG---AG--T-AAAT--AAG-A-TAAAAGAG-ACTA-TCC-TATT-T-AT-A-CATTTTCCC-CTA------CGA-ATG-ACG-TGCAAacgaaacattatgacgcaattttaca
gi|10 : ccaacacttttatcaaaaaaagataatgcagaatctatagtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaATT-AC-ATTTG--------CGCATGA--T---AAG-TA----TCAAA-AAT-A--CG-AG-ATTGATA-CAA-----TAAAAACAAAAGA-GAT-A----T--GT--AA-A-ATA-ATTTC--A-C-CG---GAAA-TATTAC-TCAT-ATAC-ATT-TTAgcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|12 : -ATTTGT------GC--ATGA--T---AAA-TA----TCGAG-AAT-T--TG-AC-AGTGATG-CAAT--AATAAAG--AACAGT-GAT-A----T--GT--GT-A-ATA-ATTTT--A-C-AG---GAAA-TTTTAC-ACGT-ATAC-ATT-TT-ATC--T-TTtt
gi|3 : G-CTA---ACAAAAGA-ATAAAT-GTA-T----TACGT--GT-A-A-A-ATTTC--A-C-GT---GGAA-TT-----ATGT-ATAC-ATCACTATTC--C-TTAG-TA
gi|11 : tccatcactttcaaaaattaaaaataaaaatgcacgaaatcctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatatttacatttgcgcatgatgaatgtcaaaatttgagaagtgctgccaaaTAC-ACGT-ATAC-ATT-TT-ATC--TATTTG-TAAGCCCCGT--GGGCT--AAT-AAAGAACGAAAAGAG-ACTC-TAACTA-TGT-ATGA-CATATT-CT-CTAGACCTCTGACATG-ATA-TTCGAcgtagtaataaataaaaaagagactaatattatgacaatttcctaccgatatgttcaacgca
gi|14 : TG-TTAG--ACGT--AG--T-AAAT-AGAG-A--------G-AC----AC-TA-T-T-GTGA-CATTTT-CC-TT-------CGATATG-ACG-TT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 11 111111 1 11111111 1 111111
lowQualScore : 55 77 5 5 5 5 5 5 5 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 3 6 999999 44 555 3 7777 3 3 6 44 3 6 3 77 44 0 22 0 33 8888888 44 7 3 3 55 3 222222 3 3 3 3 5 55 3 555 3 7777 55 3 88 55 999 99999999 2 3 3 6666 3 3 0 3 3 55 3 444444 4 4
lowQualScore : .. .. . . . . . . . . ................................................................................................................................... . . . ...... .. ... . .... . . . .. . . . .. .. . .. . .. ....... .. . . . .. . ...... . . . . . .. . ... . .... .. . .. .. ... ........ . . . .... . . . . . .. . ...... . .
lowQualScore : 77 99 7 7 7 0 7 7 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 3 8 666666 66 888 3 1111 3 3 7 66 3 7 3 99 66 4 22 4 88 4444444 66 3 6 6 00 6 333333 6 3 3 3 2 00 6 888 6 7777 00 6 66 77 555 11111111 8 6 6 5555 6 6 9 6 6 00 6 111111 0 4
consensus : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTG-GC------GCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-AGTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--AT-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGT-ATAC-ATTTTA-TC--T-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
Reference ( family-504 ) : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTGTGC------GCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-AGTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--AT-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGT-ATAC-ATTTTANTC--T-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
gi|1 : CCCAACACTTTT--C--AAAGA-ATATAAA-T-AAATG--AGAATTCTACT-ATTCC
gi|1 : GTAGATAT--AC-AT--GTGC------ATA-AA--TG---AA-TATC----GAGAT-T-T-A--G-AGTAGTGATGAC--AATTTACTAAGGAAAA-GT-GAA-TCTGATAT--AC-A-ATA-ATTTC--A-C-GT----AAC-TTTAAC-ATGT-ATAC-ATATT--TC--T-TT---TG--TA----G--CCA-TAG--TAAAAT-A-AA------GCACTAAAAAG-G-AC-TCTTAA-TA-T-TAATGA-CATTT---C-CTA------CGATATGCACG--TCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatatacatgtgcataaatgaatatcgagatttagagtagtgatgacaatttactaaggaaaagtgaatctgatatacaataatttcacgtaactttaacatgtatacatatttcttttgtagccatagtaaaataaagcactaaaaaggactcttaatattaatgacatttcctacgatatgcacgtcaacgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|10 : cccaacacttttcaaagaatataaataaatgagaattctactattccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATT-AC-ATTTG--C------GCATGA--TA---AG-TATC----AAAAA-T-A-C--G-AG-ATTGATA-C--AAT--A--AAAACAAAAGA-GAT-A----TGT--AA-A-ATA-ATTTC--A-C-CG---GAAA-TATTAC-TCAT-ATAC-ATTTTATTcgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|11 : TAC-ACGT-ATAC-ATTTTA-TC--TATT---TG-TAA----GCCCCG-TGGGCT--AAT-A-AA------GAACGAAAAGA-G-AC-TC-TAACTA-TGT-ATGA-CATATT-CT-CTAGACCTCTGACATG-ATA-TTCGA
gi|12 : -ATTTGTGC--------ATGA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AC-AGTGATG-C--AAT--AATAAAG-AACAGT-GAT-A----TGT--GT-A-ATA-ATTTT--A-C-AG---GAAA-TTTTAC-ACGT-ATAC-ATTTTA-TC--T-TT---
gi|13 : TAGATATT-AC-ATTTGCGCATAAGCGCATGC--TGGGGAA-TATCACTCGAGAAAT-TAT--GCAG-AGTGATG-C--AAT--ACTAAG----AAGC--AA-T----TGT--A
gi|14 : ---TG-TTA----G--ACG-TAG--T-AAAT-----------------AGAGA-G-AC-----AC-TA-T-T-GTGA-CATTTT-CC-TT-------CGATATG-ACG-TT
gi|15 : CCCAACACTTTT--CCCAAAAACATATAAA-T-AA-CG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCa
gi|16 : gcaCCAACACTTTT--C---AAAA-ATATAAATT-AAATG-CAGAA-TCTA-TGATTCC
gi|2 : CCCCACACTTTTTTC--AAAAA--TATGAA-TTAAATGGCAGAA-TCTA-T-ATTCCa
gi|2 : ctGTAGATATT-AC-ATTTGAGC-------CATGA--TG---AA-TATC----GATAG-T-T-TCTG-AG-AGTG----C--AAT--A-TAAGGGAAAAGTCGAA-T----TGT--AT-A-ATA-ATTTC--A-CGGT---GAAA-TTTTACAACGT-ATAC-A-TTTATTCTTT-TT---TG-TTA-------CCGTTAGT-T-AAAT-A-AA--------ATTAAAAGA-G-AC-TC-T-A-TA-TCT-ATGA-CATTTT-CCTTTA------CGATATG-ACG-TTaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagatattacatttgagccatgatgaatatcgatagtttctgagagtgcaatataagggaaaagtcgaattgtataataatttcacggtgaaattttacaacgtatacatttattcttttttgttaccgttagttaaataaaattaaaagagactctatatctatgacattttcctttacgatatgacgttaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|3 : ctccccacacttttttcaaaaatatgaattaaatggcagaatctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTAGATATTTAC-ATTTG--C------GCATGA--TG---AA-TGTC-----AAAA-T-T-T--G-AGAAGTGCTG-CCAAAT--ACTAAGG-AATAGT-GA-------TGT--AT-ACATA-ATTCC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTAATAC-A-TTTATTC--T-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T--AAT-A-AA----------TAAAAAA-G-AG-AC-TAA-TA-T-T-ATGA-CAATTT--C-CTAC-----CGATAT----G-TTCAAaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|4 : tccatcactttcaaaaattaaaaataaaaatgcacgaaatcctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCCAACACTTTT--C--AAAA--ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCcgca
gi|4 : aGTAGATATT-AC-ATTTG--C------GCATAA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-AGTGATG-A--AAT--ACTAAG--AAAAGT-GAA-T----TGT--AT-A-AAA-ATTTC--A-C-GTTG-AAAA-TTTTAC-ATGT-ATAC-ATTTTA-TC--T-TTACATT-TTATATTG---CG-TTG--T-CAAC-ACAATTTTCTG-AATAAAAAAGG-ACGT----G-TG-T-T-GTGA-CAATTT----ATA------CGATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatattacatttgcgcataatgaatatcgagaatttgagagtgatgaaatactaagaaaagtgaattgtataaaaatttcacgttgaaaattttacatgtatacattttatctttacattttatattgcgttgtcaacacaattttctgaataaaaaaggacgtgtgttgtgacaatttatacgataattgaaa
gi|5 : acccaacacttttcaaaaatataaataaatgcagaatctatattccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCAACACTTTTATC--AAAAA-A---AGA-T-AA-TG-CAGAA-TCTA-T-AGTCCattgaaa
gi|5 : ATT-AC-ATT---GC------GCATAA--TG---AA-TATC-----AGAA-TCT-T--G-AG-AG--ATG-C--AAT--ACAAAGGAAAAGGG-AAG-T----TGT---T-A-AAA-GT--C--A-CAGTTAGAAAA-GTGTAC-ACAA-ATAC-ATGTTATTC--T-TT---TG-TTA----G--TCG--AG--T-AAAT---AA------G-A-TAAAAGA-G-AC-TA-TCC-TATT-T-AT-A-CATTTTCCC-CTA------CGA-ATG-ACG-TGCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattacattgcgcataatgaatatcagaatcttgagagatgcaatacaaaggaaaagggaagttgttaaaagtcacagttagaaaagtgtacacaaatacatgttattcttttgttagtcgagtaaataagataaaagagactatcctatttatacattttcccctacgaatgacgtgcaagcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|6 : ccaacacttttatcaaaaaaagataatgcagaatctatagtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaCCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATGAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTGTGC------GCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-AGTGATG-C--AA---ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--AT-A-ATATATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGT-ATAC-ATTTTAATC--T-TT---TG-TAA----G--CCG-TGG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAAgcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|7 : ATATT-ACGATTT-TGC------G-ATAAAGTG---AACTATC----G-GAA-T-T-T--G-AG-AGTGATG-A--AAT--ACTAAGGAAGAAGT-GAA-T----TGCTAAT-A-ATA-ATTTCTTA-C--T---GAAATTTTTAC-ATGT-AT-T-ATTTTACT---T-TT---TGTTTA----G--CCA-TAG--T-AAAA-T-AA------G-ACTAAAAGA-GAAC-TC-TAA-TA-TGT-ATGAGCATTTT-CC-CTA------CGATA-G-ACG-TTCAA
gi|8 : TATT-AC-ATTTG--C------GCATAA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-TAT--G-AG-AGTGATG-A--AAT--ACTAAGGAAAA-GT-GAA-T----GGT--ATTA-ATA-ATT-C--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ATGT-ATAC-ATTTTA-TC--T-TT---TG-TTA----G--CCA-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACGATTCAAcgtaaacattaatgacgcatttt
gi|9 : ACATT-AA-ATTTG-GC------GCAGGA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AA-AGTGATG-CA-AAT--ACTAAG---AAAG--GAATT----TGT--ATAA-ATA-ATTTC--ATT-GT---GAAA-TGTTAC-ACGT--TACTATTT--ATC--T-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAATAA-AA------G-ACTAAATGA-G-GC-AC-TAC-T--T-T-ATGA-CATTTT-CC-C-A------CGATATA-Aacgaaacattatgacgcaattttaca
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222222 111111 11111111 1 111111
lowQualScore : 55 77 5 5 5 5 5 5 5 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 3 88888888 77 555 3 7777 3 3 6 44 3 3 3 3 77 44 0 88 4 33 8888888 44 3 3 3 3 55 3 222222 3 3 3 44 6 3 555 3 7777 55 3 88 55 999 99999999 2 3 3 6666 3 3 0 3 3 55 3 444444 4 4
lowQualScore : .. .. . . . . . . . . ................................................................................................................................... . . ........ .. ... . .... . . . .. . . . . .. .. . .. . .. ....... .. . . . . .. . ...... . . . .. . . ... . .... .. . .. .. ... ........ . . . .... . . . . . .. . ...... . .
lowQualScore : 77 99 7 7 7 0 7 7 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 3 33333333 99 888 3 1111 3 3 7 66 3 3 3 3 99 66 4 22 5 88 4444444 66 3 6 6 6 00 6 333333 6 3 3 66 7 6 888 6 7777 00 6 66 77 555 11111111 8 6 6 5555 6 6 9 6 6 00 6 111111 0 4
consensus : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTG-------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
Reference ( family-504 ) : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTG-------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
gi|1 : CCCAACACTTTT--C--AAAGA-ATATAAA-T-AAATG--AGAATTCTACT-ATTCC
gi|1 : GTAGATAT--AC-AT----------GTGCATAAA-TG---AA-TATC----GAGAT-T-T-A--G-AGTA-GTGATGAC--AATTTACTAAGGAAAA-GT-GAA-TCTGATAT--A-C-A-ATA-ATTTC--A-C-GT----AAC-TTTAAC-ATGTA-TACATA--TT--TCT-TT---TG--TA----G--CCA-TAG--TAAAAT-A-AA------GCACTAAAAAG-G-AC-TCTTAA-TA-T-TAATGA-CATTT---C-CTA------CGATATGCACG--TCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatatacatgtgcataaatgaatatcgagatttagagtagtgatgacaatttactaaggaaaagtgaatctgatatacaataatttcacgtaactttaacatgtatacatatttcttttgtagccatagtaaaataaagcactaaaaaggactcttaatattaatgacatttcctacgatatgcacgtcaacgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|10 : cccaacacttttcaaagaatataaataaatgagaattctactattccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATT-AC-ATTTG--------CGCATGA--TA---AG-TATC----AAAAA-T-A-C--G-AG-A-TTGATA-C--AAT--A--AAAACAAAAGA-GAT-A----TGT--A-A-A-ATA-ATTTC--A-C-CG---GAAA-TATTAC-TCATA-TACATT--TTA-Tcgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|11 : TAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCTATT---TG-TAA----GCCCCG-TGGGCT--AAT-A-AA------GAACGAAAAGA-G-AC-TC-TAACTA-TGT-ATGA-CATATT-CT-CTAGACCTCTGACATG-ATA-TTCGAt
gi|12 : -ATTTG--------TGCATGA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AC-A-GTGATG-C--AAT--AATAAAGAACA-GT-GAT-A----TGT--G-T-A-ATA-ATTTT--A-C-AG---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---
gi|13 : TAGATATT-AC-ATTTGCGCATAAGCGCATGC--TGGGGAA-TATCACTCGAGAAAT-TAT--GCAG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAG----AAGC--AA-T----TGT--A-
gi|14 : ---TG-TTA----G--ACG-TAG--T-AAAT-----------------AGAGA-G-AC-----AC-TA-T-T-GTGA-CATTTT-CC-TT-------CGATATG-ACG-TT
gi|15 : CCCAACACTTTT--CCCAAAAACATATAAA-T-AA-CG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCa
gi|16 : gcaCCAACACTTTT--C---AAAA-ATATAAATT-AAATG-CAGAA-TCTA-TGATTCC
gi|2 : CCCCACACTTTTTTC--AAAAA--TATGAA-TTAAATGGCAGAA-TCTA-T-ATTCCa
gi|2 : ctGTAGATATT-AC-ATTTGA------GC-CATGA--TG---AA-TATC----GATAG-T-T-TCTG-AG-A-GTG----C--AAT--A-TAAGGGAAAAGTCGAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-CGGT---GAAA-TTTTACAACGTA-TACATTTATTC-TTT-TT---TG-TTA-------CCGTTAGT-T-AAAT-A-AA--------ATTAAAAGA-G-AC-TC-T-A-TA-TCT-ATGA-CATTTT-CCTTTA------CGATATG-ACG-TTaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagatattacatttgagccatgatgaatatcgatagtttctgagagtgcaatataagggaaaagtcgaattgtataataatttcacggtgaaattttacaacgtatacatttattcttttttgttaccgttagttaaataaaattaaaagagactctatatctatgacattttcctttacgatatgacgttaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|3 : ctccccacacttttttcaaaaatatgaattaaatggcagaatctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTAGATATTTAC-ATTTG--------CGCATGA--TG---AA-TGTC----AA-AA-T-T-T--G-AG-AAGTGCTG-CCAAAT--ACTAAGGAATA-GT-GA-------TGT--A-T-ACATA-ATTCC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTAATACATT--TAT-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T--AAT-A-AA----------TAAAAAA-G-AG-AC-TAA-TA-T-T-ATGA-CAATTT--C-CTAC-----CGATAT----G-TTCAAaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|4 : tccatcactttcaaaaattaaaaataaaaatgcacgaaatcctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCCAACACTTTT--C--AAAA--ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCcgca
gi|4 : aGTAGATATT-AC-ATTTG--------CGCATAA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAG--AAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-AAA-ATTTC--A-C-GTTG-AAAA-TTTTAC-ATGTA-TACATT--TTA-TCT-TTACATT-TTATATTG---CG-TTG--T-CAAC-ACAATTTTCTG-AATAAAAAAGG-ACGT----G-TG-T-T-GTGA-CAATTT----ATA------CGATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatattacatttgcgcataatgaatatcgagaatttgagagtgatgaaatactaagaaaagtgaattgtataaaaatttcacgttgaaaattttacatgtatacattttatctttacattttatattgcgttgtcaacacaattttctgaataaaaaaggacgtgtgttgtgacaatttatacgataattgaaa
gi|5 : acccaacacttttcaaaaatataaataaatgcagaatctatattccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCAACACTTTTATC--AAAAA-A---AGA-T-AA-TG-CAGAA-TCTA-T-AGTCCattgaaa
gi|5 : ATT-AC-ATT---------GCGCATAA--TG---AA-TATC-----AGAA-TCT-T--G-AG-A-G--ATG-C--AAT--ACAAAGGAAAAGGG-AAG-T----TGT----T-A-AAA-G--TC--A-CAGTTAGAAAA-GTGTAC-ACAAA-TACATG--TTATTCT-TT---TG-TTA----G--TCG--AG--T-AAAT---AA------G-A-TAAAAGA-G-AC-TA-TCC-TATT-T-AT-A-CATTTTCCC-CTA------CGA-ATG-ACG-TGCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattacattgcgcataatgaatatcagaatcttgagagatgcaatacaaaggaaaagggaagttgttaaaagtcacagttagaaaagtgtacacaaatacatgttattcttttgttagtcgagtaaataagataaaagagactatcctatttatacattttcccctacgaatgacgtgcaagcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|6 : ccaacacttttatcaaaaaaagataatgcagaatctatagtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaCCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATGAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTGT------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AA---ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATATATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTAATCT-TT---TG-TAA----G--CCG-TGG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAAgcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|7 : ATATT-ACGATTTT-------GCG-ATAAAGTG---AACTATC----G-GAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAGGAAGAAGT-GAA-T----TGCTAA-T-A-ATA-ATTTCTTA-C--T---GAAATTTTTAC-ATGTA-T-TATT--TTA-CTT-TT---TGTTTA----G--CCA-TAG--T-AAAA-T-AA------G-ACTAAAAGA-GAAC-TC-TAA-TA-TGT-ATGAGCATTTT-CC-CTA------CGATA-G-ACG-TTCAA
gi|8 : TATT-AC-ATTTG--------CGCATAA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-TAT--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAGG-AAAAGT-GAA-T----GGT--ATT-A-ATA-A-TTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ATGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCA-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACGATTCAAcgtaaacattaatgacgcatttt
gi|9 : ACATT-AA-ATTTG-------GCGCAGGA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AA-A-GTGATG-CA-AAT--ACTAAG---AAAG--GAATT----TGT--A-TAA-ATA-ATTTC--ATT-GT---GAAA-TGTTAC-ACGT--TACTAT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAATAA-AA------G-ACTAAATGA-G-GC-AC-TAC-T--T-T-ATGA-CATTTT-CC-C-A------CGATATA-Aacgaaacattatgacgcaattttaca
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222222 111111 11111111 1 111111
lowQualScore : 55 77 5 5 5 5 5 5 5 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 3 88888888 77 555 3 7777 3 3 6 44 3 3 3 3 77 44 0 88 4 33 8888888 44 3 3 3 3 55 3 222222 3 3 3 44 6 3 555 3 7777 55 3 88 55 999 99999999 2 3 3 6666 3 3 0 3 3 55 3 444444 4 4
lowQualScore : .. .. . . . . . . . . ................................................................................................................................... . . ........ .. ... . .... . . . .. . . . . .. .. . .. . .. ....... .. . . . . .. . ...... . . . .. . . ... . .... .. . .. .. ... ........ . . . .... . . . . . .. . ...... . .
lowQualScore : 77 99 7 7 7 0 7 7 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 3 33333333 99 888 3 1111 3 3 7 66 3 3 3 3 99 66 4 22 5 88 4444444 66 3 6 6 6 00 6 333333 6 3 3 66 7 6 888 6 7777 00 6 66 77 555 11111111 8 6 6 5555 6 6 9 6 6 00 6 111111 0 4
consensus : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTG-------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
Reference ( family-504 ) : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTG-------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
gi|1 : CCCAACACTTTT--C--AAAGA-ATATAAA-T-AAATG--AGAATTCTACT-ATTCC
gi|1 : GTAGATAT--AC-AT----------GTGCATAAA-TG---AA-TATC----GAGAT-T-T-A--G-AGTA-GTGATGAC--AATTTACTAAGGAAAA-GT-GAA-TCTGATAT--A-C-A-ATA-ATTTC--A-C-GT----AAC-TTTAAC-ATGTA-TACATA--TT--TCT-TT---TG--TA----G--CCA-TAG--TAAAAT-A-AA------GCACTAAAAAG-G-AC-TCTTAA-TA-T-TAATGA-CATTT---C-CTA------CGATATGCACG--TCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatatacatgtgcataaatgaatatcgagatttagagtagtgatgacaatttactaaggaaaagtgaatctgatatacaataatttcacgtaactttaacatgtatacatatttcttttgtagccatagtaaaataaagcactaaaaaggactcttaatattaatgacatttcctacgatatgcacgtcaacgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|10 : cccaacacttttcaaagaatataaataaatgagaattctactattccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATT-AC-ATTTG--------CGCATGA--TA---AG-TATC----AAAAA-T-A-C--G-AG-A-TTGATA-C--AAT--A--AAAACAAAAGA-GAT-A----TGT--A-A-A-ATA-ATTTC--A-C-CG---GAAA-TATTAC-TCATA-TACATT--TTA-Tcgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|11 : TAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCTATT---TG-TAA----GCCCCG-TGGGCT--AAT-A-AA------GAACGAAAAGA-G-AC-TC-TAACTA-TGT-ATGA-CATATT-CT-CTAGACCTCTGACATG-ATA-TTCGAt
gi|12 : -ATTTG--------TGCATGA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AC-A-GTGATG-C--AAT--AATAAAGAACA-GT-GAT-A----TGT--G-T-A-ATA-ATTTT--A-C-AG---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---
gi|13 : TAGATATT-AC-ATTTGCGCATAAGCGCATGC--TGGGGAA-TATCACTCGAGAAAT-TAT--GCAG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAG----AAGC--AA-T----TGT--A-
gi|14 : ---TG-TTA----G--ACG-TAG--T-AAAT-----------------AGAGA-G-AC-----AC-TA-T-T-GTGA-CATTTT-CC-TT-------CGATATG-ACG-TT
gi|15 : CCCAACACTTTT--CCCAAAAACATATAAA-T-AA-CG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCa
gi|16 : gcaCCAACACTTTT--C---AAAA-ATATAAATT-AAATG-CAGAA-TCTA-TGATTCC
gi|2 : CCCCACACTTTTTTC--AAAAA--TATGAA-TTAAATGGCAGAA-TCTA-T-ATTCCa
gi|2 : ctGTAGATATT-AC-ATTTGA------GC-CATGA--TG---AA-TATC----GATAG-T-T-TCTG-AG-A-GTG----C--AAT--A-TAAGGGAAAAGTCGAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-CGGT---GAAA-TTTTACAACGTA-TACATTTATTC-TTT-TT---TG-TTA-------CCGTTAGT-T-AAAT-A-AA--------ATTAAAAGA-G-AC-TC-T-A-TA-TCT-ATGA-CATTTT-CCTTTA------CGATATG-ACG-TTaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagatattacatttgagccatgatgaatatcgatagtttctgagagtgcaatataagggaaaagtcgaattgtataataatttcacggtgaaattttacaacgtatacatttattcttttttgttaccgttagttaaataaaattaaaagagactctatatctatgacattttcctttacgatatgacgttaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|3 : ctccccacacttttttcaaaaatatgaattaaatggcagaatctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTAGATATTTAC-ATTTG--------CGCATGA--TG---AA-TGTC----AA-AA-T-T-T--G-AG-AAGTGCTG-CCAAAT--ACTAAGGAATA-GT-GA-------TGT--A-T-ACATA-ATTCC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTAATACATT--TAT-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T--AAT-A-AA----------TAAAAAA-G-AG-AC-TAA-TA-T-T-ATGA-CAATTT--C-CTAC-----CGATAT----G-TTCAAaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|4 : tccatcactttcaaaaattaaaaataaaaatgcacgaaatcctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCCAACACTTTT--C--AAAA--ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCcgca
gi|4 : aGTAGATATT-AC-ATTTG--------CGCATAA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAG--AAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-AAA-ATTTC--A-C-GTTG-AAAA-TTTTAC-ATGTA-TACATT--TTA-TCT-TTACATT-TTATATTG---CG-TTG--T-CAAC-ACAATTTTCTG-AATAAAAAAGG-ACGT----G-TG-T-T-GTGA-CAATTT----ATA------CGATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatattacatttgcgcataatgaatatcgagaatttgagagtgatgaaatactaagaaaagtgaattgtataaaaatttcacgttgaaaattttacatgtatacattttatctttacattttatattgcgttgtcaacacaattttctgaataaaaaaggacgtgtgttgtgacaatttatacgataattgaaa
gi|5 : acccaacacttttcaaaaatataaataaatgcagaatctatattccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCAACACTTTTATC--AAAAA-A---AGA-T-AA-TG-CAGAA-TCTA-T-AGTCCattgaaa
gi|5 : ATT-AC-ATT---------GCGCATAA--TG---AA-TATC-----AGAA-TCT-T--G-AG-A-G--ATG-C--AAT--ACAAAGGAAAAGGG-AAG-T----TGT----T-A-AAA-G--TC--A-CAGTTAGAAAA-GTGTAC-ACAAA-TACATG--TTATTCT-TT---TG-TTA----G--TCG--AG--T-AAAT---AA------G-A-TAAAAGA-G-AC-TA-TCC-TATT-T-AT-A-CATTTTCCC-CTA------CGA-ATG-ACG-TGCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattacattgcgcataatgaatatcagaatcttgagagatgcaatacaaaggaaaagggaagttgttaaaagtcacagttagaaaagtgtacacaaatacatgttattcttttgttagtcgagtaaataagataaaagagactatcctatttatacattttcccctacgaatgacgtgcaagcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|6 : ccaacacttttatcaaaaaaagataatgcagaatctatagtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaCCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATGAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTGT------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AA---ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATATATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTAATCT-TT---TG-TAA----G--CCG-TGG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAAgcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|7 : ATATT-ACGATTTT-------GCG-ATAAAGTG---AACTATC----G-GAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAGGAAGAAGT-GAA-T----TGCTAA-T-A-ATA-ATTTCTTA-C--T---GAAATTTTTAC-ATGTA-T-TATT--TTA-CTT-TT---TGTTTA----G--CCA-TAG--T-AAAA-T-AA------G-ACTAAAAGA-GAAC-TC-TAA-TA-TGT-ATGAGCATTTT-CC-CTA------CGATA-G-ACG-TTCAA
gi|8 : TATT-AC-ATTTG--------CGCATAA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-TAT--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAGG-AAAAGT-GAA-T----GGT--ATT-A-ATA-A-TTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ATGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCA-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACGATTCAAcgtaaacattaatgacgcatttt
gi|9 : ACATT-AA-ATTTG-------GCGCAGGA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AA-A-GTGATG-CA-AAT--ACTAAG---AAAG--GAATT----TGT--A-TAA-ATA-ATTTC--ATT-GT---GAAA-TGTTAC-ACGT--TACTAT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAATAA-AA------G-ACTAAATGA-G-GC-AC-TAC-T--T-T-ATGA-CATTTT-CC-C-A------CGATATA-Aacgaaacattatgacgcaattttaca
blockSeqs : TT CC C T T A G . . G T G CGCATAAG AG GGG C ACTC A C A CT C . A . CA . AC A TC ATT TA T A C T TT T AGTTAG T A A TA T A ACA T TATT CC T GC A AC TTTTCTG C G A TC C T G . G CC T GACCTC . A
blockSeqs : AT . . . . A . . . . . . AG . . . . . . A . . . . . A . GA A A TA . . . . . . . GTTG . . . . A . . . . . . T A AA GA T . . TC . . C . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . GG A T TA . . . . . . . GGT . . . . . . . . . . . . C A G A . . AC . . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . GA A C AT . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . A A G C . . GT . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . GA G T AT . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . A A G C . . TA . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . GA A T AT . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . A A G C . . TC . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GA A G GT . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . A T G C . . TC . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G A T AT . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . A A . . . . TC . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T AT . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T AT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : G******* ** ** AT***** A* G******* TC** C*
originalCons : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTG-------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
finalCons : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTGG-------CGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAAT-----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--TA-AAT-A-AAG-------ACTAAAAGA-G-ACTC--TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTTC-C-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222222 111111 11111111 1 111111
lowQualScore : 55 77 5 5 5 5 5 5 5 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 3 88888888 77 555 3 7777 3 3 6 44 3 3 3 3 77 44 0 88 4 33 8888888 44 3 3 3 3 55 3 222222 3 3 3 44 6 3 555 3 7777 55 3 88 55 999 99999999 2 3 3 6666 3 3 0 3 3 55 3 444444 4 4
lowQualScore : .. .. . . . . . . . . ................................................................................................................................... . . ........ .. ... . .... . . . .. . . . . .. .. . .. . .. ....... .. . . . . .. . ...... . . . .. . . ... . .... .. . .. .. ... ........ . . . .... . . . . . .. . ...... . .
lowQualScore : 77 99 7 7 7 0 7 7 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 3 33333333 99 888 3 1111 3 3 7 66 3 3 3 3 99 66 4 22 5 88 4444444 66 3 6 6 6 00 6 333333 6 3 3 66 7 6 888 6 7777 00 6 66 77 555 11111111 8 6 6 5555 6 6 9 6 6 00 6 111111 0 4
consensus : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTG-------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
Reference ( family-504 ) : CCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTG-------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAA
gi|1 : CCCAACACTTTT--C--AAAGA-ATATAAA-T-AAATG--AGAATTCTACT-ATTCC
gi|1 : GTAGATAT--AC-AT----------GTGCATAAA-TG---AA-TATC----GAGAT-T-T-A--G-AGTA-GTGATGAC--AATTTACTAAGGAAAA-GT-GAA-TCTGATAT--A-C-A-ATA-ATTTC--A-C-GT----AAC-TTTAAC-ATGTA-TACATA--TT--TCT-TT---TG--TA----G--CCA-TAG--TAAAAT-A-AA------GCACTAAAAAG-G-AC-TCTTAA-TA-T-TAATGA-CATTT---C-CTA------CGATATGCACG--TCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatatacatgtgcataaatgaatatcgagatttagagtagtgatgacaatttactaaggaaaagtgaatctgatatacaataatttcacgtaactttaacatgtatacatatttcttttgtagccatagtaaaataaagcactaaaaaggactcttaatattaatgacatttcctacgatatgcacgtcaacgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|10 : cccaacacttttcaaagaatataaataaatgagaattctactattccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATT-AC-ATTTG--------CGCATGA--TA---AG-TATC----AAAAA-T-A-C--G-AG-A-TTGATA-C--AAT--A--AAAACAAAAGA-GAT-A----TGT--A-A-A-ATA-ATTTC--A-C-CG---GAAA-TATTAC-TCATA-TACATT--TTA-Tcgtaaaaaatatgacgcaatatc
gi|11 : TAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCTATT---TG-TAA----GCCCCG-TGGGCT--AAT-A-AA------GAACGAAAAGA-G-AC-TC-TAACTA-TGT-ATGA-CATATT-CT-CTAGACCTCTGACATG-ATA-TTCGAt
gi|12 : -ATTTG--------TGCATGA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AC-A-GTGATG-C--AAT--AATAAAGAACA-GT-GAT-A----TGT--G-T-A-ATA-ATTTT--A-C-AG---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---
gi|13 : TAGATATT-AC-ATTTGCGCATAAGCGCATGC--TGGGGAA-TATCACTCGAGAAAT-TAT--GCAG-A-GTGATG-C--AAT--ACTAAG----AAGC--AA-T----TGT--A-
gi|14 : ---TG-TTA----G--ACG-TAG--T-AAAT-----------------AGAGA-G-AC-----AC-TA-T-T-GTGA-CATTTT-CC-TT-------CGATATG-ACG-TT
gi|15 : CCCAACACTTTT--CCCAAAAACATATAAA-T-AA-CG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCa
gi|16 : gcaCCAACACTTTT--C---AAAA-ATATAAATT-AAATG-CAGAA-TCTA-TGATTCC
gi|2 : CCCCACACTTTTTTC--AAAAA--TATGAA-TTAAATGGCAGAA-TCTA-T-ATTCCa
gi|2 : ctGTAGATATT-AC-ATTTGA------GC-CATGA--TG---AA-TATC----GATAG-T-T-TCTG-AG-A-GTG----C--AAT--A-TAAGGGAAAAGTCGAA-T----TGT--A-T-A-ATA-ATTTC--A-CGGT---GAAA-TTTTACAACGTA-TACATTTATTC-TTT-TT---TG-TTA-------CCGTTAGT-T-AAAT-A-AA--------ATTAAAAGA-G-AC-TC-T-A-TA-TCT-ATGA-CATTTT-CCTTTA------CGATATG-ACG-TTaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagatattacatttgagccatgatgaatatcgatagtttctgagagtgcaatataagggaaaagtcgaattgtataataatttcacggtgaaattttacaacgtatacatttattcttttttgttaccgttagttaaataaaattaaaagagactctatatctatgacattttcctttacgatatgacgttaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|3 : ctccccacacttttttcaaaaatatgaattaaatggcagaatctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTAGATATTTAC-ATTTG--------CGCATGA--TG---AA-TGTC----AA-AA-T-T-T--G-AG-AAGTGCTG-CCAAAT--ACTAAGGAATA-GT-GA-------TGT--A-T-ACATA-ATTCC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTAATACATT--TAT-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T--AAT-A-AA----------TAAAAAA-G-AG-AC-TAA-TA-T-T-ATGA-CAATTT--C-CTAC-----CGATAT----G-TTCAAaacgtagcataacaatatgacgcaattttgca
gi|4 : tccatcactttcaaaaattaaaaataaaaatgcacgaaatcctatattccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCCAACACTTTT--C--AAAA--ATATAAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCcgca
gi|4 : aGTAGATATT-AC-ATTTG--------CGCATAA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAG--AAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-AAA-ATTTC--A-C-GTTG-AAAA-TTTTAC-ATGTA-TACATT--TTA-TCT-TTACATT-TTATATTG---CG-TTG--T-CAAC-ACAATTTTCTG-AATAAAAAAGG-ACGT----G-TG-T-T-GTGA-CAATTT----ATA------CGATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtagatattacatttgcgcataatgaatatcgagaatttgagagtgatgaaatactaagaaaagtgaattgtataaaaatttcacgttgaaaattttacatgtatacattttatctttacattttatattgcgttgtcaacacaattttctgaataaaaaaggacgtgtgttgtgacaatttatacgataattgaaa
gi|5 : acccaacacttttcaaaaatataaataaatgcagaatctatattccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCAACACTTTTATC--AAAAA-A---AGA-T-AA-TG-CAGAA-TCTA-T-AGTCCattgaaa
gi|5 : ATT-AC-ATT---------GCGCATAA--TG---AA-TATC-----AGAA-TCT-T--G-AG-A-G--ATG-C--AAT--ACAAAGGAAAAGGG-AAG-T----TGT----T-A-AAA-G--TC--A-CAGTTAGAAAA-GTGTAC-ACAAA-TACATG--TTATTCT-TT---TG-TTA----G--TCG--AG--T-AAAT---AA------G-A-TAAAAGA-G-AC-TA-TCC-TATT-T-AT-A-CATTTTCCC-CTA------CGA-ATG-ACG-TGCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattacattgcgcataatgaatatcagaatcttgagagatgcaatacaaaggaaaagggaagttgttaaaagtcacagttagaaaagtgtacacaaatacatgttattcttttgttagtcgagtaaataagataaaagagactatcctatttatacattttcccctacgaatgacgtgcaagcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|6 : ccaacacttttatcaaaaaaagataatgcagaatctatagtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaCCCAACACTTTT--C--AAAAA-ATATGAA-T-AAATG-CAGAA-TCTA-T-ATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATATT-AC-ATTTGT------GCGCATGA--TG---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-C--AA---ACTAAGGAAAAAGT-GAA-T----TGT--A-T-A-ATATATTTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ACGTA-TACATT--TTAATCT-TT---TG-TAA----G--CCG-TGG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACG-TTCAAgcttacatgtattgacgcacaaattttgc
gi|7 : ATATT-ACGATTTT-------GCG-ATAAAGTG---AACTATC----G-GAA-T-T-T--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAGGAAGAAGT-GAA-T----TGCTAA-T-A-ATA-ATTTCTTA-C--T---GAAATTTTTAC-ATGTA-T-TATT--TTA-CTT-TT---TGTTTA----G--CCA-TAG--T-AAAA-T-AA------G-ACTAAAAGA-GAAC-TC-TAA-TA-TGT-ATGAGCATTTT-CC-CTA------CGATA-G-ACG-TTCAA
gi|8 : TATT-AC-ATTTG--------CGCATAA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-TAT--G-AG-A-GTGATG-A--AAT--ACTAAGG-AAAAGT-GAA-T----GGT--ATT-A-ATA-A-TTC--A-C-GT---GAAA-TTTTAC-ATGTA-TACATT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCA-TAG--T-AAAT-A-AA------G-ACTAAAAGA-G-AC-TC-TAA-TA-T-T-ATGA-CATTTT-CC-CTA------CGATATG-ACGATTCAAcgtaaacattaatgacgcatttt
gi|9 : ACATT-AA-ATTTG-------GCGCAGGA--TA---AA-TATC----GAGAA-T-T-T--G-AA-A-GTGATG-CA-AAT--ACTAAG---AAAG--GAATT----TGT--A-TAA-ATA-ATTTC--ATT-GT---GAAA-TGTTAC-ACGT--TACTAT--TTA-TCT-TT---TG-TTA----G--CCG-TAG--T-AAATAA-AA------G-ACTAAATGA-G-GC-AC-TAC-T--T-T-ATGA-CATTTT-CC-C-A------CGATATA-Aacgaaacattatgacgcaattttaca