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lowQualScore                  :              ..   .  .  ..   .    .  . .     .   .     ........................................    .........            .     .   .   . ..     ..  .....  . ....................    ............    ....... ..  . ..................   ...... .. .   .  .....     .  ...................  . .  .....  .....  . . ..... .....  ............    .     ..  ..    ........ .  ............    ..  .    ...    . .... . ... ...........................   ......  ...   . ..      . ..  .  .......  .........  .   ..  .     ..........   .   .  .  .  .. ....  .....   .   .    . . ...........  .  . .....    .     .  .  ..     .           
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Reference ( gi|6 )            :  ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGATGT-G-ACAAA-CAA-AAAAA----------------GA----TA----------------AGTG---------TCTAATTCTTTTCGAATCTTCT-ACG-A--TAAAC--AA-----AC-A--------T-----------ACAT------------GATC-------A-GCT-C-----T-C----A-----TTT---T--A--T-ACT-TT-----GTTTT-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TATA-CT-TG-AGTC----TATGTTGC---A---G-TT------------TAAAGCAAAG--TA--TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC---TGAT-C----A-C---A-----------------T---------GTT------TA---TCG-T--GAAAAT-TC-CA-TT--T----TA-A--AC---CA-CGC--AG-ATCTG-------A--GTGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A--TTTT-AAA-CACACC-CTA-GC------TA-CC-A-----TGGAGATTTC-CT-CA--TCCTT-TCTCGATTTTG
gi|7                          :  ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGTTG-ACAAA-----AAAAA----------------GA----TATACATGTAGTGGGATCAGTG---------TCTGATTCTTTTAGAATCCTCT-ACT-A--TAAAC--AA-----AC-A--------TT----------ACAT------------GATC-------A-GCT-C-----T-C----A-----TTT---TT-A--T-ACT-TT-----GTTTT-AA-T-T-TT-G--GT-AT-C-TATA-CT-TG-TGTC----TATGTTTC---A---G-TT------------TAAAGCAAAG--TA--TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC---TGAT-C----A-C---ATAAATATTAATGTT---T---------GTT------TA---TCG-T--GGAAAT-TA-CA-TT--TC---TATA--ACA--CA-CGC--AG-ATCTG-------
gi|1                          : aATCAA-GTACTTT-AAA-GT-CT--GAA-ACGAGGT-G-ACGAA-CAA-AAAGATATACATGTAAGTGG-GA----TC----------------AGTG---------TCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-ACG-A---GAAC--AA-----AC-AT-------T-----------ACAT------------GAAC-------G-GCT-G-----T-C----ATT---TTT---T--A--T-ACT-TT-----GTTTT-AATT-T-T--T--GT-GT-C-TA-A-C--TG-TGTC----TTAGTTTC---A---G-TT------------TAAATCAAAG--TA--TAAA--------A-GT------------AACG--GG-GATCT--TGAT-A----A-C---ATAGAATATTAAAATGTTT---------GTT------TA---TCG-T--GGAAAC-TA-CA-TT--C----TATAACAC---CA-CGC--AG-ATCTGTACATATA--GCGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A---TTT-AAA-CCCACC-CTA-AC------TA-CC-A-----TGGAAATGTC-TC-CT--TCCTT-TCT
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gi|14                         : aATCAAA-TACTT--AAA-GTTAT---AA-ACGAGGT-G-ACAAAACAA-AAAAG----------------TA-----A----------------AGTG---------TCTAAT-CTTATAGAATCCTCT-ACACA--TAAAC--AA-----AC-A--------TCA---------ACAT------------GATC-------A-GCTGC-----T-C----G-----TT
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gi|3                          :                                            AA-CAA-AAAAA----------------GAAGAATATGATC-----------AGTG------------AAATCTTTTTGAATCCTCTTACG-A--TAAACCAAA-----AC-A--------TT----------ACAT------------GATC-------A-GCT-C-----T-C----A-----TTT---TTGA--TTACT-TT-----GTTTT-AA-T-T-TTTG--GT-GTTC-TATA-CT-TGTGGTC----TATGTTTC---A---G-TT------------TAAAACAAAG--TA--TAAA--------A-GTGAGTGAAAGCTAAACG--GC-GATC---TGATCC----A-C---ATAAATATTAATGTT---T---------GTT------TA---TCGTT--GGAAATGTA-CATTT--T----TA-T--AA---CA-CAC--AG-ATCTGT------A--GTGAATTAAC-AC-CT--T----CC-A--TTTT-AAA-CATATT-C----C------TA-CC-A-----TGAAAATTTC-CT-CAT-TCCTT-TCTCGATTTTt
gi|2                          :                                                                                                                      aaaatAGTTTCCC-ACG-A--TAAAC--AACATTAAT-A--------TTT---------ATGT------------GATC-------A-GAT-CGCCGTT-C----T-----TTT---A--A--T-ACT-TT-----GATTT-AA-A-C-T--G--AA-AC-A-TAGA-CA-CA-AGTA----TAGACAACAA-A---A-TT------------AAAAACAAAG--TA--TAAA--------A-GT------------GAGA--GC-TATCATGTAAT------G-T---T-----------------T---------GTT------TA---TCG-GA-GAGGAT-TC-TA-t
gi|7                          :                                             caaagtacttaaaagttctgaaacgagatgacaaacaaaaaagatatacatgtaagtgggatcagtgtctaattctttAAT-TTCC-ACG-A--TAAAC--AA-----AC-ATTAATATTT-----------ATGT------------GATC-------A-GAT-CGCCG-T-T----AC----TTT---T--A--T-ACT-TT-----GCTTT-AA-A-C-T--G--AA-AC-A-TAGA-CA-CA-AGTA----TA-GATACCA-A---A-AT------------TAAAACAAAG--TA--TAAA--------A-AT------------GA-------GAGC---TGAT-C----A-T---GTAATGTT----------T---------GTT------TA---TAG-TA-GAGGAT-TC-TA-acatttctataacacacgcagatctgtactagtgaattaaacacacctagctaccatggaaatttcatcattctttctcgattttgt
gi|3                          :                                              aatcaaagtacttaaagttctgaaacgaggttgacaaaaaaaagatatacatgtagtgggatcagtgtctgattctttATTTCCA-ACG-A--TAAAC--AA-----AC-A--------TTA---------ATATTTATGTGGATCAGATCGCCGTTTA-GCT-T-----T-C----ACTCACTTT---T--A--T-ACT-TT-----GTTTT-AA-A-C-T--G--AA-AC-A-TAGA-CCACA-AGTA----TAGAACACCAAA---A-AT------------TAAAACAAAG--TAATCAAA--------A-AT------------GA-------GAGC---TGAT-C----A-T---G-----------------TAATGTTTTGGTT------TA---TCG-TAAGAGGAT-T--CA-----------A-A--A------------AG-ATTTC-------A--CTG-ATC-AT-AT-TC--T----TC-T--TTTT-acatttctataacacacgcagatctg
gi|10                         :                                                                                                                  aaaataacaaATCCTCT-ACG-A--TAAAC--AA-----AC-A--------TT----------ACGT------------AATC-------A--CT-C-----T-C----A-----TTT---TT-A--T-ACT-TT-----GTTTC-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TATG-TT-TC-AGTT----CATG-TAC---A---T-TT------------TAAAgtacatttttataacacacagatctgtagtgaattaacaccttccattttaaacatattcctaccatgaaaatttcctcattcctttctcgattttt
gi|17                         :                                                                                                                              CTTCC-ACG-A--TAAAC--AA-----AC-A--------T--------------T------------GATaacacactaagatctgcagtgaatgacatccttcaatttaaacacactcctactatggaaatttcctcattcctttctcgattttgt
gi|1                          :                                                                                                                        cataaatTTCC-ACG-A--TAAAC--AA-----AC-A--------TTTTAATATTCTATGT------------TATC-------AAGAT-C-----C-CCGTTAC----TTT---T--A--T-ACT-TT-----GATTT-AA----------------------A-CT--G-AAAC----TAAGACAC---A---G-TTAGACACAAAAATTAAAACAAAG--TA--TAAA--------A---------------AATG--AC--AGC---CGTT-C----A-TGTAA-----------------T---------GTT------TGTTCTCG-TA-GAGGAT-TC-TA-tgtgcatttttataacacacacatacacccttcatttaaacacat
gi|5                          :                                                     atcaagtactttaaagtctgaaacgaggtgacgaacaaaaagatatacatgtaagtgggatcagtgtctaattctttT-ACG-A---AAAT--AAT----AC-A--------T-----------GTAT------------GATC-------A-TCT-C-----TACTA--A-----TTTATTT--AATT-ACC-TTTTTGTGTTTT-CA-CCT-T--GTTGT-GT-CCTATA-CTGTG-TGTT----T-TGTTTC---AAAAG-CTA-----------TAAAGCACAG--TA--TAAA--------A-GT------------AACG--GTGGATC---TGAT-C----A-G---AAAC--------------T---------GTT------TAG--TCG-T--GAAAAT-TA-CA-TC--TTCTATA-A--GCA--CA-CGT--AG-ATCTGT------C--GTGTATT-ACGAG-CCGTT----TCTATTTTTT-AAATCGTGCCTCTA-GCATATCTTA-CC-ATCACTTAGAGATTTC-CT-CA--Tactacattctataacaccacgcagatctgtacatatagcgaattacacccttcatttaaacccaccctaactaccatggaaatgtctccttcctttct
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                     ctttttctagata-ACTGTT-----GTTTT-AA-T-T-T--G--GTTGC-T-TATA-CT-TG---TCG---TATGTTTC---A---GGTT------------TAGAAGAAAG--TA--TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC---TG-T-C----A-C---A-----------------TA--------GTG------TA---TCG-T--GAAAAT-T--AA-TTTAT----TA-AACAC---CAGCGC--AG-ATCTGT------A--GTG-ATT-ACAAC-AC--T----TC-T--CTTTAAAA-CACA-T-CTA-GC------TA-CCAA-----TGGAGATTTC-CTACA--TTCTTATCTCGATTgtatacttttcgaaaattttagtctg
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAG--TG--AGAG--------A-GT------------AACG--GC-GATC---TGAT-G----A-C---G-----------------T---------G---------A---T-G-T--TAATAT-TC-AT-TT--T----TATA--ACA--CA-CAA--AG-ATCTGC------A--GT-AAGT-AC-AC-TT--T----TC-G--TTTT-AAA-CACACC-C----C------TA-CT-A-----TGAACATTTT-CT-CA--TTTCT-TTTCGATTaaat
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): GTATACCACAAGGAAGAGATCAACCACTGCTAGTTAT






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Reference ( family-1961 )     :                 ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGT-G-ACAAACAA-AAAAAGA----TAT----A----------------GTG---------TCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CAT-T-ACGTGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-CGNG-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-GTT------TA-TCG-T-GGAAAT-TNCA--TTT-TAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTG------T--A--GTGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A--TTTTAAA-CACAC-C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AGATTTC-C-T-CA-T---TCCTTTCTCG---ATTTTG
gi|1                          :                 ATCAA-GTACTTT-AAA-GT-CT--GAA-ACGAGGT-G-ACGAACAA-AAAGATA----TAC----ATGTAAGTGGGATCA--GTG---------TCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-ACG-A---GAAC--A--A-A-CAT-T-ACATGAACGG------------CT-GT-C--ATTTTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AATT-T-T--T--GT-GT-C-TA--ACT--GTG-TC----TTAGTTTCA---G-TT-TAAATCAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GG-GATCTTGAT-A----A-CATAGAATATTAAAATGTTT-GTT------TA-TCG-T-GGAAAC-TACA--TTC-TAT--AA-C--ACC--ACGCAG-ATCTGTACATAT--A--GCGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A---TTTAAA-CCCAC-C-CTA-AC------TA-CC-A-----TGG-AAATGT--C-T-CC-T---TCCTTTCT
gi|10                         :                                                                                                                               ATCCTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CAT-T-ACGTAATCA-------------CT-CT-C--AT-TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTC-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-GTT-TCAG-TT----CATG-TACA---T-TT-TAAAA
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gi|14                         :                aATCAAA-TACTT--AAA-GTTAT---AA-ACGAGGT-G-ACAAAACA-AAAAAG-----TAA----A----------------GTG---------TCTAA-TCTTATAGAATCCTCT-ACACA--TAAAC--A--A-A-CAT-CAACATGATCAG------------CTGCT-C--G--TT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                     a-C-TAT-ACT-TGTG-TGAAGATATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAAAGTGAGAGA-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-
gi|15                         :                                                                                                                                                AAC--ATTA-A-TAT-TTATGTGATCAGATCGCCGTTACTCT-CT-C--AC-TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-aaatattaatgtt
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gi|18                         : cataaatatcaatgttATCAAAGTACTT--AAAAGTTCT--GAA-ATGAGGT-G-ACAAACGA-AAAAAGA----TATC---A----------------GTG---------t
gi|2                          :                   CAAAGTACTT--AAAAGTTCT--GAA-ACGAGAT-G-ACAAACAA-AAAA-GA----TAT----ACATGTAAGTGGGATCAGTG---------TCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-CCG-A--TAAAC--A--A-A-CAT-T-ACATGAT-AG------------CT-CT-C--AC-TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTTTAA-T-T-T--T--GTTGT-C-TAT-ACT-TGTG-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAATCAAAG--TATTAAA--------A-G-------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CATAAATATTAATGT----T-GTT------TA-TCG-TGGGAAAC-TACA--TTTCTAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTGTAC---T--A--GTGAA--------------------------TTAAA-CACA--C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AAATTTC-A-T-CA-T---T-CTTTCTCG---ATTTTGggatcagcgtct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAAAG--TA-AAAA--------AAGT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-t
gi|3                          :                                                           AACAA-AAAAAGAAGAATATGATCA----------------GTG------------AAATCTTTTTGAATCCTCTTACG-A--TAAACCAA--A-A-CAT-T-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---TTGA--TTACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-TTTG--GT-GTTC-TAT-ACT-TGTGGTC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAA--------A-GTGAGTGAAAGCTAAACG--GC-GATC-TGATCC----A-CATAAATATTAATGTT---T-GTT------TA-TCGTT-GGAAATGTACAT-TTT-TAT--AA-C--A-C--A--CAG-ATCTG------T--A--GTGAATTAAC-AC-CT--T----CC-A--TTTTAAA-CATAT-T-C----C------TA-CC-A-----TGA-AAATTTC-C-T-CA-T---TCCTTTCTCG---ATTTTaaat
gi|4                          :            aaaatATCAAAGTACTTTCAAGTGTTCTATGAATACGAGGT-GGACAAACAATAAAAAGA----TA-----A----------------GTG---------TCTA-TTCTTTTAAAATCCTCT-ACG-AAATAAAC--A--A-ACCAT-T-ACATGATCA-------------CT-CT-C--AT-TTT---T--A--T-A-T-TT-----GTTTTT-AA-T-TGT--T--GT-GTCC-TATAACTGTGTG-TT----TATGTTTCA---C-TT---AAACAA----TA-TAAT--------A-GT------------AACG--GT--ATC-TGAT-C----ATCA-------------------GTT------TA-TCG-T-GAAAAT-TAC---TTC-TAT--AA-C--A-C--ACGTAGAATCTG------TTCG--GTGAATT-AC-AC-CT--T----TC-A---TTTAAA-CATAC-C-CTA-GCT-----TA-CC-A------AA-AGATTTCGC-T-CATT---TCCTTTCTCG---t
gi|5                          :                                                                                                                     TTTTTCTAGA----TAT-ACG-A---AAAT--A--ATA-CATGT-A--TGATCAT------------CT-CTACTAA--TTTATTT--AATT-ACC-TTTTTGTG-TTTT-CA-CCT-T--GTTGT-GT-CCTAT-ACTGTGTG-TT----T-TGTTTCAAAAG-CTATAAAGCACAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GTGGATC-TGAT-C----A-GAAAC--------------T-GTT------TAGTCG-T-GAAAAT-TACATCTTC-TAT--AAGC--A-C--ACGTAG-ATCTG------T--C--GTGTATT-ACGAG-CCGTT----TCTATTTTTTAAATCGTGC-CTCTA-GCATATCTTA-CC-ATCACTTAG-AGATTTC-C-T-CA-TGTATACTTT-TCGAAAATTTTcat
gi|6                          :                cATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGATGT-G-ACAAACAA-AAAAAGA----TA-----A----------------GTG---------TCTAATTCTTTTCGAATCTTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CAT---ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-TGAG-TC----TATGTTGCA---G-TT-TAAAGCAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-GTT------TA-TCG-T-GAAAAT-TCCA--TTT-TA---AA-C----C--ACGCAG-ATCTG---------A--GTGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A--TTTTAAA-CACAC-C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AGATTTC-C-T-CA-----TCCTTTCTCG---ATTTTGagtctg
gi|7                          :                 ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGTTG-ACAAA----AAAAAGA----TAT----ACATGTAGTGGGATCA-GTG---------TCTGATTCTTTTAGAATCCTCT-ACT-A--TAAAC--A--A-A-CAT-T-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---TT-A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-TT-G--GT-AT-C-TAT-ACT-TGTG-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAGCAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CATAAATATTAATGTT---T-GTT------TA-TCG-T-GGAAAT-TACA--TTTCTAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTG------
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1961 )     :                 ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGT-G-ACAAACAA-AAAAAGA----TAT----A----------------GTG---------TCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-GTT------TA-TCG-T-GGAAAT-TACA--TTT-TAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTG------T--A--GTGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A--TTTTAAA-CACAC-C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AGATTTC-C-T-CA-T---TCCTTTCTCG---ATTTTG
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gi|10                         :                                                                                                                               ATCCTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACGTAATCA-------------CT-CT-C--AT-TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTC-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-GTT-TCA-G-TT----CATG-TACA---T-TT-TAAAA
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gi|18                         : cataaatatcaatgttATCAAAGTACTT--AAAAGTTCT--GAA-ATGAGGT-G-ACAAACGA-AAAAAGA----TATC---A----------------GTG---------t
gi|2                          :                   CAAAGTACTT--AAAAGTTCT--GAA-ACGAGAT-G-ACAAACAA-AAAA-GA----TAT----ACATGTAAGTGGGATCAGTG---------TCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-CCG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGAT-AG------------CT-CT-C--AC-TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTTTAA-T-T-T--T--GTTGT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAATCAAAG--TATTAAA--------A-G-------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CATAAATATTAATGT----T-GTT------TA-TCG-TGGGAAAC-TACA--TTTCTAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTGTAC---T--A--GTGAA--------------------------TTAAA-CACA--C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AAATTTC-A-T-CA-T---T-CTTTCTCG---ATTTTGggatcagcgtct
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gi|4                          :            aaaatATCAAAGTACTTTCAAGTGTTCTATGAATACGAGGT-GGACAAACAATAAAAAGA----TA-----A----------------GTG---------TCTA-TTCTTTTAAAATCCTCT-ACG-AAATAAAC--A--A-ACCATT-ACATGATCA-------------CT-CT-C--AT-TTT---T--A--T-A-T-TT-----GTTTTT-AA-T-TGT--T--GT-GTCC-TATAACTGTGT-G-TT----TATGTTTCA---C-TT---AAACAA----TA-TAAT--------A-GT------------AACG--GT--ATC-TGAT-C----ATCA-------------------GTT------TA-TCG-T-GAAAAT-TAC---TTC-TAT--AA-C--A-C--ACGTAGAATCTG------TTCG--GTGAATT-AC-AC-CT--T----TC-A---TTTAAA-CATAC-C-CTA-GCT-----TA-CC-A------AA-AGATTTCGC-T-CATT---TCCTTTCTCG---t
gi|5                          :                                                                                                                     TTTTTCTAGA----TAT-ACG-A---AAAT--A--ATA-CAT--GTATGATCAT------------CT-CTACTAA--TTTATTT--AATT-ACC-TTTTTGTG-TTTT-CA-CCT-T--GTTGT-GT-CCTAT-ACTGTGT-G-TT----T-TGTTTCAAAAG-CTATAAAGCACAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GTGGATC-TGAT-C----A-GAAAC--------------T-GTT------TAGTCG-T-GAAAAT-TACATCTTC-TAT--AAGC--A-C--ACGTAG-ATCTG------T--C--GTGTATT-ACGAG-CCGTT----TCTATTTTTTAAATCGTGC-CTCTA-GCATATCTTA-CC-ATCACTTAG-AGATTTC-C-T-CA-TGTATACTTT-TCGAAAATTTTcat
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gi|7                          :                 ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGTTG-ACAAA----AAAAAGA----TAT----ACATGTAGTGGGATCA-GTG---------TCTGATTCTTTTAGAATCCTCT-ACT-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---TT-A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-TT-G--GT-AT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAGCAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CATAAATATTAATGTT---T-GTT------TA-TCG-T-GGAAAT-TACA--TTTCTAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTG------
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lowQualScore                  :                             66   3     11   4       4 4        0    8  5555  3333333333333333333333   000000000            9         6   6 00     66 66 3 3   11         8888888888888  3  3 66 99   444 66 55 6   6  11111 6    6  6 0 0 55555  0  3 6   3   7   3 3 55555         888 3  3          22  1    33333333 1  666666666666    99  9    9    9 1111 9  33333333333333333 7   555555  6   6 6      0    66   7   66  7 66 3 66      3     111111111111       6  3  6  00 7777  88888      6     0 0 999  555555  0  0 00000   0 9     0 0 0  0 000          888      
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Reference ( family-1961 )     :                 ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGT-G-ACAAACAA-AAAAAGA----TAT----A----------------GTG---------TCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-GTT------TA-TCG-T-GGAAAT-TACA--TTT-TAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTG------T--A--GTGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A--TTTTAAA-CACAC-C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AGATTTC-C-T-CA-T---TCCTTTCTCG---ATTTTG
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gi|18                         : cataaatatcaatgttATCAAAGTACTT--AAAAGTTCT--GAA-ATGAGGT-G-ACAAACGA-AAAAAGA----TATC---A----------------GTG---------t
gi|2                          :                   CAAAGTACTT--AAAAGTTCT--GAA-ACGAGAT-G-ACAAACAA-AAAA-GA----TAT----ACATGTAAGTGGGATCAGTG---------TCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-CCG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGAT-AG------------CT-CT-C--AC-TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTTTAA-T-T-T--T--GTTGT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAATCAAAG--TATTAAA--------A-G-------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CATAAATATTAATGT----T-GTT------TA-TCG-TGGGAAAC-TACA--TTTCTAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTGTAC---T--A--GTGAA--------------------------TTAAA-CACA--C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AAATTTC-A-T-CA-T---T-CTTTCTCG---ATTTTGggatcagcgtct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAAAG--TA-AAAA--------AAGT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-t
gi|3                          :                                                           AACAA-AAAAAGAAGAATATGATCA----------------GTG------------AAATCTTTTTGAATCCTCTTACG-A--TAAACCAA--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---TTGA--TTACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-TTTG--GT-GTTC-TAT-ACT-TGT-GGTC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAA--------A-GTGAGTGAAAGCTAAACG--GC-GATC-TGATCC----A-CATAAATATTAATGTT---T-GTT------TA-TCGTT-GGAAATGTACAT-TTT-TAT--AA-C--A-C--A--CAG-ATCTG------T--A--GTGAATTAAC-AC-CT--T----CC-A--TTTTAAA-CATAT-T-C----C------TA-CC-A-----TGA-AAATTTC-C-T-CA-T---TCCTTTCTCG---ATTTTaaat
gi|4                          :            aaaatATCAAAGTACTTTCAAGTGTTCTATGAATACGAGGT-GGACAAACAATAAAAAGA----TA-----A----------------GTG---------TCTA-TTCTTTTAAAATCCTCT-ACG-AAATAAAC--A--A-ACCATT-ACATGATCA-------------CT-CT-C--AT-TTT---T--A--T-A-T-TT-----GTTTTT-AA-T-TGT--T--GT-GTCC-TATAACTGTGT-G-TT----TATGTTTCA---C-TT---AAACAA----TA-TAAT--------A-GT------------AACG--GT--ATC-TGAT-C----ATCA-------------------GTT------TA-TCG-T-GAAAAT-TAC---TTC-TAT--AA-C--A-C--ACGTAGAATCTG------TTCG--GTGAATT-AC-AC-CT--T----TC-A---TTTAAA-CATAC-C-CTA-GCT-----TA-CC-A------AA-AGATTTCGC-T-CATT---TCCTTTCTCG---t
gi|5                          :                                                                                                                     TTTTTCTAGA----TAT-ACG-A---AAAT--A--ATA-CAT--GTATGATCAT------------CT-CTACTAA--TTTATTT--AATT-ACC-TTTTTGTG-TTTT-CA-CCT-T--GTTGT-GT-CCTAT-ACTGTGT-G-TT----T-TGTTTCAAAAG-CTATAAAGCACAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GTGGATC-TGAT-C----A-GAAAC--------------T-GTT------TAGTCG-T-GAAAAT-TACATCTTC-TAT--AAGC--A-C--ACGTAG-ATCTG------T--C--GTGTATT-ACGAG-CCGTT----TCTATTTTTTAAATCGTGC-CTCTA-GCATATCTTA-CC-ATCACTTAG-AGATTTC-C-T-CA-TGTATACTTT-TCGAAAATTTTcat
gi|6                          :                cATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGATGT-G-ACAAACAA-AAAAAGA----TA-----A----------------GTG---------TCTAATTCTTTTCGAATCTTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CAT--ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-TGA-G-TC----TATGTTGCA---G-TT-TAAAGCAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-GTT------TA-TCG-T-GAAAAT-TCCA--TTT-TA---AA-C----C--ACGCAG-ATCTG---------A--GTGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A--TTTTAAA-CACAC-C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AGATTTC-C-T-CA-----TCCTTTCTCG---ATTTTGagtctg
gi|7                          :                 ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGTTG-ACAAA----AAAAAGA----TAT----ACATGTAGTGGGATCA-GTG---------TCTGATTCTTTTAGAATCCTCT-ACT-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---TT-A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-TT-G--GT-AT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAGCAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CATAAATATTAATGTT---T-GTT------TA-TCG-T-GGAAAT-TACA--TTTCTAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTG------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                               a-ACTGTT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GTTGC-T-TAT-ACT-TGTCG-T------ATGTTTCA---GGTT-TAGAAGAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TG-T-C----A-CA-----------------TAGTG------TA-TCG-T-GAAAAT-TA-A---TT-TATTAAA-C--A-CCAGCGCAG-ATCTG------T--A--GTG-ATT-ACAAC-AC--T----TC-T--CTTTAAA--ACACAT-CTA-GC------TA-CCAA-----TGG-AGATTTC-C-TACA-T---TCTTATCTCG---ATT
gi|9                          :                 ATCAAAGTATTT--AC--GTACT--GAA-ACGAGGT-G-ACAAACAA-AAAA-GA----TATG---A----------------GTGGGATCAGGGTCTAATTCTTTT-GAATCCTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT--------------------------T-TT-----G-TTTT-AT-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-CCT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAA--TA-CAAAAGTTAGAGA-GT------------AACG--GC-GATT-TGAT-C----A-CA-----------------T-


blockSeqs                     :                             TC   A     AT   T       T G        T       AGAA  TACATGTAAGTGGGATCA       GGATCAGGG                      T   C AA     CA TT T C   CA         GATCGCCGTTACT  G  A TA T    ATT TG AT T   G  TTTGT T    T  . C G TTG    T  T C   A   G   C G GAAGA         AAA G  A          AA  T    AGTGAGAG A  GAGTGAAAGCTA    GC  G    .    C CTAT T  TAAATATTAATGTT    A   AAAATG  G   T G      G    TC   C   TA  A CC . CA      A     TCACT              A  G  A  GT TTTC  TATTT      T     A T TAT  ATATCT  T  A TCACT   C A     G A A  T GTA          AAA
blockSeqs                     :                             .    A     .    .       . .        .       .     TACATGTAGTGGGATCA        .                              .   . .      .  .  . .   TT         A              .  . .  C    .   T  .  .   .  .     .    .  . . . GTT    T  C .   .   G   . . GAAGA         .   .  .          .   .    AGTTAGAG .  .               .   .    .    . .    .  TAAATATTAATGTT    .   .       .   . .      G    T    C   .   G .  . .       .     TACTA              .  A  .  .  .     AATT       .     . . TA   T       .  . .       . C     . . .  . .            .  
blockSeqs                     :                             .    T     .    .       . .        .       .     TGATCA                   .                              .   . .      .  .  . .   T          G              .  . .  C    .   .  .  .   .  .     .    .  . . . TG     .  . .   .   .   . . T             .   .  .          .   .    GTGAGAG  .  .               .   .    .    . .    .  TAAATATTAATGT     .   .       .   . .      G    T    .   .   . .  . .       .     TTCG               .  .  .  .  .     AA         .     . . TA   .       .  . .       . A     . . .  . .            .  
blockSeqs                     :                             .    .     .    .       . .        .       .     TCA                      .                              .   . .      .  .  . .   T          G              .  . .  T    .   .  .  .   .  .     .    .  . . . G      .  . .   .   .   . . C             .   .  .          .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  AAC               .   .       .   . .      .    T    .   .   . .  . .       .     CA                 .  .  .  .  .     GT         .     . . TA   .       .  . .       . A     . . .  . .            .  
blockSeqs                     :                             .    .     .    .       . .        .       .     TGA                      .                              .   . .      .  .  . .   T          G              .  . .  .    .   .  .  .   .  .     .    .  . . . T      .  . .   .   .   . . C             .   .  .          .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  .                 .   .       .   . .      .    .    .   .   . .  . .       .     CA                 .  .  .  .  .     AT         .     . . TA   .       .  . .       . G     . . .  . .            .  
blockSeqs                     :                             .    .     .    .       . .        .       .     AA                       .                              .   . .      .  .  . .   T          T              .  . .  .    .   .  .  .   .  .     .    .  . . . T      .  . .   .   .   . . T             .   .  .          .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  .                 .   .       .   . .      .    .    .   .   . .  . .       .     TA                 .  .  .  .  .     AT         .     . . TA   .       .  . .       . G     . . .  . .            .  
blockSeqs                     :                             .    .     .    .       . .        .       .     A                        .                              .   . .      .  .  . .   T          G              .  . .  .    .   .  .  .   .  .     .    .  . . . G      .  . .   .   .   . . T             .   .  .          .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  .                 .   .       .   . .      .    .    .   .   . .  . .       .     TC                 .  .  .  .  .     TC         .     . . .    .       .  . .       . G     . . .  . .            .  
blockSeqs                     :                             .    .     .    .       . .        .       .     A                        .                              .   . .      .  .  . .   T          G              .  . .  .    .   .  .  .   .  .     .    .  . . . G      .  . .   .   .   . . C             .   .  .          .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  .                 .   .       .   . .      .    .    .   .   . .  . .       .     TA                 .  .  .  .  .     A          .     . . .    .       .  . .       . G     . . .  . .               
blockSeqs                     :                                                                .       .     A                        .                              .   . .      .  .  . .   T          G              .  . .  .    .   .  .  .   .  .     .    .  . . . G      .  . .   .   .   . . C             .   .  .          .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  .                 .   .       .   . .      .    .    .   .   . .  . .       .     A                  .  .  .  .  .     A          .     . . .    .       .  . .       . .     . . .  . .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .   . .      .  .  . .   .          .              .  . .  .    .   .     .   .  .     .    .  .               . .   .   .   . . C             .   .  .          .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  .                 .   .       .   . .      .    .    .   .   . .  . .       .     .                  .  .  .  .  .     .          .                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                   .  .  . .   .          .              .  . .  .                                                         .   .   . . .             .   .  .          .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  .                 .                        .    .    .   .   . .  . .       .                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .   .    .        .  .               .   .    .    . .    .  .                 .                                                                                                                                                                                    
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Reference ( family-1961 )     :                 ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGT-G-ACAAACAA-AAAAAGA----TAT------------GA-------CAGTGTCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-GTT------TA-TCG-T-GGAAAT-TACA--TTT-TAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTG------T--A--GTGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A--TTTTAAA-CACAC-C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AGATTTC-C-T-CA-T---TCCTTTCTCG---ATTTTG
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                             a-C-TAT-ACT-TGT-G-TGAAGATATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAAAGTGAGAGA-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-
gi|15                         :                                                                                                                                         AAC--ATTA-A-TATTTATGTGATCAGATCGCCGTTACTCT-CT-C--AC-TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-aaatattaatgtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                        ctatacttgtgtgaagatatgtttcagt-ACT-TGT-G-TGAAGATATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAGAATA-TAAAGTGAGAG-A-GT------------AACGGCGC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -----------------T-GTT------TA-TCG-T-GGAAGTGTGCAT-TTT-TAT--AA-C--A-C--ACACA-------------------------T-AC-AC-CC--T----TC-A---TTTAAA-CACAaaatattaatgtt
gi|18                         : cataaatatcaatgttATCAAAGTACTT--AAAAGTTCT--GAA-ATGAGGT-G-ACAAACGA-AAAAAGA----TAT---------------------CAGTGt
gi|2                          :                   CAAAGTACTT--AAAAGTTCT--GAA-ACGAGAT-G-ACAAACAA-AAAA-GA----TATACATGTAAGTGGGAT------CAGTGTCTAATTCTTTTAGAATCCTCT-CCG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGAT-AG------------CT-CT-C--AC-TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTTTAA-T-T-T--T--GTTGT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAATCAAAG--TATTAAA--------A-G-------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CATAAATATTAATGT----T-GTT------TA-TCG-TGGGAAAC-TACA--TTTCTAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTGTAC---T--A--GTGAA--------------------------TTAAA-CACA--C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AAATTTC-A-T-CA-T---T-CTTTCTCG---ATTTTGggatcagcgtct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAAAG--TA-AAAA--------AAGT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-t
gi|3                          :                                                           AACAA-AAAAAGAAGAATAT------------GAT------CAGTG---AAATCTTTTTGAATCCTCTTACG-A--TAAACCAA--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---TTGA--TTACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-TTTG--GT-GTTC-TAT-ACT-TGT-GGTC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAG--TA-TAAA--------A-GTGAGTGAAAGCTAAACG--GC-GATC-TGATCC----A-CATAAATATTAATGTT---T-GTT------TA-TCGTT-GGAAATGTACAT-TTT-TAT--AA-C--A-C--A--CAG-ATCTG------T--A--GTGAATTAAC-AC-CT--T----CC-A--TTTTAAA-CATAT-T-C----C------TA-CC-A-----TGA-AAATTTC-C-T-CA-T---TCCTTTCTCG---ATTTTaaat
gi|4                          :            aaaatATCAAAGTACTTTCAAGTGTTCTATGAATACGAGGT-GGACAAACAATAAAAAGA----TA-----------------------AGTGTCTA-TTCTTTTAAAATCCTCT-ACG-AAATAAAC--A--A-ACCATT-ACATGATCA-------------CT-CT-C--AT-TTT---T--A--T-A-T-TT-----GTTTTT-AA-T-TGT--T--GT-GTCC-TATAACTGTGT-G-TT----TATGTTTCA---C-TT---AAACAA----TA-TAAT--------A-GT------------AACG--GT--ATC-TGAT-C----ATCA-------------------GTT------TA-TCG-T-GAAAAT-TAC---TTC-TAT--AA-C--A-C--ACGTAGAATCTG------TTCG--GTGAATT-AC-AC-CT--T----TC-A---TTTAAA-CATAC-C-CTA-GCT-----TA-CC-A------AA-AGATTTCGC-T-CATT---TCCTTTCTCG---t
gi|5                          :                                                                                                              TTTTTCTAGA----TAT-ACG-A---AAAT--A--ATA-CAT--GTATGATCAT------------CT-CTACTAA--TTTATTT--AATT-ACC-TTTTTGTG-TTTT-CA-CCT-T--GTTGT-GT-CCTAT-ACTGTGT-G-TT----T-TGTTTCAAAAG-CTATAAAGCACAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GTGGATC-TGAT-C----A-GAAAC--------------T-GTT------TAGTCG-T-GAAAAT-TACATCTTC-TAT--AAGC--A-C--ACGTAG-ATCTG------T--C--GTGTATT-ACGAG-CCGTT----TCTATTTTTTAAATCGTGC-CTCTA-GCATATCTTA-CC-ATCACTTAG-AGATTTC-C-T-CA-TGTATACTTT-TCGAAAATTTTcat
gi|6                          :                cATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGATGT-G-ACAAACAA-AAAAAGA----TA-----------------------AGTGTCTAATTCTTTTCGAATCTTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CAT--ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---T--A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-TGA-G-TC----TATGTTGCA---G-TT-TAAAGCAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CA-----------------T-GTT------TA-TCG-T-GAAAAT-TCCA--TTT-TA---AA-C----C--ACGCAG-ATCTG---------A--GTGAATT-AC-AC-CC--T----TC-A--TTTTAAA-CACAC-C-CTA-GC------TA-CC-A-----TGG-AGATTTC-C-T-CA-----TCCTTTCTCG---ATTTTGagtctg
gi|7                          :                 ATCAAAGTACTT--AAA-GTTCT--GAA-ACGAGGTTG-ACAAA----AAAAAGA----TATACATGTAGTGG-GAT------CAGTGTCTGATTCTTTTAGAATCCTCT-ACT-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT-CT-C--A--TTT---TT-A--T-ACT-TT-----G-TTTT-AA-T-T-TT-G--GT-AT-C-TAT-ACT-TGT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAGCAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TGAT-C----A-CATAAATATTAATGTT---T-GTT------TA-TCG-T-GGAAAT-TACA--TTTCTAT--AA-C--A-C--ACGCAG-ATCTG------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                        a-ACTGTT-----G-TTTT-AA-T-T-T--G--GTTGC-T-TAT-ACT-TGTCG-T------ATGTTTCA---GGTT-TAGAAGAAAG--TA-TAAA--------A-GT------------AACG--GC-GATC-TG-T-C----A-CA-----------------TAGTG------TA-TCG-T-GAAAAT-TA-A---TT-TATTAAA-C--A-CCAGCGCAG-ATCTG------T--A--GTG-ATT-ACAAC-AC--T----TC-T--CTTTAAA--ACACAT-CTA-GC------TA-CCAA-----TGG-AGATTTC-C-TACA-T---TCTTATCTCG---ATT
gi|9                          :                 ATCAAAGTATTT--AC--GTACT--GAA-ACGAGGT-G-ACAAACAA-AAAA-GA----TAT------------GAGTGGGATCAGGGTCTAATTCTTTT-GAATCCTCT-ACG-A--TAAAC--A--A-A-CATT-ACATGATCAG------------CT--------------------------T-TT-----G-TTTT-AT-T-T-T--G--GT-GT-C-TAT-ACT-CCT-G-TC----TATGTTTCA---G-TT-TAAAACAAAA--TA-CAAAAGTTAGAGA-GT------------AACG--GC-GATT-TGAT-C----A-CA-----------------T-
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGATTCTGTAGATGCAAAAAATATTATGAAAACTACCTCTTT
Unaligned ( gi|21 ): GTATACCACAAGGAAGAGATCAACCACTGCTAGTTAT