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Reference ( gi|5 ) : GAGAGCA-TT-AATTCA--A-TT---AA--GG--------A-T----AT-----GT--T----GA-----A-T-T-A---AA--GA----TATC-----T------------CC-A--A-T-T----A----T----A---------T---T---G------T-----T---CT--------C--T-TT--A---AA--A---G----A---AT-T-A--TT----G-----CTC-TC--A-----TC--A-AT----T------------G-----------AA--------T-T-----A--A-------C-G---AT--AT---T--G-------T---------T-AA--------T-T--C------A--AT-----------T---------AA----T--G-A-GAG-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---C--------------T--T-------T---------------------T-----A-----------------------A---A------G---------A---------T---ATC-----T-----C-CA-A-------T--T----A---T---A---T----T----G------T-----T---------C--T--------C---TT--------T--A---A------A-A---G---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--AT--------C---A-AT-T-G-----------AA--------T-T-----A--A-------C-G---A-T--AT-T--G------T------T-AA--------T-TC-----------------A--AT-----------TAA----T--G-AGAGC----A-----------A-T-----A---AT---T---C--------------T--T-------T------------T-----A-----------------------A-A------G---------A---------T---ATC-----TC-C-----A-A-------T--T----A---T---A---T----T----G------T-----T---------C----T---C---TT--------T----A---A-------A-A-------------G---------A---ATT-----A-T--T----G-----C-TC--T-C--ATC---A-AT-T-G-----------AA--------T----T-----A--A-------C-G---A-T--AT-T--G------T---------T-A------A--------T-TC-----------------A--AT-----------TAA----T--GAGAG-----C----A-----------A-T-A---AT---T---C--------------T--T---------------------T------------T--A-----------------------A---AGA---------TATC-----TC-C-----AAT----T----A----T----A---T-----T----G-------TT---------C--T---C---TT-----TA---A---A--A-------------G---------AATTA--TTGC-T-CTCATC--AAT-TGAA-TTAACGA
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gi|25 : attatacacaatatttattcgaagaattaatgcgcgcattaatctctatttaagagagagcaatataatcaattaatGAGAGCA-AT-GATATA--A-TT---AG--AG--------A-T----AT-----CT--T----TA-----A-T-TCA---AC--AA----TATC-----T------------AC-A--A-T-T----A---------A-------------------------------------------------TT--A---AA------------------------T----G-----CTC-TC--A-----TT--A-AT----T------------G------------A--------T-T----------------------AT--AT---T--GCTCTCTCT---------T-AA--------A-TAGA------G--AT-----------T---------AA----T--G-C-GCG-C------A-----------T-T-----A---------AT---T---C--------------T--T-------C---------------------G-----A-----------------------AT--A------A---------A---------T---AT
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gi|6 : aaataatgctcatattcttttctaaaaAGAACA-AT-AATTCA--A-TT---AA--TGT-------A-C----AC-----GT--C--------------------------------ATT-----T------------C--A--A-T-T----A---------A---------T-------G------T-----G---CG--------C--A-AT--A---AT--T---G----A---AT-T-A--GT----G-----TTC-TC--G-----TG--A-AT----T------------A-----------AA-------------------A-------C-C---AT----------------------------C-AA--------T-T--C------A--AT-----------G---------GA----A--G-A-GTG-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---CA-------------C--TATGTAA-T---------------------T-----A-----------------------G---T------G---------G---------T---ATC-----T-----T-CC-A-------T--TGA--A---C---A---T---------A------T-----C---------C----------------------------A---A------T-ACT-G---------A---A-TTGATACA-TTC---G-----C-TG--G-C--AT--------T---A-AT-T-C-----------TA--------T-T-----A--A-------T-G---A-T--AT--------------------AA--------T-TC-----------------A---T-----------TAA-------G-AGAGC----A-----------A-T-----A---AT---T---C--------------gagaac
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gi|1 : tcaatgtagtagaattattgctcgcaaaatttaatttgatgctcggtaT-AATTCA--A-TC---AA--AG--------A-T----CT-----CT--T----AAT----A-T-T-A---A---TA----TATC-----T------------TC-A----------------T----A-----------------A------T-----T---CT-----------------------------G----A---AT-T-A--T-----G-----CGC-GC--A-----TT--A-ATA---T------------C-----------AA--------T-T-----G--A-------T-G---AT--AT---C--T-------T---------T-AA--------T-T--CTTTGCGA--AT-----------T---------GA----A--G-A-GCG-C------T-----------A-T-----ATATTGAATTAT---T---C--------------T--TCT-----T---------------------T-----A-----------------------A---AT-----G---------A-------------ATT-----TAAACGC-CA-T-------T--A----A---T---A------------------------------------------------A---TT--------T--A---ATGCGCCG-C---A---------A---A-TTG----A-TT----G-----C-T---T-C--TT--------T---A-AT-T-G-----------AA--------T-T-----A--A-------T-----A-T--AT-C--A------T------TTAA--------T-TC-----------------A--AT------------AA----T--G-CC--C----A-----------A-T-----A---ATA--T---A--------------T--T-----------------------------------------------------------G---------C---------T---CTC-----TT-C-----A-A-------T--T----A-------A---T----T----A------TAATA-T---------CATAAT---C---ATA-------T----A---ATGCGTGCA-A-------------T---------A---ATTGAA--A-T--T----G-----C-TC--T-C--ATT---A-AT-T-G-----------AA--------T----T-----A--A-------T-A---T-T--AT-C---------T---------T-A------A-----------C-----------------A--TT-----------AAA----T--GAGAG-----C----A-----------A-T-A---AT---TA--C--------------T--T---------------------T------------T--AGAAGCAATAATAAATT-------A---AGA---------TATC-----TTAT-----AATACAAC----A----T----A---TCCATAT----GAATTAATTC---------C--T---C---TT-----T----A---A--T-------------T---------AATTA--TTGC-T-CTCTGT--AAA-TGAA-TTA
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gi|18 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagT-----AT--T----CA-----A-T-T-A---A---GA----TATC-----T------------TT-A--A-T-T----A----T--------------T---T---A------CAGCACT---TT--------A--T-TT--T---AA--G---G----A---AT-T-A--AT----G-----CGC-AC--A-----TT--A-AT----T------------C-----------AC--------T-T-----A--A-------A-G---AG--AG---C--A-------A---------T-AT--------T-T--C------A--AT-----------T---------AA----A--G-A-GAG-C------A-----------T-T-----A---------AT---T---C--------------A--A-------T---------------------T-----A-----------------------T---G------G---------A---------T---AAG-----T-----T-GA-A-------T--T----A---aagaattaaagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
gi|13 : tcaatgtagtagaattattgctcgcaaaatttaatttgatgctcggtataaatgatttaatgatctctttT--T----CA-----A-T-T-A---AA--GA----TATC-----T------------TT-A--A-T-T----A----T----T---------C---A---G------C-----A---GC--------A--T-TT--ATATAA--G---G----A---AT-T-A--AT----G-----CGC-GC--A-----TT--A--T----T------------C-----------AT--------T-T-----A--AAGAGAG-C-A---AT--AT--------------------------AA--------T-T--C------A--AT-----------T---------AA----A--G-A-GAG-C------A-----------T-T-----A---------AT---T---C--------------C--T-------TATGGA----------------T-----ATGTTGAATT--------------A---A------G---------A---------T---ATC-----T-----T-TA-A-------TA-T----AT--T---A---T----T----G------T-----C---------T--T--------C---TT--------T--A---A------A-A---G---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--AT--------T---A-AA-T-G-----------AA--------T-T-----A--A-------T-G---A-T--a
gi|35 : gtggaattattgctcgcaatatttaattttatgctcggtataaatgatttaatgattctttaa----GA-----A-T-T-A---AA--GA----TATC------------------------A-T-T----A----TTAAAA---------T---T---A------T-----T---TT--------G--T-AT------------------------T-T-A--TT----G-----CAC-GC--A-----TT--A-AA----T------------G-----------AA--------T-T-----A--A-------A-G---AT--A
gi|6 : gagcaataattcaattatacatgtagcgctaatcaattccgcaaaaA-----A-T-T-A---AT--GA----TATC-----T------------TC-A--A-T-T----C----T----T---------C---T---G------A-----T---CTGAAGTGCGC--T-AT--A---AT--T---G----A---AT-T-A--TT----G-----CTC-TC--------TT--A-A-----T------------G-----------AA--------T-T----------------------AT--AT---C--A-------T---------T-AA--------T-A--G------A--AT-----------T---------AA----T--G-C-CAG-CG-----A-----------A-TGTATCA---------AT---T---CAGTA----------T--TGGATATGT---------------------TCAATGG-----------------------A---A------G---------A---------T---ACC-----A-----C-TA-A-------T--T----A---C---A---T----A----G------T-------------------------------------------------------------G---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-AC--T-C--TT--------C---C-AT-T-G-----------AA--------T-T------------------G---A-T--GG-T--T------T------T-AA--------T-TC-----------------------------------A----C--G-AGAAC----A-----------C-T-----A---AT---T---CAA------------T--TA------T------------T-----G-----------------------C-G------C---------A---------C---AT---------T-----A-A-------T--TGAA-A---T---G---A----C----G------T-----G---------T----A---C---AT--------T----A---A-------T-T-------------G---------A---ATT-----A-T--T----G-----T-TC--T-T---TC---G-AT-T-G-----------AA--------T----C-----T--C-------C-----------T-T--G------------------------------------------------------------------------GA----T--GAGAG-----C----A-----------A-C-A---AT---T---C--------------
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gi|22 : aagtgttgtaattaatttgaaatatctcgagggaattgaagagattaacaaattatatagactgagctccaaatttgcaagctctgatcctacgtcaatgcatgatgaaagtaataattgaattaatgtgccatcaaa--T-TT--A---AA--ATGGG----A---GT-T-AG-TTAGGGG-----ATC-TCCTA-----TT--ACATA---T------------G-----------AA--------T-T-----A--A-------T-G---AT--AT---C--A-------T---------T-AA--------T-T--C------A--AT-----------T---------AA----A--G-A-GAG-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---C--------------A--A-------T---------------------T-----A-----------------------T---A------G-------------------C---GTC-----T-----T-CA-A-------T-------------------T----C----G------------------------------------------------G--A---A------A-A---G---------A---A-TT-----A-AA----G-----A-TA--T-C--AT--------C---A-AT-T-G-----------AA--------T-TATGTGA--A-------C-----A-T--A---------------------AA--------TATCAG---------------A--AT-----------TAA----A--G-ATAAC----A-----------T-T-----A---AT---T---A--------------T--T-------T------------
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gi|10 : tcttcaaataattaatgatatcttcaattcttctgatctgaagtgcgctataatt---G----A---AT-T-A--TT----G-----CTC-TC--A-----TT--A-AT----T------------G-----------CA--------T-T-----AT-G-------C-GC--GC--AT---T-----------------------A--------T-T--C------A--AT-----------T---------AA----A--G-A-G-G-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---------------------------------------------------------------------------------G---A------A---------T---------T---ATT-----G-----C-GACA-------C--T----A-------A---T----T---------------------------------------C---AT--------T--A---A------A-G---G---------A---G----------------G-----------T-C--AA--------T---A-AT-C-G-----------AA--------T-T-----A----------------------T-T--G------CGCGCACT-AA--------T--C-----------------A--AT-----------TAA----T--G-AGAGC----A-----------A-T-----A---aatcatagggctcatcaactcagcagaatgattaatgcgcgcaattgttcagaaaggaagaagtttataattttaaaattttt
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gi|8 : tcaatgtagt----A---AT-T-A--TT----G-----CTC-TC--T-----TC--A-GT----T------------G-----------AA--------T-T-----A--A-------T-G---AT--AT---C--A-------T---------T-AA--------T-T--C------A--AT-----------G---------GA----T--ACA-GA--C------A-----------A-T-----C---------AT---T---------------------------------------------------------A-----------------------A---ATT----G---------A---------T---ATCATTAAT-----T-CA-A-------T--C----A-------A---T----A----A------T-----A---------C--G--------C---TT--------A--A---T------A-ATT-G---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--TA--------C---A-AT-----------------------------------------------------------------------------AA--------T-TC-----------------A--AT-----------TGA----T--G-CGCGC----A-----------A-T-----A---AT---T---A--------------TA-T-------TCGAGGGAGAAGCT-----A-----------------------G-A------G---------A---------T---ATC-----TT-C-----A-A-------T--TTAAGA---T---A--------T----A------T-----C---------C----A---G---TT-------------------------A-T-------------G---------A---ATT-----A-T--C----G-----C-TC--T-aattatggataagttgaattaa
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gi|2 : acgcccctgaattcatatgatatgaagcgcattaattcagatgtatttaatgcgcgT-T-A--TT----G-----CGA-TC--A-----TT--A-AT----T------------G-----------AA--------C-T-----C--T-------T-G---AT--AG---C--A-------T---------T-AA--------T-T--T------A--AT-----------TATTTTGCTGAA----TT-G-ACGAG-C------GTT---------A-T-----A---------AT---T--------------------------------------------------------------------------------------------G---------A--------------------------------A-------T--T----A---T------------T----G------A-----T---------C--T--------C---TT--------C--A---A------A-T---A---------A---A-TC-----A-AT----A-----------T-C--AA--------C---A-AT-T-G-----------AA--------T-C-----A--A-------------------------------T------T-CG--------C-AC-----------------A--AT-----------AAA----A--G-AAAGT----A-----------A-T-----A---------------------------------------------------T-----A-----------------------A-A--------------------------T---AAT-----TT-C-----A-A-------T--T----A---C---A---T---------G------T---------------------------------------------------------------------------------A---AT----------------G-----C-AG--A-C--ATT---G-AT-T-C-----------AA--------T----T-----A--A-------C-G-----TCCAT-T--G-------------------------A--------T-TG-----------------A--AT-----------TGA----T--GAAGA-----C----A-----------A-T-A---AT---T----------------------------------------------------------------------------------------GA----------AT---------C-----GATGG--T----A---------A---T-----T----G-------TA---------A-----------------TA---A---A--AT------------C---------AATTA--TTGC-T-CTCATC--GAT-TGAA-TTAATgaa
gi|7 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgcatcaaatcaattattgctatcgatatcgtggatttggatgcgcg-A--TT----G-----CTC-TC--T-----TC--G-AA----T------------G-----------AA--------T-T-----G--AAG-----C-G----T--GT------A-------T---------T-AA--------T-T--C------A--AT-----------T---------AA----T--G-C-GCG-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---A--------------A--T-------T---------------------T-----A-----------------------T---T------G---------C---------T---TCC-----T-----T-CA-G-------T--T----G---A---A---T----T----A------A-----T---------A--G--------A---TG--------C--G---AGCAG--A-A---GTTG------A---A-TT-----T-TT----G-----C-TC--T-T--TT--------C---A-AT-C-G-----------AT--------T-T-----A--A-------T-G---A-T--AT-C--A------T------T-AT--------T-TT-----------------A--AT-----------TAA----T--G-CGCGC----A-----------C-C-----A---GT---T---C--------------T--T-------T------------T-----A-----------------------G-A------G---------G---------G---AGC-----AC-CTATATA-A-------C--T----A---TC--A---A----T----A------T-----C---------T----T---CAATTT--------T----A---A-------A-A-------------G---------A---ATT-----A-A--T----G-----agcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|17 : tgattcaatttatgcccgcattaatgtggtgaaatttttaatttggagctcgctataaatgatttgatgattttattccattggagatatctttaagtatctacaaagcttttgtatacggactttacacgca-A--TT----G-----CTC-TC--A-----TC--A-AT----T------------G-----------AA--------A-T-----A--A-------T-G---CG--CG---C--A-------C---------T-AA--------T-T--CA-----A--AT-----------T---------GA----T--G-A-GAG-C--------------------------A---------GT---T---A--------------T--T-------T---------------------T-----A-----------------------AT--A------G---------A---------T---TT---------------G-A-------TGGC----A---C---A---T----TA---A------T-----T---------C-------------------------------------------------------A---A-TT-----A-TT----A-----C-TT--T-C--AT--------C---A----T-G-----------CA--------T-T-----G--A-------C-G---ctaaa
gi|46 : aagtgttgtaattaatttgaaatatctcgagggaattgaagagattaacaaattatatagactgagctccaaatttgcaagctctgatccta-A--TT----G-----CTC-CT--A-----TC--A-AT----T------------T-----------AA--------T-T-----A--A-------T-G---
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gi|23 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgcatcaaatc-----TC--A-TT----T------------G-----------A---------T-T-----A--ATA-----C-GT--GC--AT---TTAA-------T---------T-CA--------T-T--C------A--AT-----------T---------AA----T--G-A-GAG-C------A-----------A-T-----G---------AT---T---C--------------A--T-------T---------------------T-----A-----------------------A---tctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaattgattcaattgttgatattgatttatttgaagagatcaataattcaattataacgctcgtcaattcagcaaaataattaaattaatgctatcaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|4 : taattaaagagagcaatagttgatttgttcgcattaattcaatggaagagagcataattaagC--A-AT----T-------------------------A--------TAT-----A--C-------C-G---GT--A-------A-------T---------T-AA--------T-T--A------A--AT-----------T---------AA----T--G-A-GAG-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---CTT------------T--T-------T---------------------T-----A-----------------------A---A------G---------A---------G---AGCAACAAT-----A-TA-A-------T--TAGAGA---T---A---T----C----T------T-----TAAATCAACAT--T--------T---TT--------T--A---A------ATT---G---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--TT--------T---A-AA-T-G-----------AA--------T-T-----A--A-------T-G---tgggcgcattagatctagttcgtggtggaatttttgctcgcaaaatttaatttaatg
gi|4 : cgca--A-AT----T------------G-----------AA--------T-T-----ATTG-------C-G---AC--A---------------T---------T-AA--------T-T--C------A--AT-----------T---------AA----T--G-T-GCA-C------T-----------T-T-----A---------AT---T---C--------------A--T-------T---------------------T-----A-----------------------A---A------G---------A---------G---AGCAATAAT-----T-CA-A-------T--T----A---T---A---A----C----A------C-----T---------C--T--------TCAATT--------C--AGC-A------A-A---G---------A---A-TT-----A-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaataattgaattattgcgacattaattcaattaatgtgcactttaattcatttaaagagagcaataattcaattataacactcttcaattcagcaaagaattaaagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
gi|42 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaat--A-AT----T------------G-----------AT--------T-T-----A--A-------T-G----T--GCG--T--A-------T---------G-AA--------T-T--C------A--AT-----------T---------GA----A--G-A-GAG-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---G--------------A--A-------T---------------------T-----A-----------------------A---T------G---------A---------T---GTC-----T-----aagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
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gi|4 : aagtgttgtaattaatttgaaatatctcgagggaattgaagagattaacaaattatatagactgagctccaaatttgcaagctctgatcctac-------T---------T-AA--------T-T--C------A--TT-----------T---------AA----A--G-A-GAG-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---CAATTTAAAAAATGTTGAT-------T---------------------T-----A-----------------------A---A------G---------A---------T---ATC-----T-----C-TA-A-------T--T----A---T---A---T----T----G------T-----TGCT------C--T--------C---TT--------T--A---A------A-AAA-G---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--AT--------T---A-AT-T-T-----------AA--------T-T-----A--ATTAC---C-G---G-T--AT-
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gi|40 : gcgcgca-------T---------T-AA--------T-T--C------A--AG-----------T---------AA----A--G-A-GAG-C------A-----------A-T-----A---------AT---T---tgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatataatgcagagcaataattgaattattgcgcgcactaattcatttaaagagagcaataattgaattat
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gi|4 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaataatt---G---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--TT--------T---A-AA-T-G-----------AA--------T-T-----A--A-------A-GTGCA-C--AT-T------------------AA--------T-TG-----------------A--AT-----------TAA----T--G--TCGC----A-----------A-T-----A---AT---T---C--------------cagcaaagaattaaagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
gi|3 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaataatt---G---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--CT--------C---A-AT-T-C-----------AA--------T-TT----A--A-------T-G---A-T--AT-T--A------T------T-CA--------T-AC-----------------A--AT-----------GGA----T--G-TGAAC----A-----------A-T-----A---AT---T---G--------------T--T-------T------------T-----A-----------------------G-A------G---------T---------G---AGC-----T----------A-------T-----------T---A---T----T----G------C-----T---------C----T---C---aattataacactcttcaattcagcaaagaattaaagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
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gi|8 : tat---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--TT--------C---A-GT-T-G-----------AA--------T-T-----A--A-------T-G---A-T--AT-C--A------T------T-AA--------T-TC-----------------A--AT-----------GGA----T--ACAGA-C----A-----------A-T-----C---AT---T------------------------------------------------A-----------------------A-ATT----G---------A---------T---ATCATTAATT-C-----A-A-------T--C----A-------A---T----A----A------T-----A---------C----G---C---TT--------A----A---T-------A-ATT-----------G---------A---ATT-----A-T--T----G-----C-TC--T-C--TAC---A-AT-----------------------------------------------------------------------------------A------A--------T-TC-----------------A--AT-----------TGA----T--GCGCG-----C----A-----------A-T-A---AT---T---A--------------TA-T---------------------TCGAGGGAGAAGCT--A-----------------------G---AGA---------TATC-----TT-C-----AAT----TTAAGA----T----A---------T----A-------TC---------C--A---G---TT--------------A--T-------------G---------AATTA--TCGC-T-CTttagattaatggcacattaagttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgctctcattaattcaattaatgctcgcattaatgtagtggaattattgctcgcaatatttaattaatgctcggtataaatgatttaatatctctttaattcattaaagatatctttaattattt
gi|11 : tctgtaattatttacaacgcctttatataaagaattaatgcatacagtaactcttttttttattaa---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TCCCT-C--AT--------T---A-AT-T-C---------------------T-T-----A--AAGAGAG-C-A---A-T--A-----A------T------T-AA--------T-TC-----------------T--TG-----------TAA----A--G-AGAGC----A-----------A-C-----T---AT---A---T--------------G--A-------T------------T-----A-----------------------A-A------G---------A---------T---ATC-----GT-T-----A-A-------T--T----agattactgcgacctttactcaaattaatgcatgctttgaattcatttgaagagagaaataattaaaaattg
gi|42 : aattcattagcggatatgtta---------A---A-TT-----A-TT----G-----C-TC--T-C--TT--------C---A-AT-T-G-----------AA--------T-TC----AT-A-------C-GC--A-C--A------------T------T-AA--------A-TC-----------------A--AT-----------Tgaattattacgttcgtcaatggtgttaagtaatgataccattaattcaatggaagagagcaataattgatttattgagcgctttaattcatttaaaaaagcaataattcagctatagcgcgccccatttcagcagaaaaattaatgatatgaattaaattaatcattaattatttcaagatat
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gi|46 : aagtgttgtaattaatttgaaatatctcgagggaattgaagagattaacaaattatatagactgagctccaaatttgcaagctctgatccta-----A-TT----G-----C-TC--C-T--AT--------C---A-AT-T-T-----------AA--------T-T-----A--A-------T-G---
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gi|13 : gtagtggaattattgctcgcaaaattttaatttaatattcagta--T-C--AT--------T---A-AT-T-C-----------AT--------T-T-----A--A-------T-G---A-G--AG-C--A------A------T-AA--------T-TC-----------------T--TT-----------TAA----A--G-AAGAC----A-----------A-T-----A---A----T---A--------------T--A-------T------------T-----A-----------------------A-A------G---------A---------T---ATC-----T--T-----A-A-------T--TCAACA---T---A--------------------------T---------C----C---A---T------------------A-------A-G-------------G---------A---ATT-----A-A--T----G-----C-TC--T-C--TTT---A-AT-T-G-----------AA--------T----T----------------------A-T--AT-T--GCTCTCTT---------T-A------A--------A-TG-----------------A--A------------TAA----T--GCGCG-----C----A-----------T-T-A---AT---T---C--------------C--TTATATAAATGCTGCTGAATAAT------------T--A-----------------------A---AGA---------TATC-----TT-T-----AAT----T----G----A----A---T-----T----------------------------------------------A---A--A-------------G---------AATCA--TT
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gi|33 : aatttggagctcagtctatataatttgttaatctcttcaattccctcgagatatttcaaattaattacaacacttttgtaaagtgatcatttcttttgttttataatgagcaattgacgacattcga---------C----T---C---TC--------T----A---A-------T-T-------------G---------A---ATT-----G-T--T----G-----C-TC--T-C--TTC---A-AA-C-G-----------AA--------T----T-----A--A-------gcgcatta
gi|22 : tgaatttatgcgcacattgatagaaagactgcgtgct---TT--------T----A---A-------A-ATGG----------G---------A---GTT-----AGT--TAGGGG-----A-TC--T-CCTATT---ACATAT-G-----------AA--------T----T-----A--A-------T-G---A-T--AT-C--A------T---------T-A------A--------T-TC-----------------A--AT-----------TAA----A--GAGAG-----C----A-----------A-T-A---AT---T---C--------------A--A---------------------T------------T--A-----------------------T---AG----------CGTC-----TT-C-----AAT-----------------------T-----C----G------------------------------------GA---A---A--A-------------G---------AATTA--AAGA-T-ATCATC--AAT-TGAA-TTAtctgtaatctcgttttagcaaacaggaaagaaatttat
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gi|29 : gcgcgca--------T----A---A-------A-A-------------TC--------A---ATT-----A-T--T----G-----C-TC--T-C--ATC---A-AT-T-G-----------AA-------------------A--G-------T-G-----T---T-T--A------T---------T-A------A--------T-TC-----------------A--AC-----------TGA----A--GAGAG-----C----A-----------A-T-A---ATTGAT---C--------------T--TTATATAA--------------T------------T--A-----------------------A---TGA---------T-----------------AAT----T----A----T----A----------------------TT---------CAAT---T---TT-----TA---A---A--A-------------cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatataatgcagagcaataattgaattattgcgcgcactaattcatttaaagagagcaataattgaattat
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gi|11 : tcaatgtagtagaattattgctcgcaaaatttaatttgatgctcggtataaatgatttaatgatctcttttattcaattaagatatctttaattatttacagcacttta---------A---ATT-----A-T--T----G-----C-TCCCT-C--ATT---A-AT-T-C---------------------T----T-----A--AAGAGAG-C-A---A-T--A-----A------T---------T-A------A--------T-TC-----------------T--TG-----------TAA----A--GAGAG-----C----A-----------A-C-T---AT---A---T--------------G--A---------------------T------------T--A-----------------------A---AGA---------TATC-----GT-T-----AAT----T----aattatggataagttgaattaa
gi|42 : aattcattagcggatatgtta---------A---ATT-----A-T--T----G-----C-TC--T-C--TTC---A-AT-T-G-----------AA--------T----TC----AT-A-------C-GC--A-C--A------------T---------T-A------A--------A-TC-----------------A--AT-----------Tgaattattacgttcgtcaatggtgttaagtaatgataccattaattcaatggaagagagcaataattgatttattgagcgctttaattcatttaaaaaagcaataattcagctatagcgcgccccatttcagcagaaaaattaatgatatgaattaaattaatcattaattatttcaagatat
gi|40 : gagtaaa---------A---ATT-----A-T--T----G-----C-TC--T-C--TTT---A-CT-T-G-----------AA--------T----T-----A--A-------T-G---gaattaatgatgtctttgaata
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gi|46 : aagtgttgtaattaatttgaaatatctcgagggaattgaagagattaacaaattatatagactgagctccaaatttgcaagctctgatccta-----A-T--T----G-----C-TC--C-T--ATC---A-AT-T-T-----------AA--------T----T-----A--A-------T-G---
gi|15 : agcaacaattgaattaatgcgcgcatcaaatcagcc----G-----C-TC--T-C--ATT---A-AC-T-G-----------AA--------T----G-----A--A-------T-G---A-T--AT-C--A------T---------T-A------A--------T-CC-----------------A--AT-----------TAA----T--GAGAG-----C----A-----------A-T-A---AT---T---C--------------T--T---------------------T------------T--A-----------------------A---AGA---------GAGCAATAATA-T-----AAT----TAAAGA----T----A---T-----C----T-------TT---------CA-TTAAC---TTATCCATA---A---T--A-------------G---------AATTA--ATGC-T-CTC-TT--AAT-TGAA-TTAcgcgc
gi|12 : ataatgatttaaatgatctcttttattcaattaaagatatctttaaattatttacaacacttttatttaaggaattaatgcgcacattaattcatttaaagagagcaa----G-----C-TC--T-C--ATT---A-AC-T-G-----------AA--------T----G-----A--A-------T-G---A-T--AT-C--A------T---------T-A------A--------T-CC-----------------A--AT-----------TAA----T--GAGAG-----C----A-----------A-T-A---AT---T---C--------------T--T---------------------T------------T--A-----------------------A---AGA---------
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gi|42 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaat---A-AT-T-G-----------AT--------T----T-----A--A-------T-G-----T--GCGT--A------T---------G-A------A--------T-TC-----------------A--AT-----------TGA----A--GAGAG-----C----A-----------A-T-A---AT---T---G--------------A--A---------------------T------------T--A-----------------------A---TGA---------TGTC-----Taagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
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gi|44 : tttaaaatgggagttagttaggggatctcctattacatatgaattaatgata--AT-T--A------C---------T-A------A--------T-TC-----------------A--GT-----------TAA----A--GAGAG-----C----A-----------T-T-A---CT---T---C--------------A--T---------------------T------------T--A-----------------------T---GGACATATATACTATC-----TC-T-----AAT----T----A----T----G---T-----A----G-------TT---------atttaa
gi|4 : g------T---------T-A------A--------T-TC-----------------A--TT-----------TAA----A--GAGAG-----C----A-----------A-T-A---AT---T---CAATTTAAAAAATGTTGAT---------------------T------------T--A-----------------------A---AGA---------TATC-----TC-T-----AAT----T----A----T----A---T-----T----G-------TTGCT------C--T---C---TT-----TA---A---A--AAA-----------G---------AATTA--TTGC-T-CTCATT--AAT-TTAA-TTAAgct
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Reference ( family-1103 ) : GAGAGCANT-AATTCA--ATTAN--GG---ATAT-G-T--T-G-AA-TT-A---A------A--G-----ATAT---C---------------------T----T-T-----A-----A-TT----A---T----A--------------T---T--GC------T-----CTC--T--TT--A----AAN---------------------G-AAT-T---AT-T--G-----C-TC-TCATT--A-A------T-----------TG--A-A--------TT----A----A-T---G------AT----A-T------C-G--T-------------T-AA-----T-----------T-----C-----A---A-----T-TA---------A---T-----G-A--------GAGCAAT-A----AT-T----C--N-------------T--------------T-----TA-----------------------A---A------G----A---------TAT---C-----T-----TCAAT-T-A--T----AT---T-----GTT---C--TCTT--TA---A---AA----G-----------A---------AT--------TAT----T--GCT---------CT-CATT-------AA-T-----------TGA--AT--T--A-ACG-A------T-A-----T-------------C-------------G---T--T---A---A-T-TC--AA-TTAA----TGAGAGCAAT---A-ATT---C--T-T------T------------TA---------A-AGA-TATCT-TCAAT-T----A-T--A-T----TGTT----CT--------C-TTTAA---AA--G---------A---------AT---------T-----AT-T-GCTC-T-------C-A-TTAAT-------T------G-AATT-AATG-ATAT---CG--TT-A-ATTCA---ATTA-A----TG--------AGA-G---C------AAT-----AATT-C-------TT--T-------TA--A-A--GAT----ATC--TTCAAT----T-ATAT----T--GTTCTCTTTA---AAN--GAATT-A--T--T-GCTCT-CAT---TAA------TTGAATTAATGA
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gi|1 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattaT-AATTCA--ATTAA--GAT--ATCT-G-T--T-A-AA-TT-ATTTA------C--G-----CGAT---T---------------------T------------------A-TT----A---T----AGGAA----------T---T--AA------T-----GCC--T--TT--G----AAT---------------------A-GCT-CGACAT-C--G-----C-TC---AT---A-A------T-----------TC--A-T--------TT----A----C-A---G------AG----A-G------C-A--A-------------T-AA-----T-----------T-----------A---A-----T-TA---------A-----------A--------GAGGAATTA----AT-T----C--A-------------TATGGATATGTTGTAT-----TAT----------------------A---A------G----A---------TAT---C-----T-----T-AAT-T----T----AT---T-----ATT---G--CTTC--TA---A---AA----GT----------A---------AT--------TAT----T--GCT---------CT-CATT-------TA-A-----------TG----T--T--A-A-G-A------T-A-----A-------------T-------------A---T--T---A---A-T-TC--AA-TTAA----TGAGAGCAATTTCA-ATT---A--T-T------G------------CA---------C-GCATTATAT---GAT-T----A-T--G-A----TATT----AT--------A-ATTAATTGAA--G---------AGAGCAATATAT---------T-----AT-T-G--G-G-------C-A-TT-AT-------T------G-AATTAAATG-ATAT----A--TT-A-ATTCA---ATTA-A----AG--------A-A-G---C------AATC----AATT-gagagcaatatattattgggcattattgaattaaatgatatattaattcaattaaagaagcaatcaatttgcggcgcattaaattattaatggcgtttaaattcatttaaagaagaataattcaatatatagcgctcttcaattcgcaaagaattaaagatatcatcaattgatattaatgcgcgcataattcagaattatgaagatatattaatattaagagatctttgattgaattatggcgcattaaataattaagatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|1 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattataattcaattatatgcgttgcaattaatgtcgtggctatgtttgcttcgcaatattaattcggtataaaatgatttaatgatctctttATT-AATTCA----TAT--GG---ATAT-G-T--T-G-TA-TT-AT--A------A--G-----ATAT---C---------------------T----T-A-----A-----T-TT----A---TT---A--------------T---T--GC------T----------T--CT--A----AAA---------------------GTAAT-T---AT-T--G-----C-TC-TCATT--T-A------A-----------TG-------------TT----A----A-----G------AT----A-A------T-A--T-------------T-AA-----T-----------T-----C-----A---A-----T-TA---------A---T-----G-A--------GAGCAAT-------T-T----C--A-------------A--------------T-----TATTGC-------------------A---C------GCATTA---------TAT-----------------GAT-T-A--T----GA---T-----ATT---A--TAAT--TA---ATTGAA----G-----------AGAGCAATATAT--------TAT----T--G-----------GG-CATT--------A-T-----------TGA--AT--TA-A-ATG-A------T-A-----T---------------------------A---T--T---A---A-T-TC--AA-TTAA----AGA-AGCAATC--A-ATT---T-----------------------------------G-CGG-CGCAT-TAAAT-T----A-TTAA-TGG--CGTTTAAATT--------CATTTAAAG-AA--G---------A---------ATAATTCAATAT-----AT-A-GCGC-T-------C-T-TCAAT-------TCGCAAAG-AATT-AAAG-ATAT---CA--TC-A-ATTGAT--ATTA-A----TG--------CGC-G---C-------AT-----AATT-CAGAA---TT--A-------TG--A-A--GAT----AT-------AT----TAATAT----TAAGAGATCTTTG---ATT--GAATT-A--T--G-G--CG-CAT---TAA------AT-AATTAAtgcggcgcattaaattattaatggcgtttaaattcatttaaagaagaataattcaatatatagcgctcttcaattcgcaaagaattaaagatatcatcaattgatattaatgcgcgcataattcagaattatgaagatatattaatattaagagatctttgattgaattatggcgcattaaataattaagatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|10 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattataattcaattatatgcgttgcaattaatgtcgtggctatgtttgcttcgcaatattaattcggtataaaatgatttaatgatctcttttaattcaattaagatatctgttaaattatttacgcgatttattataggaattaatgcctttgaatagctcgacatcgctcataattcatttacagagagcaataattaattaaagaggaAT---------------------G-AAT-T---AT-T--G-----C-TC-TCATT--A-A------T-----------TG--C-A--------TT----A------T---G------CG----C-G------C-A--T-------------T-A------T-----------T-----C-----A---A-----T-TA---------A---A-----G-A--------G-GCAAT-A----AT-T----G--A-------------A--------------T-----TATT---------------------G---C------G----A---------CA----C-----T-------AAT-T----C----AT---TAAAG-GAG---G--TCAA--TA---A---TC----G-----------A---------AT--------TAT----T--GCG---------CG-CACT-------AA-T-----------C-A--AT--T--A-ATG-AGAGCAAT-A-----TTAGATTAATGGCAC-------------A---T--T---A---AGT-TC--AA-NNNN----NNNNNNNNNN---N-NNN---N--N-N------N------------NN---------N-NNN-NNNNN-NNNNN-N----N-N--NNT----TGCT----CT--------C-ATTAA---TT--C---------A---------AT---------T-----AA-T-GCTC-G-------C-A-TTAATGTAG---T------GGAATT-ATTG-CT-----CG--CA-ATATTTA---ATTA-A----TGCTCGGTATAAATGATTT------AAT-----ATCT-C-------TT--TAATTCATTA--A-A--GAT----ATC--TTTAAT----T-ATgatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|11 : t-AATTCA---TTAGC-GG---ATAT-G-T--T-A-AA-TT-A---A------C--G-----ATAT---CTTTAATCATATAGTTGCTCTCT----T-T-----ACAAGAA-TT----AAT-T----A--------------T---T--GC------T-----CTC--T--TT--A----AGAATTAATGAGGGAGCAATAATTG-AAT-T---AT-T--A-----C-GT-TCGTC--A-A------TGG---------TGTTA-A--------GT----A----A-T---G------AT----A-C------C-A--T-------------T-AA-----T-----------T-----C-----A---A-----T-GG---------A---A-----G-A--------GAGCAAT-A----AT-T----G--A-------------T--------------T-----TA-----------------------T---T------G----A---------GCG---C-----T-----TTAAT-T----C----AT---T----------------TA--AA---A---AA----GC----------A---------AT--------AAT----TCAGCTATAGCGCGCCC-CATTTCAGCAGAA--------------AA--AT--T--A-ATG-A------T-A-----T---------------------------G----------A---A-T-TA--AA-TTAA----T-----CATT---A-ATT---A--T-T------T------------C----------A-AGA-TATtt
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gi|12 : ggtaT-A-T--T-C-AA-TT-A---A------A--G-----ATAT---C---------------------T----T-T-----A-----A-TT----A---T-------------------T---T--ACAA----C-----CCT--T--TT--ATTTTAAG---------------------G-AAT-TT--AA-T--G-----C-GC-ACATT--A-A------T-----------TT--C-A--------TTTTAAA----A-G---G------A----------------G--CA------------T-AA-----T-----------T-----C-----A---------T-TA---------AAGAT-----G-A---------AGCAATTA----AT-T----C--T-------------TA-------------T-----TATGGTTGATAATTGGTAATGACATA---A------G----A---------TAT---C-----T-----TTAAT-T-A--T----AT---TATT--GCT---C--TCTT--TA---A---AA----G-----------A---------AT--------TAT----T--GCT---------CT-CATT-------AA-T-----------TGG--AT--T--A-ATG-A------T-A-----T-------------C-------------A---T--T---C---A-T-TC--AG-TTAA----TGAGAGCatttacaacccttttattttaaggaatttaatgcgcacattaatttcattttaaaaggagcataattcattaaagatgaagcaattaattcttattatggttgataattggtaatgacataagatatctttaattatattattgctctctttaaaagaattattgctctcattaattggattaatgatatcattcattcagttaatgagagc
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gi|16 : ataatgatttaaatgatctcttt-AAT-A---AT-T--G-----C-AC-ACGTT--G-A------T-----------TG--A-A--------TT----AGTTAA-T---GC-----AC----A-C------T-T--T-------------G-AA-----------------------C-----A---A-----T-TA---------A---TTTGAAG-A--------GAGCAAT-A----AT-TAGACC--A-------------T---------------------------------------------A---A------C----A---------TG----C-----T-----TCAAT-T-A-------AT--------------------TT--GA---A---GA----GAGCAATACTTAA---------AC--------TATAACGT--GCT----------T-GATTTC-----AA-C-----------AGA--AT--A--A-ACC-T------T-ATTTTGT-------------C-------------A---T--C---A---A-T-TC--AA-TTAA----TGCGCGTAAT---A-ATG---CAGA-T------T------------TG---------G-AGA-TATGA-TTAAT-T----A-T--
gi|17 : agagagcaataattatc------C-G--T-------------C-AA-----T-----------G-----C-----A-----------TG---------A---T-----G-A--------AAGTAAT-A----AT-T----G--A-------------A--------------T-----TA-----------------------A---T------G--------------TGC---C-----A-----TCAAA-T-C--T----AT---T------------------------------A----A-----------A---------AT--------AAC----T--GCT---------CT-CATC-------AATT-----------TGA--AT--T--A-GTG-C------G-C-----G-------------C-------------A---T--T---A---T-T-TC--AA-TTGA----TGAGAGCAAT---ta
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gi|2 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgcatcaaatcT-T---AT-T--G-----C-GA-TCATT--A-A------T-----------TG--A-A--------CT----C----T-T---G------AT----A-G------C-A--T-------------T-AA-----T-----------T-----T-----A---A-----T-TATTTTGCTGAA---TT----G-AC-------GAGCGTT-A--------------------------------------------------TA-----------------------A-------------------------------------T-----TGAAT-T-A--T---------T-----GAT---C--TCTT--CA---A---AT----A-----------A---------AT--------CAA----T--A------------T-CAAC-------AA-T-----------TGA--AT--C--A-AT-----------------T-------------C-------------G---C----------A----C--AA-TAAA----AGAAAGTAAT---A--------------------------------TA---------A-A---TAATT-TCAAT-T----A-C--A-T-----GTA----ATGCAGA---C-ATTGA---TT--C---------A---------AT---------T-----AA-C-G-TC---------C-A-TTGAT-------T------G-AATT-GATG-AAGA---CA--AT-A-ATTGA---ATCG-A----TG------------------------GT-----AATT-G-------TA--A-------TA--A-A--A------------TCAAT-------TAT----T--GCTCTCATCG---ATT--GAATT-A--A--T-GCGCG-CAT---tctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaattgattcaattgttgatattgatttatttgaagagatcaataattcaattataacgctcgtcaattcagcaaaataattaaattaatgctatcaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
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Reference ( family-1103 ) : GAGAGCAAT-AAT--TCAATTA-N--GG-ATAT--GT-------T-G-AA-TT-A---AAG-----ATATC-----T----T-T-----A--A-TT---A---T----A--------------T---T--GC------T-C-T--------C--TTT--A---AAN--G----A-AT-T---ATT--G-----C-TCTC-ATT--A-A------T-----------TG-A--A--------TTAAT---G------AT----A-T------C-G--T-------------T-AAT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-AT---G-A--------GAG-C-A-AT-----A---AT----T----------C-----------A--N--------------TTA----------------A----A------G----A---------TAT---C-----T--TC--AAT-T----A--T-----A----T---T----G-T-----T---C--T-CTTTA---A---A-A----G---------A---------ATT-ATTGCTC-T-CATTAA-T-----------TGA--AT--T----A----ATG------AT-AT-------------C-------------G--T-T---A---A-T-TC--A--A-TTAA----T-----GAGAGC-AAT---AATT---C-----------T-T-------T------------TA-----------------------A-N--G---AT----AT-C-----T-T-CAAT-T----A----T--A-T--T---GTT----CTC--TTT----AA--AA-G---------A-----------AT---------TAT----TGCTC--TCAT-T--AA-T-------T------G-AAT--T------AA--TG------AT---AT---C--ATT---AA-T--TCA---ATTA-ATGAGAGC------AAT-AATT-C-------TT--T-------TAA-A--GATATCTTCAATT-A-TAT----T--GCT----------CTCNT-TAANT--GAATTA--T--TGCTCT-CAT---TAA------TTGAATTAATGA
gi|1 : AT-AAT--TCAATTA-T-----ATGC--GT-------T-GCAA-TT-A---A--------TGTC-----G----T-------G--G-CT---A---T----G--------------T---TT-GC------T---T--------C--GCA--A---TAT--T----A-AT-T-----C--G-----G-T----ATA--A-A------A-----------TG-A--T--------TTAAT---G------AT----C-T------C-T--T-------------TTAAT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-A----G-A--------TAT-C-T-GTTA---A---AT----T----------------------A--T--------------TTA----------------C----GC-----G----A---------T-----------T--T----AT-T----A--T-----AGGAAT---T----A-A-----T---G--C-CTTTG---A---ATA----GCTC------G---------AC--ATCGCTC----AT-AA-T-----------TCA--TT--T----A----CAG------AG-AG-------------C-------------A--A-T---A---A-T-T---A--A-TTAA-----------AGAGG-AATT--AATT---CATATGGATATGT-TGTA----T------------TAT----------------------A-A--G---AT----AT-C-----T-T--AAT-T---------T--A-T--T---ATT----GCT--TCT----AA--AA-GT--------A-----------AT---------TAT----TGCTC--TCAT-T--TA-A-------T------G---T--T------AA---G------AT---AA---T--ATT---AA-T--TCA---ATTA-ATGAGAGC------AAT---------------------------------------TTCAAT----TAT----T--GCA----------CGCAT-TATAT--G-ATTA--TGATATTAT-AAT---TAA------TTGAA
gi|1 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattT-AAT--TCAATTA-A--GATATCT--GT-------T-A-AA-TT-ATTTACG-----CGATT-----T---------------A-TT---A---T----AGGAA----------T---T--AA------T-G-C--------C--TTT--G---AAT--A----G-CT-CGACATC--G-----C-TC---AT---A-A------T-----------TC-A--T--------TTACA---G------AG----A-G------C-A--A-------------T-AAT-----------T-----------A---A-----T-TA-A------A--------GAG-G-A-ATT----A---AT----T----------C-----------A--TATGGATATGTTGTATTAT---------------A----A------G----A---------TAT---C-----T--T---AAT-T-------T-----A----T---T----A-T-----T---G--C-TTCTA---A---A-A----GT--------A---------ATT-ATTGCTC-T-CATTTA-A-----------TG----T--T----A----A-G------AT-AA-------------T-------------A--T-T---A---A-T-TC--A--A-TTAA----T-----GAGAGC-AATTTCAATT---A-----------T-TGCACGCAT------------TAT----------------------A-T--G---ATTATGAT-A-----T-TATAAT-T----A-------A-T--T---G------------------AA--GA-G---------AGCAATAT----AT---------TAT----TG--G--GCAT-T---A-T-------T------G-AAT--TA-----AA--TG------AT---AT------ATT---AA-T--TCA---ATTA-AAGA-AGC------AATCAATT-gagagcaatatattattgggcattattgaattaaatgatatattaattcaattaaagaagcaatcaatttgcggcgcattaaattattaatggcgtttaaattcatttaaagaagaataattcaatatatagcgctcttcaattcgcaaagaattaaagatatcatcaattgatattaatgcgcgcataattcagaattatgaagatatattaatattaagagatctttgattgaattatggcgcattaaataattaagatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|1 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattataattcaattatatgcgttgcaattaatgtcgtggctatgtttgcttcgcaatattaattcggtataaaatgatttaatgatctctttAGAGGAATTAAT--TCA--TA-T--GG-ATAT--GT-------T-G-TA-TT-AT--AAG-----ATATC-----T----T-A-----A--T-TT---A---TT---A--------------T---T--GC------T---------------TCT--A---AAA--GT---A-AT-T---ATT--G-----C-TCTC-ATT--T-A------A-----------TG-------------TTAA----G------AT----A-A------T-A--T-------------T-AAT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-AT---G-A--------GAG-C-A-AT----------T----T----------C-----------A--A--------------TTATTGC------------A----C------GCATTA---------TAT----------------GAT-T----A--T-----G----A---T----A-T-----T---A--T-AATTA---ATTGA-A----G---------AGAGCAATATATT-ATTG--G-G-CATT-A-T-----------TGA--AT--TA---A----ATG------AT-AT---------------------------A--T-T---A---A-T-TC--A--A-TTAA----A-----GA-AGC-AATC--AATT---T-----------------------------------------------------------G-C--G---GC----GC-A-----T-T-AAAT-T----A----TTAA-TGGC---GTTTAAATTCA-TTT----AAAGAA-G---------A-----------ATAATTCAATATAT----AGCGC--TCTT-C--AA-T-------TCGCAAAG-AAT--T------AA--AG------AT---AT---C--ATC---AA-T--TGAT--ATTA-ATGCGCGC-------AT-AATT-CAGAA---TT--A-------TGA-A--GATAT-----ATTAA-TAT----TAAGAG----------ATCTT-TGATT--GAATTA--T--GG--CG-CAT---TAA------AT-AATTAAtgcggcgcattaaattattaatggcgtttaaattcatttaaagaagaataattcaatatatagcgctcttcaattcgcaaagaattaaagatatcatcaattgatattaatgcgcgcataattcagaattatgaagatatattaatattaagagatctttgattgaattatggcgcattaaataattaagatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|10 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattataattcaattatatgcgttgcaattaatgtcgtggctatgtttgcttcgcaatattaattcggtataaaatgatttaatgatctcttttaattcaattaagatatctgttaaattatttacgcgatttattataggaattaatgcctttgaatagctcgacatcgctcataattcatttacagagagcaataattaattaaAT--G----A-AT-T---ATT--G-----C-TCTC-ATT--A-A------T-----------TG-C--A--------TTA-T---G------CG----C-G------C-A--T-------------T-A-T-----------T-----C-----A---A-----T-TA-AA---G-A--------G-G-C-A-AT-----A---AT----T----------G-----------A--A--------------TTATT--------------G----C------G----A---------CA----C-----T------AAT-T-------C-----A----T---TAAAGG-A-----G---G--T-CAATA---A---T-C----G---------A---------ATT-ATTGCGC-G-CACTAA-T-----------C-A--AT--T----A----ATGAGAGCAAT-ATTAGATTAATGGCAC-------------A--T-T---A---AGT-TC--A--A-NNNN----N-----NNNNNN-NNN---NNNN---N-----------N-N-------N------------NN-----------------------N-N--N---NN----NN-N-----N-N-NNNN-N----N----N--NNT--T---GCT----CTC--ATT----AA--TT-C---------A-----------AT---------TAA----TGCTC--GCAT-T--AA-TGTAG---T------GGAAT--T------AT--TGCTCGCAAT---AT---TTAATT---AA-TGCTCGGT-ATAA-ATGAT-TT------AAT-ATCT-C-------TT--TAATTCATTAA-A--GATATCTTTAATT-A-Tgatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|11 : t-AAT--TCA-TTA-GC-GG-ATAT--GT-------T-A-AA-TT-A---ACG-----ATATC-----T----T-T-----A--A-TC---A---T----ATAG-----------T---T--GC------T-C-T--------C--TTT--A---CAA--GAATTA-AT-T---ATT--G-----C-TCTC-TTT--A-A-------------------G-A--A--------TTAAT---G------A---------------------------------------------------------------------------------G-G--------GAG-C-A-AT-----A---AT----T----------G-----------A--A--------------TTATT--------------A----C------G--------------T-T---C-----G--TC--AAT-G----G--T-----G----T---T---------------------------------A-A----G---------------------T-AATGATA-C-CATTAA-T-----------TCA--AT--G----G----AAG------AG-AG-------------C-------------A--A-T---A---A-T-TG--A--T-TTAT----T-----GAGCGC-TTT---AATT---C-----------A-T-------T------------TA-----------------------A-A--A---A-----AG-CAATAAT-T-CAGC-T----A----T--A-G--C---GCG----CCCCATTTCAGCAG--AA-A---------A-----------AT---------TAA----TGAT-----AT-G--AA-T-------T------A-AAT--T------AA--TC------AT----T---A--ATT---AT-T--TCA---Att
gi|12 : ---AT----T----------C-----------A--A--------------TTA----------------A----A------G----A---------TAT---C-----T--TT--AAT-T----A--TTTACAA----C---C----C-T-----T---T--T-ATTTT---A---A-G----G---------A---------ATTTAATGCGC-A-CATTAA-T-----------TTC--AT--TTTAAA----AGG------A-------------------------------G--CAT---A---A-T-TC--A----TTAAAGA-T-----GA-AGC-AATT--AATT---C-----------T-TA------T------------TATGGTTGATAATTGGTAATGACATA-A--G---AT----AT-C-----T-T-TAAT-T----A----T--A-T--TATTGCT----CTC--TTT----AA--AA-G---------A-----------AT---------TAT----TGCTC--TCAT-T--AA-T-------T------G-GAT--T------AA--TG------AT---AT---C--ATT---CA-T--TCA---GTTA-ATGAGAGC------gatat
gi|13 : ggtataaatgatttaatgatctctttt--G----A-AT-T---ATT--G-----C-TCGC-AAT--A-T------T-----------TA-A--T--------TTTAT---G------CT-------------C-GG-TA------------T-AAA-----------T-----G-----A---T-----T-TA-AT---G-A--------T-T-C-T-TT-----A---AT----T----------C-----------A--A--------------TTA----------------A----A------G----A---------TAT---C-----T--TT--AAT-T----A--T-----T----C---A----G-C-----A---G--C-ATTTATATA---A-G----G---------A---------ATT-AATGCGC-G-CATTA--T-----------TCA--TT--T----A----AAG------AG-AG-------------C-------------AA-TAT---A---A-T-TC--A--A-TTAA----A-----GAGAGC-ATT---AATT---C-----------C-T-------TATGGA-------TATGTTGAATT--------------A-A--G---AT----AT-C-----T-T-TAATAT----AT---T--A-T--T---GTC----TTC--TTT----AA--AA-G---------A-----------AT---------TAT----TGCTC--TCAT-T--AA-A-------T------G-AAT--T------AA--TG------AT---
gi|13 : gtgT-------T-C-AA-TT-A---AAG-----ATATC-----T----T-T-----A--A-TT---A---T----T--------------C---A--GC------A-G-C--------A--TTT--ATATAAG--G----A-AT-T---AAT--G-----C-GCGC-ATT----A------T-----------TC-A--T--------TTAAA---G------AG----A-G------CAA--TA------------T-AAT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-AA---G-A--------GAG-C-A-TT-----A---AT----T----------C--------------C--------------TTATGGATATGTTGAATT-A----A------G----A---------TAT---C-----T--TT--AATAT----AT-T-----A----T---T----G-T-----C---T--T-CTTTA---A---A-A----G---------A---------ATT-ATTGCTC-T-CATTAA-A-----------TGA--AT--T----A----ATG------AT-
gi|14 : gtggaattattgctcgcaatatttaattttatgctcggtataaatgatttaatgattctttaa-----T----T-T-----A--A-TT-------T----A--------------A---T--AT------T-C-A--------G--TAT--A---AAT--G----A-TT-A---ATT--GATTCTC-TTTC-ATT--C-A------T-----------TA-A--AGATATCATTTAAA---G------AG----A-G------C-A--A-------------T-AAT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-AA---G-A--------GAG-C-A--T-----A---AT----T----------C-----------A--A--------------TTATGGGCATGTTGAATTAA----A------G----A---------TAT---C-----T--CT--AAT-T----A--T-----A----T---T----G-T-----TGCTC--T-CTTTA---A---A-A----G---------A---------ATT-ACTGCTC-T-CATTAA-TTGAATTAAGATTGA--AT--T----A----ACG------AT-AT-------------C-------------A--T-T---A---A-T-TC--A--A-TTAT----T-----GAGA
gi|14 : gtagtggaattattgctcgcaaaatGAGAGCA-T-AAT--TCAATTA-T--GG-GCAT--GT-------T-G-AA-TT-A---AAG-----ATATC-----T----C-T-----A--A-TT---A---T----ATTG-----------T---T--GC------T-C-T--------C--TTT--A---AAA--G----A-AT-T---ACT--G-----C-TCTC-ATT--A-A------TTGAATTAAGATTG-A--A--------TTAAC---G------AT----A-T------C-A--T-------------T-AAT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-TT---G-A--------GA
gi|15 : gtagtggaattattgctcgcaaaattttaatttaatattcagtataaatgattaattgattctctttcattcattaaagatatcatttaaagagagcaataattcaattaaaT--AT-------T-C-AA-TT-A---AAG-----ATATC-----T----T-T-----A--AATT---A---T-------------------T---T--ACAACACTT-T-T--------A--TTT--A---A-G--G----A-AT-T---AAT--G-----C-GCAC-ATT--A-A------T-----------TC-A--T--------TTAAA---G------AG----A-G------C-A--A-------------T-AAT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-A----G-A--------GAG-C-A-TT-----A---AT----T----------CTATTATGGATAA--G--------------TTA----------------ATGAAA------G----A---------TAT---C-----T--TT--AAT-T----A--T-----A----T---TATT-G-C-----T---C--T-CTTTA---A---A-A----G---------A---------ATT-ATTGCTC-T-CATTAA-T-----------TGG--AT--T----A----ATG------AT-AT-------------C-------------A--T-T---C---A-T-TC--A--G-TTAA----T-----GAGAGC-
gi|16 : ataatgatttaaatgatctctttGAGAGCAAT-AATTATCAATAATT--GC-ACAC--GT-------T-G--A-TT-G---AA---------------------T-T-----A--G-TT---A--------A------------------T--GC------A-C-A--------C--TTT--G---AA
gi|16 : a---------A---------ATA-ATTGCAC-A-CGTTGA-T-----------TGA--AT--T----AGTTAATGC-----AC-AC-------------T-------------T--T-G---A---A----C--A--A-TTAA----TTTGAAGAGAGC-AAT---AATTAGAC-----------C-----------------------------------------------A-T--A---AC----ATGC-----T-T-CAAT-T----A-------A-T--T----------------TG----AA--GA-G---------AGCAATACTTAAAC---------TATAACGTGCT---TGAT-TTCAA-C-------A------G-AAT--A------AACCTT------ATTTTGT---C--ATC---AA-T--TCA---ATTA-ATGCGCGT------AAT-AATG-CAG-----AT--T-------TGG-A--GATATGATTAATT-A-Tcaattaatttgaagagagcaataattagaccataacatgcttcaattaatttgaagagagcaatacttaaactataacgtgcttgatttcaacagaataaaccttattttgtcatcaattcaattaatgcgcgtaataatgcagatttggagatatgattaattatta
gi|17 : agagagcaataattatc------C-G--T-------------C-AAT-----------G-----C-----A-----------TG-AT---G-A--------AAG-T-A-AT-----A---AT----T----------G-----------A--A--------------TTA----------------A----T------G--------------TGC---C-----A--TC--AAA-T----C--T-----A----T---T-----------------------------------A----A---------A---------ATA-ACTGCTC-T-CATCAATT-----------TGA--AT--T----A----GTG------CG-CG-------------C-------------A--T-T---A---T-T-TC--A--A-TTGA----T-----GAGAGC-AAT---ta
gi|18 : aagtgttgtaattaatttgaaatatctcgagggaattgaagagattaacaaattatatagactgagctccaaatttgcaagctctgatccta--G----A-AT-T---ATT--G-----C-TCGC-AA---A-A------T-----------TT-A--A--------TT--T---G------AT----GCT------C-GG-TA------------T-AAA-----------T-----G-----A---T-----T-TA-AT---G-A--------TCT-C-T-TT-----T---AT----T----------C-----------A--A--------------TTA----------------A-----------G----A---------TAT---C-----T--TT--AAT-T----A--TTTAC-A----G---C----A-C-----T---T--T-ATTTT---A---A-G----G---------A---------ATT-AATGCGC-A-CATTAA-T-----------TCA--CT--T----A----AAG------AG-AG-------------C-------------A--A-T---A---T-T-TC--A--A-TTAA----A-----GAGAGC-ATT---AATT---C-----------A-A-------T------------TA-----------------------T-G--G---AT----AA-G-----T-T-GAAT-T----A----
gi|18 : tcaatgtagtaT--AT-------T-C-AA-TT-A---A-G-----ATATC-----T----T-T-----A--A-TT---A---TTTACA--------------G---C--AC------T-T-T--------A--TTT--T---AAG--G----A-AT-T---AAT--G-----C-GCAC-ATT--A-A------T-----------TC-A--C--------TTAAA---G------AG----A-G------C-A--A-------------T-ATT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-AA---G-A--------GAG-C-A-TT-----A---AT----T----------C-----------A--A--------------TTA----------------T----G------G----A---------TAA---G-----T--TG--AAT-T----A--a
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gi|2 : aatttggagctcagtctatataatttgttaatctcttcaattccctcgagatatttcaaattaattacaacacttttgtaaagtgatcatttcttttgttttataatgag--A---AAT--C----A-AT-T---ATT--G-----C-TCTC-ATC--G-A------T-----------TG-A--A--------TTAAT---GCGC---GC----A-T------C----C-------------A-AAT-----------C-----C-----ACG-A-----T----ATC--G-A--------TAG-C-A-AT-----A---AT----T----------G-----------A--T--------------TT-----------------------------G----A---------TGCACGC-----G--TC--AAT-------------------------------T-----T---C-------------------------------------------ATT-ATTACGC-G-CAATAA-T-----------TGA--ATCCC----A----A--------AT-AT-------------C-------------T--C-C---ATACA-T-GC--A-----TAA----T-----TAAAGC-CAT---TATT---T-----------T-gcgcatta
gi|2 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgc----A-AT-T---AAC--G-------TC-C-ATT--G-A------T-----------TG-A--A--------TTGAT---G------A-----------------------------------------------------------------------------------A--------GA--C-A-AT-----A---AT----T----------G-----------A--A--------------TCG----------------A----T------G----G---------T------------------AAT-T----G--T-----A----A---T-------------------------A---A---A-AT---C---------A---------ATT-ATTGCTC-T-CATCGA-T-----------TGA--AT--T----A----ATGCGC---GC-AT-------------C----------------C-A---A---A-T-CC--ACGA-T--A----TC----GATAGC-AAT---AATT---G-----------A-T-------T------------TG-----------------------A-T--G----C----ACGC-----G-T-CAAT------------------------TT----C----------------------------------------AT---------TAT----TACGC--GCAA-T--AA-T-------T------G-AATCCC------AA----------AT---ATCTCC--ATA---CA-T--GCA-----TA-ATTAAAGC------CAT-TATT-T-------Ttattacaattaccatcgattcaattattgtcttcatcaattcaatcaatggacgttaattgaatcaatgtctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaattgattcaattgttgatattgatttatttgaagagatcaataattcaattataacgctcgtcaattcagcaaaataattaaattaatgctatcaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|2 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcTC--A---AAT--C----A-AT-T---ATT--G-----C-TATCGAT-----A------TCG---------TG-G--A--------TT--T---GG-----AT----G-CGCG---C-A--T-------------T-AAT-----------T-----C-----A---A-----T-CG-AT---G-A--------GAG-C-A-AT-----A---AT----T----------G-----------A--T--------------TT--------------------------------------------TAT---------T--AC--AAT-T----AC-C-----A----T---C----GAT-----T---C---------------------------------A---------ATT-ATTGTCT-T-CATCAA-T-----------TCA--AT--C----A----ATG------G--A--------------C-------------G--T-T---A---A-T-TG--A--A-TCAA----T-----GTCTGC-ATT---A------C-----------A-T-------G------------TA-----------------------ATT--G---AA----A----------T-TATT-T----A----T--A-T--T---ACT----TTC--TT-----------------------------------T---------TAT----TGTGC--GAAT-T--GA-T-------T------C-AAT--T------GT--TG------AT-----------ATT---GA-T--TTA---TTTG-AAGAGATC------AAT-AATT-CAA-----TT--A-------TAA-C--G--CTCGTCAATT---CA--------G------------CAAAA-TAATT--AAATTA--A--TGCTAT-CAA---GAG------TTCAATTAATGAgaatcaatgtctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaattgattcaattgttgatattgatttatttgaagagatcaataattcaattataacgctcgtcaattcagcaaaataattaaattaatgctatcaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|2 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgcaT-GAT--TCAATTG-T--TG-ATATTGAT-------T-T-AT-TT-G---AAG-----AGATCAATAAT----T-C-----A--A-TT---A---T----A--------------A---C--GC------T-CGT--------CAATTC--A---GCA--A----A-AT----------------------------A-A------T-----------TA-A--A--------TTAAT---G------CT----A-T------C-A--A-------------G-AGT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-AT---G-A--------TCG-C-A-AT-----A---AA----G----------C-----------AGGA--------------GTG----------------A----A------G----T---------TAT---C-----A--TT--AAT-T----A--T----------T---T----G-tcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|20 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgcatcaaatcaattattgctatcgatatcgtggatttggatgcgcgcattaattcaatcgatgagagcaataattgattttattacaattaccatcgattcaattattgtcttcatcaattcaatcaatggacgttaattgaatcaatgtctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaat-ATC--A-A------T-----------T--------------TTAAT---G------CT----A-T------C-A--A-------------C-AGT-----------T-----C-----A---A-----T-TA-AC--------------GTG-C-A-GT-----A---AT----T----------CAG---------A--T--------------TTG----------------A----A------G----A---------TAT---C-----A--TT--AAT-T----A--T-----aagcgatcgttattt
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|40 : acgccccTTCAATT-A-T------T--GCT----------CTCTT-TA-CTTGA---ATTAA--TGCGCGCATTAAATACATCTGAATTAATG
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1103 ) : GAGAGCAAT-AAT--TCAATTA--TGGATAT-GT-------T----G-AA-TT-A-AAG-----ATATCT----T-T-A--ATTA---T---A---T---T--GCT-CT--------CTTT--A----A-AT--G-A-AT-TATT------GCT-CTC-AT-T--A--AT-----------T-----GA-----------ATT-AAT---G---A---T---------------A-T---CG-T--T-A----AT--T-----CA-------A-----T-T-A-A----T---GA--------GA-GC-A-A-T-----A---ATT----------C------A--ATTA-----A------N-G----AT---ATCT---------TC--AA-TT----A-------T-----A----T---T----G------T-----T---C--TC-TTT--A---A----A-A-G---------A---------A----TT------AT-TGCNC-G------------------------CA--T------TA---A------T----TGA--A----T-T----A-AT---G------A-T-A---TC-------------G--T-T--AAT-TC-------AA-TTA--A---T-----G------AG---AGC-AA--T-A---ATT----C---------------A-------------T--------------T-------TA---------A-NG------A---------TATC-------TTCAAT-TA-T---ATT--------G---C-------TC-T--------C--T---TT----AA--A--A-G---A-----------AT---------TA--T----TGCTC--T-CAT-T--AA-T-----------T------GAATT------A-------------A------TG-A---T-AT-CAT--T-AA-TT-C-A-A-TTAATG--------AGA-GCAAT---AATT-C-------TTTTAA--A-GATAT---CTTCAATT----------AT--A-T----T--GCNCN-CAT---TA-ANTGA---ATT-AT--TGCTC-TCA-TTAATTGAATTAATGA
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gi|16 : ataatgatttaaatgatctcttttGAGAGCAAT-AATTATCAATAAT-TGCACAC-GT-------T----G--A-TT-G-AA
gi|16 : a---------A---------A----TA------AT-TGCAC-A------------------------CG--T------TG---A------T----TGA--ATTAGT-T----A-AT---GC-----A-C-A---CT-------------T--T-G--AA---C-------AA-TTA--A---TTTGAAG------AG---AGC-AA--T-A---ATTAGACC---------------A------------------------------------TA---------A-C-------A---------TG-C-------TTCAAT-TA-----ATTTGAAGAGAG---C-------AA-T--------A--C---TT----A------------A-----------AC---------TA--TAACGTGCT---T-GAT-TTCAA-C-----------A------GAATA------A-------------ACC----TT-ATTTT-GT-CAT--C-AA-TT-C-A-A-TTAATG--------CGC-GTAAT---AATG-CAG-----ATTTGG--A-GATAT---GATTAATT----------AT--ttagttaatgcacactttgaacaattaatttgaagagagcaataattagaccataacatgcttcaattaatttgaagagagcaatacttaaactataacgtgcttgatttcaacagaataaaccttattttgtcatcaattcaattaatgcgcgtaataatgcagatttggagatatgattaattatta
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gi|1 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattAGAGGAATTAATTCA--TA--TGGATAT-GT--T-G-TA-TTATA------AG-----ATATCTT-A-A--TTT----A---TT--A---T---T--GCT--------------TCT--A----A-A-A--GTA-ATTATT------GC-T-CTC-AT-T-T--AA-----------T--G--TT-A----A-G---A---T----A-A---T-A--T--T-A--A-T-----------T-----C-----A-------A-----T-T-A-AT-----GA--------GA-GC-A-A-T----------T-T----------C------A--ATTATTGC-A------C-GCATTAT---AT-----------------G---A-TT----A-------T----G---A-------T--------AT------TAT--------AATTA----ATTGA---AG-AGAGCAATATA----TT-A--TT----G--G----G------------------------CA--T-T---A------T-T------G--A--AT-TA---A-A--T---G------A---TAT---------------------------A--T-T-A-A-T-TC-------AATT-AA----AGA-AGC-A-----A-T---C---A-------------------A---T--------------T----------------T----------GC-G------G---------CGCA-----TTAAAT-T---A-TTA-A-T---G---G---CGTTTAAATT-C--------A--T---TT----AAAG--A-A---G-A-----ATAATTCAATAT------A--TA----GCGC--T-C--TT-CA-A-T-----------TCGCAAAG-AATT------A-A------------------AG------AT-AT-C--AT--C-AA-T--T-GAT--ATTA--ATG--------CG---C-GC-A--T---AATT-CAGAA---TT--A-------TGA--A-GA-TAT--------------AT--TAATA-T----TA-AG-----------AGATC---TT---TGAT-------TGAATT-AT--GG--C-GCA-TTAAAT-AATTA-gagagcaatatattattgggcattattgaattaaatgatatattaattcaattaaagaagcaatcaatttgcggcgcattaaattattaatggcgtttaaattcatttaaagaagaataattcaatatatagcgctcttcaattcgcaaagaattaaagatatcatcaattgatattaatgcgcgcataattcagaattatgaagatatattaatattaagagatctttgattgaattatggcgcattaaataattaagatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|10 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattataattcaattatatgcgttgcaattaatgtcgtggctatgtttgcttcgcaatattaattcggtataaaatgatttaatgatctcttttaattcaattaagatatctgttaaattatttacgcgatttattataggaattaatgcctttgaatagctcgacatcgctcataattcatttacagagagcaataattaattaa-A-T--G-A-ATTATT------GC-T-CTC-AT-T-A--AT-----------T--GCATT-A-----TG---C---G----C-G---C-A--T--T-A----T-----------T-----C-----A-------A-----T-T-A-AA-----GA--------G--GC-A-A-T-----A---AT-T----------G------A--ATTATT---G------C-G----AC---A--CT--------------A---A-TT------------C----A---T-------TAAAG----GA------GGT--------CAATA----A---T---CG-A---------A----TT-A--TT----GC-GC---G------------------------CA--C-TA--A------T-C---------A--AT-T----A-A--T---GAGAGCAA---TATTAGATTAATGGCAC-------------A--T-T-A-AGT-TC-------AANN-NN----NNNNNNN-N-----N-N---N---NNN-N---------------N---N--------------N----------------NN---------NN-N------N---------NNNN-----NNNNNN-N---N-N---NNT---T---G---C-------TC-T--------C--A---TT----AA----T-T---C-A-----AT---------T------A--AT----GCTC--G-C--AT-TA-A-TGTAG-------T------GGAATT------A-T------------------TGCTCGCAAT-AT-TTAAT--T-AA-TGCT-CGGT-ATAA--ATG--------AT-----TTAA--T---ATCT-C-------TT--TAATTCATTAA--A-GA-TAT---C-----T-TTAAT--T-ATgatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|11 : t-AATTCA-TTAG-CGGATAT-GT--T-A-AA-TTA-A------CG-----ATATCTT-T-A--ATC----A---T---ATAGT---T--GCT-CT--------C--TTT--ACAAGA-A-T--T-A-ATTATT------GC-T-CTC-TT-T-A--A---------------GAATT-A----ATG---A--------------------------------------------------------------------------------GG--------GA-GC-A-A-T-----A---AT-T----------G------A--ATTATT---A------C-G-----T----T-CG---------T-C--A---A-TG----G-------T----G---T-------T----------------------------------------A---AGTA---------A----TG-A---T----AC-------------------------------CA--T-TA--A------T-T------C--A--AT-G----G-A--A---G------A---GAG-------------C-------------A--A-T-A-A-T-TG-------ATTT-AT----TGAGCGC-T-----T-T---A---ATT-C---------------A---T--------------T----------------TA---------AA-A------A----------AGCAATAATTCAGC-T---A-T---A-G---C---G---C-------GC-C--------CCAT---TTCAGCAG----A-A---A-A-----AT---------T------A--AT----GAT--------AT-GA-A-T-----------T------A-AATT------A-A------------------TC------AT--T-A--AT--T-AT-T--T-CA---Att
gi|12 : T--A----A-A-T--G-A-TTTAAT------GA-T-CTC-TT-T-T--AT-----------T--CAATT-A----AAG---A---T----A-T---C-T--T--T-A--A-T-----------T-----gatat
gi|12 : ggta---AT-T----------C------A--ATTA-----A------A-G----AT---AT-CT---------T-T--A---A-TT----A-------T--------T-------T--------ACAA----CCC--------TTTTATTTTA---A---GG-A---------A----TTTA--AT----GC-GC---A------------------------CA--T-TA--A------T-T------T--C--AT-TTTAAA-A--G---G------A---------------------------------G--CAT-A-A-T-TC-------A-TT-AAAGA-TGA-AGC-A-----A-TT--A---ATT-CTTATTATGGTTGATAA---T--------------TGG--------------TA---------AT-G------ACATAAGA--TATC-----TTTAAT-T---A-T---A-T---TATTG---C-------TC-T--------C--T---TT----AA----A-A---G-A-----AT---------T------A--TT----GCTC--T-C--AT-TA-A-T-----------T------G-GATT------A-A------------------TG------AT-AT-C--AT--T-CA-T--T-CA---GTTA--ATG--------AG---A-GCatttacaacccttttattttaaggaatttaatgcgcacattaatttcattttaaaaggagcataattcattaaagatgaagcaattaattcttattatggttgataattggtaatgacataagatatctttaattatattattgctctctttaaaagaattattgctctcattaattggattaatgatatcattcattcagttaatgagagc
gi|13 : ggtataaatgatttaatgatctctttt--G-A-ATTATT------GC-T-CGC-AA-T-A--TT-----------T--AATTT-T----ATG---C---T----------C-GG-TA-T-A--A-A-----------T-----G-----A-------T-----T-T-A-AT-----GA--------T--TC-T-T-T-----A---AT-T----------C------A--ATTA-----A------A-G----AT---AT-CT---------T-T--A---A-TT----A-------T----T---C-------A--------GC------AGC--------ATTTATAT-A---A---GG-A---------A----TT-A--AT----GC-GC---G------------------------CA--T-T---A------T-T------C--A--TT-T----A-A--A---G------A---GAG-------------CA------------A--TAT-A-A-T-TC-------AATT-AA----AGAGAGC-A-----T-T---A---ATT-C---------------C---T--------------TATGGA-----------TATGTTGAATTAA-G------A---------TATC-----TTTAATAT---ATT---A-T---T---G---T-------CT-T--------C--T---TT----AA----A-A---G-A-----AT---------T------A--TT----GCTC--T-C--AT-TA-A-A-----------T------G-AATT------A-A------------------TG------AT-
gi|14 : gtg--G-A-ATTATT------GC-T-CGC-AA---A--AT-----------T-----TT-A----AT------------------------T--T-A--A-TAT---------T-----C-----A-------G-----T-----AT-----AA----------------A-T-----G---AT-T-----------------A--ATTG-----A------T-------T---CT-CT---------T-T--C---A-TT------------C----A---T-------T------------------------------------A---A---AG-AT--------A----TC-A--TTTAAAGA-GA---G------------------------CA--A-TA--A------T-T------C--A--AT-T----A-A--A---G------A---GAG-------------C-------------A--T---A-A-T-TC-------AATT-A-----TGGG--C-A-------T---G----TT-G---------------A---A--------------T----------------TA---------AA-G------A---------TATC-----TCTAAT-T---A-T---A-T---T---GTTGC-------TC-T--------C--T---TT----AA----A-A---G-A-----AT---------T------A--CT----GCTC--T-C--AT-TA-A-TTGAATTAAGATT------G-AATT------A-A------------------CG------AT-AT-C--AT--T-AA-T--T-CA---ATTA--TTG--------AG---A-
gi|14 : gtagtgGAGAGCA-T-AATTCAATTA--TGGGCAT-GT--T-G-AA-TTA-A------AG-----ATATCTC-T-A--ATT----A---T---ATTGT---T--GCT-CT--------C--TTT--A----A-A-A--G-A-ATTACT------GC-T-CTC-AT-T-A--ATTGAATTAAGATT--GAATT-A----ACG---A---T----A-T---C-A--T--T-A--A-T-----------T-----C-----A-------A-----T-T-A-TT-----GA--------GA-
gi|15 : gtagtggaattattgctcgcaaaattttaatttaatattcagtataaatgattaattgattctctttcattcattaaagatatcatttaaagagagcaataattcaattaaa---AT-T----------C------A--ATTA-----A------A-G----AT---AT-CT---------T-T--A---AATT----A-------T--------T-------T--------ACAACACTTTT--------ATTTA----A---G----G-A---------A----TT-A--AT----GC-GC---A------------------------CA--T-TA--A------T-T------C--A--TT-T----A-A--A---G------A---GAG-------------C-------------A--A-T-A-A-T-TC-------AATT-AA-----GAGAGC-A-----T-T---A---ATT-CTATTATGG-------A---TAAG-----------T----------------TA---------AT-G------AAAGA-----TATC-----TTTAAT-T---A-T---A-T---TATTG---C-------TC-T--------C--T---TT----AA----A-A---G-A-----AT---------T------A--TT----GCTC--T-C--AT-TA-A-T-----------T------G-GATT------A-A------------------TG------AT-AT-C--AT--T-CA-T--T-CA---GTTA--ATG--------AG---A-GC
gi|16 : ataatgatttaaatgatctctttt-A-T--C-A-ATAATT------GC-A-CAC-GT-T-G--AT-----------T--GAATT-AGTTAATGC--A---C----A-C---T-T--T--G-A--A-------------------C-----A-------A-----T-T-A-ATTTGAAGA--------GA-GC-A-A-T-----A---AT-T----------A------G--ACC------A------T-A----AC---ATGCT---------T-C--A---A-TT----A------------A---T-------TTGAAGAGAGC------AAT--------ACTTA---------------A---------A----CT-A--TA----AC-GT---G------------------------C---T-TG--A------T-TTCAACAG--A--AT-A----A-ACCT---T------ATTTTGT-------------C-------------A--T-C-A-A-T-TC-------AATT-AA----TGCGCGT-A-----A-T---A---ATG-CAG-------------A---T--------------T----------------TG---------GA-G------A---------TATG-----ATTAAT-T---A-T---
gi|17 : agagagcaataatt-------------C-------------G--T-C-A-A-T-GC-------A--T-GA----TGAAAGT-A-----A-T---A---ATT-G---------------A---A--------------T----------------TA---------AT-G----------------TGCC-----ATCAAA-T---C-T---A-T---T------------------------------------------------A---A-A-----AT---------A------A--CT----GCTC--T-C--AT-CA-A-T-----------TT-----G-AATT------A-G------------------TG------CG-CG-C--AT--T-AT-T--T-CA---ATTG--ATG--------AG---A-GCAA--T---ta
gi|18 : aagtgttgtaattaatttgaaatatctcgagggaattgaagagattaacaaattatatagactgagctccaaatttgcaagctctgatccta--G-A-ATTATT------GC-T-CGC-AA---A--AT-----------T--TAATT-------TG---A---T----GCT---C-GG-TA-T-A--A-A-----------T-----G-----A-------T-----T-T-A-AT-----GA--------TC-TC-T-T-T-----T---AT-T----------C------A--ATTA-----A--------G----AT---AT-CT---------T-T--A---A-TT----A-------TTTACA---G-------C--------AC------TTT--------ATTTT----A---A---GG-A---------A----TT-A--AT----GC-GC---A------------------------CA--T-TA--A------T-T------C--A--CT-T----A-A--A---G------A---GAG-------------C-------------A--A-T-A-T-T-TC-------AATT-AA----AGAGAGC-A-----T-T---A---ATT-C---------------A---A--------------T----------------TA---------TG-G------A---------TAAG-----TTGAAT-T---A-
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gi|2 : -A-ATAATG------GC-T-TTA-AT-T-A---------------T--GCATG-T----ATGGAGA---T----A-T--------T--T-GGGA-T-----------T-----C-----A-------A-----T-T-A-TT-----GC--------GC-GT-A-A-T-----A---AT-G----------A------A--ATTG-----A------C-GCGT-GC---AT-CAAA-------T-C--A---A-TT----A-------T----------------T--------GC------TAT--------C-----------------G-A---------------T-A--T------C-GT---G------------------------GA--T-T------------T------G--G--AT-G----C-G--C---G--------------------------C-------------A--T-T-A-A-T-TC-------AATC-GA----TGAGAGC-A-----A-T---A---ATT-G---------------A---T--------------T----------------T------------------------------TAT------TACAAT-T---ACC---A-T---C---G---A-------T--T--------C--------------------------A-----AT---------T------A--TT----GTCT--T-C--AT-CA-A-T-----------T------C-AATC------A-A------------------TG------G--A--C--GT--T-AA-T--T-GA---ATCA--ATGTCTGCATTAC---ATGTAA--TTGAAATT-A-------TT--T---------------A-TATTACT-----T-TC--T--T-TTA-T----TG-TG-----------CG--A---AT---TGAT-------TCAATT-GT--TGAT----A-TTGATTtctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaattgattcaattgttgatattgatttatttgaagagatcaataattcaattataacgctcgtcaattcagcaaaataattaaattaatgctatcaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|2 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaTC--A----A-A-T--C-A-ATTATT------GC-T-ATCGAT------ATCG---------T--GGATT-------TGG--A---T----G-CGCGC-A--T--T-A--A-T-----------T-----C-----A-------A-----T-C-G-AT-----GA--------GA-GC-A-A-T-----A---AT-T----------G------A--TTT---------------------T---AT--T---------A-C--A---A-TT----A-------CC---A---T-------C--------GA------T-T--------C-------------------A---------A----TT-A--TT----GT-CT---T------------------------CA--T-CA--A------T-T------C--A--AT-C----A-A--T---G------G----A--------------C-------------G--T-T-A-A-T-TG-------AATC-AA----TGTCTGC-A-----T-T---A-------C---------------A---T--------------G----------------TA---------ATTG------A---------AATT-----AT---T-T---A-T---A-T---T---A---C-------TT-T--------C--T---TT----TATTGTG-C---G-A-----AT---------TGATTCAA--TT----GTTG--A-T--AT-TG-A-T-----------T------T-ATTT------G-A------------------AG------AG-AT-C--AA--T-AA-T--T-CA---ATTATAACGCTCGTC--AATTCA-GCAAAAT---AATT-A-------AA--T-------TAA--T-GC-TAT---CAAGAGT-TCAAT--T-A-A-T-----G-AT-----------CG--C---AA---TAAAGCAGGAGTGAA--------GTTA-TCA-TTAATTtatttgaagagatcaataattcaattataacgctcgtcaattcagcaaaataattaaattaatgctatcaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|20 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgca-A---------G----TC-A--TT----GA-GC---G------------------------GA--T-CA--A------T-T-------------T-T----A-A--T---G------C---TAT-------------C-------------A--A-C-A-G-T-TC-------AATT-AA----C--GTGC-A-----G-T---A---ATT-CAG-------------A---T--------------T----------------TG---------AA-G------A---------TATC-----ATTAAT-T---A-T---atttgaagcgatcgttattt
gi|21 : ttcga-----A-------A-----TCT-A-AC-----GC--------GC-GC-A-A-T-----A---AT-T----------C------A--ACTA-----AAGATCTT-G----AT---AT-CT---------T-C--A---A-TT---------------------------------------C------C----------------------------G-A---------A----TT-A--TT----GG-GC---G------------------------CA--T-TA--C------T-T------G--AATAT-T----A-C--T---G------A---TAT-------------CAATTGATTATTCTG--C-T-A-A-T-TA-------AATT-GA----AGCGCGC-T-----A-T---A---A--------------------------------------T----------------TA---------AT-A------A---------TATC-----TTGAAT-------T---G-T---T---G---C-------TC-T--------C--T---TT----AA----A-A---gaattgaaacattgccctctagcttcctatgaatatcaattgtatcagcattcgaaccggggcttatagtttgaagctgaatttacactacatggggattcttgca
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gi|23 : tttaaaatgggagttagttaggggat-A-T-TA-------AATT-AAATTTTGCGAGC-A-----A-A---A---ATT-CC--------------A---C--------------CAC--------------GA---------AC-T------A---------GATC-----T--AAT---------------------G---C-------GC-C--------C--A---TT----AA----A-T---G-A-----AT---------C------A--TT----GCTC--T-C--AT-TA-A-T-----------T------G-AATG------A-A------------------T--------T-A-----------AA-T--G-CACGTATTA--ATC--------A--------AA--T---GA---C-------TTAAT-------TAT----GC-TCT---C-----T-TCCAT--T-GAA-T----TAATG-----------CG--A---AC----AAA-------TCAACT-AT--TGCTC-TCT-TTAATT
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gi|32 : tgtggtggaattacagctcacaaaattgcattttgagatcattataaatgtttaaaaatcacagtacagcacttttgtataaggT--T-G-AA-TTA-A------TG-----TTCTCTT-TTA--ATT----GAATT---A---T---T--GCT-CT--------A--TTT--A----A-A-TATG-A-ATTAAT------GC------------A--AT-----------T--GATTC-A----AAG---A---T----A-T---C------------A-T-----------T-----G-----A-------A-----T-A-A-AT-----GA--------GA-GC-A-A-T-----G---AT-T----------G------A--ATattttta
gi|32 : GAGAACATT-AATTCAATTG--TGGATAT-Gttgtggatatg
gi|33 : attcaatcattgctctcatttattcaatgatatctttgaatcaattgcattaattcatatttaaatagagcaataattcaattaaaaG-A---------A----TT-T--AT----GC-GC---A------------------------CA--T-TG--A------T-A------G--A--AA-G----A-C--T---GC-----G---TG--------------C-------------T--T-T-A-A-T-TC-------GTTT-GA----AGAGAGC-A-----A-C---A---ATT-C---------------A---A--------------T----------------TA---------GA-G------A----------GTC-----TGTAAT-
gi|34 : t-A-C-----A---AT-T----------A------A--ATTA-----A------TTG----AT---AT-CT---------T-T--A---A-TT----AATTGCATT----G---T-------T--------GC------GCT--------TTTTA----A---A---AG-C---------A----TT-A--AT----GC-GC---A------------------------CAATT-TAC-A------T-C------C--C--TT-T----T-A--C---A------A---AAT-------------C-------------G--T-T-----T-TA-------AATT-AT----TGActcgttttagcaaacaggaaagaaatttat
gi|35 : tT-AT-C--TT--T-AA-T--T-CA---TTTA--ATG--------CG---T-GCAA--T---AAATACAAAATAATT--T-------TAATAATGA-TAT---C-----T-TTAAT--T-CTT-T----TG-CGGAATTGATTAGCG--CTACATGTATAAT-------TGAATT-AT--TGCTC-ggat
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gi|4 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag----TC-A--TT----GC-GT---G------------------------CA--TATAT-G------T-C------A--T--ATAT----A-A--T---A------AA--TAT-------------C-------------T--T-T-A-A-T-TCTTTGCTGAATT-GA----AGAGTGT-T-----A-T---A---ATT-------------------------------------------------------------------G------A----------------------AT-T---A-T---------T---G---C-------TC-T--------C--T---TT----AA----A-T---G-A-----AT---------T------A--AA----GTGC--A-C--AT-TA-A-T-----------T------G-AATT------A-A------------------TG-------T-CG-C--AA--T-AA-T--T-CA---ATTA--TTG--------aagaattaaagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
gi|40 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagT---------T-C--A---A-TT----A-------T----------------T--------GC------TCT--------CTTTA----C---T---TG-A---------A----TT-A--AT----GC-GC---G------------------------CA--T-TA--AATACATC-T------G--A--AT-T----A-A--T---GCGCTTCA---TAT-------------C-------------A--TATGA-A-T-TC-------A
gi|42 : acgcccc-A--AT-----------T--GATTT-A----ATGTGCG---T----A-T-----G-------A--A-T-----------T-----C-----A-------A-----T-T-G-AA-----GA--------GA-GC-A-A-T-----A---AT-T----------G------A--ATTA-----A------T-G----AT---GT-CT---------T-
gi|43 : gagtaaa-A-A-T-TC-------AATT-AA----TGAGAGC-A-----A-T---A---ATT-C---------------A---T--------------T----------------TG---------AT-GTGCTCAA---------TA-A-----TTCAAT-------T---A-T---T---G---C-------T--T--------C--T---tgaata
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gi|8 : tctgtaattatttacaacgcctttatataaagaattaatgcatacagtaactcttttttttattaaagagcgataattcataactggatatatcttaaattgaagatatctctagcttctccctcgaatataattattgcgcgcatcaattgaattattgtagagagcaa-----------CG--C---AG---TAAT-------CTAATT-AT--TGCTC-TCT-TCAGTTGAATTA-ATGAaaaaattg
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gi|9 : tctgtaattatttacaacgcctttatataaagaattaatgcatacagtaactcttttttttattaaagagcgataattcataactggatatatcttaaattgaagatatctctagcttctccctcgaatataattattgcgcgcatcaattgaattattgtagagagcaataattcaattattaagcgtattattgattgaattaatgatatcaatttaatgattgtctgtatccattgaattaatgatatcattaattcaactgaagagagcaataattagattactgcgacctttactcaaattaatgcatgctttg--TTC--A----A-A-T--G-ACATCAT-------GC-T-CTC-AT-T-A--AT-----------TGCGCATT-A----CT----A---TCTGCA-T---C-AT-T--T-A--A-T-----------T-----C-----A-------A-----T-T-A-CA-----GA--------GAGGC-ACA-T-----A---AT-T----------G------A--ATTATTTGCG------C-G----G----AG-C------------C--A---A-TT------------T----A---CA------T--------GT------TC---------CTTTA----A--------------------------------T----GC-GC---G------------------------CA----TA--A------T-T------G--C--AT-----------T---G------A---TA--------------------------------------------------------------GAGAGCGA-----A-T---A---ATT-C---------------A---T--------------T----------------TA---------AT----------------------------------------------T---T---G---C--------C-G--------C--C---GC----AA----ATA---A-ATTCATAT---------T------A--TT----GCTCTTT-C--ATCTA-ATT-----------T------C-AATT------A-A------------------TG------CTCGC-C--AT--T-AA-T--tg
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GATATAAATGATTCACCGATCTCTTTTATGTAATTGACTAATAGTATATCTTTAATTAATTACAATACTTTTGTAAGGAAAATTAATGAGCGCATTAGTTGTTATGAAGATAGC
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gi|16 : ataatgatttaaatgatctcttttT-----A---AT---------A--ATTA-----A------T-C----AT---ATCT---------C-C--A---A-------A-------T--------C-------T---------------GC--------------------------------------------A----TT-AT-T----AC-GCG------------------------CA--T-TA--A------T----TG--------------------A--AT-T----G-A-T---GACAAA-A---TA---A-------------G-------------G--T-T-T-A-T-TC-------TGTT----GA--AATC-AA---G-C---A---C---------------G---T--------------T-------------------------------------A---------T-A-G-----TTTAA------G---T---A-T---T---GC-------TC-T--------C--T---TC----AAATTAATTGA-A--GCATGTTATGGTCTA-----AT---------T------A--TTGCTC--T-------CTTCAAAT-TAA-T----T------G---TTCAA---A-G------------------TGTGC---AT--T---A--AC--T--------A-A-T--T-C-A--ATCA--A-----CG--------TG---T-GCAA--T---TAT---T-
gi|17 : agagagcaataattatc------A--TTGCTC--T-------C-----AT-CAA-T----T------G-AAAT------A-A------------------TG------CG-CG---C--AC--T--------A-A-T--T-CAA--ATTG--A-----TG--------AG---A-GC--------AGT---T-A-------T-T-------T------------TAAT-A-GAT-----------TTGA----------------TG-G-----------CA--C---A-T---TAAT-------TCAATT-AT--TACTT-TCA-TCATGCATTG
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gi|40 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagT---------T-C--A---A-TT----A-------T----------------T---------------GC------TCT--------CTTTA----C---TT-GA---------A----TT-AA-T----GC-GCG------------------------CA--T-TA--AATACATC----TG--------------------A--AT-T----A-A-T---GCGCTTCA---TA---T-------------C-------------A--TATGA-A-T-TC-------A
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gi|43 : gagtaaa-A-A-T-TC-------AATT-AATGA--GAGC-AA---T-A---ATT-C---------------A---T--------------T----------------TG---------AT-GTGCTCAA---------T-A-A-----TTCAAT---------T---A-T---T---GC-------T--T--------C--T---tgaata
gi|43 : gatttgattTA-T----TGAG-----------CA--C---A-T---CAAA-------TGAATT-AT--TGCTC-TCA-TTA---ATTGAATTGGTGggtgc
gi|44 : gatttgattagaagcaataattgaat-T-A-A-T-TC-------AGTT-AAAGA--GAGC-AT---T-A---CTT-C---------------A---T--------------T----------------TA---------TG-G------ACATATATACT-ATC-----TCTAAT-T---A---TGTAG-T---T---GC-------Tc
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9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1103 ) : GAGAGCAAT-AATTCAATTA--TGGATAT-GT--T-G-AA-TTA-A------AG-----A----TATC-TT-T-A--ATT----A---T---A---T---T--GCT-CT--------C--TTT--A----A-A-T--G-A-ATTATT------GCTCTCAT-T-A-AT-----------T--GAATTAATG---A-T----A-TC-G-T--T-AA-T--T-----CA-------A-----T-TA-AT---GA--------GA-GC-A-AT-----A---AT-TC------A--ATTA-----A------N-G----AT---ATCT---------T-C--A---A-------T----T----A-------T----A---T-------T---------------GC------TCT--------CTTTA----A---A---AGA---------A----T-T-ANT----GC-GC-G------------------------CA--T-TA--A------T-TG--------------------A--AT-T----A-A-T---G------A---TAT-------------C-------------G--T-T-A-A-T-TC-------AATT-AAN----GA--GAGC-AA---T-A---ATT-C---------------A---T--------------T----------------TA---------ANG---A---------T-ATC-----TTCA-------------------AT-T---A-T---A-T---T---G---C-------TC-T--------C--TTT----AA--------A-AG-------------A-----AT---------TATTGC-TC--T-CATC-AA-T-----------T------G-AATT------A-A------------------TG------AT-AT---C--AT--T-AA-T--T-C-A---ATTAAT-GAGAGCAATAAT---T-C-------T-T-------T------------TAA--A-GATAT---CTTCAATT----A-TA-T----TG-CG-----------CG--C---A-T---TAAATGAATT-AT--TGCTC-TCA-TTA---ATTGAATTAATGA
gi|1 : AT-AATTCAATTA--T--ATGC-GT--T-GCAA-TTA-ATGTCGTGG-----C----TATG-TT-T-G--CTTCGCAA---T---A---T---T--AAT--T--------CGGTAT--A----A-AAT--G-A-TTTAAT------GATCTCTT-TTA-AT-----------T--CAATTAA-G---A-T----A-TCTG-T--T-AAAT--T--------------A-----T-TT-AC---GC--------GA-TT-T-AT-----T---ATAGG------A--ATTA-----A------T-G----------CCT---------T-T--G---A-----------------A-------T----A---------------------------GC------TC---------------------------GAC--------A----T-----------C-GC-T------------------------CA--T--A--A------T-TC--------------------A--TT-T----A-C-A---G------A---GAG-------------C-------------A--A-T-A-A-T-T--------AATT-AAA----GA--G-GA-AT---T-A---ATT-C---------------A---TATGGATATGTTGTAT----------------TAT--------AAG---A---------T-ATC-----TTAA-------------------TT-T---A-TT--A-T---T---G---C-------T--------------TCT----AA--------A-AGT------------A-----AT---------TATTGC-TC--T-CATT-TA-A-----------T------G---TT------A-A-------------------G------AT-AA---T--AT--T-AA-T--T-C-A---ATTAAT-GAGAGCAAT-------------------------------------------------------TTCAAT-------TA-T----TG-CA-----------CG--C---A-T---TATATG-ATT-ATGATATTA-TAA-TTA---ATTGAA
gi|1 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattAGAGGAATTAATTCA--TA--TGGATAT-GT--T-G-TA-TTATA------AG-----A----TATC-TT-A-A--TTT----A---TT--A---T---T--GCT--------------TCT--A----A-A-A--GTA-ATTATT------GCTCTCAT-T-T-AA-----------T--G--TTAA-G---A-T----A-AT-A-T--T-AA-T--T-----CA-------A-----T-TA-AT---GA--------GA-GC-A-AT----------T-TC------A--ATTATTGC-A------C-GCATTAT---AT----------------G---A-------T----T----A-------T----G---A-------T---------------AT------TAT--------AATTA----ATTGA---AGAGAGCAATATA----T-T-ATT----G--G--G------------------------CA--T-T---A------T-TG--------------------A--AT-TA---A-A-T---G------A---TAT---------------------------A--T-T-A-A-T-TC-------AATT-AAA----GA---AGC-AA---T-C---A-------------------A---T--------------T----------------T----------GCG---G---------C-GCA-----TTAA-------------------AT-T---A-TTA-A-T---G---G---CGTTTAAATT-C--------A--TTT----AAAG------A-AG-------------A-----ATAATTCAATATATAGC-GC--T-CTTC-AA-T-----------TCGCAAAG-AATT------A-A------------------AG------AT-AT---C--AT--C-AA-T--T-G-AT--ATTAAT-GCGCGC-ATAAT---T-CAGAA---T-T-------A------------TGA--A-GATAT--------ATTA---A-TA-T----TA-AG-----------AGATC---T-T---TGATTGAATT-AT--GG--C-GCA-TTA---AAT-AATTAAgagagcaatatattattgggcattattgaattaaatgatatattaattcaattaaagaagcaatcaatttgcggcgcattaaattattaatggcgtttaaattcatttaaagaagaataattcaatatatagcgctcttcaattcgcaaagaattaaagatatcatcaattgatattaatgcgcgcataattcagaattatgaagatatattaatattaagagatctttgattgaattatggcgcattaaataattaagatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|10 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattataattcaattatatgcgttgcaattaatgtcgtggctatgtttgcttcgcaatattaattcggtataaaatgatttaatgatctcttttaattcaattaagatatctgttaaattatttacgcgatttattataggaattaatgcctttgaatagctcgacatcgctcataattcatttacagagagcaataattaattaa-A-T--G-A-ATTATT------GCTCTCAT-T-A-AT-----------T--GCATTA-TG---C-G----C-GC-A-T--T-A--T--T-----CA-------A-----T-TA-AA---GA--------G--GC-A-AT-----A---AT-TG------A--ATTATT---G------C-G----AC---A-CT--------------A---A-------T----T------------C----A---T-------TAAAG-----------GA------GGT--------CAATA----A---T---CGA---------A----T-T-ATT----GC-GC-G------------------------CA--C-TA--A------T-C---------------------A--AT-T----A-A-T---GAGAGCAA---TATTAGATTAATGGCAC-------------A--T-T-A-AGT-TC-------AANN-NNN----NN--NNNN-NN---N-N---NNN-N---------------N---N--------------N----------------NN---------NNN---N---------N-NNN-----NNNN-------------------NN-N---N-N---NNT---T---G---C-------TC-T--------C--ATT----AA--------T-TC-------------A-----AT---------TAATGC-TC--G-CATT-AA-TGTAG-------T------GGAATT------A-T------------------TGCTCGCAAT-AT---TTAAT--T-AA-TGCT-C-GGT-ATAAAT-GAT-TTAATATC---T-C-------T-T-------TAATTCAT-----TAA--A-GATAT---CTTTAATT----A-Tgatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|11 : t-AATTCA-TTAG-CGGATAT-GT--T-A-AA-TTA-A------CG-----A----TATC-TT-T-A--ATC----A---T---ATAGT---T--GCT-CT--------C--TTT--ACAAGA-A-T--T-A-ATTATT------GCTCTCTT-T-A-A---------------GAATTAATG---A-------------------------------------------------------GG--------GA-GC-A-AT-----A---AT-TG------A--ATTATT---A------C-G-----T----TCG---------T-C--A---A-------T----G----G-------T----G---T-------T-----------------------------------------------A---AGT---------A----A-T-GAT----AC-----------------------------CA--T-TA--A------T-TC--------------------A--AT-G----G-A-A---G------A---GAG-------------C-------------A--A-T-A-A-T-TG-------ATTT-ATT----GA--GCGC-TT---T-A---ATT-C---------------A---T--------------T----------------TA---------AAA---A-----------AGCAATAATTCA-------------------GC-T---A-T---A-G---C---G---C-------GC-C--------CCATTTCAGCAG--------A-AA-------------A-----AT---------TAATGA-T------ATG-AA-T-----------T------A-AATT------A-A------------------TC------AT--T---A--AT--T-AT-T--T-C-A---Att
gi|12 : T--A----A-A-T--G-A-TTTAAT------GATCTCTT-T-T-AT-----------T--CAATTAAAG---A-T----A-TC-T-T--T-AA-T--T-----gatat
gi|12 : ggta---AT-TC------A--ATTA-----A------A-G----AT---ATCT---------T-T--A---A-------T----T----A-------T--------T-------T---------------ACAA----CCC--------TTTTATTTTA---A---GGA---------A----T-TTAAT----GC-GC-A------------------------CA--T-TA--A------T-TT--------------------C--AT-TTTAAA-A-G---G------A---------------------------------G--CAT-A-A-T-TC-------A-TT-AAA----GATGAAGC-AA---TTA---ATT-CTTATTATGGTTGATAA---T--------------TGG--------------TA---------ATG---ACATAAGA--T-ATC-----TTTA-------------------AT-T---A-T---A-T---TATTG---C-------TC-T--------C--TTT----AA--------A-AG-------------A-----AT---------TATTGC-TC--T-CATT-AA-T-----------T------G-GATT------A-A------------------TG------AT-AT---C--AT--T-CA-T--T-C-A---GTTAAT-GAGAGCatttacaacccttttattttaaggaatttaatgcgcacattaatttcattttaaaaggagcataattcattaaagatgaagcaattaattcttattatggttgataattggtaatgacataagatatctttaattatattattgctctctttaaaagaattattgctctcattaattggattaatgatatcattcattcagttaatgagagc
gi|13 : ggtataaatgatttaatgatctctttt--G-A-ATTATT------GCTCGCAA-T-A-TT-----------T--AATTTTATG---C-T-------C-GGTA-T-AA-A--T-----GA-------T-----T-TA-AT---GA--------T--TC-T-TT-----A---AT-TC------A--ATTA-----A------A-G----AT---ATCT---------T-T--A---A-------T----T----A-------T----T---C-------A---------------GC------AGC--------ATTTATAT-A---A---GGA---------A----T-T-AAT----GC-GC-G------------------------CA--T-T---A------T-TC--------------------A--TT-T----A-A-A---G------A---GAG-------------CA------------A--TAT-A-A-T-TC-------AATT-AAA----GA--GAGC-AT---T-A---ATT-C---------------C---T--------------TATGGA-----------TATGTTGAATTAAG---A---------T-ATC-----TTTA-------------------ATAT---ATT---A-T---T---G---T-------CT-T--------C--TTT----AA--------A-AG-------------A-----AT---------TATTGC-TC--T-CATT-AA-A-----------T------G-AATT------A-A------------------TG------AT-
gi|14 : gtg--G-A-ATTATT------GCTCGCAA---A-AT-----------T-----TTAAT------------------T--T-AA-TATT-----CA-------G-----T----AT---AA----------------AT-----G---AT-T-------A--ATTG-----A------T-------T---CTCT---------T-T--C---A-------T----T------------C----A---T-------TAAA------------GA------TAT--------CATTT----A---A---AGA----------------------------GA-G------------------------CA--A-TA--A------T-TC--------------------A--AT-T----A-A-A---G------A---GAG-------------C-------------A--T---A-A-T-TC-------AATT-ATG----G-----GC-A----T-G----TT-G---------------A---A--------------T----------------TA---------AAG---A---------T-ATC-----TCTA-------------------AT-T---A-T---A-T---T---GTTGC-------TC-T--------C--TTT----AA--------A-AG-------------A-----AT---------TACTGC-TC--T-CATT-AA-TTGAATTAAGATT------G-AATT------A-A------------------CG------AT-AT---C--AT--T-AA-T--T-C-A---ATTATT-GAGA
gi|14 : gtagtgGAGAGCA-T-AATTCAATTA--TGGGCAT-GT--T-G-AA-TTA-A------AG-----A----TATC-TC-T-A--ATT----A---T---ATTGT---T--GCT-CT--------C--TTT--A----A-A-A--G-A-ATTACT------GCTCTCAT-T-A-ATTGAATTAAGATT--GAATTAACG---A-T----A-TC-A-T--T-AA-T--T-----CA-------A-----T-TA-TT---GA--------GA-
gi|15 : gtagtggaattattgctcgcaaaattttaatttaatattcagtataaatgattaattgattctctttcattcattaaagatatcatttaaagagagcaataattcaattaaa-TA--A------T--G--------------------A--TT-T----A-AAT---G------A---TCT-------------C-------------T--T-T-T-A-T-TC-------AATT-AAA----GA--
gi|15 : a---AT-TC------A--ATTA-----A------A-G----AT---ATCT---------T-T--A---AA------T----T----A-------T--------T-------T---------------ACAACACTTTT--------ATTTA----A---G----GA---------A----T-T-AAT----GC-GC-A------------------------CA--T-TA--A------T-TC--------------------A--TT-T----A-A-A---G------A---GAG-------------C-------------A--A-T-A-A-T-TC-------AATT-AA-----GA--GAGC-AT---T-A---ATT-CTATTATGG-------A---TAAG-----------T----------------TA---------ATG---AAAGA-----T-ATC-----TTTA-------------------AT-T---A-T---A-T---TATTG---C-------TC-T--------C--TTT----AA--------A-AG-------------A-----AT---------TATTGC-TC--T-CATT-AA-T-----------T------G-GATT------A-A------------------TG------AT-AT---C--AT--T-CA-T--T-C-A---GTTAAT-GAGAGCtatctttaaattatttacaacacttttatttaaggaattaatgcgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaattaagagagcattaattctattatggataagttaatgaaagatatctttaattatattattgctctctttaaaagaattattgctctcattaattggattaatgatatcattcattcagttaatgagagc
gi|16 : ataatgatttaaatgatctcttttT-----A---AT---------A--ATTA-----A------T-C----AT---ATCT---------C-C--A---A-----------------A-------T--------C-------T---------------GC----------------------------------------------A----T-T-ATT----AC-GC-G------------------------CA--T-TA--A------T-TG--------------------A--AT-T----G-A-T---GACAAA-A---TAA-------------G-------------G--T-T-T-A-T-TC-------TGTT--------GA--AATC-AA---G-C---A---C---------------G---T--------------T---------------------------------A---------T-A-G-----TTTA-------------------A------G-T---A-T---T---G---C-------TC-T--------C--TTC----AAATTAATTGA-AGCATGTTATGGTCTA-----AT---------TATTGC-TC--T-CTTC-AA-A-----------T------T-AATTGTTCAAA-G------------------TGTGC---AT--T---A--AC--T-AA-T--T-C-A---ATCAAC-GTGTGCAATTAT---T-
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gi|19 : tcaatgtagta-T-AAT----GC-GC-ATAT---------------------CA--T-TA--A------T-TC--------------------A--AT-T----A-A-T---T------CT--TAG-------------C-------------A--A-T-A-A-T-TC-------TCTC-AGG----AA--GAGC-AACTTT-A-----T-C---------------A---T--------------T----------------T-----------CGA--A---------T-GTC-----GTCA--------------------------------A-T---T---G---C-------TC-A--------T--TAT----AA--------A-AC-------------A-----Aa
gi|19 : aatttggagctcagtctatataatttgttaatctcttcaattccctcgagatatttcaaattaattacaacacttttgtaaagtgatcatttcttC------A--ATTG-----A------C-G----AC---AT-----------T-CGAA---A-------T----G----A-------T----AAAGT-------T---------------GC------TCT--------TCCTG----A---G---AGA---------A----T-T-ATT----GCTAA-G------------------------AA--T-TA--A------T-TG--------------------A--AT-T----A-A-T---G------A---TAT-------------
gi|2 : aatttggagctcagtctatataatttgttaatctcttcaattccctcgagatatttcaaattaattacaacacttttgtaaagtgatcatttcttttgttttataatgagCAT-T-G-AT-----------T--CAATTAACG-----T------CC-A-T--T-GA-T--T-----GA-------A-----T-TG-AT---GA--------AG-AC-A-AT-----A---AT-TG------A--ATCG-----A------T-G----GT---AATTGTAATAAAAT-C--A---A-------T----T----A-------T----------------T---------------GC------TCT--------CATCG----A---T---TGA---------A----T-T-AAT----GC-GC-GCATCCAAATCCACGATATCGATAGCA--A-TA--A------T-TG--------------------A--TT-T----G-A-T---GC-----A---CG--------------C-------------G--T-C-A-A-T-TT-------CATT-ATT----AC--GCGC-AA---T-A---ATT-G---------------A---A--------------T----------------CC---------CAA---A---------T-ATC-----TCCATACATGCATAATTAAAGCCAT-T---A-T---T-T---T---G---C-------GC-T--------C--TGT----AA--------A-CG-------------A-----CT---------T-TTGgcgcatta
gi|2 : atcattGATAGCATT-AATTTAATTA--T---TTT-GC--T-G-AA-TTG-A------CG-----AGCGTTATAATT-G-A--ATT----A---T-----------T--GAT-CT--------C--TTC--A----A-A-T--A-A-ATCAAT------A---TCAA-C-A-AT-----------T--GAATCAAT-------------TC-G-C-----A----------CA-------A-----T-AA-AA---GA--------AA-GT-A-AT-----A-------------------TA-----A-------------AT---AATT---------T-C--A---A-------T----T----A-------C----A---T------------------------------------------------------------G-----------------T-AAT----GC-AG-A------------------------CA--T-TG--A------T-TC--------------------A--AT-T----A-A-C---G----------T-C-------------C-------------A--T-T-G-A-T-TG-------AATT-GAT----GA--AGAC-AA---T-A---ATT-G---------------A---A--------------T----------------CG---------ATG---G---------T-A------------------------------AT-T---G-T---A-A---T-------------------------------------AA--------A-ATC------------A-----AT---------TATTGC-TC--T-CATC-GA-T-----------T------G-AATT------A-A------------------TGCGC---GC-ATC--C--A-----AA-T--C-C-ACG-AT--ATCGATAGCAATAAT---T-G-------A-T-------T------------T------GATGCACGCGTCAATTTC--ATTA-T----TA-CG-----------CG--C---A-A---TAATTGAATtctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaattgattcaattgttgatattgatttatttgaagagatcaataattcaattataacgctcgtcaattcagcaaaataattaaattaatgctatcaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|2 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttggg------A--ATTA-----A------T-G----AT---AACT---------T-C--A---C-------T----C---------------------C-------T---------------GC------T--------------------------------------------T-T-ATT----GC-GA-T------------------------CA--T-TA--A------T-TG--------------------A--AC-T----C-T-T---G------A---TAG-------------C-------------A--T-T-A-A-T-TT-------AATT-ATT------------------T-T---GCT-G---------------A---A--------------T----------------TG---------ACG---AGCGT-----T-ATAA----TTGA-------------------AT-T---A-T---------T---G---A-------TC-T--------C--TTC----AA--------A-TA-------------A-----AT---------CAATA------T-CAAC-AA-T-----------T------G-AATC------A-A------------------T--------T-CG---C--A-------------C-A---ATAAAA-GAAAGTAATA--------------------------------------TAA--A---TAA---TTTCAATT----A-CA-TGTAATG-CA-----------GA--C---A-T---TGATTCAATT-AA--CG-TC--CA-TTG---ATTGAATTGATGAaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|20 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgcatcaaatcaattattgctatcgatatcgtggatttggatgcgcgcattaattcaatcgatgagagcaataattgattttattacaattaccatcgattcaattattgtctA---------G----T-C-ATT----GA-GC-G------------------------GA--T-CA--A------T-T-------------------------T-T----A-A-T---G------C---TAT-------------C-------------A--A-C-A-G-T-TC-------AATT-AAC--------GTGC-AG---T-A---ATT-CAG-------------A---T--------------T----------------TG---------AAG---A---------T-ATC-----ATTA-------------------AT-T---A-T---atttgaagcgatcgttattt
gi|21 : ttcgaA-------A-----TCTA-AC---GC--------GC-GC-A-AT-----A---AT-TC------A--ACTA-----AAGATCTT-G----AT---ATCT---------T-C--A---A-------T----T----------------------------------------------C------C----------------------------GA---------A----T-T-ATT----GG-GC-G------------------------CA--T-TA--C------T-TG--------------------AATAT-T----A-C-T---G------A---TAT-------------CAATTGATTATTCTG--C-T-A-A-T-TA-------AATT-GAA----GC--GCGC-TA---T-A---A--------------------------------------T----------------TA---------ATA---A---------T-ATC-----TTGA-------------------AT-------T---G-T---T---G---C-------TC-T--------C--TTT----AA--------A-Agaattgaaacattgccctctagcttcctatgaatatcaattgtatcagcattcgaaccggggcttatagtttgaagctgaatttacactacatggggattcttgca
gi|22 : ttaaatttactacgctttttaaaaacaCTCCTAT-T-ACATA----------T--GAATTAATG---A-T----A-TC-A-T--T-AA-T--T-----CA-------A-----T-TA-AA---GA--------GA-GC-A-AT-----A---AT-TC------A--ATTA-----T------A-G-----C---GTCT---------T-C--A---A-------T--------------------------T-------C---------------G---------------------GA----A---A---AGA---------A----T-T-AAA----GA-TA-T------------------------CA--T-CA--A------T-TG--------------------A--AT-T----ATG-T---G------A----A--------------C-------------A--T-A-A-A-TATCAG-----AATT-AAA----GA--TAAC-AT---T-A---ATT-----------------A---T--------------T----------------TA---------Aat
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gi|23 : t-A-T-TA-------AATT-AAATTTTGC--GAGC-AA---A-A---ATT-CC--------------A---C--------------CAC--------------GA---------ACT---A---------G-ATC-----T--A-------------------AT---------------------G---C-------GC-C--------C--ATT----AA--------A-TG-------------A-----AT---------CATTGC-TC--T-CATT-AA-T-----------T------G-AATG------A-A------------------T--------T-A-------------AA-T--G-C-ACGTATTAAT-CA----AATGA------C-------T-TAA-----T------------TAT----GCTCT---CTTCCATT----G-AA-T----TAATG-----------CG--A---A-C----AAATCAACT-AT--TGCTC-TCT-TTA---ATTgatctagttcgtggtggaatttttgctcgcaaaatttaatttaatg
gi|23 : t---C--AT--T-AAAT--T-A-A---ATTT-T-GCGAGCAAAAAT---T-C-------C--------------------------------AC---CACGAACT----A-GA-TCTAATG-CG-----------CC--C---A-T---TAAATGAATC-AT--TGCTC-TCA-TTA---ATTGAATGAATg
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gi|24 : ttaatataagaGAGAGCAATTAATTCCATTA--TG-ATAT-GT--T-G-AATTTA-A------AT-----A----T-TC-TT-T-AATATT----A---T---A---T---TCAATTGCC--------C--TTT--A----A-A-
gi|25 : ttaatataagataattaattcgcgctgcgcattacaatctggatttaaagagagcaacgtaatttcaatttaaa---A---AGA---------A----T-T-AAT----GC-GC-G------------------------CA--T-TA--A------T-CTCT------------------A--TT-T----A-A-GA--G------A---GAG-------------C-------------A--A-T-ATA-A-TC-------AATT-AAT----GA--GAGC-AT---TTA---ATT-A---------------A---T--------------TGTAGATATTGTTGAATTA---------AAG---A---------T-ATC-----TCTA-------------------AT-T---A-TATCA-T---T---G---C-------TC-T--------C--TTT----AA--------A-gaga
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|4 : aaataatggctttaattatgcatgtaGAGAGCAAT-AATTCAATTT--AAAAAAT-GT--T----G-AT-TTA-A------AG-----A----TATC-T---C-T-A--ATT----A---T---ATTGT---T--GCT-CT--------C--TTTAAA----A-A-A--G-A-ATTATT------GCTCTCAT-T-A-AT-----------T-----TAATT---AAT-----------T----A-CC-G---------------G--T--Actatcga
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gi|4 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag---T----G-C-------------------G---------------T-G------------------------CA--TATAT-G------T-CA--------------------T--ATAT----A-A-T---A------AA--TATC-------------T--T-T-A-AT-TCTTTGCTGAATT----GAA----GA--GTGT-TA---T------A---ATT----------------------------------------------------------------------G------A------------------------------------------------AT-T---A--------T---------T---G---C-------TC-T--------C--TTT----AA---A-TG-A-----AT---------TAAAGT-GC--A-CATT-AA-T-----------T------GAATT------A-A------------------TG----T-CG----CAA--T-AA-TT-C-A---ATTA-TT-Gaagaattaaagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
gi|40 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag-----T---------T-C--A---A-------T----T----A-------T----------------T---------------G---C------T-C------T--------C--TT-TA----C---T---TGA---------A--T-T-AA---T----G-C-------------------G---------------C-G------------------------CA--T-TA--AATACATC-TG--------------------A--AT-T----A-A-T---GCGCTTCA---TATC-------------A--TATGA-AT-TC-------Aatga
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gi|44 : gatttgattagaagcaataattgaat-T-A-AT-TC-------AGTT----AAA----GA--GAGC-AT---T------A---CTT----C---------------A---T--------------T----------------TA---------T-GG------ACATATATACT-AT------C-----TCTA-------------------AT-T---A--------TGTAGT----T---G---C-------Tc
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gi|6 : tcttcaaatGAGAACACT-AATTCAATTAT-TGCGCAC-AT--T------AA-TTG-A------A------A----TG-----------A--CGT----G---T---A------------------------C--ATT--A----A-T-T--G-A-ATTATT------GTTCTT-T-C-G-AT-----------T-----GAATC------------------------TC-C---------------T--T--G---------------------------------G-AT---GA--------GA-GC---A-AC-----A---ATTC------A--ATCA-----TA-G----GG------CTC-----A---------T-C--A---A-----------------------------------------------------------------------C------T--------C--AG-CA----G---A---ATG---------A--T-T-AA---T----G-C-------------------G---------------C-G------------------------C------A--A------T-TG--------------------tagggctcatcaactcagcagaatgattaatgcgcgcaattgttcagaaaggaagaagtttataattttaaaattttt
gi|7 : tcttcaaataattaatgatatcttcaattcttctgatctgaagtgcgctataattgaattattgctctcttaatgaattatatcattaatagaattaatgccagcgaatgtatcaattcagtattggatatgttcaatggaagataccactaattacatagtgaattattgcactcttccattgaattgatggttttaattcacT-GATTCAATT-------TAT-GC--CC---G-CA-TTA-A------TGTGGTGA----AATT-T---T-T-A--ATT--------T---G---G---A--GCT-CG--------C--TAT--A----A-A-T--G-A-TTTGAT------GATTTTAT-T-CCAT-----------T-----GGA-----------G-----A-T----A-TC-T---------------T--T--AA-G--TATCTAC----A-------AAGCTTT-TGTATACGGACTTTACACGC-AC---A-TT-----A---ATTCTTTTAAA--ATTG-----AA-G----AT------ATT-----G---------A-T--A---G-------T----T----A-------T----A---TAGG----T---------------G---C------T-C------C--------C--TC-TA----A---A---AGA---------A--C-T-GG---T----G-C-------------------G---------------C-G------------------------CA--T-TA--A------T-TA--------------------A--AA-T----A-A-T---G------A---TATC-------------A--T-T-A-AA-TC-------GATT----GAA----AA--GAGC-AA---A------A---ATT----C---------------AACTT--------------C----------------TG---------C-TC------G---------C-AT------C-----T----------------------AT-T---A------------AT----T---C---A-------AC-TGAAGGAAGC--AAT----AA---A-TT-A-----AT---------TATTGC-GC--G-CATT-AA-T-----------T------GAATT------A-A------------------T----AC-ACG---CTT--C-AA-TT-C-A---TTCG-AA-GAGAGC-A-ATttcagaaaggaagaagtttataattttaaaattttt
gi|7 : -AA-TTG-A------AG-----A----TATT-G---A-T-A--GTT----A---T---A---TAGGT--GCT-CC--------C--TCT--A----A-A-A--G-A-ACTGGT------GCGCGCAT-T-A-AT-----------T-----AAAAT---AAT---G-----A-T----A-TC-A---------------T--T--AA-A--T-----C----G-------A-----T-TG-AA---AA--------GA-GC---A-AA-----A---ATTC------A--ACTT-----CT-G----CTCGC---ATC-----T------------------A-------T----T----A------------A---T-------T---------------C---A------A-C------TGAAGGAAGC--AA-TA----A---A---TTA---------A--T-T-AT---T----G-C-------------------G---------------C-G------------------------CA--T-TA--A------T-TG--------------------A--AT-T----A-A-T----------A---CA-C-------------GCTT-C-A-AT-TC-------ATTC----GAA----GA--GAGC-AA---T------ctaaa
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gi|8 : tctgtaattatttacaacgcctttatataaagaattaatgcatacagtaactcttttttttAGAGCGAT-AATTCA--TAACTGGATAT-ATCTT----A-AA-TTG-A------AG-----A----TATC-T---C-T-A--GCT--------------------T---CT-CC--------C--TCG--A----ATA-T----A-ATTATT------GCGCGCAT-C-A-AT-----------T-----GAATT---ATTGTAG-----A-G----A-GC-A---------------A--T--AA-T--T-----C----A-------A-----T-TA-TT---AA--------GC-GT---A-TT-----ATTGATTG------A--ATTA-----AT-G----AT------ATCAA---T---------T-T--A---A-------T-----------------G----A---T-------T---------------G----------T-C------T-------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------TA--T-CC--A------T-TG--------------------A--AT-T----A-A-T---G------A---TATC-------------A--T-T-A-AT-TC-------AACT----GAA----GA--GAGC-AA---T------A---ATT----tg
gi|9 : tctgtaattatttacaacgcctttatataaagaattaatgcatacagtaactcttttttttattaa--TTC--A----A-A-T--G-ACATCAT-------GCTCTCAT-T-A-AT-----------TGC---GCATT---ACT---------A-TCTGCA-TC-AT--------------T--T--AA-T--T-----C----A-------A-----T-TA-CA---GA--------GAGGC---ACAT-----A---ATTG------A--ATTATTTGCGC-G----G-------AGC-----------------C--A---A-------T----T------------T----A---CA------T---------------G---T------T-C---------------C--T-------------------------------T-T-AA---T----G-C-------------------G---------------C-G------------------------CA----TA--A------T-TG--------------------C--AT----------T---G------A---TA---------------------------------------------------GA--GAGCGAA---T------A---ATT----C---------------A---T--------------T----------------TA---------A-T-----------------------------------------------------------------------------T----T---G---C--------C-G--------C--CGC----AA---ATAA-ATTCATAT---------TATTGC-TCTTT-CATCTAATT-----------T------CAATT------A-A------------------TG---CTCGC----CAT--T-AA-Tagattactgcgacctttactcaaattaatgcatgctttgaattcatttgaagagagaaataattaaaaattg
blockSeqs : A T ACTG T CT TAAT C T T TGTCGT TGGTG GCGT A . TT AT CGCAATATT G GAAGTGCG GG AA CAAG C TCTG C TACAAC A T C TGAATTAAGATT TTT GACAAAATAAGGTT A AT ATCTACAAAGCTT C T TACGGACTTTACACGC G C GTATC TTG CTTTTAA GT TGGAAGTGTTGAAGTGAAGATATTTCTGTTTACAGAGGGGCTCTCTCTAACA GAGCAATAT AA T . TCGC GCGCATCCAAATCCACGATATCGATAG AT TG ATACAT GAGTAAAGGTCGCAGTAATCT AT TTAA AA GTA ATATCAATTGATTATTCTGC G TTTGCTG GTTC ATTTT TG G ACTT TGAATC TTG CTTATTATGGTTGATAATTGGTAATGACATAAGATATCTTTAATTATATTATTGCTCT CATTTCAGC TTCAAT TTCAT AATTCAATA T TT G T T TGAATTAAGAT CGCAAA TCCTTG T GCGCGTGAGTTACGTTCTTGATAT AA A A C A CGT . C . . ATACAAAATAATTTTAATAATGATATCTTTAATTCTTTTGCGGAATTGATTAG AT TAC G GTA G GA . T T TGC
blockSeqs : A T GCG . . C . . . . . . . . AT . ATATAGTT . GAG . . . T TATG . . A . C TCCACT . ATCTGCATCATTT . . CTTTTTTTTA . . AGAGAG . . . . C TA ATTGCTCTCTTTAAATTGAAATTACGTTGCTCTCTTTAAATCCA . C C . . TCTTTTGACTTGAATTGTAGCG . CA T TCT . A TG A CGCTTCATATCATA . AG T A . . AT T . GAATCCCAAATATCTCCATACATGCATAATTAAAGCCATTATTTTGCGCT TCT AGAAG . . . . . . . . . . . TGCGCGCATC . . . C . CG . . . . TTATATTCGAGGGAGAAGCTAGAGATATCTTCAATTTAAGATATATC . . . . . A . . . .
blockSeqs : T T TTG . . . . . . . . . . . T . ATATTGTT . . . . . . ATG . . . . . TGC . GATGCTCGGTAT . . CACGTA . . TGAGA . . . . N C GATATATCTTAAATTGAAGATATCTCTAGCTTCTCCCTCGAATA . . . . . GCATAT . C . C . T C . AGAGCAACGT . C . A . . T T . AATTGTAGATATTGTTGAATTAAAGATATCTCTAATTATATCATTGCTCT TTT AAGT . . . . . . . . . . . TGCTCTCTA . . . . . T . . . . TTGATTTGATGCACGCGTCAATTTCATTATTACG . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . TG . . . . . . . . . . . A . ATATCATT . . . . . . AGT . . . . . AT . GCTCATATTCTT . . CTGCT . . TGAGA . . . . G . ATTGATATCTTTAATTAATTGCATTGTTGCGCTTTTTAAAA . . . . . TAAG . T . G . . A . AGAGCAATA . . . T . . A G . CTATTATGGATAAGTTAATGAAAGATATCTTTAATTATATTATTGCTCT AAT AATC . . . . . . . . . . . TGCTCGC . . . . . . . . . . TTTATTGTTCCGATGAGAATAACAATTTATTGTG . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . AA . . . . . . . . . . . A . ACAGAGGG . . . . . . TA . . . . . T . GATGAGCGCTGC . . TAT . . TGAGA . . . . C . TTGCACGCATTATATGATTATGATATTATAATTAATTGAA . . . . . TGCG . . . T . . T . CTTAGCAA . . . T . . A . . CGCACAATAAAAGAAAGTAATATAAATAATTTCAATTACATGTAATGC TTT ATAA . . . . . . . . . . . AGATAT . . . . . . . . . . TTATCTTAAGAGATCTTTAACTGATAGCTACA . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . TG . . . . . . . . . . . T . GAATTATT . . . . . . TT . . . . . T . GTAGAGAGCAAT . . CAA . . TGAAA . . . . C . ATGGTAATTGTAATAAAATCAATTATTGCTCTCATCGATT . . . . . GCAG . . . C . . A . AATATCTT . . . A . . T . . CCTTATGGATATGTTGAATTAAGATATCTTTAATATATTATTGTCTT TTT TTC . . . . . . . . . . . TGCGCG . . . . . . . . . . TTCAGAATTATGAAGATATATTAATATTAAG . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . TG . . . . . . . . . . . T . ATATTGTT . . . . . . TG . . . . . T . GATATCTGTT . . GAA . . TGATC . . . . C . CTGCTCGCATCTATTAATTCAACTGAAGGAAGCAATAAAT . . . . . GCT . . . T . . A . ACACGCTT . . . A . . A . . CATATGGATATGTTGTATTATAAGATATCTTAATTTATTATTGCT TTT AAA . . . . . . . . . . . TGATAT . . . . . . . . . . CTTAATTATGCTCTCTTCCATTGAATTAATG . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . TA . . . . . . . . . . . T . GAATTATT . . . . . . AG . . . . . T . AATATCATTA . . GAT . . TGAAG . . . . C . AAGATATCTTTAATTATTTACAACCCTTTTATTTTAAG . . . . . GCA . . . C . . A . AGAGCAA . . . G . . T . . AATTCAATCAACGTGTGCAATTATTGATAATTATTGCTCT TTT AAG . . . . . . . . . . . CGATAT . . . . . . . . . . TTCTTTTAAAGATATCTCCAATTATATTGTT . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . TG . . . . . . . . . . . G . ATATAGGT . . . . . . TA . . . . . T . GATAATATT . . CAG . . AGAAA . . . . C . AAGATATCTTTAAATTATTTACAACACTTTTATTTAAG . . . . . GCG . . . C . . A . CTCTCAT . . . A . . T . . ATTTGCGGCGCATTAAATTATTAATGGCGTTTAAATTC TAT AAG . . . . . . . . . . . TGATAT . . . . . . . . . . TTCCACCACGAACTAGATCTAATGCG . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . TG . . . . . . . . . . . T . ATATTCA . . . . . . TG . . . . . T . GCGAGCATT . . CAA . . TGCGA . . . . C . ATAGTATATCTTTAATTAATTACAATACTTTTGTAAG . . . . . GCA . . . G . . A . AGAGCAA . . . A . . T . . CAACTTCTGCTCGCATCTATTAATTCAACTGAAGGAAG TGT AAG . . . . . . . . . . . TGCGCG . . . . . . . . . . TTATTTTAATAGATTTGATGG . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . TG . . . . . . . . . . . T . ATTATT . . . . . . TC . . . . . T . GATATCTTT . . GAT . . CGCGC . . . . G . GGATATGTTCAATGGAAGATACCACTAATTACATAGT . . . . . ATG . . . C . . T . AGAGCAT . . . A . . T . . CATTTAAAAAAGCAATAATTCAGCTATAGCGCGCC TTT AAG . . . . . . . . . . . TGCTAT . . . . . . . . . . TTGAATCGATGGTAATTGTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . AA . . . . . . . . . . . T . ATATT . . . . . . AC . . . . . T . GCTCGGTAT . . GAA . . AGAGA . . . . G . AAGATATCTTTAATTATTCAGCAGCATTTATATAAG . . . . . GCA . . . T . . A . ATCTCTT . . . G . . A . . GAATTAAAGATATCTCTAATTATATTGTTGCTCT ATT AAC . . . . . . . . . . . TAATAT . . . . . . . . . . TTCAATTATTGCA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AG . . . . . . . . . . . T . CTTCT . . . . . . AG . . . . . T . GATATCATT . . CAA . . AAAGG . . . . C . AGATATCTTTAATTATTTACAGCACTTTATTTTAAG . . . . . AGA . . . C . . A . AGAGCAA . . . T . . A . . CAATTATTGCGCACATTAATTGAAATGACGTGTA TTT ACG . . . . . . . . . . . CGATAT . . . . . . . . . . TTCAATCAATGCG . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . T . ATTT . . . . . . TG . . . . . T . GATAACTTC . . CAA . . TGCGC . . . . C . ACGACATTCGAAATGATAAAGTTGCTCTTCCTGAGA . . . . . GCG . . . C . . A . CTCTCTT . . . T . . A . . CGATTATTGACCTCCTTTAATGAATTAGTGTCG TTT ATG . . . . . . . . . . . TGAGAG . . . . . . . . . . TTCAATTATAGTG . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . C . ATAT . . . . . . AG . . . . . T . GATATCATT . . CAA . . AGAGA . . . . C . TTGCGCGTATCAATTAAATTGATGCGCGCATTAATT . . . . . GCG . . . G . . A . AGAGCAA . . . T . . G . . CATTATTGCGCGTATCAATTAAATTGATGCGCG TTC ATC . . . . . . . . . . . TACACG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . TGGA . . . . . . TG . . . . . T . GCTCTCTTT . . GAA . . GGAGA . . . . G . AAGATATTGATAGTTATATAGGTGCTCCCTCTAAAA . . . . . GCG . . . G . . A . CACGCGT . . . C . . A . . CTTTTAAAGATATCTCCAATTATATTGTTCT ATA ATC . . . . . . . . . . . TGATAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . ATT . . . . . . TG . . . . . A . GCACGCGTC . . GAA . . GGAGG . . . . T . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT . . . . . TAT . . . C . . T . ATCTCTT . . . A . . T . . CAATGGATACAGACAATCATTAAATTGATAT TCT AAC . . . . . . . . . . . GATAA . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . ATA . . . . . . TG . . . . . T . GTGCGTATG . . CAA . . TGAGA . . . . C . ATTCTCTTTCATTCATTAAAGATATCATTTAAAG . . . . . GAA . . . G . . A . CTATCAA . . . A . . A . . CCATTATGATATGTTGAATTTAAATATT ATT TTG . . . . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . GTA . . . . . . AG . . . . . T . GATATTGTT . . GAA . . TACGC . . . . C . AAGATATCTCCAATTATATTGTTCTCTTTAAAA . . . . . GCG . . . G . . C . CTCTCTT . . . A . . T . . TTAATAATATCTTGAATTGTTGCTCT TTT ATG . . . . . . . . . . . TGTCG . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . TG . . . . . T . GATATCTTT . . CAA . . AGAGA . . . . C . TTGATAGCATTAATTTAATTATTTTGCT . . . . . GCT . . . G . . T . AGAGCAA . . . T . . A . . CCACCACGAACTAGATCTAATGCGCC TTT AAG . . . . . . . . . . . CGTC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . T . GATATCATT . . GAA . . TGAGA . . . . C . TTTGCGCGGAGCCAATTTACATGTTCCT . . . . . NNN . . . G . . A . NNNGCAT . . . A . . A . . CATTTCGAATGTCGTCAATTGCTCA ATT TTG . . . . . . . . . . . TGTT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . T . GCATACAGT . . TCA . . TGCCA . . . . G . TAGTTTAAGTATTGCTCTCTTCAAAT . . . . . GCG . . . G . . A . ATATCAT . . . T . . A . . CATTTGATGTGCTCAATAATTC AAT ATT . . . . . . . . . . . TACG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . T . GAATATTT . . CAA . . TGAGA . . . . A . ATGACTTAATTATGCTCTCTTCCATT . . . . . GCG . . . N . . A . CGTGCTT . . . G . . A . . CGATTCAATTATAGTGCTCAT ATT AG . . . . . . . . . . . TTA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . T . GATATCTG . . CAA . . AAAGA . . . . G . ATCCTGCAAACATTAATTGATTTTTT . . . . . ACA . . . C . . N . AAATCGT . . . T . . A . . GAATCGATGGTAATTGTAAT CGC . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . GTCGCAAT . . CAA . . TAAGC . . . . G . ATGATATCAATTTAATGATTGTCT . . . . . GTG . . . G . . T . ATATTGT . . . A . . A . . GAATTAATGATATCAATTT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . ATATCATT . . GAA . . GGGA . . . . C . TTACGTTCGTCAATGGTGTTAAG . . . . . GCG . . . A . . A . ATATCAT . . . T . . T . . CATTTAATTTGCCG . . .
blockSeqs : . . . . . T . GTCCATT . . CGA . . TGAT . . . . C . AAGATCTTGATATCTTCAATTCC . . . . . GCA . . . G . . T . AGAGCAA . . . A . . A . . GAATTATTGCTCT .
blockSeqs : . . . . . T . GCTATAT . . CAA . . TAA . . . . C . TAGGGCTCATCAACTCAGCAGAA . . . . . GCA . . . G . . C . CTCTCTT . . . T . . C . . .
blockSeqs : . . . T . TACCGGT . . CAA . . AGA . . . . C . TAGGAATTAATGCCTTTGAAT . . . . . GTG . . . C . . A . ATATCAT . . . A . . A . . .
blockSeqs : . . . T . GATATC . . C . . TA . . . . C . TAGCGTCTTCAATTCGGAAAA . . . . . GCG . . . A . . A . ATATAT . . . T . . A . .
blockSeqs : . . . . . TCCTT . . C . . T . . . . G . AATAATTTCAATTACAT . . . . . GCA . . . G . . A . TCCAT . . . C . . T . .
blockSeqs : . . . . . TCGC . . . . . . . . . G . TTGCTCTGCATTATAT . . . . . TCT . . . G . . T . AACAT . . . A . . T . .
blockSeqs : . . . . . GA . . . . . . . . . GTGGTATCTTCATTCT . . . . . GCA . . . G . . A . ATATC . . . A . . A . .
blockSeqs : . . . . TT . . . . . . . . . . ACT . . . G . . A . AGCA . . . T . . A . .
blockSeqs : . TA . . . . . . . . GCG . . . G . . A . ATA . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GCG . . . G . . A . GT . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . GCG . . . A . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GCG . . . G . . T . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . GCG . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . . G . .
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blockSeqs : . . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : TG** *** ATATTGTT*************** *** GATATCGTT********************************** CAA********************* TGAGA************ *** *** ANATCAT************************* ANG***** TGATAT************************** **
originalCons : GAGAGCAAT-AATTCAATTA--TGGATAT-GT--T----G-AA-TTA-A------AG-----A----TATC-T---T-T-A--ATT----A---T---A---T---T--GCT-CT--------C--TTT--A----A-A-T--G-A-ATTATT------GCTCTCAT-T-A-AT-----------T-----GAATT---AAT---G-----A-T----A-TC-G---------------T--T--AA-T--T-----C----A-------A-----T-TA-AT---GA--------GA-GC---A-AT-----A---ATTC------A--ATTA-----AN-G----AT------ATC-----T---------T-C--A---A-------T----T----A-------T----A---T-------T---------------G---C------T-C------T--------C--TT-TA----A---A---NGA---------A--T-T-AA---T----G-C-------------------G---------------C-G------------------------CA--T-TA--A------T-TG--------------------A--AT-T----A-A-T---G------A---TATC-------------G--T-T-A-AT-TC-------AATT----AAN----GA--GAGC-AA---T------A---ATT----C---------------A---T--------------T----------------TA---------A-NG------A---------T-AT------C-----TTCA-------------------AT-T---A--------T---AT----T---G---C-------TC-T--------C--TTT----AA---A-AG-A-----AT---------TATTGC-TC--T-CATC-AA-T-----------T------GAATT------A-A------------------TG---AT-AT----CAT--T-AA-TT-C-A---ATTA-AT-GAGAGC-A-ATAAT---T----------C-------T-T-------T------------TAA--A-GATAT---CTTCAATT----A-T-A-T----TG-CG-----------CG--C---A-T---TAAATGAATT-AT--TGC--TC-TCA-TTA---ATTGAATTAATGA
finalCons : GAGAGCAAT-AATTCAATTATG--GATAT-GT--T----G-AA-TTA-A------AG-----A----TATC-T---T-T-A--ATTATATTGTT---------------GCT-CT--------C--TTT--A----A-A-T--G-A-ATTATT------GCTCTCAT-T-A-AT-----------T-----GAATT---AATGATATCGTT----------------------------------AA-T--TCAA---------------------T-TA-ATGAGA------------GC---A-AT-----A---ATTC------A--ATTA-----AN-G----AT------ATC-----T---------T-C--A---A-------T----T----A-------T----A---T-------T---------------G---C------T-C------T--------C--TT-TA----A---A---NGA---------A--T-T-AA---T----G-C-------------------G---------------C-G------------------------CA--T-TA--A------T-TG--------------------A--AT-T----A-A-T---GANATCAT-------------------------T-A-AT-TC-------AATT----AAN----GA--GAGC-AA---T------A---ATT----C---------------A---T--------------T----------------TA---------A-NG------A---------T-AT------C-----TTCA-------------------AT-T---A--------T---AT----T---G---C-------TC-T--------C--TTT----AAANG-----A-----AT---------TATTGC-TC--T-CATC-AA-T-----------T------GAATT------A-ATGATAT--------------------------CAT--T-AA-TT-C-A---ATTA-AT-GAGAGC-A-ATAAT---T----------C-------T-T-------T------------TAA--A-GATAT---CTTCAATT----A-T-A-T----TG-CG-----------CG--C---A-T---TAAATGAATT-AT--TGC--TC-TCA-TTA---ATTGAATTAATGA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): CAATTATATAGCGCGCATCAATTCATAATTTTAATGTCATCAACATCTCAATTAATTACTTTTACATTTGAAGATATAATTAATTATTTGAGGAGATCTTTAATT
Unaligned ( gi|37 ): ATTCCTTTAAAGTCTTGAAGATCTTATCCTCGCGCCGCCATTTAAATTCCGAGATTATAAGATATCGTTTTTAATAATAAAGACCTATAGCTTCATATTATTT
Unaligned ( gi|41 ): ATTGATACACGCATTAATTAATGTGGTGAAATTACTCACAAAATTTAATTTAGAGCTCGGTATAAATGTTTAATTTCCTTAATTCC
Unaligned ( gi|45 ): TATCAAATGGATTTGATGATCTCTCTAATTTAATTAAAGATTTCTTTAAATATTTACAACGCTTTTG
Unaligned ( gi|48 ): CCATCAATTCAATTAATTTGCACAATAATTTAGATTTGAAGATGTTATTGATTATTGGA
Unaligned ( gi|49 ): ACTTAGCAACAATTCAATTATAGTGCGCTTCAATTCAGCAGAAGAATTAATGATATC
Unaligned ( gi|51 ): TGTAGTGGAGTTATTGCTCGCAAAATTAAATTTAATGCTC
Unaligned ( gi|52 ): AGTGCTCTTCAATTTAGCAAAAGAATTAAAGATATCATC
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gi|1 : taattgcatAT-AATTCAATT-A--T--ATGC-GT--T----GCAA-TTA-A--------TGTCGT-------G--GC----------TATGTT------TGCT-TCGCA--A----T--ATT-A-AT-T--C------GG-T----AT-AA-AA-----------T-----GATTT---A----AT---G---AT----C-TCT-T--TT-AAT--T-----CA-------A-----T-T------A-A------GA--------TA-TCT-GTTAA---ATT----------ATT-T-----AC-G----C----G------AT-T--T------------------A-TT----A-------T----AGGAAT-------T---------------A---A------T-GC--------C-TT-TG----A---A-TA---G---------C--TC-GAC----ATC-------------------GCT------------------------CA--T--A--A------T-T------CA--TT-----------T--AC--A---G-------------A---G-AG---C--A-------------A-T---------A-A-T-T---------AATT-AAAGA--G-GA-A-----T-T---A---ATT-C---------------A---TATGGATATGTTGTA--T-----TAT--------AAG--A---------T-AT-C-----TTAA-------------------TT-T----A--TT--AT----T---G---C-------T--------------TCT----AA--AAGT-A------AT---------T-----ATT-GC-TC--T-CATT-TA-A-----------T------G--TTA-A-------------------G---AT-AA---TAT--TAA-TT-C-A---A--TTAAT-GAGAGCAAT---------------------------------------------------------------T-TCAAT---------T--------A-T----TG-CA-----------CG--C-----A-T---TA-TA-TG-ATT-ATGATATTA-TAA-TTA---ATTGAAcgttgcaattaatgtcgtggctatgtttgcttcgcaatattaattcggtataaaatgatttaatgatctcttttaattcaattaagatatctgttaaattatttacgcgatttattataggaattaatgcctttgaatagctcgacatcgctcataattcatttacagagagcaataattaattaaagaggaattaattcatatggatatgttgtattataagatatcttaatttattattgcttctaaaagtaattattgctctcatttaatgttaagataatattaattcaattaatgagagcaatttcaattattgcacgcattatatgattatgatattataattaattgaagagagcaatatattattgggcattattgaattaaatgatatattaattcaattaaagaagcaatcaatttgcggcgcattaaattattaatggcgtttaaattcatttaaagaagaataattcaatatatagcgctcttcaattcgcaaagaattaaagatatcatcaattgatattaatgcgcgcataattcagaattatgaagatatattaatattaagagatctttgattgaattatggcgcattaaataattaagatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|1 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattAGAGGAATTAATTCA--T-A--TGGATAT-GT--T----G-TA-TTATAAG-----ATATCTT-------A--AT----------T-TATT----ATTGCT---TCT--A----A--AAGTA-AT-TATT------GC-TCT-CAT-TT-AA-----------T-----G--TT---A----A----G---AT----A-ATA-T--T--AAT--T-----CA-------A-----T-T------A-AT-----GA--------GA-GCA-AT-------TTC------A--ATT-ATTGC-AC-GCATTA----T------AT-------------------G---A-TT----A-------T----G----A-------T---------------A---T------T-AT--------A-AT-TA----ATTGA-AG---AGAGCAATATA--TT-ATT----G---------------------G-G------------------------CA--T-T---A------T-T------GA--AT-----------TA-AA--T---G-------------A---T-AT------A-------------T-T---------A-A-T-T-C-------AATT-AAAGA---AGC-A-----A-T---C---A-------------------A---T----------------T-----T----------GCG--G---------C-GC-A-----TTAA-------------------AT-T----A--TTA-AT----G---G---CGTTTAAATT-C--------A--TTT----AAAGAAG--A------ATAATTCAATAT-----ATA-GC-GC--T-CTTC-AA-T-----------TCGCAAAGAATTA-A------------------AG---AT-AT---CAT--CAA-TT-G-AT--A--TTAAT-GCGCGC-ATAAT---T---CAGAA---T-T-------A------------TGA--A-GA-TAT--------------AT--TA---A-T--------A-T----TA-AG-----------AGATC-----T-T---TG-AT-TGAATT-AT--GG--C-GCA-TTA---AAT-AATTA-gagagcaatatattattgggcattattgaattaaatgatatattaattcaattaaagaagcaatcaatttgcggcgcattaaattattaatggcgtttaaattcatttaaagaagaataattcaatatatagcgctcttcaattcgcaaagaattaaagatatcatcaattgatattaatgcgcgcataattcagaattatgaagatatattaatattaagagatctttgattgaattatggcgcattaaataattaagatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|10 : taattgcatttaatctgcgcattaatctaattagagattgaatattgaattattgcgagcactagtattttaattcattaagaggaataaatcaaattatatagcgcgcacctaattaattaaaagcaaatatcatttatttgacggctattatgaagaagagcgatcaatattgtaatgcgcgcaaaattcattattgctcattataattcaattatatgcgttgcaattaatgtcgtggctatgtttgcttcgcaatattaattcggtataaaatgatttaatgatctcttttaattcaattaagatatctgttaaattatttacgcgatttattataggaattaatgcctttgaatagctcgacatcgctcataattcatttacagagagcaataattaattaaAATT-A--AAGATAT-CT--TTAATG-AA-TTA-AAG-----AGATATT-A-----A--AT----------CAT-TT----ATACCGAGCATT--A----A--TTA-A-AT--ATT------GC-GAG-CAA-TA-AT-----------TCCACTACATT---A----AT---G---CG----A-GCA-T--T--AAT--T-----GA-------A-----T-T------A-AT-----GA--------GA-GCA-AN--N---NNNN------N--NNN-N-----NN-N----N----N------NN-N--N---------N-N--N---N-NN----N-------N----N----N-------N---------------N---N------N-NN--------N-NN-NN----N---NTTG---A---------AC-TT-AAT----G-T-------------------GC-------------------------CA--T-TA--A------T-C------TA--A------------T--AT--T---G-------------C---T-CT---C--A-------------T-T---------A-A-T-T---------GATT-AGTGC--GCGC-A-----A-T---A---ATT-C---------------G---A----------------T-----TA---------TTG--A---------C-CTCC-----TTTA-------------------AT-G----AATT---AG----T---G-----------TC-G--------C--AAT----AA--TTC--A------AT---------T-----ATT-GC--C--T-CTTT-AA-T-----------T------GAA-TA-A------------------TG---CG-CG---CA---TAA-TG-C-A---A--TTAAT-GAGAGCAATAAT---T---C-------gatattctttaatattagtatttatatgagtttctgtt
gi|11 : tat-AATTCA-TT-AG-CGGATAT-GT--T----A-AA-TTA-ACG-----ATATCTT-T-----A--AT----------CATATA----GTTGCTCTCTTT--ACAAGA--ATT-A-AT-TATT------GC-TCT-CTT-TA-A------------------GAATT---A----AT---G---A-------------------------------------------------------------GG--------GA-GCA-AT--A---ATTG------A--ATT-ATT---AC-G---------T-------T-C--G---------T-C--A---A-TG----G-------T----G----T-------T-------------------------------------------------A---A-GT---A---------A---T-GAT----A-C----------------------------------------------CA--T-TA--A------T-T------CA--AT-----------G--GA--A---G-------------A---G-AG---C--A-------------A-T---------A-A-T-T-G-------ATTT-ATTGA--GCGC-T-----T-T---A---ATT-C---------------A---T----------------T-----TA---------AAA--A-----------AG-CAATAATTCA-------------------GC-T----A--T---AG----C---G---C-------GC-C--------CCATTTCAGCAG--AAA--A------AT---------T-----AAT-GA-T------ATG-AA-T-----------T------AAATTA-A------------------TC---AT--T---AAT--TAT-TT-C-A---A--attt
gi|12 : T--A----A--ATG-A-TT-TAAT------GA-TCT-CTT-TT-AT-----------T-----CAATT---A----AA---G---AT----A-TCT-T--T--AAT--T-----gatat
gi|12 : ggta---ATTC------A--ATT-A-----AA-G----A----T------AT-C--T---------T-T--A---A-TT----A-------T---------T-------T---------------A---CAA----C-CC--------T-TT-TATTTTA---A-GG---A---------A--TTTAAT----G-C-------------------GCA------------------------CA--T-TA--A------T-T------TC--AT-----------TTTAA--A---A-------------G---G-AG---C--A-------------T-----------A-A-T-T-C-------A-TT-AAAGATGAAGC-A-----A-TT--A---ATT-CTTATTATGGTTGATAA---T----------------TGG---TA---------ATG--ACATAAGA--T-AT-C-----TTTA-------------------AT-T----A--T---AT----TATTG---C-------TC-T--------C--TTT----AA--AAG--A------AT---------T-----ATT-GC-TC--T-CATT-AA-T-----------T------GGATTA-A------------------TG---AT-AT---CAT--TCA-TT-C-A---G--TTAAT-GAGAGCatttacaacccttttattttaaggaatttaatgcgcacattaatttcattttaaaaggagcataattcattaaagatgaagcaattaattcttattatggttgataattggtaatgacataagatatctttaattatattattgctctctttaaaagaattattgctctcattaattggattaatgatatcattcattcagttaatgagagc
gi|13 : ggtataaatgatttaatgatctcttttG-A-AT-TATT------GC-TCG-CAA-TA-TT-----------T-----AATTT---T----AT---G---CT-------CGGTA-T--AAA--T-----GA-------T-----T-T------A-AT-----GA--------T--TCT-TT--A---ATTC------A--ATT-A-----AA-G----A----T------AT-C--T---------T-T--A---A-TT----A-------T----T----C-------A---------------G---C------A-GC--------A-TT-TATAT-A---A-GG---A---------A--TT-AAT----G-C-------------------GCG------------------------CA--T-T---A------T-T------CA--TT-----------T--AA--A---G-------------A---G-AG---CA-A-------------TAT---------A-A-T-T-C-------AATT-AAAGA--GAGC-A-----T-T---A---ATT-C---------------C---T----------------TATGGATATGTTGAATTAAG--A---------T-AT-C-----TTTA-------------------ATAT----AT-T---AT----T---G---T-------CT-T--------C--TTT----AA--AAG--A------AT---------T-----ATT-GC-TC--T-CATT-AA-A-----------T------GAATTA-A------------------TG---AT-
gi|14 : gtgG-A-AT-TATT------GC-TCG-CAA--A-AT-----------T--------TT---A----AT-------------------T--T--AATATT-----CA-------G-----T----------AT-----AA---------------AT--G---ATT-------A--ATT-G-----AT-----------T------CT-C--T---------T-T--C---A-TT------------C----A----T-------TAAA------------G---A------T-AT--------CATT-TA----A---A-GA---G---------A------------------------------------G------------------------CA--A-TA--A------T-T------CA--AT-----------T--AA--A---G-------------A---G-AG---C--A-------------T-----------A-A-T-T-C-------AATT-ATGG-----GC-A-------T---G----TT-G---------------A---A----------------T-----TA---------AAG--A---------T-AT-C-----TCTA-------------------AT-T----A--T---AT----T---GTTGC-------TC-T--------C--TTT----AA--AAG--A------AT---------T-----ACT-GC-TC--T-CATT-AA-TTGAATTAAGATT------GAATTA-A------------------CG---AT-AT---CAT--TAA-TT-C-A---A--TTATT-GAGA
gi|14 : gtagtgGAGAGCA-T-AATTCAATT-A--TGGGCAT-GT--T----G-AA-TTA-AAG-----ATATCTC-T-----A--AT----------TATATT----GTTGCTCTCTTT--A----A--AAG-A-AT-TACT------GC-TCT-CAT-TA-ATTGAATTAAGATT-----GAATT---A----AC---G---AT----A-TCA-T--T--AAT--T-----CA-------A-----T-T------A-TT-----GA--------GA-
gi|15 : gtagtggaattattgctcgcaaaattttaatttaatattcagtataaatgattaattgattctctttcattcattaaagatatcatttaaagagagcaataattcaattaaa---ATTC------A--ATT-A-----AA-G----A----T------AT-C--T---------T-T--A---AATT----A-------T---------T-------T---------------A---CAACACTT-TT--------A-TT-TA----A-----GG---A---------A--TT-AAT----G-C-------------------GCA------------------------CA--T-TA--A------T-T------CA--TT-----------T--AA--A---G-------------A---G-AG---C--A-------------A-T---------A-A-T-T-C-------AATT-AA-GA--GAGC-A-----T-T---A---ATT-CTATTATGG-------A---TAAG-------------T-----TA---------ATG--AAAGA-----T-AT-C-----TTTA-------------------AT-T----A--T---AT----TATTG---C-------TC-T--------C--TTT----AA--AAG--A------AT---------T-----ATT-GC-TC--T-CATT-AA-T-----------T------GGATTA-A------------------TG---AT-AT---CAT--TCA-TT-C-A---G--TTAAT-GAGAGC
gi|16 : ataatgatttaaatgatctctttt--ATC-A-AT-AATT------GC-ACA-CGT-TG-AT-----------T-----GAATT---AGTTAAT---GC--AC----A-CTT-T--G--AA---------CA-------A-----T-T------A-ATTTGAAGA--------GA-GCA-AT--A---ATTA------G--ACC-------AT-A----A----C------ATGC--T---------T-C--A---A-TT----A------------A----T-------TTGAAGAGA-------G---C------A-AT--------A-CT-TA----A---A-CT---A-------------T-AAC----G-T-------------------GC-----------------------------T-TG--A------T-TTCAACAGA--AT-----------A--AACCT---T-------------ATTTT-GT---C--A-------------T-C---------A-A-T-T-C-------AATT-AATGC--GCGT-A-----A-T---A---ATG-CAG-------------A---T----------------T-----TG---------GAG--A---------T-AT-G-----ATTA-------------------AT-T----A--T---
gi|17 : agagagcaataatt-----ATT-GC-TC--T-CATC-AA-T-----------T------GAAATA-A------------------TG---CG-CG---CAC--TAA-TT-CAA---A--TTGAT-GAGAGC---AGT---T---A-------T-T-------T------------TAAT-A-GA-T-----------T-TGA---------------------------TG--G-----------CA--C-----A-T---TA-AT-TCAATT-AT--TACTT-TCA-TCATGCATTGAta
gi|18 : aagtgttgtaattaatttgaaatatctcgagggaattgaagagattaacaaattatatagactgagctccaaatttgcaagctctgatcctacgG-A-AT-TATT------GC-TCG-CAA--A-AT-----------T-----TAATT---------T---G---AT----GCTCGGTA-T--AAA--T-----GA-------T-----T-T------A-AT-----GA--------TC-TCT-TT--T---ATTC------A--ATT-A-----A--G----A----T------AT-C--T---------T-T--A---A-TT----A-------TTTACA----G-------C---------------A---C------T-TT--------A-TT-TT----A---A-GG---A---------A--TT-AAT----G-C-------------------GCA------------------------CA--T-TA--A------T-T------CA--CT-----------T--AA--A---G-------------A---G-AG---C--A-------------A-T---------A-T-T-T-C-------AATT-AAAGA--GAGC-A-----T-T---A---ATT-C---------------A---A----------------T-----TA---------TGG--A---------T-AA-G-----TTGA-------------------AT-T----A--
gi|19 : tcaatgtagtaC------A--ATT-G-----AC-G----A----C------AT--------------T-CGAA---A-TG----A-------T----AAAG-T-------T---------------G---C------T-CT--------T-CC-TG----A---G-AG---A---------A--TT-ATT----G-CT------------------AAG------------------------AA--T-TA--A------T-T------GA--AT-----------T--AA--T---G-------------A---T-ATGCGC--A-------------T-T---------A-a
gi|2 : aatttggagctcagtctatataatttgttaatctcttcaattccctcgagatatttcaaattaattacaacacttttgtaaagtgatcatttcttttgttttataatgag-CAT-TG-AT-----------T-----CAATT---A----AC---G----T------CCA-T--T--GAT--T-----GA-------A-----T-T------G-AT-----GA--------AG-ACA-AT--A---ATTG------A--ATC-G-----AT-G----G----T------AA-T--TGTAATAAAAT-C--A---A-TT----A-------T-----------------T---------------G---C------T-CT--------C-AT-CG----A---T-TG---A---------A--TT-AAT----G-C-------------------GCGCATCCAAATCCACGATATCGATAGCA--A-TA--A------T-T------GA--TT-----------T--GA--T---G-------------C---A-CG---C--G-------------T-C---------A-A-T-T-T-------CATT-ATTAC--GCGC-A-----A-T---A---ATT-G---------------A---A----------------T-----CC---------CAA--A---------T-AT-C-----TCCATACATGCATAATTAAAGCCAT-T----A--T---TT----T---G---C-------GC-T--------C--TGT----AA--ACG--A------CT---------T------TT-G
gi|2 : atcattGATAGCATT-AATTTAATT-A--T---TTT-GC--T----G-AA-TTG-ACG-----AGCGTTA-T-----A--AT----------TGAATT----ATTGATCTCTTC--A----A--ATA-A-AT-CAAT------A----T-CAA-CA-AT-----------T-----GAATC---A----AT---------------TCG-C------A---------CA-------A-----T-A------A-AA-----GA--------AA-GTA-AT--A------------------T-A-----A-------A----T------AA-T--T---------T-C--A---A-TT----A-------C----A----T----------------------------------------------------------------G-----------------T-AAT----G-C-------------------AGA------------------------CA--T-TG--A------T-T------CA--AT-----------T--AA--C---G-------------T---C------C--A-------------T-T---------G-A-T-T-G-------AATT-GATGA--AGAC-A-----A-T---A---ATT-G---------------A---A----------------T-----CG---------ATG--G---------T-A-------------------------------AT-T----G--T---AA----T---A---------------------------------AA--ATC--A------AT---------T-----ATT-GC-TC--T-CATC-GA-T-----------T------GAATTA-A------------------TGCGCGC-ATC--CA----AA-TC-C-ACG-A--T--ATCGATAGCAATAAT---T---G-------A-T-------T------------T------GA-TGCACGC-----G-TCAAT--TTC--ATT--------A-T----TA-CG-----------CG--C-----A-A---TA-AT-TGAATtctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaattgattcaattgttgatattgatttatttgaagagatcaataattcaattataacgctcgtcaattcagcaaaataattaaattaatgctatcaagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|2 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggT-TATT------GC-GAT-CAT-TA-AT-----------T-----GAACT---C----TT---G---AT----A-GCA-T--T--AAT--T-----TA-------A-----T-T------A-TT-----------------------T--T---GCTG------A--ATT-G-----AC-G----AGCGTT------AT-AA-T---------T-G--A---A-TT----A-------T-----------------T---------------G---A------T-CT--------C-TT-CA----A---A-TA---A---------A--TC-AAT----A-T----------------------------------------------CA--A-CA--A------T-T------GA--AT-----------C--AA--T------------------------T---C--G-------------C-------------A-----C-------AATA-AAAGA--AAGT-A-----A-T---A--------------------------------------------------TA---------A----A---------T-AA-T-----TTCA-------------------AT-T----A--C---ATGTAAT---G---C-------AG-A--------C--ATT----GA--TTC--A------AT---------T-----AAC-G--TC----CATT-GA-T-----------T------GAATTG-A------------------TG---AA-GA---CAA--TAA-TT-G-A---A--TCGAT-G------GTAAT---T---G-------T-A-------A------------TAA--A-A----------------TCAAT---------T--------A-T----TG-CT-----------CT--C-----A-T---CG-AT-TGAATT-AA--TGCGC-GCA-Taagagttcaattaatgatcgcaataaagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|2 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgcatcaaatcaattattgctatcgatatcgtggatttgg-----ATC-GC-T---T-CA---AA-T-------------------AATTA-A------------------TG---AT-AA---CTT--CAC-TC-C-T---GCTTTATT-GCGATCATTAAT---TGAAC-------T-C-------T------------T------GA-TAG---CATTAAT-TTAAT--T----A-TTTTGCTGAA-T----TGACG-----------AG--C-----G-T---TATAATTGAATT-AT--TGATC-TCT-TCA---AATAAATCA-ATagcaggagtgaagttatcattaattatttgaagcgatcgttattt
gi|20 : atcattcaaaagtcgtttacagagcgcaaaataatggctttaattatgcatgtatggagatatttgggattcaattattgcgcgtaataatgaaattgacgcgtgcatcaaatcaattattgctatcgatatcgtggatttggatgcgcgcattaattcaatcgatgagagcaataattgattttattacaattaccatcgattcaattattgtcttcatcaattcaatcaatggacgttaattgaatcaatgtctgcattacatgtaattgaaattatttatattactttcttttattgtgcgaattgattcaattgttgatT----G-A-------------------GCG------------------------GA--T-CA--A------T-T-----------T-----------T--AA--T---G-------------C---T-AT---C--A-------------A-C---------A-G-T-T-C-------AATT-AAC----GTGC-A-----G-T---A---ATT-CAG-------------A---T----------------T-----TG---------AAG--A---------T-AT-C-----ATTA-------------------AT-T----A--T---cgttattt
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gi|30 : atgagagcaataatagctcactctaaaacaattattgttcacatccattgtatgaataatatcattaaattgaattgaggagagcaataattcaaatcctgcaaa---------------G---C------A-CT--------T-TTGTAT---A---A-GG---A---------A--TT-AAT----G-C-------------------ACA------------------------CA--T-TA--A------T-T----------AT-----------TTGAA--G---G-------------A---C-AG---C--A-------------A-C---------A-A-T-T-taaattt
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gi|4 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagT----G-C-------------------GTG------------------------CA--TATAT-G------T-C------AT--ATA----------T--AA--T---A-------------A---ATAT---C--T-------------T-T---------A-A-T-T-CTTTGCTGAATT-GAAGA--GTGT-T-----A-T---A---ATT---------------------------------------------------------G--A-------------------------------------------AT-T----A--T---------T---G---C-------TC-T--------C--TTT----AA--ATG--A------AT---------T-----AAA-GT-GC--A-CATT-AA-T-----------T------GAATTA-A------------------TG----T-CG---CAA--TAA-TT-C-A---A--TTATT-Gaagaattaaagatatttattatatatgacatatatgcacgcaatga
gi|40 : cgcacattaattcatttaaagagagcaataattcaatttaaaaaatgttgatttaaagatatctctaattatattgttgctctctttaaaaaagaattattgctctcattaatttaattaattaccggtatataattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag--T---------T-C--A---A-TT----A-------T-----------------T---------------G---C------T-CT--------C-TT-TA----C---T-TG---A---------A--TT-AAT----G-C-------------------GCG------------------------CA--T-TA--AATACATC-T------GA--AT-----------T--AA--T---GCGCTTC-------A---T-AT---C--A-------------TATG--------A-A-T-T-C-------Aatga
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gi|7 : tcttcaaataattaatgatatcttcaattcttctgatctgaagtgcgctataattgaattattgctctcttaatgaattatatcattaatagaattaatgccagcgaatgtatcaattcagtattggatatgttcaatggaagataccactaattacatagtgaattattgcactcttccT-GATTCAATT--------TAT-GC--CC---G-CA-TTA-ATGTGGTGAAATTTT-T-----A--AT----------T----T----GGAGCTCGCTAT--A----A--ATG-A-TT-TGAT------GA-TTT-TAT-TCCAT-----------T-----GGA---------------G---AT----A-TCT-T--T--AAG--TATCTACA-------AAGCTTT-T------GTATACG--GACTTTACACGC-ACA-TT--A---ATTCTTTTAAA--ATT-G-----AA-G----A----T------AT-T--G---------A-T--A---G-TT----A-------T----A----TAGG----T---------------G---C------T-CC--------C-TC-TA----A---A-AG---A---------A--CT-GGT----G-C-------------------GCG------------------------CA--T-TA--A------T-T------AA--AA-----------T--AA--T---G-------------A---T-AT---C--A-------------T-T---------A-A-A-T-C-------GATT-GAAAA--GAGC-A-----A-A---A---ATT-C---------------AACTT----------------C-----TG---------CTC--G---------C-AT-C-----T----------------------AT-T----A------AT----T---C---A-------AC-TGAAGGAAGC--AAT----AA--ATT--A------AT---------T-----ATT-GC-GC--G-CATT-AA-T-----------T------GAATTA-A------------------T----AC-ACG--CTT--CAA-TT-C-A---T--TCGAA-GAGAGCAATttcagaaaggaagaagtttataattttaaaattttt
gi|7 : -AA-TTG-AAG-----ATATTGA-T-----A--GT----------TATATA----GGTGCTCCCTCT--A----A--AAG-A-AC-TGGT------GC-GCG-CAT-TA-AT-----------T-----AAAAT---A----AT---G---AT----A-TCA-T--T--AAA--T-----CG-------A-----T-T------G-AA-----AA--------GA-GCA-AA--A---ATTC------A--ACT-T-----CT-G----C----TCGC---AT-C--T------------------A-TT----A------------A----T-------T---------------C---A------A-CTGAAGGAAGC-AA-TA----A---A-TT---A---------A--TT-ATT----G-C-------------------GCG------------------------CA--T-TA--A------T-T------GA--AT-----------T--AA--T-----------------A---C-ACG--C--T-------------T-C---------A-A-T-T-C-------ATTC-GAAGA--GAGC-A-----A-T---ctaaa
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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