lowQualScore : 111111111 33333333333333333333 1111 2222222 33333 2222222 22 44
lowQualScore : 77 99999999 4 3 4 44 3 3 44 3 4 888 0 0 4 0 3 3 3 3 222222222 2 444 99999999999999999999 2 6666 3333 33 2 2 444 444 5 444 777777 3 2 1 5 2 888888 77 2 7777 33 3 3 8888888 44444 3 3 5555555 55 33 00
lowQualScore : .. ........ . . . .. . . .. . . ... . . . . . . . . ......... . ... .................... . .... .... .. . . ... ... . ... ...... . . . . . ...... .. . .... .. . . ....... ..... . . ....... .. .. ..
lowQualScore : 99 66666666 0 6 6 66 3 3 66 1 2 888 3 6 0 4 1 1 1 1 333333333 9 777 66666666666666666666 9 1111 6666 22 4 4 111 444 0 777 777777 1 9 4 0 9 222222 00 9 1111 99 1 1 3333333 66666 6 6 8888888 55 44 77
consensus : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCATCA--C-AAA-A--TTG-TATAGTTG-CTATCCATGTGCAT-ATTGCT-ATT-GT-A---------AT-AC---CCG----GGT--------T--AAT-A----T-A--ATCTTA--A-T-T---CCTT---TG-TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTA-TCC------A-CT-GA----AA--ATTTG-TAATCA-TGG-GAAAA-AAAACC---CTGCAA-TTGA-TCT-----A-CCACT--GAAAACAAAGGAAT--TAAGAC
Reference ( gi|1 ) : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCATCA--C-AAA-A--TTG-TACAGTTG-CTATCCATATGCAT-ATTGCT-ATT-GT-A---------AT-AC---CCG----AGT--------T--AGT-A----T-A--ATCTTA--A-T-T---CCTT---TG-TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTA-TCC------A-CT-GA----AA--ATTTG-TAATCA-TGG-TAAAACAAAACCT--CTGCAA-TTGA-TCT-----T-CCACT--GACCACAAAGGAATGGTAAGAC
gi|8 : TCAT--AACATAATT----T---CTT-A-AGATTTACATTTCATCA--C-AAA-A--TTG-TACAGTTG-CTATCCATATGCAT-ATTGCT-ATT-GT-A---------A-------------------------------------------TCTTA--A-T-T---CCTT---TG-TGTTC--AGTG------GTAG-ATCAG-TTG
gi|3 : atgatagatttatccattggaaatttgtaatcatagaaaaaaaacccaactgTCATTAAAAAAAATT----G---TGT-A-AAATTTACATTTTATCT--C-AAA-A--TTG-TATAGTTG-CTATCCATGTACAG-ATTGCT-ATT-GC-A---------AT-AC---CTG----GCTTG------T--AAT-A----T-A--ATCGCA--A-T-T---CGTT---TG-TTTC----GTG------GTAG-ATCAAGTTAGCT--T---TTTC-TCC------A--T-GATTACAA--ATTTT-CAA--A-TGGATAAAa
gi|9 : ttTCAT--AACAGATGT----GATATAT-A-AAATTTATTTCTCA--A--C-AAA-A--TTGTTATAGTTGAATATCCATGTGC-T-ATTGCT-ATT-GT----------------------------T--------T----T-A----T-------TTA--A-T------ATT---TGTTTTTC--AGTG------GTAG-AATAA-GTGCATGTT---TTT--TTC------A--T-GATTC-AA--ATTTtttaccatcca
gi|11 : taaattatccactagaAT--AACAAA-TT----G---TAT-A-AAATTTATATTTCATCA--T-ATA-A--TTG-TATAGTTA-CTATCCATAATCAT-ATTGCT-ATT-GT-A---------AT-AC---TCG----GGTTG------T--AAT-A----T-A--ATCTTA--A-T-T---Caaata
gi|15 : AT--CACAAAATT----A---AAT-A-AAATATACATTTCGTCA--C-AAA-A--TTG-TACAGTTG------CATGTGCAT-ATTGCT-ATT-GT-A---------AT-AC---
gi|2 : AT--AAACAAATTATAAG---TATGA-AAATTT-CATTTCATCA--CTAAA-A--TTG-TATAGTTG---A---ATAT-CATGATTG-T-ATT--T-A---------ATGAC---TGG----TGT--------T--GGTAA----TAA--ATATTA--AGT-T---TCTG---TGTTTTTC--AGTG------GTA
gi|10 : tggatgtaaatttatccactgaaaatatttgtaataggggaaaaatgcacttcatacgT--AACAAAAT-----G---T-T-A-AA--TTACATTTCA-CATCC-AAA-A----G----AATTG----------TGCAT-ATTGCTAATT-GTAA---------AT-ACTGGCTT----GGA--------T--AAT-A----T-A--ATCTC-----T-T---CCTT---TG-TTTTTCAAGTG------GTAGAATCAG-Tttgaa
gi|4 : aatggatgtaagttttgtaatcgtgggaaaaaaaacctgcAAATT----G---TAT-A-AAATT-ACATTTCATCA--C-AAA-T--TTG-TATAGCTG-CTATCCATTTGCAT-ATTGCC-ATT-GT-A---------AT-AC---CCGGCTTAATTG------T--AAT-A----T-A--ATCTTA--A-T-T---CCTT---TG-TTTTT--AGTG------GTAG-ATCCA-TTGcataa
gi|6 : ggatggtaaatttatccactgaaatttgttaatcatggggaaaaaactgAATT----G---TAT-AGAAATTTACATTTCATCA--C-AAACA--TTA--ATAGTTG-ATATCCATGT-C-T-ATTGCT-ATTGGT-A---------AT-AC---CTG----GCT--------T--CGT-A------A--ATATTA--A-TGTTTGTCTT---TG-TTATC--Agta
gi|16 : gataggatggtaagttattttctaatcagagtgggaggggaagaatagtctctctgtggctATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTAAACA--C-AAA-A--TTG-CATACTTG-CTATACATATGCAT-ATTGCC-ATT-GT-gt
gi|7 : catt-AAATTTACATT-CAACT--C-AAA-AGTTTA-TATAGTTG-CTATCCATA---AT--TTGCT-ACT-GT-ATAGTAGTGTAT-AA---TCGC---AGTG-------T--TGT-AAAGAT-A--ATCTCA--A-T-T---CA-T---TG-TTTC----GT-------GTA--ATCAG-TTGCA--GT---TTTT-TCCCCCATGA-TT-AA----AA--ATTT
gi|22 : tgggatgataaatgtatccaccgA--C-AAA-A--TTG-TATAGTTG-CTATCCATATA-------------T-GT-A---------AT-AC---CCG----ACT--------T--A
gi|12 : TA-TATAGTTG-C-----A-GTGCAT-ATCGTT-ATT-GT-G---------AT-AC---TCA----GGTTGTACATGT--AAT-A----T-A--ATCTTA--A-T-T---CCTGAAATG-TTTTT--AGTG------GTAG-
gi|21 : ---------AT-AC---CCG----GGT--------TGTAAT-A----T-A--ATCTAA--A-T-T---CCTT---TG-TTTTT--TGTA------GT
gi|17 : ta-AC---CCG----GGT--------TGTAAT-A----T-A--ATCGTA--A-T-T---GCTT---TG-TTTTT--AATG------GTTA-ATCAA-GTGCATTGTA
gi|20 : aaaaC---CCT----GGT--------T--GTT-A----T-GCTATCTTA--A-T-T---CCTT---TG-TTTTC--AGTG------GTAG-ATCGA-
gi|18 : CG----GGT--------TGTAAT-A----T-A--ATCTTA--A-T-T---CCTT---TG-TATTC--AGTGGTACATGTAG-ATCAA-TTG
gi|13 : a--ATCTTA--A-T-T---CCTT---TG-TTTTC--AGTG------GTAT-ATCAA-GTGCA--GT---TTTATTCC------A--T-GATTACAA--ATTT-----TCAGTGGATAAAcacttt
gi|23 : ggtggtaaa--ATCTTC--A-T-T---CATT---TG-TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTG
gi|14 : aatactgTCTTACCA-T-T---CCTT---TG-TGGTC--AGTG------GAAG-ATCAA-TTG
gi|19 : ntatccactgaaaatttgtaatcatggtaaaacaaaacctctgCAA-T-GGATGATAAATTTA-TCC------A-CT-GA----AA--ATTTG-TAATCA-TGG-GGAAAAAAc
gi|24 : CAA-T-GGATGGTAAATGTG-TCC------A-CT-GA----AA--ATTTG-TAATCA-T
gi|3 : TGGATGGTAAATTTA-TCC------ATTT-GA----AA--ATTTG-TAATCA-TGG--AGA--AAAAGCT------AACTTGA-TCT-----A-CCACG--AA--ACAAACGAAT
gi|2 : tttcattaaaaaaaattgtgtaaaatttacattttatctcaaaattgtatagttgctatccatgtacagattgctattgcaatacctggcttgtaatataatcgcaTGGATG-TAAATTTA-TCC------A-CT-GA----AAATATTTG-TAAT-A-GGG-GAAAA
gi|4 : GGATGGTAAATTTA-TCC------A-CT-G-----AA--ATTTGTTAATCA-TGG-GGAAA-AAA------CTGCAA-TGGA-TCT-----A-CCACT--AAAAACAAAGGAAT--TAAGAatgcacttcatacgtaccactgaaaaacacagaaacttaatatttattaccaacaccagtcattaaatacaatcatgatattcaactatacaattttagtgatgaaatgaaattttcatacttataatttgtttatttgaa
gi|7 : GGATGATAAATGTA-TCC------A-CC-G-----AA--ATTTT-TAATCA-TGG-GGGAA-AAAA-----CTGCAA-CTGA-Tttatattacaattaagccgggtattacaatggcaatatgcaaatggatagcagctatacaaatttgtgatgaaatgtaattttatacaatttgta
gi|13 : tgGGTGGTAAATTTA-TCC------A-CT-GA----AA--ATTTG-TAATCA-TGG----AATAAAA-----CTGCAC-TTGA-TAT-----A-CCACT--GAAAACAAAGGAAT--TAAGAtacacgaaacaatgaattgagattatctttacaacactgcgattatacactactatacagtagcaaattatggatagcaactatataaacttttgagttgaatgtaaattt
gi|8 : ATGATAGATTTA-TCC------A-TT-GG----AA--ATTTG-TAATCA-TAG--AAAA-AAAACCCAACTGCAA-CTGA-TCT-----A-CCACT--GAACACAAAGGAAT--TAAGAt
gi|9 : TAAATT-A-TCC------A-CTAGA----AA--ATTTG--AATCA-TG---AAA--AAAAC----ATGCAC-TTAT-TCT-----A-CCACT--GAttacaatagcaatatgcatatggatagcaactgtacaattttgtgatgaaatgtaaatcttaagaaattatgttatgaa
gi|14 : TA-TCC------A-CT-GA----AA--ATTTG-TAATCA-TGG-TAAAACAAAACCT--CTGCAA-TTGA-TCT-----T-CCACT--GACCACAAAGGAATGGTAAGACaaaacaaatattaaataaaacaatagcaatagcacatggatattcaactataacaattttgttgagaaataaattttatatatcacatctgttatgaaaata
gi|10 : nTTTG-TAATCG-TGG-GAAAA-AAAAC----CTGC-A-CTGATTCT-----A-CCACTTGAAAAACAAAGGAA
gi|23 : aatggatgtaagt--CTGCAA-TTGA-TCT-----A-CCACT--GAAAACAAATGAATG--AAGAgagattatattatccaagccagtatttacaattagcaatatgcacaattcttttggatgtgaaatgtaatttaacattttgttacataa
gi|18 : aataTGCAA-TTGA-TCTACATGTACCACT--GAATACAAAGGAAT--TAAGAt
gi|20 : acgggttgtaatataa-TCGA-TCT-----A-CCACT--GAAAACAAAGGAAT--TAAGActtt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AGTTTTTATAATCATGGGGAAAACACTGGCATCTGGATACCGGTAATCCATTGAAAAGATACCAGGAAATTAGATTTATATTACAAGCCACGGTATAATACTAATCAGCAATAGGACATGGAAGTCATCTCATCATATACAATTTACAGGTATCTAATTATATGTCTGAATGAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111111 333333333333 1111 1111 333333 11
lowQualScore : 66 77777777 3 3 44 3 2 33 2 777777 8 333 2 5 5 2 444444444 444 2 33 55 555555555555 33 2 2 444 444 1111 555 888888 3 3 2 2 888888 0 3 1111 44 3 7 000000 4 555 9999 4 33
lowQualScore : .. ........ . . .. . . .. . ...... . ... . . . . ......... ... . .. .. ............ .. . . ... ... .... ... ...... . . . . ...... . . .... .. . . ...... . ... .... . ..
lowQualScore : 99 88888888 6 3 66 1 9 99 7 777777 0 999 4 3 3 7 333333333 111 4 22 00 444444444444 44 5 5 444 777 0000 777 222222 6 3 3 3 888888 2 1 9999 22 3 3 111111 0 555 2222 4 88
consensus : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--G-GT--------T---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGGAAAA-AAAACC---CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAC
Reference ( family-2892 ) : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--G-GT--------T---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGGAAAA-AAAACC---CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAC
gi|1 : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG-CTATCCATATGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--A-GT--------T---AGTATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGTAAAACAAAACCT--CTGCAATTGA-T-C-TTCCACT--G-ACCACAAAGGAA-TGGTAAGAC
gi|10 : TTTG-TAATCGTGGGAAAA-AAAA-C---CTGC-ACTGATT-C-TACCACTTGA-AAAACAAAGGAA-
gi|10 : aatggatgtaagtT--AACAAAAT-----G---T-T-A-AA--TTACATTTCACATC-C-AAA-A----G-AAT-------------------TGTGCATATTGCTAATT-GTAA---------ATACTGGC-TT--G-GA--------T---AATATA--ATCTC---T-T---CCTT---TG----TTTTTCAAGTG------GTAGAATCAG-Tgagattatattatccaagccagtatttacaattagcaatatgcacaattcttttggatgtgaaatgtaatttaacattttgttacataa
gi|11 : aatggatgtaagttttgtaatcgtgggaaaaaaaacctgcAT--AACAAA-TT----G---TAT-A-AAATTTATATTTCA--TCAT-ATA-A--TTG-TATA------GTTA-CTATCCATAATCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---T-CG--G-GTTG------T---AATATA--ATCTTAA-T-T---Ccataa
gi|12 : TA-TATA------GTTG-C-----A-GTGCATATCGTT-ATT-GT-G---------ATAC---T-CA--G-GTTGTACATGT---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTGAAATG----TTTTT--AGTG------GTAG-
gi|13 : GGTGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGAATAA-AA-------CTGCACTTGA-T-A-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGA
gi|14 : TATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGTAAAACAAAACCT--CTGCAATTGA-T-C-TTCCACT--G-ACCACAAAGGAA-TGGTAAGACt
gi|15 : nAT--CACAAAATT----A---AAT-A-AAATATACATTTCG--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG------CATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---
gi|16 : ATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTAA--ACAC-AAA-A--TTG-CATA------CTTG-CTATACATATGCATATTGCC-ATT-GT-
gi|17 : cattAC---C-CG--G-GT--------TGT-AATATA--ATCGTAA-T-T---GCTT---TG----TTTTT--AATG------GTTA-ATCAA-GTGCATTGTA
gi|18 : aaaa-CG--G-GT--------TGT-AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TATTC--AGTGGTACATGTAG-ATCAA-TTG
gi|19 : aCAA-T-GGATGATAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGGGAAA-AAAcacttt
gi|2 : TGGATG-TAAATTTATCC------ACT-GA----AAATATTTG-TAAT-AGGGGAAAA-A---------TGCACTTCA-TACGTACCACT--GAAAAACACAGAAACT--TAA
gi|2 : AT--AAACAAATTATAAG---TATGA-AAATTT-CATTTCA--TCACTAAA-A--TTG-TATA------GTTGAATAT-CATG-----ATTG-T-ATT--T-A---------ATGA---C-TG--GTGTTGG-----T---AATA-A--ATATTAAGT-T---TCTG---TGT---TTTTC--AGTG------GTAtatttattaccaacaccagtcattaaatacaatcatgatattcaactatacaattttagtgatgaaatgaaattttcatacttataatttgtttatttgaa
gi|20 : tggatgtaaatttatccactgaaaatatttgtaataggggaaaaatgcacttcatacgC---C-CT--G-GT--------T---GTTATGCTATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCGA-ttgaa
gi|21 : ---------ATAC---C-CG--G-GT--------TGT-AATATA--ATCTAAA-T-T---CCTT---TG----TTTTT--TGTA------GT
gi|22 : taAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCAT----ATA--------T-GT-A---------ATAC---C-CG--A-CT--------T---A
gi|23 : ---CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAATGAA-T--GAAGA
gi|24 : aataCAA-T-GGATGGTAAATGTGTCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATt
gi|3 : TCATTAAAAAAAATT----G---TGT-A-AAATTTACATTTTA--TCTC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTACAGATTGCT-ATT-GC-A---------ATAC---C-TG--G-CTTG------T---AATATA--ATCGCAA-T-T---CGTT---TG----TTTC----GTG------GTAG-ATCAAGTTAGCT--T---TTTCTCC------A-T-GATTACAA--ATTTT-CAA--ATGGATAAA-
gi|4 : ttGGATGGTAAATTTATCC------ACT-G-----AA--ATTTGTTAATCATGGGGAAA-AAA------CTGCAATGGA-T-C-TACCACT--A-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAtttaccatcca
gi|4 : AAATT----G---TAT-A-AAATT-ACATTTCA--TCAC-AAA-T--TTG-TATA------GCTG-CTATCCATTTGCATATTGCC-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--G-CTTAATTG--T---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTT--AGTG------GTAG-ATCCA-TTGttatattacaattaagccgggtattacaatggcaatatgcaaatggatagcagctatacaaatttgtgatgaaatgtaattttatacaatttgta
gi|5 : ggatggtaaatttatccactgaaatttgttaatcatggggaaaaaactgAA-A--TTG-TATATGATGAGATGACT-TCCATGTCC-TATTGCTGATTAGT-ATT-------ATAC---CGTG--G-CT--------TGT-AATATA--AATCTAA-T-T---TCCT---GGTATCTTTTC--AATG------Ggta
gi|6 : agtttttataatcatggggaaaacactggcatctggataccggtaatAATT----G---TAT-AGAAATTTACATTTCA--TCAC-AAACA--TTA--ATA------GTTG-ATATCCATGT-C-TATTGCT-ATTGGT-A---------ATAC---C-TG--G-CT--------T---CGTA-A--ATATTAA-TGTTTGTCTT---TG----TTATC--Aacaggtatctaattatatgtctgaatgaaac
gi|7 : gataggatggtaagttattttctaatcagagtgggaggggaagaatagtctctctgtggctGGATGATAAATGTATCC------ACC-GA----AA---TTTT-TAATCATGGGGGAA-AAAA-----CTGCAACTGA-T---TA-CAC-----GAAAC-AATGAA-T--TGAGAgt
gi|7 : tg-AAATTTACATT-CA--ACTC-AAA-AGTTTA-TATA------GTTG-CTATCCATA---AT-TTGCT-ACT-GT-ATAGTAGTGTATAA---T-CGCAGTGT--------TGTAAAGATA--ATCTCAA-T-T---CA-T---TG----TTTC----GT-------GTA--ATCAG-TTGCA--GT---TTTTTCCCCCATGATT-AA----AA--ATTTttatctttacaacactgcgattatacactactatacagtagcaaattatggatagcaactatataaacttttgagttgaatgtaaattt
gi|8 : tgggatgataaatgtatccaccgATGATAGATTTATCC------ATT-GG----AA--ATTTG-TAATCAT-AGAAAA-AAAACCCAACTGCAACTGA-T-C-TACCACT--G-AACACAAAGGAA-T--TAAGA
gi|8 : TCAT--AACATAATT----T---CTT-A-AGATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG-CTATCCATATGCATATTGCT-ATT-GT-A---------AT-------------------------------------CTTAA-T-T---CCTT---TG----TGTTC--AGTG------GTAG-ATCAG-TTGttacaatagcaatatgcatatggatagcaactgtacaattttgtgatgaaatgtaaatcttaagaaattatgttatgaa
gi|9 : atgatagatttatccattggaaatttgtaatcatagaaaaaaaacccaactgTAAATT-ATCC------ACTAGA----AA--ATTTG--AATCATG---AAA-AAAACA----TGCACTTAT-T-C-TACCACT--GAAAAACAAAa
gi|9 : TCAT--AACAGATGT----GATATAT-A-AAATTTATTTCTCA----AC-AAA-A--TTGTTATA------GTTGAATATCCATGTGC-TATTGCT-ATT-GT---------------------------T--------T-----TAT------TTAA-T------ATT---TGT---TTTTC--AGTG------GTAG-AATAA-GTGCATGTT---TTT-TTC------A-T-GATTC-AA--ATTTtattaaataaaacaatagcaatagcacatggatattcaactataacaattttgttgagaaataaattttatatatcacatctgttatgaaaata
Alignments
lowQualScore : 111111111 333333333333 1111 1111 333333 11
lowQualScore : 66 77777777 3 3 44 3 2 33 2 777777 8 333 2 5 5 2 444444444 444 2 33 55 555555555555 33 2 2 444 444 1111 555 888888 3 3 2 2 888888 0 3 1111 44 3 7 000000 4 555 9999 4 33
lowQualScore : .. ........ . . .. . . .. . ...... . ... . . . . ......... ... . .. .. ............ .. . . ... ... .... ... ...... . . . . ...... . . .... .. . . ...... . ... .... . ..
lowQualScore : 99 88888888 6 3 66 1 9 99 7 777777 0 999 4 3 3 7 333333333 111 4 22 00 444444444444 44 5 5 444 777 0000 777 222222 6 3 3 3 888888 2 1 9999 22 3 3 111111 0 555 2222 4 88
consensus : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--G-GT--------T---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGGAAAA-AAAACC---CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAC
Reference ( family-2892 ) : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--G-GT--------T---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGGAAAA-AAAACC---CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAC
gi|1 : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG-CTATCCATATGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--A-GT--------T---AGTATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGTAAAACAAAACCT--CTGCAATTGA-T-C-TTCCACT--G-ACCACAAAGGAA-TGGTAAGAC
gi|10 : TTTG-TAATCGTGGGAAAA-AAAA-C---CTGC-ACTGATT-C-TACCACTTGA-AAAACAAAGGAA-
gi|10 : aatggatgtaagtT--AACAAAAT-----G---T-T-A-AA--TTACATTTCACATC-C-AAA-A----G-AAT-------------------TGTGCATATTGCTAATT-GTAA---------ATACTGGC-TT--G-GA--------T---AATATA--ATCTC---T-T---CCTT---TG----TTTTTCAAGTG------GTAGAATCAG-Tgagattatattatccaagccagtatttacaattagcaatatgcacaattcttttggatgtgaaatgtaatttaacattttgttacataa
gi|11 : aatggatgtaagttttgtaatcgtgggaaaaaaaacctgcAT--AACAAA-TT----G---TAT-A-AAATTTATATTTCA--TCAT-ATA-A--TTG-TATA------GTTA-CTATCCATAATCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---T-CG--G-GTTG------T---AATATA--ATCTTAA-T-T---Ccataa
gi|12 : TA-TATA------GTTG-C-----A-GTGCATATCGTT-ATT-GT-G---------ATAC---T-CA--G-GTTGTACATGT---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTGAAATG----TTTTT--AGTG------GTAG-
gi|13 : GGTGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGAATAA-AA-------CTGCACTTGA-T-A-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGA
gi|14 : TATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGTAAAACAAAACCT--CTGCAATTGA-T-C-TTCCACT--G-ACCACAAAGGAA-TGGTAAGACt
gi|15 : nAT--CACAAAATT----A---AAT-A-AAATATACATTTCG--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG------CATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---
gi|16 : ATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTAA--ACAC-AAA-A--TTG-CATA------CTTG-CTATACATATGCATATTGCC-ATT-GT-
gi|17 : cattAC---C-CG--G-GT--------TGT-AATATA--ATCGTAA-T-T---GCTT---TG----TTTTT--AATG------GTTA-ATCAA-GTGCATTGTA
gi|18 : aaaa-CG--G-GT--------TGT-AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TATTC--AGTGGTACATGTAG-ATCAA-TTG
gi|19 : aCAA-T-GGATGATAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGGGAAA-AAAcacttt
gi|2 : TGGATG-TAAATTTATCC------ACT-GA----AAATATTTG-TAAT-AGGGGAAAA-A---------TGCACTTCA-TACGTACCACT--GAAAAACACAGAAACT--TAA
gi|2 : AT--AAACAAATTATAAG---TATGA-AAATTT-CATTTCA--TCACTAAA-A--TTG-TATA------GTTGAATAT-CATG-----ATTG-T-ATT--T-A---------ATGA---C-TG--GTGTTGG-----T---AATA-A--ATATTAAGT-T---TCTG---TGT---TTTTC--AGTG------GTAtatttattaccaacaccagtcattaaatacaatcatgatattcaactatacaattttagtgatgaaatgaaattttcatacttataatttgtttatttgaa
gi|20 : tggatgtaaatttatccactgaaaatatttgtaataggggaaaaatgcacttcatacgC---C-CT--G-GT--------T---GTTATGCTATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCGA-ttgaa
gi|21 : ---------ATAC---C-CG--G-GT--------TGT-AATATA--ATCTAAA-T-T---CCTT---TG----TTTTT--TGTA------GT
gi|22 : taAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCAT----ATA--------T-GT-A---------ATAC---C-CG--A-CT--------T---A
gi|23 : ---CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAATGAA-T--GAAGA
gi|24 : aataCAA-T-GGATGGTAAATGTGTCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATt
gi|3 : TCATTAAAAAAAATT----G---TGT-A-AAATTTACATTTTA--TCTC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTACAGATTGCT-ATT-GC-A---------ATAC---C-TG--G-CTTG------T---AATATA--ATCGCAA-T-T---CGTT---TG----TTTC----GTG------GTAG-ATCAAGTTAGCT--T---TTTCTCC------A-T-GATTACAA--ATTTT-CAA--ATGGATAAA-
gi|4 : ttGGATGGTAAATTTATCC------ACT-G-----AA--ATTTGTTAATCATGGGGAAA-AAA------CTGCAATGGA-T-C-TACCACT--A-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAtttaccatcca
gi|4 : AAATT----G---TAT-A-AAATT-ACATTTCA--TCAC-AAA-T--TTG-TATA------GCTG-CTATCCATTTGCATATTGCC-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--G-CTTAATTG--T---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTT--AGTG------GTAG-ATCCA-TTGttatattacaattaagccgggtattacaatggcaatatgcaaatggatagcagctatacaaatttgtgatgaaatgtaattttatacaatttgta
gi|5 : ggatggtaaatttatccactgaaatttgttaatcatggggaaaaaactgAA-A--TTG-TATATGATGAGATGACT-TCCATGTCC-TATTGCTGATTAGT-ATT-------ATAC---CGTG--G-CT--------TGT-AATATA--AATCTAA-T-T---TCCT---GGTATCTTTTC--AATG------Ggta
gi|6 : agtttttataatcatggggaaaacactggcatctggataccggtaatAATT----G---TAT-AGAAATTTACATTTCA--TCAC-AAACA--TTA--ATA------GTTG-ATATCCATGT-C-TATTGCT-ATTGGT-A---------ATAC---C-TG--G-CT--------T---CGTA-A--ATATTAA-TGTTTGTCTT---TG----TTATC--Aacaggtatctaattatatgtctgaatgaaac
gi|7 : gataggatggtaagttattttctaatcagagtgggaggggaagaatagtctctctgtggctGGATGATAAATGTATCC------ACC-GA----AA---TTTT-TAATCATGGGGGAA-AAAA-----CTGCAACTGA-T---TA-CAC-----GAAAC-AATGAA-T--TGAGAgt
gi|7 : tg-AAATTTACATT-CA--ACTC-AAA-AGTTTA-TATA------GTTG-CTATCCATA---AT-TTGCT-ACT-GT-ATAGTAGTGTATAA---T-CGCAGTGT--------TGTAAAGATA--ATCTCAA-T-T---CA-T---TG----TTTC----GT-------GTA--ATCAG-TTGCA--GT---TTTTTCCCCCATGATT-AA----AA--ATTTttatctttacaacactgcgattatacactactatacagtagcaaattatggatagcaactatataaacttttgagttgaatgtaaattt
gi|8 : tgggatgataaatgtatccaccgATGATAGATTTATCC------ATT-GG----AA--ATTTG-TAATCAT-AGAAAA-AAAACCCAACTGCAACTGA-T-C-TACCACT--G-AACACAAAGGAA-T--TAAGA
gi|8 : TCAT--AACATAATT----T---CTT-A-AGATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG-CTATCCATATGCATATTGCT-ATT-GT-A---------AT-------------------------------------CTTAA-T-T---CCTT---TG----TGTTC--AGTG------GTAG-ATCAG-TTGttacaatagcaatatgcatatggatagcaactgtacaattttgtgatgaaatgtaaatcttaagaaattatgttatgaa
gi|9 : atgatagatttatccattggaaatttgtaatcatagaaaaaaaacccaactgTAAATT-ATCC------ACTAGA----AA--ATTTG--AATCATG---AAA-AAAACA----TGCACTTAT-T-C-TACCACT--GAAAAACAAAa
gi|9 : TCAT--AACAGATGT----GATATAT-A-AAATTTATTTCTCA----AC-AAA-A--TTGTTATA------GTTGAATATCCATGTGC-TATTGCT-ATT-GT---------------------------T--------T-----TAT------TTAA-T------ATT---TGT---TTTTC--AGTG------GTAG-AATAA-GTGCATGTT---TTT-TTC------A-T-GATTC-AA--ATTTtattaaataaaacaatagcaatagcacatggatattcaactataacaattttgttgagaaataaattttatatatcacatctgttatgaaaata
blockSeqs : TA ATAAG G G CA T C GT T TGATGA A GTG A A A A TAGTAGTGT TGG G CA TG TGTACATGT CT G G TTG AAA TATC TCA GTACAT A G G A CCCATG A TTAC AT T C ACCCAA T ACG TGA C GG
blockSeqs : . GATA . . . . . . . . A AAT A G G . TT . . . TG TAATTGT . . . . . T T . . . G A . . TTC . . . ACCT . C GA . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . A GTG A . . . . . . . G TGGT . . . . . T T . . . A A . . . . . . ACA . A GA . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . GTG A . . . . . . . G TGTA . . . . . . C . . . G A . . . . . . AC . C G . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . ATG A . . . . . . . G TGT . . . . . . C . . . G A . . . . . . A . C G . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . GTA A . . . . . . . G TGT . . . . . . C . . . A A . . . . . . . . C G . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . TTG A . . . . . . . G TGT . . . . . . T . . . G A . . . . . . . . C A . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . GTC A . . . . . . . G TGT . . . . . . T . . . A A . . . . . . . . C G .
blockSeqs : G . . . . . . . . . ATG A . . . . . . . G TGT . . . . . . C . . . T A . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . GTG A . . . . . . . C TGT . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . GT . . . . . . . . C T . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . . C T . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . C T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : TGT********* AC**** **
originalCons : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--G-GT--------T---AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGGAAAA-AAAACC---CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAC
finalCons : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC---C-CG--G-GTTGT---------AATATA--ATCTTAA-T-T---CCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTG-TAATCATGGGAAAA-AAAAC----CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAC
Alignments
lowQualScore : 111111111 11111111111111 1111 1111 222222 11
lowQualScore : 66 77777777 3 3 44 3 2 33 2 777777 8 333 2 5 5 2 444444444 2 33 00000000000000 33 2 2 2 2 444 1111 555 888888 3 3 2 2 888888 0 3 1111 44 3 7 555555 4 555 9999 4 33
lowQualScore : .. ........ . . .. . . .. . ...... . ... . . . . ......... . .. .............. .. . . . . ... .... ... ...... . . . . ...... . . .... .. . . ...... . ... .... . ..
lowQualScore : 99 88888888 6 3 66 1 9 99 7 777777 0 999 4 3 3 7 333333333 4 22 99999999999999 44 5 5 5 5 777 0000 777 222222 6 3 3 3 888888 2 1 9999 22 3 3 222222 0 555 2222 4 88
consensus : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATACC-CG--G----GT------T-G--T-AA-TA-TAATCTTAA-TTCCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTGT-AATCATGGGAAAA-AAAAC----CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAC
Reference ( family-2892 ) : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATACC-CG--G----GT------T-G--T-AA-TA-TAATCTTAA-TTCCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTGT-AATCATGGGAAAA-AAAAC----CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAC
gi|1 : TCAT--AACAAAATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG-CTATCCATATGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATACC-CG--A----GT-----------T-AG-TA-TAATCTTAA-TTCCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCAA-TTGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTGT-AATCATGGTAAAACAAAACCT--CTGCAATTGA-T-C-TTCCACT--G-ACCACAAAGGAA-TGGTAAGAC
gi|10 : TTTGT-AATCGTGGGAAAA-AAAAC----CTGC-ACTGATT-C-TACCACTTGA-AAAACAAAGGAA-
gi|10 : aatggatgtaagtT--AACAAAAT-----G---T-T-A-AA--TTACATTTCACATC-C-AAA-A----G-AAT-------------------TGTGCATATTGCTAATT-GTAA---------ATA-C-TG--G----CT------T-GGAT-AA-TA-TAATCTC---TTCCTT---TG----TTTTTCAAGTG------GTAGAATCAG-Tgagattatattatccaagccagtatttacaattagcaatatgcacaattcttttggatgtgaaatgtaatttaacattttgttacataa
gi|11 : aatggatgtaagttttgtaatcgtgggaaaaaaaacctgcAT--AACAAA-TT----G---TAT-A-AAATTTATATTTCA--TCAT-ATA-A--TTG-TATA------GTTA-CTATCCATAATCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATACT-CG--G----GT------T-G--T-AA-TA-TAATCTTAA-TTCcataa
gi|12 : TA-TATA------GTTG-C-----A-GTGCATATCGTT-ATT-GT-G---------ATACT-CA--G----GTTGTACAT-G--T-AA-TA-TAATCTTAA-TTCCTGAAATG----TTTTT--AGTG------GTAG-
gi|13 : GGTGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTGT-AATCATGGAATAA-AA-------CTGCACTTGA-T-A-TACCACT--G-AAAACAAAGGAA-T--TAAGA
gi|14 : TATCC------ACT-GA----AA--ATTTGT-AATCATGGTAAAACAAAACCT--CTGCAATTGA-T-C-TTCCACT--G-ACCACAAAGGAA-TGGTAAGACt
gi|15 : nAT--CACAAAATT----A---AAT-A-AAATATACATTTCG--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG------CATGTGCATATTGCT-ATT-GT-A---------ATAC
gi|16 : ATT----G---TAT-A-AAATTTACATTTAA--ACAC-AAA-A--TTG-CATA------CTTG-CTATACATATGCATATTGCC-ATT-GT-
gi|17 : cattACC-CG--G----GT------T-G--T-AA-TA-TAATCGTAA-TTGCTT---TG----TTTTT--AATG------GTTA-ATCAA-GTGCATTGTA
gi|18 : aaaa-CG--G----GT------T-G--T-AA-TA-TAATCTTAA-TTCCTT---TG----TATTC--AGTGGTACATGTAG-ATCAA-TTG
gi|19 : aCAA-T-GGATGATAAATTTATCC------ACT-GA----AA--ATTTGT-AATCATGGGGAAA-AAAcacttt
gi|2 : TGGATG-TAAATTTATCC------ACT-GA----AAATATTTGT-AAT-AGGGGAAAA-A---------TGCACTTCA-TACGTACCACT--GAAAAACACAGAAACT--TAA
gi|2 : AT--AAACAAATTATAAG---TATGA-AAATTT-CATTTCA--TCACTAAA-A--TTG-TATA------GTTGAATAT-CATG-----ATTG-T-ATT--T-A---------ATGAC-TG--GT---GT------TGG--T-AA-TA--AATATTAAGTTTCTG---TGT---TTTTC--AGTG------GTAtatttattaccaacaccagtcattaaatacaatcatgatattcaactatacaattttagtgatgaaatgaaattttcatacttataatttgtttatttgaa
gi|20 : tggatgtaaatttatccactgaaaatatttgtaataggggaaaaatgcacttcatacgCC-CT--G----GT------T-G--T-TA-TG-CTATCTTAA-TTCCTT---TG----TTTTC--AGTG------GTAG-ATCGA-ttgaa
gi|21 : ---------ATACC-CG--G----GT------T-G--T-AA-TA-TAATCTAAA-TTCCTT---TG----TTTTT--TGTA------GT
gi|22 : taAC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCAT----ATA--------T-GT-A---------ATACC-CG--
gi|23 : ----CTGCAATTGA-T-C-TACCACT--G-AAAACAAATGAA-T--GAAGAactta
gi|24 : aataCAA-T-GGATGGTAAATGTGTCC------ACT-GA----AA--ATTTGT-AATCATt
gi|3 : TCATTAAAAAAAATT----G---TGT-A-AAATTTACATTTTA--TCTC-AAA-A--TTG-TATA------GTTG-CTATCCATGTACAGATTGCT-ATT-GC-A---------ATACC-TG--G----CT------T-G--T-AA-TA-TAATCGCAA-TTCGTT---TG----TTTC----GTG------GTAG-ATCAAGTTAGCT--T---TTTCTCC------A-T-GATTACAA--ATTTTC-AA--ATGGATAAA-
gi|4 : ttGGATGGTAAATTTATCC------ACT-GA----AA---TTTGTTAATCATGGGGAAA-AAA------CTGCAATGGA-T-C-TACCACT--A-AAAACAAAGGAA-T--TAAGAtttaccatcca
gi|4 : AAATT----G---TAT-A-AAATT-ACATTTCA--TCAC-AAA-T--TTG-TATA------GCTG-CTATCCATTTGCATATTGCC-ATT-GT-A---------ATACC-CG--GCTTAAT------T-G--T-AA-TA-TAATCTTAA-TTCCTT---TG----TTTTT--AGTG------GTAG-ATCCA-TTGttatattacaattaagccgggtattacaatggcaatatgcaaatggatagcagctatacaaatttgtgatgaaatgtaattttatacaatttgta
gi|5 : ggatggtaaatttatccactgaaatttgttaatcatggggaaaaaactgAA-A--TTG-TATATGATGAGATGACT-TCCATGTCC-TATTGCTGATTAGT-ATT-------ATACCGTG--G----CT------T-G--T-AA-TA-TAAATCTAA-TTTCCT---GGTATCTTTTC--AATG------Ggta
gi|6 : agtttttataatcatggggaaaacactggcatctggataccggtaatAATT----G---TAT-AGAAATTTACATTTCA--TCAC-AAACA--TTA--ATA------GTTG-ATATCCATGT-C-TATTGCT-ATTGGT-A---------ATACC-TG--G----CT------TCG--TAAA-TATTAATGTT---TGTCTT---TG----TTATC--Aacaggtatctaattatatgtctgaatgaaac
gi|7 : gataggatggtaagttattttctaatcagagtgggaggggaagaatagtctctctgtggctGGATGATAAATGTATCC------ACC-GA----AA---TTTTT-AATCATGGGGGAA-AAAA-----CTGCAACTGA-T---TA-CAC-----GAAAC-AATGAA-T--TGAGAgt
gi|7 : tg-AAATTTACATT-CA--ACTC-AAA-AGTTTA-TATA------GTTG-CTATCCATA---AT-TTGCT-ACT-GT-ATAGTAGTGTATAAT-CGCAGT---GT------T-G--T-AAAGA-TAATCTCAA-TTCA-T---TG----TTTC----GT-------GTA--ATCAG-TTGCA--GT---TTTTTCCCCCATGATT-AA----AA--ATTTttatctttacaacactgcgattatacactactatacagtagcaaattatggatagcaactatataaacttttgagttgaatgtaaattt
gi|8 : tgggatgataaatgtatccaccgATGATAGATTTATCC------ATT-GG----AA--ATTTGT-AATCAT-AGAAAA-AAAACCCAACTGCAACTGA-T-C-TACCACT--G-AACACAAAGGAA-T--TAAGA
gi|8 : TCAT--AACATAATT----T---CTT-A-AGATTTACATTTCA--TCAC-AAA-A--TTG-TACA------GTTG-CTATCCATATGCATATTGCT-ATT-G------------------------------------------------TAATCTTAA-TTCCTT---TG----TGTTC--AGTG------GTAG-ATCAG-TTGttacaatagcaatatgcatatggatagcaactgtacaattttgtgatgaaatgtaaatcttaagaaattatgttatgaa
gi|9 : atgatagatttatccattggaaatttgtaatcatagaaaaaaaacccaactgTAAATT-ATCC------ACTAGA----AA--ATTTG--AATCATG---AAA-AAAAC----ATGCACTTAT-T-C-TACCACT--GAAAAACAAAa
gi|9 : TCAT--AACAGATGT----GATATAT-A-AAATTTATTTCTCA----AC-AAA-A--TTGTTATA------GTTGAATATCCATGTGC-TATTGCT-ATT-GT---------------------------T------T---------TA-T----TTAA-T--ATT---TGT---TTTTC--AGTG------GTAG-AATAA-GTGCATGTT---TTT-TTC------A-T-GATTC-AA--ATTTtattaaataaaacaatagcaatagcacatggatattcaactataacaattttgttgagaaataaattttatatatcacatctgttatgaaaata