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Alignments
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Reference ( family-725 ) : ATTTGA-T-A--GCATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-ATT-T-T---T--GGC--TTT-T-T---TG-A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----TT-A-AAGGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TTT--TGGGGG
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Alignments
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lowQualScore : . . .. ... .. . .. . . .. ..... .... . . .. . . . .. . . . . . .. . . . . . . . ...... .. . . ... . . . . .. . .... . . . . . ... ... ... . ...... .. ....... ... . .. . . ... .. . . .. . ..
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Reference ( family-725 ) : ATTTGA-T-A--GCATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-ATT-T-T---T--GGC--TTT-T-T---TG-A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----TT-A-AAGGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TTT--TGGGGG
gi|91097 : ATTTGA-T-A--GCATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-ATT-T-T---T--GGC--TTT-T-T---TG-A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----TT-A-AAGGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TGT--TGGGGG
gi|91098 : ATTTGA-T-G--GCATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTCT--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-ATT-T-T---TT-GGC--TTT-TTT---TG-A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----TT-A-AAGGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TTT--TGGGGG
gi|91099 : ACTTGA-T-A--GCATT---A--GTC--------CTAA-TT-GT-----A----AAGATT-CTTC--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC--TT-T-T---T--GCG--TTT-T-T---TG-A-T-AC-AC-TTTC--A-TGA----TT-A-A--GGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC---AT--TAT-TTT--TGGGGG
gi|91100 : ATTTGA-T-A--GCATT---A--GTC-T--CG-ACTAA-T--GG-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-ATT-T-T---T--GGC--TAT-T-T---TG-A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----TC-A-AAGGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--
gi|91101 : ATTTGA-T-A--G-ATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GAT-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-GCC-A-GGC-A-T-T-T---T--GGCTTTTT-T-T---TG-ACT-ACAAC-TCTC--A-TGA----TT-A-AAGGGAA-AC-T--AT---TGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-ACA-----T-TTT--TGGGGG
gi|91102 : ATTTGA-T-A--GCATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-ATT-T-T---G--GGCTTTTT-T-T---TT-A-TAACAAT-CTTT--A-TGC----TT-A-AAGGGA-----T-AAT---TGC---C---A-T------ACT--A-------------C-T--T-T-A---AC--AA--A-AT--TTT-TTT--TGGGGG
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gi|91105 : ATTTGA-T-A--GCATT---A--ATC-T---T-ACTAA-TA-GT-----A----A-GATT-ACTCGGTT-G-G-A--GTC-T-T-C-TCTGGA-CA--TT-GGC-A-GACCATT-TAT---T--GGC--ATT-T-T---TG-AAT-ACAAC-GTTC--A-TGA----TT-A-ATGGGAAGAC-T-AAT---TGC---CT--A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-A-G---AC--AAC-A------TC-TTT--TGGGG
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gi|91107 : ATTT-A-T-AAGGCATTGTGA--GTC-T--CT-ACTAA-TCTGT-----T----ATAACT-CT-C--TT-G-G-A--GTA---C-T-TC--GA--A--TT-G-C-A---C-ATT-T--------GGC--TTT-T--------A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----TT-G-CAAGGAA-AG-T-AAT---TTC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--TAT-AT--AC--AACAA-AT--TTT-TTT--TGG
gi|91108 : ATTTAA-T-A--GCATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GG-----G----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GAA-G-A-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-A-T-T-T---T--GGC--TTT-T-T---TG-ATT-ACA
gi|91109 : TTTGA-T-A--GCATT---AA-GTC-CTCCT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G---A--GTA-T---T-TCTGGAACA--TT-G-CTA-GGC-ATT-T-T------GGC--TTT-T-T---TG-A-T-ATAAC-TTTC--AATGA----TT-AGAAGGGAA-ACAT-AAT----GC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TTTG-CGGGGG
gi|91110 : TTTGAAT-A--GCATT---ACAG-C-T--CT-TCTAA-T--ACCTCAGA----A-GATTACTTC--TT-C-G-GCCGTAAT-C-CATCTGGA-CA--TTTG-C-A-GGC-ATT-T-T---CTCAGC--TAT-T-TATATGCA-T-ACAACATTTCCCA-TGA----TT-A-A-GGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-TAGCATCACTGGA-------CACA--C-TACT-T-ATTTACA-AAC-A-A----TT-TTT--TGGGGG
gi|91111 : TTGA-TTA--CCATT---A--GTCAT--CT-ACAAA-A--TT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A---TATT-C-T-TCTGCA-CA--TT-G-C-C-AGC-ATT-T-T---T--GGC--TTT-T-T------A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----T----AAAGGAA-AC---AA----TGC---C---A--------ACT--G-------AAC---CTT--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TTT--
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gi|91113 : -T-A--GCTTT---A--GGT-T--C--ATT---T--GT-----A--------TT-CTTC--TT-G-G----GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-A-A-GCC-ATT-T-T---T--G-C--TTT-T-T---TG-A-T-ACAAC-TTCT--G--GA----TTTA-AAGGGAA-AC-TTAAT---AGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---------C-A-AT--TTT--TT--TGGGGG
gi|91114 : TT---A--GTC-T---T-ACTAAAT--GT-----A----C-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GTAGT-C-TGTCTGGA-CA--TT-G-A-C-GGC-TTT-T-TTTGT--GGC---TT-T-T---TG-A-T-ACA---TTTC----TGAAATTTT-A-AAGGGAA-A--T-AAT---TGC---C---A-T------AATAAA-------CAC---C-G--TATAA---AC--AAC-ATCT--TTT-TTT--TGGGGG
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blockSeqs : . . . T A . . T . T . . T . . . . . . T . . G . . . G . . . . . CTC TT . . . . A T . . . . . . . . . AA . C . A AA G A . . A . TAA A . T . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TT . . . . . T A . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-725 ) : ATTTGA-T-A--GCATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-ATT-T-T---T--GGC--TTT-T-T---TG-A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----TT-A-AAGGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TTT--TGGGGG
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gi|91107 : ATTT-A-T-AAGGCATTGTGA--GTC-T--CT-ACTAA-TCTGT-----T----ATAACT-CT-C--TT-G-G-A--GTA---C-T-TC--GA--A--TT-G-C-A---C-ATT-T--------GGC--TTT-T--------A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----TT-G-CAAGGAA-AG-T-AAT---TTC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--TAT-AT--AC--AACAA-AT--TTT-TTT--TGG
gi|91108 : ATTTAA-T-A--GCATT---A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GG-----G----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GAA-G-A-T-TCTGGA-CA--TT-G-C-A-GGC-A-T-T-T---T--GGC--TTT-T-T---TG-ATT-ACA
gi|91109 : TTTGA-T-A--GCATT---AA-GTC-CTCCT-ACTAA-T--GT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G---A--GTA-T---T-TCTGGAACA--TT-G-CTA-GGC-ATT-T-T------GGC--TTT-T-T---TG-A-T-ATAAC-TTTC--AATGA----TT-AGAAGGGAA-ACAT-AAT----GC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TTTG-CGGGGG
gi|91110 : TTTGAAT-A--GCATT---ACAG-C-T--CT-TCTAA-T--ACCTCAGA----A-GATTACTTC--TT-C-G-GCCGTAAT-C-CATCTGGA-CA--TTTG-C-A-GGC-ATT-T-T---CTCAGC--TAT-T-TATATGCA-T-ACAACATTTCCCA-TGA----TT-A-A-GGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-TAGCATCACTGGA-------CACA--C-TACT-T-ATTTACA-AAC-A-A----TT-TTT--TGGGGG
gi|91111 : TTGA-TTA--CCATT---A--GTCAT--CT-ACAAA-A--TT-----A----A-GATT-CTTC--TT-G-G-A---TATT-C-T-TCTGCA-CA--TT-G-C-C-AGC-ATT-T-T---T--GGC--TTT-T-T------A-T-ACAAC-TTTC--A-TGA----T----AAAGGAA-AC---AA----TGC---C---A--------ACT--G-------AAC---CTT--T-T-A---AC--AAC-A-AT--TTT-TTT--
gi|91112 : TTTA-T-A--GCAT----A--GTC-T--CT-ACTAA-T--GT-----AAAGCA-AATT-CTTC--TT---G-A--GTA-TAC-T-TCTGGA-AA---T-A-C-A-GGC-A------------------TT-T-T---TG-A-T-ACAA--TTTC--A-TGA----TT-A-A--GAGA-AC-T-AAT---TGC---CATAA-T------ACT--AG------CAC---C-T--T-T-A---ACATAGC-A-AT--TTT-TTT--GGGGGG
gi|91113 : -T-A--GCTTT---A--GGT-T--C--ATT---T--GT-----A--------TT-CTTC--TT-G-G----GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-A-A-GCC-ATT-T-T---T--G-C--TTT-T-T---TG-A-T-ACAAC-TTCT--G--GA----TTTA-AAGGGAA-AC-TTAAT---AGC---C---A-T------ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---------C-A-AT--TTT--TT--TGGGGG
gi|91114 : TT---A--GTC-T---T-ACTAAAT--GT-----A----C-GATT-CTTC--TT-G-G-A--GTAGT-C-TGTCTGGA-CA--TT-G-A-C-GGC-TTT-T-TTTGT--GGC---TT-T-T---TG-A-T-ACA---TTTC----TGAAATTTT-A-AAGGGAA-A--T-AAT---TGC---C---A-T------AATAAA-------CAC---C-G--TATAA---AC--AAC-ATCT--TTT-TTT--TGGGGG
gi|91115 : ATT-CTTC--TT-G-G-A--GTA-T-C-T-TCTGGA-CA--TT-G-A-A-GGC-ATT-T-T---T--TGC--TTT-T-T---TG-A-T-ACAAC-TTTC----TGA----TT-A-AAGGGAA-AC-T-AAT---TGC---C---A-TA-----ACT--A-------CAC---C-T--T-T-A---AC--AAC-A-AA--TTT-TTT--TGGGGG
gi|91116 : ATT-CTTC--T--G-G-A--GTA-T-C-T--CTGGA-CACATT-G-A-A-GGC-ATT-T-T------GGC--TTTAG-T---TG-A-T-ACA-C-TTTC--A-TGA----AT-A-AAGGGAA-AC---GATGTGTGG---T---T-T------GCT----------CAC---C-T--C-T-ATAAAC--AAC-A-AT--TTT-TTTGCTGGG
gi|91117 : TC-CTTC--TG-G-G-A--GTA-G---T-TCTGGA-CA--TT-G-A-A-GGC-ATT-T-T---T--GGC--TTT-T-T---TG-A-T-CCCAC-TTTC--A-TGA----TT-A-AAGGGAA----T-AAT---TGCACTC---A-TC-----ACT--ACTTGAAGCAC---T-T--T-A-A---AT--TAC-A-AT--TTT-TTT--TGGGAG