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lowQualScore : 3 0 2 5 0 0 00 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 7 7 333 0 99 0 44444444444 5 2222222 6666 99 8888888 0 0 6666 6 111111111 22222 0000000 0 5 0 0 66666 0 0 5 4 2 2 444444444444444 4 0 888 999999 0 6666 1 8888 99 999999 99 0 6666 0 00 444 44 4444444 6 11 9 5555 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 77 8 0 666 6666666666 11111111111111111111111111111111 4 0 7 7 3333333333 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0
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Reference ( gi|1 ) : ACGTACGT-GTT-CATCACGA-AT-TGTGTCTGCTATTAGATTTAGTTTATAATTCTTTGTGTTGGCCCTTTTTTTGTGATTGCTCTAGACCTGTTCTGCCT----TTCCGCCATTTCGATGTG-TAGATCAC-AAGCATTTCTCATTGCCCCTTGTA-TGATAAT-ATTCTTATGGGAA-ATCTGGCATC---GCGATTGACAT----GATTCGTGAT-GTATCT----TC--T-C-TGGCTCGCAT-GTCATGA-CAAG--T--GCTAAAAT-TGGTAAAAGCCAGTTTTCCATGAAACGATGTATTCAGCTGACTATGTTTTTTT--TGTCCCCGGTCACCCTCAGGGTCTCCTTTGTGTTGGGTATCCACTTTCGTGTCTGCTATTGCA-GTGTTT-CTAAATACCAAATATTGAAGTTAAATATGCCGATGCACTTC-TG-ACAC-CGTTTGTCGCTATCATCTGTTCCTACTGCAACGACGACACGCAGGTTTTATACATGGTTATAAATACCTA---ACTG--ACCTTGACCACGA-ATTG-AGA-TAGACTTCA-ACATGTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTCAACTG--TGCAATATGTCATCTACGATAAAATTATCCAATAAAA-CTAAA--ATC-----A-GA--CAAATC-TGAA-C--TAATTTGCAATTTTACTTGGCTACTCAAA-A--GAAG-GATCT-AGGTGACTTCCTTTAGTCATTATCTGCCTCCTAACTTC--CATACT-----TTTGGAAGGATACAAGTCGATTTA-CA-----CT-GATGTGTGTGTCAGTGCGT------AAAATAACCTTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ATG-ATCGTTCAAACTTTCCA-TGG-TTCGCCACAATATTTAAAA-CAAA-TCTAGCCTG-CAATAAATGGTG-CTACTT-CC--AACT-TAAAAA--CAT-CGGTTAGAA-TTA-GAAACTTCT-ATAGACCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGCCACT--TATAATGTCT-CG---CCT-G-ACATATGCGAAA-ATG-CATC-CTCCCTCACT--C-TGTTCCAAAGACAGACGTC-TTTAACTGAAACT-GCAAAA-AT-T---ACAG-A-C-ACTGGTCTGCTTCCG----ACAATAG-G--------ACT---GCG---CT-C----TTC-CAACAAC--GACCATAT---TC----ACCC--C---T-TTAAT---CTCTC-ACAATTGGTCATTGCT-ACC--GTTA-TTTCCG-AA-T-TCAGT-TA-ATAATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACAG-TCT---G-CGT---GGCCT-------GATC--TCCAGTTG-TACATCCACGGA-CTTGTGTC-TAATA-TTCTAAC--CATCCGAACC--ACAG-T-CACTGCGAT-CA---GTAT-TATTCG--CCGAGTTT-G---TA--TAAG---TA-TACC-AAT-TGTGCG-AGC-AA--AA-TGTG-A--TGGGGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAG-CA----AGTCT-TG-T-GACACAGC----TCTTCC----ATTAAAC-ACCTTCG-G-TTG---AAAA-C-ATCGAATCTGTGTTTTTAAAAGAAA-AA-TT--AGAATATACCGACTT---TTTT-A---AAAG-TGC----TTTATAACC-T--A--TGGAA-GTACTG--T-G----CTG-AATTTGAACTCTTTAATATTAAT--ATTAAAGACTTAACATTTT----TTAT-CATTAATTGTG-TATTG-AGCTA-GC------------AAAAAGAG-AACCCCA--------------AAAAAAAT-C----CCCTA--A--TGC-TT---A------A-CA-GCAT-------------AAA-----TTGGTAGATTTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGT--T----CGTTTGCCTGTTA--GGT-T--AACTTGTC-ATTTAAGCCACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTTTGGA-ACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT-AGGAGTATGATTC-TTAATTAA-A-----AAGGCGC-ATA--TA-AATG-GCATGTAATGAATTAAATAATAATAT
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gi|4 : ccTATGGAAT-ATCTGG-ATC---AACATTGGCAT----GGCTTA-GATCATATCT-----C--T-C-TGGC-CGCA--GTCA--G-CA-G--TTTGCTA---T-TGGTAAGA--CAGTTCCC-----AGCGATGT--TCAGCT----ATGTTTTTGT---GTTCCC---------CAGGG----CTCTGTGTTGGG-A-CCAC------GTCT-TTACTGCA--TGTTTTCTAAAC-CCA--T-TTG---TGAAATATGCCGACG----TCATG-ACA------TGT-GCTATCA-CTGTT---A-TGCA--GACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACTTA---AC-GACACCTTGACCA-GA-TTTGCAGA-TAGACTTCA-ACA-GTG-CCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----CAA------TATCC--TAAAA-CT-AA--ATC-----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATCTG
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCCGCC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT-TTCAGCT-ACTATGTTT-TT---GTTCCCGG-CG--CCC-C-AGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCAC---TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCANGACAC-GTTTGT-GTTATCA-CTG-TT---A-TG---CG-CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACTTAAC-G-ACACCTGGACCA-GAATTGCAG-ATATACTGCA-ACA-GTGTCCTCTC-AGATAT----AAGCTC--CTGGATGC-A----GTCA--C-------AAAAA--TATCC--TAAAA--CTAA---A-TC----AGGA--CAAAAC-TG-AAC--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-------A--CTT-----A--G--T----GTCCG-----TAACT--CA-CA-TTTTGGA--GGAT-CG-GT-CAATT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAANA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTATTCAGCTAGACGCATCGTTCA--CTTTCCACTGGANTCCCCAAAAAATATAAAA-CAA--TCTAG--C-----A-AAAT-G-T--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-C-GGT-AGAANT--AGAAA---CTTCC-AT---CCGGATGGAC-CGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACCTACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCTTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--AC--ACTGA-CT--------------GCTT--CG-AC--TA--GTG--ACTGCGCTCTTC-CAACCAC--GACCATATTCA--C-CCCCA-TT--T-AATCT-CTCT-ACAAT-TG------GCTA-CCTGTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-GT-AAATA-C-TTTCAA-ACGGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG-G--TC-AA--TA-TCT---AAC-CATCCAAACCACGG--TCACTGCGAT-C----AA-A-ANATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACCA----AT-TGTGCGAAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTTAAAAGA-A--AANTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-G-TGC---TT--T-T-AACC---T--A--T-GAA-ACACTGT--G----CTGAANTTGAACTCT----T--ATA----TNATT-A-TTAAA-ACTNAACNTTTT----TTAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAAAAAAAA---NA--------------AAA-AAAA------T-C----CC---CCAA-G-C----T-T---A------ACA-GCA-T-------------AAA------TT-TTAGA-TTTTA--TGGA-TT--TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACT-C-TTTATGTAAAGCGCCTCCGNGGTAGAATTCTTTAGTTANTATATATNGGGCGC-TGTACCTATAATGTGCAT-TAATAAAATAGATAATAA
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gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT-T-CAGCT-A---TGCTT-T----------GG-CGTTCCC-C-AGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TG---C--CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-G-ACACCTGGACCA-GAATTGCAG-ATATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTC-AGATAT----AAGCTC--CTGGATGC-A----GTC-------------AAA--TATCC--TAAAA--CTAA---A-TC----AGGA--CAAAAC-TG-AAC--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-------A--tat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGTGAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---TA-A--T-G-A-ACAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT----T--ATA----TCATT-A-TTTAA-CCT-AACTTCTTTA--TTAT-CATT-ATAATG-GT--TG-ACATA-C----------ACAAAAAAAA---AA--------------AAATAAAA------T-----------CTAA-A-CAGCTT-T---T------ATATGCA-T-------------AAA------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-N-NNN---NN--N-N-NNNN---N--AA-T-GAA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT----T--ATA----TAATT-A-CTAAA-ACTAAATTTTTA----TTAT-CATGA--TATG-AT--TG-A-TTA-C-----------AAAAAAAAA---TA--------------AAatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTTAAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-A-TGC---TT--T-C-AACC---T--A--T-GAA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT----T--ATA----TAATTTA-TTAAA-ACT-AACATTTTA---TCAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAAAAAAAA---AA--------------AAA-AAAAAAAAAA------------CCAA---C----T-A---A------ACA-GCA-T-------------AAA------TT-T-AGA-TTTTA--TGGA-TT--TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CCA----AT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-G-TGC---TT--T-T-AACC---T--A--T-G-A-ACACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT----T--ATA----TAATT-A-TTAAA-ACT-AACTTTTA----TTAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C----------AAAAAAAAAA---
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTA--TGGA-TT-----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCTTAG-GGT--AATTTTT--GTTAA-ATATATAGGGCGC-TA----TATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT----T--ATA----TAATT-A-TTAAA-ACTAAAC-TTTT----ATATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C----------CAAAAAAAAC---AATCCCC---------AAA-AAAA------C-C----CC---TCAA-ATC----T-T---ATATCATACA-CTA-TCCCCTAAGAGACAAAA------TT-TT-GA-TTTTA--TGGA-TT--TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
gi|17 : tgCTTACGAAAGATTTGAGGAG-ATA--AAGCATTGGACAT----AGCAATTCCTACCGATCAAATA---TCT-CT-C-TGG-C-CGCA-GTC---A--GCAGG-TTGC--AAAT-TGGTGAAA--ccctttggtggtaattcctttaactg
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gi|19 : cagtgtttcacaaacacatcttgttA------T-C----CC---CTAG-T-C----CAT---A------AGA-GGA----------------AC------TT-TTAGG-TTTTAATTGGAATTAATTTG-----TTGTT----TGTGT-TTTGT----AGT-T--AGCT-GTCATT---GTC-ct
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT--TCAGCT-ACTATGTTT-TT---------GGGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCATGACAC-GTTTGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAAAAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-G-C-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AGT-CAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAATA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA-A-TTA---AAACAAA-TCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--T--GCCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--A--CACTGA-CT---------GCT----T-CGAC-ATA-----GTG--ACT-CGCTCTTC-CAAC--CACGACCATATTC--AC-CCCCA-T--TT-AATNT-CTCT-ACA-ATTG------GCT-ACCTG-TTA-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCAA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TAAC-CATCC-AACC-ACGG-T-CACTGCGAT-C----AG-A-AGATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-G-TGC---TT--T-T-AACC---T--A--T-GAA-ACACTGT--G----CTGAAATTGAACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAACNTTTT----TTAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAAAAAAAA---NA--------------AAA-AAAAT-----CC----CCCAA-A-C-----TT---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCTC---AGAGTA-AATTCT-TTAATTAATAAAGGGCGC-TATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
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gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGCTT-T-----------GGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TGC-----CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-GA-CACCTGGACCA-GAATTGCAGA-TATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----------AAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----Atat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---TA-A--T-G-A-ACAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT--T--ATA----TCATT-A-TT-TAA-CCT-AACTTCTTTA--TTAT-CATT-ATAATG-GT--TG-ACATA-C----------ACAAAAAAAA---AA--------------AAATAAAAT------------CTAA-A-CAGCT-TT---T------ATATGCAT-------------A----------AA-------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-N-NNN---NN--N-N-NNNN---N--AA-T-GAA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAATTTTTA----TTAT-CATGA--TATG-AT--TG-A-TTA-C-----------AAAAAAAAA---TA--------------AAatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-A-TGC---TT--T-C-AACC---T--A--T-GAA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-ACTAA-CATTTTA---TCAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAAAAAAAA---AA--------------AAA-AAAAAAAAAACC--------A-A-C-----TA---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TT-T-AGA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-G-TGC---TT--T-T-AACC---T--A--T-G-A-ACACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACT-AACTTTTA----TTAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C----------AAAAAAAAAA---
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTATGGATT----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCTT---AGGGTA-ATTTTTGTTAAAT-ATATAGGGCGC---TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAAC-TTTT----ATATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C----------CAAAAAAAAC---AATCCCC---------AAA-AAAAC-----CC----CTCAA-ATC-----TT---ATATCATACA-CTATCCCCTAAGAGACAA----------AA-------TT-TT-GA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
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gi|18 : -------TT-TTAGG-TTTTATGCATT-TTTGGATTATTGCT----AGTTTG-----TA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATtccagcaagatcacagttca
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gi|23 : GCTCT---G-TGT---GAC----CT-ATC------TCCAGT-G-TACATC-CA-ATACTTG--GTC--AATA-TC---TA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT--TCAGCT-ACTATGTTT-TT---------GGGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCATGACAC-GTTTGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAAAAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-G-C-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AGT-CAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAATA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA-A---TAAAA-CAAA-TCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--C--GCCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--AC--ACTGA-CT---------GCT----T-CGAC-GTA-----GTG--ACT-CGCTCTTC-CAACCAC--GACCATATTCA--C-CCCCA-TT--T-AATNT-CTCT-ACAAT-TG------GCTA-CCTGTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TAAC-CATCC-AACC-ACGG-T-CACTGCGAT-C----AG-A-AGATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--T-GAA-ACACTGT--G----CTGAAATTGAACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAACNTTTT----T--TAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C---------AAAAAAAA--------------AA---AA-----AAA-AAAAT-----CC----C-C-------A-AA--C----TT---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---NAGAGTA-AATTCT-TTAATTA-TATAGG-GCGCATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
gi|1 : TACGT-GTT-CATCACGA-ATTGTGTCTGCTATTAGATTTAGTTTATAATTCTTTGTGTTGGCCCTT-TTTTTGTGATTGC-------TCTAGACCTGTTCTGCCTTTCCGCCATTTC-GATGTG-TAGATCAC--AAGCATTTCTCATTGCCCCTTGTA-TGATAAT-ATTCTTATGGGAAATCTG----GCATC---GCGATTGA-CAT----GA---TT--CGT-GAT-G--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCATGTC---ATGACAAGT--GCTAAAAT-TGGTAAAAGCCAGT-TTTCCATGAAACGATGTATTCAGCTGACTATGTTT-TTTTTGTCCCCGGTCAC-CCT-CAGG-GTCTCCTT-TG-TGTT--GGGTATCC-----ACTTTCGTGTCTGCTAT--TGCAGTGTT-T-CTAAA-TACCAAATATTGAAGTTAAATATGCCGATGCACTTC-TGACACCGTTTGTCGCTATCATCTG-TTCCTACTGC---AACGACGACACGCAGGTTTTATACATGGTTATAAATACCTAACTG---ACCTTGACCACGAATTG-AGA-TAGACTTCA-ACATGTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTCAACTG--TGCAATATGTCATCTACGATAAAAT--TATCCAATAAAA--CTAAA---ATC----A-GA--CAAATC-TGAA-C--TAATT--TGCAATTT--TACTTGGCTAC-TCAAA-AGAAGGATCT-AGGTG-----ACTTCCTTTAGTCA--T--TATCTG-CCTCCTAACTTCCA-TACTTTTGGAAGG-ATACAAGT-CGATTT----ACACTGATGTGT--------GTGTCAGTGCGT-------AAAATAACC-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ATGATCGTTCAAACTTTCCA-TGG-TTCGCCACAATATT-TAAAA-CAAA-TCTAGCCTG--CAATAAATGGT--GCTACTT-CC--AAC-T-T-AAAAA-CAT-CGGTTAGAATT--AGAAA---CTTCTA--TAGACCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGCCACTTATA-ATGTCT-CG---CCT-G-ACATATGCGAAAA--TG-CATCCTCCCTCACT--C-TGTTCCAAAGA--CAGAC-GTC-T-TTA-A-CTGAAACT-GCAAAA-AT-T---ACAG---AC--ACTGGTCT---------GCT----TCCGACAATA-----G-G--ACTGCGCTCTTC-CAACAAC--GACCATATTCA--C-CCC---TT--T-AATCT-CTC--ACAAT-TGGTCATTGCTA-CC-GTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-T-TAATAATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACAGTCT---G-CGT---GGC----CTGATC------TCCAGTTG-TACATC-CACGGACTTGT-GTCT-AATATTC---TAAC-CATCCGAACC-ACAG-T-CACTGCGAT-C----AGTA-TTATTCG-CCGAGTTT-G---TA--TAAG---TATACC----AAT-TGTGCGAGC-AA--AA-TG--TGA--TGGGGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGA--C------ACAGCTCTT--CCATTA-AACAC---C---TTCG-GT--TGAAAA--CATCGAA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AAATTAGAAT---ATACCGACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--TAT-AACC---T--A--TGGAA-GTACTGT--G----CTGAATTTGAACTCT--TTAATA----TTAAT-A-TT-AAAGACTTAACATTTT----T--TAT-CATTAATTGTGTAT--TG-AGCTAGC---------AAAAAGAG--------------AACCCCA-----AAA-AAAAT-----CC----C-C-------T-AATGC----TT---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TTGGTAGATTTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCCTGTTA--GGT-T--AACTTGTCATTTAAGCC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-TGGAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---AGGAGTATGATTC--TTAATTA--AAAAG-GCGCATATA-AATG-GCATGTAATGAATTAAATAATAA
gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGCTT-T-----------GGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TGC-----CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-GA-CACCTGGACCA-GAATTGCAGA-TATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----------AAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----Atat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---T--AA-T-GAA--CAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT--T--ATA----TCATT-A-TT-TAA-CCTAA-CTTCTT----TATTAT-CATTA-TAATG-GT--TG-ACATA-C---------ACAAAAAA--------------AA---AA-----AAATAAAAT-----------C-T-------A-AA--CAGCTTT---T------ATATGCAT-------------A----------AA-------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-NN-NN---NN--N-N-NNNN---N--AA-T-GAA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAATTTTTA----T--TAT-CATGA--TATG-AT--TG-A-TTA-C---------AAAAAAAA--------------AT---AA-----Aatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-AT-GC---TT--T-C-AACC---T--A--T-GAA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-ACTAA-CATTTTA---T--CAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C---------AAAAAAAA--------------AA---AA-----AAA-AAAAAAAAAACC----------------AA--C----TA---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TT-T-AGA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--T-G-A-ACACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACT-AACTTTTA----T--TAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C---------AAAAAAAA--------------AA---
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTATGGATT----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCT---TAGGGTA-ATTTTTGTTAAATA-TATAGG-GCGC-TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAAC-TTTT----A--TATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C---------CAAAAAAA--------------AC---AATCCCCAAA-AAAAC-----CC----CTC-------A-AAT-C----TT---ATATCATACA-CTATCCCCTAAGAGACAA----------AA-------TT-TT-GA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
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gi|18 : -------TT-TTAGG-TTTTATGCATT-TTTGGATTATTGCT----AGTTTG-----TA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATtccagcaagatcacagttca
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gi|23 : GCTCT---G-TGT---GAC----CT-ATC------TCCAGT-G-TACATC-CA-ATACTTG--GTC--AATA-TC---TA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT--TCAGCT-ACTATGTTT-TT---------GGGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCATGACAC-GTTTGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAAAAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-G-C-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AGT-CAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAATA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA-A-TTA---AAACAAA-TCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--C--GCCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--AC--ACTGA-CT---------GCT----T-CGAC-GTA-----GTG--ACT-CGCTCTTC-CAACCAC--GACCATATTCA--C-CCCCA-TT--T-AATNT-CTCT-ACAAT-TG------GCTA-CCTGTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TAAC-CATCC-AACC-ACGG-T-CACTGCGAT-C----AG-A-AGATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATTGAACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAACNTTTT----T--TAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C---------AAAA--AAAAAA-----AA-----AAAA---------------AAAN-----CCC-CAA-A--C----TT---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---TAGAGTA-AATTCT-TTAATTA-TATAGG-GCGCATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
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gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGCTT-T-----------GGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TGC-----CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-GA-CACCTGGACCA-GAATTGCAGA-TATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----------AAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----Atat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---T--AA-TG--AA--CAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT--T--ATA----TCATT-A-TT-TAA-CCTAA-CTTCTT----TATTAT-CATTA-TAATG-GT--TG-ACATA-C---------ACAA--AAAAAA------A-----AAAA---------------TAAA-----ATC-TAA-A--CAGCTTT---T------ATATGCAT-------------A----------AA-------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-NN-NN---NN--N-N-NNNN---N--AA-TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAATTTTTA----T--TAT-CATGA--TATG-AT--TG-AT-TA-C---------AAAA--AAAAAT-----AA-----Aatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-AT-GC---TT--T-C-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-ACTAA-CATTTTA---T--CAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C---------AAAA--AAAAAA-----AA-----AAAA---------------AAAAAAAAACC----A-A--C----TA---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TT-T-AGA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACT-AACTTTTA----T--TAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C---------AAAA--AAAAAA-----
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTATGGATT----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCT---TAGGGTA-ATTTTTGTTAAATA-TATAGG-GCGC-TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAAC-TTTT----A--TATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C---------CAAA--AAAAAC-----AATCCCCAAAA---------------AAAC-----CCCTCAA-AT-C----TT---ATATCATACA-CTATCCCCTAAGAGACAA----------AA-------TT-TT-GA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
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gi|18 : -------TT-TTAGG-TTTTATGCATT-TTTGGATTATTGCT----AGTTTG-----TA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATtccagcaagatcacagttca
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gi|22 : tatgtcatacatatcccctaagaagaca-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTTTAAAAAA-A--AAT--A-AAG---A--CCTACCT---T---TTTA---AAA-GT-GC---GT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--TACTGT--G----CTGAAATTT-ACTCT--T--ATA----TAATT-
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT--TCAGCT-ACTATGTTT-TT---------GGGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCATGACAC-GTTTGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAAAAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-G-C-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AGT-CAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAATA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA-A---TAAAA-CAAA-TCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--C--GCCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--AC--ACTGA-CT---------GCT----T-CGAC-GTA-----GTG--ACT-CGCTCTTC-CAACCAC--GACCATATTCA--C-CCCCA-TT--T-AATNT-CTCT-ACAAT-TG------GCTA-CCTGTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TAAC-CATCC-AACC-ACGG-T-CACTGCGAT-C----AG-A-AGATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATTGAACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAACNTTTT----T--TAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C-----------AAAAAAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAA-----CCC--CAAA--C----TT---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---TAGAGTA-AATTCT-TTAATTA-TATAGG-GCGCATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
gi|1 : TACGT-GTT-CATCACGA-ATTGTGTCTGCTATTAGATTTAGTTTATAATTCTTTGTGTTGGCCCTT-TTTTTGTGATTGC-------TCTAGACCTGTTCTGCCTTTCCGCCATTTC-GATGTG-TAGATCAC--AAGCATTTCTCATTGCCCCTTGTA-TGATAAT-ATTCTTATGGGAAATCTG----GCATC---GCGATTGA-CAT----GA---TT--CGT-GAT-G--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCATGTC---ATGACAAGT--GCTAAAAT-TGGTAAAAGCCAGT-TTTCCATGAAACGATGTATTCAGCTGACTATGTTT-TTTTTGTCCCCGGTCAC-CCT-CAGG-GTCTCCTT-TG-TGTT--GGGTATCC-----ACTTTCGTGTCTGCTAT--TGCAGTGTT-T-CTAAA-TACCAAATATTGAAGTTAAATATGCCGATGCACTTC-TGACACCGTTTGTCGCTATCATCTG-TTCCTACTGC---AACGACGACACGCAGGTTTTATACATGGTTATAAATACCTAACTG---ACCTTGACCACGAATTG-AGA-TAGACTTCA-ACATGTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTCAACTG--TGCAATATGTCATCTACGATAAAAT--TATCCAATAAAA--CTAAA---ATC----A-GA--CAAATC-TGAA-C--TAATT--TGCAATTT--TACTTGGCTAC-TCAAA-AGAAGGATCT-AGGTG-----ACTTCCTTTAGTCA--T--TATCTG-CCTCCTAACTTCCA-TACTTTTGGAAGG-ATACAAGT-CGATTT----ACACTGATGTGT--------GTGTCAGTGCGT-------AAAATAACC-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ATGATCGTTCAAACTTTCCA-TGG-TTCGCCACAATATT-TAAAA-CAAA-TCTAGCCTG--CAATAAATGGT--GCTACTT-CC--AAC-T-T-AAAAA-CAT-CGGTTAGAATT--AGAAA---CTTCTA--TAGACCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGCCACTTATA-ATGTCT-CG---CCT-G-ACATATGCGAAAA--TG-CATCCTCCCTCACT--C-TGTTCCAAAGA--CAGAC-GTC-T-TTA-A-CTGAAACT-GCAAAA-AT-T---ACAG---AC--ACTGGTCT---------GCT----TCCGACAATA-----G-G--ACTGCGCTCTTC-CAACAAC--GACCATATTCA--C-CCC---TT--T-AATCT-CTC--ACAAT-TGGTCATTGCTA-CC-GTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-T-TAATAATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACAGTCT---G-CGT---GGC----CTGATC------TCCAGTTG-TACATC-CACGGACTTGT-GTCT-AATATTC---TAAC-CATCCGAACC-ACAG-T-CACTGCGAT-C----AGTA-TTATTCG-CCGAGTTT-G---TA--TAAG---TATACC----AAT-TGTGCGAGC-AA--AA-TG--TGA--TGGGGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGA--C------ACAGCTCTT--CCATTA-AACAC---C---TTCG-GT--TGAAAA--CATCGAA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AAATTAGAAT---ATACCGACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--TAT-AACC---T--A--TGGAAG--TACTGT--G----CTGAATTTGAACTCT--TTAATA----TTAAT-A-TT-AAAGACTTAACATTTT----T--TAT-CATTAATTGTGTAT--TG-AGCTAGC-----------AAAAAGAGAACCC--CA----AAAA---------------AAAT-----CCC--CTAATGC----TT---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TTGGTAGATTTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCCTGTTA--GGT-T--AACTTGTCATTTAAGCC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-TGGAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---AGGAGTATGATTC--TTAATTA--AAAAG-GCGCATATA-AATG-GCATGTAATGAATTAAATAATAA
gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGCTT-T-----------GGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TGC-----CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-GA-CACCTGGACCA-GAATTGCAGA-TATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----------AAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----Atat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---T--AA-TG--AA--CAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT--T--ATA----TCATT-A-TT-TAA-CCTAA-CTTCTT----TATTAT-CATTA-TAATG-GT--TG-ACATA-C-----------ACAAAAAAAA------A----AAAA---------------TAAA-----ATC--TAAA--CAGCTTT---T------ATATGCAT-------------A----------AA-------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-NN-NN---NN--N-N-NNNN---N--AA-TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAATTTTTA----T--TAT-CATGA--TATG-AT--TG-A-TTA-C-----------AAAAAAAAAT-----AA----Aatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-AT-GC---TT--T-C-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-ACTAA-CATTTTA---T--CAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C-----------AAAAAAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAAAAAAACC-----AA--C----TA---A------ACA-GCAT-------------A----------AA-------TT-T-AGA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACT-AACTTTTA----T--TAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C-----------AAAAAAAAAA-----
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTATGGATT----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCT---TAGGGTA-ATTTTTGTTAAATA-TATAGG-GCGC-TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAAC-TTTT----A--TATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C-----------CAAAAAAAAC-----AATCCCCAAA---------------AAAA-----CCCCTCAAAT-C----TT---ATATCATACA-CTATCCCCTAAGAGACAA----------AA-------TT-TT-GA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
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gi|18 : -------TT-TTAGG-TTTTATGCATT-TTTGGATTATTGCT----AGTTTG-----TA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATtccagcaagatcacagttca
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gi|21 : atcattacattgtatctgcattagatgggtttttttgtggcccttgtgatgctcgaccattccgccccctatgagtccgt-------------A----------AA-------AT-TTAGG-TTTTATGGATT-TTGGG---ATTGCT------TTTTCTTTTTA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGAATGTTGTATTT-T
gi|22 : tatgtcatacatatcccctaagaagaca-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTTTAAAAAA-A--AAT--A-AAG---A--CCTACCT---T---TTTA---AAA-GT-GC---GT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--TACTGT--G----CTGAAATTT-ACTCT--T--ATA----TAATT-
gi|23 : GCTCT---G-TGT---GAC----CT-ATC------TCCAGT-G-TACATC-CA-ATACTTG--GTC--AATA-TC---TA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT--TCAGCT-ACTATGTTT-TT---------GGGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCATGACAC-GTTTGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAAAAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-G-C-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AGT-CAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAATA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA-A-TTA---AAACAAA-TCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--C--GCCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--AC--ACTGA-CT---------GCT----T-CGAC-GTA-----GTG--ACT-CGCTCTTC-CAACCAC--GACCATATTCA--C-CCCCA-TT--T-AATNT-CTCT-ACAAT-TG------GCTA-CCTGTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TAAC-CATCC-AACC-ACGG-T-CACTGCGAT-C----AG-A-AGATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATTGAACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAACNTTTT----T--TAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAA--AAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAACC---C--CAA--C----TT---A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---TAGAGTA-AATTCT-TTAATTA-TATAGG-GCGCATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
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gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGCTT-T-----------GGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TGC-----CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-GA-CACCTGGACCA-GAATTGCAGA-TATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----------AAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----Atat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---T--AA-TG--AA--CAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT--T--ATA----TCATT-A-TT-TAA-CCTAA-CTTCTT----TATTAT-CATTA-TAATG-GT--TG-ACATA-C----------ACAA--AAAAAA------A----AAAAT--------------AAAATC---T--AAA--CAGCTTT---T------A-TATGCAT-------------A------AA-------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-NN-NN---NN--N-N-NNNN---N--AA-TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAATTTTTA----T--TAT-CATGA--TATG-AT--TG-A-TTA-C----------AAAA--AAAAAT-----AA----Aatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-AT-GC---TT--T-C-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-ACTAA-CATTTTA---T--CAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAA--AAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAAAAAAAC--CAA--C----TA---A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-T-AGA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACT-AACTTTTA----T--TAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C----------AAAA--AAAAAA-----
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTATGGATT----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCT---TAGGGTA-ATTTTTGTTAAATA-TATAGG-GCGC-TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAAC-TTTT----A--TATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C----------CAAA--AAAAAC-----AATCCCCAAA---------------AAAACC---CCTCAAATC----TT---ATATCATA-CA-CTATCCCCTAAGAGACAA------AA-------TT-TT-GA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
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gi|18 : -------TT-TTAGG-TTTTATGCATT-TTTGGATTATTGCT----AGTTTG-----TA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATtccagcaagatcacagttca
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gi|22 : tatgtcatacatatcccctaagaagaca-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTTTAAAAAA-A--AAT--A-AAG---A--CCTACCT---T---TTTA---AAA-GT-GC---GT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--TACTGT--G----CTGAAATTT-ACTCT--T--ATA----TAATT-
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gi|3 : ACGT-GTTTCATGACGACATTGTGTCTGC--TTAGATGGAG---A-AATTCTATGTGT-GGTCCGTAT----GTGAT-GCCTTTCGATC--GGCCT-AT-TGTC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCACGAAA-CATGTCTCATTGGTC---G-A-TGG-AATGATTCTTATG-AATATCTG----GGATCCAAGTCATTGG-CAT----GG---TT--TTA-GATCA--TA---TCATCTGCGTGGTCGCACA-GTC---A--GCAAGC-------AAT-TGG--GAA--CAGT-TTCC--TG---CGATGTA-TCAGCT-A--ATGCTTATT---------GGGCGTTCCCGCAGG-G----GTC-TC-AGTG--GCG-A-TCCAACAACT-----GTCT-ATAC--CGCA-TATT-TTCTAAAGC-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCAGAACAT-GTTT----TTATCA-CTGATT---A-TGCTCCG-CGAAG-CACGCAGAT---ATACATGGTT-TAAA-ACTTA-C-GAACACCTGGACCA-GATATGCAGAATATACTGCAGACA-GT-TTCTCTCAAGATAT----AAGCTC---TGG-TGCAA---GT------------AAA--TATCC--TAAAAACTT-AA---ATC----AGGA---AAAAC-TGAAAC--T-AT---T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----ACT-CT------TAAGG--TGTC---------AACT--CA-CA-TTCTGGAAGGAAT-C-AGT--AA-TT----ATC---A---GT--------GTGTC-GTGCG--------AAAACA--C---TGG-TGTTTCTTTGTA---------GC-ATCGT-----CTTTCCA-TGGA-TCCCCAAAA-----G---AAAC--A-TCTA----GGTCA--AAAT-GT--GCTACTTCCC--AAC-T-TAAAAAAGCAT-CGG-TAGAAAG--AGGAA---CTTTCAATC--ACCGAAT-GACGCG-TGT----CGAAAAC-AAGT-CAATCAGGGTCATTGGTGTATGTCT-CGAGCCTT-G-ACCTACG---AAATTTG-CC-ACTCCTCTACT--CATGTT---GAAA--AGA-C-AAA-TATTA-A-C-GAAGCTAACCAAA-ATGT---ACAGA--AC--ACT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTTGATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT--TCAGCT-ACTATGTTT-TT---------GGGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCATGACAC-GTTTGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAAAAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-G-C-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AGT-CAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAATA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA-A---TAAAA-CAAA-TCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--C--GCCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--AC--ACTGA-CT---------GCT----T-CGAC-GTA-----GTG--ACT-CGCTCTTC-CAACCAC--GACCATATTCA--C-CCCCA-TT--T-AATNT-CTCT-ACAAT-TG------GCTA-CCTGTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TAAC-CATCC-AACC-ACGG-T-CACTGCGAT-C----AG-A-AGATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATTGAACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAACNTTTT----T--TAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAA--AAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAACC---C--CAA--C----TT---A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---TAGAGTA-AATTCT-TTAATTA-TATAGG-GCGCATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
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gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGCTT-T-----------GGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TGC-----CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-GA-CACCTGGACCA-GAATTGCAGA-TATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----------AAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----Atat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---T--AA-TG--AA--CAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT--T--ATA----TCATT-A-TT-TAA-CCTAA-CTTCTT----TATTAT-CATTA-TAATG-GT--TG-ACATA-C----------ACAA--AAAAAA------A----AAAAT--------------AAAATC---T--AAA--CAGCTTT---T------A-TATGCAT-------------A------AA-------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-NN-NN---NN--N-N-NNNN---N--AA-TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAATTTTTA----T--TAT-CATGA--TATG-AT--TG-AT-TA-C----------AAAA--AAAAAT-----AA----Aatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-AT-GC---TT--T-C-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-ACTAA-CATTTTA---T--CAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAA--AAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAAAAAAAC--CAA--C----TA---A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-T-AGA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACT-AACTTTTA----T--TAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C----------AAAA--AAAAAA-----
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTATGGATT----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCT---TAGGGTA-ATTTTTGTTAAATA-TATAGG-GCGC-TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAAC-TTTT----A--TATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C----------CAAA--AAAAAC-----AATCCCCAAA---------------AAAACC---CCTCAAATC----TT---ATATCATA-CA-CTATCCCCTAAGAGACAA------AA-------TT-TT-GA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
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gi|18 : -------TT-TTAGG-TTTTATGCATT-TTTGGATTATTGCT----AGTTTG-----TA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATtccagcaagatcacagttca
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gi|22 : tatgtcatacatatcccctaagaagaca-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTTTAAAAAA-A--AAT--A-AAG---A--CCTACCT---T---TTTA---AAA-GT-GC---GT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--TACTGT--G----CTGAAATTT-ACTCT--T--ATA----TAATT-
gi|23 : GCTCT---G-TGT---GAC----CT-ATC------TCCAGT-G-TACATC-CA-ATACTTG--GTC--AATA-TC---TA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT--TCAGCT-ACTATGTTT-TT---------GGGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCATGACAC-GTTTGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAAAAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-G-C-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AGT-CAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAATA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA-A-TTA---AAACAAA-TCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--C--GCCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--AC--ACTGA-CT---------GCT----T-CGAC-GTA-----GTG--ACT-CGCTCTTC-CAACCAC--GACCATATTCA--C-CCCCA-TT--T-AATNT-CTCT-ACAAT-TG------GCTA-CCTGTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TAAC-CATCC-AACC-ACGG-T-CACTGCGAT-C----AG-A-AGATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATTGAACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAACNTTTT----T--TAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAA--AAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAACC---C--CAA--C----TT---A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---TAGAGTA-AATTCT-TTAATTA-TATAGG-GCGCATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
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gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGCTT-T-----------GGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TGC-----CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-GA-CACCTGGACCA-GAATTGCAGA-TATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----------AAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----Atat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---T--AA-TG--AA--CAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT--T--ATA----TCATT-A-TT-TAA-CCTAA-CTTCTT----TATTAT-CATTA-TAATG-GT--TG-ACATA-C----------ACAA--AAAAAA------A----AAAAT--------------AAAATC---T--AAA--CAGCTTT---T------A-TATGCAT-------------A------AA-------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-NN-NN---NN--N-N-NNNN---N--AA-TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAATTTTTA----T--TAT-CATGA--TATG-AT--TG-A-TTA-C----------AAAA--AAAAAT-----AA----Aatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-AT-GC---TT--T-C-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-ACTAA-CATTTTA---T--CAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAA--AAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAAAAAAAC--CAA--C----TA---A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-T-AGA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACT-AACTTTTA----T--TAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C----------AAAA--AAAAAA-----
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTATGGATT----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCT---TAGGGTA-ATTTTTGTTAAATA-TATAGG-GCGC-TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAAC-TTTT----A--TATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C----------CAAA--AAAAAC-----AATCCCCAAA---------------AAAACC---CCTCAAATC----TT---ATATCATA-CA-CTATCCCCTAAGAGACAA------AA-------TT-TT-GA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
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gi|18 : -------TT-TTAGG-TTTTATGCATT-TTTGGATTATTGCT----AGTTTG-----TA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATtccagcaagatcacagttca
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gi|22 : tatgtcatacatatcccctaagaagaca-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTTTAAAAAA-A--AAT--A-AAG---A--CCTACCT---T---TTTA---AAA-GT-GC---GT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--TACTGT--G----CTGAAATTT-ACTCT--T--ATA----TAATT-
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gi|3 : ACGT-GTTTCATGACGACATTGTGTCTGC--TTAGATGGAG---A-AATTCTATGTGT-GGTCCGTAT----GTGAT-GCCTTTCGATC--GGCCT-AT-TGTC---CCGCC--TTT-GATGTGATAGATCACGAAA-CATGTCTCATTGGTC---G-A-TGG-AATGATTCTTATG-AATATCTG----GGATCCAAGTCATTGG-CAT----GG---TT--TTA-GATCA--TA---TCATCTGCGTGGTCGCACA-GTC---A--GCAAGC-------AAT-TGG--GAA--CAGT-TTCC--TG---CGATGTA-TCAGCT-A--ATGCTTATT---------GGGCGTTCCCGCAGG-G----GTC-TC-AGTG--GCG-A-TCCAACAACT-----GTCT-ATAC--CGCA-TATT-TTCTAAAGC-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCAGAACAT-GTTT----TTATCA-CTGATT---A-TGCTCCG-CGAAG-CACGCAGAT---ATACATGGTT-TAAA-ACTTA-C-GAACACCTGGACCA-GATATGCAGAATATACTGCAGACA-GT-TTCTCTCAAGATAT----AAGCTC---TGG-TGCAA---GT------------AAA--TATCC--TAAAAACTT-AA---ATC----AGGA---AAAAC-TGAAAC--T-AT---T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----ACT-CT------TAAGG--TGTC---------AACT--CA-CA-TTCTGGAAGGAAT-C-AGT--AA-TT----ATC---A---GT--------GTGTC-GTGCG--------AAAACA--C---TGG-TGTTTCTTTGTA---------GC-ATCGT-----CTTTCCA-TGGA-TCCCCAAAA-----G---AAAC--A-TCTA----GGTCA--AAAT-GT--GCTACTTCCC--AAC-T-TAAAAAAGCAT-CGG-TAGAAAG--AGGAA---CTTTCAATC--ACCGAAT-GACGCG-TGT----CGAAAAC-AAGT-CAATCAGGGTCATTGGTGTATGTCT-CGAGCCTT-G-ACCTACG---AAATTTG-CC-ACTCCTCTACT--CATGTT---GAAA--AGA-C-AAA-TATTA-A-C-GAAGCTAACCAAA-ATGT---ACAGA--AC--ACT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGAG---A-AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGATTGC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTTGATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--TAA-GATCA--TA---TCTTCT-C-TGG-CTCGCA-GTC---A--GCAGGTTTGC--AAAT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC--TGAG-CGATGT--TCAGCT-ACTATGTTT-TT---------GGGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCATGACAC-GTTTGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAAAAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGATC--T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ANAAGAATCC-AGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-G-C-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AGT-CAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCGT-------AAAATA--C-TTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA-A---TAAAA-CAAA-TCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--C--GCCGGATGGACGCGTTGT----CG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACTTGTA-ACGTCT-CG---CCT-G-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-CCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA--AC--ACTGA-CT---------GCT----T-CGAC-GTA-----GTG--ACT-CGCTCTTC-CAACCAC--GACCATATTCA--C-CCCCA-TT--T-AATNT-CTCT-ACAAT-TG------GCTA-CCTGTT-A-TTTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTTG-TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TAAC-CATCC-AACC-ACGG-T-CACTGCGAT-C----AG-A-AGATTCG-T--AGTTT-G---TA--TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A-ACCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATTGAACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAACNTTTT----T--TAT-CATTAATTGTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAA--AAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAACC---C--CAA--C----TT---A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGATT-TTTGG-TTATTGTT----CGTTTGCTTGTTA--GGT-T--AGCTTGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---TAGAGTA-AATTCT-TTAATTA-TATAGG-GCGCATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
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gi|10 : acgAAA--CAGT-TTCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGCTT-T-----------GGCGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCATGACAT-GTTT-----TATCA-CTG-TT---A-TGC-----CGACGACACGCAGAT---ATACATGGTTATAAA-ACCTTAC-GA-CACCTGGACCA-GAATTGCAGA-TATACTGCA-ACA-GTGT-CTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC-----------AAA--TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA-C--TGA----T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----Atat
gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgcggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GA-TCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AAG---A-GCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---T--AA-TG--AA--CAC-GTA-G----CT--AATTGGACTCT--T--ATA----TCATT-A-TT-TAA-CCTAA-CTTCTT----TATTAT-CATTA-TAATG-GT--TG-ACATA-C----------ACAA--AAAAAA------A----AAAAT--------------AAAATC---T--AAA--CAGCTTT---T------A-TATGCAT-------------A------AA-------T
gi|12 : aaAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A-CAC---C---TACG-GT--TAGNNN--NNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-N--NNNNNN-NNN---N-NNNNNNNN---N---NNNN---NNN-NN-NN---NN--N-N-NNNN---N--AA-TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATT-AAGTCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAATTTTTA----T--TAT-CATGA--TATG-AT--TG-AT-TA-C----------AAAA--AAAAAT-----AA----Aatcctaaggagtactcggatgtttgatatgctggtttttttggacattacagtgattgcgtttgatacttg
gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TT-----AAA-AT-GC---TT--T-C-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGTAATTGA---CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-ACTAA-CATTTTA---T--CAT-CAT-AAT-GTG-AT--TG-ACCTA-C----------AAAA--AAAAAA-----AA----AAAA---------------AAAAAAAAAC--CAA--C----TA---A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-T-AGA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTG----CGTTTGCCTGT----GGG-T--AACTT-TCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : AA---TGT-CC----AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AAG---A--CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAATTTG-ACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACT-AACTTTTA----T--TAT-CA-TAA-TGTG-A---TG-A-CTA-C----------AAAA--AAAAAA-----
gi|15 : gaaaattacagtgatgttT-TTAGG-TTTTATGGATT----GA-TTTATGTT----C-TTTGCTTGT----GATCT--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCT---TAGGGTA-ATTTTTGTTAAATA-TATAGG-GCGC-TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaACTCT--T--ATA----TAATT-A-TT-AAA-ACTAAAC-TTTT----A--TATACA-TAA-TATG-AT--TG-A-CTA-C----------CAAA--AAAAAC-----AATCCCCAAA---------------AAAACC---CCTCAAATC----TT---ATATCATA-CA-CTATCCCCTAAGAGACAA------AA-------TT-TT-GA-TTTTATGGATT-TTTGG---ATTGTTGATACCTTTGCT
gi|17 : tgCTTACGAAAGATTTGAGGAG-ATA--AAGCATTGGACAT----AGCAATTCCTACCGATCAAATA---TCT-CT-C-TGG-C-CGCA-GTC---A--GCAGG-TTGC--AAAT-TGGTGAAA--ccctttggtggtaattcctttaactg
gi|18 : -------TT-TTAGG-TTTTATGCATT-TTTGGATTATTGCT----AGTTTG-----TA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATtccagcaagatcacagttca
gi|2 : cagtgtttcacaaacacatcttgttCTTCTCA--ATATTATTAAGCTC--CTGGATGCA----GTCAAA-----CAAAAAATTATTC--TAAAAT-CT-AAGCTATCCAAAAAGAGCCAAATCATGAA-TCTTGATCCTT-CATTTTATTGCT------CGCCAGACAGAAAAATTTTAGGTGTATCCATATCC------TA--G--ATTC-GGC-----AACT--CATCA-TTT--GA--G-AT-C-AGTTCAA-TTGACAACA---A---GCTCGATATAGTCCC-GTGTGTTTTAAAAAAAAAA--CCTTTGGTTGTTTTTTT-TATTCAGCTAGAC-ATC-TTC--A-TTTCCACTGGATTCCCCAAAA-AATATAAAAACAAAATCTA----T--CA--TAATTGTTGGCTACTT-CTCAAAC-TATAAAAAA-CAT-CCGGGAGATCT--AGAAATATCTTATA--A--CCCAG-TG-ACTC-TTGCTCTCCG--AA---A-TAC-ATCAGT-TCACTTGTA-A-GTCTTCC---CCT-CTACTAACGTAGATA--TGACA-TCATATCTACTTGC-TGTT---AAAATCCAG-C-GTC-T-TAA-AAC-AAAGCT-GCAAAATAT-TTCCACGAACTACCCACCAA-CTCCGTCACACACTAAGCT-CAGC-GTACTAAGGTGGAACT-CTCGCTTCGCGACCACACGACC-TAATCAAACACCCCA-CTATC-AATCT-CTCT-ACACCCTG------GCTAACCTATTTA-CTTCCG-AAGTATCAG-TACAA-AATCCTATGTTAGATATCCTTCAA-A--CTCTAGAG-CGTAAGGGCTTTTCT-ATCAATCAATCCAGTGA-CA-ATCTCA-GAGC-TGAAATCAAAATA-CCTCTTATCACATTC-ACCCAACAA-T-AACTTCGATAC----AG-ATAGA-TCG----AG--A-G---TA--AAAA---GATACTACCAAAT-TAT-CGAAC-AAAGAA-CG--TCACTCAGAAGACACGCGCGAGCTAATTGAAATG--GGGCACTGCCTAAT-CAAG-AACCTAGTCTTGATAG--AGAGAGCAAAG-TCTTCCCCA-GA-TAGAC---CGCTTTCGCGT--TTGAAAATTAGC-AACTCTG---TTCT-AAAAAG-A--AATTTA-AAA---G-A-CTACTTATGT---TCCACCCAAA-GT-GCGTATTCCC-T-GACCACGT--A---G--AACGCACTGA--GCCGCCTGAATGTGGACTC---C--ATAGGAGTGATT-AGTT-AAA-ACTAAACACATTGTAAT--TAT-CATCAA-TGTG-ATAGTGAAGATA-C----------AAAA--AAAAAACAAAGAA----AAAAGAAAGAAAAAAATACAAAACC---G--CAA--C----TTATAA------G-CA-GCATA------------A------AA-------TT-CTAGA-GATTAATGATTATTTGG--GATTG-T----CAGTTGC--ATTAGTGGTATAAAACT--TCA-T---GTCAACTGA-CGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTT-AAT-ATTA-T-GGAC--A-TTAATGTAAAGCGCCTCCGTAGAG---AATTCT-TTAATTACTATAGGCGCGTACCTATAATGTGCAT-ct
gi|20 : ATCATTACATTGTATCTGC-ATTAGATGG--------GTTTTTT-TGT-GGCCC-T-T----GTGA-TGC-------TC--GACCA-TTCCGCC---CCa
gi|20 : ATCTG----A-ATC--AGC-ATTGG-CAT----GG---TT--T-A-GATctatgagtccgtatctgaatcagcattggcatggtttagat
gi|21 : atcattacattgtatctgcattagatgggtttttttgtggcccttgtgatgctcgaccattccgccccctatgagtccgt-------------A------AA-------AT-TTAGG-TTTTATGGATT-TTGGG---ATTGCT------TTTTCTTTTTA--G-T-T--AGCT-GTCATT---GTC-ACTGAATGTTGTATTT-T
gi|22 : tatgtcatacatatcccctaagaagaca-GT--TTGAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTTTAAAAAA-A--AAT--A-AAG---A--CCTACCT---T---TTTA---AAA-GT-GC---GT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--TACTGT--G----CTGAAATTT-ACTCT--T--ATA----TAATT-
gi|23 : GCTCT---G-TGT---GAC----CT-ATC------TCCAGT-G-TACATC-CA-ATACTTG--GTC--AATA-TC---TA
gi|23 : aaATTCG-----GTTTTG---T---TAAA---TATAGC----ATT-TGTGCGGACAAA--AA-TG--T-A--TGGTGttcggttttgttaaatatagcatttgtgcggacaaaaatgtatggtg
gi|25 : aagctctgtgtgacctatctccagtgtacatccaatacttggtcaatatctATGTTT-T-----------GGCGTTCCG--AGA-G----CTCCTGCTGTTTGAGG-A-CC-----A-------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-
gi|26 : acgctgTGCTTGT----GGT-T--AACT-GTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-
gi|27 : CTACT--C-TGTT---AAAA--CAA-C-GTC-T-TTA-A-C-GAAGCT-ACAAAA-TG-T---ACAGA--AC--ACTCA-CT---------GCT----T-
gi|28 : CC--TTTGATGTGATAGATCAC--AA-CGTT-CTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGga
gi|29 : AAAA------AA----AAAA---------------ACAACC---C--CAA--C----TTA--A------A-CA-GCAT-------------A------AA-------TT-TTAGA-TTTTATGGAT
gi|3 : ACGT-GTTTCATGACGACATTGTGTCTGC--TTAGATGGAG---A-AATTCTATGTGT-GGTCCGTAT----GTGAT-GCCTTTCGATC--GGCCT-AT-TGTC---CCGCC--TTTGATGTGATAGATCACGAAA-CATGTCTCATTGGTC---G-A-TGG-AATGATTCTTATG-AATATCTG----GGATCCAAGTCATTGG-CAT----GG---TT--TTA-GATCA--TA---TCATCTGCGTGGTCGCACA-GTC---A--GCAAGC-------AAT-TGG--GAA--CAGT-TTCC--TG---CGATGTA-TCAGCT-A--ATGCTTATT---------GGGCGTTCCCGCAGG-G----GTC-TC-AGTG--GCG-A-TCCAACAACT-----GTCT-ATAC--CGCA-TATT-TTCTAAAGC-CCA----TTGGTGT--AATACGCCGACG----TCAGAACAT-GTTT----TTATCA-CTGATT---A-TGCTCCG-CGAAG-CACGCAGAT---ATACATGGTT-TAAA-ACTTA-C-GAACACCTGGACCA-GATATGCAGAATATACTGCAGACA-GT-TTCTCTCAAGATAT----AAGCTC---TGG-TGCAA---GT------------AAA--TATCC--TAAAAACTT-AA---ATC----AGGA---AAAAC-TGAAAC--T-AT---T-CATTTT--TGCT------C-CCAAA-ATAAGA--CC-AGGTG-----ACT-CT------TAAGG--TGTC---------AACT--CA-CA-TTCTGGAAGGAAT-C-AGT--AA-TT----ATC---A---GT--------GTGTC-GTGCG--------AAAACA--C---TGG-TGTTTCTTTGTA---------GC-ATCGT-----CTTTCCA-TGGA-TCCCCAAAA------GAAA-C--A-TCTA----GGTCA--AAAT-GT--GCTACTTCCC--AAC-T-TAAAAAAGCAT-CGG-TAGAAAG--AGGAA---CTTTCAATC--ACCGAAT-GACGCG-TGT----CGAAAAC-AAGT-CAATCAGGGTCATTGGTGTATGTCT-CGAGCCTT-G-ACCTACG---AAATTTG-CC-ACTCCTCTACT--CATGTT---GAAA--AGA-C-AAA-TATTA-A-C-GAAGCTAACCAAA-ATGT---ACAGA--AC--ACT
gi|30 : cacgtgcaatatctgcatactcgccgcttgatcacgcgtcaaccgggaaactggcccctagagcta----AAGCTC--CTGGATACA----GTT--------C---AA--CATCC--TAAAT--CT-AA---ATC----AGGcctg
gi|4 : --AA-CATT-CTAATTGGCC---GTA-TGG-AAT-AT-------------CTG----G-ATC--AAC-ATTGG-CAT----GG---CT--TA--GATCA--TA---TCT-CT-C-TGG-C-CGCA-GTC---A--GCAG-TTTGC--TA-T-TGGTAAGA--CAGT-TCCC----AG-CGATGT--TCAGCT-A---TGTTT-TT---------G--TGTTCCC-CAGG-G----CTC-TG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TT--TGTGAAATATGCCGACG----TCATGACA-----TGT-GCTATCA-CTG-TT---A-TGC---A--GACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACTTAAC-GA-CACCTTGACCA-GATTTGCAGA-TAGACTTCA-ACA-GTG-CCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------CAA-----TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA--------C--T-GATCT---------------------------------GGTG-----ACTTCT------CA--GATTGTC---------AACT--CA-CA-TTT--GGAGG-AT-C-AGT-CA--TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCAT-------CAAAT----------------CTTTG-----------ACAA--------A-TCTC-------TTCCC---AA-A---TAAAA-CA---TCTA----GT-CA--AAAT-GT--GTTATTT-CC--AACGT-TAAAA---CATTCGGTTAGAAGTTAAGAAA---CTTC-A--T--G----ATGG---CGTAGT-----G--AACCAA-T-C-ATCAGG-TCACTTGTA------------------------CGCGAAAT--TG-CA-CCTTCCCT--------GTT---AAAA--CAG-C-GTT-T-TTA-G-C-AAAGCT-GGCAAA-ATGT---ACAGA--AC--ATTG--CT---------GCT------CGAC--TA-----GTG--AC--CGCTCTTC-CAAC-AC--AACCATAT-AA--C-TCCCA-TT--TTAATTT-CTCT-ACA-T-TG------GCTA-CC------------G-AA-T-TCAA-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTTTA-AAGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAGTT--TACATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---T-AC-CATCC-AA-C-AAGG-T-CACTGCGAT-C-----G-A-AAATTTG-T---TTTT-GTTTTA--GAAA---TATACC----AAT-TGTGC-------------------------GGACAGGCGC-------TT----TG--ATG-----CTTCAT-CAGC-A----AGTC-TG-TGG--A------ACAG-TCTT--CC--AA-AACAC---C---TTC
gi|5 : gCGGAAA--TG-CA-C-TCCTCTATT--C-TGTT---AAA---CAG-CCGTC-T-TTAGA-C-AAAAGC-GCAAAA-TG-T---ACG-A--AC--ACTG--CT---------GCT------CGAC--TA-----GTG--ACT-AGCTTCTT-CAAACAC--GACCATAT-CA--C-TCTCA-TT--T-TATGT-CTCT-ACA-T-TG------GCTA-CCTGTT-ACTTTCCA-AA-T-TCAGATACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CGTTCAA-A-GCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATT------TCCAGT-G-TATATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TC---TA---CATCC-AACA-AGAG-TTCATTGCGAT-C----AG-A-AGACTC-----AGTTT-G---T---TAAA---TATACC----AAT-TGTGCGGACCAA--AA-TG--TGA--TGGTGT-TAGGC-C-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGACTT--TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-A---C---C---TACG-GT--TTAAAA--CATC-AA-TCTGTGTTTTG-AAAAGA-A--AATTTA-AAG---A--CCTACCT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---TGAA--TG--AA--CACTGT--G----CTGAAATTAA--TCT--T--ATA----TAATT-A-CT-AAA-ACTAAA-TTTTA----T--TAT-CATGA--TATG-AT--TG-ATTTA-C----------AAAA--AA----------------AAA---------------TAAACA---G--CAT--T----TT---AT-----ATCATACAT-------------ATCCACTAAGATTTTTTT-TTAGC-TTTTATGGA-T-TTTGG---ATTGTT-----GTTTGCTTGT----AGT-T--AGC-TGTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATATTTTAATAACTTAT-TAATTACGTTTATGTAA
gi|6 : taGTCACT-GTA-ACATCT-CG---CCTTG-ACTAA---GAAAA--TG-CA-CT--CCCTACT--A-TGTT---AAAA--CAG-CCGTCAT-TTA-A---GAAGTT-GCAAAA-AT-T---ACAGA--AC--ACTG--CT---------GC-----T-CGACTATA-----GTA--ACT-CGCTCTTC-CAAACAC---ACCATA-TCA--C-CCCCATTT--T-AATATCCTCTAACCAT-TG------GCTA-CC-GT----TTTCCGCCA-T-TAAA-TACAC-AATACTA-G-TAAATC-TTTTCAACACGCTCT---GCCTT---GGC----CT-ATA------TCCAGTTGTTAAATC-CA-GGACTT---GTC--A--A-TC---TA---TATCC-AA-C-ATGGCT-CACTGC-AT-CAAAGAA-A-AGATTCGTT--TCTTT-T---TACCTGAACTCTATACC----AACATGTGC-GAC-AA--AA-AGCAT-A--TAGTTGACAGGCTCT------TT----TG--ATCT----GTTTATCCAGC-A----AGTAT---TGG--G------ACAG-TCTT--CCC-AATAAGACTATT---TTCG-GGAATAAAAC--TACC-AA-TCCCTTTGTTT-AAAAAA-AATAACTTA-AAACATA-ACACATTT---TGAATCTA---AAA-AT------TT--T-T-
gi|7 : TACGTTGTT-CATCACGACTATGTGTCTGC-ATTAGATG--G---A-AATTC--TGTGT-G--CCCT-T----GTGA-TGC-------TG--GACCT-TTCTG-----CCGCCT-TTTGAT-TGATAGATCAC--AA-CA-TTCTCATTGGCC---GTACTGG-AAT-ATTCTTATGGAAGATCT-----G-ATC--AG-CATTGG-CATTCGGGA---TT--TAA-GATCAGCTAGAGTCATTC-A-TGG-CTCGCA-GTCTCGA--GCAGGTTTGC--ATATGTGGTAAAA--CAGTCTTCC--TGA--CGAT------AGCC-ACTATGTTT-T-----------GGCGTTCCC-AAGGAG----CTC-TT-TGAT--GGG-A-CC-----AC------GATC-TTACTGTGCA-TATTGTTTCAAG-C-ca
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blockSeqs : T T A GAGA TTT . G AT TGCCTTTCGA . . C . T GA . T . C . G A G AGGAG CAAGTC A TCGG CAA CCTACC AA GAG T GCG TCG . TCGA TTT AAA G . C TGA A ACT A TG T GC A . C C TG . . CAACAACT . TG . G G . . GT GA . AT TGTTTT . A . . TCCGC A . A . A . AA G . A C A T G G . GT A TATT . A GTCAAACAAAAAAT . AC . GCT CAAA G GC A A TCTTGATCCT . TAT CGCCAGACAGAAAAATTTT TATCC T TAGATTCGGC . T . TG A A . . TCAATTGACAACAAGCTCGATATA . TTTTAAAAAAAAAACCTT T TATTCAGCTAGACATCTTCA C C AT C A AATA A AAAA GGT . T TG C CA TA A AAG T G C TA TAT AT ATCACCGAATGACGCGTGTCGAA CC TA A G T TATGTCTCGAGCCTTG TA C T TT A TCA TGC . TC . C A A G AC A TATTTCC G CT CC ACTCCGTCACACACTAAGCTCAGCGTACTAAG GA T G C ACG AT AA A T ATC C C TA CCC . A TATTTA C G A A . T T T A C A AGA C AAG TTTT . AATCAA TGT C T . AA AA . TCTTATCA . CCA C C T A AAAGAA T T TTTCTTTTTACC CTC ACCA A G A AG A CAT CT AG C GAGCTAA GAAA CA ACTGCC G C ACCT TGA AGAGAGC . CC G TAAG CGCT C AA A AT T C T G AT A . CATAA ATG GAA CCC A T GTA CC . T ACG GA AC . CG AT CCGC G GGA AT . GGAG T G T . ATT GTAAT A TTATA . AG A CA . GAAAAAAAAA AA ACAAAGAA GAAAGAAAAAAATACAAAACCGCAACTTATAA T T CCCCTAAGAGACAA GATTTTT . . A ATT GATACC C TAGT G C AA TT . A C G A . TACG G CCG TA TG CT C A T T T A
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Reference ( family-178 ) : NNNTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCTGC-ATTAGATGGA------AATTCTTTGTGT-GGCCCTT-T----GTGAT-GC-------TC--GACCT-TTCTGCC---CCGCC--TTTGATGTGATAGATCAC--AA-CATTTCTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATGGAANATCTG----G-ATC--AGCCATTGG-CAT----GG---TT--T-A--GATCA--TA---TCTTCT-C-TGGC-CGCA--GTC---A--GCAGG-TTGC---A-AT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC-----AG-C--GAT----GT--TCAGCTA--A---TGTTT--T----GG-C----GTT--CCC-CAGG-G----CT-CTG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTGGTGTGAAATACGCCGACG----TCANGACA-----TGT-GTT-ATCA-CTG-TT---A-TGC---G-CGACGACACGCAGGT---ATACATGGTTATAAA-ACCTAAC-GA-CACCTNGACCA-GANTTGCAGA-TANACTNCA-ACA-GTGTCCTCTCA-GATAT----AAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------NAA--------TATCC--TAAAA--CT-AA---ATC----AGGA--CAAAAC-TGAA--CT-G-----T---CATTT--TTGCT------C-CCAGA---A-AAGA--CCAGGTG-----ACTTCC------CA--G--TGTC-GC-----AACT--CA-CA-TTTTGGAAGG-AT-C-AG-TCAA-TT----ACA---A---GT--------GTGTC-GTGCG---TAAAATA-----CTTTGGTTGTTTCTTTGTAT--------ACGATCGTTC--ACTTTCCA-TGGATTCCCCAAAA---A-TTAAAAC-AAATCTA----G--CA--AAAT-GT--GCTACTT-CC--AAC-T-TAAAAAA-CAT-CGGTTAGAANT--AGAAA---CTTCTA--C--GCCGGATGGACGCGTTG----TCG--AAC-AA-T-C-ATCAGGGTCACT--TGTAA-GTCT--C---CCTC-ACTNACGCGAAAA--TG-CA-NCTCCCCTACT--C-TGTT---AAAA--CAG-C-GTC-T-T-TA-AC-GAAGCT-GCAAAA-AT-T---ACGGA------------------ACACT-G--CT--GCT--CG----AC--TA--GTG--ACT-CGCTCTTC-CAAC--CACGACCATA-TC--AC-CCCCA-T--TT-AATNT-CTCTA--C-A--TTG------GCTA--CC-GT--T---TTCCG-AA-T-TCAG-TACAA-AATCCTA-G-TAAATA-CTTTCGA-ACGCTCT---G-CGT---GGC----CT-ATC------TCCAG-TG-TAC-ATC-CA-GGACTTG--GTC--AATA-TCT------A--CATCCAA--C--ACGG--TCACTGCGAT-C----AG-A-AGATT-CGNT---T-TTG--TTA--TAA-A---TA-TACC-AAT-TGTGCGGAC-AA--AA-TG--T-A--TGGTGGACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CCTCAT-CAGC-A----AGTCTTG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAC---C---TTCG-GT--TNGAAA--CATC-AATCTGTGTTTTT-AAAAGA-A--AATTTA-AA----G---A-CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAA-ATTG-ACTCT--T--ATA----TAA-TTA-TT-AAA-AC-TA---ACNTTTT--T--TAT-CA-T-AA-TG-TG-AT--TG-ACCTAC----AAAA--------AAAAAA-AA-----AAA-AAAA---ANAA-------------------NANC--TT-A----A-------T-----A--CA---GCA-T-------------AAA------TT-T--TA--GA-TTTTA--TGGA-TT--TTTGG-TATTGTT----CGTT-T-GC-TT-GT--GGT-T--AGC-TGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-T-GAACTGT-TTTATGTAAAGCGCCT---TAGAGTA-AATTCT-TTAATTA-TATAGG-GCGCATATATAATGTGCAT-TAATGAANTAGATAATAA
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gi|11 : tattgcacgtggatcgatcgc-AA--AA-TGC-T-A--TGGTG-ACTGGCCT-------TT----TGCAGTGT----CCTCAGGCAGA-G----GGTCT-G-TGGGAA------ACAG-ATCT--CCG-AA-AGAAC---G---TTCC-GT--TAGAAA--CATC-GATCTGTGTTTGT-GAAAGA-A--AACTTA-AA----G---AGCCTACCTA--T---TTTA---AAA-GTTGC---TT--T-T-AACC---T--AA-TG--AA--CAC-GTA-G----CT--A-ATTGGACTCT--T--ATA----TCA-TTA-TT-TAA-CC-TA---ACTTCTT--TATTAT-CA-T-TA-TAATG-GT--TG-ACATAC----ACAA--------AAAAA------------AAAAA---ATAA-------------------AATC--TA-A----ACAGCTTTT-----A--TAT--GCA-T-------------AAA------TA-TCCTAAGGA-GTACT--CGGA-TG--TTTGA-TA-TGCT----GGTT-T-TT-TT-G
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gi|13 : gatggaaaagttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTTTTT-AAAAGA-A--A-TTTA-AA----G---A-CCTACTT---T---TT-----AAA-AT-GC---TT--T-C-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGTA-ATTG-A--CT--T--ATA----TAATTTA-TT-AAA-AC-TA---ACATTTTA-T--CAT-CA-T-AA-TG-TG-AT--TG-ACCTAC----AAAA--------AAAAAA-AA-----AAA-AAAA---AAAA-------------------AACCAACT-A----A-------------A--CA---GCA-T-------------AAA-------T-T--TA--GA-TTTTA--TGGA-TT--TTTGG--ATTGTG----CGTT-T-GC-CT-GT--GGG-T--AAC-TTTCATT---GTC-ACTGGTCGTTGTGTTT-TA-CAAATATTCTTAAATAATTT-cagcattttatatcata
gi|14 : G-A-AAATTACAGT---G-ATG--TTA------A---TG-T-CC-AAT-TGTGCGGAC-AA--AAATG--T-A--TGGT--ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----C-TCAT-CAGC-A----AGTCT-G-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA---CAC---C---TTCG-GT--TTGAAA--CATC-AATCTGTGTTTT--AAAAGA-A--A-TTTA-AA----G---A-CCTACTT---T---TTTA---AAA-GT-GC---TT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--CACTGT--G----CTGAA-TTTG-ACTCT--T--ATA----TAA-TTA-TT-AAA-AC-TA---ACTTTTA--T--TAT-CA-T-AA-TG-TG-A---TG-A-CTAC----AAAA--------AAAAAA-
gi|15 : T-T--TA--GG-TTTTA--TGGA-TTGATTTA-----TGTT----C-TT-T-GC-TT-GT--GATCT--AGC-TGTCATT---GTC-ACTGATTTTTGTG-TT-TA-CATATATTCTTAATTACTTA-T-GCACT-T-TTTGT---AAGCGCCT---TAGGGTA-ATTTTTGTTAAATA-TATAGG-GCGC-TATATAATGTGCA--TAATAAAATAGATAATAA
gi|16 : atatttataagccatattacaacatctcgccctatgaggacaacaTG-ACTCT--T--ATA----TAA-TTA-TT-AAA-AC-TA---AACTTTT--A--TATACA-T-AA-TA-TG-AT--TG-A-CTAC----CAAA--------AAAAAC-AATCCCCAAA-AAAACCCCTCA-------------------AATC--TT-ATATCA-------T-----A--CA---CTA-TCCCCTAAGAGACAAAA------TT-T--T---GA-TTTTA--TGGA-TT--TTTGG--ATTGTTGATACCTT-T-GC-T
gi|17 : CTTACGAAAGATTTGAGGAG-ATA--AAGCATTGGACAT----AGCAATTCCT-ACCGATCAAATA---TCT-CT-C-TGGC-CGCA--GTC---A--GCAGG-TTGCA--A-AT-TGGTGAAA--------TCC-----AG-CAAGATCACAGT--TCAccctttggtggtaattcctttaactg
gi|18 : ------TT-T--TA--GG-TTTTA--TGCA-TT--TTTGG--ATTATT-----GCT-A-GT-TT-GT--AGT-T--AGC-TGTCATT---GTC-ACTGATTGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAAT
gi|19 : cagtgtttcacaaacacatcttgtt-------------AAC------TT-T--TA--GG-TTTTAATTGGAATTAATTTG----TTGTT----TGTG-T--T-TT-GT--AGT-T--AGC-TGTCATT---GTC-ct
gi|2 : aaaaagttaaacagcattttatgccttacatatcccctagtccataagaggCTTCTCA--ATATTATTAAGCTC--CTGGATGCA----GTC--------AAACAAAAAATTATTC--TAAAAT-CT-AAGCTATCCAAAAAGAGCCAAATCATGAATCTT-GATCCTT---CATTTTATTGCT------CGCCAGACAGA-AAAATTTTAGGTGTATCCATATCC------TA--G--ATTCGGC-----AACT--CATCA-TTT--GA--G-AT-C-AGTTCAA-TTGACAACA---A---GCTCGATATAGTCCC-GTGTGTTTTAAAAAAAAAACCTTTGGTTGTTTTTTT-TATTCAGCTAGAC-ATC-TTC--A-TTTCCACTGGATTCCCCAAAAAATA-TAAAAACAAAATCTA----T--CAT-AATT-GTTGGCTACTT-CTCAAAC-TATAAAAAA-CAT-CCGGGAGATCT--AGAAATATCTTATA--A--CCCAG-T-GACTC-TTGCTCTCCG--A---AA-TAC-ATCA-GTTCACT--TGTAA-GTCTTCC---CCTCTACTAACGTAGATA--TGACA-TCATATCTACTTGC-TGTT---AAAATCCAG-C-GTC-T-TAAA-AC-AAAGCT-GCAAAATAT-TTCCACGAACTACCCACCAACTCCGTCACAC--A--CTAAGCT--CAGCGTAC--TAAGGTGGAACT-CTCGCTTCGCGACCACACGACCTAA-TCAAACACCCCA-CTATC-AATCT-CTCTA--C-ACCCTG------GCTAACCT-AT--TTACTTCCG-AAGTATCAG-TACAA-AATCCTATGTTAGATATCCTTCAA-A--CTCTAGAG-CGTAAGGGCTTTTCT-ATCAATCAATCCAG-TG--ACAATCTCA-GAGC-TGAAATCAAAATA-CCTCTTATCA--CATTCAC--CCAACAA--TAACTTCGATAC----AG-ATAGA-T-CGA------GAG--TAA--AAAGA---TACTACCAAAT-TAT-CGAAC-AAAGAA-CG--TCACTCAGAAGACACGCGCGAGCTAATTGAAATG--GGGCACTGCCTAAT-CAAG-AACCTAGTCTTGATAG--AGAGAGCAAAG-TCTTCCCCA-GA-TAGAC---CGCTTTCGCGT--TTGAAAATTAGC-AA-CTCTGTTCTA-AAAAGA-A--ATTTAA-AA----G---A--CTACTTATGT---TCCACCCAAA-GT-GCGTATTCCC-T-GACCACGT--A---G--AACGCACTGA--GCCGCCTGAATGTGG-ACTC---C--ATAGGAGTGA-TTAGTT-AAA-AC-TAAACACATTGTAAT--TAT-CA-TCAA-TG-TG-ATAGTGAAGATAC----AAAA--------AAAAAACAA-----AGA-AAAA---AGAAAGAAAAAAATACAAAACCGCAAC--TT------A-------T-----AAGCA---GCA-TA------------AAA------TT-C--TA--GA-GATTA--ATGA-TTA-TTTGG-GATTG-T----CAGT-T-GCATTAGT--GGTATAAAAC-T-TCA-T---GTCAACTGA-CGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTT-AAT-ATTA-T-GGAC--A-TTAATGTAAAGCGCCTCCGTAGAG---AATTCT-TTAATTACTATAGGCGCGTACCTATAATGTGCAT-
gi|20 : ATCATTACATTGTATCTGC-ATTAGATGGG--------TTTTTT-TGT-GGCCCTT------GTGAT-GC-------TC--GACCA-TTCCGCC---CCa
gi|20 : ATCTG----A-ATC--AGC-ATTGG-CAT----GG---TT--T-A--GATctatgagtccgtatctgaatcagcattggcatggtttagat
gi|21 : atcattacattgtatctgcattagatgggtttttttgtggcccttgtgatgctcgaccattccgccccctatgagtccgt-------------AAA------AT-T--TA--GG-TTTTA--TGGA-TT--TTGGG--ATTGCT----T-TT-T-CT-TT-TT--AGT-T--AGC-TGTCATT---GTC-ACTGAATGTTGTATTT-T
gi|22 : tatgtcatacatatcccctaagaagaca-GT--TTGAAA--CATC-AATCTGTGTTTTTTAAAAAA-A--AAT--A-AA----G---A-CCTACCT---T---TTTA---AAA-GT-GC---GT--T-T-AACC---T--A--TG--AA--TACTGT--G----CTGAA-ATTT-ACTCT--T--ATA----TAA-TT
gi|23 : GCTCT---G-TGT---GAC----CT-ATC------TCCAG-TG-TAC-ATC-CA-ATACTT---------------------------------------GG--TCAAT---AT-C----------TATT-CGGT---T-TTG--TTA----A-A---TA-TAGC-ATT-TGTGCGGACAAA--AA-TG--T-A--TGGTG
gi|25 : aaGCTG--A---TGTTT--T----GG-C----GTT---CC-GAGA-G----CTCCTGCTGTTTGAGG-A-CC-----A-------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-
gi|26 : ac-T-GC-TT-GT--GGT-T--AAC-TGTCATT---GTC-ACTGATCGTTGTGTTT-TA-CATATATTCTTAAATAATTT-
gi|27 : CTACT--C-TGTT---AAAA--CAA-C-GTC-T-T-TA-AC-GAAGCT-ACAAAA-TG-T---ACAGA------------------ACACTCA--CT--GCT--TG----A
gi|28 : CC--TTTGATGTGATAGATCAC--AA-CGTT-CTCATTGGCC---GTA-TGG-AAT-ATTCTTATG
gi|29 : AAAA-AA-----AAA-AACA---ACCC-------------------CAAC--TT-A----A-------------A--CA---GCA-T-------------AAA------TT-T--TA--GA-TTTTA--TGGA-T
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gi|7 : TACGTTGTT-CATCACGACTATGTGTCTGC-ATTAGATGGA------AATTC--TGTGT-G--CCCT-T----GTGAT-GC-------TG--GACCT-TTCTG-----CCGCCT-TTTGAT-TGATAGATCAC--AA-CA-TTCTCATTGGCC---GTACTGG-AAT-ATTCTTATGGAAGATCT-----G-ATC--AG-CATTGG-CATTCGGGA---TT--TAA--GATCAGCTAGAGTCATTC-A-TGGCTCGCA--GTCTCGA--GCAGGTTTGC---ATATGTGGTAAAA--CAGTCTTCC-----TGAC--GAT----------AGCCACTA---TGTTT--T----GG-C----GTT--CCC-AAGGAG----CT-CTT-TGAT--GGG-A-CC-----AC------GATC-TTACTGTGCA-TATTGTTTCAAG-C-ca
gi|8 : gtctgatatcgcgcttgtcactctaccgaaactgccctacTACGT-GTT-CATCACGACATTGTGTCGGC-ATTAGATGAA------AATTCTT-GTGT-GGCCCTT------GTGAT-GC-------TC--GACCT-TTCTACC-----GCC--TTTGATGTGAGAGATTAC--AA-CATT-CACATTGGCC---GTA-AGG-AAT-ATTCTTATGGAATATATG----G-ATC--AGC-ATTGG-CAT----GG---TT--T-A--GATCA--TA---TCT-CT-C-TGGT-CGCA--GTC---A--GCAGG-TTGC---A-AT-TGGTAAAA--CAGT-TTCC-----AG-C--GAT----GT--TCTGCTA------TGTTT--T----GG-C----GT---CCC-CAGG-G----CT-CTG-TGTT--GGG-A-CC-----AC------GTCT-TTAC--TGCA-TGTT-TTCTAAA-C-CCA----TTG--GTGAAATATGCCGACG----TCAGAACA-----TGT-GTT-ATCA-CTG-TT---A-TGC---aacgcaataatggttcagtaattatatggcacgacgtc
gi|9 : tgcaatctgcatatcgtgcttgtcactctaccgaaactgctctac-AA--AA-TG--T-A--TG-TG-ACAGGCGC-------TT----TG--ATGC----CTCCAT-CAGCCA----AGC--TG-TGG--A------ACAG-TCTT--CCA-AA-AACAG---C-----CGTGT--TTGAAA--CATCTAATCTGCGTTGTT-AATATAGA--AATTTACAA----G---A-CTGACTT---T---TTTA---AAAAGT-GC---TT--T-TTAACC---T--AACTG--AA--CACTGTATG----CT--A-ATTG-ACTCTATC--ATA----TA--TTA-TTTAAA-AC-TA---ACATTTT--A--TAT-CA-T-AA-TG-TG-AT--TG-ACCTACGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AA-----AAA-AAAA---AAAA-------------------AAAC--TTAA----A-------C-----A--CA---GCA-T-------------AAA------TT-T--TA--GA-TTTTA--TGGA--T--TTTGG--ATTGTT-----GTTATGGT-TT-GT--GGT-A--AAC-TGTCAAT---TTC-ACT-ATCGTTGTGTTTCTAGCATATATT-TTAAATAATTT-T-cg
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