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lowQualScore                  :       3 3 55  6666 3  3 555  6     8 5 2  33   2 5 33 2 555  2 66   555    66   2 666    2  5    33 8 33     44 6 9999  6    66666666666666666666666666666  6  333333333 2  3    0000000000000000000  00   1111  555    44     3  3 555 3 0 1  2222 3 888 6    6      3      555 666666666 7777 3 3 22222222    3 3 3 99999  3 3 55  3 3 3  55 99999 55 3 3 99999  3  3 3 6666 3  99999 3 3 3 88 000000  7  3 7777   88 3 3 3  3 7777 444444444 3   666   3     4   4    666  55 4 88  3    7777  1111   3  3  44 3 7777   44  4444444 77    77  77  44 3 3 7777 3    3 3 555  3   7     3  44 3    3   0  3 55    
lowQualScore                  :       . . ..  .... .  . ...  .     . . .  ..   . . .. . ...  . ..   ...    ..   . ...    .  .    .. . ..     .. . ....  .    .............................  .  ......... .  .    ...................  ..   ....  ...    ..     .  . ... . . .  .... . ... .    .      .      ... ......... .... . . ........    . . . .....  . . ..  . . .  .. ..... .. . . .....  .  . . .... .  ..... . . . .. ......  .  . ....   .. . . .  . .... ......... .   ...   .     .   .    ...  .. . ..  .    ....  ....   .  .  .. . ....   ..  ....... ..    ..  ..  .. . . .... .    . . ...  .   .     .  .. .    .   .  . ..    
lowQualScore                  :       1 1 00  5555 1  1 444  2     6 7 9  99   9 7 99 9 000  9 88   000    99   9 444    9  7    99 6 99     22 2 3333  2    44444444444444444444444444444  7  333333333 8  1    1111111111111111111  44   9999  444    22     1  1 444 1 8 4  7777 1 555 7    7      3      888 777777777 1111 3 3 11111111    6 6 6 11111  6 6 00  6 6 6  00 11111 00 6 6 11111  6  6 6 5555 6  11111 6 6 6 66 555555  3  6 7777   66 6 6 6  6 7777 555555555 6   444   6     0   0    333  55 0 66  3    1111  7777   3  3  55 3 1111   66  2222222 99    99  99  66 3 3 1111 3    3 3 888  3   6     3  66 6    6   9  6 00    
consensus                     : TTTAAC-G-GG-CG----T-GG-A---AG-CAGCT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T--GGT---CCAATTCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-G-CT-GC-ACAC---T----TT--A-----------A----TG-TG---------TCCC-AAAG-----T--G--T-C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---G-CTTCCA----T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G-TC--C-----G--A-G-G-----TC-AA-C-T--A-C-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TG-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAG-CAA---CA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGT
Reference ( gi|102213 )       : TTTAAC-G-G--CG----T-GG-A---AG-CAGCT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T--GGT---CCAATTCTG-G---GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-G-C--GC-ACAC---T----TT--A-----------A----TG-TG---------TCCC-AAAG-----T--G--T-C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---G-CTTTCA----T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G-TC--C-----G--A-G-G-----TC-AA-C-T--A-C-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TG-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAG-C-A---CA-GGGATGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGT
gi|102214                     : TTTAACAG-G--CG----T-GG-A---AG-CTGCT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T--GGT---CCAAT-CTG-GT--GTTG-TT-TAGA--G-A--ACTGT--T-G-CT-GC-ACAC---T----TTTCA-----------A----TG-TG---------TCCC-AAAA-----T--G--T-C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---A-CTTCCA----T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-A--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G-TC--C-----G--A-G-G-----TC-AA-C-T--A-C-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TG-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--CC--TT--A-A-G----A-ACAG-CAA---CA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGT
gi|102215                     : TTTAAC-G-GG-CG----T-GG-A---AGATAACT-TTA-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T--GAT---CCAATCATG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-AGAACTGT--TTG-CT-GC-ACAC---T----TTT-A-----------A----TG-TG---------T-CC-AAAGT----T--T--T-C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---G-CTTCCA----T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G-TC--C-----G--A-G-G-----TCAAA-C-T--A-C-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------G-CCG---ATA-TGTCT-AAG-CGCC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TGTTC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAG-CAA---CA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGT
gi|102216                     : TTTAAC-G-GG-CG----T-GGGA---AG-CAGCT-C-A-GG--CCG-T-T--A-G---TA-T--GG----CCAAT-CTG-G---GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTGTGAT-GTC--GC-ACAC---T----TA--A-----------A----TG-TG---------TCCCCAAAG-----T--G--T-C-----ATCTTTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---G-CTTCCA------C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-A-G--GTCC-G-TC--C-----GCAA-G-G-----TC-AA-C-A--T-C-CG-----C-TGC-A--T------CA-GG-A----CCG--T-TAA-CTAT----G---------G-CCATTGATA-T-TCT-AAGCCGTC--AAACTG-GC-TT-CCAG----AG----TGC-TG-TC--A-G----CTC--AA-------TAAAGAG--AC--TT--T-GAA----A-ACAA-CAA---CA-GGG-TGCGC-GT--A-ACGG-CACTAA-A--CTGT
gi|102217                     : TTTAAC-A-GAGCGGCTTT-GG-A---AG-CAGCTAC-A-GGGGCCGGT-A--A-A---TA-T--GGT---CCAAT-CTGCGT--GTTG-TT-CAGATAG-A--ACTGT--TTG-CT-GC-ACACGGATG---TT--ATCGACGGGCTTA----TG-TG---------TCCC-AAAG-----TCTG--TGC-----AT--TTC----TC---GAGT--ATTGA-AT-C---G-CTTCCA----T-C---A-GACT-GGTGTTCGTTGCTGGCG---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G--C--C-----G--ATG-G-----T--AA-C-T--A-CTCG-----C-T-C-G--T------CA-GGTA----CCG--TAT-A-TA-TATGGG---------G-CCA---ATATTGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AGA---TGC-TG-TC-AA-A----CTC--AA-------T--AGAGA-AC--TT--T-G-A----A-AC-G-CAA---CAGGGGGTGCGCGGT--A-ACGG-CACAAA-A--CTGT
gi|102218                     : TTTAAC-G-GG-CG----T-GG-A---AG-CAGTA-C-A-G---CCG-T-A--G-G---TACT--GGT---C--AT-CTG-GT--GTTG-TT-C-GA--G-A---CTGT--T-G-CC-GCGAC-C---T----TT--A-----------C----TG-TG---------TCCC-AA-G-----T--G--T--------T--TTT----TC---GATT--ATGGA-ATTC---G-CCTTCAA---T-C---AAGACTTGGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-CAG-TC--T-----G--A-G-G-----TC-AA---T--A-C-CG-------T-A-GTAT------CA--G-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------GCCCA---ATA-TGTCT-AAG-TGTC---CA--G-G--TT--CAG----AG----TGC----TC-CA-G----CTC--AA-------T--TGAG---C--TT--T-G-A----A-ACAG-CAA---CA-GGGGTGCGC-GT----ACGG-ATC-AA-A--CTGT
gi|102219                     : TTTA-C-GTG--CG----T-GG-A---AGGCAGCT-C-AAGG--TCG-T-A--G-C---TA-T--GGT---CCAAT-CTG-GT--GTTG-AT-CAGA--GCA--ACTGC--T-G-T--GC-ACAC---T----TTT-A-----------A----TGCTG---------TCCC-AAAG-----T--G--T-A-----AT--T-C----TC---GATT--ATGGA-AT-C---T-CTTCCA----TTC---A-GATT-GGTGTT-GTTGCT---GG--------A----GCA-G--------AC-A-C-GCT-----TC-T-GCCGT-C-G-TC--C-----G--A-GCG-----TC-AAAC-T--A-C-CT-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCGT-T-T-A-CT-T----G---------G--CA---ATG-TGTTT-AAA-CGTC----A--GCG--TT-CCAGCAGTAG----CGC-T--TCAAA-G----CTCGAAA-------TA-AGAG--AC--TT--TAA-A----A-ACAG-CAA---CA-TGGGTGTGC-GTAAA-ACGGCCACAAA-A--CTGT
gi|102220                     : TTTAAC-G-GG-CG----TTGG-A---AG-CAGCC-T-C-GG--C-G-T-C--G-G---TA-T--GGT---CCCAT-CTG-GT--GTTG-TTTCAGA--G-A--ACTGT--T-G-CT-GC-ACAC---T----TT--A-----------A----TG-TG---------T-CC-AAAG-----TC-G----------AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---G-C-TTCA----T-C---C-GAAT-GGTGTT-GTTG-T---G---------A----G-A-G--------A
gi|102221                     : TTTAAC-G-GG-CG----T-GG-ACAAGG-CAGCTTC-A-GG--CCG-TTA--G-GATGTA-T--GGT---CCAAT-CTG-GT--ATTGATT-CAGA----A--ACTGG--T-G-CTCGCCACAC---CG---TT--A-----------A----TG-TG---------TCCC-AAAGTATCTT--G--T-C-----AT--TCA----TC---GATTACATGGA-A
gi|102222                     : TTTAAC-G-GT-CG----C-GG-A---AG-CAGCT-CCA-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T--GGT---CCAA-TCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GCC--GC-ACAacaacttttttctctacattatacttagttcatctgatttcgcttccatctccagactgggcttgttgctgactaggacgaccactcttcttggtcgttcgagatgggttcaactccgcttcgtccagaacagggcgacccgttactttggcaatat
gi|102223                     : TTTAAC-G-GG-CG----T-GG-A---AG-CAGGT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---AA-T--GGT---CCAA-TATG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTG
gi|102224                     : TTTATC-G-GG-CG----T-GG-A---AG-CAGCT-C-A-GG--TCG-TCACCG-G---TA-TC-GGTCACCCGA-TCTG-GTAAGTTG-TTGCAGA--G-A--A-TAT--T-G-CT-GC-ACCC---TCCACTT--AC----------A----TG-TGTTTGTTGTCTTCC-AAAGTC---T--G--TCC-----AC--TTCCGT-TCTCGGATT--ATGGAGAT-CTTTG-CTTCCA----T-C---
gi|102225                     :  TTAAC-G-GG-CG----T-GG-A---AG-CAGCTCC-A-GG---CG-T-A--G-G---TA-TGCGAT---CCCAATCT--G---TTTG-TT-AAGA--G-A--ACTG---T-G-CT-GC-ACAC---T----TA--A-----------G----TG-TG---------T-CC-AAAG-----T--GTTT-C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-------CCTTCA----T-C---A-GACT-CGTGTT-GTTGCT---G---------A------A-G--------ACCAGC-A-T-----TC-T-G--GT-C-G-TCTTT-----G--A-G--------C-AA-C-T--A-C-CG-----C-T-CAG--T------CAGGG-A----CC---T-T-A-C--T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAC--G-G--TTCCCAG----AG----TGCTTG-CC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--ACT-TT--T-G-A----A-ACAG-CAA---CA-GGGGTGCGC-AT--A-AC-G-CAC-AA-A--CTGT
gi|102226                     :    AAC-G-GG-TG----T-GG-A---AG-CAGCT-C-A-GG--CCG-T-A--GCG---TA-T--GGT---CCAAT-CTG-GT--GGTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-G-CC-GC--CACA--T----TT--A-----------A----TGGTG---------TCCC-AAAG-----T--G--T-C-----ATA-TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---GGCTTCCAC---T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G---G--------ACCA-C-G-T-----AC-T-G--GT-C-G-TC--C-----G--A-G-G-----TC-AA-CTT--ACC-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCGTTT-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCTAAAG-CGTCTAAAA--G-G--TT-CCAG----AGT---TGC-TG-TC-AACG----CTC--AAT------T--AGAG--ACTTTT--T-G-A----A-ACAG-CAA---CA-GGAATGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AACA--CTG
gi|102229                     :                                    -C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T--GGT---CCAA-TCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GCC--GC-ACA
gi|102227                     :                                                                                                                        ctcCAC---A----TT--A-----------ACCAGTG-CG---------TCCC-AAAG-----TT-G--T-TCTTCGATG-TTCGTATTT---GACT--AGGAA-AT-C---G-CTTTCGCAGGT-CG--A-GACTCGACGTT-GTTTCT---GTCATAATGGA----G-A-GGTTAGATCAACA-C-G-TCTTATTC-TTG--GT-C-G-TC--CATCGAG--A-G-G-----TC-AA-C-CTAA-C-CGACGGTC-T-G-A--T------CA-AG-A------G--A-T-AGCT-T----GGAGTGTACTG-CC----ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAG--G-GTTTT-TCAG----AGT---TGC-TG-TC-AA-GTTTTCTA--AAATCTATTT--GTAG--AC--TTTAT-G-ATCTTATACAGTC-A---CA-GGGGT-TGC-GT--atagagactttgaaacagcaaagcaggggtgcgcgtaacggcacaaactgt
gi|102228                     :                                                                                                                                                                          CTC-AAAG-----T--G--T-C-----AT--T-C----TC---GATT--ATGTA-AT-C---G-C-TCCA----T-C---AGGGCT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-T-G-T-----TC-T----GT-C-GTTC--C-----G--A-G-G-----TC-AA-C-T--A-C-CG-----C---C-GT-T------CAGGG-A----CC---T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TT-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAGAAAC--TT--T-G-A----A-ACAG-CAA---CA-GGGGTGCGC-GT--A-AC-G-CAC-AA-GATCTGT
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gi|102218                     :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-TA-C-A-G---CCG-T-A--G-G---TACT-G--GT---C--AT-CTG-GT--GTTG-TT-C-GA--G-A---CTGT--T-GCC-GCGAC-C---T----TT--A-----------C----T-G-TG---------TCCC-AA-G-----T--GT---------T--TTT----TC---GATT--ATGGA-ATTC---GCCTTCAA----T-C---AAGACTTGGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-CAG-TCT-----G--A-G-G-----TC-AA---T--A-C-CG-------T-A-GTAT------CA--G-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------GCCCA---ATA-TGTCT-AAG-TGTC---CA--G-G--TT--CAG----AG----TGC----TC-CA-G----CTC--AA-------T--TGAG---C--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-GT----ACGG-ATC-AA-A--CTGT
gi|102219                     :                                                                                                                                                                            TTTA-CGT-GCG----TGG-A---AGGCAG-CT-C-AAGG--TCG-T-A--G-C---TA-T-G--GT---CCAAT-CTG-GT--GTTG-AT-CAGA--GCA--ACTGC--T-G-T-GC-ACAC---T----TTT-A-----------A----T-GCTG---------TCCC-AAAG-----T--GT--A-----AT--T-C----TC---GATT--ATGGA-AT-C---TC-TTCCA----TTC---A-GATT-GGTGTT-GTTGCT---GG--------A----GCA-G--------AC-A-C-GCT-----TC-T-GCCGT-C-G-TCC-----G--A-GCG-----TC-AAAC-T--A-C-CT-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCGT-T-T-A-CT-T----G---------G--CA---ATG-TGTTT-AAA-CGTC----A--GCG--TT-CCAGCAGTAG----CGC-T--TCAAA-G----CTCGAAA-------TA-AGAG--AC--TT--TAA-A----A-ACAGCAA--CA-TGGGTGTGC-GTAAA-ACGGCCACAAA-A--CTGT
gi|102220                     :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCGT---TGG-A---AG-CAGCCT-C-G-G----CG-T-C--G-G---TA-T-G--GT---CCCA-TCTG-GT--GTTGTTT-CAGA--G-A--ACTGT--T-GCT-GC-ACAC---T----TT--A-----------A----T-G-TG---------T-CC-AAA---------GT--CG----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---GC-TT-CA----T-C---C-GAAT-GGTGTT-GTTG-T---G---------A----G-A-G--------A
gi|102221                     :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCG----TGG-ACAAGG-CAG-CTTC-A-GG--CCG-TTA--G-GATGTA-T-G--GT---CCAAT-CTG-GT--ATTGATT-CAGA----A--ACTGG--T-GCTCGCCACAC---CG---TT--A-----------A----T-G-TG---------TCCC-AAAGTATCTT--GT--C-----AT--TCA----TC---GATTACATGGA-A
gi|102221                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-C---GC-TTCCA----T-CTCCA-GACT-GGGCTT-GTTGCT---G---------ACTAGG-ACG--------ACCA-CTC-T-----TCTT-G--GT-C-G-TTC-----G--A-G-ATGGGTTC-AA-C-T----C-CG-----CTT-C-G--TCCAGAACA-GG-GCGACCCG--T-T-A-CT-T----T---------G-GCA---ATA-Tacaacttttttctctacattatacttagttcatctgatttcgcttccatctccagactgggcttgttgctgactaggacgaccactcttcttggtcgttcgagatgggttcaactccgcttcgtccagaacagggcgacccgttactttggcaatat
gi|102222                     : tttaacgggcgtggacaaggcagcttcaggccgttaggatgtatggtccaatctggtattgattcagaaactggtgctcgccacaccgttaatgtgtcccaaagtatcttgtcattcatcgattacatggaaacaacttttttctctacattatacttagttcatctgattTTTAACGG-TCG----CGG-A---AG-CAG-CT-CCA-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G--GT---CCAA-TCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GCC-GC-ACA
gi|102223                     :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-GT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---AA-T-G--GT---CCAA-TATG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTG
gi|102224                     :                                                                                                                                                                            TTTATCGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-CT-C-A-GG--TCG-TCACCG-G---TA-TCG--GTCACCCGA-TCTG-GTAAGTTG-TTGCAGA--G-A--A-TAT--T-GCT-GC-ACCC---TCCACTT--AC----------A----T-G-TGTTTGTTGTCTTCC-AAAGTC---T--GTC-C-----AC--TTCCGT-TCTCGGATT--ATGGAGAT-CTTTGC-TTCCA----T-C---
gi|102225                     :                                                                                                                                                                             TTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-CT-CCA-GG--C-G-T-A--G-G---TA-T-GCGAT---CCCAATCTG--T---TTG-TT-AAGA--G-A--ACTGT----GCT-GC-ACAC---T----TA--A-----------G----T-G-TG---------TCC--AAAG-----T--GTTTC-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C----C-TTC-A----T-C---A-GACT-CGTGTT-GTTGCT---G---------A------A-G--------ACCAGC-A-T-----TC-T-G--GT-C-G-TCTTT---G--A-G--------C-AA-C-T--A-C-CG-----C-T-CAG--T------CA-GGGA----CC---T-T-A-CT------G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAC--G-G--TTCCCAG----AG----TGCTTG-CC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--ACT-TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-AT--A-AC-G-CAC-AA-A--CTGT
gi|102226                     :                                                                                                                                                                               AACGG-GTG----TGG-A---AG-CAG-CT-C-A-GG--CCG-T-A--GCG---TA-T-G--GT---CCAA-TCTG-GT--GGTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-GCC-GC--CACA--T----TT--A-----------A----TGG-TG---------TCCC-AAAG-----T--GT--C-----ATA-TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-CG--GC-TTCCAC---T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G---G--------ACCA-C-G-T-----AC-T-G--GT-C-G-TCC-----G--A-G-G-----TC-AA-CTT--ACC-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCGTTT-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCTAAAG-CGTCTAAAA--G-G--TT-CCAG----AGT---TGC-TG-TC-AACG----CTC--AAT------T--AGAG--ACTTTT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGAATGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AACA--CTG
gi|102227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAC---A----TT--A-----------ACCAGT-G-CG---------TCCC-AAAG-----TT-GT--TCTTCGATG-TTCGTATTT---GACT--AGGAA-AT-C---GC-TTTCGCAGGT-CG--A-GACTCGACGTT-GTTTCT---GTCATAATGGA----G-A-GGTTAGATCAACA-C-G-TCTTATTC-TTG--GT-C-G-TCCATCGAG--A-G-G-----TC-AA-C-CTAA-C-CGACGGTC-T-G-A--T------CA-AG-A------G--A-T-AGCT-T----GGAGTGTACTG-CC----ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAG--G-GTTTT-TCAG----AGT---TGC-TG-TC-AA-GTTTTCTA--AAATCTATTT--GTAG--AC--TTTAT-G-ATCTTATACAGTCA--CA-GGGGT-TGC-GT--
gi|102228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTC-AAAG-----T--GT--C-----AT--T-C----TC---GATT--ATGTA-AT-C---GC--TCCA----T-C---AGGGCT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-T-G-T-----TC-T----GT-C-GTTCC-----G--A-G-G-----TC-AA-C-T--A-C-CG-----C---C-GT-T------CAGGG-A----CC---T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TT-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAGAAAC--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-GT--A-AC-G-CAC-AA-GATCTGT
gi|102229                     :                                                                                                                                                                                                             -C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G--GT---CCAA-TCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GCC-GC-ACA
gi|102229                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctcT-TCAG----AGAAACTGT-TG-CC----G----CAC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAGCAAAGCA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGTatagagactttgaaacagcaaagcaggggtgcgcgtaacggcacaaactgt
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Reference ( family-804 )      :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-CT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G--GT---CCAATTCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-GC-CGC-ACAC---T----TT--A-----------A----T-G-TG---------TCCC-AAAG-----T--GT--C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---GC-TTCCA----T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G-TCC-----G--A-G-G-----TC-AA-C-T--A-C-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TG-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGT
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gi|102222                     : tttaacgggcgtggacaaggcagcttcaggccgttaggatgtatggtccaatctggtattgattcagaaactggtgctcgccacaccgttaatgtgtcccaaagtatcttgtcattcatcgattacatggaaacaacttttttctctacattatacttagttcatctgattTTTAACGG-TCG----CGG-A---AG-CAG-CT-CCA-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G--GT---CCAA-TCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GC-CGC-ACA
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gi|102226                     :                                                                                                                                                                               AACGG-GTG----TGG-A---AG-CAG-CT-C-A-GG--CCG-T-A--GCG---TA-T-G--GT---CCAA-TCTG-GT--GGTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-GC-CGC--CACA--T----TT--A-----------A----TGG-TG---------TCCC-AAAG-----T--GT--C-----ATA-TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-CG--GC-TTCCAC---T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G---G--------ACCA-C-G-T-----AC-T-G--GT-C-G-TCC-----G--A-G-G-----TC-AA-CTT--ACC-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCGTTT-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCTAAAG-CGTCTAAAA--G-G--TT-CCAG----AGT---TGC-TG-TC-AACG----CTC--AAT------T--AGAG--ACTTTT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGAATGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AACA--CTG
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Reference ( family-804 )      :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-CT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G--GT---CCAATTCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-GC-CGC-ACAC---T----TT--A-----------A----T-G-TG---------TCCC-AAAG-----T--GT--C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---GC-TTCCA----T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G-TCC-----G--A-G-G-----TC-AA-C-T--A-C-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TG-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGT
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gi|102221                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-C---GC-TTCCA----T-CTCCA-GACT-GGGCTT-GTTGCT---G---------ACTAGG-ACG--------ACCA-CTC-T-----TCTT-G--GT-C-G-TTC-----G--A-G-ATGGGTTC-AA-C-T----C-CG-----CTT-C-G--TCCAGAACA-GG-GCGACCCG--T-T-A-CT-T----T---------G-GCA---ATA-Tacaacttttttctctacattatacttagttcatctgatttcgcttccatctccagactgggcttgttgctgactaggacgaccactcttcttggtcgttcgagatgggttcaactccgcttcgtccagaacagggcgacccgttactttggcaatat
gi|102222                     : tttaacgggcgtggacaaggcagcttcaggccgttaggatgtatggtccaatctggtattgattcagaaactggtgctcgccacaccgttaatgtgtcccaaagtatcttgtcattcatcgattacatggaaacaacttttttctctacattatacttagttcatctgattTTTAACGG-TCG----CGG-A---AG-CAG-CT-CCA-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G--GT---CCAA-TCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GC-CGC-ACA
gi|102223                     :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-GT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---AA-T-G--GT---CCAA-TATG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTG
gi|102224                     :                                                                                                                                                                            TTTATCGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-CT-C-A-GG--TCG-TCACCG-G---TA-TCG--GTCACCCGA-TCTG-GTAAGTTG-TTGCAGA--G-A--A-TAT--T-GC-TGC-ACCC---TCCACTT--AC----------A----T-G-TGTTTGTTGTCTTCC-AAAGTC---T--GTC-C-----AC--TTCCGT-TCTCGGATT--ATGGAGAT-CTTTGC-TTCCA----T-C---
gi|102225                     :                                                                                                                                                                             TTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-CT-CCA-GG--C-G-T-A--G-G---TA-T-GCGAT---CCCAATCTG--T---TTG-TT-AAGA--G-A--ACTGT----GC-TGC-ACAC---T----TA--A-----------G----T-G-TG---------TCC--AAAG-----T--GTTTC-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C----C-TTC-A----T-C---A-GACT-CGTGTT-GTTGCT---G---------A------A-G--------ACCAGC-A-T-----TC-T-G--GT-C-G-TCTTT---G--A-G--------C-AA-C-T--A-C-CG-----C-T-CAG--T------CA-GGGA----CC---T-T-A-CT------G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAC--G-G--TTCCCAG----AG----TGCTTG-CC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--ACT-TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-AT--A-AC-G-CAC-AA-A--CTGT
gi|102226                     :                                                                                                                                                                               AACGG-GTG----TGG-A---AG-CAG-CT-C-A-GG--CCG-T-A--GCG---TA-T-G--GT---CCAA-TCTG-GT--GGTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-GC-CGC--CACA--T----TT--A-----------A----TGG-TG---------TCCC-AAAG-----T--GT--C-----ATA-TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-CG--GC-TTCCAC---T-C---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G---G--------ACCA-C-G-T-----AC-T-G--GT-C-G-TCC-----G--A-G-G-----TC-AA-CTT--ACC-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCGTTT-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCTAAAG-CGTCTAAAA--G-G--TT-CCAG----AGT---TGC-TG-TC-AACG----CTC--AAT------T--AGAG--ACTTTT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGAATGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AACA--CTG
gi|102227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAC---A----TT--A-----------ACCAGT-G-CG---------TCCC-AAAG-----TT-GT--TCTTCGATG-TTCGTATTT---GACT--AGGAA-AT-C---GC-TTTCGCAGGT-CG--A-GACTCGACGTT-GTTTCT---GTCATAATGGA----G-A-GGTTAGATCAACA-C-G-TCTTATTC-TTG--GT-C-G-TCCATCGAG--A-G-G-----TC-AA-C-CTAA-C-CGACGGTC-T-G-A--T------CA-AG-A------G--A-T-AGCT-T----GGAGTGTACTG-CC----ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAG--G-GTTTT-TCAG----AGT---TGC-TG-TC-AA-GTTTTCTA--AAATCTATTT--GTAG--AC--TTTAT-G-ATCTTATACAGTCA--CA-GGGGT-TGC-GT--
gi|102228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTC-AAAG-----T--GT--C-----AT--T-C----TC---GATT--ATGTA-AT-C---GC--TCCA----T-C---AGGGCT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-T-G-T-----TC-T----GT-C-GTTCC-----G--A-G-G-----TC-AA-C-T--A-C-CG-----C---C-GT-T------CAGGG-A----CC---T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TT-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAGAAAC--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-GT--A-AC-G-CAC-AA-GATCTGT
gi|102229                     :                                                                                                                                                                                                             -C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G--GT---CCAA-TCTG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GC-CGC-ACA
gi|102229                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctcT-TCAG----AGAAACTGT-TG-CC----G----CAC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAGCAAAGCA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGTatagagactttgaaacagcaaagcaggggtgcgcgtaacggcacaaactgt
gi|102230                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctccaggccgtaggtatggtccaatctggtgttg--TT-CAAG----AGCT--TGT-TG--C-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGG-GC-C-AT--ACACGG-CAC-AA-A--CTGT


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   T      . .    G   .  T C .  .    . C .  . .    . . .   .      AT   .  .     A  .    .  A .      .  T  T   C    TCCACTTACA                    . .  .            .    TC    T   TTC       A    CGT   .      .      .  . G    .     C    . G   G    C      .      .   G         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   TT    .  . . .      .  . . AC   .  .     . . . T  .       .  G .      T  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . C   .    .     CT     .  .  A  . .      .   T       A     A   T   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   A  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . C .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  A .      .  .  T   .    ATTAACCAG                     . .  .            .    T     .   GC        G    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . A    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . .   .    .     A      .  .  A  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   A  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . . .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  . .      .  .  C   .    TTTTCAA                       . .  .            .    .     .   CG        .    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . A    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . .   .    .     T      .  .  A  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   .  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . . .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  . .      .  .  T   .    TTTTAA                        . .  .            .    .     .   CC        .    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . T    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . .   .    .     T      .  .  C  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   .  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . . .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  . .      .  .  C   .    TTTTAA                        . .  .            .    .     .   C         .    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . A    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . .   .    .     .      .  .  A  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   .  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . . .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  . .      .  .  T   .    CGTTAA                        . .  .            .    .     .   C         .    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . A    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . .   .    .     .      .  .  A  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   .  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . . .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  . .      .  .  C   .    ATTTAA                        . .  .            .    .     .   C         .    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . A    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . .   .    .     .      .  .  A  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   .  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . . .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  . .      .  .  T   .    TTAAA                         . .  .            .    .     .   A         .    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . A    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . .   .    .     .      .  .  A  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   .  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . . .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  . .      .  .  T   .    TTTAC                         . .  .            .    .     .   C         .    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . A    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .     .   .    .    .  . .   .    .     .      .  .  A  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   .  . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .      . .    .   .  . . .  .    . . .  . .    . . .   .      T    .  .     .  .    .  . .      .  .  C   .    TTTAA                         . .  .            .    .     .   C         .    .     .      .      .  . .    .     .    . .   .    .      .      .   .         .    . . .           . . . .      . . .   . . .   .     .  . . .      .  . . .    .  .     . . . .  .       .  . .      .  . . .  . .    .         .   .     .                        .   .    .     .      .  .  .  . .      .   .       .     .   .   .  . . .    .       .   .         .  .  .    .   .  . . 
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Reference ( family-804 )      :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-CT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G-G--T---CCAAT-C-TG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTGT--T-GC-CG-C-ACAC---T----TT--A-----------A----T-G-TG---------TCCC-AAAG-----T--GT--C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---GC-TTCCA----TC---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G-TCC-----G--A-G-G-----TC-AAC-T--A-C-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TG-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGT
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gi|102214                     :                                                                                                                                                                            TTTAACAG-GCG----TGG-A---AG-CTG-CT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G-G--T---CCAAT-C-TG-GT--GTTG-TT-TAGA--G-A--ACTGT--T-GC-TG-C-ACAC---T----TTTCA-----------A----T-G-TG---------TCCC-AAAA-----T--GT--C-----AT--TTC----TC---GATT--ATGGA-AT-C---AC-TTCCA----TC---A-GACT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-A--------ACCA-C-G-T-----TC-T-G--GT-C-G-TCC-----G--A-G-G-----TC-AAC-T--A-C-CG-----C-T-C-G--T------CA-GG-A----CCG--T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TG-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--CC--TT--A-A-G----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGT
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gi|102221                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-C---GC-TTCCA----TCTCCA-GACT-GGGCTT-GTTGCT---G---------ACTAGG-ACG--------ACCA-CTC-T-----TCTT-G--GT-C-G-TTC-----G--A-G-ATGGGTTC-AAC-T----C-CG-----CTT-C-G--TCCAGAACA-GG-GCGACCCG--T-T-A-CT-T----T---------G-GCA---ATA-Tacaacttttttctctacattatacttagttcatctgatttcgcttccatctccagactgggcttgttgctgactaggacgaccactcttcttggtcgttcgagatgggttcaactccgcttcgtccagaacagggcgacccgttactttggcaatat
gi|102222                     : tttaacgggcgtggacaaggcagcttcaggccgttaggatgtatggtccaatctggtattgattcagaaactggtgctcgccacaccgttaatgtgtcccaaagtatcttgtcattcatcgattacatggaaacaacttttttctctacattatacttagttcatctgattTTTAACGG-TCG----CGG-A---AG-CAG-CT-CCA-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G-G--T---CCAAT-C-TG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GC-CG-C-ACA
gi|102223                     :                                                                                                                                                                            TTTAACGG-GCG----TGG-A---AG-CAG-GT-C-A-GG--CCG-T-A--G-G---AA-T-G-G--T---CCAAT-A-TG-GT--GTTG-TT-CAGA--G-A--ACTG
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gi|102227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAC---A----TT--A-----------ACCAGT-G-CG---------TCCC-AAAG-----TT-GT--TCTTCGATG-TTCGTATTT---GACT--AGGAA-AT-C---GC-TTTCGCAGGTCG--A-GACTCGACGTT-GTTTCT---GTCATAATGGA----G-A-GGTTAGATCAACA-C-G-TCTTATTC-TTG--GT-C-G-TCCATCGAG--A-G-G-----TC-AAC-CTAA-C-CGACGGTC-T-G-A--T------CA-AG-A------G--A-T-AGCT-T----GGAGTGTACTG-CC----ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAG--G-GTTTT-TCAG----AGT---TGC-TG-TC-AA-GTTTTCTA--AAATCTATTT--GTAG--AC--TTTAT-G-ATCTTATACAGTCA--CA-GGGGT-TGC-GT--
gi|102228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTC-AAAG-----T--GT--C-----AT--T-C----TC---GATT--ATGTA-AT-C---GC--TCCA----TC---AGGGCT-GGTGTT-GTTGCT---G---------A----G-A-G--------ACCA-T-G-T-----TC-T----GT-C-GTTCC-----G--A-G-G-----TC-AAC-T--A-C-CG-----C---C-GT-T------CAGGG-A----CC---T-T-A-CT-T----G---------G-CCA---ATA-TGTCT-AAG-CGTC--AAA--G-G--TT-CCAG----AG----TGC-TT-TC-AA-G----CTC--AA-------T--AGAGAAAC--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGGTGCGC-GT--A-AC-G-CAC-AA-GATCTGT
gi|102229                     :                                                                                                                                                                                                             -C-A-GG--CCG-T-A--G-G---TA-T-G-G--T---CCAAT-C-TG-GT--GTTG-TT-CAGA--GAA--ACTGT--T-GC-CG-C-ACA
gi|102229                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctcT-TCAG----AGAAACTGT-TG-CC----G----CAC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAGCAAAGCA-GGGGTGCGC-GT--A-ACGG-CAC-AA-A--CTGTatagagactttgaaacagcaaagcaggggtgcgcgtaacggcacaaactgt
gi|102230                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctccaggccgtaggtatggtccaatctggtgttg--TT-CAAG----AGCT--TGT-TG--C-AA-G----CTC--AA-------T--AGAG--AC--TT--T-G-A----A-ACAGCAA--CA-GGGG-GC-C-AT--ACACGG-CAC-AA-A--CTGT