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Reference ( gi|2 ) : TCTCGACCTAATGCTTA--GGTCACAAA-----GAT-CGGCCG-GTAT-CCGGG-GATA--GGGGGTAA-TAGGGAATACACC--GC-TGGTTTTTGGCCATTTTT----T----CGAATTTGGA-TCAA-CACTGGTTAAAAA-A-TT-TGTCATACATCATTTACA---TAA-ATGTCAACATCCGGA--AACCGTCCAAAGACCATCTGGTAAT-CGTACGGC--GTCTGTTTTCAAAGAGAA-GTTT-----------------------T--GAGG-TG--TC-GG-CG--AC------------G--C-AGTGAATAACGGCTGG-AT-T-TCTACCGA--ATA-TT-TAT----------TACTAAT----------CAGCCGAAT---A-TC----C-TATGATGTC----------CG-TG-C--G-A-TAA-CCGGCC--T--ATT-C--ACCG---GACATCGTA--CATATGTA-CGA-ACATCG-CCC-AATTATC-----C-TAC--GGACAACGAACG-ATGTTTGTAC-CAGGCCTGC-TGTC-TCTTGTGTAGAAA-CGGGTTATA-ATGT-TTCACACT-C--ACTGACGGATGTTTAAA-TAGTCCATTCGATGTCCGACCGATGTA---CA-----GTTCT-AG---CCGGCCGGTGAACAGCCGATGCCTGT-AGC-ATA--TTTGGCC-CGCACCGATTCAAACCGGTCGGACATTGGTGAGTTACTTTCCAATGTGTAAACAGACTTCGGCCGAATATCGGCCCATGTCCGGTCCC-AAACATTT-CTCCTCTGAT--TCT--ACATACACCTT-TCGATTAT-CGCTCGAT----TTC-CGGCCGAATAACGGACGATAC-TTA-------AA-CAACG---TTTGAAG-G-ATATGTG-TCCAATTAAGAAA-ATCTACGGGATACCGG-AGACATTTTAACTTCGA-GTC-AAAACTCTTCTG-GA-AC--CTTCCTGAT-GCTGC---CTTCG-AG-CTTC--GGCC------ACCGACCGG--CAATG-C----CT----------G--GTGTC-CG-G--CCG-GT-GAC-CA-GGCC-A--AAATG---GCT-------AAAAACCATG--CCGGGAGTACA-C-CCT--AAGCCTAAT---C-G----CA-A-GGGT----TTGTGACCTAAGCATTAG
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gi|11 : cggccggtatccgggatagggggtaatcgagagtacaccactggttttggctttgtgtccgacttcggtcaacaccgataaatctttgtcacctatcatttactgtttccagaaagattttggggggaccagcgaggcagtaaataacgaccgaacttcgaccgaacatctaatactaatcagctgataatcctatgattccctggtgataaccggcctattcaccggacatcgtacgaatatcgctctagtatcctacggacgacgaacaatgcttgtaccaggcccggccgaatgtcgcacggtatgatgaccgatggctacgtctATGCTTG--GGTCACAAA-----TAT-CGGCCC-GTATACGGATATAGGGG-TAATCGGGAGTA---CACC-GTT-GGTTTT-AGCTATTTTT----C----CGACATCGGA--AAA-CACCGGTAAAAA-AAA---T--T-GTCACTCAT-CATTTACA---T----------------AA-AT-TGCA----CCGTTCG-GAGGAGCCGT--CCAAAATCCATCCGGTAA--CGTATGGC--ATCTGTTTCCAGAGAGA--A-ATTT--TTTGGGGT-CC----G-GCG--AGGGGAGCGAATAACGGCCGG--AC-T-T-TGTC----AGA--AAATCTT----------GTA-CTA---ATCGACCGA-TTAT-C----C-TATCATGTCCG-GGCTATATAACCTGCCTATTCA-ACCG-GATA----GC----GCA-----CAA-ATAT-CG-CCCA-A-GTATC-----C-TAC--GTTCAACGAAAG-ATGTT-------------------GTC-TCTCGTGTAGAAA-CTCGCTATA-ATGTTTT-GCACTGCG-ACTGAC--ATGTCT-GGT-GTCCGGCCGGTGATCAGGCC
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gi|16 : attatgcttacatgACATCT-CT----TGATCTTCT---CATAGGC-CCGGTCG--AA-----T---GT-CG--AA----CGGTGTGATTC--ACGGCCGGATATCGGACGCTAT-TT-A-------AATGACT---T-TAAA-G-GATAT-GTG-A-CTGATTATGA--CA-AACTACGGGACACCGG-A
gi|17 : GTACGGC--ATCTGTTTCCAAAGAGA--T-T-TT--TTTGGAGG-CC----G-GCG--A------TGAATAACGACCGG--AT-T-T--GAC----CGA--ACATCTATTAAATACCGGTA-CTA---ATCAGGCGA-TTTT-C----C-TATGATGTACT-GGC--GGTAATC
gi|18 : TA-TCGGC-CCATGTCTGGTCCC-AAACATTT-TTCTTCTGAGG--CT--ACATA--CACCGGCCG--AT-----A---AC-CG--CG----CGAC-----TT--CAGGCCGGATAACGGACGATAC-TT-A-------AACGA
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gi|2 : CTCGACCTAATGCTTA--GGTCACAAA-----GAT-CGGCCG-GTATCCGGGGATAGGGGGTAATAGGGAATA---CACC-GCT-GGTTTTTGGCCATTTTT----T----CGAATTTGGAT-CAA-CACTGGT-TAAA-AAA---T--TTGTCATACAT-CATTTACA---T----------------AA-AT-GTCAACATC----CG-GAAA--CCGT--CCAAAGACCATCTGGTAAT-CGTACGGC--GTCTGTTTTCAAAGAGA--A-G-TT--TTGAGGTG-TC----G-GCG--A-CGCAGTGAATAACGGCTGG--AT-T-T-CTAC----CGA--ATATTTA----------TTA-CTA---ATCAGCCGA-ATAT-C----C-TATGATGTCCG-TGC--GATAACCGGCCTATTC--ACCG-GACATCGTACATATGTA-----CGA-ACAT-CG-CCCA-A-TTATC-----C-TAC--GGACAACGAACG-ATGTTTGTAC-CAGGCCT-G-CT-GTC-TCTTGTGTAGAAA-CGGGTTATA-ATGTTTC-ACACT-C--ACTGACGGATGTTTAAATAGTCCATTCGATG-TCCGACCGATGTAC---AGTT---CT-AGCC---GGCCGGTGAACA-GCCG--ATGCCTGT-AGC-AT-ATTT-GGCC-CGCACCGATTCAAAC--CGGTCGGACATTGGTGAGTTACTT--TCCAA-TGT--GTAAACAGACTTCGGCCGA-ATA-TCGGC-CCATGTCCGGTCCC-AAACATTT-CTCCTCTGATT--CT--ACATA--CACCTTTCG--AT-----T---AT-CG--CT----CGAT-----TT--CCGGCCGAATAACGGACGATAC-TT-A-------AACAACG---TTTGAA-G-GATAT-GTG-T-CCAATTAAGA--AA-ATCTACGGGATACCGG-AGACATTTTAACTTCGA-GTC--AAAACTCTTC---TGGAACCTTCCTGAT-GCTGC---CT--TCGAG-CTTCGGCC------ACCGACCGGCA--ATG----CC-------------TG-GTGTC-CG-G--CCG-GT-GAC-CA-GGCC-A--AAATG---GCT-------AAAAACCATG--CCGGGAGTACAC-CC-T--AAGCCTAAT---C-GC----AA-GGGT-----TTGTGACCTAAG-CATTAG
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Reference ( family-2908 ) : NCTCGACCTAATGCTTA--GGTCACAAA-----GAT-CGGCCG-GTATCCGGGGATAGGGGGTAATCGGGAGTA---CACC-GCT-GGTTTT-GGCCATTTTT----C----CGACATCGGA--CAA-CACCGGT-CAAA-AAA---T--T-GTCACACAT-CATTTACA---TAA-AT-G----------------GCA----C----CG-GA----CCGT--CCAAA--------G--------GTAA---T-CGTACGGC--GTCTGTTTCCAAAGAGAA-G-TT--TTGGGGGG-CC----G-GCG--A-GGCAGTGAATAACGGCCGG--ATT-T-CGAC----CGA--ACATCTA----------ATA-CTA---ATCGGCCGA-TTAT-C----C-TATGATGTCCG-GGC--GATAACCGGCCTATTC--ACCG-GACATCGTAC----GTA-----CGA-ATAT-CG-CCCG-A-GTATC-----C-TAC--GGACAACGAACG-ATGCTTGTAC-CAGGCCC-G-CC-GTC-TCTCGTGTAGAAA-CGGGTTATA-ATGTTTT-ACACT-C--ACTGACGGATGTTTAAGTAGTCCGTCCGATG-TCCGGCCGGTGAACC---GN----TN---T---AGCC---GGCCGGCGATCGCGCCG----AT-GCCTGT-AGC--GACA--TTCGGCCGGGC-CTGGTACAAGCATCG-TTC-GN-CGTCGGTAGGNTACTTTC--A--TGTGTAGGCANACTTCGGCCGGATATCGGC-CCATGTCCGGTCCC-AAACATTT-CTCCTCTGATN--CT--ACATA--CACCGGTCG--ATT---AC-CG--CG----CGGT-----TC--CCGGCCGGATATCGGACGATAC-TT-A-------AACGACG---TGTGAA-G-GATAT-GTG-G-CCGATTATGA--AA-ATCTACGGGACACCGG-AGAAATTTTAACTTCGA-GTT--AAAACTCTTC---GGGCACCTCCCCGAT-GCTGC---CT--GAGAG-CCCCGGCC------ACCGGCCGGCC--ATG----TC-------------TG-GTGTC-CG-G--CCG-GT-GAC-CA-GGCC-A--AAATG---GCT-------AAAAATCATG--CCGGGAGTACAT-CC-T--AAGCCTAAT---C-GG----AA-GGGG-----TTGTGACCAAAG-CATTAG
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Reference ( family-2908 ) : NCTCGACCTAATGCTTA--GGTCACAAA-----GAT-CGGCCG-GTATCCGGGGATAGGGGGTAATCGGGAGTA---CACC-GCT-GGTTTT-GGCCATTTTT----C----CGACATCGGA--CAA-CACCGGT-CAAA-AAA---T--T-GTCACACAT-CATTTACA---TAA-AT-G----------------GCA----C----CG-GA----CCGT--CCAAA--------G--------GTAA---T-CGTACGGC--GTCTGTTTCCAAAGAGAA-G-TT--TTGGGGGG-CC----G-GCG--A-GGCAGTGAATAACGGCCGG--ATT-T-CGAC----CGA--ACATCTA----------ATA-CTA---ATCGGCCGA-TTAT-C----C-TATGATGTCCG-GGC--GATAACCGGCCTATTC--ACCG-GACATCGTAC----GTA-----CGA-ATAT-CG-CCCG-A-GTATC-----C-TAC--GGACAACGAACG-ATGCTTGTAC-CAGGCCC-G-CC-GTC-TCTCGTGTAGAAA-CGGGTTATA-ATGTTTT-ACACT-C--ACTGACGGATGTTTAAGTAGTCCGTCCGATG-TCCGGCCGGTG-AACC---GN---CG----T-AGCC---GGCCGGCGATCAC-GCCGAT-GCCTGT--GC--GACA--TTCGGCCGGGC-CTGGTACAAGCATCG-TTCGT-CGT--CCGT-AGGATACTTTC--A--TGTGTAGGCAGACTTCGGCCGGATATCGGCCCATGTCCGGTCCC-AAACATTT-CTCCTCTGATN--CT--ACATA--CACCGGTCG--ATT---AC-CG--CG----CGGT-----TC--CCGGCCGGATATCGGACGATAC-TT-A-------AACGACG---TGTGAA-G-GATAT-GTG-G-CCGATTATGA--AA-ATCTACGGGACACCGG-AGAAATTTTAACTTCGA-GTT--AAAACTCTTC---GGGCACCTCCCCGAT-GCTGC---CT--GAGAG-CCCCGGCC------ACCGGCCGGCC--ATG----TC-------------TG-GTGTC-CG-G--CCG-GT-GAC-CA-GGCC-A--AAATG---GCT-------AAAAATCATG--CCGGGAGTACAT-CC-T--AAGCCTAAT---C-GG----AA-GGGG-----TTGTGACCAAAG-CATTAG
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Reference ( family-2908 ) : NCTCGACCTAATGCTTA--GGTCACAAA-----GAT-CGGCCG-GTATCCGGGGATAGGGGGTAATCGGGAGTA---CACC-GCT-GGTTTT-GGCCATTTTT----C----CGACATCGGA--CAA-CACCGGT-CAAA-AAA---T--T-GTCACACAT-CATTTACA---TAA-AT-G----------------GCA----C----CG-GA----CCGT--CCAAA--------G--------GTAA---T-CGTACGGC--GTCTGTTTCCAAAGAGAA-G-TT--TTGGGGGG-CC----G-GCG--A-GGCAGTGAATAACGGCCGG--ATT-T-CGAC----CGA--ACATCTA----------ATA-CTA---ATCGGCCGA-TTAT-C----C-TATGATGTCCG-GGC--GATAACCGGCCTATTC--ACCG-GACATCGTAC----GTA-----CGA-ATAT-CG-CCCG-A-GTATC-----C-TAC--GGACAACGAACG-ATGCTTGTAC-CAGGCCC-G-CC-GTC-TCTCGTGTAGAAA-CGGGTTATA-ATGTTTT-ACACT-C--ACTGACGGATGTTTAAGTAGTCCGTCCGATG-TCCGGCCGGTG-AACCGN-GACGTAGCC---GGCCGGCGATCAC-GCCG---GCCTGT--GC--GACA--TTCGGCCGGGC-CTGGTACAAGCATCG-TTCGT-CGT--CCGT-AGGATACTTTC--A--TGTGTAAACGGACTTCGGCCGGATATCGGCCCATGTCCGGTCCC-AAACATTT-CTCCTCTGATN--CT--ACATA--CACCGGTCG--ATT---AC-CG--CG----CGGT-----TC--CCGGCCGGATATCGGACGATAC-TT-A-------AACGACG---TGTGAA-G-GATAT-GTG-G-CCGATTATGA--AA-ATCTACGGGACACCGG-AGAAATTTTAACTTCGA-GTT--AAAACTCTTC---GGGCACCTCCCCGAT-GCTGC---CT--GAGAG-CCCCGGCC------ACCGGCCGGCC--ATG----TC-------------TG-GTGTC-CG-G--CCG-GT-GAC-CA-GGCC-A--AAATG---GCT-------AAAAATCATG--CCGGGAGTACAT-CC-T--AAGCCTAAT---C-GG----AA-GGGG-----TTGTGACCAAAG-CATTAG
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gi|10 : cttattcgtatctcttataa-CGGCCG-GTATCCGGG-ATAGGGGGTAATCGAGAGTA---CACC-ACT-GGTTTT-GGCTTTGTGT----C----CGACTTCGGT--CAA-CACCGAT--AAA-TCT---T--T-GTCACCTAT-CATTTAC
gi|10 : CTGTTTCCAGAAAGA----TT--TTGGGGGGACC----A-GCG--A-GGCAGTAAATAACGACCGA--ACT-T-CGAC----CGA--ACATCTA----------ATA-CTA---ATCAGCTGA-TAAT-C----C-TATGATTCCCT-GGT--GATAACCGGCCTATTC--ACCG-GACAT----C----GTA-----CGA-ATAT-CG-CTCT-A-GTATC-----C-TAC--GGACGACGAACA-ATGCTTGTAC-CAGGCCCGG-CC-Gtgtttccagaaagattttggggggaccagcgaggcagtaaataacgaccgaacttcgaccgaacatctaatactaatcagctgataatcctatgattccctggtgataaccggcctattcaccggacatcgtacgaatatcgctctagtatcctacggacgacgaacaatgcttgtaccaggcccggccgaatgtcgcacggtatgatgaccgatggctacgtctgcggttcccgggcggatatcggacgatacttacatgaagtggccgattatgaaaacatacgaggcaccggagaaattttatcttcaagctaaaactcttcgggcacatccccgatgctgtctgagcgcccaggccacctgcaggtcatggctggtgtccggccggtgatcaggctaaagtggctaagaattatgccgggagtacatcctaagggctgtgaccaatgcat
gi|10 : cggccggtatccgggatagggggtaatcgagagtacaccactggttttggctttgtgtccgacttcggtcaacaccgataaatctttgtcacctatcatttaTAAGTA--TCGTCCGATA-TCCGCCCGG-G-AACCGCAGACGTAGCC---A-TCGGTCATCAT-ACCG--------T--GC--GACA--TTCGGCCGGGC-CTGGTACAAGCATTG-TTCGT-CGT--CCGT-AGGATACTaatgtcgcacggtatgatgaccgatggctacgtctgcggttcccgggcggatatcggacgatacttacatgaagtggccgattatgaaaacatacgaggcaccggagaaattttatcttcaagctaaaactcttcgggcacatccccgatgctgtctgagcgcccaggccacctgcaggtcatggctggtgtccggccggtgatcaggctaaagtggctaagaattatgccgggagtacatcctaagggctgtgaccaatgcat
gi|10 : cggccggtatccgggatagggggtaatcgagagtacaccactggttttggctttgtgtccgacttcggtcaacaccgataaatctttgtcacctatcatttactgtttccagaaagattttggggggaccagcgaggcagtaaataacgaccgaacttcgaccgaacatctaatactaatcagctgataatcctatgattccctggtgataaccggcctattcaccggacatcgtacgaatatcgctctG----CGGT-----TC--CCGGGCGGATATCGGACGATAC-TT-A-------CA----------TGAA-G--------TG-G-CCGATTATGA--AA-ACATACGAGGCACCGG-AGAAATTTTATCTTCAA-GCT--AAAACTCTTC---GGGCACATCCCCGAT-GCTGT---CT--GAGCG-CCCAGGCC------ACCTGCAGGTC--ATG----GC-------------TG-GTGTC-CG-G--CCG-GT-GAT-CA-GGCT-A--AAGTG---GCT-------AAGAATTATG--CCGGGAGTACAT-CC-T--AAG----------------------GG-----CTGTGACCAATG-CATcatgaagtggccgattatgaaaacatacgaggcaccggagaaattttatcttcaagctaaaactcttcgggcacatccccgatgctgtctgagcgcccaggccacctgcaggtcatggctggtgtccggccggtgatcaggctaaagtggctaagaattatgccgggagtacatcctaagggctgtgaccaatgcat
gi|11 : cggccggtatccgggatagggggtaatcgagagtacaccactggttttggctttgtgtccgacttcggtcaacaccgataaatctttgtcacctatcatttactgtttccagaaagattttggggggaccagcgaggcagtaaataacgaccgaacttcgaccgaacatctaatactaatcagctgataatcctatgattccctggtgataaccggcctattcaccggacatcgtacgaatatcgctctagtatcctacggacgacgaacaatgcttgtaccaggcccggccgaatgtcgcacggtatgatgaccgatggctacgtctATGCTTG--GGTCACAAA-----TAT-CGGCCC-GTATACGGATATAGGGG-TAATCGGGAGTA---CACC-GTT-GGTTTT-AGCTATTTTT----C----CGACATCGGA--AAA-CACCGGTAAAAA-AAA---T--T-GTCACTCAT-CATTTACA---TAA-AT-T----------------GCA----CCGTTCG-GAGGAGCCGT--CCAAAATCCATCCG--------GTAA-----CGTATGGC--ATCTGTTTCCAGAGAGAA-ATTT--TTTGGGGT-CC----G-GCG--AGGGGAGCGAATAACGGCCGG--ACT-T-TGTC----AGA--AAATCTT----------GTA-CTA---ATCGACCGA-TTAT-C----C-TATCATGTCCG-GGCTATATAACCTGCCTATTCA-ACCG-GATA----GC----GCA-----CAA-ATAT-CG-CCCA-A-GTATC-----C-TAC--GTTCAACGAAAG-ATGTT-------------------GTC-TCTCGTGTAGAAA-CTCGCTATA-ATGTTTT-GCACTGCG-ACTGAC--ATGTCT-GGT-GTCCGGCCGGTGATCAGGCC
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gi|12 : gttatgcttgggtcacaaatatcggcccgtatacggatataggggtaatcgggagtacaccgttggttttagctatttttccgacatcggaaaacaccggtaaaaaaaattgtcactcatcatttacataaattgcaccgttcggaggagccgtccaaaatccatccggtaacgtatggcatctgtttccagagagaaattttttggggtccggcgaggggagcgaataacggccggactttgtcagaaaatcttgtactaatcgaccgattatcctatcatgtccgggctatataacctgcctattcaaccggatagcgcacaaatatcgcccaagtatcctacgttcaacgaaagatgttgtctctcgtgtagaaactcgctataatgttttgcactgcgactgaATCGA----------ATA-CTA---ATCGACCGA-TTAT-C----G-TATGATGTCCG-GGC--GATA------CT--------CG-GAAATCGTA-------------CGA-ATAT-CG-CCTG-A-GTATC-----C-TAC--GGACAACGAACG-ATGCTTGTAC-CAGGCCCGG-CC-G
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gi|12 : atcgaatactaatcgaccgattatcgtatgatgtccgggcgatactcggaaatcgtacgaatatcgcctgGAT-----TC--CCGGCCAGACATCAGACAATAC-TT-A-------AACGACG---TGTGAT-T-GATAT-GTG-G-CTGATTATGA--AA-ATCTACGGGACACCAG-AGAAATTTTAACTTCGA-GTT--AAAACTCTTC---GGGCACCTCCCCAAT-GCTGC---CT--GAGAA-CC-----------------CCGGCC--ATG----TC-------------TG-GTGTC-TG-G--CCG-GT-GAC-GA-GGCT-A--AAAAG---GCT-------AAAAATAACG--CCGGGAGTATAT-CC-T--CAGTCTAAT---C-GG----AA-GGAG-----TTGTGGCAAAAG-TATTgacgtgtgattgatatgtggctgattatgaaaatctacgggacaccagagaaattttaacttcgagttaaaactcttcgggcacctccccaatgctgcctgagaaccccggccatgtctggtgtctggccggtgacgaggctaaaaaggctaaaaataacgccgggagtatatcctcagtctaatcggaaggagttgtggcaaaagtatt
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gi|3 : tGGTCGG--ATT-T-CGAC----CGA--ACATCTC----------ATA-CTA---ATCGACCGA-TTAT-C----C-TATGATGTCCG-GGC--TATGGCCTGCCAATTC--ACCG-GAC-T--TA-----GCT-----CGA-ATAT-CG-CCCA-A-GTATCAGGGAC-TAC--GTACAACGAACA-ATGTT-------------------GTC-TCTCGTGTAGAAA-CTCGTTACA-ATGTTGT-ACACT-GTGACTGACGGATGTGTAAATAGTCCATCCGA------GGCCTGTTTAA----------AGCT---GGCCGGTGACCG--GCCG---ATATCT--GT--AACA--T--------AT-CTGGTCCA--CACCGGTTGGA-CAT--CGGT-GGGTTACTTTA--AAATGTGTAAACAGACTTCGGCCGGATATCGGCCCATGTTCGGTCCC-AAACATTG-CTCCTCTGAGG--CT--ACATA--CACCGAACA--ATT---AC-CG--CT----CAAT-----TC--TCGGCCGGATATCAGACGAGAC-TT-T-------AACGACA---TGTGAA-G-GAAAT-GTG-G-GCGATTATAA--AA-ATCTACGGGATACCGC-AGACATTTTGATTTCGA-GTT--AAAATTCTTC---GGGCGCCTCCCTGAT-GCTGC---CT--TAGAG-CCCCGGCC------ACCGGCCAGCC--ATG----TC-------------TG-GTGTT-CG-G--CCG-GT-GAC-CA-GGCC-A--AAATG---GCT-------AAACATTATG--CCGGGAGTGCAT-CCTT--AAGCCTAAT---C-GT----AA-GAGG-----TTGTGACCGAAG-CATTttcgaaggccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcggatttcgaccgaacatctcatactaatcgaccgattatcctatgatgtccgggctatggcctgccaattcaccggacttagctcgaatatcgcccaagtatcagggactacgtacaacgaacaatgttgtctctcgtgtagaaactcgttacaatgttgtacactgtgactgacggatgtgtaaatagtccatccgaggcctgtttaaagctggccggtgaccggccgatatctgtaacatatctggtccacaccggttggacatcggtgggttactttaaaatgtgtaaacagacttcggccggatatcggcccatgttcggtcccaaacattgctcctctgaggctacatacaccgaacaattaccgctcaattctcggccggatatcagacgagactttaacgacatgtgaaggaaatgtgggcgattataaaaatctacgggataccgcagacattttgatttcgagttaaaattcttcgggcgcctccctgatgctgccttagagccccggccaccggccagccatgtctggtgttcggccggtgaccaggccaaaatggctaaacattatgccgggagtgcatccttaagcctaatcgtaagaggttgtgaccgaagcatt
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gi|4 : tttgtaatttgcctacatcatgccggcgtaccgggagataacgggagtaacgcacctggttttggccacttttaccttcgacgacggacaatcacagtcagcactcattcattttcatactcgcaccccgtctaacagtaattcgcagtgcacgtatgctacaaggatatgttttggggattccggccaggctgtgcgtacggatggttatcctcgattaatcgatcactaataattatatatcgactgaattataccatatgatgtccgggcgataatcgggctactcaatcgtgacatcgtgacgagatatcgcccg----CGGT-----TC--CCGGCCGGGTATTGATCGATAC-TTAA-------AACGACGAACTGTGAAGG-GATCT-ATG-G-C--ATTATGA--AATATTT-----ACATCGGCAGAAATTTTAACTTCGAGGTT--AAAATTCTACTATGAACAACCTCTCGATAGCTGCTGGCT--CAGAATCCCCGGCCCCGCCAGCTGGCCGGCCCAGTG----TCCTTTACATCCTCGTT-GTGTC-TGCGATCCGTGTGGAC-CA-GGCC-AACAAATG---GCTGAATGTAAAGAATCATG--CC-GTAG-ACAT-CC-TTAGAGCCTTATATAC-GG----AG-AGGGCGGTATTGCGACTCAAA-CATacgacgaactgtgaagggatctatggcattatgaaatatttacatcggcagaaattttaacttcgaggttaaaattctactatgaacaacctctcgatagctgctggctcagaatccccggccccgccagctggccggcccagtgtcctttacatcctcgttgtgtctgcgatccgtgtggaccaggccaacaaatggctgaatgtaaagaatcatgccgtagacatccttagagccttatatacggagagggcggtattgcgactcaaacat
gi|5 : tttgtaatttgcctacatcatgccggcgtaccgggagataacgggagtaacgcacctggttttggccacttttaccttcgacgacggacaatcacagtcagcactcattcattttcatactcgcaccccgtctaacagtaattcgcagtgcacgtatgctacaaggatatgttttggggattccggccaggctgtgcgtacggatggttatcctcgattaatcgatcactaataattatatatcgactgaattataccatatgatgtccgggcgataatcgggctactcaatcgtgacatcgtgacgagatatcgcccgaagtatccttacaggaaaaacaaacgaagctttatcaggcctgaccgaatgtcgaggcggtgtgatcgccgatggcttcgtcatTAATGCTTT--GGTCATAAATATCAGAT-CGGCCT-GTATCTGGGGATAGGGGGTGATCGGGAGTA---CACC-ACT-GGTTTT-G--CATTTTT----TTTTTCGACATCGTA--CAA-CACCGAT-CAAATAAA---T--T-GTCAAACGT-CATTTGGA---TAA-AT-G----------------GCA----C----CG----------T--CC-----------G--------GTAA---T-CGTACGGC--GTATGTTTCCAAAAATAA---TT--TTGGGGGG-CC----G-GCG--A-AGCAGTGAATAACGGCCGG--ACT-T-CGAC----CGA--ACATCTA----------ATA-CTA---ATCGGCCGA-TTAT-C----C-TATGATGTCCG-GTT--GATGACCAGCCTATTC--ACCG-GACAT----T----GTA-----CGA-ATAT-CG-CCCG-A-GTATC-----C-TAC--GGACAACGAACG-ATGCTTGTAC-CAGG
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gi|9 : gccggtatccggggataatcgggagtacgccgcttggttttggccattttttccgacaccggacaacaacggtcacacatcattttcataactcggcaccgtccagtaatcgcacgacgtatgctccaaagagaatgttttgggggaccggccggctgtggataacggatggtttttcgaacgaacatctaatattattcgactgattatcatatgatgtccgggcgataatcgggctactcatcggacatcgtacgaatatcgccgaagtatcctacagaaaacaaacgatgcttgtatcaggcctgaccgaatgtcggcggtgtgatcgccgatggctacgtcatCCTAATGCTTA--GGTCACAAA-----GAT-CGGCCG-GTATA-GGGGATAGGGGGTAATCGGGAGTA---CACC-GTC-GGTTTT-GGCCATTTCT----C----TGACATCGGA--AAA-CACCGGT-CAAA-AAAAG-T--T-GTCGCTCAT-CATTTACA---TAA-AT-G--------------------------------A----CCGT--CT-----------G--------CTAA---T-CGTACGGC--GTCTGTTTCCAACAAAAG-A-TT--TTGGGGGGACC----G-GCA--A-GGCTGTGAATAA---------------CGGC----CAG--ACTTCCA-------------------------CCGA-ACAT-C--------TAATAC-----------TAACCGGCCTATTC--ACAG-GACATCGTA-------------CGA-ATAT-CA-CCCG-A-GTATC-----C-TAC--GGACAACAGACG-ATGCTTGTAC-CAGGCCCGG-CC-G
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gi|9 : cctaatgcttaggtcacaaagatcggccggtataggggatagggggtaatcgggagtacaccgtcggttttggccatttctctgacatcggaaaacaccggtcaaaaaaagttgtcgctcatcatttacataaatgaccgtctgctaatcgtacggcgtctgtttccaacaaaagattttggggggaccggcaaggctgtgaataacggccagacttccaccgaacatctaatactaaccggcctattcacaggacatcgtacgaatatcacccgGGTGG--ATG---AC-TG--CGTCTTCGTT-----TC--CCGGTCGGATATCATGCGATAC-TT-A-------AACGACG---TGTAAA-T-GATAT-GTG-G-CCAATTATAA--AA-ATCTACGG-ACACCAG-AGAAATTTTAACTTCGG-GTT--AAAACTCTTT---GGGGACCTCCCCGAT-GCTGG---CA--GAGAG-CCCCGGCC------ATCGGTCGGTC--ATG----TC-------------TG-GTGTC-CG-G--CCG-GT-GAC-CA-GGCC-A--AAATG---GC--------AAAAACC--------------CAT---------GCCTAGT---C-GG----AA-GGGG-----TTGTGACCAAAG-CATgacgtgtaaatgatatgtggccaattataaaaatctacggacaccagagaaattttaacttcgggttaaaactctttggggacctccccgatgctggcagagagccccggccatcggtcggtcatgtctggtgtccggccggtgaccaggccaaaatggcaaaaacccatgcctagtcggaaggggttgtgaccaaagcat
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blockSeqs : . T . . . G G G . . . . CC . . C AATCTTT T . . . . GCACCGTCCG T . T TG . . . . A A C . . . . . T . . . . C . . . . TAGCT . . . . . . . . . . TGA . T A TAACCGAA G . AT G CG CA TG . . . A . TG . T . . . C CT . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : A . . . G G G . . . . TC . . C AAAAATT A . . . . GCACCGTCCA T . N AG . . . . A T C . . . . . A . . . . C . . . . CGTGA . . . . . . . . . . CGG . T A GAACCGAT G . A G CG CA CC . . . A . TT . C . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . .
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blockSeqs : . . G . . . . . . CT . . C G A . . . . ACCGTCTG . . . A . . . . G T . . . . . . A . . . . C . . . . CGTA . . . . . . . . . . TG . T A GAAACGAA G . A A C CA CC . . . A . TG . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2908 ) : NCTCGACCTAATGCTTN--GGTCACAAA-----GAT-CGGCCG-GTATCCGGGGATAGGGGGTAATCGGGAGTA---CACC-GCT-GGTTTT-GGCCATTTTT----C----CGACATCGGA--CAA-CACCGGT-CAAA-AAA---T--T-GTCACACAT-CATTTACA---TAA-AT-G----------------GCA----C----CG-GA----CCGT--CCAAA--------G--------GTAA---T-CGTACGGC--GTCTGTTTCCAAAGAGAA-G-TT--TTGGGGGG-CC----G-GCG--A-GGCAGTGAATAACGGCCGG--ATT-T-CGAC----CGA--ACATCTA----------ATA-CTA---ATCGGCCGA-TTAT-C----C-TATGATGTCCG-GGC--GATAACCGGCCTATTC--ACCG-GACATCGT-AC---------GA-ATAT-C-GCCCG-A-GTATC-----C-TAC--GGACAACGAACG-ATGCTTGTAC-CAGGC--CCGGCCGTC-TCTCGTGTAGAAA-CGGGTTATA-ATGTTTT-ACACT-C--ACTGACGGATGTTTAAGTA--TCGTCCGATGTCCG------GCC-GGGAACCGANG-AC-G----T----AGCCA-CCGGC-GATCACA-CCG---CCTG---------CGA-CA-----T--TCGGCCGGGC-CTGGTACAAGC--ATCGTTCGTTG----T--CCGT-AGGATACTTTC--A--TGTGTAAACAGACTTCGGCCGAATATCGGCCCATGTCCGGTCCCAAA-CATTTC-TCCTCTGATN--CT--ACATA--CACCGGTCGA--TT----AC-CGCN----CGGT-----TC--CCGGCCGGATATCGGACGATACTT-A-------AACGACG---TGTGAA-G-GATAT-GTGG-CCGATTATGA--AA-ATCTACGGGACACCGG-AGAAATTTTAACTTCGA-GTTAAAA-CTCTTC---GGGCACCTCCCCGAT-GCTGC---CT--GAGAG-CCCCGGCC------ACCGGCCGGCC--ATG----TC-------------TG-GTGTC-CG-G--CCG-GT-GAC-CA-GGCC-A--AAATG---GCT-------AAAAATCATG--CCGGGAGTACAT-CC-T--AAGCCTAAT---C-GG----AA-GGGG-----TTGTGACCAAAG-CATTAG
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