lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 3333 111111 11111 111 22222 11111111 111 111 11111 33 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333 111111111 11 111 111111 44444444444444 1 11 33333333333 11111111 11111 111111 11 1111 11111 2222222222 11111 11 222222 11111 11111 555555555555555555555555555555 111111 1111 1111111 222 222 1 333333333333333 111 3333 1 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 111 1111 11 11 11111 111111 11111 33333333333333333333 1 55555555 11 111111 11 4444444444444444 11111 11111 1 1111111 1111 333333 2222222 11111 1 1111 111 33
lowQualScore : 8 66 3 4 55 55 4 7777 4 3 3 000000 3 55555 3 3 6 44 44 44 444 3 3 44444 66 33333333 3 333 4 777 3 4 5 55 00000 33 777 99 55 4 4 0 55 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 88 55 88 3 3 7 0000 7777 555555555 7 22 333 3 666 000000 55 2 44444444444444 777 4 4 55 55 0 55 4 55 8888 11 4 4 55555555555 777 8 4 4 66 4 66666666 66 4 8 33333 4 4 444444 44 4 66 4 777 4 1111 8 11111 4 4444444444 99999 4 4 77 66 4 66 333333 66 4 9999 00000 4 4 00000 4 4 777 777777777777777777777777777777 555555 5 5 0000 0 5 6666666 5 5 5 444 66 5 66 5 55 777 0 7 5 66 555555555555555 111 6 6666 6 3 3 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 4 666 1111 4 4 4 11 00 4 1 1 4 777 4 4 66 4 4 4 33333 4 4 777 8 4 222222 8 99999 11111 99999999999999999999 4 4 7 66 4 5 0 5 11111111 33 555555 5 5 77 5 0000000000000000 888 6 5 11111 11111 1 4444444 5 5 5 2222 77 77 555555 5 7777777 777 33333 5 5 7 77 99 4444 666 6 77
lowQualScore : . .. . . .. .. . .... . . . ...... . ..... . . . .. .. .. ... . . ..... .. ........ . ... . ... . . . .. ..... .. ... .. .. . . . .. . ...................................................................................... ... .. .. .. . . . .... .... ......... . .. ... . ... ...... .. . .............. ... . . .. .. . .. . .. .... .. . . ........... ... . . . .. . ........ .. . . ..... . . ...... .. . .. . ... . .... . ..... . .......... ..... . . .. .. . .. ...... .. . .... ..... . . ..... . . ... .............................. ...... . . .... . . ....... . . . ... .. . .. . .. ... . . . .. ............... ... . .... . . . .................................................................................................................................................................. .. . ... .... . . . .. .. . . . . ... . . .. . . . ..... . . ... . . ...... . ..... ..... .................... . . . .. . . . . ........ .. ...... . . .. . ................ ... . . ..... ..... . ....... . . . .... .. .. ...... . ....... ... ..... . . . .. .. .... ... . ..
lowQualScore : 9 11 8 0 55 55 0 0000 0 6 6 555555 6 55555 3 3 7 66 66 66 555 6 6 11111 99 22222222 6 888 4 666 6 0 0 55 00000 55 000 55 55 0 0 9 55 4 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444 66 00 66 6 6 3 5555 7777 666666666 3 33 666 6 444 444444 00 8 99999999999999 000 0 0 55 00 9 55 0 55 5555 33 4 4 77777777777 888 9 4 4 11 4 11111111 11 4 9 55555 4 4 000000 77 4 11 4 000 4 7777 9 11111 4 3333333333 11111 4 4 00 11 4 11 000000 11 4 4444 77777 4 4 33333 4 4 888 444444444444444444444444444444 444444 0 0 6666 2 0 2222222 0 0 0 000 99 0 99 0 11 999 0 1 0 99 222222222222222 777 7 2222 7 3 3 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 66 4 000 4444 4 4 4 77 66 4 9 9 4 888 4 4 11 4 4 4 88888 4 4 888 9 4 888888 9 44444 11111 44444444444444444444 4 4 8 11 4 0 2 0 55555555 88 000000 0 0 55 0 9999999999999999 888 5 0 00000 00000 4 7777777 7 7 7 1111 99 99 777777 7 9999999 999 44444 7 7 1 99 22 2222 555 7 22
consensus : TTCAAT-AGAGTTCAA--AA-TAT-A--TGTC--CA-TGC----AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TAT-CA-----TTTCG-TTTT--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-NTACAG-TTT-AGT--CC-----TGTG-CTG---CGT--CC--A-T-TAACA--AGGGATAT----TAT-------A-TNTT-NT--------C-------------GT-----T--A----TAT--ANCC----TT-------GN--TG---CC--TTG--C--G-T-G-TGCT-A--A----AA-----CC--A-TA--TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----G--AGCAAG-ACCCAAAC---GGTT---CT-T-GTT--CCT--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TG---A----TA---CG-C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAAGA-C-T-AG---AAGTGNTGTT-GT--G-ATG-A-A-GAGACAA-G--TC-GAAATT-----TAA-AGG---A------AAAAA---T-GT-A-TC-CG--TG-A--AAG-ATT--CGA--A-C----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C----A---AC--G--TT-----G--N----ACATT---T--AAA-G-T----CCACA-G-------C-CT-TAT-CC--GT--T-AC--G-CC-ACG-C-CGC-ACATTC-AA--AC-AC--CG---CA-GTGA---AA-CT-TA-AC-G-TGCAG-ATGAAGTTGAAAG--G-A-----AGTAAC-GAAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATT--C-C-C-TGT-A--TT-T-T-GAG-GCTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--A--AC-TCAA-TT---TAT-TTT-G------ACT-AATT---C-TTG-----TCA-A-T-AC-----ACACC--T-TTT-AGACTTATTT--T-CTT-ATATT-TT-----GGAATA--AAG-----A-C-AA-AAAG-TT--C-ACT-----G---TT---TTACT-A-T---AT--NT-ATG-AATAACT-T-----T-AT-T-TTA----CCGATC--T--TTC-----ATGC-A-C-----ACAC-TTT--AG-GGAAA-T-CACC--AT--GA----TAC--AATGCAACAC-CTTC-TTTTA
Reference ( gi|3 ) : TTCAAT-AGAGTTCAA--AAATAT-A--TGTC--CA-TGC---CAC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TAT-CA-----TTTCA-TTTT--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAG-TTT-AGT--CC-----TGT--CTG---TGT--CC--A-T-TAACA--AGGGATAT----TAT-------A-TATT-AT--------A-------------AT-----T--A----TAT--ATTT----TT-------TT--TG---CC--TTG--C--G-T-G-TGCT----A----AA-----CC--A-TA--TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----G--AGCAAT-ATCCAAAC---TGTT---CT-T-GTT--CCT--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-T----A----TA---CG-C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAAGA-C-T-AG---AAGTGTTGTT-GT--G-ATG-A-A-GAGACAA-G--TC-GAAATT-----TAA-AGG---A------AAAAA---T-GT-A-TC-TG--TG-A--AAG-A-T--CGA--A-C----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C----A---AC--G--TT-----G--T----ACATT---T--AAA-G-T----CCACA-G-------C-CT-TAT-CA--AT--T-AT--G-CC-ACGAC-CGC-ACGTTC-AA--AC-AG--CG---CA-GTGA---AA-CT-GC-AC-G-TGCAG-ATGAAGTTGAAAG--G-G-----AGTAACTGAAAGTC--GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATT--C-C-T-TGT-A--TT-T-T-GAG-TCTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--A--AC-TCAA-TT---TAT-TTT-G------ACT-AATT---C-TTG-----TC--A-T-AC-----ATA-C--T-TTT-AGACTTA-TT--T-CTT-ATATT-TT-----G--ATA--AAG-----A-C-AG-AAAG-TT--C-ACT-----G---TT---TTACT-A-T---AT--CT-ATG-AATAACT-T-----T-AT-T-TTA----CCGATC--T--TT------ATGC-A-C-----ACAC-TTT--AG-GGAAA-T-CA-C--AT--GA----TAC--AATGCAACAC-CTTCATTTTAG
gi|6 : TTCTAT-AGAGTTTCACCAATTATGA--TGTCTCCA-TATTTGCAC-CTGAAAA-TCT-TT------GAT-ATTACGAATTAG-CTAA--T--TTGT-ACCTGGA---TA-TATTCAAT---TTTCG-TTTA--------GAATA-A-TATCATGTTCAATATTTA-TTACAG-TTT-AGTTCCC-----TGT--GTGGGATGT--CC--A-T-TAACA---GGGATAT----TAT-------AGTATTTGT--------AT------------AT-----C--A----TAT--ATTT----TT-------TT---G---CC--TTG--C--G-T-G-TGCT----A----CA-----AC--A-TAG-TCACAG---AA-G-G---ACATGGA----G--AG-AAT-ACCCAAAG----GTT---CTGT-TTT--CCT--ATATGG--AC-A--GT----GTG-CGAT-G-TGATAA----TG---TT-C-A-TGAA--TTTGA--------AT--AA-AACGATTTTTTTAAAAAAGA-C-T-AG---ATGTGATGTT-GT--G-ATG-ATA-GAGACAA-G--TC-GAAATT-----TAA-A-G---A------AAAAA---T-TTAA-TCAGG--TG-A--A---------GA--A-T----TCG-------------------------AA---C----A---TA--G--TT-----A--TGGAAGCATT---T--AAA-G-C----C--CT-G-------C-CT-TAT-CC--ATACT-ATGAG-CC--CGAC-GGCTGCCTTC-AAGTAT-AT--CGAGACA-GTGA---AA-CT-GTAACAG-TGCAGTATGAAGTTGAAAG--GAG-----AGTTAC-GAAA--T--GTGT
gi|1 : gTTCAATTAGAGTCCAA--A--TAT-A---GTC--CA-TAC----ACGCTGAAAA-TAT-TGTCAGACAAT-TA-AC-TATT-G-C-A---T--TTGC-AAATGGAT-ATAATAG-CA-----TTTCG-TTTTTTACATGTAGATATA-CAT---GTTCAATATTTA-TAACAG-TTT-A-T--CC-----TGTG-CTG---CGTTCCC--A-T-TAACA--AGGGAGAT----TTT-------C-TATC-TT--------C-------------CT-----TCGAGC--TAT--AGCC----TT-------GT---G---CCG-TTG--CC-G-T-G-TGCT----A----AA-----AA--A-CAGCTTACAG---AA-GCG---ACAAG-A----G--A-CAAG-AACTAACG---GGTT---CT-T-G-T--CCT--ATA-GG--AC-A--------GTGACG-T-G-TG---A----TA---CGCC-A-TAAA--TT-GT--------AT--AA-AAC-ATTTTA---AAAAAGA-C-T------AAGTGT--TT-GT--G-ATG---A-GAGAC-A-GCTTC-GAAATT-----T---AGG---A------AAATA---T-GT-A-TC-CG--TG-C--AAG-ATT--CGA--A-C----TCGAG--TCG-T-T--------AAAA-ATA---C----A-------G--TT-----G--------GAGT---T--AAA-G-T----CCACAGG-------C-CTGTAT-CC--AT--TAAC--G-CC-ACG-C-CGC-ACATC---A--AC-AGACCG---TATGCGA---AACCT-TA-AC-GAGGCAG-ATGAAAGTGAAGG--A-GGAATTAGTAACAGAAA-TCG-GTGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattcgcttgttttgatctgaaaaagtcacataatcgcttcctgcattgtttaactcaatttaattttactaaattcttgtcaatatcatcacccttatttt
gi|16 : tTTCAAT-ATAGTTCAA--AA-CAT-A--TGTC--CA-TGC----AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-A--AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ACA-TAT-CA-----GTTCG-TTTT--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTT--ATACAG-TTT-AGT--CC-----TGTA-CTA---CGT--CC--A-T-T-------------T----TTT-------A-TCTT-CC-----------------------T-----T--CGGCTTAT--AGCC----TT-------GA--TG---CC--TTG--C--G-T-G-TGCT----A----AA---------A--A--TCACA--------C------------------------------AAC---GGTC---CT-T-GTT--CCTGAATA-GG--AC-A--GT----Gcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcggggatctcccctgtattttgaggctaaaatgcaataaatcgcttctctgcatgatttcaatacttattttatgtttggactaaagtcttgtcaataacacaccttttagacttattttcttaatattttggaatcaagacaaaaaagttctattgggttttttctatatattgaataactcttattttatcgatctttcatcgcatacacaactttaggaaatcacacaatgcttaatgaacacttcttatataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|19 : TTCAATTAGAGATCAA--AA-TAT-A--TGTC--CA-TGC----AC-CTGGAAC-TAT-TG------AAT-AC-AT-CCTC-G-C-AA--T--ATAG-CACTGGA--
gi|10 : TCAAT-AGAGTTCAA--AAATAT-AATTGTC--CAATGC----AC-CTGAAAAATAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-GGC-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TAT-CA-----TTTCAGTTTT--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTATTTACAG-TTT-AGT--CC-----TGTG-CTG---TGT--CCCAA-T-TAACA--AGGGATAT----TAT-------A-TATT-TT--------ATCTTCCTTCGGCTTT-----T--A----TAG--GCCC----TT-------GA--TG---CT--TTG--CCGA-TAG-TGCTAAAAA----AA-----CC--A-TAT-TCACAGA--AA-GCG---ACATG-A----G--AGCAA--ACCC-AAC---GGTT---CT-TGGTT--CCT--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-T-G-TG---A----TA---CG-CTA-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-A-TTT----AAAAAGA-C-T-AGTCTAAGTGGTGTT-GTTGA-ATG-A-A-GAGACAA-G--TC-GAtccac
gi|15 : TCAAT-AGAGTTCAA--AA-TAT-A--TGTC--CA-CGC----AC-CTGGAAA-TAT-AG------AAT-A--AA-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TAT-CA-----TTTCG-TTTA--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTT--ATACAG-TTTCAGT--CC-----TGTG-CTG---CGT--CC--A-T-TAACA--AGGGAGATACAGTGT-------A-TTTT-ATCTTCCTTCG-------------AC-----T-------TAT--AGCC----TT-------GA--TG---CC--CCG--C--G-C-G-AGCTAA--A----AA-----CC--A-CA--TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----G--AGCAA
gi|4 : CAAT-AGATTTCAG--AA-TAT-A--TGTC--CA-TGC----AC-CT-AAAA-TAT-TG------AAT-AT-ACTAATT-G-C-AA--T--T-GT-AACTGGA--ATA-TAT-CA-----TTTCG-TT----------GAATATA-CAT---GTTCAATATTTA--TACAG-TTT-AGT--CC-----TGTG-CTG---TGT--C---A-T-TA-CA--AGGGATAT-----AT-------A-TATT--T--------C-------------ATCTTCCT--AAGCTTAT--AGCT----TT-------GA--TG---CTCGTTG--C--G-T-G-TGCT----A----AAAA---CCTAA-TA--TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----G--AGCA---------------------CT-T-GTT--CCT--ATA-GG---C-A--GT----GT-GCG-T-G-TG---A----TA---CG-C-A-TAA----T-GA--------ATTAAA-AAC-ATTTT------AAAGA-CGT-AG----AGTG-TGTT-GT--G-ATG-A-A-GAGACAACG--TC-GAAATT-----TAA-AGG---G------AAAAAAATT-GT-A-TC-CG--TG-A--AAG-ATT--CGA--A-C----TCG-G--TCA-T-TT----AA-AAAA-AAC---C----A---AA--G--TT-----G--G----ACATT---T--AAA-T-T----CCACA-G-------C-CT-TAT-CC--AT--T-AT--G-CC-ACGG--CGC-ACATTC-AA--AC-AC--CA---CA-AGGA---AA-CT-TA-AC-G-TGCAGAATGAAGTTGAAAGGAG-A-----AGTAAC-GAAA-TC--GTAT
gi|11 : cAAT-AGAGTT-AA--AAATAT-A--TGTC--CA-TG----CAC-CTGAAAA-TAT-TG-------AT-A--AC-TATT-G-C-AATTT--TTGC-AACC-GA--ATA-TAT-CAAT---TTCCG-TTTT--------AAATATAGCAT--TGTTC-ATAACTT-ATACAGTTTT-A----CC-----TGTG-CTG---TGT--CC--A-T-TAACA--AGGGA-------GAT-------A-TTTT-AT--------C-------------GT-----C--C----T-TCGACTT----TTAAAAAC-TC--TGATACC--TTGGCC--G-T-G-TACTAA--A----AA-----CC--A-TA--TCACAG---AA-GCG---ACATG-ATCTCG--AGTAAG-AACCCAAC---GGTTTTCTT-T-GTT--CCT--ATA-----------------GTGGTG-T-G-T----AGTGGTA---CGCC-A-TAAA--TT-GA--------AT---A-AAC-ATTTT----cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattccctatatttgagatctaaaaatcacataatcgcttcctgtatgatttcaactcaactttattttgactaatattgtcaatacacacctttcaaacttattttcttatattttgataaaacaaaaagttcaactgtttttatatctatgaataactttattttaccgatctttcatgcaacacctttagggaaatcaccatgatacatgcaacaccttcttta
gi|2 : tgT-AGA-TTCAA--AA-T-T-A--TGTC--CA-TGC----AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-A-TT-G-C-AA--T--TTGTTAACTGGA---TA-TAT-CA-----TTTCG-TTTT--------AGATATA-CAT--TGTTCAAT-TTTA--T-CAG-TTT-ATC--CC-----TGTA-CTG---T-T--CC--AGTGTAACA--AGGGATGT----TAT-------A-T--T-AT-----------------------T-----T--A----CTT--CTTTCGGCTTATAGGCCTTGATG---CC--TTG--C--CCT-GCTGCTTAA-A----AG-----CC--ACTA--TCACAGG--AA-GCG---ACATG------G--AGCAAGGACCCAAAC---GGTT---CT-T-GTT--CCT--ATAAGG--AC-A--GT----G-GGCG-T-GATG---A----TA---CG-C-AGTAAA--T--GA--------AT--ATTAAC-AATT-----AAAAAGA---T-AG---AAGTGT-GTT-GT--GCATG-A-AAGAGACAA-G--TCGGAAATT-----TAA-GGG---A------AAAAA-----GT-A-TC-CG--TG-A--AAA-T-T--CG---A-C----TC--G--TCGCT-TT---AAA-AAAA-AAA---CAAAAA---ACCAG--TTTTTTGG--G----ACATTAAAC--AAC-GCT----CCA-A-G-------C-CT-TATCCC--AT--T-AT--G-CC-ACG-C-CGCAACATTCAAA--AC-AC--CC---TT-G-GA---AA-CT-TA-AC-GCTGCAG-ATGAAGTTGAAAG--GAA-----AGTAAC-GAAA
gi|20 : taatTAT-A--TGTC--CA-TGC----AC-CTGAAAA-T------------------------T-G-C-AA--T-----------------TA-TAT-CA-----TTTCG-TTTT--------CGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAG-TTtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggttcccctgttattttgagactaaaaaagcacataaattcgcttcctgcatgatttttaactcaaattattttgacaattccttgtcaatacacaccttttagacttattttcttagattttggaataaagacaaaagttccactggtgtactatatctgatggaaaacttttattgttacagtcttcatgcaaacatttaggaaatcacgcatgatacaatgcaacaccttctttat
gi|8 : A-TATATA------AATGAT--T-AATT-A-T-GA--TAGCTGT-AACTGGG---CA-TAC-CAAA---TTCGA-GTAT--------CGGTATA-CAT--------AT-TTTA-TTACAG-TTT-AGT--TT-----TGTTGCTG---TGTA-CC--A---TAAGAGCAGGGA
gi|5 : -AT-AATT-G-CCAA--T--TTGC-A-CTGGTTTATA-TAT-TAACATGTTTCG-TTTT--------AGAT-TA-CAT---GTTCA-T-TTTA-TTTCAG-TTT-ATT--CCCCTTGTGC--CTG---C-T--TC--A-T-TATCA--GGAGATATAT--TATTTTCTCTG-TTTT-AT--------C-------------GC-----T-------TAT--AGCT----TT-------TGA-TG---C---TTG--C--G-T-G-TGCT----A----AAAATACTT--A-TA--TCACAG---AA-GCG---ACA-G-A----G--AGAGAC-AC---AAC---GGTC---TA-T-GTTGCTCT--ATA-GG--AC-ATAGT----GTG-CG-TTG-G----A----TA---TT-C-A-TA----TT-GA--------TT--AA-AAC-ATTTT----TAAAAGAAC-T-TA---AATTGGTGTTTGT--G-ATG-A-A-GAGACAA-C--TCCGAAATT-----TAA-AGG---G------AAAAA---G-GT-AATCATGCTTG-ATAAAG-A-TT-CGA--A-C----TCA-GCGTCG-T-TT---AAA-AAAATAAA---C----A-------G--TT-----GGGC----ACGTT---T--AAA-G-T----CCACA-A-------C-CT-TAT-C--------------------------C-ATATTC-AA--AC------G---TA-GTGAGGAAA-CT-TA-AC-G-TGCAG-ATGAAGTTGAAAG--G-AGA---AGTAAA-GAAA-TC--CTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATT--C-C-CCTGT-A--TT-T-T-GAG-GCTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-AAT-TC--A--AC-TTAA-TT---TAT-TTT-G------ACT-AATT---C-TTG-----TCA-A-A-AC-----ACA-C--CATTT-AGGCTTATTT--T-CTT-ATGCT-TT-----GGAATC--AAG-----A-C-AA-AAAG-TTC-C-ACTG----G---TT---TTACT-A-C---AT--AT-ATG-AATAACT-T-----T-AT-T-TTA----TCGATC--T--TTC-----ACGC-AGC-----AC-C-TTT--AG-GGAAA-T-CACC--AT--GA----TAC---ATGCAACAC-CTTC-TTTagcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtcagatatctgtatctccttcgagcctcatagcccctttgacttgcgtgacgctaaaaaaccagtatcacagaacgcgcaaacatgagacagaaaacccaaacgcatcttcgtttccttatatggtaactagtcgaaatggcgtgatacttcgcataaaatttgattatttatatataacatttcaagaaactgagaatgttgtcatgttgtgagaagcaactacaaactatctgtaagagggaaaaaagttgtctccgtgaaaagattcaaacctcggctcgtcttaaaaacaaacctatgtagaagttaaaaagttacaccataaccttctcagttacgcccacgcacacattcaaa
gi|18 : aAT--ATCC----TT-------GA--TG---CC--TTG--C--G-T-G-TGCT----ATAACAA-----CC--A-TA--TCACGGTCTAA-GCG---ACATG-G----C--AGCAAG-ACCCAAA----GGTC---CT-T-GTT--CCT--ATA-
gi|8 : -------TT--TG---AC--TTG--C--G-T-GACGCTAAA-A----AA-----CC--AGTA--TCACAG---AACGCGCAAACATG-A----GACAGAAA--ACCCAAACGCATCTT---CG-T-TTC--CTT--ATATGGTAACTA--GTCGAAATGGCG-T-G------A----TACTTCG-C-A-TAAAATTT-GATTATTTATAT--AT-AAC-ATTTC----AAGAA-A-C-TGAG---AA-TGTTGTC-AT--G-TTGTG-A-GAAGCAA-C--TA-CAAACTATCTGTAAGAGG---G------AAAAAAGTT-GT-C-TC-CG--TGAA--AAG-ATT--CAA--ACC----TCG-GC-TCG-TCTT---AAA-AACA-AAC---C----T---AT--G--TA-----G-------A-AGT---TAAAAA-G-TTACACCATA-A-------C-CT-TCT-CA--GT--T-AC--GCCC-ACG---CAC-ACATTC-AA--A
gi|17 : atatataaatgattaattatgatagctgtaactgggcataccaaattcgagtatcggtatacatattttattacagtttagttttgttgctgtgtaccataagagcagggaagcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtcagatatctgtatctccttcgagcctcatagccccCT--ATA-GG--AC-A--GT----GT-ACG-T-G-TG---A----TA---CG-C-A-TACA--TT-GA--------AT--AA-AACAATTTA----AAAAAGA-C-T-AG---AAGTG-TGTT-GT--G-ATG-A-A-GAGACAA-C--TC-GAAATT-----TAA-AGGAAAA------AAAAA---T-GT-A-TC-CG--TG-A--AAG-ATT--CGA--A-C----TCG-G--TCG-T-TC---AAGTTAAA-AAA---C----A---A
gi|7 : ----AAAAAGA-C-T-AAGT-AAGTGGTGTT-GT--G-ATG-A-A-GAGACAA-C--TC-GAAATT-----TAA-AGGGGAA------AAAAA---T-GT-A-TC-CG--TG-A--AAG-A-TTTCGA--A-C----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAAGATC----AGAAAC--GGTTT-----G--T----ACGTT---TTAAAA-G-T----CCATA-GGCCGCCCCGCT-TAT-CCC-AT--T-AC--G-CC-ACG-C-CGC-ACATTC-AA--ACCAC--CG---CA--TGA---AA-CTTAA-AC-G-TGCGG-ATGAAGTTGAAAG--A-------AGTAAC--GAAATCGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATTT-C-C-C-TGT-A--TT-T-TTGAG-GCTAAAAA--TCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TCCAA--AC-TTAA-TT---TAT-TTT-G------ACA-ATTT---C-TTG-----TCAAA-T-AC-----ACACC--T-TTT-AGACTTA-TT--T-TCT-AAATT-TTTTGG-A--ATC--AAG-----A-C-AA-AATG-TTC-C-ACTG----G---TT---TTACT-acccagttacatggacgttt
gi|14 : AAACT-----TAA-AGG---ACTAAAAAAAAA---TTGT-A-TCCTG--TG-A--AAGGA-T--CGATTA-CCTCATCC-G--TCG-T-TTTAAAAA-GAAA-AGA---C----A---AC--A--GT-----G--GGA--ACATT---T--AAATG-T----CCACA-G-------C-CT-TAT-CACTGT--T-AT--G-TCGACGACTCAT-ACAGTC-AA--
gi|4 : aaaactacccgataCGGGGATT--C-C-C-TAT-A---T-T-T-GAGATCTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-C-TG--TAT-G-ATT-TC--A--AC-TCAACTT---TAT-TTT-G------ACT-AA-T---A-TTG-----TCA-A-T-AC-----ACACC--T-TTC-AAACTTATTT--T-CTT-ATATT-TT-----G--ATA--AA------A-C-AA-AAAG-TT--CAACT-----G---TT---TT--T-A-T---AT--CT-ATG-AATAACT-T-----T-AT-T-TTA----CCGATC--T--TTC-----ATGCAA-C-----AC-C-TTT--AG-GGAAA-T-CACC--AT--GA----TAC---ATGCAACAC-CTTC--TTTAcaatctccaaataacgaccagaagtcgagaattcttaatcgggtgcagagctaagaaagttgaaagaggacaataaacgaagagtc
gi|6 : ccaatagatttcagaatatatgtccatgcacctaaaatattgaatatactaattgcaattgtaactggaatatatcatttcgttgaatatacatgttcaatatttatacagtttagtcctgtgctgtgtcattacaagggatatatatatttcatcttcctaagcttatagctttgatgctcgttgcgtgtgctaaaaacctaatatcacagaagcgacatgagagcacttgttcctataggcagtgtgcgtgtgatacgcataatgaattaaaaacattttaaagacgtagagtgtgttgtgatgaagagacaacgtcgaaatttaaagggaaaaaaattgtatccgtgaaagattcgaactcggtcatttaaaaaaaaccaaagttggacatttaaattccacagccttatccattatgccacggcgcacattcaaacaccacaaggaaacttaacgtgcagaatgaagttgaaaggagaagtaacgaaatcgtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGGGGATT--CGC-T-TGT-----T-T-T-GA--TCTGAAAAAGTCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--CAT-T-GTT-T---A--AC-TCAA-TT---TAA-TTT-T------ACTAAATT---C-TTG-----TC--A----------ATA-T--C-ATC-ACCCTTA-TT--T-
gi|1 : gttctatagagtttcaccaattatgatgtctccatatttgcacctgaaaatctttgatattacgaattagctaatttgtacctggatatattcaattttcgtttagaataatatcatgttcaatatttattacagtttagttccctgtgtgggatgtccattaacagggatattatagtatttgtatatcatatatttttttgccttgcgtgtgctacaacatagtcacagaaggacatggagagaatacccaaaggttctgttttcctatatggacagtgtgcgatgtgataatgttcatgaatttgaataaaacgatttttttaaaaaagactagatgtgatgttgtgatgatagagacaagtcgaaatttaaagaaaaaatttaatcaggtgaagaattcgaacatagttatggaagcatttaaagccctgccttatccatactatgagcccgacggctgccttcaagtatatcgagacagtgaaactgtaacagtgcagtatgaagttgaaaggagagttacgaaatgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGGGGATCTCC-C-C-TGT-A--TT-T-T-GAG-GCTAAAAT--GCA--ATAAAT-CGC---TTCTC-TG--CAT-G-ATT-TC--AATAC-TTAT-TT---TATGTTTGG------ACTAAAGT---C-TTG-----TCA-A-TAAC-----ACACC--T-TTT-AGACTTATTT--T-CTTAATATT-TT-----GGAATC--AAG-----A-CAAA-AAAG-TT--CTATT-----GGGTTT---TTTCT-A-T---AT--AT--TG-AATAACTCT-----T-AT-T-TTA----TCGATC--T--TTCATCGCATAC-A-C-----A-AC-TTT--A--GGAAA-T-CA-C--AC--AA----TGCTTAATG-AACAC-TTt
gi|9 : tttcaattagagtccaaatatagtccatacacgctgaaaatattgtcagacaattaactattgcatttgcaaatggatataatagcatttcgttttttacatgtagatatacatgttcaatatttataacagtttatcctgtgctgcgttcccattaacaagggagattttctatcttccttcgagctatagccttgtgccgttgccgtgtgctaaaaaacagcttacagaagcgacaagagacaagaactaacgggttcttgtcctataggacagtgacgtgtgatacgccataaattgtataaaacattttaaaaaagactaagtgtttgtgatgagagacagcttcgaaatttaggaaaatatgtatccgtgcaagattcgaactcgagtcgttaaaaatacagttggagttaaagtccacaggcctgtatccattaacgccacgccgcacatcaacagaccgtatgcgaaaccttaacgaggcagatgaaagtgaaggaggaattagtaacagaaatcggtgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttCGGGACTT--C-C-C-T-C-A--TT-TGT-GAG-GCTAACA---TCGCTAAAAAT-CGC---TTG-C-TG--CAT-A-ATT-TC--A--AT---AA-TT---TAT-TT--G------ACT-AATT---C-T-G-----TCC-A-C-AC-----ACA-C--T-TTTTAGACTTA-TT--T-CT--AGATT-TT-----GGAATATCAA------A-C-A--AAAG-TT--C-AC-----------T---TTACT-A-CTTAAT--AT-ATG-AATAACA-T-----T-AT-T-TTA----TCGATC--T--CTCA----ACGC-A-------ACAC-CTT--TA-AGAAA-T-CACC--AT--GA-----AC--ATGGCAACACTCTTcttatataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|2 : ttttaaatccacatgtctgatccatacgccacgcccgcacattcaaagcatcgcagggaaactttagcgtgcggatgaattttaaagaagtaacatgaatcgtgtccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGGGGTTC--C-C-C-TGTTA--TT-T-T-GAG-ACTAAAAAA-GCAC-ATAAATTCGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TTT-A--AC-TCAA-AT---TAT-TTT-G------AC--AATT---CCTTG-----TC--AAT-AC-----ACA-CC-T-TTT-AGACTTA-TT--TTCTT-AGATT-TT-----GGAATA--AAG-----A-C-A--AAAG-TT--CCACT-----G---GT---GTACT-A-T---AT--CTGATG-GAAAACT-T-----TTAT-TGTTA----CAG-TC--T--TC------ATGC-A-A-----ACA--TTT--AG-G-AAA-T-CA-CGCAT--GA----TAC--AATGCAACAC-CTTC--TTTAgt
gi|12 : taattagattcaaaattatgtccatgcacctgaaaatattgaatatacattgcaatttgttaactggatatatcatttcgttttagatatacattgttcaattttatcagtttatccctgtactgttccagtgtaacaagggatgttatattatttacttctttcggcttataggccttgatgccttgccctgctgcttaaaagccactatcacaggaagcgacatggagcaaggacccaaacggttcttgttcctataaggacagtgggcgtgatgatacgcagtaaatgaatattaacaattaaaaagatagaagtgtgttgtgcatgaaagagacaagtcggaaatttaagggaaaaaagtatccgtgaaaattcgactcgtcgctttaaaaaaaaaacaaaaaaccagttttttgggacattaaacaacgctccaagccttatcccattatgccacgccgcaacattcaaaacacccttggaaacttaacgctgcagatgaagttgaaaggaaagtaacgaaatgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGGGATT--C-CCT-TGT-AATTT-T-T-GAG-TCTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-CTTG--CAT-GAATT-TC--A--ACTTCAA-TT---TATATTT-GGTTAAAACT-AATTTTAC-TTG-----TCA-A-T-ATCCTCAACA-CCTT-TTT-AGATGTA-TTTAT-CTT-ATATT-TTTTTGGA--ATA--AAG-----AGC-AGAAAAG-TTTCC-ACTCTGAGG---TT---TT-TT-ATT---AT--CT-ATGAAATAACA-TATGGAT-AT-T-TTACAACCCGAGC--TTGTC------ATGC-A-------ACACTTTT--AGAGGAAATT-CA-C--ATTGGATGATTAC--ATGGCAA-AC-ATCCTTTTTt
gi|13 : GGGGATT--C-CAC-TGT-AA-TTAT-T-GAA-GCTAAAAA--TCAC-ATAAAG-TGCGCATTG-C-TGGTCATCG-ATTATC--AAGAC-TTAA-TTATATAT-TAT-G------A-T-AATT---CATTGGTACATC--A-T-ACA----ACACC--T-TTT-AGACTTATTT--T-CTT-ATATTGTT-----GGAATAACAAGCGAGAA-C-AA-AAAGAGT--T-ACTAACTGG---TTTCATTACTGA-T---ATAATG-ATGTAGTAACT-A-----T-ATAT-ATA----TAAATCGAT--CT------ATTC-A-CCGGCAACAC-CTTTAAGAGGAAA-TGCA-C--
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 111 11111 1111111111 111 11 111111111 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111111 111 1 111 11111111 111111111 1 11111 1111111111 11111 111111 1111 1111 222222222222222222222222222 11111111 1 1111111 1111 11 222222222222 1111 111111111111 111 111 11 11 222 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 111111 11111 11111 11 11111 1111 333333333 1111 111111111 111111111 11 1111 111111 1111 11111 111
lowQualScore : 8 4 55 7 3 55 55 3 7777 3 3 3 3 999999 3 22222 3 3 6 44 77 0 3 111 3 77777 3 3 2222222222 3 111 3 77 3 1 88 666 3 3 555 88 55 3 3 55 44 333333333 22 222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 999 77 44 77 3 3 6 777 3 44 888888888 6 6 222 3 555 888888 6666 88 0 2 3 666 3 7 55 44 44 0 55 3 55 7777 999 4 4 4 4 777 99 8 4 55 4 44444444 55 4 8 7777 4 4 4 4 222222222 2 4 55 4 4 4 9999 4 3 00000 55 9999999999 44444 99 111111 4 4 55 2222 0000 4 4 9999 4 4 555555555555555555555555555 99999 55 777777 00000000 2 3333333 4 99 66 0000 666 33 4 4444 4 000000000000 2222 1 999999999999 777 222 4 8 222 8 4 00 777 22 4 888 4 8 4 5 77 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 4 4 55 4 33 4 4 77 99 4 0 0 4 777 4 4 55 4 4 4 99 11 4 4 777 8 555555 4 4 777 8 00000 4 8 00000 8 4 4 4 4 777 4 1 00 11111 4 555 4 1111 4 111111111 777 4 4 5 888 1 5 5555 444444444 5 5 222222222 5 5 5 11 3333 999999 8888 5 5 88888 5 222 0 5
lowQualScore : . . .. . . .. .. . .... . . . . ...... . ..... . . . .. .. . . ... . ..... . . .......... . ... . .. . . .. ... . . ... .. .. . . .. .. ......... .. ................................................... . . ... .. .. .. . . . ... . .. ......... . . ... . ... ...... .... .. . . . ... . . .. .. .. . .. . .. .... ... . . . . ... .. . . .. . ........ .. . . .... . . . . ......... . . .. . . . .... . . ..... .. .......... ..... .. ...... . . .. .... .... . . .... . . ........................... ..... .. ...... ........ . ....... . .. .. .... ... .. . .... . ............ .... . ............ ... ... . . ... . . .. ... .. . ... . . . . .. .................................................................................................................................... . .. . . .. . .. . . .. .. . . . . ... . . .. . . . .. .. . . ... . ...... . . ... . ..... . . ..... . . . . . ... . . .. ..... . ... . .... . ......... ... . . . ... . . .... ......... . . ......... . . . .. .... ...... .... . . ..... . ... . .
lowQualScore : 0 0 55 3 6 00 00 6 7777 6 6 3 3 666666 3 11111 1 1 2 22 33 5 1 666 3 55555 3 3 7777777777 3 999 2 33 6 4 66 444 6 6 222 66 00 6 6 00 66 333333333 33 888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 0 222 99 66 99 3 3 7 111 3 66 111111111 7 7 555 3 888 888888 8888 77 5 0 6 444 6 3 00 66 66 0 00 6 00 7777 000 0 0 0 0 000 55 0 0 55 0 55555555 55 0 0 7777 0 0 0 0 999999999 7 0 55 0 0 0 5555 0 6 00000 55 5555555555 88888 55 555555 0 0 55 5555 1111 0 0 3333 0 0 000000000000000000000000000 77777 55 666666 55555555 0 0000000 0 55 88 3333 000 55 0 6666 0 555555555555 5555 9 444444444444 888 222 4 9 222 9 4 66 888 22 4 999 4 9 4 0 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 55 0 0 66 0 55 0 0 22 55 0 8 8 0 000 0 0 55 0 0 0 55 00 0 0 000 0 555555 0 0 000 0 00000 0 0 00000 0 0 0 4 4 888 4 1 66 11111 4 333 4 2222 4 777777777 888 8 4 0 888 0 0 6666 222222222 0 0 222222222 0 0 0 99 6666 444444 4444 0 0 11111 7 999 7 7
consensus : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT--TAT-------A-TN--------TT---------T-T-CG----T--T--A----TATAGCCTT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A-CA--TT---T--AAA-G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----CGA---AA---CT-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-AG--AGT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-AC--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
Reference ( family-494 ) : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-NTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT--TAT-------A-TN--------TT---------N-T-CG----T--T--A----TATANCCTT-GNTGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGNTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GN--A-CA--TT---T--AAA-G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-GT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----TGA---AA---CT-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-A---AGT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-AT--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
gi|1 : TTCAATTAGAGTC-CA--AA--TAT-A---GTC--CA-T----AC-ACGCTGAAAA-TAT-TGTCAGACAAT-TA-AC-TATT-G-C-A---T--TTGC-AAATGGAT-ATAATAGCA-----T-TTC-GTTT-TTTACATGTAGATATA-CAT---GTTCAATATTTA-TAACAGTTT-A-T--CC---TG-TGC-TG--CGTTCCC--A-T-TAACA--AGG--GA---------GAT--TTT-------C-TA--------TC---------T-T-CC----T--TCGAGC--TATAGCCTT-G-TGCCG-TTG--CC-G-T-G-TGCT---A-A--AA----AAC--A-GC-TTACAG---AA-GCG---ACAAG-A----GA---CAAG-AACTAACGGGTT---CT-T-GT---CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----G--ACG-T-G-TGATA-C---G--CCA-TAAA--TT-GT--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAAAGA-C-T-A-----A----GTGTT--T-GT--G-ATGA---GAGACA--GCTTC-G-AAATT-----TA----GG---A------AAATA---T-GTATCC--GTG------CAA-GA-TTCGA--AC----TCGAG--TCG-T-T--------AAAA-ATA---C---A--------G--TT-----GG-----A--GT---T--AAA-G-T----CCACAGGC-------CTGTAT--CC-AT--TAAC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA-------------TCAAC-A-GACCG---TATG----CGA---AAC--CT-T-AAC---GAGGCAG-A--T---GAAAGTGAAGGAGG-AATTAGT-AACAG-AAA-TCG-GTGT
gi|1 : tCGGGGA-TCTCCC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAT--GCA--ATAAAT-CGC---TTCTC-TG--CAT-G-ATT-TC--AATAC-TTAT-TT---TATGTTTGG-----ACT-AAAGT---C-TTG-----TC-AATAAC-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-TAATA---TT-TTGGAATC--AAG-----A-CAA-AAAAG-TT--CTA-TT-----GGGTTT---TTTCT-A-T---ATAT--TG----AATAAC-TCT-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-ATC-GC-A-TACACAAC-TTTA----GGAAA-T-CA-----CACAA-TGCTTAATG-AACA-CTTC-TTATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcggggatctcccctgtattttgaggctaaaatgcaataaatcgcttctctgcatgatttcaatacttattttatgtttggactaaagtcttgtcaataacacaccttttagacttattttcttaatattttggaatcaagacaaaaaagttctattgggttttttctatatattgaataactcttattttatcgatctttcatcgcatacacaactttaggaaatcacacaatgcttaatgaacacttcttatataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|10 : tttcaattagagtccaaatatagtccatacacgctgaaaatattgtcagacaattaactattgcatttgcaaatggatataatagcatttcgttttttacatgtagatatacatgttcaatatttataacagtttatcctgtgctgcgttcccattaacaagggagattttctatcttccttcgagctatagccttgtgccgttgccgtgtgctaaaaaacagcttacagaagcgacaagagacaagaactaacgggttcttgtcctataggacagtgacgtgtgatacgccataaattgtataaaacattttaaaaaagactaagtgtttgtgatgagagacagcttcgaaatttaggaaaatatgtatccgtgcaagattcgaactcgagtcgttaaaaatacagttggagttaaagtccacaggcctgtatccattaacgccacgccgcacatcaacagaccgtatgcgaaaccttaacgaggcagatgaaagtgaaggaggaattagtaacagaaatcggtgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-AATTGTC--CAAT----GC-AC-CTGAAAAATAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-GGC-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTCAGTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTATTTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--CCCAA-T-TAACA--AGG--GA---------TAT--TAT-------A-TA--------TTTTATCTTCCT-T-CGGCTTT--T--A----TAGGCCCTT-GATGCT--TTG--CCGA-TAG-TGCTAAAA-A--AA----C-C--A-TATTCACAGA--AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAA--ACCC-AACGGTT---CT-TGGTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-T-G-TGATA-C---G--CTA-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-A-TTT----AAAAA-GA-C-T-AGTCTAA----GTGGTGTT-GTTGA-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-Ataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|11 : AAT-AGAGTT-AA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG-------AT-A--AC-TATT-G-C-AATTT--TTGC-AACC-GA--ATA-TATCAAT---T-TCC-GTTT-T--------AAATATAGCAT--TGTTCATAACTTA--TACAGTTT---TA-CC---TG-TGC-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGGGAGA---------TAT--TTT-------A-TC--------GTCC-------T-T-CGACTTT--T--A-----AAAACTCT-GATACC--TTGGCC--G-T-G-TACTA--A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-ATCTCGA--GTAAG-AACCCAACGGTTTTCTT-T-GTT--CC--T--ATA-G----T-G--GT----GT---G-TAG-TGGTA-C---GC-C-A-TAAA--TT-GA--------AT---A-AAC-ATTTT----
gi|12 : tgGGGGA-TT--CC-C-TTGT-AATTT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-CTTG--CAT-GAATT-TC--AA--CTTCAA-TT---TATATTTGGTTAAAACT-AA-TTTTAC-TTG-----TC-AATA-TCCTCAA-CACCTTTTTAGATGTATTTATCT-T-ATATTTTT-TTGGAATA--AAG-----AGC-AGAAAAG-TTTCC-A-CTCTGAGG---TT---TT-TT-ATT---ATCT-ATGA---AATAAC-A-TATGGATAT-T-TT----ACAACCCGAGCT-TGTC-AT--GC-A--AC---ACTTTTA--GAGGAAATT-CACATTGGATGATTAC--ATGGCAA-ACATCC-TTTT
gi|13 : GGGGA-TT--CCAC-T-GT-AA-TTAT-TGAAG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAG-TGCGCATTG-C-TGGTCATCG-ATTATC--AAGAC-TTAA-TTATATAT-TATG------A-T-AA-TT---CATTGGTACATC-A-TA-C-----AACACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TTGTTGGAATAACAAGCGAGAA-C-A-AAAAGAGT--T-A-CTAACTGG---TTTCATTACTGA-T---ATA--ATGATGTAGTAAC-T-A-----TATAT-ATATAAA----TCGATCTAT-TC-ACCGGCAA-CAC----C-TTTAAGA-GGAAA-TGCAC----CAt
gi|14 : -AAACT-----TAAA--GG---ACTAAAAAAAAA---TTGTATCCT-GTG------AAA-GG-ATCGATTACCTCATCC-G--TCG-T-TTTAAAAA-GAAA-AGA---C---AA-----C-A--GT-----GGGAA-CA--TT---T--AAATG-T----CCACA-GC-------CT-TATCACT-GT--T-AT--GTCG-AC-G-AC-TCA-TACAGTCAACAATCTCCAA--A-TAACGAC-CA-GAAGTCGA---GAATTCT-T-AATCGGG-TGCAG-AGCTAAGAAAGTTGAAAGAGG-AC--AATAAAC-G-AA
gi|15 : aaaactacccgataTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-C----GC-AC-CTGGAAA-TAT-AG------AAT-A--AA-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-A--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTTCAGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GAGATACAGTGTAT--TTT-------A-TC--------TTCC-------T-T-CG----A--C--T----TATAGCCTT-GATGCC--CCG--C--G-C-G-AGCTA--A-A--AA----C-C--A-CA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAgagtc
gi|16 : TTCAAT-ATAGTT-CA--AAA-CAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-A--AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ACA-TATCA-----G-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTT-AGT--CC---TG-TAC-TA--CGT--CC--A-T-T----------------------TTT--TAT-------C-TT--------CC---------T-T-CG----G--C--T----TATAGCCTT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA------------A-TCACA--------C------------------------------AACGGTC---CT-T-GTT--CC--TGAATA-GG--AC-A--GT----G
gi|17 : C--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTA-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TACA--TT-GA--------AT--AA-AACAATTTA----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTG-TGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGAAAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TC---AAGTTAAA-AAA---C---AA-----
gi|18 : ATATCCTT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---ATAACAA----C-C--A-TA-TCACGGTCTAA-GCG---ACATG-G----CA--GCAAG-ACCCAAA-GGTC---CT-T-GTT--CC--T--ATA-acccagttacatggacgttt
gi|19 : TTCAATTAGAGAT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGGAAC-TAT-TG------AAT-AC-AT-CCTC-G-C-AA--TA-TAGC--ACTGGA--
gi|2 : T-AGA-TT-CA--AAA-T-T-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-A-TT-G-C-AA--T--TTGTTAACTGGA---TA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAAT-TTTA-T--CAGTTT-ATC--CC---TG-TAC-TG--T-T--CC--AGTGTAACA--AGG--GA---------TGT--TAT-------A-TTATTTACTTCT---------T-T-CGGC--T--T--A----TA-GGCCTT-GATGCC--TTG--C--CCT-GCTGCTTA-A-A--AG----C-C--ACTA-TCACAGG--AA-GCG---ACATG------GA--GCAAGGACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATAAGG--AC-A--GT----G-GGCG-T-GATGATA-C---G--C-AGTAAA--T--GA--------AT--ATTAAC-AATT-----AAAAA-GA---T-AG---AA----GTG-TGTT-GT--GCATGA-AAGAGACAA-G--TC-GGAAATT-----TAAG--GG---A------AAAAA-----GTATCC--GTG------AAA--A-TTCGA---C----TCG----TCGCT-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AAAAAACCAG--TTTTTTGGG--A-CA--TTAAAC--AAC-GCT----CCA-A-GC-------CT-TAT--CCCAT--T-AT--GCC--AC-G-CC-GCAACA------------TTCAA--AACACCC---TT-G-----GA---AA---CT-T-AAC---GCTGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAA---AGT-AAC-G-AAA-Ttccac
gi|2 : taatGGGGT-TC--CC-C-T-GTTA--TT-T-TGAGA-CTAAAAAA-GCAC-ATAAATTCGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TTT-AA--C-TCAA-AT---TAT-TTTG------AC--AA-TT---CCTTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-AGA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAGT-TC--C-A-CT-----G---GT---GTACT-A-T---ATCTGATG----GAAAACTT-T-----TAT-TGTT----A----CAG-TC--T-TC-AT--GC-A-AAC---A--TTTA----GGAAA-T-CACG---CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggttcccctgttattttgagactaaaaaagcacataaattcgcttcctgcatgatttttaactcaaattattttgacaattccttgtcaatacacaccttttagacttattttcttagattttggaataaagacaaaagttccactggtgtactatatctgatggaaaacttttattgttacagtcttcatgcaaacatttaggaaatcacgcatgatacaatgcaacaccttctttat
gi|20 : taattagattcaaaattatgtccatgcacctgaaaatattgaatatacattgcaatttgttaactggatatatcatttcgttttagatatacattgttcaattttatcagtttatccctgtactgttccagtgtaacaagggatgttatattatttacttctttcggcttataggccttgatgccttgccctgctgcttaaaagccactatcacaggaagcgacatggagcaaggacccaaacggttcttgttcctataaggacagtgggcgtgatgatacgcagtaaatgaatattaacaattaaaaagatagaagtgtgttgtgcatgaaagagacaagtcggaaatttaagggaaaaaagtatccgtgaaaattcgactcgtcgctttaaaaaaaaaacaaaaaaccagttttttgggacattaaacaacgctccaagccttatcccattatgccacgccgcaacattcaaaacacccttggaaacttaacgctgcagatgaagttgaaaggaaagtaacgaaatgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-T------------------------T-G-C-AA--T--T---------------A-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------CGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTat
gi|3 : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-A--TGTC--CA-T----GCCAC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-ATTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTT-AGT--CC---TG-T-C-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT--TAT-------A-TA--------TT---------A-T-AA----T--T--A----TATATTTTT-TTTGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--A-----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAT-ATCCAAACTGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-T-ATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGTTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCT--GTG------AAA-GA--TCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GT--A-CA--TT---T--AAA-G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CA-AT--T-AT--GCC--AC-GACC-GCA-CG------------TTCAA--A-CAGCG---CA-G----TGA---AA---CT-G-CAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-G---AGT-AACTG-AAAGTC--GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-T-T-GT-A--TT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC--ATA-C-----A-TA-C-TTTTAGACTTA-TT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AAG-----A-C-A-GAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-T--AT--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CA-----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTCATTTTA
gi|4 : CAAT-AGATTT-CA--GAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CT-AAAA-TAT-TG------AAT-AT-ACTAATT-G-C-AA--T--T-GT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTT-----------GAATATA-CAT---GTTCAATATTTA--TACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--C---A-T-TA-CA--AGG--GA---------TATA-TAT-------A-TT--------TC---------A-T-CT----TCCT--AAGCTTATAGCTTT-GATGCTCGTTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAA---C-CTAA-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCA------------------CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG---C-A--GT----GTG-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAA----T-GA--------ATTAAA-AAC-ATTTT----AAA---GA-CGT-AG---A-----GTG-TGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAACG--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAAAATT-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCA-T-TT---AAA-AAAA-AC----C---AA-----A-G--TT-----GG--A-CA--TT---T--AAA-T-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AT--GCC--AC-G-GC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCA---CA-A----GGA---AA---CT-T-AAC---G-TGCAG-AA-T---GAAGTTGAA--AGG-AGA-AGT-AAC-G-AAA-TCG-g
gi|4 : cCGGGGA-TT--CC-C-T-AT-A--TT-T--GAGATCTAAAAA--TCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--TAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAACTT---TAT-TTTG------ACT-AA-T----A-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTCAAACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AA------A-C-A-AAAAG-TT--C-AACT-----G---TT---TT--T-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-AT--GCAA-CAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattccctatatttgagatctaaaaatcacataatcgcttcctgtatgatttcaactcaactttattttgactaatattgtcaatacacacctttcaaacttattttcttatattttgataaaacaaaaagttcaactgtttttatatctatgaataactttattttaccgatctttcatgcaacacctttagggaaatcaccatgatacatgcaacaccttcttta
gi|5 : ccaatagatttcagaatatatgtccatgcacctaaaatattgaatatactaattgcaattgtaactggaatatatcatttcgttgaatatacatgttcaatatttatacagtttagtcctgtgctgtgtcattacaagggatatatatatttcatcttcctaagcttatagctttgatgctcgttgcgtgtgctaaaaacctaatatcacagaagcgacatgagagcacttgttcctataggcagtgtgcgtgtgatacgcataatgaattaaaaacattttaaagacgtagagtgtgttgtgatgaagagacaacgtcgaaatttaaagggaaaaaaattgtatccgtgaaagattcgaactcggtcatttaaaaaaaaccaaagttggacatttaaattccacagccttatccattatgccacggcgcacattcaaacaccacaaggaaacttaacgtgcagaatgaagttgaaaggagaagtaacgaaatcgtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-AATT-G-CCAA--T--TTGC-A-CTGGTTTATA-TATTAACATGT-TTC-GTTT-T--------AGAT-TA-CAT---GTTCA-T-TTTA-TTTCAGTTT-ATT--CCCCTTG-TGCCTG--C-T--TC--A-T-TATCA--GGA--GA---------TATATTATTTTCTCTG-TT--------TT---------A-T-CG----C--T-------TATAGCTTTTGATGC---TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAATACT-T--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACA-G-A----GA--G--AG-ACACAA-CGGTC---TA-T-GTTGCTC--T--ATA-GG--AC-ATAGT----GTG-CG-T-T-GGATA-T---T--C-A-TA----TT-GA--------TT--AA-AAC-ATTTT----TAAAA-GAAC-T-TA---AA----TTGGTGTTTGT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TCCG-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAA---G-GTAATC--ATGCTTGATAAA-GA-TTCGA--AC----TCA-GCGTCG-T-TT---AAA-AAAATAAA---C---A--------G--TT-----GG--G-CACGTT---T--AAA-G-T----CCACA-AC-------CT-TAT--CC-AT--------------------------A------------TTCAA--A-C---G---TA-G----TGAGGAAA---CT-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-AGA-AGT-AAA-G-AAA-TCC--TGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-CCT-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-AAT-TC--AA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AAAA-C-----A-CACC-ATTTAGGCTTATTT-TCT-T-ATG---CT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--CCA-CT-----GG--TT---TTACT-A-C---ATAT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-AC--GC-AGCAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTa
gi|6 : aTTCTAT-AGAGTTTCACCAAT-TATGA--TGTCTCCA-TATTTGC-AC-CTGAAAA-TCT-TT------GAT-ATTACGAATTAG-CTAA--T--TTGT-ACCTGGAT-ATA-T-TCAAT---T-TTC-GTTT-A--------GAATA-A-TATCATGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGTTCCC---TG-TGT-GGGATGT--CC--A-T-TAACA---GG--GA---------TAT--TAT-------AGTA--------TT---------TGTATA----T--C--A----TATATTTTT--TTGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-C--AA----C----A-TAGTCACAG---AA-G-G---ACATGGA----GA--G-AAT-ACCCAAA-GGTT---CTGT-TTT--CC--T--ATATGG--AC-A--GT----GTG-CGAT-G-TGATAAT---GTTC-A-TGAA--TTTGA--------AT--AA-AACGATTTTTTTAAAAAA-GA-C-T-AG---AT----GTGATGTT-GT--G-ATGATA-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA---G---A------AAAAA---T-TTAATCAGGTG------AAG-AA-TTCGA--AC--------A--TAG-T-T------------------------A-----T-G---------GA--AGCA--TT---T--AAA-G-C----C--CT-GC-------CT-TAT--CC-ATACT-ATGAGCCCGACGG-CT-GC--C-------------TTCAAGTA-TATCGAGACA-G----TGA---AA---CTGT-AACA--G-TGCAGTA--T---GAAGTTGAA--AGG-AG--AGT-TAC-G-AAA-T---GTGT
gi|6 : gCGGGGA-TT--CG-C-T--T-G--TT-T-TGAT--CTGAAAAAGTCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--CAT-T-GTT-T---AA--C-TCAA-TT---TAA-TTTT------ACTAAA-TT---C-TTG-----TC-AATATC-----ATCACC--------CTTATTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattcgcttgttttgatctgaaaaagtcacataatcgcttcctgcattgtttaactcaatttaattttactaaattcttgtcaatatcatcacccttatttt
gi|7 : gttctatagagtttcaccaattatgatgtctccatatttgcacctgaaaatctttgatattacgaattagctaatttgtacctggatatattcaattttcgtttagaataatatcatgttcaatatttattacagtttagttccctgtgtgggatgtccattaacagggatattatagtatttgtatatcatatatttttttgccttgcgtgtgctacaacatagtcacagaaggacatggagagaatacccaaaggttctgttttcctatatggacagtgtgcgatgtgataatgttcatgaatttgaataaaacgatttttttaaaaaagactagatgtgatgttgtgatgatagagacaagtcgaaatttaaagaaaaaatttaatcaggtgaagaattcgaacatagttatggaagcatttaaagccctgccttatccatactatgagcccgacggctgccttcaagtatatcgagacagtgaaactgtaacagtgcagtatgaagttgaaaggagagttacgaaatgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AAAAA-GA-C-T-AAGT-AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGGGAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GATTTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAAGATCAGAAA-----C-GGTTT-----GT--A-CG--TT---TTAAAA-G-T----CCATAGGCCGCCCCGCT-TATC-CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--ACCACCG---CA------TGA---AA---CT-TAAAC---G-TGCGG-A--T---GAAGTTGAA--A-G-A---AGT-AAC-G-AAA-TCGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATTT--CC-C-T-GT-AT-TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TCCAAA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACA-AT-TT---C-TTG-----TCAAATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCTAA-ATT---TT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAATG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-
gi|8 : A-TATATA------AATGAT--T-AATT-A-T-GA--TAGCTGT-AACTGGG---CA-TACCA-----AATTC-GAGTAT--------CGGTATA-CAT--------AT-TTTA-TTACAGTTT-AGT--TT---TGTTGC-TG--TGTA-CC--A---TAAGAGCAGG--GA---------
gi|8 : --GA---------TATC-TGT-------A-TC--------TC---------C-TTCGAGCCT--C--A----TAGCCCCTT---TGAC--TTG--C--G-T-GACGCT---A-A--AAAA--C-C--AGTA-TCACAG---AACGCGCAAACATG-A----GACAG-AAA-ACCCAAACGCAT---CT-TCGTT--TCCTT--ATATGGTAACTA--GTCGAAATGGCG-T-G---ATA-CTTCG--C-A-TAAAATTT-GATTATTTATAT--AT-AAC-ATTTC----AAGAA--A-C-TGAG---AATGTTGTCATGTT-GT--G-A-GA-A-G---CAA-C--TA-C-AAACTATCTGTAAGAGGG---A------AAAAAGT-T-GTCTCC--GTG------AAAAGA-TTCAA--ACC---TCG-GC-TCG-TCTT---AAA-AACA-AAC---C---TA-----T-G--TA-----GA--A--G--TT---A--AAAAG-TTACACCATA-AC-------CT-TCT--CA-GT--T-AC--GCCC-AC-G-C--ACA-CA------------TTCAA--A-agcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtcagatatctgtatctccttcgagcctcatagcccctttgacttgcgtgacgctaaaaaaccagtatcacagaacgcgcaaacatgagacagaaaacccaaacgcatcttcgtttccttatatggtaactagtcgaaatggcgtgatacttcgcataaaatttgattatttatatataacatttcaagaaactgagaatgttgtcatgttgtgagaagcaactacaaactatctgtaagagggaaaaaagttgtctccgtgaaaagattcaaacctcggctcgtcttaaaaacaaacctatgtagaagttaaaaagttacaccataaccttctcagttacgcccacgcacacattcaaa
gi|9 : atatataaatgattaattatgatagctgtaactgggcataccaaattcgagtatcggtatacatattttattacagtttagttttgttgctgtgtaccataagagcagggaagcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtca--TT---T--AAA---T----CCACATGT-------CT-GAT--CC-AT----AC--GCC--AC-G-CCCGCA-CA------------TTCAA--AGCATCG---CA-G----GGA---AA---CT-TTAGC---G-TGCGG-A--T---GAATTTTAA--AG--A---AGT-AAC-ATGAA-TC--GTGT
gi|9 : tCGGGAC-TT--CC-C-T--C-A--TT-TGTGAGG-CTAACA---TCGCTAAAAAT-CGC---TTG-C-TG--CAT-A-ATT-TC--AA--T---AA-TT---TAT-TT-G------ACT-AA-TT---C-T-G-----TC-CACA-C-----A-CACT-TTTTAGACTTATTT-C---T-AGA---TT-TTGGAATAT-CAA-----A-C---AAAAG-TT--C-A-C-----------T---TTACT-A-CTTAATAT-ATG----AATAAC-A-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-C-TCAAC--GC-A--AC---AC-CTTT--A-AGAAA-T-CAC----CATGA--AC--ATGGCAACAC--TC-TTccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgggacttccctcatttgtgaggctaacatcgctaaaaatcgcttgctgcataatttcaataatttatttgactaattctgtccacacacactttttagacttatttctagattttggaatatcaaacaaaagttcactttactacttaatatatgaataacattattttatcgatctctcaacgcaacacctttaagaaatcaccatgaacatggcaacactcttgt
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 111 11111 1111111111 111 111 111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111111 111 1 111 11111111 111111111 1 11111 1111111111 11111 111111 1111 222222222222222222222222222 11111 111111111 1 1111111 1111 11 222222222222 1111 222222222222 111 111 11 11 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 111111 11111 11111 11 11111 11 333333333 1111 111111111 111111111 1111 111111 1111 11111 111
lowQualScore : 8 4 55 7 3 55 55 3 7777 3 3 3 3 999999 3 22222 3 3 6 44 77 0 3 111 3 77777 3 3 2222222222 3 111 3 222 3 1 88 666 3 3 555 88 55 3 3 55 44 333333333 3 1 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777 44 555 3 1 77 44 77 3 3 6 777 3 44 888888888 6 6 222 3 555 888888 6666 88 0 2 3 666 3 7 55 44 44 0 55 3 55 7777 999 4 4 4 4 777 99 8 4 55 4 44444444 55 4 8 7777 4 4 4 4 222222222 0 4 55 4 4 4 9999 4 3 00000 55 9999999999 44444 99 111111 4 4 55 2222 4 99 4 4 777 4 4 888888888888888888888888888 00000 55 777 55 222222222 2 3333333 4 99 4 0000 666 33 4 4444 4 000000000000 2222 0 777777777777 222 4 4 4 222 8 4 00 777 22 88888 8 4 8 4 5 77 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 4 4 55 4 33 4 4 77 99 4 0 0 4 777 4 4 55 4 4 4 99 11 4 4 777 8 555555 4 4 777 8 00000 4 8 00000 8 4 4 4 4 777 4 1 00 11111 4 555 4 55 4 4 111111111 777 4 4 5 888 1 5 5555 444444444 5 5 222222222 5 5 5 9999 3333 999999 8888 5 5 88888 5 222 0 5
lowQualScore : . . .. . . .. .. . .... . . . . ...... . ..... . . . .. .. . . ... . ..... . . .......... . ... . ... . . .. ... . . ... .. .. . . .. .. ......... . . . ................................................. .. ... . . .. .. .. . . . ... . .. ......... . . ... . ... ...... .... .. . . . ... . . .. .. .. . .. . .. .... ... . . . . ... .. . . .. . ........ .. . . .... . . . . ......... . . .. . . . .... . . ..... .. .......... ..... .. ...... . . .. .... . .. . . ... . . ........................... ..... .. ... .. ......... . ....... . .. . .... ... .. . .... . ............ .... . ............ ... . . . ... . . .. ... .. ..... . . . . . .. .................................................................................................................................... . .. . . .. . .. . . .. .. . . . . ... . . .. . . . .. .. . . ... . ...... . . ... . ..... . . ..... . . . . . ... . . .. ..... . ... . .. . . ......... ... . . . ... . . .... ......... . . ......... . . . .... .... ...... .... . . ..... . ... . .
lowQualScore : 0 0 55 3 6 00 00 6 7777 6 6 3 3 666666 3 11111 1 1 2 22 33 5 1 666 3 55555 3 3 7777777777 3 999 2 333 6 4 66 444 6 6 222 66 00 6 6 00 66 333333333 6 8 6 7777777777777777777777777777777777777777777777777 66 888 3 3 99 66 99 3 3 7 111 3 66 111111111 7 7 555 3 888 888888 8888 77 5 0 6 444 6 3 00 66 66 0 00 6 00 7777 000 0 0 0 0 000 55 0 0 55 0 55555555 55 0 0 7777 0 0 0 0 999999999 7 0 55 0 0 0 5555 0 6 00000 55 5555555555 88888 55 555555 0 0 55 5555 0 55 0 0 000 0 0 333333333333333333333333333 33333 55 000 55 000000000 0 0000000 0 55 0 3333 000 55 0 6666 0 555555555555 5555 9 000000000000 222 4 4 4 222 9 4 66 888 22 99999 9 4 9 4 0 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 55 0 0 66 0 55 0 0 22 55 0 8 8 0 000 0 0 55 0 0 0 55 00 0 0 000 0 555555 0 0 000 0 00000 0 0 00000 0 0 0 4 4 888 4 1 66 11111 4 333 4 00 4 4 777777777 888 8 4 0 888 0 0 6666 222222222 0 0 222222222 0 0 0 9999 6666 444444 4444 0 0 11111 7 999 7 7
consensus : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNTA-TN--------TT---------T--T-C-G----T--T--A----T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----NGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
Reference ( family-494 ) : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TATA-TN--------TT---------T--T-C-G----T--T--A----T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----CGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
gi|1 : TTCAATTAGAGTC-CA--AA--TAT-A---GTC--CA-T----AC-ACGCTGAAAA-TAT-TGTCAGACAAT-TA-AC-TATT-G-C-A---T--TTGC-AAATGGAT-ATAATAGCA-----T-TTC-GTTT-TTTACATGTAGATATA-CAT---GTTCAATATTTA-TAACAGTTT-A-T--CC---TG-TGC-TG--CGTTCCC--A-T-TAACA--AGG--GA---------GAT-TTTC-TA--------TC---------T--T-C-C----T--TCGAGC--T-----ATAG--CC---TT-G-TGCCG-TTG--CC-G-T-G-TGCT---A-A--AA----AAC--A-GC-TTACAG---AA-GCG---ACAAG-A----GA---CAAG-AACTAACGGGTT---CT-T-GT---CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----G--ACG-T-G-TGATA-C---G--CCA-TAAA--TT-GT--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAAAGA-C-T-A-----A----GTG-T-TT-GT--G-ATGA---GAGACA--GCTTC-G-AAATT-----TA----GG---A------AAATA---T-GTATCC--GTG------CAA-GA-TTCGA--AC----TCGAG--TCG-T-T--------AAAA-ATA---C---A--------G--TT-----GG------A--GT---T--AAA--G-T----CCACAGGC-------CTGTAT--CC-AT--TAAC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA-------------TCAAC-A-GACCG---TATG----CGAAAC--C-T-T-AAC---GAGGCAG-A--T---GAAAGTGAAGGAGGAATTA-GT-AACAG-AAA-TCG-GTGT
gi|1 : tCGGGGA-TCTCCC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAT--GCA--ATAAAT-CGC---TTCTC-TG--CAT-G-ATT-TC--AATAC-TTAT-TT---TATGTTTGG-----ACT-AAAGT---C-TTG-----TC-AATAAC-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-TAATA---TT-TTGGAATC--AAG-----A-CAA-AAAAG-TT--CTA-TT-----GGGTTT---TTTCT-A-T---ATAT--TG----AATAAC-TCT-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-ATC--GC-A-TACACAAC-TTTA----GGAAA-T-CA-----CACAA-TGCTTAATG-AACA-CTTC-TTATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcggggatctcccctgtattttgaggctaaaatgcaataaatcgcttctctgcatgatttcaatacttattttatgtttggactaaagtcttgtcaataacacaccttttagacttattttcttaatattttggaatcaagacaaaaaagttctattgggttttttctatatattgaataactcttattttatcgatctttcatcgcatacacaactttaggaaatcacacaatgcttaatgaacacttcttatataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|10 : tttcaattagagtccaaatatagtccatacacgctgaaaatattgtcagacaattaactattgcatttgcaaatggatataatagcatttcgttttttacatgtagatatacatgttcaatatttataacagtttatcctgtgctgcgttcccattaacaagggagattttctatcttccttcgagctatagccttgtgccgttgccgtgtgctaaaaaacagcttacagaagcgacaagagacaagaactaacgggttcttgtcctataggacagtgacgtgtgatacgccataaattgtataaaacattttaaaaaagactaagtgtttgtgatgagagacagcttcgaaatttaggaaaatatgtatccgtgcaagattcgaactcgagtcgttaaaaatacagttggagttaaagtccacaggcctgtatccattaacgccacgccgcacatcaacagaccgtatgcgaaaccttaacgaggcagatgaaagtgaaggaggaattagtaacagaaatcggtgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-AATTGTC--CAAT----GC-AC-CTGAAAAATAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-GGC-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTCAGTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTATTTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--CCCAA-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TATA-TA--------TTTTATCTTCCT--T-C-GGC--T--T--T----T-----ATAGGCCC---TT-GATGCT--TTG--CCGA-TAG-TGCTAAAA-A--AA----C-C--A-TATTCACAGA--AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAA--ACCC-AACGGTT---CT-TGGTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-T-G-TGATA-C---G--CTA-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-A-TTT----AAAAA-GA-C-T-AGTCTAA----GTGGTGTT-GTTGA-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-Ataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|11 : AAT-AGAGTT-AA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG-------AT-A--AC-TATT-G-C-AATTT--TTGC-AACC-GA--ATA-TATCAAT---T-TCC-GTTT-T--------AAATATAGCAT--TGTTCATAACTTA--TACAGTTT---TA-CC---TG-TGC-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGGGAGA---------TAT-TTTA-TC--------GTCC-------T--T-C-GACTTT--T--A----------AAAA--CT---CT-GATACC--TTGGCC--G-T-G-TACTA--A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-ATCTCGA--GTAAG-AACCCAACGGTTTTCTT-T-GTT--CC--T--ATA-G----T-G--GT----GT---G-TAG-TGGTA-C---GC-C-A-TAAA--TT-GA--------AT---A-AAC-ATTTT----
gi|12 : tgGGGGA-TT--CC-C-TTGT-AATTT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-CTTG--CAT-GAATT-TC--AA--CTTCAA-TT---TATATTTGGTTAAAACT-AA-TTTTAC-TTG-----TC-AATA-TCCTCAA-CACCTTTTTAGATGTATTTATCT-T-ATATTTTT-TTGGAATA--AAG-----AGC-AGAAAAG-TTTCC-A-CTCTGAGG---TT---TT-TT-ATT---ATCT-ATGA---AATAAC-A-TATGGATAT-T-TT----ACAACCCGAGCT-TGTC-A-T--GC-A--AC---ACTTTTA--GAGGAAATT-CACATTGGATGATTAC--ATGGCAA-ACATCC-TTTT
gi|13 : GGGGA-TT--CCAC-T-GT-AA-TTAT-TGAAG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAG-TGCGCATTG-C-TGGTCATCG-ATTATC--AAGAC-TTAA-TTATATAT-TATG------A-T-AA-TT---CATTGGTACATC-A-TA-C-----AACACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TTGTTGGAATAACAAGCGAGAA-C-A-AAAAGAGT--T-A-CTAACTGG---TTTCATTACTGA-T---ATA--ATGATGTAGTAAC-T-A-----TATAT-ATATAAA----TCGATCTAT-TC-A-CCGGCAA-CAC----C-TTTAAGA-GGAAA-TGCAC----CAt
gi|14 : -AAACT-----TAAA--GG---ACTAAAAAAAAA---TTGTATCCT-GTG------AAA-GG-ATCGATTACCTCATCC-G--TCG-T-TTTAAAAA-GAAA-AGA---C---AA-----C-A--GT-----GGGAA--CA--TT---T--AAAT-G-T----CCACA-GC-------CT-TATCACT-GT--T-AT--GTCG-AC-G-AC-TCA-TACAGTCAACAATCTCCAA--A-TAACGAC-CA-GAAGTCGAGAATTC-T-T-AATCGGG-TGCAG-AGCTAAGAAAGTTGAAAGAGGAC--A-ATAAAC-G-AA
gi|15 : aaaactacccgataTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-C----GC-AC-CTGGAAA-TAT-AG------AAT-A--AA-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-A--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTTCAGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GAGATACAGTGTAT-TTTA-TC--------TTCC-------T--T-C-G----A--C--T----T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--CCG--C--G-C-G-AGCTA--A-A--AA----C-C--A-CA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAgagtc
gi|16 : TTCAAT-ATAGTT-CA--AAA-CAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-A--AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ACA-TATCA-----G-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTT-AGT--CC---TG-TAC-TA--CGT--CC--A-T-T----------------------TTT-TATC-TT--------CC---------T--T-C-G----G--C--T----T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA------------A-TCACA--------C------------------------------AACGGTC---CT-T-GTT--CC--TGAATA-GG--AC-A--GT----G
gi|17 : C--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTA-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TACA--TT-GA--------AT--AA-AACAATTTA----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GT-GTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGAAAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TC---AAGTTAAA-AAA---C---AA-----
gi|18 : -----ATAT--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---ATAACAA----C-C--A-TA-TCACGGTCTAA-GCG---ACATG-G----CA--GCAAG-ACCCAAA-GGTC---CT-T-GTT--CC--T--ATA-acccagttacatggacgttt
gi|19 : TTCAATTAGAGAT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGGAAC-TAT-TG------AAT-AC-AT-CCTC-G-C-AA--TA-TAGC--ACTGGA--
gi|2 : T-AGA-TT-CA--AAA-T-T-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-A-TT-G-C-AA--T--TTGTTAACTGGA---TA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAAT-TTTA-T--CAGTTT-ATC--CC---TG-TAC-TG--T-T--CC--AGTGTAACA--AGG--GA---------TGT-TATA-TTATTTACTTCT---------T--T-C-GGC--T--T--A----T-----A-GG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--CCT-GCTGCTTA-A-A--AG----C-C--ACTA-TCACAGG--AA-GCG---ACATG------GA--GCAAGGACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATAAGG--AC-A--GT----G-GGCG-T-GATGATA-C---G--C-AGTAAA--T--GA--------AT--ATTAAC-AATT-----AAAAA-GA---T-AG---AA----GTG-TGTT-GT--GCATGA-AAGAGACAA-G--TC-GGAAATT-----TAAG--GG---A------AAAAA-----GTATCC--GTG------AAA--A-TTCGA---C----TCG----TCGCT-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AAAAAACCAG--TTTTTTGGG--A--CA--TTAAAC--AAC--GCT----CCA-A-GC-------CT-TAT--CCCAT--T-AT--GCC--AC-G-CC-GCAACA------------TTCAA--AACACCC---TT-G-----GAAA---C-T-T-AAC---GCTGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAA--A-GT-AAC-G-AAA-Ttccac
gi|2 : taatGGGGT-TC--CC-C-T-GTTA--TT-T-TGAGA-CTAAAAAA-GCAC-ATAAATTCGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TTT-AA--C-TCAA-AT---TAT-TTTG------AC--AA-TT---CCTTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-AGA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAGT-TC--C-A-CT-----G---GT---GTACT-A-T---ATCTGATG----GAAAACTT-T-----TAT-TGTT----A----CAG-TC--T-TC-A-T--GC-A-AAC---A--TTTA----GGAAA-T-CACG---CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggttcccctgttattttgagactaaaaaagcacataaattcgcttcctgcatgatttttaactcaaattattttgacaattccttgtcaatacacaccttttagacttattttcttagattttggaataaagacaaaagttccactggtgtactatatctgatggaaaacttttattgttacagtcttcatgcaaacatttaggaaatcacgcatgatacaatgcaacaccttctttat
gi|20 : taattagattcaaaattatgtccatgcacctgaaaatattgaatatacattgcaatttgttaactggatatatcatttcgttttagatatacattgttcaattttatcagtttatccctgtactgttccagtgtaacaagggatgttatattatttacttctttcggcttataggccttgatgccttgccctgctgcttaaaagccactatcacaggaagcgacatggagcaaggacccaaacggttcttgttcctataaggacagtgggcgtgatgatacgcagtaaatgaatattaacaattaaaaagatagaagtgtgttgtgcatgaaagagacaagtcggaaatttaagggaaaaaagtatccgtgaaaattcgactcgtcgctttaaaaaaaaaacaaaaaaccagttttttgggacattaaacaacgctccaagccttatcccattatgccacgccgcaacattcaaaacacccttggaaacttaacgctgcagatgaagttgaaaggaaagtaacgaaatgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-T------------------------T-G-C-AA--T--T---------------A-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------CGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTat
gi|3 : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-A--TGTC--CA-T----GCCAC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-ATTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTT-AGT--CC---TG-T-C-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TATA-TA--------TT---------A--T-A-A----T--T--A----T-----ATAT--TT---TT-TTTGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--A-----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAT-ATCCAAACTGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-T-ATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGTTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCT--GTG------AAA-GA--TCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GT--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CA-AT--T-AT--GCC--AC-GACC-GCA-CG------------TTCAA--A-CAGCG---CA-G----TGAAA---C-T-G-CAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-G--A-GT-AACTG-AAAGTC--GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-T-T-GT-A--TT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC--ATA-C-----A-TA-C-TTTTAGACTTA-TT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AAG-----A-C-A-GAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-T--A-T--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CA-----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTCATTTTA
gi|4 : CAAT-AGATTT-CA--GAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CT-AAAA-TAT-TG------AAT-AT-ACTAATT-G-C-AA--T--T-GT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTT-----------GAATATA-CAT---GTTCAATATTTA-T-ACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--C---A-T-TA-CA--AGG--GA---------TAT--ATA-TA--------TT---------TCAT-C-T----TCCT--AAGCTT-----ATAG--CT---TT-GATGCTCGTTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAA---C-CTAA-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCA------------------CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG---C-A--GT----GTG-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAA----T-GA--------ATTAAA-AAC-ATTTT----AAA---GA-CGT-AG---A-----GTG-TGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAACG--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAAAATT-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCA-T-TT---AAA-AAAA-AC----C---AA-----A-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--T-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AT--GCC--AC-G-GC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCA---CA-A----GGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-AA-T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAC-G-AAA-TCG-g
gi|4 : cCGGGGA-TT--CC-C-T-AT-A--TT-T--GAGATCTAAAAA--TCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--TAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAACTT---TAT-TTTG------ACT-AA-T----A-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTCAAACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AA------A-C-A-AAAAG-TT--C-AACT-----G---TT---TT--T-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-T--GCAA-CAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattccctatatttgagatctaaaaatcacataatcgcttcctgtatgatttcaactcaactttattttgactaatattgtcaatacacacctttcaaacttattttcttatattttgataaaacaaaaagttcaactgtttttatatctatgaataactttattttaccgatctttcatgcaacacctttagggaaatcaccatgatacatgcaacaccttcttta
gi|5 : ccaatagatttcagaatatatgtccatgcacctaaaatattgaatatactaattgcaattgtaactggaatatatcatttcgttgaatatacatgttcaatatttatacagtttagtcctgtgctgtgtcattacaagggatatatatatttcatcttcctaagcttatagctttgatgctcgttgcgtgtgctaaaaacctaatatcacagaagcgacatgagagcacttgttcctataggcagtgtgcgtgtgatacgcataatgaattaaaaacattttaaagacgtagagtgtgttgtgatgaagagacaacgtcgaaatttaaagggaaaaaaattgtatccgtgaaagattcgaactcggtcatttaaaaaaaaccaaagttggacatttaaattccacagccttatccattatgccacggcgcacattcaaacaccacaaggaaacttaacgtgcagaatgaagttgaaaggagaagtaacgaaatcgtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-AATT-G-CCAA--T--TTGC-A-CTGGTTTATA-TATTAACATGT-TTC-GTTT-T--------AGAT-TA-CAT---GTTCA-T-TTTA-TTTCAGTTT-ATT--CCCCTTG-TGCCTG--C-T--TC--A-T-TATCA--GGA--GA---------TAT-ATTA-TT--------TT---------C--T-CTG----T--TTTA----TCGCTTATAG--CT---TTTGATGC---TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAATACT-T--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACA-G-A----GA--G--AG-ACACAA-CGGTC---TA-T-GTTGCTC--T--ATA-GG--AC-ATAGT----GTG-CG-T-T-GGATA-T---T--C-A-TA----TT-GA--------TT--AA-AAC-ATTTT----TAAAA-GAAC-T-TA---AA----TTGGTGTTTGT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TCCG-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAA---G-GTAATC--ATGCTTGATAAA-GA-TTCGA--AC----TCA-GCGTCG-T-TT---AAA-AAAATAAA---C---A--------G--TT-----GG--G--CACGTT---T--AAA--G-T----CCACA-AC-------CT-TAT--CC-AT--------------------------A------------TTCAA--A-CGTAG---TG-A----GGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAA-G-AAA-TCC--TGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-CCT-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-AAT-TC--AA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AAAA-C-----A-CACC-ATTTAGGCTTATTT-TCT-T-ATG---CT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAAAG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-A-C---ATAT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-A-C--GC-AGCAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTa
gi|6 : aTTCTAT-AGAGTTTCACCAAT-TATGA--TGTCTCCA-TATTTGC-AC-CTGAAAA-TCT-TT------GAT-ATTACGAATTAG-CTAA--T--TTGT-ACCTGGAT-ATA-T-TCAAT---T-TTC-GTTT-A--------GAATA-A-TATCATGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGTTCCC---TG-TGT-GGGATGT--CC--A-T-TAACA---GG--GA---------TAT-TATAGTA--------TT---------TG-TAT-A----T--C--A----T-----ATAT--TT---TT-T-TGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-C--AA----C----A-TAGTCACAG---AA-G-G---ACATGGA----GA--G-AAT-ACCCAAA-GGTT---CTGT-TTT--CC--T--ATATGG--AC-A--GT----GTG-CGAT-G-TGATAAT---GTTC-A-TGAA--TTTGA--------AT--AA-AACGATTTTTTTAAAAAA-GA-C-T-AG---AT----GTGATGTT-GT--G-ATGATA-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA---G---A------AAAAA---T-TTAATCAGGTG------AAG-AA-TTCGA--AC----ATA-G--------TT---A-------------------------------T-----GG--AAGCA--TT---T--AAA--G-C----C--CT-GC-------CT-TAT--CC-ATACT-ATGAGCCCGACGG-CT-GC--C-------------TTCAAGTA-TATCGAGACA-G----TGAAA---C-TGT-AACA--G-TGCAGTA--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-TAC-G-AAA-T---GTGT
gi|6 : gCGGGGA-TT--CG-C-T--T-G--TT-T-TGAT--CTGAAAAAGTCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--CAT-T-GTT-T---AA--C-TCAA-TT---TAA-TTTT------ACTAAA-TT---C-TTG-----TC-AATATC-----ATCACC--------CTTATTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattcgcttgttttgatctgaaaaagtcacataatcgcttcctgcattgtttaactcaatttaattttactaaattcttgtcaatatcatcacccttatttt
gi|7 : gttctatagagtttcaccaattatgatgtctccatatttgcacctgaaaatctttgatattacgaattagctaatttgtacctggatatattcaattttcgtttagaataatatcatgttcaatatttattacagtttagttccctgtgtgggatgtccattaacagggatattatagtatttgtatatcatatatttttttgccttgcgtgtgctacaacatagtcacagaaggacatggagagaatacccaaaggttctgttttcctatatggacagtgtgcgatgtgataatgttcatgaatttgaataaaacgatttttttaaaaaagactagatgtgatgttgtgatgatagagacaagtcgaaatttaaagaaaaaatttaatcaggtgaagaattcgaacatagttatggaagcatttaaagccctgccttatccatactatgagcccgacggctgccttcaagtatatcgagacagtgaaactgtaacagtgcagtatgaagttgaaaggagagttacgaaatgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AAAAA-GA-C-T-AAGT-AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGGGAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GATTTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAAGATCAGAAA-----C-GGTTT-----GT--A--CG--TT---TTAAAA--G-T----CCATAGGCCGCCCCGCT-TATC-CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--ACCACCG---CA------TGAAA---C-T-TAAAC---G-TGCGG-A--T---GAAGTTGAA--AG--A--A-GT-AAC-G-AAA-TCGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATTT--CC-C-T-GT-AT-TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TCCAAA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACA-AT-TT---C-TTG-----TCAAATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCTAA-ATT---TT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAATG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-
gi|8 : A-TATATA------AATGAT--T-AATT-A-T-GA--TAGCTGT-AACTGGG---CA-TACCA-----AATTC-GAGTAT--------CGGTATA-CAT--------AT-TTTA-TTACAGTTT-AGT--TT---TGTTGC-TG--TGTA-CC--A---TAAGAGCAGG--GA---------
gi|8 : --GA---------TATCTGTA-TC--------TCC--------T--T-C-GAGC-C--T-------C-----ATAG--CCCCTTT-GA---C--TTG--C--G-T-GACGCT---A-A--AAAA--C-C--AGTA-TCACAG---AACGCGCAAACATG-A----GACAG-AAA-ACCCAAACGCAT---CT-TCGTT--TCCTT--ATATGGTAACTA--GTCGAAATGGCG-T-G---ATA-CTTCG--C-A-TAAAATTT-GATTATTTATAT--AT-AAC-ATTTC----AAGAA--A-C-TGAG---AATGTTGTCATGTT-GT--G-A-GA-A-G---CAA-C--TA-C-AAACTATCTGTAAGAGGG---A------AAAAAGT-T-GTCTCC--GTG------AAAAGA-TTCAA--ACC---TCG-GC-TCG-TCTT---AAA-AACA-AAC---C---TA-----T-G--T------AG--A---A--GT---T--AAAAAG-TTACACCATA-AC-------CT-TCT--CA-GT--T-AC--GCCC-AC-G-C--ACA-CA------------TTCAA--A-agcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtcagatatctgtatctccttcgagcctcatagcccctttgacttgcgtgacgctaaaaaaccagtatcacagaacgcgcaaacatgagacagaaaacccaaacgcatcttcgtttccttatatggtaactagtcgaaatggcgtgatacttcgcataaaatttgattatttatatataacatttcaagaaactgagaatgttgtcatgttgtgagaagcaactacaaactatctgtaagagggaaaaaagttgtctccgtgaaaagattcaaacctcggctcgtcttaaaaacaaacctatgtagaagttaaaaagttacaccataaccttctcagttacgcccacgcacacattcaaa
gi|9 : atatataaatgattaattatgatagctgtaactgggcataccaaattcgagtatcggtatacatattttattacagtttagttttgttgctgtgtaccataagagcagggaagcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtca--TT---T--AAA----T----CCACATGT-------CT-GAT--CC-AT----AC--GCC--AC-G-CCCGCA-CA------------TTCAA--AGCATCG---CA-G----GGAAA---CTT-T-AGC---G-TGCGG-A--T---GAATTTTAA--AG--A--A-GT-AAC-ATGAA-TC--GTGT
gi|9 : tCGGGAC-TT--CC-C-T--C-A--TT-TGTGAGG-CTAACA---TCGCTAAAAAT-CGC---TTG-C-TG--CAT-A-ATT-TC--AA--T---AA-TT---TAT-TT-G------ACT-AA-TT---C-T-G-----TC-CACA-C-----A-CACT-TTTTAGACTTATTT-C---T-AGA---TT-TTGGAATAT-CAA-----A-C---AAAAG-TT--C-A-C-----------T---TTACT-A-CTTAATAT-ATG----AATAAC-A-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-C-TCAA-C--GC-A--AC---AC-CTTT--A-AGAAA-T-CAC----CATGA--AC--ATGGCAACAC--TC-TTccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgggacttccctcatttgtgaggctaacatcgctaaaaatcgcttgctgcataatttcaataatttatttgactaattctgtccacacacactttttagacttatttctagattttggaatatcaaacaaaagttcactttactacttaatatatgaataacattattttatcgatctctcaacgcaacacctttaagaaatcaccatgaacatggcaacactcttgt
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 111 11111 1111111111 111 111 111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888 111 111111111 111 1 111 11111111 111111111 1 11111 1111111111 11111 111111 1111 222222222222222222222222222 11111 111111111 1 1111111 1111 11 222222222222 1111 111111111111 111 111 11 11 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 111111 11111 11111 11 11111 11 333333333 1111 111111111 111111111 1111 111111 1111 11111 111
lowQualScore : 8 4 55 7 3 55 55 3 7777 3 3 3 3 999999 3 22222 3 3 6 44 77 0 3 111 3 77777 3 3 2222222222 3 111 3 222 3 1 88 666 3 3 555 88 55 3 3 55 44 333333333 3 1 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000 44 555 3 1 77 44 77 3 3 6 777 3 44 888888888 6 6 222 3 555 888888 6666 88 0 2 3 666 3 7 55 44 44 0 55 3 55 7777 999 4 4 4 4 777 99 8 4 55 4 44444444 55 4 8 7777 4 4 4 4 222222222 0 4 55 4 4 4 9999 4 3 00000 55 9999999999 44444 99 111111 4 4 55 2222 4 99 4 4 777 4 4 888888888888888888888888888 00000 55 777 55 222222222 2 3333333 4 99 4 0000 666 33 4 4444 4 000000000000 2222 0 999999999999 222 4 4 4 222 8 4 00 777 22 88888 8 4 8 4 5 77 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 4 4 55 4 33 4 4 77 99 4 0 0 4 777 4 4 55 4 4 4 99 11 4 4 777 8 555555 4 4 777 8 00000 4 8 00000 8 4 4 4 4 777 4 1 00 11111 4 555 4 55 4 4 111111111 777 4 4 5 888 1 5 5555 444444444 5 5 222222222 5 5 5 9999 3333 999999 8888 5 5 88888 5 222 0 5
lowQualScore : . . .. . . .. .. . .... . . . . ...... . ..... . . . .. .. . . ... . ..... . . .......... . ... . ... . . .. ... . . ... .. .. . . .. .. ......... . . . ................................................. .. ... . . .. .. .. . . . ... . .. ......... . . ... . ... ...... .... .. . . . ... . . .. .. .. . .. . .. .... ... . . . . ... .. . . .. . ........ .. . . .... . . . . ......... . . .. . . . .... . . ..... .. .......... ..... .. ...... . . .. .... . .. . . ... . . ........................... ..... .. ... .. ......... . ....... . .. . .... ... .. . .... . ............ .... . ............ ... . . . ... . . .. ... .. ..... . . . . . .. .................................................................................................................................... . .. . . .. . .. . . .. .. . . . . ... . . .. . . . .. .. . . ... . ...... . . ... . ..... . . ..... . . . . . ... . . .. ..... . ... . .. . . ......... ... . . . ... . . .... ......... . . ......... . . . .... .... ...... .... . . ..... . ... . .
lowQualScore : 0 0 55 3 6 00 00 6 7777 6 6 3 3 666666 3 11111 1 1 2 22 33 5 1 666 3 55555 3 3 7777777777 3 999 2 333 6 4 66 444 6 6 222 66 00 6 6 00 66 333333333 6 0 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000 66 888 3 3 99 66 99 3 3 7 111 3 66 111111111 7 7 555 3 888 888888 8888 77 5 0 6 444 6 3 00 66 66 0 00 6 00 7777 000 0 0 0 0 000 55 0 0 55 0 55555555 55 0 0 7777 0 0 0 0 999999999 7 0 55 0 0 0 5555 0 6 00000 55 5555555555 88888 55 555555 0 0 55 5555 0 55 0 0 000 0 0 333333333333333333333333333 33333 55 000 55 000000000 0 0000000 0 55 0 3333 000 55 0 6666 0 555555555555 5555 9 888888888888 222 4 4 4 222 9 4 66 888 22 99999 9 4 9 4 0 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 55 0 0 66 0 55 0 0 22 55 0 8 8 0 000 0 0 55 0 0 0 55 00 0 0 000 0 555555 0 0 000 0 00000 0 0 00000 0 0 0 4 4 888 4 1 66 11111 4 333 4 00 4 4 777777777 888 8 4 0 888 0 0 6666 222222222 0 0 222222222 0 0 0 9999 6666 444444 4444 0 0 11111 7 999 7 7
consensus : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNTA-TN--------TTC--------T--T-C-G----T--T--A----T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----NGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
Reference ( family-494 ) : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNTA-TN--------TT---------T--T-C-G----T--T--A----T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----NGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
gi|1 : TTCAATTAGAGTC-CA--AA--TAT-A---GTC--CA-T----AC-ACGCTGAAAA-TAT-TGTCAGACAAT-TA-AC-TATT-G-C-A---T--TTGC-AAATGGAT-ATAATAGCA-----T-TTC-GTTT-TTTACATGTAGATATA-CAT---GTTCAATATTTA-TAACAGTTT-A-T--CC---TG-TGC-TG--CGTTCCC--A-T-TAACA--AGG--GA---------GAT-TTTC-TA--------TC---------T--T-C-C----T--TCGAGC--T-----ATAG--CC---TT-G-TGCCG-TTG--CC-G-T-G-TGCT---A-A--AA----AAC--A-GC-TTACAG---AA-GCG---ACAAG-A----GA---CAAG-AACTAACGGGTT---CT-T-GT---CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----G--ACG-T-G-TGATA-C---G--CCA-TAAA--TT-GT--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAAAGA-C-T-A-----A----GTG-T-TT-GT--G-ATGA---GAGACA--GCTTC-G-AAATT-----TA----GG---A------AAATA---T-GTATCC--GTG------CAA-GA-TTCGA--AC----TCGAG--TCG-T-T--------AAAA-ATA---C---A--------G--TT-----GG------A--GT---T--AAA--G-T----CCACAGGC-------CTGTAT--CC-AT--TAAC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA-------------TCAAC-A-GACCG---TATG----CGAAAC--C-T-T-AAC---GAGGCAG-A--T---GAAAGTGAAGGAGGAATTA-GT-AACAG-AAA-TCG-GTGT
gi|1 : tCGGGGA-TCTCCC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAT--GCA--ATAAAT-CGC---TTCTC-TG--CAT-G-ATT-TC--AATAC-TTAT-TT---TATGTTTGG-----ACT-AAAGT---C-TTG-----TC-AATAAC-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-TAATA---TT-TTGGAATC--AAG-----A-CAA-AAAAG-TT--CTA-TT-----GGGTTT---TTTCT-A-T---ATAT--TG----AATAAC-TCT-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-ATC--GC-A-TACACAAC-TTTA----GGAAA-T-CA-----CACAA-TGCTTAATG-AACA-CTTC-TTATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcggggatctcccctgtattttgaggctaaaatgcaataaatcgcttctctgcatgatttcaatacttattttatgtttggactaaagtcttgtcaataacacaccttttagacttattttcttaatattttggaatcaagacaaaaaagttctattgggttttttctatatattgaataactcttattttatcgatctttcatcgcatacacaactttaggaaatcacacaatgcttaatgaacacttcttatataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|10 : tttcaattagagtccaaatatagtccatacacgctgaaaatattgtcagacaattaactattgcatttgcaaatggatataatagcatttcgttttttacatgtagatatacatgttcaatatttataacagtttatcctgtgctgcgttcccattaacaagggagattttctatcttccttcgagctatagccttgtgccgttgccgtgtgctaaaaaacagcttacagaagcgacaagagacaagaactaacgggttcttgtcctataggacagtgacgtgtgatacgccataaattgtataaaacattttaaaaaagactaagtgtttgtgatgagagacagcttcgaaatttaggaaaatatgtatccgtgcaagattcgaactcgagtcgttaaaaatacagttggagttaaagtccacaggcctgtatccattaacgccacgccgcacatcaacagaccgtatgcgaaaccttaacgaggcagatgaaagtgaaggaggaattagtaacagaaatcggtgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-AATTGTC--CAAT----GC-AC-CTGAAAAATAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-GGC-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTCAGTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTATTTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--CCCAA-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TATA-TA--------TTTTATCTTCCT--T-C-GGC--T--T--T----T-----ATAGGCCC---TT-GATGCT--TTG--CCGA-TAG-TGCTAAAA-A--AA----C-C--A-TATTCACAGA--AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAA--ACCC-AACGGTT---CT-TGGTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-T-G-TGATA-C---G--CTA-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-A-TTT----AAAAA-GA-C-T-AGTCTAA----GTGGTGTT-GTTGA-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-Ataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|11 : AAT-AGAGTT-AA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG-------AT-A--AC-TATT-G-C-AATTT--TTGC-AACC-GA--ATA-TATCAAT---T-TCC-GTTT-T--------AAATATAGCAT--TGTTCATAACTTA--TACAGTTT---TA-CC---TG-TGC-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGGGAGA---------TAT-TTTA-TC--------GTCC-------T--T-C-GACTTT--T--A----------AAAA--CT---CT-GATACC--TTGGCC--G-T-G-TACTA--A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-ATCTCGA--GTAAG-AACCCAACGGTTTTCTT-T-GTT--CC--T--ATA-G----T-G--GT----GT---G-TAG-TGGTA-C---GC-C-A-TAAA--TT-GA--------AT---A-AAC-ATTTT----
gi|12 : tgGGGGA-TT--CC-C-TTGT-AATTT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-CTTG--CAT-GAATT-TC--AA--CTTCAA-TT---TATATTTGGTTAAAACT-AA-TTTTAC-TTG-----TC-AATA-TCCTCAA-CACCTTTTTAGATGTATTTATCT-T-ATATTTTT-TTGGAATA--AAG-----AGC-AGAAAAG-TTTCC-A-CTCTGAGG---TT---TT-TT-ATT---ATCT-ATGA---AATAAC-A-TATGGATAT-T-TT----ACAACCCGAGCT-TGTC-A-T--GC-A--AC---ACTTTTA--GAGGAAATT-CACATTGGATGATTAC--ATGGCAA-ACATCC-TTTT
gi|13 : GGGGA-TT--CCAC-T-GT-AA-TTAT-TGAAG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAG-TGCGCATTG-C-TGGTCATCG-ATTATC--AAGAC-TTAA-TTATATAT-TATG------A-T-AA-TT---CATTGGTACATC-A-TA-C-----AACACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TTGTTGGAATAACAAGCGAGAA-C-A-AAAAGAGT--T-A-CTAACTGG---TTTCATTACTGA-T---ATA--ATGATGTAGTAAC-T-A-----TATAT-ATATAAA----TCGATCTAT-TC-A-CCGGCAA-CAC----C-TTTAAGA-GGAAA-TGCAC----CAt
gi|14 : -AAACT-----TAAA--GG---ACTAAAAAAAAA---TTGTATCCT-GTG------AAA-GG-ATCGATTACCTCATCC-G--TCG-T-TTTAAAAA-GAAA-AGA---C---AA-----C-A--GT-----GGGAA--CA--TT---T--AAAT-G-T----CCACA-GC-------CT-TATCACT-GT--T-AT--GTCG-AC-G-AC-TCA-TACAGTCAACAATCTCCAA--A-TAACGAC-CA-GAAGTCGAGAATTC-T-T-AATCGGG-TGCAG-AGCTAAGAAAGTTGAAAGAGGAC--A-ATAAAC-G-AA
gi|15 : aaaactacccgataTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-C----GC-AC-CTGGAAA-TAT-AG------AAT-A--AA-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-A--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTTCAGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GAGATACAGTGTAT-TTTA-TC--------TTCC-------T--T-C-G----A--C--T----T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--CCG--C--G-C-G-AGCTA--A-A--AA----C-C--A-CA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAgagtc
gi|16 : TTCAAT-ATAGTT-CA--AAA-CAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-A--AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ACA-TATCA-----G-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTT-AGT--CC---TG-TAC-TA--CGT--CC--A-T-T------------------------T-TTTA-TC--------TTCC-------T--T-C-G----G--C--T----T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA------------A-TCACA--------C------------------------------AACGGTC---CT-T-GTT--CC--TGAATA-GG--AC-A--GT----G
gi|17 : C--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTA-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TACA--TT-GA--------AT--AA-AACAATTTA----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GT-GTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGAAAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TC---AAGTTAAA-AAA---C---AA-----
gi|18 : -----ATAT--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---ATAACAA----C-C--A-TA-TCACGGTCTAA-GCG---ACATG-G----CA--GCAAG-ACCCAAA-GGTC---CT-T-GTT--CC--T--ATA-acccagttacatggacgttt
gi|19 : TTCAATTAGAGAT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGGAAC-TAT-TG------AAT-AC-AT-CCTC-G-C-AA--TA-TAGC--ACTGGA--
gi|2 : T-AGA-TT-CA--AAA-T-T-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-A-TT-G-C-AA--T--TTGTTAACTGGA---TA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAAT-TTTA-T--CAGTTT-ATC--CC---TG-TAC-TG--T-T--CC--AGTGTAACA--AGG--GA---------TGT-TATA-TTATTTACTTCT---------T--T-C-GGC--T--T--A----T-----A-GG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--CCT-GCTGCTTA-A-A--AG----C-C--ACTA-TCACAGG--AA-GCG---ACATG------GA--GCAAGGACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATAAGG--AC-A--GT----G-GGCG-T-GATGATA-C---G--C-AGTAAA--T--GA--------AT--ATTAAC-AATT-----AAAAA-GA---T-AG---AA----GTG-TGTT-GT--GCATGA-AAGAGACAA-G--TC-GGAAATT-----TAAG--GG---A------AAAAA-----GTATCC--GTG------AAA--A-TTCGA---C----TCG----TCGCT-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AAAAAACCAG--TTTTTTGGG--A--CA--TTAAAC--AAC--GCT----CCA-A-GC-------CT-TAT--CCCAT--T-AT--GCC--AC-G-CC-GCAACA------------TTCAA--AACACC----CT-T----GGAAA---C-T-T-AAC---GCTGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAA--A-GT-AAC-G-AAA-Ttccac
gi|2 : taatGGGGT-TC--CC-C-T-GTTA--TT-T-TGAGA-CTAAAAAA-GCAC-ATAAATTCGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TTT-AA--C-TCAA-AT---TAT-TTTG------AC--AA-TT---CCTTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-AGA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAGT-TC--C-A-CT-----G---GT---GTACT-A-T---ATCTGATG----GAAAACTT-T-----TAT-TGTT----A----CAG-TC--T-TC-A-T--GC-A-AAC---A--TTTA----GGAAA-T-CACG---CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggttcccctgttattttgagactaaaaaagcacataaattcgcttcctgcatgatttttaactcaaattattttgacaattccttgtcaatacacaccttttagacttattttcttagattttggaataaagacaaaagttccactggtgtactatatctgatggaaaacttttattgttacagtcttcatgcaaacatttaggaaatcacgcatgatacaatgcaacaccttctttat
gi|20 : taattagattcaaaattatgtccatgcacctgaaaatattgaatatacattgcaatttgttaactggatatatcatttcgttttagatatacattgttcaattttatcagtttatccctgtactgttccagtgtaacaagggatgttatattatttacttctttcggcttataggccttgatgccttgccctgctgcttaaaagccactatcacaggaagcgacatggagcaaggacccaaacggttcttgttcctataaggacagtgggcgtgatgatacgcagtaaatgaatattaacaattaaaaagatagaagtgtgttgtgcatgaaagagacaagtcggaaatttaagggaaaaaagtatccgtgaaaattcgactcgtcgctttaaaaaaaaaacaaaaaaccagttttttgggacattaaacaacgctccaagccttatcccattatgccacgccgcaacattcaaaacacccttggaaacttaacgctgcagatgaagttgaaaggaaagtaacgaaatgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-T------------------------T-G-C-AA--T--T---------------A-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------CGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTat
gi|3 : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-A--TGTC--CA-T----GCCAC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-ATTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTT-AGT--CC---TG-T-C-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TATA-TA--------TT---------A--T-A-A----T--T--A----T-----ATAT--TT---TT-TTTGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--A-----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAT-ATCCAAACTGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-T-ATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGTTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCT--GTG------AAA-GA--TCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GT--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CA-AT--T-AT--GCC--AC-GACC-GCA-CG------------TTCAA--A-CAGCG---CA-G----TGAAA---C-T-G-CAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-G--A-GT-AACTG-AAAGTC--GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-T-T-GT-A--TT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC--ATA-C-----A-TA-C-TTTTAGACTTA-TT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AAG-----A-C-A-GAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-T--A-T--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CA-----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTCATTTTA
gi|4 : CAAT-AGATTT-CA--GAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CT-AAAA-TAT-TG------AAT-AT-ACTAATT-G-C-AA--T--T-GT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTT-----------GAATATA-CAT---GTTCAATATTTA-T-ACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--C---A-T-TA-CA--AGG--GA---------TAT--ATA-TA--------TT---------TCAT-C-T----TCCT--AAGCTT-----ATAG--CT---TT-GATGCTCGTTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAA---C-CTAA-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCA------------------CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG---C-A--GT----GTG-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAA----T-GA--------ATTAAA-AAC-ATTTT----AAA---GA-CGT-AG---A-----GTG-TGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAACG--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAAAATT-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCA-T-TT---AAA-AAAA-AC----C---AA-----A-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--T-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AT--GCC--AC-G-GC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCA---CA-A----GGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-AA-T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAC-G-AAA-TCG-g
gi|4 : cCGGGGA-TT--CC-C-T-AT-A--TT-T--GAGATCTAAAAA--TCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--TAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAACTT---TAT-TTTG------ACT-AA-T----A-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTCAAACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AA------A-C-A-AAAAG-TT--C-AACT-----G---TT---TT--T-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-T--GCAA-CAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattccctatatttgagatctaaaaatcacataatcgcttcctgtatgatttcaactcaactttattttgactaatattgtcaatacacacctttcaaacttattttcttatattttgataaaacaaaaagttcaactgtttttatatctatgaataactttattttaccgatctttcatgcaacacctttagggaaatcaccatgatacatgcaacaccttcttta
gi|5 : ccaatagatttcagaatatatgtccatgcacctaaaatattgaatatactaattgcaattgtaactggaatatatcatttcgttgaatatacatgttcaatatttatacagtttagtcctgtgctgtgtcattacaagggatatatatatttcatcttcctaagcttatagctttgatgctcgttgcgtgtgctaaaaacctaatatcacagaagcgacatgagagcacttgttcctataggcagtgtgcgtgtgatacgcataatgaattaaaaacattttaaagacgtagagtgtgttgtgatgaagagacaacgtcgaaatttaaagggaaaaaaattgtatccgtgaaagattcgaactcggtcatttaaaaaaaaccaaagttggacatttaaattccacagccttatccattatgccacggcgcacattcaaacaccacaaggaaacttaacgtgcagaatgaagttgaaaggagaagtaacgaaatcgtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-AATT-G-CCAA--T--TTGC-A-CTGGTTTATA-TATTAACATGT-TTC-GTTT-T--------AGAT-TA-CAT---GTTCA-T-TTTA-TTTCAGTTT-ATT--CCCCTTG-TGCCTG--C-T--TC--A-T-TATCA--GGA--GA---------TAT-ATTA-TT--------TT---------C--T-CTG----T--TTTA----TCGCTTATAG--CT---TTTGATGC---TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAATACT-T--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACA-G-A----GA--G--AG-ACACAA-CGGTC---TA-T-GTTGCTC--T--ATA-GG--AC-ATAGT----GTG-CG-T-T-GGATA-T---T--C-A-TA----TT-GA--------TT--AA-AAC-ATTTT----TAAAA-GAAC-T-TA---AA----TTGGTGTTTGT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TCCG-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAA---G-GTAATC--ATGCTTGATAAA-GA-TTCGA--AC----TCA-GCGTCG-T-TT---AAA-AAAATAAA---C---A--------G--TT-----GG--G--CACGTT---T--AAA--G-T----CCACA-AC-------CT-TAT--CC-AT--------------------------A------------TTCAA--A-CGTAG---TG-A----GGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAA-G-AAA-TCC--TGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-CCT-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-AAT-TC--AA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AAAA-C-----A-CACC-ATTTAGGCTTATTT-TCT-T-ATG---CT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAAAG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-A-C---ATAT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-A-C--GC-AGCAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTa
gi|6 : aTTCTAT-AGAGTTTCACCAAT-TATGA--TGTCTCCA-TATTTGC-AC-CTGAAAA-TCT-TT------GAT-ATTACGAATTAG-CTAA--T--TTGT-ACCTGGAT-ATA-T-TCAAT---T-TTC-GTTT-A--------GAATA-A-TATCATGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGTTCCC---TG-TGT-GGGATGT--CC--A-T-TAACA---GG--GA---------TAT-TATAGTA--------TT---------TG-TAT-A----T--C--A----T-----ATAT--TT---TT-T-TGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-C--AA----C----A-TAGTCACAG---AA-G-G---ACATGGA----GA--G-AAT-ACCCAAA-GGTT---CTGT-TTT--CC--T--ATATGG--AC-A--GT----GTG-CGAT-G-TGATAAT---GTTC-A-TGAA--TTTGA--------AT--AA-AACGATTTTTTTAAAAAA-GA-C-T-AG---AT----GTGATGTT-GT--G-ATGATA-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA---G---A------AAAAA---T-TTAATCAGGTG------AAG-AA-TTCGA--AC----ATA-G--------TT---A-------------------------------T-----GG--AAGCA--TT---T--AAA--G-C----C--CT-GC-------CT-TAT--CC-ATACT-ATGAGCCCGACGG-CT-GC--C-------------TTCAAGTA-TATCGAGACA-G----TGAAA---C-TGT-AACA--G-TGCAGTA--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-TAC-G-AAA-T---GTGT
gi|6 : gCGGGGA-TT--CG-C-T--T-G--TT-T-TGAT--CTGAAAAAGTCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--CAT-T-GTT-T---AA--C-TCAA-TT---TAA-TTTT------ACTAAA-TT---C-TTG-----TC-AATATC-----ATCACC--------CTTATTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattcgcttgttttgatctgaaaaagtcacataatcgcttcctgcattgtttaactcaatttaattttactaaattcttgtcaatatcatcacccttatttt
gi|7 : gttctatagagtttcaccaattatgatgtctccatatttgcacctgaaaatctttgatattacgaattagctaatttgtacctggatatattcaattttcgtttagaataatatcatgttcaatatttattacagtttagttccctgtgtgggatgtccattaacagggatattatagtatttgtatatcatatatttttttgccttgcgtgtgctacaacatagtcacagaaggacatggagagaatacccaaaggttctgttttcctatatggacagtgtgcgatgtgataatgttcatgaatttgaataaaacgatttttttaaaaaagactagatgtgatgttgtgatgatagagacaagtcgaaatttaaagaaaaaatttaatcaggtgaagaattcgaacatagttatggaagcatttaaagccctgccttatccatactatgagcccgacggctgccttcaagtatatcgagacagtgaaactgtaacagtgcagtatgaagttgaaaggagagttacgaaatgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AAAAA-GA-C-T-AAGT-AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGGGAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GATTTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAAGATCAGAAA-----C-GGTTT-----GT--A--CG--TT---TTAAAA--G-T----CCATAGGCCGCCCCGCT-TATC-CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--ACCACCG---CA------TGAAA---C-T-TAAAC---G-TGCGG-A--T---GAAGTTGAA--AG--A--A-GT-AAC-G-AAA-TCGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATTT--CC-C-T-GT-AT-TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TCCAAA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACA-AT-TT---C-TTG-----TCAAATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCTAA-ATT---TT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAATG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-
gi|8 : A-TATATA------AATGAT--T-AATT-A-T-GA--TAGCTGT-AACTGGG---CA-TACCA-----AATTC-GAGTAT--------CGGTATA-CAT--------AT-TTTA-TTACAGTTT-AGT--TT---TGTTGC-TG--TGTA-CC--A---TAAGAGCAGG--GA---------
gi|8 : --GA---------TATCTGTA-TC--------TCC--------T--T-C-GAGC-C--T-------C-----ATAG--CCCCTTT-GA---C--TTG--C--G-T-GACGCT---A-A--AAAA--C-C--AGTA-TCACAG---AACGCGCAAACATG-A----GACAG-AAA-ACCCAAACGCAT---CT-TCGTT--TCCTT--ATATGGTAACTA--GTCGAAATGGCG-T-G---ATA-CTTCG--C-A-TAAAATTT-GATTATTTATAT--AT-AAC-ATTTC----AAGAA--A-C-TGAG---AATGTTGTCATGTT-GT--G-A-GA-A-G---CAA-C--TA-C-AAACTATCTGTAAGAGGG---A------AAAAAGT-T-GTCTCC--GTG------AAAAGA-TTCAA--ACC---TCG-GC-TCG-TCTT---AAA-AACA-AAC---C---TA-----T-G--T------AG--A---A--GT---T--AAAAAG-TTACACCATA-AC-------CT-TCT--CA-GT--T-AC--GCCC-AC-G-C--ACA-CA------------TTCAA--A-agcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtcagatatctgtatctccttcgagcctcatagcccctttgacttgcgtgacgctaaaaaaccagtatcacagaacgcgcaaacatgagacagaaaacccaaacgcatcttcgtttccttatatggtaactagtcgaaatggcgtgatacttcgcataaaatttgattatttatatataacatttcaagaaactgagaatgttgtcatgttgtgagaagcaactacaaactatctgtaagagggaaaaaagttgtctccgtgaaaagattcaaacctcggctcgtcttaaaaacaaacctatgtagaagttaaaaagttacaccataaccttctcagttacgcccacgcacacattcaaa
gi|9 : atatataaatgattaattatgatagctgtaactgggcataccaaattcgagtatcggtatacatattttattacagtttagttttgttgctgtgtaccataagagcagggaagcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtca--TT---T--AAA----T----CCACATGT-------CT-GAT--CC-AT----AC--GCC--AC-G-CCCGCA-CA------------TTCAA--AGCATCG---CA-G----GGAAA---CTT-T-AGC---G-TGCGG-A--T---GAATTTTAA--AG--A--A-GT-AAC-ATGAA-TC--GTGT
gi|9 : tCGGGAC-TT--CC-C-T--C-A--TT-TGTGAGG-CTAACA---TCGCTAAAAAT-CGC---TTG-C-TG--CAT-A-ATT-TC--AA--T---AA-TT---TAT-TT-G------ACT-AA-TT---C-T-G-----TC-CACA-C-----A-CACT-TTTTAGACTTATTT-C---T-AGA---TT-TTGGAATAT-CAA-----A-C---AAAAG-TT--C-A-C-----------T---TTACT-A-CTTAATAT-ATG----AATAAC-A-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-C-TCAA-C--GC-A--AC---AC-CTTT--A-AGAAA-T-CAC----CATGA--AC--ATGGCAACAC--TC-TTccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgggacttccctcatttgtgaggctaacatcgctaaaaatcgcttgctgcataatttcaataatttatttgactaattctgtccacacacactttttagacttatttctagattttggaatatcaaacaaaagttcactttactacttaatatatgaataacattattttatcgatctctcaacgcaacacctttaagaaatcaccatgaacatggcaacactcttgt
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 111 11111 1111111111 111 111 111111111 555555555555555555555555555555555555555555555 111 111111111 111 1 111 11111111 111111111 1 11111 1111111111 11111 111111 1111 222222222222222222222222222 11111 111111111 1 1111111 1111 11 222222222222 1111 111111111111 111 111 11 11 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 111111 11111 11111 11 11111 11 333333333 1111 111111111 111111111 1111 111111 1111 11111 111
lowQualScore : 8 4 55 7 3 55 55 3 7777 3 3 3 3 999999 3 22222 3 3 6 44 77 0 3 111 3 77777 3 3 2222222222 3 111 3 222 3 1 88 666 3 3 555 88 55 3 3 55 44 333333333 7 1 55 3 444444444444444444444444444444444444444444444 44 555 3 1 77 44 77 3 3 6 777 3 44 888888888 6 6 222 3 555 888888 6666 88 0 2 3 666 3 7 55 44 44 0 55 3 55 7777 999 4 4 4 4 777 99 8 4 55 4 44444444 55 4 8 7777 4 4 4 4 222222222 0 4 55 4 4 4 9999 4 3 00000 55 9999999999 44444 99 111111 4 4 55 2222 4 99 4 4 777 4 4 888888888888888888888888888 00000 55 777 55 222222222 2 3333333 4 99 4 0000 666 33 4 4444 4 000000000000 2222 0 999999999999 222 4 4 4 222 8 4 00 777 22 88888 8 4 8 4 5 77 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 4 4 55 4 33 4 4 77 99 4 0 0 4 777 4 4 55 4 4 4 99 11 4 4 777 8 555555 4 4 777 8 00000 4 8 00000 8 4 4 4 4 777 4 1 00 11111 4 555 4 55 4 4 111111111 777 4 4 5 888 1 5 5555 444444444 5 5 222222222 5 5 5 9999 3333 999999 8888 5 5 88888 5 222 0 5
lowQualScore : . . .. . . .. .. . .... . . . . ...... . ..... . . . .. .. . . ... . ..... . . .......... . ... . ... . . .. ... . . ... .. .. . . .. .. ......... . . .. . ............................................. .. ... . . .. .. .. . . . ... . .. ......... . . ... . ... ...... .... .. . . . ... . . .. .. .. . .. . .. .... ... . . . . ... .. . . .. . ........ .. . . .... . . . . ......... . . .. . . . .... . . ..... .. .......... ..... .. ...... . . .. .... . .. . . ... . . ........................... ..... .. ... .. ......... . ....... . .. . .... ... .. . .... . ............ .... . ............ ... . . . ... . . .. ... .. ..... . . . . . .. .................................................................................................................................... . .. . . .. . .. . . .. .. . . . . ... . . .. . . . .. .. . . ... . ...... . . ... . ..... . . ..... . . . . . ... . . .. ..... . ... . .. . . ......... ... . . . ... . . .... ......... . . ......... . . . .... .... ...... .... . . ..... . ... . .
lowQualScore : 0 0 55 3 6 00 00 6 7777 6 6 3 3 666666 3 11111 1 1 2 22 33 5 1 666 3 55555 3 3 7777777777 3 999 2 333 6 4 66 444 6 6 222 66 00 6 6 00 66 333333333 3 0 00 6 555555555555555555555555555555555555555555555 66 888 3 3 99 66 99 3 3 7 111 3 66 111111111 7 7 555 3 888 888888 8888 77 5 0 6 444 6 3 00 66 66 0 00 6 00 7777 000 0 0 0 0 000 55 0 0 55 0 55555555 55 0 0 7777 0 0 0 0 999999999 7 0 55 0 0 0 5555 0 6 00000 55 5555555555 88888 55 555555 0 0 55 5555 0 55 0 0 000 0 0 333333333333333333333333333 33333 55 000 55 000000000 0 0000000 0 55 0 3333 000 55 0 6666 0 555555555555 5555 9 888888888888 222 4 4 4 222 9 4 66 888 22 99999 9 4 9 4 0 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 55 0 0 66 0 55 0 0 22 55 0 8 8 0 000 0 0 55 0 0 0 55 00 0 0 000 0 555555 0 0 000 0 00000 0 0 00000 0 0 0 4 4 888 4 1 66 11111 4 333 4 00 4 4 777777777 888 8 4 0 888 0 0 6666 222222222 0 0 222222222 0 0 0 9999 6666 444444 4444 0 0 11111 7 999 7 7
consensus : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNT--A-T-N------T--T--------C-TT-CG----TT--A---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----NGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
Reference ( family-494 ) : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNT--A-T-N------T--T--------C-TT-CG----TT--A---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----NGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
gi|1 : TTCAATTAGAGTC-CA--AA--TAT-A---GTC--CA-T----AC-ACGCTGAAAA-TAT-TGTCAGACAAT-TA-AC-TATT-G-C-A---T--TTGC-AAATGGAT-ATAATAGCA-----T-TTC-GTTT-TTTACATGTAGATATA-CAT---GTTCAATATTTA-TAACAGTTT-A-T--CC---TG-TGC-TG--CGTTCCC--A-T-TAACA--AGG--GA---------GAT-TTTCTA-T-C------T--T--------CCTT-CG----AG--C---T-----ATAG--CC---TT-G-TGCCG-TTG--CC-G-T-G-TGCT---A-A--AA----AAC--A-GC-TTACAG---AA-GCG---ACAAG-A----GA---CAAG-AACTAACGGGTT---CT-T-GT---CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----G--ACG-T-G-TGATA-C---G--CCA-TAAA--TT-GT--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAAAGA-C-T-A-----A----GTG-T-TT-GT--G-ATGA---GAGACA--GCTTC-G-AAATT-----TA----GG---A------AAATA---T-GTATCC--GTG------CAA-GA-TTCGA--AC----TCGAG--TCG-T-T--------AAAA-ATA---C---A--------G--TT-----GG------A--GT---T--AAA--G-T----CCACAGGC-------CTGTAT--CC-AT--TAAC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA-------------TCAAC-A-GACCG---TATG----CGAAAC--C-T-T-AAC---GAGGCAG-A--T---GAAAGTGAAGGAGGAATTA-GT-AACAG-AAA-TCG-GTGT
gi|1 : tCGGGGA-TCTCCC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAT--GCA--ATAAAT-CGC---TTCTC-TG--CAT-G-ATT-TC--AATAC-TTAT-TT---TATGTTTGG-----ACT-AAAGT---C-TTG-----TC-AATAAC-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-TAATA---TT-TTGGAATC--AAG-----A-CAA-AAAAG-TT--CTA-TT-----GGGTTT---TTTCT-A-T---ATAT--TG----AATAAC-TCT-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-ATC--GC-A-TACACAAC-TTTA----GGAAA-T-CA-----CACAA-TGCTTAATG-AACA-CTTC-TTATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcggggatctcccctgtattttgaggctaaaatgcaataaatcgcttctctgcatgatttcaatacttattttatgtttggactaaagtcttgtcaataacacaccttttagacttattttcttaatattttggaatcaagacaaaaaagttctattgggttttttctatatattgaataactcttattttatcgatctttcatcgcatacacaactttaggaaatcacacaatgcttaatgaacacttcttatataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|10 : tttcaattagagtccaaatatagtccatacacgctgaaaatattgtcagacaattaactattgcatttgcaaatggatataatagcatttcgttttttacatgtagatatacatgttcaatatttataacagtttatcctgtgctgcgttcccattaacaagggagattttctatcttccttcgagctatagccttgtgccgttgccgtgtgctaaaaaacagcttacagaagcgacaagagacaagaactaacgggttcttgtcctataggacagtgacgtgtgatacgccataaattgtataaaacattttaaaaaagactaagtgtttgtgatgagagacagcttcgaaatttaggaaaatatgtatccgtgcaagattcgaactcgagtcgttaaaaatacagttggagttaaagtccacaggcctgtatccattaacgccacgccgcacatcaacagaccgtatgcgaaaccttaacgaggcagatgaaagtgaaggaggaattagtaacagaaatcggtgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-AATTGTC--CAAT----GC-AC-CTGAAAAATAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-GGC-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTCAGTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTATTTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--CCCAA-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TAT--A-T-A------T--TTTATCTTCC-TT-CGGC--TT--T---T-----ATAGGCCC---TT-GATGCT--TTG--CCGA-TAG-TGCTAAAA-A--AA----C-C--A-TATTCACAGA--AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAA--ACCC-AACGGTT---CT-TGGTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-T-G-TGATA-C---G--CTA-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-A-TTT----AAAAA-GA-C-T-AGTCTAA----GTGGTGTT-GTTGA-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-Ataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|11 : AAT-AGAGTT-AA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG-------AT-A--AC-TATT-G-C-AATTT--TTGC-AACC-GA--ATA-TATCAAT---T-TCC-GTTT-T--------AAATATAGCAT--TGTTCATAACTTA--TACAGTTT---TA-CC---TG-TGC-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGGGAGA---------TAT-TTT--A-TCG------T--C--------C-TT-CGACTTTT--A---------AAAA--CT---CT-GATACC--TTGGCC--G-T-G-TACTA--A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-ATCTCGA--GTAAG-AACCCAACGGTTTTCTT-T-GTT--CC--T--ATA-G----T-G--GT----GT---G-TAG-TGGTA-C---GC-C-A-TAAA--TT-GA--------AT---A-AAC-ATTTT----
gi|12 : tgGGGGA-TT--CC-C-TTGT-AATTT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-CTTG--CAT-GAATT-TC--AA--CTTCAA-TT---TATATTTGGTTAAAACT-AA-TTTTAC-TTG-----TC-AATA-TCCTCAA-CACCTTTTTAGATGTATTTATCT-T-ATATTTTT-TTGGAATA--AAG-----AGC-AGAAAAG-TTTCC-A-CTCTGAGG---TT---TT-TT-ATT---ATCT-ATGA---AATAAC-A-TATGGATAT-T-TT----ACAACCCGAGCT-TGTC-A-T--GC-A--AC---ACTTTTA--GAGGAAATT-CACATTGGATGATTAC--ATGGCAA-ACATCC-TTTT
gi|13 : GGGGA-TT--CCAC-T-GT-AA-TTAT-TGAAG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAG-TGCGCATTG-C-TGGTCATCG-ATTATC--AAGAC-TTAA-TTATATAT-TATG------A-T-AA-TT---CATTGGTACATC-A-TA-C-----AACACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TTGTTGGAATAACAAGCGAGAA-C-A-AAAAGAGT--T-A-CTAACTGG---TTTCATTACTGA-T---ATA--ATGATGTAGTAAC-T-A-----TATAT-ATATAAA----TCGATCTAT-TC-A-CCGGCAA-CAC----C-TTTAAGA-GGAAA-TGCAC----CAt
gi|14 : -AAACT-----TAAA--GG---ACTAAAAAAAAA---TTGTATCCT-GTG------AAA-GG-ATCGATTACCTCATCC-G--TCG-T-TTTAAAAA-GAAA-AGA---C---AA-----C-A--GT-----GGGAA--CA--TT---T--AAAT-G-T----CCACA-GC-------CT-TATCACT-GT--T-AT--GTCG-AC-G-AC-TCA-TACAGTCAACAATCTCCAA--A-TAACGAC-CA-GAAGTCGAGAATTC-T-T-AATCGGG-TGCAG-AGCTAAGAAAGTTGAAAGAGGAC--A-ATAAAC-G-AA
gi|15 : aaaactacccgataTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-C----GC-AC-CTGGAAA-TAT-AG------AAT-A--AA-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-A--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTTCAGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GAGATACAGTGTAT-TTT--A-T-C------T--TC-------C-TT-CG----AC--T---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--CCG--C--G-C-G-AGCTA--A-A--AA----C-C--A-CA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAgagtc
gi|16 : TTCAAT-ATAGTT-CA--AAA-CAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-A--AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ACA-TATCA-----G-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTT-AGT--CC---TG-TAC-TA--CGT--CC--A-T-T------------------------T-TTT--A-T-C------T--TC-------C-TT-CG----GC--T---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA------------A-TCACA--------C------------------------------AACGGTC---CT-T-GTT--CC--TGAATA-GG--AC-A--GT----G
gi|17 : C--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTA-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TACA--TT-GA--------AT--AA-AACAATTTA----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GT-GTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGAAAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TC---AAGTTAAA-AAA---C---AA-----
gi|18 : -----ATAT--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---ATAACAA----C-C--A-TA-TCACGGTCTAA-GCG---ACATG-G----CA--GCAAG-ACCCAAA-GGTC---CT-T-GTT--CC--T--ATA-acccagttacatggacgttt
gi|19 : TTCAATTAGAGAT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGGAAC-TAT-TG------AAT-AC-AT-CCTC-G-C-AA--TA-TAGC--ACTGGA--
gi|2 : T-AGA-TT-CA--AAA-T-T-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-A-TT-G-C-AA--T--TTGTTAACTGGA---TA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAAT-TTTA-T--CAGTTT-ATC--CC---TG-TAC-TG--T-T--CC--AGTGTAACA--AGG--GA---------TGT-TAT--A-T-TATTTACT--T--------C-TTTCGGC--TT--A---T-----A-GG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--CCT-GCTGCTTA-A-A--AG----C-C--ACTA-TCACAGG--AA-GCG---ACATG------GA--GCAAGGACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATAAGG--AC-A--GT----G-GGCG-T-GATGATA-C---G--C-AGTAAA--T--GA--------AT--ATTAAC-AATT-----AAAAA-GA---T-AG---AA----GTG-TGTT-GT--GCATGA-AAGAGACAA-G--TC-GGAAATT-----TAAG--GG---A------AAAAA-----GTATCC--GTG------AAA--A-TTCGA---C----TCG----TCGCT-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AAAAAACCAG--TTTTTTGGG--A--CA--TTAAAC--AAC--GCT----CCA-A-GC-------CT-TAT--CCCAT--T-AT--GCC--AC-G-CC-GCAACA------------TTCAA--AACACC----CT-T----GGAAA---C-T-T-AAC---GCTGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAA--A-GT-AAC-G-AAA-Ttccac
gi|2 : taatGGGGT-TC--CC-C-T-GTTA--TT-T-TGAGA-CTAAAAAA-GCAC-ATAAATTCGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TTT-AA--C-TCAA-AT---TAT-TTTG------AC--AA-TT---CCTTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-AGA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAGT-TC--C-A-CT-----G---GT---GTACT-A-T---ATCTGATG----GAAAACTT-T-----TAT-TGTT----A----CAG-TC--T-TC-A-T--GC-A-AAC---A--TTTA----GGAAA-T-CACG---CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggttcccctgttattttgagactaaaaaagcacataaattcgcttcctgcatgatttttaactcaaattattttgacaattccttgtcaatacacaccttttagacttattttcttagattttggaataaagacaaaagttccactggtgtactatatctgatggaaaacttttattgttacagtcttcatgcaaacatttaggaaatcacgcatgatacaatgcaacaccttctttat
gi|20 : taattagattcaaaattatgtccatgcacctgaaaatattgaatatacattgcaatttgttaactggatatatcatttcgttttagatatacattgttcaattttatcagtttatccctgtactgttccagtgtaacaagggatgttatattatttacttctttcggcttataggccttgatgccttgccctgctgcttaaaagccactatcacaggaagcgacatggagcaaggacccaaacggttcttgttcctataaggacagtgggcgtgatgatacgcagtaaatgaatattaacaattaaaaagatagaagtgtgttgtgcatgaaagagacaagtcggaaatttaagggaaaaaagtatccgtgaaaattcgactcgtcgctttaaaaaaaaaacaaaaaaccagttttttgggacattaaacaacgctccaagccttatcccattatgccacgccgcaacattcaaaacacccttggaaacttaacgctgcagatgaagttgaaaggaaagtaacgaaatgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-T------------------------T-G-C-AA--T--T---------------A-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------CGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTat
gi|3 : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-A--TGTC--CA-T----GCCAC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-ATTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTT-AGT--CC---TG-T-C-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TAT--A-T-A------T--T--------A-T--AA----TT--A---T-----ATAT--TT---TT-TTTGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--A-----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAT-ATCCAAACTGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-T-ATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGTTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCT--GTG------AAA-GA--TCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GT--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CA-AT--T-AT--GCC--AC-GACC-GCA-CG------------TTCAA--A-CAGCG---CA-G----TGAAA---C-T-G-CAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-G--A-GT-AACTG-AAAGTC--GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-T-T-GT-A--TT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC--ATA-C-----A-TA-C-TTTTAGACTTA-TT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AAG-----A-C-A-GAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-T--A-T--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CA-----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTCATTTTA
gi|4 : CAAT-AGATTT-CA--GAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CT-AAAA-TAT-TG------AAT-AT-ACTAATT-G-C-AA--T--T-GT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTT-----------GAATATA-CAT---GTTCAATATTTA-T-ACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--C---A-T-TA-CA--AGG--GA---------TATATAT--A-T-T------TCAT--------C-TT-CC----TA--AGCTT-----ATAG--CT---TT-GATGCTCGTTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAA---C-CTAA-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCA------------------CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG---C-A--GT----GTG-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAA----T-GA--------ATTAAA-AAC-ATTTT----AAA---GA-CGT-AG---A-----GTG-TGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAACG--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAAAATT-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCA-T-TT---AAA-AAAA-AC----C---AA-----A-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--T-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AT--GCC--AC-G-GC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCA---CA-A----GGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-AA-T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAC-G-AAA-TCG-g
gi|4 : cCGGGGA-TT--CC-C-T-AT-A--TT-T--GAGATCTAAAAA--TCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--TAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAACTT---TAT-TTTG------ACT-AA-T----A-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTCAAACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AA------A-C-A-AAAAG-TT--C-AACT-----G---TT---TT--T-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-T--GCAA-CAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattccctatatttgagatctaaaaatcacataatcgcttcctgtatgatttcaactcaactttattttgactaatattgtcaatacacacctttcaaacttattttcttatattttgataaaacaaaaagttcaactgtttttatatctatgaataactttattttaccgatctttcatgcaacacctttagggaaatcaccatgatacatgcaacaccttcttta
gi|5 : ccaatagatttcagaatatatgtccatgcacctaaaatattgaatatactaattgcaattgtaactggaatatatcatttcgttgaatatacatgttcaatatttatacagtttagtcctgtgctgtgtcattacaagggatatatatatttcatcttcctaagcttatagctttgatgctcgttgcgtgtgctaaaaacctaatatcacagaagcgacatgagagcacttgttcctataggcagtgtgcgtgtgatacgcataatgaattaaaaacattttaaagacgtagagtgtgttgtgatgaagagacaacgtcgaaatttaaagggaaaaaaattgtatccgtgaaagattcgaactcggtcatttaaaaaaaaccaaagttggacatttaaattccacagccttatccattatgccacggcgcacattcaaacaccacaaggaaacttaacgtgcagaatgaagttgaaaggagaagtaacgaaatcgtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-AATT-G-CCAA--T--TTGC-A-CTGGTTTATA-TATTAACATGT-TTC-GTTT-T--------AGAT-TA-CAT---GTTCA-T-TTTA-TTTCAGTTT-ATT--CCCCTTG-TGCCTG--C-T--TC--A-T-TATCA--GGA--GA---------TAT-ATT--A-T-T------T--T--------C-TC-TG----TTTTA---TCGCTTATAG--CT---TTTGATGC---TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAATACT-T--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACA-G-A----GA--G--AG-ACACAA-CGGTC---TA-T-GTTGCTC--T--ATA-GG--AC-ATAGT----GTG-CG-T-T-GGATA-T---T--C-A-TA----TT-GA--------TT--AA-AAC-ATTTT----TAAAA-GAAC-T-TA---AA----TTGGTGTTTGT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TCCG-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAA---G-GTAATC--ATGCTTGATAAA-GA-TTCGA--AC----TCA-GCGTCG-T-TT---AAA-AAAATAAA---C---A--------G--TT-----GG--G--CACGTT---T--AAA--G-T----CCACA-AC-------CT-TAT--CC-AT--------------------------A------------TTCAA--A-CGTAG---TG-A----GGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAA-G-AAA-TCC--TGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-CCT-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-AAT-TC--AA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AAAA-C-----A-CACC-ATTTAGGCTTATTT-TCT-T-ATG---CT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAAAG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-A-C---ATAT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-A-C--GC-AGCAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTa
gi|6 : aTTCTAT-AGAGTTTCACCAAT-TATGA--TGTCTCCA-TATTTGC-AC-CTGAAAA-TCT-TT------GAT-ATTACGAATTAG-CTAA--T--TTGT-ACCTGGAT-ATA-T-TCAAT---T-TTC-GTTT-A--------GAATA-A-TATCATGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGTTCCC---TG-TGT-GGGATGT--CC--A-T-TAACA---GG--GA---------TAT-TAT--AGT-A------T--T--------T-GTATA----TC--A---T-----ATAT--TT---TT-T-TGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-C--AA----C----A-TAGTCACAG---AA-G-G---ACATGGA----GA--G-AAT-ACCCAAA-GGTT---CTGT-TTT--CC--T--ATATGG--AC-A--GT----GTG-CGAT-G-TGATAAT---GTTC-A-TGAA--TTTGA--------AT--AA-AACGATTTTTTTAAAAAA-GA-C-T-AG---AT----GTGATGTT-GT--G-ATGATA-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA---G---A------AAAAA---T-TTAATCAGGTG------AAG-AA-TTCGA--AC----ATA-G--------TT---A-------------------------------T-----GG--AAGCA--TT---T--AAA--G-C----C--CT-GC-------CT-TAT--CC-ATACT-ATGAGCCCGACGG-CT-GC--C-------------TTCAAGTA-TATCGAGACA-G----TGAAA---C-TGT-AACA--G-TGCAGTA--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-TAC-G-AAA-T---GTGT
gi|6 : gCGGGGA-TT--CG-C-T--T-G--TT-T-TGAT--CTGAAAAAGTCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--CAT-T-GTT-T---AA--C-TCAA-TT---TAA-TTTT------ACTAAA-TT---C-TTG-----TC-AATATC-----ATCACC--------CTTATTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattcgcttgttttgatctgaaaaagtcacataatcgcttcctgcattgtttaactcaatttaattttactaaattcttgtcaatatcatcacccttatttt
gi|7 : gttctatagagtttcaccaattatgatgtctccatatttgcacctgaaaatctttgatattacgaattagctaatttgtacctggatatattcaattttcgtttagaataatatcatgttcaatatttattacagtttagttccctgtgtgggatgtccattaacagggatattatagtatttgtatatcatatatttttttgccttgcgtgtgctacaacatagtcacagaaggacatggagagaatacccaaaggttctgttttcctatatggacagtgtgcgatgtgataatgttcatgaatttgaataaaacgatttttttaaaaaagactagatgtgatgttgtgatgatagagacaagtcgaaatttaaagaaaaaatttaatcaggtgaagaattcgaacatagttatggaagcatttaaagccctgccttatccatactatgagcccgacggctgccttcaagtatatcgagacagtgaaactgtaacagtgcagtatgaagttgaaaggagagttacgaaatgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AAAAA-GA-C-T-AAGT-AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGGGAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GATTTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAAGATCAGAAA-----C-GGTTT-----GT--A--CG--TT---TTAAAA--G-T----CCATAGGCCGCCCCGCT-TATC-CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--ACCACCG---CA------TGAAA---C-T-TAAAC---G-TGCGG-A--T---GAAGTTGAA--AG--A--A-GT-AAC-G-AAA-TCGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATTT--CC-C-T-GT-AT-TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TCCAAA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACA-AT-TT---C-TTG-----TCAAATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCTAA-ATT---TT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAATG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-
gi|8 : A-TATATA------AATGAT--T-AATT-A-T-GA--TAGCTGT-AACTGGG---CA-TACCA-----AATTC-GAGTAT--------CGGTATA-CAT--------AT-TTTA-TTACAGTTT-AGT--TT---TGTTGC-TG--TGTA-CC--A---TAAGAGCAGG--GA---------
gi|8 : --GA---------TATCTGT--A-T-C------T--C--------C-TT-CGAGC-CT------C-----ATAG--CCCCTTT-GA---C--TTG--C--G-T-GACGCT---A-A--AAAA--C-C--AGTA-TCACAG---AACGCGCAAACATG-A----GACAG-AAA-ACCCAAACGCAT---CT-TCGTT--TCCTT--ATATGGTAACTA--GTCGAAATGGCG-T-G---ATA-CTTCG--C-A-TAAAATTT-GATTATTTATAT--AT-AAC-ATTTC----AAGAA--A-C-TGAG---AATGTTGTCATGTT-GT--G-A-GA-A-G---CAA-C--TA-C-AAACTATCTGTAAGAGGG---A------AAAAAGT-T-GTCTCC--GTG------AAAAGA-TTCAA--ACC---TCG-GC-TCG-TCTT---AAA-AACA-AAC---C---TA-----T-G--T------AG--A---A--GT---T--AAAAAG-TTACACCATA-AC-------CT-TCT--CA-GT--T-AC--GCCC-AC-G-C--ACA-CA------------TTCAA--A-agcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtcagatatctgtatctccttcgagcctcatagcccctttgacttgcgtgacgctaaaaaaccagtatcacagaacgcgcaaacatgagacagaaaacccaaacgcatcttcgtttccttatatggtaactagtcgaaatggcgtgatacttcgcataaaatttgattatttatatataacatttcaagaaactgagaatgttgtcatgttgtgagaagcaactacaaactatctgtaagagggaaaaaagttgtctccgtgaaaagattcaaacctcggctcgtcttaaaaacaaacctatgtagaagttaaaaagttacaccataaccttctcagttacgcccacgcacacattcaaa
gi|9 : atatataaatgattaattatgatagctgtaactgggcataccaaattcgagtatcggtatacatattttattacagtttagttttgttgctgtgtaccataagagcagggaagcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtca--TT---T--AAA----T----CCACATGT-------CT-GAT--CC-AT----AC--GCC--AC-G-CCCGCA-CA------------TTCAA--AGCATCG---CA-G----GGAAA---CTT-T-AGC---G-TGCGG-A--T---GAATTTTAA--AG--A--A-GT-AAC-ATGAA-TC--GTGT
gi|9 : tCGGGAC-TT--CC-C-T--C-A--TT-TGTGAGG-CTAACA---TCGCTAAAAAT-CGC---TTG-C-TG--CAT-A-ATT-TC--AA--T---AA-TT---TAT-TT-G------ACT-AA-TT---C-T-G-----TC-CACA-C-----A-CACT-TTTTAGACTTATTT-C---T-AGA---TT-TTGGAATAT-CAA-----A-C---AAAAG-TT--C-A-C-----------T---TTACT-A-CTTAATAT-ATG----AATAAC-A-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-C-TCAA-C--GC-A--AC---AC-CTTT--A-AGAAA-T-CAC----CATGA--AC--ATGGCAACAC--TC-TTccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgggacttccctcatttgtgaggctaacatcgctaaaaatcgcttgctgcataatttcaataatttatttgactaattctgtccacacacactttttagacttatttctagattttggaatatcaaacaaaagttcactttactacttaatatatgaataacattattttatcgatctctcaacgcaacacctttaagaaatcaccatgaacatggcaacactcttgt
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 111 11111 1111111111 111 111 111111111 555555555555555555555555555555555555555555555 111 111111111 111 1 111 11111111 111111111 1 11111 1111111111 11111 111111 1111 222222222222222222222222222 11111 111111111 1 1111111 1111 11 222222222222 1111 111111111111 111 111 11 11 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 111111 11111 11111 11 11111 11 333333333 1111 111111111 111111111 1111 111111 1111 11111 111
lowQualScore : 8 4 55 7 3 55 55 3 7777 3 3 3 3 999999 3 22222 3 3 6 44 77 0 3 111 3 77777 3 3 2222222222 3 111 3 222 3 1 88 666 3 3 555 88 55 3 3 55 44 333333333 7 1 55 3 444444444444444444444444444444444444444444444 44 555 3 1 77 44 77 3 3 6 777 3 44 888888888 6 6 222 3 555 888888 6666 88 0 2 3 666 3 7 55 44 44 0 55 3 55 7777 999 4 4 4 4 777 99 8 4 55 4 44444444 55 4 8 7777 4 4 4 4 222222222 0 4 55 4 4 4 9999 4 3 00000 55 9999999999 44444 99 111111 4 4 55 2222 4 99 4 4 777 4 4 888888888888888888888888888 00000 55 777 55 222222222 2 3333333 4 99 4 0000 666 33 4 4444 4 000000000000 2222 0 999999999999 222 4 4 4 222 8 4 00 777 22 88888 8 4 8 4 5 77 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 4 4 55 4 33 4 4 77 99 4 0 0 4 777 4 4 55 4 4 4 99 11 4 4 777 8 555555 4 4 777 8 00000 4 8 00000 8 4 4 4 4 777 4 1 00 11111 4 555 4 55 4 4 111111111 777 4 4 5 888 1 5 5555 444444444 5 5 222222222 5 5 5 9999 3333 999999 8888 5 5 88888 5 222 0 5
lowQualScore : . . .. . . .. .. . .... . . . . ...... . ..... . . . .. .. . . ... . ..... . . .......... . ... . ... . . .. ... . . ... .. .. . . .. .. ......... . . .. . ............................................. .. ... . . .. .. .. . . . ... . .. ......... . . ... . ... ...... .... .. . . . ... . . .. .. .. . .. . .. .... ... . . . . ... .. . . .. . ........ .. . . .... . . . . ......... . . .. . . . .... . . ..... .. .......... ..... .. ...... . . .. .... . .. . . ... . . ........................... ..... .. ... .. ......... . ....... . .. . .... ... .. . .... . ............ .... . ............ ... . . . ... . . .. ... .. ..... . . . . . .. .................................................................................................................................... . .. . . .. . .. . . .. .. . . . . ... . . .. . . . .. .. . . ... . ...... . . ... . ..... . . ..... . . . . . ... . . .. ..... . ... . .. . . ......... ... . . . ... . . .... ......... . . ......... . . . .... .... ...... .... . . ..... . ... . .
lowQualScore : 0 0 55 3 6 00 00 6 7777 6 6 3 3 666666 3 11111 1 1 2 22 33 5 1 666 3 55555 3 3 7777777777 3 999 2 333 6 4 66 444 6 6 222 66 00 6 6 00 66 333333333 3 0 00 6 555555555555555555555555555555555555555555555 66 888 3 3 99 66 99 3 3 7 111 3 66 111111111 7 7 555 3 888 888888 8888 77 5 0 6 444 6 3 00 66 66 0 00 6 00 7777 000 0 0 0 0 000 55 0 0 55 0 55555555 55 0 0 7777 0 0 0 0 999999999 7 0 55 0 0 0 5555 0 6 00000 55 5555555555 88888 55 555555 0 0 55 5555 0 55 0 0 000 0 0 333333333333333333333333333 33333 55 000 55 000000000 0 0000000 0 55 0 3333 000 55 0 6666 0 555555555555 5555 9 888888888888 222 4 4 4 222 9 4 66 888 22 99999 9 4 9 4 0 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 55 0 0 66 0 55 0 0 22 55 0 8 8 0 000 0 0 55 0 0 0 55 00 0 0 000 0 555555 0 0 000 0 00000 0 0 00000 0 0 0 4 4 888 4 1 66 11111 4 333 4 00 4 4 777777777 888 8 4 0 888 0 0 6666 222222222 0 0 222222222 0 0 0 9999 6666 444444 4444 0 0 11111 7 999 7 7
consensus : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNT--A-T-N------T--T--------C-TT-CG----TT--A---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----NGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
Reference ( family-494 ) : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNT--A-T-N------T--T--------C-TT-CG----TT--A---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----NGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
gi|1 : TTCAATTAGAGTC-CA--AA--TAT-A---GTC--CA-T----AC-ACGCTGAAAA-TAT-TGTCAGACAAT-TA-AC-TATT-G-C-A---T--TTGC-AAATGGAT-ATAATAGCA-----T-TTC-GTTT-TTTACATGTAGATATA-CAT---GTTCAATATTTA-TAACAGTTT-A-T--CC---TG-TGC-TG--CGTTCCC--A-T-TAACA--AGG--GA---------GAT-TTTCTA-T-C------T--T--------CCTT-CG----AG--C---T-----ATAG--CC---TT-G-TGCCG-TTG--CC-G-T-G-TGCT---A-A--AA----AAC--A-GC-TTACAG---AA-GCG---ACAAG-A----GA---CAAG-AACTAACGGGTT---CT-T-GT---CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----G--ACG-T-G-TGATA-C---G--CCA-TAAA--TT-GT--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAAAGA-C-T-A-----A----GTG-T-TT-GT--G-ATGA---GAGACA--GCTTC-G-AAATT-----TA----GG---A------AAATA---T-GTATCC--GTG------CAA-GA-TTCGA--AC----TCGAG--TCG-T-T--------AAAA-ATA---C---A--------G--TT-----GG------A--GT---T--AAA--G-T----CCACAGGC-------CTGTAT--CC-AT--TAAC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA-------------TCAAC-A-GACCG---TATG----CGAAAC--C-T-T-AAC---GAGGCAG-A--T---GAAAGTGAAGGAGGAATTA-GT-AACAG-AAA-TCG-GTGT
gi|1 : tCGGGGA-TCTCCC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAT--GCA--ATAAAT-CGC---TTCTC-TG--CAT-G-ATT-TC--AATAC-TTAT-TT---TATGTTTGG-----ACT-AAAGT---C-TTG-----TC-AATAAC-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-TAATA---TT-TTGGAATC--AAG-----A-CAA-AAAAG-TT--CTA-TT-----GGGTTT---TTTCT-A-T---ATAT--TG----AATAAC-TCT-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-ATC--GC-A-TACACAAC-TTTA----GGAAA-T-CA-----CACAA-TGCTTAATG-AACA-CTTC-TTATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcggggatctcccctgtattttgaggctaaaatgcaataaatcgcttctctgcatgatttcaatacttattttatgtttggactaaagtcttgtcaataacacaccttttagacttattttcttaatattttggaatcaagacaaaaaagttctattgggttttttctatatattgaataactcttattttatcgatctttcatcgcatacacaactttaggaaatcacacaatgcttaatgaacacttcttatataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|10 : tttcaattagagtccaaatatagtccatacacgctgaaaatattgtcagacaattaactattgcatttgcaaatggatataatagcatttcgttttttacatgtagatatacatgttcaatatttataacagtttatcctgtgctgcgttcccattaacaagggagattttctatcttccttcgagctatagccttgtgccgttgccgtgtgctaaaaaacagcttacagaagcgacaagagacaagaactaacgggttcttgtcctataggacagtgacgtgtgatacgccataaattgtataaaacattttaaaaaagactaagtgtttgtgatgagagacagcttcgaaatttaggaaaatatgtatccgtgcaagattcgaactcgagtcgttaaaaatacagttggagttaaagtccacaggcctgtatccattaacgccacgccgcacatcaacagaccgtatgcgaaaccttaacgaggcagatgaaagtgaaggaggaattagtaacagaaatcggtgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-AATTGTC--CAAT----GC-AC-CTGAAAAATAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-GGC-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTCAGTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTATTTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--CCCAA-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TAT--A-T-A------T--TTTATCTTCC-TT-CGGC--TT--T---T-----ATAGGCCC---TT-GATGCT--TTG--CCGA-TAG-TGCTAAAA-A--AA----C-C--A-TATTCACAGA--AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAA--ACCC-AACGGTT---CT-TGGTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-T-G-TGATA-C---G--CTA-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-A-TTT----AAAAA-GA-C-T-AGTCTAA----GTGGTGTT-GTTGA-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-Ataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|11 : AAT-AGAGTT-AA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG-------AT-A--AC-TATT-G-C-AATTT--TTGC-AACC-GA--ATA-TATCAAT---T-TCC-GTTT-T--------AAATATAGCAT--TGTTCATAACTTA--TACAGTTT---TA-CC---TG-TGC-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGGGAGA---------TAT-TTT--A-TCG------T--C--------C-TT-CGACTTTT--A---------AAAA--CT---CT-GATACC--TTGGCC--G-T-G-TACTA--A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-ATCTCGA--GTAAG-AACCCAACGGTTTTCTT-T-GTT--CC--T--ATA-G----T-G--GT----GT---G-TAG-TGGTA-C---GC-C-A-TAAA--TT-GA--------AT---A-AAC-ATTTT----
gi|12 : tgGGGGA-TT--CC-C-TTGT-AATTT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-CTTG--CAT-GAATT-TC--AA--CTTCAA-TT---TATATTTGGTTAAAACT-AA-TTTTAC-TTG-----TC-AATA-TCCTCAA-CACCTTTTTAGATGTATTTATCT-T-ATATTTTT-TTGGAATA--AAG-----AGC-AGAAAAG-TTTCC-A-CTCTGAGG---TT---TT-TT-ATT---ATCT-ATGA---AATAAC-A-TATGGATAT-T-TT----ACAACCCGAGCT-TGTC-A-T--GC-A--AC---ACTTTTA--GAGGAAATT-CACATTGGATGATTAC--ATGGCAA-ACATCC-TTTT
gi|13 : GGGGA-TT--CCAC-T-GT-AA-TTAT-TGAAG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAG-TGCGCATTG-C-TGGTCATCG-ATTATC--AAGAC-TTAA-TTATATAT-TATG------A-T-AA-TT---CATTGGTACATC-A-TA-C-----AACACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TTGTTGGAATAACAAGCGAGAA-C-A-AAAAGAGT--T-A-CTAACTGG---TTTCATTACTGA-T---ATA--ATGATGTAGTAAC-T-A-----TATAT-ATATAAA----TCGATCTAT-TC-A-CCGGCAA-CAC----C-TTTAAGA-GGAAA-TGCAC----CAt
gi|14 : -AAACT-----TAAA--GG---ACTAAAAAAAAA---TTGTATCCT-GTG------AAA-GG-ATCGATTACCTCATCC-G--TCG-T-TTTAAAAA-GAAA-AGA---C---AA-----C-A--GT-----GGGAA--CA--TT---T--AAAT-G-T----CCACA-GC-------CT-TATCACT-GT--T-AT--GTCG-AC-G-AC-TCA-TACAGTCAACAATCTCCAA--A-TAACGAC-CA-GAAGTCGAGAATTC-T-T-AATCGGG-TGCAG-AGCTAAGAAAGTTGAAAGAGGAC--A-ATAAAC-G-AA
gi|15 : aaaactacccgataTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-C----GC-AC-CTGGAAA-TAT-AG------AAT-A--AA-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-A--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTTCAGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GAGATACAGTGTAT-TTT--A-T-C------T--TC-------C-TT-CG----AC--T---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--CCG--C--G-C-G-AGCTA--A-A--AA----C-C--A-CA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAgagtc
gi|16 : TTCAAT-ATAGTT-CA--AAA-CAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-A--AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ACA-TATCA-----G-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTT-AGT--CC---TG-TAC-TA--CGT--CC--A-T-T------------------------T-TTT--A-T-C------T--TC-------C-TT-CG----GC--T---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA------------A-TCACA--------C------------------------------AACGGTC---CT-T-GTT--CC--TGAATA-GG--AC-A--GT----G
gi|17 : C--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTA-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TACA--TT-GA--------AT--AA-AACAATTTA----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GT-GTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGAAAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TC---AAGTTAAA-AAA---C---AA-----
gi|18 : -----ATAT--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---ATAACAA----C-C--A-TA-TCACGGTCTAA-GCG---ACATG-G----CA--GCAAG-ACCCAAA-GGTC---CT-T-GTT--CC--T--ATA-acccagttacatggacgttt
gi|19 : TTCAATTAGAGAT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGGAAC-TAT-TG------AAT-AC-AT-CCTC-G-C-AA--TA-TAGC--ACTGGA--
gi|2 : T-AGA-TT-CA--AAA-T-T-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-A-TT-G-C-AA--T--TTGTTAACTGGA---TA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAAT-TTTA-T--CAGTTT-ATC--CC---TG-TAC-TG--T-T--CC--AGTGTAACA--AGG--GA---------TGT-TAT--A-T-TATTTACT--T--------C-TTTCGGC--TT--A---T-----A-GG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--CCT-GCTGCTTA-A-A--AG----C-C--ACTA-TCACAGG--AA-GCG---ACATG------GA--GCAAGGACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATAAGG--AC-A--GT----G-GGCG-T-GATGATA-C---G--C-AGTAAA--T--GA--------AT--ATTAAC-AATT-----AAAAA-GA---T-AG---AA----GTG-TGTT-GT--GCATGA-AAGAGACAA-G--TC-GGAAATT-----TAAG--GG---A------AAAAA-----GTATCC--GTG------AAA--A-TTCGA---C----TCG----TCGCT-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AAAAAACCAG--TTTTTTGGG--A--CA--TTAAAC--AAC--GCT----CCA-A-GC-------CT-TAT--CCCAT--T-AT--GCC--AC-G-CC-GCAACA------------TTCAA--AACACC----CT-T----GGAAA---C-T-T-AAC---GCTGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAA--A-GT-AAC-G-AAA-Ttccac
gi|2 : taatGGGGT-TC--CC-C-T-GTTA--TT-T-TGAGA-CTAAAAAA-GCAC-ATAAATTCGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TTT-AA--C-TCAA-AT---TAT-TTTG------AC--AA-TT---CCTTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-AGA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAGT-TC--C-A-CT-----G---GT---GTACT-A-T---ATCTGATG----GAAAACTT-T-----TAT-TGTT----A----CAG-TC--T-TC-A-T--GC-A-AAC---A--TTTA----GGAAA-T-CACG---CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggttcccctgttattttgagactaaaaaagcacataaattcgcttcctgcatgatttttaactcaaattattttgacaattccttgtcaatacacaccttttagacttattttcttagattttggaataaagacaaaagttccactggtgtactatatctgatggaaaacttttattgttacagtcttcatgcaaacatttaggaaatcacgcatgatacaatgcaacaccttctttat
gi|20 : taattagattcaaaattatgtccatgcacctgaaaatattgaatatacattgcaatttgttaactggatatatcatttcgttttagatatacattgttcaattttatcagtttatccctgtactgttccagtgtaacaagggatgttatattatttacttctttcggcttataggccttgatgccttgccctgctgcttaaaagccactatcacaggaagcgacatggagcaaggacccaaacggttcttgttcctataaggacagtgggcgtgatgatacgcagtaaatgaatattaacaattaaaaagatagaagtgtgttgtgcatgaaagagacaagtcggaaatttaagggaaaaaagtatccgtgaaaattcgactcgtcgctttaaaaaaaaaacaaaaaaccagttttttgggacattaaacaacgctccaagccttatcccattatgccacgccgcaacattcaaaacacccttggaaacttaacgctgcagatgaagttgaaaggaaagtaacgaaatgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-T------------------------T-G-C-AA--T--T---------------A-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------CGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTat
gi|3 : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-A--TGTC--CA-T----GCCAC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-ATTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTT-AGT--CC---TG-T-C-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TAT--A-T-A------T--T--------A-T--AA----TT--A---T-----ATAT--TT---TT-TTTGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--A-----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAT-ATCCAAACTGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-T-ATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGTTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCT--GTG------AAA-GA--TCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GT--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CA-AT--T-AT--GCC--AC-GACC-GCA-CG------------TTCAA--A-CAGCG---CA-G----TGAAA---C-T-G-CAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-G--A-GT-AACTG-AAAGTC--GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-T-T-GT-A--TT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC--ATA-C-----A-TA-C-TTTTAGACTTA-TT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AAG-----A-C-A-GAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-T--A-T--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CA-----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTCATTTTA
gi|4 : CAAT-AGATTT-CA--GAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CT-AAAA-TAT-TG------AAT-AT-ACTAATT-G-C-AA--T--T-GT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTT-----------GAATATA-CAT---GTTCAATATTTA-T-ACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--C---A-T-TA-CA--AGG--GA---------TATATAT--A-T-T------TCAT--------C-TT-CC----TA--AGCTT-----ATAG--CT---TT-GATGCTCGTTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAA---C-CTAA-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCA------------------CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG---C-A--GT----GTG-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAA----T-GA--------ATTAAA-AAC-ATTTT----AAA---GA-CGT-AG---A-----GTG-TGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAACG--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAAAATT-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCA-T-TT---AAA-AAAA-AC----C---AA-----A-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--T-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AT--GCC--AC-G-GC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCA---CA-A----GGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-AA-T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAC-G-AAA-TCG-g
gi|4 : cCGGGGA-TT--CC-C-T-AT-A--TT-T--GAGATCTAAAAA--TCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--TAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAACTT---TAT-TTTG------ACT-AA-T----A-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTCAAACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AA------A-C-A-AAAAG-TT--C-AACT-----G---TT---TT--T-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-T--GCAA-CAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattccctatatttgagatctaaaaatcacataatcgcttcctgtatgatttcaactcaactttattttgactaatattgtcaatacacacctttcaaacttattttcttatattttgataaaacaaaaagttcaactgtttttatatctatgaataactttattttaccgatctttcatgcaacacctttagggaaatcaccatgatacatgcaacaccttcttta
gi|5 : ccaatagatttcagaatatatgtccatgcacctaaaatattgaatatactaattgcaattgtaactggaatatatcatttcgttgaatatacatgttcaatatttatacagtttagtcctgtgctgtgtcattacaagggatatatatatttcatcttcctaagcttatagctttgatgctcgttgcgtgtgctaaaaacctaatatcacagaagcgacatgagagcacttgttcctataggcagtgtgcgtgtgatacgcataatgaattaaaaacattttaaagacgtagagtgtgttgtgatgaagagacaacgtcgaaatttaaagggaaaaaaattgtatccgtgaaagattcgaactcggtcatttaaaaaaaaccaaagttggacatttaaattccacagccttatccattatgccacggcgcacattcaaacaccacaaggaaacttaacgtgcagaatgaagttgaaaggagaagtaacgaaatcgtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-AATT-G-CCAA--T--TTGC-A-CTGGTTTATA-TATTAACATGT-TTC-GTTT-T--------AGAT-TA-CAT---GTTCA-T-TTTA-TTTCAGTTT-ATT--CCCCTTG-TGCCTG--C-T--TC--A-T-TATCA--GGA--GA---------TAT-ATT--A-T-T------T--T--------C-TC-TG----TTTTA---TCGCTTATAG--CT---TTTGATGC---TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAATACT-T--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACA-G-A----GA--G--AG-ACACAA-CGGTC---TA-T-GTTGCTC--T--ATA-GG--AC-ATAGT----GTG-CG-T-T-GGATA-T---T--C-A-TA----TT-GA--------TT--AA-AAC-ATTTT----TAAAA-GAAC-T-TA---AA----TTGGTGTTTGT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TCCG-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAA---G-GTAATC--ATGCTTGATAAA-GA-TTCGA--AC----TCA-GCGTCG-T-TT---AAA-AAAATAAA---C---A--------G--TT-----GG--G--CACGTT---T--AAA--G-T----CCACA-AC-------CT-TAT--CC-AT--------------------------A------------TTCAA--A-CGTAG---TG-A----GGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAA-G-AAA-TCC--TGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-CCT-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-AAT-TC--AA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AAAA-C-----A-CACC-ATTTAGGCTTATTT-TCT-T-ATG---CT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAAAG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-A-C---ATAT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TC-A-C--GC-AGCAC----C-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTa
gi|6 : aTTCTAT-AGAGTTTCACCAAT-TATGA--TGTCTCCA-TATTTGC-AC-CTGAAAA-TCT-TT------GAT-ATTACGAATTAG-CTAA--T--TTGT-ACCTGGAT-ATA-T-TCAAT---T-TTC-GTTT-A--------GAATA-A-TATCATGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGTTCCC---TG-TGT-GGGATGT--CC--A-T-TAACA---GG--GA---------TAT-TAT--AGT-A------T--T--------T-GTATA----TC--A---T-----ATAT--TT---TT-T-TGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-C--AA----C----A-TAGTCACAG---AA-G-G---ACATGGA----GA--G-AAT-ACCCAAA-GGTT---CTGT-TTT--CC--T--ATATGG--AC-A--GT----GTG-CGAT-G-TGATAAT---GTTC-A-TGAA--TTTGA--------AT--AA-AACGATTTTTTTAAAAAA-GA-C-T-AG---AT----GTGATGTT-GT--G-ATGATA-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA---G---A------AAAAA---T-TTAATCAGGTG------AAG-AA-TTCGA--AC----ATA-G--------TT---A-------------------------------T-----GG--AAGCA--TT---T--AAA--G-C----C--CT-GC-------CT-TAT--CC-ATACT-ATGAGCCCGACGG-CT-GC--C-------------TTCAAGTA-TATCGAGACA-G----TGAAA---C-TGT-AACA--G-TGCAGTA--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-TAC-G-AAA-T---GTGT
gi|6 : gCGGGGA-TT--CG-C-T--T-G--TT-T-TGAT--CTGAAAAAGTCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--CAT-T-GTT-T---AA--C-TCAA-TT---TAA-TTTT------ACTAAA-TT---C-TTG-----TC-AATATC-----ATCACC--------CTTATTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattcgcttgttttgatctgaaaaagtcacataatcgcttcctgcattgtttaactcaatttaattttactaaattcttgtcaatatcatcacccttatttt
gi|7 : gttctatagagtttcaccaattatgatgtctccatatttgcacctgaaaatctttgatattacgaattagctaatttgtacctggatatattcaattttcgtttagaataatatcatgttcaatatttattacagtttagttccctgtgtgggatgtccattaacagggatattatagtatttgtatatcatatatttttttgccttgcgtgtgctacaacatagtcacagaaggacatggagagaatacccaaaggttctgttttcctatatggacagtgtgcgatgtgataatgttcatgaatttgaataaaacgatttttttaaaaaagactagatgtgatgttgtgatgatagagacaagtcgaaatttaaagaaaaaatttaatcaggtgaagaattcgaacatagttatggaagcatttaaagccctgccttatccatactatgagcccgacggctgccttcaagtatatcgagacagtgaaactgtaacagtgcagtatgaagttgaaaggagagttacgaaatgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AAAAA-GA-C-T-AAGT-AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-C--TC-G-AAATT-----TAAA--GGGGAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GATTTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAAGATCAGAAA-----C-GGTTT-----GT--A--CG--TT---TTAAAA--G-T----CCATAGGCCGCCCCGCT-TATC-CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--ACCACCG---CA------TGAAA---C-T-TAAAC---G-TGCGG-A--T---GAAGTTGAA--AG--A--A-GT-AAC-G-AAA-TCGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATTT--CC-C-T-GT-AT-TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TCCAAA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACA-AT-TT---C-TTG-----TCAAATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCTAA-ATT---TT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAATG-TTC-C-A-CTG----G---TT---TTACT-
gi|8 : A-TATATA------AATGAT--T-AATT-A-T-GA--TAGCTGT-AACTGGG---CA-TACCA-----AATTC-GAGTAT--------CGGTATA-CAT--------AT-TTTA-TTACAGTTT-AGT--TT---TGTTGC-TG--TGTA-CC--A---TAAGAGCAGG--GA---------
gi|8 : --GA---------TATCTGT--A-T-C------T--C--------C-TT-CGAGC-CT------C-----ATAG--CCCCTTT-GA---C--TTG--C--G-T-GACGCT---A-A--AAAA--C-C--AGTA-TCACAG---AACGCGCAAACATG-A----GACAG-AAA-ACCCAAACGCAT---CT-TCGTT--TCCTT--ATATGGTAACTA--GTCGAAATGGCG-T-G---ATA-CTTCG--C-A-TAAAATTT-GATTATTTATAT--AT-AAC-ATTTC----AAGAA--A-C-TGAG---AATGTTGTCATGTT-GT--G-A-GA-A-G---CAA-C--TA-C-AAACTATCTGTAAGAGGG---A------AAAAAGT-T-GTCTCC--GTG------AAAAGA-TTCAA--ACC---TCG-GC-TCG-TCTT---AAA-AACA-AAC---C---TA-----T-G--T------AG--A---A--GT---T--AAAAAG-TTACACCATA-AC-------CT-TCT--CA-GT--T-AC--GCCC-AC-G-C--ACA-CA------------TTCAA--A-agcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtcagatatctgtatctccttcgagcctcatagcccctttgacttgcgtgacgctaaaaaaccagtatcacagaacgcgcaaacatgagacagaaaacccaaacgcatcttcgtttccttatatggtaactagtcgaaatggcgtgatacttcgcataaaatttgattatttatatataacatttcaagaaactgagaatgttgtcatgttgtgagaagcaactacaaactatctgtaagagggaaaaaagttgtctccgtgaaaagattcaaacctcggctcgtcttaaaaacaaacctatgtagaagttaaaaagttacaccataaccttctcagttacgcccacgcacacattcaaa
gi|9 : atatataaatgattaattatgatagctgtaactgggcataccaaattcgagtatcggtatacatattttattacagtttagttttgttgctgtgtaccataagagcagggaagcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtca--TT---T--AAA----T----CCACATGT-------CT-GAT--CC-AT----AC--GCC--AC-G-CCCGCA-CA------------TTCAA--AGCATCG---CA-G----GGAAA---CTT-T-AGC---G-TGCGG-A--T---GAATTTTAA--AG--A--A-GT-AAC-ATGAA-TC--GTGT
gi|9 : tCGGGAC-TT--CC-C-T--C-A--TT-TGTGAGG-CTAACA---TCGCTAAAAAT-CGC---TTG-C-TG--CAT-A-ATT-TC--AA--T---AA-TT---TAT-TT-G------ACT-AA-TT---C-T-G-----TC-CACA-C-----A-CACT-TTTTAGACTTATTT-C---T-AGA---TT-TTGGAATAT-CAA-----A-C---AAAAG-TT--C-A-C-----------T---TTACT-A-CTTAATAT-ATG----AATAAC-A-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-C-TCAA-C--GC-A--AC---AC-CTTT--A-AGAAA-T-CAC----CATGA--AC--ATGGCAACAC--TC-TTccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgggacttccctcatttgtgaggctaacatcgctaaaaatcgcttgctgcataatttcaataatttatttgactaattctgtccacacacactttttagacttatttctagattttggaatatcaaacaaaagttcactttactacttaatatatgaataacattattttatcgatctctcaacgcaacacctttaagaaatcaccatgaacatggcaacactcttgt
blockSeqs : T T CC A G AT TC A ATTT C . A A . G TTACG A G C TT AG T TTA . ACATG A A AT G CAT A TTT C G TC CCT T C GAT A CA G G GC GA GATACAGTG A A . G ATTTTATCTTCCTTCGGCTTTT GC CCT T A CG GC CG C A C AAA T AC ATACTT C T TCT C CAA ATCTC CAG GG C C TTC G G GC CT GA A TA T TA CGAA TGG A A A A TTC TT T G AT T TTATTTAT TA T A TTTA . A G G AATGTT G T TG C T A CG C G ATCTG AG ACTAAAA AATT AG CTTGAT A T TT CTCA . CG C C TAA T T ACAAAAAACCAGTTTTTTG GAA CG AAA TA AAGTTACA G CGCCCCG . CA C ACT TGA CG G ACC A CAGTCAACAATC GTA ACCAGAAGTC ATT T G A CGG C T GC AAG AG GAC A A T T G GT NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T . A C TG T AT A G AT AG T T GCA . T GT C A A CA GA T C ATA A GTTAAA A . TTA A GTACA A T CCTCA A T A A . TTT G G AC CGAGA G AG A TC . A CTGAGG TCA A G T TTA C G ATGT ATATGGA A G ACAAC A G A CCG AAC ACT AGA T G CATTG T A A
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . TACT . . T . A . TA . AT . . T . T A AT . G A . . . T . . . . . . . C T . . TATTTACTTCTTTCGGCTTAT . . . A . . . . . A TA . . ACCTA G G A . . GA GC G A C . . C . . . T . . . . TGG . . . . . C . . . . . . . G . . . . . TCTAA G . . . . . G . . . . AAAA GTT T . . . . C . C . . . . . AGATCAGAAACGGTTT AAG . . . TGT T . . C . T T G . CCC . . AA AGACAGT . . . . A . . A . . GAA A . . . . G NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . G . A . . T A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . G T . . A . C . . AACTGG . A . . . A . A TTT . . ATAAA . . . T AAC AC GA . . CG . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TAC . . . . . . A . AT . . T . T A AT . G . . . . T . . . . . . . . T . . TTTCTCTGTTTTATCGCTT . . . A . . . . . . A . . AACC . . G . . A GT G A C . . . . . . T . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTAA T . . . . . C . . . . GGAA TT . . . . . . . . . . . . . ACAACAGT A . . . GCT . . . . . T T C . AC . . AC CTTG . . . . . . . . . . GAG . . . . . C . . . . G . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . C . . GG . A . . . C . . TA . . A . . . T AGC AC G . . C . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . A . . . . A . T A TT . T . . . . C . . . . . . . . T . . TTCATCTTCCTAAGCTT . . . A . . . . . . A . . CC . . . . . A GC T A C . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA G . . . . . G . . . . A T . . . . . . . . . . . . . ACAACGTT A . . . GT . . . . . T T . . CC . . AG CAGT . . . . . . . . . . GAG . . . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . . GG . A . . . C . . TT . . A . . . T AA C G . . C . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TAC . . . . . . A . . . . T . T A TT . G . . . . C . . . . . . . . A . . CGTCCTTCGACTTTTA . . . A . . . . . . . . . CC . . . . . G GC G A C . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . G . . . . A T . . . . . . . . . . . . . CAAAGTT A . . . TT . . . . . T T . . GC . . A CAAG . . . . . . . . . . GAG . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . . G . A . . . C . . TT . . A . . . T AC A G . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TAC . . . . . . A . . . . T . T A TT . G . . . . T . . . . . . . . A . . CTCCTTCGAGCCTC . . . A . . . . . . . . . CC . . . . . A GC T A C . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA G . . . . . C . . . . G G . . . . . . . . . . . . . CCTATGT G . . . GT . . . . . T C . . CT . . A TGAG . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . . G . A . . . A . . TT . . A . . . C A C A . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . A . . . . T . T A T . T . . . . T . . . . . . . . A . . CTTCCTTCGACTT . . . T . . . . . . . . . CC . . . . . A GC A A C . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . G . . . . G T . . . . . . . . . . . . . ACAGTT A . . . GC . . . . . T C . . CC . . A CAGG . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . A . . AT . . A . . . C A C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . A . . . . T . T A T . G . . . . T . . . . . . . . T . . CTTCCTTCGGCTT . . . A . . . . . . . . . CC . . . . . A GC . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . C . . . . A T . . . . . . . . . . . . . T A . . . GT . . . . . . C . . C . . A CAT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . T . . . T . G . . . . C . . . . . . . . A . . ATTTGTATATCAT . . . A . . . . . . . . . CC . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . T . . . . . . . . G . . ATTATAATTAT . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ****** TAC** A** T********* T** TT* ** ** ** ** CC******* GC** TG* AA******* N*** ACAACGTT******************* A**** T*** A*** CGGG******** *** ** GAG** G* ** ** ****** A** GG******* TT******* T*** AAC* C***** G*** C**** A**
originalCons : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNT--A-T-N------T--T--------C-TT-CG----TT--A---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAA-G--TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---CA-G----NGAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-TT--C-A-CT-----G---TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-A-C--GC-A-CAC---AC-TTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
finalCons : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-ATAC--AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGAA--TA-TATCA-----T-TTC-GTTTT---------AGATATA-CATT--GTTCAATATTTATT-ACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNT--A-T-N------T--T--------C-TT-CG----TT--A---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AACC-------A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GAGC--AAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTG-CG-T-G-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AGAA-------GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAAN---TC-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAACAACGTT-------------------GGA----CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-ATT---AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAAA---CACCGCGGG--------GAAA---C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-CA--AAAAG-TT--C-A-CTGG-------TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAACTT-------TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TC-AT---GCAAC-ACC-----TTTAG---GGAAA-T-CAC----CATGA-TACA--ATGCAACACCTTC-TTTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 111 11111 1111111111 111 111 111111111 555555555555555555555555555555555555555555555 111 111111111 111 1 11111111 111111111 1 11111 1111111111 11111 111111 1111 222222222222222222222222222 11111 111111111 1 1111111 1111 11 222222222222 1111 33333333333333 111 11 11 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 111111 11111 11111 11 111111 11111 11 1111111111111 1111 111111111 111111111 1111 11 1111 11111 111
lowQualScore : 8 4 55 7 3 55 55 3 7777 3 3 3 3 999999 3 22222 3 3 6 44 77 0 3 111 3 77777 3 3 2222222222 3 111 3 222 3 1 88 666 3 3 555 88 55 3 3 55 44 333333333 7 1 55 3 444444444444444444444444444444444444444444444 44 555 3 1 77 44 77 3 3 6 777 3 44 888888888 6 6 222 3 555 888888 6666 88 0 2 3 666 3 7 55 44 44 0 55 3 55 7777 4 4 4 4 777 99 8 4 55 4 44444444 55 4 8 7777 4 4 4 4 222222222 0 4 55 4 4 4 55 4 4 3 00000 55 9999999999 44444 99 111111 4 4 55 2222 4 99 4 4 777 4 4 888888888888888888888888888 00000 55 777 55 222222222 2 3333333 4 99 4 0000 666 33 4 4444 4 000000000000 2222 0 11111111111111 4 4 4 4 222 8 4 00 777 22 88888 8 4 8 4 5 77 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 4 4 55 4 33 4 4 77 99 4 0 0 4 777 4 4 55 4 4 4 99 11 4 4 777 8 555555 4 4 777 8 00000 4 8 00000 8 4 4 4 4 777 4 1 22 222222 4 4 4 1 11111 55 4 4 5555555555555 4 4 5 888 1 5 5555 444444444 5 5 222222222 5 5 3333 5 11 8888 5 5 88888 5 222 0 5
lowQualScore : . . .. . . .. .. . .... . . . . ...... . ..... . . . .. .. . . ... . ..... . . .......... . ... . ... . . .. ... . . ... .. .. . . .. .. ......... . . .. . ............................................. .. ... . . .. .. .. . . . ... . .. ......... . . ... . ... ...... .... .. . . . ... . . .. .. .. . .. . .. .... . . . . ... .. . . .. . ........ .. . . .... . . . . ......... . . .. . . . .. . . . ..... .. .......... ..... .. ...... . . .. .... . .. . . ... . . ........................... ..... .. ... .. ......... . ....... . .. . .... ... .. . .... . ............ .... . .............. . . . . ... . . .. ... .. ..... . . . . . .. .................................................................................................................................... . .. . . .. . .. . . .. .. . . . . ... . . .. . . . .. .. . . ... . ...... . . ... . ..... . . ..... . . . . . ... . . .. ...... . . . . ..... .. . . ............. . . . ... . . .... ......... . . ......... . . .... . .. .... . . ..... . ... . .
lowQualScore : 0 0 55 3 6 00 00 6 7777 6 6 3 3 666666 3 11111 1 1 2 22 33 5 1 666 3 55555 3 3 7777777777 3 999 2 333 6 4 66 444 6 6 222 66 00 6 6 00 66 333333333 3 0 00 6 555555555555555555555555555555555555555555555 66 888 3 3 99 66 99 3 3 7 111 3 66 111111111 7 7 555 3 888 888888 8888 77 5 0 6 444 6 3 00 66 66 0 00 6 00 7777 0 0 0 0 000 55 0 0 55 0 55555555 55 0 0 7777 0 0 0 0 999999999 7 0 55 0 0 0 00 0 0 6 00000 55 5555555555 88888 55 555555 0 0 55 5555 0 55 0 0 000 0 0 333333333333333333333333333 33333 55 000 55 000000000 0 0000000 0 55 0 3333 000 55 0 6666 0 555555555555 5555 9 88888888888888 4 4 4 4 222 9 4 66 888 22 99999 9 4 9 4 0 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 55 0 0 66 0 55 0 0 22 55 0 8 8 0 000 0 0 55 0 0 0 55 00 0 0 000 0 555555 0 0 000 0 00000 0 0 00000 0 0 0 4 4 888 4 1 22 222222 4 4 4 0 11111 00 4 4 6666666666666 8 4 0 888 0 0 6666 222222222 0 0 222222222 0 0 5555 0 99 4444 0 0 11111 7 999 7 7
consensus : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNT--A-T-N------T--T--------C-TT-CG----TT--A---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-TG-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAAC-T-C-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---------CG-GGGAAA-C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-----TT--C-A-CT----GG--TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TCA-C--GCA-ACAC--CTTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
Reference ( family-494 ) : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TNT--A-T-N------T--T--------C-TT-CG----TT--A---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAG-ACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-TG-TGATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAAN-T-C-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCG---------CG-GGGAAA-C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-AAC-G-AAA-TCG-GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAAG-----TT--C-A-CT----GG--TT---TTACT-A-T---ATNT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TCA-T--GCA-ACAC--CTTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTTA
gi|1 : TTCAATTAGAGTC-CA--AA--TAT-A---GTC--CA-T----AC-ACGCTGAAAA-TAT-TGTCAGACAAT-TA-AC-TATT-G-C-A---T--TTGC-AAATGGAT-ATAATAGCA-----T-TTC-GTTT-TTTACATGTAGATATA-CAT---GTTCAATATTTA-TAACAGTTT-A-T--CC---TG-TGC-TG--CGTTCCC--A-T-TAACA--AGG--GA---------GAT-TTTCTA-T-C------T--T--------CCTT-CG----AG--C---T-----ATAG--CC---TT-G-TGCCG-TTG--CC-G-T-G-TGCT---A-A--AA----AAC--A-GC-TTACAG---AA-GCG---ACAAG-A----GA---CAAG-AACTAACGGGTT---CT-T-GT---CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----G--ACG-TG-TGATA-C---G--CCA-TAAA--TT-GT--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAAAGA-C-T-A-----A----GTG-T-TT-GT--G-ATGA---GAGACAGC-TTC-G-AAATT-----TA----GG---A------AAATA---T-GTATCC--GTG------CAA-GA-TTCGA--AC----TCGAG--TCG-T-T--------AAAA-ATA---C---A--------G--TT-----GG------A--GT---T--AAA--G-T----CCACAGGC-------CTGTAT--CC-AT--TAAC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA-------------TCAAC-A-GACCG---------TATGCGAAACC-T-T-AAC---GAGGCAG-A--T---GAAAGTGAAGGAGGAATTA-GT-AACAG-AAA-TCG-GTGT
gi|1 : tCGGGGA-TCTCCC-C-T-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAT--GCA--ATAAAT-CGC---TTCTC-TG--CAT-G-ATT-TC--AATAC-TTAT-TT---TATGTTTGG-----ACT-AAAGT---C-TTG-----TC-AATAAC-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-TAATA---TT-TTGGAATC--AAG-----A-CAA-AAAAG-----TT--CTA-TT----GGGTTT---TTTCT-A-T---ATAT--TG----AATAAC-TCT-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TCA-TC-GCATACACAACTTTA----GGAAA-T-CA-----CACAA-TGCTTAATG-AACA-CTTC-TTATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcggggatctcccctgtattttgaggctaaaatgcaataaatcgcttctctgcatgatttcaatacttattttatgtttggactaaagtcttgtcaataacacaccttttagacttattttcttaatattttggaatcaagacaaaaaagttctattgggttttttctatatattgaataactcttattttatcgatctttcatcgcatacacaactttaggaaatcacacaatgcttaatgaacacttcttatataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|10 : tttcaattagagtccaaatatagtccatacacgctgaaaatattgtcagacaattaactattgcatttgcaaatggatataatagcatttcgttttttacatgtagatatacatgttcaatatttataacagtttatcctgtgctgcgttcccattaacaagggagattttctatcttccttcgagctatagccttgtgccgttgccgtgtgctaaaaaacagcttacagaagcgacaagagacaagaactaacgggttcttgtcctataggacagtgacgtgtgatacgccataaattgtataaaacattttaaaaaagactaagtgtttgtgatgagagacagcttcgaaatttaggaaaatatgtatccgtgcaagattcgaactcgagtcgttaaaaatacagttggagttaaagtccacaggcctgtatccattaacgccacgccgcacatcaacagaccgtatgcgaaaccttaacgaggcagatgaaagtgaaggaggaattagtaacagaaatcggtgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-AATTGTC--CAAT----GC-AC-CTGAAAAATAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-GGC-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTCAGTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTATTTACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--CCCAA-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TAT--A-T-A------T--TTTATCTTCC-TT-CGGC--TT--T---T-----ATAGGCCC---TT-GATGCT--TTG--CCGA-TAG-TGCTAAAA-A--AA----C-C--A-TATTCACAGA--AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAA--ACCC-AACGGTT---CT-TGGTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-GCG-TG-TGATA-C---G--CTA-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-A-TTT----AAAAA-GA-C-T-AGTCTAA----GTGGTGTT-GTTGA-ATGA-A-GAGACAAG-T-C-G-Ataaatttgtttatattagtttcaattgtagtttcggctttcatttaaatgagcaaaaagtgtgttcatgttggaataaaaactttatataaatta
gi|11 : AAT-AGAGTT-AA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG-------AT-A--AC-TATT-G-C-AATTT--TTGC-AACC-GA--ATA-TATCAAT---T-TCC-GTTT-T--------AAATATAGCAT--TGTTCATAACTTA--TACAGTTT---TA-CC---TG-TGC-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGGGAGA---------TAT-TTT--A-TCG------T--C--------C-TT-CGACTTTT--A---------AAAA--CT---CT-GATACC--TTGGCC--G-T-G-TACTA--A-A--AA----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-ATCTCGA--GTAAG-AACCCAACGGTTTTCTT-T-GTT--CC--T--ATA-G----T-G--GT----GT-GTA--G-TGGTA-C---GC-C-A-TAAA--TT-GA--------AT---A-AAC-ATTTT----
gi|12 : tgGGGGA-TT--CC-C-TTGT-AATTT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-CTTG--CAT-GAATT-TC--AA--CTTCAA-TT---TATATTTGGTTAAAACT-AA-TTTTAC-TTG-----TC-AATA-TCCTCAA-CACCTTTTTAGATGTATTTATCT-T-ATATTTTT-TTGGAATA--AAG-----AGC-AGAAAAG-----TTTCC-A-CTCTGAGG--TT---TT-TT-ATT---ATCT-ATGA---AATAAC-A-TATGGATAT-T-TT----ACAACCCGAGCT-TGTCA-T--GCA-ACAC--TTTTA--GAGGAAATT-CACATTGGATGATTAC--ATGGCAA-ACATCC-TTTT
gi|13 : GGGGA-TT--CCAC-T-GT-AA-TTAT-TGAAG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAG-TGCGCATTG-C-TGGTCATCG-ATTATC--AAGAC-TTAA-TTATATAT-TATG------A-T-AA-TT---CATTGGTACATC-A-TA-C-----AACACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-ATA---TTGTTGGAATAACAAGCGAGAA-C-A-AAAAGAGTTACT--A-A-CT----GG--TTTCATTACTGA-T---ATA--ATGATGTAGTAAC-T-A-----TATAT-ATATAAA----TCGATCTAT-TCA-CCGGCA-ACAC--CTTTAAGA-GGAAA-TGCAC----CAt
gi|14 : -AAACT-----TAAA--GG---ACTAAAAAAAAA---TTGTATCCT-GTG------AAA-GG-ATCGATTACCTCATCC-G--TCG-T-TTTAAAAA-GAAA-AGA---C---AA-----C-A--GT-----GGGAA--CA--TT---T--AAAT-G-T----CCACA-GC-------CT-TATCACT-GT--T-AT--GTCG-AC-G-AC-TCA-TACAGTCAACAATCTCCAA--A-TAACGACCAGAAGTCG-AGAATT-C-T-T-AATCGGG-TGCAG-AGCTAAGAAAGTTGAAAGAGGAC--A-ATAAAC-G-AA
gi|15 : aaaactacccgataTCAAT-AGAGTT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-C----GC-AC-CTGGAAA-TAT-AG------AAT-A--AA-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTTT-A--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTTCAGT--CC---TG-TGC-TG--CGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GAGATACAGTGTAT-TTT--A-T-C------T--TC-------C-TT-CG----AC--T---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--CCG--C--G-C-G-AGCTA--A-A--AA----C-C--A-CA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAgagtc
gi|16 : TTCAAT-ATAGTT-CA--AAA-CAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-A--AC-AATT-G-C-AA--T--TTGC-AACTGGA--ACA-TATCA-----G-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA--TACAGTTT-AGT--CC---TG-TAC-TA--CGT--CC--A-T-T------------------------T-TTT--A-T-C------T--TC-------C-TT-CG----GC--T---T-----ATAG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AA------------A-TCACA--------C------------------------------AACGGTC---CT-T-GTT--CC--TGAATA-GG--AC-A--GT----G
gi|17 : C--T--ATA-GG--AC-A--GT----GT-ACG-TG-TGATA-C---G--C-A-TACA--TT-GA--------AT--AA-AACAATTTA----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GT-GTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAAC-T-C-G-AAATT-----TAAA--GGAAAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TC---AAGTTAAA-AAA---C---AA-----
gi|18 : -----ATAT--CC---TT-GATGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---ATAACAA----C-C--A-TA-TCACGGTCTAA-GCG---ACATG-G----CA--GCAAG-ACCCAAA-GGTC---CT-T-GTT--CC--T--ATA-acccagttacatggacgttt
gi|19 : TTCAATTAGAGAT-CA--AAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGGAAC-TAT-TG------AAT-AC-AT-CCTC-G-C-AA--TA-TAGC--ACTGGA--
gi|2 : T-AGA-TT-CA--AAA-T-T-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-A-TT-G-C-AA--T--TTGTTAACTGGA---TA-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAAT-TTTA-T--CAGTTT-ATC--CC---TG-TAC-TG--T-T--CC--AGTGTAACA--AGG--GA---------TGT-TAT--A-T-TATTTACT--T--------C-TTTCGGC--TT--A---T-----A-GG--CC---TT-GATGCC--TTG--C--CCT-GCTGCTTA-A-A--AG----C-C--ACTA-TCACAGG--AA-GCG---ACATG------GA--GCAAGGACCCAAACGGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATAAGG--AC-A--GT----GG-GCG-TGATGATA-C---G--C-AGTAAA--T--GA--------AT--ATTAAC-AATT-----AAAAA-GA---T-AG---AA----GTG-TGTT-GT--GCATGA-AAGAGACAAG-T-C-GGAAATT-----TAAG--GG---A------AAAAA-----GTATCC--GTG------AAA--A-TTCGA---C----TCG----TCGCT-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AAAAAACCAG--TTTTTTGGG--A--CA--TTAAAC--AAC--GCT----CCA-A-GC-------CT-TAT--CCCAT--T-AT--GCC--AC-G-CC-GCAACA------------TTCAA--AACACC----------CT-TGGAAA-C-T-T-AAC---GCTGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAA--A-GT-AAC-G-AAA-Ttccac
gi|2 : taatGGGGT-TC--CC-C-T-GTTA--TT-T-TGAGA-CTAAAAAA-GCAC-ATAAATTCGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TTT-AA--C-TCAA-AT---TAT-TTTG------AC--AA-TT---CCTTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCT-T-AGA---TT-TTGGAATA--AAG-----A-C-A-AAAGT-----TC--C-A-CT----GG---T---GTACT-A-T---ATCTGATG----GAAAACTT-T-----TAT-TGTT----A----CAG-TC--T-TCA-T--GCA-A-AC--ATTTA----GGAAA-T-CACG---CATGA-TAC--AATGCAACACCTTC-TTTgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggttcccctgttattttgagactaaaaaagcacataaattcgcttcctgcatgatttttaactcaaattattttgacaattccttgtcaatacacaccttttagacttattttcttagattttggaataaagacaaaagttccactggtgtactatatctgatggaaaacttttattgttacagtcttcatgcaaacatttaggaaatcacgcatgatacaatgcaacaccttctttat
gi|20 : taattagattcaaaattatgtccatgcacctgaaaatattgaatatacattgcaatttgttaactggatatatcatttcgttttagatatacattgttcaattttatcagtttatccctgtactgttccagtgtaacaagggatgttatattatttacttctttcggcttataggccttgatgccttgccctgctgcttaaaagccactatcacaggaagcgacatggagcaaggacccaaacggttcttgttcctataaggacagtgggcgtgatgatacgcagtaaatgaatattaacaattaaaaagatagaagtgtgttgtgcatgaaagagacaagtcggaaatttaagggaaaaaagtatccgtgaaaattcgactcgtcgctttaaaaaaaaaacaaaaaaccagttttttgggacattaaacaacgctccaagccttatcccattatgccacgccgcaacattcaaaacacccttggaaacttaacgctgcagatgaagttgaaaggaaagtaacgaaatgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CTGAAAA-T------------------------T-G-C-AA--T--T---------------A-TATCA-----T-TTC-GTTT-T--------CGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTat
gi|3 : TTCAAT-AGAGTT-CA--AAAATAT-A--TGTC--CA-T----GCCAC-CTGAAAA-TAT-TG------AAT-AT-AC-AATT-G-C-AA--T--TTGT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-ATTT-T--------AGATATA-CAT--TGTTCAATATTTA-ATACAGTTT-AGT--CC---TG-T-C-TG--TGT--CC--A-T-TAACA--AGG--GA---------TAT-TAT--A-T-A------T--T--------A-T--AA----TT--A---T-----ATAT--TT---TT-TTTGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--A-----C-C--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCAAT-ATCCAAACTGTT---CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG--AC-A--GT----GTGGCG-TG-T-ATA-C---G--C-A-TAAA--TT-GA--------AT--AA-AAC-ATTTT----AAAAA-GA-C-T-AG---AA----GTGTTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAAG-T-C-G-AAATT-----TAAA--GG---A------AAAAA---T-GTATCT--GTG------AAA-GA--TCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAA---C---AA-----C-G--TT-----GT--A--CA--TT---T--AAA--G-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CA-AT--T-AT--GCC--AC-GACC-GCA-CG------------TTCAA--A-CAGCG---------CA-GTGAAA-C-T-G-CAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGG-G--A-GT-AACTG-AAAGTC--GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-T-T-GT-A--TT-T-TGAGT-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC--ATA-C-----A-TA-C-TTTTAGACTTA-TT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AAG-----A-C-A-GAAAG-----TT--C-A-CT-----G--TT---TTACT-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-T-A-T--GC--ACACA-CTTTA--G-GGAAA-T-CA-----CATGA-TAC--AATGCAACACCTTCATTTTA
gi|4 : CAAT-AGATTT-CA--GAA-TAT-A--TGTC--CA-T----GC-AC-CT-AAAA-TAT-TG------AAT-AT-ACTAATT-G-C-AA--T--T-GT-AACTGGA--ATA-TATCA-----T-TTC-GTT-----------GAATATA-CAT---GTTCAATATTTA-T-ACAGTTT-AGT--CC---TG-TGC-TG--TGT--C---A-T-TA-CA--AGG--GA---------TATATAT--A-T-T------TCAT--------C-TT-CC----TA--AGCTT-----ATAG--CT---TT-GATGCTCGTTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAA---C-CTAA-TA-TCACAG---AA-GCG---ACATG-A----GA--GCA------------------CT-T-GTT--CC--T--ATA-GG---C-A--GT----GT-GCG-TG-TGATA-C---G--C-A-TAA----T-GA--------ATTAAA-AAC-ATTTT----AAA---GA-CGT-AG---A-----GTG-TGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAACGT-C-G-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAAAATT-GTATCC--GTG------AAA-GA-TTCGA--AC----TCG-G--TCA-T-TT---AAA-AAAA-AC----C---AA-----A-G--TT-----GG--A--CA--TT---T--AAA--T-T----CCACA-GC-------CT-TAT--CC-AT--T-AT--GCC--AC-G-GC-GCA-CA------------TTCAA--A-CACCA---------CA-AGGAAA-C-T-T-AAC---G-TGCAG-AA-T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAC-G-AAA-TCG-g
gi|4 : cCGGGGA-TT--CC-C-T-AT-A--TT-T--GAGATCTAAAAA--TCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--TAT-G-ATT-TC--AA--C-TCAACTT---TAT-TTTG------ACT-AA-T----A-TTG-----TC-AATA-C-----A-CACC-TTTCAAACTTATTT-TCT-T-ATA---TT-TTG--ATA--AA------A-C-A-AAAAG-----TT--C-AACT----G---TT---TT--T-A-T---ATCT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----CCGATCT-T-TCA-T--GCA-ACAC--CTTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattccctatatttgagatctaaaaatcacataatcgcttcctgtatgatttcaactcaactttattttgactaatattgtcaatacacacctttcaaacttattttcttatattttgataaaacaaaaagttcaactgtttttatatctatgaataactttattttaccgatctttcatgcaacacctttagggaaatcaccatgatacatgcaacaccttcttta
gi|5 : ccaatagatttcagaatatatgtccatgcacctaaaatattgaatatactaattgcaattgtaactggaatatatcatttcgttgaatatacatgttcaatatttatacagtttagtcctgtgctgtgtcattacaagggatatatatatttcatcttcctaagcttatagctttgatgctcgttgcgtgtgctaaaaacctaatatcacagaagcgacatgagagcacttgttcctataggcagtgtgcgtgtgatacgcataatgaattaaaaacattttaaagacgtagagtgtgttgtgatgaagagacaacgtcgaaatttaaagggaaaaaaattgtatccgtgaaagattcgaactcggtcatttaaaaaaaaccaaagttggacatttaaattccacagccttatccattatgccacggcgcacattcaaacaccacaaggaaacttaacgtgcagaatgaagttgaaaggagaagtaacgaaatcgtatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-AATT-G-CCAA--T--TTGC-A-CTGGTTTATA-TATTAACATGT-TTC-GTTT-T--------AGAT-TA-CAT---GTTCA-T-TTTA-TTTCAGTTT-ATT--CCCCTTG-TGCCTG--C-T--TC--A-T-TATCA--GGA--GA---------TAT-ATT--A-T-T------T--T--------C-TC-TG----TTTTA---TCGCTTATAG--CT---TTTGATGC---TTG--C--G-T-G-TGCT---A-A--AAATACT-T--A-TA-TCACAG---AA-GCG---ACA-G-A----GA--G--AG-ACACAA-CGGTC---TA-T-GTTGCTC--T--ATA-GG--AC-ATAGT----GT-GCG-TT-GGATA-T---T--C-A-TA----TT-GA--------TT--AA-AAC-ATTTT----TAAAA-GAAC-T-TA---AA----TTGGTGTTTGT--G-ATGA-A-GAGACAAC-T-CCG-AAATT-----TAAA--GG---G------AAAAA---G-GTAATC--ATGCTTGATAAA-GA-TTCGA--AC----TCA-GCGTCG-T-TT---AAA-AAAATAAA---C---A--------G--TT-----GG--G--CACGTT---T--AAA--G-T----CCACA-AC-------CT-TAT--CC-AT--------------------------A------------TTCAA--A-CGTAG---------TG-AGGAAA-C-T-T-AAC---G-TGCAG-A--T---GAAGTTGAA--AGGAG--AAGT-AAA-G-AAA-TCC--TGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGA-TT--CC-CCT-GT-A--TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-ATAAAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-AAT-TC--AA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACT-AA-TT---C-TTG-----TC-AAAA-C-----A-CACC-ATTTAGGCTTATTT-TCT-T-ATG---CT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAAAG-----TTC-C-A-CT----GG--TT---TTACT-A-C---ATAT-ATG----AATAAC-T-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-T-TCA-C--GCA-GCAC--CTTTA--G-GGAAA-T-CAC----CATGA-TAC---ATGCAACACCTTC-TTTa
gi|6 : aTTCTAT-AGAGTTTCACCAAT-TATGA--TGTCTCCA-TATTTGC-AC-CTGAAAA-TCT-TT------GAT-ATTACGAATTAG-CTAA--T--TTGT-ACCTGGAT-ATA-T-TCAAT---T-TTC-GTTT-A--------GAATA-A-TATCATGTTCAATATTTA-TTACAGTTT-AGTTCCC---TG-TGT-GGGATGT--CC--A-T-TAACA---GG--GA---------TAT-TAT--AGT-A------T--T--------T-GTATA----TC--A---T-----ATAT--TT---TT-T-TGCC--TTG--C--G-T-G-TGCT---A-C--AA----C----A-TAGTCACAG---AA-G-G---ACATGGA----GA--G-AAT-ACCCAAA-GGTT---CTGT-TTT--CC--T--ATATGG--AC-A--GT----GT-GCGATG-TGATAAT---GTTC-A-TGAA--TTTGA--------AT--AA-AACGATTTTTTTAAAAAA-GA-C-T-AG---AT----GTGATGTT-GT--G-ATGATA-GAGACAAG-T-C-G-AAATT-----TAAA---G---A------AAAAA---T-TTAATCAGGTG------AAG-AA-TTCGA--AC----ATA-G--------TT---A-------------------------------T-----GG--AAGCA--TT---T--AAA--G-C----C--CT-GC-------CT-TAT--CC-ATACT-ATGAGCCCGACGG-CT-GC--C-------------TTCAAGTA-TATCGAGA------CA-GTGAAA-C-TGT-AACA--G-TGCAGTA--T---GAAGTTGAA--AGGAG--A-GT-TAC-G-AAA-T---GTGT
gi|6 : gCGGGGA-TT--CG-C-T--T-G--TT-T-TGAT--CTGAAAAAGTCAC-ATAA-T-CGC---TTC-C-TG--CAT-T-GTT-T---AA--C-TCAA-TT---TAA-TTTT------ACTAAA-TT---C-TTG-----TC-AATATC-----ATCACC--------CTTATTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggggattcgcttgttttgatctgaaaaagtcacataatcgcttcctgcattgtttaactcaatttaattttactaaattcttgtcaatatcatcacccttatttt
gi|7 : gttctatagagtttcaccaattatgatgtctccatatttgcacctgaaaatctttgatattacgaattagctaatttgtacctggatatattcaattttcgtttagaataatatcatgttcaatatttattacagtttagttccctgtgtgggatgtccattaacagggatattatagtatttgtatatcatatatttttttgccttgcgtgtgctacaacatagtcacagaaggacatggagagaatacccaaaggttctgttttcctatatggacagtgtgcgatgtgataatgttcatgaatttgaataaaacgatttttttaaaaaagactagatgtgatgttgtgatgatagagacaagtcgaaatttaaagaaaaaatttaatcaggtgaagaattcgaacatagttatggaagcatttaaagccctgccttatccatactatgagcccgacggctgccttcaagtatatcgagacagtgaaactgtaacagtgcagtatgaagttgaaaggagagttacgaaatgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AAAAA-GA-C-T-AAGT-AA----GTGGTGTT-GT--G-ATGA-A-GAGACAAC-T-C-G-AAATT-----TAAA--GGGGAA------AAAAA---T-GTATCC--GTG------AAA-GATTTCGA--AC----TCG-G--TCG-T-TT---AAA-AAAA-AAAGATCAGAAA-----C-GGTTT-----GT--A--CG--TT---TTAAAA--G-T----CCATAGGCCGCCCCGCT-TATC-CC-AT--T-AC--GCC--AC-G-CC-GCA-CA------------TTCAA--ACCACCG---------C--ATGAAA-C-T-TAAAC---G-TGCGG-A--T---GAAGTTGAA--AG--A--A-GT-AAC-G-AAA-TCGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGGATTT--CC-C-T-GT-AT-TT-T-TGAGG-CTAAAAA--TCAC-AT-AAT-CGC---TTC-C-TG--CAT-G-ATT-TCCAAA--C-TTAA-TT---TAT-TTTG------ACA-AT-TT---C-TTG-----TCAAATA-C-----A-CACC-TTTTAGACTTATTT-TCTAA-ATT---TT-TTGGAATC--AAG-----A-C-A-AAATG-----TTC-C-A-CT----GG--TT---TTACT-
gi|8 : A-TATATA------AATGAT--T-AATT-A-T-GA--TAGCTGT-AACTGGG---CA-TACCA-----AATTC-GAGTAT--------CGGTATA-CAT--------AT-TTTA-TTACAGTTT-AGT--TT---TGTTGC-TG--TGTA-CC--A---TAAGAGCAGG--GA---------
gi|8 : --GA---------TATCTGT--A-T-C------T--C--------C-TT-CGAGC-CT------C-----ATAG--CCCCTTT-GA---C--TTG--C--G-T-GACGCT---A-A--AAAA--C-C--AGTA-TCACAG---AACGCGCAAACATG-A----GACAG-AAA-ACCCAAACGCAT---CT-TCGTT--TCCTT--ATATGGTAACTA--GTCGAAAT-G-G-CG-TGATA-CTTCG--C-A-TAAAATTT-GATTATTTATAT--AT-AAC-ATTTC----AAGAA--A-C-TGAG---AATGTTGTCATGTT-GT--G-A-GA-A-G---CAAC-T-A-C-AAACTATCTGTAAGAGGG---A------AAAAAGT-T-GTCTCC--GTG------AAAAGA-TTCAA--ACC---TCG-GC-TCG-TCTT---AAA-AACA-AAC---C---TA-----T-G--T------AG--A---A--GT---T--AAAAAG-TTACACCATA-AC-------CT-TCT--CA-GT--T-AC--GCCC-AC-G-C--ACA-CA------------TTCAA--A-agcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtcagatatctgtatctccttcgagcctcatagcccctttgacttgcgtgacgctaaaaaaccagtatcacagaacgcgcaaacatgagacagaaaacccaaacgcatcttcgtttccttatatggtaactagtcgaaatggcgtgatacttcgcataaaatttgattatttatatataacatttcaagaaactgagaatgttgtcatgttgtgagaagcaactacaaactatctgtaagagggaaaaaagttgtctccgtgaaaagattcaaacctcggctcgtcttaaaaacaaacctatgtagaagttaaaaagttacaccataaccttctcagttacgcccacgcacacattcaaa
gi|9 : atatataaatgattaattatgatagctgtaactgggcataccaaattcgagtatcggtatacatattttattacagtttagttttgttgctgtgtaccataagagcagggaagcggcgtatcgggcatttagaaaaatggtca--TT---T--AAA----T----CCACATGT-------CT-GAT--CC-AT----AC--GCC--AC-G-CCCGCA-CA------------TTCAA--AGCATCG---------CA-GGGAAA-CTT-T-AGC---G-TGCGG-A--T---GAATTTTAA--AG--A--A-GT-AAC-ATGAA-TC--GTGT
gi|9 : tCGGGAC-TT--CC-C-T--C-A--TT-TGTGAGG-CTAACA---TCGCTAAAAAT-CGC---TTG-C-TG--CAT-A-ATT-TC--AA--T---AA-TT---TAT-TT-G------ACT-AA-TT---C-T-G-----TC-CACA-C-----A-CACT-TTTTAGACTTATTT-C---T-AGA---TT-TTGGAATATCAA------A-C-A-AAA-G-----TT--C-A-CT-------------TTACT-A-CTTAATAT-ATG----AATAAC-A-T-----TAT-T-TT----A----TCGATCT-C-TCAAC--GCA-ACAC--CTTTA--A-G-AAA-T-CAC----CATGA--AC--ATGGCAACAC--TC-TTccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgggacttccctcatttgtgaggctaacatcgctaaaaatcgcttgctgcataatttcaataatttatttgactaattctgtccacacacactttttagacttatttctagattttggaatatcaaacaaaagttcactttactacttaatatatgaataacattattttatcgatctctcaacgcaacacctttaagaaatcaccatgaacatggcaacactcttgt