lowQualScore : 11111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111
lowQualScore : 666666666 1 2 222 8888888 222 99999999999999999999999999999 4 33333333 111 2222 999999999999999999999999999999999999999999 3333333 11 6666666666666 11 1 555 1 2222222222 99999999999999999999999999999999999999999 1 111 3333333333333333 111111 11111 2222222222 1 55555555555555555 111 2222222 22 33 11 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 111111111111111111 1 33333333333333333333333333 1 222 1 33333333333 1111 555555555555555555555555555555 111 1 222222 22222 2222222 1111111 4444444444444444444444444444444 11 1 11 55555555555555555 111 11 1111111 1 11 88888888888888888888888 44444444444444444444444 11 11 1 111111111111
lowQualScore : 000000000 5 6 4 0 111 6666666 3 333 2 66666666666666666666666666666 0 66666666 222 6666 0 1 4 222222222222222222222222222222222222222222 1 6 6666666 33 6666666666666 3 6 11 2 222 0 1 666 3 1 3 4444444444 99 6 7 44444444444444444444444444444444444444444 1 0 1 77 000 5 9999999999999999 5 8888 0 333333 8888 5 0 3 77777 5 3333333333 0 1 6 1 77 11111111111111111 6 9999 6 9 222 1111111 11 0 8 5 33 22 0 2 44 5 3 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 5 7777 5 999999999999999999 5 44444444444444444444444444 5 5 66666 5 555 6 0 22222222222 4444 4 4 4 4 999999999999999999999999999999 4 4 55 55 222 55 4 5 3 555555 66 4 1 66 55555 5 2222222 8 5 66 6666666 5 0 99 5 5 5 2 3333333333333333333333333333333 5 2 5 4 0 22 66 5 6 77 5 33 5 33333333333333333 77 0 3 5 5 666 11 5 5 8888888 1 5 5 11 66666666666666666666666 999 77777777777777777777777 4 00 6 4 9999 4 55 00 1 3 44 5 55 55 3 66 888 5 999999999999
lowQualScore : ......... . . . . ... ....... . ... . ............................. . ........ ... .... . . . .......................................... . . ....... .. ............. . . .. . ... . . ... . . . .......... .. . . ......................................... . . . .. ... . ................ . .... . ...... .... . . . ..... . .......... . . . . .. ................. . .... . . ... ....... .. . . . .. .. . . .. . . .................................................................. . . .... . .................. . .......................... . . ..... . ... . . ........... .... . . . . .............................. . . .. .. ... .. . . . ...... .. . . .. ..... . ....... . . .. ....... . . .. . . . . ............................... . . . . . .. .. . . .. . .. . ................. .. . . . . ... .. . . ....... . . . .. ....................... ... ....................... . .. . . .... . .. .. . . .. . .. .. . .. ... . ............
lowQualScore : 000000000 0 0 0 0 000 0000000 0 555 5 00000000000000000000000000000 0 88888888 444 8888 8 4 6 333333333333333333333333333333333333333333 4 0 2222222 88 0000000000000 2 0 00 8 444 8 8 000 0 0 3 7777777777 22 0 2 22222222222222222222222222222222222222222 4 1 6 99 000 7 0000000000000000 0 9999 1 777777 1111 7 6 0 99999 7 1111111111 0 4 4 4 88 77777777777777777 7 3333 7 7 333 0000000 00 3 9 7 66 33 7 7 11 7 9 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 7 9999 7 777777777777777777 4 77777777777777777777777777 7 0 88888 0 777 7 5 33333333333 8888 4 4 4 4 666666666666666666666666666666 4 4 11 55 555 55 0 6 0 222222 11 4 1 99 66666 0 4444444 8 0 99 0000000 0 1 66 0 0 0 2 1111111111111111111111111111111 0 1 7 3 7 11 00 7 6 99 0 66 7 99999999999999999 99 7 0 7 7 444 77 7 4 0000000 9 7 7 77 99999999999999999999999 111 77777777777777777777777 4 00 0 0 9999 0 55 22 5 6 99 7 00 00 6 99 888 0 444444444444
consensus : NNNGAGAATAGTTACGAATGTTCNTGCCTTGTTTACAATACATGTATGAATTTTATNCCGGNGTANAAAGTTGCGCCACGCATNGNGTATT--ACGAGTC-ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAANC-ATGGCTAGTGATGCAAAGGCATGTTTTTCAT--CTG--AA---G----------------TCGA---AA-GTACCGTGCTATAATTCGGTACTTGTA--NT--TCAAAA--GGT--A--AAACG-GCAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCATCTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAA-ACG-CG---GTAGAA--CGTCTTTAGAAGAC--------GAAGCCAGGT--CTG---------GACGTCCACTGGATGCCACCG--ACG---A-AGAAA-----N---GTG---TAAGA-AAGT-TC-GGGAT--C-TGGTA-TACTCT-GATAGGCGAATNCAGGTGGAA-GAA----ATAGC-GCAGNCATTAGACATTCCACA-TG---------GTA--G-CGT--TT-CAACAATCTTG-CATGG-----T-CGTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGC-TGGGTTCCC-AAATC-CCTT----------AGCGA-----T-----------G---AGC-------------AAATG---------G-CA-TC----AGTAT-GCA-------GCG--CC-T--TGTTG----AA------GCGTT-TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTGA-TTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA-T--GAGC-C-AGA-G-AATAAAG--C-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCC-GA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTCAAGACGCA---ACCA--T-CTGCTGGC--AAG-GT--GATGGCCA-CA---GTA-TTTTGGGA-CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGGAC-TTTT-ACCCAAG-AG-A-AGTACAATA--AATAACTGGA--GTGNACT-A-TGCAAAC-TNGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA--AAAA--CGCCGAG-GTAAA-TC--------TC----T--AAAGGTGTTTTGC-TGC-AACAGGA--CAA-CGCG-AGAGT----C--CACACTTGCAA-AGTT-GCAA-TGG-------AT-------G------AGC--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T--AC-------CACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGACT-TCTTCCTATTCCCAAA-CTTGAAAAAG--GATA--TCCG-TGG--ACG---TCA-TTTCCGGTCT---G---A---CGAAGT
Reference ( gi|3 ) : ACAGAGA-CGGTCAC-AATTTCCATGCCTTGTTT-CAATACATGTGGTAGTATTATACCAGGGTACAAAATTATA--ATATATCGACTATCCCAGGAGTC-ATTCTTTAATA-GATATCA---AAAGTCAAAC-ATGGCTACTGATGCAAAGGCATGCTTTTCAT--TT---AA---G----------------TTAA---GA-GC-CCGTGTTATAATTCGGTACTTGT---TT--TTAAAA--GGT--A--AAACATACAAGGAAATACACGGCGAGTTAACCAATGTTTATGGGTCTTCTGCACCACCTTATGCTCAGGTTAATTT---GGTAAGGAAAT-TCAA-CCG-CG---GTAGAA--CATCTTTAGAAGGT--------GAAGCCAAACTGCTG---------GACGTCCACTGGATGCCATCG--ACG---A-AGAAA-----A---GTG---CAAGA-AAGT-TC-GGGAT--C-TAGTA-TACTCT-GATAGGCGAATTTAGGTGGAA-GAA----ATAAC-GCAGGCATTAGACATTTTACA-CG---------GTA--G-CAT--TT-CAACAATTTTA-CGTGA-----T-CGTTGGGGTATGCGCAA-GCTAACATTCCGT-TGGGTCCCA-AAATT-CTTT----------AGCGA-----T-----------G---AGC-------------A-------------G-CA-TC----AGTAT-GCA-------GCG--CC-T--TGATG----AA------GAGTT-TTCGGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGATGA-TAGTAGATGA-GACTTGGGTTCATTGAACAAAACATTA-C--GAGC-C-AGA-G-AATAAAG--A-TCAGA-GTCG-TCATTGGATAGGATCTGGGTCCCC-GA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTCTAGACACT---ATCA--T-CTGCTGGC--AAG-GA--GATGGTCA-CA---GTG-TTTGGGGA-CGCAAA--AGGCGTTGT-CATGTTGGAC-TTTTTACCCAAG-AG-A-AGTACAATAG-AATAACTGGA--GTGTACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-CGAGAACCGCC-ATCCGTGA--ACAA--CGCCGAG-GTAAA--C--------TC----T--AAAGGTGTTTTGC-TGC-AACAGGG--CAA-TGCG-AGAAT----C--CACATTTGCAA-AGTT-GCAA-CGG-------A--------G------AGC--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T--AT-------CACA-TCCTGCC-CACTC-GCCC--GA-CCTAGCTCCTA--GCGACC-TCTTCCTATTTCCAAA-TTTGGAATAG--GATA--TCCG-TGG--ACG---TCA-TTTCCGGTCT---G---A---AGAAGTG
gi|1 : GAGAATAGTTACGAATGTTCTTGCCTTGTTT-CAA---ATGTATGAATTTTATCCTGATGTAAAAAGTTGCGCCACGCATAGA-------ACGA----ATTCTTTACTAAGATATTGTTTAATGTGGAACTATGGCTAGAGA-GCAAAGGCATGATTTCCAT--CTGAAAA---GATGCGCACCGGTGCTATCAATTCAA-GTACTGTGCTACAATTCAGTACTTGT---AT--TTAAAA--GG--------------AAAGAAACACATGGCGTGTTGGCCGATATTTATGGGTCTTCTGCACCATCTTTTGCTCAGGATAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TTAA-ATG-CG---ACAAAA--TGTTTTTAGAAGAC--------GACGT-AGAGT-CCG---------GACGCCCACTAGATGCCACCG--ACA---A-AGAAA-----T---ATG---TAAGA-AAGT-GC-GATAT--C-TGGTA-TACTTT-GACAGGCGAATTCTGGTGGAA-GAA----ATACT-GCAGGCATTAAATAATCTACA-TGGTACAAAAAGTA--G-CGT--TT-CAACTATCTTA-CATGA-----T--GTTAAGGTATGTGCAA-GCTCACAGACCGC-TGCCTTTCT-AAATC-CCTC----------GACGA-----T-----------G---AGC-------------AAATG---------G-CA-ACCAGAAGTAT-GCAGAAGTATGCGGTCCAT--TGTTG----GA------GCGGT-GTCGGTCAAAAGAT-GGTTTTCGTTT-GCC-TCTGGTGA-CTGTAGATGA-CACTTGTATTCATTG---------TTA-T--GAACAC-A-A-G-AATAAAG--C-TC--A-TTTG-ACAGTGGAT-GGGCCCGGGTCCCC-AA-GT-G--CA---AA--GA-AGGTAAAGGCGCA---ACCA--T-CTTCAGTC--AAG-GT--CATGACCA-CA---CTA-TTTTAGGA-CGCAAATCA---GTTAT-TTTGTTGGAC-TTTTAACCCAAG-AA-A-AGTAC------AATAACTGCAATATGCACT-T-TTTAAAC-TTCC-TA-AC--------------CC-ATCCGTTA--AAAA--TACTAAG-TTAAC--C--------TCTG--T--AAATGTGTTTTGC-TGC-AACAGGA--CAC-CGCG-ATAGT----T--CAAAACTGCAA-AAGT-GCAA-TGG-------AT-------GTTGT--AGCATGAAACAGGTATGAATT----A----A-T--AC-------TACA-TCCCGCT-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GTGACT-TCTTCCTATCCCCAAA-CTTAAAAAAAATGATA--TCCG-TGG--ACG---TCA-TTTCCGGTCT---G---A---TGAA
gi|2 : atgCATGCTTTGTTTATAATACATGT-----T-TTATACC-GGGTACAAAATTGTC--A-----CGCGTATT----GAGTCGATTCTTTAATAAGATTTCG---TATGTCAA-C-ATAGTC---GGTACAAAGGCATGCTGTTCATCGTT---GAAACG----------------TAGA---AATAT-CGGTGCTATAATTCTGTATTTATATCTTAATCAAAA--GGTGTA--AAAAA-ACA-GGAAATACACGGCGAGTTAGCCAATGTGTATTGGT-TTCTGCGATACCT---------ATT--TCT---GGTTGGGGAATATCAA-AAGACG---GTAGAA--CGGTTTTAGGAAGCATTACCAGGTAGTCAGGT--CTG---------GACACTCACTGTATGCGA-CG--ACG---ACAGAAATG---T---GTG---TAAGA-AAGA-T--GGGAT--CTTGGTG-TA-TCT-G-TAGGCGAA-----ATGG-------------GC-GCAGGTATAGGACATTTCAAAGTG---------ATAT-GCCAT--TG-CAACAATCTTA-ACTGGT----T-CGTTTAGGTATGC-CAA-GCTAACA----G--------CCA-AAATTACTTTA---------AGCGA-----TTGACAAAGGCAG---AACCAG----------A-------------G-CAGTC----GGT-T-GCA-------GCG--TC-CAATGTTG----AA------GCGTTGTTAGGTGAAAAG---GGTTTTATTTTCGCG-TCTGATGA----CAGATGA-GTCTTGGATTCATC--------CATTA-T--GAGC-CTAGA-A-AATGTAG-------------------TGGGTAGGGCCTGGGT-CCC-GA-TG-C--C----AC--GA-AGTGATAGCCACaaagtcctgacggtagttgaggagtgggtcaatgtaaagggccctgacattttaggttctgagctgattccacttgaacactgttggtctaagtgcatcacactagagggaattccctcgaaaaagaagaggtgaatataaaccaggattataagttaggcttgttac
gi|19 : t-ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAAAT-ATGGTTAGTGATGCAAAG--ATGTTTTTCAT--CTA--AA---G----------------TT-----GA-GTACCGCGCTATAATTTGGTACTagtgttttgggatgcaaaaggcgttattatgttgtgcattttgacccaagagaatacaataattgctagattgatatgagaattcacatcgtgaaaacgccgaaagtaaacgccttaagtcacagtaaaggtagttgcctgacacagacaacgagagagtcacacaatgcaaagttgcaaatggatgctataagagcgaaacgggttcataacattcctgtctattccgaaagcctagcgactttcctcttccttaactttgaaaaagatacccattggacacgtcatttccggctgacgaagaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|21 : -ATTCTTTGATAAGATATTG---AATGCCAATC-ATGGCTAGT-ATGCAAAAGTATGTTTTTC
gi|22 : tg-ATTCTTTGATAAGATATTG---AT-GCCAATC-ATGGCTAGT-ATGCAAAAGTATGTTTT
gi|15 : -CTGTGCTATAATTCGGTACTTGT---AT--TCAAAT--GGT--A--AAACGGGCAAGAAAATCCACGGCGAGTTAGCGGATGTTTGTGGGTCTTCGGCACCATCTTATGTTCAGGTTAAATTGTGGGTAAGGGAAT-TCAA-AAG-CG---GTAGAA--CGTCTTTAGAAAAT--------GAAACCAGAC--CTA---------GATGTCCACTGAATGTCAAAG--ATG---A-GGAAC-----T---GTG---TTAGA-CTGT-TC-GGG--------------TTCT-GATAAGCGAATTCAGGTGAAA-GAA----TGAGC-GCAat
gi|7 : taCGTGCTATAATTCGGCACTTATA--TT--TTAAAATAGGC--ATTAAAC---CAAGAAAATACACGGCAAGTTAGC-GGTGTTCATGGATCTTCTGCACCATCTTAGTCTCAGGTGAAATTCTAGGTAGGGAAAT-TCAA-CCG-TG---GTAGAA--CGTCGTAAGAAGAT--------GAAGCCAG-------------------GT---CTGGATGCCACCG--ACG---A-AGAAATGTGTAAATGTG---TAAGA-AAGT-TA-GGTAT--C-TGGTA-TACTCT-GAAAGGGAAATACAGGTGGAA-GAA----ATAGC-GCAGTCATTAAGCATTCCACA-TG---------GTA--G-CGT--TT-CAACAATATTG-CATGA-----C-CGTTTAGGTACAC--------------CCGT-TGGGTCCCC-AAATC-CCTT----------AGGGA-----T-----------G---AGCAAATGGCAACCAGA-------------A-CA-TT----AGTAT-GCA-------GCG--GC-T--TGTTG----AA------GCGTT-TTAGGTCAAAATAT-TATTTT-TTTT-GCG-TCTGGTGA-TTGTAGATGA-GATTTGGATTCA-TG--------ATTA-T--GAGA-A-AGA-G-AATAAAG--C-TCAGA-ATCG-TCAGTGGGTAGGGCTTTGGTCCCC-GA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTCAAGATGCA---ACCA--T-CAGCTG
gi|18 : aaTGTTTATGGGTCTTCTGCACTATTTTATGCCCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGGAT-TCA---------------AA--CGTC--TAGACG-------------CCCA-----CTG---------GA-----------TGCCACCG--ACG---A-AGAAA-----C---GTG---TAAGA-
gi|9 : AAATCTCAAGTCG-CGTAGGTAGAGACCGTCGTAAGAGGAT--------GAAGCCAGGT--CTGAGAGGGACAGACGTTGAC--GA--CCATTGTAATGGTAA-AGAGA-----A---ATT-------A-GAGTGTC-GTGGTAGC--AGCA--ACCCTTGAAAGG--AATACAG-TAGAA-GAATGAAATAGCCGCAGTCATAAGTCAATCCACAATG---------CTAAGG-C-T--TT-CA-CAATATTAGCATGAAAAGAC-CGGTCTAATAGGTGCAG-ACGACCAG--CGTATCGTTTCCA-AA--T-CCTT----------AGGGAACAAAT-----------GGCAACC-------------A-------------GACA-TT----AG-AC-GCG-------GC------T--TGGTG----AA------GCGTT-TT-AGT--AAATAT-TATTTT-TTTT-GCGCTCTGGTGAATTGTAGATGATGATTTGA-TTC--TGA--------TTA-CTCAAGA-A-AGATG-AATAACGCTA-TGATA--TCG-TCAGTGG-TAGGGCTTTGGTCCCC-GA-GG-C--CA---AAGGGA-AGTTCAAGATGC----A-CA--TGCAGCTGGCTAAAGCGA--AAT
gi|4 : aCTGGACGCCAGGA--ACG---A-AGCAA-----A---CTGTTCCAAGAGAAGT-TTAGGGAC--C-TGGTAGTA-TCG-GATAGGTGAATC-----AGAACGGA----ACA-T-GCAG-CATTA-ACATTGCACA-TT---------GTAA-G-CGTCGTTATAACAACCCTAACAT-A-----TACGTTTAG--AAGCGCAACGCTAACAGCCCAC-TGGGTCCCCCAAATC-CCTTCTATATTGACAGCAAA----T-----------GGCAAACCCAG---------A-------------G-CA-TCC---AGTATTGCA-------TCG--CCAT--TGTTG----AACCAATAGAG-----CAGTCAAAAGATCGATTTC--TTT-AAG-CCT------TGGTA--T----ACTTGAGTTCATT------------A-T--GAGC-C-AAA-T-AATAA-G--C-TCAGAAGTCGATCAT--GGTAGGCT-TGGATCCCC-GAAGG-C--CA---AA--GACAGTTC-AAACGCA---ACCAATT-CTG-TAGC--AAT-GT--GATGGCCA-AG---GTACTTTTGGGA-CGCAAA--AGAC------TATGTTGGAC-TT-----CCAAA-AGCA-AGTACAATAG------CTG-A--G----CT-A----GAAG-TTGC-TAGGTCAGC-TGA-AACCGCCCATT-GTGGCGACAAGACGCCGGG-G-AAA--C--------TC----TTTAAAG---TTTTGCATGC-AACAAAGAACAAACGCA-AGATT----CACCACTTATGCAA-GTTT-GCAA-TGATGTTGTTA--------G------AGC--GAGACAGATATGCATT----A----A-T--AA-------TACA-TCCTGCCTTATTC-GCCT---A-CCTAGAT-CTA--GCGA-C-TTTTGGTATTCCCAAC-TT--GAACAA--AGTA--TCCA-T-G--ACA---TCATTTTCTTGT-T---G---A---CGAAG
gi|23 : AAGA-AAGT-TC-GGGAT--C-TGATA-TACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAA-GAA----attatgacgcgagttcaggagtaggacatatgaaaccctggatttttcattgtgggatgatgatggcacgtggaaatagttgttgtctgaagggtgcatcacactagaggcaattacatgaaaagaaagtagatctcaatggaaatagttaaggctggttaattattga
gi|11 : --G-NGT--TT-CAACAATCTTG-CATGG-----T-CGTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGC-TGGGTTCCC-AAATT-TCTT----------AGCAT-----T-----------G---AGC-------------AAATGGCAACCAGAG-CA-TC----AGTAT-ACA-------GAG--CC-T--TGTTGTTTAAA------GCGTT-TT-------ACGAT-GATTTTCT-----------GGTGG-CTGTAGATGA-GACTTGGTTTTAT---------CATTA-T--AAGC-C-AGA-G-AATAAAC--C-TCGG---TCG-TCAGTGGATAGGGCCTGGGTCCCT-GT-GG-C--CA---AA--GA-AGTTCAAGACGCA---ACCA--A-TTACTGGT--AAG-AT--GGTGGCCA-CA---GTA-TTATGGTA-CGCAAA--AGGGGTTAT-TATATTGGAC-TTTTTA-TCAAG-TG-A-AGTAC------AACAACTGGA--GTAGGCC-AGGGCAAAC-Tct
gi|17 : gTTG-CATGG-----T-CGTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGC-TGGGTTCCC-AAATT-TCTT----------AGCAT-----T-----------G---AGC-------------AAATGGCAACCAGAG-CA-TC----AGTAT-ACA-------GAG--CC-T--TGTTGTTTAAA------GCGTT-TT-------ACGAT-GATTTTC
gi|5 : ATATTA-T--GA-C-C-AGG-G-AATAAAG--C-TCAGA-A--G-TCATCAG--------TGGGTCCCCCGA-GTTC--CATT-AA--GC-AGTTCAAAATGCA---ACCA--T-CTG-TGGC--AAG-AATGAATGGTCAACACTTATT-TTTGGGAAATGCAAA--AGGCCTTATGTATGTTGGAC-TTTTTTCCCAAG-AG-AGAGCA-------AATAATTGGA--GTTAACTGA-TGCAAAC-TAGCCTAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA--AAAA--TGCCGAG-GTAAA--CATCTTT--CC----T--AAATGT-TTTTGC-TGTAAAAAGGA--CAA-C-CGTGGAATAGTCC--CACACTTGCAA-AGTTGGCAA-TGG-------ATTGTGTAGA------AAC--AAAACGAGTATGAATTA---C----AGTAAAC-------CACA-T-CTGCC-TATTC-GCCCTGGA-CCTCGCTCCTAGTGCGACCTTCTTCCTATTCCCAAA-CTTGAAA-AG--GAAA--CCCA-TG
gi|6 : ttATTA-T--GAGC-C-AGG-G-AATAAAG--C-TCAGA-GTCA-TCA--------G---TGGGTCCCC-GA-GT-C--CATTAAA--GC-AGTTCAAAATGCA---ACCA--T-CTGCTGGC--AAG-AT--GATGGTCA-CA---TTA-TTTTGGGA-TGCAAA--AGGCATTAT-TATGTTGGAC-TTTTTACCCAAG-AG-A-AG------AGCAATAATTGGA--GTGTACT-A-TGCAAAC-TAGC-TAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA--AAAA--TGCCGAG-GTAAACTC--------TC----T--AAATGTGTTTTGC-TGT-AACAGGA--CAA-CGCG-AGAGT----C--CACACTTGTAA-AGTT-GCAA-TGG-------AT-------GTTGTATAAC--AAAACAGGTATGAATTA---CAGTAA-C--AC-------CACA-TCTTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTCGCTCCCA--GTGACT-TCTTCCTATTCCCAAA-CTTGAAAAAG--GAAA--CCCA-TGatggtctagttgaggagtgggttctatggaaaggaccctaaatttttcagttttctggctgttggcacttcaaccccgctaattgaattggctaagtcatcacacctagaggccgattacatcaaaggaagaagaggtggaatctcaactgaaataagtcaggctggtta
gi|16 : ttattATTAGT--GAGC-C-AGG-GGAATAAAG--CCTCAGA-GT-A-TCA------AG----TGGGTCCCC-GA-GT-CATTA---AA--GC-AGTTCCAAAAGTTGCAACCA--T-CTGCTGGC--AAG-AT--GATGGTCA-CAT--ATA-TTTGCGGA-TGCAAA--AGGCCTTAT-TA-GTT-GAC-TTTT--CCCAAGAAG-A-AGAGCAATAA-GCCGA--GGA--GT-TACT-A-TG-AAACATAGC-T-GACCAGCTTGAGAACCatggtctagttgaggagtgggtctatggaaaggaccctaaatttttcagttctaggctgtggcacttcaacactgctaatttgaattggtctaagtgcatcacactagaggccgattacatcaaaaaagaagaggtggatctcaactggaaataagtcaggctggtt
gi|8 : agatcgaaggtttttattt-C--CA---AA--GA-AGTTCAAGACACA---ACCA--T-CCACTGGC--AAG------ATGAT-----------------GGC-CACA-----------GT--ATATTGGG-------ACGCAA-----A-AGTACAATA-----AATTG-A--GTGAACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGATCAGC-TGAGAACAGAC-ATCCATGA--AAAA--CGCCGAG-GTAAACTC--------TC----T--ATAGGTGTTTTGC-TGC-AACAGGA--CAA-CGAG-AGAGT----C--CGCA-TTGCAATGGAT-GC---TGT-------A--------G------AGC--AAAACGGGTATGAATT----A----A-C--AC-------CATA-TCCTGTC-TATTC-GTCT----------CTCCTA--GCGACT-TCTTCCTA-TTCCAAACTTCAAAAT-G--GATA--TATG-TGG--ACG---TCA-TTTCCGGTCT---A---A---CGAAG
gi|2 : --GATAGCCA-CA---GTG-TTTTGGGA-TGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGTGCATTTTGACCCAAG-AG-A-A-TACAAT---AATTGCTAGA--------------------TTGA-TA--------TGAGAATTCAC-ATC-GTGA--A-AA--CGCCGAAAGTAAA--CGCCTTAAGTCACAGT--AAAGGTAGTTGCC-TGA-CACAGA---CAA-CGAG-AGAGT----CA-CACAAT-GCAA-AGTT-GCAAATGG-------ATGCTATAAG------AGC--GAAACGGG------TT----C----A-T--A---------ACATTCCTGTC-TATT----CC--GA-A--AG--CCTA--GCGAC---TTTCCTCTTCCTTAA-CTTTGAAAAA--GATA--CCCATTGGACACG---TCA-TTTCCGG-CT---G---A---CGAAGaactcgtaacggcagttgaggagtgggcaacggaaaggactctgatttttttttttttagttctggatgatgacactcgaacaagtgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttaggctggttacttattgattcgcc
gi|10 : tcatgctttgtttataatacatgttttataccgggtacaaaattgtcacgcgtattgagtcgattctttaataagatttcgtatgtcaacatagtcggtacaaaggcatgctgttcatcgttgaaacgtagaaatatcggtgctataattctgtatttatatcttaatcaaaaggtgtaaaaaaacaggaaatacacggcgagttagccaatgtgtattggtttctgcgatacctatttctggttggggaatatcaaaagacggtagaacggttttaggaagcattaccaggtagtcaggtctggacactcactgtatgcgacgacgacagaaatgtgtgtaagaaagatgggatcttggtgtatctgtaggcgaaatgggcgcaggtataggacatttcaaagtgatatgccattgcaacaatcttaactggttcgtttaggtatgccaagctaacagccaaaattactttaagcgattgacaaaggcagaaccagagcagtcggttgcagcgtccaatgttgaagcgttgttaggtgaaaagggttttattttcgcgtctgatgacagatgagtcttggattcatccattatgagcctagaaaatgtagtgggtagggcctgggtcccgatgccacgaagtGC-TGAGAACCGCC-ATCTGTGA--AAAAA-CGCCGTG-GTAGAATC--------TC----T--CAAGGTGTATTTT-TGC-AACAGGA--CGA-CGCG-AAAGT----C--CACACTTGCAA-AGTT-GCAA-TGG-------A--------T-------GC------CGGATATAAATT----A----A-T--AC-------CACA-TCTTGCC-TATTC-ACGT--AA-CCTAGCTCCTA--GCGACT-TCTTCCTGTTCTCAAA-TTTAAAAAAG--GATA--TCCG-TCC--ACGGGGTCA-TTTCCGGTCT---G---ATGAAGAAGTaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|13 : gC--GAAACGAGTACGAGTTAATAC----A-T--GTGTAATACCACA-TTCTGCC-TATTTTGCCT--GA-CGTAGCTCCTA--GCGACT-TTTTCCTATTCCTAAC-TTTGAAAAAG--GATA--TCCG-TGG--ACG---TCA-TTTCCGATCT---GACAA---GGAAGTcgtaacggcagttgaggtgtgggtctgtggaaaggaccttgaccttttcagctctgggctgatagcacttgaacacagttgggttaagtgcatcacatttgagggcaattacattaaaaagcgagaggtgcatcataaccagaaatgggattggctggttgact
gi|12 : GAAAT----C----A----AG-------CAC--TC--GCC-TATGC-GCCT--GAGCCTGACTC-TA---C-ATT-TCTTCCTATTTCCAAA-CCTAAAAAAG--GATAACTCCG-tgtgacggcagttgagaattggggcaatggaaaggatcctgactttttcagttttgggcacttgtacaccgttggtctaagtgcgtcacacgagagggcaatttcatcaaaaaagaagaggtggatcagttaggttggttacttattgacttgct
gi|14 : agatgcacatgcagctggctaaagcTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--ACGATT-TCTTCCTATTTCCAAA-CCTAAAAAAG--GATA--TCCG-TGG--ACG---TTA-TTTCCGGTCTTACA---A---AGAAGTataaagttactgtattatatacggtcttacaatgaagtactagacggaagttaggagtgggtcaaatggaaagaacctgacaactcctccagttaagggctgatggtacaattgattcaccagttggggtcaatcgctccactaagaggtcaaattacatggataaaagaagaggggatctcaccggaaataagttcactgg
gi|20 : AAA-TTTGAGAAAG--GACA--TCCG-TGG--ACA---TCA-TTTCCGGTCT---G---A---CGAAGcttgacggaagttaaggagtgggtcaatggaaagaaccctgacattttcagttaagggctgatggtatttgatcaccgttggtctaatcgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttagactggttacttatta
Alignments
lowQualScore : 1 1 2 22222 1 6666666666666666666666 1111 1111 11 11 4444444444444 1111 1111 22222222222 2222 1 111 111 1111 111 22222222 1 1111111 111111111 222222222 1 1111111111 1111 8888888888888888888888888888888888888888 1111 1111111 1 2222 2222222 1 222222222 1 111 11111 111 11111 1111 2222 111111 1 888888888888888 3333333333333333333
lowQualScore : 5 5 2 1 3 7 99999 1 4 1 0 7777777777777777777777 0000 5555 7 6 33 0 33 6 0000000000000 0 6 6 6 6 4444 99 7777 88888888888 3333 0 5 6 2 2 1 222 5 000 77 1 5 2222 0 000 77 5 666 7 666 777 33333333 4 8 99 5 0 4444444 4 5 1 7 0 111111111 7 3 6 6 666666666 1 5 77 5 888 7777777777 3 44 5 1 5 4 7777 1 3 0 7777777777777777777777777777777777777777 0000 5 6666666 66 0 66 1111 5 4444444 5 5 1 5 5 8888 5 666666666 99 4 4 4 4 0 4 2 2 1 4 2 2 666666 4 3 55 111 55 3 666 1 6666 1 4 4 4 4 22222 4 4 4 66 66 5 4 4 4 8 333 4 4 1 77777 555 1 3 666 4 4 1 4 1 5 0 4 0 66 33 5 1 0000 5 5 0000 000000 1 5 5 66 0 66 5 5 77777 5 5 000000000000000 777 7777777777777777777 1 4 3 3 777 3 55 3 3 44 44 3 66 777 4 777
lowQualScore : . . . . . . ..... . . . . ...................... .... .... . . .. . .. . ............. . . . . . .... .. .... ........... .... . . . . . . ... . ... .. . . .... . ... .. . ... . ... ... ........ . . .. . . ....... . . . . . ......... . . . . ......... . . .. . ... .......... . .. . . . . .... . . . ........................................ .... . ....... .. . .. .... . ....... . . . . . .... . ......... .. . . . . . . . . . . . . ...... . . .. ... .. . ... . .... . . . . . ..... . . . .. .. . . . . . ... . . . ..... ... . . ... . . . . . . . . . .. .. . . .... . . .... ...... . . . .. . .. . . ..... . . ............... ... ................... . . . . ... . .. . . .. .. . .. ... . ...
lowQualScore : 5 0 5 0 7 3 00000 0 0 0 7 0000000000000000000000 7777 2222 5 7 33 3 88 5 5555555555555 8 7 7 7 7 2222 66 0000 00000000000 8888 8 0 7 5 5 4 111 7 000 99 9 7 1111 7 000 99 7 777 6 111 999 99999999 4 9 55 0 0 5555555 5 0 4 6 2 999999999 5 7 7 7 777777777 4 7 99 7 000 2222222222 4 55 0 4 0 2 5555 4 6 1 9999999999999999999999999999999999999999 6666 0 2222222 99 0 99 2222 0 0000000 6 0 9 7 7 4444 7 777777777 55 0 0 0 0 7 0 4 0 6 0 5 3 222222 0 6 00 444 00 6 444 8 5555 4 0 0 0 4 77777 4 4 4 11 11 7 4 4 4 9 888 4 4 1 66666 111 9 9 222 4 4 1 4 0 0 1 4 1 11 22 0 4 6666 0 0 8888 888888 4 0 0 99 0 99 0 0 44444 0 0 111111111111111 000 4444444444444444444 6 0 6 6 000 6 00 6 3 66 66 3 11 888 4 888
consensus : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACATGTG--AGTTTTATACCGG-GTACAAAATTGTG-CACGCAT-GA-TATC-C--GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAA--GTTGAGA---GTACC-G-TGCTAT-AATTC-GGTACT----TATATTT----CAAAA--GGT--ATT-AAAC-G-GCAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--TGTGT--------AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATG---------G---------C-A-----AG-----TC----AG----TAT-GCA-------GCG--CC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-AAGTACAATA-AA-TAACTGGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TNGC-TAGACCAGC-TGAGAA--CCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCGAGGTA-A--A-TCT---C--TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGAT--T-TA-GTTGT---AGC--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
Reference ( family-2589 ) : NNNGAGAATAGTTACGAATGTTCNTGCCTTGTTTACAATACATGTATGAATTTTATNCCGGNGTANAAAGTTGCGCCACGCATNGNGTATTAC--GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAANC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAA--GTCGAAA---GTACC-G-TGCTAT-AATTC-GGTACT----TGTANTT----CAAAA--GGT--A---AAAC-G-GCAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGTCCACTGGATGCCACCGACGA-A-GAAA--NGTGT--------AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATNCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGNCATTAGACATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATG---------G---------C-A------------TC----AG----TAT-GCA-------GCG--CC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-AAGTACAATA-AA-TAACTGGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TNGC-TAGACCAGC-TGAGAA--CCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCGAGGTA-A--A-TCT---C--TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGAT-------G-------AGC--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
gi|1 : GAGAATAGTTACGAATGTTCTTGCCTTGTTT-CAA---ATGTATGAATTTTATCCTGATGTAAAAAGTTGCGCCACGCATAGA-----AC--GA----ATTCTTTACTAAGATATTGTTTAATGTGGAACTATGGCTAGA-GA-GCAAAGGCATGATTTCCATC--TGAA-----AAGATGCGCACCGG-TGCTATCAATTCAAGTACTGTGCTACAATT----CAGTACTTGT--ATTTAAAA-G-G-AAAGAAACACATGGCGTGTTGGCCGATATTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTTTGCTCAGGATAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TTAAA-TG-CG---ACAAAA--TGTTTTTA-GAAG----ACGA---CGTAGAGT--CCG-GACGCCCACTAGATGCCACCGACAA-A-GAAA--TATGT--------AA-GA-AAGTGC-GAT-ATC-TGGTA-T-----ACTTT-GACAGGCGAATTCTGGTGGAAGAA----ATAC-TGCAGGCATTAAATAATCTAC-A-TGGTACAAAAAGTA-G-CGT--TT-CAACTATCTT-A-CATG----A-T---GTTAAGGTATGTGCAA-GCTCACAGACCGCTGCCTTTCT-AAATCCCTC----GACGATGAGCAAATG---------G---------C-A------------ACCAGAAG----TAT-GCAGAAGTATGCGGTCCAT--TGTTG----GAGCGGTG---TC-GGTCAAAAGAT-GGTTTTCGTTT-GCC-TCTGGTG-ACTGTAGATGA-CACTTGTATTCATTG---------TTA--TGAACAC-A-A-G-AATAAAGC-TC--A-TTTG-ACAGTGGAT-GGGCCCGGGTCCCCAA-GT-G--CA---AA--GA-AGGTA---AAGGCGCAACCA--T-CTTCAGTC-AAGG-TCA-TGACCA-CACT-A-T-TTT-A-GGA--CGCAAATCA---GTTAT-TTTGTTG-G-AC-TTTTAA-CCCAAG-AA-AAGTAC-----AA-TAAC-----TGCAAT-A-TGC--AC-TTTT-TAAACTTCC-T---AA--CC--C-ATCCGTTA----AAAA-TACTAAGTTA-AC-C-TCT---G--TAAATGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAC-CGCG--ATAGT-T-CAAAACT--GCAAAAGT-GC-AATGGAT-------GTTGT---AGCATGAAACAGGTATGAATT----A----A-T-------ACTACA-TCCCGCT-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GTGA-CTTCTTCCTATCCCCAAACTTAAA-AAAAATGATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAA
gi|10 : atgGC-TGAGAA--CCGCC-ATCTGTGA----AAAAACGCCGTGGTAGA--A-TCT---C--TCAAGGTGTATTTT-TGC-AACA--GGACGA-CGCG--AAAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGAT-------G---------C------CGGATATAAATT----A----A-T-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-ACGT--AA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTGTTCTCAAATTTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TCC--ACGGGGTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAAGaaagtcctgacggtagttgaggagtgggtcaatgtaaagggccctgacattttaggttctgagctgattccacttgaacactgttggtctaagtgcatcacactagagggaattccctcgaaaaagaagaggtgaatataaaccaggattataagttaggcttgttac
gi|11 : g-G-NGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATG---------G---------C-AACCAGAGCA---TC----AG----TAT-ACA-------GAG--CC-T--TGTTGTTTAAAGC-GTT---TT-------ACGAT-GATTTTCT-----------GGTG-GCTGTAGATGA-GACTTGGTTTTATC---------ATTA--TAAGC-C-AGA-G-AATAAACC-TCGG---TCG-TCAGTGGATAGGGCCTGGGTCCCTGT-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--A-TTACTGGT-AAGA-TGG-TGGCCA-CAGT-A-T-TAT-G-GTA--CGCAAA--AGGGGTTAT-TATATTG-G-AC-TTTT-T-ATCAAG-TG-AAGTAC-----AA-CAACTGGAGTAGGCC-AGGGCAAAC-Taagtcgtaacggcagttgaggtgtgggtctgtggaaaggaccttgaccttttcagctctgggctgatagcacttgaacacagttgggttaagtgcatcacatttgagggcaattacattaaaaagcgagaggtgcatcataaccagaaatgggattggctggttgact
gi|12 : gGAAAT----C----A---------AGCAC--TC--GCC-TATGC-GCCT--GAGCCTGACTC-TA---C-A-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATAACTCCG-
gi|13 : agatgcacatgcagctggctaaagcC--GAAACGAGTACGAGTTAATAC----A-TGTGTAATACCACA-TTCTGCC-TATTTTGCCT--GA-CGTAGCTCCTA--GCGA-CTTTTTCCTATTCCTAACTTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGATCTGACAAGGAAGTataaagttactgtattatatacggtcttacaatgaagtactagacggaagttaggagtgggtcaaatggaaagaacctgacaactcctccagttaagggctgatggtacaattgattcaccagttggggtcaatcgctccactaagaggtcaaattacatggataaaagaagaggggatctcaccggaaataagttcactgg
gi|14 : TGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--ACGA-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTTA-TTTCCGGTCTTAC---AAAGtgtgacggcagttgagaattggggcaatggaaaggatcctgactttttcagttttgggcacttgtacaccgttggtctaagtgcgtcacacgagagggcaatttcatcaaaaaagaagaggtggatcagttaggttggttacttattgacttgct
gi|15 : TACT-G-TGCTAT-AATTC-GGTACT----TGTA-TT----CAAAT--GGT--A---AAACGG-GCAAGAAAATCCACGGCGAGTTAGCGGATGTTTGTGGGTCTTCGGCACCAT-CTTATGTTCAGGTTAAATTGTGGGTAAGGGAAT-TCAAA-AG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAA----ATGA---AACCAGAC--CTA-GATGTCCACTGAATGTCAAAGATGA-G-GAAC--TGTGT--------TA-GA-CTGTTC-GGG------------------TTCT-GATAAGCGAATTCAGGTGAAAGAA----TGAG-CGCAaagtcttgacggaagttaaggagtgggtcaatggaaagaaccctgacattttcagttaagggctgatggtatttgatcaccgttggtctaatcgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttagactggttacttatta
gi|16 : TTTATTT--------ATTAG-TGAGC-C-AGG-GGAATAAAGCCTCAGA-GT-A-TCA------AG----TGGGTCCCCGA-GT-CATTA---AA--GC-AGTTCCAAAAGTTGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CA-T-A-TATTT-GCGGA--TGCAAA--AGGCCTTAT-TA-GTT--G-AC-TTTT---CCCAAGAAG-AAGAGCAATA-AGCCGA--GGAGT-TACT-A-TG-AAACATAGC-T-GACCAGCTTGAGAA--CC
gi|17 : agatcgaaggttTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGCAACCAGAG---------C-A------------TC----AG----TAT-ACA-------GAG--CC-T--TGTTGTTTAAAGC-GTT---TT-------ACGAT-GATTTTC
gi|18 : TGTTTATGGGTCTTCTGCACTAT-TTTATGCCCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGGAT-TCA---------------AA--CGTCT------AG----AC----------------------GCCCACTGGATGCCACCGACGA-A-GAAA--CGTGT--------AA-GA-
gi|19 : -ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAAAT-ATGGTTAGT-GATGCAAAG--ATGTTTTTCATC--TAAA--GTTG--A---GTACC-G-CGCTAT-AATTT-GGTACT----
gi|2 : TCATGCTTTGTTTATAATACATGT------TTTATACCGG-GTACAAAATTGT--CACGC-----GTATT----GAGTCGATTCTTTAATAAGATTTCG---TATGTCAA-C-AT----AGTCGGTACAAAGGCATGCTGTTCATCGTTGAAACGTAGAAA----TATC-GGTGCTAT-AATTC-TGTATT----TATATCTTAATCAAAA--GGTGTA---AAAA-A-ACA-GGAAATACACGGCGAGTTAGCCAATGTGTATTGGT-TTCTGCG--ATACCTAT------------TTCTGGTT-GGGGAATATCAAA-AGACG---GTAGAA--CGGTTTTAGGAAGCATTACCAGGTAGTCAGGT--CTG-GACACTCACTGTATGCGA-CGACGACA-GAAATGTGTGT--------AA-GA-AAGAT--GGG-ATCTTGGTG-T-----A-TCT-G-TAGGCGAA-----ATGG------------G-CGCAGGTATAGGACATTTCAA-AGTG---------ATATGCCAT--TG-CAACAATCTT-A-ACTG----GTTC--GTTTAGGTATGC-CAA-GCTAACAG-----------CCA-AAATTACTTTA--AGCGATTGACAAA-G---------G---------C-AGAACCAGAGCAGTC----GG----T-T-GCA-------GCG--TC-CAATGTTG----AAGC-GTTG--TTAGGTGAAAAG---GGTTTTATTTTCGCG-TCTGATG-A---CAGATGA-GTCTTGGATTCATCC--------ATTA--TGAGC-CTAGA-A-AAT------------GT-----AGTGGGTAGGGCCTGGGT-CCCGA-TG-C--C----AC--GA-AGT-------GA--TAGCCA-----------C-A--G-TG----------------T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGTGCAT-TTTG-A-CCCAAG-AG-AA-TACAAT--AA-TTGCTAGATTGA--T-A-TGAGAAT-TCAC----ATCG---TGAAAACGCCGAA-A---GT-------AAA-CGCC---TTA-A--G-TCA---CAGTAAAGGTAGTTGCC-TGA-CACA---GACAA-CGAG--AGAGT-CACACAA-T--GCAAAGTT-GCAAATGGATGCTATAAG-------AGC--GAAACGGG------TT----C----A-T-------A--ACATTCCTGTC-TATT---CCG--AA----AG--CCTA--GCGA-CT--TTCCTCTTCCTTAACTTTGA-AAAA--GATA--CCCATTGGACAC---GTCA-TTTCCGG-CTGAC---GAAG
gi|20 : AAATTTGAG-AAAG--GACA--TCCG-TGG--AC---ATCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|21 : -ATTCTTTGATAAGATATTG---AATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTTTCaagttgtgacggcagttcaggagtga
gi|22 : tg-ATTCTTTGATAAGATATTG----ATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTT
gi|23 : --------AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGATA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----at
gi|3 : GAGA-CGGTCAC-AATTTCCATGCCTTGTTT-CAATACATGTGGTAGTATTATACCAGGGTACAAAATTATA--ATATATCGACTATCCCAGGAGTC-ATTCTTTAATA-GATATCA---AAAGTCAAAC-ATGGCTACT-GATGCAAAGGCATGCTTTTCATT--T-AA--GTTAAGA---GC-CC-G-TGTTAT-AATTC-GGTACT----TGT-TTT----TAAAA--GGT--A---AAAC-ATACAAGGAAATACACGGCGAGTTAACCAATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAC-CTTATGCTCAGGTTAATTT---GGTAAGGAAAT-TCAAC-CG-CG---GTAGAA--CATCTTTA-GAAG----GTGA---AGCCAAACTGCTG-GACGTCCACTGGATGCCATCGACGA-A-GAAA--AGTGC--------AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TAGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTTAGGTGGAAGAA----ATAA-CGCAGGCATTAGACATTTTAC-A-CG---------GTA-G-CAT--TT-CAACAATTTT-A-CGTG----A-TC--GTTGGGGTATGCGCAA-GCTAACATTCCGTTGGGTCCCA-AAATTCTTT----AGCGATGAGCA-------------G---------C-A------------TC----AG----TAT-GCA-------GCG--CC-T--TGATG----AAGA-GTT---TTCGGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGATG-ATAGTAGATGA-GACTTGGGTTCATTGAACAAAACATTA--CGAGC-C-AGA-G-AATAAAGA-TCAGA-GTCG-TCATTGGATAGGATCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---TAGACACTATCA--T-CTGCTGGC-AAGG-AGA-TGGTCA-CAGT-G-T-TTG-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTGT-CATGTTG-G-ACTTTTT-A-CCCAAG-AG-AAGTACAATAGAA-TAACTGGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-CGAGAA--CCGCC-ATCCGTGA----ACAA-CGCCGAGGTA-A--A--CT---C--TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGGCAA-TGCG--AGAAT-C-CACATTT--GCAAAGTT-GC-AACGGA--------G-------AGC--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ATCACA-TCCTGCC-CACTC-GCCC--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CCTCTTCCTATTTCCAAATTTGGA-ATAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAA---GAAGTct
gi|4 : acaCTGGACGCCAGGAACGA-A-GCAA--ACTGTTCC-----AA-GAGAAGTTTAGGG-ACC-TGGTAGT-----A-TCG-GATAGGTGAAT-CAGA---ACGGA----ACA--TGCAG-CATTA-ACATTGCAC-A-TT---------GTAAG-CGTCGTTATAACAACCCT-AACATA----T-AC--GTTTAG--AAGCGCAACGCTAACAGCCCACTGGGTCCCCCAAATCCCTTCTATATTGAC-AGCAAATG---------G---------C-AAACCCAGAGCATCC----AG----TATTGCA-------TCG--CCAT--TGTTG----AACC-AATAGAGC-AGTCAAAAGATCGATTTC--TTT-AAG-CCT--TG-GT-----AT----ACTTGAGTTCATT------------A--TGAGC-C-AAA-T-AATAA-GC-TCAGAAGTCGATCA-TGG-TAGG-CTTGGATCCCCGAAGG-C--CA---AA--GACAGTTC---AA-ACGCAACCAATT-CTG-TAGC-AATG-TGA-TGGCCA-AGGT-ACT-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGAC------TATGTTG-G-AC-TT------CCAAA-AGCAAGTACAATA-G-----CTG-AG----CT-A----GAAG-TTGC-TAGGTCAGC-TGA-AA--CCGCCCATT-GTGGCGACAAGA-CGCCGGGGAA-A--C-TCT---T--TAAAG---TTTTGCATGC-AACAAAGAACAAACGCA--AGATT-C-ACCACTTATGCAAGTTT-GC-AATG-AT-------GTTGTTAGAGC--GAGACAGATATGCATT----A----A-T-------AATACA-TCCTGCCTTATTC-GCCT---A-CCTAGAT-CTA--GCGA-CTT-TTGGTATTCCC-AACTTGAACAAAG----TA--TCCA-T-G--AC---ATCATTTTCTTGT-TGAC---GAAGg
gi|5 : --------ATTA--TGA-C-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGAAGTCA-TCAGTGGGT----------CCCCCGA-GTTC--CATT-AA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTG-TGGC-AAGAATGAATGGTCAACACTTA-T-TTTTG-GGAAATGCAAA--AGGCCTTATGTATGTTG-G-AC-TTTT-TTCCCAAG-AG-AG----AGCA-AA-TAATTGGAGTTAACTGA-TGCAAAC-TAGCCTAGACCAGC-TGAGAA--CCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCGAGGTA-AACA-TCTTTCC--TAAATGT-TTTTGC-TGTAAAAA--GGACAACCGTGGAATAGTCC-CACACTT--GCAAAGTTGGC-AATGGATTGTGTAGA-------AAC--AAAACGAGTATGAATTA---C----AGTAA-----ACCACA-T-CTGCC-TATTC-GCCCTGGA-CCTCGCTCCTAGTGCGACCTTCTTCCTATTCCCAAACTTG-A-AAAG--GAAA--CCCA-TGattatgacgcgagttcaggagtaggacatatgaaaccctggatttttcattgtgggatgatgatggcacgtggaaatagttgttgtctgaagggtgcatcacactagaggcaattacatgaaaagaaagtagatctcaatggaaatagttaaggctggttaattattga
gi|6 : ttatTTATT---------ATTA--TGAGC-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCA-TCAGTGGGT-----------CCCCGA-GT-C--CATTAAA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CATT-A-T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCATTAT-TATGTTG-G-ACTTTTT-A-CCCAAG-AG-AAGAGC-----AA-TAATTGGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TAGC-TAGACCAGC-TGAGAA--CCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCGAGGTA-A--ACTCT---C--TAAATGTGTTTTGC-TGT-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GTAAAGTT-GC-AATGGAT-------GTTGTAT-AAC--AAAACAGGTATGAATTA---CAGTAA-C-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTCGCTCCCA--GTGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GAAA--CCCA-TGatggtctagttgaggagtgggttctatggaaaggaccctaaatttttcagttttctggctgttggcacttcaaccccgctaattgaattggctaagtcatcacacctagaggccgattacatcaaaggaagaagaggtggaatctcaactgaaataagtcaggctggtta
gi|7 : C-G-TGCTAT-AATTC-GGCACT----TATATTT----TAAAATAGGC--ATT-AAAC----CAAGAAAATACACGGCAAGTTAGC-GGTGTTCATGGATCTTCTGCACCAT-CTTAGTCTCAGGTGAAATTCTAGGTAGGGAAAT-TCAAC-CG-TG---GTAGAA--CGTCGTAA-GAAG----ATGA---AGCCAGGT--CTG-GA-----------TGCCACCGACGA-A-GAAA--TGTGTAAATGTGTAA-GA-AAGTTA-GGT-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GAAAGGGAAATACAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGTCATTAAGCATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATATT-G-CATG----A-CC--GTTTAGGTA----CA----------CCCGTTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGGGATGAGCAAATG---------GCAACCAGAAC-A------------TT----AG----TAT-GCA-------GCG--GC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TTAGGTCAAAATAT-TATTTT-TTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GATTTGGATTCA-TG--------ATTA--TGAGA-A-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-ATCG-TCAGTGGGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGATGCAACCA--T-CAGCTGatggtctagttgaggagtgggtctatggaaaggaccctaaatttttcagttctaggctgtggcacttcaacactgctaatttgaattggtctaagtgcatcacactagaggccgattacatcaaaaaagaagaggtggatctcaactggaaataagtcaggctggtt
gi|8 : aa-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACACAACCA--T-CCACTGGC-AAGA-TGA-TGGCCA-CAG-----------------------------------TATATTG-G-G-------A-CGCAA-----AAGTACAATA-AA-T---TG-AGTGAACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGATCAGC-TGAGAA--CAGAC-ATCCATGA----AAAA-CGCCGAGGTA-A--ACTCT---C--TATAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGAG--AGAGT-C-CGCA-----------TT-GC-AATGGATGCTGTA-G-------AGC--AAAACGGGTATGAATT----A----A-C-------ACCATA-TCCTGTC-TATTC-GTCT----------CTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATT-CCAAACTTCAA-AATG--GATA--TATG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTAAC---GAAG
gi|9 : AATCTCAAGTCG-CGTAGGTAGAGACCGTCGTAA-GAGG----ATGA---AGCCAGGT--CTGAGAGGGACA---GACGTTGACGACCA-TTGTAA--TG-GT--------AAAGAGAAATTA-GAGTGTCGTGGTA-GCAGCAACCCTTGAAAGG--AATACAG-TAGAAGAATGAAATAGCCGCAGTCATAAGTCAATCCACAA-TG---------CTA-A-GGC--TT-TCACAATATTAG-CATGAAAAG-ACCGGTCTA-ATAGGTGCAG-ACGACCAGCGTATC--GTTTCC-AAAT-CCTT----AG-G--GAACAAATG---------G---------CAA------------CC----AGACATTAG-AC--------GCG--GC-T--TGGTG----AAGC-GTT---TT-AGT--AAATAT-TATTTT-TTTT-GCGCTCTGGTGAATTGTAGATGATGATTT-GATTC--TG--------ATTACTCAAGA-A-AGATG-AATAACGC-TATGATATCG-TCAGT-GGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAGGGA-AGTTC---AAGATGCA--CA--TGCAGCTGGCTAAAG-CGA-aactcgtaacggcagttgaggagtgggcaacggaaaggactctgatttttttttttttagttctggatgatgacactcgaacaagtgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttaggctggttacttattgattcgcc
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 22222 1 1 333 888888888888 1111 1111 11 11 999999999999999999999999999 222222 11 444444444444 1 111 111 1111 111 22222222222 1 1111111 111111111 333333333 1111111111 1111 9999999999999999999999999999999 1111111 1 2222 2222222 1 222222222 11 111 11111 11 111111 1111 2222 111111 1 7777777777777 3333333333333333333
lowQualScore : 5 5 1 3 7 77777 3 3 222 222222222222 0000 0 5555 7 6 33 0 33 6 333333333333333333333333333 2 0 6 0 444444 11 999999999999 0 5 6 2 2 1 222 5 000 77 1 5 2222 0 000 77 5 6 1 5 666 44444444444 777 4 8 99 5 0 4444444 4 5 1 6 0 111111111 6 3 6 6 444444444 5 77 5 888 7777777777 3 44 5 1 1 5 4 7777 1 3 0 5555555555555555555555555555555 888 5 6666666 66 0 66 1111 9999999 5 5 1 5 5 8888 5 666666666 99 4 4 4 4 0 4 55 1 4 2 2 666666 4 3 55 111 55 3 666 1 6666 1 4 4 4 4 22222 4 4 4 66 66 0 8 4 4 4 8 33 4 4 1 1 66 666666 6 999 4 4 1 4 1 5 0 4 0 66 33 5 1 0000 5 5 0000 000000 1 5 5 66 0 66 5 5 77777 5 5 7777777777777 777 777 7777777777777777777 1 4 3 3 777 3 55 3 3 44 44 3 66 777 4 777
lowQualScore : . . . . . ..... . . ... ............ .... . .... . . .. . .. . ........................... . . . . ...... .. ............ . . . . . . ... . ... .. . . .... . ... .. . . . . ... ........... ... . . .. . . ....... . . . . . ......... . . . . ......... . .. . ... .......... . .. . . . . . .... . . . ............................... ... . ....... .. . .. .... ....... . . . . . .... . ......... .. . . . . . . .. . . . . ...... . . .. ... .. . ... . .... . . . . . ..... . . . .. .. . . . . . . .. . . . . .. ...... . ... . . . . . . . . . .. .. . . .... . . .... ...... . . . .. . .. . . ..... . . ............. ... ... ................... . . . . ... . .. . . .. .. . .. ... . ...
lowQualScore : 5 0 0 3 3 77777 3 3 000 333333333333 7777 7 2222 8 7 33 3 88 5 555555555555555555555555555 5 8 7 8 222222 00 888888888888 8 0 7 5 5 4 111 7 000 99 9 7 1111 7 000 99 7 6 7 9 111 44444444444 888 4 9 55 0 0 5555555 5 0 4 6 2 999999999 7 7 7 7 333333333 7 99 7 000 2222222222 4 55 0 4 1 0 2 5555 4 6 1 8888888888888888888888888888888 888 0 2222222 99 0 99 2222 0000000 6 0 9 7 7 4444 7 777777777 55 0 0 0 0 7 0 22 6 0 5 3 222222 0 6 00 444 00 6 444 8 5555 4 0 0 0 4 77777 4 4 4 11 11 1 4 4 4 4 9 88 4 4 1 9 22 666666 7 000 4 4 1 4 0 0 1 4 1 11 22 0 4 6666 0 0 8888 888888 4 0 0 99 0 99 0 0 44444 0 0 9999999999999 888 000 4444444444444444444 6 0 6 6 000 6 00 6 3 66 66 3 11 888 4 888
consensus : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GG--ATCC---GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTT----CAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGCA----------ACCAGA-CGTC----------AG---TAT-GCAG-------CG--CC-T--TGTTG----AAGCGTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTTA-CCCAAG-AG-AAGTACAATA-AA-TAACTGGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TNGC-TAGACCAGC-TGAGAA--CCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCGAGGTA-A--ACTCT---C--TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGAT---GTTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
Reference ( family-2589 ) : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACATGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCAT-GA-TATCC---GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAA--GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTATATTT----CAAAA--GGTATTAAACG-G-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGCA----------A-------GTC----------AG---TAT-GCAG-------CG--CC-T--TGTTG----AAGCGTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTTA-CCCAAG-AG-AAGTACAATA-AA-TAACTGGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TNGC-TAGACCAGC-TGAGAA--CCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCGAGGTA-A--A-TCT---C--TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATTTAGTTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
gi|1 : GAGAATAGTTACGAATGTTCTTGCCTTGTTT-CAA-ATGTATG--AATTTTATCCT-GATGTAAAAAGTTGCGCCACGCAT-AG-AA--C---GA----ATTCTTTACTAAGATATTGTTTAATGTGGAACTATGGCTAGA-GA-GCAAAGGCATGATTTCCATC--TGAAAAGATGCGCACCGGTGCTATCAATTCAAGTACTG-TGCTACAATTCAGTACTTGTATTT-----AAAA--GG-------------AAAGAAACACATGGCGTGTTGGCCGATATTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTTTGCTCAGGATAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TTAAA-TG-CG---ACAAAA--TGTTTTTA-GAAG----ACGA---CGTAGAGT--CCG-GACGCCCACTAGATGCCACCGACAA-A-GAAA--T--------ATGT---AA-GA-AAGTGC-GAT-ATC-TGGTA-T-----ACTTT-GACAGGCGAATTCTGGTGGAAGAA----ATAC-TGCAGGCATTAAATAATCTAC-A-TGGTACAAAAAGTAG-CGT--TT-CAACTATCTT-A-CATG----A-T---GTTAAGGTATGTGCAA-GCTCACAGACCGCTGCCTTTCT-AAATCCCTC----GACGATGAGCAAATGGCA----------A--------CC----------AGAAGTAT-GCAGAAGTATGCGGTCCAT--TGTTG----GAGCGGTG--TC-GGTCAAAAGAT-GGTTTTCGTTT-GCC-TCTGGTG-ACTGTAGATGA-CACTTGTATTCATTG---------TTA--TGAACAC-A-A-G-AATAAAGC-TCAT---TTG-ACAGTGGAT-GGGCCCGGGTCCCCAA-GT-G--CA---AA--GA-AGGTA---AAGGCGCAACCA--T-CTTCAGTC-AAGG-TCA-TGACCA-CACT-A-T-TTT-A-GGA--CGCAAATCAG---TTAT-TTTGTTG-G-AC-TTTTAACCCAAG-AA-AAGTACAATA-A-----CTG-----CAAT-A-TGCA--C-TTTT-TAAACTTCC-T---AA--CC--C-ATCCGTTA----AAAA-TACTAAGTTA-A--CCTCT---G--TAAATGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAC-CGCG--ATAGT-T-CAAAACT--GCAAAAGT-GC-AATGGAT---GTTG--T---AG---CATGAAACAGGTATGAATT----A----A-T-------ACTACA-TCCCGCT-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GTGA-CTTCTTCCTATCCCCAAACTTAAA-AAAAATGATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAA
gi|10 : atgGC-TGAGAA--CCGCC-ATCTGTGA----AAAAACGCCGTGGTAGA--A-TCT---C--TCAAGGTGTATTTT-TGC-AACA--GGACGA-CGCG--AAAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGAT--------------G---C------CGGATATAAATT----A----A-T-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-ACGT--AA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTGTTCTCAAATTTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TCC--ACGGGGTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAAGaaagtcctgacggtagttgaggagtgggtcaatgtaaagggccctgacattttaggttctgagctgattccacttgaacactgttggtctaagtgcatcacactagagggaattccctcgaaaaagaagaggtgaatataaaccaggattataagttaggcttgttac
gi|11 : g---------G-NGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGCA----------ACCAGAGCATC----------AG---TAT-ACAG-------AG--CC-T--TGTTGTTTAAAGCGTT---TT-------ACGAT-GATTTTCT-----------GGTG-GCTGTAGATGA-GACTTGGTTTTATC---------ATTA--TAAGC-C-AGA-G-AATAAACC-TCGG---TCG-TCAGTGGATAGGGCCTGGGTCCCTGT-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--A-TTACTGGT-AAGA-TGG-TGGCCA-CAGT-A-T-TAT-G-GTA--CGCAAA--AGGGGTTAT-TATATTG-G-AC-TTTTT-ATCAAG-TG-AAGTAC-----AA-CAACTGGAGTAGGCC-AGGGCAAAC-Taagtcgtaacggcagttgaggtgtgggtctgtggaaaggaccttgaccttttcagctctgggctgatagcacttgaacacagttgggttaagtgcatcacatttgagggcaattacattaaaaagcgagaggtgcatcataaccagaaatgggattggctggttgact
gi|12 : gGAAAT----C----A---------AGCAC--TC--GCC-TATGC-GCCT--GAGCCTGACTC-TA---C-A-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATAACTCCG-
gi|13 : agatgcacatgcagctggctaaagc---C--GAAACGAGTACGAGTTAATAC----A-TGTGTAATACCACA-TTCTGCC-TATTTTGCCT--GA-CGTAGCTCCTA--GCGA-CTTTTTCCTATTCCTAACTTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGATCTGACAAGGAAGTataaagttactgtattatatacggtcttacaatgaagtactagacggaagttaggagtgggtcaaatggaaagaacctgacaactcctccagttaagggctgatggtacaattgattcaccagttggggtcaatcgctccactaagaggtcaaattacatggataaaagaagaggggatctcaccggaaataagttcactgg
gi|14 : TGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--ACGA-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTTA-TTTCCGGTCTTAC---AAAGtgtgacggcagttgagaattggggcaatggaaaggatcctgactttttcagttttgggcacttgtacaccgttggtctaagtgcgtcacacgagagggcaatttcatcaaaaaagaagaggtggatcagttaggttggttacttattgacttgct
gi|15 : TACTG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATT-----CAAAT--GGTA--AAACG-GGCAAGAAAATCCACGGCGAGTTAGCGGATGTTTGTGGGTCTTCGGCACCAT-CTTATGTTCAGGTTAAATTGTGGGTAAGGGAAT-TCAAA-AG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAA----ATGA---AACCAGAC--CTA-GATGTCCACTGAATGTCAAAGATGA-G-GAAC--T--------GTGT---TA-GA-CTGTTC-GGG------------------TTCT-GATAAGCGAATTCAGGTGAAAGAA----TGAG-CGCAaagtcttgacggaagttaaggagtgggtcaatggaaagaaccctgacattttcagttaagggctgatggtatttgatcaccgttggtctaatcgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttagactggttacttatta
gi|16 : TTTATTT--------ATTAG-TGAGC-C-AGG-GGAATAAAGCCTCAGA-GT-A-TCA------AG----TGGGTCCCCGA-GT-CATTA---AA--GC-AGTTCCAAAAGTTGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CA-T-A-TATTT-GCGGA--TGCAAA--AGGCCTTAT-TA-GTT--G-AC-TTTT--CCCAAGAAG-AAGAGCAATA-AGCCGA--GGAGT-TACT-A-TG-AAACATAGC-T-GACCAGCTTGAGAA--CC
gi|17 : agatcgaaggttTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGCA----------ACCAGAGCATC----------AG---TAT-ACAG-------AG--CC-T--TGTTGTTTAAAGCGTT---TT-------ACGAT-GATTTTC
gi|18 : TGTTTATGGGTCTTCTGCACTAT-TTTATGCCCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGGAT-TCA---------------AA--CGTCT------AG----AC----------------------GCCCACTGGATGCCACCGACGA-A-GAAA--C--------GTGT---AA-GA-
gi|19 : -ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAAAT-ATGGTTAGT-GATGCAAAG--ATGTTTTTCATC--TAAA--GTT--G-------------------AGTACCG-CGCTATAATTTGGTACT
gi|2 : TCATGCTTTGTTTATAATACATGT------TTTATACC-GG-GTACAAAATTGT-C-ACGCGT-----ATT----GAGTCGATTCTTTAATAAGATTTCG---TATGTCAA-C-AT----AGTCGGTACAAAGGCATGCTGTTCATCGTTGAAACGTAGAA-------------------A-TATCGGTGCTATAATTCTGTATTTATATCTTAATCAAAA--GGTGTAAAAAA-A-CA-GGAAATACACGGCGAGTTAGCCAATGTGTATTGGT-TTCTGCG--ATACCTAT------------TTCTGGTT-GGGGAATATCAAA-AGACG---GTAGAA--CGGTTTTAGGAAGCATTACCAGGTAGTCAGGT--CTG-GACACTCACTGTATGCGA-CGACGACA-GAAATGT--------GTGT---AA-GA-AAGAT--GGG-ATCTTGGTG-T-----A-TCT-G-TAGGCGAA-----ATGG------------G-CGCAGGTATAGGACATTTCAA-AGTGATAT--------GCCAT--TG-CAACAATCTT-A-ACTG----GTTC--GTTTAGGTATGC-CAA-GCTAACAG-----------CCA-AAATTACTTTA--AGCGATTGACAAA-GGCAGAACCAGAGCA-------GTC----------GG---T-T-GCAG-------CG--TC-CAATGTTG----AAGCGTTG--TTAGGTGAAAAG---GGTTTTATTTTCGCG-TCTGATG-A---CAGATGA-GTCTTGGATTCATCC--------ATTA--TGAGC-CTAGA-A-AAT------------GT-----AGTGGGTAGGGCCTGGGT-CCCGA-TG-C--C----AC--GA-AGT-------GA--TAGCCA-----------C-A--G-TG----------------T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGTGCAT-TTTGA-CCCAAG-AG-AA-TACAAT--AA-TTGCTAGATTGA--T-A-TGAGAAT-TCAC----ATCG---TGAAAACGCCGAA-A---GT-------AAA-CGCC---TTA-A--G-TCA---CAGTAAAGGTAGTTGCC-TGA-CACA---GACAA-CGAG--AGAGT-CACACAA-T--GCAAAGTT-GCAAATGGAT---GCTA--TAAGAG---C--GAAACGGG------TT----C----A-T-------A--ACATTCCTGTC-TATT---CCG--AA----AG--CCTA--GCGA-CT--TTCCTCTTCCTTAACTTTGA-AAAA--GATA--CCCATTGGACAC---GTCA-TTTCCGG-CTGAC---GAAG
gi|20 : AAATTTGAG-AAAG--GACA--TCCG-TGG--AC---ATCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|21 : -ATTCTTTGATAAGATATTG---AATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTTTCaagttgtgacggcagttcaggagtga
gi|22 : tg-ATTCTTTGATAAGATATTG----ATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTT
gi|23 : ---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGATA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----at
gi|3 : GAGA-CGGTCAC-AATTTCCATGCCTTGTTT-CAATACATGTGGTAGTATTATACCAGG-GTACAAAATTATA--ATATATCGACTATCCCAGGAGTC-ATTCTTTAATA-GATATCA---AAAGTCAAAC-ATGGCTACT-GATGCAAAGGCATGCTTTTCATT--T-AA--GTTAAG-------------------AGC-CCG-TGTTATAATTCGGTACTTGT-TTT----TAAAA--GGTA--AAACATA-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAACCAATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAC-CTTATGCTCAGGTTAATTT---GGTAAGGAAAT-TCAAC-CG-CG---GTAGAA--CATCTTTA-GAAG----GTGA---AGCCAAACTGCTG-GACGTCCACTGGATGCCATCGACGA-A-GAAA--A--------GTGC---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TAGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTTAGGTGGAAGAA----ATAA-CGCAGGCATTAGACATTTTAC-A-CGGTA---------G-CAT--TT-CAACAATTTT-A-CGTG----A-TC--GTTGGGGTATGCGCAA-GCTAACATTCCGTTGGGTCCCA-AAATTCTTT----AGCGATGAGCA----GCA-------------------TC----------AG---TAT-GCAG-------CG--CC-T--TGATG----AAGAGTT---TTCGGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGATG-ATAGTAGATGA-GACTTGGGTTCATTGAACAAAACATTA--CGAGC-C-AGA-G-AATAAAGA-TCAGA-GTCG-TCATTGGATAGGATCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---TAGACACTATCA--T-CTGCTGGC-AAGG-AGA-TGGTCA-CAGT-G-T-TTG-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTGT-CATGTTG-G-ACTTTTTA-CCCAAG-AG-AAGTACAATAGAA-TAACTGGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-CGAGAA--CCGCC-ATCCGTGA----ACAA-CGCCGAGGTA-A--A--CT---C--TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGGCAA-TGCG--AGAAT-C-CACATTT--GCAAAGTT-GC-AACGG----AG---------AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ATCACA-TCCTGCC-CACTC-GCCC--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CCTCTTCCTATTTCCAAATTTGGA-ATAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAA---GAAGTct
gi|4 : acaCTGGACGCCAGGAACGA-A-GCAA--A--------CTGTTCCAA-GAGAAGTTTAGGG-ACC-TGGTAGT-----A-TCG-GATAGGTGAAT-CAGA---ACGGA----ACA--TGCAG-CATTA-ACATTGCAC-A-TTGTAA--------G-CGTCGTTATAACAACCCT-AACATA----T-AC--GTTTAG--AAGCGCAACGCTAACAGCCCACTGGGTCCCCCAAATCCCTTCTATATTGAC-AGCAAATGGCA----------A-------ACCCAGAGCATCCAG---TATTGCAT-------CG--CCAT--TGTTG----AACCAATAGAGC-AGTCAAAAGATCGATTTC--TTT-AAG-CCT--TG-GT-----AT----ACTTGAGTTCATT------------A--TGAGC-C-AAA-T-AATAA-GC-TCAGAAGTCGATCA-TGG-TAGG-CTTGGATCCCCGAAGG-C--CA---AA--GACAGTTC---AA-ACGCAACCAATT-CTG-TAGC-AATG-TGA-TGGCCA-AGGT-ACT-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGAC------TATGTTG-G-AC-TT-----CCAAA-AGCAAGTACAATA-G-----CTG-AG----CT-A----GAAG-TTGC-TAGGTCAGC-TGA-AA--CCGCCCATT-GTGGCGACAAGA-CGCCGGGGAA-A--C-TCT---T--TAAAG---TTTTGCATGC-AACAAAGAACAAACGCA--AGATT-C-ACCACTTATGCAAGTTT-GC-AATG-ATGTTGTTA--G---AG---C--GAGACAGATATGCATT----A----A-T-------AATACA-TCCTGCCTTATTC-GCCT---A-CCTAGAT-CTA--GCGA-CTT-TTGGTATTCCC-AACTTGAACAAAG----TA--TCCA-T-G--AC---ATCATTTTCTTGT-TGAC---GAAGg
gi|5 : --------ATTA--TGA-C-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGAAGTCA-TCAGTGGGT----------CCCCCGA-GTTC--CATT-AA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTG-TGGC-AAGAATGAATGGTCAACACTTA-T-TTTTG-GGAAATGCAAA--AGGCCTTATGTATGTTG-G-AC-TTTTTTCCCAAG-AG-AG----AGCA-AA-TAATTGGAGTTAACTGA-TGCAAAC-TAGCCTAGACCAGC-TGAGAA--CCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCGAGGTA-AACA-TCTTTCC--TAAATGT-TTTTGC-TGTAAAAA--GGACAACCGTGGAATAGTCC-CACACTT--GCAAAGTTGGC-AATGGATT--G-TG--T---AGAAAC--AAAACGAGTATGAATTA---C----AGTAA-----ACCACA-T-CTGCC-TATTC-GCCCTGGA-CCTCGCTCCTAGTGCGACCTTCTTCCTATTCCCAAACTTG-A-AAAG--GAAA--CCCA-TGattatgacgcgagttcaggagtaggacatatgaaaccctggatttttcattgtgggatgatgatggcacgtggaaatagttgttgtctgaagggtgcatcacactagaggcaattacatgaaaagaaagtagatctcaatggaaatagttaaggctggttaattattga
gi|6 : ttatTTATT---------ATTA--TGAGC-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCA-TCAGTGGGT-----------CCCCGA-GT-C--CATTAAA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CATT-A-T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCATTAT-TATGTTG-G-ACTTTTTA-CCCAAG-AG-AAGAGC-----AA-TAATTGGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TAGC-TAGACCAGC-TGAGAA--CCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCGAGGTA-A--ACTCT---C--TAAATGTGTTTTGC-TGT-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GTAAAGTT-GC-AATGGAT---GTTGTAT---AA---C--AAAACAGGTATGAATTA---CAGTAA-C-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTCGCTCCCA--GTGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GAAA--CCCA-TGatggtctagttgaggagtgggttctatggaaaggaccctaaatttttcagttttctggctgttggcacttcaaccccgctaattgaattggctaagtcatcacacctagaggccgattacatcaaaggaagaagaggtggaatctcaactgaaataagtcaggctggtta
gi|7 : CG-TGCTATAATTCGGCACTTATATTT----TAAAATAGGCATTAAAC----CAAGAAAATACACGGCAAGTTAGC-GGTGTTCATGGATCTTCTGCACCAT-CTTAGTCTCAGGTGAAATTCTAGGTAGGGAAAT-TCAAC-CG-TG---GTAGAA--CGTCGTAA-GAAG----ATGA---AGCCAGGT--CTG-GA-----------TGCCACCGACGA-A-GAAA--TGTGTAAATGTGT---AA-GA-AAGTTA-GGT-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GAAAGGGAAATACAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGTCATTAAGCATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATATT-G-CATG----A-CC--GTTTAGGTA----CA----------CCCGTTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGGGATGAGCAAATGGCA----------ACCAGAACATT----------AG---TAT-GCAG-------CG--GC-T--TGTTG----AAGCGTT---TTAGGTCAAAATAT-TATTTT-TTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GATTTGGATTCA-TG--------ATTA--TGAGA-A-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-ATCG-TCAGTGGGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGATGCAACCA--T-CAGCTGatggtctagttgaggagtgggtctatggaaaggaccctaaatttttcagttctaggctgtggcacttcaacactgctaatttgaattggtctaagtgcatcacactagaggccgattacatcaaaaaagaagaggtggatctcaactggaaataagtcaggctggtt
gi|8 : aa-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACACAACCA--T-CCACTGGC-AAGA-TGA-TGGCCA-CAG-----------------------------------TATATTG-G-G------A-CGCAA-----AAGTACAATA-AA-T---TG-AGTGAACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGATCAGC-TGAGAA--CAGAC-ATCCATGA----AAAA-CGCCGAGGTA-A--ACTCT---C--TATAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGAG--AGAGT-C-CGCA-----------TT-GC-AATGGAT---GCTG--TAG-AG---C--AAAACGGGTATGAATT----A----A-C-------ACCATA-TCCTGTC-TATTC-GTCT----------CTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATT-CCAAACTTCAA-AATG--GATA--TATG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTAAC---GAAG
gi|9 : AATCTCAAGTCG-CGTAGGTAGAGACCGTCGTAA-GAGG----ATGA---AGCCAGGT--CTGAGAGGGACA---GACGTTGACGACCA-TTGTAA--T--------G-GT---AAAGAGAAATTA-GAGTGTCGTGGTA-GCAGCAACCCTTGAAAGG--AATACAG-TAGAAGAATGAAATAGCCGCAGTCATAAGTCAATCCACAA-TGCTA---------A-GGC--TT-TCACAATATTAG-CATGAAAAG-ACCGGTCTA-ATAGGTGCAG-ACGACCAGCGTATC--GTTTCC-AAAT-CCTT----AG-G--GAACAAATGGCAACC-------A-------GAC----------AT---TAG-AC-G-------CG--GC-T--TGGTG----AAGCGTT---TT-AGT--AAATAT-TATTTT-TTTT-GCGCTCTGGTGAATTGTAGATGATGATTT-GATTC--TG--------ATTACTCAAGA-A-AGATG-AATAACGC-TATGATATCG-TCAGT-GGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAGGGA-AGTTC---AAGATGCA--CA--TGCAGCTGGCTAAAG-CGA-aactcgtaacggcagttgaggagtgggcaacggaaaggactctgatttttttttttttagttctggatgatgacactcgaacaagtgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttaggctggttacttattgattcgcc
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 22222 1 1 777777777777777777777 1111 1111 11 1111 99999999999999999999999999 222222 11 444444444444 1 111 111 1111 111 22222222222 1 1111111 1111 1 333333333 1111111111 1111 2222 2222 2222222 1 111 222222222 11 111 11111 111 44444444444444 1111 111111111111111 1 333333333 3333333333333333333
lowQualScore : 5 5 1 3 7 0 77777 3 3 444444444444444444444 0000 0 5555 1 6 33 0 9999 44444444444444444444444444 0 6 0 444444 11 444444444444 5 6 2 2 1 222 5 000 77 1 5 2222 0 000 77 5 6 1 5 666 44444444444 777 4 8 99 5 0 4444444 4 5 1 6 0 0000 3 5 6 3 3 444444444 5 77 5 888 7777777777 2 3 44 5 1 2 1 5 7777 1 3 0 66 66 5 4444 888 5 888 5 5 66 1111 9999999 5 5 1 5 5 333 5 3 666666666 4 55 4 4 4 4 0 4 55 1 4 2 7 666666 4 3 55 111 6666 666 1 6666 1 4 4 4 4 22222 4 4 4 66 66 0 8 4 4 4 4 888 4 4 1 4 66666666666666 4 66 1 4 1 5 8 66 5 0000 5 5 5 999999999999999 1 5 5 66 0 66 5 5 77777 5 5 222222222 777 66 7777777777777777777 1 4 3 3 777 3 55 3 3 44 44 3 66 777 4 777
lowQualScore : . . . . . . ..... . . ..................... .... . .... . . .. . .... .......................... . . . ...... .. ............ . . . . . ... . ... .. . . .... . ... .. . . . . ... ........... ... . . .. . . ....... . . . . . .... . . . . . ......... . .. . ... .......... . . .. . . . . . .... . . . .. .. . .... ... . ... . . .. .... ....... . . . . . ... . . ......... . .. . . . . . . .. . . . . ...... . . .. ... .... ... . .... . . . . . ..... . . . .. .. . . . . . . ... . . . . .............. . .. . . . . . .. . .... . . . ............... . . . .. . .. . . ..... . . ......... ... .. ................... . . . . ... . .. . . .. .. . .. ... . ...
lowQualScore : 5 0 0 3 3 7 77777 3 3 777777777777777777777 7777 7 2222 7 7 33 3 8888 55555555555555555555555555 8 7 8 222222 00 444444444444 0 7 5 5 4 111 7 000 99 9 7 1111 7 000 99 7 6 7 9 111 44444444444 888 4 9 55 0 0 5555555 5 0 4 6 2 6666 0 7 7 7 3 333333333 7 99 7 000 2222222222 5 4 55 0 4 5 1 0 5555 4 6 1 99 99 0 4444 888 0 888 0 0 99 2222 0000000 6 0 9 7 7 111 7 0 777777777 0 55 0 0 0 0 7 0 22 6 0 5 3 222222 0 6 00 444 2222 444 8 5555 4 0 0 0 4 77777 4 4 4 11 11 1 4 4 4 4 4 222 4 4 1 4 44444444444444 4 22 1 4 0 0 9 44 0 6666 0 0 0 999999999999999 4 0 0 99 0 99 0 0 44444 0 0 444444444 888 11 4444444444444444444 6 0 6 6 000 6 00 6 3 66 66 3 11 888 4 888
consensus : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-G---AT-C---GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACC-GTGCTATAATTCGGTACTTGTATT----TCAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAGC-GCAGGCATTAGACATTCCACA-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAG-AGC-GT---C-AG---TAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGCGTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTGA-TTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA-T--GAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAG--A-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-AAGTACAATA-AA-T-ACTGGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
Reference ( family-2589 ) : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGTGG---ATCC---GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACC-GTGCTATAATTCGGTACTTGTATT----TCAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAGC-GCAGGCATTAGACATTCCACA-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAG-A-C-GT---C-AG---TAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGCGTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTGA-TTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA-T--GAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAG--A-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-AAGTACAATA-AA-TAACTGGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TNGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGTTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
gi|1 : GAGAATAGTTACGAATGTTCTTGCCTTGTTT-CAA-ATGTATG--AATTTTATCCT-GATGTAAAAAGTTGCGCCACGCATAG---A-AC---GA----ATTCTTTACTAAGATATTGTTTAATGTGGAACTATGGCTAGA-GA-GCAAAGGCATGATTTCCATC--TGAAAAGATGCGCACCGGTGCTATCAATTCAAGTACT-GTGCTACAATTCAGTACTTGTATT----T-AAAA--GG-------------AAAGAAACACATGGCGTGTTGGCCGATATTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTTTGCTCAGGATAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TTAAA-TG-CG---ACAAAA--TGTTTTTA-GAAG----ACGA---CGTAGAGT--CCG-GACGCCCACTAGATGCCACCGACAA-A-GAAA--T--------ATGT---AA-GA-AAGTGC-GAT-ATC-TGGTA-T-----ACTTT-GACAGGCGAATTCTGGTGGAAGAA----ATACT-GCAGGCATTAAATAATCTACA-TGGTACAAAAAGTAG-CGT--TT-CAACTATCTT-A-CATG----A-T---GTTAAGGTATGTGCAA-GCTCACAGACCGCTGCCTTTCT-AAATCCCTC----GACGATGAGCAAATGGC--AA--CCAG-A-A-GTATGC-AGAAGTAT-GCGGTCCA-T--TGTTG----GAGCGGTG--TC-GGTCAAAAGAT-GGTTTTCGTTT-GCC-TCTGGTGA-CTGTAGATGA-CACTTGTATTCATTG---------TTA-T--GAACAC-A-A-G-AATAAAGC-TCAT---TTG-ACAGTGGAT-GGGCCCGGGTCCCCAA-GT-G--CA---AAG--A-AGGTA---AAGGCGCAACCA--T-CTTCAGTC-AAGG-TCA-TGACCA-CACT-A-T-TTT-A-GGA--CGCAAATCAG---TTAT-TTTGTTG-G-AC-TTTT-AACCCAAG-AA-AAGTACAATA-A-----CTG-----CAAT-A-TGCA--C-TTTT-TAAACTTCC-T---AACC--C-ATCCGTTA----AAAA-TACTA-AGTTAACC-TC------T---G----TAAATGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAC-CGCG--ATAGT-T-CAAAACT--GCAAAAGT-GC-AATGGATGTTG--T---AG---CATGAAACAGGTATGAATT----A----A-T-------ACTACA-TCCCGCT-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GTGA-CTTCTTCCTATCCCCAAACTTAAA-AAAAATGATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAA
gi|10 : atgGC-TGAGAACCGCC-ATCTGTGA----AAAAACGCCG-TGGTAGAA-TC------T---C----TCAAGGTGTATTTT-TGC-AACA--GGACGA-CGCG--AAAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGC--------------------CGGATATAAATT----A----A-T-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-ACGT--AA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTGTTCTCAAATTTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TCC--ACGGGGTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAAGaaagtcctgacggtagttgaggagtgggtcaatgtaaagggccctgacattttaggttctgagctgattccacttgaacactgttggtctaagtgcatcacactagagggaattccctcgaaaaagaagaggtgaatataaaccaggattataagttaggcttgttac
gi|11 : g---------G-NGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAG-AGC-AT---C-AG---TAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGCGTT---TT-------ACGAT-GATTTTCT-----------GGTGG-CTGTAGATGA-GACTTGGTTTTATC---------ATTA-T--AAGC-C-AGA-G-AATAAACC-TCGG---TCG-TCAGTGGATAGGGCCTGGGTCCCTGT-GG-C--CA---AAG--A-AGTTC---AAGACGCAACCA--A-TTACTGGT-AAGA-TGG-TGGCCA-CAGT-A-T-TAT-G-GTA--CGCAAA--AGGGGTTAT-TATATTG-G-AC-TTTT-T-ATCAAG-TG-AAGTAC-----AA-CAACTGGAGTAGGCC-AGGGCAAAC-Taagtcgtaacggcagttgaggtgtgggtctgtggaaaggaccttgaccttttcagctctgggctgatagcacttgaacacagttgggttaagtgcatcacatttgagggcaattacattaaaaagcgagaggtgcatcataaccagaaatgggattggctggttgact
gi|12 : gGAAAT----C----A---------AGCAC--TC--GCC-TATGC-GCCT--GAGCCTGACTC-TA---C-A-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATAACTCCG-
gi|13 : agatgcacatgcagctggctaaagc---C--GAAACGAGTACGAGTTAATAC----A-TGTGTAATACCACA-TTCTGCC-TATTTTGCCT--GA-CGTAGCTCCTA--GCGA-CTTTTTCCTATTCCTAACTTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGATCTGACAAGGAAGTataaagttactgtattatatacggtcttacaatgaagtactagacggaagttaggagtgggtcaaatggaaagaacctgacaactcctccagttaagggctgatggtacaattgattcaccagttggggtcaatcgctccactaagaggtcaaattacatggataaaagaagaggggatctcaccggaaataagttcactgg
gi|14 : TGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--ACGA-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTTA-TTTCCGGTCTTAC---AAAGtgtgacggcagttgagaattggggcaatggaaaggatcctgactttttcagttttgggcacttgtacaccgttggtctaagtgcgtcacacgagagggcaatttcatcaaaaaagaagaggtggatcagttaggttggttacttattgacttgct
gi|15 : TACT-GTGCTATAATTCGGTACTTGTATT-----CAAAT--GGTA--AAACG-GGCAAGAAAATCCACGGCGAGTTAGCGGATGTTTGTGGGTCTTCGGCACCAT-CTTATGTTCAGGTTAAATTGTGGGTAAGGGAAT-TCAAA-AG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAA----ATGA---AACCAGAC--CTA-GATGTCCACTGAATGTCAAAGATGA-G-GAAC--T--------GTGT---TA-GA-CTGTTC-GGG------------------TTCT-GATAAGCGAATTCAGGTGAAAGAA----TGAGC-GCAaagtcttgacggaagttaaggagtgggtcaatggaaagaaccctgacattttcagttaagggctgatggtatttgatcaccgttggtctaatcgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttagactggttacttatta
gi|16 : TTTATTT--------ATTAGT--GAGC-C-AGG-GGAATAAAGCCTCAGA-GT-A-TCA------AG----TGGGTCCCCGA-GT-CATTA---AAG--C-AGTTCCAAAAGTTGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CA-T-A-TATTT-GCGGA--TGCAAA--AGGCCTTAT-TA-GTT--G-AC-TTTT---CCCAAGAAG-AAGAGCAATA-AGCCGA--GGAGT-TACT-A-TG-AAACATAGC-T-GACCAGCTTGAGAACC
gi|17 : agatcgaaggttTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAG-AGC-AT---C-AG---TAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGCGTT---TT-------ACGAT-GATTTTC
gi|18 : TGTTTATGGGTCTTCTGCACTAT-TTTATGCCCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGGAT-TCA---------------AA--CGTCT------AG----AC----------------------GCCCACTGGATGCCACCGACGA-A-GAAA--C--------GTGT---AA-GA-
gi|19 : -ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAAAT-ATGGTTAGT-GATGCAAAG--ATGTTTTTCATC--T-AAA-GTT--G-------------------AGTACC-GCGCTATAATTTGGTACT
gi|2 : TCATGCTTTGTTTATAATACATGT------TTTATACC-GG-GTACAAAATTGT-C-ACGCGT-----AT-T---GAGTCGATTCTTTAATAAGATTTCG---TATGTC-AAC-A----TAGTCGGTACAAAGGCATGCTGTTCATCGTTGAAACGTAGA--------------------AATATCGGTGCTATAATTCTGTATTTATATCTTAATCAAAA--GGTGT-AAAAA-A-ACAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCAATGTGTATTGGT-TTCTGCG--ATACCTAT------------TTCTGGTT-GGGGAATATCAAA-AGACG---GTAGAA--CGGTTTTAGGAAGCATTACCAGGTAGTCAGGT--CTG-GACACTCACTGTATGCGA-CGACGACA-GAAATGT--------GTGT---AA-GA-AAGAT--GGG-ATCTTGGTG-T-----A-TCT-G-TAGGCGAA-----ATGG------------GC-GCAGGTATAGGACATTTCAAAGTGATAT--------GCCAT--TG-CAACAATCTT-A-ACTG----GTTC--GTTTAGGTATGC-CAA-GCTAACAG-----------CCA-AAATTACTTTA--AGCGATTGACAAA-GGCAGAA--CCAG-AGCAGT---C-GG---T-T-GCAGCGTC-CAATGTTG----AAGCGTTG--TTAGGTGAAAAG---GGTTTTATTTTCGCG-TCTGATGA----CAGATGA-GTCTTGGATTCATCC--------ATTA-T--GAGC-CTAGA-A-AAT------------GT-----AGTGGGTAGGGCCTGGGT-CCCGA-TG-C--C----ACG--A-AGT-------GA--TAGCCA-----------C-A--G-TG----------------T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGTGCAT-TTTG-A-CCCAAG-AG-AA-TACAATA-A----------------------------TTGC-TAGATTGATATGAGAATTCAC-AT-CGTG-----AAAA-CGCCGAAAGTAAAC-GCCTTAAGT---CACAGTAAAGGTAGTTGCC-TGA-CACA---GACAA-CGAG--AGAGT-CACACAA-T--GCAAAGTT-GCAAATGGATGCTA--TAAGAG---C--GAAACGGG------TT----C----A-T-------A--ACATTCCTGTC-TATT---CCG--AA----AG--CCTA--GCGA-CT--TTCCTCTTCCTTAACTTTGA-AAAA--GATA--CCCATTGGACAC---GTCA-TTTCCGG-CTGAC---GAAG
gi|20 : AAATTTGAG-AAAG--GACA--TCCG-TGG--AC---ATCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|21 : -ATTCTTTGATAAGATATTG---AATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTTTCaagttgtgacggcagttcaggagtga
gi|22 : tg-ATTCTTTGATAAGATATTG----ATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTT
gi|23 : ---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGATA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----at
gi|3 : GAGA-CGGTCAC-AATTTCCATGCCTTGTTT-CAATACATGTGGTAGTATTATACCAGG-GTACAAAATTATA--ATATATCGACTATCCCAGGAGTC-ATTCTTTAAT-AGATATCA---AAAGTCAAAC-ATGGCTACT-GATGCAAAGGCATGCTTTTCATT--T--AA-GTTAAG-------------------AGC-CC-GTGTTATAATTCGGTACTTGT-TT----TTAAAA--GGTA--AAACATA-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAACCAATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAC-CTTATGCTCAGGTTAATTT---GGTAAGGAAAT-TCAAC-CG-CG---GTAGAA--CATCTTTA-GAAG----GTGA---AGCCAAACTGCTG-GACGTCCACTGGATGCCATCGACGA-A-GAAA--A--------GTGC---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TAGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTTAGGTGGAAGAA----ATAAC-GCAGGCATTAGACATTTTACA-CGGTA---------G-CAT--TT-CAACAATTTT-A-CGTG----A-TC--GTTGGGGTATGCGCAA-GCTAACATTCCGTTGGGTCCCA-AAATTCTTT----AGCGATGAGCA----GC--A-------------T---C-AG---TAT-GCAGCGCC-T--TGATG----AAGAGTT---TTCGGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGATGA-TAGTAGATGA-GACTTGGGTTCATTGAACAAAACATTA-C--GAGC-C-AGA-G-AATAAAGA-TCAGA-GTCG-TCATTGGATAGGATCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAG--A-AGTTC---TAGACACTATCA--T-CTGCTGGC-AAGG-AGA-TGGTCA-CAGT-G-T-TTG-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTGT-CATGTTG-G-ACTTTTT-A-CCCAAG-AG-AAGTACAATAGAA-TAACTGGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-CGAGAACCGCC-ATCCGTGA----ACAA-CGCCG-AGGTAAA---C------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGGCAA-TGCG--AGAAT-C-CACATTT--GCAAAGTT-GC-AACGGA-G---------AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ATCACA-TCCTGCC-CACTC-GCCC--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CCTCTTCCTATTTCCAAATTTGGA-ATAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAA---GAAGTct
gi|4 : acaCTGGACGCCAGGAACGA-A-GCAA--A--------CTGTTCCAA-GAGAAGTTTAGGG-ACC-TGGTAGT-----A-TCG-GATAGGTGAAT-CAGA---ACGGA----ACA-T-GCAG-CATTA-ACATTGCACA-TTGTAA--------G-CGTCGTTATAACAACCCT-AACATA----T-AC--GTTTAG--AAGCGCAACGCTAACAGCCCACTGGGTCCCCCAAATCCCTTCTATATTGAC-AGCAAATGGC--AAACCCAG-AGC-AT---CCAG---TATTGCATCGCCAT--TGTTG----AACCAATAGAGC-AGTCAAAAGATCGATTTC--TTT-AAG-CCT--TGG-T-----AT----ACTTGAGTTCATT------------A-T--GAGC-C-AAA-T-AATAA-GC-TCAGAAGTCGATCA-TGG-TAGG-CTTGGATCCCCGAAGG-C--CA---AAG--ACAGTTC---AA-ACGCAACCAATT-CTG-TAGC-AATG-TGA-TGGCCA-AGGT-ACT-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGAC------TATGTTG-G-AC-TT------CCAAA-AGCAAGTACAATA-G-----CTG-AG----CT-A----GAAG-TTGC-TAGGTCAGC-TGA-AACCGCCCATT-GTGGCGACAAGA-CGCCG-GGG-AAAC-TC------T---T----TAAAG---TTTTGCATGC-AACAAAGAACAAACGCA--AGATT-C-ACCACTTATGCAAGTTT-GC-AATG-ATGTTG--TTAGAG---C--GAGACAGATATGCATT----A----A-T-------AATACA-TCCTGCCTTATTC-GCCT---A-CCTAGAT-CTA--GCGA-CTT-TTGGTATTCCC-AACTTGAACAAAG----TA--TCCA-T-G--AC---ATCATTTTCTTGT-TGAC---GAAGg
gi|5 : --------ATTA-T--GA-C-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGAAGTCA-TCAGTGGGT----------CCCCCGA-GTTC--CATT-AAG--C-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTG-TGGC-AAGAATGAATGGTCAACACTTA-T-TTTTG-GGAAATGCAAA--AGGCCTTATGTATGTTG-G-AC-TTTT-TTCCCAAG-AG-AG----AGCA-AA-TAATTGGAGTTAACTGA-TGCAAAC-TAGCCTAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAACATC------TTTCC----TAAATGT-TTTTGC-TGTAAAAA--GGACAACCGTGGAATAGTCC-CACACTT--GCAAAGTTGGC-AATGGATTGTG--T---AGAAAC--AAAACGAGTATGAATTA---C----AGTAA-----ACCACA-T-CTGCC-TATTC-GCCCTGGA-CCTCGCTCCTAGTGCGACCTTCTTCCTATTCCCAAACTTG-A-AAAG--GAAA--CCCA-TGattatgacgcgagttcaggagtaggacatatgaaaccctggatttttcattgtgggatgatgatggcacgtggaaatagttgttgtctgaagggtgcatcacactagaggcaattacatgaaaagaaagtagatctcaatggaaatagttaaggctggttaattattga
gi|6 : ttatTTATT---------ATTA-T--GAGC-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCA-TCAGTGGGT-----------CCCCGA-GT-C--CATTAAAG--C-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CATT-A-T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCATTAT-TATGTTG-G-AC-TTTTTA-CCCAAG-AG-AAGAGCAATA-A-----TTGGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TAGC-TAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAATGTGTTTTGC-TGT-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GTAAAGTT-GC-AATGGATGTTGTAT---AA---C--AAAACAGGTATGAATTA---CAGTAA-C-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTCGCTCCCA--GTGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GAAA--CCCA-TGatggtctagttgaggagtgggttctatggaaaggaccctaaatttttcagttttctggctgttggcacttcaaccccgctaattgaattggctaagtcatcacacctagaggccgattacatcaaaggaagaagaggtggaatctcaactgaaataagtcaggctggtta
gi|7 : C-GTGCTATAATTCGGCACTTATATT----TTAAAATAGGCATTAAAC----CAAGAAAATACACGGCAAGTTAGC-GGTGTTCATGGATCTTCTGCACCAT-CTTAGTCTCAGGTGAAATTCTAGGTAGGGAAAT-TCAAC-CG-TG---GTAGAA--CGTCGTAA-GAAG----ATGA---AGCCAGGT--CTG-GA-----------TGCCACCGACGA-A-GAAA--TGTGTAAATGTGT---AA-GA-AAGTTA-GGT-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GAAAGGGAAATACAGGTGGAAGAA----ATAGC-GCAGTCATTAAGCATTCCACA-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATATT-G-CATG----A-CC--GTTTAGGTA----CA----------CCCGTTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGGGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGAA-C-AT---T-AG---TAT-GCAGCGGC-T--TGTTG----AAGCGTT---TTAGGTCAAAATAT-TATTTT-TTTT-GCG-TCTGGTGA-TTGTAGATGA-GATTTGGATTCA-TG--------ATTA-T--GAGA-A-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-ATCG-TCAGTGGGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAG--A-AGTTC---AAGATGCAACCA--T-CAGCTGatggtctagttgaggagtgggtctatggaaaggaccctaaatttttcagttctaggctgtggcacttcaacactgctaatttgaattggtctaagtgcatcacactagaggccgattacatcaaaaaagaagaggtggatctcaactggaaataagtcaggctggtt
gi|8 : aa-C--CA---AAG--A-AGTTC---AAGACACAACCA--T-CCACTGGC-AAGA-TGA-TGGCCA-CAG-----------------------------------TATATTG-G-G-------A-CGCAA-----AAGTACAATA-AA-T---TG-AGTGAACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGATCAGC-TGAGAACAGAC-ATCCATGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TATAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGAG--AGAGT-C-CGCA-----------TT-GC-AATGGATGCTG--TAG-AG---C--AAAACGGGTATGAATT----A----A-C-------ACCATA-TCCTGTC-TATTC-GTCT----------CTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATT-CCAAACTTCAA-AATG--GATA--TATG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTAAC---GAAG
gi|9 : AATCTCAAGTCG-CGTAGGTAGAGACCGTCGTAA-GAGG----ATGA---AGCCAGGT--CTGAGAGGGACA---GACGTTGACGACCA-TTGTAA--T--------G-GT---AAAGAGAAATTA-GAGTGTCGTGGTA-GCAGCAACCCTTGAAAGG--AATACAG-TAGAAGAATGAAATAGCCGCAGTCATAAGTCAATCCACAATGCTA---------A-GGC--TT-TCACAATATTAG-CATGAAAAG-ACCGGTCTAA-TAGGTGCAG-ACGACCAGCGTATCG--TTTCC-AAATCC-TT----AG-G--GAACAAATGGC--AA--CCAG-A-C-AT---T-AG----AC-GCGGC----T--TGGTG----AAGCGTT---TT-AGT--AAATAT-TATTTT-TTTT-GCGCTCTGGTGAATTGTAGATGATGATTTG-ATTC--TG--------ATTA-CTCAAGA-A-AGATG-AATAACGC-TATGATATCG-TCAGTGG-TAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAGGGA-AGTTC---AAGATGCA--CA--TGCAGCTGGCTAAAG-CGA-aactcgtaacggcagttgaggagtgggcaacggaaaggactctgatttttttttttttagttctggatgatgacactcgaacaagtgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttaggctggttacttattgattcgcc
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 22222 1 1 777777777777777777777 1111 1111 11 1111 88888888888888888888888888 222222 11 444444444444 1 111 111 1111 111 22222222222 1 1111111 111111111 333333333 1111111111 1111 11111 2222 2222222 1 222222222 11 111 11111 111 444444 111 1111 111111111111111 11 333333333 3333333333333333333
lowQualScore : 5 5 1 3 7 0 77777 3 3 111111111111111111111 0000 0 5555 7 6 33 0 9999 66666666666666666666666666 2 0 6 0 444444 11 444444444444 5 6 2 2 1 222 5 000 77 1 5 2222 0 000 77 5 6 1 5 666 44444444444 777 4 8 99 5 0 4444444 4 5 1 6 0 111111111 6 3 6 6 444444444 5 77 5 888 7777777777 3 44 5 1 1 5 4 7777 1 3 0 66 66 22222 99 5 5 4 5 66 1111 9999999 5 5 1 5 5 8888 5 666666666 99 4 4 4 4 0 4 55 1 4 2 2 666666 4 3 55 111 55 3 666 1 6666 1 4 4 4 4 22222 4 4 4 66 66 0 8 4 4 4 4 888 4 4 4 444444 6 444 4 66 1 4 0 5 4 66 5 0000 5 5 5 999999999999999 1 5 11 5 5 66 5 5 77777 5 5 222222222 777 66 1111111111111111111 777 4 3 3 3 777 3 55 3 3 44 44 3 66 777 4 777
lowQualScore : . . . . . . ..... . . ..................... .... . .... . . .. . .... .......................... . . . . ...... .. ............ . . . . . ... . ... .. . . .... . ... .. . . . . ... ........... ... . . .. . . ....... . . . . . ......... . . . . ......... . .. . ... .......... . .. . . . . . .... . . . .. .. ..... .. . . . . .. .... ....... . . . . . .... . ......... .. . . . . . . .. . . . . ...... . . .. ... .. . ... . .... . . . . . ..... . . . .. .. . . . . . . ... . . . ...... . ... . .. . . . . . .. . .... . . . ............... . . .. . . .. . . ..... . . ......... ... .. ................... ... . . . . ... . .. . . .. .. . .. ... . ...
lowQualScore : 5 0 0 3 3 7 77777 3 3 777777777777777777777 7777 7 2222 8 7 33 3 8888 00000000000000000000000000 5 8 7 8 222222 00 444444444444 0 7 5 5 4 111 7 000 99 9 7 1111 7 000 99 7 6 7 9 111 44444444444 888 4 9 55 0 0 5555555 5 0 4 6 2 999999999 7 7 7 7 333333333 7 99 7 000 2222222222 4 55 0 4 1 0 2 5555 4 6 1 99 99 55555 00 0 0 5 0 99 2222 0000000 6 0 9 7 7 4444 7 777777777 55 0 0 0 0 7 0 22 6 0 5 3 222222 0 6 00 444 00 6 444 8 5555 4 0 0 0 4 77777 4 4 4 11 11 1 4 4 4 4 4 222 4 4 4 444444 7 333 4 22 1 4 8 0 4 44 0 6666 0 0 0 999999999999999 4 0 99 0 0 99 0 0 44444 0 0 000000000 888 11 9999999999999999999 111 0 2 6 6 000 6 00 6 3 66 66 3 11 888 4 888
consensus : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTT----CAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GC-ATC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGCGTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTACAATA-A----CTGGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGCAACA--GGACAA-C-GCG--AGAGTC-C-ACACTT--GCAAAGTTG-C-AATGGATGCTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------A--CCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTAG--CGAC-TTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
Reference ( family-2589 ) : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTT----CAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GC-GTC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGCGTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTACAATA-AAT-ACTGGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGCAACA--GGACAA-C-GCG--AGAGTC-C-ACACTT--GCAAAGTTG-C-AATGGATGCTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------A--CCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTAG--CGAC-TTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
gi|1 : GAGAATAGTTACGAATGTTCTTGCCTTGTTT-CAA-ATGTATG--AATTTTATCCT-GATGTAAAAAGTTGCGCCACGCATAGA---AC----GA----ATTCTTTACTAAGATATTGTTTAATGTGGAACTATGGCTAGA-GA-GCAAAGGCATGATTTCCATC--TGAAAAGATGCGCACCGGTGCTATCAATTCAAGTACTG-TGCTACAATTCAGTACTTGTATTT-----AAAA--GG-------------AAAGAAACACATGGCGTGTTGGCCGATATTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTTTGCTCAGGATAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TTAAA-TG-CG---ACAAAA--TGTTTTTA-GAAG----ACGA---CGTAGAGT--CCG-GACGCCCACTAGATGCCACCGACAA-A-GAAA--T--------ATGT---AA-GA-AAGTGC-GAT-ATC-TGGTA-T-----ACTTT-GACAGGCGAATTCTGGTGGAAGAA----ATAC-TGCAGGCATTAAATAATCTAC-A-TGGTACAAAAAGTAG-CGT--TT-CAACTATCTT-A-CATG----A-T---GTTAAGGTATGTGCAA-GCTCACAGACCGCTGCCTTTCT-AAATCCCTC----GACGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGAAGTATGC-AGA-AGTAT-GCGGTCCA-T--TGTTG----GAGCGGTG--TC-GGTCAAAAGAT-GGTTTTCGTTT-GCC-TCTGGTG-ACTGTAGATGA-CACTTGTATTCATTG---------TTA--TGAACAC-A-A-G-AATAAAGC-TCAT---TTG-ACAGTGGAT-GGGCCCGGGTCCCCAA-GT-G--CA---AA--GA-AGGTA---AAGGCGCAACCA--T-CTTCAGTC-AAGG-TCA-TGACCA-CACT-A-T-TTT-A-GGA--CGCAAATCAG---TTAT-TTTGTTG-G-AC-TTTT-AACCCAAG-AA-A-AGTACAATA-A----CTG-----CAAT-A-TGCA--C-TTTT-TAAACTTCC-T---AACC--C-ATCCGTTA----AAAA-TACTA-AGTTAACC-TC------T---G----TAAATGTGTTTTGC-TGCAACA--GGACAC-C-GCG--ATAGTT-C-AAAACT--GCAAAAGTG-C-AATGGATGTTG--T---AG---CATGAAACAGGTATGAATT----A----A-T-------A--CTACA-TCCCGCT-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTAG--TGAC-TTCTTCCTATCCCCAAACTTAAA-AAAAATGATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAA
gi|10 : atgGC-TGAGAACCGCC-ATCTGTGA----AAAAACGCCG-TGGTAGAA-TC------T---C----TCAAGGTGTATTTT-TGCAACA--GGACGA-C-GCG--AAAGTC-C-ACACTT--GCAAAGTTG-C-AATGGATGC--------------------CGGATATAAATT----A----A-T-------A--CCACA-TCTTGCC-TATTC-ACGT--AA-CCTAGCTCCTAG--CGAC-TTCTTCCTGTTCTCAAATTTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TCC--ACGGGGTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAAGaaagtcctgacggtagttgaggagtgggtcaatgtaaagggccctgacattttaggttctgagctgattccacttgaacactgttggtctaagtgcatcacactagagggaattccctcgaaaaagaagaggtgaatataaaccaggattataagttaggcttgttac
gi|11 : g---------G-NGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GC-ATC-AGTAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGCGTT---TT-------ACGAT-GATTTTCT-----------GGTG-GCTGTAGATGA-GACTTGGTTTTATC---------ATTA--TAAGC-C-AGA-G-AATAAACC-TCGG---TCG-TCAGTGGATAGGGCCTGGGTCCCTGT-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--A-TTACTGGT-AAGA-TGG-TGGCCA-CAGT-A-T-TAT-G-GTA--CGCAAA--AGGGGTTAT-TATATTG-G-AC-TTTT-T-ATCAAG-TG-A-AGTACAACA-----ACTGGAGTAGGCC-AGGGCAAAC-Taagtcgtaacggcagttgaggtgtgggtctgtggaaaggaccttgaccttttcagctctgggctgatagcacttgaacacagttgggttaagtgcatcacatttgagggcaattacattaaaaagcgagaggtgcatcataaccagaaatgggattggctggttgact
gi|12 : gGAAAT----C----A---------A--GCAC--TC--GCC-TATGC-GCCT--GAGCCTGACTC-TA---C-AT-TTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATAACTCCG-
gi|13 : agatgcacatgcagctggctaaagc---C--GAAACGAGTACGAGTTAATAC----A-TGTGTAATA--CCACA-TTCTGCC-TATTTTGCCT--GA-CGTAGCTCCTAG--CGAC-TTTTTCCTATTCCTAACTTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGATCTGACAAGGAAGTataaagttactgtattatatacggtcttacaatgaagtactagacggaagttaggagtgggtcaaatggaaagaacctgacaactcctccagttaagggctgatggtacaattgattcaccagttggggtcaatcgctccactaagaggtcaaattacatggataaaagaagaggggatctcaccggaaataagttcactgg
gi|14 : TGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTAA--CGAT-TTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTTA-TTTCCGGTCTTAC---AAAGtgtgacggcagttgagaattggggcaatggaaaggatcctgactttttcagttttgggcacttgtacaccgttggtctaagtgcgtcacacgagagggcaatttcatcaaaaaagaagaggtggatcagttaggttggttacttattgacttgct
gi|15 : TACTG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATT-----CAAAT--GGTA--AAACG-GGCAAGAAAATCCACGGCGAGTTAGCGGATGTTTGTGGGTCTTCGGCACCAT-CTTATGTTCAGGTTAAATTGTGGGTAAGGGAAT-TCAAA-AG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAA----ATGA---AACCAGAC--CTA-GATGTCCACTGAATGTCAAAGATGA-G-GAAC--T--------GTGT---TA-GA-CTGTTC-GGG------------------TTCT-GATAAGCGAATTCAGGTGAAAGAA----TGAG-CGCAaagtcttgacggaagttaaggagtgggtcaatggaaagaaccctgacattttcagttaagggctgatggtatttgatcaccgttggtctaatcgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttagactggttacttatta
gi|16 : TTTATTT--------ATTAG-TGAGC-C-AGG-GGAATAAAGCCTCAGA-GT-A-TCA------AG----TGGGTCCCCGA-GT-CATTA---AA--GC-AGTTCCAAAAGTTGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CA-T-A-TATTT-GCGGA--TGCAAA--AGGCCTTAT-TA-GTT--G-AC-TTTT---CCCAAGAAG-A-AGAGCAATA-AGC-CGAGGAGT-TACT-A-TG-AAACATAGC-T-GACCAGCTTGAGAACC
gi|17 : agatcgaaggttTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GC-ATC-AGTAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGCGTT---TT-------ACGAT-GATTTTC
gi|18 : TGTTTATGGGTCTTCTGCACTAT-TTTATGCCCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGGAT-TCA---------------AA--CGTCT------AG----AC----------------------GCCCACTGGATGCCACCGACGA-A-GAAA--C--------GTGT---AA-GA-
gi|19 : -ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAAAT-ATGGTTAGT-GATGCAAAG--ATGTTTTTCATC--T-AAA-GTT--G-------------------AGTACCG-CGCTATAATTTGGTACT
gi|2 : TCATGCTTTGTTTATAATACATGT------TTTATACC-GG-GTACAAAATTGT-C-ACGCGT--A---TT----GAGTCGATTCTTTAATAAGATTTCG---TATGTCAA-C-AT----AGTCGGTACAAAGGCATGCTGTTCATCGTTGAAACGTAGAA-------------------A-TATCGGTGCTATAATTCTGTATTTATATCTTAATCAAAA--GGTGT-AAAAA-A-ACAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCAATGTGTATTGGT-TTCTGCG--ATACCTAT------------TTCTGGTT-GGGGAATATCAAA-AGACG---GTAGAA--CGGTTTTAGGAAGCATTACCAGGTAGTCAGGT--CTG-GACACTCACTGTATGCGA-CGACGACA-GAAATGT--------GTGT---AA-GA-AAGAT--GGG-ATCTTGGTG-T-----A-TCT-G-TAGGCGAA-----ATGG------------G-CGCAGGTATAGGACATTTCAA-AGTGATAT--------GCCAT--TG-CAACAATCTT-A-ACTG----GTTC--GTTTAGGTATGC-CAA-GCTAACAG-----------CCA-AAATTACTTTA--AGCGATTGACAAA-GGCAGAA--CCAGA-----GCAGTC-GGT-T-GCAGCGTC-CAATGTTG----AAGCGTTG--TTAGGTGAAAAG---GGTTTTATTTTCGCG-TCTGATG-A---CAGATGA-GTCTTGGATTCATCC--------ATTA--TGAGC-CTAGA-A-AAT------------GT-----AGTGGGTAGGGCCTGGGT-CCCGA-TG-C--C----AC--GA-AGT-------GA--TAGCCA-----------C-A--G-TG----------------T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGTGCAT-TTTG-A-CCCAAG-AG-A-A-TACAATA-ATT-GCTAGA------------------TTGA-TA--------TGAGAATTCAC-AT-CGTG-----AAAA-CGCCGAAAGTAAAC-GCCTTAAGT---CACAGTAAAGGTAGTTGCC-TGACACA---GACAA-C-GAG--AGAGTCAC-ACAA-T--GCAAAGTTG-CAAATGGATGCTA--TAAGAG---C--GAAACGGG------TT----C----A-T-------A----ACATTCCTGTC-TATT---CCG--AA----AG--CCTAG--CGAC-T--TTCCTCTTCCTTAACTTTGA-AAAA--GATA--CCCATTGGACAC---GTCA-TTTCCGG-CTGAC---GAAG
gi|20 : AAATTTGAG-AAAG--GACA--TCCG-TGG--AC---ATCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|21 : -ATTCTTTGATAAGATATTG---AATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTTTCaagttgtgacggcagttcaggagtga
gi|22 : tg-ATTCTTTGATAAGATATTG----ATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTT
gi|23 : ---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGATA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----at
gi|3 : GAGA-CGGTCAC-AATTTCCATGCCTTGTTT-CAATACATGTGGTAGTATTATACCAGG-GTACAAAATTATA--ATATATCGACTATCCCAGGAGTC-ATTCTTTAATA-GATATCA---AAAGTCAAAC-ATGGCTACT-GATGCAAAGGCATGCTTTTCATT--T--AA-GTTAAG-------------------AGC-CCG-TGTTATAATTCGGTACTTGT-TTT----TAAAA--GGTA--AAACATA-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAACCAATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAC-CTTATGCTCAGGTTAATTT---GGTAAGGAAAT-TCAAC-CG-CG---GTAGAA--CATCTTTA-GAAG----GTGA---AGCCAAACTGCTG-GACGTCCACTGGATGCCATCGACGA-A-GAAA--A--------GTGC---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TAGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTTAGGTGGAAGAA----ATAA-CGCAGGCATTAGACATTTTAC-A-CGGTA---------G-CAT--TT-CAACAATTTT-A-CGTG----A-TC--GTTGGGGTATGCGCAA-GCTAACATTCCGTTGGGTCCCA-AAATTCTTT----AGCGATGAGC-----------------A-----GC-ATC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGATG----AAGAGTT---TTCGGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGATG-ATAGTAGATGA-GACTTGGGTTCATTGAACAAAACATTA--CGAGC-C-AGA-G-AATAAAGA-TCAGA-GTCG-TCATTGGATAGGATCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---TAGACACTATCA--T-CTGCTGGC-AAGG-AGA-TGGTCA-CAGT-G-T-TTG-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTGT-CATGTTG-G-ACTTTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTACAATAGAATAACTGGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-CGAGAACCGCC-ATCCGTGA----ACAA-CGCCG-AGGTAAA---C------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGCAACA--GGGCAA-T-GCG--AGAATC-C-ACATTT--GCAAAGTTG-C-AACGGA-G---------AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------A--TCACA-TCCTGCC-CACTC-GCCC--GA-CCTAGCTCCTAG--CGAC-CTCTTCCTATTTCCAAATTTGGA-ATAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAA---GAAGTct
gi|4 : acaCTGGACGCCAGGAACGA-A-GCAA--A--------CTGTTCCAA-GAGAAGTTTAGGG-ACC-TGGTAGT-----A-TCG-GATAGGTGAAT-CAGA---ACGGA----ACA--TGCAG-CATTA-ACATTGCAC-A-TTGTAA--------G-CGTCGTTATAACAACCCT-AACATA----T-AC--GTTTAG--AAGCGCAACGCTAACAGCCCACTGGGTCCCCCAAATCCCTTCTATATTGAC-AGCAAATGGC--AAACCCAGA-----GC-ATCCAGTATTGCATCGCCAT--TGTTG----AACCAATAGAGC-AGTCAAAAGATCGATTTC--TTT-AAG-CCT--TG-GT-----AT----ACTTGAGTTCATT------------A--TGAGC-C-AAA-T-AATAA-GC-TCAGAAGTCGATCA-TGG-TAGG-CTTGGATCCCCGAAGG-C--CA---AA--GACAGTTC---AA-ACGCAACCAATT-CTG-TAGC-AATG-TGA-TGGCCA-AGGT-ACT-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGAC------TATGTTG-G-AC-TT------CCAAA-AGCA-AGTACAATA-G----CTG-AG----CT-A----GAAG-TTGC-TAGGTCAGC-TGA-AACCGCCCATT-GTGGCGACAAGA-CGCCG-GGG-AAAC-TC------T---T----TAAAG---TTTTGCATGCAACAAAGAACAAAC-GCA--AGATTC-A-CCACTTATGCAAGTTTG-C-AATG-ATGTTG--TTAGAG---C--GAGACAGATATGCATT----A----A-T-------A--ATACA-TCCTGCCTTATTC-GCCT---A-CCTAGAT-CTAG--CGAC-TT-TTGGTATTCCC-AACTTGAACAAAG----TA--TCCA-T-G--AC---ATCATTTTCTTGT-TGAC---GAAGg
gi|5 : --------ATTA--TGA-C-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGAAGTCA-TCAGTGGGT----------CCCCCGA-GTTC--CATT-AA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTG-TGGC-AAGAATGAATGGTCAACACTTA-T-TTTTG-GGAAATGCAAA--AGGCCTTATGTATGTTG-G-AC-TTTT-TTCCCAAG-AG-AGAGCA-AATA-A----TTGGAGTTAACTGA-TGCAAAC-TAGCCTAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAACATC------TTTCC----TAAATGT-TTTTGC-TGTAAAAA-GGACAA-CCGTGGAATAGTC-CCACACTT--GCAAAGTTGGC-AATGGATTGTG--T---AGAAAC--AAAACGAGTATGAATTA---C----AGT-------AAACCACA-TC-TGCC-TATTC-GCCCTGGA-CCTCGCTCCTAGTGCGACCTTCTTCCTATTCCCAAACTTG-A-AAAG--GAAA--CCCA-TGattatgacgcgagttcaggagtaggacatatgaaaccctggatttttcattgtgggatgatgatggcacgtggaaatagttgttgtctgaagggtgcatcacactagaggcaattacatgaaaagaaagtagatctcaatggaaatagttaaggctggttaattattga
gi|6 : ttatTTATT---------ATTA--TGAGC-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCA-TCAGTGGGT-----------CCCCGA-GT-C--CATTAAA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CATT-A-T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCATTAT-TATGTTG-G-AC-TTTTTA-CCCAAG-AG-A-AGAGCAATA-A----TTGGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TAGC-TAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAATGTGTTTTGC-TGTAACA--GGACAA-C-GCG--AGAGTC-C-ACACTT--GTAAAGTTG-C-AATGGATGTTGTAT---AA---C--AAAACAGGTATGAATTA---CAGTAA-C-------A--CCACA-TCTTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTCGCTCCCAG--TGAC-TTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GAAA--CCCA-TGatggtctagttgaggagtgggttctatggaaaggaccctaaatttttcagttttctggctgttggcacttcaaccccgctaattgaattggctaagtcatcacacctagaggccgattacatcaaaggaagaagaggtggaatctcaactgaaataagtcaggctggtta
gi|7 : CG-TGCTATAATTCGGCACTTATATTT----TAAAATAGGCATTAAAC----CAAGAAAATACACGGCAAGTTAGC-GGTGTTCATGGATCTTCTGCACCAT-CTTAGTCTCAGGTGAAATTCTAGGTAGGGAAAT-TCAAC-CG-TG---GTAGAA--CGTCGTAA-GAAG----ATGA---AGCCAGGT--CTG-GA-----------TGCCACCGACGA-A-GAAA--TGTGTAAATGTGT---AA-GA-AAGTTA-GGT-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GAAAGGGAAATACAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGTCATTAAGCATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATATT-G-CATG----A-CC--GTTTAGGTA----CA----------CCCGTTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGGGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----AC-ATT-AGTAT-GCAGCGGC-T--TGTTG----AAGCGTT---TTAGGTCAAAATAT-TATTTT-TTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GATTTGGATTCA-TG--------ATTA--TGAGA-A-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-ATCG-TCAGTGGGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGATGCAACCA--T-CAGCTGatggtctagttgaggagtgggtctatggaaaggaccctaaatttttcagttctaggctgtggcacttcaacactgctaatttgaattggtctaagtgcatcacactagaggccgattacatcaaaaaagaagaggtggatctcaactggaaataagtcaggctggtt
gi|8 : aa-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACACAACCA--T-CCACTGGC-AAGA-TGA-TGGCCA-CAG-----------------------------------TATATTG-G-G-------A-CGCAA-----A-AGTACAATA-AAT---TG-AGTGAACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGATCAGC-TGAGAACAGAC-ATCCATGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TATAGGTGTTTTGC-TGCAACA--GGACAA-C-GAG--AGAGTC-C-GCA-----------TTG-C-AATGGATGCTG--TAG-AG---C--AAAACGGGTATGAATT----A----A-C-------A--CCATA-TCCTGTC-TATTC-GTCT----------CTCCTAG--CGAC-TTCTTCCTATT-CCAAACTTCAA-AATG--GATA--TATG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTAAC---GAAG
gi|9 : AATCTCAAGTCG-CGTAGGTAGAGACCGTCGTAA-GAGG----ATGA---AGCCAGGT--CTGAGAGGGACA---GACGTTGACGACCA-TTGTAA--T--------G-GT---AAAGAGAAATTA-GAGTGTCGTGGTA-GCAGCAACCCTTGAAAGG--AATACAG-TAGAAGAATGAAATAGCCGCAGTCATAAGTCAATCCACAA-TGCTA---------A-GGC--TT-TCACAATATTAG-CATGAAAAG-ACCGGTCTA-ATAGGTGCAG-ACGACCAGCGTATC--GTTTCC-AAAT-CCTT----AG-G--GAACAAATGGC--AA--CCAGA------C-ATT-AG-AC-GCGG---C-T--TGGTG----AAGCGTT---TT-AGT--AAATAT-TATTTT-TTTT-GCGCTCTGGTGAATTGTAGATGATGATTT-GATTC--TG--------ATTACTCAAGA-A-AGATG-AATAACGC-TATGATATCG-TCAGT-GGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAGGGA-AGTTC---AAGATGCA--CA--TGCAGCTGGCTAAAG-CGA-aactcgtaacggcagttgaggagtgggcaacggaaaggactctgatttttttttttttagttctggatgatgacactcgaacaagtgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttaggctggttacttattgattcgcc
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 22222 1 1 777777777777777777777 1111 1111 11 1111 88888888888888888888888888 222222 11 444444444444 1 111 111 1111 111 22222222222 1 1111111 111111111 222222222 1 1111111111 1111 11111 2222 2222222 1 222222222 1 111 11111 111 11111 111111111111 1111 111111111111111 1 333333333 3333333333333333333
lowQualScore : 5 5 1 3 7 0 77777 3 3 111111111111111111111 0000 0 5555 7 6 33 0 9999 66666666666666666666666666 2 0 6 0 444444 11 444444444444 5 6 2 2 1 222 5 000 77 1 5 2222 0 000 77 5 6 1 5 666 44444444444 777 4 8 99 5 0 4444444 4 5 1 6 0 111111111 6 3 6 6 666666666 1 5 77 5 888 7777777777 3 44 5 1 1 5 4 7777 1 3 0 66 66 22222 5 5 5 4 5 66 1111 5 4444444 5 5 1 5 5 8888 5 666666666 99 4 4 4 4 0 4 2 2 1 4 2 2 666666 4 3 55 111 55 3 666 1 6666 1 4 4 4 4 22222 4 4 4 66 66 5 4 4 4 4 888 4 4 4 11111 333333333333 4 66 11 4 0 5 8 66 5 0000 5 5 5 999999999999999 1 5 5 66 0 66 5 5 77777 5 5 222222222 777 66 7777777777777777777 1 4 3 3 777 3 55 3 3 44 44 3 66 777 4 777
lowQualScore : . . . . . . ..... . . ..................... .... . .... . . .. . .... .......................... . . . . ...... .. ............ . . . . . ... . ... .. . . .... . ... .. . . . . ... ........... ... . . .. . . ....... . . . . . ......... . . . . ......... . . .. . ... .......... . .. . . . . . .... . . . .. .. ..... . . . . . .. .... . ....... . . . . . .... . ......... .. . . . . . . . . . . . . ...... . . .. ... .. . ... . .... . . . . . ..... . . . .. .. . . . . . ... . . . ..... ............ . .. .. . . . . .. . .... . . . ............... . . . .. . .. . . ..... . . ......... ... .. ................... . . . . ... . .. . . .. .. . .. ... . ...
lowQualScore : 5 0 0 3 3 7 77777 3 3 777777777777777777777 7777 7 2222 8 7 33 3 8888 00000000000000000000000000 5 8 7 8 222222 00 444444444444 0 7 5 5 4 111 7 000 99 9 7 1111 7 000 99 7 6 7 9 111 44444444444 888 4 9 55 0 0 5555555 5 0 4 6 2 999999999 7 7 7 7 777777777 4 7 99 7 000 2222222222 4 55 0 4 1 0 2 5555 4 6 1 99 99 55555 0 0 0 5 0 99 2222 0 0000000 6 0 9 7 7 4444 7 777777777 55 0 0 0 0 7 0 4 0 6 0 5 3 222222 0 6 00 444 00 6 444 8 5555 4 0 0 0 4 77777 4 4 4 11 11 7 4 4 4 4 222 4 4 4 11111 444444444444 4 22 99 4 8 0 9 44 0 6666 0 0 0 999999999999999 4 0 0 99 0 99 0 0 44444 0 0 000000000 888 11 4444444444444444444 6 0 6 6 000 6 00 6 3 66 66 3 11 888 4 888
consensus : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTT----CAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTAC-----AATAA-CT--GGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
Reference ( family-2589 ) : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTT----CAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTAC-----AATAA-CT--GGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
gi|1 : GAGAATAGTTACGAATGTTCTTGCCTTGTTT-CAA-ATGTATG--AATTTTATCCT-GATGTAAAAAGTTGCGCCACGCATAGA---AC----GA----ATTCTTTACTAAGATATTGTTTAATGTGGAACTATGGCTAGA-GA-GCAAAGGCATGATTTCCATC--TGAAAAGATGCGCACCGGTGCTATCAATTCAAGTACTG-TGCTACAATTCAGTACTTGTATTT-----AAAA--GG-------------AAAGAAACACATGGCGTGTTGGCCGATATTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTTTGCTCAGGATAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TTAAA-TG-CG---ACAAAA--TGTTTTTA-GAAG----ACGA---CGTAGAGT--CCG-GACGCCCACTAGATGCCACCGACAA-A-GAAA--T--------ATGT---AA-GA-AAGTGC-GAT-ATC-TGGTA-T-----ACTTT-GACAGGCGAATTCTGGTGGAAGAA----ATAC-TGCAGGCATTAAATAATCTAC-A-TGGTACAAAAAGTA-G-CGT--TT-CAACTATCTT-A-CATG----A-T---GTTAAGGTATGTGCAA-GCTCACAGACCGCTGCCTTTCT-AAATCCCTC----GACGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGAAGTATGCA-GA-AGTAT-GCGGTCCA-T--TGTTG----GAGCGGTG---TC-GGTCAAAAGAT-GGTTTTCGTTT-GCC-TCTGGTG-ACTGTAGATGA-CACTTGTATTCATTG---------TTA--TGAACAC-A-A-G-AATAAAGC-TC--A-TTTG-ACAGTGGAT-GGGCCCGGGTCCCCAA-GT-G--CA---AA--GA-AGGTA---AAGGCGCAACCA--T-CTTCAGTC-AAGG-TCA-TGACCA-CACT-A-T-TTT-A-GGA--CGCAAATCA---GTTAT-TTTGTTG-G-AC-TTTTAA-CCCAAG-AA-A-AGTAC-----AATAA-C-------TGCAAT-A-TGC--AC-TTTT-TAAACTTCC-T---AACC--C-ATCCGTTA----AAAA-TACTA-AGTTAACC-TC------T---G----TAAATGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAC-CGCG--ATAGT-T-CAAAACT--GCAAAAGT-GC-AATGGATGTTG--T---AG---CATGAAACAGGTATGAATT----A----A-T-------ACTACA-TCCCGCT-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GTGA-CTTCTTCCTATCCCCAAACTTAAA-AAAAATGATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAA
gi|10 : atgGC-TGAGAACCGCC-ATCTGTGA----AAAAACGCCG-TGGTAGAA-TC------T---C----TCAAGGTGTATTTT-TGC-AACA--GGACGA-CGCG--AAAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGC--------------------CGGATATAAATT----A----A-T-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-ACGT--AA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTGTTCTCAAATTTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TCC--ACGGGGTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAAGaaagtcctgacggtagttgaggagtgggtcaatgtaaagggccctgacattttaggttctgagctgattccacttgaacactgttggtctaagtgcatcacactagagggaattccctcgaaaaagaagaggtgaatataaaccaggattataagttaggcttgttac
gi|11 : g-G-NGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGC-GTT---TT-------ACGAT-GATTTTCT-----------GGTG-GCTGTAGATGA-GACTTGGTTTTATC---------ATTA--TAAGC-C-AGA-G-AATAAACC-TCGG---TCG-TCAGTGGATAGGGCCTGGGTCCCTGT-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--A-TTACTGGT-AAGA-TGG-TGGCCA-CAGT-A-T-TAT-G-GTA--CGCAAA--AGGGGTTAT-TATATTG-G-AC-TTTT-T-ATCAAG-TG-A-AGTAC-----AACAA-CT--GGAGTAGGCC-AGGGCAAAC-Taagtcgtaacggcagttgaggtgtgggtctgtggaaaggaccttgaccttttcagctctgggctgatagcacttgaacacagttgggttaagtgcatcacatttgagggcaattacattaaaaagcgagaggtgcatcataaccagaaatgggattggctggttgact
gi|12 : gGAAAT----C----A---------AGCAC--TC--GCC-TATGC-GCCT--GAGCCTGACTC-TA---C-A-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATAACTCCG-
gi|13 : agatgcacatgcagctggctaaagc---C--GAAACGAGTACGAGTTAATAC----A-TGTGTAATACCACA-TTCTGCC-TATTTTGCCT--GA-CGTAGCTCCTA--GCGA-CTTTTTCCTATTCCTAACTTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGATCTGACAAGGAAGTataaagttactgtattatatacggtcttacaatgaagtactagacggaagttaggagtgggtcaaatggaaagaacctgacaactcctccagttaagggctgatggtacaattgattcaccagttggggtcaatcgctccactaagaggtcaaattacatggataaaagaagaggggatctcaccggaaataagttcactgg
gi|14 : TGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--ACGA-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTTA-TTTCCGGTCTTAC---AAAGtgtgacggcagttgagaattggggcaatggaaaggatcctgactttttcagttttgggcacttgtacaccgttggtctaagtgcgtcacacgagagggcaatttcatcaaaaaagaagaggtggatcagttaggttggttacttattgacttgct
gi|15 : TACTG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATT-----CAAAT--GGTA--AAACG-GGCAAGAAAATCCACGGCGAGTTAGCGGATGTTTGTGGGTCTTCGGCACCAT-CTTATGTTCAGGTTAAATTGTGGGTAAGGGAAT-TCAAA-AG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAA----ATGA---AACCAGAC--CTA-GATGTCCACTGAATGTCAAAGATGA-G-GAAC--T--------GTGT---TA-GA-CTGTTC-GGG------------------TTCT-GATAAGCGAATTCAGGTGAAAGAA----TGAG-CGCAaagtcttgacggaagttaaggagtgggtcaatggaaagaaccctgacattttcagttaagggctgatggtatttgatcaccgttggtctaatcgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttagactggttacttatta
gi|16 : TTTATTT--------ATTAG-TGAGC-C-AGG-GGAATAAAGCCTCAGA-GT-A-TCA------AG----TGGGTCCCCGA-GT-CATTA---AA--GC-AGTTCCAAAAGTTGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CA-T-A-TATTT-GCGGA--TGCAAA--AGGCCTTAT-TA-GTT--G-AC-TTTT---CCCAAGAAG-A-AGAGC-----AATAAGCCGAGGAGT-TACT-A-TG-AAACATAGC-T-GACCAGCTTGAGAACC
gi|17 : agatcgaaggttTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGC-GTT---TT-------ACGAT-GATTTTC
gi|18 : TGTTTATGGGTCTTCTGCACTAT-TTTATGCCCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGGAT-TCA---------------AA--CGTCT------AG----AC----------------------GCCCACTGGATGCCACCGACGA-A-GAAA--C--------GTGT---AA-GA-
gi|19 : -ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAAAT-ATGGTTAGT-GATGCAAAG--ATGTTTTTCATC--T-AAA-GTT--G-------------------AGTACCG-CGCTATAATTTGGTACT
gi|2 : TCATGCTTTGTTTATAATACATGT------TTTATACC-GG-GTACAAAATTGT-C-ACGCGT--A---TT----GAGTCGATTCTTTAATAAGATTTCG---TATGTCAA-C-AT----AGTCGGTACAAAGGCATGCTGTTCATCGTTGAAACGTAGAA-------------------A-TATCGGTGCTATAATTCTGTATTTATATCTTAATCAAAA--GGTGT-AAAAA-A-ACAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCAATGTGTATTGGT-TTCTGCG--ATACCTAT------------TTCTGGTT-GGGGAATATCAAA-AGACG---GTAGAA--CGGTTTTAGGAAGCATTACCAGGTAGTCAGGT--CTG-GACACTCACTGTATGCGA-CGACGACA-GAAATGT--------GTGT---AA-GA-AAGAT--GGG-ATCTTGGTG-T-----A-TCT-G-TAGGCGAA-----ATGG------------G-CGCAGGTATAGGACATTTCAA-AGTG---------ATATGCCAT--TG-CAACAATCTT-A-ACTG----GTTC--GTTTAGGTATGC-CAA-GCTAACAG-----------CCA-AAATTACTTTA--AGCGATTGACAAA-GGCAGAA--CCAGA-----GCAGTC-GGT-T-GCAGCGTC-CAATGTTG----AAGC-GTTG--TTAGGTGAAAAG---GGTTTTATTTTCGCG-TCTGATG-A---CAGATGA-GTCTTGGATTCATCC--------ATTA--TGAGC-CTAGA-A-AAT------------GT-----AGTGGGTAGGGCCTGGGT-CCCGA-TG-C--C----AC--GA-AGT-------GA--TAGCCA-----------C-A--G-TG----------------T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGTGCAT-TTTG-A-CCCAAG-AG-A-A-TAC-----AATAA--------------------------TTGC-TAGATTGATATGAGAATTCAC-AT-CGTG-----AAAA-CGCCGAAAGTAAAC-GCCTTAAGT---CACAGTAAAGGTAGTTGCC-TGA-CACA---GACAA-CGAG--AGAGT-CACACAA-T--GCAAAGTT-GCAAATGGATGCTA--TAAGAG---C--GAAACGGG------TT----C----A-T-------A--ACATTCCTGTC-TATT---CCG--AA----AG--CCTA--GCGA-CT--TTCCTCTTCCTTAACTTTGA-AAAA--GATA--CCCATTGGACAC---GTCA-TTTCCGG-CTGAC---GAAG
gi|20 : AAATTTGAG-AAAG--GACA--TCCG-TGG--AC---ATCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|21 : -ATTCTTTGATAAGATATTG---AATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTTTCaagttgtgacggcagttcaggagtga
gi|22 : tg-ATTCTTTGATAAGATATTG----ATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTT
gi|23 : ---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGATA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----at
gi|3 : GAGA-CGGTCAC-AATTTCCATGCCTTGTTT-CAATACATGTGGTAGTATTATACCAGG-GTACAAAATTATA--ATATATCGACTATCCCAGGAGTC-ATTCTTTAATA-GATATCA---AAAGTCAAAC-ATGGCTACT-GATGCAAAGGCATGCTTTTCATT--T--AA-GTTAAG-------------------AGC-CCG-TGTTATAATTCGGTACTTGT-TTT----TAAAA--GGTA--AAACATA-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAACCAATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAC-CTTATGCTCAGGTTAATTT---GGTAAGGAAAT-TCAAC-CG-CG---GTAGAA--CATCTTTA-GAAG----GTGA---AGCCAAACTGCTG-GACGTCCACTGGATGCCATCGACGA-A-GAAA--A--------GTGC---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TAGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTTAGGTGGAAGAA----ATAA-CGCAGGCATTAGACATTTTAC-A-CG---------GTA-G-CAT--TT-CAACAATTTT-A-CGTG----A-TC--GTTGGGGTATGCGCAA-GCTAACATTCCGTTGGGTCCCA-AAATTCTTT----AGCGATGAGC-----------------A-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGATG----AAGA-GTT---TTCGGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGATG-ATAGTAGATGA-GACTTGGGTTCATTGAACAAAACATTA--CGAGC-C-AGA-G-AATAAAGA-TCAGA-GTCG-TCATTGGATAGGATCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---TAGACACTATCA--T-CTGCTGGC-AAGG-AGA-TGGTCA-CAGT-G-T-TTG-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTGT-CATGTTG-G-ACTTTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTACAATAGAATAA-CT--GGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-CGAGAACCGCC-ATCCGTGA----ACAA-CGCCG-AGGTAAA---C------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGGCAA-TGCG--AGAAT-C-CACATTT--GCAAAGTT-GC-AACGGA-G---------AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ATCACA-TCCTGCC-CACTC-GCCC--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CCTCTTCCTATTTCCAAATTTGGA-ATAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAA---GAAGTct
gi|4 : acaCTGGACGCCAGGAACGA-A-GCAA--A--------CTGTTCCAA-GAGAAGTTTAGGG-ACC-TGGTAGT-----A-TCG-GATAGGTGAAT-CAGA---ACGGA----ACA--TGCAG-CATTA-ACATTGCAC-A-TT---------GTAAG-CGTCGTTATAACAACCCT-AACATA----T-AC--GTTTAG--AAGCGCAACGCTAACAGCCCACTGGGTCCCCCAAATCCCTTCTATATTGAC-AGCAAATGGC--AAACCCAGA-----GCA-TCCAGTATTGCATCGCCAT--TGTTG----AACC-AATAGAGC-AGTCAAAAGATCGATTTC--TTT-AAG-CCT--TG-GT-----AT----ACTTGAGTTCATT------------A--TGAGC-C-AAA-T-AATAA-GC-TCAGAAGTCGATCA-TGG-TAGG-CTTGGATCCCCGAAGG-C--CA---AA--GACAGTTC---AA-ACGCAACCAATT-CTG-TAGC-AATG-TGA-TGGCCA-AGGT-ACT-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGAC------TATGTTG-G-AC-TT------CCAAA-AGCA-AGTAC-----AATAG-CT--G-AG----CT-A----GAAG-TTGC-TAGGTCAGC-TGA-AACCGCCCATT-GTGGCGACAAGA-CGCCG-GGG-AAAC-TC------T---T----TAAAG---TTTTGCATGC-AACAAAGAACAAACGCA--AGATT-C-ACCACTTATGCAAGTTT-GC-AATG-ATGTTG--TTAGAG---C--GAGACAGATATGCATT----A----A-T-------AATACA-TCCTGCCTTATTC-GCCT---A-CCTAGAT-CTA--GCGA-CTT-TTGGTATTCCC-AACTTGAACAAAG----TA--TCCA-T-G--AC---ATCATTTTCTTGT-TGAC---GAAGg
gi|5 : --------ATTA--TGA-C-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGAAGTCA-TCAGTGGGT----------CCCCCGA-GTTC--CATT-AA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTG-TGGC-AAGAATGAATGGTCAACACTTA-T-TTTTG-GGAAATGCAAA--AGGCCTTATGTATGTTG-G-AC-TTTT-TTCCCAAG-AG-AGAGCA------AATAA-TT--GGAGTTAACTGA-TGCAAAC-TAGCCTAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAACATC------TTTCC----TAAATGT-TTTTGC-TGTAAAAA--GGACAACCGTGGAATAGTCC-CACACTT--GCAAAGTTGGC-AATGGATTGTG--T---AGAAAC--AAAACGAGTATGAATTA---C----AGTAA-----ACCACA-T-CTGCC-TATTC-GCCCTGGA-CCTCGCTCCTAGTGCGACCTTCTTCCTATTCCCAAACTTG-A-AAAG--GAAA--CCCA-TGattatgacgcgagttcaggagtaggacatatgaaaccctggatttttcattgtgggatgatgatggcacgtggaaatagttgttgtctgaagggtgcatcacactagaggcaattacatgaaaagaaagtagatctcaatggaaatagttaaggctggttaattattga
gi|6 : ttatTTATT---------ATTA--TGAGC-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCA-TCAGTGGGT-----------CCCCGA-GT-C--CATTAAA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CATT-A-T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCATTAT-TATGTTG-G-AC-TTTTTA-CCCAAG-AG-A-AGAGC-----AATAA-TT--GGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TAGC-TAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAATGTGTTTTGC-TGT-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GTAAAGTT-GC-AATGGATGTTGTAT---AA---C--AAAACAGGTATGAATTA---CAGTAA-C-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTCGCTCCCA--GTGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GAAA--CCCA-TGatggtctagttgaggagtgggttctatggaaaggaccctaaatttttcagttttctggctgttggcacttcaaccccgctaattgaattggctaagtcatcacacctagaggccgattacatcaaaggaagaagaggtggaatctcaactgaaataagtcaggctggtta
gi|7 : CG-TGCTATAATTCGGCACTTATATTT----TAAAATAGGCATTAAAC----CAAGAAAATACACGGCAAGTTAGC-GGTGTTCATGGATCTTCTGCACCAT-CTTAGTCTCAGGTGAAATTCTAGGTAGGGAAAT-TCAAC-CG-TG---GTAGAA--CGTCGTAA-GAAG----ATGA---AGCCAGGT--CTG-GA-----------TGCCACCGACGA-A-GAAA--TGTGTAAATGTGT---AA-GA-AAGTTA-GGT-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GAAAGGGAAATACAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGTCATTAAGCATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATATT-G-CATG----A-CC--GTTTAGGTA----CA----------CCCGTTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGGGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----ACA-TT-AGTAT-GCAGCGGC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TTAGGTCAAAATAT-TATTTT-TTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GATTTGGATTCA-TG--------ATTA--TGAGA-A-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-ATCG-TCAGTGGGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGATGCAACCA--T-CAGCTGatggtctagttgaggagtgggtctatggaaaggaccctaaatttttcagttctaggctgtggcacttcaacactgctaatttgaattggtctaagtgcatcacactagaggccgattacatcaaaaaagaagaggtggatctcaactggaaataagtcaggctggtt
gi|8 : aa-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACACAACCA--T-CCACTGGC-AAGA-TGA-TGGCCA-CAG-----------------------------------TATATTG-G-G-------A-CGCAA-----A-AGTAC-----AATAA-AT--TGAGTGAACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGATCAGC-TGAGAACAGAC-ATCCATGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TATAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGAG--AGAGT-C-CGCA-----------TT-GC-AATGGATGCTG--TAG-AG---C--AAAACGGGTATGAATT----A----A-C-------ACCATA-TCCTGTC-TATTC-GTCT----------CTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATT-CCAAACTTCAA-AATG--GATA--TATG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTAAC---GAAG
gi|9 : AATCTCAAGTCG-CGTAGGTAGAGACCGTCGTAA-GAGG----ATGA---AGCCAGGT--CTGAGAGGGACA---GACGTTGACGACCA-TTGTAA--T--------G-GT---AAAGAGAAATTA-GAGTGTCGTGGTA-GCAGCAACCCTTGAAAGG--AATACAG-TAGAAGAATGAAATAGCCGCAGTCATAAGTCAATCCACAA-TG---------CTA-A-GGC--TT-TCACAATATTAG-CATGAAAAG-ACCGGTCTA-ATAGGTGCAG-ACGACCAGCGTATC--GTTTCC-AAAT-CCTT----AG-G--GAACAAATGGC--AA--CCAGA------CA-TT-AG-AC-GCGG---C-T--TGGTG----AAGC-GTT---TT-AGT--AAATAT-TATTTT-TTTT-GCGCTCTGGTGAATTGTAGATGATGATTT-GATTC--TG--------ATTACTCAAGA-A-AGATG-AATAACGC-TATGATATCG-TCAGT-GGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAGGGA-AGTTC---AAGATGCA--CA--TGCAGCTGGCTAAAG-CGA-aactcgtaacggcagttgaggagtgggcaacggaaaggactctgatttttttttttttagttctggatgatgacactcgaacaagtgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttaggctggttacttattgattcgcc
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 22222 1 1 777777777777777777777 1111 1111 11 1111 88888888888888888888888888 222222 11 444444444444 1 111 111 1111 111 22222222222 1 1111111 111111111 222222222 1 1111111111 1111 11111 2222 2222222 1 222222222 1 111 11111 111 11111 111111111111 1111 111111111111111 1 333333333 3333333333333333333
lowQualScore : 5 5 1 3 7 0 77777 3 3 111111111111111111111 0000 0 5555 7 6 33 0 9999 66666666666666666666666666 2 0 6 0 444444 11 444444444444 5 6 2 2 1 222 5 000 77 1 5 2222 0 000 77 5 6 1 5 666 44444444444 777 4 8 99 5 0 4444444 4 5 1 6 0 111111111 6 3 6 6 666666666 1 5 77 5 888 7777777777 3 44 5 1 1 5 4 7777 1 3 0 66 66 22222 5 5 5 4 5 66 1111 5 4444444 5 5 1 5 5 8888 5 666666666 99 4 4 4 4 0 4 2 2 1 4 2 2 666666 4 3 55 111 55 3 666 1 6666 1 4 4 4 4 22222 4 4 4 66 66 5 4 4 4 4 888 4 4 4 11111 333333333333 4 66 11 4 0 5 8 66 5 0000 5 5 5 999999999999999 1 5 5 66 0 66 5 5 77777 5 5 222222222 777 66 7777777777777777777 1 4 3 3 777 3 55 3 3 44 44 3 66 777 4 777
lowQualScore : . . . . . . ..... . . ..................... .... . .... . . .. . .... .......................... . . . . ...... .. ............ . . . . . ... . ... .. . . .... . ... .. . . . . ... ........... ... . . .. . . ....... . . . . . ......... . . . . ......... . . .. . ... .......... . .. . . . . . .... . . . .. .. ..... . . . . . .. .... . ....... . . . . . .... . ......... .. . . . . . . . . . . . . ...... . . .. ... .. . ... . .... . . . . . ..... . . . .. .. . . . . . ... . . . ..... ............ . .. .. . . . . .. . .... . . . ............... . . . .. . .. . . ..... . . ......... ... .. ................... . . . . ... . .. . . .. .. . .. ... . ...
lowQualScore : 5 0 0 3 3 7 77777 3 3 777777777777777777777 7777 7 2222 8 7 33 3 8888 00000000000000000000000000 5 8 7 8 222222 00 444444444444 0 7 5 5 4 111 7 000 99 9 7 1111 7 000 99 7 6 7 9 111 44444444444 888 4 9 55 0 0 5555555 5 0 4 6 2 999999999 7 7 7 7 777777777 4 7 99 7 000 2222222222 4 55 0 4 1 0 2 5555 4 6 1 99 99 55555 0 0 0 5 0 99 2222 0 0000000 6 0 9 7 7 4444 7 777777777 55 0 0 0 0 7 0 4 0 6 0 5 3 222222 0 6 00 444 00 6 444 8 5555 4 0 0 0 4 77777 4 4 4 11 11 7 4 4 4 4 222 4 4 4 11111 444444444444 4 22 99 4 8 0 9 44 0 6666 0 0 0 999999999999999 4 0 0 99 0 99 0 0 44444 0 0 000000000 888 11 4444444444444444444 6 0 6 6 000 6 00 6 3 66 66 3 11 888 4 888
consensus : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTT----CAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTAC-----AATAA-CT--GGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
Reference ( family-2589 ) : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTT----CAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTAC-----AATAA-CT--GGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
gi|1 : GAGAATAGTTACGAATGTTCTTGCCTTGTTT-CAA-ATGTATG--AATTTTATCCT-GATGTAAAAAGTTGCGCCACGCATAGA---AC----GA----ATTCTTTACTAAGATATTGTTTAATGTGGAACTATGGCTAGA-GA-GCAAAGGCATGATTTCCATC--TGAAAAGATGCGCACCGGTGCTATCAATTCAAGTACTG-TGCTACAATTCAGTACTTGTATTT-----AAAA--GG-------------AAAGAAACACATGGCGTGTTGGCCGATATTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTTTGCTCAGGATAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TTAAA-TG-CG---ACAAAA--TGTTTTTA-GAAG----ACGA---CGTAGAGT--CCG-GACGCCCACTAGATGCCACCGACAA-A-GAAA--T--------ATGT---AA-GA-AAGTGC-GAT-ATC-TGGTA-T-----ACTTT-GACAGGCGAATTCTGGTGGAAGAA----ATAC-TGCAGGCATTAAATAATCTAC-A-TGGTACAAAAAGTA-G-CGT--TT-CAACTATCTT-A-CATG----A-T---GTTAAGGTATGTGCAA-GCTCACAGACCGCTGCCTTTCT-AAATCCCTC----GACGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGAAGTATGCA-GA-AGTAT-GCGGTCCA-T--TGTTG----GAGCGGTG---TC-GGTCAAAAGAT-GGTTTTCGTTT-GCC-TCTGGTG-ACTGTAGATGA-CACTTGTATTCATTG---------TTA--TGAACAC-A-A-G-AATAAAGC-TC--A-TTTG-ACAGTGGAT-GGGCCCGGGTCCCCAA-GT-G--CA---AA--GA-AGGTA---AAGGCGCAACCA--T-CTTCAGTC-AAGG-TCA-TGACCA-CACT-A-T-TTT-A-GGA--CGCAAATCA---GTTAT-TTTGTTG-G-AC-TTTTAA-CCCAAG-AA-A-AGTAC-----AATAA-C-------TGCAAT-A-TGC--AC-TTTT-TAAACTTCC-T---AACC--C-ATCCGTTA----AAAA-TACTA-AGTTAACC-TC------T---G----TAAATGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAC-CGCG--ATAGT-T-CAAAACT--GCAAAAGT-GC-AATGGATGTTG--T---AG---CATGAAACAGGTATGAATT----A----A-T-------ACTACA-TCCCGCT-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GTGA-CTTCTTCCTATCCCCAAACTTAAA-AAAAATGATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAA
gi|10 : atgGC-TGAGAACCGCC-ATCTGTGA----AAAAACGCCG-TGGTAGAA-TC------T---C----TCAAGGTGTATTTT-TGC-AACA--GGACGA-CGCG--AAAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGC--------------------CGGATATAAATT----A----A-T-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-ACGT--AA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTGTTCTCAAATTTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TCC--ACGGGGTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAAGaaagtcctgacggtagttgaggagtgggtcaatgtaaagggccctgacattttaggttctgagctgattccacttgaacactgttggtctaagtgcatcacactagagggaattccctcgaaaaagaagaggtgaatataaaccaggattataagttaggcttgttac
gi|11 : g-G-NGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGC-GTT---TT-------ACGAT-GATTTTCT-----------GGTG-GCTGTAGATGA-GACTTGGTTTTATC---------ATTA--TAAGC-C-AGA-G-AATAAACC-TCGG---TCG-TCAGTGGATAGGGCCTGGGTCCCTGT-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--A-TTACTGGT-AAGA-TGG-TGGCCA-CAGT-A-T-TAT-G-GTA--CGCAAA--AGGGGTTAT-TATATTG-G-AC-TTTT-T-ATCAAG-TG-A-AGTAC-----AACAA-CT--GGAGTAGGCC-AGGGCAAAC-Taagtcgtaacggcagttgaggtgtgggtctgtggaaaggaccttgaccttttcagctctgggctgatagcacttgaacacagttgggttaagtgcatcacatttgagggcaattacattaaaaagcgagaggtgcatcataaccagaaatgggattggctggttgact
gi|12 : gGAAAT----C----A---------AGCAC--TC--GCC-TATGC-GCCT--GAGCCTGACTC-TA---C-A-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATAACTCCG-
gi|13 : agatgcacatgcagctggctaaagc---C--GAAACGAGTACGAGTTAATAC----A-TGTGTAATACCACA-TTCTGCC-TATTTTGCCT--GA-CGTAGCTCCTA--GCGA-CTTTTTCCTATTCCTAACTTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGATCTGACAAGGAAGTataaagttactgtattatatacggtcttacaatgaagtactagacggaagttaggagtgggtcaaatggaaagaacctgacaactcctccagttaagggctgatggtacaattgattcaccagttggggtcaatcgctccactaagaggtcaaattacatggataaaagaagaggggatctcaccggaaataagttcactgg
gi|14 : TGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--ACGA-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTTA-TTTCCGGTCTTAC---AAAGtgtgacggcagttgagaattggggcaatggaaaggatcctgactttttcagttttgggcacttgtacaccgttggtctaagtgcgtcacacgagagggcaatttcatcaaaaaagaagaggtggatcagttaggttggttacttattgacttgct
gi|15 : TACTG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATT-----CAAAT--GGTA--AAACG-GGCAAGAAAATCCACGGCGAGTTAGCGGATGTTTGTGGGTCTTCGGCACCAT-CTTATGTTCAGGTTAAATTGTGGGTAAGGGAAT-TCAAA-AG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAA----ATGA---AACCAGAC--CTA-GATGTCCACTGAATGTCAAAGATGA-G-GAAC--T--------GTGT---TA-GA-CTGTTC-GGG------------------TTCT-GATAAGCGAATTCAGGTGAAAGAA----TGAG-CGCAaagtcttgacggaagttaaggagtgggtcaatggaaagaaccctgacattttcagttaagggctgatggtatttgatcaccgttggtctaatcgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttagactggttacttatta
gi|16 : TTTATTT--------ATTAG-TGAGC-C-AGG-GGAATAAAGCCTCAGA-GT-A-TCA------AG----TGGGTCCCCGA-GT-CATTA---AA--GC-AGTTCCAAAAGTTGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CA-T-A-TATTT-GCGGA--TGCAAA--AGGCCTTAT-TA-GTT--G-AC-TTTT---CCCAAGAAG-A-AGAGC-----AATAAGCCGAGGAGT-TACT-A-TG-AAACATAGC-T-GACCAGCTTGAGAACC
gi|17 : agatcgaaggttTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGC-GTT---TT-------ACGAT-GATTTTC
gi|18 : TGTTTATGGGTCTTCTGCACTAT-TTTATGCCCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGGAT-TCA---------------AA--CGTCT------AG----AC----------------------GCCCACTGGATGCCACCGACGA-A-GAAA--C--------GTGT---AA-GA-
gi|19 : -ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAAAT-ATGGTTAGT-GATGCAAAG--ATGTTTTTCATC--T-AAA-GTT--G-------------------AGTACCG-CGCTATAATTTGGTACT
gi|2 : TCATGCTTTGTTTATAATACATGT------TTTATACC-GG-GTACAAAATTGT-C-ACGCGT--A---TT----GAGTCGATTCTTTAATAAGATTTCG---TATGTCAA-C-AT----AGTCGGTACAAAGGCATGCTGTTCATCGTTGAAACGTAGAA-------------------A-TATCGGTGCTATAATTCTGTATTTATATCTTAATCAAAA--GGTGT-AAAAA-A-ACAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCAATGTGTATTGGT-TTCTGCG--ATACCTAT------------TTCTGGTT-GGGGAATATCAAA-AGACG---GTAGAA--CGGTTTTAGGAAGCATTACCAGGTAGTCAGGT--CTG-GACACTCACTGTATGCGA-CGACGACA-GAAATGT--------GTGT---AA-GA-AAGAT--GGG-ATCTTGGTG-T-----A-TCT-G-TAGGCGAA-----ATGG------------G-CGCAGGTATAGGACATTTCAA-AGTG---------ATATGCCAT--TG-CAACAATCTT-A-ACTG----GTTC--GTTTAGGTATGC-CAA-GCTAACAG-----------CCA-AAATTACTTTA--AGCGATTGACAAA-GGCAGAA--CCAGA-----GCAGTC-GGT-T-GCAGCGTC-CAATGTTG----AAGC-GTTG--TTAGGTGAAAAG---GGTTTTATTTTCGCG-TCTGATG-A---CAGATGA-GTCTTGGATTCATCC--------ATTA--TGAGC-CTAGA-A-AAT------------GT-----AGTGGGTAGGGCCTGGGT-CCCGA-TG-C--C----AC--GA-AGT-------GA--TAGCCA-----------C-A--G-TG----------------T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGTGCAT-TTTG-A-CCCAAG-AG-A-A-TAC-----AATAA--------------------------TTGC-TAGATTGATATGAGAATTCAC-AT-CGTG-----AAAA-CGCCGAAAGTAAAC-GCCTTAAGT---CACAGTAAAGGTAGTTGCC-TGA-CACA---GACAA-CGAG--AGAGT-CACACAA-T--GCAAAGTT-GCAAATGGATGCTA--TAAGAG---C--GAAACGGG------TT----C----A-T-------A--ACATTCCTGTC-TATT---CCG--AA----AG--CCTA--GCGA-CT--TTCCTCTTCCTTAACTTTGA-AAAA--GATA--CCCATTGGACAC---GTCA-TTTCCGG-CTGAC---GAAG
gi|20 : AAATTTGAG-AAAG--GACA--TCCG-TGG--AC---ATCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|21 : -ATTCTTTGATAAGATATTG---AATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTTTCaagttgtgacggcagttcaggagtga
gi|22 : tg-ATTCTTTGATAAGATATTG----ATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTT
gi|23 : ---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGATA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----at
gi|3 : GAGA-CGGTCAC-AATTTCCATGCCTTGTTT-CAATACATGTGGTAGTATTATACCAGG-GTACAAAATTATA--ATATATCGACTATCCCAGGAGTC-ATTCTTTAATA-GATATCA---AAAGTCAAAC-ATGGCTACT-GATGCAAAGGCATGCTTTTCATT--T--AA-GTTAAG-------------------AGC-CCG-TGTTATAATTCGGTACTTGT-TTT----TAAAA--GGTA--AAACATA-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAACCAATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAC-CTTATGCTCAGGTTAATTT---GGTAAGGAAAT-TCAAC-CG-CG---GTAGAA--CATCTTTA-GAAG----GTGA---AGCCAAACTGCTG-GACGTCCACTGGATGCCATCGACGA-A-GAAA--A--------GTGC---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TAGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTTAGGTGGAAGAA----ATAA-CGCAGGCATTAGACATTTTAC-A-CG---------GTA-G-CAT--TT-CAACAATTTT-A-CGTG----A-TC--GTTGGGGTATGCGCAA-GCTAACATTCCGTTGGGTCCCA-AAATTCTTT----AGCGATGAGC-----------------A-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGATG----AAGA-GTT---TTCGGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGATG-ATAGTAGATGA-GACTTGGGTTCATTGAACAAAACATTA--CGAGC-C-AGA-G-AATAAAGA-TCAGA-GTCG-TCATTGGATAGGATCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---TAGACACTATCA--T-CTGCTGGC-AAGG-AGA-TGGTCA-CAGT-G-T-TTG-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTGT-CATGTTG-G-ACTTTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTACAATAGAATAA-CT--GGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-CGAGAACCGCC-ATCCGTGA----ACAA-CGCCG-AGGTAAA---C------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGGCAA-TGCG--AGAAT-C-CACATTT--GCAAAGTT-GC-AACGGA-G---------AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ATCACA-TCCTGCC-CACTC-GCCC--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CCTCTTCCTATTTCCAAATTTGGA-ATAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAA---GAAGTct
gi|4 : acaCTGGACGCCAGGAACGA-A-GCAA--A--------CTGTTCCAA-GAGAAGTTTAGGG-ACC-TGGTAGT-----A-TCG-GATAGGTGAAT-CAGA---ACGGA----ACA--TGCAG-CATTA-ACATTGCAC-A-TT---------GTAAG-CGTCGTTATAACAACCCT-AACATA----T-AC--GTTTAG--AAGCGCAACGCTAACAGCCCACTGGGTCCCCCAAATCCCTTCTATATTGAC-AGCAAATGGC--AAACCCAGA-----GCA-TCCAGTATTGCATCGCCAT--TGTTG----AACC-AATAGAGC-AGTCAAAAGATCGATTTC--TTT-AAG-CCT--TG-GT-----AT----ACTTGAGTTCATT------------A--TGAGC-C-AAA-T-AATAA-GC-TCAGAAGTCGATCA-TGG-TAGG-CTTGGATCCCCGAAGG-C--CA---AA--GACAGTTC---AA-ACGCAACCAATT-CTG-TAGC-AATG-TGA-TGGCCA-AGGT-ACT-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGAC------TATGTTG-G-AC-TT------CCAAA-AGCA-AGTAC-----AATAG-CT--G-AG----CT-A----GAAG-TTGC-TAGGTCAGC-TGA-AACCGCCCATT-GTGGCGACAAGA-CGCCG-GGG-AAAC-TC------T---T----TAAAG---TTTTGCATGC-AACAAAGAACAAACGCA--AGATT-C-ACCACTTATGCAAGTTT-GC-AATG-ATGTTG--TTAGAG---C--GAGACAGATATGCATT----A----A-T-------AATACA-TCCTGCCTTATTC-GCCT---A-CCTAGAT-CTA--GCGA-CTT-TTGGTATTCCC-AACTTGAACAAAG----TA--TCCA-T-G--AC---ATCATTTTCTTGT-TGAC---GAAGg
gi|5 : --------ATTA--TGA-C-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGAAGTCA-TCAGTGGGT----------CCCCCGA-GTTC--CATT-AA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTG-TGGC-AAGAATGAATGGTCAACACTTA-T-TTTTG-GGAAATGCAAA--AGGCCTTATGTATGTTG-G-AC-TTTT-TTCCCAAG-AG-AGAGCA------AATAA-TT--GGAGTTAACTGA-TGCAAAC-TAGCCTAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAACATC------TTTCC----TAAATGT-TTTTGC-TGTAAAAA--GGACAACCGTGGAATAGTCC-CACACTT--GCAAAGTTGGC-AATGGATTGTG--T---AGAAAC--AAAACGAGTATGAATTA---C----AGTAA-----ACCACA-T-CTGCC-TATTC-GCCCTGGA-CCTCGCTCCTAGTGCGACCTTCTTCCTATTCCCAAACTTG-A-AAAG--GAAA--CCCA-TGattatgacgcgagttcaggagtaggacatatgaaaccctggatttttcattgtgggatgatgatggcacgtggaaatagttgttgtctgaagggtgcatcacactagaggcaattacatgaaaagaaagtagatctcaatggaaatagttaaggctggttaattattga
gi|6 : ttatTTATT---------ATTA--TGAGC-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCA-TCAGTGGGT-----------CCCCGA-GT-C--CATTAAA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CATT-A-T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCATTAT-TATGTTG-G-AC-TTTTTA-CCCAAG-AG-A-AGAGC-----AATAA-TT--GGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TAGC-TAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAATGTGTTTTGC-TGT-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GTAAAGTT-GC-AATGGATGTTGTAT---AA---C--AAAACAGGTATGAATTA---CAGTAA-C-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTCGCTCCCA--GTGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GAAA--CCCA-TGatggtctagttgaggagtgggttctatggaaaggaccctaaatttttcagttttctggctgttggcacttcaaccccgctaattgaattggctaagtcatcacacctagaggccgattacatcaaaggaagaagaggtggaatctcaactgaaataagtcaggctggtta
gi|7 : CG-TGCTATAATTCGGCACTTATATTT----TAAAATAGGCATTAAAC----CAAGAAAATACACGGCAAGTTAGC-GGTGTTCATGGATCTTCTGCACCAT-CTTAGTCTCAGGTGAAATTCTAGGTAGGGAAAT-TCAAC-CG-TG---GTAGAA--CGTCGTAA-GAAG----ATGA---AGCCAGGT--CTG-GA-----------TGCCACCGACGA-A-GAAA--TGTGTAAATGTGT---AA-GA-AAGTTA-GGT-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GAAAGGGAAATACAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGTCATTAAGCATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATATT-G-CATG----A-CC--GTTTAGGTA----CA----------CCCGTTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGGGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----ACA-TT-AGTAT-GCAGCGGC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TTAGGTCAAAATAT-TATTTT-TTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GATTTGGATTCA-TG--------ATTA--TGAGA-A-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-ATCG-TCAGTGGGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGATGCAACCA--T-CAGCTGatggtctagttgaggagtgggtctatggaaaggaccctaaatttttcagttctaggctgtggcacttcaacactgctaatttgaattggtctaagtgcatcacactagaggccgattacatcaaaaaagaagaggtggatctcaactggaaataagtcaggctggtt
gi|8 : aa-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACACAACCA--T-CCACTGGC-AAGA-TGA-TGGCCA-CAG-----------------------------------TATATTG-G-G-------A-CGCAA-----A-AGTAC-----AATAA-AT--TGAGTGAACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGATCAGC-TGAGAACAGAC-ATCCATGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TATAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGAG--AGAGT-C-CGCA-----------TT-GC-AATGGATGCTG--TAG-AG---C--AAAACGGGTATGAATT----A----A-C-------ACCATA-TCCTGTC-TATTC-GTCT----------CTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATT-CCAAACTTCAA-AATG--GATA--TATG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTAAC---GAAG
gi|9 : AATCTCAAGTCG-CGTAGGTAGAGACCGTCGTAA-GAGG----ATGA---AGCCAGGT--CTGAGAGGGACA---GACGTTGACGACCA-TTGTAA--T--------G-GT---AAAGAGAAATTA-GAGTGTCGTGGTA-GCAGCAACCCTTGAAAGG--AATACAG-TAGAAGAATGAAATAGCCGCAGTCATAAGTCAATCCACAA-TG---------CTA-A-GGC--TT-TCACAATATTAG-CATGAAAAG-ACCGGTCTA-ATAGGTGCAG-ACGACCAGCGTATC--GTTTCC-AAAT-CCTT----AG-G--GAACAAATGGC--AA--CCAGA------CA-TT-AG-AC-GCGG---C-T--TGGTG----AAGC-GTT---TT-AGT--AAATAT-TATTTT-TTTT-GCGCTCTGGTGAATTGTAGATGATGATTT-GATTC--TG--------ATTACTCAAGA-A-AGATG-AATAACGC-TATGATATCG-TCAGT-GGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAGGGA-AGTTC---AAGATGCA--CA--TGCAGCTGGCTAAAG-CGA-aactcgtaacggcagttgaggagtgggcaacggaaaggactctgatttttttttttttagttctggatgatgacactcgaacaagtgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttaggctggttacttattgattcgcc
blockSeqs : . . T A T GGTAG A . AATATATCGACTATCCCAG GTCG A A . CG GTTG CGTAGAA G G TTAATC TA TAAAACGGG G A G G A GTC A TAG AC T G CATT GGT TG A T T A CA TGTGTAAAT TCC A G TA T T GCAGCA T T C T TGAAATAGC G G A G . T C CG A AA AAAAGACCG T TA C C T C T CTAT C T AG AC . G C T A A AA TTTA . AGAGCA G C C C C AATT T GAACAAAAC CT . T T G C G A C A G A AGGGCC A T AT TTA GG C CAA C ATT C T A A A GTAC A T C AA . G G T C T TT A C G AATAG GCCGAGGAGTT G GG CA A C T GC C CGAC A A A CTTAAGTCACAG G A A AA A GA C A CTTAT G A CTATAAG AAA . AATACATGTGTAAT C T T T TGG G GT C C . AC T AC GGG T AAG
blockSeqs : . T . . . CACGCGTATT GTC T T . G T GTTAAG G . TT . TGTAAAAAA C . G C C AA . . . T . . . . . C C C TT TGT . . G C . G GT C . C T TGAG G G . . . A . . . AG GTTC T TA . C T . T TA C T . . . . . . A . . TTTA . GTTAG C . C . . GCT . T G . . . . . A A C . G G AGGGCC . . . TT . . . T TG C . . . . CTTA . . . . . C . . . . TA . . . . CTGGAGTAG . T CA . . A CA . . . . . TTTCC A . . . C . . . CTT . . TTGTTAG . . ACAGTAAC G . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A T . G T GTTG . . TT . TAAAACATA C . G C . AA . . . T . . . . . C C T G T . . . C . . T C . C T ATAA T A . . . . . . . G GTC T CG . T C . T . C A . . . . . . C . . . . TTCG C . A . . ATA . C . . . . . . A T C . T A AGGATC . . . . . . . C A C . . . . GTA . . . . . G . . . . T . . . . CTGGAGTGT . T CA . . . GC . . . . . TC G . . . . . . . TTT . . TTGTAT . . ACAGTAA C . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A A . . . C . CATTAAAC . . T C . CC . . . A . . . . . G T G A C . . . C . . T C . C A ATAG T G . . . . . . . G GTC T CG . C C . T . C A . . . . . . C . . . . TTAG C . C . . ATT . G . . . . . . A . C . G G AGGGCT . . . . . . . C T C . . . . GTG . . . . . G . . . . A . . . . TTGGAGTTA . T CA . . . GC . . . . . TC G . . . . . . . CTT . . CTGTAG . . AAT T . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CC . . . A . . . . . . G C A A . . . A . . T C . T A ACA . . . . . . . . . A ATC A TG . C C . C . T A . . . . . . C . . . . TTA . . . . . GT . G . . . . . . A . C . G G AGGGCT . . . . . . . T T C . . . . TTA . . . . . C . . . . A . . . . TTGGAGTGT . T CA . . . AA . . . . . TT G . . . . . . . CTT . . GTGT . . CAT A . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A A A . . . A . . T . . G . G . . . . A TAC G C . C T . C . G A . . . . . . C . . . . TT . . . . . A . . . . . . . . A . C . G G AGGCT . . . . . . . T T C . . . . TA . . . . . A . . . . A . . . . ATTGAGTGA . T A . . . AA . . . . . TC . . . . . . . . AT . . C . . CAT C . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A T . . . . . . . . . . . G ACC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . A . C . G G AG . . . . . . . T T C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . CTGAG . . G . . . GA . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . AAT C . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAC C . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . CA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : A*** TT**** TAAAACGNA*** ********* GTC******* ***** TTAG*** AGGGCC ** A** CTGGAGTGN*** CA GA CTGTA**** ** **
originalCons : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTT----CAAAA--GGTAT-AAACG-A-CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGC-GTT---TT-GGTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTAC-----AATAA-CT--GGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTG--T---AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
finalCons : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCGA---ATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTTT----AAAA--GGTAAAACGNA---CAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-A-GAAA--T--------GTGT---AA-GA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTCT-GATAGGCGAATTCAGGTGGAAGAA----ATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TG---------GTA-G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATGGTC-------GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGC-GTTTTAG---GTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTTA--CCCAAG-AG-A-AGTAC-----AATAACTGGAGTGN---ACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTGTA----AG---C--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 22222 1 1 777777777777777777777 1111 1111 11 1111 88888888888888888888888888 1 1111 11 33333333333 1 111 111 1111 111 1 22222222222 111 1 1111111 1111 333333333 1111111111 1111 11111 2222 111 1 222222222 11 111 11111 111 11111 111 1111 111111111111111 1 222222 3333333333333333333
lowQualScore : 5 5 1 3 7 0 77777 3 3 111111111111111111111 0000 0 5555 7 6 33 0 9999 66666666666666666666666666 2 0 6 0 0 7777 11 00000000000 0 5 6 2 2 1 222 5 000 77 1 5 2222 0 000 77 5 6 1 5 0 44444444444 222 8 99 5 0 4444444 4 5 6 0000 88 6 3 6 6 444444444 5 77 5 888 7777777777 3 44 5 1 1 5 4 7777 1 3 0 66 66 22222 5 5 5 4 5 66 1111 5 555 6 5 1 5 5 8888 5 666666666 99 4 4 4 4 0 4 55 1 4 2 2 666666 4 3 55 111 55 3 666 1 6666 1 4 4 4 4 22222 4 4 4 66 66 0 8 4 4 4 4 888 4 4 4 11111 77777 3 444 4 66 1 4 0 5 8 66 5 0000 5 5 5 999999999999999 1 5 5 66 0 66 5 5 77777 5 5 22 888888 66 7777777777777777777 1 4 3 3 777 3 55 3 3 44 44 3 66 777 4 777
lowQualScore : . . . . . . ..... . . ..................... .... . .... . . .. . .... .......................... . . . . . .... .. ........... . . . . . . ... . ... .. . . .... . ... .. . . . . . ........... ... . .. . . ....... . . . .... .. . . . . ......... . .. . ... .......... . .. . . . . . .... . . . .. .. ..... . . . . . .. .... . ... . . . . . .... . ......... .. . . . . . . .. . . . . ...... . . .. ... .. . ... . .... . . . . . ..... . . . .. .. . . . . . . ... . . . ..... ..... . ... . .. . . . . . .. . .... . . . ............... . . . .. . .. . . ..... . . .. ...... .. ................... . . . . ... . .. . . .. .. . .. ... . ...
lowQualScore : 5 0 0 3 3 7 77777 3 3 777777777777777777777 7777 7 2222 8 7 33 3 8888 00000000000000000000000000 5 8 7 8 6 0000 00 66666666666 8 0 7 5 5 4 111 7 000 99 9 7 1111 7 000 99 7 6 7 9 0 44444444444 222 9 55 0 0 5555555 5 0 6 6666 77 7 7 7 7 333333333 7 99 7 000 2222222222 4 55 0 4 1 0 2 5555 4 6 1 99 99 55555 0 0 0 5 0 99 2222 0 666 2 0 9 7 7 4444 7 777777777 55 0 0 0 0 7 0 22 6 0 5 3 222222 0 6 00 444 00 6 444 8 5555 4 0 0 0 4 77777 4 4 4 11 11 1 4 4 4 4 4 222 4 4 4 11111 88888 9 333 4 22 1 4 8 0 9 44 0 6666 0 0 0 999999999999999 4 0 0 99 0 99 0 0 44444 0 0 44 555555 11 4444444444444444444 6 0 6 6 000 6 00 6 3 66 66 3 11 888 4 888
consensus : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTTTAA----AA--GGTAT-AAACG-ACAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-AGAAA--T--------GTGT---AAGA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTC-TGATAGGCGAATTCAGGTGGAA----GAAATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGCGTT-TTAG--GTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTAC-----AATAA-CT--GGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTGT--A--AGC--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
Reference ( family-2589 ) : NNNGAGAACGGTCACGAATNTTCATGCCTTGTTT-CAATACGTGTG--AGTTTTATACC-GG-GTACAAAATTGTGC-ACGCGT-GA---TC----GAGTC-ATTCTTTAATAAGATATCG---AATGTCAAAC-ATGGCTAGT-GATGCAAAGGCATGTTTTTCATC--TGAAA-GTTGAG-------------------AGTACCG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTTTAA----AA--GGTA--AAACGNACAAGGAAATACACGGCGAGTTAGCCGATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTATGCTCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TCAAA-CG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAG----ACGA---AGCCAGGT--CTG-GACGCCCACTGGATGCCANCGACGA-AGAAA--T--------GTGT---AAGA-AAGTTC-GGG-ATC-TGGTA-T-----ACTC-TGATAGGCGAATTCAGGTGGAA----GAAATAG-CGCAGGCATTAGACATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGCGCAA-GCTAACAGCCCGCTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGCGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGTTG----AAGCGTT-TTAG--GTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GACTTGGATTCATTG--------ATTA--TGAGC-C-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCG-TCAGTGGGTAGGGCCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGG-TGA-TGGCCA-CAGT-A-T-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTG-G-AC-TTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTAC-----AATAA-CT--GGAGTGNACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-TGAGAACCGAC-ATCCGTGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGCTGT--A--AGC--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ACCACA-TCCTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGT
gi|1 : GAGAATAGTTACGAATGTTCTTGCCTTGTTT-CAA-ATGTATG--AATTTTATCCT-GATGTAAAAAGTTGCGCCACGCATAGA---AC----GA----ATTCTTTACTAAGATATTGTTTAATGTGGAACTATGGCTAGA-GA-GCAAAGGCATGATTTCCATC--TGAAAAGATGCGCACCGGTGCTATCAATTCAAGTACTG-TGCTACAATTCAGTACTTGTATTT-AA----AA--GG------------AAAGAAACACATGGCGTGTTGGCCGATATTTATGGGTCTTCTGCACCAT-CTTTTGCTCAGGATAAATTCTGGGTAGGGGAAT-TTAAA-TG-CG---ACAAAA--TGTTTTTA-GAAG----ACGA---CGTAGAGT--CCG-GACGCCCACTAGATGCCACCGACAA-AGAAA--T--------ATGT---AAGA-AAGTGC-GAT-ATC-TGGTA-T-----ACTT-TGACAGGCGAATTCTGGTGGAA----GAAATAC-TGCAGGCATTAAATAATCTAC-A-TGGTACAAAAAGTAG-CGT--TT-CAACTATCTT-A-CATG----A-T---GTTAAGGTATGTGCAA-GCTCACAGACCGCTGCCTTTCT-AAATCCCTC----GACGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGAAGTATGCA-GA-AGTAT-GCGGTCCA-T--TGTTG----GAGCGGT-GTCG--GTCAAAAGAT-GGTTTTCGTTT-GCC-TCTGGTG-ACTGTAGATGA-CACTTGTATTCATTG---------TTA--TGAACAC-A-A-G-AATAAAGC-TCAT---TTG-ACAGTGGAT-GGGCCCGGGTCCCCAA-GT-G--CA---AA--GA-AGGTA---AAGGCGCAACCA--T-CTTCAGTC-AAGG-TCA-TGACCA-CACT-A-T-TTT-A-GGA--CGCAAATCAG---TTAT-TTTGTTG-G-AC-TTTT-AACCCAAG-AA-A-AGTAC-----AATAA-CT--G-----CAAT-A-TGCA--C-TTTT-TAAACTTCC-T---AACC--C-ATCCGTTA----AAAA-TACTA-AGTTAACC-TC------T---G----TAAATGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAC-CGCG--ATAGT-T-CAAAACT--GCAAAAGT-GC-AATGGATGTTGT--A---GCATGAAACAGGTATGAATT----A----A-T-------ACTACA-TCCCGCT-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--GTGA-CTTCTTCCTATCCCCAAACTTAAA-AAAAATGATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAA
gi|10 : atgGC-TGAGAACCGCC-ATCTGTGA----AAAAACGCCG-TGGTAGAA-TC------T---C----TCAAGGTGTATTTT-TGC-AACA--GGACGA-CGCG--AAAGT-C-CACACTT--GCAAAGTT-GC-AATGGATGC-----------------CGGATATAAATT----A----A-T-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-ACGT--AA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTGTTCTCAAATTTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TCC--ACGGGGTCA-TTTCCGGTCTGAT---GAAGaaagtcctgacggtagttgaggagtgggtcaatgtaaagggccctgacattttaggttctgagctgattccacttgaacactgttggtctaagtgcatcacactagagggaattccctcgaaaaagaagaggtgaatataaaccaggattataagttaggcttgttac
gi|11 : g---------G-NGT--TT-CAACAATCTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGCGTT-TTA-----C----GAT-GATTTTCT-----------GGTG-GCTGTAGATGA-GACTTGGTTTTATC---------ATTA--TAAGC-C-AGA-G-AATAAACC-TCGG---TCG-TCAGTGGATAGGGCCTGGGTCCCTGT-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACGCAACCA--A-TTACTGGT-AAGA-TGG-TGGCCA-CAGT-A-T-TAT-G-GTA--CGCAAA--AGGGGTTAT-TATATTG-G-AC-TTTT-T-ATCAAG-TG-A-AGTAC-----AACAA-CT--GGAGTAGGCC-AGGGCAAAC-Taagtcgtaacggcagttgaggtgtgggtctgtggaaaggaccttgaccttttcagctctgggctgatagcacttgaacacagttgggttaagtgcatcacatttgagggcaattacattaaaaagcgagaggtgcatcataaccagaaatgggattggctggttgact
gi|12 : gGAAAT----C----A---------AGCAC--TC--GCC-TATGC-GCCT--GAGCCTGACTC-TA---C-A-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATAACTCCG-
gi|13 : agatgcacatgcagctggctaaagcC--GAAACGAGTACGAGTTAATAC----A-TGTGTAATACCACA-TTCTGCC-TATTTTGCCT--GA-CGTAGCTCCTA--GCGA-CTTTTTCCTATTCCTAACTTTGAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGATCTGACAAGGAAGTataaagttactgtattatatacggtcttacaatgaagtactagacggaagttaggagtgggtcaaatggaaagaacctgacaactcctccagttaagggctgatggtacaattgattcaccagttggggtcaatcgctccactaagaggtcaaattacatggataaaagaagaggggatctcaccggaaataagttcactgg
gi|14 : TGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTAGCTCCTA--ACGA-TTTCTTCCTATTTCCAAACCTAAA-AAAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTTA-TTTCCGGTCTTAC---AAAGtgtgacggcagttgagaattggggcaatggaaaggatcctgactttttcagttttgggcacttgtacaccgttggtctaagtgcgtcacacgagagggcaatttcatcaaaaaagaagaggtggatcagttaggttggttacttattgacttgct
gi|15 : TACTG-TGCTATAATTCGGTACTTGTATTC-AA----AT--GGTA--AAACGGGCAAGAAAATCCACGGCGAGTTAGCGGATGTTTGTGGGTCTTCGGCACCAT-CTTATGTTCAGGTTAAATTGTGGGTAAGGGAAT-TCAAA-AG-CG---GTAGAA--CGTCTTTA-GAAA----ATGA---AACCAGAC--CTA-GATGTCCACTGAATGTCAAAGATGA-GGAAC--T--------GTGT---TAGA-CTGTTC-GGG------------------TTC-TGATAAGCGAATTCAGGTGAAA----GAATGAG-CGCAaagtcttgacggaagttaaggagtgggtcaatggaaagaaccctgacattttcagttaagggctgatggtatttgatcaccgttggtctaatcgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttagactggttacttatta
gi|16 : TTTATTT--------ATTAG-TGAGC-C-AGG-GGAATAAAGCCTCAGA-GT-A-TCA------AG----TGGGTCCCCGA-GT-CATTA---AA--GC-AGTTCCAAAAGTTGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CA-T-A-TATTT-GCGGA--TGCAAA--AGGCCTTAT-TA-GTT--G-AC-TTTT---CCCAAGAAG-A-AGAGC-----AATAAGCCGAGGAGT-TACT-A-TG-AAACATAGC-T-GACCAGCTTGAGAACC
gi|17 : agatcgaaggttTT-G-CATG----G-TC--GTTTAGGTATGTACAA-GTTAACAGCCCGCTGGGTTCCC-AAATTTCTT----AGCATTGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----GCA-TC-AGTAT-ACAGAGCC-T--TGTTGTTTAAAGCGTT-TTA-----C----GAT-GATTTTC
gi|18 : TGTTTATGGGTCTTCTGCACTAT-TTTATGCCCAGGTTAAATTCTGGGTAGGGGGAT-TCA---------------AA--CGTCT------AG----AC----------------------GCCCACTGGATGCCACCGACGA-AGAAA--C--------GTGT---AAGA-
gi|19 : -ATTCTTTAATAAGATATTG---AATGTCAAAT-ATGGTTAGT-GATGCAAAG--ATGTTTTTCATC--T-AAA-GTT--G-------------------AGTACCG-CGCTATAATTTGGTACT
gi|2 : TCATGCTTTGTTTATAATACATGT------TTTATACC-GG-GTACAAAATTGT-C-ACGCGT--A---TT----GAGTCGATTCTTTAATAAGATTTCG---TATGTCAA-C-AT----AGTCGGTACAAAGGCATGCTGTTCATCGTTGAAACGTAGAA-------------------A-TATCGGTGCTATAATTCTGTATTTATATCTTAATCAAAA--GGTGT-AAAAAAACA-GGAAATACACGGCGAGTTAGCCAATGTGTATTGGT-TTCTGCG--ATACCTAT------------TTCTGGTT-GGGGAATATCAAA-AGACG---GTAGAA--CGGTTTTAGGAAGCATTACCAGGTAGTCAGGT--CTG-GACACTCACTGTATGCGA-CGACGACAGAAATGT--------GTGT---AAGA-AAGAT--GGG-ATCTTGGTG-T-----A-TC-TG-TAGGCGAA-----ATGG------------G-CGCAGGTATAGGACATTTCAA-AGTGATAT--------GCCAT--TG-CAACAATCTT-A-ACTG----GTTC--GTTTAGGTATGC-CAA-GCTAACAG-----------CCA-AAATTACTTTA--AGCGATTGACAAA-GGCAGAA--CCAGA-----GCAGTC-GGT-T-GCAGCGTC-CAATGTTG----AAGCGTTGTTAG--GTGAAAAG---GGTTTTATTTTCGCG-TCTGATG-A---CAGATGA-GTCTTGGATTCATCC--------ATTA--TGAGC-CTAGA-A-AAT------------GT-----AGTGGGTAGGGCCTGGGT-CCCGA-TG-C--C----AC--GA-AGT-------GA--TAGCCA-----------C-A--G-TG----------------T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCGTTAT-TATGTTGTGCAT-TTTG-A-CCCAAG-AG-A-A-TAC-----AATAA--------------------------TTGC-TAGATTGATATGAGAATTCAC-AT-CGTG-----AAAA-CGCCGAAAGTAAAC-GCCTTAAGT---CACAGTAAAGGTAGTTGCC-TGA-CACA---GACAA-CGAG--AGAGT-CACACAA-T--GCAAAGTT-GCAAATGGATGCTAT--AAGAGC--GAAACGGG------TT----C----A-T-------A--ACATTCCTGTC-TATT---CCG--AA----AG--CCTA--GCGA-CT--TTCCTCTTCCTTAACTTTGA-AAAA--GATA--CCCATTGGACAC---GTCA-TTTCCGG-CTGAC---GAAG
gi|20 : AAATTTGAG-AAAG--GACA--TCCG-TGG--AC---ATCA-TTTCCGGTCTGAC---GAAGaaatccgtgacggcagttgagaccagtatcaatgtaaagtacgtactttttcatttgaagagctatggcacttgagcaaccgattggttctaccacccaagtgcatacaactagaggcattaaatgactcaaacgattactaattgactcgcc
gi|21 : -ATTCTTTGATAAGATATTG---AATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTTTCaagttgtgacggcagttcaggagtga
gi|22 : tg-ATTCTTTGATAAGATATTG----ATGCCAATC-ATGGCTAGT--ATGCAAAAGTATGTTTT
gi|23 : ---AAGA-AAGTTC-GGG-ATC-TGATA-T-----ACTC-TGATAGGCGAATTCAGGTGGAA----GAAat
gi|3 : GAGA-CGGTCAC-AATTTCCATGCCTTGTTT-CAATACATGTGGTAGTATTATACCAGG-GTACAAAATTATA--ATATATCGACTATCCCAGGAGTC-ATTCTTTAATA-GATATCA---AAAGTCAAAC-ATGGCTACT-GATGCAAAGGCATGCTTTTCATT--T--AA-GTTAAG-------------------AGC-CCG-TGTTATAATTCGGTACTTGT-TTTTAA----AA--GGTA--AAACATACAAGGAAATACACGGCGAGTTAACCAATGTTTATGGGTCTTCTGCACCAC-CTTATGCTCAGGTTAATTT---GGTAAGGAAAT-TCAAC-CG-CG---GTAGAA--CATCTTTA-GAAG----GTGA---AGCCAAACTGCTG-GACGTCCACTGGATGCCATCGACGA-AGAAA--A--------GTGC---AAGA-AAGTTC-GGG-ATC-TAGTA-T-----ACTC-TGATAGGCGAATTTAGGTGGAA----GAAATAA-CGCAGGCATTAGACATTTTAC-A-CGGTA---------G-CAT--TT-CAACAATTTT-A-CGTG----A-TC--GTTGGGGTATGCGCAA-GCTAACATTCCGTTGGGTCCCA-AAATTCTTT----AGCGATGAGC-----------------A-----GCA-TC-AGTAT-GCAGCGCC-T--TGATG----AAGAGTT-TTCG--GTCAAAAGAT-GATTTTCTTTT-GCG-TCTGATG-ATAGTAGATGA-GACTTGGGTTCATTGAACAAAACATTA--CGAGC-C-AGA-G-AATAAAGA-TCAGA-GTCG-TCATTGGATAGGATCTGGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---TAGACACTATCA--T-CTGCTGGC-AAGG-AGA-TGGTCA-CAGT-G-T-TTG-G-GGA--CGCAAA--AGGCGTTGT-CATGTTG-G-ACTTTTT-A-CCCAAG-AG-A-AGTACAATAGAATAA-CT--GGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGACCAGC-CGAGAACCGCC-ATCCGTGA----ACAA-CGCCG-AGGTAAA---C------T---C----TAAAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGGCAA-TGCG--AGAAT-C-CACATTT--GCAAAGTT-GC-AACGGA--------G--AGC--GAAACGGGTATGAATT----C----A-T-------ATCACA-TCCTGCC-CACTC-GCCC--GA-CCTAGCTCCTA--GCGA-CCTCTTCCTATTTCCAAATTTGGA-ATAG--GATA--TCCG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTGAA---GAAGTct
gi|4 : acaCTGGACGCCAGGAACGA-AGCAA--A--------CTGTTCCAAGAGAAGTTTAGGG-ACC-TGGTAGT-----A-TC-GGATAGGTGAAT-CAGA---AC----GGAACA--TGCAG-CATTA-ACATTGCAC-A-TTGTAA--------G-CGTCGTTATAACAACCCT-AACATA----T-AC--GTTTAG--AAGCGCAACGCTAACAGCCCACTGGGTCCCCCAAATCCCTTCTATATTGAC-AGCAAATGGC--AAACCCAGA-----GCA-TCCAGTATTGCATCGCCAT--TGTTG----AACCAAT-AGAGCAGTCAAAAGATCGATTTC--TTT-AAG-CCT--TG-GT-----AT----ACTTGAGTTCATT------------A--TGAGC-C-AAA-T-AATAA-GC-TCAGAAGTCGATCA-TGG-TAGG-CTTGGATCCCCGAAGG-C--CA---AA--GACAGTTC---AA-ACGCAACCAATT-CTG-TAGC-AATG-TGA-TGGCCA-AGGT-ACT-TTT-G-GGA--CGCAAA--AGAC------TATGTTG-G-AC-TT------CCAAA-AGCA-AGTAC-----AATAG-CT--G-AG----CT-A----GAAG-TTGC-TAGGTCAGC-TGA-AACCGCCCATT-GTGGCGACAAGA-CGCCG-GGG-AAAC-TC------T---T----TAAAG---TTTTGCATGC-AACAAAGAACAAACGCA--AGATT-C-ACCACTTATGCAAGTTT-GC-AATG-ATGTTGTTAG--AGC--GAGACAGATATGCATT----A----A-T-------AATACA-TCCTGCCTTATTC-GCCT---A-CCTAGAT-CTA--GCGA-CTT-TTGGTATTCCC-AACTTGAACAAAG----TA--TCCA-T-G--AC---ATCATTTTCTTGT-TGAC---GAAGg
gi|5 : --------ATTA--TGA-C-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGAAGTCA-TCAGTGGGT----------CCCCCGA-GTTC--CATT-AA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTG-TGGC-AAGAATGAATGGTCAACACTTA-T-TTTTG-GGAAATGCAAA--AGGCCTTATGTATGTTG-G-AC-TTTT-TTCCCAAG-AG-AGAGCA------AATAA-TT--GGAGTTAACTGA-TGCAAAC-TAGCCTAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAACATC------TTTCC----TAAATGT-TTTTGC-TGTAAAAA--GGACAACCGTGGAATAGTCC-CACACTT--GCAAAGTTGGC-AATGGATTGTGTAGA--AAC--AAAACGAGTATGAATTA---C----AGTAA-----ACCACA-T-CTGCC-TATTC-GCCCTGGA-CCTCGCTCCTAGTGCGACCTTCTTCCTATTCCCAAACTTG-A-AAAG--GAAA--CCCA-TGattatgacgcgagttcaggagtaggacatatgaaaccctggatttttcattgtgggatgatgatggcacgtggaaatagttgttgtctgaagggtgcatcacactagaggcaattacatgaaaagaaagtagatctcaatggaaatagttaaggctggttaattattga
gi|6 : ttatTTATT---------ATTA--TGAGC-C-AGG-G-AATAAAGC-TCAGA-GTCA-TCAGTGGGT-----------CCCCGA-GT-C--CATTAAA--GC-AGTTC---AAAATGCAACCA--T-CTGCTGGC-AAGA-TGA-TGGTCA-CATT-A-T-TTT-G-GGA--TGCAAA--AGGCATTAT-TATGTTG-G-AC-TTTTTA-CCCAAG-AG-A-AGAGC-----AATAA-TT--GGAGTGTACT-A-TGCAAAC-TAGC-TAGACCAGC-TGAGAACCAAC-ATCCATGA----AAAA-TGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TAAATGTGTTTTGC-TGT-AACA--GGACAA-CGCG--AGAGT-C-CACACTT--GTAAAGTT-GC-AATGGATGTTGT--AT-AAC--AAAACAGGTATGAATTA---CAGTAA-C-------ACCACA-TCTTGCC-TATTC-GCCT--GA-CCTCGCTCCCA--GTGA-CTTCTTCCTATTCCCAAACTTGAA-AAAG--GAAA--CCCA-TGatggtctagttgaggagtgggttctatggaaaggaccctaaatttttcagttttctggctgttggcacttcaaccccgctaattgaattggctaagtcatcacacctagaggccgattacatcaaaggaagaagaggtggaatctcaactgaaataagtcaggctggtta
gi|7 : CG-TGCTATAATTCGGCACTTATATTTTAA----AATAGGCATTAAAC---CAAGAAAATACACGGCAAGTTAGC-GGTGTTCATGGATCTTCTGCACCAT-CTTAGTCTCAGGTGAAATTCTAGGTAGGGAAAT-TCAAC-CG-TG---GTAGAA--CGTCGTAA-GAAG----ATGA---AGCCAGGT--CTG-GA-----------TGCCACCGACGA-AGAAA--TGTGTAAATGTGT---AAGA-AAGTTA-GGT-ATC-TGGTA-T-----ACTC-TGAAAGGGAAATACAGGTGGAA----GAAATAG-CGCAGTCATTAAGCATTCCAC-A-TGGTA---------G-CGT--TT-CAACAATATT-G-CATG----A-CC--GTTTAGGTA----CA----------CCCGTTGGGTCCCC-AAATCCCTT----AGGGATGAGCAAATGGC--AA--CCAGA-----ACA-TT-AGTAT-GCAGCGGC-T--TGTTG----AAGCGTT-TTAG--GTCAAAATAT-TATTTT-TTTT-GCG-TCTGGTG-ATTGTAGATGA-GATTTGGATTCA-TG--------ATTA--TGAGA-A-AGA-G-AATAAAGC-TCAGA-ATCG-TCAGTGGGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGATGCAACCA--T-CAGCTGatggtctagttgaggagtgggtctatggaaaggaccctaaatttttcagttctaggctgtggcacttcaacactgctaatttgaattggtctaagtgcatcacactagaggccgattacatcaaaaaagaagaggtggatctcaactggaaataagtcaggctggtt
gi|8 : aa-C--CA---AA--GA-AGTTC---AAGACACAACCA--T-CCACTGGC-AAGA-TGA-TGGCCA-CAG-----------------------------------TATATTG-G-G-------A-CGCAA-----A-AGTAC-----AATAA-AT--TGAGTGAACT-A-TGCAAAC-TTGC-TAGATCAGC-TGAGAACAGAC-ATCCATGA----AAAA-CGCCG-AGGTAAAC-TC------T---C----TATAGGTGTTTTGC-TGC-AACA--GGACAA-CGAG--AGAGT-C-CGCA-----------TT-GC-AATGGATGCTGT--AG-AGC--AAAACGGGTATGAATT----A----A-C-------ACCATA-TCCTGTC-TATTC-GTCT----------CTCCTA--GCGA-CTTCTTCCTATT-CCAAACTTCAA-AATG--GATA--TATG-TGG--AC---GTCA-TTTCCGGTCTAAC---GAAG
gi|9 : AATCTCAAGTCG-CGTAGGTAGAGACCGTCGTAA-GAGG----ATGA---AGCCAGGT--CTGAGAGGGACA---GACGTTGACGACCATTGTAA--T--------G-GTA--AAGAGAAATTA-GAGTGTCGTGGTA-GCAGCAACCCTTGAAAG--GAATACA-GTAGAAGAATGAAATAGCCGCAGTCATAAGTCAATCCACAA-TGCTA---------A-GGC--TT-TCACAATATTAG-CATGAAAAG-ACCGGTCTA-ATAGGTGCAG-ACGACCAGCGTATC--GTTTCC-AAAT-CCTT----AG-G--GAACAAATGGC--AA--CCAGA------CA-TT-AG-AC-GCGG---C-T--TGGTG----AAGCGTT-TTA---GT--AAATAT-TATTTT-TTTT-GCGCTCTGGTGAATTGTAGATGATGATTT-GATTC--TG--------ATTACTCAAGA-A-AGATG-AATAACGC-TATGATATCG-TCAGT-GGTAGGGCTTTGGTCCCCGA-GG-C--CA---AAGGGA-AGTTC---AAGATGCA--CA--TGCAGCTGGCTAAAG-CGA-aactcgtaacggcagttgaggagtgggcaacggaaaggactctgatttttttttttttagttctggatgatgacactcgaacaagtgcatcacactagagggcaattacatcgaaaaagaagaggtggatctcaaccggaaataagttaggctggttacttattgattcgcc