lowQualScore : 1111 1111 111111 11 1111 1 111111
lowQualScore : 3 0000 777 99 33 4444 2 2 2 888888 2 5 8888 8888 2 5 5555 5 33 2 7 5 2 2 2 2 99999999 5 33 00 2 2 66666 4444 55555 2 33 2 33 7 5 2 2 5 2 777777 88888 555555 5 888 2 2 66 444 88 777777 222222 333 33 33 2 2 2 2
lowQualScore : . .... ... .. .. .... . . . ...... . . .... .... . . .... . .. . . . . . . . ........ . .. .. . . ..... .... ..... . .. . .. . . . . . . ...... ..... ...... . ... . . .. ... .. ...... ...... ... .. .. . . . .
lowQualScore : 3 4444 333 00 77 0000 7 7 7 000000 7 3 3333 3333 7 0 3333 0 44 5 8 0 5 5 5 5 11111111 0 44 99 5 5 22222 8888 99999 4 22 4 22 0 0 5 5 0 5 222222 88888 000000 0 999 5 5 99 444 44 222222 222222 888 44 77 7 7 7 9
consensus : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-A-ATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTTGCC-ATA-----TTACAT-G--TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-T-C-TGCTA-T------C-----TAC--T---C-TN--GGGA-TA-GA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
Reference ( gi|105434 ) : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-ATA-A-ATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-TT-TTTTTGCC-ATA-----TTACAT-A--TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGAT-C-T-C-TGCTA-T------C-----TAC--T---C-TT--GGGA-TA-GA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105435 : ATAACTAAAGT-TCA----ATTAAAAA--A--AAACCC--AG-C-A-T------TA-T-TATATA---TTCA----GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-A-ATG-A-GAT-GA--------A-CC--GA-CT-TTT-TGCC-ATA-----TTACAT-G--TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-T-C-TGCTA-T------C-----TAC--T---C-TA--GGGA-TA-GA--G---TTC--A------AGC------TATT-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105437 : ATAACTAAAGTCTCA----AT---AGA--T--AAGC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CT------GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-A-ATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-TT-TT-TTGCC-ATA-----TTACAT-G--TGCC-----T-CTTT--TG-TGTGAC--AAGTT-C-G-C-TGCTA-T------C-----TAC--T---C-TA--GGGA-TA-GA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--A-ACAACGT-C-c
gi|105436 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAAA-T--AAAC----AG-CAA-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTCATC------T-ATAA--AA-ATA-A-ATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTTGGC-ATA-----TAACAT-G--TG-C-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTTCC-T-C-TGCTA-T------C-----TAC--T---CTTT--GGGATTA-GA--G---TTCA-A------AGC------TA-T-TC--AAC--GAACAACAT-C-GA-TTT
gi|105439 : ATAACTATAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----ATCA----GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-A-ATG-A-GAT-AA--------A-TT--GA-TT-TTTTC-TC-ATT-----TTACAT-T--TGCC-----C-CATT--CG-TGTGAC--AATTT-A-T-C-TGCTA-T------C-----TAC--A---C-TA--GGGA-TA-GA--G---TTC--A------AGC------AA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCCacc
gi|105438 : ATAACGAAAAT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AT-C-A-T------TAATATATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-CGG-G-ATG-A-TAT-AA--------G-CC--GA-CTATTTTTGCC-ATA-----TTGCAT-G--TGCC-----T-CCTG--CG-TGTGAT--AAGTT-C-T-G-TACTA-T------C-----TAC--T---C-TT--GGGA-TA-GA--G---TTC--T------AAC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACGT-C-GA-TTTCCc
gi|105440 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-ATA-A-ATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTTGCC-ATA-----TTACAT-G--CGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAc
gi|105441 : ATAACTAAAGT-TCA----GTA--AAA--TAAAAACCTCAAG-C-A-TTCAATGTA-T-TAT-TCTTCCTCAGTTGGT-ATATTC-TCTGCTAAT-ACAG--AA-A-A-A-ATA-G-AAT-AAATGACTATA-TC--GACCT-TCTTTG-C-ATA-----TTA-AT-G--TGCC-----T-CTTT--CGATGTGATCAAAGTT-CTT-C-TGCTATT------C-----TAC--G---CATA--GGGA-TA-GATCG---TTC--A------AGC------TA-A-TT--AACGTG-ACAACAT-C-GA-TTTC
gi|105442 : TAACTAA-GT-TCAT---GT---AAA--T--A--C----AG-C-AGT------TA-T-TATAT----CTCAC---GT-GTATTC-TCT----AT-ATTA--AA-ATA-A-ATATA-GAT-AA--------A-CC--GACTT-TTTTTGCCGAT------TTACATTG--CGCC-----T-CTTTTTCG-TGTGAC--AATTTTC-T-C-TGCTA-T------C-----TAC--T---T-TT--GTGA-TA-GA--G---TTC--A------AGCT-----TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-CTGACTTTCC
gi|105443 : TAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-TATATA-TA-T-CATAT----CTTC----AT-GAATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGG-A-ATG-ACGAT-AC--------A-CC--GA-TT-ATTTTGCC-GTA-----TTACAT-G--TGCT-----T-CTGT--CG-TGTGAT--AAGTT-C-C-C-TGCTA-T------C-----TGC----------------------------TTC--A------AAC------CA-T-TC--AAC--G-ACAATAT-C-GA-TTTCCc
gi|105444 : AACTAAA-T-TCA----AT---AAAATT--AAAC----AG-C-A-T------GA-T--ATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-A-AA--AA-AAA-A-ATA-A-GATAAA--------A-CC--GACCT-TTTTTCCC-ATA------TACA--G--TGCC-----T-CTTT--CG-TGT-----AAATT-C-T-CTTGCTA-T------C-----TAC--T---C-TT---GGA-TA-AA--GTTTTTC--A------AGC------TT-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C--A-TTTCCc
gi|105445 : AACTAAAGT-TTACCAAAT---AAAA-T--AAAC----AG-C-A-TAT----TA-T-TATTT----CTCG----GTTGTATTC-TAA----AT-ATAA--AA-ATATA-ATA-A-GAT-AA--------AACC--GA-CT-TTTTTGCC-ATA-----TTACAT-AAGTGCCATTAAC-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-T-T-T-CTA-T------CATAAACACTAT---C-TTCGGGGA-TA-GG--G---TTTTGATGTTTCAGC------TA-T-TC--AAc
gi|105446 : AAAGT-TCA----AT---AAA--T--AA-C----AG-C---T------T--T-TATAT----C-------AT-GTATTC-T------AT-ATAA--A---TA-ATATA-A--AT-AA--------A-C---GA-TT------GCA-ATA---------AT-G--TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGG---AAGTT-C-T-C---CTA-T------C-----TGC--T---C-TT--G----TA-GA------TTC--A------AGC------TA---TC--AAC----ACAACAT-C-GA-TTTC
gi|105447 : ---AAA--A--AAACCCC-AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----GTAATAA--AA-AGA-A-ATG-A-GAT-AA--------A-CT--GA--C-TTTTTGCC-ATA-----TTACAT-G--TGCC-----T-CTTT--CG-TGTG-C--AAGTT-C-T-C-TGCTA-T------C-----AAC--T---C-TA--GGGA-TA-GA--G---TTCA-A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105448 : ---AAA--T--AAAC----AGGC-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-G-ATTCATCT----AT-ATAA--AAGATA-A-ATA-A-GAT-AA--------A-C----G-CT-TTCTTGCC-ATA-----TTACA--G--TGCC-----TCCTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-T-C-T-CTA-T------CA----TAC--T---C-TT--GGGA-TA-AA--G---TT---A------AGCT-----TT-T-TC--A----G-ACAGAAA-T-GA-TTCCCc
gi|105449 : ---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-TCTATAT----TT------AT-GTATTC-TCT----GTTATAAGAAA-AGA-A-ATG-A-GAT-AA--------A-CCCTGA-CT-T------C-ATG-----TCG-------TGC---------TGT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TTC-TGCTA-A------C-----TAC--T---C-TA--GGTA-TAAGA--G---TT---A------AGC------TA-TGTCGAAAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105450 : TCC-TCT----GT-ATAA--AA-AAAGA-ATG-A-GAT-AA--------AACC--CA-CT-TTTTTGCC-ACATATTTTTACAT-GT-TGCC-----C-CTCT--TT-TGTAAC--AAGTA-C-T-CTTGCTA--------C-----TAC--TACAC-TA--GGGA-TA-GAGGG---TTA--A------AGG------TA---TC--AAC--G-ACAACATCC-GA-ATTCc
gi|105451 : C-----T-CTTT--CA-TGTGAC--AAGTT-C-T-C-TGCTA-TCTAGGCC-----TAC--T---C-TA--GGGA-TA-GA--G---TTC--A------AGCTACATGTA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTTCtc
Alignments
lowQualScore : 1111 111111 111111
lowQualScore : 3 9999 666 88 33 3333 2 2 2 666666 2 5 7777 7777 2 4 5555 4 33 2 6 4 2 2 4 88888888 2 33 5555 2 2 55555 55 2 55555 2 33 2 33 4 4 4 2 666666 4 88888888 444 4 1 2 2 66 444 77 666666 111111 333 33 33 2 2 2 2
lowQualScore : . .... ... .. .. .... . . . ...... . . .... .... . . .... . .. . . . . . . ........ . .. .... . . ..... .. . ..... . .. . .. . . . . ...... . ........ ... . . . . .. ... .. ...... ...... ... .. .. . . . .
lowQualScore : 1 6666 999 44 44 1111 5 5 5 999999 5 0 8888 8888 5 7 0000 7 22 4 6 7 4 4 7 55555555 4 22 9999 4 4 99999 66 4 66666 2 11 2 11 7 7 7 4 888888 7 55555555 111 7 8 4 4 55 111 99 888888 555555 000 22 44 5 5 5 7
consensus : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TNGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
Reference ( family-817 ) : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TNGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105434 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-TT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--A-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGAT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TTGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105435 : ATAACTAAAGT-TCA----ATTAAAAA--A--AAACCC--AG-C-A-T------TA-T-TATATA---TTCA----GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-GA--------A-CC--GA-C--TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TATT-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105436 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAAA-T--AAAC----AG-CAA-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTCATC------T-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GGC-ATA-----TAACAT--G-TG-C-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTTCC-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---CTTTGGGATT-AGA--G---TTCA-A------AGC------TA-T-TC--AAC--GAACAACAT-C-GA-TTTc
gi|105437 : ATAACTAAAGTCTCA----AT---AGA--T--AAGC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CT------GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA--T-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--TG-TGTGAC--AAGTT-C-GC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--A-ACAACGT-C-acc
gi|105438 : ATAACGAAAAT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AT-C-A-T------TAATATATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-CGG-GATG-A-TAT-AA--------G-CC--GA-CTATTTTT-GCC-ATA-----TTGCAT--G-TGCC-----T-CCTG--CG-TGTGAT--AAGTT-C-TG-TACTA-T------C-TA--------CT---C-TTGGGA-T-AGA--G---TTC--T------AAC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACGT-C-GA-TTTCC
gi|105439 : ATAACTATAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----ATCA----GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-TT--GA--T-TTTTT-CTC-ATT-----TTACAT--T-TGCC-----C-CATT--CG-TGTGAC--AATTT-A-TC-TGCTA-T------C-TA--------CA---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------AA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCCc
gi|105440 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-CGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAc
gi|105441 : ATAACTAAAGT-TCA----GTA--AAA--TAAAAACCTCAAG-C-A-TTCAATGTA-T-TAT-TCTTCCTCAGTTGGT-ATATTC-TCTGCTAAT-ACAG--AA-A-A-AATA-G-AAT-AAATGACTATA-TC--GACCT-TCTTT-G-C-ATA-----TTA-AT--G-TGCC-----T-CTTT--CGATGTGATCAAAGTT-CTTC-TGCTATT------C-TA--------CG---CATAGGGA-T-AGATCG---TTC--A------AGC------TA-A-TT--AACGTG-ACAACAT-C-GA-TTTC
gi|105442 : TAACTAA-GT-TCAT---GT---AAA--T--A--C----AG-C-AGT------TA-T-TATAT----CTCAC---GT-GTATTC-TCT----AT-ATTA--AA-ATA-AATATA-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTTTGCCGAT------TTACATT-G-CGCC-----T-CTTTTTCG-TGTGAC--AATTTTC-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---T-TTGTGA-T-AGA--G---TTC--A------AGCT-----TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-CTGACTTTCC
gi|105443 : TAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-TATATA-TA-T-CATAT----CTTC----AT-GAATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGG-AATG-ACGAT-AC--------A-CC--GA-TT-ATTTT-GCC-GTA-----TTACAT--G-TGCT-----T-CTGT--CG-TGTGAT--AAGTT-C-CC-TGCTA-T------C-TG--------CT------------------------TC--A------AAC------CA-T-TC--AAC--G-ACAATAT-C-GA-TTTCCc
gi|105444 : AACTAAA-T-TCA----AT---AAAATT--AAAC----AG-C-A-T------GA-T--ATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-A-AA--AA-AAA-AATA-A-GATAAA--------A-CC--GACCT-TTTTT-CCC-ATA------TACA---G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGT-----AAATT-C-TCTTGCTA-T------C-TA--------CT---C-TT-GGA-T-AAA--GTTTTTC--A------AGC------TT-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C--A-TTTCCc
gi|105445 : AACTAAAGT-TTACCAAAT---AAAA-T--AAAC----AG-C-A-TAT----TA-T-TATTT----CTCG----GTTGTATTC-TAA----AT-ATAA--AA-ATATAATA-A-GAT-AA--------AACC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACATAAG-TGCCATTAAC-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TT-T-CTA-T------CATAAACACTATCT---T-CGGGGA-T-AGG--G---TTTTGATGTTTCAGC------TA-T-TC--AAc
gi|105446 : AAAGT-TCA----AT---AAA--T--AA-C----AG-C---T------T--T-TATAT----C-------AT-GTATTC-T------AT-ATAA--AT-A-A-TATA-A--AT-AA--------A-C---GA-------TT-GCA-ATA---------AT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGG---AAGTT-C-TC---CTA-T------C-TG--------CT---C-TTG----T-AGA------TTC--A------AGC------TA---TC--AAC----ACAACAT-C-GA-TTTC
gi|105447 : ---AAA--A--AAACCCC-AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----GTAATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CT--GA-C--TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTG-C--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-AA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTCA-A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105448 : ---AAA--T--AAAC----AGGC-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-G-ATTCATCT----AT-ATAA--AAGATA-AATA-A-GAT-AA--------A-C----G-CT-TTCTT-GCC-ATA-----TTACA---G-TGCC-----TCCTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-T-CTA-T------CATA--------CT---C-TTGGGA-T-AAA--G---TT---A------AGCT-----TT-T-TC--A----G-ACAGAAA-T-GA-TTCCCc
gi|105449 : ---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-TCTATAT----TT------AT-GTATTC-TCT----GTTATAAGAAA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CCCTGA-CT-T-------C-ATG-----T--CGT--G------------CTGT--CG-TGTGAC--AAGTT-CTTC-TGCTA-A------C-TA--------CT---C-TAGGTA-TAAGA--G---TT---A------AGC------TA-TGTCGAAAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105450 : TCC-TCT----GT-ATAA--AA-AAAGAATG-A-GATAAA--------A-CC--CA-CT-TTTTT-GCC-ACATATTTTTACAT--GTTGCC-----C-CTCT--TT-TGTAAC--AAGTA-C-TCTTGCTA--------C-TA--------CTACAC-TAGGGA-T-AGAGGG---TTA--A------AGG------TA---TC--AAC--G-ACAACATCC-GA-ATTCc
gi|105451 : C-----T-CTTT--CA-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-TCTAGGCC-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGCTACATGTA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTTCtc
Alignments
lowQualScore : 1111 111111 111111
lowQualScore : 3 9999 666 88 33 3333 2 2 2 666666 2 5 7777 7777 2 4 5555 4 33 2 6 4 2 2 4 88888888 2 33 5555 2 2 55555 55 2 55555 2 33 2 33 4 4 4 2 666666 4 88888888 444 4 1 2 2 66 444 77 666666 111111 333 33 33 2 2 2 2
lowQualScore : . .... ... .. .. .... . . . ...... . . .... .... . . .... . .. . . . . . . ........ . .. .... . . ..... .. . ..... . .. . .. . . . . ...... . ........ ... . . . . .. ... .. ...... ...... ... .. .. . . . .
lowQualScore : 1 6666 999 44 44 1111 5 5 5 999999 5 0 8888 8888 5 7 0000 7 22 4 6 7 4 4 7 55555555 4 22 9999 4 4 99999 66 4 66666 2 11 2 11 7 7 7 4 888888 7 55555555 111 7 8 4 4 55 111 99 888888 555555 000 22 44 5 5 5 7
consensus : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TNGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
Reference ( family-817 ) : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TNGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105434 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-TT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--A-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGAT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TTGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105435 : ATAACTAAAGT-TCA----ATTAAAAA--A--AAACCC--AG-C-A-T------TA-T-TATATA---TTCA----GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-GA--------A-CC--GA-C--TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TATT-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105436 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAAA-T--AAAC----AG-CAA-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTCATC------T-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GGC-ATA-----TAACAT--G-TG-C-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTTCC-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---CTTTGGGATT-AGA--G---TTCA-A------AGC------TA-T-TC--AAC--GAACAACAT-C-GA-TTTc
gi|105437 : ATAACTAAAGTCTCA----AT---AGA--T--AAGC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CT------GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA--T-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--TG-TGTGAC--AAGTT-C-GC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--A-ACAACGT-C-acc
gi|105438 : ATAACGAAAAT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AT-C-A-T------TAATATATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-CGG-GATG-A-TAT-AA--------G-CC--GA-CTATTTTT-GCC-ATA-----TTGCAT--G-TGCC-----T-CCTG--CG-TGTGAT--AAGTT-C-TG-TACTA-T------C-TA--------CT---C-TTGGGA-T-AGA--G---TTC--T------AAC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACGT-C-GA-TTTCC
gi|105439 : ATAACTATAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----ATCA----GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-TT--GA--T-TTTTT-CTC-ATT-----TTACAT--T-TGCC-----C-CATT--CG-TGTGAC--AATTT-A-TC-TGCTA-T------C-TA--------CA---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------AA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCCc
gi|105440 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-CGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAc
gi|105441 : ATAACTAAAGT-TCA----GTA--AAA--TAAAAACCTCAAG-C-A-TTCAATGTA-T-TAT-TCTTCCTCAGTTGGT-ATATTC-TCTGCTAAT-ACAG--AA-A-A-AATA-G-AAT-AAATGACTATA-TC--GACCT-TCTTT-G-C-ATA-----TTA-AT--G-TGCC-----T-CTTT--CGATGTGATCAAAGTT-CTTC-TGCTATT------C-TA--------CG---CATAGGGA-T-AGATCG---TTC--A------AGC------TA-A-TT--AACGTG-ACAACAT-C-GA-TTTC
gi|105442 : TAACTAA-GT-TCAT---GT---AAA--T--A--C----AG-C-AGT------TA-T-TATAT----CTCAC---GT-GTATTC-TCT----AT-ATTA--AA-ATA-AATATA-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTTTGCCGAT------TTACATT-G-CGCC-----T-CTTTTTCG-TGTGAC--AATTTTC-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---T-TTGTGA-T-AGA--G---TTC--A------AGCT-----TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-CTGACTTTCC
gi|105443 : TAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-TATATA-TA-T-CATAT----CTTC----AT-GAATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGG-AATG-ACGAT-AC--------A-CC--GA-TT-ATTTT-GCC-GTA-----TTACAT--G-TGCT-----T-CTGT--CG-TGTGAT--AAGTT-C-CC-TGCTA-T------C-TG--------CT------------------------TC--A------AAC------CA-T-TC--AAC--G-ACAATAT-C-GA-TTTCCc
gi|105444 : AACTAAA-T-TCA----AT---AAAATT--AAAC----AG-C-A-T------GA-T--ATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-A-AA--AA-AAA-AATA-A-GATAAA--------A-CC--GACCT-TTTTT-CCC-ATA------TACA---G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGT-----AAATT-C-TCTTGCTA-T------C-TA--------CT---C-TT-GGA-T-AAA--GTTTTTC--A------AGC------TT-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C--A-TTTCCc
gi|105445 : AACTAAAGT-TTACCAAAT---AAAA-T--AAAC----AG-C-A-TAT----TA-T-TATTT----CTCG----GTTGTATTC-TAA----AT-ATAA--AA-ATATAATA-A-GAT-AA--------AACC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACATAAG-TGCCATTAAC-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TT-T-CTA-T------CATAAACACTATCT---T-CGGGGA-T-AGG--G---TTTTGATGTTTCAGC------TA-T-TC--AAc
gi|105446 : AAAGT-TCA----AT---AAA--T--AA-C----AG-C---T------T--T-TATAT----C-------AT-GTATTC-T------AT-ATAA--AT-A-A-TATA-A--AT-AA--------A-C---GA-------TT-GCA-ATA---------AT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGG---AAGTT-C-TC---CTA-T------C-TG--------CT---C-TTG----T-AGA------TTC--A------AGC------TA---TC--AAC----ACAACAT-C-GA-TTTC
gi|105447 : ---AAA--A--AAACCCC-AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----GTAATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CT--GA-C--TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTG-C--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-AA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTCA-A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105448 : ---AAA--T--AAAC----AGGC-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-G-ATTCATCT----AT-ATAA--AAGATA-AATA-A-GAT-AA--------A-C----G-CT-TTCTT-GCC-ATA-----TTACA---G-TGCC-----TCCTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-T-CTA-T------CATA--------CT---C-TTGGGA-T-AAA--G---TT---A------AGCT-----TT-T-TC--A----G-ACAGAAA-T-GA-TTCCCc
gi|105449 : ---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-TCTATAT----TT------AT-GTATTC-TCT----GTTATAAGAAA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CCCTGA-CT-T-------C-ATG-----T--CGT--G------------CTGT--CG-TGTGAC--AAGTT-CTTC-TGCTA-A------C-TA--------CT---C-TAGGTA-TAAGA--G---TT---A------AGC------TA-TGTCGAAAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105450 : TCC-TCT----GT-ATAA--AA-AAAGAATG-A-GATAAA--------A-CC--CA-CT-TTTTT-GCC-ACATATTTTTACAT--GTTGCC-----C-CTCT--TT-TGTAAC--AAGTA-C-TCTTGCTA--------C-TA--------CTACAC-TAGGGA-T-AGAGGG---TTA--A------AGG------TA---TC--AAC--G-ACAACATCC-GA-ATTCc
gi|105451 : C-----T-CTTT--CA-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-TCTAGGCC-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGCTACATGTA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTTCtc
blockSeqs : C CCAA TAA AT AA CTCA G A G TCAATG A A CTTC GTTG T A GCTA A GA G G T T C A ATGACTAT A CT CTA T G TATTT AA T ATTAA C TT A CA C T T T CTAGGC A AACACTAT ACA T A T A TC TTT TG TGTTTC TACATG TT GA GT A C T C
blockSeqs : . T A A . CCC . . . ATATA . C A C . A . T . . T G . . A . . . CCT . . . T . . . . . . T T T . . A . . A T . . GG . A . T TG . . . . . .
blockSeqs : . . . A . CC . . . AT . . . . . . . . . . G . . . . . . . CCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TNGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
finalCons : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TNGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
Alignments
lowQualScore : 1111 111111 111111
lowQualScore : 3 9999 666 88 33 3333 2 2 2 666666 2 5 7777 7777 2 4 5555 4 33 2 6 4 2 2 4 88888888 2 33 5555 2 2 55555 55 2 55555 2 33 2 33 4 4 4 2 666666 4 88888888 444 4 1 2 2 66 444 77 666666 111111 333 33 33 2 2 2 2
lowQualScore : . .... ... .. .. .... . . . ...... . . .... .... . . .... . .. . . . . . . ........ . .. .... . . ..... .. . ..... . .. . .. . . . . ...... . ........ ... . . . . .. ... .. ...... ...... ... .. .. . . . .
lowQualScore : 1 6666 999 44 44 1111 5 5 5 999999 5 0 8888 8888 5 7 0000 7 22 4 6 7 4 4 7 55555555 4 22 9999 4 4 99999 66 4 66666 2 11 2 11 7 7 7 4 888888 7 55555555 111 7 8 4 4 55 111 99 888888 555555 000 22 44 5 5 5 7
consensus : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TNGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
Reference ( family-817 ) : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TNGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105434 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-TT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--A-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGAT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TTGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105435 : ATAACTAAAGT-TCA----ATTAAAAA--A--AAACCC--AG-C-A-T------TA-T-TATATA---TTCA----GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-GA--------A-CC--GA-C--TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TATT-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105436 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAAA-T--AAAC----AG-CAA-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTCATC------T-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GGC-ATA-----TAACAT--G-TG-C-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTTCC-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---CTTTGGGATT-AGA--G---TTCA-A------AGC------TA-T-TC--AAC--GAACAACAT-C-GA-TTTc
gi|105437 : ATAACTAAAGTCTCA----AT---AGA--T--AAGC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CT------GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CC--GA--T-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--TG-TGTGAC--AAGTT-C-GC-TGCTA-T------C-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------TA-T-TC--AAC--A-ACAACGT-C-acc
gi|105438 : ATAACGAAAAT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AT-C-A-T------TAATATATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-CGG-GATG-A-TAT-AA--------G-CC--GA-CTATTTTT-GCC-ATA-----TTGCAT--G-TGCC-----T-CCTG--CG-TGTGAT--AAGTT-C-TG-TACTA-T------C-TA--------CT---C-TTGGGA-T-AGA--G---TTC--T------AAC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACGT-C-GA-TTTCC
gi|105439 : ATAACTATAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----ATCA----GT-GTATTC-TCT----GT-ATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-TT--GA--T-TTTTT-CTC-ATT-----TTACAT--T-TGCC-----C-CATT--CG-TGTGAC--AATTT-A-TC-TGCTA-T------C-TA--------CA---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGC------AA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCCc
gi|105440 : ATAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-ATAA--AA-ATA-AATA-A-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-CGCC-----T-CTTT--CG-TGTGAC--AAc
gi|105441 : ATAACTAAAGT-TCA----GTA--AAA--TAAAAACCTCAAG-C-A-TTCAATGTA-T-TAT-TCTTCCTCAGTTGGT-ATATTC-TCTGCTAAT-ACAG--AA-A-A-AATA-G-AAT-AAATGACTATA-TC--GACCT-TCTTT-G-C-ATA-----TTA-AT--G-TGCC-----T-CTTT--CGATGTGATCAAAGTT-CTTC-TGCTATT------C-TA--------CG---CATAGGGA-T-AGATCG---TTC--A------AGC------TA-A-TT--AACGTG-ACAACAT-C-GA-TTTC
gi|105442 : TAACTAA-GT-TCAT---GT---AAA--T--A--C----AG-C-AGT------TA-T-TATAT----CTCAC---GT-GTATTC-TCT----AT-ATTA--AA-ATA-AATATA-GAT-AA--------A-CC--GA-CT-TTTTTTGCCGAT------TTACATT-G-CGCC-----T-CTTTTTCG-TGTGAC--AATTTTC-TC-TGCTA-T------C-TA--------CT---T-TTGTGA-T-AGA--G---TTC--A------AGCT-----TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-CTGACTTTCC
gi|105443 : TAACTAAAGT-TCA----AT---AAA--T--AAAC----AG-C-A-TATATA-TA-T-CATAT----CTTC----AT-GAATTC-TCT----AT-ATAA--AA-AGG-AATG-ACGAT-AC--------A-CC--GA-TT-ATTTT-GCC-GTA-----TTACAT--G-TGCT-----T-CTGT--CG-TGTGAT--AAGTT-C-CC-TGCTA-T------C-TG--------CT------------------------TC--A------AAC------CA-T-TC--AAC--G-ACAATAT-C-GA-TTTCCc
gi|105444 : AACTAAA-T-TCA----AT---AAAATT--AAAC----AG-C-A-T------GA-T--ATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----AT-A-AA--AA-AAA-AATA-A-GATAAA--------A-CC--GACCT-TTTTT-CCC-ATA------TACA---G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGT-----AAATT-C-TCTTGCTA-T------C-TA--------CT---C-TT-GGA-T-AAA--GTTTTTC--A------AGC------TT-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C--A-TTTCCc
gi|105445 : AACTAAAGT-TTACCAAAT---AAAA-T--AAAC----AG-C-A-TAT----TA-T-TATTT----CTCG----GTTGTATTC-TAA----AT-ATAA--AA-ATATAATA-A-GAT-AA--------AACC--GA-CT-TTTTT-GCC-ATA-----TTACATAAG-TGCCATTAAC-CTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TT-T-CTA-T------CATAAACACTATCT---T-CGGGGA-T-AGG--G---TTTTGATGTTTCAGC------TA-T-TC--AAc
gi|105446 : AAAGT-TCA----AT---AAA--T--AA-C----AG-C---T------T--T-TATAT----C-------AT-GTATTC-T------AT-ATAA--AT-A-A-TATA-A--AT-AA--------A-C---GA-------TT-GCA-ATA---------AT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTGG---AAGTT-C-TC---CTA-T------C-TG--------CT---C-TTG----T-AGA------TTC--A------AGC------TA---TC--AAC----ACAACAT-C-GA-TTTC
gi|105447 : ---AAA--A--AAACCCC-AG-C-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-GTATTC-TCT----GTAATAA--AA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CT--GA-C--TTTTT-GCC-ATA-----TTACAT--G-TGCC-----T-CTTT--CG-TGTG-C--AAGTT-C-TC-TGCTA-T------C-AA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTCA-A------AGC------TA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105448 : ---AAA--T--AAAC----AGGC-A-T------TA-T-TATAT----CTCA----GT-G-ATTCATCT----AT-ATAA--AAGATA-AATA-A-GAT-AA--------A-C----G-CT-TTCTT-GCC-ATA-----TTACA---G-TGCC-----TCCTTT--CG-TGTGAC--AAGTT-C-TC-T-CTA-T------CATA--------CT---C-TTGGGA-T-AAA--G---TT---A------AGCT-----TT-T-TC--A----G-ACAGAAA-T-GA-TTCCCc
gi|105449 : ---AAA--T--AAAC----AG-C-A-T------TA-TCTATAT----TT------AT-GTATTC-TCT----GTTATAAGAAA-AGA-AATG-A-GAT-AA--------A-CCCTGA-CT-T-------C-ATG-----T--CGT--G------------CTGT--CG-TGTGAC--AAGTT-CTTC-TGCTA-A------C-TA--------CT---C-TAGGTA-TAAGA--G---TT---A------AGC------TA-TGTCGAAAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTCC
gi|105450 : TCC-TCT----GT-ATAA--AA-AAAGAATG-A-GATAAA--------A-CC--CA-CT-TTTTT-GCC-ACATATTTTTACAT--GTTGCC-----C-CTCT--TT-TGTAAC--AAGTA-C-TCTTGCTA--------C-TA--------CTACAC-TAGGGA-T-AGAGGG---TTA--A------AGG------TA---TC--AAC--G-ACAACATCC-GA-ATTCc
gi|105451 : C-----T-CTTT--CA-TGTGAC--AAGTT-C-TC-TGCTA-TCTAGGCC-TA--------CT---C-TAGGGA-T-AGA--G---TTC--A------AGCTACATGTA-T-TC--AAC--G-ACAACAT-C-GA-TTTTCtc