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Reference ( gi|35250 )        :      CAGTGGCGT-AG--CTTG-CAT----GT-ATGCT-T-GG-ATGCT---TAAGCATCCA--CAT-C-ATTTTG
gi|35248                      :      CAGTGGCGT-AG--CTTG-CAT----GT-ATGCT-T-GG-ATGCT---CAAGCATCCA--CAT-C-ATTTTG
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Alignments
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lowQualScore                  :          .  ..    .   ....  .     . .  .      ...         .    .      
lowQualScore                  :          8  55    8   9999  8     8 8  8      222         8    9      
consensus                     : CAGTGGCGT-AG--CTTG-CAT----GT-ATGCT-T-GG-ATGCTC---AAGCATCCA-CATC-ATTTTG
Reference ( family-721 )      : CAGTGGCGT-AG--CTTG-CAT----GT-ATGCT-T-GG-ATGCTC---AAGCATCCA-CATC-ATTTTG
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gi|35247                      : CAGTGGCGT-AG--CTTG-CAT----GT-ATGCT-T-GG-ATGCTC---AAGCATCCA-CATC-ATTTTG
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gi|35249                      : CAGTGGCGT-AG--CTTG-CAC----GT-ATGCT-T-GG-ATGCTC---AAGCATCCA-CATC-ATTTTG
gi|35250                      : CAGTGGCGT-AG--CTTG-CAT----GT-ATGCT-T-GG-ATGCTT---AAGCATCCA-CATC-ATTTTG
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gi|35254                      : CAGTGGCAT-AG--CTTG-CAT----TT-AAGCT-T-GG-ATGCTC---AAG----CA-CATC-ATTTTG
gi|35255                      : CAGTGGTGT-AG--CTTA-CAT----GT-ATGCG-T-GG-ATGCTC---AAGCATCCA-CATC-ATTTTG
gi|35256                      : CAGTGGCGT-AG--CTTT-CAT----TT-ATGCT-C-GG-ATGCTC---AAGCATCCA-CAT
gi|35257                      : CAGTGGCGT-AG--CTTG-CATACATGT-ATGCT-C-GG-ATGCTC---AAGCATCCA-CATA-ATTTTG
gi|35258                      : CAGTAGCGT-AG--CTTA-CGT----GT-ATGCT-T-GG-ATGCTCTGTAAGCATCCA-CATC-ATTTTG
gi|35259                      : CAGTGGCGT-AG--CTTA-CAT----GT-TTGCT-C-GG-ATGCTC---AAGCATCCA-CATA-ATTTTG
gi|35260                      : CAGTGGCGT-AG--CTTG-CAT----GT-TTGCT-T-GG-ATGCTC---GAGCAT-CA-CATCTATTTTG
gi|35261                      : CAGTGGCGT-AAGCCTTA-CAT-----T-ATGCT-T-GG-AT-CCC---AAGCATGCA-CATC-ATTTTG
gi|35262                      : CAGTGGCCT-AG--TTTG-CAT----AT-ATGCT-T-AG-ATGCTC---AAGTA-GCA-CATA-ATTTTG
gi|35263                      : CAATGGCGT-AC--CTAC-CAT----GT-ATGTT-T-GC-ATGCTC---AAGCATGCA-CATC-ATTTTG
gi|35264                      :  AGGGGCGT-AG--CTTGCCAT----GT-ATGCTCT-GG-ATGCTC----AGCATCCAGCATC-ATTTTG
gi|35265                      :  AGTGGCGT-AC--CTAC-CAT----AT-ATGCT-T-GC-ATGCTC---AAGCATGCA-CGTC-ATTTTG
gi|35266                      :   GTGGCGTTAG--CTTG-TAT----GTTATGCT-TTGGCATGC-C---AAGCATCCA-CATC-ATTT
gi|35267                      :         T-AA--CTTG-CAT----GT-ATGCT-T-GG-ATGCTC---AAACATCCA-CATC-ATTTT