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Reference ( gi|3 )            : TCAAAGGCGGATCCAGGACCGGCGCACC--GTGCGCTCGCCCCAC-TGTTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGTGTCTG-GTT--T----TGTTA--AT-TTTGA-C----------TGC----C-T---AATACTCATA-TATAC-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------G--GGCAT-CAAA---ACAATTCTC--AG-GC-C---ACAAGA-AT---T--AC-A----CC-----------GC------------TT----CC-CC----------C-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|2                          : TCAAAGGCGGATC-AGG-CCGACGCACTCAGTGCGA-CGCCCCCC-TGTTTGAGAAAATCT-----T-----T-------GAAGGTGT-TG-TTT--T----TGTTAGAAT-TTTAG-CTGCAATGCAATGC----CAC---AATA-TCA-A-TA-AC-----TTTAATTGTTAACAATGCAATGATTACAGTATGTATTTTTAATCTTCCTTATCTCCACACAAACTTTAGGTTTGTGTTCATA-------ATCGGCATACAAACACACATTTCCC--GGTAC-C---ACAAGA-AT---TTTAT-AA---CC-----------GC------------G-----CC-CC----------C-GGTTCTGA-A-ATT-CTGGA-TTCCCCGCC
gi|6                          :  CAAAGGCGGATCCTGGGCTGGCGCACC--CCCCAC---CCCCA----TTTGA---AATTT-----T-----T-------TG-GGGGTCTG-TTT--T----TGGAA--AT-TTTGA-C----------TGC----A-T---AATGT--GTA-TATAC-----TTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--------------GGCAT-CAAA---ACAATCCCT--AC-AC-C---ACAAGA-AT---T--AT-A----GC-----------G-------------TG----CC-CC----------C-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCACtt
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gi|10                         :   AAAGGCGGATCCAAG----GCGCCCC-------CCCCCCCTCC-CGTT-GA---ATTTT-----T-----T-------GG-GGTTT----ATT--T----TGTAA--AT-TTTGA-C----------TGA----T------ATACGCATA-TAT
gi|1                          :    AAGGTGGATCCAGGGCCGGCACACC--AGGAGTGCGCCCC---TGTTTAA---AATTT-------------------GG-GGGGTCTG-TTT--TAATTTGTAA--AT-TTTGA-C----------TGC----A-C---AATttgaatgtagtcagcattcgatttcattgtgacagtatatgtattttttctttactctcaatacaaaagac
gi|4                          :    AAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACC--gatgcanggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccccagaccccaacagatcgatatacccccacccccaggttctgaaattcctggatccacca
gi|14                         :                           CC--GGGCGCGCGCCCCCC-TGTTTGA---AATTTGGGAGTGGGGGTGG-----GG-GGTGTCTA-TTT--T----TGTTA--AA-TTTTA-C----------TGC----A-T---AATACGCATA-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaacaatccccagatatctagatttataccgcgccccccgtttctgaaactccttgatcc
gi|7                          :                                    CCCACCCC-C-CGTTTGA---AAATT-----A-----T-------CG-GG-GTCTG-AAT--T----TGT-A--AT-TTTGA-C----------TGC----A-TATGAATAAGCATA-TATACATTGAAATGTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------N--GGCAT-C--A---ACGA-TCCC--AG-AC-C---CTAAGA-ATTTAT--AC-A----C-------------C------------CT----CC-CC----------C-G--TCTGA-A-ATTCCTGAG-C---CC
gi|5                          :                                    ccacCCCCCC-CCTTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGTGTCTG-TTT--T----TGTTA--AT-TTTGA-C----------TGCATATT-T---AATAATCATAATATAC-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--GGCAT-AAAA---ACAATCCTC--AG-AC-C---ACAAGA-AT---T--AT-A----CC-----------GCGCCGGGA-----TCGCGCCC-CC----------C-AGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCACcaagtgctgatttaga
gi|8                          :                                     cccCCCCGCGTATTTGA---AATTT-----C-----T-------TG-GG---CTT-GTTATT----TGTAA--ATGCTTGAAC----------TGC----A-T---AATACACATA-TATAC-----TTAATCTGTAGTCATATGCAATACTATACATTATGTAATTTTTCTCTTATCATCACTACGAAAAACCGTATATATCAAGGCA-------G----CAT-CAAA---ACAACCC-C--AG-AC-C---GCAAGA-AT---T--AT-A----CCACTCCTGGACCGC------------TT----CCTCC----------C-GGTTCTGA-ATATTCCTGGA-T---CCCCCACtgc
gi|9                          :                                                                                                   cccccGTAA--AA-TTTGA-C----------TGC----A-T---AATACTTATA-CATNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------G--GGCAT-CAAA---ACAATCCCC--AG-ACTC---CCAAGA-AT---T--AT-A----CC-----------GC-------------G----CC-CC----------T-GGTTCTGA-C-ATTCCTGGA-T---CCGCCACtg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                           caaaggcggatccagggctggcgcaccgggcgtac--GGCAT-CAAA---ACAATTCCC--AG-AC-CCTTAGAAGA-AT---T--AT-ACACCCC-----------CC------------CC----CC-CC----------C-GGTTCtg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                              --GGCAT-AAAG---AAAACCC-C--AG-AT-C---ACAAAG-AT---TTTAT-A----CC-----------GCACCGGGACCCCGCC----CC-CC----------C-CGTTCTGATA-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     -CAAA---ACAATCCCC--AG-AC-C---CCAAGA-AT---T--AC------CC------------C------------CA----CC-CC----------C--GTTCTGA-A-TGTACTAGA-T---CCGCCACt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                       AAA---ACAATCCCC--AG-AT-A---TCTAGA-TT---T--AT-A----CC-----------GC------------GC----CC-CC----------C-GTTTCTGA-A-ACTCCTTGA-T---CCt
gi|1                          :                                                                             aaggcggatccagggccggcgcaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntATCCCC--AG-AC-C---CCAACAGATCGAT--AT-A----CC-----------CC------------CA----CC-CC----------CAGGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCA
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Reference ( family-1620 )     :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACCGGGCGCG-CGCC-CCCCCG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGNGTCTG-TT----TTTG-T--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-TAT-----AC-TT----TANNCGTNGNCA-------NNNNNANNACTACANNNTGTGTNNTTNNTCTCCCNTNNCCNCNNNNAAANNCCGNGTNTGTNNTCGCA-------G--GGCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CNC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GC------------C----------CCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                               AAGGTGGATCCAGGGCCGGCACACCAGGAGTG-CG---CCCCTG----TTTAA---AA--T-----T-----T-------GG-GGGGTCTG-TTTTAATTTG-T--AAAT-TTTGA-CTGCA---C---A----ATGAT-GCA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCC--CCAG-AC-CCC---AACAGA--TCGAT--A-TA----CC------CC------------C----------ACC------------CCCAGGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCAnggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccccagaccccaacagatcgatatacccccacccccaggttctgaaattcctggatccacca
gi|10                         : aaggtggatccagggccggcacaccaggagtgcgcccctgtttaaaatttggggggtctgttttaatttgtaaattttgactgcacaatgatgcanggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAGGCGGATCCAA----GGCGCCCC-----CC-CCCC-CTCCCG-----TTGA---ATTTT-----T-----T-------GG-G--GTTTA--T----TTTG-T--AAAT-TTTGA-CTG-A---T--------AT-AC-GCATA-TA---------TT----TGAATGTAGTCAGCATTCGATTTCATTGTGACAGTATATGTATTTTTTCT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-------A--GGCAT-AAAG---AAAA-CC--CCAG-AT-CAC---AAAG-ATTT---T--A-TA----CC------GCACCGGGACCCCGC----------CCC------------CCC-CGTTCTGATA-ATTCCTGGA-T---CCGCCACttactctcaatacaaaagac
gi|12                         :                                                                                                                                                                     gtacatttgtatttatcaattctctactgtcacttcaaaacaacggtgcttgtaaagAAAGGCGGATCCAGGGCCGACGCACCAGGCGCG-CACC-CTCCCG----TTTGA---A---------T-----TGGGGGGGGG-GGGGGCTGTTT----TTTG-T--AAAT-TTTGC-CTGTA---T---A----AT-Atggtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAT-CACA---ACAATCCTTCAAG-AC-CTC---AACC-A--T---T--ACTG----CCCGGGGCGC------------C----------CCCGTCTACAC----TCC-AGTT-TGA-A-ATTCCTGGATT---CCGCCAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                      CCGGGCGCG-CGCC-CCCCTG----TTTGA---AATTTGGGAGTGGGGGTGG-----GG-GGTGTCTA-TT----TTTGTT--AAAT-TTT-A-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-Tt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGGATCAAGGGTCGGCGCACC--------CCAC-CTCCCG----TTAGA---ATTTTA----T-----TGGGGG--GG-GGGGTCTG-TT----TTT--T--AATA-TTTGA-CTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CCC---AAGA-A--T--------TA----CC-------C------------C----------CAC------------CCC-CGTTCTGA-A-TGTACTAGA-T---CCGCCAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----CC------CC------------T----------CCC------------CTC-CGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cggcgaccccccc--GGCAT-CAAA---ACAATTC--CCAG-AC-CCTTAGAAGA-A--T---T--A-TACACCCC------CC------------C----------CCC------------CCC-GGTTCtctggtatact
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Reference ( family-1620 )     :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACCGGGCGCG-CGCC-CCCCCG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGNGTCTG-TT----TTTG-T--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-TAT-----AC-TTTANATGTA----GTCA-------ATTNCATTATTACA-GTATATGTATTT-T---T--TCTCCCNTNNCCNCNNNNAAANNCCGN-GTNTGTNNTCGCA-------G--GGCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CNC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GC------------C----------CCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                               AAGGTGGATCCAGGGCCGGCACACCAGGAGTG-CG---CCCCTG----TTTAA---AA--T-----T-----T-------GG-GGGGTCTG-TTTTAATTTG-T--AAAT-TTTGA-CTGCA---C---A----ATGAT-GCA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATCC--CCAG-AC-CCC---AACAGA--TCGAT--A-TA----CC------CC------------C----------ACC------------CCCAGGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCAnggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccccagaccccaacagatcgatatacccccacccccaggttctgaaattcctggatccacca
gi|10                         : aaggtggatccagggccggcacaccaggagtgcgcccctgtttaaaatttggggggtctgttttaatttgtaaattttgactgcacaatgatgcanggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAGGCGGATCCAAGGC----GCCCC-----CC-CCCC-CTCCCG----TT-GA---ATTTT-----T-----T-------GG-GG--TTTA-TT----TT-G-T--AAAT-TTTGA-CTG-A---T---A-----T-AC-GCATA-TAT---------TTGAATGTA----GTCAGCATTCGATTTCATTGTGACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTGTATTTATCAAT--TCTCTACTGTC-ACTTCAAAACAACGGTGCTTGTAA--AGA-------A--GGCAT-AAAG---AAAA-CC--CCAG-AT-CAC---AAAG-ATTT---T--A-TA----CC------GCACCGGGACCCCGC----------CCC------------CCC-CGTTCTGATA-ATTCCTGGA-T---CCGCCACttactctcaatacaaaagac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                          gtacAAAGGCGGATCCAGGGCCGACGCACCAGGCGCG-CACC-CTCCCG----TTTGA---A---------T-----TGGGGGGGGG-GGGGGCTGTTT----TTTG-T--AAAT-TTTGC-CTGTA---T---A----AT-Atggtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CAT-CACA---ACAATCCTTCAAG-AC-CTC---AACC-A--T---T--ACTG----CCCGGGGCGC------------C----------CCCGTCTACAC----TCC-AGTT-TGA-A-ATTCCTGGATT---CCGCCAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                      CCGGGCGCG-CGCC-CCCCTG----TTTGA---AATTTGGGAGTGGGGGTGG-----GG-GGTGTCTA-TT----TTTGTT--AAAT-TTT-A-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-Tt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGGATCAAGGGTCGGCGCACC--------CCAC-CTCCCG----TTAGA---ATTTTA----T-----TGGGGG--GG-GGGGTCTG-TT----TTT--T--AATA-TTTGA-CTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CCC---AAGA-A--T--------TA----CC-------C------------C----------CAC------------CCC-CGTTCTGA-A-TGTACTAGA-T---CCGCCAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----CC------CC------------T----------CCC------------CTC-CGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cggcgaccccccc--GGCAT-CAAA---ACAATTC--CCAG-AC-CCTTAGAAGA-A--T---T--A-TACACCCC------CC------------C----------CCC------------CCC-GGTTCtctggtatact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGAATCCGGGGCCGGCGCACCGGGCGCA-CGC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                           gTCAAAGGCGGATC--AGGCCGACGCACTCAGTGCGACGCC-CCCCTG----TTTGAGAAAATCT-----T-----T-------GAAGGTGT-TG-TT----TTTG-TTAGAAT-TTTAG-CTGCAATGC---A----AT-GCCACA-A-TATCAATAAC-TTTAATTGTT----AACA-------ATGCAATGATTACA-GTAT--GTATTT-T---TAATCTTCCTTATCTCCACACAAACTTTAG-GTTTGTGTTCATA-------ATCGGCATACAAACACACATTTC--CCGGTAC-CAC---AAGA-A--T---TTTA-TAA---CC------GC------------G----------CCC------------C-C-GGTTCTGA-A-ATT-CTGGA-TTCCCCGCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGACCGGCGCACCGTGCGCT-CGCC-CCACTG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGTGTCTG-GT----TTTG-T--TAAT-TTTGA-CTGCC---T---A----AT-AC-TCATA-TAT-----AC-NNNNNNNNNN----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN-------G--GGCAT-CAAA---ACAATTC--TCAG-GC-CAC---AAGA-A--T---T--A-CA----CC------GC------------T----------TCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCACtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                               AAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAA---ACAATCC--CCAG-AT-ATC---TAGA-T--T---T--A-TA----CC------GC------------G----------CCC------------CCC-GTTTCTGA-A-ACTCCTTGA-T---CCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaacaatccccagatatctagatttataccgcgccccccgtttctgaaactccttgatcc
gi|5                          :                                                               aaggcggatccagggccggcgcaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCC-CCCCCC----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGTGTCTG-TT----TTTG-T--TAAT-TTTGA-CTGCA---T---ATTTAAT-AA-TCATAATAT-----AC-NNNNNNNNNN----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--GGCAT-AAAA---ACAATCC--TCAG-AC-CAC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GCG-----------CCGGGATCGCGCCC------------CCC-AGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                          cccCAAAGGCGGATCCTGGGCTGGCGCACC--------CCCCACCCCCA----TTTGA---AATTT-----T-----T-------TG-GGGGTCTG-TT----TTTG-G--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT----GTGTA-TAT-----AC-TTTACANNNN----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNT--------------GGCAT-CAAA---ACAATCC--CTAC-AC-CAC---AAGA-A--T---T--A-TA----GC------G-------------T----------GCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCACtgc
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Reference ( family-1620 )     :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACCGGGCGCG-CGCC-CCCCCG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGNGTCTG-TT----TTTG-T--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-TAT-----AC-TTTAAATGTA----GTCA-------ATTNCATTATTACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--CTNNTNTCCACTNCNAAACANCGG-GTTTGTNATCGNA-------G--G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CNC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GC------------C----------CCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTGTATTTATCAAT--TCT--CTACTGTC-ACTTCAAAACAACGGTGCTTGTAA--AGA-------A--G--GCAT-AAAG---AAAA-CC--CCAG-AT-CAC---AAAG-ATTT---T--A-TA----CC------GCACCGGGACCCCGC----------CCC------------CCC-CGTTCTGATA-ATTCCTGGA-T---CCGCCACgac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                          gtacAAAGGCGGATCCAGGGCCGACGCACCAGGCGCG-CACC-CTCCCG----TTTGA---A---------T-----TGGGGGGGGG-GGGGGCTGTTT----TTTG-T--AAAT-TTTGC-CTGTA---T---A----AT-Atggtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAT-CACA---ACAATCCTTCAAG-AC-CTC---AACC-A--T---T--ACTG----CCCGGGGCGC------------C----------CCCGTCTACAC----TCC-AGTT-TGA-A-ATTCCTGGATT---CCGCCAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                      CCGGGCGCG-CGCC-CCCCTG----TTTGA---AATTTGGGAGTGGGGGTGG-----GG-GGTGTCTA-TT----TTTGTT--AAAT-TTT-A-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-Tt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGGATCAAGGGTCGGCGCACC--------CCAC-CTCCCG----TTAGA---ATTTTA----T-----TGGGGG--GG-GGGGTCTG-TT----TTT--T--AATA-TTTGA-CTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CCC---AAGA-A--T--------TA----CC-------C------------C----------CAC------------CCC-CGTTCTGA-A-TGTACTAGA-T---CCGCCAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----CC------CC------------T----------CCC------------CTC-CGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cggcgaccccccc--G--GCAT-CAAA---ACAATTC--CCAG-AC-CCTTAGAAGA-A--T---T--A-TACACCCC------CC------------C----------CCC------------CCC-GGTTCtctggtatact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGAATCCGGGGCCGGCGCACCGGGCGCA-CGC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                           gTCAAAGGCGGATC--AGGCCGACGCACTCAGTGCGACGCC-CCCCTG----TTTGAGAAAATCT-----T-----T-------GAAGGTGT-TG-TT----TTTG-TTAGAAT-TTTAG-CTGCAATGC---A----AT-GCCACA-A-TATCAATAAC-TTTAATTGTT----AACA-------ATGCAATGATTACA-GTAT--GTATTT-T---TAATCTTCCTTATCTCCAC-AC-AAACTTTAG-GTTTGTGTTCATA-------ATCG--GCATACAAACACACATTTC--CCGGTAC-CAC---AAGA-A--T---TTTA-TAA---CC------GC------------G----------CCC------------C-C-GGTTCTGA-A-ATT-CTGGA-TTCCCCGCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGACCGGCGCACCGTGCGCT-CGCC-CCACTG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGTGTCTG-GT----TTTG-T--TAAT-TTTGA-CTGCC---T---A----AT-AC-TCATA-TAT-----AC-NNNNNNNNNN----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN-------G--G--GCAT-CAAA---ACAATTC--TCAG-GC-CAC---AAGA-A--T---T--A-CA----CC------GC------------T----------TCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCACtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                               AAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAA---ACAATCC--CCAG-AT-ATC---TAGA-T--T---T--A-TA----CC------GC------------G----------CCC------------CCC-GTTTCTGA-A-ACTCCTTGA-T---CCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaacaatccccagatatctagatttataccgcgccccccgtttctgaaactccttgatcc
gi|5                          :                                                               aaggcggatccagggccggcgcaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCC-CCCCCC----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGTGTCTG-TT----TTTG-T--TAAT-TTTGA-CTGCA---T---ATTTAAT-AA-TCATAATAT-----AC-NNNNNNNNNN----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--G--GCAT-AAAA---ACAATCC--TCAG-AC-CAC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GCG-----------CCGGGATCGCGCCC------------CCC-AGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                          cccCAAAGGCGGATCCTGGGCTGGCGCACC--------CCCCACCCCCA----TTTGA---AATTT-----T-----T-------TG-GGGGTCTG-TT----TTTG-G--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT----GTGTA-TAT-----AC-TTTACANNNN----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNT--------------G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CTAC-AC-CAC---AAGA-A--T---T--A-TA----GC------G-------------T----------GCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCACtgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   C-CCCCCG----TTTGA---AAATT-----A-----T-------CG-GG-GTCTG-AA----TTTG-T---AAT-TTTGA-CTGCA---TATGA----AT-AA-GCATA-TAT-----ACATTGAAATGTACNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN-------N--G--GCAT-C--A---ACGAT-C--CCAG-AC-CCT---AAGA-AT-T---T--A-TA----CA------CC------------C----------TCC------------CCC-G--TCTGA-A-ATTCCTGAG-C---CC
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                           ccCAAAGGCGGATCCAGGGCTGGCGCACCGGGCGTA-CGtg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G-T--AAAA-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-AC-TTATA-CAT-----NN-NNNNNNNNNN----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNG------------G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-ACTCCC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------G-------------C----------GCC------------CCT-GGTTCTGA-C-ATTCCTGGA-T---CCGCCACtaaaatttgactgcataatacttatacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcatcaaaacaatccccagactcccaagaattataccgcgcccctggttctgacattcctggatccgccactg





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Reference ( family-1620 )     :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACCGGGCGCG-CGCC-CCCCCG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GG-GGNGT--CTG-TT----TTTGT--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-TAT-----AC-TTTAAATGTA-----GTCA-------ATTNCATTATTACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--CTNNTCTCCACTACGAAACANCGG-GTTTGTNATCA-A--------G--G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CNC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GC------------C-CCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                               AAGGTGGATCCAGGGCCGGCACACCAGGAGTG-CG---CCCCTG----TTTAA---AA--T-----T-----T-------GG-GGGGT--CTG-TTTTAATTTGT--AAAT-TTTGA-CTGCA---C---A----ATGAT-GCA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCC--CCAG-AC-CCC---AACAGA--TCGAT--A-TA----CC------CC------------C-ACC------------CCCAGGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCAnggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccccagaccccaacagatcgatatacccccacccccaggttctgaaattcctggatccacca
gi|10                         : aaggtggatccagggccggcacaccaggagtgcgcccctgtttaaaatttggggggtctgttttaatttgtaaattttgactgcacaatgatgcanggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAGGCGGATCCAAGGC----GCCCC-----CC-CCCC-CTCCCG----TT-GA---ATTTT-----T-----T-------GG-GG--T--TTA-TT----TT-GT--AAAT-TTTGA-CTG-A---T---A-----T-AC-GCATA-TAT---------TTGAATGTA-----GTCAGCATTCGATTTCATTGTGACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--TTACTCT-CAATACAAAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTGTATTTATCAAT--TCT--CTACTGTC-ACTTCAAAACAACGGTGCTTGTAAAGA-A--------G--G---CAT-AAAG---AAAA-CC--CCAG-AT-CAC---AAAG-ATTT---T--A-TA----CC------GCACCGGGACCCCGC-CCC------------CCC-CGTTCTGATA-ATTCCTGGA-T---CCGCCACgac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                          gtacAAAGGCGGATCCAGGGCCGACGCACCAGGCGCG-CACC-CTCCCG----TTTGA---A---------T-----TGGGGGGGGG-GGGGG--CTGTTT----TTTGT--AAAT-TTTGC-CTGTA---T---A----AT-Atggtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAT-CACA---ACAATCCTTCAAG-AC-CTC---AACC-A--T---T--ACTG----CCCGGGGCGC------------C-CCCGTCTACAC----TCC-AGTT-TGA-A-ATTCCTGGATT---CCGCCAC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGGATCAAGGGTCGGCGCACC--------CCAC-CTCCCG----TTAGA---ATTTTA----T-----TGGGGG--GG-GGGGT--CTG-TT----TTT-T--AATA-TTTGA-CTG
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Reference ( family-1620 )     :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACCGGGCGCG-CGCC-CCCCCG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GGGGG-GT--CTG-TT----TTTGT--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-TAT-----AC-TTTAAATGTA-----GTCA-------ATTNCATTATTACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--CTNNTCTCCACTACGAAACANCGG-GTTTGTGATCA-A--------G--G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CNC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GC------------C-CCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCC--CCAG-AC-CCC---AACAGA--TCGAT--A-TA----CC------CC------------C-ACC------------CCCAGGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCAnggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccccagaccccaacagatcgatatacccccacccccaggttctgaaattcctggatccacca
gi|10                         : aaggtggatccagggccggcacaccaggagtgcgcccctgtttaaaatttggggggtctgttttaatttgtaaattttgactgcacaatgatgcanggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAGGCGGATCCAAGGC----GCCCC-----CC-CCCC-CTCCCG----TT-GA---ATTTT-----T-----T-------GGGG---T--TTA-TT----TT-GT--AAAT-TTTGA-CTG-A---T---A-----T-AC-GCATA-TAT---------TTGAATGTA-----GTCAGCATTCGATTTCATTGTGACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--TTACTCT-CAATACAAAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTGTATTTATCAAT--TCT--CTACTGTC-ACTTCAAAACAACGGTGCTTGTAAAGA-A--------G--G---CAT-AAAG---AAAA-CC--CCAG-AT-CAC---AAAG-ATTT---T--A-TA----CC------GCACCGGGACCCCGC-CCC------------CCC-CGTTCTGATA-ATTCCTGGA-T---CCGCCACgac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                          gtacAAAGGCGGATCCAGGGCCGACGCACCAGGCGCG-CACC-CTCCCG----TTTGA---A---------T-----TGGGGGGGGGGGG-GG--CTGTTT----TTTGT--AAAT-TTTGC-CTGTA---T---A----AT-Atggtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAT-CACA---ACAATCCTTCAAG-AC-CTC---AACC-A--T---T--ACTG----CCCGGGGCGC------------C-CCCGTCTACAC----TCC-AGTT-TGA-A-ATTCCTGGATT---CCGCCAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                      CCGGGCGCG-CGCC-CCCCTG----TTTGA---AATTTGGGAGTGGGGGT-------GGGGG-GTGTCTA-TT----TTTGTT-AAAT-TTT-A-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-Tt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGGATCAAGGGTCGGCGCACC--------CCAC-CTCCCG----TTAGA---ATTTTA----T-----TGGGGG--GGGGG-GT--CTG-TT----TTT-T--AATA-TTTGA-CTG
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Reference ( family-1620 )     :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACCGGGCGCG-CGCC-CCCCCG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GGGGG-GT--CTG-TT----TTTGT--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-TAT-----AC-TTTAAATGTA-----GTCA-------ATTNCATTATTACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--CTNNTCTCCACTACGAAACANCGG-GTTTGTGATCA-A--------G--G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CNC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GC------------C-CCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCC--CCAG-AC-CCC---AACAGA--TCGAT--A-TA----CC------CC------------C-ACC------------CCCAGGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCAnggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccccagaccccaacagatcgatatacccccacccccaggttctgaaattcctggatccacca
gi|10                         : aaggtggatccagggccggcacaccaggagtgcgcccctgtttaaaatttggggggtctgttttaatttgtaaattttgactgcacaatgatgcanggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAGGCGGATCCAAGGC----GCCCC-----CC-CCCC-CTCCCG----TT-GA---ATTTT-----T-----T-------GGGG---T--TTA-TT----TT-GT--AAAT-TTTGA-CTG-A---T---A-----T-AC-GCATA-TAT---------TTGAATGTA-----GTCAGCATTCGATTTCATTGTGACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--TTACTCT-CAATACAAAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTGTATTTATCAAT--TCT--CTACTGTC-ACTTCAAAACAACGGTGCTTGTAAAGA-A--------G--G---CAT-AAAG---AAAA-CC--CCAG-AT-CAC---AAAG-ATTT---T--A-TA----CC------GCACCGGGACCCCGC-CCC------------CCC-CGTTCTGATA-ATTCCTGGA-T---CCGCCACgac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                          gtacAAAGGCGGATCCAGGGCCGACGCACCAGGCGCG-CACC-CTCCCG----TTTGA---A---------T-----TGGGGGGGGGGGG-GG--CTGTTT----TTTGT--AAAT-TTTGC-CTGTA---T---A----AT-Atggtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAT-CACA---ACAATCCTTCAAG-AC-CTC---AACC-A--T---T--ACTG----CCCGGGGCGC------------C-CCCGTCTACAC----TCC-AGTT-TGA-A-ATTCCTGGATT---CCGCCAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                      CCGGGCGCG-CGCC-CCCCTG----TTTGA---AATTTGGGAGTGGGGGT-------GGGGG-GTGTCTA-TT----TTTGTT-AAAT-TTT-A-CTGCA---T---A----AT-AC-GCATA-Tt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGGATCAAGGGTCGGCGCACC--------CCAC-CTCCCG----TTAGA---ATTTTA----T-----TGGGGG--GGGGG-GT--CTG-TT----TTT-T--AATA-TTTGA-CTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CCC---AAGA-A--T--------TA----CC-------C------------C-CAC------------CCC-CGTTCTGA-A-TGTACTAGA-T---CCGCCAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----CC------CC------------T-CCC------------CTC-CGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cggcgaccccccc--G--GCAT-CAAA---ACAATTC--CCAG-AC-CCTTAGAAGA-A--T---T--A-TACACCCC------CC------------C-CCC------------CCC-GGTTCtctggtatact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGAATCCGGGGCCGGCGCACCGGGCGCA-CGC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                           gTCAAAGGCGGATC--AGGCCGACGCACTCAGTGCGACGCC-CCCCTG----TTTGAGAAAATCT-----T-----T-------GAAGGTGT---TG-TT----TTTGTTAGAAT-TTTAG-CTGCAATGC---A----AT-GCCACA-A-TATCAATAAC-TTTAATTGTT-----AACA-------ATGCAATGATTACA-GTAT--GTATTT-T---TAATCTTCCTTATCTCCAC-AC-AAACTTTAG-GTTTGTGTTCATA--------ATCG--GCATACAAACACACATTTC--CCGGTAC-CAC---AAGA-A--T---TTTA-TAA---CC------GC------------G-CCC------------C-C-GGTTCTGA-A-ATT-CTGGA-TTCCCCGCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGACCGGCGCACCGTGCGCT-CGCC-CCACTG----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GGGGT-GT--CTG-GT----TTTGT--TAAT-TTTGA-CTGCC---T---A----AT-AC-TCATA-TAT-----ACNNNNNNNNNNN-----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN-N--------G--G--GCAT-CAAA---ACAATTC--TCAG-GC-CAC---AAGA-A--T---T--A-CA----CC------GC------------T-TCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCACtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                               AAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAA---ACAATCC--CCAG-AT-ATC---TAGA-T--T---T--A-TA----CC------GC------------G-CCC------------CCC-GTTTCTGA-A-ACTCCTTGA-T---CCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaacaatccccagatatctagatttataccgcgccccccgtttctgaaactccttgatcc
gi|5                          :                                                               aaggcggatccagggccggcgcaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCC-CCCCCC----TTTGA---AATTT-----T-----T-------GGGGT-GT--CTG-TT----TTTGT--TAAT-TTTGA-CTGCA---T---ATTTAAT-AA-TCATAATAT-----AC-NNNNNNNNNN-----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNG--G--GCAT-AAAA---ACAATCC--TCAG-AC-CAC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------GCGCCGGGATCG--CGCCC------------CCC-AGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                          cccCAAAGGCGGATCCTGGGCTGGCGCACC--------CCCCACCCCCA----TTTGA---AATTT-----T-----T-------TGGGG-GT--CTG-TT----TTTGG--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT----GTGTA-TAT-----AC-TTTACANNNN-----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNT---------------G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CTAC-AC-CAC---AAGA-A--T---T--A-TA----GC------G-------------T-GCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCACtgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   C-CCCCCG----TTTGA---AAATT-----A-----T--------CGGG-GT--CTG-AA----TTTGT---AAT-TTTGA-CTGCA---TATGA----AT-AA-GCATA-TAT-----ACATTGAAATGTACNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN-N--------N--G--GCAT-C--A---ACGAT-C--CCAG-AC-CCT---AAGA-AT-T---T--A-TA----CA------CC------------C-TCC------------CCC-G--TCTGA-A-ATTCCTGAG-C---CC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                          ccaccccaCC-CCCCCGCGTATTTGA---AATTT-----C-----T-------TGGG---C--TTG-TTA---TTTGT--AAATGCTTGAACTGCA---T---A----AT-AC-ACATA-TAT-----AC-TTAATCTGTA-----GTCA-------TATGCAATACTATACAT-TATGTAATT-T---T--TCT--CTTATCATCACTACGAAAAACCG---TATAT-ATCA-A--------G--GCAGCAT-CAAA---ACAA-CC--CCAG-AC-CGC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------AC------------T-CCTGGACCGCTTCCTCCC-GGTTCTGA-ATATTCCTGGA-T---CCCCCACcaagtgctgatttaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                           ccCAAAGGCGGATCCAGGGCTGGCGCACCGGGCGTA-CGtg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GT--AAAA-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-AC-TTATA-CAT-----NN-NNNNNNNNNN-----NNNN-------NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-----------G--G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-ACTCCC---AAGA-A--T---T--A-TA----CC------G-------------C-GCC------------CCT-GGTTCTGA-C-ATTCCTGGA-T---CCGCCACtaaaatttgactgcataatacttatacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcatcaaaacaatccccagactcccaagaattataccgcgcccctggttctgacattcctggatccgccactg


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lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        44444444    3      7777    666  0   8888888888888888888    77  55   3  1111     888   3     3     6666666 7777  3  4   4 4   9999999999  1 22    222222222222222222222222222222222222         11111111   66  22   55  2  5    11  66  1   33333333333333333333 66    3    555       44    3  3 1 555    3 11 555  3 3 6666  4444444444444444444444444444444444444444444444   2        3 3         3 555       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        ........    .      ....    ...  .   ...................    ..  ..   .  ....     ...   .     .     ....... ....  .  .   . .   ..........  . ..    ....................................         ........   ..  ..   ..  .  .    ..  ..  .   .................... ..    .    ...       ..    .  . . ...    . .. ...  . . ....  ..............................................   .        . .         . ...       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        33333333    6      7777    444  2   5555555555555555555    33  00   6  4444     666   3     3     5555555 7777  6  1   4 4   1111111111  0 00    333333333333333333333333333333333333         44444444   11  00   11  0  2    55  00  0   88888888888888888888 11    6    888       22    1  1 0 444    1 55 444  1 1 1111  5555555555555555555555555555555555555555555555   9        1 1         1 444       
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Reference ( family-1620 )     :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACCGGGCGCG-CGCC-CCCCCG----TTTG---AAATTT-----T-----T-------GGGGG-GT--CTG-TT----TTTGT--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-ACGCAT-A-TAT-----AC---TTTAAATGTA-------GNCANNNN-------CATTATTACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--CTNNTCTCCACTACGAAACANCGN-GTNTGTNNTC----------G-----G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CNC---AAGA-A--T---TA-T-A----CC------GC------------C----------CCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                               AAGGTGGATCCAGGGCCGGCACACCAGGAGTG-CG---CCCCTG----TTTA---AAA--T-----T-----T-------GGGGG-GT--CTG-TTTTAATTTGT--AAAT-TTTGA-CTGCA---C---A----ATGATGCA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCC--CCAG-AC-CCC---AACAGA--TCGATA-T-A----CC------CC------------C----------ACC------------CCCAGGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCAnggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatccccagaccccaacagatcgatatacccccacccccaggttctgaaattcctggatccacca
gi|10                         : aaggtggatccagggccggcacaccaggagtgcgcccctgtttaaaatttggggggtctgttttaatttgtaaattttgactgcacaatgatgcanggggggtaccggaagtcctgtccacaagcacaggtgtatacttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAGGCGGATCCAAGGC----GCCCC-----CC-CCCC-CTCCCG----TT-G---AATTTT-----T-----T-------GGGG---T--TTA-TT----TT-GT--AAAT-TTTGA-CTG-A---T---A-----T-ACGCAT-A-TAT-----------TTGAATGTA-------GTCAGCATTCGATTTCATTGTGACA-GTATATGTATTT-T---T--TCT--TTACTCT-CAATACAAAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTTGTATTTATCAAT--TCT--CTACTGTC-ACTTCAAAACAACGGTGCTTGTAA-A----------GAA---G--GCAT-AAAG---AAAA-CC--CCAG-AT-CAC---AAAG-ATTT---TA-T-A----CC------GCACCGGGACCCCGC----------CCC------------CCC-CGTTCTGATA-ATTCCTGGA-T---CCGCCACgac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                          gtacAAAGGCGGATCCAGGGCCGACGCACCAGGCGCG-CACC-CTCCCG----TTTG---AA---------T-----TGGGGGGGGGGGG-GG--CTGTTT----TTTGT--AAAT-TTTGC-CTGTA---T---A----AT-Atggtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CAT-CACA---ACAATCCTTCAAG-AC-CTC---AACC-A--T---TACT-G----CCCGGGGCGC------------C----------CCCGTCTACAC----TCC-AGTT-TGA-A-ATTCCTGGATT---CCGCCAC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGGATCAAGGGTCGGCGCACC--------CCAC-CTCCCG----TTAG---AATTTTA----T-----TGGGGG--GGGGG-GT--CTG-TT----TTT-T--AATA-TTTGA-CTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CAAA---ACAATCC--CCAG-AC-CCC---AAGA-A--T------T-A----CC-------C------------C----------CAC------------CCC-CGTTCTGA-A-TGTACTAGA-T---CCGCCAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----CC------CC------------T----------CCC------------CTC-CGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cggcgaccccccc-----G--GCAT-CAAA---ACAATTC--CCAG-AC-CCTTAGAAGA-A--T---TA-T-ACACCCC------CC------------C----------CCC------------CCC-GGTTCtctggtatact
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             CAAAGGCGAATCCGGGGCCGGCGCACCGGGCGCA-CGC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                           gTCAAAGGCGGATC--AGGCCGACGCACTCAGTGCGACGCC-CCCCTG----TTTGAGAAAATCT-----T-----T-------GAAGGTGT---TG-TT----TTTGTTAGAAT-TTTAG-CTGCAATGC---A----AT-GC-CACAA-TATCAATAAC---TTTAATTGTT-------AACAATGC-------AATGATTACA-G--TATGTATTT-T---TAATCTTCCTTATCTCCAC-AC-AAACTTTAG-GTTTGTGTTC----------ATAATCG--GCATACAAACACACATTTC--CCGGTAC-CAC---AAGA-ATTT---TA-TAA----CC------G-------------C----------GCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATT-CTGGA-TTCCCCGCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                            TCAAAGGCGGATCCAGGACCGGCGCACCGTGCGCT-CGCC-CCACTG----TTTG---AAATTT-----T-----T-------GGGGT-GT--CTG-GT----TTTGT--TAAT-TTTGA-CTGCC---T---A----AT-ACTCAT-A-TAT-----ACNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNN-------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN----------G-----G--GCAT-CAAA---ACAATTC--TCAG-GC-CAC---AAGA-A--T---TA-C-A----CC------GC------------T----------TCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCACtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                               AAGGCGGATCCAGGGCCGGCGCACC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAA---ACAATCC--CCAG-AT-ATC---TAGA-T--T---TA-T-A----CC------GC------------G----------CCC------------CCC-GTTTCTGA-A-ACTCCTTGA-T---CCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaacaatccccagatatctagatttataccgcgccccccgtttctgaaactccttgatcc
gi|5                          :                                                               aaggcggatccagggccggcgcaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCC-CCCCCC----TTTG---AAATTT-----T-----T-------GGGGT-GT--CTG-TT----TTTGT--TAAT-TTTGA-CTGCA---T---ATTTAAT-AATCAT-AATAT-----AC---NNNNNNNNNN-------NNNNNNNN-------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG-----G--GCAT-AAAA---ACAATCC--TCAG-AC-CAC---AAGA-A--T---TA-T-A----CC------GCG-----------CCGGGATCGCGCCC------------CCC-AGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCGCCAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                          cccCAAAGGCGGATCCTGGGCTGGCGCACC--------CCCCACCCCCA----TTTG---AAATTT-----T-----T-------TGGGG-GT--CTG-TT----TTTGG--AAAT-TTTGA-CTGCA---T---A----AT---GTGT-A-TAT-----AC---TTTACANNNN-------NNNNNNNN-------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNT-----------------G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CTAC-AC-CAC---AAGA-A--T---TA-T-A----GC------G-------------T----------GCC------------CCC-GGTTCTGA-A-ATTCCTGGA-T---CCACCACtgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   C-CCCCCG----TTTG---AAAATT-----A-----T--------CGGG-GT--CTG-AA----TTTGT---AAT-TTTGA-CTGCA---TATGA----AT-AAGCAT-A-TAT-----ACA--TTGAAATGTACNNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN----------N-----G--GCAT-C--A---ACGAT-C--CCAG-AC-CCT---AAGA-AT-T---TA-T-A----CA------CC------------C----------TCC------------CCC-G--TCTGA-A-ATTCCTGAG-C---CC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                          ccaccccaCC-CCCCCGCGTATTTG---AAATTT-----C-----T-------TGGG---C--TTG-TTA---TTTGT--AAATGCTTGAACTGCA---T---A----AT-ACACAT-A-TAT-----AC---TTAATCTGTA-------GTCATATG-------CAATACTATACAT-TATGTAATT-T---T--TCT--CTTATCATCACTACGAAAAACCGT-ATATATCA-A----------G-----GCAGCAT-CAAA---ACAA-CC--CCAG-AC-CGC---AAGA-A--T---TA-T-A----CC------AC------------T----------CCTGGACCGCTTCCTCCC-GGTTCTGA-ATATTCCTGGA-T---CCCCCACcaagtgctgatttaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                           ccCAAAGGCGGATCCAGGGCTGGCGCACCGGGCGTA-CGtg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GT--AAAA-TTTGA-CTGCA---T---A----AT-ACTTAT-A-CAT-----NN---NNNNNNNNNN-------NNNNNNNN-------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N---N--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN----------G-----G--GCAT-CAAA---ACAATCC--CCAG-ACTCCC---AAGA-A--T---TA-T-A----CC------G-------------C----------GCC------------CCT-GGTTCTGA-C-ATTCCTGGA-T---CCGCCACtaaaatttgactgcataatacttatacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggcatcaaaacaatccccagactcccaagaattataccgcgcccctggttctgacattcctggatccgccactg