lowQualScore : 1 111111111111111 222222222222222 1 11 11 1
lowQualScore : 77 2 2 3 2 2 33 33 0 3 33 2 33 0 66 2 2 2 2 2 2 5 666666666666666 2 66 444 33 2 4 2 6 2 9999999999 44 3 3 3 44 666666 888888 3 66 3 6 3 333333333333333 55 55 3 7 55 55 8 4 4 4 3 00 4 8 66 4 44 7
lowQualScore : .. . . . . . .. .. . . .. . .. . .. . . . . . . . ............... . .. ... .. . . . . . .......... .. . . . .. ...... ...... . .. . . . ............... .. .. . . .. .. . . . . . .. . . .. . .. .
lowQualScore : 33 4 4 9 4 4 22 66 1 4 22 4 22 9 55 5 5 5 5 5 5 0 777777777777777 4 88 111 11 2 4 4 0 4 9999999999 22 1 1 1 22 777777 888888 1 44 1 2 1 222222222222222 00 00 6 3 00 00 9 4 4 4 3 66 4 9 11 8 55 0
consensus : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-AC---T--CGCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAGAATAA-TAAAGAAATAAA
Reference ( gi|105255 ) : TTTAAA--CTTCGC-A-CATGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-AC---T--TGCC-CAC-ATGG-CGAATG-ATT-------T--CTTTGA--AT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAGAATAATTAAAGAATTAAA
gi|105257 : TTTAAAA-CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--ATCGC--ATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----GG---TCT-C-AC---T--TGCC-CAC-ATGG-CGAGTGGATT-------C--CTTTGA--AT-A-AG-AAATGG--TCCT----A------ATTGTA-TT-G-GA-TTCAG-TAA-------------AAT--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAGAATAA
gi|105256 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-CAAT-A-TG---CT-----G----TCT-C-ACTGTT--TG----AC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TCAA-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAGAA----TAAAGAAATAAAagaaata
gi|105259 : TTTAAA--CTTTGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-AC---T--TG-C-CAC-AT-G-CGAGTG-ATT-------C--CTTTGA--AT-A-AG-AATTTG--TC-T----A------ATT-TA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GG-A--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATATTTT-CGATTTCAA-TTC-AATTACAGAAAAATT-AAGAAATAAA
gi|105258 : TTTAAA--CTTCGC-A-TTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-TAAAAT-T-TG---GT-----G----TCT-CGAC---T--TGCC-CCCAATGG-CGAGTG-ATT-------TTCCTTTGA--AT-A-AG-AATTAG--TC-T----A------ATTGTATTT-G-GG-TTCAT-TAA-------------A-T--TGAC--CAGAACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-TGC-TAAATA-TTTCCAATTA--A-TTCAAA--ACAAAATAA
gi|105260 : TTTAAA--CTTCGCCA-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TCT-C-AC---T--TGCC-CAC--TGG-CAAGTG-ATT-------T--CTTTGA--ACAA-AG-ATTTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GA-TTTAG-TA---------------------AT--CAG--TACAT-GTAC--CTCTTTATT-GAC--CAagaaata
gi|105261 : TTTAAA--CTTCGC-A-CA-GC-C--A--CTCGCACAATCA--TA-GTAAA--A----GC--G--G-GGCCA-CAT-ATAT-T------GTTACACG----TTC-C-AC---T--TGCC-CACCATGC-CGAGT--ATT-------T--CTTTGA--AT-A-GA-AATCG---TC-T----A------ATTGTA-TT-G-G--CTCAG-TAA-------------A-T----AC--CAG-ACGCATTGGAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTC--A-TTC-AA--ACA-AATAA--AAAAAA
gi|105262 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CGTTTTC-GA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAGT-T-TA---CT-----G----TCT-C-AC---T--CGCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATTTCTTAAAT--CTTTGA--AC-A-AG-AATTCA--TC-TTTAGA------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAATCAGTACCTCTTTA-T--TGAC--CAG-ATGCaaa
gi|105263 : TTTAAA--CTTCAC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTGGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TAT-C-AC---T--TGCC-CAC-ATGG-CGAGTT-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-----------------A------ATTGTA-TC-G-GGTTTCAG-TAA-------------
gi|105264 : TTTAAAACTTTTGC-AGCATGCTCC-A---TCGC-CATT-GC-TAAGTAAAGGAATTGGG--A-TG-GGCTC-T-A-GAAT-C-TG---CT-----G----TCTGC-AC---TCTTGCC--AC-ATGG-CTAGTA-ATT-------T---TTTGATAAC-A-GA-AATTGG--TC-T----GTCTATCATTGT--TT-G-GG-TT-AG-TAA-------------A-TATTGAAAGCAG-ACCCATCGGAA--AACTTTATTCA-CTTCAC-T-CATAAA-A-TTT-CAATTC--ATTTC-AA--ACAGAATAA
gi|105265 : TTTAAA--TTTAGA-A-CTTGC-CC-A--CTCAT-CATTTGT-GA-ACAAA--ATTTGGT--G-TC-GGCGC-C-T-TAAT-T-CA---CT-----G----TTT-C-GC---T--CGCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--TGATGA--AC-A-AG-AATTGG--TTAT----A------ATTGTA-TC-T-GG-TTTAG-TAagaaat
gi|105266 : TTTAAA--CTT-GC-A-CTTGC-CCCA--CTCGC-AAGTTGC-TA-GT-AA--ATTTTGT--
gi|105267 : TTTAAA--CTTCAT-A-CTTGC-CC-AATTTCGC-TAATT------GTAAA----TTTGT--G-TG-TACTT-A-T-AAAA-T-TG---AA-----A----TTT-T-GC---T--TGCCATGC-ATG
gi|105268 : AAA--CTTCGC-A-CTTGC-C--A---TCGC-CATTTGCCTA-GTAAA--ATTT-GT--GATGAGGCTCTC-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C--C---T----CC-CA--ATGG-CGAGTC-A-T-------T--CTTGGA--AT-A-AGCAATTTG--T--T----A------A-TGTA-TCAA-GG-TTCAGTTAA-------------ACT--TGAC--CAG-ATG-AT--GAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTCG-A-TTTAAA--ACAGAATAAAGAAAAAA
gi|105269 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC--ATATGC-GA-GTAAT--TTTTTTT--G-AG-GGCGA-C-C-AAAT-T------GT-----GAAAATC--C-TC---T--CGCC-CAC-ATGG-CGAGTA-Aa
gi|105270 : C-A-CTCGC-CC-A--C--GC-CAAT-GC-GA-GCAAA--ATTTGCT--G-TG-GGCGA-C-T-AAATAT-TG---AA-----A----ATC-C-TT---T--CGCC-CAC-ATGG-CGAGCG-ACT-------T--TT
gi|105271 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-GC-GA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AATT-TATGAAAGT----------TCT-C------T--CGCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105272 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-GC-GA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AGTT-TATGAAAGT----------TCT-C------T--CGCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105273 : T-C-AC---T--TGCC-CA--ATGGGCGAGTG-ATT----------CTTTGA--AC-ACAG-AATTGGGTTC-T----A------ATTGTA-TC-G-GGGTTTAG-TAA---------------T--T------------CAT-GTAGCTATCTTTATTGGAC--CA
gi|105274 : --TGCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTAA--AT-A-AC-AATTGG--TC-C----A------ATTGTA-TC-AAGG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAGAA----TAAAGAAATAAA
gi|105275 : GCAT-GGAA--ACCTTTTTTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAAGTC--A-TTC-AA--ACAGAATAATGAAATAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 222222222222222 1 222
lowQualScore : 66 2 2 2 2 33 22 2 2 0 2 33 2 66 2 2 2 2 2 2 4 444444444444444 2 55 555 2 4 2 2 8888888 33 33 2 2 2 33 5 6666 888888 2 5 2 5 2 444444444444444 44 3 6 44 44 8 4 4 4 2 99 4 4 55 999 4
lowQualScore : .. . . . . .. .. . . . . .. . .. . . . . . . . ............... . .. ... . . . . ....... .. .. . . . .. . .... ...... . . . . . ............... .. . . .. .. . . . . . .. . . .. ... .
lowQualScore : 88 2 2 2 2 11 88 7 2 3 2 11 1 11 4 4 4 4 4 4 7 000000000000000 2 99 111 1 2 2 2 7777777 77 99 9 9 9 99 7 1111 222222 9 7 9 7 9 999999999999999 66 3 7 66 66 0 0 0 0 0 55 0 0 55 000 0
consensus : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTG--AAC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAGAA-AA-TAAAGAAATAAA
Reference ( family-731 ) : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTG--AAC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAGAATAA-TAAAGAAATAAA
gi|105255 : TTTAAA--CTTCGC-A-CATGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAATG-ATT-------T--CTTTG--AAT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAGAATAATTAAAGAATTAAA
gi|105256 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-CAAT-A-TG---CT-----G----TCT-C-ACTG--TTT-GAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTG--AAT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TCAA-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---AA-TAAAGAAATAAA
gi|105257 : TTTAAAA-CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--ATCGC--ATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----GG---TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTGGATT-------C--CTTTG--AAT-A-AG-AAATGG--TCCT----A------ATTGTA-TT-G-GA-TTCAG-TAA-------------AATTG--ACCAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---AA-TAAAGAAATA
gi|105258 : TTTAAA--CTTCGC-A-TTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-TAAAAT-T-TG---GT-----G----TCT-CGACTT--GCC-CCCAATGG-CGAGTG-ATT-------TTCCTTTG--AAT-A-AG-AATTAG--TC-T----A------ATTGTATTT-G-GG-TTCAT-TAA-------------A-TTG--ACCAGAACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-TGC-TAAATA-TTTCCAATTA--A-TTC-AA--A-ACAA-AA-TAAAGAAATA
gi|105259 : TTTAAA--CTTTGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--G-C-CAC-AT-G-CGAGTG-ATT-------C--CTTTG--AAT-A-AG-AATTTG--TC-T----A------ATT-TA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ACGCAT-GG-A--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATATTTT-CGATTTCAA-TTC-AATTACAGAAAAA-TTAAGAAATAAA
gi|105260 : TTTAAA--CTTCGCCA-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC--TGG-CAAGTG-ATT-------T--CTTTG--AACAA-AG-ATTTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GA-TTTAG-TA---------------------ATCAG--TACAT-GTAC--CTCTTTATT-GAC--CA
gi|105261 : TTTAAA--CTTCGC-A-C--AG-CC-A--CTCGCACAATCA--TA-GTAAA--A----GC--G--G-GGCCA-CAT-ATAT-T------GTTACACG----TTC-C-ACTT--GCC-CACCATGC-CGAGT--ATT-------T--CTTTG--AAT-A-GA-AATCG---TC-T----A------ATTGTA-TT-G-G--CTCAG-TAA-------------A-T----ACCAG-ACGCATTGGAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTC--A-TTC-AA--ACA-AATAA-AAAAAAAA
gi|105262 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CGTTTT-CGA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAGT-T-TA---CT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATTTCTTAAAT--CTTTG--AAC-A-AG-AATTCA--TC-TTTAGA------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAATCAGTACCTCTTTA-TTG--ACCAG-ATGCa
gi|105263 : TTTAAA--CTTCAC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTGGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TAT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTT-ATT-------T--CTTTG--AAC-A-AG-----------------A------ATTGTA-TC-G-GGTTTCAG-TAA-------------
gi|105264 : TTTAAAACTTTTGC-AGCATGCTCC-A---TCGC-CATT-G-CTAAGTAAAGGAATTGGG--A-TG-GGCTC-T-A-GAAT-C-TG---CT-----G----TCTGC-ACTCTTGCC--AC-ATGG-CTAGTA-ATT-------T---TTTGATAAC-A-GA-AATTGG--TC-T----GTCTATCATTGT--TT-G-GG-TT-AG-TAAAT-----------A-TTGAAAGCAG-ACCCATCGGAA--AACTTTATTC-ACTTCAC-T-CATAAA-A-TTT-CAATTC--ATTTC-AA--ACAG---AA-TAAAGAAAT
gi|105265 : TTTAAA--TTTAGA-A-CTTGC-CC-A--CTCAT-CATTTG-TGA-ACAAA--ATTTGGT--G-TC-GGCGC-C-T-TAAT-T-CA---CT-----G----TTT-C-GCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--TGATG--AAC-A-AG-AATTGG--TTAT----A------ATTGTA-TC-T-GG-TTTAG-TA
gi|105266 : TTTAAA--CTT-GC-A-CTTGC-CCCA--CTCGC-AAGTTG-CTA-GT-AA--ATTTTGT--
gi|105267 : TTTAAA--CTTCAT-A-CTTGC-CC-AATTTCGC-TAATT------GTAAA----TTTGT--G-TG-TACTT-A-T-AAAA-T-TG---AA-----A----TTT-T-GCTT--GCCATGC-ATG
gi|105268 : AAA--CTTCGC-A-CTTG--CC-A---TCGC-CATTTGCCTA-GTAAA--A-TTTGT--GATGAGGCTCTC-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C--CT----CC-CA--ATGG-CGAGTC-A-T-------T--CTTGG--AAT-A-AGCAATTTG--T--T----A------A-TGTA-TCAA-GG-TTCAGTTAA-------------ACTTG--ACCAG-ATG-AT--GAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTCG-A-TTTAAA--ACAG---AA-TAAAGAAAAAAA
gi|105269 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC--ATATG-CGA-GTAAT--TTTTTTT--G-AG-GGCGA-C-C-AAAT-T------GT-----GAAAATC--C-TCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105270 : C-A-CTCGC-CC-A--C--GC-CAAT-G-CGA-GCAAA--ATTTGCT--G-TG-GGCGA-C-T-AAATAT-TG---AA-----A----ATC-C-TTTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGCG-ACT-------T--TT
gi|105271 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-G-CGA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AATT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105272 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-G-CGA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AGTT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105273 : T-C-ACTT--GCC-CA--ATGGGCGAGTG-ATT----------CTTTG--AAC-ACAG-AATTGGGTTC-T----A------ATTGTA-TC-G-GGGTTTAG-TAA---------------TT------------CAT-GTAGCTATCTTTATTGGAC--CA
gi|105274 : --GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTA--AAT-A-AC-AATTGG--TC-C----A------ATTGTA-TC-AAGG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---AA-TAAAGAAATAAA
gi|105275 : tGCAT-GGAA--ACCTTTTTTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAAGTC--A-TTC-AA--ACAGAATAA-T---GAAATAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 222222222222222 1 3333
lowQualScore : 66 2 2 2 2 33 22 2 2 0 2 33 2 66 2 2 2 2 2 2 4 444444444444444 2 55 555 2 4 2 2 8888888 33 33 2 2 2 33 5 6666 888888 2 5 2 5 2 444444444444444 44 3 6 44 44 8 4 4 4 2 99 4 4 55 6666 4
lowQualScore : .. . . . . .. .. . . . . .. . .. . . . . . . . ............... . .. ... . . . . ....... .. .. . . . .. . .... ...... . . . . . ............... .. . . .. .. . . . . . .. . . .. .... .
lowQualScore : 88 2 2 2 2 11 88 7 2 3 2 11 1 11 4 4 4 4 4 4 7 000000000000000 2 99 111 1 2 2 2 7777777 77 99 9 9 9 99 7 1111 222222 9 7 9 7 9 999999999999999 66 3 7 66 66 0 0 0 0 0 55 0 0 55 2222 0
consensus : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTG--AAC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG--A-AA-TAAAGAAATAAA
Reference ( family-731 ) : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTG--AAC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG-AA-AA-TAAAGAAATAAA
gi|105255 : TTTAAA--CTTCGC-A-CATGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAATG-ATT-------T--CTTTG--AAT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG-AATAATTAAAGAATTAAA
gi|105256 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-CAAT-A-TG---CT-----G----TCT-C-ACTG--TTT-GAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTG--AAT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TCAA-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG----AA-TAAAGAAATAAA
gi|105257 : TTTAAAA-CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--ATCGC--ATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----GG---TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTGGATT-------C--CTTTG--AAT-A-AG-AAATGG--TCCT----A------ATTGTA-TT-G-GA-TTCAG-TAA-------------AATTG--ACCAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG----AA-TAAAGAAATA
gi|105258 : TTTAAA--CTTCGC-A-TTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-TAAAAT-T-TG---GT-----G----TCT-CGACTT--GCC-CCCAATGG-CGAGTG-ATT-------TTCCTTTG--AAT-A-AG-AATTAG--TC-T----A------ATTGTATTT-G-GG-TTCAT-TAA-------------A-TTG--ACCAGAACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-TGC-TAAATA-TTTCCAATTA--A-TTC-AA--A-AC-AA-AA-TAAAGAAATA
gi|105259 : TTTAAA--CTTTGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--G-C-CAC-AT-G-CGAGTG-ATT-------C--CTTTG--AAT-A-AG-AATTTG--TC-T----A------ATT-TA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ACGCAT-GG-A--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATATTTT-CGATTTCAA-TTC-AATTACAGAAA-AA-TTAAGAAATAAA
gi|105260 : TTTAAA--CTTCGCCA-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC--TGG-CAAGTG-ATT-------T--CTTTG--AACAA-AG-ATTTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GA-TTTAG-TA---------------------ATCAG--TACAT-GTAC--CTCTTTATT-GAC--CA
gi|105261 : TTTAAA--CTTCGC-A-C--AG-CC-A--CTCGCACAATCA--TA-GTAAA--A----GC--G--G-GGCCA-CAT-ATAT-T------GTTACACG----TTC-C-ACTT--GCC-CACCATGC-CGAGT--ATT-------T--CTTTG--AAT-A-GA-AATCG---TC-T----A------ATTGTA-TT-G-G--CTCAG-TAA-------------A-T----ACCAG-ACGCATTGGAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTC--A-TTC-AA--AC----A-AA-TAAAAAAAAAAA
gi|105262 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CGTTTT-CGA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAGT-T-TA---CT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATTTCTTAAAT--CTTTG--AAC-A-AG-AATTCA--TC-TTTAGA------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAATCAGTACCTCTTTA-TTG--ACCAG-ATGC
gi|105263 : TTTAAA--CTTCAC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTGGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TAT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTT-ATT-------T--CTTTG--AAC-A-AG-----------------A------ATTGTA-TC-G-GGTTTCAG-TAA-------------
gi|105264 : TTTAAAACTTTTGC-AGCATGCTCC-A---TCGC-CATT-G-CTAAGTAAAGGAATTGGG--A-TG-GGCTC-T-A-GAAT-C-TG---CT-----G----TCTGC-ACTCTTGCC--AC-ATGG-CTAGTA-ATT-------T---TTTGATAAC-A-GA-AATTGG--TC-T----GTCTATCATTGT--TT-G-GG-TT-AG-TAAAT-----------A-TTGAAAGCAG-ACCCATCGGAA--AACTTTATTC-ACTTCAC-T-CATAAA-A-TTT-CAATTC--ATTTC-AA--ACAG----AA-TAAAGAAAT
gi|105265 : TTTAAA--TTTAGA-A-CTTGC-CC-A--CTCAT-CATTTG-TGA-ACAAA--ATTTGGT--G-TC-GGCGC-C-T-TAAT-T-CA---CT-----G----TTT-C-GCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--TGATG--AAC-A-AG-AATTGG--TTAT----A------ATTGTA-TC-T-GG-TTTAG-TA
gi|105266 : TTTAAA--CTT-GC-A-CTTGC-CCCA--CTCGC-AAGTTG-CTA-GT-AA--ATTTTGT--
gi|105267 : TTTAAA--CTTCAT-A-CTTGC-CC-AATTTCGC-TAATT------GTAAA----TTTGT--G-TG-TACTT-A-T-AAAA-T-TG---AA-----A----TTT-T-GCTT--GCCATGC-ATG
gi|105268 : AAA--CTTCGC-A-CTTG--CC-A---TCGC-CATTTGCCTA-GTAAA--A-TTTGT--GATGAGGCTCTC-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C--CT----CC-CA--ATGG-CGAGTC-A-T-------T--CTTGG--AAT-A-AGCAATTTG--T--T----A------A-TGTA-TCAA-GG-TTCAGTTAA-------------ACTTG--ACCAG-ATG-AT--GAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTCG-A-TTTAAA--ACAG----AA-TAAAGAAAAAAA
gi|105269 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC--ATATG-CGA-GTAAT--TTTTTTT--G-AG-GGCGA-C-C-AAAT-T------GT-----GAAAATC--C-TCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105270 : C-A-CTCGC-CC-A--C--GC-CAAT-G-CGA-GCAAA--ATTTGCT--G-TG-GGCGA-C-T-AAATAT-TG---AA-----A----ATC-C-TTTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGCG-ACT-------T--TT
gi|105271 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-G-CGA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AATT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105272 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-G-CGA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AGTT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105273 : T-C-ACTT--GCC-CA--ATGGGCGAGTG-ATT----------CTTTG--AAC-ACAG-AATTGGGTTC-T----A------ATTGTA-TC-G-GGGTTTAG-TAA---------------TT------------CAT-GTAGCTATCTTTATTGGAC--CA
gi|105274 : --GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTA--AAT-A-AC-AATTGG--TC-C----A------ATTGTA-TC-AAGG-TTCAG-TAA-------------A-TTG--ACCAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG----AA-TAAAGAAATAAA
gi|105275 : tGCAT-GGAA--ACCTTTTTTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAAGTC--A-TTC-AA--ACAG----AA-TAATGAAATAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 222222222222222 1 222
lowQualScore : 66 2 2 2 2 33 22 2 2 0 2 33 2 66 2 2 2 2 2 2 4 444444444444444 2 55 555 2 4 2 2 8888888 33 33 2 2 2 33 5 6666 888888 2 5 2 5 2 000000000000000 44 44 3 6 44 44 8 4 4 4 2 99 4 8 55 555 4 55
lowQualScore : .. . . . . .. .. . . . . .. . .. . . . . . . . ............... . .. ... . . . . ....... .. .. . . . .. . .... ...... . . . . . ............... .. .. . . .. .. . . . . . .. . . .. ... . ..
lowQualScore : 88 2 2 2 2 11 88 7 2 3 2 11 1 11 4 4 4 4 4 4 7 000000000000000 2 99 111 1 2 2 2 7777777 77 99 9 9 9 99 7 1111 222222 9 7 9 7 9 777777777777777 66 66 3 7 66 66 0 0 0 0 0 55 0 0 55 999 0 55
consensus : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG--AA-A--TAAAGAAATAAA
Reference ( family-731 ) : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG--AA-A--TAAAGAAATAAA
gi|105255 : TTTAAA--CTTCGC-A-CATGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAATG-ATT-------T--CTTTGA--AT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG--AATAATTAAAGAATTAAA
gi|105256 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-CAAT-A-TG---CT-----G----TCT-C-ACTG--TTT-GAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TCAA-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAATAAA
gi|105257 : TTTAAAA-CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--ATCGC--ATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----GG---TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTGGATT-------C--CTTTGA--AT-A-AG-AAATGG--TCCT----A------ATTGTA-TT-G-GA-TTCAG-TAA-------------AAT--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAATA
gi|105258 : TTTAAA--CTTCGC-A-TTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-TAAAAT-T-TG---GT-----G----TCT-CGACTT--GCC-CCCAATGG-CGAGTG-ATT-------TTCCTTTGA--AT-A-AG-AATTAG--TC-T----A------ATTGTATTT-G-GG-TTCAT-TAA-------------A-T--TGAC--CAGAACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-TGC-TAAATA-TTTCCAATTA--A-TTCAAA--ACA---AA-A--TAAAGAAATA
gi|105259 : TTTAAA--CTTTGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--G-C-CAC-AT-G-CGAGTG-ATT-------C--CTTTGA--AT-A-AG-AATTTG--TC-T----A------ATT-TA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GG-A--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATATTTT-CGATTTCAA-TTC-AATTACAGAAAA-A--TTAAGAAATAAA
gi|105260 : TTTAAA--CTTCGCCA-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC--TGG-CAAGTG-ATT-------T--CTTTGA--ACAA-AG-ATTTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GA-TTTAG-TA---------------------AT--CAG--TACAT-GTAC--CTCTTTATT-GAC--CA
gi|105261 : TTTAAA--CTTCGC-A-C--AG-CC-A--CTCGCACAATCA--TA-GTAAA--A----GC--G--G-GGCCA-CAT-ATAT-T------GTTACACG----TTC-C-ACTT--GCC-CACCATGC-CGAGT--ATT-------T--CTTTGA--AT-A-GA-AATCG---TC-T----A------ATTGTA-TT-G-G--CTCAG-TAA-------------A-T----AC--CAG-ACGCATTGGAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTC--A-TTC-AA--AC----AA-A--TAAAAAAAAAAA
gi|105262 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CGTTTT-CGA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAGT-T-TA---CT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATTTCTTAAAT--CTTTGA--AC-A-AG-AATTCA--TC-TTTAGA------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAATCAGTACCTCTTTA-T--TGAC--CAG-ATGC
gi|105263 : TTTAAA--CTTCAC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTGGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TAT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTT-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-----------------A------ATTGTA-TC-G-GGTTTCAG-TAA-------------
gi|105264 : TTTAAAACTTTTGC-AGCATGCTCC-A---TCGC-CATT-G-CTAAGTAAAGGAATTGGG--A-TG-GGCTC-T-A-GAAT-C-TG---CT-----G----TCTGC-ACTCTTGCC--AC-ATGG-CTAGTA-ATT-------T---TTTGATAAC-A-GA-AATTGG--TC-T----GTCTATCATTGT--TT-G-GG-TT-AG-TAA-------------A-TATTGAAAGCAG-ACCCATCGGAA--AACTTTATTCA-CTTCAC-T-CATAAA-A-TTT-CAATTC--ATTTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAAT
gi|105265 : TTTAAA--TTTAGA-A-CTTGC-CC-A--CTCAT-CATTTG-TGA-ACAAA--ATTTGGT--G-TC-GGCGC-C-T-TAAT-T-CA---CT-----G----TTT-C-GCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--TGATGA--AC-A-AG-AATTGG--TTAT----A------ATTGTA-TC-T-GG-TTTAG-TA
gi|105266 : TTTAAA--CTT-GC-A-CTTGC-CCCA--CTCGC-AAGTTG-CTA-GT-AA--ATTTTGT--
gi|105267 : TTTAAA--CTTCAT-A-CTTGC-CC-AATTTCGC-TAATT------GTAAA----TTTGT--G-TG-TACTT-A-T-AAAA-T-TG---AA-----A----TTT-T-GCTT--GCCATGC-ATG
gi|105268 : AAA--CTTCGC-A-CTTG--CC-A---TCGC-CATTTGCCTA-GTAAA--A-TTTGT--GATGAGGCTCTC-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C--CT----CC-CA--ATGG-CGAGTC-A-T-------T--CTTGGA--AT-A-AGCAATTTG--T--T----A------A-TGTA-TCAA-GG-TTCAGTTAA-------------ACT--TGAC--CAG-ATG-AT--GAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTCG-A-TTTAAA--ACAG---A-A--TAAAGAAAAAAA
gi|105269 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC--ATATG-CGA-GTAAT--TTTTTTT--G-AG-GGCGA-C-C-AAAT-T------GT-----GAAAATC--C-TCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105270 : C-A-CTCGC-CC-A--C--GC-CAAT-G-CGA-GCAAA--ATTTGCT--G-TG-GGCGA-C-T-AAATAT-TG---AA-----A----ATC-C-TTTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGCG-ACT-------T--TT
gi|105271 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-G-CGA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AATT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105272 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-G-CGA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AGTT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105273 : T-C-ACTT--GCC-CA--ATGGGCGAGTG-ATT----------CTTTGA--AC-ACAG-AATTGGGTTC-T----A------ATTGTA-TC-G-GGGTTTAG-TAA---------------T--T------------CAT-GTAGCTATCTTTATTGGAC--CA
gi|105274 : --GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTAA--AT-A-AC-AATTGG--TC-C----A------ATTGTA-TC-AAGG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAATAAA
gi|105275 : tGCAT-GGAA--ACCTTTTTTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAAGTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAATGAAATAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 222222222222222 1 222
lowQualScore : 66 2 2 2 2 33 22 2 2 0 2 33 2 66 2 2 2 2 2 2 4 444444444444444 2 55 555 2 4 2 2 8888888 33 33 2 2 2 33 5 6666 888888 2 5 2 5 2 000000000000000 44 44 3 6 44 44 8 4 4 4 2 99 4 8 55 555 4 55
lowQualScore : .. . . . . .. .. . . . . .. . .. . . . . . . . ............... . .. ... . . . . ....... .. .. . . . .. . .... ...... . . . . . ............... .. .. . . .. .. . . . . . .. . . .. ... . ..
lowQualScore : 88 2 2 2 2 11 88 7 2 3 2 11 1 11 4 4 4 4 4 4 7 000000000000000 2 99 111 1 2 2 2 7777777 77 99 9 9 9 99 7 1111 222222 9 7 9 7 9 777777777777777 66 66 3 7 66 66 0 0 0 0 0 55 0 0 55 999 0 55
consensus : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG--AA-A--TAAAGAAATAAA
Reference ( family-731 ) : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG--AA-A--TAAAGAAATAAA
gi|105255 : TTTAAA--CTTCGC-A-CATGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAATG-ATT-------T--CTTTGA--AT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG--AATAATTAAAGAATTAAA
gi|105256 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-CAAT-A-TG---CT-----G----TCT-C-ACTG--TTT-GAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TCAA-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAATAAA
gi|105257 : TTTAAAA-CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--ATCGC--ATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----GG---TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTGGATT-------C--CTTTGA--AT-A-AG-AAATGG--TCCT----A------ATTGTA-TT-G-GA-TTCAG-TAA-------------AAT--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAATA
gi|105258 : TTTAAA--CTTCGC-A-TTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-TAAAAT-T-TG---GT-----G----TCT-CGACTT--GCC-CCCAATGG-CGAGTG-ATT-------TTCCTTTGA--AT-A-AG-AATTAG--TC-T----A------ATTGTATTT-G-GG-TTCAT-TAA-------------A-T--TGAC--CAGAACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-TGC-TAAATA-TTTCCAATTA--A-TTCAAA--ACA---AA-A--TAAAGAAATA
gi|105259 : TTTAAA--CTTTGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--G-C-CAC-AT-G-CGAGTG-ATT-------C--CTTTGA--AT-A-AG-AATTTG--TC-T----A------ATT-TA-TT-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GG-A--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATATTTT-CGATTTCAA-TTC-AATTACAGAAAA-A--TTAAGAAATAAA
gi|105260 : TTTAAA--CTTCGCCA-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC--TGG-CAAGTG-ATT-------T--CTTTGA--ACAA-AG-ATTTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GA-TTTAG-TA---------------------AT--CAG--TACAT-GTAC--CTCTTTATT-GAC--CA
gi|105261 : TTTAAA--CTTCGC-A-C--AG-CC-A--CTCGCACAATCA--TA-GTAAA--A----GC--G--G-GGCCA-CAT-ATAT-T------GTTACACG----TTC-C-ACTT--GCC-CACCATGC-CGAGT--ATT-------T--CTTTGA--AT-A-GA-AATCG---TC-T----A------ATTGTA-TT-G-G--CTCAG-TAA-------------A-T----AC--CAG-ACGCATTGGAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTC--A-TTC-AA--AC----AA-A--TAAAAAAAAAAA
gi|105262 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CGTTTT-CGA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAGT-T-TA---CT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATTTCTTAAAT--CTTTGA--AC-A-AG-AATTCA--TC-TTTAGA------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAATCAGTACCTCTTTA-T--TGAC--CAG-ATGC
gi|105263 : TTTAAA--CTTCAC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTGGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TAT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTT-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-----------------A------ATTGTA-TC-G-GGTTTCAG-TAA-------------
gi|105264 : TTTAAAACTTTTGC-AGCATGCTCC-A---TCGC-CATT-G-CTAAGTAAAGGAATTGGG--A-TG-GGCTC-T-A-GAAT-C-TG---CT-----G----TCTGC-ACTCTTGCC--AC-ATGG-CTAGTA-ATT-------T---TTTGATAAC-A-GA-AATTGG--TC-T----GTCTATCATTGT--TT-G-GG-TT-AG-TAA-------------A-TATTGAAAGCAG-ACCCATCGGAA--AACTTTATTCA-CTTCAC-T-CATAAA-A-TTT-CAATTC--ATTTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAAT
gi|105265 : TTTAAA--TTTAGA-A-CTTGC-CC-A--CTCAT-CATTTG-TGA-ACAAA--ATTTGGT--G-TC-GGCGC-C-T-TAAT-T-CA---CT-----G----TTT-C-GCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--TGATGA--AC-A-AG-AATTGG--TTAT----A------ATTGTA-TC-T-GG-TTTAG-TA
gi|105266 : TTTAAA--CTT-GC-A-CTTGC-CCCA--CTCGC-AAGTTG-CTA-GT-AA--ATTTTGT--
gi|105267 : TTTAAA--CTTCAT-A-CTTGC-CC-AATTTCGC-TAATT------GTAAA----TTTGT--G-TG-TACTT-A-T-AAAA-T-TG---AA-----A----TTT-T-GCTT--GCCATGC-ATG
gi|105268 : AAA--CTTCGC-A-CTTG--CC-A---TCGC-CATTTGCCTA-GTAAA--A-TTTGT--GATGAGGCTCTC-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C--CT----CC-CA--ATGG-CGAGTC-A-T-------T--CTTGGA--AT-A-AGCAATTTG--T--T----A------A-TGTA-TCAA-GG-TTCAGTTAA-------------ACT--TGAC--CAG-ATG-AT--GAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCCAATTCG-A-TTTAAA--ACAG---A-A--TAAAGAAAAAAA
gi|105269 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC--ATATG-CGA-GTAAT--TTTTTTT--G-AG-GGCGA-C-C-AAAT-T------GT-----GAAAATC--C-TCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105270 : C-A-CTCGC-CC-A--C--GC-CAAT-G-CGA-GCAAA--ATTTGCT--G-TG-GGCGA-C-T-AAATAT-TG---AA-----A----ATC-C-TTTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGCG-ACT-------T--TT
gi|105271 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-G-CGA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AATT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105272 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-G-CGA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AGTT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105273 : T-C-ACTT--GCC-CA--ATGGGCGAGTG-ATT----------CTTTGA--AC-ACAG-AATTGGGTTC-T----A------ATTGTA-TC-G-GGGTTTAG-TAA---------------T--T------------CAT-GTAGCTATCTTTATTGGAC--CA
gi|105274 : --GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTAA--AT-A-AC-AATTGG--TC-C----A------ATTGTA-TC-AAGG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAATAAA
gi|105275 : tGCAT-GGAA--ACCTTTTTTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAAGTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAATGAAATAAA
blockSeqs : AC C G T C AT AC T C A GG T TT A A T A A A A GTTACACG G GA CTT A A G G TCTTAAA TC TA A C C GT C TTAG TCTATC T A A T T TCAGTACCTCTTTA AT AG A T CT TT T G A T C CA T A TT AAA . .
blockSeqs : A . . . . . C T . . . T TT . . . . . . A GTGAAAA . A G . C . . . . . . . . . A . . . A . G . AA . . . C . . T . . . C G . A . A . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . T . . . . . . . . AAAGT . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . C . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . T . . . . . . . . AAAGT . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . A . . . . . . . . GTGG . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C C . . . A . . . . . . . . CTG . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . T . . . . . . . . GTG . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . A . . . . . . . . GTG . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . T . . . . . . . . CTG . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A T . . . T . . . . . . . . CTG . G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . T . . . . . . . . CTG . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . T . . . . . . . . CTG . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . T . . . . . . . . CTG . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . T . . . . . . . . AAA . A C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . GTG . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : *** **
originalCons : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG--AA-A--TAAAGAAATAAA
finalCons : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTG-CTA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAG-TAA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-CAATTC--A-TTC-AA--ACAG---A-A--TAAAGAAATAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 1111111111 222222222222222
lowQualScore : 66 2 2 2 2 33 22 2 22 2 33 0 66 2 2 2 2 2 2 4 444444444444444 2 55 22 2 4 2 2 1111111111 33 2 2 2 33 5 6666 888888 2 2 5 5 2 000000000000000 44 44 3 6 44 44 4 8 4 4 8 4 99 4 4 55 4 777 8888
lowQualScore : .. . . . . .. .. . .. . .. . .. . . . . . . . ............... . .. .. . . . . .......... .. . . . .. . .... ...... . . . . . ............... .. .. . . .. .. . . . . . . .. . . .. . ... ....
lowQualScore : 88 2 2 2 2 11 88 7 66 2 11 4 11 4 4 4 4 4 4 7 000000000000000 2 99 99 1 2 2 2 9999999999 99 9 9 9 99 7 1111 222222 9 9 7 7 9 777777777777777 66 66 3 7 66 66 0 0 0 0 0 0 55 0 0 55 0 000 5555
consensus : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAGT-AA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-C-AATTC--ATT-C-AA--A-CAG---AA----TAAAGAAATAAA
Reference ( family-731 ) : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAGT-AA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-C-AATTC--ATT-C-AA--A-CAG---AA----TAAAGAAATAAA
gi|105255 : TTTAAA--CTTCGC-A-CATGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAATG-ATT-------T--CTTTGA--AT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TT-G-GG-TTCAGT-AA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-C-AATTC--ATT-C-AA--A-CAG---AATAATTAAAGAATTAAA
gi|105256 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-CAAT-A-TG---CT-----G----TCT-C-ACTG--TTT-GAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTGA--AT-A-AG-AATTGG--TC-T----A------ATTGTA-TCAA-GG-TTCAGT-AA-------------A-T--TGAC--CAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-C-AATTC--ATT-C-AA--A-CAG---AA----TAAAGAAATAAA
gi|105257 : TTTAAAA-CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--ATCGC--ATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----GG---TCT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTGGATT-------C--CTTTGA--AT-A-AG-AAATGG--TCCT----A------ATTGTA-TT-G-GA-TTCAGT-AA-------------AAT--TGAC--CAG-ACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-C-AATTC--ATT-C-AA--A-CAG---AA----TAAAGAAATA
gi|105258 : TTTAAA--CTTCGC-A-TTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-TAAAAT-T-TG---GT-----G----TCT-CGACTT--GCC-CCCAATGG-CGAGTG-ATT-------TTCCTTTGA--AT-A-AG-AATTAG--TC-T----A------ATTGTATTT-G-GG-TTCATT-AA-------------A-T--TGAC--CAGAACGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-TGC-TAAATA-TTTCC-AATTA--ATT-CAAA--A-CAA---AA----TAAAGAAATA
gi|105259 : TTTAAA--CTTTGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C-ACTT--G-C-CAC-AT-G-CGAGTG-ATT-------C--CTTTGA--AT-A-AG-AATTTG--TC-T----A------ATT-TA-TT-G-GG-TTCAGT-AA-------------A-T--TGAC--CAG-ACGCAT-GG-A--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATATTTT-C-GATTTCAATT-C-AATTA-CAGAAAAA----TTAAGAAATAAA
gi|105260 : TTTAAA--CTTCGCCA-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TCT-C-ACTT--GCC-CAC--TGG-CAAGTG-ATT-------T--CTTTGA--ACAA-AG-ATTTGG--TC-T----A------ATTGTA-TC-G-GA-TTTAGT-A---------------------AT--CAG--TACAT-GTAC--CTCTTTATT-GAC--CA
gi|105261 : TTTAAA--CTTCGC-A-C--AG-CC-A--CTCGCACAATCA--TA-GTAAA--A----GC--G--G-GGCCA-CAT-ATAT-T------GTTACACG----TTC-C-ACTT--GCC-CACCATGC-CGAGT--ATT-------T--CTTTGA--AT-A-GA-AATCG---TC-T----A------ATTGTA-TT-G-G--CTCAGT-AA-------------A-T----AC--CAG-ACGCATTGGAA--ACCTTTATTCAAC--CACTT-C-TAAATA-TTTCC-AATTC--ATT-C-AA--A-CA----AA----TAAAAAAAAAAA
gi|105262 : TTTAAA--CTTCGC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CGTTTTC-GA-GTAAA--AATTTGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAGT-T-TA---CT-----G----TCT-C-ACTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATTTCTTAAAT--CTTTGA--AC-A-AG-AATTCA--TC-TTTAGA------ATTGTA-TC-G-GG-TTCAGT-AATCAGTACCTCTTTA-T--TGAC--CAG-ATGC
gi|105263 : TTTAAA--CTTCAC-A-CTTGC-CC-A--CTCGC-CATTTGC-TA-GTAAA--ATTTGGT--G-TG-GGCTC-C-T-AAAT-T-TG---CT-----G----TAT-C-ACTT--GCC-CAC-ATGG-CGAGTT-ATT-------T--CTTTGA--AC-A-AG-----------------A------ATTGTA-TC-G-GGTTTCAGT-AA-------------
gi|105264 : TTTAAAACTTTTGC-AGCATGCTCC-A---TCGC-CATT-GC-TAAGTAAAGGAATTGGG--A-TG-GGCTC-T-A-GAAT-C-TG---CT-----G----TCTGC-ACTCTTGCC--AC-ATGG-CTAGTA-ATT-------T---TTTGATAAC-A-GA-AATTGG--TC-T----GTCTATCATTGT--TT-G-GG-TT-AGT-AA-------------A-TATTGAAAGCAG-ACCCATCGGAA--AACTTTATTCA-CTTCAC-T-CATAAA-A-TTT-C-AATTC--ATTTC-AA--A-CAG---AA----TAAAGAAAT
gi|105265 : TTTAAA--TTTAGA-A-CTTGC-CC-A--CTCAT-CATTTGT-GA-ACAAA--ATTTGGT--G-TC-GGCGC-C-T-TAAT-T-CA---CT-----G----TTT-C-GCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--TGATGA--AC-A-AG-AATTGG--TTAT----A------ATTGTA-TC-T-GG-TTTAGT-A
gi|105266 : TTTAAA--CTT-GC-A-CTTGC-CCCA--CTCGC-AAGTTGC-TA-GT-AA--ATTTTGT--
gi|105267 : TTTAAA--CTTCAT-A-CTTGC-CC-AATTTCGC-TAATT------GTAAA----TTTGT--G-TG-TACTT-A-T-AAAA-T-TG---AA-----A----TTT-T-GCTT--GCCATGC-ATG
gi|105268 : AAA--CTTCGC-A-CTTGC-C--A---TCGC-CATTTGCCTA-GTAAA--ATTT-GT--GATGAGGCTCTC-T-AAAT-T-TG---GT-----G----TCT-C--CTC----C-CA--ATGG-CGAGTC-ATT----------CTTGGA--AT-A-AGCAATTTG--T--T----A------AT-GTA-TC-AAGG-TTCAGTTAA-------------ACT--TGAC--CAG-ATG-AT-G-AA--ACCTTTATTCAAC--CAC-TTC-TAAATA-TTT-CCAATTCG-ATT-T-AA--AACAG---AA----TAAAGAAAAAAA
gi|105269 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC--ATATGC-GA-GTAAT--TTTTTTT--G-AG-GGCGA-C-C-AAAT-T------GT-----GAAAATC--C-TCTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105270 : C-A-CTCGC-CC-A--C--GC-CAAT-GC-GA-GCAAA--ATTTGCT--G-TG-GGCGA-C-T-AAATAT-TG---AA-----A----ATC-C-TTTC--GCC-CAC-ATGG-CGAGCG-ACT-------T--TT
gi|105271 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-GC-GA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AATT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105272 : C-A-CTCGC-CC-A--CTCGC-AAAT-GC-GA-GTAA----TTTTATTTG-TG-GGCGA-C-C-AGTT-TATGAAAGT----------TCT-C---TC--GCC-CAC-ATGG-CGAGTA-A
gi|105273 : T-C-ACTT--GCC-CA--ATGGGCGAGTG-ATT----------CTTTGA--AC-ACAG-AATTGGGTTC-T----A------ATTGTA-TC-G-GGGTTTAGT-AA---------------T--T------------CAT-GTAGCTATCTTTATTGGAC--CA
gi|105274 : --GCC-CAC-ATGG-CGAGTG-ATT-------T--CTTTAA--AT-A-AC-AATTGG--TC-C----A------ATTGTA-TC-AAGG-TTCAGT-AA-------------A-T--TGAC--CAG-ATGCAT-GGAA--ACCTTTATTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-C-AATTC--ATT-C-AA--A-CAG---AA----TAAAGAAATAAA
gi|105275 : tGCAT-GGAA--ACCTTTTTTCAAC--CAC-T-C-TAAATA-TTT-C-AAGTC--ATT-C-AA--A-CAG---AA----TAATGAAATAAA