lowQualScore : 11 22222222222222 111 1 111 11111111111111111 111111 111111111111111 11 11 1
lowQualScore : 7 4 44 44 44 3 6 77777777777777 2 33 2 0 2 6666 666 2 1 2 33 2 66 2 9999999 33 3 6 333 33333333333333333 44 999999 999999999999999 0 3 44 9999 22 5555 33 55 3 55 11 3 44 3 3 3 3 88 0 666
lowQualScore : . . .. .. .. . . .............. . .. . . . .... ... . . . .. . .. . ....... .. . . ... ................. .. ...... ............... . . .. .... .. .... .. .. . .. .. . .. . . . . .. . ...
lowQualScore : 1 4 11 22 22 1 2 88888888888888 9 99 9 1 9 1111 888 7 3 9 99 9 88 9 3333333 99 1 2 888 66666666666666666 22 222222 555555555555555 3 3 11 1111 77 0000 44 55 5 66 88 6 22 1 1 1 1 66 1 444
consensus : TATNTTTGCTCGTTT-CTC--A--TGAATTAT-GCATGA-C-------NGG--GAGT-AA--CC-AATCATAT-CACGTCC----GAC-C-AA-ACTTT-GC--TC-G--GAG-A-------GCC--CTAACAA-GTCC-CAA-CCAATC-----A-----T-----A--AGAN-----AAGGT----N-----A----AAAAG-TTCATGCATAT-T----T-AATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Reference ( gi|94288 ) : TATATCTGCTTGTTA-CTC--A--TGAATTAT-GCATGA-C-------AGG--ATGT-AA--CC-AATCATAT-CACGTCC----GAC-A-AA-ACATT-GC--TC-G--GAG-A-------GCC--CTAACAA-GTCC-CAG-CCAATC-----A-----T-----A--AGAC-----AAGGT----A-----A----AAAAG-TTCATGCATAT-T----T-AATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAAAAGGA-CTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-AATCAGAAG---CACC
gi|94287 : TATATTTGCTCTTTT-CTC--A--TGAATTAT-GCATGA-C-------TGG--GAGT-AG--CC-AATCGTAT-CACATTT----GAC-C-AA-ACTTT-GC--TC-G--GAG-A-------GCC--CTATCAA-GTCT-CAA-CCAATC-----A-----T-----A--AGATAAGAAAAGGT----C-----A----AAGGG-TTCATGCATAT-T----T-AATG----AGAAG--TGAGCCG--TTAGATTAGGA-TTGACCC-ATGGGTG-TGATG-AT-GGA-AGAA-TC-GATGAGAAG---CACC
gi|94286 : TATTTTTGCTCATTT-CTC--A--TGAATTAT-GCATGATC-------GGG--A-AT-AA--CC-AATTATAT-TACATCT----GAC-C-AA-ATTTT-AC--TT-G--TAG-A-------GCC--CTAACAA-GTCC-AAA-CCAATC-----ATAATGT-----A--AGAA-----AAGGT----T-----A----AAAAG-TTCATGTATAT-T----T-AATG----AGAAA--TGAGCT---TT--AATAGAA-TTGACCC-ACGA--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94293 : TATATTTGCTTGTTA-CTC--A--TGAATTAT-GCATGA---------ATGCCATGTAAA--CCAAATCATTT-TACGTCCCCAAGACAA-AA-ACATT-GC--TCAA--GAGCA-------GCC--CTAACAA-GTCC-C-----------------------------AAAC-----AAGGTTAAAA-----A----AGAAG-TTCATG-ATAT-T----T-ATTG----AT-AA--CGAGCTG--TTTGAAA--GG-CTGACCCGACGG--GTTGATG-AT-GGAGAGAA-CA-GATCAGAAG---CACC
gi|94291 : TATTTTTGCTTGTTT-CTC--A--TGAATTAT-GCATGA-CTATGGGTAAG--GCCT-AA--CC-AATCATAT-CACATTC----TAC-C-AA-ACTTT-AC--TT-G--GAG-ACTGGAGAGTC--CAAACAA-GTCC-CAA-TCAATC-----A-----T-----A--AGATAA---AAGGT----G-----A----AAAAG-TTCATGCATAT-TACCAT-ACTGGTAAAGAAAACCGAGCTG--TTTGAATGGGATTTGGCCC-ACGG--G-TAATG-AT-GGAGAGAA-TC-GAT
gi|94296 : TATATC-GCTTGTTA--TCGTA--TGA--TATAGCATGC-C--------GG--ATGT-AATACC-A-TCATAT-CA-GTCC----GAC-A-AAGACAT--GC--TC-G--GA--A-------GCC--TAAACAA-GATC-CA--CCAATC-----A-----T-----T--AAAC-----AAGGT----A-----A----AAAAG-TTCATGCATTA-T----T-AATG----AG-AA--CATGCTG--TTAGAAA--GA----ACCC-AC-G--G-TGATG-ATAGGAGA-AA-TCAAATCAGAAG---CACC
gi|94290 : attTATTTTTGCTCGTTT-CTC--A--TGAATTAT-GCATGA-C-------CGG--GAGT-AG--CC-AATCATAT-CACTCCC----GACTA-CA-A------------G--AAG-A-------ACC--CTAACAA-GTTT-TAA-TTAATC-----A-----T-----A--AGGT-----AAGAA----A-----AGGTCAAACG-TTCATGCATAT-T----T-AATG----AGAAA--AGAGCTG--TTGGAATAGAA-TTGACAC-ACGG--G-TGATG-AT-AATGAGAA-T------AGAAGGGTCACC
gi|94294 : TATTTTTGCTCGTTT-CGC--A--TGAATTAC--------C-------GGG--A-GT-AA--CC-AGTCATAT-TACGTTC----GAC-C-AA-AC
gi|94295 : ATTTTTGCTCTTTT-CTC--T--TGAATTAT-GCATGA-C-------CGG--AAGA-AA--CG-AATCATAT-CACATCC----GAC-C-AA-ACTTT-AC--TC-G--GAT-A-------GTT--CTAACAC-GACC-CAA-TCAATCATTAGA-----T-----A--AGAA-----AAGGT----C-----A----AAGAG-TCCATGCATAT-T----T-AATG----AGAAA--TGAGGTG--TTTGAGTAGAA-TTGGTCC-ACAA--T-TGAT--AT-GTAGAGAA-TC-GAATAGAAG---CACCtcccaacaagtaaccca
gi|94297 : ATGTTTACTCGTTT-ATC--A--TGTTTTAT-GCATGGTC-------AGG--AGTT-AA--CC-AAGCACAT-CACGTCC----GAC-C-AA-A-ATTAGC--CC-A--TAG-A-------GCC--CTAACAA-TTCC-CAA-CCAATC-----A-----C-----A--AGA
gi|94289 : TTTGCTCGTTT-CTC--A--TGAATTAT-GCATGA-CCC-----GGG--A-GC-AA--CC-AATCATAT-CATGTCT----GAC-C-AA-ACTTT-GC--TC-A--GAG-A-------GCC--CAGACAA-GTCC-CAA-CCAATC-----A-----T-----A--AGTT-----AAGAA----ATGGGCA----AAAAG-TACATGCATATATTGA-T-AATG----TAAAA--TGAGCTG--CTTGAATAGGA-TTGGCCC-ACAG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAt
gi|94298 : tgttTGCTTGTTT-GTA--A--TGATTTAT-GCATGA-C-------TGG--GAGT-AA--CC-AGTTATAT-CACGTCC----GAC-C-AA-ACTTT-GC--TC-G--TAA-A-------GCC--CTAACAA-GTCC-CAA------------------------A--AGAA-----AAGGT----C-----A----AAACG-TCCATGCATAT-T----T-AATG----AGAAA--CGGGCTG--TTTGAATGGAA-TCCACCC-ACGG--G-T-----------GAGAA-TC-GATAAAAAG---CATC
gi|94299 : ttgTGCTTGTTT-CTC--A--TGAATGAT-GTATGA-C-------CGA--GAGT-AA--CT-AATAAAAT-CATGTCC----AAC-T-AA-ACTTT-GC--TC-G--GAG-A-------ACT--CTAA
gi|94292 : tctTTGTTATCTC--AATTGCATTAT-GCATGA-C-------TGG--GAGT-AA--C---ATCACGTTCGCATCC----GAC-ATAA-ACTTT-GCGGTC-TATGAG-A-------GCTTTCTACCAATGTCCATATTCCAATC-----A-----TTGGGAAGCAGAA-----AAAGT----G-----A----AAACG-TTTATGCATAT-T----TTGATG----AGAAA--CGAGCTGTTTTTGAATAGGA-TTGACCC-ATGG--T-GGCTGAAT-GGAGAGAAGTC-GGTAAGAAG---CAC
gi|94300 : tgtttttgcttcgT-AA--CT-A-TCATAT-CACAT------GAC-T-AA-ACTTT-GC--TC-GC-GAG-A--------CC--CTA--AA-GTTCACAA-CCAATC-----A-----T-----A--TGAT-----A---T----A-----G----AAAGGATT--TGAA-AT-T----T-AATG----AAA
gi|94301 : cgagaga-AA-ACTTT-GT--TC-G--GAG-A-------G-------------TCC-CAA-TCAATC-----A-----T-----A--AGAT-----AAGcaat
gi|94293 : cc-TTCATGCATAA-T----T-CATG----AGTAA--CAAGCa
gi|94287 : tatatttTCATGCATAA-T----T-CATG----AGAAA--AGAGCtgccatgtaaaccaaatcattttacgtccccaagacaaaaacattgctcaagagcagccctaacaagtcccaaacaaggttaaaaaagaagttcatgatatttattgataacgagctgtttgaaaggctgacccgacgggttgatgatggagagaacagatcagaagcacc
gi|94286 : tatatttTCATGCATAA-T----T-CATG----AGAAA--TGAGCctgggagtagccaatcgtatcacatttgaccaaactttgctcggagagccctatcaagtctcaaccaatcataagataagaaaaggtcaaagggttcatgcatatttaatgagaagtgagccgttagattaggattgacccatgggtgtgatgatggaagaatcgatgagaagcacc
gi|94289 : tatttttTCATGCATAA-T----T-CATG----AGAAA--CGAGCtcgggaataaccaattatattacatctgaccaaattttacttgtagagccctaacaagtccaaaccaatcataatgtaagaaaaggttaaaaagttcatgtatatttaatgagaaatgagctttaatagaattgacccacgagtgatgatggagagaatcgataagaagcacc
gi|94291 : tgtttttTCATGCATAA-T----T-CATG----AGAAA--CAAGCcccgggagcaaccaatcatatcatgtctgaccaaactttgctcagagagcccagacaagtcccaaccaatcataagttaagaaatgggcaaaaagtacatgcatatattgataatgtaaaatgagctgcttgaataggattggcccacaggtgatgatggagagaatcgataagaa
gi|94290 : tatttttTCATGCATAA-T----T-CATG----AGAAA--CGAGCctatgggtaaggcctaaccaatcatatcacattctaccaaactttacttggagactggagagtccaaacaagtcccaatcaatcataagataaaaggtgaaaaagttcatgcatattaccatactggtaaagaaaaccgagctgtttgaatgggatttggcccacgggtaatgatggagagaatcgat
gi|94302 : tatttttTAACCC-A-GG--G-TGAT-----GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACCccgggagtagccaatcatatcactcccgactacaagaagaaccctaacaagttttaattaatcataaggtaagaaaaggtcaaacgttcatgcatatttaatgagaaaagagctgttggaatagaattgacacacgggtgatgataatgagaatagaagggtcacc
gi|94304 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94303 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222 1111
lowQualScore : 1 2 8888 33 2 7777 33 2 777 5 33 2 2 5555 5 2 33 9999999999 2 2 33 2 2 33 2 555 000000000000000000000000000 1 44 1 7777 1 3 3 3 2222 7777 55 55 2 2 0 3 3 33 2 2 2 2 2 1 555
lowQualScore : . . .... .. . .... .. . ... . .. . . .... . . .. .......... . . .. . . .. . ... ........................... . .. . .... . . . . .... .... .. .. . . . . . .. . . . . . . ...
lowQualScore : 0 9 9999 99 9 6666 77 7 333 3 77 7 7 7777 0 5 44 2222222222 5 5 44 7 7 77 7 666 666666666666666666666666666 0 22 0 1111 6 3 3 3 9999 1111 00 00 4 3 4 6 3 99 9 9 9 9 9 5 888
consensus : TATTTTTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG-----AAAA--GGTNAAA----AAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Reference ( family-776 ) : TATNTTTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--N-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG-----ANAA--GGTNAAA----AAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94286 : TATTTTTGCT-CATT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAT--C-GGG--A-A---T-AA--CC-AATTATA-TTACATCT----GAC-CA-AATTTTAC--T-------T--G-TAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-AAA--CCAATC-----ATAATGT----A---AG-----AAAA--GGTTAAA----AAG-TTCATGTATA-T-T----TAATG----AGAAA--TGAGCT---TT--AATAGAA-TTGACCC-ACGA--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94287 : TATATTTGCT-CTTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AG--CC-AATCGTA-TCACATTT----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTATCAA-G-T--CT-CAA--CCAATCATAAGA-----T----A---AG-----AAAA--GGTCAAA----GGG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAG--TGAGCCG--TTAGATTAGGA-TTGACCC-ATGGGTG-TGATG-AT-GGA-AGAA-TC-GATGAGAAG---CACC
gi|94288 : TATATCTGCT-TGTT----ACTCA--TGAATTAT-GCATGAC--A-GGA--T-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-AA-AACATTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAG--CCAATC-----A-----T----A---AG-----ACAA--GGTAAAA----AAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAAAAGGA-CTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-AATCAGAAG---CACC
gi|94289 : TGTTTTTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--CCGGG--A-G---C-AA--CC-AATCATA-TCATGTCT----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--A-GAG-AGC--CCAGACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AGTTA--AGAAATGGGCAAA----AAG-TACATGCATA-TATTGA-TAATG----TAAAA--TGAGCTG--CTTGAATAGGA-TTGGCCC-ACAG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAA
gi|94290 : TATTTTTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AG--CC-AATCATA-TCACTCCC----GAC-TACAA-------------------G-AAG-AAC--CCTAACAA-G-T--TT-TAA--TTAATC-----A-----T----A---AGGTAAGAAAA--GGTCAAA----C-G-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--AGAGCTG--TTGGAATAGAA-TTGACAC-ACGG--G-TGATG-AT-AATGAGAA-T------AGAAGGGTCACC
gi|94291 : TATTTTTGCT-TGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGACTAT-GGGTAA-GGCCT-AA--CC-AATCATA-TCACATTC----TAC-CA-AACTTTAC--TTGGAGACT--G-GAG-AGT--CCAAACAA-G-T--CC-CAA--TCAATC-----A-----T----A---AGAT---AAAA--GGTGAAA----AAG-TTCATGCATA-T-TACCATACTGGTAAAGAAAACCGAGCTG--TTTGAATGGGATTTGGCCC-ACGG--G-TAATG-AT-GGAGAGAA-TC-GAT
gi|94292 : TGTTTTTGCTTCGTTGTTATCTCAATTGCATTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AA--C---ATCACGTTCGCATCC----GACATA-AACTTTGCGGT-------CTAT-GAG-AGCTTTCTACCAATG-T--CC-ATATTCCAATC-----A-----TTGGGAAGCAG-----AAAA--AGTGAAA----ACG-TTTATGCATATT-T----TGATG----AGAAA--CGAGCTGTTTTTGAATAGGA-TTGACCC-ATGG--T-GGCTGAAT-GGAGAGAAGTC-GGTAAGAAG---CAC
gi|94293 : TATATTTGCT-TGTT----ACTCA--TGAATTAT-GCATGAA--T-GCC--ATG---TAAA--CCAAATCATT-TTACGTCCCCAAGACAAA-AACATTGC--T-------CA-A-GAGCAGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA-----------------------------------ACAA--GGTTAAAAAAGAAG-TTCATG-ATA-T-T----TATTG----AT-AA--CGAGCTG--TTTGAA-AGG--CTGACCCGACGG--GTTGATG-AT-GGAGAGAA-CA-GATCAGAAG---CACC
gi|94294 : TATTTTTGCT-CGTT----TCGCA--TGAATTA--------C--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AGTCATA-TTACGTTC----GAC-CA-AACT----------------------------CCCAACAA-G-TAACC-CA
gi|94295 : ATTTTTGCT-CTTT----TCTCT--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGA--A-G---A-AA--CG-AATCATA-TCACATCC----GAC-CA-AACTTTAC--T-------C--G-GAT-AGT--TCTAACAC-G-A--CC-CAA--TCAATCATTAGA-----T----A---AG-----AAAA--GGTCAAA----GAG-TCCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--TGAGGTG--TTTGAGTAGAA-TTGGTCC-ACAA--T-TGAT--AT-GTAGAGAA-TC-GAATAGAAG---CACC
gi|94296 : TATATC-GCT-TGTTA---TCGTA--TGA--TATAGCATG-C--C-GGA--T-G---T-AATACC-A-TCATA-TCA-GTCC----GAC-AA-AGACATGC--T-------C--G-GA--AGC--CTAAACAA-GAT--CC---A--CCAATC-----A-----T----T---AA-----ACAA--GGTAAAA----AAG-TTCATGCATT-A-T----TAATG----AG-AA--CATGCTG--TTAGAA-AG-----AACCC-AC-G--G-TGATG-ATAGGAGA-AA-TCAAATCAGAAG---CACC
gi|94297 : attATGTTTACT-CGTT----TATCA--TGTTTTAT-GCATGGT--C-AGG--A-G---TTAA--CC-AAGCACA-TCACGTCC----GAC-CA-AAATTAGC--C-------C--A-TAG-AGC--CCTAACAA-T-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----C----A---AG-----A
gi|94298 : TGCT-TGTT----TGTAA--TGATTTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AA--CC-AGTTATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-TAA-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA------------------------A---AG-----AAAA--GGTCAAA----ACG-TCCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGGGCTG--TTTGAATGGAA-TCCACCC-ACGG--G-T-----------GAGAA-TC-GATAAAAAG---CATCt
gi|94299 : ttgTTGCT-TGTT----TCTCA--TGAATGAT-GTATGAC--C-GAG--A-G---T-AA--CT-AATAAAA-TCATGTCC----AAC-TA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AAC--TCTAA
gi|94300 : tc-GAG--A-GA--T-AA--CT-A-TCATA-TCACAT------GAC-TA-AACTTTGC--T-------C--GCGAG-A-C--CCTAA--A-G-T--TCACAA--CCAATC-----A-----T----A---TG-----ATA-----TAGAA----AGGATT--TGAA-A-T-T----TAATG----AAA
gi|94301 : cC-CA-AACTTTGT--T-------C--G-GAG-------------A-G-T--CC-CAA--TCAATC-----A-----T----A---AG-----ATAA--Gcaat
gi|94302 : TAACCC-A-GG--G-TGAT-----GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACCa
gi|94303 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94304 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Alignments
lowQualScore : 33333333333 1111
lowQualScore : 555 2 8888 33 2 33 2 33 2 777 5 33 2 2 5555 5 2 33 9999999999 2 2 33 2 2 33 2 33 00000000000 6666 555 33 2 3 3 3 2222 7777 55 55 2 2 0 3 3 33 2 2 2 2 2 1 555
lowQualScore : ... . .... .. . .. . .. . ... . .. . . .... . . .. .......... . . .. . . .. . .. ........... .... ... .. . . . . .... .... .. .. . . . . . .. . . . . . . ...
lowQualScore : 000 9 9999 99 9 77 7 77 7 333 3 77 7 7 7777 0 5 44 2222222222 5 5 44 7 7 77 7 99 33333333333 1111 000 99 2 3 3 3 9999 1111 00 00 4 3 4 6 3 99 9 9 9 9 9 5 888
consensus : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG--AAAAGGTNAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Reference ( family-776 ) : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG--AAAAGGTNAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94286 : TATTT---TTGCT-CATT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAT--C-GGG--A-A---T-AA--CC-AATTATA-TTACATCT----GAC-CA-AATTTTAC--T-------T--G-TAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-AAA--CCAATC-----ATAATGT----A---AG--AAAAGGTTAAAAAG-TTCATGTATA-T-T----TAATG----AGAAA--TGAGCT---TT--AATAGAA-TTGACCC-ACGA--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94287 : TATAT---TTGCT-CTTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AG--CC-AATCGTA-TCACATTT----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTATCAA-G-T--CT-CAA--CCAATCATAAGA-----T----A---AG--AAAAGGTCAAAGGG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAG--TGAGCCG--TTAGATTAGGA-TTGACCC-ATGGGTG-TGATG-AT-GGA-AGAA-TC-GATGAGAAG---CACC
gi|94288 : TATAT---CTGCT-TGTT----ACTCA--TGAATTAT-GCATGAC--A-GGA--T-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-AA-AACATTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAG--CCAATC-----A-----T----A---AG--ACAAGGTAAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAAAAGGA-CTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-AATCAGAAG---CACC
gi|94289 : TGTTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--CCGGG--A-G---C-AA--CC-AATCATA-TCATGTCT----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--A-GAG-AGC--CCAGACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----ATAAGTT----A---AG--AAATGGGCAAAAAG-TACATGCATA-TATTGA-TAATG----TAAAA--TGAGCTG--CTTGAATAGGA-TTGGCCC-ACAG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAA
gi|94290 : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AG--CC-AATCATA-TCACTCCC----GAC-TACAA-------------------G-AAG-AAC--CCTAACAA-G-T--TT-TAA--TTAATC-----ATAAGGT----A---AG--AAAAGGTC-AAACG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--AGAGCTG--TTGGAATAGAA-TTGACAC-ACGG--G-TGATG-AT-AATGAGAA-T------AGAAGGGTCACC
gi|94291 : TATTT---TTGCT-TGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGACTAT-GGGTAA-GGCCT-AA--CC-AATCATA-TCACATTC----TAC-CA-AACTTTAC--TTGGAGACT--G-GAG-AGT--CCAAACAA-G-T--CC-CAA--TCAATC-----A-----T----A---AGATAAAAGGTGAAAAAG-TTCATGCATA-T-TACCATACTGGTAAAGAAAACCGAGCTG--TTTGAATGGGATTTGGCCC-ACGG--G-TAATG-AT-GGAGAGAA-TC-GAT
gi|94292 : TGTTT---TTGCTTCGTTGTTATCTCAATTGCATTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AA--C---ATCACGTTCGCATCC----GACATA-AACTTTGCGGT-------CTAT-GAG-AGCTTTCTACCAATG-T--CC-ATATTCCAATC-----A-----TTGGGAAGCAG--AAAAAGTGAAAACG-TTTATGCATATT-T----TGATG----AGAAA--CGAGCTGTTTTTGAATAGGA-TTGACCC-ATGG--T-GGCTGAAT-GGAGAGAAGTC-GGTAAGAAG---CAC
gi|94293 : TATAT---TTGCT-TGTT----ACTCA--TGAATTAT-GCATGAA--T-GCC--ATG---TAAA--CCAAATCATT-TTACGTCCCCAAGACAAA-AACATTGC--T-------CA-A-GAGCAGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--ACAAGG-----T-----T----A---A---AAAAG------AAG-TTCATG-ATA-T-T----TATTG----AT-AA--CGAGCTG--TTTGAA-AGG--CTGACCCGACGG--GTTGATG-AT-GGAGAGAA-CA-GATCAGAAG---CACC
gi|94294 : TATTT---TTGCT-CGTT----TCGCA--TGAATTA--------C--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AGTCATA-TTACGTTC----GAC-CA-AACT----------------------------CCCAACAA-G-TAACC-CA
gi|94295 : ATTT---TTGCT-CTTT----TCTCT--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGA--A-G---A-AA--CG-AATCATA-TCACATCC----GAC-CA-AACTTTAC--T-------C--G-GAT-AGT--TCTAACAC-G-A--CC-CAA--TCAATCATTAGA-----T----A---AG--AAAAGGTCAAAGAG-TCCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--TGAGGTG--TTTGAGTAGAA-TTGGTCC-ACAA--T-TGAT--AT-GTAGAGAA-TC-GAATAGAAG---CACC
gi|94296 : ATTTATATCGCT-TGTTA---TCGTA--TGA--TATAGCATG-C--C-GGA--T-G---T-AATACC-A-TCATA-TCA-GTCC----GAC-AA-AGACATGC--T-------C--G-GA--AGC--CTAAACAA-GAT--CC---A--CCAATC-----A-----T----T---AA--ACAAGGTAAAAAAG-TTCATGCATT-A-T----TAATG----AG-AA--CATGCTG--TTAGAA-AG-----AACCC-AC-G--G-TGATG-ATAGGAGA-AA-TCAAATCAGAAG---CACC
gi|94297 : ATGT---TTACT-CGTT----TATCA--TGTTTTAT-GCATGGT--C-AGG--A-G---TTAA--CC-AAGCACA-TCACGTCC----GAC-CA-AAATTAGC--C-------C--A-TAG-AGC--CCTAACAA-T-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----C----A---AG--A
gi|94298 : TT---GTGCT-TGTT----TGTAA--TGATTTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AA--CC-AGTTATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-TAA-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA------------------------A---AG--AAAAGGTCAAAACG-TCCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGGGCTG--TTTGAATGGAA-TCCACCC-ACGG--G-T-----------GAGAA-TC-GATAAAAAG---CATCt
gi|94299 : TC---TTGCT-TGTT----TCTCA--TGAATGAT-GTATGAC--C-GAG--A-G---T-AA--CT-AATAAAA-TCATGTCC----AAC-TA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AAC--TCTAA
gi|94300 : --C-GAG--A-GA--T-AA--CT-A-TCATA-TCACAT------GAC-TA-AACTTTGC--T-------C--GCGAG-A-C--CCTAA--A-G-T--TCACAA--CCAATC-----A-----T----A---TG--ATA---TAGAAAGGATT--TGAA-A-T-T----TAATG----AAA
gi|94301 : C-CA-AACTTTGT--T-------C--G-GAG-------------A-G-T--CC-CAA--TCAATC-----A-----T----A---AG--ATAAGcaat
gi|94302 : TAACCC-A-GG--G-TGAT-----GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACCa
gi|94303 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94304 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Alignments
lowQualScore : 33333333333 1111
lowQualScore : 555 2 8888 33 2 33 2 33 2 777 5 33 2 2 5555 5 2 33 9999999999 2 2 33 2 2 33 2 33 00000000000 6666 555 33 2 3 3 3 2222 7777 55 55 2 2 0 3 3 33 2 2 2 2 2 1 555
lowQualScore : ... . .... .. . .. . .. . ... . .. . . .... . . .. .......... . . .. . . .. . .. ........... .... ... .. . . . . .... .... .. .. . . . . . .. . . . . . . ...
lowQualScore : 000 9 9999 99 9 77 7 77 7 333 3 77 7 7 7777 0 5 44 2222222222 5 5 44 7 7 77 7 99 33333333333 1111 000 99 2 3 3 3 9999 1111 00 00 4 3 4 6 3 99 9 9 9 9 9 5 888
consensus : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG--AAAAGGTNAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Reference ( family-776 ) : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG--AAAAGGTNAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94286 : TATTT---TTGCT-CATT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAT--C-GGG--A-A---T-AA--CC-AATTATA-TTACATCT----GAC-CA-AATTTTAC--T-------T--G-TAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-AAA--CCAATC-----ATAATGT----A---AG--AAAAGGTTAAAAAG-TTCATGTATA-T-T----TAATG----AGAAA--TGAGCT---TT--AATAGAA-TTGACCC-ACGA--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94287 : TATAT---TTGCT-CTTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AG--CC-AATCGTA-TCACATTT----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTATCAA-G-T--CT-CAA--CCAATCATAAGA-----T----A---AG--AAAAGGTCAAAGGG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAG--TGAGCCG--TTAGATTAGGA-TTGACCC-ATGGGTG-TGATG-AT-GGA-AGAA-TC-GATGAGAAG---CACC
gi|94288 : TATAT---CTGCT-TGTT----ACTCA--TGAATTAT-GCATGAC--A-GGA--T-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-AA-AACATTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAG--CCAATC-----A-----T----A---AG--ACAAGGTAAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAAAAGGA-CTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-AATCAGAAG---CACC
gi|94289 : TGTTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--CCGGG--A-G---C-AA--CC-AATCATA-TCATGTCT----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--A-GAG-AGC--CCAGACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----ATAAGTT----A---AG--AAATGGGCAAAAAG-TACATGCATA-TATTGA-TAATG----TAAAA--TGAGCTG--CTTGAATAGGA-TTGGCCC-ACAG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAA
gi|94290 : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AG--CC-AATCATA-TCACTCCC----GAC-TACAA-------------------G-AAG-AAC--CCTAACAA-G-T--TT-TAA--TTAATC-----ATAAGGT----A---AG--AAAAGGTC-AAACG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--AGAGCTG--TTGGAATAGAA-TTGACAC-ACGG--G-TGATG-AT-AATGAGAA-T------AGAAGGGTCACC
gi|94291 : TATTT---TTGCT-TGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGACTAT-GGGTAA-GGCCT-AA--CC-AATCATA-TCACATTC----TAC-CA-AACTTTAC--TTGGAGACT--G-GAG-AGT--CCAAACAA-G-T--CC-CAA--TCAATC-----A-----T----A---AGATAAAAGGTGAAAAAG-TTCATGCATA-T-TACCATACTGGTAAAGAAAACCGAGCTG--TTTGAATGGGATTTGGCCC-ACGG--G-TAATG-AT-GGAGAGAA-TC-GAT
gi|94292 : TGTTT---TTGCTTCGTTGTTATCTCAATTGCATTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AA--C---ATCACGTTCGCATCC----GACATA-AACTTTGCGGT-------CTAT-GAG-AGCTTTCTACCAATG-T--CC-ATATTCCAATC-----A-----TTGGGAAGCAG--AAAAAGTGAAAACG-TTTATGCATATT-T----TGATG----AGAAA--CGAGCTGTTTTTGAATAGGA-TTGACCC-ATGG--T-GGCTGAAT-GGAGAGAAGTC-GGTAAGAAG---CAC
gi|94293 : TATAT---TTGCT-TGTT----ACTCA--TGAATTAT-GCATGAA--T-GCC--ATG---TAAA--CCAAATCATT-TTACGTCCCCAAGACAAA-AACATTGC--T-------CA-A-GAGCAGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--ACAAGG-----T-----T----A---A---AAAAG------AAG-TTCATG-ATA-T-T----TATTG----AT-AA--CGAGCTG--TTTGAA-AGG--CTGACCCGACGG--GTTGATG-AT-GGAGAGAA-CA-GATCAGAAG---CACC
gi|94294 : TATTT---TTGCT-CGTT----TCGCA--TGAATTA--------C--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AGTCATA-TTACGTTC----GAC-CA-AACT----------------------------CCCAACAA-G-TAACC-CA
gi|94295 : ATTT---TTGCT-CTTT----TCTCT--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGA--A-G---A-AA--CG-AATCATA-TCACATCC----GAC-CA-AACTTTAC--T-------C--G-GAT-AGT--TCTAACAC-G-A--CC-CAA--TCAATCATTAGA-----T----A---AG--AAAAGGTCAAAGAG-TCCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--TGAGGTG--TTTGAGTAGAA-TTGGTCC-ACAA--T-TGAT--AT-GTAGAGAA-TC-GAATAGAAG---CACC
gi|94296 : ATTTATATCGCT-TGTTA---TCGTA--TGA--TATAGCATG-C--C-GGA--T-G---T-AATACC-A-TCATA-TCA-GTCC----GAC-AA-AGACATGC--T-------C--G-GA--AGC--CTAAACAA-GAT--CC---A--CCAATC-----A-----T----T---AA--ACAAGGTAAAAAAG-TTCATGCATT-A-T----TAATG----AG-AA--CATGCTG--TTAGAA-AG-----AACCC-AC-G--G-TGATG-ATAGGAGA-AA-TCAAATCAGAAG---CACC
gi|94297 : ATGT---TTACT-CGTT----TATCA--TGTTTTAT-GCATGGT--C-AGG--A-G---TTAA--CC-AAGCACA-TCACGTCC----GAC-CA-AAATTAGC--C-------C--A-TAG-AGC--CCTAACAA-T-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----C----A---AG--A
gi|94298 : TT---GTGCT-TGTT----TGTAA--TGATTTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AA--CC-AGTTATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-TAA-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA------------------------A---AG--AAAAGGTCAAAACG-TCCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGGGCTG--TTTGAATGGAA-TCCACCC-ACGG--G-T-----------GAGAA-TC-GATAAAAAG---CATCt
gi|94299 : TC---TTGCT-TGTT----TCTCA--TGAATGAT-GTATGAC--C-GAG--A-G---T-AA--CT-AATAAAA-TCATGTCC----AAC-TA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AAC--TCTAA
gi|94300 : --C-GAG--A-GA--T-AA--CT-A-TCATA-TCACAT------GAC-TA-AACTTTGC--T-------C--GCGAG-A-C--CCTAA--A-G-T--TCACAA--CCAATC-----A-----T----A---TG--ATA---TAGAAAGGATT--TGAA-A-T-T----TAATG----AAA
gi|94301 : C-CA-AACTTTGT--T-------C--G-GAG-------------A-G-T--CC-CAA--TCAATC-----A-----T----A---AG--ATAAGcaat
gi|94302 : TAACCC-A-GG--G-TGAT-----GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACCa
gi|94303 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94304 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
blockSeqs : ATA T GTTA AT A TA C TA T GCC A TA A T CCAA A C GG TGGAGACT C C TT T A AA A TT ATAAGA TGGG AGC AT C A T A ACCA GTAA AC TT A T T G GT T A A G A G GGT
blockSeqs : . . A . . . . . . A T . . . . A . . CTA . . . . . . . . ATAAGT . . . A . . . TGA . . . T A . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . ATAAGG . . . C . . . . . . . T T . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . ATTAGA . . . C . . . . . . . G T . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . T T . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . T T . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . T T . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . T T . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . A . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : A**********
originalCons : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG--AAAAGGTNAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
finalCons : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATCA----------T----A---AG--AAAAGGTNAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Alignments
lowQualScore : 33333333333 1111
lowQualScore : 555 2 8888 33 2 33 2 33 2 777 5 33 2 2 5555 5 2 33 9999999999 2 2 33 2 2 33 2 33 00000000000 6666 555 33 2 3 3 3 2222 7777 55 55 2 2 0 3 3 33 2 2 2 2 2 1 555
lowQualScore : ... . .... .. . .. . .. . ... . .. . . .... . . .. .......... . . .. . . .. . .. ........... .... ... .. . . . . .... .... .. .. . . . . . .. . . . . . . ...
lowQualScore : 000 9 9999 99 9 77 7 77 7 333 3 77 7 7 7777 0 5 44 2222222222 5 5 44 7 7 77 7 99 33333333333 1111 000 99 2 3 3 3 9999 1111 00 00 4 3 4 6 3 99 9 9 9 9 9 5 888
consensus : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG--AAAAGGTNAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
Reference ( family-776 ) : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----T----A---AG--AAAAGGTNAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAATAGGA-TTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94286 : TATTT---TTGCT-CATT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAT--C-GGG--A-A---T-AA--CC-AATTATA-TTACATCT----GAC-CA-AATTTTAC--T-------T--G-TAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-AAA--CCAATC-----ATAATGT----A---AG--AAAAGGTTAAAAAG-TTCATGTATA-T-T----TAATG----AGAAA--TGAGCT---TT--AATAGAA-TTGACCC-ACGA--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94287 : TATAT---TTGCT-CTTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AG--CC-AATCGTA-TCACATTT----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTATCAA-G-T--CT-CAA--CCAATCATAAGA-----T----A---AG--AAAAGGTCAAAGGG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAG--TGAGCCG--TTAGATTAGGA-TTGACCC-ATGGGTG-TGATG-AT-GGA-AGAA-TC-GATGAGAAG---CACC
gi|94288 : TATAT---CTGCT-TGTT----ACTCA--TGAATTAT-GCATGAC--A-GGA--T-G---T-AA--CC-AATCATA-TCACGTCC----GAC-AA-AACATTGC--T-------C--G-GAG-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAG--CCAATC-----A-----T----A---AG--ACAAGGTAAAAAAG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGAGCTG--TTTGAAAAGGA-CTGACCC-ACGG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-AATCAGAAG---CACC
gi|94289 : TGTTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--CCGGG--A-G---C-AA--CC-AATCATA-TCATGTCT----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--A-GAG-AGC--CCAGACAA-G-T--CC-CAA--CCAATC-----ATAAGTT----A---AG--AAATGGGCAAAAAG-TACATGCATA-TATTGA-TAATG----TAAAA--TGAGCTG--CTTGAATAGGA-TTGGCCC-ACAG--G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAA
gi|94290 : TATTT---TTGCT-CGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGG--A-G---T-AG--CC-AATCATA-TCACTCCC----GAC-TACAA-------------------G-AAG-AAC--CCTAACAA-G-T--TT-TAA--TTAATC-----ATAAGGT----A---AG--AAAAGGTC-AAACG-TTCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--AGAGCTG--TTGGAATAGAA-TTGACAC-ACGG--G-TGATG-AT-AATGAGAA-T------AGAAGGGTCACC
gi|94291 : TATTT---TTGCT-TGTT----TCTCA--TGAATTAT-GCATGACTAT-GGGTAA-GGCCT-AA--CC-AATCATA-TCACATTC----TAC-CA-AACTTTAC--TTGGAGACT--G-GAG-AGT--CCAAACAA-G-T--CC-CAA--TCAATC-----A-----T----A---AGATAAAAGGTGAAAAAG-TTCATGCATA-T-TACCATACTGGTAAAGAAAACCGAGCTG--TTTGAATGGGATTTGGCCC-ACGG--G-TAATG-AT-GGAGAGAA-TC-GAT
gi|94292 : TGTTT---TTGCTTCGTTGTTATCTCAATTGCATTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AA--C---ATCACGTTCGCATCC----GACATA-AACTTTGCGGT-------CTAT-GAG-AGCTTTCTACCAATG-T--CC-ATATTCCAATC-----A-----TTGGGAAGCAG--AAAAAGTGAAAACG-TTTATGCATATT-T----TGATG----AGAAA--CGAGCTGTTTTTGAATAGGA-TTGACCC-ATGG--T-GGCTGAAT-GGAGAGAAGTC-GGTAAGAAG---CAC
gi|94293 : TATAT---TTGCT-TGTT----ACTCA--TGAATTAT-GCATGAA--T-GCC--ATG---TAAA--CCAAATCATT-TTACGTCCCCAAGACAAA-AACATTGC--T-------CA-A-GAGCAGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA--ACAAGG-----T-----T----A---A---AAAAG------AAG-TTCATG-ATA-T-T----TATTG----AT-AA--CGAGCTG--TTTGAA-AGG--CTGACCCGACGG--GTTGATG-AT-GGAGAGAA-CA-GATCAGAAG---CACC
gi|94294 : TATTT---TTGCT-CGTT----TCGCA--TGAATTA--------C--C-GGG--A-G---T-AA--CC-AGTCATA-TTACGTTC----GAC-CA-AACT----------------------------CCCAACAA-G-TAACC-CA
gi|94295 : ATTT---TTGCT-CTTT----TCTCT--TGAATTAT-GCATGAC--C-GGA--A-G---A-AA--CG-AATCATA-TCACATCC----GAC-CA-AACTTTAC--T-------C--G-GAT-AGT--TCTAACAC-G-A--CC-CAA--TCAATCATTAGA-----T----A---AG--AAAAGGTCAAAGAG-TCCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--TGAGGTG--TTTGAGTAGAA-TTGGTCC-ACAA--T-TGAT--AT-GTAGAGAA-TC-GAATAGAAG---CACC
gi|94296 : ATTTATATCGCT-TGTTA---TCGTA--TGA--TATAGCATG-C--C-GGA--T-G---T-AATACC-A-TCATA-TCA-GTCC----GAC-AA-AGACATGC--T-------C--G-GA--AGC--CTAAACAA-GAT--CC---A--CCAATC-----A-----T----T---AA--ACAAGGTAAAAAAG-TTCATGCATT-A-T----TAATG----AG-AA--CATGCTG--TTAGAA-AG-----AACCC-AC-G--G-TGATG-ATAGGAGA-AA-TCAAATCAGAAG---CACC
gi|94297 : ATGT---TTACT-CGTT----TATCA--TGTTTTAT-GCATGGT--C-AGG--A-G---TTAA--CC-AAGCACA-TCACGTCC----GAC-CA-AAATTAGC--C-------C--A-TAG-AGC--CCTAACAA-T-T--CC-CAA--CCAATC-----A-----C----A---AG--A
gi|94298 : TT---GTGCT-TGTT----TGTAA--TGATTTAT-GCATGAC--T-GGG--A-G---T-AA--CC-AGTTATA-TCACGTCC----GAC-CA-AACTTTGC--T-------C--G-TAA-AGC--CCTAACAA-G-T--CC-CAA------------------------A---AG--AAAAGGTCAAAACG-TCCATGCATA-T-T----TAATG----AGAAA--CGGGCTG--TTTGAATGGAA-TCCACCC-ACGG--G-T-----------GAGAA-TC-GATAAAAAG---CATCt
gi|94299 : TC---TTGCT-TGTT----TCTCA--TGAATGAT-GTATGAC--C-GAG--A-G---T-AA--CT-AATAAAA-TCATGTCC----AAC-TA-AACTTTGC--T-------C--G-GAG-AAC--TCTAA
gi|94300 : --C-GAG--A-GA--T-AA--CT-A-TCATA-TCACAT------GAC-TA-AACTTTGC--T-------C--GCGAG-A-C--CCTAA--A-G-T--TCACAA--CCAATC-----A-----T----A---TG--ATA---TAGAAAGGATT--TGAA-A-T-T----TAATG----AAA
gi|94301 : C-CA-AACTTTGT--T-------C--G-GAG-------------A-G-T--CC-CAA--TCAATC-----A-----T----A---AG--ATAAGcaat
gi|94302 : TAACCC-A-GG--G-TGAT-----GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACCa
gi|94303 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC
gi|94304 : --G-TGATG-AT-GGAGAGAA-TC-GATAAGAAG---CACC