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Reference ( gi|90488 )        : GGTGGACAA--TT-TG-TCCCCGAG--GAT---AC-T--TGTC-G-TTCGGTATA-TAT-GC--C-AA--TACG---AGTA-TA-GAGA---AGAACAAAA
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gi|90489                      : GGTGGACAA--TT-TG-TCCCCGAG--GAT---AC-T--TGTC-G-TTCGGTATA-TAT-AC--C-AT--TATG---AGTAGTA-TAAG---AGA
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Alignments
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Reference ( family-757 )      : GGTGGACAA--TTGTGTCCCCGAG--GATACTT-GT--C-G-TTCGGTATA-T-AT-G-C--C-A--TT---ATG---AGTA-TA-GAGA---AGAACAAAA
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Alignments
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Reference ( family-757 )      : GGTGGACAA--TTGTGTCCCCGAG--GATACTT-GT--C-G-TTCGGTATA-T-AT-G-C--C-A--TT---ATG---AGTA-TA-GAGA---AGAACAAAA
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blockSeqs                     :         A    .      .   .        .  .  . C    G    . .  . C    T     .     .   G  .             
blockSeqs                     :         A    .      .   .        .  .  . T    .    . .  . C    A     .     .   .  .             
blockSeqs                     :         C    .      .   .        .  .  . .    .    . .  . T    A     .     .   .  .             
blockSeqs                     :         A    .      .   .        .  .  . .    .    . .  . C    C     .     .                    


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GGTGGACAA--TTGTGTCCCCGAG--GATACTT-GT--C-G-TTCGGTATA-T-AT-G-C--C-A--TT---ATG---AGTA-TA-GAGA---AGAACAAAA
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Alignments
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lowQualScore                  :         ...  .      .   ..       .  .. . ..   .    . .  . .... ....  ...   ... .  .  ..   ...  .      
lowQualScore                  :         333  0      5   88       0  88 0 44   3    0 0  0 4444 3333  555   555 6  1  22   444  7      
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Reference ( family-757 )      : GGTGGACAA--TTGTGTCCCCGAG--GATACTT-GT--C-G-TTCGGTATA-T-AT-G-C--C-A--TT---ATG---AGTA-TA-GAGA---AGAACAAAA
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gi|90507                      :       CAA--TTTGGTCCGCGAG--GATACTT-GT--C-G-TTCGGTATA-T-AT-G-C--CAA--AT---ACGC--GGTA-TA-GAGA---AGAACAAAAcaaa