lowQualScore : 11 1111 111111 1111111111 11 111 1
lowQualScore : 2 2 2 2 55555 2 2 2 2 2 6666 11 2 44 8888888 66 3333 555 666 222222 33 2 2 2 555 3 6666666666 3 7777 3 3 00 4 66 777 888888 4 8888 4 4 4 7 333 55 9 88 4 88 1
lowQualScore : . . . . ..... . . . . . .... .. . .. ....... .. .... ... ... ...... .. . . . ... . .......... . .... . . .. . .. ... ...... . .... . . . . ... .. . .. . .. .
lowQualScore : 1 1 1 1 33333 1 1 1 2 2 1111 22 9 66 6666666 88 5555 000 888 777777 99 9 9 9 000 7 5555555555 1 1111 6 6 00 0 33 000 222222 0 5555 0 0 0 2 111 88 6 88 4 77 9
consensus : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C-TT----AG-A-CG-AG----G--AT--ATTGAAA---ATAA---TC--AAACAAN-----CA--ATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TAATAAATA-T-AGT-CTTAA-TTATCA---A---G--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATG-CA-ACACATG-GGTCCTAAAA
Reference ( gi|79238 ) : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C-TT----AC-A-CA-AG----G--AT--ATTGAAA---GTAA---TC--AAACAAA-----CA--ATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TAATAAATA-T-AGT-TTTAA-TTAGCA---A---G--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGTAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTTCAATTGATG-TA-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79237 : AGCCCGTAGAA-GATAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCAATCAA-AGTACTGAAAGTA-C-TT----AG-A-CG-AG----G--AT--ATTGAAA---ATAA---TC--AAACAAT-----CA--ATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTGC---AACAAAT----------AA-T----TAATGAATA-T-AGT-CATAG-TTATCA---A---G--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTC-G-GCTAACCCG-ATAGTTCTAAATAATG-CA-ACACATG-GGTCCTGAAA
gi|79239 : AGCCTGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C-TT----AG-A-CG-AA----G--GT--ATTGAAA---ATAA---TT--AA---------------TCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TAATAAATA-T-AGT-CTTAA-TGATCA---A---G--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATGC-A-GCTCACCTG-ATAGTTCCAAATAATG-CA-ACACATG-GGTCCTAAAAa
gi|79235 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-TCAATCAA-AATTCTGAAAGTA-C-TT----AG-A-CG-AG----G--AT--ACTGAAA---ATAA---TC--AAACAAT-----CA--ATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TAATAAATA-T-AGT-CTTAA-TTGTCA---A---A--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-G-GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATG-CA-ACACATT-GATCCTAAa
gi|79236 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-ACAATCAA-AATACTGAAAGTA-C-TT----AG-A-CG-AG----G--AT--ACTGAAA---ATAA---TC--AAACAAT-----CA--ATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TAATAAATA-T-AGT-CTTAA-TTGTTA---A---A--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG---GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATG-CA-ACACAT--GATCCTAAtaaa
gi|79241 : AGGCCGTACAA-GCTAGCA-GCCA-TTA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTAGC-TT----AG-A-CG-AG----G--ATA-ATTGAAA---GTAA---TA--AAACAAA-----CA--ATC--A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AAC--AT----------AA-T----T-ATAAATATT-AGT-CTTAA-TTCGCA---A---GGTTT-T----GAT-ACTT-G-AAGGAAATTG-AGGCTCCCCTG-TAGGTTTCAAATGATG-CA-ACACATG-GGTCCAAAAAtaaa
gi|79242 : AGCCCGTAGAT-GCTAGCA-GCCAGATACA-----GATAAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C-TT----ACGA-CG-AG----GA-AT--ATTGAAAC--GTAA---TC---AACAAA-----CA--ATCA-A-ATGTGATAA--GTTTTC---AAC-AAT----------AATT----TAATAAATA-T-AGT-CTT-A-TT-GCATTTATTTG--TT-TTTTGGAT-ACTT-GTAAGGCAATTGTA-GCTCACCTGTTTGGTTTCAAATGATGCTA-A-ACA
gi|79243 : AACCCGTAGAA--CTAGCATGCCA-TTA-A-----GA-AA--TCTATCAA-AGTAATGAAAGTA-T-CTGTTAAC-AACG-AG----G--AT--ATTGAAA-----AA---TA--AATCAAA-----CA--ATCA-AGATGTGATAA-TTTT--C---AACAAAT----------AA-T----TAATAAATA-T-AGTCCTTAA--TAGCA---A---T--TTAT----GATAACTT-G-AAGGCAATTG-AGGCTCACCTG-TTGATTTCAAATGAAT-CACACACATATGGTC--AAAA
gi|79244 : AGCCCACAGAA-GTTAGCA-GTCA-ATA-A-----GA-AAAATTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C-TT----AC-A--G-AG----A--AT--ACTGAAA---ATTA---TT--AAACAAT-----CG--ATCA-G-ATTTG--AA-TTTTTTTTTGAACAAAT----------AA-T----TAATGAACC-T-ATT-CTTGATTTATCA---A---G--TT-T----AAT-GCTT-G-AAGACAAATG-A-GCTAACATG-AAAGTTCTAAATGATG-CA-a
gi|79250 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C-T
gi|79248 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C-Tcgatcgacgattactgtttaccttgccatttaagcatttattttaattaatttgttaaataattactaattaaacaaatcacgtaattattgccgagcttggaggcagtgaagctcacctg
gi|79247 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C-Tcgatcgacga
gi|79249 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCGA-AGTACTGAAAGTA-C-TC----GT-A-GA-AA----A--AT--ATT--------TAA---TTTGAAAC--------CATTTTCA-A-AGG----AA-TTTTTTA---ATTGAATTCATGTTTTCAA-T----TAATAAATG-T-cgatcgacga
gi|79245 : AGCCC--AGAATACCAGCA-GCCA-A-A-ACGTCCGA-AAA-TTCATCGA-AGTACTGAGAGTT-A-TC----AG-A-CA-GAATTCA--AT--ATCAAAA---ATTA---TT--ACACAAT-----CG--ACCAGA-AT-TGAT-A-TTTTTT------CTAAT----------GA-T----TGATCAACA-T-ATT-CTTAA-TTATAA---A---G--TT-T----AAT-ACTT---AAGG
gi|79246 : AGCCCGTA-AA-GCTAGCA-GCCC-ATA-A-----GG-AAA-TCAATCGA-AGTACTGAAAGTA-C-TC----AT-A-GA-AA----ATTATTAATTGAAA---ACTATTTTC--AAAGGAATTTTTCA--ATTA-A-AT-TCATG---TTTTTC---AATTAAT----------AA-
gi|79240 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-A
gi|79252 : AGCCCGTAGAA-GCTATCA-GCCA-CTA-A-----GG-AAA-ATCATTAA-AGGACTGAACGTA-C-T
gi|79251 : AACTCGTAGAA-GTTAGCA-GCC---TT-T-----GA-AAA-TCCTTCAATGGT--TGAGA-TA-CTTT----AG-A-CG-AC----A--AT--ATTGAAAATTATAT---TT--AAA-AAT-----CC--ATAA-A-ATGTTAT---TTTTTGT---AACAAATA---------AA-TCGAGTAATAAA
gi|79253 : TAGCA-GCCAGCA-GCCA-ATT-A-----AG-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C-TT----AG-A-CAGAG----G--AT--ATTGAAG---ATAA---TC--AAACAAA-----CA--ATCA-A-ATGTGATAATTTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TAATAAATA-TAAGT-CTTAA-TTAGCA---A---G--TT-T----GAT-ACTTGG-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTT-GTG--TTCAA-AGATG-CA-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79254 : A-ACCAGCA-GCCA-ATA-A-----AA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C-TT----AG-A-CG-AG----G--AT--ATTGAAA---GTAA---T------CAAA-----CA--ATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---a
Alignments
lowQualScore : 111 1111111111 111111
lowQualScore : 2 2 2 2 55555 2 2 888888888 2 55555 2 333 000 2 2 33 4 444 2 2 55 2222222222 444 0 555555 2 2 4 2 444 2 2 2 6666 33 33 3 3 77 7777 3 3 555 44 3 7777 3 3 3 999 33 55 4 66 0
lowQualScore : . . . . ..... . . ......... . ..... . ... ... . . .. . ... . . .. .......... ... . ...... . . . . ... . . . .... .. .. . . .. .... . . ... .. . .... . . . ... .. .. . .. .
lowQualScore : 0 0 0 0 00000 0 0 000000000 0 33333 1 777 333 2 2 11 4 444 5 5 99 2222222222 444 9 222222 5 5 1 5 444 5 7 7 1111 99 99 1 1 99 1111 3 3 888 66 3 1111 3 3 3 111 99 55 0 44 5
consensus : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TCAAACAA-----TCAATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT-AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
Reference ( family-751 ) : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TCAAACAA-----NCAATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT-AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79235 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-TCAATC---------AA-AATTCT-----GAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ACTGAAA---A------TAA---TCAAACAA-----TCAATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT-AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-GT---CAAA--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-G-GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATGC--A-ACACATT-GATCCTAA
gi|79236 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-ACAATC---------AA-AATACT-----GAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ACTGAAA---A------TAA---TCAAACAA-----TCAATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT-AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-GT---TAAA--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG---GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATGC--A-ACACAT--GATCCTAAtaaa
gi|79237 : AGCCCGTAGAA-GATAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCAATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TCAAACAA-----TCAATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTGC---AACAAAT-AA-T----TA--A--TGAATA-T-AGT--CATA----G-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTC-G-GCTAACCCG-ATAGTTCTAAATAATGC--A-ACACATG-GGTCCTGAAAtaaa
gi|79238 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTA-C---T---T-A-C--AC-AAG---G-A-T--ATTGAAA---G------TAA---TCAAACAA-----ACAATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT-AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--TTTA----A-TT-AG---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGTAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTTCAATTGATGT--A-ACACATG-GGTCCTAAAAa
gi|79239 : AGCCTGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAA---G-G-T--ATTGAAA---A------TAA---TTAA-------------TCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT-AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TG-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATGC-A-GCTCACCTG-ATAGTTCCAAATAATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79240 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATC---------AA-Aa
gi|79241 : AGGCCGTACAA-GCTAGCA-GCCA-TTA-A-----GA-AAA-TCCATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTAGC---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-TA-ATTGAAA---G------TAA---TAAAACAA-----ACAATC--A-ATGTGATAA-TTTTTTC---AAC--AT-AA-T----T---A--TAAATATT-AGT--CTTA----A-TT-CG---CAAGGTTT-T----GAT-ACTT-G-AAGGAAATTG-AGGCTCCCCTG-TAGGTTTCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79242 : AGCCCGTAGAT-GCTAGCA-GCCAGATACA-----GATAAA-TCCATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTA-C---T---T-ACG--AC-GAG---GAA-T--ATTGAAAC--G------TAA---TC-AACAA-----ACAATCA-A-ATGTGATAA--GTTTTC---AAC-AAT-AATT----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTATTGCATTT-AT---T-TG--TT-TTTTGGAT-ACTT-GTAAGGCAATTGTA-GCTCACCTGTTTGGTTTCAAATGATGCTAA-ACA
gi|79243 : AACCCGTAGAA--CTAGCATGCCA-TTA-A-----GA-AA--TCTATC---------AA-AGTAAT-----GAAAGTA-TCTGT---T-A-ACAAC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A--------A---TAAATCAA-----ACAATCA-AGATGTGATAA-TTTT--C---AACAAAT-AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGTC-CTTA----A--T-AG---CAAT--TTAT----GATAACTT-G-AAGGCAATTG-AGGCTCACCTG-TTGATTTCAAATGAATC--ACACACATATGGTC--AAAA
gi|79244 : AGCCCACAGAA-GTTAGCA-GTCA-ATA-A-----GA-AAAATTCATC---------AA-AGTACT-----GAGAGTA-C---T---T-A-C--A--GAG---A-A-T--ACTGAAA---A------TTA---TTAAACAA-----TCGATCA-G-ATTTGA--A-TTTTTTTTTGAACAAAT-AA-T----TA--A--TGAACC-T-ATT--CTTG----A-TTTAT---CAAG--TT-T----AAT-GCTT-G-AAGACAAATG-A-GCTAACATG-AAAGTTCTAAATGATGC--A-a
gi|79245 : AGCCC--AGAATACCAGCA-GCCA-A-A-ACGTCCGA-AAA-TTCATC---------GA-AGTACT-----GAGAGTT-A---T---C-A-G--ACAGAATTCA-A-T--ATCAAAA---A------TTA---TTACACAA-----TCGACCAGA-AT-TGATA--TTTTTTC---TA---AT-GA-T----TG--A--TCAACA-T-ATT--CTTA----A-TT-AT---AAAG--TT-T----AAT-ACTT---AAGG
gi|79246 : AGCCCGTA-AA-GCTAGCA-GCCC-ATA-A-----GG-AAA-TCAATC---------GA-AGTACT-----GAAAGTA-C---TCA-T-A-G--AA-AAT---T-A-TTAATTGAAA---A------CTATTTTCAAAGGAATTTTTCAATTA-A-AT-TCATG---TTTTTC---AATTAAT-AA-
gi|79247 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATC---------AA-AGTACT-----GAGAGTA-C---TCGAT-C-G--AC-GA
gi|79248 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATC---------AA-AGTACT-----GAGAGTA-C---TCGAT-C-G--AC-GA
gi|79249 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCGAAGTACTGAA-AGTACTCGTAGAAAAATA-T---T---T-A---------------A-T---TTGAAACC-A------TTT---TCAAAGGAATTTTTTAATTG-A-AT----TCA-TGTTTTC-----------AA-T----TA--A--TAAATG-T-
gi|79250 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATC---------AA-AGTACT-----GAGAGTA-C---T---C-G-A--TC-GAC---G-ATT--ACTGTTT---ACCTTGCCAT---TTAAGCAT-----TTATTTT-A-AT----TAA-TTTGTT-------AAAT-AA-T----TACTAATTAAACA---AATCACGTA----A-TT-ATTGCCGAG---------------CTT-G-GAGGCAGTGA-A-GCTCACCTG-
gi|79251 : AACTCGTAGAA-GTTAGCA-GCCT-TT--------GA-AAA-TCCTTC---------AATGGT--T-----GAGA-TA-C---T---TTA-G--AC-GAC---A-A-T--ATTGAAAATTA------TAT---TTAAA-AA-----TCCATAA-A-ATGTTAT---TTTTTGT---AACAAATAAA-TCGAGTA--A--TAAA
gi|79252 : AGCCCGTAGAA-GCTATCA-GCCA-CTA-A-----GG-AAA-ATCATT---------AA-AGGACT-----GAACGTA-C---T---
gi|79253 : TAGCA-GCCAGCA-GCCA-ATT-A-----AG-AAA-TCCATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTA-C---T---T-A-G--ACAGAG---G-A-T--ATTGAAG---A------TAA---TCAAACAA-----ACAATCA-A-ATGTGATAATTTTTTTC---AACAAAT-AA-T----TA--A--TAAATA-TAAGT--CTTA----A-TT-AG---CAAG--TT-T----GAT-ACTTGG-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTT-GTG--TTCAAA-GATGC--A-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79254 : A-ACCAGCA-GCCA-ATA-A-----AA-AAA-TCCATC---------AA-AGTACT-----GAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---G------TAA---TCAAA---------CAATCA-A-ATGTGATAA-TTTTTTC---a
Alignments
lowQualScore : 111 1111111111 1111111111
lowQualScore : 2 2 2 2 55555 2 2 2 2 333 333 2 2 33 4 444 2 2 55 2222222222 666 33 666666 2 0 2 444 1 4444444444 2 6666 33 33 3 3 77 7777 3 3 555 44 3 7777 3 3 3 999 33 55 4 66 0
lowQualScore : . . . . ..... . . . . ... ... . . .. . ... . . .. .......... ... .. ...... . . . ... . .......... . .... .. .. . . .. .... . . ... .. . .... . . . ... .. .. . .. .
lowQualScore : 0 0 0 0 00000 0 0 0 1 777 222 2 2 11 4 444 5 5 99 8888888888 999 44 888888 5 9 5 444 9 3333333333 7 1111 99 99 1 1 99 1111 3 3 888 66 3 1111 3 3 3 111 99 55 0 44 5
consensus : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
Reference ( family-751 ) : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79235 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-TCAATCAA-AATTCTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ACTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-GT---CAAA--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-G-GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATGC--A-ACACATT-GATCCTAA
gi|79236 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-ACAATCAA-AATACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ACTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-GT---TAAA--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG---GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATGC--A-ACACAT--GATCCTAAtaaa
gi|79237 : AGCCCGTAGAA-GATAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCAATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTGC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TGAATA-T-AGT--CATA----G-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTC-G-GCTAACCCG-ATAGTTCTAAATAATGC--A-ACACATG-GGTCCTGAAAtaaa
gi|79238 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-C--AC-AAG---G-A-T--ATTGAAA---G------TAA---TC--AAACAA-----ACAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--TTTA----A-TT-AG---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGTAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTTCAATTGATGT--A-ACACATG-GGTCCTAAAAa
gi|79239 : AGCCTGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAA---G-G-T--ATTGAAA---A------TAA---TT--AA-------------TCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TG-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATGC-A-GCTCACCTG-ATAGTTCCAAATAATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79240 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-Aa
gi|79241 : AGGCCGTACAA-GCTAGCA-GCCA-TTA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTAGC---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-TA-ATTGAAA---G------TAA---TA--AAACAA-----ACAATC--AATGTGATAA-TTTTTTC---AAC--AT----------AA-T----T---A--TAAATATT-AGT--CTTA----A-TT-CG---CAAGGTTT-T----GAT-ACTT-G-AAGGAAATTG-AGGCTCCCCTG-TAGGTTTCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79242 : AGCCCGTAGAT-GCTAGCA-GCCAGATACA-----GATAAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-ACG--AC-GAG---GAA-T--ATTGAAAC--G------TAA---TC---AACAA-----ACAATCA-AATGTGATAA--GTTTTC---AAC-AAT----------AATT----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTATTGCATTT-AT---T-TG--TT-TTTTGGAT-ACTT-GTAAGGCAATTGTA-GCTCACCTGTTTGGTTTCAAATGATGCTAA-ACA
gi|79243 : AACCCGTAGAA--CTAGCATGCCA-TTA-A-----GA-AA--TCTATCAA-AGTAATGAAAGTA-TCTGT---T-A-ACAAC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---AA-----TAAA--TC--AAACAA-----TCAA----GATGTGATAA-TTTT--C---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGTC-CTTA----A--T-AG---CAAT--TTAT----GATAACTT-G-AAGGCAATTG-AGGCTCACCTG-TTGATTTCAAATGAATC--ACACACATATGGTC--AAAA
gi|79244 : AGCCCACAGAA-GTTAGCA-GTCA-ATA-A-----GA-AAAATTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---T---T-A-C--A--GAG---A-A-T--ACTGAAA---A------TTA---TT--AAACAA-----TCGATCA-GATTTGA--A-TTTTTTTTTGAACAAAT----------AA-T----TA--A--TGAACC-T-ATT--CTTG----A-TTTAT---CAAG--TT-T----AAT-GCTT-G-AAGACAAATG-A-GCTAACATG-AAAGTTCTAAATGATGC--A-a
gi|79245 : AGCCC--AGAATACCAGCA-GCCA-A-A-ACGTCCGA-AAA-TTCATCGA-AGTACTGAGAGTT-A---T---C-A-G--ACAGAATTCA-A-T--ATCAAAA---A------TTA---TT--ACACAA-----TCGACCAGAAT-TGATA--TTTTTTC---TA---AT----------GA-T----TG--A--TCAACA-T-ATT--CTTA----A-TT-AT---AAAG--TT-T----AAT-ACTT---AAGG
gi|79246 : AGCCCGTA-AA-GCTAGCA-GCCC-ATA-A-----GG-AAA-TCAATCGA-AGTACTGAAAGTA-C---TCA-T-A-G--AA-AAT---T-A-TTAATTGAAA---A------CTATTTTC--AAAGGAATTTTTCAATTA-AAT-TCATG---TTTTTC---AATTAAT----------AA-
gi|79247 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---TCGAT-C-G--AC-GA
gi|79248 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---TCGAT-C-G--AC-GA
gi|79249 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCGA-AGTACTGAAAGTA-C---TCG-T-A-G--A---AA---A-A-T--ATT--------------TAA---TTTGAAACCA-----TTT-TCA-AAGG----AA-TTTTTTA---ATTGAATTCATGTTTTCAA-T----TA--A--TAAATG-T-
gi|79250 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---T---C-G-A--TC-GAC---G-ATT--ACTGTTT---ACCTTGCCAT---TT--AAGCAT-----TTATTTT-AAT----TAA-TTTGTT-------AAAT----------AA-T----TACTAATTAAACA---AATCACGTA----A-TT-ATTGCCGAG---------------CTT-G-GAGGCAGTGA-A-GCTCACCTG-
gi|79251 : AACTCGTAGAA-GTTAGCA-GCCT-TT--------GA-AAA-TCCTTCAATGGT--TGAGA-TA-C---T---TTA-G--AC-GAC---A-A-T--ATTGAAAATTA------TAT---TT--AAA-AA-----TCCATAA-AATGTTAT---TTTTTGT---AACAAATA---------AA-TCGAGTA--A--TAAA
gi|79252 : AGCCCGTAGAA-GCTATCA-GCCA-CTA-A-----GG-AAA-ATCATTAA-AGGACTGAACGTA-C---T---
gi|79253 : TAGCA-GCCAGCA-GCCA-ATT-A-----AG-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--ACAGAG---G-A-T--ATTGAAG---A------TAA---TC--AAACAA-----ACAATCA-AATGTGATAATTTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-TAAGT--CTTA----A-TT-AG---CAAG--TT-T----GAT-ACTTGG-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTT-GTG--TTCAAA-GATGC--A-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79254 : A-ACCAGCA-GCCA-ATA-A-----AA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---G------TAA---TC--AAA---------CAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---a
Alignments
lowQualScore : 111 1111111111 1111111111
lowQualScore : 2 2 2 2 55555 2 2 2 2 333 333 2 2 33 4 444 2 2 55 2222222222 666 33 666666 2 0 2 444 1 4444444444 2 6666 33 33 3 3 77 7777 3 3 555 44 3 7777 3 3 3 999 33 55 4 66 0
lowQualScore : . . . . ..... . . . . ... ... . . .. . ... . . .. .......... ... .. ...... . . . ... . .......... . .... .. .. . . .. .... . . ... .. . .... . . . ... .. .. . .. .
lowQualScore : 0 0 0 0 00000 0 0 0 1 777 222 2 2 11 4 444 5 5 99 8888888888 999 44 888888 5 9 5 444 9 3333333333 7 1111 99 99 1 1 99 1111 3 3 888 66 3 1111 3 3 3 111 99 55 0 44 5
consensus : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
Reference ( family-751 ) : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79235 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-TCAATCAA-AATTCTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ACTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-GT---CAAA--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-G-GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATGC--A-ACACATT-GATCCTAA
gi|79236 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-ACAATCAA-AATACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ACTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-GT---TAAA--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG---GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATGC--A-ACACAT--GATCCTAAtaaa
gi|79237 : AGCCCGTAGAA-GATAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCAATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTGC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TGAATA-T-AGT--CATA----G-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTC-G-GCTAACCCG-ATAGTTCTAAATAATGC--A-ACACATG-GGTCCTGAAAtaaa
gi|79238 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-C--AC-AAG---G-A-T--ATTGAAA---G------TAA---TC--AAACAA-----ACAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--TTTA----A-TT-AG---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGTAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTTCAATTGATGT--A-ACACATG-GGTCCTAAAAa
gi|79239 : AGCCTGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAA---G-G-T--ATTGAAA---A------TAA---TT--AA-------------TCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TG-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATGC-A-GCTCACCTG-ATAGTTCCAAATAATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79240 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-Aa
gi|79241 : AGGCCGTACAA-GCTAGCA-GCCA-TTA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTAGC---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-TA-ATTGAAA---G------TAA---TA--AAACAA-----ACAATC--AATGTGATAA-TTTTTTC---AAC--AT----------AA-T----T---A--TAAATATT-AGT--CTTA----A-TT-CG---CAAGGTTT-T----GAT-ACTT-G-AAGGAAATTG-AGGCTCCCCTG-TAGGTTTCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79242 : AGCCCGTAGAT-GCTAGCA-GCCAGATACA-----GATAAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-ACG--AC-GAG---GAA-T--ATTGAAAC--G------TAA---TC---AACAA-----ACAATCA-AATGTGATAA--GTTTTC---AAC-AAT----------AATT----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTATTGCATTT-AT---T-TG--TT-TTTTGGAT-ACTT-GTAAGGCAATTGTA-GCTCACCTGTTTGGTTTCAAATGATGCTAA-ACA
gi|79243 : AACCCGTAGAA--CTAGCATGCCA-TTA-A-----GA-AA--TCTATCAA-AGTAATGAAAGTA-TCTGT---T-A-ACAAC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---AA-----TAAA--TC--AAACAA-----TCAA----GATGTGATAA-TTTT--C---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGTC-CTTA----A--T-AG---CAAT--TTAT----GATAACTT-G-AAGGCAATTG-AGGCTCACCTG-TTGATTTCAAATGAATC--ACACACATATGGTC--AAAA
gi|79244 : AGCCCACAGAA-GTTAGCA-GTCA-ATA-A-----GA-AAAATTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---T---T-A-C--A--GAG---A-A-T--ACTGAAA---A------TTA---TT--AAACAA-----TCGATCA-GATTTGA--A-TTTTTTTTTGAACAAAT----------AA-T----TA--A--TGAACC-T-ATT--CTTG----A-TTTAT---CAAG--TT-T----AAT-GCTT-G-AAGACAAATG-A-GCTAACATG-AAAGTTCTAAATGATGC--A-a
gi|79245 : AGCCC--AGAATACCAGCA-GCCA-A-A-ACGTCCGA-AAA-TTCATCGA-AGTACTGAGAGTT-A---T---C-A-G--ACAGAATTCA-A-T--ATCAAAA---A------TTA---TT--ACACAA-----TCGACCAGAAT-TGATA--TTTTTTC---TA---AT----------GA-T----TG--A--TCAACA-T-ATT--CTTA----A-TT-AT---AAAG--TT-T----AAT-ACTT---AAGG
gi|79246 : AGCCCGTA-AA-GCTAGCA-GCCC-ATA-A-----GG-AAA-TCAATCGA-AGTACTGAAAGTA-C---TCA-T-A-G--AA-AAT---T-A-TTAATTGAAA---A------CTATTTTC--AAAGGAATTTTTCAATTA-AAT-TCATG---TTTTTC---AATTAAT----------AA-
gi|79247 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---TCGAT-C-G--AC-GA
gi|79248 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---TCGAT-C-G--AC-GA
gi|79249 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCGA-AGTACTGAAAGTA-C---TCG-T-A-G--A---AA---A-A-T--ATT--------------TAA---TTTGAAACCA-----TTT-TCA-AAGG----AA-TTTTTTA---ATTGAATTCATGTTTTCAA-T----TA--A--TAAATG-T-
gi|79250 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---T---C-G-A--TC-GAC---G-ATT--ACTGTTT---ACCTTGCCAT---TT--AAGCAT-----TTATTTT-AAT----TAA-TTTGTT-------AAAT----------AA-T----TACTAATTAAACA---AATCACGTA----A-TT-ATTGCCGAG---------------CTT-G-GAGGCAGTGA-A-GCTCACCTG-
gi|79251 : AACTCGTAGAA-GTTAGCA-GCCT-TT--------GA-AAA-TCCTTCAATGGT--TGAGA-TA-C---T---TTA-G--AC-GAC---A-A-T--ATTGAAAATTA------TAT---TT--AAA-AA-----TCCATAA-AATGTTAT---TTTTTGT---AACAAATA---------AA-TCGAGTA--A--TAAA
gi|79252 : AGCCCGTAGAA-GCTATCA-GCCA-CTA-A-----GG-AAA-ATCATTAA-AGGACTGAACGTA-C---T---
gi|79253 : TAGCA-GCCAGCA-GCCA-ATT-A-----AG-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--ACAGAG---G-A-T--ATTGAAG---A------TAA---TC--AAACAA-----ACAATCA-AATGTGATAATTTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-TAAGT--CTTA----A-TT-AG---CAAG--TT-T----GAT-ACTTGG-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTT-GTG--TTCAAA-GATGC--A-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79254 : A-ACCAGCA-GCCA-ATA-A-----AA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---G------TAA---TC--AAA---------CAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---a
blockSeqs : T T G C CGTCC T A T G CTG CGA T C CA A TTC A T TA ACCTTGC TTT TG ATTTTT G T TTG A TCATGTTTTC T CGAG CT AT T A CA TTGC T T TGC GT A TTTG A G T AG TT TA C AT
blockSeqs : . . . . . . . . . . CGA . . . A . . . A ATTA A . T . . . A A . . . . . . C . . . . . . . . . . TA A . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . CG . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG A . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . AA . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
finalCons : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
Alignments
lowQualScore : 111 1111111111 1111111111
lowQualScore : 2 2 2 2 55555 2 2 2 2 333 333 2 2 33 4 444 2 2 55 2222222222 666 33 666666 2 0 2 444 1 4444444444 2 6666 33 33 3 3 77 7777 3 3 555 44 3 7777 3 3 3 999 33 55 4 66 0
lowQualScore : . . . . ..... . . . . ... ... . . .. . ... . . .. .......... ... .. ...... . . . ... . .......... . .... .. .. . . .. .... . . ... .. . .... . . . ... .. .. . .. .
lowQualScore : 0 0 0 0 00000 0 0 0 1 777 222 2 2 11 4 444 5 5 99 8888888888 999 44 888888 5 9 5 444 9 3333333333 7 1111 99 99 1 1 99 1111 3 3 888 66 3 1111 3 3 3 111 99 55 0 44 5
consensus : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
Reference ( family-751 ) : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTCCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79235 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-TCAATCAA-AATTCTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ACTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-GT---CAAA--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG-G-GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATGC--A-ACACATT-GATCCTAA
gi|79236 : AGCCCGTAGAA-ATTAGCA-GCTA-ATC-A-----GA-AAA-ACAATCAA-AATACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ACTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TT-GT---TAAA--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTG---GCTTACCTG-ATAGTTCCAAATGATGC--A-ACACAT--GATCCTAAtaaa
gi|79237 : AGCCCGTAGAA-GATAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCAATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---A------TAA---TC--AAACAA-----TCAATCA-AATGTGATAA-TTTTTGC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TGAATA-T-AGT--CATA----G-TT-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATTC-G-GCTAACCCG-ATAGTTCTAAATAATGC--A-ACACATG-GGTCCTGAAAtaaa
gi|79238 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-C--AC-AAG---G-A-T--ATTGAAA---G------TAA---TC--AAACAA-----ACAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--TTTA----A-TT-AG---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGTAATTG-A-GCTCACCTG-ATGGTTTCAATTGATGT--A-ACACATG-GGTCCTAAAAa
gi|79239 : AGCCTGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAA---G-G-T--ATTGAAA---A------TAA---TT--AA-------------TCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTA----A-TG-AT---CAAG--TT-T----GAT-ACTT-G-AAGGCAATGC-A-GCTCACCTG-ATAGTTCCAAATAATGC--A-ACACATG-GGTCCTAAAA
gi|79240 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-Aa
gi|79241 : AGGCCGTACAA-GCTAGCA-GCCA-TTA-A-----GA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTAGC---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-TA-ATTGAAA---G------TAA---TA--AAACAA-----ACAATC--AATGTGATAA-TTTTTTC---AAC--AT----------AA-T----T---A--TAAATATT-AGT--CTTA----A-TT-CG---CAAGGTTT-T----GAT-ACTT-G-AAGGAAATTG-AGGCTCCCCTG-TAGGTTTCAAATGATGC--A-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79242 : AGCCCGTAGAT-GCTAGCA-GCCAGATACA-----GATAAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-ACG--AC-GAG---GAA-T--ATTGAAAC--G------TAA---TC---AACAA-----ACAATCA-AATGTGATAA--GTTTTC---AAC-AAT----------AATT----TA--A--TAAATA-T-AGT--CTTATTGCATTT-AT---T-TG--TT-TTTTGGAT-ACTT-GTAAGGCAATTGTA-GCTCACCTGTTTGGTTTCAAATGATGCTAA-ACA
gi|79243 : AACCCGTAGAA--CTAGCATGCCA-TTA-A-----GA-AA--TCTATCAA-AGTAATGAAAGTA-TCTGT---T-A-ACAAC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---AA-----TAAA--TC--AAACAA-----TCAA----GATGTGATAA-TTTT--C---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-T-AGTC-CTTA----A--T-AG---CAAT--TTAT----GATAACTT-G-AAGGCAATTG-AGGCTCACCTG-TTGATTTCAAATGAATC--ACACACATATGGTC--AAAA
gi|79244 : AGCCCACAGAA-GTTAGCA-GTCA-ATA-A-----GA-AAAATTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---T---T-A-C--A--GAG---A-A-T--ACTGAAA---A------TTA---TT--AAACAA-----TCGATCA-GATTTGA--A-TTTTTTTTTGAACAAAT----------AA-T----TA--A--TGAACC-T-ATT--CTTG----A-TTTAT---CAAG--TT-T----AAT-GCTT-G-AAGACAAATG-A-GCTAACATG-AAAGTTCTAAATGATGC--A-a
gi|79245 : AGCCC--AGAATACCAGCA-GCCA-A-A-ACGTCCGA-AAA-TTCATCGA-AGTACTGAGAGTT-A---T---C-A-G--ACAGAATTCA-A-T--ATCAAAA---A------TTA---TT--ACACAA-----TCGACCAGAAT-TGATA--TTTTTTC---TA---AT----------GA-T----TG--A--TCAACA-T-ATT--CTTA----A-TT-AT---AAAG--TT-T----AAT-ACTT---AAGG
gi|79246 : AGCCCGTA-AA-GCTAGCA-GCCC-ATA-A-----GG-AAA-TCAATCGA-AGTACTGAAAGTA-C---TCA-T-A-G--AA-AAT---T-A-TTAATTGAAA---A------CTATTTTC--AAAGGAATTTTTCAATTA-AAT-TCATG---TTTTTC---AATTAAT----------AA-
gi|79247 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---TCGAT-C-G--AC-GA
gi|79248 : AGCCCGTAGAA-GCTAACA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---TCGAT-C-G--AC-GA
gi|79249 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-ATCATCGA-AGTACTGAAAGTA-C---TCG-T-A-G--A---AA---A-A-T--ATT--------------TAA---TTTGAAACCA-----TTT-TCA-AAGG----AA-TTTTTTA---ATTGAATTCATGTTTTCAA-T----TA--A--TAAATG-T-
gi|79250 : AGCCCGTAGAA-GCTAGCA-GCCA-ATA-A-----GG-AAA-TTCATCAA-AGTACTGAGAGTA-C---T---C-G-A--TC-GAC---G-ATT--ACTGTTT---ACCTTGCCAT---TT--AAGCAT-----TTATTTT-AAT----TAA-TTTGTT-------AAAT----------AA-T----TACTAATTAAACA---AATCACGTA----A-TT-ATTGCCGAG---------------CTT-G-GAGGCAGTGA-A-GCTCACCTG-
gi|79251 : AACTCGTAGAA-GTTAGCA-GCCT-TT--------GA-AAA-TCCTTCAATGGT--TGAGA-TA-C---T---TTA-G--AC-GAC---A-A-T--ATTGAAAATTA------TAT---TT--AAA-AA-----TCCATAA-AATGTTAT---TTTTTGT---AACAAATA---------AA-TCGAGTA--A--TAAA
gi|79252 : AGCCCGTAGAA-GCTATCA-GCCA-CTA-A-----GG-AAA-ATCATTAA-AGGACTGAACGTA-C---T---
gi|79253 : TAGCA-GCCAGCA-GCCA-ATT-A-----AG-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--ACAGAG---G-A-T--ATTGAAG---A------TAA---TC--AAACAA-----ACAATCA-AATGTGATAATTTTTTTC---AACAAAT----------AA-T----TA--A--TAAATA-TAAGT--CTTA----A-TT-AG---CAAG--TT-T----GAT-ACTTGG-AAGGCAATTG-A-GCTCACCTT-GTG--TTCAAA-GATGC--A-ACACATG-GGTCCAAAAA
gi|79254 : A-ACCAGCA-GCCA-ATA-A-----AA-AAA-TCCATCAA-AGTACTGAAAGTA-C---T---T-A-G--AC-GAG---G-A-T--ATTGAAA---G------TAA---TC--AAA---------CAATCA-AATGTGATAA-TTTTTTC---a