lowQualScore : 111 111 1111111 11 11111 1111 1 11111 11111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 1 11 222222222222222222 2222222222222 1 222 22222222222222222222 4444444444444444444444444 1 222222222 11111 1111111111 11 22222222 11111 666666 22 11 11111111111111 222222222 111111 11111 222222222222 3333333333 11111 1 11 333333333333333333333 3333333333 88888888888888888888888888888888888888888888888888 1111111 111111 22 222 777777777777777777777777777 1111111 11 11111111111111 11 111 77777777 11 1 111 1
lowQualScore : 4 444 4 66 777 000 9999 4 4 99 2222222 4 55 4 4 22 55 77777 777 6666 2222 8888 777 4 66 4 4 2 4 11111 22222222 777 4 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 0 2 2 55 4444 11 4 4 4 2 000000000000000000 6666666666666 8 55 6 666 44 1 55555555555555555555 8888888888888888888888888 2 44 3 7 44 222222222 2 6 6 77 6 3 55555 3 3 3 6 5555555555 44 6 2 66666 5 11 66666666 4 4 88 4 11111 2 5 9 5 555555 8888 1 4 888 1 666 00 00 0 8888 88888888888888 44 3 3 6 3 333333333 3 3 6 3 3 3 88888 888888 3 3 3 3 7777 55555 555 444 3 3 3 55 7777 888 3 0 55 111111111111 3 3 4444444444 3 88888 2 77 777 1 8 3 3 7 3 3 000000000000000000000 4 5555555555 4 55 77777777777777777777777777777777777777777777777777 3 888 0 0000000 8 5 6 666666 5 1 22 222 5 5 6 444444444444444444444444444 8888888 77 77 8 4 99999999999999 55 5 4 333 1 55 77777777 11 7 55 2 3 5 5 5 5 666 666 5
lowQualScore : . ... . .. ... ... .... . . .. ....... . .. . . .. .. ..... ... .... .... .... ... . .. . . . . ..... ........ ... . . ............................................................................... ... . . . .. .... .. . . . . .................. ............. . .. . ... .. . .................... ......................... . .. . . .. ......... . . . .. . . ..... . . . . .......... .. . . ..... . .. ........ . . .. . ..... . . . . ...... .... . . ... . ... .. .. . .... .............. .. . . . . ......... . . . . . . ..... ...... . . . . .... ..... ... ... . . . .. .... ... . . .. ............ . . .......... . ..... . .. ... . . . . . . . ..................... . .......... . .. .................................................. . ... . ....... . . . ...... . . .. ... . . . ........................... ....... .. .. . . .............. .. . . ... . .. ........ .. . .. . . . . . . ... ... .
lowQualScore : 4 222 4 11 000 000 4444 4 0 55 9999999 6 55 0 0 22 55 66666 000 7777 8888 5555 000 0 11 4 4 2 4 11111 33333333 888 4 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 999 1 4 0 55 6666 44 0 0 0 8 999999999999999999 0000000000000 1 55 6 777 66 2 00000000000000000000 2222222222222222222222222 3 22 1 1 22 222222222 5 2 2 33 2 1 00000 1 1 1 6 5555555555 22 7 3 77777 7 00 22222222 0 4 11 4 44444 2 0 4 0 999999 8888 1 4 222 9 111 66 66 7 2222 11111111111111 66 3 1 2 1 333333333 1 1 8 1 1 3 33333 333333 3 3 3 3 1111 66666 888 111 6 6 6 00 7777 333 6 5 00 111111111111 6 6 8888888888 6 22222 5 55 000 5 0 7 6 3 6 6 111111111111111111111 0 9999999999 0 55 55555555555555555555555555555555555555555555555555 0 888 8 9999999 9 7 6 444444 0 4 66 444 7 7 6 333333333333333333333333333 6666666 99 44 9 2 11111111111111 99 2 4 999 1 11 77777777 00 2 44 0 4 0 7 7 7 111 777 0
consensus : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-T--A-A-TGA-G-TA----AAT-TATG-G--TA---T---TTTT--A-T-TACGCG--TA----CCCCC---ATCTG-TCAAA-C-GGC----AATATC---A-GA--ATT-C-ATTG-AA-----GAAG-T-----CC---TA-G-AANA-TGTCCATA----AAA---T--TTT-----GTTT------GAG-GTATGATN---NTG---C----AA-T-------TTTTTCCCTTAAATA-TGAA--AT-AA-ATA-TGTC-T-A-ATTAGAT-AATTA-G----A-----AGTGAAAT-TTT--TANC-ATAAT--TTCATG-TTTTTT--TTAATAATGG--------------------TGGTACAAAAA-T-----G--A--CC-----CNAAT--A-CGGGCC--C--------ACGGCAG-TCAA-AAA--TA-CA-GC-----ACT-GC-A-AAA-C--------CA--CTA-ATATGAA--T-ATATT--AAAA----TTTCG-ACTTG-TG-ATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATT-TTAA-AAAT--CTACAC-C--TTCNCA-GCAT---AAAA--TT-TTCA-C-A-GCATCTC--T---CA-T-TTA-T-AT-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAGC--CATTT---TGAGG-A-TG-A-T-TTTCA--CATAA----TA--GA-AGAT--AA-AA---------AATATA-T-AAT----AC----GTAACAAGT-GC---A-GAATTGT-T---TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGCA--TN---TC-------ATGA-AAAA-AA----TC----TTTA-AA--TTTACAGA-T-AAT-TTTTAAAAC-GTGC-AATACCGC--GTATNAATT--A------TNAAT---ATGTACA---TGT-ACCTCTGGTTNT-ATGTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAAATTGGAGTCATAGT--NTATTCA-AC-TATGAGTGAT-GGG---TGT---TGT------A----TTCA-------TTT--TAC-TAAATT-AAAATACATCCAAATT--AATATGAAAACAGTAT-A---AATCCACC-TAAAATG----TGAGCAC-TTTCACTC-CAGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACTCCC
Reference ( gi|2 ) : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-T--A-A-TGA-G-TA----AAT-TATG-G--TA---T---TTCT--A-T-TACATG--TA----CCCCC---ATTTG-TCAAA-C-AGC----AATATC---A-AA--ATT-C-ATGG-AA-----AAAA-T-----CC---TA-G-AATA-TGTCCACA----AAA---T--TTT-----GTTT------CAG-GTATGATG---GTG---T----AAGT-------TTCCCCCCTCAAATA-TGAA--AT-GA-ATA-TGTC-T-A-ATCAAAT-TATTA-G----A-----AGTGAAATATTT--TATC-ATATT--TTGATGGTTTTTT--TTAATAATGG--------------------TGGTACAACAA-T-----G--A--CT-----TAAAT--A-CAGGCC--C--------TCGACAG-TCAA-AAA--TA-CA-GC-----ACT-GC-A-ACA-C--------CA--CTA-ATATAAA--T-ATATT--AAAA----TTTCG-ACTTG-TA-ATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTT-AAAATACATT-TTAT-AAAT--CTGCAC-T--TTCACA-GCAT---GATA--TT-TTCA-C-A-GCATATC--T---CA-T-TCA-T-AT-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAGT--TATTT---TGAAG-A-TG-A-T-TTTCA--CATAA----TA--AA-AGAT--AA-CA---------AATATA-T-AAT----AC----ATAACAAGT-GC---A-GACTTG--T---TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA--TA---TC-------AT---AAAA-AA----TA----TTTA-AA--TTTACAGA-A-AATGTTTTAAAAC-ATGC-AATACCCCCTGTATGAAT---A------TAAAT---ATGTACA---TGT-ACCTCTGGTTCT-ATGTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAGT--CTATTCA-AC-TATAAGTGAT-CAG---TGT---TGT------A----TTCA-------TTT--TAA-TAAATT-AAAATGCATCCAGGTC--AATATAAAAACCGCAT-A---AATCCACC-CAAAATACTAGTAAGCAA-TATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAATACTATAGACTCCC
gi|1 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-T--A-A-TGAAG-TA----AAT-TATG-G--TA---T---TTCT--A-T-TACATG--TA----CCCCC---ATTTG-TCAAA-C-AGC----AATATC---A-AA--ATT-C-ATGG-AA-----AAA--T-----CC---TA-G-AATA-TGTCCACA----AAAA--T--TTT-----GTTT------CAG-GTATGATG---GTG---T----AAGT-------TTCCCCCCTCAAATA-TGAA--AT-GA-ATA-TGTC-T-A-ATCAAAT-TATTA-G----A-----AGTGAAATATTT--TATC-ATATT--TTGATGGTTTTTT--TTAATAATGG--------------------TGGTACAACAA-T-----G--AA-CT-----TAAAT--A-CAGGCC--C--------TCGACAG-TCAA-AAAATCAGCA-AC-----ACT-GC-A-ACA-C--------CA--CTA-ATATAAA--T-ATATT--AAAA----TTTCG-ACTTG-TA-ATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTTTAAAATACATT-TTAT-AAAT--CTGCAC-T--TTCACA-GCAT---GATA--TT-TTCA-C-A-GCATATC--T---CA-T-TCAAT-AT-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAGT--TATTT---TGAAG-A-TG-A-T-TTTCA--CATAA----TA--AA-AGAT--AA-CA---------AATATA-T-AAT----AC----ATAACAAGT-GC---A-GACTTG--T---TTTTATTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA--TA---TC-------AT---AAAA-AA----TA----TTTA-AA--TTTACAGA-A-AATGTTTTAAAAC-ATGC-AATACCCCCTGTATGAAT---A------TAAAT---ATGTACA---TGT-ACCTCTGGTTCT-ATGTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAG---CTATTCA-AC-TATAAGTGAT-CAG---TGT---TGT------A----TTCA-------TTT--TAA-TAAATT-AAAATGCATCCAGGTC--AATATAAAAACCGCAT-A---AATCCACC-C-AAATACTAGTAAGCAA-TATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAAAACTATAGACTCCC
gi|3 : TTAGGGGCTTGT--CAGTA-T--A-A-TGA-G-TA----AAT-TATG-G--TA---T---TTTT--A-T-TAAGTG--TA----CCCCC---ATCTG-TCAAA-C-GGC----AATATC---A-GA--ATT-C-ATTG-AA-----GAAG-T-----CC---TA-G-AAAT-TGTCAAT-----AAT---T--TTT-----GTTT------GAG-GTATGATC---CTG---C----AA-T-------TTTTTTCTTTAGATA-TGAA--AT-AG-ATA-TGTC-T-A-ATTAGAT-AAATA-G----A-----AGTGAA--ATTT--TAAC-ATACT--TTCATG---TTTT--TTAATAATGG--------------------TGGTGCAAATT-T-----G--A--AC-----CCAAT--A-C-GGCC--C--------ACGGCAG-TAAA-CAC--TA--A-GC-----ACT-GC-A-AAA-T--------CA--CTA-ATATGAA--T-ATATA--AAAA----ATT-G-ACTTG-TG-ATTTTTC-ATTCAAAGC--TCGC-ATAAT-A--TTCATA------TATGAAT-GCTT-G-T-AAAATGCA---TTA--AAATAACTACAC-C--TTCTCAGGCATAGCGAAA--TTAATCATC-AGGCATCTCCAT---C--T-TTA-T-AT-TA-----ACGA-TTGTTCTTGG-C-C--AA-A----TAATCCCATTT---TTGAG-A-TG-A-TCTTTCA--CATAA----TA--AGTACAT--AATTA---------AATAAATT-AATA---AT----GTAAC-AGTAGC---T-GAA-TG--T---TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGCA--TT---TC-------ATGAAAAAA-AA----TC----TTTA-AA--TTTTAAGATC-AAT-TTTTAAAACGGTG--ACTACAAC--GTATCGATTC-AGT----TACAT---ATGTAC---------CCTCTGG---T-GTATGTGGAT------TAGATGACCACAAATTGGAAAGAAAATTGGAATCATAGTAAATATTCA-AC--AT-AGTGAT-GGA---TAT---TACTTA---A----TTCA---------T--TAA-TAAA-T-AAAAAACATCAA--TT--AA-ATGAAAATAGTATAA---AATCCAAC-CTAAA------TGAGCAC-TTTCAC-T-CAGTCA-TGA--G-TC-ACGG-GCTACAGAACCCC
gi|5 : aaaaGGGGG-TTGT--CAGTAAT--ACA-TGA-G-TA----AATCTATG-GG-TA---T---TTTTTAA-T-T-TATG--TATATTCCCCC---ATCTG-TTAAAAC-GGC----AATATC---A-GA--ATT-C-ATTG-AA-----GAAG-T-----CC---TA-G-AAAATTGTCCA-A----TAATTTT--TTT-----GTTT------GAG-A-ATGATC---CTG---C----AATT-------TTTTTTCCTTAAATA-TGAA--ATAGA-TTA-TGTC-T-A-ATTAGATATAATA-G----A-----AGTGAAAT-TTT--AAACAATAAT--TTTATG---TTTT--TTAATAATGG--------------------TGGTACATAAA-TTGGAAA--A--CC-------AAT--A-C-GGAC--C--------ACGGCAG-TCAA-AAA--TA-CA-GCAG---ACT-GCAA-ACA-T--------CA--CT--ATATGAA--TCATAAA--AAAA----ATT-G-CCTTGTTG-A--TTTC-ATTCGAA-C--TCGC-ATAATGATGTTCATA------TATGAAT-GCTT-TTA-AAAATACATTAAAAT-AAAT--CTACAC-C--TTCTCA--CATA--AAAA--TT-TTCA-CGA-GCATCTC--CA--CA-T-TTA-T-AT-TT-----ACAA-T--TTTTTGG-C-C--AA-A----TAGC--CATTT---TGAGG-A-T--A-T-TTTCA--CATAA----AA--GA-ACAT--AA-AA---------AAAGTA-T--AT----AT----GT-ACAAGT-GC---CTGAATTG--TGTGTTTATCC-ATTCCGGCAA-G-TG-CAT-TA-TGCA--TT---TC-------ATGAAAAAA-AA----TC----TTTACAA--TTTACAGA-ctact
gi|4 : aaataGGGGG-TTAT--CA-TA-T--A-AATGA---TA----AAT--ATG-G--TA---G---GTTT--T-T-TGC-TG--TG----ACCCC---ATCGT-TCAAA-C--GC----AATATC---A-AC--ATT-CTATTG-AG-----GAAAGT-----CC---TAAG-AAAT-TGTCAATA----A-----T--TTT-----GTTT--------------GATA---GTG---TCTGCAATT-------TTTTCC--TTAAATA-TGAAGCAT-GAGATA--GTC-T-AGATTAGAT-AAATATG----AC----AGTGA--TAATT--TAAC-ATAAG--TTCATGGTTTTTT----AATA-TGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTAAAA-AT-T-----G--AAACC-----CAA-T--AGCAACCG--C--------ACGGCAG-TCAATAAA--TA-CA-GC-----ACT-GC-A-AAA-T--------CA--CTA-ATATAA------TATT--AAAAAAAATT--G-ACT-G-TG-ATTGT-C-AT-CAAA-CACTCGC--TA-T-ATGTTCA-------ATATGAAT-GCTTTGTT-AAAATACATT-TAA--AAATA-CTACAA-C--TTCTCA--CAC---GAAA--TT-TTCA-C-A-GCAT--C--T---CAAT-TTA-T-AC-T------AC-A-T--TTTTGGC-C-C-AAAGA----TCGC--CCATT---TGAGG-A-TG-A-T-TTCAA--CATAA----TA--GA-AGATAAAA-AA---------AATATA-T-AAT----G-------AACAA-T-GC---G-GA--TG--T---TTTATCTAATTCC-TCCA-A-AG-CA--TATTGCAT-TT---TC-------AT---AAAA-AAAAACTC----TTTA-AA---TTACAGA-ATAAT-TTT---AAC--TGT-CTTACAC---GAATG-AT---AGTCAGTTAAAC---A--AATA---TGT-ACCTCT-GTTGT-ATG-GTGTGA------TAGAT-CCAACAAA-TGGAAAGAAA-ATGGAGTCATAGT---TATTCACAC-TATGAGTGA--GAGAATTTC---TGA------AGGATTTCA-------TTT--TAC-TAAAAT-AAAATACACTCAAATTTAAATGGAAAAAACATAA-A---AATCCACC-TAA---AC---TGAGGAC-TTTCACTC-CAT-CA-TGAC-GTTC-ACGCTACTAtattt
gi|7 : aattaaGGGCG-TTGT--CAGTA-TCAG-A-TAG-GCTATTTTAAT-TATG-G--TAAGGTAA-TTCT--AAT-TAC-TG--T-------------------TCAAA----------GAT-TC---G-AA--ATTGC-AT---AT-----AAAA-T-----CT---TG-T-TGTA-T-T----------AA---TGGTTT------TTT--------G-ATATCCTG---G-----------AAT-------TTTTTTTCTTAAATAATGAA--AT-AG-AT--TGTCCT-A-ATTAGAT-AAT---G----A-----AGTGAA---CTT--T-TC-ATAAT--CC-ATGTTTTTTC--CTAATA------------------------TGTTACAA-AT-T-----G--A--CC-------AAT--A-CGG--C--C--------ACGGCAGCTCAA-AAA--TA-C--GC-----A-T-GC-A-AAA-T--------CA--CTA-TT-TGA---C-ATATTCAAAAA----TTTTGGACTTG-TG-ATTTTTC-ACTCAA-----TCG--AT-AT-ATGTTCATAT---TGGATG------TT-GTT--AAATGCA-T-TAAA-AAAT--CTACAC-CTATTCGC-----T---AAAA--TT-TT-A-C-G---AT-TC--T---CA-T-T-A-T-ATCTT-----AC-A-A--TTTTTGGCC-C-AAA-A----TAGC--CATTT---TG-AG-G-TG-A-T-TTTCA--CCTAA----AA--GA-ACAT--AA--A---------ACTATA-T-AAC-----T----GTAA-AAGT-GT-----GACTTGTTT---TTTATCTAATTCC-TCAA-GATG-CAT-TATTGCA--TT---TT-------ATGA-AAAA-AA----CAAAT-TTTA-AA--TTTACAGA-T-AAT-TTT---AAC-GTGC---TACCGTAGATATCAGTTAAA------TCAAT---ATGTACgacc
gi|25 : aattagGGGGG-TTATATCAGTA-T--A-G-TGA-G-TA----AAG-TATG-T--GA---TCTGTTTT--A-T-TATACGTTTA----TCCCC---ATTAGTTCAAA-tct
gi|6 : aaactaGGCG-TTGT--CAGTA-T--A----GA---TA--------TATG-AGCTA---T---TTCA--A-T-TATGTG--TA----------------------A-C--GT----ATTCTT---A-GA---TT-C--TGGTCA-----AAGC-T-----TC---CA-G-AAAT-TGTC-ATA----AAA---T--CTTAAATTGTTT------T-G-GT-TGATG---ATGACCTG---AATT-------TTTTTTCCTTAAATAATGAA--AT-AG-ATACTGTC-T-A--TTAGATACAT---G----A-----AGTGAAAT--TT--TA-C-ATAAT--CC-ATG-TTTTTT--TCAATGATG---------------------T--TACAAAAT-T-----G--A--CC------AAAT--A-CG---C--C--------ACGGCAGCTCAA-AAAA-TA-CG--------ACT-GC-A-AAAGT--------CA--CTT-AT-TAGA--C-ATATTCAAAAA----TTTTG-ACTTG-TAGATTTTTC-ACTCAA-----TCGC-ATA-T-ATGTTC-TAT---TGGATGATTAG--T-GT---AAATGCATT---AA-AAAT--CTACACAT--CTC----GCAT---AAAA--TT-TTCA-C---GCAT-TC------CA-TGTTA-T-TC-TT-----AC-AAT--TTTTTGG-C-CCAAA-A----TAGC--C-TTT---TGAGG---TG-A-T-TTTCA--CCTAA----AA--GA-ACAT--A---A---------AATATA-T-AAC-----T----GTA--AAGT-GT-----GAATTGT-T---TTTATCTAATTCC-TCAA-GATGCCATCTATTGCA--T----TT-------ATGA-AAAA-AA----CAAACTTTTA-AA--TTTACAGA-T-AAT-TTT---AAC-GTGC---TACCGTAGGTTTCAGTTAAA------TCAAT---ATGTACtggaca
gi|11 : ggaGGGG-TTGC---AGTA-T--A-A-TGA-G-TA----AAT-TATG-G--TA---T---TT-T--A-T-TAGGC---TA-----CCCT---ATCTG-TCAAA-CAAGCCCAAAACATC---AGGA--ATG-C-ATTG-AAAACAGAAAA-TGAAAGTC---CA-G-AA-A-TGT-CAAA----AGA---TAATTT-----G--T------GAG-GTA-AATATCCTTG---C----AA-T-------TTTTTTCTTTAAATATTGAA--AT-AG-ATACTGTC-TAA-ATTAGAT-AAATA-GAGAAA-----AGTAAAAT-CTT--TAAC-ATAAT--TTCATG---TTTT--TTAATTATGG--------------------TGATACCAAAATT-----G--A--AC-----CCAAT--A-CGAGCC--C--------ACGGCAG-TCAG-AAA--TACCA-GC-----ACT-GC-A-AAT-T--------CA--CTA-tct
gi|12 : aaattaaGG-TTGT--CAGTG-T--A-A-TGA-G-TA----AAT-TATG-G--TA---T---TTTT--A-T-TATGTG--CA----GCCCC---ATCTG-TCAAA-C-AGC----AATATC---A-GA--ATT-C-ATTG-AA-----GAAG-T-----CC---TA-G-AAT--TGTCAATA----TTT---T--TTT-----GTTT------GAG-GCATGATT----TA---T----GAATCCTGTTATTTTTCCCTTAAATA-TGAA--AT-AA-ATA-TGTC-T-A-ATTAAAT-AATTA-G----A-----AGAGAAAT-TTTAACATT-ATAAT--TTCATG----TTT--TTAATAATGG--------------------TGGTACCAAAA-T-----GAAA--CC-----C-AAT--A-C-GGCC--C--------ACGGCAG-TAAA-AAA--TA-CA-GC-----ACT-GC-A-AAA-C--------CA--CTA-ACAGGAA--T-AT-TC--AAAA----
gi|29 : ATGTG--TA---T---TTTT--A-TATAAGCG--TA----CCCCCTCCATCTG-TCAAA-C-AGC----AACAAC---A-aata
gi|10 : gagccaa-TCAGA-A-GAC----AATATCTTCA-AAGTATC-C-ATTG-AA-----GTAG-T-----CCGTATA-GTAAGA-AG-CCATAGTACAAA---T--TTC-----GTTTGGATGCCAATGTATGATC---CTG---C----AA-T-------TTGTTCGCTCAACTA-TTAA--AT-GA-ATA-AGTG-T-A-ATCAAAT-AATCA-A----A-----AGTGAAA--------------ATT--TTAAT-----------------CGG--------------------TGGTACAA-GT-T-----G--A--CT-----CAA-T--G-CAGGCC-----------TCAACGG-TCAATAAA--TA--A-GCC----ACT-GC-AGACA-C--------CAATCTAGATATAGAACT-AT-TT--AAAA----AT--G-ACTTG-TG-ATTTTTCTATT-AAA-C--TCGCGATA---ATGTTCATAC-----TAT----------------AATTCATT-TTAGAAAAT--CTACAC-T--TCC-CA-TCAC---AAAAGCTT-TTCA-CAA-GCATTTT--T---CA-T-TAT-T-A--TT-----AC-A----TTGTGGG-C-C-AAA-A----TAGC--C-TTT---TG
gi|14 : tca-TGAA--AT-AA-ATG--ATC-T-A-ATTAAAT-ATTTA-G----ATTTTTAGTAAAGTGTTT--T-TA-ACATTACTTCATGTTTTTTA--TTAATAATAG--------------------TGGTACAAAAA-T-----GA-A--CTCGAGCTCAAT--A-C-GGCC--A--------ACGGCAG-TCAA-AAA--GC-CA-ACAAGCGACTGGC-A-ATA-CAGGTAACGCA--CTATATGTGAA--T-AT-TT--AAA--------CA-ACTTt
gi|24 : tttTCTTGT--TTGATAATGG--------------------TGGTACAGGAA-------A--A--TT-----CTCATCAA-C-GGCC--C--------ACGGCAG-TCAA-AAA--TA-CAGGC-----ACT-GC-A-AAA-C--------CA--tgtcatg
gi|19 : ttaacattattactTTTTTGATTAATAATGG--------------------GGGTACAAAAA-T-----G--A--AC-----TCAAT--A-CAAGCCATCGACACTAGTCGACAG-TCAT-AAA--TA-CT-GC-----ACT-GC-T-GCA-----------A--C-A-ATATGAA--T-A-ATC--AAAA----T--------------ATTTTTC-ATTCAA
gi|27 : tgGG--------------------TGGTACTA-AA-TTT---A--A--CT-----CAA-T--A-C-GGCC--C--------ACGGGAG-TCAA-AAA--TA-CA-GT-----ACT-GC-A-AAA-C--------CA--CTA-c
gi|20 : TCG-ACTTG-TG-ATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-AGAAT-ATGTTCATATG------TGGAT-GCTT-GTT-AAAATACATT-TTGA-AAAT--ATGTAC-T--TTCAGA-GCAT---AAGA--TT-TCCA-C-A-AC--ATC--T---CA-T-TTA-T-
gi|8 : AAT-GCTT-GTT-AAAACACATT-TTAA-AAAT--TTGCAT-T--TTCACA-GTAT---AAGA--TT-TTCA-C-A-GCAT--C--T---CA-T-TTA-T-AT-TT-----AC-AAT--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAGC---ATTT---TAAAG-A-TG-A-T-TTTCA--CATAA----TA--GA-AGAT--AA-CA---------AATATA----AT----AT----ATAACAAGT-GC---A-GAATTG--T---TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TA-CAT-TATTGCA--TA---TC-------AT---AAAA-AA----TC----TTTA-AA--TTTACAGA-T-AA--TTTTAA----ATCT-AATTTTGATTGTATG-AT---A------TCAATTAAACAAATA---CGT-ACCTCTGGTTGC-ATGTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAAAAGATTGGAGCCATTGT--CTATTCA-AC-TATAAATGATGGAG---CGTTAATGT------A----TTCA-------TTT--TAC-TAAATT-AAAATACATCCATGTA--AATCGAAAAA-CGTAT-A---AATCCAGC-CAAAA------TAAGCAA-TATCATTT-CGGACA-TG
gi|9 : aA--TT-TTCA-C-A-GCATCTC------CA-T-TTA-T-AT-TTTAATTAC-AAT--TTTTTGG-C-A-AAA-A----TAGC--CATTT---TGAGG-A-CG-AAT-TTTCA--CATAA----TA--GA-AGAT--AA-AA---------AATATA-T-AAT----G-----GTAACAAGT-GC---T-GAATTGT-T---TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGC---TT---TCCA-----ATG--AAAA-AA----TC----TTTA-AAGTTTTACAGA-T-AAT-TTT---AAC-GTGCTAACAC-----GTATG-AT---A------TCGAG---TTAAACAAATTGTAACCTCTGGTTGTAATGTGTGGAT------TAGATGACAA-AAA-T-GAAAGAAAATTGGAATCATAGT--ATATTCA-AC-TATGAGTGAT---G---GAT---TATTACTTAA----TTCA-------TTTACTA---AAATT-AAAATACAT-CAAATT--AA-ATGAAAA----AT-AGTTAAT-CACCTTAAAA------TGAGCAACTTTCACTC-CAATCA-TGAC-G-TCAACGCTAATA-AGA-TCCC
gi|16 : a--TT-TTCA-T-A-TCATCTC------CA-T-CTA-T-AT-TT-----AC-T-T--TTTTTAG-C-C-AAA-A----AATT--CATTT----GAAG-A-TT-A-T-TTTCA--CATGA----TA--GA-AAA---AA-AA---------AATATA-T-AAT----ACTTGTATAACAAGT-GC---A-TAATTGT-T---TTTATTTGATTCC-TCAA-G-TG-CAT-t
gi|13 : --TT-TTCA-C-A-GCA-ATC--TTCCCA-T-TCA-TAAT-TT-----ACAA-TG-TTTTTGG-CTC-AAA-AATATTAAC--CATTTGTGTGAGGCATTGTA-T-TTCCAATCATGAATCTTAGTGA-AGAT--AA-AAAAAAAGAAGAATATA-TGAATTGTAAC----ATATC--GT-GCTTGA-AAATCT--T---TTTATCTAATTCCTTCAAGG-TG-CAT-TATTGCAATTAAGTTCAATTGCGAT---GAAATAA----TATCT-TTTA-CA--ATTACAGT-C-ATTATTTTAA
gi|22 : taccttgttcaagcccgatttaaacatatttCA-C-A-GCATTTC------CA-T-TTA-T-AT-TT-----AC-A-T--TTTT-GG-C-T-AAA-A----CAGC--CATTT---TGAAG-A-AA-A-T-TTTTA--CATAC----TA--GA-AGAT--TA-AA---------AA-ATA-T-AAT----------ATAACAAGT-GC---A-cgctacacgtttg
gi|18 : -G-TG-CAT-TATTGCA--TA---TC-------AT---AAAA-AAAA--TC----TTTC-AA--TTTACAGA-T-AATAT------AT-ACGA-AAGA-------TATCAAT---AAA----CAAAT---ATGTACA---T-------CTGGTTTT-ATGTGTGCATTAGCTATAGATGACAACAAA-TGGAA
gi|26 : ATA---TGT-ACCTCTGGTTTT-ATGTGTGGAT------TCGATGACAACAAA-CGGAAAGGAAATTGGAATCATAGT--TTA
gi|15 : -TGGAAAGAA--TTGGAATCATAGTA-TTATTCA-ACTTACGAGTGAT-GGA---TAT---T-TACTTA-A----TTCA-------TTT--TACTTAAATTAAAAATACAT-CAAATT--AA-ATGAAAATAGTAT-A---AAT-CACC-TAAAA------TGAGCAC-TTTCACTCACAGTCATTGACGG-TC-ACGCTAC--TAGA-TCCCa
gi|17 : A-AC-TATGAGTGAT--GG---AGA---TTT------A----CTCAATTCGTTTTT--TAC-TAAATT-AAAATACAACAAATTA--AATG-AAAAACAGTAT-A---AATCCACC-TAAAATG------AGCAC-TTTCACTC-CAGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTAC--TAGACCCCtac
gi|23 : AATTCAAAATACATC-AAATT--AA-ATGGAAACAGTAT-A---AATCCACC-TAAAATta
gi|21 : ATT-AAAA-ACATCATTATT--AATG-AAAAATAGTAT-ATA-AATCCACC-TAAAATG------AGCAC-TATCACTC-CAGTCT-TGAT-G-TC-ACGTTACTAggcattagcactcatcatacaccacgaacgccgctactcagac
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TATAAATCCAAATAAAATGAGTACTTTCGCTCCAATCATAACGTCACTCTACTAGACCCCTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111 22222222222222 111 222222222222 111111111111111111 1111111 111111111 22222 11 11 2222222222222222222 222222222222222222 1 11111 11111 1111111 11 1 222222 11 22 111111 111111111 2222222 11111 111 222222222222 111 5555555555555555555555555555555555555 1111 111111 111 44444444444444444444444 11111111 1 111 4444444444
lowQualScore : 4 55 4 555 99 4 3 88 666 555 3 3 88888888888 55 666 666 6 7777 7777 99999 4 4 8888 22222222222222 7777 4 4 555 4 3 111111111111 55 8888 444444444444444444 1 2222222 3 666666666 7 3 55 3 3 99 3 3 3 7 11 3 00000 3 22 999 2 3 3 22 777 3333333333333333333 33 5 777777777777777777 33 0 1 00000 77777 5 5 66 5 4444 33333 2 2 999999999 2 2 33 6 1 3 3 3 5555555 1 33 3 4 4 4 88888 4 2 4 888888 1 4 4 44 44 444 99 55 1 999 4 777 44 3 2 5 2 2 4 2 00 33 2 2 3 3 77777 555555 3 6 3 6666 44 0 555 3 777 3 44 777777 44 44 3 333333333 3 3 6666666 3 44 3 55555 2 111 3 7 3 6 3 3 222222222222 1 55 555 3 7777 55 77777 3 55 88 3 7 0000000000000000000000000000000000000 4 1 4 777 0000 5 2 5 5 1 444444 4 33 222 5 5 5 2 22222222222222222222222 99999999 5 5 8 99 8 4 111 8 3 55 3 3 0000000000 3 2 3 3 4 4 4 2 7 0 7
lowQualScore : . .. . ... .. . . .. ... ... . . ........... .. ... ... . .... .... ..... . . .... .............. .... . . ... . . ............ .. .... .................. . ....... . ......... . . .. . . .. . . . . .. . ..... . .. ... . . . .. ... ................... .. . .................. .. . . ..... ..... . . .. . .... ..... . . ......... . . .. . . . . . ....... . .. . . . . ..... . . . ...... . . . .. .. ... .. .. . ... . ... .. . . . . . . . .. .. . . . . ..... ...... . . . .... .. . ... . ... . .. ...... .. .. . ......... . . ....... . .. . ..... . ... . . . . . . ............ . .. ... . .... .. ..... . .. .. . . ..................................... . . . ... .... . . . . . ...... . .. ... . . . . ....................... ........ . . . .. . . ... . . .. . . .......... . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 0 55 0 444 00 0 6 66 444 222 6 6 66666666666 00 444 444 7 2222 7777 11111 0 0 5555 99999999999999 8888 0 0 000 1 8 333333333333 55 5555 000000000000000000 6 7777777 2 000000000 3 6 00 6 6 55 6 6 6 3 77 6 55555 6 33 222 2 3 2 22 000 8888888888888888888 99 4 111111111111111111 99 6 2 00000 11111 7 7 88 7 2222 99999 9 9 444444444 9 9 99 2 3 6 6 6 9999999 2 11 6 0 0 0 00000 4 8 4 111111 4 0 0 99 22 222 55 55 0 888 0 000 22 1 9 7 9 9 8 9 55 99 9 9 1 1 77777 555555 1 2 1 5555 22 4 444 3 666 3 66 999999 66 66 3 333333333 3 3 7777777 3 66 3 99999 0 666 6 3 3 7 3 3 333333333333 0 00 888 6 7777 00 55555 6 00 66 6 3 3333333333333333333333333333333333333 4 0 4 888 8888 0 8 0 0 4 444444 4 22 888 0 0 0 2 55555555555555555555555 55555555 0 0 0 11 1 0 000 0 6 00 6 6 0000000000 6 8 6 6 0 0 0 9 3 1 9
consensus : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACG-----CG--TA--CCCCC---A---TCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AANN-TGTCNATA----AA--A---T--TTTGTT----TG-------A-GGT------ATGA-TCC---TGCAA-T-------TTTTTCCCTTAAATA-T-GAA--ATAG-A-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTT--TAAC-ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT-----G-A-C-----CCCAAT--ACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TCAA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAGTT--A-TCA-AT---ATGTACA---TGT-ACCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACCCCC
Reference ( family-2207 ) : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACG-----CG--TA--CCCCC---A---TCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AANA-TGTCCATA----AA--A---T--TTTGTT----TG-------A-GGT------ATGA-TNN---TGCAA-T-------TTTTTCCCTTAAATA-T-GAA--ATAA-A-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTT--TANC-ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT-----G-A-C-----CCNAAT--ACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TCAA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAATT--A-TNA-AT---ATGTACA---TGT-ACCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAAATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTTTCACTC-CAGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACTCCC
gi|1 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGAAGTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACA-----TG--TA--CCCCC---A---TTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----AAAA-----------A--TCC---TA-G-AATA-TGTCCACA----AA--AA--T--TTTGTT----TC-------A-GGT------ATGA-TGG---TGTAAGT-------TTCCCCCCTCAAATA-T-GAA--ATGA-A-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTT--TATC-ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT-----G-AAC-----TTAAAT--ACAGGCC-----CT-----CGACAG-TCAA-AAAATCAGC--A-AC-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTTTAAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT-CT-CA--T-TCAATA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AAT-AC----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG-T-T-TTTAT-TAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTA--AAAC-ATGCAATAC-CC--CCTGTATGAA-T--A-TAA-AT---ATGTACA---TGT-ACCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAG---CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCA-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAA-T-AAATT-AAAATGCATCCAGGTCAATA-TA---AAAA-CCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAATACTA--GTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAAAACTATAGACTCCC
gi|10 : -TCAGA-AG-AC----AATATCTTCAAAG-TATCC-ATTG----AAGT-----------A-GTCCGTATA-GTAAGA-AG-CCATAGTACAA--A---T--TTCGTT----TGGATGCCAA-TGT------ATGA-TCC---TGCAA-T-------TTGTTCGCTCAACTA-T-TAA--ATGA-A-TA-AGTG-TA-A-TCAAATA-ATCA-AA-----AGTGA-AAA--TTT--TAA--------TC---------------------------------------GGTGGTACA--AGT-T-----G-A-C-----TC-AAT--GCAGGCC-----T------CAACGG-TCAATAAA--TA----A-GCC----ACT-GC-AG-------ACA-C-CAATCTAGATATAGAACT-AT---TT--AAAAAT--G-ACTTG-T-GATTTTTCTATT-AAA-C--TCGCGATA---ATGTTCATAC---TAT------------------AATTCATTTTAGA-AAAT--CTACA-CT--TCCCA-TCAC-A---AAAGCTT-TTCA-CAA-GCA-TTT-TT-CA----TTA-TT-A-TT-----AC-A----TTGTGGGC-C-AAA-A----TAG--CC-TTT---TG
gi|11 : tcaGGGG-TTG---CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTT---AT-T-AGG-----C---TA--CCCT----A---TCTG-TCAAA-CAAGCCCAAAACATC-----AGGAATGC-ATTG----AAAACAGAAAATGAAA-GTCC----A-G-AA-A-TGTCAA-A----AG--A---TAATTTGT------G-------A-GGT------A-AA-TATCCTTGCAA-T-------TTTTTTCTTTAAATA-TTGAA--ATAG-A-TACTGTC-TA-AATTAGATA-AATA-GAGAAA-AGTAA-AAT--CTT--TAAC-ATAATTTCATG-TTTTTT----AATT-------------------ATGGTGATACC--AAAATT----G-A-A-----CCCAAT--ACGAGCC-----CA-----CGGCAG-TCAG-AAA--TACC--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-T-T-CA--CTA-t
gi|12 : aaattaaGG-TTGT--CAGTG-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ATG-----TG--CA--GCCCC---A---TCTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AAT--TGTCAATA----TT--T---T--TTTGTT----TG-------A-GGC------ATGATTTA---TG-AA-TCCTGTTATTTTTCCCTTAAATA-T-GAA--ATAA-A-TA-TGTC-TA-A-TTAAATA-ATTA-GA-----AGAGA-AAT--TTTAACATT-ATAATTTCATG----TTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACC--AAAAT-----GAA-A-----CCCAAT--AC-GGCC-----CA-----CGGCAG-TAAA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ACAG-GAA-T-AT---TC--AAAA
gi|13 : --TT-TTCA-C-A-GCAATCTTCC-CA--T-TCA-TAAT-TT-----AC-AATG-TTTTTGGCTC-AAA-AATATTAA--CCATTTGTGTGAGGCATTGTAT-TTCCAATCATGAATCTT-AGTGAAGAT--AA-AAAAAAAGAAGAATATA-TGAAT--T----GTAACATATCGT-GCTTGA-AAATC--T-T-TTTATCTAATTCCTTCAAGG-TG-CAT-TATTGCAATTAAGTTCAATTGCG--ATG-AAATA----ATA--T---CTTTTA-CA--ATTACAGTCAT-TAT-TTT-----AAC-Gaata
gi|14 : taccttgttcaagcccgatttaaacatattt-T-GAA--ATAA-A-TG--ATC-TA-A-TTAAATA-TTTA-GATTTTTAGTAA-AGTGTTTT--TAAC-ATTACTTCATG-TTTTTTAT-TAATA-------------------ATAGTGGTACA--AAAAT-----GAA-CTCGAGCTCAAT--AC-GGCC-----AA-----CGGCAG-TCAA-AAA--GC-C--A-ACAAGCGACTGGC-AATACAGGTA-A-CGCA--CTATATGT-GAA-T-AT---TT--AAA----CA-ACTTctacacgtttg
gi|15 : ttt-TGGAAAGAA--TTGGAATCATAGT--ATTATTCA-ACTTACGAGTGATGG-A---TAT---T-T---ACTTAATTCA-------TTTTACTT-AAATTAAAAATACAT-CAAATTAA-A-TG---AAAA-TAGTAT-A--AAT-C-ACC-TAAA-A------TGAGC-ACTTTCACTCACAGTCATTGACGG-TC-ACGCTAC--TAGA-TCCCtgtcatg
gi|16 : --TT-TTCA-T-A-TCA-TCT-C--CA--T-CTA-TA-T-TT-----AC-T-T--TTTTTAGC-C-AAA-A----AAT--TCATTT----GAAG-AT-T-AT-TTTCA--CATGA----T-AG--AAAA---AA-AAAA---------TATA-T-AAT-ACTTGTATAACA-A--GT-GC---A-TAATTG-T-T-TTTATTTGATTCC-TCAA-G-TG-CAT-tac
gi|17 : A-ACT-ATGAGTGATGG-A---GAT---T-T---A-----CTCAATTCGTTTTTTAC-T-AAATT-AAAATACA-ACAAATTAA-A-TG---AAAAACAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----G--AGC-ACTTTCACTC-CAGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTAC--TAGACCCC
gi|18 : -G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--ATA-AAA-A----AAA--T---C-TTTC-AA--TTTACAG--AT-AAT-ATATACGAAA------GATAT-CA-------ATAA-----A-CAA-AT---ATGTACA----------TCTGGTTTT-AT-GTGTGCATTAGCTATAGATGACAACAAA-TGGAAta
gi|19 : TG-TTTTTGAT-TAATA-------------------ATGGGGGTACA--AAAAT-----G-A-A-----CTCAAT--ACAAGCCATCGACACTAGTCGACAG-TCAT-AAA--TA-C--T-GC-----ACT-GCTGC-------A-A-C-------A-ATAT-GAA-T-A---ATC--AAAAT--------------ATTTTTC-ATTCAA
gi|2 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACA-----TG--TA--CCCCC---A---TTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----AAAA-----------A-ATCC---TA-G-AATA-TGTCCACA----AA--A---T--TTTGTT----TC-------A-GGT------ATGA-TGG---TGTAAGT-------TTCCCCCCTCAAATA-T-GAA--ATGA-A-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTT--TATC-ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT-----G-A-C-----TTAAAT--ACAGGCC-----CT-----CGACAG-TCAA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT-CT-CA--T-TCA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AAT-AC----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG-T-T-TT-ATTTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTA--AAAC-ATGCAATAC-CC--CCTGTATGAAT---A-TAA-AT---ATGTACA---TGT-ACCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCA-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAA-T-AAATT-AAAATGCATCCAGGTCAATA-TA---AAAA-CCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAA-ATACTAGTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAATACTATAGACTCCCc
gi|20 : TCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-AGAAT-ATGTTCATAT------GTGGAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTG-A-AAAT--ATGTACTT--TCAGA-GCAT-A---AGA--TT-TCCA-C-A-ACA---T-CT-CA--T-TTA-T
gi|21 : ATT-AAAA-ACATC---ATTATTAATG---AAAAATAGTAT-ATAAATCC-ACC-TAAA-AT----G--AGC-ACTATCACTC-CAGTCT-TGAT-G-TC-ACGTTACTA
gi|22 : ttcaaaaaatattCA-C-A-GCA-TTT-C--CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTT-GGC-T-AAA-A----CAG--CCATTT---TGAAG-AA-A-AT-TTTTA--CATAC----T-AG--AAGAT--TA-AAAA----------ATA-T-AAT-A------TAACA-A--GT-GC---A-aaccctacttt
gi|23 : AATTCAAAATACATC-AAATTAA-A-TG---GAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----G---GC-ATTAGCACTC---ATCA-T-AC-A-CC-ACG
gi|24 : T--TAAC-ATTATT--ACT-TCTTGT-T-TGATA-------------------ATGGTGGTACAGGAAAAT---------------TCTCATCAAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-TCAA-AAA--TA-C--AGGC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--aacgccgctactcagac
gi|25 : GGGGG-TTATATCAGTA-TA-G-TGA-GTAAAG-TATG-T--GATCTGTTTT--AT-T-ATA-----CGTTTA--TCCCC---A---TTAGTTCAAA-TG-G
gi|26 : aaactaATA---TGT-ACCTCTGGTTTT-AT-GTGTGGAT------TCGATGACAACAAA-CGGAAAGGAAATTGGAATCATAGT--TT-Aaca
gi|27 : GGTGGTACT--AAATT-----T-A-A-----CTCAAT--ACGG-CC-----CA-----CGGGAG-TCAA-AAA--TA-C--A-GT-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-a
gi|28 : TAT-A--AATCC-AAA-TAAA-AT----G--AGT-ACTTTCGCTC-CAATCA-TAAC-G-TC-ACTCTAC--TAGACCCC
gi|29 : ATGTG--TAT---TTTT--ATAT-AAG-----CG--TA--CCCCCTCCA---TCTG-TCAAA-CA-GC----AACAAC-----Ata
gi|3 : gagccaaTTAGGGGCTTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-AAG-----TG--TA--CCCCC---A---TCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AAAT-TGTCAAT-----AA--T---T--TTTGTT----TG-------A-GGT------ATGA-TCC---TGCAA-T-------TTTTTTCTTTAGATA-T-GAA--ATAG-A-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-AATA-GA-----AGTGA-AA---TTT--TAAC-ATACTTTCATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTGCA--AATTT-----G-A-A-----CCCAAT--AC-GGCC-----CA-----CGGCAG-T----AAA--CA-CTAA-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATA--AAAAATT-G-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAAGC--TCGC-ATAAT-A--TTCATA------TATGAAT-GCTT-G-T-AAAATGCATT----A-AAATAACTACACCT--TCTCAGGCAT-AGCGAAA--TTAATCATC-AGGCA-TCT-C--CATCT-TTA-TA-T-TA-----ACGA-TTGTTCTTGGC-C--AA-A----TAATCCCATTT---TTGAG-AT-G-ATCTTTCA--CATAA----TAAG--TACAT--AATTAAA---------TAAATT-AATAAT----GTAAC--A--GTAGC---T-GAA-TG---T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTTAAG--ATCAAT-TTTTA--AAACGGTG-ACTAC-AA--C--GTATCGATTCAG-TTACAT---ATGTAC---------CCTCTGG---T-GT-ATGTGGAT------TAGATGACCACAAATTGGAAAGAAAATTGGAATCATAGTAAAT-ATTCA-AC--AT-AGTGATGG-A---TAT---TACTTAA-----TTCA---------TTAA-T-AAA-T-AAAAAACATC--AATTAA-A-TG---AAAA-TAGTATAA--AATCCAACC-TAAA--------TGAGC-ACTTTCACT--CAGTCA-TGA--G-TC-ACG-GGCTACAGAACCCC
gi|4 : aaaaGGGGG-TTAT--CA-TA-TA-AATGA--TAAAT--ATG-G--TAG---GTTT--TT-T-GC------TG--TG--ACCCC---A---TCGT-TCAAA-CG--C----AATATC-----AA-CATTCTATTG----AGGA-----------AAGTCC---TAAG-AAAT-TGTCAATA----A-------T--TTTGTT----TG-------ATAGT------GT-----C---TGCAA-T-------TTTTTCC-TTAAATA-T-GAAGCATGAGA-TA--GTC-TAGA-TTAGATA-AATATGAC----AGTGATAAT--TT----AAC-ATAAGTTCATG-GTTTTT-T--AATATGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTA-A--AAATT-----G-A-AA----CCCAAT--AGCAACCG----CA-----CGGCAG-TCAATAAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT--AA-T-ATTAAAA--AAAATT--G-ACT-G-T-GATTGT-C-AT-CAAA-CACTCGC--TA-T-ATGTTCA-------ATATGAAT-GCTTTGTT-AAAATACATTT-A-A-AAATA-CTACAACT--TCTCA--CAC-G---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--AA--T-TTA-TA-C-T------AC-A-T--TTTTGGCC-C-AAAGA----TCG--CCCATT---TGAGG-AT-G-AT-TTCAA--CATAA----T-AG--AAGATAAAA-AAAA---------TATA-T-AAT-G-------AACA-A---T-GC---G-GA--TG---T-TTTATCTAATTCC-TCCA-A-AG-CA--TATTGCAT-----------TTTC--ATA-AAA-A----AAAACT---C-TTTA-AA---TTACAGA-AT-AAT-TTT-----AAC--TGTCTTACACG--A--ATGATAGTC--AGTTA-A----ACAAATA---TGT-ACCTCT-GTTGT-ATGGTGTGA--------TAGAT-CCAACAAA-TGGAAAGAAAA-TGGAGTCATAGT---T-ATTCACACT-ATGAGTGA-GA-GAATTTC---TGA---AGGAT-TTCA-------TTTTAC-T-AAAAT-AAAATACACTCAAATTTAAA-TGGAAAAAA-CA-TAA-A--AATCC-ACC-TAAA-------CTGAGG-ACTTTCACTC-CA-TCA-TGAC-GTTC-ACGCTACTActact
gi|5 : aattaaGGGGG-TTGT--CAGTAATACA-TGA-GTAAATCTATG-GG-TAT---TTTTTAAT-TTATG-----TA--TATTCCCCC---A---TCTG-TTAAAACG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AAAATTGTCCA-A----TA--ATTTT--TTTGTT----TG-------A-GA-------ATGA-TCC---TGCAATT-------TTTTTTCCTTAAATA-T-GAA--ATAG-ATTA-TGTC-TA-A-TTAGATATAATA-GA-----AGTGA-AAT--TTT--AAACAATAATTTTATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--TAAATTGGAAA-A-C-----C--AAT--ACGGA-C-----CA-----CGGCAG-TCAA-AAA--TA-C--A-GCAG---ACT-GC-AA-------ACA-T-CA--CT--ATAT-GAA-TCAT--AAA--AAAAATT-G-CCTTGTT-GA--TTTC-ATTCGAA-C--TCGC-ATAATGATGTTCATA------TATGAAT-GCTT-TTA-AAAATACATTAAA-ATAAAT--CTACACCT--TCTCA--CATAA---AAA--TT-TTCA-CGA-GCA-TCT-CCACA--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGGC-C--AA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT---AT-TTTCA--CATAA----A-AG--AACAT--AA-AAAA---------AGTA-T--AT-AT----GT-ACA-A--GT-GC---CTGAATTG-TGTGTTTATCC-ATTCCGGCAA-G-TG-CAT-TA-TGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTACAA--TTTACAG--AT--AT-TTgacc
gi|6 : aaataGGCG-TTGT--CAGTA-TA----GA--TA----TATG-AGCTAT---TTCA--AT-T-ATGTGTAACG--TA--TTCTT---AGATTCTGGTCAAA----GC------TTCC-----AG-AA----ATTG----------------------TCA---TA-A-AATC-T-----TA----AATTG---T--TTTGGT----TG-------A-TG-------ATGA--CC---TGAAT-T-------TTTTTTCCTTAAATAAT-GAA--ATAG-A-TACTGTC-TA---TTAGATACAT---GA-----AGTGA-AAT--TTT----AC-ATAATC-CATG-TTTTTT-T-CAATG-------------------ATG-T--TACA--AAATT-----G-A-C-----C-AAAT--ACG---C-----CA-----CGGCAGCTCAA-AAAA-TA-C--G--------ACT-GC-AA-------A-AGT-CA--CTT-AT-T-AGA-C-AT--ATTCAAAAATTTTG-ACTTG-TAGATTTTTC-ACTCAA-----TCGC-ATA-T-ATGTTC-TAT---TGGATGATTAG--T-GT---AAATGCATT--A-A-AAAT--CTACACAT---CTC--GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C---GCA-T-T-C--CA--TGTTA-TT-C-TT-----AC-AAT--TTTTTGGC-CCAAA-A----TAG--CC-TTT---TGAGG--T-G-AT-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT--AA-AA-----------TATA-T-AAC--T----GTAA---A--GT-GT-----GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-GATGCCATCTATTGCA------------TTT---ATG-AAA-AAAACAAA--C---T-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAC-CG--TAGGTTTCAGTTAAA-TCA-AT---ATGTAC
gi|7 : ggaGGGCG-TTGT--CAGTA-TC-A--GA--------TAGG-C--TAT---TTTA--AT-T-ATG----------------------------G-T--AA--G-GT----AAT-TC------T-AATT--ACTGTTCAAAGA--------------TTC------G-AAAT-TGCATATA----AA--A---T--CTTGTTGTATTA-------ATGGTTTTTTGAT-A-TCC---TGGAA-T-------TTTTTTTCTTAAATAAT-GAA--ATAG-A-T--TGTCCTA-A-TTAGATA-AT---GA-----AGTGA-ACT--TTT-----C-ATAATC-CATG-TTTTTT-CCTAATA-----------------------TGTTACA--AAT-T-----G-A-C-----C--AAT--ACGG--C-----CA-----CGGCAGCTCAA-AAA--TA-C----GC-----A-T-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-TT-T-GA--C-AT--ATTCAAAAATTTTGGACTTG-T-GATTTTTC-ACTCAA-----TCG--ATA-T-ATGTTCATAT---TGGATG------TT-GTT-AAA-TGCATTA-A-A-AAAT--CTACACCTATTCGC-----T-A---AAA--TT-TT-A-C-G---A-T-T-CT-CA--T-T-A-TA-TCTT-----AC-A-A--TTTTTGGC-CCAAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG--T-G-AT-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT---A-AAAC---------TATA-T-AAC--T----GTAA-A-A--GT-GT-----GACTTGTT-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-GATG-CAT-TATTGCA------------TTTT--ATG-AAA-A----AAA--CAAAT-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAC-CG--TAGATATCAGTTAAA-TCA-AT---ATGTACtct
gi|8 : aattagAAT-GCTT-GTT-AAAACACATTTTA-A-AAAT--TTGCATTT--TCACA-GTAT-A---AGA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C---A--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG---CATTT---TAAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-CAA-----------ATA-T-AAT-AT----ATAACA-A--GT-GC---A-GAATTG---T-TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TA-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AA--TTTTA--AA----TCTAATTT-TGATT--GTATGA--T--A-TCA-ATTAAACAAATA---CGT-ACCTCTGGTTGC-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAAAAGATTGGAGCCATTGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAATGATGGAG---CGTTAATGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCATGTAAAT--CG---AAAA-ACGTAT-A--AATCC-AGC-CAAA-A------TAAGC-AATATCATTT-CGGACA-TGtct
gi|9 : aAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--CA--T-TTA-TA-T-TTTAATTAC-AAT--TTTTTGGC-A-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AC-GAAT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-G-----GTAACA-A--GT-GC---T-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGC-------------TTTCCAATG--AA-A----AAA--T---C-TTTA-AAGTTTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAA-CA--C--GTATGA--T--A-TCG-AG---TTAAACAAATTGTAACCTCTGGTTGTAAT-GTGTGGAT------TAGATGACAA-AAA-T-GAAAGAAAATTGGAATCATAGT--AT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-AT--TAT---TACTTAA-----TTCA--------TTTAC-TAAAATT-AAAATACAT-CAAATTAA-A-TGA--AAAA-TAGT-T-A--A--TC-ACCTTAAA-A------TGAGCAACTTTCACTC-CAATCA-TGAC-G-TCAACGCTAATA-AGA-TCCC
Alignments
lowQualScore : 11111111111 22222222222222 222222222222 2222222222222222222222222222222 1 22222 111 11 2222222222222222222 222222222222 11111 11111 1111111 11 1 222222 11 22 111111 111111111 2222222 11111 111 222222222222 111 4444444444444444444444444444444444444 111111 111 44444444444444444444444 11111111 1 111 4444444444 22
lowQualScore : 4 55 4 555 99 4 3 88 666 555 3 3 88888888888 55 666 666 6 7777 7777 99999 4 4 8888 22222222222222 7777 4 8 99 2 3 111111111111 55 8888 2222222222222222222222222222222 4 2 7 3 55 3 3 99 3 3 3 7 11 3 00000 3 444 3 999 3 22 777 3333333333333333333 33 3 111111111111 3 2 8 1 00000 77777 5 5 66 5 4444 2 11111 2 2 999999999 2 2 33 6 1 3 3 3 5555555 1 33 3 4 4 4 88888 4 2 4 888888 1 4 4 44 44 444 99 55 1 999 4 777 44 3 2 5 2 2 4 2 00 33 2 2 3 3 77777 555555 3 6 3 6666 44 0 555 3 777 3 44 777777 44 44 3 333333333 3 3 6666666 3 44 3 55555 2 666 3 7 2 3 6 3 3 222222222222 1 55 555 3 7777 55 77777 3 55 88 3 7 9999999999999999999999999999999999999 4 0 777 1 888 5 5 2 5 5 1 444444 4 44 222 5 5 5 2 22222222222222222222222 99999999 5 5 8 99 8 4 111 8 3 55 3 3 0000000000 3 1 3 5 3 4 4 4 2 22
lowQualScore : . .. . ... .. . . .. ... ... . . ........... .. ... ... . .... .... ..... . . .... .............. .... . . .. . . ............ .. .... ............................... . . . . .. . . .. . . . . .. . ..... . ... . ... . .. ... ................... .. . ............ . . . . ..... ..... . . .. . .... . ..... . . ......... . . .. . . . . . ....... . .. . . . . ..... . . . ...... . . . .. .. ... .. .. . ... . ... .. . . . . . . . .. .. . . . . ..... ...... . . . .... .. . ... . ... . .. ...... .. .. . ......... . . ....... . .. . ..... . ... . . . . . . . ............ . .. ... . .... .. ..... . .. .. . . ..................................... . . ... . ... . . . . . . ...... . .. ... . . . . ....................... ........ . . . .. . . ... . . .. . . .......... . . . . . . . . . ..
lowQualScore : 0 55 0 444 00 0 6 66 444 222 6 6 66666666666 00 444 444 7 2222 7777 11111 0 0 5555 99999999999999 8888 0 0 88 4 8 333333333333 55 5555 5555555555555555555555555555555 0 0 3 6 00 6 6 55 6 6 6 3 77 6 55555 6 555 3 222 2 22 000 8888888888888888888 99 8 888888888888 4 9 9 2 00000 11111 7 7 88 7 2222 9 11111 9 9 444444444 9 9 99 2 3 6 6 6 9999999 2 11 6 0 0 0 00000 4 8 4 111111 4 0 0 99 22 222 55 55 0 888 0 000 22 1 9 7 9 9 8 9 55 99 9 9 1 1 77777 555555 1 2 1 5555 22 4 444 3 666 3 66 999999 66 66 3 333333333 3 3 7777777 3 66 3 99999 0 111 6 3 5 3 7 3 3 333333333333 0 00 888 6 7777 00 55555 6 00 66 6 3 3333333333333333333333333333333333333 4 1 888 3 888 0 0 8 0 0 4 444444 4 88 888 0 0 0 2 55555555555555555555555 55555555 0 0 0 11 1 0 000 0 6 00 6 6 0000000000 6 0 6 5 6 0 0 0 9 66
consensus : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACG-----CG--TA--CCCCC---A---TCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCNATA----AA--A---T--TTTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------ATCCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAATA-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA-----CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TCAA-AAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAGTT--A-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACCCCC
Reference ( family-2207 ) : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACG-----CG--TA--CCCCC---A---TCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AANNTGTCNATA----AA--A---T--TTTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------ATCCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAATA-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AC-----CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TCAA-AAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAGTT--A-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACCCCC
gi|1 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGAAGTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACA-----TG--TA--CCCCC---A---TTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----AAAA-----------A--TCC---TA-G-AATATGTCCACA----AA--AA--T--TTTGTT----TC-------A-GGT------A--TG--------ATGGT-GTAAGTTTCCCCCCTCAAATA-T-GAA--AT-GAA-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTTTATC---ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT---G-AA-----CTTAAATACAGGCC-----CT-----CGACAG-TCAA-AAAATCAGC--A-A-C-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTTTAAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT-CT-CA--T-TCAATA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AAT-AC----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG-T-T-TTTAT-TAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTA--AAAC-ATGCAATAC-CC--CCTGTATGAA-T--A-TAAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAG---CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCA-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAA-T-AAATT-AAAATGCATCCAGGTCAATA-TA---AAAA-CCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAATACTA--GTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAAAACTATAGACTCCC
gi|10 : -TCAGA-AG-AC----AATATCTTCAAAG-TATCC-ATTG----AAGT-----------A-GTCCGTATA-GTAAGAAG-CCATAGTACAA--A---T--TTCGTT----TGGATGCCAA-TGT------A--TG--------ATCCT-GCAA-TTTGTTCGCTCAACTA-T-TAA--AT-GAA-TA-AGTG-TA-A-TCAAATA-ATCA-AA-----AGTGA-AAA--TTTTAA----------TC---------------------------------------GGTGGTAC---AAGTT---G-A------CTCAA-TGCAGGCC-----T------CAACGG-TCAATAAA--TA----A-GCC-----ACT-GC-AG-------ACA-C-CAATCTAGATATAGAACT-AT---TT--AAAAAT--G-ACTTG-T-GATTTTTCTATT-AAA-C--TCGCGATA---ATGTTCATAC---TAT------------------AATTCATTTTAGA-AAAT--CTACA-CT--TCCCA-TCAC-A---AAAGCTT-TTCA-CAA-GCA-TTT-TT-CA----TTA-TT-A-TT-----AC-A----TTGTGGGC-C-AAA-A----TAG--CC-TTT---TG
gi|11 : tcaGGGG-TTG---CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTT---AT-T-AGG-----C---TA--CCCT----A---TCTG-TCAAA-CAAGCCCAAAACATC-----AGGAATGC-ATTG----AAAACAGAAAATGAAA-GTCC----A-G-AAA-TGTCAA-A----AG--A---TAATTTGT------G-------A-GGT------AAAT---------ATCCTTGCAA-TTTTTTTCTTTAAATA-TTGAA--AT-AGA-TACTGTC-TA-AATTAGATA-AATA-GAGAAA-AGTAA-AAT--CTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT----AATT-------------------ATGGTGATACC--AAAATT--G-AA-----CCCAA-TACGAGCC-----CA-----CGGCAG-TCAG-AAA--TACC--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-T-T-CA--CTA-t
gi|12 : aaattaaGG-TTGT--CAGTG-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ATG-----TG--CA--GCCCC---A---TCTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AA-TTGTCAATA----TT--T---T--TTTGTT----TG-------A-GGC------A--TGATTTATGAATCCT-GTTA--TTTTTCCCTTAAATA-T-GAA--AT-AAA-TA-TGTC-TA-A-TTAAATA-ATTA-GA-----AGAGA-AA---TTTTAACATTATAATTTCATG----TTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACC--AAAAT---GAAA-----CCCAA-TAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-TAAA-AAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ACAG-GAA-T-AT---TC--AAAA
gi|13 : --TT-TTCA-C-A-GCAATCTTCC-CA--T-TCA-TAAT-TT-----AC-AATG-TTTTTGGCTC-AAA-AATATTAA--CCATTTGTGTGAGGCATTGTAT-TTCCAATCATGAATCTT-AGTGAAGAT--AA-AAAAAAAGAAGAATATA-TGAAT--T----GTAACATATCGT-GCTTGA-AAATC--T-T-TTTATCTAATTCCTTCAAGG-TG-CAT-TATTGCAATTAAGTTCAATTGCG--ATG-AAATA----ATA--T---CTTTTA-CA--ATTACAGTCAT-TAT-TTT-----AAC-Gaata
gi|14 : taccttgttcaagcccgatttaaacatattt-T-GAA--AT-AAA-TG--ATC-TA-A-TTAAATA-TTTA-GATTTTTAGTAA-AGTGTTTTTAAC---ATTACTTCATG-TTTTTTAT-TAATA-------------------ATAGTGGTACA--AAAAT---GAACTCGAGCTCAA-TAC-GGCC-----AA-----CGGCAG-TCAA-AAA--GC-C--A-A-CAAGCGACTGGC-AATACAGGTA-A-CGCA--CTATATGT-GAA-T-AT---TT--AAA----CA-ACTTctacacgtttg
gi|15 : ttt-TGGAAAGAA--TTGGAATCATAGT--ATTATTCA-ACTTACGAGTGATGG-A---TAT---T-T---ACTTAATTCA-------TTTTACTT-AAATTAAAAATACAT-CAAATTAA-A-TG---AAAA-TAGTAT-A--AAT-C-ACC-TAAA-A------TGAGC-ACTTTCACTCACAGTCATTGACGG-TC-ACGCTAC--TAGATCCCtgtcatg
gi|16 : --TT-TTCA-T-A-TCA-TCT-C--CA--T-CTA-TA-T-TT-----AC-T-T--TTTTTAGC-C-AAA-A----AAT--TCATTT----GAAG-AT-T-AT-TTTCA--CATGA----T-AG--AAAA---AA-AAAA---------TATA-T-AAT-ACTTGTATAACA-A--GT-GC---A-TAATTG-T-T-TTTATTTGATTCC-TCAA-G-TG-CAT-tac
gi|17 : A-ACT-ATGAGTGATGG-A---GAT---T-T---A-----CTCAATTCGTTTTTTAC-T-AAATT-AAAATACA-ACAAATTAA-A-TG---AAAAACAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----G--AGC-ACTTTCACTC-CAGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTAC--TAGACCCC
gi|18 : -G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--ATA-AAA-A----AAA--T---C-TTTC-AA--TTTACAG--AT-AAT-ATATACGAAA------GATAT-CA-------ATAA-----A-CAAAT---ATGTACA-----------TCTGGTTTT-AT-GTGTGCATTAGCTATAGATGACAACAAA-TGGAAta
gi|19 : TG-TTTTTGAT-TAATA-------------------ATGGGGGTACA--AAAAT---G-AA-----CTCAA-TACAAGCCATCGACACTAGTCGACAG-TCAT-AAA--TA-C--T-G-C-----ACT-GCTGC-------A-A-C-------A-ATAT-GAA-T-A---ATC--AAAAT--------------ATTTTTC-ATTCAA
gi|2 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACA-----TG--TA--CCCCC---A---TTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----AAAA-----------A-ATCC---TA-G-AATATGTCCACA----AA--A---T--TTTGTT----TC-------A-GGT------A--TG--------ATGGT-GTAAGTTTCCCCCCTCAAATA-T-GAA--AT-GAA-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTTTATC---ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT---G-AC-----TTAAA-TACAGGCC-----CT-----CGACAG-TCAA-AAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT-CT-CA--T-TCA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AAT-AC----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG---T-TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTA--AAAC-ATGCAATAC-CC--CCTGTATGAA-T--A-TAAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCA-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAA-T-AAATT-AAAATGCATCCAGGTCAATA-TA---AAAA-CCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAA-ATACTAGTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAATACTATAGACTCCCc
gi|20 : TCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-AGAAT-ATGTTCATAT------GTGGAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTG-A-AAAT--ATGTACTT--TCAGA-GCAT-A---AGA--TT-TCCA-C-A-ACA---T-CT-CA--T-TTA-T
gi|21 : ATT-AAAA-ACATC---ATTATTAATG---AAAAATAGTAT-ATAAATCC-ACC-TAAA-AT----G--AGC-ACTATCACTC-CAGTCT-TGAT-G-TC-ACGTTAC--TAAACCC
gi|22 : ttcaaaaaatattCA-C-A-GCA-TTT-C--CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTT-GGC-T-AAA-A----CAG--CCATTT---TGAAG-AA-A-AT-TTTTA--CATAC----T-AG--AAGAT--TA-AAAA----------ATA-T-AAT-A------TAACA-A--GT-GC---A-tacttt
gi|23 : AATTCAAAATACATC-AAATTAA-A-TG---GAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----G---GC-ATTAGCACTC---ATCA-T-AC-A-CC-ACG
gi|24 : TTAAC---ATTATT--ACT-TCTTGT-T-TGATA-------------------ATGGTGGTACAGGAAAAT------T-----CTCAT-CAACGGCC-----CA-----CGGCAG-TCAA-AAA--TA-C--AGG-C-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--aacgccgctactcagac
gi|25 : GGGGG-TTATATCAGTA-TA-G-TGA-GTAAAG-TATG-T--GATCTGTTTT--AT-T-ATA-----CGTTTA--TCCCC---A---TTAGTTCAAA-TG-G
gi|26 : aaactaATA---TGT-A-CCTCTGGTTTT-AT-GTGTGGAT------TCGATGACAACAAA-CGGAAAGGAAATTGGAATCATAGT--TT-Aaca
gi|27 : GGTGGTACT--AAATT---T-AA-----CTCAA-TACGG-CC-----CA-----CGGGAG-TCAA-AAA--TA-C--A-G-T-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-a
gi|28 : TAT-A--AATCC-AAA-TAAA-AT----G--AGT-ACTTTCGCTC-CAATCA-TAAC-G-TC-ACTCTAC--TAGACCCC
gi|29 : ATGTG--TAT---TTTT--ATAT-AAG-----CG--TA--CCCCCTCCA---TCTG-TCAAA-CA-GC----AACAAC-----Ata
gi|3 : gagccaaTTAGGGGCTTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-AAG-----TG--TA--CCCCC---A---TCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCAAT-----AA--T---T--TTTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------ATCCT-GCAA-TTTTTTTCTTTAGATA-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-AATA-GA-----AGTGA-AA---TTTTAAC---ATACTTTCATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTGCA--AATTT---G-AA-----CCCAA-TAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-T----AAA--CA-CTAA-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATA--AAAAATT-G-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAAGC--TCGC-ATAAT-A--TTCATA------TATGAAT-GCTT-G-T-AAAATGCATT----A-AAATAACTACACCT--TCTCAGGCAT-AGCGAAA--TTAATCATC-AGGCA-TCT-C--CATCT-TTA-TA-T-TA-----ACGA-TTGTTCTTGGC-C--AA-A----TAATCCCATTT---TTGAG-AT-G-ATCTTTCA--CATAA----TAAG--TACAT--AATTAAA---------TAAATT-AATAAT----GTAAC--A--GTAGC---T-GAA-TG---T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTTAAG--ATCAAT-TTTTA--AAACGGTG-ACTAC-AA--C--GTATCGAT-----TCAGT----TACATA---TGT-ACCCTCTGG---T-GT-ATGTGGAT------TAGATGACCACAAATTGGAAAGAAAATTGGAATCATAGTAAAT-ATTCA-AC--AT-AGTGATGG-A---TAT---TACTTAA-----TTCA---------TTAA-T-AAA-T-AAAAAACATC--AATTAA-A-TG---AAAA-TAGTATAA--AATCCAACC-TAAA--------TGAGC-ACTTTCACT--CAGTCA-TGA--G-TC-ACG-GGCTACAGAACCCC
gi|4 : aaaaGGGGG-TTAT--CA-TA-TA-AATGA--TAAAT--ATG-G--TAG---GTTT--TT-T-GC------TG--TG--ACCCC---A---TCGT-TCAAA-CG--C----AATATC-----AA-CATTCTATTG----AGGA-----------AAGTCC---TAAG-AAATTGTCAATA----A-------T--TTTGTT----TG-------ATAGT------G--T------------CT-GCAA-TTTTTTCC-TTAAATA-T-GAAGCATGAGA-TA--GTC-TAGA-TTAGATA-AATATGAC----AGTGATAAT--TT--AAC---ATAAGTTCATG-GTTTTT-T--AATATGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTA-A--AAATT---G-AAA----CCCAA-TAGCAACCG----CA-----CGGCAG-TCAATAAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT--AA-T-ATTAAAA--AAAATT--G-ACT-G-T-GATTGT-C-AT-CAAA-CACTCGC--TA-T-ATGTTCA-------ATATGAAT-GCTTTGTT-AAAATACATTT-A-A-AAATA-CTACAACT--TCTCA--CAC-G---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--AA--T-TTA-TA-C-T------AC-A-T--TTTTGGCC-C-AAAGA----TCG--CCCATT---TGAGG-AT-G-AT-TTCAA--CATAA----T-AG--AAGATAAAA-AAAA---------TATA-T-AAT-G-------AACA-A---T-GC---G-GA--TG---T-TTTATCTAATTCC-TCCA-A-AG-CA--TATTGCAT-----------TTTC--ATA-AAA-A----AAAACT---C-TTTA-AA---TTACAGA-AT-AAT-TTT-----AAC--TGTCTTACACG--A--ATGATAGTC--AGTTAA----ACAAATA---TGT-A-CCTCT-GTTGT-ATGGTGTGA--------TAGAT-CCAACAAA-TGGAAAGAAAA-TGGAGTCATAGT---T-ATTCACACT-ATGAGTGA-GA-GAATTTC---TGA---AGGAT-TTCA-------TTTTAC-T-AAAAT-AAAATACACTCAAATTTAAA-TGGAAAAAA-CA-TAA-A--AATCC-ACC-TAAA-------CTGAGG-ACTTTCACTC-C-ATCA-TGAC-GTTC-ACGCTAC--TAGACCctact
gi|5 : aattaaGGGGG-TTGT--CAGTAATACA-TGA-GTAAATCTATG-GG-TAT---TTTTTAAT-TTATG-----TA--TATTCCCCC---A---TCTG-TTAAAACG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----AAGA-----------A-GTCC---TA-GAAAATTGTCCA-A----TA--ATTTT--TTTGTT----TG-------A-GA-------A--TG--------ATCCT-GCAATTTTTTTTCCTTAAATA-T-GAA--AT-AGATTA-TGTC-TA-A-TTAGATATAATA-GA-----AGTGA-AAT--TTTAAACA--ATAATTTTATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--TAAATTGGA-AA-----ACCAA-TACGGA-C-----CA-----CGGCAG-TCAA-AAA--TA-C--A-G-CAG---ACT-GC-AA-------ACA-T-CA--CT--ATAT-GAA-TCAT--AAA--AAAAATT-G-CCTTGTT-GA--TTTC-ATTCGAA-C--TCGC-ATAATGATGTTCATA------TATGAAT-GCTT-TTA-AAAATACATTAAA-ATAAAT--CTACACCT--TCTCA--CATAA---AAA--TT-TTCA-CGA-GCA-TCT-CCACA--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGGC-C--AA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT---AT-TTTCA--CATAA----A-AG--AACAT--AA-AAAA---------AGTA-T--AT-AT----GT-ACA-A--GT-GC---CTGAATTG-TGTGTTTATCC-ATTCCGGCAA-G-TG-CAT-TA-TGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTACAA--TTTACAG--AT--AT-TT
gi|6 : aaataGGCG-TTGT--CAGTA-TA----GA--TA----TATG-AGCTAT---TTCA--AT-T-ATGTGTAACG--TA--TTCTT---AGATTCTGGTCAAA----GC------TTCC-----AG-AA----ATTG----------------------TCA---TA-A-AATCT-----TA----AATTG---T--TTTGGT----TG-------A-TG-------A--TG--------A-CCT-GAAT-TTTTTTTCCTTAAATAAT-GAA--AT-AGA-TACTGTC-TA---TTAGATACAT---GA-----AGTGA-AAT--TTT--AC---ATAATC-CATG-TTTTTT-T-CAATG-------------------ATG-T--TACA--AAATT---G-AC-----CA-AA-TACG---C-----CA-----CGGCAGCTCAA-AAAA-TA-C--G---------ACT-GC-AA-------A-AGT-CA--CTT-AT-T-AGA-C-AT--ATTCAAAAATTTTG-ACTTG-TAGATTTTTC-ACTCAA-----TCGC-ATA-T-ATGTTC-TAT---TGGATGATTAG--T-GT---AAATGCATT--A-A-AAAT--CTACACAT---CTC--GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C---GCA-T-T-C--CA--TGTTA-TT-C-TT-----AC-AAT--TTTTTGGC-CCAAA-A----TAG--CC-TTT---TGAGG--T-G-AT-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT--AA-AA-----------TATA-T-AAC--T----GTAA---A--GT-GT-----GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-GATGCCATCTATTGCA------------TTT---ATG-AAA-AAAACAAA--C---T-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAC-CG--TAGGTTTCAGTTAAA-TCAAT---ATGTAC
gi|7 : ggaGGGCG-TTGT--CAGTA-TC-A--GA--------TAGG-C--TAT---TTTA--AT-T-ATG----------------------------G-T--AA--G-GT----AAT-TC------T-AATT--ACTGTTCAAAGA--------------TTC------G-AAATTGCATATA----AA--A---T--CTTGTTGTATTA-------ATGGTTTTTTGA--T---------ATCCT-GGAA-TTTTTTTTCTTAAATAAT-GAA--AT-AGA-T--TGTCCTA-A-TTAGATA-AT---GA-----AGTGA-ACT--TTT---C---ATAATC-CATG-TTTTTT-CCTAATA-----------------------TGTTACA--AAT-T---G-AC-----C--AA-TACGG--C-----CA-----CGGCAGCTCAA-AAA--TA-C----G-C-----A-T-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-TT-T-GA--C-AT--ATTCAAAAATTTTGGACTTG-T-GATTTTTC-ACTCAA-----TCG--ATA-T-ATGTTCATAT---TGGATG------TT-GTT-AAA-TGCATTA-A-A-AAAT--CTACACCTATTCGC-----T-A---AAA--TT-TT-A-C-G---A-T-T-CT-CA--T-T-A-TA-TCTT-----AC-A-A--TTTTTGGC-CCAAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG--T-G-AT-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT---A-AAAC---------TATA-T-AAC--T----GTAA-A-A--GT-GT-----GACTTGTT-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-GATG-CAT-TATTGCA------------TTTT--ATG-AAA-A----AAA--CAAAT-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAC-CG--TAGATATCAGTTAAA-TCAAT---ATGTACtct
gi|8 : aattagAAT-GCTT-GTT-AAAACACATTTTA-A-AAAT--TTGCATTT--TCACA-GTAT-A---AGA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C---A--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGGC-C-AAA-A----TAG---CATTT---TAAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-CAA-----------ATA-T-AAT-AT----ATAACA-A--GT-GC---A-GAATTG---T-TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TA-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AA--TTTTA--AA----TCTAATTT-TGATT--GTATGA--T--A-TCAATTAAACAAATA---CGT-A-CCTCTGGTTGC-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAAAAGATTGGAGCCATTGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAATGATGGAG---CGTTAATGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCATGTAAAT--CG---AAAA-ACGTAT-A--AATCC-AGC-CAAA-A------TAAGC-AATATCATTT-CGGACA-TGtct
gi|9 : aAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--CA--T-TTA-TA-T-TTTAATTAC-AAT--TTTTTGGC-A-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AC-GAAT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-G-----GTAACA-A--GT-GC---T-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGC-------------TTTCCAATG--AA-A----AAA--T---C-TTTA-AAGTTTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAA-CA--C--GTATGA--T--A-TCGAG---TTAAACAAATTGTAA-CCTCTGGTTGTAAT-GTGTGGAT------TAGATGACAA-AAA-T-GAAAGAAAATTGGAATCATAGT--AT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-AT--TAT---TACTTAA-----TTCA--------TTTAC-TAAAATT-AAAATACAT-CAAATTAA-A-TGA--AAAA-TAGT-T-A--A--TC-ACCTTAAA-A------TGAGCAACTTTCACTC-CAATCA-TGAC-G-TCAACGCTAATA-AGATCCC
Alignments
lowQualScore : 111111 22222222222222 1111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222 1 22222 111 11 2222222222222222222 1111111111111 11111 11111 1111111 11 222222 22 111111 111111111 2222222 11111 111 222222222222 111 4444444444444444444444444444444444444 111111 111 44444444444444444444444 11111111 1 111 4444444444 22
lowQualScore : 4 55 4 555 99 4 3 88 666 555 3 3 111111 555 666 3 5555 7777 99999 44 4 8888 55 22222222222222 9999 4 4 4 3 4444444444444444444 6666666666666666666666666666666666666 55 4 2 4 3 3 55 3 3 99 3 3 3 7 11 3 00000 3 444 3 999 0 0 22 777 3333333333333333333 33 3 5555555555555 2 8 1 00000 77777 5 2 5 33 5 4444 33333 2 2 999999999 2 2 33 6 1 3 3 3 5555555 1 33 3 4 4 4 88888 4 7 4 888888 1 4 4 44 66 444 99 55 1 999 4 777 44 3 2 5 2 2 4 2 00 33 2 2 3 3 77777 555555 3 3 3 3 6666 44 0 555 3 777 3 44 777777 44 555 3 333333333 3 3 6666666 3 44 3 55555 2 666 3 7 2 3 6 3 3 222222222222 1 55 555 3 7777 55 77777 3 55 88 3 7 9999999999999999999999999999999999999 4 0 777 1 888 5 5 2 5 5 1 444444 4 44 222 5 5 5 2 22222222222222222222222 99999999 5 5 8 99 8 4 111 8 3 55 3 3 0000000000 3 1 3 5 3 4 4 4 2 22
lowQualScore : . .. . ... .. . . .. ... ... . . ...... ... ... . .... .... ..... .. . .... .. .............. .... . . . . ................... ..................................... .. . . . . . .. . . .. . . . . .. . ..... . ... . ... . . .. ... ................... .. . ............. . . . ..... ..... . . . .. . .... ..... . . ......... . . .. . . . . . ....... . .. . . . . ..... . . . ...... . . . .. .. ... .. .. . ... . ... .. . . . . . . . .. .. . . . . ..... ...... . . . . .... .. . ... . ... . .. ...... .. ... . ......... . . ....... . .. . ..... . ... . . . . . . . ............ . .. ... . .... .. ..... . .. .. . . ..................................... . . ... . ... . . . . . . ...... . .. ... . . . . ....................... ........ . . . .. . . ... . . .. . . .......... . . . . . . . . . ..
lowQualScore : 0 55 0 444 00 0 6 66 444 222 6 6 000000 555 444 3 1111 7777 11111 99 0 5555 55 00000000000000 3333 0 0 9 8 8888888888888888888 5555555555555555555555555555555555555 55 0 0 0 6 6 00 6 6 55 6 6 6 3 77 6 55555 6 555 3 222 3 4 22 000 8888888888888888888 99 6 3333333333333 9 9 2 00000 11111 7 9 7 99 7 2222 99999 9 9 444444444 9 9 99 2 3 6 6 6 9999999 2 11 6 0 0 0 00000 4 3 4 111111 4 0 0 99 99 222 55 55 0 888 0 000 22 1 9 7 9 9 8 9 55 99 9 9 1 1 77777 555555 1 1 1 1 5555 22 4 444 3 666 3 66 999999 66 999 3 333333333 3 3 7777777 3 66 3 99999 0 111 6 3 5 3 7 3 3 333333333333 0 00 888 6 7777 00 55555 6 00 66 6 3 3333333333333333333333333333333333333 4 1 888 3 888 0 0 8 0 0 4 444444 4 88 888 0 0 0 2 55555555555555555555555 55555555 0 0 0 11 1 0 000 0 6 00 6 6 0000000000 6 0 6 5 6 0 0 0 9 66
consensus : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACGCG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCNATA----AAA---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA------CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAGTT--A-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACCCCC
Reference ( family-2207 ) : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACGCG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCNATA----AAA---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA------CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAGTT--A-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACCCCC
gi|1 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGAAGTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACATG--TA--CCCCC---ATTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----A--AAA-----------A--TCC---TA-G-AATATGTCCACA----AAAA--T--T-----TTGTT----TC-------A-GGT------A--TG--------AT--GGT-GTAAGTTTCCCCCCTCAAAT-A-T-GAA--AT-GAA-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTTTATC---ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT---G-AA------CTTAAATACAGGCC-----CT-----CGACAG-TC-AA-AAAATCAGC--A-AC-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTTTAAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT-CT-CA--T-TCAATA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AAT-AC----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG-T-T-TTTAT-TAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTA--AAAC-ATGCAATAC-CC--CCTGTATGAA-T--A-TAAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAG---CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCA-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAA-T-AAATT-AAAATGCATCCAGGTCAATA-TA---AAAA-CCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAATACTA--GTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAAAACTATAGACTCCC
gi|10 : -TCAGA-AG-AC----AATATCTTCAAAG-TATCC-ATTG----A--AGT-----------A-GTCCGTATA-G-TAAGAAGCCATAGTACAAA---T--T-----TCGTT----TGGATGCCAA-TGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTGTTCGCTCAACT-A-T-TAA--AT-GAA-TA-AGTG-TA-A-TCAAATA-ATCA-AA-----AGTGA-AAA--TTTTAA----------TC---------------------------------------GGTGGTACA--AG--T---T-GA------CTCAA-TGCAGGCC-----T------CAACGG-TC-AATAAA--TA----A-GCC----ACT-GC-AG-------ACA-C-CAATCTAGATATAGAACT-AT---TT--AAAAAT--G-ACTTG-T-GATTTTTCTATT-AAA-C--TCGCGATA---ATGTTCATAC---TAT------------------AATTCATTTTAGA-AAAT--CTACA-CT--TCCCA-TCAC-A---AAAGCTT-TTCA-CAA-GCA-TTT-TT-CA----TTA-TT-A-TT-----AC-A----TTGTGGG-C-C-AAA-A----TAG--CC-TTT---TG
gi|11 : tcaGGGG-TTG---CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTT---AT-T-AGGC---TA--CCCT----ATCTG-TCAAA-CAAGCCCAAAACATC-----AGGAATGC-ATTG----A--AAACAGAAAATGAAA-GTCC----A-G-AAAT-GTCAA-A----AGA---TAAT-----TTGT------G-------A-GGT------AAAT---------AT--CCTTGCAA-TTTTTTTCTTTAAAT-A-TTGAA--AT-AGA-TACTGTC-TA-AATTAGATA-AATA-GAGAAA-AGTAA-AAT--CTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT----AATT-------------------ATGGTGATACC--AAAATT--G-AA------CCCAA-TACGAGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AG-AAA--TACC--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-T-T-CA--CTA-t
gi|12 : aaattaaGG-TTGT--CAGTG-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ATGTG--CA--GCCCC---ATCTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G--AATTGTCAATA----TTT---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGC------A--TGATTTATGAAT--CCT-GTTA--TTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AAA-TA-TGTC-TA-A-TTAAATA-ATTA-GA-----AGAGA-AA---TTTTAACATTATAATTTCATG----TTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACC--AAAAT---GAAA------CCCAA-TAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-TA-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ACAG-GAA-T-AT---TC--AAAA
gi|13 : --TT-TTCA-C-A-GCAATCTTCC-CA--T-TCA-TAAT-TT-----AC-AATG-TTTTTGG-CTC-AAA-AATATTAA--CCATTTGTGTGAGGCATTGTAT-TTCCAATCATGAATCTT-AGTGAAGAT--AA-AAAAAAAGAAGAATATA-TGAAT--T----GTAACATATCGT-GCTTGA-AAATC--T-T-TTTATCTAATTCCTTCAAGG-TG-CAT-TATTGCAATTAAGTTCAATTGCG--ATG-AAATA----ATA--T---CTTTTA-CA--ATTACAGTCAT-TAT-TTT-----AAC-Gaata
gi|14 : taccttgttcaagcccgatttaaacatattt-T-GAA--AT-AAA-TG--ATC-TA-A-TTAAATA-TTTA-GATTTTTAGTAA-AGTGTTTTTAAC---ATTACTTCATG-TTTTTTAT-TAATA-------------------ATAGTGGTACA--AAAAT---G-AACTCGAGCTCAA-TAC-GGCC-----AA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--GC-C--A-ACAAGCGACTGGC-AATACAGGTA-A-CGCA--CTATATGT-GAA-T-AT---TT--AAA----CA-ACTTctacacgtttg
gi|15 : ttt-TGGAAAGAA--TTGGAATCATAGT--ATTATTCA-ACTTACGAGTGATGG-A---TAT---T-T---ACTTAATTCA-------TTTTACTT-AAATTAAAAATACAT-CAAATTAA-A-TG---AAAA-TAGTAT-A--AAT-C-ACC-TAAA-A------TGAGC-ACTTTCACTCACAGTCATTGACGG-TC-ACGCTAC--TAGATCCCtgtcatg
gi|16 : --TT-TTCA-T-A-TCA-TCT-C--CA--T-CTA-TA-T-TT-----AC-T-T--TTTTTAG-C-C-AAA-A----AAT--TCATTT----GAAG-AT-T-AT-TTTCA--CATGA----T-AG--AAAA---AA-AAAA---------TATA-T-AAT-ACTTGTATAACA-A--GT-GC---A-TAATTG-T-T-TTTATTTGATTCC-TCAA-G-TG-CAT-tac
gi|17 : A-ACT-ATGAGTGATGG-A---GAT---T-T---A-----CTCAATTCGTTTTTTAC-T-AAATT-AAAATACA-ACAAATTAA-A-TG---AAAAACAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----G--AGC-ACTTTCACTC-CAGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTAC--TAGACCCC
gi|18 : -G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--ATA-AAA-A----AAA--T---C-TTTC-AA--TTTACAG--AT-AAT-ATATACGAAA------GATAT-CA-------ATAA-----A-CAAAT---ATGTACA-----------TCTGGTTTT-AT-GTGTGCATTAGCTATAGATGACAACAAA-TGGAAta
gi|19 : TG-TTTTTGAT-TAATA-------------------ATGGGGGTACA--AAAAT---G-AA------CTCAA-TACAAGCCATCGACACTAGTCGACAG-TC-AT-AAA--TA-C--T-GC-----ACT-GCTGC-------A-A-C-------A-ATAT-GAA-T-A---ATC--AAAAT--------------ATTTTTC-ATTCAA
gi|2 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACATG--TA--CCCCC---ATTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----A--AAA-----------A-ATCC---TA-G-AATATGTCCACA----AAA---T--T-----TTGTT----TC-------A-GGT------A--TG--------AT--GGT-GTAAGTTTCCCCCCTCAAAT-A-T-GAA--AT-GAA-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTTTATC---ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT---G-AC------TTAAA-TACAGGCC-----CT-----CGACAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT-CT-CA--T-TCA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AAT-AC----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG---T-TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTA--AAAC-ATGCAATAC-CC--CCTGTATGAA-T--A-TAAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCA-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAA-T-AAATT-AAAATGCATCCAGGTCAATA-TA---AAAA-CCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAA-ATACTAGTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAATACTATAGACTCCCc
gi|20 : TCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-AGAAT-ATGTTCATAT------GTGGAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTG-A-AAAT--ATGTACTT--TCAGA-GCAT-A---AGA--TT-TCCA-C-A-ACA---T-CT-CA--T-TTA-T
gi|21 : ATT-AAAA-ACATC---ATTATTAATG---AAAAATAGTAT-ATAAATCC-ACC-TAAA-AT----G--AGC-ACTATCACTC-CAGTCT-TGAT-G-TC-ACGTTAC--TAAACCC
gi|22 : ttcaaaaaatattCA-C-A-GCA-TTT-C--CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTT-GG-C-T-AAA-A----CAG--CCATTT---TGAAG-AA-A-AT-TTTTA--CATAC----T-AG--AAGAT--TA-AAAA----------ATA-T-AAT-A------TAACA-A--GT-GC---A-tacttt
gi|23 : AATTCAAAATACATC-AAATTAA-A-TG---GAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----G---GC-ATTAGCACTC---ATCA-T-AC-A-CC-ACG
gi|24 : TTAAC---ATTATT--ACT-TCTTGT-T-TGATA-------------------ATGGTGGTACAGGAAAAT---T---------CTCAT-CAACGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--AGGC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--aacgccgctactcagac
gi|25 : GGGGG-TTATATCAGTA-TA-G-TGA-GTAAAG-TATG-T--GATCTGTTTT--AT-T-ATACGTTTA--TCCCC---ATTAGTTCAAA-TG-G
gi|26 : aaactaATA---TGT-A-CCTCTGGTTTT-AT-GTGTGGAT------TCGATGACAACAAA-CGGAAAGGAAATTGGAATCATAGT--TT-Aaca
gi|27 : GGTGGTACT--AAATT---T-AA------CTCAA-TACGG-CC-----CA-----CGGGAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GT-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-a
gi|28 : TAT-A--AATCC-AAA-TAAA-AT----G--AGT-ACTTTCGCTC-CAATCA-TAAC-G-TC-ACTCTAC--TAGACCCC
gi|29 : ATGTG--TAT---TTTT--ATAT-AAGCG--TA--CCCCCTCCATCTG-TCAAA-CA-GC----AACAAC-----Ata
gi|3 : gagccaaTTAGGGGCTTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-AAGTG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCAAT-----AAT---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTTCTTTAGAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-AATA-GA-----AGTGA-AA---TTTTAAC---ATACTTTCATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTGCA--AATTT---G-AA------CCCAA-TAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-T-----AAA--CA-CTAA-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATA--AAAAATT-G-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAAGC--TCGC-ATAAT-A--TTCATA------TATGAAT-GCTT-G-T-AAAATGCATT----A-AAATAACTACACCT--TCTCAGGCAT-AGCGAAA--TTAATCATC-AGGCA-TCT-C--CATCT-TTA-TA-T-TA-----ACGA-TTGTTCTTGG-C-C--AA-A----TAATCCCATTT---TTGAG-AT-G-ATCTTTCA--CATAA----TAAG--TACAT--AATTAAA---------TAAATT-AATAAT----GTAAC--A--GTAGC---T-GAA-TG---T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTTAAG--ATCAAT-TTTTA--AAACGGTG-ACTAC-AA--C--GTATCGAT-----TCAGT----TACATA---TGT-ACCCTCTGG---T-GT-ATGTGGAT------TAGATGACCACAAATTGGAAAGAAAATTGGAATCATAGTAAAT-ATTCA-AC--AT-AGTGATGG-A---TAT---TACTTAA-----TTCA---------TTAA-T-AAA-T-AAAAAACATC--AATTAA-A-TG---AAAA-TAGTATAA--AATCCAACC-TAAA--------TGAGC-ACTTTCACT--CAGTCA-TGA--G-TC-ACG-GGCTACAGAACCCC
gi|4 : aaaaGGGGG-TTAT--CA-TA-TA-AATGA--TAAAT--ATG-G--TAG---GTTT--TT-T-GC-TG--TG--ACCCC---ATCGT-TCAAA-CG--C----AATATC-----AA-CATTCTATTG----A--GGA-----------AAGTCC---TAAG-AAATTGTCAATA----A-----T--T-----TTGTT----TG-------ATAGT------G--T--------------CT-GCAA-TTTTTTCC-TTAAAT-A-T-GAAGCATGAGA-TA--GTC-TAGA-TTAGATA-AATATGAC----AGTGATAAT--TT--AAC---ATAAGTTCATG-GTTTTT-T--AATATGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTA-A--AAATT---G-AAA-----CCCAA-TAGCAACCG----CA-----CGGCAG-TC-AATAAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT--AA-T-ATTAAAA--AAAATT--G-ACT-G-T-GATTGT-C-AT-CAAA-CACTCGC--TA-T-ATGTTCA-------ATATGAAT-GCTTTGTT-AAAATACATTT-A-A-AAATA-CTACAACT--TCTCA--CAC-G---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--AA--T-TTA-TA-C-T------AC-A-T--TTTTGGC-C-C-AAAGA----TCG--CCCATT---TGAGG-AT-G-AT-TTCAA--CATAA----T-AG--AAGATAAAA-AAAA---------TATA-T-AAT-G-------AACA-A---T-GC---G-GA--TG---T-TTTATCTAATTCC-TCCA-A-AG-CA--TATTGCAT-----------TTTC--ATA-AAA-A----AAAACT---C-TTTA-AA---TTACAGA-AT-AAT-TTT-----AAC--TGTCTTACACG--A--ATGATAGTC--AGTTAA----ACAAATA---TGT-A-CCTCT-GTTGT-ATGGTGTGA--------TAGAT-CCAACAAA-TGGAAAGAAAA-TGGAGTCATAGT---T-ATTCACACT-ATGAGTGA-GA-GAATTTC---TGA---AGGAT-TTCA-------TTTTAC-T-AAAAT-AAAATACACTCAAATTTAAA-TGGAAAAAA-CA-TAA-A--AATCC-ACC-TAAA-------CTGAGG-ACTTTCACTC-C-ATCA-TGAC-GTTC-ACGCTAC--TAGACCctact
gi|5 : aattaaGGGGG-TTGT--CAGTAATACA-TGA-GTAAATCTATG-GG-TAT---TTTTTAAT-TTATGTA--TATTCCCCC---ATCTG-TTAAAACG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-GAAAATTGTCCA-A----TAATTTT--T-----TTGTT----TG-------A-GA-------A--TG--------AT--CCT-GCAATTTTTTTTCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGATTA-TGTC-TA-A-TTAGATATAATA-GA-----AGTGA-AAT--TTTAAACA--ATAATTTTATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--TAAATTGGA-AA------ACCAA-TACGGA-C-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GCAG---ACT-GC-AA-------ACA-T-CA--CT--ATAT-GAA-TCAT--AAA--AAAAATT-G-CCTTGTT-GA--TTTC-ATTCGAA-C--TCGC-ATAATGATGTTCATA------TATGAAT-GCTT-TTA-AAAATACATTAAA-ATAAAT--CTACACCT--TCTCA--CATAA---AAA--TT-TTCA-CGA-GCA-TCT-CCACA--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGG-C-C--AA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT---AT-TTTCA--CATAA----A-AG--AACAT--AA-AAAA---------AGTA-T--AT-AT----GT-ACA-A--GT-GC---CTGAATTG-TGTGTTTATCC-ATTCCGGCAA-G-TG-CAT-TA-TGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTACAA--TTTACAG--AT--AT-TT
gi|6 : aaataGGCG-TTGT--CAGTA-TA----GA--TA----TATG-AGCTAT---TTCA--AT-T-ATGTG--T--------------------AA-C--GT----ATTCTT-----AG--ATTC---TG----GTCAAA-----------G-CTTC---CA-G-AAATTGTC-ATA----AAA---T--CTTAAATTGTT----TT---------GGTTG----A--TG--------ATGACCT-GAAT-TTTTTTTCCTTAAATAA-T-GAA--AT-AGA-TACTGTC-T--A-TTAGATACAT---GA-----AGTGA-AAT--TTT--AC---ATAA-TCCATG-TTTTTT-T-CAATG-------------------AT-GT--TACA--AAATT---G--A------CCAAA-TACG---C-----CA-----CGGCAGCTCAAA-AAA--TA-C--G--------ACT-GC-AA-------A-AGT-CA--CTT-AT-T-AGA-C-AT--ATTCAAAAATTTTG-ACTTG-TAGATTTTTC-ACTCAA-----TCGC-AT-AT-ATGTTC-TAT---TGGATGATTAG--T-GT---AAATGCA--TTA-A-AAAT--CTACACA---TCTC--GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C---GCA-T-T-C--CA--TGTTA-TT-C-TT-----ACAA-T--TTTTTGGCC-C-AAA-A----TAG--CC-TTT---TGAGG--T-G-AT-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT-----AAAA---------TATA-T-AAC--T----GTA--A-A--GT-GT-----GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-GATGCCATCTATTGCA------------TTT---ATG-AAA-AAAACAAA--C---T-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAC-CG--TAGGTTTCAGTTAAA-TCAAT---ATGTAC
gi|7 : ggaGGGCG-TTGT--CAGTA-TC-A--GA--------TAGG-C--TAT---TTTA--AT-T-ATG--------------------G-T--AA--G-GT----AAT-TC------T-AATT--ACTGTTCAA--AGA--------------TTC------G-AAATTGCATATA----AAA---T--C-----TTGTTGTATTA-------ATGGTTTTTTGA--T---------AT--CCT-GGAA-TTTTTTTTCTTAAAT-AAT-GAA--AT-AGA-T--TGTCCTA-A-TTAGATA-AT---GA-----AGTGA-ACT--TTT---C---ATAATC-CATG-TTTTTT-CCTAATA-----------------------TGTTACA--AAT-T---G-A--------CCAA-TACGG--C-----CA-----CGGCAGCTC-AA-AAA--TA-C----GC-----A-T-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-TT-T-GA--C-AT--ATTCAAAAATTTTGGACTTG-T-GATTTTTC-ACTCAA-----TCG--ATA-T-ATGTTCATAT---TGGATG------TT-GTT-AAA-TGCATTA-A-A-AAAT--CTACACCTATTCGC-----T-A---AAA--TT-TT-A-C-G---A-T-T-CT-CA--T-T-A-TA-TCTT-----AC-A-A--TTTTTGG-C-CCAAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG--T-G-AT-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT---A-AAAC---------TATA-T-AAC--T----GTAA-A-A--GT-GT-----GACTTGTT-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-GATG-CAT-TATTGCA------------TTTT--ATG-AAA-A----AAA--CAAAT-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAC-CG--TAGATATCAGTTAAA-TCAAT---ATGTACtct
gi|8 : aattagAAT-GCTT-GTT-AAAACACATTTTA-A-AAAT--TTGCATTT--TCACA-GTAT-A---AGA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C---A--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG---CATTT---TAAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-CAA-----------ATA-T-AAT-AT----ATAACA-A--GT-GC---A-GAATTG---T-TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TA-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AA--TTTTA--AA----TCTAATTT-TGATT--GTATGA--T--A-TCAATTAAACAAATA---CGT-A-CCTCTGGTTGC-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAAAAGATTGGAGCCATTGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAATGATGGAG---CGTTAATGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCATGTAAAT--CG---AAAA-ACGTAT-A--AATCC-AGC-CAAA-A------TAAGC-AATATCATTT-CGGACA-TGtct
gi|9 : aAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--CA--T-TTA-TA-T-TTTAATTAC-AAT--TTTTTGG-C-A-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AC-GAAT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-G-----GTAACA-A--GT-GC---T-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGC-------------TTTCCAATG--AA-A----AAA--T---C-TTTA-AAGTTTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAA-CA--C--GTATGA--T--A-TCGAG---TTAAACAAATTGTAA-CCTCTGGTTGTAAT-GTGTGGAT------TAGATGACAA-AAA-T-GAAAGAAAATTGGAATCATAGT--AT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-AT--TAT---TACTTAA-----TTCA--------TTTAC-TAAAATT-AAAATACAT-CAAATTAA-A-TGA--AAAA-TAGT-T-A--A--TC-ACCTTAAA-A------TGAGCAACTTTCACTC-CAATCA-TGAC-G-TCAACGCTAATA-AGATCCC
Alignments
lowQualScore : 111111 22222222222222 1111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222 1 22222 111 11 2222222222222222222 1111111111111 11111 11111 1111111 11 222222 22 111111 111111111 2222222 11111 111 222222222222 111 4444444444444444444444444444444444444 111111 111 44444444444444444444444 11111111 1 111 4444444444 22
lowQualScore : 4 55 4 555 99 4 3 88 666 555 3 3 111111 555 666 3 5555 7777 99999 44 4 8888 55 22222222222222 9999 4 4 4 3 4444444444444444444 6666666666666666666666666666666666666 55 4 2 4 3 3 55 3 3 99 3 3 3 7 11 3 00000 3 444 3 999 0 0 22 777 3333333333333333333 33 3 5555555555555 2 8 1 00000 77777 5 2 5 33 5 4444 33333 2 2 999999999 2 2 33 6 1 3 3 3 5555555 1 33 3 4 4 4 88888 4 7 4 888888 1 4 4 44 66 444 99 55 1 999 4 777 44 3 2 5 2 2 4 2 00 33 2 2 3 3 77777 555555 3 3 3 3 6666 44 0 555 3 777 3 44 777777 44 555 3 333333333 3 3 6666666 3 44 3 55555 2 666 3 7 2 3 6 3 3 222222222222 1 55 555 3 7777 55 77777 3 55 88 3 7 9999999999999999999999999999999999999 4 0 777 1 888 5 5 2 5 5 1 444444 4 44 222 5 5 5 2 22222222222222222222222 99999999 5 5 8 99 8 4 111 8 3 55 3 3 0000000000 3 1 3 5 3 4 4 4 2 22
lowQualScore : . .. . ... .. . . .. ... ... . . ...... ... ... . .... .... ..... .. . .... .. .............. .... . . . . ................... ..................................... .. . . . . . .. . . .. . . . . .. . ..... . ... . ... . . .. ... ................... .. . ............. . . . ..... ..... . . . .. . .... ..... . . ......... . . .. . . . . . ....... . .. . . . . ..... . . . ...... . . . .. .. ... .. .. . ... . ... .. . . . . . . . .. .. . . . . ..... ...... . . . . .... .. . ... . ... . .. ...... .. ... . ......... . . ....... . .. . ..... . ... . . . . . . . ............ . .. ... . .... .. ..... . .. .. . . ..................................... . . ... . ... . . . . . . ...... . .. ... . . . . ....................... ........ . . . .. . . ... . . .. . . .......... . . . . . . . . . ..
lowQualScore : 0 55 0 444 00 0 6 66 444 222 6 6 000000 555 444 3 1111 7777 11111 99 0 5555 55 00000000000000 3333 0 0 9 8 8888888888888888888 5555555555555555555555555555555555555 55 0 0 0 6 6 00 6 6 55 6 6 6 3 77 6 55555 6 555 3 222 3 4 22 000 8888888888888888888 99 6 3333333333333 9 9 2 00000 11111 7 9 7 99 7 2222 99999 9 9 444444444 9 9 99 2 3 6 6 6 9999999 2 11 6 0 0 0 00000 4 3 4 111111 4 0 0 99 99 222 55 55 0 888 0 000 22 1 9 7 9 9 8 9 55 99 9 9 1 1 77777 555555 1 1 1 1 5555 22 4 444 3 666 3 66 999999 66 999 3 333333333 3 3 7777777 3 66 3 99999 0 111 6 3 5 3 7 3 3 333333333333 0 00 888 6 7777 00 55555 6 00 66 6 3 3333333333333333333333333333333333333 4 1 888 3 888 0 0 8 0 0 4 444444 4 88 888 0 0 0 2 55555555555555555555555 55555555 0 0 0 11 1 0 000 0 6 00 6 6 0000000000 6 0 6 5 6 0 0 0 9 66
consensus : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACGCG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCNATA----AAA---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA------CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAGTT--A-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACCCCC
Reference ( family-2207 ) : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACGCG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCNATA----AAA---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA------CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAGTT--A-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACCCCC
gi|1 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGAAGTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACATG--TA--CCCCC---ATTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----A--AAA-----------A--TCC---TA-G-AATATGTCCACA----AAAA--T--T-----TTGTT----TC-------A-GGT------A--TG--------AT--GGT-GTAAGTTTCCCCCCTCAAAT-A-T-GAA--AT-GAA-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTTTATC---ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT---G-AA------CTTAAATACAGGCC-----CT-----CGACAG-TC-AA-AAAATCAGC--A-AC-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTTTAAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT-CT-CA--T-TCAATA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AAT-AC----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG-T-T-TTTAT-TAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTA--AAAC-ATGCAATAC-CC--CCTGTATGAA-T--A-TAAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAG---CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCA-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAA-T-AAATT-AAAATGCATCCAGGTCAATA-TA---AAAA-CCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAATACTA--GTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAAAACTATAGACTCCC
gi|10 : -TCAGA-AG-AC----AATATCTTCAAAG-TATCC-ATTG----A--AGT-----------A-GTCCGTATA-G-TAAGAAGCCATAGTACAAA---T--T-----TCGTT----TGGATGCCAA-TGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTGTTCGCTCAACT-A-T-TAA--AT-GAA-TA-AGTG-TA-A-TCAAATA-ATCA-AA-----AGTGA-AAA--TTTTAA----------TC---------------------------------------GGTGGTACA--AG--T---T-GA------CTCAA-TGCAGGCC-----T------CAACGG-TC-AATAAA--TA----A-GCC----ACT-GC-AG-------ACA-C-CAATCTAGATATAGAACT-AT---TT--AAAAAT--G-ACTTG-T-GATTTTTCTATT-AAA-C--TCGCGATA---ATGTTCATAC---TAT------------------AATTCATTTTAGA-AAAT--CTACA-CT--TCCCA-TCAC-A---AAAGCTT-TTCA-CAA-GCA-TTT-TT-CA----TTA-TT-A-TT-----AC-A----TTGTGGG-C-C-AAA-A----TAG--CC-TTT---TG
gi|11 : tcaGGGG-TTG---CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTT---AT-T-AGGC---TA--CCCT----ATCTG-TCAAA-CAAGCCCAAAACATC-----AGGAATGC-ATTG----A--AAACAGAAAATGAAA-GTCC----A-G-AAAT-GTCAA-A----AGA---TAAT-----TTGT------G-------A-GGT------AAAT---------AT--CCTTGCAA-TTTTTTTCTTTAAAT-A-TTGAA--AT-AGA-TACTGTC-TA-AATTAGATA-AATA-GAGAAA-AGTAA-AAT--CTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT----AATT-------------------ATGGTGATACC--AAAATT--G-AA------CCCAA-TACGAGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AG-AAA--TACC--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-T-T-CA--CTA-t
gi|12 : aaattaaGG-TTGT--CAGTG-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ATGTG--CA--GCCCC---ATCTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G--AATTGTCAATA----TTT---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGC------A--TGATTTATGAAT--CCT-GTTA--TTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AAA-TA-TGTC-TA-A-TTAAATA-ATTA-GA-----AGAGA-AA---TTTTAACATTATAATTTCATG----TTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACC--AAAAT---GAAA------CCCAA-TAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-TA-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ACAG-GAA-T-AT---TC--AAAA
gi|13 : --TT-TTCA-C-A-GCAATCTTCC-CA--T-TCA-TAAT-TT-----AC-AATG-TTTTTGG-CTC-AAA-AATATTAA--CCATTTGTGTGAGGCATTGTAT-TTCCAATCATGAATCTT-AGTGAAGAT--AA-AAAAAAAGAAGAATATA-TGAAT--T----GTAACATATCGT-GCTTGA-AAATC--T-T-TTTATCTAATTCCTTCAAGG-TG-CAT-TATTGCAATTAAGTTCAATTGCG--ATG-AAATA----ATA--T---CTTTTA-CA--ATTACAGTCAT-TAT-TTT-----AAC-Gaata
gi|14 : taccttgttcaagcccgatttaaacatattt-T-GAA--AT-AAA-TG--ATC-TA-A-TTAAATA-TTTA-GATTTTTAGTAA-AGTGTTTTTAAC---ATTACTTCATG-TTTTTTAT-TAATA-------------------ATAGTGGTACA--AAAAT---G-AACTCGAGCTCAA-TAC-GGCC-----AA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--GC-C--A-ACAAGCGACTGGC-AATACAGGTA-A-CGCA--CTATATGT-GAA-T-AT---TT--AAA----CA-ACTTctacacgtttg
gi|15 : ttt-TGGAAAGAA--TTGGAATCATAGT--ATTATTCA-ACTTACGAGTGATGG-A---TAT---T-T---ACTTAATTCA-------TTTTACTT-AAATTAAAAATACAT-CAAATTAA-A-TG---AAAA-TAGTAT-A--AAT-C-ACC-TAAA-A------TGAGC-ACTTTCACTCACAGTCATTGACGG-TC-ACGCTAC--TAGATCCCtgtcatg
gi|16 : --TT-TTCA-T-A-TCA-TCT-C--CA--T-CTA-TA-T-TT-----AC-T-T--TTTTTAG-C-C-AAA-A----AAT--TCATTT----GAAG-AT-T-AT-TTTCA--CATGA----T-AG--AAAA---AA-AAAA---------TATA-T-AAT-ACTTGTATAACA-A--GT-GC---A-TAATTG-T-T-TTTATTTGATTCC-TCAA-G-TG-CAT-tac
gi|17 : A-ACT-ATGAGTGATGG-A---GAT---T-T---A-----CTCAATTCGTTTTTTAC-T-AAATT-AAAATACA-ACAAATTAA-A-TG---AAAAACAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----G--AGC-ACTTTCACTC-CAGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTAC--TAGACCCC
gi|18 : -G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--ATA-AAA-A----AAA--T---C-TTTC-AA--TTTACAG--AT-AAT-ATATACGAAA------GATAT-CA-------ATAA-----A-CAAAT---ATGTACA-----------TCTGGTTTT-AT-GTGTGCATTAGCTATAGATGACAACAAA-TGGAAta
gi|19 : TG-TTTTTGAT-TAATA-------------------ATGGGGGTACA--AAAAT---G-AA------CTCAA-TACAAGCCATCGACACTAGTCGACAG-TC-AT-AAA--TA-C--T-GC-----ACT-GCTGC-------A-A-C-------A-ATAT-GAA-T-A---ATC--AAAAT--------------ATTTTTC-ATTCAA
gi|2 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACATG--TA--CCCCC---ATTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----A--AAA-----------A-ATCC---TA-G-AATATGTCCACA----AAA---T--T-----TTGTT----TC-------A-GGT------A--TG--------AT--GGT-GTAAGTTTCCCCCCTCAAAT-A-T-GAA--AT-GAA-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTTTATC---ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT---G-AC------TTAAA-TACAGGCC-----CT-----CGACAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT-CT-CA--T-TCA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AAT-AC----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG---T-TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTA--AAAC-ATGCAATAC-CC--CCTGTATGAA-T--A-TAAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCA-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAA-T-AAATT-AAAATGCATCCAGGTCAATA-TA---AAAA-CCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAA-ATACTAGTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-ACAATACTATAGACTCCCc
gi|20 : TCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-AGAAT-ATGTTCATAT------GTGGAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTG-A-AAAT--ATGTACTT--TCAGA-GCAT-A---AGA--TT-TCCA-C-A-ACA---T-CT-CA--T-TTA-T
gi|21 : ATT-AAAA-ACATC---ATTATTAATG---AAAAATAGTAT-ATAAATCC-ACC-TAAA-AT----G--AGC-ACTATCACTC-CAGTCT-TGAT-G-TC-ACGTTAC--TAAACCC
gi|22 : ttcaaaaaatattCA-C-A-GCA-TTT-C--CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTT-GG-C-T-AAA-A----CAG--CCATTT---TGAAG-AA-A-AT-TTTTA--CATAC----T-AG--AAGAT--TA-AAAA----------ATA-T-AAT-A------TAACA-A--GT-GC---A-tacttt
gi|23 : AATTCAAAATACATC-AAATTAA-A-TG---GAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----G---GC-ATTAGCACTC---ATCA-T-AC-A-CC-ACG
gi|24 : TTAAC---ATTATT--ACT-TCTTGT-T-TGATA-------------------ATGGTGGTACAGGAAAAT---T---------CTCAT-CAACGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--AGGC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--aacgccgctactcagac
gi|25 : GGGGG-TTATATCAGTA-TA-G-TGA-GTAAAG-TATG-T--GATCTGTTTT--AT-T-ATACGTTTA--TCCCC---ATTAGTTCAAA-TG-G
gi|26 : aaactaATA---TGT-A-CCTCTGGTTTT-AT-GTGTGGAT------TCGATGACAACAAA-CGGAAAGGAAATTGGAATCATAGT--TT-Aaca
gi|27 : GGTGGTACT--AAATT---T-AA------CTCAA-TACGG-CC-----CA-----CGGGAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GT-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-a
gi|28 : TAT-A--AATCC-AAA-TAAA-AT----G--AGT-ACTTTCGCTC-CAATCA-TAAC-G-TC-ACTCTAC--TAGACCCC
gi|29 : ATGTG--TAT---TTTT--ATAT-AAGCG--TA--CCCCCTCCATCTG-TCAAA-CA-GC----AACAAC-----Ata
gi|3 : gagccaaTTAGGGGCTTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-AAGTG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCAAT-----AAT---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTTCTTTAGAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-AATA-GA-----AGTGA-AA---TTTTAAC---ATACTTTCATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTGCA--AATTT---G-AA------CCCAA-TAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-T-----AAA--CA-CTAA-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATA--AAAAATT-G-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAAGC--TCGC-ATAAT-A--TTCATA------TATGAAT-GCTT-G-T-AAAATGCATT----A-AAATAACTACACCT--TCTCAGGCAT-AGCGAAA--TTAATCATC-AGGCA-TCT-C--CATCT-TTA-TA-T-TA-----ACGA-TTGTTCTTGG-C-C--AA-A----TAATCCCATTT---TTGAG-AT-G-ATCTTTCA--CATAA----TAAG--TACAT--AATTAAA---------TAAATT-AATAAT----GTAAC--A--GTAGC---T-GAA-TG---T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTTAAG--ATCAAT-TTTTA--AAACGGTG-ACTAC-AA--C--GTATCGAT-----TCAGT----TACATA---TGT-ACCCTCTGG---T-GT-ATGTGGAT------TAGATGACCACAAATTGGAAAGAAAATTGGAATCATAGTAAAT-ATTCA-AC--AT-AGTGATGG-A---TAT---TACTTAA-----TTCA---------TTAA-T-AAA-T-AAAAAACATC--AATTAA-A-TG---AAAA-TAGTATAA--AATCCAACC-TAAA--------TGAGC-ACTTTCACT--CAGTCA-TGA--G-TC-ACG-GGCTACAGAACCCC
gi|4 : aaaaGGGGG-TTAT--CA-TA-TA-AATGA--TAAAT--ATG-G--TAG---GTTT--TT-T-GC-TG--TG--ACCCC---ATCGT-TCAAA-CG--C----AATATC-----AA-CATTCTATTG----A--GGA-----------AAGTCC---TAAG-AAATTGTCAATA----A-----T--T-----TTGTT----TG-------ATAGT------G--T--------------CT-GCAA-TTTTTTCC-TTAAAT-A-T-GAAGCATGAGA-TA--GTC-TAGA-TTAGATA-AATATGAC----AGTGATAAT--TT--AAC---ATAAGTTCATG-GTTTTT-T--AATATGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTA-A--AAATT---G-AAA-----CCCAA-TAGCAACCG----CA-----CGGCAG-TC-AATAAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT--AA-T-ATTAAAA--AAAATT--G-ACT-G-T-GATTGT-C-AT-CAAA-CACTCGC--TA-T-ATGTTCA-------ATATGAAT-GCTTTGTT-AAAATACATTT-A-A-AAATA-CTACAACT--TCTCA--CAC-G---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--AA--T-TTA-TA-C-T------AC-A-T--TTTTGGC-C-C-AAAGA----TCG--CCCATT---TGAGG-AT-G-AT-TTCAA--CATAA----T-AG--AAGATAAAA-AAAA---------TATA-T-AAT-G-------AACA-A---T-GC---G-GA--TG---T-TTTATCTAATTCC-TCCA-A-AG-CA--TATTGCAT-----------TTTC--ATA-AAA-A----AAAACT---C-TTTA-AA---TTACAGA-AT-AAT-TTT-----AAC--TGTCTTACACG--A--ATGATAGTC--AGTTAA----ACAAATA---TGT-A-CCTCT-GTTGT-ATGGTGTGA--------TAGAT-CCAACAAA-TGGAAAGAAAA-TGGAGTCATAGT---T-ATTCACACT-ATGAGTGA-GA-GAATTTC---TGA---AGGAT-TTCA-------TTTTAC-T-AAAAT-AAAATACACTCAAATTTAAA-TGGAAAAAA-CA-TAA-A--AATCC-ACC-TAAA-------CTGAGG-ACTTTCACTC-C-ATCA-TGAC-GTTC-ACGCTAC--TAGACCctact
gi|5 : aattaaGGGGG-TTGT--CAGTAATACA-TGA-GTAAATCTATG-GG-TAT---TTTTTAAT-TTATGTA--TATTCCCCC---ATCTG-TTAAAACG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-GAAAATTGTCCA-A----TAATTTT--T-----TTGTT----TG-------A-GA-------A--TG--------AT--CCT-GCAATTTTTTTTCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGATTA-TGTC-TA-A-TTAGATATAATA-GA-----AGTGA-AAT--TTTAAACA--ATAATTTTATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--TAAATTGGA-AA------ACCAA-TACGGA-C-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GCAG---ACT-GC-AA-------ACA-T-CA--CT--ATAT-GAA-TCAT--AAA--AAAAATT-G-CCTTGTT-GA--TTTC-ATTCGAA-C--TCGC-ATAATGATGTTCATA------TATGAAT-GCTT-TTA-AAAATACATTAAA-ATAAAT--CTACACCT--TCTCA--CATAA---AAA--TT-TTCA-CGA-GCA-TCT-CCACA--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGG-C-C--AA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT---AT-TTTCA--CATAA----A-AG--AACAT--AA-AAAA---------AGTA-T--AT-AT----GT-ACA-A--GT-GC---CTGAATTG-TGTGTTTATCC-ATTCCGGCAA-G-TG-CAT-TA-TGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTACAA--TTTACAG--AT--AT-TT
gi|6 : aaataGGCG-TTGT--CAGTA-TA----GA--TA----TATG-AGCTAT---TTCA--AT-T-ATGTG--T--------------------AA-C--GT----ATTCTT-----AG--ATTC---TG----GTCAAA-----------G-CTTC---CA-G-AAATTGTC-ATA----AAA---T--CTTAAATTGTT----TT---------GGTTG----A--TG--------ATGACCT-GAAT-TTTTTTTCCTTAAATAA-T-GAA--AT-AGA-TACTGTC-T--A-TTAGATACAT---GA-----AGTGA-AAT--TTT--AC---ATAA-TCCATG-TTTTTT-T-CAATG-------------------AT-GT--TACA--AAATT---G--A------CCAAA-TACG---C-----CA-----CGGCAGCTCAAA-AAA--TA-C--G--------ACT-GC-AA-------A-AGT-CA--CTT-AT-T-AGA-C-AT--ATTCAAAAATTTTG-ACTTG-TAGATTTTTC-ACTCAA-----TCGC-AT-AT-ATGTTC-TAT---TGGATGATTAG--T-GT---AAATGCA--TTA-A-AAAT--CTACACA---TCTC--GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C---GCA-T-T-C--CA--TGTTA-TT-C-TT-----ACAA-T--TTTTTGGCC-C-AAA-A----TAG--CC-TTT---TGAGG--T-G-AT-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT-----AAAA---------TATA-T-AAC--T----GTA--A-A--GT-GT-----GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-GATGCCATCTATTGCA------------TTT---ATG-AAA-AAAACAAA--C---T-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAC-CG--TAGGTTTCAGTTAAA-TCAAT---ATGTAC
gi|7 : ggaGGGCG-TTGT--CAGTA-TC-A--GA--------TAGG-C--TAT---TTTA--AT-T-ATG--------------------G-T--AA--G-GT----AAT-TC------T-AATT--ACTGTTCAA--AGA--------------TTC------G-AAATTGCATATA----AAA---T--C-----TTGTTGTATTA-------ATGGTTTTTTGA--T---------AT--CCT-GGAA-TTTTTTTTCTTAAAT-AAT-GAA--AT-AGA-T--TGTCCTA-A-TTAGATA-AT---GA-----AGTGA-ACT--TTT---C---ATAATC-CATG-TTTTTT-CCTAATA-----------------------TGTTACA--AAT-T---G-A--------CCAA-TACGG--C-----CA-----CGGCAGCTC-AA-AAA--TA-C----GC-----A-T-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-TT-T-GA--C-AT--ATTCAAAAATTTTGGACTTG-T-GATTTTTC-ACTCAA-----TCG--ATA-T-ATGTTCATAT---TGGATG------TT-GTT-AAA-TGCATTA-A-A-AAAT--CTACACCTATTCGC-----T-A---AAA--TT-TT-A-C-G---A-T-T-CT-CA--T-T-A-TA-TCTT-----AC-A-A--TTTTTGG-C-CCAAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG--T-G-AT-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT---A-AAAC---------TATA-T-AAC--T----GTAA-A-A--GT-GT-----GACTTGTT-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-GATG-CAT-TATTGCA------------TTTT--ATG-AAA-A----AAA--CAAAT-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAC-CG--TAGATATCAGTTAAA-TCAAT---ATGTACtct
gi|8 : aattagAAT-GCTT-GTT-AAAACACATTTTA-A-AAAT--TTGCATTT--TCACA-GTAT-A---AGA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C---A--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG---CATTT---TAAAG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-CAA-----------ATA-T-AAT-AT----ATAACA-A--GT-GC---A-GAATTG---T-TTTATTTAATTCC-TCGA-G-TA-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AA--TTTTA--AA----TCTAATTT-TGATT--GTATGA--T--A-TCAATTAAACAAATA---CGT-A-CCTCTGGTTGC-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAAAAGATTGGAGCCATTGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAATGATGGAG---CGTTAATGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCATGTAAAT--CG---AAAA-ACGTAT-A--AATCC-AGC-CAAA-A------TAAGC-AATATCATTT-CGGACA-TGtct
gi|9 : aAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--CA--T-TTA-TA-T-TTTAATTAC-AAT--TTTTTGG-C-A-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AC-GAAT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-G-----GTAACA-A--GT-GC---T-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGC-------------TTTCCAATG--AA-A----AAA--T---C-TTTA-AAGTTTTACAG--AT-AAT-TTT-----AAC-GTGC--TAA-CA--C--GTATGA--T--A-TCGAG---TTAAACAAATTGTAA-CCTCTGGTTGTAAT-GTGTGGAT------TAGATGACAA-AAA-T-GAAAGAAAATTGGAATCATAGT--AT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-AT--TAT---TACTTAA-----TTCA--------TTTAC-TAAAATT-AAAATACAT-CAAATTAA-A-TGA--AAAA-TAGT-T-A--A--TC-ACCTTAAA-A------TGAGCAACTTTCACTC-CAATCA-TGAC-G-TCAACGCTAATA-AGATCCC
blockSeqs : C AT A AA G C T GC CTG TTA A T TACGTT TTC TCC T CAA CCAA TTCAA GA T TTCA TC CAGAAAATGAAAG GTAT A A C T AAATCTTAAA GTATTAATGGTTTTTTGAT GA T G A A T GC G T CT C G A T TC T TTTTT T TGT T ATT GT AT TGGAGGGGGGGGGGGGGGG GG A GAACTCGAG . A G ATCGA CTAGT C A T . C TAA AAGCG G T TACAGGTA G G AT G A A C C TAAAA A TC G T A T ACAC G A G TACATG G A T T TT GA AA AT C AGG A GCG GC A T A G A T T CA TC G . A C TAATT GATTG C T C G ATAT TC GTG C TGT C AT ATCTT TG AAA T AAAGAAGAA T G ACTTGT T TC A TTGA A TG G T A G A C C ATTAAGTTCAAT G CA GAA T AAAC AC AAAT C GT TC C G TAAAACATGCAATACCCCCTGTATGAAT G TAA T AAT A C T A G C TAGCTA T GT AAA T C T G GAATTTCTGAAGGAT ATTCGTTT T A A AC T A GAA A A TA A T ATACTAGTA A T A A T G T A C TA
blockSeqs : . . . CA G . . G . T . . TGTG C . . ACG . . T . . . AAG T . . A T GTACAAATT TGAGGCATGATTTATGA . . T . . . . . . CT . . . C AT . GAAA . TA T A T AT . . A TGGAAA . G G G . C . T . . AG AG . . AC . . . T A . . . ATTCA T TC . . . . AGC . A . CTA A . . T TT AT A . A AT . . . . . G . . C . T . . . . . . AATG . . . . . . . . GA . . TA . A . . . . AAT . . . CT A TT . G A . A . . T A . GAA . . . CT . . A . . TAAAACGGTGACTACAACGTATCGAT . . T . . . C . . C . . AA A . . . G ATATTTACTTAA T . . C CC T . A A . . . . ATG . T . A . . . . C TA
blockSeqs : . . . A G . . . . T . . CATG G . . AG . . A . . . AG T . . A C TAATTTTT TGGATGCCAATGTATG . . . . . . . . . A . . . . TT . C . A T . T CC . . A TGAA . A G . . . . . . . A C . . AC . . . . G . . . ATTCA T TT . . . . AC . A . TTG A . . T TT T . . A AG . . . . . . . . C . C . . . . . . AAT . . . . . . . . T . . T . A . . . . AC . . . A C T . . G . . . . . A . GA . . . C . . . . . AACGTGCTACCGTAGGTTTCAGTTAA . . C . . . T . . G . . AA C . . . A AGCGTTAATGTA T . . . TC A . . . . . . . ATG . A . G . . . . A TA
blockSeqs : . . . A G . . . . T . . AGCG C . . CA . . A . . . AG T . . C T AGATAAT TTGGTTGATG . . . . . . . . . T . . . . TT . . . T T . T T . . A GAAA . A G . . . . . . . A . . . A . . . . A . . . ATC A TT . . . . AC . A . TTG A . . T AA A . . T AG . . . . . . . . A . T . . . . . . AAT . . . . . . . . G . . T . A . . . . AT . . . A A T . . A . . . . . T . AA . . . A . . . . . AACGTGCTACCGTAGATATCAGTTAA . . A . . . G . . G . . AA T . . . G ATTATTACTTAA T . . . CC T . . . . . . . ATG . A . A . . . . T .
blockSeqs : . . . A G . . . . T . . AGTG T . . CA . . A . . . AA T . . A T TTTTT GAGGTAAAT . . . . . . . . . T . . . . TT . . . T T . T T . . A GAAA . C G . . . . . . . A . . . A . . . . A . . . ATT T C . . . . AC . A . T A . . A TT A . . T AG . . . . . . . . T . T . . . . . . AAT . . . . . . . . A . . T . T . . . . AT . . . A A T . . C . . . . . T . AA . . . C . . . . . AACTGTCTTACACGAATGATAGTC . . T . . . G . . A . . GA C . . . A ATATTACTTAA T . . . C . . . . . . . . ATG . A . A . . . . C .
blockSeqs : . . . G G . . . . T . . TGTA C . . TG . . C . . . AG T . . A T AAATT TCAGGTATG . . . . . . . . . T . . . . AT . . . T T . G T . . A TGA . G G . . . . . . . A . . . A . . . . A . . . ATA A T . . . . AC . . . A T . . T TT A . . T A . . . . . . . . C . T . . . . . . AAT . . . . . . . . G . . T . A . . . . T . . . T A T . . A . . . . . T . GA . . . C . . . . . TAAATCTAATTTTGATTGTATGAT . . T . . . G . . G . . AA A . . . G GTGTTGTA . . . . C . . . . . . . . ATG . T . A . . . . C .
blockSeqs : . . . A . . . . . T . . TGTG C . . CA . . A . . . AG C . . C T AATTT TGAGGTATG . . . . . . . . . T . . . . AT . . . T T . T T . . T GAA . C G . . . . . . . T . . . C . . . . A . . . AAA T T . . . . . . . . . A . . T T A . . T A . . . . . . . . C . . . . . . . . TT . . . . . . . . G . . A . A . . . . A . . . G C . . . A . . . . . T . GA . . . C . . . . . AACGTGCTAACACGTATGAT . . A . . . . . . G . . . . . . . . AGATTTA . . . . C . . . . . . . . CTG . T . G . . . . C .
blockSeqs : . . . A . . . . . A . . GGC A . . CG . . A . . . GC . . . T . AAATC TGATAGTGT . . . . . . . . . T . . . . AT . . . T A . T T . . T GAC . G G . . . . . . . A . . . A . . . . A . . . TT T . . . . . . . . . . . . . . A A . . G G . . . . . . . . C . . . . . . . . AT . . . . . . . . G . . A . A . . . . G . . . A A . . . A . . . . . T . G . . . T . . . . . TACGAAAGATATCAATAA . . A . . C . . . . . . . . ATA . T . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . CTG . . . CG . . . . . . . . . . . . ATT TGAGAATG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . T TAA . G A . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . AT . . . . . . . . G . . A . A . . . . T . . . T A . . . G . . . . . A . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . ATG . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TG . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . A GAA . G A . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . TT . . . . . . . . C . . . . . . . . AT . . . . . . . . G . . T . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . TG . T . . .
blockSeqs : . G . . . . . . T GA . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : G* AG************ AAATT************** T** T* ** TTG*** T* ** N****** T** GA* AACGTGCTAACACGTATGAT***************** ANATTACTTAA************ C* ATG******* **
originalCons : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACGCG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCNATA----AAA---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA------CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-CT-CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT-AC----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTG-T-T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTTA--AAAC-GTGCAATAC-CG--C--GTATNAGTT--A-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGG-G---TGT---TGT---A-----TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATCCAAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAA-AT----GTGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTACTATAGACCCCC
finalCons : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGAG-TAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACGCG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGAAG------------TCC---TA-G-AAATTGTCNATAAAATT--------------TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATGT-TTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA------CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-GC-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATATTG---TATGAAT-GCTT-GTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT-C--CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-AT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AATN------GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTGT--T-TTTATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATGA-AA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTTAACGTGCTAACACGTATGAT-----------------A-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGGANATTACTTAA------------TTCA-------TTTTAC-T-AAATT-AAAATACATC-AAATTAATA-TG---AAAA-CAGTAT-A--AATCC-ACC-TAAAATG-------AGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-ACGCTAC--TAGACCCCC
Alignments
lowQualScore : 111111 22222222222222 1111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222 1 22222 111 11 2222222222222222222 1111111111111 11111 11111 1111111 11 222222 111111 111111111 222222222 11111 222222222222 111 444444444444444444444444444 22222222 3333333 111111 111 11 11111111111 1 22222222 111111 11111111111
lowQualScore : 4 55 4 555 99 4 3 88 666 555 3 3 111111 555 666 3 5555 7777 99999 44 4 8888 55 22222222222222 9999 4 4 4 3 4444444444444444444 6666666666666666666666666666666666666 55 4 2 4 3 3 55 3 3 99 3 3 3 7 11 3 00000 3 444 3 999 0 0 22 777 3333333333333333333 33 3 5555555555555 2 8 1 00000 77777 5 2 5 33 5 4444 2 11111 2 2 999999999 2 2 33 6 1 3 3 3 5555555 1 33 3 4 4 4 88888 4 7 4 888888 1 4 4 44 0 22 444 99 55 1 999 4 777 44 3 2 5 2 5 0 33 99 33 2 2 444 77777 555555 3 3 3 3 6666 44 0 555 3 444 3 3 44 777777 44 44 3 777777777 3 3 777777777 3 44 3 55555 2 88 3 3 7 2 3 6 3 3 222222222222 1 55 555 3 7777 55 77777 3 55 88 3 7 111111111111111111111111111 44 22222222 4 3333333 777 4 4 2 5 5 1 444444 4 44 222 5 5 5 2 55 55555555555 3 66 0 4 4 4 8 4 55555555 3 55 3 3 99999 000000 3 1 3 5 3 4 4 4 55555555555 55 8
lowQualScore : . .. . ... .. . . .. ... ... . . ...... ... ... . .... .... ..... .. . .... .. .............. .... . . . . ................... ..................................... .. . . . . . .. . . .. . . . . .. . ..... . ... . ... . . .. ... ................... .. . ............. . . . ..... ..... . . . .. . .... . ..... . . ......... . . .. . . . . . ....... . .. . . . . ..... . . . ...... . . . .. . .. ... .. .. . ... . ... .. . . . . . . .. .. .. . . ... ..... ...... . . . . .... .. . ... . ... . . .. ...... .. .. . ......... . . ......... . .. . ..... . .. . . . . . . . . ............ . .. ... . .... .. ..... . .. .. . . ........................... .. ........ . ....... ... . . . . . . ...... . .. ... . . . . .. ........... . .. . . . . . . ........ . .. . . ..... ...... . . . . . . . . ........... .. .
lowQualScore : 0 55 0 444 00 0 6 66 444 222 6 6 000000 555 444 3 1111 7777 11111 99 0 5555 55 00000000000000 3333 0 0 9 8 8888888888888888888 5555555555555555555555555555555555555 55 0 0 0 6 6 00 6 6 55 6 6 6 3 77 6 55555 6 555 3 222 3 4 22 000 8888888888888888888 99 0 3333333333333 9 9 2 00000 11111 7 9 7 99 7 2222 9 11111 9 9 444444444 9 9 99 2 3 6 6 6 9999999 2 11 6 0 0 0 00000 4 3 4 111111 4 0 0 99 8 00 222 55 55 0 888 0 000 22 1 9 7 9 7 6 99 66 99 9 9 111 77777 555555 1 1 1 1 5555 22 4 444 3 222 3 3 66 999999 66 66 3 999999999 3 3 111111111 3 66 3 99999 0 00 6 6 3 5 3 7 3 3 333333333333 0 00 888 6 7777 00 55555 6 00 66 6 3 555555555555555555555555555 99 55555555 4 6666666 888 4 4 8 0 0 4 444444 4 88 888 0 0 0 2 99 11111111111 2 99 0 0 0 0 0 0 22222222 6 00 6 6 11111 555555 6 0 6 5 6 0 0 0 55555555555 55 0
consensus : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACGCG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCNATA----AAA---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA------CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GC-TTGTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT--C--CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-A-T-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT--N-----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTGT-T-TTT-ATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT---AAC-GTG-CTAAC----AC-----GTAT-G--------ATA-TCAAT-A-ACGNATA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGGA-TATT-ACTTAA----TTCATTTT--ACT-AAATT-AAAA-TACA-T-CAA-ATTAA-AT-G---AAAACAGTAT-A--AATCC-ACC-TAA-----AA------TGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-A-------C---GCTAC--T-AGACCCCC
Reference ( family-2207 ) : TTGGGGG-TTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ACGCG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCNATA----AAA---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-ATTA-GA-----AGTGA-AAT--TTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--AAAAT---G-AA------CCCAA-TACGGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TCGC-ATAAT-ATGTTCATAT---TGTATGAAT-GC-TTGTT-AAAATACATTTTA-A-AAAT--CTACACCT--TCNCA-GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT--C--CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT-G-A-T-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT--N-----GTAACA-A--GT-GC---A-GAATTGT-T-TTT-ATCTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TNTC--ATG-AAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT---AAC-GTG-CTAAC----AC-----GTAT-G--------ATA-TCAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTNT-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGAAGATTGGAGTCATAGT--NT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGGA-NATT-ACTTAA----TTCATTTT--ACT-AAATT-AAAA-TACA-T-CAA-ATTAATAT-G---AAAACAGTAT-A--AATCC-ACC-TAA-----AA------TGAGC-ACTNTCACTC-CGGTCA-TGAC-G-TC-A-------C---GCTAC--T-AGACCCCC
gi|1 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGAAGTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACATG--TA--CCCCC---ATTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----A--AAA-----------A--TCC---TA-G-AATATGTCCACA----AAAA--T--T-----TTGTT----TC-------A-GGT------A--TG--------AT--GGT-GTAAGTTTCCCCCCTCAAAT-A-T-GAA--AT-GAA-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTTTATC---ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT---G-AA------CTTAAATACAGGCC-----CT-----CGACAG-TC-AA-AAAATCAGC--A-A-C-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GC-TTGTTTAAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT--CT-CA--T-TCAATA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-A-T-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AATA-C-----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTGT-T-TTT-AT-TAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTAAAAC-ATG-C-AAT----ACCCCCTGTAT-GA-------ATA-TAAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAG---CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCAG-TGTT-GT---A----TTCATTTT--AAT-AAATT-AAAA-TGCA-TCCAG-GTCAATAT-A---AAAACCGCAT-A--AATCC-ACC-CAAATACTAG------TAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-A-------CAAAACTA---T-AGACTCCC
gi|10 : -TCAGA-AG-AC----AATATCTTCAAAG-TATCC-ATTG----A--AGT-----------A-GTCCGTATA-G-TAAGAAGCCATAGTACAAA---T--T-----TCGTT----TGGATGCCAA-TGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTGTTCGCTCAACT-A-T-TAA--AT-GAA-TA-AGTG-TA-A-TCAAATA-ATCA-AA-----AGTGA-AAA--TTTTAA----------TC---------------------------------------GGTGGTAC----AAGT---T-GA------CTCAA-TGCAGGCC-----T------CAACGG-TC-AATAAA--TA----A-GCC-----ACT-GC-AG-------ACA-C-CAATCTAGATATAGAACT-AT---TT--AAAAAT--G-ACTTG-T-GATTTTTCTATT-AAA-C--TCGCGATA---ATGTTCATAC---TAT------------------AATTCATTTTAGA-AAAT--CTACA-CT--TCCCA-TCAC-A---AAAGCTT-TTCA-CAA-GCATTTT--T--CA----TTA-TT-A-TT-----AC-A----TTGTGGG-C-C-AAA-A----TAG--CC-TTT---TG
gi|11 : tcaGGGG-TTG---CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTT---AT-T-AGGC---TA--CCCT----ATCTG-TCAAA-CAAGCCCAAAACATC-----AGGAATGC-ATTG----A--AAACAGAAAATGAAA-GTCC----A-G-AAAT-GTCAA-A----AGA---TAAT-----TTGT------G-------A-GGT------AAAT---------AT--CCTTGCAA-TTTTTTTCTTTAAAT-A-TTGAA--AT-AGA-TACTGTC-TA-AATTAGATA-AATA-GAGAAA-AGTAA-AAT--CTTTAAC---ATAATTTCATG-TTTTTT----AATT-------------------ATGGTGATACC--AAAATT--G-AA------CCCAA-TACGAGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AG-AAA--TACC--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-T-T-CA--CTA-t
gi|12 : aaattaaGG-TTGT--CAGTG-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-ATGTG--CA--GCCCC---ATCTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G--AATTGTCAATA----TTT---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGC------A--TGATTTATGAAT--CCT-GTTA--TTTTTCCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AAA-TA-TGTC-TA-A-TTAAATA-ATTA-GA-----AGAGA-AA---TTTTAACATTATAATTTCATG----TTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACC--AAAAT---GAAA------CCCAA-TAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-TA-AA-AAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-ACAG-GAA-T-AT---TC--AAAA
gi|13 : --TT-TTCA-C-A-GCAATCTTCC--CA--T-TCA-TAAT-TT-----AC-AATG-TTTTTGG-CTC-AAA-AATATTAA--CCATTTGTGTGAGGCATTGTA-T-TTCCAATCATGAATCTT-AGTGAAGAT--AA-AAAAAAAGAAGAATATA-TGAAT--T-----GTAACATATCGT-GCTTGA-AAATC-T-T-TTT-ATCTAATTCCTTCAAGG-TG-CAT-TATTGCAATTAAGTTCAATTGCG--ATG-AAATA----ATA--T---CTTTTA-CA--ATTACAGTCAT-TAT-TTT---AAC---G-CT-AC----AC-----GTTT-G--------aata
gi|14 : taccttgttcaagcccgatttaaacatattt-T-GAA--AT-AAA-TG--ATC-TA-A-TTAAATA-TTTA-GATTTTTAGTAA-AGTGTTTTTAAC---ATTACTTCATG-TTTTTTAT-TAATA-------------------ATAGTGGTACA--AAAAT---G-AACTCGAGCTCAA-TAC-GGCC-----AA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--GC-C--A-A-CAAGCGACTGGC-AATACAGGTA-A-CGCA--CTATATGT-GAA-T-AT---TT--AAA----CA-ACTT
gi|15 : ttt-TGGAAAGAA--TTGGAATCATAGT--ATTATTCA-ACTTACGAGTGATGGA-TATTTACTTAA----TTCATTTT--ACTTAAATT-AAAAATACA-T-CAA-ATTAA-AT-G---AAAATAGTAT-A--AATC--ACC-TAA-----AA------TGAGC-ACTTTCACTCACAGTCATTGACGG-TC-A-------C---GCTAC--T-AGATCCCtgtcatg
gi|16 : --TT-TTCA-T-A-TCA-TCT--C--CA--T-CTA-TA-T-TT-----AC-T-T--TTTTTAG-C-C-AAA-A----AAT--TCATTT----GAAG-AT-T-A-T-TTTCA--CATGA----T-AG--AAAA---AA-AAAA---------TATA-T-AAT--ACTTGTATAACA-A--GT-GC---A-TAATTGT-T-TTT-ATTTGATTCC-TCAA-G-TG-CAT-tac
gi|17 : A-ACT-ATGAGTGATGGA-GATTTACTCAA----TTCGTTTTTTACT-AAATT-AAAA-TACA-A-CAA-ATTAA-AT-GA--AAAACAGTAT-A--AATCC-ACC-TAA-----AA------TGAGC-ACTTTCACTC-CAGTCA-TGAC-G-TC-A-------C---GCTAC--T-AGACCCC
gi|18 : -G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--ATA-AAA-A----AAA--T---C-TTTC-AA--TTTACAG--AT-AAT-AT---------------AT----AC-----GAAA-G--------ATA-TCAATAA-ACAAATA---TGT-A-CATCTGGTTTT-AT-GTGTGCATTAGCTATAGATGACAACAAA-TGGAAta
gi|19 : TG-TTTTTGAT-TAATA-------------------ATGGGGGTACA--AAAAT---G-AA------CTCAA-TACAAGCCATCGACACTAGTCGACAG-TC-AT-AAA--TA-C--T-G-C-----ACT-GCTGC-------A-A-C-------A-ATAT-GAA-T-A---ATC--AAAAT--------------ATTTTTC-ATTCAA
gi|2 : TTGGGGG-TTGT--TAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTCT--AT-T-ACATG--TA--CCCCC---ATTTG-TCAAA-CA-GC----AATATC-----AA-AATTC-ATGG----A--AAA-----------A-ATCC---TA-G-AATATGTCCACA----AAA---T--T-----TTGTT----TC-------A-GGT------A--TG--------AT--GGT-GTAAGTTTCCCCCCTCAAAT-A-T-GAA--AT-GAA-TA-TGTC-TA-A-TCAAATT-ATTA-GA-----AGTGA-AATA-TTTTATC---ATATTTTGATGGTTTTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--ACAAT---G-AC------TTAAA-TACAGGCC-----CT-----CGACAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------C-A-C-CA--CTA-ATAT-AAA-T-AT--ATT--AAAATTTCG-ACTTG-T-AATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-ATAAT-ATGTTCATATACATGTATGAGT-GC-TTGTT-AAAATACATTTTA-T-AAAT--CTGCACTT--TCACA-GCAT-G---ATA--TT-TTCA-C-A-GCA-TAT--CT-CA--T-TCA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--TTATTT---TGAAG-AT-G-A-T-TTTCA--CATAA----T-AA--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-T-AATA-C-----ATAACA-A--GT-GC---A-GACTTG--T-TTT-ATTTAATTCC-TCGA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---A-TTTA-AA--TTTACAG--AA-AATGTTTTAAAAC-ATG-C-AAT----ACCCCCTGTAT-GA-------ATA-TAAAT---ATGTACA---TGT-A-CCTCTGGTTCT-AT-GTGTGCAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAGGAGTTTGGAGTCATAGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAGTGATCAG-TGTT-GT---A----TTCATTTT--AAT-AAATT-AAAA-TGCA-TCCAG-GTCAATAT-A---AAAACCGCAT-A--AATCC-ACC-CAA-----AATACTAGTAAGC-AATATCACTT-CGGACA-TGAC-G-TC-A-------C---AATACTAT-AGACTCCCc
gi|20 : TCG-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAA-C--TTGC-AGAAT-ATGTTCATAT------GTGGAT-GC-TTGTT-AAAATACATTTTG-A-AAAT--ATGTACTT--TCAGA-GCAT-A---AGA--TT-TCCA-C-A-ACA-TCT-----CA--T-TTA-T
gi|21 : ATT-AAAA--ACA-T-CATTATTAATG--A---AAAATAGTAT-ATAAATCC-ACC-TAA-----AA------TGAGC-ACTATCACTC-CAGTCT-TGAT-G-TC-A-------C---GTTAC--T-AAACCC
gi|22 : ttcaaaaaatattCA-C-A-GCA-TTT--C--CA--T-TTA-TA-T-TT-----AC-A-T--TTTT-GG-C-T-AAA-A----CAG--CCATTT---TGAAG-AA-A-A-T-TTTTA--CATAC----T-AG--AAGAT--TA-AAAA----------ATA-T-AAT--A------TAACA-A--GT-GC---A-tacttt
gi|23 : AATTCAAAA-TACA-T-CAA-ATTAA-AT-G---GAAACAGTAT-A--AATCC-ACC-TAA-----AA------TG-GC-ATTAGCACTC---ATCA-T-AC-A-CC-ACGAACGCC---GCTAC--TCAGAC
gi|24 : TTAAC---ATTATT--ACT-TCTTGT-T-TGATA-------------------ATGGTGGTACAGGAAAAT---T---------CTCAT-CAACGGCC-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--AGG-C-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--
gi|25 : GGGGG-TTATATCAGTA-TA-G-TGA-GTAAAG-TATG-T--GATCTGTTTT--AT-T-ATACGTTTA--TCCCC---ATTAGTTCAAA-TG-G
gi|26 : aaactaATA---TGT-A-CCTCTGGTTTT-AT-GTGTGGAT------TCGATGACAACAAA-CGGAAAGGAAATTGGAATCATAGT--TT-Aaca
gi|27 : GGTGGTACT--AAATT---T-AA------CTCAA-TACGG-CC-----CA-----CGGGAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-G-T-----ACT-GC-AA-------A-A-C-CA--CTA-a
gi|28 : TAT-A--AATCC-AAA-TAA-----AA------TGAGT-ACTTTCGCTC-CAATCA-TAAC-G-TC-A-------C---TCTAC--T-AGACCCC
gi|29 : ATGTG--TAT---TTTT--ATAT-AAGCG--TA--CCCCCTCCATCTG-TCAAA-CA-GC----AACAAC-----Ata
gi|3 : gagccaaTTAGGGGCTTGT--CAGTA-TA-A-TGA-GTAAAT-TATG-G--TAT---TTTT--AT-T-AAGTG--TA--CCCCC---ATCTG-TCAAA-CG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-G-AAATTGTCAAT-----AAT---T--T-----TTGTT----TG-------A-GGT------A--TG--------AT--CCT-GCAA-TTTTTTTCTTTAGAT-A-T-GAA--AT-AGA-TA-TGTC-TA-A-TTAGATA-AATA-GA-----AGTGA-AA---TTTTAAC---ATACTTTCATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTGCA--AATTT---G-AA------CCCAA-TAC-GGCC-----CA-----CGGCAG-T-----AAA--CA-CTAA-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT-GAA-T-AT--ATA--AAAAATT-G-ACTTG-T-GATTTTTC-ATTCAAAGC--TCGC-ATAAT-A--TTCATA------TATGAAT-GC-TTG-T-AAAATGCATT----A-AAATAACTACACCT--TCTCAGGCAT-AGCGAAA--TTAATCATC-AGGCA-TCT--C--CATCT-TTA-TA-T-TA-----ACGA-TTGTTCTTGG-C-C--AA-A----TAATCCCATTT---TTGAG-AT-G-A-TCTTTCA--CATAA----TAAG--TACAT--AATTAAA---------TAAATT-AATAAT-----GTAAC--A--GTAGC---T-GAA-TG--T-TTT-ATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTTAAG--ATCAAT-TTTTAAAACGGTGACTACA----AC-----GTATCG--------AT--TCAGT----TACATA---TGT-ACCCTCTGG---T-GT-ATGTGGAT------TAGATGACCACAAATTGGAAAGAAAATTGGAATCATAGTAAAT-ATTCA-AC--AT-AGTGATGGA-TATT-ACTTAA----TTCA--TT--AAT-AAA-T-AAAA-AACA-T-C-A-ATTAA-AT-G---AAAATAGTATAA--AATCCAACC-T-A-----AA------TGAGC-ACTTTCACT--CAGTCA-TGA--G-TC-A-------CGG-GCTAC--A-GAACCCCC
gi|4 : aaaaGGGGG-TTAT--CA-TA-TA-AATGA--TAAAT--ATG-G--TAG---GTTT--TT-T-GC-TG--TG--ACCCC---ATCGT-TCAAA-CG--C----AATATC-----AA-CATTCTATTG----A--GGA-----------AAGTCC---TAAG-AAATTGTCAATA----A-----T--T-----TTGTT----TG-------ATAGT------G--T--------------CT-GCAA-TTTTTTCC-TTAAAT-A-T-GAAGCATGAGA-TA--GTC-TAGA-TTAGATA-AATATGAC----AGTGATAAT--TT--AAC---ATAAGTTCATG-GTTTTT-T--AATATGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTA-A--AAATT---G-AAA-----CCCAA-TAGCAACCG----CA-----CGGCAG-TC-AATAAA--TA-C--A-G-C-----ACT-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-ATAT--AA-T-ATTAAAA--AAAATT--G-ACT-G-T-GATTGT-C-AT-CAAA-CACTCGC--TA-T-ATGTTCA-------ATATGAAT-GCTTTGTT-AAAATACA-TTTA-A-AAATA-CTACAACT--TCTCA--CAC-G---AAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT--C--AA--T-TTA-TA---CT-----AC-A-T--TTTTGGC-C-C-AAAGA----TCG--CCCATT---TGAGG-AT-G-A-T-TTCAA--CATAA----T-AG--AAGATAAAA-AAAA---------TATA-T-AAT--G-------AACA-A---T-GC---G-GA--TG--T-TTT-ATCTAATTCC-TCCA-A-AG-CA--TATTGCAT-----------TTTC--ATA-AAA-A----AAAACT---C-TTTA-AA---TTACAGA-AT-AAT-TTT---AAC--TGTCTTAC----AC-----GAAT-G--------ATAGTCAGTTAAACAAATA---TGT-A-CCTCT-GTTGT-ATGGTGTGA--------TAGAT-CCAACAAA-TGGAAAGAAAA-TGGAGTCATAGT---T-ATTCACACT-ATGAGTGAGAGA--ATT-TCTGAAGGATTTCATTTT--ACT-AAAAT-AAAA-TACACT-CAA-ATTTAAAT-GGAAAAAACA-TAA-A--AATCC-ACC-TAA-----AC------TGAGG-ACTTTCACTC-C-ATCA-TGAC-GTTC-A-------C---GCTAC--T-AGACCtact
gi|5 : aattaaGGGGG-TTGT--CAGTAATACA-TGA-GTAAATCTATG-GG-TAT---TTTTTAAT-TTATGTA--TATTCCCCC---ATCTG-TTAAAACG-GC----AATATC-----AG-AATTC-ATTG----A--AGA-----------A-GTCC---TA-GAAAATTGTCCA-A----TAATTTT--T-----TTGTT----TG-------A-GA-------A--TG--------AT--CCT-GCAATTTTTTTTCCTTAAAT-A-T-GAA--AT-AGATTA-TGTC-TA-A-TTAGATATAATA-GA-----AGTGA-AAT--TTTAAACA--ATAATTTTATG---TTTT-T-TAATA-------------------ATGGTGGTACA--TAAATTGGA-AA------ACCAA-TACGGA-C-----CA-----CGGCAG-TC-AA-AAA--TA-C--A-G-CAG---ACT-GC-AA-------ACA-T-CA--CT--ATAT-GAA-TCAT--AAA--AAAAATT-G-CCTTGTT-GA--TTTC-ATTCGAA-C--TCGC-ATAATGATGTTCATA------TATGAAT-GC-TTTTA-AAAATACATTAAA-ATAAAT--CTACACCT--TCTCA--CATAA---AAA--TT-TTCA-CGA-GCA-TCT--CCACA--T-TTA-TA-T-TT-----ACAA-T--TTTTTGG-C-C--AA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AT---A-T-TTTCA--CATAA----A-AG--AACAT--AA-AAAAAG-------TATA-T-A----T-----GT-ACA-A--GT-GC---CTGAATTGTGTGTTT-ATCC-ATTCCGGCAA-G-TG-CAT-TA-TGCA------------TTTC--ATGAAAA-A----AAA--T---C-TTTACAA--TTTACAG--AT--AT-TT
gi|6 : aaataGGCG-TTGT--CAGTA-TA----GA--TA----TATG-AGCTAT---TTCA--AT-T-ATGTG--T--------------------AA-C--GT----ATTCTT-----AG--ATTC---TG----GTCAAA-----------G-CTTC---CA-G-AAATTGTC-ATA----AAA---T--CTTAAATTGTT----TT---------GGTTG----A--TG--------ATGACCT-GAAT-TTTTTTTCCTTAAATAA-T-GAA--AT-AGA-TACTGTC-T--A-TTAGATACAT---GA-----AGTGA-AAT--TTT--AC---ATAA-TCCATG-TTTTTT-T-CAATG-------------------AT-GT--TACA--AAATT---G--A------CCAAA-TACG---C-----CA-----CGGCAGCTCAAA-AAA--TA-C--G---------ACT-GC-AA-------A-AGT-CA--CTT-AT-T-AGA-C-AT--ATTCAAAAATTTTG-ACTTG-TAGATTTTTC-ACTCAA-----TCGC-AT-AT-ATGTTC-TAT---TGGATGATTAG---TGT---AAATGCA--TTA-A-AAAT--CTACACA---TCTC--GCAT-A---AAA--TT-TTCA-C---GCA-T-T--C--CA--TGTTA-TT-C-TT-----ACAA-T--TTTTTGGCC-C-AAA-A----TAG--CC-TTT---TGAGG--T-G-A-T-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT-----AAAA---------TATA-T-AAC--T-----GTA--A-A--GT-GT-----GAATTGT-T-TTT-ATCTAATTCC-TCAA-GATGCCATCTATTGCA------------TTT---ATG-AAA-AAAACAAA--C---T-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT---AAC-GTG-CT-AC-----C-----GTAG-GTTTCAGTTAAA-TCAAT---ATGTAC
gi|7 : ggaGGGCG-TTGT--CAGTA-TC-A--GA--------TAGG-C--TAT---TTTA--AT-T-ATG--------------------G-T--AA--G-GT----AAT-TC------T-AATT--ACTGTTCAA--AGA--------------TTC------G-AAATTGCATATA----AAA---T--C-----TTGTTGTATTA-------ATGGTTTTTTGA--T---------AT--CCT-GGAA-TTTTTTTTCTTAAAT-AAT-GAA--AT-AGA-T--TGTCCTA-A-TTAGATA-AT---GA-----AGTGA-ACT--TTT---C---ATAATC-CATG-TTTTTT-CCTAATA-----------------------TGTTACA--AAT-T---G-A--------CCAA-TACGG--C-----CA-----CGGCAGCTC-AA-AAA--TA-C----G-C-----A-T-GC-AA-------A-A-T-CA--CTA-TT-T-GA--C-AT--ATTCAAAAATTTTGGACTTG-T-GATTTTTC-ACTCAA-----TCG--ATA-T-ATGTTCATAT---TGGATG-------TTGTT-AAA-TGCATTA-A-A-AAAT--CTACACCTATTCGC-----T-A---AAA--TT-TT-A-C-G---A-TTC--T--CA--T-T-A-TA-TCTT-----AC-A-A--TTTTTGG-C-CCAAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG--T-G-A-T-TTTCA--CCTAA----A-AG--AACAT--AA-AAC----------TATA-T-AAC--T-----GTAA-A-A--GT-GT-----GACTTGT-T-TTTTATCTAATTCC-TCAA-GATG-CAT-TATTGCA------------TTTT--ATG-AAA-A----AAA--CAAAT-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT---AAC-GTG-CT-AC-----C-----GTA--G--------ATA-TCAGTTAAATCAATA---TGT-A--CTCTtct
gi|8 : aattagAAT-GC-TTGTT-AAAACACATTTTA-A-AAAT--TTGCATTT--TCACA-GTAT-A---AGA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT--C---A--T-TTA-TA-T-TT-----AC-AAT--TTTTTGG-C-C-AAA-A----TAG--C-ATTT---TAAAG-AT-G-A-T-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-CAAA---------TATA-A-TAT--A------TAACA-A--GT-GC---A-GAATTGT-T-TT--ATTTAATTCC-TCGA-G-TA-CAT-TATTGCA------------TATC--AT---AA-A----AAA--T---C-TTTA-AA--TTTACAG--AT-AAT-TTT---AA--AT--CTAATTTTGATT----GTAT-G--------ATA-TCAATTAAACAAATA---CGT-A-CCTCTGGTTGC-AT-GTGTGGAT------TAGATGACAACAAA-TGGAAAAAAGATTGGAGCCATTGT--CT-ATTCA-ACT-ATAAATGATGGAGCGTT-AATGTA----TTCATTTT--ACT-AAATT-AAAA-TACA-T-CCA-TGTAA-ATCG---AAAAACGTAT-A--AATCC-AGC-CAA-----AA------TAAGC-AATATCATTT-CGGACA-TG
gi|9 : aAA--TT-TTCA-C-A-GCA-TCT--C--CA--T-TTA-TA-T-TTTAATTAC-AAT--TTTTTGG-C-A-AAA-A----TAG--CCATTT---TGAGG-AC-G-AAT-TTTCA--CATAA----T-AG--AAGAT--AA-AAAA---------TATA-T-AAT--G-----GTAACA-A--GT-GC---T-GAATTGT-T-TTT-ATCTAATTCC-TCAA-G-TG-CAT-TATTGC-------------TTTCCAATG--AA-A----AAA--T---C-TTTA-AAGTTTTACAG--AT-AAT-TTT---AAC-GTG-CTAAC----AC-----GTAT-G--------ATA-TCGAG---TTAAACAAATTGTAA-CCTCTGGTTGTAAT-GTGTGGAT------TAGATGACAA-AAA-T-GAAAGAAAATTGGAATCATAGT--AT-ATTCA-ACT-ATGAGTGATGGATTATT-ACTTAA----TTCA-TTT--ACTAAAATT-AAAA-TACA-T-CAA-ATTAA-AT-GA--AAAATAGT-T-A--A--TC-ACCTTAA-----AA------TGAGCAACTTTCACTC-CAATCA-TGAC-G-TCAA-------C---GCTAA--TAAGATCCC