lowQualScore : 111111 11 11 11 222
lowQualScore : 2 2 2 4 44444 33 2 33 55 2 2 000000 2 2 888888 2 22 2 4 00 55555 33 2 2 6666 66 33 0 2 2 33 2 7777 44 2 1 2 00 2 2 4 4 0 2 66 444 000 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . . ..... .. . .. .. . . ...... . . ...... . .. . . .. ..... .. . . .... .. .. . . . .. . .... .. . . . .. . . . . . . .. ... ... . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 7 22222 11 2 11 55 1 2 333333 2 1 222222 1 99 2 4 77 66666 11 2 2 9999 55 22 7 4 4 22 4 4444 66 4 0 4 33 4 4 7 7 3 4 33 777 222 9 9 9 9 1
consensus : TATGAGTT-T-GTA-GCGTGGATTTAT---A-AA--CAC-ACTTAC--CCA-A-CGCGC-G--GN--CT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--CGCG--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CC-AAGCC-G--TATAT-CA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T---AGA-GAGCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
Reference ( gi|89642 ) : TATGAGTT-T-GTA-GCATGGATTTAT---A-AA--CAC-ACTTAC--CCA-A-CGCGC-G--GT--CT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--TGCG--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-AC-AAGCC-G--TATAT-CA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T---AGA-ACGCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89644 : TATGAGTT-T-GTA-GCATGGATTTAT---A-AAACCAC-ACTTAC--CCA-A-CGCGC-G--GT--CT-GTGA--T------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--TGCG--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-AC-AAGCC-G--TATAT-CA-AT-T-AACATCTCA-TCGAT--T---AGA-GCGCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89640 : TATGAGTT-T-GTA-GCGTGGATTTCG---A-AA--CAC-ACTTAC--CCA-A-CGCGC-G--GT--CT-GTAAA-T------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--TGCG--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CC-AAGCC-G--TATAT-CA-AT-T-AACGCCTCA-TCGAT--T---AGA-GAGCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89641 : TATGAGTT-T-GTA-GCGTGGATTTAT---A-AA--CAC-ACTTAC--CCA-A-CGCGC-G--GG--CT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGA--C-A-GCTA----ATTGCA--TGCG--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CC-AAACC-G--TATAT-CA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T---AGA-GAGCTA-CTAA-A-TA-G-AT
gi|89643 : TATGAGTT-T-GTA-GCGGGGATTTAT---A-AA--CAC-ACTTAC--ACA-A-CGTGC-G--GG--CT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-C-GT------AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--CGCA--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CC-AAACC-GTATATAT-CA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T---AGA-GAGCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89645 : TATGAGTG-T-GTA-GCGTGGATTTATTATA-AA--CAC-ACTTAC--ACA-A-CGCGC-G--GG--CT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-T-GCA-----AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--CGTG--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CC-AAACC-G--TATAT-CA-AT-T-AATGTCTCA-TCAAT--T---AGA-GAGCTA-ATCA-A-CA-G-AT
gi|89647 : TATAAGTT-T-GTA-GCGTGGATTTAT---A-AA--CAC-ACTTAC--CCA-A-TGCGC-G--GT--CT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--TGCG--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CT-AAGCC-G--TATAT-CA-AT-T-AATGT
gi|89650 : TATGAGTTCT-ATG-G--TGGATCTAT---A-AA--CAC-ACTTAC--ACA-ATCGCAC-G--GG--CT-GTGAAAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AG-T--C-A-GCTA----ATTGCA--CGCG--CC-GAGCA-G-G--T-GT----ATAT-ACCAAACC-GC-TGTAT-CA-AT-T-AACGT-TCA-TCGAT--T---AGA-GAGCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89646 : TATGAGTT-T-GTA-GCGTGGATTTAT---A-AA--CAC-ACTTAC--ACA-A-CGCGC-G--GG--TT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--CACG--CCTGAGCAGG-G--T-GT----ATAC--C-AAACC-G--TA---------------G-----------------AGA-A-GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89651 : TATGAGTT-T-GAA-GCGTGGAGT-------------AC-ACTTAC--CT-----GTGT-G------CT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-A-GCTA----ATTGCA--CGCG--CCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CC-AAGCC-GA-TATAT-CA-AT-T-AACGTCTCA-TAGA
gi|89652 : TATGAGTT-G-GTA-GCGTGGATTTAT---G-A---TACTACTTAC--CTG-A-CACTC-G--GG--CG-GTGGA-T------AT-GT--GC-A-C-GTA-----AGGT--C-A-GCT-----ATTGCA--CGCG--CC--------------------------C-AAGCC-G--TAAAT-CA-AT-T-AACGTATCA-TTGAT--T---AGA-AAGATA-CTCG-G-CG-G-AT
gi|89653 : TATGAGTT-T-GTA-GCATGGATTTAT---A-AA--CAC-AC-TAC--ACA-A-CGCGC-G--GTGCTT-GTGAA-T------AT-GT--
gi|89648 : TATAAGTT-T-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-AA--CAC-ACTTAC--CC--A-CGC
gi|89649 : TATAAGTT---GTA-GCGTGGATTTAT-----AA--CAC-ACTTAC--CC--A-CGCGC-
gi|89655 : ATGAATT-T-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-AA--CAC-ACTTGC--ACACA-CGCGCCG--GA--CTTGTGAA-TC-----AT-GT--TT-A-C-GTATTGGTAAGT--C-A-GCTA----ATTGCA--CGCA--CCGAGGAA-G-G--T-GT----ATAC-CC-AAACC-G--TATAT-CA-AT-TAAACGTCTCACTTGAT--T---AGAGACTCTA-CTTGAA-CA-G-ATCA
gi|89656 : TGAGTT-TTGTA-GCGTGAATTTAT---A-AA--CAC-ACTT-C--C-----CGTGT-G------CT-GTGAA-TCGGCCGAT-GCAATC-A-C---------AGAT--T-A-CGTA----ACTGCACCCGCA--CTCGAGCA-GAA--T-GTTGTGAT-C-CC----CT-G--T-TAT-C--AT-T-AACG-CTCA-TCGA
gi|89657 : AGTT-T-GTAAGTGAGGATTTAT---CTAA--CAC-ACTTAC--CCA-A-C-CGC-G--G---AT-GTGAA-T------AT-GT--TT-A-CCGTA-----AG-T--C-A--CTA----ATTGCA--TGCG--C--GAGCA-G-G--T--T----ATAC-CC-AA-CT-G---ATATTCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGATGCT---AGA-A-GCTA-CTCG-AGCA-GAATCA
gi|89658 : GGATTTAT---G-AA--CAC--CGTAC--G-A-C-CGCGG-GTTGT--CT-ACGAA-T------AT-GT--TT-A-T-GTA-----AGGT--C-A--CT-----ATAGCA--AGCA---ACGAGCA-G-G--A-GT----AT------AAG-C-G--TA-AT-AA-ATGT-AACGT-TCA-T-GA---T---AGA-A
gi|89645 : AT---A-AA--CAT-ATTCACAGCC----CGCGC-G--TT--GT-GTAAG-T------GT-GT--TT-A-TAATA-----AATC--C-ACGCTA----atact
gi|89659 : tatgagtgtgCA-A-CGC-C-G--GT--CT-GTGAA-T------AT-GT--TTTA-C-GTA-----AGTTTTC-A-GCTAG---ATTGCA--TGCG--CCCGAGCA-G-G--T-GT-----CAT-AC-CAGCC-GA-TATAT-CA-ATGT-A--GTGTCA-TTGATA-TAAGAGA-AGGCTA-ACCG-A-CATG-ATCAgcaaggtcagctaattgcacgtgcccgagcaggtgtatacccaaaccgtatatcaattaatgtctcatcaattagagagctaatcaacagat
gi|89660 : --CT-GTGAA-T------ATCGT--TT-AAC-GTA-------GT--C-A-GCTA-----TTGCAATTGCGGGCCTGAGCA-A-GACT--T----ATAC-CA-AAGCTTA--CATAT-CACAT-TTAACATCTCA-TCCAG--T---AGA-A-------TCG-A-CA-
gi|89654 : ggA-T------AT-GT--TT-ATC-GTA-----ATGT--CGA-GCTATATAAT--CA--T-CA--TCCGGGCA-G-G--TTGTT---ATACTCC-AAATC-G--TATAC-AG-AT-T-AACGTCTCA-TC-AT--T---AGA-G-ACTATCTCG-A-CC-G-
gi|89661 : tatgattgtaagcgtggaattataaaacacatgctttatcactctagcgaattgtacgcagcttcccgggttgttgcaattattgACGTCTCA-TTGAT--T---AGA-GAGCTA-CTCG-A-CA-G-CTCA
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 4 333 2 2 55 22 4444 1 555 2 6666666 99999999 22 1 2 6666 99999999 888888 2 22 2 4 2 55555 33 2 6666 7777 2 2 33 2 9999 4 0 2 11 2 4 4 2 55 2 2 55 2 2 2 2 2
lowQualScore : . . ... . . .. .. .... . ... . ....... ........ .. . . .... ........ ...... . .. . . . ..... .. . .... .... . . .. . .... . . . .. . . . . .. . . .. . . . . .
lowQualScore : 2 4 777 1 1 00 99 5555 4 111 0 5555555 77777777 99 0 1 6666 77777777 222222 1 99 2 4 2 66666 11 2 9999 8888 2 2 11 2 2222 4 4 2 99 2 4 4 2 99 5 5 99 5 7 7 7 9
consensus : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------G--GGCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
Reference ( family-713 ) : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------G--GNCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89640 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTCG---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------G--GTCT-GT----A--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89641 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------G--GGCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGA--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTAA-A-TA-G-AT
gi|89642 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------G--GTCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-ACAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAA-C--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89643 : TATGAGTTT-GTA-GCGGGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------TGC--------G--GGCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GT------AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCACCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-GTATATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89644 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-AACCACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------G--GTCT-GT----G--------A-T------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-ACAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACATCTCA-TCGAT--T-AGAG-C--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89645 : TATGAGTGT-GTA-GCGTGGATTTATTATA-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------CGC--------G--GGCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-T-GCA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGTGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-T-AATGTCTCA-TCAAT--T-AGAG-A--GCTA-ATCA-A-CA-G-AT
gi|89646 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------CGC--------G--GGTT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CACGCCTGAGCAGG-G--T-GT----ATA--CCAAACC-G--------------------------------T-AGAGAA--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89647 : TATAAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-TG-------CGC--------G--GTCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CTAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AATGT
gi|89648 : TATAAGTTT-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC---A-CG-------C
gi|89649 : TATAAGTT--GTA-GCGTGGATTTAT-----A-A--CACA--CTT----ACCC---A-CG-------CGC--------
gi|89650 : TATGAGTTC--TA-TGGTGGATCTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-ATCG-------CAC--------G--GGCT-GT----GA-------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----A-GT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCG-CCGAGCA-G-G--T-GT----ATATACCAAACC-GC-TGTATCA-AT-T-AACGT-TCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89651 : TATGAGTTT-GAA-GCGTGGAGT--------------ACA--CTT----ACCT---------------GT--------G--TGCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-GA-TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TAGA
gi|89652 : TATGAGTTG-GTA-GCGTGGATTTAT---G-ATA--C-TA--CTT----ACCT-G-A-CA-------CTC--------G--GGCG-GT----G--------GAT------AT-GT--GC-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCT-----ATTGCA----CGCG-------------------------C-CCAAGCC-G--TAAATCA-AT-T-AACGTATCA-TTGAT--T-AGAA-A--GATA-CTCG-G-CG-G-AT
gi|89653 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-A--CACA--C-T----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GGTGCTT-GT----G--------AAT------AT-GT--
gi|89654 : TATGA--TT-GTAAGCGTGGAATTAT---A-A-AA-CACATGCTTTATCACTCTA-G-CGAATTGTACGCAGCTTCCCG--GGTT-GTT---GCAATTATTGAT------AT-GT--TT-ATC-GTA-----ATGT--CGAGCTATATAAT--CA----T-CATCCGGGCA-G-G--TTGTT---ATACTCCAAATC-G--TATACAG-AT-T-AACGTCTCA-TC-AT--T-AGAG-A---CTATCTCG-A-CC-G-
gi|89655 : ATGAATTT-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----GCAC-ACA-CG-------CGCC-------G--GACTTGT----G--------AATC-----AT-GT--TT-A-C-GTATTGGTAAGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCACCGAGGAA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-TAAACGTCTCACTTGAT--T-AGAG-AC-TCTA-CTTGAA-CA-G-ATCA
gi|89656 : TGAGTTTTGTA-GCGTGAATTTAT---A-A-A--CACA--CTT-----CC---------------CGT--------G--TGCT-GT----G--------AATCGGCCGAT-GCAATC-A-C---------AGAT--T-ACGTA----ACTGCACC--CGCACTCGAGCA-GAA--T-GTTGTGAT-C-CC---CT-G--T-TATC--AT-T-AACG-CTCA-TCGA
gi|89657 : AGTTT-GTAAGTGAGGATTTAT---CTA-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-C--------CGC--------G--GA-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-CCGTA-----AG-T--C-A-CTA----ATTGCA----TGCGC--GAGCA-G-G--T--T----ATAC-CCAA-CT-GA-TAT-TCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGATGCT-AGA--A--GCTA-CTCG-AGCA-GAATCA
gi|89658 : GGATTTAT---G-A-A--CAC---CGT----AC---G-A-C--------CGC--------G--GGTT-GTCTACG--------AAT------AT-GT--TT-A-T-GTA-----AGGT--C-A-CT-----ATAGCA----AGCA-ACGAGCA-G-G--A-GT----AT-----AAG-C-G--TA-ATAA-ATGT-AACGT-TCA-T-GA---T-AGAA-A----TA-CT
gi|89659 : C-A-A-CG-------C-C--------G--GTCT-GT----G--------AAT------AT-GT--TTTA-C-GTA-----AGTTTTC-AGCTAG---ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GTC---ATAC-C--AGCC-GA-TATATCA-ATGT-A--GTGTCA-TTGATA-TAAGAG-AAGGCTA-ACCG-A-CATG-ATCA
gi|89660 : --GGCT-GT----G--------AAT------ATCGT--TT-AAC-GTA-------GT--C-AGCTA-----TTGCAATTGCGGGCCTGAGCA-A-GACT--T----ATAC-CAAAGCTTA--CATATCACAT-TTAACATCTCA-TCCAG--T-AGAA----------TCG-A-CA-
gi|89661 : ACGTCTCA-TTGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-CTCA
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 4 333 2 2 55 22 4444 1 555 2 6666666 99999999 2 2 2 6666 99999999 888888 2 22 2 4 2 55555 33 2 6666 7777 2 2 33 2 9999 4 0 2 11 2 4 4 2 55 2 2 55 2 2 2 2 2
lowQualScore : . . ... . . .. .. .... . ... . ....... ........ . . . .... ........ ...... . .. . . . ..... .. . .... .... . . .. . .... . . . .. . . . . .. . . .. . . . . .
lowQualScore : 2 4 777 1 1 00 99 5555 4 111 0 5555555 77777777 1 1 1 6666 77777777 222222 1 99 2 4 2 66666 11 2 9999 8888 2 2 11 2 2222 4 4 2 99 2 4 4 2 99 5 5 99 5 7 7 7 9
consensus : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
Reference ( family-713 ) : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89640 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTCG---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----A--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89641 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGA--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTAA-A-TA-G-AT
gi|89642 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-ACAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAA-C--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89643 : TATGAGTTT-GTA-GCGGGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------TGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GT------AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCACCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-GTATATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89644 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-AACCACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------A-T------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-ACAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACATCTCA-TCGAT--T-AGAG-C--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89645 : TATGAGTGT-GTA-GCGTGGATTTATTATA-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-T-GCA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGTGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-T-AATGTCTCA-TCAAT--T-AGAG-A--GCTA-ATCA-A-CA-G-AT
gi|89646 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GG-GT-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CACGCCTGAGCAGG-G--T-GT----ATA--CCAAACC-G--------------------------------T-AGAGAA--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89647 : TATAAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-TG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CTAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AATGT
gi|89648 : TATAAGTTT-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC---A-CG-------C
gi|89649 : TATAAGTT--GTA-GCGTGGATTTAT-----A-A--CACA--CTT----ACCC---A-CG-------CGC--------
gi|89650 : TATGAGTTC--TA-TGGTGGATCTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-ATCG-------CAC--------GG-GC-T-GT----GA-------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----A-GT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCG-CCGAGCA-G-G--T-GT----ATATACCAAACC-GC-TGTATCA-AT-T-AACGT-TCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89651 : TATGAGTTT-GAA-GCGTGGAGT--------------ACA--CTT----ACCT---------------GT--------GT-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-GA-TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TAGA
gi|89652 : TATGAGTTG-GTA-GCGTGGATTTAT---G-ATA--C-TA--CTT----ACCT-G-A-CA-------CTC--------GG-GC-G-GT----G--------GAT------AT-GT--GC-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCT-----ATTGCA----CGCG-------------------------C-CCAAGCC-G--TAAATCA-AT-T-AACGTATCA-TTGAT--T-AGAA-A--GATA-CTCG-G-CG-G-AT
gi|89653 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-A--CACA--C-T----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GGTGCTT-GT----G--------AAT------AT-GT--
gi|89654 : TATGA--TT-GTAAGCGTGGAATTAT---A-A-AA-CACATGCTTTATCACTCTA-G-CGAATTGTACGCAGCTTCCCGG-GT-T-GTT---GCAATTATTGAT------AT-GT--TT-ATC-GTA-----ATGT--CGAGCTATATAAT--CA----T-CATCCGGGCA-G-G--TTGTT---ATACTCCAAATC-G--TATACAG-AT-T-AACGTCTCA-TC-AT--T-AGAG-A---CTATCTCG-A-CC-G-
gi|89655 : ATGAATTT-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----GCAC-ACA-CG-------CGCC-------GG-AC-TTGT----G--------AATC-----AT-GT--TT-A-C-GTATTGGTAAGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCACCGAGGAA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-TAAACGTCTCACTTGAT--T-AGAG-AC-TCTA-CTTGAA-CA-G-ATCA
gi|89656 : TGAGTTTTGTA-GCGTGAATTTAT---A-A-A--CACA--CTT-----CC---------------CGT--------GT-GC-T-GT----G--------AATCGGCCGAT-GCAATC-A-C---------AGAT--T-ACGTA----ACTGCACC--CGCACTCGAGCA-GAA--T-GTTGTGAT-C-CC---CT-G--T-TATC--AT-T-AACG-CTCA-TCGA
gi|89657 : AGTTT-GTAAGTGAGGATTTAT---CTA-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-C--------CGC--------GG-A--T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-CCGTA-----AG-T--C-A-CTA----ATTGCA----TGCGC--GAGCA-G-G--T--T----ATAC-CCAA-CT-GA-TAT-TCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGATGCT-AGA--A--GCTA-CTCG-AGCA-GAATCA
gi|89658 : GGATTTAT---G-A-A--CAC---CGT----AC---G-A-C--------CGC--------GG-GT-T-GTCTACG--------AAT------AT-GT--TT-A-T-GTA-----AGGT--C-A-CT-----ATAGCA----AGCA-ACGAGCA-G-G--A-GT----AT-----AAG-C-G--TA-ATAA-ATGT-AACGT-TCA-T-GA---T-AGAA-A----TA-CT
gi|89659 : C-A-A-CG-------C-C--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TTTA-C-GTA-----AGTTTTC-AGCTAG---ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GTC---ATAC-C--AGCC-GA-TATATCA-ATGT-A--GTGTCA-TTGATA-TAAGAG-AAGGCTA-ACCG-A-CATG-ATCA
gi|89660 : G-GC-T-GT----G--------AAT------ATCGT--TT-AAC-GTA-------GT--C-AGCTA-----TTGCAATTGCGGGCCTGAGCA-A-GACT--T----ATAC-CAAAGCTTA--CATATCACAT-TTAACATCTCA-TCCAG--T-AGAA----------TCG-A-CA-
gi|89661 : ACGTCTCA-TTGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-CTCA
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 4 333 2 2 55 22 4444 1 555 2 6666666 99999999 2 2 2 6666 99999999 888888 2 22 2 4 2 55555 33 2 6666 7777 2 2 33 2 9999 4 0 2 11 2 4 4 2 55 2 2 55 2 2 2 2 2
lowQualScore : . . ... . . .. .. .... . ... . ....... ........ . . . .... ........ ...... . .. . . . ..... .. . .... .... . . .. . .... . . . .. . . . . .. . . .. . . . . .
lowQualScore : 2 4 777 1 1 00 99 5555 4 111 0 5555555 77777777 1 1 1 6666 77777777 222222 1 99 2 4 2 66666 11 2 9999 8888 2 2 11 2 2222 4 4 2 99 2 4 4 2 99 5 5 99 5 7 7 7 9
consensus : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
Reference ( family-713 ) : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89640 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTCG---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----A--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89641 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGA--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTAA-A-TA-G-AT
gi|89642 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-ACAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAA-C--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89643 : TATGAGTTT-GTA-GCGGGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------TGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GT------AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCACCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-GTATATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89644 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-AACCACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------A-T------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-ACAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACATCTCA-TCGAT--T-AGAG-C--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89645 : TATGAGTGT-GTA-GCGTGGATTTATTATA-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-T-GCA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGTGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-T-AATGTCTCA-TCAAT--T-AGAG-A--GCTA-ATCA-A-CA-G-AT
gi|89646 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GG-GT-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CACGCCTGAGCAGG-G--T-GT----ATA--CCAAACC-G--------------------------------T-AGAGAA--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89647 : TATAAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-TG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CTAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AATGT
gi|89648 : TATAAGTTT-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC---A-CG-------C
gi|89649 : TATAAGTT--GTA-GCGTGGATTTAT-----A-A--CACA--CTT----ACCC---A-CG-------CGC--------
gi|89650 : TATGAGTTC--TA-TGGTGGATCTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-ATCG-------CAC--------GG-GC-T-GT----GA-------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----A-GT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCG-CCGAGCA-G-G--T-GT----ATATACCAAACC-GC-TGTATCA-AT-T-AACGT-TCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89651 : TATGAGTTT-GAA-GCGTGGAGT--------------ACA--CTT----ACCT---------------GT--------GT-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-GA-TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TAGA
gi|89652 : TATGAGTTG-GTA-GCGTGGATTTAT---G-ATA--C-TA--CTT----ACCT-G-A-CA-------CTC--------GG-GC-G-GT----G--------GAT------AT-GT--GC-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCT-----ATTGCA----CGCG-------------------------C-CCAAGCC-G--TAAATCA-AT-T-AACGTATCA-TTGAT--T-AGAA-A--GATA-CTCG-G-CG-G-AT
gi|89653 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-A--CACA--C-T----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GGTGCTT-GT----G--------AAT------AT-GT--
gi|89654 : TATGA--TT-GTAAGCGTGGAATTAT---A-A-AA-CACATGCTTTATCACTCTA-G-CGAATTGTACGCAGCTTCCCGG-GT-T-GTT---GCAATTATTGAT------AT-GT--TT-ATC-GTA-----ATGT--CGAGCTATATAAT--CA----T-CATCCGGGCA-G-G--TTGTT---ATACTCCAAATC-G--TATACAG-AT-T-AACGTCTCA-TC-AT--T-AGAG-A---CTATCTCG-A-CC-G-
gi|89655 : ATGAATTT-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----GCAC-ACA-CG-------CGCC-------GG-AC-TTGT----G--------AATC-----AT-GT--TT-A-C-GTATTGGTAAGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCACCGAGGAA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-TAAACGTCTCACTTGAT--T-AGAG-AC-TCTA-CTTGAA-CA-G-ATCA
gi|89656 : TGAGTTTTGTA-GCGTGAATTTAT---A-A-A--CACA--CTT-----CC---------------CGT--------GT-GC-T-GT----G--------AATCGGCCGAT-GCAATC-A-C---------AGAT--T-ACGTA----ACTGCACC--CGCACTCGAGCA-GAA--T-GTTGTGAT-C-CC---CT-G--T-TATC--AT-T-AACG-CTCA-TCGA
gi|89657 : AGTTT-GTAAGTGAGGATTTAT---CTA-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-C--------CGC--------GG-A--T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-CCGTA-----AG-T--C-A-CTA----ATTGCA----TGCGC--GAGCA-G-G--T--T----ATAC-CCAA-CT-GA-TAT-TCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGATGCT-AGA--A--GCTA-CTCG-AGCA-GAATCA
gi|89658 : GGATTTAT---G-A-A--CAC---CGT----AC---G-A-C--------CGC--------GG-GT-T-GTCTACG--------AAT------AT-GT--TT-A-T-GTA-----AGGT--C-A-CT-----ATAGCA----AGCA-ACGAGCA-G-G--A-GT----AT-----AAG-C-G--TA-ATAA-ATGT-AACGT-TCA-T-GA---T-AGAA-A----TA-CT
gi|89659 : C-A-A-CG-------C-C--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TTTA-C-GTA-----AGTTTTC-AGCTAG---ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GTC---ATAC-C--AGCC-GA-TATATCA-ATGT-A--GTGTCA-TTGATA-TAAGAG-AAGGCTA-ACCG-A-CATG-ATCA
gi|89660 : G-GC-T-GT----G--------AAT------ATCGT--TT-AAC-GTA-------GT--C-AGCTA-----TTGCAATTGCGGGCCTGAGCA-A-GACT--T----ATAC-CAAAGCTTA--CATATCACAT-TTAACATCTCA-TCCAG--T-AGAA----------TCG-A-CA-
gi|89661 : ACGTCTCA-TTGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-CTCA
blockSeqs : T A TAT T T AC TG TATC C TA T AATTGTA AGCTTCCC T T T CTAC CAATTATT CGGCCG C AA T T C TTGGT TT G TATA ATTG G A AC T TGTG A T TA C G A C GC A A AG T A G T A
blockSeqs : . A . . . A . . C AC . . C . . . T A C . . . A . . . . G CC . . . . T T . C . G T . A . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
finalCons : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 4 333 2 2 55 22 4444 1 555 2 6666666 99999999 2 2 2 6666 99999999 888888 2 22 2 4 2 55555 33 2 6666 7777 2 2 33 2 9999 4 0 2 11 2 4 4 2 55 2 2 55 2 2 2 2 2
lowQualScore : . . ... . . .. .. .... . ... . ....... ........ . . . .... ........ ...... . .. . . . ..... .. . .... .... . . .. . .... . . . .. . . . . .. . . .. . . . . .
lowQualScore : 2 4 777 1 1 00 99 5555 4 111 0 5555555 77777777 1 1 1 6666 77777777 222222 1 99 2 4 2 66666 11 2 9999 8888 2 2 11 2 2222 4 4 2 99 2 4 4 2 99 5 5 99 5 7 7 7 9
consensus : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
Reference ( family-713 ) : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89640 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTCG---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----A--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89641 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGA--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTAA-A-TA-G-AT
gi|89642 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-ACAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAA-C--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89643 : TATGAGTTT-GTA-GCGGGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------TGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GT------AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCACCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-GTATATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89644 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-AACCACA--CTT----ACCC-A-A-CG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------A-T------AT-GT--TT-A-C-ATA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-ACAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AACATCTCA-TCGAT--T-AGAG-C--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89645 : TATGAGTGT-GTA-GCGTGGATTTATTATA-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GG-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-T-GCA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGTGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-T-AATGTCTCA-TCAAT--T-AGAG-A--GCTA-ATCA-A-CA-G-AT
gi|89646 : TATGAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GG-GT-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CACGCCTGAGCAGG-G--T-GT----ATA--CCAAACC-G--------------------------------T-AGAGAA--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89647 : TATAAGTTT-GTA-GCGTGGATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-TG-------CGC--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CTAAGCC-G--TATATCA-AT-T-AATGT
gi|89648 : TATAAGTTT-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACCC---A-CG-------C
gi|89649 : TATAAGTT--GTA-GCGTGGATTTAT-----A-A--CACA--CTT----ACCC---A-CG-------CGC--------
gi|89650 : TATGAGTTC--TA-TGGTGGATCTAT---A-A-A--CACA--CTT----ACAC-A-ATCG-------CAC--------GG-GC-T-GT----GA-------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----A-GT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCG-CCGAGCA-G-G--T-GT----ATATACCAAACC-GC-TGTATCA-AT-T-AACGT-TCA-TCGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-ATCA
gi|89651 : TATGAGTTT-GAA-GCGTGGAGT--------------ACA--CTT----ACCT---------------GT--------GT-GC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCGCCCGAGCA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAGCC-GA-TATATCA-AT-T-AACGTCTCA-TAGA
gi|89652 : TATGAGTTG-GTA-GCGTGGATTTAT---G-ATA--C-TA--CTT----ACCT-G-A-CA-------CTC--------GG-GC-G-GT----G--------GAT------AT-GT--GC-A-C-GTA-----AGGT--C-AGCT-----ATTGCA----CGCG-------------------------C-CCAAGCC-G--TAAATCA-AT-T-AACGTATCA-TTGAT--T-AGAA-A--GATA-CTCG-G-CG-G-AT
gi|89653 : TATGAGTTT-GTA-GCATGGATTTAT---A-A-A--CACA--C-T----ACAC-A-A-CG-------CGC--------GGTGCTT-GT----G--------AAT------AT-GT--
gi|89654 : TATGA--TT-GTAAGCGTGGAATTAT---A-A-AA-CACATGCTTTATCACTCTA-G-CGAATTGTACGCAGCTTCCCGG-GT-T-GTT---GCAATTATTGAT------AT-GT--TT-ATC-GTA-----ATGT--CGAGCTATATAAT--CA----T-CATCCGGGCA-G-G--TTGTT---ATACTCCAAATC-G--TATACAG-AT-T-AACGTCTCA-TC-AT--T-AGAG-A---CTATCTCG-A-CC-G-
gi|89655 : ATGAATTT-GTA-GCGTG-ATTTAT---A-A-A--CACA--CTT----GCAC-ACA-CG-------CGCC-------GG-AC-TTGT----G--------AATC-----AT-GT--TT-A-C-GTATTGGTAAGT--C-AGCTA----ATTGCA----CGCACCGAGGAA-G-G--T-GT----ATAC-CCAAACC-G--TATATCA-AT-TAAACGTCTCACTTGAT--T-AGAG-AC-TCTA-CTTGAA-CA-G-ATCA
gi|89656 : TGAGTTTTGTA-GCGTGAATTTAT---A-A-A--CACA--CTT-----CC---------------CGT--------GT-GC-T-GT----G--------AATCGGCCGAT-GCAATC-A-C---------AGAT--T-ACGTA----ACTGCACC--CGCACTCGAGCA-GAA--T-GTTGTGAT-C-CC---CT-G--T-TATC--AT-T-AACG-CTCA-TCGA
gi|89657 : AGTTT-GTAAGTGAGGATTTAT---CTA-A--CACA--CTT----ACCC-A-A-C--------CGC--------GG-A--T-GT----G--------AAT------AT-GT--TT-A-CCGTA-----AG-T--C-A-CTA----ATTGCA----TGCGC--GAGCA-G-G--T--T----ATAC-CCAA-CT-GA-TAT-TCA-AT-T-AACGCCTCA-TCGATGCT-AGA--A--GCTA-CTCG-AGCA-GAATCA
gi|89658 : GGATTTAT---G-A-A--CAC---CGT----AC---G-A-C--------CGC--------GG-GT-T-GTCTACG--------AAT------AT-GT--TT-A-T-GTA-----AGGT--C-A-CT-----ATAGCA----AGCA-ACGAGCA-G-G--A-GT----AT-----AAG-C-G--TA-ATAA-ATGT-AACGT-TCA-T-GA---T-AGAA-A----TA-CT
gi|89659 : C-A-A-CG-------C-C--------GG-TC-T-GT----G--------AAT------AT-GT--TTTA-C-GTA-----AGTTTTC-AGCTAG---ATTGCA----TGCGCCCGAGCA-G-G--T-GTC---ATAC-C--AGCC-GA-TATATCA-ATGT-A--GTGTCA-TTGATA-TAAGAG-AAGGCTA-ACCG-A-CATG-ATCA
gi|89660 : G-GC-T-GT----G--------AAT------ATCGT--TT-AAC-GTA-------GT--C-AGCTA-----TTGCAATTGCGGGCCTGAGCA-A-GACT--T----ATAC-CAAAGCTTA--CATATCACAT-TTAACATCTCA-TCCAG--T-AGAA----------TCG-A-CA-
gi|89661 : ACGTCTCA-TTGAT--T-AGAG-A--GCTA-CTCG-A-CA-G-CTCA