lowQualScore : 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 6666666666666 444 555555 22 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222 1 1 1 111 2222222 55555555555555555555 9999999999999999999999999999999999 2222 55555 77777777777777777777777777777777777777 111111 44444444444444444444 11111111111 3333333333333333333333333333 2222222 77777777777777777777777777777777777777777777777 2222 333333333333333333 2 333 222 11 4444444444444444444444 3 33333333 222 44444444444444444444444444 1 111 33333333333 11 333 11111111 666666666666666666666666 22222 11 222222222 22222222 222222 1 333 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 22 2222222222 222 11 9999999999999999999999999999999999999999999999 4444444444 333333 222 111 22222222222222 2 6666666666666666666666666666666666666 33333333333 11111 11 444444444444444444444 55555555555555555555555555555 1 22222222222 66666 222222222 8888888888888888888888888888888888888888 1 11 444444444444444444 22 111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333 5555555555 2222222222222222 2 1 888888888888888888888888888888888 3 66666666666666666666666666666666666666666666666 222 1 1 777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333333333333 111111111 1 1 11 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 5555555555555555555555555555555 2222 555555555555555555555555555555555 1111111 4444444444444444444444444444444 1 1 111 33 1 1 33333333333333333333333333333333333333 222 33333333 3 22222222222 33333333333333 1 33 11 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 222 4
lowQualScore : 6 6 5555555555555 666 777777 6 6 11 6 5 8 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 1111111 2 3 1 0 7 111 4 4444444 6 88888888888888888888 5 1 8888888888888888888888888888888888 7 6666 77777 555 99999999999999999999999999999999999999 111111 00000000000000000000 0 6 22 5 555555 55555555555 22 3 8888888888888888888888888888 2 1111111 22 3 99999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 6666 1 2 1 444444444444444444 5 8 22 22 555 1 000 0 6 222 4 00 5555555555555555555555 3 7 1 1 22 2 2 22 6666 55555555 7 0 33 22 222 77777777777777777777777777 3 66666 2 999 33 44444444444 55 33 88 111 55555555 222222222222222222222222 2 2 33333 55 33 33 777 555555555 33333333 2 5 222222 3 0 3 222 555 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 2 2 2 2 33 44 2 6 2 6 5555555555 666 11 8888888888888888888888888888888888888888888888 4444 0000000000 0 2 2 2 777777 2 444 666 44444444444444 2 0 6666666666666666666666666666666666666 4 5 44444444444 88888 2 2 55 8 44 2 2 777777777777777777777 55555555555555555555555555555 555555 777 5 55 88888888888 66 33333 5 2 6 22 33 666666666 5 3333333333333333333333333333333333333333 5 3 1 77 6 2 4 333333333333333333 55 33 33 888 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 2222222 0000000000 33 2 3 333 333 3333333333333333 3 0 2 222222222222222222222222222222222 444 0 2 88 88888888888888888888888888888888888888888888888 6 3 888888 111 6 5 3 7 666666666666666666666666666666666666666666 44 44 44 6666666666666666666666666666 777777777 4 2 3 44 3 0 6 3 3 9 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 3 777 6666666666666666666666666666666 2 55 2 0000 2 6 6 2 2 888888888 2 2 4 4 4 222222222222222222222222222222222 2 77 5555555 6666666666666666666666666666666 33 0 1 1 1 2 4444 444 66 33 11 33 5 33 99 5 6 66666666666666666666666666666666666666 4 666 33 2 2 00000000 2 3 33 2 1 33 2 11111111111 33 66 77777777777777 555 3 33 2 2 8 9 8 00 55 44 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 000 7 1 0
lowQualScore : . . ............. ... ...... . . .. . . . ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ . ....... . . . . . ... . ....... . .................... . . .................................. . .... ..... ... ...................................... ...... .................... . . .. . ...... ........... .. . ............................ . ....... .. . ............................................... . . .... . . . .................. . . .. .. ... . ... . . ... . .. ...................... . . . . .. . . .. .... ........ . . .. .. ... .......................... . ..... . ... .. ........... .. .. .. ... ........ ........................ . . ..... .. .. .. ... ......... ........ . . ...... . . . ... ... . ...................................................... . . . . . .. .. . . . . .......... ... .. .............................................. .... .......... . . . . ...... . ... ... .............. . . ..................................... . . ........... ..... . . .. . .. . . ..................... ............................. ...... ... . .. ........... .. ..... . . . .. .. ......... . ........................................ . . . .. . . . .................. .. .. .. ... .. ................................................................................... . ....... .......... .. . . ... ... ................ . . . ................................. ... . . .. ............................................... . . ...... ... . . . . .......................................... .. .. .. ............................ ......... . . . .. . . . . . . ....................................................................................................................................................... . . ... ............................... . .. . .... . . . . . ......... . . . . . ................................. . .. ....... ............................... .. . . . . . .... ... .. .. .. .. . .. .. . . ...................................... . ... .. . . ........ . . .. . . .. . ........... .. .. .............. ... . .. . . . . . .. .. .. . ..................................................... ... . . .
lowQualScore : 0 0 0000000000000 000 555555 0 0 00 0 5 8 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 6666666 0 8 0 7 0 777 8 8888888 6 55555555555555555555 9 6 2222222222222222222222222222222222 0 0000 66666 444 00000000000000000000000000000000000000 777777 66666666666666666666 1 0 88 5 888888 99999999999 66 0 8888888888888888888888888888 0 7777777 88 2 55555555555555555555555555555555555555555555555 9 9 2222 8 3 8 888888888888888888 0 0 88 88 888 4 222 5 0 888 1 33 3333333333333333333333 6 0 6 2 99 1 6 99 4444 00000000 4 1 11 33 333 88888888888888888888888888 1 22222 5 555 44 11111111111 88 11 88 333 11111111 444444444444444444444444 5 5 88888 99 44 66 888 222222222 22222222 5 0 666666 3 3 4 222 888 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 7 5 5 5 44 22 4 6 2 7 4444444444 444 66 3333333333333333333333333333333333333333333333 7777 8888888888 3 1 0 1 666666 1 666 666 00000000000000 5 0 9999999999999999999999999999999999999 3 1 33333333333 66666 2 1 66 3 33 2 2 333333333333333333333 44444444444444444444444444444 666666 111 1 22 77777777777 66 88888 7 1 7 99 77 444444444 0 3333333333333333333333333333333333333333 2 8 5 00 5 1 2 666666666666666666 00 44 44 000 33 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9999999 8888888888 11 2 8 777 999 5555555555555555 2 0 1 666666666666666666666666666666666 444 0 5 55 11111111111111111111111111111111111111111111111 7 3 222222 888 2 0 3 3 000000000000000000000000000000000000000000 66 66 22 6666666666666666666666666666 999999999 5 3 3 00 3 0 7 3 3 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 1 000 0000000000000000000000000000000 5 99 2 1111 4 3 0 1 1 444444444 2 1 7 4 4 777777777777777777777777777777777 9 22 7777777 9999999999999999999999999999999 11 5 9 4 0 0 5555 666 00 11 55 22 4 22 77 3 0 22222222222222222222222222222222222222 7 999 11 2 4 88888888 5 9 77 7 4 77 7 77777777777 99 55 88888888888888 000 1 77 9 9 5 2 9 00 00 44 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888 222 3 0 0
consensus : TTTATCACCAGTATNGGTNCCATNATGTGCGTNTGTAAGTTTCCTGACCGACTGAATGCCTTCCCATCACACN--CAC-ATCTA--T-TATAAG-GTTT-A-C-ACCAGTATGTATCTCTCA-NGT--GT-TT-TGTAAGT-TTCT-AC-TCA-TTG-AA----TGCCTTCCCAACAGACATCAACATTTATA-----AGGCTTTATCAC---AA-TGTGTATGTGTCCTCATGTGTCTCTGTAA-GTTC-CTGTCC--GCATTGAATGCCTTCC--AA-----CACA-A-CAT-C----TTATAAGGTTTATC-------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAA-------ATTTCCTNNNTC--ATTGAATACCTTCCCACAAACATCACAT---TTATAA------GGTTTATCAC--C-AGTATGTATCC--TCATGTGTGTCTGTAA-TG--CGT-T----T-T---C------G--CA--TGAATGCCTTCCCACA--GACATCAC--ATTTATAAGGT---T---CAC--TCAG-T--A-ATGTG--T----C--C-TCATGTGT---CTCTGTAA-G-T-TN--CCT--NTCNN-ACTGAATGCCTTCCCACA--GACATC------ACAT---------TTATAAGG--TTTNTC-A----------------------C---A-GTGTGTA---T-C-TCATGTG--TCT-T-----GT---GTA-N--G--TTN--TG--ACT--------C----ACTGAAT-GC-CTT-CC-A-CAGACATCACA-T--------T--TA-T-A-GGTTTNTCAC--C--A---GTATGTA-TCC-TCATG-GTGTCTTTGTAA-GT--T-T--C-C-T--CCG--ACTGAATGCCTTCCCACAGA--C-ATCAC--AT---TTA----TA-AAGGTTTNTCACCAGTAT--GTA-T-CTCTCATGTGT---TT-T-GTAAG-C-TG--CCT--GTCCGAT-----TG-AAT-N-CCTT--C-CCA-------CA-NA--CATCACATTTATAAGGTTTNTCACCAGTATGTATCCTCA-GTGTGT-CT-TT-TAAGT---CT-TCCTG-TT----C---TGAA-TG-----C--TT--CC--CA-N-ACA--------ATCACA----T-T-ATA-A-G-GTTTNTCACCAGTATGTGTCCTC-NTGTGTG--TCTGTAA---TG---CTGC---T-T---G---A--CC---TG-AAT--G--TCCT----CCC-AC-AGA-C-ATCA--CAATTTA-TAAGG-T-T-T-TCAC-CCAGTATGTATCCTCA-ATGTG--TCT---GT--A---A---TG---T----T-C-C----CG-A-T--C--CTGAATG----CCTTCCCAC---------AGA-C-ATCACA-TT--TA-TAAG-GTT-TATCAC--CAGTATG---TAT-C-CTC-GTGTGTCT-CTGTAA-G-----CGT--C-T----AT-C-----G--A-T-G-AATGCCTTCCCACA----GA-----CATCACA-T-T-A-T-A-AGGTTTATC-A-CCAG---T-ATGTGTCCT-CATGTGTGTCT--TT---AAGCGTC-NT-TGT-C-C----A-C----T--GAATGCCTTCC--CACA--G--A--T--CACATT-TAT---TAAGGTTTNTC-ACCAG--TATGTA-T-C-T-CAT-GTGTGT---CTG--T---AAG-----T-TTC--C-TGT-T----C-GACTGAATGCCTTCCCACAGACA-TCACATTTATAAGGT-T-T-T-C-ACCAGTATGTAT-TCCTCATATGT--GT--CTN--T--AAG--TGTT-C-T------G--T-T--GAC--TG-A---AT-T------CTTCC-CACAG----CA------ACATCA---CGTTTATAAGGTTTNTC--AC--CAGTATGT--N--CT--C--AT-GTGTNTCT--GT---AA---T-T-T-C-CT-N-TCCGATTGAATGCCTTCCC-ACAGA-CATCAC---------ATTT-AT-AAGG----TT---T--CACCA---GTATGTGTCCTCA-TGTGTGTCT--T-T---AA---G-TTTCC-T-T--CT-CG-CT-G--AATGCCT-T-C-CC------AC-AGA-CATCACATTTAT-A-GG--T-T--C-T-CACCAG---TGTGTN-----T-CCT--CG-ATG--T--CTCT--GT--AA-N-T-T-T-C-TGTC-C-GA--CTGAA---T-GC--CTT-CC-A-CAGACATCACATTTA-TAA-G-G-TTTATC---A--------CC------TGTGT-----C-TCAN----GTAT-TN-TCTNTAA-GTGT-CCTGT-NA-ATT-----ACTGACT--TT----GAATGCCTT-CCN-C----A-GAC-ATCACA-T-T--TATAAGGTT---TTNTCACCAGTATGTATCCTC-N-TGTG-T-C--T--GT-----A-A--NG---T-TN-CT-GT-CCGATTG-AA-ATCTCTT-CC-A-CAGA-CATCACA---------TTTA-T-AAGG-T-T-C-T-CA-C-CA-----GTAT--GTAT----C-C-TC-ATGTGTCTTTTGTAA-GTTTCCTGTCC--GACTGAA---TGC----C--TT-C-C-ACAGA-CATCACATTTA----TAA--GGTTTN-TCACC--AGTATGTATC--CTCATGTG--T-CTC-T-TAA--G-T-TT-CTG--TTTN--AC--TG------A--AGTGCCTTCCCAC-A-A-CAT--C-ACA-TT-TAT-A-GG-TTTNTCACC--AG-TATGT--ATCCT-CATGTGTNTCT-------T-GTAA-GTTTCC----TGT-CC--AT---TGAAT-GC-C-TTCCC-ACANACATCACATTT--ATAAGGT-TTC-TCACC--AG-TGTG---TGCCCTCATTGTGTGTC--CTT---AAA-TTTCCGTG-TTTGACT-TAAACATCTC-CCACA
Reference ( gi|1 ) : TTTATCGCCAGCA-AAGTGC--TCAAGTGTGT-TCTAAATTTCCCCTTTCATTAAACTCCTTTTCATCACACCT-TACTATTTAAAT-TAAAAG-GTTT-A-C-ATCAGTATGTGTCTCTCA-AG---GT-TT-CATA--T-TTCT-AT-TCA-CTG-A-----TGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTTCTCATCTGTCTCCTTAATGATC-CTGTCT--GCACTCAATCACTTCC--AAGATATCACA-ATCAT-C----TTATAAGATTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTAGTATCTCCTTTATC--ACTGAATTCCTTCCCAAAGACTTCACAT---TCATAT------GGTTTCTCAC--T-TGTA-GAATTC--TC-TGTGTATTTGTAA-TG--CGT-T----T-T---C------A--CA--TGAATGCCTTCTCACA--ATCATCACTAATATATAAGGT---T---CGC--TCAG-T--G-GTGTG--T----C--C-C--TGTGT---CCTTGTAA-A-C-TG--CCT--TTCAC-ACTGAATGCCTCCCCACA--GATATC------ACAC---------CTATAAGG--TTTCTC-A----------------------C---A-GTGTGTA---T-C-TCATGTG--TCT-T-----GT---GTA-T--G--TTG--TG--ACT--------C----ACTGAAT-GC-CTT-CT-A-CAGACATCACA-T--------TC-TA-T-A-GGTTTCTC-C--C--A---GTGTG-A-TTC-TCATG-GTGTCTTTGCAA-AT-AT-T--T-T-T--CTC--ACTGAATGCTTTCTCA-AGA--C-ATCGC--AC---TTA----TAGAAGGTTTTTCACCAGTAT--GTA-T-CTCTCATGTGT---TT-T-G-AAG-C-TG--CAT--GTCCTAT-----TG-AAT-C-CTTT--C-AC--------CA-AA--CATCACATTTATAAGGTTGCTCACCAGTATGTATCCTCAAGTGTGT-TT-TT-TAAGTCACCT-TCTTG-TT----C---TAAA-TG-----C--TT--CC--CA-A-ACA--------ATCACA----T-T-ATA-A-G-TCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTG--TGTGTAA---TG---CTGC---T-T---G---A--CC---TG-AA---A--TTCT----ATC-AC-A-A-C-ATCA--CAATTTA-TAGGG-T-T-C-TCAC-CCAGTATGTATCCTCA-ATGTG--TCT---G---A---A---TG---T----T-C-C----CG-A-TC-C--CTGAATG----CCTTCCCA----------AGA-C-ATCACA-TC--T--TAAG-GTTCTCTCAC--AAGTATG---CAT-C-TTA-GTGTGTCT-TT-TAA-G-----CGT--C-T----AT-T-----A--A-T-A-AATGCTTCCCCACA----TC-----CATCACA-T-T-A-T-A-GGTTTCCTC-A-CC-G---TGACGCATCCT-TA-GTGTGTCT--TT---AGGCGTC-GT-TGT-T-T----A-C----T--AAATGCATTCC--CACA--G--A--T--CACATC-TATTATTAAGGTTTCTC-ACTAG--TATGTA-T-C-T-CAA-GTGCGT---TT---T---AAG-----C-CAC--C-TGT-TA--GA-GACTAAAAGCCTTCCCACAGACC-TCACATTTATAGGGT-T-T-T-CAACCAGTA-GTAT-TCCTCAAATGT--GT--CTC--T--AAG--TGTT-C-T------G--T-T--GAC--T--A---AT-T------TTTTC-CACAA--G-CA------ACATCA---TA---ATAAGGTTTCTC--TC--GAGTATG---A--CC--C--AT-GTGTGTCT--GT---AA---T-T-T-C-CT-T-TCTGATTGAATGCCTT-CC-ACAGA-CATCAC--------TATCTGAT-A--G----TT---T--CACCA---GTATGTATCCT-A-TGTGCGTCA--T-T---AA---G-TCTCC-T-T--CT-CG-CTAA--AATGAC--T-C-CC------AC-A-A-CATCACATTGAT-A-GG--C-T--C-T-CATC-----TGTGTA-----T-TAT--TG-ATG--T--CTCT--GT--GA-C-T-T-T-C-TGTC-G-GA--C-GAA---A-GT--CTT-CC-A-CGCACATCACATTTA-T-A-G-G-TTTGTC---A--------TC------TAT-------C-TCAA----GTAT-TT-TCTTTAA-GTGT-CCTGT-TA-ATT-----ACT-ACTT-TT----AAATGCCCA-CCT-C----A-AAC-GTCACA-T-T--C-CAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTC-T-TGTG-A-C--T--GT-----A-A--TG---C-TG-CT-GT-CTGATTG-AA-ATCTCTT-CC-A-CAGA-CATCACA---------TTTA-T-AGGG-T-T-C-T-CATC-CA-----GTA---GTA-----C-C-TT-ATGTGTCTTTTATAATGTTTCCTGTCT--CTCTGAA---T------C--TT-C-C-ACAGA-CATCACATTTA----TAC--GGTTTC-TCACC--AGTATG-ATC--CTCAAGTG--T-TTC-T-TAA--G-T-TC-CTG--TTTT--AC--TA------A--AGCGCCTTCCCAC-A-A-CAT--C-ACA-TG-AAT-A-GG-TTTCTCACC--AG-TA-GT--ATCCT-CATGTGTGTCT-------T-GTAA-ATTTCC----TGT-C---AT---TAAAT-GC-C-TT-CC-ACATACATCACA--T--ATAAGGT-CTC-TC-CC--AT-TGTG---T-TTTTCACTGTGTGT---TTT---AAA-ATTCC-T--TTTGATT-TAAACATTTCTCCACAGCACTCACTCAAAAGGT
gi|2 : TTTATCACCAGTATGGGTCC--TAATGTGCGTCTGTAAATTTCCTAACTGACTGAATGCCTTCTCA-CA-ACC---ACCAC---ACT-TATAAG-GTTT-ATC-ACCAGTATGTTTC-CTTA-TGTGTGT-TT-T-TAAGTGTCCT-ATGTAA-TTGAA-----TACCTTCC-CACAGACATC-ACATCTATA-----AGGTTTT-TCA----------ATATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAA-GTTCTCTATCC--A-ATTCAATTCCTTCC---------CACA-AACAT-CGCATTTATAAGGTT
gi|3 : cctcatgtgtctttgtaatgatcctgtcgcactgaatgccttccaacacacatcacatttataaggTTTATCACCAGTA-T-GTGTCATCATGTGTGTATATAAGTTTCCTGACCGACTGAATGCCTTCCCA-CAGACAA-CAC-ATTTA----TAA--G-GTTTTA-C-ACCAGTGTGTATCT-TCA-TGT--GTCTT-TGTA--A-GTCT-GC-TCT-CCG-AATGAATGTCTTCCCA-CAGACATCA-CATTTATA-----AGAC-TTATCA--GCA-----GTATGTCTTCTCATGTGTCTCTGTAAGCTTC-CTGTCT--G-ACTAAATGCCTTCC--CA-----CACACATCACAT----TTATAAGGTTTATCcctcacctgtgtgtgccctcatgtgtgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|5 : ccacagacatcacattgataaggCATCACATTTATAAGGTCTA--T-CACAAGTGTGT-A-TTATCA-TATGTGTCTGT-A-AG---AT-TG----A------CT-AC-GCA-TTG-AG----TCCCTTCCAAA-AAACATC-ACATTTATA-TGGTA-----TATCAC-------CAGTATGTATCCTCATATGTATCTGAAACGTTC-CTGTTC--G-ATTGAATGCCTTCC--accagtatgtgtcctcttgtgtatctttaagcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|4 : cacaaaCATCACAC----AC-ATC-ACATCTATAAG-GTTT-T----TCAATATGTATC-CTCATAT---GT-TTGTGTAAGT-TTCTTAT-CCAATTG-AA----TGTCTTCCCA-CAGACATC-GCACTTATA-----AG-CTTCCTC-----AACTGTGTGT--GTCCTCATGTATCCCTCTAAc
gi|5 : tgttccgtgtgattgaatacttttccacaaaACAAACATCA-CATTTATA-----AGGTCT-ATCAC---AAGTGTGTAT----TATCATATGTGTCTGTAA-GAT---TGACTACGCATTGAGTCCCTTCCAAAAAACATCACA-------T----TTATATGGTATATCctttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|2 : cCTCATGTGTCTTTGTAATGATC-CTGTC---GCACTGAATGCCTTCC--AA-----CACA---CAT-C---------ACATTTAT--------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAA-------ATTTCCTAACTG--ACTGAATGCCTTCTCACAACCACCACAC---TTATAA------GGTTTATCAC--C-AGTA-TGTTTCCTTA-TGTGTGTTTTTAA--G--TGT-C----C-TATGT------A--AT--TGAATACCTTCCCACA--GACATCAC--ATCTATAAGGT---T---T-T--TCAA-T----ATGTG--T----C--C-TCATATGT---TTCTGTAA-G-T-TC--TCT--ATCCA-ATTCAATTCCTTCCCACA--AACATC------GCAT---------TTATAAGG--TTCCTC-A----------------------C---CTGTGTGTGC--C-C-TCATGTG--Taccagtatgtatcctcatatgtatctgaaacgttcctgttcgattgaatgccttccc
gi|14 : cTTGTCTGATTGAAAACCTTTCCACAGATATCACAT---TTATAA------GGTTTCTgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|5 : aaggtttctcaccactatgaatccttgtgtgtctctttaagtttgC--ATTGAGTCCCTTCCAAAAAACATCACAT---TTATAT------GGTATATCAC--C-AGTATGTATCC--TCATATGTATCTGAAA-----CGT-TCCTGT-T---C------G--AT--TGAATGCCTTCCC
gi|4 : cacaaacatcacatttataaggtctatcacaagtgtgtattatcatatgtgtctgtaagattgactacg--ATTGAATACTTTTCCACAAACATCACACACATCACATCTATAAGGTTTTTCAA--TATGTA----TCC--TCATATGTTTGTGTAA------GT-T----TCT---T------ATCCAATTGAATGTCTTCCCACA--GACATCGC--ACTTATAAGCT---T---C-C--TCAACT--GTGTGTG--T----C--C-TCATGTAT---CCCTCTAA-
gi|3 : tgttccgtgtgCCACAGACATCACAT---TGATAA------GGTTTATCAC--C-AGTATGTGTCA--TCATGTGTGTATATAA------GT-T----T-C---CTGACCGA--C---TGAATGCCTTCCCACA--GACAACAC--ATTTATAAGGT---TTTACAC---CAG-T--G--TGTA--T----CTTC-A--TGTGT---CTTTGTAA-GTC-TG--CTC--TCCGA-A-TGAATGTCTTCCCACA--GACATC------ACAT---------TTATAAGA--CTTATC-AG---------------------C---A-GTATGTCT--T-C-TCATGTG--TCT-C------T---GTA-A--GCTTCC--TG--TCT--------G----ACTAAAT-GC-CTTCCC-A-CACACATCACA-T--------T--TA-TAA-GGTTTATCAC--C--A---GTATGTG-TCC-TCTTGTGTATCTTTctttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|5 : CACAAACATCACAT---TTATAA------GGTCTATCACAAG-TGT--GTATTA--TCATATGTGTCTGTAA--G---AT-TGAC-T-A---C------G--CAT-TGAGTCCCTTCCAAAA--AACATCAC--ATTTATATGGTATAT---CAC---CAG-T----ATGTA--T----C--C-TCATATGT---ATCTG-AA-A-CGTT--CCTG-TTCG--ATTGAATGCCTTCCCaagcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|14 : ------GGTTTCTCAC--C-ACTATGAATCC--TTGTGTGTCTCTTTAAGTT--TGT-T----G-T---C------T--GAT-TGAAAACCTTTCCACA--GATATCAC--ATTTATAAGGT---T---
gi|13 : aaATCC--TCATGTGAATTTGTAA-TT--TATCT----T-T---CCG----A--C---TGAATGTCTTCCCACA--TACATTAC--ATGTAAAATGT---T---CATCACCAG-T----ATGTA--T----C--C-TCATGTGT---tct
gi|2 : C--TCATGTGTCTTTGTAA-TGATC-C-T----G-T---C------G--CAC-TGAATGCCTTCCAACA--CACATCAC--ATTTATAAGGT---TTATCAC---CAG-T--A--TGGG--T----C--C-TAATGTGC---GTCTGTAA-A-T-TT--CCT--AACTG-ACTGAATGCCTTCTCACA--ACCACC------ACAC---------TTATAAGG--TTTATC-AC---------------------C---A-GTATGTT---TCC-TTATGTG--TGT-T-----TTTAAGTG-T--C--CTA--TG----T--------A----ATTGAAT-AC-CTTCCC-A-CAGACATCACA----------TC-TA-TAA-GGTTTTT-----C--A---ATATGTG-TCC-TCAT--ATGTTTCTGTAA-GT--T-C--T-C-T--ATCCAATTCAATTCCTTCCCACAAA--C-ATCGC--AT---TTA----T--AAGGTTCCTCACCTGTGT--GTG---CCCTCATGTGT---g
gi|4 : c--TC-CGTGTGATTG-AA-TA--CTT-T----T-C---C------A--CA----AA---CATCACACA----CATCAC--ATCTATAAGGT---T---T-T--TCAA-T----ATGTA--T----C--C-TCATATGT---TTGTGTAA-G-T-TT--CTT--ATCCA-ATTGAATGTCTTCCCACA--GACATC------GCAC---------TTATAAGC--TTCCTCAA----------------------C---T-GTGTGTG---TCC-TCATGTA--TCgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|9 : tgt--TGAATGCCTTGCCATAGGATGA-CATTG----ATAAGGT---T----AT--TCAA-C--A-GTATG--TATG-C--TAA--TGTGT---CTTTG-AA-A---TG--TATTATTCCA-ACTGAATGTCTTCCCACA--AACATC------ACAcctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : tAATGCCTTTCCACA--GACATCAC--GCTCATAAGG----T---CTC--TCAC-CAAA-ATATG--T----CCTC-T--TGTGT---CTTCGCAA-GTC-TC--CAT--TTTG--ACTGTAAACCTTCCCACA--AACACA------ACAT---------TTATTAGT--TTTATC-AC---------------------C---G-GTTTGAA---T-CATCATGTG--tt
gi|3 : gggacggctcatgtgatatCACA--GACATCAC--ATTGATAAGGT---TTATCAC---CAG-T--A--TGTG--T----CATC-A--TGTGT---GTATATAA-G-T-TT--CCT--GACCG-ACTGAATGCCTTCCCACA--GACAAC------ACAT---------TTATAAGG--TTTTAC-AC---------------------C---A-GTGTGTA---T-CTTCATGTG--TCT-T------T---GTA-A--G--TC---TG---CT--------CTCCGAATGAAT-GT-CTTCCC-A-CAGACATCACA-T--------T--TA-TAA-GACTTATCAG--C--A---GTATGTC-TTC-TCAT--GTGTCTCTGTAA-GC-TT-C--C-TGT--CTG--ACTAAATGCCTTCCCACACA--C-ATCAC--AT---TTA----T--AAGGTTTATCACCAGTAT--GTG-TCCTCTTGTGTAT---CT-T-T-AAG-C-a
gi|5 : cCACA--AACATCAC--ATTTATAAGGT---C---TA---TCAC-A--A-GTGTG--TATTAT--C-A--TATGT---GTCTGTAAGA-T-TG--AC---TACGC-ATTGAGTCCCTTCCAAAA--AACATC------ACAT---------TTATATGG--TATATC-AC---------------------C---A-GTATGTA---TCC-TCATATG--TATCT-----G----AAA-C--G--TTC--CT--GTT--------CG---ATTGAAT-GC-CTT-Cgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|14 : AAGGT---T---T-C--TCAC-C--A-CTATGAAT----C--C-T--TGTGTGTCTCTT-TAA-G-T-TT--GTT--GTCTG-ATTGAAAACCTTTCCACA--GATATC------ACAT---------TTATAAGG--TTTCTcc
gi|2 : --TGTGT---CTTTGTAA-----TGATCCT--GTCGC-ACTGAATGCCTTCCAACA--CACATC------ACAT---------TTATAAGG--TTTATC-A----------------------CC--A-GTATGGG---T-CCTAATGTGCGTCT-------GT---AAA-T--T--TCC--TA--ACT--------G----ACTGAAT-GC-CTT-CTCA-CAACCACCACA-C--------T--TA-T-AAGGTTTATCAC--C--A---GTATG-T-TTCCTTATGTGTGTTTTT--AA-GT-GT-C--C-TAT--GTA--ATTGAATACCTTCCCACAGA--C-ATCAC--AT---CTA----TA--AGGTTTTTCA---ATAT--GTG-T-C-CTCATATGT---TTCT-GTAAG-T-TC--TCT--ATCCAAT-----TC-AAT-T-CCTT--C-CCA-------CA-AA--CATCGCATTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTG--TC-TC-TAA-----CT-TTTTG-CT----T---TGA
gi|13 : cctcaTTGTAA-T-T-TA--TCT--TTCCG-ACTGAATGTCTTCCCACA--TACATT------ACAT---------GTAAAATG--TTCATC-AC---------------------C---A-GTATGTA---TCC-TCATGTG--Tttaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|8 : atcctcatgtgaatTGTAA-G---TG--TCC--TGCATGATTGAATGTCTTGCCACA--GACATCATATTTACAT---------GTACAAGG--TTTATC-ATTGGTTTTATAAGGTTTATCCCC---G-GTGTGTA---TAA-TCATGTG--TCT-g
gi|12 : taAC-ACTGAAGGCTCTTCCACATTG-T-TT------ACAT---------GTATAAGG--TTTCTCTC----------------------C---A-GTGTGcttcaggt
gi|7 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaAC-ACTAAAGGCTTTGCCGCA--CTCATT------GCAC---------TTGTAAGG--TTTCTCTC----------------------C---A-GTGTGAAT--T-C-TCagttctttcat
gi|4 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacga-ATTGAATACTTTTCCACA--AACATC------ACACACATCACATCTATAAGG--TTTTT-------------------------C---A-ATATGTA---TCC-TCATATG--T-T-T-----GT---GTA-A--GT-TTC--TT--ATC--------CA---ATTGAAT-GT-CTTCCC-A-CAGACATCGCA-C--------T--TA-T-A-AGCTTC-C-T--C--AACTGTGTGTG-TCC-TCATG-caatgactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|9 : tgttccgtgtgTGAATGCCTTGCCATA--GG-ATG------ACAT---------TGATAAGG--TTATTC-AA---------------------C---A-GTATGTA---TGC-TAATGTG--TCT-T------T---GAAAT--G--T-A--TT--ATT--------CCA--ACTGAAT-GT-CTT-CCCA-CAAACATCACA-T--------Ttatccctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : tAATGCCTTTCCACA--GACATC------ACGC---------TCATAAGG--TCTCTC-A----------------------CCAAA-ATATGT----C-C-TCTTGTG--TCT-TCGCAAGT---CTC-C--A--TTT--TG--ACT--------------GTAAA---C-CTTCCC-A-CAAACACAACA-T--------T--TATT-A-GTTTTATCAC--C--G---GTTTG-A-ATCATCATG-
gi|16 : gggacggctcatgtgatatCCTTTCCACA--GATATC------ACAC---------TTGTAAGG--TTTtga
gi|3 : CCACA--GACATC------ACAT---------TGATAAGG--TTTATC-A----------------------CC--A-GTATGTG---T-CATCATGTG--T---------GT---ATA-TAAG--TTTCCTG--ACC--------G----ACTGAAT-GC-CTT-CCCA-CAGACAACACA-T--------T--TA-T-AAGGTTTTACAC--C--A---GTGTGTA-TCT-TCATG--TGTCTTTGTAA-GT--C-T--G-C-T--CTCCGAATGAATGTCTTCCCACAGA--C-ATCAC--AT---TTA----TA--AGACTTATCAGCAGTAT--GTC-T--TCTCATGTGT---CTCT-GTAAG-C-TT--CCT--GTCTGAC-----TA-AAT-G-CCTT--C-CCA-------CA-CA--CATCACATTTATAAGGTTTATCACCAGTATGTGTCCTC--TTGTGTATC-TT-TAAG
gi|5 : CACA--AACATC------ACAT---------TTATAAGG--TCTATC-A----------------------CA--A-GTGTGTA---T-TATCATATG--TGT-C------T---GTA-A--G--AT---TG--ACTACG-----C----ATTGAGT-CC-CTT-CCAA-AAAACATCACA-T--------T--TA-T-ATGGTATATCAC--C--A---GTATGTA-TCC-TCAT--ATGTATCTG-AA-AC-GT-T--C-C-TG-TTCG-ATTGAATGCCTTCCCcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|10 : TGTAAGGACTCTCTC------------------------C---A-GTATGCAGTTT-C-TCATGT-------C-----GT---GCA-A--G--GTA--TGCAATT--------CG---ATTGAAGAGC-TTG-CC-A-CATTCTTTACA-T--------TTGTA---A-GGTTTCTC-T--C--
gi|14 : ttAAGG--TTTCTC-A----------------------CC--A-CTATGAA---T-CCTTGTGTG--TCT-C-----TTTAAGTT-T--G--TTG--T----CT--------G----ATTGAAA-AC-CTTTCC-A-CAGATATCACA-T--------T--TA-TAA-GGTTTCTc
gi|7 : TCTC------------------------C---A-GTGTGGA---T--------TG--TCT-G-----AT---GGA-TT-G--CTA---G--GCTTGAACGAAC----ACTAAAG-GC-TTTGCC-G-CACTCATTGCACT--------TG-TA---A-GGTTTCTCTC--C--A---GTGTGAA-TTC-TC
gi|2 : -C-TCATGTG--TCT-T------T---GTAAT--GA-TCC--TG--TCG--------C----ACTGAAT-GC-CTT-CC-AACACACATCACA-T--------T--TA-T-AAGGTTTATCAC--C--A---GTATG-GGTCC-TAATGTGCGTCT--GTAA-AT--T-T--C-C-TAACTG--ACTGAATGCCTTCTCA-CAA--CCACCAC--AC---TTA----TA--AGGTTTATCACCAGTAT--GTT-T-C-CTTATGTGTGT-TT-T-T-AAG---------T--GTCCTATGTAATTG-AAT-A-CCTT--C-CCA-------CA-GA--CATCACATCTATAAGGTTTTT---CAATATGTGTCCTCA--TATGT-TT-CTGTAAGTTCTCTATCCAA-TT----C----AAT-TC-----C--TT--CCCACA-A-AC---------ATCGCAT---T-T-ATA-A-G-GTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTC-ATGTGTG--TCTCTAACT-TT---TTGC---T-T---caatgactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|13 : c-C-TCATGTG--AAT-T------T---GTA-A--T--TTA--TC--TTT--------CCG--ACTGAAT-GT-CTTCCC-A-CATACATTACA-T--------GT-AA-A-A-TGTTCATCAC--C--A---GTATGTA-TCC-TCATGTGTGtgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|12 : atc--------C----ACTGAAG-GCTCTT-CC-A-CATTGTTTACA-T--------G--TA-T-AAGGTTTCTCTC--C--A---GTGTG-AGTTC-T
gi|4 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaa----ATTGAAT-AC-TTTTCC-A-CAAACATCACA-CACATCACATC-TA-TAA-GGTTTTT-----C--A---ATATGTA-TCC-TCAT--ATGTTTGTGTAA-GT--T-T--C-T-T--ATCCAATTGAATGTCTTCCCACAGA--C-ATCGC--AC---TTA----T--AAGCTTCCTCAACTGTGT--GTG-T-C-CTCATGTAT---ttcat
gi|8 : tgttccgtgtg----ATTGAAT-GT-CTTGCC-A-CAGACATCATA-T--------Tccctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|11 : tatgtaagtgtcctgcatgCTGAAA-GC-TTTTCC-A-CATTCACTGCA-T--------GT-AA-A-A-GGCTTTTCTC--C--A---GTGTGAA-CTC-TC-TG-GTGtacatgtacaaggtttatcattggttttataaggtttatccccggtgtgtataatcatgtgtctcttcaggt
gi|9 : tgtggattttgtgatgttgaacaagtgtggaattatgcTGAAT-GC-CTTGCC-A-TAGG-ATGACA-T--------TG--A-T-A-AGGTTATT-CAAC--A---GTATGTA-TGC-TAATG--TGTCTTTGAAATGT-AT-T--A-T-T--CCA--ACTGAATGTCTTCCCACAAA--C-ATCAC--AT---T
gi|6 : tAAT-GC-CTTTCC-A-CAGACATCACG-C--------TCATA---A-GGTCTCTCAC--CAAA---ATATG---TCC-TC-TT-GTGTCTTCGCAA-GT-CT-C--CAT-T--TTG--ACTGTAAACCTTCCCACAAA--C-ACAAC--AT---TTA----T--TAGTTTTATCACCGGTTT--GAA-T-C-ATCATGTG
gi|3 : gggacggctcatgtgatat-CC-A-CAGACATCACA-T--------TG--A-T-AAGGTTTATCAC--C--A---GTATG-T-GTCATCATG--TGTGTATATAA-GT--T-T--C-C-TGACCG--ACTGAATGCCTTCCCACAGA--C-AACAC--AT---TTA----TA--AGGTTTTACACCAGTGT--GTA-T-CT-TCATGTGTC--TT-T-GTAAGTC-TG--C-T--CTCCGAA-----TG-AAT-G-TCTT--C-CCA-------CA-GA--CATCACATTTATAAGACTTATCAGCAGTATGTCTTCTCA--TGTGT-CT-CTGTAAG----CT-TCCTG-TCTGA-C---TAAA-TGC----C--TT--CC--CA-C-ACAC-------ATCACAT---T-T-ATA-A-G-GTTTATCACCAGTATGTGTCCTC-TTGTGTA--TCTTTAAG--CG---TTGG---T-T---GAACA--TC---TG-AA---A--a
gi|5 : -A-CAAACATCACA-T--------T--TA-T-AAGGTCTATC-A--C--AA--GTGTGTA-TTA-TCATATGTGTCTGT---A-AG-AT-TGAC-T-A--CGC--ATTGAGTCCCTTC-CA-AAAAAC-ATCAC--AT---TTA----TAT--GGTATATCACCAGTAT--GTA-T-C-CTCATATGTA--TC-T-G-AAA-CGTT--CCT--GTTCGAT-----TG-AAT-G-CCTT--C-aaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|14 : c-A-GGTTTCTCAC--C--A---CTATGAA-TCC-TTGT--GTGTCTCTTTAA-GT-TTGT--T-G-T--CTG--ATTGAAAACCTTTCCACAGA--T-ATCAC--AT---TTA----T--AAGGTTTCTcc
gi|13 : a-A-TCC-TCATG--TGAATTTGTAA-TTTAT-C--T-T-T--CCG--ACTGAATGTCTTCCCACATA--C-ATTAC--A-----TG----TAAAATGTTCATCACCAGTAT--GTA-T-C-CTCATGTGT---
gi|12 : C--ACTGAAGGCTCTTCCA------C-ATTGTTTAC---ATG----TATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAGT--T-CTTTCATg
gi|7 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaaC--ACTAAAGGCTTTGCCGCACT--C-ATTGC--AC---TTG----TA--AGGTTTCTCTCCAGTGT--GAA-T--TCTC
gi|4 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaa--ATTGAATACTTTTCCACAAA--C-ATCAC--ACACATCACATCTATAAGGTTTTTCA---ATAT--GTA-T-C-CTCATATGT---TTGT-GTAAG-T-TT--CTT--ATCCAAT-----TG-AAT-G-TCTT--C-CCA-------CA-GA--CATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCA--TGTATCCC-TC-TAA-----CT-TTTTG-TT----T---TGAcaatgactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|8 : tgttccgtgtg--ATTGAATGTCTTGCCACAGA--C-ATCAT--AT---TTACATGTACAAGGTTTATCATTGGTttaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|9 : tatgtaagtgtcctgcatgTGAATGCCTTGCCATAGG----ATGAC--AT---TGA----TA--AGGTTATTCAACAGTAT--GTA-T--GCTAATGTGTC--TT-T-G-AAA---TG--TATTATTCCAAC-----TG-AATGT-CTTC--C-CA--------CA-AA--CATCACATTtttataaggtttatccccggtgtgtataatcatgtgtctcttcaggt
gi|6 : tAATGCCTTTCCACAGA--C-ATCAC--GC---TCA----TA--AGGTCTCTCACCAAAAT--ATG-T-C-CTCTTGTGT---CT-TCGCAAGTC-TC--CAT---TTTGAC-----TGTAAA-C-CTTC--C-CA--------CA-AA--CACAACATTTATTAGTTTTATCACCGGTTTGAATCATCATGTG
gi|5 : gggacggctcatgtgatat-AAA--C-ATCAC--AT---TTA----TA--AGGTCTATCACAAGTGT--GTA-T--TATCATATGTG--TC-T-GTAAGAT-TG--ACT--ACGC-AT-----TG-AGT-C-CCTT--CCAA--------AA-AA--CATCACATTTATATGGTATATCACCAGTATGTATCCTCA--TATGT-AT-CT-GAA---ACGT-TCCTG-TT----CGATTGAA-TGC----C--TT--CC--Ca
gi|14 : cacAAGGTTTCTCACCACTAT--GAA-T-C-CTTGTGTGTCTCTT-T-A-AGT-T-TG--T-T--GTCTGAT-----TG-AAAAC-CTTT--C-CA--------CA-GA--TATCACATTTATAAGGTTTCT
gi|10 : AAGGACTCTCTCCAGTAT--GCAGT-TTCTCATGTCG---TG-C-A-AGG-TATG--CA---ATTCGAT-----TG-AAG-AGCTT-----GC--------CA-CATTCTTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCC
gi|13 : tttgtA-T-C-CTCATGTGAA--TT-T-GTAAT-T-TA--TCT--TTCCGAC-----TG-AAT-G-TCTT--C-CCA-------CA-TA--CATTACATGTAAAATGTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGTG
gi|2 : CTCATGTGTC--TT-T-GTAA----TGATCCT--GTCGCAC-----TG-AATGC-CTTC--C-AA--------CA-CA--CATCACATTTATAAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCG--TC-TG-TAAATTTCCT-AACTG--A----C---TGAA-TGC----C--TT--CT--CACA-ACC--------ACCACAC---T-T-ATA-A-G-GTTTATCACCAGTATGT-TTCCTTATGTGTG--TTTTTAAG--TG----TCC---TAT---GT--A--AT---TG-AAT--A--CCTT----CCC-AC-AGA-C-ATCA--C-ATCTA-TAAGG-T-T-T-T----TCAATATGTGTCCTCATATGTT--TCT---G---T---A---AG---T----T-C-T----CT-A-TC-CAATTCAATT----CCTTCCCAC---------AAA-C-ATCGCA-TT--TA-TAAG-GTTC-CTCACCTGTGTGTG---C-C-C-TCATGTGTGTCT-CT-
gi|6 : cG-C-T---CAT--GTGATAT--------AATGC-CTTT--C-CA--------CA-GA--CATCACGCTCATAAGGTCTCTCACCAAAATATGTCCTC--TTGTGT-CT-TCGCAAGTCTCCA-TTTTGACT----G---TAAA-C------C--TT--CC--C----ACA--------AACACAACATT-T-ATT-A-G-TTTTATCACCGGTTTGAATaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : gggacgAT-----TG-AAT-A-CTTTTCC-ACAAACATCACA-CA--CATCACATCTATAAGGTTTTTCA---ATATGTATCCTCA--TATGT-TT-GTGTAAGT----T-TCTTA-TC----CAATTGAA-TGT----C--TT--CC--CA-C-AGAC-------ATCGCAC---T-T-ATA-A-G-CTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCcatcatgtga
gi|9 : tgttccgtgtgT-----TG-AATGC-CTT-----GC--------CATAG--GATGACATTGATAAGGTTATTCAACAGTATGTATGCT--AATGTGT-CT-TT-GAAAT----G-TATTA-TTCCAAC---TGAA-TGT----C--TT--CCCACA-A-AC---------ATCACA----T-T-atgtatccctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|3 : --------CA-GA--CATCACATTGATAAGGTTTATCACCAGTATGTGTCATCATGTGTG--TA-TA-TAAGT----T-TCCTG-ACCGA-C---TGAA-TGC----C--TT--CCCACA-G-ACA--------A-CACAT---T-T-ATA-A-G-GTTTTACACCAGTGTGTA-TCTTCATGTGTC--TTTGTAA---GT---CTGC---TCT----------CCGAATG-AAT--G--TCTT----CCC-AC-AGA-C-ATCA--C-ATTTA-TAAGACT-T-A-TCA--GCAGTATGTCTTCTC--ATGTGTCTCT---G---T---A---AG---C----T-T-C----CT-G-TC-TGACTAAATG----CCTTCCCAC---------ACA-C-ATCACA-TT--TA-TAAG-GTT-TATCAC--CAGTATGTGTCCT-C-TT--GTGTATC--TT-TAA-G-----CGT--
gi|5 : cca--------CA-AA--CATCACATTTATAAGGTCTATCACAAGTGTGTATTATCATATGTGT-CT-GT-AAGATTGACT-ACGCA-T---------TGAG-TC-----C--CT--TC--CA-A-AAAAC------ATCACAT---T-T-ATATG-G-TAT-ATCACCAGTATGTATCCTC-ATATGTA--TCTGAAA---CGTTCCTGT---T-C---G---A---T---TG-AA---tggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|7 : ca--CATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATGtgccttccc
gi|15 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacactaaaggctttgccgcactATCACATTAATCAATTTTATCACCGGCATGCATACTCA--CGTGT-CT-CT-TAA---ACAT-TTCTG-TA----TGAATAAATTT-----C--TT--CC--CA-actaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|12 : TTACATGTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGcagacatca
gi|8 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaacactgaaggctcttccacattgtTTTATAAGGTTTATCCCCGGTGTGTATAATCA--TGTGT-CT-CT-TCAGagttctttcat
gi|14 : tatgtaagtgtcctgcatgattgaatgtcttgccacagacatcatatttacatgtacaaggtttatcattggtAAGGTTTCTCACCACTATGAATCCTT--GTGTGT-CTCTT-TAAGT----T-TGTTG-T-----C---TGAT-TGAAAACC--TT--TC--CA-C-AGAT-------ATCACAT---T-T-ATA-A-G-GTTTCTgt
gi|13 : ATCCTCA--TGTGAATT-TG-TAATTTATCT-TTCCG-A-----C---TGAA-TGT----C--TT--CC--CA-C-ATAC-------ATTACA----TGT-AAA-ATG-T-TCATCACCAGTATGTATCCTC---ATGTG--TG
gi|2 : CCTCA--TGTGT-CT-TTGTAA-TGATCC-TGTCG-CA----C---TGAA-TG-----C--CT--TC--CA-ACACAC-------ATCACA----T-TTATA-A-G-GTTTATCACCAGTATGGGTCCTAAT-GTGCG--TCTGTAAATTTC---CTAA---C-T---G---A--C----TG-AATGCC--TTCT------C-AC-A-A-CCACCA--CA-CTTA-TAAGG-T-T-TATCAC-C-AGTATGTTTCCTTATGTGTGTTTTT---A---A---G---TG---T--------C----CT-A-TG-TAATTGAATA----CCTTCCCAC---------AGA-C-ATCACA-TC--TA-TAAG-GTT-TTTC-----AATATG---TGT-C-CTC-ATATGTTT-CTGTAA-GTT---C-T--C-T----ATCC-----A--ATT-C-AATTCCTTCCCACA----AA-----CATCGCATT-T-A-T-A-AGGTTCCTC-A-CCTG---TG-TGTGCCCT-CATGTGTGTCT--CT---A
gi|4 : ---TGAA-TA-----C--TTTTCCA-CA-A-ACATCACACACATCACA----TCT-ATA-A-G-GTTTTTCA---ATATGTATCCTC-ATATGTT--TGTGTAA----G---TTTC---T-T---A---T--CCAATTG-AAT--G--TCTT----CCC-AC-AGA-C-ATCG--C-ACTTA-TAAGC-T-TCC-TCAA-CT-GTGTGTGTCCTC--ATGTA--TCactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|9 : tgttccgtgtgat---TGAA-TG-----CC-TT--GC--CA-T-AGG--------ATGACA----T-TGATA-A-G-GTTATTCAACAGTATGTATGCTA-ATGTGTC--TTTGAAA---TGTA-TTAT---T-C---C---A--AC---TG-AAT--G--TCTT----CCC-ACAA-A-C-ATCA--CAcctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : tAA-TG-----CCTTT--CCA-CA-G-ACA---------TCACG----C-TCATA-A-GGTCTC-TCACCAAAATATGTCCTCTT-GTGTC--TTCGCAA---GT---CTCCATTT-T---G---A--C----TGTAA---ACCTTCCCACAAAC-AC-A-A-C---------ATTTATTAGTT-T-T-A-TCA--CCGGTTTGAATCATC--ATGTG--tt
gi|3 : gggacggctcatgtgatat--CA-G-ACA---------TCACA----T-TGATA-A-G-GTTTATCACCAGTATGTGTCATCAT-GTGTG--TATATAA----G---TTTC---C-T---G---A--CCGACTG-AATGCC--TTCC------C-AC-AGA-C-AACA--CA-TTTA-TAAGG-T-T-T-T-ACACCAGTGTGTATCTTCA--TGTG--TCTTT-GT--A---AGTCTG---C----T-CTC----CG-A-------ATGAATG----TCTTCCCAC---------AGA-C-ATCACA-TT--TA-TAAG-ACT-TATCAG--CAGTATGT--CTT-C-TCA--TGTGTCT-CTGTAA-G-----CTT--CCT----GTCT-----G--ACT-A-AATGCCTTCCCACA----CA-----CATCACATT-T-A-T-A-AGGTTTATC-A-CCAG---T-ATGTGTCCTCTT-GTGTATCT--TT---AAGCGTTGGT-TGa
gi|5 : cca--CA-A-ACA---------TCACA----T-TTATA-AGG-TCT-ATCACAAGTGTGTATTATC-ATATGTG--TCTGTAAGATTGA--CTACGCAT-T---G---AGTCC---C----------TTCC----A-A-AA-A-A-C-ATCA--C-ATTTA-TATGG-TAT-A-TCA--CCAGTATGTATCCTCATATGTA--TCT---GA--A---A---CG---T----T-C-CTGTTCG-A-T------TGAATG----CCTTCCCaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|14 : caA-A-G-GTTTCTCACCACTATGAATCCT-TGTGTGTC--TCTTTAAGTTTG---TTGT---C-T---G---A--T----TG-AA---A--ACCT----TTCCAC-AGA-T-ATCA--CA-TTTA-TAAGG-T-T-
gi|13 : TCCTCATGTGAATTTGTAA---TT---TATC---T-TTCCG---A--C----TG-AAT--G--TCTT----CCC-AC-ATA-C-ATTA--CA-TGTA-AAATG-T-T-CATCAC-C-AGTATGTATCCTC--ATGTG--Ttct
gi|2 : aTGTGTC--TTTGTAA---TGATCCTG----T-C---G---C--AC---TG-AATGCC--TTCC----AAC-AC-A---C-ATCA--CA-TTTA-TAAGG-T-T-TATCAC-C-AGTATGGGTCCT-A-ATGTGCGTCT---GTA-A---A---T----T----T-C-C----TA-ACTG-A--CTGAATG----CCTTCTCA----------CAA-CCACCACA-CT--TA-TAAG-GTT-TATCAC--CAGTATG---TTT-CCTTATGTGTGT-T-TT-TAA-G-----TGT--CCT----ATGT-----A--A-TTG-AATACCTTCCCACA----GA-----CATCACA-TCT-A-T-A-AGGTTTTTC-A----A---T-ATGTGTCCT-CATATGTTTCT--GT---AAGT-TC-TC-TAT-C-CA---A-T----T--CAATTCCTTCC--CACA--AACA--T--CGCATT-TA----TAAGGTTCCTC-ACCTG--TGTGTGCC-C-T-CAT-GTGTGTC--TC---T---AAg
gi|4 : cctca----ATC-AC-ACA-C-ATCA--CA-TCTA-TAAGG-T-T-T-TT----CAATATGTATCCTCATATGTT--TGT---G---T---A---AG---T----T-T-C----TT-A-TC-CAATTGAATG----TCTTCCCAC---------AGA-C-ATCGCA-CT--TA-TAAG-CTTC-CTCAA--CTGTGTG---TGT-C-CTC-ATGTATCctttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|3 : tgttccgtgtgattgaatacttttccacaaacC-AC-AGA-C-ATCA--CA-TTGA-TAAGG-T-T-TATCAC-C-AGTATGTGTCATCA--TGTG--TGT---A---T---A---TAAGTT----T-C-C----TG-A--C-CGACTGAATG----CCTTCCCAC---------AGA-C-AACACA-TT--TA-TAAG-GTTTTA-CAC--CAGTGTG---TAT-C-TTC-ATGTGTCT-TTGTAA--------GT--C-T----GC-TCTCCGA--A-T-G-AATGTCTTCCCACA----GA-----CATCACATT-T-A-T-A-AGACTTATC-AGCA-G---T-ATGTCTTCT-CATGTGTCTCT--GT---AAGCTTC--C-TGT-C-TG---A-C----T--AAATGCCTTCCCACACA--C--A--T--CACATT-TA----TAAGGTTTATC-ACCAG--TATGTG-TCC-T-CTT-GTGTATC--TT---T---AAG-----C-cctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|5 : cC-AC-A-AAC-ATCA--CA-TTTA-TAAGG-TCT-A-TCAC-A-AGTGTGTATTATCATATGTG--TCT---GT--A---A---GA---T----T-G-A----CT-A-CG-CA-TTGAGTC----CCTTCCAA----------AAAAC-ATCACA-TT--TA-TATG-G-TATATCAC--CAGTATG---TAT-C-CTC-ATATGTAT-CT-GAA-A-----CGTTCC-T----GT-TCG---A--T-T-G-AATGCCTTCCCgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|6 : C-AC-AGA-C-ATCA--CG-CTCA-TAAGG-TCT-C-TCAC-CAAA-ATATGTCCTCT--TGTG--TCTTC-G---C---A---AG---T----C-T-C----C--A-TT-T---TGACTGTAAACCTTCCCAC---------AAA-C-ACAACA-TTTAT--TA---GTTTTATCAC--CGGTTTG---AAT-C-ATC-ATGTG
gi|15 : gggacggctcatgtgatataatgcctttc-A-C-ATTAATCAATTT--TA----------TCAC-C-GGCATGCATACTCA--CGTG--TCTCTTA---A---A---CA---T----T-T-C----TGTA-TG-A--ATAAATT----TCTTCCCAC---------AGA-C-ATCAa
gi|9 : atcATTGA-TAAGG-T-TAT-TCAA-C-AGTATGTATGCT-A-ATGTG--TCTTTGA---A---A---TG---TATTAT-T-C----CA-A-------CTGAATG----TCTTCCCAC---------AAA-C-ATCACA-T
gi|8 : ttgaatgccttgccataggatgacTTTA-TAAGG-T-T-TATC-C-CCGGTGTGTATAATCA--TGTG--TCT---t
gi|14 : tatgtaagtgtcctgcatgattgaatgtcttgccacagacatcatatttacatgtacaaggtttatcattggtAGGT-T-T-C-TCAC-C-ACTATGAATCCTTG--TGTG--TCT---CTTTA---AGTTTG---T----TGT-C----TG-A-T------TGAAAA----CCTTTCCAC---------AGA-T-ATCACA-TT--TA-TAAG-GTT-TCTcttcaggt
gi|13 : aATCCTCA--TGTGAATTT---GTA-ATTTA---TC---T----T-T-C----CG-A-------CTGAATG----TCTTCCCAC---------ATA-C-ATTACA-TG--T--AAAATGTTC-ATCAC--CAGTATG---TAT-C-CTC-ATGTGT
gi|2 : CCTCA--TGTG--TCTTT-GT--A---A---TG---A----T-C-C----TG---TCGCA-CTGAATG----CCTTCCAAC---------ACA-C-ATCACA-TT--TA-TAAG-GTT-TATCAC--CAGTATG---GGT-C-CTA-ATGTGCGT-CTGTAA-A-----TTT--C-CTA--AC-T-----G--ACT-G-AATGCCTTCTCACA----AC-----CACCACACT-T-A-T-A-AGGTTTATC-A-CCAG---T-ATGTTTCCT-TATGTGTGTTT--TT---AAGTGTC-CTATGT-A------A-T----T--GAATACCTTCC--CACA--GACA--T--CACATC-TA----TAAGGTTTTTC----AA--TATGTG-TCC-T-CA---TATGT---TTCTGT---AAG-----T-TCT--C-TAT-C----C-AATTCAATTCCTTCCCACAAACA-TCGCATTTATAAGGT-T-C-C-TCACCTGT--GTGTGCCCTCATGTGT--GT--CTC--T--AAC--T-TT-T-T------GCTT-T--GAT--T--A---Ag
gi|4 : ---TG---T----T-C-CGTG-TG-A-T------TGAATA----CTTTTCCACAAACATCACACA-C-ATCACA-TC--TA-TAAG-GTTTTT---C--AA-TATG---TAT-C-CTC-ATATGTTT-GTGTAA-G-----TTT--C-TT---AT-CC----A--A-TTG-AATGTCTTCCCACA----GA-----CATCGCACT-T-A-T-A-AGCTTCCTCAA-CT-G---TG-TGTGTCCT-CA--TGTATCatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|9 : TGAATG----CCTTGCCAT---------AGG---ATGACA-T---TGATAAG-GTTAT-TCAA--CAGTATG---TAT-G-CTA-ATGTGTCT-TT-GAA-A-----TGTA-T-T----AT-TCC---A--ACT-G-AATGTCTTCCCACA----AA-----CATCACA-T-T-cctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : tAATG----CCTTTCCAC---------AGA-C-ATCACGCTC--A--TAAG-G-TCTCTCACCAAAATATGT--CCT-C-T----TGTGTCT-TCGCAA-G-----TCT--C-C----AT-TTTG--ACTG-T-A-AA--CCTTCCCACA----AA-----CACAACATT-T-A-T-T-AGTTTTATC-A-CC-GGTTTGAATCATC
gi|3 : gggacggctcatgtgatatCCAC---------AGA-C-ATCACA-TT--GA-TAAG-GTT-TATCAC--CAGTATG---TGT-C-ATC-ATGTGTGT-ATATAA-G-----TTT--C-CTG--AC-C-----G--ACT-G-AATGCCTTCCCACA----GA-----CAACACA-T-TTA-T-A-AGGTTTTAC-A-CCAG---TG-TGTATCTT-CA--TGTGTCT--TT---GTAAGTC----TGC-T-CTCCGA-A----T--GAATGTCTTCC--CACA--G--ACAT--CACATT-TAT----AAGACTTATC-AGCAG--TATGTC-TTC-T-CAT-GTGTCT---CTG--T---AAG-----C-TTC--C-TGTCT------GACTAAATGCCTTCCCACACACA-TCACATTTATAAGGT-T-TAT-C-ACCAGTATGTG--TCCTCTTGTGT--AT--CTT--T--AAG--CGTT---G------G--T-T--GAatgtga
gi|5 : ----------AAA-C-ATCACA-TT--TA-TAAG-G-TCTATCAC--AAGTGTGTATTAT-C-ATA--TGTGTC--TG-TAA-GAT---TGA--C-T----ACGC-----A--T-T-G-AGTCCCTTCCAAAA----AA-----CATCACATT-T-A-T-ATGGTAT-ATC-A-CCAG---T-ATGTATCCT-CATATGTATC---TG---AAACGTT-CC-TGT-T-CG---A-T----T--GAATGCCTTCC--Cacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|15 : cac-ATCACA-TTAAT--CAA---TTTTATCAC--CGGCATG---CATAC-TCA--CGTGTCT-CT-TAA-A-----CAT--T-TCTGTAT-G-----A--A-T-A-AATTTCTTCCCACA----GA-----CATCA
gi|14 : AAG-GTT-TCTCAC--CACTATG---AAT-C-CTT-GTGTGTCTCTT-TAA-GTTTGTTGT--C-TG---AT-T-----G--A---A-AACCTTTCCACAGA----T-------ATCACATT-T-A-TAA-GGTTTC
gi|2 : TGTGTCT-TTGTAATG-----ATC--C-T----GT-CGC---A--C-T-G-AATGCCTTCCAACA----CA-----CATCACA-T-TTA-T-A-AGGTTTATC-A-CCAG---T-ATGGGTCCT-AATGTGCGTCT--GT---AAATTTC-CT-AAC-T-G----A-C----T--GAATGCCTTCT--CACA--ACCA--C--CACACT-TAT----AAGGTTTATC-ACCAG--TATGTT-T-CCT-TAT-GTGTGT---TT---TT--AAG-----T-GTC--C-TATGTA------ATTGAATACCTTCCCACAGACA-TCACATCTATAAGGT-T-T-T----TCAATATGTG--TCCTCATATGT--TT--CTG--T--AAG--TTCT-C-T------A--T-C--CAA--TTCA---AT-TC-----CTTCC-CACA------A------ACATCG---CATTTATAAGGTTCCTC--ACCTGTGTGTG---C--CCT-C--AT-GTGTGTCT--CT---AA---C-T-T-T-TTGC-TTTGATTAAATATCTt
gi|6 : cctca-T-----G--A-T-ATAATGCCTTTCCACA----GA-----CATCACG-C-TCA-T-A-AGGTCTCTC-A-CC-A---AAATATGTCCT-C--TTGTGTCT--TCGCAAGTCTCC-AT-T-T-T-G----A-C----TGTAAA--CCTTCC--CACA--A--A-----CACAAC-ATTTATT-AGTTTTATC-ACCGG--TTTGAA-T-CAT-CAT-GTGgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : gggacggctcatg-T-G-AATACTTTTCCACAAACATCACACACATCACA-TCT-A-T-A-AGGTTTTTC-A----A---T-ATGTATCCT-CATATGTTTGT--GT---AAGTTTC--T-TAT-C-C----AAT----T--GAATGTCTTCC--CACA--GACA--T--CGCACT-TA----TAAGCTTCCTCAACT-G--TGTGTG-TCC-T-CAT-GTa
gi|13 : tgttccgtgtgat-T-G-AATGTCTTCCCACA----TA-----CATTACA-TGT-A-A-A-ATGTTCATC-A-CCAG---T-ATGTATCCT-CATGTGTGatccctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|9 : atcctcatgtgaatttgtaatttatctttccgac-T-G-AATGCCTTGCCATA----GG------ATGACA-T-TGA-T-A-AGGTTATTC-A-ACAG---T-ATGTATGCT--A-ATGTGTCT--TTG--AAATGT--AT-TAT-T-CCA--A-C----T--GAATGTCTTCC--CACA--AACA--T--CACAT
gi|3 : tCCACA----GA-----CATCACA-T-TGA-T-A-AGGTTTATC-A-CCAG---T-ATGTGTCAT-CATGTGTGTAT--AT---AAGTTTC-CT-GAC-C-G----A-C----T--GAATGCCTTCC--CACA--G--A--CAACACATT-TAT----AAGGTTTTAC-ACCAG--TGTGTA-T-C-TTCAT-GTGTCT---TTG--T---AAG-----T-CTG--C-TCT-CC--GA-A--TGAATGTCTTCCCACAGACA-TCACATTTATAAGAC-T-T-----ATCAGCA-GTATGTCTTCTCATGT--GT--CTCTGT--AAG--CTTC-C-T------G--TCT--GAC--T--A---AA-TGC----CTTCC-CACA-----C-------ACATCA---CATTTATAAGGTTTATC--AC--CAGTATGTGTC--CT--C--TT-GTGTATCT--TT---AA---t
gi|5 : CACA----AA-----CATCACA-T-TTA-T-A-AGGTCTATC-A-CAAG---TG-TGTATTAT-CATATGTGTCT--GT---AAG-----AT-TGA-C-T----A-CGCATT--GAGTCCCTTCC--AAAA--A--ACAT--CACATT-TAT-AT---GGTATATC-ACCAG--TATGTA-TCC-T-CAT-ATGTAT---CT---G---AAA-----CGTTC--C-TGT-T----C-GATTGAATGCCTTCCCgcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|15 : ATCACA-T-T-AAT-C-AATTTTATC-A-CC-G---GCATGCATACT-CA--CGTGTCTC-TT---AAACATT-TC-TGTAT-G----A-A----T--AAATTTCTTCC--CACA--G---------ACATC-
gi|14 : -A-GGTTTC-TC-A-CC-A---CTATGAATCCT-T--GTGTGTCTCTTT---AAGT-TT-GT-TGT-C-TG---A-T----T--GAAAACCTTTC--CACA--G--A--TATCACATT-TAT----AAGGTTTCTa
gi|2 : aCCT-CA--TGTGTCT--TTGTAATG-ATC--C-TGT-CGC----A-C----T--GAATGCCTTCCAACACA--C--A--T--CACATT-TA----TAAGGTTTATC-ACCAG--TATGGG-T-C-C-TAATGTGCGT---CTG--T---AAA-----T-TTC--C-TA---A--CT-GACTGAATGCCTTCTCACA-ACCACCACACTTATAAGGT-T-TAT-C-ACCAGTATGT-T-TCCTTATGTGT--GT--TTT--T--AAG--TGTC-C-T------A--TGT--AAT--TG-A---ATAC------CTTCC-CACAG--A-CATC----ACATC----T----ATAAGGTTTTTC-------AATATGTGTC--CT--C--AT-ATGTTTCT--GT---AA---G-T-T-CTCT-A-TCCAATTCAATTCCTTCCC-ACAAA-CATCGC---------ATTT-AT-AAGG----TTCC-T--CACCT---GTGTGTGCCCTCA-TGTGTGTCT--C-T---AA---------C-T-T--TT-TG-CT
gi|13 : ----A-C----T--GAATGTCTTCC--CACA--T--ACAT--TACATG-TA--A--AATGTTCATC-ACCAG--TATGTA-TCC-T-CAT-GTGTGttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|12 : atcctcatgtgaatttgtaatttatctttccg----A-C----T--GAAGGCTCTTC--CACATTG--T--T--TACATG-TAT----AAGGTTTCTC-TCCAG--TGTG
gi|9 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaac----T--GAATGCCTTGC--CATA--GG-A--T--GACATT-GAT----AAGGTTATTC-AACAG--TATGTA-TGC-T-AAT-GTGTCT---TT---G---AA---------AT--G-TAT-TATTCC-AACTGAATGTCTTCCCACAAACA-TCACATTagttctttcat
gi|6 : tAATGCCTTTC--CACA--G--ACAT--CACGCT-CAT----AAGGTCTCTC-ACCAAAATATGT--C-C-T-C---TTGTGT---CT---TCGCAAG-----T-CTC--CATTT-T------GACTGTAAACCTTCCCACAAACA-CAACATTTATTAGTT-T-TAT-C-ACCGGT
gi|4 : gggacggctcatgtgatatTCA--CACA--C--A--T--CACATC-TAT----AAGGTTTTTC-A---A--TATGTA-T-CCT-CA---TATGT---TTGTGT---AAG-----T-TTC--T-TAT-CC--AA---TTGAATGTCTTCCCACAGACA-TCGCACTTATAAGCT-TCC-T-CAACT-GT--GTGTGTCCTC--ATGT--ATCCCTC--T--AAC--T-TT-T-T------GTTT-T--GAT--T--A---Attgaatcatcatgtga
gi|3 : tgttccgtgtgattgaatacttttccacaaacaC--CACA--G--A-------CATCACATTGATAAGGTTTATC-ACCAG--TATGTG-T-CAT-CAT-GTGTGT---ATA--T---AAG-----T-TTC--C-TG---A--CC-GACTGAATGCCTTCCCACAGACA-ACACATTTATAAGGT-T-T-T-ACACCAGTGTGTA--TCTTC--ATGT--GT--CTTTGT--AAGTCTGCT-C-T---------C-C--GAA--TG-A---ATGT------CTTCC-CACA------G------ACATCA---CATTTATAAGACTTATC--AG--CAGTATGTCTT--CT--C--AT-GTGTCTCT--GT---AAG--C-T-T-C-CT-G-TCTGACTAAATGCCTTCCC-ACACA-CATCAC---------ATTT-AT-AAGG----TTTA-T--CACCA---GTATGTGTCCT-CTTGTGTATCT--T-T---AA---G-acatctgaaataaaaaaaaa
gi|5 : --CACA--A--ACAT--CACATT-TAT----AAGGTCTATC-ACAAG--TGTGTA-T-TAT-CAT-ATGTGT---CTG--T---AAGATTGAC-TAC--G-CAT-T---GA-GTC------CCTTCCAAAAAACA-TCACATTTATATGGTAT-A-T-C-ACCAGTATGTA--TCCTCATATGT--AT--CT---G--AAA--CGTTCC-T------G--T-TC-GAT--TG-A---AT-G------CCTTC-Ccgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|15 : --A--T--CACAT--TA--ATCAAT-TTTATC-ACCGG--CATGCA-TAC-T-CAC-GTGTCT---CT---T---AAA-----C--ATTTC-TGT------ATGAATAAATTTCTTCCCACAGACA-TCAc
gi|14 : AAGGTTTCTC-ACCAC--TATGAA-T-C---CTT-GTGTGTCTCTT---T---AAG---------T--T-TGT-TG--TCTGATTGAAAACCTTTCCACAGATA-TCACATTTATAAGGT-T-T-
gi|13 : -GACTGAATGTCTTCCCACATACA-TTACATGTAAAATGT-T-CAT-C-ACCAGTATGTA--TCCTC--ATGT--GT--ct
gi|2 : atcctcatgtgaatttgtaatttatctttccACTGAATGCCTTCCAACACACA-TCACATTTATAAGGT-T-TAT-C-ACCAGTA-TGGG-TCCT--AATGTGCGT--CTG--T--AAA--TTTC-C-TA-----A--C-T--GAC--TG-A---AT-G------CCTTCTCACAA--C-CA------CCA-CAC--TT---ATAAGGTTTATC--AC--CAGTATGTTTC--CT--T--AT-GTGTGTTT--TT---AAG--T-G-T-C-CT-A-TGTAATTGAATACCTTCCC-ACAGA-CATCAC---------ATCT-AT-AAGG----TT---T--T-TCA---ATATGTGTCCTCA-TATGTTTCT--G-T---AA---GTTCTCT-A-T--CC-AA-TTCA--ATTCCT--T-C-CC------ACAA-A-CATCGCATTTATAA-GG--T-TC-C-T-CACC-----TGTGTGTGCCCT-CATG-TG--TG--T--CTC----T--AA-C-T-T-T-T-TGg
gi|9 : cctcatgtgtctttgtaatgatcctgtcgcTGAATGCCTTGCCATAGGA--TGACATTGATAAGGT-TAT-T-CAAC-AGTATGTAT-GCT---AATGT--GT--CTT--TG-AAA--TGTA-T-T------A--T-TCCAAC--TG-A---ATGT------CTTCC-CACA------A------ACATCA---CA---ctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|6 : tAATGCCTTTCCACAGACA-TCACGCTCATAAGGT-C-T-C-TCACCAA-A-ATATGTCCTC--TTGT--GT--CTTCGC--AAG--TCTC-CAT------T--T-T--GACTGT--A---AA-C------CTTCC-CACAAACA-CA------ACAT-----TT---ATTAGTTTTATC--AC--CGGTTTG---A--AT--C--ATCATGTGtt
gi|16 : gggacggctcatgtgatatCCTTTCCACAGATA-TCACACTTGTAAGGT-T-T-a
gi|3 : CCACAGACA-TCACATTGATAAGGT-T-TAT-C-ACCAGTATGTG--TCATCATGTGT--GT--ATA--T--AAG--TTTC-C-T------GA-C-C--GAC--TG-A---ATGC------CTTCC-CACAG--A-CA------ACA-CAT--TT---ATAAGGTTTTAC--AC--CAGTGTGT--A--TCTTC--AT-GTGTCTTT--GT---AAG--T-C-T-G-CT-C-TCCGAATGAATGTCTTCCC-ACAGA-CATCAC---------ATTT-AT-A--AGAC-TTA--T--CAGCA---GTATGTCTTCTCA-TGTGTCTCT--G-T---AA---G-CTTCC-TGT--CT-GA-CT-A--AATGCCT-T-C-CC------AC-ACA-CATCACATTTATAA-GG--T-T--TAT-CACCAGTA-TGTGTC-----C-TCT--TG--TG--T--ATCT--
gi|5 : CACAAACA-TCACATTTATAAGGT-C-TAT-C-ACAAGTGTGTAT-T-ATCATATGT--GT--CTG--T--AAG----------------A--T-T--GAC--T--ACGCAT-TGAGTC-CCTTC-CAAAA-----A------ACATCA---CATTTATATGGTATATC--AC--CAGTATGT--ATCCT--C--AT-ATGTATCT--GA---AA---CGT-T-C-CT-G-TTCGATTGAATGCCTT-CC-ttaagcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|4 : CACACACA-TCACATCTATAAGGT-T-T-TTCAA----TATGTA--TCCTCATATGT--TT--GTG--T--AAG--T-TT-C-TTATCCAA--T-T--GAA--T--G------T------CTTCC-CACA------G------ACATCG---CACTTATAAGCTTCCTCAACT--GTGTGTG---T--CCT-C--AT-GTATCCCT--CT---AA---C-T-T-T-TTGT-TTTGATTAAACATCTc
gi|14 : tgttccgtgtgattgaatacttttccacaaacatAAGGT-T-T-C-TCACCACTA-TGAA-TCCTTG--TGT--GT--CTC--TTTAAG--T----T-T------G--T-T--GTC--T--G---AT-TGAAAACCTTTC-CACAG------------ATATCA---CATTTATAAGGTTTCTgaaataaaaaaaaa
gi|4 : --TGTT-C-C------G--TGT--GAT--TG-A---ATAC------TTTTC-CACAA--A-CATCACACACATCA---CATCTATAAGGTTTTTC-------AATATGT--A--TC--CTCAT-ATGTTTGT--GT---AA---G-T-T-T-CT-TATCCAATTGAATGTCTTCCC-ACAGA-CATCGC---------A-CTTATAA--G----CT---T--CCTCAACTGTGTGTGTCCTCA-TGT
gi|6 : TTTC-CACA------G------ACATCACGCTC---ATAAGGTCTCTC--ACCAAAATATG---T--CC--T--CT--TGTGTCTTCGC---AAG--T-C-T-C-CA-T-TTTGACTGTAAACCTTCCC-ACAAA-CA-CAA--------CATTTATT-A--G----TTTTAT--CACCG---GTTTGAATCATCA-TGTGatccctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|9 : gggacggctcatgtgatataatgccTTGC-CATAG--GATG------ACAT-----TG---ATAAGGTTATTC--AA--CAGTATGTATG--CT--A--AT-GTGTCTTT--GA---AA---T-G-T-A-TTAT-TCCAACTGAATGTCTT-CCCACAAA-CATCAC--------a
gi|3 : ttgaatgccC-CACAG--A-CATC----ACAT-----TG---ATAAGGTTTATC--AC--CAGTATGT--G--TCATC--AT-GTGTGTAT--AT---AAG--T-T-T-C-CT-G-ACCGACTGAATGCCTT-CCCACAGA-CAACAC---------ATTT-AT-AAGG----TT---TTACACCA---GTGTGTATCTTCA-TGTG--TCT--T-TGT-AA---G-TCTGC-T----CT-C--CGAATGAATGTC--TTC-CC------AC-AGA-CATCACATTTAT-A-AG--A----C-T-TATCAGCAGTATGTC-----T-TCTCATG--TG--T--CTCT--GT--AAGC-T-T-C-C-TGTC-T-GA--C-TAA---ATGC--CTT-CCCA-CACACATCACATTTA-TAA-G-G-TTTATC---A--------CCAG----TATGTGTC--C-TCTT----GTG--TA-TCTTTAA-GCGT-att
gi|5 : -CACAA------------ACATCA---CATTTATAAGGTCTATC--AC--AAGTGTGT--A--TTATC--AT-ATGTGTCT--GT---AAGA-T-T-G-A-CT-A--CGCATTGAGTCCCTT-CC-AAAAAACATCACATT-----TATATGGT-A-------TA---T--CACCA---GTATGTATCCTCA-TATGTATC---T-G---AAAC-G-T-TCC-T-G--TT-CG-ATTG--AATGCC--T-T-CC------tggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|15 : ------ACAT-----TA---ATCAATTTTATC--AC--CGGCATGCATA--CT--C--AC-GTGTCTCT---T---AAACAT-T-T-C--T-G-TATGAATAAATTTCTT-CCCACAGA-CATCAc
gi|12 : atc---ATAAGGTTTCTC--TC--CAGTGTG---A--
gi|7 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaacactgaaggctcttccacattgtttacatgtTAAGGTTTCTC--TC--CAGTGTG---A--gttctttcat
gi|14 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacactaaaggctttgccgcactcattgcacttgAAGGTTTCTC--AC--CACTATG---AA-TC--C--TT-GTGTGTCT--CTTTAAG---T-T-T-G-TT-G-TCTGATTGAAAACCTTTCC-ACAGA-TATCAC---------ATTT-AT-AAGG----TT---T--Cattctccaatgactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|2 : --CT--C--AT-GTGTCTTT--GT---AA---T-GAT-C-CT-G-TCGCACTGAATGCCTT-CCAACACA-CATCAC---------ATTT-AT-AAGG----TTTA-T--CACCA---GTATGGGTCCTAA-TGTGCGTCT--G-T---AA---A-TTTCC-TAA--CT-GA-CT-G--AATGCCT-T-C-TC------AC-A-ACCACCACACTTATAA-GG--T-T--TAT-CACC-----AGTATGTTTCCT-TATG-TG--TG--T--TTTTAAGT--G------T-C-C-TAT--G-TAATT-GAA---T-AC--CTTCCC-A-CAGACATCACATCTA-TAA-G-G-TTTTTCA--A--------TA------TGTGTC----C-TCA------TATGTT-TCTGTAA-GTTC-TCTATCCA-ATTCA---ATT-CCTT------------CCCA-----C----A-AAC-ATCGCA-T-T--TATAAGGTT--CCTCACCTGTGTGTGCCCTCAT-G-TGTG-T-C--T--CT-----A-ACTTT---T-TG-C---T-TTGATTA-AATATCTt
gi|13 : c--CT--C--AT-GTGAATTT--GT---AA---T-T-TAT-CT-T-TCCGACTGAATGTCTT-CCCACATA-CATTAC---------ATGTAAA-AT-G----TTCA-T--CACCA---GTATGTATCCTCA-TGTGTGgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|8 : atcT--GT---AA---G-TGT-C-CT-G-CATGATTGAATGTCTTGCC-ACAGA-CATCA---------TATTT
gi|4 : taTGATTGAATACTTTTCC-ACAAA-CATCACACACATCACATCT-AT-AAGG----TT---T--T-TCA---ATATGTATCCTCA-TATGT-TTG--TGT---AA---G-TTTCT-T-A--TC-CA-ATTG--AATGTCT-T-C-CC------AC-AGA-CATCGCACTTAT-A-AG--C-TTCC-T-CAAC-----TGTGTG-----TGTCC--TC-ATGTAT--CCCT--CT--AA-C-T-T-T-T-TGTacatgtacaaggtttatcattggttttataaggtttatccccggtgtgtataatcatgtgtctcttcaggt
gi|6 : tgttccgtgTGATATAATGCCTTTCC-ACAGA-CATCAC----------GCTCAT-A--AGGTCTC---T--CACCA---AAATATGTCCT-C-T-TGTGTC---T-TCGCAA---G-TCTCCAT-T--TT-GA-CTGT--AA--ACCTT-C-CC------ACAA-A-CACAACATTTAT-tttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|9 : gggacggctcatgTTGAATGCCTTGCC-ATAGG--ATGAC---------AT-TGAT-AAGG----TTAT-T--CAACA---GTATGTATGCT-A--ATGTGTCT--T-T---GAAATG-TATTA-T-T--CC-AA-CT-G--AATGTCT-T-C-CC------ACAA-A-CATCACATTtagttttatcaccggtttgaatcatcatgtga
gi|3 : -CC-ACAGA-CATCAC---------AT-TGAT-AAGG----TT---TATCACCA---GTATGTGTCATCA-TGTGTGT-A--TAT---AA---G-TTTCC-T-G--AC-CGACTGA--A-TGCC--TTC-CC------AC-AGA-CAACACATTTAT-AAGG--T-T--T-TACACCAG---TGTGTA-----T-C-T--TC-ATG--TGTCTTT--GT--AA-G-T-C-TGC-TCTCCG-AA--T-GAA---T-GT--CTT-CCCA-CAGACATCACATTTA-TAA-G-A-CTTATC---AGCAGTATGTC------T-T-------C-TCAT----GTG--TC-TCTGTAA-GCTT-CCTGT-------------CTGAC----T----AAATGCCTT-CCCAC----A-CAC-ATCACA-T-T--TATAAGGT----TTATCACCAGTATGTGTCCTC-T-TGTGTATC--T--TT-----A-A---G---C-------GT--TGGTTG-AACATCT
gi|5 : C-ACAAA-CATCAC---------ATTT-AT-AAGG----TC---TATCACAA---GTGTGTATTATCA-TATGTGTCT--G-T---AA---G-----A-T-TGACTACG-C-----ATTGAG--T-C-CCTTCCAAAA-A-A-CATCACATTTAT-ATGG--TAT--A-T-CACCAG---TATGTA-----T-CCT--CATATG--T--ATCT--GA--AA-CGT-T-C-C-TGTT-C-GAT-T-GAA---T-GC--CTT-CC-gaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|14 : ----TC---T--CACCA---CTATGAATCCT---TGTGTGTCTCTT-T---AA---G-TTTGT-TGT--CT-GA-TTGA--AA--ACCTT-T-CC------AC-AGA-TATCACATTTAT-A-AG--G-T--T-T-Cc
gi|6 : aaggttTAT--AATGCC--T-TTCC------AC-AGA-CATCACGCTCAT-A-AGGTC-T--C-T-CACCAAAA-TATGTC-----C-TCT--TG--TG--T--CTTC--GC--AA-G-T-C-T-C-CATT-TTGA--CTGTA---A-AC--CTT-CCCA-CAAACACAACATTTATT-A-G-T-TTTATC---A--------CC------t
gi|5 : gggacggctcatgtgaC------AC-A-AACATCACATTTAT-A-AG--G-T--C-T--ATCACAAGTGTGTA-----T-TAT--CATATG--T--GTCT--GTAAGA-T-T-G-A-C-T-------A--C-GCATTGA-GTCCCTT-CCAA-AAAACATCACATTTA-T-ATG-G-TATATC---A--------CCAG----TATGTATC--C-TCA------TAT-GTATCTGAAACGT-T-CCTGT-Tggtttgaatcatcatgtga
gi|4 : C------AC-ACA-CATCACATCTATAA-GG--T-T--T-T---TCAA---TATGTA-----T-CCT--CATATG--T--TTGT--GT--AA-G-T-T-T-CTTATC-C-AAT-T-GAA---T-GT--CTTCCC-A-CAGACATCGCACTTA-T-A-A-GCTTCCTC---A--------AC------TGTGTGTGTCC-TCAT----GTA--TC-CCTCTAA-CT-T-TTTGT-Tcgattgaatgccttccc
gi|14 : tgttccgtgtgattgaatacttttccacaaacat-T--C-T-CACCAC---TATGAA-----T-CCT--TGTGTG--T--CTCT--TT--AA-G-T-T-TGT-TGTC-T-GA--TTGAA---A-AC--CTTTCC-A-CAGATATCACATTTA-TAA-G-G-TTTttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|2 : aaggttTG--T--CTTT--GT--AA-T-GAT-C-C-TGTC-G-CA--CTGAA---T-GC--CTT-CC-AACACACATCACATTTA-T-AAG-G-TTTATC---A--------CC---------------------A----GTAT-GGGTCCTAAT-GTGCGTCTGT-AA-ATTTCCTAACTGACT--------GAATGCCT--TCT-C----ACAACCACCACACT-T--A-TAAGGTT----TATCACCAGTATG--TTTCC-T-TATG-T-G--T--GTTTTTAA-G--TG-----TC-CT-AT-GTAATTG-AATACCT-TC-CC-A-CAGA-CATCACA---------TCTA-T-AAGG-T-T-T-----TT-CA-----ATAT--GTGT----C-C-TC-ATATGT-TTCTGTAA-GTTCTCTATCC--AATTCAA---TTC----C--TTCC-C-ACAAA-CATCGCATTTA----TAA--GGTTCC-TCACC--TGTGTGTGCC--CTCATGTG--T-GTC-TCTAA--C-T-TT-TTG--CTTTG-AT--TA------A--Act
gi|13 : cctcatgTTT--GT--AA-T-T-TAT-C-TTTC-C-GA--CTGAA---T-GT--CTTCCC-A-CATACATTACATGTA-A-A-ATG-TTCATC---A--------CC---------------------A----GTAT-GTATCCTCAT-GTGT-tatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|3 : atcctcatgtgaa-CC-A-CAGACATCACATTGA-TAA-G-G-TTTATC---A--------CCAGTATGTGT-------CATCAT----GTG--TG-TATATAA-GTTT-CCTG-------------ACCGAC----T----GAATGCCTT-CCCAC----A-GAC-AACACA-T-T--TATAAGGT----TTTACACCAGTGTGTATCTTC-A-TGTG-T-CTTT--GT-----A-A--GT---C-TG-CT-CT-CCGAATG--A-ATGTCTTCCC-A-CAGA-CATCACA---------TTTA-T-AAGA-----C-T-TAT--CA-----GCA---GTATGTCTT-C-TC-ATGTGTC-TCTGTAA-GCTTCCTGTCT--GACTAAA---TGC----C--TTCC-C-ACACA-CATCACATTTA----TAA--GGTTTA-TCACC--AGTATGTGTC--CTCTTGTG--T-ATCTT-TAA--G-g
gi|5 : C-A-CAAACATCACATTTA-T-A-A-G----------G--------TC------TAT-------C-ACAAGTGTGTAT-TA-TC-ATAT-GTGT--CTGT-AAGATTG----ACT-ACGCATT----GA--GTCC--CTT-CCAAAA-AAC-ATCACA-T-T--TATATGGT----ATATCACCAGTATGTATCCTCATATGTA-T-C--T--GA-----A-A--CG---T-TC-CT-GT-TCGATTG--A-ATGCCTT-CC-cgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|4 : C-A-CACACATCACATCTA-TAA-G-G-TTTTTCAATA--------TG------TATC------C-TCA------TATGTT-TGTGTAA-GTTT-CTTATCCA-A----------------TT----GAATGTCTT-CCCAC----A-GAC-ATCGCACT-T--A-TAA----GCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTC-A-TGTc
gi|4 : tgttccgtgtgattgaatacttttccacaaacatTGT-TCCGTGTG-ATTG----AAT-ACTT-TTCCACAAA----CA-TCA-C----A-CAC-ATCACA-TCT--A-TAAGGTT---TT----TCAATATGTATCCTC-A-TATG-T-T--T--GTGT---A-A---G---T-TT-CTTAT-CCAATTG-AA--TGTCTT-CCCA-CAGA-CATCGCA---------CTTA-T-AAGC-T-TCC-T-CAAC-TGT----GTGT--GT------C-C-TC-ATGTATCatccctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : AATGCCTTTCCA-C----A-GAC-ATCACG-C-T--CATAAGGT--CTCTCACCAAAATATG--TCCTC-T-TGTG-T-C--TTCGC-----A-A--GT---C-TC-CA-TT-TTGACTGTAA-ACCT-TC-CC-A-CAAA-CACAACA---------TTTATT-AGTT-T-T-A-T-CA-C-CG-----GTcctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|3 : gggacggctcatgtgatat-CCA-C----A-GAC-ATCACA-T-T--GATAAGGTT----TATCACCAGTATGTGTCATC-A-TGTG------T--GT-----ATA--TAAGTT-TC-CT-GA-CCGACTG-AA-TGCCTTC-CC-A-CAGA-CAACACA---------TTTA-T-AAGG-T-T-T-TACA-C-CA-----GTGT--GTA-----T-C-TTCATGTGTCTTT-GTAA-GT---CTG-CT--CTCCGAA---TGAATGTC--TT-C-CCACAGA-CATCACATTTA----TAA--GACTTA-TCAGC--AGTATG--TCTTCTCATGTG--T-CTC-TGTAA--GCT-TC-CTG--TCTG--AC--TA------A--A-TGCCTTCCCAC-ACA-CAT--C-ACA-TT-TATAA-GG-TTTATCACC--AG-TATGT--GTCCT-CTTGTGTATCT-------T--TAA-ttgaatcatcatgtga
gi|5 : -C----A-AAC-ATCACA-T-T--TATAAGGTC----TATCACAAGTGTGTATTATCATATGTG-T-C--T--GT-----A-A--GA---T-TGACT-A--CGCATTG-AG--TCCCTT-CC-A-AAAAACATCACA---------TTTA-T-ATGG-TAT-A-T-CA-C-CA-----GTAT--GTAT----C-C-TC-ATATGTATCTGA-AACG-TTCCTGTTC--GATTGAA---TGC----C--TT-C-C-gcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|15 : caTCACA-T-TAAT-CAA--TT---TTATCACCGGCATGCATACTC-A-CGTG-T-C--T--CTTA---A-A--CA---T-TT-CT-GT-ATGAAT--AA-ATTTCTT-CCCA-CAGA-CATCAc
gi|14 : aAAGGTT----TCTCACCACTATGAATCCTT-G-TGTG-T-C--T--CTTT---A-A--GT---T-TG-TT-GT-CTGATTG-AA-AACCTTT-CC-A-CAGA-TATCACA---------TTTA-T-AAGG-T-T-
gi|10 : TCTCTCCAGTATGCAGTTTC-T-CATG-T-CG-T--GC-----A-A--GG---TATG-CA-AT-TCGATTG-AAGAGCT-TG-CC-A-CATT-CTTTACA---------TTTG-T-AAGGTT-T-C-T-C-TC-Ctct
gi|9 : tttgtaaggacGTATGTATGCTA-A-TGTG-T-C--T--TTGA---A-A--TG-----TA-TT-ATTCCAACTG-AA--TGTCTT-CCCA-CAAA-CATCACA---------TT
gi|2 : ttgaatgccttgccataggatgacattgataaggttattcaacaCTC-A-TGTG-T-C--TTTGT-----A-A--TG---A-TC-CT-GT-CGCACTG-AA--TGCCTT-CC-AACACA-CATCACA---------TTTA-T-AAGG-T-T-TAT-CA-C-CA-----GTATGGGT------C-C-TA-ATGTG-CGTCTGTAA-ATTTCCTAACT--GACTGAA---TGC----C--TT-CTC-ACAAC-CACCACACTTA----TAA--GGTTTA-TCACC--AGTATGTTTC--CTTATGTG--TGTTT-T-TAA--G-TGTC-CTA--TGTA--AT--TG------A--A-TACCTTCCCAC-AGA-CAT--C-ACA-TC-TATAA-GG-TTTTT---C--AA-TATGT--GTCCT-CATATGTTTC--------T-GTAA-GTTCTC----TAT-CCA-AT---TCAAT-TC-C-TTCCC-ACAAACATCGCATTT--ATAAGGT-TCC-TC-AC--CTGTGTG---TGCCCTCA-TGTGTGT---CTC---TAA-CTTTT-TGCTTTGA-T-TAAATATCT
gi|8 : c--T--GT-----A-AG-TG-----TC-CT-GC-ATGATTG-AA--TGTCTTGCC-A-CAGA-CATCATA---------TTTA-C-Agaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : ta-CC-GT-GTGATTG-AA-TACTTTT-CC-A-CAAA-CATCACACACATCACATCTA-T-AAGG-T-T-T-T-T----CA-----ATAT--GTAT----C-C-TC-ATATGT-TTGTGTAA-GTTTCTTATCC--AATTGAA---TGT----C--TT-C-CCACAGA-CATCGCACTTA----TAA--GCTTCC-TCAAC--TGTGTGTGTC--CTCATGTA--T-CCC-TCTAA--C-T-TT-TTG--TTTTG-AT--TA------A--Atgtacaaggtttatcattggttttataaggtttatccccggtgtgtataatcatgtgtctcttcaggt
gi|12 : tgttACTG-AA-GGCTCTT-CC-A-CATT-GTTTACA---------TGTA-T-AAGGTT-T-C-T-C-TC-CA-----GTcatctgaaataaaaaaaaa
gi|9 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaacTTG-AA--TGCCTTGCC-A-TAGG--ATGACA---------TTGA-T-AAGG-T-TAT-T-CA-A-CA-----GTAT--GTA-----TGC-TA-ATGTGTCTTTGA-AATGTATTAT-TCC--AACTGAA---TGT----C--TT-C-CCACAAA-CATCACATTgtgagttctttcat
gi|6 : TT-CC-A-CAGA-CATCACG---------CTCA-T-AAGG-TCT-C-T-CA-C-CA-----A-A---ATATGT--C-C-TC-TTGTGTC-TTCGCAA-GTCTCCATTTTGACTGTAAA---C------C--TTCC-C-ACAAA-CACAACATTTA----TTA--GTTTTA-TCACC--GGTTTGAATC--ATCATGTG--
gi|16 : gggacggctcatgtgatataatgcctTT-CC-A-CAGA-TATCACA---------CTTG-T-AAGG-T-T-a
gi|3 : cct-CC-A-CAGA-CATCACA---------TTGA-T-AAGG-T-T-TAT-CA-C-CA-----GTAT--GTG-----T-CATC-ATGTGTGTAT-ATAA-GTTTCCTGACC--GACTGAA---TGC----C--TT-C-CCACAGA-CAACACATTTA----TAA--GGTTTT-ACACC--AGTGTGTATC--TTCATGTG--T-CTT-TGTAA--G-T----CTG--CTCT--CC--GA------ATGAATGTCTTCCCAC-AGA-CAT--C-ACA-TT-TATAA-GA-CTTATCAGC--AG-TATGT--CTTCT-CATGTGTCTC--------T-GTAA-GCTTCC----TGT-CTG-AC---TAAAT-GC-C-TTCCC-ACACACATCACATTT--ATAAGGT-TTA-TCACC--AG-TATG---TGTCCTC-TTGTGTATC--TTT---AAt
gi|5 : C-A-CAAA-CATCACA---------TTTA-T-AAGG-T---C-T--ATCACAAGTGTGTA---TTA-----T-C-AT-ATGTGTCT---GTAAGATTGACTA-CG--CATTGAG---T------CCCTT-C-C-AAAAAACATCACATTTA----TAT--GGTATA-TCACC--AGTATGTATC--CTCATATG--T-ATC-T-GAAACG-T-TC-CTG--TTCG--AT--TG------A--A-TGCCTTCCCgcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|15 : ATCACA---------TTAA-TCAATT-T-T-A-T-CA-C-CG-----GCAT--GCA-----TAC-TC-ACGTGTCTCTTA-AACATTTC-TGTAT--GAATAAA---TTT----C--TT-C-CCACAGA-CATCA
gi|14 : -AGGT-T-T-C-T-CA-C-CA-----CTAT--GAAT----C-C-TT-GTGTGTCTCTT-TAA-GTTTGTTGTCT--GATTGAAAACC------T--TT-C-C-ACAGA-TATCACATTTA----TAA--GGTTTC-T
gi|13 : a-----C-C-TC-ATGTGAATTT-GTAATTTATCTT-TCC--GACTGAA---TGT----C--TT-C-CCACATA-CATTACATGTA----AAA--TGTTCA-TCACC--AGTATGTATC--CTCATGTG--T-
gi|8 : atTGTAA-GTGTCCTGCAT--GATTGAA---TGT----C--TTGC-C-ACAGA-CATCATATTTACATGTACAAGGTTTA-TCATT--GGTg
gi|12 : taCTGAAGGCT------C--TT-C-C-ACATT-GTTTACATGTA----TAA--GGTTTC-TCTCC--AGTGTG-Atttataaggtttatccccggtgtgtataatcatgtgtctcttcaggt
gi|9 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaacaTGAA---TGC----C--TTGC-C-ATAGG--ATGACATTGA----TAA--GGTTAT-TCAAC--AGTATGTATG--CTAATGTG--T-CTT-T-GAA--A-TGTA-TTA--TTCCA-AC--TG------A--A-TGTCTTCCCACAA-A-CAT--C-ACA-Tgttctttcat
gi|6 : t--TT-C-C-ACAGA-CATCACGCTCA----TAA--GGTCTC-TCACCAAAATATG--TC--CTCTTGTG--TCTTC-G-CAA--G-T-CT-CCA--TTTTG-ACTGTA------A--A---CCTTCCCACAA-A-CAC--A-ACATTT-ATT-A-GT-TTTATCACC--GGTTT-GA--ATCAT-CATGTGt
gi|16 : gggacggctcatgtgatataatgcct--TT-C-C-ACAGA-TATCACACTTG----TAA--GGTTTa
gi|7 : cct-C-C-GCACT-CATTGCACTTG----TAA--GGTTTC-TCTCC--AGTGTGAATT--CTCCAATG--A-CTA-A-TAA--G-G-T--GTGAATTTTG-AG--TG------A--AGAG-CTTGCCAC-ATT-CAT--T-ACA-T
gi|5 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacactaaaggctttg-C-ACAAA-CATCACATTTA----TAA--GGTCTA-TCACA--AGTGTGTATT--ATCATATG--T-GTC-TGTAA--G-A-T---TG--------AC--TACGCATTG--AGTCCCTTCCAAA-A-AACAT--C-ACA-TT-TAT-ATGG-TATATCACC--AG-TATGT--ATCCT-CATATGTATC--------T-GAAA-CGTTCC----TGT-TCG-AT---TGAAT-GC-C-TT-CC-tt
gi|4 : -C-ACACA-CATCACATCTA----TAA--GGTTTT-T---C--AATATGTATC--CTCATATG--T-TTG-TGTAA--G-T-TT-CTT--ATCC--AA--TT------G--AATGTCTTCCCAC-AGA-CAT--C-GCA-CT-TAT-A-AGCTTCCTCAAC--TG-TGTGT--GTCCT-CATGTAT-CCC-------T-CTAA-CTTT-T----TGT-TTTGAT---TAAAC-AT-C-Tc
gi|15 : tgttccgtgtgattgaatacttttccacaaacatATCACATTAA----T-C--AATTTTATCACC--GGCATGCATA--CTCACGTG--T-CTC-T-TAAACA-T-TT-CTG--TATG--AA--TA------A--A-TTTCTTCCCAC-AGA-CAT--C-Agaaataaaaaaaaa
gi|14 : --GGTTTC-TCACC--ACTATGAATC--CTTGTGTG--T-CTCTT-TAA--G-T-TTGTTG--TCTG--AT--TG------A--AA-ACCTTTCCAC-AGA-TAT--C-ACA-TT-TATAA-GG-TTTCT
gi|13 : aa-ATC--CTCATGTGAAT-TTG-T---A--A-T-TT-ATC--TTTCCGAC--TG------A--A-TGTCTTCCCAC-ATA-CAT--T-ACA-TGTAAA-A-TG-TTCATCACC--AG-TATGT--ATCCT-CATGTGTG
gi|12 : --AC--TG------A--AG-GCTCTTCCAC-A-T-TGT--TTACA-TG-TAT-AAGG-TTTCTCTCC--AG-T
gi|7 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaac--AC--TA------A--AG-GCTTTGCCGC-A-CTCATTGC-ACT-TG-TA--A-GG-TTTCTCTCC--AG-T--GTGAATTCTCCA---ATGACTAATAAGGT-GTGA-ATTT------TG------AG---TGAAGAGC-T-TG-CC-ACATTCATTACA--T--gtgagttctttcat
gi|6 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacGCCTTTCCAC-AGA-CAT--C-ACG-CT-CAT-AAGG-TCTCTCACCAAAA-TA--T--GTCCT-C-T-TGTGTCT-------TCGCAA-GTCTCCATTTTGA-C---TG---TAAA---C-C-TTCCC-ACAAACACAACA--T--TTAtt
gi|9 : gggacggctcatgtgatataatGCCTTGCCAT-A-G-GAT--G-ACA-TT-GAT-AAGG-TTATTCAAC--AG-TATGT--ATGCT-AATGTGTCT-T-------T-G-AA-ATGTAT----TAT-TCCAAC---TGAAT-GT-C-TT-CCCACAAACATCACA--T--ttagttttatcaccggtttgaatcatcatgtga
gi|5 : ttgaatCAC-A-AACAT--C-ACA-TT-TAT-AAGG-TCTATCACA--AG-TGTGT--ATTAT-CATATGTGTC--------T-GTAAGATTGAC----TACGC---AT---TGAGT-CC-C-TT-CCAAAAAACATCACATTT--ATATGGT-ATA-TCACC--AG-TATG---TATCCTCA-TATGTAT---CTG---AAACGTTCC-TG-TTCGATT-GAAt
gi|4 : CAC-ACA-CAT--C-ACA-TC-TAT-AAGG-TTTTTCA-----A-TATGT--ATCCT-CATATGT-TTG-------T-GTAA-GTTTCT----TAT-CCA-AT---TGAAT-GT-C-TTCCC-ACAGACATCGCACTT--ATAAGCT--TC-CT-CA--AC-TGTG---T-GTGTCCTCATGTATCCCTCT---AAC-TTTTTGT--TTTGA-T-TAAACATCTtgccttccc
gi|15 : tgttccgtgtgattgaatacttttccacaaacatAT--C-ACA-TT-AATCA-AT-TTTATCACC--GG-CATGC--ATACT-CACGTGTCTCT-------T-AAAC-ATTT-C----TGT-----ATGAATAAAT-TT-C-TTCCC-ACAGACATCAgaaataaaaaaaaa
gi|14 : -A-GG-TTTCTCACC--AC-TATGA--ATCCT-TGTGTGTCTCT-------T--TAA-GTTTGT----TGT-CTG-AT---TGAAA-AC-CTTT-CC-ACAGATATCACATTT--ATAAGGT-TTC-T
gi|13 : a--ATCCT-CATGTGAAT-T-------T-GTAA-TTTATC----TTT-CCG-AC---TGAAT-GT-C-TT-CCCACATACATTACA--T--GTAAAATGTTCATCACC--AG-TATG---TATCCTCA-TGTGTG
gi|6 : TCA----TGT-G---AT---ATAAT-GC-C-TTTCC-ACAGACATCACGCTC--ATAAGGT-CTC-TCACCAAAA-TATG---T-CCT---CT-TGTGT---CTTCGCAAG-TCTCCAT--TTTGACTGTAAAC-CTTC-CCACA
gi|12 : gggacggc-C---AC---TGAAG-GCTC-TT-CC-ACATTGTTTACA--TGTATAAGGT-TTC-TCTCC--AG-TGTGAGTT-CTTTCAaacacaacatttattagttttatcaccggtttgaatcatcatgtga
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111 11111111111111
lowQualScore : 222 55 2 33333 1 1 1 88888888888888 22 22 1 333333333 22 1 1 1111111111111111111111111 11 444 2 55555 33 11 222 1 11111111111111 1 444444444444444444 22222 11 22222222 2 22 2 2 1 22 2 11 1 1 1 1 4444 11 1 1 222 1111 3333333333333333333333333333 1 2 777 22 1 44 1 4444444444444 4 4 4 4 444 1 1 4 11 33 1 22 6666 11 4 11 1 22 333 1 2 222 33333 333 1 1 22 1 1 2 2 11 222 2222 1 1 1 1 11 33 555555555 4 1 55 22 1 4 1 22 4 55 222 22 555 777 2222 1 4 55555 2 111 3 222222 888888888888888888888 1 222 1 2222 55555555555555 1 1 222 1 111 2 2222 444 2 4
lowQualScore : 6 777 1 55 1 4 88 0 2 44444 6 0 5 5 2 66666666666666 4 33 4 11 1 5 111111111 77 5 5 6 6666666666666666666666666 22 2 2 777 3 6 2 55 00000 55 88 888 5 77777777777777 333 2 6 1 1 11 3 1 4 3 0 8 000000000000000000 55555 88 4 44444444 8 6 0 3 77 1 1 22 0 0 1 1 33 0 1 1 0 5 2 33 0 55 88 5 0 2 5 1 9999 66 0 5 666 4 1 8 4 8888 7777777777777777777777777777 88 0 6 2 99 0 1 1 8 4 0 6 000 6 6 1 11 77 7 6 6 11 5 7777777777777 6 6 0 0 0 6 0 666 5 6 6 5 6 0 22 6 6 6 00 6 5 11 1111 6 22 6 0 6 1 22 6 5 77 555 3 5 1 0 4 444 4 22222 4 77 000 5 5 4 2 1 77 5 2 5 0 0 88 888 4 1 999 6666 1 3 3 1 0 1 6 6 3 4 3 44 66 0 6 4 6 444444444 0 5 6 6 55 1 11 6 6 1 5 0 7 6 11 0 6 6 55 6 1 1 1 1 777 6 33 1 6 6 222 000 1 8888 6 6 1 7 1 6 1 6 6 0 22222 6 0 3 111 22 0 888888 1 555555555555555555555 9 0 77 0 3 88 777 1 0 0 2222 0 22222222222222 0 0 3 0 1 2 11 3 4 1 6 6 0 000 6 9 22 99 6 333 3 2222 77 666 3 0
lowQualScore : . ... . .. . . .. . . ..... . . . . . .............. . .. . .. . . ......... .. . . . ......................... .. . . ... . . . .. ..... .. .. ... . .............. ... . . . . .. . . . . . . .................. ..... .. . ........ . . . . .. . . .. . . . . .. . . . . . . .. . .. .. . . . . . .... .. . . ... . . . . .... ............................ .. . . . .. . . . . . . . ... . . . .. .. . . . .. . ............. . . . . . . . ... . . . . . . .. . . . .. . . .. .... . .. . . . . .. . . .. ... . . . . . ... . ..... . .. ... . . . . . .. . . . . . .. ... . . ... .... . . . . . . . . . . . .. .. . . . . ......... . . . . .. . .. . . . . . . . .. . . . .. . . . . . ... . .. . . . ... ... . .... . . . . . . . . . . ..... . . . ... .. . ...... . ..................... . . .. . . .. ... . . . .... . .............. . . . . . . .. . . . . . . ... . . .. .. . ... . .... .. ... . .
lowQualScore : 0 000 0 00 0 0 55 5 5 00000 0 5 0 5 5 00000000000000 0 00 0 55 0 5 000000000 55 5 0 0 0000000000000000000000000 00 5 5 000 0 0 5 00 00000 55 55 555 0 55555555555555 000 5 0 5 2 55 2 2 2 2 2 8 222222222222222222 55555 33 7 77777777 7 7 7 7 77 0 0 00 7 7 0 0 00 0 0 0 0 0 5 00 0 00 00 5 5 5 0 5 0000 55 5 0 555 0 0 3 0 3333 3333333333333333333333333333 00 7 7 3 33 7 0 0 3 0 0 0 000 0 0 0 00 00 0 0 0 00 0 0000000000000 0 0 0 0 0 0 0 000 0 0 0 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 00 0000 0 00 0 0 0 0 00 0 0 55 000 0 5 0 0 0 555 0 55555 0 00 000 5 5 0 5 0 55 0 5 0 0 0 00 555 0 0 000 7777 0 3 3 0 7 0 7 7 3 0 3 00 77 7 7 0 0 000000000 0 0 0 0 00 0 00 0 0 0 0 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 0 0 0 000 0 00 0 0 0 000 000 0 0000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00000 0 0 0 000 88 0 888888 0 000000000000000000000 8 2 55 0 5 11 555 0 2 0 8888 2 22222222222222 2 8 3 0 0 5 00 2 0 0 7 7 7 777 2 6 44 22 2 333 0 0000 00 000 0 0
consensus : TTTATCGCCAGCATGNGTNC--TCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATCAAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAA------ATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAGACATCAC--ATNTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTNTCTGTAANNTNCCTNTCCGATTGAATGCCTTCCCACAGATATCGCACTTATAAGGTTTCTCACNTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTATGNA-TT-TCTCATGT-G-TTTGCAAGCTGC--TGTNCGA---TTGAAGNCTTTGCCGCANTCATTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGNATCCTCAAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAA-ATTCTATCACA-ACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTG-AATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCA-AGACATCACATCT-TAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTT-TAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACC-GTGACGCATCCTTA-GTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCAACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGAC-TCCCACA-ACATCACATTGATAGGCTCTCATC--TGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGAC-GAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTAT-AGGTTTGTCATC--TATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTC-CAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTA-GTA-CCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGTATCCTCNNGTGTC-TCNTAAGTTTCCG---TTTGACTG-AAGNGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATTTA-TA-GGTTTCTCACCGGTATGNATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTGTCCGATTGAANGCCTTTCCACATACATCGCATNTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGTGTTCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGT-TTTGATTTAAACATCTCTCCACA
Reference ( family-149 ) : TTTATCACCAGTATNGGTNCCATNATGTGCGTNTGTAAGTTTCCTGACCGACTGAATGCCTTCCCATCACAC-NC-AC-ATCTA--TTATAAGGTTTA-CACCAGTATGTATCTCTCANGTGT-TTTGTAAGTTTCTACTC--ATTGAATGCCTTCCCAACAGACATCAACATTTATA-----AGGCTTTATCAC---AA-TGTGTATGTGTCCTCATGTGTCTCTGTAA-GTTCCTGTCCGCATTGAATGCCTTCCAA-----CACAA-CATCTTATAAGGTTTATCAAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAA--------------ATTTCCTNNNTCATTGAATACCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCAGTATGTATCCTCATGTGTGTCTGTAATGCGTT---TT-CGCA--TGAATG----CCTTCCCACAGACATCAC--ATTTATAAGGT---TCACTCAGTAATGTGTCCTCATGTGTCTCTGTAAGTTNCCTNTCNNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCACATTTATAAGGTTTNTCACA-GTGTGTA-TCTCATGTGTCTTGTGTANGTTNTGACTCACTGAATGCCTT-CCACAGACATCACATT-TATA-GGTTTNTCACCAGTATGTATCCTCATGGTGTCTTTGTAA-GT-TTCCTCCGACTGAATGCCTTCCCACAGACATCACATTTATA-AAGGTTTNTCACCAGTATGTA-TC-TCTCATGT-GTTTTGTAAGCTGC-CTGTCCGA---TTGAATNCCTTCCCACANACATCACATTTATAAGGTTTNTCACCAGTATGTATCCTC-AGTGTGTCTTTTAAGT---CTTCCTGTTCTGAATGCTTCCCANACAATCACATTATAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCCTC-NTGTGTGTCTGTAATGCTGCTTGACCTGAATGTCCTCCCACAGACATCACAATTTATAAGGTTTTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGTAATGTTCCCGAT-CCTGAATGCCTTCCCACAGACATCACATTTATAAGGTT-TATCACCAGTATGTATCCTCGTGTGTCTCTGTAAGCGTCTATCGATGAATGCCTTCCCACAGACATCACATTATAAGGTTTATCACCAGT-ATGTGTCCTCATGTGTGTCTTTAAGCGTCNTTGTCCACTGAATGCCTTCCCACAGA--TCACAT---TTATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTATC-TCATGTGTGTCTGTAAGTTTCCTGTT--CGACTGAATGCCTTCCCACAGACATCACATTTATAAGGTTTT-C-ACCAGTATGTATTCCTCATATGTGTCTNTAAG--TGTTCTGTTGACTGAAT-TCTTCCCAC-AGCAACATCACGTTTATAAGGTTTNTCACCAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTNTCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCAC-ATTT-ATAAGGTT--TCACCAGTATGTGTCCTCATGTGTGTCTTTAAGTTTCCTTCTCGCT-GAATGCCTTCCCACAGACATCACATTTATAGGTTCTCACCAGTGTGTNTCCTCGATGTCTCTGTAANTTTCTGTCCGACTGAATGCCTTCCACAGACATCACATTTATAAGGTTTATCACCTGTGTCTCANGTATTNTCTNTAAGTGTCCTGTNAATTACTGACTTTGAATGCCTTCCNCAGACATCACATTTATAAGGTT---TTNTCACCAGTATGTATCCTCNTGTGTCTGTAANGTTNCTGTCCGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAAGGTTCTCA-CCAGTATGTATCCTCATGTGTCTTTTGTAA-GTTTCCTGTCCGACTGAATGCCTT-CCACAGACATCACATT------TATAAGGTTTNTCA---------------------CCAGTATGTATCCTCATGTGTC-TCTTAAGTTTCTG---TTTNACTG-AAGTGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATTTA-TA-GGTTTNTCACCAGTATGTATCCTCATGTGTNTCTTGTAAGTTTCCTGTCC-ATTGAATGCCTTCCCACANACATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTGTGTGCCCTCATTGTGTGTCCTTAAATTTCCGTGTTTGACTTAAACATCTC-CCACA
gi|1 : TTTATCGCCAGCA-AAGTGC--TCAAGTGTGT-TCTAAATTTCCCCTTTCATTAAACTCCTTTTCATCACAC-CTTACTATTTAAATTAAAAGGTTTA-CATCAGTATGTGTCTCTCAAG-GT-TTCATA--TTTCTATTC--ACTGA-TGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTTCTCATCTGTCTCCTTAATGATCCTGTCTGCACTCAATCACTTCCAAGATATCACAATCATCTTATAAGATTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTAGTATCTCCTTTATCACTGAATTCCTTCCCAAAGACTTCACATTCATATGGTTTCTCACTTGTA-GAATTCTC-TGTGTATTTGTAATGCGTT---TT-CACA--TGAATG----CCTTCTCACAATCATCACTAATATATAAGGT---TCGCTCAGTGGTGTGTCCC--TGTGTCCTTGTAAACTGCCTTTCACACTGAATGCCTCCCCACAGATATCACACCTATAAGGTTTCTCACA-GTGTGTA-TCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTT-CTACAGACATCACATTCTATA-GGTTTCTC-CCAGTGTG-ATTCTCATGGTGTCTTTGCAA-ATATTTTTCTCACTGAATGCTTTCTCA-AGACATCGCACTTATAGAAGGTTTTTCACCAGTATGTA-TC-TCTCATGT-GTTTTG-AAGCTGC-ATGTCCTA---TTGAATCCTTTCAC-CAAACATCACATTTATAAGGTTGCTCACCAGTATGTATCCTCAAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAA-ATTCTATCACA-ACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTG-AATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCA-AGACATCACATCT-TAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTT-TAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACC-GTGACGCATCCTTA-GTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGA--TCACATCTATTATTAAGGTTTCTCACTAGTATGTATC-TCAAGTGCGTTT-TAAGCCACCTGTTAGAGACTAAAAGCCTTCCCACAGACCTCACATTTATAGGGTTTT-CAACCAGTA-GTATTCCTCAAATGTGTCTCTAAG--TGTTCTGTTGACT-AAT-TTTTTCCACAAGCAACATCA---TAATAAGGTTTCTCTCGAGTATG---ACCCATGTGTGTCTGTAA-TTT-CCTTTCTGATTGAATGCCTT-CCACAGACATCACTATCTGATA--GTT--TCACCAGTATGTATCCT-ATGTGCGTCATTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGAC-TCCCACA-ACATCACATTGATAGGCTCTCATC--TGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGAC-GAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTAT-AGGTTTGTCATC--TATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTC-CAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTA-GTA-CCTTATGTGTCTTTTATAATGTTTCCTGTCTCTCTGAAT--CTT-CCACAGACATCACATT------TATACGGTTTCTCA---------------------CCAGTATG-ATCCTCAAGTGTT-TCTTAAGTTCCTG---TTTTACTA-AAGCGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATGAA-TA-GGTTTCTCACCAGTA-GTATCCTCATGTGTGTCTTGTAAATTTCCTGT-C-ATTAAATGCCTT-CCACATACATCACA--TATAAGGTCTCTC-CCATTGTGT-TTTTCACTGTGTGT-TTTAAAATTCC-T-TTTGATTTAAACATTTCTCCACA
gi|10 : TTTGTA-A-GGACTCTCTCCAGTATGCAGTT-TCTCATGTCG---TGCAAGGTATGCAATTCGA---TTGAAGAGCTTGCCACATTCTTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCgcactcactcaaaaggt
gi|11 : TGAAAGCTTTTCCACATTCACTGCATGTAAAAGGCTTTTCTCCAGTGTGAACTCTC
gi|12 : tgtggattttgtgatgttgaacaagtgtggaattatgccC-ACTGAAGGCTCTTCCACATTGTTTACATGTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGtggtg
gi|13 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaa--TCCTCATGTGAATTTGTAA-TTTATCTTTCCGACTGAATGTCTTCCCACATACATTAC-ATGT-AAAATGTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGTGagttctttcat
gi|14 : aA-GGTTTCTCACCACTATGAATCCTTGTGTGTCTCTT-TAAGTTTGTTGTCTGATTGAAAACCTTTCCACAGATATCACATTTATAAGGTTTCT
gi|15 : aATCACATTAATCAATTTTATCACCGGCATGCATACTCACGTGTCTCT-TAA-ACATT---TC-TGTA--TGAATAAATTTCTTCCCACAGACATCA
gi|16 : CCTTTCCACAGATATCACACTTGTAAGGTTT
gi|2 : CCTCATGTGTCTTTGTAATGATCCTGTC-GCACTGAATGCCTTCCAA-----CACA--CATC--ACA---TTTAT-AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAA--------------ATTTCCTAACTGACTGAATGCCTTCTCACAACCACCACACTTATAAGGTTTATCACCAGTATGTTTCCTTATGTGTGTTTTTAA-GTGTC---CTATGTAATTGAATA----CCTTCCCACAGACATCAC--ATCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCACAAACATCGCATTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGT
gi|2 : CAATATGTGTCC--TCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCA-CAAACATC-GC-AT-----TTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTG-CCCTCATGTGTGTCTCTAACTTTTTGCTTTGATTAAATATCTgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|3 : cctcatgtgtctttgtaatgatcctgtcgcactgaatgccttccaacacacatcacatttataaggtttatcaccagtatgggtcctaatgtgcgtctgtaaatttcctaactgactgaatgccttctcacaaccaccacacttataaggtttatcaccagtatgtttccttatgtgtgtttttaagtgtcctatgtaattgaataccttcccacagacatcacatctataaggtttttCCACAGACATCACAT---TGAT-AAGGTTTATCACCAGTATGTGTCATCATGTGTGTATATAAGTTTCCTGAC--CGACTGAATGCCTTCCCACAGACAACACATTTATAAGGTTTTAC-ACCAGTGTGTA-TCTTCATGTGTCTTTGTAAGTCTGCTCT-CCGAATGAATGTCTTCCCAC-AG--ACATCACATTTATAAGACTTATCAGCAGTATGTCTTCTCATGTGTCTCTGTAAGCTT-CCTGTCTGACTAAATGCCTTCCCACACACATCAC-ATTT-ATAAGGTTTATCACCAGTATGTGTCCTCTTGTGTATCTTTAAGgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : TTCCG---TGTGATTG-AA-TACTTTTCCAC-A-AACATCACACACATCACATCTA-TAAGGTTTTTCA---ATATGTATCCTCATATGTTT-GTGTAAGTTTCTTATCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCA-TGTATCCCTCTAACTTTTTGT-TTTGA-TTAAACATCTcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|5 : tgCACAAACATCACATTTATAAGGTCTATCACAAGTGTGTATTATCATATGTGTCTGTAA-G-ATTGACTA-CGCAT-TGAGTC----CCTTCCAAAAAACATCAC--ATTTATATGGTATATCAC-CAGT-ATGTATCCTCATATGTATCTGAAACGTTCCTGTTCGATTGAATGCCTTCCCgaaataaaaaaaaa
gi|6 : AATGCCTTTCCACAGACATCACGCT------CATAAGGTCTCTCA---------------------CCAAAATATGTCCTCTTGTGTCTTCGCAAGTCTCCAT--TTTGACTGTAA--ACCTTCCCACAA-A----------CACAACATTTATTA-GTTTTATCACCGGTTTGAATCATCATGTG
gi|7 : gggacggctcatgtgatatTCTCCAGTGTGGA-TTGTCTGATG--GATTGCTAGGCT----TGAACGAACACTAAAGGCTTTGCCGCACTCATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTC-a
gi|7 : ACTAAAGGCTTTGCCGCACTCATTGCACT------TGTAAGGTTTCTCT---------------------CCAGTGTGAATTCTCCAATGAC-TAATAAG-GTGTGAATTTTGAGTG-AAGAG-CTTGCCAC-ATT----------CATTACATTTcaatgactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|8 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacTGTAA-GTGTCCTGCATGATTGAATGTCTTGCCACAGACATCATATTTACATGTACAAGGTTTATCATTGGTTTTATAAGGTTTATCCCCGGTGTGTATAATCATGTGTC-TCTTCAG
gi|9 : taTGAATGCCTTGCCATAGG-ATGACATT-GATAAGGTTATTCAACAGTATGTATGCTAATG-TGTCTTTGAAATGTATTATTCCAACTGAATGTCTTCCCACAAACATCACATTgt
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 44444444444444 11 1 1 1 11 11 1 1 22222 11 11 222 7777777 33333333 111 222222 11 1111 444444444444 22222222 1 1 1 1 11 1 11 1 1 1 1 11 1 2 111111111 44444444444444444 11 222 1 1 1 111 222 1 1 11 1 1 1 222 222 2222 1 1 1 222222 1 1 222222 6666666666666666666666 1 33333333333 2222222 11 555555555555 1 1 11 111 11 11 1 11 1 1
lowQualScore : 5 1 1 1 1 5 1 1 1 1 5 1 00000000000000 1 66 1 5 1 5 5 1 88 88 5 1 2 5 1 22 77777 88 88 111 2222222 66666666 333 1 1 1 44 3 1 1 3 0 8 000 333333 99 7777 444444444444 1 66666666 0 2 1 0 22 1 1 4 88 2 5 5 1 66 5 1 66 5 1 1 5 1 5 1 1 5 88 1 1 0 0 777777777 2 33333333333333333 1 8 4 1 4 1 0 3 88 111 1 5 1 5 1 1 5 1 1 999 1 22 111 5 5 1 1 1 88 5 1 5 5 000 111 1 1 333 6666 1 3 3 0 6 1 3 1 999999 2 6 0 1 5 1 1 1 22 8 2 888888 9999999999999999999999 0 8 77 8 1 77777777777 6666666 88 3 8 222222222222 1 0 6 4 0 1 4 77 66 666 777 00 1 1 4 0 55 9 00 5 66 22 5 5
lowQualScore : . . . . . . . . . . . . .............. . .. . . . . . . .. .. . . . . . .. ..... .. .. ... ....... ........ ... . . . .. . . . . . . ... ...... .. .... ............ . ........ . . . . .. . . . .. . . . . .. . . .. . . . . . . . . . .. . . . . ......... . ................. . . . . . . . . .. ... . . . . . . . . . ... . .. ... . . . . . .. . . . . ... ... . . ... .... . . . . . . . . ...... . . . . . . . . .. . . ...... ...................... . . .. . . ........... ....... .. . . ............ . . . . . . . .. .. ... ... .. . . . . .. . .. . .. .. . .
lowQualScore : 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 00000000000000 0 55 0 5 0 5 0 0 00 00 5 0 5 5 0 00 00000 55 55 000 5555555 00000000 000 0 0 2 55 2 2 2 2 2 8 555 555555 00 0000 888888888888 0 88888888 0 5 0 2 00 0 0 2 33 0 0 0 0 00 5 0 55 5 0 0 0 0 5 0 0 0 00 0 0 0 0 555555555 5 55555555555555555 0 8 2 0 0 0 7 0 00 000 0 5 0 5 0 0 5 0 0 000 0 00 000 5 5 0 0 0 00 0 0 0 0 555 000 0 0 000 7777 0 3 3 7 7 0 3 0 000000 0 7 7 0 5 0 0 0 88 8 0 888888 4444444444444444444444 8 2 66 0 0 22222222222 0000000 88 2 0 000000000000 4 0 0 6 8 0 6 88 22 555 555 88 0 7 0 7 00 8 55 0 00 00 0 5
consensus : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCGN-AGGNT--GC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTTGCCGCATTCNTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCNAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAAGTTTCC--GT----TTTGA-------CTGAAGNGCCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTA-TAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACATNCATCGCATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGNGTTCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
Reference ( family-149 ) : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAGACATCAC--A---------TNTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTNTCTGTAANNTNCCTNTCCGATTGAATGCCTTCCCACAGATATCGCACTTATAAGGTTTCTCACNTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTATGNA-TT-TCTCATGT-GTTTGC-AAGCT--GC-TGTN--CGA---TTGAAGNCTTTGCCGCANTCATTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGNATCCTCAAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCAACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGTATCCTCNNGTGTC-TCNTAAGTTTCC--G-----TTTGA-------CTGAAGNGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATTTA-TA-GGTTTCTCACCGGTATGNATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACATACATCGCATNTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGTGTTCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
gi|1 : TTTATCGCCAGCA-AAGTGCTCAAGTGTGT-TCTAAATTTCCCCTTTCATTAAACTCCTTTTCATCACAC-CTTACTATTTAAATTAAAAGGTTTA-CATCAGTATGTGTCTCTCAAG-GT-TTCATA--TTTCTATTC--ACTGA-TGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTTCTCATCTGTCTCCTTAATGATCCTGTCTGCACTCAATCACTTCCAAGATATCACAATCATCTTATAAGATTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTAGTATCTCCTTTATCACTGAATTCCTTCCCAAAGACTTCACATTCATATGGTTTCTCACTTGTA-GAATTCTC-TGTGTATTTGTAATGCGTT---TT-CACA--TGAATG----CCTTCTCACAATCATCACTAA---------TATATAAGGT---TCGCTCAGTGGTGTGTCCC--TGTGTCCTTGTAAACTGCCTTTCACACTGAATGCCTCCCCACAGATATCACACCTATAAGGTTTCTCACA-GTGTGTA-TCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTT-CTACAGACATCACATTCTAT-AGGTTTCTC-CCAGTGTG-ATTCTCATGGTGTCTTTGCAA-ATATTTTTCTCACTGAATGCTTTCTCA-AGACATCGCACTTATAGAAGGTTTTTCACCAGTATGTA-TC-TCTCATGT-GTTTTG-AAGCT--GCATGTC--CTA---TTGAATCCTTT-CACCAAACATCACATTTATAAGGTTGCTCACCAGTATGTATCCTCAAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAG--ATCACATCTATTATTAAGGTTTCTCACTAGTATGTATC-TCAAGTGCGTTT-TAAGCCACCTGTTAGAGACTAAAAGCCTTCCCACAGACCTCACATTTATAGGGTTTT-CAACCAGTA-GTATTCCTCAAATGTGTCTCTAAG--TGTTCTGTTGACT-AAT-TTTTTCCACAAGCAACATCA---TAATAAGGTTTCTCTCGAGTATG---ACCCATGTGTGTCTGTAA-TTT-CCTTTCTGATTGAATGCCTT-CCACAGACATCACTATCTGAT-A-GTT--TCACCAGTATGTATCCT-ATGTGCGTCATTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTATAATGTTTCCTGTCTCTCTGAAT--CTT-CCACAGACATCACATT------TATACGGTTTCTCA---------------------CCAGTATG-ATCCTCAAGTGTT-TCTTAAGTTCCT--G-----TTTTA-------CTAAAGCGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATGAA-TA-GGTTTCTCACCAGTA-GTATCCTCATGTGTGTCTTGTAAATTTCCTG---TC--ATTAAATGCC-TTCCACATACATCACA--TATAAGGTCTCTC-CCATTGTGT-TTTTCACTGTGTG-TTTTAAAATTCC-TTTTGATTTAAACATTTCTCCACA
gi|10 : TTTGTA--AGGACTCTCTCCAGTATGCAGTT-TCTCATGTCGT--GC-AAGGTATGC-AATT--CGA---TTGAAGAGCTTGCCACATTCTTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCgcactcactcaaaaggt
gi|11 : TGAAAGCTTTTCCACATTCACTGCATGTAAAAGGCTTTTCTCCAGTGTGAACTCTC
gi|12 : tgtggattttgtgatgttgaacaagtgtggaattatgccTGTGAG-TTCTTTCATGT-ATTCGA-AGGGA--AC-TGGAAAC-A---CTGAAGGCTCTTCCACATTGTTTACATGTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAGTTCTtggtg
gi|12 : ACTGAAGGCTCTTCCACATTGTTTACATGTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAGTTCTttcat
gi|13 : tgtgagttctttcatgtattcgaagggaactggaaac--TCCTCATGTGAATTTGTAA-TTTATCTTTCCGACTGAATGTCTTCCCACATACATTAC-ATGT-AAAATGTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGTGttcat
gi|14 : aA-GGTTTCTCACCACTATGAATCCTTGTGTGTCTCTT-TAAGTTTGTTG---TCTGATTGAAAACCTTTCCACAGATATCACATTTATAAGGTTTCT
gi|15 : aATCACATTAATCAATTTTATCACCGGCATGCATACTCACGTGTCTCT-TAA-ACATT---TC-TGTA--TGAATAAATTTCTTCCCACAGACATCA
gi|16 : CCTTTCCACAGATATCACACTTGTAAGGTTT
gi|2 : CCTCATGTGTCTTTGTAATGATCCTGTC-GCACTGAATGCCTTCCAA-----CACA--CATC--ACA---TTTAT-------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAAT--------TTCCTAACTGACTGAATGCCTTCTCACAACCACCACACTTATAAGGTTTATCACCAGTATGTTTCCTTATGTGTGTTTTTAA-GTGTC---CTATGTAATTGAATA----CCTTCCCACAGACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCACAAACATCGCATTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGT
gi|2 : CAATATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCA-CAAACATC-GC-AT-----TTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTG-CCCTCATGTGTGTCTCTAACTTTTTGCTTTGATTAAATATCTgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|3 : cctcatgtgtctttgtaatgatcctgtcgcactgaatgccttccaacacacatcacatttataaggtttatcaccagtatgggtcctaatgtgcgtctgtaaatttcctaactgactgaatgccttctcacaaccaccacacttataaggtttatcaccagtatgtttccttatgtgtgtttttaagtgtcctatgtaattgaataccttcccacagacatcacatctataaggtttttCCACAGACATCACAT---TGAT-AAGGTTTATCACCAGTATGTGTCATCATGTGTGTATATAAGTTTCCTGAC--CGACTGAATGCCTTCCCACAGACAACACATTTATAAGGTTTTAC-ACCAGTGTGTA-TCTTCATGTGTCTTTGTAAGTCTGCTCT-CCGAATGAATGTCTTCCCACA---GACATCACATTTATAAGACTTATCAGCAGTATGTCTTCTCATGTGTCTCTGTAAGCTT-CCTGTCTGACTAAATGCCTTCCCACACACATCAC-ATTT-ATAAGGTTTATCACCAGTATGTGTCCTCTTGTGTATCTTTAAGgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : TTCC--G-----TGTGA-------TTGAA-TACTTTTCCAC-A-AACATCACACACATCACATCTA-TAAGGTTTTTCA---ATATGTATCCTCATATGTTTGT-GTAAGTTTCTTA---TCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCA-TGTATCCCTCTAACTTTTTGTTTTGA-TTAAACATCTcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|4 : tg--TGAATA----CTTTTCCACAAACATCAC--ACACATCACATCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTATCCTCATATGTTTGTGTAAGTTTCTTATCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCATGTATCgaaataaaaaaaaa
gi|5 : tgttccgtgtgatCACAAACATCACATTTATAAGGTCTATCACAAGTGTGTATTATCATATGTGTCTGTAA-G-ATTGACTA-CGCAT-TGAGTC----CCTTCCAAAAAACATCAC--A---------TTTATATGGTATATCAC-CAGT-ATGTATCCTCATATGTATCTGAAACGTTCCTGTTCGATTGAATGCCTTCCCcctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : AATGCCTTTCCACAGACATCACGCT------CATAAGGTCTCTCA---------------------CCAAAATATGTCCTCTTGTGTCTTCGCAAGTCTCC--AT----TTTGA-------CTGTA-AACCTTCCCACAA-A----------CACAACATTTATTA-GTTTTATCACCGGTTTGAATCATCATGTG
gi|7 : gggacggctcatgtgatatTCTCCAGTGTGGA-TTGTCTGATG--GATTGCTAGGCT-----TGAA--CGAACACTAAAGGCTTTGCCGCACTCATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATGa
gi|7 : TCT---------------------CCAGTGTGGAT-------TGTC-TGATGGATTGCTAGG-----CTTGAACGAACACTAAAG-GCTTTGCCGC-A-CT---------CATTGCACTTG-TAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATG--ACTAATAAGGT--GTGAATTTTGAGTGAAGAGCTTGCCACATTCATTACATTTactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|7 : ACTAAAGGCTTTGCCGCACTCATTGCACT------TGTAAGGTTTCTCT---------------------CCAGTGTGAATTCTCCAATGAC-TAATAAGGT-----GTGAATTTTGA-------GTGAAGAG-CTTGCCAC-ATT----------CATTACATTT
gi|8 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacTGTAA-GTGTCCTGCATGATTGAATGTCTTGCCACAGACATCATATTTACATGTACAAGGTTTATCATTGGTTTTATAAGGTTTATCCCCGGTGTGTATAATCATGTGTC-TCTTCAG
gi|9 : taTGAATGCCTTGCCATAGG-ATGACATT-GATAAGGTTATTCAACAGTATGTATGCTAATG-TGTCTTTGAAATGTATTATTCCAACTGAATGTCTTCCCACAAACATCACATTgt
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 44444444444444 11 1 1 1 11 11 1 1 22222 11 11 222 7777777 33333333 111 222222 11 1111 444444444444 22222222 1 1 1 1 11 1 11 1 1 1 1 11 1 2 1 222222222222222 11 11 222 1 1 1 111 222 1 1 11 1 1 1 222 222 2222 1 1 1 222222 1 1 222222 6666666666666666666666 2222222 11 555555555555 11 111 11 33 11 1 11 1 1
lowQualScore : 5 1 1 1 1 5 1 1 1 1 5 1 00000000000000 1 66 1 5 1 5 5 1 88 88 5 1 2 5 1 22 77777 88 88 111 2222222 66666666 333 1 1 1 44 3 1 1 3 0 8 000 333333 99 7777 444444444444 0 66666666 0 2 1 0 11 0 1 4 7 2 5 5 1 66 5 1 66 5 1 1 5 1 5 1 1 5 88 1 1 0 0 0 777 1 333333333333333 11 2 3 1 0 1 88 111 1 5 1 5 1 1 5 1 1 999 1 22 111 5 5 1 1 1 88 5 1 5 5 000 111 1 1 333 6666 1 3 3 0 6 1 3 1 999999 2 6 0 1 5 1 1 1 22 8 2 888888 9999999999999999999999 8 8 77 8 1 8 99 0 6666666 88 1 8 222222222222 1 6 0 1 4 77 66 666 777 00 1 0 3 0 44 2 7 11 66 66 5 66 22 5 5
lowQualScore : . . . . . . . . . . . . .............. . .. . . . . . . .. .. . . . . . .. ..... .. .. ... ....... ........ ... . . . .. . . . . . . ... ...... .. .... ............ . ........ . . . . .. . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . . . . .. . . . . . ... . ............... .. . . . . . .. ... . . . . . . . . . ... . .. ... . . . . . .. . . . . ... ... . . ... .... . . . . . . . . ...... . . . . . . . . .. . . ...... ...................... . . .. . . . .. . ....... .. . . ............ . . . . . .. .. ... ... .. . . . . .. . . .. .. .. . .. .. . .
lowQualScore : 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 00000000000000 0 55 0 5 0 5 0 0 00 00 5 0 5 5 0 00 00000 55 55 000 5555555 00000000 000 0 0 2 55 2 2 2 2 2 8 555 555555 00 0000 888888888888 2 88888888 0 5 2 2 00 8 2 2 3 0 0 0 0 00 5 0 55 5 0 0 0 0 5 0 0 0 00 0 0 0 0 0 888 0 888888888888888 22 8 8 0 6 0 00 000 0 5 0 5 0 0 5 0 0 000 0 00 000 5 5 0 0 0 00 0 0 0 0 555 000 0 0 000 7777 0 3 3 7 7 0 3 0 000000 0 7 7 0 5 0 0 0 88 8 0 888888 4444444444444444444444 8 2 66 0 0 0 44 8 0000000 88 0 0 000000000000 4 0 8 4 6 88 22 555 555 88 0 2 2 8 00 0 0 00 55 00 0 00 00 0 5
consensus : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-NCCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAAGNGCCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACANACATCACATTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
Reference ( family-149 ) : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCGNAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-GCCGCATTCNTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCNAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAAGNGCCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACATNCATCGCATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGNGTTCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
gi|1 : TTTATCGCCAGCA-AAGTGCTCAAGTGTGT-TCTAAATTTCCCCTTTCATTAAACTCCTTTTCATCACAC-CTTACTATTTAAATTAAAAGGTTTA-CATCAGTATGTGTCTCTCAAG-GT-TTCATA--TTTCTATTC--ACTGA-TGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTTCTCATCTGTCTCCTTAATGATCCTGTCTGCACTCAATCACTTCCAAGATATCACAATCATCTTATAAGATTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTAGTATCTCCTTTATCACTGAATTCCTTCCCAAAGACTTCACATTCATATGGTTTCTCACTTGTA-GAATTCTC-TGTGTATTTGTAATGCGTT---TT-CACA--TGAATG----CCTTCTCACAATCATCACTAA---------TATATAAGGT---TCGCTCAGTGGTGTGTCCC--TGTGTCCTTGTAAACTGCCTTTCACACTGAATGCCTCCCCACAGATATCACACCTATAAGGTTTCTCACA-GTGTGTA-TCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTT-CTACAGACATCACATTCTAT-AGGTTTCTC-CCAGTGTG-ATTCTCATGGTGTCTTTGCAA-ATATTTTTCTCACTGAATGCTTTCTCA-AGACATCGCACTTATAGAAGGTTTTTCACCAGTATGTA-TC-TCTCATGT-GTTTTGAAGCTGCATGTC--CTA---TTGAATCCTTTCACCAAA--CATCACATTTATAAGGTTGCTCACCAGTATGTATCCTCAAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAG--ATCACATCTATTATTAAGGTTTCTCACTAGTATGTATC-TCAAGTGCGTTT-TAAGCCACCTGTTAGAGACTAAAAGCCTTCCCACAGACCTCACATTTATAGGGTTTT-CAACCAGTA-GTATTCCTCAAATGTGTCTCTAAG--TGTTCTGTTGACT-AAT-TTTTTCCACAAGCAACATCA---TAATAAGGTTTCTCTCGAGTATG---ACCCATGTGTGTCTGTAA-TTT-CCTTTCTGATTGAATGCCTT-CCACAGACATCACTATCTGAT-A-GTT--TCACCAGTATGTATCCT-ATGTGCGTCATTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTATAATGTTTCCTGTCTCTCTGAAT--CTT-CCACAGACATCACATT------TATACGGTTTCTCA---------------------CCAGTATG-ATCCTCAAGTGTT-TCTTAA-GTTCCT-GTTTT-A-------CTAAAGCGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATGAAT-AGGTTTCTCACCAGTA-GTATCCTCATGTGTGTCTTGTAAATTTCCTG---TC--ATTAAATGCC-TTCCACATACATCACA--TATAAGGTCTCTC-CCATTGTGT-TTTTCACTGTGTG-TTTTAAAATTCC-TTTTGATTTAAACATTTCTCCACA
gi|10 : TTTGTA--AGGACTCTCTCCAGTATGCAGTT-TCTCATGTCGTGCAAGGTATGC-AATT--CGA---TTGAAGAGCTT-GCCACATTCTTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCgcactcactcaaaaggt
gi|11 : ---CTGAAAGCTTT-TCCACATTCACTGCATGTAAAAGGCTTTTCTCCAGTGTGAACTCTCTGGTG
gi|12 : tgtggattttgtgatgttgaacaagtgtggaattatgcTGTGAG-TTCTTTCATGT-ATTCGAAGGGAAC-TGGAAAC-A---CTGAAGGCTCT-TCCACATTGTTTACATGTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAGTTCT
gi|13 : --TCCTCATGTGAATTTGTAA-TTTATCTTTCCGACTGAATGTCTTCCCACATACATTAC-ATGT-AAAATGTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGTGttcat
gi|14 : aAAGGTTTCTCACCACTATGAATCCTTGTGTGTCTCTT-TAAGTTTGTTG---TCTGATTGAAAACCTTTCCACAGATATCACATTTATAAGGTTTCT
gi|15 : ATCACATTAATCAATTTTATCACCGGCATGCATACTCACGTGTCTCT-TAA-ACATT---TC-TGTA--TGAATAAATTTCTTCCCACAGACATCA
gi|16 : CCTTTCCACAGATATCACACTTGTAAGGTT
gi|2 : CCTCATGTGTCTTTGTAATGATCCTGTC-GCACTGAATGCCTTCCAA-----CACA--CATC--ACA---TTTAT-------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAAT--------TTCCTAACTGACTGAATGCCTTCTCACAACCACCACACTTATAAGGTTTATCACCAGTATGTTTCCTTATGTGTGTTTTTAA-GTGTC---CTATGTAATTGAATA----CCTTCCCACAGACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCACAAACATCGCATTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTt
gi|2 : CAATATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCA-CAAACATC-GC-AT-----TTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTG-CCCTCATGTGTGTCTCTAACTTTTTGCTTTGATTAAATATCTgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|3 : cctcatgtgtctttgtaatgatcctgtcgcactgaatgccttccaacacacatcacatttataaggtttatcaccagtatgggtcctaatgtgcgtctgtaaatttcctaactgactgaatgccttctcacaaccaccacacttataaggtttatcaccagtatgtttccttatgtgtgtttttaagtgtcctatgtaattgaataccttcccacagacatcacatctataaggtttttCCACAGACATCACAT---TGAT-AAGGTTTATCACCAGTATGTGTCATCATGTGTGTATATAAGTTTCCTGAC--CGACTGAATGCCTTCCCACAGACAACACATTTATAAGGTTTTAC-ACCAGTGTGTA-TCTTCATGTGTCTTTGTAAGTCTGCTCT-CCGAATGAATGTCTTCCCACA---GACATCACATTTATAAGACTTATCAGCAGTATGTCTTCTCATGTGTCTCTGTAAGCTT-CCTGTCTGACTAAATGCCTTCCCACACACATCAC-ATTT-ATAAGGTTTATCACCAGTATGTGTCCTCTTGTGTATCTTTAAGgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : TTCC-GTGT-GA-------TTGAA-TACTTTTCCAC-A-AACATCACACACATCACATCTATAAGGTTTTTCA---ATATGTATCCTCATATGTTTGT-GTAAGTTTCTTA---TCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCA-TGTATCCCTCTAACTTTTTGTTTTGA-TTAAACATCTcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|4 : tg--TGAATA----CTTTTCCACAAACATCAC--ACACATCACATCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTATCCTCATATGTTTGTGTAAGTTTCTTATCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCATGTATCgaaataaaaaaaaa
gi|5 : tgttccgtgtgatCACAAACATCACATTTATAAGGTCTATCACAAGTGTGTATTATCATATGTGTCTGTAA-G-ATTGACTA-CGCAT-TGAGTC----CCTTCCAAAAAACATCAC--A---------TTTATATGGTATATCAC-CAGT-ATGTATCCTCATATGTATCTGAAACGTTCCTGTTCGATTGAATGCCTTCCCcctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : AATGCCTTTCCACAGACATCACGCT------CATAAGGTCTCTCA---------------------CCAAAATATGTCCTCTTGTGTCTTCGCAA-GTCTCC-ATTTTGA-------CTGTA-AACCTTCCCACAA-A----------CACAACATTTATTAGTTTTATCACCGGTTTGAATCATCATGTG
gi|7 : gggacggctcatgtgatatTCTCCAGTGTGGA-TTGTCTGATGG-ATTGCTAGGCT---TGAA--CGAACACTAAAGGCTTT-GCCGCACTCATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATGa
gi|7 : TCT---------------------CCAGTGTGGAT-------TGTC-TGATGG-ATTGCTAGGCTTGAACGAACACTAAAG-GCTTTGCCGC-A-CT---------CATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATG--ACTAATAAGGT--GTGAATTTTGAGTGAAGAGCTTGCCACATTCATTACATTTactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|7 : ACTAAAGGCTTTGCCGCACTCATTGCACT------TGTAAGGTTTCTCT---------------------CCAGTGTGAATTCTCCAATGAC-TAATAAGGTGTGA-ATTTTGA-------GTGAAGAG-CTTGCCAC-ATT----------CATTACATTT
gi|8 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacTGTAA-GTGTCCTGCATGATTGAATGTCTTGCCACAGACATCATATTTACATGTACAAGGTTTATCATTGGTTTTATAAGGTTTATCCCCGGTGTGTATAATCATGTGTC-TCTTCA-G
gi|9 : taTGAATGCCTTGCCATAGG-ATGACATT-GATAAGGTTATTCAACAGTATGTATGCTAATG-TGTCTTTGAAATGTATTATTCCAACTGAATGTCTTCCCACAAACATCACATTgt
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 44444444444444 11 1 1 1 11 11 1 1 22222 11 11 222 7777777 33333333 111 222222 11 1111 444444444444 22222222 1 1 1 1 11 1 11 1 1 1 1 11 1 2 1 222222222222222 11 222 1 1 1 111 222 1 1 11 1 1 1 222 222 2222 1 1 1 222222 1 1 222222 6666666666666666666666 2222222 11 555555555555 11 111 11 11 1 1 11 1 1
lowQualScore : 5 1 1 1 1 5 1 1 1 1 5 1 00000000000000 1 66 1 5 1 5 5 1 88 88 5 1 2 5 1 22 77777 88 88 111 2222222 66666666 333 1 1 1 44 3 1 1 3 0 8 000 333333 99 7777 444444444444 0 66666666 0 2 1 0 11 0 1 4 7 2 5 5 1 66 5 1 66 5 1 1 5 1 5 1 1 5 88 1 1 0 0 0 222 1 333333333333333 99 3 1 0 44 88 111 1 5 1 5 1 1 5 1 1 999 1 22 111 5 5 1 1 1 88 5 1 5 5 000 111 1 1 333 6666 1 3 3 0 6 1 3 1 999999 2 6 0 1 5 1 1 1 22 8 2 888888 9999999999999999999999 8 8 77 8 1 8 99 0 6666666 88 1 8 222222222222 1 6 0 1 4 77 66 666 777 00 1 0 1 6 66 22 5 5 66 22 5 5
lowQualScore : . . . . . . . . . . . . .............. . .. . . . . . . .. .. . . . . . .. ..... .. .. ... ....... ........ ... . . . .. . . . . . . ... ...... .. .... ............ . ........ . . . . .. . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . . . . .. . . . . . ... . ............... .. . . . .. .. ... . . . . . . . . . ... . .. ... . . . . . .. . . . . ... ... . . ... .... . . . . . . . . ...... . . . . . . . . .. . . ...... ...................... . . .. . . . .. . ....... .. . . ............ . . . . . .. .. ... ... .. . . . . .. .. . . .. .. . .
lowQualScore : 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 00000000000000 0 55 0 5 0 5 0 0 00 00 5 0 5 5 0 00 00000 55 55 000 5555555 00000000 000 0 0 2 55 2 2 2 2 2 8 555 555555 00 0000 888888888888 2 88888888 0 5 2 2 00 8 2 2 3 0 0 0 0 00 5 0 55 5 0 0 0 0 5 0 0 0 00 0 0 0 0 0 555 0 888888888888888 00 8 4 6 33 00 000 0 5 0 5 0 0 5 0 0 000 0 00 000 5 5 0 0 0 00 0 0 0 0 555 000 0 0 000 7777 0 3 3 7 7 0 3 0 000000 0 7 7 0 5 0 0 0 88 8 0 888888 4444444444444444444444 8 2 66 0 0 0 44 8 0000000 88 0 0 000000000000 4 0 8 4 6 88 22 555 555 88 0 8 0 8 55 00 0 0 00 00 0 5
consensus : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-NCCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAAGNGCCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACAGACATCACACTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
Reference ( family-149 ) : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-NCCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAAGNGCCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACANACATCACATTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
gi|1 : TTTATCGCCAGCA-AAGTGCTCAAGTGTGT-TCTAAATTTCCCCTTTCATTAAACTCCTTTTCATCACAC-CTTACTATTTAAATTAAAAGGTTTA-CATCAGTATGTGTCTCTCAAG-GT-TTCATA--TTTCTATTC--ACTGA-TGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTTCTCATCTGTCTCCTTAATGATCCTGTCTGCACTCAATCACTTCCAAGATATCACAATCATCTTATAAGATTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTAGTATCTCCTTTATCACTGAATTCCTTCCCAAAGACTTCACATTCATATGGTTTCTCACTTGTA-GAATTCTC-TGTGTATTTGTAATGCGTT---TT-CACA--TGAATG----CCTTCTCACAATCATCACTAA---------TATATAAGGT---TCGCTCAGTGGTGTGTCCC--TGTGTCCTTGTAAACTGCCTTTCACACTGAATGCCTCCCCACAGATATCACACCTATAAGGTTTCTCACA-GTGTGTA-TCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTT-CTACAGACATCACATTCTAT-AGGTTTCTC-CCAGTGTG-ATTCTCATGGTGTCTTTGCAA-ATATTTTTCTCACTGAATGCTTTCTCA-AGACATCGCACTTATAGAAGGTTTTTCACCAGTATGTA-TC-TCTCATGT-GTTTTGAAGCTGCATGTC--CTA---TTGAATCCTTTCACCAAA--CATCACATTTATAAGGTTGCTCACCAGTATGTATCCTCAAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAG--ATCACATCTATTATTAAGGTTTCTCACTAGTATGTATC-TCAAGTGCGTTT-TAAGCCACCTGTTAGAGACTAAAAGCCTTCCCACAGACCTCACATTTATAGGGTTTT-CAACCAGTA-GTATTCCTCAAATGTGTCTCTAAG--TGTTCTGTTGACT-AAT-TTTTTCCACAAGCAACATCA---TAATAAGGTTTCTCTCGAGTATG---ACCCATGTGTGTCTGTAA-TTT-CCTTTCTGATTGAATGCCTT-CCACAGACATCACTATCTGAT-A-GTT--TCACCAGTATGTATCCT-ATGTGCGTCATTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTATAATGTTTCCTGTCTCTCTGAAT--CTT-CCACAGACATCACATT------TATACGGTTTCTCA---------------------CCAGTATG-ATCCTCAAGTGTT-TCTTAA-GTTCCT-GTTTT-A-------CTAAAGCGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATGAAT-AGGTTTCTCACCAGTA-GTATCCTCATGTGTGTCTTGTAAATTTCCTG---TC--ATTAAATGCC-TTCCACATACATCACA--TATAAGGTCTCTC-CCATTGTGT-TTTTCACTGTGTG-TTTTAAAATTCC-TTTTGATTTAAACATTTCTCCACA
gi|10 : TTTGTA--AGGACTCTCTCCAGTATGCAGTT-TCTCATGTCGTGCAAGGTATGC-AATT--CGA---TTGAAGAGCTT-GCCACATTCTTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCgcactcactcaaaaggt
gi|11 : ---CTGAAAGCTTT-TCCACATTCACTGCATGTAAAAGGCTTTTCTCCAGTGTGAACTCTCTGGTG
gi|12 : tgtggattttgtgatgttgaacaagtgtggaattatgcTGTGAG-TTCTTTCATGT-ATTCGAAGGGAAC-TGGAAAC-A---CTGAAGGCTCT-TCCACATTGTTTACATGTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAGTTCT
gi|13 : --TCCTCATGTGAATTTGTAA-TTTATCTTTCCGACTGAATGTCTTCCCACATACATTAC-ATGT-AAAATGTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGTGttcat
gi|14 : aAAGGTTTCTCACCACTATGAATCCTTGTGTGTCTCTT-TAAGTTTGTTG---TCTGATTGAAAACCTTTCCACAGATATCACATTTATAAGGTTTCT
gi|15 : ATCACATTAATCAATTTTATCACCGGCATGCATACTCACGTGTCTCT-TAA-ACATT---TC-TGTA--TGAATAAATTTCTTCCCACAGACATCA
gi|16 : CCTTTCCACAGATATCACACTTGTAAGGTTT
gi|2 : CCTCATGTGTCTTTGTAATGATCCTGTC-GCACTGAATGCCTTCCAA-----CACA--CATC--ACA---TTTAT-------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAAT--------TTCCTAACTGACTGAATGCCTTCTCACAACCACCACACTTATAAGGTTTATCACCAGTATGTTTCCTTATGTGTGTTTTTAA-GTGTC---CTATGTAATTGAATA----CCTTCCCACAGACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCACAAACATCGCATTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGT
gi|2 : CAATATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCA-CAAACATC-GC-AT-----TTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTG-CCCTCATGTGTGTCTCTAACTTTTTGCTTTGATTAAATATCTgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|3 : cctcatgtgtctttgtaatgatcctgtcgcactgaatgccttccaacacacatcacatttataaggtttatcaccagtatgggtcctaatgtgcgtctgtaaatttcctaactgactgaatgccttctcacaaccaccacacttataaggtttatcaccagtatgtttccttatgtgtgtttttaagtgtcctatgtaattgaataccttcccacagacatcacatctataaggtttttCCACAGACATCACAT---TGAT-AAGGTTTATCACCAGTATGTGTCATCATGTGTGTATATAAGTTTCCTGAC--CGACTGAATGCCTTCCCACAGACAACACATTTATAAGGTTTTAC-ACCAGTGTGTA-TCTTCATGTGTCTTTGTAAGTCTGCTCT-CCGAATGAATGTCTTCCCACA---GACATCACATTTATAAGACTTATCAGCAGTATGTCTTCTCATGTGTCTCTGTAAGCTT-CCTGTCTGACTAAATGCCTTCCCACACACATCAC-ATTT-ATAAGGTTTATCACCAGTATGTGTCCTCTTGTGTATCTTTAAGgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : TTCC-GTGT-GA-------TTGAA-TACTTTTCCAC-A-AACATCACACACATCACATCTATAAGGTTTTTCA---ATATGTATCCTCATATGTTTGT-GTAAGTTTCTTA---TCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCA-TGTATCCCTCTAACTTTTTGTTTTGA-TTAAACATCTcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|4 : tg--TGAATA----CTTTTCCACAAACATCAC--ACACATCACATCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTATCCTCATATGTTTGTGTAAGTTTCTTATCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCATGTATCgaaataaaaaaaaa
gi|5 : tgttccgtgtgatCACAAACATCACATTTATAAGGTCTATCACAAGTGTGTATTATCATATGTGTCTGTAA-G-ATTGACTA-CGCAT-TGAGTC----CCTTCCAAAAAACATCAC--A---------TTTATATGGTATATCAC-CAGT-ATGTATCCTCATATGTATCTGAAACGTTCCTGTTCGATTGAATGCCTTCCCcctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : AATGCCTTTCCACAGACATCACGCT------CATAAGGTCTCTCA---------------------CCAAAATATGTCCTCTTGTGTCTTCGCAA-GTCTCC-ATTTTGA-------CTGTA-AACCTTCCCACAA-A----------CACAACATTTATTAGTTTTATCACCGGTTTGAATCATCATGTG
gi|7 : gggacggctcatgtgatatTCTCCAGTGTGGA-TTGTCTGATGG-ATTGCTAGGCT---TGAA--CGAACACTAAAGGCTTT-GCCGCACTCATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATGa
gi|7 : TCT---------------------CCAGTGTGGAT-------TGTC-TGATGG-ATTGCTAGGCTTGAACGAACACTAAAG-GCTTTGCCGC-A-CT---------CATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATG--ACTAATAAGGT--GTGAATTTTGAGTGAAGAGCTTGCCACATTCATTACATTTactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|7 : ACTAAAGGCTTTGCCGCACTCATTGCACT------TGTAAGGTTTCTCT---------------------CCAGTGTGAATTCTCCAATGAC-TAATAAGGTGTGA-ATTTTGA-------GTGAAGAG-CTTGCCAC-ATT----------CATTACATTT
gi|8 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacTGTAA-GTGTCCTGCATGATTGAATGTCTTGCCACAGACATCATATTTACATGTACAAGGTTTATCATTGGTTTTATAAGGTTTATCCCCGGTGTGTATAATCATGTGTC-TCTTCA-G
gi|9 : taTGAATGCCTTGCCATAGG-ATGACATT-GATAAGGTTATTCAACAGTATGTATGCTAATG-TGTCTTTGAAATGTATTATTCCAACTGAATGTCTTCCCACAAACATCACATTgt
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 44444444444444 11 1 1 1 11 11 1 1 22222 11 11 222 7777777 33333333 111 222222 11 1111 444444444444 22222222 1 1 1 1 11 1 11 1 1 1 1 11 1 2 1 222222222222222 11 222 1 1 1 111 222 1 1 11 1 1 1 222 222 2222 1 1 1 222222 1 1 222222 6666666666666666666666 2222222 11 555555555555 11 111 11 11 1 1 11 1 1
lowQualScore : 5 1 1 1 1 5 1 1 1 1 5 1 00000000000000 1 66 1 5 1 5 5 1 88 88 5 1 2 5 1 22 77777 88 88 111 2222222 66666666 333 1 1 1 44 3 1 1 3 0 8 000 333333 99 7777 444444444444 0 66666666 0 2 1 0 11 0 1 4 7 2 5 5 1 66 5 1 66 5 1 1 5 1 5 1 1 5 88 1 1 0 0 0 222 1 333333333333333 99 3 1 0 44 88 111 1 5 1 5 1 1 5 1 1 999 1 22 111 5 5 1 1 1 88 5 1 5 5 000 111 1 1 333 6666 1 3 3 0 6 1 3 1 999999 2 6 0 1 5 1 1 1 22 8 2 888888 9999999999999999999999 8 8 77 8 1 8 99 0 6666666 88 1 8 222222222222 1 6 0 1 4 77 66 666 777 00 1 0 6 66 22 5 5 66 22 5 5
lowQualScore : . . . . . . . . . . . . .............. . .. . . . . . . .. .. . . . . . .. ..... .. .. ... ....... ........ ... . . . .. . . . . . . ... ...... .. .... ............ . ........ . . . . .. . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . . . . .. . . . . . ... . ............... .. . . . .. .. ... . . . . . . . . . ... . .. ... . . . . . .. . . . . ... ... . . ... .... . . . . . . . . ...... . . . . . . . . .. . . ...... ...................... . . .. . . . .. . ....... .. . . ............ . . . . . .. .. ... ... .. . . . .. .. . . .. .. . .
lowQualScore : 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 00000000000000 0 55 0 5 0 5 0 0 00 00 5 0 5 5 0 00 00000 55 55 000 5555555 00000000 000 0 0 2 55 2 2 2 2 2 8 555 555555 00 0000 888888888888 2 88888888 0 5 2 2 00 8 2 2 3 0 0 0 0 00 5 0 55 5 0 0 0 0 5 0 0 0 00 0 0 0 0 0 555 0 888888888888888 00 8 4 6 33 00 000 0 5 0 5 0 0 5 0 0 000 0 00 000 5 5 0 0 0 00 0 0 0 0 555 000 0 0 000 7777 0 3 3 7 7 0 3 0 000000 0 7 7 0 5 0 0 0 88 8 0 888888 4444444444444444444444 8 2 66 0 0 0 44 8 0000000 88 0 0 000000000000 4 0 8 4 6 88 22 555 555 88 0 8 4 55 00 0 0 00 00 0 5
consensus : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-NCCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAAGNGCCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACAGACATCACACTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
Reference ( family-149 ) : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-NCCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAAGNGCCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACAGACATCACACTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
gi|1 : TTTATCGCCAGCA-AAGTGCTCAAGTGTGT-TCTAAATTTCCCCTTTCATTAAACTCCTTTTCATCACAC-CTTACTATTTAAATTAAAAGGTTTA-CATCAGTATGTGTCTCTCAAG-GT-TTCATA--TTTCTATTC--ACTGA-TGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTTCTCATCTGTCTCCTTAATGATCCTGTCTGCACTCAATCACTTCCAAGATATCACAATCATCTTATAAGATTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTAGTATCTCCTTTATCACTGAATTCCTTCCCAAAGACTTCACATTCATATGGTTTCTCACTTGTA-GAATTCTC-TGTGTATTTGTAATGCGTT---TT-CACA--TGAATG----CCTTCTCACAATCATCACTAA---------TATATAAGGT---TCGCTCAGTGGTGTGTCCC--TGTGTCCTTGTAAACTGCCTTTCACACTGAATGCCTCCCCACAGATATCACACCTATAAGGTTTCTCACA-GTGTGTA-TCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTT-CTACAGACATCACATTCTAT-AGGTTTCTC-CCAGTGTG-ATTCTCATGGTGTCTTTGCAA-ATATTTTTCTCACTGAATGCTTTCTCA-AGACATCGCACTTATAGAAGGTTTTTCACCAGTATGTA-TC-TCTCATGT-GTTTTGAAGCTGCATGTC--CTA---TTGAATCCTTTCACCAAA--CATCACATTTATAAGGTTGCTCACCAGTATGTATCCTCAAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAG--ATCACATCTATTATTAAGGTTTCTCACTAGTATGTATC-TCAAGTGCGTTT-TAAGCCACCTGTTAGAGACTAAAAGCCTTCCCACAGACCTCACATTTATAGGGTTTT-CAACCAGTA-GTATTCCTCAAATGTGTCTCTAAG--TGTTCTGTTGACT-AAT-TTTTTCCACAAGCAACATCA---TAATAAGGTTTCTCTCGAGTATG---ACCCATGTGTGTCTGTAA-TTT-CCTTTCTGATTGAATGCCTT-CCACAGACATCACTATCTGAT-A-GTT--TCACCAGTATGTATCCT-ATGTGCGTCATTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTATAATGTTTCCTGTCTCTCTGAAT--CTT-CCACAGACATCACATT------TATACGGTTTCTCA---------------------CCAGTATG-ATCCTCAAGTGTT-TCTTAA-GTTCCT-GTTTT-A-------CTAAAGCGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATGAAT-AGGTTTCTCACCAGTA-GTATCCTCATGTGTGTCTTGTAAATTTCCTG---TC--ATTAAATGCC-TTCCACATACATCACA--TATAAGGTCTCTC-CCATTGTGT-TTTTCACTGTGTG-TTTTAAAATTCC-TTTTGATTTAAACATTTCTCCACA
gi|10 : TTTGTA--AGGACTCTCTCCAGTATGCAGTT-TCTCATGTCGTGCAAGGTATGC-AATT--CGA---TTGAAGAGCTT-GCCACATTCTTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCgcactcactcaaaaggt
gi|11 : ---CTGAAAGCTTT-TCCACATTCACTGCATGTAAAAGGCTTTTCTCCAGTGTGAACTCTCTGGTG
gi|12 : tgtggattttgtgatgttgaacaagtgtggaattatgcTGTGAG-TTCTTTCATGT-ATTCGAAGGGAAC-TGGAAAC-A---CTGAAGGCTCT-TCCACATTGTTTACATGTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAGTTCT
gi|13 : --TCCTCATGTGAATTTGTAA-TTTATCTTTCCGACTGAATGTCTTCCCACATACATTAC-ATGT-AAAATGTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGTGttcat
gi|14 : aAAGGTTTCTCACCACTATGAATCCTTGTGTGTCTCTT-TAAGTTTGTTG---TCTGATTGAAAACCTTTCCACAGATATCACATTTATAAGGTTTCT
gi|15 : ATCACATTAATCAATTTTATCACCGGCATGCATACTCACGTGTCTCT-TAA-ACATT---TC-TGTA--TGAATAAATTTCTTCCCACAGACATCA
gi|16 : CCTTTCCACAGATATCACACTTGTAAGGTTT
gi|2 : CCTCATGTGTCTTTGTAATGATCCTGTC-GCACTGAATGCCTTCCAA-----CACA--CATC--ACA---TTTAT-------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAAT--------TTCCTAACTGACTGAATGCCTTCTCACAACCACCACACTTATAAGGTTTATCACCAGTATGTTTCCTTATGTGTGTTTTTAA-GTGTC---CTATGTAATTGAATA----CCTTCCCACAGACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCACAAACATCGCATTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGT
gi|2 : CAATATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCA-CAAACATC-GC-AT-----TTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTG-CCCTCATGTGTGTCTCTAACTTTTTGCTTTGATTAAATATCTgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|3 : cctcatgtgtctttgtaatgatcctgtcgcactgaatgccttccaacacacatcacatttataaggtttatcaccagtatgggtcctaatgtgcgtctgtaaatttcctaactgactgaatgccttctcacaaccaccacacttataaggtttatcaccagtatgtttccttatgtgtgtttttaagtgtcctatgtaattgaataccttcccacagacatcacatctataaggtttttCCACAGACATCACAT---TGAT-AAGGTTTATCACCAGTATGTGTCATCATGTGTGTATATAAGTTTCCTGAC--CGACTGAATGCCTTCCCACAGACAACACATTTATAAGGTTTTAC-ACCAGTGTGTA-TCTTCATGTGTCTTTGTAAGTCTGCTCT-CCGAATGAATGTCTTCCCACA---GACATCACATTTATAAGACTTATCAGCAGTATGTCTTCTCATGTGTCTCTGTAAGCTT-CCTGTCTGACTAAATGCCTTCCCACACACATCAC-ATTT-ATAAGGTTTATCACCAGTATGTGTCCTCTTGTGTATCTTTAAGgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : TTCC-GTGT-GA-------TTGAA-TACTTTTCCAC-A-AACATCACACACATCACATCTATAAGGTTTTTCA---ATATGTATCCTCATATGTTTGT-GTAAGTTTCTTA---TCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCA-TGTATCCCTCTAACTTTTTGTTTTGA-TTAAACATCTcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|4 : tg--TGAATA----CTTTTCCACAAACATCAC--ACACATCACATCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTATCCTCATATGTTTGTGTAAGTTTCTTATCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCATGTATCgaaataaaaaaaaa
gi|5 : tgttccgtgtgatCACAAACATCACATTTATAAGGTCTATCACAAGTGTGTATTATCATATGTGTCTGTAA-G-ATTGACTA-CGCAT-TGAGTC----CCTTCCAAAAAACATCAC--A---------TTTATATGGTATATCAC-CAGT-ATGTATCCTCATATGTATCTGAAACGTTCCTGTTCGATTGAATGCCTTCCCcctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : AATGCCTTTCCACAGACATCACGCT------CATAAGGTCTCTCA---------------------CCAAAATATGTCCTCTTGTGTCTTCGCAA-GTCTCC-ATTTTGA-------CTGTA-AACCTTCCCACAA-A----------CACAACATTTATTAGTTTTATCACCGGTTTGAATCATCATGTG
gi|7 : gggacggctcatgtgatatTCTCCAGTGTGGA-TTGTCTGATGG-ATTGCTAGGCT---TGAA--CGAACACTAAAGGCTTT-GCCGCACTCATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATGa
gi|7 : TCT---------------------CCAGTGTGGAT-------TGTC-TGATGG-ATTGCTAGGCTTGAACGAACACTAAAG-GCTTTGCCGC-A-CT---------CATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATG--ACTAATAAGGT--GTGAATTTTGAGTGAAGAGCTTGCCACATTCATTACATTTactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|7 : ACTAAAGGCTTTGCCGCACTCATTGCACT------TGTAAGGTTTCTCT---------------------CCAGTGTGAATTCTCCAATGAC-TAATAAGGTGTGA-ATTTTGA-------GTGAAGAG-CTTGCCAC-ATT----------CATTACATTT
gi|8 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacTGTAA-GTGTCCTGCATGATTGAATGTCTTGCCACAGACATCATATTTACATGTACAAGGTTTATCATTGGTTTTATAAGGTTTATCCCCGGTGTGTATAATCATGTGTC-TCTTCA-G
gi|9 : taTGAATGCCTTGCCATAGG-ATGACATT-GATAAGGTTATTCAACAGTATGTATGCTAATG-TGTCTTTGAAATGTATTATTCCAACTGAATGTCTTCCCACAAACATCACATTgt
blockSeqs : T T C T T C G A A C . A ATCGCAT T CT T . T T G C AC TG A G G . G GC . . . . . . AAC G G A CG T C A A T AC GACTA AT AATT ACACATCACA ATATCAC . C T GT A A T C G . G G A A AA T G A . A T A A C . A C G C C CAA A ACTGGAAACA G T T TG AC . G . A A T A A T A C T AA AC T . T C G TC . A G G . CAT T A AGC TCTT A G A C T . G AAAAT C C T . G A G GC T A TACATG ATTGGTTTTATAAGGTTTATCC T C TT T G G TA ACGAACA GA T A AACATCACACA C A A G TC AA TGT AAT TG A T AA TG G . CC CT G .
blockSeqs : T CA T T C A G GT CTA T . A TTTT . C T GT A A T T A . G . CGA G TGAACGAACA T T A CA TC C . . C C . T ATAAG T C GC G G . A G T CA . A . C . T C . CT A A T A TT T TCT . CA T C
blockSeqs : T AA T T T A . G TC . . A TTTT . C A CG G G G . . . GCT C GCAATTCGA T T T GT G A . T A A AT . A . C . A G . TT T T A A . G G . TG G C
blockSeqs : . . G C A T T . . . T . A . G G . A T A A C T
blockSeqCons : N* N* N***********
originalCons : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-NCCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAAGNGCCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACAGACATCACACTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
finalCons : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTTN-CCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAAN-GCCTTNCCAC-AN-----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACAGACATCACACTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 44444444444444 11 1 1 1 11 11 1 1 22222 11 11 222 7777777 33333333 111 222222 11 1111 444444444444 22222222 1 1 1 1 11 1 11 1 1 1 1 11 1 2 1 222222222222222 11 222 1 1 1 111 222 1 1 11 1 1 1 222 222 2222 1 1 1 222222 1 1 222222 6666666666666666666666 2222222 555555555555 11 111 11 11 1 1 11 1 1
lowQualScore : 5 1 1 1 1 5 1 1 1 1 5 1 00000000000000 1 66 1 5 1 5 5 1 88 88 5 1 2 5 1 22 77777 88 88 111 2222222 66666666 333 1 1 1 44 3 1 1 3 0 8 000 333333 99 7777 444444444444 0 66666666 0 2 1 0 11 0 1 4 7 2 5 5 1 66 5 1 66 5 1 1 5 1 5 1 1 5 88 1 1 0 0 0 222 1 333333333333333 99 3 1 0 44 88 111 1 5 1 5 1 1 5 1 1 999 1 22 111 5 5 1 1 1 88 5 1 5 5 000 111 1 1 333 6666 1 3 3 0 6 1 3 1 999999 2 6 0 1 5 1 1 1 22 8 2 888888 9999999999999999999999 8 8 77 8 1 8 99 0 6666666 99 1 8 222222222222 1 6 0 1 4 77 66 666 777 00 1 0 6 66 22 5 5 66 22 5 5
lowQualScore : . . . . . . . . . . . . .............. . .. . . . . . . .. .. . . . . . .. ..... .. .. ... ....... ........ ... . . . .. . . . . . . ... ...... .. .... ............ . ........ . . . . .. . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . . . . .. . . . . . ... . ............... .. . . . .. .. ... . . . . . . . . . ... . .. ... . . . . . .. . . . . ... ... . . ... .... . . . . . . . . ...... . . . . . . . . .. . . ...... ...................... . . .. . . . .. . ....... .. . . ............ . . . . . .. .. ... ... .. . . . .. .. . . .. .. . .
lowQualScore : 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 00000000000000 0 55 0 5 0 5 0 0 00 00 5 0 5 5 0 00 00000 55 55 000 5555555 00000000 000 0 0 2 55 2 2 2 2 2 8 555 555555 00 0000 888888888888 2 88888888 0 5 2 2 00 8 2 2 3 0 0 0 0 00 5 0 55 5 0 0 0 0 5 0 0 0 00 0 0 0 0 0 555 0 888888888888888 00 8 4 6 33 00 000 0 5 0 5 0 0 5 0 0 000 0 00 000 5 5 0 0 0 00 0 0 0 0 555 000 0 0 000 7777 0 3 3 7 7 0 3 0 000000 0 7 7 0 5 0 0 0 88 8 0 888888 4444444444444444444444 8 2 66 0 0 0 44 8 0000000 00 0 0 000000000000 4 0 8 4 6 88 22 555 555 88 0 8 4 55 00 0 0 00 00 0 5
consensus : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-NCCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAA-NACCTTNCCAC-A-A----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACAGACATCACACTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
Reference ( family-149 ) : TTTATCGCCAGCATGNGTNCTCANGTGTNTCTNTAAGTTCCCCNTCCNATTNAACTCCTTCCCATCANACACCTGCTATTTAAATTANAAGGTTCNTCACCNGTGTGTGTCCCTCANGTGTGTCCNTAACTTTCTGCTCTGACTGAATGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTCCTCATNTGTCTCCGTAATGATCCTGTCTGCACTNAATNNCTTCCAAGATATCACAATCATCTTACAAGATTTATC------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAATATTAGTATCTCCTNNNTNACTGAATNCCTTCCCACAAACATCACATTTATAAGGTTTATCACCGGTATGTATTCTCATGTGTGTCTGTAA-GCGTT---TT-CGCA--TGAATA----CCTTCCCACAAACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TCGCTCAGT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTTCCTATCCGATTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTTGCCACAGGCATNACATTCNATAAGGTTNCTCANCAGTGTGTATNCTNATGGTGTCTTTGNAATGTATTNTTCCNACTGAATGCCTTCCCACAGACATCGCATTTGTAGAAGGNCTCTCTCCAGTGTGNA-TT-TCTCATGT-GTTCNAAGGNTGC-TGNN--CGA---CTGAAGGCTTT-NCCACATTCATTACATTTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCGGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAGACATCACATCTATNATTAAGGTTTNTCACCAGTATGTGTCATCANGTGCGTNTATAAGCCNCCTGNCAGNGACTGAANGCCTTCCCACAGACNNCACATTTATAGGGTTTTACAACCAGTGTGTATTCCTCANGTGTNTCTNTAAGTCTGCTCTGCCGANTGAATGTCTTCCCACAAGCGACATCACATTNATAAGGCTTNTCNNNAGTATG--TNCTCATGTGTNTCTGTAA-TTT-CCTTTCCGACTGAATGCCTTCCCACANACATCAC-ATNT-ATAA-GTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGCGTCNTTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTGTAATGTNTCCTGCNTNACTGAATGCCTTGCCACAGACATCGCACT------TATAAGGTTTCTCA---------------------CCAGTGTGNATCCTCNNGTGTC-TCNTAA-GTTTCC-GTTTTGA-------CTGAA-NGCCTTNCCAC-A-N----------CATCACATTTATAAGGTTTCTCACCAGTATGAATCCTCGTGTGTNTCTTGTAAGTTTCTTG---TCCGATTGAANGCCTTTCCACAGACATCACACTTATAAGGTTTCTCANCNNTGTGTGTCCTCACTGTGTNCCTCTAANNTTCCGTTTTGATTTAAACATCTCTCCACA
gi|1 : TTTATCGCCAGCA-AAGTGCTCAAGTGTGT-TCTAAATTTCCCCTTTCATTAAACTCCTTTTCATCACAC-CTTACTATTTAAATTAAAAGGTTTA-CATCAGTATGTGTCTCTCAAG-GT-TTCATA--TTTCTATTC--ACTGA-TGCCTTCCAAACAGACATCAACATTCATATTTCTAGACCTTATCACGGTAACTCTGTATACGTTCTCATCTGTCTCCTTAATGATCCTGTCTGCACTCAATCACTTCCAAGATATCACAATCATCTTATAAGATTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTAGTATCTCCTTTATCACTGAATTCCTTCCCAAAGACTTCACATTCATATGGTTTCTCACTTGTA-GAATTCTC-TGTGTATTTGTAATGCGTT---TT-CACA--TGAATG----CCTTCTCACAATCATCACTAA---------TATATAAGGT---TCGCTCAGTGGTGTGTCCC--TGTGTCCTTGTAAACTGCCTTTCACACTGAATGCCTCCCCACAGATATCACACCTATAAGGTTTCTCACA-GTGTGTA-TCTCATGTGTCTTGTGTATGTTGTGACTCACTGAATGCCTT-CTACAGACATCACATTCTAT-AGGTTTCTC-CCAGTGTG-ATTCTCATGGTGTCTTTGCAA-ATATTTTTCTCACTGAATGCTTTCTCA-AGACATCGCACTTATAGAAGGTTTTTCACCAGTATGTA-TC-TCTCATGT-GTTTTGAAGCTGCATGTC--CTA---TTGAATCCTTTCACCAAA--CATCACATTTATAAGGTTGCTCACCAGTATGTATCCTCAAGTGTGTTTTTTAAGTCACCTTCTTGTTCTAAATGCTTCCCAAACAATCACATTATAAGTCTCCTCACCTGTATGTATTCTCTTTGTGTGTGTGTAATGCTGCTTGACCTGAAATTCTATCACAACATCACAATTTATAGGGTTCTCACCCAGTATGTATCCTCAATGTGTCTGAATGTTCCCGATCCCTGAATGCCTTCCCAAGACATCACATCTTAAGGTTCTCTCACAAGTATGCATCTTAGTGTGTCTTTTAAGCGTCTATTAATAAATGCTTCCCCACATCCATCACATTATAGGTTTCCTCACCGTGACGCATCCTTAGTGTGTCTTTAGGCGTCGTTGTTTACTAAATGCATTCCCACAG--ATCACATCTATTATTAAGGTTTCTCACTAGTATGTATC-TCAAGTGCGTTT-TAAGCCACCTGTTAGAGACTAAAAGCCTTCCCACAGACCTCACATTTATAGGGTTTT-CAACCAGTA-GTATTCCTCAAATGTGTCTCTAAG--TGTTCTGTTGACT-AAT-TTTTTCCACAAGCAACATCA---TAATAAGGTTTCTCTCGAGTATG---ACCCATGTGTGTCTGTAA-TTT-CCTTTCTGATTGAATGCCTT-CCACAGACATCACTATCTGAT-A-GTT--TCACCAGTATGTATCCT-ATGTGCGTCATTAAGTCTCCTTCTCGCTAAAATGACTCCCACAACATCACATTGATAGGCTCTCATCTGTGTATTATTGATGTCTCTGTGACTTTCTGTCGGACGAAAGTCTTCCACGCACATCACATTTATAGGTTTGTCATCTATCTCAAGTATTTTCTTTAAGTGTCCTGTTAATTACTACTTTTAAATGCCCACCTCAAACGTCACATTCCAAGGTTGCCTTCTCCTCTGTATGCATTCTCTTGTGACTGTAATGCTGCTGTCTGATTGAAATCTCTTCCACAGACATCACATTTATAGGGTTCTCATCCAGTAGTACCTTATGTGTCTTTTATAATGTTTCCTGTCTCTCTGAAT--CTT-CCACAGACATCACATT------TATACGGTTTCTCA---------------------CCAGTATG-ATCCTCAAGTGTT-TCTTAA-GTTCCT-GTTTT-A-------CTAAAGCGCCTTCCCAC-A-A----------CATCACATGAAT-AGGTTTCTCACCAGTA-GTATCCTCATGTGTGTCTTGTAAATTTCCTG---TC--ATTAAATGCC-TTCCACATACATCACA--TATAAGGTCTCTC-CCATTGTGT-TTTTCACTGTGTG-TTTTAAAATTCC-TTTTGATTTAAACATTTCTCCACA
gi|10 : TTTGTA--AGGACTCTCTCCAGTATGCAGTT-TCTCATGTCGTGCAAGGTATGC-AATT--CGA---TTGAAGAGCTT-GCCACATTCTTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCgcactcactcaaaaggt
gi|11 : ---CTGAAAGCTTT-TCCACATTCACTGCATGTAAAAGGCTTTTCTCCAGTGTGAACTCTCTGGTG
gi|12 : tgtggattttgtgatgttgaacaagtgtggaattatgcTGTGAG-TTCTTTCATGT-ATTCGAAGGGAAC-TGGAAAC-A---CTGAAGGCTCT-TCCACATTGTTTACATGTATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAGTTCT
gi|13 : --TCCTCATGTGAATTTGTAA-TTTATCTTTCCGACTGAATGTCTTCCCACATACATTAC-ATGT-AAAATGTTCATCACCAGTATGTATCCTCATGTGTGttcat
gi|14 : aAAGGTTTCTCACCACTATGAATCCTTGTGTGTCTCTT-TAAGTTTGTTG---TCTGATTGAAAACCTTTCCACAGATATCACATTTATAAGGTTTCT
gi|15 : ATCACATTAATCAATTTTATCACCGGCATGCATACTCACGTGTCTCT-TAA-ACATT---TC-TGTA--TGAATAAATTTCTTCCCACAGACATCA
gi|16 : CCTTTCCACAGATATCACACTTGTAAGGTTT
gi|2 : CCTCATGTGTCTTTGTAATGATCCTGTC-GCACTGAATGCCTTCCAA-----CACA--CATC--ACA---TTTAT-------AAGGTTTATCACCAGTATGGGTCCTAATGTGCGTCTGTAAAT--------TTCCTAACTGACTGAATGCCTTCTCACAACCACCACACTTATAAGGTTTATCACCAGTATGTTTCCTTATGTGTGTTTTTAA-GTGTC---CTATGTAATTGAATA----CCTTCCCACAGACATCAC--A---------TCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCACAAACATCGCATTTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTGCCCTCATGTGT
gi|2 : CAATATGTGTCCTCATATGTTTCTGTAAGTTCTCTATCCAATTCAATTCCTTCCCA-CAAACATC-GC-AT-----TTATAAGGTTCCTCACCTGTGTGTG-CCCTCATGTGTGTCTCTAACTTTTTGCTTTGATTAAATATCTgtctctaactttttgctttgattaaatatctgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|3 : cctcatgtgtctttgtaatgatcctgtcgcactgaatgccttccaacacacatcacatttataaggtttatcaccagtatgggtcctaatgtgcgtctgtaaatttcctaactgactgaatgccttctcacaaccaccacacttataaggtttatcaccagtatgtttccttatgtgtgtttttaagtgtcctatgtaattgaataccttcccacagacatcacatctataaggtttttCCACAGACATCACAT---TGAT-AAGGTTTATCACCAGTATGTGTCATCATGTGTGTATATAAGTTTCCTGAC--CGACTGAATGCCTTCCCACAGACAACACATTTATAAGGTTTTAC-ACCAGTGTGTA-TCTTCATGTGTCTTTGTAAGTCTGCTCT-CCGAATGAATGTCTTCCCACA---GACATCACATTTATAAGACTTATCAGCAGTATGTCTTCTCATGTGTCTCTGTAAGCTT-CCTGTCTGACTAAATGCCTTCCCACACACATCAC-ATTT-ATAAGGTTTATCACCAGTATGTGTCCTCTTGTGTATCTTTAAGgaaaaaagtaaatgacacaaatttgtagtagggacattacaag
gi|4 : TTCC-GTGT-GA-------TTGAA-TACTTTTCCAC-A-AACATCACACACATCACATCTATAAGGTTTTTCA---ATATGTATCCTCATATGTTTGT-GTAAGTTTCTTA---TCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCA-TGTATCCCTCTAACTTTTTGTTTTGA-TTAAACATCTcgttggttgaacatctgaaaaaaattaataaaactaaatgtgtagtaaggtcattgcag
gi|4 : tg--TGAATA----CTTTTCCACAAACATCAC--ACACATCACATCTATAAGGT---TT-TTCAAT-ATGTATCCTCATATGTTTGTGTAAGTTTCTTATCCAATTGAATGTCTTCCCACAGACATCGCACTTATAAGCTTCCTCAACTGTGTGTGTCCTCATGTATCgaaataaaaaaaaa
gi|5 : tgttccgtgtgatCACAAACATCACATTTATAAGGTCTATCACAAGTGTGTATTATCATATGTGTCTGTAA-G-ATTGACTA-CGCAT-TGAGTC----CCTTCCAAAAAACATCAC--A---------TTTATATGGTATATCAC-CAGT-ATGTATCCTCATATGTATCTGAAACGTTCCTGTTCGATTGAATGCCTTCCCcctctaactttttgttttgattaaacatctgaaataaaaaaaaa
gi|6 : AATGCCTTTCCACAGACATCACGCT------CATAAGGTCTCTCA---------------------CCAAAATATGTCCTCTTGTGTCTTCGCAA-GTCTCC-ATTTTGA-------CTGTA-AACCTTCCCACAA-A----------CACAACATTTATTAGTTTTATCACCGGTTTGAATCATCATGTG
gi|7 : gggacggctcatgtgatatTCTCCAGTGTGGA-TTGTCTGATGG-ATTGCTAGGCT---TGAA--CGAACACTAAAGGCTTT-GCCGCACTCATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATGa
gi|7 : TCT---------------------CCAGTGTGGAT-------TGTC-TGATGG-ATTGCTAGGCTTGAACGAACACTAAA-GGCTTTGCCGC-A-CT---------CATTGCACTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGAATTCTCCAATG--ACTAATAAGGT--GTGAATTTTGAGTGAAGAGCTTGCCACATTCATTACATTTactaataaggtgtgaattttgagtgaagagcttgccacattcattacattt
gi|7 : ACTAAAGGCTTTGCCGCACTCATTGCACT------TGTAAGGTTTCTCT---------------------CCAGTGTGAATTCTCCAATGAC-TAATAAGGTGTGA-ATTTTGA-------GTGAA-GAGCTTGCCAC-ATT----------CATTACATTT
gi|8 : tctccagtgtggattgtctgatggattgctaggcttgaacgaacTGTAA-GTGTCCTGCATGATTGAATGTCTTGCCACAGACATCATATTTACATGTACAAGGTTTATCATTGGTTTTATAAGGTTTATCCCCGGTGTGTATAATCATGTGTC-TCTTCA-G
gi|9 : taTGAATGCCTTGCCATAGG-ATGACATT-GATAAGGTTATTCAACAGTATGTATGCTAATG-TGTCTTTGAAATGTATTATTCCAACTGAATGTCTTCCCACAAACATCACATTgt