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Reference ( family-857 )      : ACTTGATT----C----TAA-GA----A-GTAC------CCCGG-----GT-AT--ATCCGGCT--CAGTTC-GGTTCGC--CCGGATTAG--GGTC-AG-AATCAAGTA-T-GCTA
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finalCons                     : ACTTGATT----C----TAA-GA----A-GTAC------CCCGG-----GT-AT--ATCCGGCT--CAGTTC-GGTTCGC--CCGGATTAG--GGTC-AG-AATCAAGTA-T-GCTA





Alignments
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lowQualScore                  :         999999999   5  8888 2    444444     66666  2  33        33      2       33         33    2  2         3 3    
lowQualScore                  :         .........   .  .... .    ......     .....  .  ..        ..      .       ..         ..    .  .         . .    
lowQualScore                  :         777777777   7  3333 7    333333     77777  5  44        44      5       44         77    9  9         1 1    
consensus                     : ACTTGATT----C----TAA-GA----A-GTAC------CCCGG-----GT-AT--ATCCGGCT--CAGTTC-GGTTCGC--CCGGATTAG--GGTC-AG-AATCAAGTA-T-GCTA
Reference ( family-857 )      : ACTTGATT----C----TAA-GA----A-GTAC------CCCGG-----GT-AT--ATCCGGCT--CAGTTC-GGTTCGC--CCGGATTAG--GGTC-AG-AATCAAGTA-T-GCTA
gi|103612                     : ACTTGATT----C----TAA-GA----A-GTAC------CCCGG-----GT-AA--ATCCGGCT--CAGTTC-GGTTCGC--CCGAATTAG--GGTC-AG-AATCAAGTA-T-GCTA
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gi|103620                     : ACTTGATTT---C----TAATGAG---A-GTAG------C--GG-----GTCAT--ATCCGGCT--CAGTTCCGGTTCGC--CCGA--TAGATGGTC-AG-AATC-AGTA-T-GCTA
gi|103621                     : ACTTTATT----C----TAA-GA----A-GTAA------CTCTG-----GT-AT--ATCCGGAT--CAGTTC-GGT-------------------TC-AG-AACCAAGTA-T-GTTA
gi|103622                     : ACTTTATT----C----CAA-GAGAAAA-GTAC------CCCGG-----GT-ATTGGTCCCGCTGGCAGTTA-GGTTCGCTACCGGATT
gi|103623                     :  CTTGATT----AGGTATAA-GA----AAGTACATGTA-CCTGG-----GT--C--AACCGGCT--CAGTTC-G-TTCAC--CCGGATTAG--GGTCAAG-AATCAAGTA-TGGCTA
gi|103624                     :   TTGATT----C----TAA-GA----A-GTAC------CCCGG-----GT-AT--ACCCGGCT--CAGTTC-GGTTCGC--CCGGATTAG--CGTC-AA-AATCAAGTA-T-GCTA
gi|103625                     :    TGATT----C----GAA-GA----A-GTAC------CCCTG-----GT-AT--ATCCGGCT--CAGTTC-GGTTCGC--CTGTATTAG--TGCC-AG-AATCAATTA-T-GCTA
gi|103626                     :                       A----A-GTAC------CTCGGATCGGGT-AT--ACCTGGCT--CAGTTC-GTTTTAC--CCAGATTAG--GGTC-AG-AATCAAGTA-T-GCTA
gi|103627                     :                                                    -AT--ATCCGGCT--CAGTTC-GGTTCGC--CCAGATAAG--GGTC-AA-TATCAAGTA-T-GCTA