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Reference ( gi|100644 ) : GGCAGA-AGT-CGTG-TGTT-GG-AATGGCA-T-GCC-ACT--AAGAGGC--TAA--C--C-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTCT--T---------C-CC------GA--CCT-GT--C-T-G-GCG---ACCA---A-GCT-GTT-GT--G-T-G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TG---CC-T-G----A--A---T---AAGGC---TT--G-CA-------GTG-TA---------C-AC--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGG-C-TG----CAG-TG--T---A-AGC-GG--TAGT--C---TGA-GG-TT-----------GG-CC-AGTG--TG----AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-GAT-T---AGATTTTATTTGATT
gi|100645 : GGCAGTTAGT-CGTG-TGTTTGG-AGTGGCT-T-GCC-ACT--TGGAGGC--TAA--C--C-AGTGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---CC-AGA--GTAATC-C-GTCT--T---------C-CT------GA--CCT-GT--C-T-G-GTG---ACCA---A-GCT-GTT-GTA-G-T-G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TG---CC-T-G----A--A---T---AAGGC---CT--G-CA-------GTG-TA---------C-AC--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACTAT----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGG-C-TG----CAG-TA--T---A-AGCGGG--TAGT--C---CGA-GG-TT-----------GA-CC-AGTG--TA----AGCG--CTA-ACC-------------------A-T----TA--GC--T--------C----T-----A--CCATCA----T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-AAT-T---AGATTTTATGTGATT
gi|100647 : GGCAGT-AGT-CGTG-TGTT-GC-AGTGCTT-T-GCC-ACT--CAGAGGC--TAG--C--C-AGTGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---CCAAGA--GTAATC-C-GTCT--T---------C-CT------GA--CCT-GT--C-T-G-GCG---ACCA---A-ACT-GTT-GT--G-T-G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TG---CC-T-G----A--A---T---AAGGC---TT--G-CA-------GTGTTG---------C-AC--AGCA-GTGG----A--A--G-GGTTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----T--TG-----TC---CTG-AA-TAA-G-C-TG----CAG-TA--T---A-AGC-GG--TAGT--C---CGA-GG-TTTG---------GA-CC-AGTG--TA----AG-G--TTA-ACC-------------------A-T----TA--G---TC-------C----T-----A--CT--CA-C--T------GCCTA--T-CAC-C--CA---AT-CAT-T---TGATTTTCTTTGATT
gi|100646 : GGCAAT-AGT-CGTG-TGTTTGG-AGTGGCA-TTGCC-ACT--CAGAGGC--TAA--C--C-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTCT--T---------C-CT------GA--CCT-GT--C-T-G-GCG---ACCA---A-GCT-TTT-GT--G-T-G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TG---CC-T-G----A--A---T---AAGGT---TT--G-CA-------GTG-TA---------C-AC--AGTA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGG-C--G----CAG-TA--T---A-AGC--G--TAGT--C---CGG-GGCTC-----------GA-CC-GGCG--TA----AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----ACCCC--CA-C--T------GCCAA--T--AA-C--CA---AT-ACTAT---AGA-TTTATGTGATT
gi|100648 : GGCAGT-AAA-AGTG-TGTT-GG-AGTGGCA-T-GCC-ACT--CGGAGGC--TAA--C--C-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAA---C--AGA--GTAATC-C-GTCT--T---------C-CT------GA--CCT-GT--C-T-G-GTG---ACCA---A-GCT-GTT-GT--G-T-G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TG---CC-T-G----A--A---T---AAGGC---TT--G-CA-------GTG-CG---------C-AC--AGCA-GAGG----A-----------AT---C-ACT-T----AT-ACAG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGG-C-TG----CAG-TA--T---ATAGC-GG--TAGA--T---CGA-GG-TT-----------GA-CC-AGTG--TA----GA-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--GT--T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------G-CAA--T-CAC-C--CA---AT--AT-T---
gi|100649 : GGCAGT-GAT-CGTG-TGTT-GG-AGTGGCT-T-GTC-ACT--CAGAGGC--TAG--C--C-AGCGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---A--AGA--GTAATTTC-GTCTCTT---------C-CT------GA--C-T-GT--C-TTG-GCG---ACCA---A-GCT-GG--GT--G-T-G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TG---CC-T-G----A--A---T---AAGGC---TT--G-CA-------GTG-TA---------C-AC--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-A----CT-ACTG----TGTTG-----TC---CTG-AA-TAAGG-C-TG----CAG-TA--T---A-AGC-GT--TAGT--C---CGA-GG-TT-----------GA-CC-AGTGTATG----AA-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---TCTGGTAGAC----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CACACA-CA---AT-TA--T---AAATTTTATGTGATTgtagtgatt
gi|100651 : GACAGT-AGTTCGTG-TGTT-GG-AGTGT---T-GCC-ACT--CAGAGGC--TT---C--C-AGGGATA---GAAATT-ATCC--GCC-AAG---C--AGA--ATAATTTC-GTCT--T---------C-C-------GA--CCT-GT--C-T-G-GCGA--ACCA---A-GCT-GTT-G-------G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TA---CCTT-G----ATCA---T---AAGGC---GT--G-CA-------GTG-CA---------CAAC--AGCA--T-G----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-TA---AT-ACTA-----G-TG-----TC---CTG-AA-TAA-G-C-TGC---CA---G--T---A-AAC-G----AAC--C---CGA-GGATT-----------GA-CCGAGTG--TA----AG-G--CTA-ACC-------------------AGT----TAG-G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CG--C--CA---AT-A---T---AGATTTTA
gi|100654 : GGCAGC-AGT-CGTG-TGTA-GG-AGTGGCA-T-GCC-ACT--CGGAGGC--TAA--C--C-ATTGACA---GAGGTT-AACC--ACC-AAG---G--AGA--GTAATC-C-GTCT--T---------C-CT------TA--CCT-GT--T-T-G-GTG---ACTA---A-GTT-GTT-GT--G-T-G------C-A-T--T-----G-TG----TC--TG---TC-T-G----A--A---T---AAAGC---TT--G-CA-------GTG-TG---------C-AC--AGCA-GTG
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gi|100652 : ggctGT-AGTG-CACC-GG-AGTGACA-C-GCC-ACT--CGGAGGC--TAA--C--T-AGTAACA---GAGGTT-AGCC--TTC-AAG---G--ATAATGTAATT-C-GTCT--T---------G-TG------GA--CTC-GT--C-T-G-GTG---ACCA---A-GCT-GTT-GT--G-T-G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TA---CC-T-G----A--A---T---AATGC---TT--G-CA-------GTG-TA---------C-AC--ATCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-GCT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---ATG-AA-TGAGG-C-TG----CAG-TA--T---A-AGC-GG--TAGT--C---GGA-GG-AA-----------GA-CC-AGTG--TG----AG-G--CTggtgtgtgatt
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gi|100656 : ggctT-GG-AGTGGCAAC-GCCTACT--CGGAGGC---AA--C--TGAGTAACAA--GAGGTTTAGCT---TC-AAG---A--ATAATGTAATT---GTCT--TGTGGGTCTACGTC------AA--CC--GT--C-T-G-GTGCGGACCA---A-GCT-GTT--T--G-T-GAATTGGC-A-G--T-----G-TG----TCG-TG---CT-TTG----A--A---T---AAGGC---TTTTG-CA-------GTG-TAT--------C-AC--AGCA-GTGA----A--G--G-GGCGAT---C-ACT-T----ATTACTG----TG-TG-----TCACACTG-AACTAAGG-C-TG----CAG-TA--T---A-AGC-C---TCGT--CCCCTGA-GG-TT-----------GA-CC-AGTG--TA----AA-GGCCTA-ACC-------------------A-T----TACGG---TT-------C----T-----A--CCT-CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-CAT-T---AGATTTTATatgtgcatt
gi|100657 : GGCC-T-GCC-ACG--GAGAGGC--TGA--CCTC-AGT-AGA---GAGGCT-AGCC--Aatttgtgatt
gi|100655 : -T-GCC-ACTTCAAGAGGCCCTAAGCC--C-AGCGATATTAGAGGTG-AGCCCCACCCAAG---C--AGA--GTA-TT-C-GTCC--C---------C-CCTTCCTGGAACCCT-GTTTC-T-G--CG---ACCA---AAGCT-GTT-GTTGG-T-G------C-AAG--T-----G-TGGGGTCC--TGGCCCT-T-G----A--AAATT---AAGGC---TTT-G-CAAA-----GTG-TAAAGACAAAAC-AC---GCAAGTGGGGGGA--A--G-GGCTAT---CCACT-TTTTTATTACTGG---CG-TGGTCCACC---CTG-AAATAAGG-C-TG----CAGTTA--T---A-AGC-CGCTTAGTCCC---CGA-GG-TT-----------GA-CC-AGTG--GGGTAAAG-G--CTA-CCCCATTTAAAACTAAAGCCAAA-T----TA--GGTTT--------C----CCCCTAA--CC--CACC--T------GCCAAATT-CAC-C--CA---ATCAAT-TTAAAGATTTTATtttagttagcgtctgctgtgctcactgtccgtcctgaataaagcaatctacagtgagtacagtggttaaagagctatcacatacactatccatcctgaacaaggcagcccacagtgtatgtggtaatccgagggcgac
gi|100658 : agtagtcacccgtttggttgttaagagtggggggttGC--TGA--C--C-GGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAA---C--AGA--GTAATg
gi|100659 : ---C--AGA---CAATC-CAGTCT-----------------------A--CTTTGA--C-T-G-ACA---ATCA---G-GCT-GTT-GA--A----------C-A-G--T-----G--G-----C--TG---CC-T-G----A--A---T---AAGGC---TC--GACA-------GTG-TG---------T-GT--TGCG-GTTG----A--A--T-G--------C-ACT-T---------------TG-TG-----TA---CTG-GA-TAAGA-C-GG----AAG-TA--C---A-AGC-------GT--C---CGA-GG-CC-----------GG-CC-A
gi|100661 : A--CCT-GT--C-T-G-GCG---ACCA---A-GCT-GTT-GT--A-T-G------C-A-GACTGCAGAG-TG----TC--TG---CC-T-G----A--A---C---A
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gi|100662 : ctgtcctagatctaaCC-GTT-GT--G-T-G------C-A-G--T-----G-TG----TC--TA---CC-T-G----A--A---T---AAGGC---GT--G-CA-------GTG-CA---------C-AC--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTA----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGG-C-TG----CAG-TA--T---A-AGC-GA--TATC--C---CGA-GG-TT-----------GA-CC-AGTG--TA----AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CGC-C--CA---AT-CAT-T---AGATTTTATGTGATT
gi|100657 : CT-GCT-GT--G-C-T------C-A-C--T-----G-T------C--CGT--CC-T-G----A--A---T---AAAGCAATCT--A-CA-------GTG-AG---------T-AC--AGTG-GTTA----A--A--G-AGCTAT---C-ACA-T----AC-ACTA----TC-CA-----TC---CTG-AA-CAAGG-C-AGCCCACAG-TG--T---A-TGT-GG--TAAT--C---CGA-GG-
gi|100650 : ggcctgccacggagaggctgacctcagtagagaggctagccatttagttagcgt--G-GACTAC---C-GCT-T----AT-ACTG----CA--G------C---CTT-AT-TCAGGACACA----CAG-TA--T---A-AGC-GA--TAGC--C---gcgac
gi|100654 : ggctgtagtgcactggagtggcacaccactcggaggctaaccagtaacacgggttagcctacaaggataatgtaattcctcttgtggactcgtctggcgaccaagctgttttgtgcagtgtgtctgcctgaataaggcttgcagtgtacacatcagtggaag----TG-TG-----TCTGTCTG-AA-TAAAG-CTTG----CAG-TG--T---G-CAC-AG--CAGT--gaggttgaccagtgtaaggctaagcattattgtacccactgccaatcacccaatatttagattttaggtgtgtgatt
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Reference ( family-777 ) : GGCAGT-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-NAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
gi|100644 : GGCAGA-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AATGGCA----T-GCC-ACTA--AGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCC--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-GTA-AGC-GG--TAGTCT---GA-GG-TT----------GGCC-AGT---GT-G--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-GAT-T---AGATTTTA----TTTG-ATT
gi|100645 : GGCAGTTAGT-C----GTGTG-TTTG----G-AGTGGCT----T-GCC-ACTT--GGAGGC--TAA--CC-AGTGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---CC-AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GTA-G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---CT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACTAT----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGCGGG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AGCG--CTA-ACC-------------------A-T----TA--GC--T--------C----T-----A--CCATCA----T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-AAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
gi|100646 : GGCAAT-AGT-C----GTGTG-TTTG----G-AGTGGCA----TTGCC-ACTC--AGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTT-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGT---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGTA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGC------G----CAGT-ATA-AGC--G--TAGTCC---GG-GGCTC----------GACC-GGC---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----ACCCC--CA-C--T------GCCAA--T--AA-C--CA---AT-ACTAT---AGA-TTTA----TGTG-ATT
gi|100647 : GGCAGT-AGT-C----GTGTG-TT-G----C-AGTGCTT----T-GCC-ACTC--AGAGGC--TAG--CC-AGTGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---CCAAGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-ACTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TGTTG---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGTTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----T--TG-----TC---CTG-AA-TAA-GCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TTTG--------GACC-AGT---GT-A--AG-G--TTA-ACC-------------------A-T----TA--G---TC-------C----T-----A--CT--CA-C--T------GCCTA--T-CAC-C--CA---AT-CAT-T---TGATTTTC----TTTG-ATT
gi|100648 : GGCAGT-AAA-A----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----T-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAA---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-CG---------CA-C--AGCA-GAGG----A-----------AT---C-ACT-T----AT-ACAG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATATAGC-GG--TAGATC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--GA-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--GT--T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------G-CAA--T-CAC-C--CA---AT-----------ATTGTA-----GTG-ATT
gi|100649 : GGCAGT-GAT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCT----T-GTC-ACTC--AGAGGC--TAG--CC-AGCGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---A--AGA--GTAATTTC-GTC-----TCTT---------CCT--GA---C-TG--T--C-TT-G-GCG---A-CCA---A-GCTG-G--GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-A----CT-ACTG----TGTTG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GT--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-ATGAA-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---TCTGGTAGAC----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CACACA-CA---AT-TA--T---AAATTTTA----TGTG-ATT
gi|100650 : GGCTGT-AGT--------GCA-CT-G----G-AGTGGCA----C-ACC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTAACA---CGGGTT-AGCC--TAC-AAG---G--ATAATGTAATT-C-CTC-----T--T---------GTG--GA---CTCG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-TT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--ATCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-GCT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-AGC-------------------A-T----TA--T---T--------G----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-ATT-T---AGATTTTAGGTGTGTG-ATT
gi|100651 : GACAGT-AGTTC----GTGTG-TT-G----G-AGTGTT-------GCC-ACTC--AGAGGC--TT---CC-AGGGATA---GAAATT-ATCC--GCC-AAG---C--AGA--ATAATTTC-GTC-----T--T---------CC---GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---AACCA---A-GCTG-TT-G---------G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCTTG----ATCA---TAA---GGC---GT--G-CA--G-------TG-CA---------CAAC--AGCA--TG-----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-TA---AT-ACTA-----G-TG-----TC---CTG-AA-TAA-GCT-----GC---CAG---TA-AAC-G----AACCC---GA-GGATT----------GACCGAGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------AGT----TAG-G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CG--C--CA---AT-A---T---AGATTTTA----
gi|100652 : GGCTGT-AGT--------GCA-CC-G----G-AGTGACA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CT-AGTAACA---GAGGTT-AGCC--TTC-AAG---G--ATAATGTAATT-C-GTC-----T--T---------GTG--GA---CTCG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCT-G----A--A---TAA---TGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--ATCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-GCT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---ATG-AA-TGAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCG---GA-GG-AA----------GACC-AGT---GT-G--AG-G--CT
gi|100653 : GGCTGT-AGT------G-ATA-CT-G----GCAGTGGCA----C-GCCCACTC--GGAGGC--TAA--CCGAGT-ACAA--GAGGTT-AGCC--TCC-AAGGACT--AAT--GTAATT-C--TC-----T--T---------TGTAGGA---TTCG--T--CCT--GAGCG---A-CCA---A-GCTT-TT-GT--G---TTG-CTA-G--TTG---GT------TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GCT---TT--G-CA--G--------G-TAA--------CA-C--AGCC-ATGG----A--ACCG-GGCTAT---C-ACC-T-----T-AGTAAAAATG-TG-----TC---CTGAAA-TAA-GCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GAGGG-TTG---------GACC-AGT----T-A--AG-G--CTACACC-------------------A-A----TA------T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------TCCAA--T-CAC-TCACA---AT-CA--T---AGA--TTA----TGTGCATT
gi|100654 : GGCAGC-AGT-C----GTGTG-TA-G----G-AGTGGCA----T-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-ATTGACA---GAGGTT-AACC--ACC-AAG---G--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--TA---CCTG--T--T-T--G-GTG---A-CTA---A-GTTG-TT-GT--G---T-G-C-A-T--T-----GT-G----TC-T--G---TCT-G----A--A---TAA---AGC---TT--G-CA--G-------TG-TG---------CA-C--AGCA-GTG
gi|100655 : AGT-AGT-CACCCGTTTGGTT-GTTAAG-AGTGGGGGGTTT-GCC-ACTTCAAGAGGCCCTAAGCCC-AGCGATATTAGAGGTG-AGCCCCACCCAAG---C--AGA--GTA-TT-C-GTCCCCCCT--T---------CCT--GGAACCCTG--TTTC-T--G--CG---A-CCA---AAGCTG-TT-GTTGG---T-G-C-AAG--T-----GT-GGGGTCC-T--GGCCCTT-G----A--AAATTAA---GGC---TTT-G-CAAAG-------TG-TAAAGACAAAACA-C---GCAAGTGGGGGGA--A--G-GGCTAT---CCACT-TTTTTATTACTGG---CG-TGGTCCACC---CTG-AAATAAGGCT-----G----CAGTTATA-AGC-CGCTTAGTCCCC-GA-GG-TT----------GACC-AGTGGGGTAA--AG-G--CTA-CCCCATTTAAAACTAAAGCCAAA-T----TA--GGTTT--------C----CCCCTAA--CC--CACC--T------GCCAAATT-CAC-C--CA---ATCAAT-TTAAAGATTTTA----TG
gi|100656 : T-G----G-AGTGGCAA---C-GCCTACTC--GGAGGC---AA--CTGAGTAACAA--GAGGTTTAGCT---TC-AAG---A--ATAATGTAATT---GTC-----T--TGTGGGTCTACGT--CA---ACCG--T--C-T--G-GTGCGGA-CCA---A-GCTG-TTTGT--GAATT-GGC-A-G--T-----GT-G----TCGT--G---CTTTG----A--A---TAA---GGC---TTTTG-CA--G-------TG-TAT--------CA-C--AGCA-GTGA----A--G--G-GGCGAT---C-ACT-T----ATTACTG----TG-TG-----TCACACTG-AACTAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-C---TCGTCCCCTGA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AA-GGCCTA-ACC-------------------A-T----TACGG---TT-------C----T-----A--CCT-CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-CAT-T---AGATTTTATATTTGTG-ATT
gi|100657 : CTG-CT-GT--G---C-T-C-A-C--T-----GT-------C-C--GT--CCT-G----A--A---TAA---AGCAATCT--A-CA--G-------TG-AG---------TA-C--AGTG-GTTA----A--A--G-AGCTAT---C-ACA-T----AC-ACTA----TC-CA-----TC---CTG-AA-CAAGGCA-----GCCCACAGT-GTA-TGT-GG--TAATCC---GA-GG-GC----------GAC
gi|100658 : ggcctgccacggagaggctgacctcagtagagaggctagccatttagttagcgtGC--TGA--CC-GGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAA---C--AGA--GTAAT
gi|100659 : ---C--AGA---CAATC-CAGTC-----T--A---------CTT---------TG--A--C-T--G-ACA---A-TCA---G-GCTG-TT-GA--A-------C-A-G--T-----G--G-----C-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TC--GACA--G-------TG-TG---------TG-T--TGCG-GTTG----A--A--T-G--------C-ACT-T---------------TG-TG-----TA---CTG-GA-TAAGACG-----G----AAGT-ACA-AGC-------GTCC---GA-GG-CC----------GGCC-A
gi|100660 : CT--GT---CCTAGAT--C-TAAG-GCG---A-CCAGTGA-GCTGGTTAGT--GC--T-G-C-A-G--T-----GTTG----TC-TATG---CTC-GGTGAA--A---TAAAAAGGCA--TT--G-CA--AAAAACGATG-TA---------CG-CGAAGCA-GTGA----ACTA--GTGGTTGTTGGC-ACT-G----AC-AC-------G-TA------------------AAGGCTTTCGTG----GATT-AGA-AGCTGG--TAGTCC---GA-GT-TCTGAACCTCAGGATC-AGC---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-TCTCACG--G---C--------CGCGTT-----A--CC--CA-CAATAAACTAGCCAA--TCCAC-C--CAGCTATAAAT-C---AGAGTTT
gi|100661 : A---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--A---T-G-C-A-GACTGCAGAGT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---CA
gi|100662 : CCG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCT-G----A--A---TAA---GGC---GT--G-CA--G-------TG-CA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTA----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GA--TATCCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CGC-C--CA---AT-CAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
Alignments
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Reference ( family-777 ) : GGCAGT-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-NAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
gi|100644 : GGCAGA-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AATGGCA----T-GCC-ACTA--AGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCC--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-GTA-AGC-GG--TAGTCT---GA-GG-TT----------GGCC-AGT---GT-G--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-GAT-T---AGATTTTA----TTTG-ATT
gi|100645 : GGCAGTTAGT-C----GTGTG-TTTG----G-AGTGGCT----T-GCC-ACTT--GGAGGC--TAA--CC-AGTGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---CC-AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GTA-G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---CT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACTAT----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGCGGG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AGCG--CTA-ACC-------------------A-T----TA--GC--T--------C----T-----A--CCATCA----T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-AAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
gi|100646 : GGCAAT-AGT-C----GTGTG-TTTG----G-AGTGGCA----TTGCC-ACTC--AGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTT-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGT---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGTA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGC------G----CAGT-ATA-AGC--G--TAGTCC---GG-GGCTC----------GACC-GGC---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----ACCCC--CA-C--T------GCCAA--T--AA-C--CA---AT-ACTAT---AGA-TTTA----TGTG-ATT
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gi|100648 : GGCAGT-AAA-A----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----T-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAA---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-CG---------CA-C--AGCA-GAGG----A-----------AT---C-ACT-T----AT-ACAG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATATAGC-GG--TAGATC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--GA-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--GT--T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------G-CAA--T-CAC-C--CA---AT-----------ATTGTA-----GTG-ATT
gi|100649 : GGCAGT-GAT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCT----T-GTC-ACTC--AGAGGC--TAG--CC-AGCGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---A--AGA--GTAATTTC-GTC-----TCTT---------CCT--GA---C-TG--T--C-TT-G-GCG---A-CCA---A-GCTG-G--GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-A----CT-ACTG----TGTTG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GT--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-ATGAA-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---TCTGGTAGAC----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CACACA-CA---AT-TA--T---AAATTTTA----TGTG-ATT
gi|100650 : GGCTGT-AGT--------GCA-CT-G----G-AGTGGCA----C-ACC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTAACA---CGGGTT-AGCC--TAC-AAG---G--ATAATGTAATT-C-CTC-----T--T---------GTG--GA---CTCG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-TT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--ATCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-GCT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-AGC-------------------A-T----TA--T---T--------G----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-ATT-T---AGATTTTAGGTGTGTG-ATT
gi|100651 : GACAGT-AGTTC----GTGTG-TT-G----G-AGTGTT-------GCC-ACTC--AGAGGC--TT---CC-AGGGATA---GAAATT-ATCC--GCC-AAG---C--AGA--ATAATTTC-GTC-----T--T---------CC---GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---AACCA---A-GCTG-TT-G---------G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCTTG----ATCA---TAA---GGC---GT--G-CA--G-------TG-CA---------CAAC--AGCA--TG-----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-TA---AT-ACTA-----G-TG-----TC---CTG-AA-TAA-GCT-----GC---CAG---TA-AAC-G----AACCC---GA-GGATT----------GACCGAGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------AGT----TAG-G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CG--C--CA---AT-A---T---AGATTTTA----
gi|100652 : GGCTGT-AGT--------GCA-CC-G----G-AGTGACA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CT-AGTAACA---GAGGTT-AGCC--TTC-AAG---G--ATAATGTAATT-C-GTC-----T--T---------GTG--GA---CTCG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCT-G----A--A---TAA---TGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--ATCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-GCT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---ATG-AA-TGAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCG---GA-GG-AA----------GACC-AGT---GT-G--AG-G--CT
gi|100653 : GGCTGT-AGT------G-ATA-CT-G----GCAGTGGCA----C-GCCCACTC--GGAGGC--TAA--CCGAGT-ACAA--GAGGTT-AGCC--TCC-AAGGACT--AAT--GTAATT-C--TC-----T--T---------TGTAGGA---TTCG--T--CCT--GAGCG---A-CCA---A-GCTT-TT-GT--G---TTG-CTA-G--TTG---GT------TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GCT---TT--G-CA--G--------G-TAA--------CA-C--AGCC-ATGG----A--ACCG-GGCTAT---C-ACC-T-----T-AGTAAAAATG-TG-----TC---CTGAAA-TAA-GCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GAGGG-TTG---------GACC-AGT----T-A--AG-G--CTACACC-------------------A-A----TA------T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------TCCAA--T-CAC-TCACA---AT-CA--T---AGA--TTA----TGTGCATT
gi|100654 : GGCAGC-AGT-C----GTGTG-TA-G----G-AGTGGCA----T-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-ATTGACA---GAGGTT-AACC--ACC-AAG---G--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--TA---CCTG--T--T-T--G-GTG---A-CTA---A-GTTG-TT-GT--G---T-G-C-A-T--T-----GT-G----TC-T--G---TCT-G----A--A---TAA---AGC---TT--G-CA--G-------TG-TG---------CA-C--AGCA-GTG
gi|100655 : AGT-AGT-CACCCGTTTGGTT-GTTAAG-AGTGGGGGGTTT-GCC-ACTTCAAGAGGCCCTAAGCCC-AGCGATATTAGAGGTG-AGCCCCACCCAAG---C--AGA--GTA-TT-C-GTCCCCCCT--T---------CCT--GGAACCCTG--TTTC-T--G--CG---A-CCA---AAGCTG-TT-GTTGG---T-G-C-AAG--T-----GT-GGGGTCC-T--GGCCCTT-G----A--AAATTAA---GGC---TTT-G-CAAAG-------TG-TAAAGACAAAACA-C---GCAAGTGGGGGGA--A--G-GGCTAT---CCACT-TTTTTATTACTGG---CG-TGGTCCACC---CTG-AAATAAGGCT-----G----CAGTTATA-AGC-CGCTTAGTCCCC-GA-GG-TT----------GACC-AGTGGGGTAA--AG-G--CTA-CCCCATTTAAAACTAAAGCCAAA-T----TA--GGTTT--------C----CCCCTAA--CC--CACC--T------GCCAAATT-CAC-C--CA---ATCAAT-TTAAAGATTTTA----TG
gi|100656 : T-G----G-AGTGGCAA---C-GCCTACTC--GGAGGC---AA--CTGAGTAACAA--GAGGTTTAGCT---TC-AAG---A--ATAATGTAATT---GTC-----T--TGTGGGTCTACGT--CA---ACCG--T--C-T--G-GTGCGGA-CCA---A-GCTG-TTTGT--GAATT-GGC-A-G--T-----GT-G----TCGT--G---CTTTG----A--A---TAA---GGC---TTTTG-CA--G-------TG-TAT--------CA-C--AGCA-GTGA----A--G--G-GGCGAT---C-ACT-T----ATTACTG----TG-TG-----TCACACTG-AACTAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-C---TCGTCCCCTGA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AA-GGCCTA-ACC-------------------A-T----TACGG---TT-------C----T-----A--CCT-CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-CAT-T---AGATTTTATATTTGTG-ATT
gi|100657 : CTG-CT-GT--G---C-T-C-A-C--T-----GT-------C-C--GT--CCT-G----A--A---TAA---AGCAATCT--A-CA--G-------TG-AG---------TA-C--AGTG-GTTA----A--A--G-AGCTAT---C-ACA-T----AC-ACTA----TC-CA-----TC---CTG-AA-CAAGGCA-----GCCCACAGT-GTA-TGT-GG--TAATCC---GA-GG-GC----------GAC
gi|100658 : ggcctgccacggagaggctgacctcagtagagaggctagccatttagttagcgtGC--TGA--CC-GGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAA---C--AGA--GTAAT
gi|100659 : ---C--AGA---CAATC-CAGTC-----T--A---------CTT---------TG--A--C-T--G-ACA---A-TCA---G-GCTG-TT-GA--A-------C-A-G--T-----G--G-----C-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TC--GACA--G-------TG-TG---------TG-T--TGCG-GTTG----A--A--T-G--------C-ACT-T---------------TG-TG-----TA---CTG-GA-TAAGACG-----G----AAGT-ACA-AGC-------GTCC---GA-GG-CC----------GGCC-A
gi|100660 : CT--GT---CCTAGAT--C-TAAG-GCG---A-CCAGTGA-GCTGGTTAGT--GC--T-G-C-A-G--T-----GTTG----TC-TATG---CTC-GGTGAA--A---TAAAAAGGCA--TT--G-CA--AAAAACGATG-TA---------CG-CGAAGCA-GTGA----ACTA--GTGGTTGTTGGC-ACT-G----AC-AC-------G-TA------------------AAGGCTTTCGTG----GATT-AGA-AGCTGG--TAGTCC---GA-GT-TCTGAACCTCAGGATC-AGC---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-TCTCACG--G---C--------CGCGTT-----A--CC--CA-CAATAAACTAGCCAA--TCCAC-C--CAGCTATAAAT-C---AGAGTTT
gi|100661 : A---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--A---T-G-C-A-GACTGCAGAGT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---CA
gi|100662 : CCG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCT-G----A--A---TAA---GGC---GT--G-CA--G-------TG-CA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTA----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GA--TATCCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CGC-C--CA---AT-CAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
blockSeqs : T CACCC G T TTAA C GGGTTT C CA CC GC G TTA T CCA C GACT AT T A CCCCC CT GTGGGTCTA AG AAC GA TT C AA A CGG A GTG A G T TG AAT T G T A AC GCAGA T GGGT G AT GCC T GTGA TC AAT AAA AAT TT A AA AAAACGA T AAGACAAAA A GA A GGGG CT CC T TGG C A TTTT T AAAA T GTCCA ACA A A TTCGT CCCA T T CGCT CCT G C TGAACCTCAG G GGG A TG C GC C CATTTAAAACTAAAGCCAAATTAGGTTT GCGT CCCTA CC AT C AA AAACTA AT C A CA GCT ACTA TAA GGTG C
blockSeqs : . TC . T . . ATT T . . . G A . A . CCA AT T . . . . . . . . . T . . . . . . A A C . . . . . TG . . . . T T . . . . A T . . . . A . . . . . . . . . . A T G . . . . C . C . . GGG CC . A TG . . . . . . . ATTAGTCTGGTAGA . . . T . . . . . . A . CAAT . TATT .
blockSeqs : . C . . . . AAC . . . . . A . A . CC AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGG . . . G . . . . . . . ATCTCACGGC . . . . . . . . . . . . AAAT . . .
blockSeqs : . C . . . . TT . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . ATTACGGTT . . . . . . . . . . . . AAT . . .
blockSeqs : . C . . . . TT . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . AGTTAGGT . . . . . . . . . . . . CAT . . .
blockSeqs : . A . . . . AT . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . ATTAGCT . . . . . . . . . . . . ATT . . .
blockSeqs : . C . . . . TT . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . ATTAGTC . . . . . . . . . . . . CAT . . .
blockSeqs : . C . . . . AC . . . . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . ATTAGTT . . . . . . . . . . . . CAT . . .
blockSeqs : . . . . . . AC . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . ATTAGT . . . . . . . . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . . AC . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . ATTATT . . . . . . . . . . . . CA . .
blockSeqs : . . . . . . AT . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . ATTAGT . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . AATAT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GGCAGT-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-NAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
finalCons : GGCAGT-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-NAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111 111 111111 11 111111111 111111111 1111111111 2222222222222222222222222222222222222222222 11111 1111
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lowQualScore : . ...... . . .... . ....... . .. .. .. . ... . ... . ...... .. . . ..... .. ......... .. ... .. .. . .. . ... . ... . . . .. ... . . . . .. ..... . .... . .. ... . .... .. ... ... ... .. . .. ....... . ......... . .. . .... .. .. . ... . . .... . .... . ..... ... . . ..... .... . . ..... ... . . .......... . ... . .. . .. . ........................................... .... ..... .. .. . .. ...... .. . . .. ... ..... ... . .... .
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consensus : GGCAGT-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-NAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
Reference ( family-777 ) : GGCAGT-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-NAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
gi|100644 : GGCAGA-AGT-C----GTGTG-TT-G----G-AATGGCA----T-GCC-ACTA--AGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCC--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-GTA-AGC-GG--TAGTCT---GA-GG-TT----------GGCC-AGT---GT-G--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-GAT-T---AGATTTTA----TTTG-ATT
gi|100645 : GGCAGTTAGT-C----GTGTG-TTTG----G-AGTGGCT----T-GCC-ACTT--GGAGGC--TAA--CC-AGTGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---CC-AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GTA-G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---CT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACTAT----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGCGGG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AGCG--CTA-ACC-------------------A-T----TA--GC--T--------C----T-----A--CCATCA----T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-AAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT
gi|100646 : GGCAAT-AGT-C----GTGTG-TTTG----G-AGTGGCA----TTGCC-ACTC--AGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTT-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGT---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGTA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGC------G----CAGT-ATA-AGC--G--TAGTCC---GG-GGCTC----------GACC-GGC---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----ACCCC--CA-C--T------GCCAA--T--AA-C--CA---AT-ACTAT---AGA-TTTA----TGTG-ATT
gi|100647 : GGCAGT-AGT-C----GTGTG-TT-G----C-AGTGCTT----T-GCC-ACTC--AGAGGC--TAG--CC-AGTGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---CCAAGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-ACTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TGTTG---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGTTAT---C-ACT-T----AT-ACTG----T--TG-----TC---CTG-AA-TAA-GCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TTTG--------GACC-AGT---GT-A--AG-G--TTA-ACC-------------------A-T----TA--G---TC-------C----T-----A--CT--CA-C--T------GCCTA--T-CAC-C--CA---AT-CAT-T---TGATTTTC----TTTG-ATT
gi|100648 : GGCAGT-AAA-A----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCA----T-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAA---C--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--GA---CCTG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-CG---------CA-C--AGCA-GAGG----A-----------AT---C-ACT-T----AT-ACAG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATATAGC-GG--TAGATC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--GA-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--GT--T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------G-CAA--T-CAC-C--CA---AT-----------ATTGTA-----GTG-ATT
gi|100649 : GGCAGT-GAT-C----GTGTG-TT-G----G-AGTGGCT----T-GTC-ACTC--AGAGGC--TAG--CC-AGCGATA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAG---A--AGA--GTAATTTC-GTC-----TCTT---------CCT--GA---C-TG--T--C-TT-G-GCG---A-CCA---A-GCTG-G--GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-A----CT-ACTG----TGTTG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GT--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-ATGAA-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---TCTGGTAGAC----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CACACA-CA---AT-TA--T---AAATTTTA----TGTG-ATT
gi|100650 : GGCTGT-AGT--------GCA-CT-G----G-AGTGGCA----C-ACC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-AGTAACA---CGGGTT-AGCC--TAC-AAG---G--ATAATGTAATT-C-CTC-----T--T---------GTG--GA---CTCG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-TT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--ATCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-GCT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-AGC-------------------A-T----TA--T---T--------G----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-ATT-T---AGATTTTAGGTGTGTG-ATT
gi|100651 : GACAGT-AGTTC----GTGTG-TT-G----G-AGTGTT-------GCC-ACTC--AGAGGC--TT---CC-AGGGATA---GAAATT-ATCC--GCC-AAG---C--AGA--ATAATTTC-GTC-----T--T---------CC---GA---CCTG--T--C-T--G-GCG---AACCA---A-GCTG-TT-G---------G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCTTG----ATCA---TAA---GGC---GT--G-CA--G-------TG-CA---------CAAC--AGCA--TG-----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-TA---AT-ACTA-----G-TG-----TC---CTG-AA-TAA-GCT-----GC---CAG---TA-AAC-G----AACCC---GA-GGATT----------GACCGAGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------AGT----TAG-G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CG--C--CA---AT-A---T---AGATTTTA----
gi|100652 : GGCTGT-AGT--------GCA-CC-G----G-AGTGACA----C-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CT-AGTAACA---GAGGTT-AGCC--TTC-AAG---G--ATAATGTAATT-C-GTC-----T--T---------GTG--GA---CTCG--T--C-T--G-GTG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCT-G----A--A---TAA---TGC---TT--G-CA--G-------TG-TA---------CA-C--ATCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-GCT-T----AT-ACTG----TG-TG-----TC---ATG-AA-TGAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCG---GA-GG-AA----------GACC-AGT---GT-G--AG-G--CT
gi|100653 : GGCTGT-AGT------G-ATA-CT-G----GCAGTGGCA----C-GCCCACTC--GGAGGC--TAA--CCGAGT-ACAA--GAGGTT-AGCC--TCC-AAGGACT--AAT--GTAATT-C--TC-----T--T---------TGTAGGA---TTCG--T--CCT--GAGCG---A-CCA---A-GCTT-TT-GT--G---TTG-CTA-G--TTG---GT------TC-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GCT---TT--G-CA--G--------G-TAA--------CA-C--AGCC-ATGG----A--ACCG-GGCTAT---C-ACC-T-----T-AGTAAAAATG-TG-----TC---CTGAAA-TAA-GCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GG--TAGTCC---GAGGG-TTG---------GACC-AGT----T-A--AG-G--CTACACC-------------------A-A----TA------T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------TCCAA--T-CAC-TCACA---AT-CA--T---AGA--TTA----TGTGCATT
gi|100654 : GGCAGC-AGT-C----GTGTG-TA-G----G-AGTGGCA----T-GCC-ACTC--GGAGGC--TAA--CC-ATTGACA---GAGGTT-AACC--ACC-AAG---G--AGA--GTAATC-C-GTC-----T--T---------CCT--TA---CCTG--T--T-T--G-GTG---A-CTA---A-GTTG-TT-GT--G---T-G-C-A-T--T-----GT-G----TC-T--G---TCT-G----A--A---TAA---AGC---TT--G-CA--G-------TG-TG---------CA-C--AGCA-GTG
gi|100655 : AGT-AGT-CACCCGTTTGGTT-GTTAAG-AGTGGGGGGTTT-GCC-ACTTCAAGAGGCCCTAAGCCC-AGCGATATTAGAGGTG-AGCCCCACCCAAG---C--AGA--GTA-TT-C-GTCCCCCCT--T---------CCT--GGAACCCTG--TTTC-T--G--CG---A-CCA---AAGCTG-TT-GTTGG---T-G-C-AAG--T-----GT-GGGGTCC-T--GGCCCTT-G----A--AAATTAA---GGC---TTT-G-CAAAG-------TG-TAAAGACAAAACA-C---GCAAGTGGGGGGA--A--G-GGCTAT---CCACT-TTTTTATTACTGG---CG-TGGTCCACC---CTG-AAATAAGGCT-----G----CAGTTATA-AGC-CGCTTAGTCCCC-GA-GG-TT----------GACC-AGTGGGGTAA--AG-G--CTA-CCCCATTTAAAACTAAAGCCAAA-T----TA--GGTTT--------C----CCCCTAA--CC--CACC--T------GCCAAATT-CAC-C--CA---ATCAAT-TTAAAGATTTTA----TG
gi|100656 : T-G----G-AGTGGCAA---C-GCCTACTC--GGAGGC---AA--CTGAGTAACAA--GAGGTTTAGCT---TC-AAG---A--ATAATGTAATT---GTC-----T--TGTGGGTCTACGT--CA---ACCG--T--C-T--G-GTGCGGA-CCA---A-GCTG-TTTGT--GAATT-GGC-A-G--T-----GT-G----TCGT--G---CTTTG----A--A---TAA---GGC---TTTTG-CA--G-------TG-TAT--------CA-C--AGCA-GTGA----A--G--G-GGCGAT---C-ACT-T----ATTACTG----TG-TG-----TCACACTG-AACTAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-C---TCGTCCCCTGA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AA-GGCCTA-ACC-------------------A-T----TACGG---TT-------C----T-----A--CCT-CA-C--T------GCCAA--T-CAC-C--CA---AT-CAT-T---AGATTTTATATTTGTG-ATT
gi|100657 : CTG-CT-GT--G---C-T-C-A-C--T-----GT-------C-C--GT--CCT-G----A--A---TAA---AGCAATCT--A-CA--G-------TG-AG---------TA-C--AGTG-GTTA----A--A--G-AGCTAT---C-ACA-T----AC-ACTA----TC-CA-----TC---CTG-AA-CAAGGCA-----GCCCACAGT-GTA-TGT-GG--TAATCC---GA-GG-GC----------GAC
gi|100658 : ggcctgccacggagaggctgacctcagtagagaggctagccatttagttagcgtGC--TGA--CC-GGTGACA---GAGGTT-AGCC--ACC-AAA---C--AGA--GTAAT
gi|100659 : ---C--AGA---CAATC-CAGTC-----T--A---------CTT---------TG--A--C-T--G-ACA---A-TCA---G-GCTG-TT-GA--A-------C-A-G--T-----G--G-----C-T--G---CCT-G----A--A---TAA---GGC---TC--GACA--G-------TG-TG---------TG-T--TGCG-GTTG----A--A--T-G--------C-ACT-T---------------TG-TG-----TA---CTG-GA-TAAGACG-----G----AAGT-ACA-AGC-------GTCC---GA-GG-CC----------GGCC-A
gi|100660 : CT--GT---CCTAGAT--C-TAAG-GCG---A-CCAGTGA-GCTGGTTAGT--GC--T-G-C-A-G--T-----GTTG----TC-TATG---CTC-GGTGAA--A---TAAAAAGGCA--TT--G-CA--AAAAACGATG-TA---------CG-CGAAGCA-GTGA----ACTA--GTGGTTGTTGGC-ACT-G----AC-AC-------G-TA------------------AAGGCTTTCGTG----GATT-AGA-AGCTGG--TAGTCC---GA-GT-TCTGAACCTCAGGATC-AGC---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-TCTCACG--G---C--------CGCGTT-----A--CC--CA-CAATAAACTAGCCAA--TCCAC-C--CAGCTATAAAT-C---AGAGTTT
gi|100661 : A---CCTG--T--C-T--G-GCG---A-CCA---A-GCTG-TT-GT--A---T-G-C-A-GACTGCAGAGT-G----TC-T--G---CCT-G----A--A---CA
gi|100662 : CCG-TT-GT--G---T-G-C-A-G--T-----GT-G----TC-T--A---CCT-G----A--A---TAA---GGC---GT--G-CA--G-------TG-CA---------CA-C--AGCA-GTGG----A--A--G-GGCTAT---C-ACT-T----AT-ACTA----TG-TG-----TC---CTG-AA-TAAGGCT-----G----CAGT-ATA-AGC-GA--TATCCC---GA-GG-TT----------GACC-AGT---GT-A--AG-G--CTA-ACC-------------------A-T----TA--G---T--------C----T-----A--CC--CA-C--T------GCCAA--T-CGC-C--CA---AT-CAT-T---AGATTTTA----TGTG-ATT