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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1294 ) : ACAGTGAAACCTGTCTAA--TCC-GACAT---GCAC---T------GGGAGACAA-A-TTTTN-------T-----G-TCGG-AAT---A-N-ACAGCG---TGT----CGGA-NT-A--AAC---A-GTGT---AAA--A----A-A-------CA-TG-------G-A-A---AT-TGA----A-AAT-GGA---AATT--A-AA-A--T--G----GGTCGGANTGCCC--AG-T-GA------AA--CGG---ATTG--C-ACAG-GTGTC------GGATTAGAC-A-TGTTTTAC
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gi|5 : cACAGTGAAAACTGTCTAA--TCC-Gcactgt
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): CAGAATAAATAGTCTGTTGCATCTGTGAAAGAACGGATGAGGTAGCAGTGCTCAGTAGAGAAACTTGCTTAGGCTGATTTGCACTTGGGCTGGTATCCATA
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lowQualScore : 44 44 1 777 22 22 66 6 2222222 888 0000 6 6 888 88888 99 4444 0 6 88 6 22 888 6 8888 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 6 66 9 9 555555 55 555 99 1 4 1 111111 5 22
consensus : ACAGTGAAACCTGTCTAA--TCC-GACAT---GCACT--GGG--AGACAA-ATTTT-T-------T---GTCG---G-AA-T---A-----CACAGCGTGT----CGG-A-AT-A--AAC---A-GTGT---AAA--A----A-A-------CA-TG-------G-A-A---AT-TGA----A-AAT-GGAA---ATT--A-AA-A--T--G----GGTCGGAATGCCC--AG-T-GA------AA--CGG---ATTG--C-ACAG-GTGTC------GGATTAGAC-A-TGTTTTAC
Reference ( family-1294 ) : ACAGTGAAACCTGTCTAA--TCC-GACAT---GCACT--GGG--AGACAA-ATTTT-T-------T---GTCG---G-AA-T---A-----CACAGCGTGT----CGG-A-AT-A--AAC---A-GTGT---AAA--A----A-A-------CA-TG-------G-A-A---AT-TGA----A-AAT-GGAA---ATT--A-AA-A--T--G----GGTCGGAATGCCC--AG-T-GA------AA--CGG---ATTG--C-ACAG-GTGTC------GGATTAGAC-A-TGTTTTAC
gi|1 : AAACCTGTCGAA--TTCTGA-ATTTTGCACT--GGG--AAACCA-ATTTT-TC------T---GTCT---G--C-T---A-----TA---CTTG-----CTA-A-AT-G--AAC---A-GAGT---AGA--A----ATA-------GA-TG-------G-A-A---AA-CAA----A-AA---AAA---ATT--A-A
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gi|15 : TGAAACCTGTATAA--CCC--ACGT---G-ACTT-GGG--AGACAT--TTTT-T-------T---GTCG---G-AA-T---A-----CACAGCGTGT----CGG-A-AT-A--AAC---A-G--------------------------CA-TG-------A-A-A---AA-TGA----A-AAT--GAA---AGT--A-AA------------GGTCAAATTGCCC--AG-T-GA------AA--CAT---ATTG--C-ATAG-GGATT------GGATTAGAC-A--GTTTTcactg
gi|16 : aAGTAAAGTCTGTTTAA--TCC-GAAAT---G-ACTTTGGT--GGGGAG-GTTTT-TG------T---GTCG---G-AT-T---A-----GATGGAATGT----CAT-A-AT-T----C---A-GTGT---AAA--AGGCCA-C-------CA--G-------A-A-A---A---GA----ACAAT---------TT--G-AA-A--C--G----GAT----ATG--T--AG-A-GA------AA--CAG---ACTG--T-ATAG-GCGTC------ta
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gi|19 : attGTGAAGCCTGTTTTA--TCT-GACAT---GCAAT--GGG--AGACAA-TTTTT-T-------T---TTT--------------------------TTT----T---A-AT-A--CAC---A-GTAT---GAA--A----A-A--------A-TG-------G-T-ATTCAT-T--------------------TT--A-TG-A--TA-G----GGTTGAAATGCCC--AG-T-GG------AA--TAG---ATTgt
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): CAGAATAAATAGTCTGTTGCATCTGTGAAAGAACGGATGAGGTAGCAGTGCTCAGTAGAGAAACTTGCTTAGGCTGATTTGCACTTGGGCTGGTATCCATA