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Reference ( gi|106266 )       : GCGTACAAT-AC-ACG----T-GAC-TAAAAAA-T--------TCATCCTT--TTTTT---CTG-G---T--CTAA--GTTC-A-GG-TC-ACC---------A--A--C-GACC---G-TTT-TC--GATGTC-TT---TA-C-T-TTCAT-GTA--A--A--TATCA--C------CA-GA-G-CAG--T----CGTGT-GC--CATA-T--A-CA--C--A-------GT--AA--T-----------TA-C---G-T-AC----AAA-TGAA----A-AGACATTGAGCAACTAA--TT-CAAAATAAT-ACA
gi|106267                     : GCGTACAAT-AC-ACG----T-GAC-TAAAAAA-T---------CATCCTT--TTTTTT--CTG-G---T--CTAA--GTTC-A-GG-TC-ACC---------A--A--C-GACC---G-TTT-TC--GATG-C-TT---TA-T-T-TTCAT-GTA--A--A---ATCA--C------CA-GA-G-CAG--T----CGTGT-GC--CATA-T--A-CA--C--A-------GT--AA--T-----------TA-C---G-T-AC----AAA-TGAA----C-AGACATTGAGCAACTAA--TT-CAAAATAAT-ACA
gi|106268                     : GCGCACAAT-AC-ATG----T-GAC-TAAAAAA-T--------TCATCCTT--TTTTT---CTG-G---T--CTAA--GTTC-A-GG-TC-ACC---------A--A--C-GACC---G-TTT-TC--AAAGTC-TT---TA-C-T-TTCAT-GTA--A--A--TATCA--C------CA-GA-G-CAG--T----CATGT-GC--CATATT--A-CA--C--A-------GT--AA--T-----------TA-C---G-T-AC----AAA-TGAACTGTACAGACATTGAGCAACTAA--TT-CAAAATAAT-ACAt
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Reference ( family-765 )      :                    GCGCACAA--T-AC-ACG----T-GAC-TAAAAAA-T--------TCATCCTT--TTTTT---CTG-G---T--CTAA--GTTC-A-GG-TC-ACC---------A--A--C-GACC---G-TTT-TC--GACGTC-TT---NA----C-T-TTCGT-GTA--A--A--TAT-CA--C------CAGA-G-CAG--T----CGTGT-GC--CATA-T--A-CA--C--A-------G------T--AA---T-----------TA-C------G-T-A---CAAA-TGA-----ACAG-A--CAT-TGAGCAACTAA--TT-CAAAATAAT-ACA
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Alignments
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Reference ( family-765 )      :                    GCGCACAA--T-AC-ACG----T-GAC-TAAAAAA-T--------TCATCCTT--TTTTT---CTG-G---T--CTAA--GTTC-A-GG-TC-ACC---------A--A--C-GACC---G-TTT-TC--GACGTC-TT---NA----C-T-TTCGT-GTA--A--A--TAT-CA--C------CAGA-G-CAG--T----CGTGT-GC--CATA-T--A-CA--C--A-------G------T--AA---T-----------TA-C------G-T-A---CAAA-TGA-----ACAG-A--CAT-TGAGCAACTAA--TT-CAAAATAAT-ACA
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gi|106279                     :                          tgacacaaaaccataaacttttaaaAAAA-T--------T--TTATT--TTTTT---CCA-----TAACTAA--GTTC-A-GG-TC-AAC---------A--A--C-GACC---G-TTT-TC--GATGTC-TT---TA----C-T-TTCAT-GTA--A--A--TAT-CA--C------CAGA-G-CAG--T----CGTGT-GC--CATA-T--A-CA--C--A-------G------T--AA---T-----------TA-C------G-T-A---CAAA-TGA-----ACAG-A--CAT-TGAGCAAGTAA--TT-CAAAATAAT-ACA
gi|106280                     :                                                                         --TTTTT---CTG-G---T--CCAA--GTTT-A-AG-TC-ACC---------A--A--T-GACC---G-TTT-TTTGAACGTC--G---CA----CAC-CTCGT-GTA--A--A--T-T-TA--C---------G-G-CAG--T----TGTAT-G---TACA-T--A-TA--T--A-------G------TG-AA---TGTTATTACTAGTA-C------G-T-G---CAAA-TCA-----ATTGAA--CAT-Tt
gi|106281                     :                                                    aaaaccataacacttaaCCTTAATTTTT---CTG-G---T--CCAA--GTTT-A-AGTTC-ACC---------A--A--TGGACCT--G-TTT-TT--GACGTC-GCAGACA----C-C-TTT--------------TAT-CA--C---------G-G-CAAGTT----TGTAT-GC--TACA-T--A-TA--T--A-------G------T--AA---
gi|106282                     :                                                           aaaccattaaaaTT--TTTTT---CTG-G---T--CCAA--GTTT-A-G--TC-ACC---------A--A--T-GACC---G-TTT-TT--GACGTC-GC---AA----C-A-CTCAT-GTA--A--AT-TAT-CA--C---------G-G-CAG--T----TGTAT-GC--TACA-T--A-CA--T--A-------G------T--A
gi|106283                     :                                                                         --TTTTT---CGC-G---T--CCAA--GTTT-A-A--TC-AC----------A--A--T-GACCC--G-TTT-TT--GACGTC-GC---AA----C-A-CTCAT-GTA--A--AT-TAT-CA--C---------G-G-CAG--T----TGTAT-G---TACA-T--A-TA--T--A-------G------T--AA----------------A-T------G-T-----TAAT-TTA-----CTAG-A--TAT-CG-GCAA
gi|106284                     :                                                                                                            G-TC-ACC---------A--A--T-GACC---ATTTT-TT--GACGTT-GC---AA----C-A-CTCGT-GTA--A------AT-TA--C------CACG-G-CAG--T----TGTAT-GC--TACA-T--A-TG--T--A-------GTAAATTT--AA---T-----------TA-CTAGTAAG-T-G---CAAA-T--------CA------AT-TGAACAatcaataacatgtgtaacgggtataaaaaaatatat
gi|106285                     :                                                                                                            G-TC-ACC---------A--A--T-GACC---G-TTT-TTG-GAC-----T---CA----C---TCCGT-TTA--A--AATTAT-CA--C-----------G-CAG--T----TGTAT-GC--TACA-T--A-TAT-C--A-------G------T--AAATGT-----------TA-A------T-T-T---CTAG-TAAGT---GCAG-AATCAT-TGAACA


blockSeqs                     :                            CA G  G   CGCG T   C       C AAAAAAAT        AA     TTC   GAAA  AA    CG    T A  C  C   TGTGACTCA TT AT G    CCC T   G  TG      GCAGAC  TTAA TT    A T   GT ATA     A  TA GTTGTGCAGAG G   GT TCAT     A  CA    T AT T  TATGTAAAT     TAAATT TA  ATG GTTATTACTAG  G TAGTAA G ACGG     T   ACTGT    A AT   G           GG  C         G
blockSeqs                     :                            .  T  T   G    .   .       . .               AA     TT    TG    .     A     . .  T  .   .         .  .  .    T   .   .  G       TTTT    .    TG    A .   .  AAT     .  G  TGGCAG      .   .  .        .  .     . A  .  GTAAT         .      G   .   .            . TCA    . GA       .   GT       A .    .           .   .         .
blockSeqs                     :                            .  .  .   .    .   .       . .               .      T     AG    .     .     . .  .  .   .         .  .  .    C   .   .  .       TTT     .    AC    A .   .  AT      .  .  CAGA        .   .  .        .  .     . .  .  CCCA          .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .         .
blockSeqs                     :                            .  .  .   .    .   .       . .               .      .     GA    .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TTT     .    T     T .   .  AA      .  .  CAGA        .   .  .        .  .     . .  .  CCCA          .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .         .
blockSeqs                     :                            .  .  .   .    .   .       . .               .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TTA     .    T     A .   .  AT      .  .  CAGA        .   .  .        .  .     . .  .  TCA           .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .         .
blockSeqs                     :                            .  .  .   .    .   .       . .               .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TTA     .    T     T .   .  AT      .  .  CAAA        .   .  .        .  .     . .  .  CA            .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .         .
blockSeqs                     :                            .  .  .   .    .   .       . .               .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TTA     .    T     A .   .  A       .  .  CAGA        .   .  .        .  .     . .  .  CA            .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .         .
blockSeqs                     :                            .  .  .   .    .   .       . .               .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       GCA     .    T     A .   .  A       .  .  AAGA        .   .  .        .  .     . .  .  CA            .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .         .
blockSeqs                     :                            .  .  .   .    .   .       . .               .      .     A     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TTA     .    T     A .   .  A       .  .  AGAT        .   .  .        .  .     . .  .  TA            .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .         .
blockSeqs                     :                                                       . .               .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TCT     .    T     C .   .  A       .  .  CAGA        .   .  .        .  .     . .  .  CA            .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .          
blockSeqs                     :                                                                         .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       GCA     .    A     G .   .  A       .  .  CAGA        .   .  .        .  .     . .  .  CA            .      .   .   .            . .      . A        .   .        . .    .           .   .          
blockSeqs                     :                                                                         .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TTT     .    T     G .   .  A       .  .  CACG        .   .  .        .  .     . .  .  CA            .      .   .   .            . .      . G        .   .        . .    .                          
blockSeqs                     :                                                                         .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       GCA     .    C     A .   .  A       .  .  G           .   .  .        .  .     . .  .  TA            .      .   .   .            . .      . G        .   .        . .    .                          
blockSeqs                     :                                                                         .      .     G     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       GCA     .    A     G .   .  T       .  .  G           .   .  .        .  .     . .  .  TA            .      .   .   .            . .      . T        .   .        . .    .                          
blockSeqs                     :                                                                         .      .     .     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       GCA     .    A     A .   .  A       .  .  G           .   .  .        .  .     . .  .  TA            .      .   .   .            . .      . .        .   .        . .    .                          
blockSeqs                     :                                                                         .      .     .     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TT      .    A     A .   .  A       .  .  G           .   .  .        .  .     . .  .  TA            .      .   .   .            . .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                .     .     .     .     . .  .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       GC      .    .     G .   .  .       .  .  G           .   .  .        .  .     . .  .  TA            .      .   .                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                             .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       TC      .    .     G .   .  .       .  .  .           .   .  .        .  .     . .  .  .             .      .                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                             .  .   .         .  .  .    .   .   .  .       .       .    .     . .   .  .       .  .  .           .   .  .                                                                                                                                      


blockSeqCons                  :                    
originalCons                  :                    GCGCACAA--T-AC-ACG----T-GAC-TAAAAAA-T--------TCATCCTT--TTTTT---CTG-G---T--CTAA--GTTC-A-GG-TC-ACC---------A--A--C-GACC---G-TTT-TC--GACGTC-TT---NA----C-T-TTCGT-GTA--A--A--TAT-CA--C------CAGA-G-CAG--T----CGTGT-GC--CATA-T--A-CA--C--A-------G------T--AA---T-----------TA-C------G-T-A---CAAA-TGA-----ACAG-A--CAT-TGAGCAACTAA--TT-CAAAATAAT-ACA
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Reference ( family-765 )      :                    GCGCACAA--T-AC-ACG----T-GAC-TAAAAAA-T--------TCATCCTT--TTTTT---CTG-G---T--CTAA--GTTC-A-GG-TC-ACC---------A--A--C-GACC---G-TTT-TC--GACGTC-TT---NA----C-T-TTCGT-GTA--A--A--TAT-CA--C------CAGA-G-CAG--T----CGTGT-GC--CATA-T--A-CA--C--A-------G------T--AA---T-----------TA-C------G-T-A---CAAA-TGA-----ACAG-A--CAT-TGAGCAACTAA--TT-CAAAATAAT-ACA
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