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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                     TAAGAATATTTGGGTAATCTT-TAAAAACA----AAGATAGGCATTTGAATAT-------------------GAGTATGCA--CGCACTGTAAT------GAA-TTAG--AAGAGGAATGT-CATTTTGCTTTGAAGTGCTCACTA-TATC----TA--GATG---TA-------------------------TT---AA--AAAATAA-ACTG--G-TTTGGGCC------CTCATCT-TTCAAAC--TTAT--A--CAATTA-CTTAGT---ATCAATAAT-G--TGAAAGAATTA-CAAAAT-TTGAGGAA--ATTAAAAGTTTTGACAAATGCGTTTAAGA-AAGATA--ACTGGTTTG-T-TAGAAATT-----GTTAGATATGTTA-AAGT-ATTTGCTAAAAT-TTTGTTGATTTAAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                            cTCAGCACATTCAT-TATGCATAGAA-ACGGTAGACATAATAATATT---CCTAGAAATATGAG--AATTTGCA--AATACTGTAATTTAAACGAT-ATCG--AAGATGAATTC-CACTTTATTCTAAGTTGTCCTTTA-TA------CAATGAAA---TA--AG--AAGA--------AAATATATC---GA--AAAGTTCTACT---A-TACAAAAC--------CAAGTGTTTACAAACTTGTTAA--TACTT--TTGAGT---GTCAATAAT-GTTTG-AAGAACTA-AGTAAT-CTAGGTAA--AT------aaatgtccctgttacatgttccacatctttgtattttgttaatcacatgtggtacacagatagaaaaggattggtttttttctgaaca
gi|5                          :                                                                                                         aacataggtatctctacctgagtgtagtcttgaaaactcatccaagtgtattttgtatcgacatcttgttgaacgtttttgtttacagtattatttaacaaaaccaattggacttgtatataagcagcttattgcacgttatagaaccTCAGCACATTATTATGTATATGAAACC-GGTAGACAT---AATATATTCCT--AGAAATTGAG--AATTGGCAACCATACTGTAATTTAAACGAATATCG--AAGATGAATTC-CACTTTATTCT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                   gtgtgtagtcttgaaaactcacccaagtgtctttgttcgacacttgttgaaagtttgttgagcgagtattattaatttaacaaaaccatgactgtatagtaagcagcttatctgccgttatagaccATGCT--CGGACCATGAT------GAA-TTAG--TGAACGAGGAC-CATTTTGTTTTAAAGTGCCCTCTA-TG-------A--GATA---TG--AG--AAAT--------Aacgttggccattataaacatgaaatagaagaaaatatatcaaagttctactatacaaaaccaagtgtttataaacttgtaaatacttttgagctggtcaataatgttaaagatatatagtaactagg
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CACT-TA--------GAT-ATCG--AGGATGAATAT-CACTTTGTACTTAAATGTCAT-TACTATTATAGCG--AATTACGTA--GG--AAA------------TATATC---AC--AATGTATTACTG--G-aa
gi|11                         : atgtatgagataggtttaagacacatttggtgtaatcaagaatatattcgtatactttgtaatacttattttccaataattgagcaaataatcaatgatctttttcatgcagagtattgttgaacaaatccattcctctccaagatgtaaacttcatatacgtacgtttatgactatttttcattgcaattttacttaattaaggcaatactgcatgtctataagaaacacatattaattaagtagaattagaatgtcatcacgtaatcttgctgttgagagtgtacgtcatatgaatagagcaagaaacaatcattattgtaaatcgtgtCCGTAAT------GAA-ATCGTGAGGATGAA-ATACATTTTGTTT--ATATGTCCTGTA-T-TTAGG-CA--AATT-------AG--AGTT--------AAG----TT---AATAAAAGTATTACTGGAG-TAAAGTCCTCCATGTTCAACA-TTTA-----TT-------CAATTA-TTAAGTGTGAACAATGTT-A--ATAAGGAACTT-TG-TAT-TTAGGAAA--AT------TTgtaaaaaaatca
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttgtaaaactcgtatc------GAC-ATAG--AGGACGAGTAT-CACTTTGTATT--AATTTGCCCT----------CA-----T---TACGAG--GAACTTCGTCGTAAATATATC---AA--AAAGTACTATTG--G-CAAAAATC------ATCTGTT-TTTAAAT--TGGT--A--CAATTA-TTAAGT---
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                             cagatatttttattcaaagtttagttgagctctgagtgtatcatttacaaacatattattgaccattttcctttgcagtattacctcctaatacatgtatgtacaaaaggcatattagccgaattagactaccttctcacaatcttgaaattgaaacaggctgctataataatatacttagagtgtgtaaattatatatagaa---AA--AAAGTATTACAG--G-AGTAAGCC------CTCCATG-TTCAAAC--TTAT--T--AAATTA-TTAAGT---GTGAAAAAT-G--TTAAGGAACTT-TGTAAT-TTAGGAAA--Agttcataatatacatgaacttatcagtgtagtgaaatata
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caaattagagttaaattaataaT--A--AAATTA-CTAAGT---ACCAATAAT-G--TGAAAGAATTACATAA---------------------TTTTGACAGATGGGTTTAAGAGAA-ATA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATTAATTAAGG---CATAGAAAT-G--GAAAAGAAC-A-AGATATGTTGCTGATTTAT------TTTTC-CA--TGTTTTTAAGAGAAAAGATAATTAATTTATATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAGTT-AAATGTTCATTGATCGAAAACTa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATAGT-G--TGAAAGAATTA-TGAAAT-ATAGGGAA--AA------TTTGGACAAATGCGTTTCAGAGAAAAGATAATTGATTTA-T-AAG-AATTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTATTTTAATTG-TTATTGATCGAAAACTgtccatccaccaccatctaccattgtcactgttaccatattttgttaatcacaagtattataacagatataacattattgtttttctgaataaactatcta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T-G--TGAAAGAATTA-CGAAAT-TTAGGGAA--AC------TTTTGACAAATGCGTTTATGAGAAAAGACAATTAATTTATATAAGAAATTATATGGCTAGATAT-TTATATGC-ATTAGTTAAAgtccatccaccaccaactctattatcactgttaccatattttgtaatcacaagcataatatcagacataatagatttttttttctgaataaactatctatctacatacacata
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaT-G--TGAAAGAATTA-CGAAAT-TTAGGGtg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TA-T-AAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATTTA-TTAGTTAAAGTGTTTATTGATCGAAAACTtataagaaattatagctagatatttatatttattagttaaagtgtttattgatcgaaaactgtccatccacca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgtgaaagaattacgaaatttagggTTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAATT-AAATGTTCATTGATCGAAGACTgtccatccacca
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): GGTTTAGTTGAGCAAATTTAGTGTATTATTTACAAACATTGTTATTGACCATTTTTCCTTGCAGTACCTTTGTAAACCTTATGATACCTATCTATACAAAAGGCGTTAGCGGAATTAGACTATCTTCTCACAATCTTGAAATTGAAACAGGTTGCCATATAA
Unaligned ( gi|13 ): GGTATCCTTTGTATTAATTGGCCTCATTACGAGGAACTTTCTCCGTAAATATATTTGTTTTTAAAATGTTCATATTGGCAAAACGCCATATTGTTCATAAATTGTACAATTATTTAAGTGTTCATGATTGACATGGTGGACTTGTGCGTATAGAAACCATA
Unaligned ( gi|14 ): TATCACTTTGTATTAATTTGCCCTCATTACGAGGAACTTTCTCGTAAATATATTTTTAAAATGCTATATTGGCAAACGCCATTTGTTCATAAATTTGTACAATTATTAAGTGTTCATGATGTACATGTGTGGACTTTGCAGTTTAGGGAAACC
Unaligned ( gi|15 ): TTAAATGTTTGTTGATTGAAAATTGTCCATCCACCATCATCTGCTATGGTCAATGTTAATACAGTTTGTATATTGTTAACCACAAGCATAAAAACCAGATATAACATAGTTTTTCTGAATAAACTATACTATTCGCAATAAATGTAC
Unaligned ( gi|16 ): TGGACTTGTATAGTAAGCAGCTTATTGCACGTTATAGAACCTCAGCACATTCATTATGTATAGAAACCGGTAGACATAATAATATTCCTAGAAATATGAGAATTTGCAAATATTGTAATTTAAACGATATCG
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----CA--AATT-----AG--AG-------TTAAATTAATA-A---AAAAA-G-TATTACAGGAGTAAG-CCCTCCATG-TT--CA---A-ACTTAT--T--AA-ATTATTAAGT--GTGAAAAATG----T---TAA-----GGAA--CTT-TGTAATTTAGGAAAAtg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAATT-AAATGTTCATTGATCGAAGACT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAAGAATATTTGGGTAATCTT-TAAAAACA--A--A--GATAGGCAT-----------T----T----GA---A--T--ATG--AGTATGCA--CGCACTGTAAT------GAA-TTAG--AAGAGGAA-TGTCATTTTGC-TTTGAAGTGCTCACTA-TATC----TA--GAT---------------------------GTATT---AAAAA-A-TAA-ACTGGTTTGGG-CCCTCATCT-TT--CA---A-ACTTAT--A--CA-ATTACTTAGT--ATCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTA-CAAAATTTGAGGAAATTAAAAGTTTTGACAAATGCGTTTAAG---AAAGATAACTGGTTTG---TT--AGAAATT-----GTTAGATATGTTA-AAGT-ATTTGCTAAAAT-TTTGTTGATTTAAAAgtccatccatcaccatctaccattgccactgttaccatattttgttaatcacaagta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cAAAT--ATATT---AAAAAAG-TATTTCTGGAA-AAA-CCATCTGTT-TT--TATAAA-AATT----------ATTATGAAGT--GTTCATAATG----C---ACA-----TGAACATTG-C--AGTTTGGGGAAAT------aaatgtccctgttacatgttccacatctttgtattttgttaatcacatgtggtacacagatagaaaaggattggtttttttctgaaca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TG----T---GAA-----AGAA--TTA-CGAAATTTAGGGaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTTAGGGTATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATTT-ATTAGTTAAAGTGTTTATTGATCGAAAACTtataagaaattatagctagatatttatatttattagttaaagtgtttattgatcgaaaactgtccatccacca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtgaaagaattacgaaTGCT--CGGACCATGAT------GAA-TTAG--TGAACGAG-GACCATTTTGT-TTTAAAGTGCCCTCTA-TG-------A--GATA---TGAG--AA-------ATAAgtccatccacca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aT--A--AA-ATTACTAAGT--ACCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTA-C---AT------AA--------TTTTGACAGATGGGTTTAAGAGAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGAACCTCAGCACATTCAT-TATGCATAGAA--AC-GGTAGACAT---AATAATATT----CCTAGAA---A--TATGAG--AATTTGCA--AATACTGTAATTTAAACGAT-ATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTAAGTTGTCCTTTA-TA------CAATGAAA---TAAG--AA-------GAAAAT--ATATC---GAAAA-G-TTCTACTATACAAAA-CC---AAGTGTT--TACA-A-ACTTGTTAA--TA-CTT-TTGAGT--GTCAATAATGTT--T---G-A-----AGAA--CTA-AGTAATCTAGGTAAAT------taa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aacataggtatctctacctgagtgtagtcttgaaaactcatccaagtgtattttgtatcgacatcttgttgaacgtttttgtttacagtattatttaacaaaaccaattggacttgtatataagcagcttattgcacgttat------GAT-ATCG--AGGATGAA-TACCACTTTTTACTTAACAT
gi|5                          : atgtgatacgagatggtctaggacatatttggtgtaatcaagattatacaggcatattatgtaatacttattttccaataattagcaaagaatcattgatatttttatgcagagttttgttgaacaaatcaattcctcgatctccaagatgtaaactttttatgtatgttatgactatttttgattgcaattttacttaactaaggcaatatcgcatgtttataagaaacatatcaatagaattagaatgtcatcacataatattggtactgagagtggacatcatataaatatagcaagatctagaaacaacctgtattgtaaattatgtcacttaTCAGCACATTATTATGTATAT-GAA--ACCGGTAGACAT---AATA----TATTCCT--AGA---AATT--GAG--AATTGGCAACCATACTGTAATTTAAACGAATATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTACGTTGGCCATTA-TAAA----CAT-GAAA---TA-G--AA-------GAAAAT--ATATC-----AAA-G-TTCTACTATACAAAA-C---CAAGTGTTTATA---A-ACTTGT--A--AATACTTTTGAGCTGGTCAATAATG----T---TAA-----AGAtactattata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgtgtagtcttgaaaactcacccaagtgtctttgttcgacacttgttgaaagtttgttgagcgagtattattaatttaacaaaaccatgactgtatagtaagcagcttatctgccgttatagacc------GAC-ATAG--AGGACGAG-TATCACTTTGT-ATTAATTTGCCCTC----ATT----AC--G-------AGG--AACTTCGTCGTAAAT--ATATC---AAAAA-G-TACTATTGGCAAAAA-TCATCTGTT-TT--TA---A-ATTGGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTTCATAATA----T---ACA-----TGAAC-TTATC--AGTGTAGTGAAAT------tatatagtaactagg
gi|7                          :                                                                                                                               cagatatttttattcaaagtttagttgagctctgagtgtatcatttacaaacatattattgaccattttcctttgcagtattacctcctaatacatgtatgtacaaaaggcatattagccgaattagactaccttctcacaatcttgaaattgaaacaggctgctataataatatacttagagtgtgtaaattatatatagaaTAAGATTATCTGCACACTCTT-TGAAAATAGAATAA--GGTAGGCATTGGAATA----TA---CC--AAA---A--TCTGAGCGGGTATGCA--CACACTGTAAT------GAA-ATAG--AAGATGAA-TATCATTTTGT-TTTGAAATGTTCTCTA-TATT----CA--GATT---TAAG--AA-------ACACGC--ACATT---AAAAA-G-TATTACTGGTTCAGA-CCTTCAACT-TT--CA-------TCGT--A--CA-ATTATTAAGT--AACAATACTG----T---GAA-----AGAA--TTA-AGAAATTTAGGGAAAT------TTTTGACAAATGCGTTTAAGAGAACATATTATTGATTTA-----AAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGTAATTAGTTAAAATGTTTATTGATCGAAAACTata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tATGTTTTTAAGAGAAAAGATAATTAATTTA---TATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAGTT-AAATGTTCATTGATCGAAAACT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TATCACTTTGT-ATTAATTTGCCCT--C----ATT---AC--GA----GG--AACTTTCTCGTAAAT--ATA-TTTTTAAAAT-GCTAT-ATTGG--CAAA-CGC--CATTTGTTCATA-A-ATTTGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTTCATGATG----T---ACATGTGTGGAC--TT-TGCAGTTTAGGGAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                  AGAACCTCAGCACAT--TCAT-TATGTATAGAAACCGGTAGACATAATA---ATAT-----T-CCTAGAAA----------TATGAG--AATT-TG-CA--AATATTGTAAT------cc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tggacttgtatagtaagcagcttattgcacgttatAATG----T---GAA-----AGAA--TTACGAAATTTAGGGAAAC------TTTTGACAAATGCGTTTATGAGAAAAGACAATTAATTTA---TATAAGAAATTATATGGCTAGATAT-TTATATGC-ATTAGTTAAAttaaacgatatcg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---CA--AATT--AG--AG-------TTAAATTAATA--A---AAAAA-G-TATTACAGGAGTAAG-CCCTCCATGT--TCA---A-ACTTAT--T--AA-ATTATTAAGT--GTGAAAAATG----T---TAA-----GGAA--CTTTGTAATTTAGGAAAAtg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAATT-AAATGTTCATTGATCGAAGACT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                TAAGAATATTTGGGTAA--TCTT-TAAAAACAAA----GATAGGCAT----------T-----T-----G-AA----------TATGAG--TAT---G-CA--CGCACTGTAAT------GAA-TTAG--AAGAGGAA-TGTCATTTTGC-TTTGAAGTGCTCA--CTA-TATC---TA--GAT------------------------GTA-TT---AAAAA-A-TAA-ACTGGTTTGGG-CCCTCATCTT--TCA---A-ACTTAT--A--CA-ATTACTTAGT--ATCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACAAAATTTGAGGAAATTAAAAGTTTTGACAAATGCGTTTAAG---AAAGATAACTGGTTTG---T-T-AGAAATT-----GTTAGATATGTTA-AAGT-ATTTGCTAAAAT-TTTGTTGATTTAAAAgtccatccatcaccatctaccattgccactgttaccatattttgttaatcacaagta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cAAAT--ATA-TT---AAAAAAG-TATTTCTGGAA-AAA-CCATCTGTTT--TTATAAA-AATT----------ATTATGAAGT--GTTCATAATG----C---ACA-----TGAACATT--GCAGTTTGGGGAAAT------aaatgtccctgttacatgttccacatctttgtattttgttaatcacatgtggtacacagatagaaaaggattggtttttttctgaaca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG----T---GAA-----AGAA--TTACGAAATTTAGGGaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTTAGGGTATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATTT-ATTAGTTAAAGTGTTTATTGATCGAAAACTtataagaaattatagctagatatttatatttattagttaaagtgtttattgatcgaaaactgtccatccacca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtgaaagaattacgaa-TG-CT--CGGACCATGAT------GAA-TTAG--TGAACGAG-GACCATTTTGT-TTTAAAGTGCCCT--CTA-TG------A--GATATGAG--AA-------ATAAAgtccatccacca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aT--A--AA-ATTACTAAGT--ACCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACATAA-----------------TTTTGACAGATGGGTTTAAGAGAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                  AGAACCTCAGCACAT--TCAT-TATGCATAGAAAC-GGTAGACATAATA---ATAT-----T-CCTAG-AAA---------TATGAG--AATT-TG-CA--AATACTGTAATTTAAACGAT-ATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTAAGTTGTCCT--TTA-TA-----CAATGAAATAAG--AA-------GAAAAT--ATA-TC---GAAAA-G-TTCTACTATACAAAA-CCAAGTGTTT--ACA---A-ACTTGTTAA--TA-CTT-TTGAGT--GTCAATAATGTT--T---G-A-----AGAA--CTAAGTAATCTAGGTAAAT------taa
gi|4                          :                                                                                                    aacataggtatctctacctgagtgtagtcttgaaaactcatccaagtgtattttgtatcgacatcttgttgaacgtttttgtttacagtattatttaacaaaaccaattggacttgtatataagcagcttattgcacgttatAGAATGTCATCACATAATATT-GGTACTGAGA-----GTGGACATCATATAAATATAGCAAGATCTAG-AAACAACCTGTAT-TGTA--AATTATGTCA--CTTA-------------GAT-ATCG--AGGATGAA-TACCACTTTTTACTTAACAT
gi|5                          : atgtgatacgagatggtctaggacatatttggtgtaatcaagattatacaggcatattatgtaatacttattttccaataattagcaaagaatcattgatatttttatgcagagttttgttgaacaaatcaattcctcgatctccaagatgtaaactttttatgtatgttatgactatttttgattgcaattttacttaactaaggcaatatcgcatgtttataagaaacatatcaatagaattACCTCAGCACAT--TATTATGTATAT-GAAACCGGTAGACATAATA----TAT-----T-CCTAG-AAA---------T-TGAG--AATT-GG-CAACCATACTGTAATTTAAACGAATATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTACGTTGGCCA--TTA-TAAA---CAT-GAAATA-G--AA-------GAAAAT--ATA-TC-----AAA-G-TTCTACTATACAAAA-CCAAGTGTTT--ATA---A-ACTTGT--A--AATACTTTTGAGCTGGTCAATAATG----T---TAA-----AGAtactattata
gi|6                          :                                                                                                                                 gtgtgtagtcttgaaaactcacccaagtgtctttgttcgacacttgttgaaagtttgttgagcgagtattattaatttaacaaaaccatgactgtatagtaagcagcttatctgccgttatagCACAA--TCTT-GA--AATTGAAACAGGCTGCTATAATA---ATAT------ACTTAG-AG----------TGTGTA--AATT-----A--TATATAG-AA-------GAC-ATAG--AGGACGAG-TATCACTTTGT-ATTAATTTGCCCT--C----ATT---AC--G----AGG--AACTTCGTCGTAAAT--ATA-TC---AAAAA-G-TACTATTGGCAAAAA-TCATCTGTTT--TTA---A-ATTGGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTTCATAATA----T---ACA-----TGAAC-TTAT-CAGTGTAGTGAAAT------tatatagtaactagg
gi|7                          :                                                                                                       cagatatttttattcaaagtttagttgagctctgagtgtatcatttacaaacatattattgaccattttcctttgcagtattacctcctaatacatgtatgtacaaaaggcatattagccgaattagactaccttctTAAGATTATCTGCACAC--TCTT-TGAAAATAGAATAAGGTAGGCATTGGA---ATAT------ACC-AA-AA----------TCTGAGCGGGTA-TG-CA--CACACTGTAAT------GAA-ATAG--AAGATGAA-TATCATTTTGT-TTTGAAATGTTCT--CTA-TATT---CA--GATTTAAG--AA-------ACACGC--ACA-TT---AAAAA-G-TATTACTGGTTCAGA-CCTTCAACTT--TCA-------TCGT--A--CA-ATTATTAAGT--AACAATACTG----T---GAA-----AGAA--TTAAGAAATTTAGGGAAAT------TTTTGACAAATGCGTTTAAGAGAACATATTATTGATTTA----A-AAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGTAATTAGTTAAAATGTTTATTGATCGAAAACTata
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TATCACTTTGT-ATTAATTTGCCCT--C----ATT---AC--GA----GG--AACTTTCTCGTAAAT--ATA-TTTTTAAAAT-GCTAT-ATTGGCAAACG-CCATTTGTTCATA---A-ATTTGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTTCATGATG----T---ACATGTGTGGAC--TT-TGCAGTTTAGGGAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                  AGAACCTCAGCACAT--TCAT-TATGTATAGAA-ACC-GGTAGACATAATA---ATAT-----T-CCTAGAAATA--------TGAG--AATT-TG-CA--AATATTGTAAT------cc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tggacttgtatagtaagcagcttattgcacgttatAATG----T---GAA-----AGAA--TTACGAAATTTAGGGAAAC------TTTTGACAAATGCGTTTATGAGAAAAGACAATTAATTTA---TATAAGAAATTATATGGCTAGATAT-TTATATGC-ATTAGTTAAAttaaacgatatcg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---CA--AATT--AG--AG-------TTAAATTAATA--A---AAAAA-G-TATTACAGGAGTAAG-CCCTCCATGTTCA---A-ACTTAT--T--AA-ATTATTAAGT--GTGAAAAATG----T---TAA-----GGAA--CTTTGTAATTTAGGAAAAtg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAATT-AAATGTTCATTGATCGAAGACT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATA--------TGAG--TAT---G-CA--CGCACTGTAAT------GAA-TTAG--AAGAGGAA-TGTCATTTTGC-TTTGAAGTGCTCA--CTA-TATC---TA--GAT------------------------GTA-TT---AAAAA-A-TAA-ACTGGTTTGGG-CCCTCATCTTTCA---A-ACTTAT--A--CA-ATTACTTAGT--ATCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACAAAATTTGAGGAAATTAAAAGTTTTGACAAATGCGTTTAAG---AAAGATAACTGGTTTG---T-T-AGAAATT-----GTTAGATATGTTA-AAGT-ATTTGCTAAAAT-TTTGTTGATTTAAAAgtccatccatcaccatctaccattgccactgttaccatattttgttaatcacaagta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctaagaatatttgggtaatctttaaaaacaaagataggcatttgAAAT--ATA-TT---AAAAAAG-TATTTCTGGAA-AAA-CCATCTGTTTTTATAAA-AATT----------ATTATGAAGT--GTTCATAATG----C---ACA-----TGAACATT--GCAGTTTGGGGAAAT------aaatgtccctgttacatgttccacatctttgtattttgttaatcacatgtggtacacagatagaaaaggattggtttttttctgaaca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TG----T---GAA-----AGAA--TTACGAAATTTAGGGaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTAGGGTATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATTT-ATTAGTTAAAGTGTTTATTGATCGAAAACTtataagaaattatagctagatatttatatttattagttaaagtgtttattgatcgaaaactgtccatccacca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtgaaagaattacgaa-TG-CT--CGGACCATGAT------GAA-TTAG--TGAACGAG-GACCATTTTGT-TTTAAAGTGCCCT--CTA-TG------A--GATATGAG--AA-------ATAAAgtccatccacca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aT--A--AA-ATTACTAAGT--ACCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACATAA-----------------TTTTGACAGATGGGTTTAAGAGAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                  AGAACCTCAGCACAT--TCAT-TATGCATAGAA-A-C-GGTAGACATAATA---ATAT-----T-CCTAGAAATA--------TGAG--AATT-TG-CA--AATACTGTAATTTAAACGAT-ATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTAAGTTGTCCT--TTA-TA-----CAATGAAATAAG--AA-------GAAAAT--ATA-TC---GAAAA-G-TTCTACTATACAAAA-CCAAGTGTTTACA---A-ACTTGTTAA--TA-CTT-TTGAGT--GTCAATAATGTT--T---G-A-----AGAA--CTAAGTAATCTAGGTAAAT------taa
gi|4                          :                                                                                                    aacataggtatctctacctgagtgtagtcttgaaaactcatccaagtgtattttgtatcgacatcttgttgaacgtttttgtttacagtattatttaacaaaaccaattggacttgtatataagcagcttattgcacgttatAGAATGTCATCACATAATATT-GGTACTGAGA-------GTGGACATCATATAAATATAGCAAGATCTAGAAACAACCTGTATTGTA--AATTATGTCA--CTTA-------------GAT-ATCG--AGGATGAA-TACCACTTTTTACTTAACAT
gi|5                          : atgtgatacgagatggtctaggacatatttggtgtaatcaagattatacaggcatattatgtaatacttattttccaataattagcaaagaatcattgatatttttatgcagagttttgttgaacaaatcaattcctcgatctccaagatgtaaactttttatgtatgttatgactatttttgattgcaattttacttaactaaggcaatatcgcatgtttataagaaacatatcaatagaattACCTCAGCACAT--TATTATGTATATGAAA-C-C-GGTAGACATAATA----TAT-----T-CCTAGAAAT---------TGAG--AATT-GG-CAACCATACTGTAATTTAAACGAATATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTACGTTGGCCA--TTA-TAAA---CAT-GAAATA-G--AA-------GAAAAT--ATA-TC-----AAA-G-TTCTACTATACAAAA-CCAAGTGTTTATA---A-ACTTGT--A--AATACTTTTGAGCTGGTCAATAATG----T---TAA-----AGAtactattata
gi|6                          :                                                                                                                                 gtgtgtagtcttgaaaactcacccaagtgtctttgttcgacacttgttgaaagtttgttgagcgagtattattaatttaacaaaaccatgactgtatagtaagcagcttatctgccgttatagCACAA--TCTT--G-AAATTGAA-A-CAGGCTGCTATAATA---ATAT------ACTTAGAG-TG--------TGTA--AATT-----A--TATATAG-AA-------GAC-ATAG--AGGACGAG-TATCACTTTGT-ATTAATTTGCCCT--C----ATT---AC--G----AGG--AACTTCGTCGTAAAT--ATA-TC---AAAAA-G-TACTATTGGCAAAAA-TCATCTGTTTTTA---A-ATTGGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTTCATAATA----T---ACA-----TGAAC-TTAT-CAGTGTAGTGAAAT------tatatagtaactagg
gi|7                          :                                                                                                       cagatatttttattcaaagtttagttgagctctgagtgtatcatttacaaacatattattgaccattttcctttgcagtattacctcctaatacatgtatgtacaaaaggcatattagccgaattagactaccttctTAAGATTATCTGCACAC--TCTT-TGAAAATAGAATA-A-GGTAGGCATTGGA---ATAT------ACC--AAAATC--------TGAGCGGGTA-TG-CA--CACACTGTAAT------GAA-ATAG--AAGATGAA-TATCATTTTGT-TTTGAAATGTTCT--CTA-TATT---CA--GATTTAAG--AA-------ACACGC--ACA-TT---AAAAA-G-TATTACTGGTTCAGA-CCTTCAACTTTCA-------TCGT--A--CA-ATTATTAAGT--AACAATACTG----T---GAA-----AGAA--TTAAGAAATTTAGGGAAAT------TTTTGACAAATGCGTTTAAGAGAACATATTATTGATTTA----A-AAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGTAATTAGTTAAAATGTTTATTGATCGAAAACTata
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TATCACTTTGT-ATTAATTTGCCCT--C----ATT---AC--GA----GG--AACTTTCTCGTAAAT--ATA-TTTTTAAAAT-GCTAT-ATTGGCAAACG-CCATTTGTTCATA---A-ATTTGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTTCATGATG----T---ACATGTGTGGAC--TT-TGCAGTTTAGGGAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                  AGAACCTCAGCACAT--TCAT-TATGTATAGAA-ACC-GGTAGACATAATA---ATAT-----T-CCTAGAAATA--------TGAG--AATT-TG-CA--AATATTGTAAT------cc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tggacttgtatagtaagcagcttattgcacgttatAATG----T---GAA-----AGAA--TTACGAAATTTAGGGAAAC------TTTTGACAAATGCGTTTATGAGAAAAGACAATTAATTTA---TATAAGAAATTATATGGCTAGATAT-TTATATGC-ATTAGTTAAAttaaacgatatcg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---CA--AATT--AG--AG-------TTAAATTAATA--A---AAAAA-G-TATTACAGGAGTAAG-CCCTCCATGTTCA---A-ACTTAT--T--AA-ATTATTAAGT--GTGAAAAATG----T---TAA-----GGAA--CTTTGTAATTTAGGAAAAtg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAATT-AAATGTTCATTGATCGAAGACT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATA--------TGAG--TAT---G-CA--CGCACTGTAAT------GAA-TTAG--AAGAGGAA-TGTCATTTTGC-TTTGAAGTGCTCA--CTA-TATC---TA--GAT------------------------GTA-TT---AAAAA-A-TAA-ACTGGTTTGGG-CCCTCATCTTTCA---A-ACTTAT--A--CA-ATTACTTAGT--ATCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACAAAATTTGAGGAAATTAAAAGTTTTGACAAATGCGTTTAAG---AAAGATAACTGGTTTG---T-T-AGAAATT-----GTTAGATATGTTA-AAGT-ATTTGCTAAAAT-TTTGTTGATTTAAAAgtccatccatcaccatctaccattgccactgttaccatattttgttaatcacaagta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctaagaatatttgggtaatctttaaaaacaaagataggcatttgAAAT--ATA-TT---AAAAAAG-TATTTCTGGAA-AAA-CCATCTGTTTTTATAAA-AATT----------ATTATGAAGT--GTTCATAATG----C---ACA-----TGAACATT--GCAGTTTGGGGAAAT------aaatgtccctgttacatgttccacatctttgtattttgttaatcacatgtggtacacagatagaaaaggattggtttttttctgaaca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TG----T---GAA-----AGAA--TTACGAAATTTAGGGaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTAGGGTATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATTT-ATTAGTTAAAGTGTTTATTGATCGAAAACTtataagaaattatagctagatatttatatttattagttaaagtgtttattgatcgaaaactgtccatccacca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtgaaagaattacgaa-TG-CT--CGGACCATGAT------GAA-TTAG--TGAACGAG-GACCATTTTGT-TTTAAAGTGCCCT--CTA-TG------A--GATATGAG--AA-------ATAAAgtccatccacca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aT--A--AA-ATTACTAAGT--ACCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACATAA-----------------TTTTGACAGATGGGTTTAAGAGAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                  AGAACCTCAGCACAT--TCAT-TATGCATAGAA-A-C-GGTAGACATAATA---ATAT-----T-CCTAGAAATA--------TGAG--AATT-TG-CA--AATACTGTAATTTAAACGAT-ATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTAAGTTGTCCT--TTA-TA-----CAATGAAATAAG--AA-------GAAAAT--ATA-TC---GAAAA-G-TTCTACTATACAAAA-CCAAGTGTTTACA---A-ACTTGTTAA--TA-CTT-TTGAGT--GTCAATAATGTT--T---G-A-----AGAA--CTAAGTAATCTAGGTAAAT------taa
gi|4                          :                                                                                                    aacataggtatctctacctgagtgtagtcttgaaaactcatccaagtgtattttgtatcgacatcttgttgaacgtttttgtttacagtattatttaacaaaaccaattggacttgtatataagcagcttattgcacgttatAGAATGTCATCACATAATATT-GGTACTGAGA-------GTGGACATCATATAAATATAGCAAGATCTAGAAACAACCTGTATTGTA--AATTATGTCA--CTTA-------------GAT-ATCG--AGGATGAA-TACCACTTTTTACTTAACAT
gi|5                          : atgtgatacgagatggtctaggacatatttggtgtaatcaagattatacaggcatattatgtaatacttattttccaataattagcaaagaatcattgatatttttatgcagagttttgttgaacaaatcaattcctcgatctccaagatgtaaactttttatgtatgttatgactatttttgattgcaattttacttaactaaggcaatatcgcatgtttataagaaacatatcaatagaattACCTCAGCACAT--TATTATGTATATGAAA-C-C-GGTAGACATAATA----TAT-----T-CCTAGAAAT---------TGAG--AATT-GG-CAACCATACTGTAATTTAAACGAATATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTACGTTGGCCA--TTA-TAAA---CAT-GAAATA-G--AA-------GAAAAT--ATA-TC-----AAA-G-TTCTACTATACAAAA-CCAAGTGTTTATA---A-ACTTGT--A--AATACTTTTGAGCTGGTCAATAATG----T---TAA-----AGAtactattata
gi|6                          :                                                                                                                          gtgtgtagtcttgaaaactcacccaagtgtctttgttcgacacttgttgaaagtttgttgagcgagtattattaatttaacaaaaccatgactgtatagtaagcagcttatctgccgttatagACCTTCTCACAA--TCTT--G-AAATTGAA-A-CAGGCTGCTATAATA---ATAT------ACTTAGAG-TG--------TGTA--AATT-----A--TATATAG-AA-------GAC-ATAG--AGGACGAG-TATCACTTTGT-ATTAATTTGCCCT--C----ATT---AC--G----AGG--AACTTCGTCGTAAAT--ATA-TC---AAAAA-G-TACTATTGGCAAAAA-TCATCTGTTTTTA---A-ATTGGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTTCATAATA----T---ACA-----TGAAC-TTAT-CAGTGTAGTGAAAT------tatatagtaactagg
gi|7                          :                                                                                                              cagatatttttattcaaagtttagttgagctctgagtgtatcatttacaaacatattattgaccattttcctttgcagtattacctcctaatacatgtatgtacaaaaggcatattagccgaattagactTAAGATTATCTGCACAC--TCTT-TGAAAATAGAATA-A-GGTAGGCATTGGA---ATAT------ACC--AAAATC--------TGAGCGGGTA-TG-CA--CACACTGTAAT------GAA-ATAG--AAGATGAA-TATCATTTTGT-TTTGAAATGTTCT--CTA-TATT---CA--GATTTAAG--AA-------ACACGC--ACA-TT---AAAAA-G-TATTACTGGTTCAGA-CCTTCAACTTTCA-------TCGT--A--CA-ATTATTAAGT--AACAATACTG----T---GAA-----AGAA--TTAAGAAATTTAGGGAAAT------TTTTGACAAATGCGTTTAAGAGAACATATTATTGATTTA----A-AAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGTAATTAGTTAAAATGTTTATTGATCGAAAACTata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tATGTTTTTAAGAGAAAAGATAATTAATTTA---TATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAGTT-AAATGTTCATTGATCGAAAACT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aattaattaaggcatagaaatggaaaagaacaagatatgttgctgatttatttttccATAGTG----T---GAA-----AGAA--TTATGAAATATAGGGAAAA------TTTGGACAAATGCGTTTCAGAGAAAAGATAATTGATT-----TATAAG-AATTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTATTTTAATTG-TTATTGATCGAAAACTgtccatccaccaccatctaccattgtcactgttaccatattttgttaatcacaagtattataacagatataacattattgtttttctgaataaactatcta


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-218 )      :                                                                                                                                                                                                                                               NTAAGAACCTCAGCACAT--TCTT-TGTANATAGAA-A-C-GGTAGACATAATA---ATAT-----TACCTAGAAATA--------TGAG--AATT-TG-CA--CGTACCGTAAT------GAA-ATCG--AGGATGAA-TACCACTTTGT-TTTAANNTGCCCT--CTA-TATT---CA--GATTTAAG--AA-------GTAAAT--ATA-TC---AAAAA-G-TATTACTGGANNAAA-CCNTCCGTTTTCA---A-ACTTGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACGNAATTTAGGGAAAT------TTTTGACAAATGCGTTTAAGAGAAAAGATAATTGATTTA---TATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAGTTAAAATGTTTATTGATCGAAAACT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ------GAT-ATCG--AGGATGAA-TATCACTTTGTACTTAA-ATGTCATTACTATTATA---GC--GAATTACG--TA-------GGAAAT--ATA-TC---ACAAT-G-TATTACTGGGTAAAA-
gi|10                         :    atgtatgagataggtttaagacacatttggtgtaatcaagaatatattcgtatactttgtaatacttattttccaataattgagcaaataatcaatgatctttttcatgcagagtattgttgaacaaatccattcctctccaagatgtaaacttcatatacgtacgtttatgactatttttcattgcaattttacttaattaaggcaatactgcatgtctataagaaacacatattaattaagtagaattagaatgtcatcacgtaatcttgctgttgagagtgtacgtcatatgaatagagcaagaaacaatcattattgtaaatcgtgtcactta--CGTATC--AAT------GAA-ATCG--AGGATGAA-TACCACTTTTT-GTTAGTATGTTAT--GTA-TATTGC-CA--AATTT--G--AG-------TTAAAT---TAGTTGAAAAAAA-G-TATTACTGGAATAAA-ACCTCAAAGTTGA---A-A--TGT--ATTCA-ACTATTAAAT--GTGGACGATGTTAAT---TAA-----AGAA--TTCTGTAATTTAGGAAAAT------TTaaatca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttgtaaaactTT-TG-TAAACTTGCCGTAAT------GAA-ATCGTGAGGATGAAATAC-ATTTTGT-TT--ATATGTCCT--GTA-T-TTAGGCA--AATTAGAGTTAA-------GTTAAT--A----------AAA-G-TATTACTGGAGTAAAGTCCTCCATGTTCA---ACATTTAT--T--CA-ATTATTAAGT--GTGAACAATG----TTAATAA-----GGAA--CTTTGT-ATTTAGGAAAAT------TT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                  AGAACCTCAGCACAT--TCAT-TATGTATAGAA-ACC-GGTAGACATAATA---ATAT-----T-CCTAGAAATA--------TGAG--AATT-TG-CA--AATATTGTAAT------cc
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---CA--AATT--AG--AG-------TTAAATTAATA--A---AAAAA-G-TATTACAGGAGTAAG-CCCTCCATGTTCA---A-ACTTAT--T--AA-ATTATTAAGT--GTGAAAAATG----T---TAA-----GGAA--CTTTGTAATTTAGGAAAAtg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAATT-AAATGTTCATTGATCGAAGACT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATA--------TGAG--TAT---G-CA--CGCACTGTAAT------GAA-TTAG--AAGAGGAA-TGTCATTTTGC-TTTGAAGTGCTCA--CTA-TATC---TA--GAT------------------------GTA-TT---AAAAA-A-TAA-ACTGGTTTGGG-CCCTCATCTTTCA---A-ACTTAT--A--CA-ATTACTTAGT--ATCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACAAAATTTGAGGAAATTAAAAGTTTTGACAAATGCGTTTAAG---AAAGATAACTGGTTTG---T-T-AGAAATT-----GTTAGATATGTTA-AAGT-ATTTGCTAAAAT-TTTGTTGATTTAAAAgtccatccatcaccatctaccattgccactgttaccatattttgttaatcacaagta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctaagaatatttgggtaatctttaaaaacaaagataggcatttgAAAT--ATA-TT---AAAAAAG-TATTTCTGGAA-AAA-CCATCTGTTTTTATAAA-AATT----------ATTATGAAGT--GTTCATAATG----C---ACA-----TGAACATT--GCAGTTTGGGGAAAT------aaatgtccctgttacatgttccacatctttgtattttgttaatcacatgtggtacacagatagaaaaggattggtttttttctgaaca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TG----T---GAA-----AGAA--TTACGAAATTTAGGGaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTAGGGTATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATTT-ATTAGTTAAAGTGTTTATTGATCGAAAACTtataagaaattatagctagatatttatatttattagttaaagtgtttattgatcgaaaactgtccatccacca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtgaaagaattacgaa-TG-CT--CGGACCATGAT------GAA-TTAG--TGAACGAG-GACCATTTTGT-TTTAAAGTGCCCT--CTA-TG------A--GATATGAG--AA-------ATAAAgtccatccacca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aT--A--AA-ATTACTAAGT--ACCAATAATG----T---GAA-----AGAA--TTACATAA-----------------TTTTGACAGATGGGTTTAAGAGAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                  AGAACCTCAGCACAT--TCAT-TATGCATAGAA-A-C-GGTAGACATAATA---ATAT-----T-CCTAGAAATA--------TGAG--AATT-TG-CA--AATACTGTAATTTAAACGAT-ATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTAAGTTGTCCT--TTA-TA-----CAATGAAATAAG--AA-------GAAAAT--ATA-TC---GAAAA-G-TTCTACTATACAAAA-CCAAGTGTTTACA---A-ACTTGTTAA--TA-CTT-TTGAGT--GTCAATAATGTT--T---G-A-----AGAA--CTAAGTAATCTAGGTAAAT------taa
gi|4                          :                                                                                                    aacataggtatctctacctgagtgtagtcttgaaaactcatccaagtgtattttgtatcgacatcttgttgaacgtttttgtttacagtattatttaacaaaaccaattggacttgtatataagcagcttattgcacgttatAGAATGTCATCACATAATATT-GGTACTGAGA-------GTGGACATCATATAAATATAGCAAGATCTAGAAACAACCTGTATTGTA--AATTATGTCA--CTTA-------------GAT-ATCG--AGGATGAA-TACCACTTTTTACTTAACAT
gi|5                          : atgtgatacgagatggtctaggacatatttggtgtaatcaagattatacaggcatattatgtaatacttattttccaataattagcaaagaatcattgatatttttatgcagagttttgttgaacaaatcaattcctcgatctccaagatgtaaactttttatgtatgttatgactatttttgattgcaattttacttaactaaggcaatatcgcatgtttataagaaacatatcaatagaattACCTCAGCACAT--TATTATGTATATGAAA-C-C-GGTAGACATAATA----TAT-----T-CCTAGAAAT---------TGAG--AATT-GG-CAACCATACTGTAATTTAAACGAATATCG--AAGATGAA-TTCCACTTTAT-TCTACGTTGGCCA--TTA-TAAA---CAT-GAAATA-G--AA-------GAAAAT--ATA-TC-----AAA-G-TTCTACTATACAAAA-CCAAGTGTTTATA---A-ACTTGT--A--AATACTTTTGAGCTGGTCAATAATG----T---TAA-----AGAtactattata
gi|6                          :                                                                                                                          gtgtgtagtcttgaaaactcacccaagtgtctttgttcgacacttgttgaaagtttgttgagcgagtattattaatttaacaaaaccatgactgtatagtaagcagcttatctgccgttatagACCTTCTCACAA--TCTT--G-AAATTGAA-A-CAGGCTGCTATAATA---ATAT------ACTTAGAG-TG--------TGTA--AATT-----A--TATATAG-AA-------GAC-ATAG--AGGACGAG-TATCACTTTGT-ATTAATTTGCCCT--C----ATT---AC--G----AGG--AACTTCGTCGTAAAT--ATA-TC---AAAAA-G-TACTATTGGCAAAAA-TCATCTGTTTTTA---A-ATTGGT--A--CA-ATTATTAAGT--GTTCATAATA----T---ACA-----TGAAC-TTAT-CAGTGTAGTGAAAT------tatatagtaactagg
gi|7                          :                                                                                                              cagatatttttattcaaagtttagttgagctctgagtgtatcatttacaaacatattattgaccattttcctttgcagtattacctcctaatacatgtatgtacaaaaggcatattagccgaattagactTAAGATTATCTGCACAC--TCTT-TGAAAATAGAATA-A-GGTAGGCATTGGA---ATAT------ACC--AAAATC--------TGAGCGGGTA-TG-CA--CACACTGTAAT------GAA-ATAG--AAGATGAA-TATCATTTTGT-TTTGAAATGTTCT--CTA-TATT---CA--GATTTAAG--AA-------ACACGC--ACA-TT---AAAAA-G-TATTACTGGTTCAGA-CCTTCAACTTTCA-------TCGT--A--CA-ATTATTAAGT--AACAATACTG----T---GAA-----AGAA--TTAAGAAATTTAGGGAAAT------TTTTGACAAATGCGTTTAAGAGAACATATTATTGATTTA----A-AAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGTAATTAGTTAAAATGTTTATTGATCGAAAACTata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tATGTTTTTAAGAGAAAAGATAATTAATTTA---TATAAGAAATTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTAGTT-AAATGTTCATTGATCGAAAACT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aattaattaaggcatagaaatggaaaagaacaagatatgttgctgatttatttttccATAGTG----T---GAA-----AGAA--TTATGAAATATAGGGAAAA------TTTGGACAAATGCGTTTCAGAGAAAAGATAATTGATT-----TATAAG-AATTATA--GCTAGATAT-TTATATGT-ATTATTTTAATTG-TTATTGATCGAAAACTgtccatccaccaccatctaccattgtcactgttaccatattttgttaatcacaagtattataacagatataacattattgtttttctgaataaactatcta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GGTTTAGTTGAGCAAATTTAGTGTATTATTTACAAACATTGTTATTGACCATTTTTCCTTGCAGTACCTTTGTAAACCTTATGATACCTATCTATACAAAAGGCGTTAGCGGAATTAGACTATCTTCTCACAATCTTGAAATTGAAACAGGTTGCCATATAA
Unaligned ( gi|13 ): GGTATCCTTTGTATTAATTGGCCTCATTACGAGGAACTTTCTCCGTAAATATATTTGTTTTTAAAATGTTCATATTGGCAAAACGCCATATTGTTCATAAATTGTACAATTATTTAAGTGTTCATGATTGACATGGTGGACTTGTGCGTATAGAAACCATA
Unaligned ( gi|15 ): TTAAATGTTTGTTGATTGAAAATTGTCCATCCACCATCATCTGCTATGGTCAATGTTAATACAGTTTGTATATTGTTAACCACAAGCATAAAAACCAGATATAACATAGTTTTTCTGAATAAACTATACTATTCGCAATAAATGTAC