lowQualScore : 1 22 1 111111 111 22222222222 222222 333
lowQualScore : 5 3 6 3 44 4 44 55 2 2 6 111111 4 4 444 1 8 4 55555555555 4 3 55 4 111111 444 55 88 555 3 6666 44 6666 77777 555 0 6666 555 77777 2 5 2 2 1 3 2 4 4 3 3 3
lowQualScore : . . . . .. . .. .. . . . ...... . . ... . . . ........... . . .. . ...... ... .. .. ... . .... .. .... ..... ... . .... ... ..... . . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 4 6 7 3 44 0 77 55 5 4 0 555555 4 4 000 3 0 0 00000000000 0 0 55 0 333333 111 00 11 888 1 5555 22 8888 77777 000 4 1111 000 11111 9 7 9 1 3 3 9 0 0 3 3 3
consensus : ATAAATAATCAAATATCAATGTAACTGGTTGTTTAC-AG--ATCAAA-TGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGTTCCTA------TGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGG-TCC----------TAATGGT-GCCACA--AC-TG---NGGAAAAAAATT-T-GTT-ATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAACCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
Reference ( gi|61112 ) : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-AGCCATCAAA-TGC-GAT--ACCAGCACTATTTACATTTGAAAACGAGGTTCCTA------TGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGG-TCT----------TAATGGT-GTCACA--AC-TG---GGGAAAAAAA---T-ATC-ATC---TCG-TT----CG--ACA---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61113 : ATAAATAATCAAATATCAAAATAACTG-TTGTTTAC-AGCCATCAAA-TGC-CAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGTTCCTA------TGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAGTACAGGGTGTATGG-TC-----------TAATGGT-GTCACA--AC-TGT--GAAAAAAAAA---T-ATC-ATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAA
gi|61114 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-AGCCATCAAA-TGC-TAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGTTCCTA------TGGTACCGTGG-T-ATTAC-TAAATATACAGCGAGTAGGG-TCC----------TAATGGT-ACCACA--AC-TG---GGGGAAAAAATT-T-ATT-ATC---TCG-TT----CA--ACG---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAGTCA-TTCTGTACTAAG-AAAT-----AATTC-AAAATttaa
gi|61116 : ATAAATAAACAAATACCAATATAACTGGTTGTTTAC-AGAGATCAAA-TGC-AAT--ACCATCGCTGTTTACATCTGAAAACGAGGTTCCTA------TGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAACACAGGGTGTATGG-TCT----------TAATGGT-GCCACA--AC-TG---TG--AACAAATTTT-GTT-ATC---TCG-TT----TG--ACA---T-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GGCAGAAAA-ATTATT-AAATGCAACCA-TTTTCCACAATG-AAATTA-AGAATTC-AGA
gi|61115 : ATAAATAAACAAATATCAATATAACTGGTTGTTCAG-AG--ATCAAA-TGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAATGAGGTTCCTA------TGGTACTGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGG-TCC----------TAATTGT-GCCACA--AC-TG---TG--AACAAATTTT-GTA-ATC---TCG-TT----CG--ATGTACT-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAACTA-TTTAGTGCAATG-AAATAC-AGAATTC-AAAAT
gi|61117 : ATAAATAATCAAATATCAATACAACTG-TTGTT-AC-AGCCATCAAA-TGC-GGT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGTTCCTA------TGGTACC-CGGAT-ACT-----AATATTCAGCGTG-AAGG---C----------TAATGGT-GCCACA--ACTTG---GGGAAAAAAAT--T-ATT-AT------A-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC-----AT---AA-----ATT-GACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAA--AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61118 : TAAACAA-CAAATATCAGTGTAACTGGTTGTTTACGAG--ATCAAACT-----T--A--AG--CTGTTTACATTTGAAAACAAGATTCCTA------TGGTAC
gi|61119 : ATAAT-AAATATCAGTGTAACTG-CTGTTTAC--GAAATCAGT-TGTTGAT--ACCCTTGCTGTTTACATTTGAAATTGAGGTTCCTAATCCTATGGTATCACGG-T-ATT---GAAAAATACA-GGTGTAGAGTTCTCTTAACTGTCTAATGGT-GCCACA--AC-TC---AAAAAAAAA---------------------T----TG--ACG---A-----ATTCTT---AGCTTTTTAC---AAATTACA-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAA-CA-TT-TGTACAATGAAAATGA-GAAATTCTAAAAT
gi|61120 : AAATA--AATGTGACTGGTTGTTTACGAG--ATCAAA-TGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGTTCCTA------TGGTATCGCGG-T-ATTTG-TTAAAATACAGGGTGCAGGG-TCC----------TAATAGT-GCCACA--AC-TG---TG--AAAAGATTTT-GTT-ATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----AAT-TT---AAC----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-ATGATTAAAATTCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61121 : AAATA---ATGTGACTGGTTGTTTACGAG--ATCAAA-TGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGTTCCTA------TGGTATCGCGG-TAATTTGCTTAAAATACAGGGTGCAGGG-TCA----------TAATAGTCGCCACA--AC-T----GTGAAAAAGATTTT-GTCTATC---TCGATT----TG--ACG---T-----AAT-TT---A-C----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-AT-ATTAAAATTCAACCATTTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61122 : ATCAA--TGT-AACTGACTATCACTGTTTACATTTGAAAACGAGTTTCCTA------CGGTACCGCGG-T-ATGAA-TAAAAATACAGCATGGAGAG-TTC----------TAATGGT-GCCCCATTAT-TGTAAAGAAAAAAAA---TCGTT-ACCCATTCA-TTCCAGCG--AAA---TTTTGAATTTTTACAAGC----AGC---AA-----A-T-GAT-GAAAA-AT
gi|61123 : acacat-TAAAAATACAGCGTGTAGGA-TCC----------TAATAGT-GTCACA--AC-TG---TGAAACATTC---T-GTT-ATC---TCG-TT----CGACACA---T-----ACTCTT---AGT----TAT---AA-----A-T-GACAGGAAA-ATGATTAAtaatcat
gi|61124 : AAAAAAA---T-ATT-ATC---TCC-TT----CG--ACA---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAA
gi|61126 : -ATC---TCT-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----T-TTAACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTATGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-ATAAT
gi|61125 : -TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-TTGACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAA-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61127 : aaaacttntattataTTCTA---AAT----TATGTGAC-----A-T-GGCAGAAAAAATGATTAAAATGCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAATTGAATTC-AAAAT
Alignments
lowQualScore : 1 22 111111 111 11111111111 1111
lowQualScore : 3 2 4 00 55 3 55 000000 4 4 000 77777777777 3 55 3 2222 777 44 555 2 6666 33 555 77777 444 5555 444 66666 2 5 2 1 2 3 1 1 1 3 3 3
lowQualScore : . . . .. .. . .. ...... . . ... ........... . .. . .... ... .. ... . .... .. ... ..... ... .... ... ..... . . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 6 3 5 00 00 6 00 555555 0 0 888 33333333333 6 00 6 5555 222 00 000 9 1111 99 000 11111 777 7777 777 77777 7 3 7 2 5 1 9 0 0 1 1 1
consensus : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTACGAGCCA--TCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TG--TGGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
Reference ( family-851 ) : ATAAATAATCAAATATCAATGTAACTGGTTGTTTAC-AG--A--TCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TG--NGGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAACCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61112 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-AGCCA--TCAAATGC-GAT--ACCAGCACTATTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGGT-----------CTTAATGGT-GTCACA--AC-TG--GGGAAAAAAA---TAT-CATC---TCG-TT----CG--ACA---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61113 : ATAAATAATCAAATATCAAAATAACTG-TTGTTTAC-AGCCA--TCAAATGC-CAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAGTACAGGGTGTATGGT------------CTAATGGT-GTCACA--AC-TG--TGAAAAAAAA-A-TAT-CATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAA
gi|61114 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-AGCCA--TCAAATGC-TAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGTGG-T-ATTAC-TAAATATACAGCGAGTAGGGT-----------CCTAATGGT-ACCACA--AC-TG--GGGGAAAAAATT-TAT-TATC---TCG-TT----CA--ACG---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAGTCA-TTCTGTACTAAG-AAAT-----AATTC-AAAATttaa
gi|61115 : ATAAATAAACAAATATCAATATAACTGGTTGTTCAG-AG--A--TCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAATGAGGT------TCCTATGGTACTGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGGT-----------CCTAATTGT-GCCACA--AC-TG--T-GAACAAATTT-TGT-AATC---TCG-TT----CG--ATGTACT-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAACTA-TTTAGTGCAATG-AAATAC-AGAATTC-AAAAT
gi|61116 : ATAAATAAACAAATACCAATATAACTGGTTGTTTAC-AG--AGATCAAATGC-AAT--ACCATCGCTGTTTACATCTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAACACAGGGTGTATGGT-----------CTTAATGGT-GCCACA--AC-TG--T-GAACAAATTT-TGT-TATC---TCG-TT----TG--ACA---T-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GGCAGAAAA-ATTATT-AAATGCAACCA-TTTTCCACAATG-AAATTA-AGAATTC-AGA
gi|61117 : ATAAATAATCAAATATCAATACAACT-GTTG-TTAC-AGCCA--TCAAATGC-GGT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACC-CGGAT-ACT-----AATATTCAGCGTGAAGG--------------CTAATGGT-GCCACA--ACTTG--GGGAAAAAAA-T-TAT-TAT------A-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC-----AT---AA-----ATT-GACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAA--AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61118 : TAAACAA-CAAATATCAGTGTAACTGGTTGTTTACGAG--A--TCAAACTT-AA---------GCTGTTTACATTTGAAAACAAGAT------TCCTATGGTAC
gi|61119 : ATAAT-AAATATCAGTGTAACTG-CTGTTTACGAA--A--TCAGTTGTTGAT--ACCCTTGCTGTTTACATTTGAAATTGAGGTTCCTAATCCTATGGTATCACGG-T-ATT---GAAAAATACA-GGTGTAGAGTTCTCTTAACTGTCTAATGGT-GCCACA--AC-T---CAAAAAAAAATT-----------------------G--ACG---A-----ATTCTT---AGCTTTTTAC---AAATTACA-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAA-CA-TT-TGTACAATGAAAATGA-GAAATTCTAAAAT
gi|61120 : AAATA--AATGTGACTGGTTGTTTACGAG--A--TCAAATGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTATCGCGG-T-ATTTG-TTAAAATACAGGGTGCAGGGT-----------CCTAATAGT-GCCACA--AC-TG--T-GAAAAGATTT-TGT-TATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----AAT-TT---AAC----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-ATGATTAAAATTCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61121 : AAATA---ATGTGACTGGTTGTTTACGAG--A--TCAAATGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTATCGCGG-TAATTTGCTTAAAATACAGGGTGCAGGGT-----------CATAATAGTCGCCACA--AC-TG--TGAAAAAGATTT-TGTCTATC---TCGATT----TG--ACG---T-----AAT-TT---A-C----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-AT-ATTAAAATTCAACCATTTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61122 : AC-AT--A--TCAA-TGT-AACTGACTATCACTGTTTACATTTGAAAACGAGTT------TCCTACGGTACCGCGG-T-ATGAA-TAAAAATACAGCATGGAGAGT-----------TCTAATGGT-GCCCCATTAT-TGTAAAGAAAAAAAAT-CGT-TACCCATTCA-TTCCAGCG--AAA---TTTTGAATTTTTACAAGC----AGC---AA-----A-T-GAT-GAAAA-AT
gi|61123 : ac-TAAAAATACAGCGTGTAGGAT-----------CCTAATAGT-GTCACA--AC-TG--TG---AAACATTCTGT-TATC---TCG-TT----CGACACA---T-----ACTCTT---AGT----TAT---AA-----A-T-GACAGGAAA-ATGATTAAtaatcat
gi|61124 : AAAAAAAT---AT-TATC---TCC-TT----CG--ACA---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAA
gi|61125 : AAAACT-TNT--ATT---ATA-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-TTGACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAA-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61126 : ATC---TCT-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----T-TTAACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTATGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-ATAAT
gi|61127 : TTCTA---AAT----TATGTGAC-----A-T-GGCAGAAAAAATGATTAAAATGCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAATTGAATTC-AAAAT
Alignments
lowQualScore : 11 22 111111 111 11111111111 111
lowQualScore : 3 2 5 44 55 3 55 000000 4 4 000 77777777777 3 55 3 111 777 44 555 2 6666 33 555 77777 444 5555 444 66666 2 5 2 1 0 3 1 1 1 3 3 3
lowQualScore : . . . .. .. . .. ...... . . ... ........... . .. . ... ... .. ... . .... .. ... ..... ... .... ... ..... . . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 6 3 0 00 00 6 00 555555 0 0 888 33333333333 6 00 6 555 222 00 000 9 1111 99 000 11111 777 7777 777 77777 7 3 7 2 5 1 9 0 0 1 1 1
consensus : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-GAGCCATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TGT--GGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
Reference ( family-851 ) : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-GAGCCATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TGT--GGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61112 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-GAT--ACCAGCACTATTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGGT-----------CTTAATGGT-GTCACA--AC-TGG--GGAAAAAAA---TAT-CATC---TCG-TT----CG--ACA---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61113 : ATAAATAATCAAATATCAAAATAACTG-TTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-CAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAGTACAGGGTGTATGGT------------CTAATGGT-GTCACA--AC-TGT--GAAAAAAAA-A-TAT-CATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAA
gi|61114 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-TAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGTGG-T-ATTAC-TAAATATACAGCGAGTAGGGT-----------CCTAATGGT-ACCACA--AC-TGG--GGGAAAAAATT-TAT-TATC---TCG-TT----CA--ACG---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAGTCA-TTCTGTACTAAG-AAAT-----AATTC-AAAATttaa
gi|61115 : ATAAATAAACAAATATCAATATAACTGGTTGTTCA--GAG--ATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAATGAGGT------TCCTATGGTACTGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGGT-----------CCTAATTGT-GCCACA--AC-TGT---GAACAAATTT-TGT-AATC---TCG-TT----CG--ATGTACT-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAACTA-TTTAGTGCAATG-AAATAC-AGAATTC-AAAAT
gi|61116 : ATAAATAAACAAATACCAATATAACTGGTTGTTTACAGAG--ATCAAATGC-AAT--ACCATCGCTGTTTACATCTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAACACAGGGTGTATGGT-----------CTTAATGGT-GCCACA--AC-TGT---GAACAAATTT-TGT-TATC---TCG-TT----TG--ACA---T-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GGCAGAAAA-ATTATT-AAATGCAACCA-TTTTCCACAATG-AAATTA-AGAATTC-AGA
gi|61117 : ATAAATAATCAAATATCAATACAACTG-TTGTT-AC--AGCCATCAAATGC-GGT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACC-CGGAT-ACT-----AATATTCAGCGTGAAGG--------------CTAATGGT-GCCACA--ACTTGG--GGAAAAAAA-T-TAT-TAT------A-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC-----AT---AA-----ATT-GACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAA--AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61118 : TAAACAA-CAAATATCAGTGTAACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAACTT-AA---------GCTGTTTACATTTGAAAACAAGAT------TCCTATGGTAC
gi|61119 : ATAAT-AAATATCAGTGTAACTG-CTGTTTAC-GAA--ATCAGTTGTTGAT--ACCCTTGCTGTTTACATTTGAAATTGAGGTTCCTAATCCTATGGTATCACGG-T-ATT---GAAAAATACA-GGTGTAGAGTTCTCTTAACTGTCTAATGGT-GCCACA--AC-T-C--AAAAAAAAATT-----------------------G--ACG---A-----ATTCTT---AGCTTTTTAC---AAATTACA-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAA-CA-TT-TGTACAATGAAAATGA-GAAATTCTAAAAT
gi|61120 : AAATA--AATGTGACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAATGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTATCGCGG-T-ATTTG-TTAAAATACAGGGTGCAGGGT-----------CCTAATAGT-GCCACA--AC-TGT---GAAAAGATTT-TGT-TATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----AAT-TT---AAC----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-ATGATTAAAATTCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61121 : AAATA---ATGTGACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAATGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTATCGCGG-TAATTTGCTTAAAATACAGGGTGCAGGGT-----------CATAATAGTCGCCACA--AC-TGT--GAAAAAGATTT-TGTCTATC---TCGATT----TG--ACG---T-----AAT-TT---A-C----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-AT-ATTAAAATTCAACCATTTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61122 : ATCAA-TGT-AACTGACTATCACTGTTTACATTTGAAAACGAGTT------TCCTACGGTACCGCGG-T-ATGAA-TAAAAATACAGCATGGAGAGT-----------TCTAATGGT-GCCCCATTAT-TGTAAAGAAAAAAAAT-CGT-TACCCATTCA-TTCCAGCG--AAA---TTTTGAATTTTTACAAGC----AGC---AA-----A-T-GAT-GAAAA-AT
gi|61123 : acacat-TAAAAATACAGCGTGTAGGAT-----------CCTAATAGT-GTCACA--AC-TGT--G---AAACATTCTGT-TATC---TCG-TT----CGACACA---T-----ACTCTT---AGT----TAT---AA-----A-T-GACAGGAAA-ATGATTAAtaatcat
gi|61124 : AAAAAAAT---AT-TATC---TCC-TT----CG--ACA---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAA
gi|61125 : AAAACT-TNT--ATT---ATA-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-TTGACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAA-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61126 : ATC---TCT-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----T-TTAACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTATGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-ATAAT
gi|61127 : TTCTA---AAT----TATGTGAC-----A-T-GGCAGAAAAAATGATTAAAATGCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAATTGAATTC-AAAAT
Alignments
lowQualScore : 11 22 111111 111 11111111111 111
lowQualScore : 3 2 5 44 55 3 55 000000 4 4 000 77777777777 3 55 3 111 777 44 555 2 6666 33 555 77777 444 5555 444 66666 2 5 2 1 0 3 1 1 1 3 3 3
lowQualScore : . . . .. .. . .. ...... . . ... ........... . .. . ... ... .. ... . .... .. ... ..... ... .... ... ..... . . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 6 3 0 00 00 6 00 555555 0 0 888 33333333333 6 00 6 555 222 00 000 9 1111 99 000 11111 777 7777 777 77777 7 3 7 2 5 1 9 0 0 1 1 1
consensus : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-GAGCCATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TGT--GGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
Reference ( family-851 ) : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-GAGCCATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TGT--GGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61112 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-GAT--ACCAGCACTATTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGGT-----------CTTAATGGT-GTCACA--AC-TGG--GGAAAAAAA---TAT-CATC---TCG-TT----CG--ACA---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61113 : ATAAATAATCAAATATCAAAATAACTG-TTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-CAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAGTACAGGGTGTATGGT------------CTAATGGT-GTCACA--AC-TGT--GAAAAAAAA-A-TAT-CATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAA
gi|61114 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-TAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGTGG-T-ATTAC-TAAATATACAGCGAGTAGGGT-----------CCTAATGGT-ACCACA--AC-TGG--GGGAAAAAATT-TAT-TATC---TCG-TT----CA--ACG---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAGTCA-TTCTGTACTAAG-AAAT-----AATTC-AAAATttaa
gi|61115 : ATAAATAAACAAATATCAATATAACTGGTTGTTCA--GAG--ATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAATGAGGT------TCCTATGGTACTGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGGT-----------CCTAATTGT-GCCACA--AC-TGT---GAACAAATTT-TGT-AATC---TCG-TT----CG--ATGTACT-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAACTA-TTTAGTGCAATG-AAATAC-AGAATTC-AAAAT
gi|61116 : ATAAATAAACAAATACCAATATAACTGGTTGTTTACAGAG--ATCAAATGC-AAT--ACCATCGCTGTTTACATCTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAACACAGGGTGTATGGT-----------CTTAATGGT-GCCACA--AC-TGT---GAACAAATTT-TGT-TATC---TCG-TT----TG--ACA---T-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GGCAGAAAA-ATTATT-AAATGCAACCA-TTTTCCACAATG-AAATTA-AGAATTC-AGA
gi|61117 : ATAAATAATCAAATATCAATACAACTG-TTGTT-AC--AGCCATCAAATGC-GGT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACC-CGGAT-ACT-----AATATTCAGCGTGAAGG--------------CTAATGGT-GCCACA--ACTTGG--GGAAAAAAA-T-TAT-TAT------A-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC-----AT---AA-----ATT-GACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAA--AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61118 : TAAACAA-CAAATATCAGTGTAACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAACTT-AA---------GCTGTTTACATTTGAAAACAAGAT------TCCTATGGTAC
gi|61119 : ATAAT-AAATATCAGTGTAACTG-CTGTTTAC-GAA--ATCAGTTGTTGAT--ACCCTTGCTGTTTACATTTGAAATTGAGGTTCCTAATCCTATGGTATCACGG-T-ATT---GAAAAATACA-GGTGTAGAGTTCTCTTAACTGTCTAATGGT-GCCACA--AC-T-C--AAAAAAAAATT-----------------------G--ACG---A-----ATTCTT---AGCTTTTTAC---AAATTACA-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAA-CA-TT-TGTACAATGAAAATGA-GAAATTCTAAAAT
gi|61120 : AAATA--AATGTGACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAATGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTATCGCGG-T-ATTTG-TTAAAATACAGGGTGCAGGGT-----------CCTAATAGT-GCCACA--AC-TGT---GAAAAGATTT-TGT-TATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----AAT-TT---AAC----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-ATGATTAAAATTCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61121 : AAATA---ATGTGACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAATGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTATCGCGG-TAATTTGCTTAAAATACAGGGTGCAGGGT-----------CATAATAGTCGCCACA--AC-TGT--GAAAAAGATTT-TGTCTATC---TCGATT----TG--ACG---T-----AAT-TT---A-C----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-AT-ATTAAAATTCAACCATTTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61122 : ATCAA-TGT-AACTGACTATCACTGTTTACATTTGAAAACGAGTT------TCCTACGGTACCGCGG-T-ATGAA-TAAAAATACAGCATGGAGAGT-----------TCTAATGGT-GCCCCATTAT-TGTAAAGAAAAAAAAT-CGT-TACCCATTCA-TTCCAGCG--AAA---TTTTGAATTTTTACAAGC----AGC---AA-----A-T-GAT-GAAAA-AT
gi|61123 : acacat-TAAAAATACAGCGTGTAGGAT-----------CCTAATAGT-GTCACA--AC-TGT--G---AAACATTCTGT-TATC---TCG-TT----CGACACA---T-----ACTCTT---AGT----TAT---AA-----A-T-GACAGGAAA-ATGATTAAtaatcat
gi|61124 : AAAAAAAT---AT-TATC---TCC-TT----CG--ACA---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAA
gi|61125 : AAAACT-TNT--ATT---ATA-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-TTGACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAA-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61126 : ATC---TCT-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----T-TTAACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTATGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-ATAAT
gi|61127 : TTCTA---AAT----TATGTGAC-----A-T-GGCAGAAAAAATGATTAAAATGCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAATTGAATTC-AAAAT
blockSeqs : T T G AG CC T TG TCCTAA A A TGC TCTCTTAACTG C TT T AAA TTC CT CAT A CCAG AC TAC TTTGA ACA TTTT GTG ATTAC T T A T T C T A A T T
blockSeqs : T T G G CC . . . . . TA . . . . G TT C . . . . . . . . . . . T . G . C T A . . .
blockSeqs : A T G G CC . . . . . AC . . . . G TT T . . . . . . . . . . . . . G . T A T . . .
blockSeqs : A C G G . . . . . . TA . . . . G TT A . . . . . . . . . . . . . T . T A T . . .
blockSeqs : T T G G . . . . . . TA . . . . A TT T . . . . . . . . . . . . . A . C T A . . .
blockSeqs : T T G G . . . . . . TG . . . . G TT T . . . . . . . . . . . . . G . T A T . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . AA . . . . G TT T . . . . . . . . . . . . . G . T A T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AT T . . . . . . . . . . . . . G . C A T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CT T . . . . . . . . . . . . . G . C T A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . A . A T A . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . T . T T A . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . G . . A T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : G* ** TT*
originalCons : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-GAGCCATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TGT--GGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
finalCons : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTACG-AG--ATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TGT--GGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
Alignments
lowQualScore : 11 22 111111 111 11111111111 111
lowQualScore : 3 2 44 00 3 55 000000 4 4 000 77777777777 3 55 3 111 777 44 555 2 6666 33 555 77777 444 5555 444 66666 2 5 2 1 0 3 1 1 1 3 3 3
lowQualScore : . . .. .. . .. ...... . . ... ........... . .. . ... ... .. ... . .... .. ... ..... ... .... ... ..... . . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 6 3 00 00 6 00 555555 0 0 888 33333333333 6 00 6 555 222 00 000 9 1111 99 000 11111 777 7777 777 77777 7 3 7 2 5 1 9 0 0 1 1 1
consensus : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-GAGCCATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TGT--GGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
Reference ( family-851 ) : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTAGGGT-----------CCTAATGGT-GCCACA--AC-TGT--GGAAAAAAATT-TGT-TATC---TCG-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACNANG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61112 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-GAT--ACCAGCACTATTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGGT-----------CTTAATGGT-GTCACA--AC-TGG--GGAAAAAAA---TAT-CATC---TCG-TT----CG--ACA---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61113 : ATAAATAATCAAATATCAAAATAACT-GTTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-CAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAGTACAGGGTGTATGGT------------CTAATGGT-GTCACA--AC-TGT--GAAAAAAAA-A-TAT-CATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAA
gi|61114 : ATAAATAATCAAATATCAATATAACTGGTTGTTTAC--AGCCATCAAATGC-TAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGTGG-T-ATTAC-TAAATATACAGCGAGTAGGGT-----------CCTAATGGT-ACCACA--AC-TGG--GGGAAAAAATT-TAT-TATC---TCG-TT----CA--ACG---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAGTCA-TTCTGTACTAAG-AAAT-----AATTC-AAAATttaa
gi|61115 : ATAAATAAACAAATATCAATATAACTGGTTGTTCA--GAG--ATCAAATGC-GAT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAATGAGGT------TCCTATGGTACTGCGG-T-ATTTA-TAAAAATACAGGGTGTATGGT-----------CCTAATTGT-GCCACA--AC-TGT---GAACAAATTT-TGT-AATC---TCG-TT----CG--ATGTACT-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAACTA-TTTAGTGCAATG-AAATAC-AGAATTC-AAAAT
gi|61116 : ATAAATAAACAAATACCAATATAACTGGTTGTTTACAGAG--ATCAAATGC-AAT--ACCATCGCTGTTTACATCTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACCGCGG-T-ATTTA-TAAAAACACAGGGTGTATGGT-----------CTTAATGGT-GCCACA--AC-TGT---GAACAAATTT-TGT-TATC---TCG-TT----TG--ACA---T-----ATTCTT---AAT----TAT---AA-----A-T-GGCAGAAAA-ATTATT-AAATGCAACCA-TTTTCCACAATG-AAATTA-AGAATTC-AGA
gi|61117 : ATAAATAATCAAATATCAATACAACTG-TTGTT-AC--AGCCATCAAATGC-GGT--ACCATCGCTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTACC-CGGAT-ACT-----AATATTCAGCGTGAAGG--------------CTAATGGT-GCCACA--ACTTGG--GGAAAAAAA-T-TAT-TAT------A-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC-----AT---AA-----ATT-GACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAA--AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61118 : TAAACAA-CAAATATCAGTGTAACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAACTT-AA---------GCTGTTTACATTTGAAAACAAGAT------TCCTATGGTAC
gi|61119 : ATAAT-AAATATCAGTGTAACTG-CTGTTTAC-GAA--ATCAGTTGTTGAT--ACCCTTGCTGTTTACATTTGAAATTGAGGTTCCTAATCCTATGGTATCACGG-T-ATT---GAAAAATACA-GGTGTAGAGTTCTCTTAACTGTCTAATGGT-GCCACA--AC-T-C--AAAAAAAAATT-----------------------G--ACG---A-----ATTCTT---AGCTTTTTAC---AAATTACA-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAA-CA-TT-TGTACAATGAAAATGA-GAAATTCTAAAAT
gi|61120 : AAATA--AATGTGACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAATGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTATCGCGG-T-ATTTG-TTAAAATACAGGGTGCAGGGT-----------CCTAATAGT-GCCACA--AC-TGT---GAAAAGATTT-TGT-TATC---TCG-TT----TG--ACG---T-----AAT-TT---AAC----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-ATGATTAAAATTCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61121 : AAATA---ATGTGACTGGTTGTTTAC-GAG--ATCAAATGC-GAC--ACCCTCACTGTTTACATTTGAAAACGAGGT------TCCTATGGTATCGCGG-TAATTTGCTTAAAATACAGGGTGCAGGGT-----------CATAATAGTCGCCACA--AC-TGT--GAAAAAGATTT-TGTCTATC---TCGATT----TG--ACG---T-----AAT-TT---A-C----TTT---GA-----A-T-TACAGAAAA-AT-ATTAAAATTCAACCATTTTTGTACAATG-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61122 : --ATCAA-TGT-AACTGACTATCACTGTTTACATTTGAAAACGAGTT------TCCTACGGTACCGCGG-T-ATGAA-TAAAAATACAGCATGGAGAGT-----------TCTAATGGT-GCCCCATTAT-TGTAAAGAAAAAAAAT-CGT-TACCCATTCA-TTCCAGCG--AAA---TTTTGAATTTTTACAAGC----AGC---AA-----A-T-GAT-GAAAA-AT
gi|61123 : acacat-TAAAAATACAGCGTGTAGGAT-----------CCTAATAGT-GTCACA--AC-TGT--G---AAACATTCTGT-TATC---TCG-TT----CGACACA---T-----ACTCTT---AGT----TAT---AA-----A-T-GACAGGAAA-ATGATTAAtaatcat
gi|61124 : AAAAAAAT---AT-TATC---TCC-TT----CG--ACA---T-----ATTCTA---AAC----TAT---AA-----A-T-GACAGAAAA-ATGATTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-AAAA
gi|61125 : AAAACT-TNT--ATT---ATA-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----A-TTGACAGAAAA-AAATTTAAAATGCAATCA-TTCTGTACTAAA-AAATAA-AGAATTC-AAAAT
gi|61126 : ATC---TCT-TT----CG--ACG---T-----ATTCTT---AGC----TAT---AA-----T-TTAACAGAAAA-ATTATTAAAATGCAATCA-TTATGTACTAAG-AAATAA-AGAATTC-ATAAT
gi|61127 : TTCTA---AAT----TATGTGAC-----A-T-GGCAGAAAAAATGATTAAAATGCAACCA-TTTTGTACAATG-AAATAATTGAATTC-AAAAT