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blockSeqs : A A T A GATAGAC T G AC A G T G AT GA TTTAAGA C C T G T AAG TC C CGTGTAAC T T T A T T T AA TTCC T G A GT AT G A C G A T TG C
blockSeqs : . . T . TCTAA . . . C . . . . . . . . . . . A T . TTTTCAC T . . . . . . AA AT . . A G . . . . . . . TA C
blockSeqs : . . T . T . . . T . . . . . . . . . . . A T . ACTTT . . . . . . . . AT . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . T . . . C . . . . . . . . . . . A T . ACTTT . . . . . . . . AT . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . C T . CCAC . . . . . . . . AT . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . A T . CAC . . . . . . . . TT . . G G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . A T . CAC . . . . . . . . AT . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . A T . CAG . . . . . . . . TT . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . G T . CAC . . . . . . . . AT . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . A T . CAG . . . . . . . . AT . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . G C . CAG . . . . . . . . AA . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G A . CAG . . . . . . . . AT . . A T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . CAG . . . . . . . . T . . A T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G C . CAG . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . TTT . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . TTT . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTA-CTGAA-CCC-GA-TACAAT------T----A-G-A--CCAATT-C-T-TGTT--CAAAG--A-------AATC-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GAGT-G-AGA----C-----AC---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAG-T-GC-GAAG-TTT--A-AACCCTG
finalCons : TTTA-CTGAA-CCC-GA-TACAAT------T----A-G-A--CCAATT-C-T-TGTT--CAAAG--A-------AATC-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GAGT-G-AGA----C-----AC---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAG-T-GC-GAAG-TTT--A-AACCCTG
Alignments
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lowQualScore : 2 2 1 2 99999999999 2 2 33 1 2 2 2 33 33 8888888 2 2 2 2 2 333 33 2 444444444444444 4 2 2 2 2 2 2 66 4444 2 0 2 2 22 33 2 2 2 2 2 2 66 5
lowQualScore : . . . . ........... . . .. . . . . .. .. ....... . . . . . ... .. . ............... . . . . . . . .. .... . . . . .. .. . . . . . . .. .
lowQualScore : 9 9 4 9 99999999999 9 9 99 9 9 9 9 99 77 7777777 2 2 1 1 1 777 22 2 000000000000000 7 4 4 4 4 4 4 11 4444 2 3 2 7 88 11 2 2 2 2 5 5 99 0
consensus : TTTA-CTGAA-CCC-GA-TACAAT------T----A-G-A--CCAATT-C-T-TGTT--CAAAG--A-------AATC-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GAGT-G-AGA----C-----AC---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAG-T-GC-GAAG-TTT--A-AACCCTG
Reference ( family-766 ) : TTTA-CTGAA-CCC-GA-TACAAT------T----A-G-A--CCAATT-C-T-TGTT--CAAAG--A-------AATC-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GAGT-G-AGA----C-----AC---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAG-T-GC-GAAG-TTT--A-AACCCTG
gi|101493 : TTTA-CTGAA-CCC-AA-TACAAT------T----A-G-A--CCAATT-C-T-TATT--CAAAG--A-------AATC-ATTCG-CCAT-G-TG-GGC--AAGT-G-AGA----C-----AC---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCATG-T-GC-GAAG-TTT--A-AACCCTG
gi|101494 : TTTA-CTGAA-CCC-AA-TA-AAT------T----A-G-A--CAAATT-C-T-TATT--CAAAG--G-------AATC-ACTCG-C-AT-G-TG-G-C--AAGT-G-AGA----C-----AC---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAG-T-GC-AAAG-TTT--A-AACCCTG
gi|101495 : TTTA-CTGAA-TCC-AA-TACAAT------T----A-GGA--CCATTT-C-T-TATT--CAAAG--G-------AATCCACTCG-CCAT-G-TG-GGC--AAGT-G-AGA----CC----AC---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAAT--GCGAT--T-GG-GCAAG-T-GC-GAAGTTTT--A-AACCCTG
gi|101496 : TTTA-ATGAA-CCC-AAATACAAT------T----A-G-A--CTAATT-C-T-TATT--CAAAGGAA-------AATC-ACTCG-CCATTG-GG-GGC--AAGTCG-AGA----C-----AC---CA-A-ATTTTAG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAA-T-GC-GAAG-TTT--A-AACCC
gi|101497 : TTTA-CTGAA-CCTTGA-TACAAT------T----A-G-A--CCAATT-C-T-TATT--CAAAG--A-------AATC-ACTCG-CCAT-G-TC-AAA--CAGT-G-AGA----C-----AG---CA-T-ATTG-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAG-T-GC-GAAG-TTT--A-AACCCTG
gi|101498 : TTTAACTGAA-CCTTGA-TACA-T------T----A---A--CAAATTGC-T-TATT--CCAAG--A-------A-TG-ACTCG-CCAT---TG-GG----AG--G-AGA----C-----AC---CA-A-ATTT-AGAG-AGCCTCATC--ACAAA-T--TTTAC-TAGGCAAATG-GCGA---T-GG--CAAG-T-GC-GAAG-TTTTGA-AACC
gi|101499 : TTTA-CTGAG-CC--AA-TACAAT------T----A-G-A--C-GATT-T-C-TATT--CAAAG--A-------AAT--ACTCG-GCAT-GGTG-GGC--AAGT-G-GAA----CGTGTAAC------A-ATAT-AT-GTGGCC-C--C--GC----T--TTTAC-TA--TGATTGTGCGAG--T-GG-CT--G-T-GC-GAAG-TTT--A-AACC
gi|101500 : TTTA-CT-AA-CCC-AA--ACAATGATAGAC----A-G-A--CCAATT-T-C-TGTTATCAAA---A-------AATT-ACTAG-CCAT-G-T--GGCAAGAGT-GCAGA----C-----AG---CA-G-ATTC-TA-G-AGCC-CA-T--CCCAATTCCTTTACTTAG-C-AATG-GCGA---T-GGAGCATGCT-GCAAAAG-TTTTAA-AACCCTG
gi|101501 : TTTA-CTGAA-CCTTGA-TACAAT------T----G-G-A--CCAATT-G-T-TATT--TAAAG--A-------AATC-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--
gi|101502 : TTA-CTAAA-TCC-GA-TACAAT------T----A-G-A--CCAAAT-CTT-TGTT--CAAAG--A-------AATC-ACTTG-CCA--G-TG-GGC--AAGT-G-AGA----C-----AG---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAATT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAG-TGGC-GAAG-TTT--A-AACCCTGa
gi|101503 : TTA-CTGAAACCC-GA-TACAAT-----------------------T-C-T-TGTT--CAAAG--A-------AATA-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--AAGT-G-ATA----C-----AG---CA-A-ATTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACCAAAT--TTTAC-TAG-CAAATG-GCGAG--T-GG-GCAAG-T-GT-GAAG-TTT--A-AACCCTG
gi|101504 : TTA-CTGAA-CCC-GA-TACAAT------TCTAAA-G-A--TGAATT-C-T-TGTT--CAAAG--ATTTAAGAAATC-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GAGT-G-AGA----C-----AG---TA-A-ACTT-AG-G-AGCC-CA-C--ACAAATT--TTTAC-TCG-AAAACG-GCGAG--T-GG-GCAAG-T-GC-GAAG-TTT--A-AACCCTG
gi|101505 : TTA-CTAAA-CCCCGA-TACAAT------T----A-G-AACCCAATT-C-TGTGTT--CAAAG--A-------A-TC-ACTCGCCCAT---TG-GGC--AAGT-G-A
gi|101506 : TA-CTAAA-CCA-GA-TACAAT------T----ATA-A--CCAATT-C-T-TGTT--CATCA--A-------AATC-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GAGC-G-AAA----C-----AG---TG-A-ATTA-AG-G-CGCC-GA-C--ACCAAAT--TTTGT-TCA-CAAATG-ATGAG--T-GG-GCAAG-T-TC-TAAA-TTT--A-AACACTG
gi|101507 : AA--A-------AGTC-GCTCG-CCAT-G-TG-GGC--GAAA-G-GAT----T-----TT---CA-ATATTT-AG-T-CGCC-CA-C--AGCAAAT--TTTGC-TCG-C-ATTG-GC--G--T-GG-GCGAG-T-G
gi|101508 : TT-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GAGA-G--GATTTTC-----AC------A-ATTT-GG-T-CGCC-CT-C--AAAAAAA--ATTAC-TCG-CATAT--GCGAG--T-GG-GCGAG-T-G
gi|101509 : TT-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GA---G-AGA----------ACTTTCATA-AATT-GG-T-CGCC-CA-CAAATAAAA----TTAC-TCG-C-ATTT-GCGAG--T-GG-GCGAG-T-G--GTTA-TTT--GCAACCCTG
gi|101510 : TT-ACTCG-CCAT-G-TG-GGC--GA---G-AGA----------ACTTTCATA-AACT-GG-T-CGCC-CA-CAAATAAAA----TTAC-TCG-C-ATTT-GCGAG--T-GG-GCGAG-T-G--GTTA-TTT--GCAACCCTG
gi|101511 : CAT-G-CATGGC--AAGC-A-AAA----T-----TT---CA-A-TTTT-AT-A-AGTA-CA-C--ACAAA----TTTAC------AATTA-GCGAAATT-GG-GCAAG-T-AT-GAAG-TTT--A-AATCCTG
gi|101512 : --ACAAAAT--TT-AC-TAG-CAACTT-GCGAG--TGGG-GCAAG-T-GC--AAG-TTT--A-AACCCT