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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATGGAACATAAGGAGTTAAAAAGAGCTGCTTAAGAAAAGCTTCTG-TTATATTCACAATGATTTCA-GTG-GTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTAAACTAATGCAAACTGAGATATCAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTG-TAATAATAATTCCTCTT-CATCATAGAAAATATAATAAATGATCTTTCACACCTTTATATGACCAG--TTTAATAACACA-TGTTTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCGGGATAGCTTCC--TATATGTAGTTTTTGTCAAAGGACGTTATATACATAAAGCATCAGAACTATAAAAACCTCTTGCCAAAAAATGTTGTTTTGGAAGT-----ATAGACACATTCAGAGAGTATATGCT-CTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAA-CCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTTGAGTATCAGCCATTTTTAAACCC-CATGTTTGTGAT--TGTGTTTCT-ATTGACCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACATGAATTCATAAAATATCTTAATTA-ATGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGGTGTGCTGGAAGAG-TAA-AAATAAATGGTT-A---TTTTT-GGCAATAAGCTATGACTTGACCACTGTTACACGACCCAATTAGGTGTTAGAATTCGTCTCT-TCCAGTG-TGG-ATAGAATGCTTTTAATTTTAGGAAC-TG-AGAGATGGTAATTTAGA-TC---TGTGATTT-GTTGAAAGGTTCAAGGACAGAAAAGTTATATACCTAGTAAGTTAAAAGTTGTGGAGCCCCAGTCAAGTGCTCATCTAAGAATGATGAAAGACC----AGATTTG---AATTTTTTATTGA-TCGATGCCAACACAATTTCTGTTTTTGGTAC-AG-TT-ACCTTTAAACCAGAAGCTTGAGGAAAA-AAT-CTAAGTTATCTACAAGCTG-AAAA-----AGTGACTT----AGAT-TCCATTCAAG-GC--AAG--ATGTATCATC-GCATACTG-GCT--A---T-TTGTGTTCCTGTT-AT-CACCATC-ACAAT---TACTTTTTA-TATCCTTATTTTGTTTAATTAAAAATGCCTAGAATTTC--CAGCA-ATCGAG--GG-GAACAAATATGGAATGC-ACAGC--GATCACCTT---G-T--TGCAGGCCCCTAC-TCAAATATG-TGAACTTTGATCACGACAAAAACACCACTCTGTGAACTGCA-GC--CCTAAAATATTT-TA---TTAA----GAAGCTATAACCCATTC--AAT-ATGTAATCA-----CCAAA---A--AACAA--AAT----ATCT-AATA-CTTG--TAAATAAATGACCATGAAAT--GGAG-CAAAAGC-TTTTC---AA-ATCGATATAA--A-ACCAATAGC-CCTGGTATATTT-TTAT-TTC--TGAATAAGTCCATTAAGT-AT-TATGAATC-----T-G-TGTT--T--TCACC--TATGTACCTTCCCTTTAGGAAGCCAGAT-TGGGTT--TGGTACTGAA--AATCA-AGATGATCTTAAAGTA-AGACTTGGATTCTAT-----TACTAAG-----AC-A-TCTG-A-ATG-AGTTGTTATACATGACATTATACACAAGCGTAATACGGTACTCCAGTTTTT-GTAAAAAACTGTCTAGTTTTCTCA-CCTTTTA-GGCAAACAACGAGATGATTCCCAATCGCTGAGAAATGGGGAAGTTTCGTTTT-TGAGAGAAAATCAGTTGATTA-----TTTTA-AATATAATTTCTCTT--TTAAATCAT-CCAAAAAAATTTGAAAAGTTCAACACA---AATCC--ATCACTACCTGGATATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGTACT-TCCAAAAAATTTC-CTTTTTGCAGAAAATGATTTT-TCA--CAGAG-ACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATGTCT-TA---TTAAAATTGAAG--AT--CGCATTCCTAAT--T-TAGGGA-----CCAAA---ATTGA-AG--AATTGCCAGCT-GTTT-TTTG--TA--TAAATGACCATGACGT--GTAT-CAAATGC-TTTTTCG-AA-GTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT-CCAGGTCTATTT-TTCTCTTCAGTGTAT---TGCATTAA---AT-CG-AAATCAGCCTT-G-TATT--TGGTCACCAAAAT-TA---TCTCTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTT----AATTATTGGTG-TCATATAGTATGGGGTTGT-TTTTATGTGGCTACTGGGCCCATAC-A-CCTG---ATGCAATT-TTATAC---ACAGTATTTAAAAGGGTAAT-TGGTCCTCCAATTTTTCATGATAA--TGTCTTGGCTGGTCA-CCTTT---GGTAAatttattaaatattggtatcaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccaaatgattatccgcacagattaaaaatatataaggtggaaaaaggatcaccctgtcctgcaacttctctgatagtgattctatcgagatattgccacctggtttattttacagatgtTAACCCATTG--AATCATGTATTTA-----CCAAA---A--C-CAA--AAT----ATCTTAATG-ATTT--TAAAAAAATGACCATGAAAT--GGAGTCAAAAGCATTTTC---AAGATCGAT-CAA--A-ACCAATAAT------TATGTTT-AT-T-TTC--TGTATAA-TGCATTAAGTCATATATGAATC-----C-GGTGTT--T--TCACC--AATGTACCTTTCCTTTAGGAAGCCAGAT-TGAGtaaagtaatactaccatatctttgtgtaatagaaagaacaggctattttcataaccatattaataatctaactacgaaagatcccaaatatgtttccaaaaacatcttaaaattcagcagaaaaaccatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tct-AGGTGCTCT--AAATA--GACTTG-ATTTTAT-----TACTAGG-----ACAA-CCTGAA-ATG-AAT--TTACATATGGCATTA-A---AAATGTAATA-GGT-TTCCAGTTTT---TAAAAA
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): TTCTCTGAGCAATACATCCTGATCCAATTTTGTAAGCAACATTAAGTAAAGTAATTGATCTCAGTTTTTCATAAAATATTTACATTTACCCTCTTTAGGAATGCAAGTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTACTGAAAATTCTCTAATATCATGTCCAAAATTTAAAACTCAAACCACAAAATGTCCTATTTTACAACAAAAAACTTTATAAAATTCTGTTGTAAAGCCATCA
Unaligned ( gi|9 ): AGGTATTACCAGACTTTGGTGTTAATATCTTGTGATATCCAATGCATTCTTCAACCTTATATTTGTTGTATAGATAGAACAATATCCCAACGGTAAATATTTTTTTTTACCTTTTTTCAAACACGAAAAAAAAATACACTTGTATACAGGATAAGAACAATTGCAGTATTGTGTTGCCTTTAGATCAGGGGAGTTCACAAAATAATATATCAACTTAATAT
Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|12 ): TGGACAAATGATTTAATTTCGGATTAAATAAAGTTGTAATGACAGTGACTAGACCAATAGGAGTAAGAATTCCTCTTTTCATCGGTTCCATGGTTGCAATAATTTTGGAATTTGGAATCCAAAGTTTATATCAACAATTTCATTAAGATCAACAGAAAATTGAAAGCCTAATAAAT
Unaligned ( gi|13 ): TTTTATTCTACTGGCAATACAACCTGATGCGATTTTATACACAGTATTTAATAGAGTATTTGGTCTCCAATCGTTTTCCAGATAATATCTTGGCTTGTCACTTTTTGGTAATAAAGTAATGATACCATGCCTTTGAGTAATAGAAAAACTGTTATTTTCATAACCATAA
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGACAATAAGGAGT-AAAAAGATCTG-TTAAGAAAAGCTT-TGCTTAT-TTCA-AATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTAT-ATATTGTTAAT--ATGCAAACTTGGATATAA--AATT-TTGCTGAAAANNNTGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AGA-CT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCCAAAA-TCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAAA--AATATC--AATCCAGGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGNNAGTGACAGTAAA--CAAATGGTTTAAGCTTGCTAGGCAATAANTAGTGTTTTGACAACTGCNACCCGACCAAATGGANNGTTAGGGCTCGTCTCTATCCAATGCTNNTATCGAATGCTTCTAATTTTGGNANCCTGTATGNATTGTANTTCAAAATCAACTATGANTTAGTTNNNAATCCCAA---CNGAAAAGTTNTATGCCTAATAAGTTGAAAGTNGTNNANCCCCCGTCNAGTTTCCNTCTTAGNATGGTGANAGACC-GATCT---G--AAANTT-TTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTTTTGTTTTTTGAGC-ANTTACTTTTAAACCAGA-A--------T------AAA-G-A-TCTA---T---ATCTG-CGAG--G-AAAA-----AGAGATTC---G--AG-A--CCAT-C-AGGG--C---A-G--ATG-----TNTCGTC-GCATATTG-GNC--A--T-TTGTGCTCCT-TTATCATCANCAACAATACCTNCCTNTNACTATCTTTATTTTGCTTGACTAAGANTAGCNAGNATTTCGGC-GCACAT-GAGATGGTAAANGGATATGG--TGCGACAGNAGGNNCNCCCTGACGCTTGTGCANGNNCCTGCGTTGGGTATGATNAANTTCGCTCATGAGAGGAA-ACCGCTTTGTGNAATANATGNTGCTTNNAATGTNT-TA-TTAAAAA--TNT-NA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANACAA--AAT----AGC-TAATNNTTNTA---AATAAACGACCAT-GANATGGANTCGAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACAAATAAT--CC-GGTNTATTTTT-T--T--TCAGTGTATGA-TGCATTAAGTCATACGCGAATC-----C-GTATT--T--TCACCAA--TGTACCTTCCCTTTATGAAACCAGAT-TGAACCATCGGTACCNAATAAATCAAGGTG-TC----A----GT-A--GANTT-GATTTTAT-----T--ACTAGG-----AC-A-CCCG-A-ATG-AATT-T-TATANA--ACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-CTCCAAT--TTTT--TGANAAATTGTCTTGGCTNGTCAGCCTTTTGTGGCAAACAA-GTGATAATCCCCAGTCTTTGTGAGAT--TG--AA-------GCTCCT-TTTTCTTA---AAAAT--G-TGATTAACAGCTT--CTACAGTATAAT---TCTTGAT-T--GTCCTTCCAAAAAAA-CTTAAAAAACTCAAC-CAGTGAATTCCAATCACTTCCTGGTGATTT-GTTATTTT-TCATATTTTTTCAAGACTGT---AAAAATTTCACTTT---CAG---AT-ATCTTGTCATCCAGAGAATTTTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatTGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGC-TGTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CCAGGTCTATTTTT-C--TCTTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-GTATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATCTT--GTACTTAATTATT---GGTG-TC----ATATAGT-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATAC-A-CCTG-A--TGCAATT-T-TATAC---ACAGTATTT--A-A-AAGGGTAAT-TGGTCCTCCAAT--TTTTCATGATAA--TGTCTTGGCTGGTCA-CCTT---TGGTAATAAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA---TTTTCATA---ACCAT------ATTAATAATCTAACTAC-GAAAGAT---CCCAAATAT--GT--TTCCAAAAACATCTTAAAA
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTGTAAGACC---TCT---GCAGAATTTGTTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTGTTGTTTTTTAACA-ATTTACTTTTAAACCAGATA--------TTTTACCAAA-GTATTCTA-------ATGTGTCAAG--G-ACAGCATGTAGAGATTT---GGCAGAA--CCAT-C-AAGAGTT---A-GGAATG-----TTTCATCAGCATACTGAGAC--A--TCTTATG-GCCT-TTATCATTAACAACAATACCTTCTTGTTACTA--TTTATTTTATT--ATTAAAATT--CAAGTATTTCGGC-GCA----GAGATGG-AAAAGGATATGA--C---ACAACAGGATCGCCCTGACG-TTGTGTATGAACCTGCGTTGGATATGA--AAC--CGCTCA-GAGAGAAA-ACCACTTTGTAAAATAGATGC--CTTAAAAT-TAG-TG-TTTAAAA--TTTGGA----TCAAGTA--AAT-A-ATATTTTCA-----CCAAAGCCAAACAATGAAG----AAC-T-----TTATA---AATGGAAGACCAT-AATATAGATTC-AAAGTTTATTT--Ac
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-CAGTAAATAAATGGTT-A-GCTTGCT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACAACTGTNACNCGACCAAATGA-GTGTTAGGACTCGTCTCT-TCCAATGCTGTAT-GAATGCTTCTAATTTTAGGAAC-TG-ATGGAT-GTANTTTAAAATC--CTGTGATTTAGTTNAAAGTCT-----ACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGA-AG-TTG----A--AA------AAT---CTA---T---ATCTG-CGAGC-G--AAAA-----AGAGATTT---G--AGA--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATG-----TATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGCTCCT-TTATCAT-CATCA-CAATATACTTTTTAT-A-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAANAAATATGG--CGC-ACAGC-GGATCGCCTT---GTTGTGCANG--CCTGC-TCGGATA-TGAT-AACTTCGNTCACGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGAAATACA-GC--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-G-TGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGA-TCTCGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA---C--GACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-C-TCCAAT---TTT--TCA-GAAANTGTCTTGGCTTGTCA-CCTTTTGTGGCAA-NNAA-GTGATGATNCCNNGTCTTTGNGNAAT--AG--AA-------GCTNC-T-TTTTCNTA-AAAAT--G-TGATTAACAGCTT--CTACAGTATAAT---TCTTGAT-T--GT-CTTCCAAAAAAA-CTTAAAAAGCTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCT---GTCCTGCAA----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-G-TATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGA-TCTTG-TACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA---C---ACAGTA--TTTA-A-AAGGGTAAT-TGGT-CCTCCAAT---TTT--TCATGATAATGTCTTGGCTGGTCA-CCTT---TGGTAA-TAAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TTTTCATA-ACCAT------ATTAATAATCTAACTAC-GAAAGAT---CCCAAATAT--GT--TTCCAAAAACATCTTAAAA--TTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGGTTTA---TTGTT-GACA-TAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAAAT-A-TTGTTAGGACTCGTCTTT-TCCAATGCTGTATAGAATGCTTCTAATTTTAGGAACCTGTATGGA--GTAGTTCAAA--T--CT-TGAGTTAGTTATAAATCT-----ACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC----------------------------T---CTA---T---AGCT-----GC-A--AAAA-----AG----TT---A---------A-T--------C---AG--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTG-TTCT-TTATCAgaaaaaccatc
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAG-C--AACATTAAGT--A-A-A---GTAAT-TGAT-C-T-CAGT---TTT--TCA-TAAAATATTT--ACAT-TTA-CCCTCTTTAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AA-------AATTC-T-CT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|12 ): TGGACAAATGATTTAATTTCGGATTAAATAAAGTTGTAATGACAGTGACTAGACCAATAGGAGTAAGAATTCCTCTTTTCATCGGTTCCATGGTTGCAATAATTTTGGAATTTGGAATCCAAAGTTTATATCAACAATTTCATTAAGATCAACAGAAAATTGAAAGCCTAATAAAT
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-TAA-AAATAAATGG-TTA---TTNTT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACAACTGTNACNCGACCAA---AT--AGTGTTAGGACTCGTCTCT-TCCAATGCTGTATAGAATGCTTCTAATTTTAGGAA-CTG-ANNGAT-GTANTTTAAA-TCTGTGATTTAGTTNAAAGTCT-----ACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGA-ANTT-----NA--AA------AAT---CTA---T---ATCTACGA--GC-G--AAAAAGAGATTT---G--AGA--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATG-----TATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGNTCCT-TTATCAT-CATCA-CAATATACTTTTTAT-A-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAATAAATATGG--TGC-ACAGC-GGATCGCCCTG---TT-TGCA--AG--CCTNC-TCNGATA-TGAT-AACTTCGNTCGCGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGNAATACA-GN--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-GTGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGATT--CGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA---C--GACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-C-TCCA---GTTTTT-CA-GAAAA-TGTCTTGGCTTGTCA-CCTTTT-TGGCAAN-CAA-GTGATAATNCCNTGTCTTTGAGTAAT--NG--AA-------GCTNC-T-TT--T-TCATA---AAAAT--G-TGATTAACAGCTT---CTACAGTATAAT---TCTTGAT-T--GT-CTTCCA--AAAAAA-C-TTAAAAAGTTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCTG---TCCTGCA--A----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-GTATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA---C---ACAGTA--TTTA-A-AAGGGTAAT-TGGT-CCTCCA---ATTTTT-CATGATAA-TGTCTTGGCTGGTCA-CC--TT-TGGTAAT-AAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TT--T-TCATA---ACCAT------ATTAATAATCTAA-CTAC-GAAAGAT---CCCAAATAT--GT--TTCCA--AAAACATC-TTAAAA--TTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGGTTTA---TTGTT-GAC-ATAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAA---AT--ATTGTTAGGACTCGTCTTT-TCCAATGCTGTATAGAATGCTTCTAATTTTAGGAACCTGTATGGA--GTAGTTCAAA-TCT-TGAGTTAGTTATAAATCT-----ACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC----------------------------T---CTA---T---AGCT------GC-A--AAAAAG----TT---A---------A-T--------C---AG--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTGTT-CT-TTATCAgaaaaaccatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGGTGTAAGACC---TCT---GCAGAATTTGTTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTGTTGTTTTTTAA-CAATTTACTTTTAAACCAGATATTT-----TACCAA------AGTATTCTAATGT---GTCAAGGACAGC----ATGTAGAGATTT---GGCAGAA-CCA-TCAAG-AGTT---AGGAATG-----TTTCATCAGCATACTGAGA---C--ATCTTATGG-CCT-TTATCAT-TAACAACAATAC-CTTCTTGTTACTATTTATTTTATT--ATTAAAA-T-T-CAAGTATT-TCGGC-GCA----GAGAT-GGAAAAGGATATGA----C-ACAACAGGATCGCCCTGACGTTGTGTATGAA--CCTGCGTTGGATA-TGA--AAC--CGCTCA-GAGA--GAAA-ACCACTTTGTAAAATAGATGC--CTTAAAAT-TAG-TG-TTTAAAA--TTTGGA----TCAAGTA--AAT-A-ATATTTTCA-----CCAAAGCCAAACAATGAAG----AACT------TTATA---AATGGAAGACCAT-AATATAGATTC-AAAGTTTATTT--Ac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAG-C--AACATTAAGT--A-A-A---GTAAT-TGAT-C-TC-A---GTTTTT-CA-TAAAA-TATTTACATTTACC---CTCTT-TAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AA-------AATTC-T-CTAATATCATGTCCAAAAT-------TTAA-AACTCAAACCACAA---AATG--TCCT-AT-T------TTACAACAAAAAA-CTTTATAAAATTC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|12 ): TGGACAAATGATTTAATTTCGGATTAAATAAAGTTGTAATGACAGTGACTAGACCAATAGGAGTAAGAATTCCTCTTTTCATCGGTTCCATGGTTGCAATAATTTTGGAATTTGGAATCCAAAGTTTATATCAACAATTTCATTAAGATCAACAGAAAATTGAAAGCCTAATAAAT
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-TAA-AAATAAATGG-TT-A---TTNTT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACAACTGTNACNCGACCAA---AT--AGT-GTTAGGACTCGTCTCT-TCCAAT--GCTGTATAG----AATGCTTCT--AATTTTAGGAA-CTG-ANNGAT-GTANTTTAAA-TCTGCGATTT-GTTNAAAGTCT-----ACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGA-ANNT-----AAAA------AATCTA--A--TATCNANG--AGC-G--AAAAAGAGATTT---G--AG-A--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATG-----TATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGTTCCT-TTATCAT-CATC-ACAATATACTTTTTA-TA-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAATAAATATGG--TGC-ACAGC-GGATCGCCCT---GTT-TGCA--AG--CCTNC-TCNGATA-TGAT-AACTTCGNTCGCGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGNAATACA-GN--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-GTGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGATT--CGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA---C--GACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-C-TCCA---GTTTTT-CA-GAAAA-TGTCTTGNCTTGTCA-CCTTTT-TGGCAAT-CAA-GTGATAATNCCNTGTCTTTGAGTAAT--NG--AA-------GCTNC-T-TT--T-TCATA---AAAAT--G-TGATTAACAACTT-AACTACAGTATAAT-TCCTGAT-T---GT-CTTCCA--AAAAAA-C-TTAAAAAATTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCT---GTCCTGCA--A----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-GTATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA---C---ACAGTA--TTTA-A-AAGGGTAAT-TGGT-CCTCCA---ATTTTT-CATGATAA-TGTCTTGGCTGGTCA-CC--TT-TGGTAAT-AAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TT--T-TCATA---ACCAT------ATTAATAATCT-AACTAC-GAAAGAT-CCCAAATAT---GT--TTCCA--AAAACATC-TT--AAAATTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGGTTT-A---TTGTT-GAC-ATAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAA---AT--ATT-GTTAGGACTCGTCTTT-TCCAAT--GCTGTATAG----AATGCTTCT--AATTTTAGGAACCTGTATGGA--GTAGTTCAAA-TCT-TGAGTTAGTTATAAATCT-----ACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC--------------------------TCT---A--TAGCT------GC-A--AAAAAG----TT---A----------A-T--------C---AG--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTGTT-CT-TTATCAgaaaaaccatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGTGTAAGACC---TCT---GCAGAATTTGTTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTGTTGTTTTTT-AACAATTTACTTTTAAACCAGATATTTTACC-AAAGT-----ATTCTA--ATGTGTCAAGGACAGC----ATGTAGAGATTT---GGCAGAA--CCA-TCAAG-AGTT---AGGAATG-----TTTCATCAGCATACTGAGA---C--ATCTTATG-GCCT-TTATCAT-TAACAACAATAC-CTTCTTGTTACTATTTATTTTATT--ATT-AAAAT-T-CAAGTATT-TCGGC-GCA----GAGAT-GGAAAAGGATATG----AC-ACAACAGGATCGCCCTGACGTTGTGTATGAA--CCTGCGTTGGATA-TGA--AAC--CGCTCA-GAGA--GAAA-ACCACTTTGTAAAATAGATGC--CTTAAAAT-TAG-TG-TTTAAAA--TTTGGA----TCAAGTA--AAT-A-ATATTTTCA-----CCAAAGCCAAACAATGAAG----AACT------TTATA---AATGGAAGACCAT-AATATAGATTC-AAAGTTTATTT--Ac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAG-C--AACATTAAGT--A-A-A---GTAAT-TGAT-C-TC-A---GTTTTT-CA-TAAAA-TAT-TTACATT-TAC-CCTCTT-TAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AA-------AATTC-T-CTAATATCATGTCCAAAAT-------TTAA-AACTCAAACCACAA---AATGTCCT-AT-T-------TTACAACAAAAAA-CTTTATAAAATTC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-TAA-AAACAAATGG-TT-A---TTNTT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACGACTGTNACTCGACCAA---AT--AGT-GTTAGAATTCGTCTCT-TCCAAT--GTTGTATAG----AATGCTTTT--AATTTTAGGAAC-TGAAAGAT-GTANTTTAAA-TCNACGATTT-GTTNAAAATCT-----ACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGAANNTT---GA--A---AA--AATCTA--A--TATCNANG--AGC-G--AAAAAGAGATTT---G--AG-A--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATG-----TATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGTTCCT-TTATCAT-CATC-ACAATATACTTTTTA-TA-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAATAAATATGG--TGC-ACAGC-GGATCGCCCT---GTT-TGCA--AG--CCTNC-TCNGATA-TGAT-AACTTCGNTCGCGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGNAATACA-GN--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-GTGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGATT--CGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA---C--GACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-C-TCCA---GTTTTT-CA-GAAAA-TGTCTTGNCTTGTCA-CCTTTT-TGGCAAT-CAA-GTGATAATNCCNTGTCTTTGAGTAAT--NG--AA-------GCTNC-T-TT--T-TCATA---AAAAT--G-TGATTAACAACTT-AACTACAGTATAAT-TCCTNAT-T---GT-CTTCCA--AAAAAA-C-TTAAAAAATTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCT---GTCCTGCA--A----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-GTATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA---C---ACAGTA--TTTA-A-AAGGGTAAT-TGGT-CCTCCA---ATTTTT-CATGATAA-TGTCTTGGCTGGTCA-CC--TT-TGGTAAT-AAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TT--T-TCATA---ACCAT------ATTAATAATCT-AACTAC-GAAAGAT-CCCAAATAT---GT--TTCCA--AAAACATC-TT--AAAATTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGG-TTTA---TTGTT-GACA-TAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAA---AT--ATT-GTTAGGACTCGTCTTT-TCCAAT--GCTGTATAG----AATGCTTCT--AATTTTAGGAACCTGTATGGA-GTAGTTCAAA-TCT-TGAGTTAGTTATAAATCT-----ACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC--------------------------TCT---A--TAGCT------GC-A--AAAAAG----TT---A----------A-TC-----------AG--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTGTT-CT-TTATCAgaaaaaccatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGTGTAAGACC---TCT---GCAGAATTTGTTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTGTTGTTTTTT-AACAATTTACTTTTAAACCAGATATTT---TACCA---AAGTATTCTA--ATGTGTCAAGGACAGC----ATGTAGAGATTT---GGCAGAA--CCA-TCAAG-AGTT---AGGAATG-----TTTCATCAGCATACTGAGA---C--ATCTTATG-GCCT-TTATCAT-TAACAACAATAC-CTTCTTGTTACTATTTATTTTATT--ATT-AAAAT-T-CAAGTATT-TCGGC-GCA----GAGAT-GGAAAAGGATATG----AC-ACAACAGGATCGCCCTGACGTTGTGTATGAA--CCTGCGTTGGATA-TGA--AAC--CGCTCA-GAGA--GAAA-ACCACTTTGTAAAATAGATGC--CTTAAAAT-TAG-TG-TTTAAAA--TTTGGA----TCAAGTA--AAT-A-ATATTTTCA-----CCAAAGCCAAACAATGAAG----AACT------TTATA---AATGGAAGACCAT-AATATAGATTC-AAAGTTTATTT--Ac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAG-C--AACATTAAGT--A-A-A---GTAAT-TGAT-C-TC-A---GTTTTT-CA-TAAAA-TAT-TTACATT-TAC-CCTCTT-TAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AA-------AATTC-T-CTAATATCATGTCCAAAAT-------TTAA-AACTCAAACCACAA---AATGTCCT-AT-T-------TTACAACAAAAAA-CTTTATAAAATTC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-TAA-AAACAAATGG-TT-A---TTNTT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACGACTGTNACTCGACCAA---AT--AGT-GTTAGAATTCGTCTCT-TCCAAT--GTTGTATAG----AATGCTTTT--AATTTTAGGAAC-TGAANGNT-GTANTTTAAA-TCNACGATTTNNTNN-AAATCT-----ACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGAAANTT---GA--A---AA--AATCTA--A--TATCNANG--AGC-G--AAAAAGAGATTT---G--AG-A--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATGT-----ATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGTTCCT-TTATCAT-CATC-ACAATATACTTTTTA-TA-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAATAAATATGG--TGC-ACAGC-GGATCGCCCT---GTT-TGCA--AG--CCTNC-TCNGATA-TGAT-AACTTCGNTCGCGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGNAATACA-GN--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-GTGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGATT--CGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA---C--GACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-CTCCA---GTTTTT-CA-GAAAA-TGTCTTGNCTTGTCA-CCTTTT-TGGCAAT-CAA-GTGATAATNCCNTGTCTTTGAGTAAT--NG--AA-------GCTNC-T-TT--T-TCATA---AAAAT--G-TGATTAACAACTT-AACTACAGTATAAT-TCCTNAT-T---GT-CTTCCA--AAAAAA-C-TTAAAAAATTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCT---GTCCTGCA--A----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-GTATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA---C---ACAGTA--TTTA-A-AAGGGTAAT-TGGTCCTCCA---ATTTTT-CATGATAA-TGTCTTGGCTGGTCA-CC--TT-TGGTAAT-AAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TT--T-TCATA---ACCAT------ATTAATAATCT-AACTAC-GAAAGAT-CCCAAATAT---GT--TTCCA--AAAACATC-TT--AAAATTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGG-TTTA---TTGTT-GACA-TAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAA---AT--ATT-GTTAGGACTCGTCTTT-TCCAAT--GCTGTATAG----AATGCTTCT--AATTTTAGGAACCTGTATGGA-GTAGTTCAAA-TCT-TGAGTTAGTTATAAATCT-----ACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC--------------------------TCT---A--TAGCT------GC-A--AAAAAG----TT---A----------A-TCA-----------G--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTGTT-CT-TTATCAgaaaaaccatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGTGTAAGACC---TCT---GCAGAATTTGTTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTGTTGTTTTTT-AACAATTTACTTTTAAACCAGATATTT---TACCA---AAGTATTCTA--ATGTGTCAAGGACAGC----ATGTAGAGATTT---GGCAGAA--CCA-TCAAG-AGTT---AGGAATGT-----TTCATCAGCATACTGAGA---C--ATCTTATG-GCCT-TTATCAT-TAACAACAATAC-CTTCTTGTTACTATTTATTTTATT--ATT-AAAAT-T-CAAGTATT-TCGGC-GCA----GAGAT-GGAAAAGGATATG----AC-ACAACAGGATCGCCCTGACGTTGTGTATGAA--CCTGCGTTGGATA-TGA--AAC--CGCTCA-GAGA--GAAA-ACCACTTTGTAAAATAGATGC--CTTAAAAT-TAG-TG-TTTAAAA--TTTGGA----TCAAGTA--AAT-A-ATATTTTCA-----CCAAAGCCAAACAATGAAG----AACT------TTATA---AATGGAAGACCAT-AATATAGATTC-AAAGTTTATTT--Ac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAG-C--AACATTAAGT--A-A-A---GTAAT-TGAT-CTC-A---GTTTTT-CA-TAAAA-TAT-TTACATT-TAC-CCTCTT-TAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AA-------AATTC-T-CTAATATCATGTCCAAAAT-------TTAA-AACTCAAACCACAA---AATGTCCT-AT-T-------TTACAACAAAAAA-CTTTATAAAATTC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AGGTATTACCAGACTTTGGTGTTAATATCTTGTGATATCCAATGCATTCTTCAACCTTATATTTGTTGTATAGATAGAACAATATCCCAACGGTAAATATTTTTTTTTACCTTTTTTCAAACACGAAAAAAAAATACACTTGTATACAGGATAAGAACAATTGCAGTATTGTGTTGCCTTTAGATCAGGGGAGTTCACAAAATAATATATCAACTTAATAT
Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-TAA-AAACAAATGG-TT-A---TTNTT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACGACTGTNACTCGACCAA---AT--AGT-GTTAGAATTCGTCTCT-TCCAAT--GTTGTATAG----AATGCTTTT--AATTTTAGGAAC-TGAANGNT-GTANTTTAAA-TCNACGATTTNATTA-AAA---TC---TACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGAAANTT---GA--A---AA--AATCTA--A--TATCNANG--AGC-G--AAAAAGAGATTT---G--AG-A--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATGT-----ATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGTTCCT-TTATCAT-CATC-ACAATATACTTTTTA-TA-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAATAAATATGG--TGC-ACAGC-GGATCGCCCT---GTT-TGCA--AG--CCTNC-TCNGATA-TGAT-AACTTCGNTCGCGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGNAATACA-GN--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-GTGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGATT--CGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA---C--GACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-C-TCCA---GTTTTT-CA-GAAAA-TGTCTTGNCTTGTCA-CCTTTT-TGGCAAT-CAA-GTGATAATNCCNTGTCTTTGAGTAAT--NG--AA-------GCTNC-T-TT--T-TCATA---AAAAT--G-TGATTAACAACTT-AACTACAGTATAAT-TCCTNAT-T---GT-CTTCCA--AAAAAA-C-TTAAAAAATTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCT---GTCCTGCA--A----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-GTATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA---C---ACAGTA--TTTA-A-AAGGGTAAT-TGGT-CCTCCA---ATTTTT-CATGATAA-TGTCTTGGCTGGTCA-CC--TT-TGGTAAT-AAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TT--T-TCATA---ACCAT------ATTAATAATCT-AACTAC-GAAAGAT-CCCAAATAT---GT--TTCCA--AAAACATC-TT--AAAATTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGG-TTTA---TTGTT-GACA-TAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAA---AT--ATT-GTTAGGACTCGTCTTT-TCCAAT--GCTGTATAG----AATGCTTCT--AATTTTAGGAACCTGTATGGA-GTAGTTCAAA-TCT-TGAGTTAGTTATAAA---TC---TACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC--------------------------TCT---A--TAGCT------GC-A--AAAAAG----TT---A----------A-TCA-----------G--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTGTT-CT-TTATCAgaaaaaccatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGTGTAAGACC---TCT---GCAGAATTTGTTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTGTTGTTTTTT-AACAATTTACTTTTAAACCAGATATTT---TACCA---AAGTATTCTA--ATGTGTCAAGGACAGC----ATGTAGAGATTT---GGCAGAA--CCA-TCAAG-AGTT---AGGAATGT-----TTCATCAGCATACTGAGA---C--ATCTTATG-GCCT-TTATCAT-TAACAACAATAC-CTTCTTGTTACTATTTATTTTATT--ATT-AAAAT-T-CAAGTATT-TCGGC-GCA----GAGAT-GGAAAAGGATATG----AC-ACAACAGGATCGCCCTGACGTTGTGTATGAA--CCTGCGTTGGATA-TGA--AAC--CGCTCA-GAGA--GAAA-ACCACTTTGTAAAATAGATGC--CTTAAAAT-TAG-TG-TTTAAAA--TTTGGA----TCAAGTA--AAT-A-ATATTTTCA-----CCAAAGCCAAACAATGAAG----AACT------TTATA---AATGGAAGACCAT-AATATAGATTC-AAAGTTTATTT--Ac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAG-C--AACATTAAGT--A-A-A---GTAAT-TGAT-C-TC-A---GTTTTT-CA-TAAAA-TAT-TTACATT-TAC-CCTCTT-TAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AA-------AATTC-T-CTAATATCATGTCCAAAAT-------TTAA-AACTCAAACCACAA---AATGTCCT-AT-T-------TTACAACAAAAAA-CTTTATAAAATTC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-TAA-AAACAAATGG-TT-A---TTNTT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACGACTGTNACTCGACCAA---AT--AGT-GTTAGAATTCGTCTCT-TCCAAT--GTTGTATAG----AATGCTTTT--AATTTTAGGAAC-TGAANGNT-GTANTTTAAA-TCNACGATTTNATTA-AAA---TC---NACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGAAANTT---GA--A---AA--AATCTA--A--TATCNANG--AGC-G--AAAAAGAGATTT---G--AG-A--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATGT-----ATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGTTCCT-TTATCAT-CATC-ACAATATACTTTTTA-TA-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAATAAATATGG--TGC-ACAGC-GGATCGCCCT---GTT-TGCA--AG--CCTNC-TCNGATA-TGAT-AACTTCGNTCGCGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGNAATACA-GN--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-GTGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGATT--CGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA---C--GACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-CTCCA---GTTTTT-CA-GAAAA-TGTCTTGNCTTGTCA-CCTTTT-TGGCAAT-CAA-GTGATAATNCCNTGTCTTTGAGTAAT--NG--AA-------GCTNC-T-TT--T-TCATA---AAAAT--G-TGATTAACAACTT-AACTACAGTATAAT-TCCTNAT-T---GT-CTTCCA--AAAAAA-C-TTAAAAAATTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCT---GTCCTGCA--A----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-GTATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA---C---ACAGTA--TTTA-A-AAGGGTAAT-TGGTCCTCCA---ATTTTT-CATGATAA-TGTCTTGGCTGGTCA-CC--TT-TGGTAAT-AAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TT--T-TCATA---ACCAT------ATTAATAATCT-AACTAC-GAAAGAT-CCCAAATAT---GT--TTCCA--AAAACATC-TT--AAAATTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGG-TTTA---TTGTT-GACA-TAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAA---AT--ATT-GTTAGGACTCGTCTTT-TCCAAT--GCTGTATAG----AATGCTTCT--AATTTTAGGAACCTGTATGGA-GTAGTTCAAA-TCT-TGAGTTAGTTATAAA---TC---TACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC--------------------------TCT---A--TAGCT------GC-A--AAAAAG----TT---A----------A-TCA-----------G--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTGTT-CT-TTATCAgaaaaaccatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGTGTAAGACC---TCT---GCAGAATTTGTTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTGTTGTTTTTT-AACAATTTACTTTTAAACCAGATATTT---TACCA---AAGTATTCTA--ATGTGTCAAGGACAGC----ATGTAGAGATTT---GGCAGAA--CCA-TCAAG-AGTT---AGGAATGT-----TTCATCAGCATACTGAGA---C--ATCTTATG-GCCT-TTATCAT-TAACAACAATAC-CTTCTTGTTACTATTTATTTTATT--ATT-AAAAT-T-CAAGTATT-TCGGC-GCA----GAGAT-GGAAAAGGATATG----AC-ACAACAGGATCGCCCTGACGTTGTGTATGAA--CCTGCGTTGGATA-TGA--AAC--CGCTCA-GAGA--GAAA-ACCACTTTGTAAAATAGATGC--CTTAAAAT-TAG-TG-TTTAAAA--TTTGGA----TCAAGTA--AAT-A-ATATTTTCA-----CCAAAGCCAAACAATGAAG----AACT------TTATA---AATGGAAGACCAT-AATATAGATTC-AAAGTTTATTT--Ac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAG-C--AACATTAAGT--A-A-A---GTAAT-TGAT-CTC-A---GTTTTT-CA-TAAAA-TAT-TTACATT-TAC-CCTCTT-TAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AA-------AATTC-T-CTAATATCATGTCCAAAAT-------TTAA-AACTCAAACCACAA---AATGTCCT-AT-T-------TTACAACAAAAAA-CTTTATAAAATTC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-TAA-AAACAAATGG-TT-A---TTNTT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACGACTGTNACTCGACCAA---AT--AGT-GTTAGAATTCGTCTCT-TCCAAT--GTTGTATAG----AATGCTTTT--AATTTTAGGAAC-TGAANGNT-GTANTTTAAA-TCNACGATTTNATTA-AAA---TC---NACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGAAANTT---GA--A---AA--AATCTA--A--TATCNANG--AGC-G--AAAAAGAGATTT---G--AG-A--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATGT-----ATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGTTCCT-TTATCAT-CATC-ACAATATACTTTTTA-TA-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAATAAATATGG--TGC-ACAGC-GGATCGCCCT---GTT-TGCA--AG--CCTNC-TCNGATA-TGAT-AACTTCGNTCGCGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGNAATACA-GN--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--AAT-ATGTANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-GTGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGATT--CGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA---C--GACATTA--T--A-A-AAGNGTAAT-TGGT-CTCCA---GTTTTT-CA-GAAAA-TGTCTTGNCTTGTCA-CCTTTT-TGGCAAT-CAA-GTGATAATNCCNTGTCTTTGAGTAAT--NG--AA-------GCTNC-T-TT--T-TCATA---AAAAT--G-TGATTAACAACTT-AACTACAGTATAAT-TCCTNAT-T---GT-CTTCCA--AAAAAA-C-TTAAAAAATTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCT---GTCCTGCA--A----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTAAT--T-TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-GTATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA---C---ACAGTA--TTTA-A-AAGGGTAAT-TGGTCCTCCA---ATTTTT-CATGATAA-TGTCTTGGCTGGTCA-CC--TT-TGGTAAT-AAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TT--T-TCATA---ACCAT------ATTAATAATCT-AACTAC-GAAAGAT-CCCAAATAT---GT--TTCCA--AAAACATC-TT--AAAATTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGG-TTTA---TTGTT-GACA-TAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAA---AT--ATT-GTTAGGACTCGTCTTT-TCCAAT--GCTGTATAG----AATGCTTCT--AATTTTAGGAACCTGTATGGA-GTAGTTCAAA-TCT-TGAGTTAGTTATAAA---TC---TACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC--------------------------TCT---A--TAGCT------GC-A--AAAAAG----TT---A----------A-TCA-----------G--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTGTT-CT-TTATCAgaaaaaccatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGTGTAAGACC---TCT---GCAGAATTTGTTTTTGAGCCAAT-CCAA-ATAATTGTTGTTTTTT-AACAATTTACTTTTAAACCAGATATTT---TACCA---AAGTATTCTA--ATGTGTCAAGGACAGC----ATGTAGAGATTT---GGCAGAA--CCA-TCAAG-AGTT---AGGAATGT-----TTCATCAGCATACTGAGA---C--ATCTTATG-GCCT-TTATCAT-TAACAACAATAC-CTTCTTGTTACTATTTATTTTATT--ATT-AAAAT-T-CAAGTATT-TCGGC-GCA----GAGAT-GGAAAAGGATATG----AC-ACAACAGGATCGCCCTGACGTTGTGTATGAA--CCTGCGTTGGATA-TGA--AAC--CGCTCA-GAGA--GAAA-ACCACTTTGTAAAATAGATGC--CTTAAAAT-TAG-TG-TTTAAAA--TTTGGA----TCAAGTA--AAT-A-ATATTTTCA-----CCAAAGCCAAACAATGAAG----AACT------TTATA---AATGGAAGACCAT-AATATAGATTC-AAAGTTTATTT--Ac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAG-C--AACATTAAGT--A-A-A---GTAAT-TGAT-CTC-A---GTTTTT-CA-TAAAA-TAT-TTACATT-TAC-CCTCTT-TAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AA-------AATTC-T-CTAATATCATGTCCAAAAT-------TTAA-AACTCAAACCACAA---AATGTCCT-AT-T-------TTACAACAAAAAA-CTTTATAAAATTC


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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG






Alignments
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Reference ( family-1581 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGANNATAAGGAGTTAAAAAGANCTGCTTAAGAAAAGCTTCTGCTTATATTCACAATGATTTCAGGTGAGTTGATATTGCACTCACTACACTATTATATTGTNAACTAATGCAAACTNGGATATNAGCAATTCTTGCTGGAAAAAGTGCTATGTGGTAATAATAATTCCTCTTTCATCATAGAAAATNTAATAAATNATCTTTCACACCTTTNTATGACCAGCTTTTNATAACACAATGTNTTCAATTATCCCACTTTGATCACTTAGAATTATACCACACAGGAATGCNGGATAGCTTCCCTTATATGTAGCTTTTGTCAAAGGACGTTATNNACATGAAGCATCAGAACTATAAAAACNTCTTGCCNAAAAATGTTNTTTTGGAAGTTTTTAATAGACACATTCAGAGAGTATATGCTTCTCCAAAAATCAAGTACATTGTGTAAACAAAATCGATTACCATTAACTGCTTCAAATAAATATCTCAATCCAGGATTCTTATCAACTATCAACCTTTTCCGCAATGAACATTTTTAAAGACATAAGTAAAATTGTNGAGTGTCNGCCATTTTTAGACCCTCATGTTNGTGGTCTTGNGTTNCNGATTGANCGCTTTACTTTATCGAATGTTTCCGTTCCAACANGAANTCATAAAATATCTTAATTACACGATGAAACTGTGTCTTTTTTTGG-ATGCTGGAAGTG-TAA-AAACAAATGG-TT-A---TTNTT-GGCAATAAGTAATGTTTTGACGACTGTNACTCGACCAA---AT--AGT-GTTAGAATTCGTCTCT-TCCAAT--GTTGTATAG----AATGCTTTT--AATTTTAGGAAC-TGAANGNT-GTANTTTAAA-TCNACGATTTNATTA-AAA---TC---NACAGAAAAGTTATATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTNGAGCCCCCGTCAAGTTCCCATCTTAGAATGGTGAAAGACC-GATCT---G--AAATTT-TTTTTGAGCCGAT-CCAA-ACAATTTTTGTTTTTNGAGCTATTTACCTTTAAACCAGAAANTT---GA--A---AA--AATCTA--A--TATCNANG--AGC-G--AAAAAGAGATTT---G--AG-A--CCA-TCAAG-G--C---AG--ATGT-----ATCATC-GCATACTG-GN---T--AT-TTGTGTTCCT-TTATCAT-CATC-ACAATATACTTTTTA-TA-TCTTTATTTTGTTTGATTAAAAAT-G-CTAGAATT-TC--C-GCA-AT-GAGAT-GGAAATAAATATGG--TGC-ACAGC-GGATCGCCCT---GTT-TGCA--AG--CCTNC-TCNGATA-TGAT-AACTTCGNTCGCGANA--GAAA-ACCGCTTTGTGNAATACA-GN--CTTANAATGTTT-TA-TTNAAAA--TTT-GA----CCCATTN--A--AT-N---TANTT--A-----CCAAA---ANNCAA--AAT----ANCT-AATANTTNTA---AATAAATGACCAT-GANATGGAGTCAAAAGCTTTTTC--AA-A-TCGATACGA--A-ACNAATAAT--CC-GG---TATATTTNT-C--TTCAGTGNATAA-TGCATTAAGTCATATACGAATC-----T-G-TGTT--T--TCACCNA--TGTACCTTCCCTTTANGAAGCCAGAT-TGGATT--CGGTACCGAATAAATCAAGGTG-TC---T---AG-T-A--GACTT-GATTTTAT-----T--ACTAGGC----A---C-A-CCCG-AATGCAATT-T-TATA--C--GACATTATTTAAAAGNGTAAT-TGGT-CTCCA---GTTTTT-CA-GAAAA-TGTCTTGNCTTGTCA-CCTTTT-TGGCAAT-CAA-GTGATAATNCCNTGTCTTTGAGTAAT--TG--AAA-------CTNC-T-TT--T-TCATA---AAAAT--G-TGATTAACAACTT-AACTACAGTATAAT-TCCTNAT-T---GT-CTTCCA--AAAAAA-C-TTAAAAAATTCAACACAGTGAATCCCAATCACTNCCTGGNNATTTAGTTATTTTATCATATTTTTTCAGNACTGTCCAAAAAATTTCACTTTTTGCAGAAAATGATCTTGTCATCCAGAGAACTCTGAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gacattttttttattattatttttttattattattgttttttcatcatagattatatgcatgacaaagaaaatttgttttttctttctttcacctctcacaccctttcatacttcactcatacatttgttggtaagtacttatagatatttgtacccaagataaataataatactaaatccaaaataatcaaataacagtaagtacataatgtatattagattttttgatgttgtcaaaaagtatttcccatacatgccaggtattttcaaacttttgtatttcaaagttctgatatgcaatacatctttcagctttatatttgttgtataaatagaaaagtaattctaacaaactgggtaatttgccttttttcaaacaagaaaaaaatatatagttttgtatataaaatgagaaagttaacagttctgttgtttttagatcaatggaagttcacctaataaaatattaacaacattaaaaccaattctttggaagttgttcgatatatatgcatactcaaactgctccataaattagatatttttcacagccaataaaacatgttgaatcgtctcaacttcattattacaaaaactacaacaatcagaagacacaagattgatttttttcagatagtaattgacaggaagaattctatgaagaattctatattgtaaccattggatgaagaatccttggtcagttttaaaacatacagtaaaaacatctttaacacatatttctattccataaggcactaactctaaattccatttatgaacagaaatgggaattacatgatttacatttaactgtttgtaaacagagtgtacacttagtatgcagaatcaaaggtttgtaatatAAAT-G------ATTATC--C-GCA-C---AGATTAAAAATATATAAGG--TGG-AAAAA-GGATCACCCT---GTCCTGCA--A----CTTC-TCTGATAGTGAT-----TCTATCGAGATATTGCCA-CCTGGTTTATTT--TACA-GA----TGTAATGTCT-TA-TTAAAA----TT-GAAGATCGCATTCCTA--AT-T---TAGGG--A-----CCAAA---ATTGAAG-AATTGCCAGCT-GTTTTTTGTA-----TAAATGACCAT-GACGTGTA-TCAAATGCTTTTTC--GA-AGTCAATAAGAGTA-GCAAATAAT--CC-AGGTCTATTTTTCT-C--TTCAGTGTAT---TGCATTAAATCG-----AAATCAGCCTT-G-TATT--TGGTCACCAAAAT-TATCT---CTGAATGAAACCTGTTGTGGATC--TTGTACTTAATTATT---GGTG-TCATAT---AG-T-ATGGGGTT-GTTTTTATGTGGCT--ACTGGGCCCATA---C-A-CCTG-A-TGCAATT-T-TATA--C---ACAGTATTTAAAAGGGTAAT-TGGTCCTCCA---ATTTTT-CATGATAA-TGTCTTGGCTGGTCA-CC--TT-TGGTAAT-AAA-GTAATACTACCATATCTTTGTGTAAT--AG--AAAGAACAGGCTA----TT--T-TCATA---ACCAT------ATTAATAATCT-AACTAC-GAAAGAT-CCCAAATAT---GT--TTCCA--AAAACATC-TT--AAAATTCAGCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattcaacactagatgccctgatagttcatgattcgcttctaaaatgaatcgccAATTGTAGA-TGTCTATCATTTTTAGACTTTCATGTTGGTGGTCTTGAGTTACGGATTGAACG------TTTATC--------TCGTTCC--CAAAAAATCA-AAAATATCTT---TACACAATA--------------TTTGG-ATGTTGTAAGTGATAG-AAATAAATGG-TTTA---TTGTT-GACA-TAATTAATGTTTTAACAACTGCAACCCGACCAA---AT--ATT-GTTAGGACTCGTCTTT-TCCAAT--GCTGTATAG----AATGCTTCT--AATTTTAGGAACCTGTATGGA-GTAGTTCAAA-TCT-TGAGTTAGTTATAAA---TC---TACTGAAAAGTTA-ATGCCTAATAAGTTAAAAGTTGTTGAGCCTCCGTCAAGTTTCCATC-TAGAA-GATGAGAGACCTGATTT---GA-AAACTT-TTTTTGATTCAAT-CCAA-ATAA-TTTTG-TTTTGGAGCTGTTTACCCTCAAAC--------------------------TCT---A--TAGCT------GC-A--AAAAAG----TT---A----------A-TCA-----------G--ATGTCCCATATCATCTGCATATTG-AC---TTAAT-TTGTGTT-CT-TTATCAgaaaaaccatc
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTATGTGGTAA-AATA-TTCCTCTTTCATC-TAGAAAATC--ATAAATTAT-TTTCACACCTTTTTATA--CAGCTTTTTATAA-ACAATGTGTTCA--TA-CCCACTT-AAT-ATTT-GAATTATACCACACAGGAATGCTGGATAGCTTTCCTTATA-GTAGCTTTTGTCAAAAGAC--TATTGACATGAAGCAT-AG-ACT-TAAAAACATCTTGCCTAAAAATGTTTTTTT-----TTTTTAATA-ACACATTCAGAGA-TATATGCTTCTCC-AAAATCAAGTA-ATT-TGTAAACAAAATC-ATTACCATTAACTGCTTCAA--AAATA--TCAATCCAGGATTttaaatattggtatcaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----A---C-A-TCCT-GATCCAATT-T-TGTAAGC--AACATTAAGTAAA---GTAAT-TGAT-CTC-A---GTTTTT-CA-TAAAA-TAT-TTACATT-TAC-CCTCTT-TAGGAATGCAA-GTGATAAGTGCTTGTTTCTGAGTTAC--TG--AAA-------ATTC-T-CTAATATCATGTCCAAAAT-------TTAA-AACTCAAACCACAA---AATGTCCT-AT-T-------TTACAACAAAAAA-CTTTATAAAATTC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TCTGCCACTGTTTTTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTATTGTTTTTTCATCATAAATATCTTACATGACAAAGAAAAATATAATATTTTTTCTCTCACCTCTCACACCCTTTCATACTTCACTCATACATTTGTTGGTAAGTACTTATAGATATTTGTACATAACGATATTATGATTTTTTGATGTTGTCAAAAAGTATTGCC
Unaligned ( gi|14 ): TGGTGCAATACCTCAGCAGTATCATTTAAGAGAAAACCCTTAAAACAATTTATTTTCAAACTAGATATTTTACCATACAAGTCTAATTTGTCAAGAGCAGCATGTAGAACCTTCAAAATATTAGGGATGTATCATGAGCGTACTGG
Unaligned ( gi|16 ): TTGCCACCTTGGTTTATTACAGATGTAATGCCTGTATTAAAAATTGAAAACAATTCCTTATCGAGGG