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Reference ( gi|5 )            :              AGTACCCATTC-ATTT--CCCATAGAC------TTCAGTG-TT-AA-CATTTGAAC-CT-CT-CAC--T-AATT-----A-AC------------TATA--TT----GA----CTTG-----AG---AC--AA--TTGA-CTACCAACATTT--GAAAGTT-CGTTC----C-AAG------TGCTAC----AT------A-AAAAATG--AC-AAA----AATTATA-TAGG--GT--CCC---ATG--GCTTTTA-TA--GG-TC------ATA--A--TT-ATACATTGTTT-AAA----A-CA---C--AC--A----G--A-----T---CTGCAG-TA---ACT-------T-ACACCCTT-CA---TTT-CA-AACAT----A---CCT-------------CA---ACCATG---GCATTTTCCT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTGTG
gi|6                          :              AGTACCAATTC-ATTT--CCCATAGAT------CTCAATG-TT-AA-CCTTTGACC-CT-CT-CAC--T-AACT-----A-AC------------TATA--TT----GA----TTTG-----TG---AC--AA--ATGA-CCACCAACAACT--GAAAGGT-CATTC----C-AAGCTTAAGTGCTA-----AT------A-AAAAATG--AC-AAA----A-------------------C---ATG--GCGTTTA-TT--GG-TC------ATA--T--TT-GTACATT-TTT-AAA----A-CA---C--AC--ACAGAG--A-----T---CTGCAA-TA---AAT-------T-AC-------CA---TTT-CA-AACAT----A---CCC-------------CT---ACCATT---GCAATTTCTT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTG
gi|1                          :            agAGTACCAATTC-ATTTTCCCCATAGAC------TTCAATG-TTTAA-CCTTTGTCG-TT-CT-CAC--T-AATT-----ACAC------------GAGACCTT----GA----TTTT-----AG---AC--AA--ATGAACCACCAATATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAA------CCCT-CGGTAAT------A-AAAGATG--ACGAAA----AATTATA-TATT--GTC-CCC---ATG--GCGTTTATTACCGG-TC------ATG--T--TTGGTACATT-TTT-AAA----G-CA---CAAAC--A----G--ACGAT-T---TTGCA--TA---AAT-------TAACACCCTT-CATATTTT-GACAACAC----T---CCT------------------ACCATG---ACAATTTCCT--CATTTCTTGTC-T-CGATTTTGTG
gi|2                          :       ggaaaagAGTACCAATTC-ATTT--CCCATAGGCCAATCCTCCCATG-TT-AAACCTTGGACC-CT-CT-CACGTC-AATTC----A-AC------------TGTA--TTATAAGA-----TTG-----AGCAAAC--AA--ATGAAC--CCAACAAT---GAAAGTT--ATTC----C-AAG------TGCTAG----AT------A-AAAA-T---AC-AAA----AAT-ATAATAAG--GAGACCC---ATG--GCTTTTA--A--GG-TC-------TA--T--TT-ACACAATTTTC-AAA----AACAAAAC--AC--A----G--A-----GGAATTGCAG-TA---AAT-------T-ACACCCTT-CA---TTT-CA-AACATACCAA---CCT-------------T----ACCATGAGCGCAATTTCCT--CGTTCCAtgcaaataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacctcgtccgggtcacaggtcagtggggttgtgctactctctttcca
gi|10                         :     agggaaaagAGTACCAATGC-ATTT--CCAATAGAC------CTCAATG-CT-AA-CCTTTGTCC-CT-CT-CAT--T-AATT-----A-AT------------TATA--CT----GG----TTTT-----AG---GC--AA--TTAA-CCACCAATATTT--GAAAGTT-CATTT----C-AAG------TGGTA------------------------AT-AAA----AATTATA-TAGA--GT--CCC---GTG--ACATAGA-TA--GG-CT------ATAT-AATTT-ACACACT-TTT-AAA----A-CA---C--ATCAA----G--A-----T---CTGCCG-TG---AAT-------T-ACACCCTT-gtatctgcggtataatgtgtaatg
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gi|7                          :                     ATTC-ATTT--CCCATCAAC------CTTA-T--TT-CC-CATC--AAC----TT-TGC--TAAATT-----C-AC------------TATA--TT----GA----CTTT-----AG---AC--AT--ATGC-CCTCCAACATTT--GACAGTT-CATTC----A-AAG------TGCTA-------------A-CAAAATGCCAC-AAA----AATTGTA-TAGG--GT--CCC---ATT--GCTTTAG-TA--AG-TC------GTA--T--TT-ATAC--TGTTT-ATA----A-CA------AC--A------------------TACAA-C----ATT-------T-GCA---TT-GA---TTT-CA-AACAT----A---CC--------------CAT--ATCATG---GTAATTTCCTAAAG-TCAAT-TA-T-CAATTTTGT
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1334 )     :               AGTACC--AATTC-ATTT--CCCATAGACC------TCAATG-TT-A-------A-CCTTTGACC-C-TCT-CAC--TAA-TT-A--------------ACT---ATA--TT----GA---T-----TTNAG---AC--AAAT--G-A-CCACCAACATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAG------TGCTA-AT------A-AAAAATG--AC-AAA----AAT-TATATAGG--G--T--CCCGTGGCTTTTA-TA--GG-T----CAT---AT---TT-GTAC-ATT-TTT-----AA-AACA---C---AC--A----G--A----T---CTGCAG-TA---A------AT-T-ACACCCTT-CAT-TT-CAAAC-AC-AC---CCCT---------------ACCA--T-----G---GCAATTTCCT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTGTG
gi|1                          :               AGTACC--AATTC-ATTTTCCCCATAGACT------TCAATG-TTTA-------A-CCTTTGTCG-T-TCT-CAC--TAA-TT-AC-------------ACG---AGACCTT----GA---T-----TTTAG---AC--AAAT--G-AACCACCAATATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAACCCT--CGGTA-AT------A-AAAGATG--ACGAAA----AAT-TATATATT--G--TC-CCCATGGCGTTTATTACCGG-T----CAT---GT---TTGGTAC-ATT-TTT-----AA-AGCA---CAA-AC--A----G--ACGATT---TTGCA--TA---A------AT-TAACACCCTT-CATATT-TTGACAAC-AC---TCCT---------------ACCA--T-----G---ACAATTTCCT--CATTTCTTGTC-T-CGATTTTGTG
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Reference ( family-1334 )     :               AGTACC--AATTC-ATTT--CCCATAGACC------TCAATG-TT-A-------A-CCTTTGACC-C-TCT-CAC--TAA-TT-----A-AC------------TATA--TT----GA---T-----TT--TAG-AC--AAAT--G-A-CCACCAACATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAG------TGCTA-AT------A-AAAAATG--AC-AAA----AAT-TATATAGG--G--T--CCCGTGGCTTTTA-TA--GG-T----CAT---AT---TT-GTAC-ATT-TTT-----AA-AACA---C---AC--A----G--A----T---CTGCAG-TA---A------AT-T-ACACCCTT-CAT-TT-CAAAC-AC-AC---CCCT---------------ACCA--T-----G---GCAATTTCCT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTGTG
gi|1                          :               AGTACC--AATTC-ATTTTCCCCATAGACT------TCAATG-TTTA-------A-CCTTTGTCG-T-TCT-CAC--TAA-TT-----ACAC------------GAGACCTT----GA---T-----TT--TAG-AC--AAAT--G-AACCACCAATATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAACCCT--CGGTA-AT------A-AAAGATG--ACGAAA----AAT-TATATATT--G--TC-CCCATGGCGTTTATTACCGG-T----CAT---GT---TTGGTAC-ATT-TTT-----AA-AGCA---CAA-AC--A----G--ACGATT---TTGCA--TA---A------AT-TAACACCCTT-CATATT-TTGACAAC-AC---TCCT---------------ACCA--T-----G---ACAATTTCCT--CATTTCTTGTC-T-CGATTTTGTG
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gi|5                          :     aggggaaaagAGTACC--CATTC-ATTT--CCCATAGACT------TCAGTG-TT-A-------A-CATTTGAAC-C-TCT-CAC--TAA-TT-----A-AC------------TATA--TT----GA---C-----TT--GAG-AC--AATT--G-A-CTACCAACATTT--GAAAGTT-CGTTC----C-AAG------TGCTACAT------A-AAAAATG--AC-AAA----AAT-TATATAGG--G--T--CCCATGGCTTTTA-TA--GG-T----CAT---AA---TT-ATAC-ATTGTTT-----AA-AACA---C---AC--A----G--A----T---CTGCAG-TA---A------CT-T-ACACCCTT-CAT-TT-CAAAC-AT-AC---CTCA---------------ACCA--T-----G---GCATTTTCCT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTGTGcaa
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gi|8                          :                               TT--TCCATAAACC------GCAATA-CT-ACATTGTAA-CCTTTGGCC-C-TTT-CGC--CAA-TT---------------------------------------------T--TAG-AC--AAAT--T-A-CAACCAATAATT--GAAAGTT-CATTC----C-ACA------TGGTT-AT------T-GAAATTG--AC-AGACACAAAT-TAGA--AG--G--T--CTCGTTGCTTTT----------------------------GAAC-TTT-TTT-----AC-AACA---C---CT--A----GCGA----T---ATTCAT-TA---A------AT-T-ACACCTTT-CAT-TT-CCAAC-A--AA---CCCT---------------ATCA--T-----G---GTACTTTCCT--GGGT-CATATT-T-CAATTTT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1334 )     :               AGTACC--AATTC-ATTT--CCCATAGACC------TCAATG-TT-A-------A-CCTTTGACC-C-TCT-CAC--TAA-TT-----A-AC------------TATA--TT----GA---T-----TT--TAG-AC--AAAT--G-A-CCACCAACATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAG------TGCTA-AT------A-AAAAATG--AC-AAA----AAT-TATATAGG--G--T--CCCGTGGCTTTTA-TA--GG-T----CAT---AT---TT-GTAC-ATT-TTT-----AA-AACA---C---AC--A----G--A----T---CTGCAG-TA---A------AT-T-ACACCCTT-CAT-TT-CAAAC-AC-AC---CCCT---------------ACCA--T-----G---GCAATTTCCT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTGTG
gi|1                          :               AGTACC--AATTC-ATTTTCCCCATAGACT------TCAATG-TTTA-------A-CCTTTGTCG-T-TCT-CAC--TAA-TT-----ACAC------------GAGACCTT----GA---T-----TT--TAG-AC--AAAT--G-AACCACCAATATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAACCCT--CGGTA-AT------A-AAAGATG--ACGAAA----AAT-TATATATT--G--TC-CCCATGGCGTTTATTACCGG-T----CAT---GT---TTGGTAC-ATT-TTT-----AA-AGCA---CAA-AC--A----G--ACGATT---TTGCA--TA---A------AT-TAACACCCTT-CATATT-TTGACAAC-AC---TCCT---------------ACCA--T-----G---ACAATTTCCT--CATTTCTTGTC-T-CGATTTTGTG
gi|10                         :        ggaaaagAGTACC--AATGC-ATTT--CCAATAGACC------TCAATG-CT-A-------A-CCTTTGTCC-C-TCT-CAT--TAA-TT-----A-AT------------TATA--CT----GG---T-----TT--TAG-GC--AATT--A-A-CCACCAATATTT--GAAAGTT-CATTT----C-AAG------TGGTA-AT--------------------AAA----AAT-TATATAGA--G--T--CCCGTGACATAGA-TA--GG-C----TATATAAT---TT-ACAC-ACT-TTT-----AA-AACA---C---ATCAA----G--A----T---CTGCCG-TG---A------AT-T-ACACCCTT-tgcaaataattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacctcgtccgggtcacaggtcagtggggttgtgctactctctttcca
gi|11                         :                                                                                                                                               aaatAG-AG--AAAT--GCA-CCACCAACATTTTGAAAAGTT-CATTC----CCAAG------TGCTA-AT------AGAAAAATG--AC-AAA----AAT-TATATAGAATG--T--CCCATGGCTTTTA-TA--GG-T----CAT---AT---TT-GTAC-ATT-TTTTT---AA-AACA---C---AC--A----G--AGA--T---CTGCAG-TA---A------AT-T-ACATCCTT-CAT-TTTCAAAC-AT-AC---CCCT---------------ACCA--T-----G---GCAATTTCCT--CGTTCCAT-T--T-CGtc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   --CCCGTGGTGTTTA-TA--GGGT----CAT---ATAATTT-ACAC-ATT-TTTTAAATAA-AACA---A---AA--A----G--A----T---CTGCAG-TG---A------AT-T-ACACAGTT-AAT-TT-CAAAC-AC-AT---CCCT---------------ACCA--T-----G---G-ATTTTGCT--CATTCCTT-AC-C-TGGTTTtt
gi|15                         :                                             ------TCAATG-TA-A-------C-CCCTTGGCTTC-TCTTCAC--TAA-TT-----A-AC------------TAAA--TC----AAACTT-----TT--TATTAC--AAATTTG-A-CCACCAACA-TT--GAAAGTT-CA-TC----C-AAG------TGCTA-TT------A-catcca
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---TT-ACAC-ATT-TTT-----AA-AACA---C---AC--A----A--AGC--T---CTGCCG-TG---A------AT-T-ACACTCTT-
gi|3                          :               cGTACC--CATTC-ATTT--CCCATAGTCC------TCAATG-CT-A-------A-CTTCTG-TC-C-TCT-CAC--TAA-TTACTAGA-ACTACATGTACTTGTATA--TT----AA---T-----TT--TAA-AC--ATTT--G-A-CTACC---------GAAAGTT-CATTT----C-AAG------TGCTA-AT------T-ACCGGT---AT-AA---------TATTTAGG--GCCC--CCCGTTGCTTTTA-TA--GA-A----C----------------C-A---ATT-----AA-AA-A---T---AT--A----G--AAAATT---CTTTAA-TAGTTA------AT-T-ACGCCCTTCCAT-TC-CAAAC-ACAAC---CCCT---------------ACCAGCTACCAAG---ACAATTTCCT--CAGTCATT-TC-TAGGATTTCGTGt
gi|4                          :   taggaaaaaaggAGTACCTAAATTC-ATT--------------------CAATGATT-A-------A-CCCTTG-CT-C-TCT-CAC--TAA-TT-----A-AC------------TAAA--TC----AA---T-----TT--CAG-TCCAAAAT--G-A-CCACCAACATTTT-GAAAGTTTCATTC----C-A-G------TGCTA-AT------A-AAAACGG--AA-AAA----AAT-ATTATTAG--G--T--CCCGTGCTTTTTA-TA--GG-T----CAT---CT---TT-GTAC-ATT-TTT-----TA-AACA---CAGAAG--A----A--A----T---TTGCAG-TT---A------AT-T-ACCACCTT-CAT-TG-CAAAC-AC-AC---CCCT---------------ACCA--C-----G---ACAATGTTCT--CATTCCTT-TCTT-CAATTTTGTGcaa
gi|5                          :     aggggaaaagAGTACC--CATTC-ATTT--CCCATAGACT------TCAGTG-TT-A-------A-CATTTGAAC-C-TCT-CAC--TAA-TT-----A-AC------------TATA--TT----GA---C-----TT--GAG-AC--AATT--G-A-CTACCAACATTT--GAAAGTT-CGTTC----C-AAG------TGCTACAT------A-AAAAATG--AC-AAA----AAT-TATATAGG--G--T--CCCATGGCTTTTA-TA--GG-T----CAT---AA---TT-ATAC-ATTGTTT-----AA-AACA---C---AC--A----G--A----T---CTGCAG-TA---A------CT-T-ACACCCTT-CAT-TT-CAAAC-AT-AC---CTCA---------------ACCA--T-----G---GCATTTTCCT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTGTGcaa
gi|6                          :               AGTACC--AATTC-ATTT--CCCATAGATC------TCAATG-TT-A-------A-CCTTTGACC-C-TCT-CAC--TAA-CT-----A-AC------------TATA--TT----GA---T-----TT--GTG-AC--AAAT--G-A-CCACCAACAACT--GAAAGGT-CATTC----C-AAGCTTAAGTGCTA-AT------A-AAAAATG--AC-AAA----A---------------------CATGGCGTTTA-TT--GG-T----CAT---AT---TT-GTAC-ATT-TTT-----AA-AACA---C---AC--ACAGAG--A----T---CTGCAA-TA---A------AT-T-AC-------CAT-TT-CAAAC-AT-AC---CCCT---------------ACCA--T-----T---GCAATTTCTT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTG
gi|7                          :                      agATTC-ATTT--CCCATCAACC------TTA----TT-T-------C-CCATCAACT-T-T----GC--TAAATT-----C-AC------------TATA--TT----GA---C-----TT--TAG-AC--ATAT--G-C-CCTCCAACATTT--GACAGTT-CATTC----A-AAG------TGCTA-AC------A-AAA--TGCCAC-AAA----AAT-TGTATAGG--G--T--CCCATTGCTTTAG-TA--AG-T----CGT---AT---TT-ATACTGTT-TAT-----AACAACA---T---AC--A----AC-A----T---TTGCA-------------------------TT-GAT-TT-CAAAC-AT-AC---CCAT---------------ATCA--T-----G---GTAATTTCCTAAAG-TCAAT-TA-T-CAATTTTGT
gi|8                          :                               TT--TCCATAAACC------GCAATA-CT-ACATTGTAA-CCTTTGGCC-C-TTT-CGC--CAA-TT---------------------------------------------T--TAG-AC--AAAT--T-A-CAACCAATAATT--GAAAGTT-CATTC----C-ACA------TGGTT-AT------T-GAAATTG--AC-AGACACAAAT-TAGA--AG--G--T--CTCGTTGCTTTT----------------------------GAAC-TTT-TTT-----AC-AACA---C---CT--A----GCGA----T---ATTCAT-TA---A------AT-T-ACACCTTT-CAT-TT-CCAAC-A--AA---CCCT---------------ATCA--T-----G---GTACTTTCCT--GGGT-CATATT-T-CAATTTT
gi|9                          :               AGTACT--AATTC-ATTT--CC-ATAGACC------TCAATG-CT-A-------A-CCTTTGGCC-C-TCT-TAC--TAA-TT-----A-AT------------TATA--TT----CA---TTTGGGTT--TAG-AT--GAAT--G-A-CCATCAACATTT--GAAAGTT-TATTCTAATT-AAG------TGCTA-ATA-----A-AAAAACG--TC-AAC----AAT-TATTTAAG--G--T--CCCGCAATGTTTA-TA--GG-TCTGACATATAAT---TT-GTAT-ATT-TTT-----


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blockSeqs                     :                     .      .    .   C       .           .  . .       .      A  . .   .   .    .  .     .  .               .   .     T          .    .  .     .  . .         A  .        .     .    .   .          .  A          AATG    .   .     A         .  T                 .  .   . .      .    .    .    .   .   .      .    .   .    .  .    .  .    .       G   .   .       . .        .   .  .     . C   .      .                  .  .     .            .         .  . .
blockSeqs                     :                     .      .    .   C       .           .  . .       .      A  . .   .   .    .  .     .  .               .   .     T          .    .  .     .  . .         T  .        .     .    .   .          .  A          AATG    .   .     T         .  T                 .  .   . .      .    .    .    .   .   .      .    .   .    .  .    .  .    .       G   .   .       . .        .   .  .     . T   .      .                  .  .     .            .         .  . .
blockSeqs                     :                     .      .    .   C       .           .  . .       .      A  . .   .   .    .  .     .  .               .   .     T          .    .  .     .  . .         T  .        .     .    .   .          .  T          TGCC    .   .     T         .  T                 .  .   . .      .    .    .    .   .   .      .    .   .    .  .    .  .    .       G   .   .       . .        .   .  .     . C   .      .                  .  .     .            .         .  . .
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GCCAAATAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGTTCGAGTCACAGGTCAGGGGGTTTGGTACTCTATTTTC
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Reference ( family-1334 )     :               AGTACC--AATTC-ATTT--CCCATAGACC------TCAATG-TT-A-------A-CCTTTGACC-C-TCT-CAC--TAA-TT-----A-AC------------TATA--TT----GA---T-----TT--TAG-AC--AAAT--G-A-CCACCAACATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAG------TGCTA-AT------A-AAAAATG--AC-AAA----AAT-TATATAGG--G--T--CCCGTGGCTTTTA-TA--GG-T----CAT---AT---TT-GTAC-ATT-TTT-----AA-AACA---C---AC--A----G--A----T---CTGCAG-TA---A------AT-T-ACACCCTT-CAT-TT-CAAAC-AC-AC---CCCT---------------ACCA--T-----G---GCAATTTCCT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTGTG
gi|1                          :               AGTACC--AATTC-ATTTTCCCCATAGACT------TCAATG-TTTA-------A-CCTTTGTCG-T-TCT-CAC--TAA-TT-----ACAC------------GAGACCTT----GA---T-----TT--TAG-AC--AAAT--G-AACCACCAATATTT--GAAAGTT-CATTC----C-AAACCCT--CGGTA-AT------A-AAAGATG--ACGAAA----AAT-TATATATT--G--TC-CCCATGGCGTTTATTACCGG-T----CAT---GT---TTGGTAC-ATT-TTT-----AA-AGCA---CAA-AC--A----G--ACGATT---TTGCA--TA---A------AT-TAACACCCTT-CATATT-TTGACAAC-AC---TCCT---------------ACCA--T-----G---ACAATTTCCT--CATTTCTTGTC-T-CGATTTTGTG
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gi|5                          :     aggggaaaagAGTACC--CATTC-ATTT--CCCATAGACT------TCAGTG-TT-A-------A-CATTTGAAC-C-TCT-CAC--TAA-TT-----A-AC------------TATA--TT----GA---C-----TT--GAG-AC--AATT--G-A-CTACCAACATTT--GAAAGTT-CGTTC----C-AAG------TGCTACAT------A-AAAAATG--AC-AAA----AAT-TATATAGG--G--T--CCCATGGCTTTTA-TA--GG-T----CAT---AA---TT-ATAC-ATTGTTT-----AA-AACA---C---AC--A----G--A----T---CTGCAG-TA---A------CT-T-ACACCCTT-CAT-TT-CAAAC-AT-AC---CTCA---------------ACCA--T-----G---GCATTTTCCT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTGTGcaa
gi|6                          :               AGTACC--AATTC-ATTT--CCCATAGATC------TCAATG-TT-A-------A-CCTTTGACC-C-TCT-CAC--TAA-CT-----A-AC------------TATA--TT----GA---T-----TT--GTG-AC--AAAT--G-A-CCACCAACAACT--GAAAGGT-CATTC----C-AAGCTTAAGTGCTA-AT------A-AAAAATG--AC-AAA----A---------------------CATGGCGTTTA-TT--GG-T----CAT---AT---TT-GTAC-ATT-TTT-----AA-AACA---C---AC--ACAGAG--A----T---CTGCAA-TA---A------AT-T-AC-------CAT-TT-CAAAC-AT-AC---CCCT---------------ACCA--T-----T---GCAATTTCTT--CGTTCCAT-TC-T-CGATTTTG
gi|7                          :                      agATTC-ATTT--CCCATCAACC------TTA----TT-T-------C-CCATCAACT-T-T----GC--TAAATT-----C-AC------------TATA--TT----GA---C-----TT--TAG-AC--ATAT--G-C-CCTCCAACATTT--GACAGTT-CATTC----A-AAG------TGCTA-AC------A-AAA--TGCCAC-AAA----AAT-TGTATAGG--G--T--CCCATTGCTTTAG-TA--AG-T----CGT---AT---TT-ATACTGTT-TAT-----AACAACA---T---AC--A----AC-A----T---TTGCA-------------------------TT-GAT-TT-CAAAC-AT-AC---CCAT---------------ATCA--T-----G---GTAATTTCCTAAAG-TCAAT-TA-T-CAATTTTGT
gi|8                          :                               TT--TCCATAAACC------GCAATA-CT-ACATTGTAA-CCTTTGGCC-C-TTT-CGC--CAA-TT---------------------------------------------T--TAG-AC--AAAT--T-A-CAACCAATAATT--GAAAGTT-CATTC----C-ACA------TGGTT-AT------T-GAAATTG--AC-AGACACAAAT-TAGA--AG--G--T--CTCGTTGCTTTT----------------------------GAAC-TTT-TTT-----AC-AACA---C---CT--A----GCGA----T---ATTCAT-TA---A------AT-T-ACACCTTT-CAT-TT-CCAAC-A--AA---CCCT---------------ATCA--T-----G---GTACTTTCCT--GGGT-CATATT-T-CAATTTT
gi|9                          :               AGTACT--AATTC-ATTT--CC-ATAGACC------TCAATG-CT-A-------A-CCTTTGGCC-C-TCT-TAC--TAA-TT-----A-AT------------TATA--TT----CA---TTTGGGTT--TAG-AT--GAAT--G-A-CCATCAACATTT--GAAAGTT-TATTCTAATT-AAG------TGCTA-ATA-----A-AAAAACG--TC-AAC----AAT-TATTTAAG--G--T--CCCGCAATGTTTA-TA--GG-TCTGACATATAAT---TT-GTAT-ATT-TTT-----
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GCCAAATAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGTTCGAGTCACAGGTCAGGGGGTTTGGTACTCTATTTTC
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Unaligned ( gi|22 ): TACCATGGTAATTTCTTCATTTATTTCTAGACATACATCATG