lowQualScore                  :                                       6666666666666666666666666666                                                                         
lowQualScore                  :         5   2 2   5 55   2 5555  33   0000000000000000000000000000    33        5555 2  33     444   5555      33   77777 5 2    444       
lowQualScore                  :         .   . .   . ..   . ....  ..   ............................    ..        .... .  ..     ...   ....      ..   ..... . .    ...       
lowQualScore                  :         7   9 7   3 22   5 3333  44   8888888888888888888888888888    22        0000 4  22     111   0000      44   55555 0 5    444       
consensus                     : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATCG------------------------TA-TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
Reference ( gi|8011 )         : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATCA-----------------------ATA-TACA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8012                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----AC--ATCA-----------------------ATA-TA----TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8013                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--AGCA-------------------------G-TACA--TATCTTGC----T-GA--TTCAT---GCA----TCTGAC---TG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8014                       : TTAGGCTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATCG------------------------T--TACC--GATTCTGC----C-GA--TCCAC---GCT----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTT
gi|8015                       : TTAGGTTT-CGA-T-ATT-T-ATGA-TCGATGC--ATCG------------------------T--TACA--TATTCTGT----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T---AATG---AATATTT
gi|8016                       : TTAGGTTT-TGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC--ATCG------------------------T--TGCA--TATTCTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TTAAAC--AAG--G--T-A-AACA---CATTTT
gi|8018                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATCC-----------------------TTA-CA-A--T-TCCTGT----T-GT--TCCAC---GCA----TCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8017                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATCC-----------------------TTA-CA-A--T-TCCTGT----T-GT--TCCAC---GCA----TCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8019                       : TTAGGTTTTAGCCT-ATT-T--TGA-T----GCTAGTCG------------------------T--TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGA
gi|8020                       : TTATGTTT-AGC-T-ATT-C-CTGG-T----GC--ATCGTTAGTCGTTACTTGCGGGGTTACATG-TACA--TATCCTGC----T-TA--TCCACACTGTA----TCTGAC--ACG--GTAT-A-AATG---AATTTTT
gi|8021                       :  TAGGTTT-AGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC---TCG------------------------T--TACA--T--CCTAC----C-GA--TCCAC---ACA----TCTGAC--AAG--T--T-A-AATG---AACTTTT
gi|8022                       :  TAGGTT--AGC-T-ATT-T-ATGA-T----G---ATCG------------------------T--TACA--TATCCTGC----T-GA--CCCAT---ACA----TC-GAC--AAG--T--TTA-AATG---AATTTTT
gi|8023                       :    GGTTTGAGC-T-ATTGT-ATGACT----TC--ATCA-----------------------G-A-TAC---TATCTTGC----T--A--TCCAC---GCA----TCTGACGGAGG--G--TAA-AATG---AAGTTTT
gi|8024                       :      TTT-AAC-T-GTT-TTATGA-T----GT--ATCG------------------------T--TACA--TATCCTGC----T-GA--TCTAT---GCA----TTTGAC--AAA--G--T-A-AATG---AA
gi|8025                       :      TTT-AAC-CGATTGT-ATGA-T----GT--ATCG------------------------T--TACA--TATATTGC----T-GA--TCCAA---GCAGAAATCTGAC--ATG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8026                       :               -ATT-T-ATGA-T----GT--ATCA-----------------------ATAATACAATTATCTTGCCGCCT-GAATTCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--GC-T-T-AATT---AATT
gi|8027                       :                       TGA-T----GC--ATCA-----------------------ATA-TACA--TATCTTGC----T-GA--TCTAC---GCA----TTTGAC--AAG--C--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8028                       :                                      CA-----------------------AT--CACA--TATCTTGC----TTGA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-ATAATGCTTAATGTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                        555555555555555555555555555                                                                         
lowQualScore                  :         5   2 2   5 44   2 5555  33    111111111111111111111111111    33        4444 2  33     333   4444      33   88 55 2 2    444       
lowQualScore                  :         .   . .   . ..   . ....  ..    ...........................    ..        .... .  ..     ...   ....      ..   .. .. . .    ...       
lowQualScore                  :         3   7 5   0 33   4 0000  22    888888888888888888888888888    11        7777 2  11     999   7777      22   88 66 4 4    111       
consensus                     : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATCG------------------------T--TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
Reference ( family-795 )      : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATCG------------------------TA-TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8011                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATCAA-----------------------TA-TACA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8012                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----AC--ATCA-------------------------A-TATA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8013                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--AGCA-------------------------G-TACA--TATCTTGC----T-GA--TTCAT---GCA----TCTGAC---TG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8014                       : TTAGGCTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATCG------------------------T--TACC--GATTCTGC----C-GA--TCCAC---GCT----TCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTT
gi|8015                       : TTAGGTTT-CGA-T-ATT-T-ATGA-TCGATGC--ATCG------------------------T--TACA--TATTCTGT----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T---AATG---AATATTT
gi|8016                       : TTAGGTTT-TGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC--ATCG------------------------T--TGCA--TATTCTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TTAAAC--AAG--G--T-A-AACA---CATTTT
gi|8017                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATCC------------------------T--TACA--ATTCCTGT----T-GT--TCCAC---GCA----TCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8018                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATCC------------------------T--TACA--ATTCCTGT----T-GT--TCCAC---GCA----TCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8019                       : TTAGGTTTTAGCCT-ATT-T--TGA-T----GCTAGTCG------------------------T--TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GCA----TCTGA
gi|8020                       : TTATGTTT-AGC-T-ATT-C-CTGG-T----GC--ATCGTTAGTCGTTACTTGCGGGGTTACATG-TACA--TATCCTGC----T-TA--TCCACACTGTA----TCTGAC--ACG--GTAT-A-AATG---AATTTTT
gi|8021                       :  TAGGTTT-AGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC---TCG------------------------T--TACA--T--CCTAC----C-GA--TCCAC---ACA----TCTGAC--AAG--T--T-A-AATG---AACTTTT
gi|8022                       :  TAGGTT--AGC-T-ATT-T-ATGA-T----G---ATCG------------------------T--TACA--TATCCTGC----T-GA--CCCAT---ACA----TC-GAC--AAGT-T--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8023                       :    GGTTTGAGC-T-ATTGT-ATGACT----TC--ATCA------------------------GA-TAC---TATCTTGC----T--A--TCCAC---GCA----TCTGACGGAGG--G--TAA-AATG---AAGTTTT
gi|8024                       :      TTT-AAC-T-GTT-TTATGA-T----GT--ATCG------------------------T--TACA--TATCCTGC----T-GA--TCTAT---GCA----TTTGAC--AAA--G--T-A-AATG---AA
gi|8025                       :      TTT-AAC-CGATTGT-ATGA-T----GT--ATCG------------------------T--TACA--TATATTGC----T-GA--TCCAA---GCAGAAATCTGAC--ATG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8026                       :               -ATT-T-ATGA-T----GT--ATCAA-----------------------TAATACAATTATCTTGCCGCCT-GAATTCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--GC-T-T-AATT---AATT
gi|8027                       :                       TGA-T----GC--ATCAA-----------------------TA-TACA--TATCTTGC----T-GA--TCTAC---GCA----TTTGAC--AAG--C--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8028                       :                                                                    ACA--TATCTTGC----TTGA--TCCAC---GCA----TCTGAC--AAG--G--T-ATAATGCTTAATGTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                         333333333333333333333333333                                                                         
lowQualScore                  :         5   2 2   5 44   2 5555  33   2 111111111111111111111111111    33        4444 2  33     333  4444       33   88 55 2 2    444       
lowQualScore                  :         .   . .   . ..   . ....  ..   . ...........................    ..        .... .  ..     ...  ....       ..   .. .. . .    ...       
lowQualScore                  :         3   7 5   0 33   4 0000  22   4 666666666666666666666666666    11        7777 2  11     999  7777       22   88 66 4 4    111       
consensus                     : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
Reference ( family-795 )      : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8011                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-AATA------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8012                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----AC--ATC-A-A-------------------------TATA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8013                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--AGC-A-G-------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TTCAT---GC----ATCTGAC---TG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8014                       : TTAGGCTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACC--GATTCTGC----C-GA--TCCAC---GC----TTCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTT
gi|8015                       : TTAGGTTT-CGA-T-ATT-T-ATGA-TCGATGC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATTCTGT----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T---AATG---AATATTT
gi|8016                       : TTAGGTTT-TGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TGCA--TATTCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATTAAAC--AAG--G--T-A-AACA---CATTTT
gi|8017                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATC-C-T-------------------------TACA--ATTCCTGT----T-GT--TCCAC---GC----ATCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8018                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATC-C-T-------------------------TACA--ATTCCTGT----T-GT--TCCAC---GC----ATCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8019                       : TTAGGTTTTAGCCT-ATT-T--TGA-T----GCTAGTC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGA
gi|8020                       : TTATGTTT-AGC-T-ATT-C-CTGG-T----GC--ATC-G-TTAGTCGTTACTTGCGGGGTTACATGTACA--TATCCTGC----T-TA--TCCACACTGT----ATCTGAC--ACG--GTAT-A-AATG---AATTTTT
gi|8021                       :  TAGGTTT-AGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC---TC-G-T-------------------------TACA--T--CCTAC----C-GA--TCCAC---AC----ATCTGAC--AAG--T--T-A-AATG---AACTTTT
gi|8022                       :  TAGGTT--AGC-T-ATT-T-ATGA-T----G---ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--CCCAT---AC----ATC-GAC--AAGT-T--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8023                       :    GGTTTGAGC-T-ATTGT-ATGACT----TC--ATCAG-A-------------------------TAC---TATCTTGC----T--A--TCCAC---GC----ATCTGACGGAGG--G--TAA-AATG---AAGTTTT
gi|8024                       :      TTT-AAC-T-GTT-TTATGA-T----GT--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCTAT---GC----ATTTGAC--AAA--G--T-A-AATG---AA
gi|8025                       :      TTT-AAC-CGATTGT-ATGA-T----GT--ATC-G-T-------------------------TACA--TATATTGC----T-GA--TCCAA---GCAGAAATCTGAC--ATG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8026                       :               -ATT-T-ATGA-T----GT--ATC-AATAA-----------------------TACAATTATCTTGCCGCCT-GAATTCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--GC-T-T-AATT---AATT
gi|8027                       :                       TGA-T----GC--ATC-AATA------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TCTAC---GC----ATTTGAC--AAG--C--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8028                       :                                         -T-------------------------CACA--TATCTTGC----TTGA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-ATAATGCTTAATGTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                         333333333333333333333333333                                                                         
lowQualScore                  :         5   2 2   5 44   2 5555  33   2 111111111111111111111111111    33        4444 2  33     333  4444       33   88 55 2 2    444       
lowQualScore                  :         .   . .   . ..   . ....  ..   . ...........................    ..        .... .  ..     ...  ....       ..   .. .. . .    ...       
lowQualScore                  :         3   7 5   0 33   4 0000  22   4 666666666666666666666666666    11        7777 2  11     999  7777       22   88 66 4 4    111       
consensus                     : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
Reference ( family-795 )      : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8011                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-AATA------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8012                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----AC--ATC-A-A-------------------------TATA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8013                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--AGC-A-G-------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TTCAT---GC----ATCTGAC---TG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8014                       : TTAGGCTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACC--GATTCTGC----C-GA--TCCAC---GC----TTCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTT
gi|8015                       : TTAGGTTT-CGA-T-ATT-T-ATGA-TCGATGC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATTCTGT----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T---AATG---AATATTT
gi|8016                       : TTAGGTTT-TGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TGCA--TATTCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATTAAAC--AAG--G--T-A-AACA---CATTTT
gi|8017                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATC-C-T-------------------------TACA--ATTCCTGT----T-GT--TCCAC---GC----ATCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8018                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATC-C-T-------------------------TACA--ATTCCTGT----T-GT--TCCAC---GC----ATCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8019                       : TTAGGTTTTAGCCT-ATT-T--TGA-T----GCTAGTC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGA
gi|8020                       : TTATGTTT-AGC-T-ATT-C-CTGG-T----GC--ATC-G-TTAGTCGTTACTTGCGGGGTTACATGTACA--TATCCTGC----T-TA--TCCACACTGT----ATCTGAC--ACG--GTAT-A-AATG---AATTTTT
gi|8021                       :  TAGGTTT-AGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC---TC-G-T-------------------------TACA--T--CCTAC----C-GA--TCCAC---AC----ATCTGAC--AAG--T--T-A-AATG---AACTTTT
gi|8022                       :  TAGGTT--AGC-T-ATT-T-ATGA-T----G---ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--CCCAT---AC----ATC-GAC--AAGT-T--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8023                       :    GGTTTGAGC-T-ATTGT-ATGACT----TC--ATCAG-A-------------------------TAC---TATCTTGC----T--A--TCCAC---GC----ATCTGACGGAGG--G--TAA-AATG---AAGTTTT
gi|8024                       :      TTT-AAC-T-GTT-TTATGA-T----GT--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCTAT---GC----ATTTGAC--AAA--G--T-A-AATG---AA
gi|8025                       :      TTT-AAC-CGATTGT-ATGA-T----GT--ATC-G-T-------------------------TACA--TATATTGC----T-GA--TCCAA---GCAGAAATCTGAC--ATG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8026                       :               -ATT-T-ATGA-T----GT--ATC-AATAA-----------------------TACAATTATCTTGCCGCCT-GAATTCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--GC-T-T-AATT---AATT
gi|8027                       :                       TGA-T----GC--ATC-AATA------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TCTAC---GC----ATTTGAC--AAG--C--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8028                       :                                         -T-------------------------CACA--TATCTTGC----TTGA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-ATAATGCTTAATGTTT


blockSeqs                     :         T   C G   G TA   C CGAT  TA   A TTAGTCGTTACTTGCGGGGTTACATG     AT        CGCC T  AT     ACT  AGAA       GG   GT TA A T    CTT
blockSeqs                     :         G   . .   G A    . .     .    . ATAA                           .         .    .  .      .    .          .    GT C  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . A    . .     .    . ATA                            .         .    .  .      .    .          .    T  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . A    . .     .    . A                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . A    . .     .    . G                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . T    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . C    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . C    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . C    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . T    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . A    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . A    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . A    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :         .   . .   . A    . .     .    . A                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :               .   . .    . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :                          . .     .    . T                              .         .    .  .      .    .          .    .  .  . .    .  
blockSeqs                     :                                         T                              .         .    .  .      .    .                               


blockSeqCons                  :                                         T**************************
originalCons                  : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
finalCons                     : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-GT--------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                         333333333333333333333333333                                                                         
lowQualScore                  :         5   2 2   5 44   2 5555  33   2 111111111111111111111111111    33        4444 2  33     333  4444       33   88 55 2 2    444       
lowQualScore                  :         .   . .   . ..   . ....  ..   . ...........................    ..        .... .  ..     ...  ....       ..   .. .. . .    ...       
lowQualScore                  :         3   7 5   0 33   4 0000  22   4 666666666666666666666666666    11        7777 2  11     999  7777       22   88 66 4 4    111       
consensus                     : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
Reference ( family-795 )      : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8011                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-AATA------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8012                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----AC--ATC-A-A-------------------------TATA--TATCTTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8013                       : TTAGGTTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--AGC-A-G-------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TTCAT---GC----ATCTGAC---TG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8014                       : TTAGGCTT-AGC-T-ATT-T-ATGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TACC--GATTCTGC----C-GA--TCCAC---GC----TTCTGAC--AAG--G--T-A-AATG---AATTTT
gi|8015                       : TTAGGTTT-CGA-T-ATT-T-ATGA-TCGATGC--ATC-G-T-------------------------TACA--TATTCTGT----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T---AATG---AATATTT
gi|8016                       : TTAGGTTT-TGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC--ATC-G-T-------------------------TGCA--TATTCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATTAAAC--AAG--G--T-A-AACA---CATTTT
gi|8017                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATC-C-T-------------------------TACA--ATTCCTGT----T-GT--TCCAC---GC----ATCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8018                       : TTAATTTT-AGC-T-ATT-T-CTGG-T----GC--ATC-C-T-------------------------TACA--ATTCCTGT----T-GT--TCCAC---GC----ATCTAAC--ACGGTG--T-A-AATG---AAGTTTT
gi|8019                       : TTAGGTTTTAGCCT-ATT-T--TGA-T----GCTAGTC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCCAC---GC----ATCTGA
gi|8020                       : TTATGTTT-AGC-T-ATT-C-CTGG-T----GC--ATC-G-TTAGTCGTTACTTGCGGGGTTACATGTACA--TATCCTGC----T-TA--TCCACACTGT----ATCTGAC--ACG--GTAT-A-AATG---AATTTTT
gi|8021                       :  TAGGTTT-AGC-T-ATT-T-TTGA-T----GC---TC-G-T-------------------------TACA--T--CCTAC----C-GA--TCCAC---AC----ATCTGAC--AAG--T--T-A-AATG---AACTTTT
gi|8022                       :  TAGGTT--AGC-T-ATT-T-ATGA-T----G---ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--CCCAT---AC----ATC-GAC--AAGT-T--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8023                       :    GGTTTGAGC-T-ATTGT-ATGACT----TC--ATCAG-A-------------------------TAC---TATCTTGC----T--A--TCCAC---GC----ATCTGACGGAGG--G--TAA-AATG---AAGTTTT
gi|8024                       :      TTT-AAC-T-GTT-TTATGA-T----GT--ATC-G-T-------------------------TACA--TATCCTGC----T-GA--TCTAT---GC----ATTTGAC--AAA--G--T-A-AATG---AA
gi|8025                       :      TTT-AAC-CGATTGT-ATGA-T----GT--ATC-G-T-------------------------TACA--TATATTGC----T-GA--TCCAA---GCAGAAATCTGAC--ATG--G--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8026                       :               -ATT-T-ATGA-T----GT--ATC-AATAA-----------------------TACAATTATCTTGCCGCCT-GAATTCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--GC-T-T-AATT---AATT
gi|8027                       :                       TGA-T----GC--ATC-AATA------------------------TACA--TATCTTGC----T-GA--TCTAC---GC----ATTTGAC--AAG--C--T-A-AATG---AATTTTT
gi|8028                       :                                         -T-------------------------CACA--TATCTTGC----TTGA--TCCAC---GC----ATCTGAC--AAG--G--T-ATAATGCTTAATGTTT