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blockSeqCons :
originalCons : TAGTGTTGTT-ACG--------A-T-AGT------CGC--CGAC-TAT-CG-AAAAA-T-CGTCGCT---GAAAGCA-GC-A-CT--TGGC-G--A-CA-A-T----CGA---------T---T-AT-AAATTTTGAAC-A-TC-GA-TTGTCGCT----GACTAT
finalCons : TAGTGTTGTT-ACG--------A-T-AGT------CGC--CGAC-TAT-CG-AAAAA-T-CGTCGCT---GAAAGCA-GC-A-CT--TGGC-G--A-CA-A-T----CGA---------T---T-AT-AAATTTTGAAC-A-TC-GA-TTGTCGCT----GACTAT
Alignments
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lowQualScore : . ........ . . ...... .. . . . . . ... . . . .. . .. . . . .... ......... ... . . . . . . ....
lowQualScore : 4 11111111 1 1 888888 66 8 0 0 0 0 333 9 9 9 88 0 88 0 0 0 2222 000000000 555 0 3 1 1 1 4 0000
consensus : TAGTGTTGTT-ACG--------A-T-AGT------CGC--CGAC-TAT-CG-AAAAA-T-CGTCGCT---GAAAGCA-GC-A-CT--TGGC-G--A-CA-A-T----CGA---------T---T-AT-AAATTTTGAAC-A-TC-GA-TTGTCGCT----GACTAT
Reference ( family-699 ) : TAGTGTTGTT-ACG--------A-T-AGT------CGC--CGAC-TAT-CG-AAAAA-T-CGTCGCT---GAAAGCA-GC-A-CT--TGGC-G--A-CA-A-T----CGA---------T---T-AT-AAATTTTGAAC-A-TC-GA-TTGTCGCT----GACTAT
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gi|102423 : TAGTGT-GTT-ACG--------G-T--GT------CGC---GACCTATTCG-AAAAA-T-CG-CGTT---GAAA-CA-GT-AACT--TGGC-G--A-CA-ATT----CGA---------T---T-ATCAAATTTTGAACAA-TC-GATTTGTC-CT----GACTAT
gi|102424 : TAGCGTTGTT-ACG--------A-T-AGT------CGT--TGAC-TAT-CG-AAAAA-T-
gi|102425 : TAGTGTTGTT-ACG--------A-T-AGT------CGC--CGAC-TA
gi|102426 : GTTGTTTATG--------A-TCAGT------CGT---GAC-TAT-CG-AAAAAATGCGTCGCT---GAAAGCA-AC-A-CT--T-GC-G--G-CA-A-TATTATGA---------T---T-AT-AAATTTTTTAC-A-TC--A-TTCTTGC
gi|102427 : -T-AGT------CGC--TGAC-TAT-TG-AAAAA-T-CGTCGCT---GAAAGCA-AC-A-
gi|102428 : ------CGC--CGAC-TAT-CG-AAAAA-T-CGTCGCT---GAAAGTA-GC-A-CT--TGGC-G--A-CA-A-T----CGA---------T---T-AT-AAATTTAGGAT-A-T--GA-TTGTCGCT----AACTAT
gi|102429 : GC--CGAC-TAT-CG-AAAA--T-CGTTGCTTTTGAAAACA-G--A--T--TGCA-A--A-CACA-T----AAAAAAATTATTT---T-AT-AA--CTTAGAC-A-TC-GA-TTGTCGCT----GACTA
gi|102430 : CGCT---GGAAGCA-GC-A-CT--TGGC-G--A-CA-A-T----GAA---------T---T-AG-AAA-TTTGGAC-A-TT-GA-TAGTCGCT----GGCTAT
gi|102431 : T---GAAAGCA-GC-A-TT--TGGT-G--A-CC-A-T----CGA---------TTAAT-AT-AAATTTTGGAT-A-TC-GA-TT-TTGCT----AACTAT