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blockSeqs                     :         . T . A  .     .      G   .  .  .  .   T   . G G  . .      .     T T .   TA    G T   . .  A   . TA         .       .  G  .     .
blockSeqs                     :         . T . .  .     .      .   .  .  .  .   T   . . .  . .      .     . T .   A     . .   . .  A   . A          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . C          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .     .
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .      
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .  .      
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . A          .       .  .         
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . .          .       .  .         
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   . .          .       .  .         
blockSeqs                     :         . . . .  .     .      .   .  .  .  .   .   . . .  . .      .     . . .   .     . .   . .  .   .                                 


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTTAGCCG-A-A-T--T--AGCG-ACAATG--TT--G--C-AT-GTT---A-T-C--A-T-AGTTAT-GGTGA-G-T-TAT---AAT-G-TAG-T-TT--AA-A-A-CTTTAATA---CAAGC-AA-AA--GCCG-CAA
finalCons                     : TTTAGCCG-A-A-T--T--AGCG-ACAATG--TT--G--C-AT-GTT---A-T-C--A-T-AGTTAT-GGTGA-G-T-TAT---AAT-G-TAG-T-TT--AA-A-A-CTTTAATA---CAAGC-AA-AA--GCCG-CAA





Alignments
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lowQualScore                  :         . . . .. ..    .      ..  .. .. .  .   ... . . .. . .      .     . . .   ...   . .   . .  ..  . ...        ...   . .  .  ..    .   
lowQualScore                  :         2 7 2 33 11    2      33  11 11 2  2   333 2 4 33 2 2      2     4 7 2   222   4 4   2 2  55  2 777        111   5 4  7  99    3   
consensus                     : TTTAGCCG-A-A-T--T--AGCG-ACAATG--TT--G--C-AT-GTT---A-T-C--A-T-AGTTAT-GGTGA-G-T-TAT---AAT-G-TAG-T-TT--AA-A-A-CTTTAATA---CAAGC-AA-AA--GCCG-CAA
Reference ( family-797 )      : TTTAGCCG-A-A-T--T--AGCG-ACAATG--TT--G--C-AT-GTT---A-T-C--A-T-AGTTAT-GGTGA-G-T-TAT---AAT-G-TAG-T-TT--AA-A-A-CTTTAATA---CAAGC-AA-AA--GCCG-CAA
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gi|106574                     : TTTACCCG-A-A-T--T--AGCG-ACAATG--TT--G--C-AT-GTT---A-T-C--A-T-AGTTAT--GTGA-G-T-TAT---AAT-G-TAG-T-TTA-AA-A-A-CTTTAATA---CAAGC-AA-AA--ACCG-CA
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gi|106576                     : TTTAGCCG-A-A-T--T--AGCG-ACAATG--TT--G--C-AT-GTT---A-T-C--A-T-A-TTAT-GGTGA-G-T-TAT---AAT-GTTAG-T-TT--AA-A-A-CTTAAATA---CAAAC-AA-A
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gi|106578                     : TTT-GCCG-A-T-T--A--AACG-ACAATG--TT--G--C-AT-GTTTTAA-C-C--A-T-AGTGAT-GGTGA-G-T-TAT---AAT-G-T-G-T-TT--AA-A-A-CTTTAATA---CAAGC-AA-AA--GCCG-TAA
gi|106579                     : TTTAGC-G-A-A-T--T--AG-G-ACAATG--TT--G--C-AT-GT----A-T-C--A-T-A----T-GGTGA-G-T-TAT---AAT-G-TAG-T-TT--AA-A-A-ATTCAATA---CAAAC-AA-AA--GCCG-CA
gi|106580                     : TTTGCCCG-ACA-T--T--AGCG-ACAGTG--TT--G--A-AT-GTT---A-CAC--A-T-AGTTA--GGTGATG-A-TAT---AAT-G-TAG-T-TT--AA-A-C-CTTTATTA---CAAGCAAA-AA--GCCG-CAA
gi|106581                     : TTTACCCG-A-AAT--T--AGCG-ACA-TG--TT-----C-ATTGTT---A-T-CGAA-T-AGTTAT-GGTGA-GTT-TAT---AAT-G-TAG-T-TTTAAA-A-A-CTTAAATA---CAAAC-AA-
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gi|106583                     : TTTAGCCG-A-A-T--T--AGCG-ACAATG--TG--A--C-AT-GTT---ACT-C--A-T-AGTTAT-GGTGA---T-TA----AAT-G---G-T-TT--A-------CTTAATATTCCGAAC-AAGAA--GC
gi|106584                     : TTTAGCCG-A-A-T--T--AGCG-ACAATGTTTT--GCTC-AT-GTT---C-T-C--ATT-ACTTAT-GGTGATGTT-TATCTAGATCG-TAG-T-TT--AA-A-CTCTTTAAAA---TCAAC-AA-
gi|106585                     : TTAAGCCT-A-G-T--T--AGCG-ACAATG--CT--G--C-AT-G-----------------GCTATGGGTAA-G-TGTATA--AAT-G-CAGAT-GTA-AA-A-A-CTTTGATT---TAAGC-AAGAA--TCCG-
gi|106586                     :  TTACCCG-ATA-T--T--AGCG-GCAATG--TT--G--C-AT-GTT---A-T-C--A-T-AGTTCT-GATGA-G-T-TAT---AAT-G-TAG-T-TT--AA-A-A-CTTTAATA---CAAGC-AA-AA--GCCG-CAA
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gi|106588                     :  TTAGTCG-ATA-T--T--AGCGGACAATG--TTTTG--CGAT-GT----A---C--A-T-AGTTAT-GGTGA-GTT-TATTA-AATGG-TAG-T-TT--AATATA-CTTTAATA---CAA---AA-AATGGCCGTCAA
gi|106589                     :   TACCCG-A-A-T--TTAAGCG-ACA-TG--T---G--C-AT-GTTT--A-T-CG-A-TCAGTTAT-GGTGA-G-T--AT---AAT-G-TAG-T-TT--AA-A----CTTAATA---CAAAC-AA-AA--
gi|106590                     :     GCCA-A-A-T--T--AGCG-ACAATG--TT--G--C-AT-GTT---A-T-C--A-T-AGTTAT-GATGA-G-T-TAT---AGT-G-TA--T-GT--AA-A-