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gi|17151 : TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGCACAATTT-CAACTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TA-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17152 : TAAC-T-A-C-TTAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAT-TTCCCA-A-T-A------T------A-----TG-T-A-G-C-AG-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17153 : TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACAATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-T-AA-T---------A-T--CA-TCAT-CTG-CA-TAT
gi|17154 : TAAC-A-A-C-TCAAGTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATAATTT-CAGCTT-CT-CT--A-ATA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------C-----TA-T-A-G-C-AG-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17156 : TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TT-ATT-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A-T-AT--TCCAA-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17157 : TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAATC-AGATTGATTT-CAGCCT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TCTCCATA-T-C------T------A-----AG-T-A-T-C-AA-C-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-TA-TAT
gi|17158 : TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---G-CAAAC-GGGACGAATT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17159 : TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-T-CCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-TT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
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gi|17161 : TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGA---TTT-CAGCTT-CT-CT--A-CCG-TC-AAC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TTC-A-T--TA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17163 : AACTT---T-A---T---GATAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-CAAA-T-AT--CCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-
gi|17164 : tgaccaattgcagTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAA-C-AGGACGATTTGCAGCTTTCT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
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gi|17166 : TAAC-A-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-AC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----T
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gi|17323 : -A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-ATC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-A--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
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gi|17348 : AACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-CTCCCATA-T-T------C------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17369 : ---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T---A-TCAC-CTG-CA-TAT
Alignments
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lowQualScore : ... . . ... . ... ... . . . . .. . . . . . . ...... ...... ..... . . . . . . . .. . . .. . . . .
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Reference ( family-92 ) : TAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
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gi|17164 : tgaccaattgcagTAAC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAA-C-AGGACGATTTGCAGCTTTCT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
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gi|17243 : aacTAAC-G-A-A-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGAACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-TTTCCATA-T-T------T------A-----TG-T-G-G-C-AA-T-AC--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-AA-TAT
gi|17244 : aacAAC-A-G-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAT-CTT-CA-TAT
gi|17249 : aaccTAAC-G-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CCCCA-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-A-T------T------A-----TG-T-A-T-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-TTG-CA-TAT
gi|17250 : aacTAA--T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGATT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TGTT-A-G-C-AA-T-ATG-TCC-A-T--TA-TCAC-C-G-CA-TAT
gi|17277 : aac-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-C-AT--TCC-G-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17278 : accaC-T-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATATT-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CAGTAT
gi|17280 : ac-A-T-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-AGTACGATTT-CAGCCT-AT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TT-T-A-G-C-AA-C-AT--TTC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17289 : atca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GAGACGATTT-CAGTTT-CT-CC--A-TTG-TC-AAC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCA-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17310 : ca-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCTCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-GT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17320 : a-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-C-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17321 : AACCT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-TC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17322 : acgt-A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAACTT-CT-CC--A-TCA-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17323 : -A-C-TCAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-ATC-TTCCCATA-C-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-A-AT--TCC-A-A--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17332 : CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TA
gi|17334 : CAACTT---T-A---T---GACAAAC-GG-ACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------AAATTTTA-G-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17335 : CAATTT---T-A---T---GACAAGC-GGA--GATTT-CAGCTT-CT-TT--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------A-----TG-T-A-G-C--A-T-AT--TCC-A-T--CA-T-ACACTG-CA-TAT
gi|17346 : AACTT---T-A---T---GTCAAAC-GAGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-C------T------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTA-CA-TAT
gi|17348 : AACTT---T-A---T---GACAAAT-GGGATGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AGC-CTCCCATA-T-T------C------A-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T--CA-TCAC-CTG-CA-TAT
gi|17369 : ---T-A---T---GACAAAC-GGGACGATTT-CAGCTT-CT-CC--A-TCG-TC-AAC-TTCCCATA-T-T------T------G-----TG-T-A-G-C-AA-T-AT--TCC-A-T---A-TCAC-CTG-CA-TAT