lowQualScore                  :                          222 1 0       000 0 111 111       0          0      0  0  11 0   0  0   0        0 0 111111 111111 11111  0 0 0 0 0  11 0  11   0 0 33  0 0      0  0   
lowQualScore                  :                          ... . .       ... . ... ...       .          .      .  .  .. .   .  .   .        . . ...... ...... .....  . . . . .  .. .  ..   . . ..  . .      .  .   
lowQualScore                  :                          555 3 4       777 4 111 111       4          8      4  4  00 8   4  4   4        8 4 222222 666666 44444  4 4 4 4 4  00 4  00   4 4 44  4 4      4  8   
consensus                     :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
Reference ( gi|17105 )        :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17109                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCCG-CA-TAT
gi|17108                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17113                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CATCTG-CA-TAT
gi|17112                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17106                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17102                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17117                      :                      TAAC-T-A-C-TCCACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17121                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TCAAAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17122                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-C-CACCTG-CA-TAT
gi|17110                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATG-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-GA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17125                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---C-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CATCTG-CA-TAT
gi|17129                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---CACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17103                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC----TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17124                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------TATGTACA-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17143                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CT--A-TCG-TC-AAC-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-TA-TA
gi|17055                      :                      TACC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17118                      :            aactactaacTAAC-TTA-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGACTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17126                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-A-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17140                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-G---T---GACAAAC-GGTTCGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17130                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TC-----AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17165                      :                      TAAC-T-A-C-TCAAATT---T-A---T---GACAAAC-AGGACGATTT-CAGCTT-CT-CT--A-TCG-TT-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17158                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---G-CAAAC-GGGACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17119                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-TAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AG--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17072                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTTACAGCTT-CT-CC--A-TCT-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17111                      :             acgacaaacTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CC-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--CCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17175                      :                      TAAC-T-A-C-TGAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AACTTTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CACTAT
gi|17141                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCAATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CT-TAT
gi|17127                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TG-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-G------T------A-----TG-T-A-A-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-TA-TAT
gi|17150                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--CCC-A-T--CA-T-CACCTG-TA-TAT
gi|17152                      :                      TAAC-T-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCA-A-T-A------T------A-----TG-T-A-G-C-AG--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17134                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAACGGGGACGATTT-TAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-TCACA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17167                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-AA--T---GACAAAT-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CGCCTG--A-TAT
gi|17171                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CC-CA--A-TCG-TC-AAC--TCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-GAC-AA--T-AT--TCT-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17104                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACGT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-CC-AAT-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-A-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17133                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CCCCTG-TA-TAT
gi|17168                      :                      TAAC-A-C-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CGGTTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17136                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCAAA-T-T------T------------TT-C-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17123                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTA---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-T-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17164                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAA-C-AGGACGATTTGCAGCTTTCT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TA
gi|17060                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GGCAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--G-TCG-TC-AAC-TTCCAATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA--T-AT--TAC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17081                      :         actaacgacaaacTAACAT-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--ATTCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AG----TG-TGA-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TA
gi|17159                      :                aagaacTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-T-CCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--A-TT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17048                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CA--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------G-----TG-T-AGG-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17160                      :              ggcaaaacTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---C---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--G-TCG-TC-AAG-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--C-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-TA-TAT
gi|17170                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-TAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTTTATA-T-T------T------A-----TG-C-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CAGCTG-CA-TAT
gi|17135                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---TA--GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-C---A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-TAAATTTT------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17249                      :                      TAAC-G-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CCCCA-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------A-----TG-T-A-T-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACTTG-CA-TAT
gi|17144                      :                   aacTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGTACGATTG-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------TA-----A-----TA-T-A-C-C-AA--T-AT--TTC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TA
gi|17250                      :                      TAA--T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGATT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TGTT-A-G-C-AA--T-ATG-TCC-A-T--TA-T-CACC-G-CA-TAT
gi|17151                      :                   aacTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGCACAATTT-CAACTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA--A-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17145                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT--C--A-TCGTTC-AAC-TTCCCATA-T-T-------------------TG-T-G-A-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTGCCA-TAT
gi|17146                      :                      TAAC-A-A-C-TTAACTT---T-A---TTATGACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCC-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CGCCTG-CA-TGT
gi|17242                      :                      TAAC-T-T-C-GCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC--TCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AAT-T-AT--TCC-A-T--CATT-CATCTA-CA-TAT
gi|17153                      :                   aacTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-T-AA--T---------A-T--CA-T-CATCTG-CA-TAT
gi|17064                      :                      TACC-T-A-C-TCAACTTGAGT-AACTT---GACAAAC-GGGACGATTT-CATCTT-CT-CC--A-TCG-CC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CATCTG-CA-TAT
gi|17114                      :            tacgacaaacTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GAAAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCA-A-T------------------------T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--TA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17243                      :                      TAAC-G-A-A-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-C-AA--T-AC--TTC-A-T--CA-T-CACCTG-AA-TAT
gi|17115                      :                   aacTAAC-A-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-A-AA--C-AT--TCC-A-T--TA-T-GACTTG-CA-TAT
gi|17148                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---TTA---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT--T--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA---T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA----AT--TCC-A-T--TA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17149                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAA-TTCCCATA-T-T------T------A-----AG-T-A-G---AA--T-ATCCTCC-A-T--CA-T-TACCTG-CA-TAT
gi|17156                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TT-ATT-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A--T-AT--TCCAA-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17173                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTC---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGC-T-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-TCT------T------A-----TG-T-A-G-C-AAATT-A---TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17071                      :                      TAAA-C-A-C-TCAACTT---T-A---T---AACAAGC-GTGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--G-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-C-A-T-A-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17161                      :             acgacaaacTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGA---TTT-CAGCTT-CT-CT--A-CCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--C-AT--TTC-A-T--TA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17131                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGA-GATTT-CAGCTT-CT-CA--ACTCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----T--T-A-G-C--A--T-AT--TCC-A-T--CA-T--ACCTG-CA-TAT
gi|17154                      :                      TAAC-A-A-C-TCAAGTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATAATTT-CAGCTT-CT-CT--A-ATA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------C-----TA-T-A-G-C-AG--C-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17093                      :                      TAAC-A-A-T-CCAACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTCCCAT--T---------------------TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--TA-T-CACCTG--A-TAT
gi|17157                      :                     gTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAATC-AGATTGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCTCCATA-T-C------T------A-----AG-T-A-T-C-AA--C-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-TA-TAT
gi|17095                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---G-C---T---GACAAAC-GGAATGATTT-CAGCAT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TTC-ATT--TA-T-CACTTG-GA-CAT
gi|17142                      :                     gTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAA-TCCCC--------------------------------------A--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17137                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------
gi|17166                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-AC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----Tacgagattgatcactgtccgttatatttgcct
gi|17169                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---A-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----T
gi|17046                      :                      TAAC-C-A-C-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGGATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------------------------------AA--T-AT--TCC-A-TTATA-T-CGCCTG-CA-TAT
gi|17045                      :   ggcaaactacgagaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T--------------T-AT--TCC-A-TTATA-T-CGCCTG-CA-TAT
gi|17044                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T--------------T-AT--TCC-A-TTATA-T-CGCCTG-CA-TAT
gi|17043                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T--------------T-AT--TCC-A-TTATA-T-CGCCTG-CA-TAT
gi|17047                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-A-C-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGGATGATTT-CAGCTT-TTACC--A-ACG-CC-AAC-TT-CCATA-T-T------------------------------AA----AT--TCC-A-TTATA-T-CGCCTG-CA-TAT
gi|17128                      :  ggcaaaactacgagaaactcgAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17244                      :                     taAAC-A-G-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CATCTT-CA-TAT
gi|17059                      :                   aaccAAC-T-A-CCTCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGA-TT-CAGCTT-CT-CCA-A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA---T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-C-CCTG-CA-TAT
gi|17069                      :            attacggcaaacAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATT-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AG--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACTTG-CA-TAT
gi|17063                      :             acgacaaacttAC-A-A-C-TCAACAT---T-C---T---GACAATC-GGGACGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----AG-T-A-G---AA--TAAT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-CAT
gi|17278                      :             tacggaaaacttC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CAGTAT
gi|17320                      :                          ac-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-C-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17310                      :                            -A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-GT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17322                      :                           a-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17277                      :                            -A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--C-AT--TCC-G-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17289                      :                        acca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCA-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17323                      :                          ca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-ATC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--A-AT--TCC-A-A--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17280                      :                            -A-T-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-AGTACGATTT-CAGCCT-AT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TT-T-A-G-C-AA--C-AT--TTC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17332                      :                              atcaCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TA
gi|17334                      :                                  CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AAATTTTA-G-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17335                      :                                  CAATTT---T-A---T---GACAAGC-GGA--GATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A--T-AT--TCC-A-T--CA-TACA-CTG-CA-TAT
gi|17321                      :                                   AACCT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17348                      :                               acgtAACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-CTCCCATA-T-T------C------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-TAT
gi|17163                      :                                   AACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-CAAA--T-AT--CCC-A-T--CA-T-CACCTG-CA-
gi|17346                      :                      tgaccaattgcagAACTT---T-A---T---GTCAAAC-GAGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T--CA-T-CACCTA-CA-TAT
gi|17369                      :                                        ---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA--T-AT--TCC-A-T---A-T-CACCTG-CA-TAT





Alignments
lowQualScore                  :                          222 1 0       000 0 111 111       0          0      0  0  00 0   0  0   0        0 0 111111 111111 11111  0 0 0 0 0  0 0  11   0 0 33  0    0   0  0   
lowQualScore                  :                          ... . .       ... . ... ...       .          .      .  .  .. .   .  .   .        . . ...... ...... .....  . . . . .  . .  ..   . . ..  .    .   .  .   
lowQualScore                  :                          444 3 4       777 4 111 111       4          8      4  4  99 8   4  4   4        8 4 111111 666666 44444  4 4 4 4 4  4 4  55   4 4 44  4    4   4  8   
consensus                     :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
Reference ( family-92 )       :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17043                      :                      TAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17044                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17045                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17046                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-A-C-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGGATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------------------------------AA-T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17047                      :   ggcaaactacgagaactcgTAAC-C-A-C-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGGATGATTT-CAGCTT-TTACC--A-ACG-CC-AAC-TT-CCATA-T-T------------------------------AA---AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17048                      : ggcaaaactacgagaaactcgTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CA--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------G-----TG-T-AGG-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17055                      :              ggcaaaacTACC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17059                      :             aactactaacAAC-T-A-CCTCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGA-TT-CAGCTT-CT-CCA-A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA---T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TC-C-CTG-CA-TAT
gi|17060                      :          attacggcaaacTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GGCAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--G-TCG-TC-AAC-TTCCAATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA-T-AT--TAC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17063                      :           actaacgacaaacAC-A-A-C-TCAACAT---T-C---T---GACAATC-GGGACGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----AG-T-A-G---AA-TAAT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-CAT
gi|17064                      :          tacggaaaacttTACC-T-A-C-TCAACTTGAGT-AACTT---GACAAAC-GGGACGATTT-CATCTT-CT-CC--A-TCG-CC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17069                      :              tacgacaaacAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATT-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-TTG-CA-TAT
gi|17071                      :           acgacaaacttTAAA-C-A-C-TCAACTT---T-A---T---AACAAGC-GTGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--G-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-C-A-T-A-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17072                      :             acgacaaacTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTTACAGCTT-CT-CC--A-TCT-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17081                      :             acgacaaacTAACAT-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--ATTCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AG----TG-TGA-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17093                      :                aagaacTAAC-A-A-T-CCAACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTCCCAT--T---------------------TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG--A-TAT
gi|17095                      :                     gTAAC-A-A-C-TCAACTT---G-C---T---GACAAAC-GGAATGATTT-CAGCAT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TTC-ATT--TA-TCAC-TTG-GA-CAT
gi|17102                      :                     gTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17103                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC----TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17104                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACGT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-CC-AAT-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17105                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17106                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17108                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17109                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CCG-CA-TAT
gi|17110                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATG-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-GA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17111                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CC-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17112                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17113                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17114                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GAAAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCA-A-T------------------------T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17115                      :                      TAAC-A-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-A-AA-C-AT--TCC-A-T--TA-TGAC-TTG-CA-TAT
gi|17117                      :                      TAAC-T-A-C-TCCACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17118                      :                      TAAC-TTA-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGACTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17119                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-TAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17121                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TCAAAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17122                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-CCAC-CTG-CA-TAT
gi|17123                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTA---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-T-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17124                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------TATGTACA-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17125                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---C-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17126                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-A-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17127                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TG-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-G------T------A-----TG-T-A-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17128                      :                       AAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17129                      :                    taTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---CACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17130                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TC-----AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17131                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGA-GATTT-CAGCTT-CT-CA--ACTCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----T--T-A-G-C--A-T-AT--TCC-A-T--CA-T-AC-CTG-CA-TAT
gi|17133                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCCC-CTG-TA-TAT
gi|17134                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAACGGGGACGATTT-TAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-TCACA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17135                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---TA--GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-C---A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-TAAATTTT------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17136                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCAAA-T-T------T------------TT-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17137                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------
gi|17140                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-G---T---GACAAAC-GGTTCGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TATacgagattgatcactgtccgttatatttgcct
gi|17141                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCAATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CT-TAT
gi|17142                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAA-TCCCC--------------------------------------A-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17143                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CT--A-TCG-TC-AAC-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TA
gi|17144                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGTACGATTG-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------TA-----A-----TA-T-A-C-C-AA-T-AT--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17145                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT--C--A-TCGTTC-AAC-TTCCCATA-T-T-------------------TG-T-G-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTGCCA-TAT
gi|17146                      :                      TAAC-A-A-C-TTAACTT---T-A---TTATGACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCC-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCGC-CTG-CA-TGT
gi|17148                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---TTA---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT--T--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA---T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA---AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17149                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAA-TTCCCATA-T-T------T------A-----AG-T-A-G---AA-T-ATCCTCC-A-T--CA-TTAC-CTG-CA-TAT
gi|17150                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17151                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGCACAATTT-CAACTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17152                      :                      TAAC-T-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCA-A-T-A------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17153                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-T-AA-T---------A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17154                      :                      TAAC-A-A-C-TCAAGTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATAATTT-CAGCTT-CT-CT--A-ATA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------C-----TA-T-A-G-C-AG-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17156                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TT-ATT-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A-T-AT--TCCAA-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17157                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAATC-AGATTGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCTCCATA-T-C------T------A-----AG-T-A-T-C-AA-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17158                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---G-CAAAC-GGGACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17159                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-T-CCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-TT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17160                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---C---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--G-TCG-TC-AAG-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17161                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGA---TTT-CAGCTT-CT-CT--A-CCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TTC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17163                      :                                   AACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-CAAA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-
gi|17164                      :         tgaccaattgcagTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAA-C-AGGACGATTTGCAGCTTTCT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17165                      :                      TAAC-T-A-C-TCAAATT---T-A---T---GACAAAC-AGGACGATTT-CAGCTT-CT-CT--A-TCG-TT-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17166                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-AC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----T
gi|17167                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-AA--T---GACAAAT-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCGC-CTG--A-TAT
gi|17168                      :                      TAAC-A-C-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CGGTTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17169                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---A-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----T
gi|17170                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-TAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTTTATA-T-T------T------A-----TG-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAG-CTG-CA-TAT
gi|17171                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CC-CA--A-TCG-TC-AAC--TCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-GAC-AA-T-AT--TCT-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17173                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTC---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGC-T-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-TCT------T------A-----TG-T-A-G-C-AA---ATTATCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17175                      :                      TAAC-T-A-C-TGAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AACTTTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CACTAT
gi|17242                      :                      TAAC-T-T-C-GCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC--TCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AATT-AT--TCC-A-T--CATTCAT-CTA-CA-TAT
gi|17243                      :                   aacTAAC-G-A-A-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-C-AA-T-AC--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-AA-TAT
gi|17244                      :                    aacAAC-A-G-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTT-CA-TAT
gi|17249                      :                  aaccTAAC-G-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CCCCA-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------A-----TG-T-A-T-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-TTG-CA-TAT
gi|17250                      :                   aacTAA--T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGATT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TGTT-A-G-C-AA-T-ATG-TCC-A-T--TA-TCAC-C-G-CA-TAT
gi|17277                      :                         aac-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TCC-G-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17278                      :                     accaC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CAGTAT
gi|17280                      :                          ac-A-T-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-AGTACGATTT-CAGCCT-AT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TT-T-A-G-C-AA-C-AT--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17289                      :                        atca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCA-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17310                      :                          ca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-GT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17320                      :                           a-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17321                      :                                   AACCT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17322                      :                        acgt-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17323                      :                            -A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-ATC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-A--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17332                      :                                  CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17334                      :                                  CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AAATTTTA-G-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17335                      :                                  CAATTT---T-A---T---GACAAGC-GGA--GATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A-T-AT--TCC-A-T--CA-T-ACACTG-CA-TAT
gi|17346                      :                                   AACTT---T-A---T---GTCAAAC-GAGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTA-CA-TAT
gi|17348                      :                                   AACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-CTCCCATA-T-T------C------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17369                      :                                        ---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T---A-TCAC-CTG-CA-TAT





Alignments
lowQualScore                  :                          222 1 0       000 0 111 111       0          0      0  0  00 0   0  0   0        0 0 111111 111111 11111  0 0 0 0 0  0 0  11   0 0 33  0    0   0  0   
lowQualScore                  :                          ... . .       ... . ... ...       .          .      .  .  .. .   .  .   .        . . ...... ...... .....  . . . . .  . .  ..   . . ..  .    .   .  .   
lowQualScore                  :                          444 3 4       777 4 111 111       4          8      4  4  99 8   4  4   4        8 4 111111 666666 44444  4 4 4 4 4  4 4  55   4 4 44  4    4   4  8   
consensus                     :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
Reference ( family-92 )       :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17043                      :                      TAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17044                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17045                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17046                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-A-C-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGGATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------------------------------AA-T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17047                      :   ggcaaactacgagaactcgTAAC-C-A-C-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGGATGATTT-CAGCTT-TTACC--A-ACG-CC-AAC-TT-CCATA-T-T------------------------------AA---AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17048                      : ggcaaaactacgagaaactcgTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CA--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------G-----TG-T-AGG-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17055                      :              ggcaaaacTACC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17059                      :             aactactaacAAC-T-A-CCTCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGA-TT-CAGCTT-CT-CCA-A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA---T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TC-C-CTG-CA-TAT
gi|17060                      :          attacggcaaacTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GGCAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--G-TCG-TC-AAC-TTCCAATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA-T-AT--TAC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17063                      :           actaacgacaaacAC-A-A-C-TCAACAT---T-C---T---GACAATC-GGGACGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----AG-T-A-G---AA-TAAT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-CAT
gi|17064                      :          tacggaaaacttTACC-T-A-C-TCAACTTGAGT-AACTT---GACAAAC-GGGACGATTT-CATCTT-CT-CC--A-TCG-CC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17069                      :              tacgacaaacAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATT-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-TTG-CA-TAT
gi|17071                      :           acgacaaacttTAAA-C-A-C-TCAACTT---T-A---T---AACAAGC-GTGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--G-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-C-A-T-A-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17072                      :             acgacaaacTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTTACAGCTT-CT-CC--A-TCT-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17081                      :             acgacaaacTAACAT-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--ATTCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AG----TG-TGA-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17093                      :                aagaacTAAC-A-A-T-CCAACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTCCCAT--T---------------------TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG--A-TAT
gi|17095                      :                     gTAAC-A-A-C-TCAACTT---G-C---T---GACAAAC-GGAATGATTT-CAGCAT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TTC-ATT--TA-TCAC-TTG-GA-CAT
gi|17102                      :                     gTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17103                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC----TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17104                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACGT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-CC-AAT-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17105                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17106                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17108                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17109                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CCG-CA-TAT
gi|17110                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATG-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-GA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17111                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CC-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17112                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17113                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17114                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GAAAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCA-A-T------------------------T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17115                      :                      TAAC-A-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-A-AA-C-AT--TCC-A-T--TA-TGAC-TTG-CA-TAT
gi|17117                      :                      TAAC-T-A-C-TCCACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17118                      :                      TAAC-TTA-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGACTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17119                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-TAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17121                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TCAAAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17122                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-CCAC-CTG-CA-TAT
gi|17123                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTA---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-T-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17124                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------TATGTACA-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17125                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---C-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17126                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-A-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17127                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TG-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-G------T------A-----TG-T-A-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17128                      :                       AAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17129                      :                    taTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---CACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17130                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TC-----AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17131                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGA-GATTT-CAGCTT-CT-CA--ACTCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----T--T-A-G-C--A-T-AT--TCC-A-T--CA-T-AC-CTG-CA-TAT
gi|17133                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCCC-CTG-TA-TAT
gi|17134                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAACGGGGACGATTT-TAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-TCACA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17135                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---TA--GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-C---A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-TAAATTTT------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17136                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCAAA-T-T------T------------TT-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17137                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------
gi|17140                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-G---T---GACAAAC-GGTTCGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TATacgagattgatcactgtccgttatatttgcct
gi|17141                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCAATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CT-TAT
gi|17142                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAA-TCCCC--------------------------------------A-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17143                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CT--A-TCG-TC-AAC-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TA
gi|17144                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGTACGATTG-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------TA-----A-----TA-T-A-C-C-AA-T-AT--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17145                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT--C--A-TCGTTC-AAC-TTCCCATA-T-T-------------------TG-T-G-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTGCCA-TAT
gi|17146                      :                      TAAC-A-A-C-TTAACTT---T-A---TTATGACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCC-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCGC-CTG-CA-TGT
gi|17148                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---TTA---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT--T--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA---T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA---AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17149                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAA-TTCCCATA-T-T------T------A-----AG-T-A-G---AA-T-ATCCTCC-A-T--CA-TTAC-CTG-CA-TAT
gi|17150                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17151                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGCACAATTT-CAACTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17152                      :                      TAAC-T-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCA-A-T-A------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17153                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-T-AA-T---------A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17154                      :                      TAAC-A-A-C-TCAAGTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATAATTT-CAGCTT-CT-CT--A-ATA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------C-----TA-T-A-G-C-AG-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17156                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TT-ATT-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A-T-AT--TCCAA-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17157                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAATC-AGATTGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCTCCATA-T-C------T------A-----AG-T-A-T-C-AA-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17158                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---G-CAAAC-GGGACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17159                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-T-CCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-TT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17160                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---C---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--G-TCG-TC-AAG-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17161                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGA---TTT-CAGCTT-CT-CT--A-CCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TTC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17163                      :                                   AACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-CAAA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-
gi|17164                      :         tgaccaattgcagTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAA-C-AGGACGATTTGCAGCTTTCT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17165                      :                      TAAC-T-A-C-TCAAATT---T-A---T---GACAAAC-AGGACGATTT-CAGCTT-CT-CT--A-TCG-TT-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17166                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-AC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----T
gi|17167                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-AA--T---GACAAAT-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCGC-CTG--A-TAT
gi|17168                      :                      TAAC-A-C-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CGGTTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17169                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---A-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----T
gi|17170                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-TAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTTTATA-T-T------T------A-----TG-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAG-CTG-CA-TAT
gi|17171                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CC-CA--A-TCG-TC-AAC--TCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-GAC-AA-T-AT--TCT-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17173                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTC---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGC-T-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-TCT------T------A-----TG-T-A-G-C-AA---ATTATCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17175                      :                      TAAC-T-A-C-TGAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AACTTTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CACTAT
gi|17242                      :                      TAAC-T-T-C-GCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC--TCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AATT-AT--TCC-A-T--CATTCAT-CTA-CA-TAT
gi|17243                      :                   aacTAAC-G-A-A-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-C-AA-T-AC--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-AA-TAT
gi|17244                      :                    aacAAC-A-G-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTT-CA-TAT
gi|17249                      :                  aaccTAAC-G-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CCCCA-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------A-----TG-T-A-T-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-TTG-CA-TAT
gi|17250                      :                   aacTAA--T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGATT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TGTT-A-G-C-AA-T-ATG-TCC-A-T--TA-TCAC-C-G-CA-TAT
gi|17277                      :                         aac-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TCC-G-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17278                      :                     accaC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CAGTAT
gi|17280                      :                          ac-A-T-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-AGTACGATTT-CAGCCT-AT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TT-T-A-G-C-AA-C-AT--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17289                      :                        atca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCA-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17310                      :                          ca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-GT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17320                      :                           a-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17321                      :                                   AACCT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17322                      :                        acgt-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17323                      :                            -A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-ATC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-A--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17332                      :                                  CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17334                      :                                  CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AAATTTTA-G-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17335                      :                                  CAATTT---T-A---T---GACAAGC-GGA--GATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A-T-AT--TCC-A-T--CA-T-ACACTG-CA-TAT
gi|17346                      :                                   AACTT---T-A---T---GTCAAAC-GAGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTA-CA-TAT
gi|17348                      :                                   AACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-CTCCCATA-T-T------C------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17369                      :                                        ---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T---A-TCAC-CTG-CA-TAT


blockSeqs                     :                          AT  A               ACT TAT                                                          AAATTT ATGTAC AATTT                  CC       TA
blockSeqs                     :                          TT  A               A   A                                                            .      A      G                      TA       TA
blockSeqs                     :                          C   .               .   .                                                            .      .      .                      G        TA
blockSeqs                     :                          C   .               .   .                                                            .      .      .                      .        TA
blockSeqs                     :                          C   .               .   .                                                            .      .      .                      .        CA
blockSeqs                     :                          C   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          C   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          G   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          A   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          G   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                          T   .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                              .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                              .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                              .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                              .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                              .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                              .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                              .               .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                                              .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                                              .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                                              .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                                              .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                                              .   .                                                            .      .      .                      .        . 
blockSeqs                     :                                              .   .                                                            .      .      .                                 
blockSeqs                     :                                              .   .                                                            .      .      .                                 
blockSeqs                     :                                              .   .                                                            .                                               


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                             **
originalCons                  :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
finalCons                     :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT





Alignments
lowQualScore                  :                          222 1 0       000 0 111 111       0          0      0  0  00 0   0  0   0        0 0 111111 111111 11111  0 0 0 0 0  0 0  11   0 0 33  0    0   0  0   
lowQualScore                  :                          ... . .       ... . ... ...       .          .      .  .  .. .   .  .   .        . . ...... ...... .....  . . . . .  . .  ..   . . ..  .    .   .  .   
lowQualScore                  :                          444 3 4       777 4 111 111       4          8      4  4  99 8   4  4   4        8 4 111111 666666 44444  4 4 4 4 4  4 4  55   4 4 44  4    4   4  8   
consensus                     :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
Reference ( family-92 )       :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17043                      :                      TAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17044                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17045                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-AAC-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGAATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------A------A-----T-------------T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17046                      : ggcaaaactacgaggaactcgTAAC-C-A-C-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGGATGATTT-CAGCTT-TT-AC--A-ACG-CC-AAC-TTCCCATA-T-T------------------------------AA-T-AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17047                      :   ggcaaactacgagaactcgTAAC-C-A-C-GCAACTT---T-A---T---GACAACC-GGGATGATTT-CAGCTT-TTACC--A-ACG-CC-AAC-TT-CCATA-T-T------------------------------AA---AT--TCC-A-TTATA-TCGC-CTG-CA-TAT
gi|17048                      : ggcaaaactacgagaaactcgTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CA--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------G-----TG-T-AGG-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17055                      :              ggcaaaacTACC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17059                      :             aactactaacAAC-T-A-CCTCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGA-TT-CAGCTT-CT-CCA-A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA---T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TC-C-CTG-CA-TAT
gi|17060                      :          attacggcaaacTAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GGCAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--G-TCG-TC-AAC-TTCCAATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA-T-AT--TAC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17063                      :           actaacgacaaacAC-A-A-C-TCAACAT---T-C---T---GACAATC-GGGACGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----AG-T-A-G---AA-TAAT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-CAT
gi|17064                      :          tacggaaaacttTACC-T-A-C-TCAACTTGAGT-AACTT---GACAAAC-GGGACGATTT-CATCTT-CT-CC--A-TCG-CC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17069                      :              tacgacaaacAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATT-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-TTG-CA-TAT
gi|17071                      :           acgacaaacttTAAA-C-A-C-TCAACTT---T-A---T---AACAAGC-GTGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--G-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-C-A-T-A-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17072                      :             acgacaaacTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTTACAGCTT-CT-CC--A-TCT-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17081                      :             acgacaaacTAACAT-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--ATTCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AG----TG-TGA-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17093                      :                aagaacTAAC-A-A-T-CCAACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTCCCAT--T---------------------TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG--A-TAT
gi|17095                      :                     gTAAC-A-A-C-TCAACTT---G-C---T---GACAAAC-GGAATGATTT-CAGCAT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TTC-ATT--TA-TCAC-TTG-GA-CAT
gi|17102                      :                     gTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17103                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC----TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17104                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACGT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-CC-AAT-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17105                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17106                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17108                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17109                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CCG-CA-TAT
gi|17110                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATG-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-GA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17111                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CC-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17112                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17113                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17114                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GAAAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCA-A-T------------------------T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17115                      :                      TAAC-A-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-A-AA-C-AT--TCC-A-T--TA-TGAC-TTG-CA-TAT
gi|17117                      :                      TAAC-T-A-C-TCCACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17118                      :                      TAAC-TTA-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGACTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17119                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-TAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17121                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TCAAAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17122                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-CCAC-CTG-CA-TAT
gi|17123                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTA---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-T-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17124                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------TATGTACA-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17125                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---C-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17126                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-A-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17127                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TG-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-G------T------A-----TG-T-A-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17128                      :                       AAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17129                      :                    taTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---CACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17130                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TC-----AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17131                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGA-GATTT-CAGCTT-CT-CA--ACTCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----T--T-A-G-C--A-T-AT--TCC-A-T--CA-T-AC-CTG-CA-TAT
gi|17133                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCCC-CTG-TA-TAT
gi|17134                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAACGGGGACGATTT-TAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-TCACA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17135                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---TA--GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-C---A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-TAAATTTT------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17136                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCAAA-T-T------T------------TT-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17137                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------
gi|17140                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-G---T---GACAAAC-GGTTCGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TATacgagattgatcactgtccgttatatttgcct
gi|17141                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCAATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CT-TAT
gi|17142                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAA-TCCCC--------------------------------------A-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17143                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CT--A-TCG-TC-AAC-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TA
gi|17144                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGTACGATTG-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------TA-----A-----TA-T-A-C-C-AA-T-AT--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17145                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT--C--A-TCGTTC-AAC-TTCCCATA-T-T-------------------TG-T-G-A-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTGCCA-TAT
gi|17146                      :                      TAAC-A-A-C-TTAACTT---T-A---TTATGACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCC-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCGC-CTG-CA-TGT
gi|17148                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---TTA---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT--T--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA---T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA---AT--TCC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17149                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAA-TTCCCATA-T-T------T------A-----AG-T-A-G---AA-T-ATCCTCC-A-T--CA-TTAC-CTG-CA-TAT
gi|17150                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17151                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGCACAATTT-CAACTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17152                      :                      TAAC-T-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCA-A-T-A------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17153                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-T-AA-T---------A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17154                      :                      TAAC-A-A-C-TCAAGTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATAATTT-CAGCTT-CT-CT--A-ATA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------C-----TA-T-A-G-C-AG-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17156                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TT-ATT-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A-T-AT--TCCAA-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17157                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAATC-AGATTGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCTCCATA-T-C------T------A-----AG-T-A-T-C-AA-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17158                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---G-CAAAC-GGGACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17159                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-T-CCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-TT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17160                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---C---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--G-TCG-TC-AAG-TCCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17161                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGA---TTT-CAGCTT-CT-CT--A-CCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TTC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17163                      :                                   AACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-CAAA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-
gi|17164                      :         tgaccaattgcagTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAA-C-AGGACGATTTGCAGCTTTCT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17165                      :                      TAAC-T-A-C-TCAAATT---T-A---T---GACAAAC-AGGACGATTT-CAGCTT-CT-CT--A-TCG-TT-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17166                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-AC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----T
gi|17167                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-AA--T---GACAAAT-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCGC-CTG--A-TAT
gi|17168                      :                      TAAC-A-C-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CGGTTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TT-CCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17169                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---A-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-TT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----T
gi|17170                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-TAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTTTATA-T-T------T------A-----TG-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAG-CTG-CA-TAT
gi|17171                      :                      TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CC-CA--A-TCG-TC-AAC--TCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-GAC-AA-T-AT--TCT-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17173                      :                      TAAC-A-A-C-TCAACTC---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGC-T-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-TCT------T------A-----TG-T-A-G-C-AA---ATTATCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17175                      :                      TAAC-T-A-C-TGAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AACTTTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CACTAT
gi|17242                      :                      TAAC-T-T-C-GCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC--TCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AATT-AT--TCC-A-T--CATTCAT-CTA-CA-TAT
gi|17243                      :                   aacTAAC-G-A-A-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-C-AA-T-AC--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-AA-TAT
gi|17244                      :                    aacAAC-A-G-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTT-CA-TAT
gi|17249                      :                  aaccTAAC-G-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CCCCA-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------A-----TG-T-A-T-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-TTG-CA-TAT
gi|17250                      :                   aacTAA--T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGATT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TGTT-A-G-C-AA-T-ATG-TCC-A-T--TA-TCAC-C-G-CA-TAT
gi|17277                      :                         aac-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TCC-G-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17278                      :                     accaC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CAGTAT
gi|17280                      :                          ac-A-T-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-AGTACGATTT-CAGCCT-AT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TT-T-A-G-C-AA-C-AT--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17289                      :                        atca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCA-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17310                      :                          ca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-GT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17320                      :                           a-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17321                      :                                   AACCT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17322                      :                        acgt-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17323                      :                            -A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-ATC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-A--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17332                      :                                  CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17334                      :                                  CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AAATTTTA-G-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17335                      :                                  CAATTT---T-A---T---GACAAGC-GGA--GATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A-T-AT--TCC-A-T--CA-T-ACACTG-CA-TAT
gi|17346                      :                                   AACTT---T-A---T---GTCAAAC-GAGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTA-CA-TAT
gi|17348                      :                                   AACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-CTCCCATA-T-T------C------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17369                      :                                        ---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T---A-TCAC-CTG-CA-TAT