lowQualScore : 1111 111 11 1 111 22222222 44444444444444444444444444444444444 11111111 222222222222222222 1111 111 1111111111 1111 1111
lowQualScore : 3 3 3 8888 2 2 6666 55 2 444 33 2 000 0 2 3 2 2 5 5 555 2 5 5 33 2 66 777777 2 2 5 2 33 2 2 5 66 555 66 33 1 33 2 6666 2 66 999 2 66 2 2 777 2 66 77777 2 33 2 2 8 444 2 2 2 666 33 99999999 22222222222222222222222222222222222 88 11111111 3 44 999999999999999999 5555 3 3 555 000 5 66 2 2 2 33 2 2 6666666666 1 77777 5 2 33 77 2 1111 3 44 44 44 3 3 6 3 3 33 0000 7777 555 3 55 4 4
lowQualScore : . . . .... . . .... .. . ... .. . ... . . . . . . . ... . . . .. . .. ...... . . . . .. . . . .. ... .. .. . .. . .... . .. ... . .. . . ... . .. ..... . .. . . . ... . . . ... .. ........ ................................... .. ........ . .. .................. .... . . ... ... . .. . . . .. . . .......... . ..... . . .. .. . .... . .. .. .. . . . . . .. .... .... ... . .. . .
lowQualScore : 3 3 3 9999 5 5 9999 99 5 444 44 5 333 7 9 1 9 9 7 7 000 9 7 7 99 9 88 111111 7 7 7 9 99 9 9 7 88 000 88 99 5 99 9 1111 9 88 333 7 33 7 7 333 7 33 55555 7 77 7 7 0 777 7 7 7 111 99 66666666 00000000000000000000000000000000000 55 22222222 1 22 222222222222222222 0000 1 1 444 888 7 88 9 9 9 99 9 9 4444444444 5 11111 7 9 99 99 9 9999 1 22 22 22 1 3 7 3 3 88 4444 1111 888 6 55 0 4
consensus : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA---ATAACA-ACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A--C---AAACAA--TA--TTTA--T-CGTTT----T-T--AT---C-C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TTT--GTA----A--ACATT--AC-------------C-C---------------CCT--AA--------AACAG-A--A-----T---------G-AAAAA----TT-A-G---CCA---TGGT-AAA--GGA-CG-G-AA--A-ATTCAC-A----------ATTA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
Reference ( gi|61892 ) : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA---ATAACA-ACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A--C---AAACAA--TA--TTCA--T-CGTTT----T-T--AT---C-C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TTT--GTA----A--ACATT--A--------------C-C---------------CCT--AA--------AACAG-A--A-----T---------G-AAAAA----TT-A-G---CCA---TGGT-AAA--GGA-CG-G-AA--A-ATTCAC-A----------ATTA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61893 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA---ATAACA-ACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-T-CAAA--A---TCC-AA-C-A--AT-T-AC-A--C---AAACAA--TA--TTTA--T-CGTTT----T-T--AT---C-C--AA-ATT-C---A-TTG--A------CG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-CT-TTT--GT-----A--ACATT--A--------------C-C---------------CCT--AA--------AACAG-A--A-----T---------G--AAAA----TT-A-G---CCA---TTGT-AAA--GGA-CG-G-AA--A-ATTCAC-A----------ATTA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--TC-T-CCAC
gi|61891 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA---ATAACA-ACATA-TTTAA-TA-C-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TC-AAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A--C---AAACAA--TA--TTTA--T-CGTTT----T-T--AT---C-C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TTT--GT-----A--ACATT--AC-------------C-C---------------CCT--AA--------AACAG-A--A-----T---------G--AAAA----TT-T-T---CCA---TGGT-AAA--GGA-CG-G-AA--A-ATTCAC-A----------ATTA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61894 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-GAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA---ATAA-A-ACATA-TTTCA-TC-A-C-ACCT---A-T-AT-T--ATCT-TCCAAA------T-C-AA-C-A--AT-T-GC-A--C---AAACAA--TA--TTTA--T-CGTTT----T-T--AT---C-C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TTT--GT-----A--ACATT--A--------------CTC---------------CCT--AA--------AACAG-A--A-----T---------G--AAAA----TT-A-G---CCA---TGGT-AAA--GGA-CG-G-AA--A-ATTCAC-A----------ATTA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATA----T----GG---TA-TGA--TC-T-CCAC
gi|61895 : AAAAA-ATTA-A-GGATCAT----GATTTAACATA-T--A-ATT--ATAATTA---T--AA-CAA---ATAACA-ACATA-TTTCA-TCAA-C-AACT---A-T-AT-T--AT-T-TCAAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A--C---AAACAA--AA--TTTA--T-CGTTT----T-T--AT---C-C--AA-ATT-C---A-TCG--AGA---GCGATT--AAC-A-T-AC---AGGAACG-TAT-C---TT--GT-----A--ACATTACA--------------C-C---------------CCTAAAA--------AACAG-A--A-----T---------G---AAA----TT-ACG---CCA---TG---AAA--GGA-CG-G-AA--ACATTCACAA----------ATTA-----A-TCC--GT--TT-TAAC-AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AATGT-C-AA--ATG----T-----G---TA-TGAACCC-T-CCAC
gi|61896 : AACAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-ATTCCA-ATTTA---C--AA-CAAC--ATAACA-ACATA-TTTCA-TC---C-AACT---ATT-AT-C--ATCT-GTCAAA--A---T-C-AA-C-AAGAT-T-ACAA--C---AAACAA---A--TT-A--T-CGTTT----T-TGAAT-----C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TA--AAC-ATT-AC---A-GAAGG-CAT-CT-TTT--GTA----AC-ACGTT--ACCCCCCCCCCCACCC-C---------------CCT--AA--------AACAT----A-----T---------G---AAA----TT-A-G---CCA---TGGT-AAA---GA-CG-G-AA--A-ATTCAC-A----------A-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA------TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T-----G---TATTGA--CCAT-CCAC
gi|61897 : AAAAC-GTTA-A-GGATCATT---GATTT--CAAA-TTAA-TTTT-A-ATTTA---T--AA-CAA----TA-CACACATA-TTTCA-TC-AAC-AACT---A-T-ATCT--ATGT-TGAAAA--T---T-C-AA-C-A---T-T-AC-AA-C---AAAC----TA--TTTA--T-CGTTT----T-T--ATTATC-C--AA-TTTTC---A-TTG--A-AACTGCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C---TT--GT-----A--GCATT-----------------C-A---------------TCT---A--------AAC-G-A--A-----T---------G--TAAA----TT-A-G---CCA---TGGT-AAA--GG--CG-G-AA--A-ATTCAC-A----------AT-------A-T-C---T--GT-T----AACA-A---GA--TT--TG-ATG-AA-GTCC-AAT-ATG----T----GG---TA-TG
gi|61898 : AAAAA-GTTAGA-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTT--A-ATTTA---T--AT-CAAAAGATAA-A-GCATATTTTCATTC-ATC-AACT-----T-AT-TAAATCT-TCAATA--T---T-C-AA-C-A--ATAT-AC-A--C----AAC-A--TA--TTTA--T-CGCTT----TGT--AT---C-C--AA-ATT-C-----TTGA-A-A---GAG-TT--AAC-A-TCAC---A-G-AGG-CAT-TCATTT--GT--------ACATT--ACG------------C-C---------------CCT--AA--------AACAGAA--A-----T------------AAAA----TT-A-AGCCCCA---T-GT-AAAAGGGA-CA-G-AA--A-ATTCAC-A----------A-TA-----A-T-C--GTCCTT-T----AACA-A--TGA--TT------TG-AA-GT-----T-GTG----T----GG---
gi|61899 : AAAAATGTTA-AAGGATCGTAATGGATTTA-CAAAAT--A-ATT--A-TTTTA---T--AAACAA---ATAACA-GCATA-TTTAT-TC-A-CCAACT---A-T-CT------CT-TACAAA--GGATT-C-AAAC-A--AT-T-AC-AGTC---AAACAA--GA--TTTA--T-CGTTT----T-TT-AT---C-CC-AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-TAAC---A-GAAGACCAT-CCTTTT--GTA----G--ACATT--A--------------C-C---------------CCCTAAA--------AACAG-A--A-----T---------G-AAAAAATCCCT-A-G---CTAATTTGGTGAAA--GGA-CG-G-AA--A-ATTCAC-ACCAACCTACCATCG-----A-T-CGGGTAATT-A----AACA-AATCGA--CTTATG-ATG-AATGT-CTACC-ATGATGTT----GGTAATA-CAA--CC-T-CCA
gi|61900 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GAATTT-CAAA-T--A-ATA--C-ATTTA---TCAAA-CAA---ATAACA-ACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-TAAT-T--ATCT-TTCAAT--A---C-A-AA-CGA--AT-TAAC-A--C---AAACAA--TA--TTTATTT-CGTTT----T-T--AT---C-C--AA-ATC-CA--A-TTGAAA-A---GCG-TTAAAACAA-T-ACAGAA-GAAGG-CAT-C---TT--GT-----A--ACATT--A--------------C-CGCGAGGTACCGGTCTCCT--AAATGAAATTAACAG-A--AAGAGGTTTTTGGGGGG-AAAAAAAT-TT-A-G---CCA---TGGA-AAA--GGA-CG-G-------ATTCAC-GCC--------A-TA-----A-T-C--GT--TT-
gi|61901 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAACG-ATAAAG-ACA
gi|61902 : AACAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA---ATAA
gi|61903 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTC--A-ATTTA---T--AA-GA---------A-ACTTA-TTT-G-TT-A-TAAATT---A-A-AT-T--ATTTGT---AA--A---T-C-Agtttcttataaattgaattatttgtaaatca
gi|61904 : T----GATTT--CAAT-A--A-TTT--T-ATTTA---T--AA-CAA---ATACCA-A--TA-TTTC--TC-A-C-AA-T---A-T-AT-T--ATCT-T--AAACCA---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A--C---AAACA---TA--TTTA--T--GTTT----T-T--AT---T-C--AT-ATT-C---A-TTG--A-----GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TTTTTGTA----AGTACAT------------------C-C---------------CCT--AA--------AACAG-A--A-----T---------G-AAA------TT-A-G---CCA---TGGT-AAA--GGA-CG-GGAA--A-ATTAAC-A----------ATTA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--AT--TT-ATG-AG-GT-C-AA--ATT----T----GG---TA-TGA--CC-TACCAC
gi|61903 : T----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA---ATAA
gi|61905 : aaaaagttaaggatcatgatttacaaataattcaatttataagaaacA-CAAA-A--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA---ATAACA-ACATA-TTTCA-TC-A-C--ACT---A-TAAT-T--ATAT-T-CAAA--A---T-CAAA-C-A--AT-T-ACAA--C---AAACAAG-TA--CTTA--T-CGTTT----T-T--AT---T-CCAAA-ATT-C---ACTTG--A-A---GCC-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TTT--ATGT---A--ACATT--A--------------C-CCGA------------CCT--AA--------AACAG-A--A-----T---------G-AAAACT---TT-A-G----CA---TGGT-AAAG-GGA-CG-A-GA--A-ATTCAC-A----------ATTA-----ATT-C--GT--AT-TGTAAAATACA--TCG--TT--TG-ATGAAA-GT-C-AATAATGT---T----GG---TA-TGA--CC-T-CCA
gi|61906 : -CAAA-T--AATTT--A-ATTTAATAT--AA-CAA---ATAACA-ACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TC-AAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-TC-A--C---AAACAA--TA--TTTA--T-CGTTT----T-T--AT---C-C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GTG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TTT--GTA----A---CATT--AC-------------C-C---------------CCT--AA--------AACAG-A--A-----A---------G--AAAG----TT-A-G---CCA---TGGT-AAA--GGA-TG-A-AA--A-ATTCAC-A----------ATTA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61907 : TTCA-T--A-G-AACTTTAA-C-ATAT--ATCT-TCAAAA--A---T-C-AAAC-A--AT-T-AC-A--CTTCGAACAAGGTAGTTTGA--TGTGTTTATATT-T--ATACTCGC--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCC-GT--AAC-A-TAAC---A-G-AGG-CAT-C--TT
gi|61908 : CAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A--C---AAACAA--TA--TT--------------------AT---C-T--AA-ATC-C---A-TTG--A-A---ATG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TTT--GT-----A--ACATatgagctaactcaattttactccctcgtcataacaactacagtagtgtgagaatattctttaattctatcagacactggcgattgaaaggacgcgaagaaattcaccattaattcgtttatacaatcagttg
gi|61909 : T---C-C--AAGATT-CTATG-TTG--AGA---GCG-GT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CACACA-TTG--GTATTGTA--ACATT--AC-------------C-C---------------CCT--AA--------AACAG-ATTA-----T---------GAAAAAA----TTGA-G---CCATGTTGGTAAAA--GGAGCG-G-----A-ATTCAC-A----------ATTAAATCGA-T-T--GT--TTAT----AGTA-C--TGAGTTT--TGTATG-AA-GT-C-AAT-ATG----CTGTGGG---TG-TGA--TC-
gi|61907 : -AAA--GGA-CGCG-AAGAA-ATTCAC-C----------ATTA-----ATT-C--GT--TT-A----TACA-A--TCA--GT--TG-
Alignments
lowQualScore : 1111 11 111 111 22222 3333333333333333333333333333 11111111 33333333333333333333333333333333333333333 111 11111 1111111111 1111
lowQualScore : 3 3 3 8888 2 2 4444 55 2 444 33 2 55 444 2 2 2 2 5 5 444 2 5 5 33 2 44 666666 2 5 2 2 33 2 2 5 111 66 2 2 33 2 5555 2 66 666 444 55 2 2 666 2 55 66666 2 33 2 2 7 444 2 2 2 888 2 444 66666 55 5555555555555555555555555555 33 777777 66 22222222 777777 33 00000000000000000000000000000000000000000 2 2 444 222 22222 66 2 2 2 33 2 2 1111111111 2 66666 5 2 33 77 2 1111 2 33 33 33 2 3 6 3 3 3 9999 6666 555 3 55 3 4
lowQualScore : . . . .... . . .... .. . ... .. . .. ... . . . . . . ... . . . .. . .. ...... . . . . .. . . . ... .. . . .. . .... . .. ... ... .. . . ... . .. ..... . .. . . . ... . . . ... . ... ..... .. ............................ .. ...... .. ........ ...... .. ......................................... . . ... ... ..... .. . . . .. . . .......... . ..... . . .. .. . .... . .. .. .. . . . . . . .... .... ... . .. . .
lowQualScore : 1 1 1 9999 5 5 4444 99 5 444 44 5 99 444 5 7 7 7 3 3 777 7 3 3 77 7 44 111111 5 0 7 7 77 7 7 3 000 33 7 7 77 7 7777 7 33 999 444 99 5 5 999 5 99 55555 5 44 5 5 5 444 5 5 5 000 5 444 55555 99 7777777777777777777777777777 77 777777 33 33333333 777777 77 33333333333333333333333333333333333333333 7 7 777 000 00000 33 7 7 7 77 7 7 7777777777 7 77777 3 7 77 33 7 1111 9 99 99 99 9 1 2 1 1 1 6666 5555 444 3 00 6 0
consensus : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
Reference ( family-781 ) : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61891 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-AAT-A-C-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TC-AAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---T-----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G---AAA--------------A----TT-T-T---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61892 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTC-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA----------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61893 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-T-CAAA--A---TCC-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A------CG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-CT-TT-TG---T-----A--ACATTA----------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G---AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TTGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--TC-T-CCAC
gi|61894 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-GAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-A-AACATATTT-CAT-C-A-C-ACCT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA------T-C-AA-C-A--AT-T-GC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A---CATTA-------------C--------------TC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA-------------------TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATA----T----GG---TA-TGA--TC-T-CCAC
gi|61895 : AAAAA-ATTA-A-GGATCAT----GATTTAACATA-T--A-ATT--ATAATTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-CAA-C-AACT---A-T-AT-TA--T-T-TCAAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--AA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TCG--AGA---GCGATT--AAC-A-T-AC---AGGAACG-TAT-C---T-TG---T-----A--ACATTA-------------CA-------------CC--CC------TAAAA--------AAC------AGA--A-----T---------G----AA--------------A----TT-ACG---CCA---TG-------AAA--GGA-C-G-GA--AACATTCACAA----------AT-TA-----A-TCC--GT--TT-TAAC-AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AATGT-C-AA--ATG----T-----G---TA-TGAACCC-T-CCAC
gi|61896 : AACAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-ATTCCA-ATTTA---C--AA-CAAC-A---TA-ACAACATATTT-CAT-C---C-AACT---ATT-AT-CA--TCT-GTCAAA--A---T-C-AA-C-AAGAT-T-ACAA---CAAACAA---A--TT-A--T-CGTT----TT-TGAAT-------C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TA--AAC-ATT-AC---A-GAAGG-CAT-CT-TT-TG---TA----AC-ACGTTACCCCCCCCCCCACC--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AT---A-----T---------G----AA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA---GA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------A--TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA------TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T-----G---TATTGA--CCAT-CCAC
gi|61897 : AAAAC-GTTA-A-GGATCATT---GATTT--CAAA-TTAA-TTTT-A-ATTTA---T--AA-CAA------TACACA-CATATTT-CAT-C-AAC-AACT---A-T-ATCTA--TGT-TGAAAA--T---T-C-AA-C-A---T-T-AC-AA--CAAAC----TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--ATTATC---C--AA-TTTTC---A-TTG--A-AACTGCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C---T-TG---T-----A--GCATT-----------------------------CA--TC------T---A--------AAC-------GA--A-----T---------G---TAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GG--C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT--------A-T-C---T--GT-T----AACA-A---GA--TT--TG-ATG-AA-GTCC-AAT-ATG----T----GG---TA-TG
gi|61898 : AAAAA-GTTAGA-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AT-CAA--AAGATA-A-AGCATATTTTCATTC-ATC-AACT-----T-AT-TAAATCT-TCAATA--T---T-C-AA-C-A--ATAT-AC-A---CAA-CA---TA-TTT-A--T-CGCT----TTGT--AT---C---C--AA-ATT-C-----TTGA-A-A---GAG-TT--AAC-A-TCAC---A-G-AGG-CAT-TCATT-TG---T--------ACATTA-------------CG-------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----------------ATAAA--------------A----TT-A-AGCCCCA---T-GT-----AAAAGGGA-C-A-GA--AA-ATTCAC-A----------A--TA-----A-T-C--GTCCTT-T----AACA-A--TGA--TT------TG-AA-GT-----T-GTG----T----GG---
gi|61899 : AAAAATGTTA-AAGGATCGTAATGGATTTA-CAAAAT--A-ATT--A-TTTTA---T--AAACAA--A---TA-ACAGCATATTT-ATT-C-A-CCAACT---A-T-CT------CT-TACAAA--GGATT-C-AAAC-A--AT-T-AC-AGT-CAAACAA--GA-TTT-A--T-CGTT----TT-TT-AT---C---CC-AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-TAAC---A-GAAGACCAT-CCTTT-TG---TA----G--ACATTA-------------C--------------CC--CC------TA-AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------AATCCCT-A-G---CTAATTTGGTG----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-ACCAACCTACCAT-CG-----A-T-CGGGTAATT-A----AACA-AATCGA--CTTATG-ATG-AATGT-CTACC-ATGATGTT----GGTAATA-CAA--CC-T-CCA
gi|61900 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GAATTT-CAAA-T--A-ATA--C-ATTTA---TCAAA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-TAAT-TA--TCT-TTCAAT--A---C-A-AA-CGA--AT-TAAC-A---CAAACAA--TA-TTT-ATTT-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATC-CA--A-TTGAAA-A---GCG-TTAAAACAA-T-ACAGAA-GAAGG-CAT-C---T-TG---T-----A--ACATTA-------------CCGCGAGGTACCGGTCT--CC------T--AAATGAAATTAAC------AGA--AAGAGGTTTTTGGGGGG-A-AAA--------------AAAT-TT-A-G---CCA---TGGA-----AAA--GGA-C-G-G------ATTCAC-G----------CCATA-----A-T-C--GT--TT-
gi|61901 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAACGA---TA-AAGACA
gi|61902 : AACAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-A
gi|61903 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTC--A-ATTTA---T--AA-GA------------AACTTATTT--GT-T-A-TAAATT---A-A-AT-TA--TTTGT---AA--A---T-C-Agtttcttataaattgaattatttgtaaatca
gi|61904 : T----GATTT--CAAT-A--A-TTT--T-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-CCAA--TATTT-C-T-C-A-C-AA-T---A-T-AT-TA--TCT-T--AAACCA---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACA---TA-TTT-A--T--GTT----TT-T--AT---T---C--AT-ATT-C---A-TTG--A-----GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-CTTTT-TG---TA----AGTACAT------------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G----AA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-CGG-GA--AA-ATTAAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--AT--TT-ATG-AG-GT-C-AA--ATT----T----GG---TA-TGA--CC-TACCAC
gi|61905 : A-CAAA-A--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C--ACT---A-TAAT-TA--TAT-T-CAAA--A---T-CAAA-C-A--AT-T-ACAA---CAAACAAG-TA-CTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---T---CCAAA-ATT-C---ACTTG--A-A---GCC-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TA---TGT---A--ACATTA-------------C--------------CCGACC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------CT---TT-A-G----CA---TGGT-----AAAG-GGA-C-G-AG--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----ATT-C--GT--AT-TGTAAAATACA--TCG--TT--TG-ATGAAA-GT-C-AATAATGT---T----GG---TA-TGA--CC-T-CCA
gi|61906 : -CAAA-T--AATTT--A-ATTTAATAT--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TC-AAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-TC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GTG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A---CATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----A---------G-A-AAG-------------------TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-T-G-AA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61907 : TT-CAT---A-G-AACTTTAA-C-ATATA--TCT-TCAAAA--A---T-CAAA-C-A--AT-T-AC-ACTTCGAACAAGGTAGTTTGA--TGTGTTTATATT-T--ATA--CTCGC--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCC-GT--AAC-A-TAAC---A-G-AGG-CAT-C--TTATGAGCTAACTCA--ATTTTA-------------C--------------TC--CCTCGTCAT--AAC-------AACTACAGTAGT--G-----T---------G-A-GAATATTCTTTAATTCTA----TC-A-G---ACAC--TGGCGATTGAAA--GGA-C-GCGAAGAA-ATTCAC-C----------AT-TA-----ATT-C--GT--TT-A----TACA-A--TCA--GT--TG-
gi|61908 : CAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TT---------------------AT---C---T--AA-ATC-C---A-TTG--A-A---ATG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---T-----A--ACAT
gi|61909 : T---C---C--AAGATT-CTATG-TTG--AGA---GCG-GT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CACACA-TT-GG---TATTGTA--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGATTA-----T---------GAA-AAA--------------A----TTGA-G---CCATGTTGGTA----AAA--GGAGC-G-G----A-ATTCAC-A----------AT-TAAATCGA-T-T--GT--TTAT----AGTA-C--TGAGTTT--TGTATG-AA-GT-C-AAT-ATG----CTGTGGG---TG-TGA--TC-
Alignments
lowQualScore : 1111 11 111 111 22222 3333333333333333333333333333 11111111 33333333333333333333333333333333333333333 111 11111 1111111111 1111
lowQualScore : 3 3 3 8888 2 2 4444 55 2 444 33 2 55 444 2 2 2 2 5 5 444 2 5 5 33 2 44 666666 2 5 2 2 33 2 2 5 111 66 2 2 33 2 5555 2 66 666 444 55 2 2 666 2 55 66666 2 33 2 2 7 444 2 2 2 888 2 444 66666 55 5555555555555555555555555555 33 777777 66 22222222 777777 33 00000000000000000000000000000000000000000 2 2 444 222 22222 66 2 2 2 33 2 2 1111111111 2 66666 5 2 33 77 2 1111 2 33 33 33 2 3 6 3 3 3 9999 6666 555 3 55 3 4
lowQualScore : . . . .... . . .... .. . ... .. . .. ... . . . . . . ... . . . .. . .. ...... . . . . .. . . . ... .. . . .. . .... . .. ... ... .. . . ... . .. ..... . .. . . . ... . . . ... . ... ..... .. ............................ .. ...... .. ........ ...... .. ......................................... . . ... ... ..... .. . . . .. . . .......... . ..... . . .. .. . .... . .. .. .. . . . . . . .... .... ... . .. . .
lowQualScore : 1 1 1 9999 5 5 4444 99 5 444 44 5 99 444 5 7 7 7 3 3 777 7 3 3 77 7 44 111111 5 0 7 7 77 7 7 3 000 33 7 7 77 7 7777 7 33 999 444 99 5 5 999 5 99 55555 5 44 5 5 5 444 5 5 5 000 5 444 55555 99 7777777777777777777777777777 77 777777 33 33333333 777777 77 33333333333333333333333333333333333333333 7 7 777 000 00000 33 7 7 7 77 7 7 7777777777 7 77777 3 7 77 33 7 1111 9 99 99 99 9 1 2 1 1 1 6666 5555 444 3 00 6 0
consensus : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
Reference ( family-781 ) : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61891 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-AAT-A-C-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TC-AAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---T-----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G---AAA--------------A----TT-T-T---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61892 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTC-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA----------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61893 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-T-CAAA--A---TCC-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A------CG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-CT-TT-TG---T-----A--ACATTA----------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G---AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TTGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--TC-T-CCAC
gi|61894 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-GAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-A-AACATATTT-CAT-C-A-C-ACCT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA------T-C-AA-C-A--AT-T-GC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A---CATTA-------------C--------------TC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA-------------------TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATA----T----GG---TA-TGA--TC-T-CCAC
gi|61895 : AAAAA-ATTA-A-GGATCAT----GATTTAACATA-T--A-ATT--ATAATTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-CAA-C-AACT---A-T-AT-TA--T-T-TCAAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--AA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TCG--AGA---GCGATT--AAC-A-T-AC---AGGAACG-TAT-C---T-TG---T-----A--ACATTA-------------CA-------------CC--CC------TAAAA--------AAC------AGA--A-----T---------G----AA--------------A----TT-ACG---CCA---TG-------AAA--GGA-C-G-GA--AACATTCACAA----------AT-TA-----A-TCC--GT--TT-TAAC-AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AATGT-C-AA--ATG----T-----G---TA-TGAACCC-T-CCAC
gi|61896 : AACAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-ATTCCA-ATTTA---C--AA-CAAC-A---TA-ACAACATATTT-CAT-C---C-AACT---ATT-AT-CA--TCT-GTCAAA--A---T-C-AA-C-AAGAT-T-ACAA---CAAACAA---A--TT-A--T-CGTT----TT-TGAAT-------C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TA--AAC-ATT-AC---A-GAAGG-CAT-CT-TT-TG---TA----AC-ACGTTACCCCCCCCCCCACC--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AT---A-----T---------G----AA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA---GA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------A--TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA------TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T-----G---TATTGA--CCAT-CCAC
gi|61897 : AAAAC-GTTA-A-GGATCATT---GATTT--CAAA-TTAA-TTTT-A-ATTTA---T--AA-CAA------TACACA-CATATTT-CAT-C-AAC-AACT---A-T-ATCTA--TGT-TGAAAA--T---T-C-AA-C-A---T-T-AC-AA--CAAAC----TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--ATTATC---C--AA-TTTTC---A-TTG--A-AACTGCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C---T-TG---T-----A--GCATT-----------------------------CA--TC------T---A--------AAC-------GA--A-----T---------G---TAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GG--C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT--------A-T-C---T--GT-T----AACA-A---GA--TT--TG-ATG-AA-GTCC-AAT-ATG----T----GG---TA-TG
gi|61898 : AAAAA-GTTAGA-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--AATTT--A-ATTTA---T--AT-CAA--AAGATA-A-AGCATATTTTCATTC-ATC-AACT-----T-AT-TAAATCT-TCAATA--T---T-C-AA-C-A--ATAT-AC-A---CAA-CA---TA-TTT-A--T-CGCT----TTGT--AT---C---C--AA-ATT-C-----TTGA-A-A---GAG-TT--AAC-A-TCAC---A-G-AGG-CAT-TCATT-TG---T--------ACATTA-------------CG-------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----------------ATAAA--------------A----TT-A-AGCCCCA---T-GT-----AAAAGGGA-C-A-GA--AA-ATTCAC-A----------A--TA-----A-T-C--GTCCTT-T----AACA-A--TGA--TT------TG-AA-GT-----T-GTG----T----GG---
gi|61899 : AAAAATGTTA-AAGGATCGTAATGGATTTA-CAAAAT--A-ATT--A-TTTTA---T--AAACAA--A---TA-ACAGCATATTT-ATT-C-A-CCAACT---A-T-CT------CT-TACAAA--GGATT-C-AAAC-A--AT-T-AC-AGT-CAAACAA--GA-TTT-A--T-CGTT----TT-TT-AT---C---CC-AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-TAAC---A-GAAGACCAT-CCTTT-TG---TA----G--ACATTA-------------C--------------CC--CC------TA-AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------AATCCCT-A-G---CTAATTTGGTG----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-ACCAACCTACCAT-CG-----A-T-CGGGTAATT-A----AACA-AATCGA--CTTATG-ATG-AATGT-CTACC-ATGATGTT----GGTAATA-CAA--CC-T-CCA
gi|61900 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GAATTT-CAAA-T--A-ATA--C-ATTTA---TCAAA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-TAAT-TA--TCT-TTCAAT--A---C-A-AA-CGA--AT-TAAC-A---CAAACAA--TA-TTT-ATTT-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATC-CA--A-TTGAAA-A---GCG-TTAAAACAA-T-ACAGAA-GAAGG-CAT-C---T-TG---T-----A--ACATTA-------------CCGCGAGGTACCGGTCT--CC------T--AAATGAAATTAAC------AGA--AAGAGGTTTTTGGGGGG-A-AAA--------------AAAT-TT-A-G---CCA---TGGA-----AAA--GGA-C-G-G------ATTCAC-G----------CCATA-----A-T-C--GT--TT-
gi|61901 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAACGA---TA-AAGACA
gi|61902 : AACAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-A
gi|61903 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TA-A-TTC--A-ATTTA---T--AA-GA------------AACTTATTT--GT-T-A-TAAATT---A-A-AT-TA--TTTGT---AA--A---T-C-Agtttcttataaattgaattatttgtaaatca
gi|61904 : T----GATTT--CAAT-A--A-TTT--T-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-CCAA--TATTT-C-T-C-A-C-AA-T---A-T-AT-TA--TCT-T--AAACCA---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACA---TA-TTT-A--T--GTT----TT-T--AT---T---C--AT-ATT-C---A-TTG--A-----GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-CTTTT-TG---TA----AGTACAT------------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G----AA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-CGG-GA--AA-ATTAAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--AT--TT-ATG-AG-GT-C-AA--ATT----T----GG---TA-TGA--CC-TACCAC
gi|61905 : A-CAAA-A--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C--ACT---A-TAAT-TA--TAT-T-CAAA--A---T-CAAA-C-A--AT-T-ACAA---CAAACAAG-TA-CTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---T---CCAAA-ATT-C---ACTTG--A-A---GCC-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TA---TGT---A--ACATTA-------------C--------------CCGACC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------CT---TT-A-G----CA---TGGT-----AAAG-GGA-C-G-AG--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----ATT-C--GT--AT-TGTAAAATACA--TCG--TT--TG-ATGAAA-GT-C-AATAATGT---T----GG---TA-TGA--CC-T-CCA
gi|61906 : -CAAA-T--AATTT--A-ATTTAATAT--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TC-AAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-TC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GTG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A---CATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----A---------G-A-AAG-------------------TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-T-G-AA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61907 : TT-CAT---A-G-AACTTTAA-C-ATATA--TCT-TCAAAA--A---T-CAAA-C-A--AT-T-AC-ACTTCGAACAAGGTAGTTTGA--TGTGTTTATATT-T--ATA--CTCGC--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCC-GT--AAC-A-TAAC---A-G-AGG-CAT-C--TTATGAGCTAACTCA--ATTTTA-------------C--------------TC--CCTCGTCAT--AAC-------AACTACAGTAGT--G-----T---------G-A-GAATATTCTTTAATTCTA----TC-A-G---ACAC--TGGCGATTGAAA--GGA-C-GCGAAGAA-ATTCAC-C----------AT-TA-----ATT-C--GT--TT-A----TACA-A--TCA--GT--TG-
gi|61908 : CAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TT---------------------AT---C---T--AA-ATC-C---A-TTG--A-A---ATG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---T-----A--ACAT
gi|61909 : T---C---C--AAGATT-CTATG-TTG--AGA---GCG-GT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CACACA-TT-GG---TATTGTA--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGATTA-----T---------GAA-AAA--------------A----TTGA-G---CCATGTTGGTA----AAA--GGAGC-G-G----A-ATTCAC-A----------AT-TAAATCGA-T-T--GT--TTAT----AGTA-C--TGAGTTT--TGTATG-AA-GT-C-AAT-ATG----CTGTGGG---TG-TGA--TC-
blockSeqs : T G A AATG A A TAA CC T ATA CA A CG AGA C T T A A C TTA T A C AA G CC GGAT C A A G AG A A A CTT GG G G TT G TATA G GA TAT TCG CA G T TAT C AA AACT A AA A T C AGA G C A CAT A AGC AACTC GT CCGCGAGGTACCGGT GA TCGTCA AA ATGAAATT TACAGT TT AGAGGTTTTTGGGGGGAAAAAAAT G C GCC ATT GATTG AG G G C AG C A CCAACCTACC A AATCG T C GG CC A GTAA C AT GT TA T A T C T A ATGT TGTG TAA T AC A A
blockSeqs : . . . T . . AA T . . . . C . . . . . T A . . A A . . CC CCA . A . . . . . A GT G . . . . . . T A . C . . A . A GA . . . . A . . . . CTT . . ATTGT C CCCCCCCCCCCACC . . A C . . TGAGAATATTCTTTAATTCTA . . . TGT G G . . . . . . . . . T . . AA . AAC . . . . . . T . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . A . . . . TTT . . GT . CA . . . . . . TGAAAAAATCC . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . TT . . A . CG . . . . . . TGAAAACT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . TT . . A . C . . . . . . TGAAAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . AT . . A . C . . . . . . TGAAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . A . C . . . . . . TGAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . A . C . . . . . . TGAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . A . C . . . . . . TGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . ATAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . AGAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . TGAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : AA** CC
originalCons : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T--A-TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
finalCons : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-TAA--TTT--A-ATTTA---T--AA-CAA--A---TA-ACAACATATTT-CAT-C-A-C-AACT---A-T-AT-TA--TCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
Alignments
lowQualScore : 111 11 111 111 22222 3333333333333333333333333333 11111111 33333333333333333333333333333333333333333 111 11111 1111111111 1111
lowQualScore : 3 3 3 8888 2 2 2 5 2 2 444 33 2 000 2 2 2 2 5 5 444 2 5 5 33 2 44 666666 2 5 2 2 33 2 2 5 111 66 2 2 33 2 5555 2 66 666 444 55 2 2 666 2 55 66666 2 33 2 2 7 444 2 2 2 888 2 444 66666 55 5555555555555555555555555555 33 777777 66 22222222 777777 33 00000000000000000000000000000000000000000 2 2 444 222 22222 66 2 2 2 33 2 2 1111111111 2 66666 5 2 33 77 2 1111 2 33 33 33 2 3 6 3 3 3 9999 6666 555 3 55 3 4
lowQualScore : . . . .... . . . . . . ... .. . ... . . . . . . ... . . . .. . .. ...... . . . . .. . . . ... .. . . .. . .... . .. ... ... .. . . ... . .. ..... . .. . . . ... . . . ... . ... ..... .. ............................ .. ...... .. ........ ...... .. ......................................... . . ... ... ..... .. . . . .. . . .......... . ..... . . .. .. . .... . .. .. .. . . . . . . .... .... ... . .. . .
lowQualScore : 1 1 1 9999 5 5 5 0 5 5 444 44 5 333 5 9 7 7 3 3 777 7 3 3 77 7 44 111111 5 0 7 7 77 7 7 3 000 33 7 7 77 7 7777 7 33 999 444 99 5 5 999 5 99 55555 5 44 5 5 5 444 5 5 5 000 5 444 55555 99 7777777777777777777777777777 77 777777 33 33333333 777777 77 33333333333333333333333333333333333333333 7 7 777 000 00000 33 7 7 7 77 7 7 7777777777 7 77777 3 7 77 33 7 1111 9 99 99 99 9 1 2 1 1 1 6666 5555 444 3 00 6 0
consensus : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATT-T-A-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
Reference ( family-781 ) : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATT-T-A-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61891 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATT-T-A-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTAA-TA-C-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TC-AAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---T-----A--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G---AAA--------------A----TT-T-T---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61892 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-A-TT-T-A-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TCCAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTC-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A--ACATTA----------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61893 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATT-T-A-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-T-CAAA--A---TCC-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A------CG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-CT-TT-TG---T-----A--ACATTA----------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G---AAA--------------A----TT-A-G---CCA---TTGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--TC-T-CCAC
gi|61894 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-GAAA-T-AATT-T-A-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-A-AACATA-TTTCA-TC-A-C-ACCT---A-T-AT-T--ATCT-TCCAAA------T-C-AA-C-A--AT-T-GC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A---CATTA-------------C--------------TC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA-------------------TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATA----T----GG---TA-TGA--TC-T-CCAC
gi|61895 : AAAAA-ATTA-A-GGATCAT----GATTTAACATA-T-AATTAT-A-ATT-A---T--AA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTCA-TCAA-C-AACT---A-T-AT-T--AT-T-TCAAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--AA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TCG--AGA---GCGATT--AAC-A-T-AC---AGGAACG-TAT-C---T-TG---T-----A--ACATTA-------------CA-------------CC--CC------TAAAA--------AAC------AGA--A-----T---------G----AA--------------A----TT-ACG---CCA---TG-------AAA--GGA-C-G-GA--AACATTCACAA----------AT-TA-----A-TCC--GT--TT-TAAC-AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AATGT-C-AA--ATG----T-----G---TA-TGAACCC-T-CCAC
gi|61896 : AACAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATTCC-A-ATTTA---C--AA-CAAC--ATA-ACAACATA-TTTCA-TC---C-AACT---ATT-AT-C--ATCT-GTCAAA--A---T-C-AA-C-AAGAT-T-ACAA---CAAACAA---A--TT-A--T-CGTT----TT-TGAAT-------C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TA--AAC-ATT-AC---A-GAAGG-CAT-CT-TT-TG---TA----AC-ACGTTACCCCCCCCCCCACC--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AT---A-----T---------G----AA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA---GA-C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------A--TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA------TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T-----G---TATTGA--CCAT-CCAC
gi|61897 : AAAAC-GTTA-A-GGATCATT---GATTT--CAAA-TTAATT-TTA-ATTTA---T--AA-CAA----TACACA-CATA-TTTCA-TC-AAC-AACT---A-T-ATCT--ATGT-TGAAAA--T---T-C-AA-C-A---T-T-AC-AA--CAAAC----TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--ATTATC---C--AA-TTTTC---A-TTG--A-AACTGCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C---T-TG---T-----A--GCATT-----------------------------CA--TC------T---A--------AAC-------GA--A-----T---------G---TAA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GG--C-G-GA--AA-ATTCAC-A----------AT--------A-T-C---T--GT-T----AACA-A---GA--TT--TG-ATG-AA-GTCC-AAT-ATG----T----GG---TA-TG
gi|61898 : AAAAA-GTTAGA-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATT-T-A-ATTTA---T--AT-CAAAAGATA-A-AGCATATTTTCATTC-ATC-AACT-----T-AT-TAAATCT-TCAATA--T---T-C-AA-C-A--ATAT-AC-A---C-AAC-A--TA-TTT-A--T-CGCT----TTGT--AT---C---C--AA-ATT-C-----TTGA-A-A---GAG-TT--AAC-A-TCAC---A-G-AGG-CAT-TCATT-TG---T--------ACATTA-------------CG-------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----------------ATAAA--------------A----TT-A-AGCCCCA---T-GT-----AAAAGGGA-C-A-GA--AA-ATTCAC-A----------A--TA-----A-T-C--GTCCTT-T----AACA-A--TGA--TT------TG-AA-GT-----T-GTG----T----GG---
gi|61899 : AAAAATGTTA-AAGGATCGTAATGGATTTA-CAAAAT-AATT---A-TTTTA---T--AAACAA---ATA-ACAGCATA-TTTAT-TC-A-CCAACT---A-T-CT------CT-TACAAA--GGATT-C-AAAC-A--AT-T-AC-AGT-CAAACAA--GA-TTT-A--T-CGTT----TT-TT-AT---C---CC-AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCG-TT--AAC-A-TAAC---A-GAAGACCAT-CCTTT-TG---TA----G--ACATTA-------------C--------------CC--CC------TA-AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------AATCCCT-A-G---CTAATTTGGTG----AAA--GGA-C-G-GA--AA-ATTCAC-ACCAACCTACCAT-CG-----A-T-CGGGTAATT-A----AACA-AATCGA--CTTATG-ATG-AATGT-CTACC-ATGATGTT----GGTAATA-CAA--CC-T-CCA
gi|61900 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GAATTT-CAAA-T-AAT----ACATTTA---TCAAA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-TAAT-T--ATCT-TTCAAT--A---C-A-AA-CGA--AT-TAAC-A---CAAACAA--TA-TTT-ATTT-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATC-CA--A-TTGAAA-A---GCG-TTAAAACAA-T-ACAGAA-GAAGG-CAT-C---T-TG---T-----A--ACATTA-------------CCGCGAGGTACCGGTCT--CC------T--AAATGAAATTAAC------AGA--AAGAGGTTTTTGGGGGG-A-AAA--------------AAAT-TT-A-G---CCA---TGGA-----AAA--GGA-C-G-G------ATTCAC-G----------CCATA-----A-T-C--GT--TT-
gi|61901 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATT-T-A-ATTTA---T--AA-CAACG-ATA-AAGACA
gi|61902 : AACAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATT-T-A-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-A
gi|61903 : AAAAA-GTTA-A-GGATCAT----GATTTA-CAAA-T-AATT-C-A-ATTTA---T--AA-GA----------AACTTA-TTT-G-TT-A-TAAATT---A-A-AT-T--ATTTGT---AA--A---T-C-Agtttcttataaattgaattatttgtaaatca
gi|61904 : T----GATTT--CAA--T-AATT-T-T-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-CCAA--TA-TTTC--TC-A-C-AA-T---A-T-AT-T--ATCT-T--AAACCA---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACA---TA-TTT-A--T--GTT----TT-T--AT---T---C--AT-ATT-C---A-TTG--A-----GCG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-CTTTT-TG---TA----AGTACAT------------------------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G----AA--------------A----TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-CGG-GA--AA-ATTAAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--AT--TT-ATG-AG-GT-C-AA--ATT----T----GG---TA-TGA--CC-TACCAC
gi|61905 : A-CAAA---AATT-T-A-ATTTA---T--AA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTCA-TC-A-C--ACT---A-TAAT-T--ATAT-T-CAAA--A---T-CAAA-C-A--AT-T-ACAA---CAAACAAG-TA-CTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---T---CCAAA-ATT-C---ACTTG--A-A---GCC-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TA---TGT---A--ACATTA-------------C--------------CCGACC------T--AA--------AAC------AGA--A-----T---------G-A-AAA--------------CT---TT-A-G----CA---TGGT-----AAAG-GGA-C-G-AG--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----ATT-C--GT--AT-TGTAAAATACA--TCG--TT--TG-ATGAAA-GT-C-AATAATGT---T----GG---TA-TGA--CC-T-CCA
gi|61906 : -CAAA-T-AATT-T-A-ATTTAATAT--AA-CAA---ATA-ACAACATA-TTTCA-TC-A-C-AACT---A-T-AT-T--ATCT-TC-AAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-TC-A---CAAACAA--TA-TTT-A--T-CGTT----TT-T--AT---C---C--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GTG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---TA----A---CATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGA--A-----A---------G-A-AAG-------------------TT-A-G---CCA---TGGT-----AAA--GGA-T-G-AA--AA-ATTCAC-A----------AT-TA-----A-T-C--GT--TT-T----AACA-A--TGA--TT--TG-ATG-AA-GT-C-AAT-ATG----T----GG---TA-TGA--CC-T-CCAC
gi|61907 : TTCA-T--A-G-AACTTTAA-C-ATAT--ATCT-TCAAAA--A---T-CAAA-C-A--AT-T-AC-ACTTCGAACAAGGTAGTTTGA--TGTGTTTATATT-T--ATA--CTCGC--AA-ATT-C---A-TTG--A-A---GCC-GT--AAC-A-TAAC---A-G-AGG-CAT-C--TTATGAGCTAACTCA--ATTTTA-------------C--------------TC--CCTCGTCAT--AAC-------AACTACAGTAGT--G-----T---------G-A-GAATATTCTTTAATTCTA----TC-A-G---ACAC--TGGCGATTGAAA--GGA-C-GCGAAGAA-ATTCAC-C----------AT-TA-----ATT-C--GT--TT-A----TACA-A--TCA--GT--TG-
gi|61908 : CAAA--A---T-C-AA-C-A--AT-T-AC-A---CAAACAA--TA-TT---------------------AT---C---T--AA-ATC-C---A-TTG--A-A---ATG-TT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CAT-C--TT-TG---T-----A--ACAT
gi|61909 : T---C---C--AAGATT-CTATG-TTG--AGA---GCG-GT--AAC-A-T-AC---A-GAAGG-CACACA-TT-GG---TATTGTA--ACATTA-------------C--------------CC--CC------T--AA--------AAC------AGATTA-----T---------GAA-AAA--------------A----TTGA-G---CCATGTTGGTA----AAA--GGAGC-G-G----A-ATTCAC-A----------AT-TAAATCGA-T-T--GT--TTAT----AGTA-C--TGAGTTT--TGTATG-AA-GT-C-AAT-ATG----CTGTGGG---TG-TGA--TC-