lowQualScore : 333333333 2222222222222 111111 11111111 1 22222222222 111
lowQualScore : 3 0 555555555 3 5 888 88 33 444 33 33 2 2 33 2 3333333333333 444 55555 88888 99999999 2 2 3 5 2 0 33 5 33 999999 777777 6 33 5 00000000 33 66 2 3 3 3 9999 4 33333333333 4 999 66 5 5 5
lowQualScore : . . ......... . . ... .. .. ... .. .. . . .. . ............. ... ..... ..... ........ . . . . . . .. . .. ...... ...... . .. . ........ .. .. . . . . .... . ........... . ... .. . . .
lowQualScore : 6 7 222222222 1 7 333 33 44 111 22 44 5 5 44 5 7777777777777 444 00000 88888 11111111 5 5 1 0 5 4 44 0 77 555555 777777 3 77 7 44444444 99 88 6 3 3 6 3333 0 00000000000 4 999 11 0 0 7
consensus : AGCACT-TCCTT-N-CT----TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA-TTN--TC--TT-A--AT---T-C---CCA-----TTGGTTAA--------A-ATG-CCGTTCT-G-TCCA--AGGG-AGGTAAT--TT-TTCNNTG------ATCT--AA-TTT--------ACG--T--ACGAATTAACAA-TTT-AACA-A-GANT-TTC-----------AATC-TT--TAAA--AAAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
Reference ( gi|109977 ) : AGCACT-TCCCT-A-CT----TT-GTG-ATTGGT---A-AAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA-TTT--TC--TG-A--AT---T-C---CCA-----TTGGTTAA--------A-ATG-CCGTTCT-G-TCCA--AGGG-AGGTAAT--TT-TTCGTTG------ATTT--AA-TTT--------ACG--T--ACGAATTTACAA-TTT-AACA-A-GAAT-TTC-----------AATC-TT--AAAA--AAAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109969 : AGCACT-TCCTA-A-CT----TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA-TTG--TC--TT-A--AT---T-C---CCA-----TTGGTTAA--------A-ATG-CCGTTCT-G-CCCA--AGGG-AGGTAAA--TT-TTCTGTG------TTCT--AA-TTT--------ACG--T--ACGAAGTAACAA-TTT-AACA-A-GAAT-TTG-----------AATC-TT--TAAA--AAAAT-G-A-AAAAC-GAACCAAGAAGA
gi|109978 : actaAGCACT-TCCTT-T-CT----GTAGTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA-TTG--CT--TT-A--AT---T-C---CCA-----TTGGTTAA--------A-ATG-CTGTTCT-G-TCTA--AGGG-AGGTAAT--TT-TTCTATG------ATCT--AA-TTT--------TCG--T--ACGAATTAATAA-TTT-AACA-A-GAAT-TTC-----------AATC-TTTAAAAA--GAAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109970 : AGCACT-TCCCTTG-CT----TT-GTG-ATTGGT---ATGAAA--A---CG--CAT--GA-T-GTGA--AAA-TGT---C--TT-A--AT---T-C---CCA-----TTGGTTAA--------T-ATGGCCGTTCT-G-TCCA--AGGG-AGGTAATCTTT-TTCTGTG------ATCT--AA-TTT--------AAGGGT--ACGAATT-ACAA-TTT-AACA-A-GAAT-TTTTTTTGGGAAAAAATC-TT--TTTA--AAAAT-GTACAAAACTGAGCCAAGAAAA
gi|109971 : ataaAACACTCTCCTT-T-CTG---TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--CATTTGA-T--TGATAAAA-TTG--TC--TT-A--AT---T-C---CCA-----TTGGTTAA--------A--TG-CCGTTCTAG-TCCA--AGGGGAGGTTTT--TT-TCTGTGA------ATCT--AAATTT--------ACG--T--ACGAATTAACAA-TTC-AACA-T-AGTT-TTC-----------AATC-TT--TAAA--AAAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109972 : acAACACT-TCTCT-TTCTG---TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--C-T--GA-T--TGA--AAAATTTG-TC--TT-A---T---T-C---CCA-----TTGGTTAA--------A-CTG-C-GTTCTAG-TCCA--AGGGGAGGTATT--TT-TTTCTTG------ATCTTAAA-TTT--------ACG--T--ACGAATTAACAA-TTC-AACATA-GTAT-TTC-----------AATC-TT---AAA--AAAAT-G-AC-AAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109973 : acAGCACT-TCCTTTA-TG----TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--------A-T-GTGG--AAA-TTG--TC--TT-T--AT---T-C---CCA-----TTGGTTAA--------A-ATG-C
gi|109974 : accaAGTACT-TTTCT---CTA---TT-ATG-ATTGGT---A-GAAA--A---T---CAT--GA-T-GTGA--AAA-TTA--T------A--AT---T-CATTTCA-----TTTATTGA--------A-ATT-CTGTTCA-C-TGCA--AGGA-AGATAAT--TTGCTTG-TG------ATCT--A
gi|109975 : acaaAGCAAT-TCCTT-T-CTC---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CA
gi|109979 : acaaGCACT-TCCTT-T-CTG---CT-GTG-ATTAGT---A-GAAA--G---GG--CAT--GA-TAGT-A--AAA-TTC--TC--TT-A--AT---T-C---CAA-----TTGGTTAA--------A-ATG-TTGCTCT-G-TTCA--AGGG-AGATAAT--TT-TTCTCGG------ATCT--AA-TTT--------ACG--T--ACGAATTGACAA-ATT-AA
gi|109980 : GCATT-TCCCT---CTCAA-TG-GTG-ATTGGTTGTA-AAAACCA---TGTACAT--GA-T-GTGA--AAA-AAT--TA--CA-AT-AT---T-T---TCAC----TTGGTT-G--------A-ATG-CTGTTCT-A-T----------AATTAGT--T------TTG------ATCT--GA-TAT--------ACG--T--ACAA--CTACAT-TTT-TACA-A-G-CT-TTC-----------AGTC-TT--TAAAGGAAAAC-G-A
gi|109976 : CACT-TCCTT-A-CT----TT-GTG-ATTG-T---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA-TTA--TC--TA-A--AT---TTC---CCA-----TTGGTTAA--------A-ATG-CCGTTTT-G-TCCA--AGGG-AGATAAT--TT-TTCTGTG------ATCT--AA-TTT--------AGC--T--ACGAATTAATAA-TTTAAACA-C-CATTGTTC-----------AATC-TT--TAAA--AAGAT-G-ACAAAAC-GAACTTAGAA
gi|109982 : aaatCCTT-A-CTCTTTTT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--GAATTG--CAT--GAAT-GTGA--ATA-TTTATCC--TT-A--ATATGC-C---TCAAGGACGTGGTTAA--------AGATG-CCGTT---GCTCCACCAGGG-AGATAAT--TT-TTTCTTGTGAATAATAT--AA-TTTTACGATAAACG--TA-ATGAACCT-CAA-TTT-AACA-
gi|109981 : -GTC-ATTGGTGG-A-AAAA--A---AA--CAT--GA-T-GTAA--AAA-TTT------GG-AATAT---T-T---TCA-----TTGGTTGAAATATATTA-ATA-CTGGTCT-T-TGCA--AGGG-AAATAAT--TT-AATGCTA------ATCT--AA-TTT--------ACT--C--AC-AACTTA
gi|109983 : gcattttctctcaataTG-ATTGAT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA-TTT--TC--TT-C--AT---T-T---CCA-----TTGGTTAA--------A-GTG-CCGCTCT-G-TCCG--ACAC-AGG--------------TG------ATTC--A----T--------ACG--T--ACGAATTa
gi|109984 : TGGT---AGAAAA--A---CA--CAT--GA-T-GTAA--AAA-TTC--TA--TGTC--AT---T-----TCA-----TAAGTTGA--------A-ATT-CTGTTCA-A-CGCA--AGGG-GCATAAT--TT-GCTGGTG------A-------------------ACG--T--TCGACTTAACAATTTT-ATCA-A-GA----TC-----------AA
gi|109985 : AA--A---TA--C-T--GA-T-GTGA--AAA-TTG--TC--TT-A--AC---T-T---CCA-----TTGGTTAA--------A-ATG-CCGCTCT-G-TCCA--AGGG-
gi|109986 : ---TG--CAT--TA-T-GTGA--AAA-TTT--ACAATG-----T---T-T---TCA-----TTGGTTGA--------A-ATG-C--TTCT-T-TGCA--AGGA-AGATAAT--GTAGTTGCTG------ATCT--AA-TTT--------ACG--TAAACAACATAACAA-TTT-TACA-A-CTTT-TCC-----------AATCGTC--AAAA--GAAA
gi|109987 : TTCT-G-TCCA--AGAG-AGGTAAT--TC-TTCTGTG------TTCT--AAACTT--------ACG--T--ACGAATTAACAA-TTT-AACA-AGGAAT-TTTG----------AATC-TT--TAAA--AAAATGG-ACAAAAC-GAACCAAGAAAAga
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 1111 11111111111
lowQualScore : 2 2 2 3 999 5 5 444 2 33 666 66 33 2 2 33 66 99999 2 33 444 2 444 55555 2 00000000 2 2 4 33 4 33 2 66 777777 2 33 8 66 77 2 555 3 3 3 1111 3 77777777777 55 55 4 4 5
lowQualScore : . . . . ... . . ... . .. ... .. .. . . .. .. ..... . .. ... . ... ..... . ........ . . . .. . .. . .. ...... . .. . .. .. . ... . . . .... . ........... .. .. . . .
lowQualScore : 9 9 9 8 333 7 3 444 5 22 111 11 22 4 4 22 55 22222 4 22 111 4 111 99999 4 99999999 2 4 7 22 7 44 5 22 222222 5 44 0 33 33 7 000 1 1 3 1111 6 33333333333 55 55 0 0 0
consensus : AGCACT-TC-C-TTTCT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT-TTCTGTG------A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
Reference ( family-790 ) : AGCACT-TC-C-TTNCT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT-TTCNNTG------A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109969 : AGCACT-TC-C-TAACT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA--TTG----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GCCCA--AGGG-AGGTAAA--TT-TTCTGTG------T-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AAGTAA---CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTG-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-A-AAAAC-GAACCAAGAAGA
gi|109970 : actaAGCACT-TC-CCTTGCT---TT-GTG-ATTGGT---ATGAAA--A---CG--CAT--GA-T-GTGA--AAA--T-G----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAT-ATGG-------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAATCTTT-TTCTGTG------A-TCT--AA-TTTAAGGGT--ACG-AATTA----CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTTTTTTGGGAAAAAATCTTTTTA--A--AAAT-GTACAAAACTGAGCCAAGAAAA
gi|109971 : ataaAACACTCTC-C-TTTCTG--TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--CATTTGA-T--TGATAAAA--TTG----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA--TG--------CCGTT-CTAGTCCA--AGGGGAGGTT-T--TT-TTCTGTG------AATCT--AAATTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTC-AACA-TA--GTT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109972 : acAACACT-TCTC-TTTCTG--TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--C-T--GA-T--TGA--AAAATTTG----TCT-TA---T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-CTG--------C-GTT-CTAGTCCA--AGGGGAGGTATT--TT-TTTCTTG------A-TCTTAAA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTC-AACATAG--TAT-TTC-----------AATC-TTAAA--A--AAAT-G-AC-AAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109973 : acAGCACT-TC-C-TTTATG--TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--------A-T-GTGG--AAA--TTG----TCT-TTA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------C
gi|109974 : accaAGTACT-TT-T-CTCTA---TT-ATG-ATTGGT---A-GAAA--A---T---CAT--GA-T-GTGA--AAA--TTA--------TAA--T---T-CATTTCA-----TTTATTGAA-ATT--------CTGTT-CA-CTGCA--AGGA-AGATAAT--TT-GCTTGTG------A-TCT--A
gi|109975 : acaaAGCAAT-TC-C-TTTCTC--TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CA
gi|109976 : acaaCACT-TC-C-TTACT---TT-GTG-ATTG-T---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA--TTA----TCT-AAA--T---TTC---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-TT-GTCCA--AGGG-AGATAAT--TT-TTCTGTG------A-TCT--AA-TTTAGC--T--ACG-AATTAA---TAA-TTTAAACA-CC--ATTGTTC-----------AATCTTTAAA--A--AGAT-G-ACAAAAC-GAACTTAGAA
gi|109977 : aaatAGCACT-TC-C-CTACT---TT-GTG-ATTGGT---A-AAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA--TTT----TCT-GAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT-TTCGTTG------A-TTT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTTA---CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTC-----------AATCTTAAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109978 : AGCACT-TC-C-TTTCT---GTAGTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA--TTG----CTT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CTGTT-CT-GTCTA--AGGG-AGGTAAT--TT-TTCTATG------A-TCT--AA-TTTTCG--T--ACG-AATTAA---TAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTC-----------AATCTTTAAA--AAGAAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109979 : GCACT-TC-C-TTTCTG--CT-GTG-ATTAGT---A-GAAA--G---GG--CAT--GA-TAGT-A--AAA--TTC----TCT-TAA--T---T-C---CAA-----TTGGTTAAA-ATG--------TTGCT-CT-GTTCA--AGGG-AGATAAT--TT-TTCTCGG------A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTGA---CAA-ATT-AA
gi|109980 : GCATT-TC-C-CT-CTCAATG-GTG-ATTGGTTGTA-AAAACCA---TGTACAT--GA-T-GTGA--AAAAATTA----CAA-TAT--T---T-T---CAC-----TTGGTTGAA--TG--------CTGTT-CT-AT----------AATTAGT--TT-T-----G------A-TCT--GA-TATACG--T--AC--AACT-A---CAT-TTT-TACA-AG---CT-TTC-----------AGTCTTTAAAGGA--AAAC-G-A
gi|109981 : GCATT-TT-C-TCTCA---ATAGTC-ATTGGT---G-GAAA--A---AAAACAT--GA-T-GTAA--AAA--TTTGGAAT-----A--T---T-T---TCA-----TTGGTTGAA-ATATATTAATACTGGT-CT-TTGCA--AGGG-AAATAAT--TT-AATGCTA------A-TCT--AA-TTTACT--C--ACA-ACTTAA---
gi|109982 : CT-TA-C-TCTTT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--GAATTG--CAT--GAAT-GTGA--ATA--TTTAT--CCT-TAA--TATGC-C---TCAAGGACGTGGTTAAAGATG--------CCGTTGCT---CCACCAGGG-AGATAAT--TT-TTTCTTGTGAATAA-TAT--AATTTTACGA-TAAACGTAATGAACCTCAA-TTT-AACA-
gi|109983 : cTG-ATTGAT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTGA--AAA--TTT----TCT-TCA--T---T-T---CCA-----TTGGTTAAA-GTG--------CCGCT-CT-GTCCG--ACAC-AGGTGAT--T----CA---------------------TACG--T--ACG-AATT
gi|109984 : TGGT---A-GAAA--AA--CA--CAT--GA-T-GTAA--AAA--TTC----TATGTCA--T---T-T---C-A-----TAAGTTGAA-ATT--------CTGTT-CA-ACGCA--AGGG-GCATAAT--TT-GCTGGTG------A------------ACG--T--TCG-ACTTAA---CAATTTT-ATCA-AG--A----TC-----------AA
gi|109985 : AA--A---TA--C-T--GA-T-GTGA--AAA--TTG----TCT-TAA--C---T-T---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGCT-CT-GTCCA--AGGG-
gi|109986 : ---TG--CAT--TA-T-GTGA--AAA--TTT----AC---AATGT---T-T---TCA-----TTGGTTGAA-ATG--------C--TT-CT-TTGCA--AGGA-AGATAAT--GTAGTTGCTG------A-TCT--AA-TTTACG--TAAACA-ACATAA---CAA-TTT-TACA-AC--TTT-TCC-----------AATCGTCAAA--A--GAAA-G-A
gi|109987 : TT-CT-GTCCA--AGAG-AGGTAAT--TC-TTCTGTG------T-TCT--AAACTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AGGAATT-TTG-----------AATCTTTAAA--A--AAATGG-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
Alignments
lowQualScore : 222 11111111 1111 11111111111
lowQualScore : 2 2 22 222 5 5 444 2 33 666 66 33 2 2 33 33 33 99999 2 33 444 2 444 55555 2 00000000 2 2 4 33 4 1 33 555555 2 5555 2 55 5 66 77 2 555 3 3 3 1111 3 77777777777 55 55 4 4 5
lowQualScore : . . .. ... . . ... . .. ... .. .. . . .. .. .. ..... . .. ... . ... ..... . ........ . . . .. . . .. ...... . .... . .. . .. .. . ... . . . .... . ........... .. .. . . .
lowQualScore : 9 9 99 111 7 3 444 5 22 111 11 22 4 4 22 22 22 22222 4 22 111 4 111 99999 4 99999999 2 4 7 22 7 7 44 999999 5 3333 5 99 3 33 33 7 000 1 1 3 1111 6 33333333333 55 55 0 0 0
consensus : AGCACT-TC-CTTT-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
Reference ( family-790 ) : AGCACT-TC-CTTT-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109969 : AGCACT-TC-CTAA-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GCCCA--AGGG-AGGTAAA--TT--TT--CTG-TG----T-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AAGTAA---CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTG-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-A-AAAAC-GAACCAAGAAGA
gi|109970 : actaAGCACT-TC-CCTTGCT---TT-GTG-ATTGGT---ATGAAA--A---CG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--T-G----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAT-ATGG-------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAATCTTT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTAAGGGT--ACG-AATTA----CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTTTTTTGGGAAAAAATCTTTTTA--A--AAAT-GTACAAAACTGAGCCAAGAAAA
gi|109971 : ataaAACACTCTC-CTTT-CTG--TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--CATTTGA-T--TG--ATAAAA--TTG----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA--TG--------CCGTT-CTAGTCCA--AGGGGAGGTT-T--TT--TT--CTG-TG----AATCT--AAATTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTC-AACA-TA--GTT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109972 : acAACACT-TCTCTTT-CTG--TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--C-T--GA-T--TG--A--AAAATTTG----TCT-TA---T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-CTG--------C-GTT-CTAGTCCA--AGGGGAGGTATT--TT--TT--TCT-TG----A-TCTTAAA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTC-AACATAG--TAT-TTC-----------AATC-TTAAA--A--AAAT-G-AC-AAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109973 : acAGCACT-TC-CTTT-ATG--TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--------A-T-GTG--G--AAA--TTG----TCT-TTA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------C
gi|109974 : accaAGTACT-TT--TCT-CTA--TT-ATG-ATTGGT---A-GAAA--A---T---CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTA--------TAA--T---T-CATTTCA-----TTTATTGAA-ATT--------CTGTT-CA-CTGCA--AGGA-AGATAAT--TT--GC--TTG-TG----A-TCT--A
gi|109975 : acaaAGCAAT-TC-CTTT-CTC--TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CA
gi|109976 : acaaCACT-TC-CTTA-CT---TT-GTG-ATTG-T---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTA----TCT-AAA--T---TTC---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-TT-GTCCA--AGGG-AGATAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTAGC--T--ACG-AATTAA---TAA-TTTAAACA-CC--ATTGTTC-----------AATCTTTAAA--A--AGAT-G-ACAAAAC-GAACTTAGAA
gi|109977 : aaatAGCACT-TC-CCTA-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-AAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTT----TCT-GAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CGT-TG----A-TTT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTTA---CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTC-----------AATCTTAAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109978 : AGCACT-TC-CTTT-CT---GTAGTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----CTT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CTGTT-CT-GTCTA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTA-TG----A-TCT--AA-TTTTCG--T--ACG-AATTAA---TAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTC-----------AATCTTTAAA--AAGAAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109979 : GCACT-TC-CTTT-CTG--CT-GTG-ATTAGT---A-GAAA--G---GG--CAT--GA-TAGT---A--AAA--TTC----TCT-TAA--T---T-C---CAA-----TTGGTTAAA-ATG--------TTGCT-CT-GTTCA--AGGG-AGATAAT--TT--TT--CTC-GG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTGA---CAA-ATT-AA
gi|109980 : GCATT-TC-CCT--CTCAATG-GTG-ATTGGTTGTA-AAAACCA---TGTACAT--GA-T-GTGAAA--AAA--TTA----CAA-TAT--T---T-T---CAC-----TTGGTT-GA-ATG--------CTGTT-CT-AT----------AATTAGT--TT----------TG----A-TCT--GA-TATACG--T--AC--AACT-A---CAT-TTT-TACA-AG---CT-TTC-----------AGTCTTTAAAGGA--AAAC-G-A
gi|109981 : GCATT-TT-CTCT-CA---ATAGTC-ATTGGT---G-GAAA--A---AAAACAT--GA-T-GTA--A--AAA--TTTGGAAT-----A--T---T-T---TCA-----TTGGTTGAA-ATATATTAATACTGGT-CT-TTGCA--AGGG-AAATAAT--TTAATG--CTA-------A-TCT--AA-TTTACT--C--ACA-ACTTAA---
gi|109982 : CT-TA-CTCT-TT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--GAATTG--CAT--GAAT-GTG--A--ATA--TTTAT--CCT-TAA--TATGC-C---TCAAGGACGTGGTTAAAGATG--------CCGTTGCT---CCACCAGGG-AGATAAT--TT--TTTCTTG-TGAATAA-TAT--AATTTTACGA-TAAACGTAATGAACCTCAA-TTT-AACA-
gi|109983 : cTG-ATTGAT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTT----TCT-TCA--T---T-T---CCA-----TTGGTTAAA-GTG--------CCGCT-CT-GTCCG--ACAC-AG-----------------G-TG----A-TTC--A----TACG--T--ACG-AATT
gi|109984 : TGGT---A-GAAA--AA--CA--CAT--GA-T-GTA--A--AAA--TTC----TATGTCA--T---T-----TCA-----TAAGTTGAA-ATT--------CTGTT-CA-ACGCA--AGGG-GCATAAT--TT--GC--TGG-TG----A------------ACG--T--TCG-ACTTAA---CAATTTT-ATCA-AG--A----TC-----------AA
gi|109985 : AA--A---TA--C-T--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----TCT-TAA--C---T-T---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGCT-CT-GTCCA--AGGG-
gi|109986 : ---TG--CAT--TA-T-GTG--A--AAA--TTT----AC---AATGT---T-T---TCA-----TTGGTTGAA-ATG--------C--TT-CT-TTGCA--AGGA-AGATAAT--GT--AG--TTGCTG----A-TCT--AA-TTTACG--TAAACA-ACATAA---CAA-TTT-TACA-AC--TTT-TCC-----------AATCGTCAAA--A--GAAA-G-A
gi|109987 : TT-CT-GTCCA--AGAG-AGGTAAT--TC--TT--CTG-TG----T-TCTA-AA-CTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AGGAATT-TTG-----------AATCTTTAAA--A--AAATGG-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
Alignments
lowQualScore : 222 11111111 1111 11111111111
lowQualScore : 2 2 22 222 5 5 444 2 33 666 66 33 2 2 33 33 33 99999 2 33 444 2 444 55555 2 00000000 2 2 4 33 4 1 33 555555 2 5555 2 55 5 66 77 2 555 3 3 3 1111 3 77777777777 55 55 4 4 5
lowQualScore : . . .. ... . . ... . .. ... .. .. . . .. .. .. ..... . .. ... . ... ..... . ........ . . . .. . . .. ...... . .... . .. . .. .. . ... . . . .... . ........... .. .. . . .
lowQualScore : 9 9 99 111 7 3 444 5 22 111 11 22 4 4 22 22 22 22222 4 22 111 4 111 99999 4 99999999 2 4 7 22 7 7 44 999999 5 3333 5 99 3 33 33 7 000 1 1 3 1111 6 33333333333 55 55 0 0 0
consensus : AGCACT-TC-CTTT-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
Reference ( family-790 ) : AGCACT-TC-CTTT-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109969 : AGCACT-TC-CTAA-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GCCCA--AGGG-AGGTAAA--TT--TT--CTG-TG----T-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AAGTAA---CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTG-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-A-AAAAC-GAACCAAGAAGA
gi|109970 : actaAGCACT-TC-CCTTGCT---TT-GTG-ATTGGT---ATGAAA--A---CG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--T-G----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAT-ATGG-------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAATCTTT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTAAGGGT--ACG-AATTA----CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTTTTTTGGGAAAAAATCTTTTTA--A--AAAT-GTACAAAACTGAGCCAAGAAAA
gi|109971 : ataaAACACTCTC-CTTT-CTG--TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--CATTTGA-T--TG--ATAAAA--TTG----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA--TG--------CCGTT-CTAGTCCA--AGGGGAGGTT-T--TT--TT--CTG-TG----AATCT--AAATTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTC-AACA-TA--GTT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109972 : acAACACT-TCTCTTT-CTG--TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--C-T--GA-T--TG--A--AAAATTTG----TCT-TA---T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-CTG--------C-GTT-CTAGTCCA--AGGGGAGGTATT--TT--TT--TCT-TG----A-TCTTAAA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTC-AACATAG--TAT-TTC-----------AATC-TTAAA--A--AAAT-G-AC-AAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109973 : acAGCACT-TC-CTTT-ATG--TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--------A-T-GTG--G--AAA--TTG----TCT-TTA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------C
gi|109974 : accaAGTACT-TT--TCT-CTA--TT-ATG-ATTGGT---A-GAAA--A---T---CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTA--------TAA--T---T-CATTTCA-----TTTATTGAA-ATT--------CTGTT-CA-CTGCA--AGGA-AGATAAT--TT--GC--TTG-TG----A-TCT--A
gi|109975 : acaaAGCAAT-TC-CTTT-CTC--TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CA
gi|109976 : acaaCACT-TC-CTTA-CT---TT-GTG-ATTG-T---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTA----TCT-AAA--T---TTC---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-TT-GTCCA--AGGG-AGATAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTAGC--T--ACG-AATTAA---TAA-TTTAAACA-CC--ATTGTTC-----------AATCTTTAAA--A--AGAT-G-ACAAAAC-GAACTTAGAA
gi|109977 : aaatAGCACT-TC-CCTA-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-AAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTT----TCT-GAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CGT-TG----A-TTT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTTA---CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTC-----------AATCTTAAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109978 : AGCACT-TC-CTTT-CT---GTAGTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----CTT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CTGTT-CT-GTCTA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTA-TG----A-TCT--AA-TTTTCG--T--ACG-AATTAA---TAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTC-----------AATCTTTAAA--AAGAAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109979 : GCACT-TC-CTTT-CTG--CT-GTG-ATTAGT---A-GAAA--G---GG--CAT--GA-TAGT---A--AAA--TTC----TCT-TAA--T---T-C---CAA-----TTGGTTAAA-ATG--------TTGCT-CT-GTTCA--AGGG-AGATAAT--TT--TT--CTC-GG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTGA---CAA-ATT-AA
gi|109980 : GCATT-TC-CCT--CTCAATG-GTG-ATTGGTTGTA-AAAACCA---TGTACAT--GA-T-GTGAAA--AAA--TTA----CAA-TAT--T---T-T---CAC-----TTGGTT-GA-ATG--------CTGTT-CT-AT----------AATTAGT--TT----------TG----A-TCT--GA-TATACG--T--AC--AACT-A---CAT-TTT-TACA-AG---CT-TTC-----------AGTCTTTAAAGGA--AAAC-G-A
gi|109981 : GCATT-TT-CTCT-CA---ATAGTC-ATTGGT---G-GAAA--A---AAAACAT--GA-T-GTA--A--AAA--TTTGGAAT-----A--T---T-T---TCA-----TTGGTTGAA-ATATATTAATACTGGT-CT-TTGCA--AGGG-AAATAAT--TTAATG--CTA-------A-TCT--AA-TTTACT--C--ACA-ACTTAA---
gi|109982 : CT-TA-CTCT-TT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--GAATTG--CAT--GAAT-GTG--A--ATA--TTTAT--CCT-TAA--TATGC-C---TCAAGGACGTGGTTAAAGATG--------CCGTTGCT---CCACCAGGG-AGATAAT--TT--TTTCTTG-TGAATAA-TAT--AATTTTACGA-TAAACGTAATGAACCTCAA-TTT-AACA-
gi|109983 : cTG-ATTGAT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTT----TCT-TCA--T---T-T---CCA-----TTGGTTAAA-GTG--------CCGCT-CT-GTCCG--ACAC-AG-----------------G-TG----A-TTC--A----TACG--T--ACG-AATT
gi|109984 : TGGT---A-GAAA--AA--CA--CAT--GA-T-GTA--A--AAA--TTC----TATGTCA--T---T-----TCA-----TAAGTTGAA-ATT--------CTGTT-CA-ACGCA--AGGG-GCATAAT--TT--GC--TGG-TG----A------------ACG--T--TCG-ACTTAA---CAATTTT-ATCA-AG--A----TC-----------AA
gi|109985 : AA--A---TA--C-T--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----TCT-TAA--C---T-T---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGCT-CT-GTCCA--AGGG-
gi|109986 : ---TG--CAT--TA-T-GTG--A--AAA--TTT----AC---AATGT---T-T---TCA-----TTGGTTGAA-ATG--------C--TT-CT-TTGCA--AGGA-AGATAAT--GT--AG--TTGCTG----A-TCT--AA-TTTACG--TAAACA-ACATAA---CAA-TTT-TACA-AC--TTT-TCC-----------AATCGTCAAA--A--GAAA-G-A
gi|109987 : TT-CT-GTCCA--AGAG-AGGTAAT--TC--TT--CTG-TG----T-TCTA-AA-CTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AGGAATT-TTG-----------AATCTTTAAA--A--AAATGG-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
blockSeqs : C T TG CAA A C TGT T CC AAT TA TT A A AA TA AT TGGAA G TG ATG T ATT AGGAC G TATTAATA C G A CC G G CT AATG C AATA A TA A GG AA T CCT T A T GAAT G TTTTGGGAAAA GG AG G T T
blockSeqs : . . T G A C . . . A AA . . . . . . TAT . . . . . . . G C . A . G G . TTTC . . . A T A AA . . . . . AA . . . . . . .
blockSeqs : . . T G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . G . TT . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . .
blockSeqs : . . T G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . A . TT . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . T A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . A . TT . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . T C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . G . GC . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . .
blockSeqs : . . A G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . G . TT . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . A . TT . . . . . . . . . . . . TT . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . T . TT . . . . . . . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . A . TT . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . . . A . GC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . A . AG . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . A . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ***
originalCons : AGCACT-TC-CTTT-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
finalCons : AGCACT-TC-CTTT-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
Alignments
lowQualScore : 222 11111111 1111 11111111111
lowQualScore : 2 2 22 222 5 5 444 2 33 666 66 33 2 2 33 33 33 99999 2 33 444 2 444 55555 2 00000000 2 2 4 33 4 1 33 555555 2 5555 2 55 5 66 77 2 555 3 3 3 1111 3 77777777777 55 55 4 4 5
lowQualScore : . . .. ... . . ... . .. ... .. .. . . .. .. .. ..... . .. ... . ... ..... . ........ . . . .. . . .. ...... . .... . .. . .. .. . ... . . . .... . ........... .. .. . . .
lowQualScore : 9 9 99 111 7 3 444 5 22 111 11 22 4 4 22 22 22 22222 4 22 111 4 111 99999 4 99999999 2 4 7 22 7 7 44 999999 5 3333 5 99 3 33 33 7 000 1 1 3 1111 6 33333333333 55 55 0 0 0
consensus : AGCACT-TC-CTTT-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
Reference ( family-790 ) : AGCACT-TC-CTTT-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTN----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AG--ANT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109969 : AGCACT-TC-CTAA-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GCCCA--AGGG-AGGTAAA--TT--TT--CTG-TG----T-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AAGTAA---CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTG-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-A-AAAAC-GAACCAAGAAGA
gi|109970 : actaAGCACT-TC-CCTTGCT---TT-GTG-ATTGGT---ATGAAA--A---CG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--T-G----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAT-ATGG-------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAATCTTT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTAAGGGT--ACG-AATTA----CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTTTTTTGGGAAAAAATCTTTTTA--A--AAAT-GTACAAAACTGAGCCAAGAAAA
gi|109971 : ataaAACACTCTC-CTTT-CTG--TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--CATTTGA-T--TG--ATAAAA--TTG----TCT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA--TG--------CCGTT-CTAGTCCA--AGGGGAGGTT-T--TT--TT--CTG-TG----AATCT--AAATTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTC-AACA-TA--GTT-TTC-----------AATCTTTAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109972 : acAACACT-TCTCTTT-CTG--TT-GTGCATTGGT---A-GAAA--A---TG--C-T--GA-T--TG--A--AAAATTTG----TCT-TA---T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-CTG--------C-GTT-CTAGTCCA--AGGGGAGGTATT--TT--TT--TCT-TG----A-TCTTAAA-TTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTC-AACATAG--TAT-TTC-----------AATC-TTAAA--A--AAAT-G-AC-AAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109973 : acAGCACT-TC-CTTT-ATG--TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--------A-T-GTG--G--AAA--TTG----TCT-TTA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------C
gi|109974 : accaAGTACT-TT--TCT-CTA--TT-ATG-ATTGGT---A-GAAA--A---T---CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTA--------TAA--T---T-CATTTCA-----TTTATTGAA-ATT--------CTGTT-CA-CTGCA--AGGA-AGATAAT--TT--GC--TTG-TG----A-TCT--A
gi|109975 : acaaAGCAAT-TC-CTTT-CTC--TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CA
gi|109976 : acaaCACT-TC-CTTA-CT---TT-GTG-ATTG-T---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTA----TCT-AAA--T---TTC---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-TT-GTCCA--AGGG-AGATAAT--TT--TT--CTG-TG----A-TCT--AA-TTTAGC--T--ACG-AATTAA---TAA-TTTAAACA-CC--ATTGTTC-----------AATCTTTAAA--A--AGAT-G-ACAAAAC-GAACTTAGAA
gi|109977 : aaatAGCACT-TC-CCTA-CT---TT-GTG-ATTGGT---A-AAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTT----TCT-GAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGTT-CT-GTCCA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CGT-TG----A-TTT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTTA---CAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTC-----------AATCTTAAAA--A--AAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109978 : AGCACT-TC-CTTT-CT---GTAGTG-ATTGGT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----CTT-TAA--T---T-C---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CTGTT-CT-GTCTA--AGGG-AGGTAAT--TT--TT--CTA-TG----A-TCT--AA-TTTTCG--T--ACG-AATTAA---TAA-TTT-AACA-AG--AAT-TTC-----------AATCTTTAAA--AAGAAAT-G-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA
gi|109979 : GCACT-TC-CTTT-CTG--CT-GTG-ATTAGT---A-GAAA--G---GG--CAT--GA-TAGT---A--AAA--TTC----TCT-TAA--T---T-C---CAA-----TTGGTTAAA-ATG--------TTGCT-CT-GTTCA--AGGG-AGATAAT--TT--TT--CTC-GG----A-TCT--AA-TTTACG--T--ACG-AATTGA---CAA-ATT-AA
gi|109980 : GCATT-TC-CCT--CTCAATG-GTG-ATTGGTTGTA-AAAACCA---TGTACAT--GA-T-GTGAAA--AAA--TTA----CAA-TAT--T---T-T---CAC-----TTGGTT-GA-ATG--------CTGTT-CT-AT----------AATTAGT--TT----------TG----A-TCT--GA-TATACG--T--AC--AACT-A---CAT-TTT-TACA-AG---CT-TTC-----------AGTCTTTAAAGGA--AAAC-G-A
gi|109981 : GCATT-TT-CTCT-CA---ATAGTC-ATTGGT---G-GAAA--A---AAAACAT--GA-T-GTA--A--AAA--TTTGGAAT-----A--T---T-T---TCA-----TTGGTTGAA-ATATATTAATACTGGT-CT-TTGCA--AGGG-AAATAAT--TTAATG--CTA-------A-TCT--AA-TTTACT--C--ACA-ACTTAA---
gi|109982 : CT-TA-CTCT-TT---TT-GTG-ATTGGT---A-GAAA--GAATTG--CAT--GAAT-GTG--A--ATA--TTTAT--CCT-TAA--TATGC-C---TCAAGGACGTGGTTAAAGATG--------CCGTTGCT---CCACCAGGG-AGATAAT--TT--TTTCTTG-TGAATAA-TAT--AATTTTACGA-TAAACGTAATGAACCTCAA-TTT-AACA-
gi|109983 : cTG-ATTGAT---A-GAAA--A---TG--CAT--GA-T-GTG--A--AAA--TTT----TCT-TCA--T---T-T---CCA-----TTGGTTAAA-GTG--------CCGCT-CT-GTCCG--ACAC-AG-----------------G-TG----A-TTC--A----TACG--T--ACG-AATT
gi|109984 : TGGT---A-GAAA--AA--CA--CAT--GA-T-GTA--A--AAA--TTC----TATGTCA--T---T-----TCA-----TAAGTTGAA-ATT--------CTGTT-CA-ACGCA--AGGG-GCATAAT--TT--GC--TGG-TG----A------------ACG--T--TCG-ACTTAA---CAATTTT-ATCA-AG--A----TC-----------AA
gi|109985 : AA--A---TA--C-T--GA-T-GTG--A--AAA--TTG----TCT-TAA--C---T-T---CCA-----TTGGTTAAA-ATG--------CCGCT-CT-GTCCA--AGGG-
gi|109986 : ---TG--CAT--TA-T-GTG--A--AAA--TTT----AC---AATGT---T-T---TCA-----TTGGTTGAA-ATG--------C--TT-CT-TTGCA--AGGA-AGATAAT--GT--AG--TTGCTG----A-TCT--AA-TTTACG--TAAACA-ACATAA---CAA-TTT-TACA-AC--TTT-TCC-----------AATCGTCAAA--A--GAAA-G-A
gi|109987 : TT-CT-GTCCA--AGAG-AGGTAAT--TC--TT--CTG-TG----T-TCTA-AA-CTTACG--T--ACG-AATTAA---CAA-TTT-AACA-AGGAATT-TTG-----------AATCTTTAAA--A--AAATGG-ACAAAAC-GAACCAAGAAAA