lowQualScore                  :                                                                                              2222222222222222                                                  
lowQualScore                  :                                                      44  1    66 1    333  55 3   88         6666666666666666              2     0   2    8       6            
lowQualScore                  :                                                      ..  .    .. .    ...  .. .   ..         ................              .     .   .    .       .            
lowQualScore                  :                                                      55  9    77 9    333  11 8   33         6666666666666666              4     8   0    8       3            
consensus                     :                                      TTTTTGAAAAAGCGTG--AA-TTTTATT-GTAC---AG-NC-TGT--ACAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACANATCACATGTATG
Reference ( gi|89662 )        :                                      TTTTTGAAAAAGCGTG--AA-TTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT--ACAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89663                      :                                      TTTTGGAAAAAGCGTG--AA-TTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT--ACAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89664                      :                                    ttTTTCTTAAAAAGGGTG--AA-TGTTATT-GTAC---AG-AC-TGT--ACAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGC--ATTTTTTAT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89665                      :                                    ttTTCTTGAAAAAGTGTG--AA-TTTTTTTTGTAC---AG-AC-TGT--ACAGCATAA--A---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-TTGTTTTGT-ACAGGCTGTACATATCAAATGTATG
gi|89666                      :                                       TTTTGAAAAAGCGTG--AA-TTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT--ACAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89671                      :                                        TTTGAAAAAGTGTG--CA-TTTTTTT-TTAC---AG-TC-TGT--ACA
gi|89672                      : aacatgaattttggtgtacaggcggtacagcgtgattgcaTTGAAAAAGTGTG--CA-GTTTTTT-GCAC---AG-TC-TGT--A
gi|89673                      : gcgtggattttgatgtacaggtgtgacagcgtgaatggcaTTGAAAAAGTGTG--CATTTTTTTT-GTAC---AG-TC-CGT--ACAtggatcacatgtat
gi|89675                      : gtgtgaattttggtgtacaggcgtgacagcgtgaatgctaTTGAAAAAGTGTGCAAA-T----TT-GTGC---AG-TC-TGT--ACAtatcacatgt
gi|89676                      :    tgaattttaatgtacaggagtgacagtgggaacgagaTTGAAAAAATGTA--AA-TTTTG-T-GTAC---AG-TC-TGT--ACAtatcacatgtatg
gi|89679                      :     gaattttaatgtacaggcatggcagcatgaatgaggTTGAAAAAGTGCAC-AA-TTTCA-T-GTAC---AG-TC-TGT--ACAtatcacatgtatg
gi|89667                      :                                        aatggaaAAGCGTG--AA-TTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT--ACAGTGTGA--G---AATG--GA--TGAAAATGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATGtatcacatatatg
gi|89668                      :                                                AGCATG--AA-TTTTGGT-GTACTGCAG-AC-TGT--ACAGCGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA-TTTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89669                      :                                                AGCGTG--AA-TTTTGTT-GTAC---AA-TC-TGT--ACATTGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTAC--ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89670                      :                                                AGAGTG--AA-TTTTAAT-GTAC---AG-AA--GTG-ACAGAGTGA--A---CAGG--GA--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89671                      :                                                AACATG--AA-TTTTGGT-GTAC---AG-GC-GGT--ACAGCGTGATTG---CATT------TGAAAAAGTGTGCA-TTTTTTTTT-ACAGTCTGTACA
gi|89672                      :                                                 GCGTG--GA-TTTTGAT-GTAC---AG-G--TGTG-ACAGCGTGA-------ATG--GCATTGAAAAAGTGTGCA-GTTTTTTGC-ACAGTCTGTATGGATCACATGTAT
gi|89673                      :                                                 GTGTG--AA-TTTTGGT-GTAC---AG-GC--GTG-ACAGCGTGA-------ATGCTAT--TGAAAAAGTGTGCATTTTTTTTGT-ACAGTCCGTACATATCACATGT
gi|89674                      :                                                 GCGGG--AA-TTTAATT-GTAC---A--AC-TGTAAACAGTTT----T---AATA--GGC-TTTAAAAGTTTAAA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACA
gi|89675                      :                                                    TG--AA-TTTTAAT-GTAC---AGGAG-TG---ACAG--TGG--G---AACG--AGATTGAAAAAGTGTGCA-AATTT--GT-GCAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89676                      :                                                     G--AA-TTTTAAT-GTAC---AG-GCATG---GCAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAAATGTA-A-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89677                      :                                                     G--AA-TTTTAAT-GTAC---AG-GCATG---GCAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAA---TGAA-ATTTTGTGTGACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89678                      :                                                                                              --G---AATG--GGGTTGAAAAAGTGCACA-ATTTTGGGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89679                      :                                                                                              cgt---AATG--GAATTGAAAAAGTGCACA-ATTTCATGT-ACAGTCTGTACATATCACATATATG
gi|89666                      :                                                                                                                                 TTTGT-ACAGCCTGTACAA
gi|89663                      :                                                            ttttgaaaaagcgtgaattttattgtacagactgtacagcgtgagaatgggtgaaaaagtgtgcaatttTTTGT-ACAGCCTGTACAAtcacatgtatg
gi|89667                      :                                                         ttttttggaaaaagcgtgaattttattgtacagactgtacagcgtgagaatgggtgaaaaagtgtgcaatttTTTGT-ACAGCCTGTACAAtcacatgtatg





Alignments
lowQualScore                  :                                        1               2222222222222222                                                  
lowQualScore                  :                          3 2    444  1 2  88 33        4444444444444444              22    1   2            1            
lowQualScore                  :                          . .    ...  . .  .. ..        ................              ..    .   .            .            
lowQualScore                  :                          6 5    444  0 5  88 44        2222222222222222              66    8   2            0            
consensus                     :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AGAC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
Reference ( family-805 )      :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AGNC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACANATCACATGTATG
gi|89662                      :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AGAC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89663                      :   TTTTGGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AGAC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89664                      : ttTTTCTTAAAAAGGGTGAATGTTATT-GTAC---AGAC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGC--ATTTTTTAT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89665                      : ttTTCTTGAAAAAGTGTGAATTTTTTTTGTAC---AGAC-TGT-A--CAGCATAA--A---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-TTGTTTTGT-ACAGGCTGTACATATCAAATGTATG
gi|89666                      :    TTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AGAC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89667                      :            AAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AGAC-TGT-A--CAGTGTGA--G---AATG--GA--TGAAAATGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89668                      :             AGCATGAATTTTGGT-GTACTGCAGAC-TGT-A--CAGCGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA-TTTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89669                      :             AGCGTGAATTTTGTT-GTAC---AATC-TGT-A--CATTGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA--TTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89670                      :             AGAGTGAATTTTAAT-GTAC---AGAAGTG--A--CAGAGTGA--A---CAGG--GA--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89671                      :             AACATGAATTTTGGT-GTAC---AGGC-GGT-A--CAGCGTGATTG---CATT------TGAAAAAGTGTGCA-TTTTTTTTT-ACAGTCTGTACA
gi|89672                      :              GCGTGGATTTTGAT-GTAC---AGG--TGTGA--CAGCGTGA-------ATG--GCATTGAAAAAGTGTGCA-GTTTTTTGC-ACAGTCTGTATGGATCACATGTAT
gi|89673                      :              GTGTGAATTTTGGT-GTAC---AGGCGTG--A--CAGCGTGA-------ATGCTAT--TGAAAAAGTGTGCATTTTTTTTGT-ACAGTCCGTACATATCACATGT
gi|89674                      :              GCGGGAATTTAATT-GTAC---A-AC-TGT-AAACAGTTTTA-------ATA--GGC-TTTAAAAGTTTAAA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACA
gi|89675                      :                 TGAATTTTAAT-GTAC---AGGAGTG--A--CAG--TGG--G---AACG--AGATTGAAAAAGTGTGCA-AATTT--GT-GCAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89676                      :                  GAATTTTAAT-GTAC---AGGCATG--G--CAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAAATGTA-A-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89677                      :                  GAATTTTAAT-GTAC---AGGCATG--G--CAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAA---TGAA-ATTTTGTGTGACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89678                      :                                                        --G---AATG--GGGTTGAAAAAGTGCACA-ATTTTGGGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89679                      :                                                        cgt---AATG--GAATTGAAAAAGTGCACA-ATTTCATGT-ACAGTCTGTACATATCACATATATG





Alignments
lowQualScore                  :                                         1               2222222222222222                                                  
lowQualScore                  :                          1 2    444  2  0  88 33        4444444444444444              22    1   2            0            
lowQualScore                  :                          . .    ...  .  .  .. ..        ................              ..    .   .            .            
lowQualScore                  :                          0 5    444  5  0  88 44        2222222222222222              66    8   2            6            
consensus                     :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
Reference ( family-805 )      :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89662                      :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89663                      :   TTTTGGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89664                      : ttTTTCTTAAAAAGGGTGAATGTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGC--ATTTTTTAT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89665                      : ttTTCTTGAAAAAGTGTGAATTTTTTTTGTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCATAA--A---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-TTGTTTTGT-ACAGGCTGTACATATCAAATGTATG
gi|89666                      :    TTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89667                      :            AAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGTGTGA--G---AATG--GA--TGAAAATGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89668                      :             AGCATGAATTTTGGT-GTACTGCAG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA-TTTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89669                      :             AGCGTGAATTTTGTT-GTAC---AA-TC-TGT-A--CATTGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA--TTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89670                      :             AGAGTGAATTTTAAT-GTAC---AG-AAGTG--A--CAGAGTGA--A---CAGG--GA--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89671                      :             AACATGAATTTTGGT-GTAC---AG-GC-GGT-A--CAGCGTGATTG---CATT------TGAAAAAGTGTGCA-TTTTTTTTT-ACAGTCTGTACA
gi|89672                      :              GCGTGGATTTTGAT-GTAC---AG-G--TGTGA--CAGCGTGA-------ATG--GCATTGAAAAAGTGTGCA-GTTTTTTGC-ACAGTCTGTATGGATCACATGTAT
gi|89673                      :              GTGTGAATTTTGGT-GTAC---AG-GCGTG--A--CAGCGTGA-------ATGCTAT--TGAAAAAGTGTGCATTTTTTTTGT-ACAGTCCGTACATATCACATGT
gi|89674                      :              GCGGGAATTTAATT-GTAC---A--AC-TGT-AAACAGTTTTA-------ATA--GGC-TTTAAAAGTTTAAA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACA
gi|89675                      :                 TGAATTTTAAT-GTAC---AGGAG-TG--A--CAG--TGG--G---AACG--AGATTGAAAAAGTGTGCA-AATTT--GT-GCAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89676                      :                  GAATTTTAAT-GTAC---AG-GCATG--G--CAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAAATGTA-A-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89677                      :                  GAATTTTAAT-GTAC---AG-GCATG--G--CAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAA---TGAA-ATTTTGTGTGACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89678                      :                                                         --G---AATG--GGGTTGAAAAAGTGCACA-ATTTTGGGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89679                      :                                                         cgt---AATG--GAATTGAAAAAGTGCACA-ATTTCATGT-ACAGTCTGTACATATCACATATATG





Alignments
lowQualScore                  :                                         1               2222222222222222                                                  
lowQualScore                  :                          1 2    444  2  0  88 33        4444444444444444              22    1   2            0            
lowQualScore                  :                          . .    ...  .  .  .. ..        ................              ..    .   .            .            
lowQualScore                  :                          0 5    444  5  0  88 44        2222222222222222              66    8   2            6            
consensus                     :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
Reference ( family-805 )      :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89662                      :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89663                      :   TTTTGGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89664                      : ttTTTCTTAAAAAGGGTGAATGTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGC--ATTTTTTAT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89665                      : ttTTCTTGAAAAAGTGTGAATTTTTTTTGTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCATAA--A---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-TTGTTTTGT-ACAGGCTGTACATATCAAATGTATG
gi|89666                      :    TTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89667                      :            AAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGTGTGA--G---AATG--GA--TGAAAATGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89668                      :             AGCATGAATTTTGGT-GTACTGCAG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA-TTTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89669                      :             AGCGTGAATTTTGTT-GTAC---AA-TC-TGT-A--CATTGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA--TTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89670                      :             AGAGTGAATTTTAAT-GTAC---AG-AAGTG--A--CAGAGTGA--A---CAGG--GA--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89671                      :             AACATGAATTTTGGT-GTAC---AG-GC-GGT-A--CAGCGTGATTG---CATT------TGAAAAAGTGTGCA-TTTTTTTTT-ACAGTCTGTACA
gi|89672                      :              GCGTGGATTTTGAT-GTAC---AG-G--TGTGA--CAGCGTGA-------ATG--GCATTGAAAAAGTGTGCA-GTTTTTTGC-ACAGTCTGTATGGATCACATGTAT
gi|89673                      :              GTGTGAATTTTGGT-GTAC---AG-GCGTG--A--CAGCGTGA-------ATGCTAT--TGAAAAAGTGTGCATTTTTTTTGT-ACAGTCCGTACATATCACATGT
gi|89674                      :              GCGGGAATTTAATT-GTAC---A--AC-TGT-AAACAGTTTTA-------ATA--GGC-TTTAAAAGTTTAAA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACA
gi|89675                      :                 TGAATTTTAAT-GTAC---AGGAG-TG--A--CAG--TGG--G---AACG--AGATTGAAAAAGTGTGCA-AATTT--GT-GCAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89676                      :                  GAATTTTAAT-GTAC---AG-GCATG--G--CAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAAATGTA-A-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89677                      :                  GAATTTTAAT-GTAC---AG-GCATG--G--CAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAA---TGAA-ATTTTGTGTGACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89678                      :                                                         --G---AATG--GGGTTGAAAAAGTGCACA-ATTTTGGGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89679                      :                                                         cgt---AATG--GAATTGAAAAAGTGCACA-ATTTCATGT-ACAGTCTGTACATATCACATATATG


blockSeqs                     :                          T T    TGC  G  G  TG AA        GAACGAGAT                     TT    T   G
blockSeqs                     :                          T .    .    .  G  T  .         GAATGGGGT                     A     T   .
blockSeqs                     :                          T .    .    .  A  T  .         GAATGGG                       A     T   .
blockSeqs                     :                          T .    .    .  A  T  .         GAATGGG                       T     T   .
blockSeqs                     :                          T .    .    .  .  T  .         AAATGGG                       A     T   .
blockSeqs                     :                          G .    .    .  .  T  .         GAATGGG                       A     T   .
blockSeqs                     :                          T .    .    .  .  T  .         GAATGGA                       T     T   .
blockSeqs                     :                          A .    .    .  .  T  .         ATTCAAT                       A     G   .
blockSeqs                     :                          G .    .    .  .  T  .         ATTCAAT                       T     T   .
blockSeqs                     :                          A .    .    .  .  T  .         ACAGGGA                       G     T   .
blockSeqs                     :                          G .    .    .  .  .  .         TTGCATT                       A     T   .
blockSeqs                     :                          T .    .    .  .  .  .         ATGGCAT                       A     G   .
blockSeqs                     :                          A .    .    .  .  .  .         ATGCTAT                       A     G   .
blockSeqs                     :                          A .    .    .  .  .  .         ATGAGGT                       A     G   .
blockSeqs                     :                          A .    .    .  .  .  .         ATGAGGT                       A     G   .
blockSeqs                     :                                                         ATAGGC                        A     A   .
blockSeqs                     :                                                                                       .     .   .


blockSeqCons                  :   
originalCons                  :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
finalCons                     :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG





Alignments
lowQualScore                  :                                         1               2222222222222222                                                  
lowQualScore                  :                          1 2    444  2  0  88 33        4444444444444444              22    1   2            0            
lowQualScore                  :                          . .    ...  .  .  .. ..        ................              ..    .   .            .            
lowQualScore                  :                          0 5    444  5  0  88 44        2222222222222222              66    8   2            6            
consensus                     :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
Reference ( family-805 )      :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTANT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89662                      :   TTTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89663                      :   TTTTGGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89664                      : ttTTTCTTAAAAAGGGTGAATGTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGC--ATTTTTTAT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89665                      : ttTTCTTGAAAAAGTGTGAATTTTTTTTGTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCATAA--A---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-TTGTTTTGT-ACAGGCTGTACATATCAAATGTATG
gi|89666                      :    TTTTGAAAAAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--G---AATG--GG--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89667                      :            AAGCGTGAATTTTATT-GTAC---AG-AC-TGT-A--CAGTGTGA--G---AATG--GA--TGAAAATGTGTGCA-ATTTTTTGT-ACAGGCTGTACAAATCACATGTATG
gi|89668                      :             AGCATGAATTTTGGT-GTACTGCAG-AC-TGT-A--CAGCGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA-TTTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89669                      :             AGCGTGAATTTTGTT-GTAC---AA-TC-TGT-A--CATTGTGA--ATTCAAT-------TAAAAAAGTGTACA--TTTTTTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89670                      :             AGAGTGAATTTTAAT-GTAC---AG-AAGTG--A--CAGAGTGA--A---CAGG--GA--TGAAAAAGTGTGCA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89671                      :             AACATGAATTTTGGT-GTAC---AG-GC-GGT-A--CAGCGTGATTG---CATT------TGAAAAAGTGTGCA-TTTTTTTTT-ACAGTCTGTACA
gi|89672                      :              GCGTGGATTTTGAT-GTAC---AG-G--TGTGA--CAGCGTGA-------ATG--GCATTGAAAAAGTGTGCA-GTTTTTTGC-ACAGTCTGTATGGATCACATGTAT
gi|89673                      :              GTGTGAATTTTGGT-GTAC---AG-GCGTG--A--CAGCGTGA-------ATGCTAT--TGAAAAAGTGTGCATTTTTTTTGT-ACAGTCCGTACATATCACATGT
gi|89674                      :              GCGGGAATTTAATT-GTAC---A--AC-TGT-AAACAGTTTTA-------ATA--GGC-TTTAAAAGTTTAAA-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACA
gi|89675                      :                 TGAATTTTAAT-GTAC---AGGAG-TG--A--CAG--TGG--G---AACG--AGATTGAAAAAGTGTGCA-AATTT--GT-GCAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89676                      :                  GAATTTTAAT-GTAC---AG-GCATG--G--CAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAAATGTA-A-ATTTTGTGT-ACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89677                      :                  GAATTTTAAT-GTAC---AG-GCATG--G--CAGCATGA-------ATG--AGGTTGAAAAA---TGAA-ATTTTGTGTGACAGTCTGTACATATCACATGTATG
gi|89678                      :                                                         --G---AATG--GGGTTGAAAAAGTGCACA-ATTTTGGGT-ACAGTCTGTACATATCATATGTATG
gi|89679                      :                                                         cgt---AATG--GAATTGAAAAAGTGCACA-ATTTCATGT-ACAGTCTGTACATATCACATATATG