lowQualScore : 0 0 7777 444444444 2 11 0 00 0 11 00 0 555 3 0 0000 0 0 0000 0 0 0 5 00 11 33333 6 0
lowQualScore : . . .... ......... . .. . .. . .. .. . ... . . .... . . .... . . . . .. .. ..... . .
lowQualScore : 4 4 8888 333333333 4 00 8 66 4 00 66 8 000 5 8 9999 4 4 9999 4 4 4 3 66 00 33333 4 3
consensus : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CACAAG--AAACGC----ACATGCTAAA
Reference ( gi|57753 ) : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CACAAG--AAATGT----ACATGCTGAA
gi|57397 : CACAAG--TCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-C-TTT--CACAGG--AAATGC----ACATGTTAAA
gi|57407 : aggcCACAAG-GTCA-A---CA----------T-T--T-G--G-T--A--C-AT-A-TAG-A----A-A-G----G-TC-T-TTC--CACAAG--AAATCC----ACATGCTAAA
gi|57754 : aggtCACAAG-GTCA-A---CAA---------T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----A-TA-T-TCT--AAAAAG--AAATAC----ACATGCTAAA
gi|57405 : CACAAG-GTCA-A---CGA-----A---T-T--C-T--G-T--A--C-CG-A-TGG-A----A-T-G----G-TA-T-TCT--CACAAG--AAATGC----ACATGATAAA
gi|57746 : aggtCACTAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--A-T--A--C-CA-A-GGG-A----T-A-T----A-TC-T-TCT--CACAAG--AAATGC----ACATGCCAAA
gi|57425 : tCACAAG-GGCA-A----AA-----A---T-TGTT-G--G-T--A--T-CA-A-TGG-A----A-A-A----G-TC-T-TCG--CACAAG--GAATGT----ACATGC
gi|57422 : aggtCACAAA-GTCA-A---AAT-----A---T-A--T-G--G-T--A--C-AG-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--TACAAC--AAATGC----ACATGCTGAA
gi|57414 : aggtCACATG-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-A----G-TC----AT--CACAAG--AAATGC----ACATATTAAA
gi|57433 : aggtCACAAG-GCCT-G---CAA-----A---G-C--T-G--G-T--A--T-GA-C-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TTT--CTCAAG--AAATGC----ACATGCTGAA
gi|57464 : aagtCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---T-TC-T-G--G-T--A--C-CA-A-CAG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAACAT----ATATG-TGAA
gi|57398 : aggtCACAAGAGTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--G-T--A--T-TG-T-TTG-A----A-A-A------TC-T-CCT--CACAAG--AAATGC----ACATGCa
gi|57421 : aggtCACAAG-GTTG-A---CAG-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-AG-A-TGA-A----A-A-T----G-AC-T-TCT--CACAAGA-AAATGC----ACATGCTAA
gi|57427 : aggtCACAAG-GTCA-A---C-----------T-C--T-ATAG-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-CC-T-TTT--TACAAG--AAATGC----ACATACTTAA
gi|57749 : aggtCACAAG-GTCA-C---CAA-----C---T-C--T-G--A-T--A--C-CA-A-CAG-A----A-A-G----G-TC-T-TCA--CACACG--AGATGTATGCACATGATAAA
gi|57396 : tCACAAG-AACA-A---GAA-----A---T-C--T-G--G-T--A--T-TG-T-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TCA--CACAAG--AAATGC----ACATG
gi|57484 : agttCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--GGT--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAACAC----ACATG
gi|57505 : aggtCGCAAG-GACA-A---CAA-----A---G-T--T-G--G-C--A--T-CA-T-TTG-A----A-A-G----G-TC-T-TCTCACACAAG--AAATGC----ACA
gi|57535 : aggtcaagaaCATGAG-GTCA-A---GTA-----T---T-T--T-T--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--CACAAG--GAATGG----ACATAC
gi|57432 : aggtCACAAA-GTTA-A---CAA---------T-C--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-AAG----G-TA-T-TTT--TACAAG--AAATGC----ACATaaaa
gi|57409 : aggtCATAAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--CAG--G-T--A--T-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAACAT----ATATG-TGAAcgtaaa
gi|57731 : aggtCATAAG-GTCA-A---ATA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TTA-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--CACAAG--GAATAC----ACATa
gi|57418 : gtCACAAG--TCA-A---CAA-----A---C-T--T-T--G-T--A--C-CA-A-TTG-A----A-A-T----A-TC-T-TCT--CACATG--AAATGT----A
gi|57439 : agatCGCAGG-GTAA-A---CGT-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----A-TC-T-TAC--CACAAG--AAATAC----ACATGCCAAA
gi|57429 : agatCACCAG-GTCA-G-----------A---TGT--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--TACAAG--GAATGC----ACATGCCAAA
gi|57755 : aggtCATAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-A--T-A--G-C--A--T-CG-T-TGA-A----A-A-G----G-TC-T-TTT--TACAAA--AAATCC----ACATGCTCAA
gi|57434 : CAAAAG-GCCA-A---AAA-----A---A-G--T-T--G-T--G--C-CA-A-TGG-A----A-A-A----G-TT-T-TTC--CACAAG--AAATGC----ACATGCTAAA
gi|57442 : aggtCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--G-T--A--C-CAAG-TAG-A----A-A-G----G-AC-T-TGT--CATAAG--GAACAC----ACATG
gi|57448 : aggtCACAAG-ATCG-A---CAA-----A---T-A--T-A--A-T--A--T-GG-C-TGG-A----A-A-G----A-CC-C-CCT--CACAAG--AAATGT----ATATGCtgtaaa
gi|57399 : aggtCACCAG-GTCA-A---AGA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TAG-A----A-A-T----T-TC-T-TAC--CACAAG--GTATAC----ACACGCCAAAaga
gi|57520 : aggtCACAAG-GTCA-A---CAT-----T---T-T--T-G--G-T--A--T-CA-A--AG-A----A-A-G----GTTC-T-TGT--CACCAGAAAAATAC----ACATG-TGAA
gi|57440 : aggtCACCAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-TGG-A----A-A-G----A-TC-T-TGC--CACAAG--GAATAC----ACATACCAAAa
gi|57408 : aggtCACAAG-GCCG-G---AGA-----T---T-T--T-G--G-T--A--G-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--CACAAG--GAATAC----ACATACCAAA
gi|57410 : aggtCGCAAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-TAG-A----A-A-A----T-CC-T-TGT--CACAAG--GAATTC----ACATACCAAA
gi|57468 : aggtCACCAG-ATCA-A----GA-----A---T-T--C-A--A-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--CACAAG--AAATAC----GCATATTAAA
gi|57394 : agttCACCAG-GTCA-A---TGA-----------T--T-A--G-T--A--C-CA-A-TAG-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--CAAATG--GAATAC----ACATGC
gi|57446 : aggtCACAAA-GTCA-A---CTA-----A---T-G--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-AAATTA-A-G----G----T-TCT--CTTAAA--AATTGC----ACATGCTAAA
gi|57450 : aggtCACAAA-GTCA-A---CTA-----A---T-T--T-G--G----A--C-CT-GATGG-A----A-A-G----A-TCATATCT--TACAGG--AAAT------ACATGCTAAA
gi|57507 : aggtCACAAA-GTCA-A---CAACAAAAA---T-C--T-G--G-C--A--T-GA-A-TTG-A----A-A-TTTCTG-TC-T-TCT--AACAAG--AAATGC----ACGTGCTAAA
gi|57451 : aagtCAAAAG-GTCA-A---CAC-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-AA-A-TTT-A----T-T-G----G-TT-A-TCT--TTCAAG--AAATGC----ACATGC
gi|57534 : aggcCACAAG-GTCA-A----AG-----A---T-T--C-T--G-TTTA--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--CACAAG--GAATa
gi|57401 : aggtACAAA-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--A-C--A--C-CT-A-TGG-A----A-A-G----G-CC-T-TCT--CACAAG--AAATGC----ACATGC
gi|57757 : aggttACAAG-GTCA-A---CAA-----C---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-A----G-TC-T-TCC--CACAAG--AAAT
gi|57437 : ACAAG-GTCA-A---CAA-----A---A-T--T-G--G-T--A--T-GG-A-TAG-A----A-A-T----G-TC-T-TCT--TACAAG--ACATGC----ACATGTTAAA
gi|57467 : aagtaACAAG-GTTA-A---CAA-----A-----C--T-A--A-T--A--C-CA-T-TAG-A----A-A-A----G-TC-T-TTT--CATAAG--ATATAC----ACATGTTAAA
gi|57449 : aggttACAAG-TTCA-A---CAA-----A---T-A--T-A--T-A--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-A----G-TC-T-TCT--CACAAG--AAATG
gi|57732 : aggtaATAAG-GTCA-A---CTA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TCT---ACAc
gi|57438 : gttACAAG-GTCA-A---ATA-----T---T-T--T-G--A-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-C-G----A-TC-T-TGT--TACAAG--CAATAT----ACATACCAAA
gi|57395 : aggttCAAG-GTCA-C---CAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CACAAG--AAATGC----ACAT
gi|57745 : aggtcaatttCACG-ATCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--T-CG-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CACAAG--AAATGC----ACGTACTAAActtaaa
gi|57762 : tCAAG-GTCA-C---TGA-----A---T-C--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-C----A-A-G----G-TC-T-TCT--CACAAG--AAATGG----ACATGCTAAA
gi|57402 : CAAG-GTCA-A---AAA-----A---T-C--T-G--G-A--A--C-CA-A-TGA-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CACACG--AAATGC----ACATGCTAAA
gi|57424 : aggtcaaattCAAG-CTCA-A---CAG---------T-T--T-G--T-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TTT--AACAAG--AAATGT----ACATGCTAAA
gi|57763 : aggtcattgtCAAG-GTCA-C---AAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-C-AGG-A----A-A-G----A-TC-T--CT--CACAAG--AAATGC----ACATGCTAAA
gi|57417 : CAAT-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CGC-AT--AAATGC----ACGTGTTAAA
gi|57431 : aggtcaatgcCAAA-ATTA-AGATCAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TA-T-TCT--TACAAG--AAGTGC----ACATGC-GAA
gi|57447 : aggtCAAG-GTCA-A---CAT-----A---T-C--T-G--G-T--A----TG-G-TTG-A----ATA-G----G-CC-T-TCT--CATAAG--AAATGC----ACATGCTAAAa
gi|57766 : aggtCAAG-GTAA-A---AAA-----A---T-C--T-A--A-T--A--C-CA-A-TAC-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CAAGAG--AAATGC----ATATGCTAAA
gi|57764 : CAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--G-TG-A--T-TA-AATGA-A----A-A-G----G-TT-T-TCT--CACAGG--AAATGC----AAGGGCTAAA
gi|57776 : AAG-GTCA-A---AGG-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--TACAAG--GAATGC----GCATAC
gi|57774 : AAG-GTCA-----CAG-----A---TCT--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--CACAAT--GAATTT----ACATACTAAA
gi|57435 : AAG-GTCA-GGT-CAA-----AACCT-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TAA-A----A-A-G----G-TC-T-TGC--CACAAA--GAATAC----ACAAACTAAA
gi|57452 : aggtcaAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAATAC----ACATG
gi|57489 : aggtgaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAACAC----ACATG-TGAAtcaaa
gi|57454 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---G-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CAG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAACAT----ACATG-TGAAa
gi|57441 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAACAC----ACATG-TGAAa
gi|57477 : aggtcaggAG-GTAA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--AAATAC----ACATGa
gi|57487 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAATAC----ACAT
gi|57469 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-CGT--CATAAG--GAATAC----ACATG
gi|57526 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--TTG--A-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G--C-T-TGT--CATAAG--GAATAC----ACATG-TGAAtcaaa
gi|57522 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAG-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TCG-A----A-A-G----G-AC-T-TGT--CATAAG--GAA--T----ACATGCa
gi|57524 : aggtcaagAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--G-T--A--C-CA-G-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAACAC----ACATG
gi|57473 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A--GG-A----A-A-G----G-TC-T-TGA--CATAAG--AAACAT----ACATG-TGAA
gi|57453 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAACTA----ACATG-TGAAa
gi|57443 : aggtcaagAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--CGCA-A--GG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAACAC----ACATG-TGAAa
gi|57509 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-CGG-A----A-A-G----G-TC-T-TAT--CATAAA--GAACAT----ACATa
gi|57721 : agttcaagAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--G-T--A--C-CC-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--GAACAT----ACATG-TGAAatg
gi|57499 : ggtcaagAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--GAACAT----ACATG-TGAAa
gi|57492 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--GAACAT----ACATG-TGAAa
gi|57491 : aggtcaagAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--GAACAT----ACATG-TGAAa
gi|57504 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGA-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAACAT----ACATG-TGAAa
gi|57503 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGA-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAACAT----ACATG-TGAAa
gi|57502 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGA-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAACAT----ACATG-TGAAa
gi|57521 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TCG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAACAC----ATATa
gi|57485 : aggtcaggAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TAG-A----A-A-G----G-AC-T-TGT--CATAAG--GAACGC----ACATGta
gi|57470 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G----T--A--C-CA-A-CGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--AAGCTT----ACATG
gi|57531 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TCGAA----A-A-G----G-TC---TGT--CATAAG--GAACAC----ACATG-TGAAtaaa
gi|57530 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-G-TCGAA----A-A-G----G-TC---TGT--CATAAG--GAACAC----ACATG-TGAAa
gi|57416 : aggtcaggAG-GTCA-C---TCA-----A---T-T--T-C--G-T--A--T-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-CTT-----AAG--AAATGT----ACATGCTAAAa
gi|57476 : aggtcaatttcAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--G-T--A--C-CA-A-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAACAC----ACATG
gi|57513 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--GAACAT----ACATG-TGAA
gi|57403 : aggtcaggAA-GTCAGA---AAA-----A---T-C--T-G--G-A--A--CGCA-A-T-G-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CACACG--AAATGC----ACATGa
gi|57493 : aggtcaattcAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-AA-A-TAG-A----A-A-G----G-GC-T-TGT--CATAAG--GAATAC----ACATG
gi|57512 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---G-T--T-G--G-T--A--C-CC-A-CGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATTAG--AAACAT----ACATG
gi|57533 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-A--T-T--A--C-CA-G-TGG-A----T-A-G----G-GT-T-TGT--CATAAG--AAATAC----ACATGtaaa
gi|57483 : aggtcaggAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--G-T--ATAC-CA-A-CGA-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CACAAG--AAATAC----ACATG
gi|57478 : aggtcagAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TGT--CATAAG--GAA
gi|57508 : aggtcaggCA-A---CAAT----A---T-T--T-A----T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CGCACG--AAATGcatgtcaaa
gi|57786 : aggtcacgacgatc-A---CAA-----A---C-C--T-G--G-T--A--C-CA-A-TGG-A----A-A-A----G-TC-T-TCT--CACAAA--AAATGT----ACATGCTAAAccaatattaaa
gi|57792 : --A--C-CA-A-TGA-A----A-A-G----G-TC-T-TCT--CACAAG--AAATGC----ACATGCTAAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 7777 444444444 2 11 0 00 11 00 0 0 0 0 0000 0 0000 0 2 00 00 11 0000 2 0
lowQualScore : . . .... ......... . .. . .. .. .. . . . . .... . .... . . .. .. .. .... . .
lowQualScore : 4 4 7777 666666666 4 00 8 66 00 66 8 8 4 8 9999 4 9999 4 2 66 66 00 9999 0 5
consensus : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ACGCACATGC-TAAA
Reference ( family-73 ) : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ACGCACATGC-TAAA
gi|57394 : CACCAG-GTCA-A---TGA-----------T--T-A--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-TCTTGC--C--AAATG--GA----ATACACATGC-
gi|57395 : aggtCAAG-GTCA-C---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATCT-TAAA
gi|57396 : aggtcaatttCACAAG-AACA-A---GAA-----A---T-C--T-G--GT--A--T-T-GT-T-GGA----AA-G----G-TCTTCA--C--ACAAG--AA----ATGCACATG
gi|57397 : agttCACAAG--TCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCCTTT--C--ACAGG--AA----ATGCACATGT-TAAA
gi|57398 : aggcCACAAGAGTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--T-T-GT-T-TGA----AA-A------TCTCCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-T
gi|57399 : aggtCACCAG-GTCA-A---AGA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-T----T-TCTTAC--C--ACAAG--GT----ATACACACGC-CAAA
gi|57401 : aggtACAAA-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--AC--A--C-C-TA-T-GGA----AA-G----G-CCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-T
gi|57402 : aggttCAAG-GTCA-A---AAA-----A---T-C--T-G--GA--A--C-C-AA-T-GAA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACACG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57403 : aggtcaaattAA-GTCAGA---AAA-----A---T-C--T-G--GA--A--CGC-AA-T-G-A----AA-G----G-TCTTCT--C--ACACG--AA----ATGCACATG
gi|57405 : aggtcaattcCACAAG-GTCA-A---CGA-----A---T-T--C-T--GT--A--C-C-GA-T-GGA----AT-G----G-TATTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGA-TAAA
gi|57407 : aggtCACAAG-GTCA-A---CA----------T-T--T-G--GT--A--C-A-TA-T-AGA----AA-G----G-TCTTTC--C--ACAAG--AA----ATCCACATGC-TAAA
gi|57408 : aggtCACAAG-GCCG-G---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--G-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACATAC-CAAA
gi|57409 : aggtCATAAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--CAG--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATATATGT-GAAA
gi|57410 : aggtCGCAAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-T-AGA----AA-A----T-CCTTGT--C--ACAAG--GA----ATTCACATAC-CAAA
gi|57414 : aggtCACATG-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TC--AT--C--ACAAG--AA----ATGCACATAT-TAAA
gi|57416 : aggtAG-GTCA-C---TCA-----A---T-T--T-C--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTCTT-------AAG--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57417 : aggtcaatttcCAAT-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--GC-AT--AA----ATGCACGTGT-TAAA
gi|57418 : aggtcaatgcCACAAG--TCA-A---CAA-----A---C-T--T-T--GT--A--C-C-AA-T-TGA----AA-T----A-TCTTCT--C--ACATG--AA----ATGTA
gi|57421 : agatCACAAG-GTTG-A---CAG-----A---T-T--T-G--GT--A--C-A-GA-T-GAA----AA-T----G-ACTTCT--C--ACAAGA-AA----ATGCACATGC-TAA
gi|57422 : aggtCACAAA-GTCA-A---AAT-----A---T-A--T-G--GT--A--C-A-GA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--T--ACAAC--AA----ATGCACATGC-TGAA
gi|57424 : aggtCAAG-CTCA-A---CAG---------T-T--T-G--TT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTTT--A--ACAAG--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57425 : aggtcattgtCACAAG-GGCA-A----AA-----A---T-TGTT-G--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCG--C--ACAAG--GA----ATGTACATGC-T
gi|57427 : aggtCACAAG-GTCA-A---C-----------T-C--T-ATAGT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-CCTTTT--T--ACAAG--AA----ATGCACATAC-TTAA
gi|57429 : aggtCACCAG-GTCA-G-----------A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--T--ACAAG--GA----ATGCACATGC-CAAA
gi|57431 : aggtCAAA-ATTA-AGATCAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TATTCT--T--ACAAG--AA----GTGCACATGC-GAAA
gi|57432 : aggtCACAAA-GTTA-A---CAA---------T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AAAG----G-TATTTT--T--ACAAG--AA----ATGCACATCG-TAAA
gi|57433 : aggtCACAAG-GCCT-G---CAA-----A---G-C--T-G--GT--A--T-G-AC-T-GGA----AA-G----G-TCTTTT--C--TCAAG--AA----ATGCACATGC-TGAA
gi|57434 : aagtCAAAAG-GCCA-A---AAA-----A---A-G--T-T--GT--G--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TTTTTC--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57435 : aggtAAG-GTCA-GGT-CAA-----AACCT-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AAA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAA--GA----ATACACAAAC-TAAA
gi|57437 : aggtcaACAAG-GTCA-A---CAA-----A---A-T--T-G--GT--A--T-G-GA-T-AGA----AA-T----G-TCTTCT--T--ACAAG--AC----ATGCACATGT-TAAA
gi|57438 : aagtaACAAG-GTCA-A---ATA-----T---T-T--T-G--AT--A--C-C-AA-T-GGA----AC-G----A-TCTTGT--T--ACAAG--CA----ATATACATAC-CAAA
gi|57439 : aggttCGCAGG-GTAA-A---CGT-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----A-TCTTAC--C--ACAAG--AA----ATACACATGC-CAAA
gi|57440 : agatCACCAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-T-GGA----AA-G----A-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACATAC-CAAA
gi|57441 : aggtAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57442 : aggtcaggCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AAGT-AGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGTGTAAA
gi|57443 : aggtAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--CGC-AA---GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACACACATGT-GAAA
gi|57446 : aggtcaggCACAAA-GTCA-A---CTA-----A---T-G--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGAAATTAA-G----G---TTCT--C--TTAAA--AA----TTGCACATGC-TAAA
gi|57447 : aggtCAAG-GTCA-A---CAT-----A---T-C--T-G--GT--A--T-G-GT-T-GAA----TA-G----G-CCTTCT--C--ATAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57448 : aggtCACAAG-ATCG-A---CAA-----A---T-A--T-A--AT--A--T-G-GC-T-GGA----AA-G----A-CCCCCT--C--ACAAG--AA----ATGTATATGC-TAGA
gi|57449 : aggtACAAG-TTCA-A---CAA-----A---T-A--T-A--TA--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGC
gi|57450 : aggtaCACAAA-GTCA-A---CTA-----A---T-T--T-G--G---A--C-CTGA-T-GGA----AA-G----A-TCATAT--CTTACAGG--AA----AT--ACATGC-TAAA
gi|57451 : aggtCAAAAG-GTCA-A---CAC-----A---T-T--T-G--GT--A--C-A-AA-T-TTA----TT-G----G-TTATCT--T--TCAAG--AA----ATGCACATGC-TA
gi|57452 : aggcAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-CAAA
gi|57453 : aggtgaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACTAACATGT-GAAA
gi|57454 : aggtcaagAG-GTCA-A---CAA-----T---G-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-AGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57464 : aggtcaggCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---T-TC-T-G--GT--A--C-C-AA-C-AGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATATATGT-GAAA
gi|57467 : aggtACAAG-GTTA-A---CAA-----A-----C--T-A--AT--A--C-C-AT-T-AGA----AA-A----G-TCTTTT--C--ATAAG--AT----ATACACATGT-TAAA
gi|57468 : aggttCACCAG-ATCA-A----GA-----A---T-T--C-A--AT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--AA----ATACGCATAT-TAAA
gi|57469 : agttAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTCGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-CAAA
gi|57470 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G---T--A--C-C-AA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----GCTTACATG--TAAA
gi|57473 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA---GGA----AA-G----G-TCTTGA--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57476 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57477 : aggtcaggAG-GTAA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--AA----ATACACATG
gi|57478 : aggtcaggAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA--------ACATGT-CAAA
gi|57483 : aggtcaggAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--ATAC-C-AA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ATACACATG
gi|57484 : aggtcagCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--TGG--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57485 : aggtAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----ACGCACATG
gi|57487 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACAT
gi|57489 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57491 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57492 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57493 : aggtcaagAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-A-AA-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATG
gi|57499 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57502 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57503 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57504 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57505 : aggtcaggCGCAAG-GACA-A---CAA-----A---G-T--T-G--GC--A--T-C-AT-T-TGA----AA-G----G-TCTTCTCAC--ACAAG--AA----ATGCACA
gi|57507 : aggtcaagaaCACAAA-GTCA-A---CAACAAAAA---T-C--T-G--GC--A--T-G-AA-T-TGA----AA-TTTCTG-TCTTCT--A--ACAAG--AA----ATGCACGTGC-TAAA
gi|57508 : aagtCA-A---CAAT----A---T-T--T-A---T--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--GCACG--AA----ATGCCAATAT-TAAA
gi|57509 : aggtcacgacgatcAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-C-GGA----AA-G----G-TCTTAT--C--ATAAA--GA----ACATACAT
gi|57512 : agttcaagAG-GTCA-A---CAA-----T---G-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATTAG--AA----ACATACATG--TAAAatg
gi|57513 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57520 : aggtcaggCACAAG-GTCA-A---CAT-----T---T-T--T-G--GT--A--T-C-AA---AGA----AA-G----GTTCTTGT--C--ACCAGAAAA----ATACACATGT-GAAA
gi|57521 : aggtAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-CGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACATAT
gi|57522 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAG-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-CGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----A--TACATGC-ta
gi|57524 : aggtcaagAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57526 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----AT--T-T--T-G--AT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G--CTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-GAAA
gi|57530 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-TCGAA----AA-G----G-TC-TGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57531 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-TCGAA----AA-G----G-TC-TGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57533 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-A--TT--A--C-C-AG-T-GGA----TA-G----G-GTTTGT--C--ATAAG--AA----ATACACATG
gi|57534 : aggtcaggCACAAG-GTCA-A----AG-----A---T-T--C-T--GTTTA--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----A
gi|57535 : aggtCATGAG-GTCA-A---GTA-----T---T-T--T-T--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATGGACATAC-AAAAt
gi|57721 : aggtAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-CA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57731 : ggtcaagCATAAG-GTCA-A---ATA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-TAA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACAT
gi|57732 : gtATAAG-GTCA-A---CTA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTT
gi|57745 : gttCACG-ATCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--T-C-GA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACGTAC-TAAActaca
gi|57746 : tCACTAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--AT--A--C-C-AA-G-GGA----TA-T----A-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-CAAA
gi|57749 : tCACAAG-GTCA-C---CAA-----C---T-C--T-G--AT--A--C-C-AA-C-AGA----AA-G----G-TCTTCA--C--ACACG--AGATGTATGCACATGA-TAAA
gi|57753 : tCACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGTACATGC-TGAA
gi|57754 : CACAAG-GTCA-A---CAA---------T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----A-TATTCT--A--AAAAG--AA----ATACACATGC-TAAA
gi|57755 : CATAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-A--T-A--GC--A--T-C-GT-T-GAA----AA-G----G-TCTTTT--T--ACAAA--AA----ATCCACATGC-TCAA
gi|57757 : ACAAG-GTCA-A---CAA-----C---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCC--C--ACAAG--AA----A
gi|57762 : CAAG-GTCA-C---TGA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGC----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGGACATGC-TAAAt
gi|57763 : CAAG-GTCA-C---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AC-A-GGA----AA-G----A-TCTC-T--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57764 : CAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GTG-A--T-TAAA-T-GAA----AA-G----G-TTTTCT--C--ACAGG--AA----ATGCAAGGGC-TAAA
gi|57766 : CAAG-GTAA-A---AAA-----A---T-C--T-A--AT--A--C-C-AA-T-ACA----AA-G----G-TCTTCT--C--AAGAG--AA----ATGCATATGC-TAAA
gi|57774 : AAG-GTCA-----CAG-----A---TCT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAT--GA----ATTTACATAC-TAAA
gi|57776 : AAG-GTCA-A---AGG-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--T--ACAAG--GA----ATGCGCATAC-T
gi|57786 : -A---CAA-----A---C-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCT--C--ACAAA--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57792 : --A--C-C-AA-T-GAA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 7777 444444444 2 11 0 00 11 00 0 0 0 0 0000 0 0000 0 2 00 00 11 0000 2 0
lowQualScore : . . .... ......... . .. . .. .. .. . . . . .... . .... . . .. .. .. .... . .
lowQualScore : 4 4 7777 666666666 4 00 8 66 00 66 8 8 4 8 9999 4 9999 4 2 66 66 00 9999 0 5
consensus : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ACGCACATGC-TAAA
Reference ( family-73 ) : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ACGCACATGC-TAAA
gi|57394 : CACCAG-GTCA-A---TGA-----------T--T-A--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-TCTTGC--C--AAATG--GA----ATACACATGC-
gi|57395 : aggtCAAG-GTCA-C---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATCT-TAAA
gi|57396 : aggtcaatttCACAAG-AACA-A---GAA-----A---T-C--T-G--GT--A--T-T-GT-T-GGA----AA-G----G-TCTTCA--C--ACAAG--AA----ATGCACATG
gi|57397 : agttCACAAG--TCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCCTTT--C--ACAGG--AA----ATGCACATGT-TAAA
gi|57398 : aggcCACAAGAGTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--T-T-GT-T-TGA----AA-A------TCTCCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-T
gi|57399 : aggtCACCAG-GTCA-A---AGA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-T----T-TCTTAC--C--ACAAG--GT----ATACACACGC-CAAA
gi|57401 : aggtACAAA-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--AC--A--C-C-TA-T-GGA----AA-G----G-CCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-T
gi|57402 : aggttCAAG-GTCA-A---AAA-----A---T-C--T-G--GA--A--C-C-AA-T-GAA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACACG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57403 : aggtcaaattAA-GTCAGA---AAA-----A---T-C--T-G--GA--A--CGC-AA-T-G-A----AA-G----G-TCTTCT--C--ACACG--AA----ATGCACATG
gi|57405 : aggtcaattcCACAAG-GTCA-A---CGA-----A---T-T--C-T--GT--A--C-C-GA-T-GGA----AT-G----G-TATTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGA-TAAA
gi|57407 : aggtCACAAG-GTCA-A---CA----------T-T--T-G--GT--A--C-A-TA-T-AGA----AA-G----G-TCTTTC--C--ACAAG--AA----ATCCACATGC-TAAA
gi|57408 : aggtCACAAG-GCCG-G---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--G-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACATAC-CAAA
gi|57409 : aggtCATAAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--CAG--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATATATGT-GAAA
gi|57410 : aggtCGCAAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-T-AGA----AA-A----T-CCTTGT--C--ACAAG--GA----ATTCACATAC-CAAA
gi|57414 : aggtCACATG-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TC--AT--C--ACAAG--AA----ATGCACATAT-TAAA
gi|57416 : aggtAG-GTCA-C---TCA-----A---T-T--T-C--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTCTT-------AAG--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57417 : aggtcaatttcCAAT-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--GC-AT--AA----ATGCACGTGT-TAAA
gi|57418 : aggtcaatgcCACAAG--TCA-A---CAA-----A---C-T--T-T--GT--A--C-C-AA-T-TGA----AA-T----A-TCTTCT--C--ACATG--AA----ATGTA
gi|57421 : agatCACAAG-GTTG-A---CAG-----A---T-T--T-G--GT--A--C-A-GA-T-GAA----AA-T----G-ACTTCT--C--ACAAGA-AA----ATGCACATGC-TAA
gi|57422 : aggtCACAAA-GTCA-A---AAT-----A---T-A--T-G--GT--A--C-A-GA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--T--ACAAC--AA----ATGCACATGC-TGAA
gi|57424 : aggtCAAG-CTCA-A---CAG---------T-T--T-G--TT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTTT--A--ACAAG--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57425 : aggtcattgtCACAAG-GGCA-A----AA-----A---T-TGTT-G--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCG--C--ACAAG--GA----ATGTACATGC-T
gi|57427 : aggtCACAAG-GTCA-A---C-----------T-C--T-ATAGT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-CCTTTT--T--ACAAG--AA----ATGCACATAC-TTAA
gi|57429 : aggtCACCAG-GTCA-G-----------A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--T--ACAAG--GA----ATGCACATGC-CAAA
gi|57431 : aggtCAAA-ATTA-AGATCAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TATTCT--T--ACAAG--AA----GTGCACATGC-GAAA
gi|57432 : aggtCACAAA-GTTA-A---CAA---------T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AAAG----G-TATTTT--T--ACAAG--AA----ATGCACATCG-TAAA
gi|57433 : aggtCACAAG-GCCT-G---CAA-----A---G-C--T-G--GT--A--T-G-AC-T-GGA----AA-G----G-TCTTTT--C--TCAAG--AA----ATGCACATGC-TGAA
gi|57434 : aagtCAAAAG-GCCA-A---AAA-----A---A-G--T-T--GT--G--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TTTTTC--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57435 : aggtAAG-GTCA-GGT-CAA-----AACCT-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AAA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAA--GA----ATACACAAAC-TAAA
gi|57437 : aggtcaACAAG-GTCA-A---CAA-----A---A-T--T-G--GT--A--T-G-GA-T-AGA----AA-T----G-TCTTCT--T--ACAAG--AC----ATGCACATGT-TAAA
gi|57438 : aagtaACAAG-GTCA-A---ATA-----T---T-T--T-G--AT--A--C-C-AA-T-GGA----AC-G----A-TCTTGT--T--ACAAG--CA----ATATACATAC-CAAA
gi|57439 : aggttCGCAGG-GTAA-A---CGT-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----A-TCTTAC--C--ACAAG--AA----ATACACATGC-CAAA
gi|57440 : agatCACCAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-T-GGA----AA-G----A-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACATAC-CAAA
gi|57441 : aggtAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57442 : aggtcaggCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AAGT-AGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGTGTAAA
gi|57443 : aggtAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--CGC-AA---GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACACACATGT-GAAA
gi|57446 : aggtcaggCACAAA-GTCA-A---CTA-----A---T-G--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGAAATTAA-G----G---TTCT--C--TTAAA--AA----TTGCACATGC-TAAA
gi|57447 : aggtCAAG-GTCA-A---CAT-----A---T-C--T-G--GT--A--T-G-GT-T-GAA----TA-G----G-CCTTCT--C--ATAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57448 : aggtCACAAG-ATCG-A---CAA-----A---T-A--T-A--AT--A--T-G-GC-T-GGA----AA-G----A-CCCCCT--C--ACAAG--AA----ATGTATATGC-TAGA
gi|57449 : aggtACAAG-TTCA-A---CAA-----A---T-A--T-A--TA--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGC
gi|57450 : aggtaCACAAA-GTCA-A---CTA-----A---T-T--T-G--G---A--C-CTGA-T-GGA----AA-G----A-TCATAT--CTTACAGG--AA----AT--ACATGC-TAAA
gi|57451 : aggtCAAAAG-GTCA-A---CAC-----A---T-T--T-G--GT--A--C-A-AA-T-TTA----TT-G----G-TTATCT--T--TCAAG--AA----ATGCACATGC-TA
gi|57452 : aggcAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-CAAA
gi|57453 : aggtgaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACTAACATGT-GAAA
gi|57454 : aggtcaagAG-GTCA-A---CAA-----T---G-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-AGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57464 : aggtcaggCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---T-TC-T-G--GT--A--C-C-AA-C-AGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATATATGT-GAAA
gi|57467 : aggtACAAG-GTTA-A---CAA-----A-----C--T-A--AT--A--C-C-AT-T-AGA----AA-A----G-TCTTTT--C--ATAAG--AT----ATACACATGT-TAAA
gi|57468 : aggttCACCAG-ATCA-A----GA-----A---T-T--C-A--AT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--AA----ATACGCATAT-TAAA
gi|57469 : agttAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTCGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-CAAA
gi|57470 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G---T--A--C-C-AA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----GCTTACATG--TAAA
gi|57473 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA---GGA----AA-G----G-TCTTGA--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57476 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57477 : aggtcaggAG-GTAA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--AA----ATACACATG
gi|57478 : aggtcaggAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA--------ACATGT-CAAA
gi|57483 : aggtcaggAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--ATAC-C-AA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ATACACATG
gi|57484 : aggtcagCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--TGG--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57485 : aggtAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----ACGCACATG
gi|57487 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACAT
gi|57489 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57491 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57492 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57493 : aggtcaagAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-A-AA-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATG
gi|57499 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57502 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57503 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57504 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57505 : aggtcaggCGCAAG-GACA-A---CAA-----A---G-T--T-G--GC--A--T-C-AT-T-TGA----AA-G----G-TCTTCTCAC--ACAAG--AA----ATGCACA
gi|57507 : aggtcaagaaCACAAA-GTCA-A---CAACAAAAA---T-C--T-G--GC--A--T-G-AA-T-TGA----AA-TTTCTG-TCTTCT--A--ACAAG--AA----ATGCACGTGC-TAAA
gi|57508 : aagtCA-A---CAAT----A---T-T--T-A---T--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--GCACG--AA----ATGCCAATAT-TAAA
gi|57509 : aggtcacgacgatcAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-C-GGA----AA-G----G-TCTTAT--C--ATAAA--GA----ACATACAT
gi|57512 : agttcaagAG-GTCA-A---CAA-----T---G-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATTAG--AA----ACATACATG--TAAAatg
gi|57513 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57520 : aggtcaggCACAAG-GTCA-A---CAT-----T---T-T--T-G--GT--A--T-C-AA---AGA----AA-G----GTTCTTGT--C--ACCAGAAAA----ATACACATGT-GAAA
gi|57521 : aggtAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-CGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACATAT
gi|57522 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAG-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-CGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----A--TACATGC-ta
gi|57524 : aggtcaagAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57526 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----AT--T-T--T-G--AT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G--CTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-GAAA
gi|57530 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-TCGAA----AA-G----G-TC-TGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57531 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-TCGAA----AA-G----G-TC-TGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57533 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-A--TT--A--C-C-AG-T-GGA----TA-G----G-GTTTGT--C--ATAAG--AA----ATACACATG
gi|57534 : aggtcaggCACAAG-GTCA-A----AG-----A---T-T--C-T--GTTTA--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----A
gi|57535 : aggtCATGAG-GTCA-A---GTA-----T---T-T--T-T--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATGGACATAC-AAAAt
gi|57721 : aggtAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-CA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57731 : ggtcaagCATAAG-GTCA-A---ATA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-TAA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACAT
gi|57732 : gtATAAG-GTCA-A---CTA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTT
gi|57745 : gttCACG-ATCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--T-C-GA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACGTAC-TAAActaca
gi|57746 : tCACTAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--AT--A--C-C-AA-G-GGA----TA-T----A-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-CAAA
gi|57749 : tCACAAG-GTCA-C---CAA-----C---T-C--T-G--AT--A--C-C-AA-C-AGA----AA-G----G-TCTTCA--C--ACACG--AGATGTATGCACATGA-TAAA
gi|57753 : tCACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGTACATGC-TGAA
gi|57754 : CACAAG-GTCA-A---CAA---------T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----A-TATTCT--A--AAAAG--AA----ATACACATGC-TAAA
gi|57755 : CATAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-A--T-A--GC--A--T-C-GT-T-GAA----AA-G----G-TCTTTT--T--ACAAA--AA----ATCCACATGC-TCAA
gi|57757 : ACAAG-GTCA-A---CAA-----C---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCC--C--ACAAG--AA----A
gi|57762 : CAAG-GTCA-C---TGA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGC----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGGACATGC-TAAAt
gi|57763 : CAAG-GTCA-C---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AC-A-GGA----AA-G----A-TCTC-T--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57764 : CAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GTG-A--T-TAAA-T-GAA----AA-G----G-TTTTCT--C--ACAGG--AA----ATGCAAGGGC-TAAA
gi|57766 : CAAG-GTAA-A---AAA-----A---T-C--T-A--AT--A--C-C-AA-T-ACA----AA-G----G-TCTTCT--C--AAGAG--AA----ATGCATATGC-TAAA
gi|57774 : AAG-GTCA-----CAG-----A---TCT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAT--GA----ATTTACATAC-TAAA
gi|57776 : AAG-GTCA-A---AGG-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--T--ACAAG--GA----ATGCGCATAC-T
gi|57786 : -A---CAA-----A---C-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCT--C--ACAAA--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57792 : --A--C-C-AA-T-GAA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
blockSeqs : GATC CAAAAA G C T
blockSeqs : GTC AACC G C T
blockSeqs : C TA G T T
blockSeqs : G AT G C T
blockSeqs : C A G A T
blockSeqs : C A C C T
blockSeqs : A A . C T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : A A . C T
blockSeqs : A A . T T
blockSeqs : C A . G T
blockSeqs : C A . G C
blockSeqs : A A . G T
blockSeqs : A T . A T
blockSeqs : C A . T T
blockSeqs : T T . C T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : A A . T T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : C A . T T
blockSeqs : C A . G T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : A A . T T
blockSeqs : C A . T T
blockSeqs : A A . T T
blockSeqs : C A . G T
blockSeqs : A T . C T
blockSeqs : A T . G T
blockSeqs : C T . A T
blockSeqs : C T . G T
blockSeqs : C A . G C
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : C A . G C
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : A A . C T
blockSeqs : A A . C T
blockSeqs : C A . A T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : A A . G T
blockSeqs : A T . G C
blockSeqs : A A . G C
blockSeqs : A A . G C
blockSeqs : A A . T T
blockSeqs : A T . G T
blockSeqs : A A . G T
blockSeqs : A A . G C
blockSeqs : A A . G C
blockSeqs : A T . G C
blockSeqs : A T . G T
blockSeqs : A T . G T
blockSeqs : A A . G C
blockSeqs : A T . G C
blockSeqs : A T . G T
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : C T . G T
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : A T . G C
blockSeqs : A T . G C
blockSeqs : C A . G T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : C T . C T
blockSeqs : G T . C C
blockSeqs : A T . A C
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : C A . G T
blockSeqs : C A . G C
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : C T . G T
blockSeqs : C T . G C
blockSeqs : C A . G C
blockSeqs : C T . G T
blockSeqs : T A . G T
blockSeqs : A A . G C
blockSeqs : C A . G T
blockSeqs : A A . G T
blockSeqs : C A . G T
blockSeqs : A C . G T
blockSeqs : C A . C T
blockSeqs : . A . C T
blockSeqs : . C . C T
blockSeqs : . A . C T
blockSeqs : . A . C T
blockSeqs : . A . T T
blockSeqs : . A . C T
blockSeqs : . A . C T
blockSeqs : . T . C T
blockSeqs : . A . C T
blockSeqs : . . . G T
blockSeqs : . . . G .
blockSeqs : . . . C .
blockSeqs : . . . C
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : A********
originalCons : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ACGCACATGC-TAAA
finalCons : CACAAG-GTCA-A---CAAA--------T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ACGCACATGC-TAAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 7777 444444444 2 11 0 00 11 00 0 0 0 0 0000 0 0000 0 2 00 00 11 0000 2 0
lowQualScore : . . .... ......... . .. . .. .. .. . . . . .... . .... . . .. .. .. .... . .
lowQualScore : 4 4 7777 666666666 4 00 8 66 00 66 8 8 4 8 9999 4 9999 4 2 66 66 00 9999 0 5
consensus : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ACGCACATGC-TAAA
Reference ( family-73 ) : CACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ACGCACATGC-TAAA
gi|57394 : CACCAG-GTCA-A---TGA-----------T--T-A--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-TCTTGC--C--AAATG--GA----ATACACATGC-
gi|57395 : aggtCAAG-GTCA-C---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATCT-TAAA
gi|57396 : aggtcaatttCACAAG-AACA-A---GAA-----A---T-C--T-G--GT--A--T-T-GT-T-GGA----AA-G----G-TCTTCA--C--ACAAG--AA----ATGCACATG
gi|57397 : agttCACAAG--TCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCCTTT--C--ACAGG--AA----ATGCACATGT-TAAA
gi|57398 : aggcCACAAGAGTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--T-T-GT-T-TGA----AA-A------TCTCCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-T
gi|57399 : aggtCACCAG-GTCA-A---AGA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-T----T-TCTTAC--C--ACAAG--GT----ATACACACGC-CAAA
gi|57401 : aggtACAAA-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--AC--A--C-C-TA-T-GGA----AA-G----G-CCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-T
gi|57402 : aggttCAAG-GTCA-A---AAA-----A---T-C--T-G--GA--A--C-C-AA-T-GAA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACACG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57403 : aggtcaaattAA-GTCAGA---AAA-----A---T-C--T-G--GA--A--CGC-AA-T-G-A----AA-G----G-TCTTCT--C--ACACG--AA----ATGCACATG
gi|57405 : aggtcaattcCACAAG-GTCA-A---CGA-----A---T-T--C-T--GT--A--C-C-GA-T-GGA----AT-G----G-TATTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGA-TAAA
gi|57407 : aggtCACAAG-GTCA-A---CA----------T-T--T-G--GT--A--C-A-TA-T-AGA----AA-G----G-TCTTTC--C--ACAAG--AA----ATCCACATGC-TAAA
gi|57408 : aggtCACAAG-GCCG-G---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--G-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACATAC-CAAA
gi|57409 : aggtCATAAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--CAG--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATATATGT-GAAA
gi|57410 : aggtCGCAAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-T-AGA----AA-A----T-CCTTGT--C--ACAAG--GA----ATTCACATAC-CAAA
gi|57414 : aggtCACATG-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TC--AT--C--ACAAG--AA----ATGCACATAT-TAAA
gi|57416 : aggtAG-GTCA-C---TCA-----A---T-T--T-C--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTCTT-------AAG--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57417 : aggtcaatttcCAAT-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--GC-AT--AA----ATGCACGTGT-TAAA
gi|57418 : aggtcaatgcCACAAG--TCA-A---CAA-----A---C-T--T-T--GT--A--C-C-AA-T-TGA----AA-T----A-TCTTCT--C--ACATG--AA----ATGTA
gi|57421 : agatCACAAG-GTTG-A---CAG-----A---T-T--T-G--GT--A--C-A-GA-T-GAA----AA-T----G-ACTTCT--C--ACAAGA-AA----ATGCACATGC-TAA
gi|57422 : aggtCACAAA-GTCA-A---AAT-----A---T-A--T-G--GT--A--C-A-GA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--T--ACAAC--AA----ATGCACATGC-TGAA
gi|57424 : aggtCAAG-CTCA-A---CAG---------T-T--T-G--TT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTTT--A--ACAAG--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57425 : aggtcattgtCACAAG-GGCA-A----AA-----A---T-TGTT-G--GT--A--T-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCG--C--ACAAG--GA----ATGTACATGC-T
gi|57427 : aggtCACAAG-GTCA-A---C-----------T-C--T-ATAGT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-CCTTTT--T--ACAAG--AA----ATGCACATAC-TTAA
gi|57429 : aggtCACCAG-GTCA-G-----------A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--T--ACAAG--GA----ATGCACATGC-CAAA
gi|57431 : aggtCAAA-ATTA-AGATCAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TATTCT--T--ACAAG--AA----GTGCACATGC-GAAA
gi|57432 : aggtCACAAA-GTTA-A---CAA---------T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AAAG----G-TATTTT--T--ACAAG--AA----ATGCACATCG-TAAA
gi|57433 : aggtCACAAG-GCCT-G---CAA-----A---G-C--T-G--GT--A--T-G-AC-T-GGA----AA-G----G-TCTTTT--C--TCAAG--AA----ATGCACATGC-TGAA
gi|57434 : aagtCAAAAG-GCCA-A---AAA-----A---A-G--T-T--GT--G--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TTTTTC--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57435 : aggtAAG-GTCA-GGT-CAA-----AACCT-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AAA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAA--GA----ATACACAAAC-TAAA
gi|57437 : aggtcaACAAG-GTCA-A---CAA-----A---A-T--T-G--GT--A--T-G-GA-T-AGA----AA-T----G-TCTTCT--T--ACAAG--AC----ATGCACATGT-TAAA
gi|57438 : aagtaACAAG-GTCA-A---ATA-----T---T-T--T-G--AT--A--C-C-AA-T-GGA----AC-G----A-TCTTGT--T--ACAAG--CA----ATATACATAC-CAAA
gi|57439 : aggttCGCAGG-GTAA-A---CGT-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----A-TCTTAC--C--ACAAG--AA----ATACACATGC-CAAA
gi|57440 : agatCACCAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-T-GGA----AA-G----A-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACATAC-CAAA
gi|57441 : aggtAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57442 : aggtcaggCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AAGT-AGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGTGTAAA
gi|57443 : aggtAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--CGC-AA---GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACACACATGT-GAAA
gi|57446 : aggtcaggCACAAA-GTCA-A---CTA-----A---T-G--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGAAATTAA-G----G---TTCT--C--TTAAA--AA----TTGCACATGC-TAAA
gi|57447 : aggtCAAG-GTCA-A---CAT-----A---T-C--T-G--GT--A--T-G-GT-T-GAA----TA-G----G-CCTTCT--C--ATAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57448 : aggtCACAAG-ATCG-A---CAA-----A---T-A--T-A--AT--A--T-G-GC-T-GGA----AA-G----A-CCCCCT--C--ACAAG--AA----ATGTATATGC-TAGA
gi|57449 : aggtACAAG-TTCA-A---CAA-----A---T-A--T-A--TA--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGC
gi|57450 : aggtaCACAAA-GTCA-A---CTA-----A---T-T--T-G--G---A--C-CTGA-T-GGA----AA-G----A-TCATAT--CTTACAGG--AA----AT--ACATGC-TAAA
gi|57451 : aggtCAAAAG-GTCA-A---CAC-----A---T-T--T-G--GT--A--C-A-AA-T-TTA----TT-G----G-TTATCT--T--TCAAG--AA----ATGCACATGC-TA
gi|57452 : aggcAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-CAAA
gi|57453 : aggtgaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACTAACATGT-GAAA
gi|57454 : aggtcaagAG-GTCA-A---CAA-----T---G-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-AGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57464 : aggtcaggCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---T-TC-T-G--GT--A--C-C-AA-C-AGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATATATGT-GAAA
gi|57467 : aggtACAAG-GTTA-A---CAA-----A-----C--T-A--AT--A--C-C-AT-T-AGA----AA-A----G-TCTTTT--C--ATAAG--AT----ATACACATGT-TAAA
gi|57468 : aggttCACCAG-ATCA-A----GA-----A---T-T--C-A--AT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--AA----ATACGCATAT-TAAA
gi|57469 : agttAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTCGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-CAAA
gi|57470 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----A---T-T--T-G---T--A--C-C-AA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----GCTTACATG--TAAA
gi|57473 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA---GGA----AA-G----G-TCTTGA--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57476 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57477 : aggtcaggAG-GTAA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--AA----ATACACATG
gi|57478 : aggtcaggAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA--------ACATGT-CAAA
gi|57483 : aggtcaggAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--ATAC-C-AA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ACAAG--AA----ATACACATG
gi|57484 : aggtcagCAGAAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--TGG--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57485 : aggtAG-GTCA-A---ACA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-AGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----ACGCACATG
gi|57487 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACAT
gi|57489 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57491 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57492 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57493 : aggtcaagAG-GTCA-A---AGA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-A-AA-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATG
gi|57499 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57502 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57503 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57504 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GAA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--AA----ACATACATGT-GAAA
gi|57505 : aggtcaggCGCAAG-GACA-A---CAA-----A---G-T--T-G--GC--A--T-C-AT-T-TGA----AA-G----G-TCTTCTCAC--ACAAG--AA----ATGCACA
gi|57507 : aggtcaagaaCACAAA-GTCA-A---CAACAAAAA---T-C--T-G--GC--A--T-G-AA-T-TGA----AA-TTTCTG-TCTTCT--A--ACAAG--AA----ATGCACGTGC-TAAA
gi|57508 : aagtCA-A---CAAT----A---T-T--T-A---T--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--GCACG--AA----ATGCCAATAT-TAAA
gi|57509 : aggtcacgacgatcAG-GTCA-A----AA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-C-GGA----AA-G----G-TCTTAT--C--ATAAA--GA----ACATACAT
gi|57512 : agttcaagAG-GTCA-A---CAA-----T---G-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATTAG--AA----ACATACATG--TAAAatg
gi|57513 : aggtcaggAG-GTCA-A----AA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-CA-C-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57520 : aggtcaggCACAAG-GTCA-A---CAT-----T---T-T--T-G--GT--A--T-C-AA---AGA----AA-G----GTTCTTGT--C--ACCAGAAAA----ATACACATGT-GAAA
gi|57521 : aggtAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-CGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACATAT
gi|57522 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAG-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-CGA----AA-G----G-ACTTGT--C--ATAAG--GA----A--TACATGC-ta
gi|57524 : aggtcaagAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-GCTTGT--C--ATAAG--GA----ACACACATG
gi|57526 : aggtcaggAG-GTCA-A---AAA-----AT--T-T--T-G--AT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G--CTTGT--C--ATAAG--GA----ATACACATGT-GAAA
gi|57530 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-TCGAA----AA-G----G-TC-TGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57531 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-TCGAA----AA-G----G-TC-TGT--C--ATAAG--GA----ACACACATGT-GAAA
gi|57533 : aggtcaggAG-GTCA-A---CAA-----T---T-T--T-A--TT--A--C-C-AG-T-GGA----TA-G----G-GTTTGT--C--ATAAG--AA----ATACACATG
gi|57534 : aggtcaggCACAAG-GTCA-A----AG-----A---T-T--C-T--GTTTA--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----A
gi|57535 : aggtCATGAG-GTCA-A---GTA-----T---T-T--T-T--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATGGACATAC-AAAAt
gi|57721 : aggtAG-GTCA-A----AA-----A---TGT--T-G--GT--A--C-C-CA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--C--ATAAG--GA----ACATACATGT-GAAA
gi|57731 : ggtcaagCATAAG-GTCA-A---ATA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-TAA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAG--GA----ATACACAT
gi|57732 : gtATAAG-GTCA-A---CTA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTT
gi|57745 : gttCACG-ATCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--T-C-GA-T-GGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACGTAC-TAAActaca
gi|57746 : tCACTAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--AT--A--C-C-AA-G-GGA----TA-T----A-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-CAAA
gi|57749 : tCACAAG-GTCA-C---CAA-----C---T-C--T-G--AT--A--C-C-AA-C-AGA----AA-G----G-TCTTCA--C--ACACG--AGATGTATGCACATGA-TAAA
gi|57753 : tCACAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AG-T-AGA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGTACATGC-TGAA
gi|57754 : CACAAG-GTCA-A---CAA---------T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----A-TATTCT--A--AAAAG--AA----ATACACATGC-TAAA
gi|57755 : CATAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-A--T-A--GC--A--T-C-GT-T-GAA----AA-G----G-TCTTTT--T--ACAAA--AA----ATCCACATGC-TCAA
gi|57757 : ACAAG-GTCA-A---CAA-----C---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCC--C--ACAAG--AA----A
gi|57762 : CAAG-GTCA-C---TGA-----A---T-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGC----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGGACATGC-TAAAt
gi|57763 : CAAG-GTCA-C---AAA-----A---T-T--T-G--GT--A--C-C-AC-A-GGA----AA-G----A-TCTC-T--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA
gi|57764 : CAAG-GTCA-A---CAA-----A---T-C--T-G--GTG-A--T-TAAA-T-GAA----AA-G----G-TTTTCT--C--ACAGG--AA----ATGCAAGGGC-TAAA
gi|57766 : CAAG-GTAA-A---AAA-----A---T-C--T-A--AT--A--C-C-AA-T-ACA----AA-G----G-TCTTCT--C--AAGAG--AA----ATGCATATGC-TAAA
gi|57774 : AAG-GTCA-----CAG-----A---TCT--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGC--C--ACAAT--GA----ATTTACATAC-TAAA
gi|57776 : AAG-GTCA-A---AGG-----T---T-T--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-G----G-TCTTGT--T--ACAAG--GA----ATGCGCATAC-T
gi|57786 : -A---CAA-----A---C-C--T-G--GT--A--C-C-AA-T-GGA----AA-A----G-TCTTCT--C--ACAAA--AA----ATGTACATGC-TAAA
gi|57792 : --A--C-C-AA-T-GAA----AA-G----G-TCTTCT--C--ACAAG--AA----ATGCACATGC-TAAA