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Reference ( family-814 )      : GCGTGGCT-CGT--ACC-TCGCACACTGACCTCGGATG-TGATCG-G-A---TTGTCGCC-ATA--T-----TGG-ATATTT--GAATTCA-CGTGT--T--C-A-AAAC--AAAA-TA-------TCCGTT--TC-GTCG-G-CTC---CA----CTTACG-CGACCGTT--A-T-ATC---A--GCATG-AAAACG-GTTG-CAAATAAC--T---TACAAT-TATTCCC------------------------TGA-GT---G-AATG-CC-AAGT-CCATTTTTTCTA-A-ACTGC-A-TC--AAT-GCG-AG-AAAGTCG-TCTG-TAGCCGAAGGAACAG
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Reference ( family-814 )      : GCGTGGCT-CGT--ACC-TCGCACACTGACCTCGGATG-TGATCG-G-A---TTGTTGCC-ATA--T-----TGG-ATATTT--GAATTCA-CGTGT--T--C-A-AAAC--AAAA-TA-------TCCGTT--TC-GTCG-G-CTC---CA----CTTACG-CGACCGTT--A-T-ATC---A--GCATG-AAAACG-GTTG-CAAATAAC--T---TACAAT-TATTCCC------------------------TGA-GT---G-AATG-CC-AAGT-CCATTTTTTCTA-A-ACTGC-A-TC--AAT-GCG-AG-AAAGTCG-TCTG-TAGCCGAAGGAACAG
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blockSeqs                     :         .   .   A             C       .      . . .          .   .  .       .  T   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        CT    G   .  . .   A          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   T        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   C             C       .      . . .          .   .  .       .  A   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        AC    C   .  . .   C          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   A        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   C             C       .      . . .          .   .  .       .  A   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        CG    A   .  . .   A          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   T        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   C             C       .      . . .          .   .  .       .  A   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        GC    C   .  . .   C          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   T        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   C             T       .      . . .          .   .  .       .  A   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        AC    T   .  . .   A          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   T        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   C             C       .      . . .          .   .  .       .  T   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        AC    G   .  . .   A          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   T        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   T             A       .      . . .          .   .  .       .  A   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        GA    C   .  . .   A          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   .        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   C             T       .      . . .          .   .  .       .  T   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        GT    A   .  . .   A          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   .        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   C             C       .      . . .          .   .  .       .  T   .        .     .  .  . .    .     .  .            .   .    . .   .    .        G     A   .  . .   A          .      .    .        .  .        .       .                          .  .   .    .  .    .   .        . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :         .   .   .             .       .      . . .          .   .  .       .  .   .        .     .  .  . .    .     .                                                                                               .  .                                                                            . .     . .  .    .   .  .       .    .
blockSeqs                     :                 .             .       .      . . .          .   .  .       .  .   .        .     .  .  . .    .                                                                                                                                                                                                                            
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lowQualScore                  :         1   22  99            1       7      3 7 777        0   99 22222   5  6   99       9     99 99 9 9    88    1  8888888  1   66  3    3 3   777  1111     888   8   66 3 3   444444     7      3    3        22 444      3       111111111111111111111111   3  222 3    3  3    3   4        1 1     1 2  22   1   1  1       1    1               
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Reference ( family-814 )      : GCGTGGCT-CGT--ACC-TCGCACACTGACCTCGGATG-TGATCG-G-A---TTGTTGCC-ATA--T-----TGG-ATATTT--GAATTCA-CGTGT--T--C-A-AAAC--AAAA-TA-------TCCGTT--TC-GTCG-G-CTC---CA----CTTACG-CGACCGTT--A-T-ATC---A--GCATG-AAAACG-GTTG-CAAATAAC--T---TACAAT-TATTCCC------------------------TGA-GT---G-AATG-CC-AAGT-CCATTTTTTCTA-A-ACTGC-A-TC--AAT-GCG-AG-AAAGTCG-TCTG-TAGCCGAAGGAACAG
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gi|97335                      : GCGTGGCTTCGTTTAC--TCGCACACTGAC-TCGGATG-TGATCGCG-ACTTTTGTTGCC-ATAC-T-----TGG-ATATTT--GAATTCA-CGTGT--T--C-A-AAACA-AAAA-TA-------ACGTTT--TC-GTCG-GCCTC---CAATTTCTCACG--GACCGTTTGA-T-ATC---A--GCATGAAAAACG-GTTGCCAAATAACTTT---TACAAT-TA-TCCC------------------------TGATGT---G-AATGCCC-AAGT-CCAATTTTTATAGA-ACTGC-ATTC--AAT-GCGCAG-AAAGTCGTTCTGCTAG--GAAGGAACAG
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gi|97337                      : GCGTGGCT-CAT--GCC-TCGCATACT----CCAGATG-TGATCG-G-A---TTGTCAGC-ATA--T-----GGG-GT
gi|97338                      :  CGTGGCT-CGT--ACC-TTGCACACTGACCTCGGATG-TGATCG-G-A---TTGTTGCC-ATA--T-----TGG-ATATTT--GAATTCA-CGTGT--T--C-A-AAAC--AAAA-TA-------TCTGTT--TT-GTCG-G-CTC---CA----CTTACG-CAACTGTT--A-T-ATC---A--GCAAG-AAAATG-GTTG-CAAATAAC--T---TACAAT-TATTCCC------------------------TGA-GT---A-AATG-CC-AAGT-CTATTTTATTTG-A-ACTGC-A-TC--AAT-GCG-AG-AAAGTCG-TCTG-TAGCCGAAGGAACAG
gi|97339                      :  CGTGGCT-CGT--ACC-TCGCA-ACTGAGT--GAATGCTGATCGAG-A---TTGTTGCC--CA--TCCCTATGG-ATATTT--GAATTAAACGTGT--T--TTA-AAAC--AAAA-TA-------TCTGTTCTTCTGTCGTG-TTCTCGCA----CTTACA-CGACGTTT--A-T-ATTCTTATTGCAAG-AAAACG-GTTG-CAAATAA---T---TACAAC-TATTTCCGCTGAATAACTTACTATTATTCCCTGA-GTG--G-AATG-CCAAAGT-CTATTTTTTCTG-A-ACTGC-A-TC---AT-GCG-AG-AAAGTCG-TTTG-TAG-CGAAGGAGCAG
gi|97340                      :  CGCAACT-TGT--ACT-TCTCACACTGACCTTGGACA-CGATCG-G-A---TTGACGCC-AT---T-----T------TTTAAAAAGTCA-AGTCT--T--C-A-AAAC--AAAA-
gi|97341                      :   GTGACT-CGT--ACC-TTGCACACTGACATCGGACG-TGATCG-G-A---TTGTCGCC-ATA--T-----TTC-CTTTTT--GAATTCA-CGTGTTCT--C-A-AAAT--GAA
gi|97342                      :                 C-TCGGACACTGACTTCGGATG-TGATCG-GTA---CTGTTGCT-ATA--T-----TGG-ATATTT--GAATTC--CGTGT--T--C-A-AAAC--AAAA-TA-------TCCGTT--TC-GTCA-G-CTC---CA----CTTACA-CGACCGTT--A-T-ATC---A--ACATG-AAAATG-GTTG-CAAAT-AC--T---TACAAT-TATATCC------------------------TTA-GT---A-AAT--TC-AAGT-CCA-TTTTTCTA-A-ACTGC-A-TC--AAT-GCG-AG-AAAGTCG-TCTG-TAACCGAAGGAATAtagcatgt
gi|97343                      :                         ACTGATCTAGGATT-TGATCG-G-A---TTGTTGCC-A-A--T-----TGG-AATTTT--AAATTCA-AGTGT--T--C-A-AAAC--AAAA-TA-------TCTGTT--CC-ATTG-G-CTC---CA----CTCAAG-AAACAGTT--A-T-ATC---A--ATATA-AAAAAG-GTTG-CAAATAAT--T---AAC
gi|97344                      :                                                        TCGCCTAT---T-----TGT-ATTTTT--AAA--CA-CGTGT--T--C-A-AAAT--AAAA-TACAGTGTATCTGTT--TC-GTCG-G-CTC---CA----CAAGCG-TGACAGCT--A-T-ATC---A--GCATG-AAAACA-GTTG-CAAATAAC--T---TGCAGC-TATTCCC------------------------TGA-GTCTAA-AAT--CC----T-CCGT---------G-ACTGC-A-GC--AAT-GCG-AG-AAAGTCG-TCTG-CAGCCGAAGGAATAG
gi|97345                      :                                                                                                                                                                                                                     --T---TGCAGT-TATTCCC------------------------TGA-GT---G-AATG-TC-AAGT-CTATT------------------TC--AAT-GCA-AG-AAAGTCG-TCTT-GAACCGAAGGAAGAG
gi|97346                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -A-ACTGC-AATCGTAATTGCG-AGGAAAGTCG-TCTG-TAGCCGAAGGAACAG