lowQualScore                  :                                                                                                     2                                                                                             
lowQualScore                  :      44  11111   000    222 0 2222 1 0 11  0  2222  00 0     0 00     0  00  0 66  0 00     777777  3 0 0    0   0     0            666       0    0      0  0         22   0  0  0               
lowQualScore                  :      ..  .....   ...    ... . .... . . ..  .  ....  .. .     . ..     .  ..  . ..  . ..     ......  . . .    .   .     .            ...       .    .      .  .         ..   .  .  .               
lowQualScore                  :      88  11111   888    222 4 2222 2 4 00  4  5555  66 4     4 66     4  66  4 11  4 66     000000  7 4 4    4   8     4            999       4    4      8  4         00   9  9  9               
consensus                     :  AATT--AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
Reference ( gi|31902 )        :  AATT--AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-CTG-C--TACATA-----AAAT-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-A-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31901                      :  AATTG-AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--TA-TA----AG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----GA-T-A-TTGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31865                      :  AATTTGAG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--AA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GG--AT-A-TTG-C--TACATA-----AG-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGGGAAGCT-G-AAATCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTaatg
gi|31904                      : tAATT--AGTTGAAAGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--A-AGATG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGAG-AAG-TTGAC-GATGAAGAAGCT-G-AAATCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--CTG-TT-GG-TTTGCCGTTAATGTCtgatg
gi|31861                      :  AATTGAAG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-AAGTTTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|31899                      : tAATTG-AG-----AGA---CATA---C-ATGTAC-A-CAACA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGACG-GA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGAG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCAT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-GTAAG-TTT
gi|31863                      :  AATTG-AG-----AGA---TATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTAAC-GATAGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCTG-TTTGTC-AT-AAATTTGAtatcaaaatatgttatg
gi|31900                      : tAATTG-AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTA-A--TGATG-GA--GT-A-TTG-C--TACAT------AGAT-A-TGGG-AA--TTGAC-GATGAAGGAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31867                      :  AATTTGAG-----AGA---AATA---C-A----C-A-C--CT-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGA-AAG-TT-ACAGATAGAGAAGCT-G-AAATTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31866                      : tAATTTGAG-----AGA---CATA---A-A----C-G-C--TG-CA----TG--C-AGGTG-A--TGATA-GA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-AGGG-GAA-TTGAC-AATGGAGAAACT-G-AAATCAT-CGAA-CTTGTC-AT-AAAGTTGAT--TTG-CT-AG-TTTTCCGTAAATG
gi|31906                      : tAATTG-AG-----AGA---CATA---A-A----A-AAC--CA-TA----TA--C-AGGTG-A--TGATG-GA---T-G-TTG-C--TACATA-----GA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATAGAGAAGCT-G-AAATCGT-TCCG-TTTGTCTAT-AAgctatg
gi|31859                      :  AATT--AG-----AGA---CATAAAAC-A----CTG-C--TA-TA----TG--C-AGGTA-A--TGAAG-GA--AT-G-TTG-C--TACAT------ACAT-A--GGG-AAA-TTGAC-GAT-GAGAAGCT-G-AAATTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTC
gi|31858                      : tAATT--AG-----AGA---CATAAAAC-A----CTG-C--TA-TA----TG--C-AGGTA-A--TGAAG-GA--AT-G-TTG-C--TACAT------ACAT-A--GGG-AAA-TTGAC-GAT-GAGAAGCT-G-AAATTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTCtatg
gi|31857                      : tAATT--AG-----AGA---CATAAAAC-A----CTG-C--TA-TA----TG--C-AGGTA-A--TGAAG-GA--AT-G-TTG-C--TACAT------ACAT-A--GGG-AAA-TTGAC-GAT-GAGAAGCT-G-AAATTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTCtatg
gi|31924                      :  tATG--AG-----AGA---CATA---C-ATACAC-A-C--CA-GA----TG--T-AGTTG-A--TGATG-GA--TT-G-TTG-T--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGTC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGACGTTAATGTCtatg
gi|31923                      :   ATG--AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACA-A-----TAAT-A-TGGG-GA--TTGAC-GATGGAGAAGTT-G-AAATAGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31932                      :    TT--AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AAGTG-A--TGATG-GA--AT-A-CTG-C--TACATA-----AAA--A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGAAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TA-AG-TTTGTCGTTAATGTC
gi|31931                      :    TT--AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TA--C-AGGTG-A--TGATG-GG--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-CTGAC-GATGGAGAAGTT-G-AAATCGT-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCtatg
gi|31936                      :    TT--AG-----AGA---CATT---A-A----T-A-C--CA-TA----TG--C-AAGTG-A--TGATG-GA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA---A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGTT-G-AAATTG--CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTGAA--TTG-TT-ta
gi|31934                      :    TT--AG-----AGAGAACATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-CA--AT-A-TTG-C--TACATAG----AAATAA-TGGG-AAG-TTGAC-GATGAGAAAGCT-G-AAATCGT-CCCGTTTTGTC-AT-AAAGTTgaattatctatg
gi|31991                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TA--C-AGGGG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGA-AAG-TTGAC-GATGAAGAAGCT-G-AAATCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AA-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31952                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGG--AAG-TTGAC-GATGGAGAAACC-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--GTG-TT-AG-CTTGCCGTTAATGTCaat
gi|32007                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-ATG-TTGAC-GATGGAGAAACT-A-AAACCGT-ACCG-TTTGTT-AT-AAAGTTGAG--GTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtat
gi|32003                      :      --AA-----AGA---CATA---T-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATGTACATAAAT-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TAG-TT-AG-TTTGACGTTAATGTCtat
gi|31972                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TA--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-GAC-TTGAC-GACGGAGAAGCT-G-AAATCGT-TCCG-TTTGTC-GT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCaatg
gi|31970                      :      --AG-----AGA---CATA---A-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGGTG-GA--AT-A-TTG-C--TACATACTAGTAAGT-A-AGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGCTAATGTCtatg
gi|32029                      :      --AG-----AGG---CATA---C-A----C-A-T--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATT-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AG-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-AATGGAGAAACT-G-AAATCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31996                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGTTG-GA--AT-T-TTG-C--TACATA-----AG-T-A-TGGG-AAG-ATGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TAA-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCt
gi|31971                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TA--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-G-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-GAC-TTGAC-GACGGAGAAGCT-G-AAATCGT-TCCG--TTGTC-GT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCaatg
gi|31953                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----GA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGAAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAGGTTACG--TAG-TT-GA-TTTGCCGCTAATGTCtatg
gi|31992                      :      --AG-----AGA---CAAA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-T-TTG-C--TATATA-----AA-T-A-TGGA-AAG-TTGAC-GATGAAGAAGTT-G-AAATTGT-GCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCTGTTAATGTCaatg
gi|32011                      :      --AG-----AGA---CATA---A-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GG--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAAGATCT---AAATCGT-CCCG-TTTATC-AT-AGAGTTGAG--TTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATATCaatg
gi|31989                      :      --AG-----AGA---CATA---G-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTA-C--CACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATAAAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-ATAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTATTGTGAATGTCta
gi|31994                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--T-AGATGAA--TGATG-GA--ATAA-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG--AG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGCG--AAG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31999                      :      --AA-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTT-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AG-T-G-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGGGAAGCT-G-AAATGGT-CCCG-TTTGCC-AT-AAAGTTGAGTTTTG-TC-AC-TTTGCCGTTAATGTCaatg
gi|31980                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CG-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-ACG-TTGAC-GATGGCGAATCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT---A--TTG-TG-AA-TCTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31987                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-T-C--CA-TA----TG--C-AGGAG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AG-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-AATGGAGAAATT-G-AAATAGT-CACG-TTTGTC-AT-AAAGTTTAA--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCcatg
gi|31957                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|32015                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TAATG-GA--AT---TTG-C--TACAT-------AAT-A-TGGG-AAG-TTGAC-AAT-AAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-ATAAAAGTTGAG--TAG-TT-AGCTTTGCCG-TAATGTC
gi|31961                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTaatg
gi|31966                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CG-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31965                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-GGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31964                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACACA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31958                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGAAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32014                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-T--CA-TA----TG--C-ACATA-A--TGATG-GA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-TAG-TTGGC-CATGGAGAAGCT-G-AGATCGT-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGTTGAA--TTG-TT-AG-TGTACCATTAATGTC
gi|32001                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATG-----AA-T-A-TGGG-AGG-CTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCAT-CCCA-TTTGTC-AT-AA----------------AG-TTTGCCGTTAATGTCgatg
gi|31973                      :      --AG-----AGA---C-TA---A-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TAATG-AA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGA-AAG-TTGAC-GGTAGAGAAGCT-G-AAATC----TCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCATTAATGTt
gi|31977                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TGCACA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTttatg
gi|32021                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-CT-CACTA----TAGTT-AGGTG-A--TGATG-AA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-AATGGAGAACCT-G-AAATCAC-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGATGAG--TTG-TT-AT-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31956                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACACA-----AA-T-A-TGGG-AAA-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtacg
gi|31978                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAT-GATGGAGAAGTT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31975                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-T--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGA-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31960                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--TA-TA----TG--C-AGATG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32002                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----T-A-C--CA-TA----TG--C-AAGTG-A--TAATG-GA--AT-G-TTT-C--TACGTG-----AA-T-A-TGGG-AAT-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-CAATTGT-CCCG-TTTGTC-AT-CAAGTTTAG--CTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31981                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACACA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTG-AT-AAAGTTt
gi|31984                      :      --AG-----AGA---CATA---T-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TCG-C--TACATA-----AA-C-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31951                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-CTG-C--TACAT--------AT-ATTGGG-AAA-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31962                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-AAG-TTGAC-GA-GGAGAAGCT-G-AAATCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32020                      :      --AG-----AGA---CA-A-----A----C-A-T--TA-TA----TG--C-AAGTC-A--TAATG-GA--AT-G-TTT-C--CACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAAAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTAAG--TTG-TT-AA-TTTGCCGTTAATTTC
gi|31963                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C---A-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|32025                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-C-A--CA-TA----TG--C-AGGTA-A--TGATG-GA--AT-G-TTT-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-AAG-TTGAC-GACAAAG-ATCT-T-ATATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAGT-TTGTTT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31986                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TAG---TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAC------AAAT-A-TGGGAAAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31979                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-AAG-TT----GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31997                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AAA--A-TGGG-AAG-TTAAC-GGTAGAGAAACT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31969                      :      --AG-----AGA---CGTA---A-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGATG-A--TGATA-GA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAA-TTGAC-GATGGAGAACCT-G-AAATGGT-CACG-TGTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AT-TATACCATTAATATCt
gi|32010                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAGT-A-TGGA-AAG-TTGAC-GACGGAGAAGCT-C-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAGGTTtatg
gi|32004                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-ATGTGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-T-GG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-A-AAATCGTCCCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31976                      :      --AG-----AGG---CATA---C-A----C---C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----GA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAGTCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32009                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-GAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AATTCGT--CCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32018                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-T--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGA-ACCG-TTTGTC-AC-AAAGTT
gi|31985                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGA-TAG-TTGAT-GATGAAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|32017                      :      --AG-----AGG---CATA---C-A----A-A-T--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AC-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGAG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31967                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--T-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----GA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCAT-CTCG-TTTGAC-AT-AAAGTT
gi|32013                      :      --AG-----AGA---CATG---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TAATG-GA--AT-A-TTG-C--TA-----------AT---TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTTTC-AT-AAAGTTGAG--TAG-TT-AA-T
gi|32006                      :      --AG-----AGA---CGTA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TATATA-----GA-T-A-TTGG-AAG-TTGAC-AATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTTcaatgttcaacaaaatatcca
gi|31982                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-G-T--CA-TA----TG--T-AGGTA-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AG-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGTT-G-AAATCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31988                      :      --AG-----AGA---CATG---C-A----C-A-C--CA-TA----TA--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-T--TACATA-----CA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGCAAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31974                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-T--CA-TAATTATG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACACA-----A--T-A-TGGG-AAA-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AA----------------GG-TTTACCGTGAATGTC
gi|32027                      :      --AG-----AAA---CATG---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGTT-G-AAATTGT-ACCG-TTTGTC-AC-AAAGgatgttcaataaaatatcta
gi|32008                      :      --AG-----AGA---CAGT---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----GA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATAGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTAGTC-AT-AAAG
gi|32019                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-T-TTG-C--TACAT------AAAT-G-TGGG-AAG-TTGAC-GATAAGGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTT-AT-TAAGTT
gi|31998                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-T--C--TAAT--TG--C-AGGTG-A--TGATG-GG--AT-ATTTG-C--TACAT------AAAT-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTT
gi|32023                      :      --AG-----ATA---CATA---C-A----C-A-C--AA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACAT------AAAT-A-T-GG-AAG-TTGAA-GATGGAGAAGCT-GTAAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTctg
gi|32031                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-TGGTG-A--TGATG-GA--TT-G-TTG-C--TACATA-----GA-T-A-TGGG-AAG-CTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCAT-CCCG-TTTGTA-AT-AAAGTT
gi|31993                      :      --AG-----AGA---CATA-----A----C-A-A--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACACA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AATTCGT-CCCG-TTTG-C-AT-AAAGTT
gi|32022                      :      --AG-----AGA---CA-----C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AG-TG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TAGA-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCC-G-AAATTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32024                      :      --AA-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TA----TA--C-AGGTA-A--TGATG-AA--AT-C-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAAAAGCT-G-AAATCGC-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|31990                      :      --AG-----AGA---CATA---C-A----C-A-C--CG-TA----TG--CCAGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACACA-----AA-T-A--GGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG--TTGTCAAT-AAAGTTatgtttaataaaatat
gi|32016                      :      --AG-----AGA---CAAA---A-AA---C-A-C--CA-TA----TG--T-AGGTG-A--TGAAG-GA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTCAG-AACGGAGAAGCT-G-AAATAAT-CCTG-TTTATC-AT-AAAACT-AG--TT
gi|31870                      :         G-----AGA---CATA---CCA----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATGCGA--AT-A-TTG-CCTTACATA-----AA-T-A-TGGA-AAAATTGAC-GATG-AGAAGCTGA-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGA---TTG-TT-AG-TTTGCCtgatgt
gi|32168                      :    taagtt-----AGA---CATA---C-A----C-T-C--CA-TA----TG--C-AGATG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTa
gi|32175                      :                GA---CATA---C-A----C-A-C--CA-TAATA-TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-T--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAA-TTGGC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCAT-CCCG-TTTGTC-AT-AACGTTGAG--TTG-TT-AG-TCTGCCGTTAATGT
gi|31868                      :                 A---TATA---C-G----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTA-A--TGATG-GA--AT-G-TTGTT--TACAT------AAAT-A-TGAG-AAG-TTGAT-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTT
gi|32197                      :           taagttgagatatA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTA-A--TGATG-GAGGAT-A-TT--C--TAC-TT-----AAAT-A-TGGG-AAT-TTGAC-GATGAAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTC
gi|32187                      :                        A---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-G--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACACA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTta
gi|32196                      :                      agA---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTT-C--TACATA-----AA-T-A-TGGA-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAATTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32193                      :                        A---C-A----C-A-C--CA-TA----TG--C-AGATG-A--TGAAG-GA--AT-G-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-AAAGAGT-CCCA-TTTGCC-AT-AAAGTTGAA--TTG-T----------CTTTAATGTC
gi|32223                      :                                          aA-TG----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--CT-G-TTG-C--TACATT-----AA-T-A-AGAG-AAG-TTGAC-GATG-AGAAATT-G-ATATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--ATG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|32198                      :                                            -TA----TA--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----AA-T-A-TGGG-GAG-TTGAC-GATAGAGAAGCT-G-AAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|32228                      :                                      acaatgacA----TG--C-AGGTG-A--TGATG-GA--AT-A-TTG-C--TACATA-----GA-T-A-TGGG-AAG-TTGAC-GATGGAGAAGCT-G-CAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AACGTTGGA--ATG-TT-AG-TCTGCCGTTAATGTC

lowQualScore                  :           44  11111   000   0000 222 0 1111 1 0 11 00 0  2222  00 0      0  00   0  00  0   0  00 0   111111 00 111111  0 0       0 0     0             0   0    0    0      0  0         22   0  0  0               
lowQualScore                  :           ..  .....   ...   .... ... . .... . . .. .. .  ....  .. .      .  ..   .  ..  .   .  .. .   ...... .. ......  . .       . .     .             .   .    .    .      .  .         ..   .  .  .               
lowQualScore                  :           77  11111   888   9999 222 4 3333 2 4 00 66 4  0000  66 4      4  55   4  55  4   4  55 4   111111 55 111111  4 4       4 8     4             4   4    4    4      8  4         00   9  9  9               
consensus                     :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
Reference ( family-78 )       :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31857                      :       AATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTC
gi|31858                      :      tAATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTCtatg
gi|31859                      :      tAATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTCtatg
gi|31861                      :      tAATTGAAG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-GTTTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31863                      :      tAATTG-AG-----AGA---TAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTAAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCTG-TTTGTC-AT-AAATTTGA
gi|31865                      :      tAATTTGAG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--A--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGGGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGT
gi|31866                      :      tAATTTGAG-----AGA---CAT----A---A-A----C-G-C--T--G-CA----TG--C-AGGTGA-TG--ATA-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-AAGGGGA-A-TTGAC-AATGGAGAAACTG-AAA-TCAT-CGAA-CTTGTC-AT-AAAGTTGAT--TTG-CT-AG-TTTTCCGTAAATGtgatg
gi|31867                      :      tAATTTGAG-----AGA---AAT----A---C-A----C-A-C--C--T-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TT-ACAGATAGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgctatg
gi|31868                      :                     tA---TAT----A---C-G----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GT--TTACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAT-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTT
gi|31870                      : taagttgagatatG-----AGA---CAT----A---CCA----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATGCGA--AT-ATT-GCCTT-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-AATTGAC-GATG-AGAAGCTG-AAAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGA---TTG-TT-AG-TTTGCC
gi|31899                      : taagttAATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-ATGTAC-A-CAAC--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ACG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-GTAAG-TTTa
gi|31900                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--GT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA---TTGAC-GATGAAGGAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatcaaaatatgttatg
gi|31901                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--T--A-TA----AG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATTGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31902                      :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------AAAT-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTA-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCaatg
gi|31904                      :       AATT--AGTTGAAAGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--A-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--CTG-TT-GG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31906                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---A-A----A-AAC--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA---T-GTT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTCTAT-AAaatg
gi|31923                      :        ATG--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------A--T------AA-T-ATGGGGA---TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TAGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31924                      :        ATG--AG-----AGA---CATACATA---C-A----C-A-C--C--A-GA----TG--T-AGTTGA-TG--ATG-GA--TT-GTT-GT--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGTC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGACGTTAATGTC
gi|31931                      :         TT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-CTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCtatg
gi|31932                      :         TT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------AA-A-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TA-AG-TTTGTCGTTAATGTCta
gi|31934                      :         TT--AG-----AGAGAACAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-CA--AT-ATT-GC--T-ACA------TAGA------AA-TAATGGGAA-G-TTGAC-GATGAGAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCGTTTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31936                      :         TT--AG-----AGA---CAT----T---A-A----T-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA---ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TTG--CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTGAA--TTG-TT-
gi|31951                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------TA-T--TGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgaattatctatg
gi|31952                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGG-AA-G-TTGAC-GATGGAGAAACCG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--GTG-TT-AG-CTTGCCGTTAATGTC
gi|31953                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAGGTTACG--TAG-TT-GA-TTTGCCGCTAATGTCtat
gi|31956                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|31957                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31958                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31960                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--T--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31961                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|31962                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GA-GGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31963                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C-----A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31964                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31965                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-GGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31966                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31967                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CTCG-TTTGAC-AT-AAAGTT
gi|31969                      :           --AG-----AGA---CGT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATA-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAACCTG-AAA-TGGT-CACG-TGTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AT-TATACCATTAATATC
gi|31970                      :           --AG-----AGA---CAT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--GTG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--ACTAGTAAG-T-AAGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGCTAATGTCtatg
gi|31971                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-C-TTGAC-GACGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG--TTGTC-GT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31972                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-C-TTGAC-GACGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-GT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31973                      :           --AG-----AGA---C-T----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-AA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GGTAGAGAAGCTG-AAA----T-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCATTAATGTtatg
gi|31974                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TAATTATG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------A--T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AA----------------GG-TTTACCGTGAATGTCttatg
gi|31975                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgatgttcaataaaatatcta
gi|31976                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----C---C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAG-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31977                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-GCA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31978                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAT-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31979                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TT----GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31980                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAC-G-TTGAC-GATGGCGAATCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT---A--TTG-TG-AA-TCTGCCGTTAATGTC
gi|31981                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTG-AT-AAAGTTcatg
gi|31982                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-G-T--C--A-TA----TG--T-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31984                      :           --AG-----AGA---CAT----A---T-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATC-GC--T-ACA------T--A------AA-C-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31985                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGATA-G-TTGAT-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|31986                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TAG---TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAAAG-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31987                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-T-C--C--A-TA----TG--C-AGGAGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAATTG-AAA-TAGT-CACG-TTTGTC-AT-AAAGTTTAA--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTC
gi|31988                      :           --AG-----AGA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GT--T-ACA------T--A------CA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGCAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31989                      :           --AG-----AGA---CAT----A---G-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-AC--C-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-ATAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTATTGTGAATGTC
gi|31990                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--CCAGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-A-GGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG--TTGTCAAT-AAAGTTtatg
gi|31991                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGGGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AA-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31992                      :           --AG-----AGA---CAA----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-TTT-GC--T-ATA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGTTG-AAA-TTGT-GCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCTGTTAATGTCaat
gi|31993                      :           --AG-----AGA---CAT----A-----A----C-A-A--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAT-TCGT-CCCG-TTTG-C-AT-AAAGTTaatg
gi|31994                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGATGAATG--ATG-GA--ATAATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGG-A-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGCG--AAG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31996                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--TTG-GA--AT-TTT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-ATGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TAA-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCaatg
gi|31997                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-A-ATGGGAA-G-TTAAC-GGTAGAGAAACTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|31998                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--CTAA-T-----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATTTGC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTTt
gi|31999                      :           --AA-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTTA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-GTGGGAA-G-TTGAC-GATGGGGAAGCTG-AAA-TGGT-CCCG-TTTGCC-AT-AAAGTTGAGTTTTG-TC-AC-TTTGCCGTTAATGTCctg
gi|32001                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--G------AA-T-ATGGGAG-G-CTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCA-TTTGTC-AT-AA----------------AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|32002                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----T-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TA--ATG-GA--AT-GTT-TC--T-ACG------T--G------AA-T-ATGGGAA-T-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-CAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-CAAGTTTAG--CTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATGTCt
gi|32003                      :           --AA-----AGA---CAT----A---T-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACATGTACAT--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TAG-TT-AG-TTTGACGTTAATGTCt
gi|32004                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TGTGATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGG-AA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTA-AAA-TCGTCCCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|32006                      :           --AG-----AGA---CGT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ATA------T--A------GA-T-ATTGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTT
gi|32007                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAT-G-TTGAC-GATGGAGAAACTA-AAA-CCGT-ACCG-TTTGTT-AT-AAAGTTGAG--GTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32008                      :           --AG-----AGA---CAG----T---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTAGTC-AT-AAAGtat
gi|32009                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAT-TCGT--CCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32010                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GACGGAGAAGCTC-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAGGTT
gi|32011                      :           --AG-----AGA---CAT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAGATCT--AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AGAGTTGAG--TTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATATC
gi|32013                      :           --AG-----AGA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-A-------------------A-T--TGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTTTC-AT-AAAGTTGAG--TAG-TT-AA-Tta
gi|32014                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-ACATAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGTA-G-TTGGC-CATGGAGAAGCTG-AGA-TCGT-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGTTGAA--TTG-TT-AG-TGTACCATTAATGTCcaatgttcaacaaaatatcca
gi|32015                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-GA--AT--TT-GC--T-ACA------T---------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AAT-AAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-ATAAAAGTTGAG--TAG-TT-AGCTTTGCCG-TAATGTCgatg
gi|32016                      :           --AG-----AGA---CAA----A---A-AA---C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGGTGA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTCAG-AACGGAGAAGCTG-AAA-TAAT-CCTG-TTTATC-AT-AAAACT-AG--TTaatg
gi|32017                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----A-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AC-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtgatgt
gi|32018                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGA-ACCG-TTTGTC-AC-AAAGTT
gi|32019                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-TTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-GTGGGAA-G-TTGAC-GATAAGGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTT-AT-TAAGTT
gi|32020                      :           --AG-----AGA---CA-----A-----A----C-A-T--T--A-TA----TG--C-AAGTCA-TA--ATG-GA--AT-GTT-TC--C-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTAAG--TTG-TT-AA-TTTGCCGTTAATTTC
gi|32021                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-CT-C--ACTA----TAGTT-AGGTGA-TG--ATG-AA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAACCTG-AAA-TCAC-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGATGAG--TTG-TT-AT-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|32022                      :           --AG-----AGA---CA---------C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AG-TGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATAGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCCG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtacg
gi|32023                      :           --AG-----ATA---CAT----A---C-A----C-A-C--A--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-AT-GGAA-G-TTGAA-GATGGAGAAGCTGTAAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32024                      :           --AA-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTAA-TG--ATG-AA--AT-CTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAAAGCTG-AAA-TCGC-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|32025                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-C-A--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-TC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GACAAAG-ATCTT-ATA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAGT-TTGTTT-AG-TTTGCCGTTAATGTCatgtttaataaaatat
gi|32027                      :           --AG-----AAA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TTGT-ACCG-TTTGTC-AC-AAAGtatg
gi|32029                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATT-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAACTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32031                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-TGGTGA-TG--ATG-GA--TT-GTT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-CTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTA-AT-AAAGTTt
gi|32168                      :               -----AGA---CAT----A---C-A----C-T-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTT
gi|32175                      :                     GA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TAATA-TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GT--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGGC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTC-AT-AACGTTGAG--TTG-TT-AG-TCTGCCGTTAATGT
gi|32187                      :                             ----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGG-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32193                      :                           ag----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-GAGT-CCCA-TTTGCC-AT-AAAGTTGAA--TTG-T----------CTTTAATGTC
gi|32196                      :                            a----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-TC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|32197                      :                             ----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GAGGAT-ATT--C--T-ACT------T--A------AA-T-ATGGGAA-T-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTC
gi|32198                      :                                                       -TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTta
gi|32223                      :                                            acaatgac--A-TG----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--CT-GTT-GC--T-ACA------T--T------AA-T-AAGAGAA-G-TTGAC-GATG-AGAAATTG-ATA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--ATG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32228                      :                                                         A----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-CAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AACGTTGGA--ATG-TT-AG-TCTGCCGTTAATGTCtatg

lowQualScore                  :           44  11111   000   0000 222 0 1111 1 0 11 00 0  2222  00 0      0  00   0  00  0   0  00 0   111111 00 111111  0 0       0 0     0             0   0    0    0      0  0         22   0  0  0               
lowQualScore                  :           ..  .....   ...   .... ... . .... . . .. .. .  ....  .. .      .  ..   .  ..  .   .  .. .   ...... .. ......  . .       . .     .             .   .    .    .      .  .         ..   .  .  .               
lowQualScore                  :           77  11111   888   9999 222 4 3333 2 4 00 66 4  0000  66 4      4  55   4  55  4   4  55 4   111111 55 111111  4 4       4 8     4             4   4    4    4      8  4         00   9  9  9               
consensus                     :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
Reference ( family-78 )       :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31857                      :       AATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTC
gi|31858                      :      tAATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTCtatg
gi|31859                      :      tAATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTCtatg
gi|31861                      :      tAATTGAAG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-GTTTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31863                      :      tAATTG-AG-----AGA---TAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTAAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCTG-TTTGTC-AT-AAATTTGA
gi|31865                      :      tAATTTGAG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--A--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGGGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGT
gi|31866                      :      tAATTTGAG-----AGA---CAT----A---A-A----C-G-C--T--G-CA----TG--C-AGGTGA-TG--ATA-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-AAGGGGA-A-TTGAC-AATGGAGAAACTG-AAA-TCAT-CGAA-CTTGTC-AT-AAAGTTGAT--TTG-CT-AG-TTTTCCGTAAATGtgatg
gi|31867                      :      tAATTTGAG-----AGA---AAT----A---C-A----C-A-C--C--T-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TT-ACAGATAGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgctatg
gi|31868                      :                     tA---TAT----A---C-G----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GT--TTACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAT-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTT
gi|31870                      : taagttgagatatG-----AGA---CAT----A---CCA----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATGCGA--AT-ATT-GCCTT-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-AATTGAC-GATG-AGAAGCTG-AAAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGA---TTG-TT-AG-TTTGCC
gi|31899                      : taagttAATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-ATGTAC-A-CAAC--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ACG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-GTAAG-TTTa
gi|31900                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--GT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA---TTGAC-GATGAAGGAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatcaaaatatgttatg
gi|31901                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--T--A-TA----AG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATTGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31902                      :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------AAAT-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTA-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCaatg
gi|31904                      :       AATT--AGTTGAAAGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--A-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--CTG-TT-GG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31906                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---A-A----A-AAC--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA---T-GTT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTCTAT-AAaatg
gi|31923                      :        ATG--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------A--T------AA-T-ATGGGGA---TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TAGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31924                      :        ATG--AG-----AGA---CATACATA---C-A----C-A-C--C--A-GA----TG--T-AGTTGA-TG--ATG-GA--TT-GTT-GT--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGTC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGACGTTAATGTC
gi|31931                      :         TT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-CTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCtatg
gi|31932                      :         TT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------AA-A-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TA-AG-TTTGTCGTTAATGTCta
gi|31934                      :         TT--AG-----AGAGAACAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-CA--AT-ATT-GC--T-ACA------TAGA------AA-TAATGGGAA-G-TTGAC-GATGAGAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCGTTTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31936                      :         TT--AG-----AGA---CAT----T---A-A----T-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA---ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TTG--CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTGAA--TTG-TT-
gi|31951                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------TA-T--TGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgaattatctatg
gi|31952                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGG-AA-G-TTGAC-GATGGAGAAACCG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--GTG-TT-AG-CTTGCCGTTAATGTC
gi|31953                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAGGTTACG--TAG-TT-GA-TTTGCCGCTAATGTCtat
gi|31956                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|31957                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31958                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31960                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--T--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31961                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|31962                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GA-GGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31963                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C-----A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31964                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31965                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-GGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31966                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31967                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CTCG-TTTGAC-AT-AAAGTT
gi|31969                      :           --AG-----AGA---CGT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATA-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAACCTG-AAA-TGGT-CACG-TGTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AT-TATACCATTAATATC
gi|31970                      :           --AG-----AGA---CAT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--GTG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--ACTAGTAAG-T-AAGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGCTAATGTCtatg
gi|31971                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-C-TTGAC-GACGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG--TTGTC-GT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31972                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-C-TTGAC-GACGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-GT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31973                      :           --AG-----AGA---C-T----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-AA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GGTAGAGAAGCTG-AAA----T-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCATTAATGTtatg
gi|31974                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TAATTATG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------A--T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AA----------------GG-TTTACCGTGAATGTCttatg
gi|31975                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgatgttcaataaaatatcta
gi|31976                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----C---C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAG-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31977                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-GCA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31978                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAT-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31979                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TT----GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31980                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAC-G-TTGAC-GATGGCGAATCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT---A--TTG-TG-AA-TCTGCCGTTAATGTC
gi|31981                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTG-AT-AAAGTTcatg
gi|31982                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-G-T--C--A-TA----TG--T-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31984                      :           --AG-----AGA---CAT----A---T-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATC-GC--T-ACA------T--A------AA-C-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31985                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGATA-G-TTGAT-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|31986                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TAG---TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAAAG-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31987                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-T-C--C--A-TA----TG--C-AGGAGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAATTG-AAA-TAGT-CACG-TTTGTC-AT-AAAGTTTAA--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTC
gi|31988                      :           --AG-----AGA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GT--T-ACA------T--A------CA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGCAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31989                      :           --AG-----AGA---CAT----A---G-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-AC--C-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-ATAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTATTGTGAATGTC
gi|31990                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--CCAGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-A-GGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG--TTGTCAAT-AAAGTTtatg
gi|31991                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGGGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AA-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31992                      :           --AG-----AGA---CAA----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-TTT-GC--T-ATA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGTTG-AAA-TTGT-GCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCTGTTAATGTCaat
gi|31993                      :           --AG-----AGA---CAT----A-----A----C-A-A--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAT-TCGT-CCCG-TTTG-C-AT-AAAGTTaatg
gi|31994                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGATGAATG--ATG-GA--ATAATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGG-A-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGCG--AAG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31996                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--TTG-GA--AT-TTT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-ATGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TAA-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCaatg
gi|31997                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-A-ATGGGAA-G-TTAAC-GGTAGAGAAACTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|31998                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--CTAA-T-----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATTTGC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTTt
gi|31999                      :           --AA-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTTA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-GTGGGAA-G-TTGAC-GATGGGGAAGCTG-AAA-TGGT-CCCG-TTTGCC-AT-AAAGTTGAGTTTTG-TC-AC-TTTGCCGTTAATGTCctg
gi|32001                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--G------AA-T-ATGGGAG-G-CTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCA-TTTGTC-AT-AA----------------AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|32002                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----T-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TA--ATG-GA--AT-GTT-TC--T-ACG------T--G------AA-T-ATGGGAA-T-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-CAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-CAAGTTTAG--CTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATGTCt
gi|32003                      :           --AA-----AGA---CAT----A---T-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACATGTACAT--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TAG-TT-AG-TTTGACGTTAATGTCt
gi|32004                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TGTGATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGG-AA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTA-AAA-TCGTCCCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|32006                      :           --AG-----AGA---CGT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ATA------T--A------GA-T-ATTGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTT
gi|32007                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAT-G-TTGAC-GATGGAGAAACTA-AAA-CCGT-ACCG-TTTGTT-AT-AAAGTTGAG--GTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32008                      :           --AG-----AGA---CAG----T---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTAGTC-AT-AAAGtat
gi|32009                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAT-TCGT--CCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32010                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GACGGAGAAGCTC-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAGGTT
gi|32011                      :           --AG-----AGA---CAT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAGATCT--AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AGAGTTGAG--TTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATATC
gi|32013                      :           --AG-----AGA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-A-------------------A-T--TGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTTTC-AT-AAAGTTGAG--TAG-TT-AA-Tta
gi|32014                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-ACATAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGTA-G-TTGGC-CATGGAGAAGCTG-AGA-TCGT-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGTTGAA--TTG-TT-AG-TGTACCATTAATGTCcaatgttcaacaaaatatcca
gi|32015                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-GA--AT--TT-GC--T-ACA------T---------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AAT-AAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-ATAAAAGTTGAG--TAG-TT-AGCTTTGCCG-TAATGTCgatg
gi|32016                      :           --AG-----AGA---CAA----A---A-AA---C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGGTGA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTCAG-AACGGAGAAGCTG-AAA-TAAT-CCTG-TTTATC-AT-AAAACT-AG--TTaatg
gi|32017                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----A-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AC-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtgatgt
gi|32018                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGA-ACCG-TTTGTC-AC-AAAGTT
gi|32019                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-TTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-GTGGGAA-G-TTGAC-GATAAGGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTT-AT-TAAGTT
gi|32020                      :           --AG-----AGA---CA-----A-----A----C-A-T--T--A-TA----TG--C-AAGTCA-TA--ATG-GA--AT-GTT-TC--C-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTAAG--TTG-TT-AA-TTTGCCGTTAATTTC
gi|32021                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-CT-C--ACTA----TAGTT-AGGTGA-TG--ATG-AA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAACCTG-AAA-TCAC-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGATGAG--TTG-TT-AT-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|32022                      :           --AG-----AGA---CA---------C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AG-TGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATAGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCCG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtacg
gi|32023                      :           --AG-----ATA---CAT----A---C-A----C-A-C--A--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-AT-GGAA-G-TTGAA-GATGGAGAAGCTGTAAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32024                      :           --AA-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTAA-TG--ATG-AA--AT-CTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAAAGCTG-AAA-TCGC-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|32025                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-C-A--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-TC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GACAAAG-ATCTT-ATA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAGT-TTGTTT-AG-TTTGCCGTTAATGTCatgtttaataaaatat
gi|32027                      :           --AG-----AAA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TTGT-ACCG-TTTGTC-AC-AAAGtatg
gi|32029                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATT-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAACTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32031                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-TGGTGA-TG--ATG-GA--TT-GTT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-CTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTA-AT-AAAGTTt
gi|32168                      :               -----AGA---CAT----A---C-A----C-T-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTT
gi|32175                      :                     GA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TAATA-TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GT--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGGC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTC-AT-AACGTTGAG--TTG-TT-AG-TCTGCCGTTAATGT
gi|32187                      :                             ----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGG-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32193                      :                           ag----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-GAGT-CCCA-TTTGCC-AT-AAAGTTGAA--TTG-T----------CTTTAATGTC
gi|32196                      :                            a----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-TC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|32197                      :                             ----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GAGGAT-ATT--C--T-ACT------T--A------AA-T-ATGGGAA-T-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTC
gi|32198                      :                                                       -TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTta
gi|32223                      :                                            acaatgac--A-TG----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--CT-GTT-GC--T-ACA------T--T------AA-T-AAGAGAA-G-TTGAC-GATG-AGAAATTG-ATA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--ATG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32228                      :                                                         A----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-CAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AACGTTGGA--ATG-TT-AG-TCTGCCGTTAATGTCtatg


blockSeqs                     :           GA  TTGAA              AAA   TGTA T            ATTA                                         TGTACA    CTAGTA                                                                    TT
blockSeqs                     :           TG  .                  AAA   A    T            ATA                                          .         .                                                                         T 
blockSeqs                     :           TG  .                  .     .    .            G                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           TG  .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           G   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           G   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           G   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           G   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           G   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                         . 
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :           .   .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :               .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :               .                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                  .     .    .            .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                                          .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                                          .                                            .         .                                                                           
blockSeqs                     :                                                          .                                            .         .                                                                           


blockSeqCons                  :                                  ***
originalCons                  :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
finalCons                     :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC

lowQualScore                  :           44  11111   000   0000 222 0 1111 1 0 11 00 0  2222  00 0      0  00   0  00  0   0  00 0   111111 00 111111  0 0       0 0     0             0   0    0    0      0  0         22   0  0  0               
lowQualScore                  :           ..  .....   ...   .... ... . .... . . .. .. .  ....  .. .      .  ..   .  ..  .   .  .. .   ...... .. ......  . .       . .     .             .   .    .    .      .  .         ..   .  .  .               
lowQualScore                  :           77  11111   888   9999 222 4 3333 2 4 00 66 4  0000  66 4      4  55   4  55  4   4  55 4   111111 55 111111  4 4       4 8     4             4   4    4    4      8  4         00   9  9  9               
consensus                     :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
Reference ( family-78 )       :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31857                      :       AATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTC
gi|31858                      :      tAATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTCtatg
gi|31859                      :      tAATT--AG-----AGA---CAT----AAAAC-A----CTG-C--T--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------CA-T-A-GGGAA-A-TTGAC-GAT-GAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTT-TC-AT-AAAGTT-----TTG-AT-GT-TCTACCA--AATGTCtatg
gi|31861                      :      tAATTGAAG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-GTTTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31863                      :      tAATTG-AG-----AGA---TAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTAAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCTG-TTTGTC-AT-AAATTTGA
gi|31865                      :      tAATTTGAG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--A--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGGGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGT
gi|31866                      :      tAATTTGAG-----AGA---CAT----A---A-A----C-G-C--T--G-CA----TG--C-AGGTGA-TG--ATA-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-AAGGGGA-A-TTGAC-AATGGAGAAACTG-AAA-TCAT-CGAA-CTTGTC-AT-AAAGTTGAT--TTG-CT-AG-TTTTCCGTAAATGtgatg
gi|31867                      :      tAATTTGAG-----AGA---AAT----A---C-A----C-A-C--C--T-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TT-ACAGATAGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgctatg
gi|31868                      :                     tA---TAT----A---C-G----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GT--TTACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAT-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTT
gi|31870                      : taagttgagatatG-----AGA---CAT----A---CCA----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATGCGA--AT-ATT-GCCTT-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-AATTGAC-GATG-AGAAGCTG-AAAATCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGA---TTG-TT-AG-TTTGCC
gi|31899                      : taagttAATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-ATGTAC-A-CAAC--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ACG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-GTAAG-TTTa
gi|31900                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--GT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA---TTGAC-GATGAAGGAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatcaaaatatgttatg
gi|31901                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--T--A-TA----AG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATTGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31902                      :       AATT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------AAAT-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTA-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCaatg
gi|31904                      :       AATT--AGTTGAAAGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--A-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--CTG-TT-GG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31906                      :       AATTG-AG-----AGA---CAT----A---A-A----A-AAC--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA---T-GTT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTCTAT-AAaatg
gi|31923                      :        ATG--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------A--T------AA-T-ATGGGGA---TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TAGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31924                      :        ATG--AG-----AGA---CATACATA---C-A----C-A-C--C--A-GA----TG--T-AGTTGA-TG--ATG-GA--TT-GTT-GT--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGTC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGACGTTAATGTC
gi|31931                      :         TT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-CTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCtatg
gi|31932                      :         TT--AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------AA-A-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TA-AG-TTTGTCGTTAATGTCta
gi|31934                      :         TT--AG-----AGAGAACAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-CA--AT-ATT-GC--T-ACA------TAGA------AA-TAATGGGAA-G-TTGAC-GATGAGAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCGTTTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31936                      :         TT--AG-----AGA---CAT----T---A-A----T-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA---ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TTG--CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTGAA--TTG-TT-
gi|31951                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ACT-GC--T-ACA------T--A------TA-T--TGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgaattatctatg
gi|31952                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGG-AA-G-TTGAC-GATGGAGAAACCG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--GTG-TT-AG-CTTGCCGTTAATGTC
gi|31953                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAGGTTACG--TAG-TT-GA-TTTGCCGCTAATGTCtat
gi|31956                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|31957                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31958                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31960                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--T--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31961                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|31962                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GA-GGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31963                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C-----A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31964                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31965                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-GGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31966                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31967                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CTCG-TTTGAC-AT-AAAGTT
gi|31969                      :           --AG-----AGA---CGT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATA-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAACCTG-AAA-TGGT-CACG-TGTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AT-TATACCATTAATATC
gi|31970                      :           --AG-----AGA---CAT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--GTG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--ACTAGTAAG-T-AAGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGCTAATGTCtatg
gi|31971                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-C-TTGAC-GACGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG--TTGTC-GT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31972                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-C-TTGAC-GACGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-TCCG-TTTGTC-GT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|31973                      :           --AG-----AGA---C-T----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-AA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GGTAGAGAAGCTG-AAA----T-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCCATTAATGTtatg
gi|31974                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TAATTATG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------A--T-ATGGGAA-A-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AA----------------GG-TTTACCGTGAATGTCttatg
gi|31975                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTgatgttcaataaaatatcta
gi|31976                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----C---C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAG-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31977                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-GCA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31978                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAT-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31979                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TT----GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31980                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAC-G-TTGAC-GATGGCGAATCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT---A--TTG-TG-AA-TCTGCCGTTAATGTC
gi|31981                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTG-AT-AAAGTTcatg
gi|31982                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-G-T--C--A-TA----TG--T-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31984                      :           --AG-----AGA---CAT----A---T-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATC-GC--T-ACA------T--A------AA-C-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31985                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGATA-G-TTGAT-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|31986                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TAG---TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAAAG-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|31987                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-T-C--C--A-TA----TG--C-AGGAGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAATTG-AAA-TAGT-CACG-TTTGTC-AT-AAAGTTTAA--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTC
gi|31988                      :           --AG-----AGA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GT--T-ACA------T--A------CA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGCAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|31989                      :           --AG-----AGA---CAT----A---G-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-AC--C-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-ATAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTATTGTGAATGTC
gi|31990                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--G-TA----TG--CCAGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-A-GGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG--TTGTCAAT-AAAGTTtatg
gi|31991                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGGGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AA-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31992                      :           --AG-----AGA---CAA----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-TTT-GC--T-ATA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGAAGAAGTTG-AAA-TTGT-GCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTGCTGTTAATGTCaat
gi|31993                      :           --AG-----AGA---CAT----A-----A----C-A-A--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAT-TCGT-CCCG-TTTG-C-AT-AAAGTTaatg
gi|31994                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGATGAATG--ATG-GA--ATAATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGG-A-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGCG--AAG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|31996                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--TTG-GA--AT-TTT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-ATGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TAA-TT-AG-TTTACCGTTAATGTCaatg
gi|31997                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-A-ATGGGAA-G-TTAAC-GGTAGAGAAACTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|31998                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--CTAA-T-----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATTTGC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTTt
gi|31999                      :           --AA-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTTA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-GTGGGAA-G-TTGAC-GATGGGGAAGCTG-AAA-TGGT-CCCG-TTTGCC-AT-AAAGTTGAGTTTTG-TC-AC-TTTGCCGTTAATGTCctg
gi|32001                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--G------AA-T-ATGGGAG-G-CTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCA-TTTGTC-AT-AA----------------AG-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|32002                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----T-A-C--C--A-TA----TG--C-AAGTGA-TA--ATG-GA--AT-GTT-TC--T-ACG------T--G------AA-T-ATGGGAA-T-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-CAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-CAAGTTTAG--CTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATGTCt
gi|32003                      :           --AA-----AGA---CAT----A---T-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACATGTACAT--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TAG-TT-AG-TTTGACGTTAATGTCt
gi|32004                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TGTGATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGG-AA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTA-AAA-TCGTCCCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTaatg
gi|32006                      :           --AG-----AGA---CGT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ATA------T--A------GA-T-ATTGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AAAGTT
gi|32007                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAT-G-TTGAC-GATGGAGAAACTA-AAA-CCGT-ACCG-TTTGTT-AT-AAAGTTGAG--GTG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32008                      :           --AG-----AGA---CAG----T---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTAGTC-AT-AAAGtat
gi|32009                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAT-TCGT--CCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32010                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GACGGAGAAGCTC-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAGGTT
gi|32011                      :           --AG-----AGA---CAT----A---A-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GG--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAGATCT--AAA-TCGT-CCCG-TTTATC-AT-AGAGTTGAG--TTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATATC
gi|32013                      :           --AG-----AGA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-A-------------------A-T--TGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTTTC-AT-AAAGTTGAG--TAG-TT-AA-Tta
gi|32014                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-ACATAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGTA-G-TTGGC-CATGGAGAAGCTG-AGA-TCGT-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGTTGAA--TTG-TT-AG-TGTACCATTAATGTCcaatgttcaacaaaatatcca
gi|32015                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TA--ATG-GA--AT--TT-GC--T-ACA------T---------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AAT-AAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-ATAAAAGTTGAG--TAG-TT-AGCTTTGCCG-TAATGTCgatg
gi|32016                      :           --AG-----AGA---CAA----A---A-AA---C-A-C--C--A-TA----TG--T-AGGTGA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTCAG-AACGGAGAAGCTG-AAA-TAAT-CCTG-TTTATC-AT-AAAACT-AG--TTaatg
gi|32017                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----A-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AC-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGAGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtgatgt
gi|32018                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGA-ACCG-TTTGTC-AC-AAAGTT
gi|32019                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-TTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-GTGGGAA-G-TTGAC-GATAAGGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTT-AT-TAAGTT
gi|32020                      :           --AG-----AGA---CA-----A-----A----C-A-T--T--A-TA----TG--C-AAGTCA-TA--ATG-GA--AT-GTT-TC--C-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTAAG--TTG-TT-AA-TTTGCCGTTAATTTC
gi|32021                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-CT-C--ACTA----TAGTT-AGGTGA-TG--ATG-AA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAACCTG-AAA-TCAC-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGATGAG--TTG-TT-AT-TTTGCCGTTAATGTCtatg
gi|32022                      :           --AG-----AGA---CA---------C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AG-TGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATAGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCCG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtacg
gi|32023                      :           --AG-----ATA---CAT----A---C-A----C-A-C--A--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-AT-GGAA-G-TTGAA-GATGGAGAAGCTGTAAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32024                      :           --AA-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TA--C-AGGTAA-TG--ATG-AA--AT-CTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAAAAGCTG-AAA-TCGC-CCCA-TTTGTC-AT-AAAGT
gi|32025                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-C-A--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GA--AT-GTT-TC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GACAAAG-ATCTT-ATA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAGT-TTGTTT-AG-TTTGCCGTTAATGTCatgtttaataaaatat
gi|32027                      :           --AG-----AAA---CAT----G---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGTTG-AAA-TTGT-ACCG-TTTGTC-AC-AAAGtatg
gi|32029                      :           --AG-----AGG---CAT----A---C-A----C-A-T--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATT-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AG-T-ATGGGAA-G-TTGAC-AATGGAGAAACTG-AAA-TCGT-CTCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-CG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32031                      :           --AG-----AGA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-TGGTGA-TG--ATG-GA--TT-GTT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-CTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTA-AT-AAAGTTt
gi|32168                      :               -----AGA---CAT----A---C-A----C-T-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-GAAGTT
gi|32175                      :                     GA---CAT----A---C-A----C-A-C--C--A-TAATA-TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GT--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-A-TTGGC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCAT-CCCG-TTTGTC-AT-AACGTTGAG--TTG-TT-AG-TCTGCCGTTAATGT
gi|32187                      :                             ----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGG-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------C--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTT
gi|32193                      :                           ag----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGATGA-TG--AAG-GA--AT-GTT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-GAGT-CCCA-TTTGCC-AT-AAAGTTGAA--TTG-T----------CTTTAATGTC
gi|32196                      :                            a----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-TC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGAAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-AAA-TTGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTtatg
gi|32197                      :                             ----A---C-A----C-A-C--C--A-TA----TG--C-AGGTAA-TG--ATG-GAGGAT-ATT--C--T-ACT------T--A------AA-T-ATGGGAA-T-TTGAC-GATGAAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--TTG-TT-AG-TTTACCGTTAATGTC
gi|32198                      :                                                       -TA----TA--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------AA-T-ATGGGGA-G-TTGAC-GATAGAGAAGCTG-AAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTta
gi|32223                      :                                            acaatgac--A-TG----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--CT-GTT-GC--T-ACA------T--T------AA-T-AAGAGAA-G-TTGAC-GATG-AGAAATTG-ATA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AAAGTTGAG--ATG-TT-AG-TTTGCCGTTAATGTC
gi|32228                      :                                                         A----TG--C-AGGTGA-TG--ATG-GA--AT-ATT-GC--T-ACA------T--A------GA-T-ATGGGAA-G-TTGAC-GATGGAGAAGCTG-CAA-TCGT-CCCG-TTTGTC-AT-AACGTTGGA--ATG-TT-AG-TCTGCCGTTAATGTCtatg